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https://docs.nvidia.com/cuda/eula/index.html\n", + "\n", + "\b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\bdone\n", + "Channels:\n", + " - anaconda\n", + " - conda-forge\n", + "Platform: linux-64\n", + "Collecting package metadata (repodata.json): - \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\bdone\n", + "Solving environment: \\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\b/ \b\b- \b\b\\ \b\b| \b\bdone\n", + "\n", + "\n", + "==> WARNING: A newer version of conda exists. <==\n", + " current version: 23.11.0\n", + " latest version: 24.9.2\n", + "\n", + "Please update conda by running\n", + "\n", + " $ conda update -n base -c conda-forge conda\n", + "\n", + "\n", + "\n", + "## Package Plan ##\n", + "\n", + " environment location: /usr/local\n", + "\n", + " added / updated specs:\n", + " - ipykernel\n", + "\n", + "\n", + "The following packages will be downloaded:\n", + "\n", + " package | build\n", + " ---------------------------|-----------------\n", + " asttokens-2.0.5 | pyhd3eb1b0_0 21 KB anaconda\n", + " ca-certificates-2024.9.24 | h06a4308_0 137 KB anaconda\n", + " certifi-2024.8.30 | py310h06a4308_0 164 KB anaconda\n", + " comm-0.2.1 | py310h06a4308_0 14 KB anaconda\n", + " conda-23.11.0 | py310h06a4308_0 1013 KB anaconda\n", + " debugpy-1.6.7 | py310h6a678d5_0 2.1 MB anaconda\n", + " decorator-5.1.1 | pyhd3eb1b0_0 12 KB anaconda\n", + " exceptiongroup-1.2.0 | py310h06a4308_0 29 KB anaconda\n", + " executing-0.8.3 | pyhd3eb1b0_0 18 KB anaconda\n", + " ipykernel-6.29.5 | py310h06a4308_0 187 KB anaconda\n", + " ipython-8.27.0 | py310h06a4308_0 1.2 MB anaconda\n", + " jedi-0.19.1 | py310h06a4308_0 1022 KB anaconda\n", + " jupyter_client-8.6.0 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plumed/include/core/ExchangePatterns.h \n", + " inflating: plumed/include/core/ActionPilot.h \n", + " inflating: plumed/include/core/GREX.h \n", + " inflating: plumed/include/core/ActionWithVirtualAtom.h \n", + " inflating: plumed/include/core/PlumedMainInitializer.h \n", + " inflating: plumed/include/core/Colvar.h \n", + " inflating: plumed/include/core/PlumedMain.h \n", + " inflating: plumed/include/core/ActionAtomistic.h \n", + " inflating: plumed/include/core/FlexibleBin.h \n", + " inflating: plumed/include/core/Atoms.h \n", + " inflating: plumed/include/core/GenericMolInfo.h \n", + " inflating: plumed/include/core/CLToolRegister.h \n", + " inflating: plumed/include/core/ActionAnyorder.h \n", + " inflating: plumed/include/core/ActionSetup.h \n", + " inflating: plumed/include/core/MDAtoms.h \n", + " inflating: plumed/include/core/ActionWithValue.h \n", + " inflating: plumed/include/core/CLToolMain.h \n", + " inflating: plumed/include/core/DataFetchingObject.h \n", + " inflating: plumed/include/core/ActionRegister.h \n", + " creating: plumed/include/function/\n", + " inflating: plumed/include/function/Function.h \n", + " inflating: plumed/include/function/ActionRegister.h \n", + " creating: plumed/include/gridtools/\n", + " inflating: plumed/include/gridtools/GridVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/gridtools/HistogramOnGrid.h \n", + " inflating: plumed/include/gridtools/GridPrintingBase.h \n", + " inflating: plumed/include/gridtools/ActionWithInputGrid.h \n", + " inflating: plumed/include/gridtools/AverageOnGrid.h \n", + " inflating: plumed/include/gridtools/ContourFindingBase.h \n", + " inflating: plumed/include/gridtools/ActionWithIntegral.h \n", + " inflating: plumed/include/gridtools/GridSearch.h \n", + " inflating: plumed/include/gridtools/ActionWithGrid.h \n", + " creating: plumed/include/isdb/\n", + " inflating: plumed/include/isdb/MetainferenceBase.h \n", + " creating: plumed/include/lapack/\n", + " inflating: plumed/include/lapack/real.h \n", + " inflating: plumed/include/lapack/def_external.h \n", + " inflating: plumed/include/lapack/lapack.h \n", + " inflating: plumed/include/lapack/def_internal.h \n", + " inflating: plumed/include/lapack/lapack_limits.h \n", + " creating: plumed/include/lepton/\n", + " inflating: plumed/include/lepton/Lepton.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/CompiledExpression.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/Operation.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/ExpressionProgram.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/CustomFunction.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/ParsedExpression.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/ExpressionTreeNode.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/Exception.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/windowsIncludes.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/MSVC_erfc.h \n", + " inflating: plumed/include/lepton/Parser.h \n", + " creating: plumed/include/mapping/\n", + " inflating: plumed/include/mapping/TrigonometricPathVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/mapping/Mapping.h \n", + " inflating: plumed/include/mapping/PathBase.h \n", + " inflating: plumed/include/mapping/PathReparameterization.h \n", + " creating: plumed/include/molfile/\n", + " inflating: plumed/include/molfile/largefiles.h \n", + " inflating: plumed/include/molfile/periodic_table.h \n", + " inflating: plumed/include/molfile/vmdplugin.h \n", + " inflating: plumed/include/molfile/molfile_plugin.h \n", + " inflating: plumed/include/molfile/fastio.h \n", + " inflating: plumed/include/molfile/Gromacs.h \n", + " inflating: plumed/include/molfile/libmolfile_plugin.h \n", + " inflating: plumed/include/molfile/readpdb.h \n", + " inflating: plumed/include/molfile/endianswap.h \n", + " creating: plumed/include/multicolvar/\n", + " inflating: plumed/include/multicolvar/VolumeGradientBase.h \n", + " inflating: plumed/include/multicolvar/ActionVolume.h \n", + " inflating: plumed/include/multicolvar/AtomValuePack.h \n", + " inflating: plumed/include/multicolvar/BridgedMultiColvarFunction.h \n", + " inflating: plumed/include/multicolvar/MultiColvarBase.h \n", + " inflating: plumed/include/multicolvar/CatomPack.h \n", + " inflating: plumed/include/multicolvar/MultiColvarFilter.h \n", + " creating: plumed/include/reference/\n", + " inflating: plumed/include/reference/RMSDBase.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/MetricRegister.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/Direction.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/MultiDomainRMSD.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/ReferenceValuePack.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/DRMSD.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/ArgumentOnlyDistance.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/ReferenceConfiguration.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/ReferenceAtoms.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/ReferenceArguments.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/FakeFrame.h \n", + " inflating: plumed/include/reference/SingleDomainRMSD.h \n", + " creating: plumed/include/secondarystructure/\n", + " inflating: plumed/include/secondarystructure/SecondaryStructureRMSD.h \n", + " creating: plumed/include/setup/\n", + " inflating: plumed/include/setup/ActionSetup.h \n", + " creating: plumed/include/tools/\n", + " inflating: plumed/include/tools/PlumedHandle.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/NeighborList.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Matrix.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Log.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/SwitchingFunction.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Communicator.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/DynamicList.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/ERMSD.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/MolDataClass.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/PDB.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Stopwatch.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/TypesafePtr.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/h36.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/DLLoader.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/LinkCells.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/IFile.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/FileBase.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Subprocess.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/RMSD.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/KernelFunctions.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Tensor.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/File.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/OFile.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/HistogramBead.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/ForwardDecl.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Tree.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Minimise1DBrent.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Grid.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Units.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Citations.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Angle.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Exception.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Tools.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/LoopUnroller.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Random.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/AtomNumber.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/BiasRepresentation.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/LatticeReduction.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/MinimiseBase.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Brent1DRootSearch.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/MatrixSquareBracketsAccess.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/RootFindingBase.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Keywords.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Torsion.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Vector.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/ConjugateGradient.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/OpenMP.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/MultiValue.h \n", + " inflating: plumed/include/tools/Pbc.h \n", + " creating: plumed/include/vatom/\n", + " inflating: plumed/include/vatom/ActionWithVirtualAtom.h \n", + " inflating: plumed/include/vatom/ActionRegister.h \n", + " creating: plumed/include/vesselbase/\n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/OrderingVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/ActionWithAveraging.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/ActionWithVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/Between.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/StoreDataVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/LessThan.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/ShortcutVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/VesselRegister.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/Vessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/FunctionVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/AveragingVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/ActionWithInputVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/BridgeVessel.h \n", + " inflating: plumed/include/vesselbase/ValueVessel.h \n", + " creating: plumed/include/wrapper/\n", + " inflating: plumed/include/wrapper/Plumed.h \n", + " creating: plumed/include/xdrfile/\n", + " inflating: plumed/include/xdrfile/xdrfile_trr.h \n", + " inflating: plumed/include/xdrfile/xdrfile.h \n", + " inflating: plumed/include/xdrfile/xdrfile_xtc.h \n", + "\u001b[33mCMake Warning (dev) at CMakeLists.txt:6 (PROJECT):\n", + " cmake_minimum_required() should be called prior to this top-level project()\n", + " call. Please see the cmake-commands(7) manual for usage documentation of\n", + " both commands.\n", + "This warning is for project developers. Use -Wno-dev to suppress it.\n", + "\u001b[0m\n", + "-- The C compiler identification is GNU 11.4.0\n", + "-- The CXX compiler identification is GNU 11.4.0\n", + "-- Detecting C compiler ABI info\n", + "-- Detecting C compiler ABI info - done\n", + "-- Check for working C compiler: /usr/bin/gcc - skipped\n", + "-- Detecting C compile features\n", + "-- Detecting C compile features - done\n", + "-- Detecting CXX compiler ABI info\n", + "-- Detecting CXX compiler ABI info - done\n", + "-- Check for working CXX compiler: /usr/bin/c++ - skipped\n", + "-- Detecting CXX compile features\n", + "-- Detecting CXX compile features - done\n", + "\u001b[0mCMake Deprecation Warning at CMakeLists.txt:7 (CMAKE_MINIMUM_REQUIRED):\n", + " Compatibility with CMake < 3.5 will be removed from a future version of\n", + " CMake.\n", + "\n", + " Update the VERSION argument value or use a ... suffix to tell\n", + " CMake that the project does not need compatibility with older versions.\n", + "\n", + "\u001b[0m\n", + "-- Found MPI_C: /usr/local/lib/libmpi.so (found version \"4.1\")\n", + "-- Found MPI_CXX: /usr/local/lib/libmpicxx.so (found version \"4.1\")\n", + "-- Found MPI: TRUE (found version \"4.1\")\n", + "\u001b[33mCMake Warning (dev) at /usr/local/share/cmake-3.29/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:438 (message):\n", + " The package name passed to `find_package_handle_standard_args` (OPENCL)\n", + " does not match the name of the calling package (OpenCL). This can lead to\n", + " problems in calling code that expects `find_package` result variables\n", + " (e.g., `_FOUND`) to follow a certain pattern.\n", + "Call Stack (most recent call first):\n", + " FindOpenCL.cmake:85 (find_package_handle_standard_args)\n", + " CMakeLists.txt:90 (FIND_PACKAGE)\n", + "This warning is for project developers. Use -Wno-dev to suppress it.\n", + "\u001b[0m\n", + "-- Found OPENCL: /usr/local/lib/libOpenCL.so\n", + "\u001b[33mCMake Warning (dev) at CMakeLists.txt:100 (FIND_PACKAGE):\n", + " Policy CMP0146 is not set: The FindCUDA module is removed. Run \"cmake\n", + " --help-policy CMP0146\" for policy details. Use the cmake_policy command to\n", + " set the policy and suppress this warning.\n", + "\n", + "This warning is for project developers. Use -Wno-dev to suppress it.\n", + "\u001b[0m\n", + "-- Performing Test CMAKE_HAVE_LIBC_PTHREAD\n", + "-- Performing Test CMAKE_HAVE_LIBC_PTHREAD - Success\n", + "-- Found Threads: TRUE\n", + "-- Configuring done (2.5s)\n", + "-- Generating done (0.0s)\n", + "-- Build files have been written to: /content/OpenMM-Plumed-MPI/build\n", + "[ 12%] \u001b[32mBuilding CXX object CMakeFiles/OpenMMPlumed.dir/openmmapi/src/PlumedForce.cpp.o\u001b[0m\n", + "[ 25%] \u001b[32mBuilding CXX object CMakeFiles/OpenMMPlumed.dir/openmmapi/src/PlumedForceImpl.cpp.o\u001b[0m\n", + "[ 37%] \u001b[32m\u001b[1mLinking CXX shared library libOpenMMPlumed.so\u001b[0m\n", + "[ 37%] Built target OpenMMPlumed\n", + "[ 50%] \u001b[32mBuilding CXX object platforms/reference/CMakeFiles/OpenMMPlumedReference.dir/src/ReferencePlumedKernelFactory.cpp.o\u001b[0m\n", + "[ 62%] \u001b[32mBuilding CXX object platforms/reference/CMakeFiles/OpenMMPlumedReference.dir/src/ReferencePlumedKernels.cpp.o\u001b[0m\n", + "[ 75%] \u001b[32m\u001b[1mLinking CXX shared library libOpenMMPlumedReference.so\u001b[0m\n", + "[ 75%] Built target OpenMMPlumedReference\n", + "[ 87%] \u001b[32mBuilding CXX object platforms/reference/tests/CMakeFiles/TestReferencePlumedForce.dir/TestReferencePlumedForce.cpp.o\u001b[0m\n", + "[100%] \u001b[32m\u001b[1mLinking CXX executable TestReferencePlumedForce\u001b[0m\n", + "/usr/bin/ld: warning: libmpich.so.0, needed by /content/OpenMM-Plumed-MPI/plumed/lib/libplumedKernel.so, not found (try using -rpath or -rpath-link)\n", + "[100%] Built target TestReferencePlumedForce\n", + "[ 37%] Built target OpenMMPlumed\n", + "[ 75%] Built target OpenMMPlumedReference\n", + "[100%] Built target TestReferencePlumedForce\n", + "\u001b[36mInstall the project...\u001b[0m\n", + "-- Install configuration: \"\"\n", + "-- Installing: /content/OpenMM-Plumed-MPI/install/include/PlumedForce.h\n", + "-- Installing: /content/OpenMM-Plumed-MPI/install/include/PlumedKernels.h\n", + "-- Installing: /content/OpenMM-Plumed-MPI/install/include/internal/PlumedForceImpl.h\n", + "-- Installing: /content/OpenMM-Plumed-MPI/install/include/internal/windowsExportPlumed.h\n", + "-- Installing: /content/OpenMM-Plumed-MPI/install/lib/libOpenMMPlumed.so\n", + "-- Set non-toolchain portion of runtime path of \"/content/OpenMM-Plumed-MPI/install/lib/libOpenMMPlumed.so\" to \"\"\n", + "-- Installing: /content/OpenMM-Plumed-MPI/install/lib/plugins/libOpenMMPlumedReference.so\n", + "-- Set non-toolchain portion of runtime path of \"/content/OpenMM-Plumed-MPI/install/lib/plugins/libOpenMMPlumedReference.so\" to \"\"\n", + "[100%] \u001b[34m\u001b[1mGenerating PlumedPluginWrapper.cpp\u001b[0m\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:651: Warning 314: 'None' is a python keyword, renaming to '_None'\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:477: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:537: Warning 453: Can't apply (std::vector< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:552: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:553: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:574: Warning 453: Can't apply (std::vector< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:577: Warning 453: Can't apply (std::vector< std::vector< int > > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:588: Warning 453: Can't apply (std::vector< Vec3 > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:591: Warning 453: Can't apply (std::vector< Vec3 > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:594: Warning 453: Can't apply (std::vector< Vec3 > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:597: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:600: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:601: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:605: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:704: Warning 453: Can't apply (std::vector< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:721: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:739: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:811: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:837: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:919: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:937: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:962: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1009: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1016: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1046: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1052: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1085: Warning 453: Can't apply (std::vector< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1086: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1092: Warning 453: Can't apply (std::vector< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1093: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1102: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1134: Warning 453: Can't apply (std::vector< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1135: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1145: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1146: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1155: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1188: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1189: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1193: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1196: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1221: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1226: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1272: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1277: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1278: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1286: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1304: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1305: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1314: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1360: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1371: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1390: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1391: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1400: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1435: Warning 453: Can't apply (std::vector< Vec3 > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1438: Warning 453: Can't apply (std::vector< Vec3 > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1453: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1454: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1508: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1522: Warning 453: Can't apply (std::set< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1530: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1580: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1597: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1598: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1608: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1609: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1615: Warning 453: Can't apply (std::set< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1616: Warning 453: Can't apply (std::set< int > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1621: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1652: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1660: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1671: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1685: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1702: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1749: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1813: Warning 453: Can't apply (ContextImpl &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1887: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1923: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1947: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:1970: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2044: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2045: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2098: Warning 453: Can't apply (std::vector< Vec3 > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2101: Warning 453: Can't apply (std::vector< Vec3 > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2104: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2149: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2152: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2155: Warning 453: Can't apply (std::vector< double > &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2356: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2369: Warning 453: Can't apply (std::string &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2387: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2452: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2481: Warning 453: Can't apply (ContextImpl &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2482: Warning 453: Can't apply (ContextImpl &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2517: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2532: Warning 453: Can't apply (OpenMM::Context &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2614: Warning 453: Can't apply (OpenMM::SerializationNode &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2638: Warning 453: Can't apply (Vec3 &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2639: Warning 453: Can't apply (Vec3 &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2640: Warning 453: Can't apply (Vec3 &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2679: Warning 453: Can't apply (Vec3 &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2680: Warning 453: Can't apply (Vec3 &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/swig/OpenMMSwigHeaders.i:2681: Warning 453: Can't apply (Vec3 &OUTPUT). No typemaps are defined.\n", + "In file included from \u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/OpenMM.h:53\u001b[m\u001b[K,\n", + " from \u001b[01m\u001b[KPlumedPluginWrapper.cpp:3376\u001b[m\u001b[K:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/GayBerneForce.h:\u001b[m\u001b[K In constructor ‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::GayBerneForce::ParticleInfo::ParticleInfo(double, double, int, int, double, double, double, double, double, double)\u001b[m\u001b[K’:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/GayBerneForce.h:286:19:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::GayBerneForce::ParticleInfo::epsilon\u001b[m\u001b[K’ will be initialized after [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 286 | double sigma, \u001b[01;35m\u001b[Kepsilon\u001b[m\u001b[K, sx, sy, sz, ex, ey, ez;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/GayBerneForce.h:285:9:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K ‘\u001b[01m\u001b[Kint OpenMM::GayBerneForce::ParticleInfo::xparticle\u001b[m\u001b[K’ [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 285 | int \u001b[01;35m\u001b[Kxparticle\u001b[m\u001b[K, yparticle;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/GayBerneForce.h:291:5:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K when initialized here [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 291 | \u001b[01;35m\u001b[KParticleInfo\u001b[m\u001b[K(double sigma, double epsilon, int xparticle, int yparticle, double sx, double sy, double sz, double ex, double ey, double ez) :\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "In file included from \u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/OpenMM.h:65\u001b[m\u001b[K,\n", + " from \u001b[01m\u001b[KPlumedPluginWrapper.cpp:3376\u001b[m\u001b[K:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/NonbondedForce.h:\u001b[m\u001b[K In constructor ‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::NonbondedForce::ParticleOffsetInfo::ParticleOffsetInfo(int, int, double, double, double)\u001b[m\u001b[K’:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/NonbondedForce.h:694:19:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::NonbondedForce::ParticleOffsetInfo::parameter\u001b[m\u001b[K’ will be initialized after [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 694 | int particle, \u001b[01;35m\u001b[Kparameter\u001b[m\u001b[K;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/NonbondedForce.h:694:9:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K ‘\u001b[01m\u001b[Kint OpenMM::NonbondedForce::ParticleOffsetInfo::particle\u001b[m\u001b[K’ [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 694 | int \u001b[01;35m\u001b[Kparticle\u001b[m\u001b[K, parameter;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/NonbondedForce.h:700:5:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K when initialized here [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 700 | \u001b[01;35m\u001b[KParticleOffsetInfo\u001b[m\u001b[K(int parameter, int particle, double chargeScale, double sigmaScale, double epsilonScale) :\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~~~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/NonbondedForce.h:\u001b[m\u001b[K In constructor ‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::NonbondedForce::ExceptionOffsetInfo::ExceptionOffsetInfo(int, int, double, double, double)\u001b[m\u001b[K’:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/NonbondedForce.h:711:20:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::NonbondedForce::ExceptionOffsetInfo::parameter\u001b[m\u001b[K’ will be initialized after [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 711 | int exception, \u001b[01;35m\u001b[Kparameter\u001b[m\u001b[K;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/NonbondedForce.h:711:9:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K ‘\u001b[01m\u001b[Kint OpenMM::NonbondedForce::ExceptionOffsetInfo::exception\u001b[m\u001b[K’ [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 711 | int \u001b[01;35m\u001b[Kexception\u001b[m\u001b[K, parameter;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/NonbondedForce.h:717:5:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K when initialized here [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 717 | \u001b[01;35m\u001b[KExceptionOffsetInfo\u001b[m\u001b[K(int parameter, int exception, double chargeProdScale, double sigmaScale, double epsilonScale) :\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~~~~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "In file included from \u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/OpenMMAmoeba.h:38\u001b[m\u001b[K,\n", + " from \u001b[01m\u001b[KPlumedPluginWrapper.cpp:3377\u001b[m\u001b[K:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/AmoebaVdwForce.h:\u001b[m\u001b[K In constructor ‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::AmoebaVdwForce::VdwInfo::VdwInfo(int, double, double, int, double, bool)\u001b[m\u001b[K’:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/AmoebaVdwForce.h:492:36:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::AmoebaVdwForce::VdwInfo::epsilon\u001b[m\u001b[K’ will be initialized after [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 492 | double reductionFactor, sigma, \u001b[01;35m\u001b[Kepsilon\u001b[m\u001b[K, cutoff;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/AmoebaVdwForce.h:491:22:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K ‘\u001b[01m\u001b[Kint OpenMM::AmoebaVdwForce::VdwInfo::typeIndex\u001b[m\u001b[K’ [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 491 | int parentIndex, \u001b[01;35m\u001b[KtypeIndex\u001b[m\u001b[K;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/AmoebaVdwForce.h:501:5:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K when initialized here [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 501 | \u001b[01;35m\u001b[KVdwInfo\u001b[m\u001b[K(int parentIndex, double sigma, double epsilon, int typeIndex, double reductionFactor, bool isAlchemical) :\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "In file included from \u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/OpenMMAmoeba.h:40\u001b[m\u001b[K,\n", + " from \u001b[01m\u001b[KPlumedPluginWrapper.cpp:3377\u001b[m\u001b[K:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/HippoNonbondedForce.h:\u001b[m\u001b[K In constructor ‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::HippoNonbondedForce::ParticleInfo::ParticleInfo(double, const std::vector&, const std::vector&, double, double, double, double, double, double, double, double, double, int, int, int, int)\u001b[m\u001b[K’:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/HippoNonbondedForce.h:407:33:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::HippoNonbondedForce::ParticleInfo::quadrupole\u001b[m\u001b[K’ will be initialized after [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 407 | std::vector dipole, \u001b[01;35m\u001b[Kquadrupole\u001b[m\u001b[K;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/HippoNonbondedForce.h:406:20:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K ‘\u001b[01m\u001b[Kdouble OpenMM::HippoNonbondedForce::ParticleInfo::coreCharge\u001b[m\u001b[K’ [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 406 | double charge, \u001b[01;35m\u001b[KcoreCharge\u001b[m\u001b[K, alpha, epsilon, damping, c6, pauliK, pauliQ, pauliAlpha, polarizability;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/HippoNonbondedForce.h:414:5:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K when initialized here [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 414 | \u001b[01;35m\u001b[KParticleInfo\u001b[m\u001b[K(double charge, const std::vector& dipole, const std::vector& quadrupole, double coreCharge,\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/HippoNonbondedForce.h:406:89:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::HippoNonbondedForce::ParticleInfo::polarizability\u001b[m\u001b[K’ will be initialized after [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 406 | le charge, coreCharge, alpha, epsilon, damping, c6, pauliK, pauliQ, pauliAlpha, \u001b[01;35m\u001b[Kpolarizability\u001b[m\u001b[K;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/HippoNonbondedForce.h:405:9:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K ‘\u001b[01m\u001b[Kint OpenMM::HippoNonbondedForce::ParticleInfo::axisType\u001b[m\u001b[K’ [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 405 | int \u001b[01;35m\u001b[KaxisType\u001b[m\u001b[K, multipoleAtomZ, multipoleAtomX, multipoleAtomY;\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/HippoNonbondedForce.h:414:5:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K when initialized here [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wreorder\u0007-Wreorder\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 414 | \u001b[01;35m\u001b[KParticleInfo\u001b[m\u001b[K(double charge, const std::vector& dipole, const std::vector& quadrupole, double coreCharge,\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "In file included from \u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/State.h:35\u001b[m\u001b[K,\n", + " from \u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/Integrator.h:35\u001b[m\u001b[K,\n", + " from \u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/Context.h:35\u001b[m\u001b[K,\n", + " from \u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmmapi/include/PlumedForce.h:36\u001b[m\u001b[K,\n", + " from \u001b[01m\u001b[KPlumedPluginWrapper.cpp:3375\u001b[m\u001b[K:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/Vec3.h:\u001b[m\u001b[K At global scope:\n", + "\u001b[01m\u001b[K/content/OpenMM-Plumed-MPI/openmm/include/openmm/Vec3.h:160:13:\u001b[m\u001b[K \u001b[01;35m\u001b[Kwarning: \u001b[m\u001b[K‘\u001b[01m\u001b[KOpenMM::Vec3 OpenMM::operator*(double, OpenMM::Vec3)\u001b[m\u001b[K’ defined but not used [\u001b[01;35m\u001b[K\u001b]8;;https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Warning-Options.html#index-Wunused-function\u0007-Wunused-function\u001b]8;;\u0007\u001b[m\u001b[K]\n", + " 160 | static Vec3 \u001b[01;35m\u001b[Koperator\u001b[m\u001b[K*(double lhs, Vec3 rhs) {\n", + " | \u001b[01;35m\u001b[K^~~~~~~~\u001b[m\u001b[K\n", + "/usr/local/lib/python3.10/site-packages/setuptools/_distutils/cmd.py:66: SetuptoolsDeprecationWarning: setup.py install is deprecated.\n", + "!!\n", + "\n", + " ********************************************************************************\n", + " Please avoid running ``setup.py`` directly.\n", + " Instead, use pypa/build, pypa/installer or other\n", + " standards-based tools.\n", + "\n", + " See https://blog.ganssle.io/articles/2021/10/setup-py-deprecated.html for details.\n", + " ********************************************************************************\n", + "\n", + "!!\n", + " self.initialize_options()\n", + "/usr/local/lib/python3.10/site-packages/setuptools/_distutils/cmd.py:66: EasyInstallDeprecationWarning: easy_install command is deprecated.\n", + "!!\n", + "\n", + " ********************************************************************************\n", + " Please avoid running ``setup.py`` and ``easy_install``.\n", + " Instead, use pypa/build, pypa/installer or other\n", + " standards-based tools.\n", + "\n", + " See https://github.com/pypa/setuptools/issues/917 for details.\n", + " ********************************************************************************\n", + "\n", + "!!\n", + " self.initialize_options()\n", + "zip_safe flag not set; analyzing archive contents...\n", + "__pycache__._openmmplumed.cpython-310: module references __file__\n", + "[100%] Built target PythonInstall\n" + ] + } + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "source": [ + "!pwd" + ], + "metadata": { + "colab": { + "base_uri": "https://localhost:8080/" + }, + "id": "jPGHmPOS8kFL", + "outputId": "ce60e894-fe56-4a98-96f0-44f1628d7428" + }, + "execution_count": 2, + "outputs": [ + { + "output_type": "stream", + "name": "stdout", + "text": [ + "/content/OpenMM-Plumed-MPI/install/lib\n" + ] + } + ] + }, + { + "cell_type": "markdown", + "source": [ + "# Run Alpha-Fold distance map prediction\n", + "\n", + "\n", + "__For this example (TDP-43 WtoA):__\n", + "\n", + "The AF distance map has already been calculated and it is loaded in this notebook below.\n", + "\n", + "__For arbitrary protein sequences:__\n", + "\n", + "* Open [this](https://github.com/zshengyu14/ColabFold_distmats/blob/main/AlphaFold2.ipynb) link and chose colab.\n", + "* Input the protein sequence as query sequence.\n", + "* The rest of the options remain default and cells are run until the end.\n", + "* Download the link with the AF data and upload it as AF_data in AlphaFold-IDP folder" + ], + "metadata": { + "id": "vaE74PSo_cq_" + } + }, + { + "cell_type": "markdown", + "source": [ + "# Setup protein system in CALVADOS and OPENMM" + ], + "metadata": { + "id": "qUxcx5HRQ7CZ" + } + }, + { + "cell_type": "code", + "source": [ + "os.chdir(home)\n", + "!git clone https://github.com/vendruscolo-lab/AlphaFold-IDP" + ], + "metadata": { + "colab": { + "base_uri": "https://localhost:8080/" + }, + "id": "LG3YfCn2XpgZ", + "outputId": "07ce4a1b-325f-44c9-a490-75164dac6c07" + }, + "execution_count": 3, + "outputs": [ + { + "output_type": "stream", + "name": "stdout", + "text": [ + "Cloning into 'AlphaFold-IDP'...\n", + "remote: Enumerating objects: 308, done.\u001b[K\n", + "remote: Counting objects: 100% (219/219), done.\u001b[K\n", + "remote: Compressing objects: 100% (150/150), done.\u001b[K\n", + "remote: Total 308 (delta 97), reused 176 (delta 68), pack-reused 89 (from 1)\u001b[K\n", + "Receiving objects: 100% (308/308), 54.69 MiB | 23.53 MiB/s, done.\n", + "Resolving deltas: 100% (118/118), done.\n" + ] + } + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "source": [ + "os.chdir(home+'/AlphaFold-IDP/prep_run')\n" + ], + "metadata": { + "id": "_-LmH2G_X9NF" + }, + "execution_count": 4, + "outputs": [] + }, + { + "cell_type": "code", + "source": [ + "import shutil\n", + "import csv\n", + "dir=os.getcwd()\n", + "###################### The entries below need to be adapted in eac simulation ######################\n", + "#TDP-43 sequence\n", + "fasta_sequence=\"MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQCMRGVRLVEGILHAPDAGAGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAVQKTSDLIVLGLPAKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRACDCKLPNSKQSQDEPLRSRKVFVGRCTEDMTEDELREFFSQYGDVMDVFIPKPFRAFAFVTFADDQIAQSLCGEDLIIKGISVHISNAEPKHNSNRQLERSGRFGGNPGGFGNQGGFGNSRGGGAGLGNNQGSNMGGGMNFGAFSINPAMMAAAQAALQSSAGMMGMLASQQNQSGPSGNNQNQGNMQREPNQAFGSGNNSYSGSNSGAAIGAGSASNAGSGSGFNGGFGSSMDSKSSGAGM\"\n", + "#Conditions\n", + "pH=7.4\n", + "temp=298\n", + "ionic=0.2\n", + "PAE_cut=5\n", + "Pr_cut=0.2\n", + "NR=2\n", + "#Decide the plddt based ordered (od) and disordered (dd) regions\n", + "ordered_domains = {'od1': [3, 79], 'od2': [104,178],'od3':[191,260]}\n", + "disordered_domains={'dd1': [1,2],'dd2':[80,103],'dd3':[179,190],'dd4':[261,414]}\n", + "\n", + "#AF input created in AF-distance map prediction and used in AF-MI\n", + "pdb_af='tdp43_WtoA_bf4cc_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000.pdb'\n", + "json_af='tdp43_WtoA_bf4cc_predicted_aligned_error_v1.json'\n", + "npy_af='alphafold2_ptm_model_3_seed_000_prob_distributions.npy'\n", + "mean_af='alphafold2_ptm_model_3_seed_000_mean.csv'\n", + "#Copy AF data\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../AF_DATA/\"+pdb_af, dir+\"/pdb_af.pdb\")\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../AF_DATA/\"+json_af, dir+\"/pae.json\")\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../AF_DATA/tdp43_WtoA_bf4cc_distmat/\"+mean_af, dir+\"/mean_af.csv\")\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../AF_DATA/tdp43_WtoA_bf4cc_distmat/\"+npy_af, dir+\"/prob.npy\")\n", + "####################################################################################################\n", + "\n", + "f = open(\"sequence.dat\", \"w\")\n", + "f.write(fasta_sequence)\n", + "f.close()\n", + "#Write the csv files\n", + "with open('ordered_domains.csv', 'w') as f: # You will need 'wb' mode in Python 2.x\n", + " w = csv.DictWriter(f, ordered_domains.keys())\n", + " w.writeheader()\n", + " w.writerow(ordered_domains)\n", + "with open('disordered_domains.csv', 'w') as f: # You will need 'wb' mode in Python 2.x\n", + " w = csv.DictWriter(f, disordered_domains.keys())\n", + " w.writeheader()\n", + " w.writerow(disordered_domains)\n", + "\n", + "#Copy OPENMM calvados forcefield files\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../scripts_prep/gen_xml_and_constraints.py\", dir)\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../scripts_prep/residues.csv\", dir)\n", + "\n", + "path_gen_xml = dir+'/gen_xml_and_constraints.py sequence.dat '+str(pH)+' '+str(temp)+' '+str(ionic)\n", + "print(path_gen_xml)\n", + "os.system(f'python {path_gen_xml}')\n", + "\n" + ], + "metadata": { + "colab": { + "base_uri": "https://localhost:8080/" + }, + "id": "ccmy6TQdZoJ0", + "outputId": "1472f1fb-79cf-437b-9cf9-10109200bcb4" + }, + "execution_count": 5, + "outputs": [ + { + "output_type": "stream", + "name": "stdout", + "text": [ + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/gen_xml_and_constraints.py sequence.dat 7.4 298 0.2\n" + ] + }, + { + "output_type": "execute_result", + "data": { + "text/plain": [ + "0" + ] + }, + "metadata": {}, + "execution_count": 5 + } + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "source": [ + "#Make plumed files.\n", + "#Copy and run the prep script that makes the plumed file.\n", + "#The Collective variables (CVs) in these case are chosen to be the torsion angles between structured domains.\n", + "import subprocess\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../scripts_prep/make_plumed_distmat.py\", dir)\n", + "subprocess.run(['python', str(dir)+'/make_plumed_distmat.py', 'sequence.dat',str(PAE_cut), str(Pr_cut)], capture_output=True, text=True)" + ], + "metadata": { + "colab": { + "base_uri": "https://localhost:8080/" + }, + "collapsed": true, + "id": "5kf89j5nEOQB", + "outputId": "30dfcbf0-f44e-48bf-ca2f-fed09dddc848" + }, + "execution_count": 6, + "outputs": [ + { + "output_type": "execute_result", + "data": { + "text/plain": [ + "CompletedProcess(args=['python', '/content/AlphaFold-IDP/prep_run/make_plumed_distmat.py', 'sequence.dat', '5', '0.2'], returncode=0, stdout=\"5.0 0.2\\n[[3, 79], [104, 178], [191, 260]]\\n od1 od2 od3\\n0 [3, 79] [104, 178] [191, 260]\\n[[1, 2], [80, 103], [179, 190], [261, 414]]\\n dd1 dd2 dd3 dd4\\n0 [1, 2] [80, 103] [179, 190] [261, 414]\\n1 4\\n1 5\\n1 6\\n1 7\\n1 8\\n1 9\\n1 10\\n1 11\\n1 12\\n1 13\\n1 14\\n1 15\\n1 16\\n1 17\\n1 18\\n1 19\\n1 20\\n1 21\\n1 22\\n1 23\\n1 24\\n1 25\\n1 26\\n1 27\\n1 28\\n1 29\\n1 30\\n1 31\\n1 32\\n1 33\\n1 34\\n1 35\\n1 36\\n1 37\\n1 38\\n1 39\\n1 40\\n1 41\\n1 42\\n1 43\\n1 44\\n1 45\\n1 46\\n1 47\\n1 48\\n1 49\\n1 50\\n1 51\\n1 52\\n1 53\\n1 54\\n1 55\\n1 56\\n1 57\\n1 58\\n1 59\\n1 60\\n1 61\\n1 62\\n1 63\\n1 64\\n1 65\\n1 66\\n1 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using periodic boundary conditions\n", + "PLUMED: Action PBMETAD\n", + "PLUMED: with label pb\n", + "PLUMED: with arguments torsion1 torsion2\n", + "PLUMED: added component to this action: pb.bias \n", + "PLUMED: Uses Diffusion-based hills width: sigma must be in time steps and only one sigma is needed\n", + "PLUMED: Limits for sigmas using adaptive hills: \n", + "PLUMED: CV torsion1:\n", + "PLUMED: Min 0.05 Max 0.1 \n", + "PLUMED: Limits for sigmas using adaptive hills: \n", + "PLUMED: CV torsion2:\n", + "PLUMED: Min 0.05 Max 0.1 \n", + "PLUMED: Binsize not specified, 1/5 of sigma_min will be be used\n", + "PLUMED: Gaussian width (Note: The units of sigma are in timesteps) 1000.000000 Gaussian height 0.500000\n", + "PLUMED: Gaussian deposition pace 200\n", + "PLUMED: Gaussian files HILLS.torsion1 HILLS.torsion2 \n", + "PLUMED: Well-Tempered Bias Factor 35.000000\n", + "PLUMED: Hills relaxation time (tau) 168.484260\n", + "PLUMED: KbT 2.477710\n", + "PLUMED: Multiple walkers active 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Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 219th contact is calculated from atoms : 392 395. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 220th contact is calculated from atoms : 394 397. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 221th contact is calculated from atoms : 396 399. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 222th contact is calculated from atoms : 399 402. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 223th contact is calculated from atoms : 400 403. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 224th contact is calculated from atoms : 402 405. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 225th contact is calculated from atoms : 402 406. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 226th contact is calculated from atoms : 407 411. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 227th contact is calculated from atoms : 408 411. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: Action CONSTANT\n", + "PLUMED: with label af_dist_rest\n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-0 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-1 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-2 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-3 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-4 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-5 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-6 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-7 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-8 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-9 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-10 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-11 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-12 \n", + "PLUMED: added component to this action: 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using periodic boundary conditions\n", + "PLUMED: Action PBMETAD\n", + "PLUMED: with label pb\n", + "PLUMED: with arguments torsion1 torsion2\n", + "PLUMED: added component to this action: pb.bias \n", + "PLUMED: Uses Diffusion-based hills width: sigma must be in time steps and only one sigma is needed\n", + "PLUMED: Limits for sigmas using adaptive hills: \n", + "PLUMED: CV torsion1:\n", + "PLUMED: Min 0.05 Max 0.1 \n", + "PLUMED: Limits for sigmas using adaptive hills: \n", + "PLUMED: CV torsion2:\n", + "PLUMED: Min 0.05 Max 0.1 \n", + "PLUMED: Binsize not specified, 1/5 of sigma_min will be be used\n", + "PLUMED: Gaussian width (Note: The units of sigma are in timesteps) 1000.000000 Gaussian height 0.500000\n", + "PLUMED: Gaussian deposition pace 200\n", + "PLUMED: Gaussian files HILLS.torsion1 HILLS.torsion2 \n", + "PLUMED: Well-Tempered Bias Factor 35.000000\n", + "PLUMED: Hills relaxation time (tau) 168.484260\n", + "PLUMED: KbT 2.477710\n", + "PLUMED: Multiple walkers active 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Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 215th contact is calculated from atoms : 360 363. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 216th contact is calculated from atoms : 371 374. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 217th contact is calculated from atoms : 376 379. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 218th contact is calculated from atoms : 386 389. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 219th contact is calculated from atoms : 392 395. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 220th contact is calculated from atoms : 394 397. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 221th contact is calculated from atoms : 396 399. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 222th contact is calculated from atoms : 399 402. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 223th contact is calculated from atoms : 400 403. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 224th contact is calculated from atoms : 402 405. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 225th contact is calculated from atoms : 402 406. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 226th contact is calculated from atoms : 407 411. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: The 227th contact is calculated from atoms : 408 411. Inflection point of switching function is at 1. Using lepton switching function with parameters d0=0 func=x. Reference contact value is 0.000000\n", + "PLUMED: Action CONSTANT\n", + "PLUMED: with label af_dist_rest\n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-0 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-1 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-2 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-3 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-4 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-5 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-6 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-7 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-8 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-9 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-10 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-11 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-12 \n", + "PLUMED: added component to this action: 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Action CENTER\n", + "PLUMED: with label tt3\n", + "PLUMED: serial associated to this virtual atom is 421\n", + "PLUMED: of atoms:\n", + "PLUMED: 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215\n", + "PLUMED: 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225\n", + "PLUMED: using the geometric center\n", + "PLUMED: broken molecules will be rebuilt assuming atoms are in the proper order\n", + "PLUMED: Action CENTER\n", + "PLUMED: with label tt4\n", + "PLUMED: serial associated to this virtual atom is 422\n", + "PLUMED: of atoms:\n", + "PLUMED: 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250\n", + "PLUMED: 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260\n", + "PLUMED: using the geometric center\n", + "PLUMED: broken molecules will be rebuilt assuming atoms are in the proper order\n", + "PLUMED: Action TORSION\n", + "PLUMED: with label torsion2\n", + "PLUMED: between atoms 419 420 421 422\n", + "PLUMED: using periodic boundary conditions\n", + "PLUMED: Action PBMETAD\n", + "PLUMED: with label pb\n", + "PLUMED: with arguments torsion1 torsion2\n", + "PLUMED: added component to this action: pb.bias \n", + "PLUMED: Uses Diffusion-based hills width: sigma must be in time steps and only one sigma is needed\n", + "PLUMED: Limits for sigmas using adaptive hills: \n", + "PLUMED: CV torsion1:\n", + "PLUMED: Min 0.05 Max 0.1 \n", + "PLUMED: Limits for sigmas using adaptive hills: \n", + "PLUMED: CV torsion2:\n", + "PLUMED: Min 0.05 Max 0.1 \n", + "PLUMED: Binsize not specified, 1/5 of sigma_min will be be used\n", + "PLUMED: Gaussian width (Note: The units of sigma are in timesteps) 1000.000000 Gaussian height 0.500000\n", + "PLUMED: Gaussian deposition pace 200\n", + "PLUMED: Gaussian files HILLS.torsion1 HILLS.torsion2 \n", + "PLUMED: Well-Tempered Bias Factor 35.000000\n", + "PLUMED: Hills relaxation time (tau) 168.484260\n", + "PLUMED: KbT 2.477710\n", + "PLUMED: Multiple walkers active 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action: af_dist_rest.v-24 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-25 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-26 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-27 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-28 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-29 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-30 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-31 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-32 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-33 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-34 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-35 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-36 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-37 \n", + "PLUMED: added component to this action: af_dist_rest.v-38 \n", + "PLUMED: added component to this action: 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(temporary)\n", + "[mpiexec@6accaabb7039] Sending Ctrl-C to processes as requested\n", + "[mpiexec@6accaabb7039] Press Ctrl-C again to force abort\n", + "Ctrl-C caught... cleaning up processes\n", + "[proxy:0@6accaabb7039] HYD_pmcd_pmip_control_cmd_cb (proxy/pmip_cb.c:487): assert (!closed) failed\n", + "[proxy:0@6accaabb7039] HYDT_dmxu_poll_wait_for_event (lib/tools/demux/demux_poll.c:76): callback returned error status\n", + "[proxy:0@6accaabb7039] main (proxy/pmip.c:122): demux engine error waiting for event\n", + "[mpiexec@6accaabb7039] HYDT_bscu_wait_for_completion (lib/tools/bootstrap/utils/bscu_wait.c:109): one of the processes terminated badly; aborting\n", + "[mpiexec@6accaabb7039] HYDT_bsci_wait_for_completion (lib/tools/bootstrap/src/bsci_wait.c:21): launcher returned error waiting for completion\n", + "[mpiexec@6accaabb7039] HYD_pmci_wait_for_completion (mpiexec/pmiserv_pmci.c:189): launcher returned error waiting for completion\n", + "[mpiexec@6accaabb7039] main (mpiexec/mpiexec.c:260): process manager error waiting for completion\n" + ] + } + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "source": [ + "!tail COLVAR.1" + ], + "metadata": { + "id": "JoC0TkksbZlD", + "colab": { + "base_uri": "https://localhost:8080/" + }, + "outputId": "3126cb7f-1adb-48e7-dbc5-9c0ab3353b29" + }, + "execution_count": null, + "outputs": [ + { + "output_type": "stream", + "name": "stdout", + "text": [ + " 999.000000 3.287385 0.069073 0.064698 0.072341 0.187139 1.357131 0.718896 2.771056\n", + " 1000.000000 3.280081 0.071691 0.067392 0.068556 0.195065 1.387259 0.755816 2.762186\n", + " 1001.000000 3.271528 0.069529 0.066808 0.067597 0.194235 1.410405 0.735257 2.754690\n", + " 1002.000000 3.262847 0.070130 0.066275 0.067913 0.177680 1.378868 0.774091 2.755021\n", + " 1003.000000 3.260832 0.077362 0.066461 0.067686 0.209309 1.359885 0.780594 2.761380\n", + " 1004.000000 3.256498 0.074981 0.072810 0.070903 0.195191 1.340594 0.790086 2.754854\n", + " 1005.000000 3.249150 0.074185 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adding: forcefield.xml (deflated 79%)\n", + " adding: residues.csv (deflated 55%)\n", + " adding: prob.npy (deflated 16%)\n", + " adding: mean_af.csv (deflated 56%)\n", + " adding: pdb_af.pdb (deflated 79%)\n", + " adding: keepH.sh (deflated 52%)\n", + "Archive: files.zip\n", + " inflating: script.sh \n", + " inflating: pulchra.sh \n", + " inflating: pulchra.py \n", + " inflating: backmap.py \n", + " inflating: simulate_em.py \n", + " inflating: simulate.py \n", + " inflating: dcd2xtc.py \n", + " inflating: plumed_analysis.dat \n", + " inflating: reconstruct.dat \n", + " inflating: resample.py \n", + " inflating: fes2.py \n", + " inflating: sequence.dat \n", + " inflating: plumed.dat \n", + " inflating: struct1.pdb \n", + " inflating: struct2.pdb \n", + " inflating: struct3.pdb \n", + " inflating: input_af.pdb \n", + " inflating: r1_excl.pkl \n", + " inflating: forcefield.xml \n", + " inflating: residues.csv \n", + " inflating: prob.npy \n", + " inflating: mean_af.csv \n", + " inflating: pdb_af.pdb \n", + " inflating: keepH.sh \n" + ] + } + ] + }, + { + "cell_type": "markdown", + "source": [ + "Generate the atomistic structural ensemble" + ], + "metadata": { + "id": "f9rE7_T_ustY" + } + }, + { + "cell_type": "code", + "source": [ + "!pwd\n", + "!chmod 755 script.sh\n", + "!./script.sh {NR}\n", + "#The final atomistic structural ensemble.\n", + "!ls segment_5_input_af_rebuilt.xtc" + ], + "metadata": { + "colab": { + "base_uri": "https://localhost:8080/" + }, + "id": "wr8vswoEa4UJ", + "outputId": "b69c881c-29e1-4134-8663-1ddd3ea335aa" + }, + "execution_count": null, + "outputs": [ + { + "output_type": "stream", + "name": "stdout", + "text": [ + "\u001b[1;30;43mStreaming output truncated to the last 5000 lines.\u001b[0m\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_68_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"The Lord of the Rings can be confusing to follow because many of the bad minions look and sound familiar; that's why Tolkien gave them each an ORCid.\" (Caroline Bartman)\n", + "\n", + "In j loop 70 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_70.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.258, max = 0.987\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (13 21 12)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 190\n", + "Maximum number of conflicts: ASP[185] : 13\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 2 : -5.29, fixed : 5.33\n", + "WARNING: D-aa detected at PHE 147 : -33.20, fixed : 29.19\n", + "WARNING: D-aa detected at THR 153 : -7.47, fixed : 7.42\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 187 : -35.30, fixed : 37.66\n", + "WARNING: D-aa detected at PHE 226 : -2.23, fixed : 2.30\n", + "WARNING: D-aa detected at ILE 318 : -4.01, fixed : 4.01\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 325 : -20.56, fixed : 22.54\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_70.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.064 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_70.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_70_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_70.top -i segment_5_input_af_70.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_70.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 797 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 3.256\n", + " CYS50 SG384 2.915 2.165\n", + " MET51 SD391 2.810 1.574 0.814\n", + " HIS62 NE2479 1.944 1.849 2.103 2.004\n", + " MET85 SD654 4.454 1.511 2.312 1.886 3.081\n", + " MET132 SD1015 7.393 4.789 4.705 4.585 6.212 3.285\n", + " HIS143 NE21103 9.488 6.613 7.042 6.759 8.289 5.209 2.553\n", + " MET162 SD1260 6.950 4.541 4.652 4.302 6.101 3.244 1.742\n", + " HIS166 NE21297 8.055 5.676 5.653 5.382 7.207 4.318 1.867\n", + " MET167 SD1304 8.433 6.177 6.142 5.843 7.707 4.885 2.581\n", + " CYS173 SG1347 8.183 5.676 5.860 5.530 7.291 4.341 2.043\n", + " CYS175 SG1361 7.207 4.812 4.978 4.602 6.397 3.551 1.994\n", + " CYS198 SG1547 6.566 3.517 5.155 4.524 5.340 2.951 4.040\n", + " MET202 SD1578 6.708 3.626 5.408 4.793 5.389 3.201 4.459\n", + " MET218 SD1715 8.372 5.309 6.612 6.065 7.148 4.374 3.872\n", + " CYS244 SG1924 7.331 4.623 5.942 5.271 6.441 3.953 4.199\n", + " HIS256 NE22013 6.200 3.504 5.150 4.420 5.276 3.223 4.594\n", + " HIS264 NE22075 6.272 3.431 4.205 3.710 5.185 2.222 2.274\n", + " MET307 SD2371 4.575 1.788 3.593 2.851 3.545 1.947 4.500\n", + " MET311 SD2391 3.972 1.553 3.694 3.072 2.710 2.621 5.695\n", + " MET322 SD2472 4.788 3.206 5.225 4.679 3.704 4.325 7.308\n", + " MET323 SD2480 4.795 3.708 5.556 5.092 3.789 4.936 8.008\n", + " MET336 SD2560 5.502 2.767 4.718 4.285 3.834 3.181 5.711\n", + " MET337 SD2568 4.823 1.878 3.896 3.400 3.212 2.328 5.108\n", + " MET339 SD2580 5.605 2.850 4.925 4.399 4.083 3.269 5.749\n", + " MET359 SD2723 9.002 6.439 8.492 7.979 7.540 6.649 8.261\n", + " MET405 SD3021 12.205 9.118 10.154 9.718 10.930 7.989 6.138\n", + " MET414 SD3077 13.897 10.702 11.819 11.428 12.458 9.605 7.807\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.889\n", + " HIS166 NE21297 2.269 1.169\n", + " MET167 SD1304 2.569 1.646 0.718\n", + " CYS173 SG1347 1.949 1.239 0.558 0.880\n", + " CYS175 SG1361 2.780 0.371 1.025 1.388 1.005\n", + " CYS198 SG1547 4.379 3.523 4.377 4.779 4.034 3.581\n", + " MET202 SD1578 4.750 4.099 4.931 5.356 4.584 4.171 0.631\n", + " MET218 SD1715 3.011 3.465 3.812 4.107 3.315 3.379 1.973\n", + " CYS244 SG1924 3.983 3.111 3.770 3.932 3.339 2.993 1.703\n", + " HIS256 NE22013 4.992 3.666 4.599 4.880 4.272 3.679 1.133\n", + " HIS264 NE22075 3.341 1.571 2.575 3.068 2.396 1.733 2.035\n", + " MET307 SD2371 5.717 3.834 4.961 5.368 4.807 3.997 2.015\n", + " MET311 SD2391 7.067 5.330 6.456 6.920 6.330 5.535 3.155\n", + " MET322 SD2472 8.453 6.986 8.084 8.537 7.903 7.166 4.263\n", + " MET323 SD2480 9.255 7.759 8.866 9.336 8.709 7.957 5.128\n", + " MET336 SD2560 6.812 5.801 6.784 7.340 6.600 6.014 3.137\n", + " MET337 SD2568 6.401 5.062 6.106 6.646 5.958 5.287 2.724\n", + " MET339 SD2580 6.688 5.660 6.653 7.165 6.430 5.840 2.726\n", + " MET359 SD2723 8.243 8.280 9.022 9.472 8.646 8.364 4.866\n", + " MET405 SD3021 3.724 6.138 5.686 5.719 5.205 5.938 5.868\n", + " MET414 SD3077 5.498 8.104 7.658 7.764 7.213 7.949 7.489\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.211\n", + " CYS244 SG1924 2.213 1.760\n", + " HIS256 NE22013 1.523 2.613 1.430\n", + " HIS264 NE22075 2.586 2.589 2.214 2.348\n", + " MET307 SD2371 2.233 3.884 2.959 1.733 2.480\n", + " MET311 SD2391 3.052 5.118 4.427 3.062 3.945 1.643\n", + " MET322 SD2472 3.949 6.152 5.577 4.172 5.521 3.222 1.765\n", + " MET323 SD2480 4.801 7.011 6.465 5.057 6.317 4.017 2.452\n", + " MET336 SD2560 2.741 4.821 4.790 3.625 4.290 2.770 1.884\n", + " MET337 SD2568 2.503 4.550 4.285 3.081 3.591 1.926 1.217\n", + " MET339 SD2580 2.304 4.472 4.327 3.113 4.110 2.454 1.723\n", + " MET359 SD2723 4.242 5.640 6.115 5.363 6.762 5.682 5.173\n", + " MET405 SD3021 5.985 3.912 5.284 6.444 6.047 7.789 8.985\n", + " MET414 SD3077 7.462 5.664 7.211 8.202 7.884 9.473 10.462\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.892\n", + " MET336 SD2560 2.179 2.732\n", + " MET337 SD2568 2.296 2.949 0.949\n", + " MET339 SD2580 1.991 2.704 0.676 1.041\n", + " MET359 SD2723 4.394 4.765 3.829 4.599 3.590\n", + " MET405 SD3021 9.874 10.703 8.374 8.280 8.094 8.051\n", + " MET414 SD3077 11.147 11.912 9.528 9.620 9.311 8.556 2.216\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (2899-2900 = 0.304268 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (2899-2900 = 0.304268 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_70.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"The Lord of the Rings can be confusing to follow because many of the bad minions look and sound familiar; that's why Tolkien gave them each an ORCid.\" (Caroline Bartman)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_70.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_70.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_70.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_70.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_70.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_70_sys.pdb -s segment_5_input_af_70_sys.pdb -o segment_5_input_af_70.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_70_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"The Lord of the Rings can be confusing to follow because many of the bad minions look and sound familiar; that's why Tolkien gave them each an ORCid.\" (Caroline Bartman)\n", + "\n", + "In j loop 72 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_72.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.251, max = 0.778\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (13 17 14)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 126\n", + "Maximum number of conflicts: ARG[6] : 9\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at TYR 4 : -9.17, fixed : 9.18\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 81 : -127.59, fixed : 128.61\n", + "WARNING: D-aa detected at LEU 139 : -5.16, fixed : 5.22\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 223 : -11.18, fixed : 12.22\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 306 : -9.06, fixed : 12.28\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 359 : -0.65, fixed : 0.64\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 363 : -36.42, fixed : 37.33\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_72.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.062 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_72.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_72_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_72.top -i segment_5_input_af_72.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_72.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 783 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 3.291\n", + " CYS50 SG384 3.276 1.842\n", + " MET51 SD391 3.264 1.440 0.698\n", + " HIS62 NE2479 2.901 1.804 2.022 2.240\n", + " MET85 SD654 5.663 2.666 3.167 2.692 4.184\n", + " MET132 SD1015 6.773 5.960 5.663 5.191 7.345 4.942\n", + " HIS143 NE21103 6.970 7.166 7.032 6.556 8.417 6.872 2.530\n", + " MET162 SD1260 5.445 4.869 4.529 4.062 6.152 4.358 1.333\n", + " HIS166 NE21297 5.489 5.237 4.711 4.317 6.380 4.880 1.539\n", + " MET167 SD1304 5.376 5.778 5.138 4.824 6.713 5.814 2.431\n", + " CYS173 SG1347 5.577 5.633 5.256 4.834 6.781 5.454 1.778\n", + " CYS175 SG1361 5.525 5.211 4.848 4.401 6.441 4.828 1.373\n", + " CYS198 SG1547 3.052 3.276 2.305 2.147 3.828 4.202 4.172\n", + " MET202 SD1578 2.861 3.348 2.303 2.227 3.743 4.433 4.468\n", + " MET218 SD1715 3.039 2.597 2.970 2.394 3.833 3.614 4.065\n", + " CYS244 SG1924 3.777 4.310 3.880 3.519 5.200 4.917 3.215\n", + " HIS256 NE22013 3.977 4.439 3.588 3.367 5.147 4.934 3.336\n", + " HIS264 NE22075 5.062 4.125 3.328 3.002 5.206 3.567 2.507\n", + " MET307 SD2371 4.988 5.345 3.570 3.966 5.129 5.935 5.938\n", + " MET311 SD2391 3.730 4.642 3.107 3.371 4.519 5.649 5.433\n", + " MET322 SD2472 3.786 6.536 5.540 5.763 5.967 8.324 7.675\n", + " MET323 SD2480 4.267 6.920 5.918 6.083 6.532 8.535 7.378\n", + " MET336 SD2560 3.245 5.802 5.372 5.262 5.916 7.399 6.069\n", + " MET337 SD2568 3.945 6.236 5.765 5.614 6.504 7.590 5.697\n", + " MET339 SD2580 3.942 5.719 5.482 5.194 6.304 6.852 4.803\n", + " MET359 SD2723 4.638 5.913 6.285 5.824 6.819 6.931 5.085\n", + " MET405 SD3021 5.687 6.121 7.495 6.982 6.972 7.496 8.043\n", + " MET414 SD3077 5.231 4.933 6.270 5.661 6.194 5.799 6.204\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.748\n", + " HIS166 NE21297 2.604 0.666\n", + " MET167 SD1304 2.446 1.714 1.113\n", + " CYS173 SG1347 1.871 1.160 0.833 0.923\n", + " CYS175 SG1361 2.337 0.484 0.461 1.329 0.681\n", + " CYS198 SG1547 5.048 2.890 2.847 2.970 3.258 3.038\n", + " MET202 SD1578 5.262 3.186 3.108 3.144 3.490 3.310 0.327\n", + " MET218 SD1715 4.692 2.845 3.164 3.543 3.304 3.042 2.073\n", + " CYS244 SG1924 3.418 1.947 1.817 1.684 1.816 1.858 1.739\n", + " HIS256 NE22013 3.925 2.127 1.830 1.671 2.142 2.094 1.335\n", + " HIS264 NE22075 4.306 1.625 1.741 2.546 2.528 1.978 2.128\n", + " MET307 SD2371 7.080 5.011 4.724 4.648 5.297 5.119 3.027\n", + " MET311 SD2391 6.210 4.309 4.027 3.813 4.454 4.364 1.931\n", + " MET322 SD2472 7.387 6.497 6.137 5.435 6.137 6.365 4.292\n", + " MET323 SD2480 6.917 6.273 5.853 5.042 5.788 6.087 4.383\n", + " MET336 SD2560 5.271 4.921 4.643 3.907 4.360 4.707 3.562\n", + " MET337 SD2568 4.689 4.653 4.310 3.453 3.937 4.374 3.744\n", + " MET339 SD2580 3.744 3.783 3.538 2.821 3.067 3.500 3.419\n", + " MET359 SD2723 3.714 4.263 4.290 3.941 3.681 4.032 4.590\n", + " MET405 SD3021 7.395 7.233 7.577 7.685 7.227 7.252 7.053\n", + " MET414 SD3077 5.899 5.486 5.916 6.220 5.638 5.560 5.753\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.260\n", + " CYS244 SG1924 1.911 2.005\n", + " HIS256 NE22013 1.481 2.580 1.003\n", + " HIS264 NE22075 2.422 2.881 2.348 1.928\n", + " MET307 SD2371 2.886 5.071 4.324 3.388 3.733\n", + " MET311 SD2391 1.705 3.963 3.166 2.355 3.322 1.461\n", + " MET322 SD2472 3.999 5.564 4.706 4.422 6.138 4.352 3.312\n", + " MET323 SD2480 4.122 5.661 4.534 4.256 6.058 4.485 3.443\n", + " MET336 SD2560 3.408 3.980 3.033 3.317 5.184 5.243 3.829\n", + " MET337 SD2568 3.636 4.183 2.903 3.202 5.091 5.384 4.029\n", + " MET339 SD2580 3.410 3.386 2.157 2.780 4.483 5.611 4.251\n", + " MET359 SD2723 4.666 3.524 3.191 4.138 5.330 7.284 5.925\n", + " MET405 SD3021 7.121 5.195 6.417 7.331 7.935 9.974 8.654\n", + " MET414 SD3077 5.896 3.729 5.041 5.957 6.241 8.768 7.552\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.834\n", + " MET336 SD2560 2.656 2.429\n", + " MET337 SD2568 3.093 2.665 0.806\n", + " MET339 SD2580 4.089 3.749 1.588 1.198\n", + " MET359 SD2723 5.870 5.634 3.238 3.062 2.043\n", + " MET405 SD3021 8.588 8.715 6.453 6.732 5.963 4.323\n", + " MET414 SD3077 8.183 8.249 5.966 6.133 5.146 3.571 2.014\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (3487-3488 = 0.307287 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3487-3488 = 0.307287 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.31447 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.31447 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5432-5433 = 0.334317 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5432-5433 = 0.334317 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_72.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You Could Make More Money As a Butcher\" (F. Zappa)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_72.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_72.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_72.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_72.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_72.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_72_sys.pdb -s segment_5_input_af_72_sys.pdb -o segment_5_input_af_72.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_72_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You Could Make More Money As a Butcher\" (F. Zappa)\n", + "\n", + "In j loop 74 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_74.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.259, max = 0.987\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (13 14 15)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 134\n", + "Maximum number of conflicts: ARG[6] : 9\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 19 : -38.36, fixed : 42.26\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 85 : -22.56, fixed : 17.56\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 98 : -24.49, fixed : 25.63\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 179 : -0.52, fixed : 0.53\n", + "WARNING: D-aa detected at LEU 188 : -39.77, fixed : 40.17\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 190 : -8.09, fixed : 8.05\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 225 : -1.00, fixed : 1.05\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 280 : -11.51, fixed : 14.12\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 285 : -76.56, fixed : 77.19\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 320 : -31.14, fixed : 30.84\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 349 : -1.59, fixed : 1.59\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 358 : -0.94, fixed : 0.94\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 371 : -35.74, fixed : 35.27\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 414 : -7.01, fixed : 7.85\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_74.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.070 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_74.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_74_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_74.top -i segment_5_input_af_74.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_74.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 794 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.896\n", + " CYS50 SG384 3.206 2.088\n", + " MET51 SD391 2.964 1.323 0.839\n", + " HIS62 NE2479 1.722 1.672 2.471 2.113\n", + " MET85 SD654 4.709 2.212 4.009 3.215 3.666\n", + " MET132 SD1015 6.856 4.071 5.448 4.880 5.402 2.643\n", + " HIS143 NE21103 6.946 4.626 5.869 5.478 5.272 4.202 2.589\n", + " MET162 SD1260 6.298 3.739 5.482 4.786 4.986 1.961 1.274\n", + " HIS166 NE21297 6.825 4.371 6.113 5.461 5.421 2.851 1.521\n", + " MET167 SD1304 7.413 5.147 6.914 6.284 5.995 3.778 2.398\n", + " CYS173 SG1347 6.700 4.289 5.999 5.381 5.236 3.007 1.665\n", + " CYS175 SG1361 6.549 4.062 5.808 5.147 5.155 2.529 1.375\n", + " CYS198 SG1547 8.334 5.757 7.171 6.493 7.281 3.648 2.922\n", + " MET202 SD1578 8.211 5.581 6.922 6.266 7.136 3.530 2.747\n", + " MET218 SD1715 6.418 3.769 5.335 4.630 5.252 1.724 1.584\n", + " CYS244 SG1924 7.698 5.415 7.120 6.352 6.778 3.203 3.228\n", + " HIS256 NE22013 8.882 6.448 7.961 7.248 7.919 4.267 3.733\n", + " HIS264 NE22075 8.854 6.540 8.339 7.606 7.725 4.474 3.470\n", + " MET307 SD2371 3.237 1.974 3.721 2.904 2.835 1.909 4.506\n", + " MET311 SD2391 3.984 3.274 4.701 3.929 4.059 2.808 5.410\n", + " MET322 SD2472 5.502 4.523 6.587 5.832 4.776 3.637 4.751\n", + " MET323 SD2480 5.181 4.613 6.631 5.871 4.735 3.901 5.408\n", + " MET336 SD2560 5.448 5.654 7.422 6.826 5.068 5.694 6.868\n", + " MET337 SD2568 5.178 5.486 7.169 6.616 4.774 5.720 6.885\n", + " MET339 SD2580 3.920 4.654 6.175 5.663 3.729 5.280 6.809\n", + " MET359 SD2723 5.662 3.777 5.717 5.045 4.350 2.864 2.946\n", + " MET405 SD3021 5.641 3.882 4.430 4.337 3.954 4.722 4.208\n", + " MET414 SD3077 6.567 4.804 5.728 5.512 4.896 5.156 4.193\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 3.005\n", + " HIS166 NE21297 2.434 0.987\n", + " MET167 SD1304 2.411 1.990 1.024\n", + " CYS173 SG1347 1.983 1.316 0.499 0.944\n", + " CYS175 SG1361 2.481 0.704 0.330 1.329 0.626\n", + " CYS198 SG1547 5.382 2.829 3.343 4.047 3.812 3.277\n", + " MET202 SD1578 5.264 2.777 3.337 4.096 3.786 3.249 0.378\n", + " MET218 SD1715 3.933 1.161 2.077 3.065 2.439 1.834 2.067\n", + " CYS244 SG1924 5.395 2.516 3.035 3.652 3.524 2.964 1.479\n", + " HIS256 NE22013 6.062 3.441 3.859 4.420 4.352 3.836 0.965\n", + " HIS264 NE22075 4.983 2.933 2.759 2.805 3.194 2.914 2.524\n", + " MET307 SD2371 5.573 3.691 4.442 5.203 4.525 4.145 5.273\n", + " MET311 SD2391 6.805 4.520 5.336 6.102 5.518 5.056 5.448\n", + " MET322 SD2472 4.942 3.560 3.562 3.597 3.578 3.499 5.606\n", + " MET323 SD2480 5.716 4.195 4.333 4.457 4.373 4.235 6.074\n", + " MET336 SD2560 6.225 5.843 5.705 5.538 5.542 5.659 8.180\n", + " MET337 SD2568 6.103 5.921 5.782 5.634 5.581 5.726 8.364\n", + " MET339 SD2580 6.203 5.889 5.937 6.003 5.745 5.811 8.340\n", + " MET359 SD2723 2.775 2.067 1.783 1.887 1.590 1.728 4.751\n", + " MET405 SD3021 2.515 4.548 4.397 4.631 3.974 4.286 7.075\n", + " MET414 SD3077 1.807 4.467 4.009 3.922 3.523 4.005 7.053\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 1.938\n", + " CYS244 SG1924 1.744 2.030\n", + " HIS256 NE22013 1.324 2.806 1.376\n", + " HIS264 NE22075 2.809 3.140 2.016 2.279\n", + " MET307 SD2371 5.201 3.561 4.533 5.722 5.919\n", + " MET311 SD2391 5.422 4.155 4.600 5.726 6.235 1.412\n", + " MET322 SD2472 5.721 4.258 4.390 5.727 4.582 3.580 4.164\n", + " MET323 SD2480 6.190 4.738 4.790 6.155 5.222 3.406 3.789\n", + " MET336 SD2560 8.266 6.642 7.007 8.344 7.052 5.064 5.724\n", + " MET337 SD2568 8.428 6.735 7.249 8.584 7.318 5.067 5.821\n", + " MET339 SD2580 8.360 6.563 7.291 8.645 7.683 4.312 5.099\n", + " MET359 SD2723 4.767 3.120 4.016 5.165 3.952 3.745 4.787\n", + " MET405 SD3021 6.886 5.236 7.050 7.862 7.148 5.486 6.885\n", + " MET414 SD3077 6.921 5.379 6.954 7.749 6.650 6.078 7.443\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.893\n", + " MET336 SD2560 2.622 2.452\n", + " MET337 SD2568 2.910 2.782 0.545\n", + " MET339 SD2580 3.230 2.935 1.651 1.307\n", + " MET359 SD2723 2.182 2.967 3.975 4.015 4.189\n", + " MET405 SD3021 5.820 6.360 6.388 6.077 5.768 4.006\n", + " MET414 SD3077 5.536 6.206 6.068 5.802 5.812 3.627 1.450\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (290-291 = 0.358296 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (290-291 = 0.358296 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (1701-1702 = 0.2522 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (1701-1702 = 0.2522 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.276902 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.276902 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4362-4363 = 0.345197 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4362-4363 = 0.345197 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4637-4640 = 0.259518 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4637-4640 = 0.259518 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4849-4850 = 0.38171 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4849-4850 = 0.38171 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5230-5231 = 0.390365 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5230-5231 = 0.390365 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_74.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You Could Make More Money As a Butcher\" (F. Zappa)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_74.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_74.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_74.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_74.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_74.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_74_sys.pdb -s segment_5_input_af_74_sys.pdb -o segment_5_input_af_74.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_74_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You Could Make More Money As a Butcher\" (F. Zappa)\n", + "\n", + "In j loop 76 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_76.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.253, max = 1.832\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (13 16 12)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 166\n", + "Maximum number of conflicts: TYR[374] : 9\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 98 : -51.55, fixed : 99.64\n", + "WARNING: D-aa detected at THR 103 : -0.35, fixed : 0.33\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 180 : -39.66, fixed : 42.78\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 285 : -13.81, fixed : 13.91\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 292 : -1.05, fixed : 1.06\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 337 : -76.75, fixed : 76.53\n", + "WARNING: D-aa detected at LEU 340 : -36.20, fixed : 36.41\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 346 : -15.43, fixed : 15.22\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 385 : -5.02, fixed : 5.13\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_76.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.062 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_76.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_76_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_76.top -i segment_5_input_af_76.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_76.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 794 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.933\n", + " CYS50 SG384 3.011 2.057\n", + " MET51 SD391 2.934 1.408 0.701\n", + " HIS62 NE2479 2.640 1.534 1.752 1.585\n", + " MET85 SD654 5.137 2.523 2.853 2.418 3.465\n", + " MET132 SD1015 8.065 5.274 5.586 5.337 5.688 3.493\n", + " HIS143 NE21103 8.234 5.443 5.960 5.571 6.411 3.164 2.548\n", + " MET162 SD1260 9.019 6.121 6.877 6.513 6.697 4.585 1.716\n", + " HIS166 NE21297 8.237 5.322 6.233 5.815 5.993 3.913 1.742\n", + " MET167 SD1304 8.015 5.094 6.240 5.733 6.019 3.724 2.583\n", + " CYS173 SG1347 8.448 5.517 6.383 5.950 6.341 3.806 1.930\n", + " CYS175 SG1361 8.567 5.650 6.470 6.074 6.315 4.091 1.622\n", + " CYS198 SG1547 10.041 7.566 7.154 7.149 7.726 5.497 2.982\n", + " MET202 SD1578 10.012 7.593 7.110 7.136 7.678 5.591 3.126\n", + " MET218 SD1715 10.310 7.777 7.475 7.384 8.266 5.371 3.531\n", + " CYS244 SG1924 10.315 7.591 7.606 7.444 8.033 5.412 2.543\n", + " HIS256 NE22013 10.151 7.538 7.393 7.314 7.729 5.589 2.503\n", + " HIS264 NE22075 8.337 5.556 5.764 5.519 6.102 3.442 0.920\n", + " MET307 SD2371 5.834 4.219 2.835 3.120 4.120 2.923 4.320\n", + " MET311 SD2391 5.341 3.897 2.384 2.700 3.834 2.801 4.709\n", + " MET322 SD2472 5.090 4.550 3.064 3.331 4.799 3.859 6.669\n", + " MET323 SD2480 5.285 4.413 3.097 3.272 4.799 3.433 6.219\n", + " MET336 SD2560 7.100 5.307 4.739 4.630 6.119 3.213 5.193\n", + " MET337 SD2568 6.606 4.775 4.063 4.002 5.457 2.695 4.731\n", + " MET339 SD2580 6.020 4.324 3.377 3.399 4.851 2.494 4.756\n", + " MET359 SD2723 7.154 5.892 4.272 4.692 5.614 4.582 5.372\n", + " MET405 SD3021 8.616 6.164 5.798 5.700 6.695 3.730 2.891\n", + " MET414 SD3077 7.797 5.216 5.514 5.156 6.255 2.799 3.404\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.905\n", + " HIS166 NE21297 2.636 0.895\n", + " MET167 SD1304 2.372 1.848 1.121\n", + " CYS173 SG1347 1.876 1.258 0.891 0.949\n", + " CYS175 SG1361 2.485 0.584 0.436 1.326 0.751\n", + " CYS198 SG1547 4.233 4.062 4.526 5.324 4.448 4.232\n", + " MET202 SD1578 4.513 4.267 4.717 5.547 4.692 4.443 0.372\n", + " MET218 SD1715 3.413 4.386 4.750 5.196 4.303 4.407 1.959\n", + " CYS244 SG1924 3.256 2.985 3.574 4.255 3.310 3.185 1.706\n", + " HIS256 NE22013 4.097 3.238 3.836 4.741 3.864 3.521 1.103\n", + " HIS264 NE22075 1.901 2.102 2.171 2.746 1.951 1.945 2.680\n", + " MET307 SD2371 4.878 5.973 5.632 5.932 5.640 5.686 4.795\n", + " MET311 SD2391 5.074 6.310 5.898 6.102 5.889 5.982 5.365\n", + " MET322 SD2472 6.228 8.123 7.605 7.508 7.420 7.701 7.332\n", + " MET323 SD2480 5.667 7.647 7.138 7.021 6.913 7.219 6.911\n", + " MET336 SD2560 3.860 6.403 6.020 5.801 5.525 5.983 5.698\n", + " MET337 SD2568 3.791 6.072 5.678 5.566 5.287 5.665 5.304\n", + " MET339 SD2580 4.186 6.194 5.766 5.724 5.488 5.794 5.410\n", + " MET359 SD2723 6.015 7.083 6.910 7.329 6.886 6.888 4.849\n", + " MET405 SD3021 2.563 4.168 4.205 4.508 3.782 3.988 2.559\n", + " MET414 SD3077 1.247 4.089 3.736 3.382 3.052 3.645 4.709\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.278\n", + " CYS244 SG1924 2.054 1.751\n", + " HIS256 NE22013 1.260 2.514 1.315\n", + " HIS264 NE22075 2.903 2.761 2.059 2.409\n", + " MET307 SD2371 4.719 5.145 5.605 5.332 4.245\n", + " MET311 SD2391 5.306 5.605 6.093 5.882 4.631 0.617\n", + " MET322 SD2472 7.325 7.069 7.884 7.933 6.418 2.946 2.404\n", + " MET323 SD2480 6.926 6.565 7.387 7.498 5.923 2.731 2.227\n", + " MET336 SD2560 5.837 4.740 5.766 6.265 4.583 3.471 3.349\n", + " MET337 SD2568 5.404 4.619 5.521 5.866 4.216 2.654 2.543\n", + " MET339 SD2580 5.463 4.999 5.785 5.967 4.371 2.011 1.806\n", + " MET359 SD2723 4.698 5.288 6.040 5.641 5.202 1.727 2.052\n", + " MET405 SD3021 2.771 1.746 2.626 3.109 2.107 3.598 3.989\n", + " MET414 SD3077 4.963 3.661 4.040 4.839 2.713 4.428 4.524\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.592\n", + " MET336 SD2560 3.105 2.531\n", + " MET337 SD2568 2.703 2.125 0.825\n", + " MET339 SD2580 2.157 1.615 1.553 0.780\n", + " MET359 SD2723 3.569 3.481 4.197 3.509 3.013\n", + " MET405 SD3021 5.413 4.898 3.226 2.972 3.302 4.078\n", + " MET414 SD3077 5.284 4.702 2.700 2.772 3.290 5.533 2.450\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (682-683 = 0.251856 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (682-683 = 0.251856 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_76.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You Fill Your Space So Sweet\" (F. Apple)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_76.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_76.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_76.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_76.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_76.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_76_sys.pdb -s segment_5_input_af_76_sys.pdb -o segment_5_input_af_76.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_76_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You Fill Your Space So Sweet\" (F. Apple)\n", + "\n", + "In j loop 78 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_78.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.262, max = 0.657\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (14 15 12)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 194\n", + "Maximum number of conflicts: ARG[151] : 9\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 55 : -13.72, fixed : 13.36\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 85 : -166.40, fixed : 16.88\n", + "WARNING: D-aa detected at ASP 105 : -42.30, fixed : 50.49\n", + "WARNING: D-aa detected at LEU 139 : -6.71, fixed : 6.76\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 180 : -1.43, fixed : 1.54\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 225 : -0.05, fixed : 0.05\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 292 : -23.40, fixed : 23.36\n", + "WARNING: D-aa detected at LEU 330 : -1.24, fixed : 1.29\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 334 : -10.89, fixed : 10.90\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 337 : -9.27, fixed : 9.18\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 356 : -1.22, fixed : 1.30\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 385 : -45.96, fixed : 44.93\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 387 : -163.90, fixed : 161.99\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 395 : -10.53, fixed : 10.33\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_78.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.072 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_78.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_78_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_78.top -i segment_5_input_af_78.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_78.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 794 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISD for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.355\n", + " CYS50 SG384 3.024 2.180\n", + " MET51 SD391 3.305 1.906 0.822\n", + " HIS62 NE2479 2.082 1.636 1.830 2.186\n", + " MET85 SD654 4.617 2.578 3.271 2.462 3.951\n", + " MET132 SD1015 5.808 3.489 3.982 3.257 4.515 1.917\n", + " HIS143 NE21103 6.570 4.368 5.609 5.073 5.234 3.997 2.709\n", + " MET162 SD1260 7.444 5.123 5.431 4.735 6.060 3.338 1.640\n", + " HIS166 NE21297 7.239 4.927 5.218 4.620 5.649 3.677 1.762\n", + " MET167 SD1304 7.526 5.249 5.675 5.157 5.840 4.394 2.508\n", + " CYS173 SG1347 7.183 4.846 5.389 4.774 5.661 3.653 1.774\n", + " CYS175 SG1361 7.120 4.781 5.204 4.535 5.682 3.249 1.397\n", + " CYS198 SG1547 7.993 6.073 7.590 6.828 7.617 4.485 4.458\n", + " MET202 SD1578 7.939 6.062 7.567 6.800 7.630 4.430 4.528\n", + " MET218 SD1715 7.122 5.285 6.424 5.624 6.867 3.172 3.753\n", + " CYS244 SG1924 7.369 5.216 6.526 5.758 6.657 3.508 3.047\n", + " HIS256 NE22013 7.881 5.887 7.480 6.751 7.345 4.566 4.246\n", + " HIS264 NE22075 8.325 6.125 7.089 6.289 7.517 4.008 3.366\n", + " MET307 SD2371 9.480 7.402 8.812 8.245 8.337 6.774 5.506\n", + " MET311 SD2391 7.855 5.878 7.489 6.948 6.860 5.565 4.592\n", + " MET322 SD2472 8.254 6.034 6.696 6.221 6.582 5.426 3.624\n", + " MET323 SD2480 7.710 5.531 6.260 5.814 6.038 5.137 3.415\n", + " MET336 SD2560 6.500 4.429 5.872 5.382 5.270 4.380 3.319\n", + " MET337 SD2568 6.269 4.197 5.445 5.014 4.849 4.327 3.146\n", + " MET339 SD2580 5.203 3.020 4.370 3.885 3.878 3.181 2.358\n", + " MET359 SD2723 4.485 2.310 3.456 3.046 2.980 2.918 2.342\n", + " MET405 SD3021 6.546 4.524 4.682 3.884 5.722 2.008 2.146\n", + " MET414 SD3077 5.775 3.970 3.918 3.141 5.111 1.608 2.511\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 3.090\n", + " HIS166 NE21297 2.553 1.089\n", + " MET167 SD1304 2.182 2.000 1.000\n", + " CYS173 SG1347 2.018 1.260 0.603 0.920\n", + " CYS175 SG1361 2.540 0.596 0.682 1.540 0.718\n", + " CYS198 SG1547 4.298 4.564 5.137 5.473 4.693 4.542\n", + " MET202 SD1578 4.519 4.682 5.293 5.672 4.870 4.681 0.324\n", + " MET218 SD1715 4.854 4.118 4.913 5.576 4.667 4.243 2.100\n", + " CYS244 SG1924 3.090 3.092 3.629 4.009 3.198 3.035 1.510\n", + " HIS256 NE22013 3.543 4.340 4.729 4.903 4.217 4.211 0.985\n", + " HIS264 NE22075 3.959 2.814 3.644 4.182 3.357 3.016 2.219\n", + " MET307 SD2371 3.214 5.122 4.835 4.267 4.281 4.786 4.653\n", + " MET311 SD2391 2.144 4.729 4.414 3.961 3.818 4.296 3.977\n", + " MET322 SD2472 2.187 3.092 2.250 1.300 1.968 2.656 5.728\n", + " MET323 SD2480 1.782 3.181 2.268 1.323 1.952 2.668 5.687\n", + " MET336 SD2560 0.745 3.820 3.291 2.865 2.762 3.276 4.413\n", + " MET337 SD2568 0.850 3.713 3.013 2.512 2.569 3.130 5.012\n", + " MET339 SD2580 1.379 3.425 2.917 2.817 2.560 2.880 4.692\n", + " MET359 SD2723 2.270 3.665 3.127 3.152 2.943 3.154 5.381\n", + " MET405 SD3021 4.617 2.504 3.336 4.289 3.462 2.793 4.446\n", + " MET414 SD3077 5.082 3.328 3.968 4.889 4.121 3.509 5.067\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 1.886\n", + " CYS244 SG1924 1.672 2.122\n", + " HIS256 NE22013 1.289 2.810 1.362\n", + " HIS264 NE22075 2.310 2.302 1.391 2.396\n", + " MET307 SD2371 4.974 6.231 4.139 3.719 4.727\n", + " MET311 SD2391 4.265 5.377 3.415 3.001 4.431 1.723\n", + " MET322 SD2472 5.979 6.267 4.408 4.995 4.691 3.363 3.383\n", + " MET323 SD2480 5.928 6.186 4.366 4.935 4.810 3.459 3.187\n", + " MET336 SD2560 4.641 5.154 3.397 3.588 4.422 3.069 1.730\n", + " MET337 SD2568 5.225 5.533 3.871 4.240 4.793 3.584 2.422\n", + " MET339 SD2580 4.840 4.803 3.531 4.100 4.511 4.501 3.148\n", + " MET359 SD2723 5.489 5.159 4.200 4.897 5.088 5.444 4.109\n", + " MET405 SD3021 4.387 2.896 3.383 4.696 3.114 6.914 6.134\n", + " MET414 SD3077 4.974 3.344 4.104 5.337 4.061 7.653 6.692\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.624\n", + " MET336 SD2560 2.660 2.214\n", + " MET337 SD2568 2.401 1.846 0.760\n", + " MET339 SD2580 3.224 2.708 1.504 1.245\n", + " MET359 SD2723 3.772 3.239 2.435 2.011 0.971\n", + " MET405 SD3021 5.426 5.359 5.196 5.182 4.330 4.278\n", + " MET414 SD3077 6.068 5.913 5.599 5.523 4.505 4.248 1.075\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.386084 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.386084 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_78.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You Fill Your Space So Sweet\" (F. Apple)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_78.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_78.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_78.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_78.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_78.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_78_sys.pdb -s segment_5_input_af_78_sys.pdb -o segment_5_input_af_78.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_78_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You Fill Your Space So Sweet\" (F. Apple)\n", + "\n", + "In j loop 80 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_80.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.240, max = 0.839\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (17 21 18)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 228\n", + "Maximum number of conflicts: PHE[226] : 16\n", + "WARNING: 2 steric conflict(s) are still there.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 1 : -155.69, fixed : 74.15\n", + "WARNING: D-aa detected at ILE 5 : -1.55, fixed : 1.56\n", + "WARNING: D-aa detected at VAL 94 : -20.10, fixed : 21.75\n", + "WARNING: D-aa detected at LYS 114 : -15.90, fixed : 16.45\n", + "WARNING: D-aa detected at LEU 188 : -17.79, fixed : 18.01\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 302 : -12.68, fixed : 133.73\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 326 : -7.27, fixed : 7.27\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 336 : -17.16, fixed : 16.57\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 395 : -1.21, fixed : 1.21\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_80.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.125 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_80.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_80_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_80.top -i segment_5_input_af_80.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_80.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 796 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.833\n", + " CYS50 SG384 2.315 2.079\n", + " MET51 SD391 2.709 1.495 0.865\n", + " HIS62 NE2479 2.126 2.005 1.697 2.024\n", + " MET85 SD654 4.792 2.043 3.305 2.509 3.643\n", + " MET132 SD1015 4.678 3.153 4.655 3.955 4.995 3.474\n", + " HIS143 NE21103 4.669 3.968 5.618 5.157 5.243 5.027 2.520\n", + " MET162 SD1260 2.848 1.595 2.986 2.444 3.150 2.967 1.914\n", + " HIS166 NE21297 2.871 2.305 3.395 2.948 3.637 3.660 1.856\n", + " MET167 SD1304 2.607 2.882 3.814 3.556 3.771 4.508 2.611\n", + " CYS173 SG1347 2.920 2.494 3.706 3.303 3.727 3.936 1.992\n", + " CYS175 SG1361 3.051 2.141 3.443 2.935 3.615 3.415 1.649\n", + " CYS198 SG1547 4.022 4.475 5.353 5.457 3.837 6.152 6.111\n", + " MET202 SD1578 3.918 4.779 5.471 5.650 4.004 6.563 6.376\n", + " MET218 SD1715 2.992 3.242 4.413 4.330 3.346 5.024 4.261\n", + " CYS244 SG1924 3.483 3.261 4.286 4.301 2.741 4.831 5.307\n", + " HIS256 NE22013 4.345 4.601 5.333 5.491 3.679 6.138 6.669\n", + " HIS264 NE22075 5.416 4.570 6.136 5.925 4.744 5.618 5.678\n", + " MET307 SD2371 6.280 5.611 6.085 6.228 4.562 6.324 8.299\n", + " MET311 SD2391 7.056 6.044 6.655 6.707 5.228 6.456 8.636\n", + " MET322 SD2472 7.238 5.627 6.021 5.960 5.127 5.341 8.311\n", + " MET323 SD2480 7.804 6.108 6.629 6.527 5.708 5.728 8.667\n", + " MET336 SD2560 7.801 6.083 7.280 7.055 6.018 6.002 8.058\n", + " MET337 SD2568 7.872 6.395 7.453 7.313 6.096 6.489 8.524\n", + " MET339 SD2580 7.849 6.519 7.323 7.270 5.979 6.649 8.912\n", + " MET359 SD2723 10.316 8.997 9.174 9.227 8.246 8.680 11.693\n", + " MET405 SD3021 14.405 13.333 14.207 14.188 12.746 13.413 15.345\n", + " MET414 SD3077 13.142 12.502 13.166 13.274 11.620 12.911 14.732\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.766\n", + " HIS166 NE21297 2.543 0.753\n", + " MET167 SD1304 2.304 1.550 1.010\n", + " CYS173 SG1347 2.101 1.004 0.526 0.685\n", + " CYS175 SG1361 2.398 0.550 0.357 1.215 0.581\n", + " CYS198 SG1547 4.604 4.709 4.914 4.376 4.558 4.848\n", + " MET202 SD1578 4.825 4.924 5.054 4.423 4.696 5.033 0.646\n", + " MET218 SD1715 2.834 2.955 3.039 2.463 2.634 2.985 1.965\n", + " CYS244 SG1924 4.313 3.816 4.198 3.926 3.939 4.080 1.393\n", + " HIS256 NE22013 5.424 5.171 5.494 5.091 5.206 5.407 1.073\n", + " HIS264 NE22075 4.167 4.827 5.175 4.921 4.807 4.963 2.324\n", + " MET307 SD2371 7.767 6.853 7.433 7.413 7.311 7.272 4.298\n", + " MET311 SD2391 8.200 7.332 7.956 8.020 7.847 7.761 5.058\n", + " MET322 SD2472 8.631 7.146 7.867 8.231 7.919 7.656 6.548\n", + " MET323 SD2480 8.933 7.590 8.316 8.680 8.349 8.087 6.874\n", + " MET336 SD2560 7.674 7.211 7.865 8.058 7.736 7.593 5.647\n", + " MET337 SD2568 8.026 7.548 8.187 8.311 8.043 7.935 5.542\n", + " MET339 SD2580 8.529 7.791 8.443 8.575 8.335 8.214 5.765\n", + " MET359 SD2723 11.866 10.517 11.226 11.525 11.255 11.023 9.180\n", + " MET405 SD3021 14.441 14.425 15.010 14.982 14.798 14.770 11.316\n", + " MET414 SD3077 13.686 13.585 14.125 13.984 13.897 13.928 10.017\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.132\n", + " CYS244 SG1924 1.884 1.825\n", + " HIS256 NE22013 1.432 2.783 1.404\n", + " HIS264 NE22075 2.929 2.782 2.198 2.534\n", + " MET307 SD2371 4.692 5.526 3.702 3.272 4.368\n", + " MET311 SD2391 5.511 6.186 4.387 4.081 4.710 1.006\n", + " MET322 SD2472 7.019 7.052 5.443 5.712 6.074 3.053 2.550\n", + " MET323 SD2480 7.371 7.431 5.810 6.032 6.220 3.261 2.570\n", + " MET336 SD2560 6.241 6.374 4.858 4.952 4.306 3.024 2.287\n", + " MET337 SD2568 6.101 6.488 4.865 4.751 4.425 2.538 1.737\n", + " MET339 SD2580 6.275 6.786 5.057 4.864 4.994 2.070 1.087\n", + " MET359 SD2723 9.601 10.099 8.344 8.189 8.747 4.938 4.202\n", + " MET405 SD3021 11.720 12.810 11.223 10.493 10.385 8.263 7.568\n", + " MET414 SD3077 10.324 11.707 10.088 9.149 9.535 7.082 6.615\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.672\n", + " MET336 SD2560 3.067 2.767\n", + " MET337 SD2568 3.090 2.807 0.767\n", + " MET339 SD2580 2.527 2.270 1.533 0.949\n", + " MET359 SD2723 3.397 3.049 4.935 4.641 3.860\n", + " MET405 SD3021 8.948 8.434 7.442 6.975 6.941 7.194\n", + " MET414 SD3077 8.411 8.036 7.142 6.502 6.311 6.884 2.395\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_80.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Drugs are Bad, mmokay\" (South Park)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_80.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_80.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_80.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_80.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_80.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_80_sys.pdb -s segment_5_input_af_80_sys.pdb -o segment_5_input_af_80.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_80_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Drugs are Bad, mmokay\" (South Park)\n", + "\n", + "In j loop 82 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_82.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.253, max = 0.787\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (15 14 14)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 132\n", + "Maximum number of conflicts: LYS[121] : 7\n", + "WARNING: 4 steric conflict(s) are still there.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 98 : -3.86, fixed : 3.67\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 182 : -7.43, fixed : 7.68\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 275 : -78.49, fixed : 77.18\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 293 : -4.69, fixed : 4.90\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 341 : -32.58, fixed : 29.03\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 361 : -49.86, fixed : 50.05\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 391 : -56.42, fixed : 60.59\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 405 : -34.93, fixed : 32.90\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_82.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.114 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_82.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_82_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_82.top -i segment_5_input_af_82.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_82.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 778 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.693\n", + " CYS50 SG384 3.361 2.255\n", + " MET51 SD391 2.860 1.467 0.868\n", + " HIS62 NE2479 2.116 1.650 2.214 1.861\n", + " MET85 SD654 5.100 2.416 3.547 3.069 3.764\n", + " MET132 SD1015 6.540 5.313 4.229 4.341 6.199 5.201\n", + " HIS143 NE21103 7.908 7.133 6.361 6.325 8.107 7.154 2.496\n", + " MET162 SD1260 5.549 4.447 3.860 3.701 5.492 4.617 1.434\n", + " HIS166 NE21297 5.605 4.870 4.175 4.049 5.787 5.301 1.684\n", + " MET167 SD1304 5.888 5.616 4.930 4.800 6.412 6.302 2.571\n", + " CYS173 SG1347 6.369 5.723 4.992 4.901 6.635 6.065 1.875\n", + " CYS175 SG1361 5.848 5.026 4.338 4.220 5.981 5.339 1.530\n", + " CYS198 SG1547 4.342 4.400 2.644 3.029 4.369 5.703 3.406\n", + " MET202 SD1578 4.199 4.478 2.780 3.138 4.358 5.912 3.729\n", + " MET218 SD1715 3.942 3.708 2.996 2.804 4.334 4.882 2.896\n", + " CYS244 SG1924 5.212 5.093 3.730 3.899 5.473 6.072 2.512\n", + " HIS256 NE22013 5.235 5.387 3.578 4.010 5.343 6.575 3.491\n", + " HIS264 NE22075 6.085 5.191 3.304 3.835 5.496 5.558 2.217\n", + " MET307 SD2371 4.872 5.219 3.294 3.819 4.905 6.597 4.196\n", + " MET311 SD2391 4.512 5.061 3.247 3.710 4.689 6.586 4.425\n", + " MET322 SD2472 4.755 5.547 3.801 4.237 5.104 7.152 4.870\n", + " MET323 SD2480 4.342 5.497 3.925 4.294 4.881 7.314 5.507\n", + " MET336 SD2560 4.231 5.335 4.551 4.469 5.411 7.036 4.780\n", + " MET337 SD2568 5.020 5.820 4.866 4.856 6.014 7.292 4.335\n", + " MET339 SD2580 4.286 5.433 4.830 4.673 5.586 7.131 4.956\n", + " MET359 SD2723 5.358 5.309 5.590 5.095 6.326 6.149 4.373\n", + " MET405 SD3021 3.428 3.908 5.076 4.330 4.755 5.374 5.996\n", + " MET414 SD3077 3.375 4.944 6.040 5.365 5.257 6.826 7.545\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.700\n", + " HIS166 NE21297 2.341 0.778\n", + " MET167 SD1304 2.198 1.886 1.123\n", + " CYS173 SG1347 1.539 1.458 0.859 0.897\n", + " CYS175 SG1361 2.135 0.734 0.273 1.227 0.739\n", + " CYS198 SG1547 4.928 3.270 3.078 3.354 3.631 3.282\n", + " MET202 SD1578 5.142 3.526 3.291 3.477 3.829 3.509 0.363\n", + " MET218 SD1715 4.006 1.931 1.738 2.094 2.473 2.000 2.032\n", + " CYS244 SG1924 3.448 2.360 1.884 1.918 2.208 2.070 1.561\n", + " HIS256 NE22013 4.722 3.620 3.287 3.359 3.628 3.459 0.997\n", + " HIS264 NE22075 4.299 3.011 3.089 3.741 3.474 3.124 2.213\n", + " MET307 SD2371 5.610 4.261 4.012 4.148 4.450 4.202 1.076\n", + " MET311 SD2391 5.776 4.346 4.079 4.168 4.548 4.290 1.108\n", + " MET322 SD2472 6.032 4.785 4.447 4.402 4.848 4.662 1.639\n", + " MET323 SD2480 6.647 5.270 4.943 4.865 5.389 5.177 2.161\n", + " MET336 SD2560 5.099 4.041 3.495 2.991 3.798 3.751 2.690\n", + " MET337 SD2568 4.408 3.760 3.111 2.445 3.246 3.339 2.685\n", + " MET339 SD2580 5.113 4.118 3.559 2.981 3.830 3.812 3.102\n", + " MET359 SD2723 3.919 3.077 2.753 2.398 2.886 2.868 4.805\n", + " MET405 SD3021 6.438 4.594 4.567 4.609 5.110 4.756 5.324\n", + " MET414 SD3077 7.923 6.208 6.062 5.912 6.570 6.285 6.151\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.133\n", + " CYS244 SG1924 1.716 1.664\n", + " HIS256 NE22013 1.044 2.644 1.462\n", + " HIS264 NE22075 2.557 3.167 2.316 2.188\n", + " MET307 SD2371 0.960 3.058 2.262 0.918 2.600\n", + " MET311 SD2391 0.853 2.960 2.354 1.174 2.962 0.461\n", + " MET322 SD2472 1.353 3.347 2.651 1.454 3.440 0.870 0.597\n", + " MET323 SD2480 1.822 3.640 3.242 2.208 4.138 1.569 1.176\n", + " MET336 SD2560 2.468 2.378 2.467 2.819 4.583 3.068 2.772\n", + " MET337 SD2568 2.532 2.431 2.015 2.551 4.261 3.037 2.857\n", + " MET339 SD2580 2.898 2.511 2.759 3.256 4.937 3.534 3.239\n", + " MET359 SD2723 4.840 2.884 3.844 5.155 5.673 5.714 5.571\n", + " MET405 SD3021 5.274 3.625 5.170 6.040 6.700 6.206 5.921\n", + " MET414 SD3077 5.995 4.850 6.224 6.821 7.909 6.822 6.446\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.805\n", + " MET336 SD2560 2.709 2.708\n", + " MET337 SD2568 2.792 3.016 0.900\n", + " MET339 SD2580 3.183 3.152 0.475 1.083\n", + " MET359 SD2723 5.791 5.971 3.550 3.511 3.257\n", + " MET405 SD3021 6.166 6.027 4.165 4.699 3.897 2.807\n", + " MET414 SD3077 6.553 6.197 4.525 5.251 4.224 4.219 1.897\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_82.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Drugs are Bad, mmokay\" (South Park)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_82.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_82.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_82.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_82.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_82.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_82_sys.pdb -s segment_5_input_af_82_sys.pdb -o segment_5_input_af_82.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_82_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Drugs are Bad, mmokay\" (South Park)\n", + "\n", + "In j loop 84 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_84.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.260, max = 0.865\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (15 15 14)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 190\n", + "Maximum number of conflicts: GLU[200] : 12\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at GLU 17 : -37.49, fixed : 35.55\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 51 : -3.21, fixed : 3.25\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 99 : -7.51, fixed : 7.56\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 180 : -8.29, fixed : 8.23\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 182 : -126.25, fixed : 101.99\n", + "WARNING: D-aa detected at LYS 192 : -20.21, fixed : 55.61\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 225 : -23.38, fixed : 21.70\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 280 : -54.77, fixed : 54.69\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 342 : -46.14, fixed : 46.31\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 355 : -71.26, fixed : 74.34\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 409 : -8.33, fixed : 8.13\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 412 : -1.32, fixed : 1.34\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_84.