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MT254427.1
|
Aedes flavivirus
|
Fang,Y., Li,X.S., Zhang,W., Xue,J.B., Wang,J.Z., Yin,S.Q., Li,S.G., Li,X.H., Zhang,Y.
|
National Institute of Parasitic Diseases (NIPD), Chinese Center for Disease Control and Prevention (China CDC), Dept. of Vector-borne Tropical Disease
|
China
|
2021-05-30
| null |
Aedes flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,998 |
GenBank
| 1 |
China: Changdong community, Tengyue town, Yunnan Province
|
China
|
Aedes aegypti
| null |
2018-09-27
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Aedes flavivirus strain TC4A8_18-9L-Y-T-Aea-B-1-1, complete genome
|
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| 41,757 |
MT577804.1
|
Aedes flavivirus
|
Kubacki,J., Flacio,E., Qi,W., Guidi,V., Tonolla,M., Fraefel,C.
|
Univeristy of Zurich, Institute of Virology
|
Switzerland
|
2020-08-31
| null |
Aedes flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,038 |
GenBank
| 1 |
Switzerland: Ticino, Lugano
|
Switzerland
|
Aedes albopictus
| null |
2019-09
| null | null |
Aedes flavivirus strain AEFV/Ticino/2019, complete genome
|
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GTCCGCAAAATTCTGAACGCCGAGTCGAAATGTGATAACGTGTACAATGATGGGCTGGTCATCATGTCGCGTTTCCGAAAGAGTAATGACGTGATATAACTGCTTCAATCATATCACCTCAATTTAAGGGTCAGGAAAAGCTTTGGCGAAGTATTCCAAATAAGGCCCGTTTCGCCACGAATTCACACCCCCAGCTTCTCTAGCTAGGGGGTGATCCTCACGCTAAATTCCCCCAGTTTAGTCTGCTCGGAATTGGTGATGACCATTTCCCCTTAATGGGGAACTCAATTGTGTTCTCAACAGAACACAACATTGAAACCATGTTTACACTTTGGACTTAGGGAAATGGTTTCCGCTTGGGCGATCTTCCCAAAACGAGTCCATCGTGTGCAGATTTGGAAAACCAAATCTCCCCGCCCCGAGAGGAGAAGTCTCTCTCCCCTCGGAGTGGGGGCTGCATTGCAGTGGTTTCAGAGCAGGGCACAATAGTGTCGGGCCTGACGACCCCGCTCCCCCGAGTCGCCCAACGGAGTTTGGCTCAACTCTAAAAAGAAAATGAGCCGATTTGGACTTTCATAGTCCTATTGCCGCAGATCTACTGTTACAACGCAGCGCAGGGCATGAAAATGTCGGGCCTGACGAACCCGCGCACCCGAGTCCCCCAGCTGGGGAAGGGATCCTTGCATCCCCCCCTCCTGCAGGAAGGGCAAAAATCCTGCTGACCCCCCTGGTCATGGGAAACTGACCCGAGTAAGTAGTGGCGCCCTTGCTTGTACATCCGCCAGCTGATGGTCTTAAGCATCCCTCCCCTAGGAAAGGGGCAAGAGTGGCCTGTAAACACCACTGGAAGGCTCCAGTGCTCTTGCCTAAATGGCCAGCCAAAGCAACCCGAAGCTTTAAAAATCGGGCGGAGCAACAGGGAGAAATCCCGGGGAATTGCGAACCCCCTCCGAAATGTGAAAAATTATGGGAAAAGTACCCATCTAAGCCTCCCACCGTTAGGGAGTTTGGAATACCTTTTCTATACCATAGATGCGC
| 47,626 |
KJ741266.1
|
Aedes flavivirus
|
Bolling,B.G., Vasilakis,N., Guzman,H., Widen,S.G., Wood,T.G., Popov,V.L., Thangamani,S., Tesh,R.B.
|
University of Texas Medical Branch, Pathology
|
USA
|
2014-09-10
| null |
Aedes flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,063 |
GenBank
| 1 |
Thailand
|
Thailand
|
Aedes albopictus
| null |
2012
| null | null |
Aedes flavivirus strain Bangkok, complete genome
|
AGTTTTTAAAAACTTCTGTGAAGGTCACATCCCTAGTTGGATTACACCAATTTTAAAAATCTAGAAGTTGTTTGGAAGAGAGATATCTGGTTCGTATGAATAGGATGCTCTTGAAGAAAGGGCCTTCGGGCCAAACATCTGGTCGCCCATCGACTAGACCGCCGGACCCAGCGGAAAAGAGGGTAAAACGGGCCGCAGGAAATAAGACCAGCAAAAACCAGCGGCCACCAACAAAAGGAGCGACTCCATCATCGCTCCTTACCAGCCTATTCGGACGCAGAAAAGGAGGGGAGTGGCTTAGAATCCTCCAACTCGACATCGGGGCTGCGGTGTTGTGGCTGGCCCTCGCTGTCGGATCTCTCGGACAGCAATTGTGGCGCCAGATCACAGCGCTGAAGAAACGTGTCAATCGCTTGGAGGCACAGCGTAGTCATAGTCCTGTTTTCATTGTCTGCCTGGCTTTTTTATTCGGATTGGCTCTCTCGGAAACTTTACGGTATGGAACTGATGGAAATGGAAAACTGATTCTGGAAACGGAAAATGGTACTGCCATTGATTCTCGTAATTACAAACTTCCGGGTGACGCTTGCCTCGTGGGACTTCCGATTGAGAAACATTGCCCACTTGTTGGCAAGTTAGCCGATCTTGACAACATTGACTGTGGCTCAACGATTGAGGAGTTTAGGCTAAAGTATAACAGATGTCAAGTCACGCCCAGAAAGCGTAGGAGCTCTCAGCCACGGCCGGTCTCACACACTGGTCTAATTGAAGAAGTTGAGCTCTTGACCTTTAAATTCATGCGTGAGCACATGCCTATTTTCGTCGTTTGCCTTCTCGTTGTCTCCGTTGCTCGGAAATGGCCCATGTGGAGCGTGGTGGCCATAAGCGTGCTCACGTGGAATGTGGTTCGAGCTACTTCAATTGAGCCCTTGTACACCATAACGGCCACTGGAACATCGCTGAGTCACACCCGAATTTTGTCGAACGAGATGTACTCCATCTCCACAACTCGAGGGCTCATCCATCTGGACATCCACAACATAACGGTGCAAGGGGAAAGACCTTTTAAAACGTTGCTAACATCATGTGAGATTGTCGAAAGTGTGTCTGAAGACACATGCCCTGGTGGATCCCATCTTGAAATGGCTAAATTGCGACGTGCCAACCGGACTTGCAAAGTGGACGCATTCAATCGAGGCTGGGGAACCGGCTGTTTTGAATGGGGACTAGGACAAGTCGCTACGTGCGTAGAAGTCCAATGCCTGACCATGGTAAATGTATCCGTGCTTGTTGACTCAGTTATTCAAGCCACTGCCAGTATGGAACTCCACGGGCACCAAGACTCAAGAGCCGTGTTGCGCGACGTCCCCACTGTGTTTTACTTCGGGGATATAGGAACCATCACCTTGACTTGTGGTGCAACCACTGACAGACTGGCAAGTCAACATTACCACGTGCGTGATTCGTCGAAGTCCGGTCTCGTTTTGAAAGAGGCTGTAGATGCCTGGCCAGGGGTTATTCGTCTTGGCGAGTATGTATCCGGGATGGAGAAAATAATCAACTGGGGCGCCACGACAGCCAATGAGATTAAGGTCGATTCTGTGAGCAACCCGCAAATTGATTGGAAGGGTTCTGTTATCCAGGACATCCGCTCTATTTCGTTCACGTGTGAGATGATTTTTGAGAACGTAACGTTTACTAGCTTGCCGTTGTGTGTGGGTAATTTGAGTGGGGTATTCGTCCAAAACGGATATGGCCGAGACGGTGTTGTCTCGATCATCCTTGAGGAAAGCACCGCACAAGCGTGTAGCATCCCTATATCGAGCCGAGGTTGTACTGTCGTTGGGTCCACTGTCATTGTCGCGGCAAAGAGTCAAAGCGGCCGTGCGTACGTTATGTGCGGAAATGGAACTGGACATGTGGAACTCGCGGACAGCGTCGTTCCCGTTGAGTGTCTTGTTACACCGGTCGCTCAGGCTTGGAGGCTCATGACTCATGTTGCAGGTCGATACTCAAAACATGGCATGGCTGGTATCGGAAGCGTTTGGGAGGACCTGGTTCGCAACGTCCATTTTTCGTGGAGCTGGATCCCTGGGGGCTGGCTCGTTCCAGTTGTGTTGATCATTTTGTCCATTGTTTTCCTTGGTAGAGGGGTTACACTCGTTCTTGTTGTGGTGGTAGCTTCAATGTACATCCGCCGCGTGGCGGGGGATATCGGTTGCGGAATCGACACGACCAGGAGGACAATTTCGTGTGGACAAGGAGCTTTCGTGTGGAAGCAGCTCGGTAGTGGTCCAATGAAGGATCACTCCGTTGAGCTCGACGATTATGCCTTCACCAACTTGTACATTCGAGACATGTTCGACGGTACAAACAAACCCTGTTTGATATGTGAGGACACATTGCAGTGCGCCGCCCTGAGACGGGCAGCAGTTGCAGCAAGAATTGCTATGCATCCAGGGGTAATGTACGTGAACACTACCTTGTCGTACAACAGAACTTTCGTTGAAACTCGGAAACGAGTGTTGACAGTAACGCTGGAATCTCTGGAGTATAAAGTGGGATCTTACGTCACGCACGGCCGTCTTGAAGGAGATATGGGATATCTGCCCACATCCTTTGGCAGCCACCCTGAGCGTGAAACTGACAAAGTCCTACGAATTGTCGCTGCGCGCCCTGACATACGACGCATGTGCGGCAAAGCCATTGCATTTCAGTTCACGTTCACCGGGTTTCGGAGGAGTTTGTATGGGTCGAACGTACAAGTTGCTGTGTCAAAGCACGTGACTCGCCATTGCCCAACATATTTAGCTGGGGTAGCCGTGAAAAATGATAGGACCATAATCACTGACGGGATGTTTTGGATGGAGAGCGAGATTGTAAACGGAACTCAACGCATAGTCGTTCTTGAAATGTTGCAATCACATAGATGCCTATGGCCTTCGTCATACACTCCTGATGCGCTACTAGACCCAACAGATATGAACATATTCGTCCCTCCTGCTTGGGGGGGTCCCATCTCGAAAGCCAACCATGTCCCCGGGTATAAAATGCAAACAGACTTCCCGTGGAGCAGTCCAGAAATCTCGCTTCATCAAGGACCGGTTCCAGGCACCCAAGTTACGATCGATCCAAAGTGTGACGGTAGAATGCAAGCTAAGCCTGTGGACCCAGAAAGCAATGTAACGTGGTGTTGCAAAGCGTGTAACGCCATCATTCACTTTCGTGTCGGAGAAGAGTTTTTCTACCCAATGGAGATCCAGCCTGGCACTATGACGAACCATGAAAATCCGCGGCCAAAGATAGTAGAGACCCCACTAGACGGTGAAGAAGAGCCGCTAATGGAGGACATACTTGGAAGATACGGCAAAGCTGACGCAACTGCGGATTTTCACCGGCGGAACCCGCGCTCAGGAGGTGGGTTCGACAGATCCGTTTTAAACCTCCTGTGTCTCGCAATTGCCCTGCAGCTTATCGGGGCCCGCACACGAGCGACGACGTGGTCACGGTTAATTCTCACAACTGTAGCGATGCTTACTTTTGGCCTACCCAACATTTTTTCCTCGGTGGGCTTGTCGGCATGGGTATTTTTAGTTGCATCCTCGGCATATCAACCTATCGACGTCGTCATGAACCTCTGGATAATCCTCCAGACAGGGAGCTCGGCGGTAATCCTTCTAGGGTTCATGGTTCGACGCAAACTGTCGATAGTCTTGGGCCATCACCACCTTATGGCCTCAATTTGTCTCCAGTTTCTGTTTTGGGTTGTGGAACGTCAGCAACGAGCCTTCTCCGTATTCCTAGAAGCCGTAGCTGCGATAGTGCTGATTGGGGCCTATCGTGGGATGACCCAGGACCTTCCACCAGAGATCCTCACGTTTTGCCTGATTATGGGATGGAAAACGGCTCTGGCGCTGGGTACCGTTGCCTTACTGACGCAAGGTACGAACGCTTTTTACAAGTGGACGCAGAAATCACTAGGGTCCAAAAGCTCCTACAGGACCTCTGGCAGGAGCGCTTGGTTTTGGACCATTTCCTGTGCGAGCGCGGGCGCCATTTGGGCCGCGGAACGGGCAGACCACCCGTCGGCAGCGGCCGTCCTCGCCCTAATAACAATCATAGCCTTTCTATATATGGACCAAGCCAATGTGACCATGGAGCTTGAGTTTCTCTCGACGGGAGACGTGCCTGACGGGATTGCCCTTGAGGAAGATGAGGGGGGAAATTTCCGTGACCTACGTGGAACATATAGCGATGAGGGAATCACTATTGGCCAGGCCACGGGGTCCGCCCAGATCCCAGAAACCATGGTCATCATACTGATTGGGTGTGCTCTCACGTCTGCTTCTTTGTTTGTCGGAGCTTTGTACACCATCCTTGCCATCAGCACAAACATACCTCGCAATTTGTTTCGCCTGTGCAGATTAAAAATAAATGAGCATTGTCGCTCGGATGACCTGCTTGGTTTCGGGGGTGAGTCGACACAAGAAATTGAAACGAGTTTCGGAGACCTGCCAAATGGAATTTATCGAATTAATGTGCGCAGTTTCATGGAGAACCGACAGCGAGGAGTGGGCGTGGCTAAAAACGGAGTTTTCCACACGTTAATGCATGTCACCCGTGGAGAGCCTCTAAAATGGCGAGAAAAGCTTGTGTCTTTACATTCAGGAAGTGCTCTACGAGATGTCGTGTCGTATGGAGGGCCCTGGCAGCTGGAAAGCCCAACTGTTGCGGAGGAAATATCCCTCATGGCGTGCAAACCGGATAAGACTGTTGAGTATCACAAATATAAGCCTGGTGTTGTCAAACTGGATGACGAGAACGTGATGTTCATAAGCGTTGATTTTGGAAAGGGCTCCTCTGGATCTCCGTTTTTCGTAAATGGAGAGGTAGTGGGGTTTTACGGTTTTGGATTTTACGTGAATGGTGTGTATCGTTCCATTGTCGCGGGGGGGCGCCCCGGGGATATAACCCCAAATGAGGTTGCCGACTCCACAAGA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| 89,021 |
KC181923.1
|
Aedes flavivirus
|
Haddow,A.D., Guzman,H., Popov,V.L., Wood,T.G., Widen,S.G., Tesh,R.B., Weaver,S.C.
|
University of Texas Medical Branch, Department of Pathology
|
USA
|
2013-04-24
| null |
Aedes flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,079 |
GenBank
| 1 |
USA: Springfield, Missouri
|
USA
|
Aedes albopictus
|
pooled insects, larva
|
2011-08-09
| null | null |
Aedes flavivirus strain AEFV-SPFLD-MO-2011-MP6, complete genome
|
CCCCCAACTACTTCTGTGAAGGTCATATCCCTAGTTGGATTACGCCGCTTTTGAAAAATCTAGAAGTTGTTTGGAAAAGAGATATCTGGTTCGTATGAATAGGATGCTCTTGAAGAAAGGGCCTTCGGGCCAAACATCTGGTCGGCCATCGACCAGACCGCCGGACCCAGCGGAAAAGAGGGTAAAAAGGGCCGCAGGAAACAAGACCAGCAAAAACCAGCGGCCATCAACACGAGGAGCAACTCCATCATCGCTCCTCACCAGCTTATTCGGACGCAGAAAAGGAGGGGAATGGCTTAGAATCCTCCAACTTGACATAGGAGCCGCGGTGTTGTGGCTGGCTCTCGCTGTCGGATCTCTCGGACAACAACTGTGGCGCCAGATCACAATGCTGAAGAAACGTGTCAATCGCTTGGAGGCACAGCGTAGCCATAGTCCTGTTTTCTTTGTCTGCCTGGCTTTCTTATTTGGATTAGCTCTCTCGGAAACTCTACGGTATGGAACTGATGGAAATGGGAAACTGACCCTGGAAACGGAAGACGGTACTGCTATTGATTCTCTCAATTATAAACTTCCGGCTGACGCTTGCCTCGTAGGACTTCCGATTGAGAAACATTGCCCGCTCGTGAGCAAGCTCGCCGACCTGGACAACATTGACTGTGGCTCAACGTCTGAAGAGTTTAGGCTGAAATACAATAGATGTCAAGTCACGCCCAGAAAGCGTAGGAGCTCTCAACCACGGCCGGCCTCGCACACTGGCCTAATTGAAGAAGTTGAGCTCTTGACCTTTAAATTTACGCGTGAGCACATGCCTATTCTCGTCGTTTGCCTTCTCGTTGTCTCCGTTGCTCGGAAATGGCCCATGTGGAGTGTAGTGGCCATAAGTGTGCTGACGTGGAACGTGGTCCGAGCCACTTCTATTGAACCCCTGTACACGATAACGGCCACTGGAACATCAATGAGTCACACTCGTATCCTATCGAATGAAATGTACTCCATCTCTACGACTCGAGGGCTCATCCATCTTGACATTCACAACATAACAGTGCAAGGAGAAAGACCATTTAAAACGTTGCTAACATCATGTGAGATCGTCGAGAGTGTGTCCGAAGACACATGCCCTGGTGGATCCCATCTCGAAATGGCCAAGTTGCGACGTGCTAACCGGACCTGCAAAGTAGATGCATTCAATAGGGGCTGGGGAACCGGCTGTTTTGAATGGGGACTAGGACAAGTTGCCACGTGCGTTGAAGTCCAATGCCTGACCATGGTAAATGTCTCTGTGCTTGTTGACTCAGTTATTCAAGCCACTGCCAGTATGGAACTCCATGGGCACCAAGACTCAAGAGCCGTGTTGCGTGATGTTCCCACGGTGTTTCATTTCGGGGACATAGGAACCATCACCTTGACTTGCGGTGCAACCACTGACAGATTGGCTAGCCAACATTACCACGTGCGTGATTCCTCAAAGTCCGGTCTCGTTTTGAAAGAAGCTGTTGATGCCTGGCCCGGGGTTATTCGCCTCGGTGAATACACATCCGGGATGGAGAAAATAATCAATTGGGGCGTCACAACAGCCAATGAGATTAAGGTCGATTCTGTGAACAACCCGCAAATTGATTGGAAGGGTTCTGTTATCCAGGACATCCGCTCCATTTCGTTCACGTGCGAAATGATTTTTGAGAACGTGACGTTTACTAGTTTACCGCTGTGTGTTGGCAATTTGAGTGGGGTATTTGTCCAAAACGGGTATGGCCGCGATGGCGTTGTCTCGATCATCCTCGAAGAGAGTACTCCGCAGGCTTGTAGCATTCCTATATCGAGCCGAGGATGTACTGTCGTTGGGTCTACTGTCATCGTCGCAGCAAAAAGTCAAAGCGGCCGCGCGTACGTCATGTGTGGGAATGGGACTGGCCACGTAGAACTCGCGGACAGTGTCGTCCCTGTTGACTGTCTCGTCACACCGGTAGCCCAGGCTTGGAGGCTTATGACTCATGTGGCCGGTCGATACTCAAAACATGGCATGGCTGGTATTGGAAGCGTCTGGGAGGACCTGGTGCGAAACTTTCACTTTTCGTGGAGTTGGATTCCAGGAGGCTGGCTCGTTCCAGTTGTGTTGATTGTCTTGTCCATAGTGTTCCTAGGCAGAGGAGTTACGCTCGTTATTGTCGTGGTGATAGCCTCAATGTACATTCGTCGTGTGGCGGGGGACATTGGTTGTGGAATCGACACAACCAGGAGAACCATCTCGTGTGGACAAGGGGCCTTCGTGTGGAAGCAGCTTGGCAGTGGCCCAATGAAGGATCACTCCGTTGAGCTCGACGACTATGCTTTCACCAACTTGTACATTCGCGACATGTTCGACGGTACAAATAAACCTTGTTTGATATGCGAGGACACACTGCAGTGCGCCGCCCTGAGACGAGCCGCAGTCGCCGCAAGAATTGCTATGCATCCAGGGGTGATGTATGTGAACACCACTCTATCGTACAACAGAACTTTTGTTGAAACGCGAAAACGGGTTTTGACAGTGACGTTGGAATCTTTGGAGTATAAAGTAGGATCCTACGTCACACATGGTCGTCTTGAGGGGGACATGGGATATCTGCCTACATCCTTCGGCAGCCACCCTGAGCGTGAAACTGATAAAGTTCTACGAATTGTCGCAGCGCGCCCCGACATACGCCGCATGTGCGGCAAGGCTATTGCATTCCAGTTTACGTTCACGGGATTTCGAAGGAGTTTGTACGGGTCGAATGTACAAGTTGCCGTGTCAAAGCATGTGACTCGCCACTGTCCAACATACTTGGCCGGGGTAGCCGTTAAAAATGACAGGACCATAATCACCGACGGGATGTTTTGGATGGAGAGCGAGATTGTAAACGGAACCCAACGCATAGTTGTTCTTGAAATGTTGCAATCACATAGATGCCTTTGGCCTTCGTCATACACTCCCGATGCATTGTCAGACCCAACGGACATGAACATCTTCGTCCCTCCTGCTTGGGGAGGTCCCATCTCAAAAGCTAACCATGTCCCCGGGTATAAAATGCAAACAGACTTCCCGTGGAGTAGCCCGGAGATTTCGCTTCATCAAGGACCAGTTCCAGGCACCCAAGTCACAATTGACCCAAAATGTGACGGTAGAATGCAAGCTAAGCCCGTGGATCCAGAAAGCAATGTGACTTGGTGTTGCAAAACATGCGACGCCATTATCCACTTCCGCGTCGGAGAAGAGTTTTTCTATCCAATGGAGATTCAGCCTGGCACCATGGCGAGCCGCGAAAATCCGCGGCCAAAGATAGTGGAGACCCCGCTAGATGGTGAAGAAGAGCCGCTAATGGATGACATACTTGGAAGGTATGGCAGAGCTGACGCAACCGCGGATTTTCACCGGCGGAACCCACGCTCAGGAGGGGGGTTCGACAGATCCGTTTTAAACCTCCTGTGTCTCGCAATCGCCTTGCAGCTTATTGGGGCCCGCACACGAGCGACGACGTGGTCACGGTTGATTCTCACAACTGTCGCGATGCTTACTTTTGGCCTACCCAACATTTTTTCCTCGGTGGGCTTGTCGGCATGGGTGTTTTTAGTTGCGTCATCGGCATATCAACCTATCGACGTCGTCATGAACCTCTGGATAATCCTCCAGACAGGGAGCTCGGCTGTAATCCTCCTAGGGTTCATGGTTCGACGCAAACTGTCAATAGTTTTGGGCCATCACCACCTTATGGCCTCAATTTGTCTCCAGTTTCTGTTTTGGGTTGTGGAACGTCAGCAACGAGCCTTCTCCGTATTCCTAGAAGCCGTAGCTGCGATAGTGCTGATTGGGGCCTATCGTGGGATGACTCAGGACCTTCCACCAGAGATCCTCACGTTTTGCTTGATAATGGGATGGAAAACGGCATTGGCGCTAGGTACCGTTGCCTTACTGACGCAAGGTACGAGCGCTTTTTACAAGTGGACGCAGAAATCACTAGAGTCCAAAAGCTCCTACAGGACCTCTGGCAGGAGCGCTTGGTTTTGGACCATTTCCTGTGCGAGCGCGGGCGCCATTTGGGCCGCGGAACGGGCAGACCACCCGTCGGCAGCGGCCGTTCTCGCCCTAATAACAATCATAGCCTTTCTATACATGGACCAAGCCAATGTGACCATGGAGCTTGAGTTTCTCTCGACGGGGGACGTGCCTGACGGGATCGCCCTTGAAGAAGATGAAGGGGGAAACTTCCGTGACCTTCGAGGAACATATAGCGATGAGGGAATCACTATTGGCCAAGACATGGGGTCCGCCCAGATCCCAGAGACCATGGTCATCATATTGATTGGTTGTGCCCTCACGTCTGCTTCTTTGTTTGTCGGAGCTCTGTACACCATCCTTGCTATCAGCACAAACATACCTCGCAACTTATTCCGCCTGTGCAGATTGAAAATAAATGAGCATTGCCGCTCGGATGACTTGCTTGGTTTCGGGGGTGAGTCGACACAAAAGATTGAAACAAGCTTTGGAGACTTGCCAAATGGAATCTATCGAATTAATGTACGTAGTTTCATGGAAAACCGACAACGTGGAGTGGGTGTGGCAAAAAATGGAGTTTTCCACACGTTAATGCATGTCACTCGTGGAGAGCCCCTCAAATGGCGAGAAAAGCTAGTGTCCTTACATTCGGGAAGTGCTTTACGAGATGTAGTGTCGTATGGTGGACCTTGGCAGTTGGAAAGTCCAACTGTTGCGGAGGAGATATCCCTCATGGCGTGCAAACCGGATAAGACTGTCGAGTATCATAAATACAAGCCTGGTGTCGTAAAGCTGGACAATGAGAACGTAATGTTCATAAGCGTTGATTTTGGCAAAGGGTCCTCTGGATCTCCGTTTTTCGTTAATGGAGAAGTGGTGGGTTTTTACGGATTCGGATTTTACGTGAATGGCGTCTATCGTTCCATTGTTGCGGGGGGGCGTCCCGGGGACATAGCGCCGAATGAGGTGGCTGACTCCACGAGAA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| 94,286 |
AB488408.1
|
Aedes flavivirus
|
Hoshino,K., Isawa,H., Tsuda,Y., Sawabe,K., Kobayashi,M., Kyoko,S., Mutsuo,K.
|
Department of Medical Entomology; Toyama1-23-1, Shinjuku, Tokyo 1628640
|
Japan
|
2009-07-08
| null |
Aedes flavivirus
|
Flavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,064 |
GenBank
| 1 |
Japan:Chiba, Narita
|
Japan
|
Aedes albopictus
| null |
2003
| null | null |
Aedes flavivirus genomic RNA, complete genome, strain: Narita-21
|
AGTTTTTAAAAACTTCTGTGAAGGTCACATCCCTAGTTGGATTACGCCGCTTTTGAAAAATCTAGAAGTTGTTTGGAAAAGAGATATCTGGTTCGTATGAATAGGATGCTCTTGAAGAAAGGGCCTTCGGGCCAAACATCTGGTCGGCCATCGACCAGACCGCCGGACCCAGCGGAAAAGAGGGTAAAAAGGGCCGCAGGAAACAAGACCAGCAAAAACCAGCGGCCATCAACACGAGGAGCAACTCCATCATCGCTCCTCACCAGCTTATTCGGACGCAGAAAAGGAGGGGAATGGCTTAGAATCCTCCAACTTGACATAGGAGCCTCGGTGTTGTGGCTGGCTCTCGCTGTCGGATCCCTCGGACAACAACTGTGGCGCCAGATCACAATGCTGAAGAGACGTGTCAACCGCTTGGAGGCACAGCGTAGCCATAGTCCTGTTTTCTTTGTCTGCCTGGCTGTCTTATTTGGATTAGCTCTCTCGGAAACTCTACGGTATGGAACTGATGGAAATGGGAAACTGACCCTGGAAACGGAAGACGGTACTGCTATTGATTCTATCAATTATAAACTTCCGGCTGACGCTTGCCTCGTAGGACTTCCGATTGAGAAACACTGCCCGCTCGTGAGCAAGCTCGCCGACCTGGACAACATTGACTGTGGCTCAACGACTGAAGAGTTTAGGCTGAAATACAATAGATGTCAAGTCACGCCCAGAAAGCGTAGGAGCTCTCAACCACGGCCGGCTTCGCACACTGGCCTAATCGAAGAAGTTGAGCTCTTGACCTTCAAATTTATGCGTGAGCACATGCCTATTTTCGTCGTTTGCCTTCTCGTTGTCTCCGTTGCTCGGAAATGGCCCATGTGGAGTGTAGTGGCCATAAGTGTGCTGACGTGGAACGTGGTCCGAGCCACTTCCATTGAACCCCTGTACACGATAACGGCCACTGGAACATCAATGAGTCACACTCGTATTCTATCGAATGAAATGTACTCCATCTCTACGACTCGAGGGCTCATCCATCTGGACATCCACAACATAACAGTGCAAGGAGAAAGACCATTTAAAACGTTGCTAACATCATGTGAGATCGTCGAGAGTGTGTCCGAAGACACATGCCCTGGTGGATCCCATCTCGAAATGGCCAAGTTGCGACGTGCTAACCGGACCTGCAAAGTAGATGCATTCAATAGGGGCTGGGGAACCGGCTGTTTTGAATGGGGACTAGGACAAGTTGCCACGTGCGTTGAAGTCCAATGCCTGACCATGGTAAATGTATCTGTGCTCGTTGACTCAGTTATTCAGGCCACTGCCAGTATGGAACTCCATGGGCACCAAGACTCAAGAGCCGTGTTGCGTGATGTTCCCACGGTATTTCATTTCGGGGACATAGGAACCATCACCTTGACTTGCGGTGCTACCACTGACAGATTGGCTAGCCAACATTACCATGTGCGTGATTCGTCAAAGTCCGGTCTCGTTTTGAAAGAAGCTGTTGATGCCTGGCCCGGGGTTATTCGCCTCGGTGAATACACATCCGGGATGGAGAAAATAATCAACTGGGGCGTCACAACAGCCAATGAGATTAAGGTCGATTCTGTGAACAACCCGCAAATTGATTGGAAGGGTTCTGTTATCCAGGACATCCGCTCCGTTTCGTTCACGTGCGAAATGATTTTTGAGAACGTGACGTTTACTAGTTTACCGCTGTGTGTTGGCAATTTGAGTGGGGTATTTGTCCAAAACGGGTATGGCCGTGATGGCGTTGTCTCGATCATCCTCGAAGAGAGCACTCCGCAGGCTTGTAGCATTCCTATATCGAGCCGAGGATGTACTGTCGTTGGGTCTACTGTCATCGTCGCAGCAAAAAGTCAAAGCGGCCGCGCGTACGTCATGTGTGGGAACGGGACTGGCCACGTAGAACTCGCGGACAGTGTCGTCCCTGTTGACTGTCTCGTCACACCGGTAGCCCAGGCTTGGAGGCTTATGACTCATGTGGCCGGTCGATACTCAAAACATGGCATGGCTGGTATCGGAAGCGTCTGGGAGGACCTGGTGCGGAACTTTCACTTTTCGTGGAGTTGGATTCCAGGAGGCTGGCTCGTTCCAGTTGTGTTGATTGTCTTGTCCATAGTGTTCCTAGGCAGGGGAGTTACGCTCGTTATTGTCGTGGTGATAACCTCTATGTACATTCGTCGTGTGGCGGGGGACATTGGTTGTGGAATCGACACAACCAGGAGAACCATCTCGTGTGGACAAGGAGCCTTCGTGTGGAAGCAGCTTGGCAGTGGCCCAATGAAAGATCACTCCGTTGAGCTCGACGACTATGCTTTCACCAACTTGTACATTCGCGACATGTTCGATGGTACAAACAAACCTTGTTTGATATGCGAGGACACATTGCAGTGCGCCGCCCTGAGACGAGCCGCAGTCGCCGCAAGAATTGCTATGCATCCAGGGGTGATGTATGTGAACACCACTCTATCGTACAACAGAACTTTTGTTGAAACGCGAAAACGGGTTTTGACAGTGACGCTGGAATCTTTGGAGTATAAAGTAGGATCCTACGTCACACATGGTCGTCTTGAGGGGGACATGGGATATCTGCCCACATCCTTCGGCAGCCACCCTGAGCGTGAAACTGATAAAGTTCTACGAATTGTCGCAGCGCGCCCCGACATACGACGCATGTGCGGCAAGGCTATTGCATTCCAGTTTACGTTCACGGGATTTCGAAGGAGTTTGTACGGGTCGAATGTACAAGTTGCCGTGTCAAAGCATGTGACTCGCCACTGTCCAACATACTTGGCCGGGGTAGCCGTAAAAAATGACAGGACCATAATCACCGACGGGATGTTTTGGATGGAGAGCGAGATTGTAAACGGAACCCAACGTATAGTTGTTCTTGAAATGTTGCAATCGCATAGATGCCTTTGGCCTTCGTCATACACTCCCGATGCATTATTAGACCCAACGGACATGAACATCTTCGTCCCTCCTGCTTGGGGAGGTCCCATCTCAAAAGCCAACCATGTCCCCGGGTATAAAATGCAAACAGACTTCCCGTGGAGTAGCCCGGAGATCTCGCTTCATCAAGGACCAGTTCCAGGCACCCAAGTCACAATTGACCCAAAATGTGACGGTAGAATGCAAGCTAAGCCCGTGGATCCAGAAAGCAATGTGACTTGGTGTTGCAAAACATGTGACGCCATTATTCACTTCCGCGTCGGAGAAGAGTTTTTCTATCCAATGGAGATTCAGCCTGGCACCATGGCGAGCCGTGAAAATCCGCGGCCAAAGATAGTGGAGACCCCGCTAGATGGTGAAGAAGAGCCGCTAATGGATGACATACTTGGAAGGTATGGCAAAGCTGACGCAACCGCGGATTTTCACCGGCGGAACCCACGCTCAGGAGGGGGGTTCGACAGATCCGTTTTAAACCTCCTGTGTCTCGCAATCGCCTTGCAGCTTATTGGGGCCCGCACACGAGCGACGACGTGGTCACGGTTGATTCTTACAACTGTCGCGATGCTTACTTTTGGCCTACCCAACATTTTTTCCTCGGTGGGCTTGTCGGCATGGGTGTTGTTAGTTGCGTCATCGGCATATCAACCTATCGACGTCGTCATGAACCTCTGGATAATCCTCCAGACAGGGAGCTCGGCTGTAATTCTACTAGGGTTCATGGTTCGACGCAAACTGTCAATAGTTTTGGGCCATCACCACCTTATGGCCTCAATTTGTCTCCAGTTTCTGTTTTGGGTTGTGGAACGTCAGCAACGAGCCTTCTCCGTATTCCTAGAAGCCGTAGCTGCGATAGTGCTGATTGGGGCCTATCGTGGGATGACTCAGGACCTTCCACCAGAGATCCTCACGTTTTGCTTGATAATGGGATGGAAAACGGCATTGGCGCTAGGTACCGTTGCCTTACTGACGCAAGGTACGAGCGCTTTTTACAAGTGGACGCAGAAATCACTAGAGTCCAAAAGCTCCTACAGGACCTCTGGCAGGAGCGCTTGGTTTTGGACCATTTCCTGTGCGAGCGCGGGCGCCATTTGGGCCGCGGAACGGGCAGACCACCCGTCGGCAGCGGCCGTTCTCGCCCTAGTAACAATCATAGCCTTTCTATACATGGACCAAGCCAATGTGACCATGGAGCTTGAGTTTCTCTCGACGGGGGACGTGCCTGACGGGATCGCCCTTGAAGAAGATGAAGGGGGAAACTTCCGTGACCTTCGAGGAACATATAGCGATGAGGGGATCACTATTGGCCAAGACATGGGGTCTGCCCAGATCCCAGAGACCATGGTCATCATATTGATTGGTTGTGCCCTCACGTCTGCTTCTTTGTTTGTCGGAGCTCTGTACACCATCCTTGCTATCAGCACAAACATACCTCGCAATTTATTCCGCCTGTGCAGATTGAAAATAAATGAGCATTGCCGCTCGGATGACTTGCTTGGTTTCGGGGGTGAGTCGACACAAAAGATTGAAACAAGCTTTGGAGACTTGCCAAATGGAATCTATCGAATTAATGTACGTAGCTTCATGGAAAACCGACAGCGTGGAGTAGGTGTGGCAAAAAACGGAGTTTTCCACACGTTAATGCATGTCACTCGTGGAGAGCCCCTCAAATGGCGAGAAAAGCTAGTGTCCTTACATTCGGGAAGTGCTTTACGAGATGTAGTGTCGTATGGAGGGCCTTGGCAGTTGGAAAATCCAACTGTTGCGGAGGAGATATCCCTCATGGCGTGCAAACCGGATAAGACTGTCGAGTATCATAAATACAAGCCTGGTGTTGTCAAACTGGACAACGAGAACGTAATGTTCATAAGCGTTGATTTTGGCAAAGGGTCCTCTGGATCTCCGTTTTTCGTTAATGGAGAAGTGGTGGGTTTTTACGGATTCGGATTTTACGTGAATGGCGTCTATCGTTCCATTGTTGCGGGGGGGCGTCCCGGGGACATAGCGCCGAATGAGGTTGCTGACTCCACGAG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| 102,630 |
MF155889.1
|
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Monakhova,E.V., Pisanov,R.V., Ezhova,M.I., Titova,S.V.
|
Research Institute for Plague Control, Cholera Microbiology
|
Russia
|
2018-05-02
| null |
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Affertcholeramvirus
|
Inoviridae
|
ssDNA(+)
| 6,698 |
GenBank
| null |
Russia: Rostov-on-Don
|
Russia
|
Vibrio cholerae
| null |
1999
| null | null |
Affertcholeramvirus CTXphi, complete genome
|
TCCCACAGAGCCTGTGATACTCACCTTGTATTCGCAAGCGTAGCGCGCCAGTGTTTGAGCGCTAGCGAGTCTTTTGATTACCTACCTAAATTCTTTTTGTATTTCTCGACTCTTACTTCTCATCAGCAAAGCCTCCATCAAAATGAATAATGACTCTTTTTCTGGTTCATCAAGTGATTCAATCATTCGGATTTTCGATTTCAGCTTTTCGTCAATGTTTGTTTCGCTATCGCTGACAAGTTCAGCTATTGGTACACCATAGAATTTTGCTAATTTTTCTACAGTTTCCAGTTTTGGTGATTGTGTGCCTTTTTCATAAGCTAAATAGGTATTTTTTCCAACGCCGATACCATTTGCTACTTCTTCTTGGTTTAGATCTCTCTCAACTCTTAAATCCCTAATTTTTGAACTAAACATACATACCACCCCTATAGTTGTGCTTATTTTTGAACATTATAATCCCTGTTTTTTTGGACAGCTGTTTACAATCCCAATATTTTGGGATAACTTATCACTATAAATTGAACTTGACAGGTTTTTGAAGGCTAATGAAAAAGCAGATTTTCACTCTTGATGAATTACAACTCGATACAAACGCTTCTCCGTTTGTTTTTGTCGATTATCTTGCTTGGTCGGTTCCTTATGCTTCATTCCGTCACGCGCATAAGTCCGATTTGTCCTCGCTTATCTGGGCGCCTCTTCCTAAGCCTGATTACCGTATGGCTCGCACACCTGAGCAAAAAGAGAAGTTAATCGAGCTTTATAAGCAGAAGTGGAACGTTGCCATGATGGAACGCTTGGAGGTCTTTTGCCTTCATGTTCTTGGTCTTCGTATGTCGCCTTGGCGCGATAAGGGGCTTTATGGGTATGAAAACTCATGCCATTTGATGTCTAAGTACTCCAATAAACACGTGGGCTTTGTTGCGCTAGGGGGAAACCGTAATACCTGTTACTTCCAAATTGAGGGAGTAGGGTGTCGAACCGTGTTAGAGCACACCTCTTTATTCCGTCTTCATTGGTGGCTCGATTTATTAGGTTGCTCTCGTCTGTCTCGTATTGATTTAGCCGTTGATGACTTTCACGGTTTGTTTGGCCGTGAGTACGCCAAAAAAGCCTATTCCGATGACGCCTTTCGCACCGCTAGAGCGGGACGTGCCCCTAACGGTGGTGAGCGATTAGTCTCTGAGCCTAATGGCAAAATCATCAATGAATCTTTCGAGGTAGGCTCTCGTGAATCTCGCATTTACTGGCGTATCTACAACAAGGCTGCTCAGCTTGGTTTAGATATGCACTGGTTTCGTAATGAGGTCGAGCTTAAAGATATGCCTATCGACGTTCTGCTCAATATCGAGGGGTATTTTGCAGGTTTGTGCGCGTACTCGGCCTCAATTATCAATTCCTTGCCTGTCAAGGTGGTCACAAAAAAGCGTCAAGTGGCGCTTGATATCCACTCACGCATTAAGTGGGCTCGTCGTCAGGTCGGTAAGACGTTGTTTGATATTTCAAAGCATTTTGGTGGTGATTTGGAAAGGGTGTTTGGGGCGTTGATTTCTAAGGAAATTCACGACGATTCACTCAACCTTCCAGATTCTTATATGAAGTTAATTGATGAAATTATGGGTGATTAATATGAAATCTCGTTTTGTTGTTTTTGGTGCCTCTCATTCTGAAGGGGTGAGTAAGACTGGTGCTCCTTACCTTATCCCAGTGCTTTTTGTTGGTAAGCCGATTCGCCAGTGGAAAAACGATAAAGGCCAATGTTTGACGTTTGGCTTGCAGCATCAGGAAGTGAAATTTGTATCCAGTGACGCGATGACCAGAAAACTCGAACAGACCGCCTTTCCGGTTCTTGTCACGTTTGACAATGAGCCAGACCCAGAAGACCCATCGCGTAACCTCGTGATTGATTATCAAGTGGTGTGTTCCTTGTTTGACAACGTGCCGGGCGGCAAGCCATTGGATAAACCTCAACCCATTAAATCTTGATGGACTTAACCCATTATGTCTGGAGCGAGGCGCTCTATTTCGCGGTGGTCAAGGCCGTTCTCGTTCTGTTCTTTACATCCTTTGGGATTGGCGCGGTTGCCAGTCTCATTTTATCCACGGTAAAGGAGAAGCTACATGTTTAGCTCACTGAAAAACAAACTTAATACCTTTAAAAGCACCCTTTCACTCGGGGTTTTCTTGCTGTTTTCCGCATTTGCTAACCAAGCACTCGCGGCTGCTGATACGGGTTTGGTCGCGGAAGTCACCAAAACACTGGGCACCAGTAAAGATACGGTGATTGCGCTTGGGCCGCTTATCATGGGCGTGGTGGGAGCAATTGTTCTGATTGTTACCGTGATTGGCTTAATTCGTAAGGCTAAATAGTGCTTGAGTTGTGGCTGGGTCTCTTTGGCTCAGCGGTCATCATTATCGGCTTTGTGTCGGGCTTATATTTGGTTTAAGGGAGGAGGGCGAGCGTTCGCCCTTTTTTATGCGCTATTTTCTACTGTTTTTGACATTGCTCTTTCTTTCTCCATCGGTAACAGCTTCCTCCATCAATTGTGATCCTAATACTACTACGTCACACCAGTTACTTTTCGGTTTTGGCTCTCCCATTGTGCAATCGGTGTTATTTGATGGCTGCATGCTTGATATTGAAAAAGATGACTATGGTTTTGTTTGGTCTTGTCTCTCAAATGAAAATGGGGACTATTGCAAGGGGCTCTACAAACCCCGTTTTACACAAGGGGTGTCCCCGAACTGGCCGATGTGCGACTTGTCCGGAGCATCTGCAGAGCGCTGCATTTATCCTTATTGCCCTGAGGGGGAAGAGTGCGTTCCCTTACCACCTTCACCGCCCAGTGATTCCCCTGTTGATGGGCTGAGCAGCTCGTTTAAGTCTGCGTTCAATCAGGTCTATAAAAACCAATCAGAGATGGCTTCGACTCTCAATCATGTCAGTGGTCAGGTGTCCCACTCTCAAGATATGGTTCAGCTCAATACGAAGTTTCACGCGGACCGTGTTCTTGAAAAAGTGAACGCAATCAACAATCGATTGAATGGGCAGATAAACTATCTTGAAGAAGTTCGCATCGATGTATGGGATACACAACGGGAGGTCAGAAAAGCCAAGGATGAACTCTCTTCACGTGTTGGTTCTGTTGCACACGATGTTTACCAAAGTAAGAATGCTGTGCTTCGGGCGATTGATGAGCTTAAAGATTCACTCGGTGGGGTTGTCGTTCCGCCTAACCCAGACCAACCCAATCCCACGCCACCCGATAGCAGCAGCCCCAATTATACAGGGGCGCTTAATACCATCTCTAAAAAGCTCAATACCTTAGAGACGATTTCACAGCAACTCGACACCATGAACACGGCGCTATCAGGGCGCTGTAGTAACCCTGCTCGCTGTCAGTTTCCGATACGCGAGGCCGAGACCGAGTTAGAAACGGCTCAGCAGAATTTAAAGCAGATGATCAACGATAAAATCACCCAGTCGGCTTTGCATCAGTTCAAAGGCTCGGCGGCGGTGCCTTCGTTTTGCTCCTATGTCGAGGAGTTTGGTTACAACCTCTGTTTTGACTTCTCCCTCTTTTCTGAAAACCTGCACATCATCCGCATGATAGTGCTCGCGATGGCGTACATTCTGGCCGCCATGCTCATTTTGTTTAGGTGATGCTTATGATGGACCCCCTTTATGACTGGCTAATTGATGGCTTTACGTGGCTTGTGATCAAGCTCGGTATTATGTGGATTGAGAGCAAGATTTTTGTCATCCAATTCTTCTGGGAGATGTCCCAGAAAGTGATTGATATGTTTACCATCTATCCGCTTATCCAACAGGCTATCGATATGCTGTCTCCTCAATACAGCGGCTTTCTGTTCTTTTTAGGGTTAGACCAAGCGCTGGCTATCGTGCTTCAGGCTTTGATGACCCGTTTCGCCCTGCGAGCGTTAAACCTATGAGTATCTTTATTCATCACGGCGCGCCAGGCTCTTATAAAACGTCCGGGGCATTATGGCTTCGTCTGCTGCCGGCGATTAAGTCAGGCCGTCACATCATCACGAATGTGCGAGGCTTAAACCTTGAACGCATAGCTAAGTACTTAAAAATGGACGTCTCAGACATCAGTATCGAGTTTATTGATACAGACCATCCAGACGGTCGCTTAACGATGGCGCGTTTTTGGCACTGGGCGAGAAAGGACGCGTTTCTCTTTATTGATGAATGTGGTCGCATCTGGCCGCCGAGACTGACGGCCACCAATTTAAAGGCGCTCGACACGCCGCCGGATTTGGTCGCAGAGGATAGGCCTGAGAGCTTTGAGGTGGCTTTTGACATGCATCGTCACCACGGCTGGGATATCTGCCTAACCACGCCTAACATTGCCAAAGTGCACAACATGATAAGAGAGGCGGCGGAGATAGGGTATCGCCACTTTAACCGCGCCACGGTGGGGCTAGGGGCAAAGTTTACCCTGACCACCCACGATGCAGCCAACTCTGGACAGATGGATTCGCACGCGCTGACACGCCAAGTCAAAAAAATTCCAAGTCCGATTTTTAAGATGTACGCAAGCACCACCACAGGCAAAGCACGCGACACGATGGCCGGAACGGCGCTGTGGAAAGACAGAAAGATCCTTTTCTTGTTCGGCATGGTTTTTTTGATGTTCTCTTATTCGTTTTACGGCTTACACGACAATCCAATTTTTACAGGGGGAAATGATGCAACTATCGAGTCAGAGCAATCCGAGCCTCAGTCAAAGGCTACTGCTGGGAATGCTGTCGGGAGCAAGGCGGCTGCTCCTGCGTCTTTTGGTTTTTGTATTGGTCGGCTTTGTGTCCAAGATGGTTTTGTCACTGTTGGTGATGAGCGTTATCGCCTCGTAGACAATTTGGACATTCCTTATCGTGGTCTATGGGCGACAGGTCATCACATTTACAAGGATACGCTTACAGTGTTTTTTGAAACCGAGAGTGGCAGCGTCCCAACAGAGCTGTTTGCATCG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| 70,877 |
KJ540269.1
|
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Kim,E.J., Lee,D., Moon,S.H., Lee,C.H., Kim,S.J., Lee,J.H., Kim,J.O., Song,M., Das,B., Clemens,J.D., Pape,J.W., Nair,G.B., Kim,D.W.
|
Hanyang University, Pharmacy
|
Korea
|
2014-05-17
| null |
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Affertcholeramvirus
|
Inoviridae
|
ssDNA(+)
| 7,091 |
GenBank
| 1 | null | null | null | null | null | null | null |
Vibrio phage CTX plasmid pCTX1*Kan, complete sequence
|
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|
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|
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|
Hanyang University, Pharmacy
|
Korea
|
2014-05-17
| null |
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Affertcholeramvirus
|
Inoviridae
|
ssDNA(+)
| 7,091 |
GenBank
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|
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| 90,405 |
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|
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Kim,E.J., Lee,D., Moon,S.H., Lee,C.H., Kim,S.J., Lee,J.H., Kim,J.O., Song,M., Das,B., Clemens,J.D., Pape,J.W., Nair,G.B., Kim,D.W.
|
Hanyang University, Pharmacy
|
Korea
|
2014-05-17
| null |
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Affertcholeramvirus
|
Inoviridae
|
ssDNA(+)
| 7,088 |
GenBank
| 1 | null | null | null | null | null | null | null |
Vibrio phage CTX plasmid pCTX-5 Kan, complete sequence
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| 90,406 |
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|
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|
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|
Hanyang University, Pharmacy
|
Korea
|
2014-05-17
| null |
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Affertcholeramvirus
|
Inoviridae
|
ssDNA(+)
| 7,088 |
GenBank
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Vibrio phage CTX plasmid pCTX-6 Kan, complete sequence
|
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| 90,407 |
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|
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Kim,E.J., Kim,D.W.
|
Hanyang Universty, Pharmacy
|
Korea
|
2014-05-05
| null |
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Affertcholeramvirus
|
Inoviridae
|
ssDNA(+)
| 6,446 |
GenBank
| null |
USA: Gulf Coast
|
USA
|
Vibrio cholerae
| null | null | null | null |
Vibrio phage CTX, complete genome
|
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|
Hanyang University, Pharmacy
|
Korea
|
2013-11-03
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Affertcholeramvirus CTXphi
|
Affertcholeramvirus
|
Inoviridae
|
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|
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Hanyang University, Pharmacy
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Korea
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2013-11-03
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Affertcholeramvirus
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Inoviridae
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Vibrio phage CTX transgenic plasmid pCTX-1-1kan, complete sequence
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| 92,765 |
KF664581.1
|
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Kim,E.J., Kim,D.W.
