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import gradio as gr |
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import torch |
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from transformers import AutoTokenizer |
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import time |
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from functools import wraps |
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import sys |
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import spaces |
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from model import GenerRNA |
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def medir_tiempo(func): |
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@wraps(func) |
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def wrapper(*args, **kwargs): |
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inicio = time.time() |
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resultado = func(*args, **kwargs) |
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fin = time.time() |
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tiempo_transcurrido = fin - inicio |
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print(f"Tiempo de ejecuci贸n de '{func.__name__}': {tiempo_transcurrido:.2f} segundos") |
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return resultado |
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return wrapper |
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@spaces.GPU(duration=120) |
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@medir_tiempo |
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def generar_rna_sequence(prompt, max_length=256): |
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""" |
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Funci贸n que genera una secuencia de RNA a partir de una secuencia inicial dada. |
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""" |
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try: |
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if not prompt.strip(): |
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return "Por favor, ingresa una secuencia de inicio v谩lida." |
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inputs = tokenizer.encode(prompt, return_tensors="pt").to(device) |
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with torch.no_grad(): |
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outputs = model.generate( |
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inputs, |
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max_length=max_length, |
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num_return_sequences=1, |
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no_repeat_ngram_size=2, |
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temperature=0.7, |
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top_k=50, |
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top_p=0.95, |
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do_sample=True |
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) |
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generated_sequence = tokenizer.decode(outputs[0], skip_special_tokens=True) |
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return generated_sequence |
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except Exception as e: |
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print(f"Error durante la generaci贸n de secuencia: {e}") |
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return f"Error al generar la secuencia: {e}" |
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device = "cuda" if torch.cuda.is_available() else "cpu" |
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if device == "cpu": |
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print("Advertencia: CUDA no est谩 disponible. Se usar谩 la CPU, lo que puede ser lento.") |
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try: |
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print("Cargando el tokenizador...") |
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tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained("tokenizer_bpe_1024") |
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except ValueError as e: |
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print(f"Error al cargar el tokenizador: {e}") |
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sys.exit(1) |
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try: |
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print("Cargando el modelo GenerRNA...") |
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model = GenerRNA() |
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model.load_state_dict(torch.load("model.pt.recombined", map_location=device)) |
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model.to(device) |
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model.eval() |
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print("Modelo GenerRNA cargado exitosamente.") |
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except Exception as e: |
|
print(f"Error al cargar el modelo GenerRNA: {e}") |
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sys.exit(1) |
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titulo = "GenerRNA - Generador de Secuencias de RNA" |
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descripcion = ( |
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"GenerRNA es un modelo generativo de RNA basado en una arquitectura Transformer. " |
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"Ingresa una secuencia inicial opcional y define la longitud m谩xima para generar nuevas secuencias de RNA." |
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) |
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iface = gr.Interface( |
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fn=generar_rna_sequence, |
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inputs=[ |
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gr.Textbox( |
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lines=5, |
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placeholder="Ingresa una secuencia de RNA inicial (opcional)...", |
|
label="Secuencia Inicial" |
|
), |
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gr.Slider( |
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minimum=50, |
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maximum=1000, |
|
step=50, |
|
value=256, |
|
label="Longitud M谩xima de la Secuencia" |
|
) |
|
], |
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outputs=gr.Textbox(label="Secuencia de RNA Generada"), |
|
title=titulo, |
|
description=descripcion, |
|
examples=[ |
|
[ |
|
"AUGGCUACGUAUCGACGUA" |
|
], |
|
[ |
|
"GCUAUGCUAGCUAGCUGAC" |
|
] |
|
], |
|
cache_examples=False, |
|
allow_flagging="never" |
|
) |
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if __name__ == "__main__": |
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iface.launch() |
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