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  1. app.py +361 -0
  2. model.pkl +3 -0
  3. requirements.txt.txt +8 -0
app.py ADDED
@@ -0,0 +1,361 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ import streamlit as st
2
+ from streamlit_option_menu import option_menu
3
+ import pandas as pd
4
+ import pickle
5
+ import lime
6
+ import lime.lime_tabular
7
+ import streamlit.components.v1 as components
8
+ from PIL import Image
9
+ import seaborn as sns
10
+ import matplotlib.pyplot as plt
11
+ from datetime import datetime
12
+
13
+ # 1=sidebar menu, 2=horizontal menu, 3=horizontal menu w/ custom menu
14
+ EXAMPLE_NO = 3
15
+ st.set_page_config(layout='wide')
16
+ st.markdown("""
17
+ <style>
18
+ .block-container {
19
+ padding-top: 4rem;
20
+ padding-bottom: 0rem;
21
+ padding-left: 4rem;
22
+ padding-right: 4rem;
23
+ }
24
+ </style>
25
+ """, unsafe_allow_html=True)
26
+
27
+ def streamlit_menu(example=1):
28
+ if example == 1:
29
+ # 1. as sidebar menu
30
+ with st.sidebar:
31
+ selected = option_menu(
32
+ menu_title="Main Menu", # required
33
+ options=["Acceuil", "Statistique", "Prédiction", "Suivi"], # required
34
+ icons=["house", "book", "envelope", "clipboard-data"], # optional
35
+ menu_icon="cast", # optional
36
+ default_index=0, # optional
37
+ )
38
+ return selected
39
+
40
+ if example == 2:
41
+ # 2. horizontal menu w/o custom style
42
+ selected = option_menu(
43
+ menu_title=None, # required
44
+ options=["Acceuil", "Statistique", "Prédiction", "Suivi"], # required
45
+ icons=["house", "bar-chart", "activity", "clipboard"], # optional
46
+ menu_icon="cast", # optional
47
+ default_index=0, # optional
48
+ orientation="horizontal",
49
+ )
50
+ return selected
51
+
52
+ if example == 3:
53
+ # 2. horizontal menu with custom style
54
+ selected = option_menu(
55
+ menu_title=None, # required
56
+ options=["Acceuil", "Statistique", "Prédiction", "Suivi"], # required
57
+ icons=["house", "bar-chart", "activity", "clipboard"], # optional
58
+ menu_icon="cast", # optional
59
+ default_index=0, # optional
60
+ orientation="horizontal",
61
+ styles={
62
+ "container": {"padding": "0!important", "background-color": "#fafafa"},
63
+ "icon": {"color": "orange", "font-size": "25px"},
64
+ "nav-link": {
65
+ "font-size": "25px",
66
+ "text-align": "left",
67
+ "margin": "0px",
68
+ "--hover-color": "#eee",
69
+ },
70
+ "nav-link-selected": {"background-color": "skyblue"},
71
+ },
72
+ )
73
+ return selected
74
+
75
+
76
+ selected = streamlit_menu(example=EXAMPLE_NO)
77
+
78
+ if selected == "Prédiction":
79
+ # st.title(f"You have selected {selected}")
80
+ # Load your trained model
81
+ with open('model.pkl', 'rb') as file:
82
+ model = pickle.load(file)
83
+
84
+ obesity_mapping = {
85
+ 0: 'Normal',
86
+ 1: 'Surpoid\Obése'
87
+ }
88
+ # Define the input features for the user to input
89
+ def user_input_features():
90
+ age = st.number_input('Age:',min_value=8, max_value=19, value=19, step=1, format="%d")
91
+ classe = st.radio('Classe_', ('Primaire','Secondaire'))
92
+ Zone = st.radio('zone', ('Rurale', 'Urbaine'))
93
+ Voler = st.radio('Voler', ('Oui', 'Non'))
94
+ Diversité = st.radio('Diversité', ('Mauvaise', 'Bonne'))
95
+ Region = st.selectbox(
96
+ 'Region de ',
97
+ ('Nord_ouest' ,'Sud_ouest', 'Ouest')
98
+ )
99
+ Source_eau=st.selectbox(
100
+ 'Provenence ',
101
+ ('Camwater','Eau_de_surface','forage','Puits','Eau_minérale')
102
+ )
103
+ Sexe = st.radio('Genre', ('F', 'M'))
104
+
105
+
106
+ Zone = 1 if Zone == 'Rurale' else 0
107
+ classe = 1 if classe == 'Primaire' else 0
108
+ Diversité = 1 if Diversité == 'Mauvaise' else 0
109
+ Region = ['Nord_ouest' ,'Sud_ouest', 'Ouest'].index(Region)
110