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.109 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_84.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_84_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_84.top -i segment_5_input_af_84.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_84.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 808 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.813\n", + " CYS50 SG384 1.955 2.034\n", + " MET51 SD391 2.442 1.342 0.857\n", + " HIS62 NE2479 1.872 1.624 1.959 1.930\n", + " MET85 SD654 5.231 2.772 3.577 2.849 4.045\n", + " MET132 SD1015 5.558 4.984 4.201 4.068 5.939 4.585\n", + " HIS143 NE21103 7.860 7.433 6.705 6.597 8.428 6.858 2.558\n", + " MET162 SD1260 4.868 4.579 3.963 3.834 5.490 4.937 1.491\n", + " HIS166 NE21297 5.176 5.294 4.346 4.388 6.019 5.663 1.597\n", + " MET167 SD1304 6.020 6.322 5.356 5.439 7.006 6.701 2.393\n", + " CYS173 SG1347 5.853 5.803 4.955 4.939 6.626 5.937 1.577\n", + " CYS175 SG1361 5.523 5.338 4.559 4.496 6.208 5.460 1.245\n", + " CYS198 SG1547 3.097 4.586 2.899 3.479 4.479 5.893 3.673\n", + " MET202 SD1578 2.989 4.886 3.268 3.889 4.600 6.463 4.360\n", + " MET218 SD1715 2.364 3.051 2.230 2.371 3.371 4.774 3.543\n", + " CYS244 SG1924 3.966 4.552 3.294 3.528 4.989 5.385 2.276\n", + " HIS256 NE22013 3.948 5.333 3.634 4.180 5.305 6.390 3.557\n", + " HIS264 NE22075 3.871 4.086 2.641 2.879 4.544 4.517 2.017\n", + " MET307 SD2371 3.554 5.537 3.556 4.386 4.841 6.819 5.438\n", + " MET311 SD2391 4.540 6.517 4.581 5.339 6.018 7.707 5.388\n", + " MET322 SD2472 4.312 6.796 5.080 5.844 6.066 8.523 6.493\n", + " MET323 SD2480 4.291 6.571 4.926 5.612 6.065 8.224 5.799\n", + " MET336 SD2560 3.999 6.315 5.120 5.665 5.845 8.362 6.243\n", + " MET337 SD2568 4.177 6.216 4.978 5.478 5.953 8.044 5.521\n", + " MET339 SD2580 3.931 5.851 4.838 5.252 5.657 7.797 5.498\n", + " MET359 SD2723 4.549 5.114 5.205 5.125 5.553 7.011 5.480\n", + " MET405 SD3021 4.960 4.792 5.443 5.145 5.491 6.580 5.826\n", + " MET414 SD3077 5.332 5.933 6.212 6.116 6.289 7.954 6.657\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 3.150\n", + " HIS166 NE21297 2.794 0.982\n", + " MET167 SD1304 2.475 1.887 1.076\n", + " CYS173 SG1347 2.129 1.287 0.698 0.869\n", + " CYS175 SG1361 2.386 0.849 0.610 1.288 0.492\n", + " CYS198 SG1547 5.506 3.166 2.883 3.501 3.556 3.413\n", + " MET202 SD1578 6.074 3.693 3.408 3.902 4.076 3.968 0.764\n", + " MET218 SD1715 5.648 2.571 2.950 3.798 3.598 3.266 2.052\n", + " CYS244 SG1924 4.053 1.625 1.335 2.146 2.027 1.838 1.586\n", + " HIS256 NE22013 5.077 3.190 2.653 3.077 3.255 3.221 0.855\n", + " HIS264 NE22075 4.281 2.124 2.053 3.008 2.613 2.320 1.891\n", + " MET307 SD2371 7.297 5.306 4.973 5.536 5.595 5.472 2.280\n", + " MET311 SD2391 6.794 5.206 4.637 4.925 5.187 5.194 2.305\n", + " MET322 SD2472 7.909 5.934 5.477 5.707 6.077 6.074 2.932\n", + " MET323 SD2480 7.071 5.148 4.648 4.795 5.224 5.254 2.399\n", + " MET336 SD2560 7.531 5.208 4.936 5.082 5.518 5.504 3.063\n", + " MET337 SD2568 6.669 4.494 4.141 4.212 4.692 4.716 2.613\n", + " MET339 SD2580 6.720 4.327 4.129 4.266 4.683 4.660 2.820\n", + " MET359 SD2723 6.663 4.007 4.416 4.694 4.795 4.628 4.558\n", + " MET405 SD3021 7.102 4.439 5.092 5.503 5.406 5.155 5.499\n", + " MET414 SD3077 7.714 5.179 5.584 5.780 5.926 5.782 5.651\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.268\n", + " CYS244 SG1924 2.157 1.954\n", + " HIS256 NE22013 1.252 2.730 1.583\n", + " HIS264 NE22075 2.642 2.304 1.264 2.018\n", + " MET307 SD2371 2.244 3.924 3.748 2.488 3.484\n", + " MET311 SD2391 2.170 4.304 3.595 2.029 3.684 1.474\n", + " MET322 SD2472 2.332 4.493 4.357 2.955 4.750 2.317 1.772\n", + " MET323 SD2480 1.783 3.957 3.621 2.303 4.220 2.623 1.804\n", + " MET336 SD2560 2.338 3.677 3.982 3.270 4.833 3.914 3.507\n", + " MET337 SD2568 1.995 3.341 3.296 2.672 4.265 3.871 3.286\n", + " MET339 SD2580 2.253 3.026 3.320 3.034 4.331 4.289 3.898\n", + " MET359 SD2723 4.390 3.156 4.140 4.958 5.080 6.521 6.490\n", + " MET405 SD3021 5.446 3.718 4.932 5.980 5.660 7.444 7.604\n", + " MET414 SD3077 5.398 4.272 5.332 6.058 6.276 7.494 7.459\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 1.004\n", + " MET336 SD2560 2.319 1.795\n", + " MET337 SD2568 2.530 1.693 0.899\n", + " MET339 SD2580 3.135 2.381 1.104 0.771\n", + " MET359 SD2723 6.040 5.323 4.037 3.792 3.064\n", + " MET405 SD3021 7.258 6.598 5.369 5.163 4.438 1.460\n", + " MET414 SD3077 6.799 6.134 4.629 4.535 3.779 1.206 1.641\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (2899-2900 = 0.286461 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (2899-2900 = 0.286461 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.371448 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.371448 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4362-4363 = 0.406355 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4362-4363 = 0.406355 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5230-5231 = 0.256999 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5230-5231 = 0.256999 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_84.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"The more clearly we can focus our attention on the wonders and realities of the universe about us, the less taste we shall have for destruction.\" (Rachel Carson)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_84.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_84.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_84.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_84.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_84.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_84_sys.pdb -s segment_5_input_af_84_sys.pdb -o segment_5_input_af_84.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_84_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"The more clearly we can focus our attention on the wonders and realities of the universe about us, the less taste we shall have for destruction.\" (Rachel Carson)\n", + "\n", + "In j loop 86 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_86.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.252, max = 0.977\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (12 22 17)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 136\n", + "Maximum number of conflicts: LYS[136] : 6\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at ASP 22 : -8.16, fixed : 8.23\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 36 : -0.13, fixed : 0.14\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 52 : -52.90, fixed : 52.42\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 112 : -52.01, fixed : 50.37\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 187 : -2.01, fixed : 2.07\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 225 : -11.83, fixed : 11.27\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 227 : -25.10, fixed : 25.12\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 269 : -12.64, fixed : 12.67\n", + "WARNING: D-aa detected at PHE 313 : -42.84, fixed : 41.47\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 326 : -15.22, fixed : 14.90\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 328 : -105.26, fixed : 106.10\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 359 : -8.89, fixed : 9.60\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 363 : -2.53, fixed : 3.37\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 382 : -12.49, fixed : 142.67\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 410 : -42.54, fixed : 42.64\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_86.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.104 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_86.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_86_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_86.top -i segment_5_input_af_86.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_86.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 790 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.841\n", + " CYS50 SG384 2.844 2.088\n", + " MET51 SD391 3.028 1.663 0.732\n", + " HIS62 NE2479 1.992 1.401 1.998 2.072\n", + " MET85 SD654 4.375 1.643 2.550 1.989 2.782\n", + " MET132 SD1015 5.837 3.935 4.190 4.234 3.900 3.395\n", + " HIS143 NE21103 6.994 4.503 4.835 4.624 5.073 3.200 2.172\n", + " MET162 SD1260 5.536 3.941 3.552 3.749 3.759 3.435 1.248\n", + " HIS166 NE21297 6.254 4.435 4.072 4.188 4.449 3.634 1.434\n", + " MET167 SD1304 7.266 5.334 4.894 4.965 5.483 4.295 2.338\n", + " CYS173 SG1347 6.438 4.357 4.227 4.227 4.566 3.365 1.420\n", + " CYS175 SG1361 5.842 3.973 3.761 3.850 3.993 3.240 1.058\n", + " CYS198 SG1547 4.236 3.328 3.885 4.067 2.584 3.888 2.447\n", + " MET202 SD1578 4.130 3.346 3.905 4.100 2.539 3.984 2.640\n", + " MET218 SD1715 4.354 2.167 3.365 3.192 2.392 2.195 2.134\n", + " CYS244 SG1924 4.923 3.322 3.540 3.667 3.031 3.186 0.996\n", + " HIS256 NE22013 4.667 3.878 4.007 4.299 3.078 4.260 2.233\n", + " HIS264 NE22075 6.164 4.100 4.844 4.776 4.193 3.604 1.110\n", + " MET307 SD2371 7.518 6.103 6.629 6.750 5.752 5.928 2.805\n", + " MET311 SD2391 6.237 4.486 5.256 5.262 4.346 4.273 1.629\n", + " MET322 SD2472 7.008 5.338 5.459 5.589 5.143 4.827 1.444\n", + " MET323 SD2480 7.152 5.196 5.514 5.538 5.210 4.506 1.349\n", + " MET336 SD2560 8.130 6.456 6.491 6.632 6.282 5.831 2.526\n", + " MET337 SD2568 8.110 6.723 6.495 6.740 6.379 6.220 2.917\n", + " MET339 SD2580 8.731 7.295 7.017 7.254 6.996 6.700 3.455\n", + " MET359 SD2723 9.482 7.990 7.170 7.414 7.878 7.087 4.717\n", + " MET405 SD3021 14.536 12.907 11.751 11.840 13.217 11.614 10.771\n", + " MET414 SD3077 14.222 12.445 11.410 11.446 12.838 11.085 10.327\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.606\n", + " HIS166 NE21297 2.068 0.835\n", + " MET167 SD1304 2.038 1.931 1.113\n", + " CYS173 SG1347 1.394 1.326 0.675 1.108\n", + " CYS175 SG1361 2.006 0.603 0.516 1.577 0.750\n", + " CYS198 SG1547 4.404 2.797 3.516 4.600 3.714 3.081\n", + " MET202 SD1578 4.591 2.959 3.691 4.779 3.898 3.257 0.195\n", + " MET218 SD1715 3.171 2.722 3.170 4.120 3.028 2.656 1.958\n", + " CYS244 SG1924 2.960 1.315 1.954 3.033 2.129 1.499 1.589\n", + " HIS256 NE22013 4.351 2.345 3.092 4.156 3.427 2.742 0.898\n", + " HIS264 NE22075 2.363 2.351 2.455 3.168 2.235 2.103 2.540\n", + " MET307 SD2371 4.383 3.680 3.835 4.387 3.913 3.692 3.288\n", + " MET311 SD2391 3.238 2.769 3.016 3.782 2.946 2.685 2.227\n", + " MET322 SD2472 2.909 2.051 1.990 2.478 2.127 1.979 3.184\n", + " MET323 SD2480 2.288 2.248 2.014 2.372 1.880 1.961 3.429\n", + " MET336 SD2560 3.446 2.969 2.690 2.740 2.799 2.854 4.275\n", + " MET337 SD2568 4.084 3.004 2.838 2.928 3.154 3.063 4.379\n", + " MET339 SD2580 4.350 3.506 3.223 3.091 3.499 3.514 5.040\n", + " MET359 SD2723 4.726 4.185 3.621 2.851 3.889 4.126 6.668\n", + " MET405 SD3021 9.663 10.114 9.439 8.433 9.451 9.912 12.906\n", + " MET414 SD3077 9.071 9.744 9.032 7.997 8.981 9.493 12.535\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.077\n", + " CYS244 SG1924 1.770 1.697\n", + " HIS256 NE22013 0.978 2.513 1.422\n", + " HIS264 NE22075 2.726 1.994 1.646 2.616\n", + " MET307 SD2371 3.413 4.017 3.106 3.024 2.426\n", + " MET311 SD2391 2.393 2.343 1.856 2.294 0.902 1.722\n", + " MET322 SD2472 3.361 3.439 2.114 2.711 1.798 1.923 1.824\n", + " MET323 SD2480 3.618 3.238 2.252 3.140 1.395 2.192 1.714\n", + " MET336 SD2560 4.444 4.551 3.253 3.746 2.761 2.197 2.746\n", + " MET337 SD2568 4.529 4.960 3.443 3.690 3.393 2.600 3.294\n", + " MET339 SD2580 5.192 5.540 4.051 4.353 3.908 3.085 3.859\n", + " MET359 SD2723 6.826 6.747 5.320 5.964 5.502 5.613 5.823\n", + " MET405 SD3021 13.066 12.366 11.383 12.332 11.521 12.277 12.129\n", + " MET414 SD3077 12.701 11.879 10.982 12.007 11.021 11.875 11.664\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.812\n", + " MET336 SD2560 1.149 1.456\n", + " MET337 SD2568 1.598 2.207 0.987\n", + " MET339 SD2580 2.142 2.621 1.250 0.667\n", + " MET359 SD2723 4.033 4.269 3.494 3.113 2.744\n", + " MET405 SD3021 10.553 10.494 10.102 9.953 9.549 6.893\n", + " MET414 SD3077 10.150 10.024 9.713 9.655 9.260 6.679 0.973\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (531-532 = 0.357384 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (531-532 = 0.357384 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (1701-1702 = 0.359987 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (1701-1702 = 0.359987 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (2899-2900 = 0.379146 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (2899-2900 = 0.379146 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.371075 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.371075 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5432-5433 = 0.353238 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5432-5433 = 0.353238 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_86.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You should call it 'entropy'. No one knows what entropy really is, so in a debate you will always have the advantage.\" (John von Neumann to Claude Shannon, on why he should borrow the term for information theory)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_86.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_86.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_86.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_86.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_86.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_86_sys.pdb -s segment_5_input_af_86_sys.pdb -o segment_5_input_af_86.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_86_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"You should call it 'entropy'. No one knows what entropy really is, so in a debate you will always have the advantage.\" (John von Neumann to Claude Shannon, on why he should borrow the term for information theory)\n", + "\n", + "In j loop 88 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_88.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.267, max = 1.017\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (14 16 15)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 238\n", + "Maximum number of conflicts: GLN[182] : 18\n", + "WARNING: 4 steric conflict(s) are still there.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 85 : -6.71, fixed : 6.94\n", + "WARNING: D-aa detected at VAL 94 : -10.81, fixed : 12.65\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 104 : -8.24, fixed : 9.72\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 112 : -45.82, fixed : 48.68\n", + "WARNING: D-aa detected at ASP 169 : -0.81, fixed : 0.82\n", + "WARNING: D-aa detected at LYS 176 : -8.60, fixed : 9.84\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 190 : -9.63, fixed : 7.68\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 225 : -3.28, fixed : 3.43\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 268 : -28.68, fixed : 73.92\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 364 : -32.01, fixed : 30.50\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 403 : -36.71, fixed : 40.23\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_88.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.165 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_88.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_88_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_88.top -i segment_5_input_af_88.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_88.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 799 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 3.113\n", + " CYS50 SG384 2.279 2.116\n", + " MET51 SD391 2.766 1.714 0.725\n", + " HIS62 NE2479 2.146 1.586 1.878 2.055\n", + " MET85 SD654 3.257 0.830 2.795 2.488 1.738\n", + " MET132 SD1015 6.322 3.366 5.105 4.631 4.303 3.269\n", + " HIS143 NE21103 5.065 2.650 4.694 4.350 3.358 2.005 2.317\n", + " MET162 SD1260 7.008 4.263 6.134 5.724 5.003 3.927 1.369\n", + " HIS166 NE21297 6.682 4.171 5.980 5.654 4.667 3.774 1.774\n", + " MET167 SD1304 6.090 3.959 5.730 5.501 4.181 3.430 2.513\n", + " CYS173 SG1347 6.269 3.724 5.685 5.324 4.368 3.229 1.788\n", + " CYS175 SG1361 6.603 3.949 5.858 5.475 4.631 3.546 1.478\n", + " CYS198 SG1547 9.675 6.915 8.894 8.272 8.258 6.572 5.086\n", + " MET202 SD1578 9.911 7.181 9.157 8.534 8.525 6.830 5.395\n", + " MET218 SD1715 8.453 5.697 7.482 6.811 7.199 5.527 4.552\n", + " CYS244 SG1924 8.478 5.611 7.593 6.978 6.950 5.303 3.693\n", + " HIS256 NE22013 9.200 6.374 8.403 7.814 7.619 6.000 4.186\n", + " HIS264 NE22075 9.131 6.067 7.710 7.030 7.506 6.066 3.899\n", + " MET307 SD2371 7.228 5.539 7.521 7.239 6.004 4.754 4.829\n", + " MET311 SD2391 8.380 6.815 8.758 8.514 7.137 6.032 5.796\n", + " MET322 SD2472 7.383 5.291 7.300 6.989 5.784 4.601 3.762\n", + " MET323 SD2480 7.205 5.430 7.340 7.109 5.691 4.698 4.252\n", + " MET336 SD2560 5.328 3.559 5.377 5.190 3.708 2.844 3.221\n", + " MET337 SD2568 5.694 4.242 6.001 5.858 4.265 3.485 3.972\n", + " MET339 SD2580 5.649 4.328 6.081 5.944 4.355 3.539 4.265\n", + " MET359 SD2723 4.165 2.100 3.126 2.988 2.027 2.215 2.696\n", + " MET405 SD3021 6.969 4.043 5.067 4.451 5.250 4.439 2.665\n", + " MET414 SD3077 10.064 7.223 8.075 7.547 8.198 7.561 4.885\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.301\n", + " HIS166 NE21297 2.135 0.805\n", + " MET167 SD1304 1.820 1.792 1.063\n", + " CYS173 SG1347 1.382 1.050 0.878 1.122\n", + " CYS175 SG1361 1.836 0.519 0.593 1.362 0.544\n", + " CYS198 SG1547 5.281 4.790 5.447 6.012 4.964 4.925\n", + " MET202 SD1578 5.548 5.086 5.735 6.285 5.246 5.216 0.311\n", + " MET218 SD1715 4.811 4.802 5.466 5.997 4.889 4.881 2.011\n", + " CYS244 SG1924 4.039 3.534 4.217 4.823 3.727 3.665 1.415\n", + " HIS256 NE22013 4.504 3.723 4.378 4.997 3.975 3.890 1.166\n", + " HIS264 NE22075 5.244 4.281 5.072 5.924 4.846 4.585 2.978\n", + " MET307 SD2371 3.110 3.960 3.784 3.315 3.168 3.600 5.089\n", + " MET311 SD2391 4.308 4.707 4.465 4.002 4.064 4.412 5.805\n", + " MET322 SD2472 2.644 2.652 2.458 2.206 2.055 2.362 4.857\n", + " MET323 SD2480 2.877 3.186 2.789 2.223 2.470 2.831 5.690\n", + " MET336 SD2560 1.373 2.742 2.213 1.310 1.730 2.228 6.102\n", + " MET337 SD2568 2.090 3.325 2.776 1.829 2.343 2.833 6.377\n", + " MET339 SD2580 2.244 3.649 3.145 2.229 2.644 3.154 6.403\n", + " MET359 SD2723 2.717 3.439 3.115 2.937 3.117 3.182 7.427\n", + " MET405 SD3021 4.500 3.925 4.421 5.130 4.401 4.122 5.860\n", + " MET414 SD3077 7.170 5.626 6.174 7.134 6.518 6.045 7.257\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.168\n", + " CYS244 SG1924 1.721 1.669\n", + " HIS256 NE22013 1.431 2.467 0.983\n", + " HIS264 NE22075 3.208 2.342 2.294 2.830\n", + " MET307 SD2371 5.240 5.594 4.515 4.426 6.582\n", + " MET311 SD2391 5.924 6.665 5.422 5.103 7.500 1.414\n", + " MET322 SD2472 5.065 5.424 4.064 3.919 5.851 1.540 2.058\n", + " MET323 SD2480 5.890 6.202 4.902 4.779 6.669 1.532 1.790\n", + " MET336 SD2560 6.350 5.960 4.981 5.235 6.371 2.635 3.564\n", + " MET337 SD2568 6.603 6.408 5.378 5.528 6.951 2.220 2.982\n", + " MET339 SD2580 6.617 6.428 5.453 5.609 7.110 2.039 2.854\n", + " MET359 SD2723 7.722 6.598 6.035 6.607 6.351 5.651 6.659\n", + " MET405 SD3021 6.147 4.655 4.593 5.331 3.438 7.182 8.275\n", + " MET414 SD3077 7.511 6.646 6.311 6.689 4.471 9.405 10.193\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.866\n", + " MET336 SD2560 2.173 1.986\n", + " MET337 SD2568 2.035 1.559 0.813\n", + " MET339 SD2580 2.160 1.666 1.109 0.423\n", + " MET359 SD2723 4.926 4.969 3.138 3.872 4.137\n", + " MET405 SD3021 6.292 6.848 5.663 6.453 6.694 3.982\n", + " MET414 SD3077 8.188 8.802 8.075 8.801 9.119 6.529 3.332\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (1701-1702 = 0.369483 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (1701-1702 = 0.369483 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.309907 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (3523-3524 = 0.309907 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_88.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Two chemists walk into a bar. The first one says, 'I'll have some H2O.'. The second one says, 'I'll have some H2O, too'. He dies.\" (Anonymous)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_88.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_88.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_88.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_88.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_88.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_88_sys.pdb -s segment_5_input_af_88_sys.pdb -o segment_5_input_af_88.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_88_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Two chemists walk into a bar. The first one says, 'I'll have some H2O.'. The second one says, 'I'll have some H2O, too'. He dies.\" (Anonymous)\n", + "\n", + "In j loop 90 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_90.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.254, max = 0.714\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (14 17 12)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 186\n", + "Maximum number of conflicts: GLN[134] : 10\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at TYR 123 : -5.78, fixed : 5.79\n", + "WARNING: D-aa detected at SER 190 : -51.28, fixed : 52.63\n", + "WARNING: D-aa detected at VAL 193 : -34.85, fixed : 34.75\n", + "WARNING: D-aa detected at HIS 264 : -11.56, fixed : 11.16\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 327 : -9.22, fixed : 9.26\n", + "WARNING: D-aa detected at TYR 374 : -7.83, fixed : 7.83\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_90.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.108 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_90.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_90_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_90.top -i segment_5_input_af_90.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_90.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 788 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 3.243\n", + " CYS50 SG384 3.186 2.139\n", + " MET51 SD391 2.936 1.433 0.803\n", + " HIS62 NE2479 2.028 2.073 1.858 1.757\n", + " MET85 SD654 4.879 1.751 3.614 3.004 3.661\n", + " MET132 SD1015 6.936 4.140 6.070 5.399 6.089 2.560\n", + " HIS143 NE21103 9.103 6.077 7.761 7.203 8.016 4.362 2.309\n", + " MET162 SD1260 7.514 5.177 7.142 6.396 7.093 3.917 1.722\n", + " HIS166 NE21297 7.762 5.223 7.039 6.328 7.237 3.917 1.760\n", + " MET167 SD1304 8.334 5.573 7.227 6.577 7.636 4.173 2.118\n", + " CYS173 SG1347 8.183 5.502 7.340 6.655 7.514 4.030 1.605\n", + " CYS175 SG1361 7.827 5.352 7.263 6.538 7.320 4.010 1.679\n", + " CYS198 SG1547 8.361 6.276 8.239 7.672 7.450 4.985 4.005\n", + " MET202 SD1578 8.540 6.435 8.353 7.813 7.563 5.141 4.249\n", + " MET218 SD1715 9.888 7.358 9.239 8.703 8.785 5.780 4.270\n", + " CYS244 SG1924 8.451 6.207 8.270 7.627 7.681 4.780 3.125\n", + " HIS256 NE22013 7.919 6.001 8.025 7.418 7.165 4.810 3.841\n", + " HIS264 NE22075 6.910 4.426 6.419 5.821 5.899 2.981 2.205\n", + " MET307 SD2371 4.691 1.698 3.186 2.753 3.107 1.122 3.509\n", + " MET311 SD2391 4.594 2.276 2.538 2.525 2.630 2.627 5.056\n", + " MET322 SD2472 3.209 1.803 1.208 1.314 1.297 3.138 5.693\n", + " MET323 SD2480 3.266 2.071 0.526 1.017 1.637 3.481 6.002\n", + " MET336 SD2560 5.849 3.475 3.908 3.915 3.882 3.217 5.222\n", + " MET337 SD2568 5.289 3.234 3.329 3.442 3.277 3.401 5.653\n", + " MET339 SD2580 6.098 4.082 4.520 4.552 4.163 3.891 5.789\n", + " MET359 SD2723 7.734 5.763 6.880 6.694 6.128 5.005 5.875\n", + " MET405 SD3021 7.307 4.864 6.591 6.139 5.993 3.559 3.514\n", + " MET414 SD3077 8.940 6.234 8.070 7.545 7.754 4.599 3.206\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 3.080\n", + " HIS166 NE21297 2.718 0.956\n", + " MET167 SD1304 2.231 1.938 1.033\n", + " CYS173 SG1347 2.027 1.223 0.750 0.965\n", + " CYS175 SG1361 2.696 0.509 0.584 1.468 0.740\n", + " CYS198 SG1547 4.559 4.662 5.279 5.733 4.876 4.822\n", + " MET202 SD1578 4.690 4.987 5.569 5.978 5.142 5.126 0.390\n", + " MET218 SD1715 3.703 4.951 5.318 5.454 4.699 4.910 2.033\n", + " CYS244 SG1924 3.625 3.425 4.069 4.564 3.647 3.564 1.452\n", + " HIS256 NE22013 4.724 4.326 5.035 5.609 4.720 4.556 0.751\n", + " HIS264 NE22075 3.414 3.337 3.792 4.217 3.501 3.475 2.058\n", + " MET307 SD2371 5.073 4.966 4.992 5.191 5.037 5.059 5.200\n", + " MET311 SD2391 6.413 6.531 6.501 6.614 6.549 6.607 6.416\n", + " MET322 SD2472 7.381 6.905 6.906 7.140 7.118 7.048 7.348\n", + " MET323 SD2480 7.663 7.157 7.086 7.275 7.341 7.280 7.956\n", + " MET336 SD2560 6.177 6.851 6.827 6.848 6.720 6.879 5.978\n", + " MET337 SD2568 6.795 7.212 7.200 7.270 7.167 7.273 6.523\n", + " MET339 SD2580 6.732 7.395 7.465 7.546 7.325 7.456 5.906\n", + " MET359 SD2723 6.449 7.341 7.625 7.795 7.297 7.424 4.174\n", + " MET405 SD3021 4.206 4.853 5.202 5.457 4.840 4.936 2.144\n", + " MET414 SD3077 2.786 4.205 4.462 4.540 3.863 4.134 2.134\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 1.940\n", + " CYS244 SG1924 1.772 2.065\n", + " HIS256 NE22013 1.107 2.638 1.362\n", + " HIS264 NE22075 2.254 3.012 1.936 1.982\n", + " MET307 SD2371 5.287 6.070 5.294 5.103 3.373\n", + " MET311 SD2391 6.441 7.281 6.716 6.382 4.780 1.582\n", + " MET322 SD2472 7.431 8.428 7.544 7.169 5.655 2.426 1.586\n", + " MET323 SD2480 8.051 8.971 8.068 7.769 6.188 2.907 2.092\n", + " MET336 SD2560 5.923 6.641 6.460 6.102 4.589 2.167 1.400\n", + " MET337 SD2568 6.488 7.328 6.999 6.578 5.094 2.297 0.993\n", + " MET339 SD2580 5.807 6.681 6.593 6.062 4.801 2.824 2.073\n", + " MET359 SD2723 3.935 4.927 5.292 4.540 4.078 4.309 4.445\n", + " MET405 SD3021 2.066 2.983 2.858 2.451 1.563 3.459 4.485\n", + " MET414 SD3077 2.117 1.276 1.980 2.623 2.098 4.911 6.151\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.736\n", + " MET336 SD2560 2.950 3.454\n", + " MET337 SD2568 2.337 2.841 0.809\n", + " MET339 SD2580 3.442 4.024 0.964 1.249\n", + " MET359 SD2723 5.740 6.413 3.380 3.909 2.749\n", + " MET405 SD3021 5.643 6.254 3.881 4.488 3.853 2.581\n", + " MET414 SD3077 7.309 7.817 5.572 6.259 5.734 4.418 2.188\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (5432-5433 = 0.293733 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5432-5433 = 0.293733 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5633-5635 = 0.29378 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5633-5635 = 0.29378 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_90.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Two chemists walk into a bar. The first one says, 'I'll have some H2O.'. The second one says, 'I'll have some H2O, too'. He dies.\" (Anonymous)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_90.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_90.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_90.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_90.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_90.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_90_sys.pdb -s segment_5_input_af_90_sys.pdb -o segment_5_input_af_90.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_90_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Two chemists walk into a bar. The first one says, 'I'll have some H2O.'. The second one says, 'I'll have some H2O, too'. He dies.\" (Anonymous)\n", + "\n", + "In j loop 92 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_92.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.248, max = 0.879\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (16 24 14)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 138\n", + "Maximum number of conflicts: LEU[188] : 8\n", + "WARNING: 4 steric conflict(s) are still there.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 1 : -36.46, fixed : 38.53\n", + "WARNING: D-aa detected at THR 103 : -5.52, fixed : 5.70\n", + "WARNING: D-aa detected at LEU 139 : -2.92, fixed : 2.89\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 286 : -46.86, fixed : 50.28\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 297 : -42.85, fixed : 44.38\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 349 : -1.22, fixed : 1.21\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 391 : -133.93, fixed : 134.23\n", + "WARNING: D-aa detected at PHE 397 : -14.56, fixed : 14.61\n", + "WARNING: D-aa detected at ASP 406 : -2.25, fixed : 2.28\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_92.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.091 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_92.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_92_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_92.top -i segment_5_input_af_92.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_92.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 782 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.634\n", + " CYS50 SG384 3.469 2.276\n", + " MET51 SD391 3.004 1.366 0.929\n", + " HIS62 NE2479 2.458 1.748 2.287 1.897\n", + " MET85 SD654 4.250 2.339 3.225 2.552 4.003\n", + " MET132 SD1015 6.520 5.165 6.700 5.922 6.884 3.523\n", + " HIS143 NE21103 8.345 7.293 9.101 8.259 8.899 6.026 2.593\n", + " MET162 SD1260 7.618 5.835 7.314 6.564 7.531 4.182 1.593\n", + " HIS166 NE21297 7.640 5.851 7.466 6.679 7.504 4.410 1.858\n", + " MET167 SD1304 8.099 6.382 8.186 7.353 7.937 5.273 2.717\n", + " CYS173 SG1347 7.965 6.357 8.071 7.257 7.996 4.998 2.012\n", + " CYS175 SG1361 7.655 5.939 7.469 6.704 7.634 4.327 1.519\n", + " CYS198 SG1547 4.586 4.160 4.567 4.140 5.546 2.647 3.944\n", + " MET202 SD1578 4.494 3.898 4.188 3.789 5.281 2.337 4.036\n", + " MET218 SD1715 5.935 4.661 5.288 4.782 6.311 2.432 2.714\n", + " CYS244 SG1924 4.991 4.357 5.462 4.808 5.947 2.774 2.479\n", + " HIS256 NE22013 4.055 4.018 4.868 4.304 5.372 2.948 3.757\n", + " HIS264 NE22075 6.053 5.700 6.854 6.206 7.255 4.166 2.704\n", + " MET307 SD2371 8.357 8.295 9.714 9.004 9.790 6.972 4.372\n", + " MET311 SD2391 7.465 7.327 8.805 8.071 8.829 6.061 3.544\n", + " MET322 SD2472 8.146 8.566 10.325 9.529 9.788 7.951 5.628\n", + " MET323 SD2480 8.970 9.184 10.926 10.128 10.507 8.353 5.685\n", + " MET336 SD2560 9.392 9.419 11.391 10.525 10.687 8.810 5.996\n", + " MET337 SD2568 8.684 8.603 10.602 9.726 9.888 8.015 5.247\n", + " MET339 SD2580 8.679 8.584 10.424 9.589 9.974 7.712 4.815\n", + " MET359 SD2723 10.593 10.396 12.370 11.498 11.742 9.616 6.504\n", + " MET405 SD3021 12.954 13.395 15.445 14.576 14.401 13.143 10.482\n", + " MET414 SD3077 15.002 15.287 17.312 16.442 16.410 14.800 11.849\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.806\n", + " HIS166 NE21297 2.658 0.621\n", + " MET167 SD1304 2.518 1.760 1.161\n", + " CYS173 SG1347 1.947 1.182 0.792 0.911\n", + " CYS175 SG1361 2.533 0.274 0.565 1.628 0.952\n", + " CYS198 SG1547 6.224 5.196 5.570 6.513 5.926 5.258\n", + " MET202 SD1578 6.411 5.195 5.569 6.530 5.979 5.279 0.451\n", + " MET218 SD1715 5.168 3.595 4.084 5.170 4.528 3.706 1.981\n", + " CYS244 SG1924 4.593 3.933 4.254 5.109 4.478 3.934 1.656\n", + " HIS256 NE22013 5.782 5.191 5.472 6.274 5.718 5.203 1.143\n", + " HIS264 NE22075 4.109 4.219 4.548 5.310 4.553 4.146 2.683\n", + " MET307 SD2371 3.816 5.561 5.745 6.095 5.334 5.367 5.606\n", + " MET311 SD2391 3.317 4.852 5.020 5.405 4.665 4.667 4.855\n", + " MET322 SD2472 4.582 6.823 6.770 6.731 6.256 6.594 6.948\n", + " MET323 SD2480 4.307 6.747 6.715 6.658 6.135 6.505 7.344\n", + " MET336 SD2560 4.106 6.776 6.579 6.205 5.907 6.513 8.323\n", + " MET337 SD2568 3.459 6.036 5.820 5.451 5.172 5.777 7.674\n", + " MET339 SD2580 3.171 5.731 5.642 5.496 5.020 5.477 7.049\n", + " MET359 SD2723 4.228 7.028 6.819 6.350 6.074 6.754 9.218\n", + " MET405 SD3021 8.431 11.151 10.879 10.294 10.166 10.883 12.610\n", + " MET414 SD3077 9.579 12.375 12.132 11.537 11.372 12.101 14.190\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 1.935\n", + " CYS244 SG1924 1.907 1.792\n", + " HIS256 NE22013 1.458 2.622 1.346\n", + " HIS264 NE22075 3.048 2.669 1.419 2.267\n", + " MET307 SD2371 5.997 5.432 4.327 5.032 2.970\n", + " MET311 SD2391 5.229 4.698 3.471 4.221 2.210 0.986\n", + " MET322 SD2472 7.323 7.162 5.626 6.015 4.642 2.775 2.780\n", + " MET323 SD2480 7.721 7.328 5.953 6.513 4.836 2.425 2.711\n", + " MET336 SD2560 8.646 8.125 6.797 7.453 5.915 3.930 3.956\n", + " MET337 SD2568 7.974 7.441 6.120 6.806 5.348 3.742 3.563\n", + " MET339 SD2580 7.384 6.788 5.520 6.258 4.533 2.524 2.511\n", + " MET359 SD2723 9.530 8.771 7.637 8.444 6.699 4.489 4.671\n", + " MET405 SD3021 12.951 12.604 11.176 11.645 10.274 7.977 8.242\n", + " MET414 SD3077 14.543 14.003 12.717 13.307 11.686 9.091 9.531\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 1.048\n", + " MET336 SD2560 2.139 1.852\n", + " MET337 SD2568 2.139 2.066 0.864\n", + " MET339 SD2580 1.688 1.223 1.481 1.268\n", + " MET359 SD2723 3.337 2.698 1.390 1.931 2.244\n", + " MET405 SD3021 5.767 5.593 4.514 5.242 5.897 4.363\n", + " MET414 SD3077 7.358 6.909 5.993 6.791 7.225 5.369 2.320\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (5230-5231 = 0.374069 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5230-5231 = 0.374069 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_92.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"GROMACS First : Making MD Great Again\" (Vedran Miletic)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_92.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_92.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_92.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_92.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_92.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_92_sys.pdb -s segment_5_input_af_92_sys.pdb -o segment_5_input_af_92.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_92_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"GROMACS First : Making MD Great Again\" (Vedran Miletic)\n", + "\n", + "In j loop 94 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_94.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.259, max = 0.702\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (17 19 15)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 120\n", + "Maximum number of conflicts: PHE[226] : 11\n", + "All steric conflicts removed.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 38 : -1.48, fixed : 1.49\n", + "WARNING: D-aa detected at TYR 73 : -88.66, fixed : 88.76\n", + "WARNING: D-aa detected at THR 88 : -47.66, fixed : 46.51\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 182 : -13.56, fixed : 66.85\n", + "WARNING: D-aa detected at GLU 261 : -34.34, fixed : 30.97\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 265 : -2.71, fixed : 3.89\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 360 : -27.03, fixed : 25.42\n", + "WARNING: D-aa detected at ALA 382 : -52.14, fixed : 44.37\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_94.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.055 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_94.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_94_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_94.top -i segment_5_input_af_94.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_94.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 785 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 3.252\n", + " CYS50 SG384 2.790 2.356\n", + " MET51 SD391 2.846 1.582 0.825\n", + " HIS62 NE2479 2.769 1.657 2.431 2.098\n", + " MET85 SD654 4.866 1.832 2.991 2.386 2.726\n", + " MET132 SD1015 6.810 3.727 5.663 4.877 5.105 3.185\n", + " HIS143 NE21103 4.550 1.367 3.374 2.570 2.859 1.473 2.382\n", + " MET162 SD1260 6.945 4.197 6.328 5.506 5.546 4.192 1.383\n", + " HIS166 NE21297 6.375 3.697 5.955 5.132 4.907 3.895 1.700\n", + " MET167 SD1304 5.785 3.299 5.647 4.847 4.245 3.771 2.455\n", + " CYS173 SG1347 5.632 2.888 5.106 4.281 4.213 3.194 1.616\n", + " CYS175 SG1361 6.244 3.498 5.701 4.877 4.800 3.643 1.411\n", + " CYS198 SG1547 9.787 7.923 9.591 8.847 9.431 8.257 5.556\n", + " MET202 SD1578 10.258 8.488 10.124 9.389 9.989 8.854 6.168\n", + " MET218 SD1715 8.140 6.656 8.106 7.412 8.156 7.269 5.140\n", + " CYS244 SG1924 8.560 6.737 8.534 7.768 8.174 7.229 4.649\n", + " HIS256 NE22013 9.967 7.981 9.811 9.036 9.432 8.277 5.416\n", + " HIS264 NE22075 8.218 5.800 7.671 6.878 7.301 5.874 2.977\n", + " MET307 SD2371 6.107 5.387 7.401 6.734 5.769 6.651 5.747\n", + " MET311 SD2391 5.912 5.268 7.259 6.620 5.470 6.537 5.887\n", + " MET322 SD2472 6.334 4.727 6.910 6.136 5.646 5.660 4.016\n", + " MET323 SD2480 6.351 4.523 6.793 6.010 5.378 5.332 3.713\n", + " MET336 SD2560 4.991 3.316 5.537 4.833 3.673 4.316 4.018\n", + " MET337 SD2568 4.474 2.764 4.960 4.264 3.118 3.869 3.926\n", + " MET339 SD2580 4.222 2.576 4.644 4.011 2.558 3.633 4.245\n", + " MET359 SD2723 6.311 3.880 5.483 4.985 3.613 3.338 4.453\n", + " MET405 SD3021 9.882 6.938 8.004 7.415 8.392 5.823 4.018\n", + " MET414 SD3077 8.470 5.412 6.783 6.113 6.851 4.383 2.296\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 3.035\n", + " HIS166 NE21297 2.686 0.867\n", + " MET167 SD1304 2.601 1.906 1.039\n", + " CYS173 SG1347 1.875 1.358 0.868 1.189\n", + " CYS175 SG1361 2.415 0.767 0.404 1.276 0.624\n", + " CYS198 SG1547 6.984 4.605 5.218 6.038 5.539 5.166\n", + " MET202 SD1578 7.574 5.208 5.807 6.606 6.131 5.764 0.612\n", + " MET218 SD1715 5.937 4.278 4.730 5.406 4.772 4.603 1.939\n", + " CYS244 SG1924 5.873 3.534 4.013 4.736 4.333 3.996 1.432\n", + " HIS256 NE22013 7.001 4.358 4.950 5.754 5.402 4.961 0.920\n", + " HIS264 NE22075 4.683 2.086 2.831 3.794 3.186 2.736 2.605\n", + " MET307 SD2371 5.412 4.741 4.088 3.438 4.260 4.353 6.844\n", + " MET311 SD2391 5.393 4.988 4.263 3.483 4.392 4.532 7.430\n", + " MET322 SD2472 4.281 2.839 2.369 2.163 2.694 2.616 5.073\n", + " MET323 SD2480 4.028 2.610 2.015 1.661 2.425 2.326 5.447\n", + " MET336 SD2560 3.297 3.531 2.674 1.661 2.594 2.878 7.212\n", + " MET337 SD2568 2.880 3.596 2.753 1.773 2.487 2.882 7.355\n", + " MET339 SD2580 2.916 4.130 3.294 2.321 2.956 3.391 8.070\n", + " MET359 SD2723 3.733 5.033 4.426 3.831 4.242 4.478 9.621\n", + " MET405 SD3021 5.671 4.828 5.542 6.444 5.501 5.257 6.272\n", + " MET414 SD3077 4.086 3.240 3.880 4.740 3.825 3.593 5.777\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 2.256\n", + " CYS244 SG1924 1.924 1.571\n", + " HIS256 NE22013 1.216 2.574 1.436\n", + " HIS264 NE22075 3.213 2.747 1.888 2.461\n", + " MET307 SD2371 7.232 6.075 5.445 6.520 5.694\n", + " MET311 SD2391 7.837 6.643 6.020 7.098 6.133 0.668\n", + " MET322 SD2472 5.538 4.428 3.655 4.754 3.653 2.049 2.490\n", + " MET323 SD2480 5.941 4.902 4.056 5.076 3.764 2.176 2.465\n", + " MET336 SD2560 7.736 6.374 5.815 6.938 5.246 2.528 2.302\n", + " MET337 SD2568 7.890 6.402 5.969 7.145 5.344 2.919 2.695\n", + " MET339 SD2580 8.615 7.091 6.700 7.870 5.978 3.518 3.187\n", + " MET359 SD2723 10.218 9.013 8.438 9.328 7.112 6.238 5.887\n", + " MET405 SD3021 6.749 6.414 6.274 6.382 4.607 9.534 9.775\n", + " MET414 SD3077 6.338 5.694 5.401 5.780 3.580 7.926 8.125\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.675\n", + " MET336 SD2560 2.431 2.007\n", + " MET337 SD2568 2.758 2.396 0.581\n", + " MET339 SD2580 3.530 3.141 1.195 0.777\n", + " MET359 SD2723 5.829 5.238 3.803 3.641 3.142\n", + " MET405 SD3021 7.589 7.435 8.027 7.904 8.178 7.715\n", + " MET414 SD3077 6.047 5.835 6.311 6.193 6.463 6.126 1.734\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (5230-5231 = 0.261915 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5230-5231 = 0.261915 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_94.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"GROMACS First : Making MD Great Again\" (Vedran Miletic)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_94.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_94.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_94.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_94.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_94.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_94_sys.pdb -s segment_5_input_af_94_sys.pdb -o segment_5_input_af_94.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_94_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"GROMACS First : Making MD Great Again\" (Vedran Miletic)\n", + "\n", + "In j loop 96 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_96.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.278, max = 0.808\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (14 19 14)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 200\n", + "Maximum number of conflicts: PHE[152] : 10\n", + "WARNING: 2 steric conflict(s) are still there.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 6 : -54.06, fixed : 48.10\n", + "WARNING: D-aa detected at LYS 192 : -9.85, fixed : 9.90\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 262 : -13.12, fixed : 13.20\n", + "WARNING: D-aa detected at PRO 280 : -20.44, fixed : 19.86\n", + "WARNING: D-aa detected at PHE 313 : -5.98, fixed : 6.01\n", + "WARNING: D-aa detected at MET 336 : -14.68, fixed : 14.60\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_96.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.111 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_96.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_96_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_96.top -i segment_5_input_af_96.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_96.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 821 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.548\n", + " CYS50 SG384 3.565 2.262\n", + " MET51 SD391 3.045 1.390 0.882\n", + " HIS62 NE2479 2.379 1.438 2.211 1.695\n", + " MET85 SD654 3.760 1.428 2.717 2.052 1.843\n", + " MET132 SD1015 7.258 6.336 7.267 6.913 5.599 5.324\n", + " HIS143 NE21103 8.121 7.090 7.365 7.261 6.158 6.006 2.163\n", + " MET162 SD1260 6.142 4.796 5.744 5.353 4.235 3.649 1.765\n", + " HIS166 NE21297 6.301 5.096 5.710 5.449 4.308 4.002 1.726\n", + " MET167 SD1304 6.493 5.420 5.564 5.486 4.427 4.418 2.561\n", + " CYS173 SG1347 7.032 5.772 6.256 6.052 4.993 4.619 1.697\n", + " CYS175 SG1361 6.687 5.464 6.113 5.844 4.715 4.338 1.434\n", + " CYS198 SG1547 4.316 3.223 3.896 3.567 2.269 2.438 3.414\n", + " MET202 SD1578 4.318 2.995 3.470 3.190 2.092 2.134 3.801\n", + " MET218 SD1715 5.046 2.950 3.960 3.470 2.969 1.553 4.154\n", + " CYS244 SG1924 5.861 4.206 4.850 4.544 3.691 2.937 2.812\n", + " HIS256 NE22013 5.593 4.320 4.848 4.600 3.501 3.256 2.511\n", + " HIS264 NE22075 5.560 4.395 5.952 5.346 4.142 3.490 2.629\n", + " MET307 SD2371 3.608 3.618 3.920 3.745 2.229 3.508 4.439\n", + " MET311 SD2391 2.148 2.631 3.127 2.821 1.344 3.102 5.591\n", + " MET322 SD2472 3.840 1.754 2.582 2.070 1.632 0.655 4.988\n", + " MET323 SD2480 3.932 1.689 1.879 1.465 1.838 1.035 5.801\n", + " MET336 SD2560 6.424 4.495 3.089 3.541 4.344 3.833 7.078\n", + " MET337 SD2568 6.666 4.921 3.308 3.875 4.626 4.334 7.315\n", + " MET339 SD2580 8.001 6.044 4.680 5.146 5.851 5.227 7.645\n", + " MET359 SD2723 11.507 9.314 8.453 8.739 9.198 8.157 8.882\n", + " MET405 SD3021 9.590 7.057 7.286 7.092 7.624 5.902 7.894\n", + " MET414 SD3077 11.181 8.731 9.441 9.085 9.393 7.579 8.711\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.844\n", + " HIS166 NE21297 2.095 0.952\n", + " MET167 SD1304 1.815 2.136 1.208\n", + " CYS173 SG1347 1.476 1.449 0.753 1.216\n", + " CYS175 SG1361 1.862 0.992 0.427 1.413 0.512\n", + " CYS198 SG1547 3.933 2.133 2.050 2.304 2.748 2.462\n", + " MET202 SD1578 4.138 2.392 2.294 2.426 2.932 2.707 0.545\n", + " MET218 SD1715 4.842 2.394 2.870 3.501 3.388 3.123 2.123\n", + " CYS244 SG1924 3.204 1.167 1.323 2.001 1.760 1.559 1.764\n", + " HIS256 NE22013 2.776 1.269 0.863 1.303 1.494 1.276 1.281\n", + " HIS264 NE22075 4.370 1.691 2.542 3.674 3.100 2.604 2.670\n", + " MET307 SD2371 4.765 3.676 3.366 3.185 3.991 3.764 1.785\n", + " MET311 SD2391 6.138 4.574 4.496 4.483 5.185 4.904 2.542\n", + " MET322 SD2472 5.505 3.339 3.558 3.855 4.168 3.920 1.927\n", + " MET323 SD2480 6.130 4.137 4.286 4.432 4.840 4.650 2.678\n", + " MET336 SD2560 6.507 5.568 5.368 5.001 5.581 5.664 4.504\n", + " MET337 SD2568 6.578 5.895 5.595 5.089 5.774 5.895 4.763\n", + " MET339 SD2580 6.718 6.286 5.998 5.517 6.015 6.216 5.616\n", + " MET359 SD2723 7.666 7.919 7.682 7.346 7.343 7.681 8.260\n", + " MET405 SD3021 7.950 6.493 6.883 7.303 6.871 6.896 7.069\n", + " MET414 SD3077 9.130 7.586 8.160 8.835 8.102 8.071 8.647\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 1.905\n", + " CYS244 SG1924 1.745 1.639\n", + " HIS256 NE22013 1.445 2.301 0.963\n", + " HIS264 NE22075 3.004 2.579 2.412 2.587\n", + " MET307 SD2371 1.988 3.779 3.488 2.757 4.014\n", + " MET311 SD2391 2.584 3.958 4.265 3.782 4.495 1.494\n", + " MET322 SD2472 1.550 1.466 2.548 2.761 3.444 3.022 2.813\n", + " MET323 SD2480 2.223 2.105 3.226 3.466 4.314 3.522 3.121\n", + " MET336 SD2560 3.965 4.010 4.410 4.676 6.440 5.242 5.289\n", + " MET337 SD2568 4.237 4.516 4.755 4.915 6.858 5.333 5.444\n", + " MET339 SD2580 5.110 5.057 5.149 5.465 7.393 6.453 6.724\n", + " MET359 SD2723 7.872 7.351 7.043 7.557 9.210 9.483 10.076\n", + " MET405 SD3021 6.730 5.144 5.755 6.674 6.921 8.704 8.837\n", + " MET414 SD3077 8.429 6.658 7.192 8.149 7.699 10.393 10.558\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.890\n", + " MET336 SD2560 3.515 2.920\n", + " MET337 SD2568 3.959 3.387 0.670\n", + " MET339 SD2580 4.891 4.411 1.607 1.485\n", + " MET359 SD2723 7.881 7.659 5.410 5.421 3.969\n", + " MET405 SD3021 6.033 5.910 5.433 5.975 5.244 4.976\n", + " MET414 SD3077 7.802 7.870 7.922 8.484 7.791 6.881 2.610\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (4081-4082 = 0.404554 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4081-4082 = 0.404554 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4362-4363 = 0.363764 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (4362-4363 = 0.363764 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_96.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Cowardly refusing to create an empty archive\" (GNU tar)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_96.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_96.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_96.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_96.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_96.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_96_sys.pdb -s segment_5_input_af_96_sys.pdb -o segment_5_input_af_96.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_96_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Cowardly refusing to create an empty archive\" (GNU tar)\n", + "\n", + "In j loop 98 lenpdb 100\n", + "PULCHRA Protein Chain Restoration Algorithm version 3.06\n", + "Reading input file segment_5_input_af_98.pdb...\n", + "414 residua read.\n", + "Initial coordinates will be preserved.\n", + "Rebuilding backbone...\n", + "Backbone rebuilding deviation: average = 0.255, max = 0.766\n", + "Rebuilding side chains...\n", + "Allocating grid (9 18 11)...\n", + "Finding excluded volume conflicts...\n", + "Total number of conflicts: 166\n", + "Maximum number of conflicts: GLU[261] : 9\n", + "WARNING: 4 steric conflict(s) are still there.\n", + "Checking chirality...\n", + "WARNING: D-aa detected at GLU 58 : -16.26, fixed : 15.89\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 189 : -35.24, fixed : 33.97\n", + "WARNING: D-aa detected at ARG 268 : -2.95, fixed : 2.96\n", + "WARNING: D-aa detected at ASN 279 : -11.65, fixed : 19.95\n", + "WARNING: D-aa detected at GLN 354 : -84.42, fixed : 84.50\n", + "WARNING: D-aa detected at ASP 406 : -5.76, fixed : 5.44\n", + "Rearranging backbone atoms...\n", + "Writing output file segment_5_input_af_98.rebuilt.pdb...\n", + "Done. Reconstruction finished in 0.101 s.\n", + " :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx pdb2gmx -f segment_5_input_af_98.rebuilt.pdb -o segment_5_input_af_98_sys.pdb -p topol_segment_5_input_af_98.top -i segment_5_input_af_98.itp\n", + "\n", + "Select the Force Field:\n", + "\n", + "From '/usr/local/share/gromacs/top':\n", + "\n", + " 1: AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)\n", + "\n", + " 2: AMBER94 force field (Cornell et al., JACS 117, 5179-5197, 1995)\n", + "\n", + " 3: AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)\n", + "\n", + " 4: AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)\n", + "\n", + " 5: AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)\n", + "\n", + " 6: AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)\n", + "\n", + " 7: AMBERGS force field (Garcia & Sanbonmatsu, PNAS 99, 2782-2787, 2002)\n", + "\n", + " 8: CHARMM27 all-atom force field (CHARM22 plus CMAP for proteins)\n", + "\n", + " 9: GROMOS96 43a1 force field\n", + "\n", + "10: GROMOS96 43a2 force field (improved alkane dihedrals)\n", + "\n", + "11: GROMOS96 45a3 force field (Schuler JCC 2001 22 1205)\n", + "\n", + "12: GROMOS96 53a5 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "13: GROMOS96 53a6 force field (JCC 2004 vol 25 pag 1656)\n", + "\n", + "14: GROMOS96 54a7 force field (Eur. Biophys. J. (2011), 40,, 843-856, DOI: 10.1007/s00249-011-0700-9)\n", + "\n", + "15: OPLS-AA/L all-atom force field (2001 aminoacid dihedrals)\n", + "\n", + "Using the Amber99sb-ildn force field in directory amber99sb-ildn.ff\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/watermodels.dat\n", + "\n", + "Select the Water Model:\n", + "\n", + " 1: TIP3P TIP 3-point, recommended\n", + "\n", + " 2: TIP4P TIP 4-point\n", + "\n", + " 3: TIP4P-Ew TIP 4-point optimized with Ewald\n", + "\n", + " 4: TIP5P TIP 5-point (see https://gitlab.com/gromacs/gromacs/-/issues/1348 for issues)\n", + "\n", + " 5: SPC simple point charge\n", + "\n", + " 6: SPC/E extended simple point charge\n", + "\n", + " 7: None\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.r2b\n", + "\n", + "going to rename amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.r2b\n", + "Reading segment_5_input_af_98.rebuilt.pdb...\n", + "Read '', 3081 atoms\n", + "\n", + "Analyzing pdb file\n", + "Splitting chemical chains based on TER records or chain id changing.\n", + "\n", + "There are 1 chains and 0 blocks of water and 414 residues with 3081 atoms\n", + "\n", + " chain #res #atoms\n", + "\n", + " 1 ' ' 414 3081 \n", + "\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "All occupancy fields zero. This is probably not an X-Ray structure\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/atomtypes.atp\n", + "\n", + "Reading residue database... (Amber99sb-ildn)\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.rtp\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.hdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.n.tdb\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.c.tdb\n", + "\n", + "Processing chain 1 (3081 atoms, 414 residues)\n", + "Analysing hydrogen-bonding network for automated assignment of histidine\n", + " protonation. 620 donors and 618 acceptors were found.\n", + "There are 797 hydrogen bonds\n", + "Will use HISE for residue 62\n", + "Will use HISE for residue 143\n", + "Will use HISE for residue 166\n", + "Will use HISE for residue 256\n", + "Will use HISE for residue 264\n", + "\n", + "Identified residue MET1 as a starting terminus.\n", + "\n", + "Identified residue MET414 as a ending terminus.\n", + "9 out of 9 lines of specbond.dat converted successfully\n", + "Special Atom Distance matrix:\n", + " MET1 CYS39 CYS50 MET51 HIS62 MET85 MET132\n", + " SD5 SG295 SG384 SD391 NE2479 SD654 SD1015\n", + " CYS39 SG295 2.466\n", + " CYS50 SG384 3.183 1.807\n", + " MET51 SD391 2.901 1.523 0.738\n", + " HIS62 NE2479 2.198 1.566 1.822 2.030\n", + " MET85 SD654 4.491 2.450 3.736 3.323 3.950\n", + " MET132 SD1015 5.343 4.335 5.030 4.338 5.784 3.221\n", + " HIS143 NE21103 4.950 5.149 5.931 5.197 6.276 4.861 2.475\n", + " MET162 SD1260 3.979 2.783 3.835 3.161 4.275 1.932 1.657\n", + " HIS166 NE21297 3.387 2.618 3.401 2.672 3.924 2.658 1.987\n", + " MET167 SD1304 3.050 3.095 3.660 2.939 4.086 3.674 2.610\n", + " CYS173 SG1347 3.519 3.295 4.120 3.387 4.487 3.323 2.004\n", + " CYS175 SG1361 3.619 2.754 3.780 3.074 4.155 2.352 1.795\n", + " CYS198 SG1547 2.230 3.201 4.717 4.329 3.552 4.153 5.266\n", + " MET202 SD1578 2.086 3.109 4.598 4.239 3.374 4.186 5.383\n", + " MET218 SD1715 2.887 1.987 3.790 3.432 2.950 2.337 4.433\n", + " CYS244 SG1924 3.491 3.673 5.369 4.868 4.539 3.607 4.522\n", + " HIS256 NE22013 3.080 4.149 5.685 5.256 4.557 4.774 5.591\n", + " HIS264 NE22075 3.401 3.299 4.661 3.997 4.490 3.070 2.765\n", + " MET307 SD2371 3.976 2.524 4.250 3.868 3.772 1.537 4.049\n", + " MET311 SD2391 4.790 3.063 4.661 4.351 4.289 1.532 4.401\n", + " MET322 SD2472 6.969 5.638 7.283 6.941 6.781 3.849 5.845\n", + " MET323 SD2480 7.041 5.854 7.527 7.132 7.042 4.042 5.691\n", + " MET336 SD2560 8.266 7.041 8.541 8.033 8.452 4.862 5.301\n", + " MET337 SD2568 8.295 6.929 8.438 7.983 8.300 4.719 5.625\n", + " MET339 SD2580 9.190 7.766 9.195 8.730 9.181 5.464 6.053\n", + " MET359 SD2723 7.285 6.222 7.632 7.042 7.698 4.173 3.839\n", + " MET405 SD3021 6.614 5.553 7.028 6.452 7.005 3.569 3.610\n", + " MET414 SD3077 7.325 6.427 8.070 7.552 7.733 4.579 5.187\n", + " HIS143 MET162 HIS166 MET167 CYS173 CYS175 CYS198\n", + " NE21103 SD1260 NE21297 SD1304 SG1347 SG1361 SG1547\n", + " MET162 SD1260 2.982\n", + " HIS166 NE21297 2.690 0.984\n", + " MET167 SD1304 2.318 2.000 1.076\n", + " CYS173 SG1347 1.873 1.480 0.874 0.810\n", + " CYS175 SG1361 2.630 0.538 0.597 1.501 0.978\n", + " CYS198 SG1547 4.762 3.856 3.713 3.664 3.656 3.581\n", + " MET202 SD1578 4.918 3.942 3.776 3.723 3.757 3.670 0.235\n", + " MET218 SD1715 4.922 2.816 3.040 3.552 3.396 2.805 1.978\n", + " CYS244 SG1924 4.185 3.290 3.490 3.695 3.347 3.126 1.559\n", + " HIS256 NE22013 4.781 4.349 4.270 4.157 4.041 4.063 1.007\n", + " HIS264 NE22075 2.461 1.782 1.827 2.025 1.486 1.459 2.629\n", + " MET307 SD2371 5.010 2.561 3.146 3.927 3.574 2.765 3.006\n", + " MET311 SD2391 5.663 3.064 3.777 4.660 4.270 3.379 3.844\n", + " MET322 SD2472 6.914 4.982 5.838 6.666 6.080 5.302 5.377\n", + " MET323 SD2480 6.621 4.939 5.797 6.582 5.951 5.235 5.355\n", + " MET336 SD2560 6.352 5.243 6.164 6.949 6.186 5.578 6.744\n", + " MET337 SD2568 6.827 5.394 6.341 7.187 6.458 5.763 6.780\n", + " MET339 SD2580 7.338 6.056 7.012 7.866 7.113 6.443 7.731\n", + " MET359 SD2723 4.781 4.012 4.870 5.580 4.785 4.295 5.961\n", + " MET405 SD3021 4.542 3.499 4.368 5.099 4.327 3.778 5.263\n", + " MET414 SD3077 5.797 4.838 5.668 6.337 5.604 5.072 5.592\n", + " MET202 MET218 CYS244 HIS256 HIS264 MET307 MET311\n", + " SD1578 SD1715 SG1924 NE22013 NE22075 SD2371 SD2391\n", + " MET218 SD1715 1.973\n", + " CYS244 SG1924 1.766 1.964\n", + " HIS256 NE22013 1.190 2.712 1.435\n", + " HIS264 NE22075 2.789 2.516 1.921 2.832\n", + " MET307 SD2371 3.051 1.185 2.396 3.539 2.708\n", + " MET311 SD2391 3.881 1.996 3.162 4.337 3.482 0.896\n", + " MET322 SD2472 5.479 4.115 4.202 5.415 4.980 3.161 2.625\n", + " MET323 SD2480 5.483 4.255 4.056 5.293 4.806 3.336 2.929\n", + " MET336 SD2560 6.911 5.716 5.256 6.604 5.324 4.718 4.388\n", + " MET337 SD2568 6.928 5.606 5.357 6.706 5.569 4.552 4.093\n", + " MET339 SD2580 7.884 6.547 6.285 7.645 6.339 5.470 4.992\n", + " MET359 SD2723 6.142 5.070 4.482 5.847 4.083 4.191 4.115\n", + " MET405 SD3021 5.438 4.334 3.799 5.190 3.507 3.464 3.429\n", + " MET414 SD3077 5.771 4.843 4.073 5.337 4.489 4.023 3.885\n", + " MET322 MET323 MET336 MET337 MET339 MET359 MET405\n", + " SD2472 SD2480 SD2560 SD2568 SD2580 SD2723 SD3021\n", + " MET323 SD2480 0.649\n", + " MET336 SD2560 2.753 2.287\n", + " MET337 SD2568 2.214 1.870 0.800\n", + " MET339 SD2580 3.182 2.873 1.142 1.019\n", + " MET359 SD2723 3.453 2.996 1.623 2.229 2.580\n", + " MET405 SD3021 2.985 2.564 1.873 2.287 2.892 0.747\n", + " MET414 SD3077 2.310 1.682 1.438 1.714 2.488 1.817 1.628\n", + " \n", + " \n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/aminoacids.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/dna.arn\n", + "Opening force field file /usr/local/share/gromacs/top/amber99sb-ildn.ff/rna.arn\n", + "\n", + "Checking for duplicate atoms....\n", + "\n", + "Generating any missing hydrogen atoms and/or adding termini.\n", + "\n", + "Now there are 414 residues with 6037 atoms\n", + "\n", + "Making bonds...\n", + "\n", + "Long Bond (5202-5205 = 0.25951 nm)\n", + "\n", + "Long Bond (5202-5205 = 0.25951 nm)\n", + "\n", + "Number of bonds was 6088, now 6087\n", + "\n", + "Generating angles, dihedrals and pairs...\n", + "Before cleaning: 15783 pairs\n", + "Before cleaning: 16554 dihedrals\n", + "\n", + "Making cmap torsions...\n", + "\n", + "There are 16554 dihedrals, 1255 impropers, 10926 angles\n", + " 15693 pairs, 6087 bonds and 0 virtual sites\n", + "\n", + "Total mass 44045.469 a.m.u.\n", + "\n", + "Total charge -4.000 e\n", + "\n", + "Writing topology\n", + "\n", + "Writing coordinate file...\n", + "\n", + "\t\t--------- PLEASE NOTE ------------\n", + "\n", + "You have successfully generated a topology from: segment_5_input_af_98.rebuilt.pdb.\n", + "\n", + "The Amber99sb-ildn force field is used.\n", + "\n", + "\t\t--------- ETON ESAELP ------------\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Cowardly refusing to create an empty archive\" (GNU tar)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'em_98.trr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_98.tpr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_98.log': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'em_98.edr': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'conf_box_98.gro': No such file or directory\n", + " :-) GROMACS - gmx trjconv, 2024.3-conda_forge (-:\n", + "\n", + "Executable: /usr/local/bin.AVX2_256/gmx\n", + "Data prefix: /usr/local\n", + "Working dir: /content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis\n", + "Command line:\n", + " gmx trjconv -f segment_5_input_af_98_sys.pdb -s segment_5_input_af_98_sys.pdb -o segment_5_input_af_98.rebuilt.xtc\n", + "\n", + "Note that major changes are planned in future for trjconv, to improve usability and utility.\n", + "Will write xtc: Compressed trajectory (portable xdr format): xtc\n", + "Select group for output\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "Reading frame 0 time 0.000 \n", + "Precision of segment_5_input_af_98_sys.pdb is 0.0001 (nm)\n", + "Using output precision of 0.001 (nm)\n", + " '', 6037 atoms\n", + "Last frame 0 time 0.000 \n", + " -> frame 0 time 0.000 \n", + "Last written: frame 0 time 0.000\n", + "\n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Cowardly refusing to create an empty archive\" (GNU tar)\n", + "\n", + "rm: cannot remove 'seg_list.dat': No such file or directory\n", + "rm: cannot remove 'list': No such file or directory\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "6037\n", + "segment_5_input_af_0.rebuilt.xtc segment_5_input_af_10.rebuilt.xtc segment_5_input_af_12.rebuilt.xtc segment_5_input_af_14.rebuilt.xtc 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segment_5_input_af_18.rebuilt.xtc segment_5_input_af_20.rebuilt.xtc segment_5_input_af_22.rebuilt.xtc segment_5_input_af_24.rebuilt.xtc segment_5_input_af_26.rebuilt.xtc segment_5_input_af_28.rebuilt.xtc segment_5_input_af_2.rebuilt.xtc segment_5_input_af_30.rebuilt.xtc segment_5_input_af_32.rebuilt.xtc segment_5_input_af_34.rebuilt.xtc segment_5_input_af_36.rebuilt.xtc segment_5_input_af_38.rebuilt.xtc segment_5_input_af_40.rebuilt.xtc segment_5_input_af_42.rebuilt.xtc segment_5_input_af_44.rebuilt.xtc segment_5_input_af_46.rebuilt.xtc segment_5_input_af_48.rebuilt.xtc segment_5_input_af_4.rebuilt.xtc segment_5_input_af_50.rebuilt.xtc segment_5_input_af_52.rebuilt.xtc segment_5_input_af_54.rebuilt.xtc segment_5_input_af_56.rebuilt.xtc segment_5_input_af_58.rebuilt.xtc segment_5_input_af_60.rebuilt.xtc segment_5_input_af_62.rebuilt.xtc segment_5_input_af_64.rebuilt.xtc segment_5_input_af_66.rebuilt.xtc segment_5_input_af_68.rebuilt.xtc segment_5_input_af_6.rebuilt.xtc 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+ "segment_5_input_af_22.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_24.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_26.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_28.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_2.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_30.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_32.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_34.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_36.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_38.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_40.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_42.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_44.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_46.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_48.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_4.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_50.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_52.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_54.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_56.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_58.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_60.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_62.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_64.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_66.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_68.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_6.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_70.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_72.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_74.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + "segment_5_input_af_76.rebuilt.xtc 0.000 ps 0.000 ps WARNING: same Start time as previous\n", + 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logvalue4=-np.log(value4)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:41: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue5=-np.log(value5)\n", + "2\n", + "2\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:32: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue1=-np.log(value1)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:34: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue2=-np.log(value2)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:36: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue3=-np.log(value3)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:38: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue4=-np.log(value4)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:41: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue5=-np.log(value5)\n", + "3\n", + "3\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:32: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue1=-np.log(value1)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:34: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue2=-np.log(value2)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:36: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue3=-np.log(value3)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:38: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue4=-np.log(value4)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:41: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue5=-np.log(value5)\n", + "4\n", + "4\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:32: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue1=-np.log(value1)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:34: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue2=-np.log(value2)\n", + 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log\n", + " logvalue1=-np.log(value1)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:34: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue2=-np.log(value2)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:36: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue3=-np.log(value3)\n", + "7\n", + "7\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:32: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue1=-np.log(value1)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:34: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue2=-np.log(value2)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:36: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue3=-np.log(value3)\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:38: RuntimeWarning: divide by zero encountered in log\n", + " logvalue4=-np.log(value4)\n", + "8\n", + "8\n", + "/content/AlphaFold-IDP/prep_run/analysis/fes2.py:32: 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"WARNING: Masses and atomic (Van der Waals) radii will be guessed\n", + " based on residue and atom names, since they could not be\n", + " definitively assigned from the information in your input\n", + " files. These guessed numbers might deviate from the mass\n", + " and radius of the atom type. Please check the output\n", + " files if necessary. Note, that this functionality may\n", + " be removed in a future GROMACS version. Please, consider\n", + " using another file format for your input.\n", + "\n", + "Select group(s) for root mean square calculation\n", + "Group 0 ( System) has 6037 elements\n", + "Group 1 ( Protein) has 6037 elements\n", + "Group 2 ( Protein-H) has 3081 elements\n", + "Group 3 ( C-alpha) has 414 elements\n", + "Group 4 ( Backbone) has 1242 elements\n", + "Group 5 ( MainChain) has 1657 elements\n", + "Group 6 ( MainChain+Cb) has 2016 elements\n", + "Group 7 ( MainChain+H) has 2057 elements\n", + "Group 8 ( SideChain) has 3980 elements\n", + "Group 9 ( SideChain-H) has 1424 elements\n", + "Select a group: Selected 0: 'System'\n", + "\rReading frame 0 time 0.000 \n", + "WARNING: If there are molecules in the input trajectory file\n", + " that are broken across periodic boundaries, they\n", + " cannot be made whole (or treated as whole) without\n", + " you providing a run input file.\n", + "\n", + "\rReading frame 1 time 0.000 \rReading frame 2 time 0.000 \rReading frame 3 time 0.000 \rReading frame 4 time 0.000 \rReading frame 5 time 0.000 \rReading frame 6 time 0.000 \rReading frame 7 time 0.000 \rReading frame 8 time 0.000 \rReading frame 9 time 0.000 \rReading frame 10 time 0.000 \rReading frame 11 time 0.000 \rReading frame 12 time 0.000 \rReading frame 13 time 0.000 \rReading frame 14 time 0.000 \rReading frame 15 time 0.000 \rReading frame 16 time 0.000 \rReading frame 17 time 0.000 \rReading frame 18 time 0.000 \rReading frame 19 time 0.000 \rReading frame 20 time 0.000 \rReading frame 30 time 0.000 \rReading frame 40 time 0.000 \n", + "\n", + "GROMACS reminds you: \"Science and everyday life cannot and should not be separated.\" (Rosalind Franklin)\n", + "\n" + ] + }, + { + "output_type": "display_data", + "data": { + "text/plain": [ + "
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+---------------------------------------------------------------------------------------------------PEDDRKLFVGGLTWDTTQEDLREYFSNFGNILDCSIKHDPTTGRSRGFAFLIFDRKDIVDKILsQNEHFVKGRKIDPKPAHRRLAVTNnnnnnnnnhnhnnnhnthhhhmstssssslnsiSNNNRKVFIGGLDPHFSDVQLREYFSQFGIIDDIDLPydkekNERRPFCFISFQNEQSAQEVLrLQRHTIGDITVDVKRAKPKTLNNNQHQQQ-----IYDPYGQQNIYTNYGTGVSSYGVNAYPTVDPYATWNNYSYNQPGNPGTYSYGGS---------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A7S1ABT0 134 0.274 5.952E-29 102 261 414 29 196 428 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PSKLFIGGVSAHTTTENLHSHFFPYGQIIDAIVM--QKNGRSRGFGFVTFDSLVPAELALADTHWLDGRLLDVKRAVP-GERTQERASNKIFVGGLPQGTTTRDLKTYFSSYGALADAVVmvdrrTNRSRGFGFVRFSNTlqgSLASEAVLRDfalHRLSGKWIEVKRAAP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_UPI0007E85694 134 0.250 5.952E-29 86 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+>UniRef100_A0A132A8H3 134 0.308 8.031E-29 101 278 414 33 211 307 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ENRKLFVGGLSWETVEKDIFDYFNHFGKVEKVNIKYDLNTGRSRGFGFITFVNDETVDAVLkTGPHVIKNRTVDPKRPKGK------TGLKKIFVGGVDADLCNDDIKAYFEQFGPIENIERPfdrqrNRQREFCFIIFESGESAESAImMPKQLIGGKECDIKLAHPHRNNQNNMYHQNGGSGM--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_K0SEV3 134 0.272 8.031E-29 104 262 414 21 211 316 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLSWQTTEETLRYHFEQYGEVQSVEVMRDRNTGDPRGFAFVVFKADETVDLILRNkPHEINHKVVDVKRAQARGVAppsihggnagdpivkheengnkhlTPEERMNKVFVGGLPMHVDQAGLKDFFSVFGPVVDSIVMmdlvnNRSRGFGFVTYADGSggAQKALEAQPIDMFGKMVEVKLATPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+>UniRef100_A0A835B760 126 0.247 1.740E-26 104 271 414 127 303 655 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFVKNLSDYVDNASLQELFSKFGDVLSCKVAKN-DDGTSRGYGFVQFASQESADAAIENLHgsLFNDRKLHVAtfVKKSERSTNNDDKFTNLYMKHLDDDITEELVRLKFSQFGPIVSVKIMRRpdgsSLGFGFVSFQNPESAIKAQETMHgmLIGSKALYVARAQKKEERKQYLQR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A0J9X6A7 126 0.250 1.740E-26 103 269 414 230 420 705 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------SNLYIKNLDASTTEQQFQDLFSPYGNLASYTLPLN-EDGTSRGFGFVNFETHDEAVKAIEALNdkEINGKALYVGRAQKKFERDEEIRqqfdmlkirnpplrhapSNNLYIKELDPSVTNDELRQAFAPFGQIVSAKVMadeaGRSREFGFVCFSTPEEAQKAIagMNDTEFKGKKLYVTVAQRRDHRKSPL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 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0.235 5.726E-26 100 261 414 216 410 572 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PDEGKMFVGGLNWETTEDALKQYFAQFGSVIHCTIMRDPTNGRSRGFAFLTFADAAVVNKVMVKEHFLDGKLIDPKRAIPRGSGPVPPGppsapipdrrgpyhqfgsetpaslSNKLFCRGMPDDATPSSFRSYWAQYdsqANIEEAVLMmdrdsNRHRGFGFVNLVTGDDADALLRcGPFVMDGHPLEVKRKAP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_B6K1A4 125 0.260 5.726E-26 102 264 414 5 188 665 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PSSLFVRNLTFSTTSNDLTDFFSNAAPVKHAVVVTDKETGQSKGFGFVTFSLHEDAVRALEELknKKLDGRILRMEFAAPrkrngetsdkpkKPEQVRKDTRPRLIVRNLPWSVkKPKHLEPYFAKFGKVREIKVPtkggGRMCGFAFVWMKDRASAQKAMdtLNATEIDGRVVAVDWAVSKDE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+>UniRef100_A0A7J8RK77 124 0.235 7.711E-26 102 265 414 65 224 256 +------------------------------------------------------------------------------------------------------GRKLVINGISTEMDERILRRHFSAYGEVKHVVV------NVKKAIAFVTFVDPSKAQISLQQQHIILGRKVEVRPAKPKVE----IGKRKIFVGGLPRSITDEEFKGYFEKFGSIVDAVVihdkeTKRSRGFGFVTYEAEESANLVLRtNFHLLNNKRVEVKKVTPRQEM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_UPI0009E60C7F 124 0.285 7.711E-26 104 283 414 12 211 290 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLSRSTTNDGLRAYFDSYGEMSDCVVIVDPQSKESRGFGYVTFVDKNSVIEVLkykkeKGAHTIDEKEVEVKRAIPKddDSPTARLKTKKIFIGGLKDEATSEDIHQALADAvrGTaPNSVDLimkktedgTSKHRGFCFVEFEDEDIVDELcCLKKVNICGKSVEIKKAEPKDkDKGGPGGRGGRGGRGRGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+>UniRef100_A0A0L0SU35 124 0.209 7.711E-26 104 271 414 172 350 386 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFIKNLDPSIDNKALHDTFAAFGKILSCKVAT--RDGQSLGYGFVHYETKEAADAAIQAVNgmLLNDKAVYVGHHVPKKQREAEMavqraKFTNLYVKNLPEDMTEDAFTNMFAEFGPVLSAVIQrddeGKSKGFGFVNYGEHEAAQKAVeeLNEKEIDGKPLYVARAQKKSEREEELRR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A2P2JU60 124 0.272 7.711E-26 95 259 414 74 249 401 +-----------------------------------------------------------------------------------------------VADPDASLRKLFVRGLSPETTSDGLGSIFAPYGELDEAIVIFDKNTGKSKGYGFVTFKHVDGARLALKEPsKKIDGRMTVTQLASAGLSNSGPASDvsmRKIYVGNVPFEITSERLLSSFLVFGEIEEGPLgfdkagPGKTKGFAFFIYKTEEGARAAIAEPLkVIDGHQVLCKLA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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352 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FVGGLAWATDSDALEKAFSLYGDIVDSKIINDRETGRSRGFGFVTFASEQSMKDAIEGMNgqNLDGRNITVNEAQSRGSGGGSRGggggygggggysrggggygggggyggggyggrrdggynrngggyggdrdrgygdggsrysrggdgggyegswrnnicpkflgflllpmaaadvEYRCFVGGLAWATDSDALEKAFSQYGDVVESKIindreTGRSRGFGFVTFSSEQAMKDAIegMNGQNLDGRNITVNEAQSRGSGGGGSRGGGGYGG-GGGYNRGGGGYGGGGGYGGGRREGGYNRNGGGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A7J6PVP3 109 0.239 7.849E-21 101 257 414 155 342 405 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+>UniRef100_A0A0R3XAK3 109 0.206 7.849E-21 104 259 414 237 449 506 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLYIGGLRLSHTESQLRQHFAQYGAVTDCYIVRDCKTDESKGYAFVTFQEAAEASRALADcPHFIEGGPVCVKPSKGKKKEEREEEEEeekeeetaaaastsvakalgftstkkgvvgkkkhknegssndsraevnklRLFVGNLSPSITQQELRQHFSHYGKVTSVDVildreSGKARGIAFVNMSTHVEVEAVLdARPHRLNGESIIVRPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A319E4G4 109 0.159 7.849E-21 103 270 414 231 473 726 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+>UniRef100_A0A7J6P3T6 108 0.209 1.412E-20 105 251 414 596 805 1013 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFIGGLPSLVDRQTLWNYFSQFGQLEEAVVMMDKLTGRSRGFGFITFVNVKDLESCLSypNSHVLLDKTVDVKRAVSQEEIRaqaalrqpvnlggappggvnsvmgvmhhmmaggggqthinnfgptgatgnsnngllPQDNPCKVFCGGLPATVDRERLRQHFVRYGVITDCivkvdRTSGRSRGFGYVTFQTPAEAQAAIQGGVDGQG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UniRef100_UPI000766E13A 108 0.978 1.893E-20 100 190 414 12 102 103 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+>UniRef100_A0A7R9CKM6 102 0.266 1.137E-18 90 249 414 4 141 311 +------------------------------------------------------------------------------------------EREDGGKAEPEHIRKLFIGGLDYRTTDESLKKHFEQWGEIVDVVVMKDPNT---------------------KSLTSEDGEIEEIGRP------EAGATVKKLFVGGLKEDMEEDDMREYFKQFGTVMSVAIvvdkeTGKKRGFGFVEFDDYDPVDKICSRQRWL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A1I8GQH8 102 0.191 1.137E-18 93 255 414 56 280 337 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+>UniRef100_A0A251UDU6 96 0.248 8.924E-17 101 260 414 64 234 632 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------KGVEVFVGGLARSVTEDKVHKVFSTCGEIMDIRLIKD-QTGSLKGFGFVRFTTKDAADKAMKELNesMLEGKKIGV---------LPSASQVTLFIGNLNKGWSNDDFNKAVRQvFPDVVSIDLSQPStggeaggskklknRGFGFVKFSSHAAASRAFrvgSKPGFVLGDTLHptVKWAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_B8BZC4 96 0.238 8.924E-17 80 259 414 629 838 886 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+>UniRef100_A0A7W1ERA7 78 0.337 4.908E-11 104 184 414 2 84 85 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGNLPYTVTSEQLAEIFGESAEVVSANVITDRMNGRSKGFGFVELAESADINAVIEATNgkELDGRAITVSEARPQQPRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A8T7C7E5 78 0.318 4.908E-11 105 191 414 3 89 90 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGNLPFSTTEDQLRELFADYGTVHEIKLVYDRETGQPRGFGFVEMNETDAAAASEAlNGSEVEGRPLRINKAH-KGSQRSPSGRRN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UniRef100_A0A365XUT7 78 0.280 4.908E-11 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+------------------------------------------------------------------------------------------------RRPFNGASRLYVGNLPYTMTTDQLRDHFASFGRITDCIVKADQATGRSRGFGIVEFSEPSAAENSIDRWNNrsLEGRPLVVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A351Y3G0 78 0.367 4.908E-11 103 187 414 10 96 99 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKLFVGGLNRKLRGKDLRDEFSKFGEVAFARVKLEQETNKSKGFGFVEFVNPADAAKAQKAMNgqEIMGRAVKVEFANENPDKIKPL---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_UPI0006EC27B2 78 0.282 4.908E-11 104 193 414 1 92 101 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+>AraplaCL_Col_mCL_1032037.scaffolds.fasta_scaffold76910_1 182 0.278 4.818E-45 83 282 414 1 212 258 +-----------------------------------------------------------------------------------KMDATSQPPSTNGADDSQDPGKMFVGGLSWQTTPEGLREYFGKYGEISDCMVMRDPITKRSRGFGFVTYRDPASVDKVLANgPHEIDTKLVDPKVAFPRRPNAATQPkmitrTKKIFVGGLSSNTTLDDVKAYFQQFGKIEEAMLmfdkaTQRHRGFAFVTFESEDVVDKVCEiHFHEINNKMVECKKAQPKEVMLPQNAIRDGLGFLPAGF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719317_82888 182 0.274 4.818E-45 97 311 414 50 271 349 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453 +---------------------------------------------------------------PTGPTGASTNSSNCNNDTSSHGGSNNSGRSTPSNASDNSPGKLFVGGLSWQTTQEKLRDYFSQFGTVTDVLVMKDPVTQRSRGFGFITFSSPDSVERVLAVPsHSLDGKKIDPKHATPK-SKSKANKTKKIFVGGVSQETSADEVKAYFNQFGKVEEAVMlmdqqTKRHRGFGFVTFEQEEAVDRVCEiHFHTIKNKKVECKKAQPKEAVQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>Q6FJT3 175 0.269 8.770E-43 101 333 414 127 354 513 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ENCKMFIGGLNWETTEDGLREYFSKYGNVVELKIMKDPNTGRSRGFGFLSFDAPSSVDEVVKTQHILDGKVIDPKRAIPREEQD---KTGKIFVGGLGTDVRPKEFEEYFSQWGTIIDAQLmldkdTGRSRGFGFVTYDSPDAAEKVCeSRYREFKGKQIEIKRAEPRHQQKQagQQAVSPPVAGM---------GMNPMSNPMANPMAGMYQNPMMGGFNPM-FNPQAMQDYYQKMQEYY-------------------------------------------------------------------------------- +>W1NYF9 175 0.298 8.770E-43 100 264 414 2 172 527 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+---------------------------------------------------------------------------------------PAAAPTENPNGSTGDEVKLYVGNLDYATDEGRLREEFSQFGTVTEVFLPTERGTSRPRGFGFVTLSTRDAAEKAISKMDqaQLDGRTIRVNESRPKGERRGGMGPGgagsfnaagkeevKLYVGNLSFDTPEQEIRSMFEEFGTVSDCFMPtdrdtGKVRGFCFVTMPAADaEVACAKVNGRELDGRALRVNEAQPR-----GGDRGGRGGGYGGGYGGGGGYGGGGGYGGGGGYGGGDGYGGGGGYGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>B9GNL8 162 0.280 3.793E-38 101 273 414 3 184 306 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DEAKLFVGGISRETSEETLRNYFSKYGVVSHSLTAKDKITKFPRGFGFVVFSDPSSAARALQDNHVILGRTVTsngLGMNSDNSTSAKNNRTKKIFVGGLASSLTEEQFKNYFEQFGRTVDVVVmqdslTNRPRGFGFVTFDSEESVDKVLLiGSHELNGKRVEVKKAVPKDRINGHIVRSG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719154_377482 162 0.311 3.793E-38 104 337 414 12 257 325 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262 414 424 603 1023 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PGKMFVGGLSPETNRDRLKGYFSRFGEVVDCVVMTDATTGRTRGFGFVTFRDGRCCAKVLrERPHIIDGREVDPKMAVPREQMEQHSRSssapaaprgrsaRKVFVGGLPSNATDEALIGFFSNFGEIEEAVVihdkqTRLPRGFGFVTFVSEQVAEHVVsLHYHDLLGKMVEVKRAEPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_4_1057263.scaffolds.fasta_scaffold286794_3 161 0.335 5.141E-38 104 266 414 19 184 189 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGSLSWDTSAEDLKEYFNKFLPVTDATIVKDQATGKSRGFGFVTFESEEGISGVLsDHEHSLGGRTIYPRKANRR----GPEPIKKVFVGGLDPAVSEDEIRAYFGKFGGVENVELPfdkatQKRRGFVFVTFDSEDAADVACkDQKHHIEGKTVDVKKAVPKEQQQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+>KBSMisStandDraft_5_1062788.scaffolds.fasta_scaffold10117283_1 156 0.271 1.969E-36 87 268 414 9 225 315 +---------------------------------------------------------------------------------------SSEAPAPKPVPSNIDQGKIFVGGLSWQTTEESLRWHFEQYGPVVSVEVMRDRVTGDPRGFAFVVFRDGGTVDLVMaEAKHEINHKIVDVKRAQARGVAPPSIHEkrgesqganaeqqsqrtenkptpeqlhNKVFVGGIPPSVDRDELKNIFEQFGPVVDAIVmidqaTNRSRCFGFVTFENgcNGAAASIDAQPLNIQGRHVEVKLATPKAEQRRQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719309_514146 156 0.235 1.969E-36 98 265 414 69 246 322 +--------------------------------------------------------------------------------------------------ESKSMRKLFVGGLNYNTTEDEMRSHFERYGDLVDCVVMKFNDTGRSRGFGFITYETAAQVDECQANrPHVIGGKTLETKRATPRSDAGKPeaqASVKKIFIGGVSDEMDDSDIQDHFENYGKVTNVeqlrwNDTGKKRGFGFVEFDDYDVVDKiVLITRHVVKSRSLEVKKALSKTEM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719376_207595 156 0.274 1.969E-36 91 316 414 65 283 325 +-------------------------------------------------------------------------------------------SGAAVAPGRDDDRKLFVGGLSWDTTEKELREYFTKYGPIESINVKTDPTTGRSRGFAFLVFNSADTIDKIIaETEHNINGKKVDPKKAKAR--------HGKIFVGGLKPELSDEEIKSFFSNYGSIVEIQMPfdkmkNQRKGFCFITFEQESVVADLLKTPkINIGAHQVDLKKATPKPDMMM------MRGGMMGGRGMRGRGGPRGRGRGYGNGGYGGGYGYGGGYGQYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001421459831 156 0.236 1.969E-36 99 326 414 5 279 351 +---------------------------------------------------------------------------------------------------ESNGRKIFIGGTAYMTSEQHLREYFETFGEVEEVVIPCDRYTGRPRGFGFVTFKDAEVTEKVLDNsiQHKIRDKVVEVKRAVPRGSAQHPsfrrknnyhlqrspmrvggmgvrtndgktnindylNNTNKIFVGGLHTSVIGDEFQSHFEKFGKVADAVImydraTGRSRGFGFVTFEEEDGMKAAIdHRPHVLRGKQVEVKMAEPRGKSMGNNKKGGRGGFRRGNGGVRGGAFPSSGVPMIPPASMNGSTNGFPpqfaPIPPYGVQGGMYGGYP--------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0K9RD10 156 0.239 1.969E-36 100 263 414 3 215 380 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PDVGKLFVGGIPRETTDVILRDHFSKYGDVSSSVVAKDRLTGDPRGFGFVTFADPSLVVETLRDQHFISGRAVEVKKARPRFEHQSNTQPqllpqrqqhqqpnhgyshsskgsvrnyingsygannsddslkaKKIFVGGLSADLTEEEFKKYFEKFGKITDVVVMydntnNRPRGFGFITFESEEVVEKLMQQsHHEVGGKRVEVKRAVPRE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1J6KB42 156 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+>UniRef100_A0A2I0VSI8 154 0.257 1.644E-35 88 263 414 1 206 374 +----------------------------------------------------------------------------------------DPSPSSSSRSSMAVPAKIFVGGITKGLEDDALKEYFERYGDVKEVVVVKERATGNVKGYGFVEFVDAEAAERAIneEGQHLIRDKLLEVKRARSRSEERRHYQyachqssvqstnktsndhhnitSKKIFVGGLPSNVTEDEFRNYFEKFGSVNDVVImndseTHRPRGFGFITFDSEEAVQKTMQKrFHELNKKVVEVKIAVPKD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719433_893196|ERR1726785_k119_1233078|-|681|2.751e-195|7|2828|5011|5011[5011]:4859[4859]:153[153]|4514[4514]:4359[4359]:156[156]|4305[4314]:4195[4195]:111[102]|4134[4137]:4033[4033]:102[99]|3966[3966]:3712[3712]:255[255]|3608[3608]:3087[3087]:522[522]|3025[3025]:2828[2828]:198[198] 154 0.300 1.644E-35 96 273 414 36 245 495 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+>ERR1719162_144970 153 0.256 4.081E-35 97 281 414 214 407 417 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DAATEGTRVYVGNLPFDCTQEELMSMFSEYGKVLQCFQPADRETGRPRGFAFIQMVD-EEANAAIEGLNgsMFGGRQLTVNVSLPKGQSANRPKNTKMYVGNLSFNMEEEDVISVFSEYGVVQDCYLPreretGRVRGFAFVTMEAEDALKAeAACDGLEMDGRVLRVNQAQakPKPQRYNDDYSGGGGGGGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UPI00020F3653 153 0.274 4.081E-35 102 272 414 72 244 423 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PRKIFIGGLAHKTTTQFLRDYFSKYGAIVDAVVLRWPD-GRSRGFGYVTFADAQGAWSALQEPHEVGGRPVDVKRAVP--------GTNKLFVGGLPQNTTAAELREHFEAFGIVSDAVVmidpsTNRSRGFGFVCFlpgqEGAASAQFALEQYqnHRIRGKWIEVKSAAPPHKLAKDGSNS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>V9DIT5 153 0.258 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288 +-------------------------------------------------------------------------------------EAPGEDSGPVVPGVSEDDRKLFVGGLPQEAKDLDIKEYFGQYGDIDNINLKTDPHTGRSRGFAFIVFKDTVGLNAAsIQEAHVIKGKKVTCKKAEAKQ--------GKIYVGKLPEEgVTAEDVQAHFAQFGPVAEVVRPidksknDEPKNFCFVTFERE--AKAMVKEGTaTINGHQIDIKKVTPKDNSRGGFGGRGGRGGYGGGYGGYGGGYGDPYGGYGYGAGYGAPQGGYGGAPP--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719481_1927680 145 0.296 9.418E-33 100 315 414 59 275 291 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EDDRKLFVGALPQEAKDTDIKEYFSTFGEIENINLKMDPMTGRSRGFAFILFKEMAGIEAALAESaHVVSGKKVTCKKAEARQ--------GKIFVGKLPPGdaLSKEDIQTHFEQFGSVVEVIRPvdkmknNEPKNFAFITFGSDAAAKQLVKQGeTTINGSTVQIKKVTPKEPMGGGGGWGGPGGFQQGG-GGWGYGDPYAGGYGGYGGYGDPYGGGYGGYGGF-------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_2509928 145 0.300 9.418E-33 100 316 414 23 233 292 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------EQERKLFVGGLNKaSTDEDMLKSYFESYGNIIDCTIMRDTD-RQSRGFGFILFEEAASVDKIMTAKKdgtefSVDEHHIEIKRALPKVPGGNAGTsrtgglNRKIFVGGLPSSITEDELRQHFDQYGRVNEIELLRDRetsrlRGFAFVTFDDEDSADKCIQrRSHEICKKICEVKRAQTRSNLGGREDGQGQQG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740124_843695 145 0.271 1.722E-32 99 275 414 9 202 387 +---------------------------------------------------------------------------------------------------EEQERKLFVGGLNKSrTDEEQLKNFFEQYGSFVDCTIMRDTE-RQSRGFGFVLFEDSTSVDKIINtrrdgTDFSIDDHNIEVKRALPKvpngsaSSSRTSGLSRKVFVGGLPSSVVEDDLRSHFEVFGRVNEIELlrdreTNRLRGFAFITFDDEDCADKVVQrRSHEICKKICEVKRAQTRSNVGRDGESGGGF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719266_422656 145 0.300 1.722E-32 81 316 414 2 239 413 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+>HubBroStandDraft_1064217.scaffolds.fasta_scaffold3483689_1 144 0.271 3.147E-32 98 262 414 14 189 191 +--------------------------------------------------------------------------------------------------ETDKGKKLFVAGVSWNTTDDGFLNFFARFGDIHEALVMREKN-GRSRGFGFVTYKDLSIAEKvkaaAQSHQLTLDGQKLDIMEAIPKEEmlSSSKPLPKKIYVAGVAWNTTDDQLAEFFSRYGAVTTAqiqrdRVSGRSRGFGFVTFEDASSAEKVLAEPsVTFDGRRLEIKAAVPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712071_276246 144 0.267 3.147E-32 117 280 414 1 174 193 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+--------------------------LLTTVQAQFPGALGLRYRGPSGKAWRGIKLLDEMLHPPEDGWSDRTYIVTLPKSATNDSGPKEVASSKPVFVGSSEPKDLIVLGLSFAATGDEVRTYFEQYGELELCEVKKDKNTGRSKGFGFIKYK--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1700735_3150149 133 0.646 1.050E-28 128 257 414 0 132 134 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EILMAQVKKDPKSGLSKGFGFIRFGDYETQMKVIAKRHCIDGRWCDVRIPLSKEGGfdyQKSEFNRKIFVGRLTDDMSTDDLREYFSKYGEVSDVFIPKPFRAFAFVTFYDSDIAQGLCGEDHILKGISVHVS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>LakMenE18May11ns_1017448.scaffolds.fasta_scaffold5757545_1 133 0.328 1.050E-28 131 265 414 1 140 167 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TDCVLMRDRNTNRSRGFGFVTYASEADTKAVLSSVLELSGRKLDAKEAVPRgrdasaggpANEDAPENSKKIFVGAIAQGTSEEEFTQYFQKYGEITDSVImidkhTGRSRGFGFVTFAEASSVSSVLeHNEHELNGKRLDCKKATPREATRAPQ-RGGGYDGYGGGYNAYGGGGGYRNGGGGWGGGGYSGGGYSGG------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719160_1959430 133 0.235 1.050E-28 91 258 414 63 249 270 +-------------------------------------------------------------------------------------------PAGAPVQAGAEDPKVFVGAIPRNVTSKMLNDYFKEFGQIIKAEVSVDKDTGASKGFGFVHFATIEGMKKCLdKEEHVLEGKKFEVRQFGDRTRAAAGNKPDKqttdkdrkrrtIFVGGLPRSCDGDRLFSHFSRFGTVVKTDVlmdqtTGISRGFGFVEFAEESGVDAALkqSNSHQIEGKYFDVKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719161_270290 133 0.322 1.050E-28 102 254 414 18 171 297 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+>SaaInl3SG_22_DNA_1037383.scaffolds.fasta_scaffold254520_1 133 0.255 1.050E-28 94 268 414 184 370 388 +----------------------------------------------------------------------------------------------KKQSQRDDKNKLFVGNVPFKATAEELKDVFSQFGQILDVFIPRDSI-GEPRGFAFVTCAEADvDAVRIGANGLEFMGRSLSVNIPlapgekSEKKTKTEKPRRRKLYVGNLAFFTNEETLTEVFEEFGQVYDCYIPqdperGGSRGFGFITMEDAAAIEAIdALDGCELEGRIIAVNEAQIRRKNSKE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711988_1135292 133 0.294 1.050E-28 98 243 414 124 279 466 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1.417E-28 104 249 414 17 179 181 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGGVSPSTTNDSLRDHFSRFGPIDDAVVMRD------RGFGFVTFSNQAAADAALADPkQYVDGSNVDVKPATGKgrdgggggggggkggGKGGPGGPTDKVFVGGLPQDCADDKVRDYFGVYGNIVDAVVmkdreTGRSRGFGFVQFDNNNSVDKVMAeyNNHKI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1739848_189371 133 0.288 1.417E-28 94 246 414 33 195 201 +----------------------------------------------------------------------------------------------KENSEPEQKRKLFIGGLSYLTDDKMLFDHFSKYGELTDCVVMKDPRTKRSRGFGFVCFEKAEMLERCMAdRPHSLNGRPVEPKRAVSRLESAKPGANRSVtklhCAWNPPDELKAKDFREYFSKYGNIKEVEIPknkdtGEAKHFAFITFDDYDIVDKIIACG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001453536433 133 0.241 1.417E-28 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+>ERR1740124_341203 133 0.193 1.417E-28 100 262 414 48 238 245 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EEGRKVFIGNLPVSVTEADLKQVFDRYGTMTACYIPMNRLSGESRDFGFVVYQHAQSARDAIDAMQGysLNGQELHVTAAHPRRERRRsrsvwssprsskssdygefDLKGRKLFIGNISEKTTEADLEEAFGEFGEIEKCYIPSDWQGkykknFAFLIFEQRKAARRAvrLRNGVEFQGKVISVTFAKAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719204_190120 133 0.264 1.417E-28 92 316 414 15 231 263 +--------------------------------------------------------------------------------------------AAEVNPIPEDARKLFVGGLAQEARETEIKEYFSTFGEIDMITLKTDPHTNRSRGFAFLVFKDPSSLSAITEsDDHVVMGKKVSCKKAETKQ--------GKIYIGKLPAEgLSNEDIQAHFNNYGSVAEVVRPVDktnndtPKNFAFVTFEKEEVARQMVKEGTTnINGNEIEIRRVTQRD---------GGRGGMRGGYGGGYGGYGGGYGGDPYAMYGGYGYGDPYGYGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719282_269622 133 0.236 1.417E-28 96 268 414 61 262 306 +------------------------------------------------------------------------------------------------KEDSTHHHNIFVGDLSSDVTNDLLKKAFDPFGTVTDARVMWDHSTGRSRGYGFVAFLEKAEADRAIAEMDgkWLGSRTIRCNWANQKASSRSPAPshstsqttaprrstnfeeiamqspasNSTIYVGNLPANTPESAVRTSFQNYGTIQEVRI-QPGRCFGFVKFQNHDQATNAIigSYDMTLGGQPIRCSWGKQKTSQEHQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A1W0X9W2 133 0.331 1.417E-28 98 261 414 16 184 361 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EEHDKRDAFVGGLSPDTTEADLNAYFSQFGPVLHSVVKRDLTTGLSRGFGFVTFADAIGLNKISSvAIHTLKGKKIDAKAAVRK---HGKDVVMKIFVGGVDTAMNEDDIKAYFSRFGKVTAIQWPkdrlrdGAKKNFVFVEFDDANVVETLVKTPkHTIGSRLCDVRKAVP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712150_35578 133 0.238 1.417E-28 104 262 414 152 322 377 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KMYIRGLPWRATEDEVREYFSTCGEIISIEMPI-MDDGRSSGTAIINFKTKQACEICLElNGSDFNGRWLNIKYStpkpiwSPRQPSQKADGCTTVFVGNLSFQIDEDTLREAFGECGEITQVRFaedreTGQFKGFGHIEFANTESTDLAVkMTGTDIMGRPVRVDFANPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>G3WD81 133 0.227 1.417E-28 103 265 414 62 245 482 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNIYVKNFEEDVDDQCLEELFSEFGKTLSVKVMVD-ENGHSRGFGFVNFEKHEEAQKAVNSMNGkaLGGRVLYVGRAQKRTERQGELKRRfeqmkqervnryqgvNLYVKNLDDVIDDEKLRKEFSPYGVITSAKVMtegGHSKGFGFVCFSSPEEATKAVteMNGRIVSTKPLYVALAQRKEER---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------DDTNLYVGNLPTSVTSHKLIELFLPFGRIVRSKVADDRFTGLSQGYGFVKYAEPRSATAAIERMNGrlVDGKTLEVRVAGPPTSvfypsmqavseacslPSKEVDPCRLYVCNLPLSMDTLKLLEHFLPFGKVTDIKVPRDqatglSKGYGFVKYSDSHHAAQAItnLNGFLVEGKKIDVRVAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A087SN82 131 0.315 6.323E-28 111 255 414 682 826 1603 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------SRRCRNEKLRYYFENFGVVQEAFVSYDRHTGRPRGFGFVVFADPAVADRVVSQTHTIDRREVEAKKALPKEDSP-------VFVGGLAASVDEAAFRAFFSTYGAVEDAVVMydhenRRPRGFGFVTYADEASVDRLLADGplHAVQGKPVE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719186_1889571 130 0.295 8.526E-28 102 234 414 10 158 161 +------------------------------------------------------------------------------------------------------GFKLFCGGLDRQTDDTDLKKYFKKYGVLTDYVVMKYPNspTRQSRGFGFVTFEKEEDMEKALEEiPHTILGKEIDVKRATPKEEGKDEGACgdpeakvmRKLFIGGLDQSTSDDSIKSYFEQYGDLEDFVVMkfpdsGKSRGFGFVVFE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_988541 130 0.291 8.526E-28 120 296 414 2 185 192 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KEYFGSFGKLVDCILMRD-ADGVCRGFGFVTYQDQSAYDAVFQAELQLRGSKLDARKAVPMNEVRESKSGVKVFVGGLVPDVDKQKLEEFFSQYGAIDDAIVmmdsaTGKSRGFGFVTFAEPSSVDELLLTPkFEFYGKQIECKRAQPSATLNrlRRSRGGARGGRGRGGYGGQFGGGGAFGQPP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0T6BBU3 130 0.262 8.526E-28 101 255 414 42 197 250 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92 273 414 35 265 342 +--------------------------------------------------------------------------------------------ATDLEDMAHEAGKLFLGGLPQTISTPVIEEYFSQFGTIIDAVVM------AGRGFGFVTFDTYETAKDALQYQHVLEGRTIDVKLAVPDHNKGGGKGGGfqqmmrpephvvaggsfvpfhaptkgppcggkgsgggkggplgrgttdKIFIGGLPLDVTDDTIIEYFEAYGTLIDAVVmkdkaTQKPRGFGFVQFDNTDSADRVMDdfSTHQIGGKWVECKRAMPQDKSSGFPKGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000205091045 130 0.261 8.526E-28 100 258 414 28 195 360 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PEYYRIFVGGLSYEVDNNKLKDTFTSFGNLKKALVIRDQRTGQSKGYGFVAFSDLASFQSAMDTDIFINGRRADCHQVLTKgalKELEQRDFSNKIFVGGISQSTQNSDLQKYFSKFGAIKESRIlydgkSGKSRGFAFVLFQNTGALNKVLEiNEHKLKGKVIEVKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712137_175394 130 0.223 8.526E-28 103 262 414 21 217 387 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKVFIGGLPQTVDTQKLYSYFSQFGPILSAEVAMDKVTGNSKGYGFILFQTTDAITKVLAhyNDHTFDGKWVEVrqfgDKALDRKGGKGPGDCavmtaaalaalgcgipgglssgkeKTLFIGGLPRSVGDKRLKTHFEQFGNVLRADVkvdkeTGQSRGFGFVGFQNDADVDSVLQKReaSRIDGKWIDVKRFGDK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550534_1529397 130 0.240 8.526E-28 105 260 414 19 209 457 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344 494 +---------------------------------------------------------------------------------KRKLDESEV---DIIEGEHIELRRLYIGSLTQTTTEEDVEEYFKQYGKIIDCKLQKFKDTGKSKGMAFITFSEAKTVDAIQANrPHKLNDKKIDSRRPAPpgidPRDPEASAETCKLWVGGCDESISDEHLKEHFEKYGNVVEVEQMldssGKKRGFAFVEYDNSDCVDKiVLMSKQIVNGRSLLIKKGLNKEE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_221076 130 0.265 8.526E-28 104 260 414 10 175 506 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGGLTIETTETEILNHFSKFGFVFDILIIRNRETSISKGYGFISCNNVNTYQRILSTEHVIDGRVIDCHDSFKKNEEPEKFKdnaNKKIFVGGLSLETTDQDLTDYFSQFGSIRQAYvikdpVSRRSKKFGFAIMKTQESVDQVLDTTvHVIRGIPVSCKLFV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5436190_9622914 130 0.293 1.150E-27 114 240 414 0 127 128 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0.263 1.150E-27 102 259 414 14 178 213 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PAKLYVYNLSWETDGPALRKLFEQFGPVTDARIVKNRYTGRSKGFGFVDFES-DDIESCV-GEHQLDSRTIVARISDESLRSSAPSASlTECYIDRLQSETTQEDVREYFSQYGEILFVRLHNRPvesgeslHKYGFVEFTEASAAAQVCTEGnHEVSGNQVTVQPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719189_2506050 130 0.282 1.150E-27 104 233 414 96 233 234 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFIGGLSQQTNNDILRNYFTKIGPVKEGFVKLDPITQRSRGFGFVTFHDPNDAQKAIDNgPHELDGKYLDVKQALPHNLTQDPsytAATKKVYVGGLPQSVDTAALGQYFAQHGPLEHAMVMhdqsGVSRGFGYVTF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>T1GPS9 130 0.601 1.150E-27 132 264 414 1 132 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+>ERR1719473_850883 129 0.295 2.089E-27 105 243 414 22 170 173 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVGKLPPSASETDLKNYFSNFGTVNKAAIKRDTWTNESRGFGFVEFSCAAEAEAALSiTEHKLNGSAIGLRRAedrrvTPGTTAPAIVDKKRLWVGALPDEASENDIQEYFSQFGTVERCelktDVDGKSKGFAFISFADEQEAKAAL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719450_652639 129 0.372 2.089E-27 134 270 414 2 133 214 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VKYDPSTKKSKGFGFIRFEDADAALHVVKSDHFIMGRRCEVRLPKRK-----DDTPMKLFVGRLPERTQQEDLQKYFSEFGGLVDVYVPAPFRGFGFVTFASTGVARHVLNQSHMIQGSHINVTYAEPKKQNGEQAQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712147_37937 129 0.203 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+MADYIMVCGEEFGDCAEIAVESNGTVHLPNISALFPGTTGLKYRNPSNQAWRLVKVMNNSLQRPQEGWLHIPYQCIRPEDNMQGPEKRKAQWEGQGAGEPWPKRNfnrgwegagnrnngpgphghgphgpgpmgsgrcdacgsmlpdmangtgpgsgtwcIFVYNLEPEAEDTMLWKMFGPFGAVQNVKVFIDKESQKCKGFGFVNMTHYQEAVTAIENLNGM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1U7Y9S7 129 0.269 2.089E-27 103 262 414 101 271 401 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKIFIYGLARETTRQTLISVFEQFGEVEECNVVMDHNTGKAKGYAFVVFKSRKSADKALKKPQMtINGRVATCKLAAVKDtavNGTMEFGNRKIYVSNVPRDVAPEKLRLFFENFGEIEAGPMgfdptTGKSKGYALFLYKTVEEAKRCLEEPcKVFDGRKLYCKKaAEPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719223_167917 129 0.241 2.089E-27 101 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198 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QQLREHFARYGPIVDAVVLR-WSDGRSRGFGYITFADASAASAVLLEEHNIAGRMVEVKQAVP--------GTNKLFVGGLPQNTTATDLREYFEAFGAVSAAIVlkdpaTGRSRGFGFVCFMPGQSGIAAVQaslhqyQNHRIRGKWIEIKRAVSPD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712168_150350 129 0.267 2.816E-27 102 273 414 2 184 246 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SCKIIIRNLSYDTAEEDVKTYYEKWGTVEDIKLMKNKGTGKSKGWAILRYVKASEVDACMsARPHEIDGRTLEPHRASPREYSQKvecHHTCNEIFVGKWVPEITEEDLREYFGQYGNIEEVTFPKdkkdetKFRNFAVIKFDDYDPVDVCCyKKMHRIKDKPLIITKWIDRKTMNELQRKFG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719273_1561459 129 0.230 2.816E-27 98 271 414 54 247 253 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+>ERR1719433_2024449 126 0.269 1.686E-26 101 262 414 108 289 526 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EERKLFLGGLAPETVEKDLRKHFIQFGQIVDVQVMRDREAGVSRGFAFVTFACSFMAEAAMEhKEHLISNRLITPQFATQDVPRykktkveldatldKECENKRSIFVGALKETISEDDLVRYFSGFGRVVRAckctdPETGELRRFGFVDFADYGVVRKVMNiTKHYIKGKRIKVDLSRPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0E9NPU7 126 0.211 1.686E-26 92 269 414 22 238 700 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414 0 127 129 +----------------------------------FPGALGLKYRSPSGNAWRGVRLAEGILHPPTGGWASTTYIITMPKtdsSVKRKMEDGSSREPeaklvKTINSEYANRQDMIVLGLSFHATEEDMKNYFEQFGEVSLAEVKKDMTTGKSRGFGFVRFAD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MedtruStandDraft_1076414.scaffolds.fasta_scaffold355795_1 126 0.401 2.271E-26 102 218 414 6 127 156 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SRKIFVGGLSWDTTHDSLLKYFSRYGEVIDCVVMKNQATGKSRGFGFIKYRDANHVNKVMAsGPHILDGREVDPKVCNPrhlnKGSKSNENRHRKVFVGGLPTDCNEDQLKEVFGEYGKVSS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ADurb_Val_03_Slu_FD_contig_121_45458_length_236_multi_1_in_0_out_0_2 126 0.246 2.271E-26 104 228 414 29 158 162 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLSWETPQEEIKQHFAAWGNVMDVMVPKDRETGRSRGFCFVTFDSVQAADQSLGAEHELGGRRLNVNPAVAEAVAVDSAPTKRLYIGDLLTSTTDEELKAAFAAFGALEDAVIMRhpdsnESRGY----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719171_272386 126 0.257 2.271E-26 107 245 414 0 158 164 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2 173 205 +-------------------------------------------------------------------------------------------------PQDTSMTNLIINYLPQSMTDKKLHQMFTQIGQIEACRVMKDVKTGYSFGFGFVNFVRPEDASKAIEVMNGLqvENKRLKVSYARP---AGEDIKDTNLYVQNLPRSITERELEDLFAPYGQIVQKNILKDkysglPRGVAFVRYNKKEDAQKAIiqLNGVLLEGCTehLSVKIAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719330_501004 126 0.272 2.271E-26 101 260 414 7 181 213 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PPEKLFIARLPRAATEATVKAHFEQFGPVLKVELKM-GDDGLSKGFGFVTFQSASSAAKVVENysDNRFEGRWIACEQCVPQDGSTGGPPrsdpltaPERIFLGNLPRDVTEEGIRGVLEEYGKVADVDLKydpddGAFRGFGFVTFESKEVAELVLehHNRFVLGGRTIHCRRSQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000010478616 126 0.284 2.271E-26 105 263 414 0 168 263 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414 0 145 146 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FIGGISPSTTSEAIRTHFGKYGPISDAVVMRD------RGFGFVTFETQAGADAAIAQPqQTVDGQSVDVKMAVGKGSGRGGGGsdtgsggsgsaPHKVFVGGLPQDCGDDKIRSYFESYGKIVDAVAMkdrenGRSRGFGFVQFDNQSSVD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719373_458131 126 0.246 3.060E-26 105 243 414 8 149 159 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYVGNLSYDVTQENLSEIFSEYGFVKRVYLPTDRDTGRIRGFAFVEMQNNADETQAIEALNgaEYMGKTLKVNKAKPNSE----MATGSIYVGNLSYDVTQENLSEIFSEYGSVKRVYLPtdrdtGRIRGFAFVEMQNNADETQAI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719427_143101 126 0.281 3.060E-26 104 235 414 19 178 180 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGGLNYSSQDSDLQKYFSKFGPLTDYVVIKTPNEGRSRGFGFVCFENESDLEEVMrTKNHTIDDRNVDIKRATPREETDRSDRFggggkrkydggnaggnmddklmRKLFVGGLSYNTSQEGMADYFKQFGDLDDCVIMkfpdsGRSKGFGFIVFAS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712126_421017 126 0.301 3.060E-26 123 281 414 0 155 185 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGKYGEVENVNLKKDPYTQKSRGFAFVLFKGSEALDKVLDGSaHAIKGKKIDTKKAKVR--------SGKIFVGGLSSEMSDDDIKNHFAQHGKITEVEMPfdktkNQRKGFCFITFEHEDMMKEVLKEPkQTICGKQVDVKKATPRPE--GGAGGFGMMGGMRGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712168_1165441 126 0.303 3.060E-26 139 282 414 3 157 194 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NTKKSRGFGFITYSEPEMVDDAQnARPHVINGREVEPKRAVPREESGKPeahVTSKKIFVGGIKDGLEEEDVRDYFSQYGNVESVEImvekdnPSKKRGFAFVTFDDYDPADKcVLLKHHHIKEFRCDVKKAISKKEMENLPQKGDRMGGRGGDR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000962780024 126 0.300 3.060E-26 102 273 414 17 195 196 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PSQIFVGGLPEKTTEEVLHKYFSTFGHLTECRIVINHETQQSKGFAFVSYFDPKVAEKVLSQkTHKLLKKSITLKAAQSKEDAQASLQeesSRRMFVGNIPFQAKESEVRKLFSKYGEVEKVDLKPQS-GHGIVTFKDRMSVIKLLQPEVPIEivysGNTLECRLYTLQPKTRSNMSQKG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_30_1057271.scaffolds.fasta_scaffold87888_2 126 0.254 3.060E-26 101 273 414 1 181 215 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PATKYFLGNLPDDVSEDELKQYFASFGVVEQVDIVRDKMTGNSRNFGFLHMADDSAGDRLIGEEHSVKGHGVRVRPYNkpPTSGSSEDADPKKIHVGNMDHSISIEECKEVFAQFGSVMDVYMPKGPEGnrmsYAFVLFDNEVARDKAINAGsVTIRGFNLPLKPAAPqKKGMAKGAGKGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000228692854 126 0.308 3.060E-26 100 264 414 1 175 229 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EESITLFVGGLSQAITEDDLQEYFILYSTVLSATLVKDPRSGESKGFGFVTISSASAAYALVKMKNFICGRRVECQLASSRGEKkqcKEHMKRRKLFISNIPVGATNDELDELFSQFGLTHNSYIIQQvgsliNQPYGFVEYEDPEDAQKLLIQnpLLSLRGSTLRISGYLDKDQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719456_534865 126 0.254 3.060E-26 105 258 414 46 214 259 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFAGGLPTDLAQEDITKYFEQFGALEAVDRKINLATGESKGFAFVKYKEEAGLEACLAhESHYINEKWIDVKRyeknvagAVAAKGGKGHVGAPKLFVGGLANTVGDADLNGYFSQYGTVVEAevrmdHVTGNSKGFGFVVFDSVDTAQKvyAMYDQHSIHEKWVEVKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719412_1831008 126 0.256 3.060E-26 116 339 414 2 231 285 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EGKIREHFGQFGEIETVTLKTDMATGRSRGFCFVVYKSTESLNKAVSTEHNISGKKVAVKKAQAKQ--------GKVYIGKLPADVSDDEIKNHMATFGTIANIEQPfdkmkSERKNFCFITYEREDVAKKLLKEGtVYINGHEMEVKKVTPKPQFPGGMDPSQMYmmgGGGRGGYGggpgqWGGPGGQWGGGYGGYDGGYGGGDGGYGAWGGYGGGYGGYGGGYPAGPGGKTPRGMP-------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711937_710351 126 0.287 3.060E-26 104 283 414 78 254 293 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KMFVGGLAQDTNTASLWAYFETFGKLQDVDIKTDPYTGASRGFGFILFEEASSVEKvVVGGPHNLDGKRIDPKNA---------SKNSKIFVGGLKNETTDEDVRKYFEdNFGAIETFergldRNTQMGKPFAFITMKDENIATAICkSKWHTIDNKQVECKTAV--DNYQYKSQQAMHYGGGYGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719491_2336105 126 0.262 3.060E-26 89 280 414 80 268 429 +-----------------------------------------------------------------------------------------EDPDAGITRDRKGGFKYFVPGLPDGVVDEDLREHFSKYGAVIDAAVVTEKGTNASRGFGYVTMRDAESRDDLLNDKHVLGGKEINVLLTKDSLSG----SVKKVHLGNLREDISAEAIREVFSRFGQILDVHTPksqrdGKRQNFGFVTFGNDEAFRAALREGTaVVDDCRIKIKPA-----AQTQEGGGGKGGGDPG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719471_1661543 126 0.303 3.060E-26 103 261 414 191 353 507 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RSIFVGALRDSTSEEDLEQYFSGFGRVVRACKCTDPETGELRRFGFVDFADYGVVRKVMNiTKHYIKGKRIKVDLSRPRIEFSH--QTKTVYVGGLEDGIDDPELHTYFSEFGFVTRAlRIPnkdGPKEKFGFVDFDDYDAVDMVItQREHYICGHKVKVELALP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719174_404828 125 0.330 4.121E-26 111 246 414 0 141 145 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------PFEAEDEELRHHFGAYGEILEVSVVKDFATGGSRGFGFVTFRDGNVKDAVLNAKHEIRGKEISVRVDGKSKGAADiiSQDQRKVFVGNLSPQIDSEVLRETFSQFGTVLEVHMPKDDQGlrkkFCFVTFAGVDGYQRCLSQG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>NGEPerStandDraft_6_1074524.scaffolds.fasta_scaffold204611_2 125 0.276 4.121E-26 100 222 414 10 139 149 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EPSRKLFVGGLAPATDTKSLEAHFSQYGEIVDAVVMVDKDTNRSRGFGFVTFRDFDAVNACLDKPNNVDGKDVQCKKAVRDPPRQIEQDSRggtynslKLFVGGLPATCDYDKLTEYFGRFGKIEDAVVM----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_604530 125 0.245 4.121E-26 94 237 414 0 158 161 +----------------------------------------------------------------------------------------------KGGKGGPRPHSVFVAGLSRDITKEELREHFEQVGEVVDAFISMDRETGQSRGFGKVAFATSSGQQLAIDNLNgsEIRGRSISVRLDDPDAPRvggksgksKGANAGHSVFVAGLSFSTDADTLRAHFGTAGEVVDAYVvvhreTGQSRGFGKVAFSTPE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_723749 125 0.355 4.121E-26 3 162 414 2 162 163 +---YIQVVKsEEANDVIELPLEDDQTLDMATLTSQFPNAIGLKYK-SDSGAWRGLKVNGSTITHPGKNWSEYIKYIVTYNENKRKADEDGNGSELRAKRlaAAAQPSDLVVLNMPYDITEDDMRTYFDKYGELSFVQLKKKPD-GTSRGYGFIRYVNFNDQKTACQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719464_1014997 125 0.269 4.121E-26 129 262 414 0 154 165 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VTDVFLPSDRMSGRPRGFGFVTFASRSDAETAISKMDQtdLDGRTIKVNESRPKGEGGPRRSSGggggfnpdgkeevKLYVGNLSFDTEEQTIRDFFGQYGSVSDCFMPtdrdsGRPRGFAFVTMP-AADAQAAIeqANGYELEGRNIRVNESRPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_332886 125 0.274 4.121E-26 120 296 414 0 196 205 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGYFSKYGEIVDCIVMRDSQTRRSRGFGFVAFDRSTCVDQLQnERPHRLDGKEVDTKRVVPKQASTSQSRSdreqkvNKVFLGGLKDEITDEDIKQFFTQFGVVERLetftdKETNRRKGFAFVTFQDFDAADKCVLHAQTspdgkmnLQGYKVEVKMAKSQDEMkGGRGGGGGGGGGGRGGFGGGRGGGFGDFNQG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_858916 125 0.333 4.121E-26 107 261 414 0 163 226 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGGLAPEVDDDDLAQHFRQYGELKEAAVIRDRETGDSRKFGFVMLKSSEKEGQVLSDSHSIRGRRVSVKLhqdaassaSDHKDNGRSDSEVTKVFIGRLDPDFTKDLLRDKFSdKFGHVTEIFLASTNK-FGFITFESGSAARKALdAKSIDIDGKSVIIKEAEP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719471_11127 125 0.344 4.121E-26 98 283 414 48 228 233 +--------------------------------------------------------------------------------------------------DPESPIDLILLGLSPATTELTVRDYFEKHGEVRMVEMKRSKDANV--GYAFIRFEDKAVERQMLKEKHCIEGRQAYLKVP---NSQTGERHERKVYVSFHTQDITVEDLRNHFETFGEVEDVFIPQPFKHYGFVTFSEKRVAQALIGKEHMLKGVSLFIKPLHNHKDKEKNMMEGMRMRQMMGGMG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719318_1829923 125 0.245 4.121E-26 97 283 414 31 234 237 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RETEGMRKLFVGGLKRETNEGTMRSHFSPYGEIVDLVIIKDNTTFTSRGFGFVTFALSNSVEECFNNrPHSIDGKEVEIKRAMPREfnSAGAHARTKRLFIGgfkGLTPDLQASEIQDYIasrhANIGSIETIDLirdkeTGISKGFGFLDCSSEDFADRLAisESASTLRGRSLSIKKAEQKDGSSNRGGARGGRGTMRGGRG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719221_433962 