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Running
Running
drguilhermeapolinario
commited on
Update views/rag_med.py
Browse files- views/rag_med.py +264 -7
views/rag_med.py
CHANGED
@@ -1,7 +1,264 @@
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import
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1 |
+
import json
|
2 |
+
import os
|
3 |
+
|
4 |
+
import faiss
|
5 |
+
import numpy as np
|
6 |
+
import streamlit as st
|
7 |
+
from openai import OpenAI
|
8 |
+
from sentence_transformers import SentenceTransformer
|
9 |
+
|
10 |
+
from prompts_template import prompt
|
11 |
+
|
12 |
+
# Initialize the messages list in the session state
|
13 |
+
if "messages" not in st.session_state:
|
14 |
+
st.session_state.messages = []
|
15 |
+
|
16 |
+
STYLE = "static/style.css"
|
17 |
+
with open(STYLE, "r", encoding="utf-8") as f:
|
18 |
+
st.markdown(f"<style>{f.read()}</style>", unsafe_allow_html=True)
|
19 |
+
|
20 |
+
# STYLE = "static/styles.html"
|
21 |
+
# with open(STYLE, "r", encoding="utf-8") as f:
|
22 |
+
# st.markdown(f"<style>{f.read()}</style>", unsafe_allow_html=True)
|
23 |
+
|
24 |
+
client = OpenAI(api_key=os.environ['OPENAI_API'])
|
25 |
+
model = SentenceTransformer("all-MiniLM-L6-v2")
|
26 |
+
|
27 |
+
# índice FAISS
|
28 |
+
json_file = "scr/faiss/chunks .json"
|
29 |
+
embeddings_file = "scr/faiss/embeddings.npy"
|
30 |
+
index_file = "scr/faiss/faiss_index.index"
|
31 |
+
text_chunks_file = "scr/faiss/text_chunks.npy"
|
32 |
+
|
33 |
+
with open(json_file, "r") as file:
|
34 |
+
chunks = json.load(file)
|
35 |
+
|
36 |
+
embeddings = np.load(embeddings_file)
|
37 |
+
index = faiss.read_index(index_file)
|
38 |
+
text_chunks = np.load(text_chunks_file)
|
39 |
+
|
40 |
+
with st.sidebar:
|
41 |
+
openai_api_key = st.text_input(
|
42 |
+
"OpenAI API Key", key="chatbot_api_key", type="password"
|
43 |
+
)
|
44 |
+
st.markdown(
|
45 |
+
"[Pegue aqui sua chave OpenAI API](https://platform.openai.com/account/api-keys)"
|
46 |
+
)
|
47 |
+
if st.sidebar.button("Limpar Conversa"):
|
48 |
+
st.session_state.messages = []
|
49 |
+
st.rerun()
|
50 |
+
|
51 |
+
def retrieve(query, k=3):
|
52 |
+
"""
|
53 |
+
Retrieves the most similar document chunks to a given query.
|
54 |
+
"""
|
55 |
+
query_embedding = model.encode([query])
|
56 |
+
distances, indices = index.search(query_embedding, k)
|
57 |
+
return [chunks[idx] for idx in indices[0]]
|
58 |
+
|
59 |
+
|
60 |
+
def generate_response(query, context):
|
61 |
+
"""
|
62 |
+
Generates a response to a given query based on a provided context.