+ Source_eau=['Camwater','Eau_de_surface','forage','Puits','Eau_minérale'].index(Source_eau)
111
+ sex_f = 1 if Sexe == 'F' else 0
112
+ sex_m = 1 if Sexe == 'M' else 0
113
+
114
+ data = {
115
+ 'Region': Region,
116
+ 'Zone': Zone,
117
+ 'Classe': classe,
118
+ 'Age': age,
119
+ 'Diversité': Diversité,
120
+ 'Voler': Voler,
121
+ 'Source_eau':Source_eau,
122
+ 'Genre_F': sex_f,
123
+ 'Genre_M': sex_m
124
+ }
125
+ features = pd.DataFrame(data, index=[0])
126
+ return features
127
+
128
+ # st.title('Obesity App')
129
+
130
+ # Display the input fields
131
+ input_df = user_input_features()
132
+ # Convertir toutes les colonnes non numériques en numérique si possible
133
+ input_df = input_df.apply(pd.to_numeric, errors='coerce')
134
+
135
+ # Remplacer les NaN par une valeur arbitraire (par exemple 0) si nécessaire
136
+ input_df = input_df.fillna(0)
137
+
138
+ # Initialiser LIME
139
+ explainer = lime.lime_tabular.LimeTabularExplainer(
140
+ training_data=input_df.values, # Entraînement sur la base des données d'entrée
141
+ feature_names=input_df.columns,
142
+ class_names=[obesity_mapping[0], obesity_mapping[1]],
143
+ mode='classification'
144
+ )
145
+
146
+ # Predict button
147
+ if st.button('Predict'):
148
+ # Make a prediction
149
+ prediction = model.predict(input_df)
150
+ prediction_proba = model.predict_proba(input_df)[0]
151
+
152
+ data = {
153
+ 'Statut nutritionnel': [obesity_mapping[i] for i in range(len(prediction_proba))],
154
+ 'Probabilité': prediction_proba
155
+ }
156
+
157
+ # Create a dataframe to display the results
158
+ result_df = pd.DataFrame(data)
159
+
160
+ # Transpose the dataframe to have obesity types as columns and add a row header
161
+ result_df = result_df.T
162
+ result_df.columns = result_df.iloc[0]
163
+ result_df = result_df.drop(result_df.index[0])
164
+ result_df.index = ['Probability']
165
+
166
+ # Display the results in a table with proper formatting
167
+ st.table(result_df.style.format("{:.4f}"))
168
+ # Générer l'explication LIME pour l'individu
169
+ # exp = explainer.explain_instance(input_df.values[0], model.predict_proba, num_features=5)
170
+
171
+ # # Afficher les explications dans Streamlit
172
+ # st.subheader('Explication LIME')
173
+ # exp.show_in_notebook(show_table=True, show_all=False)
174
+ # st.write(exp.as_list())
175
+ # Générer l'explication LIME pour l'individu
176
+ exp = explainer.explain_instance(input_df.values[0], model.predict_proba, num_features=4)
177
+
178
+ # Récupérer l'explication LIME sous forme HTML
179
+ explanation_html = exp.as_html()
180
+
181
+ # Afficher l'explication LIME dans Streamlit
182
+ st.subheader('Explication LIME')
183
+
184
+ # Utiliser Streamlit pour afficher du HTML
185
+ components.html(explanation_html, height=800) # Ajuster la hauteur selon le contenu
186
+
187
+
188
+
189
+ if selected == "Acceuil":
190
+ avant_propos = """
191
+ <div style="background-color: white; padding: 20px; border-radius: 10px;
192
+ display: flex; justify-content: center; align-items: center;
193
+ width: 800px; height: auto; margin: auto; flex-direction: column;
194
+ box-shadow: 0px 0px 10px rgba(0, 0, 0, 0.1);">
195
+ <h2 style="color: blue; text-align: center; font-size: 24px;">Avant-propos</h2>
196
+ <p style="color: blue; text-align: center; font-size: 16px;">
197
+ L'obésité est l'une des principales préoccupations de santé publique à travers le monde, avec des répercussions notables sur la qualité de vie et les coûts des soins de santé.
198
+ Dans un contexte où les maladies chroniques liées à l'obésité, telles que le diabète et les maladies cardiovasculaires, continuent de croître, il est impératif de développer des outils capables de prédire et de prévenir cette condition.