125 0.229 4.121E-26 117 261 414 5 187 246 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ETLSQYFTKYGVVTHAEVKTDLVTGRTRGFGFVQFDGVEAVERAISNysDHAIEGKWIEVKKAVPQGfntaeratappvraapivaqaampcmaalPTSSRQESDKIFVGGLPQNSTAETLAQYFGKYGNVVGAEVkadqmTGRTRGFGFVQFDSAEAVDGVLAHYasHVLDGKWIEVKRAAP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719510_2246056 125 0.280 4.121E-26 116 313 414 2 200 251 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DNDIKAHFGQFGTIESVNLKTDATTNRSRGFAFVVFTETEGVDKAVaAATHNIQGKDVAVKKAQAKQ--------GKVYVGKLKAELTDEEIKTHFEQCGQIAQVEQPfdktkNERKNFCFITFEKEDSAKQLLKvGSTVVNGVELEVKKVTPKPDPRTMGMMGMGRGGRGgfGGYDFYGGYGGYGGYGGYGGGGWGYGGGFDGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719510_556199 125 0.250 4.121E-26 110 337 414 0 223 278 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LPQDAKQEDISVHFQTFGEIDNINIKTDPATGRSRGFAFVIFKAVEGVDAAVAvETHTIKTKKVAVKKAQAKQ--------GKIYVGKLSAELSDDEIKNHFASFGTIAAIkqpfdKIKNERKNFCFITFEKEDVAKKLLKEGtVYINGHELDVKRVTQKADPRQMMMGGGPM-GYPGPYG--PPMRGGRGGGPGWGASYGPPAGQWGGQGGYGQGDYGWGAPAGGYGDYYGGYG---------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719215_148723 125 0.281 4.121E-26 96 268 414 85 256 301 +------------------------------------------------------------------------------------------------KHMGSSARKMFVGGLAHETTTANLWEYFEQFGEMEDVDIKCDVYTGASRGFGFILFKDAASVEKVKAQDaHNLDGKRIDPK---------GASKNSKIFVGGLKPETDDEVIKTFFtELYGEIASFERgvdkhTEMPRPFAFMTLKDEDNAAKCVkEKWHTIDDKQVECKSAVDNYQYKQQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MDTA01.2.fsa_nt_gb|MDTA01162613.1|_3 125 0.258 4.121E-26 102 263 414 54 219 333 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+>VirMetMinimDraft_7_1064189.scaffolds.fasta_scaffold607942_1 123 0.258 3.305E-25 100 264 414 17 188 279 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QQSVKLFVGGLIGDMIKDTLAEYFSRFAQVVDSFVVYERH--KPAGFGFITTKNAKDAETILNATHTLNNSILDVKPALDRiqaRDKEESDRRRKIFVGGLPKNFPDEQLKVFFEKCGPVQKSYVvkdpmTGKTRGFGFVIFSTDEGYYKSLENPnLIIGGSEAHVKPATAKQE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A164ZUI0 123 0.276 3.305E-25 140 316 414 1 192 322 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------ESPQLRKMFVGNLAYECNVELLRDYFSKFGNIEDCNVPQDSRTRLSKGFGFVTFRRVASIDEVMcTRPHKLEGRVLEPRRSLRREVADDPtanASTTKLYIGPLHHSITERELENYFSEHGKILEISL-KSGKDHAFITFDDFDPIDKLVnMKRHRIvQGFPCAIaKKALTRRVIEEAERR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>RhiMetStandDraft_4_1073278.scaffolds.fasta_scaffold8045439_1 123 0.248 3.305E-25 103 260 414 99 271 380 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RNVFVHGFSWDTTRQDLASAFAPFGEIEECNVVIDKATGKAKGYGFVLFKSRKAAISALKETKrMVNDRMASCQLASVGSANAAsaakgkelEGGVRKIFVSNVGMSTDKEKLRAFFEKFGEIENGPIgfdkeTGKSRGYALFVYKTVEGAIKALEEPHKIfEGQQLRCSVAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550532_3578165 123 0.237 3.305E-25 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4.448E-25 105 254 414 12 199 200 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVGNLSLYTTGEKLKHFFSKHGEVENVRIMIHSETRRSRRFGFISFKNESSVTSVLQcqgnQKFQLDGKTLDVKHAFKRSDEEGGVQPvqktkkpfvprnvfeqyklsgsnqntdhAKIFVGGLAQNATEDDVRAYFSTYGEIRKINLvidkdTKGSKGFCFVVFSNEISAAAACMtKNHIIKDKRV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719221_302663 122 0.297 4.448E-25 123 314 414 0 193 210 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FEQFGEVRDAVVKIDQQTGQSRGFGFVMFVNEASIDAVVQQHaHELDGKKIDPKKAERR--------DGKMFVGGVKADTPDQSIKDYFGQFGEVETVDRPVDkstsvNKSFCFVTFKKDGVMKHAVkARYHEIDGKRCECKEGVPKAQIGGGQGggwGGNGYGGDQGGWGGHQGGGRGGYGGGYGGNDGGYGGGRGGGRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712121_505043 122 0.267 4.448E-25 115 314 414 0 212 239 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TDDAFRNHFSQYGEITDCIIIKEKEGGASKGFGFVTFTDVKSVEDSFAArPHTVDGKEVEVKRAMPKddQSNTKNEKTKRVFIGGISEDDTPEEIKEYIMKkhgteFGHVEEVDIlkdnaTQKNKKFGFINCSSEDFADRLAICERRCEGKSWNMQKAEPKDGAGRTRGGGRGRGGSRGRGGGGAYNQYSGGYDSWGGGYDGYGAGQYGGYGA--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719203_964674 122 0.245 4.448E-25 101 276 414 33 206 305 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MPKKIFVGGVPKHLSNEEFDKYFKAFGETVDCQLMRRHGESQNRGFGFIKYKDDEIATKVVGDDHQLDGNHLTVNYAKVPLKDD----SKRFYVGKIDEDsIKDTDLEEHFGAYGEITDKFIM-KTKGFGFVAISNVDAskLDKVLTDSHVVNGITLQVERAKPKPDSRDRRGRRDSYG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0V1EXC6 122 0.323 4.448E-25 86 216 414 3 135 316 +--------------------------------------------------------------------------------------ENLSSPASETVEAIEDPGKMFIGGLSWQTSVDSLRQYFMQFGEVTESVVMRDPNTKKARGFGFIKFADAASVDKVLNhQAHELDGKKIDPKVAFPKRIQPKmVTRTKKIFVGGLSASTTLEDMKNYFTQYGRV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712137_1361001 122 0.255 4.448E-25 101 267 414 13 182 368 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DLCNVFVKYLPHHFAEKELQELFQEFGDIQSVKVMVDPQTGSSLGYGFVRFAKPEQAQAAIDNLSrkKIGDRTLLCKLS------NQTTKNAILFVKPLKENTTEDTLKTMFTSFGEVIECKVSLDKKstsnqCVGFVRFVHRASAESAIqaMNGIKTEGETLTVRFADTPQQKPR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719424_959410 122 0.264 4.448E-25 104 234 414 283 437 438 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+>APCry1669192319_1035405.scaffolds.fasta_scaffold75979_1 121 0.205 8.055E-25 97 271 414 196 394 605 +-------------------------------------------------------------------------------------------------PAAQNFTNVYVKNIPLEWSEEKFRTSFQEFGTITSLNLPVD-DEGKHKGFGFVNFGDHESASKAVdgaatvevpdESKPLFADRfqkktersaMLTKKYEEQRREKSEKFKNLNLYVKNLDETVSEEKLRELFEPYGTLTSCTVMADdkkvSKGFGFVCFEEAEDATKALneMNGKMIGTKPLYVNRAQRKEDRRSMLEQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A167FJ90 121 0.255 8.055E-25 105 263 414 15 194 671 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+>ERR1740123_1543458 119 0.274 4.773E-24 108 266 414 0 153 156 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------GNIGQDVTDNQLREYFSSFGSINLCEIMpsKNHEPG-HRGFGFLRFEEQGVADEIKLKTHRINGRVLTVNDAKPK--------LVKFFVGGIARDrTTVESMRKFFEQFGEIEDIFCI-VPRGFGFVTLVEEGDNLRELKQndHHEIDGKRCEVKVARPKEEYQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719253_663466 119 0.279 4.773E-24 144 296 414 0 160 179 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGFGFITFKDAASVDKVLGEKLTLDDRSIDCKRAVPRgdvQSRGDSFKTKKIFVGGLATETTEAVFKAYFETFGTVEEAVImtdhdTGRFCGFGFVTFIDEEVVDKVCGEKHNISDKDVDCKKALPKRMMHGGRGGGRGGYGGRGGYGGRDDRHGGGYGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719367_2026451 119 0.263 4.773E-24 98 241 414 48 195 207 +--------------------------------------------------------------------------------------------------PDPDAIKMFVGQVPRSMDEEELREFFSEFGPVHQLNILRDKSTGVSRGCCFVTYFNRRDALEAQNRLHNVKTLPGMHHPLQMKPADTENRNERKLFIGMVCKKNDEEDIRQMFDKFGPVEEVTVLRDdngvSRGCAFVTFTSRQIAMK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSSwiStaDraftv2_1062776.scaffolds.fasta_scaffold13134411_1 119 0.232 4.773E-24 105 267 414 8 179 215 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFIGGIPSSMTEEVIRDHFSQYDTIVNVRIMKDRKTKGSKGYAFVTVSDHLKIPTILATPQVIAGRTVDVQVASRRGEKEkwkEEQRKRKLFISNIPSHIDNESLQNFFSKFGEVRNAFVIRDfatkaSLNYGYVEFVDANILDRVFStKELELDGADLICMPYQGKPQDKK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712038_1303112 119 0.324 4.773E-24 137 283 414 0 150 221 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DPTSGRSRGFGFVMFSSSDSVKKVLEEKsHMLHGRNIDPKRAKARGGRE---PVLKVFVGGIDPAIPEEEIKAHFSQFGAVTDIDLPfdkqkNQRRAFCFVTFESEAVVDEVCKNPkQTIGIKEVDIKKATPKQDQFGGRGGRGGGRGGYGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_2345651 119 0.215 4.773E-24 121 260 414 0 180 237 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EYFSKYGHISHAEVKTDVATGRTRGFGFIQFDGAEAVERAVAdyNTHVIEGKWIEVKRAVPQGvvsstgsagvavlpaqatipaaqaivpgmaalPKSGQQESDKIFVGGLPQNSTVEALSEYFRKFGivvgaEVKTDRLTGRTRGFGFVQFDCAEAVDRVLGAYasHVMDGKWIEVKRAV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719450_1109173 119 0.320 4.773E-24 100 324 414 37 262 272 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EERMDLILLGMLPSTTEQQVRKYFTELGaELLSCQMKKSKDLQT--GYAFIRFQQKDLETTMRRQKHIIDGRDCTLKIPDSRQADGGERGEKKVYVSYQDSSLTKEELRTHFEQFGSVEDVFIPTPWRYFAFVTFASASVAQSLIGKEHNVRGVSLLMKRGQaPKGKRESEHGHGhGGRDGDRDGWGDSWGGGPGAMADQWQMYAKMMQESMYRGGPPLPPGPPRAPW----------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719353_194506 119 0.177 4.773E-24 103 265 414 3 238 274 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKLFLGGLPQTCSTEIVRDHFSQFGNLTDAVCM------EGRGFGFVTFESPDDAAAVLGMEHVFEGRPCDIKEATKEGTKGCPKGKGgtgwvnpfgaggkfgppqvayggggyagggayagggayvaggpyvggggclpkgsggkgskggkggkgiktdKIFVGGLPPDCAEEKLVAHFEVYGTLVDAVVmkekgTGKPRGFGFVRYDNTDSADQVMAdfESHVIDGKWFECKRATPQEQM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000318153072 119 0.242 4.773E-24 91 258 414 48 237 298 +-------------------------------------------------------------------------------------------SSQASSSSMANDCTAFIEGFPFDSSEEGLKEFFSGYGcSVESMRLPVWQDTGRLRGFGHVVFASEDDATRAIEEVSGksIGKRYIVVKKPnvpkqemnRSGEVRDQPKGCKLVFVKNLPYDSTESDLHEAFSTFGKVLEggCRIarnqNNENKGFGFVEFKEPEFALAAVQQaskpfGLKVGGRPVFVDF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719354_845671 119 0.269 4.773E-24 106 256 414 52 207 302 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FVLtDLPPMMNEKDIRAHFQEFGELKRVDDIRQKRMGRQRHYAFIQFKTVEGEKAAQDGIHIFNHRRYYLQPSHKSRSGGKSKKeqelPTKLFIGRLPSSVTEADLCKYFSNYGVVKDIHIPAPFKGFGFISFERKDIANQVLNETHVVNGAFLNV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_3959404 119 0.260 4.773E-24 105 256 414 12 172 407 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVGGLSPAITEGELESHFSQHCEVNGVKLMKDKKTKLPKGYAYVYLKqEPDCLDQILSMFHTVGGRKVDVQAASkkcDKQQWKAEQQERRVFIRNLPNDATPEQLEALFGRYGKVKNAYLiydyyTGKQKGQGYLHFEDTESVQMALQSKTFINGEPISC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0B0PR36 119 0.235 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0.354 6.418E-24 116 233 414 0 117 118 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ETEVKEYFGKFGEVAKVSLKTDRVTGKSRGFAFVTFEDKESVQNVMnEKNHRLGDRKIEPKPAI------GPEPLLKIFVGGMNPATTEDDLRDHFGPHGAIKEIHIakdrdTQKPRGFAFITY------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1740137_302756 119 0.484 6.418E-24 88 213 414 3 127 128 +----------------------------------------------------------------------------------------DGNASSKFPRIELKCTDLICLGLPYSSTEEDVRTYFSKFGDVGMVQVKTDRESGKSKGFGFVRFVEYESQRNCLREKHVLEGRRFEVKISGSKGEEGKP-MSNKIFVGRMSEDITAEDLKEYFSQF-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719384_2935757 119 0.291 6.418E-24 139 264 414 0 136 137 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QTGKSRGFGFATYVNYDDAKKCLDDNLQLNGRRLDAKVAVPKDQSDSGaaqgyGSVQKIFVGALAQGTTQEEFDEYFKAYGTVTDSVImidknTGRSRGFGFVTFQETSSVDAILQhNNHEIHGKRVDCKRATPKDQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719188_2764380 119 0.317 6.418E-24 104 223 414 30 155 165 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLFVGTLPWNINEDELRRHFENFGPVQEVTLKYDRNTGEFRGFGFVTFLDVGSAKAVLDNydSNVFKGQWIECKAAEADPNKGKGKGSAevteKIFVGSLPKDTNQAAIEAHFSQFGRVVEVFLPK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719454_2497202 119 0.313 6.418E-24 123 281 414 6 163 170 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+----------------------------------------------------------------------------YVLSGKRKADAEVAAPPKKKKlangdaapeTDDPSARTVFVGRLSWNVDNDWLKAEFEECGEVISARVQMDRNTGKSRGFGYVEYADPASIEKALQfSGKEIDGRPINVDRSTSNKTSGgagnpndarraaygdkTSPPSSVLFVGNLSFDATEDSLWNVFAEYGDVKGVRVPTD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712126_95945 119 0.258 6.418E-24 126 318 414 0 190 201 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGEVENVNLKKDPYTQKSRGFAFVLFTSQDSLDKILNgSGHVIKGKRIDPKRAKAR--------TGKIFAGGLNAEMSDDDIKNHFGKFGKVIEVEMPfdkqkNQRKGFCFITYEHEEVMKEVLNEPkQSICGKQVDVKKATPRPDNGlFGMLPRGRGRGMRGAFGGRGRGWQCGWD--QYGGYGYDYGYGYDGYGGYGYN----------------------------------------------------------------------------------------------- +>F7F8W0 119 0.269 6.418E-24 110 262 414 0 162 231 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+>ERR1719309_1635879 118 0.224 1.160E-23 100 259 414 10 166 329 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EDERKIFIGGLAADVSEKSLVQYFGKFGQIEFVNMIKDHFTGSPRGFAFVTFTTVDAVEDVLkENTHTISGSVCGSYRAKPR--------NGRLFVGNLNNRIKDTDIYDYFGKFGKIIRIErssVPSKSSWFCFVVYQSMDTVKKVLQsEKPVLKNQELNVELA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719427_2202050 118 0.245 1.160E-23 97 242 414 18 176 341 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RECEAMRKMFVGGINRDTSDEVFFEYFGQFGNMVDQVVIKDPQTKTSRGFGFITFDCSDAVEKVFQsRPHTLDSKTLDVKRAMPREfnTTTAHAKVTKLFVGGVGPDLTPDDLQAYIEsrhptTVGTIDKIdflkdKITDQNEGFGFLECSSTDFADRL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0K9RHS2 118 0.220 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48 193 414 0 136 137 +------------------------------------------------NSFRGVRCQDNVLFPPtDEGWMGLSFICVRPK--------------VDDDDDCDKTVDLIVLGLPWKTTEEDIKKYFEEFGEVLMVQLKKRPNSGESRGYGFIRFADKDVEEKVLLQRHMIDGRWCDIKIPDSKQQEGgrkkDDKSSCKIF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719187_289076 116 0.260 3.787E-23 145 276 414 0 141 142 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFGFITYQDASMVDAAMAArPHTLDGREVDPKRALPREQSGNPeshMSSKKIFVGGIKDEMDEGDIKAYFSDFGNIEDVHIvkdkeTQRKRGFGFITFDDHDAVDKlVLLKHHNIGSYRVEVKKAVSKQDQDGMGGGRGGRG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712167_445443 116 0.278 3.787E-23 105 236 414 13 157 158 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VYVGNLNYDATDEDLAELFVQFGPIDHVCIKTyhkcrqndiEYGTGRSRGYGFVTFFEKSHAKRAIKELNGFvwMGRQLEVKQGTSKKAKQSYENC--VFVGHLPSDITEEVLKRKFGHCGKVKEITLARKSdgtvKGFAFVHFKHE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719494_388069 116 0.280 3.787E-23 47 201 414 2 159 160 +-----------------------------------------------SGGWRGIRITDGILKPPNGGWGDIEYFVTLRKTGSVNSKSAEEieqkkndkGYKKEVDSEEELLQDLFVLHLPRDVNDDELREYFtKKCGDMALAEVKFDRRTGKSRGFGFIRFITADAAREALNGDHLINGQRLEVRISRKKE------TPCQLFVGRLPEGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719492_213847 116 0.300 3.787E-23 111 281 414 0 169 170 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MDPTTGRSRGFAFVVFEDVDSLQSALGQEHSIKNKKVAVKKAASKQ--------GKIYVGKFMSPITEDEIRSHFEQYGSVVEIQRPvdrsknSEPKNFCFVTFDKEEPANALLKKGtVVVEGQEVEIKKVTVKPDGGMGMMRGGMRGGMRGGRGGWMGGYGGGGDWGYGGGWGADAYGPPSGpWGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001096088341 116 0.264 3.787E-23 120 262 414 1 177 236 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KAYFEQFGQVVDSHIMRDP-SGKSRCFGFVSFADPSVIDNVLSKTHILDSKQIDPKRAVAKHLQQQQQNPqymqisnnpymarnammprpgaaaggreeNKIFVGGIHIAVDEAELAQFFRQYDEVVESVLmkdhtTGKSRGFGFVTFASQEGVQKtVAAQFVEYRGRRMEIKQAVPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A172RVM7 116 0.421 3.787E-23 104 217 414 7 119 273 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------EEARKIVVLGLPYSLTEGDLWRHMrERFGVVQKADLIMDKTTGRSKGFAFVTFADGEQVKKAVEAsgTFEIDGRRIDIKLKASKGPGEESRGqkrdrdaagqhsfqppppthraslqsrgyqraveqnqnlDRRIFVAKIAPDLEGEVVRGYFASFGEIEDFHMPrqggthGPHRGIAFVSFANGADAERALETREHIvqpGCAPLAVDRAKSRQPGGGRGPRGG-YGGPRPGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719228_2069599 116 0.237 3.787E-23 78 262 414 69 283 519 +------------------------------------------------------------------------------KRQKRKLEQSKVTPEQKEEKRLErkrekwmmEERKIFLGGLADETTEKDVMEAFQEFGTVVDLKVMRDNDTGKSRNYGFLTFAQEFMLEAALEKREFhINGKLVIPKRATPDEPRyrmcktefdntseigTMCEGKRSIFVGALRDNITEDDLIEYFQGFGRVVRAhkcvdKETGIVHNYGFVDFADYGGVRKVFNvTKHYIKGKRVRIDMSRRK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>F2U536 116 0.244 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160 414 0 145 146 +--------------------EEDGNVLLRTIQTQFENAIGLKYKGP-SGAWRAIREGDNaTLIAPKEGWGHHTYSITFrqekQDTRKRKVDGTSNWEGGKQPRSDALLKDLAVIGIPYDANHKELKEVLnDRYGGVAQLNIKTDRATGKSRGFGFIRFDNEESAKQA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711915_607296 116 0.303 5.089E-23 144 262 414 0 128 161 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGFGFVTFADPSVVDKVIQDNHIIDGRTVDIKRTIPRGY------TSKIFVGGIPKTITDDEFKDYFSKFGKVIEHQImrdrsTGESRGFGFITFESEQVVEEIISEQiveqiisqdkkIELGGKQVEIKIAEPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719278_821593 116 0.324 5.089E-23 126 296 414 1 169 177 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGEIDNVDLKTDPNTGNSRGFAFIVFQEAAALQATVKQDaHVVKGKKVTCKKAEVKQ--------GKVYVGKLPEGVTDEEIKDHFAQFGPIVEVVRPidkqngDKPKNFAFITYEREEISFKLVKEGeTTLNGQKVHIKKVIPKD--QGMGGGRGGFGGGRGGYGAYGGYGDPYGGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711881_589809 116 0.262 5.089E-23 98 247 414 1 160 177 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EPEQMRKLFVGGLSYRTDDQMLFSFYSSFGTLTDCIVMKDPRSKRTRGFGFVCFQRRQMLEDCMArRPHVIDDRPVEPKRAVSRLESGHPGANRSVTKMNIKWYTDahlkEADFRSYFSRFGDIEDLDMPiseetGRHINFARVIFKDYDTVDKVINSSQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_693572 116 0.228 5.089E-23 101 277 414 26 244 258 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DRGCIWVGNLLPECEDKDLRDYFEKFGPVREANVEREKRTRLSRGFGFLKMSSQMLVDKILKEKHQIWENEIEVKLANDTTIEPEKEPekelvfeepakedagkennddadrkrkatddldegeaqPGKFFVGGLEAGTAEEDLRSYFATFGEIKEVAIAKDPQGnpknFAFVTMADASNDDSIASKEHLINGKKVDLQKSVKKGKSGKKGGGKDSGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712130_566359 116 0.263 5.089E-23 147 280 414 2 153 268 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFVTFADPEHAQDVLNRGDiELGGRRVDCKPAVPREEldvraaggrvrGPMGPRTSKIFVGGLSKETTRDEFERYFEKYGEITDAIVmtdreTGRSRGFGFITFATEDSADRVVSQAvHIIGDKQVETKKAIPKTQMDGQRPTYGSGMGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711915_104536 116 0.317 5.089E-23 135 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+---FICVAEEEGEEPIELPTEEsDNSLLISTLAAQFPGACGLKYRNPESRAWRGVRLSDGRLFPPSDtGWGTHVYVSVMPKGN--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719253_894834 113 0.287 5.391E-22 116 247 414 2 137 139 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DRALHELFKPFSP-NHSRVARFPDSGKSKGFGFVRFSDPESAQAALRELHgtEFHGRAIAVAFKGPRGSQM--NSVSKLFVGNLPWTMDVLELKEKAGEFGEVRSANIvtdpeTGLSRGFGFVTMINEEQAQHVIAQLH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12221|scaffold1652290_1|+169|01 113 0.222 5.391E-22 105 244 414 0 146 148 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+>GraSoiStandDraft_58_1057296.scaffolds.fasta_scaffold2259807_1 113 0.267 5.391E-22 131 274 414 1 157 171 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SVSVIKDAETGRSRGFGFVEMIKRDEANAAISALHQtsIKGKSVSVRDAgdkkgRERSPRRERPKGSKMFVGGLNWDAKDDDLKKLFSEHGKVLDLFImkdreTGKSKGFGFVTMSDEDSKKAIeKLNGNKFMGRNITVAEAKESGGKNNPKKRSAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711981_275252 113 0.294 5.391E-22 98 243 414 42 194 253 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+>MMETSP1395_Transcript_14013_9171831|ERR1726653_k119_2070791|-|169|3.688e-41|2|5540|5995|5995[5995]:5759[5759]:237[237]|5713[5713]:5540[5540]:174[174] 112 0.263 7.237E-22 122 263 414 0 136 137 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FFSQFGRIEECTLMMNRATGKSRCFGFVITKSGKSAKQILEtGPHNIDGKIVDCKWALPPEEISPAPvcKSRKIFVGGI---------------YGEIEDSIImqdrsTGCSRGFGFVTYCQESSAEKVLVNYdaHYIKQKWVEVKIATPKE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ETNmetMinimDraft_22_1059887.scaffolds.fasta_scaffold870169_1 112 0.263 7.237E-22 142 276 414 1 144 165 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DSGRSRGFGFVTFSTSSQLDDCQNQRsHNLANKTLETKRATPRRESGKPesqMSVKKLFIGGLTDDMSDDDLNDYFNKFGNVMNVeqlkwNDTGKKRGFGFVEFDDYDPVDKIILIGkHVLRGRRLEIKKALSKQEMN--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0K9NYN9 112 0.242 7.237E-22 99 262 414 103 270 476 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PPHGSEVFIGGIPKDVMEVDLRELCEPFGELFQVKLVKDKDKKESKGYAFLTFTKSNAAQLAIEELHdkEYKGRTLRCSLSQSK---------HRLFIGNIPKNLTDEDMKKILEENGPgvenielLKDIQNSTRNRGFVFVEYYNHSCADYARQKmsssDFKIDGSSPTVTWADPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719341_1278847 112 0.255 7.237E-22 103 256 414 110 293 518 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EEAFKSYFESFGEIEDCVVMKDKETKKSKGFGFVTYATVAQIDEAQKNrPHTIDGREVDTKRSIPKDSGESQKSLTKMFVGGMKDDTTEEQVREVFQEYGTMKSCDVIKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712212_588457 112 0.385 9.715E-22 46 180 414 2 134 135 +----------------------------------------------ESGAWRGVRATDGTLEPPLEGWGYNDYIVTVAKTAAKRKGDDDEGPESKTK--KTMLSDLIVLGLQYSSTAEDMKQYFEKFGDLAHCEVKSDPQTQKSRGFGFIRYTSQETVDEVLAAHHTMGGRTLEVRIPNSK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719330_925537 112 0.246 9.715E-22 127 254 414 0 149 150 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9.715E-22 102 251 414 1 152 160 +------------------------------------------------------------------------------------------------------GVKYFIPGLPPGVTNDELHAYFNKFGLCLKAVIVKEKGTDVSRGFGYITMADDSSRDAIVTAEHDIGGTAVR---ALVTKDTLSSGDVKKVHLDNLTPDITPDMIREAFSQFGVVLDVHRPkdfrtGERKRFGFVTFGSDEPFQAALQMGQIVIG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719215_25557 112 0.248 9.715E-22 121 262 414 0 171 222 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EYFAQFSESSDARIVAD-QTGKSRGFGYITLATPDALEDVLgmqedGQAHEIDGAEVKIKRhnqkaptasqpsraapvssSSAQSRGAAPVKTAKVFVGGLPNGCTEEAILDYFQTYGNIVDVKVmmddkTGKSRGFGFVTFEESAVVEVVLSEasKHTIQNKWVDVKPADGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APHig6443717497_1056834.scaffolds.fasta_scaffold1511965_1 112 0.282 9.715E-22 129 283 414 0 159 223 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VAHAVVKRDPTTGRSRCFAFVTFESSAGVKAVSAvSAHHIKGKKVDPKPAEPRPGEE---PCVKIFVGGLDSSMSEEELKEYFTKFGVVKNVEWPKDrardnaKKNFAFVEFESDSVVAEIIKNPkLTIGSRQCDVKKAIPAQKKQPGQFGQFDYGSPYGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712127_418689 112 0.261 9.715E-22 103 267 414 57 227 251 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGSCSWDTNDESLRSYFEKFGEVTDSKVILDFDTGRSRGFGFVTFADRSGLDAALAQDHEVDGRQVRCNEAQDKQGGGGGGRGGGGYGRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712050_96174 104 0.303 2.559E-19 115 238 414 0 130 131 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DESQIRNYFNKFGAVDQVEIIK-RKNEKPRGFAFVYYKDEESFNRALHAVRHIDGRRLDCKEALNKakaKTRLSKERSHKIFVGGLAQRTKEDILYDYFSVFGNIYKAYLiydhnTRQSRCFGFVEFEDEHS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740121_1466844 104 0.273 2.559E-19 119 252 414 0 135 138 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LREHFGNYGRIVDCAVVLDKNTQKSRGFGYVTMADTSGQDRLLNEKHMFGNEVARVMLTKGSLAG---SDVKKVHLGRLDPDVTADQIHEVFSQFGVVLDVhtpkdVRTGERKNFGFVTFSTIDAFNAAVQTGFIKVGR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719428_675715 104 0.261 2.559E-19 101 242 414 0 145 146 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PGPSVFVAGMNLETTSADLKAHFEQAGEVVFAAVFTDRDTGDSKGVGKVQFPDEETQKKAIEmcNNSQLQGKRISVREFSGGQRGPSGP---TVFISGLSPDTDNDKLWTHFEDCGEIQEngaVVFMRDgvSRCVGKIVFADEEAQKKA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_4_1057263.scaffolds.fasta_scaffold3090117_1 104 0.204 2.559E-19 105 247 414 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+LCEWVAVVQDEGDEAIEIPTENDGTILISSLTAQFPGVIGLKFRNPETNTLRGIRCSDKQLYPPNQQadsalWGKITYICTRAKTPAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_10_1057309.scaffolds.fasta_scaffold5558149_1 104 0.269 2.559E-19 105 246 414 0 150 219 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------MFVGGLPPEMTSSELEEYFAQYGYIDHVRVVGEVR-GKQRGYGFVTFSHKETLNQVLRiKDHRIKGRLIDCNYATDPKEEENGYGddendfNKKVFISDLPISAYKEDIKNHCSQFGPVKKVlffIRQNKEMAFAFVIFENEKDRDASIKAG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719421_498848 104 0.250 2.559E-19 137 319 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+>ERR1719361_2869393 104 0.218 2.559E-19 105 256 414 19 187 273 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVGDLASHVHEEDLRALFSAIGPVLKCKIIRDPVTQRSKKYGFVHYPSEEFRQRAIEQLHNtsLKGQVINVRTQHYKETDrclvKPGTKPTDVYIGNIPRGLTKSDLQREVQLWGipEVKECRIHRndnESGSFCFLTFPTEVEAKTALnilndqMNPRFLAGRSLLI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740123_471187 104 0.300 2.559E-19 106 259 414 274 429 625 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FVSNLPDGWSEQDLLEYFSRWGKVLNASVARDKGGDKSRGFAYVTMQDPMSRDMILSDRHDVGGTQLSVMLSKENLIGTE---VLKVHIDNC-ERFSPEQLRDAFSTFGLVLDVHtpkdpMTGERRRFAFVTFGTEEALQAAVSQGSVaVGDETVRVKLA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_179683 104 0.303 3.428E-19 104 198 414 1 102 104 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFVRGLSWYTDEHELRAYFEQFGPTERCVVARDRDTNKSRGFGFVTYETIEDAEKALSVEHELSNRTLYAQLSIPRERVDRRPQyddremeSHKVYCGNLP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712127_441239 104 0.252 3.428E-19 135 262 414 0 143 148 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PTDRETGLPRGFAFVTM-DEESAKAAIEALDGtiFLGREVIVNESVPKGQKPPNSRrefsegggnTRRLYVGNLSFDADEETLLDLFTEFGDVKEVFVPtwpdtGRTKGFAFVTIAS-DAASVAIEEtdGLEFLGRSIVVNEAQKR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719261_2113185 104 0.232 3.428E-19 119 245 414 1 155 156 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LSATFEAFGPVVSALIMKKPNDDTSestKGFGFVNFQNSDDAKRAVEAMNEknvaTDGeekilyvgramkkaereRQLRVKFDQMKLEQMNKYQGVNLYVKNLDDGVTDDELREHFSTIGTITSARVMkaaaGNSKGFGFVCFSTPEEATKAVAE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>M0SQ94 104 0.197 3.428E-19 123 259 414 1 157 158 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FAEHGSVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMNSVEDANAAIEKLNdtEVGGRKIKVNVTEKPfqtidlsllqaEESTFVDSPHKVYIGNLAKTVTTDVLSKFFSEKGKVLGAKVsrvpgTSKSSGFGFVSFSSDEEVEAAIAsfNNAMLEGQKIRVNKA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>RhiMethySRZTD1v2_1073278.scaffolds.fasta_scaffold611625_2 104 0.295 3.428E-19 110 260 414 0 156 164 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAPDVDDADLSSHFRKYGELQEASVIRERDSGTSRKFGFVMIKGDKT-KQVLDDTHTIRGRSVTVRLhadsggSADAAQGGAGDEVTKVFIGRLDPNFSKAMLRDKFDQkFGKVVDVFLAGSSK-FGFITFQSSSSAREALrAESIVIEGKTVVIGNAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711872_969678 104 0.302 3.428E-19 134 296 414 0 154 189 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+>ERR1719424_331021 104 0.310 4.591E-19 149 254 414 0 118 127 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VTFAESADVEKVMADDCILDGRTLDIKLAVPKEQQdalrrkdaDKGRKTCKVFIGGISPETTKEDFESHFSKYGTITDSIVMtdresGRSRGFGFVTFDHEDAVDKLIDESHEICGKSV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712093_89734 104 0.300 4.591E-19 98 216 414 15 137 138 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EELDECNLFVKYLPADVSDEQLCQLFQPFGEIVSAKVMVDHVDGHSLGYGFVRYALPEQATKAIQNMSGfkIENKKLLCKLSNVHTGfySHNTEPSTNLYVKPLLLETTDDDLRRVFSEYGEI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5687767_13562474 104 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+>SoiMetStandDraft_5_1073268.scaffolds.fasta_scaffold3068333_2 103 0.235 6.148E-19 102 260 414 2 170 277 +------------------------------------------------------------------------------------------------------CRKVFVGSIPGHLTNEQIQDYFRRIvpGAVFTLH-KKKPEDWRNCGFGFLKLANPIDITKILEVDHFLLGRKLKCERYLNGQnlaQNTQSLEKRRLFIRGLKSHISDDDLKEYFSKVGPIESAYtvlhpMTQLPRNFGYVTFMSEETAQAmLALGSFMLKGILLRVHPFE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_359557 103 0.228 6.148E-19 100 240 414 23 171 379 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+----------------------------------------------------------------------------------------------KIDHATEGFRKLYVGALGAHTTERSLEAYFGQFGKVKFCQVLRDRATNQTKGFGFVTMAESSATQQILsRSVHVVDTRTIRVSLTHSARQGHTPewrppnprrheekvelvsevagieVREGRVYVGPLPHNCSPNILADHFSTYGPIATSNVSRavhntMKKNFGLVAFTDTMPVKRVLQNPrHLVNEQFVEI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740123_471187 103 0.259 6.148E-19 100 259 414 26 187 625 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QDGVRFFIPGLPDFVTDEELAQHFGQYGRILEAVVAKERDTNVSRGFGYVTMEDGTNPDALLNDVHSIGGKDIRI---VMTKESLTGTGAKKVYLNNC-ELLSADEIRDAMAEFGQIWDVHTPKDPnsgerRRFAFVTYGTDDAYQRAVSAGSVFyGGARITIKPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719454_174104 103 0.547 8.232E-19 83 197 414 0 113 116 +-----------------------------------------------------------------------------------KNEDGLENPLSKTKRLDKKCSDLIVLGLQWKSSEEDLRSYFSQYGDLLMVQVKKDVKTGQSKGFGFVRFGDYEAQTKCLAQTHMIDGRWCYVRIPNSREGTQQNV-SRKVFIGRI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719440_1584335 103 0.290 8.232E-19 110 221 414 0 116 125 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LPPTASEGDLKTYFASFGTVVSANIKRDNWTNESRGFGFVTFASSGEAQAALSygEDHMISGSKIGLRVCEDRrvtPGEGPAQDPKRLWIGGLPEGVKEEDVTTYFSQFGELARVEM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711976_908139 103 0.274 8.232E-19 122 243 414 3 133 134 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YFSRFGELSTVELIYGSNPKESRGFAFIEFKNLKNAIDCVNTPNqTIDGRRINCKYHLSLNEikdREVFEKKCKIFVGGLLSTTTENDLIDYFSQYGKLVNCYLllnknTSKSRRFGFIHFEDEETVKKVL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5438309_7720844 103 0.307 8.232E-19 82 196 414 7 123 136 +----------------------------------------------------------------------------------RASSEPGPCTGRKSQRTIPMTVKLFVGGLSFSTSSERLREAFAGFGEVQSATVVTDRDTGRSRGFGFVEMATNEEATAAVSRLNGtdLDGRQIKVEIAKPAGSGGGQRRGGGGFGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719244_1423070 103 0.235 8.232E-19 101 216 414 17 135 137 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EATSLIINYLPQSLTDEQFHQLFEAIGPMLSARVMRNRATGYSFGYGFVNYERPEDAAKAIEKLNGLQLEHKRIKVAYSRradGSAGDEIKNANVFIANLPKTVDEEQLKSMFAPYGQI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000474589632 103 0.320 8.232E-19 91 188 414 32 131 143 +-------------------------------------------------------------------------------------------SSAKPAGGETPESKLFVGGLSWGTTDEALKAAFVEFGTVVSAEVIKDKMTGRSKGFGFVVMGSPEEAQAAVAKLNGqtLDGRQVTVNVARPKTDRPRNFG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711939_582668 103 0.295 8.232E-19 103 236 414 12 144 145 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPPSCDDRKLHMSFSQFGSISEAVVMIDRATNRSRGFGYVTFTTPSSVKFAVASGaAYIDGKSVEVKPCLPKgnvpasntswgkapqaevsysqkpnsrspmqmAPRSTGTSAVKIFVGGLPQNCDNQMLGNYFSQFGDVAESEVM----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719499_305623 103 0.274 8.232E-19 137 314 414 0 177 186 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DVNTTRSRGFAFVVFADTEGVEKALaAETHNIRGKDVAVKKAQAK--------PGKIYVGKLVEEVSDDEIKEFFAQYGGISQIEQPydkaaNKRKNFCFITFEKEETAKKLLKEGaVSIKGHEMEIKRVTPKPANPMMGGFGGqQWAGNYGPYGDAGYWGYGGPEAYGGYGYGPYGGGNQWGYGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719219_2025393 103 0.305 8.232E-19 137 316 414 3 184 196 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DPNTGNSRGFAFIVFQEAAALQATVKQDaHVVKGKKVTCKKAEVKQ--------GKVYVGKLPAEgVADEDIQKHFSQFGTVAEVVRPidkmknDEPKNFCFITFEREETARTLVKEGQTsINGHEVAIKKVTPKENSRGGFGGGrGGFGGRGRGFGGAGWGYPDPYGGYGGPYAGGYGGGWGGQQGGFG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712227_689530 103 0.250 8.232E-19 137 264 414 18 153 219 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DQMTGYSRGFGFIVFEDAASVEAVMAETsHEINNKKIGPRRAKPR---PKPDPILKVFVGGLDPSVPEETIKSYFEQYGAVEEINLPmdrttNERKNFCFVKFESEEIVNQVLANNnaegkQTVGEKEVDIKKHTPKDQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712179_570939 103 0.236 8.232E-19 140 279 414 0 185 248 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGRSRGFGFVTFTQEGGVTAAMAAqdqgPLSLCGRSLDIKPSLPRgssglvqsmqpanvgfgntfnnfgrpmaqgfgrgvaaQPAAPRASKTKLYVAGLLFSTKEAVFKAYFEAFGTVTDVYISknkdGESRGFGFVTFATEAEARDCAGKLHLIDGKRVDVKPATPKTETPPvTHNYKGGMGGYP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>S9TMC5 103 0.230 8.232E-19 98 247 414 2 166 342 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EVESRTNLLVRYLDHKVDDETLKEHFAPYGNVVTCIVQRDIHTGESRGFGFVRFELPEEAVEALakADGSRLLTKKINVLWAKKEHDSTPAGEARrkmnKLFLRNIPMSVKENEIRRVIQDCGTITSITLHRDttplsdpslQRRIAFITFGEEGAAEKSLKAIH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_7472220 103 0.229 8.232E-19 99 247 414 1 157 377 +---------------------------------------------------------------------------------------------------ERGNFRLFIGGLPVRAERESIVEFFSKFGTVLSLKLKVNQNTGRSLGFAYLTVREKTAYDNLLSQTVNFQGRVIEIKPQWNRKElhqKLEEEKNKKVFVSNLPTDIGNQDLIRYFKYFGEVKNAFVIKDPdtlrnKNYGYIIFKESSSIEKVFRYPH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719209_742829 103 0.216 8.232E-19 97 256 414 183 376 599 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RRTEGFRKLYCGAISASTTEKMLQTYFSEFGEVRAVSVVRDKDTGLSKCFGFVSMQASDGAKKApLKQIHIVDNRTIRVtltfRPPKPSEEKRKncgswkprqqeerallsdevqsiDVREGRLYIGPLAENVSPNILEDHFSKFGLVAKSNVVRGvnndiKKTYGVIRFRETQSCKRVLQNPkHHVNEKPVEV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>F4JT92 103 0.250 8.232E-19 107 265 414 605 782 816 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+>GraSoiStandDraft_41_1057321.scaffolds.fasta_scaffold1897018_1 102 0.250 1.102E-18 150 271 414 1 136 217 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TLTDPLAAEKILKtGPHIIDGKQVDCKLAIPKdtlssiEPNNAIFNTRKIFVGGLPPNLSESQMKDYFERFGPIEQCVImhdkpTGKSRGFGFVIYSQESSADIVMQhkNQHCIMGKWVDCKRAMPKEVINRDLSQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719229_862669 102 0.198 1.102E-18 141 269 414 0 185 243 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+>AntRauTorcE11897_2_1112592.scaffolds.fasta_scaffold11201_1 102 0.165 1.102E-18 112 268 414 11 294 548 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------PTLNQTGLRQYFERFGVLSDVALMRNKSTGLPRGFGFVKFRDSAVASEVLGRAHTIDGRTVDVKRAVPKDKGQQPqqqqqqqpqqkqqqqqqqhhhhhhyqqqqqqqqqqqptpanssrgggvtrgsgsgtsgggagasggasegassrssgggssrssgaktassaragasatakatstgqttgavaqpptldseQQSKKIFVGGLAPSVSDMEFRVYFERYGTINDAVVmfdrqTQRSRGFGFITFQNHGSVEQVFQdEPHELNGKAVEVKRAEPKDSRAPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719265_2083961 102 0.231 1.102E-18 103 262 414 618 811 866 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MRD-FNGVGRGFGFITYQEQSAYDDVLQAQLFLRGKKLQAKRAIPPSEVLENQSEVKVFVGGLARDMDQSQLVLAFSQYGTVEDCIImkdgvTGASRGFGFVTFAASSSVDELLKNPkFEVCGKMIECKRAQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719502_620160 102 0.312 1.475E-18 79 189 414 19 130 131 +-------------------------------------------------------------------------------DAKRAVPRDQMPSANQSAQSAASTKKLFIGGLSPETTQSDFRDYFAQFGTVEDAVIMMDSNTGRPRGFGFITFESEASADKVMNTPsHSITDRQVECKRAVPRTAMGGSRRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4051812_37005287 102 0.230 1.475E-18 105 221 414 2 127 132 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AIVKIDQQTGQSRGFGFVIFANEASIDSVTsSGTHAIDGKNVEAKKAERR--------DGKMFVGGVKPETTDDTIKAYFETFGEVEEVarpinKETNENKPFCFIVFKRDGVISECMkQEYHEIDGKKVDCKQSHPKPPPGGRGGFGGGFGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_4_1057263.scaffolds.fasta_scaffold316658_3 102 0.223 1.475E-18 111 263 414 0 178 179 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------SYSVRTEDVRALLESLDlPFTECNVLMERDgSGRSRGFGFVTFPDEEIASEAIRQLNGsdFMGRsNMQARIALDRNDPENQRRERKVpvqaapgarcYVGNMVFSARREDLVEFFSQYGNVVDSYIVQerndrgvsRSRGYGFVTFESAAEADEAVrrADGSEFMGREgLRVSIAFERP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719282_1910099 102 0.269 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VLLQRHMIDGRWCDLKVPdsQDKKDGKTDKSSCKIFVGRVTENLSKEDLRDHFEAFGQVTDVYIPTPFRQFAFVQFSECKVAQSLLGKEHLIKGVSVKIGEAAPKGRDHGGNMRGGRGGGDRfggdrfGGYdggystgGGGRDVGWGGANKGGFGGGNGGGGANSGGGGGFSMNWGSGGGYGSSGGPSWGGGQGPSFGAPGPSYGGGATGGGY-------------------------------------------------------- +>MGYP000184455397 102 0.258 1.475E-18 104 267 414 1 170 259 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIFIGGLPGQTTKVDVMCFVQKFCPVLGISLPRKSGTDKCKGYAFVKVNSGPNLERLLSNHNIINGRRVDCQLALNKGDKiayLADLQQRKLFISGISPDADIHALVSALSAYGPLRNCYRLKPRkkdKGLAFAEFTNPEAALAVINGGHLIEGKIAKVSFYRPKVPDNR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719220_1111748 102 0.271 1.475E-18 97 228 414 108 245 262 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DEAADKDKMFVGGLHKDTNFTHLYRYFQKFGPVEQVLIKYDPATKVPRGFGFVLFENEDSVTKVLtyEKEHILLDKVIDPKRAQPHNTL--PSYQHKLFLGGVSSEkgHTIENLVEHFSKYGKITSIVWPdkgsGKTKGF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719245_375494 102 0.267 1.475E-18 120 267 414 0 151 305 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KDYFGKFGDLEEANVPLDNHTKQSKGFGFVIYHESNMLDAVMKmRPHKLDGRVLEPRRAIRREEANNPaanASTNKMYIGPLSDRVDEHYLKEYFSKHGNVVNVD-KGQGKDHAFLTFDDFDPVDKCVnMKRHILRGQISIAKKGLTKTAMAE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719174_181587 102 0.235 1.475E-18 113 243 414 59 193 319 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------NIDDNALRDAFSDYGDILSCKVARE-ADGKSKGYGFVHFKSGELAKQAIERVNGmqIGEKTVTVeKYMKATDRDTEPKDFTNLYVKNMPRSWDEAKIKEMFAEFGTVTSTLVQKDPKGrtFAFVNYEDCEAAKKAI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719329_263806 102 0.234 1.475E-18 97 224 414 294 451 459 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DSDRKSNSIFVGNLPFSAQEVILRDMFSKVGQVVSVRLPLDKDTGQPKGYAFIDYNDQDTAAKAVRELHalEYSGRRLKVDRAdrigksklertpadnsvgqstekkrsnlSARSQPTTDEEELSVFVGNLPYDVEERELREFMSQAGPVTSARLVQD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1S8W4I1 102 0.294 1.975E-18 96 188 414 2 96 111 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164 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QEVMNQPHEIDGKPCDIRLADGNKGSGKGGKGKgggkgqktdKIFVGGLPPDCPDEALSDHFSAYGTLVDSVVmkekgTGKPRGFGFVRFDNTESADKVIADYgkHQILGKWIEVKRATPEDQMAGGGGGGKGYSGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001198660849 102 0.275 1.975E-18 82 188 414 59 167 168 +----------------------------------------------------------------------------------RNLTKQDSSSSSIKRSLSKMSTKLYVGNLSFSTTEASLGDFFAQIGSVASVKLITDRDTGRSRGFGFVEMSSPDEADKAISELNgkELDGRAISVSEARPQAPRSGGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712226_1193210 102 0.232 1.975E-18 103 241 414 13 170 175 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152 154 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EVGQVVDAVVMEKH--GQPRGFGFVTFKDKTSVTAVLAQGVQIDGRDVDIKRAVAEEDIDGP---SKIFVGGLGQNINSAKLKAYFIKFGEVRDCVVmmdrsTNRSRGFGFVRFASAESID----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_1805349 101 0.241 3.537E-18 94 217 414 14 154 158 +----------------------------------------------------------------------------------------------KGKGKGRRLNSIFVAGLSYDTTSDDLRKHFEQVGEVVDAHVSTDRESGNSRGFGKVALAAPESHARALEELSGssLNGRDITVRdddpnapraggkgdsKAGGKAGSKGSARPNSIFISGLSHATTDDGLRDHFAEIGEVV---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APIni6443716594_1056825.scaffolds.fasta_scaffold6223472_1 101 0.261 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YFSQFGTLADAVCMV------GRGFGFVTYDTEEIALQVMAMEHVMENRRLDLKEATRDGTKGAPQKGKgflspggggkgggggggfvpwnapdggsgmpkgggkgnpgkhgdiggnqrtdKIFIGGLPQDCTDQMIIEHFSVYGTLKDAvvmkdKVTGVNRGFGFVQFDNFDSAEAVMNdfSSHQISGKWIECKRATPQDQM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_461913 101 0.405 3.537E-18 165 358 414 3 196 202 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HIIDGRTCDVKIPNSKAGDGTAvQQSGKVFVGRTTEELTSNDLRGYFDKFGEVTDVFIPRPFRAFAFVTFMDPEVAHTLCGEDHIIKGVSVNISNATPKSDRDR-MQSGGNFGGRGGHQQGYNQGWSANQGMGRGGNWNSNRGNGPHPNNNQGWNQQGGNWNGGNGGPAGGNMAPWGSNNFPGGSGNGGPAGGNM------------------------------------------------------- +>ERR1711991_693656 101 0.213 3.537E-18 90 236 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3.537E-18 146 271 414 0 139 241 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGFVTYEDSSSVDAVMGQQRQLDGRKLDIKAAQSKDEmasdkATPKSSSNKLYVAGLAFSLTDDDLFNFFAKYGEVERAEImkdkaTGKSRGFGFVTFSQEGGVTGAIdaqaQNPLELGGRRLDIKASLPRGSSRLAQGR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_23_1057293.scaffolds.fasta_scaffold1425573_1 101 0.239 3.537E-18 80 257 414 57 240 242 +--------------------------------------------------------------------------------NKRKNEEVQQNRQDANKKPKGGCGSMIkIFNLSFQTNDDSLQEGFKGCGTILRANVAM--RDGRSRGFAFIEFEEEDAAQKALEYNNtEFEGREIRVEIAEKNSGDVPITRSANL-VGHTTRvicknclGLTQEQLQDVFSQFGEIKEVHVLND-KPVAFITYYDLRHAEAAyNKQNIDVSGVNVSID------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 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206 273 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TSESLVDAYAKFGDVEDGAVITDKTTGKSKGFGFVSFVGAIATQKALEAPStLLDGRLVRCKLAKkerkcsavvgdtsavdalvtkqlaagvrsdtiarnmgvreeggdegtndsgssggGGQAQTASLAARKLFVRGLAWQTTTETLLQHFSQFGEVQEGAVcvdreKGRSKGYGFVTYSSAAAALRALVEPsKLIDDRMTHVKFA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1Z5RB72 99 0.256 1.133E-17 111 268 414 5 171 335 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------SQRATQATYVRHFGQYGEIVDSVIMKDRYTSHPRGFGFITYSNPAVVNKVIEDKHVINGKEVEIKRTVPKSSVQSSSKDFK----------TKR--YYFFARYGTVVDHQImfdheTKCSRGFGFIVFASEQVVDDLLANGNMIDlasskmkmstkGKCIllfqmEIKKAEPKKSSNPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A9S1U0 99 0.250 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+>13989|scaffold518420_2|-213|01 99 0.263 1.515E-17 96 188 414 23 117 164 +------------------------------------------------------------------------------------------------KSGVKKSMNIYVGNLAYNATEDELRSAFGAFGQVTSVKIVRDRETGRSRGFAFVEMEAGEGAQNAVAQMNGrdLNGRNLVVNEARPREQGGGRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719420_673196 99 0.299 1.515E-17 137 296 414 0 158 172 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DMATGRSRGFAFVLFSEQSSLQSALAQEHTIMGKKVVSKQAQAKQ--------GKVHVSKLTNDITEEDIRAAFQGFGNIAAIeypydRIKGEKKNFCFVAFDREDVAKALLKQGtVQLKGKTVEINKaAANPGGNMRGGPRGGMMGGPKGGRGGGMQGGWGGGGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711963_446873 99 0.283 1.515E-17 142 318 414 1 181 187 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KSRGFGFVVFAAPESVDKVCEEkEHKLHGRNIDPKKANPR------PINKKVFVGRLDPAISEEEVKTYFEEnFGAVVKIELPfdktkDQRRAFCFVEFKKQASMKKCLdQTNHKIGTQEVEVKKATPPGGAQNMRGGRGGFgrGGGRGGFQGGYGYQGYGGYGGYGGDYGYGYNYGGQWNGGYDQN----------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719204_598095 99 0.271 1.515E-17 79 180 414 3 105 198 +-------------------------------------------------------------------------------DQKRAVPQQQKRPPGGAPSGQGSATKIFVGGLAQGVEQEEFRAFFETFGAVTDAVVMFDKMTGRSRGFGFVTFEDPGAVDMVLrENNHEISGKPIECKRATPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1043166_5609926 99 0.290 1.515E-17 91 188 414 109 208 217 +-------------------------------------------------------------------------------------------SRTGKTDMANDNNRLYVGNLPFKTTDDDLAKVFSAFGTVGRASVVTDRETGRSRGFGFVEMGTAEEAQAAITGLDGkpMDGRNLQVNVARPREDRPRRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719318_1046440|ERR599310_k119_707842|+|293|1.734e-78|1|8721|9524|8721[8721]:9524[9524]:804[804] 99 0.241 1.515E-17 99 282 414 20 206 268 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PEDDCRLFVSVFPENAKQDDISDHFQTFGEIDNIIFSSDPEAGSSKApSAFVRFKTAGGLKATFAtEEHAVKGKTFDVKKL--------PAKPGKIYVGKIKAELSNMEIKSHFAQFGPIAKVEQPfdkskKERKDFCFITFVKEDSAELLLKAGtTTVNGIELEVKKVTPKPDPRAKGMMGmdrGEKGGYGGGY----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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2.026E-17 104 224 414 19 154 162 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFIGGLPQDCTTEVLQDYFSQFGTITDAICMV------GRGFGFVTYDSPDTSDSVIGMEHVLEDRKLELKpadgakgkggkggkdkggygaPAKGGKKGGKSGSTPKVFVGGLPSGCTEEQITACFEAYGTIIDVVAMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550514_436539 98 0.254 2.026E-17 101 227 414 8 171 172 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EQGKVFVGGLAHSTTPESMTAYFSQFGPCE-CRVMYERDTGRSRGFGFAIFNSNETVQMVLnAGPHTLDGRSVACRLCVKGGGKGiggseawgggfgnsapvavhtisptftsvhpaEVEDPRKIFVGGLPQSCDEARLTAFCAQFGAVREAKIhvdqeSGRSRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ThiBiot_500_plan_1041544.scaffolds.fasta_scaffold03777_4 98 0.216 2.026E-17 129 259 414 0 170 173 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ILSVEIIKDKETGRSRGFGFIKFADAADAEKVLRTMdgSEIVGRSCKLDKAgggkggggggkdrdfrdrdgrgrndgrgrrddRGGGGRERFAEPDKLFIGKLSLETTEDDIHDAFAKCGDITVQIIKHRdaneSRGFGFIKFRDAAAADEAMrtMQGTEIGGHECRLERA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ETNvirnome_6_100_1030635.scaffolds.fasta_scaffold42685_2 98 0.262 2.026E-17 135 260 414 0 136 200 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IFDKNTGKSKGFGFITFKHVDGALIALKEPSkKIDGRMTVTQLASAglsnSGSSGGDVWSRKIYVGNVPYDIPSERLLGFFLTYGEIEEGplgfdKVTGKSKGFAFIIYKTEEGAKAAIADPmKIIDGHQVLCKMAV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3989344_7809332 98 0.285 2.026E-17 101 196 414 74 171 205 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QGNKLYVGGIPYRSTEDDLKKAFGEAGTVVSASIISDRMTGRSRGFGFVEMASEAEAQAAMDrwGGKEMDGRTLSVSFARPPGDRPPPREGGGGFGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>EndMetStandDraft_2_1072991.scaffolds.fasta_scaffold6772772_1 98 0.236 2.026E-17 121 256 414 0 143 208 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QHFKQFARVSKVEIMKHKKNKAPKGFAYVTLADASDIPNILSTLHTIDGRKVDCQVAANKKEKQKTKDDQKkkmIYVTNLPGDLQSEELHTFFEPFGQVRNAYIIFDndskiSKRFGYVEFLEADSVINIINRHIDINSHQVLC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719281_378059 98 0.302 2.026E-17 102 196 414 18 113 212 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SCKLFVGGVNFKTDEDGLRKYFEQFGDVAEAQIIMDKETQRSRGFAFVTFQDSDSARKCLKQaHHELDGRDISPRECDDRPVRNDRDNDRGGYRGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12587|Ga0255049_10100097_2|-366|00 98 0.257 2.026E-17 101 195 414 0 96 235 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSVRLFVGNMPYAATDADLRAHFSAVGEPSQVVIPLDRATGRPRGFAFVEFADRSVAEEAINrfNQHDFMGRSLSVSEARPREERTGPRPPGGGFGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719153_541277 98 0.405 2.026E-17 165 310 414 4 156 261 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLIDGRWCDIKIPESqdrKDAKGQDKSSCKIFVGRITENLTKEDLRDHFEAFGQVTDVYVPSPFRHFAFVQFSESKVAQSLLGKEHIIKGVSFKIGEASPKGREQGGGrdhdRGGNRFGGYDGGYGNPAQQGGYSGGYGGAAGGYGNSGPSWG------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001405488645 98 0.279 2.709E-17 101 184 414 0 85 98 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MAFSIYVGNLPWRTTAEDLRALFEPYGAVENSRIITDRESGRSRGFGFVDMAEEEAAKRAIAELNNYDygGRPLTVNEAQSRAAGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719183_460143 98 0.271 2.709E-17 92 183 414 1 92 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------PPAPAAPSGPVQKIFVGGLHPSVTDEEFKAYFDKYGVITDSVVMMDKQTGRSRGFGFCTFEDPKSVDKLLEDAHEINGKAVEVKKADARNEQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719487_1949786 98 0.290 2.709E-17 114 218 414 2 109 110 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TNTDLLKSHFGKYGRIIDSVVM--HKNGRPRGFGFVTFDNSFAVDQVLAETQVVDGRVVDVKRAVPGSNdraghQGEERNSNKIFIGGLPQNVTNEDLKQYFGRYGQISD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719450_1215426 98 0.361 2.709E-17 134 239 414 5 111 113 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IKYDKN-GKSRGFGFIRYKTVGAVKAALNGTHIINNRRCELRYSRRSQDQQQGEDNirTKLFVGRLPSGTTTADLQEHFSAYGVLKDVYIPTPFRGFGFVTYGSQTVA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5687768_6689236 98 0.275 2.709E-17 90 185 414 3 100 118 +------------------------------------------------------------------------------------------GRKTPKKGASKMNNKLFVGGLSFETSQSDLRQAFSAHGTVEEAVVVNDKMSGRPKGFGFVTMSSDEEARKAIEAMngHSLGGRTLTVNVAKPREERRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001134590586 98 0.263 2.709E-17 96 188 414 4 98 118 +------------------------------------------------------------------------------------------------RQEEENKKKLFVGNLPFTATQEELQEVFSKFGEITNVNLITDRMSGRPKGFGFIEYSSEEEAQAAIDGMagQKIGDREVIVNLARPRQPRNNRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>1082|scaffold_801709_c1_1|-100|01 98 0.288 2.709E-17 97 184 414 10 99 123 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------MFVGNLPFEFKEEQFRSLMSPFGPIERIFLVRSMFTGESKGYGFVDYVTRESACLAKQQLmntgsKYVGGRILRVNFAEPNLLTYEDLHSKTLFVDRLPRDFTNgEVLKELFSQSGSVTFAQVNYTLRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001055041930 98 0.310 2.709E-17 101 185 414 22 108 146 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PHMKLYVGNLSFKTTEQALEELFATVGTVTDTHLVMDRMTQRPRGFGFVTMSTEEEGQKAIESLNGktFDGRPISVSVARPKEDRPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>M2XML7 98 0.290 2.709E-17 101 191 414 2 94 148 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EDNRVFVGGLPWSISEEDLKQVFSKYGEVVDARVVIDRETGRSRGFGFISYAESSSVDECIAALDGqdLQGRTIRVNKAMTREQRDDEFASGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>2205|scaffold574454_1|-1|11 98 0.285 2.709E-17 73 182 414 38 149 151 +-------------------------------------------------------------------------CALRPQMESEEPLGRPLGRRGSQERGSNMSRKLFVGGLAWKTTDEDLRKAFESFGEIIGAAVITDRETGRSRGFGFVTYAEESQAQAALQAMQgaMLDGRALRLDAANEGRP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_189876 98 0.268 2.709E-17 142 265 414 18 147 154 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RSRGFGFVLFKSPETAQLVLSQTHTIDDKVIEVKKAMKLGQR----KSKKLFVGGLKNNISEEVLNAYFSAFGKILETSIicnrqTQRRRGFAFILFEDESTVDTIAEvKFHELtDGtekCRVEVKPMQPQTDR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719204_1062722 98 0.340 2.709E-17 164 296 414 2 145 159 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PHKVDGREVETKRVVPKDEVGKPESNmkvKKVFVGGIKFDMTEDDLREAFEKYGAITSASIPkdkttNKPRTFAFVDFEDHDSVDKVCLyKDIEVAGRRVSVRKAVDKEQMRNQEQRGGGGrdGGRGGNWGGNQGGGGGGGWGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712240_935491 98 0.256 2.709E-17 108 258 414 0 151 160 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGLPKEATVNDIKNYFQKYGDIEDVKLPICSQTGRSRCYAFVVFVDVKGAEAStAEASQIIMGNKVCCRMS--------GIITWKIFVNMFPsQGITLDDVRTHFEQFGNVYDVHKPKDwieadlSKNFCVVIFDNRDQAKKLVkMGSTTINGYKILIKK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A7SIE8 98 0.235 2.709E-17 104 259 414 11 183 184 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGGLNEDTTEETVRAYFKSFCEgseadVSSVSLAKTPE-GKSRKFCFVEFSNGSDIIDNIVfnfESHSIDNKQVEVKRAMPRDDPNElaHVRTKKLFIGGLKDEHSEEDVKTAlapLSPFAPLeikmVRDRETNKFKGYCFVNFPNEHIVDKLyLVRHIQVKGKDVEMKKA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>JI7StandDraft_1071085.scaffolds.fasta_scaffold2432047_2 98 0.218 2.709E-17 144 270 414 0 150 185 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGFGFVNYAEHDGAAKAIEELNekEVSGKKLFVGRAQKKVERERELKAKfdaakierikkyqgvNLFVKNLDDALDDDQLREHFAEYGTITSARImrepaTGTSRGFGFVCFSLPEEAAKAVteMNNKLILGKPIFVALAQRKEVRRAQLE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_420983 98 0.262 2.709E-17 145 296 414 0 151 205 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFGFVTFKTPEALEaAAAEKFHTINGKKFEPRKA--------KIQTSKIFVGGLKEQLSDDDIKNHFSQFGTITETEMPfdkqqNRRKGFCFLIFEGNDTAKNIITQGkQTITGIQVDVKKAIPsENEGGRGGGRGGGRGGFRGGRGGGGGDYSNGNGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719189_1439378 98 0.418 2.709E-17 147 267 414 0 121 207 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AFVRFKKIEVQKKVTMTRHWINSRWCVVQIPDSQEiSNAMADANNKIFVARLNGSIKAEHLRSHFECFGKVTDVFIPKPFRNYAFVTFTEQRSAEALFGRQHTIRGHTVHIKSAEPKGPTDK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719499_278996 98 0.282 2.709E-17 69 183 414 2 117 210 +---------------------------------------------------------------------NMSYSSRRSRSRSRSR-SRDRDYGGGGSRGGEANRKLFVGRLSYDTDKRTLEDVFSKYGRITDCFIPNDRETGESKGFGFVEFDKLEDAEEAMKALDQtdIDGRAISVEFSRPKRSG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_1642423 98 0.261 2.709E-17 76 184 414 11 121 226 +----------------------------------------------------------------------------FPRHRPRSKTISSQSCEKRTYENMSDEGKLFIGGLSFDTTEDSLAEAFSKYGNIAKVDVIRDQETGRSRGFGFVKYDSVDDAKDALEAMNGksLDGRTIRVDEAGNGRSGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>15185|scaffold397010_1|+2|10 98 0.267 2.709E-17 96 196 414 35 146 228 +------------------------------------------------------------------------------------------------RAEKEDTVKLFVGGLAWATDDVSLRAAFQPFGNLSDAVVIKDRDTGRSRGFGFVTYSDDASGKAALQAMNGatLDGRSIRCDEAVerergaggpPRMGGDRPPPREGGFVGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719215_704977 98 0.186 2.709E-17 101 253 414 22 230 232 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1 93 98 +------------------------------------------------------------------------------------------PPVGAEKVKLGLSMKLYIGNLSWGTKTEDLKSHFEQFGAVSDAIVITDRQSGRSRGFGFVTMDNDDEARKAMdeSNGHDLDGRPLKCSEATPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000890481495 97 0.322 4.842E-17 101 191 414 0 92 99 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MTNKLYIGNLPYNITEDELKEFFASAGNVTSVAIIKDKMTGKSKGFGFVEYSTPEEAQNAISTLNgkEIGGRAITVDEARPPKDFSDRRNDNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719495_2595442 97 0.378 4.842E-17 140 233 414 1 103 104 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+------------------------------------------------------------------------------------------------RRGNYMSKKLFVGGLAYSVTDQTMNDFFAKFGKVISAVVIVDRFTGKSKGFGFVEFETVEEAQKAMdeANNKELDGRQIVVKEARPLEPRPAGGSFNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3989344_6386624 97 0.270 6.472E-17 75 183 414 12 122 123 +---------------------------------------------------------------------------VYNKEIKLKTESLEKRKLSNTRLAVITIKKLFVGSLPWAVDDQKLGDLFSQFGSVVSAVVLKDRMTGRSRGFGFVEMANDNEAMEAIEKLNGsdMEGRKIVVNEARPREDR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712193_421270 97 0.300 6.472E-17 62 175 414 0 119 123 +--------------------------------------------------------------PPRSGWSDVTYYITETDAPSQKRKISDATSPATKMSRSVPSvdplmRDIAVLGLPWSVDNAELKQYFeEQCGELNFAEVKHDRETGKSRGFGFIRFKHREAAERALEMEHTLGGRILEVK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>17968|Ga0316601_100396321_1|+3|10 97 0.265 6.472E-17 100 191 414 19 112 124 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QMAKKIYVGNLPYSATEDDVRQLFEKFGEIQSVKMIMDSMTGRPKGFGFVEMSSDEDAGKAITALNGtpFLERTLSVSEARPQTGRGKDSRQSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>23575|scaffold_12_c1_41|+50770|00 97 0.298 6.472E-17 104 188 414 1 87 131 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLYVGNLLFNVTDSDLREAFEPFGEITEIRMIMDKFTGKSKGFGFIEMPSNEDAQKAISEMNgkEFMGRDITVSVAKPKTTRPSGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001081870990 97 0.277 6.472E-17 101 188 414 0 89 136 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSRKLFVGNLPYSVTSERLSEAFSQFGTVTSSKVIVDRETGRSRGFAFLEMETDDQGAAAMQAMNGalLDGRSIAVREAVARAGTPPPAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_47_1057283.scaffolds.fasta_scaffold2018466_2 97 0.295 6.472E-17 101 196 414 17 114 149 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PPQKLYVGNLTWDTTEQDLLDNFAAFGEVEYCKINTDPDTGKPRGYGFVTYVEKDNAEKAIQALngHDIKGRPVKVNLATERGKGGGGDFGKGGFGKG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719446_1826518 97 0.294 6.472E-17 86 219 414 7 142 154 +--------------------------------------------------------------------------------------EDKKDPPVGKRRKSRGGRKLFVGQLPKDITETDFKSLMSPFGEINGLRVLQDKKTGLGTGAGFVVFSTRKAAQAAVQH---FDGKICLRNMDRPmqvriAEGEFEPNADVKVFVGSIPPKTTEKEVQAVFEGFGNLLEV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9298|Ga0210265_1079430_1|+3|10 97 0.260 6.472E-17 87 184 414 33 132 155 +---------------------------------------------------------------------------------------SARRSCANQAESNAPGTTLFVGGLSWGTQPVTLEQAFSQYGEVVDAKIMFDKETGRSRGFAFVQFKEVNAASKAKEALNnqLLDGRTISVSFARPRPPRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>JI10StandDraft_1071094.scaffolds.fasta_scaffold718165_3 97 0.315 6.472E-17 97 189 414 25 119 157 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RKDSMPTKLYVGNLSYRTTEDQLANLFSQAGEVVSSVIIKDRTTYESRGFGFVEMSTAEEAEAAIAQLNGytLDGRAIVVSPARERSDAPNRSRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001167406497 97 0.300 6.472E-17 96 196 414 32 132 160 +------------------------------------------------------------------------------------------------KGSMESVMKLYVGNLSFSTSEQRLREIFSEHGDVASATLVMDRETGRPRGFGFVEFASDEHGKAAMAALNGknIDGRDLTVNEAKPREAGGGGGRGG--FGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_1561543 97 0.284 6.472E-17 137 296 414 1 161 166 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DPNTGNSRGFAFIVFQEAAALQATVKQDaRVVKGKKVTCKKAEVKQ--------GKVYVGKLPAEgVADEDIQKHFSQFGTVAEVVRPidkmknDEPKNFCFGTFEREETAIQLVKEGtTTINGHELAVKKVTPKENSRGGFGGGRGFGGGGGGWGYPDPYGGYGGGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719290_273323 97 0.245 6.472E-17 127 277 414 2 152 166 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GEESDLQESRSQGSGRSRGFAFIVYKEAAGVEVATKTPtHVVKGKKVTCKKAEAR--------PGKIFLGKIPDEVSEDDIRTYFAQHGNVTELVRPidksnnDKPKNFCFITFDKEEVAKKLVKEGQcTINEQVIQIKKVTPKDGGGRGGYGGGFGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001082298750 97 0.224 6.472E-17 97 227 414 18 164 169 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DPIEVPAKLFIGRFPKSMDESALIPYFEPFGKVKECVILRDFSTKQSKGCAFIKFGSVSDAVDCIRKLNnqlVLDDEigALQVQFANGEVERlglsceQIEVPPVKIFVGSLPSTIDERSLYAMFAPYGEVVETFIlhddaTGASRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5258705_6160037 97 0.245 6.472E-17 90 189 414 31 132 175 +------------------------------------------------------------------------------------------GTPIPIREESEMGKKLFVGNLSFDTTDQDLRGFFTTVGKCVSATVLMDRATGRSRGFGFVEMETDDEALRAITQLNdqELQGRRISVSEARERGAAPPPRSP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719317_1446546 97 0.233 6.472E-17 100 221 414 21 174 184 +----------------------------------------------------------------------------------------------------ECMTKLFVGSLSPRTTDDCLRNYFCQFGVVIASEIIKDTVTKESRRFGFVTFEKREDMKLALAEPkHKLDGQVLGVQEAVPKykikhqgrevgdrsrsrvkrrrvlshsrsrsPRERGRYEEKKIFVQGLGSSKDEGFLREVFEEFGEVTEAII------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0R3VY15 97 0.254 6.472E-17 102 257 414 48 219 232 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PVRLYVGGLRGKHTEDQLRQYFAQYGVVTKCCIWRDFRTHESKRCGFVTFEEVVCASRALAdRPHYIDGDLVKLAPFTPKKKKNksavPPLPVNKtdyidaitphdLVVDGLPPVPSVNDIRSLFGRFGEIIDVRV-EEELHRAFVAFSTAQALQAAVaAAPPRLKGMNLRVS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR550514_1859702 97 0.204 6.472E-17 132 271 414 2 187 233 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AEVSMDKGTGHSKGFGFVQYETLEAVASVLANytDHTFDGKWVEVRQFGDKAPTGqefklparnrgprgiavataaalaaqgygltnqsgglSDGKSRTVFVGGLPRSVGDARLKSHFEQFVKVTRADVivdreTGQSRGFGFVEFQTEEEVQTVMAKReaSRIDGKWIEVKRFGDKNPDKGQQSQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_59_1057299.scaffolds.fasta_scaffold1224134_1 97 0.243 6.472E-17 131 265 414 2 145 239 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DASTVFDSSSNRPGGFGFVVIKDDGQTESILSKEHFIKGVKIECKLALDKNQakmKDDEERTRKIFVAGLPRNLKDDLLGRYFSRFGPVQKAYVnkdfkSGKTRGFGFVVFSDIKSYNNALcQKRHVINGKEVIVKETQTRKEM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719359_1915736 97 0.217 6.472E-17 147 267 414 9 146 248 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFANFETHEMAVKAIDTMHqkEVNGRKLYVARAQTRSERDsilkkqredlrKRTKLCNLYVKPLPSTLTEQKLREYFASCGTITSAKIMhnadGSSKGFGFVCFSQPEEATRARDEDIKIDGKQLYVNLAQSKEERSQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000385925694 97 0.297 6.472E-17 92 190 414 39 139 312 +--------------------------------------------------------------------------------------------PRQPREGQAMGTKLFVRGLPWATNEHDLQEAFSAFGQVVDSAVVRDRDTGRSRGFGFVTMATDEEAAAATSGMNGarMGGRQISVSEAREDNRRRGGPPRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A4H9C4 97 0.276 6.472E-17 104 247 414 24 182 342 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLLVRFLDHTVDDVQFRVFFEPFGDITSSMVMRDIFTGESRGFGFVRFARNADATRALHEcdGKKIGGKAVNVIWAKQQhddtPAGQERLRMNKLFLRNVPLGITEAELVELVRAYGTVKEAslhsdRIPtarhSPARRIAFIVFADEGAAEAALRGVH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_148367 96 0.307 8.649E-17 119 219 414 1 102 104 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IKAHFGQFGTMSDVVVMKDAMTGHSRGFGFVTLEASDAALAA--GPHLIGGKTVDAKKAVPRGQEAEntvAASGVKIFVGGLSSETDDADFRAYFQAFGNVTDA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719400_3014207 96 0.453 8.649E-17 100 173 414 38 112 113 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QPSSKMFVGGLSWQTTEDTMKEYFSQFGPVVEAMVMRDPATKHSRGFGFVTFAQPESVEKVsQAGLHSLDGKKID------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3989338_5113916 96 0.239 8.649E-17 100 189 414 3 94 115 +----------------------------------------------------------------------------------------------------ERGMNIYVSNIPYSATDEALRDAFAAFGAVQSARIIKDRMSGRSRGFGFVEMPNDEEAQKALEGVNgaEMDGRRINAREARPREEGGPRKGN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_2775313 96 0.275 8.649E-17 96 191 414 0 97 129 +------------------------------------------------------------------------------------------------RRNMSEEISVYVGGLAYAATEDDLRDNFEKYGEVTKVNVVLDRESGNSRGFGFVHFQNKADAQAAIDALNEqdIKGRPIRCSFARPRGEGGSGGGGYR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5262245_38322864 96 0.306 8.649E-17 92 190 414 24 124 134 +--------------------------------------------------------------------------------------------ASQNERDRDMSNRLYIGNLSFNTDEGTLQNAFTRFGDVSDVKVITDRETGRSRGFAFVTMADAEGARAAISQMdgSMVDGRALRVNEAEERQQRSGGGGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>18668|Ga0209703_1487728_1|-3|11 96 0.261 8.649E-17 63 180 414 12 137 138 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------EDDRKLYVGALPPAAKESDIKTYFETFGTIESVNLKTDMATGNSRGFAFVLFNEVASLKGALAQEHSMMGKKL------------------------------------AFQGFGNIAAIeypydRIKGEKKNFAFVTYDREDVAKVLLKQGtVDFKGRSLEVNKVAIK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719271_517065 96 0.257 8.649E-17 87 216 414 49 184 185 +---------------------------------------------------------------------------------------ESSRPSTSKEPHSKQSVRFFVGGLSPDVDDKDLRDHFSQYGEVDEASVIRERETGSSRKFGFVMLKSRDRMNDILKGSHSIRGRQVTVRLHQdsaglDDRDAGRSEVSNKVFIGRLDPDMSQELIRDKIDQkFGRV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001417634775 96 0.414 8.649E-17 136 258 414 10 128 186 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+>ERR1719460_1420465 96 0.159 8.649E-17 101 259 414 32 294 760 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DSRTVFVGNIPYNATEERFHELFNTVGTVTRVFIVNDKDTGQPKGYGFVDFEDKETAEAAVHrlQGYEFEGRLLRLDqsgnhkanpaseddrvgvsvsdfpqdwinlddeslaqqvaaeleafgelasppdvvkigggarraiavfstseiahkavealngfvfkaevvqnePSHPSKRARKAESGHTIFVSNFPYDTSEAELSSIFSGVGKVLRIRLPRDKatdqlKGYSFIDYEDKESMQEAVddLNDLEFQGRRLRVRLA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000365599041 96 0.311 1.156E-16 101 188 414 0 89 90 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+MTSYVKVCEDVGkeDQTIELPTEDDQTLLLSTLASQFSGASGLRFRIASEGNIRGVKLQESKLYPPNGSWNEITYYCVFPKGR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001460040234 95 0.300 2.063E-16 101 188 414 0 89 97 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSVKLFVGNLPFSTDDNRLKEEFTKFGAVESARVVTDKHTGRSRGYGFVEFSDQTAADAAVTGMNGqnMDGRPLTVSVAKSQGTGPNGPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719362_1571378 95 0.317 2.063E-16 101 181 414 10 91 103 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MPLNRDTGKCRGFAFVAMTNSEDHEAAIEQLNQsdIAGRTIYVSESLPKDqvaekkkkfQHKKKDEGAKIYVGNLNFDTTAEDLTAAFAEFGEVNDCFLPvdydGNARGFGFIQMSDEDSLKA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740121_193816 95 0.261 2.063E-16 106 224 414 0 123 129 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FLGGVSSSTTGETLNAHFSKFGRVADTVVMRE------RGFGFVTFESQADADAALAEGqQTIDGQRIDVKPAQGKGGGGGGGGGGssggkggstdKIFVGGLPQDCADDKIRSAFACYGNIIDAVTMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5208283_1099192 95 0.267 2.063E-16 90 188 414 47 147 157 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------MSFQAFEDDVKELFNQFGNVVTVRLLT-REDGKSRGLAFVKFSKKSSFNQALElNQSEQFGRPITVEESLGKKQNDGGFKKNNfgdnkggfnkfgtgepakiesptLFIGGLSYQSTKESIADYFSSIGPVMNARIvtdreTGKPRGFGYVEFQDVETAKKA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoi013_1_40cm_1032412.scaffolds.fasta_scaffold223487_1 95 0.310 2.063E-16 87 184 414 48 147 170 +---------------------------------------------------------------------------------------SDAGSTAGVVARSKMESKLYVGNLSYSTTEDDLRNLFLQAGTVASVALIKDRDSGQSKGFAFVEMGNQAEAEKAISmfNGHNMGDRELRVSLARPREERG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712226_582473 95 0.233 2.063E-16 141 259 414 0 136 170 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GRSKGFGFVTFETAAAAADATVNPTiLIDGRQASANLAAKRSAPsaygsigtpalPGDTTLTKLFVRQLDYKTTTETLHKVFSQFGAVKEAVVlqdrnTGQSKGYGFVTFESNEAARAAIAQPQKlIDGRQTFCKLA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001168794725 95 0.357 2.063E-16 104 206 414 60 168 171 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLDENVTDLELYTYFSKFGRVVDKQIKMDPNTQRSRGFGFVTFKQIESVIAVFsSKPHFLHGLKIDCKPAKSKEESQHELQelratNRKVFVSNIPKNSSQAEI--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_273764 95 0.290 2.063E-16 101 191 414 26 118 173 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ETGKLFIGNLPYTVDDGVLRDLFSDFGSIEDCVVINDRDSGRSKGFGFVTYSEQKSADKALDQMgnYEYEGRNLNVKPANPRNSGGGGGGGYR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719350_685830 95 0.437 2.063E-16 136 262 414 0 127 175 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KDQRLGSIQRFCLCQVQRFRSARKSSLTRHMVQDRWCDVKVPESQElKHAKASSSCKIFVARLSETITADDLKEHFEKFGPVTDVYIPKPFRSFAFVTFQESKVAQSLYGKDHIVKGVSVHIGSAQPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>OM-RGC.v1.007917864 95 0.252 2.063E-16 155 262 414 0 114 190 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ESLLTVLQEPQVVDGKTVDCKMCSPKGEVMPPCKPNRIFVGGLPQSADEKQLRELFSRYGAVSEARIMtdkesGRSRGFGYVTFQSPRSCELALANRgaNCIEDKWIEVKRCTEK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719239_1475012 95 0.296 2.063E-16 71 177 414 77 184 193 +-----------------------------------------------------------------------VYFVRSSPTSSPTMAVTTPTMLSITGQKDTQFTKIFVGGLPYHTTDQSLREYFDKFGDIEEAVVITDRQTGKSRGYGFVTMADKMAAERACKEPNpIIDGRKANVNLA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12539|scaffold390981_1|+3|10 95 0.266 2.063E-16 79 185 414 75 183 198 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RSRGFAFVVFEDADALTAATKQDaHVVKGKKVTCKKAETKQ--------GKIYVGKLPAEgVTDEDIQKHFATFGAIAEVVRPidktknDEPKNFCFITFEREETARTLVKEGQTsINGHEVAIKKVTPKE------NNRGGFGGGRGGFGGRGRGFGGAGWGYPDPYAGYGGGYGGGYGGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000315163092 95 0.416 2.063E-16 101 170 414 0 71 249 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGKKLFVGSLSWDTTDQSLQEAFQAFGEVREARVILDRNTGRSRGFGFVTFVRDEDAQTAIQQMNgaMLDGR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_58_1057296.scaffolds.fasta_scaffold4414954_1 95 0.240 2.063E-16 103 243 414 32 197 271 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TTLFLGDLPAFCGEHDLYNLFSTFGELTEIKIMRSDENHRNLSYGFVKFADPMCAERALQASDGIafGGRSLKVGWASYKGKKETRNHNHKdkansssVHISYISYQlknmITEDSLRKLFGKYGTVLDCSIkksyidenINRQCGYGFVHFASDregiESALAAV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719319_930193 95 0.298 2.063E-16 99 221 414 403 526 538 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PPPTGALYVGGIFLDTTESELHQLFSAYGNVKKVEIVLNKKSGVNAGYGFVFFETEEAARRLVQNEaGNIKLKERKLKIALKKTEITKHSPTRTLYVGGITSNTKESDLRQLFSAYGNVRSTKI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001240714930 95 0.287 2.756E-16 104 181 414 1 80 81 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLFVGNLSWSVDGDVLRELFAQVGNVVDARVIKERDSGRSRGFGFVTFETEEGAESAIRdfHGHELNGRPLRIDRALERQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001366519117 95 0.300 2.756E-16 104 191 414 1 90 92 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFVGNLAFKTTETTLRKLFEEHGEVEQCTIIMDRDTGRSKGFGFVVMPTRHNALEAIKAMNGIdlDGRKLNVNESKPKPREEGGRRHAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>16234|Ga0233414_11398165_1|+3|10 95 0.267 2.756E-16 101 184 414 13 98 99 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DNTKLYIGNISWDTTDEGLKEFLSQAGEVVEAKIITDRQTGRAKGFGFATMATEEAAAKAIEELNgqELDGRQIKIAKALPPKENE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5215203_908374 95 0.277 2.756E-16 101 188 414 5 94 101 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSNKVYVGNLPYSFTNEDLRNLFAAFGPPRVVQIVLDRETGRSRGFGFVEMETSEGVQQVIRNLHdtELQGRRLTVNEARDRAPGEARPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000329027300 95 0.250 2.756E-16 101 191 414 1 92 102 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QQNKLYVGNLPFSADEAQLRDLFSAYGEISELAMITDRDTGRSKGFAFITFATQQAAEKALEQdGKDLGGRNMRVNIAQEREKKGGGRGGNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000855934250 95 0.298 2.756E-16 104 198 414 1 96 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLDFNLTEAELQQVFAEYGEVVSVKIVKDRDTGRAKGFGFVEMAEDSDAKTAIEELEgaEIRGRNIRVNEARPKPE-KSDRPSRGGFGGGRP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5260370_23057193 95 0.263 2.756E-16 104 196 414 1 95 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLPYSSTETSMRELFETYGAVTTTKIVTDKFTGSSRGFGFVEMPNNDEAQKAIDELNgkEFDGRKIVVNESRPREDNGNSRPPRRDVGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719282_2279829 95 0.305 2.756E-16 122 224 414 0 106 113 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YFQQFGELTDAIAMVDPASGRPRCFGYVTFKDPAIADQCIAAgPHTLDGHQLDVKEPHQQEAPPKklvfEQPSEKMFVGGIG-DTTKEQLVEYFGKFGGVKDCFIVKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719199_404449 95 0.436 2.756E-16 103 173 414 42 112 115 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKIFVGGLAPETTEADLKDYFSVYGELSDIVVMRDKMTGNGRGFGFVTFQDSKVADSVVAQRHEIRGRTVE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000087071940 95 0.287 2.756E-16 104 181 414 1 80 117 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFVGGFPWATTEEQLKALFGEYGDVKSCKIIFDRETGKSRGIGFVDMPNDEHAQGAMESLNgsEFGGRRLNVTEARPRE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>22520|Ga0209938_1226985_1|+3|10 95 0.268 2.756E-16 97 191 414 22 118 122 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RGKEFCMNIYIGNLSYGTTEEALKAMFDEFGEVENVKIIKDRRSGRSKGFGFLEMPSNSEADQAIKALNGsrLDGFTIKVNPADPGGKKKPKRQSRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>15167|Ga0209591_11285775_1|+2|11 95 0.316 2.756E-16 98 196 414 13 112 122 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EVPAMPSLYVGNLPYTTTDAQLEALFTPFGRVERVQVVFDRESGRSRGFGFVEMPDQLEADAAMERLNGsdMGGRALAVNIAQPRQEAG-PDEPRGGFGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719500_580903 95 0.224 2.756E-16 146 257 414 0 124 125 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGFVTFRSAEMLELCLsTQPHKVDGKTVELERATPKAGAGREDTDpenklmRKLFIGGLDYQTPEEDLKAHFEQFGELVDCVLmkfqdTGRSRGFGFVTFATASQLDTCqAARPHVLGRKTLETK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>26231|Ga0315295_10191518_1|+3|10 95 0.293 2.756E-16 101 191 414 11 102 132 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PDTNLYVGNLPWDTTKEELAARFAQFGEVRGVRIITDKETSRSRGFGFVEFAQAADAQAALvEDGQDFGGRALRVNLANRQSEDRPRSGNGN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719506_1933237 95 0.314 2.756E-16 94 195 414 15 119 134 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+---------------------------------------------------------------------------------KQSLSQNGPASMLNSIRFMGSQSKLFVGGLSYGTDDHSLKDAFSSFGEVVEARVITDRDSGRSRGFGFVSFSSDESASSAVSAMDGqdLQGRNIRVSYATERPSGNRGFG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>RhiMetdeSRZDD1v2_1073273.scaffolds.fasta_scaffold1677327_2 95 0.245 2.756E-16 80 191 414 33 146 148 +--------------------------------------------------------------------------------RDXLXKEREVMNAARAEAGESMXAKLFVGGVSYDATEDELREIFSAHGELKEVHIATDRETGRSKGFAFITFASQKAGLAAIEELNGtkLHGRKITVQESNPSGGRGRKRRPRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719230_1968990 95 0.259 2.756E-16 101 216 414 15 145 149 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QGAKLFIGQLPRGADESSIREITETFGEVVDISIVKDKATGQSKGCAFVKFSAMSFAENCRNTLHGKqpfdEGNPLQVRFANGEAERlgipehilnSTNSKDCKLFVGGLPrnHEFDEDALRTLFSSFGEL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719427_414082 95 0.344 2.756E-16 101 185 414 17 103 155 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ENSKLYVGNLPFIVSKGELEELFSPFGEIDDCIVILDRDTDKSRGFGFVTFKEVEQAEEAMEKMaeYECHGRALNVRKANPRREGGE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3954465_15513411 95 0.275 2.756E-16 93 188 414 27 124 155 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174 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPHGITEAEFRAYFSQYGELEDCVVMYDRATGKPRGFGFITYKDERSIDFVMQDKlqHKIRNKWIECKRATPKAAGNEGPSN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5256712_4506026 95 0.301 2.756E-16 77 190 414 54 169 194 +-----------------------------------------------------------------------------PRLRSFFRHLGRADSAEDVARGHVMAHKLFVGGLPFSVTSERLREVFAAAGVVESATVVTDTGTGRSRGFGFVEMATAEEAQEAVTRFNGrdLDGRQVKVELAKSPEQSGGGGRPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711988_901745 95 0.357 2.756E-16 99 195 414 21 118 270 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PQDANKLFVGGLHPKTTQEDLKEYFSSFGTVDDVTIMIDNATQKPRGFGFITFTSENVAKMCLEQTqHTILGKSVDVKTAVLRNRTVLNPQPMQNFIG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000515956907 95 0.233 2.756E-16 101 263 414 55 247 284 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PTQTVYVKNLNFNTTEDALITHVQQLGfplgkELRTASLPKNtRVSGQNAGYGFVEFCNVDIANRgVIKiSGSKLDGHVLDAKLsgkqlgaqqnrvkrgaSSASKDTTSSYKGSKLIVRNVAFQATEKEIRSLFMNFGDVKRVRIPkkmgGSHRGFAFVDFTTHAEAAAAVnaLANTHLYGRHLVIEWAKEDD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>HubBroStandDraft_4_1064222.scaffolds.fasta_scaffold4833235_1 95 0.268 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+-----------------------------------------------------------------------------------------APSFVPGTRRTCMRKNLFVGNLPFTVSADDLREVFEKFGEVAATQVITDRGTGQSKGFGFVEMKD--GADEAIANLHgaEWQGRTLTVNEAKPREERP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690606_32056137 94 0.293 3.682E-16 77 168 414 7 98 102 +-----------------------------------------------------------------------------PRGLVARRERPVTPRSHEFQRERKLSKKLFVGGLAWATTQESLSQAFGQFGPVVEAQVIMDRETGRSRGFGFVTFENPSDADQAMRSMDGAD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719309_1607162 94 0.485 3.682E-16 97 197 414 1 100 103 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DDPDQTIDLILLGLPWKTTEEDIEEYFEPFGEVLMVELKRKPN-GESKGFGFIRFADKDVERRVVMQRHMIENRWVELKVPESAEGKGRHSSSCKVFVGGV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5688500_17980100 94 0.296 3.682E-16 92 180 414 14 104 105 +--------------------------------------------------------------------------------------------APRGPKGSYGPRKLFVGGLSWHIGSDDLKAVFVQFGAVTEAKVVTDRATGRSRGFGFVTFENPLDAAAAADKMNgaELDGRRLKVNPEDSR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5271154_1678312 94 0.278 3.682E-16 101 195 414 0 95 105 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNKKLYVGNLSYDCTQEDLEGLFAQFGKVEEVHLARDKASGRARGFGFITMEKDEDAQKAMQDLHdtEFLGRKLMVKEAF-REEDKPARPSNNRFAG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719333_1453074 94 0.322 3.682E-16 96 183 414 4 93 105 +------------------------------------------------------------------------------------------------KKKMAETSRIYVGNLPYELSDQDVAEYFGKHGSVTSSQVITDRETGRSRGFAFVEFATAEEAETVIKAENgtEMEGRALKVNEAKPRGAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712030_291634 94 0.361 3.682E-16 115 221 414 0 100 106 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+>ERR1719341_1684209 93 0.250 1.170E-15 0 175 414 27 192 416 +MSAWVPVSTSELAQLVEIETEEDGKLPLTSITLYFPDATALKFCSPGNHAFcEEVPVEGGNFLAPQGGWGVATRYIAVSSTSDIKKHEP--------KKGDVECKDMVLFDMKLNTTEAQVRECFKDV-EVLGVHMMqsRDNLTK----YAFIKFSDWEVAKVLGRQKHIINGGPCSLR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001335025120 93 0.256 1.562E-15 104 183 414 1 80 81 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIFVGNLSWDTEEEDLRDLFNTYGEVTKCTIPLERDSGRKRGFGFVEMSD--GAEKAIEALNdaEVEGRKLVVNESRPRESR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000670978747 93 0.325 1.562E-15 101 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229 238 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DAYMPKDQTTKQHRGIGFVTYENAESVDKVMSESHELAGSTIAVDRATPKEETGkvwettfpgasgvfnsyvntaqygtfdmsafrgydfpgsvaigntyednygrtnlwpagppasqirgpspglsvidssamkygstdsnfaPSRVGRKIFVGRIPVEATAEDLQLYFGQFGQVLDVYLPKDakkisHRGFGFVTFAEESTAEHVAQKTHEILGHRIAVDRAAPLDE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_58_1057296.scaffolds.fasta_scaffold523702_1 92 0.227 2.783E-15 86 184 414 164 264 293 +--------------------------------------------------------------------------------------DSGRSGFTRSRGSGRNRCKIFVGSLAWETTDENLRRAFSRCGDIVEANVVKDHATGRSRGFGFITFADEESARTAVKTMdgNIVEARQVKVNFADQGRRRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001019262758 91 0.305 3.714E-15 101 193 414 0 93 94 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MAKTLYVGNLAWRTTEQMLTDFFSSYTQVLSVRIISDRETGRSRGFGFVEVPD-EDVERVINEINgqELDGRPLNVKEAQPRPQPAGRGPRERRF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712039_161536 91 0.291 3.714E-15 102 203 414 1 102 103 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PGKLFIGGLSEETDDDSLAIYLSQFGDLVHASVCLDKATGDSRGFGFAEFEEPGIADQVLEMPeHIIDGKTIFMRKAGGRKNSHSEEG-CKIFIGSLAYETTE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712224_381706 91 0.312 3.714E-15 103 180 414 23 102 105 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSMFVGNFPWSTTEQDLMDYFSQIGPIQNCRIVLDRETGRSRGFGFIDFVNEADVHTAIQQCSGadFNGRQIRCDVSQKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719262_487257 91 0.225 3.714E-15 98 207 414 6 108 109 +--------------------------------------------------------------------------------------------------PPKRSRKLFVGNVAKSATQEEFQAHFQQFGELKDCVLMKHRNDPEHRGFGFVQYVDPEVSDTVLAQTHELHSRTLNVNVAKGR--------TKKYFVGGLARDrTTTESMR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5712691_12015130 91 0.255 3.714E-15 97 184 414 27 116 119 +-------------------------------------------------------------------------------------------------PKRRSMKNIFVGNIGYNTSEEALRQLFAAFGPVNRVKIMMDDYTGKSRGFAFVEMANAEDGDKAIATLNGtlLNERALNVNEARPKKEQE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719195_601603 91 0.274 3.714E-15 113 224 414 0 117 120 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------NTPSEALSDYFSKFGAVADAVVMRD------RGFGFVTFESPDAAAAALaEQKATIEGQVIDIRPTNAKGGGkggkggfgkdsSANQQTDKVFVGGLPQDCEDEKVRNYFAQYGPIAEAVVMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719361_3040610 91 0.208 3.714E-15 101 218 414 9 125 130 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PAKKIFVGGIPKTLSDNEFTDHFKSFGDVSDIVLMRYPGNSQNRGFGFVKYNFKSIADHVLSITHKLgtNDHEVTVNYSKTKE---PSVKEKRFFVGGIPRTLTEEAYKAYFATFGVVKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001323276117 91 0.310 3.714E-15 104 188 414 2 88 132 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGSLAWATNDDSLKEFFSQFGEISSASVVTDRESHRSRGFGFVEFANDEDADKAVagADGKDLDGRQINVSVAQSAGPKEGGRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>W1NUD7 91 0.306 3.714E-15 104 189 414 35 122 135 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFVGGLSFYTTENALSEAFSQFGQVIEAKIIMDRVSDRSKGFGFVTYASEDEAQRAITEMNGkvLNGRIIFVDTAKSKARFDDGGRP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719193_492428 91 0.285 3.714E-15 156 267 414 1 126 162 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DAMEVLHKTHELKNSFLNVTLAEPKDAKTPAgqmsnnapgnnwatGPSMKLFVGRLPSGMVQHELKEYFSSYGMLTDVFVPSPPRGFGFVTYASRSDAMRVLRMNHNLNGAQLNVSPAEPKDKDAQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>EndMetStandDraft_5_1072996.scaffolds.fasta_scaffold7916569_1 91 0.215 3.714E-15 104 233 414 2 168 169 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIWVGDLLPECEDQDLFSYFSKFGQVREANVEREKRTHLSRGFGFLKMGSQMLVDKVLKSSHKIWEHPIEVKLASDVKIEPEPVPewekkpkqekpaedkeksgqkraadfeegkeePGKFFVAGLPDGTDEATLQAYFESFGEVKEASIakddrAGKLKNYGFIRM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001107697417 91 0.241 3.714E-15 120 251 414 1 170 171 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KDLFAPVAHVHYARVLKDTETGRSRGKAFVHFSSEEDRQRALEQLNNIeyEGRQltmlaVNVDSApftprggasgehreqryqnreqsrNQTQRQRPSNQGRQLFVGRIPREADEGALRQFLGQVGTVQYLRIvrdreSGQSRGFGFVCYSSTEEADRALQElsGAEFEG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719215_2472284 91 0.250 3.714E-15 101 221 414 16 167 171 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PSGRLFIGGLAPDAEDDDLRKVFSQYGRLLEARVIKDKNTGRSRNFGFVMLADSTKQDDALKSIHVVAGRRVTVKLhqedgghghgggdrsgygdrggrgggggrgDRGGGGRGGDDKHRKVFIGRLEENMSQEQIKDAFaNKFGRVSDVWL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719242_1677767 91 0.293 3.714E-15 103 216 414 59 170 173 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNLIVNYLPNDWKEKKLLELFSRYGEVLSVIVIRDPRTRLSREYGFVKFCIESEAVLAVQMLDGriICGKQLKVDFAKPRRSRA----KANLFVSRFPANWTSKHLEILFCPFGAI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719424_1575114 91 0.231 3.714E-15 101 193 414 7 101 218 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DQRKIFIGGLPHEADQETIREDFGRYGEIEDVYLPRDRETGKPKGFGFVTYRDHRDASEAATAMGGRDyrGRSITCNIARPREENKSAPEGRGGY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>18093|scaffold129914_3|-1217|00 91 0.244 3.714E-15 97 184 414 117 206 219 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RPEERTRQIFIGGLAYTTTRDEVRQLFAAYGEVQHVYLITERETGRSRGFGFVEMLDGAEAQAAIEGLHGtrLGGRTLTVSEARQQEEHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APDOM4702015118_1054815.scaffolds.fasta_scaffold3388396_1 91 0.234 3.714E-15 64 182 414 57 184 248 +----------------------------------------------------------------HDGLGEKHQISFNSQGGKNSITNSSQPVSTTSNSYANSQAKIFVGGISWSTNEESLQSYFEQFGPVDSVEIMRDRVTGNPRGFAFVIFQSDETVDRILAsaaaspgstAKHVIDCKLVDVKRAHARGS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712048_293218 91 0.246 3.714E-15 44 180 414 50 203 321 +--------------------------------------------NFERKPIRSIQSMNSAYRPPYNPqfqqQRNHHYVPKETPSPKpiesLAATKIDNPNPESQNQQIIETNKLFVGGLPVKTTEADLNEYFSKYGPIENINIMVDQQTSRPRGFGFITFSDAKDARKCLDAtnsadsensGHKLHDKIIDVKTAVSK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A118K4K8 91 0.296 3.714E-15 103 214 414 33 144 358 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKVFVGGLAWETQSETMRQYFDQFGEIMEAVVITDKNTGRSKGYGFVTFRDPESAKRAcVDSAPVIDGRRANCNLASLGRPRHslpfGHIRSPTPFAGGMP------AVRgPYFGNYG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_36_1057302.scaffolds.fasta_scaffold267226_1 91 0.254 3.714E-15 102 246 414 114 270 394 +------------------------------------------------------------------------------------------------------GKRIHVGNLligkDKYTNEDTLLEYFSQYGEVENLEFFRRKFTDLPRGFAFVTFRHVESARKVLadAESHVIDGQNVTIALPMKTEKRvVRGKTDLTVVVSKVVKDTSKQAIEEHFSQFGKVERVILAQKdpsdeNLSSYYVVFSSLHGAKKALEQP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>J4D8W7 91 0.187 3.714E-15 85 260 414 95 388 395 +-------------------------------------------------------------------------------------ENNAEEAKESVDDEKINAHRIFITRIPFDATKDDLEEYFKKFGTVYDAYCPKQSNySTLNKGFGFISFDSEETIQKVFEtSPHVIMGREVIVDRATGTKfhtgagagnangsaaganqlKRPPPPPPRryreyqdnhrfkrhfeshmeypnkyprrdrhydrdvynhnippyrqnsatfdpnksvsyvfsasrtenrnheqyrtyqstpktrernapKLFVGRIGYDTTVQTLRSYFSQFGDVVDVYIPRdaqtqKSKGFGFLTFANKNSIHTVLDPSlkHVLEGRDIIVDYAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000559906182 91 0.292 3.714E-15 104 190 414 4 92 453 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGNLDFATTHEDLRKLFQPFGDVQGINIRKDRKTGRPRGFAFVTFDDEASATRAISEMHlkEHQGRVLTVKPQLARGTGPAPATDN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1B8G7N7 91 0.201 3.714E-15 87 243 414 193 384 526 +---------------------------------------------------------------------------------------EDASAPQKPEQEKRSEHGIWVGNLPWSVSKEDLKSFLINQGPmpeeaITRIHMPspddkrsanqvesRFTRTQHNKGFAYVDFSTAEHTLAAvalseellggrrvlIKNNKSFEGRPLVAKDAAAKKETKAP--SKRIFLGNLRFDTTEESLKEHFERCGPIETCMVatfedSGKCKGYAWITFADLEASARAV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000991139868 91 0.415 4.956E-15 104 178 414 3 79 81 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGGLAWATTESSLRAACAAYGEIEDVKVITDRDTGRSKGFGFVTFTTDEAAAKCKSQMDGqiVDGRAVKVDFPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A2H0XET4 91 0.301 4.956E-15 101 181 414 0 82 84 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSKKLYVGNLPFRFTNEDIKTTFAEVGNVVDAVVITDKMTKRSRGFGFVEFSTEEEAQKALADFNGkdLEGRKLVVDMARERQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>G7SQ96 91 0.295 4.956E-15 101 184 414 1 88 89 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DNTKLYVGNLSYEMTEQELKEHFESIGEVTHAKIIFDESTsnKRSKGFGFIEMSNEENAKKAIEKLNgtEFMGRNIIVSVARPRAKRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001372805896 91 0.288 4.956E-15 101 188 414 0 89 91 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNTKLFVGNLSFKLTEQELQDLFSRSGAVVSVAMPVDRETGRKRGFAFVEMETTDGAQAAISEFNGqsIDGRQIVVNESRPREGAGSGYR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0N0D0X5 91 0.255 4.956E-15 104 191 414 1 90 92 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLSYDITQDELQQLFAEHGSVVNVNIIKDRDTGNSKGFGFVEMENQSDGENAIKELDGqsVKGRNIKVNQARPRNDRSQQPRRRN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719245_2750863 91 0.313 4.956E-15 126 221 414 2 100 101 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YGEIEDCIVMKDPGTKKSRGFGFVTFKEVSELDEAQRNrPHIIDEKETETKRAMPRGEDntANHQSVTKMFIGGIKEDTTEDHIHEVFADFGSLKSVEI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001011996246 91 0.280 4.956E-15 104 190 414 1 89 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVANLSFRIQDENLREIFEDYGTVSSAKVVKDRETGKSRGFGFVEMPDDTQAKSAIEQLNdaEWDGKILKITEARPKAEGDNQFKSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000951272544 91 0.277 4.956E-15 101 188 414 0 89 103 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSKKLYVGNMPYHTTHEELEELFSAHGNVTEAKIIKDQISNRSKGFGFVSYEDEESGQSAIDALNgkEFNGRTLKVNVAEDKNRAGSSPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>22549|Ga0209957_1052708_1|+1|10 91 0.313 4.956E-15 104 184 414 20 102 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLAWKTSSNDLKELFQNFGEVEKAFIVRDRKTKRSRGFGFVEMASDEQAQAAIDNLNntIFLERTIIVNEAKPKNNDD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9293|scaffold2607270_1|-7|00 91 0.263 4.956E-15 103 191 414 3 93 104 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSIYIGNLPYSMSEDTLRRLFEQFGIVMRVRIVVDFEIGRSKGFGFVEMSSAADAEKAIDGINqrMVEGRTLWVSWAKPKESRAPQPTTGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>18645|scaffold160621_2|-482|00 91 0.296 4.956E-15 101 189 414 0 90 105 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------PAEKSPSKFFVGGLHRNVADKEFREYFAQFGELVDAFIMYNQHLKRSRGFGFVTFVYPEDARRCLQIQHTIKGKVVEIKKAIPRDAMPRGVKGKR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719263_1619116 91 0.300 4.956E-15 104 191 414 1 90 113 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGGLPPSVDTEQLRTYFSKFGAIQDVIVMVDAANQRSRGFGFVAFSDSAAVELCMEtyNTNEIAGKWIEVKRCIPQDKMGPGEKSSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001259521133 91 0.300 4.956E-15 101 188 414 6 95 114 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------MESKLFVRNFPFDVLKSDLESLFSSAGVVVDVQIPTDRETGRPRGFAFIEMGSVEEAQKAISTLNNqdFKGRPLSVSVAQPRPERPSRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719334_1333512 91 0.274 4.956E-15 155 275 414 1 130 135 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EMVDAVQAArPHELDGRKVHTKRAVPKEkssGNEPKEGVKKLFVGKCG-SLTEEDLREYFGQYGVIEDVYMvpdkaTGKSKGIAFVTFDDYDPVDKyIIEDSHYVNETKVNVEKALPKEATQGGGGRGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719387_2473249 91 0.282 4.956E-15 101 183 414 15 99 139 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MAMKLYVGNLTYDTTDDELRQAFQGFGEIEFSKINIDADTGRPKGFGFVTFMTQESGQAALAQMNgaELKGRTIKVNHATERRDG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000629808684 91 0.279 4.956E-15 100 183 414 55 140 142 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PDEDKLYVGNLPWSVDDGELAALFSAMGAVHSARVITDRETGRSRGFGFVELADEALAGKAVGQLdgHDLNGRQLTVNAARPRATR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690606_27798692 91 0.267 4.956E-15 100 205 414 30 141 142 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+------------------------------------------------------------------------------------------SPRIRFSVQRKMSHKLFVARLPWTVGRDSLRSYFSKFGEVTDAVVITDRGTGRSKGFGFVTLGPGSNIDAVINEQHEMEGRAVIVSKAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719373_1172435 89 0.254 1.569E-14 76 184 414 34 147 153 +----------------------------------------------------------------------------RGRDRDRDRDRRPARSEhywKKPTREPAPGCKLFVGNLSWQTEERKLEDVFAKYGRIIDVYVPRDVHTQKPRGFAFISFDDPRDAYEAQRELDGtdIDGRRIVCNPPAVRRDRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>D7KGG0 89 0.314 1.569E-14 102 188 414 34 122 158 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PSKLFVGGLSPATDVELLKEAFGSFGKIVDAVVVLDRESGLSRGFGFVTYDSIEDANNAMQCMHnkELDGRIIGVSPADSGGGGGSGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711881_13310 89 0.255 1.569E-14 141 263 414 2 134 162 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKHRGYGFIQFKTVNATKVVVNMPHFICNKPIDlhytaraldmLKAGIGTECIQLDNIPTKLFIGRLAQGVTTQDLHDTFIKYGPLKDVYIPPGGKGFGFVTFSSVAAAYKAMCETHQLKGEYLVLNTANSKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5262249_4323464 89 0.288 1.569E-14 104 191 414 0 87 163 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLPYDTTADELREMFSAYGRVLSAVIATDRETGQSRGFGFVELA--EGAEEAIQALNraQFGGGSLALNQAKPREGPAGGRQSRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001199253128 89 0.284 1.569E-14 99 184 414 34 121 167 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PAPSTKLFVGKLASSTSEEDLRAYFSHYGEIKDVYIPKDGQTGQGRGFGFVKFVLADDAERAVASLNakMFNGKKLSVDTAKTRTEAE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719356_345837 89 0.275 1.569E-14 78 191 414 19 134 198 +------------------------------------------------------------------------------KGNRRRSGKNDESAKKEASEFGPPGCNLFVFHLPDDWTDDDLHEYFAPHGTVISAKVMKELGTGRSRGFGFVSYEDRVSAATAIKKMQGykILGKRLKVEFKKGEQESNPMDTGDK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719334_2156420 89 0.329 1.569E-14 101 191 414 6 96 203 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DTNKIFVGGIPRQVTEDEFRKCFSQYGEVQFIQLMIDHVTQQSRGFGFVQFSNQKDYEQVLKTDVVLCGRNLDCKKALSREEQSGMRRGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000660453257 89 0.293 1.569E-14 102 191 414 13 104 214 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PMKLLIRNLARSTTEADLLELFESYGSVQYCNLVMDSVTGGSKGFGFVEMTTAEEAEAAINRFNgsELDGRSLRVNLARPQENRGPRNNRNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712147_300422 89 0.242 1.569E-14 83 235 414 44 215 218 +-----------------------------------------------------------------------------------KIEPKIEIKTEPTKNEGPTGTTLFVKNLSFKSDEEKLQILFHRFSP-TNVQISRRLEKGKylSMGYGFITVDSQRIAMEIIKTLQgvELDGHRLELKISNRKGSetlgtqrkeaknQIQPENSSKLIVRNVPFQCTADEIRSLFSTFGQVKNARTPkkhsGQHRGFCFVEMGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719247_1416641 89 0.421 1.569E-14 101 176 414 141 215 221 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DSGKLFVGGLNSATTGDKLRDHFSHFGKVFSASVIKDPATKQSRGFGFVEFQDGISA-AVLEADHMIDGRKCSVKP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>HubBroStandDraft_6_1064221.scaffolds.fasta_scaffold220089_1 89 0.617 1.569E-14 189 277 414 11 99 230 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PSKVFVGRCTEDITADDLREYFSKFGEVTDVFIPKPFRAFSFVTFLDPDVAQSLCGEDHIVKGNSVFVSTAAPKSQDNKNYHHNNSGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719154_703344 89 0.245 1.569E-14 139 283 414 0 156 260 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QTQASKGIGFVTYDNSAAVEEALvARPHELDSRTVEIKRAIPREENTEtaHQRTKKLFIGGLPSNVVEDDITTYLNDtyrgKGEVVKCELirnkeTNEVRGFGFLEVSTEDMADLIIIKDpkPVIAGKKVEIKKCEDR--SQGGGGRGGRGGGRGGGRG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SoiMethySBSTD1v2_1073268.scaffolds.fasta_scaffold3457290_2 89 0.202 1.569E-14 105 243 414 44 254 261 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+--------------------------------------------------------------------GDSLSASPNAKARNPDVLAEKPANVKKGTAQGSKPGRIFVARIPSRVSEEDLREHFEMFGEVEDAYRPRDFAKNTYRGIGFVTFVDPAAVDRVIATKHTLGGAEVVVDRATPKElsssmerqagaeetlrrypsveamannypamdlrgffneqfdanslnsfpqmatypnsignNRGPPsnfsddflgdvglagfaselydsntsmiaaaavmkqpstpgapdgkavkggsprlsptkneknhktmtdnfahvrkvRSGPRIFVGKISKDTVEQDLADYFTQFGFVMDVYIPRsrenkkEHRGFGFVTFETEASIKRAISQGtHNLKGAVLAIDVAVP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1V8T633 89 0.214 1.569E-14 105 243 414 103 279 433 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------PGNETQIFVGGLPNNCTEHELKEYFNKFGAVSQADVKIDKNTGRSRCFGFVRFESADVVDHVVEkyKDHHIDGKWVEVRPAGAKRKNDDGPPRSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719453_2297644 89 0.363 2.092E-14 112 188 414 0 76 103 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------YDSTVESLKEYFGKFGEIEECIIMTDSATGKSRGFGFVIYENTEAAEAAVGKDHMVDGKNVEVKRAEPKRSDGGPRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12243|scaffold484263_2|-222|00 89 0.258 2.092E-14 105 191 414 3 91 105 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVGNIGFDVTEAELKKFFDQFGEIETIKLITDRETGRTRGFGFVKYVAQTSAEKAIKEANgaMLSGRNLKVNLSQPRSKDGGGSRGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3989337_2801248 89 0.275 2.092E-14 90 185 414 8 105 108 +------------------------------------------------------------------------------------------PSRVPLREDFMGTTKLYVGNLSYETSEASLRRLFERHGDVASVTVMIDRASGRSRGFAFVEMGTPDQAQAATSALDGaqLDGRSLKLDEPRAREPQAP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000376068349 89 0.333 2.092E-14 101 185 414 0 86 108 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNTRLYVGSLPYAATELDLKEIFEAYGRVVYVRILKNSETQLSRGFGFVEMSTTEEAQNAISSLDgrEVDGRQIKVNEARPKEKREE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719456_602065 89 0.259 2.092E-14 114 219 414 0 106 109 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VSDEMLHAAFAPHGKILTCKVMLDIHTGISRGFGFVLFESAEEGARAMTALHGIqlGQKQIYVSVAMTNGLSG-LQQTPKLYVRNVPKALSLDFLRSHFSQFGEIVRI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A078GUQ8 89 0.316 2.092E-14 103 199 414 8 105 112 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKIYVAGLPWITKTESLRNYFEQFGEIVYANVVCDRATKRSKGFGFITFKEAESANRACEDPNpTIDGRKTSCKLAYLGARVHNNQSNENGLVSIFPY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711981_1211243 89 0.258 2.092E-14 151 257 414 0 115 117 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FKDKDAYTKAVTTPQTIKGRRIECKPALSKQKakiKSTDEKGKKLFIGGLSLDTTEDELIQYFQNFGEIYKAYLiydknTNTSRGFGFVEFRNFTSAERVIKDGtHFIKGKEIECK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712224_643134 89 0.285 2.092E-14 102 204 414 3 100 126 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PCKLFVGNLPFSMTPERLATMFKPHGEVIGAKLVEDRTTGKKKGFGFITFQSIESVEPAIAQMHNADceGRKLTVKMATARGDKSENQPVK-------PPTRTED----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719387_344132 89 0.339 2.092E-14 81 184 414 12 117 128 +---------------------------------------------------------------------------------KGKDKSASAMALPPSPAPTGQTNKIFVGGLPKDCDDGALQAYFSSFGTVTKQEVKIDLMTGNPRGFGFVEFDSPDAVAKVLASYsaHMINGKWVEVKEAVAKGKGD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719428_209413 89 0.240 2.092E-14 141 251 414 0 132 145 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKSKGFGFIDFERVSDAEDCLQTMNGIEiaGRTCRLDRSEKGQdyaagkgggggakRSQNSQQPNKLFVGRLAVDVEEEDIRKAFEKAGEITNVKIikdreSGECKGYGFIEFAQASQAEDALKdfNGVEIKG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711953_1394684 89 0.241 2.092E-14 104 188 414 2 88 146 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLYVGNFPFSTQEHDLQNFFEGIGEITNIKLILDRDTGRPRGFGFITFADEACIQMAIDKHNGedFNGRPLRLDRAEQRQNRGGDGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A178UJY3 89 0.271 2.092E-14 87 191 414 39 145 156 +---------------------------------------------------------------------------------------PQAESQTPARPQAEPSTNLFVSGLSKRTTSEGLRTAFAQFGEVADAKVVTDRVSGYSKGFGFVRYATLEDSAKGIAGMDGkfLDGWVIFAEYARPREQSQSYQPQNN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719235_342424 89 0.280 2.092E-14 65 182 414 36 160 163 +-----------------------------------------------------------------DGEHHLVEGCRLRVQRKQDGNRAAGGQPGRSRRDVPKkpthiPAKIFVGGLPQSCHTESLQDYFRKFGNVEECVSMVDAKTGRHRGFGYVIFTDSESVDKVMEAykDHEINGKWVEVKRCIPQGQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000877314368 89 0.312 2.092E-14 97 191 414 35 130 166 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSKKLFVGGLNFKTSEEGLRSIFGAIGAIEEVKIVTDYETGRCKGFGFVTFADPAHASEAISQfdGQEVDGRRVKVSEAIDNRKRGPRDSRSQSF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5579871_168630 89 0.288 2.790E-14 104 191 414 1 90 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NMYVSNLSFHTTDADLKNLFMEFGEVSSAKVITDKESGRSRGFGFVEMSDETAAKNAMQALQgkEIAGRSLGVSVARQREERSRNSHSGN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1700687_5195316 89 0.303 2.790E-14 98 184 414 11 99 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EVRPVTNVFVSNFPFTVTDADLKECFEQFGAVENAQVIRDRETGHSRGSGFVLMKDDREALLAIQELNGrdWDGRRIQVNVARERASRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1044071_5977121 89 0.294 2.790E-14 91 190 414 2 102 104 +-------------------------------------------------------------------------------------------PRVEEKESVLMHAKLFVGNLPWSIDDAQLEELFQAHGEVTAARVITDRDSGRSRGFGFVEIDAPDIA-AVISALNGrdIDGRPLRVGEAEDRRGSGGSRRDR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719318_1129144 89 0.325 2.790E-14 104 184 414 21 103 107 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIYVGNLSFEATEQDLKDAFGAHGQVETATIVKDTFSGRSRGFGFVEMSNEAEARTAISTLNgkEIKGRTVKVNEAISKSDGRRGEGGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001019023682 89 0.266 2.790E-14 104 191 414 1 90 109 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVANLHYRLNDEDLHQIFSEFGQVTSAKIIKDHETGRSRGFGFVEMPNQEEGTLAMERLNgsEVEGKQLMVNEARPKSPSNGGGGFRN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR550519_710288 89 0.547 2.790E-14 86 180 414 10 104 109 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------SVNLFIGNLSRDVTEAELRALFEPFGKLASVSLAKDKFSGVSKGFGFVEMPDKSEAEAAIAGLHrtQLKGQSMDITEARPREQRKQGKGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719453_781402 89 0.285 2.790E-14 77 177 414 26 130 131 +-----------------------------------------------------------------------------PKKQKKTEEGDEEEPEKKGGGDDEDPtagRKCFVGGLPWSTDEETIKKDFAECGEIEDVHLPKDYDSGQIKGFGFVTFTTKEGAKKLCEwNEQDYNGRWLKVNIA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5262249_61823923 89 0.293 2.790E-14 101 190 414 0 91 133 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176 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PQPGKLFVGGLSFTTTDEALNDYFSTFGPIKEAIVMRNPSSKRSRGFGFVTYVETSSAFACVdfAGTHKVEEQEVDVKHATPR--VDPPATETKV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_999120 87 0.387 8.808E-14 104 195 414 93 177 178 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGGLPRDTTSAHMKEYFGTFGKVADAIIMKDFETGKPRGFGFVLFEEQDTVEKVLaAEKHELNGGKVEPKKCEKKE--------GKMFVG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>3300023187.a:Ga0256613_1030520_23 87 0.305 8.808E-14 104 196 414 1 94 240 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+>ERR1719240_1147143 87 0.166 1.174E-13 104 259 414 20 308 346 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPKDCDEATIHQYFSAFGALSNVEVKRDLTKGQTRGFAFVTFESWEAYGLVLAtyTEHRIGDKWVEVKQAIPLDKGKGKgdgtlvppmplwavcgkgscvgratppaqlgaaagakggsacfaskalqhtpmrsvskgvsakcfggkrfsvwpcnagfskgsdsagniqeakldeyigtgailphngvssmflanarscndssvVESHKVFVGHLPKNCDEDTLLLYFSNFGTVTEILVKRDPagqtRGFCFVSFDSPEPVAELLATraLNNINGHWIDVKQA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000453631175 87 0.260 1.174E-13 102 191 414 86 177 528 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSAKLFVGNLASSTTSDEIRRLFAAIGSVQSCNLITDRAIGQSEGFGFVEMDSVESAEAAKEELNGLDvhGRILTVKDAKPLTKSRERVSSRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719375_964449 85 0.248 3.697E-13 136 262 414 0 130 150 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TDKVTGKTRNFGFVTMADSFAKDVIIAADHIIKGKLAGIRL--DKQRPDVNDVRKQIFIGNLEPTIEPDAVKEVLSQFGEVIDVHCPkhadsGNRKNFGFVTFREPSSYDACLAtKECVVNGCTLELRPAQGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719418_316580 85 0.267 3.697E-13 145 296 414 0 150 154 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFAFLLYKEVESIDNAADgTEHKLKGKSITVKKADVK--------PGKIYVGKLPDSgLNEDDVRADLEQYGAITEVVRPidksknNEPKNFCFVTFEKERIAKKLIQTGnININGHKLMVKDVTP--NPRDPNSRGGGRGGSRGGYGQQSFGGGGYGGRG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MEHZ01.2.fsa_nt_MEHZ010487408.1_2 85 0.259 3.697E-13 141 258 414 0 126 158 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GLSKCYAFIHTSDKRTYHRILNQKHYIQGRMIDCKDGFSREENPqlfEKMNSKKFFVGGLSVATADKNLHEYFSRFGSVFKAYVivdpnTNRSKRFGFVIMDSEQGVDTVMNGGkHTINGSIVNCKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>21983|scaffold3671410_1|+1|11 85 0.228 3.697E-13 104 200 414 29 133 164 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIFVGNLPYNTTEQQLQSVLGAAGDIVNVAIPIDRATGRPRGFAFVEYASEAQATQAISKFDGqdFEGRPLRVNMAEDRPPRrpfgagPPPGGPRPQFANNFPDD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719469_819653 85 0.254 3.697E-13 90 185 414 3 104 168 +------------------------------------------------------------------------------------------PGERRASAREQPSNKIFVGGLAQSVTTDRLKEYFAGYGPIVDAVVMLDRRTNRSRGFGFVRFSPGMQGGAALDAvmmhfrSHRLAGKWIEVKRATPASSSHP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719273_1487099 85 0.268 3.697E-13 87 200 414 53 170 171 +---------------------------------------------------------------------------------------SETSDAGETEEEEEETMKIFIGGLPRSYDEDVIRGLFSPHGEVLKIFVPTDRETGQPRGFAFLEME-KESGVKATEALNqiTIEDRVIKCNEQLSKEElakKKETEEGVKIYVGNVSFE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719291_692143 85 0.287 3.697E-13 90 188 414 5 105 173 +------------------------------------------------------------------------------------------PMGGRGPPDVGGLISLKVDNFPFNTSTEDLREMFAKYGEVADCYIPRDHATGQSRGFGFVRFSEEADADAAIRgcDRKEIQGRELRVQVAQHARPALQPRG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719410_224508 85 0.308 3.697E-13 91 210 414 61 173 175 +-------------------------------------------------------------------------------------------SRSPAKRAPRGPVKLFVGGLPPEAQDQDLRDHFKQYGELLEAQVICDRATGRSRNFGFIMLHEDSRKEAALRDNHNVRGKRVSVRLHQDMEPVGNSY-------GRTEESSREPELRKVF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719282_249170 85 0.292 3.697E-13 101 200 414 12 117 188 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EPGKVFVGGLPQQADEAALTTYFSNFGTVIGVEVKRDQLTGNSRGFGFVSLDSQEAVQAVLgfTGQHIIGGKWVEVKQAEERRGNPSGmnfiAGNNNTLTGMLPSS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5579872_3393630 85 0.241 3.697E-13 103 191 414 94 184 193 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNVFVGNLDITVTEQQLRELFAAHGTVENIAMVRNRDTGEPRGMAFVEMAQATEAQAAISALNgtMLNGRPINVNEARPKRDQDPTRDAGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1740137_25821 85 0.265 3.697E-13 145 277 414 0 142 193 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFGFVRYVKASMVDAAMAArPHSLAGRTLEPHRSAPKeysEKMESHHTVNEIYVGKMVAEISEEDLRKYFGLYGNIEKVSIPkgkedGELRGFAVVTFDDYDPVDvTCYKKVHYINEKRVFISKFINKKDMEELKRRYGGGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>CryBogDrversion2_3_1035228.scaffolds.fasta_scaffold98195_1 85 0.290 3.697E-13 101 184 414 55 140 209 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DGCKLFVSSLSYSTTAEVLKRLFESVGKVADCHVAKDRESGESRGFAFVTMAREADALLALEefNGHELDGREMKVNVANAGGSGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719397_2290893 85 0.256 3.697E-13 98 224 414 98 241 243 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EAEEGSTLFVKNLNFITTNDGMVEHFTACGNVHTATVatKKDPKTGdlLSMGFGFVTYLKKISAEKALKTLQhtKLDGHCLELKRSNRASTNMEsgvnhpkkndlGKPSTKLLVRNIPFQAKKEEIVQLFRTFGELTGVRLPRK--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5262249_37102767 85 0.282 3.697E-13 102 186 414 29 113 260 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SRNFYVSNLSHQTTSEDLRAQFEPFGEVVDAQVALNRNSGRSRGFGFVEMVSGGDQALAALNGHPLHGHNLVVRETRPRDERPGP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712137_267696 85 0.279 3.697E-13 78 163 414 67 152 261 +------------------------------------------------------------------------------RDSRSYRDRDSRGSRDSREDSQGKGNTLYCGGLPFGITEEELRKKFEPFGEISYCKIPCDPHTRQGRGFGFVAFQTAESADNAIEN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719267_133925 85 0.320 3.697E-13 78 180 414 58 163 299 +------------------------------------------------------------------------------RGLRDKQQVPPKSETIETDNHEGAPCKLFLGGLSATTTADDLQAYFSPeFGEVVDACVIVDSASGRPRGFGFVSFKSASSVQRVMDAGryHRIRERDVDVKLAVPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740121_754062 85 0.354 3.697E-13 101 179 414 4 80 362 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PHGNLFVGHLPEEVTQSSLQEVFGCFGPVTSVKVTMDLQTGKSKGYGFVRYEKPEDAARAIEALNGQGG--ILVKFADS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A158Q6T3 85 0.293 3.697E-13 82 195 414 247 359 441 +----------------------------------------------------------------------------------RRSSYDDRRYTFSRRDEPEPSRCLGVFGLSLYTTERDLKELFSQYGDLDNVQLVFDHPTGRSRGFGFVYFKKIEDAIEAKErvAGTEIDGHKIRIDYSITK---RPHTPTPGIYMG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000141457166 85 0.294 4.924E-13 101 183 414 1 85 86 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ETSKVFVGGISWNIDSNQLRDIFAEVAEVKYAKIVTDRETNKSRGFGFVEFNSVEDAVKAKEEFDgaEIDGRAVKVDFAEDRRNG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>23891|scaffold_88471_c1_3|+1011|00 85 0.250 4.924E-13 104 193 414 1 92 93 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFIGNLSKETTSQELEDKFTPFGNVDTCRIIKDMRSGESKGFGFVEMSDSSKASNAIHGLNnvELNGRKLTVNEARPKNVTRSFSDSNRRY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1F4RNI2 85 0.244 4.924E-13 104 191 414 1 90 93 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLPKTTTEEAVRAIFSEYGEVTEVKLIKEKYSNELRGFGFVEMPTRSEALNAIQKVNGFevEGRSLVVNEAKPRQERSDNYRRSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000137352644 85 0.378 4.924E-13 101 179 414 0 81 95 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MASKLFVGGLPFETKEDDLKSLFEEFGEVESAVIINDKFSGRSKGFGFVEFGTEEEAKRLgqIQADCMLEtGKELGFKIPTP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719424_2143904 85 0.247 4.924E-13 93 175 414 13 97 99 +---------------------------------------------------------------------------------------------PGGRDADSEGRKIFLGGLPFEAKDDDLRHDFEKFGRIEDVHLPRDKETDRPRGFAFITYSESLDAEDAAKDMHGRDyrGRQISCR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4030042_6591776 85 0.279 4.924E-13 91 181 414 7 99 100 +-------------------------------------------------------------------------------------------SGHAGESSEKMEIKLYVGNLSKSTTQEELKALFAQAGEVTAVEVIKDRKSGESKGFAFITMSAQSDADKAVTMFNaySLGGNALKVSPAKPRE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001054243940 85 0.284 4.924E-13 104 189 414 1 88 100 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIYVGNMSYETTEASLLKTFSKHGTVLNTRVMTDKFTGRTRGFGFVEMENDQEGLKAIEQLNdtMLDERNIIVNEARPRVENSDGDRN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001101241700 85 0.261 4.924E-13 104 189 414 1 88 100 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIYIGNLSFQAEEDDLREIFADYGEVKRISLPTDRETGRKRGFAFVEMAEDAHEDKAISELDgaEWLGRELRVNKARPRNDSGGGRRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>17942|Ga0316622_102993945_1|-183|00 85 0.279 4.924E-13 101 191 414 0 92 101 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGTRLFVGRLPHSKNEQDLGAMFAPCGNVESVRIATDKETGLSRGFGFVRMSTVAEAEDAITRLNstDLDGKKLIVRVAKSQTDKRRPAAPAN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712135_82429 85 0.245 4.924E-13 135 249 414 0 97 102 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MIDKETGNSRGFGFDTYADPACINQVMA------------------------SKPHNVFLGGISMEASEDDVREHFSKYGSVVEVNFvvdktdsTRPHKGFGFVTFEDESSVDQAVRSSVEL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719410_403082 85 0.250 4.924E-13 99 185 414 6 101 103 +---------------------------------------------------------------------------------------------------EEIMRKVFIGGIPRSTTEDTLKDVFGKYGTILDCVVIKDRESKQSRGFAFVTYDNEDSVENILEwdesasklkNSIQVDGKVADVKRAIPRDQNDE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5262247_3173934 