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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-07-14
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Rhinovirus C
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Picornaviridae
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GenBank
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USA
USA
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2021-05-14
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Rhinovirus C20 strain RvC20/USA/2021/S253U4, complete genome
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2021-07-14
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2021-05-14
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PRJNA1066815
Rhinovirus C20 strain RvC20/USA/2021/WTLVJQ, complete genome
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MZ460712.1
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-07-14
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Rhinovirus C
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Picornaviridae
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GenBank
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USA
USA
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2021
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Rhinovirus C20 strain RvC20/USA/2021/WYEV2L, complete genome
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40,596
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-06-15
S5ZVP8
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Picornaviridae
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2021-04-07
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PRJNA1066815
Rhinovirus C20 strain RvC20/USA/2021/S5ZVP8, complete genome
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41,401
MZ268674.1
rhinovirus C20
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
WUS4L7
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,087
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN19131201
PRJNA723895
Rhinovirus C20 strain RvC20/USA/2021/WUS4L7, complete genome
GTGGTACACCGTGATTCCGGTCACCTTGTACGCCTGTTTGCTACCCCACCCCAACTTTCTTTCATTCTTCACTTCCAGTAACTTAGAAGTTGACACAGAGTCCAATAGGATGCAGCTAATCCAAGTCTGCTACGGACAAGCACTTCTGTTTCCCCGGGTGTGTGAATAGACTCCAACAGGGTTGAAGCTGTAGCACTCGTTATCCGCACAACTACTACGCGAATGTTAGTAACACTCTCTAAGTATAGTGGGATTTCGCTCCGCAGAAACCCCATCTGTAGATTAGGGCAATGAGGCTACACAGACCCCACTGGCGACAGTGGTGTAGCCTGCGTGGTGCCCTACCTGGGGTTTCATACCCCAGGATTCCACTTTACTGACAGGGTGTGAAGGCGCTAGTGTGCTAGTTGTGAGTCCTCCGGTCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTGGCCATTTCATGTAAACCAACATGCAAGTGGTCGTAACGAGTAATCACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTAACCGTGTTTCCTGTTTTACTTAATGTGTGTGTCTTATGGTTACAATTATAGAGTAACCATGGGTGCACAAGTGAGCAAACAAAATGTTGGATCTCACGAAAGTGGAATTTCAGCTTCGTCAGGTTCAGTGATTAAGTATTTTAATATCAATTACTATAAAGACTCAGCAAGCAGTGGATTGAGCAAACAGGACTTCTCAATGGATCCAGAAAAATTTACCAAGCCTATTGCAGAGACATTGACCAATCCAGCACTTATGAGCCCTAGCATTGAAGCTTGTGGGTTTTCTGATAGGCTTAAACAGATTACTATCGGTAACTCCACTATCACCACCCAGGATGCACTCAATACAGTGGTAGCTTACGGAGAATGGCCACAGTATTTGAGTGACATGGACGCCAGTGCAATTGACAAACCAACCCACCCAGAAACCTCAACAGACCGATTTTACACGCTAACCAGTGTGATATGGGATACAACCTCAAAAGGATGGTGGTGGAAAATTCCTGATTGCCTCAAGGAGATGGGTATGTTTGGACAGAACATGTACCACCATGCTCTGGGTCGTTCAGGGTTCATAATACATGTGCAGTGTAATGCCACCAAATTCCACAGTGGATTGTTAATAGTAGCAGTGGTACCAGAACACCAACTAGCATATATAGGTGGTACCAATGTGAGTGTTGGATACAATCACACCCACCCAGGAGAAAATGGTCACACGATTGGCCTTAATGACCAACGAGGTGATAGACAACCAGATGAGGATCCCTTTTTCAACTGCAATGGCACGCTCTTGGGAAATTTGACTATATTTCCACATCAGCTGATTAACCTAAGAACCAACAATTCAGCAACTATTGTGGTACCTTACATCAATTGTGTTCCAATGGATAGTATGCTTAGGCACAATAACCTATCACTTGTCATCATCCCAATGGTTGACTTGCGGTTTGGAACGACCGGAGTTACTACCCTACCCATAACAATTTCAATTGCACCAGTCAAATCAGAATTTTCTGGTGCTCGCCAGAGTAGGACTCAAGGTTTACCTGTCAGATTGGCAAGTGGCACTCAACAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAATCGGCAAACCTGTTACCAGGATTCCATCCTACGCCAGTTATGCACATACCAGGTGAAATCACAAACCTCATGCATATGGCTCGGGTAGACTCATTCATGCCAATAAACAACATCCCAGGCCACATAAACAAGGTACCAATATATAATGTACCCATTCTGAAAAAGTCTAGTGGAGCTCAATCAGACCTTATCTTAACCATACCCCTAAAGATGGATGATACACTATTCTCTACCACTCTTCTTGGTGAAGTACTAAGTTACTTTTCAAACTGGTCAGGTAGCATAACACTCAGTTTTATGTGTGTGTGTGACAGCTTTAGCACAGGTAAGTTTCTCATAGCATATACTCCCCCAGGAGGAGGCCACCCAAATAACAGAAAAGAAGCCATGCTTGGTGTGCATGTCATATGGGATTTGGGATTGCAGTCAACATGTACAATGGTGGTCCCATGGATCTCACAGGGTTACTATCGGCGTACCAAAGCAGATAAGTACACAGAAGCTGGATTTGTGACCCTGTGGTATCAAACTGATTTTGTAGCTGGCTCTACAACTGGTCAGGGTGCAATATTGGTCACCTGTTCAGCATGTCCAGACATGGCCGTGAGAATGATGCGTGATACGCCAATGATGTCACAAACCTTAGACATTGCACAGAACCCAGTGGAGGACTTCATAGACAACACTTTAGAACAGGTTCTTGTTGTTCCAGACACCAAGCCCAGCGGACCAATGCACACAACAAAGCCCACCGCATTGTCTGCAATGGAAATAGGAGCTTCAACCAGCACAACACCAGAAACCATGCTGGAAACTAGGTACGTCATCAACTCCAAAACAAATGACGAAGCTTTAATAGAGAACTTCCTGGGCAGATCAGCATTGTGGGCGACTGTGACAATGGACAATGGTTTTAAAACCTGGAAGATAAATTATCAGGAAAATGCACACATTCGGAAGAAGTTAGAAATGTTTACATATGTCCGATTTGATCTGGAAATAACCATTGTCACTCACAACACCGGCTTAATGCAAGTGATGTACACGCCACCTGGAATTTCAGCCCCAACAAATGCTGATGGTAAGGAGTGGGACACAGCATCAAACCCCAGTGTTTTCTATCAACCCAAATCTGGATTTCCACGTTTCACCATCCCGTTCACAGGATTAGGATCAGCATACTACATGTTCTACGACGGGTATGATCACTCAGGTGATGGATACACCTATGGTATTACCACTACCAATGACATGGGCACACTTTGTTTCAGGGCACTAGATGACAAACAGAGAAATGATGTAAAAATTTTTGCTAAACCCAAACATACACGAGCATGGATTCCAAGACCACCTAGAGCAACAGAGTACACACACATGTATAGTACTAATTACAACAAGAAGAAAGTTCCAACAGACCCCAACAATCATGAGTTAACCAAAGTACACTTTTTGAAACCCAGAACTGAGATTAAAACAACAGGTCCCAGTGACATGTATGTCCACACACGGGATGCCATCTACAAAAATGCACATTTGGCTGAAGCCAATGATAACACCATACTTATCGCTCTTACTGCTGACTTACAAGTTGATGTTGCTGACACGCCTGGAAAGGATGTGATACCTGACTGTAATTGCACCAGTGGTACCTATTATTGCAAAAGTAGAGATCGTTACTATCCTGTTGATGTTGTCACACATGATTGGTACCCTATTGAGGAAAGTCAATACTATCCTAAGCACATCCAGTACAACATCTTGTTAGGTGAGGGACCATGTGAACCAGGCGATTGTGGTGGGAAATTACTCTGCAAGCATGGTGTTATTGGAATAGTTACAGCAGGTGGAGAGGGACATGTGGCATTTACAGATTTGAGACCATATAACAACCTTGCAAAAACACAAGGCCCCATCAGTCAATATGTAACACAACTAGGCAATGCATTTGGAGAAGGCTTCACTCAGACACTAGAAACTAACCTAAAGGAGACCTGCTCAGGCATTTTTGATAAAATAACATCAAAAACTGTCAAATGGATTATTCGCATAATCAGTGCACTGACAATTGTAATCAGAAATAATTCAGACACACCAACCATCATGGCCACTATGGCCTTGCTGGGTTGTAGTGGTTCACCATGGAACTATCTGAAGACAAAACTCTGTGCATGGTTAGGAGTCAACAAGCCACCATCAAAGCAAGGAGATAGTTGGATTAAGAAATTTACAGAATGGTGCAATGCTGCTAAAGGCTTGGAATGGATTGGTTACAAAATCAGTAAATTCATTGACTGGCTCAAGGAAAAACTTCTGCCAACTGTCCAACGGAAAAAAGAGACTTTAACCGAATGCAGGAAATTGACACTGTATGAAGATCAAGTAAAAGCTTATCCTCACTCTTCAGAACAATTTCAGAACGAGCTCACCACCAAGTTGCAGGTTCTTAAGAAGAATTTAGATGATCTGAGCCCGCTCTATGCATGTGAAAACAAGAGAGTGGCCAATATGCTCAAAGACATCAAGGCAATGGCAGCCTACAAAAAGTCCCATCGCACTGAACCAGTGTGCATTTTAATCCGAGGAGGCCCAGGGTGTGGAAAATCTTTAGCAACTACAGTGATAGCTAGAGGGCTAACTGATAGTGGAAACATATATTCTCTACCCCCAAATCCTAAACACTTTGATGGTTACTGTAAACAAGACGTGGTAATAATGGATGATTTAGGTCAAAACCCAGATGGTCAAGATTTAGCCATGTTTTGTCAAATGGTGTCCACAACAGATTTTGTAGTGCCTATGGCAGCTATAGAGGATAAAGGCAAGAGTTTTACAAGTGATTATGTATTGGCTAGTACCAATATAGCACATTTGACTCCCCCAACCGTTACTATTCCCGAAGCTCTTACACGTAGATTCTTCTTGGATACAGATTTAAAAATCATGTCAAATTACAAGAACCAACATGGGTTGTTAGATACTGCCAAGGCACTGCAAGCATGTTCTGATTGTGATAAGCCCCCATATTATAAACAGTGCTGTCCATTATTATGTGGCAAAGCAATAGTTCTGCAAAATCGGAGAACCTCTGCAAGCCTATCCATCAACATGGTGGTAGCACAGTTGAGAGAGGAAAGTAGTGCCAGAAAGAAAATACACACCAATCTGAATGCAATCTTCCAAGGCTTAGGATCAGATGATACTCCAGGCTTTATAGTAGATCTATTATCAGCATCTAAAGACCCCAGGGTGATACAGTATTGTGAAAAGGAAGGATTGATCACTAAATCCCCCCACTCAGTTGAAAGGAGTTTAGAATACGTACAATATTGTCTAAATTGTTTAGGAAGCTTGGTCATAATTCTTGGTACCAT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41,404
MZ268683.1
rhinovirus C20
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
469636
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,091
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
null
null
Rhinovirus C20 isolate 469636, complete genome
ACTGTGCGTAGTACACTGTGATTCCGGTCACCTTGTACGCCTGTTTGCTACCCCACCCCAACTTTCTTTCATTCTTCACTTCCAGTAACTTAGAAGTTGACACAGAGTCCAACAGGATGCAGCTAATCCAAGTCTGCTACGGACAAGCACTTCTGTTTCCCCGGGTGTGTGAATAGACTCCAACAGGGTTGAAGCTGTAGCACTCGTTATCCGCACAACTACTACGCGAATGTTAGTAACACTCTCTAAGTATAGTGGGATTTCGCTCCGCAGAAACCCCATCTGTAGATTAGGGCAATGAGGCTACACAGACCCCACTGGCGACAGTGGTGTAGCCTGCGTGGTGCCCTACCTGGGGTTTCATACCCCAGGATTCCACTTTACTGACAGGGTGTGAAGGCGCTAGTGTGCTAGTTGTGAGTCCTCCGGTCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTGGCCATTTCATGTAAACCAACATGCAGGTGGTCGTAACGAGTAATCACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTAACCGTGTTTCCTGTTTTACTTAATGTGTGTGTCTTATGGTTACAATTATAGAGTAACCATGGGTGCACAAGTGAGTAAACAAAATGTTGGATCTCACGAAAGTGGAATTTCAGCTTCGTCAGGTTCAGTGATCAAGTATTTTAATATCAATTACTATAAAGACTCAGCAAGCAGTGGATTGAGCAAACAGGACTTCTCAATGGATCCAGAAAAATTTACCAAGCCTATTGCAGAGGCACTGACCAATCCAGCACTTATGAGCCCTAGCATTGAAGCTTGTGGGTTTTCTGATAGGCTTAAACAGATTACTATCGGTAACTCCACTATCACCACCCAGGATGCACTCAATACAGTGGTAGCTTACGGAGAGTGGCCACAGTATTTGAGTGACATGGACGCTAGTGCAATTGACAAACCAACCCACCCAGAAACCTCAACAGACCGATTTTACACGCTAACCAGTGTGATATGGGATGCAACTTCAAAAGGATGGTGGTGGAAAATTCCTGATTGCCTCAAGGAGATGGGTATGTTTGGACAGAACATGTACCACCATGCTCTGGGTCGTTCGGGGTTCATAATACATGTGCAGTGTAATGCCACCAAATTTCACAGTGGATTGTTAATAGTAGCAGTGGTACCAGAACACCAACTAGCATACATAGGTGGTACCAATGTGAGTGTTGGATATAATCACACCCACCCAGGAGAAAATGGTCACACGATTGGCCTTAATGACCAACGAGGTGATAGACAACCAGATGAGGATCCCTTTTTCAACTGCAATGGCACGCTCTTGGGAAATTTAACTATATTCCCACATCAACTGATTAACCTAAGAACCAACAATTCAGCAACCATTGTGGTACCTTACATCAATTGTGTTCCAATGGATAGTATGCTTAGGCACAATAACCTATCACTTGTCATCATCCCAATGGTTGACTTGCGGTTTGGAACGACCGGAGTTACTACCCTACCCATAACAATTTCAATTGCACCAGTCAAATCAGAATTTTCTGGTGCTCGCCAGAGTAGGACTCAAGGTTTACCTGTCAGATTAGCAAGTGGCACTCAACAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAATCGGCAAACTTGTTACCAGGATTTCATCCCACACCAGTTATGCACATACCAGGTGAGATCACAAACCTCATGCATATGGCACGGGTAGACTCATTCATGCCAATAAACAATATCCCAGGCCATATAAACAAAGTACCAATATATAATGTACCCATTCTGAAAAAGTCTAGTGGGGCTCAATCAGACCTTATCTTAACCATACCCCTAAAGATGGATGATACACTATTCTCTACCACTCTTCTTGGTGAAGTACTAAGTTACTTTTCAAACTGGTCAGGTAGTATAACACTCAGTTTTATGTGCGTGTGTGACAGCTTTAGCACAGGCAAGTTTCTCATAGCATATACTCCCCCAGGAGGAGGCCACCCAAGTAACAGAAAAGAAGCCATGCTTGGTGTGCATGTTATATGGGATTTGGGATTACAGTCAACATGTACAATGGTGGTCCCATGGATCTCACAGGGTTACTACCGGCGCACCAAAGCAGATAAGTACACAGAGGCTGGATTTGTGACCCTGTGGTACCAAACTGATTTTGTAGCTGGCTCTACAACTGGTCAGGGTGCAATATTGGTTACCTGTTCAGCATGTCCAGACATGGCTGTGAGAATGATGCGTGATACGCCAATGATGTCACAAACCTTGGACATTGCACAGAACCCAGTGGAGGACTTCATAGACAACACTTTAGAACAGGTCCTTGTTGTTCCAGACACCAAGCCCAGCGGACCAATGCACACAACAAAGCCCACCGCGTTGTCTGCAATGGAAATAGGAGCTTCAACCAGCACAACACCAGAAACCATGCTGGAAACTAGGTATGTCATCAACTCCAAAACAAATGATGAAGCTTTAATAGAAAACTTCCTGGGCAGATCAGCATTGTGGGCGACTGTGACAATGGACAATGGTTTCAAAACCTGGAAGATAAATTATCAGGAAAATGCACACATTCGGAAGAAGTTAGAAATGTTTACATATGTCCGATTTGATCTGGAAATAACTATTGTCACTCACAACACCGGTTTAATGCAAGTGATGTACACGCCACCTGGAATTTCAGCCCCAACAAATGCTGATGGTAAGGAATGGGACACAGCATCAAACCCCAGTGTTTTCTATCAACCCAAATCTGGTTTTCCACGTTTCACCATCCCGTTCACTGGATTAGGATCAGCATACTACATGTTCTATGACGGGTATGATCACTCAGGTGATGGATATACCTATGGTATTACCACTACCAATGACATGGGTACACTTTGTTTCAGGGCACTAGATGACAAACAGAGAAATGATGTAAAAATTTTTGCCAAACCCAAACACACACGAGCGTGGATTCCAAGACCACCTAGAGCAACAGAGTACACACACATGTATAGTACTAATTACAACAAGAAGAAAGTTCCAACAGACCCTAACAATCATGAGTTAACCAAAGTACACTTCTTGAAACCCAGAACTGAGATTAAAACAACAGGTCCCAGTGACATGTATGTCCACACACGGGATGCCATCTACAAAAATGCACATTTGGCTGAAGCCAATGATAATACCATACTTATTGCTCTTACTGCTGATTTACAAGTTGATGTTGCTGACACGCCTGGAAAGGATGTGATACCTGACTGTAATTGCACCAGTGGTACCTATTATTGCAAAAGTAGAGATCGTTACTATCCTGTTGATGTTGTCACACATGATTGGTACCCTATTGAGGAAAGTCAATACTATCCTAAGCACATCCAGTATAACATCTTGTTAGGTGAGGGACCATGTGAACCAGGCGATTGTGGTGGGAAATTACTCTGCAAGCATGGTGTTATTGGAATAGTTACAGCAGGTGGAGAGGGACATGTGGCATTTACAGATTTGAGACCATATAACAACCTTGCAAAAACACAAGGCCCCATCAGTCAATATGTGACACAACTAGGCAATGCATTTGGAGAAGGTTTCACTCAGACATTGGAAACTAACCTAAAGGAGACCTGCTCAGGCATTTTTGATAAAATAACATCAAAAACTGTCAAATGGATTATTCGCATAATTAGTGCATTGACAATTGTAATCAGAAATAATTCAGACACACCAACCATCATGGCCACTATGGCCTTGCTGGGTTGTAGTGGTTCACCATGGAACTATCTGAAGACAAAACTCTGTGCATGGTTAGGAGTCAACAAGCCACCATCAAAGCAAGGAGATAGTTGGATTAAGAAATTTACAGAATGGTGCAATGCTGCTAAAGGCTTGGAATGGATTGGCTACAAAATCAGTAAATTCATTGACTGGCTCAAAGAAAAGCTTTTGCCAACTGTCCAACGGAAAAAAGAGACTTTAACCGAATGCAGGAAACTGACACTGTATGAAGATCAAGTAAAAGCTTATCCTCACTCTTCAGAACAATTTCAGAACGAGCTCACCACCAAGTTGCAGGTTCTTAAAAAGAATTTAGATGATCTGAGCCCGCTCTATGCATGTGAAAACAAGAGAGTGGCCAATATGCTCAAAGATATCAAGGCAATGGCGGCCTATAAAAAGTCCCATCGCACTGAACCAGTGTGCATTTTAATCCGAGGAGGCCCAGGGTGTGGAAAATCTTTAGCAACTACAGTGATAGCTAGAGGGCTAACTGATAGTGGAAACATATATTCTCTACCCCCAAATCCTAAACACTTTGATGGTTACTGCAAACAAGATGTAGTGATAATGGATGATTTAGGTCAAAACCCAGATGGCCAAGATTTAGCCATGTTTTGTCAAATGGTGTCCACAACAGATTTTGTAGTGCCTATGGCAGCTATTGAGGATAAAGGCAAAAGTTTTACAAGTGACTATGTATTGGCTAGTACCAATATAGCACATTTGACTCCCCCAACTGTTACCATTCCTGAAGCTCTTACACGTAGATTCTTCTTGGATACAGATTTAAAAATCATGTCAAATTACAAGAACCAACATGGATTGTTAGATACTGCCAAGGCACTGCAAGCATGTTCTGATTGTGATAAGCCCCCGTATTATAAACAGTGCTGTCCATTATTATGTGGCAAAGCAATAGTTCTGCAAAACCGGAGGACCTCTGCAAGCCTATCCATCAACATGGTGGTAGCACAGTTGAGAGAGGAAAGTAGTGCCAGAAAGAAAATACACACCAATCTGAATGCAATCTTCCAAGGCTTAGGGTCAGATGATACTCCAGGCTTTATAGTAGATCTATTATCAGCATCTAAAGACCCCAGGGTGATACAGTATTGTGAAAAGGAAGGATTGATCACTAAATCCCCCCACTCAGTTGAAAGGAGTTTAGAATATGCACAATATTGTCTAAATTGCTTAGGAAGCTTAGTCATAATTCTTG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41,412
MZ268684.1
rhinovirus C20
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
469761
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,088
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN20082355
PRJNA723895
Rhinovirus C20 strain RvC20/USA/2021/469761, complete genome
GTGGTACACCGTGATTCCGGTCGCCGTGTACGCCTGTTTGCTATCCCACCCCAACTTTCTTTCATTCTTCACTTCCAGTAACTTAGAAGTTGACACAGAGTCCAATAGGATGCAGCTAATCCAAGTCTGCTACGGACAAGCACTTCTGTTTCCCCGGGTGTGTGAATAGACTCCAACAGGGTTGAAGCTGTAGCACTCGTTATCCGCACAACTACTACGCGAATGTTAGTAACACTCTCTAAGTATAGTGGGATTTCGCTCCGCAGAAACCCCATCTGTAGATTAGGGCAATGAGGCTACACACACCCCACTGGCGACAGTGGTGTAGCCTGCGTGGTGCCCTACCTGGGGTTTCATACCCCAGGATTCCACTTTTACTGACAGGGTGTGAAGGCGCTAGTGTGCTAGTTGTGAGTCCTCCGGTCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTGGCCATTTCATGTAAACCAACATGCAGGTGGTCGTAACGAGTAATCACGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTAACCGTGTTTCCTGTTTTACTTAATGTGTGTGTCTTATGGTTACAATTATAGAGTAACCATGGGTGCACAAGTGAGCAAACAAAATGTTGGATCTCACGAAAGTGGAATTTCAGCTTCGTCAGGTTCAGTGATTAAGTATTTTAATATCAATTACTATAAAGACTCAGCAAGCAGTGGATTGAGCAAACAGGACTTCTCAATGGATCCAGAAAAATTTACCAAGCCTATTGCAGAGACATTGACCAATCCAGCACTTATGAGCCCTAGCATTGAAGCTTGTGGGTTTTCTGATAGGCTTAAACAGATTACTATCGGTAACTCCACTATCACCACCCAGGATGCACTCAATACAGTGGTAGCTTACGGAGAGTGGCCACAGTATTTGAGTGACATGGACGCTAGTGCAATTGACAAACCAACCCACCCAGAAACCTCAACAGACCGATTTTACACGCTAACCAGTGTGATATGGGATACAACCTCAAAAGGATGGTGGTGGAAAATTCCCGATTGCCTCAAGGAGATGGGTATGTTTGGACAGAACATGTACCACCATGCTCTGGGTCGTTCAGGGTTCATAATACATGTGCAGTGTAATGCCACCAAATTCCACAGTGGATTGTTAATAGTAGCAGTGGTACCAGAACACCAACTAGCATATATAGGTGGTACCAATGTGAGTGTTGGATACAATCACACCCACCCAGGAGAAAATGGTCACACGATTGGCCTTAATGACCAACGAGGTGATAGACAACCAGATGAGGATCCCTTTTTCAACTGCAATGGCACGCTCTTGGGAAATTTGACTATATTTCCACATCAGCTGATTAACCTAAGAACCAACAATTCAGCAACTATTGTGGTACCTTACATCAATTGTGTTCCAATGGATAGTATGCTTAGGCACAATAACCTATCACTTGTCATCATCCCAATGGTTGATTTGCGGTTTGGGACGACCGGAGTTACTACCCTACCCATAACAATTTCAATTGCACCAGTCAAATCAGAATTTTCTGGTGCTCGCCAGAGTAGGACTCAAGGTTTACCTGTCAGATTAGCAAGTGGCACTCAACAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAATCGGCAAACTTGTTACCAGGATTCCATCCTACGCCAGTTATGCACATACCAGGTGAGATCACAAACCTCATGCATATGGCTCGGGTAGACTCATTCATGCCAATAAACAACATCCCAGGCCATATAAACAAAGTACCAATATATAATGTACCCATTCTGAAAAAGTCTAGTGGAGCTCAATCAGACCTTATCTTAACCATACCCCTAAAGATGGATGATACACTATTCTCTACCACTCTTCTTGGTGAGGTACTAAGTTACTTTTCAAACTGGTCAGGTAGCATAACACTCAGTTTTATGTGTGTGTGTGACAGCTTTAGTACAGGCAAGTTTCTCATAGCATATACTCCCCCAGGAGGAGGCCACCCAAATAACAGAAAAGAAGCCATGCTTGGTGTGCATGTCATATGGGATTTGGGATTGCAGTCAACATGTACAATGGTGGTCCCATGGATCTCACAGGGTTACTATCGGCGTACCAAAGCAGATAAGTACACAGAAGCTGGATTTGTGACCCTGTGGTATCAAACTGATTTTGTAGCTGGCTCTACAACTGGTCAGGGTGCAATATTGGTCACCTGTTCAGCATGTCCAGACATGGCCGTGAGAATGATGCGTGATACGCCAATGATGTCACAAACCTTAGACATTGCACAGAACCCAGTGGAGGACTTCATAGACAACACTTTAGAACAGGTTCTTATTGTTCCAGACACCAAGCCCAGCGGACCAATGCACACAACAAAGCCCACCGCATTGTCTGCAATGGAAATAGGAGCCTCAACCAGCACAACACCAGAAACTATGCTGGAAACTAGGTACGTCATCAACTCCAAAACAAATGACGAAGCTTTAATAGAAAACTTCCTGGGCAGATCAGCATTGTGGGCGACTGTGACAATGGACAATGGTTTTAAAACTTGGAAGATAAATTATCAGGAAAATGCACACATTCGGAAGAAGTTAGAAATGTTTACATATGTCCGATTTGATCTGGAAATAACCATTGTCACTCACAACACCGGCTTAATGCAGGTGATGTACACGCCACCTGGAATTTCAGCCCCAACAAATGCTGATGGTAAGGAGTGGGACACAGCATCAAACCCCAGTGTTTTCTATCAACCCAAATCTGGATTTCCACGTTTCACCATCCCGTTCACAGGATTAGGATCAGCATACTACATGTTCTATGACGGGTATGATCACTCAGGTGATGGATACACCTATGGTATTACCACTACCAATGACATGGGCACACTTTGTTTCAGGGCACTAGATGACAAACAGAGAAATGATGTAAAAATTTTTGCTAAACCCAAACATACACGAGCATGGATTCCAAGACCACCTAGAGCAACAGAGTACACACACATGTATAGTACTAATTACAACAAGAAGAAAGTTCCAACAGACCCCAACAATCATGAGTTAACCAAAGTACACTTTTTGAAACCCAGAACTGAGATTAAAACAACAGGTCCCAGTGACATGTATGTCCACACACGGGATGCCATCTACAAAAATGCACATTTGGCTGAAGCCAATGATAATACCATACTTATTGCTCTTACTGCTGACTTACAAGTTGATGTTGCTGACACGCCTGGAAAGGATGTGATACCTGACTGTAATTGCACCAGTGGTACCTATTATTGCAAAAGTAGAGATCGTTACTATCCTGTTGATGTTGTCACACATGATTGGTACCCTATTGAGGAAAGTCAATACTATCCTAAGCACATCCAGTACAACATCCTGTTAGGTGAGGGACCATGTGAACCAGGCGATTGTGGTGGGAAATTACTCTGCAAGCATGGTGTTATTGGAATAGTTACAGCAGGTGGAGAGGGACATGTGGCATTTACAGATTTGAGACCATATAACAACCTTGCAAAAACACAAGGCCCCATCAGTCAATATGTAACACAACTAGGCAATGCATTTGGAGAAGGTTTCACTCAGACACTAGAAACTAACCTAAAGGAGACCTGCTCAGGCATTTTTGATAAAATAACATCAAAAACTGTCAAATGGATTATTCGCATAATCAGTGCATTGACAATTGTAATCAGAAATAATTCAGACACACCAACCATCATGGCCACTATGGCCTTGCTGGGTTGTAGTGGTTCACCATGGAACTATCTGAAGACAAAACTCTGTGCATGGTTAGGAGTCAGCAAGCCACCATCAAAGCAAGGAGATAGTTGGATTAAGAAATTTACAGAATGGTGCAATGCTGCTAAAGGCTTGGAATGGATTGGTTACAAAATCAGTAAATTCATTGACTGGCTCAAAGAAAAACTTCTGCCAACTGTCCAACGGAAAAAAGAGACTTTAACCGAATGCAGGAAATTGACACTGTATGAAGATCAAGTAAAAGCTTATCCTCACTCTTCAGAACAATTTCAGAACGAGCTCACCACCAAGTTGCAGGTTCTTAAAAAGAATTTAGATGATCTGAGCCCGCTCTATGCATGTGAAAACAAGAGAGTGGCCAATATGCTCAAAGACATCAAGGCAATGGCAGCCTACAAAAAGTCCCATCGCACTGAACCAGTGTGCATTTTAATCCGAGGAGGCCCAGGGTGTGGAAAATCTTTAGCAACTACAGTGATAGCTAGAGGGCTAACTGATAGTGGAAACATATATTCTCTACCCCCAAATCCTAAACACTTTGATGGTTACTGCAAACAAGATGTGGTAATAATGGATGATTTAGGTCAAAACCCAGATGGTCAAGATTTAGCCATGTTTTGTCAAATGGTGTCCACAACAGATTTTGTAGTGCCTATGGCAGCTATAGAGGATAAAGGCAAGAGTTTTACAAGTGACTATGTATTGGCTAGTACCAATATAGCACATTTGACTCCCCCAACCGTTACTATTCCCGAAGCTCTTACACGTAGATTCTTCTTGGATACAGATTTAAAAATCATGTCAAATTACAAGAACCAACATGGGTTGTTAGATACTGCCAAGGCACTGCAAGCATGTTCTGATTGTGATAAGCCCCCATATTATAAACAGTGCTGTCCATTATTATGTGGCAAAGCAATAGTTCTGCAAAACCGGAGAACCTCTGCAAGCCTATCCATCAACATGGTGGTAGCACAGTTGAGAGAGGAAAGTAGTGCCAGAAAGAAAATACACACCAATCTGAATGCAATCTTCCAAGGCTTAGGATCAGATGATACTCCAGGCTTTATAGTAGATCTATTATCAGCATCTAAAGACCCCAGGGTGATACAGTATTGTGAAAAGGAAGGATTGATCACTAAATCCCCCCACTCAGTTGAAAGGAGTTTAGAATACGTACAATATTGTCTAAATTGTTTAGGAAGCTTGGTCATAATTCTTGGTACCA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41,413
LC699425.1
rhinovirus C3
Egawa,K., Kakizaki,M., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Takeda,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
Japan
2022-03-23
HRV_C3_Fukushima_H399_2018
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,041
GenBank
1
Japan: Fukushima
Japan
Homo sapiens
null
2018
SAMD00490735
PRJDB13572
Rhinovirus C3 HRV_C3_Fukushima_H399_2018 genomic RNA, complete genome
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32,244
OL961537.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,048
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN23789525
PRJNA723895
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/PTDPQ7, complete genome
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34,118
OM001455.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,033
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN24255362
PRJNA723895
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/U9JKY7, complete genome
TCTTGTATTACGGTACATTTCCATACCAGTTTTATACACCCCACCCCGAAACTCATAGAAGTTTGTACACAATGACCAATAGGCGGTGGCCATCCAGGTCACTAATGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCACCCTTGTATACGCTTCACCCGAGGCGAAAAACGAGGTCGTCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAAAAGCCTAGTAACACTTTGAAAACCTATGGTTGGTCGCTCAACTGTTCACCCAACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTACCGGGTGTGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCCTAACCCCGTAGCTGTTGCATGTAATCCAACATGTATGCAGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACTTTTTCATTGCTTATGGTGACAATTGTATCTGATACACTTGTTACCATGGGCGCTCAAGTGTCTAGACAGAGTGTTGGAAGCCATGAAACAATGATCCACGCTGGGACTGGGGCTGTGGTCAAATACTTTAATGTCAACTACTATAAAGATGCAGCAAGTTCTGGATTGACCAAGCAAGACTTCTCTCAAGATCCATCTAAATTCACTCAACCTGTGGCAGATATCTTGACAAACCCTGCATTGATGTCTCCTTCCATTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATTGGAAACTCCACTATCACAACGCAAGATGCTGTTAACACAATTGTTGCATATGGTGAGTGGCCTAGTTACTTATCAGACTTAGATGCAACCTCAGTTGACAAACCCACCCATCCTGAAACATCGTCAGACAGGTTTTACACGCTGAAGAGCGTTACCTGGGAGGTTGGATCATCAGGCTGGTGGTGGAAATTACCAGACTGTTTAAGGGACATGGGTGTATTTGGACAAAACATGTACCACCATGCTATGGGAAGATCTGGGTATATTATACACACCCAGTGTAATGCCACCAAATTTCATAGTGGGTGCCTACTAGTAGCAGTAGTGCCTGAACATCAGCTAGCATACATTGGAGGCGACAACACCCGAGTCAAATATAAGCACACACATCCAGGTGAATTAGGCCATAAAATTGGTAGTAACTCAGAAAGAGGTGATAATCAACCAGATGAAAACCCTTTCTTCAACTGCAATGGGACTTTGCTGGGAAATTTAACAATCTTCCCACACCAGCTCATAAACTTGAGGACAAACAACTCAAGCACCATTGTTGTGCCCTATATTAACTGCACACCCATGGACAGCATGTTACGCCATAATAATGTGTCACTTGTTATTATACCTATATGTCCTCTGCGAGCACCAGCTACAGCTCCCCCAACCTTACCAATCACAATATCCATTGCCCCCATCAAATCAGAATTTTCGGGCGCAAGACAGTCTGCTAAAGCACAAGGCCTACCAGTGAGAATACCAAGTGGAGCTAACCAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAGTCTCCAAACATACTCCCCAGCTTCCATTCAACTAAACAAATCCACATACCTGGTGAAATTAAGACAATTATGGACATGGCTCGCGTAGACTCCTTTATGCCTATAAATAATGTGAATCAGTCTCATACACTGGGGGTTTACTACATCACAATATCAAATGTGAGCAGTGAGAGGAAAATATTGGCTATACCACTAGATATGAGTAATACACTTTTCTCTACAACACTTATGGGGGAAGTTCTAAACTACTACTCAAATTGGTCTGGGTCAATCAAACTTACATTCTTCTGTGTTTGTGACAGCTTCAGTACTGGTAAGTTCTTGATAGCATACACCCCTCCAGGTGCTGACATCCCAGAGACACGCCGTGATGCAATGCTCGGCACACATGTTGTGTGGGACCTAGGTCTCCAATCATCATGCCACCTTGTTGTGCCTTGGATCAGCTCTCATTTCTTCAGGAGGACCAGAAAGGACAACTACACAGAGAGTGGGTTCGTTACACTGTGGCATCAGACAGCATTTGTGTCCAATGGAACTTCAGGATCCATAATGGTCACCTGCTCTGCTTGCTCTGACATGTCAGTCCGCATGTTGCGAGACACACCCATGATGAAGCAAGAAGATAACATCACTCAAAACCCAGTGGAAGAGTTTGTAGAGCACACATTAAAGGAGGTGTTGGTAGTTCCAGACACTCAAGCTTCAGGACCTGTTCATACCACCAAACCACAAGCTCTGGGTGCTGTAGAAATAGGAGCAACTGCTGATGTGGGCCCAGAAACATTAATTGAGACAAGATACGTGATGAATGACAACACAAATGCTGAGGCAGCAGTGGAGAACTTCCTGGGAAGATCTGCTTTGTGGGCAAATCTAAGGCTGGATCAGGGTTTCAGGAAATGGGAGATAAACTTCCAAGAACATGCCCAAGTCAGGAAAAAGTTTGAGATGTTCACGTATGTTAGATTTGACCTGGAAATAACAATTGTCACCAACAATAAGGGATTGATGCAAATTATGTTTGTACCTCCAGGAATCACACCTCCAGCAGGGAAAGATGGTAGGGAATGGGACACAGCTTCTAACCCCAGTGTTTTCTTCCAACCAAACTCTGGTTTCCCGAGATTCACGATACCCTTCACAGGGTTGGGATCGGCATACTATATGTTCTATGATGGATATGATGGTACTGACGATACCAATATAAATTATGGAATCTCATTAACAAATGACATGGGAACTTTATGTTTCCGTGCTTTAGATGGAACTGGAGCAAGTGATATCAAAGTGTTTGGTAAACCCAAGCACATAACTGCATGGATTCCCCGCCCACCCAGAGCAACCCAATACCTGCACAAATTTAGCACCAACTACAATAAGCCAAAGACGACTGGCAGCACTGAGTTGGAACCAAAGCACTTCTTTAAATACAGGCAAGACATTACAAGTATCACCAACCTAGGACCCAGTGACATGTATGTTCACACAAAAGAAGCCATCTACAAGTGTGCACACCTAACTGAACCTAATGAAAACACCATACTCCTGGCTATATCATCAGATCTTCAAGTTGACAGCACAAGCATCCCTGGCCCTGACAATATACCTACCTGTGATTGCACCACAGGCACCTATTATTGTAAAAGCAAGGACAGATACTATCCAGTGAACCTAACACACCACGGTTGGTATGTAATACAAGAATCCAGCTACTACCCAAAACACATTCAGTATGATATACTGATTGGCGAAGGGCCTTGCTCTCCAGGGGATTGTGGTGGTAAACTACTGTGTATACATGGAACCATAGGGATGGTGACAGCAGGTGGAGAGAACCATGTTGCATTCATAGACTTGAGAAACTACAGCTCACTTAGTGAACATCAGGGTATCACAGACTATGTCACACAACTGGGAAATGCATTTGGAGATGGGTTCACAAGTTCTATTAGGGAAACACTAGTATCTGCATGTGATGTGTCAGACAAACTCACTGGAAAAATCATTAAATGGACAATTAGACTGATTAGTGCCTTATCAATTATAGTTAGAAACAGCACTGACACCCCCACTGTCATAGCCACACTTGCTCTGTTAGGATGCTCCGGTTCACCATGGCGCTACTTGAAAGACAAAGTTTGCAAGTGGCTGGGTATCGATCCACCACCTAGTAGACAGAGTGACTCATGGTTAAAAAAATTCACTGAGTTCTGTAATGCAGCCCGTGGGCTAGAATGGATCGGTGATAAATTATCTAAATTCATTGATTGGCTGAAAGGAAAAATACTACCTACTCTCCGACGCAAGTCAGATATACTTAAGGAGTGTAAAAAGATTCCATTGTATAAGGAACAAGTCAAAGCATTTGCCACAGCATCAGAGGAAGCACAAGATGAATTAATGGTAAAGGTCAACAAACTTGAAAAAGGGCTCCAGGATCTTGCCCCATTATACGCACTAGAAGCCAAACAAGTGCGCGAGATGTCTAGGGAACTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACCCACAGAACAGAACCTGTCTGCATACTATTGCATGGACAACCAGGATGTGGTAAGTCCTTGGCCTCCAAAGTTATCGCTAGAGGCCTCACTAGTGAGAGCAATGTTTATTCTCTGCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATACAACCAACAGGAAGTAGTGATCATGGATGATGTTGGCCAAAATCCAGATGGAAAAGATTTGAGTCTATTTTGTCAGATGGTGTCAAGCACCGAATTCATAACACCAATGGCCAATCTTGAAGATAAGGGTAGAGCATTTACTAGTGATTATGTCATAGCCAGTACAAATATGTCTGTTCTCACACCACCCACTGTCTCATCACCTGAAGCCATAGATAGGAGATTCTTCTTGGATTGTGATGTTAAAATCATGCCAGCATACAACATAAATAACCTTCTAAATGTTGCCAAAGCTTTGCTGCCATGCACTGATTGCCCAAAACCAGAATTTTATAAACAATGTTGCCCTTTGACATGTGGTAAGGCTTTGATTCTGCAAAACAAAAGGACAAAGGCTAGTTACTCCATCAACACCGTGGTACAACAGCTACGACAGGAGAAGAAAAACAGAAAATGTGTGGAACACAATCTCACTGCCATTTTCCAGGGATTGGGAGATGATTCAACACCAGGGTTCATTATAGACCTCCTTAGTGCCTCTAAAGACCCAAAAGTCATAGAGTTCTGTGAGAAAGAGGGATGGATTAAGCAATCTAGATGCTCAAAGATTGAGCGTGACTTCAACTATGCACAATACTGTATTAACTGTGTGGGCAGCATCATCTTGATTCTAGGAACTGTCTATGCACTGTATAAGTTGATGTGTATAGCACAAGGCCCC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34,242
