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38,118
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus A
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Picornaviridae
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7,103
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
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34,254
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rhinovirus A46
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-12-11
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Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
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GenBank
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null
2021-06-22
SAMN21173567
PRJNA1066815
Rhinovirus A46 strain RvA46/USA/2021/5MXX66, complete genome
TCCCACCCAGATTTCCCATGTGGAGTAGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATAACCCCTACCCCAAGCAACTTAGAAGATAAGCACACTCGACCAATAGTGGGTGATTATCCAAATCATCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGAAGTTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAACTGAGATCGTTATCCGCAAAATGCCTACACAAAGCCTAGTATCATCTTGAAAGGCGCAGAGTTGGTCGTTCCGCTATTCCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAAACCCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTTGCAAGGCACGAAGCCCTGTGTTTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCATTTTGATTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCACACAAACCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGACGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTCTTTTTACTTTTTACTTGCTTATGGTGACAATATATAGATATATATTGACACCATGGGCGCACAGGTTTCTAGACAGAATGTTGGTACACACTCTACACAGAACACAGTTGCCAACGGCTCTAGTCTAAATTATTTTAACATCAATTACTTTAAAGATGCAGCATCATCTGGAGCATCGAGATTGGATTTCTCACAAGATCCCAGCAAATTCACTGACCCAGTCAAGGATGTTTTAACAAAAGGTATCCCTACTCTACAATCCCCTTCAGTTGAAGCATGTGGGTATTCTGACAGAATCATACAAATAACCCGTGGTAATTCAACTATTACATCACAAGATATAGCTAATGCTGTTGTGGGATATGGAGTTTGGCCAGAATATCTGGCTGATGATGATGCTAGTGCCATAGACAAACCAACACATCCAGATACATCATCTAACCGGTTTTACACCTTAGAAAGTAAACGTTGGGAGAATGACTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCATTAAAGAGTATGGGCATATTCGGTGAAAATATGTTTTACCACCACTTGGGTAGGGCTGGTTATACCATACATGTACAATGCAATGCCAGTAAATTCCATCAGGGTACTTTAATAGTCGTTGCCATACCAGAACATCAGCTGGCTTACATAGGTGGAGGCAATGTTACTGTTGGGTATAATCATACACACCCGGGTGAGTCAGGGAGACGAATCGGGGGTTTTGATGGTACTGAGCGTAACAGACAACCTAGTGATGAAAACTGGCTCAATTGCAATGGAACCTTGTTAGGGAATTTAACTATTTTTCCCCATCAATTCATTAATTTGAGGAGTAATAATTCAGCAACTCTTATATTACCATATGTTAATGCAGTGCCTATGGATTCAATGCTTAGACACAACAACTGGAGTTTGGTCATTATACCAGTTTGCCCCCTCGAAGTAGCACAGGGATCAGAGCAATATGTACCAATAACCATATCAATTAGCCCAATGTGCTCAGAGTTCTCTGGAGCACGTAATGCAGCAAAGACACAGGGGTTACCTGTATTCATTACTCCAGGTTCAGCACAGTTTCTTACTACTGATGATACACAATCACCATCAGCTTTGCCGTATTTCCACCCTACTAAGGAAATATTTATACCAGGTGAAGTCAAAAACCTCTCAGAAATTTGCCAAGTGGATTCTATGATACCTGTAAACAATGTTGAAGCAAACAAAAATTCTGTGAATATGTACTCTGTTGTCCTTTCAAAACAAACAGATCCTGCAGAAGAAATCTTTGCAATCCCAGTAGATGTGGCCTCCCAACCGTTAGCTACAACACTTATAGGTGAAATTGCTAGCTATTACACACACTGGACAGGGAGCATAAGAATCAGTTTTATGTTTTGTGGGTCTGCCAATACTAGCCTCAAACTACTAATAGCATACACCCCCCCAGGTGTCCCTAAACCTACTAGTAGAAAAGAAGCAATGCTTGGAACACACTTAGTTTGGGATGTAGGTTTACAATCAACAGCTTCTATGGTTATACCATGGGTATCTGCATCCCATTATAGATTCACTACCCCAGATATCTATACTTTAGCAGGTTATGTAACATGTTGGTACCAGACAAATCTTGTTGTGGCACCAAACACACCAACAACAGCCAGAATGATCTGTTTTGTATCAGGGTGTAAGGACTTTTGCCTACGAATGGCTAGAGACACTAACCTGCACACTCAGACTGGAGCTATTACCCAAAATCCAGTGGAAAAATATACAGAAGCTGTTCTTAATGAGGTCCTTGTAGTACCTAACATCAATGCTAGTAGTGGACATACATCCAATGCAGCTCCAACACTTGATGCAGCAGAAACTGGACATACGAGTCAAATACAACCAGAGGACATGATAGAAACCAGGTATGTTATCACAGACCAAACAAAAGATGAGATGAGTATAGAAAGTTTTCTAGGAAGATCAGGCTGCATTGCCATCATTAAGACAGAATTGAACCATGAAGAAGGGAAATACAATGCAGAAGGTCAAAATTTCTCAAAATGGAAAATATCACTGCTGGAAATGGCACAAATCAGAAGGAAGTGTGAACTTTTTACATACCTTAGATTTGACTCAGAAATAACAATAGTCACCACACTAGCAGGCCAAGGAGATGACATTGGACATGTGGTCATACAATACATGTATGTGCCTCCCGGTGCTCCATTACCGAAATACCGGAATGATTACACTTGGCAGTCTGGTACTAATGCTTCAGTGTTTTGGCAGCAAGGGCAACCATACCCTAGATTTACTATCCCATTCATGAGTATAGCTTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGTTATGAAAGTGATAAAGGTAAGATCTATGGAACTGCAGTTACCAATGATATGGGAACAATGTGTGTCAGAATTGTCACTGAACAACAAAGGCACAAGGTCCTCATAACTAGCCGAATATACCACAAGGCTAAACACATTAAAGCATGGTGCCCTAGAGCACCCAGGGCAGTCCCATACCAACATATTTATAATCCAAATTTCAAGACTACCCAACCTGAGACTATACCAGACACTCATATTGAAATTAGAAGGGATATTAAATACATTAAAACAGCTGGTCCATCAGACCTCTATGCTCATGTGGGAGATTTGATATACAAAAATCTACATTTATGTGAACCAGAAAATCTAAATGATTCTATTCTAATCAGTTACTCTAGTGACCTTGTCATTTACCGCACAAACACTACAGGTAATGACATAATTCCAACATGTGACTGTACGATAGGTACATATTACTGTAAACATAAAGACAGATATTACCCTGTGGCTGTAACAAAACATCACTGGTATGAGATACAGGAATCAGACTATTATCCTAAACACATCCAATATAACATCTTGTTGGGTGTAGGACCTTGTAAACCAGGTGACTGCGGAGGCAAACTCCTTTGCAAACATGGTGTGATTGGTATAATAACTGCTGGAGGTGATAACCACGTAGCTTTTATAGATCTTAGGGACTTCCAAGTTGCCGAAGAACAAGGAATACCAGAATACATCCACTCTCTTGGTGAAGCTTTTGGTTCAGGGTTTGTGGACAATATTAAAGACCAAATCCAGACTATCAACCCAATTAATAAAATAACAAGCAAAATAGTCAAGTGGGTGATAAGGATCATTTCAGCTGTCACTATAATAATCAGAAACAGTGCAGATCCACATACAATAGTAGCCACACTAGCTCTGTTGGGCTGTTCAGGTTCACCTTGGAGATTCATTAAAGAAAAGGTTTGTGGATGGTTACAGCTCAACTACATACACAAAGAATCAGATGGGTGGGTTAAAAAATTTACAGAAATGTGTAATGCTGCTAGAGGATTAGAATGGTTAGGCAATAAAATCTCAAAATTCATTGATTGGCTTAAATCCATGTTACCACAAGCCAGATTAAAAGTAGATTTTATTAAGAATCTTAAACAATTACCATTATTAGAAAAACAAGTGGATGGATTGAGACTTGCAACACAAAAACAACAACAGGAGTACATAGACACTCTTACTTTAATGCTGGATTCATCAAATAAATTCTTACCCCTTTATGCACTGGAGAATAAACGGATTAAAGAATTACTAAAAAGAGGTCAAATGATACTCCGCACATCCAAAAGAACTGAACCAGTTGGAGTCATTTTCCATGGTGAACCAGGCACAGGGAAATCAATCACAACATCTATTCTTGCTAGAATGCTCACTTCAGAATCAGACATTTACTCACTGCCCCCATCGCCCAAATATTTTGATGGGTATGACCAGCAAAGTGTGGTTATTATGGATGACATAATGCAAAACCCCAGTGGAGAGGACATGTCATTATTTTGTCAAATGGTGTCGTCTGTGCCATTTATACCACCCATGGCCGACCTACCGGACAAAGGAAAACCATTCTCATCAGACTATGTGCTTGCAAGCACTAATCATACTTTACTCCACCCTCCAACAATCACGTGCACAACAGCAATGAACAGGAGATTCTTCCTAGATTTAGATATCATTGTTAAAGAAGAATACAAACTAAATCAAGGTAAATTAAATCTACAGTGTGCACTCAAACCATGCAAAGAAGGGAAAATTGGTAATGCAAAATGTTGCCCTCTCATCTGTGGAAAGGCTTTGCAATTCAGAGATAGAAATAACGGAGAACATTTATCTCTAGCAACTATATATAACAGAATTACTCAAGAAAGTAAGAACAGGAAAGAGTTAACAAACTCATTACAAGCAATTTTCCAGGGACCAATTGATGTTGTAAATAAGCCACCACCACCAGCTATTGTGGATTTACTCAAATCAGTTAGAAATCCAGATGTGATTAGATATTGTGAGGAAAATAAATGGATAATCCCTGCAGATTGTAAACTTGAACGGGATCTTAA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35,272
OK181462.1
rhinovirus A46
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,105
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-17
SAMN20932996
PRJNA1066815
Rhinovirus A46 strain RvA46/USA/2021/9QUT2Q, complete genome
CATGTGGAGTAGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATAACCCCTACCCCAAGCAACTTAGAAGATAAGCACACTCGACCAATAGTGGGTGATTATCCAAATCATCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGAAGTTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAACTGAGATCGTTATCCGCGAAATGCCTACACAAAGCCTAGTATCATCTTGAAAGGCGCAGAGTTGGTCGTTCCGCTATTCCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAAACCCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTTGCAAGGCACGAAGCCCTGTGTTTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCATTTTGATTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCACACAAACCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGACGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTCTTTTTACTTTTTACTTGCTTATGGTGACANNATATATAGATATATATTGACACCATGGGCGCACAGGTTTCTAGACAGAATGTTGGTACACACTCTACACAGAACACAGTTGCCAACGGCTCTAGTCTAAATTATTTTAACATCAATTACTTTAAAGATGCAGCATCATCTGGAGCATCGAGATTGGATTTCTCACAAGATCCCAGCAAATTCACTGACCCAGTCAAGGATGTTTTAACAAAAGGTATCCCTACTTTACAATCCCCTTCAGTTGAAGCATGTGGGTATTCTGACAGAATCATACAAATAACCCGTGGTAATTCAACTATTACATCACAAGATATAGCTAATGCTGTTGTGGGATATGGAGTTTGGCCAGAATATCTGGCTGATGATGATGCTAGTGCCATAGACAAACCAACACATCCAGATACATCATCTAACCGGTTTTACACCTTAGAAAGTAAACGTTGGGAGAATGACTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCATTAAAGAGTATGGGCATATTCGGTGAAAATATGTTTTACCACCACTTGGGTAGGGCTGGTTATACCATACATGTACAATGCAATGCCAGTAAATTCCATCAGGGTACTTTAATAGTCGTTGCCATACCAGAACATCAGCTGGCTTACATAGGTGGAGGCAATGTTACTGTTGGGTATAATCATACACACCCGGGTGAATCAGGGAGACGAATCGGGGGTTTTGATGGTACTGAGCGTAACAGACAACCTAGTGATGAAAACTGGCTCAATTGCAATGGAACCTTGTTAGGGAATTTAACTATTTTTCCCCATCAATTCATTAATTTGAGGAGTAATAATTCAGCAACTCTTATATTACCATATGTTAATGCAGTGCCTATGGATTCAATGCTTAGACACAATAACTGGAGTTTGGTCATTATACCAGTTTGCCCCCTCGAAGTAGCACAGGGATCAGAGCAATATGTACCAATAACCATATCAATTAGCCCAATGTGCTCAGAGTTCTCTGGAGCACGTAATGCAGCAAAGACACAGGGGTTACCTGTATTCATTACTCCAGGTTCAGCACAGTTTCTTACTACTGATGATACACAATCACCATCAGCTTTGCCGTATTTCCACCCTACTAAGGAAATATTTATACCAGGTGAAGTCAAAAACCTCTCAGAAATTTGCCAAGTGGATTCTATGATACCTGTAAACAATGTTGAAGCAAACAAAAATTCTGTGAATATGTACTCTGTTGTCCTTTCAAAACAAACAGATCCTGCAGAAGAAATCTTTGCAATCCCAGTAGATGTGGCCTCCCAACCATTAGCTACAACACTTATAGGTGAAATTGCTAGCTATTACACACACTGGACAGGGAGCATAAGAATCAGTTTTATGTTTTGTGGGTCTGCCAATACTAGCCTCAAACTACTAATAGCATATACCCCCCCAGGTGTCCCTAAACCTACTAGTAGAAAAGAAGCAATGCTTGGAACACACTTAGTTTGGGATGTAGGTTTACAATCAACAGCTTCTATGGTTATACCATGGGTATCTGCATCCCATTATAGATTCACTACCCCAGATATCTATACTTTAGCAGGTTATGTAACATGTTGGTACCAGACAAATCTTGTTGTGGCACCAAACACACCAACAACAGCCAGAATGATCTGTTTTGTATCAGGGTGTAAGGACTTTTGCCTACGAATGGCTAGAGACACTAACCTGCACACTCAGACTGGAGCTATTACCCAAAATCCAGTGGAAAAATATACAGAAGCTGTTCTTAATGAGGTCCTTGTAGTACCTAACATCAATGCTAGTAGTGGACATACATCCAATGCAGCTCCAACACTTGATGCAGCAGAAACTGGACATACGAGTCAAATACAACCAGAGGACATGATAGAAACCAGGTATGTTATCACAGACCAAACAAAAGATGAGATGAGTATAGAAAGTTTTCTAGGAAGATCAGGCTGCATTGCCATCATTAAGACAGAATTGAACCATGAAGAAGGGAAATACAATGCAGAAGGTCAAAATTTCTCAAAATGGAAAATATCACTGCTGGAAATGGCACAAATCAGAAGGAAGTGTGAACTTTTTACATACCTTAGATTTGACTCAGAAATAACAATAGTCACCACACTAGCAGGCCAAGGAGATGACATTGGACATGTGGTCATACAATACATGTATGTGCCTCCCGGTGCTCCATTACCGAAATACCGGAATGATTACACTTGGCAGTCTGGTACTAATGCTTCAGTGTTTTGGCAGCAAGGGCAACCATACCCTAGATTTACTATCCCATTCATGAGTATAGCCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGTTATGAAAGTGATAAAGGTAAGATCTATGGAACTGCAGTTACCAATGATATGGGAACAATGTGTGTCAGAATTGTCACTGAACAACAAAGGCACAAGGTCCTCATAACTAGCCGAATATACCACAAGGCTAAACACATTAAAGCATGGTGCCCTAGAGCACCCAGGGCAGTCCCATACCAACATATTTATAATCCAAATTTCAAGACTACCCAACCTGAGACTATACCAGACACTCATATTGAAATTAGAAGGGATATTAAATACATTAAAACAGCTGGTCCATCAGACCTCTATGCTCATGTGGGAGATTTGATATACAAAAATCTACATTTATGTGAACCAGAAAATCTAAATGATTCTATTCTAATCAGTTACTCTAGTGACCTTGTCATTTACCGCACAAACACTACAGGTGATGACATAATTCCAACATGTGACTGTACGATAGGTACATACTACTGTAAACATAAAGACAGATATTACCCTGTGGCTGTAACAAAACATCACTGGTATGAGATACAGGAATCAGACTATTATCCTAAACACATCCAATATAACATCTTGTTGGGTGTAGGACCTTGTAAACCAGGTGACTGCGGAGGCAAACTCCTTTGCAAACATGGTGTGATTGGTATAATAACTGCTGGAGGTGATAACCACGTAGCTTTTATAGATCTTAGGGACTTCCAAGTTGCCGAAGAACAAGGAATACCAGAATACATCCACTCTCTTGGTGAAGCTTTTGGTTCAGGGTTTGTGGACAATATTAAAGACCAAATCCAGACTATCAACCCAATTAATAAAATAACAAGCAAAATAGTCAAGTGGGTGATAAGGATCATTTCAGCCGTCACTATAATAATCAGAAACAGTGCAGATCCACATACAATAGTAGCCACACTAGCTCTGTTGGGCTGTTCAGGTTCACCTTGGAGATTCATTAAAGAAAAGGTTTGTGGATGGTTACAGCTCAACTACATACACAAAGAATCAGATGGGTGGGTTAAAAAATTTACAGAAATGTGTAATGCTGCTAGAGGATTAGAATGGTTAGGCAATAAAATCTCAAAATTCATTGATTGGCTTAAATCCATGTTACCACAAGCCAGATTAAAAGTAGATTTTATTAAGAATCTTAAACAATTACCATTATTAGAAAAACAAGTGGATGGATTGAGACTTGCAACACAAAAACAACAACAGGAGTACATAGACACTCTTACTTTAATGCTGGATTCATCAAATAAATTCTTACCCCTTTATGCACTGGAGAATAAACGGATTAAAGAATTACTAAAAAGAGGTCAAATGATACTCCGCACATCCAAAAGAACTGAACCAGTTGGAGTCATTTTCCATGGTGAACCAGGCACAGGGAAATCAATCACAACATCTATTCTTGCTAGAATGCTCACTTCAGAATCAGACATTTACTCACTGCCCCCATCGCCCAAATATTTTGATGGGTATGACCAGCAAAGTGTGGTTATTATGGATGACATAATGCAAAACCCCAGTGGAGAGGACATGTCATTATTTTGTCAAATGGTGTCGTCTGTGCCATTTATACCACCCATGGCCGACCTACCGGACAAAGGAAAACCATTCTCATCAGACTATGTGCTTGCAAGCACTAATCATACTTTACTCCACCCTCCAACAATCACGTGCACAACAGCAATGAACAGGAGATTCTTCCTAGATTTAGATATCATTGTTAAAGAAGAATACAAATTAAATCAAGGTAAATTAAATCTACAGTGTGCACTCAAACCATGCAAAGAAGGGAAAATTGGTAATGCAAAATGTTGCCCTCTCATCTGTGGAAAGGCTTTGCAATTCAGAGATAGAAATAACGGAGAACATTTATCTCTAGCAACTATATATAACAGAATTACTCAAGAAAGTAAGAACAGGAAAGAGTTAACAAACTCATTACAAGCAATTTTCCAGGGACCAATTGATGTTGTAAATAAGCCACCACCACCAGCTATTGTGGATTTACTCAAATCAGTTAGAAATCCAGATGTGATTAGATATTGTGAGGAAAATAAATGGATAATCCCTGCAGATTGTAAACTTGAACGGGATCTTAATTATGCAAATTTAA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37,686
MZ629120.1
rhinovirus A46
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,146
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-01
SAMN20216558
PRJNA1066815
Rhinovirus A46 strain RvA46/USA/2021/6EEDHN, complete genome
TTAAAACTGAATCTGGGTTGTTCCCACCCAGATTTCCCATGTGGAGTAGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATAACCCCTACCCTAAGCAACTTAGAAGATAAGCACACTCGACCAATAGTGGGTGATTATCCAAATCATCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGAAGTTGATATGCCCCACCAGGGCAAAAACAACTGAGATCGTTATCCGCAAAATGCCTACACAAAGCCTAGTATCATCTTGAAAGGCGCAGAGTTGGTCGTTCCGCTATTCCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAAACCCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTTGCAAGGCACGAAGCCCTGTGTTTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCATTTTGATTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCACACAAACCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGACGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTCTTTTTACTTTTTACTTGCTTATGGTGACAATATATAGATATATATTGACACCATGGGCGCACAGGTTTCTAGACAGAATGTTGGTACACACTCTACACAGAACACAGTTGCCAACGGCTCTAGTCTAAATTATTTTAACATCAATTACTTTAAAGATGCAGCATCATCTGGAGCATCGAGATTGGATTTCTCACAAGATCCCAGCAAATTCACTGACCCAGTCAAGGATGTTTTAACAAAAGGTATCCCTACTCTACAATCCCCTTCAGTTGAAGCATGTGGGTATTCTGACAGAATCATACAAATAACCCGTGGTAATTCAACTATTACATCACAAGATATAGCTAATGCTGTTGTGGGATATGGAGTTTGGCCAGAATATCTGGCTGATGATGATGCTAGTGCCATAGACAAACCAACACATCCAGATACATCATCTAACCGGTTTTACACCTTAGAAAGTAAACGTTGGGAGAATGACTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCATTAAAGAGTATGGGCATATTCGGTGAAAATATGTTTTACCACCACTTGGGTAGGGCTGGTTATACCATACATGTACAATGCAATGCCAGTAAATTCCATCAGGGTACTTTAATAGTCGTTGCCATACCAGAACATCAGCTGGCTTACATAGGTGGAGGCAATGTTACTGTTGGGTATAATCATACACACCCAGGTGAGTCAGGGAGACGAATCGGGGGTTTTGATGGTACTGAGCGTAACAGACAACCTAGTGATGAAAACTGGCTCAATTGCAATGGAACCTTGTTAGGGAATTTAACTATTTTTCCCCATCAATTCATTAATTTGAGGAGTAATAATTCAGCAACTCTTATATTACCATATGTTAATGCAGTGCCTATGGATTCAATGCTTAGACACAATAACTGGAGTTTGGTCATTATACCAGTTTGCCCCCTCGAAGTAGCACAGGGATCAGAGCAATATGTACCAATAACCATATCAATTAGCCCAATGTGCTCAGAGTTCTCTGGAGCACGTAATGCAGCAAAGACACAGGGGTTACCTGTATTCATTACTCCAGGTTCAGCACAGTTTCTTACTACTGATGATACACAATCACCATCAGCTTTGCCGTATTTCCACCCTACTAAGGAAATATTTATACCAGGTGAAGTCAAAAACCTCTCAGAAATTTGCCAAGTGGATTCTATGATACCTGTAAACAATGTTGAAGCAAACAAAAATTCTGTGAATATGTACTCTGTTGTCCTTTCAAAACAAACAGATCCTGCAGAAGAAATCTTTGCAATCCCAGTAGATGTGGCCTCCCAACCATTAGCTACAACACTTATAGGTGAAATTGCTAGCTATTACACACACTGGACAGGGAGCATAAGAATCAGTTTTATGTTTTGTGGGTCTGCCAATACTAGCCTCAAACTACTAATAGCATATACCCCCCCAGGTGTCCCTAAACCTACTAGTAGAAAAGAAGCAATGCTTGGAACACACTTAGTTTGGGATGTAGGTTTACAATCAACAGCTTCTATGGTTATACCATGGGTATCTGCATCCCATTATAGATTCACTACCCCAGATATCTATACTTTAGCAGGTTATGTAACATGTTGGTACCAGACAAATCTTGTTGTGGCACCAAACACACCAACAACAGCCAGAATGATCTGTTTTGTATCAGGGTGTAAGGACTTTTGCCTACGAATGGCTAGAGACACTAACCTGCACACTCAGACTGGAGCTATTACCCAAAATCCAGTGGAAAAATATACAGAAGCTGTTCTTAATGAGGTCCTTGTAGTACCTAACATCAATGCTAGTAGTGGACATACATCCAATGCAGCTCCAACACTTGATGCAGCAGAAACTGGACATACGAGTCAAATACAACCAGAGGACATGATAGAAACCAGGTATGTTATCACAGACCAAACAAAAGATGAGATGAGTATAGAAAGTTTTCTAGGAAGATCAGGCTGCATTGCCATCATTAAGACAGAATTGAACCATGAAGAAGGGAAATACAATGCAGAAGGTCAAAATTTCTCAAAATGGAAAATATCACTGCTGGAAATGGCACAAATCAGAAGGAAGTGTGAACTTTTTACATACCTTAGATTTGACTCAGAAATAACAATAGTCACCACACTAGCAGGCCAAGGAGATGACATTGGACATGTGGTCATACAATACATGTATGTGCCTCCCGGTGCTCCATTACCGAAATACCGGAATGATTACACTTGGCAGTCTGGTACTAATGCTTCAGTGTTTTGGCAGCAAGGGCAACCATACCCTAGATTTACTATCCCATTCATGAGTATAGCCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGTTATGAAAGTGATAAAGGTAAGATCTATGGAACTGCAGTTACCAATGATATGGGAACAATGTGTGTCAGAATTGTCACTGAACAACAAAGGCACAAGGTCCTCATAACTAGCCGAATATACCACAAGGCTAAACACATTAAAGCATGGTGCCCTAGAGCACCCAGGGCAGTCCCATACCAACATATTTATAATCCAAATTTCAAGACTACCCAACCTGAGACTATACCAGACACTCATATTGAAATTAGAAGGGATATTAAATACATTAAAACAGCTGGTCCATCAGACCTCTATGCTCATGTGGGAGATTTGATATACAAAAATCTACATTTATGTGAACCAGAAAATCTAAATGATTCTATTCTAATCAGTTATTCTAGTGACCTTGTCATTTACCGCACAAACACTACAGGTGATGACATAATTCCAACATGTGACTGTACGATAGGTACATACTACTGTAAACATAAAGACAGATATTACCCTGTGGCTGTAACAAAACATCACTGGTATGAGATACAGGAATCAGACTATTATCCTAAACACATCCAATATAACATCTTGTTGGGTGTAGGACCTTGTAAACCAGGTGACTGCGGAGGCAAACTCCTTTGCAAACATGGTGTGATTGGTATAATAACTGCTGGAGGTGATAACCACGTAGCTTTTATAGATCTTAGGGACTTCCAAGTTGCCGAAGAACAAGGAATACCAGAATACATCCACTCTCTTGGTGAAGCTTTTGGTTCAGGGTTTGTGGACAATATTAAAGACCAAATCCAGACTATCAACCCAATTAATAAAATAACAAGCAAAATAGTCAAGTGGGTGATAAGGATCATTTCAGCCGTCACTATAATAATCAGAAACAGTGCAGATCCACATACAATAGTAGCCACACTAGCTCTGTTGGGCTGTTCAGGTTCACCTTGGAGATTCATTAAAGAAAAGGTTTGTGGATGGTTACAGCTCAACTACATACACAAAGAATCAGATGGGTGGGTTAAAAAATTTACAGAAATGTGTAATGCTGCTAGAGGATTAGAATGGTTAGGCAATAAAATCTCAAAATTCATTGATTGGCTTAAATCCATGTTACCACAAGCCAGATTAAAAGTAGATTTTATTAAGAATCTTAAACAATTACCATTATTAGAAAAACAAGTGGATGGATTGAGACTTGCAACACAAAAACAACAACAGGAGTACATAGACACTCTTACTTTAATGCTGGATTCATCAAATAAATTCTTACCCCTTTATGCACTGGAGAATAAACGGATTAAAGAATTACTAAAAAGAGGTCAAATGATACTCCGCACATCCAAAAGAACTGAACCAGTTGGAGTCATTTTCCATGGTGAACCAGGCACAGGGAAATCAATCACAACATCTATTCTTGCTAGAATGCTCACTTCAGAATCAGACATTTACTCACTGCCCCCATCGCCCAAATATTTTGATGGGTATGACCAGCAAAGTGTGGTTATTATGGATGACATAATGCAAAACCCCAGTGGAGAGGACATGTCATTATTTTGTCAAATGGTGTCGTCTGTGCCATTTATACCACCCATGGCCGACCTACCGGACAAAGGAAAACCATTCTCATCAGACTATGTGCTTGCAAGCACTAATCATACTTTACTCCACCCTCCAACAATCACGTGCACAACAGCAATGAACAGGAGATTCTTCCTAGATTTAGATATCATTGTTAAAGAAGAATACAAATTAAATCAAGGTAAATTAAATCTACAGTGTGCACTCAAACCATGCAAAGAAGGGAAAATTGGTAATGCAAAATGTTGCCCTCTCATCTGTGGAAAGGCTTTGCAATTCAGAGATAGAAATAACGGAGAACATTTATCTCTAGCAACTATATATAACAGAATTACTCAAGAAAGTAAGAACAGGAAAGAGTTAACAAACTCATTACAAGCAATTTTCCAGGGACCAATTGATGTTGTAAATAAGCCACCACCACCAGCTATTGTGGATTTACTCAAATCAGTTAGAAATCCAGATGTGATTAGATATTGTGAGGAAAATAAATGGATAATCCCTGCAGATTG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39,595
MZ629147.1
rhinovirus A46
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,146
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-05
SAMN20216640
PRJNA1066815
Rhinovirus A46 strain RvA46/USA/2021/L2824D, complete genome
TTAAAACTGAATCTGGGTTGTTCCCACCCAGATTTCCCATGTGGAGTAGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATAACCCCTACCCTAAGCAACTTAGAAGATAAGCACACTCGACCAATAGTGGGTGATTATCCAAATCATCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGAAGTTGATATGCCCCACCAGGGCAAAAACAACTGAGATCGTTATCCGCAAAATGCCTACACAAAGCCTAGTATCATCTTGAAAGGCGCAGAGTTGGTCGTTCCGCTATTCCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAAACCCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGTGCCTTGCAAGGCACGAAGCCCTGTGTTTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCATTTTGATTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCACACAAACCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGACGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTCTTTTTACTTTTTACTTGCTTATGGTGACAATATATAGATATATATTGACACCATGGGCGCACAGGTTTCTAGACAGAATGTTGGTACACACTCTACACAGAACACAGTTGCCAACGGCTCTAGTCTAAATTATTTTAATATCAATTACTTTAAAGATGCAGCATCATCTGGAGCATCGAGATTGGATTTCTCACAAGATCCCAGCAAATTCACTGACCCAGTCAAGGATGTTTTAACAAAAGGTATCCCTACTCTACAATCCCCTTCAGTTGAAGCATGTGGGTATTCTGACAGAATCATACAAATAACCCGTGGTAATTCAACTATTACATCACAAGATATAGCTAATGCTGTTGTGGGATATGGAGTTTGGCCAGAATATCTGGCTGATGATGATGCTAGTGCCATAGACAAACCAACACATCCAGATACATCATCTAACCGGTTTTACACCTTAGAAAGTAAACGTTGGGAGAATGACTCTAAAGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCATTAAAGAGTATGGGCATATTCGGTGAAAATATGTTTTACCACCACTTGGGTAGGGCTGGTTATACCATACATGTACAATGCAATGCCAGTAAATTCCATCAGGGTACTTTAATAGTCGTTGCCATACCAGAACATCAGCTGGCTTACATAGGTGGAGGCAATGTTACTGTTGGGTATAATCATACACACCCAGGTGAGTCAGGGAGACGAATCGGGGGTTTTGATGGTACTGAGCGTAACAGACAACCTAGTGATGAAAACTGGCTCAATTGCAATGGAACCTTGTTAGGGAATTTAACTATTTTTCCCCATCAATTCATTAATTTGAGGAGTAATAATTCAGCAACTCTTATATTACCATATGTTAATGCAGTGCCTATGGATTCAATGCTTAGACACAATAACTGGAGTTTGGTCATTATACCAGTTTGCCCCCTCGAAGTAGCACAGGGATCAGAGCAATATGTACCAATAACCATATCAATTAGCCCAATGTGCTCAGAGTTCTCTGGAGCACGTAATGCAGCAAAGACACAGGGGTTACCTGTATTCATTACTCCAGGTTCAGCACAGTTTCTTACTACTGATGATACACAATCACCATCAGCTTTGCCGTATTTCCACCCTACTAAGGAAATATTTATACCAGGTGAAGTCAAAAACCTCTCAGAAATTTGCCAAGTGGATTCTATGATACCTGTAAACAATGTTGAAGCAAACAAAAATTCTGTGAATATGTACTCTGTTGTCCTTTCAAAACAAACAGATCCTGCAGAAGAAATCTTTGCAATCCCAGTAGATGTGGCCTCCCAACCATTAGCTACAACACTTATAGGTGAAATTGCTAGCTATTACACACACTGGACAGGGAGCATAAGAATCAGTTTTATGTTTTGTGGGTCTGCCAATACTAGCCTCAAACTACTAATAGCATATACCCCCCCAGGTGTCCCTAAACCTACTAGTAGAAAAGAAGCAATGCTTGGAACACACTTAGTTTGGGATGTAGGTTTACAATCAACAGCTTCTATGGTTATACCATGGGTATCTGCATCCCATTATAGATTCACTACCCCAGATATCTATACTTTAGCAGGTTATGTAACATGTTGGTACCAGACAAATCTTGTTGTGGCACCAAACACACCAACAACAGCCAGAATGATCTGTTTTGTATCAGGGTGTAAGGACTTTTGCCTACGAATGGCTAGAGACACTAACCTGCACACTCAGACTGGAGCTATTACCCAAAATCCAGTGGAAAAATATACAGAAGCTGTTCTTAATGAGGTCCTTGTAGTACCTAACATCAATGCTAGTAGTGGACATACATCCAATGCAGCTCCAACACTTGATGCAGCAGAAACTGGACATACGAGTCAAATACAACCAGAGGACATGATAGAAACCAGGTATGTTATCACAGACCAAACAAAAGATGAGATGAGTATAGAAAGTTTTCTAGGAAGATCAGGCTGCATTGCCATCATTAAGACAGAATTGAACCATGAAGAAGGGAAATACAATGCAGAAGGTCAAAATTTCTCAAAATGGAAAATATCACTGCTGGAAATGGCACAAATCAGAAGGAAGTGTGAACTTTTTACATACCTTAGATTTGACTCAGAAATAACAATAGTCACCACACTAGCAGGCCAAGGAGATGACATTGGACATGTGGTCATACAATACATGTATGTGCCTCCCGGTGCTCCATTACCGAAATACCGGAATGATTACACTTGGCAGTCTGGTACTAATGCTTCAGTGTTTTGGCAGCAAGGGCAACCATACCCTAGATTTACTATCCCATTCATGAGTATAGCCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGTTATGAAAGTGATAAAGGTAAGATCTATGGAACTGCAGTTACCAATGATATGGGAACAATGTGTGTCAGAATTGTCACTGAACAACAAAGGCACAAGGTCCTCATAACTAGCCGAATATACCACAAGGCTAAACACATTAAAGCATGGTGCCCTAGAGCACCCAGGGCAGTCCCATACCAACATATTTATAATCCAAATTTCAAGACTACCCAACCTGAGACTATACCAGACACTCATATTGAAATTAGAAGGGATATTAAATACATTAAAACAGCTGGTCCATCAGACCTCTATGCTCATGTGGGAGATTTGATATACAAAAATCTACATTTATGTGAACCAGAAAATCTAAATGATTCTATTCTAATCAGTTATTCTAGTGACCTTGTCATTTACCGCACAAACACTACAGGTGATGACATAATTCCAACATGTGACTGTACGATAGGTACATACTACTGTAAACATAAAGACAGATATTACCCTGTGGCTGTAACAAAACATCACTGGTATGAGATACAGGAATCAGACTATTATCCTAAACACATCCAATATAACATCTTGTTGGGTGTAGGACCTTGTAAACCAGGTGACTGCGGAGGCAAACTCCTTTGCAAACATGGTGTGATTGGTATAATAACTGCTGGAGGTGATAACCACGTAGCTTTTATAGATCTTAGGGACTTCCAAGTTGCCGAAGAACAAGGAATACCAGAATACATCCACTCTCTTGGTGAAGCTTTTGGTTCAGGGTTTGTGGACAATATTAAAGACCAAATCCAGACTATCAACCCAATTAATAAAATAACAAGCAAAATAGTCAAGTGGGTGATAAGGATCATTTCAGCCGTCACTATAATAATCAGAAACAGTGCAGATCCACATACAATAGTAGCCACACTAGCTCTGTTGGGCTGTTCAGGTTCACCTTGGAGATTCATTAAAGAAAAGGTTTGTGGATGGTTACAGCTCAACTACATACACAAAGAATCAGATGGGTGGGTTAAAAAATTTACAGAAATGTGTAATGCTGCTAGAGGATTAGAATGGTTAGGCAATAAAATCTCAAAATTCATTGATTGGCTTAAATCCATGTTACCACAAGCCAGATTAAAAGTAGATTTTATTAAGAATCTTAAACAATTACCATTATTAGAAAAACAAGTGGATGGATTGAGACTTGCAACACAAAAACAACAACAGGAGTACATAGACACTCTTACTTTAATGCTGGATTCATCAAATAAATTCTTACCCCTTTATGCACTGGAGAATAAACGGATTAAAGAATTACTAAAAAGAGGTCAAATGATACTCCGCACATCCAAAAGAACTGAACCAGTTGGAGTCATTTTCCATGGTGAACCAGGCACAGGGAAATCAATCACAACATCTATTCTTGCTAGAATGCTCACTTCAGAATCAGACATTTACTCACTGCCCCCATCGCCCAAATATTTTGATGGGTATGACCAGCAAAGTGTGGTTATTATGGATGACATAATGCAAAACCCCAGTGGAGAGGACATGTCATTATTTTGTCAAATGGTGTCGTCTGTGCCATTTATACCACCCATGGCCGACCTACCGGACAAAGGAAAACCATTCTCATCAGACTATGTGCTTGCAAGCACTAATCATACTTTACTCCACCCTCCAACAATCACGTGCACAACAGCAATGAACAGGAGATTCTTCCTAGATTTAGATATCATTGTTAAAGAAGAATACAAATTAAATCAAGGTAAATTAAATCTACAGTGTGCACTCAAACCATGCAAAGAAGGGAAAATTGGTAATGCAAAATGTTGCCCTCTCATCTGTGGAAAGGCTTTGCAATTCAGAGATAGAAATAACGGAGAACATTTATCTCTAGCAACTATATATAACAGAATTACTCAAGAAAGTAAGAACAGGAAAGAGTTAACAAACTCATTACAAGCAATTTTCCAGGGACCAATTGATGTTGTAAATAAGCCACCACCACCAGCTATTGTGGATTTACTCAAATCAGTTAGAAATCCAGATGTGATTAGATATTGTGAGGAAAATAAATGGATAATCCCTGCAGATTG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39,622
DQ473506.1
rhinovirus A46
Kistler,A.L., Webster,D.R., Rouskin,S., Magrini,V., Credle,J.J., Schnurr,D.P., Boushey,H.A., Mardis,E.R., Li,H., DeRisi,J.L., Webster,D., Reich,S., Credle,J., Schnurr,D., Boushey,H., Mardis,E., Ganem,D., DeRisi,J.