85 0.270 4.924E-13 76 160 414 19 102 103 +----------------------------------------------------------------------------RPRRNRRGRERRKTARNRSCNQEGGIMR-IFIGNLPWSTTEEELAQLFEPFGTVDRAQLATDRETGRSRGFGFVDMPDDAEAREA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1U8F0H9 85 0.319 4.924E-13 83 177 414 5 101 105 +-----------------------------------------------------------------------------------KFIENYQTPFSRLTTSRHSCSKLFVGGLCYDTNEPVLKQAFEQHGEIIEVKVICDHKSGQSKGYGFVKFTSETAASKALKEMDGqlLDGRNIRISYA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>M2WZB1 85 0.268 4.924E-13 101 191 414 2 98 106 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QAVRLFIGNLSWKTSSEGLKRAFQNAigveASVVNAHVVMDRYSGRSRGFGFVTFESPEDAASAVNLLNgkELDGRAIRVDLAHEREESAPRQRRQK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719220_1456095 85 0.270 4.924E-13 87 180 414 12 107 108 +---------------------------------------------------------------------------------------PEKAPTPKTKHQTKKMASVFVGNLAWRVSEQELGDIFSQYGQVSSVRIAMDHDSGRSRGFAHVEFERQEEADAAVQQANgiEIQGRAIRTDHGRRR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_1522982 85 0.298 4.924E-13 100 184 414 5 91 109 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PRTKRIFVGGLPQACRDAELAEYFNQFGDVVEATVYMDHTTGRSRGFGYVTFEDENICELALENGeyQEIMGKSVEVKPSKPRDDED------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719237_1208601 85 0.291 4.924E-13 87 189 414 5 107 116 +---------------------------------------------------------------------------------------PSVTSSAPPKSGNGKSIKYFVGGLPPEAEDEDLKSHFSKFGELIEAQVIRDRATGRSRNFGFVAIADTMSRDRVLQESHSVKGRRVSVRIHQDMDERSGDRDS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719409_2000873 85 0.444 4.924E-13 105 175 414 0 71 119 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+------------------------------------------------------------------------------------------SPGVAAAASGDDAAAIFVGGLPFALDSDGLKKHFEYYGTVVSAVVVFNPNTGKSKGFGFVEFADSKIRDKVVAEGaQEIDGKSVEVKPKQPKAGKGSKGDGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A2H3X746 85 0.247 4.924E-13 77 188 414 15 135 203 +-----------------------------------------------------------------------------PPPNRRSRSRSSSRSRGRSRSRSQDSRaaknpgnNLYVTGLSTRVTSSDLEKYFSKEGRVQECHVVMDPRTRESRGFGFVTMETLEDADRCVKYLNrsVLEGRLITVEKAKRKRGRTPTPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719375_2273675 85 0.293 4.924E-13 102 191 414 82 173 233 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KIYVGRCTEDITVDDLRSYFSQFGEVTDVFLPRPFRAFAFVTFADAEVAHSLTGDDHIVKGTSVHVSSATPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719495_613805 85 0.278 4.924E-13 100 196 414 137 240 283 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PKLCKLFIRGLNWDTTSETLTTVFSEYGTVVESRIIMDKQMGRSKGYGFITMSTADEAKKALENvERKIDGRMTYINLASngptfgPGMSAGPRGRGRGGFGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000669060025 85 0.316 4.924E-13 102 178 414 8 86 325 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SNDIYVGNFPPTTTEAHLRTLFADFGTITKVRIATDMATGGSKGFGFVEFGEARDALMAIKEMNqlEVGGRTLKVNFAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A151Z2L9 85 0.305 4.924E-13 100 193 414 18 112 339 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QPPNTIFVGGINWRADEEAVKTYFDSFGKVLDVKIIMDKNTQKSKGYGFITFQDQESVNKVKSSPNlLFMGKNMNIGEPVRKSNPNNQINSPIVY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSMisStaDraftv2_1062788.scaffolds.fasta_scaffold6776524_1 85 0.274 4.924E-13 105 204 414 53 154 345 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVGGLHFSTDDSTLRSFCEAFGDVMFVKIIHDHDTQRSRGFGFVTFANADEARRAVQQMDGrvVDGRNLRCNLAPDKERDRRDTSFVSSFSGRGRHAVDDE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712093_390278 85 0.274 4.924E-13 100 188 414 39 129 357 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PPSKSVFVGNIPYGLTEEQIIRIFSTAGKVLNFRLVYDRETGRPKGFGFVEFPDSDSAASAVRNLndHEIMNRKLRVDFSNDGDNDDTAAP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001396735008 85 0.296 4.924E-13 92 180 414 61 151 387 +--------------------------------------------------------------------------------------------AAKEAAKEELGFKLFIGGLPYETNEEELTALFAEHGELKEVHIATDRETGKSKGFAFVTFDNYSVGKDALPNLKslKIGGRKITVQEAKER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>tagenome__1003787_1003787.scaffolds.fasta_scaffold8731003_1 85 0.239 4.924E-13 117 263 414 72 232 437 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ESVYMFFSQFGNVLDCYLP-ESATN----VAYLCFEDENTMEAVLQfppEMLCIEGVYVTLSRASPRPDYSMNNTD-RVFVKNCPDNINRADLRNYFQQFGLVTDVYIPkdkitGEQKKFAFVTFASVESARSAISFGdvhrliyidrmtNVINTIPLQVMPAEPRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0R3X2D4 85 0.252 4.924E-13 104 181 414 46 124 483 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFIGGISTSTTADDLRVFFSTYGDIDSCELMFDRATNRSRGFAFITFATESAADiVCQKQFHTVNNKKVEVKKAVPKE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A3FPV5 85 0.296 4.924E-13 68 183 414 327 443 746 +--------------------------------------------------------------------PNRLYVSRAQKKNERQVVLKSQHEAVKESHQRYQGVNLYVKNLADSINEEDLRSMFEPFGTVSSVSIKTD-ESGVSRGFGFVSFLSPDEATKAITEMHlkLVRGKPLYVGLHERKEQR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719505_410740 85 0.168 4.924E-13 78 243 414 496 744 971 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6.558E-13 101 175 414 0 76 78 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MATKLYIGNLPFKAREEELQALFQQAGAVESVNIIRDKISGQSRGFGFVEMASAEDGQKAIEmfNGHSMENREIVVN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000654582765 84 0.252 6.558E-13 104 188 414 3 86 88 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNIPFRITSEEIKNVFGQYGEVTNVNIVMDRESGRPRGFCFVEM---ENAEAAINELNGkdMGGRAIKVNIAQERPRFDSAPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001138561393 84 0.280 6.558E-13 104 183 414 12 93 94 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVAKLDYGVTSENLQTVFEEHGAVMSAVVITDRDTGRSKGFGFVEMESEEDAMNAINQLDGssLKGREIVVKKAEENRRR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5579864_1544619 84 0.313 6.558E-13 101 184 414 0 85 96 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MASRLYVGNIPHDATAEALRTVFAEFGEVADVQVVVDRYSGRPRGFTFVTMAKPEDATNAASKINgtMFGGRPLRVSDARVRRSGD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>7417|Ga0075513_1171242_1|-1|11 84 0.255 6.558E-13 134 222 414 1 97 99 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IPTDRDTGAPRGFAFVTMV-KEEADAAIENLSgvELQGRVIDVKESLPRGQKAPPRERPntsgnevKLYIGNLSFDTEEDTIRQVFEEYGELIDVYQP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3989338_4843245 84 0.285 6.558E-13 101 190 414 9 99 100 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MQTSLFVGNLSFQATEEDVKKLFERAGKVESVSIIMNRRSGKPKGYGFVQMADVESAQNAlMMSGEEFMGRSLIVAESNPKKSESGRPFSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711874_230227 84 0.313 6.558E-13 126 221 414 1 99 101 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YGIVEKVEIIRDKDTNISRGFGFVYFQDQEGLMNATSTVHHLNGRRMDCKEALNRinaKQRLSKERSHKIFVGGLSQKTKEDTLYDYFLVFGIIYKAYL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5262249_14866968 84 0.317 6.558E-13 104 188 414 17 101 104 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVYVGNIPYSTTETDLRDLFSPFGNVDSVSIITDRDTGQSKGFAFVNVDGDINAITSQLNGTMLNGRALKISEAQERQQRSGGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711879_283569 84 0.317 6.558E-13 97 180 414 18 102 104 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DRDPKVCKIFIRGLSYETTEDVVTEVFKEYGEVRNVQIIKDRQTLRSRGFGFITMGTKQQAETVLAiESREIDGRTTYVNLATER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719444_788707 84 0.288 6.558E-13 127 224 414 0 104 107 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GEITDAVVMRD------RGFGFVTFADQSSADAAMgAGSQMIDGMTIEIKPANGKGGKGGKGGCGggkgggagpvtdKVFIGGLPQDCLEERVREYFGQYGNLVDCVVMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719324_1362326 84 0.252 6.558E-13 118 224 414 0 109 110 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ELHDTFSAFGNILSCKVALD-EKGESKGYGFVHFESTESAENAIQMVNdmQLGSQKVYVGHFRPRKDREEEKETswTNVFVKDLDETIDTEKLREIFGAHGEVTSCIVMTD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5881628_204568 84 0.500 6.558E-13 102 153 414 57 108 110 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SMKLYVGNLPYNTTEDDLRTLFSQYGNVDSVAVITDRDTGRSKGFGFVEFGD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719324_517764 84 0.313 6.558E-13 104 182 414 26 108 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIFIGGLPQTCDETKLRGYFEAFGPVTDARVMMDRQTGRSRGFGYVSFQLEGSLElvlnQAQSAGHAIDEKWVEVRRCEQKNS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719409_39241 84 0.266 6.558E-13 101 203 414 14 115 117 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DSCNLIINYLPPDMDEVEVRRIFKTHGPIDSVKIVRDLKSGRSKGYGFVRYHSPEHTTNAIRVLNGlpIRGKRLKVAKARP---HSHNYQDTNVFVSRLPPHFTD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711894_242528 84 0.270 6.558E-13 78 176 414 18 117 118 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------SSKLLVKGISFTSTEESLTQAFSPFGKVLDANIVRNKVTNKSKGFGYVTFETEEDAEKALVNMNgkMVDQRVVLVDKAWPDNRKAKNVG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5438477_7018479 84 0.280 6.558E-13 102 188 414 28 116 126 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SMRIFIGNLSSETTDDDLLQAFEPFGKVNSAEVVKDKFSSESKGFGFVEMPEAADARAAIAGVNgtMVKGRAVNVSEARPRPPRREGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719414_490762 84 0.255 6.558E-13 122 216 414 0 126 127 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HFAKYGTVVDAVVMY--KDGKHRGFGFVTFDSPESMDAVLTEDQVIDGRTIDAKPAVPQGEvatsrangsmelhgppafggvrhGGPPARPSgppssigpacdKVFVGGLAQTTTEEMVRDHFGRYGNI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550514_268787 84 0.206 6.558E-13 119 235 414 3 127 130 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LCDTFSIFGHILSCKVAAD-AAGQSRGYGFVQYESEDAAKQAIERVNGmlIEGRKVFVGPFVKRDQREPvdgeAVKECSLYVRNFPMDWEDEKVSELFKPFGELASTFVMSDavtQKRYGFVNFKE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740138_423765 84 0.307 6.558E-13 102 178 414 12 89 130 +------------------------------------------------------------------------------------------------------CTSIFVGNLSWDIDEESLKEAFSSAGTVISVRLATDRNTGEFRGFGHVDFEEEDAAEKAVAlRGTEVMGRAIRVDYAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712086_784122 84 0.236 6.558E-13 116 252 414 0 130 132 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EESVKAYFSYYGDVIRVNL------NDERRFCFVRFVDSGSAKQAVeeEEPHVLDGETLDIRKVKPR-------GVGQIFVGGLPGQTTSESLKAYFSYFGAVQDAEVrvddNGKSLSWGLVDFKDKQSMSCALAEtEHVIDGK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719284_2237223 84 0.300 6.558E-13 96 182 414 42 131 133 +------------------------------------------------------------------------------------------------KAPPPETRKIFVGGLSHQTKESSLAAYFSQFGTLADVVVMTesNANGRRPRGFGFVTFEEPKAVDRVIcSRFHPIENRMVEVNPAIPREQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719409_456742 84 0.207 6.558E-13 123 235 414 2 134 135 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FADYGSLVSAEVMSKPD-GRSRGWGIVEFSTTEGAGNALDNMNgaEIDGRAIKVEFQKPRTARAPrqrrerkprqqtefaePSPSNSIYVGNLPWSFGDDDVFALFEGTGatsaEVKSGY-DGRSRGYAIVTFDS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>7151|scaffold_388463_c1_1|+250|00 84 0.304 6.558E-13 101 190 414 0 91 139 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+----------------------------------------------------------------------------------------------KGAEDELDESRLYIGNIDYSATEKDLVAHFSKFGHIAAVNIPVDRHTGKARGFGFITFKRVADAIKAMDlDGSEFKGRQIQVNFARER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SoiMethySBSTD1v2_1073268.scaffolds.fasta_scaffold2623830_1 84 0.210 6.558E-13 101 221 414 6 156 159 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DPRCCFVGGLPkgYQFTEAHMMVYFANFGTVTRAEI-RRGDDNRPRGFGYVWFSTEQEAENARAyENHVIEGKKVEVKTSLPPKPKSEGLNHGKeaawramervlqreageepglgatgvteLYVARMPMTVNEEAMYAYFSQFGPVLECKI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719318_1649529 84 0.361 6.558E-13 163 256 414 1 86 171 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NQHEMHGRTVTVKVKQEK--------PMKLFVGRLSHDATAEELEEYFSKFGKLTDVYLPKPFRNFAFITYASTEDAREVMRGHHELKGSKMNI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_612584 84 0.273 6.558E-13 146 315 414 0 170 182 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FAFIVFDSSETIDKITEvKDPLINNKKVDPKKAKAR--------HGKIFVGGLKPELTDEELKTFFSTYGKIIEMQMPfdkqnNKRKAFCFITFEQEAVVAELLKTPkLTISGHQVDLKKATPKPDmmMMRGGMMGGRGMRGRGGMRGRGRGGYGQGGYVGYGYGGYDGYGYGGGYGGY-------------------------------------------------------------------------------------------------- +>23268|scaffold84072_2|-577|00 84 0.275 6.558E-13 105 189 414 2 88 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------TVYVGKLSYSATEHDVERVFEKHGPIAEVKVIKDRETGDSRGFAFVQFENSADAQSAVDGLYgfELKGMVIQVSIAKPKQDRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000668131185 84 0.658 6.558E-13 181 262 414 5 86 234 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QEGAHQLISRKVFIARCTEDLTADDLRNHFNQYGEVVDVFIPKPFRSFAFVTFSDPEVAHSLCGEDHIVKGVSVHVSYAAPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_739796 84 0.350 6.558E-13 104 179 414 18 94 237 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLAPNVDNDVLYEYISDYGEVVDSIVMMDAETGNSRGFGFVTFTNPAVVEEIMKTPrPEILGKSVECKRARP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0U9HJ32 84 0.288 6.558E-13 78 179 414 130 233 237 +------------------------------------------------------------------------------RGRSRSRERGRTSDRNRGKGAYRPGNTVFVAGFNFITTEKDLDRKFSKYGRVVDVRIVKDRRNGESKGFGFVTMETDEDADEAVDKLDqtTWNGRVVLVEKAKS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>GraSoiStandDraft_55_1057291.scaffolds.fasta_scaffold4094805_1 84 0.301 6.558E-13 103 184 414 6 88 243 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RRIFVGGLSIDCPQQAIGDYFSQYGEVEDVYMMIDKFTGRPRGFCFVTFGTVEAKQAALdARLHTINGVEVEAKIALKKGQKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_1603941 84 0.320 6.558E-13 103 197 414 14 113 264 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKIFVGGLADTTTEESLTNYFSLYGGISEAVVKIDPLTGKSRGFGFVQFTDPASMQLVvaesIQSGHEVDGKSVEVKVYQgARQEAQQGFSGIGVANGGL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719438_398489 84 0.297 6.558E-13 54 181 414 1 131 283 +------------------------------------------------------RLIPSMLHqSPRAKQTKLRRFLLVVSAKKLLQKKIDPKHAtPKSKSKANKTKKIFVGGVSQETSADEVKAYFNQFGKVDEAVMLMDQQTKRHRGFGFVTFEHEETVDRVCEiHFHTIKNKKVECKKAQPKE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719498_1021063 84 0.250 6.558E-13 94 191 414 203 310 454 +----------------------------------------------------------------------------------------------KVPPNKKDTRKLFVGGLPTDVTEEEFELFWRQFGEITDSVVMIDKESGRSRGFGFVTFKEEASARAILQNFPdpnkygsacvLMRDKPCEVKPAVPKDGNNFYGQNHR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A212ELV6 84 0.321 6.558E-13 104 186 414 220 303 550 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+-----------------------------------------------------------------------------------KSVGKAVPAKPVMDEPEKDPCKIFVGGLKGTPNEEDIINYFGCFGEVADVKMMYDKLSGKSKGYCFVTFSAQEVAEEVLAAEvHELNGEHIDVKPS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719305_138125 83 0.322 1.548E-12 103 191 414 106 195 223 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RRMYVGALHFSTTEKSLIDYFSQWGPVERCQVIRDKDTQMTKGFGFVTMEDPATCTKIIAQaVHIVDNRTIRVSLTHTSGKNLENFKPKN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719313_792083 83 0.220 1.548E-12 141 270 414 0 153 329 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKSKKFGFINFSMHEEALLAvqLKDKYLLHGKELGVFRAQKKTERisilsrlfEERKRERvakhhglNLYVKNFPLDYGEKELRKQFSEFGTITSCKIMRDdntdnSKGFGFVCYSNVIEARRALseMKTRVGPGKPLYVSLAQTKEARRKQLE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000315158254 83 0.263 1.548E-12 101 212 414 133 239 395 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QQNKIYVGGLPTSVTSDALTVYFQKFGDIQNAVVIRSRRTGNSRGFGFVVFRGKKSLDACLQNpdPHVFDGHEVELQVARPR-----RRNLYNTFVQ--DKDATEDKIEAVMAQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719356_307380 83 0.326 1.548E-12 102 198 414 134 234 396 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SSRVFVGGLPHGCTDEMLSDYFSAYGTIVEAAVKKDLDSGKPRGFGFVAFESAGSVDMVMAdyEKHRIEDKWVEVKRAISQEvlEFKERYGSARLLLGPCP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719247_2525078 83 0.276 1.548E-12 44 173 414 337 466 535 +--------------------------------------------DADGKEKRGGKRRKGGSPATKGGAGTMRFTLKNDQREKlerlRSTSQSDTENGSTATAAAAAATNLFVGSLPRSVDGGALRTLFSNFGEVTSAKIITDRKTGKSKGFGFVTMP-KEDARAAMEA---LDGYQIE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719329_140323 83 0.195 1.548E-12 104 271 414 13 257 754 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIFVRNLPPDTVRSELEELFSDVGPIKKCSVIRDKkdaasGTALCKGFGFVRFVSAEDAEAAVssqsqdfvikrenrefklvvqstaSSSNDNHGKTeagesnisqssssssaskvVHKDDFQSKQEKSSEivpeeammKRTSRIIIRNLAFTAKKSHIEEVCKKFGNIVDIHLPtvninhsnksdrgrrqqPQHRGFAFVTFKEVQSARDAIhasaSSSILIKGRQVAIDLSMPKTKHQFQKQQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000910225357 83 0.264 2.060E-12 97 164 414 5 72 74 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RKAPMSKKLYVGNLNYDTDEAQLRSLFSQYGEITDIHLPMDKMSGRPRGFAFVTISEDAGATNAINNL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001098185679 83 0.284 2.060E-12 97 182 414 2 89 94 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RKIKPNKKVYVGNLSLETTEPDLRALFSGAGDVMSVNIVKDRQTGQPRGLAFVEMSSQWEARRAISMLNrtNFLGKNLLVKEARTTQS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>8484|Ga0316190_11523381_1|-22|00 83 0.269 2.060E-12 104 179 414 2 79 94 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIIVGNLDFSVTEGQIRRLFDPFGDINEVGIATDWETGHSRGFAFVEMDSRKDAEKAIEELrgTQLEGRSLTVRPAPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719394_750774 83 0.268 2.060E-12 98 177 414 0 81 103 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------DWTLERLKEHFGRSGEIVFAAFFTDRETGQQKGACKLEFATHEAAQRAIDEFHgsEVDGRQITVKQLDAGPPGERPERaprpprgedGRTLFVGGLSWDTSNEALGSHFARCGEV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711871_1041194 83 0.298 2.060E-12 114 188 414 1 77 120 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTPHDVRREFDRFGKIEDVFLPRDRNTGGSRGFGFVLFENLDDAEKAIEEMHerEFDGRKLQVNKSKPRPEQGSRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719223_857525 83 0.295 2.060E-12 88 191 414 7 110 120 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGGREPVLKVFVGGLDPTVPETEIKEYFGQFGTVSDVDLPfdkvkNQRRAFCFVTFESEAIVDKVCENPkQTIGAKQVDIKKATPKNDQFGGFGGRGGRGGFRGGRGGYGGYGGGYDYSQGYGNQGGYGSGGQQG------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A2H3Y7E2 83 0.247 2.060E-12 92 190 414 67 167 171 +--------------------------------------------------------------------------------------------PPAPKSASRASTRLYVSGLSFHTTKESLRNAFQNFGQLVEVTLVMDRIANRPRGFAFLRYATEEESRKAIEGMHGkfLDGRVIFVEFAKQRSELSQGSKPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719199_1387847 83 0.230 2.060E-12 100 216 414 32 174 177 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113 193 +-------------------------------------------------------------------------------------EKNRAAAEAEKLKAPPGPTRLYVGSLHFNITEQMIKAIFEPFGVVESVQLIYDSETGRSKGYGFLQFKDADAARQAMDQMNGFElaGRPMKVGPVTER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>RhiMetStandDraft_4_1073278.scaffolds.fasta_scaffold596542_1 83 0.267 2.060E-12 101 186 414 0 85 201 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGNRIFVGGLPWAVGDGELRAHFEGCGEITDAVVVMDRESGRSKGFGFVTFESDESAXXXXXXXXXXXXASARPSLAPSAAPVGLP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719183_798336 83 0.321 2.060E-12 104 188 414 16 102 225 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLSQSSDENSVMGYFSQFGNVVHVEIKRDHETGRTRGFGFVTFDSPDAVALCnsMNGQHSLDGRNLETKSAMAQGSKGGDAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>984|scaffold_7176_c1_3|+1260|00 83 0.305 2.060E-12 87 179 414 146 240 250 +---------------------------------------------------------------------------------------SAARPARKVEQAEVTSPKLYVGNLSFDATESDLVELFNGVGSVRNAEIVTHRQTEKSKGFGFVTMTSVDEAQRAVQELHEkdFLGRKLVVNGAKS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719354_765674 83 0.284 2.060E-12 91 184 414 170 264 265 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+------------------------------------------------------------------------------------------------PPGQNQFKKVFVGGLPPDTTVQDIKDYFEGSGKVTEVLLMHDRNTKRLRGFGFVTFESDLAGKHVCEAgFHKLKGKSVECKSAQPKE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5258707_2400394 82 0.256 2.742E-12 105 184 414 43 124 127 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LLVGSLGSEVTHEELRRRFETYGQVVQVHIIVDRDTGLPRGFAFVEMTNDAEAERAIKGLNGsiLRDRALDVNYARPRPERP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719188_884562 82 0.295 2.742E-12 78 173 414 8 105 128 +------------------------------------------------------------------------------RPISLLSEAPSAMQAMSEPLPPGSTKKIFVGGLPQNCTEQVLSNYFMQYGTIVDSVVMKDRETGNSRGFGFITYDSENCVEMVMAqyQDHRIERKWVE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719270_277345 82 0.290 2.742E-12 104 189 414 34 118 133 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFVGGLAQHTTKESLNAHFTQFGP-ADSIIMMDRATGRSRGFGFVDFQDEQAMKAVLASSHQVDGVMVTVSAYAGMGGQPGPQQP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711865_1054727 82 0.308 2.742E-12 97 189 414 31 124 139 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DADPTNRKLFVRGLAWETTSDELLEEFKEYGPVEEGTVCTDKSTGKSRGFGFVTFKTHAGTMAALATPgKMIGDRMTQCKLASDGAPGKQQQPP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>23183|Ga0160428_1085117_1|+350|00 82 0.341 2.742E-12 105 172 414 0 84 143 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------MFIGGLNWETTDrkpvtvatvmtktddstESLRDYFSQFGEVTECTVMRDGATGRSRGFGFLTFRDYKTVNTVMVKEHYLDGKIV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_SOC_28_MAG_00070_000000001052.2.1 82 0.257 2.742E-12 144 259 414 10 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0.284 2.742E-12 78 165 414 53 140 154 +------------------------------------------------------------------------------PRRSRSQSPAPAGKAAAPVDVANPGNNLYVANLATRVGERDLQELFSKFGRVDKCEVIVDPVTRESRGFGFVTFEDVRDAEDAVKEMN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_838649 82 0.315 2.742E-12 104 193 414 8 99 158 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVGGLTQDTTEEVLNEVFSQCGVVTETEVVKDKMTGRNRGFGFVTFSEAAGADYAVANSGILQvaGRSVEVKKCAKRTPKAEMNPTPGQF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_2398843 82 0.294 2.742E-12 90 191 414 67 168 169 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SQEDAMEVLRNTHEMKDSILNVTVAEPKDAKMPveqmsiygggasnnwnynnapgndwmTGPSMKLFVARLPSGTSQQEFKDYFACYGMLTDVFLPNPPRGFGFVTYASQNDAMRVLRMSHMMNGSQLNISPAEPREKDKEAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UPI0003288F97 82 0.285 2.742E-12 96 184 414 38 128 183 +------------------------------------------------------------------------------------------------KQRLTMNNKLYVGSLNFAVTQQDLSDFFNGAGTVLEAIVVTDRSTGNSRGFGFVTMSSEMDALNAIEKLNgkELLGREVSIKLALDREARP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSMisStaDraftv2_1062788.scaffolds.fasta_scaffold12850721_1 82 0.264 2.742E-12 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+---------------------------------------------------------------------------------------PSRSRSFKSRRLASPCRCLGVFGLSPQTDEKKIRSVFSPFGNIEKIILILDRETNRSRGFGFVYFFSVDDAQRAMQETAGmtLDDREIRIDFSFTRRER-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712150_111769 82 0.512 3.649E-12 183 262 414 0 79 153 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QNRPDESCKIFVEKLSESVTCEDLKEHFQEFGIVTDVYIPKPFRQFAFITFSESKIAQSLYGKNHTIKGINVEIRPAVPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550537_2137578 82 0.258 3.649E-12 101 183 414 0 84 165 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EENKIIIRGLPFSVEQSELEKLCAEYGETTDTFLVKDRDSGRSKGFGFVTFADKEAMEKAIEALdnYEMSGRNITVAKAEPRRER-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>VirMetMinimDraft_7_1064189.scaffolds.fasta_scaffold286038_1 82 0.208 3.649E-12 144 260 414 0 157 168 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGFAFVTFETVEDAQLVLDTPEaaEFEGKQLDIKPAVAKEdkgggkdfggkgkdfggkgkdfggkgkGKDKDAPPTKIWVGCIPLSATEVDIRQYFEYFGTITDVTLeydeMGLSRGFGHVNFENPTDAKTVLGHYSDDHfdplewdaGILLDIKPAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719487_710011 82 0.326 3.649E-12 86 184 414 61 160 168 +--------------------------------------------------------------------------------------DNWGSSDGGSGGDGAANAKLFVGGLPKGTQENALWSYFGQWGPVAKVESKMD-ENGNLRGFAFVTFHDPAHAQQVIDNkdRNKIDGKWIDCKFATSGQGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712091_574248|ERR868394_k119_2461544|+|317|1.034e-85|1|4043|4555|4043[4043]:4555[4555]:513[513] 82 0.245 3.649E-12 94 193 414 53 154 171 +----------------------------------------------------------------------------------------------KRRDESEVPNKVFFANVKYEVTEEDLRPFFSTVGPVTHVQLVRDSFTGQSKGYGFCTYSSVLAATTAIRSLHLkpFMGREIRVDDATSLSKRRKEKKATEGF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719462_1107025 82 0.230 3.649E-12 161 267 414 15 130 174 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VKEKDHVDGKVLETKRAVPRHKVKTnevvGEGVNKIFVGGL-RDLEEKDLEKYFTQFGTITSVDVlidkrTGKRRGFGFVVFDDYDAVDKiVLQDEHNVKGIRIEVRKAVDKKNMDR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712179_803588 82 0.246 3.649E-12 158 316 414 1 151 178 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DKVMEAgEHTINGKKVDPKKAKAR--------HGKIFVGGLKPEITDEEVKEFFGKFGTIIEVEMPfdkvkNARKGFCFITYEQEAVVTELLKTPkQTIKEIELDVKKATPKPDAM-------GMGMMRGGRGGRGMRGGRGRGRGGGGGGWNQGWNQGYGYGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001261646211 82 0.278 3.649E-12 103 179 414 97 175 179 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TRLFVGNLAFEVNGMALQEAFNRFGSIDNARVVNDRDTNRSRGFGFVTFSEPADAAEAVRVMDgfELQGRPIRVQHSNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SoimicMinimDraft_15_1059743.scaffolds.fasta_scaffold591732_1 82 0.246 3.649E-12 105 183 414 10 90 183 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVGNLPFDITEQEIKDAFAQYGEIASVKMLTDKMTGRFRGIAFVALVDDEKAQAAIVELNgkELKGRPMRIDKTRERENR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712226_705396 82 0.284 3.649E-12 86 190 414 1 109 187 +--------------------------------------------------------------------------------------EGAAEGAAEGAAEGAPSKNLYVAHLPLDFTKEQLDEIFKEFGEITESRILVDKFTNQSRGVGFVHFADHETAAKAIEATNqkVLEGcdKGILVKFADQKKSGGGPSSSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719244_2243105 82 0.270 3.649E-12 78 179 414 49 159 200 +------------------------------------------------------------------------------KRQKRKLEQSKETDESKKIKRDEklmntymrEERKLFLGGLTEDTTEKDLKNTFNQFGTIIDCKVMRDAESGLSRGFGFVTFACSFMTEAALdKSPFEINGAKITPKKATP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1740137_65484 82 0.278 3.649E-12 146 274 414 0 139 206 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGIVRYVKAAEVDDAMgSRPHELDGRTLEPHRAAPREYSQKPEshhTCKEIFIGAWKEEIEEEDLREYFGQYGNILEVSFPKdkkdetKFRGFATIKFDDYDPVDVCCyKKVHHIKDKRLFISKYIAKRDMDELNRKYGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1D6C3T8 82 0.322 3.649E-12 77 166 414 21 110 209 +-----------------------------------------------------------------------------PNARMFSISAFAPPSPPTPPPKADPSPNLFVSGLSKRTTTDGLREAFAKFGEVEHARVVTDRVTGFSKGFGFVRYVTVEDAAKGIEGMDG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>HubBroStandDraft_2_1064218.scaffolds.fasta_scaffold3848127_1 82 0.371 3.649E-12 104 179 414 162 239 240 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIYVGNLDFAVEESDLVEAFSECGEVGEVSVVRDHITGRSRGFAFVTMMTREGGDAAMEKMDgaELKGRNLSVKKPNS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719354_215423 82 0.244 3.649E-12 87 182 414 142 239 240 +---------------------------------------------------------------------------------------SRPSASVRKEGQGPEGANLFIYQVPPEFNDDDLVSYFQPYGNILSAKIFVDKATGASKGFGFVSYDSPASANTAISAMNGvkIGSRTLRVQLKKPREQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_57_1057295.scaffolds.fasta_scaffold1112946_1 82 0.263 3.649E-12 96 190 414 55 149 249 +------------------------------------------------------------------------------------------------PPSKEEGRGIFVGGLPVSVDDGELRKHFEAYGAVQDATVVLNQRTGKSKGFGFVEFRDAGIREAVMQKSVQIQGKVVEVKVRQAKGGKGSGKEGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>JI10StandDraft_1071094.scaffolds.fasta_scaffold1458579_1 82 0.291 3.649E-12 104 180 414 98 176 253 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFVARLSYDVTEDDLRDEFERYGPVKDVQIIKDKFTGKPRGYAFVEFESSHDLKDAFRRCDGrkIKGRRILVDVERGR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>S7NBM6 82 0.262 3.649E-12 98 198 414 2 104 289 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDGKTNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGksLDGKAIKVEQATKPSFETGPVRSSSGMGGRAP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719245_1830379 82 0.407 3.649E-12 103 177 414 231 306 308 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKLFVRKLTCSTTDRMLEETFEQFGEVEEAVVLRDRATGRSKGHGFVRFKNSESAWKAMEQPeKDVDGHEICCHWA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719397_1603514 82 0.279 3.649E-12 87 196 414 0 106 310 +---------------------------------------------------------------------------------------SGVRTMSDVNEEPEQIRKLFIGGIKENVTSEDVTEYFEKYGKVESVELLQDKASGKKRGFGFVNFDDYDVVDKiVQTRRHVISGVSIEVSKAFSKEDQTRKAG----FVNN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>AntDeeMinimDraft_5_1070356.scaffolds.fasta_scaffold58853_1 82 0.151 3.649E-12 65 266 414 23 385 387 +-----------------------------------------------------------------DGIGGSQNFSPKGKSQHPDALAEKPTSHRTGAAEGCTCGRIFVARIPSRVSEEDMQKYFEAFGAVEDAYRPRDFAKNTFRGIGFVTFTDPAVVDHVIATKHSLGGVEVVVDRATPKElcvkkehsmgtvrqtsapeteealrqrpsvetlannnsiiglggsfneqafdlnffnciprmatypnsngnNRGPPsnlsddfsgdvgsqaqglaselcdsnpvamfamnsagvvkqpgtpaakdgkvakaggsphfsqvrnekgqkavtdnfahvrkvRSGPRVFVGKISKDTVEQDLADYFSQFGFVMDVYIPRsrenkkEHRGFGFVTFETEAAIKRAISQGtHNLKGAVLAIDVAVPESSSN--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>24828|scaffold_3998_c1_8|+9937|00 82 0.231 3.649E-12 101 259 414 708 897 900 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QERTLFVRNLNFSTTEESLMAmLVKKLGKdaVLAPKIARNaTNPKQSAGYGFVECRTRDIALKAYRLLQNvaLDGYALEFQLSKSKTPAAAaaaaaasgnkkkrisdvdvKLQSEKLAVKNIAFEATFAEVKQLFSAFGEIKKLRMPvkqdRTSRGFAFVTYATKKEAQQAAdtLKHTHFYGRHLVIEQA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>S8ENL4 82 0.182 3.649E-12 101 259 414 245 485 987 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PSASVVVKGLSQKTSEEDLYRILAEWGPLQHVRLIKERNSGASRGFAFIDFPSVESAQAMMDrlaqdgllvdgrkvffeysskptggggGPHGMDGgsrygrgsrRNIMipsdwmclicgcINFARrtscfqcneprtedspaadmassnPSSSGKRGEGPTHVLvVRGLDENADEEMLRYEFSKHAPLKDLRLVRDkfthvSRGFAFIHFHSVENATKALeatnGTSLEKNGQVLRVSYA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000625077613 81 0.420 4.856E-12 104 153 414 2 51 82 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLSYNTTEESLRAMFEQHGEVNSAKVIMDRDTGRSRGFGFVEMDD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001374656739 81 0.265 4.856E-12 101 181 414 0 82 83 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNKNLFVRNIAYKATNQDLQSLFETVGTVVSAKIIFDKEQNRSKGYGFVEFATEEEAERAIQQLDGasLLEREISIQPAKPRE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>F4KLN9 81 0.265 4.856E-12 104 184 414 1 82 86 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLYLGNLSYRVRENDLEQLLSEFGEVSNARVVMDRATGRSRGFGFADMAD-EDARRAIEALseQEFEGRRLLIREAEDRPRRE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001424438140 81 0.285 4.856E-12 101 182 414 0 83 86 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MTKTLYVGNLPWSATKEDLAAFFADITEVKASRVITDPVSGRSKGFGFIEVDDQEDVERIINAANGkdMGGREIIVNEAKPRQP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1Q3JVM4 81 0.252 4.856E-12 104 184 414 1 83 90 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVSNLAFTVSNEDLNELFATYGTVDTARIVTDKFTKQSRGFGFVEMPDEDSALKAMKELDGTmqGGRSIKVTEARPRAEKQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000903547281 81 0.303 4.856E-12 101 187 414 0 88 93 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MEKKLYFFFHASATTESELQEAFERVGEVVRATIIIDRETGRSKGFGFVEMADEAAAAAAIAQLNGvqLDGRAIKVAEAQARQDRDTRP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>17536|scaffold_42123_c1_2|+902|01 81 0.280 4.856E-12 104 190 414 4 92 93 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLYVGNLSKFTTEEELRAAFAEHGPVLSVTLVLDQRTGKPRGFGFVEYETHEAAEGGLLALNgaMLHGNMLSVNVAPEQPTQSMSQDST------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5215469_10571665 81 0.302 4.856E-12 91 166 414 17 92 99 +-------------------------------------------------------------------------------------------SACHDPRSLLMGTRIYVGNLPRSTTSAELAQLFDAYGDVVDVRVITDRDTGQSKGFAFVEMSTEDAMRSAIEGLNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001407302164 81 0.271 4.856E-12 101 179 414 18 98 100 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSNTLYVGNLPFEITNDELKSHFSSAGEIREVTHVRDRVSGRSNGCGFIEMSNSSEANIAIEKLHgsELEGRIITVALARP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5882757_9428044 81 0.265 4.856E-12 90 180 414 1 94 104 +------------------------------------------------------------------------------------------SGANATESGAKMGTRLFVGNLSFETTEAELRGVFTENGlEVQEVKIVTERETGRPRGFAFVEMSSSAASQQAMDALDgrELGGRQINVKPANER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001282498832 81 0.282 4.856E-12 101 190 414 0 91 106 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MQTKLFVQNLTTKCSEEDLQNLFSSYGEVISTRIPTDRESGRGRGFGFVEMLSQNAADNALQDLDKksFNGRILHVAFSRSEQSGGSGSRNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000195631755 81 0.464 4.856E-12 3 71 414 16 86 110 +---YIVVKEEFEDEPLELELEDDGNLRMSTLISQFSGACGLRFRNKETGAMRGVRLHKDLFLPPNGaeGWPTDV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3990172_4888382 81 0.302 4.856E-12 90 183 414 7 102 111 +------------------------------------------------------------------------------------------SRRMAGARSAAMDSKLYVANLASSTTEIDLHTLFAQAGNVKAIDLVKDLDTGGSKGFAFVTMSTPAEAQKAISMLNALpvNDRELKVDLAKPREAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719453_1590367 81 0.288 4.856E-12 117 223 414 4 110 111 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EALLEAFKPHArEVFKPRVMYDRETGEHRGFGFVDL-HEDEVEAAIEAVNsapLADGTQLEASVGRPKRS---TRGQRKCFVGNINPEFSEDDLRDLMEQFGPVEDARIMR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719315_447057 81 0.247 4.856E-12 151 260 414 2 110 114 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FKDPSSVEAVIEAgTHVIDGKKINPEKAKAR--------TGKIYVGGIKPEITNNDITTFFSKFGTIVETAIPidrskNARKGFCFITFEKEAVAKKLIAEEkQTIKGIEVDVKKAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688572_9653354 81 0.425 4.856E-12 104 157 414 59 112 114 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLPWRATEAELKEVFAAFGTVRSVSIVTDRDTGRSRGFGFVEMDDADMA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712190_721954 81 0.271 4.856E-12 100 189 414 17 107 118 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PPTDKVFVGGLG-QTSQEELVEYFSQYGTIIDAVAMREKATGKLRGFGFVQYDNTESVELVMQddESHELGGKGVEVKKSIPREEMPSPVSP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719414_683811 81 0.417 4.856E-12 189 267 414 0 78 118 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NSKIFVSRLTDKITSDDLKGHFESFGTITEIFIPKPFRNYAFVTFSEQRSAEALFGRQHTIKGHTVQIKSADPKGHTDK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A010P9B2 81 0.321 4.856E-12 105 189 414 2 88 118 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------ILVRNLPKAFTQDNLEALFSEFGTIASCDLVMDEASGLSKGFGFVEMSTQEETDKAIETLNakVIDGKKIRVKWSNQEKKQAEAIDS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000614731367 81 0.274 4.856E-12 104 192 414 1 91 119 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGNLSYDTTEQKLSDALSGVGTIIDYRRPSDFNTGNPRGFAFVTMDSQESGEKAIGILDGmkIDGRELKVNEAEDRASSHPADRPQRV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711913_24351 81 0.264 4.856E-12 151 262 414 1 121 123 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FSCQASLEKCLMATHELSNRKFDCKAAIPiqfSSLRENKENEKRIFVGGLKKNWTEVELKEYFQQFGKIDTCYIAKKkdseiSRKFGFVFFDQAEVLRKVFdQEKHIIKGVEVFVKQLKPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712142_578910 81 0.428 4.856E-12 2 77 414 33 108 127 +--CYISIQDDVTGVSVELPSEKDGTLLLSTITSQFPGVIGLRFK-SETGSLRGVRLSEDkVFDIPLDGWGSVDYQIVMP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR550534_2094410 81 0.268 4.856E-12 90 184 414 8 104 148 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------ENRCKVFVRGINYETADETFEQSFKQFGQVVEATIVKDRHDGRSKGFGFVTFKTPHGAQKALEMANlTLDERTLSISRIVPPHQR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719245_2596697 81 0.242 4.856E-12 123 262 414 13 168 169 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FESWGPLVESVIKRLPD-GRSRGFAFVTFCSLAALDQCLATPeHVIDGKKVDIRRAetgsvetqeslEAKKYDPEAEQLRELHVEGLDVTCDDEEvVRDYFTQYGDIDNVAIVKKedsKETRAVITFAAAASVDSVQENrPHNIRDVKIETKRATPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_11_1057310.scaffolds.fasta_scaffold5555325_1 81 0.356 4.856E-12 105 190 414 43 129 169 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVGKLSWETTEEGLKMYFELFGEVESINLAKDKFTSQLRGFGFVQFKEKSSFDKCLAEpMHNVDGSIIEVKLSRTADGRAVLPPSN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711988_564063 81 0.226 4.856E-12 78 190 414 46 160 197 +------------------------------------------------------------------------------RRSSRSRSPREYKGNSFARKCKEESRVVGVFGMSSRTDERDLEQEFGEFGKIETVSIIYNRTTRESRGFGFITFEDKRDAVEAVDKMNGkrLDGREIRVDFSFTKDGRDGRRRDR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711916_109182 81 0.210 4.856E-12 143 264 414 9 155 197 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SLGYGFVEFDTRSQALEVLktKQHSLLDGHSLSLAFSNANKPEKDGsilavassrkrkrkgrltGKETKIIVRNLAFEATSKDIRELFSTFGQIKSVRVPRGPrnhRGFAFVDFLTHEEAVAAMKavAHTHLYGRHLKLEWAEKDKD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3569833_1891 81 0.315 4.856E-12 99 172 414 122 197 207 +---------------------------------------------------------------------------------------------------ERGSSCMYVGNLAYGVTESELHGAFSRYGSVVDVKVMNDRATGQSRGFAFVTFSSAQSMKKAIHAMNGqtLAGRPL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001100374785 81 0.294 4.856E-12 105 180 414 25 102 217 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVRNLSYDTTDDDLMSLFEPFGPIKRATVSLHKETGSSRGFGFVAYSMAEDAKSAVSALKGavLKGRSISVELAVKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001118531565 81 0.267 4.856E-12 110 219 414 3 118 250 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LPPTIHESEIIDFFSAVGKVRDVKLIRDRVTGRTKGFGFVEFYEESSVYDALAlNGSPLKGISILIKaseaeRNISHGSQGHSQGITKLYVGNIPAVFDRRDLSMLFSIFGSLLSI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711933_53542 81 0.274 4.856E-12 82 181 414 111 212 290 +----------------------------------------------------------------------------------RRERRRSPPRNRGPRPEPNREARVYVWNLPWRTSWQDLKDHFRTVGEVVYADVMTDRRTGRSKGCGIVEFADKENVQKAIDTMfdTMLGDRRISVREDRQPE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0D9VKL4 81 0.267 4.856E-12 76 189 414 266 380 397 +----------------------------------------------------------------------------FGSDNKNYKDDDSLKSSEATKPDV-KTKRLFVTGLSFYTSEKTLRAAFEPFGELVEVKIIMDKISKRSKGYAFIEYTTEEAGGAALKAMNGqiINGWMIVVDVAKTRSRDRQPSSN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001147168633 81 0.216 4.856E-12 136 266 414 0 138 435 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RNRSSSDRPGYGFVTYAQKDSAVAAIEALHfkvQMPGSTamLQAKMADGDSSNSDP----KLFVGNLVSDVMEQELRDAFQPFGSIVEIVVLRNHdgsaKGSGFVRFQTIQAAQQAIdamNNRYELRGRVLSVSMAETSRDKQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001162897777 81 0.425 6.462E-12 101 154 414 6 59 74 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MTKKLYVGNLAFATTSDDLRDAFSQFGTVTSATVITDRETGRSRGFGFVEMDDE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>14403|Ga0335071_12384635_1|+2|10 81 0.294 6.462E-12 112 187 414 0 77 83 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------YTVTEDDLREAFSAYGQVTRVSVITDKLTGRSRGFGFIEMADGAQAKAAMEALHetELKGRKMLIREAHPRGDRQSRP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001346541725 81 0.268 6.462E-12 101 180 414 0 81 84 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSVRLYIGNLPFEVSGDDLNLLFSTIGAVEDAIIVTHPGGGRPRGFGFVEMQDEQDAYAAIEQLngHLLAGRSLKVNVANSR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001288018497 81 0.307 6.462E-12 104 179 414 1 78 97 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNISFNLNSQDIHSIFSQFGEIESADVIYDRASGLSRGFAFVRMVSDDASRNAIENLHgsMVDGRALVVSESKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719325_346198 81 0.270 6.462E-12 105 187 414 13 97 99 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVGNLPYSVTKEDVQDEFLRYGTVVKTELATDRETGKSKGFAFVEFEHEAEAQDAQQNSNrkSVFGRRIIVDFKKSKGKDGKEP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712228_906315 81 0.235 6.462E-12 104 190 414 9 97 99 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KGFCYIDFADQEAADKALSyAGSDFNGRAIKIDNTQKSSAGDTDEKSLTCFVGNLSYDTDEGTVQEFFSSCGTVASVRLitdkeTGDSKGFCYVEFETQE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5665213_1230402 81 0.297 6.462E-12 101 182 414 12 94 102 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ENRKLYVGNFPYTTTEEDLRELFSDQGDVRSVRIMTNAE-GQSKGYGFIEMKTPMGAISAVKVLEQrdFGGRRLRVAFANPKNS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>10503|Ga0209438_1280493_1|-59|00 81 0.268 6.462E-12 105 183 414 3 84 107 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGGLPKDCDDGALQAYFSSFGTVTKQEVKIDLMTGNPRGFGFVEFDSPDAVAKVLASYsaHMINGKWVEVKEAVAKGKGD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5260370_18879785 81 0.247 6.462E-12 98 184 414 1 89 111 +--------------------------------------------------------------------------------------------------ERRMIKNIVVRNLSFGSTELDNRSLFEAYGKVDRVSIVTDRESGQPRGFGFVEMSDDGEGERAIAavNGHEVGGRALNVNEAKPKSSSG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712176_607305 81 0.239 6.462E-12 92 185 414 4 99 111 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+-------------------------------------------------------------------------------------------SGGRKNSQSDEGCKIFIGSLAYETTEGTIKEYLQYYGEVVDVFVAKDKETGKSKGFAFATFAFPWVADLACAdKGHMLDGKNVMMRLSENKSKAPPP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001134072413 81 0.250 6.462E-12 104 193 414 1 92 116 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGNLSGETTEEDLRHAFESFGQVRSITIVRDETSGESRGFAFVIMPLANEATNAIEKMNGkdLRGQKIKVEKGRTKAKARSSRRKRSGF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719333_2067827 81 0.289 6.462E-12 97 207 414 0 113 119 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RTPDPGANLFIGALPPTVTDASLTAAFSRFGHILSAKVMLRVSTGASRGFGFVLFSSAAEAERAMQEMDgaEIAGHPGAIQVSVSKHRGENlTAESRVVYVRNVPAVVSNDEAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001321202749 81 0.229 6.462E-12 104 188 414 1 87 127 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIFIGNLPFKISRKEIAKAFTKFGPIRSINIVKDRQTRQPKGFGFVEMAKEEDALSAIHTLNGtsLKGRSIRLEKARDRQAGGSPVP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719378_1634683 81 0.430 6.462E-12 2 78 414 29 106 131 +--DFVRECEsvDEDEKITEVAKESDGSVLLSSIQDYFPNAVGLRYK-SDSGSWRGVRLLDGVLEAPHGGWGSASYIVTLKK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690242_15873153 81 0.218 6.462E-12 98 212 414 17 143 144 +--------------------------------------------------------------------------------------------------DPEKFTNIYIKNLAATYTEDDLKRDFGAFGSIQNAVIIKDTKD-VNRAFGFVNFTEHESAQRAVDEMNGkaLNDREVYVGRAQKknerdtllkklREERAQKYQGINLYVKNLDDSVTDEKLQEAFAP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000536600513 81 0.283 6.462E-12 99 177 414 3 83 149 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PTDKHDVFVGNLAFETKEEDLWSVFGAVGKVNAVRVVMDRDTNRPKGFAFVEFDDAATALSAIRNLDGqdLNGRNLRVSYS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSMisStandDraft_5_1062788.scaffolds.fasta_scaffold8250112_1 81 0.304 6.462E-12 98 187 414 52 143 150 +--------------------------------------------------------------------------------------------------ELQGLMKIIVLNLDRSTTQSALQDCFSSFGDVQYCTLVLDKGTGKSKGFGFVEMPQAEQARAAIKGLHasDLDGSIIRVKKAEADPQDEAGP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712126_535174 81 0.228 6.462E-12 96 182 414 50 141 164 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+>ERR1719201_1293963|ERR868429_k119_3316692|+|422|2.548e-117|2|152|1167|152[152]:445[445]:294[294]|937[937]:1167[1167]:231[231] 81 0.281 6.462E-12 101 208 414 58 156 175 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DKRTLYVGGLADEVTAETLNAAFVPFGDVRDVQLPMDYAQGKHRGFGFVEFVEAEDAAAAVDNMDnaELFGRVLRVNVAANKRLRSEAL-----------WSATEDQTWE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711962_1059772 81 0.260 6.462E-12 63 176 414 27 136 176 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+>MMETSP1315_Transcript_12899_20408785|ERR868410_k119_1047087|+|468|3.621e-131|2|605|1491|605[605]:997[997]:393[393]|1285[1288]:1491[1491]:207[204] 81 0.276 6.462E-12 104 177 414 95 170 199 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLPWGVDDLQLGDLFQPFGNLTETRIVLDDQTLCSRGFGFVTYATKEDMLAAIDAMdgHQVDGRDITVQIA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719282_684687 81 0.257 6.462E-12 101 204 414 44 145 201 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNSKVYVGKLSAATTENELRELFSSFGNVSEVNVPKQRPSGLSRGFAFVTMATPEGARSAIHGLNGMVIRACRLDVSEAR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001252741549 81 0.266 8.597E-12 104 191 414 1 90 94 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIYIGNLNYRLRTEELKNEFLPYGEVLGAKIVRDQETKRSKGFGFVEMVNDADGLRAIEALngHELKGRKMIVTQAKPRESQDGIAESNN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1X4XYL8 81 0.295 8.597E-12 104 189 414 4 85 94 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLVGANLAFKTTEAEVRQLFAQAGTVTQCEVIKDRDSGQSKGFAFVTMASPAEAQKAIGRFHGasLAGRKLTGNAARPREREP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990170_2342779 81 0.292 8.597E-12 97 183 414 10 98 101 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RRVKMGPQLYVGNIAFSVTEEKLKELFSRHGSVVSVRIITDKISGCSRGFGFVEMGSGGEAQRAVAALSGadFEGRAMVVSEARAEPSR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A0G1FAE4 81 0.309 8.597E-12 101 182 414 0 83 101 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+------------------------------------------------------------------------------------------------PEAGQSNKKVFVGGI-KDIEDADLEEYFSQFGTVLSASIMTEKDTGKKRGFGFVEFDDYDTVDKIIlKGEHVVNGTRIEVRKAIDKKDMNASGGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712142_480402 81 0.454 8.597E-12 2 77 414 33 108 110 +--CYISIQDDVTGVSVELPSEKDGTMLLSTISSQFPGAVGLRFK-SESGSWRGVCLSEDkVFHVPFDGWGSVDYQVVMP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5690348_14069193 81 0.277 8.597E-12 104 184 414 1 83 111 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLYVGKLSYQTTSQDLADFFGQIGQVQDAIVVTDRETQSSRGFGFVEMQNETEACNAINQLNgtELSGQTIIVSEAHERTQQP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712018_959251 81 0.405 8.597E-12 1 78 414 0 77 112 +-ACYIKVGPNEkSTEIIEIPSERDGRLLISSVSAQYPGATGIKFR-SESGKWRGCRVQGNFIDPPENGWEEKNYYICKPK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_6884327 81 0.266 8.597E-12 104 177 414 2 76 113 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+>GraSoiStandDraft_5_1057265.scaffolds.fasta_scaffold5830225_1 81 0.257 8.597E-12 79 177 414 42 142 152 +-------------------------------------------------------------------------------DRDRDRDRGFDRERGKPPPEIHHLVSVKVDNFPYETSQRDLRPLFEKFGEIGDIHFPQDRYTGRPRGFGFVRFTSQQAADDAVAELDGrdFQGRELRVSMA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550534_313736 81 0.281 8.597E-12 104 196 414 16 111 165 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIYVGSLAFRAEERDLYDVFDKYGNVKDVRIITDRDTGKSRGFAFVEYTCKRDMEDAIkgADGKDIAGRAIKCYKANPRGEGGRGGRDRdRGYGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719316_2104047 81 0.315 8.597E-12 99 191 414 5 98 167 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PPATKKCFIGGIPATTTEEQLNDYFAQFGSVEKAVIKKN-ENGESRGFGFVIFDHWDSVRIVLQkyEEHKIDDKWIEVKEAIPGPNQISKPKAGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001019256422 81 0.283 8.597E-12 104 182 414 23 103 170 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFIGNLPFKVTNLELTELFCGFGRVVGVNHRKDRSTDKSKGFAFITFDTPAAAAAAIENMNGksFEGRVLSVKTALARGQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_1669101 81 0.290 8.597E-12 104 187 414 24 109 178 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVSGLPWACDDDMLWTKFAEHGEVSFSRVCYDQDSGRSRGFGFVSFKDEAAARKAKEGMDGadMEGRAVKCNYATDRPPAADRP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APDOM4702015159_1054818.scaffolds.fasta_scaffold2225392_1 81 0.358 8.597E-12 184 338 414 0 157 178 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QKDKSSCKICVGRITENLRKEDLKDHFETMGQVTDVYIPSPFRHFAFVHFSESKVAQSLLGKEHMIKGVSVKIGEASPKGREhggGRDFDRGNRFGGFDGGYGRGNMREGGQMGFGnPMQQGYSGGYNTGGNFGGNSPSWG-MGGGPGPSSSYGGGMGN--------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719473_970297 81 0.229 8.597E-12 103 188 414 11 97 182 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TTIYVGNVPYTSNENGLQEAFQRFGEIVEARLIRNKRTGESRGYGFIKFATQESAKAALESTDiKLENRDIIVKYASGQRRNRRNRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719189_2439885 81 0.250 8.597E-12 96 185 414 26 117 188 +------------------------------------------------------------------------------------------------KKTSEVGANLFIGNLEPEVDEKMLYDTFSAFGVLLFAKVMRDPDTGESRGFGFISYDTFEASDASLAAMNGqfLCNRPISVSYAYKKETKGE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712216_325234 81 0.181 8.597E-12 104 224 414 2 183 190 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLFIYHCPANWGDDDLKTAFAAYGQIVSATIMKDKTTGLSKGFGFVSFDNPIAAQQAIMAMNglEIEGKRLKVELKQPKVPQGgamvgnmamapyglmmggmggmggamqpwggmgnmqmmgmggmgamgkgamggggggnkGGPPGCNLFIYHVSPTWGDDDIRLCFAPFGTVISALIMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>26250|scaffold_537995_c1_1|+3|10 81 0.302 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+------------------------------------------------------------------------------EKKKRLLEDLLPGGVRRRATREDLGRKVFVGGLNPTTTTEDLRAYFSDFGTVTDSCVITDSSSKASRGFGFVEFE-GKIPEGLLDQQHIIDQRRCGVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SoimicMinimDraft_17_1059745.scaffolds.fasta_scaffold557982_1 81 0.303 8.597E-12 101 177 414 150 228 240 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MMSRIYVGCINYDTREDAIRQAFSAFGPIRSITMSWDSMTGKHKGFAFVEFEQPEAAQLALEQMNGIlvCGRNIKVGLP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719427_2002168 81 0.312 8.597E-12 104 182 414 10 89 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PDAGEKIFVGGLPKSASQDSIWNFFSQFGNCTNVDLkydeMGGFRGFGFITFANEQAAQAALGNGPsnMFEGKWIDVKPAM-KGESGKGGKSGGDKGGCKGGGDKGGCKGGGKGGKGDWGGGGGKGEKGGDGWGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>21883|Ga0256868_10064829_2|-582|00 80 0.292 1.521E-11 104 196 414 1 99 149 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLSRQTTEEKLNEAFAAFGAVESVRIVKDAASGESKGFGFVTMPVDDEAQAAIIGMNGkdLDGQTIKAEEGRAKtdvpRSRERQGGSRGGYRGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APCry1669188879_1035177.scaffolds.fasta_scaffold06736_6 80 0.220 1.521E-11 86 192 414 1 109 150 +--------------------------------------------------------------------------------------DSGSRSPPRSPRGAERAPSLHIRGLSSRIRPDDLRDEFNRFGKIRDVHLPRDYNTGEYRGFAFVEFYNKEDAEKALAEMDgkELLGRRMEVNMAQGARQTPDDMKKKDV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719336_974616 80 0.250 1.521E-11 102 183 414 11 94 153 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SKCVFVGNIPYDATEDHLIEFLGSVGEVTRLRMVYDKETGKPKGYGFYEFKDAKMAQSAIRNAHGtdFLGRAIRIDHADDDSAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719265_1273246 80 0.298 1.521E-11 78 189 414 40 153 155 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0 134 189 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKVVEVVLAKEKGGGQSKGFAYMTMGDMLSRDIILSDRHVIGGGEVSVMLS---KEELVGADGRKVHVDNC-MNISAEALREAFSRFGPVLDVhtpkdHRTGERKRFGFVTFGTEEAMSAAIATERVLIGMdEVSVKPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712223_2337785 80 0.305 1.521E-11 101 184 414 46 130 195 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DHAKIFVGGLGQDLNEEAVRSYFSTFGEIKKINLVMDKVTKRSKGFCFIVFSNEISAvAACMNNTHYIKERRVDVKKAISNTKNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719374_419091 80 0.298 1.521E-11 104 179 414 159 235 268 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------DDDTKFTKLFVGGIPYHTEDETMKQYFLQFDDIVEAVIIRERNSQRSKGYGFVTMATKEGAQRAIvNKRPVIDGRRANVDLayigAKPKTPKEAPQQDGTV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UPI00073A06B3 80 0.280 1.521E-11 92 188 414 8 107 429 +--------------------------------------------------------------------------------------------ASSDRRTAEVGANLFIGNLDPDVDEKLLYDTFSAFGVVVSTpKIMRDPDTGNSKGFGFVGFDCFEASDAAIETMggQFLAGRPVSVMYAYKKDSRGARAR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_SOC_28_MAG_00061_000000012946.1.4 80 0.309 1.521E-11 89 184 414 301 397 524 +-----------------------------------------------------------------------------------------AAASSGASRKGEASSKVFVGKLAASINEDILRQYFERFGALVDVYIPKDHSSGvAHRGFGFVTFDEISAAEKVLGMPHEIEGTPVVMDRVDPKGSKG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_26759 80 0.291 1.521E-11 86 181 414 272 367 547 +--------------------------------------------------------------------------------------ERAERRRAEAVDGGAQDKKIFIAGLPEGATSESLGQHFSRYGGVSEAVVVNDKVTGRSRGLGFVAFETAEAAAGALSSRQVVDGKQVECKACPQRQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0N0P954 80 0.234 1.521E-11 103 221 414 71 199 768 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TRSEDLREEFSKFGPIKDVYLPVDRESQRPRGFGFVTFEEQRSADDAIAQLNEqdFMGRRIQVNFARARGAPRGGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001261576668 79 0.256 2.023E-11 104 175 414 3 76 77 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NVFVGGLPLSMTEDTLRKMVKEFGTIESVKIITDKVTGRSRGFAFIEMGKKEEAAEAIKKLNekELEGLKLRAN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001491514606 79 0.263 2.023E-11 105 178 414 2 77 79 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLYVGNLPFSTTDADLQQAFSQYGTVTKAQVIQDRETGRSRGFGFVEMSSgAEEA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR6185503_6758950 79 0.256 2.023E-11 103 182 414 19 99 105 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKLYVGNLPSMTTEETVRDLFSAHGTVEKISMMFDRNTGRPRGYGYLVMSD-SDASRAMQALNGkdLDGRAISISDAEDRAP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712159_548437 79 0.424 2.023E-11 12 77 414 2 66 106 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVGGLAATVDDEILSKHFSRFGVVVSAEVMWNWQTGRSKGYGFVEFKNDEACRKALtDEPQQIAGKVIDVKLRQVRGGKSDGKGKDK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719359_2788317 79 0.309 2.023E-11 101 196 414 4 99 131 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DKKRLWVGALPDEATENDIQEYFSQFGTVERCELKTD-VDGKSKGFAFISFADEQEAKAALEfDSHTLGSKTIEVKRPNVKGKGKGKGKGGKGNMGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711934_1229859 79 0.275 2.023E-11 78 164 414 39 125 132 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+>HubBroStandDraft_2_1064218.scaffolds.fasta_scaffold51997_2 79 0.280 2.023E-11 104 188 414 3 91 176 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLLYATTHESLRKYFEKYGTIESAEVIFNRDTKKSRGFGFVIFHENYSLLQALkdqeKADHIIEGKAVEIKHCVARQDISPKSP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001351192827 79 0.359 2.023E-11 104 192 414 59 147 180 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFVGGLPQQATQWDIKDHFATFGEVVKGDLKRNQKSGRSKGIAFVMFNEVETLNTVLTQEHTIKGKKVGVEEARPKPKGKKRPLNASI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001285241579 79 0.267 2.023E-11 101 184 414 0 85 184 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MAKKLFVSNLDFEITGEQLREMFAEFGSCISAVLATDRETKRSKGFAFVEMERDEDAIKAIEALNnkIVNGRPMKVAEDRGKTSSP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711865_1192403 79 0.307 2.023E-11 101 189 414 25 115 205 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DANRIFCGGLPQTCDTNQLGEYFSQFGEILEAKVHIDPATQRSKGFGYISFDSARSVELALASGrsLTIDGKKVEVKRCETKNKDKAPGSS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719373_1126562 79 0.284 2.023E-11 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HVVKGKKVTCKKAEAKQ--------GKIFVGKLPtgETLSKEDIQAHFSQYGEVVEGTRPvdkaknKEPKGFGFVTFARDHVARDLVKQGeTTIGDHTVEIKKVTPKDP-------NAGFGGGMGGWGFDPYGGYGGFGGYGDFGGYGGYGGGPGGWGGFGGGP---------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001189545474 79 0.308 2.023E-11 99 191 414 17 110 326 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PQYSSQVFVGGLPKTATEEEVGWFFSQYGPVARVRLIYDKETGASKRYGFVEFAHPEIAAAVKDLRNlQFQNRTIDVNYASRHISQMSYGMPPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712146_770693 79 0.303 2.023E-11 101 166 414 8 73 327 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EGTKLFVANLEKSFNEEDLRKIFEKFGRVTDASLAKDRATGYSRGFGFITFDDEDDALDAKDDLNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719242_1755933 79 0.282 2.023E-11 103 193 414 144 235 377 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKIFIRSLSYETQDKTVHDLFATFGNVKEAVIVNDRMTGLSRGFGFITMSNASEAQKALAEHQkLIDGREAICNLASKPQGQRPLKPSFHHF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_37_1057305.scaffolds.fasta_scaffold1412370_1 79 0.267 2.023E-11 78 176 414 218 318 399 +------------------------------------------------------------------------------KDGKDGKGKKEKSKEKDDATFGPQGCNLFVFHLPDEWGDEDMLEYFSPHGKIVSAKVMKELGTGRSRGFGFVSYEAQADAATAIRKMQGykIQGKRLKVEF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A2E4YUX9 79 0.285 2.023E-11 96 177 414 252 335 406 +------------------------------------------------------------------------------------------------RDMYDPASRLFIGGLAPETEARDLSDLFSRCGHVVDAFVIRDRDTRVSKGYGFVTMGDAGMASQAARklNRHELHGRNIAVRPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000546897256 79 0.273 2.023E-11 79 189 414 376 491 949 +-------------------------------------------------------------------------------DQKRGDEEDVKKHDSEEEEEVHSPRvasnRLFVRNLPFATTEEELEEHFSTFGSVSECHIPVD-DRKMSKGFAFVTFSNGQDATRALEELDGtdFQGRFLHILHSRQKPQDDSGAGN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000042899417 79 0.352 2.690E-11 97 167 414 3 73 91 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DDQTKDCKIFVGNINNKTTKEDLKDLFSKYGEVDKSFIIYHHKTKQSRGFGFVEFTDKSSVERVIADKSNI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719431_2284097 79 0.393 2.690E-11 81 167 414 4 97 99 +---------------------------------------------------------------------------------KRKMDDSGDQPGAKLVRTSEEssssgssSGDMIVLGLSYSATEQEMRTYFEQFGKVELAEIKKDRTTGRSKGFGFIRFDDKSVANTVLDTSHSI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5579872_3784091 79 0.227 2.690E-11 104 180 414 18 96 99 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFVGNLAVEATEAEIRTLFEPYGTIKRVSLIRDRQSGVFKGFGFVEMRLDSAGDTAITELNgkETNGRTLDVRAARPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5262247_4294849 79 0.273 2.690E-11 104 174 414 28 100 101 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLWVGNLSPEATSEEIRDLFSNVGVVESCQLIEDKETGRPKGFAFIEMNSLEAAYKAKEkfNGHELHGKPLKV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000994285483 79 0.235 2.690E-11 104 184 414 6 90 101 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVSNLSFDVDSSQLEAMFSEIeGvNVIEAKIITDRESGRSRGFGFVTLETEEMAEKAITEMNGkvVNERPLTVNIAKPMEKRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688572_3861591 79 0.416 2.690E-11 92 151 414 42 101 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------AQQPRRNTTGPVRLFVGGLSWGTSSEDLRALFPKFGAVDEVTVIMDRATGRSRGFGFVTF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5271157_2848660 79 0.290 2.690E-11 96 179 414 5 90 104 +------------------------------------------------------------------------------------------------PPDDADYARLYVVNVPFQTADSDLQEVFGRYGDVLNVSIPVNHETGRSRGFAFIEYETAEQARKAlsMSGKLTIGGRTLYLQKAEP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712224_738473 79 0.292 2.690E-11 103 180 414 23 104 106 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSIFCGNFPWSTTEQDLHMLFETIGPLNSVRIIFDRDTQRSRGFGFIEFTNEQHAAEAIQQYDGFMmgnpARPIRCAYSNKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_3202645 79 0.311 2.690E-11 104 191 414 7 95 107 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLHVK-VAYKATESDLRRCFEKIGPVSDVCIVMDRETDRSRGFGFVTFENDQDASDAMDQLDgkEIQGRAIQISRAHARGSGGGGGRGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001039316066 79 0.296 2.690E-11 103 191 414 2 92 108 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RELYVGSLPYETTEDDLRRLFSVAGNVQSVHLITDPVSGSSKGCGYVKMTTVSEALEAINCLDGalLDGRIIAVSIAREQKPQPKGERGTR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5436309_15370526 79 0.285 2.690E-11 109 183 414 0 76 111 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLAFGLGEGELRELFRAYGTVRSAEVVRDRDTGRSRGFGFVEMGTERDARAALAGLHgkEVRGRALSVTQARVDERQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_543217 79 0.259 2.690E-11 127 226 414 3 106 117 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+------------------------------------------------------------------------------------------------KQHYPESEQVYVGNLSYQVNGYQLKEFFAQYANVDHVRLIKDNRTGRSKGFAFVTLSSVEDAKKALSANCVdLRGRALVVRMAKPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4051812_22795710 79 0.284 2.690E-11 104 193 414 33 127 132 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVAGLPNDFDDTDLKEMFELYGEVTSARIIIDRATGKSKGFGFVDMLNKTEALETIEALDGAGlrrGKKITVKQAeeQPKNNNLGGRSNNNRF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719466_550870 79 0.313 2.690E-11 105 189 414 0 85 133 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FINMVDDSSADQIFGQQHMLNGKSIDVGRSsrgkqvKPGEDITPQADKRKLFISNLTENTTEDAVRQYFQKYGDVSLITVcrdlSGNSRKFGFVKFTSEEVAKIILdeNKEHEIGDAFVVV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>4423|Ga0307474_10221989_1|-3|10 79 0.294 2.690E-11 91 188 414 1 102 136 +-------------------------------------------------------------------------------------------SAERTHGPMEQQNRLYVGNLPYDiVEDDDLGAIFTDLGfKVARPRIIKDRDTGRSKGFGFVEILPPEMTNDAIrvSNEHMIGGRPLKVSVAKPKEPGAGGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690606_31138633 79 0.275 2.690E-11 105 188 414 0 86 139 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVRNLSFGSTDEALKAHFENAGhQVRSARIVLDRETGRSRGFGFVELMSDERFDDAVSALDGsfLDGRPISVREAHDQRQGSPPRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719246_116037 79 0.234 2.690E-11 163 296 414 1 133 141 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EEHAVKGKKVAVKKAQAKQ--------GKVYVGKLKPELSDEEIKAHFEQFGQIAQVEQPfdktkNERKNFCFITFEKEDAAKKLPKEGsTTINGVELEVKKVTPKPDPRAMMGMGrGGRGGGFGGYNPYGDYYGGGYGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719187_930896 79 0.431 2.690E-11 204 312 414 0 108 145 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EDLRTYFGKYGEITDIYIPKPFRGFAFITFLSPEVAQSLCDEDHIVKGTSVHISNATPKGTGQQQNMPRGGPGGPPEGWNQGGPGGQNMNPLNMLAALTQASWGLLGNM----------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719343_1913101 79 0.352 2.690E-11 102 188 414 14 101 146 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SATVFVGHLSQATDRDALRTYFESFGEVVETDVKYDHKTKRSKGFGFVTFADSSTVTDVVNhSDHKVDNRRVDVKRYSLGGEKDDEYP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719379_115503 79 0.402 2.690E-11 119 190 414 2 73 148 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------RPEDEGRLLYVGNIPWRASWQDIKDHFREVGPVIRVDIPVDRETRRSRGFATVLFEHKDDAARAIQKLNntELNGRSITVRF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>R7U2X5 79 0.260 2.690E-11 80 192 414 7 125 156 +--------------------------------------------------------------------------------NERELELGLAGSGASWHKEFKESAWVYCGGLPYDLTEGDVVCVFSQYGEIVNVNLIRDKGTGKSKGFCFLCYEDQRSTILAVDNLNGfkILGRTIRVdhvkDYKAPKEHGDEDEVTRKI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711874_750317 79 0.265 2.690E-11 96 188 414 0 92 168 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+>ERR550534_1444127 78 0.282 4.757E-11 103 193 414 306 397 409 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKLFIRGLNLLTTDDTLREVFQAHGTVVDVNIIKDKINGTSKGYGFVTMSTASEATEALKTPSrEIDGSVTHINLASVRRNPRVAPAPIPVF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719443_907046 78 0.280 4.757E-11 112 191 414 150 231 422 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------PETTDDDFRCYFETFGDIVESQIMQDHMTGRSRGFGFITYATEEGVQAVYTHGrhHELRGKQVEVKAATPRKVDGKGGGKGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>FEC22Drversion2_1045045.scaffolds.fasta_scaffold00241_26 78 0.285 4.757E-11 103 183 414 76 159 425 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKVFVGNVSYRVKSRELKEFFSSFGKVIYAQIITDRIKKRSRGFGFVTFSNEWEAQKAKDSSDEertLDGRIMKVCSPERKKKG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719277_2116185 78 0.261 4.757E-11 82 190 414 229 338 582 +----------------------------------------------------------------------------------RAREFKAKTAPASGSQARQQGVNLFIKNLDENTDDAALRALFEPFGAITSVATPKD-ERGKCKGFGFVCFASPDEATKAVTEMHlkVVKGKPLYVGLTEKREARQERLRQR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A067MQ97 78 0.265 4.757E-11 85 167 414 424 506 900 +-------------------------------------------------------------------------------------ESMASPSKSSRPPAPEEGTTLFIRNVPFEATDEDLGELFRSFGPIRYARVTMDKGTGRSRGTGFVCFWKVADADHAVEESDKI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1Y1WIS5 78 0.290 6.324E-11 104 165 414 4 65 66 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPPSATDADLNSAFSVYGTITETKLMIDRETGRSRGYGFLQFESESSALEAVKVGN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>22843|scaffold441330_1|-2|11 78 0.315 6.324E-11 104 174 414 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QGCKLFVYGVSENVSNSELEEAFGKYGTVTDTYNTG--KGFAFVTFDNKESAEEATqqMNGQTVFGQELKVNEARPKENRGGGGYGGGRGGGGYGG-GGRGGGGYGRGGGGYGGGGYGGGRDGGGGYGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_29_1057270.scaffolds.fasta_scaffold863965_2 78 0.320 6.324E-11 101 176 414 99 176 179 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QGVCLFIYHLPPECDEATLHQLFSNFGTVLSSRVMKDFQTGRSKGFGFVNMLNDQQAQAAISGLNGfqLGGKYLKVSY--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719491_322966 78 0.277 6.324E-11 102 189 414 89 178 181 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SKTVFVGNLPFGASEEDLEELLSGCGEVVATRIVRDKDSGDPKGFAFVDYVDKECTFDAVQDLHgvEFQGRRLRITLAEGSAASDKRSDS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719161_1293720 78 0.294 6.324E-11 101 183 414 26 110 183 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DQKQLFIGGLPKTINEDALKNYLLQFGNVTSLDIKMDPTTGQPKGFAFVSFESGGGAQLCLHNysENTLDGKWFEVKPTPQKGKG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>E9AMK9 78 0.273 6.324E-11 101 182 414 17 100 245 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QSRNVYVASLPLSFDDQQLQDLFSPYGRIVSARIMRAKKSHASKGYGFVMFREASSAEKAIEGLHGrvVDGSRIQVRRANADAS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719247_479912 78 0.299 6.324E-11 86 192 414 148 253 310 +--------------------------------------------------------------------------------------QDKKAPLPRRSGRANPTQKVFIGGLSTVTTEEDLRSYFGTFGTVASVDILVDQETQKSRGFGFVVFE-GQVPDGVLGCNHCFHGRYCGTRMYDQGPSRPDAYRSSYL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>R9AI36 78 0.260 6.324E-11 105 196 414 13 108 314 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------DPEKQSTLYVRGLNEETTHGFLAEHFSQSFPIKHAIVVTDKETGKCKGYGFVTFVDHEDAKRALEEFHGqdFGGKKLNVTLA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12613|JGI10216J12902_111049547_1|-50|00 77 0.268 1.117E-10 104 183 414 57 138 142 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGNLDHSTSSAELERVFGEHGQLLSAVVISDRFTGNSRGFGFVEYVSGDAAERAVSSLNGadLRGRALVVSAARDRKPG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719228_451334 77 0.303 1.117E-10 103 190 414 8 96 143 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKMFIGGIKEDTTEDHIHEAFADFGCLKSVDIVKDKLSGKVRGFCFVEFDDYDSVDQcVLKKRHNLNGKSVEVKKAVSKDQQQSGGGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APIni6443716594_1056825.scaffolds.fasta_scaffold1961977_2 77 0.273 1.117E-10 97 189 414 14 108 151 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RREGEGFSLLVRNLPYSVLADELREDFSRYGQVRDVHLPKDFYSGKPRGFAFVEYTDRTDAEDARNQMDrrRYDGREIAVMFARQRRKTSNEMRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UPI0002310872 77 0.451 1.117E-10 101 162 414 98 159 162 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179 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PQKMCSVFVGNIFWDVSEQELGDWFSQCGVVNSAYIKTDRQSGQTLGFGFVEFNDPNIADDVIKRMdgSWLAGRNIRCNRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>WorMetDrversion2_4_1045186.scaffolds.fasta_scaffold00218_1 77 0.260 1.117E-10 96 183 414 18 109 197 +------------------------------------------------------------------------------------------------REPVARSRTIFVGSLPIDpnaASDAELAAFFARFGVVESSPVVLHRGTRRSRGFGFVTFEAAESAEAALREPsHTLRGHSLAVKLAESHDPG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>18327|Ga0308174_10608467_2|+305|01 77 0.291 1.117E-10 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------EQNNQLYVTNLPWEVDESGLEEIFSEYGAITECSIPTRK--GRSLGFGFVTFGDAECAAAAMEAMagarvGEVEGaREIAVKIAREKGAGKQQKQAKK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UPI0007FED4DE 77 0.292 1.117E-10 103 191 414 1 89 236 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKLFVKGLPSSCSNAQLQAAFASFGTIDKAFILFDHASGTSRGFGFVEFIDEAAVNRALSAVVVIDGKTLKCSQAILKQEAKVSPSEPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719198_1201553 77 0.270 1.117E-10 111 191 414 0 84 266 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------PYKTLFVGRLKYDTTEEALYQFFSRYGKLQSVHLIRDLVTGCSRGYGFVEFVHEEDFTSAFYGAHrtILDGSQILVDF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001481591047 77 0.272 1.485E-10 103 177 414 386 462 466 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RDVYIENVDYDTQNEELEELFSKFGKVLKVTLPKDFYTGRGRGFAFITMEDEESADNAIRNLSntMFNNRIIRLNWS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711962_222534 77 0.288 1.485E-10 90 184 414 376 472 474 +------------------------------------------------------------------------------------------SSYTAGKKTGPENANLFICQIPSDFNDGDLQQMFSPFGNVISAKVFLDKATGASKGFGFVSYDNSASANSAISAMDGyaIGSKRLKVQLKRPKDSKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719336_2657900 77 0.259 1.485E-10 89 192 414 149 252 488 +-----------------------------------------------------------------------------------------AEPFKPADKEQVEARTIYVENLPQDADHESLKKLFSDFGEVVYVSIPRFPSSRRSKGFAFVEFSADSAVVAVLAAMEGVQGELASIKAFQEAEAEAGPSNKRKL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1G0WGX5 77 0.265 1.485E-10 98 174 414 517 595 601 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177 +-------------------------------------------------------------------------------------------PSNDEKIKSDPHRTIFVAQLDFNTTEEMLFDTFGRYGSIERLRLVKDVKTGKSKGYAFVEFSDDSEAKRALrevkDERLVVDGRQVLVDR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_662707 76 0.239 1.974E-10 158 258 414 1 120 186 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DAVLQEQIELDGKILDVKSAAPPGQAPPPkeqmmvqqgpiggPPTDKIFVGGIGQATT-DDLNEYFSAYGNIIDSvamidKATGKLRGFGFVQFDNTESVESIMLdhESHQILGQWVDVKK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719265_2223208 76 0.301 1.974E-10 105 175 414 111 183 187 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+>BarGraIncu01122A_1022018.scaffolds.fasta_scaffold56996_1 76 0.202 3.485E-10 100 185 414 73 161 224 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PMGGNIFVFHVPINWTDEDFHAHFSPFGQIVSAKIHTDPVSKASKGFGFVSYATPQAATMAIKGMNGFDtkqGKNLKVTIKKGEETYNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000677864114 76 0.444 3.485E-10 104 157 414 168 221 253 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLFVGGLEWGVTSLDVRRYFSTFGRVDDAEVLVDRNTGRSRGFGFVSFETEDGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------PMGGNIFVFHVPINWTDEDFHAHFSPFGQIVSAKIHTDPVSKASKGFGFVSYATPQAATMAIKGMNGFDtkqGKNLKVTIKKGEETYNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>APHig2749369809_1036254.scaffolds.fasta_scaffold1780968_1 76 0.300 3.485E-10 101 188 414 4 93 326 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DASTLFVRNLSFATTSESLEAYFGEVGPTKLCFVVTDNSTDKSKGFGYVRYAVPEDATRALTELagKELDGRAPHIQYAKRRPSQQQRRG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_PSW_86_MAG_00274_000000001625.3.4 76 0.337 3.485E-10 105 182 414 312 391 393 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVYHLPAGVNEEYLYQMFSPFGQVTGVKVVVDSNTGYPKGYGFVNYATLEEAQQAIMNMNGfqIGNKRLLVSFKTQKQS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719284_139615 76 0.337 3.485E-10 97 177 414 328 410 414 +-------------------------------------------------------------------------------------------------PPCSKENTIYVGGLSFSASEGDLVAKFRVAGEVVSVDIKIDRETGKSRGFAFVSFSCPQSVEWALKKLQgvEICGRAVRLGLP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_G4LYA7 76 0.231 3.485E-10 98 184 414 3 97 451 +--------------------------------------------------------------------------------------------------DTSEGRTIFIRNLSFDVEEDALYKFFSQFGPLEFAKVVKDPATQHSRGTAFVKFVNVEDASNVLQQSDKpenahqfsLENRTLNITIAVSRTEAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001059680587 76 0.273 3.485E-10 78 161 414 279 362 478 +------------------------------------------------------------------------------EDVDEDENEEDGEEDAEDKEDARNASTIFIRNLPFTCTDETLYEHFTQFGQLQYARVVVDPETERSRGTGFVCFRNMEDAISCI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A087G4V7 76 0.276 3.485E-10 101 192 414 228 321 770 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DTGRLIVLNLTYTTTEEEIMDRFSKFGEISEVHLVIDKETKRSKGFAFIHYLIPESASRAMKELDnkVFQGRLLSVLRADKQVAFPNKYDTCNL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9300|Ga0075405_10715564_1|+1|11 75 0.363 4.630E-10 143 219 414 0 76 78 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SRGFGFVIFENEADTDFVVAKSHSLDGRNIEAKKAVFWGQIIDRFRTRKIFVGGLIASITEDEFKKYFEHYGPVSEV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000932542861 75 0.276 4.630E-10 104 177 414 1 76 79 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLNEHIEEKQLKEAFREYGKVTHAEIIRDNLTGRSKGFGYIEMPDIKQAINVITNLNGgtWDGKKITITKA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000182748631 75 0.295 4.630E-10 115 183 414 0 70 80 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TEEELESLFTSFGEIKSIKIIKDRETNKSKGFGFVEMENNKEAESAIEMLDqaMVRGRNITVKVAEERKPR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001074149623 75 0.271 4.630E-10 104 183 414 0 80 82 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLRVFSLPEDIQEDELLPLFAPFGPLErRPHVARDKDTGQSRGFAFLTYVHAEDAQAALDKKHMIRHMVLQVDLAKPRDKR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A268TB75 75 0.269 4.630E-10 105 180 414 3 79 83 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYIGNLSYGVNEQQIMELFSQYGEVASIKLVNDKETGRFKGYGFIEMND-ENALNAISDLDktQYLGRTVKVSEAKSR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A673T9Y8 75 0.597 4.630E-10 0 76 414 0 76 92 +LSEYPQVTEDENDKPIEMPSEEDGTVLLLMATAQFLGACVLPSRNLMFPCMRGVRLIEEILHVPSEAGGGNLVCVVR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000426179395 75 0.243 4.630E-10 105 184 414 4 85 98 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVAGIDFALTETQLKDVFASHGTVNSAKIITDRMSGNSRGFGFIEMSSQAEAEECIRKLdnSTLSGRQIGVRFKEDKPASG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001158971473 75 0.272 4.630E-10 105 190 414 2 89 99 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------TTIWVKGLSYDALENDLKEFFKDCGEITTIRLPMDDYKNTNRGFGFVEFASSESVDKALElDGQEMMGRWLQIQISNSPGSAKKKFSNT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712129_400188 75 0.293 4.630E-10 96 186 414 2 92 103 +------------------------------------------------------------------------------------------------PSDPNAEIKVFVGGLSQDTTKESLNRHFSRWGT-SDAYVMMDSATGRSRGFGFVNFRSNSTKNAVLAArPHIVKGQNIECRDYAKGSSKGGP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>26231|Ga0315295_12869018_2|-119|01 75 0.289 4.630E-10 104 184 414 7 89 105 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLQVRNLSPDTTEAEISGLFARCGEVLDARIVRDASSGMSKGYGFVTMSAVSEADAAVSRLdgHALRGSVLQVKLAKARTVRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719221_2208745 75 0.271 4.630E-10 105 203 414 0 106 107 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVGGLSLNTDSAILREFFSQYGAIEDAHVMDTWDqramQRRSRCFGFVVFAAPEAVDTVIAQaKFFVDEKEVeakRVDDKKGSPEGRAEVDARKVFVGGLKEGMNE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>23240|Ga0272442_10418858_1|+2|10 75 0.294 4.630E-10 116 191 414 0 77 111 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EDGLREAFGAFGEVSSVNIVRDRASGASRGFGFVIMPTEEEAETAISEMNgkEMEGRAITVEKSHGKPGGPRRNDGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001300981920 75 0.247 4.630E-10 100 186 414 6 94 116 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PKNSKLSIRNLSDSVSEHMLQELFQQAGTVYSVKIATDRDTGESKGFGFIEMASVNDAQQAIDTLNhvLVEGQEINIDFQDPNRAKSKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719295_1390292 75 0.307 4.630E-10 120 223 414 1 114 116 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KEYFGRYGELEDCVVIADSSSGGSRGFGYATFADYRCTFPVLQdkkdSGHMIDKKEVDVKRAIPRddSSAASHSRTKKIFIGGVKRDAEESEIREELEKVlegsGTVESIDMIK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719171_2208311 75 0.325 4.630E-10 127 243 414 0 119 128 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GEVADLAVKKSYTTWANVGCAFLQIRDSTGRQAILSAKHAIDGKPFNV---VLDKATLGNLTSAKVHIEGLhPQKPTEDEIRQHFSLYGTVIDVFLPkehatGKRRNFGFVTFSEPQAQQAAL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719362_2758223 75 0.413 4.630E-10 101 158 414 77 134 135 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PKSKIFVGGLDFQLTSDELKEHFMKFGEVDDAIILKDIYLGKSRGFGFVTFTDEGVAQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1700692_713765 75 0.280 4.630E-10 98 186 414 63 148 150 +--------------------------------------------------------------------------------------------------PKEEMMNLYVGNLPYRMTEAQLKEALEAYGQGSSCTIIKDKVSGSSKGFGFLEMPERTEAEAAITGLN---GREVLGRQPNGNGARPAP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711981_339886 75 0.320 4.630E-10 94 191 414 3 102 162 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+------------------------------------------------------------------------------------RDGARAGESMNDRRKTEDTAAIRVSNLSESTQEADLQELFKPFGHIARIFLSKDKVTGECRGFAFVHYYKKDDATKAIATLNGFgyDHLILNVEWAKPSGS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_1765122 75 0.220 4.630E-10 89 185 414 179 278 338 +-----------------------------------------------------------------------------------------AAAAANAGSVGPMGANIFVFHVPINWTDEDFNAHFSPFGQIMSAKIHVDPVTKASKGFGFVSYSTPQAATMAIKGMNGFDtkqGKFLKCTIKKGEEQYNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719336_2950921 75 0.260 4.630E-10 101 190 414 156 247 356 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------RELYVGSLPYEITEDDLHRLFAVAGTVQSVHLITDPVSGKSKGCGYVKMTTVGEAIEAINCLDGalVEGRIISVSEAREQKPQKSPQRP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>5467|scaffold_995326_c1_1|+193|00 75 0.280 6.150E-10 104 190 414 3 91 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLHVGGVPNDTSDQQLSELFSPAGRVVHAQVMRDAASGLSRGFGLVEMATPEETETALAALTGrtLNGGTITVRRLPPRATGWEGRNNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5947209_8463924 75 0.437 6.150E-10 104 151 414 63 110 111 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------GSKLFVRGLSYNSNEVALKDAFSQHGNVIQVKVICHPVTGRSKGYVLVKFSSETEAAAALERMSdeVLDGKKIRVDYANSEQS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719362_1820479 75 0.278 6.150E-10 105 181 414 6 84 139 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGGLSEDTNERMLRAAFVPFGPIKCVDVPINYTENKSRGFGFVTYEDDEDAIEAKYNMdgSELMGRVLTVDTAQENQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>AP95_1055475.scaffolds.fasta_scaffold57291_1 75 0.259 6.150E-10 104 182 414 72 151 153 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLYVGNLPFNAGQDDIKNLFAPYGEVIDIRMVKDRRSKRFKGYAFVEM-NTGGANAAIKQLDGNDyaGRTLRVNEAQKKEE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719309_1785767 75 0.287 6.150E-10 159 296 414 7 143 157 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACANESHVIKGKKVTCKKAEAKQ--------GKIYVGKIPTEgVTADDLQAHFSTHGAVAEIIRPKDKtnedvlRNFAFVTFEKEEVAKQLVKEGTaTVNGHELVIKRVTPK-DGGHGGMRGGYGGGGYGGYGDPYAMYGGYGGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712151_1112305 75 0.310 6.150E-10 104 175 414 60 133 167 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIYIGHLPYGFEEEGIKAYFSQYGTVTKVKLMRSKKTARSKGYGFVQFEDKEVAKVAAESMNqyLMYGKFMECK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550532_233869 75 0.255 6.150E-10 102 189 414 29 118 187 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PTRLFVGSLHENISESMLENLFKPYGSLDKIELMKDPESGSSKGYAFITFNDSECGKKAMEQLNGFElaGKPMKVNAVIARQEVTNPMGS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000069408590 75 0.347 6.150E-10 103 174 414 20 91 222 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKLFVKGLHTSVDKAKLQQVFSQFGPIDKTYILYDHKTGVSRGFGFVEFMKEEDLEKSLEVEIKIQGKVVKC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A059BGY2 75 0.260 6.150E-10 100 193 414 64 158 281 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PSKSTLYVSNLDFSLTNSDLHTLFSTFGKIARVTILKDRATRRSRGVAFVQFVSQPDAQRAAAEMHGkiLNGRKVAASIAI-DNGRAPEFIKKRVY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A103Y3Z6 75 0.294 6.150E-10 91 168 414 9 86 302 +-------------------------------------------------------------------------------------------PKGSAESKDFKTKKIFVGGIPTSVTEDEFKGFFSKHGKVVEHEIIRDHATKRSRGFGFIVFDSEQVVDTILVNGNMID----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719329_680634 75 0.202 6.150E-10 100 185 414 176 264 320 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PMGANIFAFHIPINWTDEDFHAHFSPFGQIVSAKIHTDPITKTSKGFGFVSYATPQAATMAIKGMNGFDtkqGKTLKITIKKGEEQYNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A151ZB44 75 0.252 6.150E-10 100 180 414 270 352 354 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PESNELFIYYLPPLYGDEELKTLFSKYGNVLSSKVFIDRNTNQSKCFGFVTYDNTQSAHHAIKELNGFpvDGKKLKVTFKRER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712130_386394 75 0.238 6.150E-10 103 165 414 255 317 386 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RNLYIKNIAESVTDEQLQNLFKPFGEITSAKIMVNEDTGVRRGFGFVCFKNSDDARAAITSLN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_2234809 75 0.310 6.150E-10 78 164 414 515 601 609 +------------------------------------------------------------------------------KSATRRKTGKKENEKKEVKAPIFDYTNLIVNYLPPDMDCGLLQKVFSKYGEIVSCKVVMDHKTGLSKGYGFVKFKTKEEADRAVQGL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>HubBroStandDraft_1064217.scaffolds.fasta_scaffold3611928_1 75 0.325 6.150E-10 97 177 414 701 783 789 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RPAGDESNLFVGDLARQTTEAMLEDVFKTVGDVVAVSIKKDKRTGHHLGYGFVKMASHADALRAKEKMHNadVGGRRIRVGWA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000940170804 74 0.222 8.170E-10 104 182 414 1 81 83 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIHVGNLPKTAKKEALAGLFKPFGNVVTATIARDKKTGNSRGFGYVEMSTRHEGEEAIANLNdrKFEGQKLQVGEAQERRE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000847523945 74 0.243 8.170E-10 104 183 414 1 82 88 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVKNIHSDINELQLESIFAVYGEILSTKIIYDRADWSSKGFGFIEFAKKADALKAIETLNgkELKGKKLEVKEAVEKKGR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>7131|scaffold1454546_1|+3|11 74 0.413 8.170E-10 92 149 414 37 94 95 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------GFKVFVTNLSWDTQWQGLKDHFASAGDVAFADVLTDKRTGRSKGYGIVAMSSAEAAAYAISSLNetELDGRNIAVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5579864_4468673 74 0.273 8.170E-10 107 188 414 0 83 100 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGNLTSQTTQEQLETAFAQFGTVERVEIVADRFSGQPRGFAFVEMVETAAAVTAIAGLNGtdLNGQAMNVNEARPKPSGGSASR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719498_2199428 74 0.252 8.170E-10 106 190 414 0 85 100 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FIKNLPVEWEDEQLKEYFSKCGVIKSA-IAMKGADGKPKGFGFVNYEDPSEAARAVEELHgvEVNGKAIFVGRAQKKRDRERELREK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719153_2225853 74 0.233 8.170E-10 145 245 414 0 98 103 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFAFVVVASDGSVNSALNSEHTIKGKTVTVKKADVR--------PGKVYIGGLSDGISEDDIRNALSEYGNITEFVRPVDrsnndaPKNFCFVTFERREPVRSLFSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>919|scaffold_1143872_c1_1|+2|10 74 0.307 8.170E-10 103 180 414 16 93 103 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKVYVKGLPSNCDKTKLHEVFSRFGEVDKAFILYNHKNGSTRGFGFVEFTTQESAMVAVGKVIEICGKDIQVSMAIQR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711872_573313 74 0.366 8.170E-10 119 188 414 0 70 105 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LREYFGTYGEVTDVVVMIDKMTGNSRGFGFVSFNDSSIVDSVVsSGPHQVGGFPIDVKKALPRDQNNNRGP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR6266852_4866859 74 0.289 8.170E-10 104 177 414 1 76 106 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIHVANLPPEITDGDLQTYFSSFGSVEGAEVIRDIHTGQSVGYGFVIMPSDEEAANAIAGLNGksWMDKVLTVSKA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719193_2014050 74 0.265 8.170E-10 98 178 414 11 93 106 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EEKEGRNLIINYLPPSFTQHDLLSHFTPYGMIENCKVVMDLVTQKSKGYGFVKFESREGALRAKEALNGfaIKNKQLKVAFAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719245_105457 74 0.274 8.170E-10 151 255 414 0 106 107 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FKHKQSVKDVIqhEGPHRISGKLVDPKPA------TDERRDGKIFVGGLRHETTEDQLREYFSQWGTAINIERPfdkkeNRPKGFAFLTFEEEGIHEKILDHpYHEINGKRCE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3989338_4972408 74 0.233 8.170E-10 116 207 414 0 102 107 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ELMLTEAFAKFGDLLDARIVRNPDTGRSKGFGFVSFIQKAHAERALATMNGtlLGAKNIRVNFASQEGSEPAPsadlaeapkDANTSVYLGNLASNVDERLLR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5436190_20203552 74 0.294 8.170E-10 87 164 414 30 107 108 +---------------------------------------------------------------------------------------SDDHGEQNKSGSENPGSNLFVSGIAPRLEETELEEIFSKYGRVEKVQIMLDPHTRESRGFGFVQMSTSEEADAAKEGL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712113_739381 74 0.267 8.170E-10 105 188 414 0 84 108 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LGVFGMSIDTREKDLEEIFSKYGRIESCVIVTDK-SQQSRGFGFISFSSVSDAQEAREQMNGkrIDNREVRVDYSITKRAHTPTPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5271163_746178 74 0.300 8.170E-10 101 188 414 18 107 109 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DEMNIFVGNLGPQVTETELAELFKRFGEVKTVQVSRALFTGTPKGFAFVEMPGKRHSLAAIAGLDGKDfaGRPLKVSEARPKPIRGRAPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>3300027909.a:Ga0209382_10061475_5 74 0.301 8.170E-10 104 184 414 3 85 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVDNLGKDMTESDVHALFSTVGTVLSVVLPLDHHTGARKSYGFVEMETPEQAQAAAEAMngHLIGKRALKVSHIHPAEERP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712216_1105607 74 0.292 8.170E-10 113 207 414 1 99 114 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------DTSEATLHGHFSRVGELSEAMVVCNHVTKKSRGFGFVTFRDGRTASSVLAQSHKIDNKTVDVKAAVKKgvlvADSFEQKMAKQIFLYSLPDHTSSDQLK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5438105_1900222 74 0.415 8.170E-10 105 157 414 63 115 116 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGNLPHSTTEPQLRTLFEAHGAVERVNIVMDKETGRSKGFAFVEMTDTSQA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5437667_7080087 74 0.415 8.170E-10 101 153 414 69 121 122 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------METKLYVGNLAYSATEDDLRRLFTQAGEVQSVNVIKDRDTGRAKGFAFVEMST-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_2372045 74 0.290 8.170E-10 107 191 414 0 85 122 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGGLPRDITEDQVKDFFQTYGSISDVSFAISKEDGKNKGFGFITFDDPNAAVAVVQQhYHDLNGKKVEAKSAQTREQIRRQGGGNK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000568699321 74 0.415 8.170E-10 104 156 414 1 53 124 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYIGGLPYATTNDGLKDAFSKVGNVISANVIIDKMTGRSRGFGFVEMEDEDA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690554_1971818 74 0.290 8.170E-10 81 171 414 33 124 125 +---------------------------------------------------------------------------------KRQPAKTQKPASTGQNPDGSDEVTLYVGNLPFKTSEESVQQTFETYGKVFAVRLVKDKRTGKRKGYGFVEME-PVGAELALSKLNdtEFEGRT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688500_17773126 74 0.236 8.170E-10 112 185 414 0 75 130 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------FEMTEAELEGLFAPHGKVQRVSLVMDRETGRPRGFGFVEMVDESGANAAISALdgSMVGSRKIAVNVAKPREERGP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719158_660735 74 0.370 8.170E-10 104 182 414 13 93 134 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVKARGKdDLDEEGLKGYFSTFGNIESVNVVTDKNTGEKKGFAFVEFDDYDPVDKAiIIRDHFVDGKKIEVKKAISKAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_MED_95_MAG_00467_000000009779.4.1 74 0.261 8.170E-10 100 181 414 20 103 157 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QSHRSLYVGGLEETIKDSMLRAAMIPFGNIKSVDIPMDYQKGTNRGFGFVEFDDAEDAAEAMFNMNgaELMGKVLTVNLAQANQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719375_63179 74 0.320 8.170E-10 90 164 414 62 136 158 +------------------------------------------------------------------------------------------GRQRKPRLREDTNRKVFVGGLNPSTTAEGLRTYFEQFGTVSEASVVIDKVTRTSRGFGFVMFESETTCVQSIGEL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>PorBlaBluebeHill_2_1084457.scaffolds.fasta_scaffold126231_1 74 0.226 8.170E-10 100 182 414 77 160 163 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EQDAKLYVGNIDYSASKKELESLFSKYGQVDFVNIPIDHYSGKTRGFGFIAFNCTKDALRAMDlNGTTFKGRQIQVNFARERKS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719162_1171515 74 0.298 8.170E-10 104 188 414 3 88 169 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFVGGLPKTATEDALYQLFAPFGNIQKIDLKYDPNTQEFRGFCFVAM-DKEGAERVVANKGsmSFQGKWIDCKLAGGKDGGGKGAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5215831_9714758 74 0.415 8.170E-10 101 153 414 43 95 170 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EIAGKKLTIKYSERK------TIPMKLFVGRLPRSATHTEVKDYFSDFGELDDCFVP-ANRGFAFVTFSAEEDGKGCLRAKHMFQGSQLSVVIADPRDGEGGPSSRGRRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711988_657200 74 0.256 8.170E-10 103 180 414 9 90 191 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RTILVAQLSFETTEDTVKDFFKEYGELRSVRLVRNIVTGISRGYAFVEFKRERDARAAVKdclyTPKKIDGREILVDHERER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>11153|Ga0310344_11223946_1|+3|11 74 0.267 8.170E-10 105 174 414 27 97 206 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------EIGNENKMFVGGLSKKTTVEAFRTYFEAYGEVKDVVVKTDPSTGTSRGFGFVMFTAEESIGKC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_2516133 74 0.271 1.441E-09 117 196 414 0 80 130 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ESVRQYFLSYGTLIDCVVMKDRETQRSRGFGFVQFENQEAVSAVINTPkHELDGKQIVCKPVMPQGGGGGCWGGKGAMMGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000906921094 74 0.489 1.441E-09 103 149 414 46 92 131 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------RFFIPGLPETATEDDLKQHFGKFGHVLEASLAKDRGTDQSRGFAHVTMEEQINPSNVLCESHFIGGKEVRVQLA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3954449_11888003 73 0.431 2.541E-09 99 149 414 55 105 106 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PQMGKKLYVGNLPYGVNDADLQQIFGEHGSVTSAQVIMDRDTGRSKGFGFV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712159_683892 73 0.254 2.541E-09 127 218 414 4 105 107 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTITSIRQKKDRATGQPRGYAFVQYEDEFMAEAACRELDgmEVQGHALRVTPAgnaralrgLEYKKQWKGPRRNHVFVGNVPLEATEDELRELCSKVGTIVS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719321_2526139 73 0.329 2.541E-09 108 191 414 0 83 112 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGLPEEATSEDLNTYFGQFGNLEKVELKTDHD-GKSKGFAFIRFSDAETAKQCMEyTPHTLGEKEVEVKRPNARHAGGKRKGGKN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719321_1281080 73 0.261 2.541E-09 105 190 414 3 90 113 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LLVRNIRRGTPTEDVRHAFSEFGELKDVYMPTDYYTRQPRGFGFVEYYEVADAQEACKRMHKsdLDGNIIEVVFAQQRRKSPNSMRER------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711904_290842 73 0.256 2.541E-09 119 221 414 0 108 114 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LYDYFIQFGSINKVLIPYDSNLKNegFKGYSLVTFDSKESVDKVLDQkKHIILEREVYITMAVTKKEARnlmDEKNRRKLFCGNLSKKTTKASLSDYFKKFGEVTAAYL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711879_552369 73 0.300 2.541E-09 116 211 414 0 99 116 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EEQLKQYYAQWGDVAESVVPKDNRTKLSKGFGFIIYTESKSLDVAMKArPHKLNDRTLEPRRAIRRDEADNPaanASTNKLYFGPLGHNTTRDDLGTFLS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712138_277790 73 0.246 2.541E-09 103 181 414 11 91 118 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TTLYVGGITEKVTEKILHGVFCTFGEIKSVNIPRSSENDTNRGFGFIDFYKSEDAITAIDNMNntELFGKVLHVNYARPQE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1051326_3568056 73 0.415 2.541E-09 101 153 414 47 99 121 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MEAKLYVGNLPYTTVDADLQSLFSQAGTVKSAQVIRDRASGRSKGFGFVEMSS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>23949|scaffold_399262_c1_1|-19|00 73 0.282 2.541E-09 107 182 414 43 120 124 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------ILNLPRTKTAKDLTNLFASYGVVKSCNIVMDRVTRQSKGFGFVEMPNDVEANAAIADLNckNFDGKRIRVKQVQKKDE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688572_14235392 73 0.456 2.541E-09 104 149 414 80 125 126 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0.250 2.541E-09 100 189 414 44 135 156 +----------------------------------------------------------------------------------------------------ENDGKLFIGGLSPRTTKESLEHAFSNIAgcPVKEASVMLDKQSSRSRCFGFIKFEDLSIAKNLVGQSYNIDGHNVEIKWAVPENSSSSSSSS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SoiMetStandDraft_5_1073268.scaffolds.fasta_scaffold652235_2 73 0.682 2.541E-09 201 263 414 0 62 162 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MTTDDLRSFFSNYGEVLDVYIPRPFRSFAFVTFADHVVAQSLCGEDFLIKGHSVHVNSATPKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712168_725204 73 0.289 2.541E-09 164 274 414 11 131 179 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PHELDGRTLEPHRAGPieySRRMESHHTCNQIFVGDYKPELEEGDLRDYFSQFGNVEEVSIPKEKddetkiRGFAVVKFDDYDPVDVCCHKrKHTIKDIQVYITKYIDRKTMNQLKRRFGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719419_431306 73 0.276 2.541E-09 167 319 414 0 148 183 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LDGRKIDPKPA------QALRKDGKLFAGGISTETDNDKIKEHFEQFGEIEVFerpvdKMTKKNRGFCFVTFKKDGVLKLACAErKQQLDGQEIEVKEARVEDNR----SQRGGFGRGGGGFGMRGGWGPQMGPYGYGGGFGGYGGGFDGGYGAAFGNP---------------------------------------------------------------------------------------------- +>KNS5Surf_AmetaT_FD_contig_123_8651_length_275_multi_4_in_1_out_1_1 73 0.313 2.541E-09 98 194 414 54 149 191 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EGPPGANLFIYHLPHDLTDADLATLFSTCglGRVISAKVYVDKKTGASKGFGFVSFDSAEAADHAIGQM---DGFQVGTKRLKVQHKRAGGFAQGRVSV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719387_3036516 73 0.295 2.541E-09 78 175 414 112 208 213 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+-------------------------------------------------------------------------------------EEEPKSKPANRFPEVSSGTTLFVRNLLFETTEVDLKELFKQWGPVIYARITVDKESGLSRGSGFVCMRNKADADQCLEEAEALRKRSVnngtdDQDALNSLMSKREKKKSNLVYSSILTPDAgTGEGLK--FTLHGRVLDV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>M7Z861 73 0.268 2.541E-09 85 179 414 450 546 1007 +-------------------------------------------------------------------------------------EDVEAASTTDEKKLALETGRLYICNLPYATTEEDLVQLCSQYGDVEQAHIVVDKTTKLSTGRGYVLFSLPDSAVRALDELDNlsFQGRLLRVKAAKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000963395021 72 0.420 3.374E-09 101 150 414 0 49 64 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+------------------------------------------------------------------------------------------------KKAERRDGKMFVGGVKPETNDDTIKAYFEQFGEVEEVARPINKETQENKPFCFIVFKRDGIIAECMKKDyHEIDGKKVDCKQSHPKPQGGGGFGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719317_1377029 72 0.289 5.947E-09 190 311 414 21 148 157 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RKLFVGGLPQDAKDTDIKEHFGQYGDVAQIeqpfdKVKNERKNFCFITFDKEETAKKLLKEGtVNVQGHELEIKKVNPPNKGMQGGFGGGRGGGRGGQHGGFGGPGGWGGYGGYGGYGDAYGWGGYGG------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>APIni6443716594_1056825.scaffolds.fasta_scaffold6680975_1 72 0.272 5.947E-09 103 177 414 4 80 172 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TRIFVGNIPYDFEDQDLINTLQMAGPVENLEIKLDENTGKPKGFGFCTYKDPESRSSALRNLKHIDynGRQLRINEA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712032_1097816 72 0.287 5.947E-09 104 188 414 91 177 178 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLRVTNLSEDAREGDLSELFGTYGHVSRIFLAKNQDTKLSKGFAFITYTNKANAEKAIKNLngHGYDNLVLRVEWSKPVQRDEAPRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_336191 72 0.309 5.947E-09 198 322 414 7 132 200 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEEITEDDLRQHFEKFGEVTDVYISSPWKHFAFVTFADVKIAQSLVGKEHHLGDVSLLIKSAAhTKSGKKDENGQGNGRFGDNMDRNMPPMYPGYGPGGYGPGGFGPGGYCMMPGYGGPPGPPGPM------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001277638937 72 0.266 5.947E-09 80 180 414 97 201 203 +--------------------------------------------------------------------------------NKKKTDNKYESSRKKYQDNSNkyNYNSLRVSNLSEQTTEQDVHELFNYFGRIQRVFIVRDKITQKSRGFAFITFSNSKDAANALNNLNgyGYDNLILKVEYSIDR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_UPI0009AAE3DB 72 0.425 5.947E-09 103 149 414 15 61 222 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKVFVGGLAWETQKETMRKYFEQFGEILEAVVITDKNTGRSKGYGFV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>GraSoiStandDraft_56_1057294.scaffolds.fasta_scaffold3722975_1 72 0.661 5.947E-09 204 262 414 1 59 234 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DDLRSYFSQFGEVTDVFLPRPFRAFAFVTFADAEVAHGLTGDDHIIKGTSVHVSTAAPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>P78795 72 0.264 5.947E-09 96 180 414 194 280 282 +------------------------------------------------------------------------------------------------KRERDDSATLRVTNLSDDTREEELRDLFRRFGGIQRVYLAKDKETGRAKGFAFVSYYDRDCAIKARDRLDGYGWNNliLRCEFSKPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>5950|scaffold5092557_1|-1|10 71 0.416 7.893E-09 104 151 414 11 58 59 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFVAGLPFDMDGQELKEIFEDYGPVNSANIISDRETGKSRGFGFIDF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001376446137 71 0.263 7.893E-09 104 177 414 1 76 77 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KILVSKLAREIDEKQLQELFSSYGDVDSCVIVLDKDSGKSKGFGFVEMPKHTTAKAAIRSLNGkkVAGEKIRVREA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A090I9X9 71 0.276 7.893E-09 104 177 414 1 76 78 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLLVRNLPRTMTEYELREMFKAHGSLDYCTLVLDEMTGESKGFAFVEMSNEEEALAAIEAENGkkFGKEKIRVKAA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000877300898 71 0.315 7.893E-09 107 180 414 1 76 79 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VWNLSKDAQDSDLLELFVPFGQVLRAHVVRDYKAGLSRGFGFINFAKREDAEKAMEKLsgYGYDNLILEVEWSLPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1T3MJF5 71 0.256 7.893E-09 104 183 414 1 82 86 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NILVGKLNPQTTEQQLEKHFNSFGFITAVDIIKESYSGDSLGYGYVLMPNPEEAETAIKKLNGtsLDGHSIFVSKASQNSSR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9303|Ga0075371_10802384_1|-65|01 71 0.287 7.893E-09 101 177 414 7 86 92 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PTYSLFVKNLAFKTTEEKLRKVFEKCGEISSIRFPTHRDTGKKTGFAFVEFATQAGLKNSLNinmSKIKLDGRQLILKPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A182GHN5 71 0.425 7.893E-09 103 149 414 33 79 92 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKLFVGGLPYHTTDKSLREHFSVYGDIEEAVVITDRTTNKSRGYGFV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>2230|Ga0302118_11551188_1|-3|11 71 0.346 7.893E-09 119 191 414 1 75 94 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LRKHFSAFGKVLDTEVMMDSTTGRSRGFAFVVLDNAESVRKAMAhgNRHTIDGRSSEVKQATPRSKERPAAAAAN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719277_1233125 71 0.262 7.893E-09 162 262 414 6 100 102 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EDGYLLDGRTIQIRRAGAK------NKTVKIFVGGLSPSTTVESLYSYLAYYGELSDVVV--KERGFGFATFTDPSAARAALAEdaGHIVDGKVVNLSPCEAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5659263_250764 71 0.256 7.893E-09 101 180 414 19 100 102 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DYGKIFVNNIPNYASESELTDIFNQFGEVVDVSIPKNYETGFARGFAIIEFERSESVTKAINNSGKIlyKGRTLYTQIFLPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1739836_208357 71 0.610 7.893E-09 179 237 414 6 64 102 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PLQEGNNPQVPCKVFVGRCTEDMTAEDLKEYFSKFGEVTDVFIPKPFRAFAFITFLDPE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712046_493393 71 0.240 7.893E-09 104 177 414 17 91 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KTFISGIPLSCTEEDVRAYFEKCGKITELKLVEDRETGQSRGIAFVSFSDKASFVNALKcNDEEFEGSRLKVDKA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719357_139921 71 0.342 7.893E-09 112 219 414 0 102 104 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------PTTTSAQVGEYFRKFGDLAMVELKSGRNTNVA--FAFVRFVDKAVERKVLKQKHTICERDCTVRIP---DSQQGDRSLRKIYVGYQSNTLTEKDFIDHFEKHGDVSEV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719331_828138 71 0.302 7.893E-09 105 188 414 0 85 106 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFIGGLNAEATIDEIKDKMSSAGEVVNVHIVKDKETGNTKGYGFVEFARVSDAEDAMDRLTGIDiaGRRIRLAPSGAPPGKEGGKG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719198_2438035 71 0.242 7.893E-09 137 216 414 0 94 106 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DRESGKPKGAGKIEFSSHAAAQHAIDELNgrEIDGRSIAVKvletgshpayadqVEQPQRPSRSNDDTRTVFVGGLSWDTTRESLHRHFSQCGEI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719478_1366493 71 0.302 7.893E-09 92 175 414 0 85 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------AASSGGKSRDPNTLFVGGLPPQAVDKDLRDFFQKYGAVKSAEVAMDKATGVSKKFGFVVYEDNAgvTAAGADRDNHFILSKWVDAK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001066182748 71 0.256 7.893E-09 160 258 414 0 108 113 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VISLKHEIDGKKFECKPvvnETKANQQEDIKKKRKIFVSGLGTKIEEHDLRDYFQQFGEIERAFLnrehyTNKSRGSGFVLFKSIESSKRTLAPGqvHTIKGVNVRLRF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>24913|scaffold_1290025_c1_1|-3|11 71 0.296 7.893E-09 104 188 414 28 118 119 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVKGLSSGfVHRNDLKLYFSQFGEVTDVYIPKDKATGNQKRFAFVTFKAVSQARAALAHPpdaHILptDGSFLQVMPAEPRPQSVSPPP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000294815295 71 0.315 7.893E-09 83 175 414 22 114 120 +-----------------------------------------------------------------------------------KKGGNRGGGGGAPRGDRVPGSSLYVGNLPWSVTWQDLKDVFSEHSPV-YADVKTDME-GRSKGFGIVRFATAENATAAIAAINGMDieGRSIEVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712096_365767 71 0.481 7.893E-09 103 156 414 0 53 123 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSLRVGNLPFKTHQEDLKEVFEKFGEVGDVFIPSDRETGRTRGFAFVRFYEKKD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR671912_1525697 71 0.230 7.893E-09 104 179 414 23 100 124 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVAKFDLQMQNEELKNLFKPYGEVQSAKIEIDAFTNQSRGFGYVEMADEAQAQAAISGLNdsVLNGNAITVKVAEP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1739848_169481 71 0.241 7.893E-09 109 211 414 1 117 127 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLPWRTDWRELKDHFRSVGEDTYTKVMEDRRTGRSKGCGIVEFANPQDAAKAIETMNesEIGDRRIKIREDRDPAETRRPRDD---YGGRDNFDRDrgarrednpelekkmDDDLDDYFS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719321_98711 71 0.277 7.893E-09 111 196 414 0 88 136 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------SRHTTTKQLRDHFMKYGRVIDCVAMKE-ADGRSRGFGYVTFSSQAACDRVLSEAQIIDGRTVDVKRAVPEAVGGAassfPQMPQSAFLGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719289_309716 71 0.279 7.893E-09 107 190 414 15 100 137 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VNNLLESVRTDDLRDTFDKYGKVADVYIPRDYHTFRNRGFAFVRFATQEEADEAVnrSEDLEILGQHVRVEHAMYKKNDRPPARRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR6187455_1708579 71 0.231 7.893E-09 117 239 414 1 138 140 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QQLADVFAQAGiDVTAVKLPTGDNHGVNRGYAFAQVSDGGVARKALSLDGSIslSGRVLRIEEADSDASADDERTsatqaaSSRLYVGNLSFETSAAELRSVFVVNGLIpLDVYVatdkaSGRSRGFGFVSLESATDA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000536199615 71 0.247 7.893E-09 104 190 414 57 144 145 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KMFVGGLPLESTEETVTEMFNEYGKVRSIKLAADVFTGKCKGFGFIEMEGHE-ARAAIAGLNGkiIGDKSLKVQFEEPRKGGKKGGRRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSMisStandDraft_5_1062788.scaffolds.fasta_scaffold19983_7 71 0.307 7.893E-09 117 193 414 1 78 152 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DELRNYFSNWGEVVDCNVAWDRETKRSRCFGFVTFAAPEQLVAAMdEAEHTISGKRIHVKPYTDEGAHGGTGGIKRSF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MEHZ01.4.fsa_nt_MEHZ011303544.1_1 71 0.625 7.893E-09 201 272 414 0 71 154 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MTTDDLRSFFSTYGEVLDVYIPRPFRSFAFVTFSDHMVAQSLCGEDFLIKGQSVHISSATPKAATGGAVARG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719510_2505448 71 0.258 7.893E-09 100 181 414 54 138 163 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QQGASMFIFGLPEILADEDLYDLFELYGAVRTAKIIKDPETGQSKGYGFVSMSRFRDAQVAISHLDGHacgYGKNLRVMFKRSRP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>AutmiccommuBRH17_1029484.scaffolds.fasta_scaffold02515_1 71 0.676 7.893E-09 201 268 414 0 67 164 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MTTDDLRSFFSHYGEVLDVYIPRPFRSFAFVTFGDHMVAQSLCGEDFVIKGHSVHISSATPKAGTNTQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712142_488857 71 0.262 7.893E-09 156 261 414 2 123 169 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DQKKCLSEEHRMGDRVLEVKIPQSKAAGfdevvqftsGVQRLSRRIHVGNVTPRISRKDLEEYFAQFGSITDVFIPketetRKTPMYAFLTFDEEDSARRAVEHHkaHLVQGDTLQVAFASP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_35_1057300.scaffolds.fasta_scaffold1069303_2 71 0.261 7.893E-09 84 167 414 60 143 169 +------------------------------------------------------------------------------------RQQNHKGGKKSNPKTGPPGANIFIMHLPLQWTDQELTGSFSSFGQIVSAKVFRDRLTGASRGFGCVSFTDPSGAQAAMAMNGFI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>AntAceMinimDraft_10_1070366.scaffolds.fasta_scaffold78912_4 71 0.242 7.893E-09 131 222 414 37 134 171 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ECKIVAD-ESGESKGYGFVQYATDEGAKKAIEKINnmIISGKKVYVAPFKPkhmrKDGDGSGPRFTNVYVKNLPDSVqTYADLKKFFGEYGEITSVWLP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UPI00087CD3E9 71 0.298 7.893E-09 105 179 414 48 124 187 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGRIPYGFFEEQLKQYFSQFGEVTRIRLSRNKKTGNPKHYAFLEFADEKVVDIAAEAMNnyLIEGHILQCKKVPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719491_1095693 