OK017931.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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7,048
GenBank
null
USA
USA
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null
2021-05-25
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PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/E6M6C4, complete genome
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37,576
OK017949.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
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Picornaviridae
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GenBank
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USA
Homo sapiens
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2021
SAMN20216669
PRJNA723895
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/PE4F23, complete genome
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37,594
OK161367.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,033
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-14
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Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/2DEQES, complete genome
TCTTGTATTACGGTACATTTCCATACCAGTTTTATACACCCCACCCCGAAACTCATAGAAGTTTGTACACAATGACCAACAGGCGGTGGCCATCCAGGTCACTAATGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCACCCTTGTATACGCTTCACCCGAGGCGAAAAACGAGGTCGTCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAAAAGCCTAGTAACACTTTGAAAACCTATGGTTGGTCGCTCAACTGTTCACCCAACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTACCGGGTGTGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCCTAACCCCGTAGCTGTTGCATGTAATCCAACATGTATGCAGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACTTTTTCATTGCTTATGGTGACAATTGTATCTGATACACTTGTTACCATGGGCGCTCAAGTATCTAGACAGAGTGTTGGAAGCCATGAAACAATGATCCACGCTGGGACTGGGGCTGTGGTCAAATACTTTAATGTCAACTACTATAAAGATGCAGCAAGTTCTGGATTGACCAAGCAAGACTTCTCTCAAGATCCATCTAAATTCACTCAACCTGTGGCAGATATCTTGACAAACCCTGCATTGATGTCTCCTTCCATTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATTGGAAACTCCACTATCACAACACAAGATGCTGTTAACACAATTGTTGCATATGGTGAATGGCCTAGTTACTTATCAGACTTAGATGCAACCTCAGTTGACAAACCCACCCATCCTGAAACATCGTCAGACAGGTTTTACACGCTGAAGAGCGTTACCTGGGAGGTTGGATCATCAGGCTGGTGGTGGAAATTACCAGACTGTTTAAGGGACATGGGTGTATTTGGACAAAACATGTACCACCATGCTATGGGAAGATCTGGGTATATTATACACACCCAGTGTAATGCCACCAAATTTCATAGTGGGTGCCTACTAGTAGCAGTAGTGCCTGAACATCAGCTAGCATACATTGGAGGCGACAACACCCGAGTCAAATATAAGCACACACATCCAGGTGAATTAGGCCATAAAATTGGTAGTAACTCAGAAAGAGGTGATAATCAACCAGATGAAAACCCTTTCTTCAACTGCAATGGGACTTTGCTGGGAAATTTAACAATCTTCCCACATCAGCTCATAAACTTGAGGACAAACAACTCAAGCACCATTGTTGTGCCCTATATTAACTGCACACCCATGGACAGCATGTTACGCCATAATAATGTGTCACTTGTTATTATACCTATATGTCCTCTGCGAGCACCAGCTACAGCTCCCCCAACCTTACCAATCACAATATCCATTGCCCCCATCAAATCAGAATTTTCGGGCGCAAGACAGTCTGCTAAAGCACAAGGCCTACCAGTGAGAATGCCAAGTGGAGCTAACCAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAGTCTCCAAACATACTCCCCAGCTTCCATTCAACTAAACAAATTCACATACCTGGTGAAATTAAGACAATTATGGACATGGCTCGCGTAGACTCCTTTATGCCTATAAATAATGTGAATCAGTCTCATACACTGGGGGTTTACTACATCACAATATCAAATGTGAGCAGTGAGAGGAAAATATTGGCTATACCACTAGATATGAGTAATACACTTTTCTCTACAACACTTATGGGGGAAGTTCTAAACTACTACTCAAATTGGTCTGGGTCAATCAAACTTACATTCTTCTGTGTTTGTGACAGCTTCAGTACTGGTAAGTTCTTGATAGCATACACCCCTCCAGGTGCTGACATCCCAGAGACACGCCGTGATGCAATGCTCGGCACACATGTTGTGTGGGATCTAGGTCTCCAATCATCATGCCACCTTGTTGTGCCTTGGATCAGCTCTCATTTCTTCAGGAGGACCAGAAAGGACAACTACACAGAGAGTGGGTTCGTTACACTGTGGCATCAGACAGCATTTGTGTCCAATGGAACTTCAGGATCCATAATGGTCACCTGCTCTGCCTGCTCTGACATGTCAGTCCGCATGTTGCGAGACACACCCATGATGAAGCAAGAAGATAACATCACTCAAAACCCAGTGGAAGAGTTTGTAGAGCACACATTAAAGGAGGTGTTGGTAGTTCCAGACACTCAAGCTTCAGGACCTGTTCATACCACCAAACCACAAGCTCTGGGTGCTGTAGAAATAGGAGCAACTGCTGATGTGGGCCCAGAAACATTAATTGAGACAAGATACGTGATGAATGACAACACAAATGCTGAGGCAGCAGTGGAGAACTTCCTGGGAAGATCTGCTTTGTGGGCAAATCTAAGGCTGGATCAGGGTTTCAGGAAATGGGAGATAAACTTCCAAGAACATGCCCAAGTCAGGAAAAAGTTTGAGATGTTCACGTATGTTAGATTTGACCTGGAAATAACAATTGTCACCAACAATAAGGGATTGATGCAAATTATGTTTGTACCTCCAGGAATCACACCTCCAGCAGGGAAAGATGGTAGGGAATGGGACACAGCTTCTAACCCCAGTGTTTTCTTCCAACCAAACTCTGGTTTCCCGAGATTCACGATACCCTTCACAGGGTTGGGATCGGCATACTATATGTTCTATGATGGATATGATGGTACTGACGATGCCAATATAAATTATGGAATCTCATTAACAAATGACATGGGAACTTTATGTTTCCGTGCTTTAGATGGAACTGGAGCAAGTGATATCAAAGTGTTTGGTAAACCCAAGCACATAACTGCATGGATCCCCCGCCCACCCAGAGCAACCCAATACCTGCACAAATTTAGCACCAACTACAATAAGCCAAAGACGACTGGTAGCACTGAGTTGGAACCAAAGCACTTCTTTAAATACAGACAAGACATTACAAGTATCACCAACCTAGGACCCAGTGACATGTATGTTCACACAAAAGAAGCCATCTACAAGTGTGCACACCTAACTGAACCTAATGAAAACACCATACTCCTGGCTATATCATCAGATCTTCAAGTTGACAGCACAAGCATCCCTGGCCCTGACAATATACCTACCTGTGATTGCACCACAGGCACCTATTATTGTAAAAGCAAGGACAGATACTATCCAGTGAACCTAACACACCACAGTTGGTATGTAATACAAGAATCCAGCTACTACCCAAAACACATTCAGTATGATATACTGATTGGTGAAGGGCCTTGCTCTCCAGGGGATTGTGGTGGTAAACTACTGTGTATACATGGAACCATAGGGATGGTGACAGCAGGTGGAGAGAACCATGTTGCATTCATAGACTTGAGAAACTACAGCTCACTTAGTGAACATCAGGGTATCACAGACTATGTCACACAACTGGGAAATGCATTTGGAGATGGGTTCACAAGTTCTATTAGGGAAACACTAGTATCTGCATGTGATGTGTCAGACAAACTCACTGGAAAAATCATTAAATGGACAATTAGACTGATTAGTGCCTTATCAATTATAGTTAGAAACAGCACTGACACCCCCACTGTCATAGCCACACTTGCCCTGTTAGGATGCTCCGGTTCACCATGGCGCTACTTGAAAGACAAAGTTTGCAGGTGGCTGGGTATCGATCCACCACCTAGTAGACAGAGTGACTCATGGTTGAAAAAATTCACTGAGTTCTGCAATGCAGCCCGTGGGCTAGAATGGATCGGTGATAAATTATCTAAATTCATTGATTGGCTGAAAGGAAAAATACTACCTACTCTCCGACGCAAGTCAGATACACTTAAGGAGTGTAAAAAGATTCCATTGTATAAGGAACAAGTCAAAGCATTTGCCACGGCATCAGAGGAAGCACAAGATGAATTAATGGTAAAGGTCAACAAACTTGAAAAAGGGCTCCAGGATCTTGCCCCATTATACGCACTAGAAGCCAAACAAGTGCGCGAGATGTCTAGGGAACTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACCCACAGAACAGAACCTGTCTGCATACTACTGCATGGACAACCAGGATGTGGTAAGTCCTTGGCCTCCAAAGTTATCGCTAGAGGCCTCACTAGTGAGAGCAATGTTTACTCTCTGCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATACAACCAACAGGAAGTAGTGATCATGGATGATGTTGGCCAAAATCCAGATGGAAAAGATTTGAGTCTATTTTGTCAGATGGTGTCAAGCACCGAATTCATAACACCAATGGCCAATCTTGAAGATAAGGGTAGAGCATTTACTAGTGATTATGTCATAGCCAGTACAAATATGTCTGTTCTCACACCACCCACTGTCTCGTCACCTGAAGCCATAGATAGGAGATTCTTCTTGGATTGTGATGTTAAAATCATGCCAGCATACAACACAAATAACCTTCTAAATGTTGCCAAAGCTTTGCTGCCATGCACTGATTGCCCAAAACCAGAATTTTATAAACAATGTTGCCCTTTGACATGTGGTAAGGCTTTGATTCTGCAAAACAAAAGGACAAAGGCTAGTTACTCCATCAACACCGTGGTACAACAGCTACGACAGGAGAAGAAAAACAGAAAATGTGTGGAACATAATCTCACTGCCATTTTCCAGGGATTGGGAGATGATTCAACACCAGGGTTCATTATAGACCTCCTTAGTGCTTCTAAAGACCCAAAAGTCATAGAGTTCTGTGAGAAAGAGGGATGGATTAAACAATCTAGATGCTCAAAGATTGAGCGTGACTTCAACTATGCACAATACTGTATTAACTGTGTGGGTAGCATCATCTTGATTCTAGGAACTGTCTATGCACTGTATAAGTTGATGTGTATAGCACAAGGCCCC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rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
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Picornaviridae
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2021-06-14
SAMN20932967
PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/5Q5AWX, complete genome
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37,634
OK161378.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,033
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-14
SAMN20932992
PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/96AGHN, complete genome
TCTTGTATTACGGTACATTTCCATACCAGTTTTATACACCCCACCCCGAAACTCATAGAAGTTTGTACACAATGACCAATAGGCGGTGGCCATCCAGGTCACTAATGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCACCCTTGTATACGCTTCACCCGAGGCGAAAAACGAGGTCGTCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAAAAGCCTAGTAACACTTTGAAAACCTATGGTTGGTCGCTCAACTGTTCACCCAACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTACCGGGTGTGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCCTAACCCCGTAGCTGTTGCATGTAATCCAACATGTATGCAGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACTTTTTCATTGCTTATGGTGACAATTGTATCTGATACACTTGTTACCATGGGCGCTCAAGTGTCTAGACAGAGTGTTGGAAGCCATGAAACAATGATCCACGCTGGGACTGGGGCTGTGGTCAAATACTTTAATGTCAACTACTATAAAGATGCAGCAAGTTCTGGATTGACCAAGCAAGACTTCTCTCAAGATCCATCTAAATTCACTCAACCTGTGGCAGATATCTTGACAAACCCTGCATTGATGTCTCCTTCCATTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATTGGAAACTCCACTATCACAACACAAGATGCTGTTAACACAATTGTTGCATATGGTGAATGGCCTAGTTACTTATCAGACTTAGATGCAACCTCAGTTGACAAACCCACCCATCCTGAAACATCGTCAGACAGGTTTTACACGCTGAAGAGCGTTACCTGGGAGGTTGGATCATCAGGCTGGTGGTGGAAATTACCAGACTGTTTAAGGGACATGGGTGTATTTGGACAAAACATGTACCACCATGCTATGGGAAGATCTGGGTATATTATACACACCCAGTGTAATGCCACCAAATTTCATAGTGGGTGCCTACTAGTAGCAGTAGTGCCTGAACACCAGCTAGCATACATTGGAGGCGACAACACCCGAGTCAAATATAAGCACACACATCCAGGTGAATTAGGCCATAAAATTGGTAGTAACTCAGAAAGAGGTGATAATCAACCAGATGAAAACCCTTTCTTCAACTGCAATGGGACTTTGCTGGGAAATTTAACAATCTTCCCACACCAGCTCATAAACTTGAGGACAAACAACTCAAGCACCATTGTTGTGCCCTATGTTAACTGCACACCCATGGACAGCATGTTACGCCATAATAATGTGTCACTTGTTATTATACCTATATGTCCTCTGCGAGCACCAGCTACAGCTCCCCCAACCTTACCAATCACAATATCCATTGCCCCCATCAAATCAGAATTTTCGGGCGCAAGACAGTCTGCTAAAGCACAAGGCCTACCAGTGAGAATGCCAAGTGGAGCTAACCAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAGTCTCCAAACATACTCCCCAGCTTCCATTCAACTAAACAAATTCACATACCTGGTGAAATTAAGACAATTATGGACATGGCTCGCGTAGACTCCTTTATGCCTATAAATAATGTGAATCAGTCCCATACACTGGGGGTTTACTACATCACAATATCAAATGTGAGCAGTGAGAGGAAAATATTGGCTATACCACTAGATATGAGTAATACACTTTTCTCTACAACACTTATGGGGGAAGTTCTAAACTACTACTCAAATTGGTCTGGGTCAATCAAACTTACATTCTTCTGTGTTTGTGACAGCTTCAGTACTGGTAAGTTCTTGATAGCATACACCCCTCCAGGTGCTGACATCCCAGAGACACGCCGTGATGCAATGCTCGGCACACATGTTGTGTGGGACCTAGGTCTCCAATCATCATGCCACCTTGTTGTGCCTTGGATCAGCTCTCATTTCTTCAGGAGGACCAGAAAGGACAACTACACAGAGAGTGGGTTCGTTACACTGTGGCATCAGACAGCATTTGTGTCCAATGGAACTTCAGGATCCATAATGGTCACCTGCTCTGCTTGCTCTGACATGTCAGTCCGCATGTTGCGAGACACACCCATGATGAAGCAAGAAGATAACATCACTCAAAACCCAGTGGAAGAGTTTGTAGAGCACACATTAAAGGAGGTGTTGGTAGTTCCAGACACTCAAGCTTCAGGACCTGTTCATACCACCAAACCACAAGCTCTGGGTGCTGTAGAAATAGGAGCAACTGCTGATGTGGGCCCAGAAACATTAATTGAGACAAGATACGTGATGAATGACAACACAAATGCTGAGGCAGCAGTGGAGAACTTCCTGGGAAGATCTGCTTTGTGGGCAAACCTAAGGCTGGATCAGGGTTTCAGGAAATGGGAGATAAACTTCCAAGAACATGCCCAAGTCAGGAAAAAGTTTGAGATGTTCACGTATGTTAGATTTGACCTGGAAATAACAATTGTCACCAACAATAAGGGATTGATGCAAATTATGTTTGTACCTCCAGGAATCACACCTCCAGCAGGGAAAGATGGTAGGGAATGGGACACAGCTTCTAACCCCAGTGTTTTCTTCCAACCAAACTCTGGTTTCCCGAGATTCACGATACCCTTCACAGGGTTGGGATCGGCATACTATATGTTCTATGATGGATATGATGGTACTGACGATGCCAATATAAATTATGGAATCTCATTAACAAATGACATGGGAACTTTATGTTTCCGTGCTTTAGATGGAACTGGAGCAAGTGATATCAAAGTGTTTGGTAAACCCAAGCACATAACTGCATGGATCCCCCGCCCACCCAGAGCAACCCAATACCTGCACAAATTTAGCACCAACTACAATAAGCCAAAGACGACTGGCAGCACTGAGTTGGAACCAAAGCACTTCTTTAAATACAGACAAGACATTACAAGTATCACCAACCTAGGACCCAGTGACATGTATGTTCACACAAAAGAAGCCATCTACAAGTGTGCACACCTAACTGAACCTAATGAAAACACCATACTCCTGGCTATATCATCAGATCTTCAAGTTGACAGCACACGCATCCCTGGCCCTGACAATATACCTACCTGTGATTGCACCACAGGCACCTATTATTGTAAAAGCAAGGACAGATACTATCCAGTGAACCTAACACACCACAGTTGGTATGTAATACAAGAATCCAGCTACTACCCAAAACACATTCAGTATGATATACTGATTGGTGAAGGGCCTTGCTCTCCAGGGGATTGTGGTGGTAAACTACTGTGTATACATGGAACCATAGGGATGGTGACAGCAGGTGGAGAGAACCATGTTGCATTCATAGACTTGAGAAACTACAGCTCACTTAGTGAACATCAGGGTATCACAGACTATGTCACACAACTGGGAAATGCATTTGGAGATGGGTTCACAAGTTCTATTAGAGAAACACTAGTATCTGCATGTGATGTGTCAGACAAACTCACTGGAAAAATCATTAAATGGACAATTAGACTGATTAGTGCCTTATCAATTATAGTTAGAAACAGCACTGACACCCCCACTGTCATAGCCACACTTGCCCTGTTAGGATGCTCCGGTTCACCATGGCGCTACTTGAAAGACAAAGTTTGCAGGTGGCTGGGTATCGATCCACCACCTAGTAGACAGGGTGACTCATGGTTGAAAAAATTCACTGAGTTCTGCAATGCAGCCCGTGGGCTAGAATGGATCGGTGATAAATTATCTAAATTCATTGATTGGCTGAAAGGAAAAATACTACCTACTCTCCGACGCAAGTCAGATACACTTAAGGAGTGTAAAAAGATTCCATTGTATAAGGAACAAGTCAAAGCATTTGCCACAGCATCAGAGGAAGCACAAGATGAATTAATGGTAAAGGTCAACAAACTTGAAAAAGGGCTCCAGGATCTTGCCCCATTATACGCACTAGAAGCCAAACAAGTGCGCGAGATGTCTAGGGAACTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACCCACAGAACAGAACCTGTCTGCATACTATTACATGGACAACCAGGATGTGGTAAGTCCTTGGCCTCCAAAGTTATCGCTAGAGGCCTCACTAGTGAGAGCAATGTTTACTCTCTGCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATACAACCAACAGGAAGTAGTGATCATGGATGATGTTGGCCAAAATCCAGATGGAAAAGATTTGAGTCTATTTTGTCAGATGGTGTCAAGCACCGAATTCATAACACCAATGGCCAATCTTGAAGATAAGGGTAGAGCATTTACTAGTGATTATGTCATAGCCAGTACAAATATGTCTGTTCTCACACCACCCACTGTCTCATCACCTGAAGCCATAGATAGGAGATTCTTCTTGGATTGTGATGTTAAAATCATGCCAGCATACAACACAAATAACCTTCTAAATGTTGCCAAAGCTTTACTGCCATGCACTGATTGCCCAAAACCAGAATTTTATAAACAATGTTGCCCTTTGACATGTGGTAAGGCTTTGATTCTGCAAAACAAAAGGACAAAGGCTAGTTACTCCATCAACACCGTGGTACAACAGCTACGACAGGAGAAGAAAAACAGAAAATGTGTGGAACATAATCTCACTGCCATTTTCCAGGGATTGGGAGATGATTCAACACCAGGGTTCATTATAGACCTCCTTAGTGCTTCTAAAGACCCAAAAGTCATAGAGTTCTGTGAGAAAGAGGGATGGATTAAGCAATCTAGATGCTCAAAGATTGAGCGTGACTTCAACTATGCACAATACTGTATTAACTGTGTGGGTAGCATCATCTTGATTCTAGGAACTGTCTATGCACTGTATAAGTTGATGTGTATAGCACAAGGCCCC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37,641
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rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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7,033
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-21
SAMN20933069
PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/QYZBU2, complete genome
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37,716
MZ629115.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
null
Rhinovirus C
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Picornaviridae
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7,048
GenBank
null
USA
USA
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null
2021-06-05
SAMN20216547
PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/4JZLHM, complete genome
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-07-14
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2021-05-11
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PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/TQBKLQ, complete genome
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40,550
MZ460687.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-07-14
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,025
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-05-12
SAMN19819177
PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/FNEVNZ, complete genome
GTATTACGGTACATTTCCATACCAGTTTTATACACCCCACCCCGAAACTCATAGAAGTTTGTACACAATGACCAATAGGCGGTGGCCATCCAGGTCACTAATGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCACCCTTGTATACGCTTCACCCGAGGCGAAAAACGAGGTCGTCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAAAAGCCTAGTAACACTTTGAAAACCTATGGTTGGTCGCTCAACTGTTCACCCAACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTACCGGGTGTGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCCTAACCCCGTAGCTGTTGCATGTAATCCAACATGTATGCAGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACTTTTTCATTGCTTATGGTGACAATTGTATCTGATACACTTGTTACCATGGGCGCTCAAGTGTCTAGACAGAGTGTTGGAAGCCATGAAACAATGATCCACGCTGGGACTGGGGCTGTGGTCAAATACTTTAATGTCAACTACTATAAAGATGCAGCAAGTTCTGGATTGACCAAGCAAGACTTCTCTCAAGATCCATCTAAATTCACTCAACCTGTGGCAGATATCTTGACAAACCCTGCATTGATGTCTCCTTCCATTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATTGGAAACTCCACTATCACAACACAAGATGCTGTTAACACAATTGTTGCATATGGTGAATGGCCTAGTTACTTATCAGACTTAGATGCAACCTCAGTTGACAAACCCACCCATCCTGAAACATCGTCAGACAGGTTTTACACGCTGAAGAGCGTTACCTGGGAGGTTGGATCATCAGGCTGGTGGTGGAAATTACCAGACTGTTTAAGGGACATGGGTGTATTTGGACAAAACATGTACCACCATGCTATGGGAAGATCTGGGTATATTATACACACCCAGTGTAATGCCACCAAATTTCATAGTGGGTGCCTACTAGTAGCAGTAGTGCCTGAACATCAGCTAGCATACATTGGAGGCGACAACACCCGAGTCAAATATAAGCACACGCATCCAGGTGAATTAGGCCATAAAATTGGTAGTAACTCAGAAAGAGGTGATAATCAACCAGATGAAAACCCTTTCTTCAACTGCAATGGGACTTTGCTGGGAAATTTAACAATTTTCCCACACCAGCTCATAAACTTGAGGACAAACAACTCAAGCACCATTGTTGTGCCCTATATTAACTGCACACCCATGGACAGCATGTTACGCCATAATAATGTGTCACTTGTTATTATACCTATATGTCCTCTGCGAGCACCAGCTACAGCTCCCCTAACCTTACCAATCACAATATCCATTGCCCCCATCAAATCAGAATTTTCGGGCGCAAGACAGTCTGCTAAAGCACAAGGCCTACCAGTGAGAATGCCAAGTGGAGCTAACCAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAGTCTCCAAACATACTCCCCAGCTTCCATTCAACTAAACAAATTCACATACCTGGTGAAATTAAGACAATTATGGACATGGCTCGCGTAGACTCCTTTATGCCTATAAATAATGTGAATCAGTCTCATACACTGGGGGTTTACTACATCACAATATCAAATGTGAGCAGTGAGAGGAAAATATTGGCTATACCACTAGATATGAGTAATACACTTTTCTCTACAACACTTATGGGGGAAGTTCTAAACTACTACTCAAATTGGTCTGGGTCAATCAAACTTACATTCTTCTGTGTTTGTGACAGCTTCAGTACTGGTAAGTTCTTGATAGCATACACCCCTCCAGGTGCTGACATCCCAGAGACACGCCGTGATGCAATGCTCGGCACACATGTTGTGTGGGACCTAGGTCTCCAATCATCATGCCACCTTGTTGTGCCTTGGATCAGCTCTCATTTCTTCAGGAGGACCAGAAAGGACAACTACACAGAGAGTGGGTTCGTTACACTGTGGCATCAGACAGCTTTTGTGTCCAATGGAACTTCAGGATCCATAATGGTCACCTGCTCTGCTTGCTCTGACATGTCAGTCCGCATGTTGCGAGACACACCCATGATGAAGCAAGAAGATAACATCACTCAAAACCCAGTGGAAGAGTTTGTAGAGCACACATTAAAGGAGGTGTTGGTAGTTCCAGACACTCAAGCTTCAGGACCTGTTCATACCACCAAACCACAAGCTCTGGGTGCTGTAGAAATAGGAGCAACTGCTGATGTGGGCCCAGAAACATTAATTGAGACAAGATACGTGATGAATGACAACACAAATGCTGAGGCAGCAGTGGAGAACTTCCTGGGAAGATCTGCTTTGTGGGCAAATCTAAGGCTGGATCAGGGTTTCAGGAAATGGGAGATAAACTTCCAAGAACATGCCCAAGTCAGGAAAAAGTTTGAGATGTTCACGTATGTTAGATTTGACCTGGAAATAACAATTGTCACCAACAATAAGGGATTGATGCAAATTATGTTTGTACCTCCAGGAATCACACCTCCAGCAGGGAAAGATGGTAGGGAATGGGACACAGCTTCTAACCCCAATGTTTTCTTCCAACCAAACTCTGGTTTCCCGAGATTTACGATACCCTTCACAGGGTTGGGATCGGCATACTATATGTTCTATGATGGATATGATGGTACTGACGATGCCAATATAAATTATGGAATCTCATTAACAAATGACATGGGAACTTTATGTTTCCGTGCTTTAGATGGAACTGGAGCAAGTGATATCAAAGTGTTTGGTAAACCCAAGCACATAACTGCATGGATCCCCCGCCCACCCAGAGCAACCCAATACCTGCACAAATTTAGCACCAACTACAATAAGCCAAAGATGACTGGCAGCACTGAGTTGGAACCAAAGCACTTCTTTAAATACAGACAAGACATTACAAGTATCACCAACCTAGGACCCAGTGACATGTATGTTCACACAAAAGAAGCCATCTACAAGTGTGCACACCTAACTGAACCTAATGAAAACACCATACTCCTGGCTATATCATCAGATCTTCAAGTTGACAGCACAAGCATCCCTGGCCCTGACAATATACCTACCTGTGATTGCACCACAGGCACCTATTATTGTAAAAGCAAGGACAGATACTATCCAGTGAACCTAACACACCACAGTTGGTATGTAATACAAGAATCCAGCTACTACCCAAAACACATTCAGTATGATATACTGATTGGTGAAGGGCCTTGCTCTCCAGGGGATTGTGGTGGTAAACTACTGTGTATACATGGAACCATAGGGATGGTGACAGCAGGTGGAGAGAACCATGTTGCATTCATAGACTTGAGAAACTACAGCTCACTTAGTGAACATCAGGGTATCACAGACTATGTCACACAACTGGGAAATGCATTTGGAGATGGGTTCACAAGTTCTATTAGGGAAACACTAGTATCTGCATGTGATGTGTCAGACAAACTCACTGGAAAAATCATTAAATGGACAATTAGACTGATTAGTGCCTTATCAATTATAGTTAGAAACAGCACTGACACCCCCACTGTCATAGCCACACTTGCCCTGTTAGGATGCTCCGGTTCACCATGGCGCTACTTGAAAGACAAAGTTTGCAGGTGGCTGGGTATCGATCCACCACCTAGTAGACAGAGTGACTCATGGTTGAAAAAATTCACTGAGTTCTGCAATGCAGCCCGTGGGCTAGAATGGATCGGTGATAAATTATCTAAATTCACTGATTGGCTGAAAGGAAAAATACTACCTACTCTCCGACGCAAGTCAGATACACTTAAGGAGTGTAAAAAGATTCCATTGTATAAGGAACAAGTCAAAGCATTTGCCACAGCATCAGAGGAAGCACAAGATGAATTAATGGTAAAGGTCAACAAACTTGAAAAAGGGCTCCAGGATCTTGCTCCATTATACGCACTAGAAGCCAAACAAGTGCGCGAGATGTCTAGGGAACTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACCCACAGAACAGAACCTGTCTGCATACTATTACATGGACAACCAGGATGTGGCAAGTCCTTGGCCTCCAAAGTTATCGCTAGAGGCCTCACTAGTGAGAGCAATGTTTACTCTCTGCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATACAACCAACAGGAAGTAGTGATCATGGATGATGTTGGCCAAAATCCAGATGGAAAAGATTTGAGTCTATTTTGTCAGATGGTGTCAAGCACCGAATTCATAACACCAATGGCCAATCTTGAAGATAAGGGTAGAGCATTTACTAGTGATTATGTCATAGCCAGTACAAATATGTCTGTTCTCACACCACCCACTGTCTCATCACCTGAAGCCATAGATAGGAGATTCTTCTTGGATTGTGATGTTAAAATCATGCCAGCATACAACACAAATAACCTTCTAAATGTTGCCAAAGCTTTGCTGCCATGCACTGATTGCCCAAAACCAGAATTTTATAAACAATGTTGCCCTTTGACATGTGGTAAGGCTTTGATTCTGCAAAACAAAAGGACAAAGGCTAGTTACTCCATCAACACCGTGGTACAACAGCTACGACAGGAGAAGAAAAACAGAAAATGTGTGGAACATAATCTCACTGCCATTTTCCAGGGATTGGGAGATGATTCAACACCAGGGTTCATTATAGACCTCCTTAGTGCTTCTAAAGACCCAAAAGTCATAGAGTTCTGTGAGAAAGAGGGATGGATTAAGCAATCTAGATGCTCAAAGATTGAGCGTGACTTCAACTATGCACAATACTGTATTAACTGTGTGGGTAGCATCATCTTGATTCTAGGAACTGTCTATGCACTGTATAAGTTGATGTGTATAGCACAAGGCCCCTACA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40,571
MZ460691.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-07-14
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,048
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN19819217
PRJNA723895
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/KQW8TP, complete genome
GCAGTGGTCTTGTATTACGGTACATTTCCATACCAGTTTTATACACCCCAACCCGAAACTCATAGAAGTTTGTACACAATGACCAATAGGCGGTGGCCATCCAGGTCACTAATGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCGCCCTTGTATACGCTTCACCCGAGGCGAAAAACGAGGTCGTCGTTACCCGCAAAGTGCCTACGAAAAGCCTAGTAACACTTTGAAAACCTATGGTTGGTCGCTCAACTGTTCACCCAACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCCACCGGGTGTGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCCTAACCCCGTAGCTGCTGCATGTAATCCAACATGTATGCAGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACTTTTTCATTGCTTATGGTGACAATTGTATCTGATACACTTGTTACCATGGGCGCTCAAGTGTCTAGACAGAGTGTTGGAAGCCATGAAACAATGATCCACGCTGGAACCGGGGCTGTGGTCAAATACTTTAATGTCAACTACTATAAAGATGCAGCAAGTTCTGGATTGACCAAGCAAGACTTCTCTCAAGATCCATCCAAATTCACTCAACCTGTGGCAGATATCTTGACAAACCCTGCATTGATGTCTCCTTCCATTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATCGGAAACTCCACCATCACAACACAAGATGCTGTTAACACAATTGTTGCATATGGTGAATGGCCTAGTTACTTATCAGACTTGGATGCAACCTCAGTTGACAAACCTACCCATCCTGAAACATCGTCAGACAGGTTTTACACGCTGAAGAGCGTTACCTGGGAGGTTGGGTCATCAGGCTGGTGGTGGAAATTACCAGACTGTTTAAGAGACATGGGTGTATTTGGACAAAACATGTACCACCATGCCATGGGAAGATCTGGGTATATTATACACACCCAGTGTAATGCCACCAAATTTCATAGTGGGTGCCTACTAGTAGCAGTAGTGCCTGAACATCAGCTAGCATACATTGGAGGTGACAACACCCGAGTCAAATATAAGCACACACATCCAGGTGAATTAGGCCATAAAATTGGTAGTAACTCAGAAAGAGGTGATAATCAACCAGATGAAAACCCTTTCTTCAACTGCAATGGAACTTTGCTGGGAAATTTAACAATCTTCCCACACCAGCTCATAAACTTGAGGACAAACAACTCGAGCACCATTGTTGTGCCCTATATTAACTGCACACCCATGGACAGCATGTTACGCCATAATAATGTGTCACTTGTTATTATACCTATATGTCCTCTGCGAGCACCAGCTACAGCTCCCTCAACTTTACCAATCACAATATCTATTGCCCCCATCAAATCAGAATTTTCGGGCGCAAGACAGTCTGCTAAAGCACAAGGCCTACCAGTGAGAATGCCAAGTGGAGCTAACCAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAGTCTCCAAACATACTCCCCAGCTTCCATTCAACTAAACAAATTCACATACCTGGTGAAATTAAGACAATTATGGACATGGCTCGCGTAGACTCCTTTATGCCTATAAATAATGTGAATCAGTCTCATACACTGGGGGTTTACTACATCACAATATCAAATGTGAGCAGTGAGAGGAAAATACTGGCTATACCATTAGACATGAGTAATACACTTTTCTCTACAACACTTATGGGGGAAGTTCTAAACTACTACTCAAATTGGTCTGGGTCAATCAAACTTACATTCTTCTGTGTCTGTGACAGCTTCAGTACTGGTAAGTTCTTGATAGCATACACCCCTCCAGGTGCTGACATCCCAGAGACACGCCGTGATGCAATGCTCGGCACGCATGTTGTGTGGGACCTAGGTCTCCAATCATCATGCCACCTTGTTGTGCCTTGGATCAGCTCTCACTTCTTCAGGAGGACCAGAAAGGACAACTACACAGAGAGTGGGTTCATTACACTGTGGCATCAGACAGCATTTGTGTCCAATGGGACTTCAGGATCCATAATGGTCACCTGCTCTGCTTGCTCTGACATGTCAGTCCGCATGTTGCGAGACACACCCATGATGAAGCAAGAAGATAACATCACTCAAAACCCAGTGGAAGAGTTTGTAGAGCACACATTAAAGGAGGTATTGGTAGTTCCAGACACTCAAGCTTCAGGACCTGTTCATACCACCAAACCACAAGCTCTAGGTGCTGTGGAAATAGGAGCAACTGCTGATGTGGGCCCAGAAACATTAATTGAGACAAGATATGTGATGAATGACAACACAAATGCTGAGGCAGCAGTGGAGAACTTCCTGGGAAGATCTGCTTTGTGGGCAAATCTAAGGCTGGATCAGGGTTTCAGGAAATGGGAGATAAACTTCCAAGAACATGCCCAAGTCAGGAAAAAGTTTGAGATGTTCACGTATGTTAGATTTGACCTGGAAATAACAATTGTCACCAACAATAAGGGATTGATGCAGATTATGTTTGTACCTCCAGGAATCACACCTCCAGCAGGGAAAGATGGTAGGGAATGGGACACAGCTTCTAACCCCAGTGTTTTCTTCCAACCAAACTCTGGTTTCCCGAGATTCACGATACCCTTCACAGGGTTGGGATCGGCATACTATATGTTCTATGATGGATATGATGGTACTGACGATGCCAATATAAATTATGGAATCTCATTAACAAATGACATGGGAACTTTATGTTTCCGTGCTTTAGATGGAACTGGAGCAAGTGATATCAAAGTGTTTGGTAAACCCAAGCACATAACTGCATGGATTCCCCGCCCACCCAGAGCAACCCAATACCTGCACAAATTTAGCACCAACTACAACAAGCCAAAGACGACTGGCAGCACTGAGTTGGAACCAAAGCACTTCTTTAAATACAGACAAGACATTACAAGTATCACCAACCTAGGACCCAGTGACATGTATGTTCACACGAAAGAAGCCATCTACAAGTGTGCACACCTAACTGAACCTAATGAAAACACCATACTCCTGGCTATATCATCAGATCTTCAAGTTGACAGCACAAGCATCCCTGGCCCTGACAATATACCTACCTGTGACTGCACCACAGGCACCTATTATTGTAAAAGCAAGGACAGATACTATCCAGTGAACCTAACACACCACAGTTGGTATGTAATACAAGAATCCAGCTACTACCCAAAACACATTCAGTATGATATACTGATTGGCGAAGGGCCTTGCTCTCCAGGGGATTGTGGTGGTAAACTACTGTGTATGCATGGAACCATAGGGATGGTGACAGCAGGTGGAGAGAACCATGTTGCATTCATAGACTTGAGAAACTACAGCTCACTTAGTGAACATCAGGGTATCACAGACTATGTCACACAACTGGGAAATGCATTTGGAGATGGGTTCACAAGTTCTATTAGAGAAACACTAGTATCTGCATGTGATGTGTCAGACAAACTCACTGGAAAAATCATCAAATGGACAATTAGACTGATTAGTGCCTTATCAATTATAGTTAGAAACAGCACTGACACCCCCACTGTCATAGCCACACTTGCCCTGTTAGGATGCTCCGGTTCACCATGGCGCTACTTGAAAGACAAAGTTTGCAAGTGGCTGGGTATCGATCCACCACCTAGTAGACAGAGTGACTCATGGTTAAAAAAATTCACTGAGTTCTGTAATGCAGCCCGTGGGCTAGAATGGATCGGTGATAAATTATCTAAATTCATTGATTGGCTGAAAGGAAAAATACTACCTACTCTCCGACGCAAGTCAGATACACTTAAGGAGTGTAAAAAGATTCCATTGTACAAGGAACAAGTCAAAGCATTTGCCACAGCATCAGAGGAAGCACAAGATGAATTGATGGTAAAGGTCAACAAACTTGAAAAAGGGCTCCAAGATCTTGCCCCATTATACGCACTAGAAGCCAAACAAGTGCGCGAAATGTCTAGGGAATTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACCCACAGAACAGAACCTGTCTGCATATTATTGCATGGACAACCAGGATGTGGTAAGTCCTTGGCCTCCAAAGTTATTGCTAGAGGTCTCACTAGTGAGAGCAATGTTTACTCTCTGCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATACAACCAACAGGAAGTAGTGATCATGGATGATGTTGGTCAAAATCCAGATGGAAAAGATTTGAGTCTATTTTGCCAGATGGTGTCAAGCACCGAATTCATAACACCAATGGCCAATCTTGAAGATAAGGGTAGAGCATTTACTAGTGATTATGTCATAGCCAGTACAAATATGTCTGTTCTCACACCACCCACTGTCTCATCACCTGAAGCCATAGATAGGAGATTCTTCTTGGATTGTGATGTCAAAATCATGCCAGCATATAACACAAATAACCTTCTAAATGTTGCTAAAGCTTTGCTGCCATGCACTGATTGCCCAAAACCAGAATTTTATAAACAATGTTGTCCTTTGACATGTGGCAAGGCTTTGATTCTGCAAAACAAAAGGACAAAGGCTAGTTACTCCATCAACACTGTGGTACAACAGCTACGGCAGGAGAAGAAAAACAGAAAATGTGTGGAACACAATCTCACTGCCATTTTCCAGGGACTGGGAGATGATTCAACACCAGGGTTCATTATAGACCTCCTTAGTGCTTCTAAAGACCCAAAAGTCATAGAGTTTTGTGAGAAAGAGGGATGGATTAAGCAATCTAGATGCTCAAAGATTGAGCGTGACTTCAACTATGCACAATACTGTATTAACTGTGTGGGTAGCATCATCTTGATTCTAGGAACTGTTTATGCACTGTATAAGTTGATGTGTATAGCACA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40,575
