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Bovine torovirus
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Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-03-07
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Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
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GenBank
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China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
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Bovine torovirus strain BToV9/2021/CHN, complete genome
|
GAAGCCTTGAAATAAAGCTTTTAAACCCCTTTTACGGTTTGTCCACCATACGGACATTGTTCAGACCGCAGTGTCTTGTCAAGGAGGTTCAGCCTTGACACTACTTCTCTGTGAGGAATCTACTCAGAAATACTGCTTGCGTACTAGTAGTTACAAGAGTTGACACTTAGTACTTACAAGCGGGTTTAACCGCCCTCCGGAACGGTGGAAACTCCCTCCCGAACGTGCGCTTGACGTGACCAATTTTGGTCTAGCTTTCTGAGAAATACTCCAGGGCTGTATTTGACCACATCTGTTCTTCATTTGTGGTTGTCTACAACCAAACACCGTGTGACTCACCTCCAGCTTTGCTGCAGGCCTTCTGGACTAAACGAGTTCGCACGCTTTGTGACTAGTTTTAGGACTTTTCACACTACCCACCGCCAACCTGATTCTTTTCATCCTTAAGTTTTGCGTTTATACGCTGTTTTCTTACGGTTGGCAGTTTGTTTGGTTGTTTGCACAGTTTCTTTTAATACCAATTTTTACTGTGCTCTTAGTTTTTACAGCTAAGGCTGTTTTTTATTTACTTAAGTTGCTAGAAGCAGCTTTTACAATATTAGTTTTAGTTTTAATTGAAAAGTTAAAGGGTGTCAGGAAACAACGTAGACGCCCTTCTTGTGGTGTCTAGTTAGTCTTAATCTGGCAAACAAATATCAGGTTGTTGACTCCCTTTGGAGTGAGACCTATGAGTATCAGTTTGCTTATTTTGGACACCCATATAAAAATGTCCAAGATCTCAAAAAAGCCCACCAGCGAAACCGAGCCGCTTTTGTGCTCAAGTATCTTGGACCTAACTTCCAAGTCCCAGCTTTTGGACCAGTGTTTAGGTACACCACAAAACCTGGTATCACTTTCAAAGATGGATCCATCTACCTTGGAACCACTGACTTTGGGACCCAAGTCCATATCAACCCACTGCAGCTCTTTACAAAGTTTGCAGTTACTTGTCCTGAACACCTCATCCACCCAGTTCAAATGGACTACCGGGTCTATCTCGAAACTGAGGGGTCATTTGGAGAGAGAATTGTGCAGGGGGTTAGTGCCTTTGAACGATTTTACCCCAAGCGTCAATTATGTGGAACTATCATTAGTGATCCCTTCACTTTTGACTGGGCAGGAAACATCCACAATTACTACTTCACCAGAAATGTACTCAGATACGGTACAAAATTGTATCAAGTCAATGGAAACAAACTTATTGAAAGGTGTTCAGGCATTGAAAGATCAGACATCTTGCCAAGAATACTTTCTGAATGCCAACTACCAATCCTTGATACCACCCCAACTCCTTCTGAACGCGATGAGGATGTCATCTGTTGCGACTTTGAGTCCCTTGACATTAGAGAATACCCGGCTCTTGCTGAAACTAAGCCCTTTCCATGGGGGCACTTCAGTCAGTTACACCTCAATGATTAAGGGGTTTGCAGATTGCTCTAGACGTGATGAAAAATGTCTTAAGCGTCGCTTAACAAGGGAACAAAAGAGCCAGGAGAAGGGTAGCTTTGATGCTAACAAGGTTATTACATTAGGGGGGAAGATGTATCGTTATGATGTTGTAGTTTTGAAGTGTAGTGATGAGAGTGATGATTTGAATGGTTTTGATTGTCCTAGTGAACAGTTGGAGTACACTCTTGAAACTGTACCACATTGTTGGAAAGAACTTGTTGAGGGCAAATGTTTAACTCGTGCCAAAGCAACTTGGGATCTTACAGAAGATCTTGATGTTGAGTTGAACCGTATACATATTGAAGAAACTAAGAGCCTTCAACGCTCGGATGCAAGCTGGGATCTATCTAGTGTTGGTGTTGACAGTCAAGATTTAGAGGAAAAGATTTTCTCACCTGTCTGGTTGAAACAATCATCCAGGTACTTTGGTACAAAACTACAACAAGTATCAGAACTTTTTAAGAGTGAGGGGTTGGCAGAATTAGAACCAACAATGACTGGTTTAAACTCAGTTGGGGTGGGTGATAAATGGTTGAATTTTAGAGATCAAGGCAAATCACAAGTGTTTTTTGTTTATACTGATAAAAATGTCTATTTGGCTACAACACGCCAAAGAGTTAGTTGTGATTATATTGTTACTAAATTTAAGAGTGTTAGATGGATTGGCAATAAACCAGATAAGTGTAGAATTACCAAAGTATTAGCATGGTTGATTTCTGTTAATAGAGTTAAAAATTGTACCAGAGTAGAAACCCCAATGTTATGCAAACAGGGTAAAATTAGTCATAAGAAGGTAGATTGTTTAGATATGATTGTTTTAGATAAATATGTAAGTTGTGTTTTTGGACCCACATGTGTACAAAAGGTTAAAAAGTTTTTATTAAGTTATTATAATTGTGAGAGTGATTTTGATTTGCTAGATAACTTTTTGACCCCGATTAAATGTGGTGGAAAATGGATGGTGTTTGAGAAGTGTTCTTGTAAGAACCATCAGTTTTATGTTGCACAATTTGATAATCATGTTGTGTTGGGCCTGGGGAGACCTAATGGCATCTTATATTCTGAAGAAGTACCAAGTTATGCTAAAGTTTATGCTGTTGGGTTTGCAACAGAAAGAAGTGGTGTAGAGGTTCATTATTATTCTGAGATGGAACATAATTATGTACCACAAGAGTACTGTTTTGTTGCTCACGACCAGCAACACCAAGAAGATGATAGTGAGTATGTAAACTATCATCCTGATGATGTTGAGGATGATCCATTTCCTAGGTTTGATTTTAGCTTTGATGATTGTGAGCTAATTTGGCCTGATGCACCAGTTCCTGTACCATCACCCTATGGCTACCATCACGGGCAACGTTTGAGAGACATTTGTGTTGCAGATGGTGGTTTTGGTTGTGATTGTCCTCATTGTGATGGCCTATTTATTTACCATCCTGTTAGACCTCGCCATTATGAATCTTTTGATGAAGTTGGCCCATTTATTAAAATGTGTGAGTTTAGATTTACTTACTCGGGCCAAGTTTATAACCAGTTTTATGGATTGGGACCAAAAATCTATATACAAGATTTGGTAGCAGCTAGTGATAAATTGATGCAGTTGTTAACGAGAGGACAGTTAGAGGAAGTTGATTTGCCACTTGAAATTTTGAATTGTCTGACTTATTTGAAATTAGGTCTAAACATGCACCCCTTTGTTTGGCCTGCTCCATTTTTTACATGTACTGGTGAGTGGGTTGACATCTTTGATGGTAATGATGTTGAGTTTTATGGTGAAGATTTTTCCAAAAGAGCAACAGATATGTTTGAAAGTGTAAAATATTTGTTTAACAACTTTCACTCCTTAGGCTGTCCTTTGGAGAAACTGTATCAGAGTTTACATTACGATGAGGACGTTAAACAGATGTTTTGGTCAACAACCCATATGAAACACCTTTATTTAGCCTTATTATGTAGTGAGGAGTCTTTTAGGGCTATATTGGATAGTAGACAATTGAATAACCCAGAATTAGCAAAACTAATGATAATTGGTACACTTGATGCTCCAATAGCTTCACCTTGTGTTTGTGATGGTGATTGCAACCATGCCAAACCATATAATTGGACTGGTATATTGAGTAAGGTTTGTAAATTTGTTACGTTAAACCAGTTGGTAGGACTGTCTTATTGTGAGAAAAGGCAATTAGTTTTAGAAATGACACAGCAATATTTTCAAATAGAGGAAGGGCTTTGTCAACCAGTCCAATTGTTGATGACTCCTTTTTATAGTTTTAATGATAGTGCAGAGCCAGACGAACAACCATTAACTGGTGTATTTCACCAACAGGTAATGCAGATGTTTGATACCTGTGTTATGCCTGATGTTATTACTAAATTGAAAAGATCTAGGACTTCAGCTAATGATCTTTTTGGTATATTGTCTGATTATTTTAGGCGACCATTTGGCTACCGTCGTTACCGCTTAGCCGAATTTTCGCATGTTGAAAAAACTCAGGTTTTCACGGATTTGACATCTGTTTTGCTTAGAGGGACAAACAATATTGGTGGCTACGCTGTGTGTAGAATGGTGGAGCCTAAGAGTGAGGTTACTACTTGTGAAAGCCCAAATTTTCCACCAGAGGTTGTACAGACCATCCGAAAGTTTCTTCCAGTTAGTTTTAATACAGGTGTTATGAATTATGTAGATAATAATTGTGATTTTGAATATTGTAATTTGGAATTTTGTATTAGTGGTAAAGGGCTTTGTAGGTTAGATCAGAATGATTGTATAAAATGTAAGACAAATTTGTTTGTTATTAGGTTTAGGACTTTACCTTTGTTGTATGTTACCAACAAACCTATGTATTTGAGTGAATTTAGGTTAGATGATGCAGTTTCTCTTTTGGGTGATTTTAATTTAGATATAGATATTATTCCAGGTGTTACTTTATTTGGCTTATATTTTACTAATGGGAAGGTGTGTGATGGTAGTTGGGAGACATTACCACGATTTGGACTTGGTTGTTTCTCAACTCCAAAATCACATCCTAAATTTCAACCTTTTGAGAATTTAGCTGAAGTTTGTTTTTTTAAACAAAAAGTTAAATTTGTACCACTTGTTGGCAACTTTGCACCGGCTGAAATGGTTAAACCAAATATTCCAAAAACCGTAACAGTTGAGTTATTACCATACTATGGCTCAGTTGGATTTCAAGGTTTTGTTGCACCCAAGTGTGTTTTGCCTGGAACTTTAGCAACTCAATATTGTAAGTTGAATTATCAATTTGATAAATGTGTTCAGGTTGTAAAGTTGGCAGTTTCTCATGCATTTTATTTTAAACCATCAAATATGGGTTCACCTTATCACTTAGATCCAATGGTTGGTACTAGTTATGGAAAGCCAGCAATAGTTCAATTTGAACCTGTAGGACTTATAAAGGAAGTTAATGTACTTGTTTATCAATTTGGCAACCATGTCGCTATACACTACTTCCCTGAATGCCCTACGTATGTGGCTGATGGACATTATCCTA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| 17,633 |
ON376728.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-03-07
| null |
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,354 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus strain BToV8/2021/CHN, complete genome
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| 17,634 |
ON376729.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-03-07
| null |
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,302 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus strain BToV7/2021/CHN, complete genome
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| 17,635 |
ON624115.1
|
Bovine torovirus
|
Haibo,S.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-02-21
|
BToV10/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,326 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV10/2021/CHN, complete genome
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| 18,082 |
ON165540.1
|
Bovine torovirus
|
Wang,X.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural Unversity, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
|
2023-02-19
| null |
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,336 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
UNVERIFIED: Bovine torovirus strain BToV3/2021/CHN, complete genome
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| 18,212 |
ON165541.1
|
Bovine torovirus
|
Wang,X.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural Unversity, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
|
2023-02-19
| null |
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,299 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
UNVERIFIED: Bovine torovirus strain BToV4/2021/CHN, complete genome
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| 18,213 |
ON165542.1
|
Bovine torovirus
|
Wang,X.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural Unversity, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
|
2023-02-19
| null |
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,334 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
UNVERIFIED: Bovine torovirus strain BToV5/2021/CHN, complete genome
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| 18,214 |
ON165543.1
|
Bovine torovirus
|
Wang,X.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural Unversity, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
|
2023-02-19
| null |
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,350 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
UNVERIFIED: Bovine torovirus strain BToV6/2021/CHN, complete genome
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| 18,215 |
ON337872.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-02-07
|
BToV18/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,343 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV18/2021/CHN, complete genome
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| 18,702 |
ON337873.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-02-07
|
BToV17/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,298 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV17/2021/CHN, complete genome
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| 18,703 |
ON337874.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-02-07
|
BToV16/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,383 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV16/2021/CHN, complete genome
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| 18,704 |
ON337875.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-02-07
|
BToV15/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,301 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV15/2021/CHN, complete genome
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| 18,705 |
ON337876.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-02-07
|
BToV14/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,293 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV14/2021/CHN, complete genome
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| 18,706 |
ON337877.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-02-07
|
BToV13/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,295 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV13/2021/CHN, complete genome
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| 18,707 |
ON337878.1
|
Bovine torovirus
|
Sun,H.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Disease
|
China
|
2023-02-07
|
BToV12/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,297 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV12/2021/CHN, complete genome
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| 18,708 |
ON142321.1
|
Bovine torovirus
|
Wang,X.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
|
2022-08-30
|
BToV1/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,288 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV1/2021/CHN, complete genome
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| 26,541 |
ON142322.1
|
Bovine torovirus
|
Wang,X.
|
Heilongjiang Bayi Agricultural University, Laboratory for the Prevention and Control of Swine Infectious Diseases
|
China
|
2022-08-30
|
BToV2/2021/CHN
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,263 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2021
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV2/2021/CHN, complete genome
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| 26,542 |
MN882587.1
|
Bovine torovirus
|
Zhao,L.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
|
China
|
2020-05-19
|
BToV-China/BToV yak-XZ01/2019
|
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,314 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos grunniens
| null |
2018-07-09
| null | null |
Bovine torovirus isolate BToV-China/BToV yak-XZ01/2019, complete genome
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| 50,422 |
MN073058.1
|
Bovine torovirus
|
Li,H., Yue,H., Tang,C.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
|
China
|
2020-01-28
| null |
Bovine torovirus
|
Torovirus
|
Tobaniviridae
|
ssRNA(+)
| 28,297 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bovidae
|
feces
|
2018-09
| null | null |
Bovine torovirus strain BToV SC-1 Sichuan/2018, complete genome
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| 54,419 |
NC_001461.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Colett,M.S., Larson,R., Gold,C., Strick,D., Anderson,D.K., Purchio,A.F.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-02
| null |
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,573 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Bovine viral diarrhea virus 1, complete genome
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| 8,977 |
OP649599.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Lee,E.-Y., Park,S.-J., Lee,K.-K., Ku,B.-K., Jeoung,H.-Y.
|
Animal and Plant Quarantine Agency, Animal Disease Diagnostic Division
| null |
2024-01-07
|
19Q060
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,112 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Bos taurus
|
fetus
|
2019
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate 19Q060, complete genome
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CGTATACAGATTGGGCACTCAAAAATAACAATTAGGCCTAGGGTACAAATCCTCCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAATTGAGGGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTGAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACACCTATGGGATGTAGGTCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCACAGCACATCTTAGCCTGGGCGGGGGTCGCTCAGGTGAAAGCGGTTTAACCAACTGCTACGGATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGCACTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCACTGGGGTGGAGGAACCAGTGTATGACAGAGCGGGCAACCCCCTGTTTGGTGAAAGAGGAGCAATCCACCCCCAGTCGACACTAAAGCTCCCACACAAAAGGGGGGGACGTGAAGTCCCAACCAATATAAGATCCCTGCCAAAGAAAGGTGACTGTAGATCAGGCAACAGTAAGGGACCCGTGAGTGGGATCTATCTGAAGCCAGGGCCGCAGTACTACCAGGACTATGGAGGCCCCGTCTACCATAGGGCGCCATTAGAGCTCTTCGAAGAAGGGCCAATGTGTGAGGTAACCAAAAGGATTGGGAGGGTGACTGGTAGTGATGGCAGGTTGTACCACATCTACGTATGTATAGATGGGTGCATCCTAGTGAAAAGTGCCACCAGGGACCATCCAAAAATATTAAAATGGGTACATAACAGACTCAATTGCCCTCTATGGGTTGCAAGTTGTTCTGATAATGGAGGAGAAGGGGCTAAGAAAAAGACCCAACAAAAACCAGACAGAATGGAGAGGGGGAAAATGAAGATAACACCCAAGGAATCTGAGAGGGACAGCAAGACTAGACCACCAGATGCCACGATAGTGGTAGATGGGGTGAAGTATCAGGTGAAGAAGAAGGGGAAAGTCAAGAGCAAGAATACTCAGGACGGCTTATACCACAACAAAAATAAGCCACAAGAATCACGTAAGAAACTAGAGAAAGCATTGTTGGCATGGGCAATACTGGCTATGGTCCTGTTTCAAGTTACAACAGGAGAAAACATAACACAGTGGAACTTGCAAGACAATGGGACAGAAGGAATCCAACGGGCAATGTTTCTAAGAGGTGTAAACAGGAGCCTACACGGAATCTGGCCAGAGAAAGTATGCTCAGGAGTTCCTTCACACCTGGCCACAGATGTTGAGTTGAAAGCAATACATGGCATGATGGATGCAAGTGAGAAGACTAACTACACATGTTGTAGACTTCAACGCCATGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGTAACTGGTATAATATTGAACCATGGATCCTCCTCATGAACAAAACCCAAGCCAACCTCTCAAAGGGTCAACCACCTAGAGAGTGCGCTGTCACATGCAGGTATGACAGAGATGCCGACCTGAATGTGGTGACACAGGCGAGGGATAGCCCCACACAATTGACAGGTTGTAAGAAGGGGAAGAACTTCTCGTTTGCAGGTGTGTTAACGCAGAAACCTTGCAATTTCAAGATAGCCGTGAGCGATGTACTATTCAAAGAACACGATTGCACCAATGTGCTCCAAGACACTGCTCACTACCTGGTTGACGGAATGACTAACACTCTGGAGGGTGCTAGACAAGGCACAGCAAAACTGACAACTTGGTTAGGTAAACAACTCGGGATACTAGGAAAAAAGTTGGAAAACAAGAGCAAGACATGGTTCGGAGCATACGCAGCCTCCCCTTACTGTGATGTAGAGAAAAGAATCGGCTACATCTGGTACACAAAAAACTGCACCCCTGCCTGCTTGCCGAAAAACACAATGATCATAGGCCCTGGGAAGTTTGACACCAACGCAGAGGATGGCAAGATATTACATGAGATGGGGGGCCACTTGCCTGAGATGTTACTACTCTCACTAGTGGTGTTGTCTGACTTTGCCCCAGAGACAGCTAGTGTGATATATCTAATTCTTCATTTTTCCATTCCGCAAAGCCACACTGAGGTACTAGATTGTGACAAAAATCAATTAAACTTAACTGTGGAACTCACAACAGCGGATGTGATACCAGGGTCGGTCTGGAATCTCGGCAAGTACGTCTGCATCAGGCCGAACTGGTGGCCTTATGAGACGGCCACGGTACTGATGTTTGAAGAGGTAGGCCAGGTGGTGAAGATCGCTCTTAGAGCACTAAGAGATTTGATGCGCATCTGGAACGCTGCTACGACAACTGCGTTCCTGGTGTGTATCGTAAAGGTGGTGAGGGGTCAGGTATTGCAAGGCATACTGTGGTTGTTGTTAATAACTGGGGTACAAGGGCTTCCAGATTGCAAACCTGATTACTCATATGCAATAGCTAAGAGTGACAAAATCGGGCCATTAGGGGCCGAAGACCTCACAACCACTTGGCATGAATACTCAGCCAGGATGAGGTTGAAAGACGCAATGGTTGAGGTTTGGTGCAAGGACAGTAAATTATTGATCTACAAGAGATGTGTAAAAGAGACCAGGTACCTGGCCATCCTGCATGTGAGGGCTCTGCCTACATCAGTAACCTTTGAAAAAATTGCAGACGTGCAACAAAAGGAGGCTGTTGTTGAGATGGGTGACGATTTTGAATTCGGACTTTGTCCGTGTGACTCCAAACCCTTGGTGAGAGGCAAATTTAATACAACATTACTGAATGGACCGGCCTTTCAAATGGTATGCCCCACGGGGTGGACAGGAACAGTGAGCTGTGTACTGGTCAACCAGGGCACCTTATACACAACCACAATACAAACCTACAGGAGACTTAAGCCTTTCACTTACAGGCAAGGTTGTGTTGACACAAAAGTTGAAGGGGAAGACCTCTATAGCTGTATTTATGGAGGGAATTGGACCTGTGTCCCCGGGGAGCAGATGAAGTATACAGGGGGGGTCATCGAGTCCTGCAAGTGGTGCGGCTACAAGTTTTTAAAAAGTGAGGGTTTGCCACATTACCCTATAGGTAAATGTCGGCTGACCAATGAGACTGGCTACCGGTTGGTGGACGACACTTCCTGCAATAGGGATGGCGTGGTTATAGTAAAAAATGGATTGATAAAATGCAAAATAGGAGATACAGTAGTCCAAGTTGTTGCAATGGATGACAAGCTAGGGCCTATGCCCTGTAAGCCGCATGAGATCATACAGAGTGAGGGTCCAGTGGAAAAGACAGCATGCACATTCAATTATACAAAGACACTTAAAAACAAGTATTTTGAACCCAGAGACAACTACTTCCAACAATATATGCTGAAAGGGGATTATCAATACTGGTTTGATTTAGAAGTCACCGACCACCATAAAGACTACTTTGCTGAGTTTATACTGGTAATTGTGGTTGCACTCTTGGGCGGCAGGTATGTCCTCTGGTTATTAGTCTCATATTTGGTTCTATCAGAACAAAAAGCCTCAGGTGCCAACTATGGAGCTGGGGAAATAGTGATGATGGGCAATCTGTTGACTCATGACAATACTGAGGTGGTAACATACTTCTTATTGTTATACCTTCTACTAAGGGAGGAAAGCATCAAGAAATGGGTTATACTGTTGTACCATACACTTGTAATGCACCCACTAAAATCAGTGACAGTGATGCTGCTAATGATTGGAGGAGCAGTGAACGCAGAGGCAGATACTCAAGAGCTCTCAGAGCGCGTTGACCTCTGTTATATATTGGTTGTACTCATTGTCATAGGTCTAGTTATGGTGAGACGTGACCCAACGGTGGTGCCTCTGGTAACAATGGTCGCGACATTGAGGGTAACAGGACTAGCCTATGGACCCGGAGTGGATGCAGCTATGTCAGTATTGACTCTAACCCTACTGATGGTCAGCTATGTAACAGATTACTTCAGGTACAAAAAATGGTTACAGTGTCTTCTTAGCTTGATAGCAGGGGTGTTCTTAATTAGGAGCCTAAAACACCTGGGTGGAATTGAGGTGCCAGAGCTGGCGATGCCAAGCTGGAGGCCGCTGACACTTATATTGATGTACCTGATCTCAACAACAATTGTAACAATGTGGAAGGTTGACTTAGCTGGTTTACTACTACAAGGAGTGCCAATAATACTGCTGATAACCACCCTGTGGGCCGACTTTCTGACACTTATACTAATCTTACCCACCTATGAATTGGCAAAGTTGTACTATTTGAAAACCGTCAAGACTGACGTAGAGAAAAGCTGGTTAGGGGGGGTGGATTACAAAAGGGTTGATACCATCTACGACGTGGATGAGAGTGGAGAGGGTGTGTATCTATTTCCATCCAGGCAAAAAACAAACAAAAACATTAGCATACTCCTGCCCCTGGTCAGAGCAACACTCATAAGTTGTATCAGTAGCAAATGGCAACTGATCTACATGGCTTACCTGACTGTGGACTTCGCATACTACATGCACAAAAAAATCATAGAAGAGATCTCAGGAGGTACCAATCTGATGTCTAGAATAGTAGCAGCCCTCATAGAACTAAACTGGTCTATGGATGATGAGGAGTGCAAGGGTTTGAAGAAATTTTTTCTGCTGTCTGGGAGACTGAGAAACCTGATAATGAAACACAAAGTCAGGAACGACACAGTGGCAGGCTGGTACGGAGAAGAAGAAGTCTACGGCATGCCTAAAACCATGACTATAATAAAGGCTTGCACACTAAGCAAAAACAAGCACTGCATAATATGCACAGTGTGTGAAGGAAAGAAGTGGAAAGGTGGCAACTGCCCCAAGTGCGGGCGCCATGGTAAGCCTATAACATGTGGGATGTCACTGGCAGATTTTGAAGAAAGGCACTATAAGAGGATATTTATAAGAGAAGGAGACTCCGAGGGACCTTTTAGGCAAGAATATAATGGTTTTGTTCA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| 9,706 |
ON676186.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Lee,E.-Y., Park,S.-J., Park,J.-Y., Lee,K.-K., Ku,B.-K., Jeoung,H.-Y.
|
Animal and Plant Quarantine Agency, Animal Disease Diagnostic Division
| null |
2023-12-09
| null |
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,697 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Bos taurus
| null |
2018
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 strain Jincheon, complete genome
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ATGGAGTTGATTGCAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCGTCGGGGTGGTGGAACCCGTTTACGATCAGGCAGGTAACCCTTTATTTGGTGAGAGGGGGGCAATCCACCATCAATCAACGCTAAAGCTCCCACACAAGAGAGGGGAACGTGACGTCCCAACCAATTTGGCTTCTTTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGGTCTGGTAATAGCAGAGGGCCTGTGAGTGGAATCTACCTGAAACCAGGGCCACTATTTTATCAAGACTATAAGGGTCCCGTCTATCACAGAGCCCCGCTAGAGCTCTTTGAGGAGGGGATTATGTGTGAAACAACTAAACGGATAGGGAGAGTGACTGGCAGTGACGGAAAGCTGTACCACATTTATGTGTGTATAGATGGATGTATCACATTGAAGAGTGCCACAAGAAGTCACCAAAGGGTACTTAGGTGGGTCCACAATAGGCTCAACTGCCCTCTATGGGTCACAAGCTGCTCGGATACGAAAGAAGAAGGGGCAACAAAAAAGAAACACCAGAAACCCGACAGACTGGAGAAGGGGAGGATGAAAATAGTGCCCAGAGAGTCTGAGAAAGACAGCAGGACTAAACCTCCGGATGCTACGATAGTGGTAGATGGAGTGAAATACCAGGTGAAGAAGAAGGGGAAAGTCAAAAGCAAAAACACACAGGACGGTTTATACCACAACAAAAATAAGCCGCCAGAATCACGTAAGAAACTTGAGAAAGCATTATTGGCATGGGCAATATTGGCTATGGTCTTGATTCAAGTTACAATGGGCGAAAACATAACACAGTGGAACCTACAAGATAATGGGACGGAAGGGATACAACGGGCAATGTTCCAAAGGGGGGTGAACAGAAGTCTACACGGCATCTGGCCAGAGAAAGTCTGTACCGGCGTCCCATCCCATCTAGCCACCGACGTGGAACTAAAAACAATCCAAGGTATGATGGATGCAAGTGAGAAGACCAACTACACGTGTTGCAGACTTCAACGCCATGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGCAACTGGTACAACATCGAACCTTGGATTTTAATCATGAATAGAACCCAAGCCAATCTCAGTGAAGGTCAACCACCAAGAGAATGCGCAGTCACTTGCAGATATGATAGGGATAGTGACCTGAACGTAGTAACACAAGCTAGAGATAGCCCCACGCCATTGACAGGCTGTAAGAAAGGAAAAAATTTTTCTTTTGCAGGCATATTGATGCGGGGTCCCTGTAACTTTGAAATAGCTGCGAGTGATGTGTTGTTCAAAGAACATGACTGCACCAGTGTGTTTCAGGATACTGCTCATTACCTCGTTGACGGGATGACCAATTCCTTGGAAAGTGCCAGACAAGGGACCGCTAAACTGACAACCTGGTTAGGCAAGCAGCTCAGGATACTAGGAAAGAAATTGGAAAACAAGAGCAAGACATGGTTTGGAGCATATGCGGCTTCCCCTTATTGTGATGTTGATAAAAAACTTGGTTACATATGGTTTACAAAAAATTGCACCCCTGCTTGCTTACCCAAGAACACAAAAATTATTGGCCCTGGGAAGTTTGATACTAATGCAGAGGATGGCAAGATATTGCATGAAATGGGGGGTCACTTGTCGGAGGTACTACTACTTTCTTTAGTAGTGTTGTCTGATTTTGCACCAGAAACAGCTAGCGCAATGTATCTAATTCTACATTTTTCCATCCCACAGAACCACGTTGATATAATGGACTGTGATAAGACCCAATTGAACCTCACTGTGGAGCTCACAACAGCAGATGTAATACCAAGGTCGGTCTGGAATCTAGGCAAATATGTCTGCATAAGACCGGATTGGTGGCCTTATGAGACAGCTGCAGTGCTGGCGTTCGAAGAGGTGGGCCAGATGATAAAGATAGTGTTGAGGGCACTTAGAGATTTGACACGCATCTGGAACGCTGCTACGACAACTGCATTCTTGGTATGCCTTGTCAAGATGGTCAGGGGCCAGTTGGTACAGGGCATCCTGTGGCTACTACTGATAACAGGGGTGCAAGGACACCTAGACTGCAAACCTGAATACTCATATGCCATAGCCAAGAATGATAGAATCGGCCCATTAGGAGCTGAAGGCCTCACCACTGTTTGGAAGGATTACTCACATGAAATGACACTGGAAGACACAATGGTCGTAGCCTCGTGCAGAGATGGTAAGTTCATATACCTCACAAGGTGCACGAGAGAAACCAGATATCTTGCAGTCTTGCATTCAAGAGCCTTACCGACTAGTGTGGTATTCAAAAAACTTTTTGAGGGACAAAAGCAAGAGGGCACAGTCGAAATGGATGACAACTTCGAATTCGGGCTCTGCCCATGCGATGCCAAGCCTATAGTAAGAGGGATGTACAACACAACACTGCTAAATGGACCGGCCTTCCAGATGGTATGCCCAATAGGATGGACAGGGACTGTGAGCTGTATGTTAGCTAATAAGGATACCCTAGAAACAACAGTGGTACGGACATATAGGAGGTCTAGACCATTCCCATACAGGCAAGGCTGTATCACTCAAAAAATTCTGGGGGAGGATCTCTATAACTGTATTCTTGGAGGAAATTGGACTTGTGTAACTGGGGACCAACTACAATATTCAGGAGGCTCTATTGAATCCTGCAAGTGGTGTGGTTTCAAATTCCAAAGTAGTGAGGGATTACCACACTACCCCATTGGCAAGTGTAGGCTGAAGAATGAGACTGGCTACAGATTAGTAGATAACACTTCTTGCAACAGAGAAGGTGTGGCAATAGTACCACAGGGGTTGGTAAAGTGTAAGATAGGAGACACAATTGTACAAGTCGTGGCTCTTGATACCAAACTTGGGCCTATGCCCTGCAAGCCATATGAGATCATATCAAGTGAGGGGCCTGTAGAAAAGACGGCATGCACCTTCAACTACACAAGGACATTAAAGAATAAATACTTTGAGCCCAGAGATAGCTACTTCCAGCAGTATATGCTAAAAGGGGAGTATCAATACTGGTTTGACCTGGAGGTCACTGACCATCATCGGGACTACTTCGCCGAATCCATATTAGTGGTGGTGGTAGCCCTCCTGGGTGGTAGATACGTGCTATGGCTACTGGTCACATACATGGTACTATCAGAACAAAAAGTCCTAGGGACCCAATATGGGGCAGGGGCAGTAGTGATGATGGGAAACTTATTAACACATGACAGTATTGAAGTGGTGACATACTTCTTGTTGCTATACCTACTGCTAAGAGAGGAGAGCGTGAAGAAGTGGGTCTTACTCTTATACCATATCTTAGTGGCACACCCATTGAAATCAGTAACAGTGATATTATTGATGATTGGGGATGCGGTGAAGGCCGATCCAGGAGACCAAGGGTACTTGGGGCAGATAGATATCTGTTTCACAATGGTTGTACTGATCGTCATAGGTTTGATCATAGCCAGGCGTGACCCGACTGTAGTGCCACTGGTCACAATAGTTGCATCGCTGAGGGTCACTGGATTGACCTACGGACCTGGGGTGGATGTAGCCATAGCGGTCATGACCATAACCTTGCTGATGGTTAGCTATGTGACAGATTACTTCAGGTATAAAAGATGGCTGCAGTGCATCCTCAGCTTGCTATCAGGGGTCTTCTTGATAAGAAGCCTAATACATCTAGGTAGAATTGAGATGCCAGAGGTGACCATCCCAAACTGGAGACCGCTAACTTTAATTCTGCTATACTTGATCTCAACAACAATTGTTACAATGTGGAAGGTTGACTTAGCTGGCCTATTGTTACAAGGTGTGCCTATCTTATTGCTGATCACAACCCTGTGGGCCGATTTTCTAACTCTCATACTGATTCTGCCCACTTATGAATTGGTTAAGTTATACTACCTTAAAAATATAAAGACTGATGTAGAAAGAAGTTGGCTAGGGGGGTTGGACTATAAAAGAGTTGACTCCATCTACGATGTTGATGAGAGTGGAGAGGGCGTATATCTTTTTCCATCAAGGCAGAAGACACAGAAAAACATCTCCATACTCTTGCCCCTTGTCAGAGCCACATTGATAAGTTGTGTTAGCAATAAATGGCAGCTAATATACATGGCATATCTAACTGTGGACTTTATGTATTACATGCACAGGAAAGTCATAGAAGAAATCTCAGGAGGTACCAACATGATATCCAGGTTAGTGGCGGCACTTATAGAGCTGAACTGGTCCATGGAAGGAGAAGAAACCAAAGGCTTGAAGAAGTTTTATCTATTGTCTGGAAGGTTGAGGAACCTAATAATAAAACACAAAGTGAGGAATGATACCGTGGCTCGTTGGTACGGAGAGGAAGAAGTTTACGGCATGCCAAAGATCATGACTATAATAAAGGCTAGTACGCTGAATAAGAACAGGCACTGCATAATATGCACTGTATGTGAAGGAAAAAAGTGGAAAGGTGGCACCTGCCCAAAATGCGGACGCCATGGAAAACCCATAACATGCGGGATGTCACTAGCAGATTTTGAAGAAAGGCACTATAAGAGGATCTTTATAAGGGAAGGCAACTTTGATGGCCCTTTCAGACAAGAATATAATGGTTTTATACAATACACCGCTAGGGGGCAGTTATTTTTAAGAAACCTGCCCATATTGGCAACTAAAGTAAAAATGCTCATGGTAGGCAACCTTGGAGAAGAAATCGGGGACCTAGAACACCTTGGGTGGATCCTAAGGGGGCCTGCCGTGTGCAAGAAGATCACAGAACATGAAAGATGCCACGTCAACATACTAGACAAATTAACTGCATTTTTCGGGATCATGCCAAGGGGGACTACACCCAGAGCCCCAGTGAGGTTCCCTACGAGTTTGTTAAAAGTAAGGAGGGGTCTGGAGACTGGTTGGGCTTATACGCACCAAGGTGGGATAAGTTCGGTCGACCATGTAACCGCTGGCAAAGATCTATTGGT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| 10,387 |
ON676187.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Lee,E.-Y., Park,S.-J., Park,J.-Y., Lee,K.-K., Ku,B.-K., Jeoung,H.-Y.
|
Animal and Plant Quarantine Agency, Animal Disease Diagnostic Division
| null |
2023-12-09
| null |
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,697 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Bos taurus
| null |
2018
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 strain Chilgok, complete genome
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ATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCACTGGAGTGGAGGAACCGGTATACGACCAAGCTGGTAACCCTTTGTTTGGAGAAAGAGGAGTGATTCATCCGCAATCAACGCTAAAACTGCCACATAAAAGAGGGGAGCGTGAAGTCCCCACCAATTTGGCCTCCCTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGGTCGGGTAATAGCAAGGGGCCTGTGAGTGGAATCTACCTAAAACCAGGGCCGTTATTCTACCAGGATTACAAAGGACCTGTCTATCATAGAGCCCCGTTGGAGCTTTTTGAGGAAGCGTCTATGTGTGAGATAACTAAAAGAATCGGGAGAGTAACTGGCAGTGATAGCAAATTATACCACATTTATGTGTGTATTGATGGGTGCATAATAGTCAAGAGTGCTACAAGAGACCGTCAAAAAGTACTCAAGTGGGTCCACAACAAGCTAAACTGCCCCCTATGGGTTTCAAGCTGCTCCGATACAAAGGATGAAGGGGCGGTGAGAAAGAAGCAACAAAAACCAGATAGGTTAGAAAAGGGGAAAATGAAGATAACACCTAAGGAGTCAGAGAAAGACTGCAAGACCAAGCCACCAGACGCCACGATAGTGGTAGATGGAGTCAAGTATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAAGTCAAGAGCAAGAATACCCAGGATGGCCTATACCACAATAAAAATAAACCTCAAGAGTCACGCAAGAAATTGGAGAAAGCCCTACTGGCCTGGGCAATAATAGCCCTGGTTTTGTTCCAAGTCACAGTAGGAGAGAACATAACGCAATGGAACTTACAAGATAATGGAACGGAAGGAATACAACGAGCCATGTTTCAAAGAGGAGTGAATAGAAGTCTACATGGAATCTGGCCGGAGAAAATCTGTACAGGTGTTCCTTCCCACTTGGCCACTGACCCAGAACTGAAGGCAATTCACGGTATGATGGATGCAAGTGAGAAGACAAATTATACATGCTGCAGACTCCAACGCCATGAATGGAACAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAATATTAATCCTTGGATCCTTCTTATGAATAAAACTCAAGCCAACCTCACCGAGGGTCAGCCACTAAGGGAGTGTGCCGTCACATGCCGGTATGATCGAGATAGTGATCTGAATGTAGTAACACAAGCTAGGGATAGCCCCACACCATTGACAGGTTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCCTTTGCAGGGATATTGGTACAAGGGCCTTGCAACTTTGAAATAGCCGCAAGTGATGTGCTGTTCAAAGAGCATGATTGCACTGGTGTAATTCAAGACACAGCTCACTACCTCGTAGACGAGATGACCAACTCCCTAGAAAGAGCAAGGCAAGGGACTGCAAAACTAACAACTTGGCTGGGCAGGCAGCTTAAGACACTAGGGAAGAAACTGGAAAACAAGAGTAAGACATGGTTCGGGGCATATGCAGCCTCTCCCTACTGTGAGGTGGAACGGAAGCTTGGTTACGTCTGGTATACAAAGAATTGCACTCCTGCCTGTTTGCCTAGGAATACAAAGATCATTGGCCCCGGTAGGTTTGACACCAATGCTGAGGATGGTAAAATACTGCATGAGATGGGGGGTCACTTGTCAGAGGTGCTACTACTTTCAGTGGTGGTTCTTTCCGATTTCGCTCCAGAGACAGCCAGTGTGATATACTTGATCCTTCATTTCTCCATTCCACAAGGGCACACTGATGTACAAGACTGTGACAAAAACCAACTAAACCTCACGGTAGAGCTCACAACAGCAGAAGTAGTGCCAGGCTCAGTTTGGAATTTGGGTAAATATGTTTGTATAAGACCAGATTGGTGGCCTTATGAGACAGCCACGGTCATGGTGATTGAAGAGGTGGGTCAAGTAATCAAGATTGTCTTAAGGGCGTTAAGGGATCTGACGCGCATTTGGACCGCTGCTACAACCACCGCATTCTTGATTTGTCTGGTGAAGGTGGTGAGAGGCCAAGTGTTGCAAGGTATACTGTGGCTGATACTCATAACAGGGGCGCAAGGGTACCCATATTGCAAACCCGACTTTTCATACGCCATAGCCAAAAATGATGAGATTGGCCCACTTGGAGCTACAGGCCTCACCACTCAGTGGTACGAATACTCGGACGGGATGCGGCTGCAGGACTCAACGGTTGAAGTTTGGTGTAAGGATGGAGAGATCAAATTTTTAACTAAATGTGAGAGGGAAGCCAGGTATCTGGCTGCTCTACACAAGAGAGCCTTGCCGACGTCTGTAGTATTTGAAAAAATTCTTGAAGGAAAGAAACAAGAGGACATAGTAGAAATGGATGACAACTTTGAATTCGGTCTCTGCCCATGTGATGCTAGACCCTTGATAAGGGGAAAATTTAACACAACACTTCTAAATGGGCCAGCCTTCCAGATGGTTTGCCCTATAGGGTGGACAGGGACTGTAAGCTGTACACTGGCCAATAAGGATACTTTAGTCACAACTGTTGTGCGAACGTATAAGAGGGTCAGGCCTTTTCCATATAGGCAGGACTGTGTCACCCAGAAAACCATTGGGGAAGACCTCTACGACTGTGCCTTAGGAGGGAATTGGACTTGTGTGCCGGGGGATGCACTACGATATGTAGCTGGGCCCATCGAGTCTTGCAAGTGGTGTGGTTACAAGTTTTTTAAAAATGAGGGTCTGCCGCATTTCCCAATTGGCAAATGCAGGCTGAAGAATGAGAGTGGCTATAGACAAGTGGACGAGACTTCTTGCAACAGAGATGGCGTGGCTATAGTGCCAACTGGCACGATCAAATGCAGGATAGGGGACACAGTGGTGCAAGTCGTTGCAATGGATGATAAACTAGGACCTATGCCTTGCAAACCACATGAGATCATATCCAGCGAGGGGCCTGTGGAAAAGACGGCATGCACCTTCAATTACACAAGAACATTAAAAAACAAGTACTTTGAGCCTAGAGACAACTATTTCCAACAATACATGTTAAAGGGGGAGTACCAATATTGGTTTGACCTAGAGATCACTGATCACCACCGAGATTACTTCGCTGAGTCCCTGCTGGTGATAGTAGTTGCACTCCTGGGTGGCAGGTACGTGCTTTGGCTGCTGGTCTCATACATGATCCTATCAGAACAGATGGCCTTGGGTTCCCAGTATGGAGCAGGTGAAATAGTGATGATGGGCAACTTGTTAACACATGACAGTGTTGAAGTGGTGACATATTTCTTACTATTATACCTACTACTGAGAGAGGAAAACATCAAAAAATGGGTTATACTTATATACCACATCTTAGTAATGCACCCACTAAAATCGGTGACGGTGATATTGCTAATGGTTGGAGGGATGGCAAAAGCTGAATCAGGTGCCCAAGGGTACCTAGAGCAGGTAGACCTTAGTTTTACGATGATAACGATCATTGTAATAGGTTTGGTTGTAGCTAGGCGTGATCCCACTGTGGTGCCATTAGTCACAATAGTTGCGGCACTGAAGATCACGGGGCTAGGCTTTGGGCCCGGAGTGGATGCAGCTATGGCAGCCCTCACCTTAACCCTACTGATGATTAGTTATGTAACAGACTACTTCAGGTATAAAAGGTGGATACAATGTATCCTCAGCTTAGTAGCCGGGGTATTCCTTATTAGGAGCCTTAAACATCTAGGTGAAATTGAAACCCCTGAGCTGACCATACCGAACTGGAGGCCACTAACTTTCATACTACTATACCTGACTTCAGCGACAGTTGTTACAAGATGGAAAATTGACATAGCTGGCATATTCCTGCAAGGGGCTCCAATCCTTTTGATGATCGCCACCCTATGGGCTGACTTCTTGACCCTTATTCTGATCCTACCCACCTACGAGTTAGTCAAGCTGTACTACCTAAAGAACGTCAAGACTGACGTGGAAAAGAGCTGGCTGGGGGGGTTAGACTACAAGACAATTGACTCTGTTTATGATGTGGATGAAAGTGGAGAAGGCGTGTACCTCTTCCCGTCCAGACAGAAGAAAAACAAGAATATCAGCATACTCTTGCCCCTCATCAGAGCTACACTGATAAGTTGTATTAGCAGCAAATGGCAGATGGTGTATATGGCTTACTTAACCCTGGACTTCATGTACTACATGCACAGAAAGGTTATTGAAGAAATATCAGGGGGTACCAACGTGTTGTCTAGAGTGATAGCAGCACTCATAGAGTTAAATTGGTCCATGGAAGAAGAAGAGAGCAAGGGCTTAAAGAAGTTTTTTATACTATCTGGAAGGCTGAGGAACCTTATAATAAAACATAAGGTTAGGAACCAGACTGTAGCAAGCTGGTATGGGGAGGAAGAAGTCTACGGCATGCCAAAAGTGGTGACCATAATAAGGGCCTGCACACTAAACAAGAATAAACATTGCATAATATGCACAGTATGTGAGGCTAGAAAGTGGAAGGGAGGCAACTGCCCTAAATGCGGCCGCCATGGTAAGCCCATCTCTTGCGGGATGACTCTAGCAGATTTTGAAGAAAGGCACTACAAGAGAATTTTTATAAGGGAAGGTAACTTCGAAGGACCCTTTAGGCAGGAATACAGTGGATTTGTGCAATACACCGCTAGGGGGCAATTGTTCCTGAGAAATTTACCCATATTGGCAACCAAAGTAAAAATGCTTATGGTAGGCAACCTAGGAGAAGAAATCGGTGATCTAGAACACCTAGGATGGATCCTAAGGGGACCTGCCGTGTGCAAGAAAATAACTGAGCACGAAAAATGCCATGTTAACATAATGGACAAGCTGACTGCGTTTTTCGGTGTTATGCCAAGAGGGACCACACCAAGGGCTCCGGTGAGATTCCCAACAGCACTACTAAAGGTAAGGAGGGGGTTGGAAACCGGTTGGGCTTACACGCATCAAGGTGGCATAAGCTCAGTAGACCATGTGACCGCTGGCAAGGATTTATTGGT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| 10,388 |
OR753412.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Xie,J.
