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NC_023635.1
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Arumowot virus
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Palacios,G., Savji,N., Sze,W., Hutchinson,S., Tesh,R., Travassos da Rosa,A., Lipkin,W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-03-04
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Phlebovirus arumowotense
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Phlebovirus
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Spain
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OL774817.1
|
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|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
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Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
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GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
|
Pelomys isseli
| null |
1972-02
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|
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| 21,241 |
OL774820.1
|
Arumowot virus
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,376 |
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
|
Otomys tropicalis
| null |
1972-02
| null | null |
Arumowot virus strain SB3176 segment L, complete sequence
|
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| 21,242 |
OL774823.1
|
Arumowot virus
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,375 |
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
| null | null |
1973-03
| null | null |
Arumowot virus strain SC707 segment L, complete sequence
|
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| 21,243 |
OL774826.1
|
Arumowot virus
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,369 |
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
| null | null |
1973-03
| null | null |
Arumowot virus strain SC680 segment L, complete sequence
|
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| 21,244 |
MF593931.1
|
Arumowot virus
|
Ly,H.J., Lokugamage,N., Nishiyama,S., Ikegami,T.
|
The University of Texas Medical Branch at Galveston, Pathology
|
USA
|
2017-10-02
|
Ar 1286-64
|
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,376 |
GenBank
| 1 |
Sudan
|
Sudan
|
Culex antennatus
| null |
1963
| null | null |
Arumowot virus isolate Ar 1286-64 segment L, complete sequence
|
ACACAAAGGCGCCAAGAATGAATCAATTGCTATCAAAACAAACCTCACCAAGAGTGGGTTTTTTCTGTAAAGCTATAGGACACCATGACTATTTTGTGGGAAATGTTGTCCTACCCAATTTCCAAGTCAGGAGAGTGATGGATGGGATAGAGATTGATTTGAATCTAGATGACTTGGACACAGCATCTGATCTGGGCTCTTCCTTAAGGCCTTCTTTAACAGTGAGGTCTAACAATGTCCCAAATTTCATACATGACTTTACATTTGGTCATTTGGCAGACACCACTGATAGAGCCTTTTCTTCTGTGTTCCAAGTTGTGAATGATGGCTTTGATGATCTGACACCAGATGTTATTGTTAAAACTCCTTCCGGCAGCTTCCATGTTGTGGAGTTTACAACCTTTAGAGGACGACAAGAGGAAGCTAGATTTGCCACTCAAAACAAAATAACAAAATATGAATTAGCTTGTAGAAACAGATCAGTTCAAGGCCCAGTGTCATTGCACACTATTGGGGTGCATAGAGGAGGCCTATGGACCAACATGAAAATTGACCAAAAAGAGGTTGAAGAGCTTTGCTTTAGATTTAGACTATCGCTAGCTATTGAAGCAGAAATTAAATTGATCTGCCCTGATTTAAGGGAGGTTGACGAAGAGTATTCAAAATTGGAGAGGGAAATATTAGGGATTGTTTCAGGGATTAAAATTGACTGGGATGTAACTCAGTCAGTTTTCCCTTCATTCAAGAGAGAATTGTTTAGAAGATTCTACCAATCTGAGCCTGATCAAGAGTATCTTCAATCCATAATTGATAAAGTCACTAGAAAGTCTCAAGATGATCTCCTAAAATCATCTTTCATTAATCTAACCAACACTCTACCTGAGAGGTTGATGAGCAACCTCCAAGAATGCGAGAATGCAATTACTGACTTTATTGACAATCATGAATCAAGAGATAATTTAAGGCCAGCAAACTGGAGGAAGGGGACTGTCCTGTTTCCCCCTTGGGTGTTTAGAGAATCAGATGAAGGAAAGAGCTTAACTCCTCTAAAGGATCTAAATGTAGAAGGAGACCATCCTATGTGTAGAATATGGGAAAGAGTCAGGCTATCAGCTCAATTAGAAGAAATTGAAAGAATGGATGATGATCCTGAGAGTGAATTAGAATTTGCACTATCTGGAGAGAGAACTAGAGATGATGAGAGGAGCAAGTATCATAGAGTGAGGGTTGATTTGGACTTGGAAGAAAAGGAGTTTGTGGCTATGCTTGGTATTAATGGGAAAGCCTATAAGGACTGGTCTTCTATTAAGGATAATAGAGAAAAGAGTAAATTAATATTTTCAATTTACCATGATACAACACCGGTTGAAGAATTTTTATACACAGATTCATCTTTAGACATGACTCCAGAAGATGATTTATACGGGCCTTACCTTGAGGATATTGAGCTGAGATTACAAGCTCAAAAGATTCACCAGCCAACTCTATCTAGGAAAGGCTTAAACGAGTTTGTAGAATGTCATCAAGGGATTCTGAAAACTCCCTTAGGATCTTGGTGTCAATTTGTGAATGTTGTAGGCTCGGAATTATCAGCCTCAGTTAAACAACATGTCAAGCCTAGTAGTTTTGTGGTGAAAAGGTTGTTAAATTCTCCTGTGTACCTTTTAATTAAACCAACCTCTTCCAAAGGTCACATATTTGTGTCCTTTGCCATAGACAGGAGTTACTATATAAGAGATCTGCTGGGAAGTTCATGTTTTCGGACCTACTATGATGCAGGAGATTTACTTGTCACTGATTTTGTATCTTTCAAACTAAGTAAGTTGACAAATTTGTGTAAAACATCAGCTTTGTATGAATCAGCTCTCTGCTTTTGGAATGAGTGTTATGGTAAGAAGGTCTGGCTATCTCATGACCCTTCTCATATAACAACAAACACAAACAAGGACATTCAGTACATGGTAAAATTGTCTCTCTTAACTTTGATGGAAGACAAAGCTACAACTGAAGAGTTGCAGACTCTATCTAGATATATAGTTATGGAGGGCTTTGTCTCTCAACCAGAACTGCCAAAACCTCAAAAAATGCTCTCAAAGTTGCCCACAAAATTAAGGTCAGAGTTGCAGGTTTTCCTCATAAATAGACTCTTCTCCGCAATGAAGAGAATTAGTCAGAGTCCTTTTAATCTTAAGAGGGGTGAAAACTCTTTATCCTGGTCTGGTCTCTTCAATCCACTGTCTGGGAGAGATACAACAGAAATTCAACCCATAATTAATGCATGTTATAATGGTTATTTCAAAAATAAAGAAGAAGAGACAGAGCCTTCTGCTTTATCAGGCATGTATAAGAAAATAATAGAGCTTGAGCATTTAAGACCAGAGACAGACAGATATCTGGGCTGGGATGATCCACAAGATCCTAAAATGCATGAATTTAGTAGAAGTTATCTAAAAGAAGTCTGTAATCATGGAAAGAATTTGCTCCAAAAACTATATGGAAAGAATGTATTAGAACAAATAGACCAAGATATTAGAAGAGAAGTCGGATCTTTGACCCTTGAGAGGCTGGCAACACTTAAAGCAACCAGCAACTTCTCAGAGGATTGGTACATTTACAAGGATGTTAAGGATAAGAATTATACTCGTGATAAAGTTCTAGTTAAAATGACAGAGTATGCTAAGAGAGGCAAGACTTTAGCTATTGAAATGTTTGATGAATGTATGAGTAGCATAGAAGAGAAGGGCTGTATGCATATCTGTCTATTCAAGAAGCAGCAACATGGTGGTTTGAGGGAGATTTATGTCATGGCTGCAGAAGAAAGAATAGTTCAATCTATAGTAGAGTCCATCTCCAAATGCATTGGCAGATTCTTCCCTTCAGACACTTTGTGCAATCCTAGTAATAAGACAAAAATTCCAGAGAGTCATGGTATTAGAGCAAGAAAGCACTGCAAAGGCTCAGTTTGGACAACTGCAACATCAGATGATGCACGGAAGTGGAATCAAGGTCACTTTGTCACAAAGTTTGCTCTAATGCTATGCGAATTCACAAATTCAATGTGGTGGCCGATAATTATACGAGGTTGCTCTATGTTTACTAAGAAAAGAATGATGATGAATTTAGATTTCATGAATATAATAGACAGCAAAAGGGAGTTAGAATTGGAAGATGATTTTGTTATGACACTATACAATGCTTATCATGGAAATCTTACAGTTCCATGGCTAGAAGCTGGTAAGACTTATCTAGAAACTTCCACTGGAATGATGCAGGGCATACTTCACTTCACCTCATCCCTACTACATTCTTTGCATCAAGAATATATTCGATCTCTATCTTTCAAAGTCTTCAATTCCAAAGTTAATCCTGAAATGAGTCTATCTGTTGTTTGTGACATGATGCAAGGATCAGATGATAGCAGTATGCTGATAAGCTTCCCAAGCTCATCAGAAGAGATTGTAGTAAAATGTAAAGTTGCTTCTGCAATATGTTTTAGGATTAAGAAAAATCTTGGCTATTATTTAGGCATTTACCCTTCAGAGAAATCAACTGCTAATACTGATTTTGTGATGGAATATAACTCAGAGTTTTACTTCCATAATCAGCACATACGGCCTACTATAAGATGGATTGCTGCCAGTAATAACTTATCAGAGGCAGAAACATTAGTTGCTAGACAAGAAGAAGCATCCAACCTTGTCACACCTGTTTGTGAGGGAGGAGGATCTTTTTCATTGACAGCAATGATTCAGCAATCTCAATGCACAACACATTATGCTCTGATGGGAATGGGAGTATCTAGCTTATTTCGAGAATACAAAAAAGCAATTCTTAAGTGGTGTGATCCTGGACTTGGTTTTTTCTTACTAGACAACCCTAGAGCAGCTGGCTTGGGAGGATTCAGGTACAACTTGTATAAGGCAATAACTAGAACACAACTCTCAAAAATCTATAGCTTCTTCATGAAGAAGGTTAGAATTGGAGCCTCACCAGATGATCCAAATGAGATTCCTGAAACATGCAGTGTTAGCCCAGGTGGTGCATTAATCTTAAGTTCTTCTCTCAAATGGGGGTCAAGGAAAAAGTTCCAGAAACTAAGAGCTAGGCTAGGAATAGCAGATGACTGGGTAGATCAGATAAACAGGAATCCACATATACTCTATAGAGCTCCTAGAACAGGAGAAGAAATTTTATTAAGAATTGCAGAAAAGGTTCATAGTCCAGGTGTAGTCTCCTCTCTATCAACTGGTAATGCTGTAGCTAAGGTGATGGCATCTTCTGTTTACTTTTTGTCAGCCACTATCTTTGAGGATGCAGGAAGACCAGAGTTTTCATTTATTGAAGATTCAAAGTATTCCCTTCTGTATAAGCTTGCATCATATGAAGGCTACTCTGATTTTGATGAAATTGATCCTGAAGATGTTCTTTTTCTTTTCCCTAATTTAGAGGAATTCTATTCTTTAGATCAATTGATTTTTGACAGAGGGGAGGTAGAAATCATACTGCGATCAAACATGAGAGAAGCAACACAGACCAGAGTCACTGTTTTTGACCATTCTGCTAATGATAAATGCTCTCCTGAGAAATTAGTATCTGATAAGTGGTTTGGCACCCAGAAATGTAGAATAGGAAGGACTGGGATGAATAGAGAGTGGGAAAGACTCAAACTTACAATTAGGTGGTTAAAAGACTCTCCTGAGGAGACTTTGGAATCTTCACCACTTCACAATCATATTCAAATCCGAAATTTCTTTGCCAGAATGGAAGGCAAGGCAAGAACAATAAGAATAACAGGGGCTCCAGTTAAGAAAAGATCTGGTCTAAGCAAACTCTCAATGGTAGTGAGAGATAACTTTACGAAAGTGGGAATACTAGGAGGAATTGAAGATGATCTTGCTATCACAAGATCAGTATCTGTTGATATAGCAAAACACACATTATTCTCCATTTTAAATGGTCCTTATTCAGACGAGACAAAAGCCAGATTTTGCCAGAAGAGC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| 74,505 |
HM566144.1
|
Arumowot virus
|
Palacios,G., Savji,N., Sze,W., Hutchinson,S., Tesh,R., Travassos da Rosa,A., Lipkin,W.
|
Columbia University, Center for Infection and Immunity
|
USA
|
2012-05-18
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,376 |
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
| null | null | null | null | null |
Arumowot virus segment L, complete sequence
|
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| 97,108 |
NC_025388.1
|
Asian prunus virus 1
|
Marini,D.B., Gibson,P.G., Scott,S.W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-10-31
|
tatao5
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,409 |
RefSeq
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Asian prunus virus 1 isolate tatao5, complete genome
|
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| 6,340 |
MW427274.1
|
Asian prunus virus 1
|
Dong,Z., Zhan,B., Wang,H., Li,S.
|
China Agriculture University, College of Horticulture
|
China
|
2023-06-26
|
Guizhou
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,617 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Prunus persica
| null |
2020-10-30
| null | null |
Asian prunus virus 1 isolate Guizhou, complete genome
|
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| 15,011 |
KY310580.1
|
Asian prunus virus 1
|
Jo,Y., Lian,S., Chu,H., Choi,H., Cho,J.K., Cho,W.K.
|
Seoul National University, Department of Agricultural Biotechnology
|
Korea
|
2017-07-10
|
JH
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,870 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Prunus persica
| null |
2014-05-18
| null | null |
Asian prunus virus 1 isolate JH, complete genome
|
GAACGATCTATCAACAAACAACTTCGCTCGAAACAGACCTAAGTTGTTCGTAATGGCTTTGACATACCGAAGCCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACTTCTGAAGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCAGTTTCACGTTTAACCCAATTTGAAGTCAACAACCATAAGCTCTTTTCATTCGCAATGAGTGAGAAGGCGAAAGAAAAATTGATTAAAGTTGGTATATACCTGAGTCCATTTTCCTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAAACTTTGGAGAACCACATCTTGTATAATGTTCTTGTAAATAAGTTAGATAATAGTTTCTATGCTATAGGAATAAAAGGGTCTAAAGTCAATTTCCTGAAGAGCAGGTCAAAGAACCTGAGCATGCTTGAATACATGAACCGTATTGTTACAAGTGCTGACAAGTACCGATATGGTAGTGACTTCACGACTCTTAGCACCCAACAGATTGACAATCTTTGCTCCAAGCAGAGCCTTGAGAAGTGTGGAACATTGAGGGAGCTTGTGCCCTTGGTCAAAATGAGTAAAAAGAAAAGGAACTTCTTTCTGCATGATGAGCTGCATTATTGGAGCTCACATGACTTAATGCTCTTTCTTGATTCCATAAATCCTGACCACCTTCTTGCCACTGTTGTGTTTCCACCGGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAGAGTCTGAATCCGTGGTGCTATAGCTTTCAGAGGCATGGAAGTAAGTTAACTTTCTTCCCTGATGGGGTGCAAAGCGAGTCATACACTCAACCCCTGAGCGCTGGCTATATACTTCAAGCTTCGAAAATCATTTGTCCAAGCGGTCAGATTTACTCTGTTGATCTGGTTTACTCGGCGTTTGCTCACCACATTATCAGCATCACCAAAGGGGACTTGCCTGGCCTAGAGCGTCGCTTCTTCTCTAACTTCGAGGCCACTGGTGTTAAACATCTATCTGGACTCTCTTACTCAGTAAGGGACTGTATTCCAGTCAGTTCTGATCTCATTTCAAAGCTATACAGGTACATTCGTACTCTTAAAAAGCCAGATCTGCAATCCTGTATGGCAAAACTAAGTCAGATTGTTCCAAACCCGACCGGCACTGAAATCAAATTCACTGAGGACTTTGCCCGTTTGACTATGGATGTACAGCCAATGCGCTCCATGCTCATGCCTGAGACAGCCAAGTTAATAGGGTCTCTTTTTGCCTCCTTCCTTCCATTCAAAATGGCCAGATTCTTTGACTGCTACAAAACTAGCTCACTTGATAAATTCATTCATGATCTCGAGCCCTTCAGTTTCTCCGTAGAAACAAAGGTTATCAGTAGCAAATCCAGTCCAATGTTTGAGGCAGTAACCCTTGGTGAAACGATGAGTTCAGAAGAGGTCCTGAAGATTTTGGCCAAGTTGGACATGGGGGCCCCAATGAGCCTAGAGGGATTAACAGGGAAATTCAAGTACTCAAGTGAGGCTTATCATGGGCTACATCATGTGCTGGATGGGTGTGGGCCGCATGTGTTTAGGAGATTGGTGAGGAAGGTTGCTGACTCCTTTTGCAATGAATTTGGAATTTACAGGAAGAGCAGTTACGTCTCTTCCGTTGCCATAACAGTCCTGCAGAGAAAAACCAACTCCAATTTGAGCTTCATTTTTGGGACTGACCTCAATCCAATGATCATTGGTTTTGTGAGGAACTACTTTGCTTCCAGGCGATCTTCTCTACTCATATGGTTTCACGACAGACCGGAATCTTGGTTCCAATTTTCGAGACTAAGGGCCAACCAAAAGTTTTTACGTTCTCCAATCTGGTCTAGTGAACTTGATTTGGCCGAATTTAGAGTGAGGAAGAATTTGGCGCTTGAGATTCTTGGCTTCAATAAAGGCAGCAATTTAAGAAAGTTGGGATCTTTCCAAACTGCCCCAACAAACACAAAGTCCCAAACCTCAATTCCTGAAGGAGCTTCAAGTCATCAGGGGAGCCAGGGAGGGCAGTGTAATGAAGCCAAACTTCAAATCAATTTTCAAAGGGAGCTAGAGTTCTGCATGGGATCTCTGCCAGAAGCTGAAAGTTTCAAAAGCCTTGCTTCATGTGTCGAGGAAATTGTTGAAACTGGCGATGAAGTCATACCATCGAGGGCAGGGCCTGGAAAAGATGGTTTAGTCTTTGGATGTATTCCTGCGGCATCCACGCCTGCATTCACATTCAGCTCAGCAAACCAGGAAGATAGACTCTTCTCTTCCGTTGTAGAGGAGAACGTTGTTGATGTCGGCATCCTCCCACCAATGGAGCTTGTCCTACCTTCAGATGCAGAGGCTACACCATTAAACGGTCGCCAATGCTACTTCTTCACCAGGTGTGGCTGCATTGATTATGGTCACAACAAAATCAGATACAAGCCGAACAAATGGTTCAGTGGCCTGGACTCAATTTTAAAAGATGAGAGCACATACTACAACGCCTGCCTGTTGCAAGTTTATGAAGCTGGTGCCGGGATCGGGTTTCATTCTGATAATGAAAAGGTTTACCACAGGAGTCCAATTAAAACAATCAACTTCTGTGGTGAGGCTGATTTTGTGGTGAAGGCCAAAGGGAGACGCGGTGTTGGAGTTAATGCTACATGCCACATGAGAACCGGTCAGTTCTTCACTATGGACTCAAACTTCCAGTCGTACTACCAACATTCTGTGCAAAATTGCAGTGAGGGTCGAGTTTCCCTCACATTTAGGTATCACGTGAACAGCATTGCCGGGCTGCCCATTAAACATACTTGTGGCGAGTTTGGAGATACAGAATCCCTCTTCGATGTTCTGATCAGAAGAAGCTTCTCCTACTCTTCAAGGAATTTTCACACGTTCCCTGTTCCAGGGGATGGGGATTGCTTTTGGCATAGTTTAGGGGCCTTGCTTGGGGTCGATGGTGAGGAGCTCAAGAAGATCTCTGCAAGAGAAATCTCAAAAAATGAAATGCTGTCAAGAAATTCAAGTCTGTCAATGCAAATGGAAAGTAAGCAATACGCTGAGAGAGAATCAATTGCAGCATTCTGTAAAATCCAATCTGTCCATCTTGTTGTTTTGCTTCCTGATCAAAATTTTTCATACGAGTTTTTGCCAATGCAGAATGCTGAGGTGACCCAACTTTTTGTTCAATTGAGTGGTGAGCACTTCGAGCCTGCTCTCCCCATCAATGGCTGTGTTGTAAAGTCAATTGCTGAGACCCTAAATCAAACTGAGGCGAAAATTTTGTCAGTCATCGGAAGGCCCAACAACCGCCTAATTCTGGAGGGTTTAGTTGAGGGGGAGGGTCTGAATATTGAAGATTTAGAGGCAGCCTTTTCGGTCTTTGGAATTTGCGCCCGGGTCAGCACGGAGAAAGGGGTTTTTACGCTTAACAAGGAGGGCAATCTCTATGCAAATTATGAATTGAAATCTGGGCACATCATGTATTTAAAAAAAAACTCCAGTTCACAATTTGCGCCAACAAATCCCATACAAAATTTTAATTGTCAGGGTCCTGAGATCTTCCTTCGGGGTATAGTGAGCGAAGTTGATTACAAACCAAGCTGGGAGCGGGCTAGGAATCTTGAAGAGTCTCTCCTCAATGGAACCACAGGCATTTTGTGTGACAAAATAATTAATCTTCAAAAGAACTGGTTAACTGAGGACAGGAAATTAAATGATGGCTCTCGAAGTCTTGGGGTTGTCTTAGGGACTTTTGGTTCTGGAAAGAGTTCGCTGTTCAAGAGGTTTATTGTCAAGAACCCATCCCGCTCAATTATCTTCGTCTCACCTAGGAGATCACTTGCCAACCAGATTAAAGAGGATCTTGGGCTCAACACAAAGAGAGGGAAATCACTTAGGGTGCGAGTTCTCACCTTGGAAAGCTTCATCAAGGCTGTCTTTTCTTTTAAGGCTGCCAGTGTCGTCTTGGACGAGGTTCAATTGTACCCTCCTGGGTACTTGGATTTGGTGATGCTGTGCCTTAGCCTGAATTGCCAGATTTATTTGGCTGGTGATCCATGCCAGAGTGACTATGATTCAGCCAAGGACAGGGCCTTGTTTGATGGTTTGAGGGGTGACATTTTTGAAGTTCTCAGTGAGAAGAGATACAAATTTAATATCTCAAGCCGCAGGTTTCAGTCTGAAATGTTTGTGGGGCGACTCCCCTGCAGAATGGATACAAAGGCCATGACTGAGAATGAAAGTTTCCATTGGTTGGAGAGCATTGAGTCAGCTGCAGAAGTGAGTAATACTGAGTATGATGTGGTTCTAGTCTCTAGCTTTGAGGAAAAGAAGATCGTGTGGGCTCATCTTGGAAGAGACCTGGATGTTCTGACTTTTGGTGAATCCACAGGTCTGACTTTCAATAGGGGCATCATCCTCATTTCTCATGAAAGCACTTTGACCAGTGAGAGGAGGTGGATTACCGCACTCTCAAGATTTAGGCTCAACATCATCTTTGTAAATCTGGTTGGAAATAGTGTTGAGGATGTTTGCCAGGTGTTCCACGATAGAACTTTGGACAGATTTTTAACTAAGCGAGCAACAATTGCCAACATAGTTGATCAGCTACCAGGTTTGCCAGAACTGACAAATGATTTCGGCGATAAGATTGGTCGCTCTGAAGGGGTGATGGAGGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGTTAAAGACAGAAATTGACCTACTTCAAGATGAGGATCAGGAAATGGAAGAACTTGCTGAGGAAGTTAGACATGAACCGTGGTTCAAGACCCACCTGCCCCTCTTTGAGTTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGGGAATATCGTGAGGTTCGTTGCGGCTCAGAGGTCACAACCCAGTTTCCTGATGACCACCCCAACGGAGCAAAAATGACTCTGGCAAATGCGGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCGAGGCATAGGGGAAGTGACTCAGTCACATTTTTAATGGCAGTCAAGA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| 75,892 |
KR998046.1
|
Asian prunus virus 1
|
Pu,L., Bateman,M., Kinard,G.R., Li,R.
|
USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
|
USA
|
2016-06-30
|
APV_1_D2267
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,474 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
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Prunus persica
| null |
2009-01-09
| null | null |
Asian prunus virus 1 isolate APV_1_D2267, complete genome
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| 81,484 |
KR998047.1
|
Asian prunus virus 1
|
Pu,L., Bateman,M., Kinard,G.R., Li,R.