MZ268652.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
256015
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,047
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
null
null
Rhinovirus C3 isolate 256015, complete genome
GCAGTGGTCTTGTATTACGGTACATTTCCATACCAGTTTTATACACCCCACCCCGAAACTCATAGAAGTTTGTACACAATGACCAATAGGCGGTGGCCATCCAGGTCACTAATGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCACCCTTGTATACGCTTCACCCGAGGCGAAAAACGAGGTCGTCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAAAAGCCTAGTAACACTTTGAAAACCTATGGTTGGTCGCTCAACTGTTCACCCAACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTACCGGGTGTGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCCTAACCCCGTAGCTGTTGCATGTAATCCAACATGTATGCAGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACTTTTTCATTGCTTATGGTGACAATTGTATCTGATACACTTGTTACCATGGGCGCTCAAGTGTCTAGACAGAGTGTTGGAAGCCATGAAACAATGATCCACGCTGGGACTGGGGCTGTGGTCAAATACTTTAATGTCAACTACTATAAAGATGCAGCAAGTTCTGGATTGACCAAGCAAGACTTCTCTCAAGATCCATCTAAATTCACTCAACCTGTGGCAGATATCTTGACAAACCCTGCATTGATGTCTCCTTCCATTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATTGGAAACTCCACTATCACAACACAAGATGCTGTTAACACAATTGTTGCATATGGTGAATGGCCTAGTTACTTATCAGATTTAGATGCAACCTCAGTTGACAAACCCACCCATCCTGAAACATCGTCAGACAGGTTTTACACGCTGAAGAGCGTTACCTGGGAGGTTGGATCATCAGGCTGGTGGTGGAAATTACCAGACTGTTTAAGGGACATGGGTGTATTTGGACAAAACATGTACCACCATGCTATGGGAAGATCTGGGTATATTATACACACCCAGTGTAATGCCACCAAATTTCATAGTGGGTGCCTACTAGTAGCAGTAGTGCCTGAACATCAGCTAGCATACATTGGAGGCGACAACACCCGAGTCAAATATAAGCACACACATCCAGGTGAATTAGGCCATAAAATTGGTAGTAACTCAGAAAGAGGTGATAATCAACCAGATGAAAACCCTTTCTTCAACTGCAATGGGACTTTGCTGGGAAATTTAACAATCTTCCCACACCAGCTCATAAACTTGAGGACAAACAACTCAAGCACCATTGTTGTGCCCTATATTAACTGCACACCCATGGACAGCATGTTACGCCATAATAATGTGTCACTTGTTATTATACCTATATGTCCTCTGCGAGCACCAGCTACAGCTCCCCCAACCTTACCAATCACAATATCCATTGCCCCCATCAAATCAGAATTTTCGGGCGCAAGACAGTCTGCTAAAGCACAAGGCCTACCAGTGAGAATGCCAAGTGGAGCTAACCAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAGTCTCCAAACATACTCCCCAGCTTCCATTCAACTAAACAAATTCACATACCTGGTGAAATTAAGACAATTATGGACATGGCTCGCGTAGACTCCTTTATGCCTATAAATAATGTGAATCAGTCTCATACACTGGGGGTTTACTACATCACAATATCAAATGTGAGCAGTGAGAGGAAAATATTGGCTATACCACTAGATATGAGTAATACACTTTTCTCTACAACACTTATGGGGGAAGTTCTAAACTACTACTCAAATTGGTCTGGGTCAATCAAACTTACATTCTTCTGTGTTTGTGACAGCTTCAGTACTGGTAAGTTCTTGATAGCATACACTCCTCCAGGTGCTGACATCCCAGAGACACGCCGTGATGCAATGCTCGGCACACATGTTGTGTGGGACCTAGGTCTCCAATCATCATGCCACCTTGTTGTGCCTTGGATCAGCTCTCATTTCTTCAGGAGGACCAGAAAGGACAACTACACAGAGAGTGGATTCGTTACACTGTGGCATCAGACAGCATTTGTGTCCAATGGAACTTCAGGATCCATAATGGTCACCTGCTCTGCTTGCCCTGACATGTCAGTCCGCATGTTGCGAGACACACCCATGATGAAGCAAGAAGATAACATCACTCAAAACCCAGTGGAAGAGTTTGTAGAGCACACATTAAAGGAGGTGTTGGTAGTTCCAGACACTCAAGCTTCAGGACCTGTTCATACCACCAAACCACAAGCTCTGGGTGCTGTAGAAATAGGAGCAACTGCTGATGTGGGCCCAGAAACATTAATTGAGACAAGATACGTGATGAATGACAACACAAATGCTGAGGCAGCAGTGGAGAACTTCCTGGGAAGATCTGCTTTGTGGGCAAATCTAAGGCTGGATCAGGGTTTCAGGAAATGGGAGATAAACTTCCAAGAACATGCCCAAGTCAGGAAAAAGTTTGAGATGTTCACGTATGTTAGATTTGACCTGGAAATAACAATTGTCACCAACAATAAGGGATTGATGCAAATTATGTTTGTACCTCCAGGAATCACACCTCCAGCAGGGAAAGATGGTAGGGAATGGGACACAGCTTCTAACCCCAGTGTTTTCTTCCAACCAAACTCTGGTTTCCCGAGATTCACGATACCCTTCACAGGGTTGGGATCGGCATACTATATGTTCTATGATGGATATGATGGTACTGACGATGCCAATATAAATTATGGAATCTCATTAACAAATGACATGGGAACTTTATGTTTCCGTGCTTTAGATGGAACTGGAGCAAGTGATATCAAAGTGTTTGGTAAACCCAAGCACATAACTGCATGGATTCCCCGCCCACCCAGAGCAACCCAATACCTGCACAAATTTAGCACTAACTACAATAAGCCAAAGACGACTGGCAGCACTGAGTTGGAACCAAAGCACTTCTTTAAATACAGACAAGACATTACAAGTATCACCAACCTAGGACCCAGTGACATGTATGTTCACACAAAAGAAGCCATCTACAAGTGTGCACACCTAACTGAACCTAATGAAAACACCATACTCCTGGCTATATCATCAGATCTTCAAGTTGACAGCACAAGCATCCCTGGCCCTGACAATATACCTACCTGTGATTGCACCACAGGCACCTATTATTGTAAAAGCAAGGACAGATACTATCCAGTGAACCTAACACACCACAGTTGGTATGTAATACAAGAATCCAGCTACTACCCAAAACACATTCAGTATGATATACTGATTGGCGAAGGGCCTTGCTCTCCAGGGGATTGTGGTGGTAAACTACTGTGTATACATGGAACCATAGGGATGGTGACAGCAGGTGGAGAGAACCATGTTGCATTCATAGACTTGAGAAACTACAGCTCACTTAGTGAACATCAGGGTATCACAGACTATGTCACACAACTGGGAAATGCATTTGGAGATGGGTTCACAAGTTCTATTAGGGAAACACTAGTATCTGCATGTGATGTGTCAGACAAACTCACTGGAAAAATCATTAAATGGACAATTAGACTGATTAGTGCCTTATCAATTATAGTTAGAAACAGCACTGACACCCCCACTGTCATAGCCACACTTGCCCTGTTAGGATGCTCCGGTTCACCATGGCGCTACTTGAAAGACAAAGTTTGCAAGTGGCTGGGTATCGATCCACCACCTAGTAGACAGAGTGACTCATGGTTGAAAAAATTCACTGAGTTCTGTAATGCAGCCCGTGGGCTAGAATGGATCGGTGATAAATTATCTAAATTCATTGATTGGCTGAAAGGGAAAATACTACCTACTCTCCGACGCAAGTCAGATACACTTAAGGAGTGTAAAAAGATTCCATTGTATAAGGAACAAGTCAAAGCATTTGCCACAGCATCAGAGGAAGCACAAGATGAATTAATGGTAAAGGTCAACAAACTTGAAAAAGGGCTCCAGGATCTTGCCCCATTATACGCACTAGAAGCCAAACAAGTGCGCGAGATGTCTAGGGAACTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACCCACAGAACAGAACCTGTCTGCATACTATTGCATGGACAACCAGGATGTGGTAAGTCCTTGGCCTCCAAAGTTATCGCTAGAGGCCTCACTAGTGAGAGCAATGTTTACTCTCTGCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATACAACCAACAGGAAGTAGTGATCATGGATGATGTTGGCCAAAATCCAGATGGAAAAGATTTGAGTCTATTTTGTCAGATGGTGTCAAGCACCGAATTCATAACACCAATGGCCAATCTTGAAGATAAGGGTAGAGCATTTACTAGTGATTATGTTATAGCCAGTACAAATATGTCTGTTCTCACACCACCCACTGTCTCATCACCTGAAGCCATAGATAGGAGATTCTTCTTGGATTGTGATGTTAAAATCATGCCAGCATACAACACAAATAACCTTCTAAATGTTGCCAAAGCTTTGCTGCCATGCACTGATTGCCCAAAACCAGAATTTTATAAACAATGTTGCCCTTTGACATGTGGTAAGGCTTTGATTCTGCAAAACAAAAGGACAAAGGCTAGTTACTCCATCAACACCGTGGTACAACAGCTACGACAGGAGAAGAAAAACAGAAAATGTGTGGAACACAATCTCACTGCCATTTTCCAGGGATTGGGAGATGATTCAACACCAGGGTTCATTATAGACCTCCTTAGTGCTTCTAAAGACCCAAAAGTCATAGAGTTCTGTGAGAAAGAGGGATGGATTAAGCAATCTAGATGCTCAAAGATTGAGCGTGACTTCAACTATGCACAATACTGTATTAACTGTGTGGGTAGCATCATCTTGATTCTAGGAACTGTCTATGCACTGTATAAGTTGATGTGTATAGCACA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41,385
MZ268662.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
AKGDSB
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,048
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN19177310
PRJNA723895
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/AKGDSB, complete genome
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41,392
MZ268677.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
163432
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,048
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-08
SAMN19131244
PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/163432, complete genome
GCAGTGGTCTTGTATTACGGTACATTTCCATACCAGTTTTATACACCCCACCCCGAAACTCATAGAAGTTTGTACACAATGACCAATAGGCGGTGGCCATCCAGGTCACTAATGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCACCCTTGTATACGCTTCACCCGAGGCGAAAAACGAGGTCGTCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAAAAGCCTAGTAACACTTTGAAAACCTATGGTTGGTCGCTCAACTGTTCACCCAACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGACACTCCCCACCAGCGATGGTGGTCTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTACCGGGTGTGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCCTAACCCCGTAGCTGTTGCATGTAATCCAACATGTATGCAGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTACTTTTTCATTGCTTATGGTGACAATTGTATCTGATACACTTGTTACCATGGGCGCTCAAGTGTCTAGACAGAGTGTTGGAAGCCATGAAACAATGATCCACGCTGGGACTGGGGCTGTGGTCAAATACTTTAATGTCAACTACTATAAAGATGCAGCAAGTTCTGGATTGACCAAGCAAGACTTCTCTCAAGATCCATCTAAATTCACTCAACCTGTGGCAGATATCTTGACAAACCCTGCATTGATGTCTCCTTCCATTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATTGGAAACTCCACTATCACAACACAAGATGCTGTTAACACAATTGTTGCATATGGTGAATGGCCTAGTTACTTATCAGACTTAGATGCAACCTCAGTTGACAAACCCACCCATCCTGAAACATCGTCAGACAGGTTTTACACGCTGAAGAGCGTTACCTGGGAGGTTGGATCATCAGGCTGGTGGTGGAAATTACCAGACTGTTTAAGGGACATGGGTGTATTTGGACAAAACATGTACCACCATGCTATGGGAAGATCTGGGTATATTATACACACCCAGTGTAATGCCACCAAATTTCATAGTGGGTGCCTACTAGTAGCAGTAGTGCCTGAACATCAGCTAGCATACATTGGAGGCGACAACACCCGAGTCAAATATAAGCACACACATCCAGGTGAATTAGGCCATAAAATTGGTAGTAACTCAGAAAGAGGTGATAATCAACCAGATGAAAACCCTTTCTTCAACTGCAATGGGACTTTGCTGGGAAATTTAACAATCTTCCCACACCAGCTCATAAACTTGAGGACAAACAACTCAAGCACCATTGTTGTGCCCTATATTAACTGCACACCCATGGACAGCATGTTACGCCATAATAATGTGTCACTTGTTATTATACCTATATGTCCTCTGCGAGCACCAGCTACAGCTCCCCCAACCTTACCAATCACAATATCCATTGCCCCCATCAAATCAGAATTTTCGGGCGCAAGACAGTCTGCTAAAGCACAAGGCCTACCAGTGAGAATGCCAAGTGGAGCTAACCAGTTCATGACAACAGAAGATGAACAGTCTCCAAACATACTCCCCAGCTTCCATTCAACTAAACAAATTCACATACCTGGTGAAATTAAGACAATTATGGACATGGCTCGCGTAGACTCCTTTATGCCTATAAATAATGTGAATCAGTCTCATACACTGGGGGTTTACTACATCACAATATCAAATGTGAGCAGTGAGAGGAAAATATTGGCTATACCACTAGATATGAGTAATACACTTTTCTCTACAACACTTATGGGGGAAGTTCTAAACTACTACTCAAATTGGTCTGGGTCAATCAAACTTACATTCTTCTGTGTTTGTGACAGCTTCAGTACTGGTAAGTTCTTGATAGCATACACCCCTCCAGGTGCTGACATCCCAGAGACACGCCGTGATGCAATGCTCGGCACACATGTTGTGTGGGACCTAGGTCTCCAATCATCATGCCACCTTGTTGTGCCTTGGATCAGCTCTCATTTCTTCAGGAGGACCAGAAAGGACAACTACACAGAGAGTGGGTTCGTTACACTGTGGCATCAGACAGCATTTGTGTCCAATGGAACTTCAGGATCCATAATGGTCACCTGCTCTGCTTGCTCTGACATGTCAGTCCGCATGTTGCGAGACACACCCATGATGAAGCAAGAAGATAACATCACTCAAAACCCAGTGGAAGAGTTTGTAGAGCACACATTAAAGGAGGTGTTGGTAGTTCCAGACACTCAAGCTTCAGGACCTGTTCATACCACCAAACCACAAGCTCTGGGTGCTGTAGAAATAGGAGCAACTGCTGATGTGGGCCCAGAAACATTAATTGAGACAAGATACGTGATGAATGACAACACAAATGCTGAGGCAGCAGTGGAGAACTTCCTGGGAAGATCTGCTTTGTGGGCAAATCTAAGGCTGGATCAGGGTTTCAAGAAATGGGAGATAAACTTCCAAGAACATGCCCAAGTCAGGAAAAAGTTTGAGATGTTCACGTATGTTAGATTTGACCTGGAAATAACAATTGTCACCAACAATAAGGGATTGATGCAAATTATGTTTGTACCTCCAGGAATCACACCTCCAGCAGGGAAAGATGGTAGGGAATGGGACACAGCTTCTAACCCCAGTGTTTTCTTCCAACCAAACTCTGGTTTCCCGAGATTCACGATACCCTTCACAGGGTTGGGATCGGCATACTATATGTTCTATGATGGATATGATGGTACTGACGATGCCAATATAAATTATGGAATCTCATTAACAAATGACATGGGAACTTTATGTTTCCGTGCTTTAGATGGAACTGGAGCAAGTGATATCAAAGTGTTTGGTAAACCCAAGCACATAACTGCATGGATTCCCCGCCCACCCAGAGCAACCCAATACCTGCACAAATTTAGCACCAACTACAATAAGCCAAAGACGACTGGCAGCACTGAGTTGGAACCAAAGCACTTCTTTAAATACAGACAAGACATTACAAGTATCACCAACCTAGGACCCAGTGACATGTATGTTCACACAAAAGAAGCCATCTACAAGTGTGCACACCTAACTGAACCTAATGAAAACACCATACTCCTGGCTATATCATCAGATCTTCAAGTTGACAGCACAAGCATCCCTGGCCCTGACAATATACCCACCTGTGATTGCACCACAGGCACCTATTATTGTAAAAGCAAGGACAGATATTATCCAGTGAACCTGACACACCACAGTTGGTATGTAATACAAGAATCCAGCTACTACCCAAAACACATTCAGTATGATATACTGATTGGCGAAGGGCCTTGCTCTCCAGGGGATTGTGGTGGTAAACTACTGTGTATACATGGAACCATAGGGATGGTGACAGCAGGTGGAGAGAACCATGTTGCATTCATAGACTTGAGAAACTACAGCTCACTTAGTGAACATCAGGGTATCACAGACTACGTCACACAACTGGGAAATGCATTTGGAGATGGGTTCACAAGTTCTATTAGGGAAACACTAGTATCTGCATGTGATGTGTCAGACAAACTCACTGGAAAAATCATTAAATGGACAATTAGACTGATTAGTGCCTTATCAATTATAGTTAGAAACAGCACTGACACCCCCACTGTCATAGCCACACTTGCCCTGTTAGGATGCTCCGGTTCACCATGGCGCTACTTGAAAGACAAAGTTTGCAAGTGGCTGGGTATCGATCCACCACCTAGTAGACAGAGTGACTCATGGTTGAAAAAATTCACTGAGTTCTGTAATGCAGCCCGTGGGCTAGAATGGATCGGTGATAAATTATCTAAATTCATTGATTGGCTGAAAGGAAAAATACTACCTACTCTCCGACGCAAGTCAGATACACTTAAGGAGTGTAAAAAGATTCCATTGTATAAGGAACAAGTCAAAGCATTTGCCACAGCATCAGAGGAAGCACAAGATGAATTAATGGTAAAGGTCAACAAACTTGAAAAAGGGCTCCAGGATCTTGCCCCATTATACGCACTAGAAGCCAAACAAGTGCGCGAGATGTCTAGGGAACTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACCCACAGAACAGAACCTGTCTGCATACTATTGCATGGACAACCAGGATGTGGTAAGTCCTTGGCCTCCAAAGTTATCGCTAGAGGCCTCACTAGTGAGAGCAATGTTTACTCTCTGCCACCTGATCCCAAGTACTTTGATGGATACAACCAACAGGAAGTAGTGATCATGGATGATGTTGGCCAAAATCCAGATGGAAAAGATTTGAGTCTATTTTGTCAGATGGTGTCAAGCACCGAATTCATAACACCAATGGCCAATCTTGAAGATAAGGGTAGAGCATTTACTAGTGATTATGTCATAGCCAGTACAAATATGTCTGTTCTCACACCACCCACTGTCTCATCACCTGAAGCCATAGATAGGAGATTCTTCCTGGATTGTGATGTTAAAATCATGCCAGCATACAACACAAATAACCTTCTAAATGTTGCCAAAGCTTTGCTGCCATGCACTGATTGCCCAAAACCAGAATTTTATAAACAATGTTGCCCTTTGACATGTGGTAAGGCTTTGATTCTGCAAAACAAAAGGACAAAGGCTAGTTACTCCATCAACACCGTGGTACAACAGCTACGACAGGAGAAGAAAAACAGAAAATGTGTGGAACACAATCTCACTGCCATTTTCCAGGGATTGGGAGATGATTCAACACCAGGGTTCATTATAGACCTCCTTAGTGCTTCTAAAGACCCAAAAGTCATAGAGTTCTGTGAGAAAGAGGGATGGATTAAGCAATCTAGATGCTCAAAGATTGAGCGTGACTTCAACTATGCACAATACTGTATTAACTGTGTGGGTAGCATCATCTTGATTCTAGGAACTGTCTATGCACTGTATAAGTTGATGTGTATAGCACA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41,406
MZ268688.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
469829
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,048
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
null
2021
null
null
Rhinovirus C3 isolate 469829, complete genome
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41,417
MZ268691.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
470093
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,048
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
null
null
Rhinovirus C3 isolate 470093, complete genome
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
470156
Rhinovirus C
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Picornaviridae
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7,048
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null
2021
null
null
Rhinovirus C3 isolate 470156, complete genome
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41,422
MZ268711.1
rhinovirus C3
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
255245
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,048
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-13
SAMN20082332
PRJNA1066815
Rhinovirus C3 strain RvC3/USA/2021/255245, complete genome
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41,439
OM001346.1
rhinovirus C33
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,073
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-22
SAMN24288762
PRJNA1066815
Rhinovirus C33 strain RvC33/USA/2021/6N55CL, complete genome
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34,134
OK254823.1
rhinovirus C33
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-12-11
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,073
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN21173553
PRJNA723895
Rhinovirus C33 strain RvC33/USA/2021/2APVU4, complete genome
GTGCGTGGTACACTGGAATTTAGGTTCCTTTGTACGCCTGTTTTCCCCTTCCTTTTGTTTGTGTATTTCATGTTAATTTGTAACTTAGAAGCATTATGTACAAAGCCCAATAGGGAACACCTTCTCCAGAGGTGTAGAGGGCAAGCACTTCTGTTACCCCGGACGTGTGAATAGACCTTACCCAAGGTTGAAGCTAAAGCGTTCGTTATCCGCACATCTACTGCGCAATGGCTAGTAGGACTTTGAATGTGCTGTGGTGTTTCGCTCAGCAGTAATCCCCCTGTAGATCGGGGCAATGGGGCTACACATCCCCCACTGGTGACAGTGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCTGGGTCTCTGACCCAGGACGCCACAGTACAGACAGGGTGTGAAGACCGGCGTGCGCTAGTTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCTAACCCCGCAGCCATTGCATGCAACCCAGCATGTCTGTGGTCGTAACGAGCAATTGTGGGATGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTATTTTTTATTGTTTGTGTCTCATGGTTACAAGTATAGTGTAATCATGGGTGCACAAGTGAGTAAGCAAAATACTGGCTCACATGAGAATTCAGTTTCAGCTACGGGAGGTTCAGTTATAAAATACTTTAACATCAATTACTACAAGGATTCAGCTAGCTCAGGTTTAACAAAACAAGATTTTTCTCAAGATCCTTCAAAATTTACACAACCCTTGGCAGATGCTTTGACAAACCCAGCATTAATGTCACCCAGTGTTGAGGCATGTGGATATTCTGATAGGCTAAAACAAATCACTATTGGAAACTCCACAATTACCACACAGGATAGCTTAAACACTGTCTTGGCTTATGGAGAATGGCCTCAGTACCTATCTGATATAGATGCAACTTCTGTTGACAAACCGACCCATCCTGAAACATCATCTGATAGATTTTATACTCTGGATAGTGTAGAGTGGAGTGGTAGCTCATTGGGATGGTGGTGGAAACTCCCAGATTGCCTGAGAGATATGGGTATGTTCGGGCAAAACATGTATTATCACTCATTGGGAAGATCAGGTTATGTAATACATGTCCAGTGCAATGCTACAAAATTTCATAGTGGATGTCTCATAGTAGCAGTTGTACCAGAACACCAGATCGCATATATAGGTAGTGGTGTAACCAGGGTTAAGTATAAGCATACCCACCCAGGTGATCAGGGGCATACACTGAAAGTCTCATCCAATAGGAGAGATAATCAACCAGATGAGGATCCCTTTTATAACTGCAATGGTACACTGTTGGGTAACATAACTATGTTCCCCCATCAGATGATCAATCTGCGAACAAATAACTCAGCTACCATTGTAGTACCATACATAAATGCTGTGCCCATGGACAACATGCTACGGCATAATAATGTCAGTTTAATGATAATACCAATTGTCACCCTTAGATCTAATGGCAATGTTGCTAACACTTTACCAATAACAGTAACTATTGCACCGGATAAATCTGAATTTTCCGGAGCTATGCAACACCAGACACAAGGGCTACCTACCAGATTACCAAGTGGATCACAACAATTCATGACAACTGAGGATGAGCAATCACCAAACATACTACCAGAATATAGTCCTACTAAAGAGATGCACATACCAGGTCAAATAACTAATGTTTTGCATATGGCTATGGTTCATTCATTTATTCCCATGAACAACCAACCACAACACAAAGGGGACAAAGCCATATATGGGGTTCAAGTAGTCGCCCAAACAACACACAATGGGCTTATAGTTGCTATACCTCTACAGATGGATAACACACTGTTTAGTACAACACTTTTAGGTGAAATCTTGAATTACTTTTCCAATTGGTCAGGAAGCATAAAAATAACATTCATGTGTGTGTGTGATTCATTTAGCACTGGGAAATTTCTGATGGCTTATACACCACCAGGAGGGAGACTACCTGAATCTAGGAAAGATGCTATGCTAGGGACACACCTTATCTGGGACCTAGGTTTACAATCATCATGTACCATGGTTATACCATGGATGAGCTCCACATATTACCGGCATACCAAATCAGACAATTACACTTCAGGTGGTTATGTGACTTTGTGGTACCAAACAAATTTCGTTCCAAGTGCAAATAATGGAATAGGTACCATACTAGCCACATGTTCAGGATGCGAGGACTTATCTGTGAGAATGTTAAGAGACACACCAATGATAAAACAACCTGAGAATGACATACAAAATCCAGTAGAAGACTTCATTGATGAAACTCTCAAAGAAGTGTTAGTTGTTCCAAACACACAACCATCAGGGCCTATACATACAACCAAACCTACTACACTTGGTGCCATGGAGATAGGGGCAACATCTGATGCCACACCAGAGTCAGTGATTGAGACACGGTATGTCATTAACAACCATACCAATAATGAAGCATTGATTGAGAATTTTCTTGGTAGATCTGCACTATGGACAAACCTAACACTGAGAGATGGTTTTGTAAAATGGGAAATAAACTTTCAAGAGCAGGCACACATAAGGAAAAAACTTGAACTCTTCACCTATGTGCGCTTTGACATGGAGGTCACAGTAGTGACCAACAACACTGGGTTAATGCAGATAATGTACTCACCACCAGGCATCACACCACCAGGAAGTGAATCAGATAAAAGATGGGATAGTGCAACAAATCCTAGTGTTTTTTATCAACCCAAGAGTGGCTTCCCCCGCTTCACTATACCTTTCACAGGACTTGGCTCTGCATATTACATCTTTTATGATGGATATGATGAAACATCCAAGGAGGCTGTATCATATGGTATATCATCTACCAATGATATGGGTACACTATGCTTCAGAGCTCTTGAAGACAAAACTAAACAGACTATTAAGGTGTTCATCAAACCCAAACACATCAAAGCTTGGTGTCCCCGTCCACCACGTGCTGTAGATTACACTCACAAATACAATCCCAATTATCATATACCAATTGAAGGAGGAAGTGGAAATCTCAAAGAGGAACACTATTTCAAGTTCAGAAATGATATTAAGGCAACTGTAGAAACAGCAGGACCCAGTGATTTGTTTGTACACACTCAAGAATTCATATACAGAAATGCCCATTTGGCCACCCCTAGTGATAAGACAGTGTTGTTATCTTATACCTCTGATTTACAGGTGGACACATGTGACACACCAGGACCAGATAATATACCTGTTTGTGATTGCACAGAGGGCTGTTACTACTCACGCTCTAAAGACAGGTATTTTGTAATCAAAGTTAAGGCTTATGATTGGTACGAAGTCCAAGAAACAGTATATTACCCTAGACATATCCAGTACAATATGCTTATTGGAGAAGGTCATTGTCAACCAGGGGATTGTGGAGGTAAATTAATGTGCAGACATGGTGTAATCGGTATAATAACAGCAGGAGGAGATAACCATGTGGCATTCACTGATCTTAGACCATACAAATTTTGTGCTGAAACACAAGGTCCAGTCTCAGATTACCTCAATCAACTCGGTAATGCTTTTGGTGAAGGATTCACACAAAACATTAAAGATAATTTCAATCACATATCTAACAACATCCAAGACCAGATCACAGGAAAGATCCTTAAATGGTTTGTTCGCATTATCAGTGCAATGACTATTATGATTAGGAATAGTGCAGATGTCCCCACAGTTTTAGCTACTCTCGCACTACTGGGATGCCACCACTCTCCATGGACATTTCTTAAAGACAAAATATGCAAATGGCTTGGGATCCCTAAACCACCCTCCAAGCAAGGTGATGGTTGGCTCAAGAAGTTTACAGAGTGGTGCAATGCTGCCAAAGGACTAGAATGGGTGGGTGTTAAAATAAGTAAATTTATAGATTGGCTAAAAGAAAAACTGATTCCAGCCGTGCAGAGCAAAAGGGACTTACTCAAGGAATGCAAGAAGATACCATTATACCAGGAGCAGATCAAAGCTTTTGCTCATGCTAAAGAGGATGCTCAAAATGAACTAATTGTAAATATAGATAAATTAAAGAAAGGTTTAGATCAGTTAGCACCTTTGTATGCAGTGGAAAACAAGAAGGTCACAGAGATGCAGAAAGAGCTTAAGAGGTTGAGCTCCTATAAGAGAACACACCGACATGAACCAGTCTGTCTTCTTATTCATGGTGTGCCTGGCTGTGGTAAATCATTAACGACAACTGTCATAGCCAGAGGCTTGGCTTCGGAATCTGAAATTTACTCACTACCACCAGACCCGAAGTACTTTGATGGGTATGACCAGCAGAAGGTTGTTATAATGGATGATGTGGGTCAAAACCCAGACGGCCAAGACATGGGGTTGTTCTGTCAAATGGTTTCCACCACAGACTTTCATGTACCTATGGCTGCTCTTGAAGATAAAGGAAAGAGTTTCACTAGTACTTATCTATTAGCTAGTACAAATTTACAACACCTAAACCCATCTACAGTACAAACACCAGATGCTGTAGATAGAAGATTTTTCTTGGATACAGACTTAAAGATCATGCCCAAATTTGTCAACCAAGCAGGGATGCTAAACACCGCACAAGCACTTCAGGCATGTCAAAATTGCCCAAAACCCAAACACTATAATCAGTGTTGCCCACTACTGTGTGGTAAGGCGGTTGTACTATACAACCGTAGAACACAAGCTAGTTACTCCATAAATATGGTTGTGGAGCAAATGAGAGAAGAGGCGACAGCCAGACTCAAGGTTAGACATAATCTAGATGCAATATTTCAAGGATTAGGTGACTCTGAAACACCAGGTTTCATAATTGATTTATTATCTTCATCAAAAGACCCTAAGGTTATTCAGTATTGTGAGGATAATGGTTTGATTTCACATGCAGAAAGTAGTATTGATAGGCACATAAACCACACACACTATATTCTAAATTGTATAGGTAGTTTAATTATTATCTTGGGAAC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35,264
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rhinovirus C33
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-12-11
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Rhinovirus C
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Picornaviridae
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USA
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2021-07-02
SAMN22069255
PRJNA1066815
Rhinovirus C33 strain RvC33/USA/2021/R37U6K, complete genome
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35,363
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-09-28
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USA
USA
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2021-05-25
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2021-05-25
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PRJNA1066815
Rhinovirus C33 strain RvC33/USA/2021/Q88UTK, complete genome
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37,596
MZ670597.1
rhinovirus C33
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-07
U2X3AR
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,071
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-01
SAMN20216714
PRJNA1066815
Rhinovirus C33 strain RvC33/USA/2021/U2X3AR, complete genome
GTGCGTGGTACACTGGAATTTAGGTTCCTTTGTACGCCTGTTTTCCCTTCCTTTTGTTTGTGTATTTTATGTTAATTTGTAACTTAGAAGCATTATGTACAAAGCCCAATAGGGAACACCTTCTCCAGAGGTGTAGAGGGCAAGCACTTCTGTTACCCCGGACGTGTGAATAGACCTTACCCAAGGTTGAAGCTAAAGCGTTCGTTATCCGCACATCTACTGCGCAATGGCTAGTAGGACTTTGAATGTGCTGTGGTGTTTCGCTCAGCAGTAATCCCCCTGTAGATCGGGGCAATGGGGCTACACATCCCCCACTGGTGACAGTGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCTGGGTCTCTGACCCAGGACGCCACAGTACAGACAGGGTGTGAAGACCGGCGTGCGCTAGTTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCTAACCCCGCAGCCATTGCATGCAACCCAGCATGTCTGTGGTCGTAATGAGCAATTGTGGGATGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTATTTTTATTGTTTGTGTCTCATGGTTACAAGTATAGTGTAATCATGGGTGCACAAGTGAGTAAGCAAAATACTGGCTCACATGAGAATTCAGTTTCAGCTACGGGAGGTTCAGTTATAAAATACTTTAACATCAATTACTACAAGGATTCAGCTAGCTCAGGTTTAACAAAACAAGATTTTTCTCAGGATCCTTCAAAATTTACACAACCCTTGGCAGATGCTTTGACAAACCCAGCATTAATGTCACCCAGTGTTGAGGCATGTGGATATTCTGATAGGCTAAAACAAATCACTATTGGAAACTCCACAATTACCACACAGGATAGCTTAAACACTGTCTTGGCTTATGGAGAATGGCCTCAGTACCTATCTGATATAGATGCAACTTCTGTTGACAAACCGACCCATCCTGAAACATCATCTGATAGATTTTACACTCTGGATAGTGTAGAGTGGAGTGGTAGCTCATTGGGATGGTGGTGGAAACTCCCAGATTGCCTGAGAGATATGGGTATGTTCGGGCAAAACATGTATTATCACTCATTGGGAAGATCAGGTTATGTAATACATGTCCAGTGCAATGCTACAAAATTTCATAGTGGATGTCTCATAGTAGCAGTTGTACCAGAACACCAGATCGCATATATAGGTAGTGGTGTAACCAGGGTTAAGTATAAGCATACCCACCCAGGTGATCAGGGGCATACACTGAAAGTCTCATCCAATAGGAGAGATAATCAACCAGATGAGGATCCCTTTTATAACTGCAATGGCACACTGTTAGGTAACATAACTATGTTCCCCCATCAGATGATCAATCTGCGAACAAATAACTCAGCTACCATTGTAGTACCATACATAAATGCCGTGCCCATGGACAACATGCTACGGCATAATAATGTCAGTTTAATGATAATACCAATTGTCACCCTTAGATCTAATAGCAATGTTGCTAACACTTTACCAATAACAGTAACTATTGCACCGGATAAATCTGAATTTTCCGGAGCTATGCAACACCAGACACAAGGGCTACCTACCAGATTACCAAGTGGATCACAACAATTCATGACAACTGAGGATGAGCAATCACCAAACATACTACCAGAATATAGTCCTACTAAAGAGATGCACATACCAGGTCAAATAACTAATGTTTTGCATATGGCTATGGTTCATTCATTTATTCCCATGAACAACCAACCACAACACAAAGGGGACAAAGCCATATATGGGGTTCAAGTAGCCGCCCAAACAACACACAATGGGCTTATAGTTGCTATACCTCTACAGATGGATAACACACTGTTTAGCACAACACTTTTAGGTGAAATCCTGAATTACTTTTCCAATTGGTCAGGAAGCATAAAAATAACATTCATGTGTGTGTGTGATTCATTTAGCACTGGGAAATTTCTGATGGCTTATACACCACCAGGAGGGAGACTACCTGAATCTAGGAAAGATGCTATGCTGGGGACACATCTTATCTGGGACCTAGGTTTACAATCATCGTGTACCATGGTTATACCATGGATGAGTTCCACATATTACCGGCATACCAAATCAGACAATTACACTTCAGGTGGTTATGTAACTTTGTGGTACCAAACAAATTTTGTTCCAAGTGCAAATAATGGAATAGGTACCATACTAGCCACATGTTCAGGATGCGAGGACTTATCTGTGAGAATGTTAAGAGACACACCAATGATAAAACAACCTGAGAATGACATACAAAATCCAGTAGAAGACTTCATCGATGAAACTCTCAAAGAAGTGTTAGTTGTTCCAAACACACAACCATCAGGGCCTATACATACAACCAAACCTACTACACTTGGTGCCATGGAGATAGGGGCAACATCTGATGCCACACCAGAGTCAGTGATTGAGACACGGTATGTCATTAACAACCATACCAATAATGAAGCATTGATTGAGAATTTTCTTGGTAGATCTGCACTATGGACAAACCTAACACTGAGAGATGGTTTTGAAAAATGGGAAATAAACTTTCAAGAGCAGGCACACATAAGGAAAAAACTTGAACTCTTCACCTATGTGCGCTTTGACATGGAGGTCACAGTAGTGACCAACAACACTGGGTTAATGCAGATAATGTACTCACCACCAGGCATCACACCACCAGGAAGTGAATCAGATAAAAGATGGGATAGTGCAACAAATCCTAGTGTTTTTTATCAACCCAAGAGTGGCTTCCCCCGCTTCACTATACCTTTCACAGGACTTGGTTCTGCATATTACATCTTTTATGATGGATATGATGAAACATCCAAGGAGGCTGTATCATATGGTATATCATCTACCAATGATATGGGTACACTATGCTTCAGAGCTCTTGAAGACAAAACTAAACAGACTATTAAGGTGTTCATCAAACCCAAACACATCAAAGCTTGGTGTCCCCGTCCACCACGTGCTGTAGATTACACTCACAAATACAATCCCAATTATCATATACCAATTGAAGGAGGAAGTGGAAATCTTAAAGAGGAACACTATTTCAAATTCAGAAATGATATTAAGGCAACTGTAGAAACAGCAGGACCCAGTGATTTGTTTGTACACACTCAGGAATTCATATACAGAAATGCCCATTTAGCCACCCCTAGTGATAAGACAGTGCTGTTATCTTATACCTCTGATTTACAGGTGGACACATGTGATACACCAGGACCAGATAATATACCTGTTTGTGATTGCACAGAGGGCTGTTACTACTCACGCTCTAAAGACAGGTATTTTGTAATCAAAGTTAAGGCTTATGATTGGTACGAGGTCCAAGAAACAGTATATTACCCTAAACATATCCAGTACAATATGCTTATTGGAAAAGGTCATTGTCAACCAGGGGATTGTGGAGGTAAATTAATGTGCAGACATGGTGTAATCGGTATAATAACAGCAGGAGGAGATAGCCATGTGGCATTCACTGATCTTAGACCATACAAATTTTGTGCTGAAACACAAGGTCCAGTCTCAGATTACCTCAATCAACTCGGTAATGCTTTTGGTGAAGGATTCACACAAAACATTAAAGATAATTTCAATCACATATCTAACAACATCCAGGACCAGATCACAGGAAAGATCCTTAAATGGTTTGTTCGCATTATCAGTGCAATGACTATTATGATTAGGAATAGTGCAGATGTCCCCACAGTTTTAGCTACTCTCGCACTACTGGGATGCCATCACTCTCCATGGACATTTCTTAAAGACAAAATATGCAAATGGCTTGGGATCCCTAAACCACCCTCCAAGCAAGGTGATGGCTGGCTCAAGAAGTTTACAGAGTGGTGCAATGCTGCCAAAGGACTAGAATGGGTGGGTGTTAAAATAAGTAAATTTATAGATTGGCTAAAAGAAAAACTGATTCCAGCCGTGCAGAGCAAAAGGGACTTACTCAAGGAATGCAAGAAGATACCATTATACCAAGAGCAGATCAAAGCTTTTGCTCATGCTAAAGAGGATGCTCAAAATGAACTAATTGTAAATATAGATAAATTAAAGAAAGGTTTAGATCAGTTAGCACCTTTGTATGCAGTGGAAAACAAGAAAGTCACAGAGATGCAGAAAGAACTTAAGAGGTTAAGCTCCTATAAAAGAACACACCGACATGAACCAGTCTGTCTTCTTATTCATGGTGTGCCTGGCTGTGGTAAATCATTAACGACAACTGTCATAGCCAGAGGCTTGGCTTCGGAATCTGAAATTTACTCACTACCACCAGACCCAAAGTACTTTGATGGGTATGACCAACAGAAGGTTGTTATAATGGATGATGTGGGTCAAAACCCAGACGGCCAAGACATGGGGTTGTTCTGTCAAATGGTTTCCACCACAGACTTTCATGTACCTATGGCCGCTCTTGAAGATAAAGGAAAGAGTTTCACTAGTACTTATCTATTAGCTAGTACTAATTTACAACACCTAAATCCATCTACAGTACAAACACCAGATGCTGTAGATAGAAGATTTTTCCTGGATACAGACTTAAAGATCATGCCCAAATTTGTCAACCAAGCAGGGATGCTAAACACCGCACAAGCACTTCAGGCATGTCAAAATTGCCCAAAACCCAAACACTACAATCAGTGTTGCCCACTACTGTGTGGTAAGGCGGTTGTACTATACAACCGTAGAACACAAGCTAGTTACTCTATAAATATGGTTGTGGAGCAAATGAGAGAAGAGGCGATAGCCAGACTCAAGGTTAGACATAATCTAGATGCAATATTTCAAGGATTAGGTGACTCTGAAACACCAGGTTTCATAATTGATTTATTGTCTTCATCAAAAGACCCTAAGGTTATTCAGTATTGTGAGGATAATGGTTTGATTTCACATGCAGAAAGTAGTATTGATAGGCACATAAACCACACACACTATATTCTAAATTGTATAGGTAGTTTAATCATTATCTTGGGAACAT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38,134