|
Xinjiang Agricultural University, Laboratory of Animal Etiology and Epidemiology, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-11-12
|
BI-2023
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,273 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2022
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate BI-2023, complete genome
|
GTATAACGAGTTAGGCAAGTTCTCGTATACATATTGGACACTCTAAAAAGTAATTAGGTCTAGGGGACAAAAATCCTCCTTAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAATAAGGGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTGAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCTTTGGAGGACAAGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCACAGCACATCTTAACCTGGACAGGGGTCGTTCAGGTGAAAACGGTTTAACCAACCGCTACGAATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCACTGGAGTGGAGGAACCAGTATACGACCAAGCTGGTAATCCTTTGTTTGGAGAAAGAGGAGTGATTCATCCGCAGTCAACGCTAAAACTGCCTCATAAAAGAGGGGAGCGTGAAGTCCCCACCAACTTAGCTTCTTTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGGACGGGTAACAGCAAGGGGCCTGTGAGTGGAATCTACTTAAAACCAGGGCCGTTATTCTACCAGGATTATAAAGGACCTGTCTATCATAGAGCCCCATTGGAGCTTTTTGAGGAAGCACCTATGTGTGAGACAACTAAAAGAATCGGGAGAGTAACTGGTAGTGACAGCAAATTATACCACATTTATGTGTGTATTGATGGGTGCATAATAGTCAAGAGTGCAACAAAAGACCGCCAAAAAGTACTCAAGTGGGTCCACAACAAGCTAAACTGCCCCCTATGGGTTTCAAGCTGCTCCGACACAAAGGATGAAGGGGCGGGAAAAAAGAAGCTACAAAAACCAGATAGGTTGGAAAAGGGGAGAATGAAGATAACACCTAAAGAGTCAGAGAAAGACTGTAAGACCAAGCCACCAGACGCCACGATAGTGGTAGATGGAGTCAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAAGTCAAGAGCAAGAACACCCAGGATGGCTTATACCACAATAAAAATAAACCTCAAGAGTCACGCAAGAAATTAGAAAAAGCCCTACTGGCCTGGGCAATAATAGCCCTGGTTTTGTTCCAAGTTACAATGGGGGAGAACATAACGCAGTGGAACTTACAAGATAATGGGACGGAAGGAATACAACGAGCCATGTTTCAGAGAGGAGTGAATAGAAGTCTACATGGGATCTGGCCGGAGAAAATCTGTACAGGCGTTCCTTCCCACCTGGCCACTGACACAGAACTGAAGGCAATTCATGGTATGATGGATGCAAGCGAGAAGACAAATTATACATGCTGCAGACTCCAACGCCATGAATGGAACAAACACGGTTGGTGCAATTGGTACAACATTGAACCTTGGATCCTTCTTATGAATAAAACTCAAGCCAACCTCACCGAGGGTCAGCCGCCAAGGGAGTGTGCCGTCACATGCCGGTATGATCGAGATAGTGACCTGAATGTAGTGACACAAGCTAGGGATAGTCCCACACCATTGACAGGTTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCCTTTGCAGGCATATTGGTAAAGGGACCTTGCAACTTTGAAATAGCAGTTAGTGATGTGCTGTTCAAAGAGCATGATTGCACTAGTGTGATTCAAGACACAGCTCACTACCTCGTAGACGGGATGACCAACTCCCTAGAGAGAGCTAGGCAAGGGACCGCAAAACTAACAACTTGGCTGGGTAGGCAGCTTGGAATACTAGGAAAGAAACTGGAAAACAAGAGTAAGACATGGTTTGGGGCATATGCAGCCTCTCCCTACTGTGAGGTAGAACGGAAGCTTGGTTACGTCTGGTATACAAAGAATTGCACTCCTGCCTGTTTGCCTAGGAATACGAAGATTATTGGCCCCGGCAGGTTTGACACCAATGCTGAGGATGGTAAAATACTGCATGAGATGGGGGGTCACTTGTCGGAGGTACTACTACTCTCAGTGGTAGTGCTGTCCGATTTCGCTCCAGAGACAGCCAGTGTGATATACTTGATCCTTCATTTCTCCATCCCACAAGGACACACCGATATACAAGACTGTGACAAAAACCAACTAAACCTCACCGTAGAACTTACAACAGCAGAAGTAGTACCAGGATCAGTTTGGAATTTGGGGAAATATGTTTGTATAAGACCAGATTGGTGGCCTTATGAGACTGCCACGGTCCTGGTGCTTGAAGAGGTGGGTCAAGTGGTTAAGCTTGTCTTAAGGGCGTTAAAGGACCTGACGCGCATTTGGACCGCTGCTACAACCACTGCATTCTTGGTTTGTTTGGTGAAGGTGGTGAGAGGCCAAGTATTGCAGGGTATATTGTGGCTGATACTCATAACAGGGGCGCAAGGGTACCCAGACTGCAAACCCGACTATTCATACGCCATAGCCAAAAATGATGAGGTTGGCCCACTTGGAGCTACAGGTCTCACCACTCAGTGGTACGAATACTCGGATGGGATGCGGCTGCAGGACTCAACAGTTGAAGTTTGGTGTAAAGATGGAGAGATCAAATATCTAGCCAAATGTGAGAGGGAAGCCAGGTATCTGGCTGTTCTACATACGAGAGCCTTGCCGACATCTGTAGCATTTGAAAAGATTTTAGAGGGAAAAAAACAAGAGGACATAGTAGAAATGGATGACAACTTTGAATTCGGCCTTTGCCCGTGTGATGCTAAACCCTTGGTAAGGGGGAAATTTAATACAACACTTCTAAATGGGCCAGCCTTCCAGATGGTTTGCCCTATAGGATGGACAGGGACTGTAAGCTGTACACTGGCCAATAAGGATACGTTAGCCACAACCGTTGTGAGGACATATAAGAGGGTCAGGCCTTTTCCATATAGACAGGGCTGCATCACCCAGAAAACCATTGGGGAAGACCTCTACGACTGTGTCTTAGGAGGGAATTGGACTTGTGTGCCGGGGGATGAACTACGATATGTAGCTGGGCCCGTCGAGTCTTGTAAGTGGTGTGGTTACAAGTTTTTTAAAAGTGAGGGTCTACCACATTTCCCAATTGGCAAATGCAGACTGAAGAATGAGAGTGGCTACAGACAAGTGGATGAGACTTCTTGCAACAGAGACGGCGTAGCTATAGTGCAATCCGGCATAGTCAAATGCAAGATAGGGGACACAGTGGTGCATGTCATTGCAATGGATGATAAACTAGGACCTATGCCTTGTAAACCACATGAAATCATATCCAGTGAGGGGCCGGTGGAAAAGACGGCATGCACCTTCAACTACACAAGGACATTAAAAAATAAGTACTTTGAGCCTAGAGACAACTACTTCCAACAATACATGTTAAAGGGGGAGTACCAATATTGGTTTGACCTAGAGATAACTGATCACCACCGAGATTACTTCGCTGAGTCCCTGCTGGTGATAATAGTCGCACTCCTGGGTGGCAGGTACGTGCTTTGGTTGTTGGTCACATACATGGTCCTATCAGAACAGATGGCCTTGGGTGCCCAGTATGGGGCAGGTGAAATAGTAATGATGGGCAACCTGTTAACACATGACAGTGTTGAAGTGGTGACATATTTCTTACTGCTATACCTACTACTAAGAGAGGATAACACCAGAAAATGGGTTATACTTATATATCACACCATAGTAATGCACCCACTGAAATCGGTGACAGTGATATTGCTAATGGTTGGAGGGATGGTAAAGGCTGAACCAGGCGCCCAGGGGTATCTAGAGCAGGTAGACCTTAGTTTTACGATGATTACGATCATTGTAATAGGTCTGGTTATAGCCAGGCGTGATCCCACTGTAGTGCCACTAGTCACAATAGTTGCGGCACTGAAGATCACAGGACTAGGCTTTGGGCCCGGGGTGGATGCAGCCATGGCAGTCCTCACCTTAACCCTACTGATGATTAGTTATGTAACAGACTACTTCAGGTATAAAAGGTGGATACAGTGTATCCTCAGCTTAGTAGCTGGTGTGTTTCTTATCCGGAGCCTTAAACATCTAGGTGAAATCGAAACCCCTGAGCTGACCATACCAAACTGGAGGCCACTAACCTTCATACTATTATACCTGACTTCAGCGACAGTTGTTACAAGATGGAAAATTGACATAGCTGGCATATTCCTTCAAGGGGCCCCAATCCTTTTGATGATCGCCACCCTATGGGCTGACTTCTTGACCCTTGTTCTGATCCTACCCACCTACGAATTAGCCAAGTTGTACTACCTAAAGAACGTCAAGACTGACGTGGAAAAGAGTTGGCTGGGGGGGTTAGACTACAAGACAATTAACTCTGTTTATGATGTGGATGAAAGTGGAGAAGGCGTGTACCTCTTCCCGTCTAGACAGAAGAAAAACAAGAATATCAGCATACTCTTGCCCCTCATCAGAGCTACGCTAATAAGTTGTATTAGCAGCAAATGGCAGATGGTGTATATGGCTTACTTAACCCTGGACTTTGTATACTACATGCACAGAAAGGTTATTGAAGAGATATCAGGGGGTACCAACGTGATGTCTAGAGTGATAGCAGCACTCATAGAGTTAAACTGGTCCATGGATGAAGAAGAGAGCAAGGGCTTAAAGAAGTTTTTTGTACTATCTGGAAGGTTGAAGAACCTTATAATAAAGCATAAAGTTAGGAACCAGACTGTAGCAAGCTGGTATGAGGAGGAAGAAGTCTACGGCATGCCAAAAGTCGTGACCCTAATAAAAGCCTGCACACTAAACAAAAATAAACATTGCATAATATGCACAGTATGTGAGGCTAGAAAGTGGAAGGGAGGCAACTGTCCTAAGTGCGGCCGCCACGGGAAGCCCATCACTTGCGGGATGACTCTAGCGGATTTTGAAGAAAGGCACTACAAGAGAATTTTTATAAGGGAAGGTGACTTCGAAGGACCCTTTAGG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| 11,110 |
OR683432.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Park,G.N., Shin,J., Choe,S., Kim,K.S., Kim,J.J., Lim,S.I., An,B.H., Hyun,B.H., An,D.J., Park,G.-N., Kim,K.-S., Kim,J.-J., Lim,S.-I., An,B.-H., Hyun,B.-H., An,D.-J.
|
Animal and Plant Quarantine Agency, Virus Disease Division
| null |
2023-11-05
|
KD26
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,307 |
GenBank
| 1 |
South Korea
|
South Korea
|
Bos taurus
|
feces
|
2005
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate KD26, complete genome
|
GTATACGAGAATTAGAAAAGGCTCTCGTATACGTATTGGGCAATTAAAATAATAATTAGGCCTAGGGAACAAAAGTCCCCCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCATAAAGAGGGGGGTAGCAGCAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTTAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCCTTGGAATAAAGGTCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCAAAGCACATCTTAACCTGAGCGGGGGTCGCCCAGGTAAAAGCAGTTCTAACCGACTGTTACGAATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTTCTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACTTACAAACAAAAACCCGTCGGGGTGGAAGAACCTGTTTATGATCAGGCAGGTGATCCCTTATTTGGTGAAAGGGGAGCAGTCCACCCTCAATCGACGTTAAAGCTCCCACACAAGAGAGGGGAATGCGATGTACCCATCAACTTGGCATCTTTACCAAAAAGGGGTGACTGCAGGTCGGGTAATAGCAGAGGACCTGTGAGCGGGATCTACTTGAAGCCAGGGCCACTATTTTACCAGGACTATAAGGGTCCCGTCTATCACAGGGCCCCGCTGGAGCTCTTTGAAGAGGGAACCATGTGTGAAACGACTAAACGGATAGGGAGAGTAACTGGAAGTGACGGAAAGTCGTACCACATTTATGTGTGTATAGATGGATGTATAATAATAAAAAGTGCCACAAGAAGTCACCAAAGGGTGCTTAGGTGGGTCCATAATAGGCTTAACTGCCCTCTATGGGTCACAAGTTGCTCAGACACGAAAGAAGAGGGAGCAACAAAAAAGAAAACACAGAAACCCGACAGACTAGAGAAGGGGAAGATGAAAATAGTGCCCAGAGAATCCGAAAAAGACAGCAAAACTAAACCTCCGGATGCTACAATAGTGGTAGATGGAGTTAAATACCAGGTGAAGAAGAAGGGAAAAATCAAGAGTAAGAGCACTCAGGACGGCTTGTACCATAACAAAAACAAACCGCCGGAATCACGTAAGAAACTGGAAAAAGCATTGCTGGCATGGGCAATAATAACTATAGTTTTGTTTCAAGTTACAATGGGAGAAAACATAACACAGTGGAACCTACAAGACAATGGGACGGAAGGGATACAACGGGCAATGTTTCAAAGGGGTGTGAATAGAAGTCTACATGGAATCTGGCCAGAGAAAATCTGTACTGGTGTCCCTTCCCATCTAGCCACCGATATGGAACTAAAAACAATCCATGGTATGATGGATGCAAGTGAGAAGACCAACTACACGTGTTGCAGACTTCAACGCCATGAGTGGAACAAGCATGGTTGGTGCAACTGGTACAATATTGAACCCTGGATTCTAGTCATGAATAGAACCCAAGCCAATCTTACTGAGGGACAACCACCAAGGGAGTGCGCAGTCACTTGCAGGTATGATAGGGATAGTGACTTAAACGTAGTAACACAAGCTAGAGATAGCCCCACACTCTTGACAGGTTGCAAGAAAGGAAAGAACTTCTCCTTTGCAGGCATACTGACGCGGGGTCCCTGCAACTTTGAAATAGCTGCGAGTGATGTATTATTCAAAGAACATGACTGCACTAGTATGTTCCAGGATACTGCTCATTACCTTGTTGACGGGATGACCAACTCCTTAGAAAATGCCAGACAAGGAACCGCTAAACTGACAACCTGGTTAGGCAAGCAGCTCGGGATACTAGGGAAAAAGTTGGAAAACAAGAGTAAGACGTGGTTTGGAGCATACGCGGCTTCCCCCTACTGTGATGTCGATCGAAAGATTGGCTACATATGGTATACAAAAAATTGTACCCCTGCCTGCTTGCCCAAGAACACAAAAATTGTCGGCCCTGGGAAGTTTGACACCAACGCAGAGGACGGCAAGATACTACATGAGATGGGGGGCCACTTGTCGGAGGTACTACTACTTTCTTTAGTGGTGCTGTCCGACTTCGCACCGGAAACAGCCAGCGCAATGTACCTAATCCTACATTTTTCCATCCCACAAAGTCACGTTGACATAATGGAATGTGATAAGACCCAGTTGAACCTCACAGTGGAGCTTACAACAGCTGATGTAATACCAGGATCAGTCTGGAACCTAGGCAAATGGGTATGTATAAGACCAAATTGGTGGCCTTATGAGACAACTGTGGTGTTGGCATTTGAAGAGGTGAGCCAGGTGGTGAAGTTAGTGTTGAGGGCACTCAGAGATTTGACACGCATTTGGAACGCTGCAACAACTACTGCTTTCTTAATATGCCTTGTTAAGATAGTCAGGGGCCAGATGGTACAGGGCATTCTGTGGCTACTACTGATAACAGGGGTACAAGGGGACTTGGATTGCAAACCTGAATTCTCATATGCCATAGCAAGGGATGAAAGAATTGGTCAACTGGGGGCTGAAGGCCTTACTACCACTTGGAAGGATTACTCGCCTGAAATGAAACTGGAAGACACAATGGTCATAGCTTGGTGCAAAGATGGTAAGTTTACGTACCTCCCAAGGTGCACGAGAGAAACCAGATATCTCGCGATCTTGCATACAAGAGCCTTACCGACCAGTGTGGTATTCAAAAAACTTTTTGATGGGCGAAAGCAAGAGGATGTAGTCGAAATGGACGACAACTTTGAATTTGGACTCTGCCCATGTGATGCCAAACCCATAGTAAGAGGGAAATTCAATACAACACTGCTGAACGGATCGGCCTTCCAGATGGTATGCCCCATAGGATGGACAGGGACTGTAAGCTGTATGTCATTCAATATGGACACCTTAGCCACAACCGTGATACGGACATATAGAAGGTCCAAACCATTTCCTCATAGGCAAGGCTGTATCACCCAAAAGACTCTGGGGGAGGATCTCCATAACTGCATCCTCGGAGGAAATTGGACTTGTGTGCCTGGAGACATGCTATTATACAAAGGGGGCTCTATTGAATCCTGCAAGTGGTGTGGTTATCAATTTAAAGAGAGCGAGGGACTACCACACTACCCCATTGGCAAGTGTAGATTAGAGAATGAGACTGGTTACAGACTAGTAGACGATACCTCTTGTAATAGAGAAGGTGTGGCCATAGTACCACAAGGGACATTACGGTGCAAGATAGGAAAAACTACTATACAGGTCATAGCTATGGATACCAAACTCGGGCCTATGCCTTGCAGACCATATGAAATAATATCAAGTGAGGGGCCTGTAGAAAGGACAGCGTGTACCTTCAACTACACTAAAACATTAAAAAATAAGTATTTTGAGCCCAGAGACAGCTACTTCCAGCAATACATGCTAAAAGGAAAGTATCAATACTGGTTTGACCTGGAGGTAACCGACCATCACCGGGATTACTTTGCCGAGTCCATATTAGTGGTGGTGGTAGCCCTCCTGGGTGGCAGATATGTACTTTGGTTACTAGTTACATACATGGTCTTATCAGAACAGAAGGCCTCAGGGACTCAGTATGGAGCAGGGGAAGTAGTGATGATGGGCAACTTGCTAACCCATAATGACATTGAAGTGGTGACATACTTCTTGCTGTTGTACCTACTGCTGAGGGAAGAGAGCGTAAAGAAGTGGGTCTTACTTTTATACCACATCTTAGTGTCACACCCAATCAAATCTGTAACTGTGATCCTATTGATGATTGGGGATGTGGTAAAGGCAGACTCAGGGGGCCAAGGGTACTTTGGGCAAATAGACCTCTGTTTTACAATAGTTGTACTAATCATCATAGGTTTAATCATAGCCAGGCGTGACCCAACTATAGTGCCACTAGTAACAATAATGGCAGCACTGAGGGTCACTGGATTGACCTACCAGCCTGGAGTTGACGTCGCTATGGCAGTCATGACCATAACCCTACTGATGATTAGCTATGTGACAGATTACTTTAGATATAAAAGATGGTTACAGTGCGTTCTCAGCCTGGTGTCAGGGGTGTTCTTGATAAGAAGCCTAATGCACCTAGGTAGAATAGAGGTGCCAGAGGTAACCATCCCAAACTGGAGACCACTAACTTTAATACTGTTATATTTGATCTCAACAACAATTGTAACAATGTGGAAGGTTGACATCGCTGGCTTGTTGTTGCAATGCCTGCCTATCTTTTTACTGGCCACAACCTTGTGGGCCGACTTCTTAACCCTCATACTGATCCTGCCTACCTATGAATTGGTTAAATTATACTACCTGAAAACTGTTAGGACTGATATAGAAAGAAGTTGGCCAGGGGGGATAGACTGTACAAGAGTTGACTCCATCTACGACATTGATGAGAGTGGAGAGGGCGTATATCTCTTTCCATCAAGGCAGAAAGGACAGAGGAGCTTTTCCATACTCTTGCCCCTTGTCAAAGCAACACTGATAAGTTGCGTCAGCAGTAAATGGCAGCTAATATACATGAGTTACCTAACTTTGGACTTTATGTACTACATGCACAGGAAAGTTATAGAAGAGATATCAGGAGGCACCAACATGATATCCAGGTTAGTAGCGGCACTCATAGAGCTGAACTGGTTCATGGAAGAAGAGGAGAGCAAAGGCCTAAAGAAGTTTTATCTATTATCTGGAAGGTTGAGAAACCTAATAATAAAACATAAAGTAAGAAATGAGACCGTGGCTTCTTGGTACGGGGAGGAGGAAGTCTACGGTATGCCAAAGATCATGACAATAATCAAGGCCAGTACGCTGAGTAAGAGCAAGCACTGCATGATATGCACTGTATGTGAGAGCCGAGAGTGGAAAGGCGGCACCTGCCCAAAATGTGGACGCCATGGGAAACCGATAATGTGTGGGATGTCGCTAGCGGATTTTGAAGAAAGACACTATAAAAGAATCTTTATAAGGGAAGGTAACTTTGAGGGTCCTTTT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| 11,250 |
ON732849.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Yang,S., Chen,J., Zhang,L., Yang,H.
|
Institute of Animal Science and Veterinary Medicine Shandong Academy of Agricultural Science, Shandong Key Lab of Animal Disease Control and Breeding
|
China
|
2023-08-22
|
SDJN01
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,294 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2016
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate SDJN01, complete genome
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GGAAAACACTCGTGTACATATTGGACAATCTAAAATAACAATTGGACCTAGGGAATGAATCCCCTTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCATAATGGAGGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTTAAGCCCTGAGTACAGGGCAGTCGTCAGTGGTTCGACACCTTGGAAGAACAAGGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCAAAGCACATCTTAACTTGGGCGGGGGTCGCTCAGGTGAAAGCAGTTTTTAACCAACTGTTACGAATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATATAAACAAAAACCCGTTGGAGTGGAGGAACCAGTTTACGATCGGGAAGGTAACCCATTATTTGGTGAGAAGGGGGCAGTCCACCACCAATCGACGCTAAAGCTTCCGCACAAAAGAGGGGAGCGCGAAGTCCCTGCCAGCCTGGCGTCGTTACCAAAGCGAGGTGACTGCAGATCGGGCAACAGTAGAGGCCCTGTGAGTGGGATCTACCTTAAGCCGGGGCCACAATTCTACCAGGATTATATAGGGCCAGTCTACCATAGAGCACCATTGGAGTTGTTCGAGGAAGGATCTATGTGTGAAACAACAAAACGGATAGGGAGAGTGACCGGCAGTGATGGCAAGTTGTACCACATTTATGTATGTATAGATGGGTGTATAATAGTGAAGAGTGCCACAAGAAGTCACCAGAAGGTACTGAGATGGGTCCACGATAAGCTCAACTGCCCTCTATGGGTTACAAGCTGCTCAGACACGAAAGAAGAAGGAGTAACTAGGAAGAAACAACAAAAACCGGATAGGCTAGAAAAGGGAAGAATGAAGATAACACCCAGAGAATCCGAGAAGGATAGCAAGACTAAACCACCAGACGCTACAATAGTAGTAGATGGGGTCAAGTACCAGGTAAAGAAGAAGGGGAAAGTTAAGAGCAAAAACACCCAGGACGGTTTGTACCACAACAAGAACAAGCCACAAGAGTCACGAAAGAAACTGGAGAAAGCTCTATTGGCGTGGGCTATCCTGGCTATTGTTTTGTTCCAAGTCACGATGGGTGAAAACATAACACAGTGGAACCTACAAGATAATGGGACAGAAGGGATACAACGGGCGATGTTCCAAAGGGGCGTGAATAGGAGCCTACATGGAATCTGGCCAGAGAAAATCTGTACAGGTGTCCCGTCCCATCTAGCAACTGATTTAGAATTAAAATCAATTCATGGCATGATGGACGCAAGTGAAAAGACCAACTACACATGTTGCAGACTTCAGCGCCACGAGTGGAATAAACACGGTTGGTGCAACTGGTACAACATTGAACCTTGGATTCTAGTCATGAACAAAACCCAAGCTAATCTTACAGAGGGGCAACCACCAAGAGAGTGCGCCGTCACGTGCAGGTATGATAGAGATAATGACATAAATGTTGTAACACAAGCTAGAGACAGTCCCACACAACTGACAGGCTGTAAGAAAGGAAAGAATTTCTCCTTTGCAGGAATATTGATGCAGGGTCCTTGCAACTTTGAGATAGCAGCGAGTGATGTGCTGTTTAAAGAACATGACTGCACTAATGTATTCCAGGATACTGCTCATTACCTTGTCGACGGGATGACCAACTCCTTAGAAAGTGCCAGGCAAGGGACCGCTAAACTAACAACTTGGTTAGGCAGACAGCTTAGGACACTAGGAAAAAAACTGGAGAACAAGAGTAAGACATGGTTCGGGGCATATGCGGCCTCCCCATACTGTGATGTTGACCGAAAACTTGGCTACATCTGGTTTACAAAAAATTGCACACCTGCCTGCTTACCGGAGAACACAAAAATTATAGGCCCTGGGATGTTTGACACCAATGGAGATGATGGTAAAATACTGCATGAGATGGGGGGTCACTTGTCAGAGGTACTACTACTCTCTCTAGTGGTACTGTCTGATTTCGCCCCAGAAACAGCTAGCGCATTGTACCTGGTACTGCATTTTTCCATCCCGCAAAGTCACACTGATATAACGGATTGTGATAAGAACCAGTTGAACCTCACTATAGGACTCACAACTGAAGATGTGGTGCCAGGGTCAGTCTGGAACGTAGGCAAATACGTCTGCATAAGGCCGAACTGGTGGCCCTATGAGACAGCTACAGTGCTGGCATTTGAAGAAGTGGGGCAGGTGATAAAGATTGCACTGAGGGCATTGAGAGACCTAACACGCATATGGAATGCCGCTACCACTACTGCATTCTTGATATGTCTAGTGAAGATCGTGAGAGGTCAGTTGCTGCAGGGCATACTGTGGCTACTGTTAATTACAGGGGTACAGGGCCACCTGGACTGCAGACCTGATTTCTCATATGCCATAGCTAAGAATGAAAAGATTGGCCCATTAGGTGCTGAAAGCCTTACCACCGTTTGGAAAGAATACTCACCAGGAATGAGGTTAGAAGACACAATGGTTGTAGCTTGGTGCAAAGACGGCCAGTTTACACTCATGAAAAGGTGTGCAAGGGAAGCCAGATATCTGGCCATCTTGCACACAGGAGCCCTACCAACTTCTGTAGTATTTAAAAAACTTTTTGATGAACAGAGGCTGAAGGACACAGTAGAAATGGGAGACGACTTTGAATTCGGACTTTGCCCATGTGATGCCAGACCTGTAGTGAAGGGGAAATTCAATACAACACTGTTAAACGGGCCAGCCTTCCAAATGGTATGTCCCATAGGATGGACGGGGTCTGTCAGCTGTATGCTAGTTAATGAAGATACCTTAGACACAACTGTAGTACAGACGTATAGGAGGCCCAAACCATTTCCTTACAGACAAGGCTGTATTACCCAAAAAGTTGTAGGGGAGGACCTCCACGACTGTATCCTTGGAGGAAATTGGACATGTGTAGTGGGGGAGCAACTACGATACACAGGGGGTCACATTGAATCATGCAAGTGGTGCGGTTACAGATTCCTAAGAAGTGAGGGGCTACCACATTACCCGATTGGCAAATGCAAGCTAGAGAACGAAACTGGCTACAGAATAGTGGATGACACTTCTTGCAACAGAGACGGTGTGGCCATAGTACCACAAGGACGGGTGAAATGCAAGATAGGAGATACGGTCGTACAGGTCATCGCTTTGGACACCAAACTCGGGCCTATGCCTTGCAGACCACATGAGATTATACCAAGTGAGGGGCCTGTGCAAAAGACGGCATGTACCTTCAATTATACAAAGACATTAAAGAACAAATACTTCGAGCCAAGGGACAGTTACTTCCAGCAATATATGCTAAAAGGGGAGTATCAATACTGGTTTGACCTCGAGGCCACAGATCACCACCGGGATTACTTCGCTGAGTCTATATTGGTGATAGTGGTGGCCCTCCTGGGCGGCAGATACGTGCTATGGTTGCTGGTCACGTATATGGTCTTATCAGAACAAAGAGCCTCGGGGGCCCAGTATGGAGCAGGAGAAATAGTGATGATGGGAAACTTACTGACGCATGACAGTATTGAGGTGGTGACATATTTTCTGTTGCTATACCTGTTACTAAGAGAGGAAAACATCAAGAAATGGGTCATACTACTATACCATGTCTTTGTAGCACACCCGTTAAAATCAGTGACAGTGATCTTGCTGATGACTGGGGAATTGGTGAAAGCCGACTCAGGGGCCCAAGGGTACTTGGAGAGGGTAGATCTCTGTTTCACAATGGTAGTATTAATTGTCATAGGTTTAGTCATAGCTAGGCGTGACCCCACAGTGGTGCCGCTGGTCACAATAGTGGTGTCATTGAGGGTCACTGGGTCAACCTTCGGGCCAGGAGTGGATGTAGCTGTGGCAGTCCTGACTCTAACATTGCTGATGGTTAGCTACTTGACAGATTACTTCAGGTATAAAAGATGGCTACAGTGCACGCTCAGCCTAGTGGCAGGGGTGTTCTTGATGAGAAGCCTAATACACCTAGGTAAAATCGAGACGCCGGGGTTGACGATCCCAAGTTGGCGGCCACTGACATTTGTACTATTATATTTGATCTCAACAGCAGTTGTCACGATGTGGAAGATTGATATGGCTGGTCTTTTGTTACAATGCGTGCCCATCCTATTGCTGGTCATGACTCTGTGGGCTGACTTCTTAACCCTCTTATTAATTTTGCCTACTTATGAACTGGTCAAGTTATACTATCTAAAAAACATCAAGACTGATGTAGAAAGAAGTTGGCTAGGCGGACTAGACTACAAAAGGATTAACACCATCTATGATGTGGATGAGAGTGGAGAAGGCGTATATCTCTTCCCGTCTAAGCAGAAAGCAAATAAAAATATTTCCATACTCTTGCCCCTTGTTAGAGCAACACTAATAAGTTGTGTTAGTAGTAAATGGCAACTATTATATCTGGCCTACCTAACTTTGGACTTTATGTATTACATGCACAGGAAGATCATAGAAGAGATCTCAGGAGGCACCAATATGATATCAAGAATTGTGGCGGCACTTGTAGAGCTTAACTGGTCTATGGAAGAGGAAGAAAGCGGGGGCTTGAAGAAATTTTATCTATTGTCTGGGAGACTGAGGAACCTAATACTAAAACACAAAGTAAGGAATGAGACTGTGGCAAACTGGTATGGGGAGGAAGAAGTCTATGGCATGCCAAAGATAATAACTATAATCAAGGCTAGTACACTGAATAGAAACAAGCACTGTATAGTATGTACAGTCTGCGAGGGTCGAAAGTGGAAAGGTGGCACCTGCCCAAAATGTGGACGCCACGGGAAGCCCATAACGTGTGGAATGTCATTGGCGGATTTTGAAGAAAGACACTATAAAAGAATCTTCATAAGGGAAGGTAACTTTGAAGGTCCTTTCAGACAGGAATATA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| 13,561 |
OR004805.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2101
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,038 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2021-01-05
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2101, complete genome
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| 14,417 |
OR004806.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2102
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,007 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2021-01-05
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2102, complete genome
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GCCTACCAACTAGCTCAGGGAAACTGGGAGCCCCTCGATTGTGGAGTTCACCTGGGCACCATACCTGCCAGGAGGGTAAAAATCCACCCATATGAAGCCTACCTGAAACTGAAGGATTTATTAGAAGAAGAAGAAAATAAACCAAAGTGTAGAGATACAGTAATAAGAGAGCATAACAAGTGGATCCTCAAAAAAGTGAGGCACCAAGGGAATCTTAACACAAAGAAAATCCTCAACCCTGGAAAGCTATCAGAGCAGCTAGATAGAGAAGGGCATAAAAGAAACATATATAATAACCAGATTGGCACTATAATGACAGGAGCAGGAATAAGGCTAGAAAAATTACCAATAGTTAGAGCCCAGACTGACACTAAAAATTTCCATGAGGCAATTAGAGATAAGATAGACAAGAATGAAAATCAGCAGAGCCCAGGGCTGCATGATAAATTGTTAGAGATCTTTCATACAATAGCCCAACCTAGCCTAAGACACACCTATGGTGAAGTGACGTGGGATCAACTTGAGGCAGGGATTAATAGAAAAGGGGCTGCAGGCTTTCTAGAGAAGAAGAATGTTGGAGAAGTACTGGACTCAGAGAAGCACCTGGTGGAACAATTGATCAGAGATTTGAAAACAGGAAGGAAGATAAGATATTATGAGACAGCAATACCAAAAAATGAGAAGAGAGATGTCAGTGATGATTGGCAATCGGGGGATATAGTTGATGAGAAGAAACCAAGAGTGATTCAATACCCTGAGGCTAAGACAAGACTAGCCATTACTAAAGTAATGTACAACTGGGTGAAGCAGCAGCCTGTCGTGATCCCAGGGTATGAAGGGAAGACCCCATTATTCAACATCTTCAACAAGGTGAGGAAGGAATGGGATTTGTTTAATGAACCAGTAGCTGTGAGTTTCGACACTAAGGCTTGGGACACCCAAGTAACTAGTAGAGATCTACGGCTTATTGGTGAAATTCAAAAATATTACTACAAGAAAGAGTGGCACAAATTCATCGACACCATTACTGACCATATGGTGGAGGTGCCCGTCATAACAGCAGACGGCGAGGTATACATAAGAAATGGACAAAGGGGTAGTGGCCAGCCAGACACAAGTGCAGGCAACAGCATGCTAAATGTGTTAACAATGATGTATGCCTTCTGTGAAAGTACGGGGGTTCCATATAAAAGTTTCAATAGGGTAGCAAGGATCCATGTCTGCGGGGATGACGGCTTCCTAATAACTGAGAAGGGACTGGGATTAAAATTTGCCAACAATGGGATGCAAATTCTGCATGAAGCGGGCAAGCCTCAAAAGATAACCGAAGGGGAAAGAATGAAAGTAGCCTATAGGTTTGAGGACATAGAATTTTGCTCTCATACACCAGTCCCCGTTAGGTGGTCTGATAACACCAGCAGTTACATGGCCGGTAGAGATACTGCCGTTATATTATCAAAAATGGCAACAAGATTGGATTCAAGTGGAGAAAGGGGTACTATAGCATATGAAAAAGCAGTGGCTTTTAGTTTCTTGCTGATGTACTCCTGGAACCCTCTCGTGAGGAGGATCTGTTTACTGGTTCTTTCACAGCAGCCAGAGACAACTCCATCAACCCAGGCCACTTACTATTACAAAGGAGACCCAATAGGAGCCTACAAAGAAGTAATAGGTAAGAACTTGATTGAATTAAAAAGGACGGGTTTTGAAAAATTGGCTAATCTAAACTTAAGCCTGTCCACTTTAGGAATCTGGTCCAAACATACAAGTAAAAGAATTATCCAAGACTGTGTAACCATCGGGAGAGAGGAAGGCAATTGGCTAGTCAATGCCGATAGGCTGATATCCAGCAAAACTGGCCATTTGTACATACCTGACAAAGGTTATACATTACAAGGGAAACATTATGAACAACTTCAGCTGCAGGCGAGAACTAGCCCGGTTATTGGAGTAGGGACAGAGAGATACAAACTAGGCCCTATAGTAAACCTGCTGCTGAGGAGGTGA
| 14,418 |
OR004807.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2103
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,037 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2021-01-31
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2103, complete genome
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| 14,419 |
OR004808.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2104
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,999 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2021-02-04
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2104, complete genome
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TTGGACCTCCAAGTATTAGGTCTAGGGAAAATCCCCCTTAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAATAAGGGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTGAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCTTCAGAGGACAAGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCACAGCACATCTTAACCTGGACGGGGGTCGCTCAGGTGAAAACGGTTTAACCGACCGTTACGAATACAGTCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTGAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCACTGGAGTGGAGGAACCAGTATACGACCAAGCTGGTAACCCTTTGTTTGGAGAAAGAGGAGTGATCCATCCGCAGTCAACGCTAAGACTGCCACATAAAAGAGGGGAGCGTGAAGTCCCCACCAATTTGGCTAACTTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGGTCGGGTAATAGCAAGGGGCCTGTGAGTGGAATCTATTTAAAACCAGGGCCGGTATTCTACCAGGATTATAAAGGACCCGTTTATCATAGAGCCCCATTGGAGTTTTTTGAGGAAGCGTCAATGTGTGAGATAACCAAAAGAATTGGGAGAATAACTGGTAGTGACAGCAAATTGTACCACATTTATGTGTGTATTGATGGCTGCATAATAGTCAAGAGTGCTACAAGAGATCGTCAAAAAGTACTCAAATGGGTCCACAACAAGCTAAACTGCCCCCTGTGGGTTTCAAGCTGCTCCGATGCAAAGGATGAAGGGGCGGTGAGAAAGAAGCAACAAAAACCAGATAGGTTGGAGAAGGGGAGAATGAAGATAACACCTAAGGAGTCAGAGAAAGACAGTAAGACCAAGCCACCAGACGCCACGATAGTGGTAGATGGAGTCAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAAGTCAAGAGCAAGAATACCCAGGATGGCTTATACCACAACAAAAATAAACCTCAAGAGTCACGTAAGAAACTGGAGAAAGCCCTATTGGCCTGGGCAATAATAGCTCTGGTTTTATTCCAAGCCATAGCGGGAGAGAACATAACGCAATGGAACTTACAAGATAATGGAACAGAAGGAATACAACGAGCCATGTTTTTAAGAGGTGTGAATAGAAGTCTGCATGGGATCTGGCCAGAGAAAATTTGTGCGGGTGTTCCTTCCCACCTGGCCACTGACACAGAACTTAAAGCAATTCACGGTATGATGGATGCAAGTGAGAAGACAAATTATACATGCTGCAGACTCCAACGCCATGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAATATTGAACCTTGGATCCTTCTTATGAATAAAACTCAGGCCAACCTTACCGAGGGTCAACCACTAAGGGAATGTGCCGTCACATGCCGGTATGACCGAGATAGTGACCTGAATGTAGTAACACAAGCTAGAGATAGCCCCACACAACTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCCTTTGCAGGTATATTGGTACAAGGGCCTTGCAATTTTGAAATAGCCGTAAGTGATGTGCTGTTTAAAGAGCATGATTGCACTAGTGTGATTGAAGACACAGCCCACTACCTCGTAGACGGGATGACCAACACCCTAGAGAGTGCTAGGCAAGGGACCGCTAAACTAACAACTTGGCTAGGCAGGCAGCTTGGGATACTAGGAAAGAAGCTGGAAAACAAGAGTAAGACATGGTTTGGGGCATATGCAGCTTCTCCCTACTGTGAGGTAGAACGGAAGCTTGGTTACATCTGGTATACAAAGAATTGTACTCCTGCCTGTTTGCCTAAGAATACAAAGATCATTGGCCCCGGTAGGTTCGACACCAACGCTGAAGATGGTAAAATATTGCATGAGATGGGGGGTCACTTGTCCGAGGTGCTACTACTTTCAGTGGTGGTGCTGTCTGATTTCGCTCCAGAGACAGCTAGCTTGATATACTTGGTCCTTCATTTCTCCATCCCACAAGGGCACACTGATATACAAGATTGTGACAAAAACCAACTAAACCTCACCGTAGAACTCACAACAGCAGAAATAATACCAGGGTCAGTTTGGAATCTGGGAAAATATGTTTGTATAAGACCAGATTGGTGGCCTTACGAGACAGCCACGGTCTTGGCGTTTGAAGAGATGGGTCAAGTAATCAAGATTGTCTTAAGGGCGTTAAGAGATCTGACGCGCATTTGGACCGCTGCTACAACCACTGCATTCTTGGTTTGTCTGGTGAAGGTGGTGAGAGGCCAAGTGTTACAAGGTATACTGTGGCTGTTACTTATAACAGGGGCTCAAGGGTACCCAGAATGCAAACCCGACTTCTCATACGCCATAGCCAAAAATGATGAGATTGGCCCACTTGGTGCCACAGGCCTCATCACTCAGTGGTACGAATACTCGGATGGGATGCGGCTACAGGACTCAGCAGTTGTAGTCTGGTGTGAAGCTGGGAAGTTAAGATACCTGACTAAATGTGAGAGGGAAGCCAGGTATCTGGCTGCTCTACACACGAGGGCCTTGCCGACATCTGTAGTATTCGAAAAAATTCTGGATGGAAAAAAACAGGAGGACATAGTAGAAATGGATGACAACTTTGAATTCGGCCTTTGCCCATGTGATGCTAGACCCTTGGTAAAAGGAAAATTTAATACAACACTTCTAAATGGGCCAGCCTTCCAGATGGTTTGCCCTATAGGATGGACTGGGACTATAATCTGTACTCTGGCCAATGAGGATACGCTAGCCACAACTGTTGTGCGAACGTATAAGAGGGTCAGGCCTTTTCCATATAGGCAGGACTGTGTCACCCAGAAAACCATTGGGGAAGACCTCTACAATTGTGTCTTAGGAGGGAATTGGACCTGTGTGCCGGGGGATGCACTACGATATGTAGCTGGGCCCGTTGAGTCTTGTAAGTGGTGTGGTTACAAGTTTTTTAAAAGTGAGGGTCTGCCGCATTACCCAATCGGCAAATGCAGGCTGAAGAATGAGAGTGGCTATAGACAAGTGGATGAGACTTCTTGCAACAGAGACGGCGTAGCTATAGTGTCATCTGGCCTGGTCAAATGCAAGATAGGGGACACAGTGGTGCAAGTCATTGCAATGGATGATAAACTAGGGCCCATGCCTTGCAAACCATATGAAATCATATCCAGTGAAGGGCCGGTGGAAAAGACGGCATGCACCTTCAACTACACAAGAACATTAAAAAACAAGTACTTTGAGCCTAGGGACAACTATTTCCAACAATACATGTTAAAGGGGGAATACCAATATTGGTTTGACCTAGAGATCACTGACCACCACCGGGATTACTTCGCTGAGTCCCTGCTGGTGATAGTAGTTGCGCTCTTGGGTGGCAGGTACGTGCTTTGGTTGCTGGTCTCATACATGGTCCTATCAGAACAAATGGCCTCGGGTGCCCAGTATGGGGCAGGTGAAATAGTGATGATGGGCAATTTGTTAACACATGACAGTGTTGAAGTGGTGACATATTTCTTACTACTATACCTACTACTAAAAGAGGAAAATATCAAAAAATGGGTCATACTTATATTCCACATTATAGTGATGCACCCACTAAAATCAGTGACAGTGATATTACTAATGGTTGGAGGGATGGTGAAGGCTGAACCAGGAGCCCAGGGGTACCTAGAGCAGGTAGACCTTAGTTTCACGATGATTACGATCATCGTAGTAGGTCTGGTTATAGCCAGGCGTGATCCCACTGTGGTGCCACTAGTGACAATAGTTGCGGCACTAAAAATCACAGGACTAGGCTTTGGGCCCGGAGTGGATGCAGCTATGGCAGTCCTCACCTTAACCCTATTGATGATTAGTTATGTGACAGACTACTTCAGGTATAAAAGGTGGATACAATGTATCCTCAGTTTAGTAGCCGGGGTGTTCCTTATTCGAAGCCTTAAACATCTAGGTGAAATCAAAACCCCTGAGCTGACCATACCGAACTGGAGGCCACTAACCTTCATACTATTATACCTGACATCAGCAACAGTTGTTACAAGATGGAAAGTTGACATAGCCGGCATACTACTGCAAGGGGCCCCAATCCTTCTGCTGATTGCCACCCTATGGGCCGATTTTCTAACCCTTGTTTTGATCCTACCCACCTACGAATTAGTCAAGTTGTACTACCTAAAGAACGTCAAGACTGACGTGGAAAAGAGTTGGCTAGGGGGGTTAGACTATAAGACAATTGATTCTGTTTATGACGTGGATGAAAGTGGAGAAGGCGTGTACCTCTTCCCATCCAGACAAAAAAAGAATAAGAATATCAGCATACTCTTGCCCCTAATCAGAGCTACGCTAATAAGTTGCATTAGCAGCAAATGGCAGATGGTGTATATGGCTTACCTAACCTTGGACTTTATGTACTACATGCACAGAAAGGTTATTGATGAGATATCAGGGGGTACCAACGTGATGTCTAGAGTGGTGGCAGCACTCATAGAGTTAAACTGGTCCATGGAAGAGGAGGAGAGCAGGGGTTTAAAGAAGTTTTTTATATTATCTGGAAGGTTGAGGAACCTTATAATAAAACATAAGGTTAGGAACCAAACTGTGGCAAGCTGGTATGGAGAGGAAGAAGTCTACGGCATGCCAAAGGTCGTGACCATAATAAGGGCTTGCACACTAAACAAGAATAAACACTGCATAATATGCACAGTATGTGAGGCTAGAAAGTGGAAGGGCGGCAACTGCCCTAAATGCGGCCGCCACGGGAAGCCCATCACTTGTGGTATGACTCTAGCGGATTTTGAAGAAAGGCACTACAAGAGAATTTTTATAAGAGAAGGTAACTTTGAAGGACCCTTCAGGCAGGAATACAGTGGGTTTGTACAATACACCGCTAGGGGGCAG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| 14,420 |
OR004809.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2105