|
Hanyang University, Pharmacy
|
Korea
|
2013-11-03
| null |
Affertcholeramvirus CTXphi
|
Affertcholeramvirus
|
Inoviridae
|
ssDNA(+)
| 7,091 |
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Vibrio phage CTX transgenic plasmid pCTX-3kan, complete sequence
|
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| 92,766 |
NC_077070.1
|
Agapanthus tungrovirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
19-3001
|
Tungrovirus agapanthi
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,942 |
RefSeq
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-01-24
| null |
PRJNA485481
|
Agapanthus tungrovirus isolate 19-3001, complete genome
|
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| 775 |
MT501685.1
|
Agapanthus tungrovirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3001
|
Tungrovirus agapanthi
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,942 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-01-24
| null | null |
Agapanthus tungrovirus isolate 19-3001, complete genome
|
TGGTATCAGAGCATGGTCTTTCTGGAAAACAATTAATTAAAGTTACCTTACTATTTAAACTTCAGTTATCCTTAGAATAGTTAGTTTTCATGACTGAATCCCCTTTTCCCTACCAACTTTACGAACACCGTTTTGATTACTTATCGTTAGAATTACCTGAAAAACATAAACATAAAAATCTTTCTCTTGATAAATGTTCTTTCAATTGCTTCTTTAATCGATCATTTAAACACGTTCTTCATTCTGAAGACAATCATTTAAACGGTATAACTGATCTTTTGATCAATTTGGGTTCTAATTTAACCCTTAATTGGGAAAAATTAAAATCAGTTATAGAAAAATTAATTTTACTCCCTGGTAAAACAACCAAGGAAGTTAAAGAACTCTCTCAAGAGTTTAATCAAGTTAAAATTAATTTCGACTTTTTAAAAGACCAACAGAACTTAATTCTTAGTCGGTTAAAAGGTTTGAAAAATCTTGATAAAAATATTGCTGAGCTAACTATTGAAATTCAGAACGCTAAACCTAAGCAGGTTGAGCTTAAAACATTACAATTGTTAGAAAAGCACGATAACCAATTGGTCCGTTTTGACCAAGAAATAGATAAAATAAAAGAAATTCTTGCTAAAATTGCTTATGCTTCAGGCATATGACTGATTACCCTACGTTTGTTGAAGCACGTAATTTCTTTAAAAACAAGGAATCGTCTGCTTTGCCTCTCAATTCCCCAGGTTCCCTAGACGATACTTTAAACCTTGACTACACCTGTGTTAGGACAGGGATAGATAAAGCCCAGATTAGCAAACACTTGTTAAATGCTTATCTGTTAATAGAGCTTCATAAAAAGCTTGATAAATTAAGTCTAGAACAAGTTACTAGACAACCTGCCCCTATTGTGCCTTTTGGTTCTAACCTTCAAGGTAGATATAAAGCACCATCTAAATTAGGGATAAAAAGAAAAAGACAATCATGAGTCTTAATCCGTTTTCTGGATCTTCCAGAACTATAAGTGAAAAAGGTCAAACTTCGCAAGATAGTTTACCTGATAAAAAAGGTAAAAATAAAGTTACAAAAATCCTTGAAGAAGAAGTTGATATAGATGAAACTCTAGCAACTTTTGATCTTCATAAAATAAAAACAATTCCTAAAAATGAAATTTACAAGAAGAATTGGCTAGAAAGTAAAAGTAAAATCTTTCAAAGTTACAGAGAGGATGCCCTTGAAGTAACTAATAATTCTCAGTTAATTAATATAATTTCTGAGGATACTATAAAGAAAATGAGGTCTCAAGACCAAATTTACTGCCATATTGGGTTAATAGCCATAGGAATTAAAGGTCTTCATAGAAAGAAGATTGGGGCTAGAACTCTCATTGCCTTACTGGACCTCAGTTGGCAAAATATGGAACAAGCCATGTTCGGCGCTATTGAAATGGATATGAACGCCGGTTATGGAATCTTCTTTTGTGTTCCTGATTTCCAAAAAGAAATTAAGGACATGAGCAAGATTAAAATAGGAATCCAAACCCATGGATATGAGTCGTATGATGGTAAGAATATTACCATATACGTTAACTTTATAGGTCGATTGTCGACAAGAATGCACTCCAAATTCAAAATCAAGGCTACAGAGATTATTGAACAAATTGCATCTAAAGGAATTCAGATGATTAAGCCTATGATTATAAATTCGGAAAAATTGGATGGAGAAGAATGGAAATTAGAAAAATTCCAAGAACTAGAAAACTCCTCCAGAGTGCCTGATAAACTTTTGATGTATAAAAATTATACAGGAGGAACATCCTTAAGATTTTCAGATTATAAAAACAAATTAATGAAAAATCCCGATGATGAGGATAAAGAAGATGAAGATGTTCCCATCTTTGGTATGTTTCAAGACAGAGATGCTTGGTTAGCTAGTCTTGAAGATAATATTAATAGTGATAGTGAGGACGATGATGAGTACCTCAGCTATAACAAAGAGTTTGAACAACTTAAACTCGAAGAACTAAATAACGATGGTTGGGAAGACGACCTAAATGATGATGAATTAAGTTTAATGCATGATAAAGCTTTTGAGCCCTTAACAGCTATAATGGGTAAGAAAACAGTTCAAGAAACTGTTGATGATATTTTCCTTGAGTTATTAAACATACATGGAAATGCTACAATAGCAGAAAAGCTGTTAAACGAAAAGATTCATTTAGATAAAATCGAGTTGATTGAACAGAATAAAATGCCAATTAATGAACTGTTCAAAAAACATGTTAAATCTGGAATCACTGATACATCTTCTTCAGCACCACCAGCTCCTGAGAATTATGATACTGAGATGCGAGAAGATTGGTCTCGTAAACCTTATGTACCTAACGATCAGCGTTATAACCCTGCGAACGAAAATTACAAGTTCAAAGGAGGTAAAAATTGGAACTATAAACCTAAAGATTCCATAGTTCTGAATCTTGATAATATTGATATTCAATATTGGAGAGAAGAAGTAGAACATTGGGAAGGTATAGTTAAAAACGAGTGGGAAGCTCGAAAGACCGAAGGTATGGATATGTGGTCATGGATGGATGGCCGTTTATCGGGATTAATTTCCAAAACTTTTAGATCTTACAAAGTAGCCCGGAAAGAAGAATTTCAGACCGTGGTAAACAGAGGCGATAGGCCAGAAAACTTTGTTAAAATTATTAAAGATCTTCTCTTCTTAGACGATCCTACAGAAGAGAATAACACTTTAACTCAAAGGTTAGCCCTTAGAGAATTAGAATCGTTAAAATGTGATAACCCAAAATTTATCACTGAATACCTTAGAGACTTTTTAAGATTAATAAATAATGCCAATTTACTCTATGATAATGATGTCAAAACTAAAATCTTTGACAAGTTACCAGGAGAACTTGGTATAACAATCAAAAATGCCTATATGGCAAATCCCTCTCTTGTCAATAATTACAATACAACTCCAGCCACTGTTATGGCAAATTACATTGTTTCATATATGCGAGATCAGTGTAAAATGGAAGTTAAAAGAAAACAAGAGAAAAAGGCTGCTCTTCAATTTTGCCAGAGCATTGTCACTCCTGAATCTGCAAGATACAGGAAAAAATTAGTTAAAAGAAAGGCTGTAAATCCAGCCAAAAAGAATAAATTCGTTAAAAAACCTTCTATGAGGAAATGTAAATGTTTTCTTTGTGGAGATGTTAGCCATTTGGCAAACACGTGCCCACAGCGTAATAATAGAAGTAGACCATTTAACCAAAGTGCAAGGATGGCCTTGATAAATGGGTTAGATGAAGATGTCGTGTCATTAGACGGCAATGAAAACGACGACGAAATTTATGAAATATCATCAGATATTGATGATGAAGAAATTTTTGTCCGATCAGGGCAATTAACTGAAATAGGAGAAACTTCTCATAGACACTCCTTTAAAAAGGGTGGGAAGTTAGATAAAAAGTGTCAAAAATGCAAATTATATAGTTCACTCAAATTGACAATTTGTTGTGAAATCTGTAACTTGCAATACTGCAATATCTGTGCTAAAGAGGAAAATTTAGAAACAGATGAAGATATAAACATTAACATGACGGTCAATGAGTTAAAACAAATGGTGCTTAAGCATGACGCTAAAATCACCTTAATTGAACATAAGTTAAATCTACCTGCGTTACAACAAGAATTTGAAAATGTAATGCTAGGGAATAAAGCCGCTTCTAACGAACAGCTTACAGAGATTGTACCAGCCACAGCTAATACAATCAAAGTTAAAAACATTACTACAGCCTGTTATGTTGACTGTAGAATAGAATTGTTTGGAAAAACGGTTGTTACAAAAGGTTTTATTGACTCTGGTAGCACTTATACTCTAATATGCCCTACCTTAGCACCGAAAGAATGGGTGAGAACTTTGCCTTACGGCATAACTGTCACCACAATTGATAACCGAACTTTTATTATAGATCAAGGTCTTCACCTCGATGTTAAAATCCGTTTTAAGGAAGTGGATGATAAATTTGGTCCCTCTTATGAACTTGGAATGGTATATCTTTCCAAAGAACCAATTAAACAAATTTTCATTGGGTGGTCATTTATCACCAAAGATAGAGGAGGTATGTATCTCTCTCGAGATTATATCCAAATTTATAAAAATGTCGGTATTTTTCCTACAATTATCCACACACTACGATCAGAATGCGATCGAAATCGTGGTGAGATTGAGGCCCCGAAAAAACACGGTCTCGAAAAACAAATTGATAATTTTGTTCAGGGAATTTTATTCCAACCCTATCAAAAGATACCTGCAAATGCCAATGCAAGTATAGATAATACACCTGAAGTAGCCGAAACTCCCAGTTTGTTTAAAATCCTAAAAGATTTAGAAACACATGGTTTTCTCGGTGAAGATATCACACGCTGTAAAAGCAATTGGGTCTGTAAGTTCAAAATCATGAACCCAGACATTAAAATTACATGCAAGGCGATTGATGAATCACCTGCCGATAAAGAAGAATTTCGTAAACAAATTGACGAAATGCTAAAACAAGGTTTAATATATCCCGCCAAACCTGACTGTAGACACAGATCAGCTGCTTTTATTGTTCGGAATCATTCCGAAGAAAAACGAGGAAAAGCAAGGATAGTCTATAACTATAAACGTCTCAATGACATAATGGAAACTGATCCTTTTAATCTTCCTCATAAAAATTCCTTGATAAATCTAATCCAAGGAGCAACAGTTTTTTCTAAATTTGACCTAAAGTCAGGTTTTCACCAAATGAAACTTGAAGAATGGTTTCAACCGTGGACTACCTTTACTTGTTCAATTGGACTCTTTACTTGGAAAGTTTGCCCCTTCGGTATAGCAAATGCACCCTGTGCTTTCCAACGATTTATGCAGGAAACATTTGGCCATCTGCCATTTTGTTTAATCTACATAGATGATATATTAGTCTTATCGAAAGACAAAAATCAGCATAAATCTCATTTGTTAAAATT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| 41,665 |
MT501686.1
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Agapanthus tungrovirus
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Read,D.A., Thompson,G.D.
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Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
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2021-06-01
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19-3004
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Tungrovirus agapanthi
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Tungrovirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 7,956 |
GenBank
| null |
South Africa
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South Africa
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Agapanthus
| null |
2019-08-05
| null | null |
Agapanthus tungrovirus isolate 19-3004, complete genome
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| 41,666 |
MT501687.1
|
Agapanthus tungrovirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3005
|
Tungrovirus agapanthi
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,953 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-08-05
| null | null |
Agapanthus tungrovirus isolate 19-3005, complete genome
|
TGGTATCAGAGCATGGTCAATCACTGGTTAGAATTTTACTATCATTAAAATCTAGTTACATGTTTTACATATGACCGATAACTCAGAGTTTCCTTACCTTTTGTACGAAAACCGCTTCGATTATCTTTCATTAGAACTTCCTGTAAAACATAAACATAAAAATACATCACTAGATAAATGCGTTTTTAACTGTTACTTTGAACGCAAATTTAAGCACGTTCTTCATTCAGAAGAACAACATCTAAACGGGATAACCGATCTCTTAATTAGTCTCGGTTCAAACTTAACCCTTAACTGGGAAAAGTTAAAATCTGTAATAGAAAAGTTGATTTTACTCCCCGGTAAAACAACTAAAGAAGTCAAGGAACTTTCCCTTGAATTTGATAAAGTAAAAGGAAATTTTGATTTCCTTAAAGATCAGCAGAATTTAATTCTGAAAAAGATCAAGGCTTTAAAAGACCTTGATAAAAATATTGCTGACCTCAAAATTGAGATTCAGCAAGCCAAGCCTAAACAAGTTGAATTAAAGACCCTAGAGTTATTAGAAAAACACGACGGTCAATTAATTAGGTTTGATAAAGAAATTGATAGGATCAAATCAATCCTTGACAAAATAGCATATGCATCTGGCATATGAATGAGTGATTATCCTACCTTCAGAGAAGCTGTAAGTTACTTTAAGGACTTAGAATCTAAAGCTTTACCTGAAACAGCTGCTGGAGCTAAAGATAACACACTAAATTTAGATTATACCTGTGTTCGCACTGGTATTGATAAAGCCCAGATATCCAAACATCTGGTAAATTCATACCTTCTTATTGACTTACATAAGAAGCTTGATAAATTATCTCTTCAGCAAGTTGTACCCCAACCTGCTCCTATAGTAGAATTTGGTTCTAATTTATTAGGACAATATAAGCCACCTTCTAAGTTGGGCATTAAACGGAAAAGATCTAGACTTCATTATGAGTCTTAATCCTTTTACCGGAAATTCTAGGACCCTAGCTGATAAGGGATCCTCATCGTCAGACAAAGGTCTGCAAAATAAAACTTCTAAAGGAAAACAGAAAATCCTGGAAGAAGAAGTAGACGTCGATGAGACGTTGGCTAAATTTGATCTTGGAAAAATTAAAACTATACCCAAGAATGAAATCTATAAACATAATTGGTTCGATAGCAAGGAAAAAATATTTCAAGCCTATCGAGAAGATGCTCTGGAAGTTACGAATAACTCCCAGCTAATCAGTATCATTTCAGATGATACAATAAAACGTATGAAAACCCAAAATCAGATATATTGCCATATTGGTCTTATAGCCATAGGGATTAAGGGTTTACATAGAAAGAAAATAGGTGCTAGAACTCTAGTCACCCTATTAGATTTAAGTTGGCAGAATATGGATGAAGCCATATTTGGTGCAATCGAGATGGACATGAATGTTAACTATGGAATTTTCTTTTGTGTACCCGATTTTCAAAAGGAAATTAAAGATATGTCCAAAATTAAAATTGGAATTCAGACTCACGGGTATGAGTCTTATGAGGGTAAAAATCTTACCATTTATGTGAATTTTATTGGCAGACTATCTACTAGGATGCACAGTAAATTCAAAATTAAAGCCACAGAAATTGTGGAACAAATTGCCTCAAAAGGCATACAAATGATCCGACCGATGCTTATTTCATCGGAGAAATTTGATGGCGAGGAATGGAAACTCGACCAGTTTAGGGAACTAGAAAATTCAGCTAGAATCCCAGATAAAATGCTGATGTATAAAAATTACACTGGCGGAACATCGTTAAGGTTCAGTGACTATAAAAATAAATCTATGAAGAACCCTGATGATGATAAAGATAGTGATGAGGATGATATCCCCATACTAGGAATGTTTCAAGACCATAATGAATGGATGAAACATCTAAATGATGTCGTGTCTGATAGTGAAGACGACGACGAATATCTCGATTATAATCTGGCTTTTGAGCAGATGAAAATCGAAGAAGATAATGGGTGGAATGAGATTTCTGACGAAGAGTTAGAACTAGACATATCCACAGAAAAATTATTTGAGCCTCTAGATAACATCTTAGGCAAGAAATCTGTCCAAGAGACAGTAGATGATATATTTTTGGAGTTATTAAACATCCATGGAAATACTGCTATGGCAGAAAAGGTCCTTAATGAAAGAATTCATTTGGACAAAATTGAGCTTGTTGAACAGAACAAAATACCCATAGAGGATTTGTTTAAACAACATGCTAAATCAGGCCAAGAAGGAACTTCTTCGGCAATAACTGAGGGCAATAATTACGACACAGAAATGCGTGATGACTGGTCACGTAAACCATATGCCCCAAACAGAGATAAATATAATCCTGATAATGAAAATTACAAATTCAAAGGATTAAAAAGATGGAACTATAAGCCCCGAGACTCTATAGTCTTAAATTTAGACAATGTCAACATCCAGTATTGGAGAGAAGAAGTTGAACATTGGGAGGGCATAGTTAAAAATGAATGGGAAGCCAGAAAGACTCCCGGAATGGACATGTGGTCATGGATGGATGGTAGACTGTCAGGTCTAATCTCAAAAACCTTTAGGGCTTATAAGGTAAATCAACCTAATGAGTACCAGACCATAGTAAATAGGGGCGATCGGCCCGAGAATTTTGTTAAAATCGTCAAAGATTTATTATTTCTTGTTGACCCTACAGAGGACGATACTTTAACGCAAAGGCTAGCTCTTAGGGAGTTAGAAGCATTAAAATGTGATAATCCTAAATTTATCACAGAATATCTTAGGGATTTCCTAAGACTTATAAATAATGCAAATTTACTGTATGATAATACAGTAAAAGTTAAAATATTTGATAAATTACCTGGAGACCTAGGTAATACAATTAAACAAGCCTATTTAGAAAATAGGGTTTTATCTGAATCTTTACCAACAACACCTGCAACTGTAATGGCTAATTACATTGTATCTTATATGAGGGATAAATGCAAGCAGGAGGTAAAGAAAAAACAAGAGAAAAAGGCAGCTTTACAGTTTTGCCAAAGTATTGTAACACCAGAATCGGCTAGTTACAATAAAAAATCACTCGTTAAAAGAAAACGAGTTGATCCTGCAAGGAAATCTAAGTTTGTAAAGAAACCATCAAACAGAAAATGTAAATGTTATGTTTGTGGTGACTTCTCACACTTAGCAAACAACTGCCCCAAGAGAGCAGATAATAGATCAGCTAGAGCAGCACTTATTGCTGGCCTAGATGATGATATAGTCTCCCTAGATGGAGATGAAAATGAGAATGAAATCTATGAGATCATATCAGATCTCAATGATGAATTCGAAGATTTCATTGCATGTTCAGGATTATCAGAAATCCAACATGTACATACTTGGACTAAGGGAGGAAACCTTAGTAAAAAGTGCTATCAATGCAAATTGTTTAGTACTTTGGATAAAACTATTTGGTGCGAAGAATGCAAACAGCAGATTTGCTCTATCTGTGCCAAAGAAATTGACCTTCAGACTCAAGAGGAGGCTGAAGTAAATTTAACCATTAAAGAATTAAAACAAATGGTTCTTAAACATGATGCAAAGATTGCATTAATTGAGCATAAATTAAATATGCCTGATTTACATCGGGAATTTAATTTAGCTATACAGGGAAATGCCGCTGAAGAAGCAAGCACCCAAAATCCGATTGTAGCTAATACAATCAAGGTTAAAAATATAACTACAGCATGTTATGTTGACTGTAGAGTGGAATTATTTGGTAAAGTTGTGGTGACTAAAGGATTTATTGACTCGGGTAGTACCTATACCCTTATCTGTCCCAAACTTGTACCTAAAGAATGGATTCGAACTTTGCCATATGCGGTTACAGTTACCACCATTGACAATAGGCAGTTCAATATAAATCAAGGGCTTCATCTTGAAGCAAAAATTAGATTTAAGGAAGTTGATGATAAGTACGGACCTTCCTATGACCTAGGAATAGTTTACATATCCAACGAACCTATAAATCAAATTTTTATCGGTTGGTCCTTCATATCAAAGGACAAAGGTGGTATGTATCTCTCCAGAGACTACATACAAATCTATAGGAATGTTGGGATTTTTCCCACCATAACCCATACACTTAGATCAGAGTGCGATCAGAATCGTGGTGGAAACATACCCCCAGAATTTCCTGCAGATTTTCCACTAAAATCTTCATTTTGGAAACCCTACCAGAAAATACCTGCAAATGCAAATGCAAGTGTTGATCTTTTACCAAAAGAATTTTCACCAACACATGGGCTTTTCAAAAGGATAAAAGACTTAGAAACACTAGGTTTTCTAGGCGATGACATTACCAAATGTCAGAGTAATTGGGTTTGTAAGTTCAAAGTACTTAACCCAGACATTAAAATAACATGTAAAGGTATTGACGAAACTCCTGCTGATAAGGAAGAATTTCGAAAGCAGATAGCTGAGCTCCTAAATCAAGGACTCATTTATCAGGCTAAACCAGATTGTCGACATAGATCGGCAGCATTTATTGTCCGAAACCATTCGGAAGAAAAACGGGGAAAAGCGCGCATAGTTTACAACTATAAACGGCTTAATGATAATATGGAAACTGACCCCTTTAACCTACCACACAAGAATTCATTGATGAATCTTATCCAAGGGGCAAAAGTGTTTTCTAAATTCGATTTAAAATCTGGTTTTCACCAGATGAAATTAGAAGAATGGTTTCAACCATGGACTACCTTCACTTGTAGTGAAGGTCTATATACTTGGAAAGTCTGTCCATTTGGCATAGCAAATGCACCATGTGCATTTCAGAGATTCATGCAAGATGTCTTTGGACACTTAAAATTTTGTCTGGTCTATATAGATGATATTCTTGTAATGTCTAAATCAAGAGACCAGCATAAAAAACATTTATTGGAATTTTTTGACACTGTCAAGAATAACGGGATAGTCCTCTCTAAAAAGAAAACTGAA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Agapanthus tungrovirus
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Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
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South Africa
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2021-06-01
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19-3007
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Tungrovirus agapanthi
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Tungrovirus
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GenBank
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South Africa
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South Africa
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Agapanthus
| null |
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Agapanthus tungrovirus isolate 19-3007, complete genome
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| 41,668 |
MT501689.1
|
Agapanthus tungrovirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3010
|
Tungrovirus agapanthi
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,061 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-08-06
| null | null |
Agapanthus tungrovirus isolate 19-3010, complete genome
|
TGGTATCAGAGCATGGTCAATCACTGGTTAGAATTTTACTATCATTAAAATCTAGTTACATGTTTTACATATGACCGATAACTCAGAGTTTCCTTACCTTTTGTACGAAAACCGCTTCGATTATCTTTCATTAGAACTTCCTGTAAAACATAAACATAAAAATACATCACTAGATAAATGCGTTTTTAACTGTTACTTTGAACGCAAATTTAAGCACGTTCTTCATTCAGAAGAACAACATCTAAACGGGATAACCGATCTCTTAATTAGTCTCGGTTCAAACTTAACCCTTAACTGGGAAAAGTTAAAATCTGTAATAGAAAAGTTGATTTTACTCCCCGGTAAAACAACTAAAGAAGTCAAGGAACTTTCCCTTGAATTTGATAAAGTAAAAGGAAATTTTGATTTCCTTAAAGATCAGCAGAATTTAATTCTGAAAAAGATCAAGGCTTTAAAAGACCTTGATAAAAATATTGCTGACCTCAAAATTGAGATTCAGCAAGCCAAGCCTAAACAAGTTGAATTAAAGACCCTAGAGTTATTAGAAAAACACGACGGTCAATTAATTAGGTTTGATAAAGAAATTGATAGGATCAAATCAATCCTTGACAAAATAGCATATGCATCTGGCATATGAATGAGTGATTATCCTACCTTCAGAGAAGCTGTAAGTTACTTTAAGGACTTAGAATCTAAAGCTTTACCTGAAACAGCTGCTGGAGCTAAAGATAACACACTAAATTTAGATTATACCTGTGTTCGCACTGGTATTGATAAAGCCCAGATATCCAAACATCTGGTAAATTCATACCTTCTTATTGACTTACATAAGAAGCTTGATAAATTATCTCTTCAGCAAGTTGTACCCCAACCTGCTCCTATAGTAGAATTTGGTTCTAATTTATTAGGACAATATAAGCCACCTTCTAAGTTGGGCATTAAACGGAAAAGATCTAGACTTCATTATGAGTCTTAATCCTTTTACCGGAAATTCTAGGACCCTAGCTGATAAGGGATCCTCATCGTCAGACAAAGGTCTGCAAAATAAAACTTCTAAAGGAAAACAGAAAATCCTAGAAGAAGAAGTAGACGTCGATGAGACGTTGGCTAAATTTGATCTTGGTAAAATTAAAACTATACCCAAGAATGAAATCTATAAACATAATTGGTTCGATAGCAAGGAAAAAATATTTCAAGCCTATCGAGAAGATGCTCTGGAAGTTACGAATAACTCCCAGCTAATCAGTATCATTTCAGATGATACAATAAAACGTATGAAAACCCAAAATCAGATATATTGCCATATTGGTCTTATAGCCATAGGGATTAAGGGTTTACATAGAAAGAAAATAGGTGCTAGAACTCTAGTCACCCTATTAGATTTAAGTTGGCAGAATATGGATGAAGCCATATTTGGTGCAATCGAGATGGACATGAATGTTAACTATGGAATTTTCTTTTGTGTACCTGATTTTCAAAAGGAAATTAAAGATATGTCCAAAATTAAAATTGGAATTCAGACTCACGGGTATGAGTCTTATGAGGGTAAAAATCTTACCATTTATGTGAATTTTATTGGCAGACTATCTACTAGGATGCACAGTAAATTCAAAATTAAAGCCACAGAAATTGTGGAACAAATTGCCTCAAAAGGCATACAAATGATCCGACCGATGCTTATTTCATCGGAGAAATTTGATGGCGAGGAATGGAAACTCGACCAGTTTAGGGAACTAGAAAATTCAGCTAGAATCCCAGATAAAATGCTGATGTATAAAAATTACACCGGCGGAACATCGTTAAGGTTCAGTGACTATAAAAATAAATATATGAAGAACCCTGATGATGATAAAGATAGTGATGAGGATGATATCCCCATACTAGGAATGTTTCAAGACCATAATGAGTGGATGAAACATCTAAATGATGTCGTGTCTGATAGTGAAGACGACGACGAATATCTCGATTATAATCTGGCTTTTGAGCAGATGAAAATCGAAGAAGATAATGGGTGGAATGAGATTTCTGACGAAGAGTTAGAACTAGACATATCCACAGAAAAATTATTTGAGCCTCTAGATAACATCTTAGGCAAGAAATCTGTCCAAGAGACAGTAGATGATATATTTTTGGAGTTATTAAACATCCATGGAAATACTGCTATGGCAGAAAAGGTCCTTAATGAAAGAATTCATTTGGACAAAATTGAGCTTGTTGAACAGAACAAAATACCCATAGAGGATTTGTTTAAACAACATGCTAAATCAGGCCAAGAAGGAACTTCTTCGGCAATAACTGAGGGCAATAATTACGACACAGAAATGCGTGATGACTGGTCACGTAAACCATATGCCCCAAACAGAGATAAATATAATCCTGATAATGAAAATTACAAATTCAAAGGATTAAAAAGATGGAACTATAAGCCCCGAGACTCTATAGTCTTAAACTTAGACAATGTCAACATCCAGTATTGGAGAGAAGAAGTTGAACATTGGGAGGGCATAGTTAAAAATGAATGGGAAGCCAGAAAGACTCCCGGAATGGACATGTGGTCATGGATGGATGGTAGACTGTCAGGTCTAATCTCAAAAACCTTTAGGGCTTATAAGGTAAATCAACCTAATGAGTACCAGACCATAGTAAATAGGGGCGATCGGCCCGAGAATTTTGTTAAAATCGTCAAAGATTTATTATTTCTTGTTGACCCTTCAGAGGACGATACTTTAACGCAAAGGCTAGCTCTTAGGGAGTTAGAAGCATTAAAATGTGATAATCCTAAATTTATCACAGAATATCTTAGGGATTTCCTAAGACTTATAAATAATGCAAATTTACTGTATGATAATACAGTAAAAGTTAAAATATTTGATAAATTACCTGGAGACCTAGGTAATACAATTAAACAAGCCTATTTAGAAAATAGGGTTTTATCTGAATCTTTACCAACAACACCTGCAACTGTAATGGCTAATTACATTGTATCTTATATGAGGGATAAATGCAAGCAGGAGGTAAAGAAAAAACAAGAGAAAAAGGCAGCTTTACAGTTTTGCCAAAGTATTGTAACACCAGAATCGGCTAGTTACAATAAAAAATCACTCGTTAAAAGAAAACGAGTTGATCCTGCAAGGAAATCTAAGTTTGTAAAGAAACCATCAAACAGAAAATGTAAATGTTATGTTTGTGGTGACTTCTCACACTTAGCAAACAACTGCCCCAAGAGAGCAGATAATAGATCAGCTAGAGCAGCACTTATTGCTGGCCTAGATGATGATATAGTCTCCCTAGATGGAGATGAAAATGAGAATGAAATCTATGAGATCATATCAGATCTCAATGATGAATTCGAAGATTTCATTGCATGTTCAGGATTATCAGAAATCCAACATGTACATACTTGGACTAAGGGAGGAAACCTTAGTAAAAAGTGCTATCAATGCAAATTGTTTAGTACTTTGGATAAAACTATTTGGTGCGAAGAATGCAAACAGCAGATTTGCTCTATCTGTGCCAAAGAAATTGACCTTCAGACTCAAGAGGAGGCTGAAGTAAATTTAACCATTAAAGAACTAAAACAAATGGTTCTTAAACATGATGCAAAGATTGCATTAATTGAGCATAAATTAAATATGCCTGATTTACATCGGGAATTTAATTTAGCTATACAGGGAAATGCCGCTGAAGAAGCAAGCGCCCAAAATCCGATTGTAGCTAATACAATCAAGGTTAAAAATATAACTACAGCATGTTATGTTGACTGTAGAGTGGAATTATTTGGTAAAGTTGTGGTGACTAAAGGATTTATTGACTCGGGTAGTACCTATACCCTTATCTGTCCCAAACTTGTACCTAAAGAATGGATTCGAACTTTGCCTTATGCGGTTACAGTTACCACCATTGACAATAGGCAGTTCAATATAAATCAAGGGCTTCATCTTGAAGCAAAAATTAGATTTAAGGAAGTTGATGATAAGTACGGACCTTCCTATGACCTAGGAATAGTTTACATATCCAACGAACCTATAAATCAAATTTTTATCGGTTGGTCCTTCATATCAAAGGACAAAGGTGGTATGTATCTCTCAAGAGACTACATACAAATCTATAGGAATGTTGGGATTTTTCCCACCATAACCCATACACTTAGATCAGAGTGCGATCAGAATCGTGGTGGAAACATACCCCCAGAATTTCCTGCAGATTTTCCACTAAAATCTTCATTTTGGAAACCCTACCAGAAAATACCTGCAAATGCAAATGCAAGTATTGATCTTTTACCAAAAGAAATTTCACCAACACATGGGCTTTTCAAAAGGATAAAAGACTTAGAAACACTAGGTTTTCTAGGCGATGACATTACCAAATGTCAGAGTAATTGGGTTTGTAAGTTCAAAGTACTTAACCCAGACATTAAAATAACATGTAAAGGTATTGACGAAACTCCTGCTGATAAGGAAGAATTTCGAAAGCAGATAGCTGAGCTCCTAAATCAAGGACTCATTTATCAGGCTAAACCAGATTGTCGACATAGATCGGCAGCATTTATTGTCCGAAACCATTCGGAAGAAAAACGGGGAAAAGCACGCATAGTTTACAACTATAAACGGCTTAATGATAATATGGAAACTGACCCCTTTAACCTACCACACAAGAATTCATTGATGAATCTTATCCAAGGGGCAAAAGTGTTTTCTAAATTCGATTTAAAATCTGGTTTTCACCAGATGAAATTAGAAGAATGGTTTCAACCATGGACTACCTTCACTTGTAGTGTAGGTCTATATACTTGGAAAGTCTGTCCATTTGGCATAGCAAATGCACCATGTGCATTTCAGAGATTCATGCAAGATGTCTTTGGGCACTTAAAATTTTGTCTGGTCTATATAGATGATATTCTTGTAATGTCTAAATCAAGAGACCAGCATAAAAAACATTTATTGGAATTTTTTGACACTGTCAAGAATAACGGGATAGTCCTCTCTAAAAAGAAAACTGAA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MT501690.1
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Agapanthus tungrovirus
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Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
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South Africa
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Tungrovirus agapanthi
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Tungrovirus
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Caulimoviridae
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GenBank
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South Africa
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South Africa
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Agapanthus
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Agapanthus tungrovirus isolate 19-3013, complete genome
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| 41,670 |
MT501691.1
|
Agapanthus tungrovirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3013
|
Tungrovirus agapanthi
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,965 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-10-04
| null | null |
Agapanthus tungrovirus isolate 19-3013, complete genome
|
TGGTATCAGAGCATGGTCTTTCTGGAAAACAATTAATTAAAGTTACCTTACTATTTAAACTTCAGTTATCCTTAGAATAGTTAGTTTTCATGACTGAATCCCCTTTTCCCTACCAACTTTACGAACACCGTTTTGATTACTTATCGTTAGAATTACCTGAAAAACATAAACATAAAAATCTTTCTCTTGATAAATGTTCTTTCAATTGCTTCTTTAATCGATCTTTTAAACACGTTCTTCATTCTGAAGACAATCATTTAAACGGTATAACTGATCTTTTGATCAATTTGGGTTCTAATTTAACCCTTAATTGGGAAAAATTAAAATCAGTTATAGAAAAATTAATTTTACTCCCTGGTAAAACAACCAAGGAAGTTAAAGAACTCTCTCAAGAGTTTAATCAAGTTAAAATTAATTTCGACTTTTTAAAAGACCAACAGAACTTAATTCTTAGTCGGTTAAAAGGTTTGAAAAATCTTGATAAAAATATTGCTGAGCTAACTATTGAAATTCAGAACGCTAAACCTAAGCAGGTTGAGCTTAAAACATTACAATTGTTAGAAAAGCACGATAACCAATTGGTCCGTTTCGACCAAGAAATAGATAAAATAAAAGAAATTCTTGCTAAAATTGCTTATGCTTCAGGCATATGACTGATTACCCTACGTTTGTTGAAGCACGTAATTTCTTTAAAAACAAGGAATCGTCTGCTTTGCCTCTCAATTCCCCAGGTTCCCTAGACGATACTTTAAACCTTGACTACACCTGTGTTAGGACAGGGATAGATAAAGCCCAGATTAGCAAACACTTGTTAAATGCTTATCTGTTAATAGAGCTTCATAAAAAGCTTGATAAAATAAGTCTAGAACAAGTTACTAGACAACCTGCCCCTATTGTGCCTTTTGGTTCTAACCTTCAAGGTAGATATAAAGCACCATCTAAATTAGGGATAAAAAGAAAAAGACAATCATGAGTCTTAATCCGTTTTCTGGATCTTCCAGAACTATAAGTGAAAAAGGTCAAACTTCGCAAGATAGTTTACCTGATAAAAAAGGTAAAAATAAAGTTACAAAAATCCTTGAAGAAGAAGTTGATATAGATGAAACCCTAGCAACTTTTGATCTTCATAAGATAAAAACAATTCCTAAAAATGAAATTTACAAGAAGAATTGGCTAGAAAGTAAAAGTAAAATCTTTCAAAGTTACAGAGAGGATGCCCTTGAAGTAACTAATAATTCTCAGTTAATTAATATAATTTCTGAGGATACTATTAAGAAAATGAGGTCTCAAGACCAAATTTACTGCCATATTGGGTTGATAGCCATAGGAATTAAAGGTCTTCATAGAAAGAAGATTGGGGCTAGAACTCTCATTGCCTTACTGGACCTTAGTTGGCAAAATATGGAACAAGCCATGTTCGGCGCTAACGCTATTGAAATGGATATGAACGCCGGTTATGGAGTCTTCTTTTGTGTTCCTGATTTCCAGAAAGAAATTAAGGACATGAGCAAGATTAAAATAGGAATACAAACCCATGGATATGAGTCGTATGATGGTAAGAATATTACCATATACGTTAACTTTATAGGTCGATTGTCGACAAGAATGCACTCCAAATTCAAAATCAAGGCTACAGAGATTATTGAACAAATTGCATCTAAAGGAATTCAGATGATTAAGCCTATGATTATAAATTCGGAAAAATTGGATGGAGAAGAATGGAAATTAGAAAAATTCCAAGAACTAGAAAACTCCTCCAGAGTGCCTGATAAACTTTTGATGTATAAAAATTATACAGGAGGAACATCCTTAAGATTTTCAGATTATAAAAACAAATTAATGAAAAATCCCGATGATGAGGATAAAGAAGATGAAGATGTTCCCATCTTTGGTATGTTTCAAGACAGAGATGCTTGGTTAGCTAGTCTTGAAGATGATATTAATAGTGATAGTGAGGACGATGATGAGTACCTCAGCTATAATAAAGAGTTTGAACAACTTAAACTCGAAGAACAACTAAATAACGATGGTTGGGAAGACGACCTAAATGATGATGAATTAAGTTTAATGCATGATAAAGCTTTTGAGCCCTTAACAGCTATAATGGGTAAGAAAACAGTTCAAGAAACTGTTGATGATATTTTCCTTGAGTTATTAAACATACATGGAAATGCTACAATAGCAGAAAAGCTGTTAAACGAAAAGATTCATTTAGATAAAATCGAGTTGATTGAACAGAATAAAATGCCAATTAATGAACTGTTCAAAAAACATGTTAAATCTGGAATCACTGAAGCATCTTCTTCAGCACCACCAGCTCCTGAGAATTATGATACTGAGATGCGAGAAGATTGGTCTCGTAAACCTTATGTACCTAACGATCAGCGTTATAACCCTGCGAACGAAAATTACAAGTTCAAAGGAGGTAGAAATTGGAACTATAAACCTAAAGATTCCATAGTTCTGAATCTTGATAATATTGATATTCAATATTGGAGAGAAGAAGTAGAACATTGGGAAGGTATAGTTAAAAACGAGTGGGAAGCTCGAAAGATCGAAGGTATGGATATGTGGTCATGGATGGATGGCCGTTTATCGGGATTAATTTCCAAAACTTTTAGATCTTACAAAGTAGCCCGGAAAGAAGAATTTCAGACCGTGGTAAACAGAGGCGATAGGCCAGAAAACTTTGTTAAAATTATTAAAGATCTTCTCTTCTTAGACGATCCTACAGAAGAGAATAACACTTTAACTCAAAGGTTAGCCCTTAGAGAATTAGAATCGTTAAAATGTGATAACCCAAAATTTATCACTGAATATCTTAGAGACTTTTTAAGATTAATAAATAATGCCAATTTACTCTATGATAATGATGTCAAAACTAAAATTTTTGACAAGTTACCAGGAGAACTTGGTATAACAATCAGAAATGCCTATATGGCAAATCCCTCTCTTGTCAATAATTACAATACAACTCCAGCCACTGTTATGGCAAATTACATTGTTTCATATATGCGAGATCAGTGTAAAATGGAAGTTAAAAGAAAACAAGAGAAAAAGGCTGCTCTTCAATTTTGCCAGAGCATTATCACTCCTGAATCTGCAAGATACAGGAAAAAATTAGTTAAAAGAAAGGCTGTAAATCCAGCCAAAAAGAATAAATTCGTTAAAAAACCTTCTATGAGGAAATGTAAATGTTTTCTTTGTGGAGATGTTAGCCATTTGGCAAACACGTGCCCACAGCGTAATAATAGAAGTAGACCATTTAACCAAAGTGCAAGGATGGCCTTGATAAATGGGTTAGATGAAGATGTCGTGTCATTGGACGGCAATGAAAACGACGACGAAATTTATGAAATATCATCAGATATTGATGATGAAGAAATTTTTGTCCGATCAGGGCAATTAACTGAAATAGGAGAAACTTCTCATAGACACTCCTTTAAAAAGGGTGGGAAGTTAGATAAAAAGTGTCAAAAATGCAAATTATATAGTTCACTCAAATTAACAATTTGTTGTGAAATCTGTAACTTGCAATACTGCAACATCTGTGCTAAAGAGGAAAATTTAGAAACAGATGAAGATATAAACATTAACATGACGGTTAATGAGTTAAAACAAATGGTGCTTAAGCATGACGCTAAAATCACCTTAATCGAACATAAGTTAAATCTACCTGCGTTACAACAAGAATTTGAGAATGTAATGCTAGGGAATAAAGCCGCTTCTAACGAACAGCTTACAGAGATTGTACCAGCCACAGCTAATACAATCAAAGTTAAAAACATTACTACAGCCTGTTATGTTGACTGTAGAATAGAATTGTTTGGAAAAACGGTTATTACAAAAGGTTTTATTGACTCTGGTAGCACTTATACTCTAATATGCCCTACCTTAGCACCAAAAGAATGGGTGAGAACTTTGCCTTACGGCATAACTGTCACCACAATTGATAACCGAACTTTTATTATAGATCAAGGTCTTCACCTTGATGTTAAAATCCGTTTTAAGGAAGTGGATGATAAATTTGGTCCCTCTTATGAACTTGGAATGGTATATCTTTCCAAAGAACCAATTAAACAAATTTTCATTGGGTGGTCATTTATCACCAAAGATAGAGGAGGTATGTATCTCTCTCGAGATTATATCCAAATTTATAAAAATGTAGGTATTTTTCCTACAATTGTCCACACACTACGATCAGAATGCGATCGAAATCGTGGTGAGATTGAGGCCCCGAAAAAACACGGTCTCGAAAAACAAATTGATAATTTTGTTCAGGGAATTTTATTCCAACCCTATCAAAAGATACCTGCAAATGCCAATGCAAGTATAGATAATACACCTGAAGTAGCCGAAACTCCCAGTTTGTTTAAAATCCTAAAAGATTTAGAAACACATGGTTTTCTCGGTGAAGATATCACACGCTGTAAAAGCAATTGGGTCTGTAAGTTCAAAATCATGAACCCAGACATTAAAATTACATGCAAGGCGATTGATGAATCACCTGCCGATAAAGAAGAATTTCGTAAACAAATTGACGAAATGCTAAAACAAGGTTTAATATATCCCGCTAAACCTGACTGTAGACACAGATCAGCTGCTTTTATTGTTCGGAATCATTCCGAAGAAAAACGAGGAAAAGCAAGGATAGTCTATAACTATAAACGTCTCAATGACATAATGGAAACTGATCCTTTTAATCTTCCTCATAAAAATTCCTTGATAAATCTAATCCAAGGAGCAACAGTCTTTTCTAAATTTGACCTAAAGTCAGGTTTTCACCAAATGAAACTTGAAGAATGGTTTCAACCGTGGACTACCTTTACTTGTTCAATTGGACTCTTTACTTGGAAAGTTTGCCCCTTCGGAATAGCAAATGCACCCTGTGCTTTCCAACGATTTATGCAAGAAACATTTGGCCATCTGCCATTTTGTTTAATCTACATAGATGATATATTAGTCTTATCGAAAGACAAAAATCAGCATAAATCTCATTT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| 41,671 |
MW080813.1
|
Agapanthus tungrovirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3017
|
Tungrovirus agapanthi
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 8,013 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
|
plant leaf
|
2019-10-04
| null | null |
Agapanthus tungrovirus isolate 19-3017, complete sequence
|
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| 41,692 |
MW080814.1
|
Agapanthus tungrovirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3021
|
Tungrovirus agapanthi
|
Tungrovirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,991 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
|
plant leaf
|
2019-10-04
| null | null |
Agapanthus tungrovirus isolate 19-3021, complete sequence
|
TGGTATCAGAGCATGGTCTTTCTGGAAAACAATTAATTAAAGTTACCTTACTATTTAAACTTCAGTTATCCTTAGAATAGTTAGTTTTCATGACTGAATCCCCTTTTCCCTACCAACTTTACGAACACCGTTTTGATTACTTATCGTTAGAATTACCTGAAAAACATAAACATAAAAATCTTTCTCTTGATAAATGTTCTTTCAATTGCTTCTTTAATCGATCTTTTAAACACGTTCTTCATTCCGAAGACAATCATTTAAACGGTATAACTGATCTTTTGATCAATTTGGGTTCTAATTTAACCCTTAATTGGGAAAAATTAAAATCAGTTATAGAAAAATTAATTTTACTCCCTGGTAAAACAACCAAGGAAGTTAAAGAACTCTCTCAAGAGTTTAATCAAGTTAAAATTAATTTCGACTTTTTAAAAGACCAACAGAACTTAATTCTTAGTCGGTTAAAAGGTTTGAAAAATCTTGATAAAAATATTGCTGAGCTAACTATTGAAATTCAGAACGCTAAACCTAAGCAGGTTGAGCTTAAAACATTACAATTGTTAGAAAAGCACGATAACCAATTGGTCCGTTTTGACCAAGAAATAGATAAAATAAAAGAAATTCTTGCTAAAATTGCTTATGCTTCAGGCATATGACTGATTACCCTACGTTTGTTGAAGCACGTAATTTCTTTAAAAACAAGGAATCGTCTGCTTTGCCTCTCAATTCCCCAGGTTCCCTAGACGATACTTTAAACCTTGACTACACCTGTGTTAGGACAGGGATAGATAAAGCCCAGATTAGCAAACACTTGTTAAATGCTTATCTGTTAATAGAGCTTCATAAAAAGCTTGATAAATTAAGTCTAGAACAAGTTACTAGACAACCTGCCCCTATTGTGCCTTTTGGTTCTAACCTTCAAGGTAGATATAAAGCACCATCTAAATTAGGGATAAAAAGAAAAAGACAATCATGAGTCTTAATCCGTTTTCTGGATCTTCCAGAACTATAAGTGAAAGAGGTCAAACTTCGCAAGATAGTTTACCTGATAAAAAAGGTAAAAATAAAGTTACAAAAATCCTTGAAGAAGAAGTTGATATAGATGAAACTCTAGCAACTTTTGATCTTCATAAGATTAAAACAATTCCTAAAAATGAAATTTACAAGAAGAATTGGCTAGAAAGTAAAAGTAAAATCTTTCAAAGTTACAGAGAGGATGCCCTTGAAGTAACTAATAATTCTCAGTTAATTAATATAATTTCTGAGGATACTATTAAGAAAATGAGGTCTCAAGACCAAATTTACTGCCATATTGGGTTAATAGCCATAGGAATTAAAGGTCTTCATAGAAAGAAGATTGGGGCTAGAACTCTCATTGCCTTACTGGACCTCAGTTGGCAAAATATGGAACAAGCCATGTTCGGCGCCATTGAAATGGATATGAACGCCGGTTATGGAATCTTCTTTTGTGTTCCTGATTTCCAAAAAGAAATTAAGGACATGAGCAAGATTAAAATAGGAATCCAAACCCATGGATATGAGTCGTATGATGGTAAGAATATTACCATATACGTTAACTTTATAGGTCGATTGTCGACAAGAATGCACTCCAAATTCAAAATCAAGGCTACAGAGATTATTGAACAAATTGCATCTAAAGGAATTCAGATGATTAAGCCTATGATTATAAATTCGGAAAAATTGGATGGAGAAGAATGGAAATTAGAAAAATTCCAAGAACTAGAAAACTCCTCCAGAGTGCCTGATAAACTTTTGATGTATAAAAATTATACAGGAGGAACATCCTTAAGATTTTCAGATTATAAAAACAAATTAATGAAAAATCCCGATGATGAGGATAAAGAAGATGAAGATGTTCCCATCTTTGGTATGTTTCAAGACAGAGATGCTTGGTTAGCTAGTCTTGAAGATAATATTAATAGTGATAGTGAGGACGATGATGAGTACCTCAGCTATAACAAAGAGTTTGAACAACTTAAACTCGAAGAACAACTAAATAACGATGGTTGGGAAGACCTAAATGATGATGAATTAAGTTTAATGCATGATAAAGCTTTTGAGCCCTTAACAGCTATAATGGGAAAGAAAACAGTTCAAGAAACTGTTGATGATATTTTCCTTGAGTTATTAAACATACATGGAAATGCTACAATAGCAGAAAAGCTGTTAAACGAAAAGATTCATTTAGATAAAATCGAGTTGATTGAACAGAATAAAATGCCAATTAATGAACTGTTCAAAAAACATGTTAAATCTGGAATCACTGAAGCATCTTCTTCAGCACCACCAGCTCCTGAGAATTATGATACTGAGATGCGAGAAGATTGGTCTCGTAAACCTTATGTACCTAACGATCAGCGTTATAACCCTGCGAACGAAAATTACAAGTTCAAGGGAGGTAAAAATTGGAACTATAAACCTAAAGATTCCATAGTTCTGAATCTTGATAATATTGATATTCAATATTGGAGAGAAGAAGTAGAACATTGGGAAGGTATAGTTAAAAACGAGTGGGAAGCTCGAAAGATCGAAGGTATGGATATGTGGTCATGGATGGATGGCCGTTTATCGGGATTAATTTCCAAAACTTTTAGATCTTACAAAGTAGCCCGGAAAGAAGAATTTCAGACCGTGGTAAACAGAGGCGATAGGCCAGAAAACTTTGTTAAAATTATTAAAGATCTTCTCTTCTTAGACGATCCTACAGAAGAGAATAACACTTTAACTCAAAGGTTAGCCCTTAGAGAATTAGAATCGTTAAAATGTGATAACCCAAAATTTATCACTGAATACCTTAGAGACTTTTTAAGATTAATAAATAATGCCAATTTACTCTATGATAATGAAGTCAAAACTAAAATCTTTGACAAGTTACCAGGAGAACTTGGTATAACAATCAAAAATGCCTATATGGCAAATCCCTCTCTTGTCAATAATTACAATACAACTCCAGCCACTGTTATGGCAAATTACATTGTTTCATATATGCGAGATCAGTGTAAAATGGAAGTTAAAAGAAAACAAGAGAAAAAGGCTGCTCTTCAATTTTGCCAGAGCATTATCACTCCTGAATCTGCAAGATACAGGAAAAAATTAGTTAAAAGAAAGGCTGTAAATCCAGCCAAAAAGAATAAATTCGTTAAAAAACCTTCTATGAGGAAATGTAAATGTTTTCTTTGTGGAGATGTTAGCCATTTGGCAAACACGTGCCCACAGCGTAATAATAGAAGTAGACCATTTAACCAAAGTGCAAGGATGGCCTTGATAAATGGGTTAGATGAAGATGTCGTGTCATTGGACGGCAATGAAAACGACGACGAAATTTATGAAATATCATCAGATATTGATGATGAAGAAATTTTTGTCCGATCAGGGCAATTAACTGAAATAGGAGAAACTTCTCATAGACACTCCTTTAAAAAGGGTGGGAAGTTAGATAAAAAGTGTCAAAAATGCAAATTATATAGTTCACTCAAATTAACAATTTGTTGTGAAATCTGTAACTTGCAATACTGCAATATCTGTGCTAAAGAGGAAAATTTAGAAACAGATGAAGATATAAACATTAACATGACGGTCAATGAGTTAAAACAAATGGTGCTTAAGCATGACGCTAAAATCACCTTAATTGAACATAAGTTAAATCTACCTGCGTTACAACAAGAATTTGAGAATGTAATGCTAGGGAATAAAGCCGCTTCTAACGAACAGCTTACAGAGATTGTACCAGCCACAGCTAATACAATCAAAGTTAAAAACATTACTACAGCCTGTTATGTTGACTGTAGAATAGAATTGTTTGGAAAAACGGTTGTTACAAAAGGTTTTATTGACTCTGGTAGCACTTATACTCTAATATGCCCTACCTTAGCACCGAAAGAATGGGTGAGAACTTTGCCTTACGGCATAACTGTCACCACAATTGACAACCGAACTTTTATTATAGATCAAGGTCTTCACCTTGATGTTAAAATCCGTTTTAAGGAAGTGGATGATAAATTTGGTCCCTCTTATGAACTTGGAATGGTATATCTTTCCAAAGAACCAATTAAACAAATTTTCATTGGGTGGTCATTTATCACCAAAGATAGAGGAGGTATGTATCTCTCTCGAGATTATATCCAAATTTATAAAAATGTAGGTATTTTTCCTACAATTATCCACACACTACGATCAGAATGCGATCGAAATCGTGGTGAGATTGAGGCCCCGAAAAAACACGGTCTCGAAAAACAAATTGATAATTTTGTCCAGGGAATTTTATTCCAACCCTATCAAAAGATACCTGCAAATGCCAATGCAAGTATAGATAATACACCTGAAGTAGCCGAAACTCCTAGTTTGTTTAAAATCCTAAAAGATTTAGAAACACATGGTTTTCTCGGTGAAGATATCACACGCTGTAAAAGCAATTGGGTCTGTAAGTTCAAAATCATGAACCCAGACATTAAAATTACATGCAAGGCGATTGATGAATCACCTGCCGATAAAGAAGAATTTCGTAAACAAATTGACGAAATGCTAAAACAAGGTTTAATATATCCCGCCAAACCTGACTGTAGACACAGATCAGCTGCTTTTATTGTTCGGAATCATTCCGAAGAAAAACGAGGAAAAGCAAGGATAGTCTATAACTATAAACGTCTCAATGACATAATGGAAACTGATCCTTTTAATCTTCCTCATAAAAATTCCTTGATAAATCTAATCCAAGGAGCAACAGTTTTTTCTAAATTTGACCTAAAGTCAGGTTTTCACCAAATGAAACTTGAAGAATGGTTTCAACCGTGGACTACCTTTACTTGTTCAATTGGACTCTTTACTTGGAATGTTTGCCCCTTCGGTATAGCAAATGCACCCTGTGCTTTCCAACGATTTATGCAGGAAACATTTGGCCATCTGCCATTTTGTTTAATCTACATAGATGATATATTAGTCTTATCGAAAGACAAAAATCAGCATAAATCTCATTTGTTAAAATT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| 41,693 |
