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CHANGED
@@ -28,20 +28,15 @@ faixas = {
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|
28 |
"TROPONINA": (0, 0.5)
|
29 |
}
|
30 |
|
31 |
-
# Chaves relativas à seção EAS
|
32 |
-
EAS_KEYS = [
|
33 |
-
"PROTEINA UR","GLI UR","CETONAS UR","SANGUE UR",
|
34 |
-
"LEUC ESTERASE","NITRITO UR","LEUCO EAS","HEMA EAS","BACTERIAS UR"
|
35 |
-
]
|
36 |
-
|
37 |
def classificar(nome, valor):
|
38 |
-
"""Anexa ↓/↑ se fora da faixa."""
|
39 |
try:
|
40 |
v = float(valor.replace(">", "").replace("<", "").strip())
|
41 |
-
|
42 |
-
|
43 |
-
if v < lo:
|
44 |
-
|
|
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|
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45 |
return valor
|
46 |
except:
|
47 |
return valor
|
@@ -67,8 +62,8 @@ def extrair_texto_pdf(pdf_input):
|
|
67 |
texto_nativo.append(page.get_text())
|
68 |
pix = page.get_pixmap(dpi=300)
|
69 |
img = Image.open(io.BytesIO(pix.tobytes("png")))
|
70 |
-
ocr_imgs.append(
|
71 |
-
tn = re.sub(r"\s+", " ", "
|
72 |
tocr = re.sub(r"\s+", " ", " ".join(pytesseract.image_to_string(im) for im in ocr_imgs))
|
73 |
return tn, tocr
|
74 |
|
@@ -76,54 +71,100 @@ def extrair_texto_pdf(pdf_input):
|
|
76 |
exames = {
|
77 |
# Hemograma
|
78 |
"LEUCO": r"leuc[óo]citos.*?([\d.,]+)\s*/u?l",
|
79 |
-
"B":
|
80 |
-
"SS":
|
81 |
-
"EOS":
|
82 |
"LINF": r"linf[oó]citos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
83 |
"MONO": r"mon[óo]citos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
84 |
-
"HB":
|
85 |
-
"HT":
|
86 |
-
"PLT":
|
87 |
# Bioquímica
|
88 |
"AMIL": r"amilase.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
89 |
-
"BT":
|
90 |
-
"BD":
|
91 |
-
"BI":
|
92 |
-
"CR":
|
93 |
-
"UREIA":
|
94 |
-
"FAL":
|
95 |
-
"GGT":
|
96 |
-
"TGO":
|
97 |
-
"TGP":
|
98 |
-
"GLI":
|
99 |
-
"LIP":
|
100 |
"MG++": r"magn[eé]sio.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
101 |
# Coagulação
|
102 |
-
"TAP":
|
103 |
-
"INR":
|
104 |
-
"TTP":
|
105 |
"DIMERO D": r"d[ií]mero d.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
106 |
# Inflamatório e Cardíacos
|
107 |
-
"PCR":
|
108 |
-
"CKMB":
|
109 |
-
"CPK":
|
110 |
-
"TROPONINA":
|
111 |
"TROPONINA QUAL": r"troponina qualitativa.*?resultado[:\s]*(positivo|negativo)",
|
112 |
-
# EAS completo (Urina)
|
113 |
-
"PROTEINA UR":
|
114 |
-
"GLI UR":
|
115 |
-
"CETONAS UR":
|
116 |
-
"SANGUE UR":
|
117 |
-
"LEUC ESTERASE":
|
118 |
-
"NITRITO UR":
|
119 |
-
"LEUCO EAS":
|
120 |
-
"HEMA EAS":
|
121 |
-
"BACTERIAS UR":
|
122 |
}
|
123 |
|
124 |
-
# Ordem para exibição
|
125 |
ordem = [
|
126 |
"LEUCO","B","SS","EOS","LINF","MONO",
|
127 |
"HB","HT","PLT","AMIL","BT","BD","BI",
|
128 |
-
"CR","UREIA","
|
129 |
-
|
|
|
|
|
|
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|
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|
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|
|
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|
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28 |
"TROPONINA": (0, 0.5)
|
29 |
}
|
30 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
31 |
def classificar(nome, valor):
|
|
|
32 |
try:
|
33 |