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,039 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2021-02-04
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2105, complete genome
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GTATACGAGGTTAGGCAAGTTCTCGTATACATATTGGACATTCCAAAAAATAATTAGGTCTAGGGGAAAAATCCCCCTTAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAATAAGGGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTGAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCTTCAGAGGACAAGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCACAGCACATCTTAACCTGGACGGGGGTCGCTCAGGTGAAAACGGTTTAACCGACCGTTACGAATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTGAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCACTGGAGTGGAGGAACCAGTATACGACCAAGCTGGTAACCCTTTGTTTGGAGAAAGAGGAGTGATCCATCCGCAGTCAACGCTAAGACTGCCACATAAAAGAGGGGAGCGTGAAGTCCCCACCAATTTGGCTAACTTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGGTCGGGTAATACCAAGGGGCCTGTGAGTGGAATCTATTTAAAACCAGGGCCGGTATTCTACCAGGATTATAAAGGACCCGTTTATCATAGAGCCCCATTGGAGTTTTTTGAGGAAGCGTCAATGTGTGAGATAACCAAAAGAATTGGGAGAATAACTGGTAGTGACAGCAAATTGTACCACATTTATGTGTGTATTGATGGCTGCATAATAGTCAAGAGTGCTACAAAAGATCTTCAAAAAGTACTCAAATGGGTCCACAACAAGCTAAACTGCCCCCTGTGGGTTTCAAGCTGCTCCGATGCAAAGGATGAAGGGGCGGTGAGAAAGAAGCAACAAAAACCAGATAGGTTGGAAAAGGGGAGAATGAAGATAACACCTAAGGAGTCAGAGAAAGACAGTAAGACCAAGCCACCAGACGCCACGATAGTGGTAGATGGAGTCAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAAGTCAAGAGCAAGAATACCCAGGATGGCTTATATCACAACAAAAATAAACCTCAAGAGTCACGTAAGAAACTAGAGAAAGCCCTATTGGCCTGGGCAATAATAGCTTTGGTTTTATTCCAAGCCATAGCGGGAGAGAACATAACGCAATGGAACTTACAAGATAATGGAACAGAAGGAATACAACGAGCCATGTTTTTAAGAGGTGTGAATAGAAGTCTGCATGGGATCTGGCCAGAGAAAATTTGTGCGGGTGTTCCTTCCCACCTGGCCACTGACACAGAACTTAAAGCAATTCACGGTATGATGGATGCAAGTGAGAAGACAAATTATACATGCTGCAGACTCCAACGCCATGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAATATTGAACCTTGGATCCTTCTTATGAATAAAACTCAGGCCAACCTTACCGAGGGTCAACCACTAAGGGAATGTGCCGTCACATGCCGGTATGACCGAGATAGTGACCTGAATGTAGTAACACAAGCTAGAGATAGCCCCACACAACTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCCTTTGCAGGTATATTGGTACAAGGGCCTTGCAATTTTGAAATAGCCGTAAGTGATGTGCTGTTTAAAGAGCATGATTGCACTAGTGTGATTGAAGACACAGCCCACTACCTCGTATACGGGATGACCAACACCCTAGAGAGTGCTAGGCAAGGGACCGCTAAACTAACAACTTGGCTAGGCAGGCAGCTTGGGACACTAGGAAAGAAGCTGGAAAACAAGAGTAAGACATGGTTTGGGGCATATGCAGCTTCTCCCTACTGTGAGGTAGAACGGAAGCTTGGTTACATCTGGTATACAAAGAATTGTACTCCTGCCTGTTTGCCGGAAAATACAAAGATCATTGGCCCCGGTAGGTTCGACACTAACGCTGAAGATGGTAAAATATTGCATGAGATGGGGGGTCACTTGTCCGAGGTGCTACTACTTTCGGGGGTGGTGCTGTCTGATTTCGCTCCAGAGACAGCTAGCTTGATATACTTGGTCCTTCACTTCTCCATCCCACAAGGGCACAATGATATACAAGATTGTGACAAAAACCAACTAAACCTCACCGTGGAACTCACAACAGCAGAAATAATACCAGGGTCAGTTTGGAATCTGGGAAAATATGTTTGTATAAGACCAGATTGGTGGCCTTACGAGACAGCCACGGTCTTGGCGTTTGAAGAGATGGGTCAAGTAATCAAGATTGTCTTAAGGGCGTTAAGAGATCTGACGCGCATTTGGACCGCTGCTACAACCACTGCATTCTTGGTTTGTCTGGTGAAGGTGGTGAGAGGCCAAGTGTTACAAGGTATACTGTGGCTGTTACTTATAACAGGGGCTCAAGGGTACCCAGAATGCAAACCCGACTTCTCATACGCCATAGCCAAAAATGATGAGATTGGCCCACTTGGAGCCACAGGCCTCATCACTCAGTGGTACGAATACTCGGATGGGATGCGGCTACAGGACTCAGCGGTTGTAGTCTGGTGTGAAGCTGGGAAGTTAAGATACCTGACTAAATGTGAGAGGGAAGCCAGGTATCTGGCTGCTCTACACACGAGGGCCTTGCCGACATCTGTAGTATTAGAAAAAATTCTGGATGGAAAAAAACAGGAGGACATAGTAGAAATGGATGACAACTTTGAATTTGGCCTTTGCCCATGTGATGCTAGACCCTTGGTAAAAGGAAAATTTAATACAACACTTCTAAATGGGCCAGCCTTCCAGATGGTTTGCCCTATAGGATGGACTGGGACTATAATCTGTACTCTGGCCAATGAGGATACGCTAGCCACAACTGTTGTGCGAACGTATAAGAGGGTCAGGCCTTTTCCATATAGGCAGGACTGTGTCACCCAGAAAACCATTGGGGAAGACCTCTACGATTGTGTCTTAGGAGGGAATTGGACCTGTGTGCCGGGGGATGCACTACGATATGTAGCTGGGCCCGTTGAGTCTTGTAAGTGGTGTGGTTACAAGTTTTTTAAAAATGAGGGTCTGCCGCATTTCCCAATCGGCAAATGCAGGCTGAAGAATGAGAGTGGCTATAGACAAGTGGATGAGACTTCTTGCAACAGAGACGGCGTAGCTATAGTGTCATCTGGCCTGGTCAAATGCAAGATAGGGGACACAGTGGTGCAAGTCATTGCAATGGATGATAAACTAGGGCCCATGCCTTGCAAACCATATGAAATCATATCCAGTGAAGGGCCGGTGGAAAAGACGGCATGCACCTTCAACTACACAAGAACATTAAAAAACAAGTACTTTGAGCCTAGGGACAACTATTTCCAACAATACATGTTAAAGGGGGAATACCAATATTGGTTTGACCTAGAGATCACTGACCACCACCGGGATTACTTCGCTGAGTCCCTGCTGGTGATAGTAGTTGCGCTCTTGGGTGGCAGGTACGTGCTTTGGTTGCTGGTCTCATACATGGTCCTATCAGAACAAATGGCCTCGGGTGCCCAGTATGGGGCAGGTGAAATAGTGATGATGGGCAATTTGTTAACACATGACAGTGTTGAAGTGGTGACATATTTCTTACTACTATACCTACTACTAAAAGAGGAAAATATCAAAAAATGGGTCATACTTATATTCCACATTATAGTGATGCACCCACTAAAATCAGTGACAGTGATATTACTAATGGTTGGAGGGATGGTGAAGGCTGAACCAGGAGCCCAGGGGTACCTAGAGCAGGTAGACCTTAGTTTCACGATGATTACGATCATCGTAGTAGGTCTGGTTATAGCCAGGCGTGATCCCACTGTGGTGCCACTAGTGACAATAGTTGCGGCACTAAAAATCACAGGACTAGGCTTTGGGCCCGGAGTGGATGCAGCTATGGCAGTCCTCACCTTAACCCTATTGATGATTAGTTATGTGACAGACTACTTCAGGTATAAAAGGTGGATACAAGTTCCTTCCCGTTTAGTAGCCGGGGTGTTCCTTATTCGAAGCCTTAAACATCTAGGTGAAATCAAAACCCCTGAGCTGACCATACCGAACTGGAGGCCACTAACCTTCATACTATTATACCTGACATCAGCAACAGTTGTTACAAGATGGAAAGTTGACATAGCCGGCATACTACTGCAAGGGGCCCCAATCCTTCTGCTGATTGCCACCCTATGGGCCGATTTTCTAACCCTTGTTTTGATCCTACCCACCTACGAATTAGTCAAGTTGTACTACCTAAAGAACGTCAAGACTGACGTGGAAAAGAGTTGGCTAGGGGGGTTAGACTATAAGACAATTGATTCTGTTTATGACGTGGATGAAAGTGGAGAAGGCGTGTACCTCTTCCCATCCAGACAAAAAAAGAATAAGAATATCAGCATACTCTTGCCCCTAATCAGAGCTACGCTAATAAGTTGCATTAGCAGCAAATGGCAGATGGTGTATATGGCTTACCTAACCTTGGACTTTATGTACTACATGCACAGAAAGGTTATTGATGAGATATCAGGGGGTACCAACGTGATGTCTAGAGTGGTGGCAGCACTCATAGAGTTAAACTGGTCCATGGAAGAGGAGGAGAGCAGGGGTTTAAAGAAGTTTTTTATATTATCTGGAAGGTTGAGGAACCTTATAATAAAACATAAGGTTAGGAACCAAACTGTGGCAAGCTGGTATGGAGAGGAAGAAGTCTACGGCATGCCAAAGGTCGTGACCATAATAAGGGCTTGCACACTAAACAAGAATAAACACTGCATAATATGCACAGTATGTGAGGCTAGAAAGTGGAAGGGCGGCAACTGCCCTAAATGCGGCCGCCACGGGAAGCCCATCACTTGTGGTATGACTCTAGCGGATTTTGAAGAAAGGCACTACAAGAGAATTTTTATAAGAGAAGGTAACTTTGAAGGACCCTTCAGGCA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| 14,421 |
OR004810.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2106
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,007 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2021-01-30
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2106, complete genome
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TTGGGCCCTCCAAAAAAAATAATTAGGTCTAGGGAAAAATCCCCCTTAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAATAAGGGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTGAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCTTCAGAGGACAAGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCACAGCACATCTTAACCTGGACGGGGGTCGCTCAGGTGAAAACGGTTTAACCGACCGTTACGAATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTGAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCACTGGAGTGGAGGAACCAGTATACGACCAAGCTGGTAACCCTTTGTTTGGAGAAAGAGGAGTGATCCATCCGCAGTCAACGCTAAGACTGCCACATAAAAGAGGGGAGCGTGAAGTCCCCACCAATTTGGCTAACTTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGGTCGGGTAATAGCAAGGGGCCTGTGAGTGGAATCTATTTAAAACCAGGGCCGGTATTCTACCAGGATTATAAAGGACCCGTTTATCATAGAGCCCCATTGGAGTTTTTTGAGGAAGCGTCAATGTGTGAGATAACCAAAAGAATTGGGAGAATAACTGGTAGTGACAGCAAATTGTACCACATTTATGTGTGTATTGATGGCTGCATAATAGTCAAGAGTGCTACAAGAGATCGTCAAAAAGTACTCAAATGGGTCCACAACAAGCTAAACTGCCCCCTGTGGGTTTCAAGCTGCTCCGATGCAAAGGATGAAGGGGCGGTGAGAAAGAAGCAACAAAAACCAGATAGGTTGGAAAAGGGGAGAATGAAGATAACACCTAAGGAGTCAGAGAAAGACAGTAAGACCAAGCCACCAGACGCCACGATAGTGGTAGATGGAGTCAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAAGTCAAGAGCAAGAATACCCAGGATGGCTTATACCACAACAAAAATAAACCTCAAGAGTCACGTAAGAAACTGGAGAAAGCCCTATTGGCCTGGGCAATAATAGCTCTGGTTTTATTCCAAGCCATAGCGGGAGAGAACATAACGCAATGGAACTTACAAGATAATGGAACAGAAGGAATACAACGAGCCATGTTTTTAAGAGGTGTGAATAGAAGTCTGCATGGGATCTGGCCAGAGAAAATTTGTGCGGGTGTTCCTTCCCACCTGGCCACTGACACAGAACTTAAAGCAATTCACGGTATGATGGATGCAAGTGAGAAGACAAATTATACATGCTGCAGACTCCAACGCCATGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAATATTGAACCTTGGATCCTTCTTATGAATAAAACTCAGGCCAACCTTACCGAGGGTCAACCACTAAGGGAATGTGCCGTCACTTGCCGGTATGACCGAGATAGTGACCTGAATGTAGTAACACAAGCTAGAGATAGCCCCACACAACTGACAGGCTGTAAGAAAGGCAAGAACTTTTCCTTTGCAGGTATATTGGTACAAGGGCCTTGCAATTTTGAAATAGCCGTAAGTGATGTGCTGTTTAAAGAGCATGATTGCACTAGTGTGATTGAAGACACAGCCCACTACCTCGTAGACGGGATGACCAACACCCTAGAGAGTGCTAGGCAAGGGACCGCTAAACTAACAACTTGGCTAGGCAGGCAGCTTGGGATACTAGGAAAGAAGCTGGAAAACAAGAGTAAGACATGGTTTGGGGCATATGCAGCTTCTCCCTACTGTGAGGTAGAACGGAAGCTTGGTTACATCTGGTATACAAAGAATTGTACTCCTGCCTGTTTGCCTAAGAATACAAAGATCATTGGCCCCGGTAGGTTCGACACTAACGCTGAAGATGGTAAAATATTGCATGAGATGGGGGGTCACTTGTCCGAGGTGCTACTACTTTCAGTGGTGGTGCTGTCTGATTTCGCTCCAGAGACAGCTAGCTTGATATACTTGGTCCTTCATTTCTCCATCCCACAAGGGCACACTGATATACAAGATTGTGACAAAAACCAACTAAACCTCACCGTAGAACTCACAACAGCAGAAATAATACCAGGGTCAGTTTGGAATCTGGGAAAATATGTTTGTATAAGACCAGATTGGTGGCCTTACGAGACAGCCACGGTCTTGGCGTTTGAAGAGATGGGTCAAGTAATCAAGATTGTCTTAAGGGCGTTAAGAGATCTGACGCGCATTTGGACCGCTGCTACAACCACTGCATTTTTGGTTTGTCTGGTGAAGGTGGTGAGAGGCCAAGTGTTACAAGGTATACTGTGGCTGTTACTTATAACAGGGGCTCAAGGGTACCCAGAATGCAAACCCGACTTCTCATACGCCATAGCCAAAAATGATGAGATTGGCCCACTTGGAGCCACAGGCCTCATCACTCAGTGGTACAAATACTCGGATGGGATGCGGCTACAGGACTCAGCAGTTGTAGTCTGGTGTGAAGCTGGGAAGTTAAGATACCTGACTAAATGTGAGAGGGAAGCCAGGTATCTGGCTGCTCTACACACGAGGGCCTTGCCGACATCTGTAGTATTCGAAAAAATTCTGGATGGAAAAAAACAGGAGGACATAGTAGAAATGGATGACAACTTTGAATTCGGCCTTTGCCCATGTGATGCTAGACCCTTGGTAAAAGGAAAATTTAATACAACACTTCTAAATGGGCCAGCCTTCCAGATGGTTTGCCCTATAGGATGGACCGGGACTATAACCTGTACTCTGGCCAATGAGGATACGCTAGCCACAACTGTTGTGCGAACGTATAAGAGGGTCAGGCCTTTTCCATATAGGCAGGACTGTGTCACCCAGAAAACCATTGGGGAAGACCTCTACGATTGTGTCTTAGGAGGGAATTGGACCTGTGTGCCGGGGGATGCACTACGATATGTAGCTGGGCCCGTTGAGTCTTGTAAGTGGTGTGGTCACAAGTTTTTTAAAAGTGAGGGTCTGCCGCATTACCCAATCGGCAAATGCAGGCTGAAGAATGAGAGTGGCTATAGACAAGTGGATGAGACTTCTTGCAACATAGACGGCGTAGCTATAGTGTCATCTGGCCTGGTCAAATGCAAGATAGGGGACACAGTGGTGCAAGTCATTGCAATGGATGATAAACTAGGGCCCATGCCTTGCAAACCATATGAAATCATATCCAGTGAAGGGCCAGTGGAAAAGACGGCATGCACCTTCAACTACACAAGAACATTAAAAAACAAGTACTTTGAGCCTAGGGACAACTATTTCCAACAATACATGTTAAAGGGGGAATACCAATATTGGTTTGACCTAGAGATCACTGACCACCACCGGGATTACTTCGCTGAGTCCCTGCTGGTGATAGTAGTTGCGCTCTTGGGTGGCAGGTACGTGCTTTGGTTGCTGGTCTCATACATGGTCCTATCAGAACAAATGGCCTCGGGTGCCCAGTATGGGGCAGGTGAAATAGTGATGATGGGCAATTTGTTAACACATGACAGTGTTGAAGTGGTGACATATTTCTTACTACTATACCTACTACTAAAAGAGGAAAATATCAAAAAATGGGTCATACTTATATTCCACATTATAGTGATGCACCCACTAAAATCAGTGACAGTGATATTACTAATGGTTGGAGGGATGGTGAAGGCTGAACCAGGAGCCCAGGGGTACCTAGAGCAGGTAGACCTTAGTTTCACGATGATTACGATCATCGTAGTAGGTCTGGTTATAGCCAGGCGTGATCCCACTGTGGTGCCACTAGTGACAATAGTTGCGGCACTAAAAATCACAGGACTAGGCTTTGGGCCCGGAGTGGATGCAGCTATGGCAGTCCTCACCTTAACCCTATTGATGATTAGTTATGTGACAGACTACTTCAGGTATAAAAGGTGGATACAAGACCTTCAGAGTTTAGTAGCCGGGGTGTTCCTTATTCGAAGCCTTAAACATCTAGGTGAAATCAAAACCCCTGAGCTGACCATACCGAACTGGAGGCCACTAACCTTCATACTATTATACCTGACATCAGCAACAGTTGTTACAAGATGGAAAGTTGACATAGCCGGCATACTACTGCAAGGGGCCCCAATCCTTCTGCTGATTGCCACCCTATGGGCCGATTTTCTAACCCTTGTTTTGATCCTACCCACCTACGAATTAGTCAAGTTGTACTACCTAAAGAACGTCAAGACTGACGTGGAAAAGAGTTGGCTAGGGGGGTTAGACTATAAGACAATTGATTCTGTTTATGACGTGGATGAAAGTGGAGAAGGCGTGTACCTCTTCCCATCCAGACAAAAAAAGAATAAGAATATCAGCATACTCTTGCCCCTAATCAGAGCTACGCTAATAAGTTGCATTAGCAGCAAATGGCAGATGGTGTATATGGCTTACCTAACCTTGGACTTTATGTACTACATGCACAGAAAGGTTATTGATGAGATATCAGGGGGTACCAACGTGATGTCTAGAGTGGTGGCAGCACTCATAGAGTTAAACTGGTCCATGGAAGAGGAGGAGAGCAGGGGTTTAAAGAAGTTTTTTATATTATCTGGAAGGTTGAGGAACCTTATAATAAAACATAAGGTTAGGAACCAAACTGTGGCAAGCTGGTATGGAGAGGAAGAAGTCTACGGCATGCCAAAGGTCGTGACCATAATAAGGGCTTGCACACTAAACAAGAATAAACACTGCATAATATGCACAGTATGTGAGGCTAGAAAGTGGAAGGGCGGCAACTGCCCTAAATGCGGCCGCCACGGGAAGCCCATCACTTGTGGTATGACTCTAGCGGATTTTGAAGAAAGGCACTACAAGAGAATTTTTATAAGAGAAGGTAACTTTGAAGGACCCTTCAGGCAGGAATACAGTGGGTTTGTACAATACACCGCTA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GCCTACCAACTAGCTCAGGGAAACTGGGAGCCCCTCGATTGTGGAGTTCACCTGGGCACCATACCTGCCAGGAGGGTAAAAATCCACCCATATGAAGCCTACCTGAAACTGAAGGATTTATTAGAAGAAGAAGAAAATAAACCAAAGTGTAGAGATACAGTAATAAGAGAGCATAACAAGTGGATCCTCAAAAAAGTGAGGCACCAAGGGAATCTTAACACAAAGAAAATCCTCAACCCTGGAAAGCTATCAGAGCAGCTAGATAGAGAAGGGCATAAAAGAAACATATATAATAACCAGATTGGCACTATAATGACAGGAGCAGGAATAAGGCTAGAAAAATTACCAATAGTTAGAGCCCAGACTGACACTAAAAATTTCCATGAGGCAATTAGAGATAAGATAGACAAGAATGAAAATCAGCAGAGCCCAGGGCTGCATGATAAATTGTTAGAGATCTTTCATACAATAGCCCAACCTAGCCTAAGACACACCTATGGTGAAGTGACGTGGGATCAACTTGAGGCAGGGATTAATAGAAAAGGGGCTGCAGGCTTTCTAGAGAAGAAGAATGTTGGAGAAGTACTGGACTCAGAGAAGCACCTGGTGGAACAATTGATCAGAGATTTGAAAACAGGAAGGAAGATAAGATATTATGAGACAGCAATACCAAAAAATGAGAAGAGAGATGTCAGTGATGATTGGCAATCGGGGGATATAGTTGATGAGAAGAAACCAAGAGTGATTCAATACCCTGAGGCTAAGACAAGACTAGCCATTACTAAAGTAATGTACAACTGGGTGAAGCAGCAGCCTGTCGTGATCCCAGGGTATGAAGGGAAGACCCCATTATTCAACATCTTCAACAAGGTGAGGAAGGAATGGGATTTGTTTAATGAACCAGTAGCTGTGAGTTTCGACACTAAGGCTTGGGACACCCAAGTAACTAGTAGAGATCTACGGCTTATTGGTGAAATTCAAAAATATTACTACAAGAAAGAGTGGCACAAATTCATCGACACCATTACTGACCATATGGTGGAGGTGCCCGTCATAACAGCAGACGGCGAGGTATACATAAGAAATGGACAAAGGGGTAGTGGCCAGCCAGACACAAGTGCAGGCAACAGCATGCTAAATGTGTTAACAATGATGTATGCCTTCTGTGAAAGTACGGGGGTTCCATATAAAAGTTTCAATAGGGTAGCAAGGATCCATGTCTGCGGGGATGACGGCTTCCTAATAACTGAGAAGGGACTGGGATTAAAATTTGCCAACAATGGGATGCAAATTCTGCATGAAGCGGGCAAACCCCAAAAGATAACCGAAGGGGAAAGAATGAAAGTAGCCTATAGGTTTGAGGACATAGAATTTTGCTCTCATACACCAGTCCCCGTTAGGTGGTCTGATAACACCAGCAGTTACATGGCCGGTAGAGATACTGCCGTTATATTATCAAAAATGGCAACAAGATTGGATTCAAGTGGAGAAAGGGGTACTATAGCATATGAAAAAGCAGTGGCTTTTAGTTTCTTGCTGATGTACTCCTGGAACCCTCTCGTGAGGAGGATCTGTTTACTGGTTCTTTCACAGCAGCCAGAGACAACTCCATCAACCCAGGCCACTTACTATTACAAAGGAGACCCAATAGGAGCCTACAAAGAAGTAATAGGTAAGAACTTGATTGAATTAAAAAGGACGGGTTTTGAAAAATTGGCTAATCTAAACTTAAGCCTGTCCACTTTAGGAATCTGGTCCAAACATACAAGTAAAAGAATTATCCAAGACTGTGTAACCATCGGGAGAGAGGAAGGCAATTGGCTGGTCAATGCCGATAGGCTGATATCCAGCAAAACTGGCCATTTGTACATACCTGACAAAGGTTATACATTACAAGGGAAACATTATGAACAACTTCAGCTGCAGGCGAGAACTAGCCCGGTTATTGGAGTAGGGACAGAGAGATACAAACTAGGCCCTATAGTAAACCTGCTGCTGAGGAGGTGA
| 14,422 |
OR004811.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2107
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,038 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2021-01-30
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2107, complete genome
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| 14,423 |
OR004812.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2108
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,001 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2021-01-31
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2108, complete genome
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| 14,424 |
OR004813.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wu,Y., Zhang,G., Jiang,H., Xin,T., Jia,L., Zhang,Y., Yang,Y., Qin,T., Xu,C., Cao,J., Ameni,G., Ahmad,A., Ding,J., Li,L., Ma,Y., Fan,X., Yuan,L.
|
Hebei Agricultural University, Veterinary Medicine
|
China
|
2023-08-01
|
TJ2109
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,038 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
blood
|
2020-12-31
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate TJ2109, complete genome
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| 14,425 |
OP661170.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Zhao,F.M., Guo,T., Hao,Y.Q.
|
Inner Mongolia Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-05-02
|
HH839
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,213 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2021
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate HH839, complete genome
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GGAAAAGCTCCTGTATACAGATTGGGCAATTAAAAATTGAAGATTAGGCCTAGGGAAAAATCCCTCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAATGAGAGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCATTGGATGGCTGAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACACCTCGGAAAGAAGGTCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCACAGCACATCTTAACCTGGACGGGGGTCGCCCAGGTAAAAGCAGTTTAACTAACTGTTATGGACACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGCATTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTACAAATGAACTTTTATACAAAACATATAAACAAAAACCCGCTGGAGTGGAGGAGCCAGTCTACGACCGGACAGGCAACCCCTTGTTTGGCGAAAGGGGGCCAATACACCCACAATCAACATTGAAACTACCACACAAGAGAGGAAAAAATGAAATTCCCACCAATTTGGCATCCCTACCTAGAAAAGGTGACTGCAGATCAGGCAATAGTAGAGGGTCTGTGAGTGGTATCTATGTAAAACCAGGGCCGCTGTTTTACCAAGATTACATTGGACCTGTCTACCATAGGGCCCCATTGGAGTTCTTTGAAGAAGGGTCTATGTGTGAAACAACTAAAAGGATTGGGAGGACAACTGGTAGTGATGGTAAGTTGTACCACATTTATGTGTGTATAGATGGATGCATATTGATAAAAAGCGCCACAAGATACCACCAAAAGGTGCTTAGATGGGTCCACAACAAACTCAACTGCCCCCTGTGGGTAACAAGTTGCTCTGATACAAAAGAAGAAGGTGCAAAAAAGAAACAACAGAAACCAGACAGGGTGGAAAAGGGGCGTTTGAAGATAACACCTAAGGAAGCTGAGAAAGATAGCAGGACCAAACCGCCTGATGCTACGATAGTAGTGGACGGGGTTAAATACCAGGTGAAGAAGAAGGGTAAGGTCAAGAGCAAAAACACCCAAGATGGCTTGTACCACAATAAAAATAAACCACAAGAGTCACGCAAGAAGCTGGAGAAGGCTCTATTGGCTTGGGCAATACTAGCTGCAGTCTTATTTCAGGTCACAATGGGAGAAAACATAACACAGTGGAATCTACAAGACAATGGAACAGAAGGGATACAACGGGCAATGTTTGAAAGAGGTGTCAATAGGAGTCTACGTGGAATTTGGCCAGAAAAAATCTGTACAGGTATCCCATCTCACTTAGCTACCGATATAGAGTTGAAGAGAATCCATGGTATGATGGACGCGAGTGAGAAGACCAACTACACATGTTGCAGGCTTCAACGTCATGAGTGGAATAAACATGGTTGGTGCAACTGGTACAATATCGAGCCTTGGATTCTGCTCATGAATGAGACCCAGGCTAACCTCACTGAAGGCCAACCACAAAGAGAATGTGCCGTCACCTGCAGGTATGACAAGAGTAGTGACCTGAACATAGTTACACAGGCCAGAAATAGCCCGACACCACTGACAGGCTGTAAAAAAGGGAAGAATTTCTCTTTTTCAGGCATAGTAATCAAAGGTCCCTGTAATTTTGAAATAACCGCAAGCGACGTACTGTTCAAAGAACATGATTGCACAAACATATTTCATGATACTGCTCATTACCTAGTTGACGGGATGACTAACTCTCTAGAGAGTACTAGGCAAGGGACCGCAAAACTAACAACTTGGTTGGGAAAACAACTTGGGATACTAGGAAAGAAACTAGAGAACAAGAGCAAGACATGGTTCGGGGCTTACGCATCTTCCCCTTACTGTGATGTGGAACGAAAGCTTGGTTACATCTGGTTTACAAAAAATTGCACCCCTGCCTGTCTCCCAAAAAATACAAAAATAGTTGGTCCCGGGAAGTTCGACACCAATGCTGAGGACGGAAAAATATTGCATGAAATGGGAGGTCACTTGTCGGAGGTACTATTACTTTCATTGGTAGTGCTATCCGATTTCGCACCAGAGACAGCTAGTGCAATGTATCTAGTCCTACACTTTTCCATCCCACAAAGACATACTGATACACTGGACTGTGATAAGAGTCAACTAAACCTTACCGTGGGGGTCACAACAGCAGATGTGATACCAGGATCAGTCTGGAATTTGGGCAAATGGGTCTGTATAAGACCTGATTGGTGGCCTTATGAAACAGCTACAGTACTGGCTTTTGAAGAGGCAGGGCAAGTAGTAAGGATAGCATTGAGGGCACTCAGAGACTTGACGCGCATCTGGAACGCAGCCACAACCACTGCATTTCTGGTATGCCTAGTAAAAGTGGTGAGGGGTCAGGTAGTACAAGGAGTAATATGGCTGCTACTAATAACAGGGGCGCAAGGACACCTAAATTGCAAGCCTGACTTTTCATATGCCATAGCCAAAGATGAAAGGATTGGTCTACTGGGAGCCGAAGGTCTCACCACCACCTGGTATGATTACTCAGATGGGATGCAGATAAGTGACACAATGGTTGAGATTCGGTGCAAGGGTGGTGAGTTTACATTCGTCCGAAAGTGCAAGACAGAAACCAGGTATTTGGCCACCTTGCATACACGAGCCTTACCAACATCAGTAGTATTTGAAAAACTCTTTGATGGACAGAAATCAGCAGACATAATTGAAATGGATGACAACTTTGAATTTGCGATTTGCCCATGTGATGCAAAACCTGTAGTAAGAGGGAAATTCAACACAACACTACTAAATGGGCCAGCCTTTCAGATGGTGTGCCCCATAGGATGGACAGGAACTGTGAACTGCGTCCTAACCAATAAGGACACTCTGGACATGGTTGTAGTGCGGACGTATAAGAGGGTCAGCCCATTCCCTAATAGGCAAGGTTGTGTCACTCAAAAACTTCTGGGGGAAGACCTCTATGACTGTACTCTTGGAGGAAACTGGACTTGTATAGCAGGGGAACAGCTACATTACACAGGGGGTACCATAGAATCCTGTAAGTGGTGCGGCTATAGTTTTTTGAAGAGTGAAGGGCTACCACACTATCCAATTGGCAAATGTAGACTAAAAAACGAAACCGGCTACAGGCTGGTAGACGAAACCTCTTGCAATAGGGATGGTGTAGCAATAGTGCCACACGGAACCCTGAAGTGTAGAATTGGAGACACAGTGGTGCAGGTCGTAGCAATGGACACAAAACTTGGGCCTATGCCTTGCAAACCACATGAAATCACACCTAGTGAGGGGCCAGTGGAAAAGACAGCATGCACATTTAATTATACGAAGACCTTAAAGAACAAGTATTTTGAGCCCAGGGACAACTACTTCCAGCAATACATGCTAAAAGGGGACTACCAATATTGGTTTGATCTGGAGGTCAACGACCACCATCGAGATTACTTCACAGAGTTCTTGCTGGTCGTGGTGGTAGCCTTGTTGGGTGGGAGGTACGTGCTTTGGCTGCTGGTCACGTATCTCGTCCTGTCAGAACAGAATGCCTCAGGAACTCAGTATGGGGCAGGAGAAATAGTGATGATGGGTAACTTGTTGACACATGACAGCATTGAGGTAACAACATACTTTCTACTGCTATATCTGTTGCTAAGAGAAGAGAGCATCAGGAAGTGGATTATACTCTTATTCCACGTCTTTGTGGAACACCCACTAAAATCAGTGACAGTGGTGCTACTAATGGTCGGAGGGGCCGTGAAGGCCGAGCCGGAGACCCAGGGGTTCATAGAGCGGGCAGACCTCAGCTTCACATTGGTTGTACTCATTGTTATAGGTCTAGTCATGGCTAGGCGTGACCCAACTGTGGTACCACTAGTTACCGTAGTGGCGTCGCTAAGAACCATGGGAATAAGCTCTGGACCCGGAGTGGATGCAGCCATGGCTGTCCTGACACTAGCCCTTCTGGTGATCAGCTATATAACAGATTACTTCAGATACAAGAGGTGGTTACAATGCATTGTCAGCCTAGTAGCAGGGGTGTTCCTGATCAGAACCCTGAAACACCTGGGTGAAATCGAGGTGCCCGGGATGACGATCCCTAGCTGGAGGCCTTTGACCTTTATATTATTATACCTAATTTCGACAACAGTTGTCACCAGGTGGAAGGTTGACATAGCTGGCCTGTTGTTGCAGGGGGTACCCATCCTACTTCTGATTACTACGCTGTGGGCCGACCTCTTGACTCTTATATTAATCCTGCCCACCTACGAACTAGTAAAATTGTATTACTTAAAAGCAGTCAAAACTGATGTAGAAAAGAGCTGGTTGGGGGGGTTGGTCTACCAAAGTGTCAACACCATCTATGATGTGGACGAGAGTGGAGAGGGTGTATATCTCTTCCCATCCAGACAGAAGACACATAAGGGTTGCAGCATACTCTTGCCCCTTGTCAGAGCAACACTGATAAGTTGTGTTAGTAGCAAATGGCAGATGGTATACATGTCTTATCTGGCAGTAGACTTTATGTACTATATGCATAGGAAGATCATTGAAGAAATCGCAGGAGGAACCAACATGATCTCCAGGATAGTAGCAGCACTCATAGAACTAAACTGGTCCATGGAAGGTGAAGAAAGTAAGGGCTTAAAGAAGTTCTTTTTACTATCTGGGAGGCTGAAGAATCTGATAATAAAGCACAAAGTAAGGAATGAGACAGTAGCAAGATGGTATGGAGAGGAAGAAGTCTACGGCATGCCAAAAATTATGACTATAATCAAGGCTAGCACGCTGAATAGAAATAAGCACTGCATAATATGCACAGTGTGTGAGGGCAAGAAGTGGAAAGGAGGTAGCTGCCCTAAATGTGGGCGTCACGGAAAACCCATAACATGTGGGATGACACTGGCAGACTTTGAAGAAAAGCACTACAAGAAGATTTTTATAAGAGAAGGGAACTTTGAAGGGCCTTTTAGACAAGAGTACAGTGGTT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| 16,215 |
ON098979.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wang,H.
|
Northwest Minzu University
|
China
|
2023-01-25
|
21NX-300
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,149 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2021-05
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate 21NX-300, complete genome
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ATGCCATGCCTTTAGTAGGACTAGCATGATGAGGGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTTAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCCTTGGCACAACAAGGTCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCACGCCCAAAGCACATCTTAACCTGAGCGGGGGTCGCTCAGGCAAAAGCGGTCAAACCGACTGCTACGGATACAGCCTGATAGGGTGATGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCTGTAGGAGTGGAGGAACCAGTTTATGATCGGGGAGGGAACCCTTTATTTGGTGAGAAGGGGACAGTCCACCACCAATCGACGCTAAAGCTCCCACATAAGAGAGGAGAGCGCGAAGTCCCTACCAATTTGGTGTCCCTACCGAAGAGAGGTGACTGCAGATCGGGTAACAATAGAGGTCCTGTGAGCGGAATCTATCTTAAGCCAGGGCCACAATTCTACCAGGACTATGTAGGGCCGGTCTACCACAGAGCCCCGCTGGAGCTATTCGAGGAAGGGTCTATGTGTGAAACAACCAAACGGATAGGGAGAGTGACTGGCAGTGATAGCAAGCTATACCATATTTATGTGTGTATAGATGGATGTATAATAGTGAAGAGTGCCACGAGAAGTAACCAGAGGGTATTGAGATGGGTCCACAACAAGCTCAACTGCCCTCTATGGCCTGCTCAGTCAGTGACGAAAGAAGAAGGAGCAACTAGGAAGAAACAACAAAAACCGGATAGGTTAGAAAAGGGTAAAATGAAGATAACACCCAGAGAATCCGAGAAGGATAGCAGGACTAAACCACCAGATGCTACGATAGTAGTGGATGGGGTCAAGTACCAGGTAAAGAAGAAGGGGAAAGTCAAAAGCAAAAACACCCAGGATGGTTTGTACCACAACAAGAACAAGCCACCAGAGTCACGCAAGAAACTAGAGAAAGCCCTGTTAGCGTGGGCAATACTGACTATCGTTTTGTTCCAAGCCACGGTGGGCGAAAACATAACACAGTGGAACTTACAGGATAAGGGAACAGAAGGGATACAACGGGCGATGTTCCAAAGGGGTGTCAATAGGAGCCTACATGGGATCTGGCCAGAGAAAATCTGTACAGGTGTCCCATCCCATCTAGCCACTGATATGGAATTAAAAGCAATTCATGGTATGATGGATGCAAGTGAAAAGACCAACTACACATGTTGCAGACTCCAGCGCCACGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGCAACTGGTACAACATTGAGCCTTGGATTTTAATCATGAACAAGACCCAAGCTAATCTAACAGAGGGTCAACCATCAAGAGAGTGCGCCGTCACGTGCAGGTATGACAGAGATAATGACATAAATGTAGTAACACAAGCTAGAAACAGACCCACGCTACTGACAGGTTGCAAGAAAGGAAAGAACTTCTCCTTTGCAGGAATATTGATGCAGGGTCCTTGCAACTTTGAGATAGCGGCTAGTGATGTGCTGTTTAAAGAACACGACTGCACTAATGTACTTCAGGATACTGCTCATTACCTTGTCGACGGGATGACCAACTCCTTAGAGAGTGCCAGGCAAGGGACCGCCAAGCTAACAACTTGGTTGGGAAGGCAGCTTGGGATACTAGGGAAAAAGCTGGAGAACAAGAGTAAGACATGGTTCGGGGCATATGCGGCCTCCCCATACTGTGATGTTGAACGAAAACTCGGCTACATCTGGTATACAAAAAATTGCACACCAGCCTGCTTGCCCAAGAACACGAAAATCATAGGCCCCGGGATGTTTGACACCAATGGAGATGATGGTAAAATATTGCATGAGATGGGGGGCCACTTGTCTGAAGTACTACTACTCTCTCTAGTGGTGCTGTCTGACTTTGCCCCAGAAACAGCTAGCGCAATGTACCTGATACTGCATTTTTCTATCCCGCAAAGCCACACTGATGTAACGGACTGTGATAAGGACCAGTTGAATCTCACTATAGGACTCACAACAGCAGATGTGGTGCCAGGGTCAGTCTGGAATGTGGGTAAATACGTCTGTATAAGGCCAGACTGGTGGCCTTATGAGACAGCTACTGTGCTGGCATTTGAAGAAGTTGGGCAGGTGGTAAAGATTGCATTGAGGGCATTGAGAGACTTAACACGCATATGGGATGCTGCTACCACTACCGCATTCCTGGTGTGTCTAGTTAAGGTGGTGAGGGGCCAGGTGCTGCAGGGCATCCTGTGGCTACTGCTGATTACAGGGGTACAGGGCTACCACGACTGTAGACCTGATTTCTCATATGCCATAGCAAAGGATGAAAGGATCGGCCTGTTAGGTGCCGAAAGCCTTACCACCGTCTGGAAGGAATACTCTCCCAGAATGAAGTTGGAAGATACAATGGTTGTAGCCTGGTGCAAAGATGGTCAGTTTACATTCATGGAAAGGTGTGCAAGAGAAGCCAGATATCTTGCCATCTTGCACACAAGAGCCCTGGCAACTTCTGTAAAATTTGAAAAAATTTTTGATGGACGGAGCCAGAAGGATACAGTTGAAATGGGAGATGACTTTGAATTCGGACTTTGCCCATGTGATGCCAGACCCGTAGTGAAAGGGAAGTTCAATACGACACTGCTGAATGGGCCAGCCTTCCAGATGGTTTGTCCCATAGGATGGACGGGGTCTGTCGACTGTATGCTAGCTAATGAAGATACCTTAGCCACAACTGTAGTACGGACGTATAGGAGGCCCAAACCATTTCCTCACAGACAAGGCTGTATTACCCGAAAAATTGTGGGGGAGGACCTCCATGACTGTACCCCTGGAGGAAATTGGACATGTGTAGAGGGGGAACAACTACGATACACAGGGGGGCACGTCGAGTCATGCAAGTGGTGTGGTTACAGATTCCTAAAGGGCGAGGGATTACCACATTACCCGATTGGGAAGTGTAAGCTAGAGAACGAGACTGGCTACAGGTTAGTAGATGACACTTCTTGTAACAGGGACGGCGTGGCCATAGTACCACATGGGCTGGTAAGATGCAATATAGGGGATACGGTTGTACAGGTCATTGCTTTGGACACCAAGCTCGGGCCTATGCCTTGCAGACCATATGAGATCATATCAAGTGAGGGGCCTGTGGAAAAGACGGCGTGCACCTTCAATTACACAAAGACATTGAAGAATAAGTACTTCGAGCCCAGGGACAGTTTCTTCCAGCAATACATGCTAAAAGGAGAGTATCAATACTGGTTTGATCTCGAGGTCACGGATCACCACCGGGATTACTTCGCCGAGTCTATATTGGTGATTGTGGTGGCCCTCTTGGGTGGCAGGTACGTGCTATGGTTACTGGTCACGTATATGGTCTTATCAGAACAAAGAGCCTCGGGACCAGTATGGGCAGGAGAAATAGTGATGATGGGAAACTTGCTAACGCATGACAGCATTGAGGTGGTGACGTATTTCCTGTTGCTATACCTGTTGCTAAGAGAGGAAAATATCAAGAAGTGGGTCATACTGCTATACCATGTCTTTGTAACTAACCCATTGAAATCAGTTGCAGTGATCTTGCTGATGACAGGGGATGTGGTGAAAGCCGATACAGGTGCCCAAGGATACTTGGAGCGAGTAGATCTCTGCTTCACAATGGTAGTACTAATTGTCATAGGTTTAGTCATAGCTAGGCGTGACCCTACAGTGGTGCCGTTGGTCACAATAGTGGTGTCACTGAGGGTCACTGGGCTAACCTTTGGGCCAGGAGTGGATATAGCTGTGGCAGTCCTAACTTTAACATTGTTGGTGGCTAGCTACTTGACAGATTACTTCAGATATAAAAGATGGCTGCAGTGCACCCTCAGTCTAGTGGCAGGGGTGTTCTTAATGAGGAGCCTAATACACCTAGGTAGGTTTGAGACACCGGGGTTGACGATTCCAAGTTGGAGGCCACTGACATTTATACTATTATATTTGATCTCAACAGCAGTTGTCACGATGTGGAAGATCGATCTGGCTGGTCTACTGCTGCAATGTGTACCCGTCTTATTGCTGGTCATGACTCTGTGGGCCGACTTCCTAACTCTCTTACTGATACTACCTACTTACGAACTGGTCAAGTTGTATTATCTGAAGAACATTAAGACTGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGCGGACTAGACTACAAAAGGGTTGACACCATCTATGATGTGGATGAGAGTGGAGAAGGCGTATATCTCTTCCCATCTAAACAGAAGGCAAACAAAGATATTTCCATACTTTTGCCCCTTGTTAGAGCAACACTAATAAGTTGTGTTAGCAGCAAGTGGCAAGTATTATATCTGGCCTACCTAACTCTGGACTTTATGTACTACATGCACAGGAAGATTATAGAAGAGATCTCAGGAGGTACTAACTTGATATCCAGGGTTGTGGCAGCACTTATAGAGCTTAACTGGTCCTTGGAAGATGAAGAAAGCAGGGGCTTAAAAAAATTTTATCTACTATCTGGGAGACTGAGAAACCTAATACTAAAGCACAAAGTAAGAAATGAGACCGTGGCAGCTTGGTATGGGGAGGAAGAAGTTTTTGGCATGCCAAAAATAATGACCATAATCAAGGCTAGTACACTGAATAGAAGTAAGCACTGTATAATATGTACAGTGTGCGAGGGTCGAAAGTGGAAAGGTGGCACATGCCCCAAATGTGGGCGCTACGGGAAGCCTATGATGTGTGGGATGTCATTAGCAGATTTTGAAGAAAGACATTATAAAAGAATCTTCATAAGGGAAGGTAACTTTGAAGGCCCTTTCAGACAAGAATACAATGGTTTCATACAATACACCGCCAGGGGGCAATTATTCTTGAGAAACTTGCCCATACTGGCAACAAAAGTAAAAATGCTT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| 19,146 |
ON165517.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wang,H.
