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let hist_bins_sorted_low ( ) = Alcotest . ( check ( array int ) ) " bin below sorted " [ | 0 ] | ( To_test . hist_bin_sorted Data . bin_low Data . x1_sorted ) |
let hist_bins_sorted_high ( ) = Alcotest . ( check ( array int ) ) " bin above sorted " [ | 0 ] | ( To_test . hist_bin Data . bin_high Data . x1_sorted ) |
let hist_bins_wrong ( ) = Alcotest . ( check_raises ) " histogram with bins " ( Failure " Need at least two bin boundaries " ) ! ( fun ( ) -> To_test . hist_bin Data . bin_wrong Data . x1 |> ignore ) |
let hist_bins_2 ( ) = Alcotest . ( check ( array int ) ) " histogram with infinite bins " [ | 1 ; 2 ; 2 ] | ( To_test . hist_bin Data . bin2 Data . x2 ) |
let hist_bins_sorted_2 ( ) = Alcotest . ( check ( array int ) ) " histogram with infinite bins sorted " [ | 1 ; 2 ; 2 ] | ( To_test . hist_bin_sorted Data . bin2 Data . x2_sorted ) |
let fao = let open Alcotest in let fl = testable Fmt . float ( fun x y -> x = y || abs_float ( x . - y ) <= eps ) in option ( array fl ) |
let hist_bins_weights ( ) = Alcotest . ( check ( pair ( array int ) fao ) ) " weighted histogram with bins " ( [ | 3 ] , | Some [ | 3 . ] ) | ( To_test . hist_bin_weighted Data . bin1 Data . w1 Data . x1 ) |
let hist_bins_weights_sorted ( ) = Alcotest . ( check ( pair ( array int ) fao ) ) " weighted histogram with bins sorted " ( [ | 3 ] , | Some [ | 3 . ] ) | ( To_test . hist_bin_weighted_sorted Data . bin1 Data . w1_sorted Data . x1_sorted ) |
let hist_bins_normalise ( ) = Alcotest . ( check ( pair fao fao ) ) " normalisation test unweighted " ( Some [ | 1 . . / 5 . ; 2 . . / 5 . ; 2 . . / 5 . ] | , Some [ | 1 . . / 5 . ; 2 . . / 5 . . / sqrt 0 . 5 ; 2 . . / 5 . . / ( 3 . . - sqrt 0 . 5 ) ] | ) ( To_test . hist_normalise Data . bin2 Data . x2 ) |
let hist_bins_normalise_weights ( ) = Alcotest . ( check ( pair fao fao ) ) " normalisation test with weights " ( Some [ | 2 . . / 4 . 2 ; 1 . . / 4 . 2 ; 1 . 2 . / 4 . 2 ] | , Some [ | 2 . . / 4 . 2 ; 1 . . / 4 . 2 . / sqrt 0 . 5 ; 1 . 2 . / 4 . 2 . / ( 3 . . - sqrt 0 . 5 ) ] | ) ( To_test . hist_normalise Data . bin2 ~ weights : Data . w2 Data . x2 ) |
let hist_bins_normalise_binf ( ) = Alcotest . ( check ( pair fao fao ) ) " normalisation test unweighted , infinite bins " ( Some [ | 1 . . / 6 . ; 2 . . / 6 . ; 3 . . / 6 . ] , | Some [ | 0 . ; 2 . . / 6 . . / sqrt 0 . 5 ; 0 . ] ) | ( To_test . hist_normalise Data . bin2_inf Data . x2 ) |
let tukey_fences ( ) = Alcotest . ( check ( pair ( float 0 . 0 ) ( float 0 . 0 ) ) ) " tukey fences test with data containing outliers " ( - 3 . 0 , 5 . 0 ) ( To_test . tukey_fences Data . with_outliers ) |
let quantiles ( ) = Alcotest . ( check fao ) " quantiles calculation " ( Some [ | 0 . 106500 ; 0 . 190700 ; 0 . 376750 ; 0 . 767625 ; 0 . 978800 ] ) | ( To_test . quantiles ~ p [ :| 0 . ; 0 . 25 ; 0 . 5 ; 0 . 75 ; 1 . ] | [ | 0 . 1182 ; 0 . 8388 ; 0 . 4569 ; 0 . 1902 ; 0 . 8652 ; 0 . 2966 ; 0 . 9788 ; 0 . 5541 ; 0 . 1065 ; 0 . 1922 ] ) | |
let test_set = [ " mannwhitneyu_test_left_side_asym " , ` Slow , mannwhitneyu_test_left_side_asym ; " mannwhitneyu_test_right_side_asym " , ` Slow , mannwhitneyu_test_right_side_asym ; " mannwhitneyu_test_both_side_asym " , ` Slow , mannwhitneyu_test_both_side_asym ; " mannwhitneyu_test_both_side_exact " , ` Slow , mannwhitneyu_test_both_side_exact ; " mannwhitneyu_test_right_side_exact " , ` Slow , mannwhitneyu_test_right_side_exact ; " mannwhitneyu_test_left_side_exact " , ` Slow , mannwhitneyu_test_left_side_exact ; " wilcoxon_test_both_side_exact " , ` Slow , wilcoxon_test_both_side_exact ; " wilcoxon_test_right_side_exact " , ` Slow , wilcoxon_test_right_side_exact ; " wilcoxon_test_left_side_exact " , ` Slow , wilcoxon_test_left_side_exact ; " wilcoxon_test_both_side_asymp " , ` Slow , wilcoxon_test_both_side_asymp ; " wilcoxon_test_right_side_asymp " , ` Slow , wilcoxon_test_right_side_asymp ; " wilcoxon_test_left_side_asymp " , ` Slow , wilcoxon_test_left_side_asymp ; " fisher_test_both_side " , ` Slow , fisher_test_both_side ; " fisher_test_right_side " , ` Slow , fisher_test_right_side ; " fisher_test_left_side " , ` Slow , fisher_test_left_side ; " ks_teststat1 " , ` Slow , ks_teststat1 ; " ks_teststat2 " , ` Slow , ks_teststat2 ; " ks_pval_test1 " , ` Slow , ks_pval_test1 ; " ks_pval_test2 " , ` Slow , ks_pval_test2 ; " ks_pval_test3 " , ` Slow , ks_pval_test3 ; " ks_pval_test4 " , ` Slow , ks_pval_test4 ; " ks_pval_test5 " , ` Slow , ks_pval_test5 ; " ks2_pval_test1 " , ` Slow , ks2_pval_test1 ; " ks2_pval_test2 " , ` Slow , ks2_pval_test2 ; " ks2_pval_test3 " , ` Slow , ks2_pval_test3 ; " ks2_teststat " , ` Slow , ks2_teststat ; " hist_uni_1 " , ` Slow , hist_uni_1 ; " hist_uni_sorted_1 " , ` Slow , hist_uni_sorted_1 ; " hist_bins_1 " , ` Slow , hist_bins_1 ; " hist_bins_low " , ` Slow , hist_bins_low ; " hist_bins_high " , ` Slow , hist_bins_high ; " hist_bins_sorted_low " , ` Slow , hist_bins_low ; " hist_bins_sorted_high " , ` Slow , hist_bins_high ; " hist_bins_wrong " , ` Slow , hist_bins_wrong ; " hist_bins_2 " , ` Slow , hist_bins_2 ; " hist_bins_sorted_2 " , ` Slow , hist_bins_sorted_2 ; " hist_bins_weights " , ` Slow , hist_bins_weights ; " hist_bins_weights_sorted " , ` Slow , hist_bins_weights_sorted ; " hist_bins_normalise " , ` Slow , hist_bins_normalise ; " hist_bins_normalise_weights " , ` Slow , hist_bins_normalise_weights ; " hist_bins_normalise_binf " , ` Slow , hist_bins_normalise_binf ; " tukey_fences " , ` Slow , tukey_fences ; " quantiles " , ` Slow , quantiles ] |