71 0.198 7.893E-09 100 235 414 0 183 195 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PHRGRIIVADLLPECEDQDLFSYFNQWGKVFDAKVAREKETLLSKCFGSVKMADVSLVSQILQQDHRIWENSITVRLptelekdtliadilastaAMPESEQSPyaypvqesrwsapvqesrwsepvdysyqrfesPFAPGKFFIPMVHADLSEEHLTAYFMQFGMVASCTLTR--RGCCFVQMAD---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1S3C324 71 0.292 7.893E-09 87 190 414 50 155 259 +---------------------------------------------------------------------------------------SSTKSGGGSGGLVPSKSTVYVSNFDYSLTNSDLHTLFSTFGKIARVTVLKDRQTRKSRGVAFVQFISQDDAVKAAKQMHGkiLNGRVLKAAIATDNGRAAEFIRKR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_566464 71 0.237 7.893E-09 106 184 414 93 172 360 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------YVGNLPYNASDDDVGNFFAEHCDVIDVKIRVDHATGRNKGFGYVTFDNVESLREALgANDAEFLGRNIRVDVAEGQRDKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR6218665_2342227 71 0.272 7.893E-09 91 176 414 285 372 379 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------PSRGVRFFVPGLPANVTEEELSKHFSKYGTVAEATIARDRVTEVSRGFGHVTIEDGLNPGTIIAETHFIGGQEIKAQLAKDGLNGSEIM---KVYI--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688500_17923920 71 0.329 1.048E-08 109 188 414 0 81 107 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLSYATTSADLQGLFSTHGAVQSEDVVSDRDTGDSKGFGFVRMGSDEEALATIAALHGgqHDGRVLILAQAKPRETDGRSSG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712231_15068 71 0.310 1.048E-08 116 188 414 6 79 108 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGESEIESRFEQFGKLTDVFIPKDSHTRRSKGFAFVTFDDHRDARDAMKDLDGIevDGRRIMVEKARGRRRVGSRSQSYR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5512143_421028 71 0.275 1.048E-08 102 179 414 18 97 125 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PVKLYVGNLAETTTENGLRQMFARAGEVLTVHLMRDLSNGRPEGHAFVTMATAAGAQKAIATFREapMGQRQLTVNIAES------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719203_1686966 71 0.320 1.048E-08 101 176 414 46 123 126 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PGVCLFVYHLPQEATEITLYQLFSSYGTVLSAKVMKDLRTGRTKGFGFVNMMNEQQGALAVQSLNGynLGGKYLKVSF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_2699198 71 0.291 1.048E-08 96 172 414 51 129 130 +------------------------------------------------------------------------------------------------KKPSDGNCTVKIDNISFDSTDRDLKQAFDCFGEIGDVYIPKDRSTGRSRGFAFCRFLNDKDAAAAVSFMDGrnLCGRNI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719376_1377972 71 0.337 1.048E-08 101 175 414 6 82 132 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EDNKLFIGGIKPDTKEKTLREYFGQFGSIIKYEKPSDHATGKSRGFCFISFNSPEGVKATLSagQFHYVDGSRRECK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5437764_14340705 71 0.440 1.048E-08 104 153 414 84 133 135 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLFVGNLSYQTMENDLQEYFSAAGVVSSVNLMLDKFTGKSRGFAFIEFST-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719447_1285369 71 0.269 1.048E-08 200 314 414 1 115 137 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DVTEADMQEYFEKFGELKECYIPSPNKGFGFVSFKKQSSARKVLKSTHVLKGQYLNVGHPVSKKGDNNRGDRNNGNDQWNSGFGGGRGGGFRGGHGGGFGGGRGGGFGSFGGMGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719436_1544279 71 0.310 1.048E-08 117 215 414 0 89 138 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DDLKDYFSKFGNVNSVEQMTEKSTGKKRGFGFVEFDDYDSVDKAlLEQNHKIKDWRIDIKKAVSKDSASTNQG----------YSANRDDGRSYGGNFGN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>EndMetStandDraft_5_1072996.scaffolds.fasta_scaffold14081_1 71 0.693 1.048E-08 201 262 414 0 61 154 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------RNVDEMVTLKVDGVPNRAAPSELLEVFARFGEVGDVYIPRDYHTQEARGFAFVRFTDQRGAEEACDRMNGynFQGRELRVQFAQKRRPANP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ETNvirnome_2_130_1030620.scaffolds.fasta_scaffold215364_1 71 0.278 1.048E-08 88 166 414 58 136 186 +----------------------------------------------------------------------------------------DQGASAEKKASGPPGANIFILHLPTHWGNAELTGAFNPFGHIISATVYKDRVTNHSKGFGFVSYADPASAQQAISSMNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719500_110537 71 0.606 1.048E-08 200 265 414 0 65 204 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+>ERR1719234_2433046|ERR538171_k119_721877|-|1099|4.06616e-321|2|792|2497|2497[2497]:2408[2408]:90[90]|2279[2291]:792[792]:1488[1476] 71 0.329 1.048E-08 108 188 414 37 118 522 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGIGEETTDEDITEYFSQFGNVLDVMQLYHQRSGEKKGCGFVMFEDKDSvAKAARNELHSIGFRQVRVKRAVPKAEMEENKR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A2G5U5R9 71 0.299 1.048E-08 86 190 414 261 367 877 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------EVDDEELKQYFSTFGNVKQVKIIIDKNTMRKRGFAFVEFDDYDPVHKCIlQKNHEIRGNRVDVKTAVNRKDSNYGQRNAN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A2A4JUS1 70 0.293 1.390E-08 104 176 414 55 129 183 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFIGRLNPRTTEETLKSEFYKFGRILNCRVVRDIVTGKSKQYAFIEFENLGSVDRALKEMQkeYIDGAEVIVER--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719163_1071423 70 0.338 1.390E-08 102 172 414 132 199 229 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------DPDSGHTLFIYNTGPNITETELYALFGPFGAITKVHVRRDPATGMGKGFGFVTYDIYDDAVNAIQAMNGYENerngyKPLQVSFKTSKRKSD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719309_288744 70 0.275 1.845E-08 100 184 414 263 349 370 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QGGYTLFVFGIGFNATERTLWQLFAPFGTVQKVNIMMDYEKSQCKGYGFVTMTNHQEAVNAINCLihYFFNGRSLQVSFKNENQQAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711879_693756 70 0.309 1.845E-08 107 188 414 103 186 392 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGNLSFQATEQDLGELFAAQVAVESVQIVTNQNTGKSRGFGFVTFKEREDLEFALDAhgKAELFERIITVKVSSAPKGRQQRTR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_778527 70 0.320 1.845E-08 105 176 414 446 520 523 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVYNIGASADEKTLWSLFQPYGDITKVNVIRDHgKGGVSKGFGFVTLATPEQAQVAMEHLNGyvLNGRAIQVSP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A026WHA4 70 0.260 1.845E-08 79 172 414 328 423 888 +-------------------------------------------------------------------------------DDKANIKWRKQEEALKNEESIAESGRMFIRNLTYTTTEDDIKQVFEKYGPLSEVNLPVDKVTRKPKGFGTVTFVMPEHAVRAYNELDGsaLSGRML------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>Q54PB2 70 0.252 1.845E-08 94 174 414 351 433 895 +----------------------------------------------------------------------------------------------KEDEDVGESGRIFVRNLSYSTKEEDLEKVFSKFGKISEIHIPIDYDSKKSKGIAFILYLIPENAVQALNDMDGkvFQGRLIHV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>G7E469 70 0.265 1.845E-08 85 167 414 507 589 976 +-------------------------------------------------------------------------------------DEKEDDEGPKQRSSSTDAATLFVRNIQFEATEDELYQVFKQFGPVRYARIVMDKKLNRSKGTGFVCFYNEAHARETLAESDLI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>7292|scaffold_1121527_c1_1|-45|01 70 0.271 2.449E-08 123 190 414 0 69 81 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FEQFGQVGEVRLIKDKYSGESRGYGFVKMSSKEEAEKAIEEMNgkEFMGSSVNVNVAKPKTSGGGSIRGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>L1JD44 70 0.289 2.449E-08 107 180 414 0 75 84 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VRNIGDRTDGQDLRELFGRYGTVKDVYIPIDYYTKRPKPFAFVEFINYEEARDAKEDMDrrEFQGRVIDVVFAQQR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>W5JX05 70 0.342 2.449E-08 104 172 414 9 78 85 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGNIAWTVGHRELRNYFSQFGKVSWAQVVFDRKTGLSKGYGFVSFQKKTALENLeRNQKHILDNTPI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001491045627 70 0.304 2.449E-08 101 180 414 0 81 91 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNNTLYVGGLSLFTTNLSLEKSFIVAGRVQRAVVITDRVTGRSKGFGFVEMTTANEAAEAVLQLNdlQLEGHKITVSLAKER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550517_1688827 70 0.282 2.449E-08 140 225 414 1 92 99 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGSSLGFGFITFQESDMMKSCLEsQPHYLNKKAVELRRATPPQPKSVNGESlnssdKKLFIGGLDINVTDDYLMEYFEQFGKLTDWVVMKNS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712110_1399455 70 0.270 2.449E-08 105 176 414 27 100 102 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVFHLPPDVKNHDLFSLFSGCGTVLSVRIITDALTQQSKGYGFVNMATHQEAQYAIQclNGNRMGNKYLKVSF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9307|Ga0075374_10250158_1|+3|11 70 0.267 2.449E-08 99 167 414 29 99 104 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PTTPFCLFVYNLPQDTDENSMYRLFGPYGElgINSVKVIREVDTGLCKGYGFVNYLKLEDAQQAIQALNGF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR4029453_4052263 70 0.411 2.449E-08 103 153 414 55 105 106 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------DFGKDDLHDMFKKFGRIVSSEIKRDPKTKESRGFGFVTFENPADGEKAIQEMHgtEIERRILRVELS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719510_2698134 70 0.285 2.449E-08 84 172 414 25 115 117 +------------------------------------------------------------------------------------MERTGLPPVEDNFQSTEFATNLIINFLPLTFKESQLRNLFSTAGPISSVRIMKNRKTAKSKGYGFVKYSGHEFAKRAIEQFNglEIQGKQI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_120703 70 0.220 2.449E-08 123 227 414 0 126 131 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+-----------------------------------------------------------------------------------------EADAPKEEVEEIESKSLFIKNINFETTEETLKEHFEQAGSVTSVKII--QKDGFSCGYGFVEFGNDRGVRKAMSNLNnqVVDGHALKLTPSHGK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APLak6261670063_1056076.scaffolds.fasta_scaffold110471_1 70 0.247 2.449E-08 100 190 414 60 152 155 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PPGANVFVFNLPLNVDEAALHQMFCRFGQVVSTRVCKDINSRQSKGYGFVSFTTEHSALSACASLNgyMLGDKKLTVEIKDSGGRSRNSNRAN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719334_2847773 70 0.333 2.449E-08 115 183 414 2 70 162 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TEDMMKKYFRRFGAIQSVVVVKDRDTKKPRGFGFVTFATIDSSIHTTLATHNLGGQTLTCQRATPKPGQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711957_107343 70 0.256 2.449E-08 113 188 414 1 78 170 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------SMKEKHLREPFEKVGELNKCEIVRDPFSGESRGFGFISYVKDEDAVKACEELNktEIHGRTVAVEIAKGKKARTPTPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711973_197609 70 0.279 2.449E-08 106 191 414 0 79 180 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FVGRLPRSSTHTEVKEYFSDFGELDDCFVP------AGRGFAFVTFTAEEDGKGCLRAHHMFQGSQLSVVVAEPRAGEEMPPGGSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711974_330598 70 0.292 2.449E-08 97 161 414 17 81 203 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RPVRANTTLYIGNLPIDITAQELEEKFKEFGTITSCSIPHDPHTKDNRSFGFVCFADEQSCDDAI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR6266576_1138803 70 0.202 2.449E-08 105 221 414 52 199 207 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VWIGNLPWSATKATLRTFLTDHsnindGQITRVHMPepnnaansKQITKPQNKGFAYVDFTDSETLDAAIAlSETLMGGRKLLIKNAKSFEGRpdkpketedgkssvstvGGKPPNKRVFIGNLGFDVTKEDLIEHYTQCGEVVDLHM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719319_668323 70 0.246 2.449E-08 97 169 414 113 185 423 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RSDPNRKKVFIRGIVYDATDEEIKRVFSQFGKVVSLNLMRNAFDGRSKGFGFVCYETEHGAAAALKMKSITHG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_54_1057290.scaffolds.fasta_scaffold319434_2 70 0.298 2.449E-08 100 166 414 3 69 455 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EAGAKLFVGQVPAICSEDQLNAIFGQFGDILEIQIMRDKVTNRSKGSAWVTFRESSAADDAIETLHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0K2V054 70 0.252 2.449E-08 85 167 414 124 206 484 +-------------------------------------------------------------------------------------DKIRRKSSFKGPKPDEEARTIYVENIPSHSTQESLQQIFQEYGPVEYVSLPKYTESHLPKGFAFVEFQTVESAQKALEAYGFI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0D6EL04 70 0.288 2.449E-08 102 191 414 286 372 654 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------VLVKNLNYKTEVYGLRSHFEKFGALKDVYIPTDFYTRQPKGFGFVEFHETKDAAKAVQEMDGanVDGNNLIVCIAQNRRRSPNAMRQR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001167102236 69 0.333 4.310E-08 119 188 414 2 73 76 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LRAASEAYGQVEDVKVITDRDTGRSKGFGFETFSSEEAATRCKASMdgQMLDGRAVKVDFPREREEGDRGPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001174056308 69 0.277 4.310E-08 101 181 414 4 86 88 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DEKELREAFEAFGHVAVVKIIRDRGSGTSKGFAFVEMPSKAEGQAAMDGLNrkELSGRTLDLTEARAPGQGGRGNRPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>L5KCZ2 69 0.281 4.310E-08 165 252 414 5 100 102 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HKVDGRVVEPQRSVSRdfQRPGAHLTVTKIFVGGIKEDTEQHRLRDYLEQYGKTEVIEIMtdqgssGKKRGFAFVTFDNDSENKAVIQKYHTVNSH----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719247_328194 69 0.440 4.310E-08 102 151 414 82 131 132 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SSKVFIGGLPSLTTEADLRSYFGMYGTVHSADILKDSETNKSRGFGFIVF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719229_698979 69 0.307 4.310E-08 103 177 414 37 114 133 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNVWLSGLPKDWDELDAEDYFGKFGKIVSINIWKDFKTNKSRGSGFIDFKYPESAKQCIRELegHQFDGcRPLIVKYA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719321_570415 69 0.289 4.310E-08 117 190 414 0 75 137 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DQLRWHFQQFGEIALSDVRMDPLTGQSKGFGFVEYVNPQAIEYALqaQNQHHIDGKWVEVKRFGNDNSKGGGKGGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719188_38653 69 0.247 4.310E-08 97 182 414 27 114 139 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DAPKDCAKLVARNVAFEATERELRDVFKTFGELKSVRLPK-KVTGSHRGFAFVEFQSVAEAKRAMESLrhsTHLYGRRLVLEWAAAEEE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719206_825805 69 0.309 4.310E-08 148 282 414 0 138 141 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FVQFSESKVAQSLLGKEHIIKGVSVKIGEASPKgreqGGGRDHDRGGNRFGGYDGGYGRGGGNMGGFGNPGQVTDVYVPSPFRHFAFVQFSESKVAQSLLGKEHIIKGVRVKIGEASPKGREQGGGRDHDRGGNRFGGY----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_880695 69 0.243 4.310E-08 103 178 414 53 130 183 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RTLYIGGLDPAVTETLLRASFLPFGPIQHIDIPMDYAHGTHKGFAFLEFVDFDDANEAIYNMDgaELLGKALTCNVAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>EndMetStandDraft_5_1072996.scaffolds.fasta_scaffold6241226_1 69 0.280 4.310E-08 158 259 414 5 116 202 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DEVLRDTHTVCGRKITVKLhqdaaaetsSADRGGGRDDPAYRRIFVGRLEKHFTTDMLREAFaKKFGKVTDVFLaTG--KNFGFVTFDSEADARRALDAGSTsVDGSNVVIKPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712168_608098 69 0.239 4.310E-08 101 190 414 26 117 209 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QTTSVYVRNLHHECRQEDLRKIFSKYGEITDVYIPLDYHTRQMRGFAYIQFIHFEDAEDAVYyiDGTSLFGRALETQIAQSDRKTPSQMRFR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0P6H6V4 69 0.279 4.310E-08 85 170 414 138 223 333 +-------------------------------------------------------------------------------------DETNESNSSKRKKQKFQGYTLFIGNLSYDTTKEDVLRHFAKCGAIKNVRIPLEKITNQPRGFGYIEVEEHVTYENVLSMHHTFLKR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_11_1057310.scaffolds.fasta_scaffold3666767_1 69 0.229 4.310E-08 104 201 414 35 156 355 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVASLPFTCDDAQLRASFENFGAIKSAHVVRDYygaeqideadgqeqvegeEEGISRGYGFVTFVEADSYEKALQQsEHEIDGRTLIVKAAnDPLNSRAMSESTYKIHGqdgqSDLPPDV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_1832417 69 0.333 4.310E-08 105 174 414 23 94 427 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVARLSPDTCNEALRSHFEACGEVSHCSVMTDRDTGKSKCAGRVMFRSAAARQKGIDERHEsnLDGRAIVV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>HubBroStandDraft_2_1064218.scaffolds.fasta_scaffold2220454_2 69 0.277 4.310E-08 102 182 414 5 87 554 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SASLYVGDLLSDVTEGMLFEVFSVIGQVTLIRVCRDAMTKRSLGYAYVNYLNREDAETALRTLNTtpIKGRPCRIMWSQRDPS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001346000736 69 0.277 4.310E-08 82 180 414 284 384 841 +----------------------------------------------------------------------------------RYSEEPQQSPEEITIAKISETGRLFVRNILYTSTEQEFRELFETYGPLEEVHVAIDTRTGKSKGFVYIQFFKNENAVAAYHALdkQIFQGRLLHILPAEKK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000250545013 68 0.252 5.718E-08 104 166 414 1 63 65 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNIPEEVEEKELKSLFERYKSLISTTIVKDKNSGVSRGFAFIEFEDNKDGQNAMEKFNE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001066284029 68 0.289 5.718E-08 104 177 414 1 76 78 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLIVLNLPREFDEQKLESMFKVHGPVISCSLVIDQNRGVSKGFGFIEMEHEDDAMIAIEKLHGkkMKQSRIRVKPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12901|scaffold3908745_1|+2|10 68 0.295 5.718E-08 120 188 414 0 70 82 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------REFFTPYGEVLSAEVVRDRATGKSKGFGFVVMKDAVAARQAISELHEgrVEGNIVKVMEARPEKKAAIPKG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>25878|scaffold_557320_c1_1|-2|10 68 0.227 5.718E-08 101 177 414 0 77 86 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MQTKLMIRNLSYETTEADLENFFAPHGAVIGAEIQRFMD-GQSRGYAFVEMSNQVSAEAAIRYLNlrELNGRQVKVSFP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000060614126 68 0.437 5.718E-08 104 151 414 39 86 90 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPVPLDEKELKRVFSTFGAITDIVIIQDKNTKQSRGFGFVEF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719335_1406848 68 0.270 5.718E-08 116 198 414 0 84 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ENELKEIFGRAGTVVALRMVYDRETRQPKGYGFCDFADPETAVKAIKELSdvEINGRRIRIDLADNALRGRMGAPPKQLALGDVP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000243391820 68 0.234 5.718E-08 142 231 414 8 104 105 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QSQGFAKVTFISP-VPRSILNQKHFLKDKEVEVREYQDDEDKfimKCYRKTKKIFVGGLSLETTKSSLGKYFEQFGPIQDISIPinyysKQSKGFAFI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712185_198850 68 0.252 5.718E-08 116 181 414 0 66 109 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ENDFVGYFSLYGPVIDCVIMCDPHTRKPRGFGFITFDNSVAVDRAcVNKFHELNGKFVEVKRAIPQE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000470433735 68 0.247 5.718E-08 138 225 414 10 102 115 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RSPDISKGYGFIVCDNQKTYDRILEQKHfVIKNRKVEVNHATKRSGDNEPscevRENKKLFVGGLSGTTTKEDLYEHFTKFGKVDCTYIIYDP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719219_2246134 68 0.291 5.718E-08 104 196 414 11 106 119 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLLVKGFNDEMTDEIVEEYFAKFGNVEKVSQLRWPDSGRKRGYGFIEFDDSDAVDKiVLHGKHMIMGVRMGVKKALSKQEMAEAKSKemGNMYGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719500_312060 68 0.413 5.718E-08 20 77 414 3 60 123 +--------------------ESDGYVNLGGITCQLPGTTGLKYRNPDTQGWRLVRCHNECLQMPKEGWMAVAYLCIRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719239_229444 68 0.298 5.718E-08 101 175 414 0 76 169 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PEYTVFVGRLHPNTTEETLRSSLREFGKINRVRLIKDIVTGFSKCYGFVEFTNKYDAEDACRKGHrmIIDDHEILID---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719473_76504 68 0.320 5.718E-08 105 177 414 0 74 172 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------ILVRGLHLRTSMGVLRYHFQKFGDVKDVYMPVDFETRQPRGFGFVEFWDAHDAMKAMKSMdgQEIDEKKIECKPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>OrbTmetagenome_4_1107371.scaffolds.fasta_scaffold275926_1 68 0.284 5.718E-08 105 190 414 9 96 189 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LLVKNLSPRVTKDVLKERFEKFGAVKDVYIPQDYFTKQLKSFGFVNFEKESDARDAMEALDGTDveGNQISVQVAKDRRKTPDEMRRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9301|Ga0075375_12129331_1|+2|10 68 0.252 5.718E-08 105 167 414 74 136 235 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYISGIAWGVNEGTLKQYFNQFGNIERIYIPRSKRSGRVKGYAFVEFEDMETAEVAAKTMNNF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>LauGreSuBDMM15SN_2_FD.fasta_scaffold90206_2 68 0.300 5.718E-08 100 176 414 204 283 291 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EPTNTLFVTNLDWKSTDDDLFQHFSQAGsTPTSAAVQKNEANGRSKGWGLVMYNTPEEAESAMIQLNNtdLDSRKIRVRF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1Y1I0G8 68 0.315 5.718E-08 101 174 414 417 492 503 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PGASLFVYHLPTEFRDNDLMTTFSPFGNLVNAKVFIDQNTGESKGFGTVSFDTPEAAEAAASVLDGfaLGGKTLKV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000973835101 68 0.258 5.718E-08 78 162 414 298 382 732 +------------------------------------------------------------------------------EEDEEDEEEAQEVSTPAKKQSTDNSSTIFIRNLPFTTTDEQLQGFFARFGAVRYARVVMDKVTEKPAGTGFVCFVKGEDAKSCIK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001239060884 68 0.428 7.586E-08 101 149 414 0 48 49 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGKKLYVGSLPYETTEDQIHAMFTACGPVTNVQLILDRETGRSKGCGFV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>10605|scaffold3848848_1|+2|11 68 0.446 7.586E-08 105 151 414 35 81 82 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGNLSTSTTEADLERLFGLYGTVTRAQVITDSETGRSRGFAFVEM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>26187|Ga0315273_18174964_1|-36|01 68 0.252 7.586E-08 115 183 414 0 70 82 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TDDNLRKAFASYGEITETKIITDHGTGRSQGFGFVTFAQDEDAKTTISKINnmNLNNKTIKVNETQEKSPR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000862504697 68 0.265 7.586E-08 104 184 414 1 83 85 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLQITNIARDLSEEDFTKLFEKFGPLKECKLIFDAVTGKSKGFGFVVISNEMNAVKAQKMLHGriVNGQKMKVKFCAPTPRKD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000941575781 68 0.284 7.586E-08 104 189 414 1 88 93 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIIVLNLPRDVTEDALTDLFAVHGKVVACDIVSDTATGESKGFGFVVMPKKREALVAIKRIHntKLGENRIRAKLADRPQNDSSTTEP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000266774487 68 0.250 7.586E-08 101 182 414 0 83 98 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSRRLIIGNLALDTDKSDLQKLFESLGRVSTIELVEDPRSGKQKGFAFVEFETRAEALKALGAapSTELNGRLITINSCAQQQE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719261_2281265 68 0.252 7.586E-08 110 182 414 0 78 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LDYRTTELDLREFFEQYGPIKEVFMPQHPEFGRSRGFCFITFEDAADAKQTIKEMDgkEYDGgygkRFLRVSTPEVRGQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719491_2951278 68 0.433 7.586E-08 105 157 414 0 52 104 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LGVFGLSLHTTERELESEFGKFGPLEKVIIVMDGKTGRSRGFGFINFESSEDA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_621657 68 0.318 7.586E-08 76 166 414 11 101 107 +----------------------------------------------------------------------------RPSEKKRKRKEAAAQAEVQKARQSKASQVIYVGHLPHGFYEKELQGFFSQFGTVSRVKVSRSKKSGASKHYAFVEFEHGGIADIAASAMHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719397_1601374 68 0.234 7.586E-08 131 241 414 1 106 107 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SVDIKRDKRTHNNLGYGFVQFATREQAVGAKTQLNgvEIGNRKIRIGWAQ---------KNTTLFIGDLDGSITTRQLRDIFAKYGDLVedETFVRAGSGRYGFVRYKHRSDAEK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719491_1769383 68 0.271 7.586E-08 104 204 414 0 102 107 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVKNLNKATSERELRELFGKHGSVVEVEIPQDKETGLGKGKAYVRMKTAEQADKCVRELNFTKpwGRALVVERRPGPGEADKELKSADVAAEKPPKSPTEE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5262245_51664187 68 0.265 7.586E-08 96 177 414 23 104 110 +------------------------------------------------------------------------------------------------PPQVVMETNLFVGNLPPDMTDADLRAVFGRFGTALRARVARDSRSGRRLGFGFVEMDgGAGEAARALDGT-AFHGHALTVREA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719456_112551 68 0.289 7.586E-08 101 182 414 35 117 120 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DEATVRVTNVSEDTTEDDLRALFdRKVGNVQRVYLARDKNSGRSKGFAFVAFYERSTAEKAVKLMNNFGFNHLILQVEMSRPS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719186_1001631 68 0.247 7.586E-08 123 230 414 0 108 120 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------EPPFTRIYVSNLHPSLGEQQIRELFEPFGEIIVINLQVDMVTRESQGFAFIKYVEHESAVRAIKEVNgkEILGLKIKMNKA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>D8M5R2 68 0.226 7.586E-08 100 193 414 98 191 259 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PNHCSLIVRGFRDVVDRSEIQNIFSKYGNVHDVHIPRDYYTHKQRGFAFIEFENREQAEDAISH---LDGRSVcgsTVSVSIAKNNRKTSAEMRRLY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719419_102726 68 0.296 7.586E-08 96 174 414 0 80 279 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IPQNHMTDGRLSNAPERQDKMNGKKDKASCRISVRPVTEILTKEDLWDHFEAFGEVTEVCISKPFCQVAFVQFSECKVAQSLLGKELLIKGVSVKIGEAAPRGRDYRGNMRGGGGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>5922|Ga0209166_10960451_1|-190|01 68 0.293 1.006E-07 121 193 414 0 72 76 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ELFLPFGVVIDAFVVIDKTSGKSKGFGFVEMENEESAQKAIQNLHNtsFSKRKLVVAIAKPK--GEKPITTSTIF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000135333617 68 0.270 1.006E-07 104 175 414 2 75 95 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VTEADLQKSFEECGKVTSIRLPTN-EDGTMKGFGFIEFASADAATKALEfNGQDYQGRALTISIAQEKPgfeggksprwsagASEKPPGCRSCFLGNLSWNVEEDNI--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719234_1340548 68 0.338 1.006E-07 113 182 414 3 73 119 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------DTDEFHLREYFESFGRIETVDIMEERSTGKKRGFCFVTFDDHDVVDKIVAQKyHTINTHSCEVRKALSKQE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_1045133 68 0.287 1.006E-07 168 262 414 1 100 124 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGCWLDIQPARPDSSASVPVSE-KLFIGGLPLDAEEDSIRKFYEQFGMVREVFLKRDlggiFRGFGFVTYMSIQEAQACLNspNSRWYHNTQVEVRPAYQK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719277_1981959 68 0.333 1.006E-07 104 188 414 2 87 125 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVGGLPKVPDETAIRLYFSRFGEIEEVKMMLN-GDGASRGFCFVIFKETASAQAVFDnyNDNIIDGKCVDCKHPDSGAGDKAKPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_ARC_108_MAG_00235_000000000215.20.1 68 0.298 1.006E-07 100 174 414 3 79 129 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348 349 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSVYIGNLPWEVRWQDLKDTFKQYGNIEFAEVATEggRPNGRSMGWGTVRFTNASSAIKAINDMHgrEMDGRTIECRYDQKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1S3NW19 68 0.290 1.006E-07 103 164 414 61 122 382 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNLYIRGLPPATTDHDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAVTAL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>T1INR9 68 0.301 1.006E-07 97 169 414 99 171 417 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+>ERR1719491_2669842|ERR599224_k119_554603|+|272|3.637e-72|1|306|623|306[306]:623[623]:318[318] 67 0.318 1.335E-07 104 169 414 20 84 106 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIFVGDLPLPFTNGELFNFFQQFGTVRKSKIVLDRE-GVSRGFGFVTFADPEVTQSLLNTRDNAWG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9297|Ga0210249_1006219_1|+1|11 67 0.205 1.335E-07 119 210 414 0 110 111 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+>A0A1E4TAF9_919776|ERR873969_k119_169946|-|660|5.769e-189|1|74599|76464|76464[76464]:74599[74599]:1866[1866] 67 0.282 1.335E-07 86 163 414 273 350 622 +--------------------------------------------------------------------------------------EPQEEETPRKKSNKQEAYSIFVRNIPYDADEESLKEHFEAFGPVKYALPVIDKDTGLSKGSAFVAFKKEDAYLDCLDN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A077RAD4 67 0.271 1.335E-07 101 190 414 306 396 800 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+------------------------------------------------------------------------------------------------KGGNDDEVRAFIGGLPKSATEQSVTAALSQFGPVARVQLKYDATTSEFKGFGFVNFGTKEALQAAVNGASVaVDGKRIDVKPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719187_1008092 67 0.243 1.770E-07 145 258 414 0 114 115 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFAFITFAAEEAvAAVAAAAPHTIAGKEVTAKKASGKQ--------GKVYVGKIPEEGPGEvEIREQLVQFGAIAQLERPvdrslgNKPKDFCFVTFEKESVAKKLLEAGtITVEGVEMMVKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719424_2292100 67 0.312 1.770E-07 110 188 414 0 79 118 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAQVTNNDSLQAYFEQFGQVVLADVRFDQGSGNSKGFGFITFGDPRSVQACLDhNEHVVDDRQVDVKPYASGGKGGAEQR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719219_54155 67 0.280 1.770E-07 104 160 414 62 118 123 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFVGGISQDLTSDDILDYFSKFGAIEECNLLRDRSNGRHRGFGFIFYIEEIHADLA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712212_14478 67 0.252 1.770E-07 104 182 414 17 99 127 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLIIRNLSFKCEEEHLRGYFGVYGKLIDVSVPTKKVNGKdvKKGYAFIQFADVGNAKTAVAEMNlkEIMGRQVVVDWAISKDE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719253_400896 67 0.250 1.770E-07 100 191 414 5 95 130 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PEPGQFFLAGFGKECSEDDLRAHFEAYGEVEKVSLVKDP-SGISKQFAFLTMADPARDSEILEAEHEMNGKKMDVKAYKDKKNRTENDGYSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711879_159194 67 0.312 1.770E-07 103 166 414 2 65 131 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNLYIEGLPTDWDENKVKELFEQFGEITESRVLINRKTNAKTGVGFIHFKSTEEAEKAIAGLNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_659946 67 0.227 1.770E-07 96 229 414 1 147 149 +------------------------------------------------------------------------------------------------RPGPPLATSVSIFGLSSGVTEKHISDYFGCYGQIEDIHLL--GGT-----FAAVRFSSVRSVSLVLndRARHVLCGKKVDVRPhriedieaheaAHQKchaGRDDSDHDPLKVFVGGLPKDCGQTEVEIYFEKYGEIEDIFMPegveGEIRGFA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719263_791640 67 0.293 1.770E-07 105 177 414 14 88 153 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGMLGRNINDRDLYNIFSCYGKITEIHLMRNHD-GYSKGCAFIKFATYESARAAIDDLHDFippwSTRAMVVKFANSKPSGPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1S3D5A9 67 0.285 1.770E-07 101 170 414 147 216 628 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DECTIYVEKLPPEAEHDYIESVFSKYGKVTYVSLPKFKSTGKLKGFAFVEFSTKEEAAKALEAYTEMGCR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>8941|scaffold1408511_1|-18|01 66 0.323 2.347E-07 118 180 414 0 64 65 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+>ERR1719446_348151 66 0.272 3.113E-07 100 185 414 176 263 265 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PKGANLAVFCIPNSYYDQQVLDLVNSYGNVIFCQVATHRDTGMSRGYAFVSYDTVESAEKAISELHNmsVEGRALRVELARSDKGEKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711957_54669 66 0.260 3.113E-07 105 175 414 95 167 285 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYIGHLPWGFDEKGVKKYFEQFGNITRIMLPRSSKSGRVKGYGFVEFDAMEIAEVAAKTMNnyILFDRMLICN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690242_840030 66 0.263 3.113E-07 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------EDRKLFVGMLGKTLEEQDVRKVFEAFGPIEECTILRTPE-GQSKGCAFVKLASHQEAKTAIEQLHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719414_2669176 66 0.241 4.127E-07 96 180 414 12 98 114 +------------------------------------------------------------------------------------------------RPDISDLITLKIDNVSHRTVVDDLDILFGKFGKIGDIHIPRDVRTGDNKGFAFVRFVHRRDAEDAMEDINGrkFDGRELRIQFAKNR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>4415|Ga0307471_109604987_1|-2|11 66 0.263 4.127E-07 117 190 414 0 75 114 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RELQVSWADTKSEADPAimEKVKTLYVKNLATEVTEDTLKENFEPFGELEKV---KKVKDFAFVTYADRAYALAAIEGMHGENrfGKDLDVTLARPQDNKERE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719259_148747 66 0.268 4.127E-07 101 180 414 4 85 131 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PKNTLFVGRLSLKTEESTLGDLFSRYGKIKKLKIVRDLVTGYSKRYAFIEFEDFVDAKKAFKDAHnrIVDESSIIVDWEHSR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_41_1057321.scaffolds.fasta_scaffold6883558_1 66 0.297 4.127E-07 117 188 414 0 73 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0 78 79 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGKKLFVEGFPDSDTDQQLYDLFAPFGQVVSARVVRGHR-GESLRFGFVEMASDEEAVRAQEALHrtLLEGHSLIVTFAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719213_63939 65 0.304 5.472E-07 113 179 414 1 69 99 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------NVDEYILYRIFSAFGDVKNVNIPRDVHNNTHRGFAFVEFFEEEDAAASIDNIHhaEIMGRVCRVNYAQP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719223_722777 65 0.268 5.472E-07 93 185 414 3 99 102 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PEMPEDEVRSYFGQFGKIAEMDLPfdkvkGQRRAFCFITYEDASGADQACANLkHKLPGkdKEVDVKKAIPKE------QQGGGRGGYGAGFGRGGFGGRGGTRGRGRGGYNQGGNSGWGNQGGYN------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719238_1895592 65 0.264 5.472E-07 89 156 414 87 153 156 +-----------------------------------------------------------------------------------------EAPAADGDEDDENKRTLFVRNLPFSVTDEQMQETFSPYGE-CQCRLIMDRERGTPKGIGFVEYATIAE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719339_533497 65 0.239 5.472E-07 78 165 414 69 164 209 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VAKDKDGQTSRGFGYITVPEGTDPDALLALPHFLGGVEVKVMM---TKESLAGADVKKIHLNNI-EHLSADDLRTTFVQFGTVWDVHTPKDPntgarKKFGFVTYGNDEA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712136_572891 63 0.620 2.240E-06 212 269 414 0 57 148 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QYGPVHDVYIPTPFRAFAFVTFEDPETAESLIGDDHVIKGVSVHISHPEPKRKRPDQQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0J7N8L3 63 0.246 2.240E-06 98 176 414 50 130 180 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+>KNS12Surf_metaT_2_FD_contig_51_3502481_length_477_multi_2_in_0_out_0_1 63 0.261 2.240E-06 103 166 414 208 272 301 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNLFVKQFPRSWTEEIFKKHFEPFGTITSTFLPPNKDiEGECRGFGFINFETNAMAVKALEEMNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719229_2087727 63 0.209 2.240E-06 96 206 414 173 300 301 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0.285 2.968E-06 101 175 414 4 79 84 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DKHKIIVVGLPASATSDDLIKLTKPFGNPLDANLAVDAE-GRPRGFAFVRFADDDAAKAAIEKLDktELGGRILHVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711933_280831 63 0.229 2.968E-06 97 170 414 18 91 98 +-------------------------------------------------------------------------------------------------REIDKDANIFVKNLHPDVTVKELESTMSQYGKIFTSKIAMNASTGQSRGYGYIQYESRLDAENCMKLAQNIDIR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719361_367328 63 0.230 2.968E-06 99 174 414 22 98 99 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+>9306|Ga0075372_10304818_1|+2|10 63 0.310 3.934E-06 109 166 414 1 58 73 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLPVWMTDEGLMQLFSPYGSIVSVKAIVDLGTRQCKGIGFVRLQTAEMAQNAIATMNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001419375881 63 0.280 3.934E-06 105 177 414 4 77 79 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVEGFPESYTDQQLYDFFAPFGPVVSARVVR-GCTGESLRFGFVEMASEEEAARAQQALYrtWLEGQSLIVTFS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4051794_5355443 63 0.294 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGYVEFANAADAAMALKTKKGaqIDGREINIDFSTPRPNDSNPrervnsraqtygdetsPESDTLFVGNLSFEVDENTIGEEFGKWGTVTHVRLPTDMYGF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4051812_9437952 63 0.225 3.934E-06 123 213 414 0 101 112 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FSEFGDIITVRIPVHSDTGRKKGMAFVQFSSPAEAEAALvKDKAEMMGRYLNVNLstsgsrpsssPRKQELSEKPAGCKTVFVGNLSKRQKQATLPVLFCSC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719396_201106 63 0.285 3.934E-06 104 173 414 18 83 115 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0.280 1.213E-05 104 190 414 217 303 401 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLYIGNLPLELDENDLKDVFQEFHP-TGSRIAKN-SNESSKGFGFVEFANSKDQQDALDALdqSEINGRVVSVKVSTSDRGRRNRRNRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_2721629 61 0.373 1.213E-05 100 166 414 16 80 662 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PRMSRLIVKNLPFSVTEAKLRNTFSSHGSVTDLQLKY--KNGKFRGFGFVGFLTEEEAKKAKEYLDG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>I0YK06 61 0.265 1.213E-05 101 177 414 0 77 876 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DDQITQFFSRYGPVKEFKMMYDENKQRPRGFGFITFDSEECANQVLQEHYiQFNGKQIEVKPQIHNLKQQMPYQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719265_2452142 61 0.271 1.607E-05 117 183 414 0 69 106 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EQLKEVFDAFGPTISVRVQFDPVTKVSRGFGFVSYKDHASAQKAVSELagsRVLGSRPLFVTYALRRDAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712025_1201611 61 0.306 1.607E-05 115 174 414 2 63 109 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234 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PEENQLFILGLPKNTTDLDLYRIFAPFGSIpaMGVKAKTNPD-GSCTGVGWVDFNEVTSAQAAIAALNGIslpDGTVLKVNQKRPKAGGEQPGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1U8PI51 58 0.252 8.678E-05 105 189 414 293 379 485 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYVKNLPKDVTQDQLKKLFEHHGKITKVVLPPAKPGQERNRIAFVHFAERTCAMKALndSEKYELDGQVVECSLAKPLTDQKTPGGS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001128781537 58 0.452 1.149E-04 108 149 414 1 42 50 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+>SwirhirootsSR2_FD_contig_51_1513660_length_586_multi_1_in_0_out_0_1 57 0.274 1.522E-04 105 166 414 13 73 174 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYIKNFPKRWGNAELEKLCSPFGEIASCCVQMESED-RSKGFGYVDFKEHADAKKCVEALHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719193_3078091 57 0.294 1.522E-04 109 174 414 0 67 221 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HISNAEPKHGNRQAMDRAGRFG----------NGFGAQGFGSARGGLGSNTNSSMTNFGSFSLNPAMMAAAQAALQSSWGMMGMLASQQGATTAAASTTAS----TTRDQTYGSNSTSY-SSPSSASLGWAAGTNSASSSGFSSGFGTSMESKSSGWG- +>ERR1719188_1244077 46 0.256 3.886E-01 96 168 414 273 349 352 +------------------------------------------------------------------------------------------------KRKRDPQSSLYLGNLgnePKDVTEPALREVLDPleLENVTEIHVGADQE-GNCRGFAFISFADENSTTTALSKLQYMD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1J7H3R3 46 0.163 3.886E-01 101 161 414 367 427 780 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453 +---------------------------------------------------------------PTGPTGASTNSSNCNNDTSSHGGSNNSGRSTPSNASDNSPGKLFVGGLSWQTTQEKLRDYFSQFGTVTDVLVMKDPVTQRSRGFGFITFSSPDSVERVLAVPsHSLDGKKIDPKHATPK-SKSKANKTKKIFVGGVSQETSADEVKAYFNQFGKVEEAVMlmdqqTKRHRGFGFVTFEQEEAVDRVCEiHFHTIKNKKVECKKAQPKEAVQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>Q6FJT3 175 0.269 8.770E-43 101 333 414 127 354 513 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ENCKMFIGGLNWETTEDGLREYFSKYGNVVELKIMKDPNTGRSRGFGFLSFDAPSSVDEVVKTQHILDGKVIDPKRAIPREEQD---KTGKIFVGGLGTDVRPKEFEEYFSQWGTIIDAQLmldkdTGRSRGFGFVTYDSPDAAEKVCeSRYREFKGKQIEIKRAEPRHQQKQagQQAVSPPVAGM---------GMNPMSNPMANPMAGMYQNPMMGGFNPM-FNPQAMQDYYQKMQEYY-------------------------------------------------------------------------------- +>W1NYF9 175 0.298 8.770E-43 100 264 414 2 172 527 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+---------------------------------------------------------------------------------------PAAAPTENPNGSTGDEVKLYVGNLDYATDEGRLREEFSQFGTVTEVFLPTERGTSRPRGFGFVTLSTRDAAEKAISKMDqaQLDGRTIRVNESRPKGERRGGMGPGgagsfnaagkeevKLYVGNLSFDTPEQEIRSMFEEFGTVSDCFMPtdrdtGKVRGFCFVTMPAADaEVACAKVNGRELDGRALRVNEAQPR-----GGDRGGRGGGYGGGYGGGGGYGGGGGYGGGGGYGGGDGYGGGGGYGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>B9GNL8 162 0.280 3.793E-38 101 273 414 3 184 306 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DEAKLFVGGISRETSEETLRNYFSKYGVVSHSLTAKDKITKFPRGFGFVVFSDPSSAARALQDNHVILGRTVTsngLGMNSDNSTSAKNNRTKKIFVGGLASSLTEEQFKNYFEQFGRTVDVVVmqdslTNRPRGFGFVTFDSEESVDKVLLiGSHELNGKRVEVKKAVPKDRINGHIVRSG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719154_377482 162 0.311 3.793E-38 104 337 414 12 257 325 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262 414 424 603 1023 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PGKMFVGGLSPETNRDRLKGYFSRFGEVVDCVVMTDATTGRTRGFGFVTFRDGRCCAKVLrERPHIIDGREVDPKMAVPREQMEQHSRSssapaaprgrsaRKVFVGGLPSNATDEALIGFFSNFGEIEEAVVihdkqTRLPRGFGFVTFVSEQVAEHVVsLHYHDLLGKMVEVKRAEPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_4_1057263.scaffolds.fasta_scaffold286794_3 161 0.335 5.141E-38 104 266 414 19 184 189 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGSLSWDTSAEDLKEYFNKFLPVTDATIVKDQATGKSRGFGFVTFESEEGISGVLsDHEHSLGGRTIYPRKANRR----GPEPIKKVFVGGLDPAVSEDEIRAYFGKFGGVENVELPfdkatQKRRGFVFVTFDSEDAADVACkDQKHHIEGKTVDVKKAVPKEQQQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+>KBSMisStandDraft_5_1062788.scaffolds.fasta_scaffold10117283_1 156 0.271 1.969E-36 87 268 414 9 225 315 +---------------------------------------------------------------------------------------SSEAPAPKPVPSNIDQGKIFVGGLSWQTTEESLRWHFEQYGPVVSVEVMRDRVTGDPRGFAFVVFRDGGTVDLVMaEAKHEINHKIVDVKRAQARGVAPPSIHEkrgesqganaeqqsqrtenkptpeqlhNKVFVGGIPPSVDRDELKNIFEQFGPVVDAIVmidqaTNRSRCFGFVTFENgcNGAAASIDAQPLNIQGRHVEVKLATPKAEQRRQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719309_514146 156 0.235 1.969E-36 98 265 414 69 246 322 +--------------------------------------------------------------------------------------------------ESKSMRKLFVGGLNYNTTEDEMRSHFERYGDLVDCVVMKFNDTGRSRGFGFITYETAAQVDECQANrPHVIGGKTLETKRATPRSDAGKPeaqASVKKIFIGGVSDEMDDSDIQDHFENYGKVTNVeqlrwNDTGKKRGFGFVEFDDYDVVDKiVLITRHVVKSRSLEVKKALSKTEM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719376_207595 156 0.274 1.969E-36 91 316 414 65 283 325 +-------------------------------------------------------------------------------------------SGAAVAPGRDDDRKLFVGGLSWDTTEKELREYFTKYGPIESINVKTDPTTGRSRGFAFLVFNSADTIDKIIaETEHNINGKKVDPKKAKAR--------HGKIFVGGLKPELSDEEIKSFFSNYGSIVEIQMPfdkmkNQRKGFCFITFEQESVVADLLKTPkINIGAHQVDLKKATPKPDMMM------MRGGMMGGRGMRGRGGPRGRGRGYGNGGYGGGYGYGGGYGQYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001421459831 156 0.236 1.969E-36 99 326 414 5 279 351 +---------------------------------------------------------------------------------------------------ESNGRKIFIGGTAYMTSEQHLREYFETFGEVEEVVIPCDRYTGRPRGFGFVTFKDAEVTEKVLDNsiQHKIRDKVVEVKRAVPRGSAQHPsfrrknnyhlqrspmrvggmgvrtndgktnindylNNTNKIFVGGLHTSVIGDEFQSHFEKFGKVADAVImydraTGRSRGFGFVTFEEEDGMKAAIdHRPHVLRGKQVEVKMAEPRGKSMGNNKKGGRGGFRRGNGGVRGGAFPSSGVPMIPPASMNGSTNGFPpqfaPIPPYGVQGGMYGGYP--------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0K9RD10 156 0.239 1.969E-36 100 263 414 3 215 380 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PDVGKLFVGGIPRETTDVILRDHFSKYGDVSSSVVAKDRLTGDPRGFGFVTFADPSLVVETLRDQHFISGRAVEVKKARPRFEHQSNTQPqllpqrqqhqqpnhgyshsskgsvrnyingsygannsddslkaKKIFVGGLSADLTEEEFKKYFEKFGKITDVVVMydntnNRPRGFGFITFESEEVVEKLMQQsHHEVGGKRVEVKRAVPRE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1J6KB42 156 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+>UniRef100_A0A2I0VSI8 154 0.257 1.644E-35 88 263 414 1 206 374 +----------------------------------------------------------------------------------------DPSPSSSSRSSMAVPAKIFVGGITKGLEDDALKEYFERYGDVKEVVVVKERATGNVKGYGFVEFVDAEAAERAIneEGQHLIRDKLLEVKRARSRSEERRHYQyachqssvqstnktsndhhnitSKKIFVGGLPSNVTEDEFRNYFEKFGSVNDVVImndseTHRPRGFGFITFDSEEAVQKTMQKrFHELNKKVVEVKIAVPKD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719433_893196|ERR1726785_k119_1233078|-|681|2.751e-195|7|2828|5011|5011[5011]:4859[4859]:153[153]|4514[4514]:4359[4359]:156[156]|4305[4314]:4195[4195]:111[102]|4134[4137]:4033[4033]:102[99]|3966[3966]:3712[3712]:255[255]|3608[3608]:3087[3087]:522[522]|3025[3025]:2828[2828]:198[198] 154 0.300 1.644E-35 96 273 414 36 245 495 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+>ERR1719162_144970 153 0.256 4.081E-35 97 281 414 214 407 417 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DAATEGTRVYVGNLPFDCTQEELMSMFSEYGKVLQCFQPADRETGRPRGFAFIQMVD-EEANAAIEGLNgsMFGGRQLTVNVSLPKGQSANRPKNTKMYVGNLSFNMEEEDVISVFSEYGVVQDCYLPreretGRVRGFAFVTMEAEDALKAeAACDGLEMDGRVLRVNQAQakPKPQRYNDDYSGGGGGGGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UPI00020F3653 153 0.274 4.081E-35 102 272 414 72 244 423 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PRKIFIGGLAHKTTTQFLRDYFSKYGAIVDAVVLRWPD-GRSRGFGYVTFADAQGAWSALQEPHEVGGRPVDVKRAVP--------GTNKLFVGGLPQNTTAAELREHFEAFGIVSDAVVmidpsTNRSRGFGFVCFlpgqEGAASAQFALEQYqnHRIRGKWIEVKSAAPPHKLAKDGSNS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>V9DIT5 153 0.258 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288 +-------------------------------------------------------------------------------------EAPGEDSGPVVPGVSEDDRKLFVGGLPQEAKDLDIKEYFGQYGDIDNINLKTDPHTGRSRGFAFIVFKDTVGLNAAsIQEAHVIKGKKVTCKKAEAKQ--------GKIYVGKLPEEgVTAEDVQAHFAQFGPVAEVVRPidksknDEPKNFCFVTFERE--AKAMVKEGTaTINGHQIDIKKVTPKDNSRGGFGGRGGRGGYGGGYGGYGGGYGDPYGGYGYGAGYGAPQGGYGGAPP--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719481_1927680 145 0.296 9.418E-33 100 315 414 59 275 291 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EDDRKLFVGALPQEAKDTDIKEYFSTFGEIENINLKMDPMTGRSRGFAFILFKEMAGIEAALAESaHVVSGKKVTCKKAEARQ--------GKIFVGKLPPGdaLSKEDIQTHFEQFGSVVEVIRPvdkmknNEPKNFAFITFGSDAAAKQLVKQGeTTINGSTVQIKKVTPKEPMGGGGGWGGPGGFQQGG-GGWGYGDPYAGGYGGYGGYGDPYGGGYGGYGGF-------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_2509928 145 0.300 9.418E-33 100 316 414 23 233 292 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------EQERKLFVGGLNKaSTDEDMLKSYFESYGNIIDCTIMRDTD-RQSRGFGFILFEEAASVDKIMTAKKdgtefSVDEHHIEIKRALPKVPGGNAGTsrtgglNRKIFVGGLPSSITEDELRQHFDQYGRVNEIELLRDRetsrlRGFAFVTFDDEDSADKCIQrRSHEICKKICEVKRAQTRSNLGGREDGQGQQG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740124_843695 145 0.271 1.722E-32 99 275 414 9 202 387 +---------------------------------------------------------------------------------------------------EEQERKLFVGGLNKSrTDEEQLKNFFEQYGSFVDCTIMRDTE-RQSRGFGFVLFEDSTSVDKIINtrrdgTDFSIDDHNIEVKRALPKvpngsaSSSRTSGLSRKVFVGGLPSSVVEDDLRSHFEVFGRVNEIELlrdreTNRLRGFAFITFDDEDCADKVVQrRSHEICKKICEVKRAQTRSNVGRDGESGGGF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719266_422656 145 0.300 1.722E-32 81 316 414 2 239 413 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+>HubBroStandDraft_1064217.scaffolds.fasta_scaffold3483689_1 144 0.271 3.147E-32 98 262 414 14 189 191 +--------------------------------------------------------------------------------------------------ETDKGKKLFVAGVSWNTTDDGFLNFFARFGDIHEALVMREKN-GRSRGFGFVTYKDLSIAEKvkaaAQSHQLTLDGQKLDIMEAIPKEEmlSSSKPLPKKIYVAGVAWNTTDDQLAEFFSRYGAVTTAqiqrdRVSGRSRGFGFVTFEDASSAEKVLAEPsVTFDGRRLEIKAAVPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712071_276246 144 0.267 3.147E-32 117 280 414 1 174 193 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+--------------------------LLTTVQAQFPGALGLRYRGPSGKAWRGIKLLDEMLHPPEDGWSDRTYIVTLPKSATNDSGPKEVASSKPVFVGSSEPKDLIVLGLSFAATGDEVRTYFEQYGELELCEVKKDKNTGRSKGFGFIKYK--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1700735_3150149 133 0.646 1.050E-28 128 257 414 0 132 134 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EILMAQVKKDPKSGLSKGFGFIRFGDYETQMKVIAKRHCIDGRWCDVRIPLSKEGGfdyQKSEFNRKIFVGRLTDDMSTDDLREYFSKYGEVSDVFIPKPFRAFAFVTFYDSDIAQGLCGEDHILKGISVHVS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>LakMenE18May11ns_1017448.scaffolds.fasta_scaffold5757545_1 133 0.328 1.050E-28 131 265 414 1 140 167 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TDCVLMRDRNTNRSRGFGFVTYASEADTKAVLSSVLELSGRKLDAKEAVPRgrdasaggpANEDAPENSKKIFVGAIAQGTSEEEFTQYFQKYGEITDSVImidkhTGRSRGFGFVTFAEASSVSSVLeHNEHELNGKRLDCKKATPREATRAPQ-RGGGYDGYGGGYNAYGGGGGYRNGGGGWGGGGYSGGGYSGG------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719160_1959430 133 0.235 1.050E-28 91 258 414 63 249 270 +-------------------------------------------------------------------------------------------PAGAPVQAGAEDPKVFVGAIPRNVTSKMLNDYFKEFGQIIKAEVSVDKDTGASKGFGFVHFATIEGMKKCLdKEEHVLEGKKFEVRQFGDRTRAAAGNKPDKqttdkdrkrrtIFVGGLPRSCDGDRLFSHFSRFGTVVKTDVlmdqtTGISRGFGFVEFAEESGVDAALkqSNSHQIEGKYFDVKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719161_270290 133 0.322 1.050E-28 102 254 414 18 171 297 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+>SaaInl3SG_22_DNA_1037383.scaffolds.fasta_scaffold254520_1 133 0.255 1.050E-28 94 268 414 184 370 388 +----------------------------------------------------------------------------------------------KKQSQRDDKNKLFVGNVPFKATAEELKDVFSQFGQILDVFIPRDSI-GEPRGFAFVTCAEADvDAVRIGANGLEFMGRSLSVNIPlapgekSEKKTKTEKPRRRKLYVGNLAFFTNEETLTEVFEEFGQVYDCYIPqdperGGSRGFGFITMEDAAAIEAIdALDGCELEGRIIAVNEAQIRRKNSKE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711988_1135292 133 0.294 1.050E-28 98 243 414 124 279 466 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1.417E-28 104 249 414 17 179 181 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGGVSPSTTNDSLRDHFSRFGPIDDAVVMRD------RGFGFVTFSNQAAADAALADPkQYVDGSNVDVKPATGKgrdgggggggggkggGKGGPGGPTDKVFVGGLPQDCADDKVRDYFGVYGNIVDAVVmkdreTGRSRGFGFVQFDNNNSVDKVMAeyNNHKI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1739848_189371 133 0.288 1.417E-28 94 246 414 33 195 201 +----------------------------------------------------------------------------------------------KENSEPEQKRKLFIGGLSYLTDDKMLFDHFSKYGELTDCVVMKDPRTKRSRGFGFVCFEKAEMLERCMAdRPHSLNGRPVEPKRAVSRLESAKPGANRSVtklhCAWNPPDELKAKDFREYFSKYGNIKEVEIPknkdtGEAKHFAFITFDDYDIVDKIIACG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001453536433 133 0.241 1.417E-28 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+>ERR1740124_341203 133 0.193 1.417E-28 100 262 414 48 238 245 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EEGRKVFIGNLPVSVTEADLKQVFDRYGTMTACYIPMNRLSGESRDFGFVVYQHAQSARDAIDAMQGysLNGQELHVTAAHPRRERRRsrsvwssprsskssdygefDLKGRKLFIGNISEKTTEADLEEAFGEFGEIEKCYIPSDWQGkykknFAFLIFEQRKAARRAvrLRNGVEFQGKVISVTFAKAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719204_190120 133 0.264 1.417E-28 92 316 414 15 231 263 +--------------------------------------------------------------------------------------------AAEVNPIPEDARKLFVGGLAQEARETEIKEYFSTFGEIDMITLKTDPHTNRSRGFAFLVFKDPSSLSAITEsDDHVVMGKKVSCKKAETKQ--------GKIYIGKLPAEgLSNEDIQAHFNNYGSVAEVVRPVDktnndtPKNFAFVTFEKEEVARQMVKEGTTnINGNEIEIRRVTQRD---------GGRGGMRGGYGGGYGGYGGGYGGDPYAMYGGYGYGDPYGYGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719282_269622 133 0.236 1.417E-28 96 268 414 61 262 306 +------------------------------------------------------------------------------------------------KEDSTHHHNIFVGDLSSDVTNDLLKKAFDPFGTVTDARVMWDHSTGRSRGYGFVAFLEKAEADRAIAEMDgkWLGSRTIRCNWANQKASSRSPAPshstsqttaprrstnfeeiamqspasNSTIYVGNLPANTPESAVRTSFQNYGTIQEVRI-QPGRCFGFVKFQNHDQATNAIigSYDMTLGGQPIRCSWGKQKTSQEHQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A1W0X9W2 133 0.331 1.417E-28 98 261 414 16 184 361 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EEHDKRDAFVGGLSPDTTEADLNAYFSQFGPVLHSVVKRDLTTGLSRGFGFVTFADAIGLNKISSvAIHTLKGKKIDAKAAVRK---HGKDVVMKIFVGGVDTAMNEDDIKAYFSRFGKVTAIQWPkdrlrdGAKKNFVFVEFDDANVVETLVKTPkHTIGSRLCDVRKAVP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712150_35578 133 0.238 1.417E-28 104 262 414 152 322 377 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KMYIRGLPWRATEDEVREYFSTCGEIISIEMPI-MDDGRSSGTAIINFKTKQACEICLElNGSDFNGRWLNIKYStpkpiwSPRQPSQKADGCTTVFVGNLSFQIDEDTLREAFGECGEITQVRFaedreTGQFKGFGHIEFANTESTDLAVkMTGTDIMGRPVRVDFANPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>G3WD81 133 0.227 1.417E-28 103 265 414 62 245 482 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNIYVKNFEEDVDDQCLEELFSEFGKTLSVKVMVD-ENGHSRGFGFVNFEKHEEAQKAVNSMNGkaLGGRVLYVGRAQKRTERQGELKRRfeqmkqervnryqgvNLYVKNLDDVIDDEKLRKEFSPYGVITSAKVMtegGHSKGFGFVCFSSPEEATKAVteMNGRIVSTKPLYVALAQRKEER---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------DDTNLYVGNLPTSVTSHKLIELFLPFGRIVRSKVADDRFTGLSQGYGFVKYAEPRSATAAIERMNGrlVDGKTLEVRVAGPPTSvfypsmqavseacslPSKEVDPCRLYVCNLPLSMDTLKLLEHFLPFGKVTDIKVPRDqatglSKGYGFVKYSDSHHAAQAItnLNGFLVEGKKIDVRVAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A087SN82 131 0.315 6.323E-28 111 255 414 682 826 1603 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------SRRCRNEKLRYYFENFGVVQEAFVSYDRHTGRPRGFGFVVFADPAVADRVVSQTHTIDRREVEAKKALPKEDSP-------VFVGGLAASVDEAAFRAFFSTYGAVEDAVVMydhenRRPRGFGFVTYADEASVDRLLADGplHAVQGKPVE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719186_1889571 130 0.295 8.526E-28 102 234 414 10 158 161 +------------------------------------------------------------------------------------------------------GFKLFCGGLDRQTDDTDLKKYFKKYGVLTDYVVMKYPNspTRQSRGFGFVTFEKEEDMEKALEEiPHTILGKEIDVKRATPKEEGKDEGACgdpeakvmRKLFIGGLDQSTSDDSIKSYFEQYGDLEDFVVMkfpdsGKSRGFGFVVFE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_988541 130 0.291 8.526E-28 120 296 414 2 185 192 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KEYFGSFGKLVDCILMRD-ADGVCRGFGFVTYQDQSAYDAVFQAELQLRGSKLDARKAVPMNEVRESKSGVKVFVGGLVPDVDKQKLEEFFSQYGAIDDAIVmmdsaTGKSRGFGFVTFAEPSSVDELLLTPkFEFYGKQIECKRAQPSATLNrlRRSRGGARGGRGRGGYGGQFGGGGAFGQPP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0T6BBU3 130 0.262 8.526E-28 101 255 414 42 197 250 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92 273 414 35 265 342 +--------------------------------------------------------------------------------------------ATDLEDMAHEAGKLFLGGLPQTISTPVIEEYFSQFGTIIDAVVM------AGRGFGFVTFDTYETAKDALQYQHVLEGRTIDVKLAVPDHNKGGGKGGGfqqmmrpephvvaggsfvpfhaptkgppcggkgsgggkggplgrgttdKIFIGGLPLDVTDDTIIEYFEAYGTLIDAVVmkdkaTQKPRGFGFVQFDNTDSADRVMDdfSTHQIGGKWVECKRAMPQDKSSGFPKGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000205091045 130 0.261 8.526E-28 100 258 414 28 195 360 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PEYYRIFVGGLSYEVDNNKLKDTFTSFGNLKKALVIRDQRTGQSKGYGFVAFSDLASFQSAMDTDIFINGRRADCHQVLTKgalKELEQRDFSNKIFVGGISQSTQNSDLQKYFSKFGAIKESRIlydgkSGKSRGFAFVLFQNTGALNKVLEiNEHKLKGKVIEVKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712137_175394 130 0.223 8.526E-28 103 262 414 21 217 387 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKVFIGGLPQTVDTQKLYSYFSQFGPILSAEVAMDKVTGNSKGYGFILFQTTDAITKVLAhyNDHTFDGKWVEVrqfgDKALDRKGGKGPGDCavmtaaalaalgcgipgglssgkeKTLFIGGLPRSVGDKRLKTHFEQFGNVLRADVkvdkeTGQSRGFGFVGFQNDADVDSVLQKReaSRIDGKWIDVKRFGDK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550534_1529397 130 0.240 8.526E-28 105 260 414 19 209 457 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344 494 +---------------------------------------------------------------------------------KRKLDESEV---DIIEGEHIELRRLYIGSLTQTTTEEDVEEYFKQYGKIIDCKLQKFKDTGKSKGMAFITFSEAKTVDAIQANrPHKLNDKKIDSRRPAPpgidPRDPEASAETCKLWVGGCDESISDEHLKEHFEKYGNVVEVEQMldssGKKRGFAFVEYDNSDCVDKiVLMSKQIVNGRSLLIKKGLNKEE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_221076 130 0.265 8.526E-28 104 260 414 10 175 506 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGGLTIETTETEILNHFSKFGFVFDILIIRNRETSISKGYGFISCNNVNTYQRILSTEHVIDGRVIDCHDSFKKNEEPEKFKdnaNKKIFVGGLSLETTDQDLTDYFSQFGSIRQAYvikdpVSRRSKKFGFAIMKTQESVDQVLDTTvHVIRGIPVSCKLFV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5436190_9622914 130 0.293 1.150E-27 114 240 414 0 127 128 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0.263 1.150E-27 102 259 414 14 178 213 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PAKLYVYNLSWETDGPALRKLFEQFGPVTDARIVKNRYTGRSKGFGFVDFES-DDIESCV-GEHQLDSRTIVARISDESLRSSAPSASlTECYIDRLQSETTQEDVREYFSQYGEILFVRLHNRPvesgeslHKYGFVEFTEASAAAQVCTEGnHEVSGNQVTVQPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719189_2506050 130 0.282 1.150E-27 104 233 414 96 233 234 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFIGGLSQQTNNDILRNYFTKIGPVKEGFVKLDPITQRSRGFGFVTFHDPNDAQKAIDNgPHELDGKYLDVKQALPHNLTQDPsytAATKKVYVGGLPQSVDTAALGQYFAQHGPLEHAMVMhdqsGVSRGFGYVTF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>T1GPS9 130 0.601 1.150E-27 132 264 414 1 132 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+>ERR1719473_850883 129 0.295 2.089E-27 105 243 414 22 170 173 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVGKLPPSASETDLKNYFSNFGTVNKAAIKRDTWTNESRGFGFVEFSCAAEAEAALSiTEHKLNGSAIGLRRAedrrvTPGTTAPAIVDKKRLWVGALPDEASENDIQEYFSQFGTVERCelktDVDGKSKGFAFISFADEQEAKAAL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719450_652639 129 0.372 2.089E-27 134 270 414 2 133 214 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VKYDPSTKKSKGFGFIRFEDADAALHVVKSDHFIMGRRCEVRLPKRK-----DDTPMKLFVGRLPERTQQEDLQKYFSEFGGLVDVYVPAPFRGFGFVTFASTGVARHVLNQSHMIQGSHINVTYAEPKKQNGEQAQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712147_37937 129 0.203 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+MADYIMVCGEEFGDCAEIAVESNGTVHLPNISALFPGTTGLKYRNPSNQAWRLVKVMNNSLQRPQEGWLHIPYQCIRPEDNMQGPEKRKAQWEGQGAGEPWPKRNfnrgwegagnrnngpgphghgphgpgpmgsgrcdacgsmlpdmangtgpgsgtwcIFVYNLEPEAEDTMLWKMFGPFGAVQNVKVFIDKESQKCKGFGFVNMTHYQEAVTAIENLNGM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1U7Y9S7 129 0.269 2.089E-27 103 262 414 101 271 401 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKIFIYGLARETTRQTLISVFEQFGEVEECNVVMDHNTGKAKGYAFVVFKSRKSADKALKKPQMtINGRVATCKLAAVKDtavNGTMEFGNRKIYVSNVPRDVAPEKLRLFFENFGEIEAGPMgfdptTGKSKGYALFLYKTVEEAKRCLEEPcKVFDGRKLYCKKaAEPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719223_167917 129 0.241 2.089E-27 101 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198 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QQLREHFARYGPIVDAVVLR-WSDGRSRGFGYITFADASAASAVLLEEHNIAGRMVEVKQAVP--------GTNKLFVGGLPQNTTATDLREYFEAFGAVSAAIVlkdpaTGRSRGFGFVCFMPGQSGIAAVQaslhqyQNHRIRGKWIEIKRAVSPD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712168_150350 129 0.267 2.816E-27 102 273 414 2 184 246 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SCKIIIRNLSYDTAEEDVKTYYEKWGTVEDIKLMKNKGTGKSKGWAILRYVKASEVDACMsARPHEIDGRTLEPHRASPREYSQKvecHHTCNEIFVGKWVPEITEEDLREYFGQYGNIEEVTFPKdkkdetKFRNFAVIKFDDYDPVDVCCyKKMHRIKDKPLIITKWIDRKTMNELQRKFG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719273_1561459 129 0.230 2.816E-27 98 271 414 54 247 253 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+>ERR1719433_2024449 126 0.269 1.686E-26 101 262 414 108 289 526 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EERKLFLGGLAPETVEKDLRKHFIQFGQIVDVQVMRDREAGVSRGFAFVTFACSFMAEAAMEhKEHLISNRLITPQFATQDVPRykktkveldatldKECENKRSIFVGALKETISEDDLVRYFSGFGRVVRAckctdPETGELRRFGFVDFADYGVVRKVMNiTKHYIKGKRIKVDLSRPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0E9NPU7 126 0.211 1.686E-26 92 269 414 22 238 700 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414 0 127 129 +----------------------------------FPGALGLKYRSPSGNAWRGVRLAEGILHPPTGGWASTTYIITMPKtdsSVKRKMEDGSSREPeaklvKTINSEYANRQDMIVLGLSFHATEEDMKNYFEQFGEVSLAEVKKDMTTGKSRGFGFVRFAD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MedtruStandDraft_1076414.scaffolds.fasta_scaffold355795_1 126 0.401 2.271E-26 102 218 414 6 127 156 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SRKIFVGGLSWDTTHDSLLKYFSRYGEVIDCVVMKNQATGKSRGFGFIKYRDANHVNKVMAsGPHILDGREVDPKVCNPrhlnKGSKSNENRHRKVFVGGLPTDCNEDQLKEVFGEYGKVSS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ADurb_Val_03_Slu_FD_contig_121_45458_length_236_multi_1_in_0_out_0_2 126 0.246 2.271E-26 104 228 414 29 158 162 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLSWETPQEEIKQHFAAWGNVMDVMVPKDRETGRSRGFCFVTFDSVQAADQSLGAEHELGGRRLNVNPAVAEAVAVDSAPTKRLYIGDLLTSTTDEELKAAFAAFGALEDAVIMRhpdsnESRGY----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719171_272386 126 0.257 2.271E-26 107 245 414 0 158 164 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2 173 205 +-------------------------------------------------------------------------------------------------PQDTSMTNLIINYLPQSMTDKKLHQMFTQIGQIEACRVMKDVKTGYSFGFGFVNFVRPEDASKAIEVMNGLqvENKRLKVSYARP---AGEDIKDTNLYVQNLPRSITERELEDLFAPYGQIVQKNILKDkysglPRGVAFVRYNKKEDAQKAIiqLNGVLLEGCTehLSVKIAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719330_501004 126 0.272 2.271E-26 101 260 414 7 181 213 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PPEKLFIARLPRAATEATVKAHFEQFGPVLKVELKM-GDDGLSKGFGFVTFQSASSAAKVVENysDNRFEGRWIACEQCVPQDGSTGGPPrsdpltaPERIFLGNLPRDVTEEGIRGVLEEYGKVADVDLKydpddGAFRGFGFVTFESKEVAELVLehHNRFVLGGRTIHCRRSQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000010478616 126 0.284 2.271E-26 105 263 414 0 168 263 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414 0 145 146 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FIGGISPSTTSEAIRTHFGKYGPISDAVVMRD------RGFGFVTFETQAGADAAIAQPqQTVDGQSVDVKMAVGKGSGRGGGGsdtgsggsgsaPHKVFVGGLPQDCGDDKIRSYFESYGKIVDAVAMkdrenGRSRGFGFVQFDNQSSVD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719373_458131 126 0.246 3.060E-26 105 243 414 8 149 159 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYVGNLSYDVTQENLSEIFSEYGFVKRVYLPTDRDTGRIRGFAFVEMQNNADETQAIEALNgaEYMGKTLKVNKAKPNSE----MATGSIYVGNLSYDVTQENLSEIFSEYGSVKRVYLPtdrdtGRIRGFAFVEMQNNADETQAI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719427_143101 126 0.281 3.060E-26 104 235 414 19 178 180 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGGLNYSSQDSDLQKYFSKFGPLTDYVVIKTPNEGRSRGFGFVCFENESDLEEVMrTKNHTIDDRNVDIKRATPREETDRSDRFggggkrkydggnaggnmddklmRKLFVGGLSYNTSQEGMADYFKQFGDLDDCVIMkfpdsGRSKGFGFIVFAS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712126_421017 126 0.301 3.060E-26 123 281 414 0 155 185 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGKYGEVENVNLKKDPYTQKSRGFAFVLFKGSEALDKVLDGSaHAIKGKKIDTKKAKVR--------SGKIFVGGLSSEMSDDDIKNHFAQHGKITEVEMPfdktkNQRKGFCFITFEHEDMMKEVLKEPkQTICGKQVDVKKATPRPE--GGAGGFGMMGGMRGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712168_1165441 126 0.303 3.060E-26 139 282 414 3 157 194 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NTKKSRGFGFITYSEPEMVDDAQnARPHVINGREVEPKRAVPREESGKPeahVTSKKIFVGGIKDGLEEEDVRDYFSQYGNVESVEImvekdnPSKKRGFAFVTFDDYDPADKcVLLKHHHIKEFRCDVKKAISKKEMENLPQKGDRMGGRGGDR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000962780024 126 0.300 3.060E-26 102 273 414 17 195 196 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PSQIFVGGLPEKTTEEVLHKYFSTFGHLTECRIVINHETQQSKGFAFVSYFDPKVAEKVLSQkTHKLLKKSITLKAAQSKEDAQASLQeesSRRMFVGNIPFQAKESEVRKLFSKYGEVEKVDLKPQS-GHGIVTFKDRMSVIKLLQPEVPIEivysGNTLECRLYTLQPKTRSNMSQKG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_30_1057271.scaffolds.fasta_scaffold87888_2 126 0.254 3.060E-26 101 273 414 1 181 215 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PATKYFLGNLPDDVSEDELKQYFASFGVVEQVDIVRDKMTGNSRNFGFLHMADDSAGDRLIGEEHSVKGHGVRVRPYNkpPTSGSSEDADPKKIHVGNMDHSISIEECKEVFAQFGSVMDVYMPKGPEGnrmsYAFVLFDNEVARDKAINAGsVTIRGFNLPLKPAAPqKKGMAKGAGKGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000228692854 126 0.308 3.060E-26 100 264 414 1 175 229 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EESITLFVGGLSQAITEDDLQEYFILYSTVLSATLVKDPRSGESKGFGFVTISSASAAYALVKMKNFICGRRVECQLASSRGEKkqcKEHMKRRKLFISNIPVGATNDELDELFSQFGLTHNSYIIQQvgsliNQPYGFVEYEDPEDAQKLLIQnpLLSLRGSTLRISGYLDKDQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719456_534865 126 0.254 3.060E-26 105 258 414 46 214 259 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFAGGLPTDLAQEDITKYFEQFGALEAVDRKINLATGESKGFAFVKYKEEAGLEACLAhESHYINEKWIDVKRyeknvagAVAAKGGKGHVGAPKLFVGGLANTVGDADLNGYFSQYGTVVEAevrmdHVTGNSKGFGFVVFDSVDTAQKvyAMYDQHSIHEKWVEVKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719412_1831008 126 0.256 3.060E-26 116 339 414 2 231 285 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EGKIREHFGQFGEIETVTLKTDMATGRSRGFCFVVYKSTESLNKAVSTEHNISGKKVAVKKAQAKQ--------GKVYIGKLPADVSDDEIKNHMATFGTIANIEQPfdkmkSERKNFCFITYEREDVAKKLLKEGtVYINGHEMEVKKVTPKPQFPGGMDPSQMYmmgGGGRGGYGggpgqWGGPGGQWGGGYGGYDGGYGGGDGGYGAWGGYGGGYGGYGGGYPAGPGGKTPRGMP-------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711937_710351 126 0.287 3.060E-26 104 283 414 78 254 293 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KMFVGGLAQDTNTASLWAYFETFGKLQDVDIKTDPYTGASRGFGFILFEEASSVEKvVVGGPHNLDGKRIDPKNA---------SKNSKIFVGGLKNETTDEDVRKYFEdNFGAIETFergldRNTQMGKPFAFITMKDENIATAICkSKWHTIDNKQVECKTAV--DNYQYKSQQAMHYGGGYGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719491_2336105 126 0.262 3.060E-26 89 280 414 80 268 429 +-----------------------------------------------------------------------------------------EDPDAGITRDRKGGFKYFVPGLPDGVVDEDLREHFSKYGAVIDAAVVTEKGTNASRGFGYVTMRDAESRDDLLNDKHVLGGKEINVLLTKDSLSG----SVKKVHLGNLREDISAEAIREVFSRFGQILDVHTPksqrdGKRQNFGFVTFGNDEAFRAALREGTaVVDDCRIKIKPA-----AQTQEGGGGKGGGDPG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719471_1661543 126 0.303 3.060E-26 103 261 414 191 353 507 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RSIFVGALRDSTSEEDLEQYFSGFGRVVRACKCTDPETGELRRFGFVDFADYGVVRKVMNiTKHYIKGKRIKVDLSRPRIEFSH--QTKTVYVGGLEDGIDDPELHTYFSEFGFVTRAlRIPnkdGPKEKFGFVDFDDYDAVDMVItQREHYICGHKVKVELALP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719174_404828 125 0.330 4.121E-26 111 246 414 0 141 145 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------PFEAEDEELRHHFGAYGEILEVSVVKDFATGGSRGFGFVTFRDGNVKDAVLNAKHEIRGKEISVRVDGKSKGAADiiSQDQRKVFVGNLSPQIDSEVLRETFSQFGTVLEVHMPKDDQGlrkkFCFVTFAGVDGYQRCLSQG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>NGEPerStandDraft_6_1074524.scaffolds.fasta_scaffold204611_2 125 0.276 4.121E-26 100 222 414 10 139 149 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EPSRKLFVGGLAPATDTKSLEAHFSQYGEIVDAVVMVDKDTNRSRGFGFVTFRDFDAVNACLDKPNNVDGKDVQCKKAVRDPPRQIEQDSRggtynslKLFVGGLPATCDYDKLTEYFGRFGKIEDAVVM----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_604530 125 0.245 4.121E-26 94 237 414 0 158 161 +----------------------------------------------------------------------------------------------KGGKGGPRPHSVFVAGLSRDITKEELREHFEQVGEVVDAFISMDRETGQSRGFGKVAFATSSGQQLAIDNLNgsEIRGRSISVRLDDPDAPRvggksgksKGANAGHSVFVAGLSFSTDADTLRAHFGTAGEVVDAYVvvhreTGQSRGFGKVAFSTPE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_723749 125 0.355 4.121E-26 3 162 414 2 162 163 +---YIQVVKsEEANDVIELPLEDDQTLDMATLTSQFPNAIGLKYK-SDSGAWRGLKVNGSTITHPGKNWSEYIKYIVTYNENKRKADEDGNGSELRAKRlaAAAQPSDLVVLNMPYDITEDDMRTYFDKYGELSFVQLKKKPD-GTSRGYGFIRYVNFNDQKTACQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719464_1014997 125 0.269 4.121E-26 129 262 414 0 154 165 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VTDVFLPSDRMSGRPRGFGFVTFASRSDAETAISKMDQtdLDGRTIKVNESRPKGEGGPRRSSGggggfnpdgkeevKLYVGNLSFDTEEQTIRDFFGQYGSVSDCFMPtdrdsGRPRGFAFVTMP-AADAQAAIeqANGYELEGRNIRVNESRPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_332886 125 0.274 4.121E-26 120 296 414 0 196 205 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGYFSKYGEIVDCIVMRDSQTRRSRGFGFVAFDRSTCVDQLQnERPHRLDGKEVDTKRVVPKQASTSQSRSdreqkvNKVFLGGLKDEITDEDIKQFFTQFGVVERLetftdKETNRRKGFAFVTFQDFDAADKCVLHAQTspdgkmnLQGYKVEVKMAKSQDEMkGGRGGGGGGGGGGRGGFGGGRGGGFGDFNQG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_858916 125 0.333 4.121E-26 107 261 414 0 163 226 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGGLAPEVDDDDLAQHFRQYGELKEAAVIRDRETGDSRKFGFVMLKSSEKEGQVLSDSHSIRGRRVSVKLhqdaassaSDHKDNGRSDSEVTKVFIGRLDPDFTKDLLRDKFSdKFGHVTEIFLASTNK-FGFITFESGSAARKALdAKSIDIDGKSVIIKEAEP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719471_11127 125 0.344 4.121E-26 98 283 414 48 228 233 +--------------------------------------------------------------------------------------------------DPESPIDLILLGLSPATTELTVRDYFEKHGEVRMVEMKRSKDANV--GYAFIRFEDKAVERQMLKEKHCIEGRQAYLKVP---NSQTGERHERKVYVSFHTQDITVEDLRNHFETFGEVEDVFIPQPFKHYGFVTFSEKRVAQALIGKEHMLKGVSLFIKPLHNHKDKEKNMMEGMRMRQMMGGMG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719318_1829923 125 0.245 4.121E-26 97 283 414 31 234 237 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RETEGMRKLFVGGLKRETNEGTMRSHFSPYGEIVDLVIIKDNTTFTSRGFGFVTFALSNSVEECFNNrPHSIDGKEVEIKRAMPREfnSAGAHARTKRLFIGgfkGLTPDLQASEIQDYIasrhANIGSIETIDLirdkeTGISKGFGFLDCSSEDFADRLAisESASTLRGRSLSIKKAEQKDGSSNRGGARGGRGTMRGGRG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719221_433962 125 0.229 4.121E-26 117 261 414 5 187 246 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ETLSQYFTKYGVVTHAEVKTDLVTGRTRGFGFVQFDGVEAVERAISNysDHAIEGKWIEVKKAVPQGfntaeratappvraapivaqaampcmaalPTSSRQESDKIFVGGLPQNSTAETLAQYFGKYGNVVGAEVkadqmTGRTRGFGFVQFDSAEAVDGVLAHYasHVLDGKWIEVKRAAP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719510_2246056 125 0.280 4.121E-26 116 313 414 2 200 251 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DNDIKAHFGQFGTIESVNLKTDATTNRSRGFAFVVFTETEGVDKAVaAATHNIQGKDVAVKKAQAKQ--------GKVYVGKLKAELTDEEIKTHFEQCGQIAQVEQPfdktkNERKNFCFITFEKEDSAKQLLKvGSTVVNGVELEVKKVTPKPDPRTMGMMGMGRGGRGgfGGYDFYGGYGGYGGYGGYGGGGWGYGGGFDGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719510_556199 125 0.250 4.121E-26 110 337 414 0 223 278 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LPQDAKQEDISVHFQTFGEIDNINIKTDPATGRSRGFAFVIFKAVEGVDAAVAvETHTIKTKKVAVKKAQAKQ--------GKIYVGKLSAELSDDEIKNHFASFGTIAAIkqpfdKIKNERKNFCFITFEKEDVAKKLLKEGtVYINGHELDVKRVTQKADPRQMMMGGGPM-GYPGPYG--PPMRGGRGGGPGWGASYGPPAGQWGGQGGYGQGDYGWGAPAGGYGDYYGGYG---------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719215_148723 125 0.281 4.121E-26 96 268 414 85 256 301 +------------------------------------------------------------------------------------------------KHMGSSARKMFVGGLAHETTTANLWEYFEQFGEMEDVDIKCDVYTGASRGFGFILFKDAASVEKVKAQDaHNLDGKRIDPK---------GASKNSKIFVGGLKPETDDEVIKTFFtELYGEIASFERgvdkhTEMPRPFAFMTLKDEDNAAKCVkEKWHTIDDKQVECKSAVDNYQYKQQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MDTA01.2.fsa_nt_gb|MDTA01162613.1|_3 125 0.258 4.121E-26 102 263 414 54 219 333 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+>VirMetMinimDraft_7_1064189.scaffolds.fasta_scaffold607942_1 123 0.258 3.305E-25 100 264 414 17 188 279 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QQSVKLFVGGLIGDMIKDTLAEYFSRFAQVVDSFVVYERH--KPAGFGFITTKNAKDAETILNATHTLNNSILDVKPALDRiqaRDKEESDRRRKIFVGGLPKNFPDEQLKVFFEKCGPVQKSYVvkdpmTGKTRGFGFVIFSTDEGYYKSLENPnLIIGGSEAHVKPATAKQE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A164ZUI0 123 0.276 3.305E-25 140 316 414 1 192 322 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------ESPQLRKMFVGNLAYECNVELLRDYFSKFGNIEDCNVPQDSRTRLSKGFGFVTFRRVASIDEVMcTRPHKLEGRVLEPRRSLRREVADDPtanASTTKLYIGPLHHSITERELENYFSEHGKILEISL-KSGKDHAFITFDDFDPIDKLVnMKRHRIvQGFPCAIaKKALTRRVIEEAERR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>RhiMetStandDraft_4_1073278.scaffolds.fasta_scaffold8045439_1 123 0.248 3.305E-25 103 260 414 99 271 380 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RNVFVHGFSWDTTRQDLASAFAPFGEIEECNVVIDKATGKAKGYGFVLFKSRKAAISALKETKrMVNDRMASCQLASVGSANAAsaakgkelEGGVRKIFVSNVGMSTDKEKLRAFFEKFGEIENGPIgfdkeTGKSRGYALFVYKTVEGAIKALEEPHKIfEGQQLRCSVAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550532_3578165 123 0.237 3.305E-25 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4.448E-25 105 254 414 12 199 200 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVGNLSLYTTGEKLKHFFSKHGEVENVRIMIHSETRRSRRFGFISFKNESSVTSVLQcqgnQKFQLDGKTLDVKHAFKRSDEEGGVQPvqktkkpfvprnvfeqyklsgsnqntdhAKIFVGGLAQNATEDDVRAYFSTYGEIRKINLvidkdTKGSKGFCFVVFSNEISAAAACMtKNHIIKDKRV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719221_302663 122 0.297 4.448E-25 123 314 414 0 193 210 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FEQFGEVRDAVVKIDQQTGQSRGFGFVMFVNEASIDAVVQQHaHELDGKKIDPKKAERR--------DGKMFVGGVKADTPDQSIKDYFGQFGEVETVDRPVDkstsvNKSFCFVTFKKDGVMKHAVkARYHEIDGKRCECKEGVPKAQIGGGQGggwGGNGYGGDQGGWGGHQGGGRGGYGGGYGGNDGGYGGGRGGGRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712121_505043 122 0.267 4.448E-25 115 314 414 0 212 239 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TDDAFRNHFSQYGEITDCIIIKEKEGGASKGFGFVTFTDVKSVEDSFAArPHTVDGKEVEVKRAMPKddQSNTKNEKTKRVFIGGISEDDTPEEIKEYIMKkhgteFGHVEEVDIlkdnaTQKNKKFGFINCSSEDFADRLAICERRCEGKSWNMQKAEPKDGAGRTRGGGRGRGGSRGRGGGGAYNQYSGGYDSWGGGYDGYGAGQYGGYGA--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719203_964674 122 0.245 4.448E-25 101 276 414 33 206 305 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MPKKIFVGGVPKHLSNEEFDKYFKAFGETVDCQLMRRHGESQNRGFGFIKYKDDEIATKVVGDDHQLDGNHLTVNYAKVPLKDD----SKRFYVGKIDEDsIKDTDLEEHFGAYGEITDKFIM-KTKGFGFVAISNVDAskLDKVLTDSHVVNGITLQVERAKPKPDSRDRRGRRDSYG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0V1EXC6 122 0.323 4.448E-25 86 216 414 3 135 316 +--------------------------------------------------------------------------------------ENLSSPASETVEAIEDPGKMFIGGLSWQTSVDSLRQYFMQFGEVTESVVMRDPNTKKARGFGFIKFADAASVDKVLNhQAHELDGKKIDPKVAFPKRIQPKmVTRTKKIFVGGLSASTTLEDMKNYFTQYGRV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712137_1361001 122 0.255 4.448E-25 101 267 414 13 182 368 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DLCNVFVKYLPHHFAEKELQELFQEFGDIQSVKVMVDPQTGSSLGYGFVRFAKPEQAQAAIDNLSrkKIGDRTLLCKLS------NQTTKNAILFVKPLKENTTEDTLKTMFTSFGEVIECKVSLDKKstsnqCVGFVRFVHRASAESAIqaMNGIKTEGETLTVRFADTPQQKPR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719424_959410 122 0.264 4.448E-25 104 234 414 283 437 438 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+>APCry1669192319_1035405.scaffolds.fasta_scaffold75979_1 121 0.205 8.055E-25 97 271 414 196 394 605 +-------------------------------------------------------------------------------------------------PAAQNFTNVYVKNIPLEWSEEKFRTSFQEFGTITSLNLPVD-DEGKHKGFGFVNFGDHESASKAVdgaatvevpdESKPLFADRfqkktersaMLTKKYEEQRREKSEKFKNLNLYVKNLDETVSEEKLRELFEPYGTLTSCTVMADdkkvSKGFGFVCFEEAEDATKALneMNGKMIGTKPLYVNRAQRKEDRRSMLEQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A167FJ90 121 0.255 8.055E-25 105 263 414 15 194 671 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+>ERR1740123_1543458 119 0.274 4.773E-24 108 266 414 0 153 156 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------GNIGQDVTDNQLREYFSSFGSINLCEIMpsKNHEPG-HRGFGFLRFEEQGVADEIKLKTHRINGRVLTVNDAKPK--------LVKFFVGGIARDrTTVESMRKFFEQFGEIEDIFCI-VPRGFGFVTLVEEGDNLRELKQndHHEIDGKRCEVKVARPKEEYQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719253_663466 119 0.279 4.773E-24 144 296 414 0 160 179 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGFGFITFKDAASVDKVLGEKLTLDDRSIDCKRAVPRgdvQSRGDSFKTKKIFVGGLATETTEAVFKAYFETFGTVEEAVImtdhdTGRFCGFGFVTFIDEEVVDKVCGEKHNISDKDVDCKKALPKRMMHGGRGGGRGGYGGRGGYGGRDDRHGGGYGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719367_2026451 119 0.263 4.773E-24 98 241 414 48 195 207 +--------------------------------------------------------------------------------------------------PDPDAIKMFVGQVPRSMDEEELREFFSEFGPVHQLNILRDKSTGVSRGCCFVTYFNRRDALEAQNRLHNVKTLPGMHHPLQMKPADTENRNERKLFIGMVCKKNDEEDIRQMFDKFGPVEEVTVLRDdngvSRGCAFVTFTSRQIAMK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSSwiStaDraftv2_1062776.scaffolds.fasta_scaffold13134411_1 119 0.232 4.773E-24 105 267 414 8 179 215 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFIGGIPSSMTEEVIRDHFSQYDTIVNVRIMKDRKTKGSKGYAFVTVSDHLKIPTILATPQVIAGRTVDVQVASRRGEKEkwkEEQRKRKLFISNIPSHIDNESLQNFFSKFGEVRNAFVIRDfatkaSLNYGYVEFVDANILDRVFStKELELDGADLICMPYQGKPQDKK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712038_1303112 119 0.324 4.773E-24 137 283 414 0 150 221 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DPTSGRSRGFGFVMFSSSDSVKKVLEEKsHMLHGRNIDPKRAKARGGRE---PVLKVFVGGIDPAIPEEEIKAHFSQFGAVTDIDLPfdkqkNQRRAFCFVTFESEAVVDEVCKNPkQTIGIKEVDIKKATPKQDQFGGRGGRGGGRGGYGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_2345651 119 0.215 4.773E-24 121 260 414 0 180 237 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EYFSKYGHISHAEVKTDVATGRTRGFGFIQFDGAEAVERAVAdyNTHVIEGKWIEVKRAVPQGvvsstgsagvavlpaqatipaaqaivpgmaalPKSGQQESDKIFVGGLPQNSTVEALSEYFRKFGivvgaEVKTDRLTGRTRGFGFVQFDCAEAVDRVLGAYasHVMDGKWIEVKRAV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719450_1109173 119 0.320 4.773E-24 100 324 414 37 262 272 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EERMDLILLGMLPSTTEQQVRKYFTELGaELLSCQMKKSKDLQT--GYAFIRFQQKDLETTMRRQKHIIDGRDCTLKIPDSRQADGGERGEKKVYVSYQDSSLTKEELRTHFEQFGSVEDVFIPTPWRYFAFVTFASASVAQSLIGKEHNVRGVSLLMKRGQaPKGKRESEHGHGhGGRDGDRDGWGDSWGGGPGAMADQWQMYAKMMQESMYRGGPPLPPGPPRAPW----------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719353_194506 119 0.177 4.773E-24 103 265 414 3 238 274 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKLFLGGLPQTCSTEIVRDHFSQFGNLTDAVCM------EGRGFGFVTFESPDDAAAVLGMEHVFEGRPCDIKEATKEGTKGCPKGKGgtgwvnpfgaggkfgppqvayggggyagggayagggayvaggpyvggggclpkgsggkgskggkggkgiktdKIFVGGLPPDCAEEKLVAHFEVYGTLVDAVVmkekgTGKPRGFGFVRYDNTDSADQVMAdfESHVIDGKWFECKRATPQEQM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000318153072 119 0.242 4.773E-24 91 258 414 48 237 298 +-------------------------------------------------------------------------------------------SSQASSSSMANDCTAFIEGFPFDSSEEGLKEFFSGYGcSVESMRLPVWQDTGRLRGFGHVVFASEDDATRAIEEVSGksIGKRYIVVKKPnvpkqemnRSGEVRDQPKGCKLVFVKNLPYDSTESDLHEAFSTFGKVLEggCRIarnqNNENKGFGFVEFKEPEFALAAVQQaskpfGLKVGGRPVFVDF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719354_845671 119 0.269 4.773E-24 106 256 414 52 207 302 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FVLtDLPPMMNEKDIRAHFQEFGELKRVDDIRQKRMGRQRHYAFIQFKTVEGEKAAQDGIHIFNHRRYYLQPSHKSRSGGKSKKeqelPTKLFIGRLPSSVTEADLCKYFSNYGVVKDIHIPAPFKGFGFISFERKDIANQVLNETHVVNGAFLNV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_3959404 119 0.260 4.773E-24 105 256 414 12 172 407 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVGGLSPAITEGELESHFSQHCEVNGVKLMKDKKTKLPKGYAYVYLKqEPDCLDQILSMFHTVGGRKVDVQAASkkcDKQQWKAEQQERRVFIRNLPNDATPEQLEALFGRYGKVKNAYLiydyyTGKQKGQGYLHFEDTESVQMALQSKTFINGEPISC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0B0PR36 119 0.235 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0.354 6.418E-24 116 233 414 0 117 118 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ETEVKEYFGKFGEVAKVSLKTDRVTGKSRGFAFVTFEDKESVQNVMnEKNHRLGDRKIEPKPAI------GPEPLLKIFVGGMNPATTEDDLRDHFGPHGAIKEIHIakdrdTQKPRGFAFITY------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1740137_302756 119 0.484 6.418E-24 88 213 414 3 127 128 +----------------------------------------------------------------------------------------DGNASSKFPRIELKCTDLICLGLPYSSTEEDVRTYFSKFGDVGMVQVKTDRESGKSKGFGFVRFVEYESQRNCLREKHVLEGRRFEVKISGSKGEEGKP-MSNKIFVGRMSEDITAEDLKEYFSQF-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719384_2935757 119 0.291 6.418E-24 139 264 414 0 136 137 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QTGKSRGFGFATYVNYDDAKKCLDDNLQLNGRRLDAKVAVPKDQSDSGaaqgyGSVQKIFVGALAQGTTQEEFDEYFKAYGTVTDSVImidknTGRSRGFGFVTFQETSSVDAILQhNNHEIHGKRVDCKRATPKDQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719188_2764380 119 0.317 6.418E-24 104 223 414 30 155 165 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLFVGTLPWNINEDELRRHFENFGPVQEVTLKYDRNTGEFRGFGFVTFLDVGSAKAVLDNydSNVFKGQWIECKAAEADPNKGKGKGSAevteKIFVGSLPKDTNQAAIEAHFSQFGRVVEVFLPK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719454_2497202 119 0.313 6.418E-24 123 281 414 6 163 170 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+----------------------------------------------------------------------------YVLSGKRKADAEVAAPPKKKKlangdaapeTDDPSARTVFVGRLSWNVDNDWLKAEFEECGEVISARVQMDRNTGKSRGFGYVEYADPASIEKALQfSGKEIDGRPINVDRSTSNKTSGgagnpndarraaygdkTSPPSSVLFVGNLSFDATEDSLWNVFAEYGDVKGVRVPTD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712126_95945 119 0.258 6.418E-24 126 318 414 0 190 201 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGEVENVNLKKDPYTQKSRGFAFVLFTSQDSLDKILNgSGHVIKGKRIDPKRAKAR--------TGKIFAGGLNAEMSDDDIKNHFGKFGKVIEVEMPfdkqkNQRKGFCFITYEHEEVMKEVLNEPkQSICGKQVDVKKATPRPDNGlFGMLPRGRGRGMRGAFGGRGRGWQCGWD--QYGGYGYDYGYGYDGYGGYGYN----------------------------------------------------------------------------------------------- +>F7F8W0 119 0.269 6.418E-24 110 262 414 0 162 231 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+>ERR1719309_1635879 118 0.224 1.160E-23 100 259 414 10 166 329 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EDERKIFIGGLAADVSEKSLVQYFGKFGQIEFVNMIKDHFTGSPRGFAFVTFTTVDAVEDVLkENTHTISGSVCGSYRAKPR--------NGRLFVGNLNNRIKDTDIYDYFGKFGKIIRIErssVPSKSSWFCFVVYQSMDTVKKVLQsEKPVLKNQELNVELA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719427_2202050 118 0.245 1.160E-23 97 242 414 18 176 341 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RECEAMRKMFVGGINRDTSDEVFFEYFGQFGNMVDQVVIKDPQTKTSRGFGFITFDCSDAVEKVFQsRPHTLDSKTLDVKRAMPREfnTTTAHAKVTKLFVGGVGPDLTPDDLQAYIEsrhptTVGTIDKIdflkdKITDQNEGFGFLECSSTDFADRL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0K9RHS2 118 0.220 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48 193 414 0 136 137 +------------------------------------------------NSFRGVRCQDNVLFPPtDEGWMGLSFICVRPK--------------VDDDDDCDKTVDLIVLGLPWKTTEEDIKKYFEEFGEVLMVQLKKRPNSGESRGYGFIRFADKDVEEKVLLQRHMIDGRWCDIKIPDSKQQEGgrkkDDKSSCKIF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719187_289076 116 0.260 3.787E-23 145 276 414 0 141 142 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFGFITYQDASMVDAAMAArPHTLDGREVDPKRALPREQSGNPeshMSSKKIFVGGIKDEMDEGDIKAYFSDFGNIEDVHIvkdkeTQRKRGFGFITFDDHDAVDKlVLLKHHNIGSYRVEVKKAVSKQDQDGMGGGRGGRG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712167_445443 116 0.278 3.787E-23 105 236 414 13 157 158 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VYVGNLNYDATDEDLAELFVQFGPIDHVCIKTyhkcrqndiEYGTGRSRGYGFVTFFEKSHAKRAIKELNGFvwMGRQLEVKQGTSKKAKQSYENC--VFVGHLPSDITEEVLKRKFGHCGKVKEITLARKSdgtvKGFAFVHFKHE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719494_388069 116 0.280 3.787E-23 47 201 414 2 159 160 +-----------------------------------------------SGGWRGIRITDGILKPPNGGWGDIEYFVTLRKTGSVNSKSAEEieqkkndkGYKKEVDSEEELLQDLFVLHLPRDVNDDELREYFtKKCGDMALAEVKFDRRTGKSRGFGFIRFITADAAREALNGDHLINGQRLEVRISRKKE------TPCQLFVGRLPEGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719492_213847 116 0.300 3.787E-23 111 281 414 0 169 170 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MDPTTGRSRGFAFVVFEDVDSLQSALGQEHSIKNKKVAVKKAASKQ--------GKIYVGKFMSPITEDEIRSHFEQYGSVVEIQRPvdrsknSEPKNFCFVTFDKEEPANALLKKGtVVVEGQEVEIKKVTVKPDGGMGMMRGGMRGGMRGGRGGWMGGYGGGGDWGYGGGWGADAYGPPSGpWGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001096088341 116 0.264 3.787E-23 120 262 414 1 177 236 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KAYFEQFGQVVDSHIMRDP-SGKSRCFGFVSFADPSVIDNVLSKTHILDSKQIDPKRAVAKHLQQQQQNPqymqisnnpymarnammprpgaaaggreeNKIFVGGIHIAVDEAELAQFFRQYDEVVESVLmkdhtTGKSRGFGFVTFASQEGVQKtVAAQFVEYRGRRMEIKQAVPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A172RVM7 116 0.421 3.787E-23 104 217 414 7 119 273 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------EEARKIVVLGLPYSLTEGDLWRHMrERFGVVQKADLIMDKTTGRSKGFAFVTFADGEQVKKAVEAsgTFEIDGRRIDIKLKASKGPGEESRGqkrdrdaagqhsfqppppthraslqsrgyqraveqnqnlDRRIFVAKIAPDLEGEVVRGYFASFGEIEDFHMPrqggthGPHRGIAFVSFANGADAERALETREHIvqpGCAPLAVDRAKSRQPGGGRGPRGG-YGGPRPGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719228_2069599 116 0.237 3.787E-23 78 262 414 69 283 519 +------------------------------------------------------------------------------KRQKRKLEQSKVTPEQKEEKRLErkrekwmmEERKIFLGGLADETTEKDVMEAFQEFGTVVDLKVMRDNDTGKSRNYGFLTFAQEFMLEAALEKREFhINGKLVIPKRATPDEPRyrmcktefdntseigTMCEGKRSIFVGALRDNITEDDLIEYFQGFGRVVRAhkcvdKETGIVHNYGFVDFADYGGVRKVFNvTKHYIKGKRVRIDMSRRK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>F2U536 116 0.244 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160 414 0 145 146 +--------------------EEDGNVLLRTIQTQFENAIGLKYKGP-SGAWRAIREGDNaTLIAPKEGWGHHTYSITFrqekQDTRKRKVDGTSNWEGGKQPRSDALLKDLAVIGIPYDANHKELKEVLnDRYGGVAQLNIKTDRATGKSRGFGFIRFDNEESAKQA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711915_607296 116 0.303 5.089E-23 144 262 414 0 128 161 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGFGFVTFADPSVVDKVIQDNHIIDGRTVDIKRTIPRGY------TSKIFVGGIPKTITDDEFKDYFSKFGKVIEHQImrdrsTGESRGFGFITFESEQVVEEIISEQiveqiisqdkkIELGGKQVEIKIAEPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719278_821593 116 0.324 5.089E-23 126 296 414 1 169 177 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGEIDNVDLKTDPNTGNSRGFAFIVFQEAAALQATVKQDaHVVKGKKVTCKKAEVKQ--------GKVYVGKLPEGVTDEEIKDHFAQFGPIVEVVRPidkqngDKPKNFAFITYEREEISFKLVKEGeTTLNGQKVHIKKVIPKD--QGMGGGRGGFGGGRGGYGAYGGYGDPYGGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711881_589809 116 0.262 5.089E-23 98 247 414 1 160 177 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EPEQMRKLFVGGLSYRTDDQMLFSFYSSFGTLTDCIVMKDPRSKRTRGFGFVCFQRRQMLEDCMArRPHVIDDRPVEPKRAVSRLESGHPGANRSVTKMNIKWYTDahlkEADFRSYFSRFGDIEDLDMPiseetGRHINFARVIFKDYDTVDKVINSSQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_693572 116 0.228 5.089E-23 101 277 414 26 244 258 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DRGCIWVGNLLPECEDKDLRDYFEKFGPVREANVEREKRTRLSRGFGFLKMSSQMLVDKILKEKHQIWENEIEVKLANDTTIEPEKEPekelvfeepakedagkennddadrkrkatddldegeaqPGKFFVGGLEAGTAEEDLRSYFATFGEIKEVAIAKDPQGnpknFAFVTMADASNDDSIASKEHLINGKKVDLQKSVKKGKSGKKGGGKDSGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712130_566359 116 0.263 5.089E-23 147 280 414 2 153 268 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFVTFADPEHAQDVLNRGDiELGGRRVDCKPAVPREEldvraaggrvrGPMGPRTSKIFVGGLSKETTRDEFERYFEKYGEITDAIVmtdreTGRSRGFGFITFATEDSADRVVSQAvHIIGDKQVETKKAIPKTQMDGQRPTYGSGMGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711915_104536 116 0.317 5.089E-23 135 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+---FICVAEEEGEEPIELPTEEsDNSLLISTLAAQFPGACGLKYRNPESRAWRGVRLSDGRLFPPSDtGWGTHVYVSVMPKGN--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719253_894834 113 0.287 5.391E-22 116 247 414 2 137 139 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DRALHELFKPFSP-NHSRVARFPDSGKSKGFGFVRFSDPESAQAALRELHgtEFHGRAIAVAFKGPRGSQM--NSVSKLFVGNLPWTMDVLELKEKAGEFGEVRSANIvtdpeTGLSRGFGFVTMINEEQAQHVIAQLH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12221|scaffold1652290_1|+169|01 113 0.222 5.391E-22 105 244 414 0 146 148 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+>GraSoiStandDraft_58_1057296.scaffolds.fasta_scaffold2259807_1 113 0.267 5.391E-22 131 274 414 1 157 171 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SVSVIKDAETGRSRGFGFVEMIKRDEANAAISALHQtsIKGKSVSVRDAgdkkgRERSPRRERPKGSKMFVGGLNWDAKDDDLKKLFSEHGKVLDLFImkdreTGKSKGFGFVTMSDEDSKKAIeKLNGNKFMGRNITVAEAKESGGKNNPKKRSAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711981_275252 113 0.294 5.391E-22 98 243 414 42 194 253 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+>MMETSP1395_Transcript_14013_9171831|ERR1726653_k119_2070791|-|169|3.688e-41|2|5540|5995|5995[5995]:5759[5759]:237[237]|5713[5713]:5540[5540]:174[174] 112 0.263 7.237E-22 122 263 414 0 136 137 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FFSQFGRIEECTLMMNRATGKSRCFGFVITKSGKSAKQILEtGPHNIDGKIVDCKWALPPEEISPAPvcKSRKIFVGGI---------------YGEIEDSIImqdrsTGCSRGFGFVTYCQESSAEKVLVNYdaHYIKQKWVEVKIATPKE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ETNmetMinimDraft_22_1059887.scaffolds.fasta_scaffold870169_1 112 0.263 7.237E-22 142 276 414 1 144 165 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DSGRSRGFGFVTFSTSSQLDDCQNQRsHNLANKTLETKRATPRRESGKPesqMSVKKLFIGGLTDDMSDDDLNDYFNKFGNVMNVeqlkwNDTGKKRGFGFVEFDDYDPVDKIILIGkHVLRGRRLEIKKALSKQEMN--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0K9NYN9 112 0.242 7.237E-22 99 262 414 103 270 476 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PPHGSEVFIGGIPKDVMEVDLRELCEPFGELFQVKLVKDKDKKESKGYAFLTFTKSNAAQLAIEELHdkEYKGRTLRCSLSQSK---------HRLFIGNIPKNLTDEDMKKILEENGPgvenielLKDIQNSTRNRGFVFVEYYNHSCADYARQKmsssDFKIDGSSPTVTWADPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719341_1278847 112 0.255 7.237E-22 103 256 414 110 293 518 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EEAFKSYFESFGEIEDCVVMKDKETKKSKGFGFVTYATVAQIDEAQKNrPHTIDGREVDTKRSIPKDSGESQKSLTKMFVGGMKDDTTEEQVREVFQEYGTMKSCDVIKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712212_588457 112 0.385 9.715E-22 46 180 414 2 134 135 +----------------------------------------------ESGAWRGVRATDGTLEPPLEGWGYNDYIVTVAKTAAKRKGDDDEGPESKTK--KTMLSDLIVLGLQYSSTAEDMKQYFEKFGDLAHCEVKSDPQTQKSRGFGFIRYTSQETVDEVLAAHHTMGGRTLEVRIPNSK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719330_925537 112 0.246 9.715E-22 127 254 414 0 149 150 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9.715E-22 102 251 414 1 152 160 +------------------------------------------------------------------------------------------------------GVKYFIPGLPPGVTNDELHAYFNKFGLCLKAVIVKEKGTDVSRGFGYITMADDSSRDAIVTAEHDIGGTAVR---ALVTKDTLSSGDVKKVHLDNLTPDITPDMIREAFSQFGVVLDVHRPkdfrtGERKRFGFVTFGSDEPFQAALQMGQIVIG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719215_25557 112 0.248 9.715E-22 121 262 414 0 171 222 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EYFAQFSESSDARIVAD-QTGKSRGFGYITLATPDALEDVLgmqedGQAHEIDGAEVKIKRhnqkaptasqpsraapvssSSAQSRGAAPVKTAKVFVGGLPNGCTEEAILDYFQTYGNIVDVKVmmddkTGKSRGFGFVTFEESAVVEVVLSEasKHTIQNKWVDVKPADGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APHig6443717497_1056834.scaffolds.fasta_scaffold1511965_1 112 0.282 9.715E-22 129 283 414 0 159 223 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VAHAVVKRDPTTGRSRCFAFVTFESSAGVKAVSAvSAHHIKGKKVDPKPAEPRPGEE---PCVKIFVGGLDSSMSEEELKEYFTKFGVVKNVEWPKDrardnaKKNFAFVEFESDSVVAEIIKNPkLTIGSRQCDVKKAIPAQKKQPGQFGQFDYGSPYGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712127_418689 112 0.261 9.715E-22 103 267 414 57 227 251 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGSCSWDTNDESLRSYFEKFGEVTDSKVILDFDTGRSRGFGFVTFADRSGLDAALAQDHEVDGRQVRCNEAQDKQGGGGGGRGGGGYGRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712050_96174 104 0.303 2.559E-19 115 238 414 0 130 131 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DESQIRNYFNKFGAVDQVEIIK-RKNEKPRGFAFVYYKDEESFNRALHAVRHIDGRRLDCKEALNKakaKTRLSKERSHKIFVGGLAQRTKEDILYDYFSVFGNIYKAYLiydhnTRQSRCFGFVEFEDEHS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740121_1466844 104 0.273 2.559E-19 119 252 414 0 135 138 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LREHFGNYGRIVDCAVVLDKNTQKSRGFGYVTMADTSGQDRLLNEKHMFGNEVARVMLTKGSLAG---SDVKKVHLGRLDPDVTADQIHEVFSQFGVVLDVhtpkdVRTGERKNFGFVTFSTIDAFNAAVQTGFIKVGR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719428_675715 104 0.261 2.559E-19 101 242 414 0 145 146 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PGPSVFVAGMNLETTSADLKAHFEQAGEVVFAAVFTDRDTGDSKGVGKVQFPDEETQKKAIEmcNNSQLQGKRISVREFSGGQRGPSGP---TVFISGLSPDTDNDKLWTHFEDCGEIQEngaVVFMRDgvSRCVGKIVFADEEAQKKA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_4_1057263.scaffolds.fasta_scaffold3090117_1 104 0.204 2.559E-19 105 247 414 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+LCEWVAVVQDEGDEAIEIPTENDGTILISSLTAQFPGVIGLKFRNPETNTLRGIRCSDKQLYPPNQQadsalWGKITYICTRAKTPAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_10_1057309.scaffolds.fasta_scaffold5558149_1 104 0.269 2.559E-19 105 246 414 0 150 219 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------MFVGGLPPEMTSSELEEYFAQYGYIDHVRVVGEVR-GKQRGYGFVTFSHKETLNQVLRiKDHRIKGRLIDCNYATDPKEEENGYGddendfNKKVFISDLPISAYKEDIKNHCSQFGPVKKVlffIRQNKEMAFAFVIFENEKDRDASIKAG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719421_498848 104 0.250 2.559E-19 137 319 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+>ERR1719361_2869393 104 0.218 2.559E-19 105 256 414 19 187 273 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVGDLASHVHEEDLRALFSAIGPVLKCKIIRDPVTQRSKKYGFVHYPSEEFRQRAIEQLHNtsLKGQVINVRTQHYKETDrclvKPGTKPTDVYIGNIPRGLTKSDLQREVQLWGipEVKECRIHRndnESGSFCFLTFPTEVEAKTALnilndqMNPRFLAGRSLLI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740123_471187 104 0.300 2.559E-19 106 259 414 274 429 625 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FVSNLPDGWSEQDLLEYFSRWGKVLNASVARDKGGDKSRGFAYVTMQDPMSRDMILSDRHDVGGTQLSVMLSKENLIGTE---VLKVHIDNC-ERFSPEQLRDAFSTFGLVLDVHtpkdpMTGERRRFAFVTFGTEEALQAAVSQGSVaVGDETVRVKLA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_179683 104 0.303 3.428E-19 104 198 414 1 102 104 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFVRGLSWYTDEHELRAYFEQFGPTERCVVARDRDTNKSRGFGFVTYETIEDAEKALSVEHELSNRTLYAQLSIPRERVDRRPQyddremeSHKVYCGNLP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712127_441239 104 0.252 3.428E-19 135 262 414 0 143 148 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PTDRETGLPRGFAFVTM-DEESAKAAIEALDGtiFLGREVIVNESVPKGQKPPNSRrefsegggnTRRLYVGNLSFDADEETLLDLFTEFGDVKEVFVPtwpdtGRTKGFAFVTIAS-DAASVAIEEtdGLEFLGRSIVVNEAQKR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719261_2113185 104 0.232 3.428E-19 119 245 414 1 155 156 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LSATFEAFGPVVSALIMKKPNDDTSestKGFGFVNFQNSDDAKRAVEAMNEknvaTDGeekilyvgramkkaereRQLRVKFDQMKLEQMNKYQGVNLYVKNLDDGVTDDELREHFSTIGTITSARVMkaaaGNSKGFGFVCFSTPEEATKAVAE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>M0SQ94 104 0.197 3.428E-19 123 259 414 1 157 158 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FAEHGSVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMNSVEDANAAIEKLNdtEVGGRKIKVNVTEKPfqtidlsllqaEESTFVDSPHKVYIGNLAKTVTTDVLSKFFSEKGKVLGAKVsrvpgTSKSSGFGFVSFSSDEEVEAAIAsfNNAMLEGQKIRVNKA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>RhiMethySRZTD1v2_1073278.scaffolds.fasta_scaffold611625_2 104 0.295 3.428E-19 110 260 414 0 156 164 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAPDVDDADLSSHFRKYGELQEASVIRERDSGTSRKFGFVMIKGDKT-KQVLDDTHTIRGRSVTVRLhadsggSADAAQGGAGDEVTKVFIGRLDPNFSKAMLRDKFDQkFGKVVDVFLAGSSK-FGFITFQSSSSAREALrAESIVIEGKTVVIGNAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711872_969678 104 0.302 3.428E-19 134 296 414 0 154 189 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+>ERR1719424_331021 104 0.310 4.591E-19 149 254 414 0 118 127 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VTFAESADVEKVMADDCILDGRTLDIKLAVPKEQQdalrrkdaDKGRKTCKVFIGGISPETTKEDFESHFSKYGTITDSIVMtdresGRSRGFGFVTFDHEDAVDKLIDESHEICGKSV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712093_89734 104 0.300 4.591E-19 98 216 414 15 137 138 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EELDECNLFVKYLPADVSDEQLCQLFQPFGEIVSAKVMVDHVDGHSLGYGFVRYALPEQATKAIQNMSGfkIENKKLLCKLSNVHTGfySHNTEPSTNLYVKPLLLETTDDDLRRVFSEYGEI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5687767_13562474 104 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+>SoiMetStandDraft_5_1073268.scaffolds.fasta_scaffold3068333_2 103 0.235 6.148E-19 102 260 414 2 170 277 +------------------------------------------------------------------------------------------------------CRKVFVGSIPGHLTNEQIQDYFRRIvpGAVFTLH-KKKPEDWRNCGFGFLKLANPIDITKILEVDHFLLGRKLKCERYLNGQnlaQNTQSLEKRRLFIRGLKSHISDDDLKEYFSKVGPIESAYtvlhpMTQLPRNFGYVTFMSEETAQAmLALGSFMLKGILLRVHPFE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_359557 103 0.228 6.148E-19 100 240 414 23 171 379 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+----------------------------------------------------------------------------------------------KIDHATEGFRKLYVGALGAHTTERSLEAYFGQFGKVKFCQVLRDRATNQTKGFGFVTMAESSATQQILsRSVHVVDTRTIRVSLTHSARQGHTPewrppnprrheekvelvsevagieVREGRVYVGPLPHNCSPNILADHFSTYGPIATSNVSRavhntMKKNFGLVAFTDTMPVKRVLQNPrHLVNEQFVEI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740123_471187 103 0.259 6.148E-19 100 259 414 26 187 625 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QDGVRFFIPGLPDFVTDEELAQHFGQYGRILEAVVAKERDTNVSRGFGYVTMEDGTNPDALLNDVHSIGGKDIRI---VMTKESLTGTGAKKVYLNNC-ELLSADEIRDAMAEFGQIWDVHTPKDPnsgerRRFAFVTYGTDDAYQRAVSAGSVFyGGARITIKPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719454_174104 103 0.547 8.232E-19 83 197 414 0 113 116 +-----------------------------------------------------------------------------------KNEDGLENPLSKTKRLDKKCSDLIVLGLQWKSSEEDLRSYFSQYGDLLMVQVKKDVKTGQSKGFGFVRFGDYEAQTKCLAQTHMIDGRWCYVRIPNSREGTQQNV-SRKVFIGRI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719440_1584335 103 0.290 8.232E-19 110 221 414 0 116 125 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LPPTASEGDLKTYFASFGTVVSANIKRDNWTNESRGFGFVTFASSGEAQAALSygEDHMISGSKIGLRVCEDRrvtPGEGPAQDPKRLWIGGLPEGVKEEDVTTYFSQFGELARVEM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711976_908139 103 0.274 8.232E-19 122 243 414 3 133 134 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YFSRFGELSTVELIYGSNPKESRGFAFIEFKNLKNAIDCVNTPNqTIDGRRINCKYHLSLNEikdREVFEKKCKIFVGGLLSTTTENDLIDYFSQYGKLVNCYLllnknTSKSRRFGFIHFEDEETVKKVL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5438309_7720844 103 0.307 8.232E-19 82 196 414 7 123 136 +----------------------------------------------------------------------------------RASSEPGPCTGRKSQRTIPMTVKLFVGGLSFSTSSERLREAFAGFGEVQSATVVTDRDTGRSRGFGFVEMATNEEATAAVSRLNGtdLDGRQIKVEIAKPAGSGGGQRRGGGGFGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719244_1423070 103 0.235 8.232E-19 101 216 414 17 135 137 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EATSLIINYLPQSLTDEQFHQLFEAIGPMLSARVMRNRATGYSFGYGFVNYERPEDAAKAIEKLNGLQLEHKRIKVAYSRradGSAGDEIKNANVFIANLPKTVDEEQLKSMFAPYGQI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000474589632 103 0.320 8.232E-19 91 188 414 32 131 143 +-------------------------------------------------------------------------------------------SSAKPAGGETPESKLFVGGLSWGTTDEALKAAFVEFGTVVSAEVIKDKMTGRSKGFGFVVMGSPEEAQAAVAKLNGqtLDGRQVTVNVARPKTDRPRNFG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711939_582668 103 0.295 8.232E-19 103 236 414 12 144 145 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPPSCDDRKLHMSFSQFGSISEAVVMIDRATNRSRGFGYVTFTTPSSVKFAVASGaAYIDGKSVEVKPCLPKgnvpasntswgkapqaevsysqkpnsrspmqmAPRSTGTSAVKIFVGGLPQNCDNQMLGNYFSQFGDVAESEVM----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719499_305623 103 0.274 8.232E-19 137 314 414 0 177 186 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DVNTTRSRGFAFVVFADTEGVEKALaAETHNIRGKDVAVKKAQAK--------PGKIYVGKLVEEVSDDEIKEFFAQYGGISQIEQPydkaaNKRKNFCFITFEKEETAKKLLKEGaVSIKGHEMEIKRVTPKPANPMMGGFGGqQWAGNYGPYGDAGYWGYGGPEAYGGYGYGPYGGGNQWGYGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719219_2025393 103 0.305 8.232E-19 137 316 414 3 184 196 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DPNTGNSRGFAFIVFQEAAALQATVKQDaHVVKGKKVTCKKAEVKQ--------GKVYVGKLPAEgVADEDIQKHFSQFGTVAEVVRPidkmknDEPKNFCFITFEREETARTLVKEGQTsINGHEVAIKKVTPKENSRGGFGGGrGGFGGRGRGFGGAGWGYPDPYGGYGGPYAGGYGGGWGGQQGGFG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712227_689530 103 0.250 8.232E-19 137 264 414 18 153 219 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DQMTGYSRGFGFIVFEDAASVEAVMAETsHEINNKKIGPRRAKPR---PKPDPILKVFVGGLDPSVPEETIKSYFEQYGAVEEINLPmdrttNERKNFCFVKFESEEIVNQVLANNnaegkQTVGEKEVDIKKHTPKDQ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712179_570939 103 0.236 8.232E-19 140 279 414 0 185 248 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGRSRGFGFVTFTQEGGVTAAMAAqdqgPLSLCGRSLDIKPSLPRgssglvqsmqpanvgfgntfnnfgrpmaqgfgrgvaaQPAAPRASKTKLYVAGLLFSTKEAVFKAYFEAFGTVTDVYISknkdGESRGFGFVTFATEAEARDCAGKLHLIDGKRVDVKPATPKTETPPvTHNYKGGMGGYP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>S9TMC5 103 0.230 8.232E-19 98 247 414 2 166 342 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EVESRTNLLVRYLDHKVDDETLKEHFAPYGNVVTCIVQRDIHTGESRGFGFVRFELPEEAVEALakADGSRLLTKKINVLWAKKEHDSTPAGEARrkmnKLFLRNIPMSVKENEIRRVIQDCGTITSITLHRDttplsdpslQRRIAFITFGEEGAAEKSLKAIH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_7472220 103 0.229 8.232E-19 99 247 414 1 157 377 +---------------------------------------------------------------------------------------------------ERGNFRLFIGGLPVRAERESIVEFFSKFGTVLSLKLKVNQNTGRSLGFAYLTVREKTAYDNLLSQTVNFQGRVIEIKPQWNRKElhqKLEEEKNKKVFVSNLPTDIGNQDLIRYFKYFGEVKNAFVIKDPdtlrnKNYGYIIFKESSSIEKVFRYPH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719209_742829 103 0.216 8.232E-19 97 256 414 183 376 599 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RRTEGFRKLYCGAISASTTEKMLQTYFSEFGEVRAVSVVRDKDTGLSKCFGFVSMQASDGAKKApLKQIHIVDNRTIRVtltfRPPKPSEEKRKncgswkprqqeerallsdevqsiDVREGRLYIGPLAENVSPNILEDHFSKFGLVAKSNVVRGvnndiKKTYGVIRFRETQSCKRVLQNPkHHVNEKPVEV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>F4JT92 103 0.250 8.232E-19 107 265 414 605 782 816 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+>GraSoiStandDraft_41_1057321.scaffolds.fasta_scaffold1897018_1 102 0.250 1.102E-18 150 271 414 1 136 217 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TLTDPLAAEKILKtGPHIIDGKQVDCKLAIPKdtlssiEPNNAIFNTRKIFVGGLPPNLSESQMKDYFERFGPIEQCVImhdkpTGKSRGFGFVIYSQESSADIVMQhkNQHCIMGKWVDCKRAMPKEVINRDLSQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719229_862669 102 0.198 1.102E-18 141 269 414 0 185 243 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+>AntRauTorcE11897_2_1112592.scaffolds.fasta_scaffold11201_1 102 0.165 1.102E-18 112 268 414 11 294 548 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------PTLNQTGLRQYFERFGVLSDVALMRNKSTGLPRGFGFVKFRDSAVASEVLGRAHTIDGRTVDVKRAVPKDKGQQPqqqqqqqpqqkqqqqqqqhhhhhhyqqqqqqqqqqqptpanssrgggvtrgsgsgtsgggagasggasegassrssgggssrssgaktassaragasatakatstgqttgavaqpptldseQQSKKIFVGGLAPSVSDMEFRVYFERYGTINDAVVmfdrqTQRSRGFGFITFQNHGSVEQVFQdEPHELNGKAVEVKRAEPKDSRAPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719265_2083961 102 0.231 1.102E-18 103 262 414 618 811 866 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MRD-FNGVGRGFGFITYQEQSAYDDVLQAQLFLRGKKLQAKRAIPPSEVLENQSEVKVFVGGLARDMDQSQLVLAFSQYGTVEDCIImkdgvTGASRGFGFVTFAASSSVDELLKNPkFEVCGKMIECKRAQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719502_620160 102 0.312 1.475E-18 79 189 414 19 130 131 +-------------------------------------------------------------------------------DAKRAVPRDQMPSANQSAQSAASTKKLFIGGLSPETTQSDFRDYFAQFGTVEDAVIMMDSNTGRPRGFGFITFESEASADKVMNTPsHSITDRQVECKRAVPRTAMGGSRRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4051812_37005287 102 0.230 1.475E-18 105 221 414 2 127 132 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AIVKIDQQTGQSRGFGFVIFANEASIDSVTsSGTHAIDGKNVEAKKAERR--------DGKMFVGGVKPETTDDTIKAYFETFGEVEEVarpinKETNENKPFCFIVFKRDGVISECMkQEYHEIDGKKVDCKQSHPKPPPGGRGGFGGGFGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_4_1057263.scaffolds.fasta_scaffold316658_3 102 0.223 1.475E-18 111 263 414 0 178 179 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------SYSVRTEDVRALLESLDlPFTECNVLMERDgSGRSRGFGFVTFPDEEIASEAIRQLNGsdFMGRsNMQARIALDRNDPENQRRERKVpvqaapgarcYVGNMVFSARREDLVEFFSQYGNVVDSYIVQerndrgvsRSRGYGFVTFESAAEADEAVrrADGSEFMGREgLRVSIAFERP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719282_1910099 102 0.269 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VLLQRHMIDGRWCDLKVPdsQDKKDGKTDKSSCKIFVGRVTENLSKEDLRDHFEAFGQVTDVYIPTPFRQFAFVQFSECKVAQSLLGKEHLIKGVSVKIGEAAPKGRDHGGNMRGGRGGGDRfggdrfGGYdggystgGGGRDVGWGGANKGGFGGGNGGGGANSGGGGGFSMNWGSGGGYGSSGGPSWGGGQGPSFGAPGPSYGGGATGGGY-------------------------------------------------------- +>MGYP000184455397 102 0.258 1.475E-18 104 267 414 1 170 259 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIFIGGLPGQTTKVDVMCFVQKFCPVLGISLPRKSGTDKCKGYAFVKVNSGPNLERLLSNHNIINGRRVDCQLALNKGDKiayLADLQQRKLFISGISPDADIHALVSALSAYGPLRNCYRLKPRkkdKGLAFAEFTNPEAALAVINGGHLIEGKIAKVSFYRPKVPDNR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719220_1111748 102 0.271 1.475E-18 97 228 414 108 245 262 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DEAADKDKMFVGGLHKDTNFTHLYRYFQKFGPVEQVLIKYDPATKVPRGFGFVLFENEDSVTKVLtyEKEHILLDKVIDPKRAQPHNTL--PSYQHKLFLGGVSSEkgHTIENLVEHFSKYGKITSIVWPdkgsGKTKGF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719245_375494 102 0.267 1.475E-18 120 267 414 0 151 305 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KDYFGKFGDLEEANVPLDNHTKQSKGFGFVIYHESNMLDAVMKmRPHKLDGRVLEPRRAIRREEANNPaanASTNKMYIGPLSDRVDEHYLKEYFSKHGNVVNVD-KGQGKDHAFLTFDDFDPVDKCVnMKRHILRGQISIAKKGLTKTAMAE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719174_181587 102 0.235 1.475E-18 113 243 414 59 193 319 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------NIDDNALRDAFSDYGDILSCKVARE-ADGKSKGYGFVHFKSGELAKQAIERVNGmqIGEKTVTVeKYMKATDRDTEPKDFTNLYVKNMPRSWDEAKIKEMFAEFGTVTSTLVQKDPKGrtFAFVNYEDCEAAKKAI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719329_263806 102 0.234 1.475E-18 97 224 414 294 451 459 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DSDRKSNSIFVGNLPFSAQEVILRDMFSKVGQVVSVRLPLDKDTGQPKGYAFIDYNDQDTAAKAVRELHalEYSGRRLKVDRAdrigksklertpadnsvgqstekkrsnlSARSQPTTDEEELSVFVGNLPYDVEERELREFMSQAGPVTSARLVQD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1S8W4I1 102 0.294 1.975E-18 96 188 414 2 96 111 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164 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QEVMNQPHEIDGKPCDIRLADGNKGSGKGGKGKgggkgqktdKIFVGGLPPDCPDEALSDHFSAYGTLVDSVVmkekgTGKPRGFGFVRFDNTESADKVIADYgkHQILGKWIEVKRATPEDQMAGGGGGGKGYSGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001198660849 102 0.275 1.975E-18 82 188 414 59 167 168 +----------------------------------------------------------------------------------RNLTKQDSSSSSIKRSLSKMSTKLYVGNLSFSTTEASLGDFFAQIGSVASVKLITDRDTGRSRGFGFVEMSSPDEADKAISELNgkELDGRAISVSEARPQAPRSGGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712226_1193210 102 0.232 1.975E-18 103 241 414 13 170 175 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152 154 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EVGQVVDAVVMEKH--GQPRGFGFVTFKDKTSVTAVLAQGVQIDGRDVDIKRAVAEEDIDGP---SKIFVGGLGQNINSAKLKAYFIKFGEVRDCVVmmdrsTNRSRGFGFVRFASAESID----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_1805349 101 0.241 3.537E-18 94 217 414 14 154 158 +----------------------------------------------------------------------------------------------KGKGKGRRLNSIFVAGLSYDTTSDDLRKHFEQVGEVVDAHVSTDRESGNSRGFGKVALAAPESHARALEELSGssLNGRDITVRdddpnapraggkgdsKAGGKAGSKGSARPNSIFISGLSHATTDDGLRDHFAEIGEVV---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APIni6443716594_1056825.scaffolds.fasta_scaffold6223472_1 101 0.261 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YFSQFGTLADAVCMV------GRGFGFVTYDTEEIALQVMAMEHVMENRRLDLKEATRDGTKGAPQKGKgflspggggkgggggggfvpwnapdggsgmpkgggkgnpgkhgdiggnqrtdKIFIGGLPQDCTDQMIIEHFSVYGTLKDAvvmkdKVTGVNRGFGFVQFDNFDSAEAVMNdfSSHQISGKWIECKRATPQDQM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_461913 101 0.405 3.537E-18 165 358 414 3 196 202 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HIIDGRTCDVKIPNSKAGDGTAvQQSGKVFVGRTTEELTSNDLRGYFDKFGEVTDVFIPRPFRAFAFVTFMDPEVAHTLCGEDHIIKGVSVNISNATPKSDRDR-MQSGGNFGGRGGHQQGYNQGWSANQGMGRGGNWNSNRGNGPHPNNNQGWNQQGGNWNGGNGGPAGGNMAPWGSNNFPGGSGNGGPAGGNM------------------------------------------------------- +>ERR1711991_693656 101 0.213 3.537E-18 90 236 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3.537E-18 