University of California, San Francisco, Biochemistry and Biophysics
USA
2007-05-07
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,149
GenBank
1
USA
USA
null
null
null
null
null
Rhinovirus A46, complete genome
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107,199
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rhinovirus A47
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
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ssRNA(+)
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GenBank
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USA
USA
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2021-07-02
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34,144
OM001387.1
rhinovirus A47
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
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2022-01-04
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Rhinovirus A
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2021-07-06
SAMN24289227
PRJNA1066815
Rhinovirus A47 strain RvA47/USA/2021/P7ZHVJ, complete genome
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34,175
OM001400.1
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UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
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USA
USA
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2021-06-21
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Rhinovirus A
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USA
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2021
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PRJNA723895
Rhinovirus A47 strain RvA47/USA/2021/T4J636, complete genome
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34,235
KY369890.1
rhinovirus A47
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
UW, Lab Medicine
USA
2017-01-15
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,028
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2016
SAMN07309838
PRJNA338014
Rhinovirus A47 strain SC122, complete genome
TGTGGAGTAGTACACTGTTATTACGGTAACCTTGTACGCCAGTTTTATCACCCCTTCCCCCTTGTAACTTAGAAGTTATAAACTCGAGACCAATAGGCAGTGATCAACCAGATCACTAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAACGCTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAGCCGCGATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCAAAGCCTAGTAATATCTTGAATGATGTATGGTTGGTCGTTCAGCTAAACCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAAATTCCCCACTGGCGACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACTCTCACGAGTGCGAAGCCATATATTTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCATACAATCCAGTGTGTGGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTATAATTTGCTTATGGTGACAGTATATAGCTTATATATTGTTACCATGGGCGCACAAGTCTCCAGACAGAATGTTGGCACACACTCCACACAAAACATGGTCTCAAATGGGTCTAGTTTAAATTATTTTAACATAAATTATTTTAAGGATGCAGCCTCCAGCGGCGCTTCAAAATTAGAATTTTCACAAGACCCAAGTAAATTTACTGACCCAGTCAAAGATGTCCTTGAAAAGGGAATCCCAACATTACAATCTCCTACAGTAGAGGCATGTGGTTATTCAGATAGAATAATGCAAATCACAAGGGGTGATTCTACAATAACATCACAGGATGTTGCAAATGCAGTGGTGGGTTATGGGGTATGGCCACACTATTTGAGTGCAAAAGATGCCACTGCTATTGATAAACCCACACAGCCAGACACTTCATCAAATAGATTTTACACATTAGACAGTAAAATATGGAAATCAGATTCTAAGGGATGGTGGTGGAAGTTACCAGATGCATTGAAGGAAATGGGTATATTTGGAGAAAATATGTACTACCATTATCTTGGCAGAAGTGGTTATACTGTACACGTTCAATGCAATGCCAGCAAATTTCATCAAGGGACTTTACTAATTTTGATGATACCTGAACATCAGTTAGCAAATGCAAATGCTACCAATGCAGATGCTGGATACAATTATACCCATCCTGGTGAACGAGGCAGAGAGGTTGGTGGTGATCGCATTGCTCATGCTAACCTCCCAAGTGATGATAACTGGCTCAATTTTGATGGTACTTTATTAGGTAATGCTCTTATATTTCCCCACCAATTTATTAATTTGAGAAGCAATAACTCTGCAACACTGATAGTCCCTTATGTAAATGCTGTTCCAATGGACTCAATGCTTAGACATAATAACTGGAGCTTAGTAATAATTCCAATCTGTGAATTATTGGCAGATACCAAAGCCAGTGCTGTAGTCCCAATCACTATATCAATAAGCCCAATGTTTGCTGAATTCTCTGGGGCACGTGCAAAACCAGTAGCTGCTACACAGGGTCTACCAATTTATATGACACCTGGCTCAGGTCAATTTATGACAACTGATGATTTCCAATCACCTTCAGCCTTACCGTGGTATCACCCAACCAAGGAAATCCTAATCCCAGGGGAGGTCAAAAATTTAATAGAGATGTGTCAGGTGGATACTTTGATCCCTATCAATAACACAACACAAAACTTGAGAAAGGTGAATATGTATACTATACAGTTAGAAAATCAAACAGAAATGGCCAAAGAGATTTTTGCTATTAAAGTAGATATTGCATCACAACCTTTAGCAAACACCATGATTGGAGAAATTGCAAGCTATTTTACACATTGGACTGGTAGTTTGCGTTTTAGTTTCATGTTCTGTGGTACAGCAAATACCACTCTCAAACTACTCCTAGCATACACACCACCAGGCATTGGCAAACCAAGAGACAGGAAGCAAGCTATGCTTGGGACACACATAGTTTGGGACGTTGGGCTGCAGTCAACAGTGTCTTTAGTTGTTCCATGGGTTAGTGCCAGTCATTTTAGATACACATCTAGGGATGAACATTCAGCAGCTGGATTTATAACATGTTGGTATCAGACAAATTTTGTTTTTCCCCCAAACACTCCTAATAGGGCTGACATGCTGTGTTTCGTATCAGCGTGCAAAGATTTCTGCCTGCGCATGGCCAGAGACACAGATATGCACATACAAAATGATGCCATTGAACAAAACCCAATTGAAAATTATGTGGAGGAGGTGCTTAATGAGGTTTTAGTTGTACCAAATATTAAAGAGAGTCATCCAAGCACGTCTAATTCTGCTCCAATTTTAGATGCTGCCGAAACTGGACACACTAGTAATGTACAACCAGAGGACACAATTGAAACCCGATATGTACAAACAACACAAACAAGAGATGAGATGAGCATTGAGAGCTTCCTTGGCAGGTCAGGATGTGTACACTCTTCAACAATAGCACATGATGAACAACACACTAATAAATTTAGAGTGTGGCGCATCAATTTACAAGAAATGGCCCAGATTAGGCGTAAGTATGAAATGTTTACATATGTGAGATTTGATTCAGAGATAACCATGGTTCCAAGCATTGCAGGGTATGGTAATGATGTGGGTCATATAGTCATGCAATATATGTATGTACCACCTGGAGCTCCAGAACCAACAAGTAGAGAACATTTTGCATGGCAATCAGGCACCAATGCATCTATCTTCTGGCAACAAGGACAGCCCTTCCCAAGATTTTCACTACCATTTTTGAGTGTTGCATCTGCTTATTACATGTTTTATGATGGTTATAATGGTGACACACCTGGATCCAAATATGGTACCACAGTAGTCAACCGCATGGGTGCACTGTGCATGAGGGTTGTGACAAATAAACAAGTCAATAAAGTTGAGATTACAACTAATATATACCATAAGGCTAAACATGTGAAAGCATGGTGCCCCAGACCACCCAGAGCTGTTCCATACAGGTATGTTGGATCAACAAATTACAAGAAGCCTAATCAAGAGGATGTTACAATTTTCATTGAACACAGAGAGAACCCAAAAATCATTACAGCAGGACCAAGTGATTTGTTTGTACATGTGGGTAATTTAATATACAGAAATTTACATCTGTTTAATTCAGAAGTACATGACTCAGTATTAATATCATATTCCTCAGATTTAGTCATCTACCGCACAAACACTACAGGTAATGACTACATTCCCACATGTGACTGCACTCAAGCAACCTATTATTGTAGACATAAAGATAGGTATTATCCAATCAATGTCACCAGTCACGACTGGTATGAGATTCAAGAAAGTGAATACTACCCAAAACACATTCAATATAACCTTTTGATTGGTGAAGGTCCATGTGAACCAGGAGACTGTGGAGGAAAGTTATTGTGTAAACATGGAGTGATTGGAATAATAACAGCAGGTGGAGAGGGCCATGTGGCATTTATCGATCTCAGGCAATTTCACTGCGCAGATGAGCAAGGAATAACTGATTACATTCACATGCTGGGTGAAGCCTTTGGATCAGGATTTGTAGATAGTGTCAAAGATCAAATAAATGCTATTAATCCAATTAACAATATTAGTAAAAAGATAGTTAAATGGTTACTTAGGATAATCTCTGCAATGGTTATAATTATTAGAAATTCCTCTGATCCACAAACAATCATAGCCACATTAACACTAATTGGATGTTCAGGTTCCCCCTGGCGATTTCTTAAAGAAAAATTTTGCAAATGGACCCAATTAAATTACATACATAAGGAATCTGATTCATGGTTGAAGAAATTTACTGAAATGTGCAATGCAGCTAGAGGCCTAGAATGGATTGGTAATAAAATATCAAAATTCATTGAATGGATGAAATCTATGCTTCCTCAGGCTCAGCTTAAAGTCAAATATTTGAGTGAGCTCAAGAAACTTAGTTTTTTAGAGAAGCAGATGGAGCACTTGAGAGTTGCTGACTCACAAACACAGGAAAAAATTAAATGTGAAATTGACACTTTACATGATCTTTCTTGCAAATTTTTACCACTCTATGCTAGTGAAGCCAAAAGAATAAAGATATTATACAACAAATGCAATACAATTATTAAACAGAAGAAAAGGTGTGAACCAGTTGCAGTTGCCATACATGGTGAACCTGGTACTGGTAAATCTATGACTACAAACTTTCTTGCTAGAATGATAACTAATGATAGTGACATATACTCCCTACCACCTGATCCTAAATACTTTGATGGATATGACCAGCAGAGTGTGGTTATTATGGATGACATTATGCAAAATCCAAGTGGGGAAGATATGACCTTATTCTGTCAAATGGTATCTAGTGTCACATTCATACCACCAATGGCTGATTTACCTGATAAGGGTAAACCTTTTGATTCTAGGTTTGTATTGTGCAGTACTAATCATAATTTGTTAGCACCCCCTACAATTACCTCATTGCCAGCTATGAATAGAAGATTCTTCTTAGATTTAGATATTGTGGTGTGTGATAAATACAAAGACTCACAGGGAAAGTTAAATGTAGCTGCTGCCTTCCAGCCTTGTGATGTAAATACAAAAATTGGAAATGCTCGCTGTTGCCCCTTTATCTGTGGTAAAGCTGTCATTTTTAGGGATCGCAACAATTGTCAGACTTACACTCTGGCGCAAGTGTACAATCAAATACTTGCTGAGGACAAAAGACGTAGGCAAGTAGTAGATGTTATGGCAGCAATTTTTCAGGGACCCATTACTCTTGAAGGACCTCCACCTGCAGCAATAAATGACTTATTGAAATCAGTTAGAACTCCAGAGGTCATTAAGTATTGTGAGGATAATAAATGGATAATACCAGCTGAGTGTAAGGTTGAAAGAGATCTCAACATAGCTAACACTGTTATTACAATCATTGCTAACAT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78,644
FJ445133.1
rhinovirus A47
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,132
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 47 strain ATCC VR-1157, complete genome
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103,701
OL961540.1
rhinovirus A49
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,056
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-05-27
SAMN23789528
PRJNA1066815
Rhinovirus A49 strain RvA49/USA/2021/QYDYAG, complete genome
CTGTTATTACGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTATCCTCCCTTTACCCCATGCAACTTAGAAGTTTTTCATAAAGACCAATAGTTGGTAATCATCCAGATTACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAACGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGCGATCGTTATCCGCAAAGCGCCTACGCAAAGCCTAGTAGCGCCTTTGAGATTATTTGGTTGGTCGTTCCGCCATTTCCCCTGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAAGTACCCCACTGGCGACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTATGGGTGTGAAGCCAAATAATGGACAAAGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCGCTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGAGCACACAAGCCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACTTATAATTGCTTATGGTGACAATATATATATAGTATATATTGGCACCATGGGCGCACAGGTATCCAGACAGAATGTTGGGACTCACTCTACACAAAACTCTGTATCTAATGGATCTAGTTTAAACTATTTCAACATCAACTACTTTAAGGATGCTGCTTCAAATGGTGCGTCTAAGTTAGAGTTCACTCAGGATCCTAGCAAATTCACAGACCCTGTTAAGGATGTATTAGAGAAAGGAATACCAACACTGCAATCACCCACAGTTGAAGCTTGTGGATATTCAGATAGAATCATACAAATTACAAGAGGGGATTCAACTATAACATCACAGGATGTGGCAAATGCTGTTGTTGCATATGGTGTTTGGCCACACTATCTATCCTCTAAAGATGCTTCTGCAATCGATAAGCCCACCCGCCCAGACACATCTTCCAATAGGTTTTATACTCTAAAGAGTGTGACTTGGTCTAACTCTTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAATTACCAGATGCACTAAAGGAAATGGGTATTTTTGGTGAGAATATGTTTTACCACTACTTGGGCAGAAGTGGCTATACAATACATGTACAGTGCAATGCCAGCAAATTCCACCAAGGCACACTAATCGTTGCACTGATACCTGAACACCAGATTGCAAGTGCACTCCATGGTGATGTAAATGTTGGTTATAAATACACTCACCCAGGAGAAGGAGGGAGAGAGGTCAAAAGTGATAGGAATATAAATCTAGCTGTGCAACCTACTGAAGAGTATTGGCTGAACTTTGATGGAACACTACTTGGAAACATCACCATATACCCTCATCAATTCATTAACCTGAGAAGCAACAACTCTGCTACAATAATTGCTCCATATGTTAATGCAGTTCCTATGGATTCAATGCGCAGCCACAACAACTGGAGTTTGGTGATAATCCCAATATGTCCTCTTGAAACATCAAGTACTGTTAACACAATACCTATTACAATATCAATAAGTCCCATGTGTGCAGAGTTTTCTGGAGCACGTGCCAAAAACCAGGGTTTACCAGTTTTCATCACACCAGGATCAGGTCAATTTCTGACAACAGATGATTTCCAATCCCCATGCGCACTCCCTTGGTATCACCCAACTAAGGAAATATCCATCCCAGGTGAGGTGAAAAACTTAGTTGAAATATGTCAGGTGGATAGCTTAGTACCAATAAACAATACTGAAACCAACATCACCAATGGGGACATGTATTCAGTCATATTGCAATCAACAATTGGAGAATCAGATAAAATCTTTTCAATCAAAGCAGATGTAGCCTCTCAACCACTGGCCACTACTCTGATTGGTGAAATATCCAGTTATTACACTCACTGGACAGGAAGTCTTCGCTTCAGTTTTATGTTCTGTGGTACAGCCAACACTACTGTTAAACTCTTGCTAGCCTATACACCGCCTGGTATTAGAGAGCCTACTACAAGAAGAGAAGCAATGTTAGGTACTCATGTAATATGGGATATAGGCCTTCAATCTACAATATCGATGGTGGTGCCATGGATTAGTGCCAGTCATTATAGAAATACATCATCAGGTGCATCTACAGCAGGATACATAACATGCTGGTATCAAACCAGATTAGTAATTCCACCTCAAACTCCACCCACAGCTAGATTATTGTGTTTTGTATCAGGCTGCAAGGACTTCTGCTTACGCATGGCTCGTGATACTAACTTGCATCTGCAGAGTGGGCCAATAGAGCAAAATCCTGTTGAACACTACATAGATGAGGTCCTTAATGAGGTTTTAGTAGTTCCAAATATTAACAGTAGTCATCCTACAACATCAAACTCTGCTCCAGCACTAGATGCTGCAGAAACAGGACACACTAGTAATGTGCAACCTGAAGATGTCATTGAAACCAGATATGTACAGACATCACAAACAAGAGATGAGATGAGCTTAGAGAGTTTTCTTGGTAGATCAGGGTGTATACATGAATCTAAACTGGAGGTCACACTTACAAATTACAATGAAAATAATTTTAAAGTGTGGAACATCAACTTACAAGAAATGGCCCAGATTAGAAGGAAATTTGAACTATTCACCTACACTAGATTTGACTCTGAGATAACCCTAGTCCCATGTATTTCTGCACTTAGCGAGGACATTGGACATGTTACTATGCAGTACATGTATGTACCACCAGGTGCACCTGTACCAGAGAGCAGGGATGATTATGCATGGCAGTCTGGTACCAATGCATCTATTTTCTGGCAACATGGGCAAGCATACCCAAGATTTTCTCTACCCTTTCTGAGTGTGGCTTCAGCTTACTATATGTTTTATGATGGATATAATGAGGAAGGGCAAAATTATGGCACAGTAAGCACAAATAACATGGGGTCATTATGTTCTAGAATAGTGACAGAGAAACACATTCATAATATGCATATTATGACAAGAATCTATCATAAAGCCAAACATGTCAAAGCATGGTGCCCGCGCCCACCCAGAGCACTTGAGTATACTCGTGCTCATCGCACCAACTTTAAGATTCAAAATAAAGATATCAAAACAGGAATTAAATCCAGAGCAATTATTACAACAGCTGGCCCCAGTGATATGTATGTCCATGTTGGTAATCTTATTTATAGAAATTTACACCTCTTCAACTCTGAAATGCATGAATCTATACTAGTGTCTTATTCATCAGATTTAATCATTTACCGAACAAACACCATAGGTGATGATTATATTCCCTCTTGTGATTGCACTCAGGCCACATACTATTGTAAACATAAAAATAGATATTTCCCAATAACAGTGACAAGTCATGACTGGTATGAAATACAGGAAAGTGAATACTACCCCAAACATATACAGTACAATTTGCTAATTGGTGAGGGTCCTTGTGAGCCAGGTGATTGTGGTGGGAAATTGTTATGTAAACATGGTGTTATTGGCATAGTAACAGCTGGTGGTGATAATCATGTGGCTTTCATTGATCTTAGACATTTTCATTGTGCTGAAGAGCAAGGGATTTCAGATTACATACATATGCTGGGTGAAGCATTTGGAAATGGATTCGTAGATAGTGTAAAAGAGCACATACATGCCATTAACCCAGTTGGAAACATTAGCAAAAAGATCATTAAATGGATGCTAAGGATAATATCTGCAATGGTCATAATAATAAGAAATTCCTCTGATCCACAAACTATATTGGCAACACTAACATTGATTGGATGTTCTGGTTCACCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTTTGTAAATGGACACAGCTCAATTATATACATAAAGAATCAGATTCATGGTTGAAGAAATTCACTGAAGCATGCAATGCAGCCAGAGGGCTTGAGTGGATAGGAAACAAAATATCCAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTCCCACAAGCACAACTCAAGGTTAAATACTTAAATGAACTTAAGAAATTGAGCCTGTATGAAAAGCAAGTTGAGAGTCTTAGAGTAGCAGATGTAAGAACACAAGAAAAGATCAAGATGGAAATTGACACTTTACATGACTTATCATGCAAATTTTTACCATTATATGCAAGTGAAGCAAAGAGAATAAAAACACTACACATCAAGTGTGACACCATTATCAAACAAAAGAAAAGGTGTGAGCCAGTAGCCATAGTCATCCATGGGCCACCTGGTGCTGGAAAATCAATAACAACAAATTTTCTAGCTAGGATGATAACTAATGATAGTGATATATACTCTCTACCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGTTACGACCAACAAAGTGTTGTAATAATGGATGATATTATGCAAAATCCAGCTGGGGAAGATATGACCCTATTCTGTCAAATGGTTTCAAGTGTCACTTTTATACCACCAATGGCTGATTTACCAGACAAGGGCAAGGCCTTTGACTCTAGGTTTGTGCTATGCAGCACGAATCACTCACTTTTAGCACCACCTACAATAACATCACTACCTGCAATGAATAGAAGATTCTTTTTAGATTTAGACATATTAGTACATGATAATTTCAAGGACTCACAGGGCAAGCTTAATGTGGCAGCTGCTTTCCAACCGTGCGATGTGGATAACAAAATTGGAAATGCCCGGTGTTGTCCATTCGTGTGTGGGAAGGCTGTTTCTTTCAAGGACCGCAATTCTTGTAATAAATACACCTTAGCACAAGTATATAACATAATGCTTGAAGAAGACAAACGTAGGAGGCAAGTGGTTGATGTTATGTCAGCTATTTTCCAGGGACCAATCGACATGAAAAATCCACCACCGCCTGCAATTACAGATCTACTCCAATCAGTTAGGACTCCTGAGGTTATCAAGTATTGTGAAGATAATAGGTGGATAATACCAGCAGAATGTAAGATAGAGAAGGAGCTAAATTTAGCTAATACAATCATAACAATCATTGCCAATGTTATTAGTATAGCAGGCATTATATATGTTATCTACAAACT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34,121
OM001351.1
rhinovirus A49
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,054
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-22
SAMN24288767
PRJNA1066815
Rhinovirus A49 strain RvA49/USA/2021/LVAT6B, complete genome
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USA
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USA
USA
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2021-07-09
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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PRJNA1066815
Rhinovirus A49 strain RvA49/USA/2021/JAPSEF, complete genome
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
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USA
USA
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2021-07-15
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-12-11
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Rhinovirus A
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35,455
OL133741.1
rhinovirus A49
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-12-11
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USA
USA
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2021-07-10
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2021
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Rhinovirus A49 strain RvA49/USA/2021/Z392UL, complete genome
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37,614
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
USA
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2021-06-18
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Rhinovirus A49 strain RvA49/USA/2021/5WDY9S, complete genome
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37,678
MZ835608.1
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-07
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Picornaviridae
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USA
USA
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2021-06-10
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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Rhinovirus A49 strain RvA49/USA/2021/WTHQKT, complete genome
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38,188
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
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Picornaviridae
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GenBank
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USA
USA
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2021-06-01
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rhinovirus A49
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null
Rhinovirus A49 isolate NNR8PC, complete genome
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41,461
MZ153248.1
rhinovirus A49
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-05-18
R8PC55
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,056
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-13
SAMN20082379
PRJNA1066815
Rhinovirus A49 strain RvA49/USA/2021/R8PC55, complete genome
CTGTTATTACGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTATCCTCCCCTTACCCCATGCAACTTAGAAGTTTTTCATAAAGACCAATAGTTGGTAATCATCCAGATTACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAACGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGCGATCGTTATCCGCAAAGCGCCTACGCAAAGCCTAGTAGCGCCTTTGAGATTATTTGGTTGGTCGTTCCGCCATTTCCCCTGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAAGTACCCCACTGGCGACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTATGGGTGTGAAGCCAAATAATGGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCGCTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGAGCACACAAGCCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACTTATAATTGCTTATGGTGACAATATATATATAGTATATATTGGCACCATGGGCGCACAGGTATCCAGACAGAATGTTGGGACTCACTCTACACAAAACTCTGTATCTAATGGATCTAGTTTAAACTATTTCAACATCAACTACTTTAAGGATGCTGCTTCAAATGGTGCGTCTAAGTTAGAGTTCACTCAGGATCCTAGTAAATTCACAGACCCTGTTAAGGATGTATTAGAGAAAGGAATACCAACACTGCAATCACCCACAGTTGAAGCTTGTGGATATTCAGATAGAATCATACAAATTACAAGAGGGGATTCAACTATAACATCACAGGATGTGGCAAATGCTGTTGTTGCATATGGTGTTTGGCCACACTATCTATCCTCTAAAGATGCTTCTGCAATCGATAAGCCCACCCGCCCAGACACATCTTCCAATAGGTTTTATACTCTAAAGAGTGTGACTTGGTCTAACTCTTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAATTACCAGATGCACTAAAGGAAATGGGTATTTTTGGTGAGAATATGTTTTACCACTACTTGGGCAGAAGTGGCTATACAATACATGTACAGTGCAATGCCAGCAAATTCCACCAAGGCACACTAATCGTTGCACTGATACCTGAACACCAGATTGCAAGTGCACTCCATGGTGATGTAAATGTTGGTTATAAATACACTCACCCAGGAGAAGGAGGGAGAGAGGTCAAAAGTGATAGGAATATAAATCTAGCTGTGCAACCTACTGAAGAGTATTGGCTGAACTTTGATGGAACACTACTTGGAAACATCACCATATACCCTCATCAATTCATTAACCTGAGAAGCAACAACTCTGCTACAATAATTGCTCCATATATTAATGCAGTTCCTATGGATTCAATGCGCAGCCACAACAACTGGAGTTTGGTGATAATCCCAATATGTCCTCTTGAAACATCAAGTACTGTTAACACAATACCTATTACAATATCAATAAGTCCCATGTGTGCAGAGTTTTCTGGAGCACGTGCCAAAAACCAGGGTTTACCAGTTTTCATCACACCAGGATCAGGTCAATTTCTGACAACAGATGATTTCCAATCCCCATGCGCACTCCCTTGGTATCACCCAACTAAGGAAATATCCATCCCAGGTGAAGTGAAAAACTTAGTTGAAATATGTCAGGTGGATAGCTTAGTACCAATAAACAATACTGAAACCAACATCACCAATGGGGACATGTATTCAGTCATATTGCAATCAACAATTGGAGAATCAGATAAAATCTTTTCAATCAAAGCAGATGTAGCCTCTCAACCACTGGCCACTACTCTGATTGGTGAGATATCCAGTTATTACACTCACTGGACAGGAAGTCTTCGCTTCAGTTTTATGTTCTGTGGTACAGCCAACACTACTGTTAAACTCTTGCTAGCCTATACACCGCCTGGTATTAGAGAGCCTACTACAAGAAGAGAAGCAATGTTAGGTACTCATGTAATATGGGATATAGGTCTTCAATCTACAATATCGATGGTAGTGCCATGGATTAGTGCCAGTCATTATAGAAATACATCATCAGGTGCATCTACAGCAGGATACATAACATGCTGGTATCAAACCAGATTAGTAATTCCACCTCAAACTCCACCCACAGCTAGATTATTGTGTTTTGTATCAGGCTGCAAGGACTTCTGCTTACGCATGGCTCGTGATACTAACTTGCATCTGCAGAGTGGGCCAATAGAGCAAAATCCTGTTGAACACTACATAGATGAGGTCCTTAATGAGGTTTTAGTAGTTCCAAATATTAACAGCAGTCATCCTACAACATCAAACTCTGCTCCAGCACTAGATGCTGCAGAAACAGGACATACTAGTAATGTGCAACCTGAAGATGTCATTGAAACCAGATATGTACAGACATCACAAACAAGAGATGAGATGAGCTTAGAGAGTTTTCTTGGTAGATCAGGGTGTATACATGAATCTAAACTGGAGGTCACACTTACAAATTACAATGAAAATAATTTTAAAGTGTGGAACATCAACTTACAAGAAATGGCCCAGATTAGAAGGAAATTTGAACTATTCACCTACACTAGATTTGACTCTGAGATAACCCTGGTCCCATGTATTTCTGCACTTAGCGAGGACATTGGACATGTTACTATGCAGTACATGTATGTACCACCAGGTGCACCTGTACCAGAGAGCAGGGATGATTATGCATGGCAGTCTGGTACCAATGCATCTATTTTCTGGCAACATGGGCAAGCATACCCAAGATTTTCTCTACCCTTTCTGAGTGTGGCTTCAGCTTACTATATGTTTTATGATGGATATAATGAGGAAGGGCAAAATTATGGCACAGTAAGCACAAATAACATGGGGTCATTATGTTCTAGAATAGTGACAGAGAAACACATTCATAATATGCATATTATGACAAGAATCTATCATAAAGCCAAACATGTCAAAGCATGGTGCCCGCGCCCACCCAGAGCACTTGAGTATACTCGTGCTCATCGCACCAACTTTAAGATTCAAAATAAAGATATCAAAACAGGAATTAAATCCAGAGCAATTATTACAACAGCTGGCCCCAGTGATATGTATGTCCATGTTGGTAATCTTATTTATAGAAATTTACACCTCTTCAACTCTGAAATGCATGAATCTATACTAGTGTCTTACTCATCAGATTTAATCATTTACCGAACAAACACCATAGGTGATGATTATATTCCCTCTTGTGATTGCACTCAGGCCACATACTATTGTAAACATAAAAATAGATATTTCCCAATAACAGTGACAAGTCATGACTGGTATGAAATACAGGAAAGTGAGTACTACCCAAAACATATACAGTACAATTTGCTAATTGGTGAGGGTCCTTGTGAGCCAGGTGATTGTGGTGGGAAATTGTTATGTAAACATGGTGTTATTGGCATAGTAACAGCTGGTGGTGATAATCATGTGGCTTTCATTGATCTTAGACATTTTCATTGTGCTGAAGAGCAAGGGATTTCAGATTACATACATATGCTGGGTGAAGCATTTGGAAATGGATTCGTAGATAGTGTAAAAGAGCACATACATGCCATTAACCCAGTTGGAAACATTAGCAAAAAGATCATTAAATGGATGCTAAGGATAATATCTGCAATGGTCATAATAATAAGAAATTCCTCTGATCCACAAACTATATTGGCAACACTAACATTGATTGGATGTTCTGGTTCACCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTTTGTAAATGGACACAGCTCAATTATATACATAAAGAATCAGATTCATGGTTGAAGAAATTCACTGAAGCATGCAATGCAGCCAGAGGGCTTGAGTGGATAGGAAACAAAATATCCAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTCCCACAAGCACAACTCAAGGTTAAATACTTAAATGAACTTAAGAAATTAAGCCTGTATGAAAAGCAAGTTGAGAGTCTTAGAGTAGCAGATGTAAGAACACAAGAAAAGATCAAGATGGAAATTGACACTTTACATGACTTATCATGCAAATTTTTACCATTATATGCAAGTGAAGCAAAGAGAATAAAAACACTACACATCAAGTGTGACACCATTATCAAACAAAAGAAAAGGTGTGAGCCAGTGGCCATAGTCATCCATGGGCCACCTGGTGCTGGAAAATCAATAACAACAAATTTTCTAGCTAGGATGATAACTAATGATAGTGATATATACTCTCTACCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGTTACGATCAACAAAGTGTTGTAATAATGGATGATATTATGCAAAATCCAGCTGGGGAAGATATGACCCTATTCTGTCAAATGGTTTCAAGTGTCACTTTTATACCACCAATGGCTGATTTACCAGACAAGGGCAAGGCCTTTGACTCTAGGTTTGTGCTATGCAGCACAAATCACTCACTTTTAGCACCACCTACAATAACATCACTACCTGCAATGAATAGAAGATTCTTTTTAGATTTAGACATATTAGTACATGATAATTTCAAGGACTCACAGGGCAAGCTTAATGTAGCAGCTGCTTTCCAACCGTGCGATGTGGATAACAAAATTGGAAATGCCCGGTGTTGTCCATTCGTGTGTGGGAAGGCTGTCTCTTTCAAGGACCGCAATTCTTGTAATAAATACACCTTAGCACAAGTATATAACATAATGCTTGAAGAAGACAAACGTAGGAGGCAAGTGGTTGATGTTATGTCAGCTATTTTCCAGGGACCAATCGACATGAAAAATCCACCACCGCCTGCAATTACAGATCTACTCCAATCAGTTAGGACTCCTGAGGTTATCAAGTATTGTGAAGATAATAGGTGGATAATACCAGCAGAATGTAAGATAGAGAAGGAGCTAAATTTAGCTAATACAATCATAACAATCATTGCCAATGTTATTAGTATAGCAGGCATTATATATGTTATCTACAAACT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41,899
LC530048.1
rhinovirus A49
Takeuchi,S., Kawada,J., Ito,Y.