MT533600.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3004
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,480 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-08-05
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3004, complete genome
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| 41,672 |
MT533601.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3005
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,656 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-08-05
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3005, complete genome
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| 41,673 |
MT533602.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3006
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,575 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-08-05
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3006, complete genome
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| 41,674 |
MT533603.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3008
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,489 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-08-06
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3008, complete genome
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| 41,675 |
MT533604.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3009
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,492 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-08-06
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3009, complete genome
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| 41,676 |
MT533605.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3010
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,506 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-08-06
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3010, complete genome
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| 41,677 |
MT533606.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3013
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,521 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-10-04
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3013, complete genome
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| 41,678 |
MT533607.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3017
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,508 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
| null |
2019-10-04
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3017, complete genome
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| 41,679 |
MW080811.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3007
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,544 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
|
plant leaf
|
2019-08-05
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3007, complete sequence
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| 41,690 |
MW080812.1
|
Agapanthus velarivirus
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-06-01
|
19-3007
|
Agapanthus velarivirus
|
Velarivirus
|
Closteroviridae
|
ssRNA(+)
| 17,598 |
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Agapanthus
|
plant leaf
|
2019-08-05
| null | null |
Agapanthus velarivirus isolate 19-3007, complete sequence
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| 41,691 |
NC_074775.1
|
Aichi virus 1
|
Sasaki,J., Kusuhara,Y., Maeno,Y., Kobayashi,N., Yamashita,T., Sakae,K., Takeda,N., Taniguchi,K.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
| null |
Aichivirus A
|
Kobuvirus
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Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,280 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
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Aichi virus genomic RNA, complete genome
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| 294 |
NC_001918.1
|
Aichi virus 1
|
Yamashita,T., Sakae,K., Tsuzuki,H., Suzuki,Y., Ishikawa,N., Takeda,N., Miyamura,T., Yamazaki,S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1998-07-09
|
A846/88
|
Aichivirus A
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,251 |
RefSeq
| 1 | null | null |
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Aichi virus, complete genome
|
TCACCCTCTTTCCCGGTGGTCTGGTCCCGGACCACCGTTACTCCATTCAGCTTCTTCGGAACCTGTTCGGAGGAATTAAACGGGCACCCATACTCCCCCCACCCCCCTTTGGTAACTAAGTATGTGTGCTCGTGATCTTGGCTCCCACGGAGCGGACCGATCCGTTGGTGAACAAACAGCTAGGTCCACATCCTCCCTTCCCCTGGGAGGGCCCCCGCCCTCCCACATCCTCCCCCCAGCCTGACGTATCACAGGCTGTGTGAAGCCCCCGCGAAAGCTGCTCACGTGGCAATTGTGGGTCCCCCCTTCATCAAGACACCAGGTCTTTCCTCCTTAAGGCTAGCCCCGGCGTGTGAATTCACGTTGGGCAACTAGTGGTGTCACTGTGCGCTCCCAATCTCGGCCGCGGAGTGCTGTTCCCCAAGCCAAACCCCTGGCCCTTCACTATGTGCCTGGCAAGCATATCTGAGAAGGTGTTCCGCTGTGGCTGCCAACCTGGTAACAGGTGCCCCAGTGTGCGTAACCTTCTTCCGTCTCCGGACGGTAGTGATTGGTTAAGATTTGGTGTAAGGTTCATGTGCCAACGCCCTGTGCGGGATGAAACCTCTACTGCCCTAGGAATGCCAGGCAGGTACCCCACCTCCGGGTGGGATCTGAGCCTGGGCTAATTGTCTACGGGTAGTTTCATTTCCAATCCTTTTATGTCGGAGTCATGGCTGCAACACGGGTTTCACGATCTGTGCTCGCTGCTGTGGCTCACTCTGCCGCTCACCGCACCTACCACACTGTCCTTGACTGCTATGATAGGCTTTACCTCAACACCAACCCCCATCTCTCTTATCCCCTTCCCAAAAACTCTTCCTTCCCTTGCCCGTTCTGTCAGTACGACGAGCAGAATGAGGTCCTCTCCCCAGAGTCTCTCTGTGGCGAGGGAGCTGAACCCTGCTGGAAGTGCTCACAGGACAAACCCCGCCGCAAGTACAACACCACCCCTCCTGAAGACTGGCTCTATGATTCTGATGTCCAATCCTGGTTCTATCCTGAAACATACTACTCTGACCTTCAGCAAAAGTTCTTTGACAAATTGGCTCTCCTCTCTCTTCCAGGTGCCTACCAAGCAAAGACCCCGGAGGAGCGTGCCCTCGCGGGCGCGCTCACCCAACTCCTCAACTTCCCCTCCACCCCCCCTCTCACACTCCCTACCACTAACCTCCAACGGCAAGGCAACTCGGTCACCAACATCTACGGTAACGGCAACAACGTCAACACTGACGTTGGCGCCAACGGTTGGGCCCCCACGGTCTCAACTGGCCTAGGTGATGGTCCCGTCTCATGCACTCCGCCGACTCCCTCCCCGGGCGATACGGAGGTGCCTCCTCCGAGAAAACCCACAACGTTTCCGGCTCCTCCAACAAAGTCTGGATCCCGCTTTTCCAAGTGGTGGGAACCAGCAGCCGCCCGCGCTTCGGAATCCGCCACCGACTCGGCTATCGAGGGAATCGATGCTGCCGGGAAGGCCGCCTCCAAGGCCATCACGCGGAAGCTGGACCGCCCCGCCGCCCCCTCCTCAACCGCCAATCCCCAACCATCTCTCATCGCTCTCAACCCTTCTGCCACGCAATCCGGCAACGCTTCCATCTTGACCGGATCAACTGCTCCCTCCCTCCTCGCCTACCCCACCGCCACCCCTGTTCCCCTTCCCAACCCCGATGAACCCTCCCAACCCGGACCATCCGGCGACCGCACCTGGTTGTTGGATACAGTCACCTGGTCCCAGGAGTTCACCCGCGGCTGGAACATCGCAGGCTCCAATGGCATGCAATGGACCGGCCTGGAATCCCTTATCTTCCCTGTCTCCACTGACACCAATTGGACCTCCACCTCCAGTCCTACCGCATATCCCCTCCCTTTCTCCTTCGTGCGTGCTTACCCAGACTCCTCCTGGGCTGCCATGTACAACACCCACTCCATGTGGAATTGCGGTTGGCGCGTTCAAGTGACCGTCAACGGCTCACAGTTCCATGCCGGAGCCCTTATCCTCTACATGGTCCCTGAAGCCACCACCCATGCCATCCAAACGGCTCGGGACAACGCTGGCTTTGTCTTCCCCTATGTCATCCTCAATCTCTATGAAAGCAACACCGCTACCATAGAGGTCCCCTACATCTCCCCCACCCCCAATACCTCGAGTGGACTCCACGCCCCGTGGACGTTCTACCTCCAGGTGCTCTCACCCCTCAATCCTCCCCCTTCTCTCCCCACTTCCTTATCCTGCTCTATCTATGTCACCCCCGTTGACTCCTCTTTCCACGGTCTCCGCTACCTCGCCCCACAGCACTGGAAGACTCGCGCCGTCCCAGGTGCGGGCACTTTCGGATCTGCCGTGGCTGGCCAGGAACTCCCTCTCTGTGGAGTCCGTGCCTACTACCCCCCCAATGCCTACATCCCTGCCCAGGTACGCGACTGGCTTGAGTTCGCCCACCGGCCTGGTCTCATGGCCACAGTGCCGTGGACCATGGCGGACGAGCCGGCCGAGCGCCTCGGTATCTTCCCCGTCTCTCCCAGTGCTATCGCTGGGACTGGCGCCCCCATCTCCTATGTTATTTCTCTCTTCTCCCAGTGGCGCGGTGAACTCGCCGCCCACCTCCTCTTCACTGGCTCCGCTCAGCACTACGGCCGCCTGGTCGTGTGCTACACTCCTGCTGCCCCCCAACCCCCCTCCACCATGCAGGAAGCGATGCGCGGAACATACACCGTATGGGACGTCAACGCTGCCTCAACCCTGGAGTTCACCATCCCCTTCATCTCTAACTCCTACTGGAAAACAGTGGACGTTAACAACCCCGACGCTCTGCTGTCCACCACCGGCTATGTTTCCATCTGGGTTCAAAACCCGCTAGTCGGACCCCACACCGCCCCTGCGTCGGCCCTCGTGCAGGCATTCATCTCCGCAGGTGAATCCTTCAACGTACGACTGATGCAAAACCCCGCCCTCACTTCCCAAACCCTCACCGAAGACCTCGATGCACCCCAAGACACCGGGAACATTGAGAACGGTGCGGCTGACAACTCCCCGCAGCCCCGCACCACCTTCGACTACACCGGAAACCCCCTCCCTCCAGACACCAAACTGGAAAACTTCTTCTCCTTCTACCGCTTGCTGCCCATGGGTGGCAGCGGTGCTCCATCTCTTTCTTTCCCCGCTGACGAAGGCACAATCATCCCACTCGACCCAATCAATTGGCTCAAAGGGGCGGACGTCTCCGGGATCGCTGCGATGCTATCGTGCTTCACGTACATCGCTGCGGACCTGCGAATCACGCTCCGCTTCTCCAACCCAAATGACAACCCTGCCACCATGCTTGTTGCCTTCGCTCCCCCTGGCGCCACCATCCCCCTCAAACCCACGCGCCAAATGCTCTCCAACTTCTACATGGCGGAGGTCCCAGTCTCCGCTGCCACCTCCACCATGGTCTCTTTCTCCATCCCCTACACCTCCCCCCTCTCTGCCATCCCCACCTCATACTTCGGATGGGAGGACTGGTCAGGTACCAACTTTGGCCAGCTCTCCTCCGGGTCATGGGGAAACCTCATGCTCATCCCCTCTCTCTCTGTCGACTCTGCTATCCCCTTCGACTTCCAGCTCTCTTGCTGGGTCGCCTTCGGCAACTTCAAAGCCTGGGTCCCCCGCCCACCTCCACCTCTCCCCCCCCTCCCCACCCCTGCCGCGAACGCGGAACGCACAGTGGCCGTGATCAAGCAGGGCGCCGCCTCAGCGACTCCCGATGTGGACCCCGACGATCGGGTCTACATCGTGCGCGCGCAGCGCCCCACCTACGTCCACTGGGCCATCCGCAAGGTGGCCCCCGACGGCAGTGCCAAACAGATCTCGCTGTCCCGCAGCGGGATCCAGGCACTGGTCGCCCTCGAACCCCCCGAGGGTGAACCTTACCTCGAAATTCTCCCCTCCCATTGGACCCTTGCTGAACTCCAACTTGGCAACAAGTGGGAGTACAGCGCCACCAACAACTGTACCCACTTCGTCAGCTCCATCACTGGCGAATCCCTCCCCAACACCGGCTTCTCCCTGGCCCTCGGAATCGGTGCCCTCACCGCCATCGCAGCCTCGGCTGCTGTTGCCGTGAAAGCGCTCCCAGGCATCAGGCGACAGGGTCTCCTCACCCTCTCTGCCGATACCGAGACCAACCAGACCCTCAACAAGATCACTGGATCTGTCAACCAAGCTGCCCAGGTCGTCTCCCAATTCGATCTGAGCGGCCCTGCAAATTCTGTCTCCCTTGCTGCTTCTGACATCCGCGAGGCTGCCCACAAAGTGGCCTCCTCCCTCAATGGCTTCACTGACGTCATCGCTGACATCAAAGATTCCCTGTTCACCAGGGTGTCTGACGCTGTCGAGAGCGGTGTCGCCACTTTCCTCACTTGGCTCGTCAAACTCTTTGGCTACCTCCTTGTTCTCTTTGGCTCTCCAACCCCCATGTCCATCTCCGGTCTCCTCGTCATCATCTGTGCCGACCTTGCCCCCCACGCTCGTGAATTTTTCACCGCCTCTGGAAATGTCCTCTCCTCACTCTACTACTGGATTGCCTCAAAATTAGGCCTGTCCGTCACGCCCCAAGAGTGTGAACGGGCAACCCTTGAACCTCAAGGGCTCAAAGACTTCAACGACGGCGCACTCGCAATGCGCAACGTCGAGTGGATTGGTGAGACCGCCTGGAAATGGGCCCACCGCCTCCTTGACTGGATCCCCGGTAAGGCCAAGACAGACCCCCAGGCCAAACTCGCCGACGTCCACGATGAAATCATGCTCCACTACTCAGACTCCATATTGGCTCTCGGATCTGAGAAACTCCCCATTGATCACATCACTAAATCCATCTCCCGCTGCCGTGAATTGGTCTCCATCGCCCAGGAGGCCAAATCCGGCCCTCACTCTTCCTTCCTCAACCAAGCAGTCAAAAACTACACCCTTGCCATCTCCC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| 8,798 |
OP255993.1
|
Aichi virus 1
|
Schmitz,D., Zwagemaker,F., van der Veer,B., Vennema,H., Bosch,T., Laros,J.F.J., Koopmans,M.P.G., de Graaf,M., Kroneman,A.
|
Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu, Center for Infectious Diseases
|
Netherlands
|
2023-07-01
| null |
Aichivirus A
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,252 |
GenBank
| null |
Netherlands
|
Netherlands
|
Homo sapiens
|
feces
|
2018-12-12
| null | null |
Aichi virus 1 strain A_RIVM_R04-15/Hu/NL/2019, complete genome
|
TCACCCCCTTTTCCGGTGGTCTGGCCCCGGACCACCGTTACTCCATTCAGCTTCTTCGGAACCTGTTCGGGGGAATTAAACGGGCACCCATACACCCTCACCCCCTTTCCGCAACTCAAGTATGTGTGCTCGTGATCTTGACTCCCACGGAATGGATCGATCCGCTGGAGAACAAACTGCTAGATCCACATCCTCCCTCCCCCTGGGAGGACCTCGGTCCTCCCACATCCTCCCCCCAGCCTGACGTACCACAGGCTGTGTGAAGCCCCCGCGAAAGCTGCTCACGTGGCAATTGTGGGTCCCCCCTTCATCAAGACACCAGGTCTTTCCTCCTTAAGGCTAGCCCCGATGTGTGAATTCACATTGGGCAACTAGTGGTGTCACTGTGCGCTCCCAATCTCGGCCGCGGAGTGCTGTTCCCCAAGCCGAACCCCTGGCCCTTCACTATGTGCCTGGCAAGCATATCTGAGAAGGTGTTCCGCTGCGGCTGCCAGCCTGGCAACAGGTGCCCCAGTGTGCGTAACCTTCTTCCGTCTCCGGACGGTAGTGATTGGTTAAGATTTGGTGTAAGGTTCATGTGCCAACGCCCTGTGCGGGATGAAACCTCTACTGCCCTAGGAATGCCAGGCAGGTACCCCACCCCCGGGTGGGATCTGAGCCTGGGCTAATTGTCTACGGGTAGTTTCATTTCCAATTCTCTTATGTCGGAGTCATGGCTGCAACACGGGTTTCACGATCTGTGCTCGCTGCCGTGGCTCACTCTGCTGCCCACCGCACCTACCACACTGTCCTTGACTGCTATGATAGGCTTTATCTTTCCACCAACCCCCACCTTTCATACCCCCTTCCCAAAAACTCTTCTTTCCCCTGTCCCTTCTGCCAGTACGACGAGCAGAGCGAAGTCCTCTCCCCAGAGTCTCTCTGTGGTGAGGGGGCCGAACCCTGCTGGAAGTGCTCGCAGGACAAACCCCGCCGCAAGTACAACACTGTCCCCCCTGAAGAATGGCTCTATGATTCTGATGTCCAATCCTGGTTCTATCCTGAAACATACTATTCTGACCTCCAACAAAAATTCTTTGACAAATTGGCTCTCCTCTCCCTTCCGGGTGCCTACCAAGCAAAGACCCCGGAAGAGCGCGCCCTTGCCGGTGCGCTCACCCAACTTCTCAACTTCCCCACCACGCCCCAACTTTCCATCCCCACTACCAATCTTCAACGGCAAGGCAACTCGGTCACCAACATCTACGGCAATGGCAACAACGTCACTACTGACGTTGGTGCCAATGGTTGGGCCCCCACGGTCTCAACCGGTCTAGGTGATGGTCCCGTTTCCGCCTCTGCCGACTCCCTTCCTGGGCGATCCGGAGGTGCTTCCTCCGAGAAAACCCACACCGTCTCCGGCTCCTCCAACAAAGTCGGATCCCGCTTCTCCAAGTGGTGGGAACCAGCTGCCGCGCGTGCTCTGGAACGCGCCACCGACTCGGCCATCGACGGAATCGATGCTGCCGGGAAGGCCGCCTCCAAGGCGATCACGCGAAAGCTGGACCGTCCCGCCGCTCCCTCCTCCACCGCCACCCCCCAACCCTCTCTCATCGCTCTCAACCCATCCGCCACCCAATCCGGTAACGCCTCCATCCTTACCGGATCCACCGCCCCTTCCTTCCTCGCTTACCCCACCGCCACCCCTGTCCCCCTCCCAAACCCGGACGAACCCTCCCAGCCTGGTCCATCCGGCGACCGCACCTGGTTGCTGGACACGGTCACCTGGTCGCAGGAGTTCACCCGAGGCTGGAACATTGCAGGCCCCAACGGCATGCAGTGGGCTGGCCTGGAAAGCCCCATATTCCCCGTCTCCACGGACACCAACTGGACCTCTTCCACAAATGCTCCCACCGCATACCCCTTGCCCTTCTCCTTCGTGCGTGCGTACCCAGATTCCCCCTGGGCTGCCATGTACAACACCCACTCCATGTGGAACTGCGGTTGGCGCATCCAAGTGACCGTCAACGGCTCACAGTTCCACGCTGGAGCCCTCATCCTCTACATGGTCCCTGAGGCCACCACCGAGTCGATCCAAACGGCTCGGAACAACGCTGGCTTCGTCTTCCCCTATGTCATCCTCAATCTCTATGAGAGCAACACTGCCACCATAGAGGTCCCCTACATCTCACCCACCCCCAACACCTCTAGTGGACTCCACGCTCCGTGGACGTTCTATCTCCAGGTCCTCTCTCCTCTGAACCCTCCTCCTTCACTCCCCACTTCCTTATCTTGCTCCATCTACGTCACACCCGTTGACTCCTCCTTCCACGGTCTCCGCTACCTGGCCCCACAGCACTGGAAGACCCGTGCCGTCCCCGGCGCGGGCACTTTCGGTTCAGCTGTCGCCGGTCAGGAACTCCCACTCTGCGGAGTCCGGGCTTATTACCCACCCAATTCCTACATCCCCGCCCAAGTCCACGATTGGCTGGAATTCGCGCACCGTCCTGGTCTCATGGCCACCGTGCCGTGGACCATGGCGGACGAACCAGCTGAGCGCCTGGGCATCTTCCCCGTCTCCCCCAGCGCCATCGCTGGCACTGGAGCTCCCATCTCCTACGTCATTTCTCTCTTCTCCCAGTGGCGCGGTGAACTTGCCGCCCACCTTCTCTTCACTGGCTCTGCCCAGCACTACGGCCGTCTGGTCGTATGCTACACCCCAGCTGCCCCCCAGCCACCCACCACCATGCAGGAGGCAATGCGCGGAACATACACTGTATGGGACGTCAACGCCGCCTCAACCCTCGAATTCACCATTCCCTTCATCTCCAACTCCTACTGGAAGACAGTGGACGTCAACAACCCTGACGCTCTGCTGTCAACCACCGGCTATGTCTCCATCTGGGTTCAAAACCCACTAGTCGGGCCCCACACCGCCCCTGCATCGGCCCTCGTCCAGGCATTCATCTCCGCAGGTGAATCCTTCAACGTCCGGCTGATGCAAAACCCTGCCCTCACCTCCCAGACCCTCACCGAGGATCTCGACGCGCCGCAAGACACCGGCAACATCGAGAATGGCGCCGCGGACAACACCCCACAACCGCGCACCACTTTCGACTACACCGAGAATCCTCTGCCTCCCGACACCAAACTGGAAAACTTCTTCTCCTTCTACCGGTTGTTGCCAATGGGCAACAATGGTGCCCCCTCCCTCTCCTTCCCCGCCAACGAAGGCACAATCATCCCTCTCAACCCCATCAATTGGCTCCAGGGAGCCGACGTGTCTGGAATCGCATCGATGCTATCGTGCTTCACATACATCGCCGCGGACCTCCGGATCACGCTCAGGTTCTCCAATCCAAACGACAACCCCGCCACCATGCTTGTTGCCTTCGCCCCGCCTGGCGCAACAATCCCCCTCCACCCCACGCGCCAGATGCTCTCAAATTTCTACATGGCGGAGGTTCCGGTCTCGGCCGCCACTTCCACCATGGTCTCCTTTTCCATCCCCTACACTTCCCCTCTCTCCGCCATCCCCACCTCGTACTTCGGATGGGAGGACTGGTCAGGCACCAACTTTGGCCAGCTCTCCTCCGGATCATGGGGCAATCTCATGCTCATCCCCTCCCTCGCTGTTGACTCTGCCATCCCCTTTGATTTCCAGCTCTCTTGCTGGGTTGCTTTCGGCAACTTCAAAGCCTGGGTCCCCCGTCCCCCCCCCCCTCTCCCGCCTCTCCCCACCCCAGCCGCCAACGCGGAACGCACAGTGGCCGTCATCAAACAAGGTGCCGCCGCCGCCACACCAGATGTGGACCCCGATGATCGGGTCTACATCGTGCGCGCGCAGCGCCCCACATACGTCCACTGGGCCATCCGCAAGGTCTCCCCGGACGGCAGTGCCCAACAGATCTCGCTGTCCCGCAGCGGGATCCGGGCACTGGTCGCCCTCGAACCCCCCGAGGGCGAACTCCACCTTGAAGTCCTCCCCTCACATTGGACTCTCGCTGAACTCCAACTCGGTAACGAGTGGGAGTACAGTGCCACCAACAACTGCACCCACTTCGTCAGTTCCATCACTGGCGAATCCCTTCCAAACACTGGCTTCTCTCTTGCTCTCGGTATCGGCGCCCTCACCGCCATCGCAGCCTCGGCTGCTGTTGCCGTGAAAGCGCTCAAAGGCATCAGGCGCCAGGGCCTCCTCACCCTCTCTGCCGATACTGAAACCAATCACACCCTCAACAAAATTACTGAATCTGTCAACCAAGCAGCTCAGGTTGTCTCACAGTTCGACCTGAGCGGCCCTGCAAATTCTGTCTCCCTTGCTGCTTCTGACATCCGGGAGGCTGCCCACAAGGTGGCCTCCTCTCTCAACGGCTTCACCGACGTCATCGCCGACATCAAGGATTCCCTCTTCACCCGGGTTTCCGATGCCGTCGAGACCGGCGTTGCCACCTTCCTCACCTGGCTTGTCAAACTCTTTGGCTACCTCCTGGTCCTCTTTGGATCTCCCACCCCCATGTCTATCTCTGGCCTCCTTGTAATCATCTGTGCTGACCTTGCCCCCCACGCCCGCGAGTTCTTCACTGCTTCTGAAAATGTCCTCTCTTCCCTCTACTACTGGATTGCCACAAAATTAGGCCTGTCCGTTACACCCCAAGAGTGTGAACGGGCAACCCTTGAACCTCAAGGGCTCAAAGACTTCAACGACGGCGCACTCGCAATGCGCAACGTCGAGTGGATTGGTGAGACTGCCTGGAAATGGGCCCACCGCCTCCTTGACTGGATCCGCGGCAAGGCCAAAACCGACCCCCAGGCAAAACTCGCCGACGTCCACGATGAAATCATGCTCCACTACTCAGACTCCATATTGGCCCTCGGATCTGAGAAACTTCCAATTGAGCACATCACCCAATCCATCTCCCGCTGCCGGGAACTGGTCTCCATCGCCCAGGAGGCTAAATCCGGCCCCCACTCTTCCTTCCTCAATCAATCCATCAAAAACTACACCCTTGCCATCTCCC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| 14,828 |
OQ121963.1
|
Aichi virus 1
|
Seoyoung,W.
|
Chung-Ang University, Food and Nutrition
| null |
2023-05-30
|
hu/C8_Seoul_02/2019
|
Aichivirus A
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,228 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Homo sapiens
|
feces
|
2019
| null | null |
Aichi virus 1 isolate hu/C8_Seoul_02/2019, complete genome
|
GTGTTACTCCATTCAGCTTCTTCGGAACCTGTTCGGAGGAATTAAACGGGCACCCATACTCCCTCCCCCCTTTTTGTAACTAAGTATGTGTGCTCGTGACCTTGACTCCCACGGAACGGACCGATCCGTTGGTGAACAAACAGCTAGGTCCACATCCCCCCTTCCCCTGGGAGGGTCCCCACCCTCCCACATCCTCCCCCCAGCCTGACGTATCACAGGCTGTGTGAAGCCCCCGCGAAAGCTGCTCACGTGGCAATTGTGGGTTCCCCCTTCATCAAGACACCAGGTCTTTCCTCCTTAAGGCTAGCCCCGGCGTGTGAACTCACGTTGGGCAACTAGTGGTGTCACTGTGCGCTCCCAATCTCGGCCGCGGAGTGCTGTTCCCCAAGCCAAACCCCTGGCCCTTCACTATGTGCCTGGCAAGCATATCTGAGAAGGTGTTCCGCTGTGGCTGCCAGCCTGGTAACAGGTGCCCCAGTGTGCGTAACCTTCTCCCGTCTTCGGACGGTAGTGGTTGGTTAAGATTTGGTGTAAGGTTCATGTGCCAACGCCCTGCGCGGGATGAAACCTCTACTGCCCTAGGAATGCCAGGCAGGTACCCCACCTCCGGGTGGGATCTGAGCCTGGGCTAATTGTCTACGGGTAGTTTCATTTCCAATTCTTTCATGTCGGAGTCATGGCTGCAACACGGGTTTCGCGATCTGTGCTCGCTGCTGTGGCTCACTCCGCTGCTCACCGCACCTACCACACTGTCCTTGACTGCTATGATAGGCTCTACCTCAACACCAACCCCCATCTCTCCTATCCCCTTCCCAAAAACTCCTCCTTCCCTTGTCCGTTCTGCCAGTACGACGAGCAGAATGAAGTCCTCTCCCCAGAGTCTCTCTGCGGTGAGGGGGCCGAACCCTGCTGGAAGTGCTCACAGGACAGACCCCGCCGCAAGTATAATACCACTCCTCCTGAAGACTGGCTCTATGATTCTGATGTCCAATCCTGGTTCTATCCTGAAACATACTACTCTGACCTTCAGCAAAAATTCTTTGACAAATTGGCTCTCCTCTCTCTCCCAGGTGCCTATCAAGCTAAGACCCCGGAGGAGCGTGCCCTCGCGGGCGCGCTCACCCAGCTCCTCAACTTCCCCTCCACCCCTCCTCTCACACTCCCTACCACCAATCTCCAACGGCAAGGCAACTCGGTCACCAACATCTACGGCAACGGCAATAACGTCACCACTGACGTTGGCGCCAACGGTTGGGCCCCCACGGTCTCAACTGGCCTAGGTGATGGCCCCGTCTCTGCCTCCGCCGACTCCCTCCCCGGGCGATCCGGAGGTGCCTCCTCCGAGAAAACCCACACCGTCTCCGGCTCTTCCAACAAGGTCGGGTCCCGTTTCTCCAAGTGGTGGGAACCAGCCGCCGCCCGCGCTTTGGAACGCGCCACCGACACGGCCATCGATGGAATCGATGCCGCCGGGAAGGCCGCCTCCAAGGCCATCACGCGGAAGCTGGACCGCCCCACCGCCCCTTCCTCAACCACTAACCCTCAACCATCTCTTATTGCTCTCAACCCCTCCGCCACACAATCCGGTAACGCTTCCATCTTAACCGGATCAACTGCTCCCTCCTTCCTCGCCTACCCCACCGCCACCCCTGTCCCCCTTCCCAACCCCGACGAACCCTCTCAACCTGGGCCATCCGGCGACCGCACCTGGTTGTTGGACACAGTCACCTGGTCCCAGGAGTTCACCCGTGGTTGGAACATTGCAGGTCCCAATGGCATGCAATGGACCGGCCTGGAATCCCCCATCTTCCCCATCTCCACTGACACCAACTGGACCTCCACCTCCAGTCCCACTGCATACCCCCTCCCCTTCTCCTTCGTGCGTGCTTACCCAGACTCCCCCTGGGCTGCCATGTACAACACCCACTCCATGTGGAATTGTGGCTGGCGCGTCCAAGTGACCGTCAACGGCTCACAGTTCCATGCCGGAGCCCTCATTCTCTACATGGTCCCTGAAGCCACCACCCAAGCCATCCAAACGGCTCGGAACAACGCTGGCTTCGTCTTCCCCTATGTCATCCTCAATCTCTATGAAAGCAACACCGCCACCATAGAGGTCCCCTACATCTCCCCCACCCCCAACACCTCAAGTGGACTCCACGCCCCGTGGACGTTCTACCTCCAGGTGCTCTCACCCCTCAACCCTCCCCCTTCTCTCCCCACTTCCTTATCCTGTTCTATCTATGTCACCCCTGTCGACTCCTCTTTCCACGGTCTCCGCTACCTCGCCCCACAGCACTGGAAGACCCGCACCGTCCCTGGTGCGGGCACTTTCGGGTCCGCCGTGGCCGGCCAGGAACTCCCTCTCTGTGGAGTCCGTGCCTACTACCCCCCCAATGCCTACATCCCCGCTCAGGTGCACGACTGGCTTGAGTTCGCCCACCGACCTGGTCTCATGGCTACAGTGCCGTGGACCATGGCGGACGAGCCGGCCGAGCGCCTCGGTATCTTCCCCGTCTCTCCCAGTGCCATCGCTGGGACTGGCGCCCCCATCTCCTATGTCATCTCCCTCTTCTCCCAGTGGCGCGGTGAACTCGCCGCCCACCTTCTTTTCACCGGCTCTGCTCAGCACTACGGCCGTCTGGTCGTGTGCTACACCCCTGCTGCCCCCCAACCCCCTTCCACCATGCAGGAAGCGATGCGCGGAACATACACCGTATGGGACGTCAACGCTGCCTCAACCCTAGAATTCACCATCCCCTTCATCTCCAACTCCTACTGGAAAACAGTAGACGTCAACAATCCCGACGCTCTGCTGTCTACCACCGGCTATGTTTCCATCTGGGTTCAAAACCCGCTAGTCGGACCCCACACCGCCCCTGCGTCGGCCCTCGTGCAGGCGTTCATCTCCGCAGGTGAATCCTTCAACGTACGGCTGATGCAAAACCCTGCCCTCACTTCCCAGACCCTCACCGAAGACCTCGATGCACCCCAAGACACCGGGAACATTGAGAATGGTGCGGCCGACAACTCCCCGCAGCCTCGCACCACCTTCGACTACACTGAAAATCCCCTCCCTCCAGACACCAAACTGGAAAACTTCTTTTCCTTCTACCGCCTGTTGCCTATGGGTGACGACGGTGCTCCATCCCTCTCCTTCCCCGCCGACGAAGGCACAATCATCCCACTCAACCCAATCAATTGGCTCAAAGGGGCGGATGTTTCCGGGATCGCTTCGATGCTGTCGTGTTTCACGTACATCGCTGCGGACCTGCGAATCACACTCCGTTTCTCCAATCCAAATGACAATCCTGCCACCATGCTTGTTGCCTTTGCTCCTCCTGGCGCCACCATTCCCCTCAAACCCACGCGCCAGATGCTCTCCAACTTCTACATGGCGGAGGTCCCAGTCTCTGCTGCCACCTCCACTATGGTTTCCTTCTCCATCCCCTACACCTCCCCCCTCTCTGCCATCCCTACCTCATACTTCGGTTGGGAGGACTGGTCAGGCTCCAACTTTGGCCAACTCTCCTCCGGATCATGGGGAAACCTCATGCTCATCCCCTCTCTCTCTGTTGCTTCTGCCATCCCCTTCGACTTCCAGCTCTCTTGCTGGGTCGCCTTCGGCAACTTCAAAGCCTGGGTCCCCCGCCCACCCCCACCTCTCCCTCCCCTCCCCACCCCTGCCGCGAACGCGGAACGCACAGTGGCCGTGATCAAGCAGGGTGCTGCCGCAACGACACCGGATGTTGACCCCGACGACCGGGTCTACATCGTGCGCGCGCAGCGCCCCACTTACGTCCACTGGGCCATCCGCAAAGTGGCCCCCGACGGCAGTGCCAAACAGATCTCGCTGTCTCGCAGTGGGATCCAGGCACTGGTCGCCCTCGAACCCCCCGAGGGCGCGCTCTACCTCGAAGTCCTCCCCTCCCATTGGACCCTTGCTGAACTCCAACTTGGCAACAAGTGGGAGTACAGCGCCACCAACAACTGCACCCACTTCGTCAGCTCCATCACTGGCGAATCCCTCCCCAACACCGGCTTCTCCCTGGCCCTCGGAATCGGCGCCCTCACCGCCATCGCAGCCTCGGCTGCTGTTGCCGTGAAAGCGCTCCCAGGCATCAGGCGACAGGGCCTCCTCACCCTCTCCGCCGATACCGAGACCAACCAGACCCTCAACAAAATCACTGAATCTGTCAACCAGGCTGCCCAGGTCGTCTCCCAGTTCGATCTGAGCGGCCCTGCAAATTCTGTCTCCCTTGCTGCTTCTGACATCCGCGAGGCCGCCCACAAAGTGGCCTCCTCCCTCAATGGCTTCACTGACGTCATCGCCGACATCAAGGATTCCCTGTTCACCAGGGCGTCCGACGCTGTCGAGAACGGTGTCGCCACTTTCCTCACCTGGCTCGTCAAACTCTTTGGCTACCTCCTTGTCCTCTTTGGCTCCCCAACCCCCATGTCCATCTCCGGCCTCCTCGTCATCATCTGTGCTGACCTTGCCCCCCACGCCCGTGAGTTCTTCACCGCCTCTGAAAACGTCCTCTCTTCACTTTACTACTGGATTGCCTCAAAATTAGGCCTGTCCGTCACACCCCAGGAGTGTGAACGGGCGACCCTTGAACCTCAAGGGCTCAAAGACTTCAACGACGGTGCACTGGCAATGCGTAACGTCGAGTGGATCGGCGAAACCGCCTGGAAATGGGCCCACCGCCTCCTTGACTGGATCCGCGGTAAGGCCAAAACAGACCCCCAGGCCAAACTCGCCGATGTCCACGATGAAATCATGCTTCATTACTCAGATTCCATATTGGCTCTCGGATCTGAGAAACTCCCCATTGATCACATCACCACTTCCATCTCCCGCTGCCGTGAGCTGGTCTCCATCGCCCAGGAGGCCAAATCCGGCCCCCACTCTTCCTTCCTTAACCAGGCAATCAAAAACTACACCCTTGCCATCTCCCAACACCGCAAACGCCAGACAGGCCCCAGGCCTGAACCCGTGGTGGTCTACCTCTACGGACCCCCCGGCACTGGCAAATCCCTCCTTGCTTCACTCCTTGCCCAAACCCTTTCCCAGCGCCTTGCTGGAACCCCCGACGACGTCTACTCCCCCTCCTCCGCATCCTGCGAGTACTTCGATGGGTACACGGGTCAAACCGTGCACTTCATCGATGACATCGGACAGGATCCGGAGGGGCGGGACTGGGCTAACTTCCCAAACCTCGTCTCCTCTGCCCCCTTCATTGTCCCAATGGCCTCCCTCGAGGAGAAGGGCACCCACTACACCTCCAAGGTCATCGTGGTTACCTCCAACTTCCACGAGCCTAACGAGCGCGCCGCGCGTTCGATGGGTGCTCTTCGACGCCGCGTCCACCTGCGGATCAACGTCACCTCAAATGGAGTGCCATTTGACCCCACCAATGCCCTCAACCCTATCCCCGGGACTCAATCCAAATACTTCACTGCCCAAACGCCTCTCACCCTGTTCCAGTCCAACACGGTCCGCCTGGACCGTGACTCCATCTGGACCCCCACCTTCACCAACATGGACGAACTGGTGGACGCGATTGTGACTCGTCTCGATCGCTCCACCGGTGTGTCCAATTCCCTCGCCTCCCTCATCAAACGCCAGGGTAACCGGGTCATCGACGCGGAACCCAGGGAAATCCCCCTGGAATACGCGGATGATCTCCTGGAAGCCATGGCGCATCACCGCCCTGTACCATGCTCCCTTGGCCTCTCCCAAGCCATCACAAACAACACCCCCCTCCAACAAATCTCTGAAACCTTCTGGAAATACCGCAAGCCCATCTTCACTTGCACCACTTTTCTCGCTGTCCTTGGTTTCCTCTGCTCTGTCATCCCTCTTGCTCGCTCCCTGTGGAAGTCCAAACAGGACACACCACAGGAACCCCAAGCTGCCTACTCTGCTATCCCCCACCAGAAATCCAAGCCCAAATCCCAGAAACCTGTCCCCACCCGCCACATCCAGCGCCAAGGAATCTCCCCCGCTGTCCCCGGCATCTCCAACAATGTCGTCCACGTCGAGTCCGGCAACGGTCTCAACAAGAACGTCATGTCTGGCTTCTACATCTTCTCCCGCTTCCTTCTGGTCCCCACCCACCTCCGTGAACCCCACCACACCACTCTCATGGTGGGCACCGACACCTACGACTGGGCCACCCTCCAGACGCAGGAGTTTGGTGAAATCACCATTGTCCACACTCCCACCTCCCGCCAGTACAAGGACATGCGGCGCTTTATCGGCGCCCATCCCTACCCCACTGGACTCCTTGTTTCCCAATTCAAAACTGCCCCCCTCTACATCCGTATCTCCGACAACCGGATCCTGGACCTTGACTTCCCCGGAGTCGTCGTCTGCAAGCAGGCGTACGGATACCGCGCCGCGACCTTCGAAGGTCTGTGCGGATCCCCGCTTGTCACGGATGATCCCTCCGGAGTCAAGATTCTGGGCCTCCACGTCGCTGGAGTCGCGGGCACGAGTGGATTCTCCGCCCCCATCCACCCCATCCTCGGTCAAATCACCCAATTTGCCACCACCCAGCAATCTCTCATTGTCCCCACTGCTGAAGTCCGGCCTGGCGTCAACGTCAACCGGATGTCCCGCCTGCACCCCTCCCCCGCCTACGGTGCTTTCCCCGTCAAGAAACAACCCGCTCCTCTCAAGCGCAACGACAAGCGCCTGCAGGAGGGCGTCGATCTTGACACCCAGCTTTTTCTCAAGCACGGCAAAGGCGACGTTACCGAGCCCTGGCCCGGTCTCGAAGCTGCTGCTGACCTCTACTTCTCTACTTTCCCCACCTCCCTCCCGGTCCTCACCCAGGAACAGGCCATCCATGGAACACCAAACATGGAGGGCCTGGACATGGGCCAGGCGGCCGGATACCCCTGGAACACCCTTGGGCGCTCCCGGCGATCCCTCTTCGACGAGGTCGAGCCGGGAGTGTTCGTCCCCAAACCTGAACTCCAAGCTGAAATCAACCAGACACTTGAAGACCCGGATTACGTGTACTCCACCTTCCTCAAGGACGAACTCAGACCAACGGCTAAGGTTGAACAGGGACTGACCAGAATCGTCGAAGCTGCTCCCATCCACGCCATCGTCGCTGGCCGGATGCTCCTCGGTGGTCTTATCGACTACATGCAGGGGCGTCCCGGCGAGCACGGCAGTGCGGTTGGTTGCAACCCAGATGTTCACTGGACCTCCTTCTTCTACGCCTTTAGCGAGTTCTCTCAGGTATACGATCTGGACTACAAGTGTTTTGACGCTACCCTCCCCTCTGCTGTCTTCACCCTTGTTGCTGACCATCTTACCCGCATTACCGGAGATCCCCGTGTCGGTCGCTATATCCACTCCATTCGCCATTCACACCACATCTATGGCAACCGGATGTACGACATGATCGGGGGGAACCCCTCTGGTTGTGTGGCCACCTCCATCCTCAACACCATCATCAACAACATCTGTGTCCTCTCTGCCCTCATCCAACACCCTGATTTCTCTCCCTCCCGCTTCCACATCCTGGCGTATGGTGACGACGTCATCTACGCCACGGAACCCCCCATCCACCCTTCCTACCTCCGGGAGTTCTACCAGAAGCACACCCCTCTGGTGGTCACCCCCGCTAACAAAGGCCAGGACTTCCCACCCACGTCCACGATCTATGAAGTCACCTTCCTCAAGCGCTGGTTCGTTCCGGACGACGTCAGGCCCATCTACATCCACCCAGTGATGGACCCTGACACGTACGAACAATCGGTGATGTGGTTGCGTGATGGAGATTTTCAGGATGTGGTCACTTCCCTCTGCCACCTGGCCTTCCACAGCGGACCCAAGACATACGCTGCTTGGTGCATGAAAGTGCGCGAGCAGTGTCTCAAGTCTGGGTTCGCCCCCAACTTCCTCCCCTACTCCTACCTCCAACTCCGCTGGCTCAATCTGCTGGCTGCCTGATAGTTAGGGAACACAGTGCTTCGGCACGCTTAGTTAGTTAGAACCCTTTGCCCACTCCTCCATGGTGATATAAAGACCACCCACTTCCTTCGGGTGAGCCCCTAAGCCATGGTTGTACTGCACTATCAATCTAAGACGGTCCTTCTTCGGATCGCAATTTCACTCTGGTGCCGCGCTTCCTCCGGGAACTGCACCCGCGGACCAGGGTCGTCTTTGAACTTTTCTAACTGTTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAA
| 15,531 |
FJ890523.1
|
Aichi virus 1
|
Yang,S., Zhang,W., Shen,Q., Yang,Z., Zhu,J., Cui,L., Hua,X.
|
Shanghai Jiaotong University, School of Agriculture and Biology
| null |
2009-10-06
|
Chshc7
|
Aichivirus A
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,244 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2008
| null | null |
Aichi virus isolate Chshc7, complete genome
|
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| 102,064 |
DQ028632.1
|
Aichi virus 1
|
Oh,D.Y., Silva,P.A., Hauroeder,B., Diedrich,S., Cardoso,D.D., Schreier,E., Cardoso,D.D.P.
|
Robert Koch Institute, Molecular Epidemiology of Viral Pathogens
|
Germany
|
2005-05-29
|
Goiania/GO/03/01/Brazil
|
Aichivirus A
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,266 |
GenBank
| 1 |
Brazil
|
Brazil
| null |
feces
| null | null | null |
Aichi virus isolate Goiania/GO/03/01/Brazil, complete genome
|
GGCTTCGGCCCCCTCACCCTCTTTTCCGGTGGTCTGGTCCCGGACCACCGTTACTCCATTCAGCTTCTTCGGAACCTGTTCGGAGGAATTAAACGGGCACCCATACACCCCCATCCCCTTTTTTGCAACTTAAGTATGTGTGCTCGTAATCTTGACTCCCACGGAATGGATCGATCCGCTGGAGAACAAACTGCTAGATCCACATCCTCCCTCCCCCCTGGGAGGACCTCGGTCCTCCCACATCCTCCCCCCAGCCTGACGTATCACAGGCTGTGTGAAGCCCCCGCGAAAGCTGCTCACGTGGCAATTGTGGGTCCCCCCTTCATCAAGACACCAGGTCTTTCCTCCTTAAGGCTAGTCCCGATGTGTGAATTCACATCGGGCAACTAGTGGTGTCACTGTGCGCTCCCAATCTCGGCCGCGGAGTGCTGTTCCCCAAGCCAAACCCCTGGCCCTTCACTATGTGCCTGGCAAGCATATCTGAGAAGGCGTTCCGCTGTGGCTGCCAGCCTGGTAACAGGTGCCCCAGTGTGCGTAACCTTCTTCCGTCCCCGGACGGTAGTGATTGGTTAAGACTTGGCGTAAGGTTCATGTGCCAACGCCCTGTGCGGGATGAAACCTCTACTGCCCTAGGAATGCCAGGCAGGTACCCCACCTTCGGGTGGGATCTGAGCCTGGGCTAATTGTCTACGGGTAGTTTCATTTCTAATTCTTTCATGTCGGAGTCATGGCTGCAACACGGGTTTCACGATCTGTGCTCGCTGCTGTGGCTCACTCCGCTGCTCACCGCACCTACCACACTGTCCTTGACTGCTATGATAGGCTCTATCTCTCCACCAATCCCCACCTCTCATACCCCCTCCCCAAAAACTCCTCCTTCCCCTGTCCCTTCTGCCAGTACGACGAGCAGAACGAAGTCCTCTCCCCAGAGTCTCTCTGTGGTGAGGGGGCCGAACCCTGCTGGAAGTGCTCGCAGGACAAACCCCGCCGCAAACACAACACTGTCCCTCCTGAAGAATGGCTCTATGATTCTGATGTCCAATCCTGGTTCTATCCTGAAACATACTATTCTGACCTCCAACAAAAGTTCTTTGACAAATTGGCTCTTCTCTCCCTCCCAGGTGCCTACCAAGCAAAGACCCCGGAGGAGCGTGCCCTCGCTGACGCGCTCGCTCAACTTCTCAATTTCCCCTCCACACCCCGACTCTCCATTCCCACCGCCAATCTCCAACGGCAAGGCAATTCGGTCACCAACATCTACGGCAATGGCAACAACGTCACCACTGACGTTGGCGCCAACGGTTGGGCCCCCACGGTCTCAACTGGTCTAGGTGATGGTCCCGTTTCCGCCTCTGCCGACTCCCTCCCCGGGCGATCCGGAGGTGCTTCCTCCGAGAAAACCCACACCGTCTCCGGCTCTTCCAACAAAGTCGGATCCCGCTTCTCCAAGTGGTGGGAACCAGCCGCCGCGCGTGCTCTGGAGCGCGCCACCGACTCAGCCATCGACGGAATCGATGCTGCCGGGAAGGCCGCCTCCAAAGCGATCACGCGAAAGCTGGACCGTCCCGCTGCTCCCTCCTCCACCACCCACCCCCAACCCTCCCTCATCGCTCTCAACCCATCTGCCACCCAATCCGATAACGCCTCCATCCTTACCGGATCCACCGCCCCCTCATTCCTCGCTTACCCTACCGCCACCCCTGTCCCCCTTCCAAATCCGGACGAACCCTCCCAGCCTGGCCCATCTGGCGACCGCACCTGGTTGCTGGACACAGTTACCTGGTCACAGGAGTTCACCCGGGGCTGGAATATTGCAGGCCCCAATGGCATGCAGTGGAACGGCCTGGAAAACCCCCTCTTTCCCGTCTCCACAGACACCAACTGGACCTCCTCCACAAACCCTTCCACCGCTTACCCTCTACCCTTCTCCTTCGTGCGTGCGTACCCGGATTCCCCCTGGGCTGCCATGTACAACACCCACTCCATGTGGAACTGCGGTTGGCGCGTCCAAGTGACCGTCAACGGCTCACAATTCCACGCTGGAGCCCTCATCCTCTACATGGTCCCAGAAGCCACCACCGAGTCGATCCAAACGGCCCGAAACAACGCTGGCTTCGTCTTCCCCTACGTCATCCTCAACCTCTATGAGAGCAACACTGCTACCATAGAGGTCCCCTACATCTCACCCACTCCCAACACCTCTAGTGGACTCCACGCCCCGTGGACGTTCTACCTCCAGGTCCTCTCCCCCCTGAACCCCCCTCCCTCACTCCCCACTTCTCTGTCCTGCTCCATCTACGTCACACCTGTTGACTCCTCCTTCCACGGTCTCCGTTACCTGGCTACACAGCACTGGAAGACCCGCGCCGTCCCCGGTGCGGGTACTTTCGGCTCAGCTGTCGCTGGCCAGGAACTCCCACTCTGCGGAGTCCGGGCTTATTACCCACCGAACTCCTACATCCCAGCCCAAGTCCGCGATTGGTTGGAATTCGCCCACCGTCCCGGTCTCATGGCCACCGTGCCGTGGACCATGGCGGACGAACCAGCTGAACGCCTTGGCATCTTTCCTGTCTCTCCCAGTGCCATTGCTGGTACTGGAGCCCCCATCTCCTACGTCATCTCCCTCTTCTCCCAGTGGCGCGGTGAACTCGCCGCCCACCTCCTCTTCACTGGCTCTGCACAGCATTACGGCCGTCCGGTCGTGTGCTACACCCCCGCTGCCCCCCAGCCACCCACCACCATGCAGGAGGCAATGCGCGGAACATACACAGTATGGGACGTCAATGCCGCCTCAACCCTCGAATTCACCATCCCCTTCATCTCCAACTCCTACTGGAAGACGGTGGACGTCAACAACCCTGACGCACTACTGTCAACCACCGGCTACGTCTCCATCTGGGTGCAAAACCCACTAGTCGGACCCCACACCGCCCCTGCGTCGGCCCTCGTTCAGGCATTCATCTCCGCGGGTGAATCCTTTAACGTCCGGTTGATGCAAAACCCCGCCCTCACCTCCCAGACCCTCACCGAGGATCTCGATGCACCACAAGACACCGGCAACATCGAGAATGGCGCCGCGGACAACACCCCACAACCGCGCACCACTTTCGACTACACCGAGAATCCTCTGCCCCCTGACACCAAACTGGAAAACTTCTTCTCCTTCTACCGGTTGCTGCCCATGGGCAACAACGGTGCTCCCTCACTTTCCTTCCCCGCCAACGAAGGCACAGTCATCCCCCTCAACCCTATCAATTGGCTTCAGGGAGCCGACGTGTCCGGAATCGCGTCGATGCTATCGTGCTTCACATACATCGCCGCGGATCTCCGGATCACGCTCAGGTTCGCCAATCCAAACGACAACCCCGCCACCATGCTTGTCGCCTTCGCCCCGCCTGGCGCAACAATCCCTCTCCATCCCACGCGCCAAATGCTCTCAAACTTTTACATGGCAGAGGTTCCGGTCTCGGCCGCTACCTCTACCATGGTCTCCTTTTCCATCCCCTACACTTCTCCCCTCTCCGCCATCCCTACCTCGTACTTCGGATGGGAGGACTGGTCAGGCACCAACTTTGGCCAGCTCTCTTCCGGATCATGGGGCAACCTCATGCTCATCCCCTCCCTCGCCGTCGACTCTGCCATTCCCTTCGACTTCCAGCTCTCCTGCTGGGTCGCCTTCGGCAACTTCAAAGCCTGGGTTCCCCGCCCCCCCCCTCCTCTCCCACCCCTCCCCACCCCAGCCACCAACGCGGAACGCACAGTGGCCGTCATCAAACAAGGTGCCGCCACCGCCACACCAGACGTGAACCCCGACGACCGGGTCTACATCGTGCGTGCGCAGCGTCCCACCTACGTCCACTGGGCCATCCGCAAGGTCTCCCCAGACGGCAGTGCTCAACAGATCTCGCTGTCCCGCAGCGGGATCCGGGCACTGGTCGCCCTCGAACCCCCCGAGGGCGAACTCCACCTTGAAGTCCTTCCCTCACATTGGACTCTCGCTGAACTCCAACTCGGCAACGAGTGGGAGTACAGTGCCACCAACAACTGCACCCACTTCGTCAGTTCCATCACTGGCGAACCCCTCCCAAACACCGGCTTCTCCCTTGCTCTCGGTATCGGTGCCCTCACCGCCATCGCAGCCTCGGCTGCTGTTGCCGTGAAAGCGCTCAAAGGCATCAGGCGCCAGGGCCTCCTCACCCTCTCTGCCGATACTGAAACCAATCAAACCCTCAACAAAATCACTGAATCTGTCAATCAAGCAGCTCAGGTTGTTTCACAGTTCGACCTGAGCGGCCCTGCAAATTCTGTCTCCCTTGCCGCCTCTGACATTCGAGAGGCCGCCCACAAAGTGGCCTCCTCCCTCAATGGCTTCACCGACGTCATCGCCGACATCAAGGATTCCCTCTTCACCCGGGTTTCCGATGCCGTCGAGACTGGCGTTGCCACCTTCCTCACCTGGCTCGTCAAACTCTTTGGCTACCTCTTGGTCCTCTTTGGATCTCCCACTCCCATATCTATCTCTGGCCTCCTTGTAATCATCTGTGCTGATCTTGCCCCCCACGCCCGCGAGTTCTTCACTGCTTCTGAAAATGTTCTCTCCTCTCTCTACTACTGGATTGCCACAAAGCTAGGCCTGTCCGTCACACCCCAAGAGTGTGAACGGGTGACCCTTGAACCTCAAGGGCTCAAAGACTTCAACGACGGCGCACTCGCAATGCGCAACGTCGAGTGGATTGGTGAGACTGCCTGGAAATGGGCCCACCGCCTCCTTGACTGGATCCGCGGTAAGGCCAAAACCGACCCTCAGGCAAAGCTCGCCGACGTCCACGATGAAATCATGCTCCACTACTCAGACTCCATATTGGCTCTCGGATCTGAGAAACTCCCAATTGAACACATCACACAATCCATCTCCCGCTGCCGGGAACTGGTCTCCATCGCCCAAGAGGCCAAGTCCGGCCCCCACTCTTCCTTCCTCAACCAATCCATCAAAAACTACA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| 109,004 |
AB040749.1
|
Aichi virus 1
|
Sasaki,J., Kusuhara,Y., Maeno,Y., Kobayashi,N., Yamashita,T., Sakae,K., Takeda,N., Taniguchi,K.
