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  1. app.py +81 -46
app.py CHANGED
@@ -1,4 +1,4 @@
1
- import streamlit as st
2
  from PIL import Image
3
  import numpy as np
4
  import cv2
@@ -6,66 +6,101 @@ from huggingface_hub import from_pretrained_keras
6
 
7
  st.header("Segmentaci贸n de dientes con rayos X")
8
 
9
- st.subheader("Esta es una iteraci贸n de prueba para buscar mejorar el Demo")
10
-
11
- st.markdown('''
12
-
13
  Hola 馃殌. Este es un modelo de prueba como ejercicio de Platzi
14
 
15
  El modelo fue creado por [SerdarHelli](https://huggingface.co/SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net).
16
 
17
- ''')
 
18
 
 
19
  model_id = "SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net"
20
- model=from_pretrained_keras(model_id)
21
 
22
- ## Si una imagen tiene m谩s de un canal entonces se convierte a escala de grises (1 canal)
 
 
 
23
  def convertir_one_channel(img):
24
- if len(img.shape)>2:
25
- img= cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
26
  return img
27
  else:
28
  return img
29
-
 
30
  def convertir_rgb(img):
31
- if len(img.shape)==2:
32
- img= cv2.cvtColor(img,cv2.COLOR_GRAY2RGB)
33
  return img
34
  else:
35
  return img
36
 
37
-
38
- image_file = st.file_uploader("Sube aqu铆 tu imagen.", type=["png","jpg","jpeg"])
39
-
40
-
41
- if image_file is not None:
42
-
43
- img= Image.open(image_file)
44
-
45
- st.image(img,width=850)
46
-
47
- img=np.asarray(img)
48
-
49
- img_cv=convertir_one_channel(img)
50
- img_cv=cv2.resize(img_cv,(512,512), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4)
51
- img_cv=np.float32(img_cv/255)
52
-
53
- img_cv=np.reshape(img_cv,(1,512,512,1))
54
- prediction=model.predict(img_cv)
55
- predicted=prediction[0]
56
- predicted = cv2.resize(predicted, (img.shape[1],img.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4)
57
- mask=np.uint8(predicted*255)#
58
- _, mask = cv2.threshold(mask, thresh=0, maxval=255, type=cv2.THRESH_BINARY+cv2.THRESH_OTSU)
59
- kernel =( np.ones((5,5), dtype=np.float32))
60
- mask=cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_OPEN, kernel,iterations=1 )
61
- mask=cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_CLOSE, kernel,iterations=1 )
62
- cnts,hieararch=cv2.findContours(mask,cv2.RETR_TREE,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
63
- output = cv2.drawContours(convertir_one_channel(img), cnts, -1, (255, 0, 0) , 3)
64
-
65
-
66
- if output is not None :
67
- st.subheader("Segmentaci贸n:")
68
- st.write(output.shape)
69
- st.image(output,width=850)
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
70
 
71
  st.markdown("Gracias por utilizar este Demo")
 
1
+ import streamlit as st
2
  from PIL import Image
3
  import numpy as np
4
  import cv2
 
6
 
7
  st.header("Segmentaci贸n de dientes con rayos X")
8
 
9
+ st.markdown(
10
+ """
 
 
11
  Hola 馃殌. Este es un modelo de prueba como ejercicio de Platzi
12
 
13
  El modelo fue creado por [SerdarHelli](https://huggingface.co/SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net).
14
 
15
+ """
16
+ )
17
 
18
+ ## Seleccionamos y cargamos el modelo
19
  model_id = "SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net"
20
+ model = from_pretrained_keras(model_id)
21
 
22
+ ## Permitimos a la usuaria cargar una imagen
23
+ archivo_imagen = st.file_uploader("Sube aqu铆 tu imagen.", type=["png", "jpg", "jpeg"])
24
+
25
+ ## Si una imagen tiene m谩s de un canal entonces se convierte a escala de grises (1 canal)
26
  def convertir_one_channel(img):
27
+ if len(img.shape) > 2:
28
+ img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
29
  return img
30
  else:
31
  return img
32
+
33
+
34
  def convertir_rgb(img):
35
+ if len(img.shape) == 2:
36
+ img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2RGB)
37
  return img
38
  else:
39
  return img
40
 
41
+
42
+ ## Manipularemos la interfaz para que podamos usar im谩genes ejemplo
43
+ ## Si el usuario da click en un ejemplo entonces el modelo correr谩 con 茅l
44
+ ejemplos = ["dientes_1.png", "dientes_2.png", "dientes_3.png"]
45
+
46
+ ## Creamos tres columnas; en cada una estar谩 una imagen ejemplo
47
+ col1, col2, col3 = st.columns(3)
48
+ with col1:
49
+ ## Se carga la imagen y se muestra en la interfaz
50
+ ex = Image.open(ejemplos[0])
51
+ st.image(ex, width=200)
52
+ ## Si oprime el bot贸n entonces usaremos ese ejemplo en el modelo
53
+ if st.button("Corre este ejemplo 1"):
54
+ archivo_imagen = ejemplos[0]
55
+
56
+ with col2:
57
+ ex1 = Image.open(ejemplos[1])
58
+ st.image(ex1, width=200)
59
+ if st.button("Corre este ejemplo 2"):
60
+ archivo_imagen = ejemplos[1]
61
+
62
+ with col3:
63
+ ex2 = Image.open(ejemplos[2])
64
+ st.image(ex2, width=200)
65
+ if st.button("Corre este ejemplo 3"):
66
+ archivo_imagen = ejemplos[2]
67
+
68
+ ## Si tenemos una imagen para ingresar en el modelo entonces
69
+ ## la procesamos e ingresamos al modelo
70
+ if archivo_imagen is not None:
71
+ ## Cargamos la imagen con PIL, la mostramos y la convertimos a un array de NumPy
72
+ img = Image.open(archivo_imagen)
73
+ st.image(img, width=850)
74
+ img = np.asarray(img)
75
+
76
+ ## Procesamos la imagen para ingresarla al modelo
77
+ img_cv = convertir_one_channel(img)
78
+ img_cv = cv2.resize(img_cv, (512, 512), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4)
79
+ img_cv = np.float32(img_cv / 255)
80
+ img_cv = np.reshape(img_cv, (1, 512, 512, 1))
81
+
82
+ ## Ingresamos el array de NumPy al modelo
83
+ predicted = model.predict(img_cv)
84
+ predicted = predicted[0]
85
+
86
+ ## Regresamos la imagen a su forma original y agregamos las m谩scaras de la segmentaci贸n
87
+ predicted = cv2.resize(
88
+ predicted, (img.shape[1], img.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4
89
+ )
90
+ mask = np.uint8(predicted * 255) #
91
+ _, mask = cv2.threshold(
92
+ mask, thresh=0, maxval=255, type=cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU
93
+ )
94
+ kernel = np.ones((5, 5), dtype=np.float32)
95
+ mask = cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_OPEN, kernel, iterations=1)
96
+ mask = cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_CLOSE, kernel, iterations=1)
97
+ cnts, hieararch = cv2.findContours(mask, cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
98
+ output = cv2.drawContours(convertir_one_channel(img), cnts, -1, (255, 0, 0), 3)
99
+
100
+ ## Si obtuvimos exitosamente un resultadod entonces lo mostramos en la interfaz
101
+ if output is not None:
102
+ st.subheader("Segmentaci贸n:")
103
+ st.write(output.shape)
104
+ st.image(output, width=850)
105
 
106
  st.markdown("Gracias por utilizar este Demo")