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CHANGED
@@ -28,18 +28,11 @@ faixas = {
|
|
28 |
"TROPONINA": (0, 0.5)
|
29 |
}
|
30 |
|
31 |
-
# Chaves relativas à seção EAS
|
32 |
-
EAS_KEYS = [
|
33 |
-
"PROTEINA UR","GLI UR","CETONAS UR","SANGUE UR",
|
34 |
-
"LEUC ESTERASE","NITRITO UR","LEUCO EAS","HEMA EAS","BACTERIAS UR"
|
35 |
-
]
|
36 |
-
|
37 |
def classificar(nome, valor):
|
38 |
-
"""Anexa ↓/↑ se fora da faixa."""
|
39 |
try:
|
40 |
v = float(valor.replace(">", "").replace("<", "").strip())
|
41 |
-
|
42 |
-
|
43 |
if v < lo: return f"{valor} ↓"
|
44 |
if v > hi: return f"{valor} ↑"
|
45 |
return valor
|
@@ -54,12 +47,9 @@ def melhorar_imagem(img: Image.Image) -> Image.Image:
|
|
54 |
|
55 |
# Extrai texto nativo + OCR
|
56 |
def extrair_texto_pdf(pdf_input):
|
57 |
-
if isinstance(pdf_input, dict):
|
58 |
-
|
59 |
-
|
60 |
-
pdf_path = pdf_input.name
|
61 |
-
else:
|
62 |
-
pdf_path = str(pdf_input)
|
63 |
|
64 |
texto_nativo, ocr_imgs = [], []
|
65 |
with fitz.open(pdf_path) as doc:
|
@@ -68,7 +58,7 @@ def extrair_texto_pdf(pdf_input):
|
|
68 |
pix = page.get_pixmap(dpi=300)
|
69 |
img = Image.open(io.BytesIO(pix.tobytes("png")))
|
70 |
ocr_imgs.append(melhorar_imagem(img))
|
71 |
-
tn = re.sub(r"\s+", " ", "
|
72 |
tocr = re.sub(r"\s+", " ", " ".join(pytesseract.image_to_string(im) for im in ocr_imgs))
|
73 |
return tn, tocr
|
74 |
|
@@ -110,66 +100,60 @@ exames = {
|
|
110 |
"TROPONINA": r"troponina(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([>\d.,]+)",
|
111 |
"TROPONINA QUAL": r"troponina qualitativa.*?resultado[:\s]*(positivo|negativo)",
|
112 |
# EAS completo (Urina)
|
113 |
-
"PROTEINA UR": r"prote[ií]na\s*([A-Za-z
|
114 |
-
"GLI UR": r"glicose\s*([A-Za-z
|
115 |
-
"CETONAS UR": r"corpos cet[oô]nicos.*?([A-Za-z
|
116 |
-
"SANGUE UR": r"sangue\s*
|
117 |
-
"LEUC ESTERASE": r"leuc[óo]
|
118 |
-
"NITRITO UR": r"nitrito\s*(
|
119 |
-
"LEUCO EAS": r"leuc[óo]citos?\s*([\d]+[
|
120 |
-
"HEMA EAS": r"hem[áa]cias?\s*([\d]+[
|
121 |
-
"BACTERIAS UR": r"bact[ée]rias?\s*([A-Za-z
|
122 |
}
|
123 |
|
124 |
-
# Ordem para exibição
|
125 |
ordem = [
|
126 |
"LEUCO","B","SS","EOS","LINF","MONO",
|
127 |
"HB","HT","PLT","AMIL","BT","BD","BI",
|
128 |
"CR","UREIA","FAL","GGT","TGO","TGP","GLI","LIP","MG++",
|
129 |
"PCR","CKMB","CPK","TROPONINA","TROPONINA QUAL",
|
130 |
-
"TAP","INR","TTP","DIMERO D",
|
131 |
# EAS
|
132 |
-
|
133 |
]
|
134 |
|
135 |
# Montagem do texto formatado
|
136 |
-
def extrair_exames_formatado(pdf_file):
|
137 |
-
if not pdf_file:
|
138 |
-
return "Nenhum arquivo enviado.", None
|
139 |
tn, tocr = extrair_texto_pdf(pdf_file)
|
140 |
texto = (tn + " " + tocr).lower()
|
141 |
resultados = {}
|
142 |
-