|
63 |
+
"""
|
64 |
+
prompt_query = (
|
65 |
+
f"Com base nos seguintes dados: {context}\n\nPergunta: {query}\n\nResposta:"
|
66 |
+
)
|
67 |
+
response = client.chat.completions.create(
|
68 |
+
model="gpt-4o-mini",
|
69 |
+
messages=[
|
70 |
+
{
|
71 |
+
"role":
|
72 |
+
"system",
|
73 |
+
"content":
|
74 |
+
"Você é um assistente especializado em análise de encaminhamentos médicos.",
|
75 |
+
},
|
76 |
+
{
|
77 |
+
"role": "user",
|
78 |
+
"content": prompt_query
|
79 |
+
},
|
80 |
+
],
|
81 |
+
)
|
82 |
+
return response.choices[0].message.content
|
83 |
+
|
84 |
+
co1, co2, co3 = st.columns([1.5, 0.4, 3])
|
85 |
+
with co1:
|
86 |
+
st.write('')
|
87 |
+
with co2:
|
88 |
+
st.image('icons/icon.svg', width=80)
|
89 |
+
|
90 |
+
with co3:
|
91 |
+
st.title("Encaminhamento Médico")
|
92 |
+
|
93 |
+
col1, col2, col3, col4, col5 = st.columns([1, 3, 0.5, 3, 1])
|
94 |
+
|
95 |
+
fem= 'icons/iconF.svg'
|
96 |
+
with col1:
|
97 |
+
st.write('')
|
98 |
+
|
99 |
+
with col2:
|
100 |
+
st.header(" :black_nib: Entrada de Dados")
|
101 |
+
st.markdown("#### ")
|
102 |
+
# Campos para preenchimento do relatório
|
103 |
+
cl1, cl2, cl3 = st.columns([2, 1, 2])
|
104 |
+
with cl1:
|
105 |
+
idade = st.text_input("###### IDADE", value="")
|
106 |
+
sexo_opcao = st.radio("Sexo", ("Masculino", "Feminino"),
|
107 |
+
index=0)
|
108 |
+
sexo = (sexo_opcao == "Masculino")
|
109 |
+
with cl2:
|
110 |
+
st.write("")
|
111 |
+
with cl3:
|
112 |
+
st.write("Condições")
|
113 |
+
has = st.checkbox("HAS", value=False)
|
114 |
+
dm = st.checkbox("DM TIPO 2", value=False)
|
115 |
+
tabaco = st.checkbox("TABAGISTA?", value=False)
|
116 |
+
alcool = st.checkbox("ALCOOLISTA?", value=False)
|
117 |
+
|
118 |
+
comorbidades = st.text_area("Outras Comorbidades e medicamentos em uso")
|
119 |
+
motivo = st.text_area("Motivo do Encaminhamento")
|
120 |
+
historia_clinica = st.text_area("História Clínica Resumida")
|
121 |
+
exame_fisico = st.text_area(
|
122 |
+
"Exame Físico Relevante",
|
123 |
+
"EF:\nBEG, hidratado, s/ edema\nAR: MVUA s/ RA | AC: RCR 2t bnf",
|
124 |
+
)
|
125 |
+
exames_complementares = st.text_area("Exames Complementares")
|
126 |
+
hipotese_diagnostica = st.text_input("Hipótese Diagnóstica")
|
127 |
+
justificativa = st.text_area("Justificativa do Encaminhamento")
|
128 |
+
|
129 |
+
# Prioridade
|
130 |
+
prioridade = st.selectbox("Prioridade",
|
131 |
+
["Selecione...", "P0", "P1", "P2", "P3"])
|
132 |
+
|
133 |
+
especialidades = [
|
134 |
+
"Cardiologia",
|
135 |
+
"Dermatologia",
|
136 |
+
"Endocrinologia",
|
137 |
+
"Gastroenterologia",
|
138 |
+
"Geriatria",
|
139 |
+
"Hematologia",
|
140 |
+
"Infectologia",
|
141 |
+
"Medicina de Família e Comunidade",
|
142 |
+
"Nefrologia",
|
143 |
+
"Neurologia",
|
144 |
+
"Obstetrícia",
|
145 |
+
"Oftalmologia",
|
146 |
+
"Oncologia",
|
147 |
+
"Ortopedia",
|
148 |
+
"Otorrinolaringologia",
|
149 |
+
"Pediatria",
|
150 |
+
"Pneumologia",
|
151 |
+
"Psiquiatria",
|
152 |
+
"Reumatologia",
|
153 |
+
"Urologia",
|
154 |
+
]
|
155 |
+
|
156 |
+
especialidade_selecionada = st.multiselect(
|
157 |
+
"Selecione a(s) Especialidade(s):", especialidades)
|
158 |
+
|
159 |
+
with col3:
|
160 |
+
st.write("")
|
161 |
+
|
162 |
+
with col4:
|
163 |
+
st.header(" 🤖 Relatório Gerado por IA ")
|
164 |
+
|
165 |
+
# Botão para gerar relatório
|
166 |
+
if st.button("Gerar Relatório"):
|
167 |
+
user_prompt = f"""
|
168 |
+
Relatório de Encaminhamento Médico
