BioRAG / UI.py
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# UI.py
import gradio as gr
import numpy as np # Necesario para np.inf
def create_interface(process_function_for_button):
"""
Crea la interfaz de usuario completa para el modelado de bioprocesos.
"""
with gr.Blocks(theme='gradio/soft') as demo:
gr.Markdown("# Modelado de Bioprocesos con Ecuaciones Personalizadas y Análisis por IA")
gr.Markdown(
"Sube un archivo Excel (columnas: 'Tiempo', 'Biomasa', 'Sustrato', 'Producto'). "
"Ingresa ecuaciones (usa 't' para tiempo; 'X_val' para X(t) en S/P), "
"parámetros y límites. El sistema ajustará los modelos y un LLM analizará los resultados."
)
with gr.Row():
with gr.Column(scale=2):
gr.Markdown("### 1. Carga de Datos y Configuración General del Gráfico")
file_input = gr.File(label="Subir archivo Excel (.xlsx)", file_types=[".xlsx"])
show_legend_ui = gr.Checkbox(label="Mostrar leyenda en gráficos", value=True)
show_params_ui = gr.Checkbox(label="Mostrar parámetros ajustados en gráficos", value=True)
legend_position_ui = gr.Dropdown(
label="Posición de la leyenda",
choices=['best', 'upper right', 'upper left', 'lower right', 'lower left', 'center left', 'center right', 'lower center', 'upper center', 'center'],
value='best',
type="value"
)
with gr.Column(scale=1):
gr.Markdown("### 2. Conteo de Ecuaciones a Probar")
gr.Markdown("Define cuántas ecuaciones diferentes probar para cada componente (1-3).")
biomass_eq_count_ui = gr.Number(label="Ecuaciones de Biomasa:", value=1.0, minimum=1.0, maximum=3.0, step=1.0, precision=0)
substrate_eq_count_ui = gr.Number(label="Ecuaciones de Sustrato:", value=1.0, minimum=1.0, maximum=3.0, step=1.0, precision=0)
product_eq_count_ui = gr.Number(label="Ecuaciones de Producto:", value=1.0, minimum=1.0, maximum=3.0, step=1.0, precision=0)
# --- Contenedores para campos dinámicos ---
# Biomasa
with gr.Accordion("3. Definición de Modelos de Biomasa", open=True):
gr.Markdown("Ecuación (ej: `Xm*(1 - exp(-um*(t - t_lag)))`), Parámetros (ej: `Xm, um, t_lag`), Límites (ej: `(0, np.inf), (0, 5), (0, 100)`).")
with gr.Row():
with gr.Column():
biomass_eq1_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Biomasa 1", value="Xm * (1 - exp(-um * (t - t_lag)))", lines=2)
biomass_param1_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Biomasa 1", value="Xm, um, t_lag")
biomass_bound1_ui = gr.Textbox(label="Límites Biomasa 1", value="(0, np.inf), (0, np.inf), (0, np.inf)")
biomass_col2_container = gr.Column(visible=False)
with biomass_col2_container:
biomass_eq2_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Biomasa 2", value="", lines=2, placeholder="Opcional: X0 * exp(um * t)")
biomass_param2_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Biomasa 2", value="", placeholder="Opcional: X0, um")
biomass_bound2_ui = gr.Textbox(label="Límites Biomasa 2", value="", placeholder="Opcional: (0, np.inf), (0, np.inf)")
biomass_col3_container = gr.Column(visible=False)
with biomass_col3_container:
biomass_eq3_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Biomasa 3", lines=2, value="", placeholder="Opcional")
biomass_param3_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Biomasa 3", value="", placeholder="Opcional")
biomass_bound3_ui = gr.Textbox(label="Límites Biomasa 3", value="", placeholder="Opcional")
# Sustrato
with gr.Accordion("4. Definición de Modelos de Sustrato", open=True):
gr.Markdown("Usa `X_val` para X(t) si es necesario. Ej: `S0 - (X_val / YXS)`.")
with gr.Row():
with gr.Column():
substrate_eq1_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Sustrato 1", value="S0 - (X_val / YXS) - mS * t", lines=2)
substrate_param1_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Sustrato 1", value="S0, YXS, mS")
substrate_bound1_ui = gr.Textbox(label="Límites Sustrato 1", value="(0, np.inf), (1e-9, np.inf), (0, np.inf)")
substrate_col2_container = gr.Column(visible=False)
with substrate_col2_container:
substrate_eq2_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Sustrato 2", lines=2, value="", placeholder="Opcional")
substrate_param2_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Sustrato 2", value="", placeholder="Opcional")
substrate_bound2_ui = gr.Textbox(label="Límites Sustrato 2", value="", placeholder="Opcional")
substrate_col3_container = gr.Column(visible=False)
with substrate_col3_container:
substrate_eq3_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Sustrato 3", lines=2, value="", placeholder="Opcional")
substrate_param3_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Sustrato 3", value="", placeholder="Opcional")
substrate_bound3_ui = gr.Textbox(label="Límites Sustrato 3", value="", placeholder="Opcional")
# Producto
with gr.Accordion("5. Definición de Modelos de Producto", open=True):
gr.Markdown("Usa `X_val` para X(t) si es necesario. Ej: `P0 + YPX * X_val`.")