Department of Pediatrics; 65 Tsurumai-cho, Showa-ku, Nagoya, Aichi 466-8550
Japan
2020-03-18
sugckmmaht NGO1
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,025
GenBank
null
Japan
Japan
Homo sapiens
null
2019-02-27
null
null
Human rhinovirus A49 sugckmmaht NGO1 genomic RNA, complete genome
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53,304
KY369896.1
rhinovirus A49
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
UW, Lab Medicine
USA
2017-01-15
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,025
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2016
null
PRJNA338014
Rhinovirus A49 strain SC1066, complete genome
GGGAGTGGTACTCTGTTATTACGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTATCCTCCCCTTACCCCATGTAACTTAGAAGTTTTTCACAAAGACCAATAGTTGGTAATCATCCAGATTACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAACGTTGATATGCCCCAACAGGGCAAAAACAACTGCGATCGTTATCCGCAAAGCGCCTACGCAAAGCTTAGTAGCACCTTTGAGATTATTTGGTTGGTCGTTCCGCCATTTCCCCTGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAAGTACCCCACTGGCGACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTATGGGTGTGAAGCCAAATAATGGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCGCTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGAGCACACAAGCCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACTTATAATTGCTTATGGTGACAATATATATATAGTATATATTGGCACCATGGGCGCACAGGTATCCAGACAGAATGTTGGGACTCACTCTACACAAAACTCTGTATCTAATGGATCTAGTTTAAACTACTTCAACATCAACTACTTCAAAGATGCTGCTTCAAATGGTGCATCTAAATTGGAGTTCACCCAGGATCCTAGCAAATTCACAGACCCTGTTAAAGATGTATTAGAGAAAGGAATACCAACACTGCAGTCACCCACAGTTGAGGCTTGTGGATATTCAGATAGAATTATACAGATTACCAGAGGGGATTCAACTATAACATCACAGGATGTGGCAAATGCTGTTGTTGCATATGGTGTTTGGCCACACTATCTATCTTCTAAAGATGCTTCTGCAATTGATAAGCCTTCCCGCCCAGACACATCTTCCAATAGGTTTTATACTTTAAAGAGTGTGACTTGGTCTAACTCTTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAATTACCAGATGCACTGAAGGAAATGGGTATTTTTGGTGAGAATATGTTTTACCACTACTTGGGCAGAAGTGGTTATACAATACATGTACAGTGCAATGCTAGTAAATTCCACCAAGGCACACTAATCGTTGCACTGATACCTGAACATCAGATTGCAAGCGCACTCCATGGTGATGTAAATGTTGGTTATAAATACACTCACCCAGGAGAAACAGGGAGAGAGGTCAAAAGTGATAGGAATATAAACCTAGCTGTGCAACCCACTGAAGAGTATTGGCTGAATTTCGATGGAACACTACTTGGAAACATCACCATATACCCTCATCAATTCATTAACCTGAGAAGCAACAACTCTGCTACAATAATTGCTCCATATGTTAATGCAGTTCCTATGGATTCAATGCGCAGCCATAACAACTGGAGCCTGGTGATAATCCCAATATGTCCTCTTGAAACATCAAGTACTGTTAACACAATACCTATTACAATATCAATAAGTCCCATGTGTGCAGAGTTTTCTGGAGCACGTGCCAAAAACCAGGGTTTACCAGTTTTCATCACACCAGGATCAGGTCAATTCCTAACAACAGATGATTTCCAATCCCCATGCGCGCTCCCTTGGTATCACCCAACTGAGGAAATATCCATCCCGGGTGAGGTGAAAAACTTAGTTGAAATATGTCAAGTGGATAGCTTAGTACCAATAAACAATACTGAAAACAACATCACCAATGGGGACATGTATTCGGTCATATTGCAATCAACAATTGGAGAATCAGATAAAATCTTTTCAATCAAAGCAGATGTAGCCTCTCAGCCACTAGCCACCACTCTAATTGGTGAAATATCCAGCTATTACACTCACTGGACAGGAAGCCTCCGTTTCAGTTTTATGTTCTGTGGTACAGCCAACACTACTGTTAAACTCTTACTAGCCTATACACCACCTGGTATTAGAGAGCCTACTACAAGGAGAGAAGCAATGTTAGGTACTCATGTAATATGGGATATAGGCCTTCAATCCACAATATCAATGGTGGTACCATGGATTAGTGCCAGCCATTACAGAAATACATCATCAGGTGCATCTACAGCAGGATATATAACATGCTGGTATCAAACCAGATTAGTAATTCCACCTCAAACTCCACCCACAGCTAGATTGTTGTGTTTTGTATCAGGCTGCAAGGACTTTTGTTTGCGCATGGCTCGTGATACTAACTTGCATCTACAGAGTGGGCCAATAGAGCAAAATCCTGTTGAACACTACATAGATGAGGTCCTTAATGAGGTTTTAGTAGTTCCAAATATTAATAGTAGTCATCCCACAACATCAAATTCTGCCCCAGCGCTAGATGCTGCAGAAACAGGACATACCAGTAATGTGCAACCTGAAGATGTCATTGAAACCAGATATGTACAGACATCACAAACAAGAGATGAAATGAGCTTAGAGAGTTTTCTTGGTAGATCAGGGTGCATACATGAATCTAAACTGGAGGTCACACTTACAAATTACAATGAAAATAATTTTAAAGTGTGGAATATCAACTTACAAGAAATGGCCCAAATTAGAAGGAAATTTGAACTATTCACCTACACTAGATTTGACTCTGAGATAACCCTAGTTCCATGTATTTCTGCACTTAGTGAGGACATTGGGCATGTTACTATGCAGTACATGTATGTACCACCAGGTGCACCTGTACCAGAGAGCAGAGATGATTATGCATGGCAGTCTGGTACCAACGCATCTATCTTCTGGCAACATGGGCAAGCATACCCAAGATTTTCTCTACCCTTTCTGAGTGTGGCCTCAGCTTACTATATGTTTTATGATGGATATAATGAAAAAGGGCAAAATTATGGCACAGTAAGCACAAATAACATGGGGTCATTATGTTCTAGAATAGTAACAGAGAAACACATTCATAATATGCATATTATGACAAGAATCTATCATAAAGCCAAACATGTCAAAGCGTGGTGCCCACGCCCACCCAGAGCACTTGAATATACCCGTGCTCACCGCACTAACTTTAAGATTCAAAATAAAGATATCAAAACAGGAATTAAATCCAGAGCAATTATTACAACAGCTGGCCCTAGTGATATGTATGTCCATGTTGGTAATCTTATTTATAGAAATTTACACCTCTTCAACTCTGAGATGCATGAATCTATACTGGTGTCTTATTCATCAGATTTAATCATTTACCGAACAAACACCATAGGTGATGATTATATTCCCTCTTGTGATTGTACCCAGGCTACATACTATTGTAAACATAAAAATAGATATTTCCCAATAACAGTGACAAGTCATGACTGGTATGAGATACAGGAAAGTGAATACTACCCAAAACATATACAGTATAATTTGCTAATTGGTGAGGGTCCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGGAAATTGTTATGTAAACATGGTGTTATTGGCATAGTAACAGCTGGTGGTGATAATCATGTGGCTTTCATCGATCTTAGACATTTTCATTGTGCTGAAGAGCAAGGCATTTCAGACTACATACATATGCTGGGTGAAGCATTTGGAAATGGATTTGTAGATAGTGTAAAAGAACACATACATGCTATTAACCCAGTTGGAAACATTAGCAAAAAGATCATTAAATGGATGCTAAGGATAATATCTGCAATGGTCATAATAATAAGGAATTCCTCTGATCCACAAACTATATTGGCAACACTCACATTGATTGGATGTTCTGGTTCACCATGGAGATTTTTAAAAGAGAAATTTTGTAAATGGACACAGCTTAATTATATACATAAAGAATCAGATTCATGGTTGAAGAAATTCACTGAAGCATGCAATGCAGCCAGAGGGCTTGAGTGGATAGGAAACAAAATATCCAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTCCCACAAGCACAACTCAAGGTGAAATACTTAAATGAACTCAAAAAATTAAGTCTGTATGAAAAACAGGTTGAGAGTCTTAGAATAGCAGACATAAGAACACAAGAAAAGATCAAGATGGAAATTGACACTTTACATGACTTATCATGCAAATTCTTGCCATTATATGCAAGTGAAGCAAAGAGAATAAAGACATTACACATCAAGTGTGACACCATTATTAAACAAAAGAAAAGGTGTGAGCCAGTAGCTATAGTCATCCATGGGCCACCTGGTGCTGGAAAGTCAATAACAACAAATTTTCTAGCTAGGATGATAACTAATGATAGTGATATATACTCTTTACCCCCAGATCCAAAATATTTCGATGGTTACGACCAACAAAGTGTTGTAATAATGGATGATATTATGCAAAATCCAGCTGGGGATGATATGACCCTATTCTGTCAAATGGTTTCGAGTGTCACTTTTATACCACCAATGGCTGATTTACCAGACAAGGGCAAGGCTTTTGACTCTAGGTTTGTGTTATGTAGTACAAATCACTCACTTTTAGCACCACCTACAATAACATCACTACCTGCAATGAATAGAAGATTCTTTTTAGATCTAGACATACTAGTACATGATAATTTCAAGGACTCACAGGGCAAGCTTAATGTAGCAGCAGCTTTCCAACCATGCGACGTGGACAACAAAATCGGGAATGCCCGGTGTTGCCCATTCGTGTGTGGGAAGGCTGTTTCTTTCAAGGACCGCAATTCTTGCAATAAATACACCTTAGCACAAGTATATAACATAATGCTTGAAGAAGACAAACGCAGGAGACAAGTGGTTGATGTTATGTCAGCTATTTTTCAGGGACCAATTGACATGAAAAACCCACCACCACCTGCAATTACAGATCTACTCCAATCAGTTAGGACTCCTGAGGTCATCAAGTATTGTGAAGATAATAGATGGATAATACCAGCAGAATGCAAGATAGAGAAGGAGTTAAATTTAGCTAATACCATTATAACAATCATTGCCAATGTTATTAGTATAGCAGGTATTATATATGTTATCTACAAACTCTTCTGCACACTACAGGGGCCATACTCAGGAGAACCCAAACCTAAAACTAAAGTTCCAGAGAGGCGTGTTGTAGCGCAAGGACCAGAGGAAGAGTTTGGAATGTCCTTAATCAAACACAACTCATGTGTAATCACAACAGATAATGGAAAGTTTACAGGTCTTGGAATTTATGACAAGTTTGTAGTTGTGCCAACACATGCAGACCCTGGGAAAGAAGTTCAAGTTGATGGTATAACTACAAAAGTTGCTGATTCATTTGATTTGTACAATAAAGATGGTGTAAAATTAGAGATAACAGTCCTTAAATTAGATAGGAATGAGAAATTTAGAGACATCAGAAAATATATACCAAATAGTGAAGATGACTACCCTGATTGTAACTTAGCCTTGTTAGCAAATCAACCTGAGCCCACTATAATCAATGTCGGAGATGTTGTATCCTATGGTAACATACTACTCAGTGGCAACCAGACAGCTAGGATGCTCAAGTACAACTATCCAACAAAATCTGGGTATTGTGGGGGTGTCTTATATAAAATTGGACAAGTACTCGGGATACATGTAGGGGGGAATGGTAGAGATGGATTTTCAGCTATGTTACTTAGATCTTACTTTACTGATGTGCAGGGTCAAATAGTTTCATCAAAGAAAACTAGTGAGTGTAACCTCCCCAGTATACATAGTCCATCCAAAACAAAATTGCAACCCAGTATTTTCTATGATGTTTTCCCCGGTTCAAAAGAACCAGCTGTGTTATCTGAGAAAGATGCTCGACTTCAGGTCGATTTTAATGAAGCACTGTTCTCCAAATATAAAGGAAACACAAACTGCTCTATGAATGATCACATAAAGATTGCATCTTCTCACTATGCAGCTCAGTTAATTACTTTAGACATTGACCCAAGTCCTATTACTCTTGAAGATAGTGTTTTTGGTACTGATGGATTAGAAGCTCTCGACCTAAACACTAGTGCAGGGTTCCCTTACATCACAATGGGTATAAAGAAGAGAGATTTAATAAACAACAAGACCAAAGATATAAGCAAACTTAGAGAAGCAATTGACAAGTATGGAGTTGACTTGCCCATGGTTACTTTCTTAAAGGATGAACTTAGGAAGCATGAAAAGATAATCAAGGGTAAAACTAGGGTCATTGAGGCCAGTAGTGTGAATGATACTCTGCTATTTAGAACAACTTTTGGGAATCTTTTTTCAAAATTTCATCTAAATCCTGGGATCGTCACTGGATCAGCGGTCGGATGTGACCCAGAGACTTTCTGGTCAAAAATACCGGCAATGTTAGATGACAAGTGTATAATGGCCTTTGATTATACAAATTATGATGGTAGCATACACCCCATTTGGTTTGAAGCCCTTAAACGAGTATTGATGGACTTGTCTTTTGATCCCATGCTTATAGATAGACTATGTAAATCCAAACACATCTTCAAAAACACATACTATGAGGTTGAAGGGGGTGTTCCATCTGGATGTTCAGGTACTAGCATTTTTAACACAATGATTAATAACATTATTATAAGGACTCTGGTGCTAGATGCTTATAAAAATATAGATTTAGATAAGCTTAAGATAATTGCATATGGTGATGATGTTATATTCTCATATACATATGAATTAGATATGGAAGCTATAGCAGTAGAGGGCACTAAATATGGTCTAACCATAACCCCTGCTGACAAATCCACCACTTTTGTGAAATTAAATTACAATAATGTCACCTTTTTAAAAAGAGGATTCAAGCAAGATGAGAAATACAACTTCTTGATACACCCTACATTTCCTGAGAGTGAAATATTTGAATCCATCAGGTGGACAAAGAAGCCTTCACAGATGCATGAGCACGTACTGTCCCTGTGTCACTTAATGTGGCATAATGGGCGTGATGCGTACGAAAAGTTTGTGGAGAAGATACGCAGTGTGAGCGCTGGTCGTGCACTGTATATCCCTCCATATGACTTGCTTCTGCATGAGTGGTATGAAAAATTTTAAAC
78,650
FJ445134.1
rhinovirus A49
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
F04
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,109
GenBank
1
USA
USA
Homo sapiens
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 49 isolate F04, complete genome
TTAAAACTGGATCTGGGTTGTTCCCACTTGGATCTCCCAAAGGGAGTGGTACTCTGTTATTACGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTATCCTCCCCTTACCCCATGTAACTTAGAAGTTTTTCATAAAGACCAATAGTTGGTAATCATCCAGATTACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAATGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGCGATCGTTATCCGCAAAGCGCCTACGCAAAGCTTAGTAGCACCTTTGAGATTGTTTGGTTGGTCGTTCCGCCATTTCCCCTGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGTACCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTGTGGGTGTGAAGCCAAATAATGGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCGCTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGAGCATACAAACCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTTTTTACTTATAATTGCTTATGGTGACAATATATATATAGTATATATTGACACCATGGGCGCACAGGTATCTAGACAGAATGTTGGAACCCACTCTACACAAAACTCTGTATCTAATGGATCTAGCTTAAACTACTTCAACATCAACTACTTCAAAGATGCTGCTTCAAATGGTGCATCCAAATTAGAGTTCACTCAGGACCCTAGCAAATTCACAGATCCCGTTAAAGATGTATTAGAGAAGGGAATACCAACACTGCAATCACCCACAGTTGAGGCTTGTGGATATTCGGATAGAATCATACAGATTACTAGAGGAGATTCAACAATAACATCACAGGATGTGGCAAATGCCGTTGTTGCATATGGTGTTTGGCCACACTATTTATCCTCTAAAGATGCTTCTGCAATTGACAAGCCTTCCCGCCCAGACACATCTTCCAATAGATTTTATACTTTAAAGAGTGTGACTTGGTCTAACTCTTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAATTACCGGATGCATTGAAGGAAATGGGCATCTTTGGTGAAAATATGTTTTACCACTATTTGGGCAGAAGTGGTTATACAATACATGTACAGTGTAATGCTAGTAAATTCCATCAAGGTACATTAATCGTTGCACTAATACCTGAACACCAAATTGCAAGTGCACTCCATGGTGATGTGAATGTTGGTTATAAATATACTCACCCAGGAGAAGCAGGGAGAGAAGTTAAAAGTGACAGAAATATAAACCTAAATGTGCAACCCACTGAAGAATACTGGCTGAATTTTGATGGAACACTACTTGGAAACATCACCATATTCCCTCATCAATTCATTAACCTGAGAAGCAACAACTCTGCTACAATAATTGCTCCATATGTTAATGCAGTTCCCATGGATTCAATGCGCAGTCACAACAACTGGAGCCTGGTGATAATCCCAATATGTCCTCTTGAAACATCAAGTACTGTTAACACAATACCTATTACAATATCAATAAGTCCCATGTGTGCAGAGTTTTCTGGAGCACGTGCCAAAAACCAGGGTCTACCAGTTTTCATCACGCCAGGGTCAGGTCAATTTCTAACAACAGATGATTTTCAATCCCCATGTGCACTCCCTTGGTACCACCCAACCAAGGAAATATCTATCCCAGGTGAGGTAAAAAACCTAGTTGAAATATGTCAAGTGGATAGCTTAGTACCAATAAATAATACTGAGAATAACATCACCAATGGGGACATGTATTCAGTTATATTGCAATCAACAATTGGAGAACCAGACAAAATCTTTTCAATCAAAACAGATGTAGCCTCTCAGCCACTAGCCACCACTCTAATTGGTGAAATATCCAGCTATTACACTCACTGGACAGGAAGCCTCCGTTTCAGTTTCATGTTTTGTGGTACAGCCAACACTACTGTTAAACTCTTACTAGCCTATACACCGCCTGGTATTAGAGAGCCCACTACAAGAAGAGAAGCAATGTTAGGCACTCATGTAATATGGGATATAGGTCTTCAATCTACAATATCAATGGTGGTACCATGGATTAGTGCTAGCCACTACAGAAACACATCATCGGGTGCATCTACAGCTGGGTATGTAACATGCTGGTATCAAACCAGATTAGTAATTCCACCTCAAACCCCACCCACAGCTAGGTTACTATGTTTTGTATCAGGCTGCAAGGACTTTTGTTTACGCATGGCTCGAGACACTAATTTACATCTACAGAGTGGGCCAATAGAGCAAAACCCTGTTGAACAATATATAGATGAGGTCCTTAATGAGGTTTTAGTTGTTCCAAATATTAATAGTAGTCATCCCACAACATCAAACTCTGCCCCAGCACTAGACGCTGCAGAAACAGGGCATACTAGTAATGTGCAGCCTGAAGATGTCATTGAAACCAGATATGTACAGACATCACAAACAAGAGATGAGATGAGTTTAGAGAGTTTTCTTGGTAGATCAGGGTGTATACATGAATCTAAACTGGAGGTCACGCTTACAAATTACAATGAAAACAATTTCAAAGTGTGGAACATTAACCTACAAGAGATGGCCCAGATTAGAAGGAAATTTGAACTGTTCACCTATACTAGATTTGACTCAGAGATAACCCTAGTCCCATGTATTTCTGCACTTAGTGAGGACATTGGACATATTACTATGCAATACATGTATGTACCACCAGGTGCACCTGTACCAAAGAGCAGGGATGATTATGCATGGCAGTCTGGCACTAATGCATCTATTTTCTGGCAACATGGACAAGCATACCCAAGATTTTCTCTACCCTTTCTGAGCGTGGCTTCAGCTTATTATATGTTTTATGATGGATATAATGAGGAAGGGCAAAATTATGGTACGGTGAGCACAAATAACATGGGATCATTATGTTCTAGAATAGTGACAGAGAAACACATTCATAATATGCACATTATGACAAGAATCTATCACAAAGCTAAACATGTCAAAGCGTGGTGCCCGCGCCCACCCAGAGCACTCGAATATACTCGTGCACACCGCACCAATTTTAAGATTCAAAATAGAGATATCAAAACAGGAATTAAATCCAGACCAATTATTACAACAGCTGGCCCTAGTGATATGTATGTCCATGTTGGTAATCTTATTTATAGAAATCTACATCTCTTCAACTCTGAAATGCATGAATCTATACTGGTATCCTACTCATCAGATTTAATCATTTACCGAACAAACACTATAGGTGATGATTATATTCCCTCTTGTGATTGCACCCAGGCTACATATTATTGTAAACATAAAAGTAGATATTTCCCAATAACAGTGACAAGCCATGACTGGTATGAAATACAGGAAAGTGAATACTATCCCAAACATATACAATACAACTTGCTAATTGGCGAAGGCCCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGGAAATTATTATGTAAACATGGTGTTATTGGCATAGTAACAGCTGGTGGTGACAATCATGTGGCTTTCATCGATCTTAGACACTTTCATTGTGCTGAAGAGCAAGGAGTCACAGATTACATACACATGCTAGGTGAAGCATTTGGAAATGGATTCGTAGATAGTGTAAAAGAACACATACATGCCATTAACCCAGTTGGAAATATTAGCAAAAAGATCATCAAATGGATGCTAAGGATAATATCTGCAATGGTCATAATAATAAGGAACTCCTCTGATCCACAAACTATATTGGCAACACTCACACTGATTGGATGTTCTGGTTCACCATGGAGATTTTTAAAAGAGAAATTTTGTAAATGGACACAACTTAATTATATACACAAAGAGTCAGACTCATGGTTGAAGAAATTTACTGAAGCATGTAATGCAGCCAGAGGGCTTGAGTGGATAGGAAACAAAATATCTAAATTCATTGAATGGATGAAGTCAATGCTTCCACAAGCACAACTCAAGGTTAAGTACTTAAATGAACTTAAAAAATTGAGCCTGTATGAAAAGCAAGTTGAAAGTCTTAGAATAGCAGATGTAAGAACACAAGAAAAAATCAAAATGGAAATTGACACTCTACATGACTTATCATGCAAGTTTCTGCCATTATATGCAAGTGAAGCAAAGAGAATAAAGACACTACACATCAAGTGTGATAACATTATCAAACAAAAGAAAAGATGTGAGCCGGTGGCTGTAGTCATCCATGGGCCACCTGGCGCTGGAAAATCAATAACAACAAATTTTCTAGCCAGGATGATAACCAATGATAGTGATATATACTCTTTACCTCCAGATCCAAAATATTTTGATGGCTACGATCAACAAAGTGTCGTAATAATGGATGATATCATGCAAAATCCAGCTGGGGATGATATGACCCTATTCTGTCAAATGGTTTCCAGTGTCACTTTTATACCACCAATGGCTGATTTACCAGACAAGGGCAAGGCCTTTGACTCTAGGTTTGTACTATGTAGCACAAATCACTCACTTTTAGCACCACCTACAATAACATCACTACCTGCAATGAATAGAAGGTTCTTTTTAGATTTAGACATATTAGTGCATGATAATTTCAAGGACTCACAAGGCAAACTTAATGTAGCAGCAGCCTTCCAACCATGCGACGTGGACAACAAAATTGGGAATGCCCGGTGTTGTCCATTCGTGTGTGGAAAGGCTGTTTCTTTCAAGGATCGCAACACCTGCAATAAATACACCTTAGCACAAGTATACAACATAATGCTTGAAGAAGACAAACGCAGGAGACAAGTGGTTGACGTTATGTCAGCCATTTTCCAGGGACCAATTGACATGAAAAACCCACCGCCGCCTGCAATTACAGATCTACTCCAATCAGTTAGGACTCCCGAGGTCATCAAGTATTGTGAAGACAATAGGTGGATAATACCAGCAGAATGTAAGATAGAAAAGGAGTTAAATTTAGCTAATACAATCAT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103,702
DQ473496.1
rhinovirus A49
Kistler,A.L., Webster,D.R., Rouskin,S., Magrini,V., Credle,J.J., Schnurr,D.P., Boushey,H.A., Mardis,E.R., Li,H., DeRisi,J.L., Webster,D., Reich,S., Credle,J., Schnurr,D., Boushey,H., Mardis,E., Ganem,D., DeRisi,J.
University of California, San Francisco, Biochemistry and Biophysics
USA
2007-05-07
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,106
GenBank
1
USA
USA
null
null
null
null
null
Rhinovirus A49, complete genome
TTAAAACTGGATCCAGGTTGTTCCCACCTGGATCTCCCAAAGGGAGTGGAACTCTGTTATTACGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTATCCTCCCCCACCCCATGTAACTTAGAAGCTTTTCACAAAGACCAATAGTTGGTAATCATCCAGATTACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAACGTTGATATGCTCTAACAGGGCAAAAACAACTGCGATCGTTATCCGCAAAGCGCCTACGCAAAGCCTAGTAACACCTTTGAAATTGTTTGGTTGGTCGTTCCGCCATTTTCCCTGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAACACCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTGTGGGTGTGAAGCCAAATAATGGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCGCTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGAGCACACAAGCCAGTGTGTATCTAGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACTTATAATTGCTTATGGTGACAATATATATATAGTATATATATTGACACCATGGGCGCACAGGTATCTAGGCAAAATGTTGGAACTCATTCTACACAAAACTCCGTATCAAATGGATCTAGTTTGAACTATTTCAACATCAACTACTTTAAAGATGCTGCTTCTAATGGCGCATCCAAATTGGAGTTTACTCAAGACCCTAGCAAATTTACAGACCCTGTTAAAGATGTATTAGAGAAAGGAATACCAACACTACAATCACCCACAGTCGAGGCTTGTGGATATTCGGATAGAATCATACAAATCACTAGAGGAGATTCAACAATAACTTCACAAGATGTGGCAAATGCTGTTGTTGCATATGGTGTTTGGCCACATTATCTATCCTCCAAAGATGCTTCTGCAATTGACAAACCTTCTCGTCCGGATACATCTTCTAATAGATTTTATACTTTGAAGAGTGTGACTTGGACCAACTCTTCAAAAGGTTGGTGGTGGAAATTGCCAGATGCACTGAGAGAAATGGGCATCTTTGGTGAAAACATGTTTTATCACTATTTGGGCAGGAGTGGTTACACAATACATGTACAGTGCAATGCTAGCAAATTCCATCAAGGCACGTTAATCGTTGCACTAATACCTGAACACCAAATTGCAAGCGCCCTTCATGGTGATGTGAATGTTGGTTATAACTTTACCCATCCAGGAGAAACGGGAAGGGAGGTCAAAAGTGACAGGAGCATGAACCTTAATTTGCAACCCACTGAAGAGTATTGGCTTAATTTTGATGGAACACTACTCGGAAATATTACTATATTTCCCCATCAATTTATTAACTTGAGAAGCAACAACTCTGCTACAATAATTGCTCCATATGTCAATGCAGTCCCTATGGACTCAATGCGCAGCCACAACAACTGGAGTCTGGTGATAATCCCAATATGCCCTCTTGAAACATCAAGTACCGTTAACACAATACCTATCACAATATCAATAAGTCCCATGTGTGCAGAGTTCTCTGGTGCGCGTGCTAAGAGTCAGGGTTTACCGGTTTTCATCACGCCAGGGTCAGGCCAGTTTCTGACAACAGATGACTTTCAATCCCCATGTGCACTCCCTTGGTATCACCCAACCAAAGAAATCTCTATTCCAGGTGAGGTAAAAAATTTAGTTGAAATATGTCAAGTAGATAGTTTAGTGCCAATAAATAATACTGAAAATAACATCACTAATGAAAACATGTATTCGGTTGTGCTGCAATCAACAGTTGGAGAACCAGATAAAATCTTTTCTATCAAAACAGATGTAGCCTCTCAGCCATTAGCTACTACTCTAATTGGTGAAATATCCAGTTATTATACTCACTGGACAGGAAGTCTCCGCTTCAGCTTCATGTTCTGTGGCACAGCCAATACCACTGTTAAACTCTTGTTAGCCTATACGCCACCTGGCATCGCAGAACCTACTACAAGAAAGGAAGCAATGTTAGGTACTCATGTAATATGGGATGTAGGTCTTCAATCTACAATATCAATGGTGGTACCATGGATCAGTGCTAGTCACTACAGGAACACATCACCAGGTACATCTACATCTGGATACATAACATGCTGGTATCAAACTAGGCTAGTAATTCCACCTCAAACTCCAGCCACAGCTAGGTTATTATGTTTTGTATCAGGCTGTAAAGATTTTTGTTTACGCATGGCTCGGGACACTAATTTGCATTTGCAGAGTGGGGTAATAGAACAAAATCCTGTTGAACACTACATAGATGAGGTCCTTAATGAGGTTTTAGTTGTTCCAAATATTAATAGTAGTCACCCCACGACATCAAACTCTGCTCCAGCATTAGATGCTGCAGAAACAGGGCACACTAGCAATGTGCAACCTGAAGATGTCATTGAAACCAGATATGTACAGACATCACAAACAAGAGATGAAATGAGTTTAGAGAGTTTTCTTGGTAGGTCAGGGTGTATACATGAATCCAAACTAGAGGTCACACTTACAAATTACAATGAAAATAATTTCAAAGTATGGAACATCAATTTGCAAGAAATGGCCCAGATCAGAAGAAAATTTGAACTGTTTACTTACACTAGATTCGATTCTGAAATAACCTTGGTTCCATGCATTTCTGCACTTAGCAAGGATATTGGACACATTACAATGCAATACATGTATGTGCCGCCAGGTGCACCTGTACCAAAGAGCAGAGATGATTATGCATGGCAGTCTGGCACTAATGCATCTGTTTTCTGGCAACATGGGCAAGCATACCCAAGATTTTCTCTACCCTTTTTGAGTGTAGCTTCAGCTTACTACATGTTTTATGATGGATATAATGAACAGGGCCAAAATTATGGTACGGTAAGTACAAACAACATGGGATCATTATGCTCTAGGATAGTAACAGAGAAACACATTCACAGTATGCATATCATGACAAGAATCTATCATAAAGCTAAACACGTCAAAGCATGGTGTCCGCGCCCACCCAGAGCACTTGAATATACTCGCGCTCACCGTACTAATTTCAAAGTTGAAGACAGAGACATTAAAACAGGAATCACATCCAGAGCAATTATTACAACAGCTGGTCCTAGTGATATGTATGTTCATGTTGGTAATCTTATCTATAGAAATTTACATCTCTTCAATTCTGAAATGCATGAATCTATACTGGTATCTTATTCATCAGATTTAATCATTTACCGAACAAACACCATAGGTGATGATTATATCCCCTCTTGTGATTGCACCCAGGCTACATATTACTGTAAACATAAAAATAGATATTTCCCAATCACAGTGACAAGCCATGACTGGTATGAAATACAGGAAAGTGAATACTACCCCAAGCATATACAATACAATTTACTAATTGGTGAGGGCCCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGGAAATTGTTATGTAAACATGGTGTTATTGGTATAGTAACAGCTGGTGGTGATAATCATGTGGCTTTTATTGATCTTAGACACTTTCACTGTGCTGAGGAGCAAGGAATTACAGATTACATACACATGTTAGGTGAAGCATTTGGAAATGGATTTGTAGATAGTGTAAAAGAACATATACATGCCATTAATCCAGTAGGAAATGTTAGTAAAAAGATCATCAAATGGATGCTGAGGATAATATCAGCAATGGTTATAATAATAAGGAATTCCTCTGATCCACAAACTATATTGGCAACACTCACGCTAATTGGATGTTCTGGTTCACCATGGAGATTTTTAAAGGAGAAATTTTGCAAATGGACACAACTCAATTATATACATAAAGAATCAGACTCATGGTTGAAAAAATTTACTGAAGCATGCAATGCAGCCAGAGGACTTGAGTGGATAGGGAATAAAATATCTAAATTCATTGAATGGATGAAATCAATGCTCCCACAAGCACAACTTAAGGTCAAGTACTTAAATGAACTCAAAAAATTGAGCTTGTATGAAAAACAAGTTGAAAGTCTTAGAGTAGCAGATGTAAGAACACAAGAAAAGATTAAAATGGAAATTGATACCCTACATGACTTATCATGCAAATTTTTACCATTGTATGCAGGTGAAGCAAAAAGGATAAAGACGTTACATATTAAGTGTGATAACATTATCAAACAAAAGAAAAGGTGTGAACCAGTGGCTATAGTTATCCACGGGCCACCTGGTGCTGGAAAATCAATAACAACAAATTTTTTAGCTAGGATGATAACTAATGATAGTGATATATACTCTTTACCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGCTACGATCAACAAAGTGTGGTGATAATGGATGATATCATGCAAAATCCAGCTGGGGATGACATGACTCTATTCTGTCAAATGGTTTCCAGTGTCACGTTCATACCACCAATGGCTGATTTACCAGATAAGGGCAAGGCCTTTGACTCTAGGTTTGTATTATGCAGCACAAATCACTCTCTTTTAGCACCGCCTACAATAACCTCACTGCCTGCTATGAACAGAAGATTCTTTTTAGACTTAGACATAATAGTACATGATAATTTCAAGGATTCACAGGGTAAACTTAATGTAGCAGCAGCCTTCCAACCATGTAATGTGGACAATAAAATTGGGAATGCTCGTTGTTGCCCATTTGTGTGTGGAAAGGCTTTTTCTTTCAAAGATCGCAATTCTTGCAATAAATACACCCTAGCACAAGTGTACAACATAATGCTTGAAGAAGACAAACGGAGGAGACAAGTGGTTGACGTCATGTCGGCCATATTCCAAGGACCAATTGACATGAAAAACCCACCACCACCTGCAATTACTGATTTACTCCAGTCAGTTAGGACTCCTGAGGTTATCAAGTATTGTGAAGTTAATAGATGGATAATTCCAGCAGAATGTAAAATAGAGAAGGAATTAAATTTAGCCAATACAATCATAAC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107,189
LC699416.1
rhinovirus A54
Egawa,K., Kakizaki,M., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Takeda,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
Japan
2022-03-23
HRV_A54_Fukushima_H504_2019
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,122
GenBank
1
Japan: Fukushima
Japan
Homo sapiens
null
2019
SAMD00490726
PRJDB13572
Rhinovirus A54 HRV_A54_Fukushima_H504_2019 genomic RNA, complete genome
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32,235
OL961530.1
rhinovirus A54
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,133
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN23789518
PRJNA723895
Rhinovirus A54 strain RvA54/USA/2021/K6S7UL, complete genome
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34,111
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rhinovirus A54
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-12-11
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Rhinovirus A
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Picornaviridae
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null
2021-07-14
SAMN22069262
PRJNA1066815
Rhinovirus A54 strain RvA54/USA/2021/SLPWR2, complete genome
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35,369
MZ540950.1
rhinovirus A54
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
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7,118
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-05-12
SAMN19819190
PRJNA1066815
Rhinovirus A54 strain RvA54/USA/2021/W58KP8, complete genome
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39,575
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rhinovirus A54
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UW Virology, Laboratory Medicine
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2019-09-16
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Picornaviridae
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GenBank
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2018
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PRJNA338014
Rhinovirus A54 strain SC9916, complete genome
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59,492
KY369875.1
rhinovirus A54
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
UW, Lab Medicine
USA
2017-01-15
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,104
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2016
SAMN28125221
PRJNA338014
Rhinovirus A54 strain SC176, complete genome
TTAAAACTGGGTCTAGGTTGTTCCCACCTAGATCTCCTACACGGAGTTGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTAWATCCCTTCCCCCACGTAACTTAGAAGTTTGACACACTGACCAATAGGCGGCAATTAACCAAATTGCTAAAGGTCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGTCAAGATTGATACGCTCTACCAGGGCGAAAACAGTCGAGATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCGAAGCTTAGTAACATCTTGAAGAATTTATGACTGGTCGCTCCGCCATTACCCATGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAACTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTACGGGTGTGAAGCCATACATTTGACAAGGTGTGAAGAGCCTAGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAAACCCGTAGCTAGTGCACACAAGCCAGTGTGTAGCTAGTCGTAATGAGCAATTACGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACTTTTATATTTGCTTATGGTGACAATATATAGATTATATATTGACACCATGGGCGCTCAAGTCTCCAGACAGAATGTTGGCACTCATTCAACCCAAAACTCTGTTTCAAATGGATCCAGTTTAAACTATTTCAACATAAACTATTTCAAGGATGCCGCTTCAAGCGGTGCATCAAAGTTAGAGTTCTCACAGGATCCAAGTAAATTTACTGACCCAGTTAAGGATGTTTTGGAAAAGGGAATACCAACTTTGCAATCACCTACAGTGGAAGCTTGTGGTTACTCAGACAGAATAATTCAGATAACTAGAGGAGATTCAACAATAACATCACAAGATGTGGCAAATGCTGTTGTAGGTTACGGTGTTTGGCCACATTACTTGACAGCACAAGATGCAACTGCCATAGATAAACCTACACAACCAGACACATCCTCAAACAGATTTTACACACTTGAGAGTAAATTGTGGCATGAAACGTCAAAAGGCTGGTGGTGGAAATTACCTGATGCACTGAAAGATATGGGTATATTTGGTGAAAATATGTACTATCACTTCCTAGGAAGATCAGGATACACTGTACATGTACAGTGTAATGCAAGTAAATTTCATCAAGGCACATTGTTAATTGCTATGGTACCAGAACATCAACTAGCAAGTGCAAGCCGTGGTAATGTTGCTGCGGGATATAATTTTACACACCCCGGGGAACTTGGAAGAGTAGTTGGACAAGCTAGAACTCAGAATAGTGAAAATCAGCCTAGTGATGATAATTGGTTGAACTTTGATGGCACTTTCCTCGGAAACTTGTTAATATACCCACATCAATTCATCAATTTGAGAAGTAATAACTCAGCAACAATTATTGTTCCTTATGTAAATGCTGTGCCCATGGACTCAATGTTAAGACATAATAATTGGAGTTTATTAATAATTCCTGTTAGCCCTCTGAAAAGTGACCAAGCATCAATTAGAGTACCAATAACAATCTCAATTAGTCCAATGTGTGCTGAATTTTCTGGAGCCAGAGCAAGACCAACTGCTGCAGCGCAAGGTCTCCCAGTTTATATTACACCAGGATCTGGACAATTTATGACCACAGATGATTTGCAATCTCCATGCGCTTTGCCATGGTATCACCCAACCAAGGAGATTTTCATACCAGGTGAGGTTAAAAACCTTATTGAAATGTGCCAAGTTGATACACTCATTCCAGTCAACAACACAATTGCAAATTTGCGTAATGTCAATAAGTATGCTGTATCATTATCTAGTCAGACTGATTTTGCCATGGAAATATTTGCCATTAGGGTAGATGTGGCCTCTCAACCCCTCTCAAGTACACTTTTAGGTGAAATATGTAGCTACTACACACATTGGACAGGTAGTCTACGTTTTAGCTTCATGTTCTGTGGTACAGCCAACACAACACTCAAAATACTTATTGCTTATACACCACCAGGAATCAAGAAACCTGAGAACAGGAAACAAGCCATGTTAGGCACACATATAGTGTGGGATGTGGGATTGCAGTCAACAGTCTCCTTGGTTGTCCCTTGGGTCAGTGCTAGTCATTTTAGATATACAACTCCAGATACATACTCTGCAGCAGGTTACATAACCTGTTGGTACCAAACAAATTTTGTGTTCCCACCAAATACGCCAAACAGTGCTGACATGTTATGTTTTGTTTCTGCATGCAAAGATTTTTGCTTGCGCATGGCTAGAGATACTGACATGCACGTTCAGGAAGTGCCAATAGAACAGAATCCTGTAGAGAGATATGTAGATGAAGTATTAAATGAGGTGTTAGTTGTCCCAAACATTAGAGAGAGCCATCCAGCCACATCCAATTCAGCTCCTGCATTAGATGCAGCAGAAACTGGACACACTAGTGGAATACAACCTGAGGATACTATAGAAACAAGATATGTACAGACATCACAGACTAGAGATGAGATGAGCATTGAAAGTTTTCTAGGTAGGGCTGGTTGCATACATGAATCCACCATTACAATCCAAAACAATGTAGAGTATAATGACCATCATTTTAGACAATGGGATATAACACTGCAAGAAATGGCACAAATTCGCAGGAAATTTGAATTCTTTACCTATGTTAGATTTGATTCAGAAGTTACCCTAGTTCCTTGCATAGCTGGCAAGGGAGCTGACATTGGACACATTGTTATGCAATTTATGTATGTCCCACCTGGTGCACCCAAACCCAAAAAGAGGAATGATTATACCTGGGAATCAAGCACAAACCCTTCTATATTCTGGCAACATGGTCAAGCCTATCCAAGATTTTCTTTACCATTCTTGAGTATTGCATCCGCTTACTACATGTTCTATGATGGGTATGATGGTGATGCGCCTGGATCAAGATATGGAACTTCAGTCACTAACCACATGGGCACCTTATGCTCAAGAGTAGTTACAGGTAAACAAGAACACCCAGTTGAAATCACCACACGTGTGTATCATAAAGCAAAACATATCAGAGCATGGTGTCCGCGCGCACCTAGAGCTGTTCCATACACACACACTAGATCAACTAATTATGTACCTCAAGATGGTGAGCCAACAATCTTTCTCAAGCACAGAAAAGATCTTGTGACAGCTGGACCCAGTGACATGTATGTACATGTTGGTAACTTAATATACAGAAATTTGCACCTCTTTAACTCAGAAATGCATGATTCTATTTTGGTCTCATATTCTTCTGATCTAGTCATATACCGCACAAACACAATAGGTGATGACTATATCCCAACATGTGACTGTACAGAAGCTACATATTACTGTAAACATAAGAATAGATATTACCCAATCAAAGTAACTAGTCATGACTGGTATGAAATACAAGAAAGTGAGTATTATCCTAAGCACATACAATACAATCTTTTGATTGGGGAAGGGCCATGTGAACCAGGTGATTGTGGAGGGAAATTATTGTGTAAACATGGAGTTATTGGAATAATCACTGCTGGTGGAGAGGGACATGTGGCATTTATTGATCTTAGACATTTCCATTGTGCTGAGGAACAAGGTATAACTGATTACATTCACATGCTTGGTGAAGCTTTTGGTGCAGGTTTTGTTGATAGCGTCAAGGATCAAATAAACGCCATCAATCCTATTAACAATATTAGCAAGAAAATAATCAAGTGGCTCCTTAGAATTATATCAGCTATGGTGATAATAATTAGAAACTCATCTGACCCACAGACAATCATAGCTACTTTAACTTTAATTGGTTGTTCAGGTTCGCCTTGGAGATTCCTCAAGGAAAAGTTCTGTAAATGGACTCAACTTAATTATATTCACAAGGAATCTGATTCATGGCTCAAAAAATTTACAGAAATGTGCAATGCAGCAAGAGGGCTAGAGTGGATTGGTAACAAGATATCCAAATTCATAGATTGGATGAAGTCAATGCTGCCGCAAGCTCAACTAAAGATTAAATACTTGAGTGAATTAAAGAAATTAAATCTTCTTGAAAAGCAAATGGAATATCTTAGAGTTGCTGACTCTCAAACTCAAGAAAAAATTAAACATGAAATTGATACTCTCCATGACCTTTCGTGCAAGTTCCTTCCATTGTACGCAAGTGAGGCAAAAAGAATAAAGATTTTACATAATAGATGTAGTACAATTATCAAGCAGAAGAAAAGATGTGAGCCTGTTGCTGTTGTTATACATGGTGAGCCAGGCACTGGTAAATCTATGACTACAAACTTCTTAGCTAGAATGATAACTAATGACAGTGATATATATTCCCTACCCCCAGATCCTAAATATTTTGATGGGTATGACCAACAAAGTGTGGTTATCATGGATGATGTGATGCAGAACCCAAGTGGAGATGACATGACCCTGTTTTGCCAAATGGTTTCTAGTGTTACATTTATACCACCTATGGCTGATTTACCAGATAAAGGAAAACCCTTTGATTCTAGATTTGTACTGTGCAGCACTAATCATAATCTATTAGCACCTCCTACAATAACCTCTTTGCCAGCAATGAACAGAAGATTCTTCCTTGATTTAGATATAATAGTGTGTGACAAATACAAAGATCCACAAGGAAAGCTGAATGTATCTGCTGCTTTTAAACCATGTGATGTTGATACAAAAATTGGAAATGCTAAATGCTGTCCCTTTATATGTGGAAAAGCTGTCATCTTTAGAGATAGAAATACATGCCAGACATACACATTATCGCAAGTATATAATCAAATACTTGATGAAGACAAAAGACGCAGACAAGTTGTGGATGTGATGGCAGCAATATTTCAGGGCCCAATCACACTTGAAGGACCACCACCAGCAGCAATAAGTGATCTTCTACAATCAGTTAGGACTCCAGAAGTAATCAAATACTGTGAGGATAACAAATGGATAATACCAGCAGAATGTAAGATAGAAAGAGATTTAA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78,629