|
169 |
+
|
170 |
+
1. Identificação do Paciente
|
171 |
+
Idade: {idade}, {sexo}
|
172 |
+
|
173 |
+
2. Fatores de Risco e Comorbidades
|
174 |
+
HAS: {'Sim' if has else 'Não'}
|
175 |
+
DM TIPO 2: {'Sim' if dm else 'Não'}
|
176 |
+
TABAGISTA: {'Sim' if tabaco else 'Não'}
|
177 |
+
ALCOOLISTA: {'Sim' if alcool else 'Não'}
|
178 |
+
Outras Comorbidades e medicamentos em uso: {comorbidades}
|
179 |
+
|
180 |
+
3. Motivo do Encaminhamento
|
181 |
+
{motivo}
|
182 |
+
|
183 |
+
4. História Clínica Resumida
|
184 |
+
{historia_clinica}
|
185 |
+
|
186 |
+
5. Exame Físico Relevante
|
187 |
+
{exame_fisico}
|
188 |
+
|
189 |
+
6. Exames Complementares
|
190 |
+
{exames_complementares}
|
191 |
+
|
192 |
+
7. Hipótese Diagnóstica
|
193 |
+
{hipotese_diagnostica}
|
194 |
+
|
195 |
+
8. Justificativa do Encaminhamento
|
196 |
+
{justificativa}
|
197 |
+
|
198 |
+
9. Prioridade
|
199 |
+
{prioridade}
|
200 |
+
|
201 |
+
10. Especialidade(s) de Destino
|
202 |
+
{', '.join(especialidade_selecionada)}
|
203 |
+
|
204 |
+
Com base nessas informações, elabore um relatório de
|
205 |
+
encaminhamento médico conciso, mas informativo.
|
206 |
+
Certifique-se de:
|
207 |
+
|
208 |
+
1. Manter uma linguagem profissional e clara.
|
209 |
+
2. Destacar os pontos mais relevantes para a especialidade
|
210 |
+
de destino.
|
211 |
+
3. Incluir apenas informações pertinentes ao encaminhamento.
|
212 |
+
4. Justificar claramente a necessidade do encaminhamento e a
|
213 |
+
prioridade atribuída.
|
214 |
+
5. Limitar o relatório a no máximo 300 palavras.
|
215 |
+
|
216 |
+
Por favor, gere o relatório mantendo a estrutura fornecida,
|
217 |
+
mas adaptando o conteúdo para ser mais fluido e coeso.
|
218 |
+
"""
|
219 |
+
st.text_area("Prompt gerado:", user_prompt, height=600)
|
220 |
+
|
221 |
+
completion = client.chat.completions.create(
|
222 |
+
model="gpt-4o-mini",
|
223 |
+
messages=[{
|
224 |
+
"role": "system",
|
225 |
+
"content": prompt() + user_prompt
|
226 |
+
}],
|
227 |
+
temperature=0.4,
|
228 |
+
max_tokens=1500,
|
229 |
+
)
|
230 |
+
resposta = completion.choices[0].message.content
|
231 |
+
st.text_area("Resposta da IA:", resposta, height=800)
|
232 |
+
st.write(
|
233 |
+
"O relatório gerado pela IA será exibido aqui após o processamento dos dados inseridos."
|
234 |
+
)
|
235 |
+
|
236 |
+
#---------------------------------------------------------------
|
237 |
+
|
238 |
+
# Interface do chat
|
239 |
+
st.title("Chat Médico Baseado em Query")
|
240 |
+
|
241 |
+
# Exibe as mensagens já enviadas
|
242 |
+
for message in st.session_state.messages:
|
243 |
+
with st.chat_message(message["role"]):
|
244 |
+
st.markdown(message["content"])
|
245 |
+
|
246 |
+
# Campo de entrada de texto para o usuário
|
247 |
+
if prompt := st.chat_input("Digite sua pergunta"):
|
248 |
+
st.session_state.messages.append({"role": "user", "content": prompt})
|
249 |
+
with st.chat_message("user"):
|
250 |
+
st.markdown(prompt)
|
251 |
+
|
252 |
+
# Processa a query e gera a resposta
|
253 |
+
retrieved_context = retrieve(prompt)
|
254 |
+
response = generate_response(prompt, retrieved_context)
|
255 |
+
|
256 |
+
# Adiciona a resposta do bot
|
257 |
+
st.session_state.messages.append({
|
258 |
+
"role": "assistant",
|
259 |
+
"content": response
|
260 |
+
})
|
261 |
+
with st.chat_message("assistant"):
|
262 |
+
st.markdown(response)
|
263 |
+
with col5:
|
264 |
+
st.write('')
|