|
Jun Sasaki, Fujita Health University, Department of Virology and Parasitology, School of Medicine; Dengakugakubo 1-98, Kutsukake-cho, Toyoake, Aichi 470-1192
|
Japan
|
2001-08-15
| null |
Aichivirus A
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,280 |
GenBank
| 1 | null | null | null | null | null | null | null |
Aichi virus genomic RNA, complete genome
|
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| 111,060 |
AB010145.1
|
Aichi virus 1
|
Yamashita,T., Sakae,K., Tsuzuki,H., Suzuki,Y., Ishikawa,N., Takeda,N., Miyamura,T., Yamazaki,S.
|
Department of Virology; Nagare 7-6, Tsujimachi, Kita-ku, Nagoya, Aichi 462
|
Japan
|
1998-07-09
|
A846/88
|
Aichivirus A
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,251 |
GenBank
| 1 | null | null |
Homo sapiens
| null | null | null | null |
Aichi virus genomic RNA, complete genome
|
TCACCCTCTTTCCCGGTGGTCTGGTCCCGGACCACCGTTACTCCATTCAGCTTCTTCGGAACCTGTTCGGAGGAATTAAACGGGCACCCATACTCCCCCCACCCCCCTTTGGTAACTAAGTATGTGTGCTCGTGATCTTGGCTCCCACGGAGCGGACCGATCCGTTGGTGAACAAACAGCTAGGTCCACATCCTCCCTTCCCCTGGGAGGGCCCCCGCCCTCCCACATCCTCCCCCCAGCCTGACGTATCACAGGCTGTGTGAAGCCCCCGCGAAAGCTGCTCACGTGGCAATTGTGGGTCCCCCCTTCATCAAGACACCAGGTCTTTCCTCCTTAAGGCTAGCCCCGGCGTGTGAATTCACGTTGGGCAACTAGTGGTGTCACTGTGCGCTCCCAATCTCGGCCGCGGAGTGCTGTTCCCCAAGCCAAACCCCTGGCCCTTCACTATGTGCCTGGCAAGCATATCTGAGAAGGTGTTCCGCTGTGGCTGCCAACCTGGTAACAGGTGCCCCAGTGTGCGTAACCTTCTTCCGTCTCCGGACGGTAGTGATTGGTTAAGATTTGGTGTAAGGTTCATGTGCCAACGCCCTGTGCGGGATGAAACCTCTACTGCCCTAGGAATGCCAGGCAGGTACCCCACCTCCGGGTGGGATCTGAGCCTGGGCTAATTGTCTACGGGTAGTTTCATTTCCAATCCTTTTATGTCGGAGTCATGGCTGCAACACGGGTTTCACGATCTGTGCTCGCTGCTGTGGCTCACTCTGCCGCTCACCGCACCTACCACACTGTCCTTGACTGCTATGATAGGCTTTACCTCAACACCAACCCCCATCTCTCTTATCCCCTTCCCAAAAACTCTTCCTTCCCTTGCCCGTTCTGTCAGTACGACGAGCAGAATGAGGTCCTCTCCCCAGAGTCTCTCTGTGGCGAGGGAGCTGAACCCTGCTGGAAGTGCTCACAGGACAAACCCCGCCGCAAGTACAACACCACCCCTCCTGAAGACTGGCTCTATGATTCTGATGTCCAATCCTGGTTCTATCCTGAAACATACTACTCTGACCTTCAGCAAAAGTTCTTTGACAAATTGGCTCTCCTCTCTCTTCCAGGTGCCTACCAAGCAAAGACCCCGGAGGAGCGTGCCCTCGCGGGCGCGCTCACCCAACTCCTCAACTTCCCCTCCACCCCCCCTCTCACACTCCCTACCACTAACCTCCAACGGCAAGGCAACTCGGTCACCAACATCTACGGTAACGGCAACAACGTCAACACTGACGTTGGCGCCAACGGTTGGGCCCCCACGGTCTCAACTGGCCTAGGTGATGGTCCCGTCTCATGCACTCCGCCGACTCCCTCCCCGGGCGATACGGAGGTGCCTCCTCCGAGAAAACCCACAACGTTTCCGGCTCCTCCAACAAAGTCTGGATCCCGCTTTTCCAAGTGGTGGGAACCAGCAGCCGCCCGCGCTTCGGAATCCGCCACCGACTCGGCTATCGAGGGAATCGATGCTGCCGGGAAGGCCGCCTCCAAGGCCATCACGCGGAAGCTGGACCGCCCCGCCGCCCCCTCCTCAACCGCCAATCCCCAACCATCTCTCATCGCTCTCAACCCTTCTGCCACGCAATCCGGCAACGCTTCCATCTTGACCGGATCAACTGCTCCCTCCCTCCTCGCCTACCCCACCGCCACCCCTGTTCCCCTTCCCAACCCCGATGAACCCTCCCAACCCGGACCATCCGGCGACCGCACCTGGTTGTTGGATACAGTCACCTGGTCCCAGGAGTTCACCCGCGGCTGGAACATCGCAGGCTCCAATGGCATGCAATGGACCGGCCTGGAATCCCTTATCTTCCCTGTCTCCACTGACACCAATTGGACCTCCACCTCCAGTCCTACCGCATATCCCCTCCCTTTCTCCTTCGTGCGTGCTTACCCAGACTCCTCCTGGGCTGCCATGTACAACACCCACTCCATGTGGAATTGCGGTTGGCGCGTTCAAGTGACCGTCAACGGCTCACAGTTCCATGCCGGAGCCCTTATCCTCTACATGGTCCCTGAAGCCACCACCCATGCCATCCAAACGGCTCGGGACAACGCTGGCTTTGTCTTCCCCTATGTCATCCTCAATCTCTATGAAAGCAACACCGCTACCATAGAGGTCCCCTACATCTCCCCCACCCCCAATACCTCGAGTGGACTCCACGCCCCGTGGACGTTCTACCTCCAGGTGCTCTCACCCCTCAATCCTCCCCCTTCTCTCCCCACTTCCTTATCCTGCTCTATCTATGTCACCCCCGTTGACTCCTCTTTCCACGGTCTCCGCTACCTCGCCCCACAGCACTGGAAGACTCGCGCCGTCCCAGGTGCGGGCACTTTCGGATCTGCCGTGGCTGGCCAGGAACTCCCTCTCTGTGGAGTCCGTGCCTACTACCCCCCCAATGCCTACATCCCTGCCCAGGTACGCGACTGGCTTGAGTTCGCCCACCGGCCTGGTCTCATGGCCACAGTGCCGTGGACCATGGCGGACGAGCCGGCCGAGCGCCTCGGTATCTTCCCCGTCTCTCCCAGTGCTATCGCTGGGACTGGCGCCCCCATCTCCTATGTTATTTCTCTCTTCTCCCAGTGGCGCGGTGAACTCGCCGCCCACCTCCTCTTCACTGGCTCCGCTCAGCACTACGGCCGCCTGGTCGTGTGCTACACTCCTGCTGCCCCCCAACCCCCCTCCACCATGCAGGAAGCGATGCGCGGAACATACACCGTATGGGACGTCAACGCTGCCTCAACCCTGGAGTTCACCATCCCCTTCATCTCTAACTCCTACTGGAAAACAGTGGACGTTAACAACCCCGACGCTCTGCTGTCCACCACCGGCTATGTTTCCATCTGGGTTCAAAACCCGCTAGTCGGACCCCACACCGCCCCTGCGTCGGCCCTCGTGCAGGCATTCATCTCCGCAGGTGAATCCTTCAACGTACGACTGATGCAAAACCCCGCCCTCACTTCCCAAACCCTCACCGAAGACCTCGATGCACCCCAAGACACCGGGAACATTGAGAACGGTGCGGCTGACAACTCCCCGCAGCCCCGCACCACCTTCGACTACACCGGAAACCCCCTCCCTCCAGACACCAAACTGGAAAACTTCTTCTCCTTCTACCGCTTGCTGCCCATGGGTGGCAGCGGTGCTCCATCTCTTTCTTTCCCCGCTGACGAAGGCACAATCATCCCACTCGACCCAATCAATTGGCTCAAAGGGGCGGACGTCTCCGGGATCGCTGCGATGCTATCGTGCTTCACGTACATCGCTGCGGACCTGCGAATCACGCTCCGCTTCTCCAACCCAAATGACAACCCTGCCACCATGCTTGTTGCCTTCGCTCCCCCTGGCGCCACCATCCCCCTCAAACCCACGCGCCAAATGCTCTCCAACTTCTACATGGCGGAGGTCCCAGTCTCCGCTGCCACCTCCACCATGGTCTCTTTCTCCATCCCCTACACCTCCCCCCTCTCTGCCATCCCCACCTCATACTTCGGATGGGAGGACTGGTCAGGTACCAACTTTGGCCAGCTCTCCTCCGGGTCATGGGGAAACCTCATGCTCATCCCCTCTCTCTCTGTCGACTCTGCTATCCCCTTCGACTTCCAGCTCTCTTGCTGGGTCGCCTTCGGCAACTTCAAAGCCTGGGTCCCCCGCCCACCTCCACCTCTCCCCCCCCTCCCCACCCCTGCCGCGAACGCGGAACGCACAGTGGCCGTGATCAAGCAGGGCGCCGCCTCAGCGACTCCCGATGTGGACCCCGACGATCGGGTCTACATCGTGCGCGCGCAGCGCCCCACCTACGTCCACTGGGCCATCCGCAAGGTGGCCCCCGACGGCAGTGCCAAACAGATCTCGCTGTCCCGCAGCGGGATCCAGGCACTGGTCGCCCTCGAACCCCCCGAGGGTGAACCTTACCTCGAAATTCTCCCCTCCCATTGGACCCTTGCTGAACTCCAACTTGGCAACAAGTGGGAGTACAGCGCCACCAACAACTGTACCCACTTCGTCAGCTCCATCACTGGCGAATCCCTCCCCAACACCGGCTTCTCCCTGGCCCTCGGAATCGGTGCCCTCACCGCCATCGCAGCCTCGGCTGCTGTTGCCGTGAAAGCGCTCCCAGGCATCAGGCGACAGGGTCTCCTCACCCTCTCTGCCGATACCGAGACCAACCAGACCCTCAACAAGATCACTGGATCTGTCAACCAAGCTGCCCAGGTCGTCTCCCAATTCGATCTGAGCGGCCCTGCAAATTCTGTCTCCCTTGCTGCTTCTGACATCCGCGAGGCTGCCCACAAAGTGGCCTCCTCCCTCAATGGCTTCACTGACGTCATCGCTGACATCAAAGATTCCCTGTTCACCAGGGTGTCTGACGCTGTCGAGAGCGGTGTCGCCACTTTCCTCACTTGGCTCGTCAAACTCTTTGGCTACCTCCTTGTTCTCTTTGGCTCTCCAACCCCCATGTCCATCTCCGGTCTCCTCGTCATCATCTGTGCCGACCTTGCCCCCCACGCTCGTGAATTTTTCACCGCCTCTGGAAATGTCCTCTCCTCACTCTACTACTGGATTGCCTCAAAATTAGGCCTGTCCGTCACGCCCCAAGAGTGTGAACGGGCAACCCTTGAACCTCAAGGGCTCAAAGACTTCAACGACGGCGCACTCGCAATGCGCAACGTCGAGTGGATTGGTGAGACCGCCTGGAAATGGGCCCACCGCCTCCTTGACTGGATCCCCGGTAAGGCCAAGACAGACCCCCAGGCCAAACTCGCCGACGTCCACGATGAAATCATGCTCCACTACTCAGACTCCATATTGGCTCTCGGATCTGAGAAACTCCCCATTGATCACATCACTAAATCCATCTCCCGCTGCCGTGAATTGGTCTCCATCGCCCAGGAGGCCAAATCCGGCCCTCACTCTTCCTTCCTCAACCAAGCAGTCAAAAACTACACCCTTGCCATCTCCC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| 111,637 |
NC_004421.1
|
Aichivirus B
|
Yamashita,T., Ito,M., Kabashima,Y., Tsuzuki,H., Fujiura,A., Sakae,K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2002-11-18
| null |
Aichivirus B
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,374 |
RefSeq
| 1 | null | null |
Bos taurus
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Aichivirus B genomic RNA, complete genome, strain:U-1
|
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| 8,555 |
OP805596.1
|
Aichivirus B
|
Curini,V., Camma,C., Petrini,S., Righi,C.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale Dell'umbria E Delle Marche, "Togo Rosati", CEREP - CEREL - CRNIBR
|
Italy
|
2023-05-13
|
Calf 300917/2021
|
Aichivirus B
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,301 |
GenBank
| null |
Italy: Marche
|
Italy
|
Bovidae
|
feces
|
2021
| null | null |
Aichivirus B isolate Calf 300917/2021, complete genome
|
CGCACGTTCGCGTCGTCGTAAGTCTGGATTCCCAAGGCCAACTCGGTTCAACTTCGGTTTCCGGACAAATATAAAGAACCTCAGTCCTCTTGGTACTTTCTCGCCTGAGTTGCCAAAGCGAGAAACCTGCCCCTCCAACGCCAGACGAGCGGCATAAAACTTGAACTTCTGGCACGCTCCACTTTCCCTTCCCCTTTACCCCATCCCACTGCGCTCTCAAGGTCGCGCTCTTCTGGGACTAGCCCAGATTTAAAAGTTCCTGGCACCCTTTGCCCCTTTAGGCCCTTATGGTAGGAACTGACCTTGTGCTGTGATCTCGGTGCGGAAGTGCTACTGCGTAGTGGTCGTAAGCTCCTCATGTGGTTCTGCCCTGGCAAGGCTACAGAGTACTGTGATCCGCTGCGGATGCCATCCTGGTAACAGGACCCCCAGTGTGCGCAACAGTATGTCCACGGTTCGCCGTGTTCACCATGTCTGGAACACTGCTTCCATGAAACAGTGTGTGTCCAATCCCTGTGATCAGTAACAACCACACCACCTAGGAATGCTAGGAAGGTACCCCGGCCCGCCGGGATCTGATCCTAGGCTAATTGTCTACGGTGGTGCTCCCTTTATTTTCACCTCAACTCTCTGGTTACAACTGTTTGATTCTGTGTTTGCTGTTCTTTCCTGCTCTCATTGCCATTCTCAAGTGTTCACACTGTCCAAGCTCCTTTGGTTGTTTTCTTCCACTTGCCACTGTCAACTCTTGTCATGGACTCCTCCAATCTCAAACTGTTCTCCATCTCCCACCGTGCCGCCAAACGCTGGTCGTGGCGCAGATTCCGCATGGAAACGCATGAACGTCTCCGCTACGCTTATGTGGATCCTGCGATTGACGCCTACTTCAAGCGCGATCGGCACCTCCCCTTTTCCTTGCCCAAACCCTCTCACTTCTATGACTGTCTCTTCTGTAATCACCCCTCCGATGAGGATGAGGACTCGCTCCTTACCCTCGACGGGGAATATGGTGATCCCTGTCCTCTACACTCTGGTGTGCTTGACCCCACCCCCCGCTACTCCAAGACCCCAGAGGACATCCTGGAGGATTCATGCTGGTGTGACGTCCTTGACGAGGATGCTACTTTCAGTACTGATGCTCTCCAGAATGCCTTCGACCAATTGGCTCTTGCTCTGCTCCCCGGCTCCCACCAAGTAAAGGACCCCGCCATCGTCTCTTCCCTCTACTCCAAGCTCTTCTCACTCTCCCAATTCCCTGGTGTCCCCACCACCTCCCTCACCCTTCCCAAGCCCACTGGCAACATCATCCCCCAAGGCCAAAGCCAAACCAACATTTACGGCAACGGGAACAACGTGACCACCGATCTCGGTGCTAACGGCTGGTCCCCTACTGTGAACACTGGTCTCGGCGATGGACCCGTCTCCTCCTCCCAAGATGAGGTCCCAGGCCGTGCTGGTGGTTCCTCCTCTGCCCCCAAGAATTCCTCCTCTGCTGCCTCCACCACCCACGTTCAAAACTTCAAACATTGGTGGGAACCTGCTGCTTCCAAGGCCCTTTCCCGCGGTGTCGACAAGGCTCTCGATGGAATAGAAGGAGCTGGCAAACTCGCCAGCGATGCTATAAAGTCGAAGCTTACCGGCACTCGCCCAGGCCCTTCCCCCAACCTCATTGCCCTCAACCCTTCATCCACCCAACATGGGAACGCAATGATCACCACGGGTTCCACTGCTCCTGTGGTCGTTGCTTACCCACCCACCCCCTCTGTGCCCCTCCCCAATCCGGACTGCCCTTCCGAACCTGGCCCGTCGGGCGACCGCACATGGCTCCTGGACACTTTCGACTGGTCCCAGGAGAACCCCATGTGGTGGTGCCTGGCTGGACAGAATGGGATGCAGTATAACACCCTTGTTAACCCCACCTACCCCTTTTCCGCTTCCACCAACTGGGGCGTCCAAAACGGAACTGCTGCCACCGCCTATCCACTACCTGCCTCATTCGTGCAGGCGTATCCAGACTGCCCCTGGACCGCCATGCATGACACCCATGCCTACTTCAACTGTGGCTGGCGCATGCAGGTCGTGGTGAACGGTACCCAGTTCCACGCTGGTGCCCTTCTCATCTACGCCGTGCCGGAGCGCCCCGTGCTCCCAAACGGTGCTGAGTATGAGAATACCACTTTTGTCTACCCCTACACCATCCTCAACCTCTACCAATCCAACACCGCGACGTTGGAGGTTCCATATGTCGGGTGCACACCAAACACCACCACCTGTGTGCACTCACCTTGGACCTTCTTCATTGCAGTCCTCACCCCCCTGGCTGTCGCCTCCTCTTCTAACCAGTCTCTATCTGTTTCTGTCTACATCACTCCTGTCAACTCCTCTTTCTATGGCCTCCGCCATGTGACCAAACAGCACTGGAAGACCAGGGCCATCCCAGGCTCTGGGGCTTTCGGAACTGCGGTTGCAGGTCAGGAGATTCCCATCTACGCTTTTGAAACCTTCACTCCTCCTGTCGACTACCTACCTGCTGAAGTCCACGATTGGCTTGAGTATGCTCACCGGCCCGGTTGGGCAGACATGTTCAGCTGGACCACGGCAGATACTCAGGACACTCGCCTTGCTCTGGTCCCCGTCTCACCCGCTTGGCTTTCCGCCTCTGGCACACCCATTTCCTTTGTCCTAGACCTCTTCACACAGTGGCGTGGTGAGCTCACCCTGTCCCTCCTCTTCACAGGGTCTTCACAGCATTATGGCCGTCTGGTCGTGTGTTACTCACCACCAAGCAGCGCTCCTCCCGCTACCATCACGGAAGCAATGCGCGGCACTTACACTGTATGGGACATCAACTCTTCTTCCACTCTCGACTTCACCATTCCCTTCATCTCCCAGTCCTATTGGAAGATCACCAACATCTCAACCCCTGACTCTCTCCTCGCCTCTCTTGGCACACTCACTCTCTGGGTTGTGGCCCCCCTTGTCGCACCCTCCGCAGCGCCTCCCAGCGCAACCATTCACGCCTTCCTTTCCGCTTCAAATTCCTTCTCTGTTCGAGGCATGTCGATGCCCACCCTGGCCCTCCAAGCCGGGGATGGCATCGAAGCCCCGACCCCCGTTTCCAATCTGGAGAATGGTGAGGCGGCTCACACTCCTGAGCCGCGGACCACTTTCCAGTACACTGATAACCCCTCCACCCCTGAAACCAACCTGCGCCGATATTTCTCTGTGTATAGACCTGTCTTTATGCAGGGGAATAGCTACGGCATCACCGCCACTGCTGGCGTCCACTCGGTGACCTACAATCCTGTCGAGTGGATTGCCAACGCACAGGTTGGTGACACCCTCCCACTCCTCCTTTCCGCTTTCACCTACTTTCGCGGTGACCCCCGGGTTGCTTTCACCATCTCCAATCCGGCGGCCTACACTGCGCAGGTGACCTTCCACTACTTCCCCCCCGGCGCCACTCCTTACGACGCCTCTTCTCCCAACGCCTCCACTGACCTGGCAAACTGCTTCACCGTCGATGCACAGATCCCACCGACATCGATGGACACGGTCTGCCTCTCCTTCCCTTATCTCTCAGTTCTTTCAGCCATCCCCACCTCCTATTTTGGCTTTTCCAATTTCCAGGGTGGCTCCGATGTGCTCAACACCACATTGGGAACGATTGTGATCTATGTTGGGTGGCAAGGTGATGTCCCCACGGGCACCGCTCTCACCATCTTCCAGAAGATTGCTTTCGGTAACTTCCGTGGGTTCGTGCCTCGCAACCCCCCCAAACTCACTGCCTACTCCCAGCCTAACATGACAACGAAGACGAATGCCATCGTCAAGTTGCCAGTTTACCGGCCGATGGCGGCTGCCAAAGCCATGGTACGCCGCCAGTGCGCTGGTGAATCTCTCTTCCAACCCTGTCTCTGCTCACGCGTCTACATCGTTCGCGCGCAGCGCATGACCTACACCCACTGGGCCCTGCGCTGCGTCGACAGCGATGGAACACGCCAAATCTCTCTCTCCCGCTTTAAACTGTCCGCTGTTGTGGCATACGAGGATCCGGAAGGAGAGGTCTACCGAGAGGTGGAACCTTTCCACTGGTCCTTGGCTGTTGCGATGGTGGGCAGTCCCTGGGATTATTCTGCTTCCAACAACTGCACTCACTTTGTCTCCAACATCACCGGTGTTGAGCTCCCCAACACCGGCTTTTCCCTTGCCCTCGGCATTGGGGCGCTGGCGATCGTGGCTGGTGTCATGGCCGTCCAAACTGCCAAAGGCCGTATCACCCGCCAAGGATTGCTGTCCCTCGAGGCCCCCCCTGAGGCGATCGATGCTGCACACCGTGTCTCAAGATCCATTGAGGAAACGGCCGCTGCCATTCGATCTGCTGATCTCCTCAACTCCACTGCCAACCTTTCCCTTGCTGCTTCCGACATCCGCGAGGCCTCTACTCGCGTGTCCTCTTCCATTGATGGCTTCTCCAACATGCTCCAAGATTTTGCCCGCAATTTCAAAGGGCGTGTGGACGATGTCATCAGCTCTGGCATCTCCTCCTTCCTCACTTGGCTTACCAAAATCTTTGGTTACCTTTTGATTCTCTTTGGCTCTCCCACCCCCATGTCCATTGCTGGACTCTTGGTGATAATCTGTGCGGACCTGGCACCACAGGCTTCGCACTACTTCACCGAGAGGAACACCGCTTTGGGCGCCCTCTTCTACTGGCTGGCAACCAAGCTTGGTCTGTCAGTCACCCCAGAGGAGGCGGAGGCTGCTGCCATCGAGCCTCAAGGCGTGCGTGATTTCAACGACGGTGTCCAAGCTGTTCGCAACACCGAATGGCTTGCCGAGACCGCGTGGAAATGGGCAAAGAGGGTTCTGGATTGGATTCGTGGGAAAGTCAAGACTGACCCCCAGGCCATTCTTGCTGACTCTCATGATGAAATTCTCAGACACTACTCTGAGTCCATTACTGCGCTCGGCTCAGAACGCACTCCCATCAGTGCCATCACCGACGCTATCTCTCGCTGCCGCGAGCTCGTCAAGGTTGCAGCCGATGCCAAGTCTGCCCCCCACTCTTCTTTTCTCAATCAGGCTCTCCGCAACTACCAACTTGCTCTCGCCCAGAACCGGATGGCCGATGCAGGCCCACGACCCGAACCGGTTGTGATCTACCTGTACGGGCCGCCCGGTACCGGGAAATCCCTGCTTGGCTCTCTTCTTTCTTCAGTCCTTGCTCAGAAGCTCTCTGGTGATCCCAACGATGTGTACTCCCCTACATCGGCTTCCTGTGAATACTTCGATGGATACACAGGACAGGTCGTCCACTTCATCGACGACCTGGGACAAGATCCAGAGGGCCGTGACTGGGCCAACTTCCCCAACCTTGTCTCCTCTGCTCCCTTCATTGTACCAATGGCCAACCTCGAGGCCAAAGGTACTCATTACACTTCCAAGGTGATCGTTGTCACATCGAACTTCACCGGCCCCAACCAACGGGCCGCCCGATCCATGGGCGCACTCGAACGCAGACTCCACCTCCGGATCTGTGTTGACCGCAAAGATGGGTATAAGTTCGACGCCGACGACGCTCTCCGTCCCCTCGACCTTCCTTCTAAATACCTCACCTCCCAGACTAAGCTTTCCCTCTTCAAATGCTTTAACCTGAAACCTGATCTTAACTCTATCTTCCTCCCTGAGTTCCATGATTTCGACCAACTCGTCGACGCAATCGTTGCTAGGTTGGACAGAGCCTCAGGTGTCAGCTCCCGCCTTGCTGCTCTCATCAAGCGGCAGGGTGCCCACTCCGAGCGCACCTTTGAAACTGCTCCTTCCGAGATCGACGCGGACGAGGTTCTCGAGATCCTTTCTAAATCTAAACCTGCCCCCACCCACCTCACCCTTGAGCGTGCGATTGCATCAAACGCTCCTCTCTCTTTCATTGATACCCTCTGGAAGTGGCGGAGACCCATTTTCGCCACCACCACCTTCCTTACAGTTCTAGGCTTCGTCATCACCGTCCTTGGTGTTGCCAAGGTGCTCTGGACCAAGAAGGAGGACACACCGAATGAGCCGCAAGCGGCTTATTCGGGCATGCCTCAACTTGGTAAGAAGGACGCCAAGGCAAAGGGCCCAAAACCTGCCCCCACCAGGGGCGTCGTGCGGCAAGCCGGCCCCTCTCCTGCTCTTCCCAAAATCGCCGACAACGTCTTGCCAATCCAGGCCAAGACACCCGCCGGCGTGAACAAATGCTCTGCCCTCTATCTCTATAACCGCATCTGCATTGTCCCCACCCACATCGTTCCAGACACTACGATCCAGGTCCAAATCGGGAATGACGTGTATGATTGGGCAACCTTGAAGCACGTCAGACTCGGTAAGGAAATGACCGTACTCTGGACTCCCACTTCCCGCCAGTACCGCGACCTCCGTCGCTTTCTGGGCTCCCACCCCTACCCCACTGGCCATCTCATTTCTGCTTTCCAAGGTGTCCCGATGTACATACGGTTCTCCAAGAACCATATGGTCACTCTGGATGTCGAATCTGTTGTCCATGAACCCATTGCCTATGGTTACAAGACACCCAGCTTCGAAGGTATGTGCGGTGCCCCGCTCATTACCGACGACCCCGCTGGGATCAAGCTTCTTGGTTTCCATGTGGCCGGGATCGTGGGCTCCACTGGCTTCTCTGTCCCTTTCTATCCCTACCTGCCTGAGATTGAACAGTTCGCTACGGAATGCCAATCCCTGATCATACCAGGTCCGGAAATCCATCCGGGCGTGAATGTGAACAGGAAGTCTCAGCTTGGGCACTCTCCTGCCCACGGCGCATTCCCAGTGAAGAAACAACCTGCTGTCCTTCATCAGCGCGATGCTCGTCTCGAGCCTGGAACCAAACTGGATGGCCAACTCTTCCTTAAGCACAACAAGGGAGACATGGACAAACCATGGCCCGGACTCGAGGCAGCAGCAGCTCTTTACTTCTCTAAGTTTCCAACCTTCATCCGAACGTTGACTCAGGAAGAAGCAATCAATGGTACTCCAAATCTGGATGGTATGGACATGAACCAGGCTGCTGGGTACCCCTGGAACACCATGGGCAAATCTCGCCGCTCACTGTTCATTGAAGAGGCACCCGGATACTATGTCCCCACATCCGAACTCCAGGCTGAAATTGACAAAACCCTGGAGAACCCAGATTATTTCTACTCAACCTTCCTCAAAGATGAGCTCAGACCGACCCCAAAAGTCACCGCCGGTCTGACTCGTGTGGTTGAGGCTGCCCCAGTACACGCCATTGTTGCCGGGCGCATGCTCCTCGGTGGCCTCATCGAGTACATGCAGGCCTACCCCGGCCGGCATGGCAGTGCTGTGGGTTGCAACCCAGATCTCCACTGGTCCAAGTTTTTCTTCAAATTTGCCAAATTTGATCAAGTGTACGACCTGGACTACAAATGTTTTGATGCAACACTCCCCTCCTGCGCATTCAGGATTGTCGAAGATCACCTCGTGAAACTGACTGGCGATGAGCGTGTCCGCACGTACATTGAGACCATTAGGCATTCCAAACATGTCTATGGCAGCCAGACTTACGAGATGATCGGCGGCAACCCATCTGGATGTGTTGGCACCTCCATCATCAACACCATCATCAACAACATCTGTGTCCTATCTGCACTCATCCAACATCCTGACTTCTCTCCTGACAACTACCGGATCCTGGCTTATGGTGATGATGTCATCTACGGGTGCGATCCGCCAATCCATCCCAGGTACATCAAGGAGTTCTACGACAAACACACACCTCTTGTCGTGACTCCCGCCAACAAAGGTTCTGACTTTCCTGACTCTTCCACTCTCTACGACGTCACCTTCCTCAAACGGTGGTTTGTTCCAGATGACCAGCGTCCATTCTACATCCACCCAGTGATGGACCCGGACACCTACGAGCAATCTGTCATGTGGCTGCGTGGCGGCGACTTTCAGGATCTTGTCACCTCCCTCTGCTACCTTGCTTTCCATTCTGGTCCGAAGACCTATGGGCGCTGGTGCGAACGTGTTCGTGAGCAGTGCCTGAAGACTTCGGGCTTCTCTCCTACTTTCCTACCCTACGAATACCTCCAGCTCCGCTGGCTCAATCTCTGTGCAGCTTGACCTTAGAACTCTGGCCCCCCACTGTTCGTTCTGGTAGAATAGACAAGCTTTCCACTATCCCTAAGACCACTCTCTCTGTGGCACTTTCCTCTCAGTGTCCTGCTCCCTCACGGGACTGCACTCAGGAACTGTGAGACCTCCCCCGTCCTTGAAATT
| 15,917 |
OP805597.1
|
Aichivirus B
|
Curini,V., Camma,C., Di Lollo,V., Torresi,C., Pirani,S., Gobbi,P., Giammarioli,M., Viola,G., Pela,M., Feliziani,F., Petrini,S., Righi,C.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale Dell'umbria E Delle Marche, "Togo Rosati", CEREP - CEREL - CRNIBR
|
Italy
|
2023-05-13
|
Bovine_59254_2/21 TR
|
Aichivirus B
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,289 |
GenBank
| null |
Italy: Marche
|
Italy
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Aichivirus B isolate Bovine_59254_2/21 TR, complete genome
|
CGCACGTTCGCGTCGTCGTAAGTCTGGATTCCCAAGGCCAACTCGGTTCAACTTCGGTTTCCGGACAAATATAAAGAACCTCAGTCCTCTTGGTACTTTCTCGCCTGAGTTGCCAAAGCGAGAAACCTGCCCCTCCAACGCCAGACGAGCGGCATAAAACTTGAACTTCTGGCACGCTCCACTTTCCCTTCCCCTTTACCCCATCCCACTGCGCTCTCAAGGTCGCGCTCTTCTGGGACTAGCCCAGATTTAAAAGTTCCTGGCACCCTTTGCCCCTCTAGGCCCTTATGGTAGGAACTGACCTTGTGCTGTGATCTCGGTGCGGAAGTGCTACTGCGTAGTGGTCGTAAGCTCCTCATGTGGTTCTGCCCTGGCAAGGCTACAGAGTACTGTGATCCGCTGCGGATGCCATCCTGGTAACAGGACCCCCAGTGTGCGCAACAGTATGTCCACGGTTCGCCGTGTTCACCATGTCTGGAACACTGCTTCCATGAAACAGTGTGTGTCCAATCCCTGTGATCAGTAACAACCACACCACCTAGGAATGCTAGGAAGGTACCCCGGCCCGCCGGGATCTGATCCTAGGCTAATTGTCTACGGTGGTGCTCCCTTTATTTTCACCTCAACTCTCTGGTTACAACTGTTTGATTCTGTGTTTGCTGTTCTTTCCTGCTCTCATTGCCATTCTCAAGTGTTCACACTGTCCAAGCTCCTTTGGTTGTTTTCTTCCACTTGCCACTGTCAACTCTTGTCATGGACTCCTCCAATCTCAAACTGTTCTCCATCTCCCACCGTGCCGCCAAACGCTGGTCGTGGCGCAGATTCCGCATGGAAACGCATGAACGTCTCCGCTACGCTTATGTGGATCCTGCGATTGACGCCTACTTCAAGCGCGATCGGCACCTCCCCTTTTCCTTGCCCAAACCCTCTCACTTCTATGACTGTCTCTTCTGTAATCACCCCTCCGATGAGGATGAGGACTCGCTCCTTACCCTCGACGGGGAATATGGTGATCCCTGTCCTCTACACTCTGGTGTGCTTGACCCCACCCCTAGATNNNNNAAGACCCCAGAGGACATCCTGGAGGATTCATGCTGGTGTGACGTCCTTGACGAGGATGCTACTTTCAGTACTGATGCTCTCCAGAATGCCTTCGACCAATTGGCTCTTGCTCTGCTCCCCGGCTCCCACCAAGTAAAGGACCCCGCCATCGTCTCCTCCCTCTACTCCAAGCTCTTCTCACTCTCCCAATTCCCTGGTGTCCCCACCACCTCCCTCACCCTTCCCAAGCCCACTGGCAACATCATCCCCCAAGGCCAAAGCCAAACCAACATTTACGGCAACGGGAACAACGTGACCACCGATCTCGGTGCTAACGGCTGGTCCCCTACTGTGAACACTGGTCTCGGCGATGGACCCGTCTCCTCCTCCCAAGATGAGGTCCCAGGCCGTGCTGGTGGTTCCTCCTCTGCCCCCAAGAATTCCTCCTCTGCTGCCTCCACCACCCACGTTCAAAACTTCAAACATTGGTGGGAACCTGCTGCTTCCAAGGCCCTTTCCCGCGGTGTCGACAAGGCTCTCGATGGAATAGAGGGAGCTGGCAAACTCGCCAGCGATGCTATAAAGTCGAAGCTTACCGGCACTCGCCCAGGCCCTTCCCCCAACCTCATTGCCCTCAACCCTTCATCCACCCAACACGGGAACGCAATGATCACCACAGGTTCCACTGCTCCTGTGGTCGTTGCTTACCCACCCACCCCCTCTGTGCCCCTCCCCAATCCGGACTGCCCTTCCGAACCTGGCCCGTCGGGCGACCGCACATGGCTCCTGGACACTTTCGATTGGTCCCAGGAGAACCCCATGTGGTGGTGCCTGGCTGGACAGAATGGGATGCAGTATAACACCCTTGTTAACCCCACCTACCCCTTTTCCGCTTCCACCAACTGGGGCGTCCAAAACGGAACTGCTGCCACCGCCTATCCACTACCTGCCTCATTCGTGCAGGCGTATCCAGACTGCCCCTGGACCGCCATGCATGACACCCATGCCTACTTCAACTGTGGCTGGCGCATGCAGGTCGTGGTGAACGGTACCCAGTTCCACGCTGGTGCCCTTCTCATCTACGCCGTGCCGGAGCGCCCCGTGCTCCCAAACGGTGCTGAGTATGAGAATACCACTTTTGTCTACCCCTACACCATCCTCAACCTCTACCAATCCAACACCGCGACGTTGGAGGTTCCATATGTCGGGTGCACACCAAACACCACCACCTGTGTGCATTCACCTTGGACCTTCTTCATTGCAGTCCTCACCCCCCTGGCTGTCGCCTCCTCTTCTAACCAGTCTCTATCTGTTTCTGTCTACATCACTCCTGTCAATTCCTCTTTCTATGGCCTCCGCCATGTGACCAAACAGCACTGGAAGACCAGGGCCATCCCAGGCTCTGGGGCTTTCGGAACTGCGGTTGCAGGTCAGGAGATTCCCATCTACGCTTTTGAAACCTTCACTCCTCCTGTCGACTACCTACCTGCTGAAGTCCACGATTGGCTTGAGTATGCTCACCGGCCCGGTTGGGCAGACATGTTCAGCTGGACCACGGCAGATACTCAGGACACTCGCCTTGCTCTGGTCCCCGTCTCACCCGCTTGGCTTTCCGCCTCTGGCACACCCATTTCCTTTGTCCTAGACCTCTTCACACAGTGGCGTGGTGAGCTCACCCTGTCTCTCCTCTTCACAGGGTCTTCACAGCATTATGGCCGTCTGGTCGTGTGTTACTCACCACCAAGCAGCGCTCCTCCCGCTACCATCACGGAAGCAATGCGCGGCACCTACACCGTATGGGACATCAACTCTTCTTCCACTCTCGACTTCACCATTCCCTTCATCTCCCAGTCCTATTGGAAGATTACCAACATCTCAACCCCTGACTCTCTCCTCGCCTCTCTTGGCACACTCACTCTCTGGGTTGTGGCCCCCCTTGTCGCACCCTCCGCAGCGCCTCCCAGCGCAACCATTCACGCCTTCCTTTCCGCTTCAAATTCCTTCTCTGTCCGAGGCATGTCGATGCCCACCCTGGCCCTCCAAGCCGGGGATGGCATCGAAGCCCCGACCCCCGTTTCCAATCTGGAGAATGGTGAGGCAGCTCACACTCCTGAGCCGCGGACCACTTTCCAGTACACTGATAACCCCTCCACCCCTGAAACCAACCTGCGCCGATATTTCTCTGTGTATAGACCTGTCTTTATGCAGGGGAATAGCTACGGCATCACGGCCACTGCTGGCGTCCACTCGGTGACCTACAATCCTGTCGAGTGGATTGCCAACGCACAGGTTGGTGACACCCTCCCACTCCTCCTTTCCGCTTTCACCTACTTTCGCGGTGACCCCCGGGTTGCTTTCACCATCTCCAATCCGGCGGCCTACACTGCGCAGGTGACCTTCCACTACTTCCCCCCCGGCGCCACTCCTTACGACGCCTCTTCTCCCAACGCCTCCACTGACCTGGCAAACTGCTTCACCGTCGATGCACAGATCCCACCGACATCGATGGACACGGTCTGCCTCTCCTTCCCTTATCTCTCAGTTCTTTCAGCCATCCCCACCTCCTATTTTGGCTTTTCCAATTTCCAGGGTGGCTCCGATGTGCTCAACACCACATTGGGAACGATTGTGATCTATGTTGGGTGGCAAGGTGATGTCCCCACGGGCACCGCTCTCACCATCTTCCAGAAGATTGCTTTCGGTAACTTCCGTGGGTTCGTGCCTCGCAACCCCCCCAAACTCACTGCCTACTCCCAGCCCAACATGACAACGAAGACGAATGCCATCGTCAAGTTGCCAGTTTACCGGCCGATGGCGGCTGCCAAAGCCATGGTACGCCGCCAGTGCGCTGGTGAATCTCTCTTCCAACCCTGTCTCTGCTCACGCGTCTACATCGTTCGCGCGCAGCGCATGACCTACACCCACTGGGCCCTGCGCTGCGTCGACAGCGATGGAACACGCCAAATCTCTCTCTCCCGCTTTAAACTGTCCGCTGTTGTGGCATACGAGGATCCGGAAGGAGAGGTCTACCGAGAGGTGGAACCTTTCCACTGGTCCTTGGCTGTTGCGATGGTGGGCAGTCCCTGGGATTATTCTGCTTCCAACAACTGCACTCACTTTGTCTCCAACATCACCGGTGTTGAGCTCCCCAACACAGGCTTTTCCCTTGCCCTCGGCATTGGGGCGCTGGCGATCGTGGCTGGTATCATGGCCGTCCAAACTGCCAAAGGCCGTATCACCCGCCAAGGATTGCTGTCCCTCGAGGCCCCCCCTGAGGCGATCGATGCTGCACACCGTGTCTCAAGATCCATTGAGGAAACGGCCGCTGCCATTCGATCTGCTGATCTCCTCAACTCCACTGCCAACCTTTCCCTTGCTGCTTCCGACATCCGCGAGGCCTCTACTCGCGTGTCCTCTTCCATTGATGGCTTCTCCAACATGCTCCAAGATTTTGCCCGCAATTTCAAAGGGCGTGTGGACGATGTCATCAGCTCTGGCATCTCCTCCTTCCTCACTTGGCTTACCAAAATCTTTGGTTACCTTTTGATTCTCTTTGGCTCTCCCACCCCCATGTCCATTGCTGGACTCTTGGTGATAATTTGTGCGGACCTGGCACCACAGGCTTCGCACTACTTCACCGAGAGGAACACCGCTTTGGGCGCCCTCTTCTACTGGCTGGCAACCAAGCTTGGTCTGTCAGTCACCCCAGAGGAGGCGGAGGCTGCTGCCATCGAGCCTCAAGGCGTGCGTGATTTCAACGACGGTGTCCAAGCTGTTCGCAACACCGAATGGCTTGCCGAGACCGCGTGGAAATGGGCAAAGAGGGTTCTGGATTGGATTCGTGGGAAAGTCAAGACTGACCCCCAGGCCATTCTTGCTGACTCTCATGATGAAATCCTCAGACACTACTCTGAGTCCATTACTGCGCTCGGCTCAGAACGCACTCCCATCAGTGCCATCACCGACGCTATCTCTCGCTGCCGCGAGCTCGTCAAGGTTGCAGCCGATGCCAAGTCTGCCCCCCACTCTTCTTTTCTCAATCAGGCTCTCCGCAACTATCAACTTGCTCTCGCCCAGAACCGGATGGCCGATGCAGGCCCACGACCCGAACCGGTTGTGATCTACCTGTACGGGCCGCCCGGTACCGGGAAATCCCTGCTTGGCTCTCTTCTTTCTTCAGTCCTTGCTCAGAAGCTCTCTGGTGATCCCAACGATGTGTACTCCCCTACATCGGCTTCCTGTGAATACTTCGATGGATACACAGGACAGGTCGTCCACTTCATCGACGACCTGGGACAAGATCCAGAGGGCCGTGACTGGGCCAACTTCCCCAACCTTGTCTCCTCTGCTCCCTTCATTGTACCAATGGCCAACCTTGAGGCCAAAGGTACTCATTACACTTCCAAGGTGATCGTTGTCACATCGAACTTCACCGGCCCCAACCAACGGGCCGCCCGATCCATGGGCGCACTCGAACGCAGACTCCACCTCCGGATCTGTGTTGACCGCAAAGATGGGTATAAGTTCGACGCCGACGACGCTCTCCGTCCCCTCGACCTTCCTTCTAAATACCTCACCTCCCAGACTAAGCTTTCCCTCTTCAAATGCTTTAACCTGAAACCTGATCTTAACTCTATCTTCCTCCCTGAGTTCCATGATTTCGACCAACTCGTCGACGCAGTCGTTGCTAGGTTGGACAGAGCCTCAGGTGTCAGTTCCCGCCTTGCTGCTCTCATCAAGCGGCAGGGTGCCCACTCCGAGCGCACCTTTGAAACTGCTCCTTCCGAGATCGACGCGGACGAGGTTCTCGAGATCCTTTCTAAATCTAAACCTGCCCCCACCCACCTCACCCTTGAGCGTGCGATTGCATCAAACGCTCCTCTCTCTTTCATTGATACCCTCTGGAAGTGGCGGAGACCCATTTTCGCCACCACCACCTTTCTTACAGTTCTAGGCTTCGTTATCACCGTCCTTGGTGTTGCCAAGGTGCTCTGGACCAAGAAGGAGGACACACCGAATGAGCCGCAAGCGGCCTATTCGGGCATGCCTCAACTTGGTAAGAAGGACGCCAAGGCAAAGGGCCCAAAACCTGCCCCCACCAGGGGCGTCGTGCGGCAAGCCGGCCCCTCTCCTGCTCTTCCCAAAATCGCCGACAACGTCTTGCCAATCCAGGCCAAGACACCCGCCGGCGTGAACAAATGCTCTGCCCTCTATCTCTATAACCGCATCTGCATTGTTCCCACCCACATCGTTCCAGACACTACGATCCAGGTCCAAATCGGGAATGACGTGTATGATTGGGCAACCTTGAAGCACGTCAGACTCGGTAAGGAAATGACCGTACTCTGGACTCCCACTTCCCGCCAGTACCGCGACCTCCGTCGCTTTCTGGGCTCCCACCCCTACCCCACTGGCCATCTCATTTCTGCTTTCCAAGGTGTCCCGATGTACATACGGTTCTCCAAGAACCATATGGTCACTCTGGATGTCGAATCTGTTGTCCATGAACCCATTGCCTATGGTTACAAGACACCCAGTTTCGAAGGTATGTGCGGTGCCCCGCTCATTACCGACGACCCCGCTGGGATCAAGCTTCTTGGTTTCCATGTGGCCGGGATCGTGGGCTCCACTGGCTTCTCTGTCCCTTTCTATCCCTACCTGCCTGAGATTGAACAGTTCGCTACGGAATGCCAATCCCTGATCATACCAGGTCCGGAAATCCATCCGGGCGTGAATGTGAACAGGAAGTCTCAGCTTGGGCACTCTCCTGCCCACGGCGCATTCCCAGTGAAGAAACAACCTGCTGTCCTCCATCAGCGCGATGCTCGTCTCGAGCCTGGAACCAAACTGGATGGCCAACTCTTCCTTAAGCACAACAAGGGAGACATGGACAAACCATGGCCCGGACTCGAGGCAGCAGCAGCTCTTTACTTCTCTAAGTTTCCAACCTTCATCCGAACGTTGACCCAGGAAGAAGCAATCAATGGCACTCCAAATCTGGATGGTATGGACATGAACCAGGCTGCTGGGTACCCCTGGAACACCATGGGCAAATCTCGCCGCTCACTGTTCATTGAAGAGGCACCCGGATACTATGTCCCCACATCCGAACTCCAGGCTGAAATTGACAAAACCCTGGAGAACCCAGATTATTTCTACTCAACCTTCCTCAAAGATGAGCTCAGACCGACCCCAAAAGTCACCGCCGGTCTGACTCGTGTGGTTGAGGCTGCCCCAGTACACGCCATTGTTGCCGGGCGCATGCTCCTCGGTGGCCTCATCGAGTACATGCAGGCCTACCCCGGCCGGCATGGCAGTGCTGTGGGTTGCAACCCAGATCTCCACTGGTCCAAGTTTTTCTTCAAATTTGCCAAATTTGATCAAGTGTACGACCTGGACTACAAATGTTTTGATGCAACACTCCCCTCCTGCGCATTCAGGATTGTCGAAGATCACCTCGTGAAACTGACTGGCGATGAGCGTGTCCGCACGTACATTGAGACCATTAGGCATTCCAAACATGTCTATGGCAGCCAGACTTACGAGATGATCGGCGGCAACCCATCTGGATGTGTTGGCACCTCCATTATCAACACCATCATCAACAACATCTGTGTCCTATCTGCACTCATCCAACATCCTGACTTCTCTCCTGACAACTACCGGATCCTGGCTTATGGTGATGATGTCATCTACGGGTGCGATCCGCCAATCCATCCCAGGTACATCAAGGAGTTCTACGACAAACACACACCTCTTGTCGTGACTCCCGCCAACAAAGGTTCTGACTTTCCTGACTCTTCTACTCTCTACGACGTCACCTTCCTCAAACGGTGGTTTGTTCCAGATGACCAGCGTCCATTCTACATCCACCCAGTGATGGACCCGGACACCTACGAGCAATCTGTCATGTGGCTGCGTGGCGGCGACTTTCAGGATCTTGTCACCTCCCTCTGCTACCTTGCTTTCCATTCTGGTCCGAAGACCTATGGGCGCTGGTGCGAACGTGTTCGTGAGCAGTGCCTGAAGACTTCGGGCTTCTCTCCTACTTTCCTACCCTACGAATACCTCCAGCTCCGCTGGCTCAATCTCTGTGCAGCTTGACCTTAGAACTCTGGCCCCCCACTGTTCGTTCTGGTAGAATAGACAAGCTTTCCACTATCCCTAAGACCACTCTCTCTGTGGCACTTTCCTCTCAGTGTCCTGCTCCCTCACGGGACTGCACTCAGGAACTGTGAGACCTCCCCC
| 15,918 |
OP805598.1
|
Aichivirus B
|
Curini,V., Camma,C., Di Lollo,V., Torresi,C., Pirani,S., Gobbi,P., Giammarioli,M., Viola,G., Pela,M., Feliziani,F., Petrini,S., Righi,C.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale Dell'umbria E Delle Marche, "Togo Rosati", CEREP - CEREL - CRNIBR
|
Italy
|
2023-05-13
|
Bovine_59254_11/21 TR
|
Aichivirus B
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,283 |
GenBank
| null |
Italy: Marche
|
Italy
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Aichivirus B isolate Bovine_59254_11/21 TR, complete genome
|