type ( ' a , ' b ) t_iter = ( ' a -> int -> ' b -> ' a ) -> ' a -> int * ' a |
let trace pos = let a , b , c , d = pos in Printf . printf " trace :% s :% d :% d :% d \ n " %! a b c d |
module Cubic = struct type t = { lx : float ; rx : float ; dx : float ; p0 : float ; p1 : float ; p ' 0 : float ; p ' 1 : float ; poly : float array } let f t x = let u = ( x . - t . lx ) . / t . dx in let u2 = u . * u in let u3 = u2 . * u in ( t . poly . ( 0 ) . * u3 ) . + ( t . poly . ( 1 ) . * u2 ) . + ( t . poly . ( 2 ) . * u ) . + t . poly . ( 3 ) let df t x = let u = ( x . - t . lx ) . / t . dx in let u2 = u . * u in ( ( t . poly . ( 0 ) . * u2 . * 3 . ) . + ( t . poly . ( 1 ) . * u . * 2 . ) . + t . poly . ( 2 ) ) . / t . dx let find_x_of_value t p = let rec iter n x = if n > 0 then ( let f ' = df t x in let f ' = max f ' 0 . 01 in let dx = ( f t x . - p ) . / f ' in let x ' = x . - dx in iter ( n - 1 ) x ' ) else x in iter 40 ( ( t . lx . + t . rx ) . / 2 . ) let fit lx rx p0 p ' 0 p1 p ' 1 = let dx = rx . - lx in let f0 = p0 in let f1 = p1 in let f ' 0 = dx . * p ' 0 in let f ' 1 = dx . * p ' 1 in let d = f0 in let c = f ' 0 in let a = ( 2 . . * ( f0 . - f1 ) ) . + ( f ' 1 . + f ' 0 ) in let b = ( 3 . . * ( f1 . - f0 ) ) . - ( f ' 1 . + ( 2 . . * f ' 0 ) ) in let t = { lx ; rx ; dx ; p0 ; p1 ; p ' 0 ; p ' 1 ; poly = [ | a ; b ; c ; d ] | } in t end |
module CdfTree = struct type binary_node = | Leaf of int | Balance of ( float * binary_node * binary_node ) let rec create_node cdf_x_of_p logn p dp i di = if logn <= 0 then Leaf ( i / 2 ) else ( let ndp = dp . / 2 . in let ndi = di / 2 in let node_l = create_node cdf_x_of_p ( logn - 1 ) ( p . - ndp ) ndp ( i - ndi ) ndi in let node_r = create_node cdf_x_of_p ( logn - 1 ) ( p . + ndp ) ndp ( i + ndi ) ndi in let x = cdf_x_of_p p in Balance ( x , node_l , node_r ) ) let create cdf_x_of_p logn = create_node cdf_x_of_p logn 0 . 5 0 . 5 ( 1 lsl logn ) ( 1 lsl logn ) let rec display ( ? prefix = " " ) ( ? dirn = 0 ) t = match t with | Leaf n -> Printf . printf " % s +-- % n \ n " prefix n | Balance ( x , l , r ) -> let subprefix_0 = prefix ^ ( if dirn > 0 then " " | else " " ) ^ " " in let subprefix_1 = prefix ^ ( if dirn < 0 then " " | else " " ) ^ " " in display ~ prefix : subprefix_0 ~ dirn ( :- 1 ) l ; Printf . printf " % s + % 8f -+\ n " prefix x ; display ~ prefix : subprefix_1 ~ dirn : 1 r let cdf_x_of_p ( ? min_x = - 1 . E4 ) ( ? max_x = 1 . E4 ) cdf p = let rec find_x_of_p lx rx = let dx = rx . - lx in let mx = ( lx . + rx ) . / 2 . in let mp = cdf mx in if dx < 1E - 8 then mx else if mp > p then find_x_of_p lx mx else find_x_of_p mx rx in find_x_of_p min_x max_x let rec value t x = match t with | Leaf n -> n | Balance ( nx , nl , nr ) -> if x < nx then value nl x else value nr x let create_from_rv rv logn = create ( cdf_x_of_p rv ) logn end |
let _ = let tree = CdfTree . create_from_rv ( M . gaussian_cdf ~ mu : 0 . ~ sigma : 1 . ) 5 in CdfTree . display tree ; List . iter ( fun x -> Printf . printf " bucket of % f : % d \ n " x ( CdfTree . value tree x ) ) [ - 1 . ; - 0 . 5 ; 0 . ; 0 . 5 ; 1 . ] |
module Distribution = struct type t = { name : string ; num_buckets : int ; cdf_x_array : float array ; pdf_x_array : float array ; cubics : t_cubic array ; dut_cdf : float -> float ; dut_pdf : float -> float } let create name dut_cdf dut_pdf cdf_x_array pdf_x_array = let num_buckets = Array . length cdf_x_array - 1 in let num_buckets_f = float num_buckets in let cubics = let rec add_cubic acc i = if i >= 0 then ( let lx = cdf_x_array . ( i ) in let rx = cdf_x_array . ( i + 1 ) in let p0 = float i . / num_buckets_f in let p1 = float ( i + 1 ) . / num_buckets_f in let p ' 0 = pdf_x_array . ( i ) in let p ' 1 = pdf_x_array . ( i + 1 ) in let c = Cubic . fit lx rx p0 p ' 0 p1 p ' 1 in add_cubic ( c :: acc ) ( i - 1 ) ) else acc in Array . of_list ( add_cubic [ ] ( num_buckets - 1 ) ) in { name ; num_buckets ; dut_cdf ; dut_pdf ; pdf_x_array ; cdf_x_array ; cubics } let value t i = t . cdf_x_array . ( i ) let bucket_of_p t p = let i = int_of_float ( p . * float t . num_buckets ) in min ( t . num_buckets - 1 ) ( max i 0 ) let interp_x_of_p t p = let i = bucket_of_p t p in Cubic . find_x_of_value t . cubics . ( i ) p let search_for_x t x = let rec find_x li ri = if ri <= li + 1 then li , ri else ( let mi = ( ri + li ) / 2 in let mx = t . cdf_x_array . ( mi ) in if x < mx then find_x li mi else find_x mi ri ) in let li , ri = if x <= t . cdf_x_array . ( 0 ) then 0 , 1 else if x >= t . cdf_x_array . ( t . num_buckets ) then t . num_buckets - 1 , t . num_buckets else find_x 0 t . num_buckets in li , ri , t . num_buckets let dut_cdf t = t . dut_cdf let dut_pdf t = t . dut_pdf let interp_cdf t x = let li , _ , _ = search_for_x t x in Cubic . f t . cubics . ( li ) x let interp_pdf t x = let li , _ , _ = search_for_x t x in Cubic . df t . cubics . ( li ) x end |