146 271 414 0 139 241 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGFVTYEDSSSVDAVMGQQRQLDGRKLDIKAAQSKDEmasdkATPKSSSNKLYVAGLAFSLTDDDLFNFFAKYGEVERAEImkdkaTGKSRGFGFVTFSQEGGVTGAIdaqaQNPLELGGRRLDIKASLPRGSSRLAQGR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_23_1057293.scaffolds.fasta_scaffold1425573_1 101 0.239 3.537E-18 80 257 414 57 240 242 +--------------------------------------------------------------------------------NKRKNEEVQQNRQDANKKPKGGCGSMIkIFNLSFQTNDDSLQEGFKGCGTILRANVAM--RDGRSRGFAFIEFEEEDAAQKALEYNNtEFEGREIRVEIAEKNSGDVPITRSANL-VGHTTRvicknclGLTQEQLQDVFSQFGEIKEVHVLND-KPVAFITYYDLRHAEAAyNKQNIDVSGVNVSID------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 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206 273 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TSESLVDAYAKFGDVEDGAVITDKTTGKSKGFGFVSFVGAIATQKALEAPStLLDGRLVRCKLAKkerkcsavvgdtsavdalvtkqlaagvrsdtiarnmgvreeggdegtndsgssggGGQAQTASLAARKLFVRGLAWQTTTETLLQHFSQFGEVQEGAVcvdreKGRSKGYGFVTYSSAAAALRALVEPsKLIDDRMTHVKFA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1Z5RB72 99 0.256 1.133E-17 111 268 414 5 171 335 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------SQRATQATYVRHFGQYGEIVDSVIMKDRYTSHPRGFGFITYSNPAVVNKVIEDKHVINGKEVEIKRTVPKSSVQSSSKDFK----------TKR--YYFFARYGTVVDHQImfdheTKCSRGFGFIVFASEQVVDDLLANGNMIDlasskmkmstkGKCIllfqmEIKKAEPKKSSNPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A9S1U0 99 0.250 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+>13989|scaffold518420_2|-213|01 99 0.263 1.515E-17 96 188 414 23 117 164 +------------------------------------------------------------------------------------------------KSGVKKSMNIYVGNLAYNATEDELRSAFGAFGQVTSVKIVRDRETGRSRGFAFVEMEAGEGAQNAVAQMNGrdLNGRNLVVNEARPREQGGGRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719420_673196 99 0.299 1.515E-17 137 296 414 0 158 172 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DMATGRSRGFAFVLFSEQSSLQSALAQEHTIMGKKVVSKQAQAKQ--------GKVHVSKLTNDITEEDIRAAFQGFGNIAAIeypydRIKGEKKNFCFVAFDREDVAKALLKQGtVQLKGKTVEINKaAANPGGNMRGGPRGGMMGGPKGGRGGGMQGGWGGGGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711963_446873 99 0.283 1.515E-17 142 318 414 1 181 187 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KSRGFGFVVFAAPESVDKVCEEkEHKLHGRNIDPKKANPR------PINKKVFVGRLDPAISEEEVKTYFEEnFGAVVKIELPfdktkDQRRAFCFVEFKKQASMKKCLdQTNHKIGTQEVEVKKATPPGGAQNMRGGRGGFgrGGGRGGFQGGYGYQGYGGYGGYGGDYGYGYNYGGQWNGGYDQN----------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719204_598095 99 0.271 1.515E-17 79 180 414 3 105 198 +-------------------------------------------------------------------------------DQKRAVPQQQKRPPGGAPSGQGSATKIFVGGLAQGVEQEEFRAFFETFGAVTDAVVMFDKMTGRSRGFGFVTFEDPGAVDMVLrENNHEISGKPIECKRATPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1043166_5609926 99 0.290 1.515E-17 91 188 414 109 208 217 +-------------------------------------------------------------------------------------------SRTGKTDMANDNNRLYVGNLPFKTTDDDLAKVFSAFGTVGRASVVTDRETGRSRGFGFVEMGTAEEAQAAITGLDGkpMDGRNLQVNVARPREDRPRRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719318_1046440|ERR599310_k119_707842|+|293|1.734e-78|1|8721|9524|8721[8721]:9524[9524]:804[804] 99 0.241 1.515E-17 99 282 414 20 206 268 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PEDDCRLFVSVFPENAKQDDISDHFQTFGEIDNIIFSSDPEAGSSKApSAFVRFKTAGGLKATFAtEEHAVKGKTFDVKKL--------PAKPGKIYVGKIKAELSNMEIKSHFAQFGPIAKVEQPfdkskKERKDFCFITFVKEDSAELLLKAGtTTVNGIELEVKKVTPKPDPRAKGMMGmdrGEKGGYGGGY----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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2.026E-17 104 224 414 19 154 162 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFIGGLPQDCTTEVLQDYFSQFGTITDAICMV------GRGFGFVTYDSPDTSDSVIGMEHVLEDRKLELKpadgakgkggkggkdkggygaPAKGGKKGGKSGSTPKVFVGGLPSGCTEEQITACFEAYGTIIDVVAMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550514_436539 98 0.254 2.026E-17 101 227 414 8 171 172 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EQGKVFVGGLAHSTTPESMTAYFSQFGPCE-CRVMYERDTGRSRGFGFAIFNSNETVQMVLnAGPHTLDGRSVACRLCVKGGGKGiggseawgggfgnsapvavhtisptftsvhpaEVEDPRKIFVGGLPQSCDEARLTAFCAQFGAVREAKIhvdqeSGRSRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ThiBiot_500_plan_1041544.scaffolds.fasta_scaffold03777_4 98 0.216 2.026E-17 129 259 414 0 170 173 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ILSVEIIKDKETGRSRGFGFIKFADAADAEKVLRTMdgSEIVGRSCKLDKAgggkggggggkdrdfrdrdgrgrndgrgrrddRGGGGRERFAEPDKLFIGKLSLETTEDDIHDAFAKCGDITVQIIKHRdaneSRGFGFIKFRDAAAADEAMrtMQGTEIGGHECRLERA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ETNvirnome_6_100_1030635.scaffolds.fasta_scaffold42685_2 98 0.262 2.026E-17 135 260 414 0 136 200 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IFDKNTGKSKGFGFITFKHVDGALIALKEPSkKIDGRMTVTQLASAglsnSGSSGGDVWSRKIYVGNVPYDIPSERLLGFFLTYGEIEEGplgfdKVTGKSKGFAFIIYKTEEGAKAAIADPmKIIDGHQVLCKMAV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3989344_7809332 98 0.285 2.026E-17 101 196 414 74 171 205 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QGNKLYVGGIPYRSTEDDLKKAFGEAGTVVSASIISDRMTGRSRGFGFVEMASEAEAQAAMDrwGGKEMDGRTLSVSFARPPGDRPPPREGGGGFGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>EndMetStandDraft_2_1072991.scaffolds.fasta_scaffold6772772_1 98 0.236 2.026E-17 121 256 414 0 143 208 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QHFKQFARVSKVEIMKHKKNKAPKGFAYVTLADASDIPNILSTLHTIDGRKVDCQVAANKKEKQKTKDDQKkkmIYVTNLPGDLQSEELHTFFEPFGQVRNAYIIFDndskiSKRFGYVEFLEADSVINIINRHIDINSHQVLC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719281_378059 98 0.302 2.026E-17 102 196 414 18 113 212 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SCKLFVGGVNFKTDEDGLRKYFEQFGDVAEAQIIMDKETQRSRGFAFVTFQDSDSARKCLKQaHHELDGRDISPRECDDRPVRNDRDNDRGGYRGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12587|Ga0255049_10100097_2|-366|00 98 0.257 2.026E-17 101 195 414 0 96 235 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSVRLFVGNMPYAATDADLRAHFSAVGEPSQVVIPLDRATGRPRGFAFVEFADRSVAEEAINrfNQHDFMGRSLSVSEARPREERTGPRPPGGGFGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719153_541277 98 0.405 2.026E-17 165 310 414 4 156 261 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLIDGRWCDIKIPESqdrKDAKGQDKSSCKIFVGRITENLTKEDLRDHFEAFGQVTDVYVPSPFRHFAFVQFSESKVAQSLLGKEHIIKGVSFKIGEASPKGREQGGGrdhdRGGNRFGGYDGGYGNPAQQGGYSGGYGGAAGGYGNSGPSWG------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001405488645 98 0.279 2.709E-17 101 184 414 0 85 98 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MAFSIYVGNLPWRTTAEDLRALFEPYGAVENSRIITDRESGRSRGFGFVDMAEEEAAKRAIAELNNYDygGRPLTVNEAQSRAAGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719183_460143 98 0.271 2.709E-17 92 183 414 1 92 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------PPAPAAPSGPVQKIFVGGLHPSVTDEEFKAYFDKYGVITDSVVMMDKQTGRSRGFGFCTFEDPKSVDKLLEDAHEINGKAVEVKKADARNEQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719487_1949786 98 0.290 2.709E-17 114 218 414 2 109 110 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TNTDLLKSHFGKYGRIIDSVVM--HKNGRPRGFGFVTFDNSFAVDQVLAETQVVDGRVVDVKRAVPGSNdraghQGEERNSNKIFIGGLPQNVTNEDLKQYFGRYGQISD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719450_1215426 98 0.361 2.709E-17 134 239 414 5 111 113 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IKYDKN-GKSRGFGFIRYKTVGAVKAALNGTHIINNRRCELRYSRRSQDQQQGEDNirTKLFVGRLPSGTTTADLQEHFSAYGVLKDVYIPTPFRGFGFVTYGSQTVA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5687768_6689236 98 0.275 2.709E-17 90 185 414 3 100 118 +------------------------------------------------------------------------------------------GRKTPKKGASKMNNKLFVGGLSFETSQSDLRQAFSAHGTVEEAVVVNDKMSGRPKGFGFVTMSSDEEARKAIEAMngHSLGGRTLTVNVAKPREERRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001134590586 98 0.263 2.709E-17 96 188 414 4 98 118 +------------------------------------------------------------------------------------------------RQEEENKKKLFVGNLPFTATQEELQEVFSKFGEITNVNLITDRMSGRPKGFGFIEYSSEEEAQAAIDGMagQKIGDREVIVNLARPRQPRNNRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>1082|scaffold_801709_c1_1|-100|01 98 0.288 2.709E-17 97 184 414 10 99 123 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------MFVGNLPFEFKEEQFRSLMSPFGPIERIFLVRSMFTGESKGYGFVDYVTRESACLAKQQLmntgsKYVGGRILRVNFAEPNLLTYEDLHSKTLFVDRLPRDFTNgEVLKELFSQSGSVTFAQVNYTLRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001055041930 98 0.310 2.709E-17 101 185 414 22 108 146 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PHMKLYVGNLSFKTTEQALEELFATVGTVTDTHLVMDRMTQRPRGFGFVTMSTEEEGQKAIESLNGktFDGRPISVSVARPKEDRPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>M2XML7 98 0.290 2.709E-17 101 191 414 2 94 148 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EDNRVFVGGLPWSISEEDLKQVFSKYGEVVDARVVIDRETGRSRGFGFISYAESSSVDECIAALDGqdLQGRTIRVNKAMTREQRDDEFASGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>2205|scaffold574454_1|-1|11 98 0.285 2.709E-17 73 182 414 38 149 151 +-------------------------------------------------------------------------CALRPQMESEEPLGRPLGRRGSQERGSNMSRKLFVGGLAWKTTDEDLRKAFESFGEIIGAAVITDRETGRSRGFGFVTYAEESQAQAALQAMQgaMLDGRALRLDAANEGRP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_189876 98 0.268 2.709E-17 142 265 414 18 147 154 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RSRGFGFVLFKSPETAQLVLSQTHTIDDKVIEVKKAMKLGQR----KSKKLFVGGLKNNISEEVLNAYFSAFGKILETSIicnrqTQRRRGFAFILFEDESTVDTIAEvKFHELtDGtekCRVEVKPMQPQTDR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719204_1062722 98 0.340 2.709E-17 164 296 414 2 145 159 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PHKVDGREVETKRVVPKDEVGKPESNmkvKKVFVGGIKFDMTEDDLREAFEKYGAITSASIPkdkttNKPRTFAFVDFEDHDSVDKVCLyKDIEVAGRRVSVRKAVDKEQMRNQEQRGGGGrdGGRGGNWGGNQGGGGGGGWGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712240_935491 98 0.256 2.709E-17 108 258 414 0 151 160 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGLPKEATVNDIKNYFQKYGDIEDVKLPICSQTGRSRCYAFVVFVDVKGAEAStAEASQIIMGNKVCCRMS--------GIITWKIFVNMFPsQGITLDDVRTHFEQFGNVYDVHKPKDwieadlSKNFCVVIFDNRDQAKKLVkMGSTTINGYKILIKK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A7SIE8 98 0.235 2.709E-17 104 259 414 11 183 184 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGGLNEDTTEETVRAYFKSFCEgseadVSSVSLAKTPE-GKSRKFCFVEFSNGSDIIDNIVfnfESHSIDNKQVEVKRAMPRDDPNElaHVRTKKLFIGGLKDEHSEEDVKTAlapLSPFAPLeikmVRDRETNKFKGYCFVNFPNEHIVDKLyLVRHIQVKGKDVEMKKA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>JI7StandDraft_1071085.scaffolds.fasta_scaffold2432047_2 98 0.218 2.709E-17 144 270 414 0 150 185 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGFGFVNYAEHDGAAKAIEELNekEVSGKKLFVGRAQKKVERERELKAKfdaakierikkyqgvNLFVKNLDDALDDDQLREHFAEYGTITSARImrepaTGTSRGFGFVCFSLPEEAAKAVteMNNKLILGKPIFVALAQRKEVRRAQLE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_420983 98 0.262 2.709E-17 145 296 414 0 151 205 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFGFVTFKTPEALEaAAAEKFHTINGKKFEPRKA--------KIQTSKIFVGGLKEQLSDDDIKNHFSQFGTITETEMPfdkqqNRRKGFCFLIFEGNDTAKNIITQGkQTITGIQVDVKKAIPsENEGGRGGGRGGGRGGFRGGRGGGGGDYSNGNGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719189_1439378 98 0.418 2.709E-17 147 267 414 0 121 207 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AFVRFKKIEVQKKVTMTRHWINSRWCVVQIPDSQEiSNAMADANNKIFVARLNGSIKAEHLRSHFECFGKVTDVFIPKPFRNYAFVTFTEQRSAEALFGRQHTIRGHTVHIKSAEPKGPTDK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719499_278996 98 0.282 2.709E-17 69 183 414 2 117 210 +---------------------------------------------------------------------NMSYSSRRSRSRSRSR-SRDRDYGGGGSRGGEANRKLFVGRLSYDTDKRTLEDVFSKYGRITDCFIPNDRETGESKGFGFVEFDKLEDAEEAMKALDQtdIDGRAISVEFSRPKRSG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_1642423 98 0.261 2.709E-17 76 184 414 11 121 226 +----------------------------------------------------------------------------FPRHRPRSKTISSQSCEKRTYENMSDEGKLFIGGLSFDTTEDSLAEAFSKYGNIAKVDVIRDQETGRSRGFGFVKYDSVDDAKDALEAMNGksLDGRTIRVDEAGNGRSGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>15185|scaffold397010_1|+2|10 98 0.267 2.709E-17 96 196 414 35 146 228 +------------------------------------------------------------------------------------------------RAEKEDTVKLFVGGLAWATDDVSLRAAFQPFGNLSDAVVIKDRDTGRSRGFGFVTYSDDASGKAALQAMNGatLDGRSIRCDEAVerergaggpPRMGGDRPPPREGGFVGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719215_704977 98 0.186 2.709E-17 101 253 414 22 230 232 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1 93 98 +------------------------------------------------------------------------------------------PPVGAEKVKLGLSMKLYIGNLSWGTKTEDLKSHFEQFGAVSDAIVITDRQSGRSRGFGFVTMDNDDEARKAMdeSNGHDLDGRPLKCSEATPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000890481495 97 0.322 4.842E-17 101 191 414 0 92 99 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MTNKLYIGNLPYNITEDELKEFFASAGNVTSVAIIKDKMTGKSKGFGFVEYSTPEEAQNAISTLNgkEIGGRAITVDEARPPKDFSDRRNDNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719495_2595442 97 0.378 4.842E-17 140 233 414 1 103 104 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+------------------------------------------------------------------------------------------------RRGNYMSKKLFVGGLAYSVTDQTMNDFFAKFGKVISAVVIVDRFTGKSKGFGFVEFETVEEAQKAMdeANNKELDGRQIVVKEARPLEPRPAGGSFNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3989344_6386624 97 0.270 6.472E-17 75 183 414 12 122 123 +---------------------------------------------------------------------------VYNKEIKLKTESLEKRKLSNTRLAVITIKKLFVGSLPWAVDDQKLGDLFSQFGSVVSAVVLKDRMTGRSRGFGFVEMANDNEAMEAIEKLNGsdMEGRKIVVNEARPREDR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712193_421270 97 0.300 6.472E-17 62 175 414 0 119 123 +--------------------------------------------------------------PPRSGWSDVTYYITETDAPSQKRKISDATSPATKMSRSVPSvdplmRDIAVLGLPWSVDNAELKQYFeEQCGELNFAEVKHDRETGKSRGFGFIRFKHREAAERALEMEHTLGGRILEVK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>17968|Ga0316601_100396321_1|+3|10 97 0.265 6.472E-17 100 191 414 19 112 124 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QMAKKIYVGNLPYSATEDDVRQLFEKFGEIQSVKMIMDSMTGRPKGFGFVEMSSDEDAGKAITALNGtpFLERTLSVSEARPQTGRGKDSRQSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>23575|scaffold_12_c1_41|+50770|00 97 0.298 6.472E-17 104 188 414 1 87 131 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLYVGNLLFNVTDSDLREAFEPFGEITEIRMIMDKFTGKSKGFGFIEMPSNEDAQKAISEMNgkEFMGRDITVSVAKPKTTRPSGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001081870990 97 0.277 6.472E-17 101 188 414 0 89 136 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSRKLFVGNLPYSVTSERLSEAFSQFGTVTSSKVIVDRETGRSRGFAFLEMETDDQGAAAMQAMNGalLDGRSIAVREAVARAGTPPPAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_47_1057283.scaffolds.fasta_scaffold2018466_2 97 0.295 6.472E-17 101 196 414 17 114 149 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PPQKLYVGNLTWDTTEQDLLDNFAAFGEVEYCKINTDPDTGKPRGYGFVTYVEKDNAEKAIQALngHDIKGRPVKVNLATERGKGGGGDFGKGGFGKG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719446_1826518 97 0.294 6.472E-17 86 219 414 7 142 154 +--------------------------------------------------------------------------------------EDKKDPPVGKRRKSRGGRKLFVGQLPKDITETDFKSLMSPFGEINGLRVLQDKKTGLGTGAGFVVFSTRKAAQAAVQH---FDGKICLRNMDRPmqvriAEGEFEPNADVKVFVGSIPPKTTEKEVQAVFEGFGNLLEV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9298|Ga0210265_1079430_1|+3|10 97 0.260 6.472E-17 87 184 414 33 132 155 +---------------------------------------------------------------------------------------SARRSCANQAESNAPGTTLFVGGLSWGTQPVTLEQAFSQYGEVVDAKIMFDKETGRSRGFAFVQFKEVNAASKAKEALNnqLLDGRTISVSFARPRPPRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>JI10StandDraft_1071094.scaffolds.fasta_scaffold718165_3 97 0.315 6.472E-17 97 189 414 25 119 157 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RKDSMPTKLYVGNLSYRTTEDQLANLFSQAGEVVSSVIIKDRTTYESRGFGFVEMSTAEEAEAAIAQLNGytLDGRAIVVSPARERSDAPNRSRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001167406497 97 0.300 6.472E-17 96 196 414 32 132 160 +------------------------------------------------------------------------------------------------KGSMESVMKLYVGNLSFSTSEQRLREIFSEHGDVASATLVMDRETGRPRGFGFVEFASDEHGKAAMAALNGknIDGRDLTVNEAKPREAGGGGGRGG--FGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_1561543 97 0.284 6.472E-17 137 296 414 1 161 166 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DPNTGNSRGFAFIVFQEAAALQATVKQDaRVVKGKKVTCKKAEVKQ--------GKVYVGKLPAEgVADEDIQKHFSQFGTVAEVVRPidkmknDEPKNFCFGTFEREETAIQLVKEGtTTINGHELAVKKVTPKENSRGGFGGGRGFGGGGGGWGYPDPYGGYGGGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719290_273323 97 0.245 6.472E-17 127 277 414 2 152 166 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GEESDLQESRSQGSGRSRGFAFIVYKEAAGVEVATKTPtHVVKGKKVTCKKAEAR--------PGKIFLGKIPDEVSEDDIRTYFAQHGNVTELVRPidksnnDKPKNFCFITFDKEEVAKKLVKEGQcTINEQVIQIKKVTPKDGGGRGGYGGGFGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001082298750 97 0.224 6.472E-17 97 227 414 18 164 169 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DPIEVPAKLFIGRFPKSMDESALIPYFEPFGKVKECVILRDFSTKQSKGCAFIKFGSVSDAVDCIRKLNnqlVLDDEigALQVQFANGEVERlglsceQIEVPPVKIFVGSLPSTIDERSLYAMFAPYGEVVETFIlhddaTGASRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5258705_6160037 97 0.245 6.472E-17 90 189 414 31 132 175 +------------------------------------------------------------------------------------------GTPIPIREESEMGKKLFVGNLSFDTTDQDLRGFFTTVGKCVSATVLMDRATGRSRGFGFVEMETDDEALRAITQLNdqELQGRRISVSEARERGAAPPPRSP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719317_1446546 97 0.233 6.472E-17 100 221 414 21 174 184 +----------------------------------------------------------------------------------------------------ECMTKLFVGSLSPRTTDDCLRNYFCQFGVVIASEIIKDTVTKESRRFGFVTFEKREDMKLALAEPkHKLDGQVLGVQEAVPKykikhqgrevgdrsrsrvkrrrvlshsrsrsPRERGRYEEKKIFVQGLGSSKDEGFLREVFEEFGEVTEAII------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0R3VY15 97 0.254 6.472E-17 102 257 414 48 219 232 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PVRLYVGGLRGKHTEDQLRQYFAQYGVVTKCCIWRDFRTHESKRCGFVTFEEVVCASRALAdRPHYIDGDLVKLAPFTPKKKKNksavPPLPVNKtdyidaitphdLVVDGLPPVPSVNDIRSLFGRFGEIIDVRV-EEELHRAFVAFSTAQALQAAVaAAPPRLKGMNLRVS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR550514_1859702 97 0.204 6.472E-17 132 271 414 2 187 233 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AEVSMDKGTGHSKGFGFVQYETLEAVASVLANytDHTFDGKWVEVRQFGDKAPTGqefklparnrgprgiavataaalaaqgygltnqsgglSDGKSRTVFVGGLPRSVGDARLKSHFEQFVKVTRADVivdreTGQSRGFGFVEFQTEEEVQTVMAKReaSRIDGKWIEVKRFGDKNPDKGQQSQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_59_1057299.scaffolds.fasta_scaffold1224134_1 97 0.243 6.472E-17 131 265 414 2 145 239 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DASTVFDSSSNRPGGFGFVVIKDDGQTESILSKEHFIKGVKIECKLALDKNQakmKDDEERTRKIFVAGLPRNLKDDLLGRYFSRFGPVQKAYVnkdfkSGKTRGFGFVVFSDIKSYNNALcQKRHVINGKEVIVKETQTRKEM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719359_1915736 97 0.217 6.472E-17 147 267 414 9 146 248 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFANFETHEMAVKAIDTMHqkEVNGRKLYVARAQTRSERDsilkkqredlrKRTKLCNLYVKPLPSTLTEQKLREYFASCGTITSAKIMhnadGSSKGFGFVCFSQPEEATRARDEDIKIDGKQLYVNLAQSKEERSQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000385925694 97 0.297 6.472E-17 92 190 414 39 139 312 +--------------------------------------------------------------------------------------------PRQPREGQAMGTKLFVRGLPWATNEHDLQEAFSAFGQVVDSAVVRDRDTGRSRGFGFVTMATDEEAAAATSGMNGarMGGRQISVSEAREDNRRRGGPPRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A4H9C4 97 0.276 6.472E-17 104 247 414 24 182 342 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLLVRFLDHTVDDVQFRVFFEPFGDITSSMVMRDIFTGESRGFGFVRFARNADATRALHEcdGKKIGGKAVNVIWAKQQhddtPAGQERLRMNKLFLRNVPLGITEAELVELVRAYGTVKEAslhsdRIPtarhSPARRIAFIVFADEGAAEAALRGVH---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_148367 96 0.307 8.649E-17 119 219 414 1 102 104 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IKAHFGQFGTMSDVVVMKDAMTGHSRGFGFVTLEASDAALAA--GPHLIGGKTVDAKKAVPRGQEAEntvAASGVKIFVGGLSSETDDADFRAYFQAFGNVTDA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719400_3014207 96 0.453 8.649E-17 100 173 414 38 112 113 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QPSSKMFVGGLSWQTTEDTMKEYFSQFGPVVEAMVMRDPATKHSRGFGFVTFAQPESVEKVsQAGLHSLDGKKID------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3989338_5113916 96 0.239 8.649E-17 100 189 414 3 94 115 +----------------------------------------------------------------------------------------------------ERGMNIYVSNIPYSATDEALRDAFAAFGAVQSARIIKDRMSGRSRGFGFVEMPNDEEAQKALEGVNgaEMDGRRINAREARPREEGGPRKGN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_2775313 96 0.275 8.649E-17 96 191 414 0 97 129 +------------------------------------------------------------------------------------------------RRNMSEEISVYVGGLAYAATEDDLRDNFEKYGEVTKVNVVLDRESGNSRGFGFVHFQNKADAQAAIDALNEqdIKGRPIRCSFARPRGEGGSGGGGYR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5262245_38322864 96 0.306 8.649E-17 92 190 414 24 124 134 +--------------------------------------------------------------------------------------------ASQNERDRDMSNRLYIGNLSFNTDEGTLQNAFTRFGDVSDVKVITDRETGRSRGFAFVTMADAEGARAAISQMdgSMVDGRALRVNEAEERQQRSGGGGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>18668|Ga0209703_1487728_1|-3|11 96 0.261 8.649E-17 63 180 414 12 137 138 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------EDDRKLYVGALPPAAKESDIKTYFETFGTIESVNLKTDMATGNSRGFAFVLFNEVASLKGALAQEHSMMGKKL------------------------------------AFQGFGNIAAIeypydRIKGEKKNFAFVTYDREDVAKVLLKQGtVDFKGRSLEVNKVAIK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719271_517065 96 0.257 8.649E-17 87 216 414 49 184 185 +---------------------------------------------------------------------------------------ESSRPSTSKEPHSKQSVRFFVGGLSPDVDDKDLRDHFSQYGEVDEASVIRERETGSSRKFGFVMLKSRDRMNDILKGSHSIRGRQVTVRLHQdsaglDDRDAGRSEVSNKVFIGRLDPDMSQELIRDKIDQkFGRV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001417634775 96 0.414 8.649E-17 136 258 414 10 128 186 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+>ERR1719460_1420465 96 0.159 8.649E-17 101 259 414 32 294 760 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DSRTVFVGNIPYNATEERFHELFNTVGTVTRVFIVNDKDTGQPKGYGFVDFEDKETAEAAVHrlQGYEFEGRLLRLDqsgnhkanpaseddrvgvsvsdfpqdwinlddeslaqqvaaeleafgelasppdvvkigggarraiavfstseiahkavealngfvfkaevvqnePSHPSKRARKAESGHTIFVSNFPYDTSEAELSSIFSGVGKVLRIRLPRDKatdqlKGYSFIDYEDKESMQEAVddLNDLEFQGRRLRVRLA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000365599041 96 0.311 1.156E-16 101 188 414 0 89 90 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+MTSYVKVCEDVGkeDQTIELPTEDDQTLLLSTLASQFSGASGLRFRIASEGNIRGVKLQESKLYPPNGSWNEITYYCVFPKGR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001460040234 95 0.300 2.063E-16 101 188 414 0 89 97 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSVKLFVGNLPFSTDDNRLKEEFTKFGAVESARVVTDKHTGRSRGYGFVEFSDQTAADAAVTGMNGqnMDGRPLTVSVAKSQGTGPNGPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719362_1571378 95 0.317 2.063E-16 101 181 414 10 91 103 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MPLNRDTGKCRGFAFVAMTNSEDHEAAIEQLNQsdIAGRTIYVSESLPKDqvaekkkkfQHKKKDEGAKIYVGNLNFDTTAEDLTAAFAEFGEVNDCFLPvdydGNARGFGFIQMSDEDSLKA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740121_193816 95 0.261 2.063E-16 106 224 414 0 123 129 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FLGGVSSSTTGETLNAHFSKFGRVADTVVMRE------RGFGFVTFESQADADAALAEGqQTIDGQRIDVKPAQGKGGGGGGGGGGssggkggstdKIFVGGLPQDCADDKIRSAFACYGNIIDAVTMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5208283_1099192 95 0.267 2.063E-16 90 188 414 47 147 157 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------MSFQAFEDDVKELFNQFGNVVTVRLLT-REDGKSRGLAFVKFSKKSSFNQALElNQSEQFGRPITVEESLGKKQNDGGFKKNNfgdnkggfnkfgtgepakiesptLFIGGLSYQSTKESIADYFSSIGPVMNARIvtdreTGKPRGFGYVEFQDVETAKKA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoi013_1_40cm_1032412.scaffolds.fasta_scaffold223487_1 95 0.310 2.063E-16 87 184 414 48 147 170 +---------------------------------------------------------------------------------------SDAGSTAGVVARSKMESKLYVGNLSYSTTEDDLRNLFLQAGTVASVALIKDRDSGQSKGFAFVEMGNQAEAEKAISmfNGHNMGDRELRVSLARPREERG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712226_582473 95 0.233 2.063E-16 141 259 414 0 136 170 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GRSKGFGFVTFETAAAAADATVNPTiLIDGRQASANLAAKRSAPsaygsigtpalPGDTTLTKLFVRQLDYKTTTETLHKVFSQFGAVKEAVVlqdrnTGQSKGYGFVTFESNEAARAAIAQPQKlIDGRQTFCKLA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001168794725 95 0.357 2.063E-16 104 206 414 60 168 171 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLDENVTDLELYTYFSKFGRVVDKQIKMDPNTQRSRGFGFVTFKQIESVIAVFsSKPHFLHGLKIDCKPAKSKEESQHELQelratNRKVFVSNIPKNSSQAEI--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_273764 95 0.290 2.063E-16 101 191 414 26 118 173 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ETGKLFIGNLPYTVDDGVLRDLFSDFGSIEDCVVINDRDSGRSKGFGFVTYSEQKSADKALDQMgnYEYEGRNLNVKPANPRNSGGGGGGGYR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719350_685830 95 0.437 2.063E-16 136 262 414 0 127 175 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KDQRLGSIQRFCLCQVQRFRSARKSSLTRHMVQDRWCDVKVPESQElKHAKASSSCKIFVARLSETITADDLKEHFEKFGPVTDVYIPKPFRSFAFVTFQESKVAQSLYGKDHIVKGVSVHIGSAQPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>OM-RGC.v1.007917864 95 0.252 2.063E-16 155 262 414 0 114 190 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ESLLTVLQEPQVVDGKTVDCKMCSPKGEVMPPCKPNRIFVGGLPQSADEKQLRELFSRYGAVSEARIMtdkesGRSRGFGYVTFQSPRSCELALANRgaNCIEDKWIEVKRCTEK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719239_1475012 95 0.296 2.063E-16 71 177 414 77 184 193 +-----------------------------------------------------------------------VYFVRSSPTSSPTMAVTTPTMLSITGQKDTQFTKIFVGGLPYHTTDQSLREYFDKFGDIEEAVVITDRQTGKSRGYGFVTMADKMAAERACKEPNpIIDGRKANVNLA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12539|scaffold390981_1|+3|10 95 0.266 2.063E-16 79 185 414 75 183 198 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RSRGFAFVVFEDADALTAATKQDaHVVKGKKVTCKKAETKQ--------GKIYVGKLPAEgVTDEDIQKHFATFGAIAEVVRPidktknDEPKNFCFITFEREETARTLVKEGQTsINGHEVAIKKVTPKE------NNRGGFGGGRGGFGGRGRGFGGAGWGYPDPYAGYGGGYGGGYGGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000315163092 95 0.416 2.063E-16 101 170 414 0 71 249 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGKKLFVGSLSWDTTDQSLQEAFQAFGEVREARVILDRNTGRSRGFGFVTFVRDEDAQTAIQQMNgaMLDGR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_58_1057296.scaffolds.fasta_scaffold4414954_1 95 0.240 2.063E-16 103 243 414 32 197 271 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TTLFLGDLPAFCGEHDLYNLFSTFGELTEIKIMRSDENHRNLSYGFVKFADPMCAERALQASDGIafGGRSLKVGWASYKGKKETRNHNHKdkansssVHISYISYQlknmITEDSLRKLFGKYGTVLDCSIkksyidenINRQCGYGFVHFASDregiESALAAV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719319_930193 95 0.298 2.063E-16 99 221 414 403 526 538 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PPPTGALYVGGIFLDTTESELHQLFSAYGNVKKVEIVLNKKSGVNAGYGFVFFETEEAARRLVQNEaGNIKLKERKLKIALKKTEITKHSPTRTLYVGGITSNTKESDLRQLFSAYGNVRSTKI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001240714930 95 0.287 2.756E-16 104 181 414 1 80 81 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLFVGNLSWSVDGDVLRELFAQVGNVVDARVIKERDSGRSRGFGFVTFETEEGAESAIRdfHGHELNGRPLRIDRALERQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001366519117 95 0.300 2.756E-16 104 191 414 1 90 92 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFVGNLAFKTTETTLRKLFEEHGEVEQCTIIMDRDTGRSKGFGFVVMPTRHNALEAIKAMNGIdlDGRKLNVNESKPKPREEGGRRHAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>16234|Ga0233414_11398165_1|+3|10 95 0.267 2.756E-16 101 184 414 13 98 99 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DNTKLYIGNISWDTTDEGLKEFLSQAGEVVEAKIITDRQTGRAKGFGFATMATEEAAAKAIEELNgqELDGRQIKIAKALPPKENE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5215203_908374 95 0.277 2.756E-16 101 188 414 5 94 101 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSNKVYVGNLPYSFTNEDLRNLFAAFGPPRVVQIVLDRETGRSRGFGFVEMETSEGVQQVIRNLHdtELQGRRLTVNEARDRAPGEARPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000329027300 95 0.250 2.756E-16 101 191 414 1 92 102 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QQNKLYVGNLPFSADEAQLRDLFSAYGEISELAMITDRDTGRSKGFAFITFATQQAAEKALEQdGKDLGGRNMRVNIAQEREKKGGGRGGNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000855934250 95 0.298 2.756E-16 104 198 414 1 96 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLDFNLTEAELQQVFAEYGEVVSVKIVKDRDTGRAKGFGFVEMAEDSDAKTAIEELEgaEIRGRNIRVNEARPKPE-KSDRPSRGGFGGGRP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5260370_23057193 95 0.263 2.756E-16 104 196 414 1 95 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLPYSSTETSMRELFETYGAVTTTKIVTDKFTGSSRGFGFVEMPNNDEAQKAIDELNgkEFDGRKIVVNESRPREDNGNSRPPRRDVGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719282_2279829 95 0.305 2.756E-16 122 224 414 0 106 113 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YFQQFGELTDAIAMVDPASGRPRCFGYVTFKDPAIADQCIAAgPHTLDGHQLDVKEPHQQEAPPKklvfEQPSEKMFVGGIG-DTTKEQLVEYFGKFGGVKDCFIVKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719199_404449 95 0.436 2.756E-16 103 173 414 42 112 115 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKIFVGGLAPETTEADLKDYFSVYGELSDIVVMRDKMTGNGRGFGFVTFQDSKVADSVVAQRHEIRGRTVE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000087071940 95 0.287 2.756E-16 104 181 414 1 80 117 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFVGGFPWATTEEQLKALFGEYGDVKSCKIIFDRETGKSRGIGFVDMPNDEHAQGAMESLNgsEFGGRRLNVTEARPRE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>22520|Ga0209938_1226985_1|+3|10 95 0.268 2.756E-16 97 191 414 22 118 122 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RGKEFCMNIYIGNLSYGTTEEALKAMFDEFGEVENVKIIKDRRSGRSKGFGFLEMPSNSEADQAIKALNGsrLDGFTIKVNPADPGGKKKPKRQSRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>15167|Ga0209591_11285775_1|+2|11 95 0.316 2.756E-16 98 196 414 13 112 122 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EVPAMPSLYVGNLPYTTTDAQLEALFTPFGRVERVQVVFDRESGRSRGFGFVEMPDQLEADAAMERLNGsdMGGRALAVNIAQPRQEAG-PDEPRGGFGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719500_580903 95 0.224 2.756E-16 146 257 414 0 124 125 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGFVTFRSAEMLELCLsTQPHKVDGKTVELERATPKAGAGREDTDpenklmRKLFIGGLDYQTPEEDLKAHFEQFGELVDCVLmkfqdTGRSRGFGFVTFATASQLDTCqAARPHVLGRKTLETK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>26231|Ga0315295_10191518_1|+3|10 95 0.293 2.756E-16 101 191 414 11 102 132 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PDTNLYVGNLPWDTTKEELAARFAQFGEVRGVRIITDKETSRSRGFGFVEFAQAADAQAALvEDGQDFGGRALRVNLANRQSEDRPRSGNGN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719506_1933237 95 0.314 2.756E-16 94 195 414 15 119 134 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+---------------------------------------------------------------------------------KQSLSQNGPASMLNSIRFMGSQSKLFVGGLSYGTDDHSLKDAFSSFGEVVEARVITDRDSGRSRGFGFVSFSSDESASSAVSAMDGqdLQGRNIRVSYATERPSGNRGFG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>RhiMetdeSRZDD1v2_1073273.scaffolds.fasta_scaffold1677327_2 95 0.245 2.756E-16 80 191 414 33 146 148 +--------------------------------------------------------------------------------RDXLXKEREVMNAARAEAGESMXAKLFVGGVSYDATEDELREIFSAHGELKEVHIATDRETGRSKGFAFITFASQKAGLAAIEELNGtkLHGRKITVQESNPSGGRGRKRRPRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719230_1968990 95 0.259 2.756E-16 101 216 414 15 145 149 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QGAKLFIGQLPRGADESSIREITETFGEVVDISIVKDKATGQSKGCAFVKFSAMSFAENCRNTLHGKqpfdEGNPLQVRFANGEAERlgipehilnSTNSKDCKLFVGGLPrnHEFDEDALRTLFSSFGEL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719427_414082 95 0.344 2.756E-16 101 185 414 17 103 155 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ENSKLYVGNLPFIVSKGELEELFSPFGEIDDCIVILDRDTDKSRGFGFVTFKEVEQAEEAMEKMaeYECHGRALNVRKANPRREGGE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3954465_15513411 95 0.275 2.756E-16 93 188 414 27 124 155 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174 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPHGITEAEFRAYFSQYGELEDCVVMYDRATGKPRGFGFITYKDERSIDFVMQDKlqHKIRNKWIECKRATPKAAGNEGPSN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5256712_4506026 95 0.301 2.756E-16 77 190 414 54 169 194 +-----------------------------------------------------------------------------PRLRSFFRHLGRADSAEDVARGHVMAHKLFVGGLPFSVTSERLREVFAAAGVVESATVVTDTGTGRSRGFGFVEMATAEEAQEAVTRFNGrdLDGRQVKVELAKSPEQSGGGGRPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711988_901745 95 0.357 2.756E-16 99 195 414 21 118 270 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PQDANKLFVGGLHPKTTQEDLKEYFSSFGTVDDVTIMIDNATQKPRGFGFITFTSENVAKMCLEQTqHTILGKSVDVKTAVLRNRTVLNPQPMQNFIG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000515956907 95 0.233 2.756E-16 101 263 414 55 247 284 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PTQTVYVKNLNFNTTEDALITHVQQLGfplgkELRTASLPKNtRVSGQNAGYGFVEFCNVDIANRgVIKiSGSKLDGHVLDAKLsgkqlgaqqnrvkrgaSSASKDTTSSYKGSKLIVRNVAFQATEKEIRSLFMNFGDVKRVRIPkkmgGSHRGFAFVDFTTHAEAAAAVnaLANTHLYGRHLVIEWAKEDD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>HubBroStandDraft_4_1064222.scaffolds.fasta_scaffold4833235_1 95 0.268 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+-----------------------------------------------------------------------------------------APSFVPGTRRTCMRKNLFVGNLPFTVSADDLREVFEKFGEVAATQVITDRGTGQSKGFGFVEMKD--GADEAIANLHgaEWQGRTLTVNEAKPREERP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690606_32056137 94 0.293 3.682E-16 77 168 414 7 98 102 +-----------------------------------------------------------------------------PRGLVARRERPVTPRSHEFQRERKLSKKLFVGGLAWATTQESLSQAFGQFGPVVEAQVIMDRETGRSRGFGFVTFENPSDADQAMRSMDGAD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719309_1607162 94 0.485 3.682E-16 97 197 414 1 100 103 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DDPDQTIDLILLGLPWKTTEEDIEEYFEPFGEVLMVELKRKPN-GESKGFGFIRFADKDVERRVVMQRHMIENRWVELKVPESAEGKGRHSSSCKVFVGGV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5688500_17980100 94 0.296 3.682E-16 92 180 414 14 104 105 +--------------------------------------------------------------------------------------------APRGPKGSYGPRKLFVGGLSWHIGSDDLKAVFVQFGAVTEAKVVTDRATGRSRGFGFVTFENPLDAAAAADKMNgaELDGRRLKVNPEDSR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5271154_1678312 94 0.278 3.682E-16 101 195 414 0 95 105 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNKKLYVGNLSYDCTQEDLEGLFAQFGKVEEVHLARDKASGRARGFGFITMEKDEDAQKAMQDLHdtEFLGRKLMVKEAF-REEDKPARPSNNRFAG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719333_1453074 94 0.322 3.682E-16 96 183 414 4 93 105 +------------------------------------------------------------------------------------------------KKKMAETSRIYVGNLPYELSDQDVAEYFGKHGSVTSSQVITDRETGRSRGFAFVEFATAEEAETVIKAENgtEMEGRALKVNEAKPRGAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712030_291634 94 0.361 3.682E-16 115 221 414 0 100 106 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+>ERR1719341_1684209 93 0.250 1.170E-15 0 175 414 27 192 416 +MSAWVPVSTSELAQLVEIETEEDGKLPLTSITLYFPDATALKFCSPGNHAFcEEVPVEGGNFLAPQGGWGVATRYIAVSSTSDIKKHEP--------KKGDVECKDMVLFDMKLNTTEAQVRECFKDV-EVLGVHMMqsRDNLTK----YAFIKFSDWEVAKVLGRQKHIINGGPCSLR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001335025120 93 0.256 1.562E-15 104 183 414 1 80 81 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIFVGNLSWDTEEEDLRDLFNTYGEVTKCTIPLERDSGRKRGFGFVEMSD--GAEKAIEALNdaEVEGRKLVVNESRPRESR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000670978747 93 0.325 1.562E-15 101 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229 238 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DAYMPKDQTTKQHRGIGFVTYENAESVDKVMSESHELAGSTIAVDRATPKEETGkvwettfpgasgvfnsyvntaqygtfdmsafrgydfpgsvaigntyednygrtnlwpagppasqirgpspglsvidssamkygstdsnfaPSRVGRKIFVGRIPVEATAEDLQLYFGQFGQVLDVYLPKDakkisHRGFGFVTFAEESTAEHVAQKTHEILGHRIAVDRAAPLDE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_58_1057296.scaffolds.fasta_scaffold523702_1 92 0.227 2.783E-15 86 184 414 164 264 293 +--------------------------------------------------------------------------------------DSGRSGFTRSRGSGRNRCKIFVGSLAWETTDENLRRAFSRCGDIVEANVVKDHATGRSRGFGFITFADEESARTAVKTMdgNIVEARQVKVNFADQGRRRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001019262758 91 0.305 3.714E-15 101 193 414 0 93 94 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MAKTLYVGNLAWRTTEQMLTDFFSSYTQVLSVRIISDRETGRSRGFGFVEVPD-EDVERVINEINgqELDGRPLNVKEAQPRPQPAGRGPRERRF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712039_161536 91 0.291 3.714E-15 102 203 414 1 102 103 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PGKLFIGGLSEETDDDSLAIYLSQFGDLVHASVCLDKATGDSRGFGFAEFEEPGIADQVLEMPeHIIDGKTIFMRKAGGRKNSHSEEG-CKIFIGSLAYETTE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712224_381706 91 0.312 3.714E-15 103 180 414 23 102 105 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSMFVGNFPWSTTEQDLMDYFSQIGPIQNCRIVLDRETGRSRGFGFIDFVNEADVHTAIQQCSGadFNGRQIRCDVSQKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719262_487257 91 0.225 3.714E-15 98 207 414 6 108 109 +--------------------------------------------------------------------------------------------------PPKRSRKLFVGNVAKSATQEEFQAHFQQFGELKDCVLMKHRNDPEHRGFGFVQYVDPEVSDTVLAQTHELHSRTLNVNVAKGR--------TKKYFVGGLARDrTTTESMR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5712691_12015130 91 0.255 3.714E-15 97 184 414 27 116 119 +-------------------------------------------------------------------------------------------------PKRRSMKNIFVGNIGYNTSEEALRQLFAAFGPVNRVKIMMDDYTGKSRGFAFVEMANAEDGDKAIATLNGtlLNERALNVNEARPKKEQE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719195_601603 91 0.274 3.714E-15 113 224 414 0 117 120 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------NTPSEALSDYFSKFGAVADAVVMRD------RGFGFVTFESPDAAAAALaEQKATIEGQVIDIRPTNAKGGGkggkggfgkdsSANQQTDKVFVGGLPQDCEDEKVRNYFAQYGPIAEAVVMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719361_3040610 91 0.208 3.714E-15 101 218 414 9 125 130 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PAKKIFVGGIPKTLSDNEFTDHFKSFGDVSDIVLMRYPGNSQNRGFGFVKYNFKSIADHVLSITHKLgtNDHEVTVNYSKTKE---PSVKEKRFFVGGIPRTLTEEAYKAYFATFGVVKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001323276117 91 0.310 3.714E-15 104 188 414 2 88 132 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGSLAWATNDDSLKEFFSQFGEISSASVVTDRESHRSRGFGFVEFANDEDADKAVagADGKDLDGRQINVSVAQSAGPKEGGRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>W1NUD7 91 0.306 3.714E-15 104 189 414 35 122 135 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFVGGLSFYTTENALSEAFSQFGQVIEAKIIMDRVSDRSKGFGFVTYASEDEAQRAITEMNGkvLNGRIIFVDTAKSKARFDDGGRP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719193_492428 91 0.285 3.714E-15 156 267 414 1 126 162 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DAMEVLHKTHELKNSFLNVTLAEPKDAKTPAgqmsnnapgnnwatGPSMKLFVGRLPSGMVQHELKEYFSSYGMLTDVFVPSPPRGFGFVTYASRSDAMRVLRMNHNLNGAQLNVSPAEPKDKDAQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>EndMetStandDraft_5_1072996.scaffolds.fasta_scaffold7916569_1 91 0.215 3.714E-15 104 233 414 2 168 169 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIWVGDLLPECEDQDLFSYFSKFGQVREANVEREKRTHLSRGFGFLKMGSQMLVDKVLKSSHKIWEHPIEVKLASDVKIEPEPVPewekkpkqekpaedkeksgqkraadfeegkeePGKFFVAGLPDGTDEATLQAYFESFGEVKEASIakddrAGKLKNYGFIRM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001107697417 91 0.241 3.714E-15 120 251 414 1 170 171 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KDLFAPVAHVHYARVLKDTETGRSRGKAFVHFSSEEDRQRALEQLNNIeyEGRQltmlaVNVDSApftprggasgehreqryqnreqsrNQTQRQRPSNQGRQLFVGRIPREADEGALRQFLGQVGTVQYLRIvrdreSGQSRGFGFVCYSSTEEADRALQElsGAEFEG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719215_2472284 91 0.250 3.714E-15 101 221 414 16 167 171 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PSGRLFIGGLAPDAEDDDLRKVFSQYGRLLEARVIKDKNTGRSRNFGFVMLADSTKQDDALKSIHVVAGRRVTVKLhqedgghghgggdrsgygdrggrgggggrgDRGGGGRGGDDKHRKVFIGRLEENMSQEQIKDAFaNKFGRVSDVWL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719242_1677767 91 0.293 3.714E-15 103 216 414 59 170 173 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNLIVNYLPNDWKEKKLLELFSRYGEVLSVIVIRDPRTRLSREYGFVKFCIESEAVLAVQMLDGriICGKQLKVDFAKPRRSRA----KANLFVSRFPANWTSKHLEILFCPFGAI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719424_1575114 91 0.231 3.714E-15 101 193 414 7 101 218 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DQRKIFIGGLPHEADQETIREDFGRYGEIEDVYLPRDRETGKPKGFGFVTYRDHRDASEAATAMGGRDyrGRSITCNIARPREENKSAPEGRGGY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>18093|scaffold129914_3|-1217|00 91 0.244 3.714E-15 97 184 414 117 206 219 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RPEERTRQIFIGGLAYTTTRDEVRQLFAAYGEVQHVYLITERETGRSRGFGFVEMLDGAEAQAAIEGLHGtrLGGRTLTVSEARQQEEHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APDOM4702015118_1054815.scaffolds.fasta_scaffold3388396_1 91 0.234 3.714E-15 64 182 414 57 184 248 +----------------------------------------------------------------HDGLGEKHQISFNSQGGKNSITNSSQPVSTTSNSYANSQAKIFVGGISWSTNEESLQSYFEQFGPVDSVEIMRDRVTGNPRGFAFVIFQSDETVDRILAsaaaspgstAKHVIDCKLVDVKRAHARGS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712048_293218 91 0.246 3.714E-15 44 180 414 50 203 321 +--------------------------------------------NFERKPIRSIQSMNSAYRPPYNPqfqqQRNHHYVPKETPSPKpiesLAATKIDNPNPESQNQQIIETNKLFVGGLPVKTTEADLNEYFSKYGPIENINIMVDQQTSRPRGFGFITFSDAKDARKCLDAtnsadsensGHKLHDKIIDVKTAVSK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A118K4K8 91 0.296 3.714E-15 103 214 414 33 144 358 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKVFVGGLAWETQSETMRQYFDQFGEIMEAVVITDKNTGRSKGYGFVTFRDPESAKRAcVDSAPVIDGRRANCNLASLGRPRHslpfGHIRSPTPFAGGMP------AVRgPYFGNYG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_36_1057302.scaffolds.fasta_scaffold267226_1 91 0.254 3.714E-15 102 246 414 114 270 394 +------------------------------------------------------------------------------------------------------GKRIHVGNLligkDKYTNEDTLLEYFSQYGEVENLEFFRRKFTDLPRGFAFVTFRHVESARKVLadAESHVIDGQNVTIALPMKTEKRvVRGKTDLTVVVSKVVKDTSKQAIEEHFSQFGKVERVILAQKdpsdeNLSSYYVVFSSLHGAKKALEQP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>J4D8W7 91 0.187 3.714E-15 85 260 414 95 388 395 +-------------------------------------------------------------------------------------ENNAEEAKESVDDEKINAHRIFITRIPFDATKDDLEEYFKKFGTVYDAYCPKQSNySTLNKGFGFISFDSEETIQKVFEtSPHVIMGREVIVDRATGTKfhtgagagnangsaaganqlKRPPPPPPRryreyqdnhrfkrhfeshmeypnkyprrdrhydrdvynhnippyrqnsatfdpnksvsyvfsasrtenrnheqyrtyqstpktrernapKLFVGRIGYDTTVQTLRSYFSQFGDVVDVYIPRdaqtqKSKGFGFLTFANKNSIHTVLDPSlkHVLEGRDIIVDYAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000559906182 91 0.292 3.714E-15 104 190 414 4 92 453 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGNLDFATTHEDLRKLFQPFGDVQGINIRKDRKTGRPRGFAFVTFDDEASATRAISEMHlkEHQGRVLTVKPQLARGTGPAPATDN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1B8G7N7 91 0.201 3.714E-15 87 243 414 193 384 526 +---------------------------------------------------------------------------------------EDASAPQKPEQEKRSEHGIWVGNLPWSVSKEDLKSFLINQGPmpeeaITRIHMPspddkrsanqvesRFTRTQHNKGFAYVDFSTAEHTLAAvalseellggrrvlIKNNKSFEGRPLVAKDAAAKKETKAP--SKRIFLGNLRFDTTEESLKEHFERCGPIETCMVatfedSGKCKGYAWITFADLEASARAV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000991139868 91 0.415 4.956E-15 104 178 414 3 79 81 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGGLAWATTESSLRAACAAYGEIEDVKVITDRDTGRSKGFGFVTFTTDEAAAKCKSQMDGqiVDGRAVKVDFPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A2H0XET4 91 0.301 4.956E-15 101 181 414 0 82 84 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSKKLYVGNLPFRFTNEDIKTTFAEVGNVVDAVVITDKMTKRSRGFGFVEFSTEEEAQKALADFNGkdLEGRKLVVDMARERQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>G7SQ96 91 0.295 4.956E-15 101 184 414 1 88 89 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DNTKLYVGNLSYEMTEQELKEHFESIGEVTHAKIIFDESTsnKRSKGFGFIEMSNEENAKKAIEKLNgtEFMGRNIIVSVARPRAKRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001372805896 91 0.288 4.956E-15 101 188 414 0 89 91 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNTKLFVGNLSFKLTEQELQDLFSRSGAVVSVAMPVDRETGRKRGFAFVEMETTDGAQAAISEFNGqsIDGRQIVVNESRPREGAGSGYR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0N0D0X5 91 0.255 4.956E-15 104 191 414 1 90 92 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLSYDITQDELQQLFAEHGSVVNVNIIKDRDTGNSKGFGFVEMENQSDGENAIKELDGqsVKGRNIKVNQARPRNDRSQQPRRRN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719245_2750863 91 0.313 4.956E-15 126 221 414 2 100 101 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YGEIEDCIVMKDPGTKKSRGFGFVTFKEVSELDEAQRNrPHIIDEKETETKRAMPRGEDntANHQSVTKMFIGGIKEDTTEDHIHEVFADFGSLKSVEI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001011996246 91 0.280 4.956E-15 104 190 414 1 89 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVANLSFRIQDENLREIFEDYGTVSSAKVVKDRETGKSRGFGFVEMPDDTQAKSAIEQLNdaEWDGKILKITEARPKAEGDNQFKSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000951272544 91 0.277 4.956E-15 101 188 414 0 89 103 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSKKLYVGNMPYHTTHEELEELFSAHGNVTEAKIIKDQISNRSKGFGFVSYEDEESGQSAIDALNgkEFNGRTLKVNVAEDKNRAGSSPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>22549|Ga0209957_1052708_1|+1|10 91 0.313 4.956E-15 104 184 414 20 102 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLAWKTSSNDLKELFQNFGEVEKAFIVRDRKTKRSRGFGFVEMASDEQAQAAIDNLNntIFLERTIIVNEAKPKNNDD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9293|scaffold2607270_1|-7|00 91 0.263 4.956E-15 103 191 414 3 93 104 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSIYIGNLPYSMSEDTLRRLFEQFGIVMRVRIVVDFEIGRSKGFGFVEMSSAADAEKAIDGINqrMVEGRTLWVSWAKPKESRAPQPTTGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>18645|scaffold160621_2|-482|00 91 0.296 4.956E-15 101 189 414 0 90 105 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------PAEKSPSKFFVGGLHRNVADKEFREYFAQFGELVDAFIMYNQHLKRSRGFGFVTFVYPEDARRCLQIQHTIKGKVVEIKKAIPRDAMPRGVKGKR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719263_1619116 91 0.300 4.956E-15 104 191 414 1 90 113 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGGLPPSVDTEQLRTYFSKFGAIQDVIVMVDAANQRSRGFGFVAFSDSAAVELCMEtyNTNEIAGKWIEVKRCIPQDKMGPGEKSSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001259521133 91 0.300 4.956E-15 101 188 414 6 95 114 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------MESKLFVRNFPFDVLKSDLESLFSSAGVVVDVQIPTDRETGRPRGFAFIEMGSVEEAQKAISTLNNqdFKGRPLSVSVAQPRPERPSRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719334_1333512 91 0.274 4.956E-15 155 275 414 1 130 135 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EMVDAVQAArPHELDGRKVHTKRAVPKEkssGNEPKEGVKKLFVGKCG-SLTEEDLREYFGQYGVIEDVYMvpdkaTGKSKGIAFVTFDDYDPVDKyIIEDSHYVNETKVNVEKALPKEATQGGGGRGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719387_2473249 91 0.282 4.956E-15 101 183 414 15 99 139 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MAMKLYVGNLTYDTTDDELRQAFQGFGEIEFSKINIDADTGRPKGFGFVTFMTQESGQAALAQMNgaELKGRTIKVNHATERRDG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000629808684 91 0.279 4.956E-15 100 183 414 55 140 142 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PDEDKLYVGNLPWSVDDGELAALFSAMGAVHSARVITDRETGRSRGFGFVELADEALAGKAVGQLdgHDLNGRQLTVNAARPRATR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690606_27798692 91 0.267 4.956E-15 100 205 414 30 141 142 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+------------------------------------------------------------------------------------------SPRIRFSVQRKMSHKLFVARLPWTVGRDSLRSYFSKFGEVTDAVVITDRGTGRSKGFGFVTLGPGSNIDAVINEQHEMEGRAVIVSKAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719373_1172435 89 0.254 1.569E-14 76 184 414 34 147 153 +----------------------------------------------------------------------------RGRDRDRDRDRRPARSEhywKKPTREPAPGCKLFVGNLSWQTEERKLEDVFAKYGRIIDVYVPRDVHTQKPRGFAFISFDDPRDAYEAQRELDGtdIDGRRIVCNPPAVRRDRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>D7KGG0 89 0.314 1.569E-14 102 188 414 34 122 158 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PSKLFVGGLSPATDVELLKEAFGSFGKIVDAVVVLDRESGLSRGFGFVTYDSIEDANNAMQCMHnkELDGRIIGVSPADSGGGGGSGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711881_13310 89 0.255 1.569E-14 141 263 414 2 134 162 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKHRGYGFIQFKTVNATKVVVNMPHFICNKPIDlhytaraldmLKAGIGTECIQLDNIPTKLFIGRLAQGVTTQDLHDTFIKYGPLKDVYIPPGGKGFGFVTFSSVAAAYKAMCETHQLKGEYLVLNTANSKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5262249_4323464 89 0.288 1.569E-14 104 191 414 0 87 163 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLPYDTTADELREMFSAYGRVLSAVIATDRETGQSRGFGFVELA--EGAEEAIQALNraQFGGGSLALNQAKPREGPAGGRQSRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001199253128 89 0.284 1.569E-14 99 184 414 34 121 167 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PAPSTKLFVGKLASSTSEEDLRAYFSHYGEIKDVYIPKDGQTGQGRGFGFVKFVLADDAERAVASLNakMFNGKKLSVDTAKTRTEAE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719356_345837 89 0.275 1.569E-14 78 191 414 19 134 198 +------------------------------------------------------------------------------KGNRRRSGKNDESAKKEASEFGPPGCNLFVFHLPDDWTDDDLHEYFAPHGTVISAKVMKELGTGRSRGFGFVSYEDRVSAATAIKKMQGykILGKRLKVEFKKGEQESNPMDTGDK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719334_2156420 89 0.329 1.569E-14 101 191 414 6 96 203 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DTNKIFVGGIPRQVTEDEFRKCFSQYGEVQFIQLMIDHVTQQSRGFGFVQFSNQKDYEQVLKTDVVLCGRNLDCKKALSREEQSGMRRGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000660453257 89 0.293 1.569E-14 102 191 414 13 104 214 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PMKLLIRNLARSTTEADLLELFESYGSVQYCNLVMDSVTGGSKGFGFVEMTTAEEAEAAINRFNgsELDGRSLRVNLARPQENRGPRNNRNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712147_300422 89 0.242 1.569E-14 83 235 414 44 215 218 +-----------------------------------------------------------------------------------KIEPKIEIKTEPTKNEGPTGTTLFVKNLSFKSDEEKLQILFHRFSP-TNVQISRRLEKGKylSMGYGFITVDSQRIAMEIIKTLQgvELDGHRLELKISNRKGSetlgtqrkeaknQIQPENSSKLIVRNVPFQCTADEIRSLFSTFGQVKNARTPkkhsGQHRGFCFVEMGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719247_1416641 89 0.421 1.569E-14 101 176 414 141 215 221 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DSGKLFVGGLNSATTGDKLRDHFSHFGKVFSASVIKDPATKQSRGFGFVEFQDGISA-AVLEADHMIDGRKCSVKP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>HubBroStandDraft_6_1064221.scaffolds.fasta_scaffold220089_1 89 0.617 1.569E-14 189 277 414 11 99 230 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PSKVFVGRCTEDITADDLREYFSKFGEVTDVFIPKPFRAFSFVTFLDPDVAQSLCGEDHIVKGNSVFVSTAAPKSQDNKNYHHNNSGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719154_703344 89 0.245 1.569E-14 139 283 414 0 156 260 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QTQASKGIGFVTYDNSAAVEEALvARPHELDSRTVEIKRAIPREENTEtaHQRTKKLFIGGLPSNVVEDDITTYLNDtyrgKGEVVKCELirnkeTNEVRGFGFLEVSTEDMADLIIIKDpkPVIAGKKVEIKKCEDR--SQGGGGRGGRGGGRGGGRG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SoiMethySBSTD1v2_1073268.scaffolds.fasta_scaffold3457290_2 89 0.202 1.569E-14 105 243 414 44 254 261 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+--------------------------------------------------------------------GDSLSASPNAKARNPDVLAEKPANVKKGTAQGSKPGRIFVARIPSRVSEEDLREHFEMFGEVEDAYRPRDFAKNTYRGIGFVTFVDPAAVDRVIATKHTLGGAEVVVDRATPKElsssmerqagaeetlrrypsveamannypamdlrgffneqfdanslnsfpqmatypnsignNRGPPsnfsddflgdvglagfaselydsntsmiaaaavmkqpstpgapdgkavkggsprlsptkneknhktmtdnfahvrkvRSGPRIFVGKISKDTVEQDLADYFTQFGFVMDVYIPRsrenkkEHRGFGFVTFETEASIKRAISQGtHNLKGAVLAIDVAVP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1V8T633 89 0.214 1.569E-14 105 243 414 103 279 433 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------PGNETQIFVGGLPNNCTEHELKEYFNKFGAVSQADVKIDKNTGRSRCFGFVRFESADVVDHVVEkyKDHHIDGKWVEVRPAGAKRKNDDGPPRSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719453_2297644 89 0.363 2.092E-14 112 188 414 0 76 103 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------YDSTVESLKEYFGKFGEIEECIIMTDSATGKSRGFGFVIYENTEAAEAAVGKDHMVDGKNVEVKRAEPKRSDGGPRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12243|scaffold484263_2|-222|00 89 0.258 2.092E-14 105 191 414 3 91 105 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVGNIGFDVTEAELKKFFDQFGEIETIKLITDRETGRTRGFGFVKYVAQTSAEKAIKEANgaMLSGRNLKVNLSQPRSKDGGGSRGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3989337_2801248 89 0.275 2.092E-14 90 185 414 8 105 108 +------------------------------------------------------------------------------------------PSRVPLREDFMGTTKLYVGNLSYETSEASLRRLFERHGDVASVTVMIDRASGRSRGFAFVEMGTPDQAQAATSALDGaqLDGRSLKLDEPRAREPQAP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000376068349 89 0.333 2.092E-14 101 185 414 0 86 108 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNTRLYVGSLPYAATELDLKEIFEAYGRVVYVRILKNSETQLSRGFGFVEMSTTEEAQNAISSLDgrEVDGRQIKVNEARPKEKREE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719456_602065 89 0.259 2.092E-14 114 219 414 0 106 109 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VSDEMLHAAFAPHGKILTCKVMLDIHTGISRGFGFVLFESAEEGARAMTALHGIqlGQKQIYVSVAMTNGLSG-LQQTPKLYVRNVPKALSLDFLRSHFSQFGEIVRI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A078GUQ8 89 0.316 2.092E-14 103 199 414 8 105 112 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKIYVAGLPWITKTESLRNYFEQFGEIVYANVVCDRATKRSKGFGFITFKEAESANRACEDPNpTIDGRKTSCKLAYLGARVHNNQSNENGLVSIFPY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711981_1211243 89 0.258 2.092E-14 151 257 414 0 115 117 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FKDKDAYTKAVTTPQTIKGRRIECKPALSKQKakiKSTDEKGKKLFIGGLSLDTTEDELIQYFQNFGEIYKAYLiydknTNTSRGFGFVEFRNFTSAERVIKDGtHFIKGKEIECK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712224_643134 89 0.285 2.092E-14 102 204 414 3 100 126 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PCKLFVGNLPFSMTPERLATMFKPHGEVIGAKLVEDRTTGKKKGFGFITFQSIESVEPAIAQMHNADceGRKLTVKMATARGDKSENQPVK-------PPTRTED----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719387_344132 89 0.339 2.092E-14 81 184 414 12 117 128 +---------------------------------------------------------------------------------KGKDKSASAMALPPSPAPTGQTNKIFVGGLPKDCDDGALQAYFSSFGTVTKQEVKIDLMTGNPRGFGFVEFDSPDAVAKVLASYsaHMINGKWVEVKEAVAKGKGD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719428_209413 89 0.240 2.092E-14 141 251 414 0 132 145 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKSKGFGFIDFERVSDAEDCLQTMNGIEiaGRTCRLDRSEKGQdyaagkgggggakRSQNSQQPNKLFVGRLAVDVEEEDIRKAFEKAGEITNVKIikdreSGECKGYGFIEFAQASQAEDALKdfNGVEIKG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711953_1394684 89 0.241 2.092E-14 104 188 414 2 88 146 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLYVGNFPFSTQEHDLQNFFEGIGEITNIKLILDRDTGRPRGFGFITFADEACIQMAIDKHNGedFNGRPLRLDRAEQRQNRGGDGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A178UJY3 89 0.271 2.092E-14 87 191 414 39 145 156 +---------------------------------------------------------------------------------------PQAESQTPARPQAEPSTNLFVSGLSKRTTSEGLRTAFAQFGEVADAKVVTDRVSGYSKGFGFVRYATLEDSAKGIAGMDGkfLDGWVIFAEYARPREQSQSYQPQNN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719235_342424 89 0.280 2.092E-14 65 182 414 36 160 163 +-----------------------------------------------------------------DGEHHLVEGCRLRVQRKQDGNRAAGGQPGRSRRDVPKkpthiPAKIFVGGLPQSCHTESLQDYFRKFGNVEECVSMVDAKTGRHRGFGYVIFTDSESVDKVMEAykDHEINGKWVEVKRCIPQGQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000877314368 89 0.312 2.092E-14 97 191 414 35 130 166 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSKKLFVGGLNFKTSEEGLRSIFGAIGAIEEVKIVTDYETGRCKGFGFVTFADPAHASEAISQfdGQEVDGRRVKVSEAIDNRKRGPRDSRSQSF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5579871_168630 89 0.288 2.790E-14 104 191 414 1 90 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NMYVSNLSFHTTDADLKNLFMEFGEVSSAKVITDKESGRSRGFGFVEMSDETAAKNAMQALQgkEIAGRSLGVSVARQREERSRNSHSGN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1700687_5195316 89 0.303 2.790E-14 98 184 414 11 99 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EVRPVTNVFVSNFPFTVTDADLKECFEQFGAVENAQVIRDRETGHSRGSGFVLMKDDREALLAIQELNGrdWDGRRIQVNVARERASRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1044071_5977121 89 0.294 2.790E-14 91 190 414 2 102 104 +-------------------------------------------------------------------------------------------PRVEEKESVLMHAKLFVGNLPWSIDDAQLEELFQAHGEVTAARVITDRDSGRSRGFGFVEIDAPDIA-AVISALNGrdIDGRPLRVGEAEDRRGSGGSRRDR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719318_1129144 89 0.325 2.790E-14 104 184 414 21 103 107 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIYVGNLSFEATEQDLKDAFGAHGQVETATIVKDTFSGRSRGFGFVEMSNEAEARTAISTLNgkEIKGRTVKVNEAISKSDGRRGEGGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001019023682 89 0.266 2.790E-14 104 191 414 1 90 109 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVANLHYRLNDEDLHQIFSEFGQVTSAKIIKDHETGRSRGFGFVEMPNQEEGTLAMERLNgsEVEGKQLMVNEARPKSPSNGGGGFRN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR550519_710288 89 0.547 2.790E-14 86 180 414 10 104 109 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------SVNLFIGNLSRDVTEAELRALFEPFGKLASVSLAKDKFSGVSKGFGFVEMPDKSEAEAAIAGLHrtQLKGQSMDITEARPREQRKQGKGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719453_781402 89 0.285 2.790E-14 77 177 414 26 130 131 +-----------------------------------------------------------------------------PKKQKKTEEGDEEEPEKKGGGDDEDPtagRKCFVGGLPWSTDEETIKKDFAECGEIEDVHLPKDYDSGQIKGFGFVTFTTKEGAKKLCEwNEQDYNGRWLKVNIA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5262249_61823923 89 0.293 2.790E-14 101 190 414 0 91 133 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176 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PQPGKLFVGGLSFTTTDEALNDYFSTFGPIKEAIVMRNPSSKRSRGFGFVTYVETSSAFACVdfAGTHKVEEQEVDVKHATPR--VDPPATETKV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_999120 87 0.387 8.808E-14 104 195 414 93 177 178 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGGLPRDTTSAHMKEYFGTFGKVADAIIMKDFETGKPRGFGFVLFEEQDTVEKVLaAEKHELNGGKVEPKKCEKKE--------GKMFVG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>3300023187.a:Ga0256613_1030520_23 87 0.305 8.808E-14 104 196 414 1 94 240 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+>ERR1719240_1147143 87 0.166 1.174E-13 104 259 414 20 308 346 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPKDCDEATIHQYFSAFGALSNVEVKRDLTKGQTRGFAFVTFESWEAYGLVLAtyTEHRIGDKWVEVKQAIPLDKGKGKgdgtlvppmplwavcgkgscvgratppaqlgaaagakggsacfaskalqhtpmrsvskgvsakcfggkrfsvwpcnagfskgsdsagniqeakldeyigtgailphngvssmflanarscndssvVESHKVFVGHLPKNCDEDTLLLYFSNFGTVTEILVKRDPagqtRGFCFVSFDSPEPVAELLATraLNNINGHWIDVKQA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000453631175 87 0.260 1.174E-13 102 191 414 86 177 528 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSAKLFVGNLASSTTSDEIRRLFAAIGSVQSCNLITDRAIGQSEGFGFVEMDSVESAEAAKEELNGLDvhGRILTVKDAKPLTKSRERVSSRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719375_964449 85 0.248 3.697E-13 136 262 414 0 130 150 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TDKVTGKTRNFGFVTMADSFAKDVIIAADHIIKGKLAGIRL--DKQRPDVNDVRKQIFIGNLEPTIEPDAVKEVLSQFGEVIDVHCPkhadsGNRKNFGFVTFREPSSYDACLAtKECVVNGCTLELRPAQGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719418_316580 85 0.267 3.697E-13 145 296 414 0 150 154 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFAFLLYKEVESIDNAADgTEHKLKGKSITVKKADVK--------PGKIYVGKLPDSgLNEDDVRADLEQYGAITEVVRPidksknNEPKNFCFVTFEKERIAKKLIQTGnININGHKLMVKDVTP--NPRDPNSRGGGRGGSRGGYGQQSFGGGGYGGRG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MEHZ01.2.fsa_nt_MEHZ010487408.1_2 85 0.259 3.697E-13 141 258 414 0 126 158 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GLSKCYAFIHTSDKRTYHRILNQKHYIQGRMIDCKDGFSREENPqlfEKMNSKKFFVGGLSVATADKNLHEYFSRFGSVFKAYVivdpnTNRSKRFGFVIMDSEQGVDTVMNGGkHTINGSIVNCKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>21983|scaffold3671410_1|+1|11 85 0.228 3.697E-13 104 200 414 29 133 164 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIFVGNLPYNTTEQQLQSVLGAAGDIVNVAIPIDRATGRPRGFAFVEYASEAQATQAISKFDGqdFEGRPLRVNMAEDRPPRrpfgagPPPGGPRPQFANNFPDD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719469_819653 85 0.254 3.697E-13 90 185 414 3 104 168 +------------------------------------------------------------------------------------------PGERRASAREQPSNKIFVGGLAQSVTTDRLKEYFAGYGPIVDAVVMLDRRTNRSRGFGFVRFSPGMQGGAALDAvmmhfrSHRLAGKWIEVKRATPASSSHP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719273_1487099 85 0.268 3.697E-13 87 200 414 53 170 171 +---------------------------------------------------------------------------------------SETSDAGETEEEEEETMKIFIGGLPRSYDEDVIRGLFSPHGEVLKIFVPTDRETGQPRGFAFLEME-KESGVKATEALNqiTIEDRVIKCNEQLSKEElakKKETEEGVKIYVGNVSFE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719291_692143 85 0.287 3.697E-13 90 188 414 5 105 173 +------------------------------------------------------------------------------------------PMGGRGPPDVGGLISLKVDNFPFNTSTEDLREMFAKYGEVADCYIPRDHATGQSRGFGFVRFSEEADADAAIRgcDRKEIQGRELRVQVAQHARPALQPRG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719410_224508 85 0.308 3.697E-13 91 210 414 61 173 175 +-------------------------------------------------------------------------------------------SRSPAKRAPRGPVKLFVGGLPPEAQDQDLRDHFKQYGELLEAQVICDRATGRSRNFGFIMLHEDSRKEAALRDNHNVRGKRVSVRLHQDMEPVGNSY-------GRTEESSREPELRKVF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719282_249170 85 0.292 3.697E-13 101 200 414 12 117 188 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EPGKVFVGGLPQQADEAALTTYFSNFGTVIGVEVKRDQLTGNSRGFGFVSLDSQEAVQAVLgfTGQHIIGGKWVEVKQAEERRGNPSGmnfiAGNNNTLTGMLPSS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5579872_3393630 85 0.241 3.697E-13 103 191 414 94 184 193 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNVFVGNLDITVTEQQLRELFAAHGTVENIAMVRNRDTGEPRGMAFVEMAQATEAQAAISALNgtMLNGRPINVNEARPKRDQDPTRDAGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1740137_25821 85 0.265 3.697E-13 145 277 414 0 142 193 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFGFVRYVKASMVDAAMAArPHSLAGRTLEPHRSAPKeysEKMESHHTVNEIYVGKMVAEISEEDLRKYFGLYGNIEKVSIPkgkedGELRGFAVVTFDDYDPVDvTCYKKVHYINEKRVFISKFINKKDMEELKRRYGGGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>CryBogDrversion2_3_1035228.scaffolds.fasta_scaffold98195_1 85 0.290 3.697E-13 101 184 414 55 140 209 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DGCKLFVSSLSYSTTAEVLKRLFESVGKVADCHVAKDRESGESRGFAFVTMAREADALLALEefNGHELDGREMKVNVANAGGSGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719397_2290893 85 0.256 3.697E-13 98 224 414 98 241 243 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EAEEGSTLFVKNLNFITTNDGMVEHFTACGNVHTATVatKKDPKTGdlLSMGFGFVTYLKKISAEKALKTLQhtKLDGHCLELKRSNRASTNMEsgvnhpkkndlGKPSTKLLVRNIPFQAKKEEIVQLFRTFGELTGVRLPRK--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5262249_37102767 85 0.282 3.697E-13 102 186 414 29 113 260 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SRNFYVSNLSHQTTSEDLRAQFEPFGEVVDAQVALNRNSGRSRGFGFVEMVSGGDQALAALNGHPLHGHNLVVRETRPRDERPGP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712137_267696 85 0.279 3.697E-13 78 163 414 67 152 261 +------------------------------------------------------------------------------RDSRSYRDRDSRGSRDSREDSQGKGNTLYCGGLPFGITEEELRKKFEPFGEISYCKIPCDPHTRQGRGFGFVAFQTAESADNAIEN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719267_133925 85 0.320 3.697E-13 78 180 414 58 163 299 +------------------------------------------------------------------------------RGLRDKQQVPPKSETIETDNHEGAPCKLFLGGLSATTTADDLQAYFSPeFGEVVDACVIVDSASGRPRGFGFVSFKSASSVQRVMDAGryHRIRERDVDVKLAVPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740121_754062 85 0.354 3.697E-13 101 179 414 4 80 362 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PHGNLFVGHLPEEVTQSSLQEVFGCFGPVTSVKVTMDLQTGKSKGYGFVRYEKPEDAARAIEALNGQGG--ILVKFADS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A158Q6T3 85 0.293 3.697E-13 82 195 414 247 359 441 +----------------------------------------------------------------------------------RRSSYDDRRYTFSRRDEPEPSRCLGVFGLSLYTTERDLKELFSQYGDLDNVQLVFDHPTGRSRGFGFVYFKKIEDAIEAKErvAGTEIDGHKIRIDYSITK---RPHTPTPGIYMG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000141457166 85 0.294 4.924E-13 101 183 414 1 85 86 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ETSKVFVGGISWNIDSNQLRDIFAEVAEVKYAKIVTDRETNKSRGFGFVEFNSVEDAVKAKEEFDgaEIDGRAVKVDFAEDRRNG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>23891|scaffold_88471_c1_3|+1011|00 85 0.250 4.924E-13 104 193 414 1 92 93 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFIGNLSKETTSQELEDKFTPFGNVDTCRIIKDMRSGESKGFGFVEMSDSSKASNAIHGLNnvELNGRKLTVNEARPKNVTRSFSDSNRRY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1F4RNI2 85 0.244 4.924E-13 104 191 414 1 90 93 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLPKTTTEEAVRAIFSEYGEVTEVKLIKEKYSNELRGFGFVEMPTRSEALNAIQKVNGFevEGRSLVVNEAKPRQERSDNYRRSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000137352644 85 0.378 4.924E-13 101 179 414 0 81 95 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MASKLFVGGLPFETKEDDLKSLFEEFGEVESAVIINDKFSGRSKGFGFVEFGTEEEAKRLgqIQADCMLEtGKELGFKIPTP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719424_2143904 85 0.247 4.924E-13 93 175 414 13 97 99 +---------------------------------------------------------------------------------------------PGGRDADSEGRKIFLGGLPFEAKDDDLRHDFEKFGRIEDVHLPRDKETDRPRGFAFITYSESLDAEDAAKDMHGRDyrGRQISCR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4030042_6591776 85 0.279 4.924E-13 91 181 414 7 99 100 +-------------------------------------------------------------------------------------------SGHAGESSEKMEIKLYVGNLSKSTTQEELKALFAQAGEVTAVEVIKDRKSGESKGFAFITMSAQSDADKAVTMFNaySLGGNALKVSPAKPRE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001054243940 85 0.284 4.924E-13 104 189 414 1 88 100 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIYVGNMSYETTEASLLKTFSKHGTVLNTRVMTDKFTGRTRGFGFVEMENDQEGLKAIEQLNdtMLDERNIIVNEARPRVENSDGDRN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001101241700 85 0.261 4.924E-13 104 189 414 1 88 100 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIYIGNLSFQAEEDDLREIFADYGEVKRISLPTDRETGRKRGFAFVEMAEDAHEDKAISELDgaEWLGRELRVNKARPRNDSGGGRRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>17942|Ga0316622_102993945_1|-183|00 85 0.279 4.924E-13 101 191 414 0 92 101 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGTRLFVGRLPHSKNEQDLGAMFAPCGNVESVRIATDKETGLSRGFGFVRMSTVAEAEDAITRLNstDLDGKKLIVRVAKSQTDKRRPAAPAN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712135_82429 85 0.245 4.924E-13 135 249 414 0 97 102 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MIDKETGNSRGFGFDTYADPACINQVMA------------------------SKPHNVFLGGISMEASEDDVREHFSKYGSVVEVNFvvdktdsTRPHKGFGFVTFEDESSVDQAVRSSVEL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719410_403082 85 0.250 4.924E-13 99 185 414 6 101 103 +---------------------------------------------------------------------------------------------------EEIMRKVFIGGIPRSTTEDTLKDVFGKYGTILDCVVIKDRESKQSRGFAFVTYDNEDSVENILEwdesasklkNSIQVDGKVADVKRAIPRDQNDE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5262247_3173934 85 0.270 4.924E-13 76 160 414 19 102 103 +----------------------------------------------------------------------------RPRRNRRGRERRKTARNRSCNQEGGIMR-IFIGNLPWSTTEEELAQLFEPFGTVDRAQLATDRETGRSRGFGFVDMPDDAEAREA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1U8F0H9 85 0.319 4.924E-13 83 177 414 5 101 105 +-----------------------------------------------------------------------------------KFIENYQTPFSRLTTSRHSCSKLFVGGLCYDTNEPVLKQAFEQHGEIIEVKVICDHKSGQSKGYGFVKFTSETAASKALKEMDGqlLDGRNIRISYA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>M2WZB1 85 0.268 4.924E-13 101 191 414 2 98 106 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QAVRLFIGNLSWKTSSEGLKRAFQNAigveASVVNAHVVMDRYSGRSRGFGFVTFESPEDAASAVNLLNgkELDGRAIRVDLAHEREESAPRQRRQK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719220_1456095 85 0.270 4.924E-13 87 180 414 12 107 108 +---------------------------------------------------------------------------------------PEKAPTPKTKHQTKKMASVFVGNLAWRVSEQELGDIFSQYGQVSSVRIAMDHDSGRSRGFAHVEFERQEEADAAVQQANgiEIQGRAIRTDHGRRR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_1522982 85 0.298 4.924E-13 100 184 414 5 91 109 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PRTKRIFVGGLPQACRDAELAEYFNQFGDVVEATVYMDHTTGRSRGFGYVTFEDENICELALENGeyQEIMGKSVEVKPSKPRDDED------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719237_1208601 85 0.291 4.924E-13 87 189 414 5 107 116 +---------------------------------------------------------------------------------------PSVTSSAPPKSGNGKSIKYFVGGLPPEAEDEDLKSHFSKFGELIEAQVIRDRATGRSRNFGFVAIADTMSRDRVLQESHSVKGRRVSVRIHQDMDERSGDRDS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719409_2000873 85 0.444 4.924E-13 105 175 414 0 71 119 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+------------------------------------------------------------------------------------------SPGVAAAASGDDAAAIFVGGLPFALDSDGLKKHFEYYGTVVSAVVVFNPNTGKSKGFGFVEFADSKIRDKVVAEGaQEIDGKSVEVKPKQPKAGKGSKGDGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A2H3X746 85 0.247 4.924E-13 77 188 414 15 135 203 +-----------------------------------------------------------------------------PPPNRRSRSRSSSRSRGRSRSRSQDSRaaknpgnNLYVTGLSTRVTSSDLEKYFSKEGRVQECHVVMDPRTRESRGFGFVTMETLEDADRCVKYLNrsVLEGRLITVEKAKRKRGRTPTPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719375_2273675 85 0.293 4.924E-13 102 191 414 82 173 233 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KIYVGRCTEDITVDDLRSYFSQFGEVTDVFLPRPFRAFAFVTFADAEVAHSLTGDDHIVKGTSVHVSSATPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719495_613805 85 0.278 4.924E-13 100 196 414 137 240 283 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PKLCKLFIRGLNWDTTSETLTTVFSEYGTVVESRIIMDKQMGRSKGYGFITMSTADEAKKALENvERKIDGRMTYINLASngptfgPGMSAGPRGRGRGGFGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000669060025 85 0.316 4.924E-13 102 178 414 8 86 325 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SNDIYVGNFPPTTTEAHLRTLFADFGTITKVRIATDMATGGSKGFGFVEFGEARDALMAIKEMNqlEVGGRTLKVNFAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A151Z2L9 85 0.305 4.924E-13 100 193 414 18 112 339 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QPPNTIFVGGINWRADEEAVKTYFDSFGKVLDVKIIMDKNTQKSKGYGFITFQDQESVNKVKSSPNlLFMGKNMNIGEPVRKSNPNNQINSPIVY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSMisStaDraftv2_1062788.scaffolds.fasta_scaffold6776524_1 85 0.274 4.924E-13 105 204 414 53 154 345 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVGGLHFSTDDSTLRSFCEAFGDVMFVKIIHDHDTQRSRGFGFVTFANADEARRAVQQMDGrvVDGRNLRCNLAPDKERDRRDTSFVSSFSGRGRHAVDDE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712093_390278 85 0.274 4.924E-13 100 188 414 39 129 357 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PPSKSVFVGNIPYGLTEEQIIRIFSTAGKVLNFRLVYDRETGRPKGFGFVEFPDSDSAASAVRNLndHEIMNRKLRVDFSNDGDNDDTAAP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001396735008 85 0.296 4.924E-13 92 180 414 61 151 387 +--------------------------------------------------------------------------------------------AAKEAAKEELGFKLFIGGLPYETNEEELTALFAEHGELKEVHIATDRETGKSKGFAFVTFDNYSVGKDALPNLKslKIGGRKITVQEAKER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>tagenome__1003787_1003787.scaffolds.fasta_scaffold8731003_1 85 0.239 4.924E-13 117 263 414 72 232 437 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ESVYMFFSQFGNVLDCYLP-ESATN----VAYLCFEDENTMEAVLQfppEMLCIEGVYVTLSRASPRPDYSMNNTD-RVFVKNCPDNINRADLRNYFQQFGLVTDVYIPkdkitGEQKKFAFVTFASVESARSAISFGdvhrliyidrmtNVINTIPLQVMPAEPRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0R3X2D4 85 0.252 4.924E-13 104 181 414 46 124 483 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFIGGISTSTTADDLRVFFSTYGDIDSCELMFDRATNRSRGFAFITFATESAADiVCQKQFHTVNNKKVEVKKAVPKE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A3FPV5 85 0.296 4.924E-13 68 183 414 327 443 746 +--------------------------------------------------------------------PNRLYVSRAQKKNERQVVLKSQHEAVKESHQRYQGVNLYVKNLADSINEEDLRSMFEPFGTVSSVSIKTD-ESGVSRGFGFVSFLSPDEATKAITEMHlkLVRGKPLYVGLHERKEQR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719505_410740 85 0.168 4.924E-13 78 243 414 496 744 971 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6.558E-13 101 175 414 0 76 78 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MATKLYIGNLPFKAREEELQALFQQAGAVESVNIIRDKISGQSRGFGFVEMASAEDGQKAIEmfNGHSMENREIVVN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000654582765 84 0.252 6.558E-13 104 188 414 3 86 88 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNIPFRITSEEIKNVFGQYGEVTNVNIVMDRESGRPRGFCFVEM---ENAEAAINELNGkdMGGRAIKVNIAQERPRFDSAPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001138561393 84 0.280 6.558E-13 104 183 414 12 93 94 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVAKLDYGVTSENLQTVFEEHGAVMSAVVITDRDTGRSKGFGFVEMESEEDAMNAINQLDGssLKGREIVVKKAEENRRR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5579864_1544619 84 0.313 6.558E-13 101 184 414 0 85 96 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MASRLYVGNIPHDATAEALRTVFAEFGEVADVQVVVDRYSGRPRGFTFVTMAKPEDATNAASKINgtMFGGRPLRVSDARVRRSGD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>7417|Ga0075513_1171242_1|-1|11 84 0.255 6.558E-13 134 222 414 1 97 99 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IPTDRDTGAPRGFAFVTMV-KEEADAAIENLSgvELQGRVIDVKESLPRGQKAPPRERPntsgnevKLYIGNLSFDTEEDTIRQVFEEYGELIDVYQP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3989338_4843245 84 0.285 6.558E-13 101 190 414 9 99 100 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MQTSLFVGNLSFQATEEDVKKLFERAGKVESVSIIMNRRSGKPKGYGFVQMADVESAQNAlMMSGEEFMGRSLIVAESNPKKSESGRPFSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711874_230227 84 0.313 6.558E-13 126 221 414 1 99 101 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YGIVEKVEIIRDKDTNISRGFGFVYFQDQEGLMNATSTVHHLNGRRMDCKEALNRinaKQRLSKERSHKIFVGGLSQKTKEDTLYDYFLVFGIIYKAYL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5262249_14866968 84 0.317 6.558E-13 104 188 414 17 101 104 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVYVGNIPYSTTETDLRDLFSPFGNVDSVSIITDRDTGQSKGFAFVNVDGDINAITSQLNGTMLNGRALKISEAQERQQRSGGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711879_283569 84 0.317 6.558E-13 97 180 414 18 102 104 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DRDPKVCKIFIRGLSYETTEDVVTEVFKEYGEVRNVQIIKDRQTLRSRGFGFITMGTKQQAETVLAiESREIDGRTTYVNLATER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719444_788707 84 0.288 6.558E-13 127 224 414 0 104 107 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GEITDAVVMRD------RGFGFVTFADQSSADAAMgAGSQMIDGMTIEIKPANGKGGKGGKGGCGggkgggagpvtdKVFIGGLPQDCLEERVREYFGQYGNLVDCVVMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719324_1362326 84 0.252 6.558E-13 118 224 414 0 109 110 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ELHDTFSAFGNILSCKVALD-EKGESKGYGFVHFESTESAENAIQMVNdmQLGSQKVYVGHFRPRKDREEEKETswTNVFVKDLDETIDTEKLREIFGAHGEVTSCIVMTD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5881628_204568 84 0.500 6.558E-13 102 153 414 57 108 110 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SMKLYVGNLPYNTTEDDLRTLFSQYGNVDSVAVITDRDTGRSKGFGFVEFGD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719324_517764 84 0.313 6.558E-13 104 182 414 26 108 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIFIGGLPQTCDETKLRGYFEAFGPVTDARVMMDRQTGRSRGFGYVSFQLEGSLElvlnQAQSAGHAIDEKWVEVRRCEQKNS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719409_39241 84 0.266 6.558E-13 101 203 414 14 115 117 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DSCNLIINYLPPDMDEVEVRRIFKTHGPIDSVKIVRDLKSGRSKGYGFVRYHSPEHTTNAIRVLNGlpIRGKRLKVAKARP---HSHNYQDTNVFVSRLPPHFTD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711894_242528 84 0.270 6.558E-13 78 176 414 18 117 118 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------SSKLLVKGISFTSTEESLTQAFSPFGKVLDANIVRNKVTNKSKGFGYVTFETEEDAEKALVNMNgkMVDQRVVLVDKAWPDNRKAKNVG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5438477_7018479 84 0.280 6.558E-13 102 188 414 28 116 126 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SMRIFIGNLSSETTDDDLLQAFEPFGKVNSAEVVKDKFSSESKGFGFVEMPEAADARAAIAGVNgtMVKGRAVNVSEARPRPPRREGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719414_490762 84 0.255 6.558E-13 122 216 414 0 126 127 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HFAKYGTVVDAVVMY--KDGKHRGFGFVTFDSPESMDAVLTEDQVIDGRTIDAKPAVPQGEvatsrangsmelhgppafggvrhGGPPARPSgppssigpacdKVFVGGLAQTTTEEMVRDHFGRYGNI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550514_268787 84 0.206 6.558E-13 119 235 414 3 127 130 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LCDTFSIFGHILSCKVAAD-AAGQSRGYGFVQYESEDAAKQAIERVNGmlIEGRKVFVGPFVKRDQREPvdgeAVKECSLYVRNFPMDWEDEKVSELFKPFGELASTFVMSDavtQKRYGFVNFKE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740138_423765 84 0.307 6.558E-13 102 178 414 12 89 130 +------------------------------------------------------------------------------------------------------CTSIFVGNLSWDIDEESLKEAFSSAGTVISVRLATDRNTGEFRGFGHVDFEEEDAAEKAVAlRGTEVMGRAIRVDYAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712086_784122 84 0.236 6.558E-13 116 252 414 0 130 132 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EESVKAYFSYYGDVIRVNL------NDERRFCFVRFVDSGSAKQAVeeEEPHVLDGETLDIRKVKPR-------GVGQIFVGGLPGQTTSESLKAYFSYFGAVQDAEVrvddNGKSLSWGLVDFKDKQSMSCALAEtEHVIDGK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719284_2237223 84 0.300 6.558E-13 96 182 414 42 131 133 +------------------------------------------------------------------------------------------------KAPPPETRKIFVGGLSHQTKESSLAAYFSQFGTLADVVVMTesNANGRRPRGFGFVTFEEPKAVDRVIcSRFHPIENRMVEVNPAIPREQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719409_456742 84 0.207 6.558E-13 123 235 414 2 134 135 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FADYGSLVSAEVMSKPD-GRSRGWGIVEFSTTEGAGNALDNMNgaEIDGRAIKVEFQKPRTARAPrqrrerkprqqtefaePSPSNSIYVGNLPWSFGDDDVFALFEGTGatsaEVKSGY-DGRSRGYAIVTFDS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>7151|scaffold_388463_c1_1|+250|00 84 0.304 6.558E-13 101 190 414 0 91 139 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+----------------------------------------------------------------------------------------------KGAEDELDESRLYIGNIDYSATEKDLVAHFSKFGHIAAVNIPVDRHTGKARGFGFITFKRVADAIKAMDlDGSEFKGRQIQVNFARER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SoiMethySBSTD1v2_1073268.scaffolds.fasta_scaffold2623830_1 84 0.210 6.558E-13 101 221 414 6 156 159 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DPRCCFVGGLPkgYQFTEAHMMVYFANFGTVTRAEI-RRGDDNRPRGFGYVWFSTEQEAENARAyENHVIEGKKVEVKTSLPPKPKSEGLNHGKeaawramervlqreageepglgatgvteLYVARMPMTVNEEAMYAYFSQFGPVLECKI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719318_1649529 84 0.361 6.558E-13 163 256 414 1 86 171 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NQHEMHGRTVTVKVKQEK--------PMKLFVGRLSHDATAEELEEYFSKFGKLTDVYLPKPFRNFAFITYASTEDAREVMRGHHELKGSKMNI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_612584 84 0.273 6.558E-13 146 315 414 0 170 182 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FAFIVFDSSETIDKITEvKDPLINNKKVDPKKAKAR--------HGKIFVGGLKPELTDEELKTFFSTYGKIIEMQMPfdkqnNKRKAFCFITFEQEAVVAELLKTPkLTISGHQVDLKKATPKPDmmMMRGGMMGGRGMRGRGGMRGRGRGGYGQGGYVGYGYGGYDGYGYGGGYGGY-------------------------------------------------------------------------------------------------- +>23268|scaffold84072_2|-577|00 84 0.275 6.558E-13 105 189 414 2 88 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------TVYVGKLSYSATEHDVERVFEKHGPIAEVKVIKDRETGDSRGFAFVQFENSADAQSAVDGLYgfELKGMVIQVSIAKPKQDRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000668131185 84 0.658 6.558E-13 181 262 414 5 86 234 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QEGAHQLISRKVFIARCTEDLTADDLRNHFNQYGEVVDVFIPKPFRSFAFVTFSDPEVAHSLCGEDHIVKGVSVHVSYAAPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_739796 84 0.350 6.558E-13 104 179 414 18 94 237 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLAPNVDNDVLYEYISDYGEVVDSIVMMDAETGNSRGFGFVTFTNPAVVEEIMKTPrPEILGKSVECKRARP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0U9HJ32 84 0.288 6.558E-13 78 179 414 130 233 237 +------------------------------------------------------------------------------RGRSRSRERGRTSDRNRGKGAYRPGNTVFVAGFNFITTEKDLDRKFSKYGRVVDVRIVKDRRNGESKGFGFVTMETDEDADEAVDKLDqtTWNGRVVLVEKAKS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>GraSoiStandDraft_55_1057291.scaffolds.fasta_scaffold4094805_1 84 0.301 6.558E-13 103 184 414 6 88 243 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RRIFVGGLSIDCPQQAIGDYFSQYGEVEDVYMMIDKFTGRPRGFCFVTFGTVEAKQAALdARLHTINGVEVEAKIALKKGQKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_1603941 84 0.320 6.558E-13 103 197 414 14 113 264 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKIFVGGLADTTTEESLTNYFSLYGGISEAVVKIDPLTGKSRGFGFVQFTDPASMQLVvaesIQSGHEVDGKSVEVKVYQgARQEAQQGFSGIGVANGGL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719438_398489 84 0.297 6.558E-13 54 181 414 1 131 283 +------------------------------------------------------RLIPSMLHqSPRAKQTKLRRFLLVVSAKKLLQKKIDPKHAtPKSKSKANKTKKIFVGGVSQETSADEVKAYFNQFGKVDEAVMLMDQQTKRHRGFGFVTFEHEETVDRVCEiHFHTIKNKKVECKKAQPKE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719498_1021063 84 0.250 6.558E-13 94 191 414 203 310 454 +----------------------------------------------------------------------------------------------KVPPNKKDTRKLFVGGLPTDVTEEEFELFWRQFGEITDSVVMIDKESGRSRGFGFVTFKEEASARAILQNFPdpnkygsacvLMRDKPCEVKPAVPKDGNNFYGQNHR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A212ELV6 84 0.321 6.558E-13 104 186 414 220 303 550 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+-----------------------------------------------------------------------------------KSVGKAVPAKPVMDEPEKDPCKIFVGGLKGTPNEEDIINYFGCFGEVADVKMMYDKLSGKSKGYCFVTFSAQEVAEEVLAAEvHELNGEHIDVKPS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719305_138125 83 0.322 1.548E-12 103 191 414 106 195 223 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RRMYVGALHFSTTEKSLIDYFSQWGPVERCQVIRDKDTQMTKGFGFVTMEDPATCTKIIAQaVHIVDNRTIRVSLTHTSGKNLENFKPKN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719313_792083 83 0.220 1.548E-12 141 270 414 0 153 329 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKSKKFGFINFSMHEEALLAvqLKDKYLLHGKELGVFRAQKKTERisilsrlfEERKRERvakhhglNLYVKNFPLDYGEKELRKQFSEFGTITSCKIMRDdntdnSKGFGFVCYSNVIEARRALseMKTRVGPGKPLYVSLAQTKEARRKQLE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000315158254 83 0.263 1.548E-12 101 212 414 133 239 395 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QQNKIYVGGLPTSVTSDALTVYFQKFGDIQNAVVIRSRRTGNSRGFGFVVFRGKKSLDACLQNpdPHVFDGHEVELQVARPR-----RRNLYNTFVQ--DKDATEDKIEAVMAQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719356_307380 83 0.326 1.548E-12 102 198 414 134 234 396 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SSRVFVGGLPHGCTDEMLSDYFSAYGTIVEAAVKKDLDSGKPRGFGFVAFESAGSVDMVMAdyEKHRIEDKWVEVKRAISQEvlEFKERYGSARLLLGPCP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719247_2525078 83 0.276 1.548E-12 44 173 414 337 466 535 +--------------------------------------------DADGKEKRGGKRRKGGSPATKGGAGTMRFTLKNDQREKlerlRSTSQSDTENGSTATAAAAAATNLFVGSLPRSVDGGALRTLFSNFGEVTSAKIITDRKTGKSKGFGFVTMP-KEDARAAMEA---LDGYQIE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719329_140323 83 0.195 1.548E-12 104 271 414 13 257 754 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIFVRNLPPDTVRSELEELFSDVGPIKKCSVIRDKkdaasGTALCKGFGFVRFVSAEDAEAAVssqsqdfvikrenrefklvvqstaSSSNDNHGKTeagesnisqssssssaskvVHKDDFQSKQEKSSEivpeeammKRTSRIIIRNLAFTAKKSHIEEVCKKFGNIVDIHLPtvninhsnksdrgrrqqPQHRGFAFVTFKEVQSARDAIhasaSSSILIKGRQVAIDLSMPKTKHQFQKQQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000910225357 83 0.264 2.060E-12 97 164 414 5 72 74 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RKAPMSKKLYVGNLNYDTDEAQLRSLFSQYGEITDIHLPMDKMSGRPRGFAFVTISEDAGATNAINNL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001098185679 83 0.284 2.060E-12 97 182 414 2 89 94 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RKIKPNKKVYVGNLSLETTEPDLRALFSGAGDVMSVNIVKDRQTGQPRGLAFVEMSSQWEARRAISMLNrtNFLGKNLLVKEARTTQS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>8484|Ga0316190_11523381_1|-22|00 83 0.269 2.060E-12 104 179 414 2 79 94 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIIVGNLDFSVTEGQIRRLFDPFGDINEVGIATDWETGHSRGFAFVEMDSRKDAEKAIEELrgTQLEGRSLTVRPAPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719394_750774 83 0.268 2.060E-12 98 177 414 0 81 103 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------DWTLERLKEHFGRSGEIVFAAFFTDRETGQQKGACKLEFATHEAAQRAIDEFHgsEVDGRQITVKQLDAGPPGERPERaprpprgedGRTLFVGGLSWDTSNEALGSHFARCGEV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711871_1041194 83 0.298 2.060E-12 114 188 414 1 77 120 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTPHDVRREFDRFGKIEDVFLPRDRNTGGSRGFGFVLFENLDDAEKAIEEMHerEFDGRKLQVNKSKPRPEQGSRGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719223_857525 83 0.295 2.060E-12 88 191 414 7 110 120 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGGREPVLKVFVGGLDPTVPETEIKEYFGQFGTVSDVDLPfdkvkNQRRAFCFVTFESEAIVDKVCENPkQTIGAKQVDIKKATPKNDQFGGFGGRGGRGGFRGGRGGYGGYGGGYDYSQGYGNQGGYGSGGQQG------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A2H3Y7E2 83 0.247 2.060E-12 92 190 414 67 167 171 +--------------------------------------------------------------------------------------------PPAPKSASRASTRLYVSGLSFHTTKESLRNAFQNFGQLVEVTLVMDRIANRPRGFAFLRYATEEESRKAIEGMHGkfLDGRVIFVEFAKQRSELSQGSKPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719199_1387847 83 0.230 2.060E-12 100 216 414 32 174 177 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113 193 +-------------------------------------------------------------------------------------EKNRAAAEAEKLKAPPGPTRLYVGSLHFNITEQMIKAIFEPFGVVESVQLIYDSETGRSKGYGFLQFKDADAARQAMDQMNGFElaGRPMKVGPVTER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>RhiMetStandDraft_4_1073278.scaffolds.fasta_scaffold596542_1 83 0.267 2.060E-12 101 186 414 0 85 201 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGNRIFVGGLPWAVGDGELRAHFEGCGEITDAVVVMDRESGRSKGFGFVTFESDESAXXXXXXXXXXXXASARPSLAPSAAPVGLP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719183_798336 83 0.321 2.060E-12 104 188 414 16 102 225 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLSQSSDENSVMGYFSQFGNVVHVEIKRDHETGRTRGFGFVTFDSPDAVALCnsMNGQHSLDGRNLETKSAMAQGSKGGDAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>984|scaffold_7176_c1_3|+1260|00 83 0.305 2.060E-12 87 179 414 146 240 250 +---------------------------------------------------------------------------------------SAARPARKVEQAEVTSPKLYVGNLSFDATESDLVELFNGVGSVRNAEIVTHRQTEKSKGFGFVTMTSVDEAQRAVQELHEkdFLGRKLVVNGAKS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719354_765674 83 0.284 2.060E-12 91 184 414 170 264 265 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+------------------------------------------------------------------------------------------------PPGQNQFKKVFVGGLPPDTTVQDIKDYFEGSGKVTEVLLMHDRNTKRLRGFGFVTFESDLAGKHVCEAgFHKLKGKSVECKSAQPKE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5258707_2400394 82 0.256 2.742E-12 105 184 414 43 124 127 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LLVGSLGSEVTHEELRRRFETYGQVVQVHIIVDRDTGLPRGFAFVEMTNDAEAERAIKGLNGsiLRDRALDVNYARPRPERP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719188_884562 82 0.295 2.742E-12 78 173 414 8 105 128 +------------------------------------------------------------------------------RPISLLSEAPSAMQAMSEPLPPGSTKKIFVGGLPQNCTEQVLSNYFMQYGTIVDSVVMKDRETGNSRGFGFITYDSENCVEMVMAqyQDHRIERKWVE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719270_277345 82 0.290 2.742E-12 104 189 414 34 118 133 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFVGGLAQHTTKESLNAHFTQFGP-ADSIIMMDRATGRSRGFGFVDFQDEQAMKAVLASSHQVDGVMVTVSAYAGMGGQPGPQQP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711865_1054727 82 0.308 2.742E-12 97 189 414 31 124 139 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DADPTNRKLFVRGLAWETTSDELLEEFKEYGPVEEGTVCTDKSTGKSRGFGFVTFKTHAGTMAALATPgKMIGDRMTQCKLASDGAPGKQQQPP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>23183|Ga0160428_1085117_1|+350|00 82 0.341 2.742E-12 105 172 414 0 84 143 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------MFIGGLNWETTDrkpvtvatvmtktddstESLRDYFSQFGEVTECTVMRDGATGRSRGFGFLTFRDYKTVNTVMVKEHYLDGKIV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_SOC_28_MAG_00070_000000001052.2.1 82 0.257 2.742E-12 144 259 414 10 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0.284 2.742E-12 78 165 414 53 140 154 +------------------------------------------------------------------------------PRRSRSQSPAPAGKAAAPVDVANPGNNLYVANLATRVGERDLQELFSKFGRVDKCEVIVDPVTRESRGFGFVTFEDVRDAEDAVKEMN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_838649 82 0.315 2.742E-12 104 193 414 8 99 158 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVGGLTQDTTEEVLNEVFSQCGVVTETEVVKDKMTGRNRGFGFVTFSEAAGADYAVANSGILQvaGRSVEVKKCAKRTPKAEMNPTPGQF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_2398843 82 0.294 2.742E-12 90 191 414 67 168 169 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SQEDAMEVLRNTHEMKDSILNVTVAEPKDAKMPveqmsiygggasnnwnynnapgndwmTGPSMKLFVARLPSGTSQQEFKDYFACYGMLTDVFLPNPPRGFGFVTYASQNDAMRVLRMSHMMNGSQLNISPAEPREKDKEAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UPI0003288F97 82 0.285 2.742E-12 96 184 414 38 128 183 +------------------------------------------------------------------------------------------------KQRLTMNNKLYVGSLNFAVTQQDLSDFFNGAGTVLEAIVVTDRSTGNSRGFGFVTMSSEMDALNAIEKLNgkELLGREVSIKLALDREARP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSMisStaDraftv2_1062788.scaffolds.fasta_scaffold12850721_1 82 0.264 2.742E-12 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+---------------------------------------------------------------------------------------PSRSRSFKSRRLASPCRCLGVFGLSPQTDEKKIRSVFSPFGNIEKIILILDRETNRSRGFGFVYFFSVDDAQRAMQETAGmtLDDREIRIDFSFTRRER-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712150_111769 82 0.512 3.649E-12 183 262 414 0 79 153 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QNRPDESCKIFVEKLSESVTCEDLKEHFQEFGIVTDVYIPKPFRQFAFITFSESKIAQSLYGKNHTIKGINVEIRPAVPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550537_2137578 82 0.258 3.649E-12 101 183 414 0 84 165 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EENKIIIRGLPFSVEQSELEKLCAEYGETTDTFLVKDRDSGRSKGFGFVTFADKEAMEKAIEALdnYEMSGRNITVAKAEPRRER-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>VirMetMinimDraft_7_1064189.scaffolds.fasta_scaffold286038_1 82 0.208 3.649E-12 144 260 414 0 157 168 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RGFAFVTFETVEDAQLVLDTPEaaEFEGKQLDIKPAVAKEdkgggkdfggkgkdfggkgkdfggkgkGKDKDAPPTKIWVGCIPLSATEVDIRQYFEYFGTITDVTLeydeMGLSRGFGHVNFENPTDAKTVLGHYSDDHfdplewdaGILLDIKPAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719487_710011 82 0.326 3.649E-12 86 184 414 61 160 168 +--------------------------------------------------------------------------------------DNWGSSDGGSGGDGAANAKLFVGGLPKGTQENALWSYFGQWGPVAKVESKMD-ENGNLRGFAFVTFHDPAHAQQVIDNkdRNKIDGKWIDCKFATSGQGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712091_574248|ERR868394_k119_2461544|+|317|1.034e-85|1|4043|4555|4043[4043]:4555[4555]:513[513] 82 0.245 3.649E-12 94 193 414 53 154 171 +----------------------------------------------------------------------------------------------KRRDESEVPNKVFFANVKYEVTEEDLRPFFSTVGPVTHVQLVRDSFTGQSKGYGFCTYSSVLAATTAIRSLHLkpFMGREIRVDDATSLSKRRKEKKATEGF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719462_1107025 82 0.230 3.649E-12 161 267 414 15 130 174 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VKEKDHVDGKVLETKRAVPRHKVKTnevvGEGVNKIFVGGL-RDLEEKDLEKYFTQFGTITSVDVlidkrTGKRRGFGFVVFDDYDAVDKiVLQDEHNVKGIRIEVRKAVDKKNMDR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712179_803588 82 0.246 3.649E-12 158 316 414 1 151 178 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DKVMEAgEHTINGKKVDPKKAKAR--------HGKIFVGGLKPEITDEEVKEFFGKFGTIIEVEMPfdkvkNARKGFCFITYEQEAVVTELLKTPkQTIKEIELDVKKATPKPDAM-------GMGMMRGGRGGRGMRGGRGRGRGGGGGGWNQGWNQGYGYGGYG------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001261646211 82 0.278 3.649E-12 103 179 414 97 175 179 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TRLFVGNLAFEVNGMALQEAFNRFGSIDNARVVNDRDTNRSRGFGFVTFSEPADAAEAVRVMDgfELQGRPIRVQHSNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SoimicMinimDraft_15_1059743.scaffolds.fasta_scaffold591732_1 82 0.246 3.649E-12 105 183 414 10 90 183 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVGNLPFDITEQEIKDAFAQYGEIASVKMLTDKMTGRFRGIAFVALVDDEKAQAAIVELNgkELKGRPMRIDKTRERENR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712226_705396 82 0.284 3.649E-12 86 190 414 1 109 187 +--------------------------------------------------------------------------------------EGAAEGAAEGAAEGAPSKNLYVAHLPLDFTKEQLDEIFKEFGEITESRILVDKFTNQSRGVGFVHFADHETAAKAIEATNqkVLEGcdKGILVKFADQKKSGGGPSSSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719244_2243105 82 0.270 3.649E-12 78 179 414 49 159 200 +------------------------------------------------------------------------------KRQKRKLEQSKETDESKKIKRDEklmntymrEERKLFLGGLTEDTTEKDLKNTFNQFGTIIDCKVMRDAESGLSRGFGFVTFACSFMTEAALdKSPFEINGAKITPKKATP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1740137_65484 82 0.278 3.649E-12 146 274 414 0 139 206 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGIVRYVKAAEVDDAMgSRPHELDGRTLEPHRAAPREYSQKPEshhTCKEIFIGAWKEEIEEEDLREYFGQYGNILEVSFPKdkkdetKFRGFATIKFDDYDPVDVCCyKKVHHIKDKRLFISKYIAKRDMDELNRKYGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1D6C3T8 82 0.322 3.649E-12 77 166 414 21 110 209 +-----------------------------------------------------------------------------PNARMFSISAFAPPSPPTPPPKADPSPNLFVSGLSKRTTTDGLREAFAKFGEVEHARVVTDRVTGFSKGFGFVRYVTVEDAAKGIEGMDG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>HubBroStandDraft_2_1064218.scaffolds.fasta_scaffold3848127_1 82 0.371 3.649E-12 104 179 414 162 239 240 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIYVGNLDFAVEESDLVEAFSECGEVGEVSVVRDHITGRSRGFAFVTMMTREGGDAAMEKMDgaELKGRNLSVKKPNS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719354_215423 82 0.244 3.649E-12 87 182 414 142 239 240 +---------------------------------------------------------------------------------------SRPSASVRKEGQGPEGANLFIYQVPPEFNDDDLVSYFQPYGNILSAKIFVDKATGASKGFGFVSYDSPASANTAISAMNGvkIGSRTLRVQLKKPREQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_57_1057295.scaffolds.fasta_scaffold1112946_1 82 0.263 3.649E-12 96 190 414 55 149 249 +------------------------------------------------------------------------------------------------PPSKEEGRGIFVGGLPVSVDDGELRKHFEAYGAVQDATVVLNQRTGKSKGFGFVEFRDAGIREAVMQKSVQIQGKVVEVKVRQAKGGKGSGKEGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>JI10StandDraft_1071094.scaffolds.fasta_scaffold1458579_1 82 0.291 3.649E-12 104 180 414 98 176 253 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFVARLSYDVTEDDLRDEFERYGPVKDVQIIKDKFTGKPRGYAFVEFESSHDLKDAFRRCDGrkIKGRRILVDVERGR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>S7NBM6 82 0.262 3.649E-12 98 198 414 2 104 289 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EADRPGKLFIGGLNTETNEKALEAVFGKYGRIVEVLLMKDGKTNKSRGFAFVTFESPADAKDAARDMNGksLDGKAIKVEQATKPSFETGPVRSSSGMGGRAP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719245_1830379 82 0.407 3.649E-12 103 177 414 231 306 308 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKLFVRKLTCSTTDRMLEETFEQFGEVEEAVVLRDRATGRSKGHGFVRFKNSESAWKAMEQPeKDVDGHEICCHWA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719397_1603514 82 0.279 3.649E-12 87 196 414 0 106 310 +---------------------------------------------------------------------------------------SGVRTMSDVNEEPEQIRKLFIGGIKENVTSEDVTEYFEKYGKVESVELLQDKASGKKRGFGFVNFDDYDVVDKiVQTRRHVISGVSIEVSKAFSKEDQTRKAG----FVNN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>AntDeeMinimDraft_5_1070356.scaffolds.fasta_scaffold58853_1 82 0.151 3.649E-12 65 266 414 23 385 387 +-----------------------------------------------------------------DGIGGSQNFSPKGKSQHPDALAEKPTSHRTGAAEGCTCGRIFVARIPSRVSEEDMQKYFEAFGAVEDAYRPRDFAKNTFRGIGFVTFTDPAVVDHVIATKHSLGGVEVVVDRATPKElcvkkehsmgtvrqtsapeteealrqrpsvetlannnsiiglggsfneqafdlnffnciprmatypnsngnNRGPPsnlsddfsgdvgsqaqglaselcdsnpvamfamnsagvvkqpgtpaakdgkvakaggsphfsqvrnekgqkavtdnfahvrkvRSGPRVFVGKISKDTVEQDLADYFSQFGFVMDVYIPRsrenkkEHRGFGFVTFETEAAIKRAISQGtHNLKGAVLAIDVAVPESSSN--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>24828|scaffold_3998_c1_8|+9937|00 82 0.231 3.649E-12 101 259 414 708 897 900 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QERTLFVRNLNFSTTEESLMAmLVKKLGKdaVLAPKIARNaTNPKQSAGYGFVECRTRDIALKAYRLLQNvaLDGYALEFQLSKSKTPAAAaaaaaasgnkkkrisdvdvKLQSEKLAVKNIAFEATFAEVKQLFSAFGEIKKLRMPvkqdRTSRGFAFVTYATKKEAQQAAdtLKHTHFYGRHLVIEQA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>S8ENL4 82 0.182 3.649E-12 101 259 414 245 485 987 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PSASVVVKGLSQKTSEEDLYRILAEWGPLQHVRLIKERNSGASRGFAFIDFPSVESAQAMMDrlaqdgllvdgrkvffeysskptggggGPHGMDGgsrygrgsrRNIMipsdwmclicgcINFARrtscfqcneprtedspaadmassnPSSSGKRGEGPTHVLvVRGLDENADEEMLRYEFSKHAPLKDLRLVRDkfthvSRGFAFIHFHSVENATKALeatnGTSLEKNGQVLRVSYA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000625077613 81 0.420 4.856E-12 104 153 414 2 51 82 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLSYNTTEESLRAMFEQHGEVNSAKVIMDRDTGRSRGFGFVEMDD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001374656739 81 0.265 4.856E-12 101 181 414 0 82 83 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNKNLFVRNIAYKATNQDLQSLFETVGTVVSAKIIFDKEQNRSKGYGFVEFATEEEAERAIQQLDGasLLEREISIQPAKPRE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>F4KLN9 81 0.265 4.856E-12 104 184 414 1 82 86 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLYLGNLSYRVRENDLEQLLSEFGEVSNARVVMDRATGRSRGFGFADMAD-EDARRAIEALseQEFEGRRLLIREAEDRPRRE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001424438140 81 0.285 4.856E-12 101 182 414 0 83 86 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MTKTLYVGNLPWSATKEDLAAFFADITEVKASRVITDPVSGRSKGFGFIEVDDQEDVERIINAANGkdMGGREIIVNEAKPRQP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1Q3JVM4 81 0.252 4.856E-12 104 184 414 1 83 90 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVSNLAFTVSNEDLNELFATYGTVDTARIVTDKFTKQSRGFGFVEMPDEDSALKAMKELDGTmqGGRSIKVTEARPRAEKQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000903547281 81 0.303 4.856E-12 101 187 414 0 88 93 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MEKKLYFFFHASATTESELQEAFERVGEVVRATIIIDRETGRSKGFGFVEMADEAAAAAAIAQLNGvqLDGRAIKVAEAQARQDRDTRP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>17536|scaffold_42123_c1_2|+902|01 81 0.280 4.856E-12 104 190 414 4 92 93 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLYVGNLSKFTTEEELRAAFAEHGPVLSVTLVLDQRTGKPRGFGFVEYETHEAAEGGLLALNgaMLHGNMLSVNVAPEQPTQSMSQDST------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5215469_10571665 81 0.302 4.856E-12 91 166 414 17 92 99 +-------------------------------------------------------------------------------------------SACHDPRSLLMGTRIYVGNLPRSTTSAELAQLFDAYGDVVDVRVITDRDTGQSKGFAFVEMSTEDAMRSAIEGLNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001407302164 81 0.271 4.856E-12 101 179 414 18 98 100 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSNTLYVGNLPFEITNDELKSHFSSAGEIREVTHVRDRVSGRSNGCGFIEMSNSSEANIAIEKLHgsELEGRIITVALARP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5882757_9428044 81 0.265 4.856E-12 90 180 414 1 94 104 +------------------------------------------------------------------------------------------SGANATESGAKMGTRLFVGNLSFETTEAELRGVFTENGlEVQEVKIVTERETGRPRGFAFVEMSSSAASQQAMDALDgrELGGRQINVKPANER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001282498832 81 0.282 4.856E-12 101 190 414 0 91 106 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MQTKLFVQNLTTKCSEEDLQNLFSSYGEVISTRIPTDRESGRGRGFGFVEMLSQNAADNALQDLDKksFNGRILHVAFSRSEQSGGSGSRNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000195631755 81 0.464 4.856E-12 3 71 414 16 86 110 +---YIVVKEEFEDEPLELELEDDGNLRMSTLISQFSGACGLRFRNKETGAMRGVRLHKDLFLPPNGaeGWPTDV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR3990172_4888382 81 0.302 4.856E-12 90 183 414 7 102 111 +------------------------------------------------------------------------------------------SRRMAGARSAAMDSKLYVANLASSTTEIDLHTLFAQAGNVKAIDLVKDLDTGGSKGFAFVTMSTPAEAQKAISMLNALpvNDRELKVDLAKPREAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719453_1590367 81 0.288 4.856E-12 117 223 414 4 110 111 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EALLEAFKPHArEVFKPRVMYDRETGEHRGFGFVDL-HEDEVEAAIEAVNsapLADGTQLEASVGRPKRS---TRGQRKCFVGNINPEFSEDDLRDLMEQFGPVEDARIMR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719315_447057 81 0.247 4.856E-12 151 260 414 2 110 114 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FKDPSSVEAVIEAgTHVIDGKKINPEKAKAR--------TGKIYVGGIKPEITNNDITTFFSKFGTIVETAIPidrskNARKGFCFITFEKEAVAKKLIAEEkQTIKGIEVDVKKAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688572_9653354 81 0.425 4.856E-12 104 157 414 59 112 114 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLPWRATEAELKEVFAAFGTVRSVSIVTDRDTGRSRGFGFVEMDDADMA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712190_721954 81 0.271 4.856E-12 100 189 414 17 107 118 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PPTDKVFVGGLG-QTSQEELVEYFSQYGTIIDAVAMREKATGKLRGFGFVQYDNTESVELVMQddESHELGGKGVEVKKSIPREEMPSPVSP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719414_683811 81 0.417 4.856E-12 189 267 414 0 78 118 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NSKIFVSRLTDKITSDDLKGHFESFGTITEIFIPKPFRNYAFVTFSEQRSAEALFGRQHTIKGHTVQIKSADPKGHTDK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A010P9B2 81 0.321 4.856E-12 105 189 414 2 88 118 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------ILVRNLPKAFTQDNLEALFSEFGTIASCDLVMDEASGLSKGFGFVEMSTQEETDKAIETLNakVIDGKKIRVKWSNQEKKQAEAIDS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000614731367 81 0.274 4.856E-12 104 192 414 1 91 119 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFIGNLSYDTTEQKLSDALSGVGTIIDYRRPSDFNTGNPRGFAFVTMDSQESGEKAIGILDGmkIDGRELKVNEAEDRASSHPADRPQRV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711913_24351 81 0.264 4.856E-12 151 262 414 1 121 123 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FSCQASLEKCLMATHELSNRKFDCKAAIPiqfSSLRENKENEKRIFVGGLKKNWTEVELKEYFQQFGKIDTCYIAKKkdseiSRKFGFVFFDQAEVLRKVFdQEKHIIKGVEVFVKQLKPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712142_578910 81 0.428 4.856E-12 2 77 414 33 108 127 +--CYISIQDDVTGVSVELPSEKDGTLLLSTITSQFPGVIGLRFK-SETGSLRGVRLSEDkVFDIPLDGWGSVDYQIVMP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR550534_2094410 81 0.268 4.856E-12 90 184 414 8 104 148 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------ENRCKVFVRGINYETADETFEQSFKQFGQVVEATIVKDRHDGRSKGFGFVTFKTPHGAQKALEMANlTLDERTLSISRIVPPHQR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719245_2596697 81 0.242 4.856E-12 123 262 414 13 168 169 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FESWGPLVESVIKRLPD-GRSRGFAFVTFCSLAALDQCLATPeHVIDGKKVDIRRAetgsvetqeslEAKKYDPEAEQLRELHVEGLDVTCDDEEvVRDYFTQYGDIDNVAIVKKedsKETRAVITFAAAASVDSVQENrPHNIRDVKIETKRATPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_11_1057310.scaffolds.fasta_scaffold5555325_1 81 0.356 4.856E-12 105 190 414 43 129 169 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVGKLSWETTEEGLKMYFELFGEVESINLAKDKFTSQLRGFGFVQFKEKSSFDKCLAEpMHNVDGSIIEVKLSRTADGRAVLPPSN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711988_564063 81 0.226 4.856E-12 78 190 414 46 160 197 +------------------------------------------------------------------------------RRSSRSRSPREYKGNSFARKCKEESRVVGVFGMSSRTDERDLEQEFGEFGKIETVSIIYNRTTRESRGFGFITFEDKRDAVEAVDKMNGkrLDGREIRVDFSFTKDGRDGRRRDR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711916_109182 81 0.210 4.856E-12 143 264 414 9 155 197 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SLGYGFVEFDTRSQALEVLktKQHSLLDGHSLSLAFSNANKPEKDGsilavassrkrkrkgrltGKETKIIVRNLAFEATSKDIRELFSTFGQIKSVRVPRGPrnhRGFAFVDFLTHEEAVAAMKavAHTHLYGRHLKLEWAEKDKD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3569833_1891 81 0.315 4.856E-12 99 172 414 122 197 207 +---------------------------------------------------------------------------------------------------ERGSSCMYVGNLAYGVTESELHGAFSRYGSVVDVKVMNDRATGQSRGFAFVTFSSAQSMKKAIHAMNGqtLAGRPL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001100374785 81 0.294 4.856E-12 105 180 414 25 102 217 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVRNLSYDTTDDDLMSLFEPFGPIKRATVSLHKETGSSRGFGFVAYSMAEDAKSAVSALKGavLKGRSISVELAVKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001118531565 81 0.267 4.856E-12 110 219 414 3 118 250 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LPPTIHESEIIDFFSAVGKVRDVKLIRDRVTGRTKGFGFVEFYEESSVYDALAlNGSPLKGISILIKaseaeRNISHGSQGHSQGITKLYVGNIPAVFDRRDLSMLFSIFGSLLSI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711933_53542 81 0.274 4.856E-12 82 181 414 111 212 290 +----------------------------------------------------------------------------------RRERRRSPPRNRGPRPEPNREARVYVWNLPWRTSWQDLKDHFRTVGEVVYADVMTDRRTGRSKGCGIVEFADKENVQKAIDTMfdTMLGDRRISVREDRQPE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0D9VKL4 