CGCACGTTCGCGTCGTCGTAAGTCTGGATTCCCAAGGCCAACTCGGTTCAACTTCGGTTTCCGGACAAATATAAAGAACCTCAGTCCTCTTGGTACTTTCTCGCCTGAGTTGCCAAAGCGAGAAACCTGCCCCTCCAACGCCAGACGAGCGGCATAAAACTTGAACTTCTGGCACGCTCCACTTTCCCCTTCCCCTTTACCCCATCCCACTGCGCTCTCAAGGTCGCGCTCTTCTGGGACTAGCCCAGATTTAAAAGTTCCTGGCACCCTTTGCCCCTTTAGGCCCTTATGGTAGGAACTGACCTTGTGCTGTGATCTCGGTGCGGAAGTGCTACTGCGTAGTGGTCGTAAGCTCCTCATGTGGTTCTGCCCTGGCAAGGCTACAGAGTACTGTGATCCGCTGCGGATGCCATCCTGGTAACAGGACCCCCAGTGTGCGCAACAGTATGTCCACGGTTCGCCGTGTTCACCATGTCTGGAACACTGCTTCCATGAAACAGTGTGTGTCCAATCCCTGTGATCAGTAACAACCACACCACCTAGGAATGCTAGGAAGGTACCCCGGTCCGCCGGGATCTGATCCTAGGCTAATTGTCTACGGTGGTGCTCCCTTTATTTTCACCTCAACTCTCTGGTTACAACTGTTTGATTCTGTGTTTGCTGTTCTTTCCTGCTCTCACTGCCATTCTCAAGTGTTCACACTGTCCAAGCTCCTTTGGTTGTTTTCTTCCACTTGCCACTGTCAACTCTTGTCATGGACTCCTCCAATCTCAAACTGTTCTCCATCTCCCACCGTGCCGCCAAACGCTGGTCGTGGCGCAGATTCCGCATGGAAACGCATGAACGTCTCCGCTACGCTTATGTGGATCCTGCGATTGACGCCTACTTCAAGCGCGATCGGCACCTCCCCTTTTCCTTGCCCAAACCCTCTCACTTCTATGACTGTCTCTTCTGTAATCACCCCTCCGATGAGGATGAGGACTCGCTCCTTACCCTCGACGGGGAATATGGTGATCCCTGTCCTCTACACTCTGGTGTGCTTGACCCCACNNNNNNNNNNNNNAAGACCCCAGAGGACATCCTGGAGGATTCATGCTGGTGTGACGTCCTTGACGAGGATGCTACTTTCAGTACTGATGCTCTCCAGAATGCCTTCGACCAATTGGCTCTTGCTCTGCTCCCCGGCTCCCACCAAGTAAAGGACCCCGCCATCGTCTCTTCCCTCTACTCCAAGCTCTTCTCACTCTCCCAATTCCCTGGTGTCCCCACCACCTCCCTCACCCTTCCCAAGCCCACTGGCAACATCATCCCCCAAGGCCAAAGCCAAACCAACATTTACGGCAACGGGAACAACGTGACCACCGATCTCGGTGCTAACGGCTGGTCCCCTACTGTGAACACTGGTCTCGGTGATGGACCCGTCTCCTCCTCCCAAGATGAGGTCCCAGGCCGTGCTGGTGGTTCCTCCTCTGCCCCCAAGAATTCCTCCTCTGCTGCCTCCACCACCCACGTTCAAAACTTCAAACATTGGTGGGAACCTGCTGCTTCCAAGGCCCTTTCCCGCGGTGTCGACAAGGCTCTCGATGGAATAGAGGGAGCTGGCAAACTCGCCAGCGATGCTATAAAGTCGAAGCTTACCGGCACTCGCCCAGGCCCTTCCCCCAACCTCATTGCCCTCAACCCTTCATCCACCCAACACGGGAACGCAATGATCACCACGGGTTCCACTGCTCCTGTGGTCGTTGCTTACCCACCCACCCCCTCTGTGCCCCTCCCCAATCCGGACTGCCCTTCCGAACCTGGCCCGTCGGGCGACCGCACATGGCTCCTGGACACTTTCGATTGGTCCCAGGAGAACCCCATGTGGTGGTGCCTGGCTGGACAGAATGGGATGCAGTATAACACCCTTGCTAACCCCACCTACCCCTTTTCCGCTTCCACCAACTGGGGCGTCCAAAACGGAACTGCTGCCACCGCCTATCCACTACCTGCCTCATTCGTGCAGGCGTATCCAGACTGCCCCTGGACCGCCATGCATGACACCCATGCCTACTTCAACTGTGGCTGGCGCATGCAGGTCGTGGTGAACGGTACCCAGTTCCACGCTGGTGCCCTTCTCATCTACGCCGTGCCGGAGCGCCCCGTGCTCCCAAACGGTGCTGAGTATGAGAATACCACTTTTGTCTACCCCTACACCATCCTCAACCTCTACCAATCCAACACCGCGACGTTGGAGGTTCCATATGTCGGGTGCACACCAAACACCACCACCTGTGTGCACTCACCTTGGACCTTCTTCATTGCAGTCCTCACCCCCCTGGCTGTCGCCTCCTCTTCTAACCAGTCTCTATCTGTTTCTGTCTACATCACTCCTGTCAATTCCTCTTTCTATGGCCTCCGCCATGTGACCAAACAGCACTGGAAGACCAGGGCCATCCCAGGCTCTGGGGCTTTCGGAACTGCGGTTGCAGGTCAGGAGATTCCCATCTACGCTTTTGAAACCTTCACTCCTCCTGTCGACTACCTACCTGCTGAAGTCCACGATTGGCTTGAGTATGCTCACCGGCCCGGTTGGGCGGACATGTTCAGCTGGACCACGGCAGATACTCAGGACACTCGCCTTGCTCTGGTCCCCGTCTCACCCGCTTGGCTTTCCGCCTCTGGCACACCCATTTCCTTTGTCCTAGACCTCTTCACACAGTGGCGTGGTGAGCTCACCCTGTCCCTCCTCTTCACAGGGTCTTCACAGCATTATGGCCGTCTGGTCGTGTGTTACTCACCACCAAGCAGCGCTCCTCCCGCTACCATCACGGAAGCAATGCGCGGCACTTACACTGTATGGGACATCAACTCTTCTTCCACTCTCGACTTCACCATTCCCTTCATCTCCCAGTCCTATTGGAAGATCACCAACATCTCAACCCCTGACTCTCTCCTCGCCTCTCTTGGCACACTCACTCTCTGGGTTGTGGCCCCCCTTGTCGCACCCTCCGCAGCGCCTCCCAGCGCAACCATTCACGCCTTCCTTTCCGCTTCAAATTCCTTCTCTGTTCGAGGCATGTCGATGCCCACCCTGGCCCTCCAAGCCGGGGATGGCATCGAAGCCCCAACCCCCGTTTCCAATCTGGAGAATGGTGAGGCGGCTCACACTCCTGAGCCGCGGACCACTTTCCAGTACACTGATAACCCCTCCACCCCTGAAACCAACCTGCGCCGATATTTCTCTGTGTATAGACCTGTCTTTATGCAGGGGAATAGCTACGGCATCACCGCCACTGCTGGCGTCCACTCGGTGACCTACAATCCTGTCGAGTGGATTGCCAACGCACAGGTTGGTGACACCCTCCCACTCCTCCTTTCCGCTTTCACCTACTTTCGCGGTGACCCCCGGGTTGCTTTCACCATCTCCAATCCGGCGGCCTACACTGCGCAGGTGACCTTCCACTACTTCCCCCCCGGCGCCACTCCTTACGACGCCTCTTCTCCCAACGCCTCCACTGACCTGGCAAACTGCTTCACCGTCGATGCACAGATCCCACCGACATCGATGGACACGGTCTGCCTCTCCTTCCCTTATCTCTCAGTTCTTTCAGCCATCCCCACCTCCTATTTTGGCTTTTCCAATTTCCAGGGTGGCTCCGATGTGCTCAACACCACATTGGGAACGATTGTGATCTATGTTGGGTGGCAAGGTGATGTCCCCACGGGCACCGCTCTCACCATCTTCCAGAAGATTGCTTTCGGTAACTTCCGTGGGTTCGTGCCTCGCAACCCCCCCAAACTCACTGCCTACTCCCAGCCTAACATGACAACGAGGACGAATGCCATCGTCAAGTTGCCAGTTTACCGGCCGATGGCGGCTGCCAAAGCCATGGTACGCCGCCAGTGCGCTGGTGAATCTCTCTTCCAACCCTGTCTCTGCTCACGCGTCTACATCGTTCGCGCGCAGCGCATGACCTACACCCACTGGGCCCTGCGCTGCGTCGACAGCGATGGAACACGCCAAATCTCTCTCTCCCGCTTTAAACTGTCCGCTGTTGTGGCATACGAGGATCCGGAAGGAGAGGTCTACCGAGAGGTGGAACCTTTCCACTGGTCCTTGGCTGTTGCGATGGTGGGCAGTCCTTGGGATTATTCTGCTTCCAACAACTGCACTCACTTTGTCTCCAACATCACCGGTGTTGAGCTCCCCAACACCGGCTTTTCCCTTGCCCTCGGCATTGGGGCGCTGGCGATCGTGGCTGGTGTCATGGCCGTCCAAACTGCCAAAGGCCGTATCACCCGCCAAGGATTGCTGTCCCTCGAGGCCCCCCCTGAGGCGATCGATGCTGCACACCGTGTCTCAAGATCCATTGAGGAAACGGCCGCTGCAATTCGATCTGCTGATCTCCTCAACTCCACTGCCAACCTTTCCCTTGCTGCTTCCGACATCCGCGAGGCCTCTACTCGCGTGTCCTCTTCCATTGATGGCTTCTCCAACATGCTCCAAGATTTTGCCTGCAATTTCAAAGGGCGTGTGGACGATGTCATCAGCTCTGGCATCTCCTCCTTCCTCACTTGGCTTACCAAAATCTTTGGTTACCTTTTGATTCTCTTTGGCTCTCCCACCCCCATGTCCATTGCTGGACTCTTGGTGATAATCTGTGCGGACCTGGCACCACAGGCTTCGCACTACTTCACCGAGAGGAACACCGCTTTGGGCGCCCTCTTCTACTGGCTGGCGACCAAGCTTGGTCTGTCAGTCACTCCAGAGGAGGCGGAGGCTGCTGCCATCGAGCCTCAAGGCGTGCGTGATTTCAACGACGGTGTCCAAGCTGTTCGCAACACCGAATGGCTTGCCGAGACCGCGTGGAAATGGGCAAAGAGGGTTCTGGATTGGATTCGTGGGAAAGTCAAGACTGACCCCCAGGCCATTCTTGCTGACTCTCATGATGAAATCCTCAGACACTACTCTGAGTCCATTACTGCGCTCGGCTCAGAACGCACTCCCATCAGTGCCATCACCGACGCTATCTCTCGCTGCCGCGAGCTCGTCAAGGTTGCAGCCGATGCCAAGTCTGCCCCCCACTCTTCTTTTCTCAATCAGGCTCTCCGCAACTACCAACTTGCTCTCGCCCAGAACCGGATGGCCGATGCAGGCCCGCGACCCGAACCGGTCGTGATCTACCTGTACGGGCCGCCCGGTACCGGGAAATCCCTGCTTGGCTCTCTTCTTTCTTCAGTCCTTGCTCAGAAGCTCTCTGGTGATCCCAACGATGTGTACTCCCCTACATCGGCTTCCTGTGAATACTTCGATGGATACACAGGACAGGTCGTCCACTTCATCGACGACCTGGGGCAAGATCCAGAGGGCCGTGACTGGGCCAACTTCCCCAACCTTGTCTCCTCTGCTCCCTTCATTGTACCAATGGCCAACCTCGAGGCCAAAGGTACTCATTACACTTCCAAGGTGATCGTTGTCACATCGAACTTCACCGGCCCCAACCAACGGGCCGCCCGCTCCATGGGCGCACTCGAACGCAGACTCCACCTCCGGATCTGTGTTGACCGCAAAGATGGGTATAAGTTCGACGCCGACGACGCTCTCCGTCCCCTCGACCTTCCTTCTAAATACCTCACCTCCCAGACTAAGCTTTCCCTCTTCAAATGCTTCAACCTGAAACCTGATCTTAACTCTATCTTCCTCCCTGAGTTCCATGATTTCGACCAACTCGTCGACGCAATCGTTGTTAGGTTGGACAGAGCCTCAGGTGTCAGTTCCCGCCTTGCTGCTCTCATCAAGCGGCAGGGTGCCCACTCCGAGCGCACCTTTGAAACTGCTCCTTCCGAGATCGACGCGGACGAGGTTCTCGAGATCCTTTCTAAATCTAAACCTGCCCCCACCCACCTCACCCTTGAGCGTGCGATTGCATCAAACGCTCCTCTCTCTTTCATTGATACCCTCTGGAAGTGGCGGAGACCCATTTTCGCCACCACCACCTTCCTTACAGTTCTAGGCTTCGTCATCACCGTCCTTGGTGTTGCCAAGGTGCTCTGGACCAAGAAGGAGGACACACCGAATGAGCCGCAAGCGGCTTATTCGGGCATGCCTCAACTTGGTAAGAAGGACGCCAAGGCAAAGGGCCCAAAACCTGCCCCCACCAGGGGCGTCGTGCGGCAAGCCGGCCCCTCTCCTGCTCTTCCCAAAATCGCCGACAACGTCTTGCCAATCCAGGCCAAGACACCCGCCGGCGTGAACAAATGCTCTGCCCTCTATCTCTATAACCGCATCTGCATTGTCCCCACCCACATCGTTCCAGACACTACGATCCAGGTCCAAATCGGGAATGACGTGTATGATTGGGCAACCTTGAAGCACGTCAGACTCGGTAAGGAAATGACCGTACTCTGGACTCCCACTTCCCGCCAGTACCGCGACCTCCGTCGCTTTCTGGGCTCCCACCCCTACCCCACTGGCCATCTCATTTCTGCTTTCCAAGGTGTCCCGATGTACATACGGTTCTCCAAGAACCATATGGTCACTCTGGATGTCGAATCTGTTGTCCATGAACCCATTGCCTATGGTTACAAGACACCCAGCTTCGAAGGTATGTGCGGTGCCCCGCTCATTACCGACGACCCCGCTGGGATCAAGCTTCTTGGTTTCCATGTGGCCGGGATCGTGGGCTCCACTGGCTTCTCTGTCCCTTTCTATCCCTACCTGCCTGAGATTGAACAGTTCGCTACGGAATGCCAATCCCTGATCATACCAGGTCCGGAAATCCATCCGGGCGTGAATGTGAACAGGAAGTCTCAGCTTGGGCACTCTCCTGCCCACGGCGCATTCCCAGTGAAGAAACAACCTGCTGTCCTCCATCAGCGCGATGCTCGTCTCGAGCCTGGAACCAAACTGGATGGCCAACTCTTCCTTAAGCACAACAAGGGAGACATGGACAAACCATGGCCCGGACTCGAGGCAGCAGCAGCTCTTTACTTCTCTAAGTTTCCAACCTTCATCCGAACGTTGACCCAGGAAGAAGCAATCAATGGTACTCCAAATCTGGATGGTATGGACATGAACCAGGCTGCTGGGTACCCCTGGAACACCATGGGCAAATCTCGCCGCTCACTGTTCATTGAAGAGGCACCCGGATACTATGTCCCCACATCCGAACTCCAGGCTGAAATTGACAAAACCCTGGAGAACCCAGATTATTTCTACTCAACCTTCCTCAAAGATGAGCTCAGACCGACCCCAAAAGTCACCGCCGGTCTGACTCGTGTGGTTGAGGCTGCCCCAGTACACGCCATTGTTGCCGGGCGCATGCTCCTCGGTGGCCTCATCGAGTACATGCAGGCCTACCCCGGCCGGCATGGCAGTGCTGTGGGTTGCAACCCAGATCTCCACTGGTCCAAGTTTTTCTTCAAATTTGCCAAATTTGATCAAGTGTACGACCTGGACTACAAATGTTTTGATGCAACACTCCCCTCCTGCGCATTCAGGATTGTCGAAGATCACCTCGTGAAACTGACTGGCGATGAGCGTGTCCGCACGTACATTGAGACCATTAGGCATTCCAAACATGTCTATGGCAGCCAGACTTACGAGATGATTGGCGGCAACCCATCTGGATGTGTTGGCACCTCCATCATCAACACCATCATCAACAACATCTGTGTCCTATCTGCACTCATCCAACATCCTGACTTCTCTCCTGACAACTACCGGATCCTGGCTTATGGTGATGATGTCATCTACGGGTGCGATCCGCCAATCCATCCCAGGTACATCAAGGAGTTCTACGACAAACACACACCTCTTGTCGTGACTCCCGCCAACAAAGGTTCTGACTTTCCTGACTCTTCCACTCTCTACGACGTCACCTTCCTCAAACGGTGGTTTGTTCCAGATGACCAGCGTCCATTCTACATCCACCCAGTGATGGACCCGGACACCTACGAGCAATCTGTCATGTGGCTGCGTGGCGGCGACTTTCAGGATCTTGTCACCTCCCTCTGCTACCTTGCTTTCCATTCTGGTCCGAAGACCTATGGGCGCTGGTGCGAACGTGTTCGTGAGCAGTGCCTGAAGACTTCGGGCTTTTCTCCTACTTTCCTACCCTACGAATACCTCCAGCTCCGCTGGCTCAATCTCTGTGCAGCTTGACCTTAGAACTCTGGCCCCCCACTGTTCGTTCTGGTAGAATAGACAAGCTTTCCACTATCCCTAAGACCACTCTCTCTGTGGCACTTTCCTCTCAGTGTCCTGCTCCCTCACGGGACTGCACTCAGGAACTGTGAGAC
| 15,919 |
AB084788.1
|
Aichivirus B
|
Yamashita,T., Ito,M., Kabashima,Y., Tsuzuki,H., Fujiura,A., Sakae,K.
|
Department of Microbiology; 7-6, Nagare, Tsujimachi, Kita-ku, Nagoya, Aichi 4628576
|
Japan
|
2002-11-09
| null |
Aichivirus B
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,374 |
GenBank
| 1 | null | null |
Bos taurus
| null | null | null | null |
Aichivirus B genomic RNA, complete genome, strain:U-1
|
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| 110,562 |
NC_077164.1
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
|
Litov,A.G., Belova,O.A., Kholodilov,I.S., Gadzhikurbanov,M.N., Gmyl,L.V., Oorzhak,N.D., Saryglar,A.A., Ishmukhametov,A.A., Karganova,G.G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
ADSV_23
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,712 |
RefSeq
| 1 |
Russia: Republic of Tuva
|
Russia
|
Melophagus ovinus
| null |
2012
| null |
PRJNA485481
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus strain 13577, complete genome
|
ACAAAACAACACACCAGCTAATGAAAACAAGAAAAAATCAAGTATCGTTCTCGGTTGAATCCTTTTATTTTATGATGAAATGTGGTTGTGAGAGTGGGAATGGGCCAAATTAAGTAGATAAGGTTGTATCTGAGTGTGGATATTGTCGATTATTCAATTGATTTTTTTTAATTTGGGTTTTAGGAGGTCATTTTGGTGAACTGGTTTATTAAATTGTTATCTAAATATGTTGATAAAGTTGTCTTGTCTCAAGATTAAACTTTATTCTCTAATGTAATAATTTTCAGTTTCATCATCGTCTTCTATCATGGGGTTATCTAACAATATGGAAATTCTTTCAGGCGGAACTGACTCAAAGATTATAGTGGGGTTTAAATATAGAGAAAATAGTCCTGTATTACGATCAAAGATATTTATAGTGATTCCAGGATTGTATTCTTTCAATAATAGATTAATTGTTGGAATATCAATTACTAAATCAAGGTTATAAAAGATTCTTCTTAGGGTTCTTATGACTGATCCAATACTTGCCATTTGATCATCAAGTTGAATAAATTTGGAAATAGAATCTGGTATGGGGTGTAATTTGAATTGAGATTGGAAATATCTATTTTCAGGTGGGGATTTGCTCATATAAAAGGGAAAATAATAATTGATGAATGATTGTCCTAATTTTGTAACAGGGAAGTTATTTAATTCAAATCCTAACCAAATAAAAAACCCAGATATCCAAGTACCCAATGATCGTATAACTCCATCAGATGGTATAAATACTTTTTTAGTGTAAGTAATGCTGTAGGGAACAATTCCATGAGTAACTAGTGAAAATAATAAAATAACATAATTTAAAGATGTAGGGTTTGCAGTTAACTCAGTTGAGTATCTATAACATAAATCAGTTCTTATTCTAAATGAAACTAATAAGTTCATCAATTGGTGATCCTTTTCCGGAATTAGTTCACGAGGTATACCCCTTATTAAATCTTGTCTTTTTATTTGTAGGGCTCTGTAAAATTCGTTTTCTTCTGTTTGATAATATGGGAATAAAAATCTATTTTCATATAAGTCATTATAATCCAAGAATGTTGTTTGTCTGATTAATCCTCTTTGTGTTGGATTTTGAAATATTACATAAACTTCAGAAGATTGGGACGAGGTTGTTGCAGTAGTTGCCAATTCAATATTTTCAAACGCTCCAGCTAGTTTGTTTAAAATATTGTTGTGGGTTGAAAAGATTCTAGTTAAATAAGTTTTAAAGATGATTACAGATTGATGTTCACACAATATCTCATACCATCTAACTAAGTTATCTTCGATTAAGTTGATAGACTCGATATCAACGACTTCCATATCAAAGATTAGTAAATTCAAATGCAATTGGAAGTCAGTTTTTAATTTTACGAAATTTCTCCATGTGGTATCAAGCCTTAAATCATTTGGTTCAAGCCAGCAAGTATTCAAATTAACACATCTTTCAGGGTCTGTTAAACAGTGTAGTATTGCAGATGGGGGAGATGGAGTGTTCCCCTTTAAGTTAACTTTCGAAAATTCGCAAAGTGTATTAAAAATTGCTTTGGAAGTGCGATATTTCCTTAAAAATAAAGCAGTTAACCCACCTGATCCATCACCTCCAATCAATCCATCCTGAATTGGAAGAGTCAATCGGTTTAATATAGCATGAACTTTGTAATGAGCTCCAGTTGCTAATTGTGCAATTCTTAATCCGGATATTAAGGGATTTTGATATCGATCCTTGTATAATTCGGGAATATTTACCCAATTATTTATTGTTAAATAATTGACCGGTATAAAGTTTGCCCATCCTGGATCCTCATTAGACCAGTCTAAACTACGATTATCTTCGAAATAGATAGTTTCTCCTTCTATTAGTCTGACTGCATGTCTGACCTCTTGGTCGGTCAAAATAAGATTTTCTAAAAGAGGTTGAATTATTGTATGCAAGTTTTCTGGAGCATCATCTAGACTTCTTAGTTGTGTAGACAAATCTCTCAATCCTGCAATATACTCTCTAATACGTTTTGACAAATGAGGTTCTCTTAACACTTTCATAAATCTATCCGAAATTCCTATAAGGCCTACTATGGAGGATTTATAAATATCTGCAAATATCCATATTGGTTGAAATCCTATATGTTCTGAAAGGTACCTAGATCCAAAATTAGAAAGTTCATATTTCATGTAGTCTGATCCTAATCGGGTTATATCTTCTGTAATTATTGGATAAGATGGAGGAATTTTATGAGGTATTGAAGCAAATAACCTCAAAAACTGAGGTTCTCTCCAAATATTGATTAAATTTAAATTATTGGCTAATTTACCGATAGTTAAAGTTGCATGTCCGATTATATGTCTATGATAAGATCTCGAGCTTGTCAATCCTCGTTGATGTAATATAGATAAAGCGCTACTCCTTATAACTCCAACTATTAGCCCTCTCATATATTCTCTAGGTGTAATTTTATTTCTGATTGTTAGTGGAAATAATGCTGGATCTTCATAAAGGGAACTAGATCCCCAAACAGAATCACCAAATACAAATCCTTGAGCTTGTGCAATCTGGAATGATTTCTGAGGTCTTGTTAATCTATTCCAGTTTCTTGAGGGGATGGATAAGGTTACATTAATCACACCCCATGATGCATTATCAGGTTTCCAATCYTTTAATAAATTGTGTACGTCTGGATGTTGATAAGCATAATTGCAATTGATTTTRATTTCATCTATTTCTCTTAAACAGTCTTTACATTTGATGTGATGATGRTAAAACCCATGTTCTTGATCATAATGATGAATTTCTCCGGTGGATATCAAGCTATTTAAGATACAATTTTGAAACATRAAGTCATAATTTTTATCACCCAGTTCCAAAAGACTATTTGTTGTAGCTAACATTCGAGTTAATTTAGAGGGRTTTTGAGCTGAATATCCACCATTACTTTGTCTGGAACAATTAAATCTGTGTAATGCTGATCCCGTTCTCTTRAATCCTTCAAGATTTTGAGACCARTCTTCCCCCGTTAATGCCCTAAGATTGTTTAAAATAGAATGTGCAAGAGGAGAATTRTAATCAATAAACCACCCTATTGCATTTCTTAATGATGTAGCTCTCTTTAATAAAGGGATYTTTGTTTCTTTYTCCCATGACTGTAGAATACTGGTAGACTCTAATGTTGCTGATCCTAAGTAAGCTGCACATGATCCTCTAATYGTTTTTAAATCCTTGAACCCAGACGGAACCAAAATCGAAATATATAAACGGTTTGGGAATGAACCAAGACATGGTTCACACTCWCCTCKAAATTGTATCGGGATATGAAATAATTCGGCAGGATGAGGAATAGTAGCTCCGTACACTTTTTGTCCCCATGATAAGAATCTTAAATGATCTGCATGAGACGAGGAACATTTCCACATTGGAATTTTAATTTTTAAATCTTGTCTTATCAAACATTTAAGACTATATATTTCTGCTGCTATTATAATCTGATCATATTTAATACTCAAAGCTCTTTTGAATTGATTTCTAATTGTTTTTGAATTTTGAAATAATTCAATCATTGAATCAGTAATTCCCAAATAAGTCCCAGCTCGATATTCACTCAGAAACCTGGGAAACAAAGGGGTAATTGATCTCAGATGACTTAAGAAAGCAGGCTCAGTTTCTCGTCTATGCTGAACTGCTGACCTAATGATCAAGTTCTTTATTTCCATTTGTGAGCGAAATAAGGAAGTCTTAATTGCCTCTTTAATCATTGTATTAGCATCTATACCTCTAGCTATATTTAAGGACAAAGGATCTTCTAAAAGTTTACTTATGTTAGGGACCATCTCTTGTTTGATTTTTGGGTATCCATATTGAGGGATTAAAATTTTAAATTGTTCATCTAGGATATTTTCGTAAACTAATTTCAAAAATGTCAAACTCTCAGAAATTGGGTCAGGAAACATTCTGACTATGAATCTAGTTAATGACATTCCGCACACTCCTCCCATTGATGGGTCTAAAAATAAGGTTTTAAATAAGTAACCCTTCGTCATTAAATCATTTGCTTGGAGTTTCAACATTTTTTGAACTGGACCTCGTAAAGCGGGATTATGAAATTCACAAATGATTCTGACAAAATGGGCAATGAAGTTATAATAGTACATAGAATTAATCGGTGAGTCGGAGTAGTGTGATACTGTTAAGGCATTGCTAGTAGTTGTGGATATTACATTGGCCATAGTAGGTAATTGATCATTTGTAACACAATTAACTCTTGACCAACGTTTGGTTTCTAAATTTCTGATATTTCCCCTGAATATTATATTTTTCCCATAATTTAAAAATTCGGAACTTTTAATTGTCTCATCTTTATTTATAATTAACCCAAGCTTCCTGGTTCCATCTGCAATTTTATTTAACAACATTCGGTTATTCAACATTATGGAATTTATGTTACTATTTAATTGGGCTTCTGTTCTGAACTGTTGAATTCGGTATAGGGAACAAATCACCTGATTGTCACCTTGGGCTAAAACCTTAATTTTTGTATTCAAGGAGTATCCTTCCCTTCTGAGAACTAATAAATTGCAAATGCTCCACCCTTTTTGACGTAGTCCTTCTAATCCTCCTTGTTGCCCTAACCAACAAACTCTCTTTTCGGTTTTGTTCATTAGATTATTTGAAGCATCGATTCCTAGTAAATCTCCTCTGTTATTGTAATAAATCCAAGATTTTTCAAATATTTCATGAGTTCTTGTTATTAAATTAGGATATCCTAAAAATTGCCCCATGACTTTAAATACAGGGTTATTTGCTTTGCCTCTTTGATGATTGTTCCATTTGGTGTAATCTATGTGATCTGCTATAGTAATTTGTTTATAATCTGATTCTCCTTGATTTGAAGAATTTTCTAACATTTTGCCTATTACGGTGGTAAAGTCATCTGCCATAGTTAATCCTTTAAATAAGGGGACAAAATGTAATTTGATCAAAT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| 823 |
OL420706.1
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
|
Litov,A.G., Belova,O.A., Kholodilov,I.S., Gadzhikurbanov,M.N., Gmyl,L.V., Oorzhak,N.D., Saryglar,A.A., Ishmukhametov,A.A., Karganova,G.G.
|
Chumakov Institute of Poliomyelitis and Viral Encephalitides, Laboratory of Arboviruses
|
Russia
|
2022-01-24
|
ADSV_20
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,640 |
GenBank
| 1 |
Russia: Republic of Tuva
|
Russia
|
Melophagus ovinus
| null |
2010
| null | null |
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus strain 7456, complete genome
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AAACAACACACCAGCTAATGAAAACAAGAAAAAATCAAGTATCGTTCTCGGTTGAATCCTTTTATTTTATGATGAAATGTGGTTGTGAGAGTGGGAATGGGCCAAATTAAGTAGATAAGGTTGTATCTGAGTGTGGATATTGTCGATTATTCAATTGTTTTTTTGTAATTTGGGTTTTAGGAGGTCATTTTAGTGAACTAGTTTATTAAATTGTTATCTAAATATGTTGATAAAGTTGTCTTGTCTCAAGATTAAACTTTATTCTCTAATGTAATAATTTTCAGTTTCATCATCGTCTTCTATCATGGGGTTATCTAATAATATGGAAATTCTTTCAGGCGGAACTGACTCAAAGATTATAGTGGGGTTTAAATATAGAGAAAATAGTCCTGTATTACGATCAAAGATATTTATAGTGATTCCAGGATTGTATTCTTTCAATAATAGATTAATTGTTGGAATATCAATTACTAAATCAAGGTTATAAAAGATTCTTCTTAGGGTTCTTATGACTGATCCAATACTTGCCATTTGATCATCAAGTTGAATAAATTTGGAAATCGAATCTGGTATAGGGTGTAATTTAAATTGAGATTGGAAATATCTATTTTCAGGTGGGGATTTGCTCATATAAAAGGGAAAATAATAATTGATGAATGATTGTCCTAATTTTGTAACAGGGAAGTTATTTAATTCAAATCCTAACCAAATAAAAAACCCAGATATCCAAGTACCCAATGATCGTATAACTCCATCAGATGGTATAAATACTTTTTTAGTGTAAGTAATGCTGTAGGGAACAATTCCATGAGTAACTAGTGAAAATAATAAAATAACATAATTTAAAGATGTAGGGTTTGCAGTTAACTCAGTTGAATATCTATAACATAAATCAGTTCTTATTCCAAATGAAACTAATAAGTTCATCAATTGGTGATCCTTTTCCGGAATTAGTTCACGAGGTATACCCCTTATTAAATCTTGTCTTTTTATTTGTAGAGCTCTGTAAAATTCGTTTTCTTCTGTTTGATAATATGGGAATAAAAATCTATTTTCATATAAGTCATTATAATCCAAGAATGTTGTTTGTCTGATTAATCCTCTTTGTGTTGGATTTTGAAATATTACATAAACTTCAGAAGATTGGGACGAGGTTGTCGCAGTAGTTGCCAATTCAATATTTTCAAATGCTCCAGCTAGTTTGTTTAAAATATTGTTGTGGGTTGAAAAGATTCTAGTTAAATAAGTTTTAAAGATGATTACAGATTGATGTTCACACAATATCTCATACCATCTAACTAAGTTATCTTCGATTAAGTTGATAGACTCGATATCAACGACTTCCATATCAAAGATTAGTAAATTTAAATGCAATTGGAAGTCAGTTTTTAATTTTACGAAATTTCTCCATGTGGTATCAAGCCTTAAATCATTTGGTTCAAGCCAGCAAGTATTCAAATTGACACATCTTTCAGGGTCTGTTAAGCAGTGTAGTATTGCAGATGGGGGAGATGGAGTGTTCCCCTTTAAGTTAACTTTCGAAAATTCACAAAGTGTATTAAAAATTGCTTTGGAAGTGCGATATTTCCTTAAAAATAAAGCAGTTAACCCACCTGATCCATCACCTCCAATCAATCCATCTTGAATTGGAAGAGTCAATCGGTTTAATATAGCATGAACTTTGTAATGAGCTCCAGTTGCTAATTGTGCAATTCTTAATCCAGATATTAAGGGATTTTGATATCGATCCTTGTATAATTCGGGAATATTTACCCAATTATTTATTGTTAAGTAATTGACCGGTATAAAGTTTGCCCATCCTGGATCCTCATTAGACCAGTTTAAACTACGATTATCCTCGAAATAGATAGTTTCTCCTTCTATTAGTCTGACTGCATGTCTGACCTCTTGGTCGGTCAAAATAAGATTTTCTAAAAGAGGTTGAATTATTGTATGCAAGTTTTCTGGAGCATCATCTAGACTTCTTAGTTGTGTAGACAAATCTCTCAATCCTGCAATATACTCTCTAATACGTTTTGACAAATGAGGTTCTCTTAACACTTTCATAAATCTATCCGAAATTCCTATAAGGCCTACTATGGAGGATTTATAAATATCTGCAAATATCCATATTGGTTGAAATCCTATATGTTCTGAAAGGTACCTAGATCCAAAATTAGAAAGTTCATATTTCATGTAATCTGATCCTAATCGGGTTATGTCTTCTGTAATTATTGGATAAGATGGAGGAATTTTATGAGGTATTGAAGCAAATAACCTCAAAAACTGAGGTTCTCTCCAAATATTGATTAAATTTAAATTGTTGGCTAATTTACCAATAGTTAAAGTTGCATGTCCGATTATATGTCTATGATAAGATCTCGAGCTTGTCAATCCTCGTTGATGTAATATAGATAAAGCGCTACTCCTTATAACTCCAACTATTAGCCCTCTCATATATTCTCTAGGTGTAATTTTATTTCTGATTGTTAGTGGAAATAATGCTGGATCTTCATAAAGGGAACTAGATCCCCAAACAGAATCACCAAATACAAATCCTTGAGCTTGTGCAATCTGGAATGATTTCTGAGGTCTTGTTAATCTATTCCAGTTTCTTGATGGGATGGATAAGGTTACATTAATCACACCCCATGATGCATTATCAGGTTTCCAATCCTTTAATAAATTGTGTACGTCTGGATGTTGGTAAGCATAATTGCAATTGATTTTGATTTCATCTATTTCTCTTAAACAGTCTTTACATTTGATGTGATGATGATAAAACCCATGTTCTTGATCATAATGATGAATTTCTCCGGTGGATATCAAGCTATTTAAGATACAATTTTGAAACATGAAGTCATAATTTTTATCACCCAGTTCCAAAAGACTATTTGTTGTAGCTAACATTCGAGTTAATTTAGAGGGATTTTGAGCTGAATATCCACCATTACTTTGTCTGGAACAATTAAATCTGTGTAATGCTGATCCCGTTCTCTTGAATCCTTCAAGATTTTGAGACCAATCTTCCCCCGTTAATGCCCTAAGATTGTTTAAAATAGAATGTGCAAGAGGAGAATTGTAATCAATAAACCACCCTATTGCATTTCTTAATGATGTAGCTCTCTTTAATAAAGGGATTTTTGTTTCTTTTTCCCATGACTGTAGAATACTGGTAGACTCTAATGTTGCTGATCCTAAATAAGCTGCACATGATCCTCTAATCGTTTTTAAATCCTTGAACCCAGACGGAACCAAAATCGAAATATATAAACGGTTTGGGAATGAACCAAGACATGGTTCACACTCACCTCGAAATTGTATCGGGATATGAAATAATTCGGCAGGATGAGGAATAGTAGCTCCGTACACTTTTTGTCCCCATGATAAGAATCTTAAATGATCTGCATGAGACGAGGAACATTTCCACATCGGAATTTTAATTTTTAAATCTTGTTTTATCAAACATTTAAGACTATATATTTCTGCTGCTATTATAATCTGATCATATTTAATACTCAAAGCTCTTTTGAATTGATTTCTAATTGTTTTTGAATTTTGAAATAATTCAATCATTGAATCAGTAATTCCCAAATAAGTCCCAGCTCGATATTCACTCAGAAACCTGGGAAACAAAGGGGTAATTGATCTCAGATGACTTAAGAAAGCAGGCTCAGTTTCTCGTCTATGCTGAACTGCTGACCTAATGATCAAATTCTTTATTTCCATTTGTGAGCGAAATAAGGAAGTCTTAATTGCTTCTTTAATCATTGTATTAGCATCTATACCTCTAGCTATATTTAAGGACAAAGGATCTTCTAAAAGTTTACTTATGTTAGGGACCATCTCTTGTTTGATTTTTGGGTATCCATATTGAGGGATTAAAATTTTAAATTGTTCATCTAGGATATTTTCGTAAACTAATTTCAAAAATGTTAAACTCTCAGAAATTGGGTCAGGAAACATTCTGACTATGAATCTGGTTAATGACATTCCGCACACTCCTCCCATTGATGGGTCTAAAAATAAGGTTTTAAATAAGTAACCCTTCGTCATTAAATCATTTGCTTGGAGTTTCAACATTTTTTGAACTGGACCTCGTAAAGCGGGATTATGAAATTCACAAATGATTCTGACAAAATGGGCAATGAAGTTATAATAGTACATAGAATTAATCGGTGAGTCGGAGTAGTGTGATACTGTTAAGGCATTGCTAGTAGTTGTGGATATTACATTGGCCATAGTAGGTAATTGATCATTTGTAACACAATTAACTCTTGACCAACGTTTGGTTTCTAAATTTCTGATATTTCCCCTGAATATTATGTTTTTCCCATAATTTAAAAATTCGGAACTTTTTATTGTCTCATCTTTATTTATAATTAACCCAAGCTTCCTGGTTCCATCTGCAATTTTATTTAACAACATTCGGTTATTCAACATTATGGAATTTATGTTACTATTTAATTGGGCTTCTGTTCTGAACTGTTGAATTCGGTATAAGGAACAAATCACCTGATTGTCACCTTGGGCTAAAACCTTAATTTTTGTATTCAAAGAGTATCCTTCCCTTCTGAGAACTAATAAATTGCAAATGCTCCACCCTTTTTGACGTAGTCCTTCTAATCCTCCTTGTTGCCCTAACCAACAAACTCTCTTTTCGGTTTTGTTCATTAGATTATTTGAAGCATCGATTCCTAGTAAATCTCCTCTGTTATTGTAATAAATCCAAGATTTTTCAAATATTTCATGAGTTCTTGTTATTAAATTAGGATATCCTAAAAATTGCCCCATAACTTTAAATACAGGGTTATTTGCTTTGCCTCTTTGATGATTGTTCCATTTGGTGTAATCTATGTGATCTGCTATAGTAATTTGTTTATAATCTGATTCTCCTTGATTTGAAGAATTTTCTAACATTTTGCCTATTACGGTGGTGAAGTCATCTGCCATAGTCAATCCTTTAAATAAGGGGACAAAATGTAATTTGATCAAATATT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| 33,558 |
OL420707.1
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
|
Litov,A.G., Belova,O.A., Kholodilov,I.S., Gadzhikurbanov,M.N., Gmyl,L.V., Oorzhak,N.D., Saryglar,A.A., Ishmukhametov,A.A., Karganova,G.G.
|
Chumakov Institute of Poliomyelitis and Viral Encephalitides, Laboratory of Arboviruses
|
Russia
|
2022-01-24
|
ADSV_21
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,703 |
GenBank
| 1 |
Russia: Republic of Tuva
|
Russia
|
Melophagus ovinus
| null |
2010
| null | null |
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus strain 7461, complete genome
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GTGGGAATGGGCCAAATTAAGTAGATAAGGTTGTATCTGAGTGTGGAGAGACAAAACAACACACCAGCTAATGAAAACAAGAAAAAATCAAGTATCGTTCTCGGTTGAATCCTTTTATTTTATGATGAAATGTGGTTGTGAGAGTGGGAATGGGCCAAATTAAGTAGATAAGGTTGTATCTGAGTGTGGATATTGTCGATTATTCAATTGATTTTTTGTAATTTGGGTTTTAGGAGGTCATTTTAGTGAACTGGTTTATTAAATTGTTATCTAAATATGTTGATAAAGTTGTCTTGTCTCAAGATTAAACTTTATTCTCTAATGTAATAATTTTCAGTTTCATCATCGTCTTCTATCATGGGGTTATCTAACAATATGGAAATTCTTTCAGGCGGAACTGACTCAAAGATTATAGTGGGGTTTAAATATAGAGAAAATAGTCCTGTATTACGATCAAAGATATTTATAGTGATTCCAGGATTGTATTCTTTCAATAATAGATTAATTGTTGGAATATCAATTACTAAATCAAGGTTATAAAAGATTCTTCTTAGGGTTCTTATGACTGATCCAATACTTGCCATTTGATCATCAAGTTGAATAAATTTGGAAATCGAATCTGGTATAGGGTGTAATTTGAATTGAGATTGGAAATATCTATTTTCAGGTGGGGATTTGCTCATATAAAAGGGAAAATAATAATTGATGAATGATTGTCCTAATTTTGTAACAGGGAAGTTATTTAACTCAAATCCTAACCAAATAAAAAACCCAGATATCCAAGTACCCAATGATCGTATAACTCCATCAGATGGTATAAATACTTTTTTAGTGTAAGTAATGCTGTAGGGAACAATTCCATGAGTAACTAGTGAAAATAATAAAATAACATAATTTAAAGATGTAGGGTTTGCAGTTAACTCAGTTGAGTATCTATAACATAAATCAGTTCTTATTCCAAATGAAACTAATAAGTTCATCAATTGGTGATCCTTTTCCGGAATTAGTTCACGAGGTATACCCCTTATTAAATCTTGTCTTTTTATTTGTAGAGCTCTGTAAAATTCGTTTTCTTCTGTTTGATAATATGGGAATAAAAATCTGTTTTCATATAAGTCATTATAATCCAAGAATGTTGTTTGTCTGATTAATCCTCTTTGTGTTGGATTTTGAAATATTACATAAACTTCAGAAGATTGGGACGAGGTTGTCGCAGTAGTTGCCAATTCAATATTTTCAAATGCTCCAGCTAGTTTGTTTAAAATGTTGTTGTGGGTTGAAAAGATTCTAGTTAAATAAGTTTTAAAGATGATTACAGATTGATGTTCACACAATATCTCATACCATCTAACTAAGTTATCTTCGATTAAGTTGATAGACTCGATATCAACGACTTCCATATCAAAGATTAGTAAATTTAAATGCAATTGGAAGTCAGTTTTTAATTTTACGAAATTTCTCCATGTGGTATCAAGCCTTAAATCATTTGGTTCAAGCCAGCAAGTATTCAAATTGACACATCTTTCAGGGTCTGTTAAACAGTGTAGTATTGCAGATGGGGGAGATGGAGTGTTCCCCTTTAAGTTAACTTTCGAAAATTCACAAAGTGTATTAAAAATTGCTTTGGAAGTGCGATATTTCCTTAAAAATAAAGCAGTTAACCCACCTGATCCATCACCTCCAATTAATCCATCCTGAATTGGAAGAGTCAATCGGTTTAATATAGCATGCACTTTGTAATGAGCTCCAGTTGCTAATTGTGCAATTCTTAATCCAGATATTAAGGGATTTTGATATCGATCCTTGTATAATTCGGGAATATTTACCCAATTATTTATTGTTAAGTAATTGACCGGTATAAAGTTTGCCCATCCTGGATCCTCATTAGACCAGTTTAAACTACGATTATCTTCGAAATAGATAGTTTCTCCTTCTATTAGTCTGACTGCATGTCTGACCTCTTGGTCGGTCAAAATAAGATTTTCTAAAAGAGGTTGAATTATTGTATGCAAGTTTTCTGGAGCATCATCTAGACTTCTTAGTTGTGTAGACAAATCTCTCAATCCTGCAATATACTCTCTAATACGTTTTGACAAATGAGGTTCTCTTAACACTTTCATAAATCTATCCGAAATTCCTATAAGGCCTACTATGGAGGATTTATAAATATCTGCAAATATCCATATTGGTTGAAATCCTATATGTTCTGAAAGGTACCTAGATCCAAAATTAGAAAGTTCATATTTCATGTAATCTGATCCTAATCGGGTTATGTCTTCTGTAATTATTGGATAAGACGGAGGAATTTTATGAGGTATTGAAGCAAATAACCTCAAAAACTGAGGTTCTCTCCAAATATTGATCAAATTTAAATTATTGGCTAATTTACCGATAGTTAAAGTTGCATGTCCGATTATATGTCTATGATAAGATCTCGAGCTTGTCAATCCTCGTTGATGTAATATAGATAAAGCGCTACTCCTTATAACTCCAACTATTAGCCCTCTCATATATTCTCTAGGTGTAATTTTATTTCTGATTGTTAGTGGAAATAATGCTGGATCTTCATAAAGGGAACTAGATCCCCAAACAGAATCACCAAATACAAATCCTTGAGCTTGTGCAATCTGGAATGATTTCTGAGGTCTTGTTAATCTATTCCAGTTTCTTGAGGGGATGGATAAGGTTACATTAATCACACCCCATGATGCATTATCAGGTTTCCAATCCTTTAATAAATTGTGTACGTCTGGATGTTGATAAGCATAATTGCAATTGATTTTGATTTCATCTATTTCTCTTAAACAGTCTTTACATTTGATGTGATGATGATAAAACCCATGTTCTTGATCATAATGATGAATTTCTCCGGTGGATATCAAGCTATTTAAGATACAATTTTGAAACATGAAGTCATAATTTTTATCACCCAGTTCCAAAAGACTATTTGTTGTAGCTAACATTCGAGTTAATTTAGAGGGATTTTGAGCTGAATATCCACCATTACTTTGTCTGGAACAATTGAATCTGTGTAATGCTGATCCCGTTCTCTTGAATCCTTCAAGATTTTGAGACCAATCTTCCCCCGTTAATGCCCTAAGATTGTTTAAAATAGAATGTGCAAGAGGAGAATTGTAATCAATAAACCACCCTATTGCATTTCTTAATGATGTAGCTCTCTTTAATAAAGGGATTTTTGTTTCTTTTTCCCATGACTGTAGAATACTGGTAGACTCTAATGTTGCTGATCCTAAGTAAGCTGCACATGATCCTCTAATCGTTTTTAAATCCTTGAACCCAGACGGAACCAAAATCGAAATATATAAACGGTTTGGGAATGAACCAAGACATGGTTCACACTCACCTCGAAATTGTATCGGGATATGAAATAATTCGGCAGGATGAGGAATAGTAGCTCCGTACACTTTTTGTCCCCATGATAAGAATCTTAAATGATCTGCATGAGACGAGGAACATTTCCACATTGGAATTTTAATTTTAAGATCTTGTTTTATCAAACATTTAAGACTATATATTTCTGCTGCTATTATAATCTGATCATATTTAATACTCAAAGCTCTTTTGAATTGATTTCTAATTGTTTTTGAATTTTGAAATAATTCAATCATTGAATCAGTAATTCCCAAATAAGTCCCAGCTCGATATTCACTCAGAAACCTGGGAAACAAAGGGGTAATTGATCTCAGATGACTTAAGAAAGCAGGCTCAGTTTCTCGTCTATGCTGAACTGCTGACCTAATGATCAAGTTCTTTATTTCCATTTGTGAGCGAAATAAGGAAGTCTTAATTGCTTCTTTAATCATTGTATTAGCATCTATACCTCTAGCTATATTTAAGGACAAAGGATCTTCTAAAAGTTTACTTATGTTAGGGACCATCTCTTGTTTGATTTTTGGGTATCCATATTGAGGGATTAAAATTTTAAATTGTTCATCTAGGATATTTTCGTAAACTAATTTCAAAAATGTCAAACTCTCAGAAATTGGGTCAGGAAACATTCTGACTATGAATCTGGTTAATGACATTCCGCACACTCCTCCCATTGATGGGTCTAAAAATAAGGTTTTAAATAAGTAACCCTTCGTCATTAAATCATTCGCTTGGAGTTTCAACATTTTTTGAACTGGACCTCGTAAAGCGGGATTATGAAATTCACAAATGATTCTGACAAAATGGGCAATGAAGTTATAATAGTACATAGAATTAATCGGTGAGTCGGAGTAGTGTGATACTGTTAAGGCATTGCTAGTAGTTGTGGATATTACATTGGCCATAGTAGGTAATTGATCATTTGTAACACAATTAACTCTTGACCAACGTTTGGTTTCTAAATTTCTGATATTTCCCCTGAATATTATATTTTTCCCATAATTTAAAAATTCGGAACTTTTTATTGTCTCATCTTTATTTATAATTAACCCAAGCTTCCTGGTTCCATCCGCAATTTTATTCAACAACATTCGGTTATTCAACATTATGGAATTTATGTTACTATTTAATTGGGCTTCTGTTCTGAACTGTTGAATTCGGTATAGGGAACAAATCACCTGATTGTCACCTTGGGCTAAAACCTTAATTTTTGTATTCAAAGAGTATCCTTCCCTTCTGAGAACTAATAAATTGCAAATGCTCCACCCTTTTTGACGTAGTCCTTCTAATCCTCCTTGTTGCCCTAACCAACAAACTCTCTTTTCGGTTTTGTTCATTAGATTATTTGAAGCATCGATTCCTAGTAAATCTCCTCTGTTATTGTAATAAATCCAAGATTTTTCAAATATTTCATGAGTTCTTGTTATTAAATTAGGATATCCTAAAAATTGCCCCATGACTTTAAATACAGGGTTATTTGCTTTGCCTCTTTGATGATTGTTCCATTTGGTGTAATCTATGTGATCTGCTATAGTAATTTGTTTATAATCTGATTCTCCTTGATTTGAAGAATTTTCTAACATTTTGCCTATTACGGTGGTGAAGTCATC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| 33,559 |
OL420709.1
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
|
Litov,A.G., Belova,O.A., Kholodilov,I.S., Gadzhikurbanov,M.N., Gmyl,L.V., Oorzhak,N.D., Saryglar,A.A., Ishmukhametov,A.A., Karganova,G.G.