# extrai todos os campos
|
143 |
for nome, pat in exames.items():
|
144 |
m = re.search(pat, texto, re.IGNORECASE)
|
145 |
-
if m:
|
146 |
-
|
147 |
-
|
148 |
-
|
149 |
-
|
150 |
-
if
|
151 |
-
|
152 |
-
|
153 |
-
|
154 |
-
|
155 |
-
|
156 |
-
line_eas = f"🟤 EAS → {' / '.join(eas_fields)}" if eas_fields else ""
|
157 |
-
line_main = ' / '.join(main_fields)
|
158 |
-
final = '\n'.join([l for l in (line_eas, line_main) if l]).upper()
|
159 |
# CSV
|
160 |
-
df = pd.DataFrame([[k, resultados
|
161 |
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv")
|
162 |
df.to_csv(tmp.name, index=False)
|
163 |
return final, tmp.name
|
164 |
|
165 |
# Gradio UI
|
166 |
with gr.Blocks() as demo:
|
167 |
-
gr.Markdown("## 🧪 Extrator Avançado com OCR + EAS +
|
168 |
pdf_input = gr.File(file_types=[".pdf"], label="📄 PDF de exames")
|
169 |
btn = gr.Button("🔍 Extrair")
|
170 |
-
out_txt = gr.Textbox(lines=15, label="📋
|
171 |
dl = gr.File(label="📥 Baixar CSV")
|
172 |
-
btn.click(extrair_exames_formatado, inputs=
|
173 |
|
174 |
if __name__ == "__main__":
|
175 |
demo.launch()
|
|
|
28 |
"TROPONINA": (0, 0.5)
|
29 |
}
|
30 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
31 |
def classificar(nome, valor):
|
|
|
32 |
try:
|
33 |
v = float(valor.replace(">", "").replace("<", "").strip())
|
34 |
+
if nome in faixas:
|
35 |
+
lo, hi = faixas[nome]
|
36 |
if v < lo: return f"{valor} ↓"
|
37 |
if v > hi: return f"{valor} ↑"
|
38 |
return valor
|
|
|
47 |
|
48 |
# Extrai texto nativo + OCR
|
49 |
def extrair_texto_pdf(pdf_input):
|
50 |
+
if isinstance(pdf_input, dict): pdf_path = pdf_input.get("name") or pdf_input.get("file_path")
|
51 |
+
elif hasattr(pdf_input, "name") and isinstance(pdf_input.name, str): pdf_path = pdf_input.name
|
52 |
+
else: pdf_path = str(pdf_input)
|
|
|
|
|
|
|
53 |
|
54 |
texto_nativo, ocr_imgs = [], []
|
55 |
with fitz.open(pdf_path) as doc:
|
|
|
58 |
pix = page.get_pixmap(dpi=300)
|
59 |
img = Image.open(io.BytesIO(pix.tobytes("png")))
|
60 |
ocr_imgs.append(melhorar_imagem(img))
|
61 |
+
tn = re.sub(r"\s+", " ", "".join(texto_nativo))
|
62 |
tocr = re.sub(r"\s+", " ", " ".join(pytesseract.image_to_string(im) for im in ocr_imgs))
|
63 |
return tn, tocr
|
64 |
|
|
|
100 |
"TROPONINA": r"troponina(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([>\d.,]+)",
|
101 |
"TROPONINA QUAL": r"troponina qualitativa.*?resultado[:\s]*(positivo|negativo)",
|
102 |
# EAS completo (Urina)
|
103 |
+
"PROTEINA UR": r"prote[ií]na\s*(ausente|[A-Za-z]+)",
|
104 |
+
"GLI UR": r"glicose\s*(ausente|[A-Za-z]+)",
|
105 |
+
"CETONAS UR": r"corpos cet[oô]nicos.*?(ausente|[A-Za-z]+)",
|
106 |
+
"SANGUE UR": r"sangue\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