module RandomTest = struct type test_hypothesis = { test_name : string ; score_name : string ; hypothesis : M . hypothesis } let make_hypothesis reject p_value score : M . hypothesis = { reject ; p_value ; score } let make_test_hypothesis test_name score_name hypothesis = { test_name ; score_name ; hypothesis } let is_fail t = t . hypothesis . reject let assert_hypothesis ( ? should_reject = false ) rv_name test_hypothesis = let hypothesis = test_hypothesis . hypothesis in let name = test_hypothesis . test_name in let data_name = test_hypothesis . score_name in Printf . printf " ********************************************************************************\ n " ; Printf . printf " % s % s test \ n " rv_name name ; Printf . printf " % s = % f \ n " data_name hypothesis . score ; Printf . printf " p_value = % f \ n " hypothesis . p_value ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Statistical test ' % s ' for random variable ' % s ' " name rv_name ) should_reject hypothesis . reject ; ( ) let iterate ( sampler : int -> int -> int * ( int -> ' b ) ) ( start : int ) ( length : int ) ( f : ' c -> int -> ' b -> ' c ) ( acc : ' c ) : int * ' c = let actual_length , sampler_next = sampler start length in let rec x acc i n = if n <= 0 then acc else ( let new_acc = f acc i ( sampler_next i ) in x new_acc ( i + 1 ) ( n - 1 ) ) in length , x acc 0 actual_length let match_distribution ( ? significance = 0 . 01 ) ( dist : Distribution . t ) = let diff i = let x = float i . / 32 . in Distribution . interp_cdf dist x . - Distribution . dut_cdf dist x in let diff2 i = diff i ** 2 . in let rec sum_diff2 acc i = if i >= 0 then sum_diff2 ( acc . + diff2 i ) ( i - 1 ) else acc in let p = sum_diff2 0 . 32 . / 32 . in let hypothesis = make_hypothesis ( p < significance ) p p in hypothesis module C = Owl . Dense . Matrix . C let do_fft ( ? significance = 0 . 01 ) ( ? n = 1024 ) f iter = let x = C . zeros 1 n in let blah acc i b = if i < n then C . set x 0 i { Complex . re = f b ; im = 0 . } ; acc in let _ , _ = iter blah 0 in C . print ~ max_col : 64 x ; let f = Owl . Fft . S . fft x in C . print ~ max_col : 64 f ; let p = 0 . 95 in let q = 1 . . - p in let t2 = float n . * . - log q in Printf . printf " t2 % f \ n " t2 ; let rec count_above_threshold i acc = if i < 0 then acc else ( let c = C . get f 0 i in let new_acc = if Complex . norm2 c < t2 then acc + 1 else acc in count_above_threshold ( i - 1 ) new_acc ) in let n_over = count_above_threshold ( ( n / 2 ) - 1 ) 0 in let x = float n_over . - ( float ( n / 2 ) . * p ) in let x = x . / sqrt ( float ( 2 * n ) . * p . * q ) in let x = abs_float x in let p = Maths . erfc x in let hypothesis = make_hypothesis ( p < significance ) p ( float n_over . / float ( n / 2 ) ) in hypothesis end |
module BinaryTest = struct include RandomTest let frequency ( ? significance = 0 . 01 ) ( ? p = 0 . 5 ) iter = let q = 1 . . - p in let inc_if_true_else_dec acc _ b = if b then acc + 1 else acc - 1 in let n , sum = iter inc_if_true_else_dec 0 in let x = float sum . - ( ( ( 2 . . * p ) . - 1 . ) . * float n ) in let x = x . / sqrt ( 8 . . * p . * q . * float n ) in let x = abs_float x in let p = Maths . erfc x in let hypothesis = make_hypothesis ( p < significance ) p x in make_test_hypothesis ( sfmt " Frequency with % d samples " n ) " Partial sum " hypothesis let block_frequency ( ? significance = 0 . 01 ) ( ? p = 0 . 5 ) m iter = let number_ones_in_block ( i_of_m , acc , chi2 , n ) _ b = let v = if b then 1 else 0 in if i_of_m + 1 == m then ( let chi2_obs = ( ( float ( acc + v ) . / float m ) . - p ) ** 2 . in 0 , 0 , chi2_obs . + chi2 , n + 1 ) else i_of_m + 1 , acc + v , chi2 , n in let _ , ( _ , _ , chi2 , n ) = iter number_ones_in_block ( 0 , 0 , 0 . , 0 ) in let chi2 = chi2 . * float m . / p in let p = 1 . . - M . chi2_cdf chi2 ~ df ( : float n ) in let hypothesis = make_hypothesis ( p < significance ) p chi2 in make_test_hypothesis ( sfmt " Block frequency of % d run lengths of size % d " n m ) " Chi ^ 2 " hypothesis let occurrence_of_patterns ( ? significance = 0 . 01 ) m iter = let num_pats = 1 lsl m in let mask = num_pats - 1 in let obs_counts = Array . make num_pats 0 in let rec count_ones_in_n acc i v = if i == 0 then acc else count_ones_in_n ( acc + ( v land 1 ) ) ( i - 1 ) ( v lsr 1 ) in let count_observations ( sum_z , sum_o , m_seen , pat ) _ b = let v = if b then 1 else 0 in let new_pat = ( ( pat lsl 1 ) land mask ) + v in if m_seen == m then ( obs_counts . ( new_pat ) <- obs_counts . ( new_pat ) + 1 ; sum_z + 1 - v , sum_o + v , m_seen , new_pat ) else sum_z + 1 - v , sum_o + v , m_seen + 1 , new_pat in let n , ( sum_z , sum_o , _ , _ ) = iter count_observations ( 0 , 0 , 0 , 0 ) in let prob_z = float sum_z . / float ( n - m + 1 ) in let prob_o = float sum_o . / float ( n - m + 1 ) in let set_exp_counts i = let num_o = count_ones_in_n 0 m i in let num_z = m - num_o in ( prob_o ** float num_o ) . * ( prob_z ** float num_z ) . * float ( n - m + 1 ) in let exp_counts = Array . init num_pats set_exp_counts in let rec sum_chi2 acc i = if i == num_pats then acc else ( let obs_m = float obs_counts . ( i ) in let exp_m = exp_counts . ( i ) in sum_chi2 ( acc . + ( ( ( obs_m . - exp_m ) ** 2 . ) . / exp_m ) ) ( i + 1 ) ) in let chi2 = sum_chi2 0 . 0 in let p = 1 . . - M . chi2_cdf chi2 ~ df ( : float ( num_pats - 1 ) ) in let hypothesis = make_hypothesis ( p < significance ) p chi2 in make_test_hypothesis ( sfmt " Occurrences of % d - bit patterns in run length of size % d " m n ) " Chi ^ 2 " hypothesis let occurrences_of_patterns ( ? significance = 0 . 01 ) n m iter = let rec accum_n acc f n = if n <= 0 then acc else accum_n ( f acc ) f ( n - 1 ) in let accum acc = occurrence_of_patterns ~ significance : 0 . 01 m iter :: acc in let run_results = accum_n [ ] accum n in let num_passing = List . fold_left ( fun a i -> if is_fail i then a else a . + 1 . ) 0 . run_results in let chi2 = ( ( num_passing . - ( 0 . 99 . * float n ) ) ** 2 . ) . / ( 0 . 99 . * float n ) in let p = 1 . . - M . chi2_cdf chi2 ~ df : 1 . in let hypothesis = make_hypothesis ( p < significance ) p num_passing in make_test_hypothesis ( sfmt " % d iterations of ' % s ' " n ( List . hd run_results ) . test_name ) " Num passing " hypothesis let fft ( ? significance = 0 . 01 ) ~ n iter = let hypothesis = do_fft ~ significance ~ n ( fun b -> if b then 1 . else - 1 . ) iter in make_test_hypothesis ( sfmt " FFT of size % d " n ) " # peaks above 95 % power " hypothesis end |
