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app and requeriments

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  1. app.py +105 -0
  2. requeriments.txt +5 -0
app.py ADDED
@@ -0,0 +1,105 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ import streamlit as st
2
+ from PIL import Image
3
+ import numpy as np
4
+ import cv2
5
+ from huggingface_hub import from_pretrained_keras
6
+
7
+ st.header("Segmentaci贸n de dientes con rayos X")
8
+
9
+ st.subheader("Este es una iteraci贸n para bucar mejorar el demo")
10
+
11
+ st.markdown(
12
+ """
13
+ Este es un demo prueba para identificaci贸n de dientes en un archivo de rayos X!
14
+ """
15
+ )
16
+
17
+ ## Seleccionamos y cargamos el modelo
18
+ model_id = "SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net"
19
+ model = from_pretrained_keras(model_id)
20
+
21
+ ## Permitimos a la usuaria cargar una imagen
22
+ archivo_imagen = st.file_uploader("Sube aqu铆 tu imagen.", type=["png", "jpg", "jpeg"])
23
+
24
+ ## Si una imagen tiene m谩s de un canal entonces se convierte a escala de grises (1 canal)
25
+ def convertir_one_channel(img):
26
+ if len(img.shape) > 2:
27
+ img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
28
+ return img
29
+ else:
30
+ return img
31
+
32
+
33
+ def convertir_rgb(img):
34
+ if len(img.shape) == 2:
35
+ img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2RGB)
36
+ return img
37
+ else:
38
+ return img
39
+
40
+
41
+ ## Manipularemos la interfaz para que podamos usar im谩genes ejemplo
42
+ ## Si el usuario da click en un ejemplo entonces el modelo correr谩 con 茅l
43
+ ejemplos = ["dientes_1.png", "dientes_2.png", "dientes_3.png"]
44
+
45
+ ## Creamos tres columnas; en cada una estar谩 una imagen ejemplo
46
+ col1, col2, col3 = st.columns(3)
47
+ with col1:
48
+ ## Se carga la imagen y se muestra en la interfaz
49
+ ex = Image.open(ejemplos[0])
50
+ st.image(ex, width=200)
51
+ ## Si oprime el bot贸n entonces usaremos ese ejemplo en el modelo
52
+ if st.button("Corre este ejemplo 1"):
53
+ archivo_imagen = ejemplos[0]
54
+
55
+ with col2:
56
+ ex1 = Image.open(ejemplos[1])
57
+ st.image(ex1, width=200)
58
+ if st.button("Corre este ejemplo 2"):
59
+ archivo_imagen = ejemplos[1]
60
+
61
+ with col3:
62
+ ex2 = Image.open(ejemplos[2])
63
+ st.image(ex2, width=200)
64
+ if st.button("Corre este ejemplo 3"):
65
+ archivo_imagen = ejemplos[2]
66
+
67
+ ## Si tenemos una imagen para ingresar en el modelo entonces
68
+ ## la procesamos e ingresamos al modelo
69
+ if archivo_imagen is not None:
70
+ ## Cargamos la imagen con PIL, la mostramos y la convertimos a un array de NumPy
71
+ img = Image.open(archivo_imagen)
72
+ st.image(img, width=850)
73
+ img = np.asarray(img)
74
+
75
+ ## Procesamos la imagen para ingresarla al modelo
76
+ img_cv = convertir_one_channel(img)
77
+ img_cv = cv2.resize(img_cv, (512, 512), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4)
78
+ img_cv = np.float32(img_cv / 255)
79
+ img_cv = np.reshape(img_cv, (1, 512, 512, 1))
80
+
81
+ ## Ingresamos el array de NumPy al modelo
82
+ predicted = model.predict(img_cv)
83
+ predicted = predicted[0]
84
+
85
+ ## Regresamos la imagen a su forma original y agregamos las m谩scaras de la segmentaci贸n
86
+ predicted = cv2.resize(
87
+ predicted, (img.shape[1], img.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4
88
+ )
89
+ mask = np.uint8(predicted * 255) #
90
+ _, mask = cv2.threshold(
91
+ mask, thresh=0, maxval=255, type=cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU
92
+ )
93
+ kernel = np.ones((5, 5), dtype=np.float32)
94
+ mask = cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_OPEN, kernel, iterations=1)
95
+ mask = cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_CLOSE, kernel, iterations=1)
96
+ cnts, hieararch = cv2.findContours(mask, cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
97
+ output = cv2.drawContours(convertir_one_channel(img), cnts, -1, (255, 0, 0), 3)
98
+
99
+ ## Si obtuvimos exitosamente un resultadod entonces lo mostramos en la interfaz
100
+ if output is not None:
101
+ st.subheader("Segmentaci贸n:")
102
+ st.write(output.shape)
103
+ st.image(output, width=850)
104
+
105
+ st.markdown("Gracias por usar nuestro demo! Nos vemos pronto")
requeriments.txt ADDED
@@ -0,0 +1,5 @@
 
 
 
 
 
 
1
+ numpy
2
+ Pillow
3
+ scipy
4
+ opencv-python
5
+ tensorflow