81 0.267 4.856E-12 76 189 414 266 380 397 +----------------------------------------------------------------------------FGSDNKNYKDDDSLKSSEATKPDV-KTKRLFVTGLSFYTSEKTLRAAFEPFGELVEVKIIMDKISKRSKGYAFIEYTTEEAGGAALKAMNGqiINGWMIVVDVAKTRSRDRQPSSN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001147168633 81 0.216 4.856E-12 136 266 414 0 138 435 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RNRSSSDRPGYGFVTYAQKDSAVAAIEALHfkvQMPGSTamLQAKMADGDSSNSDP----KLFVGNLVSDVMEQELRDAFQPFGSIVEIVVLRNHdgsaKGSGFVRFQTIQAAQQAIdamNNRYELRGRVLSVSMAETSRDKQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001162897777 81 0.425 6.462E-12 101 154 414 6 59 74 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MTKKLYVGNLAFATTSDDLRDAFSQFGTVTSATVITDRETGRSRGFGFVEMDDE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>14403|Ga0335071_12384635_1|+2|10 81 0.294 6.462E-12 112 187 414 0 77 83 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------YTVTEDDLREAFSAYGQVTRVSVITDKLTGRSRGFGFIEMADGAQAKAAMEALHetELKGRKMLIREAHPRGDRQSRP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001346541725 81 0.268 6.462E-12 101 180 414 0 81 84 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSVRLYIGNLPFEVSGDDLNLLFSTIGAVEDAIIVTHPGGGRPRGFGFVEMQDEQDAYAAIEQLngHLLAGRSLKVNVANSR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001288018497 81 0.307 6.462E-12 104 179 414 1 78 97 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNISFNLNSQDIHSIFSQFGEIESADVIYDRASGLSRGFAFVRMVSDDASRNAIENLHgsMVDGRALVVSESKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719325_346198 81 0.270 6.462E-12 105 187 414 13 97 99 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVGNLPYSVTKEDVQDEFLRYGTVVKTELATDRETGKSKGFAFVEFEHEAEAQDAQQNSNrkSVFGRRIIVDFKKSKGKDGKEP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712228_906315 81 0.235 6.462E-12 104 190 414 9 97 99 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KGFCYIDFADQEAADKALSyAGSDFNGRAIKIDNTQKSSAGDTDEKSLTCFVGNLSYDTDEGTVQEFFSSCGTVASVRLitdkeTGDSKGFCYVEFETQE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5665213_1230402 81 0.297 6.462E-12 101 182 414 12 94 102 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ENRKLYVGNFPYTTTEEDLRELFSDQGDVRSVRIMTNAE-GQSKGYGFIEMKTPMGAISAVKVLEQrdFGGRRLRVAFANPKNS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>10503|Ga0209438_1280493_1|-59|00 81 0.268 6.462E-12 105 183 414 3 84 107 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGGLPKDCDDGALQAYFSSFGTVTKQEVKIDLMTGNPRGFGFVEFDSPDAVAKVLASYsaHMINGKWVEVKEAVAKGKGD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5260370_18879785 81 0.247 6.462E-12 98 184 414 1 89 111 +--------------------------------------------------------------------------------------------------ERRMIKNIVVRNLSFGSTELDNRSLFEAYGKVDRVSIVTDRESGQPRGFGFVEMSDDGEGERAIAavNGHEVGGRALNVNEAKPKSSSG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712176_607305 81 0.239 6.462E-12 92 185 414 4 99 111 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+-------------------------------------------------------------------------------------------SGGRKNSQSDEGCKIFIGSLAYETTEGTIKEYLQYYGEVVDVFVAKDKETGKSKGFAFATFAFPWVADLACAdKGHMLDGKNVMMRLSENKSKAPPP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001134072413 81 0.250 6.462E-12 104 193 414 1 92 116 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGNLSGETTEEDLRHAFESFGQVRSITIVRDETSGESRGFAFVIMPLANEATNAIEKMNGkdLRGQKIKVEKGRTKAKARSSRRKRSGF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719333_2067827 81 0.289 6.462E-12 97 207 414 0 113 119 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RTPDPGANLFIGALPPTVTDASLTAAFSRFGHILSAKVMLRVSTGASRGFGFVLFSSAAEAERAMQEMDgaEIAGHPGAIQVSVSKHRGENlTAESRVVYVRNVPAVVSNDEAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001321202749 81 0.229 6.462E-12 104 188 414 1 87 127 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIFIGNLPFKISRKEIAKAFTKFGPIRSINIVKDRQTRQPKGFGFVEMAKEEDALSAIHTLNGtsLKGRSIRLEKARDRQAGGSPVP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719378_1634683 81 0.430 6.462E-12 2 78 414 29 106 131 +--DFVRECEsvDEDEKITEVAKESDGSVLLSSIQDYFPNAVGLRYK-SDSGSWRGVRLLDGVLEAPHGGWGSASYIVTLKK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690242_15873153 81 0.218 6.462E-12 98 212 414 17 143 144 +--------------------------------------------------------------------------------------------------DPEKFTNIYIKNLAATYTEDDLKRDFGAFGSIQNAVIIKDTKD-VNRAFGFVNFTEHESAQRAVDEMNGkaLNDREVYVGRAQKknerdtllkklREERAQKYQGINLYVKNLDDSVTDEKLQEAFAP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000536600513 81 0.283 6.462E-12 99 177 414 3 83 149 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PTDKHDVFVGNLAFETKEEDLWSVFGAVGKVNAVRVVMDRDTNRPKGFAFVEFDDAATALSAIRNLDGqdLNGRNLRVSYS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSMisStandDraft_5_1062788.scaffolds.fasta_scaffold8250112_1 81 0.304 6.462E-12 98 187 414 52 143 150 +--------------------------------------------------------------------------------------------------ELQGLMKIIVLNLDRSTTQSALQDCFSSFGDVQYCTLVLDKGTGKSKGFGFVEMPQAEQARAAIKGLHasDLDGSIIRVKKAEADPQDEAGP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712126_535174 81 0.228 6.462E-12 96 182 414 50 141 164 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+>ERR1719201_1293963|ERR868429_k119_3316692|+|422|2.548e-117|2|152|1167|152[152]:445[445]:294[294]|937[937]:1167[1167]:231[231] 81 0.281 6.462E-12 101 208 414 58 156 175 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DKRTLYVGGLADEVTAETLNAAFVPFGDVRDVQLPMDYAQGKHRGFGFVEFVEAEDAAAAVDNMDnaELFGRVLRVNVAANKRLRSEAL-----------WSATEDQTWE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711962_1059772 81 0.260 6.462E-12 63 176 414 27 136 176 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+>MMETSP1315_Transcript_12899_20408785|ERR868410_k119_1047087|+|468|3.621e-131|2|605|1491|605[605]:997[997]:393[393]|1285[1288]:1491[1491]:207[204] 81 0.276 6.462E-12 104 177 414 95 170 199 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLPWGVDDLQLGDLFQPFGNLTETRIVLDDQTLCSRGFGFVTYATKEDMLAAIDAMdgHQVDGRDITVQIA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719282_684687 81 0.257 6.462E-12 101 204 414 44 145 201 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNSKVYVGKLSAATTENELRELFSSFGNVSEVNVPKQRPSGLSRGFAFVTMATPEGARSAIHGLNGMVIRACRLDVSEAR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001252741549 81 0.266 8.597E-12 104 191 414 1 90 94 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIYIGNLNYRLRTEELKNEFLPYGEVLGAKIVRDQETKRSKGFGFVEMVNDADGLRAIEALngHELKGRKMIVTQAKPRESQDGIAESNN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1X4XYL8 81 0.295 8.597E-12 104 189 414 4 85 94 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLVGANLAFKTTEAEVRQLFAQAGTVTQCEVIKDRDSGQSKGFAFVTMASPAEAQKAIGRFHGasLAGRKLTGNAARPREREP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990170_2342779 81 0.292 8.597E-12 97 183 414 10 98 101 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RRVKMGPQLYVGNIAFSVTEEKLKELFSRHGSVVSVRIITDKISGCSRGFGFVEMGSGGEAQRAVAALSGadFEGRAMVVSEARAEPSR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A0G1FAE4 81 0.309 8.597E-12 101 182 414 0 83 101 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+------------------------------------------------------------------------------------------------PEAGQSNKKVFVGGI-KDIEDADLEEYFSQFGTVLSASIMTEKDTGKKRGFGFVEFDDYDTVDKIIlKGEHVVNGTRIEVRKAIDKKDMNASGGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712142_480402 81 0.454 8.597E-12 2 77 414 33 108 110 +--CYISIQDDVTGVSVELPSEKDGTMLLSTISSQFPGAVGLRFK-SESGSWRGVCLSEDkVFHVPFDGWGSVDYQVVMP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5690348_14069193 81 0.277 8.597E-12 104 184 414 1 83 111 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLYVGKLSYQTTSQDLADFFGQIGQVQDAIVVTDRETQSSRGFGFVEMQNETEACNAINQLNgtELSGQTIIVSEAHERTQQP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712018_959251 81 0.405 8.597E-12 1 78 414 0 77 112 +-ACYIKVGPNEkSTEIIEIPSERDGRLLISSVSAQYPGATGIKFR-SESGKWRGCRVQGNFIDPPENGWEEKNYYICKPK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3990167_6884327 81 0.266 8.597E-12 104 177 414 2 76 113 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+>GraSoiStandDraft_5_1057265.scaffolds.fasta_scaffold5830225_1 81 0.257 8.597E-12 79 177 414 42 142 152 +-------------------------------------------------------------------------------DRDRDRDRGFDRERGKPPPEIHHLVSVKVDNFPYETSQRDLRPLFEKFGEIGDIHFPQDRYTGRPRGFGFVRFTSQQAADDAVAELDGrdFQGRELRVSMA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550534_313736 81 0.281 8.597E-12 104 196 414 16 111 165 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RIYVGSLAFRAEERDLYDVFDKYGNVKDVRIITDRDTGKSRGFAFVEYTCKRDMEDAIkgADGKDIAGRAIKCYKANPRGEGGRGGRDRdRGYGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719316_2104047 81 0.315 8.597E-12 99 191 414 5 98 167 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PPATKKCFIGGIPATTTEEQLNDYFAQFGSVEKAVIKKN-ENGESRGFGFVIFDHWDSVRIVLQkyEEHKIDDKWIEVKEAIPGPNQISKPKAGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001019256422 81 0.283 8.597E-12 104 182 414 23 103 170 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFIGNLPFKVTNLELTELFCGFGRVVGVNHRKDRSTDKSKGFAFITFDTPAAAAAAIENMNGksFEGRVLSVKTALARGQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_1669101 81 0.290 8.597E-12 104 187 414 24 109 178 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVSGLPWACDDDMLWTKFAEHGEVSFSRVCYDQDSGRSRGFGFVSFKDEAAARKAKEGMDGadMEGRAVKCNYATDRPPAADRP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APDOM4702015159_1054818.scaffolds.fasta_scaffold2225392_1 81 0.358 8.597E-12 184 338 414 0 157 178 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QKDKSSCKICVGRITENLRKEDLKDHFETMGQVTDVYIPSPFRHFAFVHFSESKVAQSLLGKEHMIKGVSVKIGEASPKGREhggGRDFDRGNRFGGFDGGYGRGNMREGGQMGFGnPMQQGYSGGYNTGGNFGGNSPSWG-MGGGPGPSSSYGGGMGN--------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719473_970297 81 0.229 8.597E-12 103 188 414 11 97 182 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TTIYVGNVPYTSNENGLQEAFQRFGEIVEARLIRNKRTGESRGYGFIKFATQESAKAALESTDiKLENRDIIVKYASGQRRNRRNRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719189_2439885 81 0.250 8.597E-12 96 185 414 26 117 188 +------------------------------------------------------------------------------------------------KKTSEVGANLFIGNLEPEVDEKMLYDTFSAFGVLLFAKVMRDPDTGESRGFGFISYDTFEASDASLAAMNGqfLCNRPISVSYAYKKETKGE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712216_325234 81 0.181 8.597E-12 104 224 414 2 183 190 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLFIYHCPANWGDDDLKTAFAAYGQIVSATIMKDKTTGLSKGFGFVSFDNPIAAQQAIMAMNglEIEGKRLKVELKQPKVPQGgamvgnmamapyglmmggmggmggamqpwggmgnmqmmgmggmgamgkgamggggggnkGGPPGCNLFIYHVSPTWGDDDIRLCFAPFGTVISALIMKD--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>26250|scaffold_537995_c1_1|+3|10 81 0.302 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+------------------------------------------------------------------------------EKKKRLLEDLLPGGVRRRATREDLGRKVFVGGLNPTTTTEDLRAYFSDFGTVTDSCVITDSSSKASRGFGFVEFE-GKIPEGLLDQQHIIDQRRCGVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SoimicMinimDraft_17_1059745.scaffolds.fasta_scaffold557982_1 81 0.303 8.597E-12 101 177 414 150 228 240 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MMSRIYVGCINYDTREDAIRQAFSAFGPIRSITMSWDSMTGKHKGFAFVEFEQPEAAQLALEQMNGIlvCGRNIKVGLP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719427_2002168 81 0.312 8.597E-12 104 182 414 10 89 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PDAGEKIFVGGLPKSASQDSIWNFFSQFGNCTNVDLkydeMGGFRGFGFITFANEQAAQAALGNGPsnMFEGKWIDVKPAM-KGESGKGGKSGGDKGGCKGGGDKGGCKGGGKGGKGDWGGGGGKGEKGGDGWGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>21883|Ga0256868_10064829_2|-582|00 80 0.292 1.521E-11 104 196 414 1 99 149 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVGNLSRQTTEEKLNEAFAAFGAVESVRIVKDAASGESKGFGFVTMPVDDEAQAAIIGMNGkdLDGQTIKAEEGRAKtdvpRSRERQGGSRGGYRGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APCry1669188879_1035177.scaffolds.fasta_scaffold06736_6 80 0.220 1.521E-11 86 192 414 1 109 150 +--------------------------------------------------------------------------------------DSGSRSPPRSPRGAERAPSLHIRGLSSRIRPDDLRDEFNRFGKIRDVHLPRDYNTGEYRGFAFVEFYNKEDAEKALAEMDgkELLGRRMEVNMAQGARQTPDDMKKKDV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719336_974616 80 0.250 1.521E-11 102 183 414 11 94 153 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SKCVFVGNIPYDATEDHLIEFLGSVGEVTRLRMVYDKETGKPKGYGFYEFKDAKMAQSAIRNAHGtdFLGRAIRIDHADDDSAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719265_1273246 80 0.298 1.521E-11 78 189 414 40 153 155 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0 134 189 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GKVVEVVLAKEKGGGQSKGFAYMTMGDMLSRDIILSDRHVIGGGEVSVMLS---KEELVGADGRKVHVDNC-MNISAEALREAFSRFGPVLDVhtpkdHRTGERKRFGFVTFGTEEAMSAAIATERVLIGMdEVSVKPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712223_2337785 80 0.305 1.521E-11 101 184 414 46 130 195 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DHAKIFVGGLGQDLNEEAVRSYFSTFGEIKKINLVMDKVTKRSKGFCFIVFSNEISAvAACMNNTHYIKERRVDVKKAISNTKNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719374_419091 80 0.298 1.521E-11 104 179 414 159 235 268 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------DDDTKFTKLFVGGIPYHTEDETMKQYFLQFDDIVEAVIIRERNSQRSKGYGFVTMATKEGAQRAIvNKRPVIDGRRANVDLayigAKPKTPKEAPQQDGTV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UPI00073A06B3 80 0.280 1.521E-11 92 188 414 8 107 429 +--------------------------------------------------------------------------------------------ASSDRRTAEVGANLFIGNLDPDVDEKLLYDTFSAFGVVVSTpKIMRDPDTGNSKGFGFVGFDCFEASDAAIETMggQFLAGRPVSVMYAYKKDSRGARAR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_SOC_28_MAG_00061_000000012946.1.4 80 0.309 1.521E-11 89 184 414 301 397 524 +-----------------------------------------------------------------------------------------AAASSGASRKGEASSKVFVGKLAASINEDILRQYFERFGALVDVYIPKDHSSGvAHRGFGFVTFDEISAAEKVLGMPHEIEGTPVVMDRVDPKGSKG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_26759 80 0.291 1.521E-11 86 181 414 272 367 547 +--------------------------------------------------------------------------------------ERAERRRAEAVDGGAQDKKIFIAGLPEGATSESLGQHFSRYGGVSEAVVVNDKVTGRSRGLGFVAFETAEAAAGALSSRQVVDGKQVECKACPQRQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0N0P954 80 0.234 1.521E-11 103 221 414 71 199 768 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TRSEDLREEFSKFGPIKDVYLPVDRESQRPRGFGFVTFEEQRSADDAIAQLNEqdFMGRRIQVNFARARGAPRGGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001261576668 79 0.256 2.023E-11 104 175 414 3 76 77 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NVFVGGLPLSMTEDTLRKMVKEFGTIESVKIITDKVTGRSRGFAFIEMGKKEEAAEAIKKLNekELEGLKLRAN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001491514606 79 0.263 2.023E-11 105 178 414 2 77 79 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLYVGNLPFSTTDADLQQAFSQYGTVTKAQVIQDRETGRSRGFGFVEMSSgAEEA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR6185503_6758950 79 0.256 2.023E-11 103 182 414 19 99 105 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKLYVGNLPSMTTEETVRDLFSAHGTVEKISMMFDRNTGRPRGYGYLVMSD-SDASRAMQALNGkdLDGRAISISDAEDRAP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712159_548437 79 0.424 2.023E-11 12 77 414 2 66 106 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVGGLAATVDDEILSKHFSRFGVVVSAEVMWNWQTGRSKGYGFVEFKNDEACRKALtDEPQQIAGKVIDVKLRQVRGGKSDGKGKDK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719359_2788317 79 0.309 2.023E-11 101 196 414 4 99 131 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DKKRLWVGALPDEATENDIQEYFSQFGTVERCELKTD-VDGKSKGFAFISFADEQEAKAALEfDSHTLGSKTIEVKRPNVKGKGKGKGKGGKGNMGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711934_1229859 79 0.275 2.023E-11 78 164 414 39 125 132 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+>HubBroStandDraft_2_1064218.scaffolds.fasta_scaffold51997_2 79 0.280 2.023E-11 104 188 414 3 91 176 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLLYATTHESLRKYFEKYGTIESAEVIFNRDTKKSRGFGFVIFHENYSLLQALkdqeKADHIIEGKAVEIKHCVARQDISPKSP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001351192827 79 0.359 2.023E-11 104 192 414 59 147 180 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFVGGLPQQATQWDIKDHFATFGEVVKGDLKRNQKSGRSKGIAFVMFNEVETLNTVLTQEHTIKGKKVGVEEARPKPKGKKRPLNASI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001285241579 79 0.267 2.023E-11 101 184 414 0 85 184 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MAKKLFVSNLDFEITGEQLREMFAEFGSCISAVLATDRETKRSKGFAFVEMERDEDAIKAIEALNnkIVNGRPMKVAEDRGKTSSP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711865_1192403 79 0.307 2.023E-11 101 189 414 25 115 205 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DANRIFCGGLPQTCDTNQLGEYFSQFGEILEAKVHIDPATQRSKGFGYISFDSARSVELALASGrsLTIDGKKVEVKRCETKNKDKAPGSS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719373_1126562 79 0.284 2.023E-11 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HVVKGKKVTCKKAEAKQ--------GKIFVGKLPtgETLSKEDIQAHFSQYGEVVEGTRPvdkaknKEPKGFGFVTFARDHVARDLVKQGeTTIGDHTVEIKKVTPKDP-------NAGFGGGMGGWGFDPYGGYGGFGGYGDFGGYGGYGGGPGGWGGFGGGP---------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001189545474 79 0.308 2.023E-11 99 191 414 17 110 326 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PQYSSQVFVGGLPKTATEEEVGWFFSQYGPVARVRLIYDKETGASKRYGFVEFAHPEIAAAVKDLRNlQFQNRTIDVNYASRHISQMSYGMPPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712146_770693 79 0.303 2.023E-11 101 166 414 8 73 327 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EGTKLFVANLEKSFNEEDLRKIFEKFGRVTDASLAKDRATGYSRGFGFITFDDEDDALDAKDDLNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719242_1755933 79 0.282 2.023E-11 103 193 414 144 235 377 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKIFIRSLSYETQDKTVHDLFATFGNVKEAVIVNDRMTGLSRGFGFITMSNASEAQKALAEHQkLIDGREAICNLASKPQGQRPLKPSFHHF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_37_1057305.scaffolds.fasta_scaffold1412370_1 79 0.267 2.023E-11 78 176 414 218 318 399 +------------------------------------------------------------------------------KDGKDGKGKKEKSKEKDDATFGPQGCNLFVFHLPDEWGDEDMLEYFSPHGKIVSAKVMKELGTGRSRGFGFVSYEAQADAATAIRKMQGykIQGKRLKVEF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A2E4YUX9 79 0.285 2.023E-11 96 177 414 252 335 406 +------------------------------------------------------------------------------------------------RDMYDPASRLFIGGLAPETEARDLSDLFSRCGHVVDAFVIRDRDTRVSKGYGFVTMGDAGMASQAARklNRHELHGRNIAVRPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000546897256 79 0.273 2.023E-11 79 189 414 376 491 949 +-------------------------------------------------------------------------------DQKRGDEEDVKKHDSEEEEEVHSPRvasnRLFVRNLPFATTEEELEEHFSTFGSVSECHIPVD-DRKMSKGFAFVTFSNGQDATRALEELDGtdFQGRFLHILHSRQKPQDDSGAGN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000042899417 79 0.352 2.690E-11 97 167 414 3 73 91 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DDQTKDCKIFVGNINNKTTKEDLKDLFSKYGEVDKSFIIYHHKTKQSRGFGFVEFTDKSSVERVIADKSNI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719431_2284097 79 0.393 2.690E-11 81 167 414 4 97 99 +---------------------------------------------------------------------------------KRKMDDSGDQPGAKLVRTSEEssssgssSGDMIVLGLSYSATEQEMRTYFEQFGKVELAEIKKDRTTGRSKGFGFIRFDDKSVANTVLDTSHSI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5579872_3784091 79 0.227 2.690E-11 104 180 414 18 96 99 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFVGNLAVEATEAEIRTLFEPYGTIKRVSLIRDRQSGVFKGFGFVEMRLDSAGDTAITELNgkETNGRTLDVRAARPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5262247_4294849 79 0.273 2.690E-11 104 174 414 28 100 101 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLWVGNLSPEATSEEIRDLFSNVGVVESCQLIEDKETGRPKGFAFIEMNSLEAAYKAKEkfNGHELHGKPLKV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000994285483 79 0.235 2.690E-11 104 184 414 6 90 101 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVSNLSFDVDSSQLEAMFSEIeGvNVIEAKIITDRESGRSRGFGFVTLETEEMAEKAITEMNGkvVNERPLTVNIAKPMEKRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688572_3861591 79 0.416 2.690E-11 92 151 414 42 101 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------AQQPRRNTTGPVRLFVGGLSWGTSSEDLRALFPKFGAVDEVTVIMDRATGRSRGFGFVTF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5271157_2848660 79 0.290 2.690E-11 96 179 414 5 90 104 +------------------------------------------------------------------------------------------------PPDDADYARLYVVNVPFQTADSDLQEVFGRYGDVLNVSIPVNHETGRSRGFAFIEYETAEQARKAlsMSGKLTIGGRTLYLQKAEP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712224_738473 79 0.292 2.690E-11 103 180 414 23 104 106 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSIFCGNFPWSTTEQDLHMLFETIGPLNSVRIIFDRDTQRSRGFGFIEFTNEQHAAEAIQQYDGFMmgnpARPIRCAYSNKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_3202645 79 0.311 2.690E-11 104 191 414 7 95 107 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLHVK-VAYKATESDLRRCFEKIGPVSDVCIVMDRETDRSRGFGFVTFENDQDASDAMDQLDgkEIQGRAIQISRAHARGSGGGGGRGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001039316066 79 0.296 2.690E-11 103 191 414 2 92 108 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RELYVGSLPYETTEDDLRRLFSVAGNVQSVHLITDPVSGSSKGCGYVKMTTVSEALEAINCLDGalLDGRIIAVSIAREQKPQPKGERGTR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5436309_15370526 79 0.285 2.690E-11 109 183 414 0 76 111 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLAFGLGEGELRELFRAYGTVRSAEVVRDRDTGRSRGFGFVEMGTERDARAALAGLHgkEVRGRALSVTQARVDERQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_543217 79 0.259 2.690E-11 127 226 414 3 106 117 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+------------------------------------------------------------------------------------------------KQHYPESEQVYVGNLSYQVNGYQLKEFFAQYANVDHVRLIKDNRTGRSKGFAFVTLSSVEDAKKALSANCVdLRGRALVVRMAKPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4051812_22795710 79 0.284 2.690E-11 104 193 414 33 127 132 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVAGLPNDFDDTDLKEMFELYGEVTSARIIIDRATGKSKGFGFVDMLNKTEALETIEALDGAGlrrGKKITVKQAeeQPKNNNLGGRSNNNRF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719466_550870 79 0.313 2.690E-11 105 189 414 0 85 133 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FINMVDDSSADQIFGQQHMLNGKSIDVGRSsrgkqvKPGEDITPQADKRKLFISNLTENTTEDAVRQYFQKYGDVSLITVcrdlSGNSRKFGFVKFTSEEVAKIILdeNKEHEIGDAFVVV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>4423|Ga0307474_10221989_1|-3|10 79 0.294 2.690E-11 91 188 414 1 102 136 +-------------------------------------------------------------------------------------------SAERTHGPMEQQNRLYVGNLPYDiVEDDDLGAIFTDLGfKVARPRIIKDRDTGRSKGFGFVEILPPEMTNDAIrvSNEHMIGGRPLKVSVAKPKEPGAGGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690606_31138633 79 0.275 2.690E-11 105 188 414 0 86 139 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IFVRNLSFGSTDEALKAHFENAGhQVRSARIVLDRETGRSRGFGFVELMSDERFDDAVSALDGsfLDGRPISVREAHDQRQGSPPRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719246_116037 79 0.234 2.690E-11 163 296 414 1 133 141 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EEHAVKGKKVAVKKAQAKQ--------GKVYVGKLKPELSDEEIKAHFEQFGQIAQVEQPfdktkNERKNFCFITFEKEDAAKKLPKEGsTTINGVELEVKKVTPKPDPRAMMGMGrGGRGGGFGGYNPYGDYYGGGYGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719187_930896 79 0.431 2.690E-11 204 312 414 0 108 145 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EDLRTYFGKYGEITDIYIPKPFRGFAFITFLSPEVAQSLCDEDHIVKGTSVHISNATPKGTGQQQNMPRGGPGGPPEGWNQGGPGGQNMNPLNMLAALTQASWGLLGNM----------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719343_1913101 79 0.352 2.690E-11 102 188 414 14 101 146 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SATVFVGHLSQATDRDALRTYFESFGEVVETDVKYDHKTKRSKGFGFVTFADSSTVTDVVNhSDHKVDNRRVDVKRYSLGGEKDDEYP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719379_115503 79 0.402 2.690E-11 119 190 414 2 73 148 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------RPEDEGRLLYVGNIPWRASWQDIKDHFREVGPVIRVDIPVDRETRRSRGFATVLFEHKDDAARAIQKLNntELNGRSITVRF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>R7U2X5 79 0.260 2.690E-11 80 192 414 7 125 156 +--------------------------------------------------------------------------------NERELELGLAGSGASWHKEFKESAWVYCGGLPYDLTEGDVVCVFSQYGEIVNVNLIRDKGTGKSKGFCFLCYEDQRSTILAVDNLNGfkILGRTIRVdhvkDYKAPKEHGDEDEVTRKI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711874_750317 79 0.265 2.690E-11 96 188 414 0 92 168 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+>ERR550534_1444127 78 0.282 4.757E-11 103 193 414 306 397 409 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKLFIRGLNLLTTDDTLREVFQAHGTVVDVNIIKDKINGTSKGYGFVTMSTASEATEALKTPSrEIDGSVTHINLASVRRNPRVAPAPIPVF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719443_907046 78 0.280 4.757E-11 112 191 414 150 231 422 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------PETTDDDFRCYFETFGDIVESQIMQDHMTGRSRGFGFITYATEEGVQAVYTHGrhHELRGKQVEVKAATPRKVDGKGGGKGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>FEC22Drversion2_1045045.scaffolds.fasta_scaffold00241_26 78 0.285 4.757E-11 103 183 414 76 159 425 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------CKVFVGNVSYRVKSRELKEFFSSFGKVIYAQIITDRIKKRSRGFGFVTFSNEWEAQKAKDSSDEertLDGRIMKVCSPERKKKG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719277_2116185 78 0.261 4.757E-11 82 190 414 229 338 582 +----------------------------------------------------------------------------------RAREFKAKTAPASGSQARQQGVNLFIKNLDENTDDAALRALFEPFGAITSVATPKD-ERGKCKGFGFVCFASPDEATKAVTEMHlkVVKGKPLYVGLTEKREARQERLRQR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A067MQ97 78 0.265 4.757E-11 85 167 414 424 506 900 +-------------------------------------------------------------------------------------ESMASPSKSSRPPAPEEGTTLFIRNVPFEATDEDLGELFRSFGPIRYARVTMDKGTGRSRGTGFVCFWKVADADHAVEESDKI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1Y1WIS5 78 0.290 6.324E-11 104 165 414 4 65 66 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPPSATDADLNSAFSVYGTITETKLMIDRETGRSRGYGFLQFESESSALEAVKVGN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>22843|scaffold441330_1|-2|11 78 0.315 6.324E-11 104 174 414 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QGCKLFVYGVSENVSNSELEEAFGKYGTVTDTYNTG--KGFAFVTFDNKESAEEATqqMNGQTVFGQELKVNEARPKENRGGGGYGGGRGGGGYGG-GGRGGGGYGRGGGGYGGGGYGGGRDGGGGYGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_29_1057270.scaffolds.fasta_scaffold863965_2 78 0.320 6.324E-11 101 176 414 99 176 179 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QGVCLFIYHLPPECDEATLHQLFSNFGTVLSSRVMKDFQTGRSKGFGFVNMLNDQQAQAAISGLNGfqLGGKYLKVSY--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719491_322966 78 0.277 6.324E-11 102 189 414 89 178 181 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SKTVFVGNLPFGASEEDLEELLSGCGEVVATRIVRDKDSGDPKGFAFVDYVDKECTFDAVQDLHgvEFQGRRLRITLAEGSAASDKRSDS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719161_1293720 78 0.294 6.324E-11 101 183 414 26 110 183 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DQKQLFIGGLPKTINEDALKNYLLQFGNVTSLDIKMDPTTGQPKGFAFVSFESGGGAQLCLHNysENTLDGKWFEVKPTPQKGKG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>E9AMK9 78 0.273 6.324E-11 101 182 414 17 100 245 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QSRNVYVASLPLSFDDQQLQDLFSPYGRIVSARIMRAKKSHASKGYGFVMFREASSAEKAIEGLHGrvVDGSRIQVRRANADAS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719247_479912 78 0.299 6.324E-11 86 192 414 148 253 310 +--------------------------------------------------------------------------------------QDKKAPLPRRSGRANPTQKVFIGGLSTVTTEEDLRSYFGTFGTVASVDILVDQETQKSRGFGFVVFE-GQVPDGVLGCNHCFHGRYCGTRMYDQGPSRPDAYRSSYL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>R9AI36 78 0.260 6.324E-11 105 196 414 13 108 314 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------DPEKQSTLYVRGLNEETTHGFLAEHFSQSFPIKHAIVVTDKETGKCKGYGFVTFVDHEDAKRALEEFHGqdFGGKKLNVTLA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12613|JGI10216J12902_111049547_1|-50|00 77 0.268 1.117E-10 104 183 414 57 138 142 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGNLDHSTSSAELERVFGEHGQLLSAVVISDRFTGNSRGFGFVEYVSGDAAERAVSSLNGadLRGRALVVSAARDRKPG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719228_451334 77 0.303 1.117E-10 103 190 414 8 96 143 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKMFIGGIKEDTTEDHIHEAFADFGCLKSVDIVKDKLSGKVRGFCFVEFDDYDSVDQcVLKKRHNLNGKSVEVKKAVSKDQQQSGGGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APIni6443716594_1056825.scaffolds.fasta_scaffold1961977_2 77 0.273 1.117E-10 97 189 414 14 108 151 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RREGEGFSLLVRNLPYSVLADELREDFSRYGQVRDVHLPKDFYSGKPRGFAFVEYTDRTDAEDARNQMDrrRYDGREIAVMFARQRRKTSNEMRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UPI0002310872 77 0.451 1.117E-10 101 162 414 98 159 162 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179 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PQKMCSVFVGNIFWDVSEQELGDWFSQCGVVNSAYIKTDRQSGQTLGFGFVEFNDPNIADDVIKRMdgSWLAGRNIRCNRS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>WorMetDrversion2_4_1045186.scaffolds.fasta_scaffold00218_1 77 0.260 1.117E-10 96 183 414 18 109 197 +------------------------------------------------------------------------------------------------REPVARSRTIFVGSLPIDpnaASDAELAAFFARFGVVESSPVVLHRGTRRSRGFGFVTFEAAESAEAALREPsHTLRGHSLAVKLAESHDPG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>18327|Ga0308174_10608467_2|+305|01 77 0.291 1.117E-10 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------EQNNQLYVTNLPWEVDESGLEEIFSEYGAITECSIPTRK--GRSLGFGFVTFGDAECAAAAMEAMagarvGEVEGaREIAVKIAREKGAGKQQKQAKK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UPI0007FED4DE 77 0.292 1.117E-10 103 191 414 1 89 236 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKLFVKGLPSSCSNAQLQAAFASFGTIDKAFILFDHASGTSRGFGFVEFIDEAAVNRALSAVVVIDGKTLKCSQAILKQEAKVSPSEPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719198_1201553 77 0.270 1.117E-10 111 191 414 0 84 266 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------PYKTLFVGRLKYDTTEEALYQFFSRYGKLQSVHLIRDLVTGCSRGYGFVEFVHEEDFTSAFYGAHrtILDGSQILVDF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001481591047 77 0.272 1.485E-10 103 177 414 386 462 466 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RDVYIENVDYDTQNEELEELFSKFGKVLKVTLPKDFYTGRGRGFAFITMEDEESADNAIRNLSntMFNNRIIRLNWS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711962_222534 77 0.288 1.485E-10 90 184 414 376 472 474 +------------------------------------------------------------------------------------------SSYTAGKKTGPENANLFICQIPSDFNDGDLQQMFSPFGNVISAKVFLDKATGASKGFGFVSYDNSASANSAISAMDGyaIGSKRLKVQLKRPKDSKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719336_2657900 77 0.259 1.485E-10 89 192 414 149 252 488 +-----------------------------------------------------------------------------------------AEPFKPADKEQVEARTIYVENLPQDADHESLKKLFSDFGEVVYVSIPRFPSSRRSKGFAFVEFSADSAVVAVLAAMEGVQGELASIKAFQEAEAEAGPSNKRKL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1G0WGX5 77 0.265 1.485E-10 98 174 414 517 595 601 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177 +-------------------------------------------------------------------------------------------PSNDEKIKSDPHRTIFVAQLDFNTTEEMLFDTFGRYGSIERLRLVKDVKTGKSKGYAFVEFSDDSEAKRALrevkDERLVVDGRQVLVDR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_662707 76 0.239 1.974E-10 158 258 414 1 120 186 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DAVLQEQIELDGKILDVKSAAPPGQAPPPkeqmmvqqgpiggPPTDKIFVGGIGQATT-DDLNEYFSAYGNIIDSvamidKATGKLRGFGFVQFDNTESVESIMLdhESHQILGQWVDVKK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719265_2223208 76 0.301 1.974E-10 105 175 414 111 183 187 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+>BarGraIncu01122A_1022018.scaffolds.fasta_scaffold56996_1 76 0.202 3.485E-10 100 185 414 73 161 224 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PMGGNIFVFHVPINWTDEDFHAHFSPFGQIVSAKIHTDPVSKASKGFGFVSYATPQAATMAIKGMNGFDtkqGKNLKVTIKKGEETYNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000677864114 76 0.444 3.485E-10 104 157 414 168 221 253 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLFVGGLEWGVTSLDVRRYFSTFGRVDDAEVLVDRNTGRSRGFGFVSFETEDGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------PMGGNIFVFHVPINWTDEDFHAHFSPFGQIVSAKIHTDPVSKASKGFGFVSYATPQAATMAIKGMNGFDtkqGKNLKVTIKKGEETYNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>APHig2749369809_1036254.scaffolds.fasta_scaffold1780968_1 76 0.300 3.485E-10 101 188 414 4 93 326 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DASTLFVRNLSFATTSESLEAYFGEVGPTKLCFVVTDNSTDKSKGFGYVRYAVPEDATRALTELagKELDGRAPHIQYAKRRPSQQQRRG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_PSW_86_MAG_00274_000000001625.3.4 76 0.337 3.485E-10 105 182 414 312 391 393 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVYHLPAGVNEEYLYQMFSPFGQVTGVKVVVDSNTGYPKGYGFVNYATLEEAQQAIMNMNGfqIGNKRLLVSFKTQKQS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719284_139615 76 0.337 3.485E-10 97 177 414 328 410 414 +-------------------------------------------------------------------------------------------------PPCSKENTIYVGGLSFSASEGDLVAKFRVAGEVVSVDIKIDRETGKSRGFAFVSFSCPQSVEWALKKLQgvEICGRAVRLGLP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_G4LYA7 76 0.231 3.485E-10 98 184 414 3 97 451 +--------------------------------------------------------------------------------------------------DTSEGRTIFIRNLSFDVEEDALYKFFSQFGPLEFAKVVKDPATQHSRGTAFVKFVNVEDASNVLQQSDKpenahqfsLENRTLNITIAVSRTEAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001059680587 76 0.273 3.485E-10 78 161 414 279 362 478 +------------------------------------------------------------------------------EDVDEDENEEDGEEDAEDKEDARNASTIFIRNLPFTCTDETLYEHFTQFGQLQYARVVVDPETERSRGTGFVCFRNMEDAISCI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A087G4V7 76 0.276 3.485E-10 101 192 414 228 321 770 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DTGRLIVLNLTYTTTEEEIMDRFSKFGEISEVHLVIDKETKRSKGFAFIHYLIPESASRAMKELDnkVFQGRLLSVLRADKQVAFPNKYDTCNL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9300|Ga0075405_10715564_1|+1|11 75 0.363 4.630E-10 143 219 414 0 76 78 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SRGFGFVIFENEADTDFVVAKSHSLDGRNIEAKKAVFWGQIIDRFRTRKIFVGGLIASITEDEFKKYFEHYGPVSEV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000932542861 75 0.276 4.630E-10 104 177 414 1 76 79 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNLNEHIEEKQLKEAFREYGKVTHAEIIRDNLTGRSKGFGYIEMPDIKQAINVITNLNGgtWDGKKITITKA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000182748631 75 0.295 4.630E-10 115 183 414 0 70 80 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TEEELESLFTSFGEIKSIKIIKDRETNKSKGFGFVEMENNKEAESAIEMLDqaMVRGRNITVKVAEERKPR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001074149623 75 0.271 4.630E-10 104 183 414 0 80 82 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLRVFSLPEDIQEDELLPLFAPFGPLErRPHVARDKDTGQSRGFAFLTYVHAEDAQAALDKKHMIRHMVLQVDLAKPRDKR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A268TB75 75 0.269 4.630E-10 105 180 414 3 79 83 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYIGNLSYGVNEQQIMELFSQYGEVASIKLVNDKETGRFKGYGFIEMND-ENALNAISDLDktQYLGRTVKVSEAKSR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A673T9Y8 75 0.597 4.630E-10 0 76 414 0 76 92 +LSEYPQVTEDENDKPIEMPSEEDGTVLLLMATAQFLGACVLPSRNLMFPCMRGVRLIEEILHVPSEAGGGNLVCVVR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000426179395 75 0.243 4.630E-10 105 184 414 4 85 98 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVAGIDFALTETQLKDVFASHGTVNSAKIITDRMSGNSRGFGFIEMSSQAEAEECIRKLdnSTLSGRQIGVRFKEDKPASG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001158971473 75 0.272 4.630E-10 105 190 414 2 89 99 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------TTIWVKGLSYDALENDLKEFFKDCGEITTIRLPMDDYKNTNRGFGFVEFASSESVDKALElDGQEMMGRWLQIQISNSPGSAKKKFSNT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712129_400188 75 0.293 4.630E-10 96 186 414 2 92 103 +------------------------------------------------------------------------------------------------PSDPNAEIKVFVGGLSQDTTKESLNRHFSRWGT-SDAYVMMDSATGRSRGFGFVNFRSNSTKNAVLAArPHIVKGQNIECRDYAKGSSKGGP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>26231|Ga0315295_12869018_2|-119|01 75 0.289 4.630E-10 104 184 414 7 89 105 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLQVRNLSPDTTEAEISGLFARCGEVLDARIVRDASSGMSKGYGFVTMSAVSEADAAVSRLdgHALRGSVLQVKLAKARTVRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719221_2208745 75 0.271 4.630E-10 105 203 414 0 106 107 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVGGLSLNTDSAILREFFSQYGAIEDAHVMDTWDqramQRRSRCFGFVVFAAPEAVDTVIAQaKFFVDEKEVeakRVDDKKGSPEGRAEVDARKVFVGGLKEGMNE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>23240|Ga0272442_10418858_1|+2|10 75 0.294 4.630E-10 116 191 414 0 77 111 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EDGLREAFGAFGEVSSVNIVRDRASGASRGFGFVIMPTEEEAETAISEMNgkEMEGRAITVEKSHGKPGGPRRNDGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP001300981920 75 0.247 4.630E-10 100 186 414 6 94 116 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PKNSKLSIRNLSDSVSEHMLQELFQQAGTVYSVKIATDRDTGESKGFGFIEMASVNDAQQAIDTLNhvLVEGQEINIDFQDPNRAKSKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719295_1390292 75 0.307 4.630E-10 120 223 414 1 114 116 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KEYFGRYGELEDCVVIADSSSGGSRGFGYATFADYRCTFPVLQdkkdSGHMIDKKEVDVKRAIPRddSSAASHSRTKKIFIGGVKRDAEESEIREELEKVlegsGTVESIDMIK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719171_2208311 75 0.325 4.630E-10 127 243 414 0 119 128 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GEVADLAVKKSYTTWANVGCAFLQIRDSTGRQAILSAKHAIDGKPFNV---VLDKATLGNLTSAKVHIEGLhPQKPTEDEIRQHFSLYGTVIDVFLPkehatGKRRNFGFVTFSEPQAQQAAL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719362_2758223 75 0.413 4.630E-10 101 158 414 77 134 135 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PKSKIFVGGLDFQLTSDELKEHFMKFGEVDDAIILKDIYLGKSRGFGFVTFTDEGVAQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1700692_713765 75 0.280 4.630E-10 98 186 414 63 148 150 +--------------------------------------------------------------------------------------------------PKEEMMNLYVGNLPYRMTEAQLKEALEAYGQGSSCTIIKDKVSGSSKGFGFLEMPERTEAEAAITGLN---GREVLGRQPNGNGARPAP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711981_339886 75 0.320 4.630E-10 94 191 414 3 102 162 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+------------------------------------------------------------------------------------RDGARAGESMNDRRKTEDTAAIRVSNLSESTQEADLQELFKPFGHIARIFLSKDKVTGECRGFAFVHYYKKDDATKAIATLNGFgyDHLILNVEWAKPSGS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_1765122 75 0.220 4.630E-10 89 185 414 179 278 338 +-----------------------------------------------------------------------------------------AAAAANAGSVGPMGANIFVFHVPINWTDEDFNAHFSPFGQIMSAKIHVDPVTKASKGFGFVSYSTPQAATMAIKGMNGFDtkqGKFLKCTIKKGEEQYNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719336_2950921 75 0.260 4.630E-10 101 190 414 156 247 356 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------RELYVGSLPYEITEDDLHRLFAVAGTVQSVHLITDPVSGKSKGCGYVKMTTVGEAIEAINCLDGalVEGRIISVSEAREQKPQKSPQRP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>5467|scaffold_995326_c1_1|+193|00 75 0.280 6.150E-10 104 190 414 3 91 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLHVGGVPNDTSDQQLSELFSPAGRVVHAQVMRDAASGLSRGFGLVEMATPEETETALAALTGrtLNGGTITVRRLPPRATGWEGRNNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5947209_8463924 75 0.437 6.150E-10 104 151 414 63 110 111 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------GSKLFVRGLSYNSNEVALKDAFSQHGNVIQVKVICHPVTGRSKGYVLVKFSSETEAAAALERMSdeVLDGKKIRVDYANSEQS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719362_1820479 75 0.278 6.150E-10 105 181 414 6 84 139 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGGLSEDTNERMLRAAFVPFGPIKCVDVPINYTENKSRGFGFVTYEDDEDAIEAKYNMdgSELMGRVLTVDTAQENQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>AP95_1055475.scaffolds.fasta_scaffold57291_1 75 0.259 6.150E-10 104 182 414 72 151 153 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NLYVGNLPFNAGQDDIKNLFAPYGEVIDIRMVKDRRSKRFKGYAFVEM-NTGGANAAIKQLDGNDyaGRTLRVNEAQKKEE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719309_1785767 75 0.287 6.150E-10 159 296 414 7 143 157 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACANESHVIKGKKVTCKKAEAKQ--------GKIYVGKIPTEgVTADDLQAHFSTHGAVAEIIRPKDKtnedvlRNFAFVTFEKEEVAKQLVKEGTaTVNGHELVIKRVTPK-DGGHGGMRGGYGGGGYGGYGDPYAMYGGYGGYG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712151_1112305 75 0.310 6.150E-10 104 175 414 60 133 167 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIYIGHLPYGFEEEGIKAYFSQYGTVTKVKLMRSKKTARSKGYGFVQFEDKEVAKVAAESMNqyLMYGKFMECK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550532_233869 75 0.255 6.150E-10 102 189 414 29 118 187 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PTRLFVGSLHENISESMLENLFKPYGSLDKIELMKDPESGSSKGYAFITFNDSECGKKAMEQLNGFElaGKPMKVNAVIARQEVTNPMGS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000069408590 75 0.347 6.150E-10 103 174 414 20 91 222 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKLFVKGLHTSVDKAKLQQVFSQFGPIDKTYILYDHKTGVSRGFGFVEFMKEEDLEKSLEVEIKIQGKVVKC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A059BGY2 75 0.260 6.150E-10 100 193 414 64 158 281 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PSKSTLYVSNLDFSLTNSDLHTLFSTFGKIARVTILKDRATRRSRGVAFVQFVSQPDAQRAAAEMHGkiLNGRKVAASIAI-DNGRAPEFIKKRVY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A103Y3Z6 75 0.294 6.150E-10 91 168 414 9 86 302 +-------------------------------------------------------------------------------------------PKGSAESKDFKTKKIFVGGIPTSVTEDEFKGFFSKHGKVVEHEIIRDHATKRSRGFGFIVFDSEQVVDTILVNGNMID----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719329_680634 75 0.202 6.150E-10 100 185 414 176 264 320 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PMGANIFAFHIPINWTDEDFHAHFSPFGQIVSAKIHTDPITKTSKGFGFVSYATPQAATMAIKGMNGFDtkqGKTLKITIKKGEEQYNP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A151ZB44 75 0.252 6.150E-10 100 180 414 270 352 354 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PESNELFIYYLPPLYGDEELKTLFSKYGNVLSSKVFIDRNTNQSKCFGFVTYDNTQSAHHAIKELNGFpvDGKKLKVTFKRER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712130_386394 75 0.238 6.150E-10 103 165 414 255 317 386 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RNLYIKNIAESVTDEQLQNLFKPFGEITSAKIMVNEDTGVRRGFGFVCFKNSDDARAAITSLN-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_2234809 75 0.310 6.150E-10 78 164 414 515 601 609 +------------------------------------------------------------------------------KSATRRKTGKKENEKKEVKAPIFDYTNLIVNYLPPDMDCGLLQKVFSKYGEIVSCKVVMDHKTGLSKGYGFVKFKTKEEADRAVQGL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>HubBroStandDraft_1064217.scaffolds.fasta_scaffold3611928_1 75 0.325 6.150E-10 97 177 414 701 783 789 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RPAGDESNLFVGDLARQTTEAMLEDVFKTVGDVVAVSIKKDKRTGHHLGYGFVKMASHADALRAKEKMHNadVGGRRIRVGWA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000940170804 74 0.222 8.170E-10 104 182 414 1 81 83 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIHVGNLPKTAKKEALAGLFKPFGNVVTATIARDKKTGNSRGFGYVEMSTRHEGEEAIANLNdrKFEGQKLQVGEAQERRE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000847523945 74 0.243 8.170E-10 104 183 414 1 82 88 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVKNIHSDINELQLESIFAVYGEILSTKIIYDRADWSSKGFGFIEFAKKADALKAIETLNgkELKGKKLEVKEAVEKKGR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>7131|scaffold1454546_1|+3|11 74 0.413 8.170E-10 92 149 414 37 94 95 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------GFKVFVTNLSWDTQWQGLKDHFASAGDVAFADVLTDKRTGRSKGYGIVAMSSAEAAAYAISSLNetELDGRNIAVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5579864_4468673 74 0.273 8.170E-10 107 188 414 0 83 100 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGNLTSQTTQEQLETAFAQFGTVERVEIVADRFSGQPRGFAFVEMVETAAAVTAIAGLNGtdLNGQAMNVNEARPKPSGGSASR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719498_2199428 74 0.252 8.170E-10 106 190 414 0 85 100 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FIKNLPVEWEDEQLKEYFSKCGVIKSA-IAMKGADGKPKGFGFVNYEDPSEAARAVEELHgvEVNGKAIFVGRAQKKRDRERELREK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719153_2225853 74 0.233 8.170E-10 145 245 414 0 98 103 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFAFVVVASDGSVNSALNSEHTIKGKTVTVKKADVR--------PGKVYIGGLSDGISEDDIRNALSEYGNITEFVRPVDrsnndaPKNFCFVTFERREPVRSLFSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>919|scaffold_1143872_c1_1|+2|10 74 0.307 8.170E-10 103 180 414 16 93 103 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RKVYVKGLPSNCDKTKLHEVFSRFGEVDKAFILYNHKNGSTRGFGFVEFTTQESAMVAVGKVIEICGKDIQVSMAIQR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711872_573313 74 0.366 8.170E-10 119 188 414 0 70 105 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LREYFGTYGEVTDVVVMIDKMTGNSRGFGFVSFNDSSIVDSVVsSGPHQVGGFPIDVKKALPRDQNNNRGP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR6266852_4866859 74 0.289 8.170E-10 104 177 414 1 76 106 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIHVANLPPEITDGDLQTYFSSFGSVEGAEVIRDIHTGQSVGYGFVIMPSDEEAANAIAGLNGksWMDKVLTVSKA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719193_2014050 74 0.265 8.170E-10 98 178 414 11 93 106 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EEKEGRNLIINYLPPSFTQHDLLSHFTPYGMIENCKVVMDLVTQKSKGYGFVKFESREGALRAKEALNGfaIKNKQLKVAFAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719245_105457 74 0.274 8.170E-10 151 255 414 0 106 107 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FKHKQSVKDVIqhEGPHRISGKLVDPKPA------TDERRDGKIFVGGLRHETTEDQLREYFSQWGTAINIERPfdkkeNRPKGFAFLTFEEEGIHEKILDHpYHEINGKRCE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3989338_4972408 74 0.233 8.170E-10 116 207 414 0 102 107 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ELMLTEAFAKFGDLLDARIVRNPDTGRSKGFGFVSFIQKAHAERALATMNGtlLGAKNIRVNFASQEGSEPAPsadlaeapkDANTSVYLGNLASNVDERLLR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5436190_20203552 74 0.294 8.170E-10 87 164 414 30 107 108 +---------------------------------------------------------------------------------------SDDHGEQNKSGSENPGSNLFVSGIAPRLEETELEEIFSKYGRVEKVQIMLDPHTRESRGFGFVQMSTSEEADAAKEGL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712113_739381 74 0.267 8.170E-10 105 188 414 0 84 108 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LGVFGMSIDTREKDLEEIFSKYGRIESCVIVTDK-SQQSRGFGFISFSSVSDAQEAREQMNGkrIDNREVRVDYSITKRAHTPTPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5271163_746178 74 0.300 8.170E-10 101 188 414 18 107 109 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DEMNIFVGNLGPQVTETELAELFKRFGEVKTVQVSRALFTGTPKGFAFVEMPGKRHSLAAIAGLDGKDfaGRPLKVSEARPKPIRGRAPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>3300027909.a:Ga0209382_10061475_5 74 0.301 8.170E-10 104 184 414 3 85 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVDNLGKDMTESDVHALFSTVGTVLSVVLPLDHHTGARKSYGFVEMETPEQAQAAAEAMngHLIGKRALKVSHIHPAEERP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712216_1105607 74 0.292 8.170E-10 113 207 414 1 99 114 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------DTSEATLHGHFSRVGELSEAMVVCNHVTKKSRGFGFVTFRDGRTASSVLAQSHKIDNKTVDVKAAVKKgvlvADSFEQKMAKQIFLYSLPDHTSSDQLK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5438105_1900222 74 0.415 8.170E-10 105 157 414 63 115 116 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGNLPHSTTEPQLRTLFEAHGAVERVNIVMDKETGRSKGFAFVEMTDTSQA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5437667_7080087 74 0.415 8.170E-10 101 153 414 69 121 122 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------METKLYVGNLAYSATEDDLRRLFTQAGEVQSVNVIKDRDTGRAKGFAFVEMST-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_2372045 74 0.290 8.170E-10 107 191 414 0 85 122 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGGLPRDITEDQVKDFFQTYGSISDVSFAISKEDGKNKGFGFITFDDPNAAVAVVQQhYHDLNGKKVEAKSAQTREQIRRQGGGNK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000568699321 74 0.415 8.170E-10 104 156 414 1 53 124 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYIGGLPYATTNDGLKDAFSKVGNVISANVIIDKMTGRSRGFGFVEMEDEDA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690554_1971818 74 0.290 8.170E-10 81 171 414 33 124 125 +---------------------------------------------------------------------------------KRQPAKTQKPASTGQNPDGSDEVTLYVGNLPFKTSEESVQQTFETYGKVFAVRLVKDKRTGKRKGYGFVEME-PVGAELALSKLNdtEFEGRT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688500_17773126 74 0.236 8.170E-10 112 185 414 0 75 130 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------FEMTEAELEGLFAPHGKVQRVSLVMDRETGRPRGFGFVEMVDESGANAAISALdgSMVGSRKIAVNVAKPREERGP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719158_660735 74 0.370 8.170E-10 104 182 414 13 93 134 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVKARGKdDLDEEGLKGYFSTFGNIESVNVVTDKNTGEKKGFAFVEFDDYDPVDKAiIIRDHFVDGKKIEVKKAISKAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_MED_95_MAG_00467_000000009779.4.1 74 0.261 8.170E-10 100 181 414 20 103 157 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QSHRSLYVGGLEETIKDSMLRAAMIPFGNIKSVDIPMDYQKGTNRGFGFVEFDDAEDAAEAMFNMNgaELMGKVLTVNLAQANQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719375_63179 74 0.320 8.170E-10 90 164 414 62 136 158 +------------------------------------------------------------------------------------------GRQRKPRLREDTNRKVFVGGLNPSTTAEGLRTYFEQFGTVSEASVVIDKVTRTSRGFGFVMFESETTCVQSIGEL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>PorBlaBluebeHill_2_1084457.scaffolds.fasta_scaffold126231_1 74 0.226 8.170E-10 100 182 414 77 160 163 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EQDAKLYVGNIDYSASKKELESLFSKYGQVDFVNIPIDHYSGKTRGFGFIAFNCTKDALRAMDlNGTTFKGRQIQVNFARERKS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719162_1171515 74 0.298 8.170E-10 104 188 414 3 88 169 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFVGGLPKTATEDALYQLFAPFGNIQKIDLKYDPNTQEFRGFCFVAM-DKEGAERVVANKGsmSFQGKWIDCKLAGGKDGGGKGAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5215831_9714758 74 0.415 8.170E-10 101 153 414 43 95 170 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+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EIAGKKLTIKYSERK------TIPMKLFVGRLPRSATHTEVKDYFSDFGELDDCFVP-ANRGFAFVTFSAEEDGKGCLRAKHMFQGSQLSVVIADPRDGEGGPSSRGRRG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711988_657200 74 0.256 8.170E-10 103 180 414 9 90 191 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RTILVAQLSFETTEDTVKDFFKEYGELRSVRLVRNIVTGISRGYAFVEFKRERDARAAVKdclyTPKKIDGREILVDHERER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>11153|Ga0310344_11223946_1|+3|11 74 0.267 8.170E-10 105 174 414 27 97 206 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------EIGNENKMFVGGLSKKTTVEAFRTYFEAYGEVKDVVVKTDPSTGTSRGFGFVMFTAEESIGKC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_2516133 74 0.271 1.441E-09 117 196 414 0 80 130 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ESVRQYFLSYGTLIDCVVMKDRETQRSRGFGFVQFENQEAVSAVINTPkHELDGKQIVCKPVMPQGGGGGCWGGKGAMMGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000906921094 74 0.489 1.441E-09 103 149 414 46 92 131 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------RFFIPGLPETATEDDLKQHFGKFGHVLEASLAKDRGTDQSRGFAHVTMEEQINPSNVLCESHFIGGKEVRVQLA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR3954449_11888003 73 0.431 2.541E-09 99 149 414 55 105 106 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PQMGKKLYVGNLPYGVNDADLQQIFGEHGSVTSAQVIMDRDTGRSKGFGFV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712159_683892 73 0.254 2.541E-09 127 218 414 4 105 107 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTITSIRQKKDRATGQPRGYAFVQYEDEFMAEAACRELDgmEVQGHALRVTPAgnaralrgLEYKKQWKGPRRNHVFVGNVPLEATEDELRELCSKVGTIVS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719321_2526139 73 0.329 2.541E-09 108 191 414 0 83 112 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGLPEEATSEDLNTYFGQFGNLEKVELKTDHD-GKSKGFAFIRFSDAETAKQCMEyTPHTLGEKEVEVKRPNARHAGGKRKGGKN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719321_1281080 73 0.261 2.541E-09 105 190 414 3 90 113 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LLVRNIRRGTPTEDVRHAFSEFGELKDVYMPTDYYTRQPRGFGFVEYYEVADAQEACKRMHKsdLDGNIIEVVFAQQRRKSPNSMRER------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711904_290842 73 0.256 2.541E-09 119 221 414 0 108 114 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LYDYFIQFGSINKVLIPYDSNLKNegFKGYSLVTFDSKESVDKVLDQkKHIILEREVYITMAVTKKEARnlmDEKNRRKLFCGNLSKKTTKASLSDYFKKFGEVTAAYL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711879_552369 73 0.300 2.541E-09 116 211 414 0 99 116 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EEQLKQYYAQWGDVAESVVPKDNRTKLSKGFGFIIYTESKSLDVAMKArPHKLNDRTLEPRRAIRRDEADNPaanASTNKLYFGPLGHNTTRDDLGTFLS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712138_277790 73 0.246 2.541E-09 103 181 414 11 91 118 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TTLYVGGITEKVTEKILHGVFCTFGEIKSVNIPRSSENDTNRGFGFIDFYKSEDAITAIDNMNntELFGKVLHVNYARPQE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1051326_3568056 73 0.415 2.541E-09 101 153 414 47 99 121 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MEAKLYVGNLPYTTVDADLQSLFSQAGTVKSAQVIRDRASGRSKGFGFVEMSS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>23949|scaffold_399262_c1_1|-19|00 73 0.282 2.541E-09 107 182 414 43 120 124 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------ILNLPRTKTAKDLTNLFASYGVVKSCNIVMDRVTRQSKGFGFVEMPNDVEANAAIADLNckNFDGKRIRVKQVQKKDE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688572_14235392 73 0.456 2.541E-09 104 149 414 80 125 126 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0.250 2.541E-09 100 189 414 44 135 156 +----------------------------------------------------------------------------------------------------ENDGKLFIGGLSPRTTKESLEHAFSNIAgcPVKEASVMLDKQSSRSRCFGFIKFEDLSIAKNLVGQSYNIDGHNVEIKWAVPENSSSSSSSS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SoiMetStandDraft_5_1073268.scaffolds.fasta_scaffold652235_2 73 0.682 2.541E-09 201 263 414 0 62 162 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MTTDDLRSFFSNYGEVLDVYIPRPFRSFAFVTFADHVVAQSLCGEDFLIKGHSVHVNSATPKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1712168_725204 73 0.289 2.541E-09 164 274 414 11 131 179 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PHELDGRTLEPHRAGPieySRRMESHHTCNQIFVGDYKPELEEGDLRDYFSQFGNVEEVSIPKEKddetkiRGFAVVKFDDYDPVDVCCHKrKHTIKDIQVYITKYIDRKTMNQLKRRFGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719419_431306 73 0.276 2.541E-09 167 319 414 0 148 183 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LDGRKIDPKPA------QALRKDGKLFAGGISTETDNDKIKEHFEQFGEIEVFerpvdKMTKKNRGFCFVTFKKDGVLKLACAErKQQLDGQEIEVKEARVEDNR----SQRGGFGRGGGGFGMRGGWGPQMGPYGYGGGFGGYGGGFDGGYGAAFGNP---------------------------------------------------------------------------------------------- +>KNS5Surf_AmetaT_FD_contig_123_8651_length_275_multi_4_in_1_out_1_1 73 0.313 2.541E-09 98 194 414 54 149 191 +--------------------------------------------------------------------------------------------------EGPPGANLFIYHLPHDLTDADLATLFSTCglGRVISAKVYVDKKTGASKGFGFVSFDSAEAADHAIGQM---DGFQVGTKRLKVQHKRAGGFAQGRVSV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719387_3036516 73 0.295 2.541E-09 78 175 414 112 208 213 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+-------------------------------------------------------------------------------------EEEPKSKPANRFPEVSSGTTLFVRNLLFETTEVDLKELFKQWGPVIYARITVDKESGLSRGSGFVCMRNKADADQCLEEAEALRKRSVnngtdDQDALNSLMSKREKKKSNLVYSSILTPDAgTGEGLK--FTLHGRVLDV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>M7Z861 73 0.268 2.541E-09 85 179 414 450 546 1007 +-------------------------------------------------------------------------------------EDVEAASTTDEKKLALETGRLYICNLPYATTEEDLVQLCSQYGDVEQAHIVVDKTTKLSTGRGYVLFSLPDSAVRALDELDNlsFQGRLLRVKAAKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000963395021 72 0.420 3.374E-09 101 150 414 0 49 64 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+------------------------------------------------------------------------------------------------KKAERRDGKMFVGGVKPETNDDTIKAYFEQFGEVEEVARPINKETQENKPFCFIVFKRDGIIAECMKKDyHEIDGKKVDCKQSHPKPQGGGGFGGR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719317_1377029 72 0.289 5.947E-09 190 311 414 21 148 157 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RKLFVGGLPQDAKDTDIKEHFGQYGDVAQIeqpfdKVKNERKNFCFITFDKEETAKKLLKEGtVNVQGHELEIKKVNPPNKGMQGGFGGGRGGGRGGQHGGFGGPGGWGGYGGYGGYGDAYGWGGYGG------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>APIni6443716594_1056825.scaffolds.fasta_scaffold6680975_1 72 0.272 5.947E-09 103 177 414 4 80 172 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TRIFVGNIPYDFEDQDLINTLQMAGPVENLEIKLDENTGKPKGFGFCTYKDPESRSSALRNLKHIDynGRQLRINEA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712032_1097816 72 0.287 5.947E-09 104 188 414 91 177 178 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLRVTNLSEDAREGDLSELFGTYGHVSRIFLAKNQDTKLSKGFAFITYTNKANAEKAIKNLngHGYDNLVLRVEWSKPVQRDEAPRR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550519_336191 72 0.309 5.947E-09 198 322 414 7 132 200 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEEITEDDLRQHFEKFGEVTDVYISSPWKHFAFVTFADVKIAQSLVGKEHHLGDVSLLIKSAAhTKSGKKDENGQGNGRFGDNMDRNMPPMYPGYGPGGYGPGGFGPGGYCMMPGYGGPPGPPGPM------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001277638937 72 0.266 5.947E-09 80 180 414 97 201 203 +--------------------------------------------------------------------------------NKKKTDNKYESSRKKYQDNSNkyNYNSLRVSNLSEQTTEQDVHELFNYFGRIQRVFIVRDKITQKSRGFAFITFSNSKDAANALNNLNgyGYDNLILKVEYSIDR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_UPI0009AAE3DB 72 0.425 5.947E-09 103 149 414 15 61 222 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKVFVGGLAWETQKETMRKYFEQFGEILEAVVITDKNTGRSKGYGFV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>GraSoiStandDraft_56_1057294.scaffolds.fasta_scaffold3722975_1 72 0.661 5.947E-09 204 262 414 1 59 234 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DDLRSYFSQFGEVTDVFLPRPFRAFAFVTFADAEVAHGLTGDDHIIKGTSVHVSTAAPK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>P78795 72 0.264 5.947E-09 96 180 414 194 280 282 +------------------------------------------------------------------------------------------------KRERDDSATLRVTNLSDDTREEELRDLFRRFGGIQRVYLAKDKETGRAKGFAFVSYYDRDCAIKARDRLDGYGWNNliLRCEFSKPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>5950|scaffold5092557_1|-1|10 71 0.416 7.893E-09 104 151 414 11 58 59 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFVAGLPFDMDGQELKEIFEDYGPVNSANIISDRETGKSRGFGFIDF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001376446137 71 0.263 7.893E-09 104 177 414 1 76 77 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KILVSKLAREIDEKQLQELFSSYGDVDSCVIVLDKDSGKSKGFGFVEMPKHTTAKAAIRSLNGkkVAGEKIRVREA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A090I9X9 71 0.276 7.893E-09 104 177 414 1 76 78 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLLVRNLPRTMTEYELREMFKAHGSLDYCTLVLDEMTGESKGFAFVEMSNEEEALAAIEAENGkkFGKEKIRVKAA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000877300898 71 0.315 7.893E-09 107 180 414 1 76 79 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VWNLSKDAQDSDLLELFVPFGQVLRAHVVRDYKAGLSRGFGFINFAKREDAEKAMEKLsgYGYDNLILEVEWSLPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1T3MJF5 71 0.256 7.893E-09 104 183 414 1 82 86 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NILVGKLNPQTTEQQLEKHFNSFGFITAVDIIKESYSGDSLGYGYVLMPNPEEAETAIKKLNGtsLDGHSIFVSKASQNSSR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9303|Ga0075371_10802384_1|-65|01 71 0.287 7.893E-09 101 177 414 7 86 92 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PTYSLFVKNLAFKTTEEKLRKVFEKCGEISSIRFPTHRDTGKKTGFAFVEFATQAGLKNSLNinmSKIKLDGRQLILKPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A182GHN5 71 0.425 7.893E-09 103 149 414 33 79 92 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKLFVGGLPYHTTDKSLREHFSVYGDIEEAVVITDRTTNKSRGYGFV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>2230|Ga0302118_11551188_1|-3|11 71 0.346 7.893E-09 119 191 414 1 75 94 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LRKHFSAFGKVLDTEVMMDSTTGRSRGFAFVVLDNAESVRKAMAhgNRHTIDGRSSEVKQATPRSKERPAAAAAN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719277_1233125 71 0.262 7.893E-09 162 262 414 6 100 102 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EDGYLLDGRTIQIRRAGAK------NKTVKIFVGGLSPSTTVESLYSYLAYYGELSDVVV--KERGFGFATFTDPSAARAALAEdaGHIVDGKVVNLSPCEAR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5659263_250764 71 0.256 7.893E-09 101 180 414 19 100 102 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DYGKIFVNNIPNYASESELTDIFNQFGEVVDVSIPKNYETGFARGFAIIEFERSESVTKAINNSGKIlyKGRTLYTQIFLPR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1739836_208357 71 0.610 7.893E-09 179 237 414 6 64 102 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PLQEGNNPQVPCKVFVGRCTEDMTAEDLKEYFSKFGEVTDVFIPKPFRAFAFITFLDPE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712046_493393 71 0.240 7.893E-09 104 177 414 17 91 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KTFISGIPLSCTEEDVRAYFEKCGKITELKLVEDRETGQSRGIAFVSFSDKASFVNALKcNDEEFEGSRLKVDKA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719357_139921 71 0.342 7.893E-09 112 219 414 0 102 104 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------PTTTSAQVGEYFRKFGDLAMVELKSGRNTNVA--FAFVRFVDKAVERKVLKQKHTICERDCTVRIP---DSQQGDRSLRKIYVGYQSNTLTEKDFIDHFEKHGDVSEV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719331_828138 71 0.302 7.893E-09 105 188 414 0 85 106 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFIGGLNAEATIDEIKDKMSSAGEVVNVHIVKDKETGNTKGYGFVEFARVSDAEDAMDRLTGIDiaGRRIRLAPSGAPPGKEGGKG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719198_2438035 71 0.242 7.893E-09 137 216 414 0 94 106 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DRESGKPKGAGKIEFSSHAAAQHAIDELNgrEIDGRSIAVKvletgshpayadqVEQPQRPSRSNDDTRTVFVGGLSWDTTRESLHRHFSQCGEI----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719478_1366493 71 0.302 7.893E-09 92 175 414 0 85 110 +--------------------------------------------------------------------------------------------AASSGGKSRDPNTLFVGGLPPQAVDKDLRDFFQKYGAVKSAEVAMDKATGVSKKFGFVVYEDNAgvTAAGADRDNHFILSKWVDAK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001066182748 71 0.256 7.893E-09 160 258 414 0 108 113 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VISLKHEIDGKKFECKPvvnETKANQQEDIKKKRKIFVSGLGTKIEEHDLRDYFQQFGEIERAFLnrehyTNKSRGSGFVLFKSIESSKRTLAPGqvHTIKGVNVRLRF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>24913|scaffold_1290025_c1_1|-3|11 71 0.296 7.893E-09 104 188 414 28 118 119 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVKGLSSGfVHRNDLKLYFSQFGEVTDVYIPKDKATGNQKRFAFVTFKAVSQARAALAHPpdaHILptDGSFLQVMPAEPRPQSVSPPP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000294815295 71 0.315 7.893E-09 83 175 414 22 114 120 +-----------------------------------------------------------------------------------KKGGNRGGGGGAPRGDRVPGSSLYVGNLPWSVTWQDLKDVFSEHSPV-YADVKTDME-GRSKGFGIVRFATAENATAAIAAINGMDieGRSIEVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712096_365767 71 0.481 7.893E-09 103 156 414 0 53 123 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSLRVGNLPFKTHQEDLKEVFEKFGEVGDVFIPSDRETGRTRGFAFVRFYEKKD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR671912_1525697 71 0.230 7.893E-09 104 179 414 23 100 124 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIYVAKFDLQMQNEELKNLFKPYGEVQSAKIEIDAFTNQSRGFGYVEMADEAQAQAAISGLNdsVLNGNAITVKVAEP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1739848_169481 71 0.241 7.893E-09 109 211 414 1 117 127 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLPWRTDWRELKDHFRSVGEDTYTKVMEDRRTGRSKGCGIVEFANPQDAAKAIETMNesEIGDRRIKIREDRDPAETRRPRDD---YGGRDNFDRDrgarrednpelekkmDDDLDDYFS---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719321_98711 71 0.277 7.893E-09 111 196 414 0 88 136 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------SRHTTTKQLRDHFMKYGRVIDCVAMKE-ADGRSRGFGYVTFSSQAACDRVLSEAQIIDGRTVDVKRAVPEAVGGAassfPQMPQSAFLGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719289_309716 71 0.279 7.893E-09 107 190 414 15 100 137 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VNNLLESVRTDDLRDTFDKYGKVADVYIPRDYHTFRNRGFAFVRFATQEEADEAVnrSEDLEILGQHVRVEHAMYKKNDRPPARRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR6187455_1708579 71 0.231 7.893E-09 117 239 414 1 138 140 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QQLADVFAQAGiDVTAVKLPTGDNHGVNRGYAFAQVSDGGVARKALSLDGSIslSGRVLRIEEADSDASADDERTsatqaaSSRLYVGNLSFETSAAELRSVFVVNGLIpLDVYVatdkaSGRSRGFGFVSLESATDA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>MGYP000536199615 71 0.247 7.893E-09 104 190 414 57 144 145 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KMFVGGLPLESTEETVTEMFNEYGKVRSIKLAADVFTGKCKGFGFIEMEGHE-ARAAIAGLNGkiIGDKSLKVQFEEPRKGGKKGGRRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>KBSMisStandDraft_5_1062788.scaffolds.fasta_scaffold19983_7 71 0.307 7.893E-09 117 193 414 1 78 152 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DELRNYFSNWGEVVDCNVAWDRETKRSRCFGFVTFAAPEQLVAAMdEAEHTISGKRIHVKPYTDEGAHGGTGGIKRSF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MEHZ01.4.fsa_nt_MEHZ011303544.1_1 71 0.625 7.893E-09 201 272 414 0 71 154 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MTTDDLRSFFSTYGEVLDVYIPRPFRSFAFVTFSDHMVAQSLCGEDFLIKGQSVHISSATPKAATGGAVARG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719510_2505448 71 0.258 7.893E-09 100 181 414 54 138 163 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QQGASMFIFGLPEILADEDLYDLFELYGAVRTAKIIKDPETGQSKGYGFVSMSRFRDAQVAISHLDGHacgYGKNLRVMFKRSRP---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>AutmiccommuBRH17_1029484.scaffolds.fasta_scaffold02515_1 71 0.676 7.893E-09 201 268 414 0 67 164 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MTTDDLRSFFSHYGEVLDVYIPRPFRSFAFVTFGDHMVAQSLCGEDFVIKGHSVHISSATPKAGTNTQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712142_488857 71 0.262 7.893E-09 156 261 414 2 123 169 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DQKKCLSEEHRMGDRVLEVKIPQSKAAGfdevvqftsGVQRLSRRIHVGNVTPRISRKDLEEYFAQFGSITDVFIPketetRKTPMYAFLTFDEEDSARRAVEHHkaHLVQGDTLQVAFASP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_35_1057300.scaffolds.fasta_scaffold1069303_2 71 0.261 7.893E-09 84 167 414 60 143 169 +------------------------------------------------------------------------------------RQQNHKGGKKSNPKTGPPGANIFIMHLPLQWTDQELTGSFSSFGQIVSAKVFRDRLTGASRGFGCVSFTDPSGAQAAMAMNGFI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>AntAceMinimDraft_10_1070366.scaffolds.fasta_scaffold78912_4 71 0.242 7.893E-09 131 222 414 37 134 171 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ECKIVAD-ESGESKGYGFVQYATDEGAKKAIEKINnmIISGKKVYVAPFKPkhmrKDGDGSGPRFTNVYVKNLPDSVqTYADLKKFFGEYGEITSVWLP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UPI00087CD3E9 71 0.298 7.893E-09 105 179 414 48 124 187 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGRIPYGFFEEQLKQYFSQFGEVTRIRLSRNKKTGNPKHYAFLEFADEKVVDIAAEAMNnyLIEGHILQCKKVPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719491_1095693 71 0.198 7.893E-09 100 235 414 0 183 195 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PHRGRIIVADLLPECEDQDLFSYFNQWGKVFDAKVAREKETLLSKCFGSVKMADVSLVSQILQQDHRIWENSITVRLptelekdtliadilastaAMPESEQSPyaypvqesrwsapvqesrwsepvdysyqrfesPFAPGKFFIPMVHADLSEEHLTAYFMQFGMVASCTLTR--RGCCFVQMAD---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1S3C324 71 0.292 7.893E-09 87 190 414 50 155 259 +---------------------------------------------------------------------------------------SSTKSGGGSGGLVPSKSTVYVSNFDYSLTNSDLHTLFSTFGKIARVTVLKDRQTRKSRGVAFVQFISQDDAVKAAKQMHGkiLNGRVLKAAIATDNGRAAEFIRKR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_566464 71 0.237 7.893E-09 106 184 414 93 172 360 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------YVGNLPYNASDDDVGNFFAEHCDVIDVKIRVDHATGRNKGFGYVTFDNVESLREALgANDAEFLGRNIRVDVAEGQRDKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR6218665_2342227 71 0.272 7.893E-09 91 176 414 285 372 379 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------PSRGVRFFVPGLPANVTEEELSKHFSKYGTVAEATIARDRVTEVSRGFGHVTIEDGLNPGTIIAETHFIGGQEIKAQLAKDGLNGSEIM---KVYI--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5688500_17923920 71 0.329 1.048E-08 109 188 414 0 81 107 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLSYATTSADLQGLFSTHGAVQSEDVVSDRDTGDSKGFGFVRMGSDEEALATIAALHGgqHDGRVLILAQAKPRETDGRSSG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712231_15068 71 0.310 1.048E-08 116 188 414 6 79 108 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGESEIESRFEQFGKLTDVFIPKDSHTRRSKGFAFVTFDDHRDARDAMKDLDGIevDGRRIMVEKARGRRRVGSRSQSYR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR5512143_421028 71 0.275 1.048E-08 102 179 414 18 97 125 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PVKLYVGNLAETTTENGLRQMFARAGEVLTVHLMRDLSNGRPEGHAFVTMATAAGAQKAIATFREapMGQRQLTVNIAES------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719203_1686966 71 0.320 1.048E-08 101 176 414 46 123 126 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PGVCLFVYHLPQEATEITLYQLFSSYGTVLSAKVMKDLRTGRTKGFGFVNMMNEQQGALAVQSLNGynLGGKYLKVSF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_2699198 71 0.291 1.048E-08 96 172 414 51 129 130 +------------------------------------------------------------------------------------------------KKPSDGNCTVKIDNISFDSTDRDLKQAFDCFGEIGDVYIPKDRSTGRSRGFAFCRFLNDKDAAAAVSFMDGrnLCGRNI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719376_1377972 71 0.337 1.048E-08 101 175 414 6 82 132 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------EDNKLFIGGIKPDTKEKTLREYFGQFGSIIKYEKPSDHATGKSRGFCFISFNSPEGVKATLSagQFHYVDGSRRECK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5437764_14340705 71 0.440 1.048E-08 104 153 414 84 133 135 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLFVGNLSYQTMENDLQEYFSAAGVVSSVNLMLDKFTGKSRGFAFIEFST-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719447_1285369 71 0.269 1.048E-08 200 314 414 1 115 137 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DVTEADMQEYFEKFGELKECYIPSPNKGFGFVSFKKQSSARKVLKSTHVLKGQYLNVGHPVSKKGDNNRGDRNNGNDQWNSGFGGGRGGGFRGGHGGGFGGGRGGGFGSFGGMGG--------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719436_1544279 71 0.310 1.048E-08 117 215 414 0 89 138 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DDLKDYFSKFGNVNSVEQMTEKSTGKKRGFGFVEFDDYDSVDKAlLEQNHKIKDWRIDIKKAVSKDSASTNQG----------YSANRDDGRSYGGNFGN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>EndMetStandDraft_5_1072996.scaffolds.fasta_scaffold14081_1 71 0.693 1.048E-08 201 262 414 0 61 154 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------RNVDEMVTLKVDGVPNRAAPSELLEVFARFGEVGDVYIPRDYHTQEARGFAFVRFTDQRGAEEACDRMNGynFQGRELRVQFAQKRRPANP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ETNvirnome_2_130_1030620.scaffolds.fasta_scaffold215364_1 71 0.278 1.048E-08 88 166 414 58 136 186 +----------------------------------------------------------------------------------------DQGASAEKKASGPPGANIFILHLPTHWGNAELTGAFNPFGHIISATVYKDRVTNHSKGFGFVSYADPASAQQAISSMNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719500_110537 71 0.606 1.048E-08 200 265 414 0 65 204 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+>ERR1719234_2433046|ERR538171_k119_721877|-|1099|4.06616e-321|2|792|2497|2497[2497]:2408[2408]:90[90]|2279[2291]:792[792]:1488[1476] 71 0.329 1.048E-08 108 188 414 37 118 522 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGIGEETTDEDITEYFSQFGNVLDVMQLYHQRSGEKKGCGFVMFEDKDSvAKAARNELHSIGFRQVRVKRAVPKAEMEENKR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A2G5U5R9 71 0.299 1.048E-08 86 190 414 261 367 877 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------EVDDEELKQYFSTFGNVKQVKIIIDKNTMRKRGFAFVEFDDYDPVHKCIlQKNHEIRGNRVDVKTAVNRKDSNYGQRNAN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A2A4JUS1 70 0.293 1.390E-08 104 176 414 55 129 183 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLFIGRLNPRTTEETLKSEFYKFGRILNCRVVRDIVTGKSKQYAFIEFENLGSVDRALKEMQkeYIDGAEVIVER--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719163_1071423 70 0.338 1.390E-08 102 172 414 132 199 229 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------DPDSGHTLFIYNTGPNITETELYALFGPFGAITKVHVRRDPATGMGKGFGFVTYDIYDDAVNAIQAMNGYENerngyKPLQVSFKTSKRKSD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719309_288744 70 0.275 1.845E-08 100 184 414 263 349 370 +----------------------------------------------------------------------------------------------------QGGYTLFVFGIGFNATERTLWQLFAPFGTVQKVNIMMDYEKSQCKGYGFVTMTNHQEAVNAINCLihYFFNGRSLQVSFKNENQQAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711879_693756 70 0.309 1.845E-08 107 188 414 103 186 392 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VGNLSFQATEQDLGELFAAQVAVESVQIVTNQNTGKSRGFGFVTFKEREDLEFALDAhgKAELFERIITVKVSSAPKGRQQRTR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719369_778527 70 0.320 1.845E-08 105 176 414 446 520 523 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVYNIGASADEKTLWSLFQPYGDITKVNVIRDHgKGGVSKGFGFVTLATPEQAQVAMEHLNGyvLNGRAIQVSP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A026WHA4 70 0.260 1.845E-08 79 172 414 328 423 888 +-------------------------------------------------------------------------------DDKANIKWRKQEEALKNEESIAESGRMFIRNLTYTTTEDDIKQVFEKYGPLSEVNLPVDKVTRKPKGFGTVTFVMPEHAVRAYNELDGsaLSGRML------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>Q54PB2 70 0.252 1.845E-08 94 174 414 351 433 895 +----------------------------------------------------------------------------------------------KEDEDVGESGRIFVRNLSYSTKEEDLEKVFSKFGKISEIHIPIDYDSKKSKGIAFILYLIPENAVQALNDMDGkvFQGRLIHV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>G7E469 70 0.265 1.845E-08 85 167 414 507 589 976 +-------------------------------------------------------------------------------------DEKEDDEGPKQRSSSTDAATLFVRNIQFEATEDELYQVFKQFGPVRYARIVMDKKLNRSKGTGFVCFYNEAHARETLAESDLI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>7292|scaffold_1121527_c1_1|-45|01 70 0.271 2.449E-08 123 190 414 0 69 81 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FEQFGQVGEVRLIKDKYSGESRGYGFVKMSSKEEAEKAIEEMNgkEFMGSSVNVNVAKPKTSGGGSIRGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>L1JD44 70 0.289 2.449E-08 107 180 414 0 75 84 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------VRNIGDRTDGQDLRELFGRYGTVKDVYIPIDYYTKRPKPFAFVEFINYEEARDAKEDMDrrEFQGRVIDVVFAQQR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>W5JX05 70 0.342 2.449E-08 104 172 414 9 78 85 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGNIAWTVGHRELRNYFSQFGKVSWAQVVFDRKTGLSKGYGFVSFQKKTALENLeRNQKHILDNTPI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001491045627 70 0.304 2.449E-08 101 180 414 0 81 91 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MNNTLYVGGLSLFTTNLSLEKSFIVAGRVQRAVVITDRVTGRSKGFGFVEMTTANEAAEAVLQLNdlQLEGHKITVSLAKER----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR550517_1688827 70 0.282 2.449E-08 140 225 414 1 92 99 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGSSLGFGFITFQESDMMKSCLEsQPHYLNKKAVELRRATPPQPKSVNGESlnssdKKLFIGGLDINVTDDYLMEYFEQFGKLTDWVVMKNS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712110_1399455 70 0.270 2.449E-08 105 176 414 27 100 102 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVFHLPPDVKNHDLFSLFSGCGTVLSVRIITDALTQQSKGYGFVNMATHQEAQYAIQclNGNRMGNKYLKVSF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9307|Ga0075374_10250158_1|+3|11 70 0.267 2.449E-08 99 167 414 29 99 104 +---------------------------------------------------------------------------------------------------PTTPFCLFVYNLPQDTDENSMYRLFGPYGElgINSVKVIREVDTGLCKGYGFVNYLKLEDAQQAIQALNGF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR4029453_4052263 70 0.411 2.449E-08 103 153 414 55 105 106 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------DFGKDDLHDMFKKFGRIVSSEIKRDPKTKESRGFGFVTFENPADGEKAIQEMHgtEIERRILRVELS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719510_2698134 70 0.285 2.449E-08 84 172 414 25 115 117 +------------------------------------------------------------------------------------MERTGLPPVEDNFQSTEFATNLIINFLPLTFKESQLRNLFSTAGPISSVRIMKNRKTAKSKGYGFVKYSGHEFAKRAIEQFNglEIQGKQI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740130_120703 70 0.220 2.449E-08 123 227 414 0 126 131 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+-----------------------------------------------------------------------------------------EADAPKEEVEEIESKSLFIKNINFETTEETLKEHFEQAGSVTSVKII--QKDGFSCGYGFVEFGNDRGVRKAMSNLNnqVVDGHALKLTPSHGK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>APLak6261670063_1056076.scaffolds.fasta_scaffold110471_1 70 0.247 2.449E-08 100 190 414 60 152 155 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PPGANVFVFNLPLNVDEAALHQMFCRFGQVVSTRVCKDINSRQSKGYGFVSFTTEHSALSACASLNgyMLGDKKLTVEIKDSGGRSRNSNRAN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719334_2847773 70 0.333 2.449E-08 115 183 414 2 70 162 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TEDMMKKYFRRFGAIQSVVVVKDRDTKKPRGFGFVTFATIDSSIHTTLATHNLGGQTLTCQRATPKPGQ-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711957_107343 70 0.256 2.449E-08 113 188 414 1 78 170 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------SMKEKHLREPFEKVGELNKCEIVRDPFSGESRGFGFISYVKDEDAVKACEELNktEIHGRTVAVEIAKGKKARTPTPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711973_197609 70 0.279 2.449E-08 106 191 414 0 79 180 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FVGRLPRSSTHTEVKEYFSDFGELDDCFVP------AGRGFAFVTFTAEEDGKGCLRAHHMFQGSQLSVVVAEPRAGEEMPPGGSR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711974_330598 70 0.292 2.449E-08 97 161 414 17 81 203 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RPVRANTTLYIGNLPIDITAQELEEKFKEFGTITSCSIPHDPHTKDNRSFGFVCFADEQSCDDAI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>SRR6266576_1138803 70 0.202 2.449E-08 105 221 414 52 199 207 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VWIGNLPWSATKATLRTFLTDHsnindGQITRVHMPepnnaansKQITKPQNKGFAYVDFTDSETLDAAIAlSETLMGGRKLLIKNAKSFEGRpdkpketedgkssvstvGGKPPNKRVFIGNLGFDVTKEDLIEHYTQCGEVVDLHM------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719319_668323 70 0.246 2.449E-08 97 169 414 113 185 423 +-------------------------------------------------------------------------------------------------RSDPNRKKVFIRGIVYDATDEEIKRVFSQFGKVVSLNLMRNAFDGRSKGFGFVCYETEHGAAAALKMKSITHG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_54_1057290.scaffolds.fasta_scaffold319434_2 70 0.298 2.449E-08 100 166 414 3 69 455 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EAGAKLFVGQVPAICSEDQLNAIFGQFGDILEIQIMRDKVTNRSKGSAWVTFRESSAADDAIETLHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0K2V054 70 0.252 2.449E-08 85 167 414 124 206 484 +-------------------------------------------------------------------------------------DKIRRKSSFKGPKPDEEARTIYVENIPSHSTQESLQQIFQEYGPVEYVSLPKYTESHLPKGFAFVEFQTVESAQKALEAYGFI------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0D6EL04 70 0.288 2.449E-08 102 191 414 286 372 654 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------VLVKNLNYKTEVYGLRSHFEKFGALKDVYIPTDFYTRQPKGFGFVEFHETKDAAKAVQEMDGanVDGNNLIVCIAQNRRRSPNAMRQR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001167102236 69 0.333 4.310E-08 119 188 414 2 73 76 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LRAASEAYGQVEDVKVITDRDTGRSKGFGFETFSSEEAATRCKASMdgQMLDGRAVKVDFPREREEGDRGPR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001174056308 69 0.277 4.310E-08 101 181 414 4 86 88 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DEKELREAFEAFGHVAVVKIIRDRGSGTSKGFAFVEMPSKAEGQAAMDGLNrkELSGRTLDLTEARAPGQGGRGNRPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>L5KCZ2 69 0.281 4.310E-08 165 252 414 5 100 102 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HKVDGRVVEPQRSVSRdfQRPGAHLTVTKIFVGGIKEDTEQHRLRDYLEQYGKTEVIEIMtdqgssGKKRGFAFVTFDNDSENKAVIQKYHTVNSH----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719247_328194 69 0.440 4.310E-08 102 151 414 82 131 132 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SSKVFIGGLPSLTTEADLRSYFGMYGTVHSADILKDSETNKSRGFGFIVF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719229_698979 69 0.307 4.310E-08 103 177 414 37 114 133 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNVWLSGLPKDWDELDAEDYFGKFGKIVSINIWKDFKTNKSRGSGFIDFKYPESAKQCIRELegHQFDGcRPLIVKYA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719321_570415 69 0.289 4.310E-08 117 190 414 0 75 137 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DQLRWHFQQFGEIALSDVRMDPLTGQSKGFGFVEYVNPQAIEYALqaQNQHHIDGKWVEVKRFGNDNSKGGGKGGK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719188_38653 69 0.247 4.310E-08 97 182 414 27 114 139 +-------------------------------------------------------------------------------------------------DAPKDCAKLVARNVAFEATERELRDVFKTFGELKSVRLPK-KVTGSHRGFAFVEFQSVAEAKRAMESLrhsTHLYGRRLVLEWAAAEEE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719206_825805 69 0.309 4.310E-08 148 282 414 0 138 141 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FVQFSESKVAQSLLGKEHIIKGVSVKIGEASPKgreqGGGRDHDRGGNRFGGYDGGYGRGGGNMGGFGNPGQVTDVYVPSPFRHFAFVQFSESKVAQSLLGKEHIIKGVRVKIGEASPKGREQGGGRDHDRGGNRFGGY----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719401_880695 69 0.243 4.310E-08 103 178 414 53 130 183 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------RTLYIGGLDPAVTETLLRASFLPFGPIQHIDIPMDYAHGTHKGFAFLEFVDFDDANEAIYNMDgaELLGKALTCNVAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>EndMetStandDraft_5_1072996.scaffolds.fasta_scaffold6241226_1 69 0.280 4.310E-08 158 259 414 5 116 202 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DEVLRDTHTVCGRKITVKLhqdaaaetsSADRGGGRDDPAYRRIFVGRLEKHFTTDMLREAFaKKFGKVTDVFLaTG--KNFGFVTFDSEADARRALDAGSTsVDGSNVVIKPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712168_608098 69 0.239 4.310E-08 101 190 414 26 117 209 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------QTTSVYVRNLHHECRQEDLRKIFSKYGEITDVYIPLDYHTRQMRGFAYIQFIHFEDAEDAVYyiDGTSLFGRALETQIAQSDRKTPSQMRFR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A0P6H6V4 69 0.279 4.310E-08 85 170 414 138 223 333 +-------------------------------------------------------------------------------------DETNESNSSKRKKQKFQGYTLFIGNLSYDTTKEDVLRHFAKCGAIKNVRIPLEKITNQPRGFGYIEVEEHVTYENVLSMHHTFLKR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_11_1057310.scaffolds.fasta_scaffold3666767_1 69 0.229 4.310E-08 104 201 414 35 156 355 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVASLPFTCDDAQLRASFENFGAIKSAHVVRDYygaeqideadgqeqvegeEEGISRGYGFVTFVEADSYEKALQQsEHEIDGRTLIVKAAnDPLNSRAMSESTYKIHGqdgqSDLPPDV-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1740129_1832417 69 0.333 4.310E-08 105 174 414 23 94 427 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------VFVARLSPDTCNEALRSHFEACGEVSHCSVMTDRDTGKSKCAGRVMFRSAAARQKGIDERHEsnLDGRAIVV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>HubBroStandDraft_2_1064218.scaffolds.fasta_scaffold2220454_2 69 0.277 4.310E-08 102 182 414 5 87 554 +------------------------------------------------------------------------------------------------------SASLYVGDLLSDVTEGMLFEVFSVIGQVTLIRVCRDAMTKRSLGYAYVNYLNREDAETALRTLNTtpIKGRPCRIMWSQRDPS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001346000736 69 0.277 4.310E-08 82 180 414 284 384 841 +----------------------------------------------------------------------------------RYSEEPQQSPEEITIAKISETGRLFVRNILYTSTEQEFRELFETYGPLEEVHVAIDTRTGKSKGFVYIQFFKNENAVAAYHALdkQIFQGRLLHILPAEKK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000250545013 68 0.252 5.718E-08 104 166 414 1 63 65 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLYVGNIPEEVEEKELKSLFERYKSLISTTIVKDKNSGVSRGFAFIEFEDNKDGQNAMEKFNE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001066284029 68 0.289 5.718E-08 104 177 414 1 76 78 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLIVLNLPREFDEQKLESMFKVHGPVISCSLVIDQNRGVSKGFGFIEMEHEDDAMIAIEKLHGkkMKQSRIRVKPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>12901|scaffold3908745_1|+2|10 68 0.295 5.718E-08 120 188 414 0 70 82 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------REFFTPYGEVLSAEVVRDRATGKSKGFGFVVMKDAVAARQAISELHEgrVEGNIVKVMEARPEKKAAIPKG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>25878|scaffold_557320_c1_1|-2|10 68 0.227 5.718E-08 101 177 414 0 77 86 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MQTKLMIRNLSYETTEADLENFFAPHGAVIGAEIQRFMD-GQSRGYAFVEMSNQVSAEAAIRYLNlrELNGRQVKVSFP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000060614126 68 0.437 5.718E-08 104 151 414 39 86 90 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLPVPLDEKELKRVFSTFGAITDIVIIQDKNTKQSRGFGFVEF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719335_1406848 68 0.270 5.718E-08 116 198 414 0 84 103 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ENELKEIFGRAGTVVALRMVYDRETRQPKGYGFCDFADPETAVKAIKELSdvEINGRRIRIDLADNALRGRMGAPPKQLALGDVP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000243391820 68 0.234 5.718E-08 142 231 414 8 104 105 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QSQGFAKVTFISP-VPRSILNQKHFLKDKEVEVREYQDDEDKfimKCYRKTKKIFVGGLSLETTKSSLGKYFEQFGPIQDISIPinyysKQSKGFAFI-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712185_198850 68 0.252 5.718E-08 116 181 414 0 66 109 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ENDFVGYFSLYGPVIDCVIMCDPHTRKPRGFGFITFDNSVAVDRAcVNKFHELNGKFVEVKRAIPQE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000470433735 68 0.247 5.718E-08 138 225 414 10 102 115 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RSPDISKGYGFIVCDNQKTYDRILEQKHfVIKNRKVEVNHATKRSGDNEPscevRENKKLFVGGLSGTTTKEDLYEHFTKFGKVDCTYIIYDP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719219_2246134 68 0.291 5.718E-08 104 196 414 11 106 119 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLLVKGFNDEMTDEIVEEYFAKFGNVEKVSQLRWPDSGRKRGYGFIEFDDSDAVDKiVLHGKHMIMGVRMGVKKALSKQEMAEAKSKemGNMYGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719500_312060 68 0.413 5.718E-08 20 77 414 3 60 123 +--------------------ESDGYVNLGGITCQLPGTTGLKYRNPDTQGWRLVRCHNECLQMPKEGWMAVAYLCIRP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719239_229444 68 0.298 5.718E-08 101 175 414 0 76 169 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PEYTVFVGRLHPNTTEETLRSSLREFGKINRVRLIKDIVTGFSKCYGFVEFTNKYDAEDACRKGHrmIIDDHEILID---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719473_76504 68 0.320 5.718E-08 105 177 414 0 74 172 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------ILVRGLHLRTSMGVLRYHFQKFGDVKDVYMPVDFETRQPRGFGFVEFWDAHDAMKAMKSMdgQEIDEKKIECKPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>OrbTmetagenome_4_1107371.scaffolds.fasta_scaffold275926_1 68 0.284 5.718E-08 105 190 414 9 96 189 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LLVKNLSPRVTKDVLKERFEKFGAVKDVYIPQDYFTKQLKSFGFVNFEKESDARDAMEALDGTDveGNQISVQVAKDRRKTPDEMRRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9301|Ga0075375_12129331_1|+2|10 68 0.252 5.718E-08 105 167 414 74 136 235 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYISGIAWGVNEGTLKQYFNQFGNIERIYIPRSKRSGRVKGYAFVEFEDMETAEVAAKTMNNF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>LauGreSuBDMM15SN_2_FD.fasta_scaffold90206_2 68 0.300 5.718E-08 100 176 414 204 283 291 +----------------------------------------------------------------------------------------------------EPTNTLFVTNLDWKSTDDDLFQHFSQAGsTPTSAAVQKNEANGRSKGWGLVMYNTPEEAESAMIQLNNtdLDSRKIRVRF--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1Y1I0G8 68 0.315 5.718E-08 101 174 414 417 492 503 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PGASLFVYHLPTEFRDNDLMTTFSPFGNLVNAKVFIDQNTGESKGFGTVSFDTPEAAEAAASVLDGfaLGGKTLKV----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000973835101 68 0.258 5.718E-08 78 162 414 298 382 732 +------------------------------------------------------------------------------EEDEEDEEEAQEVSTPAKKQSTDNSSTIFIRNLPFTTTDEQLQGFFARFGAVRYARVVMDKVTEKPAGTGFVCFVKGEDAKSCIK----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001239060884 68 0.428 7.586E-08 101 149 414 0 48 49 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGKKLYVGSLPYETTEDQIHAMFTACGPVTNVQLILDRETGRSKGCGFV------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>10605|scaffold3848848_1|+2|11 68 0.446 7.586E-08 105 151 414 35 81 82 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGNLSTSTTEADLERLFGLYGTVTRAQVITDSETGRSRGFAFVEM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>26187|Ga0315273_18174964_1|-36|01 68 0.252 7.586E-08 115 183 414 0 70 82 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TDDNLRKAFASYGEITETKIITDHGTGRSQGFGFVTFAQDEDAKTTISKINnmNLNNKTIKVNETQEKSPR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000862504697 68 0.265 7.586E-08 104 184 414 1 83 85 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLQITNIARDLSEEDFTKLFEKFGPLKECKLIFDAVTGKSKGFGFVVISNEMNAVKAQKMLHGriVNGQKMKVKFCAPTPRKD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000941575781 68 0.284 7.586E-08 104 189 414 1 88 93 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIIVLNLPRDVTEDALTDLFAVHGKVVACDIVSDTATGESKGFGFVVMPKKREALVAIKRIHntKLGENRIRAKLADRPQNDSSTTEP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000266774487 68 0.250 7.586E-08 101 182 414 0 83 98 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MSRRLIIGNLALDTDKSDLQKLFESLGRVSTIELVEDPRSGKQKGFAFVEFETRAEALKALGAapSTELNGRLITINSCAQQQE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719261_2281265 68 0.252 7.586E-08 110 182 414 0 78 102 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LDYRTTELDLREFFEQYGPIKEVFMPQHPEFGRSRGFCFITFEDAADAKQTIKEMDgkEYDGgygkRFLRVSTPEVRGQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719491_2951278 68 0.433 7.586E-08 105 157 414 0 52 104 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LGVFGLSLHTTERELESEFGKFGPLEKVIIVMDGKTGRSRGFGFINFESSEDA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_621657 68 0.318 7.586E-08 76 166 414 11 101 107 +----------------------------------------------------------------------------RPSEKKRKRKEAAAQAEVQKARQSKASQVIYVGHLPHGFYEKELQGFFSQFGTVSRVKVSRSKKSGASKHYAFVEFEHGGIADIAASAMHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719397_1601374 68 0.234 7.586E-08 131 241 414 1 106 107 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SVDIKRDKRTHNNLGYGFVQFATREQAVGAKTQLNgvEIGNRKIRIGWAQ---------KNTTLFIGDLDGSITTRQLRDIFAKYGDLVedETFVRAGSGRYGFVRYKHRSDAEK---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719491_1769383 68 0.271 7.586E-08 104 204 414 0 102 107 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVKNLNKATSERELRELFGKHGSVVEVEIPQDKETGLGKGKAYVRMKTAEQADKCVRELNFTKpwGRALVVERRPGPGEADKELKSADVAAEKPPKSPTEE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5262245_51664187 68 0.265 7.586E-08 96 177 414 23 104 110 +------------------------------------------------------------------------------------------------PPQVVMETNLFVGNLPPDMTDADLRAVFGRFGTALRARVARDSRSGRRLGFGFVEMDgGAGEAARALDGT-AFHGHALTVREA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719456_112551 68 0.289 7.586E-08 101 182 414 35 117 120 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DEATVRVTNVSEDTTEDDLRALFdRKVGNVQRVYLARDKNSGRSKGFAFVAFYERSTAEKAVKLMNNFGFNHLILQVEMSRPS--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719186_1001631 68 0.247 7.586E-08 123 230 414 0 108 120 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------EPPFTRIYVSNLHPSLGEQQIRELFEPFGEIIVINLQVDMVTRESQGFAFIKYVEHESAVRAIKEVNgkEILGLKIKMNKA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>D8M5R2 68 0.226 7.586E-08 100 193 414 98 191 259 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PNHCSLIVRGFRDVVDRSEIQNIFSKYGNVHDVHIPRDYYTHKQRGFAFIEFENREQAEDAISH---LDGRSVcgsTVSVSIAKNNRKTSAEMRRLY---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719419_102726 68 0.296 7.586E-08 96 174 414 0 80 279 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IPQNHMTDGRLSNAPERQDKMNGKKDKASCRISVRPVTEILTKEDLWDHFEAFGEVTEVCISKPFCQVAFVQFSECKVAQSLLGKELLIKGVSVKIGEAAPRGRDYRGNMRGGGGGG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>5922|Ga0209166_10960451_1|-190|01 68 0.293 1.006E-07 121 193 414 0 72 76 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ELFLPFGVVIDAFVVIDKTSGKSKGFGFVEMENEESAQKAIQNLHNtsFSKRKLVVAIAKPK--GEKPITTSTIF---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP000135333617 68 0.270 1.006E-07 104 175 414 2 75 95 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+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VTEADLQKSFEECGKVTSIRLPTN-EDGTMKGFGFIEFASADAATKALEfNGQDYQGRALTISIAQEKPgfeggksprwsagASEKPPGCRSCFLGNLSWNVEEDNI--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719234_1340548 68 0.338 1.006E-07 113 182 414 3 73 119 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------DTDEFHLREYFESFGRIETVDIMEERSTGKKRGFCFVTFDDHDVVDKIVAQKyHTINTHSCEVRKALSKQE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_1045133 68 0.287 1.006E-07 168 262 414 1 100 124 +------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGCWLDIQPARPDSSASVPVSE-KLFIGGLPLDAEEDSIRKFYEQFGMVREVFLKRDlggiFRGFGFVTYMSIQEAQACLNspNSRWYHNTQVEVRPAYQK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719277_1981959 68 0.333 1.006E-07 104 188 414 2 87 125 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RVFVGGLPKVPDETAIRLYFSRFGEIEEVKMMLN-GDGASRGFCFVIFKETASAQAVFDnyNDNIIDGKCVDCKHPDSGAGDKAKPG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>TARA_ARC_108_MAG_00235_000000000215.20.1 68 0.298 1.006E-07 100 174 414 3 79 129 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348 349 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TSVYIGNLPWEVRWQDLKDTFKQYGNIEFAEVATEggRPNGRSMGWGTVRFTNASSAIKAINDMHgrEMDGRTIECRYDQKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1S3NW19 68 0.290 1.006E-07 103 164 414 61 122 382 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNLYIRGLPPATTDHDLVKLCQPYGKIVSTKAILDKTTNKCKGYGFVDFDSPAAAQKAVTAL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>T1INR9 68 0.301 1.006E-07 97 169 414 99 171 417 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+>ERR1719491_2669842|ERR599224_k119_554603|+|272|3.637e-72|1|306|623|306[306]:623[623]:318[318] 67 0.318 1.335E-07 104 169 414 20 84 106 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TIFVGDLPLPFTNGELFNFFQQFGTVRKSKIVLDRE-GVSRGFGFVTFADPEVTQSLLNTRDNAWG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>9297|Ga0210249_1006219_1|+1|11 67 0.205 1.335E-07 119 210 414 0 110 111 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+>A0A1E4TAF9_919776|ERR873969_k119_169946|-|660|5.769e-189|1|74599|76464|76464[76464]:74599[74599]:1866[1866] 67 0.282 1.335E-07 86 163 414 273 350 622 +--------------------------------------------------------------------------------------EPQEEETPRKKSNKQEAYSIFVRNIPYDADEESLKEHFEAFGPVKYALPVIDKDTGLSKGSAFVAFKKEDAYLDCLDN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A077RAD4 67 0.271 1.335E-07 101 190 414 306 396 800 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+------------------------------------------------------------------------------------------------KGGNDDEVRAFIGGLPKSATEQSVTAALSQFGPVARVQLKYDATTSEFKGFGFVNFGTKEALQAAVNGASVaVDGKRIDVKPA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719187_1008092 67 0.243 1.770E-07 145 258 414 0 114 115 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GFAFITFAAEEAvAAVAAAAPHTIAGKEVTAKKASGKQ--------GKVYVGKIPEEGPGEvEIREQLVQFGAIAQLERPvdrslgNKPKDFCFVTFEKESVAKKLLEAGtITVEGVEMMVKP----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719424_2292100 67 0.312 1.770E-07 110 188 414 0 79 118 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAQVTNNDSLQAYFEQFGQVVLADVRFDQGSGNSKGFGFITFGDPRSVQACLDhNEHVVDDRQVDVKPYASGGKGGAEQR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719219_54155 67 0.280 1.770E-07 104 160 414 62 118 123 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KVFVGGISQDLTSDDILDYFSKFGAIEECNLLRDRSNGRHRGFGFIFYIEEIHADLA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712212_14478 67 0.252 1.770E-07 104 182 414 17 99 127 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLIIRNLSFKCEEEHLRGYFGVYGKLIDVSVPTKKVNGKdvKKGYAFIQFADVGNAKTAVAEMNlkEIMGRQVVVDWAISKDE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719253_400896 67 0.250 1.770E-07 100 191 414 5 95 130 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PEPGQFFLAGFGKECSEDDLRAHFEAYGEVEKVSLVKDP-SGISKQFAFLTMADPARDSEILEAEHEMNGKKMDVKAYKDKKNRTENDGYSK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711879_159194 67 0.312 1.770E-07 103 166 414 2 65 131 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNLYIEGLPTDWDENKVKELFEQFGEITESRVLINRKTNAKTGVGFIHFKSTEEAEKAIAGLNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712232_659946 67 0.227 1.770E-07 96 229 414 1 147 149 +------------------------------------------------------------------------------------------------RPGPPLATSVSIFGLSSGVTEKHISDYFGCYGQIEDIHLL--GGT-----FAAVRFSSVRSVSLVLndRARHVLCGKKVDVRPhriedieaheaAHQKchaGRDDSDHDPLKVFVGGLPKDCGQTEVEIYFEKYGEIEDIFMPegveGEIRGFA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719263_791640 67 0.293 1.770E-07 105 177 414 14 88 153 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGMLGRNINDRDLYNIFSCYGKITEIHLMRNHD-GYSKGCAFIKFATYESARAAIDDLHDFippwSTRAMVVKFANSKPSGPP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A1S3D5A9 67 0.285 1.770E-07 101 170 414 147 216 628 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DECTIYVEKLPPEAEHDYIESVFSKYGKVTYVSLPKFKSTGKLKGFAFVEFSTKEEAAKALEAYTEMGCR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>8941|scaffold1408511_1|-18|01 66 0.323 2.347E-07 118 180 414 0 64 65 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+>ERR1719446_348151 66 0.272 3.113E-07 100 185 414 176 263 265 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PKGANLAVFCIPNSYYDQQVLDLVNSYGNVIFCQVATHRDTGMSRGYAFVSYDTVESAEKAISELHNmsVEGRALRVELARSDKGEKP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1711957_54669 66 0.260 3.113E-07 105 175 414 95 167 285 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYIGHLPWGFDEKGVKKYFEQFGNITRIMLPRSSKSGRVKGYGFVEFDAMEIAEVAAKTMNnyILFDRMLICN---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR5690242_840030 66 0.263 3.113E-07 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+-----------------------------------------------------------------------------------------------------EDRKLFVGMLGKTLEEQDVRKVFEAFGPIEECTILRTPE-GQSKGCAFVKLASHQEAKTAIEQLHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719414_2669176 66 0.241 4.127E-07 96 180 414 12 98 114 +------------------------------------------------------------------------------------------------RPDISDLITLKIDNVSHRTVVDDLDILFGKFGKIGDIHIPRDVRTGDNKGFAFVRFVHRRDAEDAMEDINGrkFDGRELRIQFAKNR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>4415|Ga0307471_109604987_1|-2|11 66 0.263 4.127E-07 117 190 414 0 75 114 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RELQVSWADTKSEADPAimEKVKTLYVKNLATEVTEDTLKENFEPFGELEKV---KKVKDFAFVTYADRAYALAAIEGMHGENrfGKDLDVTLARPQDNKERE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719259_148747 66 0.268 4.127E-07 101 180 414 4 85 131 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------PKNTLFVGRLSLKTEESTLGDLFSRYGKIKKLKIVRDLVTGYSKRYAFIEFEDFVDAKKAFKDAHnrIVDESSIIVDWEHSR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>GraSoiStandDraft_41_1057321.scaffolds.fasta_scaffold6883558_1 66 0.297 4.127E-07 117 188 414 0 73 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0 78 79 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------MGKKLFVEGFPDSDTDQQLYDLFAPFGQVVSARVVRGHR-GESLRFGFVEMASDEEAVRAQEALHrtLLEGHSLIVTFAQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719213_63939 65 0.304 5.472E-07 113 179 414 1 69 99 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------NVDEYILYRIFSAFGDVKNVNIPRDVHNNTHRGFAFVEFFEEEDAAASIDNIHhaEIMGRVCRVNYAQP------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>ERR1719223_722777 65 0.268 5.472E-07 93 185 414 3 99 102 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+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PEMPEDEVRSYFGQFGKIAEMDLPfdkvkGQRRAFCFITYEDASGADQACANLkHKLPGkdKEVDVKKAIPKE------QQGGGRGGYGAGFGRGGFGGRGGTRGRGRGGYNQGGNSGWGNQGGYN------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719238_1895592 65 0.264 5.472E-07 89 156 414 87 153 156 +-----------------------------------------------------------------------------------------EAPAADGDEDDENKRTLFVRNLPFSVTDEQMQETFSPYGE-CQCRLIMDRERGTPKGIGFVEYATIAE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719339_533497 65 0.239 5.472E-07 78 165 414 69 164 209 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VAKDKDGQTSRGFGYITVPEGTDPDALLALPHFLGGVEVKVMM---TKESLAGADVKKIHLNNI-EHLSADDLRTTFVQFGTVWDVHTPKDPntgarKKFGFVTYGNDEA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712136_572891 63 0.620 2.240E-06 212 269 414 0 57 148 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QYGPVHDVYIPTPFRAFAFVTFEDPETAESLIGDDHVIKGVSVHISHPEPKRKRPDQQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>A0A0J7N8L3 63 0.246 2.240E-06 98 176 414 50 130 180 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+>KNS12Surf_metaT_2_FD_contig_51_3502481_length_477_multi_2_in_0_out_0_1 63 0.261 2.240E-06 103 166 414 208 272 301 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TNLFVKQFPRSWTEEIFKKHFEPFGTITSTFLPPNKDiEGECRGFGFINFETNAMAVKALEEMNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719229_2087727 63 0.209 2.240E-06 96 206 414 173 300 301 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0.285 2.968E-06 101 175 414 4 79 84 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------DKHKIIVVGLPASATSDDLIKLTKPFGNPLDANLAVDAE-GRPRGFAFVRFADDDAAKAAIEKLDktELGGRILHVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1711933_280831 63 0.229 2.968E-06 97 170 414 18 91 98 +-------------------------------------------------------------------------------------------------REIDKDANIFVKNLHPDVTVKELESTMSQYGKIFTSKIAMNASTGQSRGYGYIQYESRLDAENCMKLAQNIDIR--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719361_367328 63 0.230 2.968E-06 99 174 414 22 98 99 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+>9306|Ga0075372_10304818_1|+2|10 63 0.310 3.934E-06 109 166 414 1 58 73 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------NLPVWMTDEGLMQLFSPYGSIVSVKAIVDLGTRQCKGIGFVRLQTAEMAQNAIATMNG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001419375881 63 0.280 3.934E-06 105 177 414 4 77 79 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFVEGFPESYTDQQLYDFFAPFGPVVSARVVR-GCTGESLRFGFVEMASEEEAARAQQALYrtWLEGQSLIVTFS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4051794_5355443 63 0.294 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FGYVEFANAADAAMALKTKKGaqIDGREINIDFSTPRPNDSNPrervnsraqtygdetsPESDTLFVGNLSFEVDENTIGEEFGKWGTVTHVRLPTDMYGF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>SRR4051812_9437952 63 0.225 3.934E-06 123 213 414 0 101 112 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FSEFGDIITVRIPVHSDTGRKKGMAFVQFSSPAEAEAALvKDKAEMMGRYLNVNLstsgsrpsssPRKQELSEKPAGCKTVFVGNLSKRQKQATLPVLFCSC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719396_201106 63 0.285 3.934E-06 104 173 414 18 83 115 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0.280 1.213E-05 104 190 414 217 303 401 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------TLYIGNLPLELDENDLKDVFQEFHP-TGSRIAKN-SNESSKGFGFVEFANSKDQQDALDALdqSEINGRVVSVKVSTSDRGRRNRRNRR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719233_2721629 61 0.373 1.213E-05 100 166 414 16 80 662 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PRMSRLIVKNLPFSVTEAKLRNTFSSHGSVTDLQLKY--KNGKFRGFGFVGFLTEEEAKKAKEYLDG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>I0YK06 61 0.265 1.213E-05 101 177 414 0 77 876 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+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DDQITQFFSRYGPVKEFKMMYDENKQRPRGFGFITFDSEECANQVLQEHYiQFNGKQIEVKPQIHNLKQQMPYQ--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719265_2452142 61 0.271 1.607E-05 117 183 414 0 69 106 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EQLKEVFDAFGPTISVRVQFDPVTKVSRGFGFVSYKDHASAQKAVSELagsRVLGSRPLFVTYALRRDAR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1712025_1201611 61 0.306 1.607E-05 115 174 414 2 63 109 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234 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PEENQLFILGLPKNTTDLDLYRIFAPFGSIpaMGVKAKTNPD-GSCTGVGWVDFNEVTSAQAAIAALNGIslpDGTVLKVNQKRPKAGGEQPGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1U8PI51 58 0.252 8.678E-05 105 189 414 293 379 485 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYVKNLPKDVTQDQLKKLFEHHGKITKVVLPPAKPGQERNRIAFVHFAERTCAMKALndSEKYELDGQVVECSLAKPLTDQKTPGGS-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>MGYP001128781537 58 0.452 1.149E-04 108 149 414 1 42 50 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+>SwirhirootsSR2_FD_contig_51_1513660_length_586_multi_1_in_0_out_0_1 57 0.274 1.522E-04 105 166 414 13 73 174 