|
Chumakov Institute of Poliomyelitis and Viral Encephalitides, Laboratory of Arboviruses
|
Russia
|
2022-01-24
|
ADSV_23
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,712 |
GenBank
| 1 |
Russia: Republic of Tuva
|
Russia
|
Melophagus ovinus
| null |
2012
| null | null |
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus strain 13577, complete genome
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ACAAAACAACACACCAGCTAATGAAAACAAGAAAAAATCAAGTATCGTTCTCGGTTGAATCCTTTTATTTTATGATGAAATGTGGTTGTGAGAGTGGGAATGGGCCAAATTAAGTAGATAAGGTTGTATCTGAGTGTGGATATTGTCGATTATTCAATTGATTTTTTTTAATTTGGGTTTTAGGAGGTCATTTTGGTGAACTGGTTTATTAAATTGTTATCTAAATATGTTGATAAAGTTGTCTTGTCTCAAGATTAAACTTTATTCTCTAATGTAATAATTTTCAGTTTCATCATCGTCTTCTATCATGGGGTTATCTAACAATATGGAAATTCTTTCAGGCGGAACTGACTCAAAGATTATAGTGGGGTTTAAATATAGAGAAAATAGTCCTGTATTACGATCAAAGATATTTATAGTGATTCCAGGATTGTATTCTTTCAATAATAGATTAATTGTTGGAATATCAATTACTAAATCAAGGTTATAAAAGATTCTTCTTAGGGTTCTTATGACTGATCCAATACTTGCCATTTGATCATCAAGTTGAATAAATTTGGAAATAGAATCTGGTATGGGGTGTAATTTGAATTGAGATTGGAAATATCTATTTTCAGGTGGGGATTTGCTCATATAAAAGGGAAAATAATAATTGATGAATGATTGTCCTAATTTTGTAACAGGGAAGTTATTTAATTCAAATCCTAACCAAATAAAAAACCCAGATATCCAAGTACCCAATGATCGTATAACTCCATCAGATGGTATAAATACTTTTTTAGTGTAAGTAATGCTGTAGGGAACAATTCCATGAGTAACTAGTGAAAATAATAAAATAACATAATTTAAAGATGTAGGGTTTGCAGTTAACTCAGTTGAGTATCTATAACATAAATCAGTTCTTATTCTAAATGAAACTAATAAGTTCATCAATTGGTGATCCTTTTCCGGAATTAGTTCACGAGGTATACCCCTTATTAAATCTTGTCTTTTTATTTGTAGGGCTCTGTAAAATTCGTTTTCTTCTGTTTGATAATATGGGAATAAAAATCTATTTTCATATAAGTCATTATAATCCAAGAATGTTGTTTGTCTGATTAATCCTCTTTGTGTTGGATTTTGAAATATTACATAAACTTCAGAAGATTGGGACGAGGTTGTTGCAGTAGTTGCCAATTCAATATTTTCAAACGCTCCAGCTAGTTTGTTTAAAATATTGTTGTGGGTTGAAAAGATTCTAGTTAAATAAGTTTTAAAGATGATTACAGATTGATGTTCACACAATATCTCATACCATCTAACTAAGTTATCTTCGATTAAGTTGATAGACTCGATATCAACGACTTCCATATCAAAGATTAGTAAATTCAAATGCAATTGGAAGTCAGTTTTTAATTTTACGAAATTTCTCCATGTGGTATCAAGCCTTAAATCATTTGGTTCAAGCCAGCAAGTATTCAAATTAACACATCTTTCAGGGTCTGTTAAACAGTGTAGTATTGCAGATGGGGGAGATGGAGTGTTCCCCTTTAAGTTAACTTTCGAAAATTCGCAAAGTGTATTAAAAATTGCTTTGGAAGTGCGATATTTCCTTAAAAATAAAGCAGTTAACCCACCTGATCCATCACCTCCAATCAATCCATCCTGAATTGGAAGAGTCAATCGGTTTAATATAGCATGAACTTTGTAATGAGCTCCAGTTGCTAATTGTGCAATTCTTAATCCGGATATTAAGGGATTTTGATATCGATCCTTGTATAATTCGGGAATATTTACCCAATTATTTATTGTTAAATAATTGACCGGTATAAAGTTTGCCCATCCTGGATCCTCATTAGACCAGTCTAAACTACGATTATCTTCGAAATAGATAGTTTCTCCTTCTATTAGTCTGACTGCATGTCTGACCTCTTGGTCGGTCAAAATAAGATTTTCTAAAAGAGGTTGAATTATTGTATGCAAGTTTTCTGGAGCATCATCTAGACTTCTTAGTTGTGTAGACAAATCTCTCAATCCTGCAATATACTCTCTAATACGTTTTGACAAATGAGGTTCTCTTAACACTTTCATAAATCTATCCGAAATTCCTATAAGGCCTACTATGGAGGATTTATAAATATCTGCAAATATCCATATTGGTTGAAATCCTATATGTTCTGAAAGGTACCTAGATCCAAAATTAGAAAGTTCATATTTCATGTAGTCTGATCCTAATCGGGTTATATCTTCTGTAATTATTGGATAAGATGGAGGAATTTTATGAGGTATTGAAGCAAATAACCTCAAAAACTGAGGTTCTCTCCAAATATTGATTAAATTTAAATTATTGGCTAATTTACCGATAGTTAAAGTTGCATGTCCGATTATATGTCTATGATAAGATCTCGAGCTTGTCAATCCTCGTTGATGTAATATAGATAAAGCGCTACTCCTTATAACTCCAACTATTAGCCCTCTCATATATTCTCTAGGTGTAATTTTATTTCTGATTGTTAGTGGAAATAATGCTGGATCTTCATAAAGGGAACTAGATCCCCAAACAGAATCACCAAATACAAATCCTTGAGCTTGTGCAATCTGGAATGATTTCTGAGGTCTTGTTAATCTATTCCAGTTTCTTGAGGGGATGGATAAGGTTACATTAATCACACCCCATGATGCATTATCAGGTTTCCAATCYTTTAATAAATTGTGTACGTCTGGATGTTGATAAGCATAATTGCAATTGATTTTRATTTCATCTATTTCTCTTAAACAGTCTTTACATTTGATGTGATGATGRTAAAACCCATGTTCTTGATCATAATGATGAATTTCTCCGGTGGATATCAAGCTATTTAAGATACAATTTTGAAACATRAAGTCATAATTTTTATCACCCAGTTCCAAAAGACTATTTGTTGTAGCTAACATTCGAGTTAATTTAGAGGGRTTTTGAGCTGAATATCCACCATTACTTTGTCTGGAACAATTAAATCTGTGTAATGCTGATCCCGTTCTCTTRAATCCTTCAAGATTTTGAGACCARTCTTCCCCCGTTAATGCCCTAAGATTGTTTAAAATAGAATGTGCAAGAGGAGAATTRTAATCAATAAACCACCCTATTGCATTTCTTAATGATGTAGCTCTCTTTAATAAAGGGATYTTTGTTTCTTTYTCCCATGACTGTAGAATACTGGTAGACTCTAATGTTGCTGATCCTAAGTAAGCTGCACATGATCCTCTAATYGTTTTTAAATCCTTGAACCCAGACGGAACCAAAATCGAAATATATAAACGGTTTGGGAATGAACCAAGACATGGTTCACACTCWCCTCKAAATTGTATCGGGATATGAAATAATTCGGCAGGATGAGGAATAGTAGCTCCGTACACTTTTTGTCCCCATGATAAGAATCTTAAATGATCTGCATGAGACGAGGAACATTTCCACATTGGAATTTTAATTTTTAAATCTTGTCTTATCAAACATTTAAGACTATATATTTCTGCTGCTATTATAATCTGATCATATTTAATACTCAAAGCTCTTTTGAATTGATTTCTAATTGTTTTTGAATTTTGAAATAATTCAATCATTGAATCAGTAATTCCCAAATAAGTCCCAGCTCGATATTCACTCAGAAACCTGGGAAACAAAGGGGTAATTGATCTCAGATGACTTAAGAAAGCAGGCTCAGTTTCTCGTCTATGCTGAACTGCTGACCTAATGATCAAGTTCTTTATTTCCATTTGTGAGCGAAATAAGGAAGTCTTAATTGCCTCTTTAATCATTGTATTAGCATCTATACCTCTAGCTATATTTAAGGACAAAGGATCTTCTAAAAGTTTACTTATGTTAGGGACCATCTCTTGTTTGATTTTTGGGTATCCATATTGAGGGATTAAAATTTTAAATTGTTCATCTAGGATATTTTCGTAAACTAATTTCAAAAATGTCAAACTCTCAGAAATTGGGTCAGGAAACATTCTGACTATGAATCTAGTTAATGACATTCCGCACACTCCTCCCATTGATGGGTCTAAAAATAAGGTTTTAAATAAGTAACCCTTCGTCATTAAATCATTTGCTTGGAGTTTCAACATTTTTTGAACTGGACCTCGTAAAGCGGGATTATGAAATTCACAAATGATTCTGACAAAATGGGCAATGAAGTTATAATAGTACATAGAATTAATCGGTGAGTCGGAGTAGTGTGATACTGTTAAGGCATTGCTAGTAGTTGTGGATATTACATTGGCCATAGTAGGTAATTGATCATTTGTAACACAATTAACTCTTGACCAACGTTTGGTTTCTAAATTTCTGATATTTCCCCTGAATATTATATTTTTCCCATAATTTAAAAATTCGGAACTTTTAATTGTCTCATCTTTATTTATAATTAACCCAAGCTTCCTGGTTCCATCTGCAATTTTATTTAACAACATTCGGTTATTCAACATTATGGAATTTATGTTACTATTTAATTGGGCTTCTGTTCTGAACTGTTGAATTCGGTATAGGGAACAAATCACCTGATTGTCACCTTGGGCTAAAACCTTAATTTTTGTATTCAAGGAGTATCCTTCCCTTCTGAGAACTAATAAATTGCAAATGCTCCACCCTTTTTGACGTAGTCCTTCTAATCCTCCTTGTTGCCCTAACCAACAAACTCTCTTTTCGGTTTTGTTCATTAGATTATTTGAAGCATCGATTCCTAGTAAATCTCCTCTGTTATTGTAATAAATCCAAGATTTTTCAAATATTTCATGAGTTCTTGTTATTAAATTAGGATATCCTAAAAATTGCCCCATGACTTTAAATACAGGGTTATTTGCTTTGCCTCTTTGATGATTGTTCCATTTGGTGTAATCTATGTGATCTGCTATAGTAATTTGTTTATAATCTGATTCTCCTTGATTTGAAGAATTTTCTAACATTTTGCCTATTACGGTGGTAAAGTCATCTGCCATAGTTAATCCTTTAAATAAGGGGACAAAATGTAATTTGATCAAAT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| 33,560 |
OL420710.1
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
|
Litov,A.G., Belova,O.A., Kholodilov,I.S., Gadzhikurbanov,M.N., Gmyl,L.V., Oorzhak,N.D., Saryglar,A.A., Ishmukhametov,A.A., Karganova,G.G.
|
Chumakov Institute of Poliomyelitis and Viral Encephalitides, Laboratory of Arboviruses
|
Russia
|
2022-01-24
|
ADSV_24
|
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,644 |
GenBank
| 1 |
Russia: Republic of Tuva
|
Russia
|
Melophagus ovinus
| null |
2012
| null | null |
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus strain 13580, complete genome
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TCACACCAGCTAATGAAAACAAGAAAAAATCAAGTATCGTTCTCGGTTGAATCCTTTTATTTTATGATGAAATGTGGTTGTGAGAGTGGGAATGGGCCAAATTAAGTAGATAAGGTTGTATCTGAGTGTGGATATTGTCGATTATTCAATTGATTTTTTTTAATTTGGGTTTTAGGAGGTCATTTTGGTGAACTGGTTTATTAAATTGTTATCTAAATATGTTGATAAAGTTGTCTTGTCTCAAGATTAAACTTTATTCTCTAATGTAATAATTTTCAGTTTCATCATCGTCTTCTATCATGGGGTTATCTAACAATATGGAAATTCTTTCAGGCGGAACTGACTCAAAGATTATAGTGGGGTTTAAATATAGAGAAAATAGTCCTGTATTACGATCAAAGATATTTATAGTGATTCCAGGATTGTATTCTTTCAATAATAGATTAATTGTTGGAATATCAATTACTAAATCAAGGTTATAAAAGATTCTTCTTAGGGTTCTTATGACTGATCCAATACTTGCCATTTGATCATCAAGTTGAATAAATTTGGAAATAGAATCTGGTATGGGGTGTAATTTGAATTGAGATTGGAAATATCTATTTTCAGGTGGGGATTTGCTCATATAAAAGGGAAAATAATAATTGATGAATGATTGTCCTAATTTTGTAACAGGGAAGTTATTTAATTCAAATCCTAACCAAATAAAAAACCCAGATATCCAAGTACCCAATGATCGTATAACTCCATCAGATGGTATAAATACTTTTTTAGTGTAAGTAATGCTGTAGGGAACAATTCCATGAGTAACTAGTGAAAATAATAAAATAACATAATTTAAAGATGTAGGGTTTGCAGTTAACTCAGTTGAGTATCTATAACATAAATCAGTTCTTATTCTAAATGAAACTAATAAGTTCATCAATTGGTGATCCTTTTCCGGAATTAGTTCACGAGGTATACCCCTTATTAAATCTTGTCTTTTTATTTGTAGGGCTCTGTAAAATTCGTTTTCTTCTGTTTGATAATATGGGAATAAAAATCTATTTTCATATAAGTCATTATAATCCAAGAATGTTGTTTGTCTGATTAATCCTCTTTGTGTTGGATTTTGAAATATTACATAAACTTCAGAAGATTGGGACGAGGTTGTTGCAGTAGTTGCCAATTCAATATTTTCAAACGCTCCAGCTAGTTTGTTTAAAATATTGTTGTGGGTTGAAAAGATTCTAGTTAAATAAGTTTTAAAGATGATTACAGATTGATGTTCACACAATATCTCATACCATCTAACTAAGTTATCTTCGATTAAGTTGATAGACTCGATATCAACGACTTCCATATCAAAGATTAGTAAATTCAAATGCAATTGGAAGTCAGTTTTTAATTTTACGAAATTTCTCCATGTGGTATCAAGCCTTAAATCATTTGGTTCAAGCCAGCAAGTATTCAAATTAACACATCTTTCAGGGTCTGTTAAACAGTGTAGTATTGCAGATGGGGGAGATGGAGTGTTCCCCTTTAAGTTAACTTTCGAAAATTCGCAAAGTGTATTAAAAATTGCTTTGGAAGTGCGATATTTCCTTAAAAATAAAGCAGTTAACCCACCTGATCCATCACCTCCAATCAATCCATCCTGAATTGGAAGAGTCAATCGGTTTAATATAGCATGAACTTTGTAATGAGCTCCAGTTGCTAATTGTGCAATTCTTAATCCGGATATTAAGGGATTTTGATATCGATCCTTGTATAATTCGGGAATATTTACCCAATTATTTATTGTTAAATAATTGACCGGTATAAAGTTTGCCCATCCTGGATCCTCATTAGACCAGTCTAAACTACGATTATCTTCGAAATAGATAGTTTCTCCTTCTATTAGTCTGACTGCATGTCTGACCTCTTGGTCGGTCAAAATAAGATTTTCTAAAAGAGGTTGAATTATTGTATGCAAGTTTTCTGGAGCATCATCTAGACTTCTTAGTTGTGTAGACAAATCTCTCAATCCTGCAATATACTCTCTAATACGTTTTGACAAATGAGGTTCTCTTAACACTTTCATAAATCTATCCGAAATTCCTATAAGGCCTACTATGGAGGATTTATAAATATCTGCAAATATCCATATTGGTTGAAATCCTATATGTTCTGAAAGGTACCTAGATCCAAAATTAGAAAGTTCATATTTCATGTAGTCTGATCCTAATCGGGTTATATCTTCTGTAATTATTGGATAAGATGGAGGAATTTTATGAGGTATTGAAGCAAATAACCTCAAAAACTGAGGTTCTCTCCAAATATTGATTAAATTTAAATTATTGGCTAATTTACCGATAGTTAAAGTTGCATGTCCGATTATATGTCTATGATAAGATCTCGAGCTTGTCAATCCTCGTTGATGTAATATAGATAAAGCGCTACTCCTTATAACTCCAACTATTAGCCCTCTCATATATTCTCTAGGTGTAATTTTATTTCTGATTGTTAGTGGAAATAATGCTGGATCTTCATAAAGGGAACTAGATCCCCAAACAGAATCACCAAATACAAATCCTTGAGCTTGTGCAATCTGGAATGATTTCTGAGGTCTTGTTAATCTATTCCAGTTTCTTGAGGGGATGGATAAGGTTACATTAATCACACCCCATGATGCATTATCAGGTTTCCAATCTTTTAATAAATTGTGTACGTCTGGATGTTGATAAGCATAATTGCAATTGATTTTGATTTCATCTATTTCTCTTAAACAGTCTTTACATTTGATGTGATGATGGTAAAACCCATGTTCTTGATCATAATGATGAATTTCTCCGGTGGATATCAAGCTATTTAAGATACAATTTTGAAACATAAAGTCATAATTTTTATCACCCAGTTCCAAAAGACTATTTGTTGTAGCTAACATTCGAGTTAATTTAGAGGGATTTTGAGCTGAATATCCACCATTACTTTGTCTGGAACAATTAAATCTGTGTAATGCTGATCCCGTTCTCTTGAATCCTTCAAGATTTTGAGACCAGTCTTCCCCCGTTAATGCCCTAAGATTGTTTAAAATAGAATGTGCAAGAGGAGAATTATAATCAATAAACCACCCTATTGCATTTCTTAATGATGTAGCTCTCTTTAATAAAGGGATCTTTGTTTCTTTCTCCCATGACTGTAGAATACTGGTAGACTCTAATGTTGCTGATCCTAAGTAAGCTGCACATGATCCTCTAATTGTTTTTAAATCCTTGAACCCAGACGGAACCAAAATCGAAATATATAAACGGTTTGGGAATGAACCAAGACATGGTTCACACTCTCCTCGAAATTGTATCGGGATATGAAATAATTCGGCAGGATGAGGAATAGTAGCTCCGTACACTTTTTGTCCCCATGATAAGAATCTTAAATGATCTGCATGAGACGAGGAACATTTCCACATTGGAATTTTAATTTTTAAATCTTGTTTTATCAAACATTTAAGACTATATATTTCTGCTGCTATTATAATCTGATCATATTTAATACTCAAAGCTCTTTTGAATTGATTCCTAATTGTTTTTGAATTTTGAAATAATTCAATCATTGAATCAGTAATTCCCAAATAAGTCCCAGCTCGATATTCACTCAGAAACCTGGGAAACAAAGGGGTAATTGATCTCAGATGACTTAAGAAAGCAGGCTCAGTTTCTCGTCTATGCTGAACTGCTGACCTAATGATCAAGTTCTTTATTTCCATTTGTGAGCGAAATAAGGAAGTCTTAATTGCCTCTTTAATCATTGTATTAGCATCTATACCTCTAGCTATATTTAAGGACAAAGGATCTTCTAAAAGTTTACTTATGTTAGGGACCATCTCTTGTTTGATTTTTGGGTATCCATATTGAGGGATTAAAATTTTAAATTGTTCATCTAGGATATTTTCGTAAACTAATTTCAAAAATGTCAAACTCTCAGAAATTGGGTCAGGAAACATTCTGACTATGAATCTGGTTAATGACATTCCGCACACTCCTCCCATTGATGGGTCTAAAAATAAGGTTTTAAATAAGTAACCCTTCGTCATTAAATCATTTGCTTGGAGTTTCAACATTTTTTGAACTGGACCTCGTAAAGCGGGATTATGAAATTCACAAATGATTCTGACAAAATGGGCAATGAAGTTATAATAGTACATAGAATTAATCGGTGAGTCGGAGTAGTGTGATACTGTTAAGGCATTGCTAGTAGTTGTGGATATTACATTGGCCATAGTAGGTAATTGATCATTTGTAACACAATTAACTCTTGACCAACGTTTGGTTTCTAAATTTCTGATATTTCCCCTGAATATTATATTTTTCCCATAATTTAAAAATTCGGAACTTTTTATTGTCTCATCTTTATTTATAATTAACCCAAGCTTCCTGGTTCCATCTGCAATTTTATTTAACAACATTCGGTTATTCAACATTATGGAATTTATGTTACTATTTAATTGGGCTTCTGTTCTGAACTGTTGAATTCGGTATAGGGAACAAATCACCTGATTGTCACCTTGGGCTAAAACCTTAATTTTTGTATTCAAGGAGTATCCTTCCCTTCTGAGAACTAATAAATTGCAAATGCTCCACCCTTTTTGACGTAGTCCTTCTAATCCTCCTTGTTGCCCTAACCAACAAACTCTCTTTTCGGTTTTGTTCATTAGATTATTTGAAGCATCGATTCCTAGTAAATCTCCTCTGTTATTGTAATAAATCCAAGATTTTTCAAATATTTCATGAGTTCTTGTTATTAAATTAGGATATCCTAAAAATTGCCCCATGACTTTAAATACAGGGTTATTTGCTTTGCCTCTTTGATGATTGTTCCATTTGGTGTAATCTATGTGATCTGCTATAGTAATTTGTTTATAATCTGATTCTCCTTGATTTGAAGAATTTTCTAACATTTTGCCTATTACGGTGGTGAAGTCATCTGCCATAGTCAATCCTTTAAATAAAGGGACAAAATGTAATTTGATCAAATATTCTGTA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| 33,561 |
OP037813.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Carpio,K.L., Thompson,J.K., Widen,S.G., Smith,J.K., Juelich,T.L., Clements,D.E., Freiberg,A.N., Barrett,A.D.T.
|
University of Texas Medical Branch, Biochemistry, Cellular, and Molecular Biology
|
USA
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2023-03-13
|
ALKV
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Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
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ssRNA(+)
| 10,774 |
GenBank
| 1 | null | null | null | null | null | null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus isolate ALKV, complete genome
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AGATTTTTTTGCACGTGAGTGCTCTCGTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTACTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAGGGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGACAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAGCTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTCAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCCCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAGTGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCACTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCACACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTATGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCTATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTTGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGAC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TTTGGCAATCTGCTCAGCTGTGCCCATTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGC
| 17,586 |
KU884971.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Al-Saeed,M.S., El-Kafrawy,S.A., Farraj,S.A., Al-Subhi,T.L., Othman,N.A., Alsultan,A., Ben Helaby,H.G., Alshawdari,M.M., Hassan,A.M., Charrel,R.N., Azhar,E.I., Hashem,A.M., Faraj,S.A., Alsaeed,M.S.
|
King Abdulaziz University, Special Infectious Agents Unit, King Fahad Medical Research Center
|
Saudi Arabia
|
2017-03-11
|
2014067667
|
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,558 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-06
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus isolate 2014067667, complete genome
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TTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAGAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTTAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAAGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACTACCGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCTTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTTGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAGGTGGCTTAGGGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTTATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAATCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAGCCCTGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAGGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTACCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCTAAGTTTGCCTGTGAGGCTAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGACCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGCAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGAAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATACCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTACACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAATCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGTACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCTTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGTCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGGCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTTGTGACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCTTGTGCCGTTATGTGGTGGCCGTCGGCATCCTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGTCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGCCAACGGGACCAAAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAATCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAAGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGATCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGAAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTCCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACTTCGGGAAGTCCG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TGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCAAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAAGACACGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCCTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAAGTTATGA
| 77,717 |
JX271892.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Carletti,F., Zaki,A.M., Yousef,A.I., Aref,H., Meschi,S., Zaccaro,P., Capobianchi,M.R., Di Caro,A.
|
National Institute for Infectious Diseases 'Lazzaro Spallanzani' IRCCS, Virology Laboratory
|
Italy
|
2013-11-06
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,655 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2000
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 1336, complete genome
|
TCAGACAACGTTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGAAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAGGGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAGCTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAGTGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCACTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCACACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCTATGGCGTTTTGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCCGA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GACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGACAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGGAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAC
| 92,738 |
JX271893.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Carletti,F., Zaki,A.M., Yousef,A.I., Aref,H., Meschi,S., Zaccaro,P., Capobianchi,M.R., Di Caro,A.
|
National Institute for Infectious Diseases 'Lazzaro Spallanzani' IRCCS, Virology Laboratory
|
Italy
|
2013-11-06
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,655 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2011
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 5676, complete genome
|
TCAGACAACGTTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTTAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAAGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACTACCGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTTGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCACAAGTGGCTTAGGGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGTTTACCGACAAGGTTCATTGTTATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAATCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAGCCCTGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGTTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTACCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGATTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGACCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCCTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGCAAGTACCACCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCATGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGAAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATACCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTACACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAATCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGTACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGTCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTTGTGACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCTTGTGCCGTTATGTGGTGGCCGTCGGCATCCTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGTCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGCCAACGGGACCAAAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAGCCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAATCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAAGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGATCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAAGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAAGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACTTGAGCAAAGGTACTTCGGGAAGTCCGA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GACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCAAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAAGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAACCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTGGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAAGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAC
| 92,739 |
JF416949.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2002
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200201032, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCTGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGGGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGACAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGTCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTTTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAATAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGCATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTCGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAACTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGACCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAACCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCATGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTAGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTAAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGCCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCCGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGATGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGATAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATTTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGACAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGTCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCACTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,350 |
JF416950.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2002
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200201034, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCTGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAATAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGACGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGTAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATAGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATGACAGTGGCCCTTTGCCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACATCAGGAGAGCCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGACGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAACGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCTTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTACGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGTCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGTGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCTAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATCGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGATATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,351 |
JF416951.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2002
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200201035, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCTGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGGGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGACAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGTCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAATAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGCATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCTGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTCGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAACTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGACCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCATGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTAAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGCCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCCGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATTTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGACAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGTCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCACTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,352 |
JF416952.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2002
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200201036, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCTGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGGGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGACAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGTCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAATAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGCATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAATCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAACTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGACCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCATGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGCCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACTTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATTTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGTCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCACTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,353 |
JF416953.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2002
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200204519, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGATATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCATGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAGGGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGATCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAGCTGCCACCAGGAGATAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAGTGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAGAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCACTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCACACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTAGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAAGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGATTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAACCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCTATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGATCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,354 |
JF416954.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2002
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200300001, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAAGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGTAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACCGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCTGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGAGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGGGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGACAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGTCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAATAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGCATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTCGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAACTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGACCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCATGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTAAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGCCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAAGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATTTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGACAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGTCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCACTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,355 |
JF416955.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
2003
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200307463, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGTAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCTGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGAGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGGGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGACAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGTCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAATAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGCATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTCGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGCCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTAGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAACTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGACCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCATGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTAAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGCCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAGGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATTTAGATGCACTAACCACCTGGAACCAGACAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGTCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCACTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,356 |
JF416956.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
1995
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain Zaki #1, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAAGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGTAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACCGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCTGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGAGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGGGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGACAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGTCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAATAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGCATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTCGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAACTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGACCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCATGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTAAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGCCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATTTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGACAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGTCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCACTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,357 |
JF416957.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,775 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Homo sapiens
| null |
1994
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain Zaki #2, complete genome
|
AGATTTTTTTGCACGTGAGTGCTCTCGTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTACTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAGGGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGACAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAGCTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTCAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCCCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAGTGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAGGGGACTGGGGAGTGTCCACTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCACACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTATGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCTATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGAC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TTTGGCAATCTGCTCAGCTGTGCCCATTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAAGGCCGAACTGGGAGGCCATGAAGGCCCCTGGCTTTAGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCTATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCGGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,358 |
JF416961.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Hyalomma dromedarii
| null |
2009
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200904529, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCACATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGTTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGCGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCATGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAGGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAGGGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCTTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGTTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGATCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTATAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAGCTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTGGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAGTGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGGAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAAGGGACTGGGGAGTGTCCACTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCACACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGTCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGATTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGTGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCTATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTCTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAACCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCCGATAATCAATGCTCAGGGAGAGGTGGTGGGTCTTTACGGGAATGGCCTGAAGACCAATGAAGCTTATGTTAGTAGCATAGCACAAGGAGAAGCCGAGAAAAGTAGACCGGAACTTCCGCTGAGTGTGCAGGGGACAGGCTGGATGTCAAAAGGTCAGATTACGGTGCTGGACATGCACCCGGGATCAGGGAAGACACATCGAGTCCTCCCGGAGCTCGTGAGGCAGTGTGCAAACCGAGGGATGAGAACTCTAGTTCTTGCCCCTACCCGGGTGGTTCTGAAGGAGATGGAGAAGGCGCTTGCTGGCAAGAAGGTCCGCTTCCACTCACCCGCGGTAGAAGGGCAGAGCACAGCGGGAGCCGTTGTTGACGTTATGTGCCATGCCACGTACGTCCACAGAAGGCTGCTGCCTCAGGGGAGACAGAATTGGGAAGTTGCCATAATGGATGAAGCCCATTGGACCGATCCACATAGCATCGCGGCGAGAGGGCATCTTTACTCGCTTGCCAAAGAAAACAGGTGCGCTTTGGTGCTCATGACAGCAACCCCACCCGGCCGGGGAGATCCATTCCCGGAGTCCAATGGAGCCATCATGAGTGAGGAAAGGGCCATTCCGGACGGAGAGTGGAGAGAAGGCTTTGATTGGATAACAGAGTATGAGGGGCGGACAGCATGGTTCGTCCCATCCATATCAAAAGGTGGAGCCATTGCAAGAACCCTGCGCCAGAGAGGCAAAAGTGTGATCTGTCTCAATAGCAAAACCTTTGAGAAGGATTACCTGCGGGTCAGAGAAGAGAAGCCAGATTTTGTGGTAACAACAGACATCTCTGAGATGGGTGCCAACTTGGATGTCAGCCGAGTTATTGATGGCAGAACAAACATAAAGCCAGAGGAGGTGGATGGAAAGGTGGAGATGACTGGAACCAGAAAGATCACGACAGCATCGGCAGCTCAACGCCGGGGCAGGGTGGGAAGGACATCCGGACGCACTGATGAGTACATATACTCTGGACAGTGTGACGATGATGACACCAGCCTCGTTCAATGGAAGGAGGCACAGATACTCCTGGACAACATTACCACACTGAGAGGTCCAGTTGCTACTTTTTATGGACCTGAGCAGATGAAGATGCCAGAAGTGGCTGGCCACTACAGGCTGAATGAGGAGAAAAGGAAACACTTCCGGCACTTGATGACTCAATGTGACTTTACGCCTTGGCTGGCATGGCATGTTGCTACCAACACCAGCAATGTGCTGGATCGGAGCTGGACCTGGCAAGGGCCGGAGGGAAATGCTATTGATGGGGCCGATGGAGATCTAGTGCGGTTCAAAACACCCGGCGGCTCAGAACGTGTCTTGCAGCCGGTGTGGAAGGACTGCAGAATGTTCCGTGAGGGACGGGACGTTAAAGACTTTATACTGTACGCCTCCGGGCGTCGCAGCGTTGGCGATGTCCTGGGTGGTCTAGCAGGGGTCCCCGGTCTCCTGAGGCACAGGTGTGCCAGTGCGCTTGATGTAGTTTACACCCTCCTCAATGAGAATCCAGGTAGCAGAGCAATGCGCATGGCTGAGAGAGATGCGCCAGAGGCATTTCTGACAATTGTTGAGGTGGCCGTTCTAGGGGTGGCCACTCTTGGCATACTGTGGTGCTTTGTGGCAAGAACTTCGGTTAGCCGAATGTTTTTGGGCACGGTTGTGCTCTTTGCTGCCCTCTTGCTGCTGTGGATTGGTGGGGTGGACTACGGACACATGGCAGGGATAGCCCTGATATTCTACATCTTCCTCACTGTGCTGCAGCCAGAGCCGGGGAAACAGCGAAGTAGCGATGACAATAGACTGGCATACTTCCTTCTAGGACTCCTTAGCTTGGCTGGACTTGTGACGGCTAACGAAATGGGCATGCTGGATAAAACAAAAGCTGACCTTGCAGGGCTAATGTGGCGCGGAGAGCAAAGGCATCCAGCCTGGGAGGAGTGGACAAATGTGGACATCCAGCCAGCACGATCCTGGGGAACGTATGTGTTGATCGTCTCTCTGTTCACCCCCTACATGTTGCACCAGCTTCAGACAAAAATACAACAACTGGTGAATAGTTCGGTGGCTAGTGGTGCTCAGGCTATGAGAGATCTTGGGGGTGGGACTCCCTTCTTCGGGGTGGCCGGTCATGTAATTGCCTTGGGTGTCATGTCACTTGTGGGTGCCACTCCCTTGTCTTTGGGTTTGGGGGTGGCTCTGGCTGCCTTCCACTTAGCCATCGTCGCTTCGGGATTGGAAGCAGAACTGACGCAGAGGGCGCACAGGGTGTTCTTCTCGGCAATGGTCAAAAATCCAATGGTGGATGGAGACGTCATCAATCCCTTCCCTGATGGAGAGACAAAGCCAGTGCTATACGAGAGAAGGATGAGTCTAATCCTAGCCATTGCCTTGTGCATGGTTTCAGTGGTTCTCAACCGAACTGCGGCCTCAATGACAGAGGCTGGGGCTGTTGGTCTAGCTGCGTTGGGCCAGTTGGTCCATCCCGAGACTGAGACACTCTGGACAATGCCAGTGGCGTGTGGTATGGCGGGACTCGTGCGAGGGAGCTTCTGGGGCCTGTTGCCCATGGGACACCGATTATGGCTCAAGACAACTGGAACACGCAGAGGAGGTGCCGATGGAGAAACTCTTGGGGACATCTGGAAGAGGCGGCTGAATGGTTGCTCTAGGGAGGAGTTTTTTCAGTACCGACGAAGTGGAGTCATGGAGACGGAACGTGACAGGGCTCGAGAGCTTCTGAAAAGAGGTGAGACAAACATGGGACTGGCTGTCTCTCGAGGGACGGCTAAGCTAGCATGGCTAGAAGAACGGGGCTATGCGACCTTGAAAGGTGAGGTTGTTGATCTAGGCTGTGGCAGAGGCGGTTGGTCATACTATGCCGCTTCCAGGCCCGCCGTCATGGGAGTGAAGGCCTACACGATAGGGGGGAAAGGTCATGAGGTCCCAAGACTGATCACAAGCCTCGGGTGGAACCTCATCAAGTTCAGAACCGGGATGGATGTGTATTCCCTAGAGGCACACAGGGCTGACACCATTCTTTGTGATATTGGTGAGAGCAACCCAGATCCCTTGGTGGAAGGAGAGAGGAGTCGCCGTGTCATCCTCCTAATGGAGAAATGGAAACTCCGCAACCCTGACGCGTCCTGCGTGTTCAAGGTTTTGGCCCCGTATAGACCAGAGGTACTTGAGGCTCTTCACAGATTCCAGCTTCAATGGGGCGGGGGGCTAGTCCGCGTCCCCTTTTCCCGCAATTCCACGCATGAGATGTACTTCTCCACTGCTGTTAGTGGCAACATCGTCAATTCAGTGAACATCCAGTCCAGGAAGTTGTTAGCCAGATTTGGAGACCAGCGGGGACCTACCAAGGTTCCTGAAGTGGATCTGGGGACTGGCACACGCTGTGTGGTACTGGCAGAGGATAAGGTTAGGGAAGCTGATGTGGCCGAAAGAATAACTGCTCTCAAAACCCAATATGGTGACTCCTGGCACGTGGATAAAGAACATCCATACAGAACATGGCAATACTGGGGAAGTTACAAGACAGAAGCCACAGGATCGGCTGCCTCTTTGATCAATGGAGTGGTGAAGCTTCTCAGTTGGCCTTGGAATGCTAGGGAGGATGTGGTGCGCATGGCAATGACAGATACCACGGCCTTTGGCCAACAGAGGGTTTTCAAGGAAAAGGTGGATACCAAAGCGCAGGAGCCACAGGTGGGAACCAAGATCATTATGAGGGCCGTCAATGACTGGATTCTCGAAAGACTCGCGGGAAAGAAAACACCACGACTGTGCACGCGAGAAGAATTCATCGCAAAGGTGCGCTCAAACGCTGCGCTCGGAGCTTGGTCAGATGAACAAAATCGCTGGTCAAATGCTCGGGAAGCAGTGGAGGACCCCGAGTTTTGGAGGCTTGTTGATGAGGAAAGAGAGAGACATCTTAGAGGACGGTGTGCCCAGTGCGTGTACAACATGATGGGCAAGAGAGAGAAGAAACTTGGTGAATTCGGTGTCGCCAAGGGGAGCCGCGCCATCTGGTATATGTGGTTGGGGAGCCGGTATCTGGAATTTGAGGCACTGGGTTTCCTCAATGAGGATCACTGGGCTTCCAGGGATCTCAGTGGAGCGGGGGTTGAGGGGATTAGTCTCAACTACCTGGGATGGCACTTGAAAAGACTGTCCGAACTTGAAGGAGGGCTTTTCTATGCAGACGACACAGCGGGCTGGGACACAAGAATAACCAATGCAGACCTTGAGGATGAGGAGCAAATCCTGCGTTATCTGAGGGGCGAACACCGAACCCTCGCAAAGACAATTTTGGAAAAAGCCTATCATGCCAAAGTGGTCAAAGTGGCTCGCCCCTCCAGCTCGGGAGGCTGCGTCATGGACATCATAACTAGAAGAGACCAACGTGGTTCAGGTCAGGTGGTGACTTACGCTCTGAACACCCTCACGAACATCAAGGTGCAGCTCATCCGCATGATGGAGGGAGAGGGCGTGATCAGGCCATCAGACTCACAGGATCCTCGACTTTTACGTGTGGAGGCCTGGCTGAAAGAGTACGGAGAGGAACGTCTCACCCGTATGCTGGTCAGCGGGGATGATTGTGTTGTGAGACCTATCGACGACCGCTTCGGGAAGGCCCTCTACTTCTTGAATGATATGGCTAAGGTGAGAAAGGACATTGGAGAATGGGAGCCCTCGGAGGGTTACTCCAGCTGGGAAGAGGTTCCCTTCTGCTCTCACCATTTCCATGAGCTGACGATGAAGGACGGCAGGGTCATAATTGTCCCATGCAGAGATCAAGATGAGCTGGTGGGGCGGGCAAGAGTGTCTCCTGGGTGTGGCTGGAGCGTCAGGGAAACAGCATGTCTCTCAAAGGCCTACGGACAGATGTGGCTGTTAAGCTACTTTCACAGGAGGGATCTGAGAACGCTTGGCTTGGCAATCTGCTCAGCTGTGCCCATTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGAGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGATATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTGGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTGCCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,362 |
JF416962.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Ornithodoros savignyi
| null |
2009
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200905926, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCTTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCACATGATCGCCGGGACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGTTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGCGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCATGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGGAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAGGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAGGGGGGACTCAGTCAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTGGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAATCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGTTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACATTGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATTTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGACATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGATCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTATAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGTTTCGTTGAACTGCAGCTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTGGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTGGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGCTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAGTGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGGAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATTGAAGGGACTGGGGAGTGTCCACTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTGGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCACACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTCCTTCCAGTAAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGTCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCCTGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGGTGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGATTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTTGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGTGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCTATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTCTTCACTGGGCCGGCATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATCTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTATGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAACCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGAGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGATATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTGGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTGCCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCAAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,363 |
JF416963.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Ornithodoros savignyi
| null |
2009
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200905915, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCCTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGAACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGCTTCTCACATCAATCTTGCTAGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGAAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTTAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTTACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTTGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACAATGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATCTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGATATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGGTTTGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTAGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGTTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTTCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTATAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATCGAGGGGACTGGGGAGTGTCCACTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTAGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGTACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTTCTTCCAGTTAGCCTGGCTGGCCCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCATGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGTCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGATGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGAGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTCGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATTTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGTATTCTGATAGTATTGGCCATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATTTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTACGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCCATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,364 |
JF416964.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Ornithodoros savignyi
| null |
2009
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200905916, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCCTGGTGGGAAAGTGTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCATCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGAACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCTATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGTTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGATTCGGAAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTTAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTTGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACAATGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATCTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGATATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGGTTTGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTAGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCCACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGTTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATCGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTAGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTTCTTCCAGTTAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCGACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCATGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGATGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAGGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATTCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTCGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTTACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGTATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGGGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATTTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTACGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCGGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAACTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTTCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,365 |
JF416965.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Ornithodoros savignyi
| null |
2009
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200905919, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCCTGGTGGGAAAGTGTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCATCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGAACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCTATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGTTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGATTCGGAAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTTAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTTGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACAATGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATCTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGATATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGGTTTGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTAGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCCACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGTTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTGCTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATCGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTAGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTTCTTCCAGTTAGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCGACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCATGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGATGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAGGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATTCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTCGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTTACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGTATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGGGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATTTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTACGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCGGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATCTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAACTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTTCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,366 |
JF416966.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Ornithodoros savignyi
| null |
2009
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200905921, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCCTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGAGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGAACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGTTTCTCACATCAATCTTGCTGGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGAACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGAAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTTAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGATGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTACCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTCACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTTGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACAATGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCCAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATCTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCTGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGATATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAGTACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGGTTTGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTAGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACACTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGTTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTACTCAACTTGGCCCTCGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACCTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATCGAGGGGACTGGGGAGTGTCCGCTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTAGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTTCTTCCAGTTGGCCTGGCTGGACCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTTAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCTATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCATGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACCGGTCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAAGCTGTGATGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCCTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGGGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTCGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGTATTCTGATAGTATTGGCTATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATTTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTACGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCTATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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TTGACTGGGTCCCGCAGGGACGAACCACATGGAGCATCCACGCGAGTGGAGCGTGGATGACCACAGAGGACATGCTGGAAGTGTGGAATCGAGTCTGGATTCTTGACAATCCTTTTATGAGTGACAAAGGGAAAGTGAAGGAATGGAGGGACATCCCGTACCTCCCTAAGTCCCAGGATGGGTTGTGCTCTTCCCTGGTAGGACGCCGAGAACGGGCGGAATGGGCAAAGAACATTTGGGGATCAGTGGAGAAAGTGAGGAGGATGATCGGGCCCGAGAGGTATGCAGATTACCTGTCTTGCATGGACAGGCATGAGCTTCACTGGGACCTGAAGCTGGAAAGCAACATCATCTAGATGCACTAACCACCTGGAACTAGATAAGACAAACACCCTCACCGTGTGATAGGGGCAACACGGTAAGGATTGAAGGAGCCCCAACGACGAACTGTGGCAGCACACCATTTGGTGACGGGAAGCTGGTCGCTCCCGACGCAGGCCGTCGTAAGAACTTTGTGAGACCAAAGCCTCCCAGAGAGGGCCGAACTGGGAGGTTATGAAGGCCCCTGGCTTTGGCCAGGAGGGGGGAGAGGGAAAATTGGCATTCCCTCTCAGGAGATTTCCTCCCCCTACAACTAAATTTCCCCCTGCCATGCAGGGGGGGCGGTTCTTGTTCTCCCCGAACCATCATCACCAAGACACAGATTGTCAGACAAGGAGGTGGTGCATGTTTCGGAAAAAACATCCGCT
| 97,367 |
JF416967.1
|
Alkhumra hemorrhagic fever virus
|
Dodd,K.A., Bird,B.H., Khristova,M.L., Albarino,C.G., Carroll,S.A., Comer,J.A., Erickson,B.R., Rollin,P.E., Nichol,S.T.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Viral Special Pathogens Branch
|
USA
|
2012-03-22
| null |
Orthoflavivirus kyasanurense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,749 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Ornithodoros savignyi
| null |
2009
| null | null |
Alkhumra hemorrhagic fever virus strain 200905922, complete genome
|
GTTTCAGACAACGTGAGTGGCGCTTTGTTTGTATTTCCCTGGTGGGAAAGTTTTGAAGCGTTAACGTGTTGAGGAAAAGACAGCTTAGGAGAACAAGAGCTGGGGATGGCCAAAGGAGCCGTCCTTAAAGGAAAGGGGGGCGGTCCCCCTAGGCGAGTGCCGAAAGAGACCGCAAAAAAGACGCGTCAAGGACCAGGCCGATTGCCAAATGGACTGGTGTTGATGCGCATGATGGGAGTGTTGTGGCATATGATCGCCGGAACGGCCAGGAGTCCGATTCTCAAGCGATTCTGGGCGACAGTTCCGGTGCGGCAGGCCATCGCAGCGCTCCGCAAAATTAGAAAGACAGTTGGACTGCTATTGGACTCTCTAAACAGAAGAAGAGGGAAGAGAAGGTCAACCACTGGGTTTCTCACATCAATCCTGCTAGCCTGCCTGGCGACACTGGTGATCTCCGCGACAATTCGCAGAGAGAGGACAGGGGACATGGTGATCAGGGCAGAAGGAAAGGACGCTGCCACGCAAGTGGAAGTCGTGAATGGAACGTGCATCATTCTCGCCACAGACATGGGGAGTTGGTGTGATGATTCAATCATGTACGAGTGCGTCACTATTGACTCGGAAGAAGAACCAGTTGATGTGGACTGTTTCTGCAGGGGCGTCGAGCGGGTGTCCCTGGAATACGGGAGGTGTGGGAAGCCAGTTGGCGGCAGAAGCAGGAGGTCGGTGTCGATTCCAGTGCATGCTCATAGTGATCTTACCGGAAGAGGGCATAAGTGGCTTAAAGGGGACTCAGTTAAGACGCATCTGACACGTGTGGAAGGCTGGGTATGGAAGAATAAGCTCCTGACGCTGGCCTTTTGTGCAGTTGTGTGGATGGTCACAGATAGCTTGCCGACAAGGTTCATTGTCATAACAGTGGCCCTTTGTCTGGCTCCCACATATGCCACTCGGTGCACACACCTGCAGAACCGGGACTTTGTTTCAGGGATCCAAGGGACGACTAGAGTCTCATTGGTGTTGGAATTGGGTGGCTGTGTTACTCTCACGGCTGAAGGCAAACCATCCGTTGATGTCTGGCTCGATGACATACACCAGGAGAACCCGGCTAAGACACGAGAGTATTGTCTCCATGCCAAGCTGGCAAGCTCAAAGGTGGTCGCACGCTGCCCGGCCATGGGTCCGGCGACAATGCCAGAGGAGCATCAGGCGAGCACAGTCTGCAGACGAGACCAGAGTGATAGAGGATGGGGCAACCACTGTGGACTGTTTGGGAAGGGCAGCATTGTGGCTTGTGCCAAGTTTGCCTGTGAGGCTAAGAAGAAGGCAACCGGATATGTGTATGATGTCAATAAGATCACATATGTGGTGAAAGTGGAACCCCACACGGGTGACTATCTGGCAGCTAATGAGTCCCACAGCAATCGAAAAACGGCATCTTTTACAACGCAGTCCGAGAAGACCATCTTGACACTGGGAGATTATGGAGATATCTCTCTCACGTGCCGGGTGACTAGTGGAGTGGATCCTGCCCAAACTGTGGTATTGGAACTGGACAAGACAGCGGAACACTTGCCCAAGGCTTGGCAGGTGCACCGAGACTGGTTTGAAGACCTCTCCTTGCCATGGCGACACGAGGGCGCCCATGAATGGAACCACGCTGACCGGCTCGTGGAATTTGGTGAACCGCATGCTGTGAAAATGGATATTTTTAACCTTGGAGACCAGACTGGCATCCTGTTGAAGTCTCTGGCTGGAGTGCCCGTGGCCAACATAGAGGGCAGTAAATACCATCTCCAGAGTGGTCATGTCACCTGTGATGTGGGCCTTGAAAAACTCAAGATGAAAGGAATGACATACACGGTCTGTGAGGGATCAAAGTTTGCTTGGAAGAGGCCGCCAACCGACAGTGGGCATGACACTGTGGTCATGGAAGTGACTTACACTGGGAGCAAGCCATGCAGAATACCAGTGAGAGCCGTGGCCCATGGAGAACCTAATGTCAATGTAGCTAGCCTGATAACTCCAAATCCATCCATGGAGACAACTGGAGGAGGGTTTGTTGAACTGCAACTGCCACCAGGAGACAACATCATCTATGTTGGTGAGCTGAGTCACCAGTGGTTTCAGAAGGGTAGTACAATAGGCCGTGTTCTGGAAAAGACCAGGAGGGGCATAGAGAGACTCACAGTGGTGGGAGAGCACGCTTGGGACTTTGGTTCGGTGGGTGGTGTGCTGTCATCAGTGGGGAAGGCTCTGCACACAGCTTTTGGTGCAGCATTTAACACCATTTTTGGAGGAGTAGGATTTCTCCCACGTATTCTGTTGGGGGTGGCTCTGGCTTGGCTGGGGCTCAACTCACGGAACCCTACCCTCTCAGTCGGGTTTTTGATCACTGGTGGACTTGTGTTAACAATGACATTGGGGGTTGGTGCCGACATGGGCTGTGCAATTGATGCCAACAGGATGGAGCTACGTTGTGGTGAGGGCCTTGTTGTGTGGAGAGAGGTCACTGATTGGTATGATGGTTATGCATTCCACCCAGAATCGCCCCCTGTTCTTGCGGCATCTCTAAAGGAAGCATATGAGGAGGGAGTCTGTGGGATTGTGCCCCAGAACCGGCTTGAGATGGCCATGTGGAGACGTGTGGAGGCTGTACTCAACTTGGCCCTTGCAGAGAATGATGCCAACCTCACGGTGGTTGTGGATAGAAGGGATCCTAGTGACTACAGGGGAGGCAAAGTGGGGATCTTAAAGCGGTCAGGCAAGGAGATGAAGACTTCATGGAAGGGATGGAGCCAATCCTTTGTGTGGAGTGTCCCAGAATCGCCACGGCGTTTTATGGTTGGGATCGAGGGGACTGGGGAGTGTCCACTTGATAAACGCCGAACAGGAGTCTTCACGGTAGCAGAGTTTGGGATGGGAATGAGGACCAAGATCTTCTTGGATCTACGGGAGACTAGTTCTTCAGACTGTGACACCGGAGTCATGGGGGCTGCAGTCAAGAGCGGTCATGCCGTCCACACCGATCAGAGTCTCTGGATGAAGTCGCACAGGAACGCAACGGGAGTGTTCATATCAGAACTGATAGTGACCGACTTACGGAACTGCACATGGCCAGCCAGTCACACCCTGGACAATGCCGGTGTCGTTGATTCAAAACTCTTTCTTCCAGTTAGCCTGGCTGGCCCACGGTCGCATTACAATCACATTCCTGGGTATGCAGAACAGGTTAGGGGACCGTGGAACCAAACACCCCTACGGGTGGTCAGAGAACCCTGCCCTGGGACCACAGTCAAGATTGACCAGAATTGTGACAAAAGGGGGTCGTCGTTGCGTAGCACGACAGAAAGCGGGAAGGCCATACCAGAATGGTGCTGCCGCACATGTGAGCTGCCTCCGGTCACATTCCGTAGTGGGACCGATTGCTGGTACGCCATGGAAATCAGACCAGTCCACCAACAGGGTGGTCTGGTGAGGTCGATGGTGCTGGCTGACAACGGAGCCATGTTAAGTGAAGGTGGAGTCCCTGGCATTGTGGCCGTATTCGTGGTCCTGGAGCTAGTCATTAGGAGACGCCCAACAACTGGCACCTCAGTGGTGTGGTGTGGAGTGGTCGTTCTTGGCCTAGTCGTAACTGGGCTAGTCACCATTGAAGGCCTGTGCCGTTATGTGGTGGCTGTCGGCATCTTGATGAGCATGGAACTTGGACCAGAGATTGTGGCACTAGTCATGCTGCAGGCGGTGTTTGACATGAGGACTGGCCTCCTTGTGGCTTTCGCAGTTAAAAGGGCCTACACAACTAGAGAGGCTGTGATGACCTATTTCTTGCTCCTCGTGCTGGAGCTTGGGTTTCCAGAGGCCTCACTGAGCAACATTTGGAAGTGGGCTGACTCCTTGGCAATGGGAACATTGATTCTACAGGCGTGCAGTCAAGAGGGCAGAGCCCGAGTGGGCTATCTCCTGGCAGCTATGATGACCCAAAAGGACATGGCCATAATCCACACAGGCTTGACCATTTTTCTATCAGCCGCCACGGCAATGGCGGTCTGGAGCATGATCAAGGGTCAACGAGACCAGAAGGGACTGTCCTGGGCCACACCACTTGTAGGCCTCTTCGGAGGCGAAGGTGTGGGTCTTAGACTGCTGGCGTTTCGAAGGCTCGCAGAGCGAAGGAACAGACGGTCTTTCAGTGAACCACTAACAGTGGTGGGCGTCATGCTCACTGTGGCAAGTGGGATGGTGAGACACACATCCCAGGAGGCTCTGTGCGCTCTTGTGGCTGGGGCCTTTCTCCTCCTCATGATGGTGCTGGGAACACGGAAGATGCAGCTCATCGCAGAATGGTGCGGTGAAGTGGAATGGAACCCAGACCTAGTGAATGAGGGGGGAGAGGTCAATCTGAAAGTGAGGCAGGACGCCATGGGGAATCTCCATCTCACTGAGGTGGAGAAGGAAGAACGCGCGATGGCGTTATGGCTTCTTGCAGGGTTGGTGGCTTCAGCTTTTCACTGGGCCGGTATTCTGATAGTATTGGCCATATGGACATTCTTTGAGATGCTGAGCTCGGGGCGAAGGTCTGAACTTGTCTTCTCTGGACAGGGGACCCGGACCGAAAGGAATCGGCCTTTTGAGATCAAGGATGGAGCCTACCGCATCTACAGTCCTGGTTTGCTGTGGGGACATCGCCAGATTGGAGTGGGGTATGGAGCCAAGGGAGTCCTGCACACCATGTGGCACGTCACAAGGGGAGCAGCCCTGGTTGTGGAAGAGGCAATTTCCGGACCCTATTGGGCTGACGTCAGGGAAGATGTTGTATGCTACGGTGGAGCATGGAGCCTTGAGAGCCGGTGGAGGGGTGAGACCGTCCAGGTGCACGCATTTCCACCAGGGAGACCCCAAGAGACACACCAATGTCAGCCGGGAGAACTCATCCTGGAGAATGGTAGGAAACTTGGAGCAGTTCCCATTGACCTGAGCAAAGGTACCTCGGGAAGTCC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| 97,368 |
NC_054003.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
O'Dea,M., Prada,D., Jackson,B., Boyd,V., Baker,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
WA1087
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,170 |
RefSeq
| null |
Australia
|
Australia
| null | null |
2018
| null |
PRJNA485481
|
Alphacoronavirus sp. isolate WA1087, complete genome
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| 283 |
NC_076684.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
O'Dea,M., Prada,D., Jackson,B., Boyd,V., Baker,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
WA2028
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,435 |
RefSeq
| null |
Australia
|
Australia
| null | null |
2018
| null |
PRJNA485481
|
Alphacoronavirus sp. isolate WA2028, complete genome
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| 598 |
NC_076685.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
O'Dea,M., Prada,D., Jackson,B., Boyd,V., Baker,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
WA3607
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,009 |
RefSeq
| null |
Australia
|
Australia
| null | null |
2018
| null |
PRJNA485481
|
Alphacoronavirus sp. isolate WA3607, complete genome
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TGCTTACCGCTATAAAACACCTCTGTTTATTATCTTAAACACCTCACTACTGGCATTCATTAATGGCAAAGGTTGGTATTATGACCGTCAGCCATTTATGGTGCTGTCAGGTGGTGAACACTTCGTTAACTTTGGCATACACATTGTGCCTTTTGTTGTATCGAAGGACTTGTACGTAGCTATTAGAGGTCTCCATGACGAAGACCTTTGTTTAGTACGTTGTGTGGAACTTATTAATGGTTCCTTCTTTTACATCTTCGCACGCGATCCCGTCGTTGGTGTTGTAAATATGAATTTCACTGAAATTCAACTGTACGAAGATGTTGCTTCGCTTGGTTAATGACAATGGAATTGTCATTAACGTCATTCTTTGGTTGTTTGTTTTGTTGTTTGTGCTTATCATTTGTATCACATTTATACAGCTGATTCAACTGTGCATTTCTTGTCACAGGTTTGTCAGTAGTACTGTGTACATACCAGCATATAAGGCATACAAACTGTACCAAAATTATATGCAAATAACGCCCTTGCCCGTCATTGATGTATAAACTACAACGATGTCGAACAATACCATTCCAGTAGAAGAGGTGGTTCACCACCTAAGAAACTGGAATTTCAGTTGGAACGTCATTTTGACGATCTTTCTGATTGTTTTACAGTATGGCCAGTACAAGTATAGTAAAGTTCTTTATGGCCTTAAAATGCTTGTGCTCTGGTTGCTGTGGCCACTAGTGCTCGCATTGTCAATTTTTGACAGTTGGGCTTCCTTTGGCGTGAACTGGACGTTCTTTGCATTCAGCATCCTTATGTCCTGCATAACACTGCTGCTGTGGATAATGTATTTTGTCAACAGCTTCAGATTGTATCGCAGAACACAAACGTTCTGGGCATTTAACCCAGAAACTGATGCCATTATATCGCTCTCTGTTTTTGGCCGAAATGTTTCGATCCCTATAATTACAGCCCCGACAGGCATCACGTTGACCGTTCTTAGTGGTACTCTCCTTGTGGAGGGCATTAAGGTTGCTACTGGTGTGTTGGTAAATCAATTACCATCATACGTAACAGTTGCCAAACCTGGGACCACGATAGTCTATCAACGTGCAGGCAGATCGCTTAATGCAAAATCCAACACTGGTTGGGCTTTTTATGTCAGATCGAAAAACGGCGACTACTCTGCTGTGGCTAGTCCTAGTGACGTGCTTACAGAAGGTGAGAGAGTGTTACATCTTGTTTAAACTAAACAAATGGCTTCAGTCAGTTTCGAGAAGAGCCGTGGTCGCTCCGGTCGAGTACCTCTTTCATTTTATGCCCCTATCATTGTAGAGGGTGACAAACCTCTTTGGAAGGTTTTGCCAGCTAATGCAGTGCCAACGGGCAAGGGAAACAAAAATCAGCAAATTGGTTACTGGAATGAACAACCTCGCTGGCGCATGGTGAAAGGCAGGCGTGTAGAGTTGCCGTCCAAATGGCACTTCTACTACCTTGGAACCGGACCCCATGCTGATCAGACATTCAGAACTCGCACTGATGGTGTGTTCTGGGTTGCTGTACAAGGTTCTAAAACCGAACCTACTGGTCTTGGTACACGGAAACGTAACCAGGAAACAGTCACTCCAAATTTTGGTGTGAAGCTGCCAGCGAATATTCAAATTCAGCAAAATTCCAGCAGTCCCAACTCCCGTGCTTCGTCGAGGTCAAACTCGCGCGGTGCAAGTGTTGGACGTAACCAGCAAAATAACAACTCCCGGAGCAATTCCAGAAATAATTCTCGTAACCCTTCTAATAACAGAGGTGGTACTCTCCTCAACTCTCAGAACAATTCACGTGATCCCTCTCGCAACAGAGGTCAGCAGAATCAGAAGAAAAACAATAACAGTGGCAACACATCGCAAGATGACCTTGTTGCTGCCGTTAAGCAAGCTCTATTGGGACTCGGTTTTTCCGACCAAACCCAAAATAAGAGCAAGTCAAACCAAAATAAAAGTGGGAGCCAAACCCCAAAAGAGCAACGCTCAAAATCTCCAGCCAGACAGTCCCAGCCTGCAAAGCGCCAAACAGAAAGGCCTGAGTGGAAGCGTGTCCCGAACAAGTCTAATAGCGTCACAGCATGCTTCGGTCCGCGTGATGCTGCCAGAAACTTCGGTAATGCTTCCCTCATATCAGAGGGTGTGGATTCAAAACACTACCCTCAGCTTGCAGAACTTGTACCAACCCCAGCAGCATTGCTGTTTGGGAGTAGGATCACAACAAGAGAGCTGTCTGATGAAGTGGAACTCCACTTCCACTACAAGATGAACGTACCAAAGTCAGACAAGTCGCTGCCGCCATTTTTGGCACAGGTTAATGCTTATGAAGGAGCTTCGGATGTTAGTGCAGAGACTATTGTCAATGCCATGTCTGAGACCCCTGAGTTCACATTCAACCCTGCAGCGCCAGAGTTCGCCCCCATGAGTGGTGTGGACGATGACGTTCATATTGAGATTATTGATCAGGTTTTTGACAGCACAGATGCGTAATCATCTAAACATCATGGATGACTGGTGGCTCATGCATTACTGGTATGTCCTATTGATGATTTTTTCAGATTGCATTCTTATGCTGCTTCATGGCATTGCCACTTTTACTTTTTGGTCTGTAATTTTCCTTACCATTATTATCAGCTTACCTGTGTTTGCAGACTTTATAATGGTTAATGGATATGAAAGAGTCATGCTCTACTATCGTGCTTTGCACGATTTTTATGTCAGACTCATGTTTATGTAATAACCACCCAATCCTTGTGGTTGTTTGGTGGTACTCTTATACAGAATGGTAAGCCTGTAGTTATGTTAGTATAAGTAGAATATAGCTATATTACTGCCCTTAGATGAAACGGAATCCAACCATAGATCGCAGAGTCAGAGTACTTAAAGATCCGCTTGACGAGCCTATATGGAAGAGCTGTCATGTGACTATGAATTGGACCCTTAGTAATTGCTAGTAGGTTCGGTTTTGATGAGGATACAC
| 599 |
OK017907.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Zhu,W., Huang,Y., Gong,J., Dong,L., Yu,X., Chen,H., Li,D., Zhou,L., Yang,J., Lu,S., Xu,J.