OM001437.1
rhinovirus C36
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
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Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,026
GenBank
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Homo sapiens
null
2021
SAMN24255342
PRJNA723895
Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/L4RCSQ, complete genome
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34,224
OK254856.1
rhinovirus C36
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-12-11
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,026
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-22
SAMN21173603
PRJNA1066815
Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/FVW3YC, complete genome
GCCTGTTTTCCCTCCCCCCCCCCTCCTTTAATGTAACTTAGAAGCTTGAACAAACGCCCAATAGGATATGACCACTCCATGGTCGTAAAGGGCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGGTGTGTGAATAGGCTCTAACAGGGCTGAAGCTGTAGCACTCGTTATCCGCGCATCTACTACGCAGAGGCTAGTAGGACCATGTCAATCCTTTAGGCGTTTCGCTCAGCGTGTACCCCCCACGTAGATCAGGGCAATGGGGCTGCACATTCCCCATCGGCGACGATGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCTAGGCCTACTCGGCCTAGGACGCCAAAGGAAAGACAGGGTGTGAAGACCCGAGTGTGCTAGGTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTAGCCATGGTGTACAAGCCAGTACAAACATGGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTCTTTTTACCTTTCACTGCATTTATGGTTACAAGCTTGTAAATACAGACTTGTAATCATGGGTGCCCAGGTCAGCAAACAGAGTGTTGGAGCGCACGAAAACAGCATAACTGCTAACAAAGGCTCTATTGTTAAATACTTTAATATTAATTATTATAAGGATGCAGCAAGTTCTGGACTGACAAAACAGGATTTTTCTCAAGATCCCTCAAAATTCACCCAACCACTGGCAGATGCATTAACAAACCCAGCACTCATGTCCCCCAGCATTGAAGCATGTGGGTTCTCTGATAGGCTAAAACAGATCACTATCGGAGATTCTACTATTACCACACAAGATACACTTAACAGTGTGGTAGCTTATGGGGAGTGGCCTCAATACTTGTCTGACCTTGATGCCTCATCAATTGATAAGCCTACCCATCCTGAAACATCAGCTGATAGATTTTACACACTTGACAGCGTCAATTGGACTGGCACATCCCTGGGTTGGTGGTGGAAATTACCTGATTGCCTTAGAGAGATGGGTCTTTTTGGCCAGAATATGTATTACCACTCAATGGGTAGAACAGGTTATATCATCCATGTACAATGCAATGCTACAAAGTTTCACAGTGGATGCCTCATGGTTGCCGTTATACCTGAACATCAGATGGCGTACATTGGAGCAGGTGGGACTAATGTGAGGTATGACCAAACACACCCTGGTGAGGCAGGCCACACCATTACAGCATCTAAGCAGTGGGGTGAGCATAATCCTGATGAAAATCCATTCTATAATTTAAATGGTACCTTATTTGGAAATATACAAATATTCCCTCACCAGATGATTAACCTTAGGACTAATAACTCAGCAACAATAGTTGTTCCTTACATAAACTGTTTACCCATGGATAATATGTTGAGACACAATAATCTAACTTTGATGATCATCCCCATCGTGAAGTTACGTCACGGGACAACTGGAACCACGACTCTGCCAATAACTGTCACAATTGCTCCAGACAAATCAGAGTTCTCTGGGCCTATGCAGACCCAAAAGCAGGGTATACCCACTCGTATGCCCAGTGGAGCACAACAGTTTATGACAACTGAGGATGAGCAATCAGCAAACCTACTACCAGAGTACAGTCCTACCAAAGAAATACACATCCCAGGGAAAATCACCAATATGTTGCATATAGCACAGGTTGAATCATTCTTACCATTAAACAACACTGATCAGCATGTGGGTAGTATAGATATTTATGGTGTTACCATCACAGGAGCATCAGATAACAAGTTAATAGTGGCTATACCCTTACAGATGGACAATACTTTGTTTGCTACTACTTTATTAGGTGAGGTTCTTAATTATTATGCAAATTGGTCTGGAAGTGTTAGAGTAACGTTTATGTGTGTTTGTGATTCTTTTAGCACTGGTAAATTCCTGCTTGCATATACACCCCCGGGCGGTAGGCTACCACGGGATAGGAAAGAAGCTATGCTTGGTACCCATGTAGTGTGGGATCTAGGATTGCAATCAAGTTGCACCATGGTGGCACCATGGATATCCAGTACCTTTTTCCGCAGGACAAAAGCTGACAAGTACTCATCAGGTGGTATTATAACATTATGGCACCAAACTGCTTTTGTTAGCGGAGACACCGCCAATGTGGGCACTATACTGGCTACATGTTCTGGATGTCCTGATATATCTGTCAGGATGCTCCGGGATACTCCAATGGCAAAGCAACCCCAGAATATTAGACAAAACCCAGTTGAACAATTTATTGATGACACTCTTAAGGAAGTCCTTGTAGTACCAGATACTCAAACCTCGGGACCAATACATACAACTAAACCCACTGTTCTTAACGCCATGGAAATTGGTGCCACACCAGATGTGAATCCAGATGATGTCATTGAAACCCGCTACGTTATTAACAACCATGTTAATAACGAGGCTCTCATTGAAAACTTTCTTGGCCGATCAGCTCTTTGGGCGGAATTTCGGTTACAAGGTGGGTTTAAGAAGTGGGACATCAATTTTCAAGAGCAGGCACACATCAGGCGTAAGCTAGAGTTCTTCACATACGTGAGGTTTGACATGGAGGTCACCATTGTTACCAACAACACGGGCTTGATGCAGATAATGTTTATACCACCAGGCATTGAGGCCCCAGGTAATATCAGTGATAAAAGGTGGGATGGTGCCTCAAACCCCAGTATCTTTTACCAACCTAAAAGCGGTTTTCCGCGATTCACCATCCCTTTCACTGGTCTGGGGTCAGCATACTACATGTTCTATGATGGTTATGATGAAACAGAGAAAACTGGAACCGCATATGGAATTTCTGCAACAAATGATATGGGGACACTCTGCTTCAGAGCACTGGAAGACACTACCAATGATGATGTAAAAGTCTTCATCAAGCCAAAACACACGTCCGCATGGTGCCCCAGACCACCCAGAGCGGTTGATTACACCCACAAATACTCACCAAATTATCATACACGAACTGGGGAGAACAATGGCACACTAGAAGAAAAGCACTACATCAAAACACGCACAGATATTAAAACATTTGGTCCAAGTGATCAATTTGTACACACACAACATGCCAAGTACACCAACGCTCATCTGACCAACCCGAATGAGCACACCATTCTTTTAGCCTTGACAGCAGACTTGCAGGTGGATGCTACCATAGAACCAGGAAGTGATGTCATACCGGATTGTGATTGCGTGGAAGGGTGTTACTACTGCAAATCTCAGGACAGGTATTTCCCTATCAAGACCACACAGCATGATTGGTATGAGATACAAGAGACCGTGTACTACCCAAAGCATATACAGTATAACATCTTAATTGGGGAAGGACCAGCTAAACCAGGTGACTGTGGTGGTAAACTTTTGTGTAGACATGGTGTGATAGGCATACTCACTGCAGGCGGGGAGGGCCATGTTGCATTCACAGACCTCAGACCATATCGGGATCTAAATCACCATCAAGGACCTATTTCAAATTATCTGACACAGTTAGGCAATGCATTTGGTGAGGGTTTTACCCAAAATATTAAAGATAGTTTCTCTAACATCAGCACTTCCATTACTGACAAGTTAACTTCCAAAGTGATCAAGTGGCTGGTACGCATCATTAGTGCTCTTACTATCATGGTTAGGAATAGTGCTGACACACCCACAATCTTGGCCACCCTTGCCTTACTAGGTTGCAGTAAATCACCGTGGACATTCTTGAAGGAAAAAATCTGCATGTGGCTTGGAATCAGTAAACCCCCAAGTAAGCAAGGAGACAACTGGTTGAAGAAATTCACAGAATGCTGCAATGCTGCTAAAGGACTTGAGTGGATAGGAAACAAGATTAGTAAATTTATTGACTGGCTCAAGGAAAAACTGATACCAGCTGTTCAATCAAAGAAGATTATACTTGCAGAGTGTAAAAAGATTCCCTTGTATCAAGAACAGGTGAAAGGCTATCCAATGGCAGATGAAAAGGCACAGGGTGAATTATCAGTCACTATTGATAAATTAAAGAAAGGATTGGATGGTCTTGCACCACTTTATGCCAGGGAAAACAAATTAGTGACTGATATGCAAAAGCAACTGAACCAACTCAAGGCATATCAGCGCACGCACAGGACTGAACCAGTGTGTTTATTAATACATGGAGATCCAGGGTGCGGTAAATCTCTAGCCACAACAATAGTGTCACGAGGCCTTGCAGCAGAGGGAGATATTTACTCCCTACCACCCAATCCAAAGCACTTTGATGGATATAACCAACAGAAGGTGGTGATCATGGATGATGTAGGACAAAACCCTGATGGGGAAGATCTTGGCATCTTTTGTCAGATGGTTTCAACAACAGACTTCCACGTCCCCATGGCAGCTCTAGAAGATAAAGGCAGGTGCTTTACTAGTGATTACGTACTGGCAAGTACCAACATGTCAACACTTACACCACCAACTGTGCAATTACCTGAAGCACTGAACAGGAGATTCTACCTTGACATGGAGTTAAAGATAATGCCTAACTACTACTCAGCTGGAAACATGTTGAATACTGCCAAAGCTCTACAAAAGTGTGAAGGATGTGCTGCACCACCCTATTATAAACAATGTTGTCCAATGTTGTGTGGCAAGGCAGTGGTGCTACAAAATAGAAGAACCAAGGCTAATTACTCAATTAATATGGTGGTGGCACAAATGAGAGAGGAACTCCAGCACAGAAAGAGTGTAAAAAATAATTTACAGGCAATTTTCCAAGGGCTGGGTGACGACACTACACCTGGGTTTATCGTGGACTTACTAGCTTCGTCAAAGGATCCTAAAGTGATTAAGTACTGTGAAGAAAATGGCCTCATATCTCAGGCAAAGTGCACACTTGAGAGAAATATCGATCATCTGCAGTACATTCTTAATTGTCTAGGAAGTTTGATTCTCATCCTGGGTACCGTCTATGCACTATACAAACTTATGTGTATAGCACAAGGACCTTACTCTGGT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35,297
OK017953.1
rhinovirus C36
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,025
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
null
2021-05-25
SAMN20216683
PRJNA1066815
Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/QSP2V8, complete genome
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37,598
OK017957.1
rhinovirus C36
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
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Rhinovirus C
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Picornaviridae
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null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
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PRJNA723895
Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/SR8BMV, complete genome
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37,602
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rhinovirus C36
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-09-07
null
Rhinovirus C
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2021-06-09
SAMN20216754
PRJNA1066815
Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/YW8JLC, complete genome
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38,133
MZ835600.1
rhinovirus C36
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-07
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,025
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN20243988
PRJNA723895
Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/RPMS88, complete genome
GCCTGTTTTCCCTCCCCCCCCCCTCCTTTAATGTAACCTAGAAGCTTGAACAAACGCCCAATAGGATATGACCACTCCATGGTCGTAAAGGGCAAGCACTTCTGTCTCCCCGGGTGTGTGAATAAGCTCTAACAGGGCTGAAGCTGTAGCACTCGTTATCCGCGCACCTACTACGCAGAGGCTAGTAGGACCATGTCAATCCTTTAGGCGTTTCGCTCAGCGTGTACCCCCACGTAGATCAGGGCAATGGGGCTACACATTCCCCATCGGCGACGATGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCTAGGCCTACACGGCCTAGGACGCCAAAGGAAAGACAGGGTGTGAAGACCCGAGTGTGCTAGGTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGTAGCCATGGTGTACAAGCCAGTACAAACATGGTCGTAATGGGCAACTATGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTCTTTTTACCTTTCACTGCATTTATGGTTACAAGCTTGTAAATACAGACTTGTAATCATGGGTGCCCAGGTCAGCAAACAGAGTGTTGGAGCGCACGAAAACAGCATAACTGCTAACAAAGGCTCTATTGTTAAATACTTTAATATTAATTATTATAAGGATGCAGCAAGTTCTGGACTGACAAAACAGGATTTTTCTCAAGATCCCTCAAAGTTCACCCAACCACTGGCAGATGCATTAACAAACCCAGCACTCATGTCCCCCAGCATTGAAGCATGTGGGTTCTCTGATAGGCTAAAACAGATCACTATCGGAGATTCTACTATTACCACACAAGATACACTTAACAGTGTGGTAGCTTATGGGGAGTGGCCTCAATATTTGTCTGACCTTGATGCCTCATCAATTGATAAGCCTACCCATCCTGAAACATCAGCTGATAGATTTTACACACTTGACAGCGTCAATTGGACTGGCACATCCCTGGGTTGGTGGTGGAAATTACCTGATTGCCTTAGAGAGATGGGTCTTTTTGGCCAGAATATGTATTACCACTCAATGGGTAGAACAGGTTATATCATCCATGTACAATGCAATGCTACAAAGTTTCACAGTGGATGCCTCATGGTTGCCGTTATACCTGAACACCAGATGGCGTACATTGGAGCAGGTGGGACTAATGTGAGATATGACCAAACACACCCTGGTGAAGCAGGCCACACCATTACAGCATCTAAGCAGTGGGGTGAGCATAATCCTGATGAAAACCCATTCTATAATTTAAATGGTACCTTATTTGGAAATATACAAATATTCCCTCACCAGATGATTAACCTTAGGACTAACAACTCAGCAACAATAGTTATCCCTTACATAAACTGTTTACCCATGGATAATATGTTGAGACACAATAATCTAACTTTGATGATCATCCCCATCGTGAAGTTACGTCACGGGACAACTGGAACCACGACTCTGCCAATAACTGTCACAATTGCTCCAGACAAATCAGAGTTCTCTGGGCCTATGCAGACCCAAAAGCAGGGTATACCCACCCGTATGCCCAGTGGAGCACAACAGTTTATGACAACTGAGGATGAGCAATCAGCAAACCTACTACCAGAGTACAGTCCTACCAAAGAAATACACATCCCAGGGAAAATCACCAATATGTTGCATATAGCACAGGTTGAATCATTCTTACCATTAAACAACACTGATCAGCATGTGGGTAGCATAGATATTTATGGTGTCACCATCACTGGGGCATCAGACAACAAGTTAATAGTGGCTATACCCTTACAGATGGACAATACTTTGTTTGCTACTACTTTATTAGGTGAGGTTCTTAATTATTATGCAAATTGGTCTGGAAGTGTTAGAGTAACGTTTATGTGTGTTTGTGATTCTTTTAGCACTGGTAAATTCCTGCTTGCATATACACCCCCGGGCGGTAGACTACCACGGGATAGGAAAGAAGCTATGCTTGGTACCCATGTAGTGTGGGATCTAGGATTGCAATCAAGTTGCACCATGGTAGCACCATGGATATCCAGTACCTTTTTCCGCAGGACAAAAGCTGACAAGTACTCATCAGGTGGTATTATAACATTATGGCACCAAACTGCTTTTGTTAGCGGAGACACCGCCAATGTGGGCACTATACTGGCTACATGTTCTGGATGTCCTGATATATCTGTCAGGATGCTCCGGGATACTCCAATGGCAAAGCAACCCCAGAATATTAGACAAAACCCAGTTGAACAATTTATTGATGACACTCTTAAGGAAGTCCTTGTAGTGCCAGATACTCAAACCTCGGGACCAATACATACAACTAAACCCACTGTTCTTAACGCCATGGAAATTGGTGCCACACCAGATGTGAATCCAGATGATGTCATTGAAACCCGCTACGTTATTAACAACCATGTTAATAACGAGGCTCTCATTGAAAACTTTCTTGGCCGATCAGCTCTTTGGGCGGAATTTCGGTTACGAGGTGGGTTTAAGAAGTGGGACATCAATTTTCAAGAGCAGGCACACATCAGGCGTAAGCTAGAGTTCTTCACATACGTGAGGTTCGACATGGAGGTTACCATTGTTACCAACAACACGGGCTTGATGCAGATAATGTTTATACCACCAGGCATTGAGGCCCCAGGTAATATCAGTGATAAAAGGTGGGATGGTGCCTCAAACCCCAGTATCTTTTACCAACCCAAAAGCGGTTTTCCGCGATTCACCATCCCTTTCACTGGTCTGGGGTCAGCATACTACATGTTCTATGATGGTTATGATGAAACAGAGAAAACTGGAACCGCATATGGAATTTCTGCAACAAATGATATGGGGACACTCTGCTTCAGAGCACTGGAAGACACTACCAATGATGATGTAAAAGTCTTCATCAAGCCAAAACACACATCCGCATGGTGCCCCAGACCACCCAGAGCGGTTGATTACACCCACAAATACTCACCAAATTATCATACACGAACTGGGGAGAACAATGGCACACTAGAAGAAAAGCACTACATCAAAACACGCACAGATATTAAAACATTTGGTCCAAGTGATCAATTTGTACACACACAACATGCCAAGTACACCAACGCTCATCTGACCAACCCGAATGAGCACACCATTCTTTTAGCCTTGACAGCAGACTTGCAGGTGGATGCTACCGCAGAACCAGGAAGTGATGTCATACCGGATTGTGATTGCGTGGAAGGGTGTTACTACTGCAAATCTCAGGACAGGTATTTCCCTGTCAAGACCACACAGCATGATTGGTATGAGATACAAGAGACCGTGTACTACCCAAAGCATATACAGTATAACATCTTAATTGGGGAAGGACCAGCTAAACCAGGTGACTGTGGTGGTAAACTTTTGTGTAGACATGGTGTGATAGGCATACTCACTGCAGGCGGGGAGGGCCATGTTGCATTCACAGACCTCAGACCATATCGGGATCTAAATCACCATCAAGGACCTATTTCAAATTATCTGACACAGTTAGGCAATGCATTTGGTGAGGGTTTTACCCAAAATATTAAAGACAGTTTCTCTAACATCAGCACTTCCATTACTGACAAGTTAACTTCCAAAGTGATCAAGTGGCTGGTACGCATCATTAGTGCTCTTACTATCATGGTTAGAAATAGTGCTGACACACCCACAATCTTGGCCACCCTTGCCTTACTAGGTTGCAGTAAATCACCGTGGACATTCTTGAAGGAAAAAATCTGCATGTGGCTTGGAATCAGTAAACCCCCAAGTAAGCAAGGAGACAACTGGTTGAAGAAATTCACAGAATGCTGCAATGCTGCTAAAGGACTTGAGTGGATAGGAAACAAGATTAGTAAGTTTATTGACTGGCTCAAGGAAAAACTGATACCAGCTGTTCAATCAAAGAAGATTATACTTGCAGAGTGTAAAAAGATTCCCTTGTATCAAGAACAGGTGAAAGGCTATCCAATGGCAGATGAAAAGGCACAGGGTGAATTATCAGTTACTATTGATAAATTAAAGAAAGGATTGGATGGTCTTGCACCACTTTATGCCAGGGAAAACAAATTAGTGACTGATATGCAAAAGCAACTGAACCAACTCAAGGCATATCAGCGCACGCACAGGACTGAACCAGTGTGTTTATTAATACATGGAGATCCAGGGTGCGGTAAATCTCTAGCCACAACAATAGTGTCACGAGGCCTTGCAGCAGAGGGAGATATTTACTCCCTACCACCCAATCCAAAGCACTTTGATGGATATAACCAACAGAAGGTGGTGATCATGGATGATGTAGGACAAAACCCTGATGGGGAAGATCTTGGCATCTTTTGTCAGATGGTTTCAACAACGGACTTCCACGTTCCCATGGCAGCTCTAGAAGATAAAGGCAGATGCTTTACTAGTGATTACGTACTGGCAAGTACCAACATGTCAACACTTACACCACCAACTGTGCAATTACCTGAAGCACTGAACAGGAGATTCTACCTTGACATGGAGTTAAAGATAATGCCTAACTACTACTCAGCTGGAAACATGTTGAATACTGCCAAAGCTCTACAAAAGTGTGAGGGATGTGCTGCACCACCCTATTATAAACAATGTTGTCCAATGTTGTGTGGCAAGGCAGTGGTGCTACAAAATAGAAGAACCAAGGCTAATTACTCAATTAATATGGTGGTGGCACAAATGAGAGAGGAACTCCAGCACAGAAAGAGTGTAAAAAATAATTTACAGGCAATTTTCCAAGGGCTGGGTGACGACACTACACCTGGGTTTATCGTAGACTTACTAGCTTCATCAAAGGATCCTAAAGTGATTAAGTACTGTGAAGAAAATGGCCTCATATCTCAGGCAAAGTGCACACTTGAGAGAAATATCGATCATTTGCAGTACATTCTTAATTGTCTAGGAAGTTTGATTCTCATCCTGGGTACCGTCTATGCACTATACAAACTTATGTGTATAGCACAAGGACCCTACTCTGGTC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38,176
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rhinovirus C36
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN20216670
PRJNA723895
Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/PEXCU4, complete genome
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39,584
MZ629160.1
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
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Rhinovirus C
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Picornaviridae
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USA
USA
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2021-06-01
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Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/R7HPRS, complete genome
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rhinovirus C36
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-04-19
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Rhinovirus C36 strain RvC36/USA/2021/373119-4, complete genome
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41,717
OL638426.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
D6RUSG
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Enterovirus
Picornaviridae
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USA
USA
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2021-06-18
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PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/D6RUSG, complete genome
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2021
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PRJNA723895
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35,383
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-12-11
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Rhinovirus C
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USA
USA
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2021
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rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-09-28
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2021-06-18
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PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/D7KU9F, complete genome
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37,695
OK181499.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,106
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-18
SAMN20933092
PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/UUAFSF, complete genome
TGCACCCACCCACACTGTCTACGGACGTTGTACTCTTGTATTCCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCTATACACCCCGTAACAATAGAAGTTTATACACACTCAGACCAATAGGGGGTGTTCATCCAGTTCACCCAGGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATAGGGGTGTTAGGTTTCACCCGAGGCCGAAGCTCTGATTGTCGTTATCCGCACAACTACTGGACAAAGCTTAGTAACATCTTACGATACAGCATGGTTGGTTGTTCCGCCAGTACCCCCTGGTAAACCTGGCAGATGGGGCTAGAAGTTCCTCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCTCCCTTACGGGAGAAGCCATTCTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGACTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCTGCAGCCATTGCATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTGTTTTTCTTTTACTGACGTTTATGGTGACAATATATATATAACGTATATATTGTTCACCATGGGCGCTCAGGTATCTAGACAAACCACTGGATCGCATGAGAATGCCATCACTGCTACCAATGGAGGCCTTATCAAGTATTTCAACATAAACTACTACAAGGATTCGGCTAGTTCAGGTTTGGCTAAACAAGACTTCACTCAAGATCCATCCAAATTTACTCAACCCCTGGCAGAGGTTCTGACAAATCCAGCTCTTATGTCCCCAACCGTTGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATCACTACACAGGATGCTCTTCATACAGTTCTGGCCTATGGAGAATGGCCTAGTTATTTGTCAGATCTTGATGCCACTTCAGTGGACAAACCCACACATCCGGAAACTTCATCGGACAGATTTTACACCCTCACCAGTGTGGAATGGAATGCTACTTCAAGCGGATGGTGGTGGAAACTTCCAGACGCCTTAAAAGATATGGGAATTTTTGGCCAAAACTTATACTACCACTCAATGGGTAGAGCAGGGTACATAATACACACACAATGTAATGCTACTAAATTCCACAGTGGAGCATTGATGGTTGTTTTAATACCTGAACATCAGCTGGCATATGCTGGTGGTGCAAATGCCAGTGTTGGATACAAGCACACTCATCCAGGTGAGGATGGTCATAAAATTGAGAAGAGAGGTTTCGATGACAACAAACCAGATGAAGACCCCTTTTTTAACTGCAACGGGACACTGTTTGGTAACCTCACTATATTCCCACACCAGATTATTAATCTTAGAACCAATAACTCCAGCACAATTATTAGCCCTTACATCAATTGCCAACCAATGGATAACATGCTAAAGCACAACAATCTTACATTGCTGATAGTGCCACTGGTTAAACTTACACCTGGAACTGGTGCCTCACCCAACGTGTCTATAACAGTGTCAATTGCACCATACAAATCAGAGTTTTCTGGTGCTATGGAGACACGTTACACAGTACAACAACAGGGTTTACCCATTCGCATGCCAAGTGGGTCCCAGCAATTTATGACTACTGAAGATGAACAATCACCCAACATGCTACCTGGCTACCACTCCAGCAAGAAAATACACATACCAGGTATGATCACAAATGTCTTGCACATGGCTAGAGTTGACTCCTTCATGCCTATCAACAATATCCGTTCTGAGATCGGCAAGGTTTCAATTTACAATATACCAATATTAAGGAAAACTAACAATGATGGATTAATACTCTCCATACCCTTAGACATGAGTAATAGTCTATTTGCCACCACACTGTTGGGGGAAGTGCTGAATTACTTTACTAACTGGTCAGGTAGTATTACTCTCACTTTCATGTGCGTGTGTGATTCTTTCTCAACTGGAAAATTCTTATTAGCGTACACCCCCCCTGGAGGAGCACATCCTGCCAACAGAAAGCAAGCCATGTTAGGGGTGCATGTTGTTTGGGATCTGGGTCTACAATCATCATGTACCATGGTGATACCTTGGATATCTTCAGGATTTTATCGCAACACTAAATCTGATGACCACACTGAAGCAGGGTACGTTTCACTCTGGTACCAGACAGATTTCGTAACTACCACAACAGCAGGACAAGGTGCTATATTAGTTACTTGTAGTGGATGCCCAGATATCTCAGTCAGAATGTTAAGAGACACACCAATGATGAAACAAGATGATGATGAATTGCAGAATAATGATCCAATAGAGCAATTTGTACATGATACACTAAATGAAGTTGTAGTAGTACCCAACACACAAGCTTCTGGACCTCAACACACCACACGGCCCAGTGCGTTAAGTGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCACAGCTACCCCTGAATCCACACTAGAGACTAGGTATGTAGTGAATGATAACACAAATGAAGAAGCCGAGATAGAGATATTCTTGGGGAGATCAGCAATTTGGACCAAAAAGACCTTGAAACAAGGATTCTTGAAATGGAAGATAAGTTTCCAGGAACAAGCTCACATTAGGAAAAAGTTTGAGCTATTCACTTACCTCAGGTTTGACATGGAAGTCACAATAGTCATTAACAACCAAGATCTAATGCAAATAATGTATATACCACCTGGTATAGCCATACCTGACGGTAAGGATGACAACAAATGGGATTCAGCCTCCAACCCAAGTGTATTCTACCAGCCCAAAAGTGGATTCCCCCGCTTCACAATACCTTTTACAGGTCTAGCCTCTGCTTATTACATATTTTATGATGGTTACAGTAAGACAACTGGTGAACCTAGGGATACCTATGGTATCTCTCCTACCAATGATATGGGCACATTGTGCTTCCGTTCACTGGAAGGAACAGGCAATGCAGAGGTGAGGGTTTACGTGAAACCAAAACACACTACAGCATGGATTCCCAGACCTCCCCGCGCTGTACAATACACACATACCTACAGTACAAACTACCACTACAAGAAGGAAGATGCCACCTTGGAGGACAGACACTTCATACAACACAGAGAAGGCATCAAAATTTTACAGAATGCAGGACCAAGTGATCTGTATGTCCATACTAAAGATGCTATCTACACATGTGCACACTTAACCACACCAAATGATAGCACCATCCTGCTGGCCTACACAGCAGATCTGCAAGTTGATAGTAGTGAAACCAAGGGCCCAGATCACATTCCAGATTGTGATTGTACCTCAGGTTGTTATTATGTCAGGCACTTAGATAGATACTGCCCAGTAACTTTAACTTCCCACGACTGGTACGAAATACAAGAATCAGATTACTACCCCAGACACATACAATATAACATCCTGATTGGTGAGGGTCCTTGCAAGCCTGGAGATTGCGGTGGTAAATTACTTTGTAGACATGGAGTCATAGGGATTGTCACTGCTGGTGGTGAAGGGCATGTTGCATTCACTGATTTACGCCCATACTCAAGTCTTTCCACTCATCAGGGAGTTATATCAGATTACTTCACTCAATTGGGCGATGCTTTTGGGGAGGGTTTCACACACAACATAAAAGAACACTTCTCTAATCTGTCTTCAAACATTACTGATAAAATTACAGGCAAGGTAGTTAAATGGTTAGTGCGCATCATTAGTGCTCTCACTATCATGATTAGAAACTCAACAGATACAGCAACAATACTTGCCACTTTGGCGCTGTTAGGGTGTCAGAGCTCCCCATGGAACTTCCTTAAAAATAAGATATGCCAGTGGCTAGACATACCCAAACCCCCTTCCAGACAAGGTGATTCGTGGATTAAGAAATTTACAGAATGCTGTAATGCAGCCAAGGGTTTAGAATGGGTTGCCATAAAAATTGGGAAATTTATTGATTGGTTGAAAGAAAAATTAATTCCCACAGTGCAACGGAAAAAGGAAACACTGGAACAATGCAAGAAGCTGGCCCTCTATGAGGAGCAATGTAAGGGATTTTCCAAGTCAGATGCTCAGGCCCAACAACAACTCATCATAGAAGTAGCTAAGCTGAAGAAAGGTCTAGATGAATTGGCACCTTTGTATGCTAGTGAGAACAAAAGAGCAACAGGAGTTCAGAAAGAACTACAACGCATGACTGCGTACCACAAAACACATCGACATGAACCAGTCTGTTGTCTAATACGTGGGCAACCTGGATGTGGGAAATCACTAGTCACCTCAATCATTGCACGTGGACTTGCGTCAGAGGCTCATGTCTATTCACTGCCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGCTACGACCAACAGAAAGTTGTCATAATGGATGACATAGGGCAAAATCCAGATGGGAAAGATCTCAGCATGTTCTGTCAAATGGTTTCCACCACAGAATTCATAGTGCCAATGGCCAATATAGAAGAGAAGGGTAGATCATTCACCAGTGAATACATCTTAGCCAGCACGAACCTTGATGCACTTACTCCACCTACAATAACTATTCCAGATGCAATCAAAAGGAGGTTCTTCATAGATGTGGACTTAGTTATTATTAGCAAGTTTAGAAACTCTAGTGGCCTTTTAGATACAGCAAAGGCACTACAACCCTGTGCTAATTGCCCCAAACCAGCCTGCTTTAAGCAATGCTGTCCCTTGCTGTGTGGCCAAGCAGTTGTTCTGCAAGATAGGAAAAGCAAAGCTAGTTATCCTGTGAATGCAATAGTACAGCAACTCCAACATGAGAACTCAACGCGCAAGAAGGTGAAAGATAACCTAGAAGCCATATTCCAAGGATTGGGTGACCCAACTCCACCAGGATTTATTGTGGACCTGTTGTCAGCTTCAAAAAACCCAAAGGTTATTGAATACTGTGTGGAGCAAGGGTGGGTTGGTAAAGCAAACTCTACTGTTGAGAGAGATTTGAATTATGTTCACTACATACTAAATTGTTTAGGG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rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-09-07
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Rhinovirus C
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Picornaviridae
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2021-06-10
SAMN20244009
PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/XY4C8S, complete genome
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38,192
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-07-14
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Rhinovirus C
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Picornaviridae
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GenBank
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USA
USA
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2021-05-12
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Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/BZ2L22, complete genome
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40,570
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rhinovirus C42
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2021-07-14
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PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/TCES2G, complete genome
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40,589
MZ268647.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