with gr.Row():
with gr.Column():
product_eq1_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Producto 1", value="P0 + YPX * X_val + mP * t", lines=2)
product_param1_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Producto 1", value="P0, YPX, mP")
product_bound1_ui = gr.Textbox(label="Límites Producto 1", value="(0, np.inf), (0, np.inf), (0, np.inf)")
product_col2_container = gr.Column(visible=False)
with product_col2_container:
product_eq2_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Producto 2", lines=2, value="", placeholder="Opcional")
product_param2_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Producto 2", value="", placeholder="Opcional")
product_bound2_ui = gr.Textbox(label="Límites Producto 2", value="", placeholder="Opcional")
product_col3_container = gr.Column(visible=False)
with product_col3_container:
product_eq3_ui = gr.Textbox(label="Ecuación Producto 3", lines=2, value="", placeholder="Opcional")
product_param3_ui = gr.Textbox(label="Parámetros Producto 3", value="", placeholder="Opcional")
product_bound3_ui = gr.Textbox(label="Límites Producto 3", value="", placeholder="Opcional")
def update_eq_visibility(count_value):
try:
count = int(float(count_value)) if count_value is not None else 0
except ValueError:
count = 0
return gr.update(visible=count >= 2), gr.update(visible=count >= 3)
biomass_eq_count_ui.change(fn=update_eq_visibility, inputs=biomass_eq_count_ui, outputs=[biomass_col2_container, biomass_col3_container])
substrate_eq_count_ui.change(fn=update_eq_visibility, inputs=substrate_eq_count_ui, outputs=[substrate_col2_container, substrate_col3_container])
product_eq_count_ui.change(fn=update_eq_visibility, inputs=product_eq_count_ui, outputs=[product_col2_container, product_col3_container])
submit_button = gr.Button("Procesar y Analizar Modelos", variant="primary", scale=1, elem_id="submit_button_main")
gr.Markdown("## Resultados del Análisis y Modelado")
with gr.Row():
image_output = gr.Image(label="Gráfico Generado de Ajustes", type="pil", scale=2, show_download_button=True, height=750, interactive=False)
with gr.Column(scale=3):
analysis_output = gr.Markdown(label="Análisis del Modelo por IA")
all_inputs_for_button = [
file_input,
biomass_eq1_ui, biomass_eq2_ui, biomass_eq3_ui,
biomass_param1_ui, biomass_param2_ui, biomass_param3_ui,
biomass_bound1_ui, biomass_bound2_ui, biomass_bound3_ui,
substrate_eq1_ui, substrate_eq2_ui, substrate_eq3_ui,
substrate_param1_ui, substrate_param2_ui, substrate_param3_ui,
substrate_bound1_ui, substrate_bound2_ui, substrate_bound3_ui,
product_eq1_ui, product_eq2_ui, product_eq3_ui,
product_param1_ui, product_param2_ui, product_param3_ui,
product_bound1_ui, product_bound2_ui, product_bound3_ui,
legend_position_ui,
show_legend_ui,
show_params_ui,
biomass_eq_count_ui,
substrate_eq_count_ui,
product_eq_count_ui
]
outputs_for_button = [image_output, analysis_output]
# ... (dentro de la función create_interface)
submit_button.click(
fn=process_function_for_button,
inputs=all_inputs_for_button,
outputs=outputs_for_button,
api_name="process_data" # ¡DESCOMENTA ESTA LÍNEA!
)
# ... (resto del código)
def set_initial_visibility_on_load_wrapper(b_c_val, s_c_val, p_c_val):
b_c_int = int(float(b_c_val)) if b_c_val is not None else 0
s_c_int = int(float(s_c_val)) if s_c_val is not None else 0
p_c_int = int(float(p_c_val)) if p_c_val is not None else 0
b_vis2_upd, b_vis3_upd = update_eq_visibility(b_c_int)
s_vis2_upd, s_vis3_upd = update_eq_visibility(s_c_int)
p_vis2_upd, p_vis3_upd = update_eq_visibility(p_c_int)
return b_vis2_upd, b_vis3_upd, s_vis2_upd, s_vis3_upd, p_vis2_upd, p_vis3_upd
demo.load(
fn=set_initial_visibility_on_load_wrapper,
inputs=[biomass_eq_count_ui, substrate_eq_count_ui, product_eq_count_ui],
outputs=[
biomass_col2_container, biomass_col3_container,
substrate_col2_container, substrate_col3_container,
product_col2_container, product_col3_container
]
)
return demo