199
+ </p>
200
+ <p style="color: blue; text-align: center; font-size: 16px;">
201
+ L'application que nous présentons ici repose sur les technologies modernes de <strong>machine learning</strong> pour prédire le risque d'obésité à partir de divers facteurs liés au mode de vie,
202
+ aux habitudes alimentaires et aux caractéristiques individuelles. Cette solution, développée à l'aide de <strong>Streamlit</strong>, permet non seulement d'offrir une interface intuitive et accessible,
203
+ mais également d'analyser rapidement et précisément les données des utilisateurs afin d'anticiper les risques associés au surpoids.
204
+ </p>
205
+ <p style="color: blue; text-align: center; font-size: 16px;">
206
+ L'objectif principal de cette application est de fournir une aide à la décision pour les professionnels de santé, les chercheurs, et même les utilisateurs individuels
207
+ qui souhaitent comprendre et gérer leur risque personnel. En quelques clics, les utilisateurs peuvent explorer les facteurs influents et recevoir des prévisions basées sur des algorithmes avancés d'apprentissage automatique.
208
+ </p>
209
+ <p style="color: blue; text-align: center; font-size: 16px;">
210
+ Cette application permet aussi de faire un suivi personnalisé sur l'indice de masse corporelle, precisement de
211
+ son statut nutritionnel.
212
+ </p>
213
+ </div>
214
+ """
215
+
216
+ # Afficher le texte stylisé en bleu et centré sur un fond blanc
217
+ st.markdown(avant_propos, unsafe_allow_html=True)
218
+ # Ajouter un bouton qui redirige vers un site externe
219
+ url = "https://www.who.int/fr/news-room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight" # Remplacez par l'URL souhaitée
220
+ if st.button("pour plus d'informations"):
221
+ st.write(f"[Cliquez ici pour visiter le site]({url})")
222
+ if selected == "Statistique":
223
+ # Ouvrir l'image avec Pillow
224
+ #image = Image.open("az.JPEG")
225
+
226
+ # Redimensionner l'image (largeur, hauteur)
227
+ #image = image.resize((300, 200)) # Par exemple, 300x200 pixels
228
+
229
+ # Afficher l'image redimensionnée
230
+ #st.image(image, caption="Image redimensionnée", use_column_width=False)
231
+ # Titre de l'application
232
+ st.title("Visualisation des données avec Seaborn et Pandas")
233
+
234
+ # Charger le fichier CSV
235
+ uploaded_file = st.file_uploader("Choisissez un fichier", type=["csv", "xlsx", "json"])
236
+
237
+ if uploaded_file is not None:
238
+ # Lecture du fichier CSV
239
+ file_extension = uploaded_file.name.split('.')[-1]
240
+ if file_extension == 'csv':
241
+ # Lecture du fichier CSV
242
+ df = pd.read_csv(uploaded_file)
243
+ elif file_extension == 'xlsx':
244
+ # Lecture du fichier Excel
245
+ df = pd.read_excel(uploaded_file)
246
+ elif file_extension == 'json':
247
+ # Lecture du fichier JSON
248
+ df = pd.read_json(uploaded_file)
249
+ else:
250
+ st.error("Format de fichier non supporté!")
251
+
252
+
253
+ # Afficher le dataframe
254
+ st.write("Aperçu du dataset :")
255
+ st.write(df.head())
256
+
257
+ # Afficher les statistiques descriptives
258
+ st.write("Statistiques descriptives :")
259
+ st.write(df.describe())
260
+
261
+ # Sélection des variables pour les visualisations
262
+ numerical_columns = df.select_dtypes(include=['float64', 'int64']).columns.tolist()
263
+ categorical_columns = df.select_dtypes(include=['object', 'category']).columns.tolist()
264
+
265
+ # Distribution d'une variable
266
+ st.subheader("Distribution d'une variable numérique")
267
+ selected_column = st.selectbox("Choisissez une variable numérique", numerical_columns)
268
+ if st.button("Afficher la distribution"):
269
+ fig, ax = plt.subplots(figsize=(5, 6))
270
+ sns.histplot(df[selected_column], kde=True, ax=ax)
271
+ st.pyplot(fig)
272
+
273
+ # Scatter plot
274
+ st.subheader("Scatter Plot entre deux variables numériques")