7CST74
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,098
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN19177296
PRJNA723895
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/7CST74, complete genome
ACCCACCCACACTGTCTACGGACGTTGTACACTTGTATTCCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCTATACACCCCGTAACAGTAGAAGTTTACACACACCCAGACCAATAGGGGGTGTTCATCCAGTTCACCCAGGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATAGGGGTGTTAGGTTTCACCCGAGGCCGAAGCTCCGATTGTCGTTATCCGCACAACTACTGGACAAAGCTTAGTAACATCTTACGATGTAGCATGGTTGGTTGTTCCGCCAGTACCCCCTGGTAAACCTGGCAGATGGGGCTAGAAGTTCCTCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCTCCCTCACGGGAGAAGCCATCCTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGATTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCTGCAGCCATTGCATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTTACTGACGTTTATGGTGACAATATATATATAACGTATATATTGTTCATCATGGGCGCTCAGGTATCTAGACAAACCACTGGATCGCATGAGAATGCCATCACTGCTACCAATGGAGGCCTTATCAAATACTTCAACATAAACTACTACAAGGATTCGGCTAGTTCAGGTTTGGCTAAACAAGACTTCACTCAAGATCCATCCAAGTTTACTCAACCCCTGGCAGAGGTTCTGACAAATCCAGCTCTTATGTCCCCAACCGTTGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATCACTACACAGGATGCTCTTCATACAGTTCTGGCCTACGGAGAATGGCCTAGTTATTTGTCAGATCTTGATGCCACTTCAGTGGACAAACCCACACACCCGGAAACTTCATCAGACAGATTTTACACCCTTACCAGCGTGGAATGGAATGCTACTTCAAGCGGGTGGTGGTGGAAACTTCCAGACGCCTTAAAAGACATGGGCATTTTTGGCCAAAACTTATATTACCACTCAATGGGTAGAGCAGGGTACATAATACACACACAATGTAATGCTACTAAATTCCACAGTGGAGCATTGATGGTTGTTTTAATACCTGAACACCAGCTGGCATATGCTGGAGGTGCAAATGCCAGTGTTGGATACAAACACACTCATCCAGGTGAGGATGGTCATAAAATTGAGAAGCGAGGTTTTGATGACAACAAACCAGATGAAGACCCCTTCTTCAACTGCAACGGGACACTGTTTGGTAACCTCACTATATTCCCACACCAGATTATTAATCTTAGAACCAATAATTCCAGCACAATTATTAGCCCTTACATCAATTGCCAACCAATGGACAACATGCTAAAGCACAACAATCTTACACTACTGATAGTACCACTGGTTAAACTTACACCTGGAACTGGTGCCTCACCCAACGTGTCTATAACAGTGTCAATCGCACCATATAAATCAGAGTTTTCTGGTGCTATGGAGACACGTTATACAGTACAACAACAGGGTTTACCCGTTCGCATGCCAAGTGGGTCCCAGCAATTTATGACCACTGAAGATGAACAATCACCCAACATGCTACCTGGCTACCACTCCAGCAAGAAAATACACATACCAGGTATGATCACAAATGTCTTGCACATGGCTAGAGTTGACTCCTTCATGCCTATCAACAACATCCGTTCCGAGATCGGCAAGGTACCAATTTACAATATACCAATATTAAGGAAAACTAACAATGATGGATTAATACTCTCCATACCCTTAGACATGAGTAATAGTCTATTTGCCACCACACTGTTGGGGGAAGTGCTGAATTACTTTACCAACTGGTCAGGTAGTATTACTCTTACTTTCATGTGTGTGTGTGATTCTTTCTCAACTGGAAAATTCTTGTTAGCGTACACCCCCCCAGGAGGAGCACATCCTGCCAACAGAAAACAGGCCATGTTAGGGGTGCATGTTGTTTGGGATCTGGGTCTACAATCATCATGTACCATGGTGATACCTTGGATATCTTCAGGATTTTATCGCAACACCAAATCTGATGACCACACAGAAGCAGGGTACGTTTCACTTTGGTACCAGACAGATTTCGTAACTACCACAACAGCAGGACAAGGTGCTATACTAGTTACTTGTAGTGGGTGCCCAGATATATCAGTCAGAATGTTAAGAGACACACCAATGATGAAACAAGATGATGATGAATTGCAGAATAATGACCCAATAGAGCAATTTGTACATGACACACTAAATGAAGTTGTAGTAATACCCAACACACAAGCTTCTGGGCCTCAACATACCACACGGCCCAGTGCGTTAAGTGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCACAGCTACCCCTGAATCCACACTAGAGACCAGGTATGTAGTGAATGATAACACAAATGAAGAAGCTGAAATAGAGATATTCTTGGGGAGATCAGCAATTTGGACCAAAAAGACCTTAAAACAAGGATTCTTGAAATGGAAGATAAGTTTCCAGGAACAAGCTCACATTAGGAAAAAGTTTGAGCTATTCACTTACCTCAGATTTGACATGGAAATCACAATAGTCATTAACAACCAAGATCTAATGCAAATAATGTATATACCACCTGGCATAGCCATACCTGATGGTAAGGATGACAACAAGTGGGATTCAGCCTCCAACCCAAGTGTGTTCTACCAGCCTAAAAGTGGATTCCCCCGCTTTACAATACCCTTTACAGGTCTAGCCTCTGCATATTACATATTTTATGATGGTTACAGTAAAACAACTGGTGAACCTAGAGATACCTATGGTATCTCTCCTACCAATGATATGGGCACCTTGTGCTTCCGTTCACTGGAAGGAACAGGCAATGCAGAGGTGAGGGTCTATGTGAAACCAAAACACACTACAGCATGGATTCCCAGACCTCCCCGCGCTGTACAATACACACATACCTACAGTACAAACTACCACTACAAGAAGGAGGACGCCACCTTGGAGGACAGGCACTTCATACAACACAGAGAGGGCATCAAAATTTTACAGAATGCAGGACCAAGTGATCTGTATGTCCATACTAAAGATGCTATCTATACATGTGCACACTTAACTACACCAAATGATGACACCATCCTGCTGGCCTACACAGCAGATCTGCAAGTTGATAGTAGTGAAACCAAGGGTCCAGATCACATTCCAGATTGTGATTGTACCTCAGGTTGTTATTATGTCAGACACTTAGATAGATACTGCCCAGTAACTTTAACTTCCCATGACTGGTACGAAATACAAGAATCAGATTACTACCCCAGACACATACAATATAATATCCTGATTGGTGAGGGTCCTTGCAAGCCTGGGGACTGCGGTGGCAAATTACTTTGCAAGCATGGGGTCATAGGTATTGTCACCGCTGGTGGTGAAGGACATGTAGCATTCACTGACTTGCGCCCATACTCAAGTCTTTCCACTCATCAGGGAGTTATATCAGATTACTTCACTCAATTGGGTGATGCTTTTGGTGAGGGCTTCACACACAACATAAAAGAACATTTCTCTAATCTGTCCTCAAACATTACTGATAAAATTACAGGCAAGGTAGTTAAATGGTTAGTGCGCATTATTAGTGCTCTGACTATCATGATTAGAAACTCAACAGACACAGCAACAATACTTGCCACCTTGGCGCTATTAGGGTGTCAGAGCTCCCCATGGAACTTCCTCAAGAATAAGATATGCCAGTGGCTAGATATACCCAAACCCCCTTCCAGACAAGGTGACTCATGGATTAAGAAATTTACAGAATGCTGTAATGCAGCCAAGGGTTTAGAATGGGTTGCTATAAAAATTGGGAAATTTATTGATTGGTTGAAAGAAAAATTAATTCCCACAGTGCAACGGAAAAAGGAAACACTGGAACAATGCAAGAAACTGGCCCTCTATGAGGAGCAATGCAAGGGATTTTCCAAATCAGATGCCCAGGCCCAACAACAACTCATCATAGAAGTGGCTAAGCTGAAGAAAGGTCTAGATGAATTAGCACCTTTGTATGCTAGTGAGAACAAAAGAGCAACAGGAATTCAGAAAGAACTACAACGCATGACTGCGTACCACAAAACACATCGACATGAACCAGTCTGTTGTCTAATACGTGGACAACCTGGATGTGGGAAATCACTAGTCACTTCAATCATTGCGCGTGGACTTGCGTCAGAGGCTCATGTCTACTCACTGCCCCCAGATCCAAAATACTTTGATGGTTACGACCAACAGAAAGTTGTCATAATGGATGATATAGGGCAAAATCCAGATGGGAAAGACCTCAGCATGTTCTGTCAAATGGTTTCCACCACAGAATTCATAGTGCCAATGGCCAATATAGAAGAGAAGGGTAGATCATTTACCAGTGAGTACATCTTAGCCAGCACAAATCTTGATGCTCTTACTCCACCCACAATAACTATACCAGATGCAATCAAAAGGAGGTTCTTCATAGATGTGGATTTAGTTATTATTAGCAAGTTTAGAAACTCTAGTGGTCTTTTAGATACAGCAAAGGCACTACAACCCTGTGCTAATTGCCCCAAACCAGCCTGCTTTAAGCAATGCTGTCCCTTATTGTGTGGTCAAGCAGTTGTTCTGCAAGATAGGAGAAGCAAAGCTAGTTATCCTGTGAATGCAATAGTACAGCAACTCCAACATGAGAACTCAACGCGCAAGAAGGTGAAAGATAACCTAGAAGCCATATTCCAAGGATTGGGTGATCCAACCCCACCAGGATTTATTGTGGACCTGTTGTCAGCTTCAAAAAACCCAAAGGTCATTGAATACTGTGTGGAACAAGGGTGGGTTGGTAAAGCAAACTCTACTGTTGAGAGAGACTTGAATTATGTTCACTACATACTAAATTGCTTGGGGAGT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41,380
MZ268709.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
044858
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,104
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
null
2021-05-03
SAMN19177353
PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/044858, complete genome
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41,437
MZ363413.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
5E6LQM
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,098
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN19406348
PRJNA723895
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/5E6LQM, complete genome
ACCCACCCACACTGTCTACGGACGTTGTACTCTTGTATTCCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCTATACACCCCGTAACAATAGAAGTTTATACACACTCAGACCAATAGGGGGTGTTCATCCAGTTCACCCAGGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATAGGGGTGTTAGGTTTCACCCGAGGCCGAAGCTCTGATTGTCGTTATCCGCACAACTACTGGACAAAGCTTAGTAACATCTTACGATATAGCATGGTTGGTTGTTCCGCCAGTACCCCCTGGTAAACCTGGCAGATGGGGCTAGAAGTTCCTCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCTCCCTTACGGGAGAAGCCATTCTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGACTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCTGCAGCCATTGCATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTTACTGACGTTTATGGTGACAATATATATATAACGTATATATTGTTCATCATGGGCGCTCAGGTATCTAGACAAACCACTGGATCGCATGAGAATGCCATCACTGCTACCAATGGAGGCCTTATCAAGTATTTCAACATAAACTACTACAAGGATTCGGCTAGTTCAGGTTTGGCTAAACAAGACTTCACTCAAGATCCATCCAAATTTACACAACCCCTGGCAGAGGTTCTGACAAATCCAGCTCTTATGTCCCCAACCGTTGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATCACTACACAGGATGCTCTTCATACAGTTCTGGCCTATGGAGAATGGCCTAGTTATTTGTCAGATCTTGATGCCACTTCAGTGGACAAACCCACACATCCGGAAACTTCATCGGACAGATTTTACACCCTCACCAGTGTGGAATGGAATGCTACTTCAAGCGGATGGTGGTGGAAACTTCCAGACGCCTTAAAAGACATGGGCATTTTTGGCCAAAACTTATACTACCACTCAATGGGTAGAGCAGGGTACATAATACACACACAATGTAATGCTACTAAATTCCACAGTGGAGCATTGATGGTTGTTTTAATACCTGAACACCAGCTGGCATATGCTGGTGGTGCAAATGCCAGTGTTGGATACAAGCACACTCATCCAGGTGAGGATGGTCATAAAATTGAGAAGCGAGGTTTCGATGACAACAAACCAGATGAAGACCCTTTCTTTAACTGCAACGGGACACTGTTTGGTAACCTCACTATATTCCCACACCAGATTATTAATCTTAGAACTAATAATTCCAGCACAATTATTAGCCCCTACATCAATTGCCAACCAATGGATAACATGCTAAAGCACAACAATCTTACATTGCTGATAGTGCCACTGGTTAAACTTACACCTGGAACTGGTGCCTCACCCAACGTGTCTATAACAGTGTCAATTGCACCATACAAATCAGAGTTTTCTGGTGCCATGGAGACACGTTACACAGTACAACAACAGGGTTTACCTATTCGCATGCCAAGTGGGTCCCAGCAATTCATGACTACTGAAGATGAACAATCACCCAACATGCTACCTGGCTACCACTCCAGCAAGAAAATACACATACCAGGTATGATCACAAATGTCTTGCACATGGCTAGAGTTGATTCCTTCATGCCTATCAACAATATCCGTTCTGAGATCGGCAAGGTTTCAATTTACAATATACCAATATTAAGGAAAACTAACAATGATGGATTAATACTCTCCATACCCTTAGACATGAGTAATAGTCTATTTGCCACCACACTGTTGGGGGAAGTGCTGAATTACTTTACTAACTGGTCAGGTAGTATTACTCTCACTTTTATGTGCGTGTGTGATTCCTTCTCAACTGGAAAATTCTTATTAGCGTACACCCCCCCTGGAGGAGCACATCCTACCAACAGAAAGCAAGCCATGTTAGGGGTGCATGTTGTTTGGGATCTGGGTCTACAATCATCATGTACCATGGTGATACCTTGGATATCTTCAGGATTTTATCGCAACACCAAATCTGATGACCACACTGAAGCAGGGTACGTTTCACTCTGGTACCAGACAGATTTCGTAACTACCACAACAGCAGGACAAGGTGCTATATTAGTTACTTGTAGTGGATGCCCAGATATCTCAGTCAGAATGTTAAGAGACACACCAATGATGAAACAAGATGATGATGAATTACAGAATAATGACCCAATAGAGCAATTTGTACATGATACACTAAATGAAGTTGTAGTAGTACCCAACACACAAGCTTCTGGACCTCAACACACCACACGGCCCAGTGCGTTAAGTGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCACAGCTACCCCTGAATCCACACTAGAGACTAGGTATGTAGTGAATGATAACACAAATGAAGAAGCCGAGATAGAGATATTCTTGGGGAGATCAGCAATTTGGACCAAAAAGACCTTGAAACAAGGATTCTTGAAATGGAAGATAAGTTTCCAGGAACAAGCTCACATTAGGAAAAAGTTTGAGCTATTCACTTATCTCAGGTTTGACATGGAAGTCACAATAGTCATTAACAACCAAGATCTAATGCAAATAATGTATATACCACCTGGTATAGCCATACCTGACGGTAAGGATGACAACAAATGGGATTCAGCCTCCAACCCAAGTGTATTCTACCAGCCCAAAAGTGGATTCCCCCGCTTCACAATACCCTTTACAGGTCTAGCCTCTGCTTATTACATATTTTATGATGGTTACAGTAAGACAACTGGTGAACCTAGGGATACCTATGGTATCTCTCCTACCAATGACATGGGCACCTTGTGCTTCCGTTCACTGGAAGGAACAGGCAATGCAGAGGTGAGGGTTTACGTGAAACCAAAACACACTACAGCATGGATTCCCAGACCTCCCCGCGCTGTACAATACACACATACCTACAGTACAAACTACCACTACAAAAAGGAAGATGCCACCCTGGAGGACAGACACTTCATACAACACAGAGAAGGCATCAAAATTTTACAGAATGCAGGACCAAGTGATCTGTATGTCCATACAAAAGATGCTATCTACACATGTGCACACTTAACCACACCAAATGATAGCACCATCCTGCTGGCCTACACAGCAGATCTGCAAGTTGATAGTAGTGAAACCAAGGGCCCAGATCACATTCCAGATTGTGATTGTACCTCAGGTTGTTATTATGTCAGACACTTAGATAGATACTGCCCAGTAACTTTAACTTCCCACGACTGGTACGAAATACAAGAATCAGATTACTACCCCAGACACATACAATATAACATCCTGATTGGTGAGGGTCCTTGCAAGCCTGGAGATTGCGGTGGTAAATTACTTTGTAGACATGGAGTCATAGGGATTGTCACTGCTGGTGGTGAAGGGCATGTTGCATTCACTGATTTACGCCCATACTCAAGTCTTTCCACTCATCAGGGAGTTATATCAGATTACTTCACTCAATTGGGCGATGCTTTTGGGGAGGGTTTCACACACAACATAAAAGAACACTTCTCTAATCTGTCTTCAAACATTACTGATAAAATTACAGGCAAGGTAGTTAAATGGTTAGTGCGCATCATTAGTGCTCTCACTATCATGATTAGAAATTCAACAGATACAGCAACAATACTTGCCACTTTGGCGCTGTTAGGGTGTCAGAGCTCCCCATGGAGCTTCCTTAAAAATAAGATATGCCAGTGGCTAGACATACCCAAACCCCCTTCCAGACAAGGTGATTCGTGGATTAAGAAATTTACAGAATGCTGTAATGCAGCCAAGGGTTTAGAATGGGTTGCCATAAAAATCGGGAAATTTATTGATTGGTTGAAAGAAAAATTAATTCCCACAGTGCAACGGAAAAAGGAAACACTGGAACAATGCAAGAAACTGGCCCTCTATGAGGAGCAATGTAAGGGATTTTCCAAGTCAGATGCTCAGGCCCAACAACAACTTATCATAGAAGTAGCTAAGCTGAAGAAGGGTCTAGATGAATTGGCACCTTTGTATGCTAGTGAGAACAAAAGAGCAACAGGAGTTCAGAAAGAACTACAACGCATGACTGCGTACCACAAAACACATCGACATGAACCAGTTTGTTGTCTAATACGTGGGCAACCTGGATGTGGGAAATCACTAGTCACCTCAATCATTGCACGTGGACTTGCGTCAGAGGCTCATGTCTATTCACTGCCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGCTACGATCAACAGAAAGTTGTCATAATGGATGACATAGGGCAAAATCCAGATGGGAAAGATCTCAGCATGTTCTGTCAAATGGTTTCCACCACAGAATTCATAGTGCCAATGGCCAATATAGAAGAGAAGGGTAGATCATTCACCAGTGAATACATCTTAGCCAGCACAAATCTTGATGCACTTACTCCACCTACAATAACTATTCCAGATGCAATCAAAAGGAGGTTCTTCATAGATGTAGACTTAGTTATTATTAGTAAGTTCAGAAACTCTAGTGGCCTTTTAGATACAGCAAAGGCACTACAACCCTGTGCTAATTGCCCCAAACCAGCCTGCTTTAAGCAATGCTGTCCCTTGCTATGTGGCCAAGCAGTTGTTCTGCAAGATAGGAAAAGCAAAGCTAGTTATCCTGTGAATGCAATAGTACAGCAACTCCAACATGAGAACTCAACGCGCAAGAAGGTGAAAGATAACCTAGAAGCCATATTCCAAGGATTGGGTGACCCAACTCCACCAGGATTTATTGTGGACCTGTTGTCAGCTTCAAAAAACCCAAAGGTTATTGAATACTGTGTGGAGCAAGGGTGGGTTGGTAAAGCAAACTCTACCGTTGAGAGAGACTTGAATTATGTTCACTACATACTAAATTGTTTGGGGAGT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41,491
MZ363432.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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2021-06-15
413233
Rhinovirus C
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Picornaviridae
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2021-04-21
SAMN19406311
PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/413233, complete genome
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41,510
MZ363434.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
414488
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,098
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-21
SAMN19406323
PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/414488, complete genome
ACCCACCCACACTGTCTACGGACGTTGTACTCTTGTATTCCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCTATACACCCCGTAACAATAGAAGTTTACACACACTCAGACCAATAGGGGGTGTTCATCCAGTTCACCCAGGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATAGGGGTGTTAGGTTTCACCCGAGGCCGAAGCTCTGATTGTCGTTATCCGCACAACTACTGGACAAAGCTTAGTAACATCTTACGACATAGCATGGTTGGTTGTTCCGCCAGTACCCCCTGGTAAACCTGGCAGATGGGGCTAGAAGTTCCTCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCTCCCTCACGGGAGAAGCCATCCTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGACTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCTGCAGCCATTGCATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTCACTGACGTTTATGGTGACAATATATATATAACGTATATATTGTTCATCATGGGCGCTCAGGTATCTAGACAAACCACTGGATCGCATGAAAATGCCATCACTGCTACCAATGGAGGCCTTATCAAATATTTCAACATAAACTACTACAAGGATTCGGCTAGTTCAGGTTTGGCTAAGCAAGACTTCACTCAAGATCCATCCAAATTTACCCAACCCCTGGCAGAGGTTCTGACAAATCCAGCTCTTATGTCCCCAACCGTTGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATCACTACACAGGATGCTCTTCATACAGTTCTGGCCTATGGAGAATGGCCTAGTTATTTGTCAGATCTTGATGCCACTTCAGTGGACAAACCCACACATCCGGAAACTTCATCGGACAGATTTTACACCCTCACCAGTGTGGAATGGAATGCTACTTCAAGCGGATGGTGGTGGAAACTTCCAGACGCCTTAAAAGACATGGGCATTTTTGGTCAAAACTTATACTACCACTCAATGGGTAGAGCAGGGTACATAATACACACACAATGTAATGCTACTAAATTCCACAGTGGAGCATTGATGGTTGTTTTAATACCTGAACACCAACTAGCATATGCTGGTGGTGCAAATGCCAGTGTTGGATACAAACACACTCATCCAGGTGAGGATGGTCATAAAATTGAGAAGCGAGGTTTCGATGACAACAAACCAGATGAAGACCCCTTCTTTAACTGCAATGGGACACTATTTGGTAACCTCACTATATTCCCACACCAGATTATTAATCTTAGAACCAACAATTCCAGCACAATTATTAGCCCTTACATCAATTGCCAACCAATGGATAACATGCTAAAACACAACAATCTTACATTGCTAATAGTACCACTGGTTAAACTTACACCTGGAACTGGTGCCTCACCCAACGTGTCTATAACAGTATCAATCGCACCATACAAATCAGAGTTTTCTGGTGCCATGGAGACACGTTACACAGTACAACAACAGGGTTTACCCATTCGCATGCCAAGTGGGTCCCAGCAATTTATGACTACTGAAGATGAACAATCACCCAACATGCTACCTGGCTACCACTCCAGCAAGAAAATACACATACCAGGTATGATCACAAATGTCTTGCACATGGCTAGAGTTGACTCCTTCATGCCTATCAACAATATCCGTTCTGAGATCGGCAAGGTTTCAATTTACAATATACCAATATTAAGGAAAACTAACAATGATGGATTAATACTCTCCATACCCTTAGACATGAGTAATAGTCTATTTGCCACCACACTGTTGGGGGAAGTGCTGAATTACTTTACTAACTGGTCAGGTAGTATTACTCTCACTTTCATGTGCGTGTGTGATTCTTTCTCAACTGGAAAATTCTTGTTAGCATACACCCCCCCTGGAGGAGCACATCCTGCCAACAGAAAGCAAGCCATGTTAGGGGTGCATGTTGTTTGGGATCTGGGTCTACAATCATCATGTACCATGGTGATACCTTGGATATCTTCAGGATTTTATCGTAACACCAAATCTGATGACCACACTGAAGCAGGGTACGTTTCACTCTGGTACCAGACAGATTTCGTAACTACCACAACAGCAGGACAAGGTGCTATATTAGTTACTTGTAGTGGATGCCCAGATATCTCAGTCAGAATGTTAAGAGACACACCAATGATGAAACAAGATGATGATGAATTGCAGAATAATGACCCAATAGAGCAATTTGTACATGATACACTAAATGAAGTTGTAGTAGTACCCAACACACAAGCTTCTGGACCTCAACATACCACACGGCCCAGTGCGTTAAGTGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCACTGCTACCCCTGAATCCACACTAGAGACTAGGTATGTAGTGAATGATAACACAAATGAAGAAGCCGAGATAGAGATATTCTTGGGGAGGTCGGCAATTTGGACCAAAAAGACCTTGAAACAAGGATTCTTGAAATGGAAGATAAGTTTCCAGGAACAAGCTCACATTAGGAAAAAGTTTGAGCTATTCACTTACCTCAGATTTGACATGGAAATCACAATAGTCATTAACAACCAAGATCTAATGCAAATAATGTATATACCACCTGGTATAGCCATACCTGATGGTAAGGATGACAACAAATGGGACTCAGCCTCCAATCCAAGTGTATTCTACCAGCCCAAAAGCGGATTCCCCCGCTTCACAATACCCTTTACAGGTCTAGCCTCTGCTTATTACATATTTTATGATGGTTACAGTAAGACAACTGGTGAACCTAGGGATACCTATGGTATCTCTCCTACCAATGACATGGGCACCTTGTGTTTCCGTTCACTGGAAGGAACAGGCAATGCAGAGGTGAGGGTCTACGTGAAACCAAAACACACTACAGCATGGATTCCCAGACCTCCCCGCGCTGTACAATACACACATACCTACAGTACAAACTACCACTACAAGAAGGAAGATGCCACCTTGGAGGACAGACACTTCATACAACACAGAGAAGGCATCAAAATTTTACAGAATACAGGACCAAGTGATCTGTATGTCCATACTAAAGATGCTATTTACACATGTGCACACCTAACCACACCAAATGATAACACCATCCTGCTGGCCTACACAGCAGATCTGCAAGTTGATAGTAGTGAAACCAAGGGCCCAGATCACATTCCAGATTGTGATTGTACCTCAGGTTGTTATTATGTCAAACACTTAGATAGATACTGCCCAGTAACTTTAACTTCCCACGACTGGTACGAAATACAAGAATCAGATTACTACCCCAGACACATACAATACAACATCCTGATTGGTGAGGGTCCTTGCAAGCCTGGAGATTGCGGTGGTAAATTACTTTGTAGACATGGGGTCATAGGCATTGTCACTGCTGGTGGTGAAGGGCATGTTGCATTCACTGATTTACGCCCATACTCAAGTCTTTCCACTCATCAGGGAGTTATATCAGATTACTTCACTCAATTGGGCGATGCTTTTGGGGAGGGTTTCACACACAACATAAAAGAACACTTCTCTAATCTGTCTTCAAACATTACTGATAAAATTACAGGCAAGGTGGTTAAATGGTTAGTGCGCATCATTAGTGCTCTCACTATCATGATTAGAAACTCAACAGATACAGCAACAATACTTGCCACTTTGGCGCTGTTAGGGTGTCAGAGCTCCCCATGGAACTTCCTTAAAAATAAGATATGCCAGTGGCTAGACATACCCAAACCCCCTTCCAGACAAGGTGATTCGTGGATTAAGAAATTTACAGAATGCTGTAATGCAGCCAAGGGTTTAGAATGGGTTGCCATAAAAATTGGGAAATTTATTGATTGGTTGAAAGAGAAATTAATTCCCACAGTACAGCGGAAAAAGGAAACACTGGAACAATGCAAGAAACTGGCCCTCTATGAGGAGCAATGCAAGGGATTTTCCAAGTCAGATGCCCAGGCCCAACAACAACTCATCATAGAAGTAGCTAAGCTGAAGAAAGGTCTAGATGAATTGGCACCTTTGTATGCTAGTGAGAACAAAAGAGCAACAGGAATTCAGAAAGAACTACAACGCATGACTGCGTACCACAAAACACATCGACATGAACCAGTCTGTTGTCTAATACGTGGGCAACCTGGATGTGGGAAGTCACTAGTCACTTCAATCATTGCACGTGGACTTGCGTCAGAGGCTCATGTCTACTCACTGCCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGCTATGATCAACAGAAAGTTGTCATAATGGATGACATAGGGCAAAATCCAGATGGGAAAGATCTTAGCATGTTCTGTCAAATGGTTTCCACCACAGAATTCATAGTGCCAATGGCCAATATAGAAGAGAAGGGTAGATCATTCACCAGTGAATACATTTTAGCCAGCACAAATCTTGATGCACTTACTCCACCTACAATAACTATTCCAGATGCAATTAAAAGGAGGTTCTTTATAGATGTGGACTTAGTTATTATTAGTAAGTTCAGAAACTCTAGTGGCCTTTTAGATACAGCAAAGGCACTACAACCCTGTGCTAATTGCCCCAAACCAGCCTGCTTTAAGCAATGCTGTCCCTTGCTGTGTGGCCAAGCAGTTGTTCTGCAAGATAGGAGAAGCAAAGCTAGTTATCCTGTGAATGCAATAGTACAGCAACTACAACATGAGAACTCAACGCGCAAGAAAGTGAAAGATAACCTAGAAGCCATATTCCAAGGATTGGGTGACCCAACTCCACCAGGATTTATTGTGGACCTGTTGTCAGCCTCAAAAAACCCAAAGGTCATTGAATACTGTGTGGAGCAAGGGTGGGTTGGTAAAGCAAACTCTACTGTTGAGAGAGACTTGAATTATGTTCACTACATACTAAATTGCTTAGGGAGT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41,512
MZ363440.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
C8W8BF
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,098
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-26
SAMN19406361
PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/C8W8BF, complete genome
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41,518
MZ363448.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
L9X8RZ
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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7,098
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-26
SAMN19406374
PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/L9X8RZ, complete genome
ACCCACCCACACTGTCTACGGACGTTGTACTCTTGTATTCCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCTATACACCCCGTAACAATAGAAGTTTATACACACTCAGACCAATAGGGGGTGTTCATCCAGTTCACCCAGGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATAGGGGTGTTAGGTTTCACCCGAGGCCGAAGCTCTGATTGTCGTTATCCGCACAACTACTGGACAAAGCTTAGTAACATCTTACGACATAGCATGGTTGGTTGTTCCGCCAGTACCCCCTGGTAAACCTGGCAGATGGGGCTAGAAGTTCCTCACTGGTGACAGTGTTCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCTCCCTCACGGGAGAAGCCATCCTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGACTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCTGCAGCCATTGCATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTTACTGACGTTTATGGTGACAATATATATATAACGTATATATTGTTCATCATGGGCGCTCAGGTATCTAGACAAACCACTGGATCGCATGAAAATGCCATCACTGCTACCAATGGAGGCCTTATCAAATATTTCAACATAAACTACTACAAGGATTCGGCTAGTTCAGGTTTGGCTAAACAAGACTTCACTCAAGATCCATCCAAATTTACTCAACCCCTGGCAGAGGTTCTGACAAATCCAGCTCTTATGTCCCCAACCGTTGAAGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATCACAACACAGGATGCTCTTCATACAGTTCTGGCCTATGGAGAATGGCCTAGTTATTTGTCAGATCTTGATGCCACTTCAGTGGACAAACCCACACATCCGGAAACTTCATCGGACAGATTTTACACCCTCACCAGTGTGGAATGGAATGCTACTTCAAGCGGATGGTGGTGGAAACTTCCAGACGCCTTAAAAGACATGGGCATTTTTGGTCAAAACTTATACTACCACTCAATGGGTAGAGCAGGGTACATAATACACACACAATGTAATGCTACTAAATTCCACAGTGGAGCATTGATGGTTGTTTTAATACCTGAACACCAGCTAGCATATGCTGGTGGTGCAAATGCCAGTGTTGGATACAAACACACTCATCCAGGTGAAGATGGTCATAGAATTGAGAAGCGAGGTTTCGATGACAACAAACCAGATGAAGACCCCTTCTTTAACTGCAATGGGACACTATTTGGTAACCTCACTATATTCCCACACCAGATTATTAATCTTAGAACCAACAACTCCAGCACAATTATTAGCCCTTACATCAATTGCCAACCAATGGATAACATGCTAAAACACAACAATCTTACATTGCTGATAGTACCACTGGTTAAACTTACACCTGGAACTGGTGCCTCACCCAACGTGTCTATAACAGTGTCAATCGCACCATACAAATCAGAGTTTTCTGGTGCCATGGAGACACGTTACACAGTACAACAACAGGGTTTACCCATTCGCATGCCAAGTGGGTCCCAGCAATTTATGACTACTGAAGATGAACAATCACCCAACATGCTACCTGGCTACCACTCCAGCAAGAAAATACACATACCAGGTATGATCACAAATGTCTTGCACATGGCTAGAGTTGACTCCTTCATGCCTATCAACAATATCCGTTCTGAGATCGGCAAGGTTTCAATTTACAATATACCAATATTAAGGAAAACTAACAATGATGGATTAATACTCTCCATACCCTTAGACATGAGTAATAGTCTATTTGCCACCACACTGTTGGGGGAAGTGCTGAATTACTTTACTAACTGGTCAGGTAGTATTACTCTCACTTTCATGTGCGTGTGTGATTCTTTCTCAACTGGAAAATTCTTGTTAGCGTACACCCCCCCTGGAGGAGCACATCCTGCCAACAGAAAGCAAGCCATGTTAGGGGTGCATGTTGTTTGGGATCTGGGTCTACAATCATCATGTACCATGGTGATACCTTGGATATCTTCAGGATTTTATCGCAACACCAAATCTGATGACCACACTGAAGCAGGGTACGTTTCACTCTGGTACCAGACAGATTTCATAACTACCACAACAGCAGGACAAGGTGCTATATTAGTTACTTGTAGTGGATGCCCAGATATCTCAGTCAGAATGTTAAGAGACACACCAATGATGAAACAAGATGATGATGAATTGCAGAATAATGACCCAATAGAGCAATTTGTACATGATACACTAAATGAAGTTGTAGTAGTACCCAACACACAAGCTTCTGGACCTCAACATACCACACGGCCCAGTGCGTTAAGTGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCACTGCTACCCCTGAATCCACACTAGAGACTAGGTATGTAGTGAATGATAACACAAATGAAGAAGCCGAGATAGAGATATTCTTGGGGAGGTCGGCAATTTGGACCAAAAAGACCTTGAAACAAGGATTCTTGAAATGGAAGATAAGTTTCCAGGAACAAGCTCACATTAGGAAAAAGTTTGAGCTATTCACTTACCTCAGATTTGACATGGAAGTCACAATAGTCATTAACAACCAAGATCTAATGCAAATAATGTATATACCACCTGGTATAGCCATACCTGATGGTAAGGATGACAACAAATGGGACTCAGCCTCCAATCCAAGTGTATTCTACCAGCCCAAAAGCGGATTCCCCCGCTTCACAATACCCTTTACAGGTCTAGCCTCTGCTTATTACATATTTTATGATGGTTACAGTAAGACAACTGGTGAACCTAGGGATACCTATGGTATCTCTCCTACCAATGACATGGGCACCTTGTGTTTCCGTTCACTGGAAGGAACAGGCAATGCAGAGGTGAGGGTCTACGTGAAACCAAAACACACTACAGCATGGATTCCCAGACCTCCCCGCGCTGTACAATACACACATACCTACAGTACAAACTACCACTACAAGAAGGAAGATGCCACCTTGGAGGACAGACACTTCATACAACACAGAGAAGGCATCAAAATTTTACAGAATACAGGACCAAGTGATCTGTATGTCCATACTAAAGATGCTATTTACACATGTGCACACCTAACCACACCAAATGATAACACCATCCTGCTGGCCTACACAGCAGATCTGCAAGTTGATAGTAGTGAAACCAAGGGCCCAGATCACATTCCAGATTGTGATTGTACCTCAGGTTGTTATTATGTCAAACACTTAGATAGATACTGCCCAGTAACTCTAACTTCCCACGACTGGTACGAAATACAAGAATCAGATTACTACCCCAGACACATACAATACAACATCCTGATTGGTGAGGGTCCTTGCAAGCCTGGAGATTGCGGTGGTAAATTACTTTGTAGACATGGGGTCATAGGCATTGTCACTGCTGGTGGTGAAGGGCATGTTGCATTCACTGATTTACGCCCATACTCAAGTCTTTCCACTCATCAGGGAGTTATATCAGATTACTTCACTCAATTGGGCGATGCTTTTGGGGAGGGTTTCACACACAACATAAAAGAACACTTCTCTAATCTGTCTTCAAACATTACTGATAAAATTACAGGCAAGGTGGTTAAATGGTTAGTGCGCATCATTAGTGCTCTCACTATCATGATTAGAAACTCAACAGATACAGCAACAATACTTGCCACTTTGGCGCTGTTAGGGTGTCAGAGCTCCCCATGGAACTTCCTTAAAAATAAGATATGCCAGTGGCTAGACATACCCAAACCCCCTTCCAGACAAGGTGATTCGTGGATTAAGAAATTTACAGAATGCTGTAATGCAGCCAAGGGTTTAGAATGGGTTGCCATAAAAATTGGGAAATTTATTGATTGGTTGAAAGAGAAATTAATTCCCACAGTGCAACGGAAAAAGGAAACACTGGAACAATGCAAGAAACTGGCCCTCTATGAGGAGCAATGCAAGGGATTTTCCAAGTCAGATGCCCAGGCCCAACAACAACTCATCATAGAAGTAGCTAAGCTGAAGAAAGGTCTAGATGAATTGGCACCTTTGTATGCTAGTGAGAACAAAAGAGCAACAGGAATTCAGAAAGAACTACAACGCATGACTGCGTACCACAAAACACATCGACATGAACCAGTCTGTTGTCTAATACGTGGGCAACCTGGATGTGGGAAGTCACTAGTCACTTCAATCATTGCACGTGGACTTGCGTCAGAGGCTCATGTCTACTCACTGCCCCCAGATCCAAAATATTTTGATGGCTATGATCAACAGAAAGTTGTCATAATGGATGACATAGGGCAAAATCCAGATGGGAAAGATCTCAGCATGTTCTGTCAAATGGTTTCCACCACAGAATTCATAGTGCCAATGGCCAATATAGAAGAGAAGGGTAGATCATTCACCAGTGAATACATCTTAGCCAGCACAAATCTTGATGCACTCACTCCACCTACAATAACTATTCCAGATGCAATCAAAAGGAGGTTCTTCATAGATGTGGACTTAGTTATTATTAGTAAGTTCAGAAATTCTAGTGGCCTTTTAGATACAGCAAAGGCACTACAACCCTGTGCTAATTGCCCCAAACCAGCCTGCTTTAAGCAATGCTGTCCCTTGCTGTGTGGCCAAGCAGTTGTTCTGCAAGATAGGAGAAGCAAAGCTAGTTATCCTGTGAATGCAATAGTACAGCAACTACAACATGAGAACTCAACGCGCAAGAAAGTGAAAGATAACCTAGAAGCCATATTCCAAGGATTGGGTGACCCAACTCCACCAGGATTTATTGTGGACCTGTTGTCAGCCTCAAAAAACCCAAAGGTCATTGAATACTGTGTGGAGCAAGGGTGGGTTGGTAAAGCAAACTCTACTGTTGAGAGAGACTTGAATTATGTTCACTACATACTAAATTGCTTAGGGAGT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41,526
MZ153246.1
rhinovirus C42
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-05-18
YGHJB
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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7,106
GenBank
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USA
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null
2021-04-13
SAMN20082378
PRJNA1066815
Rhinovirus C42 strain RvC42/USA/2021/YGHJB, complete genome
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41,897
MH752985.1
rhinovirus C42
Padilla,T., Huynh,T., Pan,C.-Y., Yagi,S., Wadford,D.A., Marine,R., Castro,C.J.
