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CHANGED
@@ -7,7 +7,7 @@ import pytesseract
|
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7 |
from PIL import Image, ImageEnhance, ImageFilter
|
8 |
import io
|
9 |
|
10 |
-
# 🎯 Faixas de referência
|
11 |
faixas = {
|
12 |
"LEUCO": (4000, 11000),
|
13 |
"B": (0, 1), "SS": (45, 59), "EOS": (1, 6), "LINF": (30, 50), "MONO": (1, 8),
|
@@ -41,19 +41,34 @@ def classificar(nome, valor):
|
|
41 |
except:
|
42 |
return valor
|
43 |
|
|
|
44 |
def melhorar_imagem(img: Image.Image) -> Image.Image:
|
45 |
img = img.convert("L")
|
46 |
img = ImageEnhance.Contrast(img).enhance(2)
|
47 |
return img.filter(ImageFilter.SHARPEN)
|
48 |
|
|
|
49 |
def extrair_texto_pdf(pdf_input):
|
50 |
-
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51 |
-
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52 |
-
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53 |
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54 |
-
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55 |
exames = {
|
56 |
-
# Hemograma
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57 |
"LEUCO": r"\bleuc[óo]citos\b.*?([\d.,]+)\s*/u?l",
|
58 |
"B": r"\bbastonetes\b.*?([\d.,]+)\s?%",
|
59 |
"SS": r"\bsegmentados\b.*?([\d.,]+)\s?%",
|
@@ -63,7 +78,6 @@ exames = {
|
|
63 |
"HB": r"\bhemoglobina\b.*?([\d.,]+)\s?g/dl",
|
64 |
"HT": r"\bhemat[óo]crito\b.*?([\d.,]+)\s?%",
|
65 |
"PLT": r"\bplaquetas\b.*?([\d.,]+)\s*/u?l",
|
66 |
-
# Bioquímica
|
67 |
"AMIL": r"\bamilase\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
68 |
"BT": r"\bbilirrubina total\b.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
69 |
"BD": r"\bbilirrubina direta\b.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
@@ -77,18 +91,15 @@ exames = {
|
|
77 |
"GLI": r"\bglicose\b(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
78 |
"LIP": r"\blipase\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
79 |
"MG++": r"\bmagn[eé]sio\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
80 |
-
# Coagulação
|
81 |
"TAP": r"\btempo de protrombina\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
82 |
"INR": r"\binr\b.*?([\d.,]+)",
|
83 |
"TTP": r"\bttpa\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
84 |
"DIMERO D": r"\bd[ií]mero d\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
85 |
-
# Inflamatório e Cardíacos
|
86 |
"PCR": r"\bpcr\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
87 |
"CKMB": r"\bck[- ]?mb\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
88 |
"CPK": r"\bcpk\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
89 |
-
"TROPONINA": r"troponina(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([><\d.,]+)(?=\s*ng
|
90 |
"TROPONINA QUAL": r"troponina qualitativa.*?resultado[:\s]*(positivo|negativo)",
|
91 |
-
# EAS completo (Urina)
|
92 |
"PROTEINA UR": r"\bprote[ií]na\b.*?\b(ausente|positivo|negativo)",
|
93 |
"GLI UR": r"\bglicose\b.*?\b(ausente|positivo|negativo)",
|
94 |
"CETONAS UR": r"\bcorpos cet[oô]nicos\b.*?\b(ausente|positivo|negativo)",
|
@@ -100,13 +111,13 @@ exames = {
|
|
100 |
"BACTERIAS UR": r"\bbact[ée]rias?\b.*?\b(raras|ausentes|positivas|negativas)"
|
101 |
}
|
102 |
|
|
|
103 |
ordem = [
|
104 |
"LEUCO","B","SS","EOS","LINF","MONO",
|
105 |
"HB","HT","PLT","AMIL","BT","BD","BI",
|
106 |
"CR","UREIA","FAL","GGT","TGO","TGP","GLI","LIP","MG++",
|
107 |
"PCR","CKMB","CPK","TROPONINA","TROPONINA QUAL",
|
108 |
"TAP","INR","TTP","DIMERO D",
|
109 |
-
# EAS
|
110 |
"PROTEINA UR","GLI UR","CETONAS UR","SANGUE UR","LEUC ESTERASE","NITRITO UR","LEUCO EAS","HEMA EAS","BACTERIAS UR"
|
111 |
]
|
112 |
|
@@ -132,14 +143,15 @@ def extrair_exames_formatado(pdf_file):
|
|
132 |
line_main = ' / '.join(main_fields)
|
133 |
final = '\n'.join([l for l in (line_eas, line_main) if l])
|
134 |
|
135 |
-
# Gera CSV
|
136 |
df = pd.DataFrame([[k, resultados[k]] for k in resultados], columns=["Exame", "Valor"])
|
137 |
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv")
|
138 |
df.to_csv(tmp.name, index=False)
|
139 |
return final, tmp.name
|
140 |
|
141 |
-
#
|
142 |
-
|
|
|
143 |
gr.Markdown("## 🧪 Extrator Avançado com OCR + EAS + Troponina (Quant. e Qual.)")