let test_rough_cdf pydist = let ( name , imprecision , dut_cdf , dut_pdf , dut_logcdf , dut_logpdf , dut_opt_ppf , dut_sf , dut_logsf , dut_opt_isf , cdf_x_array , pdf_x_array ) = pydist in let dist = Distribution . create name dut_cdf dut_pdf cdf_x_array pdf_x_array in let sum_diff_cdf_2 = ref 0 . in let sum_diff_pdf_2 = ref 0 . in let max_diff_cdf_2 = ref 0 . in let max_diff_pdf_2 = ref 0 . in let sum_err_log_cdf_2 = ref 0 . in let sum_err_log_pdf_2 = ref 0 . in let sum_err_ppf_2 = ref 0 . in let sum_err_isf_2 = ref 0 . in let sum_err_sf_2 = ref 0 . in let sum_err_log_sf_2 = ref 0 . in let n = 1000 in let total = float n . * 0 . 96 in for i = n * 2 / 100 to n * 98 / 100 do let p = float i . / float n in let x = Distribution . interp_x_of_p dist p in let cdf_x = Distribution . interp_cdf dist x in let pdf_x = Distribution . interp_pdf dist x in let dut_cdf_x = Distribution . dut_cdf dist x in let dut_pdf_x = Distribution . dut_pdf dist x in let diff_cdf_2 = ( cdf_x . - dut_cdf_x ) ** 2 . in let diff_pdf_2 = ( ( pdf_x . / dut_pdf_x ) . - 1 . ) ** 2 . in let err_log_cdf_2 = ( log dut_cdf_x . - dut_logcdf x ) ** 2 . in let err_log_pdf_2 = ( log dut_pdf_x . - dut_logpdf x ) ** 2 . in let option_get o = match o with | Some x -> x | None -> raise Owl_exception . TEST_FAIL in let dut_cdf_ppf_p , dut_ppf_p , dut_isf_o_m_p = match dut_opt_ppf with | None -> p , 0 . , 0 . | Some dut_ppf -> let dut_isf = option_get dut_opt_isf in dut_cdf ( dut_ppf p ) , dut_ppf p , dut_isf ( 1 . . - p ) in let err_ppf_2 , err_isf_2 = ( dut_cdf_ppf_p . - p ) ** 2 . , ( dut_ppf_p . - dut_isf_o_m_p ) ** 2 . in let err_sf_2 = ( dut_cdf x . + dut_sf x . - 1 . ) ** 2 . in let err_log_sf_2 = ( dut_logsf x . - log ( dut_sf x ) ) ** 2 . in if ! max_diff_cdf_2 < diff_cdf_2 then max_diff_cdf_2 := diff_cdf_2 ; if ! max_diff_pdf_2 < diff_pdf_2 then max_diff_pdf_2 := diff_pdf_2 ; sum_diff_cdf_2 := ! sum_diff_cdf_2 . + diff_cdf_2 ; sum_diff_pdf_2 := ! sum_diff_pdf_2 . + diff_pdf_2 ; sum_err_log_cdf_2 := ! sum_err_log_cdf_2 . + err_log_cdf_2 ; sum_err_log_pdf_2 := ! sum_err_log_pdf_2 . + err_log_pdf_2 ; sum_err_ppf_2 := ! sum_err_ppf_2 . + err_ppf_2 ; sum_err_isf_2 := ! sum_err_isf_2 . + err_isf_2 ; sum_err_sf_2 := ! sum_err_sf_2 . + err_sf_2 ; sum_err_log_sf_2 := ! sum_err_log_sf_2 . + err_log_sf_2 done ; let avg_diff_cdf_2 = ! sum_diff_cdf_2 . / total in let avg_diff_pdf_2 = ! sum_diff_pdf_2 . / total in let avg_err_log_cdf_2 = ! sum_err_log_cdf_2 . / total in let avg_err_log_pdf_2 = ! sum_err_log_pdf_2 . / total in let avg_err_ppf_2 = ! sum_err_ppf_2 . / total in let avg_err_isf_2 = ! sum_err_isf_2 . / total in let avg_err_sf_2 = ! sum_err_sf_2 . / total in let avg_err_log_sf_2 = ! sum_err_log_sf_2 . / total in Printf . printf " % s : Avg sq diff in cdf % g pdf % g max cdf % g pdf % g \ n " name avg_diff_cdf_2 avg_diff_pdf_2 ! max_diff_cdf_2 ! max_diff_pdf_2 ; Printf . printf " Avg err logcdf % g logpdf % g ppf % g isf % g \ n " avg_err_log_cdf_2 avg_err_log_pdf_2 avg_err_ppf_2 avg_err_isf_2 ; Printf . printf " Avg err sf % g logsf % g \ n " avg_err_sf_2 avg_err_log_sf_2 ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Avg sq diff in ' % s ' cdf < 1E - 8 " name ) true ( avg_diff_cdf_2 < 1E - 8 . * imprecision ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Max sq diff in ' % s ' cdf < 1E - 5 " name ) true ( ! max_diff_cdf_2 < 1E - 5 . * imprecision ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Avg sq diff in ' % s ' pdf < 1E - 3 " name ) true ( avg_diff_pdf_2 < 1E - 3 . * imprecision ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Max sq diff in ' % s ' pdf < 1E - 1 " name ) true ( ! max_diff_pdf_2 < 1E - 1 . * imprecision ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Avg logcdf error in ' % s ' < 1E - 28 " name ) true ( avg_err_log_cdf_2 < 1E - 28 ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Avg logpdf error in ' % s ' < 1E - 28 " name ) true ( avg_err_log_pdf_2 < 1E - 28 ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Avg ppf error in ' % s ' < 1E - 28 " name ) true ( avg_err_ppf_2 < 1E - 28 ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Avg isf error in ' % s ' < 1E - 28 " name ) true ( avg_err_isf_2 < 1E - 28 ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Avg sf error in ' % s ' < 1E - 28 " name ) true ( avg_err_sf_2 < 1E - 28 ) ; Alcotest . ( check bool ) ( sfmt " Avg log sf error in ' % s ' < 1E - 28 " name ) true ( avg_err_log_sf_2 < 1E - 28 ) ; ( ) |
let test_rough_cdf_matches _ = List . iter test_rough_cdf cdf_approximations ; ( ) |
let _ = Owl_stats_prng . self_init ( ) ; Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 |
let one_third = 1 . . / 3 . |
type t_bin_iter = | IOfBool of ( ( int , bool ) t_iter -> RandomTest . test_hypothesis ) | IIIIOfBool of ( ( int * int * int * int , bool ) t_iter -> RandomTest . test_hypothesis ) | IIFIOfBool of ( ( int * int * float * int , bool ) t_iter -> RandomTest . test_hypothesis ) |
let bin_frequency = IOfBool BinaryTest . frequency |
let bin_frequency_1_of_3 = IOfBool ( BinaryTest . frequency ~ p : one_third ) |