107 |
+
"LEUC ESTERASE": r"leuc[óo]cito esterase\s*[:\-]?\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
108 |
+
"NITRITO UR": r"nitrito\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
109 |
+
"LEUCO EAS": r"leuc[óo]citos?\s*([\d]+[-\/–][\d]+)",
|
110 |
+
"HEMA EAS": r"hem[áa]cias?\s*([\d]+[-\/–][\d]+)",
|
111 |
+
"BACTERIAS UR": r"bact[ée]rias?\s*(raras|ausentes|[A-Za-z]+)"
|
112 |
}
|
113 |
|
|
|
114 |
ordem = [
|
115 |
"LEUCO","B","SS","EOS","LINF","MONO",
|
116 |
"HB","HT","PLT","AMIL","BT","BD","BI",
|
117 |
"CR","UREIA","FAL","GGT","TGO","TGP","GLI","LIP","MG++",
|
118 |
"PCR","CKMB","CPK","TROPONINA","TROPONINA QUAL",
|
119 |
+
"TAP","INR","TTP","DIMERO D",
|
120 |
# EAS
|
121 |
+
"PROTEINA UR","GLI UR","CETONAS UR","SANGUE UR","LEUC ESTERASE","NITRITO UR","LEUCO EAS","HEMA EAS","BACTERIAS UR"
|
122 |
]
|
123 |
|
124 |
# Montagem do texto formatado
|
125 |
+
def extrair_exames_formatado(pdf_file):
|
126 |
+
if not pdf_file: return "Nenhum arquivo enviado.", None
|
|
|
127 |
tn, tocr = extrair_texto_pdf(pdf_file)
|
128 |
texto = (tn + " " + tocr).lower()
|
129 |
resultados = {}
|
|
|
130 |
for nome, pat in exames.items():
|
131 |
m = re.search(pat, texto, re.IGNORECASE)
|
132 |
+
if not m: continue
|
133 |
+
raw = m.group(1).strip().upper()
|
134 |
+
resultados[nome] = raw if "QUAL" in nome or nome.endswith("UR") else classificar(nome, raw.replace(",", "."))
|
135 |
+
|
136 |
+
# Linhas EAS e gerais
|
137 |
+
eas_fields = [f"{k}: {resultados[k]}" for k in ordem if k in resultados and k.endswith(('UR','EAS'))]
|
138 |
+
main_fields = [f"{r}: {resultados[r]}" for r in ordem if r in resultados and not r.endswith(('UR','EAS'))]
|
139 |
+
line_eas = f"🟤 EAS → {' / '.join(eas_fields).upper()}" if eas_fields else ""
|
140 |
+
line_main = ' / '.join(main_fields).upper()
|
141 |
+
final = '\n'.join([l for l in (line_eas, line_main) if l])
|
142 |
+
|
|
|
|
|
|
|
143 |
# CSV
|
144 |
+
df = pd.DataFrame([[k, exames and resultados.get(k, '')] for k in resultados], columns=["Exame","Valor"])
|
145 |
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv")
|
146 |
df.to_csv(tmp.name, index=False)
|
147 |
return final, tmp.name
|
148 |
|
149 |
# Gradio UI
|
150 |
with gr.Blocks() as demo:
|
151 |
+
gr.Markdown("## 🧪 Extrator Avançado com OCR + EAS + Troponina (Quant. e Qual.)")
|
152 |
pdf_input = gr.File(file_types=[".pdf"], label="📄 PDF de exames")
|
153 |
btn = gr.Button("🔍 Extrair")
|
154 |
+
out_txt = gr.Textbox(lines=15, label="📋 Resultados")
|
155 |
dl = gr.File(label="📥 Baixar CSV")
|
156 |
+
btn.click(extrair_exames_formatado, inputs=pdf_input, outputs=[out_txt, dl])
|
157 |
|
158 |
if __name__ == "__main__":
|
159 |
demo.launch()
|