|
USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
|
USA
|
2016-06-30
|
APV_1_D2363
|
Asian prunus virus 1
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Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,472 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null |
2009-01-09
| null | null |
Asian prunus virus 1 isolate APV_1_D2363, complete genome
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| 81,485 |
KT893293.1
|
Asian prunus virus 1
|
Marais,A., Faure,C., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2015-12-26
|
Bungo Q-1256-01
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,473 |
GenBank
| 1 |
Japan
|
Japan
|
Prunus mume
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 1 isolate Bungo Q-1256-01, complete genome
|
GGATAAACAGAACGATCTATCAACAAACCACCTAGCTCGAAACAGACCTAAGTTGTTCGTAATGGCTTTGACATACCGAAGTCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACTTCTGAAGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCAGTCTCACGTTTGACCCAATTTGAAGTCAATAATCATAAGCTCTTTTCATTCGCAATGAGCGAGAAGGCAAAAGAGAAATTGATTAAAGTTGGTATATACCTGAGTCCATTCTCCTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAGACTTTGGAGAATCACATCCTGTACAATATCCTTGTAAATAAATTAGATAATAGTTTCTATGCTATAGGAATAAAGGGGTCTAAAGTTAATTTCCTAAAGAGTAGGTCAAAGAACTTGAGCATGCTTGAGTATATGAACCGTGTTGTCACGAGTGCTGACAAGTATCGATATGGTAGTGACTTCACGACCCTTAGTACTCAACAGATCGACAATCTTTGCTCCAAACAGAGTCTTGAAAAATGTGGAACATTGAGGGAGCTTGTGCCCCTGGTCAAAATGAGCAAAAAGAAAAGGAACTTCTTTCTTCATGATGAGCTGCATTATTGGAGCTCACATGACTTAATGCTTTTCCTTGATTCCGTAAATCCTGACCACCTTCTTGCCACTGTCGTGTTTCCATCAGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAAAGTTTGAACCCATGGTGCTATAGCTTCCAGAGGCATGGAAGCAAGTTAACTTTCTTCCCTGATGGGGTGCAAAGCGAATCGTACACTCAACCCCTGAGTGCTGGTTATATACTTCAAGCTTCGAAAATCGTTTGTCCAAGCGGCCAGATCTACTCTGTTGACCTGGTTTACTCGGCGTTCGCCCACCACATCGTCAGCATAACTAAAGGGGATCTGCCTGGTCTAGAGCGTCGGTTTTTTTCTAACTTCGAAGCCACTGGCGTTAAGCACCTATCTGGACTCTCCTACTCGGTAAGGGACTGCATTCCGGTCAGCTCAGAGCTCATTTCAAAGCTGTATAGATACATTCGTACACTCAAAAAACCAGATTTACAGTCTTGTATGGCAAAACTGAGCCAGATTGTCCCAAACCCAACTGGCACTGAGATCAAATTCACTGAGGACTTTGCCCGCCTAACTATGGATGTACAGCCGATGCGCTCCATGCTCATGCCTGAGACAGCCAAGCTGATAGGGTCTCTTTTTGCCTCCTTCCTTCCATTCAAGATGGCTAGATTCTTTGACTGCTACAAAGCTAGTTCACTTGACAAATTCATTCATGATCTCGAGCCTTTCAGTTTCTCTGTAGAAACAAAGATTATTAACAGCAGATCCAGCCCAATGTTTGAGGCAGTGACTCTTGGTGAAACAATGAGTTCAGAAGAGGTCTTGAAGATTCTGGCCAAGTTGGACATGGGGGCCCCAATGAGCCTGGAAGGATTAACCGGAAAGTTCAAGTATTCAAGTGAGGCTTATCATGGGCTGCATCACGTGCTGGATGGGTGTGGACCACATGTGTTTAGGAGATTGGTAAGAAAGATTGCTGACTCCTTCTGCAATGAATTTGGGATTTACAGGAAGAGCAGTTACGTGTCTTCCGTTGCCATAACAGTCCTGCAGAGGAAAACCAACTCCAATCTAAGCTTCATTTTCGGGGCTGACCTCAATCCAATGATCATTGGTTTTGTGAGGAACTACTTTGCTTCCAGGCGGTCTTCTTTACTCATATGGTTTCATGACAGACCAGAATCTTGGTTCCAATTTTCAAGACTAAGGGCCAATCAAAAGTTTTTACGCTCTCCAATCTGGTCCAATGAACTTGATCTGGCTGAATTTAGAATGAGAAAGAATTTGGTTCTTGAGATCCTTGGTTTCAATAAAGACGGCAATTTGAGAAAGCTGGGATCTTTCCAGACTGTCCTAACAAACACGAAGTCCCGAACTTCAACTCCTGAAGGAATTTCAAACCATCAGGGGAGTCAGAAAGGACTATGTGATGAGGCCAAACTCCAAGTTAACTTTCAAAAAGAACTCGAATTCTGCATGGGCTCTCTGCCAGAAGCTGACAGTCCCAGAAGCCTAACCTCATGTGTCGAGGCAGTGGTCGAAACCAACAATGAAGTTCCACCATTGGGGGCAGGGTCTGAAGCAAATGGTTTAGTCTTTGGATGTGTTCCTGCTGCATCCACGCCTGCATTTACATTCAGCTCAGCAAATCAGAAAGACAGGCTTTTTTCCTCCGTTGTAGAGGAGAACATCACTGATGTCGGTGTTCTTCCATCAATGGAGCTCGCCCTACCTTCAGACGCAGAGGCTACACCATTAAATGGTCGCCAGTGCTACTTTTTCACCAGGTGCAGTTGCATTGATTACGGCCACAACAAAATAAGATACAAACCAAACAAATGGTTCAGTGGTCTGGATTCAATTTTGAAGGATGAAAGCACATACTACAACGCATGCTTGTTACAAATTTATGAGGCTGGTGCCGGGATCGGATTTCATTCCGATAATGAGAAGGTTTACCACAGAAGTCCAATTAAAACAATCAATTTTTGTGGTGAGGCTGATTTCGTGGTTAAGGCTAAAGGAAGACGAGATATCGGAGTCAACGCCACATGTCACATGAGAACCGGTCAGTTCTTCACTATGGACTCGAACTTTCAGTCGTATTACCAGCATTCTGTACAAAATTGCAGTGAAGGTCGGGTTTCCCTCACATTTCGGTACCATGTGAACAACATCGCCGGGTTGCCCATTAAACACACTTGTGGTGAATTTGGAGATACAGAATCTCTCTTCGATGTCCTAATCAGAAGAAGCTTCTCCTACTCGTCAAGGAATTTTCACACGTTCCCCGTTCCAGGGGATGGGAATTGCTTTTGGCATAGTTTGGGAGCCCTGCTTGGGGTTGATGGTGAGGAGCTAAAGAAGATTTCTGCAAGAGAGATCTCAAAAAATGAAATGCTGTCAAGAAATGCAAGTCTGTCAATGCAGATGGAAAATAAGCAATACGCTGAGAGAGAATCAATTGCAGCATTCTGTAGAATCCAATCTATCCATCTTGTTGTTTTGCTTCCTGATCAAAATTTTGCATACGAATTTCTGCCGATGCAAAATGCTGAGGTGACCCAACTTTTCATTCAATTGAGTGGTGAGCACTTCGAACCTGCTCTCCCCATCAACGGCTGCGTTGTGAAATCGATTGCTGAGACCTTGAATCAGACTGAAGCAAAAATCTTGTCAGTCATTGGAAGACCCAACAACCGCCTAATTCTGGAGGGTTTAGTTGAGGGGGAGGGTCTTAATGTTGAAGATTTGGAGGCAGCCTTTTCAATCTTTGGAATTTGCGCCCGGGTCAGTACGGAGAAAGGGGTATTCACTCTTAACAAGGATGGCAATCTCCATGCAAATTATGAGTTGAAGTCTGGGCACATTATGTATTTGAAAAAAGCCTCCAGTTCACAATTTGCACCAACAAATCCCATACAAAATTTCAATTGTCAGGGTCCTGAGATTTTCCTTCGGGGTATAGTGAGCGAGGTTGATTACAAACCAAGCTGGGAGCGAGCTAGAAATCTTGAGGAGTCTTTCCTCAATGGAACCACAGGGATCCTGTGTGATAGAACAATCAATCTTCAAAAGAACTGGTTAACTGAGGACAGAAAATTGAATGATGGTTCTCGAAATCTTGGGGTTGTTTTAGGGACTTTTGGCTCTGGAAAGAGCTCGCTGTTTAAGAGGTTTATTGTTAAGAACCCTTCCCGCTCAATCATCTTCGTTTCACCCAGGAGGTCACTTGCTGACCAGATTAAAGAGGATCTTGGGCTCAACACAAGGAGGGGGAAGTCACTTAGGGTGCGAGTTCTGACCTTGGAAAGTTTTATTAAGGCTGTCTTTACTTTTAAGGCTGCAAGTATTGTGTTGGATGAAGTTCAACTGTATCCTCCTGGGTACTTGGATTTAGTGATGTTGTGCCTTAGTTTGAATTGCCAGATTTATTTGGCTGGTGATCCATGCCAGAGTGACTATGATTCGGCCAAAGATAGGGCCTTGTTTGATGGTTTGAGGGGTGACATTTTTGAAGTTCTCAGTGAGAAAAGATACAAGTTCAATATCTCGAGCCGCAGATTCCAGTCCGAAATGTTTGTGGGGCGACTTCCTTGCAGAATGGATACAAAGGCCATGACTGAGAATGAAAGTTTCCACTGGTTGGAGAGCATTGAGTCAGCCGCAGAAGTGAGCAACACTGAGTATGATGTGGTTCTCGTCTCGAGCTTTGAGGAAAAGAAGATTGTGTGGGCTCATCTTGGGAGGGACCTGGAGGTTCTAACTTTTGGTGAATCCACGGGTCTGACTTTCAATAGGGGCATCATTCTCATTTCTCATGAGAGCACTTTGACCAGTGAGAGGAGGTGGATTACCGCACTCTCTAGATTTAGGCTTAACATCATTTTCGTGAATCTGGTTGGAAATTGTGTTGAGGATGTTTGCCAGGTGTTCCATGACAGAACTTTAAGCAGATTCTTAACTAAACGAGCAACAGTCGCCAACATAGTCGATCAACTACCAGGTCTGCCAGAACTGACAAATGATTTCGGTGATAAGGTTGGCCGCTCTGAAGGGGTGATGGAAGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGTTAAAGACAGAAATTGACCTACTTCAAGATGAGGACCAGGAGATGGAAGAACTTGCTGAGGAAGTTAGCCATGAACCATGGTTCAAGACCCACCTGCCTCTCTTTGAGTTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGGGAATATCGTGAGGTACGTTGCGGCTCAGAGGTCACAACTCAGTTTCCTGATGATCATCCCAACGGAGCAAAGATGACTCTAGCGAATGCAGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCAAGGCATAGGGGAAGTGACTCAGTAACATTTTTAATGG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| 84,421 |
FJ824737.1
|
Asian prunus virus 1
|
Marini,D.B., Gibson,P.G., Scott,S.W.