|
Northwest Minzu University
|
China
|
2023-01-25
|
21NX-69
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,198 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2021-05
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate 21NX-69, complete genome
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TGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCATAATGGAAGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTTAAGCCCTGAGTACAGGGCAGTCGTCAGTGGTTCGACACCTTGGAAGAACAAGGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCAAAGCACATCTTAACCTGGGCGGGGGTCGCTCAGGTGAAACAGTCTAACCGACTGCCACGGATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCTGTAGGAGTGGAGGAACCAGTTTATGATCGGGGAGGGAACCCTTTATTTGGTGAGAAGGGGACAGTCCACCACCAATCGACGCTAAAGCTCCCACATAAGAGAGGAGAGCGCGAAGTCCCTACCAATTTGGTGTCCCTACCGAAGAGAGGTGACTGCAGATCGGGTAACAATAGAGGTCCTGTGAGCGGAATCTATCTTAAGCCAGGGCCACAATTCTACCAGGACTATGTAGGGCCGGTCTACCACAGAGCCCCGCTGGAGCTATTCGAGGAAGGGTCTATGTGTGAAACAACCAAACGGATAGGGAGAGTGACTGGCAGTGATAGCAAGCTATACCATATTTATGTGTGTATAGATGGATGTATAATAGTGAAGAGTGCCACGAGAAGTAACCAGAGGGTATTGAGATGGGTCCACAACAAGCTCAACTGCCCTCTGTGGGTTACAAGCTGCTCAGACACAAAAGAAGAAGGAGCAACTAGGAAGAAACAACAAAAACCGGATAGGTTAGAAAAGGGTAAAATGAAGATAACACCCAGAGAATCCGAGAAGGATAGCAGGACTAAACCACCAGATGCTACGATAGTAGTGGATGGGGTCAAGTACCAGGTAAAGAAGAAGGGGAAAGTCAAAAGCAAAAACACCCAGGATGGTTTGTACCACAACAAGAACAAGCCACCAGAGTCACGCAAGAAACTAGAGAAAGCCCTGTTAGCGTGGGCAATACTGACTATCGTTTTGTTCCAAGCCACGGTGGGCGAAAACATAACACAGTGGAACTTACAGGATAATGGAACAGAAGGGATACAACGGGCGATGTTCCAAAGGGGTGTCAATAGGAGCCTACATGGGATCTGGCCAGAGAAAATCTGTACAGGTGTCCCATCCCATCTAGCCACTGATATGGAATTAAAAGCAATTCATGGTATGATGGATGCAAGTGAAAAGACCAACTACACATGTTGCAGACTCCAGCGCCACGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGCAACTGGTACAACATTGAGCCTTGGATTTTAATCATGAACAAGACCCAAGCTAATCTAACAGAGGGTCAACCATCAAGAGAGTGCGCCGTCACGTGCAGGTATGACAGAGATAATGACATAAATGTAGTAACACAAGCTAGAAACAGACCCACGCTACTGACAGGTTGCAAGAAAGGAAAGAACTTCTCCTTTGCAGGAATATTGATGCAGGGTCCTTGCAACTTTGAGATAGCGGCTAGTGATGTGCTGTTTAAAGAACACGACTGCACTAATGTACTTCAGGATACTGCTCATAATGGTGCCGACGGGATGACCAACTCCTTAGAGAGTGCCAGGCAAGGGACCGCCAAGCTAACAACTTGGTTGGGAAGGCAGCTTGGGATACTAGGGAAAAAGCTGGAGAACAAGAGTAAGACATGGTTCGGGGCATATGCGGCCTCCCCATACTGTGATGTTGAACGAAAACTCGGCTACATCTGGTATACAAAAAATTGCACACCAGCCTGCTTGCCCAAGAACACGAAAATCATAGGCCCCGGGATGTTTGACACCAATGGAGATGATGGTAAAATATTGCATGAGATGGGGGGCCACTTGTCTGAAGTACTACTACTCTCTCTAGTGGTGCTGTCTGACTTTGCCCCAGAAACAGCTAGCGCAATGTACCTGATACTGCATTTTTCTATCCCGCAAAGCCACACTGATGTAACGGACTGTGATAAGGACCAGTTGAATCTCACTATAGGACTCACAACAGCAGATGTGGTGCCAGGGTCAGTCTGGAATGTGGGTAAATACGTCTGTATAAGGCCAGACTGGTGGCCTTATGAGACAGCTACTGTGCTGGCATTTGAAGAAGTTGGGCAGGTGGTAAAGATTGCATTGAGGGCATTGAGAGACTTAACACGCATATGGGATGCTGCTACCACTACCGCATTCCTGGTGTGTCTAGTTAAGGTGGTGAGGGGCCAGGTGCTGCAGGGCATCCTGTGGCTACTGCTGATTACAGGGGTACAGGGCTACCACGACTGTAGACCTGATTTCTCATATGCCATAGCAAAGGATGAAAGGATCGGCCTGTTAGGTGCCGAAAGCCTTACCACCGTCTGGAAGGAATACTCTCCCAGAATGAAGTTGGAAGATACAATGGTTGTAGCCTGGTGCAAAGATGGTCAGTTTACATTCATGGAAAGGTGTGCAAGAGAAGCCAGATATCTTGCCATCTTGCACACAAGAGCCCTGGGCAACCTTCTGAAATTTGAAAAAAATTTTTGGACGGAGCCAGAAAGGATACAGTTGAAATGGGAGATGACTTTGAATTCGGACTTTGCCCAATGTGATGCCAGACCCGTAGTGAAAGGGAAGTTCAATACGACACTGCTGAATGGGCCAGCCTTCCAGATGGTTTGTCCCATAGGATGGACGGGGTCTGTCGACTGTATGCTAGCTAATGAAGATACCTTAGCCACAACTGTAGTACGGACGTATAGGAGGCCCAAACCATTTCCTCACAGACAAGGCTGTATTACCCAGAAAATTGTGGGGGAGGACCTCCATGACTGTACCCTTGGAGGAAATTGGACATGTGTAGAGGGGGAACAACTACGATACACAGGGGGGCACGTCGAGTCATGCAAGTGGTGTGGTTACAGATTCCTAAAGGGCGAGGGATTACCACATTACCCGATTGGGAAGTGTAAGCTAGAGAACGAGACTGGCTACAGGTTAGTAGATGACACTTCTTGTAACAGGGACGGCGTGGCCATAGTACCACATGGGCTGGTAAGATGCAATATAGGGGATACGGTTGTACAGGTCATTGCTTTGGACACCAAGCTCGGGCCTATGCCTTGCAGACCATATGAGATCATATCAAGTGAGGGGCCTGTGGAAAAGACGGCGTGCACCTTCAATTACACAAAGACATTGAAGAATAAGTACTTCGAGCCCAGGGACAGTTTCTTCCAGCAATACATGCTAAAAGGAGAGTATCAATACTGGTTTGATCTCGAGGTCACGGATCACCACCGGGATTACTTCGCCGAGTCTATATTGGTGATTGTGGTGGCCCTCTTGGGTGGCAGGTACGTGCTATGGTTACTGTCCACGTATATGGTCTTATCAGAACAAAGAGCCTCGGGAGCCCAGTATGGGGCAGGTGAAATAGTGATGATGGGAAACTTGCTAACGCATGACAGCATTGAGGTGGTGACGTATTTCCTGTTGCTATACCTGTTGCTAAGAGAGGAAAATATCAAGAAGTGGGTCATACTGCTATACCATGTCTTTGTAACTAACCCATTGAAATCAGTTGCAGTGATCTTGCTGATGACAGGGGAATTGGTGAAAGCCGATACAGGTGCCCAAGGATACTTGGAGCGAGTAGATCTCTGCTTCACAATGGTAGTACTAATTGTCATAGGTTTAGTCATAGCTAGGCGTGACCCTACAGTGGTGCCGTTGGTCACAATAGTGGTGTCACTGAGGGTCACTGGGCTAACCTTTGGGCCAGGAGTGGATATAGCTGTGGCAGTCCTAACTTTAACATTGTTGGTGGCTAGCTACTTGACAGATTACTTCAGATATAAAAGATGGCTGCAGTGCACCCTCAGTCTAGTGGCAGGGGTGTTCTTAATGAGGAGCCTAATACACCTAGGTAGGTTTGAGACACCGGGGTTGACGATTCCAAGTTGGAGGCCACTGACATTTATACTATTATATTTGATCTCAACAGCAGTTGTCACGATGTGGAAGATCGATCTGGCTGGTCTACTGCTGCAATGTGTACCCGTCTTATTGCTGGTCATGACTCTGTGGGCCGACTTCCTAACTCTCTTACTGATACTACCTACTTACGAACTGGTCAAGTTGTATTATCTGAAGAACATTAAGACTGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGCGGACTAGACTACAAAAGGGTTGACACCATCTATGATGTGGATGAGAGTGGAGAAGGCGTATATCTCTTCCCATCTAAACAGAAGGCAAACAAAGATATTTCCATACTTTTGCCCCTTGTTAGAGCAACACTAATAAGTTGTGTTAGCAGCAAGTGGCAAGTATTATATCTGGCCTACCTAACTCTGGACTTTATGTACTACATGCACAGGAAGATTATAGAAGAGATCTCAGGAGGTACTAACTTGATATCCAGGGTTGTGGCAGCACTTATAGAGCTTAACTGGTCCTTGGAAGATGAAGAAAGCAGGGGCTTAAAAAAATTTTATCTACTATCTGGGAGACTGAGAAACCTAATACTAAAGCACAAAGTAAGAAATGAGACCGTGGCAGCTTGGTATGGGGAGGAAGAAGTTTTTGGCATGCCAAAAATAATGACCATAATCAAGGCTAGTACACTGAATAGAAGTAAGCACTGTATAATATGTACAGTGTGCGAGGGTCGAAAGTGGAAAGGTGGCACATGCCCCAAATGTGGGCGCTACGGGAAGCCTATGATGTGTGGGATGTCATTAGCAGATTTTGAAGAAAGACATTATAAAAGAATCTTCATAAGGGAAGGTAACTTTGAAGGCCCTTTCAGACAAGAATACAATGGTTTCATACAATACACCGCCAGGGGGCAATTATTCTTGAGAAACTTGCCCATACTGGCAACAAAAGTAAAAATGCTTATGGTAGGCAA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| 19,150 |
ON165518.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1
|
Wang,H.
|
Northwest Minzu University
|
China
|
2023-01-25
|
21SD-5
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,216 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2021-05
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1 isolate 21SD-5, complete genome
|
TGCCATGCCCCTTGTAGGACTAGCATAATGGAAGGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTTAAGCCCTGAGTACAGGGCAGTCGTCAGTGGTTCGACACCTTGGAAGAACAAGGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCAAAGCACATCTTAACCTGGGCGGGGGTCGCTCAGGTGAAAACAGTCTAACCGACTGCCACGAATACAGCTTGATAGGGTGATGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCTGTAGGAGTGGAGGAACCAGTTTATGATCGGGGAGGGAACCCTTTATTTGGTGAGAAGGGGACAGTCCACCACCAATCGACGCTAAAGCTCCCACATAAGAGAGGAGAGCGCGAAGTCCCTACCAATTTGGTGTCCCTACCGAAGAGAGGTGACTGCAGATCGGGTAACAATAGAGGTCCTGTGAGCGGAATCTATCTTAAGCCAGGGCCACAATTCTACCAGGACTATGTAGGGCCGGTCTACCACAGAGCCCCGCTGGAGCTATTCGAGGAAGGGTCTATGTGTGAAACAACCAAACGGATAGGGAGAGTGACTGGCAGTGATAGCAAGCTATACCATATTTATGTGTGTATAGATGGATGTATAATAGTGAAGAGTGCCACGAGAAGTAACCAGAGGGTATTGAGATGGGTCCACAACAAGCTCAACTGCCCTCTATGGGTTACAAGTTGCTCAGACACAAAAGAAGAAGGAGCAACTAGGAAGAAACAACAAAAACCGGATAGGTTAGAAAAGGGTAAAATGAAGATAACACCCAGAGAATCCGAGAAGGATAGCAGGACTAAACCACCAGATGCTACGATAGTAGTGGATGGGGTCAAGTACCAGGTAAAGAAGAAGGGGAAAGTCAAAAGCAAAAACACCCAGGATGGTTTGTACCACAACAAGAACAAGCCACCAGAGTCACGCAAGAAACTAGAGAAAGCCCTGTTAGCGTGGGCAATACTGACTATCGTTTTGTTCCAAGCCACGGTGGGCGAAAACATAACACAGTGGAACTTACAGGATAATGGAACAGAAGGGATACAACGGGCGATGTTCCAAAGGGGTGTCAATAGGAGCCTACATGGGATCTGGCCAGAGAAAATCTGTACAGGTGTCCCATCCCATCTAGCCACTGATATGGAATTAAAAGCAATTCATGGTATGATGGATGCAAGTGAAAAGACCAACTACACATGTTGCAGACTCCAGCGCCACGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGCAACTGGTACAACATTGAGCCTTGGATTTTAATCATGAACAAGACCCAAGCTAATCTAACAGAGGGTCAACCATCAAGAGAGTGCGCCGTCACGTGCAGGTATGACAGAGATAATGACATAAATGTAGTAACACAAGCTAGAAACAGACCCACGCTACTGACAGGTTGCAAGAAAGGAAAGAACTTCTCCTTTGCAGGAATATTGATGCAGGGTCCTTGCAACTTTGAGATAGCGGCTAGTGATGTGCTGTTTAAAGAACACGACTGCACTAATGTACTTCAGGATACTGCTCATTACCTTGTCGACGGGATGACCAACTCCTTAGAGAGTGCCAGGCAAGGGACCGCCAAGCTAACAACTTGGTTGGGAAGGCAGCTTGGGATACTAGGGAAAAAGCTGGAGAACAAGAGTAAGACATGGTTCGGGGCATATGCGGCCTCCCCATACTGTGATGTTGAACGAAAACTCGGCTACATCTGGTATACAAAAAATTGCACACCAGCCTGCTTGCCCAAGAACACGAAAATCATAGGCCCCGGGATGTTTGACACCAATGGAGATGATGGTAAAATATTGCATGAGATGGGGGGCCACTTGTCTGAAGTACTACTACTCTCTCTAGTGGTGCTGTCTGACTTTGCCCCAGAAACAGCTAGCGCAATGTACCTGATACTGCATTTTTCTATCCCGCAAAGCCACACTGATGTAACGGACTGTGATAAGGACCAGTTGAATCTCACTATAGGACTCACAACAGCAGATGTGGTGCCAGGGTCAGTCTGGAATGTGGGTAAATACGTCTGTATAAGGCCAGACTGGTGGCCTTATGAGACAGCTACTGTGCTGGCATTTGAAGAAGTTGGGCAGGTGGTAAAGATTGCATTGAGGGCATTGAGAGACTTAACACGCATATGGGATGCTGCTACCACTACCGCATTCCTGGTGTGTCTAGTTAAGGTGGTGAGGGGCCAGGTGCTGCAGGGCATCCTGTGGCTACTGCTGATTACAGGGGTACAGGGCTACCACGACTGTAGACCTGATTTCTCATATGCCATAGCAAAGGATGAAAGGATCGGCCTGTTAGGTGCCGAAAGCCTTACCACCGTCTGGAAGGAATACTCTCCCAGAATGAAGTTGGAAGATACAATGGTTGTAGCCTGGTGCAAAGATGGTCAGTTTACATTCATGGAAAGGTGTGCAAGAGAAGCCAGATATCTTGCCATCTTGCACACAAGAGCCCTGGCAACTTCTGTAAAATTTGAAAAAATTTTTGATGGACGGAGCCAGAAGGATACAGTTGAAATGGGAGATGACTTTGAATTCGGACTTTGCCCATGTGATGCCAGACCCGTAGTGAAAGGGAAGTTCAATACGACACTGCTGAATGGGCCAGCCTTCCAGATGGTTTGTCCCATAGGATGGACGGGGTCTGTCGACTGTATGCTAGCTAATGAAGATACCTTAGCCACAACTGTAGTACGGACGTATAGGAGGCCCAAACCATTTCCTCACAGACAAGGCTGTATTACCCAGAAAATTGTGGGGGAGGACCTCCATGACTGTACCATAAGAGGAAATTGGACATGTGTAGAGGGGGAACAACTACGATACACAGGGGGGCACGTCGAGTCATGCAAGTGGTGTGGTTACAGATTCCTAAAGGGCGAGGGATTACCACATTACCCGATTGGGAAGTGTAAGCTAGAGAACGAGACTGGCTACAGGTTAGTAGATGACACTTCTTGTAACAGGGACGGCGTGGCCATAGTACCACATGGGCTGGTAAGATGCAATATAGGGGATACGGTTGTACAGGTCATTGCTTTGGACACCAAGCTCGGGCCTATGCCTTGCAGACCATATGAGATCATATCAAGTGAGGGGCCTGTGGAAAAGACGGCGTGCACCTTCAATTACACAAAGACATTGAAGAATAAGTACTTCGAGCCCAGGGACAGTTTCTTCCAGCAATACATGCTAAAAGGAGAGTATCAATACTGGTTTGATCTCGAGGTCACGGATCACCACCGGGATTACTTCGCCGAGTCTATATTGGTGATTGTGGTGGCCCTCTTGGGTGGCAGGTACGTGCTATGGTTACTGGTCACGTATATGGTCTTATCAGAACAAAGAGCCTCGGGAGCCCAGTATGGGGCAGGAGAAATAGTGATGATGGGAAACTTGCTAACGCATGACAGCATTGAGGTGGTGACGTATTTCCTGTTGCTATACCTGTTGCTAAGAGAGGAAAATATCAAGAAGTGGGTCATACTGCTATACCATGTCTTTGTAACTAACCCATTGAAATCAGTAACAGTGATCTTGCTGATGATAGGGGATGTGGTGAAAGCCGATACAGGTGCCCAAGGATACTTGGAGCGAGTAGATCTCTGCTTCACAATGGTAGTACTAATTGTCATAGGTTTAGTCATAGCTAGGCGTGACCCTACAGTGGTGCCGTTGGTCACAATAGTGGTGTCACTGAGGGTCACTGGGCTAACCTTTGGGCCAGGAGTGGATATAGCTGTGGCAGTCCTAACTTTAACATTGTTGGTGGCTAGCTACTTGACAGATTACTTCAGATATAAAAGATGGCTGCAGTGCACCCTCAGTCTAGTGGCAGGGGTGTTCTTAATGAGGAGCCTAATACACCTAGGTAGGTTTGAGACACCGGGGTTGACGATTCCAAGTTGGAGGCCACTGACATTTATACTATTATATTTGATCTCAACAGCAGTTGTCACGATGTGGAAGATCGATCTGGCTGGTCTACTGCTGCAATGTGTACCCGTCTTATTGCTGGTCATGACTCTGTGGGCCGACTTCCTAACTCTCTTACTGATACTACCTACTTACGAACTGGTCAAGTTGTATTATCTGAAGAACATTAAGACTGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGCGGACTAGACTACAAAAGGGTTGACACCATCTATGATGTGGATGAGAGTGGAGAAGGCGTATATCTCTTCCCATCTAAACAGAAGGCAAACAAAGATATTTCCATACTTTTGCCCCTTGTTAGAGCAACACTAATAAGTTGTGTTAGCAGCAAGTGGCAAGTATTATATCTGGCCTACCTAACTCTGGACTTTATGTACTACATGCACAGGAAGATTATAGAAGAGATCTCAGGAGGTACTAACTTGATATCCAGGGTTGTGGCAGCACTTATAGAGCTTAACTGGTCCTTGGAAGATGAAGAAAGCAGGGGCTTAAAAAAATTTTATCTACTATCTGGGAGACTGAGAAACCTAATACTAAAGCACAAAGTAAGAAATGAGACCGTGGCAGCTTGGTATGGGGAGGAAGAAGTTTTTGGCATGCCAAAAATAATGACCATAATCAAGGCTAGTACACTGAATAGAAGTAAGCACTGTATAATATGTACAGTGTGCGAGGGTCGAAAGTGGAAAGGTGGCACATGCCCCAAATGTGGGCGCTACGGGAAGCCTATGATGTGTGGGATGTCATTAGCAGATTTTGAAGAAAGACATTATAAAAGAATCTTCATAAGGGAAGGTAACTTTGAAGGCCCTTTCAGACAAGAATACAATGGTTTCATACAATACACCGCCAGGGGGCAATTATTCTTGAGAAACTTGCCCATACTGGCAACAAAAGTAAAAATGCTTATGGTAGGCA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| 19,151 |
MK509774.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1b
|
Choe,S., Lim,S.I., Kim,J., Cha,R.M., Cho,I.S., An,D.J.
|
Animal and Plant Quarantine Agency, Viral Disease Division
|
Korea
|
2019-09-04
|
BVD1b-JH
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,110 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Bos taurus
|
feces
|
2008-10
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1b isolate BVD1b-JH, complete genome
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AAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAATAAGGGGGGTAGCAACGGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTGAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCCTTGGAGGACAGGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCACGCCCACAGCACATCTTAACCTGGACGGGGGTCGTTCAGGTGAAAGCGGTTAAATTGACCGCTACGAATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTATTGCTACTAAAAATCTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCACTGGAGTGGAGGAACCAGTATACGACCAAGCTGGTAACCCTTTGTTTGGAGAAAGAGGAGTGATTCATCCGCAGTCAACGCTAAAACTGCCACATAAAAGAGGGGAGCGTGAAGTTCCCACCAATTTAGCTTCTTTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGATCAGGTAATTGCAAGGGGCCTGTGAGTGGAATCTATTTAAAACCAGGGCCGTTATTCTATCAAGATTATAAAGGTCCCGTCTATCATAGAGCCCCATTGGAGCTTTTTGAGGAAGCATCCATGTGTGAGGTAACTAAAAGAATCGGGAGAGTAACTGGTAGTGACAGTAAATTATACCACATTTATGTGTGTATTGATGGGTGCATAATAGTTAAGAGTGCCACGAAAGATCGTCAAAAAGTACTCAAATGGGTCCACAACAAACTAGACTGCCCCCTATGGGTTTCAAGCTGCTCCGACACAAAAGATGAAGGAGCGGTGAGAAAGAAGCAACAGAAGCCTGATAGGTTGGAGAAGGGGAGAATGAAGATAACACCTAAGGAGTCAGAGAAAGACAGTAAGACCAAGCCACCAGATGCCACGATTGTGGTAGACGGAGTTAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAAGTCAAGAGCAAGAACACCCAGGATGGCTTATACCACAACAAAAATAAACCTCAAGAGTCACGCAAGAAACTAGAGAAAGCCCTATTGGCCTGGGCAATAATAGCCTTGGTTTTGATCCAAGTCACAGTGGGAGAGAACATAACGCAATGGAACTTACAAGATAATGGAACGGAAGGAATACAACGAGCCATGTTTGAAAGGGGCGTGAATAGAAGTCTACATGGGATCTGGCCAGAGAAAATCTGTACAGGTGTTCCACCCCACCTGGCTACTGACACGGAACTGAAGGCAATTCACGGTATGATGGATGCAAGTGAAAAGACAAATTATACATGCTGCAGACTCCAGCGCCATGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGCAATTGGTATAATATTGAACCTTGGATCCTTCTCATGAATAAAACTCAAGCCAACCTTACTGAGGGTCAGCCTCTAAAGGAGTGTGCCGTCACATGCAGGTATGATCGAGATAGTGACCTGAATGTAGTAACACAAGCTAGAGATAGCCCCACATCATTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCCTTTGCAGGCATATTGGTACAAGGGCCTTGCAACTTTGAAATAGCCGTGAGTGACGTGCTGTTCAAAGAGCACGATTGCACTAGTGTGATTCAAGACACAGCTCACTACCTTGTAGACGGGATGACCAACTCCCTAGAGAGTGCTAGGCAAGGGACCGCAAAACTAACAACTTGGTTGGGCAGGCAACTTGGGATACTAGGAAAGAAACTGGAAAACAAGAGTAAGACATGGTTTGGGGCATATGCAGCCTCTCCCTACTGCGAGGTAGAACGGAAGCTTGGTTACGTATGGTATACAAAGAATTGCACTCCTGCCTGTTTACCTAGGAATACAAAGATAATCGGCCCCGGTAGGTTTGACACCAATGCTGAGGATGGTAAAATACTACATGAGATGGGGGGTCACTTGTCGGAGGTGCTATTGCTCTCAGTGGTAGTGCTTTCCGATTTTGCACCAGAGACAGCCAGTTTGATATACTTGGTTCTCCATTTCTCCATCCCACAAGGACACACTGATATACAAGATTGTGACAAAAACCAACTAAACCTCACCGTAGAACTCACAACAGCAGAAGTAATACCAGGGTCAGTTTGGAATTTGGGTAAATATGTTTGTATAAGACCAGATTGGTGGCCTTATGAGACAGCCACGGTCCTGGTATTTGAAGAGGTGGGCCAAGTAATTAAGATTGTTTTAAGGGCATTAAAAGATCTGACGCGCATTTGGACCGCTGCTACTACCACTGCATTCTTGGTTTGTCTGGTGAAGGTGGTAAGAGGCCAGGTGTTGCAAGGTATACTGTGGCTGATACTCATAACAGGGGCGCAAGGGTACCCAGACTGCAAACCCGACTTTTCATACGCCATAGCCAAAAATGATGAGATCGGCCCACTTGGAGCTACAGGCCTCACCACTCAGTGGTACGAATACTCAGATGGAATGCGGCTGCAGGACTCAACAGTTGAAGTTTGGTGTAAAGATGGAAAGTTCAGATATCTAACCAAATGTGAGAGGGAAGCCAGGTATCTGGCTATTCTACACACGAGAGCCTTGCCAACATCTGTAGAATTTAAGAAAATTTTAAATGGAAAAGAACAAGAGGACATAGTAGAAATGGAAGACAACTTTGAATTCGGTCTTTGCCCATGTGATGCTAGACCCTTGGTAAAGGGAAAATTCAATACAACACTTCTAAATGGGCCGGCCTTCCAGATGGTTTGTCCTATAGGATGGACAGGGACTGTAAGCTGCATACTGGCCAATAAAGATACGTTAGCCACAATCGTTGTGCGAACGTATAAGAGGGTCAGGCCTTTCCCATATAGGCAGTACTGCGTTACCCAGAAGACCATTGGGGAGGACCTTCACGACTGTGCCTTAGGAGGGAATTGGACTTGTGTGCCGGGGGATCAACTACGATATGTGGCTGGGCCCGTCGAGTCTTGTAAGTGGTGTGGTTACAAGTTTTTTAAAAGTGAGGATCTGCCGCATTTCCCAATTGGTAAATGCAGGCTTAAGAATGAGAGTGGCTATAGGCTGGTGGATGAGACTCCTTGCAATAGAGACGGCGTGGCTATAGTACCATCTGGCCTGGTCAAATGCAAGATAGGGGACACAGTAGTGCAAGTCATTGCAATGGATAGTAAACTAGGGCCTATGCCTTGCAAACCATATGAAATCATACCCAGTGAGGGGCCAGTGGAAAAGACGGCATGCACCTTCAACTACACAAGAACATTAGAAAACAAGTACTTTGAGCCTAGGGACAACTATTTCCAACAATACATGTTAAAGGGGGGGTACCAATATTGGTTTGATCTAGAGATCACTGACCACCACCGGGATTACTTCGCTGAGTCCCTACTGGTGATAGTAGTTGCACTCCTGGGTGGTAGGTACGTGCTTTGGTTGCTGGTCACATATATGGTCCTATCAGAACAAATGGCCTCGGGTGCCCAGTATGGGGCAGGTGAAATAGTGATGATGGGTAACTTGTTAACACATGACAGTCTTGAAGTGGTGACATACTTCTTACTACTATACCTGCTACTAAAGGAGGAAGACATCAAAAAATGGGTCATACTCATATTCCACATCATAGTAATGCACCCACTAAAATCGGTGACGGTGATATTGCTAATGGTTGGAGGGATGGTAAAAGCTGAACCAGGCGCCCAAGGGTACCTAGAGCAGGTAGACCTTAGTTTTACGATGATTACAATCATCGTAGTAGGTCTGGTCATAGCCAGGCGTGATCCCACTGTGATTCCACTAGTCACAATAGTTGCGGCACTGAAGGTCACAGGACTAGGCTTTGGGCCCGGAGTAGACGCAGCTATGGCAGTCCTCACCTTAACCTTACTAATGATTAGTTATGTGACAGACTACTTCAGGTATAAAAGGTGGATACAATGTATCCTCAGTTTAGTAGCCGGGGTGTTCCTTATTCGGAGCCTTAGACATCTAGGTGAAATCGAAACCCCTGAGCTGACCATACCGAATTGGAGGCCACTAACCTTCATACTATTATACCTGACTTCAGCAGCAGTTGTTACAAGATGGAAGATTGACATAGCTGGCATATTACTGCAAGGGGCTCCAATCCTTTTGCTGATCGCCACCCTATGGGCCGACTTCCTGACCCTTGTTCTGATCCTACCCACCTACGAACTAGTTAAGTTGTACTACCTAAAGAACGTCAAGACTGACGTGGAAAAGAGTTGGCTTGGGGGGTTAGACTACAAGACAATTGACTCTGTTTATGATGTGGATGAAAGTGGAGAAGGCGTGTACCTCTTTCCGTCCAGACAGAAAAAAAATAAGAATATCAGCATACTCCTGCCTCTCATCAGAGCTACGCTAATAAGTTGTGTTAGCAGCAAATGGCAGATGGTGTATATGGCTTACCTAACCCTGGACTTTATGTACTATATGCACAGAAAAGTTATTGAAGAGATATCAGGGGGTACCAACGTGATGTCTAGAATAATAGCAGCACTTATAGAGTTAAATTGGTCCATGGAAGAAGAAGAGAGCAAGGGGTTAAAGAAGTTTTTTATACTGTCTGGAAGGTTGAGGAACCTCATAATAAAGCATAAGGTTAGGAACCAGACTGTAGCAGGCTGGTATGGGGAGGAAGAAGTCTACGGTATGCCAAAGGTTGTGACCATAATAAGGGCCTGCACACTAAACAAGAATAAACATTGCATAATATGCACAGTATGTGAGGCTAGAAAGTGGAAGGGAGGTAACTGCCCTAAATGCGGCCGCCACGGGAAGCCCATCACCTGTGGGATGACTCTAGCGGATTTTGAAGAAAGGCACTACAAGAGAATTTTTATAAGGGAAGGCAACTTTGAAGGACCATTCAGACAGGAATATAGTGGTTTTGTACAATACACCGCTAGGGGGCAATTGTTCCTGAGGAATTTACCCATATTGGCAACCAAGGTAAAAATGCTCATG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| 59,570 |
MH490943.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1b
|
Liu,C., Fabiola,V., Wei,W., Leal,E., Zhai,S., Li,J., Cui,S.
|
Chinese Academy of Agricultural Sciences, Institute of Animal Sciences
|
China
|
2018-12-03
| null |
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,269 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2016
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1b strain BVDV BJ-2016, complete genome
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| 66,465 |
KY964311.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1b
|
Hong,K., Diao,N.-C., Shi,K., Du,R.
|
Jilin Agricultural University, College of Animal Science & Technology
|
China
|
2017-10-25
|
Y2
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,306 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Cervidae
| null |
2014
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 1b isolate Y2, complete genome
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| 74,265 |
KT355592.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1b
|
Nam,B., Li,G., Zheng,Y., Zhang,J., Shuck,K.M., Timoney,P.J., Balasuriya,U.B., Balasuriya,U.B.R.
|
University of Kentucky, Department of Veterinary Science
|
USA
|
2015-08-19
| null |
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,271 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
| null | null | null | null | null |
Bovine viral diarrhea virus type 1b strain HP-KY-RK13, complete genome
|
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| 86,318 |
JN704144.1
|
Bovine viral diarrhea virus 1b
|
He,Y.H., Huang,X., Bo,X.W., Wang,X.H.
|
Xinjiang Academy of Agricultural Reclamation, Key Laboratory of Sheep Reproduction Biology of Bingtuan
|
China
|
2012-02-15
|
3156
|
Pestivirus bovis
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,302 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null | null | null | null |
Bovine viral diarrhea virus type 1b isolate 3156, complete genome
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GTATACGAGAATTTGCCTAACCTCGTATACACATTGGGCACTCTAAAAATGAATTAGGCCTGAGGGACAAATCCTCCTTAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAACAAGGAGGGTAGCAACAGTGGTGAGTTCGTTGGATGGCTGAAGCCCTGAGTACAGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCTTTGTGCGACAAGCCTCGAGATGCCACGTGGACGAGGGCATGCCCACAGCACATCTTAACCTGAGCGGGGGTCCTTCAGGTGGAAACGGTGTAACCAACCGCTACGAATACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGGCCCACTGTATCGCTACTAAAACTATCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATCACAAATGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCCGCTGGAGTGGAGGAACCAGTGTACAACCGAGCGGGCGACCCTTTGTTTGGCGAGAGAGGAGAGGTTCATCCGCAGGCAACGCTAAAACTACCACATAAAAGAGGGGAGCGTGAAGTTCCTACTAATTTGGCGTCTCTACCAAAAAGAGGTGACTGCAGATCGGGTAACAGCAAGGGGCCCGTGAGTGGGATCTATCTGAAACCGGGGCCATTATTTTACCAGGATTACAAAGGACCCGTCTACCATAGAGCACCATTGGAGTATTTTCAGGAAGCGTCTATGTGTGAGACAACTAAGAGGATTGGGAGAGTAACTGGTAGTGATGGTAAATTGTACCACATTTATGTGTGCATAGATGGATGCATAATAGTTAAGAGTGCCACAAAATATCGTCAGAAGGTACTCAAATGGGTCTACAACAAACTAAATTGCCCTCTATGGGTTTCAAGCTGCTCCGACACAAATGCAGAAGGGGCGACAAGAAAGAAGCAACAAAAACCAGATAGGTTGGAAAAGGGGAGGATGAAGATAACTCCTAAAGAGTCGGAGAAAGATAGTAAGACCAAACCGCCAGATGCCACGATAGTGGTAGATGGAGTAAAATATCTGGTAAAGAAGAAAGGGAAAGTCAAGAGCAAGAACACCCAGGACGGCTTGTACCACAACAAAAACAAACCTCAAGAGCCACGCAAGAAACTAGAGAAAGCCCTGTTGGCATGGGCGATAATAGGCTTAGTTTTGTTTCAGGTTGCAGTGGGAGAGAACATAACACAATGGAACCTACAAGATAATGGGACGGAAGGAATACAACGGGCCATGTTCCAAAGAGGTATAAATAGAAGTCTGCATGGGATCTGGCCAGAGAAAATATGTACAGGTGTCCCCTCCCACTTGGTCACTGACACAGAACTGAAGGCAATTCATGGTATGATGGATGCTAGCGAGAAGACAAATTACACATGCTGCAGGCACCAACGCCATGAGTGGAACAAGCATGGTTGGCGCAATTGGTTCAATATTGAACCTTGGATTCTTCTCATGAATAAAACTCAAGCAAACCTTACTGAGGGTCAGCCACCAAGGGAGTGTGCCGTCACATGCCGGTATGACCGAGATAGTGACCTAAATGTAGTAACACAAGCTAGGGACAGCCCCACGCCATTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCCTTTGCAGGTGTGTTAGTACAAGGGCCTTGCAACTTTGAAATAGCCGTAAGTGATGTGCTGTTCAAAGAGCACGATTGCACTAGTGTGATTCAAGACACGGCTCACTATCTGGTAGACGGGATGACCAATTCTCTAGAAAGTGCTAGGCAAGGGACCGCAAAGCTAACAACTTGGTTTGGTAGGCAACTTGGGATTTTAGGAAAGAAGCTGGAAAACAAGAGTAAGACATGGTTTGGGGCATATGCAGCCTCTCCCTACTGTGAGGTAGAACGGAGGCTCGGTTACATCTGGTATACAAAGAATTGCACCCCCGCCTGTCTGCCAAAAAATACAAAGATTATTGGCCCCGGTAAGTTCGACACCAATGCGGAAGATGGTAAAATACTGCATGAGATGGGGGGCCACTTATCGGAGGTGTTACTACTCTCAGTAGTAGTGCTTTCCAATTTCGCTCCAGAGACAGCCAGCGTAATATACTTAATCCTACATTTTACCATCCCACAAGGACACACTGATATACATGACTGTGACAAAAACCAACTAAACCTCACCGTAGAACTCACAACAGCTGAAGTGATACCAGGGTCAGTTTGGAATTTGGGCAAATATGTTTGTATAAGACCAGATTGGTGGCCTTATGAAACAGCCACGGTCCTAGTGCTTGAAGAGGTGGGTCAAGTGATCAAGATAGTCTTGAGAGCATTAAGGGATCTAATGCGCATTTGGAACGCTGCTACGACCACTGCATTCCTGGTGTGTCTGGTGAAGGTGGCGAGAGGCCAAGTGTTGCAAGGCATACTGTGGTTAATACTCATAACAGGAGCACAAGGGCTCCCAGCCTGTAAACCTGACTTTTCTTACGCCATAGCCAAAAACAATGAGATCGGCCCTCTTGGAGCTACGGGCCTCACCACTCAATGGTATGAATACTCGGATGGGATGCGGCTGCAGGACACGGAAGTTGTAGTGTGGTGTAAAGATGGAGAGATCAAATATCTAATTACGTGTGAGAGGGAAGCCAGGTATCTGGCCATTTTACACACGAGAGCCCTGCCGACATCTGTAGTATTTGAAAAAATCATAAAAGGAAAAGAACAAGAGGACGTAGTTGAAATGGATGATGACTTTGAGTTCGGTCTTTGCCCGTGTGATGCTAAACCCTTGGTAAGGGGAAAATTTAATACAACACTTCTAAATGGGCCAGCTTTCCAGATGGTTTGCCCTATAGGATGGACTGGGACTGTGAGCTGTGCACTGGCTAATAAGGATACGTTAGCCTTGACCGTTGTACGAACATACACGAGGCACAAGCCGTTCCCCTATAGGCAAGGCTGCATCACCCAGAAAACCCTGGGGGAGGATCTCTATGACTGTGTCCTCGGAGGAAACTGGACTTGCGTACCCGGGGACCAGTCACGGTACACAGGAGGCTTTATCGAATCCTGTAAGTGGTGTGGCTATAAATTTCAAAAAAGTGAGGGGCTACCACACTACCCTATTGGTAAGTGTAGGTTGAATAATGAAACTGGCTACAGATTAGTAGATGACACCTCTTGCAACAGAGAAGGTGTGGCCATAGTACCACACGGGCAGGTAAAGTGTAAGATAGGGGATACAACTGTACAGGTCATAGCTATGGACACCAAACTTGGGCCTATGCCTTGCAAACCACATGAGATCATATCAAGTGAGGGGCCAATAGAAAAGACAGCATGCACCTTCAATTACACGAGGACATTAAAAAATAAATATTTTGAACCCAGAGACAGTTACTTCCAGCAATACATGCTAAAGGGAGATTATCAATACTGGTTTGACCTGGAGGTCACTGACCGTCATCGGGATTACTTTGCCGAGTCCATATTAGTGGTGGTGGTAGCTCTTCTGGGTGGTAGATATGTGCTCTGGTTACTGGTCACATACATGGTCCTATCAGAACAAAAGGCCTCAGGGGCCCAGTATGGGGCAGGGGAGGTGGTGATGATGGGCAACTTGTTAACACATGATAATGTTGAAGTGGTGACATATTTCTTCTTGCTATACCTGCTGCTAAGAGAGGAGAGTGTAAAGAAGTGGGTCTTACTCTTATACCACATCTTGGTGGCACACCCATTAAAGTCAGTGATAGTGATCCTATTGATGATTGGGGATGTGGTGAAGGCTGACCCAGGGGGGCAAGACTACCTGGGCCAGATAGATGTCTGCTTCACAATGGTTGTACTAATCATAATAGGTTTAATCATAGCCAGGCGTGATCCGACCATAGTACCACTGATCACGATAGTAGCATCGCTGAGGGTCACTGGATTGACCTACAGCCCTGGAGTGGATGCAGCAATGGCAGTGATAACCATAACCTTGCTGATGGCTAGTTATGTGACAGATTACTTCAGATATAAAAGATGGCTGCAGTGCATTCTCAGCCTGGTATCAGGGGTGTTCTTGATAAGAAGCCTAATACACCTAGGTAGAATTGAGACGCCAGAGGTGACCATCCCAAGCTGGAGACCATTAACCTTAATACTGTTATATCTGATCTCAACAACAGTTGTTACAATGTGGAAGATTGACTTGGCCGGCCTATTGTTGCAAGGTGTGCCTATCTTATTGCTGATCACGACCCTGTGGGCCGACTTTTTAACCCTCATACTGATACTGCCTACCTATGAACTGGTTAAGTTATACTACCTGAAAACTATTAAGACTGATATAGAAAAAAGCTGGCTGGGGGGGTTAGACTATAAGAGAGTTGACTCCATCTACGATGTTGATGAGAGTGGAGAGGGTGTATATCTTTTCCCATCTAGGCAGAAGGCACAGAAAAACTTCTCTATGCTTTTGCCTCTTGTGAGAGCGACACTGATAAGTTGTATTAGCAGTAAATGGCAGCTAATATACATGGCTTACTTATCTGTGGACTTTATGTACTACATGCATAGGAAAGTTATAGAAGAGATCTCAGGAGGCACCAATGTGATATCTAGGGTGATAGCAGCACTCATAGAGCTAAACTGGTCCATGGAAGAGGAAGAAAGCAAGGGCTTAAAGAAGTTTTTTATACTGTCTGGGCGGTTGAGGGCCCTTATAATGAAGCACAAGGTTAGGAACCAGACTGTAGCAAGCTGGTATGGGGAGGAAGAAGTCTACGGCATGCCAAAAATAATTACCATAATAAGGGCTTGCACACTAAACAAGAACAAGCACTGCATAATATGCACAGTATGCGAGGCTAAAGAGTGGAAGGGTGGCAACTGCCCTAAATGCGGTCGCTACGGGAAGCCCATCACTTGTGGAATGACTCTAGCGGATTTTGAAGAGAGGTACTACAAGAGGATTTTTATAAGAGAGGGTACCTTCGAAGGACCCTTCAGGCA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| 97,521 |
NC_076032.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Zhu,L., Lin,Y., Ding,X., Zhang,G., Zhu,G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
| null |
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,284 |
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2004-12-08
| null |
PRJNA485481
|
Bovine viral diarrhea virus 2 strain XJ-04, complete genome
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| 405 |
NC_039237.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Ridpath,J.F., Bolin,S.R.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
|
890
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,513 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Bovine viral diarrhea virus 2 polyprotein gene, complete cds
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CTATTTTTGGAAGCAAAAATTCAGGCTGACTTATATCACCTAATTGGCAGTGTTGATAGTATAAAAAGCAAAGCAAAGGAATTAGGGGCCACAGATAACACAAAGATAGTGAAGGAAGTCGGGGCTAGGACCTATACGATGAAATTGAGCAGCTGGAGCACACAAGTCACTAAAAAACAGATGAGTCTAGCCCCCCTCTTCGAAGAGCTGTTAATAAAGTGCCCTCCATGTAGTAAAATTTCAAAGGGACATATGGTGTCAGCATACCAACTGGCTCAAGGAAACTGGGAACCCCTCGGGTGTGGGGTCTATATGGGGACCATACCAGCTAGGCGTCTCAAGATCCACCCTTATGAGGCCTACCTTAAACTCAAAGAGCTGGTGGAAGTTGAACTTTCAAGGGTTACTGCAAAAGAATCCATCATAAGAGAACATAACACCTGGATTCTACGGAAAGTGAGACACGAAGGGAACCTAAGAACTAAATCAATGATTAACCCTGGAAAAATATCAGATCAGCTATGCAGAGATGGACACAAAAGAAACATATATAATAAGATTATAGGCTCAACAATGGGCTCTGCTGGTATTAGGCTGGAGAAACTGCCAGTAGTCCGAGCCCAAACTGACACAACCAGTTTCCACCAAGCTATAAGAGAAAAAATTGATAAACCAGAAAACAAGCAGACCCCTGAATTGCATGAAGAACTAATGAAGGTTTTCGACTGCTTAAAGATCCCAGAGCTGAAGGAATCGTTTGATGAAGTCTCATGGGAACAATTAGAAGCCGGGATAAACCGTAAGGGAGCAGCCGGTTATCTAGAGAGTAAGAACATAGGGGAAGTGCTAGACACAGAGAAACACATAGTAGAACAGCTGATCAAGGATCTGAGGAAGGGGAAGAAAATTAGGTACTATGAAACAGCCATTCCCAAGAATGAGAAGAGAGACGTCAGCGACGACTGGGAAGCCGGAGAGTTCGTTGATGAAAAGAAACCAAGGGTAATCCAGTACCCGGACGCCAAGGTGAGACTGGCCATTGCAAAAGTGATGTACAAGTGGGTGAAGCAAAAACCAGTGGTGATACCCGGTTATGAAGGTAAAACACCGCTATTTGACATATTCAACAAAGTGAAGAAGGAGTGGGATTCATTCCAGGACCCCGTAGCAGTGAGCTTTGACACCAAAGCATGGGATACACAAGTCACCAGTAAAGACCTAATGTTGATAAAGGACATCCAAAAATATTATTTCAAGAGAAGTACACACAAATTTTTAGATACAATAACAGAACACATGGTGGAGGTACCCGTCATAACAGCAGACGGTGAAGTTTACATAAGGAATGGTCAGAGGGGTAGTGGCCAACCCGACACAAGCGCTGGTAATAGTATGTTGAATGTCCTAACCATGATATATGCCTTCTGTAAAAGTACAGGTATACCTTACAGGGGATTCAGCAGAGTGGCAAGAATCCATGTGTGTGGTGATGATGGCTTTCTGATAACAGAAAGAGGACTGGGATTGAAATTCTCTGAGAAGGGTATGCAGATATTACATGAGGCCGGGAAGCCCCAGAAAATAACTGAAGGGGAAAAAATGAAAGTGGCATACAGATTTGAGGACATTGAGTTTTGTTCCCATACCCCCGTGCCAGTCAGATGGGCAGATAACACCAGTAGTTACATGGCAGGGAGGAGCACAGCCACCATACTAGCTAAGATGCCAACCAGGTTGGATTCCAGCGGAGAGAGGGGTAGCACAGCTTATGAGAAGCCCGTAGCTTTTAGCTTCCTTTTGATGTACTCATGGAACCCCGTAGTTAGAAGGATCTGCTTACTGGTGTTGTCACAGTTTCCTGAAATATCCCCATCCAAAAACACAATATACTACTACCAAGGGGATCCTATAGCTGCGTACAGAGAAGTGATAGGGAAACAGCTGTGTGAACTGAAAAGAACAGGATTTGAGAAGTTGGCTAGTTTGAATTTGAATATGACCACTTTAGGCATCTGGACAAAACATACTAGTAAAAGACTAATCCAAGACTGTGTGGAAATAGGTAAGAGAGAAGGTAACTGGTTAGTTAATGCTGACAGACTGATTGCAGGAAAGACTGGGAAGTTTTACATCCCAAGCACTGGTGTCACTCTGTTGGGAAAACATTATGAGGAAATTAACTTAAAGCAAAAGGCGGCACAATCGCCGATAGAGGGGGTTGACAGATATAAGTTGGGCCCCATAGTTAATGTTATCTTGAGAAGACTGAGGGTGATGCTGATGACAGTGGCCAGCGGAAGCTGGTGAATCTGCCCAGAGAGTCGTGCCCTCACTCAAGGTGTCATTTGTAAATATGGTGAATAGACAGCTAAGATATATATTGTAGTTGGATAGTAATGTAGTGATAGTAGATACCCCGATTTAACACTACCTCCAATGCACTAAGCACTTTAGCTGTGTGAGGTTAACTCGACGTCCATGGTTGGACTAGAGGATGGCTCTAACGGTCCCCC
| 4,241 |
ON676188.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Lee,E.-Y., Park,S.-J., Park,J.-Y., Lee,K.-K., Ku,B.-K., Jeoung,H.-Y.