Centers for Disease Control and Prevention, Polio and Picornavirus Laboratory Branch
USA
2018-08-22
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,115
GenBank
null
USA: CA, San Joaquin County
USA
Homo sapiens
oronasopharynx
2016-01-26
null
PRJNA322324
Rhinovirus C42 strain USA/CA/2016-23027, complete genome
TTAAAACTGAGTGTGGGTTGCTCCCACCCACACTGTCTACGGGACGTTGTACTCTTGTATTCCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCCACCCTAAATACCCCGTAACAATAGAAGTCTACGCACACTTAGACCAATAGGGGGTGTTCATCCAGTTCACCCAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGCATAGGGGTGTTAGGCTTCACCCGAGGCCAAAGCTCTGATTGTCGTTATCCGCACAACTACTGGACAAAGCCTAGTAGCGCCCTACGATGTAGTATGGTTGGTTGTTCCGCCAGTATCCCCTGGTAAACCTGGCAGATGGGGCTAGAAGTTCCTCACTGGCGACAGTGTTCTAGCCCGCGTGGCTGCCTGCTCCCTCACGGGAGAAGCCATTCTACTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGATTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCTGCAGCCATTACATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTTCTTTTACTGACGTTTATGGTGACAATATATATATAACGTATATATTGTTCATCATGGGCGCTCAAGTATCTAGACAAACCACTGGATCGCATGAGAATGCTATCACTGCTACCAATGGAGGCCTTATCAAGTATTTTAACATAAACTACTACAAGGATTCGGCTAGTTCAGGCTTGGCTAAACAAGACTTTACTCAAGATCCATCCAAATTTACTCAACCCCTGGCAGAGGTTTTAACAAATCCAGCACTTATGTCCCCGACTGTTGAGGCATGTGGGTTTTCCGATAGGCTCAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATCACTACACAGGACGCTCTTCACACAGTGCTGGCTTATGGTGAATGGCCCAGTTATTTATCAGATCTTGATGCCACTTCAGTAGATAAACCCACACACCCAGAAACTTCATCAGATAGGTTTTACACCCTTACTAGTGTAGAATGGGATGCTTCTTCGAGCGGTTGGTGGTGGAAGCTTCCAGACGCTCTAAAAGATATGGGAATTTTTGGTCAAAACTTGTACTACCACTCAATGGGTAGGGCAGGGTACATAATACATACACAATGTAATGCTACCAAATTCCACAGTGGGGCTTTGATGGTTGTTCTGATACCCGAACACCAACTGGCGTATGCAGGTGGTGCAAATGCCAGTGTTGGGTATAAACACACTCACCCAGGTGAGAATGGCCATAAGATTGAGAAGCGCGGTTTTGATGATAACAAGCCAGATGAAGACCCCTTCTTTAACTGCAATGGAACACTGTTTGGCAATCTCACTATATTTCCACATCAGATTATTAATCTTAGAACCAATAATTCCAGCACAATTATTAGTCCTTACATTAATTGCCAGCCAATGGACAACATGCTGAAGCATAACAATCTCACATTGCTGATAGTGCCACTGGTTAAACTTACACCTGGAACTGGTGCCTCACCCAGTGTGTCAATAACAGTGTCAATTGCACCATACAAATCAGAGTTTTCTGGTGCCATGGAGACACGTTACACAGTGCAACAACAGGGTCTACCTGTTCGCATGCCAAGTGGGTCCCAGCAATTCATGACAACTGAGGATGAACAATCACCCAACATGCTACCTGGCTACCATTCCAGCAAGAAAATACACATACCAGGTATGATCACAAACGTCTTACACATGGCCAGAGTTGACTCCTTTATGCCTATCAACAATATCCGTACCGAGATTGGCAAGGTATCAATATACAATATACCAATATTAAGGAAAACCAACAATGATGGATTAATACTCTCCATACCCTTGGACATGAGCAACAGTTTGTTTGCCACCACACTACTGGGGGAAGTGCTGAATTACTTTACTAACTGGTCAGGCAGTATTACTCTCACTTTCATGTGTGTGTGTGATTCTTTCTCAACTGGAAAATTCTTGTTAGCATACACCCCCCCTGGAGGAGCACACCCAGCTAGCAGAAAGCAAGCCATGTTAGGGGTGCATGTTGTTTGGGATCTGGGTTTACAATCATCATGTACTATGGTAATACCTTGGATATCCTCTGGATTTTATCGTAATACCAAATCTGATGACCACACTGAAGCAGGGTACGTTTCACTTTGGTACCAAACAGATTTCGTGACCACTACAACAGCAGGACAGGGTGCTATACTAGTTACTTGTAGTGGATGCCCGGATATCTCAGTTAGAATGTTAAGAGATACACCAATGATGAAACAAGATGATGATGTGCTGCAGAACAATGATCCAATAGAGCAATTTGTACATGACACACTAAATGAAGTTGTGGTGGTGCCCAACACACATGCCTCTGGACCTCAACACACCACACGACCCAGTGCATTAAGTGCAATGGAGATAGGAGCTTCCAGCACAGCCACTCCTGAATCCACACTAGAGACCAGGTATGTGGTGAATGATAACACAAATGAAGAAGCTGAAATAGAAATATTCCTGGGGAGATCAGCAATTTGGACCAAAAGGGCTTTGAATGAGGGATTCTTGAAATGGAAGATAAGTTTCCAGGAACAAGCTCACATTAGGAAAAAGTTTGAACTGTTCACTTACCTCAGATTTGATATGGAAATCACAATAGTTATTAATAATCAAGATCTAATGCAGATAATGTATGTACCTCCTGGTATAGCCACACCTGATACCAAGGGTGATAACAAATGGGACTCAGCTTCTAATCCAAGTGTTTTCTATCAGCCTAAAAGTGGATTCCCCCGTTTCACAATACCCTTCACGGGCCTAGCCTCAGCTTATTACATGTTCTATGATGGTTATAGTAATACAACTGGTGAGCCTAGGAATACCTATGGCATCTCTCCTACCAATGATATGGGTACCTTGTGTTTCCGCTCGTTGGAAGGGACAGGCAATGCAGAGGTGAGGGTCTATGTGAAACCAAAACATACTACAGCGTGGATCCCCAGACCTCCTCGCGCTGTACAATACACACACACCTACAGTACAAACTACCACTACAAAAAGGGGGATGCCCCCTTGGAAGACAGACACTTTATACAACACAGAGAAGGCATCAAAATTCTGCAGAATACAGGTCCTAGTGATTTGTACGTCCACACTAAAGATGCCATCTATACATGTGCACATCTAACCAAACCAAATGATAACACCATCCTGTTGGCCTACACGGCAGATCTGCAAGTTGATAGCAGTGAAACCGAGGGTCCAGATCACATCCCAGATTGTGACTGTACCTCAGGTTGTTACTATGTCAGACATTTGGATAGATACTGCCCAGTAACCCTAACTTCTCATGATTGGTATGAAATACAAGAATCAAATTACTACCCCAAACATATACAATACAACATTTTGATTGGTGAGGGTCCTTGCAAACCTGGAGATTGTGGTGGTAAATTACTCTGTAAACACGGGGTCATAGGCATTGTCACTGCTGGTGGTGAGGGGCACGTGGCTTTCACTGATTTACGCCCATACTCAAGTCTCTCCACCCACCAGGGAATTGTGTCAGATTACTTCACCCAATTGGGTGATGCCTTTGGTGAGGGCTTCACACATAATATAAAAGAGCATTTTTCTAATCTGTCTTCAAACATTACTGATAAAATTACAGGCAAAGTAGTTAAATGGTTAGTGCGCATTATTAGTGCTCTCACTATTATGATTAGGAACTCAACAGATACAGCAACAATACTTGCTACTCTGGCGCTATTAGGGTGTCAGAGTTCCCCATGGAACTTCCTTAAAAATAAGATATGCCAATGGCTAGATATACCCAAACCCCCTTCCAAACAAGGTGATTCATGGATTAAGAAATTCACAGAGTGTTGTAATGCAGCTAAAGGCTTAGAATGGGTTGCCATCAAAATAGGGAAATTTATTGACTGGTTGAAGGAAAAACTAATCCCCACAGTACAGCGGAAAAAGGAAACATTGGAACAATGCAAGAAACTGGCCCTTTATGAAGAGCAATGCAAAGGATTCTCCAAATCAGATGCCCAGGCCCAACAACAACTCATCATAGAAGTAGCTAAGCTGAAGAAAGGTTTGGATGAGTTAGCACCTTTGTATGCTAGTGAGAATAAAAGAGCAACAGGAATTCAGAAAGAGCTGCAACGCATGACCGCGTACCACAAAACACATCGGCATGAACCAGTCTGTTGTCTAATACGTGGACAACCTGGATGTGGGAAATCGCTGGTCACCTCAATCATTGCACGTGGGCTCGCACCAGAGGCTCATGTTTACTCATTGCCCCCAGACCCAAAATATTTTGATGGTTACGATCAACAGAAGGTTGTTATAATGGATGATATAGGGCAAAATCCAGATGGGAAAGACCTCAGTATGTTCTGCCAAATGGTTTCCACCACAGAATTCATAGTACCAATGGCCAACATAGAAGAAAAGGGTAGATCATTTACTAGTGAATACATTCTGGCCAGTACAAATCTTGATGCACTCACTCCACCCACAATAACTATTCCAGAGGCAATTAAAAGAAGGTTCTTTATAGATGTGGATTTAGTTATTATTAGCAAGTTTAGAAATTCCAGTGGTCTTCTGGACACAGCAAAAGCACTCCAACCCTGCGCTAATTGCCCCAAACCAGCCTGCTTTAAGCAATGTTGCCCCCTGCTGTGTGGTCAAGCAGTTGTCTTACAAGATAGAAGAAGTAAAGCCAATTATCCTGTGAATGCAATAGTACAGCAGCTCCAACATGAAAACTCAACGCGCAAGAAGGTAAAAGATAACCTAGAAGCCATATTTCAAGGACTGGGTGACCCAACCCCCCCAGGGTTTATTGTGGATTTGCTGTCAGCTTCAAAAGACCCAAAAGTTATTGAGTACTGTGTAGAGCAAGGATGGGTTGGTAAAGCAAACTCTACCGTTGAAAGGGACTTAAACTATGTTCACTA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69,019
OK649386.1
rhinovirus C43
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-12-11
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
6,954
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021
SAMN22330349
PRJNA723895
Rhinovirus C43 strain RvC43/USA/2021/DXYK42, complete genome
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35,405
OK161404.1
rhinovirus C43
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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GenBank
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USA
USA
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2021-06-15
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PRJNA1066815
Rhinovirus C43 strain RvC43/USA/2021/WYX8S9, complete genome
CTGTGGTTGCCCAAAGGGCGTGGTGGTCTTGTATTACGGTACATTTCCATGCCAGTTTTATCCCCCCTCCCGAAACGTAGAAGAAATGCACACACCGACCAATAGGAGGTGGTCAACCAGACCACTAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGGCTTGGATATGCTTCACCCGAGGCAAAAACCGGGCCAATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAGAAGCCTAGTAACACCTTTGAAGCCAATGGTTGGTCGCTCCGTTGCAACCCCAGCAACAGACCTGGCAGATGAGGCTGAGCATTCCCCACCAGCGATGGTGGCTCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCATCCTTCGGGATGCGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGCAGCTACCACACATAAGCCAATGTGCAGGTAGTCGTAACGGGCAACTGTGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTGTTATCTTTTTGAATGCCTATGGTGACAATTGTACAGTATACATTTGTTACCATGGGCGCCCAGGTTTCTAAACAGAGTGTTGGAGCACATGAAACCACAGTTCATGCAGGATCCGGAGCAGTGGTTAAATATTTTAACATCAACTATTACAAAGATGCTGCAAGTTCAGGTCTCACAAAACAAGATTTCTCTCAAGATCCATCAAAATTTACTCAACCTGTGGCTGATTTACTGACGAATCCTGCTTTGATGTCTCCGTCGGTTGAAGCTTGTGGTTACTCCGATAGGCTTAAGCAAATCACTATCGGTAGTTCCACCATCACAACCCAAGATGCTGTCAACACAATCGTGGCATATGGAGAATGGCCCAGCTACCTCTCGGATTTGGACGCTACATCAGTCGATAAGCCAACACACCCTGAGACCTCATCAGATCGGTTCTACACATTGGAGAGTGTTACATGGAATGGCTCTTCTCAAGGCTGGTGGTGGAAACTTCCTGACTGTCTTAAGGATATGGGTATCTTTGGTCAGAATATGTACCACCATGCTATGGGTAGATCTGGTTACATCATTCATACCCAGTGCAATGCTACCAAGTTCCATAGTGGTTGTTTGTTGGTAGCAGTGGTTCCGGAACACCAGCTAGCCTACATAGGTGGCTCTAATGCTCAGGTTAGTTATGAACACACACACCCTGGTGAACGTGGCCATGAAATAGGTTCTAACACAAATAGAGACAGAAACCAACCGGATGAGGATCCCTTCTTTAACTGCAATGGTACACTATTAGGAAACTTAACCATTTTTCCTCACCAGCTCATCAATTTAAGAACAAACAACTCTAGTACAATAGTTGTCCCTTACATAAACTGTGTGCCAATGGACAGCATGTTACGGCACAATAATGTATCATTAGTTATCATACCAATATGCCCTCTACGTACATCCGGCAATGCCCCTCAAACTCTACCAGTTACCATTTCCATTGCACCAGACAAATCAGAATTCTCTGGAGCTAGACAATCTGTTGAGCCCCAAGGTTTGCCAGTGAGAATGCCTAGTGGATCCAACCAATTCATGACTACAGAAGATGAGCAATCACCCAACATCCTACCTAGTTTCCACTCTACTAAGCAGATACACATACCAGGCCAAATCAAGACAATAATGGACATGGCAAGAGTGGATTCATTCATGCCAATAAACAACATTCCTTCACAGATACAGAAGGTAGGTATATATAATATACAAGTCTCTGCAGCATCTACAGGAAAAATACTAACACTACCTCTTGACATGAGTCACACAGTTTTTGCCACGACATTATTGGGGGAGGTCTTGAACTACTTCTCAAATTGGTCAGGTTCTGTCAAGCTCACATTCTTCTGTGTTTGTAACAGCTTTAGTACTGGGAAATTTCTGATTGCTTACACACCCCCTGGGGCAGGAATACCTGAAACCCGTAAGGATGCTATGCTGGGCACCCATGTAGTTTGGGATCTAGGCTTACAGTCATCATGTCACCTTATAGTACCATGGATAAGCTCTCACTTTTACAGGAGAACAAAGAGAGATGATTATACAGATGGAGGCTATGTAACATTGTGGCTTCAAACAGCTTTTGTGTCCAACGACACAGTGGGTGCCATCATGGTTACGTGCTCAGCGTGCCCCGACATGGCCGTGCGCATGCTTCGAGACACACCAATGATGAAGCAGGAAGATGACATTGTGCAAAATCCAGTGGAAGAGTTTGTAGACCATGCACTTAAAGAGGTTTTAGTTGTCCCAGACACCCAGGCTTCAGGTCCAATACATACAACCAAACCACAGACCCTGGGTGCCTTGGAGATAGGTGCTACATCCAACGCAGGCCCAGAGACCATGATTGAAACACGCTATGTCATGAATGACAATACCAATGGTGAGGCCGCCATTGAGAATTTTCTAGGTAGGTCTGCACTGTGGTCAAATTTGACATTAAGTAGTGGTTTTGTGGAGTGGAAAATCAACTTCCAGGAACACGCCCAGGTGAGGAAGAAGTTTGAGATGTTTACATATGTCAGATTTGATTTGGAGATAACAGTGGTTACCAACAATACAGGCTTGATGCAGATTATGTATGTACCCCCAGGTATCACAGCCCCTGCGAGAATCGATAGCAGAGAGTGGGATTCAGCCTCCAATCCTAGTGTCTTCTACCAGCCAAACTCTGGTTTTCCTAGATTCACCATACCATTTACAGGTCTTGGCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGCACTAGCAGTAGTAACACACGGTATGGAATCTCACAGACCAATGATATGGGAACCTTGTGCATACGCGCACTAGATGACACCAAGAGAAATGATGTGAAAATTTTTGCTAAACCCAAACACACATCTGCGTGGATACCACGTCCTCCCAGAGCTACACAGTACCTACACAAATTTAGCACCAATTACAACAAGATAAAGGTCGAAGCCACCAAAGAATTGGAGCAGAAGCACTTTCTTAAACCAAGACAGGACATCAGGAATGTAGGACCCAGTGATATGTATGTGCACACGAAAGAAGCTATCTACAAGTGTGCTCATTTAACCAATCCCAATGAGAACACAATACTGCTAGCTATCTCATCAGATCTACAGGTTGATGGTACTAATAATCCTGGACCAGACCACATACCCACATGCAACTGCACGAATGGTACATATTACTGTAAGAGTAGAGATAGGTACTATCCAGTGGAATTTGTCCAACACAATTGGTATGAGATTCAGGAATCTGACTACTACCCAAAACATATACAATACAATATTTTAATTGGAAAGGGACCTTGCTCACCAGGAGATTGTGGTGGTAAGTTACTATGTGTGCATGGGACCATAGGTATGATTACAGCTGGTGGTGATGAACATGTGGCTTTCATTGACCTCAGAAATTATGCTTCACTTGGTGAACATCAGGGAATCTCAGATTATGTTACAAATCTTGGCAGTGCCTTTGGTGAAGGTTTCACAAATTCAATCAAACAAACGCTCACTAGCGCTTGTGATGTATCAGACAAATTAACAGGAAAGGTGATCAAATGGACTATTAGATTGATTAGCGCTCTGGCAATCATGGTTAGAAACAGCTCAGACCCCGCCACAGTAATAGCTACACTAGCTTTGCTAGGTTGTTCAGGTTCGCCGTGGCGCTACCTGAAGGACAAAGTTTGTAAGTGGCTGGGTATTGATCCACCCCCCAGCAAGCAGGGTGACTCATGGTTGAAAAAGTTCACAGAATTTTGCAATGCTGCGCGTGGGCTGGAGTGGATTGGGGACAAGCTATCTAAATTTATTGATTGGCTAAAAGGGAAAATCCTGCCCACATTACGCCGCAAATCAGACACTTTAAAAGAATGTAAGAAAATTCCCTTGTACAGAGAACAGGTGAAAGCATTTGGGGCTGCATCAGAAGAAGCGCAGAATGAGCTCATCATCAACATCAACAAGTTGGAGAAGGGGCTCCAAGAACTTGCACCACTTTATGCCAGTGAAGCCAAGCAGGTGCGTGAGATGAGTAGAGAGCTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACTCACAGAACTGAACCTGTCTGTATATTGCTGCACGGGCAACCTGGATGTGGCAAGTCACTAGCCTCTAAAGTAATAGCAAGAGGCTTATCATCTGAGAGCAATGTCTACTCACTACCACCTGACCCCAAGTACTTTGATGGATACAATCAGCAAGAAGTTGTGATTATGGATGATGTTGGACAAAATCCAGACGGTAAAGATCTTAGTCTATTTTGTCAAATGGTGTCCAGCACAGAGTTTATCACACCAATGGCCAACCTGGAAGACAAGGGTAGAGCATTCACCAGTGATTACGTGATTGCCAGCACCAATATGACAGTCCTCACTCCACCGACCGTCTCCTCTCCAGAGGCCATAGACAGAAGATTCTTTCTAGATTGTGATGTGAAAATAATGCCAGCATTTAATACCAATAGTCTCCTGAATGTAGCCAAAGCACTTCTCCCATGTACAGATTGCCCCAAACCTGAGCACTATAAGCAGTGTTGTCCACTAATTTGTGGTAAGGCCTTAATACTCCAGAATAAAAGAACTAAGGCCAGCTATTCTATAAACACAGTGGTCCAACAACTAAGGCAAGAGAAGAAAAACAGGAAATGTGTAGAGCATAACTTGTCTGCCATTTTCCAGGGTCTTGGTGATGATACTACACCAGGTTTCATCATAGATCTACTAAGTGCTTCCAAAGATCCAAAAGTGATTGAGTTTTGTGAGAAAGAGGGATGGATAAAACAATCCAAACACTCAAAATTAGAGCGTGAATTTAATTATGTACAATATTGTTTAAATTGTGTGGGTAGCATAGTATTAATTTTAGGCACAGTTTACGCTTTATACAGACTAATGTGTA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37,667
MZ629145.1
rhinovirus C43
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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Rhinovirus C
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2021-06-01
SAMN20216637
PRJNA1066815
Rhinovirus C43 strain RvC43/USA/2021/K2GPNX, complete genome
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39,620
MZ363437.1
rhinovirus C43
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
AXWQE9
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
6,957
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-05-04
SAMN19406359
PRJNA1066815
Rhinovirus C43 strain RvC43/USA/2021/AXWQE9, complete genome
CCCGAAACGTAGAAGAAATGCACACACCGACCAATAGGAGGTGGTCAACCAGACCACTAAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGGCTTGGATATGCTTCACCCGAGGCAAAAACCGGGCCAATCGTTATCCGCAAAGTGCCTACGAGAAGCCTAGTAACACCTTTGAAGCCAATGGTTGGTCGCTCCGTTGCAACCCCAGCAACAGACCTGGCAGATGAGGCTGAGCATTCCCCACCAGCGATGGTGGCTCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCATCCTTCGGGATGCGAAGCCAGAAAGTGGACAAGGTGTGAAGAGCCTATTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAATCCTAACCCCGCAGCTACCACACATAAGCCAATGTGCAGGTAGTCGTAACGGGCAACTGTGGGATGGAACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTGTTATCTTTTTGAATGCCTATGGTGACAATTGTACAGTATACATTTGTTACCATGGGCGCCCAGGTTTCTAAACAGAGTGTTGGAGCACATGAAACCACAGTTCATGCAGGATCCGGAGCAGTGGTTAAATATTTTAACATTAACTATTACAAAGATGCTGCAAGTTCAGGTCTCACAAAACAAGATTTCTCTCAAGATCCATCAAAATTTACTCAACCTGTGGCTGATTTACTGACGAATCCTGCTTTGATGTCTCCGTCGGTTGAAGCTTGTGGTTACTCCGATAGGCTCAAGCAAATCACTATCGGTAGTTCCACCATCACAACCCAAGATGCTGTCAACACAATCGTGGCATATGGAGAATGGCCCAGCTACCTCTCGGATTTGGACGCTACATCAGTTGATAAGCCAACACACCCTGAGACCTCATCAGATCGGTTCTACACATTGGAGAGTGTTACATGGAATGGCTCTTCTCAAGGCTGGTGGTGGAAACTTCCTGACTGTCTTAAGGATATGGGTATCTTTGGTCAGAATATGTACCACCATGCTATGGGTAGATCTGGTTACATCATTCATACCCAGTGCAATGCTACCAAGTTCCATAGTGGTTGTTTGTTGGTAGCAGTGGTTCCAGAACACCAGCTAGCCTACATAGGTGGCTCTAATGCTCAGGTTAGTTATGAACACACACACCCTGGTGAACGTGGCCATGAAATAGGTTCTAACACAAATAGAGACAGAAACCAACCGGATGAGGATCCCTTCTTTAACTGCAATGGTACACTATTAGGAAACTTAACCATTTTTCCTCACCAGCTCATTAATTTAAGAACAAACAACTCTAGTACAATAGTTGTCCCTTACATAAACTGTGTGCCAATGGACAGCATGTTACGGCACAATAATGTATCATTAGTTATCATACCAATATGCCCTCTACGTACATCCGGTAATGCCCCTCAAACTCTACCAGTTACCATTTCCATTGCACCAGACAAATCAGAATTCTCTGGAGCTAGACAATCTGTTGAGCCCCAAGGTTTGCCAGTGAGAATGCCTAGTGGATCCAACCAATTCATGACTACAGAAGATGAGCAATCACCCAACATCCTACCTAGTTTCCACTCTACTAAGCAGATACACATACCAGGCCAAATCAAGACAATAATGGACATGGCAAGAGTGGATTCATTCATGCCAATAAACAACATTCCTTCACAGATACAGAAGGTAGGTATATATAATATACAAGTCTCTGCAGCATCTACAGGAAAAATACTAACACTACCTCTTGACATGAGTCACACAGTTTTTGCCACGACATTATTGGGGGAGATCTTGAACTACTTCTCAAATTGGTCAGGTTCTGTCAAGCTCACATTCTTCTGTGTTTGTAACAGCTTTAGTACTGGGAAATTTCTGATTGCTTACACACCCCCTGGGGCAGGAATACCTGAAACCCGTAAGGATGCTATGCTGGGCACCCATGTAGTTTGGGATCTAGGCTTACAGTCATCATGTCACCTTATAGTACCATGGATAAGCTCTCACTTTTACAGGAGAACAAAGAGAGATGATTATACAGATGGAGGCTATGTAACATTGTGGCTTCAAACAGCTTTTGTGTCCAACGACACAGTGGGTGCCATCATGGTTACGTGCTCAGCGTGCCCCGACATGGCCGTGCGCATGCTTCGAGACACACCAATGATGAAGCAGGAAGATGACATTGTGCAAAATCCAGTGGAAGAGTTTGTAGACCATGCACTTAAAGAGGTTTTAGTTGTCCCAGACACCCAGGCTTCAGGTCCAATACATACAACCAAACCACAGACCCTGGGTGCCTTAGAGATAGGTGCTACATCCAACGCAGGCCCAGAGACCATGATTGAAACACGCTATGTCATGAATGACAATACCAATGGTGAGGCCGCCATTGAGAATTTTCTAGGTAGGTCTGCACTGTGGTCAAATTTGACATTAAATAGTGGTTTTGTGGAGTGGAAAATCAACTTCCAGGAACACGCCCAGGTGAGGAAGAAGTTTGAGATGTTTACATATGTCAGATTTGATTTGGAGATAACAGTGGTTACCAACAATACAGGCTTGATGCAGATTATGTATGTACCCCCAGGTATCACAGCCCCTGCGAGAATCGATAGCAGAGAGTGGGATTCAGCCTCCAATCCTAGTGTCTTCTACCAGCCAAACTCTGGTTTTCCTAGATTCACCATACCATTTACAGGTCTTGGCTCAGCATATTACATGTTTTATGATGGTTATGATGGCACTAGCAGTAGCAACACACGGTATGGAATCTCACAGACCAATGATATGGGAACCTTGTGCATACGCGCACTAGATGACACCAAGAGAAATGATGTGAAAATTTTTGCTAAACCCAAACACACATCTGCGTGGATACCACGTCCTCCCAGAGCTACACAGTACCTACACAAATTTAGCACCAATTACAATAAGATAAAGGTCGAAGCCACCAAAGAATTGGAGCAGAAGCACTTTCTTAAACCAAGACAGGACATCAGGAATGTAGGACCCAGTGATATGTATGTGCACACGAAAGAAGCTATCTACAAGTGTGCTCATTTAACCAATCCCAATGAGAACACAATACTGCTAGCTATCTCATCAGATCTACAGGTTGATGGTACTAATAATCCTGGACCAGACCACATACCCACATGCAACTGCACGAATGGTACATATTACTGTAAGAGTAGAGATAGGTACTATCCAGTGGAATTTGTCCAACACAATTGGTACGAGATTCAGGAATCTGACTACTACCCAAAACATATACAATACAATATTTTAATTGGAAAGGGACCTTGCTCACCAGGAGATTGTGGTGGTAAGTTACTATGTGTGCATGGAACCATAGGTATGATTACAGCTGGTGGTGATGAACATGTGGCTTTCATTGACCTCAGAAATTATGCTTCACTTGGTGAACATCAGGGAATCTCAGATTATGTTACAAATCTTGGCAGTGCCTTTGGTGAAGGTTTCACAAATTCAATCAAACAAACGCTCACCAGCGCTTGTGATGTATCAGACAAATTAACAGGAAAGGTGATCAAATGGACTATTAGATTGATTAGCGCTCTGGCAATCATGGTTAGAAACAGCTCAGACCCCGCCACAGTAATAGCTACACTAGCTTTGCTAGGTTGTTCAGGTTCGCCGTGGCGCTACCTGAAGGACAAAGTTTGTAAGTGGCTGGGTATTGATCCACCCCCCAGCAAGCAGGGTGACTCATGGTTGAAAAAGTTCACAGAATTTTGCAATGCTGCGCGTGGGCTGGAGTGGATTGGGGACAAGCTATCTAAATTTATTGATTGGCTAAAAGGGAAAATCCTGCCCACATTACGCCGCAAATCAGACACTTTAAAAGAATGCAAGAAAATTCCCTTGTACAGAGAACAGGTGAAAGCATTTGGGGCTGCATCAGAAGAAGCGCAGAATGAGCTCATCATCAACATCAACAAGTTGGAGAAGGGGCTCCAAGAACTTGCACCACTTTATGCCAGTGAAGCCAAGCAGGTGCGTGAGATGAGTAGGGAGCTACAGCGCATGATGTGCTACAAGAAAACTCACAGAACTGAACCTGTCTGTATATTGCTGCACGGGCAACCTGGATGTGGCAAGTCACTAGCCTCTAAAGTAATAGCAAGAGGCTTATCATCTGAGAGCAATGTCTACTCACTACCACCTGACCCCAAGTACTTTGATGGATACAATCAACAAGAAGTTGTGATTATGGATGATGTTGGACAAAATCCAGACGGTAAAGATCTTAGTCTATTTTGTCAAATGGTGTCCAGCACAGAGTTTATCACACCAATGGCCAACCTGGAAGACAAGGGTAGAGCATTCACCAGTGATTACGTGATTGCCAGCACCAATATGACAGTTCTCACTCCACCGACCGTCTCCTCTCCAGAGGCCATAGACAGAAGATTCTTTCTAGATTGTGATGTGAAAATAATGCCAGCATTTAATACCAATAGTCTCCTGAATGTAGCCAAAGCACTTCTCCCATGTACAGATTGCCCCAAACCTGAGCACTATAAGCAGTGTTGTCCACTAATTTGTGGTAAGGCCTTAATACTCCAGAATAAAAGAACTAAGGCCAGCTATTCTATAAACACAGTGGTCCAACAACTAAGGCAAGAGAAGAAAAACAGGAAATGTGTAGAGCATAACTTGTCTGCCATTTTCCAGGGTCTTGGTGATGATACTACACCAGGTTTCATCATAGATCTACTAAGTGCTTCTAAAGATCCAAAAGTGATTGAGTTTTGTGAGAAAGAGGGATGGATAAGACAATCCAAACACTCAAAATTAGAGCGTGAATTTAATTATGTACAGTATTGTTTAAATTGTGTGGGTAGCATAGTATTAATTTTAGGCACAGTTTACGCTTTATACAGACTAATGTGTATTGCCCAAGGCCCGTATACGGGTCTCCCCCAACCCAAAACAACTAAACCAGAACTTAGGAGAGCTGTG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41,515
KY369878.1
rhinovirus C43
Greninger,A.L., Makhsous,N., Kuypers,J.M., Shean,R.C., Jerome,K.R.