let bin_block_frequency_7 = IIFIOfBool ( BinaryTest . block_frequency 7 ) |
let bin_block_frequency_70 = IIFIOfBool ( BinaryTest . block_frequency 70 ) |
let bin_block_frequency_700 = IIFIOfBool ( BinaryTest . block_frequency 700 ) |
let bin_block_frequency_1_of_3_7 = IIFIOfBool ( BinaryTest . block_frequency ~ p : one_third 7 ) |
let bin_block_frequency_1_of_3_70 = IIFIOfBool ( BinaryTest . block_frequency ~ p : one_third 70 ) |
let bin_block_frequency_1_of_3_700 = IIFIOfBool ( BinaryTest . block_frequency ~ p : one_third 700 ) |
let bin_patterns_2 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 2 ) |
let bin_patterns_3 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 3 ) |
let bin_patterns_4 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 4 ) |
let bin_patterns_5 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 5 ) |
let bin_patterns_6 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 6 ) |
let bin_patterns_7 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 7 ) |
let bin_patterns_8 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 8 ) |
let bin_patterns_9 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 9 ) |
let bin_patterns_10 = IIIIOfBool ( BinaryTest . occurrences_of_patterns 8 10 ) |
let bin_fft_64 = IOfBool ( BinaryTest . fft ~ n : 64 ) |
let bin_fft_1024 = IOfBool ( BinaryTest . fft ~ n : 1024 ) |
let run_random_tests test_name pretest sampler tests = let run_test ( test , should_reject , start , length ) = pretest ( ) ; let test_result = match test with | IOfBool t -> t ( RandomTest . iterate sampler start length ) | IIFIOfBool t -> t ( RandomTest . iterate sampler start length ) | IIIIOfBool t -> t ( RandomTest . iterate sampler start length ) in RandomTest . assert_hypothesis test_name ~ should_reject test_result in List . iter run_test tests ; ( ) |
let tests_for_p_0_5 = [ bin_frequency , false , 0 , 2000 ; bin_frequency , false , 0 , 10000 ; bin_frequency_1_of_3 , true , 0 , 1000 ; bin_frequency_1_of_3 , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , false , 0 , 100000 ; bin_block_frequency_1_of_3_70 , true , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_1_of_3_70 , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_1_of_3_700 , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_1_of_3_700 , true , 0 , 100000 ; bin_patterns_2 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_4 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_5 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_6 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_8 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_9 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_10 , false , 0 , 10000 ; bin_fft_64 , false , 0 , 1024 ; bin_fft_1024 , false , 0 , 1024 ] |
let tests_for_p_0_3 = [ bin_frequency , true , 0 , 1000 ; bin_frequency , true , 0 , 10000 ; bin_frequency_1_of_3 , false , 0 , 100 ; bin_frequency_1_of_3 , false , 0 , 1000 ; bin_frequency_1_of_3 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , true , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , true , 0 , 100000 ; bin_block_frequency_1_of_3_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_1_of_3_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_1_of_3_70 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_1_of_3_70 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_1_of_3_700 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_1_of_3_700 , false , 0 , 100000 ; bin_patterns_2 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_4 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_5 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_6 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_8 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_9 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_10 , false , 0 , 10000 ; bin_fft_64 , false , 0 , 1024 ; bin_fft_1024 , false , 0 , 1024 ] |
let test_true_is_not_random _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 ; let test_name = " always true " in let pretest _ = ( ) in let sampler _ length = length , fun _ -> true in let tests = [ bin_frequency , true , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , true , 0 , 100 ; bin_fft_64 , false , 0 , 1024 ; bin_fft_1024 , true , 0 , 1024 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_alternate_is_not_random _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 ; let test_name = " every other " in let pretest _ = ( ) in let sampler _ length = length , fun x -> x land 1 == 0 in let tests = [ bin_frequency , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_patterns_2 , true , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , true , 0 , 1000 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_three_of_four_is_not_random _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 ; let test_name = " three of four " in let pretest _ = ( ) in let sampler _ length = length , fun x -> x land 3 == 0 in let tests = [ bin_frequency , true , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , true , 0 , 1000 ; bin_patterns_2 , true , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , true , 0 , 1000 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_two_of_four_is_not_random _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 ; let test_name = " two of four " in let pretest _ = ( ) in let sampler _ length = length , fun x -> x land 3 < 2 in let tests = [ bin_frequency , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_2 