|
Animal and Plant Quarantine Agency, Animal Disease Diagnostic Division
| null |
2023-12-09
| null |
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,694 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Bos taurus
| null |
2019
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 strain Mungyeong, complete genome
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ATGGAGTTGTTTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATATAAACAGAAACCAGCAGGCGTCGTGGAACCTGTTTATGACGTCAACGGGCGTCCACTGTTTGGAGAGAGCAGTGACTTGCACCCGCAGTCCACACTAAAACTACCACACCAACGAGGCAGCGCCAACATCCTGACCAATGCTAGGTCTCTACCGCGGAAAGGTGACTGCCGGAGAGGTAATGTGAATGGAGCGGTGAGTGGCATCTATATCAAACCAGGGCCGATCTACTACCAGGACTATGCGGGGCCCGTCTATCATAGAGCCCCACTGGAACTATGTAGGGAGGCAAGTATGTGTGAAACAACTAGGAGAGTTGGCAGAGTGACCGGTAGTGATGGGAAATTATACCATATCTACATCTGCATAGATGGGTGTATCCTCCTGAAGAGGGCAACTAGGAACCAACCAGAAGTCCTAAAATGGGTATACAACAGATTAAATTGTCCTTTATGGGTCACCAGCTGCTCCGATGAAGGGAGTAAAGGTGCTACAAATAAGAAGCAGCCTAAGCCAGATAGGATAGAAAAAGGCAAGATGAAAATAGCCCCGAAAGAGACAGAAAAAGATTGCAAAACCAGACCCCCTGATGCGACTATAGTAGTAGAAGGGGTTAAGTACCAGGTGAAGAAGAAAGGAAAGGTAAGGGGAAAAAATACTCAAGATGGGTTGTATCACAACAAGAATAAGCCCCCTGAATCAAGAAAGAAATTGGAGAAGGCACTGCTGGCATGGGCCATCTTGGCAGCGGTTCTGCTTCAGCTGGTAACAGGTGAGAATATTACCCAGTGGAACTTGATGGACAACGGCACCGAAGGAATACAGCGAGCGATGTTCCTAAGAGGGGTGAACAGGAGTCTACATGGAATTTGGCCAGAAAAAATTTGCACCGGAGTGCCAACTCACTTAGCAACAGACTATGAGCTTAAAGAGATAGTGGGGATGATGGACGCGAGTGAGAAGACCAACTATACGTGTTGCAGGTTGCAAAGGCATGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGTAACTGGTTTCATATAGAACCGTGGATATGGGTGATGAACAAAACCCAAAACAACCTGACAGAAGGACAGCCGCTTAGGGAGTGTGCCGTGACCTGTAGGTATGACAAGGAAGCAGAATTGAACATCGTGACACAGGCTAGGGACAGGCCTACAACTCTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAATTTCTCCTTCGCAGGTGTTGTACTGGATGGGCCCTGTAACTTTAAAGTATCGGTTGAAGATGTGCTGTTCAAGGAACACGATTGCGGCAACATGCTGCAAGAGACCGCGATACAGCTACTCGATGGGGCAACCAACACCATTGAGGGAGCAAGGGTAGGGACAGCCAAGTTGACAACCTGGTTAGGGAAGCAATTAGGGATCCTTGGTAAGAAGTTGGAAAATAAAAGCAAAGCATGGTTTGGTGCACATGCAGCAAGTCCATACTGCGGAGTGGAGAGGAAGGTCGGTTACGTCTGGTATACAAAGAACTGCACTCCGGCTTGCCTTCCAAGAAACACTAAGATAATAGGCCCCGGGAAGTTTGATACCAACGCCGAAGATGGCAAAATACTCCATGAGATGGGGGGGCATCTCTCAGAATTTGCCCTATTGTCCTTGGTGGTTCTGTCTGACTTTGCCCCAGAAACCGCGAGTGTCATCTACTTGGTTCTACATTTTGCGATCCCGCAAAGCCACGTTGATGTAGACACATGCGACAAGAACCAGCTGAATTTAACGGTCACAACTACAGTAGCAGAAGTCATACCAGGGACAGTGTGGAACCTAGGGAAGTATGTCTGCATAAGACCAGACTGGTGGCCATATGAGACGGCGACAGTCTTCGTCTTAGAGGAAGCAGGGCAAGTAATCAAATTGGGGCTAAGGGCCATCAGAGACTTAACTAGGATATGGAACGCTGCCACCACCACAGCTTTCCTAATCTTTTTAGTGAAAGTGCTAAGGGGACAACTAATCCAAGGGCTATTGTGGCTGATGCTAATAACAGGGGCACAGGGCTTCCCTGAATGCAAAGAGGGCTTCCAATATGCCATATCGAAAGACAGAAAAATGGGGTTATTGGGACCAGAGAGCTTGACTACAACATGGCACCTTCCCACAAAAAAAATAGTGGACTCCATGGTACAAGTATGGTGTGAAGGAGAAAACTTGAAAATATTAAAAACGTGCACAAAGGAAGAGAGGTACCTAGTGGCTGTGCACGAGAGAGCCTTATCAACCAGTGCAGAGTTTATGCAGATCAGTGAAGGGACGAGAGGCCCAGAAGTGATAGATATGCCTGATGACTTTGAGTTTGGACTTTGCCCTTGTGACTCAAAACCAGTGATAAAGGGCAAATTCAATGCCAGTTTACTGAATGGACCAGCTTTCCAGATGGTATGCCCACAGGGGTGGACTGGTAGAATAGAATGCACCCTAGTGAACCAAGACACCTTGGACACAACTGTCATTAGGACATATATAAGAACTACTCCATTCCAGCGGAGAAAATGGTGCACCTATGAAAAAATAATAGGGGAAGATATCCATGAATGCGTTCTAGGTGGAAACTGGACATGCATAACTGGTGACCATAGCAGGTTGAAAGACGGGCCTATCAAGAAGTGTAAGTGGTGTGGCTATGACTTCTTCAACTCAGAGGGACTGCCACACTACCCAATAGGTAAGTGCATGCTCATCAATGAGGGTGGGTACAGGTATGTAGATGACACCTCTTGCGATAGGGGTGGTGTAGCCATAGTTCCAACAGGCACTGTAAAGTGTAGAATAGGTAACGTCACGGTGCAGGTTATCGCTACTAACAATAATCTGGGACCCATGCCCTGCAGCCCAGCTGAAGTGATAGCAAGTGAAGGACCAGTAGAAAAGACTGCATGCACATTTAACTATTCAAGGACACTACCTAATAAGTACTATGAGCCAAGGGACCGGTACTTCCAACAATACATGTTAAAAGGGGAGTGGCAATATTGGTTCGACCTGGATTCTGTAGACCACCACAAAGACTACTTCTCAGAGTTCATAATCATAGCAGTGGTCGCCTTGTTGGGTGGTAAGTACGTACTGTGGCTCTTGATAACATACACAATATTGTCTGAGCAGATGGCTATGGGTGCTGGAGTGAACACTGAAGAGATAGTCATGATAGGCAACTTGCTGACACACAGCGATATTGAGGTTGTGATCTATTTCCTTCTTCTGTACTTAATAGTTAAAGAGGAACTGGTGAGGAAATGGATTATACTGGTGTACCACATCCTTGTAGCCAACCCTATGAAAACAATTGGGGTCATCTTACTAATGCTAGGGGGAGTGGTGAAGGCCAGCAGAATCAGTGCTGATGACCAAAGTGCTATGGACCCATGCTTTCTTCTCGTGACAGGCTTAGTGGCTGTTTTGATGATCGCTAGAAGAGAACCTGCCACCTTACCACTGATTGTAGCATTGCTAGCAATAAGAACATCAGGATTCCTACTGCCCGCTAGCATTGATATAACCGTAGCAGTAGTATTAATTGTACTTTTGCTGGCTAGCTACATAACAGACTACTTTAGATATAAAAAGTGGCTTCAATTCTCATTTAGTCTGATAGCTGGTATCTTTGTTGTAAGGAGCTTGAAACACATCAACCAGATGGAGGTACCAGAAATATCTATGCCAAGTTGGAGACCTCTAGCCTTTGTCATTTTCTATATAACATCTACAGCAATAACCACTAATTGGGACATTGACCTAGCAGGCTTCCTGCTACAATGGGCACCAGCAGTGATCATGATGGCTACCATGTGGGCAGACTTTTTGACCCTGATCATAGTCCTACCCAGTTACGAGTTATCTAAGCTTTACTTCCTAAAGAACGTCAGGACGGACGTGGAAAAGAACTGGCTCGGCAAAGTGAAATACAGACAGATCAGCTCAGTTTATGACATCTGTGATAGTGAAGAAGCAGTGTATCTATTTCCATCAAGGCATAAGAGTGGAAGCAGACCAGATTTCATATTACCTTTTTTGAAAGCCGTGTTAATAAGCTGCATCAGTAGCCAATGGCAAGTGGTCTACATTTCTTACCTAATACTGGAAATTACATACTATATGCACAGGAAAATCATAGATGAGGTGTCAGGAGGAGCAAATTTTTTATCAAGACTTATAGCAGCCATCATAGAATTAAATTGGGCCATAGATGATGAGGAATGTAAAGGGCTGAAGAAACTGTATCTCTTGTCAGGGAGAGTGAAGAACTTGATAGTTAAACACAAGGTAAGAAATGAAGCCGTCCACAGATGGTTTGGTGAGGAGGAAATATACGGGGCACCCAAGGTGATTACTATCATAAAAGCTAGTACCCTAAGCAAAAACAGGCACTGCATAATTTGCACGATCTGTGAAGGGAAAGATTGGAATGGAGCCAACTGCCCAAAGTGTGGAAGACAAGGAAAGCCCATAACATGTGGAATGACACTCGCAGACTTTGAGGAGAAACATTACAAAAAGATATTTATAAGAGAAGGATGCCACGATGGGCCCTTCAGGGAAGAGTATAAGGGTTACATCCAATACACAGCCAGAGGACAACTCTTTCTGAGGAACCTACCAATTCTAGCGACGAAGATGAAGCTATTAATGGTGGGGAACCTCGGCGCAGAAATTGGCGACTTGGAACATCTAGGATGGGTACTGAGAGGGCCAGCCGTGTGCAAGAAAATTACCAACCATGAGAAGTGCCACGTAAACATCATGGATAAGCTAACTGCATTTTTTGGAATCATGCCTAGAGGCACAACCCCTAGGGCACCTGTGAGGTTCCCCACAGCACTACTGAAAGTGAGAAGGGGGCTAGAGACAGGATGGGCTTATACACACCAAGGAGGGATCAGCTCGGTGGACCATGTCACAGCCGGAAAGGATTTACTAGTGTGTGA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| 10,389 |
LC727649.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Dong,H.V., Suzuki,M., Takemae,H., Jamsransuren,D., Matsuda,S., Nguyen,H.D., Mizutani,T., Takeda,Y., Ogawa,H.
|
Department of Veterinary Medicine; 2-11 Inada, Obihiro, Hokkaido 080-8555
|
Japan
|
2023-01-05
|
Tokachi-47
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,260 |
GenBank
| 1 |
Japan:Hokkaido
|
Japan
|
Bos taurus
| null |
2017-03-24
|
SAMD00518795
|
PRJDB14131
|
Bovine viral diarrhea virus 2 Tokachi-47 RNA, nearly complete genome
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AAGTACTCGTATACAGATTGGATGTTGACAAAATATCGAATTGACAAGGTAGGGAACTTTCCCCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAAGGAGGGGACTAGCGGTAGCAGTGAGTTCATTGGATGGCCTAATCCCTGAGTACAGGGAAGTCGTCAATGGTTCGACACTCCATCAGTTGTGGAGTCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCATGCCCAGGGCACATCTTAACCTATGCGGGGGTTGCATAGGCGAAAGCACCATTTGCGGTGTTATGGACACAGCCTGATAGGGTGTAGCAGAGACCTGCTATTCCGCTAGTAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGTTTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATATAAACAAAAACCAGCAGGCATCGTGGAACCCGTTTATGACATCAATGGGCGTCCATTATTCGGGGAGAGCAGTGGGATACATCCGCAATCTACATTAAAGCTACCACACCAACGGGGCAGCGCTAACATCTTAACCAATGCTAGGTCCCTGCCGCGGAAAGGCGACTGCCGGAAAGGCAATGCGAACGGAGCGGTGAGTGGTATCTACATTAAACCAGGGCCAGTCTACTATCAGGACTATGCAGGGCCCGTATATCATAGAGCCCCACTGGAACTATGTAGAGAGGCGAGCATGTGTGAAACAACTAGGAGAATTGGCAGAGTGACCGGTAGTAATGGAAATCTATACCATATCTATGTCTGCATCGACGGGTGCATCCTCCTAAAGAGGGCAATTCGGGACCAACCAGAAGTCCTCAAATGGGTATACAACAGATTAAACTGCCCATTATGGGTCACCAGCTGCTCTGATGAGGGAGGTAAGGGTGCTACAAGCAAGAAGCAGCCTAAACCAGATAGGATAGAAAAAGGTAAGATGAAAATAGCCCCTAAAGAGACAGAAAAGGATAGTAAAACCAGACCCCCTGACGCAACTATAGTAGTAGAAGGGGTTAAGTACCAGGTGAAGAAGAAAGGAAAGGTAAGAGGAAAAAACACTCAAGATGGGTTGTATCACAATAAGAATAAACCCCCCGAATCAAGAAAGAAATTGGAGAAGGCACTGTTAGCATGGGCCATCTTGGCAGTGGTTTTGCTTCAGCTAGTCACGGGAGAGAACATTACCCAGTGGAACCTGATGGACAACGGTACCGAAGGCATACAGCAAGCAATGTTCCTAAGGGGGGTGAATAGGAGTCTACACGGGATTTGGCCAGAAAAGATTTGCACCGGAGTACCAACTCACTTAGCTACAGACTATGAGCTCAAGGAGATAGTGGGGATGATGGACGCAAGTGAGAAGACCAACTATACATGCTGCAGGTTGCAAAGGCATGAGTGGAATAAACATGGTTGGTGCAACTGGTTTCACATAGAACCATGGATATCGCTAATGAACAAAACCCAAAGCAACCTGACTGAAGGACAGCCGCCTAGGGAGTGCGCTGTGACCTGTAGGTATGATAAGGAAACTGAATTGAACATCGTAACACAGGCTAGGAACAGCCCTACAACCTTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCATTTGCGGGTATTGTGCTAAATGGGCCCTGCAACTTTAAAGTATCAGCTGAGGACGTGCTGTTTAAGGAGCACGATTGCGGCACCATGTTACAGGAGACCGCGATACAGCTACTTGATGGTGTAACCAACACAATCGAGGGAGCAAGGGCAGGGACGGCCAAGTTAACAACCTGGTTGGGAAAACAATTAAAAATCCTTGGTAGGAAGTTAGAGAATAAAAGCAAAGCATGGTTTGGTGCACATGCAGCAAGTCCATACTGTGATGTGGAGAGAAAGATAGGTTACATCTGGTACACAAAAAACTGCACTCCAGCTTGCCTACCGAGAAACACTAAGATAATAGGCCCCGGGAAGTTCGACACCAACGCCGAAGATGGCAAAATACTCCATGAGATGGGGGGGCACCTCTCAGAATTCGTCCTATTGTCCTTGGTGGTTTTATCTGACTTTGCCCCAGAAACAGCGAGTGTCATCTACTTGGTTCTACATTTTACGATCCCGCAAAGCTACGTCAGCGTAGACACATGCGACAAGAACCAGTTGAATTTAACGGTCGCAACTACAGTAGCAGAAGTCATACCAGGGTCAGTGTGGAACCTAGGAAAGTATGTTTGTATAAGACCAGACTGGTGGCCATATGAGACGACCGCAGTTTTCGTCTTGGAGGAGGCAGGCCAAGTAGTCAAATTAGGGCTAAGGGCCATCAAAGACTTAACCAGGATATGGAACGCTGCCACCACCACAGCCTTCTTAGTCTTTTTAGTGAAAGCACTAAGGGGACAACTAATCCAAGGGCTATTGTGGCTGATGTTAATAACAGGGGCACAGGGCTTCCCTGAATGCAAAGAGGGCTTCCAGTATGCCATATCAAAAGACAAAAAGATGGGGTTATTGGGGCCAGAGAGTTTAACTACGACATGGCACTATCCCACTAAAAAACTAATTGACTCCATGGTACAGGTATGGTGTGAAGGAAAGGACTTGAAAATATTAAGGACGTGCACAAAGGAAGAGAGGTACTTAGTGGCTGTGCACGAAAGAGCCTTATCAACCAGTGCTGAATTTTTAAAGATCAGCGATGGGACAACTGGCCCAGAGGTGATAGATATGCCTGATGACTTTGAGTTCGGACTCTGCCCTTGCGACTCAAAACCAATAATAAAGGGTAAATTCAATGCTAGCTTACTAAATGGACCAGCTTTCCAAATGGTATGTCCACAAGGGTGGACAGGTACAATAGAATGCACCCTAGCGAACCAAGACACCTTGGATACAACTGTTATTAGGACATATAGAAGAACCACCCCATTTCAACGGAGAAAATGGTGTGTATATGAAAAAATAATAGGGGAAGATATCTATGAATGCATTCTTGGTGGAAACTGGACATGCATAACTGGCGACCACAGCAAGTTGAGAGATGGGCCTATTAAGAAGTGTAAGTGGTGCGGCTATGACTTCCCCAGCCCAGAGGGGCTGCCACACTACCCAATAGGCAAGTGCATGCTCAGCAATGAGAGTGGGTACAGGCATGTAGATGACACCTCTTGTGATAGGGGTGGTGTTGCCATAGTTCCAACAGGCACCGTGAAGTGTAGAATAGGCAACGTCACGGTACAGGTCATCGCCACTAATAAGGACCTGGGGCCCATGCCCTGCAGCCCATCTGAAGTAATAGCGAGTGAAGGCCCAGTGGAAAAGACGGCATGCACGTTCAACTATGCAAAGACATTACCTAATAAGTATTATGAGCCAAGGGACCGGTACTTCCAACAATACATGTTAAAAGGGGAGTGGCAATATTGGTTTGACCTGGATTCTGTAGACCACCACAAAGATTACTTTTCAGAGTTCATAATCATAGCAGTGGTTGCCTTATTGGGTGGTAAATATGTACTGTGGCTCTTAGTAACATACATGATACTGTCCGAGCAGATGGCCATGGGTGCTGGAGTGAATACTGAAGAGATAGTCATGATAGGCAACTTGCTGACACACAGTGACATTGAGGTTGTGGTCTATTTCCTTCTTTTGTACTTAATAATCAAAGAAGAACCGGTGAGAAAATGGGTTGTACTAGTGTACCACATCCTTGTAGCCAGTCCCATGAAAACAATCGGAGTCATCCTACTACTGTTAGGGGGAATGGTGAAGGCCAGCAAGATTAATACTGATGACCAGAGTGCAATGGACCCATGCTTTTTTCTTGTAACAGGCTTAGTGGCTGTTTTGATGGTCGCTAGAAGAGAACCTGCCACCTTACCACTAGTTGTAGCATTGCTGGCAATAAGAACATCAGGATTCCTATTACCTGCTAGCATTGATATAACTGTAGCAGTGGTATTAACTGTACTCTTACTAGCCAGCTACGTAACGGACTATTTTAGATATAAAAAGTGGCTCCAATTCTCATTCAGCCTGATAGCTGGTATTTTCATTATAAGGAGCTTGAACCACATCAACCAGATGGAAGTTCCAGAAATGTCCATACCAAGGTGGAGACCTCTAGCCCTTGTTTTTTTATATATAATATCAACAGCAATAACCACTAGTTGGGATATTGACTTAGCAGGCTTTCTATTGCAGTGGGCACCAGCAGTGATAATGATGACCACCATGTGGGCAGACTTCTTGACTCTAATCGTAGTCTTACCCAGTTACGAGCTATCAAAACTCTACTTCCTAAAGAACGTCAGGACAGACGTGGAAAAGAACTGGATTGGCAAAGTGAAATACAGACAGATCAGCTCAGTTTATGATATTTGTGACAGTGAAGAGGCAGTATACCTATTTCCATCAAAGCATAAAAGTGGGAGTAGACCAGATTTCATATTACCTTTTGTGAAAGCTGTATTGATAAGCTGCATCAGTAGCCAGTGGCAGATGGTATACATTTCTTACCTGATGCTGGAAATCACATACTATATGCACAGGAAAATCATAGACGAGGTGTCAGGGGGAGCAAACTTTTTGTCAAGACTTATAGCAGGCATCTTGGAATTGAATTGGGCTATAGATGATGAGGAATGTAAAGGACTGAAGAAACTGTATCTCTTATCAGGGAGGGTGAGGAATCTGATAGTCAAGCACAAGGTAAGAAACGAAGCCGTCCACAGATGGTTTGGCGAGGAGGAAATATACGGGGTACCCAAGTTGATCACCATCATAAAAGCTAGTACTCTCAGCAAAAATAAGCACTGCATAGTCTGCACGATCTGTGAAGGGAAAGATTGGAACGGAGCCAACTGCCCAAAGTGTGGAAGACAGGGAAAACCTATAACATGTGGTATGACACTCGCAGACTTTGAAGAGAAACATTACAAAAAGATATTCATAAGAGAAGGGTGCCATGGTGGACCTCTCAGAGAAGAGTATAAGGGTTATGT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| 19,724 |
LC727650.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Dong,H.V., Suzuki,M., Takemae,H., Jamsransuren,D., Matsuda,S., Nguyen,H.D., Mizutani,T., Takeda,Y., Ogawa,H.
|
Department of Veterinary Medicine; 2-11 Inada, Obihiro, Hokkaido 080-8555
|
Japan
|
2023-01-05
|
Tokachi-31
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,174 |
GenBank
| 1 |
Japan:Hokkaido
|
Japan
|
Bos taurus
| null |
2016-05-24
|
SAMD00518794
|
PRJDB14131
|
Bovine viral diarrhea virus 2 Tokachi-31 RNA, nearly complete genome
|
TTTCCCCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAAGGAGGGGACTAGCGGTAGCAGTGAGTTCATTGGATGGCCTAATCCCTGAGTACAGGGAAGTCGTCAATGGTTCGACACTCCATCAGTCGTGGAGTCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCATGCCCAAGGTACATCTTAACCTATGCGGGGGTTGCATAGGCGAAAGCACCATTCGCGGTGTTATGGACACAGCCTGATAGGGTGTAGCAGAGACCTGCTATTCCGCTAGTAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGTTTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATATAAACAAAAACCAGCAGGCATCGTGGAACCCGTTTATGACATCAATGGGTGTCCATTATTTGGGGAGAGCAGTGGGATACATCCGCAATCTACATTAAAGCTACCACACCAACGAGGCAGCGCTAACATCTTAACCAATGCTAGGTCCCTGCCGCGGAAAGGCGACTGCCGGAAAGGCAATGTGAACGGAGCGGTGAGTGGTATCTACATTAAACCAGGGCCAGTCTACTATCAGGACTATGCAGGGCCCGTATATCATAGAGCCCCACTGGAACTATGTAGAGAGGCGAGCATGTGTGAAACAACTAGGAGAATTGGCAGAGTGACCGGTAGTAATGGGAAACTATACCACATCTATGTCTGCATCGATGGGTGCATCCTCCTGAAGAGAGCAATTCGGGACCAACCAGAAGTCCTCAAATGGGTATACAACAGATTAAACTGCCCATTATGGGTCACCAGCTGCTCTGATGAGGGAGGTAAGGGTGCTACAAGCAAGAAGCAGCCTAAACCAGATAGGATAGAAAAAGGCAAGATGAAAATAGCCCCTAAAGAGACAGAAAAGGATAGTAAAACCAGGCCCCCTGACGCAACTATAGTAGTAGAAGGGGTTAAGTACCAGGTGAAGAAGAAAGGAAAGGTAAGAGGAAAAAACACTCAAGATGGGTTGTATCACAATAAGAATAAACCCCCCGAATCAAGAAAGAAATTGGAGAAGGCACTGTTAGCATGGGCCATCTTGGCAGTGGTTTTACTTCAGCTGGTTACGGGAGAGAACATTACCCAGTGGAACCTGATGGACAACGGTACTGAAGGCATACAGCAAGCGATGTTCCTAAGGGGGGTGAATAGGAGTTTACACGGAATTTGGCCAGAGAAGATTTGCACCGGAGTACCAACTCACTTAGCTACAGACTATGAGCTCAAGGAGATAGTGGGGATGATGGACGCAAGTGAGAAGACCAACTACACATGTTGCAGGTTGCAAAGGCATGAGTGGAATAAACATGGTTGGTGCAACTGGTTTCACATAGAACCATGGATACAGCTAATGAACAAAACCCAAAGCAACCTAACTGAAGGACAGCCGCCTAGGGAGTGCGCTGTGACCTGTAGGTATGACAGGGAAACTGAATTGAACATCGTAACACAGGCTAGGAACATCCCTACAACCTTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCATTTGCGGGTATTGTGCTAAATGGGCCCTGCAACTTTAAAGTATCAGCTGAAGACGTGCTGTTTAAGGAGCACGATTGCGGCAACATGCTACAGGAGACCGCGATACAGCTACTTGATGGTGCAACCAACGCAATCGAGGGAGCAAGGGCAGGAACAGCCAAGTTAACAACCTGGTTGGGGAAACAATTAGGAATCCTTGGTAAGAAGTTAGAGAATAAAAGCAAAGCATGGTTTGGTGCATATGCAGCAAGTCCATACTGTGATGTGGAGAGGAAGATCGGTTACATCTGGTACACAAAAAACTGCACTCCAGCTTGCCTACCGAGAAACACTAAGATAATAGGCCCCGGGAAGTTTGATACCAATGCCGAAGATGGCAAAATACTCCATGAGATGGGGGGGCACCTCTCAGAATTCGTCCTATTGTCCTTGGTGGTTTTATCTGACTTTGCCCCAGAAACGGCGAGTGTCATCTACTTGGTTCTACATTTTACAATCCCGCAAAGCTACGTCAGCATAGACACATGCGACAAGAACCAGCTGAATTTAACGGTCGCAACTACAGTAGCAGAAGTCATACCAGGGTCAGTGTGGAACCTAGGAAAGTATGTTTGTATAAGACCAGACTGGTGGCCATATGAGACGACCACAGTTTTCGTCTTAGAGGAGGCAGGCCAAGTAGTCAAATTAGGGCTAAGGGCCATCAGAGACTTAACCAGGATATGGAACGCTGCCACCACCACGGCCTTCTTAGTCTTTTTAGTGAAAGCACTAAGGGGACAACTAATCCAAGGGCTATTGTGGCTGATGTTAATAACAGGGGCACAGGGCTTCCCTGAATGCAAAGAGGGCTTCCAGTATGCCATATCAAAAGACAAAAAGATGGGGTTATTAGGGCCAGAGAGTTTAACTACGACATGGCACTATCCCACTAAAAAATTAATTGACTCCATGGTACAGGTATGGTGTGAAGGAAAGGACTTGAAAATATTAAGGACGTGCACAAAGGAAGAGAGGTACTTAGTGGCCGTGCACGAAAGAGCCCTATCAACCAGTGCTGAATTTTTAAAGATCAGTAATGGGGCAACTGGCCCAGAGGTGATAGATATGCCTGATGACTTTGAGTTCGGACTCTGCCCTTGCGACTCAAAACCAATAATAAAGGGTAAATTCAATACTAGCTTACTAAATGGACCAGCTTTTCAGATGGTATGTCCACAGGGGTGGACAGGTACAATAGAATGCACCCTAGCGAACCAAGACACCTTGGATACAACTGTTATTAGGACATATAGAAGAACCACCCCATTTCAACGGAGAAAATGGTGTGCATATGAAAAAATAATAGGGGAAGATATCCATGAATGCATTCTTGGTGGAAACTGGACATGCATAGTTGGCGACCACAGCAAGTTGAAAGATGGGCCTATTAAGAAGTGTAAGTGGTGCGGCTATGACTTCTCCGGCCCAGAGGGTCTGCCACACTACCCAATAGGTAAGTGCATGCTCAGCAATGAGAGTGGGTACAGGTATGTAGATGACACCTCTTGCGATAGGGGTGGTGTGGCCATAGTTCCAAGAGGCACCGTGAAGTGTAAAATAGGCAACGTCACAGTACAGGTCATCGCCCTTAATGAGGACCTGGGGCCCATGCCCTGCAGCCCATCTGAAGTAATAGCAAGTGAAGGCCCAGTGGAAAAGACGGCATGCACGTTCAACTATTCAGAGACATTACCTAATAAGTATTATGAGCCAAGGGACCGGTACTTCCAACAATACATGTTAAAAGGAAAGTGGCAATATTGGTTTGACCTGGATTCTGTAGACCACCACAAAGATTACTTTTCAGAGTTCATAATCATAGCAGTGGTTGCCTTGTTGGGTGGTAAATATGTACTGTGGCTCTTAGTAACATACATGATACTGTCCGAGCAGATGGCCATGGGTGCTGGAGTGAATACTGATGAGATAGTCATGATAGGCAACCTGCTGACACACAGTGACATTGAGGTTGTGGTCTATTTCCTTCTTTTGTACTTAATAATCAAAGAAGAACCGGTGAGGAAATGGATTATACTAGTGTACCACATCCTTGTAGCCAGTCCTATGAAAACAATCGGAGTCATCCTGCTGCTGTTAGGGGGAATGGTGAAGGCCAGCAAGATCAATACTGATGACCAGAGTGCAATGGACCCATGCTTTTTTCTCGTAACAGGCTTAGTGGCTGTTTTGATGGTCGCTAGAAGAGAACCTGCCACCTTACCACTAGTTGTAACATTGCTAGCAATAAGAACATCAGGATTCCTATTACCTGCTAGCATTGATATAACTGTAGCAGTAGTATTAACTGTACTTCTACTAGCCAGCTACGTAACTGACTATTTTAGATATAAAAAGTGGCTCCAATTCTCATTCAGCCTGATAGCTGGTATTTTCATTATAAGGAGCTTGAATCACATCAACCAGATGGAAGTTCCAGAAATGTCCATACCAAGGTGGAGACCTCTAGCCCTTGTTTTTTTATATATAATATCAACAGCAATAACCACTAGTTGGGATATTGACTTAGCAGGCTTTCTATTGCAATGGGCACCAGCAGTGATAATGATGACCACCATGTGGGCAGACTTTTTGACTCTAATCGTAGTCTTACCCAGTTACGAGCTATCAAAGCTCTACTTCCTAAAGAACGTCAGGACAGACGTGGAAAAGAACTGGATTGGCAAAGTGAAATACAGACGGATCAGCTCAGTTTATGATATTTGTGACAGTGAAGAGGCAGTATACCTATTTCCATCAAGGCATAAGAGTGGGAGTAGACCAGATTTCATACTACCTTTTATGAAAGCTGTGTTGATAAGCTGCATCAGTAGCCAGTGGCAGTTGGTCTACATCTCTTACCTGGTGCTGGAAATCACATACTATATGCACAGGAAAATCATAGACGAGGTGTCAGGGGGAGCAAACTTTTTGTCAAGACTCATAGCAGGCATCTTGGAATTAAATTGGGCCATAGATGATGAGGAATGTAAAGGACTGAAAAAACTGTATCTCTTATCAGGGAGGGTGAGGAATCTGATAGTCAAACACAAGGTAAGAAACGAAGCCGTCCACAGATGGTTTGGTGAGGAGGAAATATACGGGGTACCCAAGGTGATCACCATCATAAAAGCCAGTACCCTCAGCAAAAACAAGCACTGCATAGTCTGCACGATCTGTGAAGGGAAAGATTGGAACGGAGCCAACTGCCCAAAGTGTGGAAGACAGGGAAAACCTATAACATGTGGTATGACACTCGCAGACTTTGAAGAGAAACATTACAAAAAGATATTCATAAGAGAAGGGTGCCATGGTGAACCTCTCAGGGAAGAGTATAGGGGTTATGTTCAATACACAGCCAGAGGACAACTCTTTCTGAGGAACCTACCAATTCTAGCGACGAA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GTGGGGTTTACATGGGGACTATACCAGCAAGGCGTCTCAAGATCCACCCTTATGAGGCCTACCTTAAACTCAAAGAGCTGGTGGAAACTGAGCTTTCGAAGGTTGCAGCAAAAGAATCCATCATAAAAGAACATAACACCTGGATTTTGCGGAAAGTGAAACATGAAGGGAACTTAAGAACTAAATCAATGATTAACCCTGGGAAAGTATCAGAACAGCTGTGCAGAGAGGGACACAAAAGAAACATATATAATAAGATTATAGGCTCAACAATGACCTCTGTTGGCATCAGGCTGGAAAAACTGCCAGTAGTCCGAGCCCAAACTGACACAACCAACTTCCACCAAGCTATAAGAGAGAAAATCGATAAACCAGAAAACAAGCAAACCCCTGAACTGCATGGAGAGCTAATGAAAGTTTTCGATTGCTTAAAGATCCCAGAGCTGAAGGAATCGTATGATGAAGTCCCATGGGAACAGTTAGAAGCAGGGATAAACCGCAAAGGAGCAGCTGGTTTTCTAGAGAGTAAGAACATAGGTGAAGTGCTAGACAGGGATAAACACAGAGTAAAACAACTGATCAGGGATCTGAGGAAAGGGAAGAAGATCAGGTACTATGAAACAGCCATTCCCAAGAATGAGAAGAGAGACGTCAGTGACGACTGGGAAGCTGGAGAATTCGTTGATGAAAAGAAGCCAAGAGTAATCCAGTACCCGGACGCCAAGGTGAGGCTGGCCATTGCAAAAGTAATGTACAAGTGGGTAAAGCAGCAACCAGTGGTAATACCAGGCTATGAGGGCAAAACACCGCTATTTGACATATTTAATAAGGTAAAGAAGGAATGGGATTCATTCCAGGACCCTGTAGCGGTGAGCTTTGACACCAAAGCATGGGATACACAAGTTACTAGTAGAGACCTAATGTTGATAAGAGACATCCAAAAATATTATTTCAAGAAAAACATACACAAATTCTTAGATACAATAACAGAACACATGGTGGAGGTACCCGTCATTACATCAGACGGCGAAGTTTACATAAGGAATGGTCAGAGGGGTAGTGGCCAACCCGACACAAGTGCTGGTAATAGTATGTTAAATGTCCTAACAATGATATATGCCTTTTGTAAAAGCACAGGTATACCTTACAGGGGATTCAGTAGGGTAGCAAGAATCCATGTGTGTGGTGATGATGGCTTCCTGATAACAGAAAGAGGACTGGGACTGAAGTTCTCTGAGAAGGGTATGCAGATATTACATGAGGCCGGGAAGCCCCAGAAAATAACTGAAGGGGATAGGATGAAAGTGGCATATAGATTCGAAGACATTGAGTTCTGTTCTCACACTCCCGTGCCGGTCAGATGGGCTGATAACACCAGTAGTTACATGGCAGGGAGAAGCACAGCCACTATACTAGCTAAGATGGCAACAAGGTTGGATTCCAGTGGAGAGAGGGGTAGCACAGCTTATGAGAAGGCCGTAGCCTTTAGCTTCCTTTTGATGTACTCATGGAATCCAGTAGTTAGAAGGATCTGCCTAATGGTGCTATCACAATATCCCGAAGTGATCCCATCCAAACATACAATATACTACTACCAAGGGGATCCCATAGCAGCATATAGAGAAGTGATAGGGAAACAGCTATGTGAACTGAAGAGGACAGGATTTGAGAAGCTAGCCAGTCTGAATCTGAGTATGACCACTTTAGGTATCTGGACAAAACATACCAGTAAAAGACTAATCCAGGACTGTGTAGAGATAGGTAAGAAAGAAGGCAACTGGTTAGTTAATGCCGACAGACTGATTTCAGGAAAGACTGGGAAGTTTTACATCCCAAGCACTGGCGTCACCCTGTTGGGAAAACATTATGAGGAAATTAACTTGAAACAAAAGGCGGGGCAACCGCCAATAGAAGGGGTTGACAGATATAAGTTGGGCCCCATAGTTAATATCATCTTGAGAAGACTGAGGGTGATGCTGATGGCAGTAGCAGGCGGAAGCCGGTGAACCTGTCCAGGGCATCGCACCCCCATTAAAGGTATTTAATTGTAAATATTGTAAATAGACAGCTAAGATATTTATTGTAGTTGGAAAGAATTGTAGTGATAGCAAATACCCCAATTTAACACTACCTCCAATGCACTAAGCACTTTAGCTGTACGAGGTTAACTCGAC
| 19,725 |
OP792028.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Chai,C.X., Zhang,F., Yin,H., Diao,Y., Zhou,Y.Y., Zhang,J.L., Niu,R., Wang,W.
|
Inner Mongolia University, State Key Laboratory of Reproductive Regulation and Breeding of Grassland Livestock
|
China
|
2022-12-26
| null |
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,233 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2021
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 strain BVDV2NM21, complete genome
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| 20,175 |
MN527354.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
LI,Y., Mao,L., Luo,X.
|
Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology
|
China
|
2021-10-06
| null |
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,235 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Bos taurus
| null |
2018-08-10
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 strain GS2018, complete genome
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CTAAAGTACTCGTATACAGATTGGATGTTGACAAAATATTGAATTGGTTAAGTAGGGAATTCTCCCCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAAGGAGGGGACTAGCGGTGGCAGTGAGTTCATTGGATGGCCGAATCCCTGAGTACAGGGAAGTCGTCAATGGTTCGACACTCCATCAACCGAGGAGTCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCATGCCCACGGCACATCTTAACCTATGCGGGGGTTGCATGGGTGAAAGCACCATTCGTGGTGTTATGGACACAGCCTGATAGGGTGTAGCAGAGACCTGCTATTCCGCTAGTAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATATAAACAAAAACCAGCAGGTGTTATGGAACCTGTTTACGACATCGACGGGCGTCCACTGTTTGGAGAGAGCAGCGAGGTACACCCACAATCCACACTAAAGCTACCACACCAACGAGGCAGTGCTAACATCCTAACCAATGCTAGGTCCTTGCCGCAGAAAGGTGATTGCCGAAAAGGCAATGTGAATGGAACGGTGAGTGGTATTTACATTAAACCAGGGCCGGTCTACTATCAAGACTATGCGGGGCCTGTCTATCATAGAGCCCCACTGGAATTATGTAGAGAGGCGAGCATGTGTGAAGTGACTAGGAGAGTTGGCAGAGTGACCGGTAGCAATGGGAAATTATACCACATCTATGTTTGCGTGCATGGGTGTATCCTCCTAAAGAGGGCTACTAGGAACCAACCAGAAGTCCTCAAATGGGTATACAACAGATTAAATTGCCCATTATGGGTAACCAGCTGCTCCGATGAAGGGGGTAAGGGTGTTCCAAACAAGAAACAGCCTAAGCCTGATAGGATAGAAAAAGGCAAGATGAAAATAGCCCCTAAAGAAACAGAAAAAGATTGTAAAACCAGACCCCCTGACGCAACTATAGTAGTAGAAGGGGTTAAGTACCAGGTGAAGAAGAAAGGAAAGGTAAGGGGTAAAAATACCCAAGATGGGTTGTATCACAATAAGAACAAACCCCCTGAATCAAGAAAGAAACTGGAGAAGGCACTGTTAGCATGGGCCATCTTGGCAGCGGTTCTGTTTCAGCTGGTTACGGGAGAGAATATTACCCAGTGGAACTTGATGGACAATGGCACCGAAGGTATACAGCAAGCAATGTTTCTAAGAGGGGTAAACAGAAGTCTACATGGAATTTGGCCAGAGAAGATTTGCACTGGAGTACCAACACACTTAGCAACAGACTATGAACTCAAGGAGATAGTGGGGATGATGGACGCGAGTGAGAAGACCAACTACACGTGTTGCAGGTTGCAAAGGCATGAGTGGAATAAACACGGTTGGTGTAACTGGTTCCATATAGAACCTTGGATATGGCTGATGAACAAAACCCAAAGCAACCTAACTGAAGGACAGCCGCCTAGGGAGTGCGCTGTGACCTGCAGGTATGACAGGGAAACAGAGTTGAACATCGTAACACAGGCTAGGGACAGTCCTACAACTTTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAATTTTTCCTTTGCAGGTATTGTACTAAATGGGCCCTGTAACTTTAAGGTAGCAGTTGAAGACGTGCTGTTTAAGGAGCACGATTGCGGTAACATGCTGCAGGAGACCGCACTACAGCTACTTGGTGGGGCGACCAACACCATTGAGGGAGCAAGGGTAGGGACGGCCAAGTTGACAACCTGGTTAGGGAAGCAATTAGGGATCCTTGGTAAAAAGTTGGAGAATAAGAGCAAAGCATGGTTTGGTGCACATGCAGCAAGCCCATACTGCGATGTAGAGAGGAAGATCGGTTACATCTGGTATACGAAAAACTGCACTCCAGCTTGCCTGCCAAGAAACACTAGGATAATAGGCCCCGGGAAATTCGACACTAACGCTGAAGATGGCAAAATACTCCATGAGATGGGGGGACACCTCTCAGAGTTTGCCCTATTGTCCTTAGTGGTTCTGTCTGACTTTGCCCCAGAAACCGCGAGTGCCATCTACTTGGTTCTACACTTTGCGATCCCGCAAAGTTATGTTAGTGTAGACACATGTGATAAAAACCAGCTGAATTTAACGGTCGCAACTACGGTAGCAGAAGTCATACCAGGGTCAGTGTGGAACCTAGGAAAGTACGTCTGCATAAGACCAGACTGGTGGCCATATGAGACAACCACAGTCTTTGTTTTAGAGGAAGCAGGCCAAGTAGTCAAATTGGGGCTAAGGGCCATCAGAGACTTAACTAGAATATGGAATGCTGCTACCACCACAGCCTTCTTAGTCTTTTTAGTGAAAGTACTGAGGGGACAACTAATCCAAGGGCTATTGTGGCTGATGCTAATAACGGGGGCACAGAGCTTCCCTGAATGCAAAGAGGGCTTCCAATATGCCATATCAAAAGACAAAAAAATGGGGTTATTGGGACCAGAGAGTTTAACTACGACATGGCACCTTTCCACCAAGAAATTAGTGGATTCCATGGCACAGGTATGGTGTGAAGGAAAAGACTTGAAAATATTAAGAACGTGCACAAAGGAAGAGAGGTACCTAGTGGCAGTGCACGAAAGAGCCCTATCAACCAATGCTGAATTTATGCAGATCAGTAATGGGACAATAGGCCCAGAAATGATAGATATGCCTGATGACTTTGAGTTTGGACTCTGTCCTTGCGATTCAAAACCAATAATAAGGGGCAAATTTAATGCTAGCTTACTGAATGGACCAGCTTTCCAGATGGTATGCCCACTGGGGTGGACTGGTACAATAGAATGCATCCTAGCGAACCAGGACACCTTGGACACAACTGTAATTAGGACATATAGAAGAACTACTCCATTTCAGCGGAGAAAATGGTGTGCTTATGAAAAGATGGTAGGGGAGGATATCCATGAATGCACTCTTGGTGGAAACTGGACATGCATAGCTGGTGACCATAGCAAGTTGAAAGATGGACCTATCAAGAAGTGTAAGTGGTGCGGCTACGACTTCTTCAACTCAGAGGGACTGCCACATTACCCAATAGGCAAGTGTATGCTCAGCAATGAGAGTGGGTATAGATATGTAGATGACACCCCTTGCGATAGAGGTGGTGTAGCCATAGTTCCAACAGGCACCGTAAAGTGCAGAATAGGTAACGTCACGGTGCAAGTTATCGCCACGAATAAGGACCTGGGACCCATGCCCTGCAGCCCAGATGAAGTGGTAGCAAGTGAAGGACCAGTGGAAAAGACGGCATGCACGTTCAACTATTCAAAGACACTACCTAACAAGTATTATGAGCCAAGGGACCGGTACTTCCAACAGTACATGTTAAAAGGAGAGTGGCAATATTGGTTTGACCTGGATTCCGTAGACCACCATAAAGATTACTTTTCAGAGTTCATAGTCATAGCAGTGGTAGCTTTGTTGGGTGGTAAGTATGTATTGTGGCTCTTAGTAACATACATGATACTGTCCGAGCAGATAGCTATGGGTGCTAGAGTGAACACTGAGGAGATAGTCATGATAGGCAACTTGCTAACACACAATGATATTGAGGTTGTGGTCTATTTTCTTCTTTTGTACTTAATAGTCAAAGAGGAACTGGTGAGGAAATGGATTATACTAGTGTACCACATCCTTGTAGCCAATCCTATGAAAACAATCGGGGTTATCCTACTAATGCTAGGGAGTGTGCTGAAGGCCAGAGAAATCAACACTGGTGACCAAAGTGCTATGGACCCATGCTTTCTTCTCGTAACAGGCTTAGTGGCTGTTTTGATGATTGCTAGAAGAGAACCTGCCACCTTACCACTGGTTGTCGTATTGTTAGCAATTAGAACATCAGGATTCTTATTACCCGCTAGCATTGATATAACTGTAGCAGTGGTATTAACTGTGCTTTTGCTAGCTAGCTACGTAACAGACTATTTTAAATATAAAAAGTGGCTTCAATTTTCATTTAGTCTAATAGCTGGTATTTTTATTATAAGGAGTTTAAAACACATCAATCAGATGGAGGTACCAGAAATATCTATACCAAGTTGGAGGCCTCTAGCCCTTGTTATCTTTTATATAATATCCACAGCAATAACAACTAATTGGGACATTGACTTAGCAGGCTTCCTACTGCAATGGGCACCAACAGTGATCATGATGGCCACCATGTGGGCAGACTTTTTGACCCTAATCATAGTCCTACCCAGTTACGAGTTATCAAAGCTTTACTTCCTCAAGAACGTCAGGACAGACGTGGAAAAGAACTGGCTTGGCAAAGTGAAATACAAACAGATCAGCTCAGTTTATGATATCTGTGACAGTGAAGAGGCAGTGTACCTATTCCCGTCAAGGCATAAGAGTGGGAGCAGACCAGATTTCATATTACCTTTCTTGAAAGCTGTGTTGATAAGCTGCATCAGTAGCCAGTGGCAGGTGGTCTACATTTCCTACCTGATACTGGAAATCACATACTATATGCACAGAAAAATAATTGACGAGGTGTCAGGAGGAGCAAACTTCTTGTCAAGACTCATAGCAGCCATCCTAGAATTAAACTGGGCCACAGATGATGAGGAATGTAAAGGACTGAAGAAACTGTATCTCCTATCAGGGAGGGTAAGGAATCTGATAGTTAAACACAAGGTAAGAAATGAAACCGTCTACAGATGGTTTGGTGAGGAGGAAATATACGGGGTGCCCAAGGTAATCACCATCATAAGAGCTAGTACCCTCAGCAAAAGTAAGCACTGCATAGTTTGTACAATCTGTGAAGGGAAGGATTGGAATGGAGCCAACTGCCCAAAGTGTGGTAGACAGGGGAAGCCCATAACATGTGGAATGACACTCGCAGACTTTGAGGAGAAACATTACAAGAAAATTTTTATAAGAGAAGGGTGCCCCGATGGACCTCTCAGGGAAGAGTATAAGGGTTA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| 37,390 |
LC649064.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Nishimori,A., Hirose,S., Ogino,S., Andoh,K., Isoda,N., Sakoda,Y., Jizou,M., Nagai,M.