v = float(valor.replace(">", "").replace("<", "").strip())
|
34 |
+
if nome in faixas:
|
35 |
+
lo, hi = faixas[nome]
|
36 |
+
if v < lo:
|
37 |
+
return f"{valor} ↓"
|
38 |
+
if v > hi:
|
39 |
+
return f"{valor} ↑"
|
40 |
return valor
|
41 |
except:
|
42 |
return valor
|
|
|
62 |
texto_nativo.append(page.get_text())
|
63 |
pix = page.get_pixmap(dpi=300)
|
64 |
img = Image.open(io.BytesIO(pix.tobytes("png")))
|
65 |
+
ocr_imgs.append(melhor_imagem(img))
|
66 |
+
tn = re.sub(r"\s+", " ", "".join(texto_nativo))
|
67 |
tocr = re.sub(r"\s+", " ", " ".join(pytesseract.image_to_string(im) for im in ocr_imgs))
|
68 |
return tn, tocr
|
69 |
|
|
|
71 |
exames = {
|
72 |
# Hemograma
|
73 |
"LEUCO": r"leuc[óo]citos.*?([\d.,]+)\s*/u?l",
|
74 |
+
"B": r"bas[óo]filos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
75 |
+
"SS": r"segmentados.*?([\d.,]+)\s?%",
|
76 |
+
"EOS": r"eosin[óo]filos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
77 |
"LINF": r"linf[oó]citos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
78 |
"MONO": r"mon[óo]citos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
79 |
+
"HB": r"hemoglobina.*?([\d.,]+)\s?g/dl",
|
80 |
+
"HT": r"hemat[óo]crito.*?([\d.,]+)\s?%",
|
81 |
+
"PLT": r"plaquetas.*?([\d.,]+).*?/u?l",
|
82 |
# Bioquímica
|
83 |
"AMIL": r"amilase.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
84 |
+
"BT": r"bilirrubina total.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
85 |
+
"BD": r"bilirrubina direta.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
86 |
+
"BI": r"bilirrubina indireta.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
87 |
+
"CR": r"creatinina.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
88 |
+
"UREIA":r"ureia.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
89 |
+
"FAL": r"fosfatase alcalina.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
90 |
+
"GGT": r"ggt.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
91 |
+
"TGO": r"tgo.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
92 |
+
"TGP": r"tgp.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
93 |
+
"GLI": r"glicose(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
94 |
+
"LIP": r"lipase.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
95 |
"MG++": r"magn[eé]sio.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
96 |
# Coagulação
|
97 |
+
"TAP": r"tempo de protrombina.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
98 |
+
"INR": r"inr.*?([\d.,]+)",
|
99 |
+
"TTP": r"ttpa.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
100 |
"DIMERO D": r"d[ií]mero d.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
101 |
# Inflamatório e Cardíacos
|
102 |
+
"PCR": r"pcr.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
103 |
+
"CKMB": r"ck[- ]?mb.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
104 |
+
"CPK": r"cpk.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
105 |
+
"TROPONINA": r"troponina(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([>\d.,]+)",
|
106 |
"TROPONINA QUAL": r"troponina qualitativa.*?resultado[:\s]*(positivo|negativo)",
|
107 |
+
# EAS completo (Urina)
|
108 |
+
"PROTEINA UR": r"prote[ií]na\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