|
National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention
|
China
|
2023-05-05
|
CD30
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,151 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Chiroptera
|
feces
|
2021-03
| null | null |
Alphacoronavirus sp. isolate CD30, complete genome
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| 16,154 |
OQ405400.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Mols,V.C., Lamers,M.M., Leijten,L.M.E., Breugem,T.I., van de Bildt,M.W.G., van den Doel,P.B., Lina,P.H.C., Koopmans,M.P.G., Haagmans,B.L., Kuiken,T., Begeman,L., Oude Munnink,B.B., van der Linden,A., van de bildt,M.W.G.
|
Erasmus MC, Viroscience
|
Netherlands
|
2023-02-21
|
AlphaCoV/P.nathusii/NL/2018-403.3
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,588 |
GenBank
| null |
Netherlands
|
Netherlands
|
Pipistrellus nathusii
|
feces
|
2018
| null | null |
UNVERIFIED: Alphacoronavirus sp. isolate AlphaCoV/P.nathusii/NL/2018-403.3, complete genome
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| 18,170 |
OK287352.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Xia,X., Wang,B., Huang,B., Fan,Y., Huang,X., Qu,L., Hou,Y., Wang,R.
|
Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology
|
China
|
2022-08-20
|
Yunnan/Hp_JC8xc/2020
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,435 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Hipposideros pomona
|
abdominal cavity
|
2020-05
| null | null |
Alphacoronavirus sp. isolate Yunnan/Hp_JC8xc/2020, complete genome
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| 26,706 |
OK287353.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Xia,X., Wang,B., Huang,B., Fan,Y., Huang,X., Qu,L., Hou,Y., Wang,R.
|
Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology
|
China
|
2022-08-20
|
Yunnan_Rs_CX18c_2020
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,974 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Rhinolophus sinicus
|
feces, abdominal cavity
|
2020-10
| null | null |
Alphacoronavirus sp. isolate Yunnan_Rs_CX18c_2020, complete genome
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| 26,707 |
ON378803.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Lo,V.T., Kim,H.K.
|
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Bionanotechnology Research Center
|
South Korea
|
2022-05-23
|
BatCoV_B20-97
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,162 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Rhinolophus ferrumequinum
|
feces
|
2020-09-29
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SAMN27963145
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PRJNA833201
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MAG: Alphacoronavirus sp. isolate BatCoV_B20-97, complete genome
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| 30,655 |
ON378804.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Lo,V.T., Kim,H.K.
|
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Bionanotechnology Research Center
|
South Korea
|
2022-05-23
|
BatCoV_B20-104-1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,159 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Myotis petax
|
feces
|
2020-05-18
|
SAMN27963146
|
PRJNA833201
|
MAG: Alphacoronavirus sp. isolate BatCoV_B20-104-1, complete genome
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| 30,656 |
ON378805.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Lo,V.T., Kim,H.K.
|
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Bionanotechnology Research Center
|
South Korea
|
2022-05-23
|
BatCoV_B20-104-2
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,836 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Myotis petax
|
feces
|
2020-05-18
|
SAMN27963146
|
PRJNA833201
|
MAG: Alphacoronavirus sp. isolate BatCoV_B20-104-2, complete genome
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AACTAACGAATAGCAATGGTGCTAAAAGTTGTTGAGGACAATGGCCTTATTGTTAACGCGATTATCTGGCTCTTGATTTTAGTTTTTGTACTACTTATTTGTATTACCATTTTAAAGGTTATACAATTGTGTTTTGCATGTCACCAGTTTGCAGACAGAACGCTTTATACACCTGCCTATGGTATTTATAAGATGTACAAAAATTATATGCGGATTACGCCCTTACCACCTATTTATGATGTTTAAACTAAAACGATGGCTGATAATTCATCCATCCCCGTAGGGGAGGTTTTAGAACATCTTCGTAATTGGAGCTTTGCATGGAACATAGTTCTTACTGTGTTGATTGTGCTGCTCCAGTACGGTAATTTTAAGTACAGCAAAGTCCTTTATGGACTTAAAATGCTTGTACTTTGGCTGCTTTGGCCCCTGGTGATAGCTTTGTCTATCACCAATGCATGGGCTGACTTCAACCAGAATTGGGCGTATTTCGGCATTAGCATCTTAATGCTAGTCATAACACTAGTCCTCTGGATCATGTACTTTGCAGCAAGCATCAGGCTGTACCGCAGAACACGCACGTTCTGGGCTTTCAATCCTGAAACAGACGCAATCATCGTCTTCTCTGTCTATGGCAAGTCATACTCCATTCCTGTCCTGCAGGCTCCGACTGGTATCACTCTCACAGTGCTTAGTGGCACTCTTTTGGTTGACGGCATTAAGATTGCTACTGGTGTGCGCATTGAAGCGCTACCGCAGTATATCACCGTTGCCAAGGCCACTACCACCATCATCTACCACAGAGTTGGTAAAGCTGTGAATGAGAAGACCCAGACTGGCTGGCTGTTCTATGTCAGAACTAAGCACGGTGATTACGCTGCTCATTCGACTGGAACCGGACAGATGACAGAGAATGAAAAATTGCTGCATTTAGTTTAAACTAAACAATGAGCTCTGTCAGTTTTGAATCTTCAAAACGCAGTGGTAGAGTTCCTTTGTCCTTTTACTCTCCTTTAGTGATAACCTCAGACAAGAAATTTTGGAACGTTCTCCCTAAAAATGCAGTCCCAACCGGAAAAGGCAAAGCGGCCCAGCAAGTTGGATACTGGAATGAACAGCCCCGCTGGCGAATGCAAAAAGGCCAGCGGGTGGAGAAACCTTCTTTCTGGCACTTCTACTACCTTGGTACCGGCCCTCACGCTGATGCCAAGTTTAGAGAACGCATCCAAGGTGTGGTGTGGGTTAGCAAGGCGAATGCTGACCTTAAACCGACTGAACTTGGAACCAGACCTAAGACTAGAAATCCTAGTGTTCCAAAATTTGACTCTCAGCTCCCTGCAGACATTGAGGTGGTTGACAAGTCCTCTCAGCCACCTTCAAGGTCCGCTTCGCGTGGGCAGAGCCGAAGTAGAAGCGGCGGTTCAAAGAATCGAGCGGACTCCGGCAATCAGTCACGTGACAATTCCAACAACAGAGGAGCATCTCAATCTCGTAATAACTCACGCAGACGCGGTCAACAGCGTAATAATGACCAGCAACGCCAACGCGCTGGTAACTCAAGTAATAACACTGCTGACCTCGCTGCCGCCATTGTGCTGGCCCTTGAAAAAGCTGGCCTTACGAGAGAGTCTGAGAAGGCTCCTAAGAAGGAGAGTTCTAATAATAATAAAAAATCAAAGTCCAGAGCAAGTTCTCCTGCTGCAGCTCAGTCCAAAGGACAAGATCAGCTAGGCAAGGTCGTGTGGAAACGCACGCCCGAGCCTGGCTGTGATGTCGAACAATGCTTTGGACCAAGATCTCAGCATCAAAACTTTGGTGACCAGGATGCCGTGCAAAATGGCATTCGTTCAAAACACTTCCCGTCATGGACAGAGCTGGTGCCCAACGCTGCTGCAATGCTGTTTGGCAGTGAAATCGTAACTGTTGAGGATGGTGACGACGTCATCATCAATTACAACCATTCAGTGCGTGTGCCAAAGTCTAACCCGGCACTCGCCATCTTCCTGCCACAAGTCAGTGCTTATGCTCAACCCGCAGTTGACACTGTGGAGCTTGAGGATGAGGAACAACCGACAACCAGTGCCGCAGCAACCCAGCTTAATCCTAAGGCAGAAACCTTCGTCCCACCCCGTGTAGACCCTAGCTACTTTAAGGGTATGAAGGTTGAAATCATGAACAAGACTGTAACAGATGACAGTACAGCATAAACGATGTTTCTGTATCTGTTTGCACTTCTTGGACCTATTGCTTATTGTATTTTGCAGTACTTTCAGGCTATAATCAGAGCCTACAACTATTGTAGTCTACTGCCTGATGACGTTGTCAACAACCCTCTTTTTGTTGACTACGCCATTGGTGGGCAAACCTTGTGCTTGCTCACACATCAGGATTTCCTCTATCCTATGTTCCTTCTCACTTTTGTGATTATACCGTTTGCTCTTTGCTGCACTTACGGCTTTGAACTTTGGGAGGAATACTCCTTTTTCTTGCGGCGCCTACACAGCCTTTTCATTCGTGCATTGGTTGAGTTCTGCGCCGTTGCTTGCTTTATACTAGCTTTGCTTCTGATTGTGACATGGTCGTTGGGCCACCGTTTTTGGTGACTAGCGGCCTAGTCTTGCACACAATGGTAAGCCAGTAGTAATGTCAGTGCAAGAAGGATATTACTATATCACTATGTGTAGGTGAAACTCTTTCTTTTACATCTAAGTCAGATCACGAGTGCCCAAAGATCGCGTGACGAGCCCACTAGGATATGTCCTAGGGGAAGAGCGTGAATGACATTTGTCTTAGATTGATTAGTAACCAAAGATCATATAGTGTTGATATGGATACT
| 30,657 |
ON378806.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Lo,V.T., Kim,H.K.
|
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Bionanotechnology Research Center
|
South Korea
|
2022-05-23
|
BatCoV_20-177
|
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,187 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Myotis macrodactylus
|
feces
|
2020-09-21
|
SAMN27963147
|
PRJNA833201
|
MAG: Alphacoronavirus sp. isolate BatCoV_20-177, complete genome
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| 30,658 |
MZ081383.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
|
Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
|
China
|
2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,019 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Chaerephon plicatus
|
feces
|
2019-07-11
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/CpYN11/2019, complete genome
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CTATAAGACTTGCCTCTTTGTCATTCTGAATGCCACTACATTAGCATTCATTGAAGGAAAGGGCTGGTATTATACCAATGAACCATTCCTTGTTCTTTCTGGAGGTGAGCATTTTGTTAATTTTGGCATTCACATGATTCCTTTCGTGGTGTCAAAAGATCTCTACGTCGCTATCCGAGGTGCACGTGACGAGGACTTGTGCCTTGTTAGGTGTGTTGAGCTTATTAGCGGCGCATTCTTCTACATTTTCGCTAGAGAACCTGTTGTAGGTGTCGTCAATATGAGCTTCACTGAAATACAACTCTACGAAGATGTTACAACTGATTGATGACCATGGTTTTGTCCTCAATCTCGTAATATGGTTAATGATATGTTGTGCTGTTATTGTGATTTGCAATGCTGTTATACAGACTGTGCAGTTGATTTTCACCTGCCACAGGTTTTGTAGCAGTACTGTTTACACACCTGTTATAGCAGTATACCGTGTCTACCAGAATTACATGCGAATTGACCCATTGCCTGTTATTGACGTCTAAACGAATTAGAATGTCAAGTGGTGACAGTAATAACCAGACCGTCCCTATGGACGAGGTGATTACTCACCTTCGCAACTGGAATTTCAGTTGGAATATTATTCTAACTGTTTTCCTGATTGTGCTGCAATATGGGCACTATAAGTACAGCAAGTTCCTTTATGGTCTTAAGATGACCATTCTGTGGCTGCTGTGGCCTCTTGTGCTTGCCCTTTCCATCTTTGATGCATGGGCTAGCTTTGGCGTAAATTGGGTCTTCTTCGCTTTTAGCATCTTAATGGCCTGTATCACATTGATACTGTGGATAATGTATTTTGTCAACAGTTTCAGGTTGTACCGCCGAACACAGACTTTCTGGGCTTTTAACCCAGAAACTGATGCCATCATTTCGCTCTCCGTCTTCGGGCGCCCCGTTGCGATTCCTGTTTTGACAGCCCCTACTGGCATCACGTTGACCGTTCTAAGTGGAAACCTCCTTGTGGAGGGCATTAAGGTTGCTTCTGGTGTGTTGGTAAATCAATTACCTTCATACGTAACAGTCGCCAAAGCCGGTACCACTATAGTTTACCAGCGTGCTGGACGGTCATTGAATGCCAGATCTAACACTGGTTGGGCTTTCTATGTCAGATCGAAAAACGGTGACTACTCAGCTGTGACAAGTCCAAGTGACGTGCTCACAGAGAGTGAGAGAGTGCTTCATTTAGTATAAACTAAACAAGATGGCTTCCGTCAGTTTTGAACAACGTGGCCGCACTGGACGAGTTCCTCTCTCCTACTATGCTCCTCTTATGGTCAATAACAGCCAGCCCTTTTGGAAAGCACTCCCTCAGAATGCTGTCCCTCAGGGAATGGGCAACAAGGACCAACAAATTGGCTACTGGAATGAACAGGTTCGTTGGCGCACCCAGAAGGGCAAGCGTGTCGACCTTGCTTCCAAGTGGCACTTCTATTATCTTGGCACTGGACCTCATGCAGACAAATCCTTCAGGACTAAGACTGCCGGTGTGTACTGGGTAGCTGTTCAAGGTTCCAAGACTGAGAACACCAACCTGGGCACTCGTAAGCGCAATCAGCCTGTCAAGGAACCCAAGTTTGCTTTCCAGCTGCCAAATAATGTGCAAGTTGAAATGCCTACCTCTGCTCCTAACTCCCGTTCCAATTCTCGGAGCCAGAGCAACAACAGGAGCCAAAGCCGTGATAAGAGCAACAACCGGTCTCAGAGCTCCAACAGGAATCAGAGCCGGTCTAACTCTAACACGAGGAGCAATCAGAACCAAAATAACAACAACAACAACCGTGGTGGCAATCGTTCCAATTCAAAGAACAGGAACCAAAGCCGAAATAATTCAAAGTCAAGAGATAATTCCCAGAACAGGAACAACAACAGGACATCCAACAAAGATGACCTTGTTGCTGCTGTTCGCGAAGCTCTTATGGGACTCGGTATTCAATCGAACCGGGGAGGATCTAAGGCTTCTGGCAGAAATACGCCCAAGCAACAGCGGTCTAAGTCTCCTGCAAGACCTTCACAGTCACCAAAGAGACAATCAGACCGACCAGAATGGAAGCGAGTACCGAACACTGGCCATAACGTTACGGCATGCTTCGGACCGCGCGATGAGTCCCGTAACTTCGGAGATTCTCATCTGATCAAAGAGGGTGTTGATTCCAAAATGTACCCACAGATTGCAGAACTGGTTCCAACTCCAGCTGCACTGCTGTTTGGTAGCAAGGTGTCTGTTCGTGAGACGCCCAATGACTTTGAAATCAAATTTCACTACAAAATGCATGTGCCCAAAACCGACAAGGCACTTGCTGCTTTCCTGCCCCAGGTTGATGCTTACATCAAAGGTGATCCTGAACCTGCTGCTGTTGAGACCACTCTCAACCCAAATGCACCTGTATTCGACCCACTTGCTGGTGTTGATGACAGTGAAGAGCAGATCGAGATCATTGACCAGGTTTTGGATTTCGATGCGCCAGGTTCTTCTGATGTGTGATCAACTAAATCACTATGGACCTTGTGCTGATGGAAATCTGGTATTTCATTGGTATCTGCTGTGTTGACATCTTGCTGTGTCTAACTGTAGGTTTTAACCTCTTCACCTTTGTATTTGCTGTTATTGGAGCTATTATAATCAGTGCACATGCCGATCTCCTGATTGAGAATGGTTTTGAACGGGTCATGGAATACTATCGTGCTAGCCACGACAAATTTGTTCAATTGATGTTTCTTTAATGCAATACTCACCCAATCCTTAGCGGTTGTTTGGTGACTACTCTTATACAGAATGGTAAGCCTGTAGTTATGTTAGTATAAGTAGAACATACTATGTTACTGCCCTTAGCTGAACTGAGTAACCTTTTACAGCTCTTAGAGTCAGCGTAATCAAAGATCCGCTTGACGAGCCTATATGGAAGAGCTGTCATAAGACTGTAATCAAGGCCTCATAGTATAGTGAAGATAGGTGTGGTTTCGATGGGGA
| 41,361 |
MZ081384.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
|
Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
|
China
|
2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,203 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Hipposideros cineraceus
|
feces
|
2020-07-29
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/HcYN26/2020, complete genome
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Alphacoronavirus sp.
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Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
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Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
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China
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2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,201 |
GenBank
| 1 |
China
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China
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Myotis muricola
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feces
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2020-04-18
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/MmYN16/2020, complete genome
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ATCTTTCTGTAGAAAGACAGTGTCTTTTCTAGACCTCGCGTCTCATCCCCTCAACTAAACGAAATTTTTCTCTCCGTCCACATGGCTAGTGTGGCGTGAGAAGTAATTGAAATTTCAACAGATTGCCTAAGTGTGGGTTCAAGTGTTGTGTGCCCTGGTGTTCCTGGTTAGGTGTTCCGTCACCAACCATACACCACAAGCACCCTCTGATAGTTCTGTCTGTCGGAGTGAGTGAATACCAAGTTTTGTCTTGGTTGAAACCAATAACTGACCCTCATGGCTTGCAATCATATTTCTCTGGCATTTGCCAGCGATTCAGAGATTTCAGCTATTGGCTTTGGCACCGTCGAAGAGGCCGTCTCATTTTATAGTGAGTCCGCTGTTGATGGTTTTGCCAATTGCCGATTTGTCGCTGCGGGTCTTCAGGATATCGTCACTGGTGTCCTTGAAGACGAGTTTGTTATGTGTGTCACTGGCATACATCAACTCACAGCCCGTATCGGCAAATTTGGTGACCGCCCTCGTAATTTAAGAGGTTGGTTGCTGTTCTCTAACTCTAATTACTTTCTTGGGGAGTTAGAACTTGTCTTTGGAGGTCGTGGTGGTTCTACGATCTATGTAGACAACTTTATGTGTGGTGCCAATGGACAACCCGTTTTATCGGATGATAAATGGGAGTTCAAGGATTACTTTGGTGAATTAACTGAGGTACTCATTGATGGTGTCACATATGTTAAGGCCTGGAACGTTGATCGTGCTGATGGCCCATATTCAAGTCAAACCTTGGTGTCTATTAATGCTATAACATGGTGTGGAAATATCCCACATACTTTGCCTGATGGTACTACAACGGCTGTTGCACCTAGTGTTCATAAGAGTAAGACTGTGGTGCTTGATAAGTACTACACTAAGCTTTATGAAGCTGTGGGTGTGCCCTTTGTGCATAATGGCAGTTGTCTTAAGGATGTACTTACTAAACCTGTTTTTCTACATGCCCTTGTAAAGTGTCATTGTGGTACCACCAGTTGGACTGTTGGTGATTGGAGTTGTTACAAATCCACGTGTTGTGGCGTTGTATGTAAACCCATCTGTACGTCCAGTGGTAATGTGGAGCCTGGTGATGTTGTTGTTACTAGTAACAAAGTGTCACCTTCTGGTGTCAAATACTACAATGGCATGGTTCTTAAGTTTGTTGACACCTTGGATGGTTTTCATTTGTGGCGTGTTATTAAACTTCAGAGTGTCAAGAATTTTGTGGCCTCGGCTAATTACAATCCTGAAGAATACACGTATCTTTCTGACCACATTTGCAGTCCCACTAATATGCTGGAAGTTGCCTTCTGCTTTAAGTTGGGTATGCTTAATGGTGTGTTTACTGAAGAAGTTAAGTTGGCTGTGCTTGCTGGTAATATTACAGTTAGCAATTGCATTCTCGATCTTACAGACATTATAATGAGCAAACCATGGTTTGTTCGTAAACTGGAAGAGTTGATCGGTTCTGCATGGGACACATTTGTGACTGGTATAAAGTGTTTAATCTACACCAGTGGGCAACTCTTGGAGCTTGTTAAATCATTTACACAGGCGACGTTGACTGCTACTAGGGATAGCATCTGTTTTGATGCTACGGTACCAGACTGTTTTAAGGGTTGCTTTGATGTGTTCAAAGATTTTGTTAATTGTGTTTTTGACCTTACTGTTAGTACTTTGACAATTGCAGGTAACAGTTTTAAGCGTGTTGGCTCGTATGTTTTACTAGACAATGCGCTTGTGAAGCTTGTGTCCGTTAAGGTTAAAGGGTTGCGTCAAGCTGGTATCAATAAAACACAGTATGCCGTATCCGTGGTGGGTAAGACCAGTAAAGTTAAGTCAAAGAGGCTTGAGTCATCTGACGCCAACTTGGTGTTGGTTGAGACTGCAGTCCCGTTAGTTAAAGAAGGTGTTTCTAAGATTATAGGAGGTTTGTCATTCTTTTGTAGTGGTGGTCACTATAGATTGATGAGTGACTGTGACACAGTTCTTAATGAGCCAGTTTTCTGTGCTGCTAAGAACTGCACACCTGTGTTTGAGTGTGCCGTACCTAAGGGTTTTGCTCCTCCTGTGGCAACTAATGTTGCTGATTTAGTCACTGCTACAGTTACACAGCTGCTTAAGCTCAACACACCATACAAAGTTTATGATGTTAAAGTTGTTAATGAGCAGTGTGTGGTTACTTGTAATTACTCTTTTAGAGCACCTTCTTATATTGCAGATTCGGATGCTTTTGTTAAGGCTTGTATTGATTGTGTTGACAAGGATGGCTTTGATTCATTCTATGTTAATGCCCATAGTGCGAGTGCCTTAATTGCATTTGAGCCATGTTTTCCAAATTTTGAACAATTTTTACAGCCTGTGTCATGTCCGCCACTGTTAGAGGATGTGGATGGTGGCACTATATGGACTTCTTTCATTAAGACTGTTTGTAATGCTGCAGATTTTGCAAAGTCTCTTGTTGTTAGTTTTGACTTTGGTGGCATTGTCATTAAGACTACAAAGCGTTTCAAGCGATTTGCTGCTGCACTTACAAATCTATACAGGGAGTTCATAGCCACTGTTACTAAACACATTAAAATAGGTGGTGTGACTTTTGCTTATTATGCCTTTACAGTGCCAAAAATCTTTGTTTCTGGTGTTTTGCACAATGTCAGGCGTGTTGATGCTCGATCCCTTGGTATGTCTATTGAAGACATATTGGTGGAGTTCAATGTTTTCGACGGTGCCACTACGCCAGTGACACCTACAAAGGTAGAACAATCTTTTGTTCAATTGGAGGAATCTGATTTTGTGCAACCAGCACCTAATGGTGTTCTGACAGTTATAGACGATTATTCGTTCTATAATAGTGGTGATTACTACTATCCTTCTAATGAAGCCGCCATATTACCAGTTTGCTTTAAGCGTAATGGTGGAGGTGTTATACAATTTTCAGACCAGGTCGATGTTAAAGAAATTGACCCTGTGTACAAAGTGCAATTGGACTTCGAGTTTGAGGATGAGAACATCTCAGCTGTGTGCACGAAAGCTATTGGTAAGAGTCTGAAGTATAATGGTAGTGATTGGGAAGGATTTTGTGGTCAAATTCATAGTGTTATGGCTGTTGTTGCTGAGCACTTGGATGTGCCTCAATACTACATCTATGATGAAGAAGGTGGTCAGGACATGTGTAAGATGATTATGATCTCACAGTGGCCCGTTGCAGATTCTACTGATCATGTTGAAAGCCAATTGGAAGATCCACAGGCTGAAATTGAGTCTATTGTAGATCAGACTAAGGAGGTTGCTGAAGCATTGTCTTTTATAACTGAGACAGAAGTTAAACCAACACCTAAGAGTCCGTTTGCTTTCGAGTTTTACGACCTTAATGGTGTGCGTGTTTTGCAACAGTCAGCTAATAATTGTTGGGTTGCATCAGCGTTGGTGCAACTACAATTACTGGATTGTTATAATAGTGATGCTTTTGACTTATTTAAAGTTGGTCGTGTTGCACCAATGGTACAGAAGTGCTATGAAGCCACAAAGAATATCTGGGGTGGTTTAGGTGATGCTTCACATTGTCTTGAAGTTTTGCTTAAGGAAACTCACACTATGTTCTTGCATTGTGCAGTTGATTGCAAGTGTGGTCGTTCTTATGCTGATATTAGTGGTTGTGTGTTTCGCTTCTTACCTACGGACAAACCCTTTCCGTATGGAGGTTGTCGTGGTTGTGGAGCCATACGTATGTACACTATTATATCCATGCAGGGTACTGGTGTGTTTTGCCAAGAGCCTAAACCACTTGATATAAGTACTTTGCTTACAGAACCATTGTGTGCATCTGTCTTTATGGGTAACCATTACAAGACTAATATCTACAAGTTTAACATCTGTGTGGATGGTAATGGTCGTAGTCCTATTAGTTGGAATACGGTCAATACTGTGTGCTTTAAGGATGTGTCCTTTACAAAGGGTGTTGAACCACTACCGTTTGCGCAACATGGTAATGTTCAATTTTTCCAAGGTGAGCTTAATGACATTAAAGTCACGAGTCATGACTTTGTTGTTAATGCTGCCAATGAAAATTTGAGTCATGGTGGTGGTATCGCCCAAGCACTTGACAAGATGACTGGTGGTTTGTTGCAAAAGTTGTCTAACGAGTATATTAGTGCCAACGGCAAAGTTAAGGTGGGTAGTGGTGTCATGTTGACCTGTGGTAGTGCCAACATTTACAATGTTGTTGGGCCTCGACAGGGTAAACATGCTTACACTTTGTTAGAGAAGGCTTATAGTGCTATCCTCTCTAATCCTGGTGTTCCCCTTACACCACTTATCTCTGTTGGTATTTTTAAAGTACCCATTGAGGATTCATTGAAGGCACTCCTCTCAGTGGTTGGTGACCGTGTCGTAAAATGTTTTTGCTATGGTCAGTTAGAGCGTGAAAAGATAGTTAATTATCTTAGTGCTTTGCCTACTGTTAGTGGAGCCCACGACTCTCTTAATGAGATAAGAGATGTTAAATCAATTGAACCACTAAAACCTTACCGTAGTGAAGGTAGGTTTGACTTCTATGACAATGTTAGTGATGTTGTGTTGTTAAAACCTGATAGATTGGTATTTTATACTGACACTAACCTAACATTGGACCCATGTGCTAGTGCATACGACAAAGTTGTCGATGGCGCCATTGCATCATGTATTGCTGCATATAAAGCAGAAAATAAGTCTGTTCCTCCTGGTAATTTAATTACCTTTAAGTGTGAGGGTGCTGTAGATGTTAGCTTTGCGGTGTTGCCTAGTAGTGATAGTGTGTCTTATGATAAAGACGTAATGCGCACATTAACTAAGGTTACAAAGCTTAAGGGTAACATTGTCACAACAGTGCCTGCCTTAGATGTTCTGCAGAAGGCTCTTAAGTGCTGTGACTGTTCTTTTGTAGTCTGCACAGAAACGAAGGACGTTGTTACAAAGTGTTTCAGTGTTCAAAG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Alphacoronavirus sp.
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Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
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Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
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China
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2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,161 |
GenBank
| 1 |
China
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China
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Rhinolophus sinicus
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feces
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2019-10-22
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/RsYN12/2019, complete genome
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CCTCAACTAAACGAAATTTTTCTCTCCGTCCACATGGCTAGTGTGGCGTGAGAAGTAATTGAAATTTCAACAGATTGCCTAAGTGTGGGTTCAAGTGTTGTGTGCCCTGGTGTTCCTGGTTAGGTGTTCCGTCACCAACCATACACCACAAGCACCCTCTGATAGTTCTGTCTGTCGGAGTGAGTGAATACCAAGTTTTGTCTTGGTTGAAACCAATAACTGACCCTCATGGCTTGCAATCATATTTCTCTGGCATTTGCCAGCGATTCAGAGATTTCAGCTATTGGCTTTGGCACCGTCGAAGAGGCCGTCTCATTTTATAGTGAGTCCGCTGTTGATGGTTTTGCCAATTGCCGATTTGTCGCTGCGGGTCTTCAGGATATCGTCACTGGTGTCCTTGAAGACGAGTTTGTTATGTGTGTCACTGGCATACATCAACTCACAGCCCGTATCGGCAAATTTGGTGACCGCCCTCGTAATTTAAGAGGTTGGTTGCTGTTCTCTAACTCTAATTACTTTCTTGGGGAGTTAGAACTTGTCTTTGGAGGTCGTGGTGGTTCTACGATCTATGTAGACAACTTTATGTGTGGTGCCAATGGACAACCCGTTTTATCGGATGATAAATGGGAGTTCAAGGATTACTTTGGTGAATTAACTGAGGTACTCATTGATGGTGTCACATATGTTAAGGCCTGGAACGTTGATCGTGCTGATGGCCCATATTCAAGTCAAACCTTGGTGTCTATTAATGCTATAACATGGTGTGGAAATATCCCACATACTTTGCCTGATGGTACTACAACGGCTGTTGCACCTAGTGTTCATAAGAGTAAGACTGTGGTGCTTGATAAGTACTACACTAAGCTTTATGAAGCTGTGGGTGTGCCCTTTGTGCATAATGGCAGTTGTCTTAAGGATGTACTTACTAAACCTGTTTTTCTACATGCCCTTGTAAAGTGTCATTGTGGTACCACCAGTTGGACTGTTGGTGATTGGAGTTGTTACAAATCCACGTGTTGTGGCGTTGTATGTAAACCCATCTGTACGTCCAGTGGTAATGTGGAGCCTGGTGATGTTGTTGTTACTAGTAACAAAGTGTCACCTTCTGGTGTCAAATACTACAATGGCATGGTTCTTAAGTTTGTTGACACCTTGGATGGTTTTCATTTGTGGCGTGTTATTAAACTTCAGAGTGTCAAGAATTTTGTGGCCTCGGCTAATTACAATCCTGAAGAATACACGTATCTTTCTGACCACATTTGCAGTCCCACTAATATGCTGGAAGTTGCCTTCTGCTTTAAGTTGGGTATGCTTAATGGTGTGTTTACTGAAGAAGTTAAGTTGGCTGTGCTTGCTGGTAATATTACAGTTAGCAATTGCATTCTCGATCTTACAGACATTATAATGAGCAAACCATGGTTTGTTCGTAAACTGGAAGAGTTGATCGGTTCTGCATGGGACACATTTGTGACTGGTATAAAGTGTTTAATCTACACCAGTGGGCAACTCTTGGAGCTTGTTAAATCATTTACACAGGCGACGTTGACTGCTACTAGGGATAGCATCTGTTTTGATGCTACGGTACCAGACTGTTTTAAGGGTTGCTTTGATGTGTTCAAAGATTTTGTTAATTGTGTTTTTGACCTTACTGTTAGTACTTTGACAATTGCAGGTAACAGTTTTAAGCGTGTTGGCTCGTATGTTTTACTAGACAATGCGCTTGTGAAGCTTGTGTCCGTTAAGGTTAAAGGGTTGCGTCAAGCTGGTATCAATAAAACACAGTATGCCGTATCCGTGGTGGGTAAGACCAGTAAAGTTAAGTCAAAGAGGCTTGAGTCATCTGACGCCAACTTGGTGTTGGTTGAGACTGCAGTTCCGTTAGTTAAAGAAGGTGTTTCTAAGATTATAGGAGGTTTGTCATTCTTTTGTAGTGGTGGTCACTATAGATTGATGAGTGACTGTGACACAGTTCTTAATGAGCCAGTTTTCTGTGCTGCTAAGAACTGCACACCTGTGTTTGAGTGTGCCGTACCTAAGGGTTTTGCTCCTCCTGTGGCAACTAATGTTGCTGATTTAGTCACTGCTACAGTTACACAGCTGCTTAAGCTCAACACACCATACAAAGTTTATGATGTTAAAGTTGTTAATGAGCAGTGTGTGGTTACTTGTAATTACTCTTTTAGAGCACCTTCTTATATTGCAGATTCGGATGCTTTTGTTAAGGCTTGTATTGATTGTGTTGACAAGGATGGCTTTGATTCATTCTATGTTAATGCCCATAGTGCGAGTGCCTTAATTGCATTTGAGCCATGTTTTCCAAATTTTGAACAATTTTTACAGCCTGTGTCATGTCCGCCACTGTTAGAGGATGTGGATGGTGGCACTATATGGACTTCTTTCATTAAGACTGTTTGTAATGCTGCAGATTTTGCAAAGTCTCTTGTTGTTAGTTTTGACTTTGGTGGCATTGTCATTAAGACTACAAAGCGTTTCAAGCGATTTGCTGCTGCACTTACAAATCTATACAGGGAGTTCATAGCCACTGTTACTAAACACATTAAAATAGGTGGTGTGACTTTTGCTTATTATGCCTTTACAGTGCCAAAAATCTTTGTTTCTGGTGTTTTGCACAATGTCAGGCGTGTTGATGCTCGATCCCTTGGTATGTCTATTGAAGACATATTGGTGGAGTTCAATGTTTTCGACGGTGCCACTACGCCAGTGACACCTACAAAGGTAGAACAATCTTTTGTTCAATTGGAGGAATCTGATTTTGTGCAACCAGCACCTAATGGTGTTCTGACAGTTATAGACGATTATTCGTTCTATAATAGTGGTGATTACTACTATCCTTCTAATGAAGCCGCCATATTACCAGTTTGCTTTAAGCGTAATGGTGGAGGTGTTATACAATTTTCAGACCAGGTCGATGTTAAAGAAATTGACCCTGTGTACAAAGTGCAATTGGACTTCGAGTTTGAGGATGAGAACATCTCAGCTGTGTGCACGAAAGCTATTGGTAAGAGTCTGAAGTATAATGGTAGTGATTGGGAAGGATTTTGTGGTCAAATTCATAGTGTTATGGCTGTTGTTGCTGAGCACTTGGATGTGCCTCAATACTACATCTATGATGAAGAAGGTGGTCAGGACATGTGTAAGATGATTATGATCTCACAGTGGCCCGTTGCAGATTCTACTGATCATGTTGAAAGCCAATTGGAAGATCCACAGGCTGAAATTGAGTCTATTGTAGATCAGACTAAGGAGGTTGCTGAAGCATTGTCTTTTATAACTGAGACAGAAGTTAAACCAACACCTAAGAGTCCGTTTGCTTTCGAGTTTTACGACCTTAATGGTGTGCGTGTTTTGCAACAGTCAGCTAATAATTGTTGGGTTGCATCAGCGTTGGTGCAACTACAATTACTGGATTGTTATAATAGTGATGCTTTTGACTTATTTAAAGTTGGTCGTGTTGCACCAATGGTACAGAAGTGCTATGAAGCCACAAAGAATATCTGGGGTGGTTTAGGTGATGCTTCACATTGTCTTGAAGTTTTGCTTAAGGAAACTCACACTATGTTCTTGCATTGTGCAGTTGATTGCAAGTGTGGTCGTTCTTATGCTGATATTAGTGGTTGTGTGTTTCGCTTCTTACCTACGGACAAACCCTTTCCGTATGGAGGTTGTCGTGGTTGTGGAGCCATACGTATGTACACTATTATATCCATGCAGGGTACTGGTGTGTTTTGCCAAGAGCCTAAACCACTTGATATAAGTACTTTGCTTACAGAACCATTGTGTGCATCTGTCTTTATGGGTAACCATTACAAGACTAATATCTACAAGTTTAACATCTGTGTGGATGGTAATGGTCGTAGTCCTATTAGTTGGAATACGGTCAATACTGTGTGCTTTAAGGATGTGTCCTTTACAAAGGGTGTTGAACCACTACCGTTTGCGCAACATGGTAATGTTCAATTTTTCCAAGGTGAGCTTAATGACATTAAAGTCACGAGTCATGACTTTGTTGTTAATGCTGCCAATGAAAATTTGAGTCATGGTGGTGGTATCGCCCAAGCACTTGACAAGATGACTGGTGGTTTGTTGCAAAAGTTGTCTAACGAGTATATTAGTGCCAACGGCAAAGTTAAGGTGGGTAGTGGTGTCATGTTGACCTGTGGTAGTGCCAACATTTACAATGTTGTTGGGCCTCGACAGGGTAAACATGCTTACACTTTGTTAGAGAAGGCTTATAGTGCTATCCTCTCTAATCCTGGTGTTCCCCTTACACCACTTATCTCTGTTGGTATTTTTAAAGTACCCATTGAGGATTCATTGAAGGCACTCCTCTCAGTGGTTGGTGACCGTGTCGTAAAATGTTTTTGCTATGGTCAGTTAGAGCGTGAAAAGATAGTTAATTATCTTAGTGCTTTGCCTACTGTTAGTGGAGCCCACGACTCTCTTAATGAGATAAGAGATGTTAAATCAATTGAACCACTAAAACCTTACCGTAGTGAAGGTAGGTTTGACTTCTATGACAATGTTAGTGATGTTGTGTTGTTAAAACCTGATAGATTGGTATTTTATACTGACACTAACCTAACATTGGACCCATGTGCTAGTGCATACGACAAAGTTGTCGATGGCGCCATTGCATCATGTATTGCTGCATATAAAGCAGAAAATAAGTCTGTTCCTCCTGGTAATTTAATTACCTTTAAGTGTGAGGGTGCTGTAGATGTTAGCTTTGCGGTGTTGCCTAGTAGTGATAGTGTGTCTTATGATAAAGACGTAATGCGCACATTAACTAAGGTTACAAAGCTTAAGGGTAACATTGTCACAACAGTGCCTGCCTTAGATGTTCTGCAGAAGGCTCTTAAGTGCTGTGACTGTTCTTTTGTAGTCTGCACAGAAACGAAGGACGTTGTTACAAAGTGTTTCAGTGTTCAAAGTGTTTCTGTGAAAGTGACAGAGAATGGCAGAGATGTTAAAGATATTGT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Alphacoronavirus sp.