|
Laboratory of Microbiology, Department of Disease Control, Faculty of Veterinary Medicine; Kita 18 jou Nishi 9 tyoume, Sapporo, Hokkaido 060-0818
|
Japan
|
2021-09-03
| null |
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,285 |
GenBank
| null |
Japan: Ishikawa, Kanazawa
|
Japan
|
Bos taurus
| null |
1991
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 KZ-91-NCP genomic RNA, complete genome
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| 38,256 |
MW168422.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Liu,X., Yang,G., Bi,J., Yin,G.
|
Yunnan Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2021-09-01
|
YNJG2020
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,288 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2020-01-06
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate YNJG2020, complete genome
|
GTATACGAGATTAGCTAAAGTACTCGTATACGGATTGGGTGTTAACAAATATTTAATTGGCTAAGTAGGGAATCTTTCCCCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAAGGAGGGGACTAGCGGTAGCAGTGAGTTCATTGGATGGCCGAATCCCTGAGTACAGGGAAGTCGTCAATGGTTCGACACTCCATCAATCGAGGAGTCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCATGCCCACGGCACATCTTAACCTATGCGGGGGTTGCATGGGTGAAAGCGCCATTCGTGGTGTTATGGACACAGCCTGATAGGGTGTAGCAGAGACCTGCTATCCCGCTAGTAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATATAAACAAAAACCAGTAGGTGTTGTGGAACCTGTTTATGACGTCGACGGGCGTCCACTGTTCGGAGAGAGCAGCGAGGTACACCCGCAATCCACACTAAAGCTACCACACCAACGAGGCAGTGCTAACATCCTGACCAATGCTAGGTCCCTGCCGCAGAAAGGTGATTGCCGGAAAGGTAATGTGAATGGAGCGGTGAGTGGTATCTACATCAAACCAGGGCCGGTCTACTACCAGGACTATGCAGGGCCCGTCTATCATAGAGCCCCACTGGAGTTATGTAGAGAGGCAAGCATGTGTGAAGTGACCAGGAGAATTGGCAGAGTGACCGGTAGCAATGGGAAATTATACCACATCTATGTCTGCATGGATGGGTGTGTCCTCCTGAAGAGGGCGACTAGGAACCAACCAGAAGTCCTCAAATGGGTGTACAACAGATTAAATTGTCCATTGTGGGTCACCAGCTGCTCCGATGAAGGGGGTAAAGGTGTTCCAAACAACAAGAAGCAGCCTAAGCCTGACAGGATAGAAAAAGGTAAGATGAAAATAGCCCCTAAAGAGACAGAAAAAGATTGTAAAACCAGACCCCCTGACGCAACTATAGTAGTAGAAGGGGTTAAGTACCAGGTGAAGAAGAAAGGAAAGGTGAGGGGTAAAAATACCCAAGATGGGTTGTATCACAACAAGAACAAACCCCCTGAATCAAGAAAAAAACTGGAGAAGGCACTGTTAGCGTGGGCCATCTTGGCAGCGGTTCTGCTTCAGCTGGCCACGGGAGAGAATATTACCCAGTGGAACTTGATGGACAACGGCACTGAAGGTATACAGCAAGTAATGTTTCTAAGAGGGGTGAACAGAAGCCTACACGGAATTTGGCCGGAGAAGATTTGCACTGGAGTACCAACTCACTTGGCAACAGACTATGAACTCAAGGAGATAGTGGGGATGATGGACGCGAGTGAGAAGACCAACTACACGTGCTGCAGGTTGCAAAGGCATGAGTGGAACAAACATGGTTGGTGTAACTGGTTCCACATAGAACCGTGGATATGGCTGATGAACAAAACCCCAAGCAATTTAACCGAAGGACAGCCGCCTAGGGAGTGCGCTGTGACTTGTAGGTATGACAGGGAAACGGAGTTGAACATCGTAACACAGGCTAGGGACAGACCTACAACTTTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGGACTTTTCATTCGCGGGTATCGTACTAAACGGGCCCTGCAACTTCAAGGTAGCAGTTGAAGACGTGCTGTTTAAGGAGCACGATTGCGGCAACATGCTACAGGAGACCGCACTACAGCTACTTGATGGGGCGACCAACACCATCGAGGGAGCAAGGGTGGGGACTGCCAAGTTGACAACCTGGTTAGGGAAGCAATTAAGAATCCTTGGTAAGAAGTTGGAGAATAAAAGCAAAGCATGGTTTGGTGCGCATGCAGCAAGCCCATACTGTGACGTGGAGAGGAAGATCGGTTACATCTGGTATACAAAAAACTGCACTCCAGCTTGCCTACCAAGAAACACTAGGATAATAGGCCCCGGGAAATTCGACACCAACGCTGAAGATGGCAAAGTTCTCCATGAGATGGGAGGACACCTCTCAGAATTTGCCATATTGTCCTTAGTGGTTCTGTCTGACTTTGCCCCAGAAACCGCGAGTGCCATCTACTTGGTTCTACACTTTGTGATCCCGCAAAGTCACGTTAGCATAGACACTTGTGACAAGAACCAGCTGAATTTAACAGTCGCAACCACGGTAGCAGAAGTCATACCAGGGTCAGTGTGGAACCTAGGAAAATACGTCTGCATAAGACCGGATTGGTGGCCATATGAGACAACCACAGTCTTTGTTTTAGAGGAAGCAGGCCAAGTAATTAAATTGGGGCTAAGGGCCATCAGAGACTTAACCAGGATATGGAATGCTGCTACCACCACAGCTTTCTTAGTCTTTTTAGTGAAAGTACTGAGGGGACAACTAATCCAAGGGCTATTGTGGCTGATGCTAATAACAGGGGCACAGAGTTTTCCTGAATGCAAAGAGGGCTTCCAATATGCCATATCAAAAGACAAAAGAATAGGGCCATCGGGGCCAGAGAGTTTAACTACGACATGGCACCCTCACACCAAAAAATTAATGGATTCCATGGTACAGGTATGGTGTGAAGGAAAAGACTTGAAAATACTGAAAACGTGCACAAAGGAAGAGAGGTACCTAGTGGCAGTGCACGAAAGAGCCCTATCAACCAGTGCTGAATTTTTGCAGATCAGCGATGGGACAATAGGCCCAGAAGTGATAGATATGCCCGATGACTTTGAGTTTGGACTCTGCCCTTGCGACTCGAAACCAGTAATAAAGGGCAAATTCAATGCTAGCTTACTGAATGGACCAGCTTTCCAGATGGTATGTCCACAGGGGTGGACTGGTAGAATAGAATGCACCCTAGCAAACCAGGACACCTTGGACACAACTGTCATTAGGACATATAGAAGAACTACTCCATTTCAGCGGAGAAAATGGTGTGATTATGAAAAGATAGTAGGGGAAGACATCCATGAATGCATTCTTGGTGGAAATTGGACATGCATAACTGGTGACCATAGTAAGTTGAGAGACGGACCCATCAAGAAGTGTAAGTGGTGTGGTTACGACTTTTTCAACTCAGAGGGACTGCCGCATTACCCAATAGGTAAGTGTATGCTCAGCAATGAGAGCGGGTATAGGTATGTAGATGACACTCCTTGTGATAGGGGTGGTGTAGCTATAGTCCCAACAGGCACCATAAAATGTAGAATAGGTAACGCCACGGTGCAGGTTATCGCCACTAATAGTGACCTCGGACCCATGCCCTGCAGCCCAGATGAGGTAGTAGCTAGTGAAGGACCAGTGGAAAAGACGGCATGCACATTCAACTATTCAAGGACACTACCCAACAAGTATTATGAGCCAAGGGACCGGTACTTCCAACAATACATGTTAAAAGGGGAGTGGCAGTATTGGTTTGACCTGGATTCTGTGGACCACCATAAAGATTACTTTTCAGAGTTTATAGTCATAGCAGTGGTTGCTTTGTTGGGTGGTAAGTATGTATTGTGGCTTCTAGTAACATACATAATACTATCCGAGCAGATAGCTATGGGTGCTAGAGTGAACACTGAAGAGATAGTCATGATGGGCAACTTGCTGACACACAATGACATTGAGGTTGTGGTCTATTTTCTTCTTTTGTACTTAATAGTCAAAGAGGAACTGGTGAGGAAATGGGTTATACTAGTGTACCACATCCTTGTAGCCAACCCTATGAAAACTATTGGGGTTATCCTACTAATGCTAGGGGGTGTGGTGAAGGCCAGAGAAACCAACACTGGTAACCAAAGTGCTATGGACCCATGCTTTCTTCTCGTAACTGGCTTAGTGGCTGTCTTGCTGATCGCTAGAAGAGAACCTGCCACTTTACCACTGGTTGTAGCATTGCTAGCAATTAGAACATCAGGATTCATATTACCCGCTAGCATTGATGTAACCGTAGCAATAGTATTAACTGTGCTTTTGCTAGCTAGCTACGTAACAGACTATTTCAAATATAAAAGGTGGCTTCAATTCTCATTTAGTTTGATAGCTGGTATTTTCATTATAAGGAGCTTGAAACACATTAATCAGGTGGAGGTACCAGAAATATCTATACCAAGTTGGAGGCCTCTAGCCATTGTTATTTTTTATATAATATCCACAGCAATAACAACTAATTGGGATATTGACTTAGCAGGCTTCCTACTGCAATGGGCACCAACAGTGATCATGATGGCCACCATGTGGGCAGACTTTCTGACTCTGATCATAGTTCTACCCAGTTACGAGTTATCAAAGCTTTACTTCCTCAAGAACGTCAGGACAGACGTGGAAAAGAACTGGCTTGGTAAAGTGAGATATAAACAGATCAGCTCAGTTTATGATATATGTGACAGCGAAGAGGCAGTGTACCTATTCCCGTCAAGGCATAAGAGTGGAAGCAGACCAGATTTCATATTACCTTTCTTAAAGGCTGTGTTGATAAGCTGCATTAGTAGCCAGTGGCAGGTGGTCTACATTTCCTACCTGATACTGGAAACTACATACTATATGCACAGTAAAATAATTGACGAGGTGTCAGGAGGAGCAAACTTTCTGTCAAGACTCATAGCAGCCATCTTAGAATTAAACTGGGCCATAGATGATGAGGAATGTAAAGGACTGAAGAAACTGTATCTCTTATCAGGGAGAGTGAGGAATCTGATAGTTAAACACAAGGTAAGGAATGAAGCCGTCCACAGATGGTTTGGTGAGGAGGAAATATACGGGGTACCCAAGATAATCACCATCACAAAAGCTGATACTCTCAGCAGAAGTAAAAACTGCATAGTCTGCACAATCTGTGAAGGGAAAGATTGGAATGGAGCCAACTGCCCAAAGTGTGGTAGACAGGGGAAGCCTATAACATGTGGAGTGACACTCGCAGACTTTGAGGAGAAACATTATAAGAAAATATTCATAAGAGAAGGGTGCCCCGATGGACCTCTCAGG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| 38,261 |
MW528234.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
King,J., Pohlmann,A., Dziadek,K., Beer,M., Wernike,K., Kerstin,W.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Diagnostic Virology
| null |
2021-07-21
|
D66-11-28
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,181 |
GenBank
| 1 |
Germany
|
Germany
|
Bos taurus
|
blood
|
2011
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate D66-11-28, complete genome
|
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| 40,254 |
MW528235.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
King,J., Pohlmann,A., Dziadek,K., Beer,M., Wernike,K., Kerstin,W.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Diagnostic Virology
| null |
2021-07-21
|
TV02-13_T136
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,286 |
GenBank
| 1 |
Germany
|
Germany
|
Bos taurus
|
blood
|
2013
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate TV02-13_T136, complete genome
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| 40,255 |
MW006485.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Wang,Q.Y.
|
Chinese Academy of Agricultural Sciences, Institute of Special Animal and Plant Sciences
|
China
|
2020-11-24
|
HEN01
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,188 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
| null |
2014
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate HEN01, complete genome
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| 45,603 |
MH806434.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Neill,J.D., Workman,A.M., Hesse,R., Bai,J., Porter,E.P., Meadors,B., Anderson,J., Bayles,D.O., Falkenberg,S.M.
|
National Animal Disease Center, Ruminant Diseases and Immunology Research Unit
|
USA
|
2018-12-25
|
125c
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,621 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
| null | null |
1990
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate 125c, complete genome
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| 66,052 |
MH806435.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Neill,J.D., Workman,A.M., Hesse,R., Bai,J., Porter,E.P., Meadors,B., Anderson,J., Bayles,D.O., Falkenberg,S.M.
|
National Animal Disease Center, Ruminant Diseases and Immunology Research Unit
|
USA
|
2018-12-25
|
1336H
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,221 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
| null | null |
2005
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate 1336H, complete genome
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| 66,053 |
MH806436.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Neill,J.D., Workman,A.M., Hesse,R., Bai,J., Porter,E.P., Meadors,B., Anderson,J., Bayles,D.O., Falkenberg,S.M.
|
National Animal Disease Center, Ruminant Diseases and Immunology Research Unit
|
USA
|
2018-12-25
|
296c
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,629 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
| null | null |
1995
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate 296c, complete genome
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| 66,054 |
MH806437.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Neill,J.D., Workman,A.M., Hesse,R., Bai,J., Porter,E.P., Meadors,B., Anderson,J., Bayles,D.O., Falkenberg,S.M.
|
National Animal Disease Center, Ruminant Diseases and Immunology Research Unit
|
USA
|
2018-12-25
|
9231
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,285 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
| null | null |
2004
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate 9231, complete genome
|
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| 66,055 |
MH806438.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Neill,J.D., Workman,A.M., Hesse,R., Bai,J., Porter,E.P., Meadors,B., Anderson,J., Bayles,D.O., Falkenberg,S.M.
|
National Animal Disease Center, Ruminant Diseases and Immunology Research Unit
|
USA
|
2018-12-25
|
McCart_c
|
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,598 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
| null | null |
1989
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 isolate McCart_c, complete genome
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| 66,056 |
MG879027.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Colitti,B., Nogarol,C., Bertolotti,L., Rosati,S.
|
University of Torino, Veterinary Science
|
Italy
|
2018-02-09
| null |
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,273 |
GenBank
| null |
Italy
|
Italy
|
Bos taurus
| null |
2014
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 strain CN10.2015.821, complete genome
|
GTATACGAGTACTTTAGCTAACCTCGTATACAGATTGGATGTTGACAAACATTGAATTGGCAAAGTAGGGAACCTTTCCCCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAAGGAGGGGACTAGCGGTAGCAGTGAGTTCATTGGATGGCCGAATCCCTGAGTACAGGGAAGTCGTCAATGGTTCAACACTCCACTAATCGAGGAGTCTTGAGATGCCATGTGGACGAGGGCATGCCCACGGCACATCTTAACCTATGCGGGGGTTGCATGGGTGAAAGCACCATTTGTGGTGTTATGGACACAGCCTGATAGGGTGTAGCAGAGACCTGCTATTCCGCTAGTAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGATTTCAAATGAACTTTTATACAAAACATATAAACAAAAACCAGCAGGTGTTGTGGAACCTGTTTATGACATCGAAGGGTGCCCACTGTTTGGAGAGAGCAGCGAGGTACACCCGCAATCCACACTAAAGCTGCCACACCAACGAGGCAGTGCTAACATCCTAACCAATGCTAGGTCCCTGCCGCAGAAAGGTGACTGCCGGAAAGGCAATGTGAATGGAGCGGTGAGTGGCATCTACATTAAACCAGGGCCGATCTACTACCAGGACTATGCGGGGCCCGTCTATCATAGAGCCCCACTGGAATACTGTAGAGAGGCGAGCATGTGTGAAGTGACCAGGAGAGTTGGCAGAGTGACTGGTAGCAATGGGAAATTATACCACATCTATGTCTGCATGGATGGGTGTATCCTCCTGAAGAGGGCGACTAGGAACCAACCAGAAGTCCTCAAATGGGTGTACAACAGATTAAATTGCCCATTGTGGGTCACTAGCTGTTCCGATGAAGGGGGTAAAGGTGTCTCAAACAAGAAGCAGCCCAAGCCTGATAGGATAGAAAAAGGCAAGATGAAAATAGCCCCTAAAGAGACAGAAAAAGATTGTAAAACCAGACCCCCTGACGCAACTATAGTAGTAGAAGGGGTTAAGTACCAGGTGAAGAAGAAAGGAAAGGTGAGGGGTAAAAATACCCAAGATGGGTTGTATCACAATAAGAACAAACCCCCTGAATCAAGAAAGAAACTGGAGAAGGCACTGTTAGCATGGGCCATCTTGACAGCGGTTCTGCTTCAGCTGGTCACGGGAGAGAATATTACCCAGTGGAACTTGATGGACAACGGCACCGAAGGTATACAGCAAGTAATGTTTCTAAGAGGGGTGAACAGAAGTCTACACGGAATTTGGCCAGAGAAGATTTGTACCGGAGTACCAACTCACTTAGCAACAGACTACGAACTCAAGGAGATAGTGGGGATGATGGACGCGAGTGAGAAGACCAACTACACGTGTTGCAGGTTGCAAAGGCATGAGTGGAACAAGCATGGTTGGTGTAACTGGTTCCATATAGAACCGTGGATATGGCTGATGAACAAAACCCAAAGCAACCTAACCGAAGGACAGCCGCCTAGGGAGTGCGCTGTGACCTGTAGGTATGACAGGGAAACAGAGTTGAACATCGTAACACAGGCAAGGGACAGACCTACAACTTTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAACTTTTCCTTCGCAGGTATAGTATTAAATGGGCCCTGCAACTTTAAGGTAGCAGTTGAAGACGTGCTGTTTAAGGAGCACGATTGTGGCAACATGCTACAGGAGACCTCGCTAAAACTACTTGATGGGGTGACCAACACCATCGAAGGAGCAAGGGTAGGAACGGCCAAGTTGACAACCTGGTTAGGGAAGCAATTAGGGATCCTTGGTAAGAAGTTGGAAAATAAAAGTAAAGCATGGTTTGGTGCGCATGCAGCAAGCCCATACTGTGAAGTGGAGAGGAAGATCGGTTACATTTGGTATACAAAGAACTGCACTCCAGCTTGCCTACCAAGAAACACTAGGATAATAGGCCCCGGGAAATTCGACACCAACGCCGAAGATGGCAAAATTCTCCATGAGATGGGAGGACACCTCTCAGAATTTGCCCTATTGTCCTTAGTGGTCCTGTCTGACTTTGCCCCAGAAACCGCGAGTGCTATCTACTTGGTTCTACACTTTATAATCCCACAAAGTTACACTAGCGTAGACACTTGCGACAAAAACCAGCTGAATTTAACGGTCGCGACTACGGTAGCAGAAGTCATACCAGGGACAGTGTGGAACCTAGGAAAGTACGTCTGCATAAGACCGGACTGGTGGCCATATGAGACGACCACAGTCTTTGTTTTAGAGGAAGCAGGCCAAGTAGTTAAATTGGGGCTAAGGGCCATCAGAGACTTAACTAGGATATGGAACGCTGCTACCACCACAGCCTTCTTAGTTTTTTTGGTGAAAGTACTGAGGGGACAATTAATCCAAGGGTTGTTGTGGCTGATGCTAATAACAGGGGCACAGAGTTTTCCTGAATGCAAAGAGGGCTTCCAATATGCTATATCAAAAGACAAAAAAATAGGGTTACTGGGGCCAGAGAGTCTAACTACGAAATGGCACCTTCCCACCAAAAAATTAGTGGATTCCATGGTACAGGTATGGTGTGAAGGAAAAGACTTGAAAATATTAAAAACGTGCACAAAGGAAGAGAGGTACTTAGTGGCAGTGCACGAAAGAGCCCTATCAACCAGTGCTGAATTTATGCAGATCAGTGAAGGGACAACAGGCACAGAAGTGATAGATATGCCTGATGACTTTGAGTTTGGACTCTGCCCTTGCGATTCAAAACCAATAGTAAGGGGCAAATTTAATGCTAGCTTACTTAATGGACCAGCTTTCCAGATGGTATGCCCACTGGGGTGGACTGGCACTATAGAATGCACCCTAGCAAACCAGGACACCTTGGACACAACTGTTATTAGGATATATAGAAGAACTGCTCCATTCCAGCGGAGAAAATGGTGCGCTTATGAAATGATAGTAGGGGAAGATATCCATGAATGCATTCTTGGTGGAAACTGGACATGCATAGCTGGCGACCATAGTAAGTTGAAAGATGGACCTATCAAGAAGTGTAAGTGGTGTGGCTACGACTTCCCCAACTCAGAGGGACTGCCGCATTACCCAATAGGTAAGTGTATGCTCAGCAATGAGAGTGGGTATAGGTATGTAGATGACACCCCTTGTGATAGGGGTGGCGTAGCCATAGTTCCAACAGGCACCGTAAAGTGTAGAATAGGTGAAGTCAAGGTGCAGGTTATCGCTACTAATAATGACTTGGGGCCCATGCCTTGCAGCCCAGATGAAGTAGTAGCAAGTGAAGGACCAGTGGAAAAGACGGCATGCACGTTCAACTATTCAAAGACACTGCCCAACAAGTATTATGAGCCAAGGGACCGGTACTTCCAACAATACATGTTAAAAGGGGAGTGGCAATATTGGTTTGACCTGGATTCTGTGGACCACCACAAAGACTACTTTTCTGAGTTCATAGTCATAGCAGTGGTCGCTTTGTTGGGTGGTAAGTATGTATTGTGGCTCTTAGTAACATACATGATACTGTCGGAGCAGATAGCTATGGGTGCTAGAGTGAACACTGAAGAGATAGTCATGATAGGCAACTTGCTGACACACAATGATATTGAGGTTGTGGTCTATTTTCTTCTTTTGTACTTGATAGTCAAAGAGGAACTGGTGAGGAAATGGGTTATACTAGTGTACCACATCCTTGTAGCTAATCCTATGAAAACGATTGGGGTTATCCTACTAATGCTAGGGGGTGTGGTGAAGGCAAGAGAAATCAATACTGGTGACCAAAGTACTATGGACCCATGCTTTCTTCTCGTAACAGGCTTAGTGGCTGTTTTGATGATTGCTAGAAGAGAACCTGCCACCTTACCACTGGTTGTTGTATTGCTAGCAATTAGAACATCAGGGTTCTTATTACCCGCTAGCATTGATATAACAGTAGCAGTAGTATTAACTGTGCTTTTGCTAGCTAGCTATGTAACAGACTATTTCAAATATAAAAAGTGGCTTCAATTTTCATTTAGTCTGATAGCTGGTATTTTCATTATAAGGAGCTTGAAACACATCAATCATATGGAGGTACCAGAAATATCTATACCAAGTTGGAGGCCTCTAGCCCTTGTTGTTTTTTATATAATATCCACAGCAATAACAACTAACTGGGATATTGACTTAGCAGGCTTCCTACTGCAATGGGCACCAACAGTGATCATGATGGCTACTATGTGGGCAGACTTTTTGACTCTAATCATAGTCCTACCCAGTTACGAACTATCAAAACTTTACTTCCTCAAGAACGTCAGGACAGATGTGGAAAAGAACTGGCTTGGCAAAGTGAAATACAAACAGATTAGCTCAGTTTATGATATCTGTGACAGTGAAGAGGCGGTGTACCTATTCCCGTCTAGGCATAAGAGTGGGAGTAGACCAGATTTCATATTACCTTTCTTAAAAGCTGTGTTGATAAGCTGCATTAGTAGCCGGTGGCAGGTGGTCTACATTGCCTACCTGATACTGGAAATTACATACTATATGCACAGAAAGATAATTGACGAGGTGTCAGGAGGAGCTAACTTCCTGTCAAGACTCATAGCAGCCATCTTAGAATTAAACTGGGCCATAGATGATGAGGAATGTAAAGGACTGAAGAAACTGTATCTCTTATCAGGGAGAGTAAGAAATCTGATAGTTAAACACAAGGTAAGAAATGAAGCCGTCCACAGATGGTTTGGTGAGGAGGAAATATACGGGGTACCTAAGATAATCACCATCATAAAAGCTAGTACCCTCAGCAAAAGTAAGCACTGCATAGTCTGCACAATCTGTGAAGGAAAAGATTGGAATGGAGCCAACTGCCCAAAGTGTGGTAGACAGGGGAAGCCTATAACATGTGGAATGACACTCGCAGACTTTGAGGAGAAACATTATAAGAAAATATTCATAAGAGAAGGGTGCCCCGATGGACCTCTCAGGGAA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| 72,172 |
KX096718.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Li,Y., Wu,Q.
|
China Agriculture University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2016-12-14
| null |
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,282 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2015-11
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 strain HB-1511, complete genome
|
GTATACGAGATTAGCTAAAGTACTCGTATACGGATTGGATGTCGACAAATATTGAATTGGCAAAGTAGGGAATTTTCCCCTCAGCGAAGGCCGAAAAGAGGCTAGCCATGCCCTTAGTAGGACTAGCAAAAGAAGGGGACTAGCGGTAGCAGTGAGTTCATTGGATGGCCGAATCCCTGAGTACAGGGAAGTCGTCAATGGTTCGACACTCCATCAGTCGAGGAGTCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCATGCCCACGGCACATCTTAACCTATGCGGGGGTTGCATGGGTGAAAACGCCAACCGTGGTGTTATGGACACAGCCTGATAGGGTGTAGCAGAGACCTGCTATTCCGCTAGTAAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGTTTTCAAATGATCTTTTATACAAAACATATAAACAAGGACCAGCAGGTGTTGTGGAACCTGTTTACGATATCAACGGGCTTCCATTGTTTGGAGAGAGCAGCGAGGTACACCCGCAATCCACACTAAAGCTACCACACCAACGAGGCAGTGCTAACATCCTAACCAATGCTAGGTCCCTACCGAAAAAAGGTGATTGCCGGAAAGGCAATGTGAATGGAGCGGTAAGTGGTATCTATATCAAACCAGGGCCGGTCTACTATCAGGACTATGCAGGGCCCGTCTACCATAGAGCCCCACTGGAATTATGTAGAGAGGCGAGTATGTGTGAAGTAACCAGGAGAGTTGGCAGAGTGACCGGTAGTAATGGGAAATTATACCACATTTATATCTGCATAGATGGGTGTATCCTCCTAAAGAGAGCGACCAGGGACCAACCAGAAGTCCTCAAATGGGTGTACAACAGATTAAATTGCCCATTATGGGTCACCAGCTGCTCCGATGAAGGGGGCAAGGGTGCTACAAGCAAGAAGCAATCTAAGCCAGATAGGATAGAAAAAGGCAAGATGAAAATAGCCCCTAAAGAGGCAGAAAAAGATTGTAAAACCAGACCCCCTGACGCGACTATAGTAGTAGAAGGGGTTAAGTACCAGGTGAAGAAGAAGGGAAAAGTAAGGGGGAAAAATACCCAAGATGGGTTGTATCACAATAAGAATAAACCCCCTGAATCAAGAAAGAAGTTGGAGAAGGCACTGTTAGCATGGGCTATCTTGGCAGTGGTTCTGCTTCAGGTGGTCACAGGAGAGAATATTACCCAGTGGAACTTGATGGACAACGGCACCGAAGGTATACAGCAAGCAATGTTCCTAAGAGGGGTGAACAGGAGTCTACATGGAATTTGGCCAGAGAAGATTTGTACCGGAGTACCAACTCACTTAGCAACAGACTATGAGCTCAAAGAGATAGTGGGGATGATGGACGCGAGTGAGAAGACCAACTACACGTGTTGCAGGTTGCAAAGGCATGAGTGGAACAAACACGGTTGGTGCAATTGGTTTCATATAGAACCGTGGATATGGCTGATGAACAAAACGCAAAGCAACCTAACTGAGGGACAGCCGCCTAGGGAGTGCGCAGTGACTTGTAGGTACGACAGGGGAGCAGAATTGAACATTGTAACACAGGCTAGGGACAGGCCTACAACTTTGACAGGCTGCAAGAAAGGCAAGAAATTTTCCTTCGCGGGTATTGTGCTAGATGGGCCCTGCAACTTTAAAGTATCAGTCGAAGACGTGCTGTTTAAGGAGCACGATTGCGGCAACATGCTGCAGGAGACCGCACTACAGCTACTTGATGGGGCGACCAACACCATTGAGGGAGCAAGGGCGGGGACGGCCAAGTTGACCACCTGGCTAGGGAAGCAGTTAAGCATCCTTGGTAAGAAGTTGGAAAATAAAAGCAAAGCATGGTTTGGCGCATATGCAGCAAGTCCATACTGTGATGTGGAGAGGAAGATCGGTTACATCTGGTATACGAAAAACTGCACTCCAGCTTGCCTGCCAAGAAACACTAGGATAATAGGCCCCGGGAAGTTCGACACCAACGCCGAAGATGGCAAAATACTCCATGAGATGGGAGGGCACCTCTCAGAATTTGTCCTATTGTCCTTGGTGGTTCTATCTGATTTTGCCCCAGAAACCTCGAGTGCCATCTACTTGGTTCTACATTTCGCAATCCCGCAAAGCCACGTTAACGTAGACACATGCGACAAAAACCAGCTGAATCTAACAGTCGCAACTACAGTGGCAGAAGTGATACCAGGGTCAGTGTGGAACTTGGGAAAGTACGTCTGCATAAGACCAGATTGGTGGCCATACGAGACGACCACAGTCCTTGTTTTAGAGGAAGCAGGCCAAGTAGTTAAATTGGGGCTAAGGGCCATCAGAGACTTAACTAGGATATGGAACGCTGCCACCACTACAGCCTTCTTGGTCTTTTTAGTGAAAGTACTGAGGGGACAACTAATCCAAGGGCTATTGTGGCTGATGCTAATAACAGGAGCACAGAGCTTCCCTGAATGCAAAGAGGACTTCCAATATGCCATATCAAAAGACAAAAAAATAGGGTTACTGGGGCCAGAGAGTTTAACTACGACATGGCACTCTCACACCAATAAATTAGTGGACTCCATGGTACAAGTATGGTGTGAAGGAAAAAACTTGAAAGTACTGAAAACGTGCACAAAGGAAAAAAGGTACTTAGTGGCTGTGCACAAAAGAGCCCTATCAACCAGTGCTGAATTTATGCAGATCAGTAAAAGGAAAAAAGGCCCAGACGTAATAGACATGCCTGATGACTTTGAGTTTGGACTCTGCCCTTGTGACTCTAAACCAATAATAAGGGGCAAATTCAATGCTAGCTTAATGAATGGACCAGCCTTCCAGATGGTATGCCCACAGGGGTGGACTGGTACGATAGAATGCACCATAGCGAACCAAGACACCTTGGACACAACTGTCATTAGGACATATAGAAGAACTACTCCATTTCAGCGAAAAAAATGGTGTGTCTATGAAAAGATAATAGGGGAAGACATCCATGAATGCATTCTTGGTGGAAACTGGACATGCATAGCTGGTGACCATAGCAAGTTGAAAGATGGGCCTATCAAGAAGTGTAAGTGGTGTGGCTACGACTTCTTCAACTCAGAGGGACTGCCACACTACCCAATAGGTAAGTGCATGCTCAGCAATGAGAGTGGGTACAGGTATGTGGATGACACCTCTTGCGATAGGGGTGGTGTAGCTATAGTTCCAACAGGCACCGTAAAGTGTAAGATAGGCAACGTCACGGTGCAGGTTATCGCCACCAATAATGACCTGGGACCCATGCCCTGCAGCCCACATGAAGTGATAGCAAGCGAAGGACCAGTCGAAAAGACGGCATGCACGTTCAACTATTCAAAGACACTACCTAATAAGTATTATGAGCCAAGGGACCGGTACTTCCAACAATACATGTTAAAAGGGGAGTGGCAATATTGGTTTGACCTGGATTCTGTAGACCACCACAAAGATTATTTTTCAGAGTTCATAATCATAGCAGTGGTTGCCTTGTTGGGTGGCAAGTGTGTACTGTGGCTCTTAGTAACATACATGATACTGTCCGAGCAGATGGCTATGGGTGCTAGAGTGAATACTGAAGAGATAGTTATGATAGGCAACTTACTGACACACAGTGACATCGAGGTCGTGGTCTATTTTCTTCTTTTGTACTTAATAGTCAAAGAGGAACTGGTGAGGAAATGGATTATACTAGTGTACCATATCCTTGTAGCCAATCCTATGAAAACAATTGGGGTTATCCTATTAATGCTAGGGGGAGCGGTGAAGGCCAGAGAAATCAATACTTATGACCAAAGTGCTATGGACCCATGCTTTCTTCTCGTAACAGGCTTGGTGGCCGTTTTGATGATTGCTAGAAGAGAACCCGCCACCTTGCCACTGGTTGCAGCATTGCTAGCAATAAGAACATCAGGATTCTTATCGTCCACTAGTATTGATATAACTGTAGCAGTAGTATTAATCGTACTTTTGCTAGCTAGCTACGTAACAGACTATTTCAGATACAAAAAGTGGCTTCAATTTTTATTTAGTCTGATGGCTGGTATATTTGTTATAAGGAGCTTGAAACACATCAACCAGATGGAGGTACCAGAAATATCTATACCAAGTTGGAGGCCTCTAGCCCTTGTTATTTTTTATATAGCATCTACAGCAATAACCACTAGTTGGGATATTGACTTAGCAGGCTTCCTGCTGCAATGGGCACCAGCAGTAATTATGATGGCCACCATGTGGGCGGACTTTTTGACTCTAATCATAGTTCTGCCCAGTTACGAGTTGTCAAAGCTTTACTTCCTCAAGAATGTCAGGACAGACGTAGAAAAGAACTGGCTCGGTAAAATGAAATACAAACAGATCAGCTCAGTTTATGATATCAGTGACAGTGAAGAAGCAGTGTACTTATTTCCATCAAGGCATAAGAGTGGGAGCAGACCAGATTTCATATTACCTTTTTTGAAAGCTGTGTTGATAAGCTGCATCAGTAGCCAGTGGCAGATGGTCTACATTGCTTACCTGATACTGGAAATTACATACTACATGCATAGAAAAATCATAGACGAGGTATCGGGAGGAGCAAACTTTTTGTCAAGACTTATAGCAGCTATCTTAGAACTAAACTGGGCTATAGATGATGAGGAATGCAAGGGACTGAAGAAACTGTATATCCTATCAGGGAGAGTGAGGAATCTGATTGTTAAACACAAGGTAAGAAATGAAGCTGTCCATAGATGGTTTGGTGAGGAGGAGATATACGGGGTACCCAAGGTAATCACCATTATAAAAGCTAGTTCCCTCAACAAAAGTAAGCACTGCATAGTCTGCACAATCTGTGAAGGGAAAGATTGGAATGGAGCCAACTGCCCAAAGTGTGGAAGACAGGGGAAACCTATAACATGTGGGATGACACTCGCAGACTTTGAGGAGAAACATTACAAAAAGATATTTATAAGAGAAGGGTACCACGACGGACCTCTCAGGGAA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| 79,070 |
KT832817.1
|
Bovine viral diarrhea virus 2
|
Workman,A.M., Heaton,M.P., Harhay,G.P., Smith,T.P.L., Grotelueschen,D.M., Sjeklocha,D., Brodersen,B., Petersen,J.L., Chitko-McKown,C.G.
|
USDA, ARS, US Meat Animal Research Center
|
USA
|
2016-02-23
| null |
Pestivirus tauri
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,235 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Bos taurus
| null |
2014-04-30
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 2 strain USMARC-60764, complete genome
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| 83,696 |
OP210314.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Yang,N.N., Chen,C.C., Sheng,J.L., Xu,M.G.
|
Shihezi University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2022-10-09
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,239 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Bos taurus
|
feces
|
2022
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain XJ-BVDV-3, complete genome
|
CCCAAATTAATAATTTGGTCTAGGGACCAATTCCCCTGGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTAAATCTTAACCCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGGGAGTCATTATATGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTGAACTTTGAACTGTTATATAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATATGGGGAGCCAAGTGGTATACACCCCCAGTCCACACTCAAATTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGACAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGTTTGTTCGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTGTATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGGATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTACCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGGGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTTTATAACGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCGAGACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTGCAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGCAAAACCAAGCCACCAGATGCAACAATAGTAGTAGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAGGGGAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAATTGGAAAAGGCCCTGTTGGCATGGGCGATACTGGCCTTGGTTCTGTGGCAACCAGTAGGTGCGGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATGCTATGTTCATCAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGCAGAACTAAAGCAAATACACGGTATGATGGACGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAGTGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATGGGACCCAAGCCAACTTAACCGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAAGAGATCAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCTTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATCGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTCTATGATGAAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCTCAACACGTAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGAGCTGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAACAACTGGGAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGCAACATCACCAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGTACCCCCGCTTGCTTGCCCAAGAACACTAGGATTGTGGGGCCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGAAGATGGAAAAATCTTGCATGAGATGGGTAGCCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTTCTTTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTAAAGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCTGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCCTCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTCGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATCTGACCAATATGTGGAACGCAGCGTCCACGACAGCTTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAGGGTGTGATATGGTTATTGCTGATAACTGGAGCCCAGGGGGACCTCAGTTGTAGGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATTGGTCCATTGGGGCCTACTGGCATGACCACAAGGTGGTATGCGTACAACGAAAAGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGACCTTACTTGTGTAGATGGGAACTTCCTAGTACACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGTAGATACCTGGCCACCATACATGAGAGGGCATTATCTACATCTGTGAAGTTCACTCTAATAGCTGATCCACAGGATCCAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGATTTTGAATTCGGCTTATGCCCTTGCGACTCGACACCCTTAATAAGGGGAAAATACAACACAACCCTCCTCAATGGGCCTGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAGTAGAGTGCACTATAGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTCAAGAGATTTACAAGGTATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGTACTGTATGGATCAAATGGTCGTAGGCGAGGACCTATATCAATGTCTGTATGGTGGGAACTGGACATGTATACCGGGGGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAGGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTTACATTTGAAGAGCCTAGTGATTTACCACACTTCCCACTAGGCAAGTGCAGACTCGTTAACGAGACCGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACTTGTAATAGAGATGGAGTGGCAGTAACGGAACAAGGAACTCTAAAGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAAAGTCTTGGCCCTGAACAGAGACTTGGGGCCTATGCCATGTAAACCAAGCTATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACTTTCAACTGGACTGAGACGTTGGAAAACAAGTACTTTGAACCCAGGGATAACTACTTCCAACAATACATGTTGAAGGGGAAATACCAGTACTGGTTTGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTATTTTGCTGAGTTCATTGTGATTATCGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTGCTAATAGTTTACTACGTGGCGACTGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTGGTCCTAATAGGGGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGATACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGCCAGAGGTGACGATGGGAAGGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTTTACGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTAAAAAGAGACCCTACAACAATCCCTGCAGTAGTGATAATAACAGGTATTAAAACAAGGCAATATGCTGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCGTTGTCAATAGTTGCGGCTGTTGTGCTACTCCATACCTATATTAGTAGTTACTATAGGTACAAGCAATGGTTACAGTGTTTAATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTTATAATAAGGACGTTGAAAGCTTTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCCATAGTGCTTATATACCTAGCTACAACCACTTTGGTGACCCACCAGAACCTGGATTTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACACACCAGTCATGTTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATATACTCACCCTCATTCTGGTCCTGCCAACCTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAAAAGGGTAAAGAAGGACATAGAGAGGAGCTGGCTGGGGGCTACAAATTTCACACGTGTGGACTCTGTTTATGAATTAGATGGATCTGATGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCCCCAGAGCGAAGGCAGGTGAGGTACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATCGATTTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCCGGTGGGACCAACGTGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTAGACGAAGAAGAGGGCAAAGGGCTCAAAAAATTCTTCATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGATAATGAAGCACAAAGTCAGAAATGAAACTGTTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGATATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGCTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTTTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGTCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATTTTCATAAGAGAAGGAGAATGGGACGAGCCTTTCAGGCAGGAAGCCAGAGGTTATTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGCTTTTCC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GCACAAGGGAACTGGGAGCCCATGAGTTGCAATGTATATATGGGCACAATACCGGCAAGAAGGGTAAAGACACACCCTTATGAAGCATACTTGAAACTAAAAGATCTCTTGAGTGAGCACAAGATGAGGGTGGTAACTGGCTTTGCTGACTTGAAAGAACACAACAGGTGGATACTAAGGAAAGTGAAGCACCAAGGGAACTTAAGAACGAAGCACATCTTGAACCCGGGTAAACTATCAGAACAGCTGGAACGAGAAGGACGGAAATACAATGTGTATAACAAGCAAATAGGATCCATTATGACTTCAATAGGAATTAGAATGGAGAAGCTCCCCGTAGTAAGAGCTCAAACAGACACCGTCAGTTTCCATCAAGCAATCAGAGACAAAATAGATAAGGAAGAAAATGCCCAGAGCCCAGATCTGCATGAGAAGCTATGGGAAGTGTTTGATACGCTTAAGGTCCCAGAACTAAAAGGTGCTTATGACGAGGTGTCATGGGAGGAACTAGAGGCGGGCATAAACAGGAAAGGAGCAGCAGGGTTCCTGGAAAAGAAAAACATAGGGGAGGTGCTCGCTTCAGAGAAGAACCTAGTTGAAGAAATAGTTAAGGATCTGAAAAGAGGGAAGAAGATCAATTACTATGAGACAGCCATACCTAAGAATGAGAAGAGAGATGTCAACGATGACTGGGAAGCAGGGGACCTGGTAGATGAAAAGAAACCAAGAGTTATACAGTACCCAGATGCTAAAGTCAGATTAGCAATCACTAAAGTGATGTACAAGTGGGTCAAGCAAAAACATGTGGTGATACCGGGGTACGAAGGAAAAACCCCACTTTTCCAAATCTTTGACAAGGTAAAGAAGGAGTGGGATGGCTTCAACGACCCGGTAGCAGTGAGTTTTGACACAAAGGCTTGGGACACTCAGGTGACAAGCCGCGATCTCCGCCTCATAGGGAAGATACAAAAATACTATTTTAAGAGCAGCTGGCGCAAGTTCATTGACACCTTAACAGAACACATGACTGAGGTCCCGGTGATCACAGCTGATGGTGAGGTCTACATAAGAAAGGGGCAGAGGGGCAGTGGCCAACCAGACACAAGCGCAGGGAACAGCATGCTAAATGTGCTAACCATGGTATATGCTTTTTGTGAGAGCACTGGGGTCCCATACAGGAGCTTCAACAGAGTAGCCAGAATACATGTTTGTGGAGATGACGGCTTTCTGATAACAGAGAGAGGCCTAGGGTTGAAGTTTGCCAGTAAAGGAGCCCAGATATTGTATGAATCTGGCAAACCACAAAAGATACTAGAAGGAGACAAAATGAAGGTGGCTTACAAATTTGAAGACATAGAGTTTTGTTCCCATACACCAATCCCCGTTAGATGGTCAGACAACAGTAGTGGTTACATGGCCGGAAGGAACACCGCCACGGTGCTTGCAAAAATGGCCACTAGGCTCGACTCAAGTGGGGAGAGGGGTACTGCCGCATATGAGAAAGCAGTGGCATTCAGCTTCCTCCTAATGTACTCCTGGAACCCTTTAATCAGGAGGATTTGTCTGTTGACCTTATCATCAAAACCAGAGGTAGACCCCTCTAAACAAACCACTTACTATTATAAGGGAGACCCTATAGGGGCCTACAAGGAGGTTATAGGGCATAACCTGCATGATCTGAAGAGAGTTGGTTTTGAGAAGCTGGCTAGCTTAAACCTGAGTATGTCCACATTGGGGATATGGACAAGGCATACCAGTAAAAGACTACTCGAAGACTGTGTGAAGGTGGGGAAGGAAGAAGGTAACTGGCTTGTCAACGCTGACCGGCTAGTTTCTAGCAAGACTAACAAAATGTACATCCCCGATGAAGGATACACCTTGCAAGGCAAGTATTATGAAGAACTGAGGCTAATAGGGCCAGGAGGACCCACCTTAAGGGTGGGGAAAGGCAGATACCATCTTGGTCCAATAGTCAATGTAATCCTGAGAAGGCTGAGGGTCTTGCTTATGGCGGCCGTAGGAGAGAAGGCTGTCATCTAGGCAGGAACATGTGTGTATATAAATGTAAATAATAGTAACATGTAATATATAGTGTAGATATTTGTTAGAGCTAATTTATTACTTTAGGCTAATGAGAACTACCTCATTTAACAACACTACACTCATTAATTAACAGCACTTTAGCTGTTTGGGAAAGACCCGACGTCCGCAGTCGGACCAGGGAAAATCCTTAACGGCC
| 23,751 |
MH410812.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Silveira,S., Cibulski,S.P., Mosena,A.C.S., Weber,M.N., Canal,C.W.