FJ445138.1
rhinovirus A54
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,134
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 54 strain ATCC VR-1164, complete genome
TTAAAACTGGGTCTAGGTTGTTCCCACCTAGACCTCCTACATGGAGTTGTACTCTATTATTTCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATATCCCCTTTCCCCACGTAACTTAGAAGTTTAACACACTGACCAATAGGTGGCAATTAACCAAATTGCTAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGATTGATACGCTCTACCAGGGCGAAAACAATTGAGATCGTTAMCCGCAAAGTGCCTACGCGAAGCCTAGTAACATCTTGAAGAATTTATGGTTGGTCGCTCCACTATTCCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATTCCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTACGGGTGTGAAGCCATATATTTGACAAGGTGTGAAGAGCCTAGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAAACCCGTAGCTAGTGCATACAATCCAGTGTGTGGCTAGTCGTAACGAGCAATTACGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTTATATTTGCTTATGGTGACAATATATAGATTATATATTGACACCATGGGTGCTCAAGTATCTAGACAGAATGTTGGTACTCATTCAACTCAGAACTCTGTGTCAAATGGATCTAGTTTGAATTATTTTAATATAAATTATTTCAAGGATGCTGCTTCAAGTGGAGCATCAAAATTAGAATTTTCACAAGATCCAAGTAAATTTACAGACCCAGTAAAGGATGTTTTGGAGAAAGGGATACCAACTTTACAATCACCCACAGTGGAAGCTTGTGGTTACTCAGACAGGATTATACAAATAACCAGAGGAGATTCAACAATGACATCACAAGATGTAGCAAATGCTGTTGTGGGATACGGCGTCTGGCCACATTACTTAACAGCACAAGATGCTACAGCTATAGATAAACCTACACAACCTGACACATCTTCTAACAGATTTTATACACTTGAAAGCAAATTATGGGATGAGACATCAAAAGGCTGGTGGTGGAAATTACCTGATGCACTTAAAGATATGGGTATATTTGGTGAGAATATGTTCTATCATTTCCTTGGGAGATCAGGATACACTGTGCATGTACAGTGTAATGCAAGTAAATTCCATCAAGGCACATTATTGGTTGCTATGGTACCAGAACATCAACTAGCTAGTGCAAGTCGTGGTAATGTCACTGCAGGGTATAATTACACACACCCCGGAGAACTCGGTAGAGTAGTTGGGCAAGCTAGAGTCCAGACCAATGATAATCAACCTAGTGATGACAACTGGTTAAATTTTGATGGTACTTTTCTTGGAAACTTGTTAATATTCCCACACCAATTCATTAATTTGAGAACTAACAACTCAGCAACAATCATTGTTCCATATGTAAATGCAGTACCCATGGACTCAATGTTGAGACATAACAATTGGAGTTTGTTGATTATTCCTGTGAGCCCTCTGAAAAGTGACCAAGCATCTGTTAGAGTGCCAATAACAATTTCAATTAGTCCAATGTGTGCCGAATTCTCTGGCGCCAGAGCAAGACCAGCTGCCGCAGCACAGGGTTTACCAGTTTATGTTACACCAGGATCTGGACAATTCATGACTACAGATGACTTGCAATCCCCATGTGCTTTGCCATGGTATCACCCAACCAAAGAAATTTTCATACCTGGCGAGGTTAGAAACCTCATTGAAATGTGTCAAGTTGATACACTCATTCCAATTAATAACACATTTGCAAATCTTCGTAATGTTAACAAGTATGCTGTCTCATTGTTTAGCCAAACTGATTTTGCCAAGGAAATATTTGCCATTAAGGTAGATGTAGCTTCTCAACCTCTTTCAAGTACACTCCTGGGTGAAATATGTAGTTATTACACACACTGGACAGGTAGTTTGCGTTTTAGTTTCATGTTTTGTGGTACGGCTAACACAACACTCAAGGTGCTCATTGCTTACACACCACCAGGGATCAAGAAACCTGAAACCAGGAAACAAGCCATGCTGGGTACACATATAGTATGGGATGTGGGATTACAATCAACTGTTTCTTTAGTTGTCCCTTGGGTTAGTGCTAGTCATTTTAGATACACAACTCCAGATACATACTCTGCAGCAGGGTATATAACTTGTTGGTACCAAACAAATTTCGTGTTTCCACCTAACACACCAAATAGCGCTGATATGTTGTGCTTTGTGTCTGCTTGTAAAGACTTCTGCTTACGTATGGCTAGGGACACTGACATGCATGTGCAAAATGTGCCAATAGAACAAAATCCTGTAGAAAGATATGTTGATGAAGTGTTAAATGAAGTGTTAGTTGTCCCAAACATTAGAGAAAGTCATCCAGCTACATCTAATTCAGCCCCTGCGCTAGATGCGGCAGAAACTGGACACACTAGTGGAATACAACCCGAGGACACCATAGAAACAAGATTTGTGCAGACATCACAAACTAGAGATGAAATGAGCATAGAAAGTTTTCTAGGCAGGGCTGGTTGCATACATGAATCCACCATTACAATTCAAAATGATGTAGAATACAATGATCACCATTTTAAGAAATGGGATATAACATTACAAGAGATGGCACAAATACGAAGGAAATTTGAATTCTTTACTTATGTTAGGTTTGATTCAGAAATTACTCTAGTCCCCTGTATAGCTGGTAAGGGAGTTGATATTGGACACATTGTCATGCAATTCATGTATGTACCGCCTGGTGCACCAAAACCAGAAAAAAGGAATGATTACACCTGGGAGTCAAGCACAAACCCTTCTATATTTTGGCAACATGGCCAAGCTTATCCAAGATTCTCTTTACCATTTTTAAGTATTGCATCTGCTTACTACATGTTTTATGATGGGTATGATGGTGACGCACCTGGATCAAGATATGGGACTTCAGTTACCAATCATATGGGTACTTTGTGTTCAAGAGTGGTTACTGGTAAACAAAAACACCCAGTTGAAATCACCACACGGGTGTATCACAAGGCAAAACACATTAGAGCATGGTGTCCACGTGCACCTAGGGCTGTCCCATACACACATACTAGATCAACAAATTACATGCCACGGGAGGGTGATCCAACAATTTTCCTTAAACACAGGACAAACCTTGTAACAGCTGGACCAAGTGACATGTATGTGCATGTTGGTAATTTAATATACAGAAACTTACATCTTTTCAATTCTGAAATGCATGATTCTATTCTGGTTTCTTACTCTTCTGACTTAGTCATATACCGCACAAACACAATAGGAGATGACTATATCCCAACATGTGATTGTACAGAAGCTACATACTACTGTAAGCATAAGAATAGATATTATCCAATTAAAGTAACTAGCCATGATTGGTATGAAATACAGGAAAGTGAATATTATCCCAAACATATACAATACAACCTCTTGATTGGAGAAGGGCCATGTGAACCAGGAGACTGTGGAGGGAAATTACTATGTAAACATGGGGTTATTGGAATAATCACTGCTGGTGGAGAAGGGCATGTGGCATTTATTGATCTTAGACATTTCCACTGTGCTGAAGAACAAGGTATAACTGATTATATCCACATGCTTGGTGAGGCCTTTGGCACAGGTTTTGTTGATAGCGTCAAGGATCAAATAAACGCTATTAACCCCATCAATAGCATCAGCAAGAAAGTGATTAAATGGCTCCTTAGAATCATATCAGCTATGGTGATAATTATTAGAAACTCATCAGATCCACAGACAATCATAGCCACATTGACCTTAATTGGTTGCTCAGGTTCACCTTGGAGATTTCTTAAAGAGAAGTTTTGCAAATGGACTCAACTCAACTACATTCACAAAGAGTCTGATTCATGGCTCAAAAAATTCACAGAAATGTGTAATGCAGCAAGGGGATTAGAGTGGATTGGCAATAAAATATCTAAATTTATTGATTGGATGAAATCTATGTTACCACAAGCTCAACTTAAGATAAAATACTTGAGTGAGCTTAAAAAATTAAATTTCCTTGAAAAGCAAATGGAGCATCTCAGGGTTGCAGATTCGCAAACACAAGAGAAGATTAAACATGAAATTGATACTCTTCATGATCTTTCATGCAAATTTCTTCCACTGTATGCAAGTGAAGCAAAGAGGATTAAAGTCTTATACAATAGATGTAGTACCATTATCAAGCAAAAGAAAAGGTGTGAGCCCGTTGCTGTCGTAATACATGGCGAACCGGGTACGGGTAAATCTATGACTACAAACTTCCTAGCTAGAATGATAACCAATGACAGTGATATATATTCTTTACCTCCAGATCCCAAATATTTTGATGGATATGATCAACAAAGTGTGGTTATCATGGATGATGTAATGCAAAATCCAAGTGGAGATGACATGACTCTGTTTTGCCAAATGGTCTCTAGTGTCACATTTATACCACCTATGGCTGATCTGCCAGATAAGGGAAAACCTTTTGATTCTAGATTTGTGTTGTGCAGTACTAATCACAATTTATTGGCACCCCCTACAATAACCTCTTTACCAGCTATGAACAGGAGATTCTTTCTTGATTTAGACATAGTAGTGTGTGACAAATACAAAGATTCACAAGGGAAACTAAACGTGTCTGCTGCCTTCAAACCATGTGATGTTAACACAAAAATTGGAAATGCCAAATGTTGCCCTTTTATATGTGGGAAAGCTGTCGTTTTCAGAGACAGAAACACATGCCAAACCTACACGCTATCTCAAGTATACAATCAAATACTTGATGAAGATAAAAGGCGTAGACAGGTTGTTGATGTGATGGCAGCAATATTTCAAGGTCCAATTTCACTTGAAGGACCACCACCAGCAGCAATAAGTGATCTTTTGCAGTCAGTTAGAACTCCAGAAGTAATTAAATACTGTGAATATAATAAATGGATAATACCAGCAGAGTGTAAAATAGAGAGAGACTTG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103,706
FJ445139.1
rhinovirus A54
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
F05
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,133
GenBank
1
USA
USA
Homo sapiens
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 54 isolate F05, complete genome
TTAAAACTGGATCTAGGTTGTTCCCACCTAGATCTCCTACATGGAGTTGTACTCTATTATTCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATATCCCTACCCCCATGTAACTTAGAAGTTAAGCACAACGACCAATAGGAGGCAATTGACCAAATTGCTAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGATTGATACGCTCCACCAGGGCGAAAACAATTGAGATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCGAAGCCTAGTAACACTTTGAAGAGTTTATGGTTGGTCGCTCCGCTATTCCCCATAGCAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGCTCCCCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTATGGGTGTGAAGCCATATACTTGACAGGGTGTGAAGAGCCTAGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAAACCCGTAGCTAGTGCACACAATCCAGTGTGTGGCTAGTCGTAATGAGCAATTACGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTTGTATTTGCTTATGGTGACAATATATAGATTATATATTGACACCATGGGCGCTCAGGTATCTAGACAGAATGTTGGTACTCACTCAACTCAAAACTCTGTGTCAAATGGATCCAGCTTGAATTATTTCAATATAAATTATTTTAAAGATGCTGCTTCAAGTGGAGCGTCCAAATTGGAATTCTCACAAGATCCAAGTAAGTTTACTGACCCAGTAAAAGATGTTCTGGAAAAAGGGATACCAACTTTACAATCACCCACAGTGGAGGCTTGTGGCTACTCAGATAGGATTATACAAATAACTAGAGGAGATTCAACAATAACATCACAAGATGTGGCAAATGCCGTTGTGGGATATGGTGTCTGGCCACATTATTTAACAGCACAGGATGCCACAGCCATAGATAAACCTACACAACCTGACACATCATCCAACAGATTTTACACACTTGACAGTAAATTGTGGGACGAGACATCAAAAGGCTGGTGGTGGAAGTTGCCTGATGCACTCAAAGACATGGGCATATTTGGTGAGAATATGTTTTACCATTTCCTTGGGAGATCAGGATACACTGTACATGTACAGTGTAATGCAAGTAAATTTCATCAAGGTACACTGCTAATCGCCATGGTACCAGAACATCAATTAGCCAGCGCAAGTCGTGGCAATGTCACTGCAGGATATAATTATACACACCCTGGTGAACTTGGTAGAGTAGTTGGGCAACCTAGGACACAGATTAATGATCACCAACCTAGTGATGACAACTGGTTAAATTTTGATGGTACTTTCCTTGGAAATCTGTTAATATTCCCACACCAATTTATTAATTTAAGAAGCAATAATTCAGCAACAATCATTGTTCCATATGTGAATGCAGTGCCAATGGACTCAATGCTAAGACATAACAATTGGAGTTTGTTAATTATCCCTGTGAGTTCTCTGAAAAGCGATCAGGCATCTGTTAGAGTGCCAATAACAATTTCAATTAGTCCAATGTGTGCTGAATTCTCTGGTGCCAGAGCAAGACCAGCTGCTGCAGCACAAGGTTTGCCGGTTTATATTACACCAGGATCTGGACAGTTCATGACTACAGATGATTTACAATCCCCATGTGCTCTACCATGGTACCACCCGACTAAGGAAATTTTCATACCTGGTGAGGTTAGAAACCTTATTGAGATGTGCCAAGTCGACACACTCATCCCAATTAATAACACACTTCCAAACCTTCGTAATGTTAGTAAGTATGCTGTTTCACTGTCTAGTCAAACTGATTTTGCTAAGGAAATATTTGCTATTAAAGTGGATGTAGCTTCCCAACCTCTTTCAAGTACACTTTTAGGTGAAATATGTAGTTATTACACACACTGGACAGGTAGTTTACGTTTTAGCTTCATGTTCTGTGGTACAGCCAATACAACGCTTAAGGTGCTCATTGCTTACACACCACCAGGGATCAAGAAACCTGAAACCAGAAAGCAAGCCATGCTGGGTACACATATAGTGTGGGATGTGGGGCTACAATCGACTGTTTCTCTGGTTGTCCCTTGGGTTAGTGCTAGCCACTTCAGATACACAACTCCAGATACATACTCTGCAGCAGGGTACATAACTTGTTGGTATCAAACAAACTTTGTATTTCCACCTAATACACCTAATAATGCTGACATGTTGTGTTTTGTGTCTGCTTGTAAAGACTTTTGCTTACGCATGGCTAGAGACACTGACATGCACGTGCAAAATGTGCCAATAGAGCAAAATCCTGTAGAAAAGTATGTTGATGAAGTGTTAAATGAAGTATTAGTTGTTCCAAACATCAGAGAAAGTCATCCAGCTACATCCAATTCAGCCCCTGCGTTGGATGCGGCAGAAACTGGACATACTAGTGGAATACAACCTGAGGACACTATAGAAACAAGATACGTACAGACTTCACAAACCAGAGATGAAATGAGCATAGAGAGCTTTTTAGGTAGAGCTGGTTGCATACATGAATCCACCATCACAATTCGGAATGATGTTGAATACAATGATCATCACTTCAAGAAATGGGACATAACATTACAAGAAATGGCACAAATACGGAGAAAATTTGAATTCTTTACTTATGTTAGGTTTGATTCAGAAATTACTCTAGTCCCTTGTATAGCTGGTAAGGGAGCTGATATTGGGCATATTGTCATGCAATTCATGTATGTACCACCTGGTGCACCAAAACCAGAGAAAAGGAATGATTACACCTGGGAGTCAAGTACAAACCCTTCTATATTTTGGCAACATGGTCAAGCTTATCCAAGATTCTCTTTACCCTTCTTAAGCATTGCATCTGCTTACTACATGTTCTATGATGGTTATGATGGTGATGCACCAGGGTCAAGGTATGGGACCTCAGTCACCAACCACATGGGTACATTGTGCTCAAGAGTGGTTACTGGTAAACAAGAACATCCAGTTGAGATCACTACAAGAGTGTATCATAAAGCAAAACACATTAGAGCATGGTGTCCACGTGCACCTAGGGCTGTCCCATACACACATACTAGATCAACAAATTACATGCCACAGGATGGTGAACCAACAATTTTCCTTAAGCACAGGGAAACTCTTACAACAGCTGGACCCAGTGACATGTATGTACATGTCGGTAATTTAATATACAGGAATCTACATCTTTTCAATTCTGAAATGCATGACTCTATTCTGATTTCTTACTCTTCTGATTTAGTCATATACCGCACAAACACAATAGGAGATGACTATATTCCAACATGTGATTGCACAGAAGCCACATATTACTGTAAGCACAAGAATAGATATTACCCAATTAAAGTAACTAGTCATGATTGGTATGAAATACAAGAAAGTGAATATTACCCTAAACACATTCAATATAACCTTTTGATTGGAGAAGGACCATGTGAACCAGGAGACTGTGGAGGCAAATTACTGTGTAAACATGGGGTCATCGGAATAATCACTGCTGGTGGAGAAGGACATGTGGCATTTATTGATCTTAGACATTTCCATTGTGCCGAAGAGCAAGGCATAACTGACTACATCCACATGCTTGGTGAAGCCTTTGGTACAGGTTTTGTTGATAGTGTTAAGGATCAAATAAATGCTATCAACCCAATCAATAATATTAGTAAGAAAATAATTAAATGGCTCCTTAGAATCATATCAGCTATGGTAATAATAATCAGAAATTCATCAGATCCACAGACAATTATAGCCACTTTAACTTTAATTGGTTGTTCAGGTTCACCATGGAGATTTTTGAAGGAGAAATTCTGCAAATGGACTCAACTTAACTACATCCACAAGGAGTCTGATTCGTGGCTCAAAAAATTTACAGAAATGTGCAATGCAGCAAGAGGATTAGAGTGGATTGGCAATAAGATATCTAAATTTATTGATTGGATGAAATCTATGCTACCACAAGCTCAGCTTAAAATAAAATACTTGAGTGAGCTAAAGAAATTGAATCTCCTGGAAAAGCAGATGGAACACCTTAGAGTTGCGGATTCTCAAACACAGGAGAAAATTAAACATGAAATCGACACTCTTCATGACCTTTCATGCAAATTTCTTCCATTATATGCAAGTGAAGCAAAGAGAATTAAAATTTTACACAATAGGTGTAGTACTATTATTAAGCAAAAGAAAAGGTGTGAGCCTGTTGCCGTTGTAATACATGGTGAACCAGGTACAGGAAAATCTATGACCACAAACTTCCTAGCTAGAATGATAACCAATGATAGTGATATATATTCTTTACCTCCAGATCCTAAATATTTTGATGGATATGATCAACAAAGTGTGGTCATCATGGATGACGTGATGCAAAATCCAAGTGGAGATGATATGACTCTATTTTGTCAGATGGTCTCTAGTGTCACTTTTATACCACCTATGGCTGATTTACCAGATAAGGGAAAACCTTTTGATTCTAGATTTGTGTTATGTAGTACTAATCATAATTTACTGGCACCTCCCACAATAACTTCTTTACCAGCTATGAACAGGAGATTCTTTCTTGATCTAGATATAGTGGTGTGTGATAAATATAAAGATTCACAAGGAAAATTAAATGTGTCTGCTGCTTTTAAACCATGTGATGTTAACACAAAAATTGGAAATGCCAAGTGCTGCCCCTTCATATGTGGCAAGGCTGTCATGTTCAGGGATAGAAATACATGTCAAACCTATACACTATCTCAAGTCTATAATCAAATACTTGATGAAGATAAAAGGCGTAGACAGGTTGTTGACGTGATGGCAGCAATATTTCAAGGCCCAATTTCACTTGAAGGACCACCACCAGCAGCAATAAGTGACCTTTTGCAATCAGTTAGAACCCCAGAGGTGATCAAGTATTGTGAAGACAATAAATGGATAATACCAGCAGAGTGCAAGATAGAGAGAGATCTGAATTTGGCAAACACCATTATCACAATCATTGCAAATATTATTAGTATTTCAGGTATAATTTATGTGATATACAAACTCTTTTGTACACTTCAAGGTCCATATTCAGGTGAACCCAAACCCAAAACCAAAGTGCCAGAAAGAAGAGTAGTAGCACAAGGTCCTGAAGAAGAATTTGGTAGATCACTTATTAAACACAACTCATGTGTGGTCACCACTTCAAATGGTAAATTTACAGGTTTAGGAATTTATGATAGAACATTGATTGTACCCACACATGCAGATCCAGGTAAAGAAGTACAAATAGATGGCATCACAACTGAGGTCCAAGATTCTTATGATTTGTATAACAAAGATGGTATAAAATTGGAAATTACAGTTCTTAAACTTAAAAGAAATGAGAAATTCAAGGACATTAGGAAGTATATTCCAGAAAATGAAGATGATTATCCAGATTGTAATTTGGCTTTATCTGCCAACCAACCAGAAACTACAATTATTAATGTTGGAGATGTAGTATCATATGGGAACATTTTACTCAGTGGAAATCAAACAGCAAGAATGCTCAAATACAACTACCCAACAAAATCAGGGTATTGTGGTGGGATACTATACAAAATTGGGCAAGTCTTGGGCATTCATGTTGGTGGCAATGGAAGGGATGGATTTGCAGCTATGCTATTAAGATCATACTTTACAGAGGCACAAGGTCAAATAGTTACCACTAAATCTACCATAGAGTGTAACCTACCTAGCATTCATACACCTAGTAAAACCAAATTACAACCCAGTGTATTTTATGATGTCTTCCCCGGGAGTAAAGAGCCAGCTGTGCTCTCAGAACATGATCCTAGATTAGAAGTTGATTTTAAACAAGCTTTGTTTTCAAAGTATAAAGGCAATAATCAGTGTGAAATAAATGAGCACATCAAAGTGGCAGCATCCCACTATTCAGCACAGTTAATGACATTGGACATTGATTCAAATCCAATTTCACTAGAAGATAGTGTGTTCGGCACAGAGGGCCTAGAAGCACTTGATCTCACCACTAGTGCTGGATTTCCTTATGTGTCTATGGGTATCAAGAAAAGAGATTTGATTAACAAACAAACAAAAGACATCACCAAGCTTAAGATAGCTCTAGATAAATATGGTGTTGATCTGCCCATGGTCACATTTCTTAAAGATGAACTTAGGAAAAAAGAAAAGATTCACACTGGAAAGACACGTGTTATTGAGGCTAGTAGTGTAAATGACACTGTGTTATTTAGAACAACCTTTGGAAATCTTTTTTCAAAATTTCATTTGAATCCTGGCATTGTCACTGGTTCCGCAGTGGGGTGTGATCCAGAGACCTTTTGGTCAAAAATACCAGTGATGTTAGATGGTGAATGCATAATGGCATTTGATTACACAAACTATGATGGTAGCATACATCCAATATGGTTCCAGGCTCTTAAAGAAGTACTATCCAACTTAGGGTTCCAACCCAATTTAATAGATAGATTGTGCAAATCTAAACATATTTTTAAAAATGTGTATTATGAAGTTGAAGGGGGGGTACCATCAGGTTGTTCTGGGACAAGTATATTCAACACAATGATTAACAATATCATCATTAGAACACTAGTGCTGGATGCATATAAAAATATTGATCTGGACAAGCTCAAAATAATAGCTTATGGGGATGATGTCATCTTTTCCTATAAATATCAATTAGATATGGAAGCAATTGCTAAAGAAGGTGTTAAATATGGTCTAACTATAACCCCAGCTGATAAATCAAGTGAATTTAAGAAATTAGATTATAGCAATGTAACTTTTCTTAAAAGAGGGTTCAAGCAGGATGAAAGATATTCATTTTTAATACATCCAACTTTTCCAGTCAATGAAATTCAAGAGTCCATACGATGGACAAAGAAACCATCTCAGATGCAGGAGCATGTTCTATCACTGTGTCACTTAATGTGGCATAATGGTAGGGATGTGTATAAGCAATTTGAACAGAAGATACGCAGTGTTAGCGCTGGCCGTGCACTGTACATTCCTCCTTATGATCTGCTTCTGCATGAGTGGTATGAAAAATTTTAAATTGTTTAGATATAGAAATAATAAACAGTTAGTTTTTTAGTTTTAT
103,707
LC699420.1
rhinovirus A58
Egawa,K., Kakizaki,M., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Takeda,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
Japan
2022-03-23
HRV_A58_Fukushima_H681_2019
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,143
GenBank
1
Japan: Fukushima
Japan
Homo sapiens
null
2019
SAMD00490730
PRJDB13572
Rhinovirus A58 HRV_A58_Fukushima_H681_2019 genomic RNA, complete genome
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32,239
OL638449.1
rhinovirus A58
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
QTAXQT
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Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
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GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-14
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PRJNA1066815
Rhinovirus A58 strain RvA58/USA/2021/QTAXQT, complete genome
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rhinovirus A58
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USA
2022-01-04
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Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
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GenBank
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USA
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Homo sapiens
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2021
SAMN23789508
PRJNA723895
Rhinovirus A58 strain RvA58/USA/2021/7SWEF2, complete genome
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34,102
OM001348.1
rhinovirus A58
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,072
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-22
SAMN24288764
PRJNA1066815
Rhinovirus A58 strain RvA58/USA/2021/B4AML4, complete genome
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34,136
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rhinovirus A58
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
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Rhinovirus A
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Picornaviridae
ssRNA(+)
7,094
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
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2021-05-27
SAMN20216551
PRJNA1066815
Rhinovirus A58 strain RvA58/USA/2021/56XQM8, complete genome
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37,561
OK017922.1
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
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USA
USA
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2021
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Rhinovirus A
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2021-05-27
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PRJNA1066815
Rhinovirus A58 strain RvA58/USA/2021/Q9RUYV, complete genome
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37,595
MZ670593.1
rhinovirus A58
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-07
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,084
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-09
SAMN20216704
PRJNA1066815
Rhinovirus A58 strain RvA58/USA/2021/T28K2D, complete genome
GTACACTGTTATTACGGTAACTTTGTATGCCAGTTTTTATCACCCTTCCCCGTAACGTAAATTAGAAGTTTGTACATTCAGACCAATAGGTGATAATTATCCAGATTATCAACGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCGATGAGGATATGCTTTACCCAAGGCAAAAACCTTAAAGATCGTTATCCCCGCATTGCCTACACAGAGCCTAGTATCACTTTTGATGTATTTAGGCTGGTCGCTCCCTGCAACCCCAGCAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGACGTTCCCCACTGGCGACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCCCACCCATCTGGGTGGGAAGCCTAATTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCGCGTGTGCTCAATGTGTTTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCCGCAGCCGCTGTCCACAAACCAGTGGATATACGGTCGTAATGCGCAAGTGTGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTTCTTTTTATGCATTTTATGGTGACAATTTATGGTATATAGATTGTCATCATGGGTGCACAAGTGTCAAGACAGAATGTTGGTACACACTCAACACAGAACTCAGTGAGCAATGGATCAAGTCTTAATTATTTCAATATTAATTATTTTAAGGATGCAGCTTCAAGTGGTGCTTCTAGATTAGATTTTTCTCAAGACCCCAGTAAATTCACAGATCCTGTAAAAGATGTATTAGAAAAGGGTATTCCAACACTTCAATCACCAACAGTTGAAGCATGTGGTTATTCAGATAGATTAATACAGATCACTCGTGGAGACTCTACTATAACATCACAAGATATTGCAAATGCAGTTGTTGCTTACGGGGTGTGGCCATCATATTTGACTCCAGATGATGCAACTGCAATTGACAAACCCACACAACCTGATACTTCATCTAATAGATTTTACACTTTGGAAAGTCGGAATTGGACAAACTCATCGACTGGATGGTGGTGGAAATTGCCTGATGCCCTTAAAAATATGGGTATATTTGGAGAAAATATGTTCTATCACTTCTTGGGAAGATCAGGATATACTATCCATGTACAATGCAACTCTAGTAAGTTTCACCAAGGTTTATTAATAGTTGCTGCTATACCAGAACATCAGCTGGCATCTGCAACAAGTGGAAATGTGTGGGTAGGATATCAACACACTCACCCGGGTGAACAGGGCAGAGAGATAGATCCAAACCGGAGGTCAACTGACAACAAGAGACCCAGTGATGACAATTGGTTAAATTTTGATGGAACATTACTTGGTAATTTACCTATCTATCCTCATCAGTACATTAATCTGAGAACCAATAATTCGGCTACCCTTATTTTACCCTATGTTAATGCTGTACCAATGGACTCTATGCTTAGACATAACAACTGGAGTTTGGTGATTATACCAATATGTCCTCTCCAAGTTGAAGGTAGCGGTACGCCATCTATACCTATAACAGTATCTATTAGTCCAATGTTTTCAGAATTTTCAGGACCAAGAAATAAGGTTGTTTTTAGTCAAGGTTTGCCAGTTATGTTAACTCCTGGGTCGGGACAATTCTTGACAACTGATGACACACAATCACCGTCAGCATTTCCTTATTTCCATCCAACCAAAGAAATATTTATACCTGGTCAAGTCAGAAATTTGATCGAGATGTGCCAAGTTGACACACTCATTCCTATTAATAATGTAGGAAACAATGTCAAGTCTGTAAACATGTATACCGTTGATCTAAGATCGCAAACAGAACTTGCACAAGAAGTTTTTGCTATACCAGTCGACATTGCTTCACAACCCTTAGCTACTACAATTATAGGGGAAATTGCTAGTTACTACACTCACTGGACAGGTAGTCTACGCTTTAGCTTTATGTTTTGTGGTTCTGCTAGTGCTACTTTAAAACTACTAATTGCTTACACACCTCCTGGTGTAGCAAAACCTAAGTCTAGGAAAGAAGCCATGCTTGGTACTCATCTGGTATGGGATGTTGGCCTGCAATCCACTGCCTCGCTGGTTGTGCCGTGGGTTAGTGCTAGCCACTTCAGGTTCACAACACCTGACACATATTCTTCTGCAGGCTATATTACATGTTGGTACCAAACCAATTTTGTTGTACCTGCCAACACACCAACCAATGCAAAGATGGTGTGTATGGTATCAGCTTGCAAAGATTTTTGCCTGAGGCTGGCTAGAGATACCAATCTACACATGCAAGATGGGGTACTCACACAAAATCCAGTAGAAAATTATATAGATAATGTGTTAAATGAAGTACTTGTAGTTCCAAATATCCAATCTAGTACATCTGTGTCAAGTCATTCTGTGCCTGCTTTGGATGCCGCAGAAACGGGACACACAAGTTCTGTTCAGCCTGAGGATATGATTGAAACTAGATATGTCATCACAGATCAAACAAGAGATGAAACTAGCATTGAGAGCTTTTTAGGTAGATCTGGTTGTATTGCTATCATAAAGTTTAATACAAATGAGACCAATTATGATGACATAGGTGTGGGATATAAAACATGGAAAATTAGCCTTCAGGAAATGGCACAAATTAGGAGGAAATTTGAATTGTTCACATACACAAGATTTGATTCAGAAATCACAATAGTCACTGCAGCAGCTGCTCAGGGAGAAGATAATGGGCATGTTGTACTTCAATTCATGTATGTACCTCCAGGAGCACCTGTGCCCAAAAATCGGGATGATTACACATGGCAATCAGGCACAAATGCATCTGTTTTCTGGCAAGAAGGACAACCATACCCCAGATTCACAATCCCTTTCATGAGCATTGCATCGGCTTACTATATGTTTTATGATGGTTATGACGGTGATGATGCAAAATCTAAATATGGTTCCGTGGTGACAAACGACATGGGAACCATATGTGTCAGAATAGTTACATCCAAACAGAGACATAATTTAAATATTGTTTCCCGCATTTACCATAAAGCCAAACACATAAAAGCATGGTGCCCACGTCCACCAAGAGCTGTTGCTTACCAATTTACACACTCCACTAATTACATACCAAATGAAGGCGAAGTAACAACACAAATTAAGCCTAGAACCAATGTTTACACTATTACATCTGCTGGCCCATCCTCGATGTTCGTGCATGTAGGCAACTTAATTTATAGAAACCTTCATCTTTTTAATTCTAACTTAGATGAGTCCATTCTTGTCTCATACTCTAGTGATTTAATCATATACCGAACAAACACTGAAGGTGATGATGTAATTCCTAATTGTGACTGCACTGAATGTACATATTATTGCCATCATAAAGATAGATATTTTCCTATCAAAGTTACCGCACATGACTGGTATGAAATTCAAGAATCAGAGTACTATCCTAGACATGTTCAGTATAACTTGTTGATTGGAGAAGGACCTTGTGAACCTGGAGACTGTGGGGGTAAATTATTATGCAAACATGGAGTCATCGGTATAGTAACAGCTGGAGGCGATGGCCATGTTGCCTTTATTGATCTTAGAAAGTTCCAATGTGCTGAAGAACAGGGACTATCAGATTATGTGGAACATCTGGGACAAGTATTTGGTGTGGGCTTTGTGGATAGTATCAAAGAACAAGTGAATTTTATTAACCCCACTAGTAAAATTGGATCAAAAGTAGTTAAATGGTTACTAAGAATAGTTTCAGCTATGATAATAATGGTAAGAAATAGTTCAGACCCCCAAACAATAATTGCTACTCTCACCCTGCTGGGTTGTTCAGGTTCACCATGGAAGTTTCTTAAGGAGAAATTTTGTGCATGGCTTCAGCTTAATTATGTACATAAACAATCTGATTCATGGCTTAAAAAGTTTACTGAAGCATGTAATGCTGCACGTGGATTGGAATGGATTGGACAAAAAATATCTAAATTCATAGATTGGATCAAAAGTATGCTACCACAAGCTCAGCTAAAAGTTGATTATTTAACCAAATTAAAACAACTGAACCTGCTAGAAAAACAGGTAGAAACAATTAGATTAGCCCCAGCTAATGATCAGGAAAAAATCTTTACAGAAATAAGCACCCTCCATGATTTATCCTTAAAATTTTTGCCATTATATGCATCTGAAGCACGTAGGATTAAAAATTTGTATATCAAGTGTAACAATATTATTAAAGGGGGAAAAAGAAATGAACCAGTTGCAGTACTCATACATGGCTCTCCTGGTACTGGGAAATCTCTTGCTACTTCTGTCCTTGCTCGAATGTTAACTGTTGAAACTGACATATACTCACTACCCCCAGACCCCAAATATTTTGATGGATATGATCAGCAGAGTGTTGTCATCATGGATGATATTATGCAAAATCCAAATGGAGAAGACATGACATTATTTTGTCAAATGGTGTCTAGTGTTCCTTTCATCCCTCCCATGGCAGACCTCCCGGATAAAGGAAAACCATTTACATCTAAATTTGTACTTGCAAGCACTAATCACACACTCCTCACTCCACCAACAGTATCCTCACTACCAGCAATGTCAAGAAGATTTTATTTTGATCTAGATATTCAAGTTAAGAAGGATTATCTTTTAGATGGGAAATTAGACATAGCGAAAAGTTTCCGTCCTTGTGATGTTAACACTAAAATAGGCAATGCTAAGTGCTGTCCATTTATCTGTGGCAAGGCTGTAGAATTTAAGGATAGAAATACATGTAGTGTCTTATCTTTATCCCAACTATACAATCACATCAGAGAAGAAGATAGAAGAAGGAGTAGTGCAGCACAAGCCATGGAAGCCATCTTTCAAGGTATAGATTTGCAATCTCCACCACCTCCAGCTATAACTGATTTATTAAGATCTGTTAGAACCCCAGAAATTATTAAATACTGTCAAGATAATAATTGGATTGTCCCAGCTGAATGTTCTATTGAGAGGGATTTAGGGGTAGCAAATATGGCTATAAGCATAATAGCCAATG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38,130
FJ445142.1
rhinovirus A58
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,140
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 58 strain ATCC VR-1168, complete genome
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103,710
ON729338.1
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Sereewit,J., Xie,H., Greninger,A.
UW Virology, Laboratory Medicine
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2022-07-20
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
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GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
null
2017
SAMN28886787
PRJNA338014
Rhinovirus A59 strain SC1090, complete genome
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27,945
OL638425.1
rhinovirus A59
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
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2022-01-04
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Picornaviridae
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2021-07-10
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PRJNA1066815
Rhinovirus A59 strain RvA59/USA/2021/C69TDF, complete genome
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34,057
KY629935.1
rhinovirus A59
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J., Shean,R.C., Jerome,K.R., Kuypers,J.M.