|
Clemson University, Entomology, Soils and Plant Sciences
|
USA
|
2009-08-15
|
tatao5
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,409 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 1 isolate tatao5, complete genome
|
GATAAACAGAACGATCTATCAACAAACTACCTAGCTCGACAAACAGACCTAAGTTGTTCGTATGGCTTTGACATACCGAAGTCCGATAGGGGAAGTTCTTAATCGCTTCACATCTGAGGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCGGTTTCACGTCTGACCCAATTTGAAGTCAACAATCATAAGCTTTTCTCATTCGCAATGAGCGAGAAGGCTAAAGAAAAGTTGATCAAAGTTGGCATATACCTGAGTCCGTTCTCTTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAAACTTTGGAGAATCACATTTTGTACAATATTCTTGTAAATAAGTTGGATAATAGTTTTTATGCTATAGGAATAAAGGGGTCTAAGGTCAACTTTCTGAAAAGCAGGTCAAAAAACCTGAGCATGCTTGAATACATGAACCGTATCGTCACTAGTGCCGACAAGTACCGATATGGTAGCGACTTTACGACCCTCAGCACTCAACAAATTGATAATCTCTGTTCCAAGCAAAGTCTTGAAAAATGTGGAACATTGAGAGAGCTCGTGCCCTTGGTCAAAATGAGCAAGAAGAAAAGAAATTTCTTTCTGCATGATGAGCTTCATTATTGGAGTTCACATGACTTGATGCTTTTCCTAGATTCAATAAATCCTGACCACCTCCTTGCTACTATTGTGTTCCCACCAGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAAAGTCTGAACCCATGGTGTTATAGCTTCCAAAGGCATGGTAGCAAGCTAACTTTCTTTCCTGATGGGGTGCAAAGCGAGTCATACACTCAACCTTTGAGCGCAGGTTACATACTTCAGGCTTCAAAAATCGTCTGTCCAAGTGGCCAAGTTTACTCTGTTGATTTGGTTTACTCAGCATTCGCCCACCACATTGTTAGCATCACTAAAGGGGATCTGCCTGGTCTAGAGCGTCGTTTCTTTTCAAATTTCGAGGCCACAGGCGTGAAACACTTATCTGGGCTCTCTTACTCAGTGAGGGACTGTATTCCGGTTAGCTCAGAACTCATTTCAAAGCTGTACAGGTACATTCGCACACTTAAAAAACCAGACTTGCAGTCCTGTATGGCAAAACTGAGCCAGATTGTTCCAAACCCCACAGGCACTGAGATCAAATTTACTGAGGATTTTGCCCGTCTGACTATGGACGTGCAGCCTATGCGATCCATGCTCATGCCTGAAACGGCCAAGCTGATAGGGTCTCTTTTCTCTTCCTTCCTTCCTTTCAAAATGGCTAGGTTCTTTGATTGCTACAAGGCCTGCTCACTGGATAAGTTCATTCATGATCTTGAACCTTTTAGTTTCTCTGTGGAAACGAAGGTTATCAATAGCAGATCCAACCCGATGTTTGAGGCTGTGACCCTTGGTGAAACAATGAGTTCAGAGGAGGTCCTAAAGATCTTGGCCAAACTAGACATGGGGGCCCCAACAAGCTTAGAGGGGTTGACTGGAAAATTCAAGTATTCAAGTGAGGCCTATCATGGACTGCATCATGTTTTGGATGGATGTGGGCCGCATGTGTTTAGGAGGTTGGTGAGAAAGATTGCTGACTCCTTCTGCAATGAGTTTGGAATTTACAGGAAGAGCAGTTACGTGTCCTCCGTAGCTATCACAGTCTTGCAAAGAAAGACCAATTCCAATCTGAGTTTCATCTTCGGAACTGATCTCAACCCAATGATTATTGGCTTTGTAAGAAATTACTTTGCCTCCAGGCGGTCTTCTTTATTAATATGGTTTCATGATAGGCCAGAGTCTTGGTTTCAATTTTCGAGATTGAGAGCCAACCAGAAATTTTTGCGCTCCCCAATCTGGCCTAATGATCTCGGTTTGGTTGAATTCAGAATGAGAAAGAACTTGGCGCTCGAAATTTCAAACTTTGATAGAAACAGCAACTTGAGGAAGTTGGGATCTTTCCAGACTGCTCCAACAAATTCGAAGTCCAATACTTCATCTTCTGAGGGAGCCTCAAATCATCAGAGGGAACAGAGAGACCAATGTGATGAAGCCACCCTCCAAGTCAATTTTCAAAGGGAAATTGAGTTCTGCATGGGCTCTCTGCCGGAAGCTAACAGCTTCAAGAGCTTCACTCCATGTGTTGAGGCAGTTGCTGAGACTAGTTATGAAGTTCAGCCATTGGAGCCGGAACCTGAAGCAAATGGCTTGGTCCTTGGGTGCATTCCTGATGCATCTACCCCTGCCTTCACCTTCAACTCAGCAAACCAGAAGGACAGGTTATTCTCTTCCGTTGTGGAGGAGAATATTACTGACATCGGCATTCTCTCACCAATGGAGCTCGTCCTGCCTTCAAGTGCAGAGGCCACACCATTAAATGGTCGCCAATGCTACTTCTTCACCAGGTGTGGCTGCATTGACTATGGCCACAACAAAATCAGATACAAGCCGAACAAATGGTTCAGTGGCCTGGATTCAATTTTGAAAGATGAGAGTACGTACTATAATGCATGCCCGTTGCAAATCTACGAAGCTGGCGCCGGAATTGGGTTTCATTCTGACAATGAGAAGGTCTATCATAGAAGTCCAATCAAGACAATCAACTTCTGTGGTGAGGCAGATTTTGTTGTTAAGGCCAAAGGAAAACGCGATGTTGGAGTTAATGCTACCTGCCACATGAAAACCGGCCAGTTTTTCACTATGGACTCAAACTTTCAGTCGTATTACCAACATTCTGTGCAAAATTGTAGTGAGGGTCGTGTTTCCCTCACATTTAGGTACCACGTGAACAACATTGCCGGGCTGCCCATCAAACACACCTGTGGTGAATTTGGAGACACCGAATCCCTCTTTGATGTCCTAATTAGGAGAAGCTTTTCTTACTCTTCAAAGAATTTTCACACTTTTCCCGTTCCAGGGGATGGGAGCTGTTTTTGGCACAGTCTGGGGGCTCTGCTTGGAGTTGATGGTGAGGAGCTTAAAAAAATCTCAGCGAGAGAAATTTTAAAAAATGAGGTGCTATCAAGGAATTTGAGTCTGTCAGCGCAGATGGAAAATAAGCAATACGCTGAAAGGGAGTCGATTGCCGCATTCTGTAGAATTCAGTCCATCCACCTCGTTGTTCTGCTTCCCGACCAAAATTTCTCATATGAATTCCTGCCGATGCAAAATGCTGAAGTGACCCAACTCTTCGTCAAATTAAGTGGCGAGCATTTTGAGCCTGCTCTTCCCATCAACGGCTGCGTTGTGAAGTCAATCGCCGAGACCCTAAATCAAACTGAGGCAAAGATCTTGTCAGTCATTGGAAGACCTAACAATCGCCTAATTCTGGAGGGTCTAGTTGAGGGGGAAGGGCTAAACATTGAAGATTTGGAAGCAGCCTTTTCAGTCTTCGGAATATGTGCTCGAGTTAGCACAGAGAGGGGGGTATTCACACTGAACAAGGAGGGTAATCTCCATGCGAACTATGAATTGAAGTCTGGGCACATTATGTACTTAAAAAAAGCGTCAAGTTCGCAATTTGCGCCAACAAATCCAATACAAAATTTCAATGGTCAAGGTCCTGAGATCTTCCTCCGGGGCATAGTAAGCGAGGTTGATTATAAACCCAGTTGGGGACGAGCCAGAAATCTTGAAGAATCTCTCCTTAATGGAACCACAGGCATTTTGTGCGATAGAACGATCAATCTTCAAAAAAACTGGTTAACTGTGGACAGAAAACTGAATGATAATTCTCGGAATCTTGGGGTTGTTTTGGGAACCTTTGGCTCTGGAAAGAGCTCTCTGTTCAAGAGGTTTATTGTTAAGAATCCTTCCCGCTCGATTGTCTTTGTCTCGCCCAGGAGATCGCTTGCTGACCAAATTAAAGATGATCTTGGACTCAACACAAAAAGGGGTAAGTCACTTAGGGTTCGAGTACTCACTTTGGAGAGCTTCATTAAGGCTGTCTTCACTTTCAAGGCAGCCAGTGTTGTATTAGATGAGGTCCAACTGTACCCTCCTGGATACTTGGATTTGGTGATGTTGTGTCTCAGTTTAAACTGTCAGATCTATTTAGCTGGCGACCCATGCCAAAGTGATTACGATTCGGCCAAAGACAGGGCTTTGTTCGATGGCTTGAAGGGTGATATATTTGAGGTTCTCAGCGGGAAAAAGTATAAATTTAATGTCTCAAGCCGCAGGTTCCAGTCTGAAATGTTTGTGGGGCGACTTCCCTGCAGAATGGACACAAAAGCAATGACTGAAAATGAGAATTTTCACTGGCTGGAGAGTATTGAGTCAGCTGCAGAAGTGAGCAACACTGAGTATGATGTGGTCCTCGTTTCAAGCTTTGAGGAGAAGAAGATTGTGTGGGCTCACCTTGGAAGAGACCTGGAGGTTCTAACTTTTGGTGAATCTACAGGCCTGACCTTTAATAGGGGCATCATTCTCATTTCCCACGAAAGCACCTTAACCAGTGAGAGGAGGTGGATCACCGCACTCTCTAGATTCAGGCTCAACATTATCTTTGTGAATTTGGTCGGAAACTGTCTTGAGGATGCTTGCCAGGTATTTCATGATAGAACCCTGGACAGGTTTCTAACTAAGCGAGCAACAATTGCCAATATAGTCGATCAGTTACCAGGTCTGCCAGAGTTAACAAATGATTTTGGCGACAAGGTTGGTCGTTCTGAAGGGGTGATGGAAGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGCTGAAAACTGAGATTGATCTGCTTCAGGATGAGGATCAGGAGATGGAAGAGCTCGCTGAGGAGGTCAAACATGAACCATGGTTCAAAACCCATCTGCCTCTTTTTGAATTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGAGAATATCGTGAGGTGCGTTGCGGTTCAGAAACCACAACTCAATTTCCTGATGATCACCCCAGCGGAGCGAAAATTACTTTGGCAAATGCAGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCAAGGCACAGGGGAAGTGATTCAGTCACCTTTCTAATGG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| 102,417 |
NC_028868.1
|
Asian prunus virus 2
|
Marais,A., Faure,C., Candresse,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-01-05
|
Bungo Q-1256-01
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,362 |
RefSeq
| 1 |
Japan
|
Japan
|
Prunus mume