|
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Laboratorio de Virologia Veterinaria
| null |
2019-02-13
|
LV168-36/16RN
|
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,295 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Bos taurus
|
blood
|
2013
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate LV168-36/16RN, complete genome
|
GTTGGGTGTGTTTGGGCCGGGTAGCTCATGTCGGCGTATATGATTGGGTATCCCAAATTAATAATTTGGTTTAGGGACTAACTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATGGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCGTAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATATGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATTACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCAAGTGATACACACCCCCAGTCCACACTCAAATTACCCCACCCGAGGGGGGAAAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGACGGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGTTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTCTACCAGGATTACTCTGGCCCAGTGTATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCCGGCTCCAATGTGTGAAGTCACCAAAAGAATTGGGAGGGTCACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGCATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAACGTATTGGACAGCCCCATCTGGGTAGCAAGCTGCTCTGATGAAAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAGAGATAGCAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAATTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCTTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACGAACGGGATACAGCATGCTATGTTCGTCAGAGGAGTAAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACTCACCTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACGGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAAAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATTGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAGGATATGCTTTATGATGAAATGGAATGTACAGGTATCTTCCAAGAAATGGCTCAACACGTAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGAGCTGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAACAACTGGGGATCTTGGGGAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACTCCTGCTTGCTTACCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGTAAATTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAAATGGGTAGCCACCTATCCGAACTGGCCATATTGGCGCTTGTGGTAATGTCGGACTTCGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTCTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGGGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAATTGGGTTTGTGTGAGACCTCCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTCGCTTTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCGTTAAAAGATTTGACTAATATGTGGAACGCAGCGTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTGCTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGTAAGCCTGAGTTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCAACTTACTGGGGCCCACCGGTTTGACCACAAGGTGGCATGCATACAGTGAAAAGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGACCTTACTTGTGTAGATGGGAACTTCCTAGTATACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCTGTGAGGTTCACTCTAGTCGCCGACCCACAGGATGTAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAGTTTGGCTTATGCCCTTGTGACTCGGCACCCATAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTCCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACGATAGAGTGCACTGTGGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTACAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGCGAGGACTTATATGAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAAGTAAAGGACTGCAAGTGGTGCGGTTTCACGTTTGAGGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCATTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGATACCACCTGTGATAGAGATGGAGTGGCAATAACGAAACAAGGAACTCTAAAGTGTAAGATAGGCAAGGTAGAAGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCAAGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCGAAGACGGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACGCTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTCCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTATTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTCGCTGAGTTCATTGTGATTATTGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTCTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGCAACTGAACAAGGAGCTAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAAGTGGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTATTACTGTACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTAAAAAGAGACCCCACAACGATCCCTGCAGTAGTGATAATAACAGGTGTTAAAACAAGACAATATGCTGCATGGCTAGAACTGGATATAGCTTTGTCAATAGTTGCAGCCGTTGTGCTACTCCATTCCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAGCAATGGTTACAGTGTGTAATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTTATAATAAGAACGTTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGTAATAACAGTGCCTAATGTAAGGCCCTTGCCCATAGTGTTCATATATCTAATTACAACTACTTTGGTGACCCACCAGAACCTGGATTTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCGCCAATTGTGTTAATGGTACTAACCCTATGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGGTCCTGCCAACTTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGATACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTAAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAACCTACCTGGTGATTGAACTAGTATACTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAATGCGCTCTCTAGAACGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGACTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGGTAGTGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGCTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAAGGTGGCAGCTGCCCTAAGTGCGGCCGTTCCGGTAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTCA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CCCCCCAGTGGTAGACAAACTAAGGGACATGTGGTGTCTGCATACCAACTAGCACAAGGGAACTGGGAGCCCGTAAGTTGCAATGTATATATGGGTACAATACCAGCAAGAAGGGTAAAGACACACCCTTATGAAGCATATTTGAAACTAAAAGATCTCTTGAGTGAGCACAAGATGAGGGTGGAGACTGGCTTTGCTGACTTAAAAGATCACAACAGGTGGATACTAAGGAAAGTGAAGCACCAAGGGAACTTAAGAACGAAGCACATCTTGAACCCAGGTAAACTAACAGAACAGCTGGAACGAGAAGGACGAAAACACAATGTGTACAATAAGCAAATAGGATCCATTATGACTTCAATAGGAATTAGAATGGAGAAGCTCCCCGTAGTAAGAGCTCAAACAGACACTGTCAGTTTCCACCAAGCAATTAGAGACAAAATAGATAAGGAAGAAAATGCCCAGAGCCCAGATCTGCATGAGAAGCTATGGGAAGTGTTCGATACGCTTAAGGTCCCAGAATTAAAAGGTGTTTATGACGAGGTGTCATGGGAGGAACTAGAGACGGGCATAAACAGGAAAGGAGCAGCAGGGTTCCTGGAAAAGAAAAATATAGGGGAGGTGCTTGCTTCAGAGAAGAACTTAGTTGAAGAGATAGTCAAGGATCTGAAAAGAGGGAAGAAGATCAATTACTATGAGACAGCTATACCTAAGAATGAGAAGAGAGACGTCAATGATGACTGGGAAGCAGGGGACTTGGTAGATGAGAAAAAACCAAGAGTTATACAGTACCCAGATGCCAAAGTCAGATTGGCAATTACTAAAGTGATGTACAAGTGGGTCAAGCAAAAACCTGTGGTGATACCGGGGTACGAAGGAAAAACCCCACTTTTCCAAATCTTTGACAAGGTAAAGAAGGAGTGGGACGGCTTCAACGACCCGGTAGCAGTGAGTTTTGACACAAAGGCATGGGACACTCAGGTGACAAGCCGCGATCTCCGCCTCATAGGGAGAATACAAAAATACTATTTCAAGAGCAGATGGCATAAGTTTATTGACACCTTAACAGAACACATGACTGAGGTCCCGGTGATTACAGCTGATGGTGAGGTCTACATAAGGAAGGGGCAGAGAGGCAGTGGCCAACCAGATACAAGCGCAGGGAACAGCATGCTAAATGTGCTAACCATGGTGTATGCTTTTTGTGAGAGCACTGGGGTCCCATACAGGAGTTTCAACAGAGTAGCAAGAATACATGTCTGTGGAGATGACGGCTTTCTGATAACAGAGAGAGGCCTAGGGTTGAAGTTTGCCAGCAGAGGAGCCCAGATATTGTATGAATCTGGCAAACCACAAAAGATACTAGAAGGAGACAAAATGAAGGTGGCTTACAGATTTGAAGATATAGAGTTTTGTTCCCACACACCAATCCCCGTTAGATGGTCAGACAACAGCAGTGGCTACATGGCCGGAAGGAACACCGCCACGGTGCTTGCAAAAATGGCCACTAGACTTGACTCAAGTGGGGAGAGGGGCACTGCCGCATATGAGAAAGCAGTGGCATTCAGCTTCCTCCTGATGTACTCCTGGAACCCTTTAATCAGGAGGATTTGTCTGTTGACCTTATCATCAAAACCAGAGGTGGACCCCTCTAAACAAGCCACTTACTATTATAAGGGAGACCCTATAGGGGCCTACAAGGAGGTTGTAGGGCACAACCTGCATGATCTGAAGAGAGTTGGTTTTGAGAAGCTGGCTAGCTTAAACCTGAGTATGTCCACATTGGGGATATGGACAAGGCACACCAGTAAAAGACTACTCGAAGACTGTGTGAAGGTAGGAAAGGAAGAAGGTAACTGGCTTGTCAACGCTGACCGGCTAGTTTCTAGTAAGACCAACAAAATGTACATCCCCGATGAAGGACACACCTTGCAAGGCAAGTATTATGAAGAACTGAGACTATTAGGGCCAGGAAGACCCATCTTAAGGGTGGGAAAAGACAGATACCGTCTTGGTCCAATCGTCAATGTAATCCTGAGAAGGCTGAGGGTCTTGATGATGGCGGCCGTAGGAGAGAAGGCTGTCATCTAGGCAGGAACATGTGTGTATATAAATGTAAATAATAATAACATGTAATATATAGTGTAGATATTGTTAGAGCTAATTTATTACTTTAGGCTAATGAGAACTACCTCATTTAACAACACTACACTCATTGATTAACAGCACTTTAGCTGTTTGGGAAAGACCCGACGTCCGCAGTCGGACTAGGGAAAATCCCTAACGGCCCAACCA
| 65,366 |
MH410813.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Silveira,S., Cibulski,S.P., Mosena,A.C.S., Weber,M.N., Canal,C.W.
|
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Laboratorio de Virologia Veterinaria
| null |
2019-02-13
|
LV168-29/16RN
|
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,184 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Bos taurus
|
blood
|
2013
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate LV168-29/16RN, complete genome
|
GTTTGTGTTTGGTTTAGGGACTAACTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATGGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCGTAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATATGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATTACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCAAGTGATACACACCCCCAGTCCACACTCAAATTACCCCACCCGAGGGGGGAAAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGACGGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGTTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTCTACCAGGATTACTCTGGCCCAGTGTATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCCGGCTCCAATGTGTGAAGTCACCAAAAGAATTGGGAGGGTCACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGCATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAACGTATTGGACAGCCCCATCTGGGTAGCAAGCTGCTCTGATGAAAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAGAGATAGCAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAATTGGAGAAGGCTCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCTTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACGAACGGGATACAGCATGCTATGTTCGTCAGAGGAGTAAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACTCACCTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACGGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAAAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATTGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAGGATATGCTTTATGATGAAATGGAATGTACAGGTATCTTCCAAGAAATGGCTCAACACGTAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGAGCTGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAACAACTGGGGATCTTGGGGAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACTCCTGCTTGCTTACCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGTAAATTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAAATGGGTAGCCACCTATCCGAACTGGCCATATTGGCGCTTGTGGTAATGTCGGACTTCGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTCTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGGGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTCCTAACCAAACACACCCAACGGCCACAGTGCTCGCTTTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCGTTAAAAGATTTGCCAAATATGTGGAACGCAGCGTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTGCTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGTAAGCCTGAGTTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCAACTTACTGGGGCCCACCGGTTTGACCACAAGGTGGTATGCATACAGTGAAAAGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGACCTTACTTGTGTAGATGGGAACTTCCTAGTATACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCTGTGAGGTTCACTCTAGTCGCCGACCCACAGGATTTAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAGTTTGGCTTATGCCCTTGTGACTCGACACCCATAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTCCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACGATAGAGTGCACTGTGGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTACAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGCGAGGACTTATATGAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAAGTAAAGGACTGCAAGTGGTGCGGTTTCACGTTTGAGGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGATACCACCTGTGATAGAGATGGAGTGGCAATAACGAAACAAGGAACTCTAAAGTGTAAGATAGGCAAGGTAGAAGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCAAGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCGAAGACGGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACGCTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTCCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTATTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTCGCTGAGTTCATTGTGATTATTGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTCTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGCAACTGAACAAGGAGCTAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAAGTGGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTATTACTGTACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTAAAAAGAGACCCCACAACGATCCCTGCAGTAGTGATAATAACAGGTGTTAAAACAAGACAATATGCTGCATGGCTAGAACTGGATATAGCTTTGTCAATAGTTGCAGCCGTTGTGCTACTCCATTCCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAGCAATGGTTACAGTGTGTAATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTTATAATAAGAACGTTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGTAATAACAGTGCCTAATGTAAGGCCCTTGCCCATAGTGTTCATATATCTAATTACAACTACTTTGGTGACCCACCAGAACCTGGATTTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCGCCAATTGTGTTAATGGTACTAACCCTATGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGGTCCTGCCAACTTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGATACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCCCCGGAGCAAACACAGGTGAAATACTGCCAGTATTAAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAACCTACCTGGTGATTGAACTAGTATACTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAATGCGCTCTCTAGAACGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGACTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGGTAGTGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGCTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGTTGGGTGTGTTTGGAAAGGTGGCAGCTGCCCTAAGTGCGGCCGTTCCGGTAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTCAGGCAGGAGGCCAGAGGGTATTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGCTTTTCCTAAGGA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| 65,367 |
MH410814.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Silveira,S., Cibulski,S.P., Mosena,A.C.S., Weber,M.N., Canal,C.W.
|
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Laboratorio de Virologia Veterinaria
| null |
2019-02-13
|
LV125-8/16MA
|
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,156 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Bos taurus
|
blood
|
2013
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate LV125-8/16MA, complete genome
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GGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCACGTGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCATATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGTAGTATTATTTGGGGAGCCAAGTGATATACACCCCCAGTCCACGCTCAAACTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGAGAGTGGGCATAGCTAACTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACTGCCTGGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAGTCACCAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACAGCTAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGTTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTGCAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACGGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCTAGGAAAAAATTGGAGAAGGCCCTGCTGGCATGGGCAGTACTGGCCTTGGTCTTGTGGCAACCGGTGGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATGCTATGTTCATTAGAGGAGTTAACCGTAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGCGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAAACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGATAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACGACCCTGACTGGGTGGTGTTTGGGTGAGTGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATCGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGGAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGATATGGCCCAACACGTAGTTGATGGGACCACCAACACCATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACCACCTGGTTAGGGAAGCAACTGGGAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAAATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGGACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGTAGTCACCTATCAGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGACACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTCCGTGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTTAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATTTGACCAACATGTGGAACGCAGCCTCCACAACGGCTTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGGGTAATATGGCTATTGCTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGCTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGCGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGATCTTACTTGTGTAGATGGGAATTTCCTAGTGTACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTGCATGAGAGGGCACTTTCTACATCTGTGAAGTTCACCCTAGTCGCCGATCCACAGGACTTAGAAGAAGTCCAAATGGGAGATGATTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACTCGAAACCAATAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAGTAGAGTGCACTGTGGTTAGTCATAGCACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGCGAGGACTTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGATTTCACATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGCTACCGTTACGTAGACAACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAATGAAACAAGGAACTCTAAAGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGGAACAGAGTGAAGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACATTTAATTGGACTGAGACGCTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGACAACTACTTCCAACAATATATGTTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTACCGAGTTCATTGTGATTGTCGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGTGACTGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTGGTCTTAATTGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATTAAAGATGAACCATTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGCTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTAAAAAGAGACCCCACAACCATCCCTGCAGTAGTGGTAATAACAGGTATTAAGACTAGACAATATGCTGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAACAGTTGCGGCCGTTGTGCTACTCCATACCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAACAATGGTTACAGTGTGTAATAAGCCTAGTAGCTGGTTTTTTTATAATAAGGACTCTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCCAATGTGAGGCCCTTGTCCATAGTGTTAATATACCTAATTGCAACCACTTTTGTAACCCACCAGAACCTGGATTTGGGTGGAATATTCCTCAGTAATGCACCAATCATATTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGGTCCTACCAACTTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTATCTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCTCCGCAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCGGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGATATATCTAATCTATCTGGTGATTGAACTGGTGTATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTGATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAAGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAGGAACTTGGTAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTTGGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCTGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAAGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTCAGACAGGAGGCCGGAGGGTATTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGCTTTTCCTAAGGAATTTACCAATACTGGCAACCAAAGTAAAACTATTAATGGTAGGGAACCTGGGATCCGAAGTAGGCGATCTCGAACACCTT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| 65,368 |
MH410815.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Silveira,S., Cibulski,S.P., Mosena,A.C.S., Weber,M.N., Canal,C.W.
|
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Laboratorio de Virologia Veterinaria
| null |
2019-02-13
|
LV127-29/16MA
|
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,096 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Bos taurus
|
blood
|
2013
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate LV127-29/16MA, complete genome
|
GGGTATCCCAAATTAATAATTTGGTTTAGGGACTAATCCCCCTGGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACCCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGCCATTGTATGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCGAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCAAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTCAGATTACCCCACCCAAGAGGGGAGAAAGAGGTGATGGTGGGTATGCGTGATTTACCAAGGAAAGGTGACTGCAGGACAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGCGGCTTGTTCGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCTATTTAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCACATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACGGCCAAGAGAGAAGGGCAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAACGTACTGGACAGTCCTATCTGGGTGGCAAGCTGTTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAGACCAAAAGAGAAATCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCAACAATAGTAGTAGAAGGGGTGAAATATCAGGTGAAGAAAAAGGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTGTACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAATTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCATTACTGGCCTTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATGCCATGTTCATTAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGCAGAACTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGTACACCCCTCAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGGTTAACATTGTAACGCAGGCCCCAAACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGCAAGAGGTTTTCATTCGCAGGTGAGGTAATCGATGGTCCCTGCAATTTCGATATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCTCAACACGTAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGAGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAACAACTGGGAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAATATCAACAAGAAGGTAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAATACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGTAGCCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTGGTGGTAATGTCAGACTTTGCACCTGAATCAGCTAGTGTCCTTTACCTGGTCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCGTCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTTCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATTTGACCAATATGTGGAACGCAGCATCCACAACAGCTTTCCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTGTTGCTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGTAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTAATGAGATCAACCTAATGGGGCCCACTGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGCGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCTGTTGACCTTACTTGTGTAGATGGGAACTTCCTAGTGTACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGGTACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCAACATCCGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCGACCCACAGGATTTAGAAGAAGTCCAAATGGAAGATGATTTTGAGTTTGGCTTATGTCCTTGCGACTCGACACCCATAATAAGGGGGAAATTTAACACAACCCTCCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAATAGAGTGCACTGTGGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTTCAAGGTATGAACCGTTCCCCCATAGGAAGCATTGTATGGACCAAATGGTTATAGGCGAGGACTTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAGGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTTACATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACTTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACAGAACAAGGAACTCTAAGGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGATTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCAAGTGATACAGAGCGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACACTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTCCAACAATACATGTTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATTATCGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTGCTAATAGTTTACTATGTGGTGACTGAACAAGGAGCCAGGGGACAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTGGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGTTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATGATAGTGGCAGTTCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCAATGGTATGCATACTACTGATGGTAAAAAGAGACCCTACAACAATCCCCGCGGTAGTGATAATAACAGGTGTCAAAACAAGACAATATACTGCATGGTTAGAATTGGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCAGCCGCTGTGCTACTCCATACCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAGCAATGGTTACAGTGTGTAATAAGTCTACTAGCTGGTTTCTTTATAATAAGGACGTTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGACCCTTGCCCATAGTGCTTATATACCTAATTGCAACCACTTTGGTGACCCACCAGAATTTGGATTTGGCTGGAATATTTCTCAGTAACGCACCAGTTATTTTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTTATTCTGGTCCTGCCAACCTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGAGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTATATTTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCCCCGGAGCAAAGACAGGTGAAATATTGCCAGTACTAAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAATGGACGTATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAAGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAGTTTGGTAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAGACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGGTCAAAGCTGCCTCACTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAAGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGTGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTACAAAAGGATTTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGAAGGGCCTTTCAGGCAGGAGGCCAGAGGGTATTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGC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| 65,369 |
MH410816.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Silveira,S., Cibulski,S.P., Mosena,A.C.S., Weber,M.N., Canal,C.W.
|
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Laboratorio de Virologia Veterinaria
| null |
2019-02-13
|
LV03/12
|
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,032 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Bos taurus
|
blood
|
2011
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate LV03/12, complete genome
|
ACCTTCAGTAGGACGAGCGTAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACACCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGCTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGACAAAAGTGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCGAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTCAAATTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGACTGCAGGTCAGGCAACCGTCTGGGACCGGTTAGTGGCCTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATATTGGCCCGGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAGTCACCAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAAGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAAAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAGTTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCATTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATACTATGTTTATTAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGCATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGTAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACTTAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCTAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATACGACAAGAATACTGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAAAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATTGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGATATGCTTTATGATGAAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAGCACGTAGTCGATGGGACCACCAATACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACTTGGTTAGGGAAGCAACTGGAAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCAGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGTAGCCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCGCTTGTGGTAATGTCGGACTTCGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTCTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAGGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTGACAGTGAGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTACCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTCCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATCTGACCAATATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCTTTTCTGGTGTGCCTGGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTGCTGATAACCGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGCAAACCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGGCCCACTGGGGCCCACCGACTTGACCACAAGGTGGCATGCGTACAGTGAAAGATTGCATATCACAGACTCATCTGTCGATCTTACCTGTGTAAATGGGAATTTCCTAGTGTACTGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTAAAGTTCACTCTAGTCGCCGATCCACAGGATTTAGAAGATGACCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACTCGACACCCATAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAACGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACCGGTACAGTAGAGTGCACTGTGGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTACAAGATATAAACCGTTCCCTCCTAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGCGAGGACCTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAAGTAAAGGACTGCAAGTGGTGCGGTTTCACATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAATGAAACAAGGGACTCTAAAGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTCGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCAATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACGTTTAACTGGACTGAGACGCTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTCCAACAATATATGTTGAAGGGGAAATACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATAATCGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGTGACTGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTATTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCGAGGAAAACGATGATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCGGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGGGGGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTGTGCATACTCCTGATGGTAAAAAGGGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATAATAACAGGTGTTAAAACTAGACAATATGCTGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTGCTACTCCATTCCTACATTAGTAGTTACTATAGATACAAACAATGGTTACAGTGTGTAATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTTATAATAAGAACATTGAAAACTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCCGTAGTGCTTATATACCTAATTACAACCACTTTGGTGACCCACCAGAACCTGGATTTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATCATGTTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGGTCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTATCTGTTCCCCTCCAGGCTAGGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTAATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAAGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCCTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGGTAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGTGGGATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACACTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAACTGGATGGGCCTTTCAGACAGGAGGCCAGAGGGTATTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGCTCTTCCTAAGGAATTTACCAATACTGGCAACCAAAGTAAAACTATTAATGGTAGGGAACCTAGGATCCG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| 65,370 |
KY762287.2
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Mosena,A.C.S., Cibulski,S.P., Weber,M.N., Silveira,S., Silva,M.S., Mayer,F.Q., Roehe,P.M., Canal,C.W.
|
UFRGS, Laboratorio de Virologia Veterinaria
|
Brazil
|
2017-07-06
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,239 |
GenBank
| 1 |
Brazil
|
Brazil
|
Bos taurus
|
blood
|
2012
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain PB22487, complete genome
|
CCCAAATTAATAATTTGGTCTAGGGACTAATTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTTAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACCCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATATGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCAAGTGATATACACCCCCAGTCCACGCTCAAATTACCCCACTCGAGGGGGAAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGACAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGTTTGTTCGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTTGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTAAAGTGGGTCTATAACGTACTGGACAGTCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCAGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAGAGATAGTAAAACTAAGCCACCAGATGCAACAATAGTAGTAGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAGGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGATGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAATTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTGCTGGCCTTGGTCTTGTGGCAACCAGTAGGTGGAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAATGGGATACAGCATGCTATGTTCATTAGAGGAGTCAGCCGCAGCCTACATGGCATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACCGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGAAAAAGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATCGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTCTATGATGAAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCTCAACACATAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGAGCCGCCAAGCTTACTACCTGGTTAGGGAAACAACTGGGAATCCTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAATATCAACAAGAAGGTAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAATACTAGGATTATGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCCTACATGAGATGGGCAGCCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCTGAATCAGCTAGTGTCCTTTACCTGATCCTGCACTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTTCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTCGCTTTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTTAAGTTGGTACTGAGAGCATTAAAAGATTTGACCAATATGTGGAACGCAGCGTCCACGACAGCTTTCCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTGCTGATAACTGGGGCCCAGGGCGACCTCAGTTGTAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGGCCCTTTGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAAGTGGTATGCGTACAGCGAAAAGTTGCGTATCTCAGACTCATCTATCGACCTTACCTGTGTGGATGGGAGCTTCCTAGTATACAAGAGGTGTGTGAGGAAACGGAGATACCTAGCCACCATACATGAGAGGGCATTTTCTACATCTGTGAAGTTCACTCTAGTCGCTGAACCACAGAGTCTTGAAGATGTCCAAATGGGGGACGATTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACTCGACACCCATAATAAGGGGAAAATTTAATACAACCCTCCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAATAGAGTGCACTGTGGTTAGTGATAGCACCCTAAAGACCCAATTGGTTAAGAGATTTGTAAGATATAAACCTTTCCCCCACAGGAAGCACTGTATGGACCAAATGGTTGTAGGTGAAGACTTGTATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGTATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAGGTAAAGAACTGCAAATGGTGCGGTTATACATTTGAAGAGCCAAGCGAGTTGCCACACTTCCCACTAGGCAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACTTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACCCTAAAGTGCAGGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCTATGCCGTGCAAACCAAGCTATGTGAAACAGAGTGAGGGACCGGTTTCAAAGACAGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACGCTCGAAAACAAGTACTTTGAACCCAGGGACAACTACTTCCAACAATACATGTTGAAGGGGAAGTATCAGTACTGGTTTGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATTATCGTAGTGGCTCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGTTACTAATAGTTTACTACGTGGTGACTGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTGGTCCTAATAGGAGAAATGATAACACATGACAGTATTGAAGTCGTAACCTATTTCCTACTACTATACCTGCTTATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATCGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAAAGGTGACGATGGGAGGGCGAACCAAGGAGATGAGCTTGATGTATGGTTCTACGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTGAAAAGAGACCCTACAACAATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAGGTGTTAAAACGAGACAATACACTGCATGGTTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAACAGTTGCGGCCGTTGTGCTACTCCATACCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAGCAATGGTTGCAGTGTGTAATAAGTCTACTGGCTGGTTTTTTTATAATAAGGACGTTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTACAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCTTTGCCCATAGTGTTTATATACCTAATTACAACCACCTTAGTGACCCACCAGAACCTGGATTTGGCTGGAATGTTCCTCAGTAACGCACCAGTTATTTTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTTATTCTGGTCCTGCCAACCTATGAGTTAACAAAATTGTACTATATCAGAAGGGTGAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTTGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAAGCAAGGCCCCGGAGCAAAGACAGGTGAGATACTGCCAGTGTTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCGTCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCCGGTGGAACCAACGTGCTCTCTAGAATAATTGCTGGACTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAAGAAGAGAACAAAGGGCTTAAAAAATTCTTTATTTTGTCCGCTAGGCTCAAGAATTTGGTAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCATGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGCTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGATTTTGAGGAGAAACATTATAAAAGGATTTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTCAGGCAGGAGGCCAGAGGGTACTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGCTTTTCC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GCACAAGGGAACTGGGAGCCCGTAAGCTGCAATGTATATATGGGTACAATACCAGCAAGAAGGGTAAAGACACACCCTTATGAAGCATACTTGAAACTAAAAGACCTCCTGAGTGAGCATAAGATGAGGGTGGAAACTGGCTTTGCTGACTTAAAAGACCACAACAGGTGGATACTAAGGAAAGTGAAGCACCAAGGGAACTTAAGAACGAAGCACATCTTGAACCCGGGTAAACTATCAGAACAGCTGGAACGAGAGGGACGAAAACACAATGTGTACAATAAGCAAATAGGGTCCATTATGACTTCAATAGGAATTAGAATGGAGAAGCTCCCCATAGTAAGAGCCCAAACAGACACTGTCAGTTTCCACCAAGCAATCAGAGACAAAATAGATAAGGAAGAAAACACCCAGACCCCAGATCTGCATGAGAAGTTATGGGAAGTTTTTGATACGCTCAAGGTCCCAGAACTAAAAGGTGCTTATGACGAGGTGTCATGGGAAGAACTAGAGGCGGGCATAAACAGGAAAGGAGCAGCAGGGTTCCTGGAAAAGAAAAATATAGGGGAGGTGCTCGCTTCGGAAAAGGACTTAGTTGAAGACATAGTTAAGGATCTGAGAAGGGGGAAGAAGATTAATTACTATGAGACAGCCATACCTAAGAATGAGAAGAGAGATGTCAACGATGACTGGGAAGCAGGGGACTTGGTAGATGAAAAGAAACCAAGAGTTATACAGTACCCAGATGCTAAAGTCAGATTGGCTATCACCAAAGTAATGTATAAGTGGGTCAAGCAAAAACCTGTGGTAATACCGGGGTACGAAGGAAAAACCCCACTTTTCCAAATCTTTGACAAGGTAAAGAGGGAGTGGGATGGCTTCAACGACCCGGTAGCAGTGAGTTTTGACACAAAGGCTTGGGACACTCAGGTGACAAGCCGCGATCTCCGCCTCATAGGGAGGATACAAAAATACTATTTCAAGAGCAGATGGCACAAGTTCATTGACACCTTAACAGAACACATGACTGAGGTCCCGGTGATTACAGCTGATGGTGAGGTCTACATAAGAAAGGGGCAGAGGGGCAGTGGCCAACCAGATACAAGCGCAGGGAACAGCATGCTAAATGTGCTAACCATGGTGTATGCTTTTTGTGAGAGCACTGGGGTCCCATACAGGAGCTTCAACAGAGTAGCAAGAATACATGTTTGTGGAGATGACGGCTTTCTGATAACAGAGAAAGGCCTAGGGTTGAAGTTTGCCAGTAAAGGAGCCCAGATATTGTATGAATCTGGCAAACCACAAAAGATACTAGAAGGAGACAAAATGAAGGTGGCTTACAGATTTGAAGACATAGAGTTTTGTTCCCACACACCAATCCCCGTTAGATGGTCAGACAACAGCAGTGGCTACATGGCCGGAAGGAACACCGCCACAGTGCTTGCAAAAATGGCCACTAGGCTTGACTCAAGTGGGGAGAGGGGCACTGCCGCATATGAGAAAGCAGTGGCATTCAGCTTCCTCCTAATGTACTCCTGGAACCCTTTAATCAGGAGGATTTGTCTGTTGACATTATCATCAAAACCAGAGGTAGACCCCTCTAGACAAGCCACTTACTATTATAAGGGAGACCCTATAGGGGCCTACAAGGAGGTTGTAGGGCACAACCTGCACGATCTGAAGAGAGTTGGTTTTGAGAAGCTGGCTAGCTTAAACCTGAGTATGTCCACATTGGGGATATGGACAAGGCACACCAGTAAAAGACTACTCGAAGACTGTGTGAAGGTGGGAAAGGAAGAAGGTAACTGGCTTGTCAACGCTGACCGGCTAGTTTCTAGTAAGACCAACAAAATGTACATCCCCAACGAAGGACACACCTTGCAAGGCAAGTATTATGAAGAACTGAGACTAATAGGGCCAGGAGGACCCATCTCAAGGGTGGGAAAAGACAGGTACCGTCTTGGTCCAATAGTCAATGTAATCCTGAGAAGGCTGAGGGTCTTGATGATGGCGGCCGTAGGAAAGGAGGCTGTCATCTAGGCAGGAACATATGTGTACATAAATGTAAATAATAACAACATGTAATATATAGTGTAGATATTTGTTAGGGCTAATTTATTACTTTGGGCTAATGAGAACTACCTCATTTAACAACACTACACTCATCAATTAACAGCACTTTAGCTGTTTGGGAAAAACCCGACGTCCGCAGTCGGACTAGGGAAAATCCTTAACGGCC
| 75,923 |
KY767958.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Mosena,A.C.S., Cibulski,S.P., Weber,M.N., Silveira,S., Silva,M.S., Mayer,F.Q., Roehe,P.M., Canal,C.W.
|
UFRGS, Laboratorio de Virologia Veterinaria
|
Brazil
|
2017-07-06
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,266 |
GenBank
| 1 |
Brazil
|
Brazil
|
Bos taurus
|
blood
|
2007
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain SV478/07, complete genome
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TAGCTCATGTCGGCGTATATGATTGGATATCCCAAATTAATAATTTGGTCTAGGGACTAATTCCCCTAGCGAAGGCCGAAAAAGGTTAACCATACCTTTAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGAGAGCCAAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTCAAATTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATGGTGGGCATGCGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGTTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCGAATGTGTGAAGTCACAAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATATACTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTATTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAAGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGATGGACTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGAAAAAAATTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAATACTGGCCTTAGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACGAACGGAATACAGCATGCCATGTTCATTAGAGGAGTTAACCGCAGCCTTCATGGTATATGGCCTAATAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGCAGAACTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACTTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATACGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAATATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCTACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTGACCGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGAATGTACAAGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACGTAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGAGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAACAGCTGGGAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCGAAAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTACACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCGGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGTAGCCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTCGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCTCATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTCCATGGTGGCCATATGAAACGGCCACAGTGCTCGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATTTGACCAAAATGTGGAACGCAGCATCCACGACGGCTTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTGCTAATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGATACTGATGAGATCAACTCACTGGGGCCCACCGGTTTGACTACAAGGTGGTATGCGTACAGTGAAAAGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGATCTTACTTGTGTAGATGGGAATTTCCTAGTGTACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTAGCCATCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCTGTGAAGTTCATTCTAGTCGCCGACCCACAGGATGTAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGATTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGTGACTCGACACCCATAATAAGGGGAAAATTCAACACAACCCTTCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGCACAGTAGAGTGCACCGTGGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTGTACACCAAATGGTTGTAGGAGAGGACTTATATGAATGCCTGTATGGCGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGACAGGGTACTATACCAAGGAGGTGAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCACATTTGAAGAGCCAAGCGAATTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACAACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAGCGGAACAAGGAACTCTAAAGTGCAAGATAGGCAAGGTGGAGGTCAGAGTCTTGGCCTTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACGTTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAAATACTTCCAACAATATATGTTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGCGACCGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTGGTCCTAATAGGTGACATGATAACACACGATAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTATTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCGAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGAGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTTTATGTGGTACTAGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTGAAAAGAGACCCCACAACAATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAGGTATTAAAACAAGGCAATATGCTGCATGGCTAGAACTAGATGTAGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTACTACTCCATACCTACATCAGTAGTTACTATAGATACAAACAATGGTTGCAGTGTATAATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACTTTGAAAACTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTGATGTGAGGCCCTTGCCCTTAGTGCTTATATACCTAATCACAACCACTTTGGTGGCCCACCAGAACCTGGATTTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATTATGTTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGACCTACTTACCCTCATTCTGGTCCTGCCAACTTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGATACAAACTTCACACGCGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGAGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAATATTGAGGTGCGTGCTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAAATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGATGAAGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAATTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGGTAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTGGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAAGAAAAACATTATAAAAGGATCTTTATAAGAGAGGGAGAATTAGACGGGCCTTTCAGGCAGGAGGCCAGAGGGTATT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| 75,924 |
KY683847.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Cortez,A., Araujo,J.P. Jr., Heinemann,M.B., Flores,E.F., Ribeiro,M.G., Megid,J., Paes,A.C., Oliveira Filho,J.P., Ullmann,L.S., Malossi,C.D.
|
Sao Paulo State University - UNESP, Microbiology and immunology
|
Brazil
|
2017-06-26
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,280 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Bos indicus
|
abdominal cavity
|
2015-06
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain SV757/15, complete genome
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TACGCCGACGTGAGCTAACCGGACGTATATGATTGGGTATCCCAAATTAATAATTTGGTTTAGGGACTAATTCCCCTGGCGAAGGCCGAAATAGGTTAGCCATACCTTCAGTAGGACGAGCGTAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAATGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAACCAAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTCAAACTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACATGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCCTAGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTGTATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCCCCAATGTGTGAAGCCACCAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGATAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTACTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAAAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAATTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCTTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACTAACGGGATACAGCATGCTATGTTCATTAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCTCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATATGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAAGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATCGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACTTAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAGCAACTGGGAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTGACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCAGAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGTGGCCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTCGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACCTGATCCTGCATTTTTCCATACCACAGGCACATAAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTCCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATTTGACCAATATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCTTTTCTAGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTGTTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGCGAAAAGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGATCTTACTTGTGTAGATGGGAATTTCCTAGTGTACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGGTACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCCACATCAGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCGATCCACAGGATTTAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACTCGACACCCATAATAAGGGGAAAGTTTAACGCAACCCTTCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAGTAGAGTGCACTACGGTCAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTACAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGCGAGGACCTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGTATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGCTTCACATTTGAAGAGCCAAGCGACTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACTCTAAAGTGTAAGATAGGCAAGGTAGAAGTCAAAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAGCCAAGCCTTGTGACACAGAGTGAGGGGCCAGTTTCAAAGACAGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACATTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTCCAGCAATATATGTTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGTGACTGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGGGAGGTAGTCCTAATAGGAGATATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATAAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGCCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCGGCTTAGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGTGACCCAAGGAGGTGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTTAAAAGAGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATAATAACAGGTGTTAAAACAAGACAATATACTGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTGCTACTCCATTCCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAACAATGGTTGCAGTGTGTAATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACGTTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCGATAACAGTGCCTAATGTGAAGCCCTTGCCCATAGTGCTTATATACCTAATTACAACCACTTTTGTGACCCACCAGAACCTGGATTTGGCTGGAATATTCCTCAGTAATGCACCAATTATGTTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGGTCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGATTCTGTGTATGAATTAGACGGATCTGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCCCCGGAGCAAAAACGGGTGAAATACTGCCAATATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCRTCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATACTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAACGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCTTCATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATCTGATAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACCATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTACGGAATGCCAAAAATCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTCAGGCAGGAGGCC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| 75,994 |
KU563155.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Shi,H.
|
China-UK-NYNU-RRes Joint Libratory of Insect Biology, Nanyang Normal University, Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain
|
China
|
2016-07-31
|
HN1507
|
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,556 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Capra hircus
| null |
2015
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate HN1507, complete genome
|
GTATACGCCCGGTTAGCTCATGTCGGCGTATATGATTGGGTATCCCAAATTAATGATTTGGTTTAGGGACTAAATTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGGGTACAGGGTCGTCGTCAATAAGGTTCGACGCATCAACGAGTGGATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTATGTCTTAACCCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGATGGTCGATTATGTGGCCCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTATATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCGAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTTAAACTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATCGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTAGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCCAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAACTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCCTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATACTATGTTCATAAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACTTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATACGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTGATCGACGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGGATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACATAGTTGATGGCACTACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAGCAACTGGGGATCTTGGGAAAGAAACTAGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGCAGTCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACTTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTGAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCCCCATGGTGGCCGTATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTACTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGACTTGACCAATATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTACTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGCTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGTGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCCGTCGATCTTACTTGTGTGGATGGGAATTTCCTAGTGCACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCAATCCACAGGATATAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACGCGACACCCGTAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAACGGGCCGGCCTTCCAATTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGCACAGTAGAGTGCACTGTAGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGTGAGGACTTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTAAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCATATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACTCTAAGGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTAAGGGGCCGGTTTCAAAGAGGGCATGCACTTTCAACTGGACTGAGACACTTGAAGAAAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTTCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTAGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTATGTGGTAACTGATCAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTATCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACCTGACGTATGGTTCTATGTGGTGCTGGCTATGGTGTGCATACTCCTGATGGTAAAAAGGGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAGGTGTCAAAACAAGACAATATGTCGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTACTAATCCATACCTACATTAGTAGTTACTATAAATACAAACAATGGCTACAGTGTGTGATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACATTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCCATAGTGCTTATATACTTAATTACAACCACTTTGGTGGCCTACCAGAACCTGGATCTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATCATGTTGATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGATCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCCGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAATGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGATAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGGCGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTTA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| 80,765 |
KJ627179.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Decaro,N., Lanave,G., Lucente,M.S., Mari,V., Varello,K., Losurdo,M., Larocca,V., Bozzetta,E., Cavaliere,N., Martella,V., Buonavoglia,C., Camero,M., Lorusso,E.
|
University of Bari, Department of Veterinary Medicine
|
Italy
|
2014-06-23
|
Italy-68/13ncp
|
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,243 |
GenBank
| 1 |
Italy
|
Italy
|
Bos taurus
|
brain
|
2013-03
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate Italy-68/13ncp, complete genome
|
GTATACGCCCGGTTAGCTCATGTCGGCGTATATGATTGGGTATCCCAAATTAATGATTTGGTTTAGGGACTAAATTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATGCCCATAGTAGGACTAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCGAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTTAGACTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCTTGGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATCGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTAGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCCAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAGAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAACTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCCTGGTCCTGTGGCAACCGGTGGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATACTATGTTCATAAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACTTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTGATCGACGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGGATGTACATGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACATAGTTGATGGCACTACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAGCAACTGGGGGTCTTGGGAAAGAAACTAGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCATATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTATGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGCAGTCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACTTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGGAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTGAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCCCCATGGTGGCCGTATCAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTACTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGACTTGACCAATATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTACTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGCTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGTGAAAGGTTGTATATCACAGACTCATCCGTCGATCTTACTTGTGTGGATGGGAATTTCCTAGTGCACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCAATCCACAGGATATAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACGCGACACCCGTAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAACGGGCCGGCCTTCCAATTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGCACAGTAGAGTGCACTGTAGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGTGAGGACTTATATGAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTAAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCATATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACTCTAACGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACTTTCAACTGGACTGAGACACTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTTCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTTGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTAGTGGCCCTCYTGGGTGGSAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTATGTGGTAACTGATCAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTATTACTGATCTATCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACCTGACGTATGGTTCTATGTGGTGCTGGCTATGGTGTGCATACTCCTGATGGTAAAAAGGGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAGGTGTCAAAACAAGACAATATGTCGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTACTAATCCATACCTACATTAGTTGTTACTATAAATACAAACAATGGCTACAGTGTGTGATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACATTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCTATAGTGCTTATATACTTAATTACAACCACTTTGGTGGCCTACCAGAACCTGGATCTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATCATGTTGATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGATCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGCTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCCGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAATGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGCTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGAAAGAGAGCAAGGGGCCTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGATAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTACGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGGCGTGACTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTTAGGCAGGA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GTGGTAGACAAACCAAGGGACATGTAGTGTCTGCATACCAACTAGCACAAGGGAACTGGGAGCCCATAAGTTGCAATGTATATATGGGCACAATACCAGCAAGAAGGGTAAAGACTCACCCTTATGAAGCATACTTGAAACTAAAAGATCTCTTGAGTGAACACAAGATGAGGGTGGAAACTGGCTTTGCTGACTTAAAAGATCACAACAGGTGGATATTAAGGAAAGTGAAGCACCAAGGGAACTTAAGAACGAAGCACATCTTGAACCCGGGTAAACTATCAGAACAGCTGGAGCGAGAAGGACGAAAACACAATGTGTACAACAAGCAGATAGGATCCATTATGACTTCAATAGGAATTAGAATGGAGAAGCTCCCCGTAGTAAGAGCTCAAACGGACACTGTCAGTTTCCATCAAGCAATCAGAGACAAGATAGATAAGGAAGAAAACGCCCAGAGCCCAGATCTGCATGAGAAGCTATGGGAAGTGTTTGATACGCTCAAGGTCCCAGAGCTAAAAGGTGTTTATGACGAGGTGTCATGGGAGGAACTGGAGGCGGGCATAAACAGAAAAGGAGCAGCAGGGTTCCTGGAAAAGAAAAATATAGGGGAGGTGCTCGCTTCAGAGAAGAACTTAGTTGAAGAAATAGTTAAGGATCTGAAGAGAGGGAAGAAGATCAATTACTATGAGACAGCCATACCTAAGAATGAGAAGAGAGATGTCAACGATGACTGGGAGGCAGGGGACTTAGTAGATGAAAAGAAACCAAGAGTTATACAGTACCCAGATGCCAAAGTCAGATTGGCAATCACCAAAGTGATGTACAAGTGGGTCAAGCAAAAACCTGTGGTGATACCGGGGTACGAAGGAAAAACCCCACTTTTCCAAATCTTCGACAAGGTAAAGAAGGAGTGGGATGGCTTCAACGACCCGGTGGCAGTGAGTTTTGACACAAAGGCTTGGGACACCCAGGTGACAAGCCGCGATCTCCGCCTCATAGGGAGGATACAAAAATACTATTTCAAGAACAGATGGCACAAGTTCATTGACACCTTAACAGAACACATGACTGAGGTCCCGGTGATCACAGCTGATGGTGAGGTCTACATAAGAAAGGGGCAGAGAGGCAGTGGCCAACCAGATACAAGCGCAGGGAACAGCATGCTAAATGTGCTAACCATGGTGTATGCTTTCTGTGAGAGCACTGGGGTCTCATACAGGAGTTTCAACAGAGTAGCAAGAATACATGTCTGTGGAGATGACGGCTTTCTGATAACAGAGAGAGGCCTAGGGTTGAAGTTTGCCAGTAAAGGAGCCCAGATATTGTATGAATCCGGAAAGCCACAAAAGATACTAGAAGGAGACAAAATGAAGGTGGCTTACAGATTTGAAGACATAGAGTTTTGTTCCCACACACCAATCCCCGTTAGATGGTCAGACAACAGCAGTGGCTACATGGCCGGAAGAAATACCGCCACGGTGCTTGCAAAAATGGCCACTAGGCTTGACTCAAGTGGAGAGAGGGGCACTGCCGCATATGAGAAAGCAGTGGCATTCAGCTTCCTCCTAATGTACTCCTGGAACCCTTTAATCAAGAGGATTTGTCTGTTGACCTTATCATCAAAACCAGAGGTAGACCCTTCTAAACAAGCCACTTACTATTATAAGGGAGACCCTATAGGGGCCTACAAGGAGGTTGTAGGGCACAACTTGCATGACCTGAAGAGAGTTGGTTTTGAGAAACTGGCTAGCTTAAACCTGAGTATGTCCACATTGGGGATATGGACAAGGCACACCAGTAAAAGACTACTTGAAGACTGTGTGAAGGTGGGAAAGGAAGAAGGTAACTGGCTCGTCAATGCTGACCGGCTAGTTTCTAGTAAGACCAACAAAATGTACATCCCCGATGAAGGACACACCTTGCAAGGCAAGTATTATGAAGAACTGAGACTAATAGGGCCAGGAGGACCCATCTTAAGGGTGGGGAAAGATAGATACCGTCTTGGTCCAATAGTCAATGTAATCCTGAGAAGGTTGAGGGTCTTGCTGATGGCGGCCGTAGGAGAGAGGGCTGTCATCTAGGCAGGAACATGTGTGTATATAAATGTAAATAATAATAACATGTAATATATAGTGTAGATATTGTTAGAGCTAATTTATTACTTTAGGCTAATGAGAACTACCTCATTAAACAACACTACACTCATTAATTAACAGCACTTTAGCTGTTTGGGAAAGACC
| 90,115 |
KJ627180.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Decaro,N., Lanave,G., Lucente,M.S., Mari,V., Varello,K., Losurdo,M., Larocca,V., Bozzetta,E., Cavaliere,N., Martella,V., Buonavoglia,C., Camero,M., Lorusso,E.