UW, Lab Medicine
USA
2017-04-29
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,130
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2016
null
PRJNA338014
Rhinovirus A59 strain 16-J2, complete genome
TTAAAACTGGATCCAGGTTGTTCCCACCTGGATCTCCCAAGTGGAGTGGTACACTATTATCCCGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATAACCCCTCCCCCCCTTGTAACTTAGAAGATGTAAACACAGACCAATAGGTGGTAACTAACCAAGTTACTAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCTGATATTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAATAGAAGTCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCAAAGCCTAGTAGCACTTTAGATTGTGTATGGTTGGTCGCTCAGCTATTCCCCCTAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATACCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACCCTTTCGGGTGCGAAGCCATATACATGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCTCCTGAATGTGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCAGTGCACATAAGCCAATGTGTAGCTGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGATGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCCTTTAATTTTGCTTATGGTGACAATATATAGATAATATATATTGGCATCATGGGCGCTCAGGTTTCTAGACAGAACGTTGGCACGCACTCAACACAAAACTCTGTTTCAAATGGATCAAGCCTTAATTATTTCAACATCAATTACTTTAAGGATGCTGCCTCGAGTGGGGCTTCCAAACTTGAATTTTCACAAGATCCAAGTAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTTCTTGAAAAGGGAATTCCAACTCTGCAATCTCCAACAGTAGAGGCTTGTGGTTATTCGGATAGAATTATCCAAATAACCCGAGGTGACTCAACAATAACATCTCAAGATGTGGCCAATGCAGTAGTAGGATATGGTGTGTGGCCTCATTATTTAACACCACAAGATGCCACAGCTATTGACAAACCCACACAACCAGATACATCATCAAATAGATTTTACACCTTAGAAAGCAAAACATGGGTTGAAGCATCAAAAGGGTGGTGGTGGAAACTACCGGATGCACTCAAAGACATGGGTATTTTTGGTGAAAACATGTTCTATCACTTCTTAGGTCGATCTGGTTATACAATCCATGTGCAGTGCAATGCTAGTAAATTCCACCAAGGTACATTGCTAGTTGCTATGGTACCTGAACACCAATTGGCTAGTGCAAATACTGGCAATGTTACTGCTGGATATAATTACACACACCCTGGCGAATCTGGTAGGGACGTCGGGCAAAACAGGCAGAATAATGACAAGCAACCCAGTGATGACAATTGGCTGAATTTTGATGGTACCCTGCTAGGAAATTTGTTGATTTTCCCTCATCAATTTATTAATCTTAGAAGTAATAATTCTGCAACAATTATTGTACCTTATGTAAATGCTGTCCCAATGGATTCTATGCTTAGACATAATAATTGGAGTTTGTTGATTATTCCAATTAGCCCGCTTAAAAGTGATGCATCAGCAACATCAAAAGTCCCAATTACTATCTCAATAAGTCCAATGTTTGCTGAATTTTCTGGAGCAAGAGCAAAACCGATGGCAGTGGGCCAAGGACTTCCAGTGTACATCACACCTGGATCAGGCCAGTTTATGACTACTGATGATCTTCAATCTCCGTCAGCATTGCCTTGGTACCACCCAACAAAGGAAATCTTTATACCTGGTGAAGTCAAAAATTTAATTGAAATGTGTCAAGTTGATACTTTGATACCTATAAATAATACTGCATCTAATATAAAGAATGTTAGTATGTATACTGTACAGTTAACTAGTCAAGTGAATTTGGCCCAAGAAATTTTTGCAATAAAAGTTGATGTTGCATCTCAACCACTGTCAAGTACTTTGTTAGGTGAAATTTGCAGTTATTACACACACTGGACTGGTAGCTTGCGCTTCAGTTTCATGTTCTGTGGTACAGCCAACACCACCCTTAAGTTATTATTAGCTTACACACCACCTGGAATAAAGAAACCAGAGAACAGGAAACAAGCCATGTTAGGGACACACATCGTTTGGGACGTAGGGTTACAATCTACAATCTCTTTAGTTGTACCATGGGTCAGTGCCAGCCACTTTAGATATACAACTCCAGATAATTATTCATCTGCTGGATACATAACATGTTGGTACCAAACAAATTTTGTGTTCCCACCTAATACACCATCTTCTGCAGATATGCTATGTTTTGTCTCTGCATGCAAAGATTTCTGTCTGCGTATGGCCAGAGATACTGATACGCACACACAGCTTGTCCCGATAACTCAAAATCCAGTGGAAAATTATGTCAATGATGTGCTCAATGAGGTTTTGGTGGTACCAAATATACAGGAAAGTCACCCAACCACTTCAAATGCTGCCCCAGCACTAGATGCAGCAGAGACTGGACATACAAGTAGTATACAACCTGAGGATACTATAGAAACAAGATATGTTCAGACATCACAAACTAGAGATGAAATGAGTGTAGAAAGTTTCCTGGGTAGATCTGGGTGCATACACATTTCAACCATTACAGTTAATAAAAACATAGAATATGATGGTGGACACTTCCTCAAATGGCCCATAACACTACAAGAAATGGCACAAATCAGAAGAAAATTTGAATTGTTCACATATGTTAGATTTGATTCAGAAATTACCTTAGTACCCTGCATAGCTGGAAAAGGGGATGATATTGGCCATATAGTTATGCAATACATGTATGTTCCACCAGGTGCTCCACTGCCCACAAAGAGAGATGATTATACATGGCAATCTGGTACTAATGCTTCAATATTTTGGCAACATGGGCAAACATTTCCAAGATTCTCACTACCTTTTCTAAGCATAGCATCAGCTTACTATATGTTCTATGATGGTTATGATGGGGACAAATCTGAATCTAGGTATGGTGTGTCTGTAACTAACCAAATGGGTACTTTGTGTTCTAGGATAGTTACAAATAGTCAGGAACATCCAGTGGAAGTTGTTACACGTGTGTACCATAAAGCCAAACATGTCAAAGCCTGGTGTCCTAGAGCTCCTAGAGCAGTTCCCTACACACACAGTAATGTGACCAACTACAAGATTACTGGAAAGGAACCTGAAATTTTCTTAAAGCCAAGACTGAACATTACAACGGCTGGACCTAGTGACATGTATGTTCATGTTGGTAATCTTATATATAGGAATCTTCATCTATTTAATTCAGAAATGCATGATTCTATCCTTGTATCTTACTCATCTGATCTAGTCATATACCGAACAAACACAAAAGGTGATGACTACATACCTACATGTGATTGCACTCAAGCTACATACTACTGCAAACATAAGAATAGATACTATCCAATCAATGTTACAAGTCATGACTGGTATGAAATTCAAGAGAGTGAATATTACCCAAAACACATTCAGTATAATCTGCTGATCGGTGAGGGGCCTTGTGAACCAGGAGATTGTGGAGGAAAACTTTTGTGTAAACATGGTGTTATAGGTATCATCACTGCAGGTGGGGAAGGTCATGTTGCTTTCATAGATTTAAGGCATTTCCATTGTGCTGAGGAGCAGGGTATCACAGATTATATACACATGCTGGGTGAAGCCTTTGGCACGGGTTTTGTGGACAGCGTGAAAGAACAAATAAGTGCTATAAACCCAGTCAACAATATCAGCAAGAAAATAATTAAATGGATGCTCAGAATCATATCAGCTATGGTTATAATCATCAGAAACTCATCAGATCCCCAGACCATAATAGCCACACTCACACTAATTGGATGTTCAGGATCTCCTTGGAGATTCCTCAAAGAGAAATTCTGTAAATGGACGCAACTAAATTATGTGCATAAGGAATCAGACACTTGGTTGAAGAAATTTACTGAAATGTGTAATGCAGCTAGAGGCTTAGAATGGATAGGAAATAAAATATCTAAGTTTATAGAATGGATGAAATCTATGTTGCCACAAGCACAGTTAAAAGTCAAATATCTTAAAGAGCTTAAGAAACTTAATTTTTTAGAAAAACAAATTGAACACCTTAGAGTGGCAGATTCACAAACACAAGAGAAAATCAAATGTGAGATTGACACTTTACATGACTTGTCATGCAAATTCCTACCATTGTATGCAAGTGAGGCCAAAAGAATTAAGGCATTGCATAACAAATGTAATGTAATAATTAAACAAAAGAAAAGATGTGAACCAGTGGCCGTTGTGATTCACGGAGAACCAGGTACTGGCAAGTCTATGACAACAAATTTTCTAGCTAGGATGATAACAAATGATAGTGACATATACTCATTGCCTCCTGACCCCAAATATTTTGATGGTTATGATCAGCAAAGTGTTGTCATAATGGATGATATCATGCAGAATCCAAGTGGAGATGACATGACTCTATTTTGTCAAATGGTGTCAAGTGTTACATTTATACCACCAATGGCTGATCTACCTGATAAAGGTAAACCTTTTGATTCTAGATTTGTATTGTGTAGTACAAACCACAACATGTTAGCCCCACCCACTATAACCTCATTACCAGCAATGAACAGGAGATTTTATCTTGATTTAGATATAATAGTTAATGATAGATACAAAGATCCACAAGGGAAATTAAATGTCTCTGCAGCCTTTCAGCCTTGTGATGTTGATGCAAAGGTTGGAAATGCTCGATGCTGTCCTTTTATTTGTGGTAAAGCAGTTACTTTCAGGGATCGTAACACCTGCCAAAATTACACCCTCTCTCAAGTTTATAATCAAATGCTTGAGGAAGACAAAAGACGGCGTCAAGTGGTAGATGTTATGGCAGCTATCTTTCAAGGCCCTATAACCCTTGAGGGACCACCACCAGCCGCCATAAGTGATCTTCTTCAATCAGTACGCACACCAGAGGTCATTAAATACTGTGAGGAAAATAAATGGATAATCCCAGCTGAGTGTAAAGTTGAGAGAGAC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76,852
KY369893.1
rhinovirus A59
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
UW, Lab Medicine
USA
2017-01-15
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,074
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2016
null
PRJNA338014
Rhinovirus A59 strain SC1095, complete genome
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78,647
KY369895.1
rhinovirus A59
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
UW, Lab Medicine
USA
2017-01-15
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
6,972
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2016
SAMN07309834
PRJNA338014
Rhinovirus A59 strain SC1038, complete genome
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78,649
DQ473500.1
rhinovirus A59
Kistler,A.L., Webster,D.R., Rouskin,S., Magrini,V., Credle,J.J., Schnurr,D.P., Boushey,H.A., Mardis,E.R., Li,H., DeRisi,J.L., Webster,D., Reich,S., Credle,J., Schnurr,D., Boushey,H., Mardis,E., Ganem,D., DeRisi,J.
University of California, San Francisco, Biochemistry and Biophysics
USA
2007-05-07
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,135
GenBank
1
USA
USA
null
null
null
null
null
Rhinovirus A59, complete genome
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107,193
ON729329.1
rhinovirus A60
Sereewit,J., Xie,H., Greninger,A.
UW Virology, Laboratory Medicine
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2022-07-20
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,076
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2017
SAMN28886802
PRJNA338014
Rhinovirus A60 strain SC42, complete genome
GAGTAGTACACTATTATTACGGTAATCTTGTACGCCAGTTTTATATCCCCTTCCCCTTTTGTAACTTAGAAGTTGAACAAAGTGACCAATAGGCGGCAATCACCCAGATTGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCGAAGCTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAGCCGAGATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCAAAGCCTAGTAACATTTTCGAAGTTATATGGTTGGTCGCTCAGCCAAACCCCATGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATACCCCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTCTGGGTGTGAAGCCATATAATAGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCATGTAATCCAGCATGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTTTATCCTTATTGATTGCTTATGGTGACAATATATAGTACTATATATTGACACCATGGGCGCTCAGGTATCAAGACAGAATGTTGGCACACACTCAACTCAAAATGTGGTTTCTAGTGGCTCTAGTTTAAATTATTTTAACATTAATTATTTTAAAGATGCAGCCTCAAGTGGTGCATCAAAATTGGAGTTTTCACAAGATCCAAGCAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTGTTAGAAAAAGGTATTCCTACCCTCCAATCTCCAACAGTTGAAGCATGTGGATACTCTGACAGAATCATTCAAATTACCAGAGGAGATTCTACCATAACATCACAAGATGTAGCCAATGCTGTTGTCGGCTATGGAGTATGGCCCCACTATCTCACAGCACAAGATGCCACCGCAATAGATAAACCATCACAACCTGATACATCATCTAATAGATTTTATACATTAGAGAGTAAATTGTGGACAAATGAATCAAAAGGTTGGTGGTGGAAGCTGCCTGATGCTCTCAAAGAAATGGGTGTTTTTGGACAAAACATGTATTACCATTTTCTCGGAAGAAGTGGCTATACAGTGCACGTCCAATGTAATTCTAGCAAATTTCATCAAGGTACACTGATAGTGGCAATGATACCAGAGCATCAATTAGCGGCAGCAGAGAAGGGAAATGTAACTGCCGGTTACAATTTGACACACCCAGGTGAGAGAGGCAGAACAATTGGGATTCCCGATCGTCTACATCCAAATAAACAACCTAGTGATGATAATTGGTTAAACTTTGATGGCACACTGCTAGGGAACATAACCATTTTTCCACACCAATTCATTAATCTGAGGAGCAACAACTCAGCCACAATAATTGTGCCTTATGTGAATGCAGTACCTATGGATTCTATGCTCAGTCATAATAATTGGAGTTTGGTTATAATCCCCATTTGTCCTTTAGAGGTTAGTACCACTGGAACCAATGGTATACCCATAACTGTATCAATCAGCCCCATGTTTGCTGAGTTTTCTGGCGCACGTGCCAGAAGCCAAGGTCTGCCAACTATGTTAACACCTGGATCTGGACAATTCATGACCACAGATGATTTCCAATCACCTTGTGCGCTGCCGTGGTTCCATCCCACAAAGGAGATTTCAATACCTGGTGAAGTCAAGAATTTGATTGAGTTGTGTCAGGTTGACAGCATGATTCCAATAAATAATGTTGCAGGTAAAATAAGGAGTGTTGACATGTATACAGTAGTGCTGCAGAGACAAGATGAACTAATGCAGGAGGTTTTTGCCATAAGGGTTGACGTGGCATCGCAACCACTTGCAACAACATTAATTGGTGAAATCTCAAGCTATTACACCCAATGGACAGGGAGTCTCCGCTTCAGTTTCATGTTTTGTGGAACAGCTAATACAACACTCAAACTTTTAATAGCATATACACCCCCAGGTATAGCAAAACCCCAAAATAGGAAAGATGCAATGTTAGGAACTCATATTGTATGGGATGTGGGCCTGCAATCAACAATATCTATGATTGTACCTTGGGTTAGTGCCAGTCATTTCAGAAACACCACACCCGATACATACTCTCTAGCTGGGTTCATAACATGTTGGTACCAAACCAATCTTGTGTTTCCTCCAGACACCCCAAACACTGCTAGAATGCTTTGTTTTGTATCTGGCTGCAAGGATTTTTGTTTACGCATGGCCAGAGACACAAATTTACACAAACAATCAGGAATTATAACGCAGAACCCAGTGGAAAATTATATAGATGGAATTTTAAATGAAGTCCTTGTAGTTCCAAACATTAAAGAGAGCCAACCCACTACTTCCAATTCTGCTCCAGCATTAGATGCTGCTGAAACTGGTCACACTAGCAATGTGCAACCTGAAGACATGATTGAAACACGTTACGTGCAGATCACACAAACTAGAGATGAAATGAGTGTTGAAAGTTTCCTTGGTAGGTCTGGATGCATTCACATTTCCAAGTTAGAGATTGATTATAACAATTATAATGAAAAGAACAAAAATTTCACAACTTGGCAAATCAACTTAAAGGAAATGGCACAAATTAGAAGAAAATTTGAATTATTTACATATGTAAGATTTGATTCAGAAGTAACTTTAGTCCCATGCATAGCAGCAAAAAGTGATGGTATAGGTCACGTTGTCATGCAGTACATGTATGTTCCTCCAGGAGCACCATTACCAACAAAAAGGGATGATTACACGTGGCAATCTGGCACAAATGCTTCTGTATTTTGGCAACATGGACAAACATATCCTAGATTCTCACTCCCATTTCTGAGCATTGCATCTGCTTACTACATGTTCTATGATGGTTATGACGGCCACACAACTGAATCACATTACGGGACAGTTGTGACCAATGACATGGGAACATTATGCTCCAGAATAGTTACTGAACATCACGGAACGCAGGTACATGTCACAACAAGAATATACCACAAAGCAAAACATGTCAAAGCTTGGTGCCCAAGACCTCCAAGAGCGGTTGAATATAGGCATACACATGTAAACAATTATAGACCAGATGAAGGAGAGGCAGCCATAACAATCCCCACCAGAACTGACATACGAACAATAAAAACAGTTGGCCCCAGTGATATGTATGTACATGTAGGGAATTTAATATATAGAAATCTGCACTTATTCAATTCAGAAATTAGTGATTCTGTTTTAGTTTCTTACTCATCAGATTTAGTCATTTACCGAACAAACACTACAGGTGATGACTACATTCCCACTTGTGACTGCACAGATGCAACATATTATTGTAAACACAAGAACAGATACTACCCAATTAAAGTCACTAGCCATGATTGGTATGAAATACAGGAAAGTGAATATTACCCAAAACACATACAATACAACTTGTTAATTGGTGAAGGGCCTTGTGAACCTGGAGACTGTGGAGGGAAACTATTATGTAAACACGGCGTGATTGGCATCATCACAGCCGGTGGAGAAGGACATGTGGCGTTCATAGATTTACGTCACTTTCACTGTGCAGAAGAGCAGGGAATCACTGATTATATACACATGCTTGGTGAGGCATTTGGTAATGGCTTTGTGGATAGTGTGAAGGAACAAGTCAATGCCATAAATCCAATTAATAACATCAGCAAGAAATTGATTAAGTGGATGCTTAGAATAATTTCAGCAATGGTAATAATAATCAGGAATTCCTCAGACCCCCAAACAATTGTAGCCACACTCACATTGATAGGGTGCTCTGGATCACCATGGCGATTCCTTAAGGAGAAATTTTGTAAATGGACACAGCTAACTTATATCCACAAGGAATCAGATTCATGGCTCAAAAAATTCACAGAAATGTGCAATGCAGCTAGAGGCCTTGAATGGATTGGCAACAAAATATCCAAATTTATTGATTGGATGAAATCCATGTTACCACAAGCACAATTGAAAGTTAAATACCTTAGTGAGTTAAAGAAATTAAATCTATTGGAGAAACAAATTGAGAATTTGCGTGGTGCTGATACCAATACACAAGAGAAAATTAAACTAGAGATTGATACACTACATGATCTATCTTGTAAATTTCTCCCTCTGTATGCTAGTGAGGCTAAAAGGATTAAAGTACTATACAACAAATGTAACACAATCATTAAGCAAAAGAAAAGAAGTGAGCCAGTTGCTATCATGATACATGGTCCGCCAGGAACAGGCAAATCTATAACAACCAGCTTCCTTGCTAGGATGATAACCAATGAGAGTGATATTTATTCATTACCTCCAGATCCAAAGTACTTTGATGGATATGATCAGCAAAGTGTTGTTATAATGGATGATATAATGCAAAACCCAGATGGAGAAGATATGTCACTATTTTGTCAAATGGTGTCAAGTGTAGCATTTATACCCCCAATGGCTGACCTTCCGGATAAAGGAAAACCATTTGATTCTAGATTTGTCTTTTGTAGCACAAACCAATCTTTGTTAACTCCACCAACTATCACCTCCCTCTCTGCAATGAATAGGAGATTTTATTTAGATTTAGATATTACAGTCCATGACAATTATAAGGATAACCTAGGTAAGCTGGATGTACCAAAAGCATTTAAACCATGTGATGTTGACACGAAAATAGGTAATGCCAAATGTTGTCCATTTATTTGTGGTAAAGCTGTGTCATTCAAAGATCGCAATACTTGCCAGGTGTACTCACTTAGTCAAATTTACAACTCAATCATAGAAGAGGATAAACGCCGTAGGAATGTTGTTGATGTTATGTCAGCAATTTTCCAAGGTCCCATATCTATGAATGCCCCTCCACCACCAGCAATAGCAGATCTATTACAGTCAGTTAGAACCCCAGAAGTCATTAAATACTGTGAGGAAAATAAATGGATTATTCCAGCAGATTGTAAGATAGAACGTGATTTGAATTTAGCAAATAATATAATAACAATTATAGCAAATAT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27,939
LC699422.1
rhinovirus A60
Egawa,K., Kakizaki,M., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Takeda,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
Japan
2022-03-23
HRV_A60_Fukushima_OR4-2_2020
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,142
GenBank
1
Japan: Fukushima
Japan
Homo sapiens
null
2020
SAMD00490732
PRJDB13572
Rhinovirus A60 HRV_A60_Fukushima_OR4-2_2020 genomic RNA, complete genome
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32,241
OM001349.1
rhinovirus A60
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
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7,022
GenBank
null
USA
USA
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null
2021-06-22
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Rhinovirus A60 strain RvA60/USA/2021/F7HHAW, complete genome
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34,137
OL133750.1
rhinovirus A60
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
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2021-12-11
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Picornaviridae
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2021-06-21
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PRJNA1066815
Rhinovirus A60 strain RvA60/USA/2021/P6RQRD, complete genome
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USA
USA
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2021-04-20
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PRJNA1066815
Rhinovirus A60 strain RvA60/USA/2021/398799, complete genome
AAAACGACCAATAGGCGGCAATCACCCAGGTTGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAGGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAGCCAAGATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCAAAGCCTAGTAACATCTTCGAAGTTATATGGTTGGTCGTTCAGCCAAACCCCATGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATACCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTCTGGGTGTGAAGCCATATAATAGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCATGCAATCCAGCATGTATCTAGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATCTTTATTGATTGCTTATGGTGACAATATATAGTATTATATATTGACACCATGGGCGCCCAGGTATCAAGACAGAATGTTGGCACACACTCAACACAAAATGTGGTTTCTAGTGGTTCTAGTTTGAATTATTTTAACATCAATTATTTCAAAGATGCAGCCTCAAGTGGTGCATCAAAGTTAGAGTTCTCACAAGATCCAAGTAAATTTACTGATCCAGTTAAAGATGTGTTAGAAAAAGGTATTCCTACCCTCCAATCTCCAACAGTCGAAGCATGTGGGTATTCTGATAGAATCATTCAAATTACTAGAGGGGATTCTACTATAACATCACAGGATGTGGCCAATGCTGTTGTCGGTTATGGAGTTTGGCCCCACTATCTCACAGCACAAGATGCTACCGCAATAGACAAACCATCACAACCTGACACATCATCTAATAGATTTTACACACTAGAGAGTAAATTGTGGACAAATGAGTCAAAGGGCTGGTGGTGGAAATTGCCTGATGCTCTTAAGGACATGGGTGTTTTTGGACAGAACATGTACTACCATTTTCTCGGGAGAAGTGGTTATACAGTACATGTCCAATGTAATTCTAGTAAATTTCATCAAGGTACACTAATAGTGGCAATGATACCAGAACACCAATTAGCAGCAGCAGAAAAAGGAAATGTGACTGCTGGCTACAATTTGACACATCCAGGTGAGAGAGGTAGAACAATTGGGATACCTGATCGTTTGCATCCAAATAAACAACCCAGTGATGACAATTGGTTAAACTTTGATGGCACATTGCTGGGCAACATAACTATCTTTCCACACCAATTCATTAATTTAAGGAGCAACAATTCAGCCACAATAATTGTGCCTTATGTGAATGCAGTGCCCATGGATTCTATGCTCAGTCACAATAATTGGAGTTTGGTCATAATTCCCATCTGTCCTTTAGAGGTTAGTACCACTGGGACCAATGGCATACCCATAACTGTGTCAATTAGCCCCATGTTTGCTGAGTTTTCTGGTGCACGTGCCAGAAGTCAAGGTCTACCAACTATGTTAACACCTGGATCTGGACAATTTATGACCACAGATGATTTCCAATCACCATGTGCACTACCATGGTTCCACCCCACAAAGGAGATTTCAATACCTGGTGAAGTTAAAAATTTAATTGAGTTGTGCCAAGTTGACAGCATGATTCCAATAAATAATGTTGCAGACAAAATTAGGAGTGTTGACATGTATACAGTGGTATTGCAGAGACAAGATGAGCTAATGCAGGAGGTTTTTGCCATAAGGGTTGATGTAGCATCGCAACCACTTGCAACAACATTAATTGGTGAAATTTCAAGTTATTACACTCAATGGACAGGAAGTCTCCGCTTCAGTTTCATGTTTTGTGGGACAGCTAATACAACACTTAAACTTTTAATAGCATACACACCTCCAGGTATAGCAAAACCTAAGAGCAGGAAAGAGGCAATGCTGGGAACCCATATTGTGTGGGATGTGGGTCTGCAATCAACAATATCTATGATTGTACCCTGGGTTAGTGCCAGTCATTTCAGAAACACCACACCTGACACATATTCTCTAGCTGGGTTTATAACATGTTGGTATCAAACTAATCTTGTGTTTCCTCCAGATACCCCAACCACTGCTAGAATGCTTTGTTTTGTTTCTGGCTGTAAGGACTTTTGTCTACGCATGGCTAGAGACACAAATTTACACAAACAATCAGGAATTATAACGCAGAACCCAGTAGAAAGTTACATAGATGGAATTTTAAATGAAGTCCTTGTAGTTCCAAACATCAAAGAAAGCCAACCCACTACTTCCAATTCTGCTCCAGCATTAGATGCTGCTGAGACTGGCCACACTAGCAATGTACAACCTGAAGATATGATTGAAACACGTTATGTGCAGATTACACATACTAGAGATGAAATGAGTGTTGAAAGCTTCCTTGGTAGGTCTGGATGCATTCATATTTCCAAATTAGAGATTGATTATAGTAATTATAATGAATTGAATAAAAATTTTACAACTTGGCAAATCAACTTAAAGGAAATGGCACAAATTAGAAGAAAATTTGAGTTATTTACATATGTAAGATTTGATTCAGAAGTGACTTTAGTCCCATGCATAGCAGCAAAAGGTGATGGCATAGGCCACGTTGTCATGCAATACATGTATGTTCCTCCAGGAGCACCATTACCAACAAAAAGGGATGATTACACGTGGCAATCTGGCACAAATGCTTCTGTATTCTGGCAACATGGACAAACATATCCTAGATTTTCACTCCCATTTTTGAGTATTGCATCTGCTTACTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGTCACACAACTGAATCACATTACGGGACAGTTGTGACCAATGACATGGGAACACTATGCTCCAGAATAGTCACTGAGCATCATGGAACGCAGGTCCATGTCACAACAAGAATATATCACAAAGCAAAACATGTCAAGGCTTGGTGTCCAAGACCCCCAAGAGCCGTCGAGTATAGACATACACATGTAAATAATTATAGACCAGATGAAGGAGAAGCAGCCATAACAATCCCTACCAGAACTGACATACGAGCAATTAAAACAGTTGGCCCCAGTGATATGTATGTACATGTAGGGAATTTAATATATAGAAATCTGCACTTATTTAACTCAGAAATTAGTGATTCTGTTTTAGTTTCATACTCATCAGATTTAGTCATATACCGAACAAACACTACAGGTGATGACTATATTCCAACCTGTGACTGCACAGATGCAACATATTATTGCAAACACAAAAATAGATACTACCCAATTAAAGTTACCAGCCATGATTGGTATGAAATTCAGGAAAGTGAGTATTACCCAAAGCATATACAATACAACTTGTTAATTGGTGAAGGACCTTGTGAACCTGGAGACTGTGGAGGGAAACTATTATGTAAACATGGCGTGATTGGCATCATTACAGCCGGTGGAGAAGGACATGTGGCGTTCATAGACCTACGTCACTTCCATTGTGCAGAGGAGCAGGGAATCACTGATTACATACACATGCTTGGAGAGGCATTTGGTAATGGTTTTGTAGACAGTGTGAAGGAACAAGTTAATGCCATAAACCCAATCAATAACATTAGCAAGAAGTTAATTAAGTGGATGCTTAGAATAATTTCAGCAATGGTAATAATAATTAGGAATTCTTCAGATCCTCAAACAATTATAGCCACACTCACATTAATAGGATGCTCTGGATCACCATGGCGATTCCTTAAGGAGAAGTTCTGTAAATGGACACAACTAACTTATATTCATAAGGAGTCAGATTCATGGCTTAAAAAATTCACAGAAATGTGTAATGCAGCTAGAGGTCTTGAATGGATTGGCAACAAAATATCTAAATTTATTGATTGGATGAAATCTATGCTACCACAAGCACAGTTGAAAGTTAAGTATCTTAGTGAGCTAAAGAAATTAAATCTACTGGAGAAACAAATTGAAAATCTGCGTGGTGCTGATACTAACACACAAGAAAAAATTAAACTAGAGATTGACACACTACATGATCTATCCTGTAAATTTCTCCCTCTGTATGCTAGTGAGGCTAAAAGGATTAAAGTGCTATACAACAAATGCAACACAATCATTAAACAGAAGAAAAGAAGTGAACCAGTCGCTATCATGATACATGGTCCACCAGGAACAGGTAAATCTATAACAACCAGCTTCCTTGCTAGGATGATAACTAATGAGAGTGATATTTACTCATTACCTCCAGATCCAAAGTACTTTGATGGATATGATCAGCAGAGTGTTGTTATAATGGATGATATTATGCAAAACCCAGATGGAGAAGATATGTCACTATTTTGTCAAATGGTGTCAAGTGTGGCGTTCATACCTCCAATGGCTGACCTTCCGGATAAAGGAAAACCATTTGATTCTAGATTCGTCTTTTGTAGTACAAACCAGTCTTTATTAACTCCACCAACCATCACCTCCCTCTCTGCAATGAATAGGAGATTTTACTTAGATTTAGATATTACAGTTCATGATAACTATAAGGACAACTTGGGTAAGCTAGATGTACCAAAAGCATTTAAACCATGTGATGTTGATACAAAAATAGGTAATGCTAAATGTTGCCCATTTATTTGTGGTAAAGCTGTGTCATTCAAAGATCGCAACACCTGCCAGGTGTATTCACTTAGCCAAATTTACAACTTAATTATAGAAGAGGATAAACACCGTAGAAATGTTGTTGACGTTATGTCGGCAATCTTCCAAGGTCCCATATCTATGAATGCTCCTCCGCCACCAGCAATAGCAGATCTATTACAATCAGTTAGAACCCCAGAAGTCATTAAATATTGTGAGGAAAATAAATGGATCATTCCAGCAGATTGCAAAATAGAACGTGATCTAAATTTAGCAAATAATATAATAACAATTATAGCAAATATTATTAGTATAGCAGGTATTATATTTGTAATTTATAAATTGTTCTGTTCACTCCAAGGTCCTTATTCTGGGGAACCTAAAC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41,443
FJ445143.1
rhinovirus A60
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,139
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 60 strain ATCC VR-1473, complete genome
TTAAAACTGGATCCAGGTTGTTCCCACCTGGATCTCCTAACGGGAGTAGTACACTATTATTACGGTAATTTTGTACGCCAGTTTTATGATCCCCTCCCCCTTTTGTAACTTAGAAGTTAAACAAAATGACCAATAGGCGGCAATCTCCCAGATTGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAAGCTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAGCTGAGATCGTTACCCGCAAAGTGCCTACGCAAAGCTTAGTAACACTTTTGAAGTTACGTGGTTGGTCGCTCAGCCAAACCCCATGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAGTACCCCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTCTGGGTGTGAAGCCATATAATGGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCATGCAATCCAGTATGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTTATCCTTATTGATTGCTTATGGTGACAATATATAGTATTATATATTGACRCCATGGGCGCCCAGGTATCTAGACAGAATGTTGGTACACACTCAACTCAAAATGTGGTTTCTAGTGGATCTAGTTTAAATTATTTCAACATCAATTATTTCAAAGATGCAGCCTCGAGCGGTGCATCAAAATTGGAATTTTCACAAGATCCAAGTAAATTCACTGATCCAGTCAAAGATGTACTAGAGAAAGGCATTCCCACTCTTCAATCCCCAACGGTCGAAGCGTGTGGATACTCTGACAGAATCATTCAAATTACTAGAGGAGATTCTACTATAATATCACAAGATGTGGCCAATGCTGTTGTTGGCTATGGAGTATGGCCTCACTATCTCACAGCACAGGATGCCACCGCAATAGACAAACCATCACAACCTGACACATCATCTAATAGATTTTATACATTAGAGAGTAAATTGTGGACAAATGAATCAAAAGGTTGGTGGTGGAAGTTGCCTGATGCTCTTAAGGATATGGGTGTTTTTGGACAAAACATGTACTACCACTTCCTCGGAAGAAGTGGTTATACAGTCCATGTCCAATGCAATTCTAGCAAATTTCACCAGGGCACATTGATAGTAGCAATGATACCAGAACATCAATTAGCAGCAGCAGAAAAGGGAAATGTAACTGCTGGTTACAACTTGACACATCCAGGTGAGAAAGGTAGAACAATTGGAATACCCGATCGTTTGCATCCAAGTAAACAACCTAGTGATGACAATTGGTTAAATTTCGATGGCACATTGCTAGGAAATATAACCATCTTTCCACATCAATTCATCAACTTGAGGAGCAACAATTCAGCTACAATAATTGTTCCTTATGTGAATGCAGTACCTATGGATTCCATGCTCAGCCATAACAATTGGAGTTTGGTTATAATCCCCATCTGTCCTTTAGAAGTTAGTACTACTGGAACTAATGGTATACCTATAACTGTGTCTATCAGTCCTATGTTTGCTGAATTTTCTGGTGCACGTGCTAGAAGCCAAGGTTTGCCAACTATGCTAACACCTGGGTCTGGACAATTTATGACTACAGATGATTTCCAATCACCTTGTGCACTACCATGGTTCCACCCCACAAAGGAGATTTCAATACCTGGTGAAGTTAAGAATTTGATTGAATTGTGCCAAGTTGATAGTATGATTCCAATAAATAATGTTGCAGACAAAATCAGGAGTGTGGACATGTATACAGTAGTGCTGCAGAGACAAGATGAACTAATGCAAGAGGTCTTTGCTATAAGGGTTGATGTGGCATCGCAACCGCTTGCAACAACATTAATTGGTGAAATCTCAAGTTATTATACCCAATGGACTGGAAGTCTCCGCTTCAGCTTCATGTTTTGTGGAACAGCTAATACAACACTTAAACTTTTAATAGCATACACACCCCCAGGCATAGCAAAACCCAAAAGTAGGAAAGAAGCAATGTTGGGAACCCATATTGTATGGGATGTGGGTTTACAATCAACAATATCCATGATTGTACCTTGGGTTAGTGCTAGCCATTTCAGAAATACCACACCTGATACATACTCTTCAGCTGGGTTCATAACATGCTGGTATCAAACTAATCTTGTGTTTCCTCCAGATACCCCAACCACTGCTAGAATGCTTTGCTTCGTATCTGGCTGTAAAGATTTTTGTCTACGTATGGCTAGAGATACAAACCTGCACAAACAATCTGGTATCATTACACAGAATCCAGTAGAAAGCTACATAGATGGGGTCTTAAACGAAGTCCTTGTGGTTCCAAACATTAGGGAGAGCCAACCCACTACTTCTAATTCTGCTCCAGCATTGGATGCTGCTGAGACTGGTCACACTAGTAATGTACAGCCTGAGGACGTGATTGAAACACGTTATGTGCAGATTACACAAACTAGAGATGAGATGAGTGTTGAGAGCTTCCTCGGCAGATCTGGATGTATTCATATTTCCAAATTAGAAATTGACTATAGTAACTACAATGAGGAGAATAAAAATTTCACAACTTGGCAAATTAACCTAAAGGAAATGGCACAAATAAGAAGAAAGTTTGAATTATTTACATATGTAAGATTTGATTCAGAATTGACTCTGGTCCCATGCATAGCAGCAAAAAATGATGGCATAGGTCATGTTGTCATGCAATACATGTATGTCCCCCCAGGAGCACCATTACCTACTAAAAGAGACGATTACACATGGCAATCTGGCACAAATGCTTCTGTATTTTGGCAGCATGGACAAACATACCCTAGATTTTCACTTCCATTTCTAAGTATTGCATCTGCCTACTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGTCACTCAACTGAATCACATTATGGGACGGTTGTGACCAATGACATGGGAACGTTGTGCTCCAGAATAGTTACTGAACACCATGGTACACAGGTTCACGTCGCAACAAGAATATATCATAAAGCAAAGCATGTTAAGGCTTGGTGTCCAAGACCTCCAAGGGCAGTTGAATATAGACACACACATGTAAACAACTATAGACCAGATGATGGAGAAGCAGCCATAACAATCCCCATTAGAACTGATATACGAGCAATCAGAACAGTTGGTCCTAGTGATATGTATGTGCATGTAGGGAACTTAATATATAGAAATTTACATTTGTTTAACTCAGAAATTAGTGATTCTGTTTTAGTTTCTTACTCATCGGATTTAGTCATTTACCGAACAAACACCACAGGTGATGACTACATTCCAACTTGTGACTGTACAGATGCAACATATTACTGCAAGCACAAAAACAGGTATTATCCAATCAAAGTTACCAGCCATGATTGGTATGAAATTCAGGAAAGTGAGTATTACCCAAAACATATACAATACAACTTATTAATTGGTGAAGGGCCTTGTGAACCTGGTGATTGTGGTGGAAAATTACTATGTAAGCATGGTGTGATTGGTATCATCACAGCTGGTGGAGAAGGGCATGTGGCGTTTATAGATCTACGCCACTTCCATTGTGCAGAGGAGCAAGGAATCACTGATTACATACATATGCTTGGAGAAGCATTTGGTAATGGATTTGTAGATAGTGTAAGAGATCAAGTTAACGCCATAAATCCAATTAATAATATCAGTAAAAAATTAATTAAATGGATGCTTAGGATAATTTCAGCAATGGTGATAATAATTAGAAATTCTTCGGACCCTCAAACAATTGTAGCCACACTAACATTAATAGGGTGCTCTGGATCACCATGGCGTTTTCTTAAGGAGAAATTCTGCAAATGGACACAATTAACTTATATCCATAAGGAATCAGACTCATGGCTTAAAAAATTTACAGAAATGTGTAATGCAGCTAGAGGTCTTGAGTGGATTGGTAATAAAATATCTAAATTTATTGATTGGATGAAATCCATGCTACCACAAGCACAATTAAAAGTCAAATACCTTAGTGAATTGAAGAAATTAAATTTACTAGAAAAGCAAATTGAGAATTTGCGTGGTGCTGATACTAATACACAAGAAAAAATTAAATTAGAAATTGACACACTACATGATTTGTCCTGTAAATTTCTCCCTCTATATGCTAGTGAAGCTAAAAGGATTAAAGTATTATTCAACAAGTGCAACACAATCATAAAGCAGAAGAAGAGAAGTGAACCAGTTGCCATCATGATACATGGCCCACCAGGAACAGGCAAATCTATAACAACCAGTTTCCTTGCAAGGATGATAACCAATGAGAGTGATATTTATTCATTACCTCCAGACCCAAAATACTTTGATGGTTATGATCAGCAGAGTGTTGTTATAATGGATGATATTATGCAAAATCCAGATGGAGAAGATATGTCACTATTTTGTCAGATGGTATCAAGTGTGGCATTTATACCTCCAATGGCTGATCTTCCAGATAAAGGTAAACCATTTGACTCTAGATTTGTTTTTTGTAGTACAAATCAATCCTTACTAGCTCCACCAACTATTACCTCTCTCTCTGCAATGAATCGGAGATTCTATCTAGACTTGGACATCACAGTTCATGATAATTATAAGGATAATCTGGGTAAACTGGATGTGCCAAAGGCATTCAAACCATGTGATGTTGACACAAAAATAGGTAATGCTAAATGTTGTCCATTTATCTGTGGTAAAGCTGTGTCATTCAAAGATCGCAATACCTGCCAGGTGTACCCACTTAGTCAAATCTATAATTTAATTATAGAAGAGGATAAGCGCCGTAGAAATGTTGTTGATGTTATGTCGGCAATTTTCCAGGGCCCTATATCCATGAATGCTCCCCCACCACCAGCAATAGCAGATTTGTTGCAATCAGTTAGAACTCCAGAAGTCATTAAATACTGTGAGGAGAATAAATGGGTTATCCCAGCAGATTGCAAAATAGAACGTG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103,711
ON881121.1
rhinovirus A61
Xie,Z. Sr.