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Asian prunus virus 2 isolate Bungo Q-1256-01, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACATCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTCTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGATAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCTAAGGTTAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAACCTAAGCATGTTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGCGCAGATAAGTATAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGTTCAAAAAAAAGCCTTAGTGAGTGTGGCACATTAAAGGAACTGGTTCCACTGGTCAAAATGAGCAAGAAGAGGAATTTTTTCTTACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACCTGATGCTATTTTTGGACTCAGTCAATCCTGATCACTTGGTAGCAACGGTGGTCTTTCCTCCCGAGATATTAGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTGAATCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAGGGCAGCAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCCTGAAGGCATCAAAAATTGTGTGTCCAAGTGGTCAGATCTACTCTGTGGATCTTGTGTATTCAGCCTTTGCACACCATGTTGTAAGCATAACAAAGGGAAATTTACCAGGGCTTGAAAGGAGGTTTTTTTCGAACTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCCACTCTGTGAGGGACTGCATTCCAGTCAGCACTGATCTAATATCTAAGATCTACAGATATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACTTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAGATAGTCCCTAATCCAACTGGTGTTGAAATTAAATTCACAGAGGATTTCTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTTTAAAGTCCCTTCTTATGCCTGACACTGCGAAATTAATTGGGGCTTTGTTTGCTTCCTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTCTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCATTTAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTCATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAGGAAGTTATCCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGTAACCTGGTGGGAAAGTTCAAATACTCAAATGAGGCCTATCATTGTCTTCACCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGTTGATTAGAAGAGTGGCAGGTTCCTTCTGTAATGAATTCGGCGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTGTTCCAAAGGAGGTCAAACCTAAATCTTGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTAAATCAAAAGGTTGTTTGCATTGTCCGCAATTTCTTTTCCTCAAAGAAATCTTCTCAGCTTATCTGGTATTCCACAAATTCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCGAAGCTGAGAGCCAATCAAAAGTTTCTGAGATCACCAATTTTTCCTGCCTCCATGAACTGCAAAGACCTTTCAACTAGGAAAAATCTAATACTTGACTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTAAGAAAGCTTGGGTCTTCGGGAGTTTCTTCAGTGGTGCCTCCCAAACCTGTTCTTGGTGGCTTTGAGTTTGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATGATATTGAGGTGAAGTCGAATACCATGGCAAAGATGTTTGATCCATCACCACAGGCAGTTCTTGGAATTGAAGGTCCAGCTGCTGGTGTGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAACTCTCTCTCCCAAAGCTGCTGACCTTGAGGAACGAAATGGTCTTATTTTTGGATGTGTTCCTGAACCAAGCTTGATGAATTTTTCATTCAGTTCAGCCAACCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATCGTGAATGAAAACATAGTAGATGTTGGAATTCTCCCTCCCACCGAACTGAAAATCCCATTGGATGCCAAGGTCACACAAATCAATGGTCGAGATTGCTACTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGCCACAATAAGATCAAGTACACTGCTAATAACTGGTTTTCAGGCCTAGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCGTGCCTTCTGCAAGTTTACAGGGCTGGCAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCATAGAAGTCCTATCAAAACTGTCAATCTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTAGGGACTGTTGCAAGAGGACATCTCTTTCCAGGACACTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCGGTCCAAGATTGCAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACTTTCCGCCATCATGTAAACAATGTCACAGGACTGCCAATCAAACATACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCATACCTTCCCAGTCCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTCTGCTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAATTTTACTATCCAACCTGAGCCTACGTCAGCAGATGGCAAATAAGCAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTTCCGTCACAAAATCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAGCTAACGGATGAACACTTCGAGCCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTTAATCAAACCGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATTCTCGACAATTTAGTCGAGGGAGAAGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAGGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGAGTTAGCTCAGAAAATGGTGTTTTTACCCTAAATAGGGATGGCAATCTGCATGCAAACTATGAGTTGAAATCTGGTCATATAATGTACTTGAGGAAAGTCCCTAACTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATCCAAAACTTTAATGGACAAGGGCCTGACCTGTTTGGGAAGGGGGCTAGAAATTTAGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTGTGTGACCGCACTGTCAATCTCCAGAAGAATTGGTTGACTGAGGGAAGAAGGTTAGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTTAAGCGGTTCATCGTAAAAAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATTTAGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCTTGAGAGTCAGAGTTTTAACCTTGGAGAGCTTCATCAAAGCAGTCTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTAGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTATCCCCCTGGGTACCTTGACTTGGTGATGCTATGTCTCAGTGGAAATTGTCAAATCTACCTCTCAGGAGATCCGTGCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAAGACAGAGCGCTCTTTGATGGGATGAAGGGGGATATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAAAGCTATAAATTCAATGCATCCAGTAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGATATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGCAACACTGAATACGACGTTGTTCTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTCCTAACTTTTGGAGAATCAACAGGCTTGACCTTCAACCGGGGCATTATCCTCATTTCTCACGAAAGTACCCTCACTGGTGAAAGAAGATGGATTACTGCGCTGTCAAGGTTTAGACTAAACATTATCTTTGTCAACTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTTCATGATCGAACATTGTTCAAATTTCTCAATCGCACCGCAACAATTGGAGACATTATTAAGCAACTTCCTGGCAACCCAGAATTGACAAATGACTTTGGTGATAAAGTTGGGAAGTCGGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGACTGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGGTCGAGCTGGCAGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCCTATTTGAGTTGGAATCAATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCAACCCAGTTCCCTGAGGACCACCCCAATAAGTATAAGGTGACCCTAGCCAATGCAGCCGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACACAAGGGAAGTGATTCTGTAACCTTTCTAATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCAAGACCATCAGTTGAGTCAGCCAAGT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| 5,766 |
MT218431.1
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Asian prunus virus 2
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Bu,F., Liu,Z., Chen,J., Xiang,B., Shen,M., Cui,B., Zheng,Y.
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Shihezi University, School of Life Sciences
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China
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2021-03-01
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Tao4
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Asian prunus virus 2
