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@@ -21,7 +21,7 @@ def predict(input_mol, style, view_str, chains):
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21 |
chain_str += f" '{chain_dict[chain]}'"
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22 |
if style == "Goodsell3D":
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23 |
os.system(f"cellscape cartoon --pdb {input_mol.name} --outline residue --depth_shading --depth_lines --colors {chain_str} --depth flat --back_outline --view view_matrix --save outline_all.svg")
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24 |
-
elif style == "
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25 |
os.system(f"cellscape cartoon --pdb {input_mol.name} --outline residue --depth_contour_interval 10 --colors {chain_str} --depth contours --back_outline --view view_matrix --save outline_all.svg")
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26 |
else:
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27 |
os.system(f"cellscape cartoon --pdb {input_mol.name} --outline chain --colors {chain_str} --depth flat --back_outline --view view_matrix --save outline_all.svg")
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21 |
chain_str += f" '{chain_dict[chain]}'"
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22 |
if style == "Goodsell3D":
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23 |
os.system(f"cellscape cartoon --pdb {input_mol.name} --outline residue --depth_shading --depth_lines --colors {chain_str} --depth flat --back_outline --view view_matrix --save outline_all.svg")
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24 |
+
elif style == "Contour":
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25 |
os.system(f"cellscape cartoon --pdb {input_mol.name} --outline residue --depth_contour_interval 10 --colors {chain_str} --depth contours --back_outline --view view_matrix --save outline_all.svg")
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26 |
else:
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27 |
os.system(f"cellscape cartoon --pdb {input_mol.name} --outline chain --colors {chain_str} --depth flat --back_outline --view view_matrix --save outline_all.svg")
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