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CHANGED
@@ -4,7 +4,7 @@ from transformers import pipeline
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import time
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from functools import wraps
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import sys
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-
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# Decorador para medir el tiempo de ejecuci贸n
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def medir_tiempo(func):
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@@ -19,26 +19,16 @@ def medir_tiempo(func):
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return wrapper
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# Verificar si CUDA est谩 disponible para el modelo principal
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device =
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if device ==
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print("Advertencia: CUDA no est谩 disponible. Se usar谩 la CPU, lo que puede ser lento.")
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# Cargar el
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model_name = "multimolecule/mrnafm"
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try:
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30 |
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print("Cargando el
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except ValueError as e:
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print(f"Error al cargar el tokenizador: {e}")
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sys.exit(1)
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-
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-
try:
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print("Cargando el modelo...")
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model = RnaFmModel.from_pretrained(model_name)
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model.to(device)
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40 |
except Exception as e:
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41 |
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print(f"Error al cargar el
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sys.exit(1)
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@medir_tiempo
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@@ -54,16 +44,13 @@ def predecir_fill_mask(secuencias):
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secuencias_lista = [seq.strip().upper() for seq in secuencias.strip().split('\n') if seq.strip()]
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resultados = []
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-
# Crear el pipeline de fill-mask utilizando el tokenizador y modelo cargados
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fill_mask = pipeline('fill-mask', model=model, tokenizer=tokenizer, device=0 if device == "cuda" else -1)
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-
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60 |
for seq in secuencias_lista:
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61 |
# Asegurarse de que la secuencia contenga al menos un <mask>
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if "<MASK>" not in seq and "<mask>" not in seq:
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resultados.append(f"Secuencia sin token <mask>: {seq}. Agrega <mask> donde desees predecir.")
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continue
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-
# Realizar la predicci贸n de
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predictions = fill_mask(seq)
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# Formatear las predicciones
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import time
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from functools import wraps
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import sys
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+
import multimolecule # Importar para registrar los modelos de multimolecule
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# Decorador para medir el tiempo de ejecuci贸n
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def medir_tiempo(func):
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return wrapper
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# Verificar si CUDA est谩 disponible para el modelo principal
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+
device = 0 if torch.cuda.is_available() else -1
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+
if device == -1:
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print("Advertencia: CUDA no est谩 disponible. Se usar谩 la CPU, lo que puede ser lento.")
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+
# Cargar el pipeline de Fill-Mask
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try:
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+
print("Cargando el pipeline de Fill-Mask...")
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+
fill_mask = pipeline('fill-mask', model='multimolecule/mrnafm', device=device)
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except Exception as e:
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+
print(f"Error al cargar el pipeline de Fill-Mask: {e}")
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sys.exit(1)
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@medir_tiempo
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secuencias_lista = [seq.strip().upper() for seq in secuencias.strip().split('\n') if seq.strip()]
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resultados = []
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for seq in secuencias_lista:
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48 |
# Asegurarse de que la secuencia contenga al menos un <mask>
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49 |
if "<MASK>" not in seq and "<mask>" not in seq:
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50 |
resultados.append(f"Secuencia sin token <mask>: {seq}. Agrega <mask> donde desees predecir.")
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51 |
continue
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52 |
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53 |
+
# Realizar la predicci贸n de Fill-Mask
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predictions = fill_mask(seq)
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# Formatear las predicciones
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