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Foveavirus
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Betaflexiviridae
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ssRNA(+)
| 9,393 |
GenBank
| null |
China
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China
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Prunus persica f. compressa
| null |
2019-05-07
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate Tao4, complete genome
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CCGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTGAGTTCAACCTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAAGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGGATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAACATTTTAGCTAATAAATTAGACAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTTTTAAAAAGTAGATCAAAGAACCTAAGCATGTTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGCGCAGATAAGTACAGATATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAAAGCCTTAGTGAGTGTGGCACACTGAAGGAATTGGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGGAATTTTTTTTTGCATGACGAGCTTCATTACTGGAGCCCACAAGACTTGATGCTCTTTTTGGACTCAGTAAACCCTGATCACTTGGTAGCAACGGTGGTTTTTCCTCCCGAAATACTGGCTGGAGCCAAAGAGAGTCTTAATCCATGGTGCTACTCATTCCACCGGCAAGGTAGCAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTTAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCCAAAATTGTGTGTCCGAGTGGTCAAATTTACTCTGTGGATCTTGTGTACTCAGTCTTTGCACACCATGTTGTAAGCATAACAAAGGGAAATTTACCAGGGCTTGAAAGGCGGTTCTTTTCAAATTTTGAGGCAACTGGAGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCTATTCTGTGAGAGACTGCATTCCAGTTAGCACTGATCTAATATCTAAGATCTACAGGTATATYAGGACCCTCAAGAAGCCTGACTTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAGATAGTTCCCAATCCAACTGGGGTTGAAATCAAATTCACAGAGGACTTCTCACGACTAGTTATGGAGATTCAGCCTCTGAAGTCCCTTCTTATGCCAGACACTGCTAAACTAATTGGGGCCTTGTTCGCTTCCTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCATTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTTATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGARGCAATTTCTTTGGGTGAATCAATGAGTCCAGAGGAAGTTATCCAGATATTGAGCCGAATGGAAATGGGGGCTCTCGCTGGGTCATGTAACTTGGTAGGGAAGTTTAAATACTCAAATGAGGCCTATCATTGTCTCCACCATGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGCTGATTAGAAGAGTGGCAAGTTCCTTTTGTAACGAATTTGGTGTTTACCGAAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTGTTCCAGAGGAGATCAAACCTAAATCTCGACTTTGTCTTGGGGTCTGATCTAAATCAAAAAGTCGTTTGCATTGTTCGCAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCCTCTCAGCTCATCTGGTATTCCACAAACTCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCAAAGCTGAGAGCTAATCAGAAGTTTCTAAGATCACCAATTTTTCCTGCGTCCATGGATTGCAGAGACCTCTCAATTAGGAAAAATCTGATGTTCGACTTTGAGATTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTGAGAAAGCTTGGGCCTTCGGGAATTTCTTCAGCGGTGCCCTCTAAACCTGTTCTTGGTGGCTTTGAGTTCGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATGATATTGAGGTGGAGTTGAATACCATGATGAAGATGTCTGACCCATCAACACAGGTGGTTCTTGGAATTGAAGGTCTAGCTGTTTGTGTGCATGAAACTGACCCACAAGATCAAATTTTCTCTCCCAAAGCTGCCAACCTTGAGGAACAAACTGGTCTTATTTTTGGATGTATCCCTGAACCAAGTTTAGGGAATTTTTCATTTAGTTCAGCCAATCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATTGTCAATGAAAACATAATAGATGTTGGAATTCTTCCTCCCACTGAATTGAAAATTCCATTGGATGCTAAGGTCACACGAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGCCACAATAAGATTAAATACACTGCTAACAACTGGTTTTCAGGCCTCGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCATGCCTCCTGCAAGTTTACAGGGCTGGTAGTGGAATTGGTTTTCACTCAGACAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGCCCCATCAAAACTGTTAATCTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCCAAGGGTAGGAGGGACTTAGGGACTGTTGCTAGAGGACATCTCTTCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAGCATTCAGTTCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACCTTTCGCCATCATGTAAATAATGTCACAGGGCTGCCAATCAAACACACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGCTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCACACCTTCCCAGTTCCTGGGGATGGCAGCTGCTTTTGGCATAGCATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCCGCGAGAGAGATTCAGAAAAATGAAGTTTTGCTATCCAATCTGAGCCTACGTCAGCAAATGGCCAACAAACAGTATGCTGAGAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATTCATTTGGTTGTCCTGCTTCCAGGCAACAATTTTTCTTATGAGTTTCTTCCGTCGCAAAACCCTGAAGTCACCCAATTGTTTGTTAAACTTACGGATGAACACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTRAATGGATGCGTTGTTAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACTGAAGCAAAGATCTTGTCAGTAATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATCCTCGACAACTTAGTCGAGGGAGAGGGACTCAATCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTTACTATCTTTGGAATATGTGCTAGAGTCAGCTCAGAACATGGGGTTTTCACCCTAAACAGGGATGGCAATCTGCATGCGAACTATGAATTGAAATCTGGTCACATAATGTACTTGAGGAAAGTCCCTAGCTCACAATTTGCCCCCTCCACACCAATCCAGAATTTTAATGGACAAGGGCCTGAGCTGTTCCTAAAGGGAATTGTTAGTGAGGTAAAATATAAGCCAGATTGGGAAAGGGCCAGGAATTTAGAGGAATCATTCCTTAATGGTACAACAGGGGTCTTATGTGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAGAATTGGTTGACGGAGGGGAGAAGGCTAGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTCAAACGGTTCATCGTGAAGAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAGATCAAGGAGGATCTGGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCTTAAGAGTTAGGGTCTTGACCTTGGAAAGCTTCATCAAGGCAGTTTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTTGTTCTCGATGAAGTGCAGCTGTATCCCCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGTCTTTGTGGAAATTGTCAGATCTACCTTTCAGGAGATCCATGCCAGAGCGACTACGATTCAGCTAAGGACAGAGCGCTTTTTGATGGGATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGCAAAAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTAGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGACATGGTTGGGGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATAGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGCAACACCGAATACGACGTTGTTTTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATAATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTCCTCACTTTTGGAGAATCAACAGGCTTAACCTTCAACCGGGGCATCATTCTCATTTCTCATGAAAGCACCCTCACTAGTGAAAGGAGATGGATTACAGCGCTATCAAGGTTTAGACTAAACATCATCTTTGTGAATTTGGTTGGCAACAACATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTCCATGACCGAACACTATTCAAATTTCTCAATCGCACCGCAACTATTGGGGACATCATCAAGCAACTCCCTGGTCACCCAGAACTAACAAATGACTTTGGGGATAAGGTTGGGAAGTCGGAAGGAATCATGGAAGACAAACTTGCTGGTGATCCGTGGTTGAAGGCTGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGATTGAGCTGGCTGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCTTGTTTGAGTTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTTTCGACCCAGTTCCCTGAGGACCACCCAAACAAGTATAAGGTGACTCTAGCCAATGCAGCTGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCGAGACATAGGGGAAGTGATTCTGTAACCTTTCTAATGGCTGTCAAAAAAAGGCTCAG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| 43,897 |