109 |
+
"GLI UR": r"glicose\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
110 |
+
"CETONAS UR": r"corpos cet[oô]nicos.*?(ausente|positivo|negativo)",
|
111 |
+
"SANGUE UR": r"sangue\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
112 |
+
"LEUC ESTERASE": r"leuc[óo]citos? esterase\s*[:\-]?\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
113 |
+
"NITRITO UR": r"nitrito\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
114 |
+
"LEUCO EAS": r"leuc[óo]citos?\s*([\d]+[-\/–][\d]+)",
|
115 |
+
"HEMA EAS": r"hem[áa]cias?\s*([\d]+[-\/–][\d]+)",
|
116 |
+
"BACTERIAS UR": r"bact[ée]rias?\s*(raras|ausentes|positivas|negativas)"
|
117 |
}
|
118 |
|
|
|
119 |
ordem = [
|
120 |
"LEUCO","B","SS","EOS","LINF","MONO",
|
121 |
"HB","HT","PLT","AMIL","BT","BD","BI",
|
122 |
+
"CR","UREIA","FAL","GGT","TGO","TGP","GLI","LIP","MG++",
|
123 |
+
"PCR","CKMB","CPK","TROPONINA","TROPONINA QUAL",
|
124 |
+
"TAP","INR","TTP","DIMERO D",
|
125 |
+
# EAS
|
126 |
+
"PROTEINA UR","GLI UR","CETONAS UR","SANGUE UR","LEUC ESTERASE","NITRITO UR","LEUCO EAS","HEMA EAS","BACTERIAS UR"
|
127 |
+
]
|
128 |
+
|
129 |
+
# Montagem do texto formatado
|
130 |
+
def extrair_exames_formatado(pdf_file):
|
131 |
+
if not pdf_file:
|
132 |
+
return "Nenhum arquivo enviado.", None
|
133 |
+
tn, tocr = extrair_texto_pdf(pdf_file)
|
134 |
+
texto = (tn + " " + tocr).lower()
|
135 |
+
resultados = {}
|
136 |
+
for nome, pat in exames.items():
|
137 |
+
m = re.search(pat, texto, re.IGNORECASE)
|
138 |
+
if not m:
|
139 |
+
continue
|
140 |
+
raw = m.group(1).strip().upper()
|
141 |
+
# se for valor qualitativo ou EAS, mantém texto
|
142 |
+
if "QUAL" in nome or nome.endswith("UR") or nome.endswith("EAS"):
|
143 |
+
resultados[nome] = raw
|
144 |
+
else:
|
145 |
+
resultados[nome] = classificar(nome, raw.replace(",", "."))
|
146 |
+
|
147 |
+
# Linhas EAS e principais
|
148 |
+
eas_fields = [f"{k}: {resultados[k]}" for k in ordem if k in resultados and (k.endswith("UR") or k.endswith("EAS"))]
|
149 |
+
main_fields = [f"{r}: {resultados[r]}" for r in ordem if r in resultados and not (r.endswith("UR") or r.endswith("EAS"))]
|
150 |
+
line_eas = f"🟤 EAS → {' / '.join(eas_fields)}" if eas_fields else ""
|
151 |
+
line_main = ' / '.join(main_fields)
|
152 |
+
final = '\n'.join([l for l in (line_eas, line_main) if l])
|
153 |
+
|
154 |
+
# CSV
|
155 |
+
df = pd.DataFrame([[k, resultados[k]] for k in resultados], columns=["Exame","Valor"])
|
156 |
+
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv")
|
157 |
+
df.to_csv(tmp.name, index=False)
|
158 |
+
return final, tmp.name
|
159 |
+
|
160 |
+
# Gradio UI
|
161 |
+
with gr.Blocks() as demo:
|
162 |
+
gr.Markdown("## 🧪 Extrator Avançado com OCR + EAS + Troponina (Quant. e Qual.)")
|
163 |
+
pdf_input = gr.File(file_types=[".pdf"], label="📄 PDF de exames")
|
164 |
+
btn = gr.Button("🔍 Extrair")
|
165 |
+
out_txt = gr.Textbox(lines=15, label="📋 Resultados")
|
166 |
+
dl = gr.File(label="📥 Baixar CSV")
|
167 |
+
btn.click(extrair_exames_formatado, inputs=pdf_input, outputs=[out_txt, dl])
|
168 |
+
|
169 |
+
if __name__ == "__main__":
|
170 |
+
demo.launch()
|