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , true , 0 , 1000 ; bin_patterns_4 , true , 0 , 1000 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_uniform_ints_0_1 _ = let test_name = " uniform_int ~ a : 0 ~ b : 1 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . uniform_int_rvs ~ a : 0 ~ b : 1 == 0 in let tests = [ bin_frequency , false , 0 , 100 ; bin_frequency , false , 0 , 1000 ; bin_frequency , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , false , 0 , 1000 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_uniform_ints_1_100 _ = let test_name = " uniform_int ~ a : 1 ~ b : 100 <= 50 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . uniform_int_rvs ~ a : 1 ~ b : 100 < 51 in let tests = [ bin_frequency , false , 0 , 100 ; bin_frequency , false , 0 , 1000 ; bin_frequency , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , false , 0 , 100000 ; bin_patterns_2 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_4 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_5 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_6 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_8 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_9 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_10 , false , 0 , 10000 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_uniform_ints_1_100_even _ = let test_name = " uniform_int ~ a : 1 ~ b : 100 even " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 0 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . uniform_int_rvs ~ a : 1 ~ b : 100 land 1 == 0 in let tests = tests_for_p_0_5 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_uniform_ints_0_to_65535 ( bit : int ) _ = let test_name = sfmt " uniform_int ~ a : 0 ~ b : 65535 bit % d " bit in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 0 in let sampler _ length = length , fun _ -> ( M . uniform_int_rvs ~ a : 0 ~ b : 65535 lsr bit ) land 1 == 0 in let tests = tests_for_p_0_5 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_0 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 0 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_1 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 1 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_2 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 2 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_3 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 3 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_4 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 4 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_5 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 5 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_6 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 6 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_7 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 7 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_8 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 8 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_9 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 9 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_10 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 10 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_11 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 11 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_12 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 12 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_13 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 13 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_14 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 14 ( ) |
let test_uniform_ints_0_to_65535_bit_15 _ = test_uniform_ints_0_to_65535 15 ( ) |
let test_uniform_ints_1_100_48 _ = let test_name = " uniform_int ~ a : 1 ~ b : 100 <= 48 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 0 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . uniform_int_rvs ~ a : 1 ~ b : 100 <= 48 in let tests = [ bin_frequency , false , 0 , 100 ; bin_frequency , false , 0 , 1000 ; bin_frequency , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , true , 0 , 100000 ; bin_patterns_2 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_4 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_5 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_6 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_8 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_9 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_10 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 100000 ; bin_patterns_8 , false , 0 , 100000 ; bin_patterns_9 , false , 0 , 100000 ; bin_patterns_10 , false , 0 , 100000 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_uniform_ints_1_100_45 _ = let test_name = " uniform_int ~ a : 1 ~ b : 100 <= 45 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 0 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . uniform_int_rvs ~ a : 1 ~ b : 100 <= 45 in let tests = [ bin_frequency , false , 0 , 100 ; bin_frequency , true , 0 , 1000 ; bin_frequency , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , true , 0 , 100000 ; bin_patterns_2 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_4 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_5 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_6 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_8 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_9 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_10 , false , 0 , 10000 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_uniform_ints_1_300_100 _ = let test_name = " uniform_int ~ a : 1 ~ b : 300 mod 3 is 0 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . uniform_int_rvs ~ a : 1 ~ b : 300 mod 3 = 0 in let tests = [ bin_frequency , true , 0 , 100 ; bin_frequency , true , 0 , 1000 ; bin_frequency , true , 0 , 10000 ; bin_frequency_1_of_3 , false , 0 , 100 ; bin_frequency_1_of_3 , false , 0 , 1000 ; bin_frequency_1_of_3 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , true , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_70 , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , true , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_700 , true , 0 , 100000 ; bin_block_frequency_1_of_3_7 , false , 0 , 100 ; bin_block_frequency_1_of_3_7 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_1_of_3_70 , false , 0 , 1000 ; bin_block_frequency_1_of_3_70 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_1_of_3_700 , false , 0 , 10000 ; bin_block_frequency_1_of_3_700 , false , 0 , 100000 ; bin_patterns_2 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_3 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_4 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_5 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_6 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 1000 ; bin_patterns_7 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_8 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_9 , false , 0 , 10000 ; bin_patterns_10 , false , 0 , 10000 ] in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_gaussian_mean_0 _ = let test_name = " gaussian mean 0 sd 1 > 0 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . gaussian_rvs ~ mu : 0 . ~ sigma : 1 . > 0 . in let tests = tests_for_p_0_5 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_gaussian_mean_0_p0_3_left _ = let test_name = " gaussian mean 0 sd 1 < . - 43 0 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . gaussian_rvs ~ mu : 0 . ~ sigma : 1 . < - 0 . 43 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_gaussian_mean_0_p0_3_right _ = let test_name = " gaussian mean 0 sd 1 > 0 . 43 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . gaussian_rvs ~ mu : 0 . ~ sigma : 1 . > 0 . 43 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_exponential_lambda_1 _ = let test_name = " exponential lambda 1 > 0 . 69 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . exponential_rvs ~ lambda : 1 . > 0 . 69 in let tests = tests_for_p_0_5 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_exponential_lambda_1_p0_3_left _ = let test_name = " exponential lambda 1 < 0 . 41 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . exponential_rvs ~ lambda : 1 . < 0 . 41 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_exponential_lambda_1_p0_3_right _ = let test_name = " exponential lambda 1 > 1 . 10 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . exponential_rvs ~ lambda : 1 . > 1 . 10 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_hypergeometric_50_500_100 _ = let test_name = " hypergeometric 50 of 500 good pick 100 > 9 good " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 2 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . hypergeometric_rvs ~ good : 100 ~ bad ( : 1000 - 100 ) ~ sample : 195 >= 20 in let tests = tests_for_p_0_5 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_hypergeometric_50_500_100_p0_3_left _ = let test_name = " hypergeometric 50 of 500 good pick 100 > 9 good " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 2 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . hypergeometric_rvs ~ good : 100 ~ bad ( : 1000 - 100 ) ~ sample : 180 >= 20 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_hypergeometric_50_500_100_p0_3_right _ = let test_name = " hypergeometric 50 of 500 good pick 100 > 9 good " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 2 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . hypergeometric_rvs ~ good : 100 ~ bad ( : 1000 - 100 ) ~ sample : 212 < 20 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_gamma_shape_7_5_scale_1 _ = let test_name = " gamma scale 7 . 5 scale 1 . 0 > 7 . 17 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . gamma_rvs ~ shape : 7 . 5 ~ scale : 1 . > 7 . 17 in let tests = tests_for_p_0_5 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_gamma_shape_7_5_scale_1_p0_3_left _ = let test_name = " gamma scale 7 . 5 scale 1 . 0 < 6 . 08 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . gamma_rvs ~ shape : 7 . 5 ~ scale : 1 . < 6 . 08 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_gamma_shape_7_5_scale_1_p0_3_right _ = let test_name = " gamma scale 7 . 5 scale 1 . 0 > 8 . 38 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . gamma_rvs ~ shape : 7 . 5 ~ scale : 1 . > 8 . 38 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_beta_alpha_2_beta_5 _ = let test_name = " beta ( alpha 2 beta 5 ) 0 . 265 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . beta_rvs ~ a : 2 . 0 ~ b : 5 . 0 > 0 . 265 in let tests = tests_for_p_0_5 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_beta_alpha_2_beta_5_p0_3_left _ = let test_name = " beta ( alpha 2 beta 5 ) < 0 . 195 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . beta_rvs ~ a : 2 . 0 ~ b : 5 . 0 < 0 . 195 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_beta_alpha_2_beta_5_p0_3_right _ = let test_name = " beta ( alpha 2 beta 5 ) > 0 . 