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------IYIKNFPKRWGNAELEKLCSPFGEIASCCVQMESED-RSKGFGYVDFKEHADAKKCVEALHG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>ERR1719193_3078091 57 0.294 1.522E-04 109 174 414 0 67 221 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HISNAEPKHGNRQAMDRAGRFG----------NGFGAQGFGSARGGLGSNTNSSMTNFGSFSLNPAMMAAAQAALQSSWGMMGMLASQQGATTAAASTTAS----TTRDQTYGSNSTSY-SSPSSASLGWAAGTNSASSSGFSSGFGTSMESKSSGWG- +>ERR1719188_1244077 46 0.256 3.886E-01 96 168 414 273 349 352 +------------------------------------------------------------------------------------------------KRKRDPQSSLYLGNLgnePKDVTEPALREVLDPleLENVTEIHVGADQE-GNCRGFAFISFADENSTTTALSKLQYMD----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>A0A1J7H3R3 46 0.163 3.886E-01 101 161 414 367 427 780 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+---------------------------------------------------------------------------------------------------PEDDRKLFVGGLTWDTTQEDLREYFSNFGNILDCSIKHDPTTGRSRGFAFLIFDRKDIVDKILsQNEHFVKGRKIDPKPAHRRLAVTNnnnnnnnnhnhnnnhnthhhhmstssssslnsiSNNNRKVFIGGLDPHFSDVQLREYFSQFGIIDDIDLPydkekNERRPFCFISFQNEQSAQEVLrLQRHTIGDITVDVKRAKPKTLNNNQHQQQ-----IYDPYGQQNIYTNYGTGVSSYGVNAYPTVDPYATWNNYSYNQPGNPGTYSYGGS---------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A7S1ABT0 134 0.274 5.952E-29 102 261 414 29 196 428 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PSKLFIGGVSAHTTTENLHSHFFPYGQIIDAIVM--QKNGRSRGFGFVTFDSLVPAELALADTHWLDGRLLDVKRAVP-GERTQERASNKIFVGGLPQGTTTRDLKTYFSSYGALADAVVmvdrrTNRSRGFGFVRFSNTlqgSLASEAVLRDfalHRLSGKWIEVKRAAP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_UPI0007E85694 134 0.250 5.952E-29 86 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+>UniRef100_A0A132A8H3 134 0.308 8.031E-29 101 278 414 33 211 307 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------ENRKLFVGGLSWETVEKDIFDYFNHFGKVEKVNIKYDLNTGRSRGFGFITFVNDETVDAVLkTGPHVIKNRTVDPKRPKGK------TGLKKIFVGGVDADLCNDDIKAYFEQFGPIENIERPfdrqrNRQREFCFIIFESGESAESAImMPKQLIGGKECDIKLAHPHRNNQNNMYHQNGGSGM--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_K0SEV3 134 0.272 8.031E-29 104 262 414 21 211 316 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLSWQTTEETLRYHFEQYGEVQSVEVMRDRNTGDPRGFAFVVFKADETVDLILRNkPHEINHKVVDVKRAQARGVAppsihggnagdpivkheengnkhlTPEERMNKVFVGGLPMHVDQAGLKDFFSVFGPVVDSIVMmdlvnNRSRGFGFVTYADGSggAQKALEAQPIDMFGKMVEVKLATPR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+>UniRef100_A0A835B760 126 0.247 1.740E-26 104 271 414 127 303 655 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFVKNLSDYVDNASLQELFSKFGDVLSCKVAKN-DDGTSRGYGFVQFASQESADAAIENLHgsLFNDRKLHVAtfVKKSERSTNNDDKFTNLYMKHLDDDITEELVRLKFSQFGPIVSVKIMRRpdgsSLGFGFVSFQNPESAIKAQETMHgmLIGSKALYVARAQKKEERKQYLQR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A0J9X6A7 126 0.250 1.740E-26 103 269 414 230 420 705 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------SNLYIKNLDASTTEQQFQDLFSPYGNLASYTLPLN-EDGTSRGFGFVNFETHDEAVKAIEALNdkEINGKALYVGRAQKKFERDEEIRqqfdmlkirnpplrhapSNNLYIKELDPSVTNDELRQAFAPFGQIVSAKVMadeaGRSREFGFVCFSTPEEAQKAIagMNDTEFKGKKLYVTVAQRRDHRKSPL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 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0.235 5.726E-26 100 261 414 216 410 572 +----------------------------------------------------------------------------------------------------PDEGKMFVGGLNWETTEDALKQYFAQFGSVIHCTIMRDPTNGRSRGFAFLTFADAAVVNKVMVKEHFLDGKLIDPKRAIPRGSGPVPPGppsapipdrrgpyhqfgsetpaslSNKLFCRGMPDDATPSSFRSYWAQYdsqANIEEAVLMmdrdsNRHRGFGFVNLVTGDDADALLRcGPFVMDGHPLEVKRKAP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_B6K1A4 125 0.260 5.726E-26 102 264 414 5 188 665 +------------------------------------------------------------------------------------------------------PSSLFVRNLTFSTTSNDLTDFFSNAAPVKHAVVVTDKETGQSKGFGFVTFSLHEDAVRALEELknKKLDGRILRMEFAAPrkrngetsdkpkKPEQVRKDTRPRLIVRNLPWSVkKPKHLEPYFAKFGKVREIKVPtkggGRMCGFAFVWMKDRASAQKAMdtLNATEIDGRVVAVDWAVSKDE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+>UniRef100_A0A7J8RK77 124 0.235 7.711E-26 102 265 414 65 224 256 +------------------------------------------------------------------------------------------------------GRKLVINGISTEMDERILRRHFSAYGEVKHVVV------NVKKAIAFVTFVDPSKAQISLQQQHIILGRKVEVRPAKPKVE----IGKRKIFVGGLPRSITDEEFKGYFEKFGSIVDAVVihdkeTKRSRGFGFVTYEAEESANLVLRtNFHLLNNKRVEVKKVTPRQEM---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_UPI0009E60C7F 124 0.285 7.711E-26 104 283 414 12 211 290 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KIFVGGLSRSTTNDGLRAYFDSYGEMSDCVVIVDPQSKESRGFGYVTFVDKNSVIEVLkykkeKGAHTIDEKEVEVKRAIPKddDSPTARLKTKKIFIGGLKDEATSEDIHQALADAvrGTaPNSVDLimkktedgTSKHRGFCFVEFEDEDIVDELcCLKKVNICGKSVEIKKAEPKDkDKGGPGGRGGRGGRGRGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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+>UniRef100_A0A0L0SU35 124 0.209 7.711E-26 104 271 414 172 350 386 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------NIFIKNLDPSIDNKALHDTFAAFGKILSCKVAT--RDGQSLGYGFVHYETKEAADAAIQAVNgmLLNDKAVYVGHHVPKKQREAEMavqraKFTNLYVKNLPEDMTEDAFTNMFAEFGPVLSAVIQrddeGKSKGFGFVNYGEHEAAQKAVeeLNEKEIDGKPLYVARAQKKSEREEELRR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A2P2JU60 124 0.272 7.711E-26 95 259 414 74 249 401 +-----------------------------------------------------------------------------------------------VADPDASLRKLFVRGLSPETTSDGLGSIFAPYGELDEAIVIFDKNTGKSKGYGFVTFKHVDGARLALKEPsKKIDGRMTVTQLASAGLSNSGPASDvsmRKIYVGNVPFEITSERLLSSFLVFGEIEEGPLgfdkagPGKTKGFAFFIYKTEEGARAAIAEPLkVIDGHQVLCKLA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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352 +----------------------------------------------------------------------------------------------------------FVGGLAWATDSDALEKAFSLYGDIVDSKIINDRETGRSRGFGFVTFASEQSMKDAIEGMNgqNLDGRNITVNEAQSRGSGGGSRGggggygggggysrggggygggggyggggyggrrdggynrngggyggdrdrgygdggsrysrggdgggyegswrnnicpkflgflllpmaaadvEYRCFVGGLAWATDSDALEKAFSQYGDVVESKIindreTGRSRGFGFVTFSSEQAMKDAIegMNGQNLDGRNITVNEAQSRGSGGGGSRGGGGYGG-GGGYNRGGGGYGGGGGYGGGRREGGYNRNGGGGYG---------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A7J6PVP3 109 0.239 7.849E-21 101 257 414 155 342 405 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+>UniRef100_A0A0R3XAK3 109 0.206 7.849E-21 104 259 414 237 449 506 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------RLYIGGLRLSHTESQLRQHFAQYGAVTDCYIVRDCKTDESKGYAFVTFQEAAEASRALADcPHFIEGGPVCVKPSKGKKKEEREEEEEeekeeetaaaastsvakalgftstkkgvvgkkkhknegssndsraevnklRLFVGNLSPSITQQELRQHFSHYGKVTSVDVildreSGKARGIAFVNMSTHVEVEAVLdARPHRLNGESIIVRPA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A319E4G4 109 0.159 7.849E-21 103 270 414 231 473 726 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+>UniRef100_A0A7J6P3T6 108 0.209 1.412E-20 105 251 414 596 805 1013 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LFIGGLPSLVDRQTLWNYFSQFGQLEEAVVMMDKLTGRSRGFGFITFVNVKDLESCLSypNSHVLLDKTVDVKRAVSQEEIRaqaalrqpvnlggappggvnsvmgvmhhmmaggggqthinnfgptgatgnsnngllPQDNPCKVFCGGLPATVDRERLRQHFVRYGVITDCivkvdRTSGRSRGFGYVTFQTPAEAQAAIQGGVDGQG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UniRef100_UPI000766E13A 108 0.978 1.893E-20 100 190 414 12 102 103 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+>UniRef100_A0A7R9CKM6 102 0.266 1.137E-18 90 249 414 4 141 311 +------------------------------------------------------------------------------------------EREDGGKAEPEHIRKLFIGGLDYRTTDESLKKHFEQWGEIVDVVVMKDPNT---------------------KSLTSEDGEIEEIGRP------EAGATVKKLFVGGLKEDMEEDDMREYFKQFGTVMSVAIvvdkeTGKKRGFGFVEFDDYDPVDKICSRQRWL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A1I8GQH8 102 0.191 1.137E-18 93 255 414 56 280 337 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+>UniRef100_A0A251UDU6 96 0.248 8.924E-17 101 260 414 64 234 632 +-----------------------------------------------------------------------------------------------------KGVEVFVGGLARSVTEDKVHKVFSTCGEIMDIRLIKD-QTGSLKGFGFVRFTTKDAADKAMKELNesMLEGKKIGV---------LPSASQVTLFIGNLNKGWSNDDFNKAVRQvFPDVVSIDLSQPStggeaggskklknRGFGFVKFSSHAAASRAFrvgSKPGFVLGDTLHptVKWAE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_B8BZC4 96 0.238 8.924E-17 80 259 414 629 838 886 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+>UniRef100_A0A7W1ERA7 78 0.337 4.908E-11 104 184 414 2 84 85 +--------------------------------------------------------------------------------------------------------KLFVGNLPYTVTSEQLAEIFGESAEVVSANVITDRMNGRSKGFGFVELAESADINAVIEATNgkELDGRAITVSEARPQQPRD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A8T7C7E5 78 0.318 4.908E-11 105 191 414 3 89 90 +---------------------------------------------------------------------------------------------------------LYVGNLPFSTTEDQLRELFADYGTVHEIKLVYDRETGQPRGFGFVEMNETDAAAASEAlNGSEVEGRPLRINKAH-KGSQRSPSGRRN------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ +>UniRef100_A0A365XUT7 78 0.280 4.908E-11 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+------------------------------------------------------------------------------------------------RRPFNGASRLYVGNLPYTMTTDQLRDHFASFGRITDCIVKADQATGRSRGFGIVEFSEPSAAENSIDRWNNrsLEGRPLVVR---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_A0A351Y3G0 78 0.367 4.908E-11 103 187 414 10 96 99 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------TKLFVGGLNRKLRGKDLRDEFSKFGEVAFARVKLEQETNKSKGFGFVEFVNPADAAKAQKAMNgqEIMGRAVKVEFANENPDKIKPL---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- +>UniRef100_UPI0006EC27B2 78 0.282 4.908E-11 104 193 414 1 92 101 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-8.406 21.328 12.578 1.00 80.12 C +ATOM 82 O ASP A 10 -10.430 23.656 13.812 1.00 80.12 O +ATOM 83 CG ASP A 10 -7.945 20.172 13.453 1.00 80.12 C +ATOM 84 OD1 ASP A 10 -8.555 19.922 14.516 1.00 80.12 O +ATOM 85 OD2 ASP A 10 -6.961 19.500 13.070 1.00 80.12 O +ATOM 86 N GLU A 11 -10.328 21.875 15.031 1.00 72.19 N +ATOM 87 CA GLU A 11 -10.641 22.578 16.281 1.00 72.19 C +ATOM 88 C GLU A 11 -9.594 23.625 16.609 1.00 72.19 C +ATOM 89 CB GLU A 11 -10.758 21.578 17.438 1.00 72.19 C +ATOM 90 O GLU A 11 -9.898 24.641 17.250 1.00 72.19 O +ATOM 91 CG GLU A 11 -11.969 20.656 17.344 1.00 72.19 C +ATOM 92 CD GLU A 11 -12.141 19.750 18.547 1.00 72.19 C +ATOM 93 OE1 GLU A 11 -13.234 19.172 18.719 1.00 72.19 O +ATOM 94 OE2 GLU A 11 -11.172 19.641 19.328 1.00 72.19 O +ATOM 95 N ASN A 12 -8.391 23.516 15.945 1.00 76.50 N +ATOM 96 CA ASN A 12 -7.305 24.422 16.250 1.00 76.50 C +ATOM 97 C ASN A 12 -7.176 25.531 15.203 1.00 76.50 C +ATOM 98 CB ASN A 12 -5.984 23.672 16.391 1.00 76.50 C +ATOM 99 O ASN A 12 -6.367 26.438 15.359 1.00 76.50 O +ATOM 100 CG ASN A 12 -6.004 22.656 17.531 1.00 76.50 C +ATOM 101 ND2 ASN A 12 -5.492 21.469 17.266 1.00 76.50 N +ATOM 102 OD1 ASN A 12 -6.473 22.969 18.625 1.00 76.50 O +ATOM 103 N ASP A 13 -8.109 25.500 14.258 1.00 81.25 N +ATOM 104 CA ASP A 13 -8.023 26.484 13.188 1.00 81.25 C +ATOM 105 C ASP A 13 -9.039 27.609 13.398 1.00 81.25 C +ATOM 106 CB ASP A 13 -8.242 25.828 11.828 1.00 81.25 C +ATOM 107 O ASP A 13 -10.008 27.438 14.148 1.00 81.25 O +ATOM 108 CG ASP A 13 -7.059 24.984 11.375 1.00 81.25 C +ATOM 109 OD1 ASP A 13 -5.918 25.266 11.797 1.00 81.25 O +ATOM 110 OD2 ASP A 13 -7.270 24.047 10.586 1.00 81.25 O +ATOM 111 N GLU A 14 -8.562 28.828 12.836 1.00 86.81 N +ATOM 112 CA GLU A 14 -9.469 29.969 12.891 1.00 86.81 C +ATOM 113 C GLU A 14 -10.711 29.734 12.031 1.00 86.81 C +ATOM 114 CB GLU A 14 -8.758 31.250 12.430 1.00 86.81 C +ATOM 115 O GLU A 14 -10.609 29.266 10.898 1.00 86.81 O +ATOM 116 CG GLU A 14 -7.754 31.781 13.438 1.00 86.81 C +ATOM 117 CD 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CD ARG A 52 -26.219 17.656 19.297 1.00 89.00 C +ATOM 402 NE ARG A 52 -26.734 17.094 20.547 1.00 89.00 N +ATOM 403 NH1 ARG A 52 -28.594 18.469 20.641 1.00 89.00 N +ATOM 404 NH2 ARG A 52 -28.234 16.906 22.281 1.00 89.00 N +ATOM 405 CZ ARG A 52 -27.844 17.500 21.141 1.00 89.00 C +ATOM 406 N GLY A 53 -23.828 15.961 14.523 1.00 89.50 N +ATOM 407 CA GLY A 53 -23.859 16.109 13.078 1.00 89.50 C +ATOM 408 C GLY A 53 -24.969 17.031 12.594 1.00 89.50 C +ATOM 409 O GLY A 53 -26.016 17.109 13.227 1.00 89.50 O +ATOM 410 N VAL A 54 -24.656 17.766 11.586 1.00 91.25 N +ATOM 411 CA VAL A 54 -25.641 18.625 10.945 1.00 91.25 C +ATOM 412 C VAL A 54 -26.406 17.828 9.883 1.00 91.25 C +ATOM 413 CB VAL A 54 -25.000 19.875 10.320 1.00 91.25 C +ATOM 414 O VAL A 54 -25.797 17.109 9.094 1.00 91.25 O +ATOM 415 CG1 VAL A 54 -26.047 20.766 9.672 1.00 91.25 C +ATOM 416 CG2 VAL A 54 -24.219 20.656 11.383 1.00 91.25 C +ATOM 417 N ARG A 55 -27.688 17.906 9.891 1.00 92.38 N +ATOM 418 CA ARG A 55 -28.547 17.188 8.953 1.00 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+ATOM 776 N LYS A 102 5.527 7.688 -3.514 1.00 61.78 N +ATOM 777 CA LYS A 102 6.934 7.297 -3.572 1.00 61.78 C +ATOM 778 C LYS A 102 7.148 6.164 -4.570 1.00 61.78 C +ATOM 779 CB LYS A 102 7.430 6.875 -2.188 1.00 61.78 C +ATOM 780 O LYS A 102 6.270 5.324 -4.766 1.00 61.78 O +ATOM 781 CG LYS A 102 7.418 7.996 -1.159 1.00 61.78 C +ATOM 782 CD LYS A 102 7.980 7.535 0.179 1.00 61.78 C +ATOM 783 CE LYS A 102 7.875 8.625 1.237 1.00 61.78 C +ATOM 784 NZ LYS A 102 8.680 8.297 2.455 1.00 61.78 N +ATOM 785 N THR A 103 8.000 6.406 -5.570 1.00 72.06 N +ATOM 786 CA THR A 103 8.453 5.434 -6.562 1.00 72.06 C +ATOM 787 C THR A 103 9.148 4.254 -5.887 1.00 72.06 C +ATOM 788 CB THR A 103 9.406 6.082 -7.582 1.00 72.06 C +ATOM 789 O THR A 103 9.789 4.418 -4.852 1.00 72.06 O +ATOM 790 CG2 THR A 103 8.711 7.191 -8.359 1.00 72.06 C +ATOM 791 OG1 THR A 103 10.531 6.633 -6.891 1.00 72.06 O +ATOM 792 N SER A 104 8.617 3.014 -6.156 1.00 79.88 N +ATOM 793 CA SER A 104 9.203 1.766 -5.672 1.00 79.88 C +ATOM 794 C SER A 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-3.178 -17.359 1.00 93.06 C +ATOM 916 CD1 LEU A 120 18.844 -3.789 -15.961 1.00 93.06 C +ATOM 917 CD2 LEU A 120 17.766 -3.512 -18.203 1.00 93.06 C +ATOM 918 N LYS A 121 19.844 1.304 -17.875 1.00 94.31 N +ATOM 919 CA LYS A 121 19.656 2.732 -17.625 1.00 94.31 C +ATOM 920 C LYS A 121 19.312 3.463 -18.922 1.00 94.31 C +ATOM 921 CB LYS A 121 20.906 3.344 -17.000 1.00 94.31 C +ATOM 922 O LYS A 121 18.406 4.305 -18.953 1.00 94.31 O +ATOM 923 CG LYS A 121 20.750 4.797 -16.578 1.00 94.31 C +ATOM 924 CD LYS A 121 21.984 5.309 -15.852 1.00 94.31 C +ATOM 925 CE LYS A 121 21.797 6.750 -15.391 1.00 94.31 C +ATOM 926 NZ LYS A 121 23.000 7.258 -14.680 1.00 94.31 N +ATOM 927 N GLU A 122 20.000 3.156 -20.000 1.00 94.31 N +ATOM 928 CA GLU A 122 19.781 3.781 -21.297 1.00 94.31 C +ATOM 929 C GLU A 122 18.391 3.451 -21.828 1.00 94.31 C +ATOM 930 CB GLU A 122 20.844 3.340 -22.297 1.00 94.31 C +ATOM 931 O GLU A 122 17.672 4.332 -22.328 1.00 94.31 O +ATOM 932 CG GLU A 122 22.203 3.994 -22.078 1.00 94.31 C +ATOM 933 CD GLU A 122 23.281 3.473 -23.016 1.00 94.31 C +ATOM 934 OE1 GLU A 122 24.469 3.795 -22.812 1.00 94.31 O +ATOM 935 OE2 GLU A 122 22.922 2.734 -23.969 1.00 94.31 O +ATOM 936 N TYR A 123 18.031 2.219 -21.719 1.00 93.06 N +ATOM 937 CA TYR A 123 16.734 1.793 -22.219 1.00 93.06 C +ATOM 938 C TYR A 123 15.602 2.443 -21.422 1.00 93.06 C +ATOM 939 CB TYR A 123 16.609 0.268 -22.156 1.00 93.06 C +ATOM 940 O TYR A 123 14.664 2.994 -22.016 1.00 93.06 O +ATOM 941 CG TYR A 123 15.266 -0.250 -22.625 1.00 93.06 C +ATOM 942 CD1 TYR A 123 14.250 -0.547 -21.734 1.00 93.06 C +ATOM 943 CD2 TYR A 123 15.023 -0.442 -23.984 1.00 93.06 C +ATOM 944 CE1 TYR A 123 13.016 -1.026 -22.172 1.00 93.06 C +ATOM 945 CE2 TYR A 123 13.797 -0.920 -24.438 1.00 93.06 C +ATOM 946 OH TYR A 123 11.586 -1.683 -23.969 1.00 93.06 O +ATOM 947 CZ TYR A 123 12.805 -1.209 -23.516 1.00 93.06 C +ATOM 948 N PHE A 124 15.680 2.455 -20.078 1.00 93.19 N +ATOM 949 CA PHE A 124 14.594 2.920 -19.234 1.00 93.19 C +ATOM 950 C PHE A 124 14.602 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+ATOM 968 CB THR A 126 13.516 5.617 -23.781 1.00 92.44 C +ATOM 969 O THR A 126 11.383 7.633 -22.672 1.00 92.44 O +ATOM 970 CG2 THR A 126 14.883 5.438 -24.438 1.00 92.44 C +ATOM 971 OG1 THR A 126 13.086 4.359 -23.250 1.00 92.44 O +ATOM 972 N PHE A 127 11.828 6.324 -21.016 1.00 89.44 N +ATOM 973 CA PHE A 127 10.508 6.453 -20.406 1.00 89.44 C +ATOM 974 C PHE A 127 10.484 7.578 -19.391 1.00 89.44 C +ATOM 975 CB PHE A 127 10.078 5.133 -19.766 1.00 89.44 C +ATOM 976 O PHE A 127 9.484 8.281 -19.250 1.00 89.44 O +ATOM 977 CG PHE A 127 9.930 3.996 -20.734 1.00 89.44 C +ATOM 978 CD1 PHE A 127 8.742 3.816 -21.438 1.00 89.44 C +ATOM 979 CD2 PHE A 127 10.969 3.104 -20.938 1.00 89.44 C +ATOM 980 CE1 PHE A 127 8.594 2.764 -22.328 1.00 89.44 C +ATOM 981 CE2 PHE A 127 10.836 2.049 -21.844 1.00 89.44 C +ATOM 982 CZ PHE A 127 9.641 1.881 -22.531 1.00 89.44 C +ATOM 983 N GLY A 128 11.547 7.734 -18.734 1.00 88.75 N +ATOM 984 CA GLY A 128 11.664 8.727 -17.688 1.00 88.75 C +ATOM 985 C GLY A 128 13.023 8.727 -17.016 1.00 88.75 C +ATOM 986 O GLY A 128 13.930 7.996 -17.422 1.00 88.75 O +ATOM 987 N GLU A 129 13.188 9.695 -16.078 1.00 91.06 N +ATOM 988 CA GLU A 129 14.430 9.789 -15.320 1.00 91.06 C +ATOM 989 C GLU A 129 14.555 8.633 -14.328 1.00 91.06 C +ATOM 990 CB GLU A 129 14.508 11.125 -14.578 1.00 91.06 C +ATOM 991 O GLU A 129 13.680 8.438 -13.477 1.00 91.06 O +ATOM 992 CG GLU A 129 15.859 11.398 -13.930 1.00 91.06 C +ATOM 993 CD GLU A 129 15.922 12.734 -13.211 1.00 91.06 C +ATOM 994 OE1 GLU A 129 16.938 13.016 -12.555 1.00 91.06 O +ATOM 995 OE2 GLU A 129 14.938 13.500 -13.312 1.00 91.06 O +ATOM 996 N VAL A 130 15.664 7.848 -14.562 1.00 92.25 N +ATOM 997 CA VAL A 130 15.922 6.676 -13.727 1.00 92.25 C +ATOM 998 C VAL A 130 16.797 7.066 -12.539 1.00 92.25 C +ATOM 999 CB VAL A 130 16.594 5.543 -14.539 1.00 92.25 C +ATOM 1000 O VAL A 130 17.844 7.688 -12.711 1.00 92.25 O +ATOM 1001 CG1 VAL A 130 16.844 4.324 -13.648 1.00 92.25 C +ATOM 1002 CG2 VAL A 130 15.734 5.168 -15.742 1.00 92.25 C +ATOM 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+ATOM 1139 O GLY A 148 15.414 -5.859 -11.539 1.00 92.44 O +ATOM 1140 N PHE A 149 17.062 -4.395 -10.984 1.00 93.56 N +ATOM 1141 CA PHE A 149 16.172 -3.441 -10.336 1.00 93.56 C +ATOM 1142 C PHE A 149 16.328 -2.051 -10.938 1.00 93.56 C +ATOM 1143 CB PHE A 149 16.453 -3.393 -8.828 1.00 93.56 C +ATOM 1144 O PHE A 149 17.453 -1.634 -11.266 1.00 93.56 O +ATOM 1145 CG PHE A 149 16.188 -4.695 -8.117 1.00 93.56 C +ATOM 1146 CD1 PHE A 149 14.914 -5.023 -7.684 1.00 93.56 C +ATOM 1147 CD2 PHE A 149 17.234 -5.594 -7.895 1.00 93.56 C +ATOM 1148 CE1 PHE A 149 14.672 -6.230 -7.027 1.00 93.56 C +ATOM 1149 CE2 PHE A 149 17.000 -6.801 -7.238 1.00 93.56 C +ATOM 1150 CZ PHE A 149 15.711 -7.113 -6.809 1.00 93.56 C +ATOM 1151 N VAL A 150 15.102 -1.468 -11.086 1.00 93.75 N +ATOM 1152 CA VAL A 150 15.109 -0.102 -11.594 1.00 93.75 C +ATOM 1153 C VAL A 150 14.172 0.768 -10.758 1.00 93.75 C +ATOM 1154 CB VAL A 150 14.688 -0.055 -13.086 1.00 93.75 C +ATOM 1155 O VAL A 150 13.109 0.313 -10.328 1.00 93.75 O +ATOM 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OE1 GLN A 164 6.027 0.858 -22.781 1.00 87.06 O +ATOM 1279 N ARG A 165 5.238 -4.465 -21.719 1.00 89.69 N +ATOM 1280 CA ARG A 165 6.312 -5.426 -21.938 1.00 89.69 C +ATOM 1281 C ARG A 165 7.504 -4.770 -22.625 1.00 89.69 C +ATOM 1282 CB ARG A 165 5.816 -6.613 -22.766 1.00 89.69 C +ATOM 1283 O ARG A 165 7.328 -3.977 -23.562 1.00 89.69 O +ATOM 1284 CG ARG A 165 6.777 -7.793 -22.781 1.00 89.69 C +ATOM 1285 CD ARG A 165 6.141 -9.031 -23.391 1.00 89.69 C +ATOM 1286 NE ARG A 165 7.098 -10.125 -23.531 1.00 89.69 N +ATOM 1287 NH1 ARG A 165 5.496 -11.789 -23.641 1.00 89.69 N +ATOM 1288 NH2 ARG A 165 7.723 -12.328 -23.734 1.00 89.69 N +ATOM 1289 CZ ARG A 165 6.770 -11.414 -23.641 1.00 89.69 C +ATOM 1290 N HIS A 166 8.773 -5.133 -22.203 1.00 90.75 N +ATOM 1291 CA HIS A 166 9.977 -4.473 -22.703 1.00 90.75 C +ATOM 1292 C HIS A 166 10.859 -5.445 -23.469 1.00 90.75 C +ATOM 1293 CB HIS A 166 10.758 -3.842 -21.547 1.00 90.75 C +ATOM 1294 O HIS A 166 10.898 -6.637 -23.156 1.00 90.75 O +ATOM 1295 CG HIS A 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CB PHE A 226 -7.918 -24.328 6.664 1.00 86.62 C +ATOM 1780 O PHE A 226 -6.000 -25.281 8.789 1.00 86.62 O +ATOM 1781 CG PHE A 226 -8.414 -23.078 7.348 1.00 86.62 C +ATOM 1782 CD1 PHE A 226 -8.984 -23.141 8.617 1.00 86.62 C +ATOM 1783 CD2 PHE A 226 -8.305 -21.844 6.727 1.00 86.62 C +ATOM 1784 CE1 PHE A 226 -9.445 -21.984 9.250 1.00 86.62 C +ATOM 1785 CE2 PHE A 226 -8.758 -20.688 7.359 1.00 86.62 C +ATOM 1786 CZ PHE A 226 -9.328 -20.766 8.617 1.00 86.62 C +ATOM 1787 N ARG A 227 -4.930 -23.422 8.234 1.00 89.38 N +ATOM 1788 CA ARG A 227 -4.305 -23.266 9.539 1.00 89.38 C +ATOM 1789 C ARG A 227 -4.727 -21.938 10.188 1.00 89.38 C +ATOM 1790 CB ARG A 227 -2.781 -23.312 9.422 1.00 89.38 C +ATOM 1791 O ARG A 227 -4.004 -21.391 11.016 1.00 89.38 O +ATOM 1792 CG ARG A 227 -2.254 -24.656 8.914 1.00 89.38 C +ATOM 1793 CD ARG A 227 -0.771 -24.578 8.578 1.00 89.38 C +ATOM 1794 NE ARG A 227 0.033 -24.266 9.758 1.00 89.38 N +ATOM 1795 NH1 ARG A 227 2.012 -24.016 8.594 1.00 89.38 N +ATOM 1796 NH2 ARG A 227 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N +ATOM 1831 CA VAL A 232 -1.943 -10.695 2.090 1.00 92.38 C +ATOM 1832 C VAL A 232 -0.764 -9.812 1.688 1.00 92.38 C +ATOM 1833 CB VAL A 232 -3.096 -9.828 2.639 1.00 92.38 C +ATOM 1834 O VAL A 232 -0.080 -9.250 2.545 1.00 92.38 O +ATOM 1835 CG1 VAL A 232 -3.506 -8.766 1.617 1.00 92.38 C +ATOM 1836 CG2 VAL A 232 -4.289 -10.703 3.018 1.00 92.38 C +ATOM 1837 N THR A 233 -0.525 -9.695 0.354 1.00 88.62 N +ATOM 1838 CA THR A 233 0.537 -8.852 -0.183 1.00 88.62 C +ATOM 1839 C THR A 233 -0.042 -7.594 -0.816 1.00 88.62 C +ATOM 1840 CB THR A 233 1.381 -9.617 -1.224 1.00 88.62 C +ATOM 1841 O THR A 233 -0.877 -7.672 -1.720 1.00 88.62 O +ATOM 1842 CG2 THR A 233 2.584 -8.789 -1.667 1.00 88.62 C +ATOM 1843 OG1 THR A 233 1.845 -10.844 -0.650 1.00 88.62 O +ATOM 1844 N PHE A 234 0.418 -6.414 -0.260 1.00 87.94 N +ATOM 1845 CA PHE A 234 -0.043 -5.129 -0.768 1.00 87.94 C +ATOM 1846 C PHE A 234 0.944 -4.559 -1.781 1.00 87.94 C +ATOM 1847 CB PHE A 234 -0.244 -4.133 0.381 1.00 87.94 C +ATOM 1848 O PHE A 234 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-11.211 45.469 1.00 46.47 C +ATOM 2763 N ASN A 364 -15.664 -7.484 46.500 1.00 32.56 N +ATOM 2764 CA ASN A 364 -16.172 -6.203 46.969 1.00 32.56 C +ATOM 2765 C ASN A 364 -15.039 -5.277 47.406 1.00 32.56 C +ATOM 2766 CB ASN A 364 -17.156 -6.410 48.125 1.00 32.56 C +ATOM 2767 O ASN A 364 -14.211 -5.645 48.219 1.00 32.56 O +ATOM 2768 CG ASN A 364 -18.562 -5.988 47.781 1.00 32.56 C +ATOM 2769 ND2 ASN A 364 -19.453 -6.047 48.750 1.00 32.56 N +ATOM 2770 OD1 ASN A 364 -18.844 -5.613 46.625 1.00 32.56 O +ATOM 2771 N GLN A 365 -14.805 -4.113 46.688 1.00 39.25 N +ATOM 2772 CA GLN A 365 -14.641 -2.848 47.406 1.00 39.25 C +ATOM 2773 C GLN A 365 -14.344 -1.708 46.406 1.00 39.25 C +ATOM 2774 CB GLN A 365 -13.523 -2.951 48.438 1.00 39.25 C +ATOM 2775 O GLN A 365 -13.461 -1.820 45.562 1.00 39.25 O +ATOM 2776 CG GLN A 365 -13.945 -3.656 49.719 1.00 39.25 C +ATOM 2777 CD GLN A 365 -12.984 -3.402 50.875 1.00 39.25 C +ATOM 2778 NE2 GLN A 365 -13.320 -3.922 52.031 1.00 39.25 N +ATOM 2779 OE1 GLN A 365 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-0,0 +1,674 @@ + GNU GENERAL PUBLIC LICENSE + Version 3, 29 June 2007 + + Copyright (C) 2007 Free Software Foundation, Inc. + Everyone is permitted to copy and distribute verbatim copies + of this license document, but changing it is not allowed. + + Preamble + + The GNU General Public License is a free, copyleft license for +software and other kinds of works. + + The licenses for most software and other practical works are designed +to take away your freedom to share and change the works. By contrast, +the GNU General Public License is intended to guarantee your freedom to +share and change all versions of a program--to make sure it remains free +software for all its users. We, the Free Software Foundation, use the +GNU General Public License for most of our software; it applies also to +any other work released this way by its authors. You can apply it to +your programs, too. + + When we speak of free software, we are referring to freedom, not +price. Our General Public Licenses are designed to make sure that you +have the freedom to distribute copies of free software (and charge for +them if you wish), that you receive source code or can get it if you +want it, that you can change the software or use pieces of it in new +free programs, and that you know you can do these things. + + To protect your rights, we need to prevent others from denying you +these rights or asking you to surrender the rights. Therefore, you have +certain responsibilities if you distribute copies of the software, or if +you modify it: responsibilities to respect the freedom of others. + + For example, if you distribute copies of such a program, whether +gratis or for a fee, you must pass on to the recipients the same +freedoms that you received. You must make sure that they, too, receive +or can get the source code. And you must show them these terms so they +know their rights. + + Developers that use the GNU GPL protect your rights with two steps: +(1) assert copyright on the software, and (2) offer you this License +giving you legal permission to copy, distribute and/or modify it. + + For the developers' and authors' protection, the GPL clearly explains +that there is no warranty for this free software. For both users' and +authors' sake, the GPL requires that modified versions be marked as +changed, so that their problems will not be attributed erroneously to +authors of previous versions. + + Some devices are designed to deny users access to install or run +modified versions of the software inside them, although the manufacturer +can do so. This is fundamentally incompatible with the aim of +protecting users' freedom to change the software. The systematic +pattern of such abuse occurs in the area of products for individuals to +use, which is precisely where it is most unacceptable. Therefore, we +have designed this version of the GPL to prohibit the practice for those +products. If such problems arise substantially in other domains, we +stand ready to extend this provision to those domains in future versions +of the GPL, as needed to protect the freedom of users. + + Finally, every program is threatened constantly by software patents. +States should not allow patents to restrict development and use of +software on general-purpose computers, but in those that do, we wish to +avoid the special danger that patents applied to a free program could +make it effectively proprietary. To prevent this, the GPL assures that +patents cannot be used to render the program non-free. + + The precise terms and conditions for copying, distribution and +modification follow. + + TERMS AND CONDITIONS + + 0. Definitions. + + "This License" refers to version 3 of the GNU General Public License. + + "Copyright" also means copyright-like laws that apply to other kinds of +works, such as semiconductor masks. + + "The Program" refers to any copyrightable work licensed under this +License. Each licensee is addressed as "you". "Licensees" and +"recipients" may be individuals or organizations. + + To "modify" a work means to copy from or adapt all or part of the work +in a fashion requiring copyright permission, other than the making of an +exact copy. The resulting work is called a "modified version" of the +earlier work or a work "based on" the earlier work. + + A "covered work" means either the unmodified Program or a work based +on the Program. + + To "propagate" a work means to do anything with it that, without +permission, would make you directly or secondarily liable for +infringement under applicable copyright law, except executing it on a +computer or modifying a private copy. Propagation includes copying, +distribution (with or without modification), making available to the +public, and in some countries other activities as well. + + To "convey" a work means any kind of propagation that enables other +parties to make or receive copies. Mere interaction with a user through +a computer network, with no transfer of a copy, is not conveying. + + An interactive user interface displays "Appropriate Legal Notices" +to the extent that it includes a convenient and prominently visible +feature that (1) displays an appropriate copyright notice, and (2) +tells the user that there is no warranty for the work (except to the +extent that warranties are provided), that licensees may convey the +work under this License, and how to view a copy of this License. If +the interface presents a list of user commands or options, such as a +menu, a prominent item in the list meets this criterion. + + 1. Source Code. + + The "source code" for a work means the preferred form of the work +for making modifications to it. "Object code" means any non-source +form of a work. + + A "Standard Interface" means an interface that either is an official +standard defined by a recognized standards body, or, in the case of +interfaces specified for a particular programming language, one that +is widely used among developers working in that language. + + The "System Libraries" of an executable work include anything, other +than the work as a whole, that (a) is included in the normal form of +packaging a Major Component, but which is not part of that Major +Component, and (b) serves only to enable use of the work with that +Major Component, or to implement a Standard Interface for which an +implementation is available to the public in source code form. A +"Major Component", in this context, means a major essential component +(kernel, window system, and so on) of the specific operating system +(if any) on which the executable work runs, or a compiler used to +produce the work, or an object code interpreter used to run it. + + The "Corresponding Source" for a work in object code form means all +the source code needed to generate, install, and (for an executable +work) run the object code and to modify the work, including scripts to +control those activities. However, it does not include the work's +System Libraries, or general-purpose tools or generally available free +programs which are used unmodified in performing those activities but +which are not part of the work. For example, Corresponding Source +includes interface definition files associated with source files for +the work, and the source code for shared libraries and dynamically +linked subprograms that the work is specifically designed to require, +such as by intimate data communication or control flow between those +subprograms and other parts of the work. + + The Corresponding Source need not include anything that users +can regenerate automatically from other parts of the Corresponding +Source. + + The Corresponding Source for a work in source code form is that +same work. + + 2. Basic Permissions. + + All rights granted under this License are granted for the term of +copyright on the Program, and are irrevocable provided the stated +conditions are met. This License explicitly affirms your unlimited +permission to run the unmodified Program. The output from running a +covered work is covered by this License only if the output, given its +content, constitutes a covered work. This License acknowledges your +rights of fair use or other equivalent, as provided by copyright law. + + You may make, run and propagate covered works that you do not +convey, without conditions so long as your license otherwise remains +in force. You may convey covered works to others for the sole purpose +of having them make modifications exclusively for you, or provide you +with facilities for running those works, provided that you comply with +the terms of this License in conveying all material for which you do +not control copyright. Those thus making or running the covered works +for you must do so exclusively on your behalf, under your direction +and control, on terms that prohibit them from making any copies of +your copyrighted material outside their relationship with you. + + Conveying under any other circumstances is permitted solely under +the conditions stated below. Sublicensing is not allowed; section 10 +makes it unnecessary. + + 3. Protecting Users' Legal Rights From Anti-Circumvention Law. + + No covered work shall be deemed part of an effective technological +measure under any applicable law fulfilling obligations under article +11 of the WIPO copyright treaty adopted on 20 December 1996, or +similar laws prohibiting or restricting circumvention of such +measures. + + When you convey a covered work, you waive any legal power to forbid +circumvention of technological measures to the extent such circumvention +is effected by exercising rights under this License with respect to +the covered work, and you disclaim any intention to limit operation or +modification of the work as a means of enforcing, against the work's +users, your or third parties' legal rights to forbid circumvention of +technological measures. + + 4. Conveying Verbatim Copies. + + You may convey verbatim copies of the Program's source code as you +receive it, in any medium, provided that you conspicuously and +appropriately publish on each copy an appropriate copyright notice; +keep intact all notices stating that this License and any +non-permissive terms added in accord with section 7 apply to the code; +keep intact all notices of the absence of any warranty; and give all +recipients a copy of this License along with the Program. + + You may charge any price or no price for each copy that you convey, +and you may offer support or warranty protection for a fee. + + 5. Conveying Modified Source Versions. + + You may convey a work based on the Program, or the modifications to +produce it from the Program, in the form of source code under the +terms of section 4, provided that you also meet all of these conditions: + + a) The work must carry prominent notices stating that you modified + it, and giving a relevant date. + + b) The work must carry prominent notices stating that it is + released under this License and any conditions added under section + 7. This requirement modifies the requirement in section 4 to + "keep intact all notices". + + c) You must license the entire work, as a whole, under this + License to anyone who comes into possession of a copy. This + License will therefore apply, along with any applicable section 7 + additional terms, to the whole of the work, and all its parts, + regardless of how they are packaged. This License gives no + permission to license the work in any other way, but it does not + invalidate such permission if you have separately received it. + + d) If the work has interactive user interfaces, each must display + Appropriate Legal Notices; however, if the Program has interactive + interfaces that do not display Appropriate Legal Notices, your + work need not make them do so. + + A compilation of a covered work with other separate and independent +works, which are not by their nature extensions of the covered work, +and which are not combined with it such as to form a larger program, +in or on a volume of a storage or distribution medium, is called an +"aggregate" if the compilation and its resulting copyright are not +used to limit the access or legal rights of the compilation's users +beyond what the individual works permit. Inclusion of a covered work +in an aggregate does not cause this License to apply to the other +parts of the aggregate. + + 6. Conveying Non-Source Forms. + + You may convey a covered work in object code form under the terms +of sections 4 and 5, provided that you also convey the +machine-readable Corresponding Source under the terms of this License, +in one of these ways: + + a) Convey the object code in, or embodied in, a physical product + (including a physical distribution medium), accompanied by the + Corresponding Source fixed on a durable physical medium + customarily used for software interchange. + + b) Convey the object code in, or embodied in, a physical product + (including a physical distribution medium), accompanied by a + written offer, valid for at least three years and valid for as + long as you offer spare parts or customer support for that product + model, to give anyone who possesses the object code either (1) a + copy of the Corresponding Source for all the software in the + product that is covered by this License, on a durable physical + medium customarily used for software interchange, for a price no + more than your reasonable cost of physically performing this + conveying of source, or (2) access to copy the + Corresponding Source from a network server at no charge. + + c) Convey individual copies of the object code with a copy of the + written offer to provide the Corresponding Source. This + alternative is allowed only occasionally and noncommercially, and + only if you received the object code with such an offer, in accord + with subsection 6b. + + d) Convey the object code by offering access from a designated + place (gratis or for a charge), and offer equivalent access to the + Corresponding Source in the same way through the same place at no + further charge. You need not require recipients to copy the + Corresponding Source along with the object code. If the place to + copy the object code is a network server, the Corresponding Source + may be on a different server (operated by you or a third party) + that supports equivalent copying facilities, provided you maintain + clear directions next to the object code saying where to find the + Corresponding Source. Regardless of what server hosts the + Corresponding Source, you remain obligated to ensure that it is + available for as long as needed to satisfy these requirements. + + e) Convey the object code using peer-to-peer transmission, provided + you inform other peers where the object code and Corresponding + Source of the work are being offered to the general public at no + charge under subsection 6d. + + A separable portion of the object code, whose source code is excluded +from the Corresponding Source as a System Library, need not be +included in conveying the object code work. + + A "User Product" is either (1) a "consumer product", which means any +tangible personal property which is normally used for personal, family, +or household purposes, or (2) anything designed or sold for incorporation +into a dwelling. In determining whether a product is a consumer product, +doubtful cases shall be resolved in favor of coverage. For a particular +product received by a particular user, "normally used" refers to a +typical or common use of that class of product, regardless of the status +of the particular user or of the way in which the particular user +actually uses, or expects or is expected to use, the product. A product +is a consumer product regardless of whether the product has substantial +commercial, industrial or non-consumer uses, unless such uses represent +the only significant mode of use of the product. + + "Installation Information" for a User Product means any methods, +procedures, authorization keys, or other information required to install +and execute modified versions of a covered work in that User Product from +a modified version of its Corresponding Source. The information must +suffice to ensure that the continued functioning of the modified object +code is in no case prevented or interfered with solely because +modification has been made. + + If you convey an object code work under this section in, or with, or +specifically for use in, a User Product, and the conveying occurs as +part of a transaction in which the right of possession and use of the +User Product is transferred to the recipient in perpetuity or for a +fixed term (regardless of how the transaction is characterized), the +Corresponding Source conveyed under this section must be accompanied +by the Installation Information. But this requirement does not apply +if neither you nor any third party retains the ability to install +modified object code on the User Product (for example, the work has +been installed in ROM). + + The requirement to provide Installation Information does not include a +requirement to continue to provide support service, warranty, or updates +for a work that has been modified or installed by the recipient, or for +the User Product in which it has been modified or installed. Access to a +network may be denied when the modification itself materially and +adversely affects the operation of the network or violates the rules and +protocols for communication across the network. + + Corresponding Source conveyed, and Installation Information provided, +in accord with this section must be in a format that is publicly +documented (and with an implementation available to the public in +source code form), and must require no special password or key for +unpacking, reading or copying. + + 7. Additional Terms. + + "Additional permissions" are terms that supplement the terms of this +License by making exceptions from one or more of its conditions. +Additional permissions that are applicable to the entire Program shall +be treated as though they were included in this License, to the extent +that they are valid under applicable law. If additional permissions +apply only to part of the Program, that part may be used separately +under those permissions, but the entire Program remains governed by +this License without regard to the additional permissions. + + When you convey a copy of a covered work, you may at your option +remove any additional permissions from that copy, or from any part of +it. (Additional permissions may be written to require their own +removal in certain cases when you modify the work.) You may place +additional permissions on material, added by you to a covered work, +for which you have or can give appropriate copyright permission. + + Notwithstanding any other provision of this License, for material you +add to a covered work, you may (if authorized by the copyright holders of +that material) supplement the terms of this License with terms: + + a) Disclaiming warranty or limiting liability differently from the + terms of sections 15 and 16 of this License; or + + b) Requiring preservation of specified reasonable legal notices or + author attributions in that material or in the Appropriate Legal + Notices displayed by works containing it; or + + c) Prohibiting misrepresentation of the origin of that material, or + requiring that modified versions of such material be marked in + reasonable ways as different from the original version; or + + d) Limiting the use for publicity purposes of names of licensors or + authors of the material; or + + e) Declining to grant rights under trademark law for use of some + trade names, trademarks, or service marks; or + + f) Requiring indemnification of licensors and authors of that + material by anyone who conveys the material (or modified versions of + it) with contractual assumptions of liability to the recipient, for + any liability that these contractual assumptions directly impose on + those licensors and authors. + + All other non-permissive additional terms are considered "further +restrictions" within the meaning of section 10. If the Program as you +received it, or any part of it, contains a notice stating that it is +governed by this License along with a term that is a further +restriction, you may remove that term. If a license document contains +a further restriction but permits relicensing or conveying under this +License, you may add to a covered work material governed by the terms +of that license document, provided that the further restriction does +not survive such relicensing or conveying. + + If you add terms to a covered work in accord with this section, you +must place, in the relevant source files, a statement of the +additional terms that apply to those files, or a notice indicating +where to find the applicable terms. + + Additional terms, permissive or non-permissive, may be stated in the +form of a separately written license, or stated as exceptions; +the above requirements apply either way. + + 8. Termination. + + You may not propagate or modify a covered work except as expressly +provided under this License. Any attempt otherwise to propagate or +modify it is void, and will automatically terminate your rights under +this License (including any patent licenses granted under the third +paragraph of section 11). + + However, if you cease all violation of this License, then your +license from a particular copyright holder is reinstated (a) +provisionally, unless and until the copyright holder explicitly and +finally terminates your license, and (b) permanently, if the copyright +holder fails to notify you of the violation by some reasonable means +prior to 60 days after the cessation. + + Moreover, your license from a particular copyright holder is +reinstated permanently if the copyright holder notifies you of the +violation by some reasonable means, this is the first time you have +received notice of violation of this License (for any work) from that +copyright holder, and you cure the violation prior to 30 days after +your receipt of the notice. + + Termination of your rights under this section does not terminate the +licenses of parties who have received copies or rights from you under +this License. If your rights have been terminated and not permanently +reinstated, you do not qualify to receive new licenses for the same +material under section 10. + + 9. Acceptance Not Required for Having Copies. + + You are not required to accept this License in order to receive or +run a copy of the Program. Ancillary propagation of a covered work +occurring solely as a consequence of using peer-to-peer transmission +to receive a copy likewise does not require acceptance. However, +nothing other than this License grants you permission to propagate or +modify any covered work. These actions infringe copyright if you do +not accept this License. Therefore, by modifying or propagating a +covered work, you indicate your acceptance of this License to do so. + + 10. Automatic Licensing of Downstream Recipients. + + Each time you convey a covered work, the recipient automatically +receives a license from the original licensors, to run, modify and +propagate that work, subject to this License. You are not responsible +for enforcing compliance by third parties with this License. + + An "entity transaction" is a transaction transferring control of an +organization, or substantially all assets of one, or subdividing an +organization, or merging organizations. If propagation of a covered +work results from an entity transaction, each party to that +transaction who receives a copy of the work also receives whatever +licenses to the work the party's predecessor in interest had or could +give under the previous paragraph, plus a right to possession of the +Corresponding Source of the work from the predecessor in interest, if +the predecessor has it or can get it with reasonable efforts. + + You may not impose any further restrictions on the exercise of the +rights granted or affirmed under this License. For example, you may +not impose a license fee, royalty, or other charge for exercise of +rights granted under this License, and you may not initiate litigation +(including a cross-claim or counterclaim in a lawsuit) alleging that +any patent claim is infringed by making, using, selling, offering for +sale, or importing the Program or any portion of it. + + 11. Patents. + + A "contributor" is a copyright holder who authorizes use under this +License of the Program or a work on which the Program is based. The +work thus licensed is called the contributor's "contributor version". + + A contributor's "essential patent claims" are all patent claims +owned or controlled by the contributor, whether already acquired or +hereafter acquired, that would be infringed by some manner, permitted +by this License, of making, using, or selling its contributor version, +but do not include claims that would be infringed only as a +consequence of further modification of the contributor version. For +purposes of this definition, "control" includes the right to grant +patent sublicenses in a manner consistent with the requirements of +this License. + + Each contributor grants you a non-exclusive, worldwide, royalty-free +patent license under the contributor's essential patent claims, to +make, use, sell, offer for sale, import and otherwise run, modify and +propagate the contents of its contributor version. + + In the following three paragraphs, a "patent license" is any express +agreement or commitment, however denominated, not to enforce a patent +(such as an express permission to practice a patent or covenant not to +sue for patent infringement). To "grant" such a patent license to a +party means to make such an agreement or commitment not to enforce a +patent against the party. + + If you convey a covered work, knowingly relying on a patent license, +and the Corresponding Source of the work is not available for anyone +to copy, free of charge and under the terms of this License, through a +publicly available network server or other readily accessible means, +then you must either (1) cause the Corresponding Source to be so +available, or (2) arrange to deprive yourself of the benefit of the +patent license for this particular work, or (3) arrange, in a manner +consistent with the requirements of this License, to extend the patent +license to downstream recipients. "Knowingly relying" means you have +actual knowledge that, but for the patent license, your conveying the +covered work in a country, or your recipient's use of the covered work +in a country, would infringe one or more identifiable patents in that +country that you have reason to believe are valid. + + If, pursuant to or in connection with a single transaction or +arrangement, you convey, or propagate by procuring conveyance of, a +covered work, and grant a patent license to some of the parties +receiving the covered work authorizing them to use, propagate, modify +or convey a specific copy of the covered work, then the patent license +you grant is automatically extended to all recipients of the covered +work and works based on it. + + A patent license is "discriminatory" if it does not include within +the scope of its coverage, prohibits the exercise of, or is +conditioned on the non-exercise of one or more of the rights that are +specifically granted under this License. You may not convey a covered +work if you are a party to an arrangement with a third party that is +in the business of distributing software, under which you make payment +to the third party based on the extent of your activity of conveying +the work, and under which the third party grants, to any of the +parties who would receive the covered work from you, a discriminatory +patent license (a) in connection with copies of the covered work +conveyed by you (or copies made from those copies), or (b) primarily +for and in connection with specific products or compilations that +contain the covered work, unless you entered into that arrangement, +or that patent license was granted, prior to 28 March 2007. + + Nothing in this License shall be construed as excluding or limiting +any implied license or other defenses to infringement that may +otherwise be available to you under applicable patent law. + + 12. No Surrender of Others' Freedom. + + If conditions are imposed on you (whether by court order, agreement or +otherwise) that contradict the conditions of this License, they do not +excuse you from the conditions of this License. If you cannot convey a +covered work so as to satisfy simultaneously your obligations under this +License and any other pertinent obligations, then as a consequence you may +not convey it at all. For example, if you agree to terms that obligate you +to collect a royalty for further conveying from those to whom you convey +the Program, the only way you could satisfy both those terms and this +License would be to refrain entirely from conveying the Program. + + 13. Use with the GNU Affero General Public License. + + Notwithstanding any other provision of this License, you have +permission to link or combine any covered work with a work licensed +under version 3 of the GNU Affero General Public License into a single +combined work, and to convey the resulting work. The terms of this +License will continue to apply to the part which is the covered work, +but the special requirements of the GNU Affero General Public License, +section 13, concerning interaction through a network will apply to the +combination as such. + + 14. Revised Versions of this License. + + The Free Software Foundation may publish revised and/or new versions of +the GNU General Public License from time to time. Such new versions will +be similar in spirit to the present version, but may differ in detail to +address new problems or concerns. + + Each version is given a distinguishing version number. If the +Program specifies that a certain numbered version of the GNU General +Public License "or any later version" applies to it, you have the +option of following the terms and conditions either of that numbered +version or of any later version published by the Free Software +Foundation. If the Program does not specify a version number of the +GNU General Public License, you may choose any version ever published +by the Free Software Foundation. + + If the Program specifies that a proxy can decide which future +versions of the GNU General Public License can be used, that proxy's +public statement of acceptance of a version permanently authorizes you +to choose that version for the Program. + + Later license versions may give you additional or different +permissions. However, no additional obligations are imposed on any +author or copyright holder as a result of your choosing to follow a +later version. + + 15. Disclaimer of Warranty. + + THERE IS NO WARRANTY FOR THE PROGRAM, TO THE EXTENT PERMITTED BY +APPLICABLE LAW. EXCEPT WHEN OTHERWISE STATED IN WRITING THE COPYRIGHT +HOLDERS AND/OR OTHER PARTIES PROVIDE THE PROGRAM "AS IS" WITHOUT WARRANTY +OF ANY KIND, EITHER EXPRESSED OR IMPLIED, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, +THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR +PURPOSE. THE ENTIRE RISK AS TO THE QUALITY AND PERFORMANCE OF THE PROGRAM +IS WITH YOU. SHOULD THE PROGRAM PROVE DEFECTIVE, YOU ASSUME THE COST OF +ALL NECESSARY SERVICING, REPAIR OR CORRECTION. + + 16. Limitation of Liability. + + IN NO EVENT UNLESS REQUIRED BY APPLICABLE LAW OR AGREED TO IN WRITING +WILL ANY COPYRIGHT HOLDER, OR ANY OTHER PARTY WHO MODIFIES AND/OR CONVEYS +THE PROGRAM AS PERMITTED ABOVE, BE LIABLE TO YOU FOR DAMAGES, INCLUDING ANY +GENERAL, SPECIAL, INCIDENTAL OR CONSEQUENTIAL DAMAGES ARISING OUT OF THE +USE OR INABILITY TO USE THE PROGRAM (INCLUDING BUT NOT LIMITED TO LOSS OF +DATA OR DATA BEING RENDERED INACCURATE OR LOSSES SUSTAINED BY YOU OR THIRD +PARTIES OR A FAILURE OF THE PROGRAM TO OPERATE WITH ANY OTHER PROGRAMS), +EVEN IF SUCH HOLDER OR OTHER PARTY HAS BEEN ADVISED OF THE POSSIBILITY OF +SUCH DAMAGES. + + 17. Interpretation of Sections 15 and 16. + + If the disclaimer of warranty and limitation of liability provided +above cannot be given local legal effect according to their terms, +reviewing courts shall apply local law that most closely approximates +an absolute waiver of all civil liability in connection with the +Program, unless a warranty or assumption of liability accompanies a +copy of the Program in return for a fee. + + END OF TERMS AND CONDITIONS + + How to Apply These Terms to Your New Programs + + If you develop a new program, and you want it to be of the greatest +possible use to the public, the best way to achieve this is to make it +free software which everyone can redistribute and change under these terms. + + To do so, attach the following notices to the program. It is safest +to attach them to the start of each source file to most effectively +state the exclusion of warranty; and each file should have at least +the "copyright" line and a pointer to where the full notice is found. + + + Copyright (C) + + This program is free software: you can redistribute it and/or modify + it under the terms of the GNU General Public License as published by + the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or + (at your option) any later version. + + This program is distributed in the hope that it will be useful, + but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of + MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the + GNU General Public License for more details. + + You should have received a copy of the GNU General Public License + along with this program. If not, see . + +Also add information on how to contact you by electronic and paper mail. + + If the program does terminal interaction, make it output a short +notice like this when it starts in an interactive mode: + + Copyright (C) + This program comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY; for details type `show w'. + This is free software, and you are welcome to redistribute it + under certain conditions; type `show c' for details. + +The hypothetical commands `show w' and `show c' should show the appropriate +parts of the General Public License. Of course, your program's commands +might be different; for a GUI interface, you would use an "about box". + + You should also get your employer (if you work as a programmer) or school, +if any, to sign a "copyright disclaimer" for the program, if necessary. +For more information on this, and how to apply and follow the GNU GPL, see +. + + The GNU General Public License does not permit incorporating your program +into proprietary programs. If your program is a subroutine library, you +may consider it more useful to permit linking proprietary applications with +the library. If this is what you want to do, use the GNU Lesser General +Public License instead of this License. But first, please read +. diff --git a/data/environment.yml b/data/environment.yml new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..323019f352b7c86751c4ef853382d8de72426841 --- /dev/null +++ b/data/environment.yml @@ -0,0 +1,12 @@ +name: AlphaFold-IDP +dependencies: + - python=3.8 + - numpy + - pandas + - scipy + - matplotlib + - notebook + - conda-forge::mdtraj + - plumed + - gromacs + diff --git a/data/prep_run/.ipynb_checkpoints/prepare_run-checkpoint.ipynb b/data/prep_run/.ipynb_checkpoints/prepare_run-checkpoint.ipynb new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0001a9f2435c8190f34fea1c8af49bad05ac85d6 --- /dev/null +++ b/data/prep_run/.ipynb_checkpoints/prepare_run-checkpoint.ipynb @@ -0,0 +1,85688 @@ +{ + "cells": [ + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 170, + "id": "f16ba8ea", + "metadata": { + "scrolled": true + }, + "outputs": [ + { + "name": "stdout", + "output_type": "stream", + "text": [ + "/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/gen_xml_and_constraints.py sequence.dat\n", + "MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQCMRGVRLVEGILHAPDAGAGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAVQKTSDLIVLGLPAKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRACDCKLPNSKQSQDEPLRSRKVFVGRCTEDMTEDELREFFSQYGDVMDVFIPKPFRAFAFVTFADDQIAQSLCGEDLIIKGISVHISNAEPKHNSNRQLERSGRFGGNPGGFGNQGGFGNSRGGGAGLGNNQGSNMGGGMNFGAFSINPAMMAAAQAALQSSAGMMGMLASQQNQSGPSGNNQNQGNMQREPNQAFGSGNNSYSGSNSGAAIGAGSASNAGSGSGFNGGFGSSMDSKSSGAGM\n" + ] + }, + { + "data": { + "text/plain": [ + "0" + ] + }, + "execution_count": 170, + "metadata": {}, + "output_type": "execute_result" + } + ], + "source": [ + "import shutil\n", + "import os\n", + "import csv\n", + "dir=os.getcwd()\n", + "\n", + "#TDP-43 sequence\n", + 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"shutil.copy2(dir+\"/../AF_DATA/tdp43_WtoA_bf4cc_distmat/alphafold2_ptm_model_3_seed_000_prob_distributions.npy\", dir)\n", + "\n", + "#Copy OPENMM calvados forcefield files\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../scripts_prep/gen_xml_and_constraints.py\", dir)\n", + "shutil.copy2(dir+\"/../scripts_prep/residues.csv\", dir)\n", + "\n", + "path_gen_xml = dir+'/gen_xml_and_constraints.py sequence.dat'\n", + "print(path_gen_xml)\n", + "os.system(f'python {path_gen_xml}')\n" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 171, + "id": "f6caee7a", + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [ + "#Decide the plddt based ordered (od) and disordered (dd) regions \n", + "ordered_domains = {'od1': [3, 79], 'od2': [104,178],'od3':[191,260]}\n", + "disordered_domains={'dd1': [1,2],'dd2':[80,103],'dd3':[179,190],'dd4':[261,414]}\n", + "\n", + "\n", + "#Write the csv files\n", + "with open('ordered_domains.csv', 'w') as f: # You will need 'wb' mode in Python 2.x\n", + " w = csv.DictWriter(f, 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True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, False, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, False, False, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, True, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False, False]\n", + "key dis {'od1': [[3, 79]], 'od2': [[104, 178]], 'od3': [[191, 260]]}\n", + "key dis {'dd1': [[1, 2]], 'dd2': [[80, 103]], 'dd3': [[179, 190]], 'dd4': [[261, 414]]}\n", + "[[3, 79]]\n", + "[ 3 4 5 6 7 8 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209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226\n", + " 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244\n", + " 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260]\n" + ] + }, + { + "data": { + "text/plain": [ + "0" + ] + }, + "execution_count": 3, + "metadata": {}, + "output_type": "execute_result" + } + ], + "source": [ + "#Copy and run the prep script that makes the plumed file. \n", + "#The Collective variables (CVs) in these case are chosen to be the torsion angles between structured domains. \n", + "shutil.copy2(dir+\"/../scripts_prep/make_plumed_distmat.py\", dir)\n", + "path_gen_distmap = dir+'/make_plumed_distmat.py sequence.dat '+str(PAE_cut)+' '+str(Pr_cut)\n", + "print(path_gen_distmap)\n", + "os.system(f'python {path_gen_distmap}')\n", + " " + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": 4, + "id": "a5a24354", + "metadata": {}, + "outputs": [ + { + "name": "stdout", + "output_type": "stream", + "text": 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\"mdtraj/formats/dcd/dcd.pyx\", line 131, in mdtraj.formats.dcd.load_dcd\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 174, in _parse_topology\n", + " _traj = load_frame(top, 0, **kwargs)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 310, in load_frame\n", + " _assert_files_exist(filename)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 100, in _assert_files_exist\n", + " raise IOError('No such file: %s' % fn)\n", + "OSError: No such file: input_af.pdb\n", + "ls: output_0.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_1.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_2.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_3.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_4.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_5.xtc: No such file or directory\n", + "./script.sh: line 23: gmx_mpi: command not found\n", + "\n", + "DRIVER: Found molfile format trajectory xtc with name cat_trjcat.xtc\n", + "gromacsplugin) Cannot open file 'cat_trjcat.xtc', cannot open file\n", + "PLUMED: Cycles Total Average Minimum Maximum\n", + "PLUMED: 1 0.000036 0.000036 0.000036 0.000036\n", + "libc++abi.dylib: terminating with uncaught exception of type PLMD::Plumed::std_bad_alloc: std::bad_alloc\n", + "./script.sh: line 32: 31442 Abort trap: 6 plumed driver --plumed plumed_analysis.dat --mf_xtc cat_trjcat.xtc\n", + "\n", + "DRIVER: Found molfile format trajectory xtc with name cat_trjcat.xtc\n", + "gromacsplugin) Cannot open file 'cat_trjcat.xtc', cannot open file\n", + "./script.sh: line 33: 31443 Segmentation fault: 11 plumed --no-mpi driver --plumed reconstruct.dat --mf_xtc cat_trjcat.xtc --timestep 1\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File \"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/resample.py\", line 31, in \n", + " time=np.loadtxt(\"FULLBIAS\")[:, 0]\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/npyio.py\", line 1067, in loadtxt\n", + " fh = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 193, in open\n", + " return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 533, in open\n", + " raise IOError(\"%s not found.\" % path)\n", + "OSError: FULLBIAS not found.\n", + "1\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File \"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/fes2.py\", line 18, in \n", + " time=np.loadtxt(\"FULLBIAS\")[:, 0]\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/npyio.py\", line 1067, in loadtxt\n", + " fh = 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"OSError: FULLBIAS not found.\n", + "5\n", + "5\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File \"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/fes2.py\", line 18, in \n", + " time=np.loadtxt(\"FULLBIAS\")[:, 0]\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/npyio.py\", line 1067, in loadtxt\n", + " fh = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 193, in open\n", + " return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 533, in open\n", + " raise IOError(\"%s not found.\" % path)\n", + "OSError: FULLBIAS not found.\n", + "6\n", + "6\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File 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\n", + " time=np.loadtxt(\"FULLBIAS\")[:, 0]\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/npyio.py\", line 1067, in loadtxt\n", + " fh = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 193, in open\n", + " return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 533, in open\n", + " raise IOError(\"%s not found.\" % path)\n", + "OSError: FULLBIAS not found.\n" + ] + }, + { + "name": "stdout", + "output_type": "stream", + "text": [ + "8\n", + "8\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File \"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/fes2.py\", line 18, in \n", + " time=np.loadtxt(\"FULLBIAS\")[:, 0]\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/npyio.py\", line 1067, in loadtxt\n", + " fh = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 193, in open\n", + " return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 533, in open\n", + " raise IOError(\"%s not found.\" % path)\n", + "OSError: FULLBIAS not found.\n", + "9\n", + "9\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File \"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/fes2.py\", line 18, in \n", + " time=np.loadtxt(\"FULLBIAS\")[:, 0]\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/npyio.py\", line 1067, in loadtxt\n", + " fh = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 193, in open\n", + " return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 533, in open\n", + " raise IOError(\"%s not found.\" % path)\n", + "OSError: FULLBIAS not found.\n", + "10\n", + "10\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File \"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/fes2.py\", line 18, in \n", + " time=np.loadtxt(\"FULLBIAS\")[:, 0]\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/npyio.py\", line 1067, in loadtxt\n", + " fh = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 193, in open\n", + " return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 533, in open\n", + " raise IOError(\"%s not found.\" % path)\n", + "OSError: FULLBIAS not found.\n", + "11\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File \"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/backmap.py\", line 48, in \n", + " topology = md.load(pdb).topology\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 396, in load\n", + " kwargs[\"top\"] = _parse_topology(kwargs.get(\"top\", filename_or_filenames[0]), **topkwargs)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 174, in _parse_topology\n", + " _traj = load_frame(top, 0, **kwargs)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 310, in load_frame\n", + " _assert_files_exist(filename)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 100, in _assert_files_exist\n", + " raise IOError('No such file: %s' % fn)\n", + "OSError: No such file: input_af.pdb\n", + "python: can't open file '/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/pulchra.py': [Errno 2] No such file or directory\n", + "sh: keepH.sh: No such file or directory\n" + ] + } + ], + "source": [ + "!./script.sh" + ] + }, + { + "cell_type": "code", + "execution_count": null, + "id": "a5bbcd53", + "metadata": {}, + "outputs": [], + "source": [] + } + ], + "metadata": { + "kernelspec": { + "display_name": "Python 3 (ipykernel)", + "language": "python", + "name": "python3" + }, + "language_info": { + "codemirror_mode": { + "name": "ipython", + "version": 3 + }, + "file_extension": ".py", + "mimetype": "text/x-python", + "name": "python", + "nbconvert_exporter": "python", + "pygments_lexer": "ipython3", + "version": "3.9.18" + } + }, + "nbformat": 4, + "nbformat_minor": 5 +} diff --git a/data/requirements.txt b/data/requirements.txt new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..12215394c5a2cd8479cdd1bc228debb9d69938ef --- /dev/null +++ b/data/requirements.txt @@ -0,0 +1,8 @@ +numpy +pandas +scipy +sklearn +mdtraj +matplolib +plumed +gromacs diff --git a/data/scripts_prep/backmap.py b/data/scripts_prep/backmap.py new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..311f5ce57f2bf64026b94b19a047cd3adbd0dd69 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/backmap.py @@ -0,0 +1,103 @@ +#!/usr/bin/env python +# coding: utf-8 + + + +#Make the plumed file +import mdtraj as md +import os +import sys +name='input_af' +pdb=name+'.pdb' +########### Conactenate ######## +n_rep=int(sys.argv[1]) +trajs = list() +skip=2 +eq=10 + + +############# +xtc='r0/conf-protein.xtc' +topology = md.load(pdb).topology +traj = md.load(xtc, top=pdb) + +table, bonds = topology.to_dataframe() +print('CALVADOS topology',table.head()) + +######### +fasta_file = open('sequence.dat',mode='r') +fasta = fasta_file.read().replace("\n","") +fasta_file.close() +print(fasta[0]) + +aminoacids=['ALA','ARG','ASN','ASP','CYS','GLU','GLN','GLY','HIS','ILE','LEU','LYS','MET','PHE','PRO','SER','THR','TRP','TYR','VAL'] +aminos_sin=['A','R','N','D','C','E','Q','G','H','I','L','K','M','F','P','S','T','W','Y','V'] + +print(aminoacids[aminos_sin.index(fasta[0])]) +print(aminoacids[aminos_sin.index(fasta[-1])]) +table.loc[table.index[-1],'resName']=aminoacids[aminos_sin.index(fasta[-1])] +table.loc[table.index[0],'resName']=aminoacids[aminos_sin.index(fasta[0])] + +table.loc[table.index[-1],'name']=aminoacids[aminos_sin.index(fasta[-1])] +table.loc[table.index[0],'name']=aminoacids[aminos_sin.index(fasta[0])] +table['serial'] = table['resSeq'] +######## + +for AA in aminoacids: + table['name'] = table['name'].replace([AA], 'CA') + + +print('new topology with CA, cg naming', table.head()) + + +topologyCA = md.Topology.from_dataframe(table, bonds) + + +print(topologyCA) + + +traj = md.load_pdb(pdb,top=topologyCA) +traj.save(name+'cg.pdb') + + + + +#Trajectory +for j in range(5,5+1): + name='input_af' + pdb=name+'.pdb' + dcd='r0/conf-protein.xtc' + traj_name=name+'_'+str(j)+'dcd.pdb' + topology = md.load(pdb).topology + traj = md.load(dcd, top=pdb) + traj.save(traj_name) + pdb=traj_name + table, bonds = topology.to_dataframe() + print('CALVADOS topology',table.head()) + ######### + fasta_file = open('sequence.dat',mode='r') + fasta = fasta_file.read().replace("\n","") + fasta_file.close() + print(fasta[0]) + + aminoacids=['ALA','ARG','ASN','ASP','CYS','GLU','GLN','GLY','HIS','ILE','LEU','LYS','MET','PHE','PRO','SER','THR','TRP','TYR','VAL'] + aminos_sin=['A','R','N','D','C','E','Q','G','H','I','L','K','M','F','P','S','T','W','Y','V'] + + print(aminoacids[aminos_sin.index(fasta[0])]) + print(aminoacids[aminos_sin.index(fasta[-1])]) + table.loc[table.index[-1],'resName']=aminoacids[aminos_sin.index(fasta[-1])] + table.loc[table.index[0],'resName']=aminoacids[aminos_sin.index(fasta[0])] + + table.loc[table.index[-1],'name']=aminoacids[aminos_sin.index(fasta[-1])] + table.loc[table.index[0],'name']=aminoacids[aminos_sin.index(fasta[0])] + table['serial'] = table['resSeq'] + ######## + for AA in aminoacids: + table['name'] = table['name'].replace([AA], 'CA') + print('new topology with CA, cg naming', table.head()) + topologyCA = md.Topology.from_dataframe(table, bonds) + traj = md.load_pdb(pdb,top=topologyCA) + traj.save(name+'_'+str(j)+'dcdcg.pdb') + print('laste'+str(j)) + for i in range(0,len(traj)): + traj[i].save('segment_'+str(j)+'_'+name+'_'+str(i)+'.pdb') diff --git a/data/scripts_prep/dcd2xtc.py b/data/scripts_prep/dcd2xtc.py new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d0308f81299d425feec2daa260f0f794fb292659 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/dcd2xtc.py @@ -0,0 +1,23 @@ +#Make the plumed file +import mdtraj as md +import os +import sys +name='input_af' +pdb=name+'.pdb' +########### Conactenate ######## +n_rep=int(sys.argv[1]) +trajs = list() +skip=1 +eq=1 +os.system('rm input_af_*rebuilt.xtc input_af_bm_em.pdb input_af_bm_em_*.pdb *rebuilt.pdb segment*pdb *dcd') +for i in range(0,n_rep): + try: + print(f'loading {i}') + traj = md.load_dcd(f'../output_{i}.dcd', top='input_af.pdb') + + traj.save('output_'+str(i)+'.xtc') + except KeyboardInterrupt: + raise + except Exception as e: + raise + diff --git a/data/scripts_prep/fes2.py b/data/scripts_prep/fes2.py new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..63aa1852885561031705e021905d2aa79ff6254a --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/fes2.py @@ -0,0 +1,54 @@ +import numpy as np +import matplotlib.pyplot as plt +import itertools +import os +import pandas as pd +import argparse, sys +parser = argparse.ArgumentParser() +parser.add_argument("--CV_col", help="CV column in the COLVAR file (starting at 0)",required=True,type=str) +parser.add_argument("--CV_name", help="CVname",required=True,type=str) + +args = parser.parse_args() + +CVcol =args.CV_col +CVname =args.CV_name +print(int(CVcol)) +eq_steps=1 + +time=np.loadtxt("FULLBIAS")[:, 0] +bias=np.loadtxt("FULLBIAS")[:, 1] +CV=np.loadtxt("COLVAR")[:, int(CVcol)] +KBT = 2.49 +weights = np.exp(bias/ KBT) +weights /= weights.sum() + +#value, bins=np.histogram(CVname[eq_steps:-1], bins=30, weights=weights[eq_steps:-1], density=True) +value1, bins1=np.histogram(CV[eq_steps:int(len(CV)/5)], bins=30, weights=weights[eq_steps:int(len(CV)/5)], density=True) +value2, bins2=np.histogram(CV[eq_steps:int(2*len(CV)/5)], bins=30, weights=weights[eq_steps:int(2*len(CV)/5)], density=True) +value3, bins3=np.histogram(CV[eq_steps:int(3*len(CV)/5)], bins=30, weights=weights[eq_steps:int(3*len(CV)/5)], density=True) +value4, bins4=np.histogram(CV[eq_steps:int(4*len(CV)/5)], bins=30, weights=weights[eq_steps:int(4*len(CV)/5)], density=True) +value5, bins5=np.histogram(CV[eq_steps:int(5*len(CV)/5)], bins=30, weights=weights[eq_steps:int(5*len(CV)/5)], density=True) + +logvalue1=-np.log(value1) +logvalue1=logvalue1-min(logvalue1) +logvalue2=-np.log(value2) +logvalue2=logvalue2-min(logvalue2) +logvalue3=-np.log(value3) +logvalue3=logvalue3-min(logvalue3) +logvalue4=-np.log(value4) +logvalue4=logvalue4-min(logvalue4) + +logvalue5=-np.log(value5) +logvalue5=logvalue5-min(logvalue5) +plt.tick_params(labelsize=24) +plt.plot(bins1[:-1],logvalue1,linewidth=3,color='red') +plt.plot(bins2[:-1],logvalue2,linewidth=3,color='green') +plt.plot(bins3[:-1],logvalue3,linewidth=3,color='blue') +plt.plot(bins4[:-1],logvalue4,linewidth=3,color='pink') +plt.plot(bins5[:-1],logvalue5,linewidth=3,color='yellow') +plt.legend( ['t1', 't2','t3','t4','t5'],loc='lower right',ncol=2,prop={'size': 11}) +figure = plt.gcf() +figure.set_size_inches(6, 7) +plt.xlabel(str(CVname),fontsize=24 ) +plt.ylabel('F (kJ/mol)',fontsize=24 ) +plt.savefig('FES'+str(CVname)+'.png',dpi=400,transparent=True, bbox_inches='tight') diff --git a/data/scripts_prep/gen_xml_and_constraints.py b/data/scripts_prep/gen_xml_and_constraints.py new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..02ed109bc6a4f1b76dd38d48a2b02c50da617e25 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/gen_xml_and_constraints.py @@ -0,0 +1,124 @@ +#python gen_xml_and_constraints.py sequence.dat 7.4 298 0.2 +import pandas as pd +import numpy as np +import pickle +import mdtraj as md +import sys + +def adjust_terminals_HIS(r,pH,fasta): + r.loc['H','q'] = 1. / ( 1 + 10**(pH-6) ) + r.loc['X'] = r.loc[fasta[0]] + r.loc['X','q'] = r.loc[fasta[0],'q'] + 1. + r.loc['X','MW'] = r.loc[fasta[0],'MW'] + 2. + r.loc['X','three'] = 'X' + + r.loc['Z'] = r.loc[fasta[-1]] + r.loc['Z','q'] = r.loc[fasta[-1],'q'] - 1. + r.loc['Z','MW'] = r.loc[fasta[-1],'MW'] + 16. + r.loc['Z','three'] = 'Z' + + return r.set_index('three') + +def calculate_yukawa_params(temp,ionic): + RT = 8.3145*temp*1e-3 + fepsw = lambda T : 5321/T+233.76-0.9297*T+0.1417*1e-2*T*T-0.8292*1e-6*T**3 + epsw = fepsw(temp) + lB = 1.6021766**2/(4*np.pi*8.854188*epsw)*6.022*1000/RT + yukawa_kappa = np.sqrt(8*np.pi*lB*ionic*6.022/10) + return yukawa_kappa, RT, lB + +def generate_atomtypes_block(res): + tag = 'AtomTypes' + atomtypes = "" + for i,r in res.iterrows(): + atomtype = '\n'.format(i,i,str(r.MW)) + atomtypes += " " + atomtype + out = " <{0}>\n{1} \n\n".format(tag,atomtypes) + return out + +def generate_residues_block(res): + tag = 'Residues' + residues = "" + for i,r in res.iterrows(): + atom = ' '.format(i,r.q) + bond = ' '.format(i) + if i not in ['X','Z']: + bond += '\n '.format(i) + residue = '\n{}\n{}\n \n'.format(i,atom,bond) + residues += " " + residue + out = " <{0}>\n{1} \n\n".format(tag,residues) + return out + +def generate_harmonicBond_block(length,k): + tag = "HarmonicBondForce" + bond = ' '.format(length,k) + out = " <{0}>\n{1}\n \n\n".format(tag,bond) + return out + +def generate_yukawa_block(res,temp,ionic,r_cut): + kappa, RT, lB = calculate_yukawa_params(temp,ionic) + energy_eq = "RT*lB*epsilon1*epsilon2*(exp(-r*kappa)/r-exp(-r_cut*kappa)/r_cut)" + tag = "CustomNonbondedForce" + outer = ' <{} energy="{}" bondCutoff="0">\n'.format(tag,energy_eq) + inner = ' \n'.format(RT) + inner += ' \n'.format(lB) + inner += ' \n'.format(kappa) + inner += ' \n'.format(r_cut) + inner += ' \n' + for i,r in res.iterrows(): + inner += ' \n'.format(i,r.q) + out = outer+inner+" \n\n".format(tag) + return out + +def generate_ashbaugh_block(res,rcut): + lj_eps = 4.184*.2 + threshold= 2**(1/6) + energy_eq = "c1*vlj+c2-shift;vlj=4*epsilon*((sigma/r)^12-(sigma/r)^6);c1=select(delta(d),lambda,s1);c2=select(delta(d),0,s2);s1=select(step(d),lambda,1);s2=select(step(d),0,(1-lambda)*epsilon);d=r-threshold*sigma;shift=lambda*vlj_shift;vlj_shift=4*epsilon*((sigma/rcut)^12-(sigma/rcut)^6);lambda=0.5*(lambda1+lambda2);sigma=0.5*(sigma1+sigma2)" + tag = "CustomNonbondedForce" + outer = ' <{} energy="{}" bondCutoff="0">\n'.format(tag,energy_eq) + inner = ' \n'.format(lj_eps) + inner += ' \n'.format(threshold) + inner += ' \n'.format(rcut) + inner += ' \n' + inner += ' \n' + for i,r in res.iterrows(): + inner += ' \n'.format(i,r.sigmas,r.lambdas) + out = outer+inner+" \n\n".format(tag) + return out + +def generate_forcefield_xml(fasta, residues, xml_name, pH, temp, ionic): + residues = adjust_terminals_HIS(residues,pH,fasta) + atomTypes_block = generate_atomtypes_block(residues) + residues_block = generate_residues_block(residues) + harmonic_bond_block = generate_harmonicBond_block(0.38,8033.0) + yukawa_block = generate_yukawa_block(residues,temp,ionic,4) + ashbaugh_block = generate_ashbaugh_block(residues,2) + xml_output="\n\n{}{}{}{}{}".format(atomTypes_block,residues_block,harmonic_bond_block,yukawa_block,ashbaugh_block) + with open(xml_name, "w") as f: + f.write(xml_output) + +def create_exclusions_file(n_res): + excl = [] + for i in range(n_res-1): + excl.append([i,i+1]) + with open('r1_excl.pkl', 'wb') as fp: + pickle.dump(excl, fp) + +if len(sys.argv) == 5: + pH = float(sys.argv[2]) + #print(pH) + temp = float(sys.argv[3]) + ionic = float(sys.argv[4]) +else: + pH = 7.4 + temp = 298 + ionic = 0.2 + +fasta_file = open(sys.argv[1],mode='r') +fasta = fasta_file.read().replace("\n","") +fasta_file.close() + +residues = pd.read_csv('residues.csv').set_index('one',drop=False) + +generate_forcefield_xml(fasta, residues, "forcefield.xml", pH, temp, ionic) +create_exclusions_file(len(fasta)) diff --git a/data/scripts_prep/keepH.sh b/data/scripts_prep/keepH.sh new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d15f7cd32b793692a9acf0c04624a2a578138204 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/keepH.sh @@ -0,0 +1,20 @@ +for k in $(echo 5);do + rm seg_list.dat + rm list + for f in $(ls segment_"$k"_input_af_*sys.pdb);do + grep ATOM $f |tail -n 1|awk '{print $2}' >>list + done + atom=$(sort -n -k 1 list|uniq -c |sort -r -n -k 1 |awk '{print $2}' |head -n 1) + for i in $(ls segment_"$k"_input_af_*sys.pdb);do + atoms=$(grep ATOM $i |tail -n 1|awk '{print $2}') + echo $atoms + if [ $atoms -eq $atom ]; then + echo "$i " >> seg_list.dat + fi + done + + xtcs=$(cat seg_list.dat |sed 's/_sys.pdb/.rebuilt.xtc/'g|xargs -n 100000000 ) + echo $xtcs + gmx trjcat -f $xtcs -cat -o segment_"$k"_input_af_rebuilt.xtc + +done diff --git a/data/scripts_prep/make_plumed_analysis.py b/data/scripts_prep/make_plumed_analysis.py new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9efaa73cb24b71cf34d87d7eafdafdd53136a756 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/make_plumed_analysis.py @@ -0,0 +1,107 @@ +#!/usr/bin/env python +# coding: utf-8 + +# In[1]: + + +import Bio.PDB +import sys +import glob +import numpy as np +import pandas as pd +import ast + + +df = pd.read_csv('ordered_domains.csv') +kkeys=[] +lis=[] +# Convert the string column back to a list column +for i in df.keys(): + hi = df[i].apply(ast.literal_eval) + kkeys.append(i) + lis.append(hi[0]) + +print(lis) +my_df = pd.DataFrame(columns = kkeys) +my_df.loc[len(my_df)] = lis +print(my_df) +ordered_domains=my_df.to_dict('list') + + +df = pd.read_csv('disordered_domains.csv') +kkeys=[] +lis=[] +# Convert the string column back to a list column +for i in df.keys(): + hi = df[i].apply(ast.literal_eval) + kkeys.append(i) + lis.append(hi[0]) + +print(lis) +my_df = pd.DataFrame(columns = kkeys) +my_df.loc[len(my_df)] = lis +print(my_df) +disordered_domains=my_df.to_dict('list') + + +fasta_file = open(sys.argv[1],mode='r') +sequence = fasta_file.read().replace("\n","") +fasta_file.close() + +print('key dis',ordered_domains) +print('key dis',disordered_domains) + + + + +f=open("plumed_analysis.dat","w") +r=open("reconstruct.dat","w") +f.write("RESTART\n") +f.write("MOLINFO MOLTYPE=protein STRUCTURE=input_af.pdb\n") +r.write("MOLINFO MOLTYPE=protein STRUCTURE=input_af.pdb\n") +f.write("WHOLEMOLECULES ENTITY0=1-"+str(len(sequence))+"\n\n") +r.write("WHOLEMOLECULES ENTITY0=1-"+str(len(sequence))+"\n\n") +r.write("DUMPATOMS STRIDE=1 FILE=conf_0_recon.gro ATOMS=1-"+str(len(sequence))+"\n") + +r.close() + +cvnames=[] +#CV definition +f.write("Rg: GYRATION TYPE=RADIUS ATOMS=1-"+str(len(sequence))+"\n") +cvnames.append("Rg") +indexx=1 +for i in ordered_domains.keys(): + f.write("RMSD"+str(indexx)+": RMSD REFERENCE=struct"+str(indexx)+".pdb TYPE=OPTIMAL\n") + cvnames.append("RMSD"+str(indexx)) + indexx+=1 +indexx=1 + + +indexx=1 + +f.write("# PBMetaD\n") +f.write("PBMETAD ...\n") +f.write(" LABEL=pb\n") +f.write(" ARG=__FILL__\n") +f.write(" SIGMA=__FILL__\n") +f.write(" SIGMA_MIN=__FILL__\n") +f.write(" SIGMA_MAX=__FILL__\n") +f.write(" ADAPTIVE=DIFF\n") +f.write(" HEIGHT=__FILL__\n") +f.write(" PACE=20000000\n") +f.write(" BIASFACTOR=__FILL__\n") +f.write(" GRID_MIN=__FILL__\n") +f.write(" GRID_MAX=__FILL__\n") +f.write(" GRID_WSTRIDE=__FILL__\n") +f.write(" WALKERS_MPI\n") +f.write(" TEMP=__FILL__\n") +f.write("... PBMETAD\n") + + +cv=','.join(cvnames) +f.write("PRINT ARG=pb.bias FILE=FULLBIAS STRIDE=1\n") +f.write("PRINT FILE=COLVAR ARG=__FILL__ STRIDE=1\n") +f.write("ENDPLUMED\n") + +f.close() + diff --git a/data/scripts_prep/make_plumed_distmat.py b/data/scripts_prep/make_plumed_distmat.py new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..71b4610210dc333fa98402293d739f656f5c5bbe --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/make_plumed_distmat.py @@ -0,0 +1,336 @@ +#!/usr/bin/env python +# coding: utf-8 + +# In[1]: + + +import Bio.PDB +import sys +import glob +import numpy as np +import pandas as pd +import ast +skip_ev=3 +fasta_file = open(sys.argv[1],mode='r') +PAE_cut=float(sys.argv[2]) +Pr_cut=float(sys.argv[3]) +print(PAE_cut,Pr_cut) +sequence = fasta_file.read().replace("\n","") +fasta_file.close() + +df = pd.read_csv('ordered_domains.csv') +kkeys=[] +lis=[] +# Convert the string column back to a list column +for i in df.keys(): + hi = df[i].apply(ast.literal_eval) + kkeys.append(i) + lis.append(hi[0]) + +print(lis) +my_df = pd.DataFrame(columns = kkeys) +my_df.loc[len(my_df)] = lis +print(my_df) +ordered_domains=my_df.to_dict('list') + + +df = pd.read_csv('disordered_domains.csv') +kkeys=[] +lis=[] +# Convert the string column back to a list column +for i in df.keys(): + hi = df[i].apply(ast.literal_eval) + kkeys.append(i) + lis.append(hi[0]) + +print(lis) +my_df = pd.DataFrame(columns = kkeys) +my_df.loc[len(my_df)] = lis +print(my_df) +disordered_domains=my_df.to_dict('list') + + +#"MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQCMRGVRLVEGILHAPDAGAGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAVQKTSDLIVLGLPAKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFVRFTEYETQVKVMSQRHMIDGRACDCKLPNSKQSQDEPLRSRKVFVGRCTEDMTEDELREFFSQYGDVMDVFIPKPFRAFAFVTFADDQIAQSLCGEDLIIKGISVHISNAEPKHNSNRQLERSGRFGGNPGGFGNQGGFGNSRGGGAGLGNNQGSNMGGGMNFGAFSINPAMMAAAQAALQSSAGMMGMLASQQNQSGPSGNNQNQGNMQREPNQAFGSGNNSYSGSNSGAAIGAGSASNAGSGSGFNGGFGSSMDSKSSGAGM" +file=open('resid_sel_all.dat', 'w') +#for i in range(1,len(sequence)+1,skip_ev): +for i in range(1,len(sequence)+1): + # for j in range(i+skip_ev,len(sequence),skip_ev): + for j in range(i+skip_ev,len(sequence)): + print(i,j) + file.write(str(i)+" "+str(j)+"\n") +file.close() + + +# ### Read the AF csv contact map distances + +# In[2]: + + +# relative path to search all text files +files = glob.glob("mean_af.csv") + +#The contact map is in distance (Angstong) +print(files[0]) +AF_contacts_file=files[0] +AF_resid_sel_file="resid_sel_all.dat" + +AF_contacts=pd.read_csv(AF_contacts_file) +AF_contacts + +exp=[] +labels=[] +lista=[] +residue_pairs=np.loadtxt(AF_resid_sel_file,usecols=(0,1)) + +####### Select residues that have a prob at p_d_i<0.03 at the last value + +import json +import numpy as np +import matplotlib.pyplot as plt + +js = glob.glob("*json") + + +f=open(js[0]) +data=json.load(f) +l=0 +PAE_array = np.empty(shape=(len(sequence),len(sequence))) +PAE_array.fill('NaN') + +for i in data["predicted_aligned_error"]: + print(i,len(i)) + for j in range(0,len(i)): + #if (i[j]<5): + PAE_array[l][j]=i[j] + #print(i[j]) + print('l',l) + l+=1 + +plt.matshow(PAE_array,cmap='jet',interpolation='none',vmin=0, vmax=40) +plt.colorbar() +plt.savefig('pae_m.png') +plt.close() + +f.close() + + +pddf_pairs=np.load('prob.npy') +for i in range(len(residue_pairs)): + + r1=int(residue_pairs[i][0]) + r2=str(int(residue_pairs[i][1])) + #This is to accoun that the trajectory starts residues from 1 while the AF contact map from 0. + r1_m1=int(residue_pairs[i][0]-1) + + r1_label=str(r1) + r2_label=r2 + ind1=int(r1_label)-1 + ind2=int(r2_label)-1 + + if ( (PAE_array[ind1][ind2]+PAE_array[ind2][ind1])/2.0 0 and pddf_pairs[ind1][ind2+1][-1] CG af + +# In[ ]: + +files = glob.glob("pdb_af.pdb") +print(files) +AF_pdb=files[0] +#"TDP_43_WtoA_7643e_unrelaxed_rank_001_alphafold2_ptm_model_3_seed_000.pdb" +name='input_af' + +import mdtraj as md +traj=md.load(AF_pdb,top=AF_pdb) +selection_CA=traj.topology.select('name CA') + +traj_CA=traj.atom_slice(selection_CA) + +traj_CA.save(name+'.pdb') + + +topology = md.load(name+'.pdb').topology + +table, bonds = topology.to_dataframe() + +table['name'] = table['resName'] +table['serial'] = table['resSeq'] +table.loc[table.index[-1],'resName']='Z' +table.loc[table.index[0],'resName']='X' +table['name'] = table['resName'] + +print(table['resName']) + +topologyCA = md.Topology.from_dataframe(table, bonds) +print(topologyCA) +traj = md.load_pdb(name+'.pdb',top=topologyCA) +traj.save(name+'.pdb') + + +# In[ ]: +###################### +p = Bio.PDB.PDBParser() +#path = '/Volumes/BROTZAKIS/PROJECTS_LOCAL/AF_MI/Rela/prep' # your file path here +structure = p.get_structure('protein', AF_pdb) +plddt = [a.get_bfactor() for a in structure.get_atoms()] +aa=[a.get_name() for a in structure.get_atoms()] +res_ca=[] +for i in range(0,len(aa)): + if (aa[i] == "CA"): + res_ca.append(plddt[i]) +plddt_cut=80 +res_ca2=[n > plddt_cut for n in res_ca] +print(res_ca2) + + + +print('key dis',ordered_domains) +print('key dis',disordered_domains) +###################### +# In[ ]: + + + +indexx=1 +for i in ordered_domains.keys(): + print(ordered_domains[i],str(ordered_domains[i][0][0]),str(ordered_domains[i][0][1])) + selection=traj.topology.select('resid '+str(ordered_domains[i][0][0])+' to '+str(ordered_domains[i][0][1])) + print(selection) + sel=traj.atom_slice(selection) + sel.save('struct'+str(indexx)+'.pdb') + indexx+=1 + + +# In[7]: + + +f=open("plumed.dat","w") + +f.write("MOLINFO MOLTYPE=protein STRUCTURE=input_af.pdb\n") +f.write("WHOLEMOLECULES ENTITY0=1-"+str(len(sequence))+"\n\n") + +#Forward model +ordered_lista=[] +f.write("distance_rest_domains: CONTACTMAP ...\n") +for i in range(0,len(lista)): + for k in ordered_domains.keys(): + if ( lista[i][0] in [*range(ordered_domains[k][0][0],ordered_domains[k][0][1])] and lista[i][1] in [*range(ordered_domains[k][0][0],ordered_domains[k][0][1])]): + ordered_lista.append(i) +ord_index=0 +##########Make restrained contact map###### +restr_array = np.empty(shape=(len(sequence),len(sequence))) +restr_array.fill('NaN') +for i in range(0,len(lista)): + if (i not in ordered_lista): + restr_array[lista[i][0]-1][lista[i][1]-1]=25 + +plt.matshow(restr_array,cmap='viridis_r',interpolation='none',vmin=0, vmax=25) +plt.colorbar() +plt.savefig('restr_distmap.png') +plt.close() + + + +################## +for i in range(0,len(lista)): + if (i not in ordered_lista): + ord_index+=1 + f.write("ATOMS"+str(ord_index)+"="+str(lista[i][0])+","+str(lista[i][1])+"\n") +f.write("SWITCH={CUSTOM FUNC=x R_0=1}\n") +f.write("...\n\n") + + +#AF exp distance map definition. It has to be 1 to 1 +f.write("af_dist_rest: CONSTANT VALUES=") +for i in range (0,len(exp)-1): + if (i not in ordered_lista): + f.write(str(exp[i]*0.1)+",") + #f.write(str(exp[i])+",") + +#This is converting to nm +if (len(exp)-1 not in ordered_lista): + f.write(str(exp[len(exp)-1]*0.1)+" NODERIV\n\n") +f.write("af_dist2: CONSTANT VALUES=0 NODERIV\n") + +#CV definition +f.write("Rg: GYRATION TYPE=RADIUS ATOMS=1-"+str(len(sequence))+"\n") + +indexx=1 +cvnames=[] +for i in ordered_domains.keys(): + f.write("RMSD"+str(indexx)+": RMSD REFERENCE=struct"+str(indexx)+".pdb TYPE=OPTIMAL\n") + cvnames.append("RMSD"+str(indexx)) + indexx+=1 + +indexx=1 +RMSDs=[] +AT=[] +KAPPAS=[] +EXP=[] +EPS=[] +OFFSET=[] +for i in ordered_domains.keys(): + RMSDs.append("RMSD"+str(indexx)) + KAPPAS.append("100000") + AT.append("0.02") + EXP.append("2") + EPS.append("1") + OFFSET.append("0") + indexx+=1 + +f.write("uwall: UPPER_WALLS ARG="+','.join(RMSDs)+" AT="+','.join(AT)+" KAPPA="+','.join(KAPPAS)+" EXP="+','.join(EXP)+" EPS="+','.join(EPS)+" OFFSET="+','.join(OFFSET)+"\n") + + +f.write("PRINT FILE=DISTANCE_MAP_REST ARG=distance_rest_domains.* STRIDE=200\n") +f.write("PRINT FILE=COLVAR ARG=__FILL__ STRIDE=200\n") +f.write("PBMETAD ...\n") +f.write(" LABEL=pb\n") +f.write(" ARG=__FILL__\n") +f.write(" SIGMA=__FILL__ \n") +f.write(" SIGMA_MIN=__FILL__ \n") +f.write(" SIGMA_MAX=__FILL__ \n") +f.write(" ADAPTIVE=DIFF\n") +f.write(" HEIGHT=__FILL__ \n") +f.write(" PACE=200\n") +f.write(" BIASFACTOR=__FILL__ \n") +f.write(" GRID_MIN=__FILL__ \n") +f.write(" GRID_MAX=__FILL__ \n") +f.write(" GRID_WSTRIDE=__FILL__ \n") +f.write(" WALKERS_MPI\n") +f.write(" TEMP=__FILL__ \n") +f.write("... PBMETAD\n") +f.write("METAINFERENCE ...\n") +f.write(" ARG=(distance_rest_domains.*),pb.bias REWEIGHT\n") +f.write(" PARARG=(af_dist_rest.*)\n") +f.write(" SIGMA_MEAN0=1\n") +f.write(" NOISETYPE=MGAUSS OPTSIGMAMEAN=SEM AVERAGING=200\n") +f.write(" SIGMA0=10.0 SIGMA_MIN=0.0001 SIGMA_MAX=10.0 DSIGMA=0.1\n") +f.write(" MC_STEPS=10\n") +f.write(" MC_CHUNKSIZE=23\n") +f.write(" WRITE_STRIDE=10000\n") +f.write(" TEMP=__FILL__ \n") +f.write(" LABEL=af_mi_rest_domains\n") +f.write("... METAINFERENCE\n") +f.write("FLUSH STRIDE=200\n") +f.write("PRINT FILE=ENERGY ARG=pb.bias STRIDE=200\n") +f.write("PRINT ARG=af_mi_rest_domains.* STRIDE=200 FILE=BAYES_rest_domains\n") +f.write("ENDPLUMED\n") + +f.close() + diff --git a/data/scripts_prep/plumed_TDP-43.dat b/data/scripts_prep/plumed_TDP-43.dat new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0471d89b4072ae257119d710afe206d997440bb6 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/plumed_TDP-43.dat @@ -0,0 +1,300 @@ +MOLINFO MOLTYPE=protein STRUCTURE=input_af.pdb +WHOLEMOLECULES ENTITY0=1-414 + +distance_rest_domains: CONTACTMAP ... +ATOMS1=1,4 +ATOMS2=2,5 +ATOMS3=2,20 +ATOMS4=28,79 +ATOMS5=31,79 +ATOMS6=35,79 +ATOMS7=37,79 +ATOMS8=38,79 +ATOMS9=39,79 +ATOMS10=40,79 +ATOMS11=41,79 +ATOMS12=42,79 +ATOMS13=74,79 +ATOMS14=75,79 +ATOMS15=76,79 +ATOMS16=102,105 +ATOMS17=102,106 +ATOMS18=102,150 +ATOMS19=102,151 +ATOMS20=102,152 +ATOMS21=102,155 +ATOMS22=102,158 +ATOMS23=102,159 +ATOMS24=102,161 +ATOMS25=103,106 +ATOMS26=103,107 +ATOMS27=103,108 +ATOMS28=103,120 +ATOMS29=103,121 +ATOMS30=103,124 +ATOMS31=103,130 +ATOMS32=103,131 +ATOMS33=103,132 +ATOMS34=103,133 +ATOMS35=103,134 +ATOMS36=103,135 +ATOMS37=103,147 +ATOMS38=103,148 +ATOMS39=103,149 +ATOMS40=103,150 +ATOMS41=103,151 +ATOMS42=103,152 +ATOMS43=103,153 +ATOMS44=103,154 +ATOMS45=103,155 +ATOMS46=103,156 +ATOMS47=103,157 +ATOMS48=103,158 +ATOMS49=103,159 +ATOMS50=103,160 +ATOMS51=103,161 +ATOMS52=103,162 +ATOMS53=103,175 +ATOMS54=103,176 +ATOMS55=103,177 +ATOMS56=103,178 +ATOMS57=104,178 +ATOMS58=105,178 +ATOMS59=105,179 +ATOMS60=106,178 +ATOMS61=106,179 +ATOMS62=107,178 +ATOMS63=107,179 +ATOMS64=108,178 +ATOMS65=108,179 +ATOMS66=109,178 +ATOMS67=109,179 +ATOMS68=110,178 +ATOMS69=111,178 +ATOMS70=120,178 +ATOMS71=124,178 +ATOMS72=131,178 +ATOMS73=132,178 +ATOMS74=133,178 +ATOMS75=134,178 +ATOMS76=135,178 +ATOMS77=136,178 +ATOMS78=137,178 +ATOMS79=145,178 +ATOMS80=146,178 +ATOMS81=147,178 +ATOMS82=147,179 +ATOMS83=148,178 +ATOMS84=148,179 +ATOMS85=149,178 +ATOMS86=149,179 +ATOMS87=150,178 +ATOMS88=150,179 +ATOMS89=151,178 +ATOMS90=151,179 +ATOMS91=152,178 +ATOMS92=155,178 +ATOMS93=158,178 +ATOMS94=159,178 +ATOMS95=159,179 +ATOMS96=161,178 +ATOMS97=161,179 +ATOMS98=162,178 +ATOMS99=162,179 +ATOMS100=163,178 +ATOMS101=164,178 +ATOMS102=165,178 +ATOMS103=166,178 +ATOMS104=173,178 +ATOMS105=174,178 +ATOMS106=174,179 +ATOMS107=175,178 +ATOMS108=175,179 +ATOMS109=176,179 +ATOMS110=189,192 +ATOMS111=189,233 +ATOMS112=189,240 +ATOMS113=190,193 +ATOMS114=190,194 +ATOMS115=190,195 +ATOMS116=190,209 +ATOMS117=190,210 +ATOMS118=190,211 +ATOMS119=190,212 +ATOMS120=190,213 +ATOMS121=190,214 +ATOMS122=190,216 +ATOMS123=190,217 +ATOMS124=190,218 +ATOMS125=190,219 +ATOMS126=190,220 +ATOMS127=190,230 +ATOMS128=190,231 +ATOMS129=190,232 +ATOMS130=190,233 +ATOMS131=190,234 +ATOMS132=190,235 +ATOMS133=190,236 +ATOMS134=190,237 +ATOMS135=190,238 +ATOMS136=190,239 +ATOMS137=190,240 +ATOMS138=190,241 +ATOMS139=190,242 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+ATOMS195=259,262 +ATOMS196=298,301 +ATOMS197=300,303 +ATOMS198=304,307 +ATOMS199=318,321 +ATOMS200=321,324 +ATOMS201=321,325 +ATOMS202=321,326 +ATOMS203=322,325 +ATOMS204=322,326 +ATOMS205=323,326 +ATOMS206=323,327 +ATOMS207=324,327 +ATOMS208=325,328 +ATOMS209=326,329 +ATOMS210=348,351 +ATOMS211=350,353 +ATOMS212=351,354 +ATOMS213=352,355 +ATOMS214=357,360 +ATOMS215=360,363 +ATOMS216=371,374 +ATOMS217=376,379 +ATOMS218=386,389 +ATOMS219=392,395 +ATOMS220=394,397 +ATOMS221=396,399 +ATOMS222=399,402 +ATOMS223=400,403 +ATOMS224=402,405 +ATOMS225=402,406 +ATOMS226=407,411 +ATOMS227=408,411 +SWITCH={CUSTOM FUNC=x R_0=1} +... + +af_dist_rest: CONSTANT 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\"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/dcd2xtc.py\", line 15, in \n", + " traj = md.load_dcd(f'../output_{i}.dcd', top='input_af.pdb')\n", + " File \"mdtraj/formats/dcd/dcd.pyx\", line 131, in mdtraj.formats.dcd.load_dcd\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 174, in _parse_topology\n", + " _traj = load_frame(top, 0, **kwargs)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 310, in load_frame\n", + " _assert_files_exist(filename)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/mdtraj/core/trajectory.py\", line 100, in _assert_files_exist\n", + " raise IOError('No such file: %s' % fn)\n", + "OSError: No such file: input_af.pdb\n", + "ls: output_0.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_1.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_2.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_3.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_4.xtc: No such file or directory\n", + "ls: output_5.xtc: No such file or directory\n", + "./script.sh: line 23: gmx_mpi: command not found\n", + "\n", + "DRIVER: Found molfile format trajectory xtc with name cat_trjcat.xtc\n", + "gromacsplugin) Cannot open file 'cat_trjcat.xtc', cannot open file\n", + "PLUMED: Cycles Total Average Minimum Maximum\n", + "PLUMED: 1 0.000036 0.000036 0.000036 0.000036\n", + "libc++abi.dylib: terminating with uncaught exception of type PLMD::Plumed::std_bad_alloc: std::bad_alloc\n", + "./script.sh: line 32: 31442 Abort trap: 6 plumed driver --plumed plumed_analysis.dat --mf_xtc cat_trjcat.xtc\n", + "\n", + "DRIVER: Found molfile format trajectory xtc with name cat_trjcat.xtc\n", + "gromacsplugin) Cannot open file 'cat_trjcat.xtc', cannot open file\n", + "./script.sh: line 33: 31443 Segmentation fault: 11 plumed --no-mpi driver --plumed reconstruct.dat --mf_xtc 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\"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/fes2.py\", line 18, in \n", + " time=np.loadtxt(\"FULLBIAS\")[:, 0]\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/npyio.py\", line 1067, in loadtxt\n", + " fh = np.lib._datasource.open(fname, 'rt', encoding=encoding)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 193, in open\n", + " return ds.open(path, mode, encoding=encoding, newline=newline)\n", + " File \"/Users/fdn/opt/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/lib/_datasource.py\", line 533, in open\n", + " raise IOError(\"%s not found.\" % path)\n", + "OSError: FULLBIAS not found.\n", + "2\n", + "2\n", + "Traceback (most recent call last):\n", + " File \"/Users/fdn/Documents/Uni/Projects_mac/metad_protocol/marco/final/PDP/MI_H0p5_RMSD/tdp43_harder_RMSD_short_eq/Github/prep_run/analysis/fes2.py\", line 18, in 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glob('./segment_'+str(k)+'_input_af_*.pdb') +print(pdb_files) +split=int(np.ceil(len(pdb_files)/5)) +print ('SPLIT='+str(split)) +start=0 +end=int(np.ceil(len(pdb_files))) +print('end',end) +for j in range(start,len(pdb_files),2): + print('In j loop', j,'lenpdb',len(pdb_files)) + name='segment_'+str(k)+'_input_af_'+str(j) + os.system("pulchra -v {name}.pdb".format(name=name)) + os.system('echo "6 \n 7" | gmx pdb2gmx -f {name}.rebuilt.pdb -o {name}_sys.pdb -p topol_{name}.top -i {name}.itp'.format(name=name)) + os.system("rm topol_{name}.top {name}.itp em_{j}.trr em_{j}.tpr em_{j}.log em_{j}.edr conf_box_{j}.gro ".format(j=j,name=name)) + os.system('echo "0"|gmx trjconv -f {name}_sys.pdb -s {name}_sys.pdb -o {name}.rebuilt.xtc'.format(j=j,name=name)) + diff --git a/data/scripts_prep/pulchra.sh b/data/scripts_prep/pulchra.sh new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b0092ed3c66e7bcc3024bf0551161a928273195d --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/pulchra.sh @@ -0,0 +1,5 @@ +#!/bin/bash +for i in $(echo 5);do + echo $i > k.dat + python pulchra.py +done diff --git a/data/scripts_prep/resample.py b/data/scripts_prep/resample.py new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c648d8fb1e1e1f91d1f6e1497c91ad820b3d0255 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/resample.py @@ -0,0 +1,66 @@ +import itertools +import os +from pathlib import Path + +import numpy as np +from matplotlib import rc +import matplotlib.pyplot as plt +#from matplotlib.colors import LinearSegmentedColormap +#from mpl_toolkits.axes_grid1 import make_axes_locatable +import mdtraj as md +#import seaborn as sns +#from scipy.stats import gaussian_kde + +#rc("font", **{"family": "sans-serif", +#colors = sns.husl_palette() + +#get_ipython().run_line_magic('matplotlib', 'inline') +#get_ipython().run_line_magic('config', "InlineBackend.figure_format = 'retina'") + + +# In[5]: + + +#from typing import Union, List, Callable + + +KBT = 2.494339 # kJ/mol, 300K +n_replica = 1 +top_file = "input_af.pdb" +biased_cvs = {} +time=np.loadtxt("FULLBIAS")[:, 0] +bias=np.loadtxt("FULLBIAS")[:, 1] +bias10=bias +print(len(bias10)) +weights = np.exp(bias10/ KBT) +weights /= weights.sum() +nframes = {weights.shape[0]} + + +# ## Clustering Full Protein +# Gromos clustering with a trajectory subsample, based on CA RMSD. We first evaluate different cutoffs: +# gmx trjconv -f cat_traj_recon.gro -s structure.pdb -o cat_traj_recon_noh_skip10_noh.gro -skip 10 +# + +# In[15]: + + +#traj = md.load_xtc("conf_0_recon.xtc",top='output.pdb') +traj = md.load("conf_0_recon.gro",stride=1) + + +# In[25]: + + +N = 1000 +n_rounds = 5 + +folder = Path(f"./") +n_frames = traj.n_frames +inds = np.arange(n_frames) + +for i in range(n_rounds): + (folder / f"r{i}").mkdir(exist_ok=True) + inds_sample = np.random.choice(inds, size=N, replace=False, + p=weights / weights.sum()) + traj[inds_sample].save_xtc((folder / f"r{i}" / f"conf-protein.xtc").as_posix()) diff --git a/data/scripts_prep/residues.csv b/data/scripts_prep/residues.csv new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cd2950bbbfba381d7e51b86da63209928abd83f1 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/residues.csv @@ -0,0 +1,21 @@ +three,one,MW,lambdas,sigmas,q,CALVADOS1,CALVADOS2 +ARG,R,156.19,0.7307624767517166,0.6559999999999999,1,0.7249915947715212,0.7307624767517166 +ASP,D,115.09,0.0416040480605567,0.5579999999999999,-1,0.0291821237763497,0.0416040480605567 +ASN,N,114.1,0.4255859009787713,0.568,0,0.4383272997027284,0.4255859009787713 +GLU,E,129.11,0.0006935460962935,0.5920000000000001,-1,0.0061002816086497,0.0006935460962935 +LYS,K,128.17,0.1790211738990582,0.636,1,0.0586171731586979,0.1790211738990582 +HIS,H,137.14,0.4663667290557992,0.608,0,0.4651948082346978,0.4663667290557992 +GLN,Q,128.13,0.3934318551056041,0.602,0,0.3268188050525212,0.3934318551056041 +SER,S,87.08,0.4625416811611541,0.518,0,0.4648570130065605,0.4625416811611541 +CYS,C,103.14,0.5615435099141777,0.5479999999999999,0,0.610362354303913,0.5615435099141777 +GLY,G,57.05,0.7058843733666401,0.45,0,0.7012713677972457,0.7058843733666401 +THR,T,101.11,0.3713162976273964,0.562,0,0.5379777613307019,0.3713162976273964 +ALA,A,71.07,0.2743297969040348,0.504,0,0.0011162643859539,0.2743297969040348 +MET,M,131.2,0.5308481134337497,0.618,0,0.7458993420826714,0.5308481134337497 +TYR,Y,163.18,0.9774611449343455,0.6459999999999999,0,0.9950108229594324,0.9774611449343455 +VAL,V,99.13,0.2083769608174481,0.5860000000000001,0,0.4185006852559869,0.2083769608174481 +TRP,W,186.22,0.9893764740371644,0.6779999999999999,0,0.9844235478393932,0.9893764740371644 +LEU,L,113.16,0.6440005007782226,0.618,0,0.5563020305733198,0.6440005007782226 +ILE,I,113.16,0.5423623610671892,0.618,0,0.6075268330845265,0.5423623610671892 +PRO,P,97.12,0.3593126576364644,0.5559999999999999,0,0.3729641853599348,0.3593126576364644 +PHE,F,147.18,0.8672358982062975,0.636,0,0.9216959832175944,0.8672358982062975 diff --git a/data/scripts_prep/script.sh b/data/scripts_prep/script.sh new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6ac58c6f578eb9ccd3660c9f86361702430dd7b9 --- /dev/null +++ b/data/scripts_prep/script.sh @@ -0,0 +1,36 @@ +#!/bin/bash +nrep=$1 +rm COLVAR* HILLS* FULLBIAS +cp ../HILLS.* . +cp ../GRID* . +cp ../BAYES* . + +rm segment*pdb segment*xtc +#Convert dcds to xtc +python dcd2xtc.py $nrep +for ((c=0;c<$nrep;c++)) +do + +for part in $(ls output_"$c".xtc) +do +echo $part +gmx trjconv -f $part -s ../input_af.pdb -o nosolv_$c.xtc <