UW, Lab Medicine
USA
2017-01-15
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,052
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2016
SAMN07309842
PRJNA338014
Rhinovirus C43 strain SC174, complete genome
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78,632
OL961535.1
rhinovirus C44
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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6,911
GenBank
null
USA
USA
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null
2021
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PRJNA723895
Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/PBXE3T, complete genome
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34,116
OL961544.1
rhinovirus C44
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
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2022-01-04
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Rhinovirus C
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2021
SAMN23789532
PRJNA723895
Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/SFJ6NZ, complete genome
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34,125
OM001412.1
rhinovirus C44
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Sereewit,J., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2022-01-04
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,069
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-22
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PRJNA1066815
Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/86PLMK, complete genome
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34,199
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rhinovirus C44
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-09-28
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
6,911
GenBank
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USA
USA
Homo sapiens
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2021-05-27
SAMN20216633
PRJNA1066815
Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/J9YXQX, complete genome
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37,583
MZ629168.1
rhinovirus C44
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
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Picornaviridae
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GenBank
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USA
USA
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2021-06-01
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PRJNA1066815
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2021-04-09
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Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/8DU56B, complete genome
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41,383
MZ268678.1
rhinovirus C44
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
163436
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,098
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-08
SAMN19131245
PRJNA1066815
Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/163436, complete genome
CCACACTGTCTACGGACGTAGTACTCTTGTATTTCGGTACACTTGTACGCCAGTTTGCTACCCTCCCCAAACGTAACAATAGAAGCTAAATGCACTATGGCCAATAGGAGGCAACACACCACGTTGTCTACGGTCAAGCACTTCTGTTACCCCGGCATGAAGGGTGTTAAGTCTTCCCCAAGACCGAAGCCTTGATTGTCGTTACCCGCACAACTACTGGACAAAGCCTAGTAATACCTGACGATATAGTGTGGTTGGTCGCTCCACCAGTGGACCCCTGGTAGACCTGGCAGATGAGGCTGGAGTTTCCCCACTGGTAACAGTGTTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCTCCCTCACGGGAGAAGCCATTCTATTGACAAGGTGTGAAGAGCCCCGTACGCTAGTTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCGCAGCCATTGCATGGAAGCCACCATGTGGATGGTCGTAATGAGTAATTGCGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCTTGTTTTACCTTTTAACTGCTTATGGTGACAATATACGTATAAGATATATTGTTCACCATGGGCGCTCAAGTGTCAAGACAAACAACTGGTTCGCATGAGAATGCAATTTCAGCAAGCAATGGAGGATTAATTAAGTACTTTAATATAAATTACTATAAGGATTCAGCTAGCTCAGGATTAGCCAAACAAGACTTCTCACAAGACCCGTCAAAATTTACACAACCCTTAGCTGATGTGTTGACTAACCCGGCACTCATGTCTCCAACAGTGGAAGCTTGTGGGTTTTCCGATAGGCTTAAGCAAATTACTATCGGAAACTCCACTATTACCACCCAGGATGCATTGAACACCGTTCTAGCTTATGGAGAATGGCCAGAATACCTATCGGATATTGATGCCACTTCAGTAGATAAGCCCACACACCCTGAGACTTCATCAGATAGATTCTATACACTAGCTAGTGTAGAATGGGTAGGTACATCAAAAGGTTGGTGGTGGAAGCTCCCAGATGCCCTTAAAGATATGGGCATATTTGGACAGAATTTATATTACCACTCAATGGGAAGGGCAGGATACATCATACACACTCAGTGTAATGCCACTAAATTTCATAGTGGTGCACTACTGGTGGTTCTCATTCCTGAACATCAATTGGCCTATGCGGGCGGTACCAAAGCTAATGTTGGGTATGCACACACACACCCTGGTGAAGATGGGCATGAAATTCGTGACCGAGGTAAAGGTAGCCATGAACCAGATGAGGATCCTTTCTTTAACTGTAATGGAACTTTGTTTGGAAATCTTACAATATTCCCACACCAGATCATTAACTTGAGGACTAACAATTCCAGTACAATTATTAGTCCATATATTAACTGTCAACCAATGGATAACATGCTCAAGCACAACAACCTGACACTGTTAATAGTACCACTAGTTAATCTCAGACCAGCACCAAATGCATCCCCCAGTGTTTCAATAACCATATCAGTTGCCCCGTATAAATCTGAGTTCTCAGGGGCCATGGAGACCCGCTTCACCGTGCGGGCACAGGGTCTTCCAGTTCGTCTACCCAGTGGTGGACAGCAGTTCATGACAACTGAGGATGAACAATCCCCTAATATCTTACCAGGGTATCACTCCAGCAAAAAGATCCATATACCTGGAAAAATCACTAGTGTGCTCCACATGGCCAGAGTTGACTCTTTTATGCCCATTAACAATATAGATAGACATATAGGACAGGTATCAATATACAATGTCACTGTATCAAAGAGAGCATCAGGAGGGGACGGATTAATTCTGTCCATCCCACTTGACATGAGTAACAGTTTATTTTCCACCACACTACTTGGTGAGGTGCTCAACTACTTTACTAACTGGTCAGGTAGCATCACACTCACCTTCATGTGCGTATGTGATTCATTCTCCACAGGAAAGTTCTTAATAGCATACACCCCTCCAGGTGGTGCACTCCCAACAACTCGGAAACAGGCCATGCTAGGAACTCATGTGATTTGGGATTTAGGTCTGCAATCATCATGCACTATGGTTGTCCCATGGATTTCTTCAGGATTTTACCGCAACACCAAATCAGATGAACACACAGAAGCGGGATTCGTGTCCCTCTGGCATCAGACTGATTTCATAGCTACAAACATAACTGGGCAAGGTGCCATTCTTGTCACATGTAGTGGGTGCCCAGATATATCAGTAAGAATGTTAAGAGACACTCCTATGATGAAACAAGATGATGTCTTGCAGAACAATGATCCAATAGAACAATTTGTACATGATACATTGAATGAAGTAATTGTTGTCCCAAACACACAGGCTTCTGGACCACAGCACACCACAAAACCCAGTGCATTGAGTGCCATGGAAATAGGTGCTTCAAGCACGGCTACACCAGAATCAACAATGGAAACAAGGTATGTAGTCAATGATAACACTAATGAAGAGGCTGAGATTGAGAACTTCCTAGGCAGGTCAGCAATATGGACATATCTCCAGTTGGAAAATGGCTTTAAGAAATGGAACATTAACTTTCAGGAGCAGGCACACATCAGAAAGAAATTTGAATTATTTACTTATCTGAGATTTGACATGGAAGTAACGATTGTCACAAACAATCATGGTTTAATGCAAACAATGTATGTTCCACCAGGGATAAAACCACCTGAATCCAAAGCTGACACCACTTGGGATTCGGCATCTAATCCAAGTGTTTTCTACCAACCCAAGAGCGGGTTCCCACGATTCACCATTCCCTTTACTGGTTTAGCTTCAGCTTATTACATGTTCTATGATGGCTATAGCACCACATCCAGAGAGCCAGGGAATACCTATGGTATATCCCCTACTAATGATATGGGCACATTGTGTTTCCGAGTCCTAGATGGATCAGATACTGCTCATGTGAGAGTGTATGTAAAACCCAAACACACCACAGCATGGATTCCCCGACCCCCACGTGCCGTTCAATATACGCACACATACAGTACAAATTACCACTTTAGAACTGTGCATGAAGGGAAGAACATCTTGAAGGACAGGCATTTTATAGTACCAAGGAGCAACATATTGGGACTACAGAATGTCGGACCCAGTGATTTGTGTGTTCACACCAAGGATGCTGTATACACTTGTGCTCACTTAACACAGCCAACTGACAAAACCATCTTATTGGCTTACACAGCAGATTTGCAGGTTGATGCATGTGACACCGAAGGCCCAGACAATATCCCTACATGTGACTGTACAGTAGGTTGCTATTATGTGAAACATTTAGACAGATACTTCCCAATCACTGTAACCCCACACGACTGGTATGAAATTCAGGAATCACCGTATTATCCAAAACACATACAATACAACATACTAATTGGGGAAGGACCTTGCAAGCCTGGTGACTGTGGAGGCAAGCTACTGTGTAGGCATGGTGTTATTGGGATTGTTACAGCTGGTGGTGAAGGTCATGTTGCTTTCACAGATCTCCGCCCATACTCATGCCTAGCACAACACCAGGGTGTAGTATCAGACTATTTCACACAACTTGGGGGCGCCTTTGGTGAGGGTTTTACACATAACATCAGAGAGCATTTCTCAAATTTAAGTACTAGTATTACTGACAAACTTACAAGTAAAGTGGTGAAGTGGTTGGTTCGTATCATCAGTGCCTTAACAATTATGATTAGAAACTCTACAGATACCGCTACAGTATTAGCAACTTTAGCGTTGCTAGGGTGCCAGAGCTCTCCATGGAACTTTTTAAAGAACAAGATCTGTCAGTGGCTGGATATACCTAGACCAGCGTCCAGACAAGGAGACTCTTGGATCAAAAAATTTACAGAGTGTTGCAATGCTGCCAAGGGCCTGGAATGGGTTGCCATAAAAATAGGTAAATTTATTGATTGGTTGAAAGAAAAACTACTCCCCACAGTGCAGCGTAAAAAGGAAACACTAGAGCAGTGCAAAAAACTAGCATTATATGAAGAACAATGCAAGGGATTTTCCAAATCTGATGCTGCAGCACAACAACAGCTGATTCTAGAAGTCTCTAAGCTAAAGAAAGGATTAGATGAACTTGCCCCTTTGTATGCATGTGAGAATAAAAGAGTTTCAATCATACAAAAGGAGTTGCAGCGCATGACTGCATACCACAAAACTCACCGTCATGAACCAGTGTGCTGTTTGATACGCGGTCCGCCTGGCTGTGGTAAATCCTTAATCACTTCTGTCATCGCACGAGGATTGGCATCAGAAGCCCAAATATATTCACTGCCTCCAGATCCAAAATATTTTGATGGATACGATCAACAGAAGGTTGTCATTATGGATGATATAGGACAAAATCCAGATGGCAAGGATCTCAGCATGTTTTGTCAAATGGTGTCAACCACAGAATACGTGGTTCCCATGGCTAGTGTAGAAGAAAAAGGCAGGTCCTTCACCAGTGAATACATCCTGGCCAGCACAAATTTGGATTCGCTTGCACCACCTACAATCACCATTCCAGATGCAATCAGGAGACGGTTCTTTATTGATGTTGACCTAGTAATTATTAGTAAATTTAGAAACCCAAGTGGCCTTCTGGATACAGCAAAAGCATTACAACCGTGTGCAAATTGCCCGAAACCTGCTTGCTTCAAGCAGTGTTGCCCCTTGCTTTGTGGACAGGCAATAGTTTTGCAAGATAGGAAGAGCAAAGCAAGTTACCCTGTCAATGCAATAGTTCAACAACTACAGCATGAGAATTCAACTCGGAAAAAAGTTAAAGACAACCTTACAGCCATTTTTCAAGGTTTGGGAGATACTACCCCCCCAGGATTCATAGTGGATCTGTTATCAGCATCTAAAGACCCAAAAGTTGTTGAGTACTGTGCAGAACAGGGCTGGATTGGGAAGGCTAACTCAACAGTTGAAAGAGATTTAAATTATGTCCACTATGTGCTTAATTGCTTAGGTAGT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41,407
MZ268708.1
rhinovirus C44
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
044640
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,069
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-05-03
SAMN19177351
PRJNA1066815
Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/044640, complete genome
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41,436
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USA
2021-06-15
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Picornaviridae
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USA
USA
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2021-04-09
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PRJNA1066815
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2021-05-10
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Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/QQUGQ5, complete genome
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MZ363456.1
rhinovirus C44
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
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Enterovirus
Picornaviridae
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USA
USA
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2021-05-06
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PRJNA1066815
Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/SQUPYT, complete genome
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2021-04-10
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PRJNA1066815
Rhinovirus C44 strain RvC44/USA/2021/KNT548, complete genome
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41,909
ON881138.1
rhinovirus C53
Xie,Z.
Beijing Pediatric Research Institute, Laboratory of Infection and Virology
China
2023-03-25
GY17017
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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7,145
GenBank
null
China
China
Homo sapiens
oronasopharynx
2017-12-18
null
null
Rhinovirus C53 isolate GY17017, complete genome
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17,239
ON881139.1
rhinovirus C53
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Beijing Pediatric Research Institute, Laboratory of Infection and Virology
China
2023-03-25
GZFE17033
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,146
GenBank
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China
China
Homo sapiens
oronasopharynx
2018-03-26
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Rhinovirus C53 isolate GZFE17033, complete genome
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17,240
ON881140.1
rhinovirus C53
Xie,Z.
Beijing Pediatric Research Institute, Laboratory of Infection and Virology
China
2023-03-25
GZFE17044
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,146
GenBank
null
China
China
Homo sapiens
oronasopharynx
2018-04-25
null
null
Rhinovirus C53 isolate GZFE17044, complete genome
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17,241
ON881141.1
rhinovirus C53
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Beijing Pediatric Research Institute, Laboratory of Infection and Virology
China
2023-03-25
GZFE17049
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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GenBank
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China
China
Homo sapiens
oronasopharynx
2018-04-25
null
null
Rhinovirus C53 isolate GZFE17049, complete genome
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17,242
ON881142.1
rhinovirus C53
Xie,Z.
Beijing Pediatric Research Institute, Laboratory of Infection and Virology
China
2023-03-25
WZ17195
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,146
GenBank
null
China
China
Homo sapiens
oronasopharynx
2018-05-24
null
null
Rhinovirus C53 isolate WZ17195, complete genome
AGGGATTTTAAAACAGTCGACCGGTTGTTCCCACCGGCGAGCATACTGTGCGTTGTACACTGGAATTACGGTTCCTTTGTATGCCTGTTTTATAATCCCCTCCCCTCTTTTCTATCGTCTCCAATTTTCCACGTAACTTAGAAGCAAAGTACATGAGCCTAATAGGAGCGGCTAATCCATAGCCGTATAGGGCAAGCACTTCTGTTACCCCGGATGCGTGAATAGACTTCTCACGAGGTTGAAGCTGAAGCATTCGTTACCCGCACTTGTACTGCGCGGAAATTAGTAGCACCTTTGCCAGCTTCATGGCGTTTCGCTCAGCGTTTCCCCCACGTAGATCAGGGCAATGGGGCTACACAACCCCCACCGGCGACGGTGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCCGAGCTATCAGCTCGGGACGCCATGATGAAGACAGGGTGTGAAGGTTCGAGTGCGCTACAAGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCCGTAGCTGTGGTATGCATGCCAGCATAAACACAGTCGTAATGGGCAACTACGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTAAATTTGTCTTATGGTTACAGGTTTATGCAAATAGATCTGTAATCATGGGCGCTCAGGTGACTAAACAAAAAGTTGGATCACATGATAATACCATTGCAGCACAGAGTGGTTCGGTAGTCAAATATTTTAACATCAACTACTACAAAGATGCTGCCAGTTCAGGGCTCTCTAAACAAGATTTCTCACAAGACCCATCTAAGTTTACACAACCGCTTGCCGATGTTTTGACAAACCCTGCACTCATGTCACCCAGCATTGAAGCTTGCGGTTACTCTGACAGACTCAAACAGATCACAATTGGAGACTCCACTATAACAACTCAAGACACCTTGAATAGTGTTGTGGCATATGGAGAATGGCCTGAATACTTGTCTGATATAGATGCTTCATCAATAGACAAACCGACACACCCAGAAACATCAGCTGATAGATTTTATACCCTTGATAGTGTTGATTGGTCTGAAAACTCAACTGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGACTGCCTGAGAGATATGGGTCTGTTTGGTCAGAATATGTATTTTCATGCCATGGGGAGGACTGGTTACATTGTACACGTGCAATGTAATGCAACCAAGTTTCACAGTGGTTGTCTGATGGTAGCGGCTATACCAGAACATCAGCTAGCATACATTGGTGGAGGTAATGCCAACGTTAAATATAAGCACACCCACCCAGGAGACAGAGGACATACCATGAGACCATCAGATGTACGAGGTGATAACAACCCAGATGAGGACCCCTTCTACTTGTGTAATGGCACACTGTTTGGGAACATACAGGTTTATCCACACCAGATGATCAACTTGCGCACAAACAACTCAGCAACTTTGATCATACCTTACATCAACTGCCTGCCCATGGACAGCATGCTCAGACACAACAACATCTCTCTTGTGATAATTCCACTTGTCAGACTCAAGACGGGAACAACTGGTAGCACAACTCTCCCCATAACAATCACTATTGCCCCCGATAAATCTGAATTCTCTGGCCCAATGCAAAACCAGAAGCAAGGTATACCAACCCGCATACCCAGTGGATCTCAGCAATTCATGACTACAGAGGATGAACAATCACCAAACATTCTACCTGAGTACAGTCCAACTAAAGTTGTACATATTCCAGGAGAAGTAACCAATCTGATACATCTTGCACAGGTGGAATCATTCATCCCTCTAAACAACATTAAACAACACGAGGGGAAGATTGACATCTACTCAGTCACAATCACAAGGAAACCCACCCGAGATCTTATTGTGACCATCCCACTGCAGATGGATAATGCATTGTTTGCAACCACACTCCTAGGTGAAATCCTTAACTACTATGCTAACTGGTCTGGGAGTGTTAGAATCACTTTCATGTGTGTATGTGATGGATTCAGCACTGGAAAATTCCTTATGGCATATACTCCACCTGGTGGAACAGTACCAGCATCCAGGAAGCAAGCAATGTTGGGCCCACATGTGGTATGGGACCTAGGCCTACAATCCAGTTGTAGCATGGTAGCACCTTGGATATCTAGTACCTTCTTCCGCAGGACAAACTCAGACAACTACTCATCGGGTGGCTATATCACTCTGTGGTATCAGACAGATTTTGTCAGTGATAGTCCCAACAACAATGGAGCTATCGTAGCCACTTGTTCGGGATGCCCAGATATATCTGTACGCATGCTGCGTGACACCCCCACCTTAGCATTCCCACGTTCTACACTCCAGAATCCAGTAGAAGATTTTATTGATACCACACTCAAAGAAGTGTTGGTTGTTCCAGACACGCACCCATCGGGACCTGTCCACACCACACGACCGACGGTACTTGGAGCAATGGAAATTGGGGCAACACCAAACGTCCTACCAGAAGATGTGATTGAGACCAGATATGTGATCAATAACCACGTAAACAATGAAGCACTACTGGAGAATTTTCTTGGCCGCTCATCTCTGTGGGCAGAATTTCAGTTACAGAGCAAATTCAAGAAGTGGGAAATCAATTTTCAAGAGCAACCACAGTTCAGAAGGAAAATAGAATTCTTCACATACGTGAGGTTTGACATGGAAATCACTGTTGTTACAAATAACACAGGGTTGATGCAAATAATGTATGTGCCACCAGGCGCTAAAGCACCAGCCACCCACAGTGATAACAAATGGGATGGTGCCTCAAACCCCAGTGTGTTTTACCAACCCAAGAGTGGATTCCCCCGTTTCACCATCCCCTTTACAGGTCTTGGATCAGCATATTATGTATTCTATGATGGGTATGATCAAGTTGGTGATGATGTGACCAAATATGGAATATCCTCCACGAATGACATGGGCACCTTGTGTTTCAGAGCACTTGAGGATGAGCAGAACAATGATGTCAAGATTTTTGTAAAACCTAAACATACTAGAGCATGGTGTCCCAGACCACCTCGAGCAACATCATACACTCACAAGTTCTCTCCCAATTATCATATTTCAGTAGGCCAGGATCAGCCCCTGGAGGTGGACCACTCCTTCACTTTCCGCACAGATATTAAGGAACTCCAAACTGCGGGCCCAGGTGATCAGTATGTTCACACCAAAGATGCTATTTACAGAAATGCTCATCTTGCTACTGCCAATGACAATACAATCTTGATAGCCCTGACATCAGATTTACAGGTAGACTACACAGACACACCTGGTTCAGATTACATCCCAGAATGTGATTGTTTAGAAGGTTGTTATTACTGCAAATCACAAGATCGGTATTTCCCAATCAAATGTACTGCATATGATTGGTATGAAATCCAAGAGACATCCTACTACCCAAAGCATATCCAGTATAATATTTTAATAGGGGAAGGTCCAGCATTACCTGGTGACTGTGGTGGTAAGCTACTTTGTAAGCATGGTGTGATCGGGATTCTCACTGCGGGAGGCGAGGGACACGCTGCCTTCACAGATCTAAGACCTTACCGTGATTTGAACACACAACAGGGACCAATAACTGATTACTTAACACAACTTGGCAACGCATTTGGTGAGGGCTTCACACAAAACATTAAAGATGGGTTTAATGATATAGGGAAGAACATCACAGACAAATTAACATCCAAAGTGTTTAAGTGGCTTATTAGAATAATAAGTGCTCTCACTATCATGGTTAGAAACAGTGCTGACACTCCCACTGTGTTAGCTACATTAGCCCTATTGGGCTGCAGTAAATCTCCATGGACCTTCCTCAAAGATAAGATATGCAGCTGGCTTAATATTCCCAAGCCTCCAGGACATCAGGGGGATGGTTGGTTGAAGAAATTTACTGAGTGTTGCAATGCAGCTAAAGGCTTAGAGTGGATTGGTGTAAAGATTAGCAAATTTATAGATTGGCTAAAAGAAAAACTTATACCAGCTGTCCAATCAAAGAAACAAACTCTCACTGAATGCAAGAAGATCCCTCTCTACCAAGAACAAGTTAAGGGATACCCCTATGCATCTGAGGATGCCCAACGAGAACTTTGTGTCAACATTGACAAACTCAAGAAAGGGCTGGACAGCTTGGCACCACTCTACGCAAAGGAAAACAAATTAGTGAGTGACATGCAAAAGCAACTCAAACAGATGTTCTCATACCAGAGATCACATAGGGTAGAACCCGTATGTGTGCTCATACATGGGAGCCCAGGTTCCGGTAAATCTTTAACCACGACCATTCTATCCAGAGGGCTGGCTGGGGAGGCAGATATATACTCATTACCTCCAAATCCAAAACATTTTGATGGCTACACACAACAGAAAGTTGTCATCATGGATGATGTAGGGCAGAACCCAGATGGTGGTGACCTAAGTATTTTTTGTCAAATGGTTTCTACAACTGATTTCCATGTACCCATGGCAGCATTAGAAGATAAGGGCATGTGTTTTACTAGCGAGTATGTGTTAGCTAGCACAAACTTATCAAATCTTACACCTCCTACAGTTCAAATCCCAGAGGCACTACACAGGAGATTTTTCATGGACATGGATATCAAAATAATGCCAAACTTTTGCACCCCTACGGGAATGCTCAATACTGCAAAGGCCCTTTCCAAATGTGATGGTTGCCCAAGCCCTCCTCATTACAAGACATGCTGCCCCATGTTATGTGGTAAAGCAATAGTTTTACAAGACAGGAAAACCAAAGTTAACTATTCAATAAATATGGTGGTTGCCCAGATCCGCGAGGAGTTGTCAGGCAGGAAAAGTGTACAACTAAACCTAAATAACATCTTCCAGGGATTGGGAGATGATGAGACACCAGGCTTTATTATAGACCTATTATCCTCATCAAAAGACCCAAAAGTTATTAGATACTGTGAGGAAAATGGATTAATAGGGAAAGCCAAATGTACAATTGAAAGGAATATTGACCA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17,243
MF775366.1
rhinovirus C53
Ng,T.F.F., Lu,X., Castro,C.J., Chern,S.-W.W., Magana,L.C., Marine,R.L., Erdman,D., Nix,W.A.
Centers for Disease Control and Prevention, Polio and Picornavirus Laboratory Branch
USA
2017-09-05
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,081
GenBank
null
USA: CO
USA
Homo sapiens
oronasopharynx
2014-08-13
null
PRJNA322324
Rhinovirus C53 strain USA/CO/2014-20993, complete genome
GGCGAGCACACTGTGCGTTGTACACTGGAATTACGGTTCCTTTGTATGCCTGTTTTATAACCCCTTCCCCTCTTTTCTATCATCTCTAATTTCCATGTAACTTAGAAGCAACGTACATGAGCCCAATAGGAGCGGCTAACCCACAGCCGTACAGGGCAAGCACTTCTGTTACCCCGGATGTGTGAATAGACTTCTCACGAGGTTGAAGCTGAAGCATTCGTTATCCGCACTTGTACTGCACGGAAATTAGTAGCACCCTTGCCAGCTTCATGGTGTTTCGCTCAGCGTTTCCCCCACGTAGATCAGGGCAATGGGGCTACACAACCCCCACCGGCGACGGTGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCCGGGCTATCAGCCCGGGACGCCATGATGAAGACAGGGTGTGAAGGTTCGAGTGCGCTACAAGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCCTAACCCCGTAGCTGTGGTGTGCACGCCAGCACAAGCACAGTCGTAATGGGTAACTACGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTCCTTTAAATTTGTCCTATGGTTACAGGTTTATGCAAATAGATCTGTAATCATGGGCGCTCAGGTGACTAAACAAAAGGTTGGATCGCATGATAATACTATTGCAGCACAAAGTGGTTCAGTAGTTAAGTACTTTAACATCAATTACTATAAGGATGCTGCTAGTTCAGGACTTTCCAAACAGGATTTCTCCCAGGACCCATCTAAGTTCACACAACCACTTGCCGACGTCTTGACTAATCCTGCACTCATGTCGCCCAGTATTGAAGCTTGCGGCTACTCTGACAGACTTAAGCAGATTACAATTGGAGATTCCACCATAACAACCCAAGATACGCTAAATAGTGTTGTAGCATATGGAGAGTGGCCTGAGTACTTGTCTGACATAGATGCCTCATCAATAGACAAACCAACACACCCAGAAACTTCAGCTGATAGATTCTATACTCTTGATAGTGTTGACTGGTCTGAAAATTCAACTGGGTGGTGGTGGAAATTGCCAGACTGTTTAAGAGATATGGGTCTATTTGGCCAGAATATGTATTATCATGCTATGGGGAGAACTGGATATATTGTGCATGTACAGTGTAATGCTACTAAATTCCACAGTGGATGTTTGATGGTGGCAGCCATACCAGAGCATCAGCTAGCTTACATTGGCGGGGGCAATGCCAATGTTAAATATAAGCACACTCATCCAGGGGACAGAGGACACACCATGAGACCATCAGATGTGCGAGGTGATAATAACCCAGATGAAGACCCCTTCTACTTGTGTAATGGCACGCTGTTTGGAAACATACAGATTTACCCACACCAGATGATCAACTTGCGCACAAACAACTCAGCAACTTTGATCATACCTTACATTAACTGCCTGCCAATGGACAGCATGCTCAGACACAATAATATTTCTCTTGTAATAATTCCACTTGTCAGACTCAAGACGGGTACAACTGGTAGCACGACACTCCCTATAACAATCACAATTGCACCTGACAAATCTGAATTTTCTGGCCCGATGCAAAACCAGAAACAGGGTATACCAACCCGCATGCCCAGTGGATCTCAGCAATTTATGACTACAGAGGATGAACAATCACCAAACATTCTACCCGAGTACAGTCCAACCAAAGTTGTACATATTCCAGGAGAAGTAACCAATTTGATACACCTTGCACAGGTGGAATCATTCATCCCCTTAAACAACATCAAACAACACGAGGGGAAGATTGATATTTACTCAGTCACGATCACAAGGAAACCTACCCGAGATCTTATCGTGACTATTCCACTACAGATGGACAATGCATTGTTTGCAACCACACTCCTAGGGGAAATTCTCAATTATTATGCTAACTGGTCTGGGAGCGTCAGAATCACCTTCATGTGTGTGTGCGACGGATTCAGCACCGGGAAATTCCTCATGGCATACACTCCACCTGGCGGAACAATTCCAGCATCCAGGAAACAAGCAATGTTGGGCCCGCATGTAGTGTGGGACCTGGGTTTACAATCCAGCTGTAGCATGGTAGCACCCTGGATATCTAGTACTTTTTTCCGCAGAACAAATTCAGATAACTACTCATCGGGTGGTTATATTACTCTGTGGTATCAAACAGACTTTGTTAGTGATAGTCCCAACAATAATGGAGCTATAGTGGCAACTTGCTCAGGATGCCCAGACATATCCGTGCGCATGTTGCGTGATACCCCTACCTTAGCATTCCCACGTTCTGCGCTTCAGAACCCAGTAGAAGACTTCATTGATACTACACTTAAAGAAGTGTTAGTTGTCCCAGATACCCACCCATCCGGACCTGTCCATACCACACGACCAACTGCGCTTGGAGCAATGGAAATTGGAGCAACGCCAAATGTCTTGCCAGAGGACGTAATTGAGACCAGATACGTAATTAACAACCATGTGAACAATGAAGCACTACTGGAGAATTTCCTTGGCCGCTCATCCCTGTGGGCAGAGTTCCAGCTGCAGAATAAATTTAGGAAATGGGAAATCAACTTCCAAGAGCAACCACAATTCAGGAGGAAAATAGAATTTTTCACGTATGTGAGATTTGATATGGAGATTACTGTCGTCACAAACAACACAGGGTTGATGCAAATAATGTATGTACCGCCAGGTGCCAAAGCACCGACCGCTCACAATGACAACAAATGGGATGGTGCTTCGAACCCTAGTGTATTTTACCAACCCAAAAGTGGATTTCCCCGCTTTACCGTCCCTTTCACAGGTCTTGGGTCAGCATACTATGTATTCTATGATGGGTATGACCAGGTTGGTGATGAAGTAACCAAATACGGCATATCCTCCACAAATGATATGGGCACCCTGTGTTTTAGAGCACTTGAAGATGAGCAGAACAATGATGTCAAAATTTTTGTTAAACCCAAGCACACCAGAGCATGGTGTCCTAGACCGCCCCGAGCAACATCATACACCCACAAGTTTTCTCCCAATTACCATATTTCAGTTGGACAGGACCAACCTCTGGAAGTGGACCACTCTTTCACTTTTCGTACTGATATTAAGCAACTCCAGACTGCAGGTCCAAGTGACCAGTATGTTCACACCAGGGACGCTATCTATAGGAATGCTCACCTTGCTACTGCTAATGATAACACGATCTTGATAGCCCTGACATCTGACTTGCAGGTAGATTATACAGATACACCTGGTCCAGACTACATCCCAGAATGTGACTGTCTAGAAGGTTGCTATTACTGCAAATCACAAGATCGGTACTTCCCGATCAAATGCACCGCACATGATTGGTATGAAATCCAAGAGACATCCTATTACCCAAAACACATCCAGTACAACATTATGATAGGAGAGGGCCCAGCATTACCTGGTGATTGTGGTGGCAAACTATTATGCAAGCATGGTGTAATCGGGATCCTTACTGCAGGAGGTGAGGGACACGCTGCTTTCACGGATCTGAGACCCTACCGTGAACTAAACACACAACAGGGACCAATAACTGATTACCTAACACAACTTGGCAGTGCATTTGGTGAAGGTTTTACACAAAACATTAAAGATGGATTTAATGATATAGGAAAAAACATCACAGACAAATTAACTTCTAAGGTGTTTAAATGGCTTATCAGAATAATAAGTGCTCTTACTATCATGGTTAGAAATAGTGCTGACACTCCTACTGTATTGGCCACACTAGCCCTACTGGGTTGCAGTAAATCTCCATGGACCTTCCTCAAAGATAAGATATGCAGTTGGCTTAACATTCCTAAACCCCCAGGGCATCAGGGGGACAGCTGGTTAAAGAAATTCACTGAATGTTGCAATGCAGCTAAAGGCCTGGAGTGGATTGGTGTCAAGATTAGCAAATTTATAGACTGGCTGAAGGAGAAGCTTATACCAGCTGTCCAATCAAAGAAACAAACTCTCACCGAGTGCAAGAAGATCCCTCTCTACCAAGAACAAGTCAAGGGATACCCTTACGCTTCTGAAGATGCCCAGAGAGAACTCTGTGTCAACATCGATAAACTCAAGAAAGGGCTGGACAACCTAGCACCACTTTATGCAAAGGAAAATAAACTAGTGAGTGATATGCAAAAACAGCTCAAACAGATGTTCTCGTACCAGAGATCACATAGGGTAGAACCTGTATGCGTGCTCATACATGGGAGTCCAGGCTCCGGTAAATCTTTAACTACAACCATTCTATCTAGAGGATTGGCTGGGGAAGCAGACATATACTCATTGCCTCCTAATCCGAAGCACTTCGATGGCTATACACAGCAGAAAGTTGTCATCATGGACGATGTGGGCCAAAATCCAGATGGTGGTGACCTAAGTATCTTCTGTCAGATGGTTTCTACAACTGATTTCCACGTACCCATGGCAGCATTAGAGGATAAGGGTATGTGTTTCACCAGCGAATATGTATTGGCTAGTACAAACTTGTCAAATCTTACACCCCCCACAGTCCAAATTCCAGAGGCATTGCACAGGAGATTCTTCATGGACATGGATATTAAAATCATGCCAAATTTTTGTACCCCCACAGGAATGCTTAATACCGCAAAGGCTCTCTCCAAATGCGATGGTTGCCCACAACCCCCCCATTACAAAACATGCTGCCCAATGCTTTGTGGTAAGGCAATAGTGTTGCAGGATAGGAAGACCAAAGTAAATTACTCAATAAACATGGTAGTTGCCCAGATCCGTGAGGAACTATCGGGCAGGAAAAGTGTGCAACTGAATCTCAACAACATCTTCCAAGGACTAGGAGATAGTGAAACACCAGGCTTCATTATAGACCTATTATCCTCATCAAAGGACCCAAAAGTTATCAGATACTGTGAAGAGAATGGATTAATAGGAAAAGCTAAATGTACAATTGAGAGAAACATTGATCATTTACAATATACACTAAACTGTTTAGGTAGCCTGGT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74,996
MF775367.1
rhinovirus C53
Ng,T.F.F., Lu,X., Castro,C.J., Chern,S.-W.W., Magana,L.C., Marine,R.L., Erdman,D., Nix,W.A.