341 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . beta_rvs ~ a : 2 . 0 ~ b : 5 . 0 > 0 . 341 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_chi2_df_4 _ = let test_name = " chi2 ( 4 df ) > 3 . 36 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . chi2_rvs ~ df : 4 . 00 > 3 . 36 in let tests = tests_for_p_0_5 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_chi2_df_4_p0_3_left _ = let test_name = " chi2 ( 4 df ) < 2 . 38 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 2 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . chi2_rvs ~ df : 4 . 00 < 2 . 38 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_chi2_df_4_p0_3_right _ = let test_name = " chi2 ( 4 df ) > 4 . 58 " in let pretest _ = Owl_stats_prng . sfmt_seed 1 in let sampler _ length = length , fun _ -> M . chi2_rvs ~ df : 4 . 00 > 4 . 58 in let tests = tests_for_p_0_3 in run_random_tests test_name pretest sampler tests |
let test_set = [ " true_is_not_random " , ` Slow , test_true_is_not_random ; " alternate_is_not_random " , ` Slow , test_alternate_is_not_random ; " three_of_four_is_not_random " , ` Slow , test_three_of_four_is_not_random ; " two_of_four_is_not_random " , ` Slow , test_two_of_four_is_not_random ; " uniform_int_0_or_1 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_1 ; " uniform_ints_1_to_100 " , ` Slow , test_uniform_ints_1_100 ; " uniform_ints_1_to_100_even " , ` Slow , test_uniform_ints_1_100_even ; " uniform_ints_1_to_100_48 " , ` Slow , test_uniform_ints_1_100_48 ; " uniform_ints_1_to_100_45 " , ` Slow , test_uniform_ints_1_100_45 ; " uniform_ints_1_to_300_100 " , ` Slow , test_uniform_ints_1_300_100 ; " gaussian_mean_0 " , ` Slow , test_gaussian_mean_0 ; " gaussian_mean_0_p0_3_left " , ` Slow , test_gaussian_mean_0_p0_3_left ; " gaussian_mean_0_p0_3_right " , ` Slow , test_gaussian_mean_0_p0_3_right ; " exponential_lambda_1 " , ` Slow , test_exponential_lambda_1 ; " exponential_lambda_1_p0_3_left " , ` Slow , test_exponential_lambda_1_p0_3_left ; " exponential_lambda_1_p0_3_right " , ` Slow , test_exponential_lambda_1_p0_3_right ; " hypergeometric_50_500_100 " , ` Slow , test_hypergeometric_50_500_100 ; " hypergeometric_50_500_100_p0_3_left " , ` Slow , test_hypergeometric_50_500_100_p0_3_left ; ( " hypergeometric_50_500_100_p0_3_right " , ` Slow , test_hypergeometric_50_500_100_p0_3_right ) ; " gamma_shape_7_5_scale_1 " , ` Slow , test_gamma_shape_7_5_scale_1 ; " gamma_shape_7_5_scale_1_p0_3_left " , ` Slow , test_gamma_shape_7_5_scale_1_p0_3_left ; " gamma_shape_7_5_scale_1_p0_3_right " , ` Slow , test_gamma_shape_7_5_scale_1_p0_3_right ; " beta_alpha_2_beta_5 " , ` Slow , test_beta_alpha_2_beta_5 ; " beta_alpha_2_beta_5_p0_3_left " , ` Slow , test_beta_alpha_2_beta_5_p0_3_left ; " beta_alpha_2_beta_5_p0_3_right " , ` Slow , test_beta_alpha_2_beta_5_p0_3_right ; " chi2_df_4 " , ` Slow , test_chi2_df_4 ; " chi2_df_4_p0_3_left " , ` Slow , test_chi2_df_4_p0_3_left ; " chi2_df_4_p0_3_right " , ` Slow , test_chi2_df_4_p0_3_right ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_0 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_0 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_1 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_1 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_2 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_2 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_3 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_3 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_4 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_4 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_5 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_5 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_6 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_6 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_7 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_7 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_8 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_8 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_9 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_9 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_10 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_10 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_11 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_11 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_12 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_12 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_13 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_13 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_14 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_14 ; " uniform_ints_0_to_65536_bit_15 " , ` Slow , test_uniform_ints_0_to_65535_bit_15 ; " rough_cdf_matches " , ` Slow , test_rough_cdf_matches ] |
let cdf_approximations = M . 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let assert_parse_eq ( ? eof = true ) p str v = match parse_string ~ eof p str with | Failed _ -> assert_failure " parse failure " | Success x -> assert_equal x v |
let assert_parse ( ? eof = true ) p str = match parse_string ~ eof p str with | Failed _ -> assert_failure " parse failure " | Success _ -> assert_bool " ok " true |
let assert_parse_fail ( ? eof = true ) p str = match parse_string ~ eof p str with | Failed _ -> assert_bool " ok " true | Success _ -> assert_failure " expected parse failure " |
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