275
+ x_axis = st.selectbox("Choisissez la variable pour l'axe X", numerical_columns)
276
+ y_axis = st.selectbox("Choisissez la variable pour l'axe Y", numerical_columns, key='scatter')
277
+ if st.button("Afficher le scatter plot"):
278
+ fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))
279
+ sns.scatterplot(x=df[x_axis], y=df[y_axis], ax=ax)
280
+ st.pyplot(fig)
281
+
282
+ # Boxplot
283
+ st.subheader("Boxplot d'une variable numérique par rapport à une variable catégorielle")
284
+ selected_categorical = st.selectbox("Choisissez une variable catégorielle", categorical_columns)
285
+ selected_numerical = st.selectbox("Choisissez une variable numérique", numerical_columns, key='boxplot')
286
+ if st.button("Afficher le boxplot"):
287
+ fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))
288
+ sns.boxplot(x=df[selected_categorical], y=df[selected_numerical], ax=ax)
289
+ st.pyplot(fig)
290
+
291
+ if selected == "Suivi":
292
+ # Charger ou initialiser les données de suivi
293
+ def load_data():
294
+ try:
295
+ data = pd.read_csv('imc_data.csv')
296
+ except FileNotFoundError:
297
+ data = pd.DataFrame(columns=['Date', 'Weight', 'Height', 'BMI', 'Status'])
298
+ return data
299
+
300
+ def save_data(data):
301
+ data.to_csv('imc_data.csv', index=False)
302
+
303
+ # Calculer l'IMC et le statut nutritionnel
304
+ def calculate_bmi(weight, height):
305
+ return weight / (height ** 2)
306
+
307
+ def get_nutritional_status(bmi):
308
+ if bmi < 18.5:
309
+ return "Insuffisance pondérale"
310
+ elif 18.5 <= bmi < 25:
311
+ return "Poids normal"
312
+ elif 25 <= bmi < 30:
313
+ return "Surpoids"
314
+ else:
315
+ return "Obésité"
316
+
317
+ # Interface utilisateur Streamlit
318
+ st.title("Suivi de l'IMC et du Statut Nutritionnel")
319
+
320
+ # Collecte des données utilisateur
321
+ weight = st.number_input("Poids (en kg)", min_value=30.0, max_value=200.0, value=70.0)
322
+ height = st.number_input("Taille (en mètres)", min_value=1.0, max_value=2.5, value=1.75)
323
+
324
+ # Calculer l'IMC et le statut nutritionnel
325
+ if height > 0:
326
+ bmi = calculate_bmi(weight, height)
327
+ status = get_nutritional_status(bmi)
328
+ st.write(f"Votre IMC est : {bmi:.2f}")
329
+ st.write(f"Statut nutritionnel : {status}")
330
+
331
+ # Charger et mettre à jour les données de suivi
332
+ data = load_data()
333
+ if st.button("Enregistrer vos données"):
334
+ new_entry = pd.DataFrame({
335
+ 'Date': [datetime.now().strftime("%Y-%m-%d %H:%M:%S")],
336
+ 'Weight': [weight],
337
+ 'Height': [height],
338
+ 'BMI': [bmi],
339
+ 'Status': [status]
340
+ })
341
+ data = pd.concat([data, new_entry], ignore_index=True)
342
+ save_data(data)
343
+ st.success("Vos données ont été enregistrées avec succès !")
344
+
345
+ # Afficher l'évolution de l'IMC
346
+ if not data.empty:
347
+ st.subheader("Évolution de votre IMC")
348
+ data['Date'] = pd.to_datetime(data['Date'])
349
+ plt.figure(figsize=(10, 6))
350
+ plt.plot(data['Date'], data['BMI'], marker='o')
351
+ plt.title("Évolution de l'IMC")
352
+ plt.xlabel("Date")
353
+ plt.ylabel("IMC")
354
+ plt.grid(True)
355
+ st.pyplot(plt)
356
+
357
+ # Afficher l'historique des données soumises
358
+ st.subheader("Historique des données soumises")
359
+ st.dataframe(data[['Date', 'Weight', 'Height', 'BMI', 'Status']])
360
+ else:
361
+ st.warning("Veuillez entrer une taille valide pour calculer l'IMC.")
model.pkl ADDED
@@ -0,0 +1,3 @@
 
 
 
 
1
+ version https://git-lfs.github.com/spec/v1
2
+ oid sha256:28aa471b6ae23de5abe249cfe72e5bfe8240d72e942feeacb56980d1aed7020c
3
+ size 335533
requirements.txt.txt ADDED
@@ -0,0 +1,8 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ streamlit==1.25.0
2
+ streamlit-option-menu==0.3.2
3
+ pandas==2.1.1
4
+ pickle5==0.0.12
5
+ lime==0.2.0.1
6
+ Pillow==9.2.0
7
+ seaborn==0.12.2
8
+ matplotlib==3.7.1