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Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
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Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
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China
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2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,100 |
GenBank
| 1 |
China
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China
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Rhinolophus malayanus
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feces
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2020-06-03
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/RmYN21/2020, complete genome
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GAAAGACAGTGTCTTTTCTAGACCTCGCGTCTCATCCCCTCAACTAAACGAAATTTTTCTCTCCGTCCACATGGCTAGTGTGGCGTGAGAAGTAATTGAAATTTCAACAGATTGCCTAAGTGTGGGTTCAAGTGTTGTGTGCCCTGGTGTTCCTGGTTAGGTGTTCCGTCACCAACCATACACCACAAGCACCCTCTGATAGTTCTGTCTGTCGGAGTGAGTGAATACCAAGTTTTGTCTTGGTTGAAACCAATAACTGACCCTCATGGCTTGCAATCATATTTCTCTGGCATTTGCCAGCGATTCAGAGATTTCAGCTATTGGCTTTGGCACCGTCGAAGAGGCCGTCTCATTTTATAGTGAGTCCGCTGTTGATGGTTTTGCCAATTGCCGATTTGTCGCTGCGGGTCTTCAGGATATCGTCACTGGTGTCCTTGAAGACGAGTTTGTTATGTGTGTCACTGGCATACATCAACTCACAGCCCGTATCGGCAAATTTGGTGACCGCCCTCGTAATTTAAGAGGTTGGTTGCTGTTCTCTAACTCTAATTACTTTCTTGGGGAGTTAGAACTTGTCTTTGGAGGTCGTGGTGGTTCTACGATCTATGTAGACAACTTTATGTGTGGTGCCAATGGACAACCCGTTTTATCGGATGATAAATGGGAGTTCAAGGATTACTTTGGTGAATTAACTGAGGTACTCATTGATGGCGTCACATATGTTAAGGCCTGGAACGTTGATCGTGCTGATGGCCCATATTCAAGTCAAACCTTGGTGTCTATTAATGCTATAACATGGTGTGGAAATATCCCACATACTTTGCCTGATGGTACTACAACGGCTGTTGCACCTAGTGTTCATAAGAGTAAGACTGTGGTGCTTGATAAGTACTACACTAAGCTTTATGAAGCTGTGGGTGTGCCCTTTGTGCATAATGGCAGTTGTCTTAAGGATGTACTTACTAAACCTGTTTTTCTACATGCCCTTGTAAAGTGTCATTGTGGTACCACCAGTTGGACTGTTGGTGATTGGAGTTGTTACAAATCCACGTGTTGTGGCGTTGTATGTAAACCCATCTGTACGTCCAGTGGTAATGTGGAGCCTGGTGATGTTGTTGTTACTAGTAACAAAGTGTCACCTTCTGGTGTCAAATACTACAATGGCATGGTTCTTAAGTTTGTTGACACCTTGGATGGTTTTCATTTGTGGCGTGTTATTAAACTTCAGAGTGTCAATAATTTTGTGGCCTCGGCTAATTACAATCCTGAAGAATACACGTATCTTTCTGACCACATTTGCAGTCCCACTAATATGCTGGAAGTTGCCTTCTGCTTTAAGTTGGGTATGCTTAATGGTGTGTTTACTGAAGAAGTTAAGTTGGCTGTGCTTGCTGGTAATATTACAGTTAGCAATTGCATTCTCGATCTTACAGACATTATAATGAGCAAACCATGGTTTGTTCGTAAACTGGAAGAGTTGATCGGTTCTGCATGGGACACATTTGTGACTGGTATAAAGTGTTTAATCTACACCAGTGGGCAACTCTTGGAGCTTGTTAAATCATTTACACAGGCGACGTTGACTGCTACTAGGGATAGCATCTGTTTTGATGCTACGGTACCAGACTGTTTTAAGGGTTGCTTTGATGTGTTCAAAGATTTTGTTAATTGTGTTTTTGACCTTACTGTTAGTACTTTGACAATTGCAGGTAACAGTTTTAAGCGTGTTGGCTCGTATGTTTTACTAGACAATGCGCTTGTGAAGCTTGTGTCCGTTAAGGTTAAAGGGTTGCGTCAAGCTGGTATCAATAAAACACAGTATGCCGTATCCGTGGTGGGTAAGACCAGTAAAGTTAAGTCAAAGAGGCTTGAGTCATCTGACGCCAACTTGGTGTTGGTTGAGACTGCAGTCCCGTTAGTTAAAGAAGGTGTTTCTAAGATTATAGGAGGTTTGTCATTCTTTTGTAGTGGTGGTCACTATAGATTGATGAGTGACTGTGACACAGTTCTTAATGAGCCAGTTTTCTGTGCTGCTAAGAACTGCACACCTGTGTTTGAGTGTGCCGTACCTAAGGGTTTTGTTCCTCCTGTGGCAACTAATGTTGCTGATTTAGTCACTGCTACAGTTACACAGCTGCTTAAGCTCAACACACCATACAAAGTTTATGATGTTAAAGTTGTTAATGAGCAGTGTGTGGTTACTTGTAATTACTCTTTTAGAGCACCTTCTTATATTGCAGATTCGGATGCTTTTGTTAAGGCTTGTATTGATTGTGTTGACAAGGATGGCTTTGATTCATTCTATGTTAATGCCCATAGTGCGAGTGCCTTAATTGCATTTGAGCCATGTTTTCCAAATTTTGAACAATTTTTACAGCCTGTGTCATGTCCGCCACTGTTAGAGGATGTGGATGGTGGCACTATATGGACTTCTTTCATTAAGACTGTTTGTAATGCTGCAGATTTTGCAAAGTCTCTTGTTGTTAGTTTTGACTTTGGTGGCATTGTCATTAAGACTACAAAGCGTTTCAAGCGATTTGCTGCTGCACTTACAAATCTATACAGGGAGTTCATAGCCACTGTTACTAAACACATTAAAATAGGTGGTGTGACTTTTGCTTATTATGCCTTTACAGTGCCAAAAATCTTTGTTTCTGGTGTTTTGCACAATGTCAGGCGTGTTGATGCTCGATCCCTTGGTATGTCTATTGAAGACATATTGGTGGAGTTCAATGTTTTCGACGGTGCCACTACGCCAGTGACACCTACAAAGGTAGAACAATCTTTTGTTCAATTGGAGGAATCTGATTTTGTGCAACCAGCACCTAATGGTGTTCTGACAGTTATAGACGATTATTCGTTCTATAATAGTGGTGATTACTACTATCCTTCTAATGAAGCCGCCATATTACCAGTTTGCTTTAAGCGTAATGGTGGAGGTGTTATACAATTTTCAGACCAGGTCGATGTTAAAGAAATTGACCCTGTGTACAAAGTGCAATTGGACTTTGAGTTTGAGGATGAGAACATCTCAGCTGTGTGCACGAAAGCTATTGGTAAGAGTCTGAAGTATAATGGTAGTGATTGGGAAGGATTTTGTGATCAAATTCATAGTGTTATGGCTGTTGTTGCTGAGCACTTGGATGTGCCTCAATACTACATCTATGATGAAGAAGGTGGTCAGGACATGTGTAAGATGATTATGATCTCACAGTGGCCCGTTGCAGATTCTACTGATCATGTTGAAAGCCAATTGGAAGATCCACAGGCTGAAATTGAGTCTATTGTAGATCAGACTAAGGAGGTTGCTGAAGCATTGTCTTTTATAACTGAGACAGAAGTTAAACCAACACCTAAGAGTCCGTTTGCTTTCGAGTTTTACGACCTTAATGGTGTGCGTGTTTTGCAACAGTCAGCTAATAATTGTTGGGTTGCATCAGCGTTGGTGCAACTACAATTACTGGATTGTTATAATAGTGATGCTTTTGACTTATTTAAAGTTGGTCGTGTTGCACCAATGGTACAGAAGTGCTATGAAGCCACAAAGAATATCTGGGGTGGTTTAGGTGATGCTTCACATTGTCTTGAAGTTTTGCTTAAGGAAACTCACACTATGTTCTTGCATTGTGCAGTTGATTGCAAGTGTGGTCGTTCTTATGCTGATATTAGTGGTTGTGTGTTTCGCTTCTTACCTACGGACAAACCCTTTCCGTATGGAGGTTGTCGTGGTTGTGGAGCCATACGTATGTACACTATTATATCCATGCAGGGTACTGGTGTGTTTTGCCAAGAGCCTAAACCACTTGATATAAGTACTTTGCTTACAGAACCATTGTGTGCATCTGTCTTTATGGGTAACCATTACAAGACTAATATCTACAAGTTTAACATCTGTGTGGATGGTAATGGTCGTAGTCCTATTAGTTGGAATACGGTCAATACTGTGTGCTTTAAGGATGTGTCCTTTACAAAGGGTGTTGAACCACTACCGTTTGCGCAACATGGTAATGTTCAATTTTTCCAAGGTGAGCTTAATGACATTAAAGTCACGAGTCATGACTTTGTTGTTAATGCTGCCAATGAAAATTTGAGTCATGGTGGTGGTATCGCCCAAGCACTTGACAAGATGACTGGTGGTTTGTTGCAAAAGTTGTCTAACGAGTACATTAGTGCCAACGGCAAAGTTAAGGTGGGTAGTGGTGTCATGTTGACCTGTGGTAGTGCCAACATTTACAATGTTGTTGGGCCTCGACAGGGTAAACATGCTTACACTTTGTTAGAGAAGGCTTATAGTGCTATCCTCTCTAATCCTGGTGTTCCCCTTACACCACTTATCTCTGTTGGTATTTTTAAAGTACCCATTGAGGATTCATTGAAGGCACTCCTCTCAGTGGTTGGTGACCGTGTCGTAAAATGTTTTTGCTATGGTCAGTTAGAGCGTGAAAAGATAGTTAATTATCTTAGTGCTTTGCCTACTGTTAGTGGAGCCCACGACTCTCTTAATGAGATAAGAGATGTTAAATCAATTGAACCACTAAAACCTTACCGTAGTGAAGGTAGGTTTGACTTCTATGACAATGTTAGTGATGTTGTGTTGTTAAAACCTGATAGATTGGTATTTTATACTGACACTAACCTAACATTGGACCCATGTGCTAGTGCATACGACAAAGTTGTCGATGGCGCCATTGCATCATGTATTGCTGCATATAAAGCAGAAAATAAGTATGTTCCTCCTGGTAATTTAATTACCTTTAAGTGTGAGGGTGCTGTAGATGTTAGCTTTGCGGTGTTGCCTAGTAGTGATAGTGTGTCTTATGATAAAGACGTAATGCGCACATTAACTAAGGTTACAAAGCTTAAGGGTAACATTGTCACAACAGTGCCTGCCTTAGATGTTCTGCAGAAGGCTCTTAAGTGCTGTGACTGTTCTTTTGTAGTCTGCACAGAAACGAAGGACGTTGTTACAAAGTGTTTCAGTGTTCAAAGTGTTTCTGTGA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Alphacoronavirus sp.
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Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
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Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
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China
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2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,068 |
GenBank
| 1 |
China
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China
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Hipposideros larvatus
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feces
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2020-07-28
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/HlYN23/2020, complete genome
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TATAGATAGAGTGTGTTCTTTCTAGACCTCGTGTCTCATCCCCTCAACTAAACGAAATTTTTCTCTCCGCGTGCATGTGTCATGCACCGTGAGAAGTTATTGAAATTTCACTAGGTTACTTAAGTGTGGGTTCAAGTGTCGTGTGCCCTAGTGGTCATAGTGCGGTGTTCCGTCACCTACTATACACTACAAGCACCCTCTGTCAGTTTCGTCTGTCAGAGTGTGTGGATATCAAGTTCTGTCTTGGTTGAAACCGATAACTGTCCCTCATGGCTCGTAACCATCTTTCTTTGGCTTTTGCCAATGATTCAGAGATTTCAGCTTCTGGCTGTTGCACCTTCGAAGATGCCGTCTTACAATATAGTGAGGCCGCTGTCGATGGTTTTGTCAACTGCCGATTTGTCGCTGCGGGTTTACAAGACACCGTTGTTGGTGTTAGTGATTCTGATTTTGTCATGTGTGTTACTGGCATTCATCAGCTCACAGCCCGTATAGGCAGATTCGGTGACCGACCTACTAATCTTAGGGGTTGGTTGCTGTTCTCTAACTCAAATTATTTTCTGGATGAGTTAGATATTGTCTTTGGTGGACGTGGTGGTAACACTGTCCATGTAGACAATTACATGTGTGATGCCAATGGTAAACCTGTTTTGCCAGAAAATGTATGGGAGTGTAAAGATTACTTTGGTGAACTCTCCGAGATTCTGGTTAATGGCACCACATATGTTAAGGCCTGGATCGTCGATCGTTCCTCAGGTCCTTTTGCAAGTCAATCCTTGCTTTCAATTAAAGCTATCACTTGGTGTGGCACTGTAGCGCATACTCTAGCTGATGGCGCTACCTTGAGTGTTGCAGCCCCTGCCCGTAAGAGTAAGACTGTTGTCCTCGATAAGTATTACAGCAAGTTGTATGATGCTGCTGGAGTGCCATTCGTTCGTAATGGTAAAACATTGAAGGACGTCATAACAAATCCTGTTTTCTGCCATGCTCTTATTAAGTGTCATTGTGGTGTTACTAGCTGGACTGTTGGTGATTGGAGTAGTTATAAGTCCACATGTTGTGGTGTGGCTTGTAAGCCAATTTGTACAGCCAGTGGTGTTGTCAAGCCAGGTAGTGTCCTTGTTACTAGTAATAAGGTCTCTACTGATGGTGTCAAATATTACAATGGCATGGTACTGAAGTTTATTGACACCCTGGATGGCTTACATCTGTGGCGTGTTGTTAAACTTCAAAGTGTCAAAGGCTTCGTGGCCTCGGCTAACTTTGACAGAGGTGAGTATGTTTATCTTTCTAATCATGCATGTAGTCCTGCTAATGACGAAGAAGTTGCTATCAGCTTTAGGTTCTCGCTCCTCAATGGTGTTTTTACTGCTGATGTAAGGACGGCTATTGCTGAGGGAGCCATTATTGTTGGTAGTTGCATTTTCGACATACTTGATGAGGTTCTTGTTGAGCCATGGTTTGTCCGTAAGCTCAAAGATCTCATAGGCAGTGCATGGGAATCATTTGTGTCAGGCATTAGGTGTGTTGGTTACACTAGTGTACAGGCTATACAGCTTGCTACGTCTTTAGCTAGTGCAACTTTACAAGTTTCTAGAGATGGCATTACTCTCATGGCTACTGTACCTGATTGTTTCGAACGTTGTTTCGAAGCATTTAGGGACTTCGTGGTAGGAGTTTTTGACCTTACTGTGAGTACTATCAAGATTGCTGGTTGTAACTTTAAGTGCGTTGGTTCCTACGTGTTGTTGGACAATGCACTTGTGAAGTTAGTGGCTGGTAAGTTTAGAGGGCCTAAACAATCCGGTCTGAAGAAGGTTCAGTACGCTAGTACCATTCTCGGCAAGACGACGAGAGTTGTCTCAAAGAGGGTGGAGCGTTCTGAGGCTAATTTGACCGTTGTGGATGAACCAGCCTCTCTTATTAAAGAGGGCGTTACCAAGGTTATAGGTGGACAGGCATTCTTTTGTAGTGGAGACTATTATAGACTCCTTAGTGATGCTGACATTGTACTGGATGAACCGGTCTATAGGGCCACGGCTTCTTATAGCCCTGTTTTTGAGTGTATACCACCTAAAGGTTTTACGCCACCAGTCTGTGACTCGCTACCAAGTCTTGTGACAAGTACTGTTAGTCAGTTGCTTCCATTTAACACACCATATCGTGTGTATAATGTTAGCGTTGCTAATGACCAGTGTGTTGTCACTGTGAGTCACAACTTTAGAGCACCTGCCTATATTAATGATATAGTTGCATTTACAGATGCTTGCTTAGTTTGTGTTAACAGAGATGGCTTCGATTCGTTCTATGTTAATGCACATGCTGCGAGTTCTCTTGTTGCATTTGACCCTGTTTTTCCTGAATTTTTCACGTTTAAGACTGTTGCAGATCTTTTTACCAGTGTTGTTGCTTGTCCAGAGCTTCTGGAGGAGATAGATGGTGGTGGGATCTGGAACACCTTTATTAAAACGGTGAATAATGCAGTTGAGTTTGCTAAGTCTTTGTCCTTTAGTTTTGATCTTAGCGGTATTGTCATTAAGACAACTAAGAGATTTAGGCGGTTTGCTGCAGCATTAACAAATTTATATAGGGAATTTATTGCCACTGTTACTAGAGTCGTTAGTGTTGGCAGTGTTGCATTTACATATTACGCCTTCAGTGTACCAAAAGTCTTTGTTTCTGGTGTCTTACATAGTGTCAGGCGTGTTAAGGCCACTGACCTGTCCATGTCCGTAGAGGATGTGATAGCAGAATTTAGTGTCTTTGATGGGGCTATGATACCTGTTGAGCCATCTAGAGTTGAGTCTGCCACTGTTCAGTTTGAGGAGGTAGACTTTGTCCAGCCTGCTAGTGGTGGTATTCTTGCTATTGTGGATGATTTCTCCTTTTATAATACAGGAGACCTCTATTATCCATCTAATGAGAGTGCAGTTATACCTGTCTGCTACAAGCGTTGTGGTGGCGGTGTCATTCAGTTTTCTGACACTGTGGATGTTAAGGAAATAGATCCTGTTTACAAGGTTAAGCTTGACTTCGAATTTGAGAGTGAAGAACTCGTCGCTGTCTGTAAGAAGGTCACTGGCCGTTATATTGAGTATAATGGTTCTGACTGGGAAGGTTTGCGCGAGCAGATTGACTCCGTTATGAATGCTGTTGGTGACTTTCTTGAAGTTCCCACTTATTACGTCTATGACGAAGAGGGCGGACAAGATATGAACAAGATTGTTATGGTTTCGCAGTGGGCTATAAGTTCTGATGCAACGAGTGTTGATGTAGTGACTGAGCCTATCGTAGAAGCTACACAAGATGAAGTTCAAGAAGTTGAAGAAGCTCTATCCTTTATTGTTGAATCTGTACAACCACCTGCAAAACCTGTTAATAGCCCCTTTGCTTTTGAATTTTATGACCTTAGTGGCATAAAAGTTTTAAGGCAAGCAGCAAATAATTGCTGGGCTACTGCTGCACTCGTTCAATTACAATTGTTGGATTGCTATGAGAGTGATGCCTTTAATCTTTTTAAGGTTGGAAGAGTTGCTCCCATGACTCAACAGTGCTATACTGCCACAGGTAATATTTGGGGTAGTATGGGTGACACATCACATTGTTTGGAGGCCTTGCTTAAAGACACTTACACGATGTTTGTGCGCTGTGAGGTTAAATGTAAGTGTGGTACTAGCTTTGAAGAGCTTAGTGGTTGTGTGTTTAGATTTATGCCTACTGACAATCCTTTCCCCTATGGTTGTTGTGGACAATGTCGTAAGACAAGGATGTTCACAATTGTATCGATGCAGGGGACTGGTGTATTTTGTCAAGAACCAAGTGAGTTTGATGTTAGTAAACTCCTTTGTGAGCCATTATGTGCCTCAGTTTTTAAGGGTAACCATTATAAAACCAACATTTACACTCATAATGTGTGTGTTGATGGTAATGGTAAAGGGCCTATCGACTGGAACACAATTAACACAGTTTGCTTTAAGGATGTTAATTACAGCAAGGTTGTTGAACTCGTGCCTTTTACCACCTACCAGAACATCGCTTTCTACCAGGGCGACCTTAATGATGTTAAGTCCGTGTCACATGACTTTATTGTTAATGCGGCAAATGAGAATTTGAGTCATGGTGGTGGTATTGCACAAGCACTTAATAAGATGACTGATGGTAAGCTGCAAAAGCTGTCTGACAAATATATTGGTTTGAATGGCAAACTTAAAGTTGGTACTGGTGTCATGATTGACTGTGATGGCACACCAATATTTAATGTTGTTGGTCCTCGCAAGGGCAAGCATGCTACACCCTTACTTGAAAAAGCATACCAGTCTATTTTTTCTAATCCAGGTGTCCCATTGACACCATTGATTAGTATTGGGATCTTCAAAGTGCCTTTGGAAGATTCGCTATCTGCTTTAGTAAAGACTGCAGCGGGTAGGGTTGTTAAGTGCTTTTGCTACCTTGATGCCGAGCGTGACAAAATAATGTCACACTTAGAGTCTCTAAAAAGTGTCGGTGTTGCCACTCCTGTAGAGGAAGTTGCACCACCTGTAGAGACCGCCGTAATTGTACCCAAGCCATATCGTAGTGAGGGACGTTTTGACTTTTATGATGTGAAGGTTAGTGACATCCCTGCGCTGAAACCCGACAAGCTTGTCATATTTACAGATCCAGACTTCACTTTTAGTGAGTTTGCGTGTAATTTTGACAAGCATGTTGATGGAGGTTTAACGGCGTGTGTTGAGGCATACAAGGCAGAAAATAAGACTGTACCAGCCGGTAATATCATTACATTTAAGTGTGATGCATTTCTGGCTGTTAGCTTTGCAGTTTTACCCCGCATTGATGATGTCTCGTATGAGAAAAATCTCATGCGTACTATTACCAAGGTCGCCAAACTCAAGGGTGTTGTAATTTCTACCATTCCTGCACTAGATGTTTTGCGGAAATTATTGAAGTGCTGTGATTGTGCGTTTGTTGTGGACACTCAATCTAAGAGCGTTGTGACAGAG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MZ081389.1
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Alphacoronavirus sp.
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Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
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Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
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China
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2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 28,168 |
GenBank
| 1 |
China
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China
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Hipposideros larvatus
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feces
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2019-05-06
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/HlYN10/2019, complete genome
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GTCTTTTCCTAGACCTTGTGTCTCCTCCTCTCAACTAAACGAAATTTTCTCCGTCGCTAGTATGCTTTGCATGCTGCGTATGGTGTAATTGAAATTTCACCAGGTTGCCAAATTTTGGTAACAAGTGTCGTGCGTCCTAGTAGCTCTGGTTAGGTGTTCCGTCACCAACCACCTACTACAAACGCCCTCTGACAGTTCCGTCTGTTAGAGTGTGTGGAAGACGAGTTCAATCTTGTCTGAAACCGATAACTGTACCTTATGGCTCGCAACCAGATCACATTGGCTTTTGCCAATGACCCAGAGATTTCATCCTTTGGCTTTGAGTCTATCGGTGATGCCGTAGAACAATATAGTTTTGCCGCTGCCGATGGTTTTGTTCAATGCCGTTTTGTTAGTACGGGCTTGCAGGGTATCGTTGATGGTGTTCGTGATAGCGACTACGTGTTAGTTATCACCGGCATTAACCAACTCTGTGCTCGTATTGGCAAGTTTGGTGACCGCCCACAAAATTTGCGCGGTTGGTTGCTGTTCTCTAATTCAAATTACTTTTTAAGTGAGATGGATTTGACTTTTGGTGGTCGTGGCGGTAATACCGTTTACGTTGACCAATACCTTTGTGGTGCCAATGGCTATCCAGCACTTGATGAAGCCATCTGGGAATTCAAAGATTACTTTGGAGAACTCGATGAGATAATAGTCAATGGCACCACCTTTGTTAAGGCCTGGCTCGTTGTTAGATCTCCAGGTCCTTACAAATCTCAGAATCTCTTGTCCGTACAGGCTATTACCTGGTGTGGTGACTGTCCACATGCTCTCGCTGATGGCGCGACATTGAAAAATGCTGGACCCGTTAAGAAGAACAAGAGCATTGTTGTTGGCAGAAAATTCGAGCTACTTTACGATAAAGTTGGCTCTCCTTTTGTCACTAACGGCAAGACACTGAGTGAAATACTGACCAATCCTGTCTTTTGTCATGCACTTGTTAAGTGTCATTGTGGCACAACGTCATGGACTCTTGGAGACTGGAGTGGTTATAAATCAATGTGTTGTGGCAAGGTTTGCAAACCATCCACCATTGTAGTGGGTGAAGTAAAACCAGGTGATGTGCTTGTCACATCATCTAAAGTCTCAACCAATGGAGTTAAATACTATAGTGGTATGATACTTGATTTCGTTACAAAAGTTGATGACATCTGTTTGTGGCGCATTGCAAAAGTGCAGAGTGCTGATGATTTTGTTGCCTCTGGTAACTTTGACATCGAAGACCACACTTACAGACTTGAGGAAATTTGCAGTCCTTTTACAAGTTCAGAGCTTGCCAAGGAATTTAAGTTGTGCTACTACACTGGTGTCTATACAGATGCTGTTCGTGCCGCCATTATTAATGGCGACATTGACGTCAACACTACAGTGTGCAGTGTAGCAGACGAAGTTCTCTACAAACCTTGGTTTGTTAGAGAACTTCAAGACTTACTTGGATCATCTTGGGACATCTTTGTCAGTGCTGTTAAGACCCTAGCTGTTAAGAACAGTGACTTGGTTCTGCTCATGAAATCGTTGACTAAGGCAACTATCAAAGTTGCTAAAGGTGTCATTGACTTCTGTGCGGATGTGCCATCTGTCTTTGCCAGCTGTTTTGAAGTACTCAAGAGTTTTGTTGTAACAATGTTTGATCTAACTGTTAACACCTTCACCATCGCAGGTGTTAAAGTTAAGGCGGTTGGCGACTATGTTTTGCTTGATAATGCAATTGTCAAGTTTGTCTCCGCTAAGGTCAAGGGTGTCAAACAGGATGGTTTGAAAACTATCTCTTTTGCACACACAATTGTTGGTGACACTTTGAAAGTGAAATCAAAACGATTTGAGTACAGCAATGTTAACTTGGTCATAGTCCCTGACGAACTTGTTGTTACAGAAGGTGTGATTAAGTCTATTGGTGGTAAAGCTTTCTTTTACAGTGGTGGTTGTTACCGTCTCATGAAAGATAATGAAACTGTATTAACAACACCCACTTTTAAGGCTCAAGCACCTGCAACTGTTATTTTCCAGTGCGCAAAGCCTGATGGTTTTGTTGAACCGAAATGTGCAGACATCGTTGAATTGGTTGGTGAAGTTACTAAGCAACTCATGCAGCTCAACAAACCTTATCGTTTCTACGACGTTAAGGTGCAAGCTGACAATTGCATTGTGACCGAAAGCCTAAACTTCAGAGCACCTTCTTATATCTGTGATGCAGAAAAGTTTGTTAAACTCTGTGTTGAGTTTGCCAACGATGATAGGTTTGACATCTTTTATGCAAATGCACATGCCGCTGTTAACCTCGTGCAGTTTGAACCAGTCTTCGAAGCATTTGAATGTTTCAGACAAGTTGTCGAGTGCCCTGAGTTGTTAAAAGACATTGACAACGGTGGCATTTGGTATTCTTTCATTGGAACAGTTAGTGATGCTCTGTCATTCGCTAAATCCATTAGGGTGGATTTTGGTTTGAATGGTATTGTTATCACAGCAACCAAACGCTTCAAACGTTTTGCTGGCGCGCTTATGAACTTGTATAGAGAATTCATTGCCAGTGTTACAACGTGCCTTATGATTGGTTCAAAGAAATTTACCTATTACACATTTGAAAGACCAAAAATATTGATCGCCGGTGCCTTATACTCTGTGTTTGTCAAACAAGCTTCTGACTGTGACTGTGCAGTTGAGGATGGCGTTGGTTCTGTTTCTATGCTTGCTAGTCAAGAAATTGAGATAGAACCAATGCGTCTGGAACTGCATGATGTGGAGTTGGAAGACTGTGGCTTTGCAGAACCCCAGAAAGGAGGTGTTTTGGCTGTTGTCAATGGATACACCTTCTACAACACTGGTGATTATTACTACCCCTCTAATGACAAATATGCTATTTCAACATGTTACAAGAGAGGTAGTGGTAAAAGTGTACAATTTGCTGAAGTTGTTTCTGTTAAGGAGATTGACCCTGTTCACAAAGTCTACCTTGATTTTGAATTTGAAGATGACACTATTACTAATGTTTGCAAGCGTGTCATTGGTAAAAAGATCAAGTTTATAGGCTCAGATTGGGGTGAATTTTGCCAGGTTGTTCATACATACATGGACGCTGTTAGTACACAGTTGGAAGTTCCACCTTACTTCATCTATGATGAGGAGGGTGGTAGCGACCTAACTAAACCTATTATGGTTTCACAGTGGCCAGTGGTGGAAGAGCAATCTGTTGAGGCAACACCTGTACCAGAAACTTCAGATCAAACTGCTGTTGAAGAAGCACTTAGCTTTATAGTGGATAATGGCGTTGCTCCTGTTGTTAGTCCATTTGCCTTTGAATTCTACGACCTCAATGGTATTAGAGTTCTGAAGCAGTGTAATAACAACTGTTGGGTTTCTACAACTCTTGTGCAATTACAGTTGCTTGGAGTTTATGACGATCCAGCATTTGACTTGTTCAAGGTTGGACGTGTTTCCGCTATGGTTAAGAAGTGCTACGAAGCTACAAACAATATTGTGGGTGCTGCAGGTGACACAGCTCATTGCTTAGAAGTCCTGTTGAAAGAGTCTCACACCATGTTTATTACATTCAAAGTCGAATGTAAGTGTGGTGTGGAGCAATCTCAGCTTAGTGGTTGTGTTTTCCATTTTATGCCAACGCCAAAACCATTCGTATATGGTAACTGTCAGTGGTGTAAAACACCTGCTATGCACACCATAAATTCTATGAAGGGTACTGGTGTGTTTTGCCAACAACCTAAGCCTACAGACATCAATGCACTTCTGCTAAAACCCACTTGCGCATCAGTGTTTCTGGGTAATGACAGTGTTTGTGGACATTATAAGACAAACATTTACGATAAAAATGTTTGTGTTGATGGTCATGGACAAGGTCCAATTACAATGAACACCCTGAACACTCTTTGCTACAAAGACGTTTCATACACCAGACAAGTTGCTCCCTGTCCTTCCAAACCTGAACCCACACCATTCTTGGTCCACAAGAATGTTGAGTTCTACGTTGGTGACATTACAGAGCTCATTGCTGTTAAACACGATTTTGTTGTTAATGCAGCTAATGAAAATCTTAGTCATGGTGGTGGCATTGCTGCTGCGCTTAATAAGTTGACTGGTGGCATTCTTCAGGAAGTTTCTAACAGCTATGTTAGAGACAATGGTAAACTGAAAGTTGCCACAGGAGTCATGCTGGATTGTGGTGCTGAGCGTGTCTACAATGTTGTAGGCCCCCGGGCTGGCAAGCATGCTCCTGAACTTTTGCGCAAGGCGTATAAAGCTGTTCTGTCACAAAGAGGTTTGCCGCTGACACCTCTTTTGAGTACTGGCATCTTTAAAGTGCCTGTTGTTGACTCTATTTCAGCACTTCTAGAGGTTGCAGGTGACCACGCTGTTAAGTGTTTCTGCCTTACGACTAATGAGTGCGACTTGATCAAACAGTTTGTTGCTTCTCTCAACTCAGTTGTAGTGGCAGCAGAAGTTGTTGATCAGACAGTCGAGTATAGTTCTAAGGTAGAACCTACACCAGCACCTGCAGTTGTACCTGTGCCTTTTAGGTGTGAAGGTAAATTTGAGTTCTATGATGCACCTGTAGTAGATTTGCTAGCTCTTCAATTAGAGCGTTTTGTGTTTTTCACCGACAGTAGCTTTGCATTTTGCTCTGTTGCTAAGTCGTTGGATTTACACTATGATGGTGCTCTTACTAATTGTGTGCAAAGTTACCTCGAAACTACACCTAATGTGCCTGCAGGTAATGTTGTTACATTTAAATGTGAAAGTGCTGTGGCTGTCAGCTTTGCTGTAGTCCCTGATGTTAGTGAAGCCAACTATGGTAAGAATGTCAAGCGTTTGCTTACCAAGTTGTCCAAAATTAAGGGTTTCACAATGGCCACAGTTCCATACACAGCCTTCTTTAAGTCTTTACTTAAGTGTTGTTCATTTCACTTTGTCGTGTGTACATACACTAAGCCTATTGTAGCAGATTG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GCACTTGGTGCGTCTGTTGCTATAAAAGTGACTGAGTACTCTTGGAACAAGCGCCTTTATGAGTTAATACAACGTTTTGAGTTTTGGACATTGTTTTGTACTAGTGTTAATACTTCTTCATCAGAAGCTTTTCTTATTGGTGTTAATTATTTGGGCAACTTTGCTAGTAATCCTGTTATTGACGGCAATGTAGTACACGCTAATTACATATTTTGGCGTAATTCCACTATCATGTCTTTGTCTTATAACAGTGTGTTGGATCTCGCCAAGTTTAATTGTAAACACAAGGCCACTGTTGTAGTATCATTAAAAGACAGTGATATTAATGACATTGTTCTAGGGCTTGTGAAGAAAGGCAAATTGCTTATTAGAAAGAATGGGACTTATATGGGTTTTTCAAACCATTTAGTCTCAACTAAACAAAAATGATTTCTCTTGCTGTGTTTTTGGCAGAGTTATTGGTCATTATTAGCAAATTACCACCTGTTTTATTAAATAGCCCTGCTGACCTGTGCTCTTGGGATGCTGGTGAAAAACCCACAATAGATTTGGGTTTACCACCTAACTCCACAGTGTTTGTTAGTGGTTATTTGCCAACGCCTGAAAACCAATGGCATTGTAAAACTGGTCTTGTGTCCTATGAAAATGTGCATGGGTTTTTCTGGTCTTACTACGCCCAGGCTGAAAATGTCGCCATTGGTGTCTCTAGTGCTGATTTAACTAACAACAGAGACCAGTGGGCTGTCTATATATGGCAGCGTAATAATGGTGGTGGCAATGCACGTCTTAAGATTTGTAAATGGACTGCAACTTATGTACCATCTTACGACCCACATTTTGAGCGTGGTGCATGCATTGTAAACATTCGTTTCACTATGCAATTTTACCATACTGGTAAACAAGTTGTGGGTTTAACTTGGAATGGTGACATTGTAACCATTTATGGGTTAAGTAAAACTTATAGATTTCACTTAGCCAACAACTGGTCGAGAGTTACAGTGCAATGTCAAACACCACAGTCTTGCGGCATTTTACCTGTTTATAATGTGACCACACTTAATATCACTACAGACGCTTATGGCCGTATTGCCACTTATAGTGTTTGTGAATCTTGTGACGGTTTTCCTGCACATGTTTTTCCGGTTGGTGATGGTGGTTATATACCTATTGACTTTGACTTTACTAATTGGTTTGTTTTAACAAACAAGTCTACTATTGTTCAGGGTCGTACCACTACCATTCAGCCTTTGCGTTTACTTTGTCTTTGGCCAGTCCCAGTTTTGTTGGCTACGGATAACCCTATTTACTTCAATTTGTCCAAGAGTGAGGGTGTTCGTTGTAATGGTTTTAGAACAGAGGGTGTTGCTGATGTTTTAAGATTCTCTCTTAACTTCACACAGTCGCAAGTGCTTAACGGTGTGCACAACATTGTTTTTAATACAGATTACAGCAATTACACTTTCACATGTACAAATGACACTGTCATAGGCAATGGTCGTTCTATGGTGCCATTTGGTTTCTTGGATGAAGTTTATAGGTGTTTTGTTTTAACACAAACACTTAATGGAACTATTAGTAACTTTGTTGGTGTTTTACCACCAGTTACACGAGAGTTTGTTGTTTCTCGGTTTGGTGCTGTTTATGTTAATGGTGTCAGGATGATGTCACTCCCACCTCTAGATAGCGTTATTTTTAACGTTACTAGTAGTGTTGGCTCAGATTTTTGGACTGTGGCTTTTGCCAATGATGCCGAAGTTTTACTTGACATTAATGCCACCAACATTGTTGGTTTGCAGTATTGTGACTCTCATGTTGACAAGCTTAAGTGCTCACAACTTTCATACACTCTTAGTGATGGTTTTTACACCGCATCTAGCCTTGTTAAAACCTCACTATACCGCACTTATGTAGCTTTGCCGTATCATGCAACTCACACTGATGTAGAGTTGAATGTCACAATGCGATTCACTGGCCACAGTATTACGCTTAATGGGCAAAATAGTGGTGTTGTGTGTGTTAATACATCGCAGTTCACTACTAAATTGCACACTAATGCTGATCCCACATATCATGGTGATGTCACTAATGTTGATTGTCCTTTTAATTTTTACTCACTCAATAATTATCTAGCTTTTGGCACAATTTGTTTCTCACTGCAACCACTGGCTAGTTCTTGCAGTATGAGTATAGATAGTGTCATCCTAGGATATCATCAACCCTTGGGTGTGTTGTACATCAGTCATTCTAGTGGTTCTACAACCACAGGCATGCCGCGTTCTACTGGTGGTGTTTATGATTCAAGTGTTGTTTACACGGGTGTTTGTACTGACTATACAATTTATGGTGTTACTGGCAGAGGTATAATTACCGAGCTTAACACAACTATAATTGCTGGTTTGTATTATACATCTGTGTCTGGCCAACTACTTGGTTTCAAAAATGCCACTAACGGCGTTGTTTATGCTGTACGTCCTTGTGATTTGTCTAGTCAAGTTGCCGTCTATGAAGACAATATCATAGGTGTGGTTTCATCTGAACCTAATGTGACTTTTGGTTTCAATAACACTCTACAACTGCCTAACTTCTACTATCACTCCAATAGTTTGGATAACTGCTCAGAACCTGTACTAACTTACGGGTCTATTGGTGTTTGTAGTGATGGCAGCATAACGCAAGTCCAAGTTCGCAAATCCGAACCTCAACCTGCCACACCTATTCTTACTGGTCAAATTAACATACCTTCCAATTTTAGCTTGTCAGTGCAAGTTGAATATTTGCAAATGCACATGCAACCAGTCAGTGTTGATTGCAGTAGGTATGTTTGTAACGGAAATTCACATTGTCTTAGGTTACTTACACAGTATGTTTCTGCTTGCAAAAATATTGAAGATGCACTCCAACTTAGTGCTCGTTTAGAGTCTATGGAGATTAATAGTGCTATCACTATTTCTGACAATGCTTTGCAACTGGCCAATGTTTCCAACTTTGATTATTTCAACATGTCTGCGTTATTGCCACGGAAAAATGGTAAGAGTGCTATTGAAGATTTGCTGTTTAACAAAGTTGTTACTAGTGGCCTTGGTACTGTTGACCAGGACTATAAGAAGTGCATACAGGACAGTGGTTTGGCAGATGTTGCTGACTTAGCTTGTGCTCAGTATTATAATGGTATTATGGTGCTGCCAGGTGTTGTTGATGAAGTCAAAATGGGCTTGTACACAGCATCTCTGACAGGTGCTATGGTGTTAGGAGGTTTCACTGCTGCAGCTGCCATACCCTTCTCTCTTGCTGTACAGTCCCGTCTTAATTATGTTGCTTTGCAAACTGATGTTTTGCAGCAAAACCAAAAGATTTTGGCAGACTCTTTCAACAGCGCTATGAGTAACATTACTCTTGCTTTTACAGAAGTTAATGAGGCTCTCAAAGACACTTCTGAAGCAATTAACACTGTTGCACAAGCTCTTAATAAAGTTCAAACTGTTGTCAACGAACAAGGACAGGCACTAGCTCAACTTACACGTCAATTAGCCTCTAATTTCCAAGCTATTTCATCTTCTATTGAAGATATTTATAATAGACTGGATGTTTTGGCAGCTGATGCGCAAGTTGACAGATTGATATCTGGTCGTCTAAGTGCACTTAATGCCTTTGTAACACAAACTTTAACTAAGTACACTGACGTCCGTGCTAGTCGTCAATTGGCCTTGCAGAAAATTAATGAGTGTGTTAAGTCTCAATCTTCGCGGTATGGGTTTTGTGGCAACGGCACCCATTTGTTTTCAATTGCTAATGCAGCGCCCAATGGCATTATGTTGTTTCATACTGTTTTGGTTCCAACTCAGTATGTGGCTGTAAGTGCTTGGGCTGGAATTTGCGTTTCAGGTTCCGGATTTGTTTTGCGTGATGTTAAGAGTGCTTTGTTTAATGTCAATGATACTTATTACATCACTTCTCGTGATATGTATGAACCCCGCATACCACAGTCTAGTGATTTTGTTCGTATTACTGGTTGTATTGTTACTTATCTTAATCTGAGTTCTGATGAATTGAGTCAGGTTATACCAGATTATATAGATGTTAATAAGACACTTGAGGATTTTGCTCAAAATATGCCTAATTATTCTGTGCCAAACTTGGACCTTGGTGTCTACAACTACACTATTCTCAATCTCACTACAGAGATAGACTTGCTACAAAACAAGTCTGATCAACTACTTGCATCCACTGTGCGTCTGCAAGAACTTATTGACAACCTCAACAAGACCTATGTTGACCTTGAGTGGTTGAATCGCTTCGAACAATATGTTAAATGGCCATGGTATGTTTGGTTAGCAATTTTCCTTGCCATCATACTTTTCTCCTTTTTAATGCTTTATTGTTGTTGTGCCACTGGTTGTTGTGGTTGTTTAAGTTGCTTGTCTAGTTCTTGTGATTGTGGTAAAAACCTTCAACATTACGAAGTAGAAAAAGTCCACATTCAGTGATGGAAACTGGATTGTTTCAAACGCACTTAGTCCCTGCAGTGCAAAAAGTTAAGCAACTTGTTGAGCGGATGCCTATCCCTGACGTTCATTTTCAGCATGCGTTGCCTATTTCAAATTTTCTATTTACAAGTGTTTTCGTAGTTTACTTTGCACTTTACAAGGCAAAATCAGTTAAAAATAACTGTGTTTTGCTTTGTTTAAGGCTGTTTGCTATGTTCTTTTATGCACCTTTACTATGTTACTTTGAATTGTACGTAGATGCGGTGCTTGTTTTTGTCGTGCTCTACATTAGATTAATGTACGTTACTTATTGGTCTTGCCGATATCGTACTTTAGCATTTATTGTGCTTAACACTGACAAACTTGCCTTTGTTCAAGGCTACTATTGGTACTATAATGACAATTCTTACATCACCCTACAAGGTGGTGAGAATTTTCTCATTTTAGGAACTAAGTTAGTGCCTTTTGCATTGGCTAATGACATTTACATAGCTCTTCGTGGCAAGAAAGATGACG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| 41,367 |
MZ081390.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
|
Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
|
China
|
2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,479 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Hipposideros pomona
|
feces
|
2019-11-07
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/HpYN13/2019, complete genome
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| 41,368 |
MZ081391.1
|
Alphacoronavirus sp.
|
Zhou,H., Ji,J., Chen,X., Bi,Y., Li,J., Wang,Q., Hu,T., Song,H., Zhao,R., Chen,Y., Cui,M., Zhang,Y., Hughes,A.C., Holmes,E.C., Shi,W.
|
Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences, Key Laboratory of Etiology and Epidemiology of Emerging Infectious Diseases in Universities of Shandong
|
China
|
2021-06-15
| null |
Alphacoronavirus sp.
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,498 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Rhinolophus malayanus
|
feces
|
2020-07-14
| null | null |
Alphacoronavirus sp. strain bat/Yunnan/RmYN22/2020, complete genome
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| 41,369 |
OV054251.1
|
Alphamesonivirus 1
| null |
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2021-11-25
|
CCT1C7-20
|
Alphamesonivirus 1
|
Alphamesonivirus
|
Mesoniviridae
|
ssRNA(+)
| 20,125 |
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Culex pipiens
| null |
2019-09-24
|
SAMEA10017989
|
PRJEB45282
|
Alphamesonivirus 1 isolate CCT1C7-20 genome assembly, complete genome: monopartite
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TGCAGATATCAATACATATCTTGTGCGAAGAAAATACATTGCGAGAGACGCATTGAGTAGTGAAGCATTAGGACCCCGAAATCGGTTAGGGCTTAGTAGTATGGAGCTTGGCATTACAGGTAAAA
| 35,736 |
MW699044.1
|
Alphamesonivirus 1
|
Wang,L., Rosales Rosas,A.L., De Coninck,L., Shi,C., Bouckaert,J., Matthijnssens,J., Delang,L.
|
KU Leuven, Microbiology, Immunology and Transplantation
|
Belgium
|
2021-04-18
|
AV1_Leuven_Pool1
|
Alphamesonivirus 1
|
Alphamesonivirus
|
Mesoniviridae
|
ssRNA(+)
| 20,145 |
GenBank
| null |
Belgium
|
Belgium
|
Culicidae
| null |
2019
| null | null |
Alphamesonivirus 1 isolate AV1_Leuven_Pool1, complete genome
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| 42,613 |
MN101550.1
|
Alphamesonivirus 1
|
Sardi,S.I., Carvalho,R.H., Pacheco,L.G.C., de Almeida,J.P.P., Belitardo,E.M.M.A., Pinheiro,C.S., Campos,G.S., Aguiar,E.R.G.R., Hughes,R., Rocha,D.J.P., Belitardo,E.M.M.
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Universidade Federal da Bahia, Programa de Pos-graduacao em Biotecnologia - Instituto de Ciencias da Saude
| null |
2020-07-21
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Salvador
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Alphamesonivirus 1
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Alphamesonivirus
|
Mesoniviridae
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ssRNA(+)
| 20,194 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
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Aedes albopictus
| null |
2017-11-11
| null | null |
Alphamesonivirus 1 isolate Salvador, complete genome
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| 48,260 |
MT197495.1
|
Alphamesonivirus 1
|
Ferreira,R.S., Cruz,L.C.T.A., Souza,V.J., Neves,N.A.S., Souza,V.C., Filho,L.C.F., Lemos,P.S., Lima,C.P.S., Naveca,F.G., Atanaka,M., Nunes,M.R.T., Slhessarenko,R.D.
|
Universidade Federal de Mato Grosso, Ciencias Basicas em Saude
| null |
2020-05-13
| null |
Alphamesonivirus 1
|
Alphamesonivirus
|
Mesoniviridae
|
ssRNA(+)
| 20,161 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Culex quinquefasciatus
| null |
2017
| null | null |
UNVERIFIED: Alphamesonivirus 1 strain 112, complete genome
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| 50,527 |
MT096515.1
|
Alphamesonivirus 1
|
Birnberg,L., Temmam,S., Aranda,C., Correa-Fiz,F., Talavera,S., Bigot,T., Eloit,M., Busquets,N.
|
IRTA, Animal Health CReSA
|
Spain
|
2020-03-25
|
FTA1-1
|
Alphamesonivirus 1
|
Alphamesonivirus
|
Mesoniviridae
|
ssRNA(+)
| 20,053 |
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
| null | null |
2015
|
SAMN13978317
|
PRJNA604676
|
MAG: Alphamesonivirus 1 isolate FTA1-1, complete genome
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GAGTAGTGAAGCATTAGGACCCCGAAATCGGTTAGGGCTTAGTAGTATGGAGC
| 53,182 |
MH520100.1
|
Alphamesonivirus 1
|
Hang,J., Sanborn,M.A., Fung,C.K., Figueroa,K.L., Kim,H.-C., Klein,T.A., Jarman,R.G.
|
Walter Reed Army Institute of Research, Viral Diseases Branch
|
USA
|
2018-08-14
| null |
Alphamesonivirus 1
|
Alphamesonivirus
|
Mesoniviridae
|
ssRNA(+)
| 20,089 |
GenBank
| null |
South Korea: Yongsan
|
South Korea
|
Culex pipiens
| null |
2016-10-14
| null | null |
Alphamesonivirus 1 strain A16.2707/ROK/2016, complete genome
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TCTTGTGCGAAGAAAATACATTGCGAGAGACGCATTGAGTAGTGAAGCATTAGGACCCCGAAATCGGTTAGGGCTTAGTAGTATGGAGC
| 69,219 |
MH520101.1
|
Alphamesonivirus 1
|
Hang,J., Sanborn,M.A., Fung,C.K., Figueroa,K.L., Kim,H.-C., Klein,T.A., Jarman,R.G.
|
Walter Reed Army Institute of Research, Viral Diseases Branch
|
USA
|
2018-08-14
| null |
Alphamesonivirus 1
|
Alphamesonivirus
|
Mesoniviridae
|
ssRNA(+)
| 20,089 |
GenBank
| null |
South Korea: Yongsan
|
South Korea
|
Culex pipiens
| null |
2016-10-17
| null | null |
Alphamesonivirus 1 strain 16-0986/ROK/2016, complete genome
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TCTTGTGCGAAGAAAATACATTGCGAGAGACGCATTGAGTAGTGAAGCATTAGGACCCCGAAATCGGTTAGGGCTTAGTAGTATGGAGC
| 69,220 |
MH520102.1
|
Alphamesonivirus 1
|
Hang,J., Sanborn,M.A., Fung,C.K., Figueroa,K.L., Kim,H.-C., Klein,T.A., Jarman,R.G.
|
Walter Reed Army Institute of Research, Viral Diseases Branch
|
USA
|
2018-08-14
| null |
Alphamesonivirus 1
|
Alphamesonivirus
|
Mesoniviridae
|
ssRNA(+)
| 20,085 |
GenBank
| null |
South Korea: Yongsan
|
South Korea
|
Culex pipiens
| null |
2016-09-19
| null | null |
Alphamesonivirus 1 strain 16-0840/ROK/2016, complete genome
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