Beijing Pediatric Research Institute, Laboratory of Infection and Virology
China
2023-03-25
BCH19193
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,111
GenBank
null
China
China
Homo sapiens
oronasopharynx
2019-11-18
null
null
Rhinovirus A61 isolate BCH19193, complete genome
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17,222
ON881122.1
rhinovirus A61
Xie,Z. Sr.
Beijing Pediatric Research Institute, Laboratory of Infection and Virology
China
2023-03-25
GZFE19111
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,111
GenBank
null
China
China
Homo sapiens
oronasopharynx
2019-09-20
null
null
Rhinovirus A61 isolate GZFE19111, complete genome
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17,223
OL961529.1
rhinovirus A61
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
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7,110
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-07-09
SAMN23789517
PRJNA1066815
Rhinovirus A61 strain RvA61/USA/2021/JS4VWQ, complete genome
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34,110
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rhinovirus A61
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus A
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Picornaviridae
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GenBank
null
USA
USA
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null
2021-07-09
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PRJNA1066815
Rhinovirus A61 strain RvA61/USA/2021/2EX6MN, complete genome
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2022-01-04
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2021
SAMN24255333
PRJNA723895
Rhinovirus A61 strain RvA61/USA/2021/FUT2YA, complete genome
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34,215
OK254882.1
rhinovirus A61
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-12-11
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,109
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-21
SAMN21173644
PRJNA1066815
Rhinovirus A61 strain RvA61/USA/2021/ZXE7KZ, complete genome
TTAAAACTGGGTCTGGGTTGTCCCCACCCAGACCACCCACGTGGTGTTGTACACTGTTATCCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTGAACTCCCCTACCCCTTTTGCAACTTAGAAGTTATACACACCGACCAACAGCAGACAATCATCCAGATTGTTTATGGTCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGTCTCCTCTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAGAGTAGATCGTTACCCGCAAGATGCCTACGCAACGCCTAGTAACACTTTGAAGTGATTTTGGTTGGTCGCTCATTTACAACCCCAGTAATAGACCTGGCAGATGAGGCTAGATGTTCCCCACTGGCGACAGTGATCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTCGTGGGTGTGAAGCCAAATTTATGACAAGGTGCGAAGAGCCACGTGTGCTCATCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCCATTGCTCACAAACCAGTGAGTATGTGGTCGTAATGAGAAATTGCGGGACGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACCTTATTTTTGCTTATGGTGACAATATATATATAGATATATATTGACACCATGGGCGCCCAGGTATCTAGACAGAATGTTGGTACTCACTCCACCCAAAACTCTGTTTCAAATGGCTCTAGTTTAAATTACTTTAATATTAATTATTTTAAAGATGCAGCCTCAAGTGGAGCATCAAAATTGGAATTTTCACAAGACCCCAGCAAATTCACGGATCCAGTTAAAGATGTTTTAGAAAAAGGAATACCAACTTTACAATCACCTACAGTTGAAGCATGTGGTTATTCAGATAGAATCATACAAATTACAAGAGGTGATTCTACAATTACCTCACAAGATGTGGCCAACGCTGTTGTTGGATATGGGGTCTGGCCACACTATTTGACACCACAAGATGCCACTGCTATTGACAAACCCTCTAAACCTGACACATCTTCCAATAGATTCTACACATTAGAAAGTCAGACCTGGACTAATGAATCCAAAGGTTGGTGGTGGAAGCTACCAGATGCTTTGAAAGACATGGGAATTTTTGGAGAGAACATGTTTTACCATTTTCTTGGCAGGAGCGGGTACACAGTCCATGTTCAGTGCAACGCTAGTAAGTTCCATCAAGGAACCCTTTTGGTAGCGATGATACCAGAACACCAACTAGCAACCGCTGTAGGTGGTAGTGTGTCTGCAGGATATAATTACACACACCCTGGTGAAAAGGGTAGAGATGTTGGAAAATTAAACCGTGAGTCCAACCCAAGACAACCTAGTGATGACAATTGGTTGAATTTTGATGGCACATTATTAGGGAATCTAACAATATTTCCTCACCAATTTATCAACCTTAGAAGTAATAACTCTGCTACTATTATAGTGCCCTATGTCAATGCTGTCCCAATGGATTCAATGCTGAGACACAATAACTGGAGTTTAGTCATCATACCCATCTGTGAGCTTAGAGGTAGTGGTGTTGATCTTACCATTCCTATTACAATTTCTATCAGTCCTATGTGTGCTGAATTTTCTGGGGCAAGAGCAAATAGTCAGGGGTTACCGGTCTTACTAACACCCGGTTCAGGTCAATTTATGACAACAGATGATTTCCAATCTCCAAGTGCTTTACCTTGGTACCATCCCACCAAGGAAATCTCAATACCTGGGCAAGTTAGAAATCTAGTAGAACTATGTCAAGTGGATACTTTAATACCAATCAATAATACAGAAGCCAATATCAGAAATAAAAACATGTACACTGTACAACTTGGTGGTGAACCTGACCCCACAACCCCAGTTTTTACAATTAGAGTTGATATTGCATCACAACCACTAGCTACCACACTTATAGGTGAGATCTCCAGTTATTACACACACTGGACTGGAAGTGTTAGGTTTAGCTTCATGTTTTGTGGATCAGCACTTACAACATTAAAACTACTAATTGCATACACCCCACCTGGCATCAGAGTTCCTAGGAACAGAAAGGAAGCAATGCTTGGTACACACTTGATATGGGATGTTGGTTTACAATCCACTGTGTCAATGGTGGTTCCATGGGTCAGTGCTAGCCATTATAGAAATACAACCCCAGATACATATTCACTAGCTGGCTTCATTACATGTTGGTACCAAACAAAACTGGTAGTTCCTCCAAACACAGCCTCCACAGCTGATATGCTATGCTTTGTTTCAGGGTGCAAGGATTTCTGTCTACGCATGGCAAGAGACACCAATTTACACAAGCAAAGTGGGCCCATTGAACAAAATCCTGTAGAAAGATATGTAGATGAAGTTTTAAATGAAGTACTTGTGGTCCCAAATATCAATCAAAGCAACCCTACAACATCCAACTCAGCACCAGTCTTGGACGCTGCTGAAACAGGCCACACCAGCAATGTTCAACCAGAAGATATGATTGAAACACGATATGTGCAAACATCACAAACAAGAGATGAAATGAGCATAGAAAGTTTCTTAGGTAGATCAGGGTGCATACACATGTCAACATTGAATATAAATTATGACAATTATGATGACTCTATTGAAAATTTTAAGGTATGGAAAATAAACCTACAGGAGATGGCACAAATACGTAGAAAATTTGAACTGTTCACATATGCCAGATTTGACTCAGAAATTACAATTGTACCTTGCGTAGCCGGACAGGGCGGTGACATTGGGCATGTGGTCATGCAATACATGTATGTACCACCTGGTGCGCCCACACCTGAGAAAAGAAATGACTTCACATGGCAATCAGGTACAAATGCATCTGTTTTCTGGCAGCATGGTCAAGCCTACCCCAGATTCTCACTACCATTCCTAAGCATTGCATCTGCATATTACATGTTCTATGATGGTTATGATGGAGATTCTGAATCAACTCGCTACGGGACATCAGTAACAAATGACATGGGTGCATTGTGTTTTAGAATAGTAACTGAACAACATACAAATCAAGTTAAAATTACAACTAGGATTTACCATAAAGCCAAACATGTCAAAGTCTGGTGCCCCAGACCGCCCAGGGCAGTTGAATACACTAATGTACACCTCACCAATTACAAACCTAAAGACAGTGAGAAGCAAGTTAGTACCTTTATTAAACCCAGAGCTAATCTGAGAGAGATCAGGACATTTGGACCTAGTGACATGTATGTACATGTTGGAAATTTAATATATAGAAATCTACACTTGTTTAATTCAGAAGCACATGACTCCATATTGGTATCTTATTCATCAGATTTAGTCATTTACCGCACAAACACCGTAGGTGATGACTTTATACCAACATGTGATTGCACACAAGCCACATATTACTGCAGACACAAGAATAGATACTACCCAATCACAGTCACTAGTCATGATTGGTATGAAATCCAAGAGAGTGAATATTACCCAAAGCATATTCAATACAATTTGTTAATTGGTGAGGGTCCCTGTGAACCAGGTGATTGTGGTGGAAAACTGCTATGTAAACATGGAGTCATTGGCATTATAACTGCTGGTGGTGAAGGGCATGTTGCCTTTATAGATTTAAGACACTTTCTTTGTGCTGAAGAGCAAGGAGTAACAGATTATATCCACATGTTAGGTGAAGCTTTTGGAAATGGTTTTGTAGATAGTGTTAGAGACCATGTGAATGCTATAAATCCTATAAACAATATTAGCAAGAAAGTGATTAAATGGTTACTAAGGATTGTGTCTGCTATGGTTATAATAATCAGAAATTCCTCTGATCCCCAAACTGTTGTTGCCACTTTAACATTGATTGGATGTTCTGGATCACCATGGAGGTTCTTGAAAGAGAAGTTCTGTAAGTGGACACAGCTGACTTACATTCACAAAGAATCTGATTCTTGGCTTAAAAAATTTACTGAAATGTGTAATGCAGCAAGAGGACTTGAATGGATCGGAAACAAAATATCAAAATTTATAGAATGGATGAAATCAATGTTGCCCCAAGCGCAGCTTAAAGTAAAGTACTTAAATGAGTTAAAAAAGTTGAACTTGCTTGAAAAACAGATTGAGAACCTGAGAAGTGCTGATTCAAAAACCCAAGAAAGGATTAAGATTGAAATAGACACATTACATGACTTATCCTGTAAGTTCCTTCCACTTTATGCTAGTGAAGCTAAGAGGATTAAAGTTATACATAATAAGTGTAATACTATCATAAAACAGAAGAAGAGGAGCGAACCAGTTGCAGTGATGATACATGGTTCGCCAGGTACTGGGAAATCTATAACAACAAATTTTCTGGCTAGGATGATAACAAATGAGAGTGACATATACTCACTGCCACCTGATCCTAAATATTTTGATGGATATGATCAGCAATCAGTTGTCATAATGGATGACATCATGCAAAATCCAGATGGTGAAGATATGGCATTATTTTGTCAGATGGTCTCCAGTGTAACCTTCATACCCCCAATGGCTGATTTGCCCGATAAGGGAAAACCATTTGATTCTAGATTTGTCCTTTGTAGCACTAACCACTCTATGTTAGCCCCCCCAACAATAACATCTCTCCAGGCAATGAATAGACGCTTCTTTCTTGACTTAGACATTGTAGTACATGACAATTACAAAGATTCACAAGGAAAATTAGATGTATCTAAGGCCTTTAAACCATGTGATGTTGAGGCAAAAATTGGCAATGCACGTTGTTGTCCATTTATCTGTGGTAAAGCAGTTACATTCAAGGACCGTAACACGTGTTTAAGTTACCCATTAAGTCAAATTTACAATTTAATTCTTGAAGAAGACAAAAGACGTACTCATGTTGTAGATGTCATGTCTGCCATATTTCAGGGACCAATTTCTATGGAAGTGCCCCCCCCTCCTGCAATAACTGATCTACTCCGATCTGTCAAGACACCAGAGGTTATTAAGTATTGTGAAGATAATAAATGGATTATTCCAGCTGATTGTAAAAT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rhinovirus A61
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-12-11
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Rhinovirus A
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2021
SAMN22330330
PRJNA723895
Rhinovirus A61 strain RvA61/USA/2021/5D9SG5, complete genome
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35,387
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-09-28
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Rhinovirus A
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USA
USA
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2021-06-08
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-06-21
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PRJNA1066815
Rhinovirus A61 strain RvA61/USA/2021/MEL8WE, complete genome
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37,709
MZ363465.1
rhinovirus A61
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
XSS275
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,107
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-05-06
SAMN19490566
PRJNA1066815
Rhinovirus A61 strain RvA61/USA/2021/XSS275, complete genome
TTAAAACTGGGTCTGGGTTGTCCCCACCCAGACCACCCACGTGGTGTTGTACACTGTTATTCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTAAACTCCCTTACCCCTTTGTAACTTAGAAGTTAAACAAACCGACCGATAGCAGGCAATCACCCAGATTGCTTATGGTCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGTCTCCTTTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAGAGTGGATCGTTATCCGCAAGATGCCTACGCAACGCCTAGTAGCATTTTGAAGTAACTTTGGCTGGTTGCTCATTTACAATCCCAGTAATAGACCTGGCAGATGAGGCTAGATACTCCCCACTGGCGACAGTGATCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTCCCGGGTGTGAAGCCAAATTTATGACAAGGTGTGAAGAGCCACGTGTGCTCATCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCCATTGCCTACAAGCCAGTGGGTATGTGGTCGTAATGAGAAATTGCGGGATGGGACCGAATACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACCTTATATTTGCTTATGGTGACAATATATATATAGATATATATTGACACCATGGGCGCCCAGGTATCTAGACAAAATGTTGGTACTCATTCTACCCAGAACTCTGTTTCAAATGGTTCTAGCTTGAATTATTTTAACATTAATTATTTCAAAGATGCAGCTTCAAGCGGAGCATCCAAATTGGAATTTTCACAAGATCCTAGCAAATTTACTGATCCAGTCAAAGATGTTTTGGAGAAAGGAATACCAACTTTACAATCACCTACTGTTGAGGCATGTGGTTATTCAGATAGGATCATTCAAATTACAAGGGGTGACTCTACAATCACCTCACAAGATGTGGCTAACGCTGTTGTTGGATATGGTGTTTGGCCACACTATTTGACACCACAGGACGCCACTGCTATAGATAAACCTTCCAAACCTGACACATCTTCCAATAGATTTTACACACTAGAAAGCCAGACTTGGACCAATGAATCCAAAGGTTGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTTTAAAAGACATGGGAATTTTTGGGGAGAACATGTTTTATCATTTTCTAGGCAGAAGTGGATACACAGTTCATGTTCAGTGTAATGCTAGCAAGTTTCACCAAGGAACTCTTTTGGTAGCAATGATACCTGAGCATCAGCTAGCTACAGCTGTAGGCGGCAGTGTGTCTGCAGGATACAATTACACACACCCTGGTGAGAAAGGTAGAGATGTTGGAAAATTAAACCGTGAATCTAATCAGAGACAACCCAGTGATGACAATTGGTTAAACTTTGATGGTACATTACTAGGAAACTTGACAATATTCCCTCACCAGTTCATCAATCTTAGGAGCAACAACTCAGCTACTATTATAGTACCTTATGTCAATGCTGTTCCAATGGATTCAATGCTGAGACACAACAATTGGAGTTTAGTCATTATACCCATCTGTGAACTTAGAGGTAGTGGTGTTGATCTCACTATTCCCATCACAATCTCTATTAGTCCTATGTGTGCTGAATTCTCTGGAGCAAGAGCAAGCAGTCAGGGATTGCCAGTTCTATTAACACCTGGTTCTGGTCAATTCATGACTACAGATGATTTTCAATCTCCCAGTGCTTTACCCTGGTATCACCCTACCAAGGAAATTTCAATACCTGGGCAGGTTAGAAACTTAGTGGAATTATGTCAAGTGGACACTTTAATACCAATTAACAATACAGAGGCTAATATTAGAAATAAAAATATGTATACTGTACAGCTTGGTGGTGAACCTGATCCCACGACCCCAGTTTTCACAATTAGAGTTGATATTGCATCACAACCATTAGCCACCACGCTTATAGGTGAAATCTCCAGCTATTACACACACTGGACTGGGAGTATCAGATTTAGTTTCATGTTTTGTGGGTCGGCACTCACAACACTAAAATTATTAATAGCATACACCCCACCTGGAATTAGAGTTCCAAGAAACAGAAAAGAAGCAATGCTTGGCACACACCTAATATGGGACGTTGGTTTGCAGTCGACAGTGTCAATGGTGGTTCCCTGGGTCAGTGCTAGTCATTACAGAAACACAACTCCAGACACATACTCATTAGCTGGCTTTATCACATGTTGGTACCAAACAAAGTTAGTGGTTCCTCCAAATACAGCCTCCACAGCTGACATGTTGTGTTTTGTTTCAGGATGTAAAGACTTCTGCCTACGCATGGCTAGAGATACCAATTTACATAAGCAAAGTGGACCTATTGAGCAAAACCCTGTGGAAAGGTACGTGGATGAGGTCTTAAATGAGGTACTTGTGGTTCCAAACATCAATCAGAGTAACCCCTCAACATCCAATTCAGCACCAGTTCTAGATGCTGCTGAAACAGGCCACACTAGCAGTGTTCAACCAGAGGACATGATTGAAACACGGTATGTTCAAACATCACAGACAAGAGATGAAATGAGCATAGAAAGCTTTTTAGGTAGATCAGGGTGTATTCACATGTCAACATTGAATATAAATTATGAGAATTATGATGATTCAATTGACAATTTCAAAGTATGGAAAATAAACCTACAAGAGATGGCTCAGATACGTAGAAAATTTGAGTTGTTCACATATGCTAGATTTGACTCAGAGATTACAATTGTACCTTGTGTTGCTGGACAAGGTGGTGACATTGGGCATGTGGTCATGCAGTACATGTATGTCCCACCTGGTGCACCCACACCAGAGAAAAGGAGTGATTTCACATGGCAATCCGGTACAAATGCATCTGTTTTCTGGCAGCATGGTCAAGCCTACCCCAGATTTTCACTGCCGTTCTTGAGCATTGCATCCGCATATTACATGTTCTATGATGGTTATGATGGGGATTCTGAATCAACACGTTATGGAACATCAGTAACAAATGACATGGGTGCACTGTGTTTTAGGATAGTAACTGAACAACATACAAATCAGGTTAAAATCACAACTAGAATTTACCATAAGGCCAAACATGTTAAAGTCTGGTGTCCTAGACCCCCCAGAGCAGTGGAGTATACTAACGTACACCTCACCAACTATAAACCTAAAGACAGAGAAAAGCAAGTTAGTACTTTTATTAAGCCTAGAGCTGACTTGAGGGAAATTAGAACATTTGGACCTAGTGACATGTATGTACATGTTGGAACTTTAATATACAGAAATTTACACCTATTTAATTCAGAAGCACACGATTCTGTGTTGGTGTCTTACTCATCAGATTTAGTCATTTACCGCACAAACACTGTAGGTGATGACTATATACCAACATGTGATTGCACACAAGCCACATACTATTGCAAACACAAAAACAGATACTACCCAATTACAGTCACTAGCCATGATTGGTATGAAATTCAGGAGAGTGAATACTATCCAAAACATATCCAATACAATTTGTTGATTGGTGAAGGCCCTTGTGAGCCAGGTGATTGTGGTGGGAAACTTCTCTGTAAACATGGGGTTATTGGTATCATAACTGCTGGTGGTGAAGGACATGTTGCCTTTATAGATTTAAGACATTTCTTGTGTGCTGAAGAACAAGGGGTGACAGATTATATCCACATGTTAGGTGAAGCCTTTGGAAATGGTTTTGTAGACAGTGTTAAAGAACATGTAAATGCCATAAATCCTATAAACAATATAAGTAAAAAAGTGATTAAGTGGTTATTGAGGATTGTTTCTGCCATGGTTATAATAATTAGGAACTCATCTGATCCCCAGACTGTTGTTGCTACCTTAACACTAATTGGATGTTCTGGGTCACCGTGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTTTGTAAATGGACCCAACTAACTTATATTCATAAAGAATCTGATTCTTGGCTTAAAAAATTCACTGAGATGTGTAATGCAGCAAGAGGGCTTGAATGGATAGGAAATAAGATATCAAAATTTATAGAATGGATGAAATCAATGTTACCACAAGCACAACTTAAGGTGAAATATCTAAATGAACTTAAGAAATTGAACCTCCTTGAAAAACAGATTGAGAATCTTAGGAGTGCTGACTCAAAAACACAAGAAAGGATCAAAGTAGAAATAGACACATTGCATGATCTATCCTGTAAATTTCTACCACTTTACGCTAGTGAAGCTAAGAGAATTAAGGTGATACATAACAAGTGTAATACCATCATAAAGCAAAAGAAAAGAAGTGAACCAGTTGCAGTAATGATACATGGTTCACCAGGTACTGGAAAGTCTATAACAACAAATTTTCTAGCCAGAATGATAACAAATGAGAGTGATATATATTCACTACCACCTGATCCTAAATATTTTGATGGCTATGATCAACAGTCAGTTGTTATAATGGATGACATCATGCAAAATCCTGATGGTGAGGATATGGCGCTATTTTGCCAGATGGTATCCAGTGTAACCTTTATACCCCCAATGGCTGATTTACCTGATAAAGGAAAACCCTTTGACTCTAGATTTGTTCTTTGTAGCACTAATCACTCTATGTTGGCTCCTCCAACAATTACTTCTCTTCAAGCAATGAACAGGCGCTTCTTTCTTGATTTAGACATAGTAGTACATGACAATTATAAAGATTCACAAGGGAAATTAGATGTATCTAAAGCTTTCAAGCCATGTGATGTTGAAACAAAAATAGGCAATGCACGCTGTTGCCCGTTCATTTGTGGTAAGGCAGTCACATTCAAAGATCGCAACACATGCTTGAGTTACCCATTAAGCCAAATTTACAACCTAATCCTTGAAGAAGACAAAAGACGCACTCATGTCGTAGATGTCATGTCTGCCATATTTCAGGGACCAATTTCTATGGAAGTGCCTCCTCCTCCTGCAATAACAGATTTACTTCGATCTGTTAAGACACCTGAAGTTATTAAATACTGTGAGGATAACAAATGGATCATTCCAGCTGATTGTAAAATT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41,542
KY369886.1
rhinovirus A61
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
UW, Lab Medicine
USA
2017-01-15
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,112
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2016
null
PRJNA338014
Rhinovirus A61 strain SC628, complete genome
TTAAAACTGGGTCTGGGTTGTCCCCACCCAGACCACCCACGTGGTGTTGTACACTGTTATTCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTGAACTCCCCTTACCCCTTTTGTAACTTAGAAGTTAAACAAACCGACCGATAGCAGGCAATCACCCAGATTGCTTATGGTCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGTCTCCTTTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAGAGTAGATCGTTATCCGCAAGATGCCTACGCAACGCCTAGTAGCATTTTGAAGTAATTTTGGCTGGTCGCTCATTTACAACCCCAGTAATAGACCTGGCAGATGAGGCTAGATACTCCCCACTGGTGACAGTGATCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTTCCGGGTGTGAAGCCAAACTTATGACAAGGTGTGAAGAGCCACGTGTGCTCATCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCTGCAGCCATTGCCTACAAGCCAGTGGGTATGTGGTCGTAATGAGAAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTACCTTATATTTGCTTATGGTGACAATATATATATAGATATATATTGACACCATGGGCGCCCAGGTATCCAGACAAAATGTTGGTACTCACTCTACCCAGAACTCTGTTTCAAATGGTTCCAGCTTGAATTATTTTAACATTAATTATTTTAAAGATGCAGCCTCAAGCGGAGCATCCAAATTGGAATTTTCACAAGATCCTAGTAAATTTACTGATCCAGTCAAAGATGTTTTGGAGAAAGGAATACCAACTTTACAATCACCTACTGTTGAGGCATGTGGTTACTCAGATAGGATCATTCAAATCACAAGAGGTGACTCCACAATCACCTCACAAGACGTGGCCAACGCTGTTGTTGGATATGGTGTTTGGCCACACTACTTGACACCACAGGATGCCACTGCTATAGATAAACCTTCTAAACCTGACACATCCTCCAATAGATTTTACACACTAGAAAGCCAGACCTGGACTAATGAATCCAAAGGTTGGTGGTGGAAACTACCAGATGCTTTAAAAGACATGGGAATTTTTGGAGAGAACATGTTTTATCATTTTCTAGGCAGGAGCGGATACACAGTTCATGTTCAGTGTAATGCTAGCAAGTTTCACCAAGGAACTCTTTTGGTAGCAATGATACCCGAGCATCAGCTAGCTACAGCTGTAGGTGGCAGTGTGTCTGCAGGATACAATTACACACACCCTGGTGAGAAAGGTAGAGATGTTGGAAAATTAAACCGTGAATCTAATCAGAGACAACCTAGTGATGACAATTGGTTAAACTTTGATGGTACATTACTGGGAAATTTGACAATATTCCCTCACCAGTTCATCAACCTTAGGAGCAACAACTCAGCTACTATTATAGTACCTTATGTCAATGCTGTCCCAATGGATTCAATGCTGAGGCATAACAATTGGAGTTTAGTCATTATACCCATCTGTGAGCTTAGAGGTAGTGGTGTTGATCTCACTATTCCTATCACAATTTCTATTAGTCCTATGTGTGCTGAATTCTCTGGAGCAAGAGCAAGCAGTCAGGGATTACCAGTTCTATTAACACCTGGTTCTGGTCAATTCATGACTACAGATGATTTTCAATCTCCTAGTGCTTTACCCTGGTATCACCCTACCAAAGAAATTTCAATACCTGGACAGGTTAGAAACTTAGTGGAATTATGCCAAGTGGACACTTTAATACCAATTAACAACACAGAGGCTAATATCAGAAATAAAAACATGTACACTGTACAGCTTGGTGGTGAACCTGATCCCACAACCCCAGTCTTCACAATTAGAGTTGATATTGCATCACAGCCACTAGCCACCACACTTATAGGTGAAATCTCCAGCTATTACACACATTGGACTGGGAGTGTTAGATTTAGTTTCATGTTTTGTGGGTCGGCACTCACAACGTTAAAGTTATTAATAGCATACACCCCACCTGGAATTAGAGTTCCGAGAAACAGAAAAGAAGCAATGCTTGGCACACATCTTATATGGGATGTTGGTTTGCAGTCTACAGTATCAATGGTGGTTCCCTGGGTCAGTGCTAGTCATTACAGAAACACAACTCCAGATACATACTCATTAGCTGGCTTCATTACATGTTGGTATCAGACAAAATTAGTAGTTCCTCCAAATACAGCCTCCACAGCTGACATGTTATGTTTTGTTTCAGGATGTAAAGATTTCTGCCTACGCATGGCTAGAGATACCAATTTACATAAGCAAAGTGGACCCATTGAGCAAAACCCTGTAGAAAGGTATGTGGATGAGGTCTTAAATGAGGTACTTGTGGTTCCAAACATCAATCAAAGTAACCCTTCAACATCCAATTCAGCACCAGTTCTAGATGCTGCTGAAACAGGTCACACTAACAGTGTTCAACCAGAGGACATGATTGAAACACGGTATGTTCAAACATCACAGACAAGAGATGAAATGAGCATAGAAAGCTTTTTGGGTAGATCAGGGTGCATCCACATGTCCACATTGAATATAAATTATGAGAATTATGATGATTCAATTGACAATTTCAAAGTATGGAAAATAAACCTACAAGAGATGGCTCAGATACGCAGAAAATTTGAGCTATTCACATATGCTAGATTTGACTCAGAGATTACAATTGTACCTTGTGTTGCTGGACAGGGTGGCGACATTGGGCATGTGGTCATGCAATACATGTATGTCCCACCTGGTGCACCCACACCGGAGAAAAGGAGTGATTTCACATGGCAATCTGGCACAAATGCATCTGTTTTCTGGCAGCACGGTCAAGCTTACCCCAGATTTTCACTGCCATTCTTAAGCATTGCATCTGCATATTACATGTTCTATGATGGTTATGATGGGGATTCTGAATCGACACGCTATGGAACATCAGTGACAAATGACATGGGTGCATTGTGTTTTAGGATAGTAACTGAACAACATACAAACCAGGTTAAAATCACAACTAGGATTTATCACAAAGCTAAACATGTTAAAGTCTGGTGTCCTAGACCCCCCAGAGCAGTGGAGTATACTAATGTACACCTTACCAACTATAAACCTAAAGATAGAGAAAAGCAAGTTAGCACTTTCATTAAGCCTAGAACTGACTTGAGGGAAATTAGAACATTTGGACCTAGTGACATGTATGTGCATGTTGGAAATTTAATATACAGAAATTTACACTTATTTAATTCAGAAGCACATGATTCTGTATTGGTGTCCTACTCATCAGATTTAGTCATTTACCGCACAAACACTGTAGGTGATGACTTTATACCAACATGTGATTGCACACAAGCCACGTACTATTGTAAACACAAAAACAGATACTACCCAATTACAGTCACTAGCCATGATTGGTATGAAATTCAAGAAAGTGAATACTATCCAAAACATATTCAATACAATTTGTTAATTGGTGAAGGTCCTTGTGAGCCAGGTGATTGTGGTGGGAAGCTGCTGTGTAAACATGGGGTTATTGGCATTATAACTGCTGGTGGTGAAGGACATGTTGCCTTTATAGATTTAAGACATTTTTTGTGTGCTGAAGAACAAGGGGTGACAGATTATATCCACATGTTAGGTGAAGCTTTTGGAAATGGTTTCGTAGATAGTGTTAGAGAACATGTAAATGCCATAAATCCCATAAACAATATTAGTAAAAAGGTAATTAAGTGGTTACTGAGAATTGTCTCTGCCATGGTTATAATAATTAGGAACTCATCTGATCCCCAAACTGTTGTTGCTACCTTAACACTAATTGGATGTTCTGGGTCGCCATGGAGATTTTTAAAAGAAAAATTTTGTAAATGGACCCAACTAACCTATATTCATAAAGAATCTGATTCTTGGCTCAAAAAATTCACTGAGATGTGCAATGCAGCTAGAGGGCTTGAATGGATAGGAAATAAGATATCAAAATTTATAGAATGGATGAAATCAATGTTACCGCAAGCACAACTTAAGGTGAAATATCTAAATGAACTTAAAAAGTTGAACCTCCTTGAAAAGCAGATTGAGAATCTTAGGAGTGCCGACTCAAAAACACAAGAAAGGATCAAAGTAGAAATAGACACATTGCATGATTTATCCTGTAAATTTCTACCACTTTATGCTAGTGAAGCTAAGAGGATTAAGGTGATACATAACAAGTGTAATACCATCATAAAACAAAAGAAAAGGAGTGAACCAGTTGCAGTCATGATACATGGTTCACCAGGTACTGGAAAGTCCATAACAACAAACTTTCTAGCCAGAATGATAACAAATGAGAGTGACATATATTCACTACCACCTGATCCTAAATACTTTGATGGCTATGACCAACAGTCAGTTGTTATAATGGATGACATTATGCAAAATCCAGATGGTGAGGATATGGCGCTGTTTTGTCAGATGGTATCCAGTGTAACCTTTATACCCCCAATGGCTGATCTACCTGATAAAGGAAAACCCTTTGATTCTAGATTTGTTCTTTGTAGCACTAATCACTCTATGTTGGCTCCCCCGACAATTACTTCTCTTCAAGCAATGAATAGGCGCTTCTTTCTTGATTTAGACATAGTAGTGCATGATAATTACAAAGATTCACAAGGAAAACTAGATGTATCTAAAGCTTTCAAGCCATGTGATGTTGAAACAAAAATAGGCAACGCACGCTGTTGCCCGTTTATTTGCGGTAAGGCAGTTACATTCAAAGACCGCAACACATGCTTGAGTTATCCATTGAGTCAAATTTACAACCTAATCCTTGAAGAAGATAAAAGACGCACTCATGTTGTAGATGTCATGTCTGCCATATTTCAGGGACCAATTTCTATGGAAGTACCCCCTCCTCCTGCAATAACTGACTTACTTCGATCTGTTAAGACGCCTGAAGTTATTAAATACTGTGAAGATAACAAATGGATTATTCCAGCTGATTGTAAAA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78,640
FJ445144.1
rhinovirus A61
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,139
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 61 strain ATCC VR-1171, complete genome
TTAAAACTGGGTCTGGGTTGCTCCCACCCAGACCACCCATGTGGTGTTGTACACTGTTATTCCGGTAACTTTGTACGCCAGTTTTGAACTCCCCTACCCCTTTTGTAACTTAGAAGCTAAACACATCGACCAATAGCAGGCAATCACCCAGATTGCTTATGGTCAAGTACTTCTGTTTCCCCGGTCTCCTCTGATATGCTCTACCAGGGCAAAAACAGAGTAGATCGTTATCCGCAAGATGCCTACGCAACGCCTAGTAACACTTTGAAGTGTTTTTGGTTGGTCGCTCAGTTACAACCCCAGTAATAGACCTGGCAGATGAGGCTAGATATCCCCCACTGGCGACAGTGATCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTTATGGGTGTGAAGCCAAACATATGACAAGGTGCGAAGAGCCACGTGTGCTCATCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTCAACCCTGCAGCCATTGCTCACAAGCCAGTGGGTATGTGGTCGTAATGAGAAATTGCGGGACGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTTACCTTATTTTGCTTATGGTGACAATATATATACAGATATATATTGACACCATGGGCGCTCAGGTATCCAGACAAAACGTTGGTACTCATTCTACTCAGAATTCTGTTTCAAATGGTTCTAGTTTAAACTATTTTAACATTAATTACTTTAAAGATGCGGCTTCAAGTGGAGCATCCAAATTGGAATTTTCACAAGACCCCAGCAAATTTACAGATCCAGTCAAGGATGTTTTAGAGAAGGGAATACCAACTCTACAATCACCAACTGTTGAAGCATGTGGTTATTCAGATAGAATCATCCAAATTACAAGAGGTGACTCCACAATTACCTCACAAGATGTTGCTAATGCTGTAGTTGGGTATGGAGTTTGGCCACATTACTTAACACCACAAGATGCCACTGCTATAGATAAACCTTCTAAGCCTGACACATCTTCTAATAGATTTTACACATTAGAAAGCCAGACCTGGACCAATGAATCCAAGGGCTGGTGGTGGAAATTACCAGATGCTTTGAAAGACATGGGTATTTTTGGAGAAAACATGTTTTACCATTTTCTAGGCAGAAGTGGATACACGGTTCATGTCCAGTGCAACGCCAGCAAGTTTCATCAGGGAACTCTTCTGGTAGCAATGATACCAGAGCACCAGCTAGCTACCGCTGTAGGCGGCAGTGTATCTGCAGGATACAATTACACACACCCTGGTGAAAAGGGTAGGGATGTTGGAAAATTAAACCGTGAATCCAATCCAAGACAACCTAGTGATGACAATTGGTTAAATTTTGATGGCACATTATTAGGAAACTTGACAATATTTCCTCACCAATTCATTAACCTTAGAAGTAACAACTCGGCTACTATTATAGTACCATATGTTAATGCTGTCCCAATGGATTCAATGCTAAGGCACAATAATTGGAGTTTAGTCATCATACCCATTTGTGAGCTTAGAGGTAGCGGTGTTGATCTCACCATCCCTATTACAATTTCCATTAGTCCTATGTGTGCTGAATTCTCTGGAGCAAGAGCAAACAGCCAGGGGTTGCCGGTCTTACTAACACCCGGTTCTGGCCAATTCATGACAACAGATGATTTTCAATCTCCCAGTGCTCTACCCTGGTACCATCCTACCAAGGAAATTTCAATACCTGGACAGGTTAGAAATCTAGTGGAATTATGCCAAGTAGATACCTTGATACCAATTAACAACACAGAAGCCAACATCAGAAATAAAAATATGTACACCGTACAACTTGGTGGTGAACCTGACCCTACAACCCCGGTTTTCACAATTAGGGTTGATATTGCATCACAACCATTAGCCACTACACTTATAGGTGAAGTTTCCAGCTACTACACACATTGGACTGGGAGTGTTAGATTTAGTTTTATGTTCTGTGGATCAGCACTTACAACACTAAAGTTATTGATTGCATATACCCCACCTGGTATTAGAGTTCCAAGAAATAGAAAAGAAGCAATGCTTGGTACACATCTAATATGGGACGTTGGTCTACAGTCCACAGTGTCAATGGTGGTTCCCTGGGTCAGTGCTAGTCATTATAGAAACACAACCCCAGATACATATTCAATAGCTGGCTTCATTACATGCTGGTATCAAACAAAACTGGTAGTTCCCCCAAACACAGCCTCCACAGCTGATATGCTGTGCTTTGTTTCAGGGTGCAAAGATTTCTGCCTACGCATGGCAAGAGATACTAACTTACACAAGCAAAGTGGACCTATTGAGCAAAACCCTGTGGAAAGATATGTAGATGAAGTTTTAAATGAAGTGCTTGTAGTCCCAAACATTAATCAGAGCAACCCTACAACATCCAACTCAGCACCAGTCTTAGACGCTGCTGAAACAGGTCATACCAGCAATGTTCAACCGGAGGACATGATTGAAACACGATATGTTCAAACCTCACAGACAAGAGATGAAATGAGTGTAGAAAGTTTCTTGGGTAGATCAGGGTGCATACATATGTCAACATTAAATATAAACTATGATAACTATGATGATTCTATTGAAAACTTCAAGGTGTGGAAAATAAACCTGCAAGAGATGGCACAAATACGTAGAAAATTTGAGTTGTTCACATATGCTAGATTTGATTCAGAGATTACAATTGTACCTTGTGTTGCTGGGCAAGGTGGTGACATTGGACACGTGGTCATGCAATACATGTATGTTCCACCTGGTGCACCTACACCTGAGAAAAGAAATGATTTCACATGGCAATCAGGCACAAATGCATCTGTTTTCTGGCAACATGGTCAAGCTTATCCCAGATTTTCATTACCATTCCTAAGTATTGCATCTGCATATTATATGTTTTATGATGGTTATGATGGAGATTCTGAAATAACGCGCTATGGAACATCAGTGACAAATGATATGGGTGCATTGTGCTTTAGAATAGTAACTGAACAGCATACAAATCAAGTTAAAATCACAACTAGGATTTACCATAAAGCTAAACATGTTAAAGTCTGGTGTCCTAGACCCCCCAGAGCAGTGGAATATACTAATGTGCATTTGACCAATTACAAGCCCAAAGATAGTGAAAAACAAGTTACCACTTTCATCAAACCTAGAGCTAACTTAAGAGAGATTAGAACATTTGGGCCCAGTGACATGTATGTGCATGTCGGAAATTTAATATATAGAAATCTGCACTTATTTAATTCAGAGGCACATGATTCTGTATTAGTATCCTACTCATCAGATTTAGTCATTTACCGCACAAACACCGTAGGTGATGACTTTATACCAACATGTGATTGCACACAAGCTACATATTATTGTAAGCACAAAAACAGGTACTTCCCAATCACAGTCACTAGTCATGATTGGTACGAAATCCAAGAGAGTGAATATTATCCAAAACATATTCAATATAATCTATTAATTGGTGAGGGTCCTTGTGAACCAGGTGATTGTGGAGGGAAGTTACTGTGTAAACATGGAGTCATTGGCATTATAACTGCTGGTGGTGAAGGGCATGTTGCCTTCATAGATTTAAGACATTTCCTGTGTGCTGAAGAGCAAGGAGTAACAGATTATATCCACATGTTAGGTGAGGCTTTTGGAAATGGCTTTGTAGATAGTGTTAAAGAACATGTGAATGCTATAAATCCTGTAAATAATATTAGTAAAAAAGTAATTAAGTGGTTGTTGAGAATTGTATCTGCTATGGTTATAATAATCAGAAACTCATCTGATCCCCAAACCGTTGTTGCCACTTTAACATTAATTGGATGTTCTGGGTCACCATGGAGATTCTTAAAAGAAAAATTCTGTAAATGGACCCAACTAACTTACATTCATAAAGAATCTGATTCTTGGCTCAAAAAATTCACCGAAATGTGCAATGCAGCAAGAGGACTTGAATGGATAGGGAATAAAATATCAAAATTTATAGAATGGATGAAATCAATGTTGCCACAAGCACAGCTTAAAGTTAAATATTTAAATGAGTTGAAAAAATTAAACCTTCTTGAAAAGCAGATTGAGAACCTGAGAAGTGCTGATTCTAAAACTCAAGAAAGGATTAAGGTTGAGATAGACACATTACATGATTTGTCCTGTAAATTTCTTCCACTTTATGCTAGTGAAGCCAAGAGGATCAAGGTGATACACAATAAATGTAATACTATCATAAAACAAAAGAAAAGGAGTGAACCGGTTGCAGTGATGATACATGGTTCACCAGGTACTGGAAAATCCATAACAACAAATTTTCTGGCAAGAATGATAACAAATGAGAGTGACATATATTCATTACCACCTGATCCTAAATATTTTGATGGGTACGATCAGCAGTCTGTTGTCATAATGGATGATATCATGCAAAATCCAGATGGTGAAGACATGGCACTATTTTGTCAGATGGTCTCTAGTGTAACTTTTATACCCCCAATGGCTGATTTACCTGATAAAGGAAAACCCTTTGACTCCAGATTTGTTCTTTGCAGTACTAACCACTCCATGTTGGCCCCTCCAACAATTACATCCCTTCAGGCAATGAATAGACGCTTCTTTCTTGATTTAGATATTGTGGTACATGATAATTACAAAGATTCACAAGGGAAACTAAATGTGTCTAAAGCTTTTAAACCATGTGATGTTGGAACAAAAATAGGTAACGCACGTTGTTGTCCATTCATTTGTGGCAAGGCAGTTACATTCAAAGATCGCAACACGTGCTTGAGCTACCCATTGAGTCAAATTTACAACCTAATTCTCCAAGAGGACAAGAGGCGTACTCATGTTGTAGATGTTATGTCTGCTATATTTCAGGGACCAATCTCTATGGAAGTACCTCCTCCTCCTGCAATAACTGATTTGCTCCGATCTGTTAAGACACCTGAAGTTATTAAATATTGTGAAGACAATAAATGGACCATTCCAGCTGATTGTAAGAT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103,712
OK539487.1
rhinovirus A66
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-12-11
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,063