|
144 |
pdf_input = gr.File(file_types=[".pdf"], label="📄 PDF de exames")
|
145 |
btn = gr.Button("🔍 Extrair")
|
|
|
7 |
from PIL import Image, ImageEnhance, ImageFilter
|
8 |
import io
|
9 |
|
10 |
+
# 🎯 Faixas de referência (valores de referência mínimos e máximos)
|
11 |
faixas = {
|
12 |
"LEUCO": (4000, 11000),
|
13 |
"B": (0, 1), "SS": (45, 59), "EOS": (1, 6), "LINF": (30, 50), "MONO": (1, 8),
|
|
|
41 |
except:
|
42 |
return valor
|
43 |
|
44 |
+
# Ajustes para melhorar OCR
|
45 |
def melhorar_imagem(img: Image.Image) -> Image.Image:
|
46 |
img = img.convert("L")
|
47 |
img = ImageEnhance.Contrast(img).enhance(2)
|
48 |
return img.filter(ImageFilter.SHARPEN)
|
49 |
|
50 |
+
# Extrai texto nativo + OCR do PDF
|
51 |
def extrair_texto_pdf(pdf_input):
|
52 |
+
if isinstance(pdf_input, dict):
|
53 |
+
pdf_path = pdf_input.get("name") or pdf_input.get("file_path")
|
54 |
+
elif hasattr(pdf_input, "name") and isinstance(pdf_input.name, str):
|
55 |
+
pdf_path = pdf_input.name
|
56 |
+
else:
|
57 |
+
pdf_path = str(pdf_input)
|
58 |
|
59 |
+
texto_nativo, ocr_imgs = [], []
|
60 |
+
with fitz.open(pdf_path) as doc:
|
61 |
+
for page in doc:
|
62 |
+
texto_nativo.append(page.get_text())
|
63 |
+
pix = page.get_pixmap(dpi=300)
|
64 |
+
img = Image.open(io.BytesIO(pix.tobytes("png")))
|
65 |
+
ocr_imgs.append(melhorar_imagem(img))
|
66 |
+
tn = re.sub(r"\s+", " ", "".join(texto_nativo))
|
67 |
+
tocr = re.sub(r"\s+", " ", " ".join(pytesseract.image_to_string(im) for im in ocr_imgs))
|
68 |
+
return tn, tocr
|
69 |
+
|
70 |
+
# Padrões de extração com word boundaries e unidades obrigatórias
|
71 |
exames = {
|
|
|
72 |
"LEUCO": r"\bleuc[óo]citos\b.*?([\d.,]+)\s*/u?l",
|
73 |
"B": r"\bbastonetes\b.*?([\d.,]+)\s?%",
|
74 |
"SS": r"\bsegmentados\b.*?([\d.,]+)\s?%",
|
|
|
78 |
"HB": r"\bhemoglobina\b.*?([\d.,]+)\s?g/dl",
|
79 |
"HT": r"\bhemat[óo]crito\b.*?([\d.,]+)\s?%",
|
80 |
"PLT": r"\bplaquetas\b.*?([\d.,]+)\s*/u?l",
|
|
|
81 |
"AMIL": r"\bamilase\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
82 |
"BT": r"\bbilirrubina total\b.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
83 |
"BD": r"\bbilirrubina direta\b.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
|
|
91 |
"GLI": r"\bglicose\b(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
92 |
"LIP": r"\blipase\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
93 |
"MG++": r"\bmagn[eé]sio\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
|
|
94 |
"TAP": r"\btempo de protrombina\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
95 |
"INR": r"\binr\b.*?([\d.,]+)",
|
96 |
"TTP": r"\bttpa\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
97 |
"DIMERO D": r"\bd[ií]mero d\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
|
|
98 |
"PCR": r"\bpcr\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
99 |
"CKMB": r"\bck[- ]?mb\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
100 |
"CPK": r"\bcpk\b.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
101 |
+
"TROPONINA": r"troponina(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([><\d.,]+)(?=\s*ng\/m[lL])",
|
102 |
"TROPONINA QUAL": r"troponina qualitativa.*?resultado[:\s]*(positivo|negativo)",
|
|
|
103 |
"PROTEINA UR": r"\bprote[ií]na\b.*?\b(ausente|positivo|negativo)",
|
104 |
"GLI UR": r"\bglicose\b.*?\b(ausente|positivo|negativo)",
|
105 |
"CETONAS UR": r"\bcorpos cet[oô]nicos\b.*?\b(ausente|positivo|negativo)",
|
|
|
111 |
"BACTERIAS UR": r"\bbact[ée]rias?\b.*?\b(raras|ausentes|positivas|negativas)"
|
112 |
}
|
113 |
|
114 |
+
# Ordem de exibição
|
115 |
ordem = [
|
116 |
"LEUCO","B","SS","EOS","LINF","MONO",
|
117 |
"HB","HT","PLT","AMIL","BT","BD","BI",
|
118 |
"CR","UREIA","FAL","GGT","TGO","TGP","GLI","LIP","MG++",
|
119 |
"PCR","CKMB","CPK","TROPONINA","TROPONINA QUAL",
|
120 |
"TAP","INR","TTP","DIMERO D",
|
|
|
121 |
"PROTEINA UR","GLI UR","CETONAS UR","SANGUE UR","LEUC ESTERASE","NITRITO UR","LEUCO EAS","HEMA EAS","BACTERIAS UR"
|
122 |
]
|
123 |
|
|
|
143 |
line_main = ' / '.join(main_fields)
|
144 |
final = '\n'.join([l for l in (line_eas, line_main) if l])
|
145 |
|
146 |
+
# Gera CSV
|
147 |
df = pd.DataFrame([[k, resultados[k]] for k in resultados], columns=["Exame", "Valor"])
|
148 |
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv")
|
149 |
df.to_csv(tmp.name, index=False)
|
150 |
return final, tmp.name
|
151 |
|
152 |
+
# Interface Gradio
|
153 |
+
demo = gr.Blocks()
|
154 |
+
with demo:
|
155 |
gr.Markdown("## 🧪 Extrator Avançado com OCR + EAS + Troponina (Quant. e Qual.)")
|
156 |
pdf_input = gr.File(file_types=[".pdf"], label="📄 PDF de exames")
|
157 |
btn = gr.Button("🔍 Extrair")
|