Centers for Disease Control and Prevention, Polio and Picornavirus Laboratory Branch
USA
2017-09-05
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,146
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
oronasopharynx
2015-10-09
null
PRJNA322324
Rhinovirus C53 strain USA/2015-20994, complete genome
AGGGATTTTAAAACAGTCGACCGGTTGTTCCCACCGGCGAGCATACTGTGCGTTGTACACTGGAATTACGGTTCCTTTGTATGCCTGTTTTATAATCCCTTCCCCTCTTTTCTATCGTCTCTAATTTTCCACGTAACTTAGAAGCAAAGTACATGAGCCCAATAGGAGCGGCTAACCCATAGCCGTATAGGGCAAGCACTTCTGTTACCCCGGATGTGTGAATAGACTTCTCACGAGGTTGAAGCTGAAGCATTCGTTACCCGCACTTGTACTGCGCGGAAATTAGTAGCACCTTTGCCAGCTTCATGGCGTTTCGCTCAGCGTTTCCCCCACGTAGATCAGGGCAATGGGGCTACACAACCCCCACCGGCGACGGTGGTGTAGCCCGCGTGGTGCCCCGCCCGAGCTATCAGCTCGGGACGCCATGATGAAGACAGGGTGTGAAGGTTCGAGTGCGCTACAAGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAACCCCGTAGCTGTGGTATGCATGCCAGCATAAACACAGTCGTAATGGGCAACTACGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTTTTTTCCTTAAATTTGTCTTATGGTTACAGGTTTATGCAAATAGATCTGTAATCATGGGCGCTCAGGTGACTAAACAAAAAGTTGGATCACATGATAATACCATTGCAGCACAGAGTGGCTCGGTAGTCAAGTATTTTAACATCAATTACTACAAAGATGCTGCCAGTTCAGGGCTCTCTAAACAAGATTTCTCACAAGACCCATCTAAGTTTACACAACCGCTTGCCGATGTTCTGACAAACCCTGCGCTTATGTCACCCAGCATTGAAGCTTGCGGTTACTCTGACAGACTTAAGCAGATCACAATTGGAGACTCCACTATAACAACTCAAGACACCTTGAATAGTGTTGTGGCATATGGAGAATGGCCTGAATACTTATCTGATATAGATGCCTCATCAATAGACAAGCCTACACACCCAGAAACATCAGCTGATAGATTTTATACCCTTGATAGTGTTGATTGGTCTGAAAACTCAACTGGATGGTGGTGGAAATTGCCAGACTGCCTGAGAGATATGGGTCTGTTTGGTCAGAATATGTATTATCATGCTATGGGGAGGACTGGTTACATTGTACACGTGCAGTGTAATGCAACCAAATTTCACAGTGGTTGTCTGATGGTAGCGGCTATACCAGAACATCAGCTAGCATACATTGGTGGAGGTAATGCCAACGTTAAATATAAGCACACCCACCCAGGAGACAGAGGACACACTATGAGACCATCGGATGTACGAGGTGATAACAACCCAGATGAGGATCCCTTCTACTTGTGTAATGGCACACTGTTTGGGAACATACAGGTTTATCCACACCAGATGATCAATTTGCGCACAAACAACTCAGCAACTTTGATCATACCTTACATCAACTGCTTGCCTATGGACAGCATGCTCAGACACAACAACATCTCTCTTGTGATAATTCCACTTGTCAGACTCAAGACGGGAGCAACTGGTAGCACAACTCTCCCCATAACAATCACTATTGCCCCCGATAAATCTGAATTCTCTGGCCCAATGCAAAACCAGAAGCAAGGTATACCAACCCGCATACCCAGTGGATCTCAGCAGTTTATGACCACAGAGGATGAACAATCACCAAACATTCTACCTGAGTACAGTCCAACTAAAGTTGTACATATTCCAGGAGAAGTGACCAATCTGATACATCTTGCACAGGTAGAATCATTCATCCCTCTAAACAACATTAAACAACACGAGGGGAAGATTGACATCTACTCAGTCACAATCACAAGGAAACCCACTCGAGATCTTATTGTGACCATCCCACTGCAGATGGATAATGCATTGTTTGCAACCACACTCCTAGGTGAGATTCTTAACTACTATGCTAACTGGTCCGGGAGTGTTAGAATCACTTTCATGTGTGTGTGTGATGGATTCAGCACTGGAAAATTCCTTATGGCATACACTCCACCTGGTGGAACAGTACCAACATCCAGAAAGCAAGCAATGTTGGGCCCACATGTGGTATGGGACTTAGGCCTACAATCCAGTTGTAGCATGGTAGCACCTTGGATATCCAGCACCTTCTTCCGCAGGACAAACTCAGACAACTACTCATCGGGTGGTTATATCACTCTGTGGTATCAGACAGACTTTGTCAGTGATAGTCCCAACAACAATGGAGCTATTGTAGCCACTTGTTCGGGGTGCCCAGATATATCCGTACGCATGCTGCGTGACACCCCCACTTTAGCATTCCCACGTTCCACACTCCAGAATCCAGTAGAAGATTTTATTGATACCACACTCAAAGAAGTGTTGGTTGTTCCAGACACGCACCCATCGGGACCTGTCCACACCACACGACCGACGGTGCTTGGAGCAATGGAAATTGGGGCAACACCAAACGTCCTACCAGAAGATGTAATTGAGACCAGATATGTGATCAATAACCATGTAAACAATGAAGCACTACTGGAAAATTTTCTTGGCCGCTCATCTCTGTGGGCAGAATTTCAGTTACAGAGTAAATTCAAGAAATGGGAAATCAATTTTCAAGAGCAACCACAATTCAGAAGGAAAATAGAATTCTTCACATATGTGAGATTTGACATGGAAATCACTGTTGTTACAAATAACACAGGGTTGATGCAAATAATGTATGTGCCACCAGGTGCTAAAGCACCAACCACCCACAGTGACAATAAATGGGATGGTGCCTCAAACCCTAGTGTGTTTTACCAACCCAAGAGTGGATTTCCCCGTTTCACCATCCCCTTTACAGGTCTTGGATCAGCATATTATGTATTCTATGATGGGTATGATCAAGTTGGTGATGATGTGACCAAATATGGAATATCCTCCACAAATGATATGGGCACCTTGTGTTTCAGAGCACTTGAGGATGAGCAGAATAATGATGTCAAAATTTTTGTAAAACCCAAGCATACTAGAGCATGGTGTCCCAGACCACCCCGAGCAACATCATACACTCACAAGTTCTCTCCCAATTACCATATTTCAGTAGGCCAGGATCAGCCCCTGGAGGTGGACCACTCCTTCACTTTCCGCACCGATATTAAGGAGCTCCAAACTGTGGGCCCAAGTGATCAATATGTTCACACCAAAGATGCTATTTACAGAAATGCCCATCTTGCTACTGCCAATGACAATACAATCTTGATAGCCCTGACATCAGATTTACAGGTAGATTACACAGATACACCTGGTTCAGATTACATCCCAGAATGTGATTGTTTAGAAGGCTGCTATTACTGCAAATCACAAGACCGGTATTTCCCAATCAAATGTACTGCATATGATTGGTATGAAATCCAAGAGACATCCTACTACCCAAAGCATATCCAGTATAATATTTTGATAGGGGAAGGTCCAGCATTACCTGGTGACTGTGGCGGTAAGCTGCTTTGTAAGCATGGTGTGATCGGGATTCTCACTGCAGGAGGCGAGGGATACGCTGCCTTCACAGATCTAAGACCCTACCGTGATTTGAACACACAACAGGGGCCAATAACTGATTACTTAACACAACTTGGCAACGCATTTGGTGAGGGCTTCACACAAAACATCAAAGATGGGTTTAATGATATAGGGAAGAACATCACAGACAAATTAACATCTAAAGTGTTTAAATGGCTTATTAGAATAATAAGTGCTCTCACCATCATGGTTAGAAACAGTGCTGACACTCCCACTGTGTTAGCTACATTAGCCCTACTAGGCTGCAGTAAATCTCCATGGACTTTTCTCAAAGATAAGATATGCAGCTGGCTTAATATTCCCAAGCCTCCAGGGCATCAGGGGGATGGTTGGTTGAAGAAATTTACTGAGTGCTGCAACGCAGCTAAAGGCCTAGAGTGGATTGGTGTAAAGATTAGCAAATTTATAGATTGGCTAAAAGAAAAACTTATACCAGCTGTCCAATCAAAGAAACAAACTCTCACTGAGTGCAAGAAGATCCCTCTCTACCAAGAACAAGTCAAGGGATACCCCTACGCATCTGAGGATGCCCAACGAGAGCTTTGTGTCAACATTGATAAACTCAAGAAAGGGCTGGACAGTTTGGCACCACTCTACGCAAAGGAAAACAAATTAGTGAGTGACATGCAAAAGCAACTCAAACAGATGTTCTCATACCAGAGATCACATAGGGTGGAACCCGTATGTGTACTCATACATGGGAGTCCAGGTTCCGGTAAATCTTTAACCACAACCATTCTGTCCAGAGGGTTGGCTGGGGAGGCAGATATATACTCATTACCTCCAAATCCAAAACACTTTGATGGTTACACACAACAGAAAGTTGTCATCATGGATGATGTGGGGCAAAACCCAGATGGTGGTGACCTAAGTATTTTTTGTCAAATGGTTTCTACAACTGATTTCCATGTACCCATGGCAGCACTAGAAGATAAGGGTATGTGTTTTACTAGCGAGTATGTGTTAGCTAGCACAAACTTATCAAATCTTACACCTCCTACAGTTCAAATCCCAGAGGCACTACACAGGAGATTCTTCATGGACATGGATATCAAGATAATGCCAAACTTTTGCACCCCTACAGGAATGCTCAATACTGCAAAGGCCCTCTCTAAATGTGATGGTTGCCCAAGCCCTCCTCATTACAAGACATGCTGCCCCATGCTGTGTGGTAAAGCAATAGTTTTACAAGACAGGAAGACCAAAGTTAACTATTCAATAAACATGGTGGTTGCCCAGATCCGTGAAGAATTGTCAGGCAGGAAAAGTGTGCAGCTAAACCTAAATAACATCTTCCAGGGATTGGGAGACAATGAGACACCAGGCTTTATTATAGACTTGTTATCCTCATCAAAGGACCCAAAAGTTATCAGATACTGTGAGGAAAATGGATTAATAGGGAAAGCCAAATGTACAATTGAAAGAAATATTGACCA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74,997
MZ629123.1
rhinovirus C56
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-08-08
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,107
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-06-01
SAMN20216563
PRJNA1066815
Rhinovirus C56 strain RvC56/USA/2021/6LBP22, complete genome
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39,598
MZ268724.1
rhinovirus C56
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
465986
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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7,102
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-23
SAMN19131273
PRJNA1066815
Rhinovirus C56 strain RvC56/USA/2021/465986, complete genome
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41,452
MZ268726.1
rhinovirus C56
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
466615
Rhinovirus C
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Picornaviridae
ssRNA(+)
7,113
GenBank
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USA
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null
2021-04-23
SAMN19131277
PRJNA1066815
Rhinovirus C56 strain RvC56/USA/2021/466615, complete genome
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41,454
MZ268729.1
rhinovirus C56
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
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Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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7,112
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
null
2021-04-09
SAMN19131227
PRJNA1066815
Rhinovirus C56 strain RvC56/USA/2021/E5AKW2, complete genome
ACCCACACCGTCTACGGACGTAGTACTCTTGTATCTCGGTACATTTGTACGCCAGTTTTCCCTCCCTCCCCCCCCTTCACGTAACTTATAGAAGCTTGAACATATAGGCGAATAGGAAGCCAACAAACCATGTTGGTAAACGCCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTATTAGAGTGTTAGGCTTCTCACGAGGCTGAAGCTTGATATATCGTTACCCGCACAGTTACTAAGCAGAGCCTAGTAACACTTTGATCTTTATACTGGCTGGTCGCTCCGTCAGAAACCCCCTGATAGACCTGGCAGATGGGGCTGGAAATTCCCCACTGGCGACAGTGTTCCAGCCCGCGTGGCTGCCTGTCCCCCTTTCCTGGGGGAAAGCCAATATATAGACAAGGTGCCAAGAGCCGCGTTTGCTAACTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTATCGCATGGATTCCACCATGTAGGTAGTCGTAATGGGCAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATACCTTATTTTATCTCATGGTGACAACATATATTCATAAGTATATGTTGACTACCATGGGTGCACAAGTGTCCAAGCAAAACACTGGATCTCACGAAAATGCAATCAGTGCCAACAATGGAGGTGTGATTAAGTATTTCAACATTAACTACTATAAGGACTCTGCTAGCTCAGGTTTAACCAAACAGGATTTTTCTCAAGATCCGTCTAAGTTCACACAGCCTCTTGTTGACACTTTGACAAACCCTGCTTTAATGTCTCCCTCAGTAGAAGCATGTGGATTTTCCGACAGGCTCAAACAAATCACTATCGGCAACTCCACAATTACTACCCAAGATGCTATACACACAGTTCTTGCTTATGGGGAATGGCCACAGTATCTTTCTGACATCGATGCTACATCAGTTGATAAACCCACACACCCAGAAACATCAGCGGATAGATTCTATACTTTAGCTAGTGTGGACTGGGATGGGAACTCCAAGGGTTGGTGGTGGAAGCTACCAGATGCTTTAAAGGAGATGGGAATTTTCGGGCAAAATATGTACTATCACTCAATGGGAAGGTCAGGTTACATAATACACACTCAGTGTAATGCTACCAAATTCCATAGTGGAGCACTCTTGGTTGTCCTTATTCCAGAACACCAGTTAGCATATATAGGTAGTGAGAAGGTAGACGTTGCTTATGAACATACACACCCTGGAGAAAGTGGTCACAAAATAGGCGTTAATAAGTTAAGGGACAACTTTCAACCAGATGAGGATCCATTCTATAATTGTAATGGCACTCTTTTCGGTAACCTCACTATCTTCCCCCACCAGATTATCAATCTGAGGACAAACAATTCCAGTACAATTATAACACCATACATTAATTGTCAACCAATGGACAACATGCTCAAACATAACAACTTGACACTGTTGATAGTACCATTAGTCACACTCAGAGCCAGCATCACTACCACCCCTACAGTATCTATAACTGTTACAATAGCACCATATAAATCTGAGTTTTCCGGTGCTATGCAACATCAAACCCAGGGATTACCCACACGTATACCTAGTGGGGGGCAACAGTTTATGACCACAGAGGATGAGCAATCAGCCAACTTACTCCCTGGGTTTCATCCAAGTAAGAAGATACAAATTCCAGGCAAGATCACCAGTGTTCTTCACATGGCGAGGGTGGATTCCTTCATGCCCATTAACAATATACCAACCGAGGAAGGTAAGGTGAGTATGTACAACATTACCGTCACCCGCAAAGGCTCAAATAGCGGGCTCTTGCTCACCATACCGCTAGAGATGAGCAACACACTCTTTTCCACTACTCTACTAGGTGAAGTGCTCAATTACTTCACGAACTGGTCTGGTAGCATAACACTAACTTTCATGTGTGTATGTGATTCATTTTCCACTGGGAAATTTCTCTTGGCTTACACGCCACCAGGAGGGGCCCACCCAAAAAACCGCAAGGAAGCCATGCTTGGTGTTCACATCATATGGGATCTAGGCCTGCAATCTTCTTGCACAATGGTTGTACCATGGATGTCTTCAGGATTTTATCGTAGAACAGAGTCAGATAATTATACACATGCTGGCTACGTTTCACTGTGGTACCAAACAGACTTCATTCCATCTTCAACACAAGTAACCCAGGGGGCCATTCTGGTCACTTGCAGTGGGTGTCCTGATCTATCTGTAAGAATGTTAAGAGATACACCAATGATGAAACAAACCAACGACTTACAGAACAATGATCCCATTGACACATATGTCCATGATGTCCTCAATGAGGTTGTTGTGGTTCCAGATACCAAACCGTCGGGACCACAACATACCACTAGACCCAGTGCATTGGGTGCAATGGAAATAGGGGCCTCCAGCTCAACCATCCCTGAGTCAGTAATAGAAACCAGATATGTAGTGAATGACAACACAAATGAGGAAGCTGAAATAGAGATGTTCTTGGGTCGTTCCGCTTTATGGTCAAAGTTTAATCTAACTGGTAAGTTTGCCAGGTGGGACATTAGTTTCCAGGAACAAGCTAGCATTAGGAAAAAGTTTGAACTTTTCACATATCTCAGATTTGACATGGAAGTCACAATTGTCACCAACAACGAGGGTCTAATGCAGGTCATGTTCATCCCTCCAGGACTTGAAAAACCCACCAGTGATGCAGATCGACTATGGGACTCTGCATCTAACCCCAGTGTCTTTTTCCAACCCAAGAATGGATTCCCTCGCTTCACCATCCCGTTCACTGGACTAGCCTCAGCTTATTACATCTTCTATGATGGATATACCACAAGAGAAGTGCCCAGAGACAACACCTATGGCATTTCCCCAACTAATGATATGGGGACATTGTGTTTCCGATCATTAGATGATTCTGCCAATAGTCACATCAAGGTGTACATCAAACCAAAGCACATAACTGCTTGGATCCCTAGACCACCCAGAGCTACTGAGTATACCCATGCATACAGTACAAACTATCACTACAGGAAGAAAGCTGAACCAGAACAAAATCTAAGGAATAGACACTTCATGAAATTTAGGGATGAGATCAAAACAACATACCCACTCGTTTCAGCAGGACCTAGTGATTTGTGTGTGCACACCAAAGATGCCATATACACATGTGCGCATCTCACCCAACCTAATGAAAACACAATTTTGTTGGCATTGACAGCAGATCTGCAAGTGGATGCCTCAGATACTCAAGGTCCAGACAACATACCTACATGTGATTGTACCCAAGCTTGCTACTACGCAAAGCATGCAGACAGATATTATCCTGTCAACCTGGTTGCACATGATTGGTATGAGATTCAAGAATCAGAGTACTATCCAAAACATATACAGTATAATATCCTGATAGGTGAAGGTCCTTGCAAGCCTGGGGATTGTGGGGGAAAACTACTCTGTAAACATGGTGTAATAGGGATAATCACAGCAGGTGGTGAGGGGCACGTGGCATTCACAGACTTACGACCATATGCATGCCTCACTTCCCACCAAGGCTTGGTGACTGACTATGTCAATCAATTGGGTGTTGCTTTTGGAGATGGATTCTCCAGCAATATTAAGGATCATTTAACAGGGTTGTGCACCTCAATATCAGATAAAATAACTACCAGGGTTATAAAATGGTTAATTAGAATCATTAGTGCCTTGACCATCATGATCAGAAATTCAAGTGATACTGCAACAATTCTAGCAACATTGGCACTTCTAGGGTGTCATGGATCTCCATGGGCTTTTCTTAAAGACAAAATATGTCAATGGTTAAACATCCCCAAACCCCCATCTAGACAGGGAGAATCCTGGCTAAAGAAATTCACAGAATGTTGCAATGCTGCCAAAGGTCTTGAGTGGGTCGCCCAGAAAATAGGCAAATTTATTGACTGGCTGAAAGAAAAACTTATACCCACAGTCCAAAGAAAGAGAGAAACTCTGGAACAGTGTAAAAAGATAGGGCTATATGAACAGCAGGTGCAAGGTTTTGCACATTCAGATGCTGATGCCCAACAACAGCTGATAGTAGAAATATCCAAACTGAAGAGAGGGTTGGACGATCTTGCCCCATTGTATGCTAGTGAGAATAAAAGGGTGACCAATATACAGAAAGATTTGCAGCGTCTGACAGCATACCAGAAAACCCACAGACATGAACCCGTATGCTGCTTGATACGAGGACCACCTGGGTGTGGTAAGTCCTTGGTAACATCTATAATAGCACACGGATTAACTAATGAGGCCAATATATATTCATTGCCACCAGACCCCAAACATTTTGATGGTTACAACCAGCAGACGGTAGTGATTATGGATGATGTGGGTCAAAACCCCGATGGAAAAGATCTTAGTATGTTTTGTCAGATGGTTTCGACTACAGAATTTATTGTACCCATGGCAAGCATCGAAGATAAAGGTAGATCATTTACTAGCCATTATGTCCTTGCTAGTACCAACCTGGATTCTTTATCCCCTCCGACCATTACAATACCAGAAGCAATCAGCAGGAGGTTTTTCCTGGATACCGATTTACAAGTGCTTAGCAAATTTAAGACACCAAATGGTTTGCTAGATGTGGCTAAGGCATTACAACCTTGTACAAAGTGTCCCAAACCTATGCACTACAAGCAGTGCTGCCCAATACTATGTGGCCAAGCATTAGTATTGAAGGACAGAAGAACTTCAGCTAGTTATCCCTTATTGGCAGTGGTGGAACAACTCAGGGCAGAGAATGAGACGAGAGGCAAAGTCAAAACCAACCTCAGAGCTATATTCCAAGGGCTAGGAGACACCACACCACCTGGTTTCATAGTAGATTTGCTATCCAGCTCAAAAGACCCCAAAGTGATGGAATACTGTGTGGAACAAGGATGGATGGGTAAAGCACATTCCACAATAGAGAGAGATTTCAATTATGTACAATATGCTCTT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41,457
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rhinovirus C56
Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
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USA
2021-06-15
9CDWUK
Rhinovirus C
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Picornaviridae
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7,103
GenBank
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2021-04-26
SAMN19406357
PRJNA1066815
Rhinovirus C56 strain RvC56/USA/2021/9CDWUK, complete genome
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
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Enterovirus
Picornaviridae
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USA
USA
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2021-04-19
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41,506
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rhinovirus C56
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2021-06-15
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Picornaviridae
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2021-04-23
SAMN19406343
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Rhinovirus C56 strain RvC56/USA/2021/466519, complete genome
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41,513
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-06-15
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Picornaviridae
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USA
USA
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2021-05-10
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2021-04-19
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Rhinovirus C56 strain RvC56/USA/2021/60602, complete genome
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41,988
MW802583.1
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Greninger,A.L., Xie,H., Cruz,K., Phung,Q., Lin,M.J.
UW Virology, DLMP
USA
2021-04-20
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Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
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GenBank
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USA
USA
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2021-02-22
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PRJNA1066815
Rhinovirus C56 strain RvC56/USA/2021/69444, complete genome
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42,557
MG950178.1
rhinovirus C56
Pan,C.-Y., Padilla,T., Yagi,S., Huynh,T., Ng,T.F., Marine,R., Nix,W.A., Wadford,D.A.
California Department of Public Health, Viral and Rickettsial Disease Laboratory
USA
2018-03-03
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,096
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
oronasopharynx
2016
null
null
Rhinovirus C56 strain USA/2016/CA-RGDS-1002, complete genome
CCACACCGTCTACGGACGTAGTACTCTTGTATCTCGGTACATTTGTACGCCAGTTTTCCCTCCCTCCCCCCTTTCACGTAACTTATAGAAGCTTGAACATACAGGCGAATAGGAAGCCAACAAACCATGTTGGTAAACGCCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTATTAGAGTGTTAGGCTTCTCACGAGGCTGAAGCTTGATATATCGTTACCCGCACAGTTACTAAGCAGAGCCTAGTAACACTTTGATCTCTATACTGGCTGGTCGCTCCGTCAGAAACCCCCTGATAGACCTGGCAGATGGGGCTGGAAATTCCCCACTGGTGACAGTGTTCCAGCCCGCGTGGCTGCCTGTCCCCCTTTCTTGGGGGAAAGCCAATATATAGACAAGGTGCCAAGAGCCGCGTTTGCTAATTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTATCGCATGGATTCCACCATGTAGGTAGTCGTAATGGGCAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATACCTTATTTTATCTCATGGTGACAACATATATTGATAAGTATATGTTGACTACCATGGGTGCACAAGTGTCCAAGCAAAACACTGGATCTCACGAAAATGCAATCAATGCCAACAATGGAGGTGTGATTAAGTACTTCAATATTAACTACTATAAGGACTCTGCTAGCTCAGGTTTAACCAAACAGGATTTTTCTCAAGATCCGTCTAAGTTTACACAGCCTCTTGTTGACACATTGACAAACCCTGCTTTAATGTCTCCCTCAGTAGAAGCATGTGGATTTTCTGATAGGCTCAAACAAATCACTATCGGCAACTCCACAATTACTACCCAAGATGCTATACACACAGTTCTTGCTTATGGGGAATGGCCACAGTATCTTTCTGACATTGATGCTACATCAGTTGATAAACCCACACACCCAGAAACATCAGCAGATAGATTCTATACTTTAGCTAGTGTGGACTGGGATGGGAATTCCAAGGGTTGGTGGTGGAAGCTGCCAGATGCTTTAAAGGAGATGGGAATTTTCGGGCAAAATATGTACTATCACTCAATGGGAAGGTCAGGTTACATAATACACACACAGTGTAATGCTACCAAATTCCATAGTGGAGCACTCTTGGTTGTCCTTATACCAGAACACCAGTTAGCATATATAGGTAGTGAGAAGGTAGACGTTGCTTATGAACATACACACCCTGGAGAAAATGGTCACAAGATAGGCGTTAACAAGTTAAGGGACAACTTTCAACCAGATGAGGATCCATTCTACAATTGTAATGGCACTCTTTTTGGTAACCTTACTATCTTCCCCCATCAGATTATCAATCTGAGGACAAATAATTCCAGTACAATTATAACACCATATATTAATTGTCAACCAATGGACAACATGCTCAAACATAACAACTTGACACTGTTAATAGTACCATTAGTCACACTCAGAGCCAGCATCACTACCACCCCTACAGTATCTATAACTGTTACAATAGCACCATATAAATCTGAGTTTTCCGGTGCTATGCAACATCAAACCCAGGGATTACCCACACGTATACCTAGTGGGGGGCAACAGTTTATGACCACAGAGGATGAGCAATCAGCTAACTTACTCCCTGGGTTTCATCCAAGCAAGAAGATACAAATTCCAGGCAAGATCACCAGTGTTCTTCACATGGCGAGGGTGGACTCTTTCATGCCCATTAACAATATACCAACCGAGGAAGGTAAGGTGAGTATGTACAACATTACCGTCACCCGCAAAGGCTCAAATAGCGGACTCTTGCTCACCATACCGCTAGAAATGAGCAACACACTCTTTTCCACTACTCTACTAGGTGAAGTGCTTAATTACTTCACGAACTGGTCTGGTAGCATAACACTAACTTTCATGTGTGTATGTGATTCATTTTCCACTGGGAAATTTCTCTTAGCTTACACGCCACCGGGAGGGGCCCACCCAAAAAACCGCAAGGAAGCCATGCTTGGTGTTCACATCATATGGGATCTAGGCCTGCAATCTTCTTGCACAATGGTTGTACCATGGATGTCTTCAGGATTTTATCGTAGAACAGAGTCAGATAATTATACACATGCTGGCTACGTTTCACTGTGGTACCAAACAGACTTCATTCCATCTTCAACACAAGTAACCCAGGGGGCCATTCTAGTCACTTGCAGTGGGTGTCCTGATCTATCTGTAAGAATGTTAAGAGATACACCAATGATGAAACAAACCAACGACTTACAGAACAATGATCCCATTGACACATATGTCCATGATGTCCTCAATGAAGTTGTTGTGGTTCCAGATACCAAACCGTCGGGACCACAACATACCACTAGACCCAGTGCATTGGGTGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCTCAACCATCCCTGAGTCAGTAATAGAAACCAGATATGTAGTGAATGACAACACAAATGAGGAAGCTGAAATAGAGATGTTCTTGGGTCGTTCCGCTTTGTGGTCAAAGTTTAATCTAACTGGTAAGTTTGCCAAGTGGGACATTAGTTTCCAGGAACAGGCTAGCATTAGGAAAAAGTTTGAACTTTTCACATATCTCAGATTTGACATGGAAGTCACAATTGTCACCAACAATGAGGGTCTAATGCAAGTCATGTTCATCCCTCCAGGACTTGAAAAACCCACCAGTGATGCAGATCGACTATGGGACTCTGCATCCAACCCCAGTGTCTTTTTCCAACCCAAGAATGGATTCCCTCGCTTCACCATCCCGTTCACTGGACTAGCCTCAGCTTATTACATCTTCTATGATGGATATACCACAAGAGAAGTACCCAGAGACAACACTTATGGCATCTCCCCAACTAATGATATGGGGACATTGTGTTTCCGATCATTAGATGATTCTGTCAATAGTCACATCAAGGTGTACATCAAACCAAAGCACATAACTGCTTGGATCCCTAGACCACCCAGAGCTACTGAGTATACCCATGCATACAGTACAAACTATCACTACAGAAAGAAAACTGAACCAGAACAAAATCTAAGGAATAGACACTTCATGAAATTTAGGGATGAGATCAAAACAACATATCCACTCGTTTCAGCAGGACCTAGTGATTTGTGTGTGCACACCAAAGATGCCATATACACATGTGCGCATCTCACCCAACCTAATGAAAACACAATTTTACTAGCATTGACAGCAGATTTGCAAGTGGATGCCTCAGATACTCAAGGTCCAGACAACATACCTACATGTGATTGTACCCAAGCTTGCTACTACGCAAGGCATGCAGACAGATATTATCCTGTTAACCTGGTTGCACATGATTGGTATGAGATTCAAGAATCAGAGTACTATCCAAAACATATACAGTATAATATCTTGATAGGTGAAGGTCCTTGCAAGCCTGGGGATTGTGGGGGAAAACTACTCTGTAAACATGGTGTAATAGGGATAATCACAGCAGGTGGTGAGGGGCACGTGGCATTTACAGACTTACGACCATATGCATGCCTTACTTCCCACCAAGGCTTGGTAACTGACTATGTCAATCAATTGGGTGTTGCTTTTGGAGATGGATTCTCCAGCAATATTAAGGATCATTTAACAGGGTTGTGCACCTCAATATCAGATAAAATAACTACCAGGGTCATAAAATGGCTAATTAGAATCATTAGTGCCTTGACCATCATGATCAGAAATTCAAGTGACACTGCAACAATTCTAGCAACATTAGCACTTCTAGGGTGTCATGGATCCCCATGGGCTTTTCTTAAAGACAAAATATGTCAATGGTTAAACATCCCCAAGCCCCCATCTAGACAGGGAGAGTCCTGGCTAAAGAAATTCACAGAATGTTGCAATGCTGCCAAAGGTCTTGAGTGGGTCGCCCAGAAAATAGGCAAATTTATTGACTGGTTGAAAGAAAAACTTATACCCACAGTCCAAAGAAAGAGAGAAACTCTGGAACAGTGTAAAAAGATAGGGCTATATGAACAGCAGGTGCAAGGTTTTGCACATTCAGATGCTGATGCCCAACAACAGCTGATAGTAGAAATATCCAAATTGAAGAGAGGGTTGGACGATCTTGCCCCATTGTATGCTAGTGAGAATAAAAGGGTAACCAATATACAGAAAGATTTGCAGCGTCTGACAGCATACCAGAAAACCCACAGGCATGAACCCGTATGTTGCTTGATACGAGGACCACCTGGGTGTGGTAAGTCCTTGGTAACATCTATAATAGCACACGGATTAACTAATGAGGCCAATATATATTCATTGCCACCAGACCCCAAGCATTTTGATGGTTACAACCAGCAGACGGTAGTGATTATGGATGATGTGGGTCAAAACCCTGATGGAAAAGATCTTAGTATGTTTTGTCAGATGGTTTCAACTACAGAATTTATTGTACCCATGGCAAGCATTGAAGATAAAGGTAGATCATTTACTAGCCATTATGTCCTTGCTAGTACCAACTTGGATTCTTTATCCCCTCCAACCATTACAATACCAGAAGCAATCAGCAGGAGGTTTTTCCTGGATACCGATTTACAAGTGCTTAGCAAATTTAAAACACCAAATGGTTTGCTAGATGTGGCTAAGGCATTACAACCTTGTACAAAGTGTTCCAAACCTATGCACTACAAGCAGTGCTGCCCAATACTATGTGGCCAAGCATTAGTATTGAAGGACAGAAGAACTTCAGCTAGTTATCCCTTATTGGCAGTGGTAGAACAACTCAGGGCAGAAAATGAGACGAGAGGCAAAGTCAAAACCAACCTCAGAGCTATATTCCAAGGGCTAGGAGACACCACACCACCTGGTTTCATAGTAGATTTGCTATCCAGCTCAAAAGACCCCAAAGTGATGGAATACTGTGTAGAACAAGGATGGATGGGTAAAGCACATTCCACAATAGAGAGAGATTTCAATTATGTACAATATGCTCTTAAT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71,958
MG950179.1
rhinovirus C56
Pan,C.-Y., Padilla,T., Yagi,S., Huynh,T., Ng,T.F., Marine,R., Nix,W.A., Wadford,D.A.
California Department of Public Health, Viral and Rickettsial Disease Laboratory
USA
2018-03-03
null
Rhinovirus C
Enterovirus
Picornaviridae
ssRNA(+)
7,097
GenBank
null
USA
USA
Homo sapiens
oronasopharynx
2017
null
null
Rhinovirus C56 strain USA/2017/CA-RGDS-1003, complete genome
ACCCACACCGTCTACGGACGTAGTACTCTTGTATTTCGGTACATTTGTACGCCAGTTTTCCCTCCCTCCCCCCTTTCACGTAACTTATAGAAGCTTGAACATACAGGCGAATAGGAAGCCAACAAACCATGTTGGTAAACGCCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTATTAGAGTGTTAGGCTTCTCACGAGGCTGAAGCTTGATATATCGTTACCCGCACAGTTACTAAGCAGAGCCTAGTAACACTTTGATCTCTATACTGGCTGGTCGCTCCGTCAGAAACCCCCTGATAGACCTGGCAGATGGGGCTGGAAATTCCCCACTGGTGACAGTGTTCCAGCCCGCGTGGCTGCCTGTCCCCCTTTCTTGGGGGAAAGCCAATATATAGACAAGGTGCCAAGAGCCGCGTTTGCTAATTGTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCCAACCCCACAGCTATCGCATGGATTCCACCATGTAGGTAGTCGTAATGGGCAACTGTGGGACGGAACCGACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCCTTTTATACCTTATTTTATCTCATGGTGACAACATATATTGACAAGTATATGTTGACTACCATGGGTGCACAAGTGTCCAAGCAAAACACTGGATCTCACGAAAATGCAATCAATGCCAACAATGGAGGTGTGATTAAGTATTTCAATATTAACTACTATAAGGACTCTGCCAGCTCAGGTTTAACCAAACAGGATTTTTCTCAAGATCCGTCTAAGTTTACACAGCCTCTTGTTGACACATTGACAAACCCTGCTTTAATGTCTCCCTCAGTAGAAGCATGTGGATTTTCCGATAGGCTCAAACAAATCACTATCGGCAACTCCACAATTACTACCCAGGATGCTATACACACAGTTCTTGCTTATGGGGAATGGCCACAGTATCTTTCTGACATCGATGCTACATCAGTTGATAAACCCACACACCCAGAAACATCAGCGGATAGATTCTATACTTTAGCTAGTGTGGACTGGGATGGGAACTCCAAGGGTTGGTGGTGGAAGCTGCCAGATGCTTTAAAGGAGATGGGAATTTTCGGGCAAAATATGTACTATCACTCAATGGGAAGGTCAGGTTACATAATACACACACAGTGTAACGCTACCAAATTTCATAGTGGAGCACTCTTGGTTGTCCTTATACCAGAACACCAGTTAGCATATATAGGTAGTGAGAAGGTAGACGTTGCTTATGAACATACACACCCTGGAGAAAATGGTCACAAGATAGGCGTTAACAAGTTAAGGGACAACTTTCAACCAGATGAGGATCCATTCTACAATTGTAATGGCACTCTTTTTGGTAACCTTACTATCTTCCCCCATCAGATTATCAATCTGAGGACAAATAATTCCAGTACAATTATAACACCATATATTAATTGTCAACCAATGGACAACATGCTCAAACATAATAACTTGACACTGTTAATAGTACCATTAGTCACACTCAGAGCCAGCATCACTACCACCCCTACAGTATCTATAACTGTTACAATAGCACCATATAAATCTGAGTTTTCTGGTGCTATGCAACATCAAACCCAGGGATTACCCACACGTATACCTAGTGGAGGGCAACAGTTTATGACCACAGAGGATGAGCAATCAGCCAACTTACTCCCTGGGTTTCATCCAAGCAAGAAGATACAAATTCCAGGCAAGATCACAAGTGTTCTTCACATGGCGAGGGTGGACTCTTTCATGCCCATTAACAATATACCAACCGAGGAAGGTAAGGTGAGTATGTACAACATTACCGTCACCCGCAAAGGCTCAAATAGCGGGCTCTTGCTCACCATACCGCTAGAAATGAGCAACACACTCTTTTCCACTACTCTACTAGGTGAAGTGCTTAATTACTTCACGAACTGGTCTGGTAGCATAACACTAACCTTTATGTGTGTGTGTGATTCATTTTCCACTGGGAAATTTCTCTTAGCTTACACGCCACCAGGAGGGGCCCACCCAAAAAACCGCAAGGAAGCTATGCTTGGTGTTCACATCATATGGGATCTAGGCCTGCAATCTTCTTGCACAATGGTTGTACCATGGATGTCTTCAGGATTTTATCGTAGAACAGAGTCAGATAATTATACACATGCTGGCTACGTTTCACTGTGGTACCAAACAGACTTCATTCCATCTTCAACACAAGTAACTCAGGGGGCCATTCTAGTCACTTGCAGTGGGTGTCCTGATCTATCTGTAAGAATGTTAAGAGATACACCAATGATGAAACAAACCAACGACTTACAGAACAATGATCCCATTGACACATATGTCCATGATGTCCTCAATGAGGTTGTTGTGGTTCCAGACACCAAACCGTCGGGACCACAACATACCACTAGACCCAGTGCATTGGGTGCAATGGAAATAGGAGCCTCCAGCTCAACCATCCCTGAGTCAGTAATAGAAACCAGATATGTAGTGAATGACAACACAAATGAGGAAGCTGAAATAGAGATGTTCTTGGGTCGTTCCGCTTTGTGGTCAAAGTTTAATCTAACTGGTAAGTTTGCCAAGTGGGACATTAGTTTCCAGGAACAGGCTAGCATTAGGAAAAAGTTTGAACTTTTCACATATCTCAGATTTGACATGGAAGTCACAATTGTCACCAACAACGAGGGTCTAATGCAAGTCATGTTCATCCCTCCAGGACTTGAAAAACCCACCAGTGATGCAGATCGACTATGGGACTCTGCATCCAACCCCAGTGTCTTTTTCCAACCCAAGAATGGATTCCCTCGCTTCACCATCCCGTTCACTGGACTAGCCTCAGCTTATTACATCTTCTATGATGGATACACCACAAGAGAAGTACCCAGAGACAACACTTATGGCATCTCCCCAACTAATGATATGGGGACATTGTGTTTCCGATCATTAGATGATTCTGTCAATAGTCACATCAAGGTGTACATCAAACCAAAGCACATAACTGCTTGGATCCCTAGACCACCCAGAGCTACTGAGTATACCCATGCATACAGTACAAACTATCACTACAGAAAGAAAACTGAACCAGAACAAAATCTAAGGAATAGACACTTCATGAAATTTAGGGATGAGATCAAAACAACATATCCACTCGTTTCAGCAGGACCTAGTGATTTGTGTGTGCACACCAAAGATGCCATATACACATGTGCGCATCTCACCCAACCTAATGAAAACACAATTTTACTAGCATTGACAGCAGATTTGCAAGTGGATGCCTCAGATACTCAAGGCCCAGACAACATACCTACATGTGATTGTACCCAAGCTTGCTACTACGCAAAGCATGCAGACAGATATTATCCTGTTAACCTGGTTGCACATGATTGGTATGAGATTCAAGAATCAGAGTACTATCCAAAACATATACAGTATAATATCCTGATAGGTGAAGGTCCTTGCAAGCCTGGGGATTGTGGGGGAAAACTACTCTGTAAACATGGTGTAATAGGGATAATCACAGCAGGTGGTGAGGGACACGTGGCGTTTACAGACTTACGACCATATGCATGCCTCACTTCCCACCAAGGCTTGGTAACTGACTATGTCAATCAATTGGGTGTTGCTTTTGGAGATGGATTCTCCAGCAATATTAAGGATCACTTAACAGGGTTGTGCACCTCAATATCAGATAAAATAACTACCAGGGTCATAAAATGGCTAATTAGAATCATTAGTGCCTTGACTATCATGATCAGAAATTCAAGTGACACTGCAACAATTCTAGCAACATTAGCACTTCTAGGGTGTCATGGATCCCCATGGGCTTTTCTTAAAGACAAAATATGTCAATGGTTAAACATCCCCAAGCCCCCATCTAGACAGGGAGAGTCCTGGCTAAAGAAATTCACAGAATGTTGCAATGCTGCCAAAGGTCTTGAGTGGGTCGCCCAGAAAATAGGCAAATTTATTGACTGGTTGAAAGAAAAACTTATACCCACAGTCCAAAGAAAGAGAGAAACTCTGGAACAGTGTAAAAAGATAGGGCTATATGAACAGCAGGTGCAAGGTTTTGCACATTCAGATGCTGATGCCCAACAACAGCTGATAGTAGAAATATCCAAATTGAAGAGAGGGTTGGACGATCTTGCCCCATTGTATGCTAGTGAGAATAAAAGGGTAACCAATATACAGAAAGATTTGCAGCGTCTGACAGCATACCAGAAAACCCACAGGCATGAACCCGTATGCTGCTTGATACGAGGACCACCTGGGTGTGGTAAGTCCTTGGTAACATCTATAATAGCACACGGATTAACTAATGAGGCCAATATATATTCATTGCCACCAGACCCCAAGCATTTTGATGGTTACAACCAGCAGACGGTAGTGATTATGGATGATGTGGGTCAAAACCCTGATGGAAAAGATCTTAGTATGTTTTGTCAGATGGTTTCAACTACAGAATTTATTGTACCCATGGCAAGCATTGAGGATAAGGGTAGATCATTTACTAGCCATTATGTCCTTGCTAGTACCAACCTGGATTCTTTATCCCCTCCAACCATTACAATACCAGAAGCAATCAGCAGGAGGTTTTTCCTAGATACCGATTTACAAGTGCTTAGCAAATTTAAAACACCAAATGGTTTGCTAGATGTGGCTAAGGCATTACAACCTTGTACAAAGTGTTCCAAACCTATGCACTACAAGCAGTGCTGCCCAATACTATGTGGCCAAGCATTAGTATTGAAGGACAGAAGAACTTCAGCTAGTTATCCCTTATTGGCAGTGGTAGAACAACTCAGGGCAGAAAATGAGACGAGAGGCAAAGTCAAAACCAACCTCAGAGCTATATTCCAAGGGCTAGGAGACACCACACCACCTGGTTTCATAGTAGATTTGTTATCCAGCTCAAAAGACCCCAAAGTGATGGAATACTGTGTAGAACAAGGATGGATGGGTAAAGCACATTCCACAATAGAGAGAGATTTCAAATATGTACAATATGCTCTTA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71,959