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-07-02
SAMN22069241
PRJNA1066815
Rhinovirus A66 strain RvA66/USA/2021/H8TU7P, complete genome
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USA
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Rhinovirus A66 strain RvA66/USA/2021/ZVWUUZ, complete genome
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37,669
MZ835579.1
rhinovirus A66
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-07
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Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,054
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-07
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PRJNA1066815
Rhinovirus A66 strain RvA66/USA/2021/H5ZT4C, complete genome
CTATTATTCCGGTAATCTTGTACGCCAGTTTTATATCCCCCCCCCTTTTGTAACTTAGAAGTTATGAACATAGACCAATAGGTGGTGATCACCCAGATCACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCGACGTTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAACAGAGATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGCAAAGCCTAGTAACCCCTTGGAGAGTATGTGGTTGGTCGCTCAGCTATTCCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACTCTTATGAGTGCGAAGCCATATATTTGACAAGGTGCGAAGAGCCCCGTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCATGAAATCCATCATGTTGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTTATATTTGCTTATGGTGACAATATATATATAACATATATATTGGCATCATGGGCGCACAGGTTTCTAGACAGAATGTTGGAACACACTCAACACAGAATACAGTGTCAAATGGATCAAGCCTCAATTATTTTAACATCAATTATTTCAAGGATGCAGCTTCTAGTGGAGCATCAAAATTGGAGTTTTCACAAGATCCTAGCAAATTCACAGACCCAGTCAAAGATGTTCTTGAAAAAGGAATTCCAACACTTCAATCCCCAACTGTTGAGGCATGTGGATATTCAGACAGGATAATACAGATTACTAGGGGTGACTCCACAATTACATCACAAGATGTTGCCAATGCAGTCGTTGGTTATGGTGTCTGGCCACACTATCTGAGTGGTACAGATGCTACTGCCATTGACAAACCTAGTCGACCTGACACATCATCAAATAGATTCTACACCCTTGAAAGTAAAGTGTGGACTCCAACCTCACAGGGATGGTGGTGGAAACTACCAGATGCACTTAAGGATATGGGCATTTTTGGAGAGAACATGTTCTATCACTATTTAGGAAGGAGTGGATATACTGTACATGTGCAATGTAATGCTAGTAAGTTTCACCAAGGCACCTTGCTGGTAGTTATGATACCAGAACATCAATTGGCAGCTGCAAACACTGGTAACGTTGCAGCAGGGTATAATTTCACACATCCTGGTGAAAAAGGAAGAGAGGTTGGGAGTCCGCGAGAGACACACCCAAATCACCCAAGTGATGACAGCTGGTTAAATTTTGATGGTACCTTGTTAGGCAATGCACTTATATTTCCTCATCAATTCATTAATCTTAGAAGCAATAATTCAGCAACAATAATAGTGCCATATGTAAATGCAGTGCCAATGGACTCAATGCTTAGACATAATAACTGGAGTTTGGTGATAATTCCTATTAGTCCATTAAAAGCAGAAAATGCTACTAGTGTTATAGTCCCAATAACTATATCCATTAGTCCTATGTTTGCAGAATTCTCTGGAGCAAGAGCCCGACCCGTAGCTCAAGGGTTGCCTGTGTATATTACACCTGGATCTGGACAATTTATGACTACTGATGACTTGCAATCACCATCAGCACTGCCATGGTACCACCCAACAAAGGAGATCATGATACCAGGTGAGGTTAAGAACTTGATAGAAATGTGCCAAGTGGACACTTTGATCCCCATTAATAACACACAAGCCAATTTGAAGAAAATCAACATATACACAATACAATTGTCTAATCAGTCTAGAGTGGCTGAGGAAATCTTTGCTATTAAGGTGGACATTGCATCACAGCCCTTATCTAATACTCTGCTTGGACAAATTGCTAGTTATTTCACACACTGGACTGGTAGCTTACGCTTTAGTTTCATGTTTTGTGGCACAGCTAACACAACTCTGAAATTACTTTTAGCATACACACCACCAGGTATAAGAAAACCTGAGAACAGGAAACAAGCAATGCTTGGGACTCACATAGTGTGGGATGTAGGCTTACAATCAACTGTGTCCCTAGTTGTTCCATGGGTTAGTGCTAGTCATTTTAGATACACTACGCCAGATACATACTCAGCAGCTGGATACATAACTTGTTGGTATCAGACAAATTTTGTTTTTCCCCCAAACACCCCAAACACAGCTGATATGCTGTGTTTTGTCTCAGCATGTAAGGATTTCTGTCTACGTATGGCTAGAGATACTGACATGCATGTTCAGAATGATGCTATTACACAAAATCCAGTTGAAGATTATGTTGAAGGCGTTCTGAATGAAGTTTTAGTAGTACCAAACATTAAAGAAAGCCATCCAAGCACATCAAACGCTGCTCCAATATTAGATGCAGCTGAAACAGGTCACACTAGCAAAGTACAACCAGAGGATACTGTTGAGACCCGCTATGTACAAACATCACAGACTAGAGATGAAATGAGTATAGAAAGTTTTCTAGGCAGGTCAGGGTGCATCCATATATCAACAATTAGTGTGGACAGTACAAAAACATATGATGAATCCAAATTTAGAACATGGCAAATCACATTACAAGAAATGGCTCAAATAAGACGCAAATTTGAGATGTTCACATATGTTAGGTTTGATTCTGAAATTACATTAGTCCCATGTGTTGCTGGAAAAGGTGATGATATAGGACACATTGTGATGCAATACATGTATGTACCACCTGGAGCCCCAATTCCAGATAACAGAACACACTTTGCTTGGCAGTCAGGAACAAATGCATCTATATTCTGGCAGCTTGGACAACCATTCCCAAGATTTTCACTACCTTTTCTAAGTATAGCTTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGAGATACTCCTGGATCTCGCTATGGAAACACAGTAGTCAATCACATGGGTACATTATGTATTAGAATAGTTACAAATGAGCAACACCATAATGTTGAGATTACTACCAGAGTATATCATAAAGCTAAACACGTCAAAGCTTGGTGTCCTAGACCACTCAGAGCTGTGCCATACACAACTATAAATTCAACTAATTATGTACCTCATACTGGTGACTTGCAAATTTTTATTAAACCTAGGACAGATCCAAAAGTGGTTACTGTAGGACCCAGTGACATGTTTGTACATGTCGGTAATCTCATATATAGAAATCTTCACTTGTTCAACTCAGAGATGCATGATTCAGTACTAGTATCTTATTCATCAGACTTAGTCATTTACCGCACAAATACCATAGGTAATGACTATATCCCAACATGTGATTGTACAGATGCCACATATTATTGTAGACATAAAGATAGATATTATCCAATCAAAGTGACAAGCCATGACTGGTATGAAATCCAGGAGAGTGAATACTACCCCAAACACATACAGTATAACCTTTTAATTGGTGAGGGACCATGTGAACCAGGTGATTGTGGAGGAAAGTTGCTTTGCAAACATGGTGTCATTGGGATAATTACTGCTGGTGGAGAAGGACATGTAGCATTTATTGATCTCAGGCATTTTCACTGTGCAGAGGAACAAGGCATAACTGACTACATCCACATGCTTGGCGAGGCCTTTGGTACAGGTTTTGTAGACAGTGTAAAAGATCAAATAAGTGCTATAAATCCAATTAACAATATTAGTAAGAAAATAATCAAATGGTTACTCAGGATAATATCAGCAATGGTCATAATTATTAGAAATTCATCTGATCCACAGACCATAATAGCAACATTAACACTAATTGGTTGTTCAGGTTCCCCATGGAGATTTCTTAAAGAAAAATTTTGTAAATGGACACAACTAAATTATGTTCATAAGGAATCAGATTCATGGCTCAAGAAATTCACTGAAATGTGCAATGCGGCCAGGGGACTGGAATGGATTGGTAATAAAATCTCAAAATTTATTGACTGGATGAAATCTATGTTACCACAAGCCCAATTAAAAGTCAAGTATCTTAATGAATTAAAGAAACTTAATTTCCTGGAAAAACAGATGGAGCACTTGAGAGTAGCAGACTCAAAAACACAGGAGAAAATTAAACATGAAATTGATACACTGCATGATTTGTCCTGCAAGTTTCTTCCCTTATATGCTAATGAGGCAAAGAGAATCAAAATCCTACATAACAGATGCAGCACAATTATTAAACAAAAGAAGAGGTGTGAACCAGTTGCAGTTGTCATACATGGTGAACCTGGTACTGGAAAATCTATGACTACAAATTTTCTAGCTAGAATGATAACAAGTGATAGTGATATCTATTCTCTGCCACCTGATCCAAAGTACTTTGATGGTTACGATCAACAAAGTGTGGTCATAATGGATGACATAATGCAGAACCCAAGTGGTGATGACATGACTTTATTCTGCCAGATGGTTTCGAGTGTAACATTTATACCACCAATGGCTGATTTACCAGACAAGGGAAAACCATTTGATTCCAAGTTTGTACTGTGTAGTACTAATCATCATTTATTAGCACCACCTACAATAACTTCATTGCCAGCTATGAATAGGAGATTCTTCTTAGATCTAGATATTGTAGTATGTGATAAGTATAAAGATTCTCAGGGAAAATTAAATGTATCAGCTGCTTTTCAACCATGTGATGTCAACACAAAAATAGGAAATGCCCGTTGCTGTCCATTTATTTGTGGTAAAGCTGTAATTTTTAGGGATCGCAATACATGTCAGACTTACACTCTAGCTCAAGTATATAATTTAATGCTTGAAGAAGACAGGAAACGTACACAGGTTATTGATGTCATGGCCGCAATCTTCCAGGGTCCAATTACCCTTGAAGGACCACCACCAGCAGCAATCAGTGACTTGTTACAGTCAGTAAGAACTCCTGAAGTCATCAAGTACTGTGAGGATAACAAATGGATAATACCTGCTGAATGTAAAGTAGAGAGAGACCTTAATATAGCTAATACCATTATAACAATAATTGCCAATATTATTAGCATTT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rhinovirus A66
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-06-15
AY5HJB
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2021-04-28
SAMN19177321
PRJNA1066815
Rhinovirus A66 strain RvA66/USA/2021/AY5HJB, complete genome
TATTATTCCGGTAATCTTGTACGCCAGTTTTATATNCCCCCCCCCTTTTGTAACTTAGAAGTTATGAACATAGACCAATAGGTGGTGATCACCCAGATCACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCGACGTTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAACAGAGATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGCAAAGCCTAGTAACCCCTTGGAGAGTATGTGGTTGGTCGCTCAGCTATTCCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACTCTTATGAGTGCGAAGCCATATATTTGACAAGGTGCGAAGAGCCCCGTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGTGCATGAAATCCATCATGTTGCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTTATATTTGCTTATGGTGACAATATATATATAACATATATATTGGCATCATGGGCGCACAGGTTTCTAGACAGAATGTTGGAACACACTCAACACAGAATACAGTGTCAAATGGATCAAGCCTCAATTATTTTAACATCAATTATTTCAAGGATGCAGCTTCTAGTGGAGCATCAAAATTGGAGTTTTCACAAGATCCTAGCAAATTCACAGACCCAGTCAAAGATGTTCTTGAAAAAGGAATTCCAACACTTCAATCTCCAACTGTTGAGGCATGTGGATATTCAGACAGGATAATACAGATTACTAGGGGTGACTCCACAATTACATCACAAGATGTTGCCAATGCGGTCGTTGGTTATGGTGTCTGGCCACACTATTTGAGTGGTACAGATGCTACTGCCATTGACAAACCTAGTCGACCTGACACATCATCAAATAGATTCTACACCCTTGAAAGTAAAGTGTGGACTCCAACCTCACAGGGATGGTGGTGGAAACTACCAGATGCACTTAAGGATATGGGCATTTTTGGAGAGAACATGTTCTATCACTATCTAGGAAGGAGTGGATATACTGTACATGTGCAATGTAATGCTAGTAAGTTTCACCAAGGCACCTTGCTGGTAGTTATGATACCAGAACATCAATTGGCAGCTGCAAACACTGGTAACGTTGCAGCAGGGTACAATTTTACACATCCTGGTGAAAAAGGAAGAGAGGTTGGGAGTCCGCGAGAGACACACCCAAATCACCCAAGTGATGACAGCTGGTTAAATTTTGATGGTACCTTGTTAGGCAATGCACTTATATTTCCTCATCAATTCATTAATCTTAGAAGCAATAATTCAGCAACAATAATAGTGCCATATGTAAATGCAGTGCCAATGGACTCAATGCTTAGACATAATAACTGGAGTTTGGTGATAATTCCTATTAGTCCATTAAAAGCAGAAAATGCTACTAGTGTTATAGTCCCAATAACTATATCCATTAGTCCTATGTTTGCAGAATTCTCTGGAGCAAGAGCCCGACCCGTAGCTCAGGGGTTGCCTGTGTATATTACACCTGGATCTGGACAATTTATGACTACTGATGACTTGCAATCACCATCAGCACTGCCATGGTACCACCCAACAAAGGAGATCATGATACCAGGTGAGGTTAAGAACTTGATAGAAATGTGCCAAGTGGACACTTTGATCCCCATTAATAACACACAAGCCAATTTGAAGAAAATCAACATATACACAATACAATTGTCTAATCAGTCTAGAGTGGCTGAGGAAATCTTTGCTATTAAGGTGGACATTGCATCACAGCCCTTATCTAATACTCTACTTGGACAAATTGCTAGTTATTTCACACACTGGACTGGTAGCTTACGCTTTAGTTTCATGTTTTGTGGCACAGCTAACACAACTCTGAAATTACTTTTAGCATACACACCACCAGGTATAAGAAAACCTGAGAACAGGAAACAAGCAATGCTTGGGACTCACATAGTGTGGGATGTAGGCTTACAATCAACTGTGTCCCTAGTTGTTCCATGGGTTAGTGCTAGTCATTTTAGATACACTACGCCAGATACATACTCAGCAGCTGGATACATAACTTGTTGGTATCAGACAAATTTTGTTTTTCCCCCAAACACCCCAAACACAGCTGATATGCTGTGTTTTGTCTCAGCATGTAAGGATTTCTGTCTACGTATGGCTAGAGATACTGACATGCATGTTCAGAATGATGCTATTACACAAAATCCAGTTGAAGATTATGTTGAAGGCGTTCTGAATGAAGTTTTAGTAGTACCAAACATTAAAGAAAGCCATCCAAGCACATCAAACGCTGCTCCAATATTAGATGCAGCTGAAACAGGTCACACTAGCAAAGTACAACCAGAGGATACTGTTGAGACCCGCTATGTACAAACATCACAGACTAGAGATGAAATGAGTATAGAAAGTTTTCTAGGCAGGTCAGGGTGCATCCATATATCAACAATTAGTGTGGACAGTACAAAAACATATGATGAATCCAAATTTAGAACATGGCAAATCACATTACAAGAAATGGCTCAAATAAGACGCAAATTTGAGATGTTCACATATGTTAGGTTTGATTCTGAAATTACATTAGTCCCATGTGTTGCTGGAAAAGGTGATGATATAGGACACATTGTGATGCAATACATGTATGTACCACCTGGAGCCCCAATTCCAGATAACAGAACACACTTTGCTTGGCAGTCAGGAACAAATGCATCTATATTCTGGCAGCTTGGACAACCATTCCCAAGATTTTCACTACCTTTTCTAAGTATAGCTTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGAGATACTCCTGGATCTCGCTATGGAAACACAGTAGTCAATCACATGGGTACATTATGTATTAGAATAGTTACAAATGAGCAACACCATAATGTTGAGATTACTACCAGAGTATATCATAAAGCTAAACACGTCAAAGCTTGGTGTCCTAGACCACTCAGAGCTGTGCCATACACAACTATAAATTCAACTAATTATGTACCTCATACTGGTGACTTGCAAATTTTTATTAAACCTAGGACAGATCCAAAAGTGGTTACTGTAGGACCCAGTGACATGTTTGTACATGTCGGTAATCTCATATATAGAAATCTTCACTTGTTCAACTCAGAGATGCATGATTCAGTACTAGTATCTTACTCATCAGACTTAGTCATTTACCGCACAAATACCATAGGTAATGACTATATCCCAACATGTGATTGTACAGATGCCACATATTATTGTAGACATAAAGATAGATATTATCCAATCAAAGTGACAAGCCATGACTGGTATGAAATCCAGGAGAGTGAATACTACCCCAAACACATACAGTATAACCTTTTAATTGGTGAGGGACCATGTGAACCAGGTGATTGTGGAGGAAAGTTGCTTTGCAAACATGGTGTCATTGGGATAATTACTGCTGGTGGAGAAGGACATGTAGCATTTATTGATCTCAGGCATTTTCACTGTGCAGAGGAACAAGGCATAACTGACTACATCCACATGCTTGGCGAGGCCTTTGGTACAGGTTTTGTAGACAGTGTAAAAGATCAAATAAGTGCTATAAATCCAATTAACAACATTAGTAAGAAAATAATCAAATGGTTACTCAGGATAATATCAGCAATGGTCATAATTATTAGAAATTCATCTGATCCACAGACCATAATAGCAACATTAACACTAATTGGTTGTTCAGGTTCCCCATGGAGATTTCTTAAAGAAAAATTTTGTAAATGGACACAACTAAATTATGTTCATAAGGAATCAGATTCATGGCTCAAGAAATTCACTGAAATGTGCAATGCGGCCAGGGGACTGGAATGGATTGGTAATAAAATCTCAAAATTTATTGACTGGATGAAATCTATGTTACCACAAGCCCAATTAAAAGTCAAGTATCTTAATGAATTAAAGAAACTTAATTTCCTGGAAAAACAGATGGAGCACTTGAGAGTAGCAGACTCAAAAACACAGGAGAAAATTAAACATGAAATTGATACACTGCATGATTTGTCCTGCAAGTTTCTTCCCTTATATGCTAATGAGGCAAAGAGAATCAAAATCCTACATAACAGATGCAGCACAATTATTAAACAAAAGAAGAGGTGTGAACCAGTTGCAGTTGTCATACATGGTGAACCTGGCACTGGAAAATCTATGACTACAAATTTTCTAGCTAGAATGATAACAAGTGATAGTGATATCTATTCTCTGCCACCTGATCCAAAGTACTTTGATGGTTACGATCAACAAAGTGTGGTCATAATGGATGACATAATGCAGAACCCAAGTGGTGATGACATGACTTTATTCTGCCAGATGGTTTCGAGTGTAACATTTATACCACCAATGGCTGATTTACCAGACAAGGGAAAACCATTTGATTCCAAGTTTGTGCTGTGTAGTACTAATCATCATTTATTAGCACCACCTACAATAACTTCATTACCAGCTATGAATAGGAGATTCTTCTTAGATCTAGATATTGTAGTATGTGATAAGTATAAAGATTCTCAGGGAAAATTAAATGTATCAGCTGCTTTTCAACCATGTGATGTCAACACAAAAATAGGAAATGCCCGTTGCTGTCCATTTATTTGTGGTAAAGCTGTAATTTTCAGGGATCGCAACACATGTCAGACTTACACTCTAGCTCAAGTATATAATTTAATGCTTGAAGAAGACAGGAAACGTACACAAGTTATTGATGTCATGGCCGCAATCTTCCAGGGTCCAATTACCCTTGAAGGACCACCACCAGCAGCAATCAGTGACTTGTTACAGTCAGTAAGAACTCCTGAAGTCATCAAGTACTGTGAGGACAACAAATGGATAATACCTGCTGAATGTAAAGTAGAGAGAGACCTTAATATAGCTAATACCATTATAACAATAATTGCCAATATTATTAGCATTT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41,393
MN749158.1
rhinovirus A66
Addetia,A., Phung,Q., Greninger,A.L.
University of Washington, UW Virology
USA
2020-01-20
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,112
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2015
null
null
Rhinovirus A66 strain 12O6, complete genome
TTAAAACTGGATCTAGGTTGTCCCCACCTAGATCTCCCATGTGGAGTGGTACTCTATTATTCCGGTAATCTTGTACGCCAGTTTTATATCCCCTCCCCCTTTTGTAACTTAGAAGTTATGAACATAGACCAATAGGTGGTGATCATCCAGATCACTTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCGACGTTGATATGCTCCACCAGGGCAAAAACAACAGAGATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACACAAAGCCTAGTAACCCCTTGGAGAGTATGTGGTTGGTCGCTCAGCTATTCCCCATAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACTCTTATGAGTGCGAAGCCATATATTTGACAAGGTGCGAAGAGCCCCGTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCCTAACCCTGCAGCTAGTGCATGAAATCCATCATGTTGCTAGTCGTAATGAGTAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTTATATTTGCTTATGGTGACAATATATATATAACATATATATTGGCATCATGGGCGCACAGGTTTCTAGACAGAATGTTGGAACACACTCAACACAGAATGTAGTGTCAAATGGATCAAGCCTCAATTATTTCAACATCAATTATTTCAAGGATGCGGCTTCTAGTGGGGCATCAAAATTGGAGTTTTCACAAGATCCTAGCAAATTCACAGACCCAGTCAAAGATGTTCTTGAAAAAGGAATTCCAACACTTCAATCTCCAACTGTTGAGGCATGTGGATATTCAGACAGGATAATACAGATTACAAGGGGTGACTCCACAATTACATCACAAGATGTTGCCAATGCAGTCGTTGGTTATGGTGTTTGGCCACATTATCTGAGTGGTACAGATGCTACTGCCATTGACAAACCTAGTAGACCTGACACATCATCAAATAGATTCTATACCCTTGAAAGTAAGGTGTGGACCCCAACTTCACAGGGATGGTGGTGGAAATTACCAGATGCACTTAAGGATATGGGCATTTTTGGGGAGAACATGTTTTATCACTATCTAGGAAGGAGTGGATATACTGTACATGTACAATGTAATGCTAGTAAGTTTCACCAAGGCACCTTGCTAGTGGTTATGATACCAGAACATCAATTGGCAGCCGCAAACACTGGTAACGTTGCAGCAGGGTACAATTTCACACACCCTGGTGAAAAAGGAAGAGAGGTTGGGAGTCCACGAGAGGCACATCCAAACCACCCAAGTGATGATAACTGGTTAAATTTTGATGGTACCTTATTAGGTAATGCACTTATATTTCCTCATCAATTCATTAATCTTAGAAGCAATAATTCGGCAACAATAATAGTACCATATGTAAATGCAGTGCCAATGGATTCAATGCTTAGACATAATAACTGGAGTTTGGTGATAATCCCTATTAGTCCATTAAAAGCAGAAAATGCTACTAGTGTCATAGTCCCAATAACTATATCCATTAGTCCTATGTTTGCAGAATTTTCTGGAGCAAGAGCCCGACCTGTAGCTCAGGGGCTGCCTGTGTATATTACGCCTGGATCTGGACAATTTATGACTACTGATGACTTGCAATCACCGTCGGCACTGCCATGGTACCACCCAACAAAGGAGATCATGATACCAGGTGAGGTTAAGAACTTGATAGAAATATGTCAAGTGGACACTTTGATCCCCATTAATAACACACAAGCCAATTTAAAGAAAATCAACATATACACAATACAATTGTCTAGTCAGTCCAGAGTAGCTGAGGAAATCTTTGCCATTAAGGTGGACATTGCATCACAGCCCTTATCAAACACTCTACTTGGACAAATTGCTAGTTATTTCACACACTGGACCGGTAGCTTACGCTTTAGTTTTATGTTTTGTGGCACAGCTAACACAACTCTGAAATTACTTCTAGCATACACACCACCAGGTATAAGGAAGCCTGAGAACAGGAAACAAGCAATGCTTGGAACTCACATAGTGTGGGATGTAGGCTTACAATCAACTGTGTCCCTAGTTGTTCCATGGGTTAGTGCTAGTCACTTTAGATATACAACACCAGACACATACTCAGCAGCTGGGTACATAACTTGTTGGTATCAGACAAACTTTGTTTTTCCCCCAAACACCCCAAACACAGCTGATATGCTGTGTTTTGTCTCAGCATGTAAGGATTTCTGCCTGCGCATGGCCAGGGATACTGACATGCATGTTCAGAATGATGCTATTACACAAAATCCAGTTGAAGATTATGTTGAAGGTGTTCTAAATGAGGTTTTAGTAGTACCAAACATTAAAGAAAGCCACCCAAGCACATCAAACGCTGCCCCAATATTAGATGCAGCTGAAACGGGCCACACTAGCAAAGTACAGCCAGAGGATACTGTTGAAACCCGCTATGTGCAAACATCACAGACTAGAGATGAAATGAGTATAGAAAGTTTTCTGGGCAGGTCAGGGTGTATCCATATATCAACAATTAGTGTGGACAGCACAAAAACATATGATGAATCTAAATTCAGAATATGGCAAATCACATTACAAGAAATGGCTCAAATAAGACGCAAATTTGAGATGTTCACATATGTTAGGTTTGATTCTGAAATTACATTAGTTCCATGTGTTGCTGGGAAGGGTGATGATATAGGACACATTGTAATGCAATACATGTATGTACCACCTGGAGCCCCAATTCCAGACAACAGAACACACTTTGCTTGGCAGTCGGGAACAAATGCATCTATATTCTGGCAACTTGGACAACCATTCCCAAGATTTTCACTACCTTTTCTAAGTATAGCTTCAGCATACTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGAGATGCTCCTGGGTCTCGCTATGGAAACACAGTAGTCAATCACATGGGTACATTATGTATTAGAATAGTTACAAATGAGCAACACCATAATGTCGAGATCACTACCAGAGTATATCATAAAGCTAAACATGTCAAAGCTTGGTGTCCTAGATCACTCAGAGCTGTACCATACACAACTATAAATTCAACTAATTATGTACCTCATACTGGTGACTTACAAATTTTCATTAAACCTAGGACAGATCCAAAAGTTGTTACTGTAGGGCCTAGTGATATGTTTGTACATGTTGGTAATCTCATATACAGAAATCTTCACTTATTTAACTCAGAGATGCATGATTCAGTATTAGTATCTTACTCATCAGATTTAGTCATTTACCGCACAAATACCACAGGTAATGACTACATCCCGACATGTGACTGTACAGATGCCACATATTATTGTAGACACAAAGATAGATATTATCCAATCAAAGTGACAAGCCATGACTGGTATGAAATCCAAGAGAGTGAATATTACCCCAAACACATACAATATAACCTTTTAATTGGTGAGGGACCGTGTGAACCAGGTGATTGTGGAGGAAAGTTGCTTTGCAAACATGGTGTGATTGGGATAATCACTGCTGGTGGAGAAGGACATGTAGCATTTATTGATCTTAGGCATTTCCACTGTGCAGAGGAACAAGGCATAACTGATTACATCCACATGCTCGGCGAGGCCTTTGGTACAGGTTTTGTAGATAGTGTAAAAGATCAGATAAGTGCTATAAATCCAATTAACAACATTAGTAAGAAGATAATTAAATGGTTACTTAGGATAATATCAGCAATGGTCATAATTATTAGAAATTCATCTGATCCACAAACCATAATAGCAACATTAACACTGATTGGCTGTTCAGGCTCCCCATGGAGATTTCTCAAAGAAAAATTTTGCAAATGGACACAATTAAATTATGTTCATAAGGAATCAGATTCATGGCTCAAGAAATTTACTGAAATGTGCAATGCAGCCAGGGGTCTGGAATGGATTGGTAATAAAATCTCAAAATTTATTGACTGGATGAAATCTATGTTACCACAAGCCCAATTAAAAGTCAAGTATCTTAATGAATTAAAGAAACTTAATTTCCTGGAAAAGCAGATGGAGCATTTGAGAGTAGCAGACTCAAAAACACAAGAGAAAATTAAACATGAAATTGATACATTGCATGATTTGTCCTGTAAGTTCCTCCCCTTATATGCTAGTGAGGCAAAGAGAATCAAAATCCTACATAACAGATGCAGCACAATTATTAAACAAAAGAAAAGGTGTGAACCAGTTGCAGTTGTCATACATGGTGAACCTGGTACTGGAAAATCTATGACTACAAATTTTCTAGCTAGGATGATAACAAGTGATAGTGATATCTATTCTCTACCACCTGATCCAAAATACTTTGATGGTTATGACCAGCAAAGTGTGGTCATAATGGATGACATAATGCAGAACCCAAGTGGTGATGACATGACTTTATTCTGCCAAATGGTTTCAAGTGTAACATTTATACCACCAATGGCTGATTTACCAGATAAGGGAAAACCATTTGATTCCAAGTTTGTGCTATGTAGTACTAATCATCATTTATTAGCACCACCTACAATAACTTCATTGCCAGCTATGAATAGGAGATTTTTCTTAGATCTAGATATTGTAGTATGTGATAAGTATAAGGATTCTCAGGGAAAACTAAATGTGTCAGCTGCTTTTCAACCATGTGATGTTAATACAAAAATAGGAAATGCCCGCTGCTGTCCATTTATTTGTGGTAAAGCTGTAATTTTCAGGGATCGTAATACATGTCAGACTTACACTCTAGCTCAAGTGTATAATTTAATGCTTGAAGAAGACAGGAAACGTACACAAGTTGTTGATGTCATGGCTGCAATCTTCCAGGGTCCAATTACCCTTGAAGGACCACCACCAGCAGCAATCAGTGACTTGTTACAGTCAGTAAGAACTCCTGAAGTCATTAAGTACTGTGAAGACAACAAATGGATAATACCTGCTGAGTGTAAAGTAGAAAGAG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54,620
FJ445148.1
rhinovirus A66
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,139
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 66 strain ATCC VR-1176, complete genome
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103,716
OL638431.1
rhinovirus A67
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
EM2BBA
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,089
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-07-10
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PRJNA1066815
Rhinovirus A67 strain RvA67/USA/2021/EM2BBA, complete genome
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34,063
OM001385.1
rhinovirus A67
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
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2022-01-04
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Enterovirus
Picornaviridae
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USA
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2021-07-02
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PRJNA1066815
Rhinovirus A67 strain RvA67/USA/2021/MU2GFR, complete genome
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USA
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rhinovirus A67
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35,265
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-12-11
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USA
USA
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2021
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-12-11
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Rhinovirus A
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2021-07-14
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USA
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2021-07-14
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37,714
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-07
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Picornaviridae
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USA
USA
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2021-06-09
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USA
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Picornaviridae
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USA
USA
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2021-04-26
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2021-02-22
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PRJNA1066815
Rhinovirus A67 strain RvA67/USA/2021/69797, complete genome
TGTTATTACGGTAACCTTGTACGCCGGTTTTGCCACCCTTCCCTAATATGTAACTTAGAAGTTTGAGCAACACGACCAATAGGTGATAATCATCCAGATTGTCAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAATGAGGATATGCTTTACCCAAGGCAAAAACCTTAAAGATCGTTATCCACACACTGCCTACACAGAGCCTAGTACCACTTTCGATGTAATTAGGTTGGTCGCTCCCTGCAAACCCAGCAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGCGACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCTCACCCTATTGGGTGAGAAGCCTACTTATTGACAAGGTGCGAAGAGCCGCGTGTGCTCAGTGTGCTTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCCGCTGCCCATAATCCAATGGGTTTACGGTCGTAACGCGTAAGTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTATTTTTCCTATATATTTGCTTATGGTGACAATATATAATCACTTGTATATTGGCACCATGGGCGCTCAAGTGTCTAGACAGAATGTTGGAACTCACTCTACACAAAATTCAGTTTCAAACGGGTCTAGTCTAAATTATTTCAACATAAATTATTTCAAAGACGCTGCTTCAAGTGGCGCGTCAAAACTTGAATTTTCACAAGATCCCAGCAAATTCACAGACCCAGTTAAAGATGTTCTTGAGAAGGGGATACCAACTTTACAGTCACCTACAGTTGAAGCATGTGGATATTCTGATAGGATAATTCAGATCACAAGAGGAGATTCAACAATCACCTCCCAAGATGTTGCAAATGCTGTCGTTGGTTATGGAGTGTGGCCTCACTACCTTACCCCCCAAGATGCAACTGCTATAGACAAACCCTCACACCCTGATACTTCCTCTAATAGATTTTATACTTTGGAGAGCAAGACTTGGAGTGCCGAATCCAAAGGATGGTGGTGGAAGCTGCCTGATGCACTTAAAGACATGGGAGTGTTCGGACAAAACATGTATTATCACTTCCTTGGCAGAAGTGGGTATACAGTACATGTTCAATGCAATTCAAGTAAATTTCATCAAGGAACGCTAATAGTTGCCATGATACCAGAACATCAGCTAGCCGCAGCAGAAAGAGGGAATGTCACTGCTGGTTACAACTTTACCCACCCTGGAGAGACTGGCAGAGATGTTGGGAAGACTGAACGTGTATATCAGAATAAACAACCTAGTGATGATAATTGGCTTAATTTTGATGGAACTCTTTTAGGAAACATAACCATCTTCCCACACCAATTTATCAATTTAAGGAGCAATAACTCAGCTACAATAATAGTACCGTATGTAAATGCGGTGCCAATGGATTCTATGCTCAGACACAATAACTGGAGTTTGGTGATTATACCAATTTGTCCCTTACAAGTTGAGGGAGCAGGCTCAAACACAATACCTATTACAGTTTCCATTAGTCCCATGTTTGCTGAGTTTTCTGGTGCACGAGCACGGAATCAAGGTTTGCCAGTATTAACAACACCAGGATCTGGCCAATTTATGACTACAGATGATTTTCAATCACCCAGTGCATTACCATGGTTCCATCCTACAAAGGAAATTTCCATACCTGGCCAAGTTAGAAATTTAATTGAAATGTGCCAAGTGGACACAATCATACCCATAAACAATACTGGGACAAATACTACAAGTATTAACATGTATACAGTGCAATTGCAGAGACAAGCTGAACTTATGCAAGAAATCTTTGCCATCAATGTAGATATAGCCTCACACCCTTTGGCAACCACATTATTAGGAGAAATTGCAAGTTATTACACACACTGGACAGGTAGTTTACGCTTTAGCTTTATGTTTTGTGGATCAGCAAGTTCTACTCTGAAACTCCTTCTTGCATACACTCCACCAGGAATTTCTAAACCTACAAGTAGGAAAGAGGCAATGCTAGGTACACATGTGGTCTGGGATGTAGGGTTGCAATCTACTATATCCATGATAGTACCATGGATTAGTGCCAGCCACTTTAGAAATACAACACCTGACAAATACTCACTAGCCGGGTTTATCACATGCTGGTATCAAACCAATCTTGTCGTACCTGCAAACACACCAACCACAGCCAACCTGCTTTGCTTTGTATCCGCATGCAAAGATTTCTGCTTGCGCATGGCTAGAGACACAAACCTTCATAAACAAACAGGACCCATTACCCAAAACCCAGTAGAAGATTATGTAGATCAAGTGTTAAATGAGGTCCTGGTGGTGCCAAATATAAAGCAAAGTGAACCCACAACTTCTAACTCAGCCCCAGCTTTAGATGCTGCTGAGACAGGTCATACCAGTGGTGTACAGCCTGAAGATATGATTGAGACTCGTTATGTGCAGCCATCAAACACTAGAGATGAAATGAGTCTTGAAAGCTTCCTTGGAAGGTCAGGTTGTGTCCATATATCAAAGTTGAATATCAATTACACTGCATATGATGAAAGTAGGGATAATTTCACAATCTGGAAAATAAACATAAAGGAAATGGCCCAAATTAGGAGGAAATTTGAATTATTTACATACACAAGGTTTGATTCTGAGATAACACTAGTACCATGCATAGCTGCAGAGAGTGACAGTATTGGACATGTTGTGATGCAATACATGTATGTGCCCCCTGGGGCACCATTACCCACAAAGAGAGATGACTACACATGGCAATCAGGCACAAATGCATCCATCTTTTGGCAACATGGACAATCATACCCCAGATTTTCATTACCATTCTTGAGCATCGCCTCTGCTTATTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGTGGACCAGACTCACAATATGGCACTATAGTAACCAATGATATGGGTTCCTTGTGTTCCCGTATAGTTACTGAAGAACATGGCTCTCGTGTGAAAATTGCAACGCGAGTGTATCATAAGGCTAAGCATGTAAAGGCTTGGTGCCCAAGACCCCCTAGAGCAGTAGAATACACACACACACATGTTACAAATTACAGACCAGAAACAGGTGAGGCACAGACAGTTATACCTGTCAGAGCAGATGTTAGAACAATTAGGAATGTGGGACCCAGTGATTTGTATGTGCATGTGGGAAATCTTATATACAGAAATCTACACTTGTTTAATTCAGAAGCCAATGATTCAGTGTTGATATCATACTCCTCAGATTTAGTCATATACCGCACAAACACTATAGGTGATGACTATATACCAACATGTGATTGCACAGAAGCCACTTATTATTGTAGACACAAAAACAGGTACTACCCAACTAAAGTTACTAGTCATGATTGGTATGAAATACAAGAAAGTGAGTATTACCCAAAACACATACAATACAATTTGTTAATTGGGGAAGGACCTTGTGAACCTGGTGATTGTGGTGGGAAACTGCTATGCAAGCATGGAGTAATAGGTATAATTACAGCTGGTGGTGAGGGCCACGTTGCATTCATAGACCTAAGACATTTTCATTGTGCAGAGGAACAAGGCATTACTGATTACATACACATGCTGGGTGAGGCATTTGGAAATGGCTTTGTAGATAGTGTTAAAGAACAAGTCAATGCCATCAACCCAATAAATAACATAAGCAAGAAAATAATCAAATGGATGCTTAGAATAATTTCAGCTATGGTTATCATAATTAGGAATAGTTCAGACCCACAAACTATAATTGCTACCTTAACCTTGATAGGCTGTTCTGGATCACCATGGAGATTCCTAAAGGAAAAGTTTTGTAAATGGACACAACTAAATTATGTGCACAAAGAATCAGATTCTTGGCTTAAGAAATTCACAGAAATGTGTAATGCAGCAAGAGGTCTTGAATGGATAGGAAATAAAATATCTAAGTTTATAGATTGGATGAAGTCTATGTTACCGCAGGCACAACTTAAAGTTAAGTACTTAAGTGAATTGAAAAAACTCAATTTATTAGAAAAGCAGATTGACAATCTACGTTGTGCTGACACCAAAGTGCAGGAGAAGATAAAATTTGAAATAGATACACTTCATGATTTATCATGTAAATTCCTCCCATTATATGCTAGTGAAGCCAAGAGAATTAAGATATTGCATAACAAATGCTGTAACATAATTAAGCAGAAGAAGAGGAGTGAACCAGTTGCAATCATGATACATGGTCCACCTGGTACTGGAAAGTCTATTACAACCAGTTTCCTTGCTAGAATGATAACGAATGAAAGTGACATCTACTCCCTTCCACCTGATCCTAAATACTTTGATGGCTACGATCAACAGAGTGTTGTAATAATGGATGACATCATGCAAAATCCTGGTGGTGAGGACATGTCTTTGTTTTGTCAAATGGTCTCCAGTGTCACATTCATACCTCCAATGGCAGATTTGCCTGATAAAGGAAAACCCTTTGATTCAAGATTTGTGTTTTGTAGTACAAATCACTCACTTTTAGCCCCTCCCACAATCACATCTCTTTCTGCAATGAATAGAAGGTTCTATTTAGATTTAGATATTGTAGTTAATGAAAATTATAGAGATACACAAGGGAAATTAGATGTGCCAAAATCCTTTAAACCGTGTGACATAGATAATAAGATTGGAAATGCAAAATGTTGCCCTTTTATATGTGGAAAAGCAGTTGTGTTCAAAGATCGCAACACATGCCAAACATACACACTGAGCCAAATATACAATATGATTATTGAAGAAGACAAACGGCGCAGAAATGTAATTGATGTTATGACTGCAATATTCCAAGGTCCCATTTCAATGAACTCACCACCACCGCCTGCTATAACTGACTTATTGCAATCAGTGAGAACTCCAGAGGTAGTCAAATACTGTGAAGATAATAATTGGATAATTCCTGCAGAGTGTAAAATAGAGAGAGACTTAAATCTTGCTAATAACATAATAACAATAATTGCAAACATCATTAGTAT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41,993
FJ445149.1
rhinovirus A67
Palmenberg,A.C., Spiro,D., Kuzmickas,R., Wang,S., Djikeng,A., Rathe,J.A., Fraser-Liggett,C.M., Liggett,S.B., Overton,L., Tsitrin,T., Gallagher,T., Liu,J., Pushparaj,V., Tallon,L.J.