|
University of Bari, Department of Veterinary Medicine
|
Italy
|
2014-06-23
|
Italy-68/13cp
|
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,549 |
GenBank
| 1 |
Italy
|
Italy
|
Bos taurus
|
brain
|
2013-03
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate Italy-68/13cp, complete genome
|
CTATACGCCCGGTTAGCTCATGTCGGCGTATATGATTGGGTATCCCAAATTAATGATTTGGTTTAGGGACTAAATTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACTAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCGAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTTAARCTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATCGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTAGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAATCCAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAGAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAACTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCCTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATACTATGTTCATAAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTGAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACTTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATACGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTGATCGACGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGGATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACATAGTTGATGGCACTACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAGCGACTGGGGATCTTGGGAAAGAAACTAGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGCAGTCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACTTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTGAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCCCCATGGTGGCCGTATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTACTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGACTTGACCAGTATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTACTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGCTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGTGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCCGTCGATCTTACTTGTGTGGATGGGAATTTCCTAGTGCACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCATACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCAATCCACAGGATATAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACGCGACACCCGTAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAACGGGCCGGCCTTCCAATTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGCACAGTAGAGTGCACTGTAGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGTGAGGACTTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTAAGGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCATATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACTCTAAGGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACTTTCAACTGGACTGAGACACTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTTCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTAGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTATGTGGTAACTGATCAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTATCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACCTGACGTATGGTTCTATGTGGTGCTGGCTATGGTGTGCATACTCCTGATGGTAAAAAGGGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAGGTATCAAAACAAGACAATATGTCGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTACTAATCCATACCTACATTAGTAGTTACTATAAATACAAACAATGGCTACAGTGTGTGATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACATTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCACTTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCCATAGTGCTTATATACTTAATTACAACCACTTTGGTGGCCTACCAGAACCTGGATCTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATCATGTTGATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGATCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCCGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAATGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGAAAGAGAGCAAGGGGCCTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGATAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACATTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGGCGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTTACGATGAT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| 90,116 |
KC788748.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Decaro,N., Mari,V., Lucente,M.S., Sciarretta,R., Elia,G., Ridpath,J.F., Buonavoglia,C.
|
University of Bari, Department of Veterinary Medicine
|
Italy
|
2013-12-22
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,118 |
GenBank
| 1 |
Italy
|
Italy
|
Bos taurus
|
oronasopharynx
|
2007
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain Italy-129/07, complete genome
|
CCTTTAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCGAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTTAAACTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATCGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTAGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCCAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAACTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCCTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATACTATGTTCATAAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACTTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTGATCGACGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGGATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACATAGTTGATGGCACTACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAGCAACTGGGGATCTTGGGAAAGAAACTAGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGCAGTCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTACACCCGAATCAACTAGTGTCCTTTACTTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTGAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCCCCATGGTGGCCGTATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTACTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGACTTGACCAATATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTACTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGCTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGTGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCCGTCGATCTTACTTGTGGGGATGGGAATTTCCTAGTGCACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCAATCCACAGGATATAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACGCGACACCCGTAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAACGGGCCGGCCTTCCAATTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAGTAGAGTGCACTGTAGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTAGTAGGCGAGGACTTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACACGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTAAAGTAAAGGACTGCCAATGGTGCGGTTTCATATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACTCTAAGGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGTCGGTTTCAAAGACGACATGCACTTTCAACTGGACTGAGACACTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTTCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTAGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTATGTGGTAACTGATCAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTATTGATTTATCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTTTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACCTGACGTATGGTTCTATGTGGTGCTGGCTATGGTGTGCATACTCCTGATGGTAAAAAGGGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAGGTGTCAAAACAAGACAATATGTCGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTACTAATCCATACCTACATTAGTAGTTACTATAAATACAAACAATGGCTACAGTGTGTGATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACATTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCCATAGTGCTTATATACTTAATTACAACCACTTTGGTGGCCTACCAGAACCTGGATCTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATCATGTTGATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGATCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCCGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAATGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCTTGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGATAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGGCGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTTAGGCAGGAGGCCAGAGGGTATTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGCTTTTCCTAAGGAATTTACCAATACTGGCAACTAAAGTAAAACTATTAATGGTAGGGAACCTGGGATCCGA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| 92,236 |
AB871953.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Kozasa,T., Hoffmann,B., Beer,M., Schirrmeier,H., Ishimaru,M., Nakamura,S.
|
Forestry and Fisheries, Animal Products Safety Division, Food Safety and Consumer Affairs Bureau; 1-2-1 Kasumigaseki, Chiyoda-ku, Tokyo 100-8950
|
Japan
|
2013-11-12
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,265 |
GenBank
| null | null | null |
Bos taurus
| null | null | null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 RNA, complete genome, strain: D32/00_'HoBi'
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CTCATGTCGGCGTATATGATTGGCTATCCCAAATTAATAATTTGGTTTAGGGACTAACTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATGGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATATGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCAAGTGATACACACCCCCAGTCCACACTCAAATTACCCCACCCGAGGGGGGAAAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGACGGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGTTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTCTACCAGGATTACTCTGGCCCAGTGTATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAGTCACCAAAAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAACGTATTGGACAGCCCCATCTGGGTAGCAAGCTGCTCTGATGAAAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAGAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACTCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAGAAATTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCTTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACGAACGGGATACAGCATGCTATGTTCGTCAGAGGAGTAAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACTCACCTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACGGGAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAAAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATTGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGATATGCTTTATGATGAAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCTCAACACGTAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGAGCTGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAACAACTGCGAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGTTTACCTAAGAACACTAGGATTGTAGGACCAGGCAAATTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAAATGGGTAGCCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTCGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTCTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGGGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTCCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTCGCTTTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATCTGACTAATATGTGGAACGCAGCGTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTACTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGTAAGCCTGAGTTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCAACTTACTGGGGCCCACCGGTTTGACCACAACGTGGCATGCATACAGTGAAAAGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGACCTTACTTGTGTAGATGGGAACTTCCTAGTATACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCTGTGAGGTTCACTCTAGTCGCCGACCCACAGGATTTAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGTGACTCGGTACCCATAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTCCTCAATGGGTCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACGATAGAGTGCACTGTGGTCAGTGATAGTACCCTAAAAACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGCGAGGACTTATATGAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCACGTTTGAGGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACAACACCACCTGTGATAGAGATGGAGTGGCAATAATGGAACAAGGAACTCTAAAGTGTAAGATAGGCAAGGTAGAAGTCAGAGTCTCGGCCCTAAACAAAAACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCGAAGACGGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACGCTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTCCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTATTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTCGCTGAGTTCATTGTGATTATTGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTCTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGCAACTGAACAAGGAGCTAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTGGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTATTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTAAAAAGAGACCCCACAACGATCCCTGCAGTAGTGATAATAACAGGTGTTAAAACAAGACAATATGCTGCATGGCTAGAACTGGATATAGCTTTGTCAATAGTTGCAGCCGTTGTGCTACTCCATTCCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAACAATGGTTACAGTGTGTAATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTTATAATAAGGACGTTGAAAGCTGTAGGGGAGTACCAATTGCCTGTAATAACAGTGCCTAATGTAAGGCCCTTGCCCATAGTGTTCATATATCTAATTACAACCACTTTGGTGACCCACCAGAACCTGGATCTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCGCCAATTGTGTTAATGGTACTAACCCTATGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGGTCCTGCCAACTTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTATCTGTTCCCCTCCAGGCTAGGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAACCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAATGCACTCTCTAGAACGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGACTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGGTATTGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGCTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAAGGTGGCAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGTAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTCAGGCAGGAGGCCAGAGGGTATTTAC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| 92,520 |
JX985409.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Zhou,W., Xia,H., Stalder,H., Peterhans,E., Belak,S., Liu,L.
|
National Veterinary Institute (SVA), Virology, Immunobiology and Parasitology (VIP)
|
Sweden
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2013-10-31
|
CH-KaHo/cont
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Pestivirus brazilense
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Pestivirus
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Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,279 |
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 isolate CH-KaHo/cont, complete genome
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TACGCCTAGTTAGCYCACGTAGGCGTATATGATTGGGTACCCCAAATTAATAATTTGGTTTAGGGACTAATTCCCCTGGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCATAACGGGGGACTAGTGGTRGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAGCAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCAAGTGGTATACACCCCCAGTCCACACTCAAATTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATGCGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGTCTGGGACCGGTTAGTGGCCTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTCTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAGTTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAGTCACCAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTAGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATATATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGTTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAGAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGACGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAATTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAATACTGGCCTTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACACAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATGCTATGTTCATTAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCTACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATCGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGGATGTACAGGTCTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACGTAGTTGATGGGACTACCAACACTATAGAGGGAGCCAGACAAGGGGCTGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAACAACTGGGAATCTTGGGGAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAGACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGTAGCCACCTGTCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACGGTGAGCCTAAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTTCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACAGTGCTCGCATTTGAGGAAATTGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATTTGACCAATATGTGGAACGCAGCGTCCACGACGGCTTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTGCTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGTAAGCCTGGATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCAACTTATTGGGGCCCACTGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGCGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGACCTTACTTGTGAAGGTGGGAAATTCCTAGTGTACAAGAGGTGCGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTCTCTACATCTGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCGATCCACAGGGTTTAGAAGAAGTCCAAATGGGAGATGATTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACTCGAAGCCCATAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTCCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAATAGAGTGCACTGTGGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTACAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATAGATCAGATGGTTGTAGGCGAGGACTTATACAAATGTCTGTATGGTRGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCACATTTGAAGAGCCAAGCGACTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACAACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAATGGAACAAGGAACTCTAAAGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAAAGTCTTGGCCTTAAACAAAGACTTGGGGCCAATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGACCGGTTTCAAAGACGGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACGTTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTCCAACAATATATGTTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGTAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTGGTAGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGTGACTGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTGGTCCTAATAGGAGATATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTATTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGAGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTAAAAAGAGACCCCACAACAATCCCTGCAGTAGTGATAATAACAGGTATTAAAACAAGACAATATGCCGCATGGCTAGAACTAGATATAGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTACTACTTCATTCCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAACAATGGTTGCAGTGTGCAATAAGTCTACTAGCTGGTTTYTTCATAATAAGGACTTTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGTAATAACAGTGCCTAATGTGAAGCCCTTGCCCTTAGTGCTTACATACCTAATTACAACCACTTTGGTGACCTACCAGAACCTGGATTTGGCTGGAATATTCCTTAGTAACGCACCAATTATGTTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGGTCCTGCCAACCTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTACGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCCCCAGAACAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGCTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAAATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTATCTAGATTGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAAGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAGTTTGGTAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTGGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACACTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGTAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTCAGGCAGGAGGCC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| 92,795 |
KC297709.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Gao,S., Du,J., Tian,Z., Xing,S., Chang,H., Liu,G., Luo,J., Yin,H.
|
Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology, National Foot and Mouth Disease Reference Laboratory
|
China
|
2013-03-25
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,282 |
GenBank
| 1 | null | null |
Bos taurus
| null |
2012-05
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain LVRI/cont-1, complete genome
|
GTATACGCCCAGTTAGCTCATGTCGGCGTATATGATTGGGTATCCCAAATTAATAATTTGGTTTAGGGATTAATTCCCCTGGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCGTAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGCACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACCCAAGCGGGGGTCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATATGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTGTTATATAAAACACACAAACAAAAACCAGCCCGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGCATTATACGGGGAGCCAAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTCAAATTGCCCCACCCGAGGGGGAAGAAAGAGGTGATGGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATAGCAGGACAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGTTTGTTCGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGCGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCATCGACGGTTGTATCCTGGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTAGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAGGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAATTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAATACTGGCCTTGGTCCTGTGGCAGCCGGTAGGTGCAGAGAATATAATGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATGCTATGTTCATTAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGTTATGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATCGATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACATGTAGTTGATGGGACCACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAGGCAACTGGGAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAGGATAGGTTATGTGTGGTACACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACCCTAGGATTGTGGGGCCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGTAGCCACCTATCTGAACTGACCATATTGGCACTTGTGGTGATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACCTGATCCTGCATTTTTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTAAGGACTGACGAAGTAGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTAAGACCTCCATGGTGGCCATATGAGACGGCCACGGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTAAGAGCATTAAAAGATTTGACCAATATGTGGAACGCAGCGTCCACGACGGCTTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTGATCTGGCTATTGCTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGAAGAGATCAACTCATTGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGTGAAAAGTTGCATATCACAGACTCATCCATCGACCTTACTTGTGTAGGTGGGAATTTCTTAGTGTACAAGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTGAAATTCACTCTAGTCGCCGATCCACAGGATTTAGAAGAAGTCCAAATGGGAGATGATTTTGAAGTTGGCTTATGCCCTTGCGACTCGACACCCATAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAGTAGAGTGTACTGTGGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGCTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATAGATCAAATGGTTGTAGGTGAGGACTTATATGAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCATGGAGGTGAAGTAAAAGACTGCAAATGGTGCGGTTTCACATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACATTACCCACTAGGTAAGTGCAGGCTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACAACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACTCTAAAGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCAAGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCGAAAACGGCATGCACATTCAACTGGACTGAGACGCTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTCCAACAATATATGTTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGATCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATTATCGTGGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTACGTTGTGACTGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAGCCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGCATTGAAGTCATAACCTACTTCCTATTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAGCCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTACCACGCAATCACAGCCAGTCCAAGGGCAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGCTCTCCAGCTTGGTCAGAGGCGATGATGGGAGAGAGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTATGCATACTCCTGATGGTGAAGAGAGACCCCACAACAATCCCTGCAGTAGTGATAATAATAGGTATTAAAACAAGACAACGTACTGCATGGCTAGAACTAGATATAGCTTTGTCAATAGTTGCAGCCGTTGTACTACTCCATACCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAACAATGGTTGCAGTGTGTAATAAGTCTATTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACTTTGAAAGCTGTAGGAGAGTGCCAATTGCCTGTAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTACCCTTAGTGATTATATACCTAATTACAACCACTTTGGTGACCCACCAGAACATAGATTTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATTATGTTAATGGTACTAACCCTATGGGCAGATCTACTTACCCTTATTCTGGTCCTGCCAACTTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCCACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTATCTGTTTCCCTCTAGGCAAGGCTCTGAAGCAAAAACAGGCGAAATACTGCCAGTGTTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCGTCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAAATAGCTGGTGGAACCAACTGGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAAGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGGTAATGAAGCACAAGGTTAGAAATGAAACTATTGGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGTCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACAGTATGTGAGAGACGTGACTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCGTGCGGAATGACTCTAGCGGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTTGATGGGCCTTTCAGGCAGGAA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| 94,408 |
JX469119.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Mao,L., Li,W., Zhang,W., Yang,L., Jiang,J.
|
Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Institute of Veterinary Medicine
|
China
|
2012-10-14
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,145 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
| null | null |
2012-04-01
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain JS12/01, complete genome
|
ATTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTTAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAGTGGTTCGACGCATTAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACCCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGGGAGTCATTATATGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGCTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTGTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTTCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCGGTATTATATGGGGAGCCAAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTCAAATTACCCCACCCGAGGGGGAAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGACAGGCAACTGCCTAGGACCGGTTAGTGGCTTGTTCGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATTGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTGTTGAAGACAGCTAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAACGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCTAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCAACAATAGTAGTAGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAGGGGAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGATGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAGTTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAATACTGGCCTTGGTCCTATGGCAACCAGTAGGTGCGGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATGCTATGTTCATTAGAGGAGTTAACCGCAGTCAACATGGCATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACCTGGCCTCGGATACAGAACTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCCGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAGCATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATACGGTTGATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACCGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATCAACATTGTGACACAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTAATCAATGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTCTACGATGAAATGGAATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCTCAACACGTAGTTGATGGCACCACCAACATTATTGAGGGGGCCAGACAAGGAGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAACAACTGGGAATCTTGGGAAAGAAACTGGAACATAAGAGCAAAACATGGTTCGGGGCACATGCGGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCCAAGAATACTAGGATCATGGGGCCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGAAGATGGAAAAATCTTGCATGAGATGGGTAGCCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACCTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTGAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCTTCATGGTGGCCGTATGAGACGGCCACAGTGCTCGCATTTGAGGAAATTGGGCAAGTGCTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGATTTGACCAATATGTGGAACGCAGCGTCCACGACAGCTTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGAGGACAGATAGTACAGGGTGTAATATGGCTATTGCTAATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGTTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATTAACGAATTGGGGCCTACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCATACAGCGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCTGTCGACCTTACTTGTATAGATGGGAACTTCCTAGTACACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGGAGATACCTGGCTACCATACATGAGAGGGCACTATCTACATCTGTGAAGTTCACTCTAATTGCCGATCCACAGGATCCAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGATTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACTCGACACCCATAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTCCTCAATGGGCCGGCCTTCCAACTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGTACAATAGAGTGCACTGTGGTTAGTGGTAGTACCCTAAATACCCAAGTGGTTAAGAGATTCACAAGGTATGAACCGTTTCCCCATAGGAAGCAATGCATGGATCAAATGGTCGTAGGCGAGGACTTATATGAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTGAGGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTTACATTTGAAGAGTCAAGCGATTTACCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCATTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACTTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACATGGAACTCTAAAGTGTAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAAAGTCTTGGCCCTGAACAAAGACTTGGGGCCTATGCCATGTAAACCAAGCTATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACTTTCAACTGGACTGAGACGCTTGAGAACAAGTACTTTGAACCCAGGGATAACTACTTCCAACAATACATGTTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTTGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTATTTTGCTGAGTTCATTGTGATTATCGTAGTGGCCCTCCAGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTACGTGGTGACTGAACAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCAGGAGAGGTGGTCCTGATAGGGGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGACATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTATCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGCTCTCCAGCTTGGCCAGAGGTGACGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACTTGACGTATGGTTCTATGTGGTACTGGCTATGGTGTGCATACTCCTGATGGTAAAAAGAGACCCTACAACAATCCCTGCAGTAGTGGTTATAACAGGTATTAAAACAAGACAATATGCTGCATGGCTAGAACTAGATGTGGTTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTGCTACTCCATTCCTATATTAGTAGTTACTATAGATACAAGCAATGGTTACAGTGTTTAATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACATTGAAAGCTGCAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTAACGTGAGGCCCTTACCCATAGTGTTTATATACCTAATTACAACCACTTTTGTGACCCACCAGAATCTGGATTTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACATACCAATTATGTTAATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGGTTCTGCCAACCTATGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTAAAGAAGGACGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAAATTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTGGATGGATCTGAAGAAGGGGTGTACTTGTTCCCCTCCAGGCAAGGCCCAGGAGCAAAGACAGGTGACTTACTGCCAATATTGAGGTGTGTGCTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGGTATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGTGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAAGAAGAGAGCAAAGGGCTAAAAAAATTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGGTAATGAAGCACAAGGTTAGAAATGAAACAATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGCTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGACGTGATTGGAAGGGTGGTAGTTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATTTTCATAAGAGAGGGAGAATGGGATGGGCCTTTCAGGCAGGAGGCCAGAGGTTATTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGCTTTTCCTAAGGAATTTACCAATACTGGCAACCAAG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| 96,073 |
JQ612704.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Decaro,N., Mari,V., Pinto,P., Lucente,M.S., Sciarretta,R., Cirone,F., Colaianni,M.L., Elia,G., Thiel,H.J., Buonavoglia,C.
|
Faculty of Veterinary Medicine of Bari, University of Bari, Department of Veterinary Public Health
|
Italy
|
2012-07-15
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,243 |
GenBank
| 1 |
Italy
|
Italy
|
Bos taurus
|
lung
|
2010-03
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain Italy-83/10-ncp, complete genome
|
GTATACGCCCGGTTAGCTCATGTCGGCGTATATGATTGGGTATCCCAAATTAATGATTTGGTTTAGGGACTAAATTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATGCCTTCAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCGAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTTAAACTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATCGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTAGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCCAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAAAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAACTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCCTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATACTATGTTCATAAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACTTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATACGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACACAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTGATCGACGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGGATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACATAGTTGATGGCACTACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAGCAACTGGGGATCTTGGGAAAGAAACTAGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGCAGTCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACTTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTGAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCCCCATGGTGGCCGTATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTACTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGACTTGACCAATATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTACTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGCTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTTTGCGTACAGTGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCCGTCGATCTTACTTGTGTGGATGGGAATTTCCTAGTGCACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCAATCCACAGGATATAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACGCGACACCCGTAATAAGGGGCAAATTTAACACAACCCTTCTCAACGGGCCGGCCTTCCAATTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGCACAGTAGAGTGCACTGTAGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGTAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGAAGGTGAGGACTTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTAAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCATATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGAAACAAGGAACTCTAAGGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACTTTCAACTGGACTGAGACACTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTTCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTAGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTATGTGGTAACTGATCAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTATCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACCTGACGTATGGTTCTATGTGGTGCTGGCTATGGTGTGCATACTCCTAATGGTAAAAAGGGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAGGTGTCAAAACAAGACAATATGTCGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTACTAATCCATACCTACATTAGTAGTTACTATAAATACAAACAATGGCTACAGTGTGTGATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACATTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCAATTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCCATAGTGCTTATATACTTAATTACAACCACTTTGGTGGCCCACCAGAACCTGGATCTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATCATGTTGATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATATACTTACCCTCATTCTGATCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCCGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAATGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGATATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAATTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGATAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGGCGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTTAGGCAGGA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| 96,671 |
JQ612705.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Decaro,N., Mari,V., Pinto,P., Lucente,M.S., Sciarretta,R., Cirone,F., Colaianni,M.L., Elia,G., Thiel,H.J., Buonavoglia,C.
|
Faculty of Veterinary Medicine of Bari, University of Bari, Department of Veterinary Public Health
|
Italy
|
2012-07-15
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,549 |
GenBank
| 1 |
Italy
|
Italy
|
Bos taurus
|
lung
|
2010-03
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain Italy-83/10-cp, complete genome
|
GTATACGCCCGGTTAGCTCATGTCGGCGTATATGATTGGGTATCCCAAATTAATGATTTGGTTTAGGGACTAAATTCCCCTAGCGAAGGCCGAAATAGGTTAACCATACCTTCAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACCTGCTACATCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAATTGTTAAACTTTGAACTTTTATACAAAACATACAAACAAAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCGAGTGATACACACCCCCAGTCCACACTTAAGCTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATCGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTAGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAATCCAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAGAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAACTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCCTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATACTATGTTCATAAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTGAGATTTGCTCAGGAGTACCCACCCACTTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATACGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTGATCGACGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGGATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACATAGTTGATGGCACTACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAGCGACTGGGGATCTTGGGAAAGAAACTAGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTGACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGACCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGCAGTCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACTTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTGAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCCCCATGGTGGCCGTATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTACTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGACTTGACCAGTATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTACTGATAACTGGGGCCCATGGGGACCTCAGCTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTATGCGTACAGTGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCCGTCGATCTTACTTGTGTGGATGGGAATTTCCTAGTGCACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCATACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCAATCCACAGGATATAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACGCGACACCCGTAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAACGGGCCGGCCTTCCAATTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGCACAGTAGAGTGCACTGTAGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGTGAGGACTTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTAAGGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCATATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACTCTAAGGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACTTTCAACTGGACTGAGACACTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTTCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTAGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTATGTGGTAACTGATCAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTATCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGATGGGAGGGCGACCCAAGGAGATGGACCTGACGTATGGTTCTATGTGGTGCTGGCTATGGTGTGCATACTCCTGATGGTAAAAAGGGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAGGTATCAAAACAAGACAATATGTCGCATGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAATAGTTGCGGCCGTTGTACTAATCCATACCTACATTAGTAGTTACTATAAATACAAACAATGGCTACAGTGTGTGATAAGTCTACTAGCTGGTTTTTTCATAATAAGGACATTGAAAGCTGTAGGGGAGTGCCACTTGCCTGCAATAACAGTGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCCATAGTGCTTATATACTTAATTACAACCACTTTGGTGGCCTACCAGAACCTGGATCTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATCATGTTGATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATCTACTTACCCTCATTCTGATCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCCGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAATGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAGTTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGATAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACATTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGGCGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTTACGATGAT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| 96,672 |
HQ231763.1
|
Bovine viral diarrhea virus 3
|
Decaro,N., Lucente,M.S., Mari,V., Cirone,F., Cordioli,P., Camero,M., Sciarretta,R., Losurdo,M., Lorusso,E., Buonavoglia,C.
|
Faculty of Veterinary Medicine of Bari, Department of Veterinary Public Health
|
Italy
|
2011-08-20
| null |
Pestivirus brazilense
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 12,104 |
GenBank
| 1 |
Italy
|
Italy
|
Bos taurus
|
lung
|
2010-01
| null | null |
Bovine viral diarrhea virus 3 strain Italy-1/10-1, complete genome
|
CCTTTAGTAGGACGAGCATAATGGGGGACTAGTGGTAGCAGTGAGCTCCTTGGATTACCGAAGCCCCGAGTACGGGGTAGTCGTCAATGGTTCGACGCATCAAGGAATGCCTCGAGATGCCATGTGGACGAGGGCGTGCCCACGGTGAATCTTAACTCAAGCGGGGGCCGCTTGGGTGAAAGAGGGTCATTATGTGGCTCTTTGGGAGTACAGCCTGATAGGGTGTTGCAGAGACTTGCTACACCACTAGTATAAAAACTCTGCTGTACATGGCACATGGAGTTGTTAAACTTTGAACTTTTATATGAAACATACAAACACAAACCAGCCGGGGTCCAAGAACCCCTGTATGATAAAAATGGGGCAGTATTATTTGGGGAGCCGAGTGATATACACCCCCAGTCCACACTTAAACTACCCCACCCGAGGGGGGAGAAAGAGGTGATAGTGGGCATACGTGATTTACCAAGGAAAGGTGATTGCAGGTCAGGCAACCGCCTGGGACCGGTTAGTGGCTTGTTTGTAAAACCGGGACCTGTTTTTTACCAGGATTATTCTGGCCCAGTATATCACAGAGCCCCCCTCGAGCAATTCAAGCAGGCTCCAATGTGTGAAACCACCAAGAGAATCGGGAGGGTTACAGGAAGTGATGGCAATCTGTATCATATGTATGTGTGCACCGACGGTTGTATCCTAGTGAAGACAGCCAAGAGAGAAGGACAGGATGTATTGAAGTGGGTCTATAATGTACTGGACAGCCCCATCTGGGTGGCAAGCTGCTCCGATGAGAAAGCGGGTGCAAAACCAAAAGAGAAGTCCAAACCGGATAGGGTACAGAAGGGGAAGATGCAGATAAGCCCAAAAGAGACAGAAAAAGATAGTAGAACCAAGCCACCAGATGCGACAATAGTAGTGGAAGGGGTGAAATATCAGGTAAAGAAAAAAGGAAAGGTTAGAGGAAAGAACACCCAAGACGGGCTATACCACAATAAAAACAAACCAGAACAGTCAAGGAAAAAACTGGAGAAGGCCCTGTTGGCATGGGCAGTACTGGCCCTGGTCCTGTGGCAACCGGTAGGTGCAGAGAATATAACGCAATGGAACTTGAAAGATAATGGTACAAACGGGATACAGCATACTATGTTCATAAGAGGAGTTAACCGCAGCCTACATGGTATATGGCCTAGTAAGATCGACCCAGGAGTACACACCCACTTGGCCACGGATGCAGAGCTAAAGCAAATACATGGTATGATGGATGCTAGTGAGAAAACCAACTACACCTGCTGCAGGCTACAGAGGCATGAATGGAATAAACATGGTTGGTGCAATTGGTACAACATAGAGCCTTGGATACGGTTAATGAATAAGACCCAAGCCAACTTAACTGAAGGCACACCCCTTAAGGAATGTGCAGTGACTTGCAGATATGACAAGGATAAGGAGATTAACATTGTAACGCAGGCCAGAGACAGACCCACAACCCTGACTGGGTGTAAGAAGGGTAAGAGGTTCTCTTTCGCAGGTGAGGTGATCGACGGTCCCTGCAATTTCAACATATCTGCTGAAGACATGCTTTATGATGAAATGGGATGTACAGGTGTCTTCCAAGAAATGGCCCAACACATAGTTGATGGCACTACCAACACTATAGAGGGGGCCAGACAAGGGGCCGCCAAGCTCACTACCTGGTTAGGGAAGCAACTGGGGATCTTGGGAAAGAAACTAGAACATAAGAGTAAAACATGGTTCGGGGCACATGCAGCAACACCTTACTGTAACATCAACAAGAAGATAGGTTATGTGTGGTATACTAACAACTGCACCCCTGCTTGCTTGCCTAAGAACACTAGGATTGTGGGGCCAGGCAAGTTTGATACCAATGGGGACGATGGAAAAATCTTACATGAGATGGGCAGTCACCTATCTGAACTGGCCATATTGGCACTTGTGGTAATGTCGGACTTTGCACCCGAATCAGCTAGTGTCCTTTACTTGATCCTGCATTTCTCCATACCACAGGCACATGAGGAAGTAGACCAATGTGACAGGAACCAGTTGAACCTAACAGTGAGCCTGAGGACCGACGAAGTGGTGCCATCTTCCGTCTGGAACTTAGGAAAGTGGGTTTGTGTGAGACCCCCATGGTGGCCGTATGAGACGGCCACAGTGCTTGCATTTGAGGAAATCGGGCAAGTACTCAAGTTGATACTGAGAGCATTAAAAGACTTGACCAATATGTGGAACGCAGCCTCCACGACAGCCTTTCTGGTGTGCCTAGTCAAGATACTGAGGGGACAGATAGTACAAGGTGTAATATGGCTATTACTGATAACTGGGGCCCAGGGGGACCTCAGCTGCAAGCCTGAATTTCAATATGCAATATCTGAAACTGATGAGATCGACTTAACGGGGCCCACCGGCTTGACCACAAGGTGGTTTGCGTACAGTGAAAGGTTGCATATCACAGACTCATCCGTCGATCTTACTTGTGTGGATGGGAATTTCCTAGTGCACAGGAGGTGTGTGAGGAAACGAAGATACCTGGCCACCGTACATGAGAGGGCACTTTCTACATCAGTGAAGTTCACTCTAGTCGCCAATCCACAGGATATAGAAGATGTCCAAATGGGAGATGACTTTGAATTTGGCTTATGCCCTTGCGACGCGACACCCGTAATAAGGGGAAAATTTAACACAACCCTTCTCAACGGGCCGGCCTTCCAATTGGTGTGCCCCTATGGATGGACAGGCACAGTAGAGTGCACTGTAGTTAGTGATAGTACCCTAAAGACCCAAGTGGTTAAGAGATTTGCAAGATATAAACCGTTCCCCCATAGGAAGCACTGTATGGATCAAATGGTTGTAGGTGAGGACTTATATAAATGCCTGTATGGTGGGAACTGGACATGCATACCAGGAGATAGGGTACTGTACCAAGGAGGTAAAGTAAAGGACTGCAAATGGTGCGGTTTCATATTTGAAGAGCCAAGCGATTTGCCACACTTCCCACTAGGTAAGTGCAGACTCACTAACGAGACTGGTTACCGTTACGTGGACGACACCACCTGTAATAGAGATGGAGTGGCAATAACGGAACAAGGAACTCTAAGGTGCAAGATAGGCAAGGTAGAGGTCAGAGTCTTGGCCCTAAACAAAGACTTGGGGCCGATGCCGTGTAAACCAAGCCATGTGACACAGAGTGAGGGGCCGGTTTCAAAGACGGCATGCACTTTCAACTGGACTGAGACACTTGAAAACAAGTACTTTGAACCTAGGGATAACTACTTTCAACAATATATGCTGAAGGGGAAGTACCAGTACTGGTTCGATCTTGAAGCAACAGACCACCACCAAGACTACTTTGCTGAGTTCATTGTGATCATCGTAGTGGCCCTCCTGGGTGGCAGGTATGTGCTTTGGCTACTAATAGTTTACTATGTGGTAACTGATCAAGGAGCCAGGGGGCAGCAGATGAACCCGGGAGAGGTAGTCCTAATAGGAGACATGATAACGCATGACAGTATTGAAGTCATAACCTACTTCCTACTACTATACCTGCTGATCAAAGATGAACCAGTCAAGAAATGGGTACTACTGATCTATCACGCAATCACGGCCAGTCCAAGGAAAACAATAATAGTGGCAGTCCTGATGTTCTCCAGCTTGGTCAGAGGTGATGACGCGAGGGCCACCCAAGGAGATGGACCTGACCCATGGCTCTATGTGGCGCTGGCTATGGTGAGCATACTCCTGATGGTAGGAAAAGACCCCACAACTATCCCTGCAGTAGTGATGATAACAAGTATCAAAACAAGACAAGATGTCGCACGGCTAGAACTAGATGTGGCTTTGTCAAAAATTGCGGCCGGTGTACTAATCCATACCTACATCAATAGTGACTATAAATACAAACAATGGCTACAGTGCGTGAGAAGTCTACTAGCGGGTTTTTTCATAATAAGGACATTGAAACCTGCAGGGGAGTGCCACTTGCCTGCAATAACAGCGCCTAATGTGAGGCCCTTGCCCAGAGGGCTTATATACTTAATTACAACCACTTTGGTGGCCTACCAGAACATGGATCTGGCTGGAATATTCCTCAGTAACGCACCAATCATGTTGATGGTACTAACCCTGTGGGCAGATATACTTACCCTCATTCTGATCCTGCCAACTTACGAATTAACAAAATTGTACTACATCAGAAGGGTGAAGAAGGATGTAGAGAGGAGTTGGCTAGGGGCTACAAACTTCACACGTGTGGACTCTGTGTATGAATTAGATGGATCCGAAGAAGGGGTGTATTTGTTCCCCTCCAGGCAATGCCCCGGAGCAAAAACAGGTGAAATACTGCCAGTATTGAGGTGTGTGTTAATAAGCTGCATCAGCAGTTACTGGCAGTGGACATATCTAATCTACCTGGTGATTGAACTGGTATATTTCATGCATAGAAGAGTGATAGAAGAGATAGCTGGTGGAACCAACGCGCTCTCTAGAATGATTGCTGGGCTAATAGAAATGAGTTGGGCTCTGGACGAGGAAGAGAGCAAGGGGCTTAAAAAATTCTTTATTTTGTCTGCTAGGCTCAAGAATTTGATAATGAAGCACAAGGTCAGAAATGAAACTATTAGGGCGTGGTATGAGGAAGAAGAAATTTATGGAATGCCAAAAGTCATCACATTGATCAAAGCTGCCTCGTTAAGCCAGAGCAAACACTGTATTCTATGCACTGTATGTGAAAGGCGTGATTGGAAGGGTGGTAGCTGCCCTAAGTGCGGTCGTTCCGGCAGGCCCATATCATGCGGAATGACTCTAGCTGACTTTGAGGAAAAACATTATAAAAGGATCTTCATAAGAGAGGGAGAATTGGACGGGCCTTTTAGGCAGGAGGCCAGAGGGTATTTACAGTACATAGCAAGAGGACAGCTCTTCCTAAGGAATTTACCAATACTGGCAACTAAAGTAAAACTATTAATGGTAGGGAACCTGGGATCCGA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| 98,323 |
NC_006633.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 27,346 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle1
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| 8,282 |
NC_006634.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 14,975 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle2
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| 8,283 |
NC_006635.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 29,874 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
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Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle3
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| 8,284 |
NC_006636.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 15,876 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle4
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| 8,285 |
NC_006637.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 14,489 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
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Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle5
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| 8,286 |
NC_006638.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 15,230 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
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PRJNA485481
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Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle6
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| 8,287 |
NC_006639.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 24,748 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
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PRJNA485481
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Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle7
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| 8,288 |
NC_006640.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 5,032 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle8
|
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ATTAAATGCTTCGAAAATTTGTGTCTTTTTGA
| 8,289 |
NC_006641.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 15,959 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle9
|
CTAGCGGGAAGTTGCACGGATGGCCTTTAGGGTGAACCGTTTTTCTAATTTTTAACTTCCCGCTAAAAATCTGAGATTTTCAAAAATCGGGAAGTTATTGTTCTCACCCCATTTTACAAAAATCGAGTTTTCATCAGATCTCGACGTTTGAAGGTCACAGAAAGCTTCCCTGACTATTTTTACGATGATGTCCGTAGGTCTGTATGCGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTCCCTTTAGGGGGGGGGGGAATCCTTTTTAAGGATTCTAGGCATAGATGTTGGCCCGGATATGTGGCGACTCGACGCAGCGTCATACTAAAACTTGACGCTGACGCCCCTACCCACTAAACCCTAAACCCCTTTCTCTTCTATCCTCTGATCCCCCATGGTACCGCCGTAAGGCATTTCTTCGCGGGGGGAGGAATTAGCTGCCGCTCTTCCTTCTGGTGGCTAAGATGTTATTTCTTCCTTCTAGTTTCTGTCATTCGCTCTTTTCTTCTCAATGGATTGCAACTCGGTAAGCACTTTTGTAGCAAAAGTGCTTGTGGCGTTCCAGGCAGCTTCTGATGACAGCATTGCTGCTACTATTATCTCTGGTTGGATTTTCCTCTTCAGGATATTCTCCAGCTCATCCCGATGTGGGTAAAAACGTGAGCACTCAAAGAAAACGTGCTCTGCATCTTCATTGACTCCTGGGCAGGATGGGCACTCTGGGGAATTATCATGCTTGGAGCGGTGGAGATACGCCCGGAAACAGCCGTGTCCTGATAACATCTGTGTAAGATAATAGTTGACCTCACCGTGACTCCGGTTTAGCCAAACGTTGATCCTTGGTATGAGACGATGCGTCCATCTACCATTCACTGTGGCATCCCACTGTAGTTGCCATCGACTTATGCTCCTCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTAAACCTCTTGTAACTTTTGAACGACTTGACCGATTTCATCGCAGTTAGTGTCATTCGAAAGGGCTTCACTAAACTTAGATTTCCTGAAAATTTGAACCGATTCGGACCGGTAGATTTCGAGAAAATACAAAAAAAGTGAAAAAAAAGTAAAAAAAAAAGTTGTTTTTTTTTTATTTTTTTTAAATATCTCCGAATTGGCTGAACCGATCGGTCTCAAAAACTAATCAGCTCTTAACCATGAAAACCCCCATCGATCGCCAGCAAAAACGTTAGAATCGGTTGATGCGTTCGTGAGATATCGTTGTCGAAAAAAATCGAAAAAAGTGTTTTTTTGTAATAACTTCGAAATTCATGGCTCGATCGATTTAATCTTGAAAATTTTTTATGGAGCTTCAAAAACTGCGTCGATTGCCGCCAACCGCGTGAAAATCGGTTCATTTATTCAAAAGTTATTGCCGTTTGAAAATTCAAAAAATTGTGTCTTTAAACTGCTATTAGAGTTTTGAGCTCGAAGAGCTCAAATTGACACAAAAATAAGTTCGAAGAGCTCAAAAACGTAATGTGTAGTTTGAATTGTTCAAGTACAAAATGAGCGGGAGGTTGCAGAGATGGCCTTTAGGGTGAACCGTTTTTCTAATTTTTTTTCAGTAAAGTCATGTGGTGCAAATATGAGCAGCGGATAAGAGTGCGCAATCCTATGCATTGGGGACTCAAATGAATGAGTTTGCGCACTCTTGTTCTGAGAAATTCACTACCTATCGACTGTTGTTTTCGCATAAGTTAAAATAACAAATCCAGCTGGAAAATTAATTGACGTGAAAGCTTCGGATTGGTTGAATGTTTCATATACGTCACGTTCGACCGTATATAATAAGCAACTTGCGACGACGAGGCACACTTGAGTTCAAGCAGTAGCATCGTGAACATTCAGACAATTGCTCAGTAATTAGTTACAATCTGACAAATATGGCTCTCGGAAAGGGATCACTCTTTTTATTTTTCATCATTGGTACATCAAGTAAGTTTCAATACTATTACAGAAGTGGTGTAGCATTTTCAAGTGTTAAAACTTTGTTCTCCTACCAGATGATCGGTTCAAAGTCTGACATATTGGTACCAATGTAATCATTACTAAAGTTACTTTTATTTTCACAGTGCTCCCGAGTGGCAGTTCATCAAGTCTTCCATACTCGCAGCCCCCGCCTGACCTTCTCGTCCAAGGCTTGCAAGAATTAGCAAACCGTCTTGAAAATCAAGCTCCGTCAAGCAAAAGTTCGACCAGTTACGGATCGATCACAAATCAATTCGATAACCAGTTTGACAATGACCACATAGATGGAGACGTCAGCCTAGGATCAGGAACTGTTCAAAAGAACAATAACTTCGGTGATGCTGGGGTCCAGACGAATCGTGTGGATACTTATGGGTCAATTACTAACCAAGGATTTAACTCCTACAATTTTGCACATATAGGAGGTAAATTGACTGTGGGGTCAAATACTTACCAAGAAAACAACAAGTTTTAGTATCCTAAGGTAGTTATTTATCTTACAACGATTCTTCACTATCTGCAAGATAATGGTCTCGCCAATTGTCAATTGTTAAATTTAAATATTAGTTTTTGTACTAGTTTCGACTTAATGTTTATAAATATACTTTTGTGATGTAATTGTTAAACTACTAATTTTATAGTGGAAAATTTGAAGTTAAGTAAATAAATATAAATACAGAAAATTATGTGATGTTTTTGTTTTAAAAGTTAGTTACCGAAATTAAAACAAGTATTCATATATCTATGAAGGATTATTGAGTTATTTCGATCTTGATATTTCCAAGCAAAACAAACGATTATTTTAGCTGAAACGCGGATCATAACGTTCTACTTCCGACGCTAACCAAAATGTGAGCTTAAGCTCTTACTTCTGCAGTATCTAAACGACAGGCTAGCTTAAAAATAAAGTGTTTCTGAGACTTTATACATGATGCTAAAATTAAGCTTTCTCAAACGTTAACTTGAGATTTTTTAGCGGGGGGTAGGGAAATATTTGTACTCAAAGCTATTATCTAGTCTTCAAATGTCCTGACTATCTTGTTATTACAAATTCAATGATACTTATGAAAAAAATTAAGTCACTTTTGGCTCTTTTGCATCAGCCAGAAATATTGATCAGTTACACTTGAATCCAAGCAGTATCATCATTAACATCCAGACAGTCGTCCAGTTGAATGCAATGCTATAACTATCAAAGTTAGAATTGTTAGTGTTCAATAGTCTGTTAGTAATGATTTCTCTTCCATTTTAGTCTCTAGTCTAACTTAAAAGATCAATAGTTAAACACTTCTCACCAGATCACGCCATATGACGTTTAAGTTTCGCAGAATATAGTTGTGAACCCGGATGTAAGATACCCGATATCACGCCGAGTATGACAATGGTCATGTTCGGGTAGTAGTTTTTTTTCATTGTCGATTTTTCTGCCATGTAACAAAAAATTACCCGTAAGCCGACGGTAGAGTAGTCTGTCAACGTGTATCTTTGTCCAGGTCGCCCAATAATTTCTTAAACACGAAAAACGACTTAGGAGGTGTGCTCTCAAACTCTTAAGCGACCTGTAGCTGTGTCTCAGGCTGGCTTAGTGTACAGTGATTTGGACGCTAGACCTTATGTCAGTTTGAAAAAATGACAAACTGTAGTGAGTTGATCACTATTTTTGTTCACTATTCAAAAAGCTATTTGCTTATGAAGTTTGTTAATGATTAAAAACAATTTTAACCGCAATAAAGTCTCAATTAGATTACTTTCTAAATTCAGCTTGATCGGAAAATGTATCGCTGAACTATAATGTACTCATAAACAAATACAACCTCATAAAACAAAACATAAATTTCTTAAAAGAAAAATAAGATTATGGAATTAGGAAAAAATTCCAGGCTGATAGTATCGTTTTATTAGCTTTCAAATTTAGAAGCTTCTAGTAAGTTATCAATCCAAATTGTCATCTGCTATAAAGAAAAATATGTTTACTGCCCTTAGTGACAATGAATCATCACGCTAATTATAGCGTTTCCACCGTGATGATCTCATTAGACACGTGATACATGAGCTTCGTCACGTATGTTGTCTTTCTTGTTATCAGTAACTGCTCCTTCTCTAAATAAACGTGGCAGAAGCATTTAACACGTGTTTATGTAACCCCCACGCAATTATCGAAAACAATTACATGTTGCATTAGGTATTAGTGAGTCACGTGAAAATATAAGCATTTATCTAATGGTTTTTCCAAACGGCTTTGATTTGAATATGTTAGAAGGACAAAGGAAGCTTATATCAAAATTGTAGTGGTCCTATCAGAAATAAGAGAATAGCTTTATAATCTGTTTCATGAAGCGTTATAAAGACTGTAGATAAATCCTTGTTGTTTTTGAATAAGGTTTGAGACATTGGTGTATGTATTCAATAAAATAAATACAGCTGATAAATAAAACAAATATTAACAATTTTCTAAAATCAATAATACCTGTAGTTGATTCTTAATACTGTTGTAATACTCAAACTACAGTCTTGAAAATATTAATTAATACCCGTAAACCATCCCAAAAAATTGAACTAATACACTATCATTAACCTAATAAATAGTAATTAATTTTGCTACAATAAATAATACAAGTAGACAATACAAATTCAAATCTCAACAATAGTAGGACAAGAACACTGTTCACTAACAATAATAGCTCGCTTTAACATTTGCACTATTCAATTTTCTAATGCACTAAAAACTATAACATAAAATTATTGAGCGCATTAAATATGGAATGCAATAAGTTATTGTGATGAAAGATCAATGAAAGTGATTGATTAAATAAATGAATTAATAAATCAATGACAAGATTCTTAGCCTTAGTAATTAGGACCATAAGATAACTCGACTTATGATCAATGATTAATAATCATAATAGTTAAC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| 8,290 |
NC_006642.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 14,286 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle10
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| 8,291 |
NC_006643.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 12,903 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
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PRJNA485481
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Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle11
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| 8,292 |
NC_006644.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 16,103 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle12
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| 8,293 |
NC_006645.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 21,388 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle13
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| 8,294 |
NC_006646.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 31,972 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle14
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| 8,295 |
NC_006647.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 8,785 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle15
|
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| 8,296 |
NC_006648.1
|
Bracoviriform congregatae
|
Espagne,E., Dupuy,C., Huguet,E., Cattolico,L., Provost,B., Martins,N., Poirie,M., Periquet,G., Drezen,J.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-01-13
| null |
Bracoviriform congregatae
|
Bracoviriform
|
Polydnaviriformidae
|
dsDNA
| 15,158 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null |
SAMEA3283066
|
PRJNA485481
|
Cotesia congregata virus complete genome, segment Circle17
|
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