University of Maryland School of Medicine
USA
2009-02-13
null
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,135
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA32533
Human rhinovirus 67 strain ATCC VR-1177, complete genome
TTAAAACTGGATCTAGGTTGTTCCCACCTAGATCTCCCAAGTGGAGTGGTACACTATTATCACGGTAATTTTGTACGCCGGTTTTATCTCCCCTTACCCCAAGTAACTTAGAAGTATTACATAAAGACCAACAGGCAGTGATTATCCAGATCACTAAAGGTCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGTCAAAGTTGATATGCTCCAACAGGGCAAAAACAACTGAGATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGCAGAGCCTAGTAACTACCTTGAAATTACTTGGTTGGTCGTTCCACCAAACCCCATGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAAATTCCCCACTGGTAACAGTGTTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTTGGGTGTGAAGCCAAGTAATGGACAGGGTGTGAAGAGCCGAGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAACCCTGCAGCTAGAGCGCGCAAACCAGCGTGTATCTAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGACGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTTTTATTCTTATATTTGCTTATGGTGACAATATATAATTATTTGTATATTGGCACCATGGGCGCTCAAGTGTCTAGACAGAATGTTGGCACTCACTCTACACAAAATTCAGTTTCAAATGGATCTAGTTTAAATTATTTTAACATAAATTATTTCAAGGACGCCGCCTCGAGTGGCGCATCAAAACTTGAATTTTCACAGGATCCCAGCAAATTCACAGACCCAGTCAAAGATGTTCTTGAGAAGGGGATACCAACCTTGCAATCACCTACAGTTGAAGCATGTGGGTATTCTGATAGAATAATTCAGATTACAAGAGGGGATTCAACAATTACCTCCCAGGATGTTGCAAATGCTGTGGTTGGTTATGGAGTATGGCCTCATTACCTTACCCCCCAAGATGCAACTGCCATAGACAAACCCTCACACCCCGATACCTCTTCTAACAGATTCTACACTTTGGAAAGTAAGACATGGAGTGCTGATTCTAAAGGATGGTGGTGGAAGTTGCCTGATGCACTGAAAGACATGGGGGTGTTTGGACAAAACATGTATTACCACTTCCTCGGCAGAAGCGGGTACACAGTTCATGTGCAATGTAATTCAAGTAAATTTCATCAAGGAACACTAATAGTTGCCATGATACCAGAACATCAGCTAGCTGCAGCGGAGAGAGGGAATGTTACTGCTGGTTACAACTTCACCCACCCTGGTGAGACTGGTAGAGATGTTGGGAAAACTGAACGTGTGTATCAGAACAAACAACCTAGTGATGATAATTGGCTTAATTTTGATGGTACTCTTTTAGGAAACATAACCATCTTCCCACACCAATTTATTAACTTAAGAAGCAATAACTCAGCCACAATAATAGTACCATATGTAAATGCAGTGCCAATGGATTCTATGCTTAGGCATAATAACTGGAGCTTGGTAATCATACCAATTTGTCCCCTACAGGTTGAGGGAGCAGGTTCAAACATAATACCTATTACAGTTTCTATTAGTCCCATGTTTGCTGAGTTTTCTGGTGCACGAGCACGGAATCAAGGTTTACCAGTACTAACAACACCAGGTTCTGGTCAATTTATGACCACAGATGATTTCCAGTCGCCCAGTGCATTACCATGGTTTCATCCCACAAAGGAAATATCCATACCTGGCCAAGTTAGGAATTTAATTGAGATATGTCAAGTAGACACACTTATACCTATAAACAATACTGGGACAAACACTACAAGCATTAATATGTACACAGTGCAGTTACAGAGACAGGCTGAGCTTATGCAAGAAATTTTTGCCATCAATGTAGACATAGCCTCACATCCTTTAGCAACCACATTGTTAGGGGAAATTGCAAGTTACTATACACACTGGACAGGCAGTTTACGCTTTAGTTTCATGTTTTGTGGGTCAGCGAGCTCCACTTTGAAGCTTCTTCTTGCATACACTCCACCAGGGATCTCTAAACCTACAAGTAGAAAGGAAGCAATGTTAGGTACACATGTAGTTTGGGATGTAGGATTACAATCAACTATATCCATGATAGTACCATGGATTAGCGCTAGCCACTTTAGAAATACAACACCTGACAAATACTCATTAGCTGGATTCATTACATGTTGGTATCAAACCAATCTTGTGGTGCCTGCAAACACACCAACCACAGCCAATTTGCTTTGTTTTGTATCTGCATGCAAGGATTTCTGTCTGCGCATGGCTAGGGACACAAACCTTCATAAACAAACGGGGCCCATTACCCAAAACCCAGTAGAAGATTATGTAGATCAGGTATTGAATGAGGTCCTGGTGGTGCCAAATATAAAGCAAAGTGAACCCACGACTTCCAATTCAGCCCCAGCTCTAGATGCTGCTGAGACAGGTCACACTAGCAGTGTACAACCTGAAGATATGATCGAGACTCGTTATGTACAGGCATCAAATACCAGAGATGAAATGAGTCTCGAGAGCTTTCTTGGAAGGTCAGGCTGTATTCATATATCAAAATTGAATATTGATTATAATGCATATGATGAAAGTAGGGACAATTTCACAATTTGGAAAATAAATATAAAAGAAATGGCCCAGATTAGGAGGAAATTTGAACTATTCACATATACAAGATTTGATTCTGAGATAACACTGGTACCATGCATAGCTGCAGAGAGTGACAGCATTGGGCATGTTGTAATGCAATATATGTATGTACCTCCAGGAGCACCATTACCAACAAAAAGAGATGACTACACATGGCAATCAGGTACAAATGCATCCATCTTTTGGCAACATGGACAATCATACCCCAGATTCTCACTACCATTCTTAAGTATTGCCTCTGCTTATTACATGTTTTATGATGGCTATGATGGTGGACCAGATTCACTATATGGCACCATAGTAACTAATGATATGGGTTCCTTGTGTTCGCGTATAGTTACTGAAGAACATGGTTCTCGCGTAAAAATTGCAACGCGGGTGTATCATAAGGCTAAACATGTAAAAGCTTGGTGCCCAAGGCCCCCTAGAGCAGTTGAATACATACACACACATGTTACAAACTATAGACCAGAAACAGGTGAGGCTCAAACGGTTATACCTGTTAGAGCAGATGTTAGAACAATTAGAAATGTAGGTCCTAGTGATTTGTATGTGCATGTGGGAAATCTCATATACAGAAATCTGCATTTATTTAATTCAGAGGCCAATGATTCAGTGCTAATATCATACTCTTCAGACTTAGTCATATACCGCACAAACACTGTAGGCGATGACTATATACCAACATGTGATTGCACAGAAGCCACTTATTATTGTAGACACAAAAACAGATACTACCCAATTAGAGTCACTAGTCATGACTGGTACGAAATACAGGAGAGTGAGTACTATCCAAAACACATACAATACAATTTACTAATTGGAGAAGGACCTTGTGAACCCGGTGATTGTGGTGGAAAGCTGTTATGCAAACATGGAGTGATAGGTATAATTACAGCTGGTGGTGAGGGTCATGTTGCATTCATAGATCTAAGACACTTTCATTATGCAGAAGAACAAGGCATTACTGATTACATACACATGTTAGGTGAAGCATTTGGAAATGGTTTTGTAGATAGTGTCAAAGAACAAGTCAATGCCATTAACCCAATAAATAACATAAGTAAGAAAATAATTAAATGGATGCTTAGGATAATTTCAGCTATGGTTATCATAATTAGAAATAGTTCAGACCCACAAACTATAATTGCTACTTTAACCTTAATAGGCTGCTCTGGTTCACCTTGGAGATTCCTAAAGGAAAAATTTTGTAAATGGACACAATTAAATTATGTGCACAAGGAATCAGACTCTTGGCTTAAAAAATTCACAGAGATGTGCAATGCAGCAAGAGGTCTTGAATGGATAGGGAATAAAATATCTAAGTTTATAGATTGGATGAAGTCTATGCTACCACAAGCACAACTTAAAGTTAAGTATTTGAGTGAATTGAAGAAGCTTAATTTATTAGAAAAACAAATTGACAATCTGCGTTGTGCTGACACTAAAGTGCAAGAGAAAATAAAATTTGAAATAGATACACTTCATGATTTATCATGTAAATTCCTCCCATTATATGCTAGTGAAGCTAAGAGGATTAAAATATTGCATAATAAATGCTGCAATATAATTAAACAGAAAAAGAGAAGTGAACCAGTTGCAATCATGATACATGGCCCACCTGGCACTGGAAAGTCTATAACTACCAGTTTCCTTGCTAGAATGATAACAAATGAAAGTGATATTTACTCACTTCCACCAGATCCCAAATACTTTGATGGTTACGATCAACAGAGTGTTGTTATAATGGATGACATCATGCAAAACCCTGGTGGTGAGGATATGTCTTTGTTTTGTCAAATGGTCTCTAGTGTTACATTTATACCTCCAATGGCAGATTTACCGGATAAAGGAAAACCCTTTGATTCAAGGTTTGTATTTTGTAGCACTAATCACTCACTTTTAGCCCCTCCTACGATCACATCCCTTTCTGCAATGAATAGAAGGTTCTACTTAGATTTAGATATTGTAGTTAATGAGAATTATAGAGATACACAAGGGAAACTAAATGTGCCAAAGTCTTTCAAGCCATGTGACATAGATAACAAAATTGGAAATGCAAAATGTTGCCCCTTCATATGTGGAAAAGCAGTTGTGTTCAAAGATCGTAACACATGTCAGACATACACACTGTGCCAAATATACAATATGATTATTGAAGAAGACAAGCGGCGCAGAAATGTCATTGATGTCATGACTGCAATATTCCAAGGTCCCATATCAATGAACTTACCACCACCACCTGCCATAACTGATTTATTGCAGTCAGTAAGAACTCCAGAAGTAGTTAAATACTGTGAAGATAATAATTGGATAATTCCTGCAGAGTGTAAAATAGAGAGAGATTTA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103,717
LC699414.1
rhinovirus A78
Egawa,K., Kakizaki,M., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Takeda,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
Japan
2022-03-23
HRV_A78_Fukushima_H260_2018
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,180
GenBank
1
Japan: Fukushima
Japan
Homo sapiens
null
2018
SAMD00490724
PRJDB13572
Rhinovirus A78 HRV_A78_Fukushima_H260_2018 genomic RNA, complete genome
CATGGTTGTTCCCACCATGATTACCTACGGGTGTAGTACACTTGTATCCCGGTACATTTGTGCGCCAGTTTTATATCCCCTCCCCAATCGTAACTTAGAAGTTGGACATCACAAGATCAATAGGCGGTGGTTATCCAAACCATCAATGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTAGGTGTGAATATGCTTTAACCAAGGCAGAAGCTAATCCTATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGGGAAGCCTATTAACACCTTGGAAGAGATTTGGCTGGTCGCTCAGTTGCACAACCCCATGCAATAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACGAACCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTATTGGGTGTGAAGCCAGAGATTGGACAGGGTGCGAAGAGCCTACTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCTGCAGCTGTTGCACAAAAGCCATTGTGTATGCAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTGTTTTCTTTATTATTGCTTATGGTGACAAGTATATATAGATATATTTGTCATCATGGGCGCTCAAGTATCAAGGCAGAATGTTGGTACTCACTCAACACAAAACTCAGTTTCAAATGGTTCAAGCCTAAATTACTTTAACATCAATTATTTCAAGGATGCAGCCTCTTCAGGAGCATCTAGACTTGATTTTTCGCAAGACCCAAGTAAATTTACTGATCCAGTTAAAGATGTACTTACTAAGGGAATACCAACACTCCAGTCCCCATCAGTTGAGGCATGTGGATATTCTGATAGAATAATACAAATTACAAGAGGTGATTCTACCATAACATCCCAAGATATAGCCAATGCAGTTGTAGCATATGGTGTATGGCCCAGCTATCTTACTGCAAAGGATGCATCTGCAATTGACAAACCAACACAACCAGATACTTCATCTAATCGGTTCTACACTCTAGAGAGCAAAAATTGGCAAAGTGATTCAAAAGGATGGTGGTGGAAACTTCCAGATGCCTTGAAGGACATGGGCATTTTTGGTGAAAATATGTTTTATCATTTCTTAGGAAGATCAGGGTACACTGTTCATGTCCAGTGCAATGCCAGTAAATTTCATCAAGGAACACTATTAGTTGTTGCCATCCCAGAACATCAGCTTGCTTACATAGGTACTGGTAATGTCACAGTCGGGTACAAACACACACATCCTGGAGAGTCTGGTAGAATAATAGCAACTAATTCAGTTAATAACAATACAAGACAACCCAGTGATGATAACTGGCTAAATTGTAATGGTACTTTGATGGGGAATCTACCAATTTTCCCACATCAATTCATCAATCTGAGGAGCAACAATTCAGCAACACTTATACTACCATATATGAATGCAGTACCAATGGATTCCATGTTAAGGCATAATAACTGGAGTATAGTCATCATCCCAGTCTGTCCATTGCAAAGTGAGGCAGGTGCTACTGGGCTTGTACCAATCACAGTGTCTATCAGCCCAATGTTTGCCGAATTTTCTGGAGCAAGAAACGCAGTGGTTCAACAGGGTTTACCAGTGATGCTTACACCAGGATCAGAACAATTTTTAACTACAGATGACAATCAGTCTCCTTCAGCACTACCGTGGTTTCATCCCTCCAAGGAAATATTCATCCCAGGTAAGGTGACCAATTTGGCAGAAATATGCCAAGTAGACACTTTGATCCCAGTTAATAATGTGCAAGCTTCCAAAAATAATGTCAGTATGTACACCGTCATGCTATCAACCCAGACACAAACTGCTCAGGAGATATTCGCTATCCCAGTTGATATAGCCTCCCAGCCTCTTGCTACAACATTAATTGGTGAAATAGCTAGTTACTACACTCACTGGACTGGAAGCTTGAGATTCAGCTTTATGTTCTGTGGCACAGCAAACACAACATTGAAACTTCTTATAGCTTACACTCCACCAGGAGTTCCAAAGCCAGATACTAGAAAGAAGGCAATGCTAGGAACACATCTTGTATGGGATGTTGGCTTGCAATCAACAGTGTCTCTAGTTGTACCTTGGGTTAGTGCAAGTCATTTCAGATTTACCACCCCTGATACATACTCCAAAGCTGGGTATATAACATGCTGGTACCAAACCAACTTTGTGGTACCCCCAGGAACTCCTAACACCGCAAATATGCTATGTTTTGTTTCTGGTTGTAAGGATTTTTGTTTGCGAATGGCTAGGGATACAGATTTACATGTTCAAACAACTCCAATAACACAAAATCCAGTAGAAGAATATGTTGATCAGGTTTTAAATGAGGTCTTAGTTGTTCCAAATATAAAAGAAAGTAAACCCCAGTCTAGTAACTCTGCTCCAGTTTTGGATGCTGCAGAAACAGGTCATACTAACCAAGTGCAGCCTGAGGATACCATAGAAACCAGATATGTTATAACTGACCAAACAAGAGATGAAATGAGCATTGAAAGCTTCCTTGGAAGATCAGGTTGTGTAACGATCATGAGACTAGAACTAGACCACACTGATTATAACGCTGAAGGGAAAAATTTCACAACATGGAAAATCAACCTGCAGGAGATGGCCCAGATCAGAAGGAAGAATGAACTATTCACATATCTCAGATTCGATTCAGAGATTACTCTTGTGTGTGCAGTAGCCTCACAAGGAGATAATAATGGACATGTGGTACTACAATTCATGTTTGTTCCACCTGGAGCCCCTATACCAAAGAAGAGAGATGATTATACTTGGCAGTCGGGCACTAATGCATCTGTGTTTTGGCAGCAAGGTCAAACATACCCCAGGTTTTCTATACCGTTTTCTAGTATTGCCTCAGCTTATTATATGTTTTATGATGGATATTCAGATGATAGCACATCCTCACCATATGGCACTGTAGTTACTAATGACATGGGCACACTGTGCATGAGAATGGTTACAGATCAGCAACAGCATAAGGTTACAATCACAGCTAGAGTCTACCACAAGGCAAAACATATCAGTGCATGGGGCCCAAGACCCCCCAGAGCGGTACCTTATCAGCACATATATAACCCTAATTATAAAACTGAAGAAGGGACTCCAGACACCAAAGTGGCAATTAGAGCTAACATTAAAACTGTTGGGCCCTCAGATTTATATGTACATGTTGGAAATTTAATATATAGAAACTTACACTTATGTACTAATGAAAATCTTAGTGACTCAACACTCATATGTTACTCATCAGATTTAGTCATATACCGTACAAACGCCAGAGGTAATGACTACATTCCAACATGTGATTGTACACAGTGCACTTATTACTGCAAGAGTAAAGATAGATACTACCCAATAACAGTTAGAAAGCATGATTGGTATGAAATTCAAGAATCAGAATATTACCCAAAACATATCCAGTATAATATATTGATAGGTGAGGGACCATGCGAACCAGGAGACTGTGGTGGAAAACTGTTATGTAAGCATGGTGTCATTGGCATTGTGACAGCTGGTGGAGAAGGACACGTTGCCTTTATAGACATTAGAGATTTCCAATGTGCTGAGGAACAAGGAATATCAGATTACATGCAGTACTTAGGTGAGGCTTTTGGAACTGGATTTGTAGACAGTGTAAAAGAGCATATACAAAATATAAACCCAATTAATAAGATCAATTCCAAAATGGTTAAGTGGTTACTCAGAATCATCTCAGCAATGGTTATAATCATCAGAAACAACGCCGATCCTCAGACCATAATTGCAACTCTTACTCTTCTTGGATGCAGTGGATCACCATGGAGGTTTCTTAAAAACAAATTTTGTAATTGGTTTGGCTTAACTTATGTACACAAAGAATCAGATTCATGGCTGAAGAAATTTACAGAGATGTGTAATGCTGCACGCGGCCTTGAATGGATAGGAAACAAAATTTCAAAATTCATTGATTGGATCAAGTCTATGCTACCCCAAGCAAAGCTAAAAGTGACATATATACAATCTCTTAAACAGTTACCACTGTTGGAAAAAAGTGTTGATGGACTAAGACTTGCTAATCCAGAAAAACAATACTTGTTTTTGAAGCAAATTGAAGAGATGAAAGACCTTTCCAATAAATTTCTACCACTTTATGCAAATGAGGCAAAAAGAATTAAAGCCCTTGCCCACAAAGCATCCAATATAGTCAAGAATGCAAAAAGAGTTGAGCCTGTTGCAGTTATGTTCCACGGAAATCCAGGAACGGGTAAATCTTTGGCAACAAATTTCCTTGGCAGAATGATTACTAGTGAGACAGACATATACTCATTACCACCAGATCCAAAACACTTTGATGGCTATGATCAACAAACGGTAGTAATAATGGATGATGTTATGCAGAACCCTGATGGAGAAGATATGTCCCTATTCTGCCAAATGGTATCCTCAGTGCCATTTATCCCACCCATGGCAGACCTTCCTGACAAAGGTAAGCCCTTTTCGTCCAGATATGTTTTATGTTCTACAAACCATAATATACTAACACCCCCAACAATATCCTCTTTACCTGCCATGAATAGAAGATTCTTTCTGGATCTGGACATTGAAGTCAGTGAGAATTATAAAGATGCAAATGGTAGAATTCAGTTAGATTGTGCACTCAAACCATGTAATGATAATATTAAGATTGGGAATGCCAAATGCTGTCCATTTGTATGTGGTAAAGCAATAACATTTAGAGATAGGAATAGTTGTGAAAAGTATACTCTAGCTCAGATCTATCACAAAATCTTGGAGGAAGATAAAAGGAGACAATGCCTTTCTAATGCTTTAGAAGCAGTTTTTCAAGGTCCAATAACACTAAATGGGCCACCTCCACCAGCTATATTAGACTTGCTCAAGTCAGTTCGCACACCAGAGGTCATCAAATATTGTGAAGATAATAAATGGATTGTGCCAGCTGAAAATACCATCGAACGAGACTTGA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32,233
OL638448.1
rhinovirus A78
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
PN6LLL
Rhinovirus A
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,094
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN23213190
PRJNA723895
Rhinovirus A78 strain RvA78/USA/2021/PN6LLL, complete genome
GTGTAGTACACTTGTATCCCGGTACATTTGTGCGCCAGTTTTATATCCCCTCCCCAATCGTAACTTAGAAGCTGAACAACACAAGATCAATAGGCGGTGGTTATCCAAACCATCAATGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTAGGTGTGAATATGCTTTAACCAAGGCAGAAGCTGATCCTATCGTTATCCGCAAGGTGCCTACGGGAAGCCTATTAACACTTTGAAAGAGATTTGGCTGGTCGCTCAGTTGCACAACCCCATGCAATAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACAAACCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTATTGGGTGTGAAGCCAGAGATTGGACAGGGTGCGAAGAGCCTACTGTGCTCACCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCTGCAGCTGTTGCACAAAAGCCATTGTGTATGCAGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTGTTTTCTTTATTATTGCTTATGGTGACAAGTATATATAGATATATTTGTCATCATGGGCGCTCAGGTATCAAGGCAGAATGTTGGTACTCACTCAACACAAAACTCAGTTTCAAATGGTTCAAGTCTAAATTACTTTAACATTAATTATTTCAAAGATGCAGCCTCTTCAGGAGCATCTAGACTTGATTTTTCACAAGACCCGAGCAAGTTCACTGATCCAGTCAAAGATGTACTTACTAAGGGAATACCAACACTTCAGTCCCCATCAGTTGAGGCATGTGGATATTCTGATAGAATAATACAAATTACAAGAGGTGATTCCACCATAACATCCCAGGATATAGCTAATGCAGTTGTAGCATATGGCGTGTGGCCCAGCTATCTTACTGCAAAAGATGCATCTGCAATTGACAAACCAACACAACCAGATACTTCATCCAATCGGTTCTACACTCTAGAGAGCAAAAATTGGCAAAGTGATTCAAAAGGATGGTGGTGGAAACTTCCAGATGCCTTGAAGGACATGGGCATTTTTGGCGAAAATATGTTTTATCATTTCCTAGGAAGATCAGGGTACACTGTTCATGTCCAGTGCAATGCCAGTAAATTTCATCAAGGAACACTATTAGTTGTTGCCATCCCAGAACATCAGCTTGCTTACATAGGTACTGGTAATGTCACAGTTGGGTATAAACATACACATCCTGGAGAATCTGGTAGAATAATAGCAACTAATTCAGTTAATAACAATACAAGACAACCCAGTGATGATAATTGGCTAAATTGTAATGGTACCTTGATGGGGAACCTACCAATTTTCCCACATCAATTCATTAATCTAAGAAGCAACAATTCAGCAACACTTATATTACCATATATGAATGCAGTACCAATGGATTCCATGTTAAGGCACAACAACTGGAGCATAGTCATCATCCCAGTTTGTCCATTGCAAAGCGAGACAGGTGCCACTGGACTTGTACCAATCACAGTGTCTATCAGCCCAATGTTTGCTGAATTTTCTGGAGCAAGAAACGCAGTGGTTCAACAGGGTTTACCAGTGATGCTTACGCCAGGGTCAGAACAATTTTTAACCACAGATGACAATCAGTCTCCTTCAGCACTACCGTGGTTTCATCCCTCTAAGGAAATATTCATCCCAGGTAAGGTGACCAATTTGGCAGAAATATGCCAAGTGGACACTTTAATCCCAGTTAATAATGTGCAAGCTTCCAAAAATAACGTCAGTATGTACACTGTTATGCTATCAACTCAGACACAAACTGCTCAGGAAATATTTGCTATCCCAGTTGATATAGCTTCCCAGCCTCTTGCTACAACATTAATTGGTGAGATAGCTAGTTACTACACCCACTGGACTGGAAGTTTAAGGTTCAGCTTTATGTTCTGTGGCACAGCAAACACAACATTAAAACTTCTTATAGCTTACACTCCACCAGGAGTTCCAAAACCAGATACTAGAAAGAAAGCAATGCTAGGAACACACCTTGTATGGGATGTTGGCTTGCAATCAACAGTGTCTCTAGTTGTACCTTGGGTCAGTGCAAGTCATTTCAGATTCACCACTCCTGATACATACTCCAAAGCTGGGTATATAACATGCTGGTACCAGACCAACTTTGTGGTACCCCCAGGAACTCCTAACACTGCAAATATGCTGTGTTTTGTTTCTGGTTGTAAGGATTTCTGTTTGCGAATGGCTAGAGATACAGATCTACATGTTCAAACAACTCCAATAACACAAAATCCAGTAGAAGAATATGTCGATCAGGTTTTGAATGAGGTTTTAGTTGTTCCAAATATAAAAGAAAGTAAACCCCAGTCTAGCAACTCTGCTCCAGTCTTGGATGCTGCAGAAACAGGTCACACTAATCAAGTGCAGCCTGAAGACACCATAGAAACCAGGTATGTCATAACTGACCAAACAAGAGATGAGATGAGCATCGAAAGCTTTCTTGGGAGATCAGGTTGTGTAACAATTATGAGATTAGAACTAGACCACACTGATTACAACGCTGAAGGGAAAAATTTTACAACATGGAAAATTAACCTGCAGGAAATGGCCCAGATCAGAAGGAAGAATGAATTATTCACATATCTCAGATTTGATTCAGAGATCACTCTTGTGTGTGCTGTAGCCTCGCAAGGGGACAATAATGGACATGTGGTGCTTCAATTCATGTTTGTTCCACCTGGAGCTCCTATACCAAAGAAGAGAGATGATTATACCTGGCAATCGGGTACTAATGCATCTGTGTTTTGGCAGCAAGGTCAAACATACCCTAGGTTCTCTATACCGTTCTCTAGTATTGCCTCAGCTTATTATATGTTTTATGATGGATATTCAGATGACAGCACATCCTCACCATATGGCACCGTAGTTACTAATGACATGGGCACACTGTGCATGAGAATGGTTACAGATCAGCAACAGCATAAGGTTACAATTACAGCTAGAGTCTATCACAAGGCCAAACATATTAGTGCATGGGGCCCAAGACCTCCCAGAGCAGTACCTTATCAGCACATATATAACCCTAATTACAAAACTGAAGAAGGAACTCCAGACACCAAAGTGGCAATCAGAGCTAACATTAAAACTGTTGGACCCTCAGACTTGTACGTGCATGTTGGAAATTTAATATATAGAAACTTGCACTTATGTACTAATGAAAATCTTAGTGATTCAACACTCATATGCTACTCATCAGATTTAGTCATATACCGTACAAACGTCAAAGGTAATGACTACATTCCAACATGTGATTGTACACAGTGCACCTACTACTGTAAGAGTAAAGACAGATACTACCCAGTAACAGTTAGAAAGCATGATTGGTATGAAATTCAAGAATCAGAATACTACCCAAAACATATCCAGTATAATATTTTGATAGGTGAGGGACCATGTGAACCAGGAGACTGTGGTGGAAAATTGTTGTGCAAGCATGGTGTTATTGGCATTGTAACAGCTGGAGGAGAAGGACATGTTGCCTTTATAGATATTAGAGATTTTCAATGTGCTGAGGAACAAGGAATATCAGATTACATGCAGTACTTAGGTGAGGCTTTTGGAACTGGATTTGTAGATAGTGTGAAAGAGCATATACAAAACATAAACCCAATTAATAAGATCAATTCCAAAATGGTTAAGTGGTTACTTAGAATTATCTCAGCAATGGTTATAATCATCAGAAACAATGCCGATCCCCAGACTATAATTGCAACCCTTACTCTTCTTGGATGTAGTGGATCACCGTGGAGGTTTCTTAAGAACAAGTTTTGTAATTGGTTTGGCTTGACTTACATACACAAAGAATCAGATTCATGGCTGAAGAAATTCACGGAGATGTGTAATGCTGCACGCGGCCTTGAATGGATAGGAAATAAAATCTCAAAATTCATTGATTGGATCAAGTCTATGCTACCCCAAGCAAAGTTAAAAGTGACATATATACAATCTCTTAAACAGTTACCACTGCTGGAAAAAAGTGTTGATGGACTAAGACTTGCCAATCCAGAAAAACAATATTTGTTTTTAAAGCAAATCGAAGAGATGAAAGACCTTTCCAATAAATTTCTACCACTTTATGCAAATGAGGCAAAAAGAATTAAAGCCCTTGCTCACAAAGCATCCAATATAGTTAAGAATGCAAAAAGAGTTGAGCCTGTTGCAGTTATGTTCCATGGAAATCCAGGAACGGGTAAATCTTTAGCAACAAACTTCCTTGGCAGGATGATCACTAGCGAAACGGACATATATTCATTACCACCAGATCCAAAACACTTTGATGGCTATGATCAACAAACGGTGGTAATAATGGATGATGTTATGCAGAACCCTGATGGAGAAGATATGTCCCTATTTTGTCAAATGGTGTCTTCAGTACCATTTATACCACCCATGGCAGATCTTCCTGACAAAGGTAAGCCCTTCTCATCTAGATATGTTTTATGTTCCACAAACCATAATATACTGACACCCCCAACAATATCCTCTTTACCTGCTATGAATAGAAGATTCTTTTTGGATCTGGACATTGAAGTTAGTGAAAATTATAAAGATTCAAATGGTAGAATTCAGTTAGATTGTGCACTCAAACCATGTAATGACAATATTAAGATTGGGAATGCCAAATGCTGTCCATTTGTATGTGGCAAGGCAATAACATTTAGAGATAGGAATAGTTGTGAAAAGTACACCCTAGCCCAGATTTATCACAAAATCTTGGAAGAAGATAAAAGAAGACAATGCCTTTCCAATGCTTTAGAAGCAGTCTTTCAAGGTCCAATAACACTAAATGGACCACCTCCACCAGCTATATTAGATTTGCTCAGGTCGGTTCGCACACCAGAGGTCATCAAATATTGTGAAGATAATAAATGGATTGTGCCAGCTGAAAATACTATCGAACGAGACTTGAACGTGGCAAATTCAGTAATAACCATAATTG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34,080