LC522985.1
|
Asian prunus virus 2
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Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS10
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,374 |
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus armeniaca
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 2 TAS10 RNA, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCAGCTCGAAACAGACCCAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGACAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTTCTAAAAAGCAGGTCAAAGAACCTAAGTATGTTGGAGTATGTTAACCGTGTTGTTACCAGCGCAGATAAGTACAGATATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAAAGCCTTAGCGAGTGTGGCACACTAAAAGAACTGGTACCACTGGTGAAAATGAGCAAAAAAAGAAACTTCTTTTTACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTAATGCTCTTTTTGGATTCAGTCAATCCTGATCATTTGGTCGCAACTGTGGTCTTTCCCCCCGAAATACTAGCTGGAGCTAAGGAGAGTCTTAATCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAAGGCAGCAAATTGACATTTTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCCAAGATTGTGTGTCCGAGTGGTCAAATATACTCTGTGGATCTTGTGTACTCAGTCTTTGCGCACCATGTTGTAAGCATAACAAAAGGAAATCTACCAGGGCTTGAAAGGCGGTTCTTTTCAAATTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCTATTCTGTGAGGGACTGCATTCCAGTTAGTGCTGATTTAATATCTAAGATCTACAGGTATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTACAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAAATCGTTCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATCAAATTCACAGAGGATTTCTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTCTGAAGTCCCTTCTAATGCCAGACACTGCTAAACTAATTGGGGCTTTGTTCGCTTCCTTCCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTCTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGACTTGGAACCGTTTAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTTATTGACTGCAATACCATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAGGAGGTCATCCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGCAACTTGGTAGGAAAGTTCAAGTACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCATCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGCTGATTAGAAGAGTAGCAAGTTCCTTTTGTAATGAATTTGGTGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTTTTCCAGAGGAGATCAAACTTAAATCTCGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTTGCATTGTCCGCAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCTTCTCAGCTCATCTGGTATTCCACAAATCCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCAAAGCTGAGAGCTAATCAAAAATTTCTAAGATCACCAATTTTTCCTACCTCCATGAATTGCAAAGACCTTTCAATTAGGAAAAATCTGATGTTTGACTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTGAGAAAGCTTGGGTCTTCGGAAGTTTCTCCAGTGGCGCCTTCCAAACCTGTTCTTGGTGGCTTTGAATTCGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCTCGAGGATGATATTGAGGTAGAGTTTAACACCGTGGTAAAAATGTCTGATCCATCGCCACAGGTGGTTCTTGGAATTGAAGGTTCAGCTGTTCTTACGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAGCTTTCTCTCCCAAAGCTACTAACCTTGAGGAACGAACTGGTCTTATTTTTGGATGCGTCCCTGAACCAAGCTTAGGGAACTTTTCATTCAGTTCAGCTAATCAGGGTGATCGCCTCTTTGCCAACATTGTAAACGAAAACATAATAGATGTTGGAATTCTTCCTCCCACCGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAGGTCACACAAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTTTTCACGAGGTGCTCATGTATTGACTATGGCCACAATAAGATCAAATACACTGCTAATAATTGGTTTTCAGGCCTTGATCAATTTCTATCCAATGAGGGGACATACTACAATGCATGCCTCCTGCAAGTTTACAGGGCTGGTAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGATAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGTCCTATCAAAACTGTCAATTTGTGTGGAGAGGCTGACTTCCTTGTCAAAGCTAAAGGTAGGAGGGACTTAGGGACTGTTGCAAGGGGACATCTCTTCCCAGGACATTACTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCAGTCCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACTTTCCGCCATCATGTTAATAATGTCACAGGGTTGCCAATCAAACACACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTCTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCACACCTTTCCAGTTCCTGGGGATGGTAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTGAAGAAAATATCCGCAAGAGAGATCCAGAAGAACGAGGTTCTACTATCCAATCTGAGCCTACGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTCCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTTCCGTCACAAAATCCTGAAGTCACCCAATTGTTTGTCAAACTAACGGATGAACACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACTGAGGCAAAGATTTTGTCAGTGATTGGGAGACCTACAAATAGAATGATTCTTGATAACTTAGTCGAGGGAGAGGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTTACAATCTTCGGAATATGCGCTAGAGTCAGCTCAGAACATGGGGTTTTTACCCTAAACAGGGATGGTAATCTGCATGCGAACTATGAATTGAAATCTGGTCACATAATGTACTTGAGGAAAGTCCCTAGCTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATCCAAAATTTTAATGGACAGGGGCCTGAGCTGTTCCTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTAAAATATAAGCCAGATTGGGAGAGGGCCAGGAATTTGGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTATGTGACCGCACCGTCAATCTCCAAAAAAATTGGTTGACTGAGGGAAGAAGGCTGGTAAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTCCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACGTTATTCAAGCGGTTTATCGTGAAAAATCCCGCAAGGTCAATTGTCTTTGTTTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGACCAGATTAAGGAGGATTTGGGCCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTGAGAGTCAGGGTCTTAACTTTGGAGAGCTTCATCAAAGCCGTTTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTGGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTACCCCCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGCCTTAGTGGAAACTGTCAGATTTACCTCTCAGGAGATCCGTCCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAGGACAGAGCACTCTTTGATGGGATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGCAAAAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTCCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGACATGGTTGGGGATGAGGACTTTCACTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGCAACACCGAATACGACGTTGTCTTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAGAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTCCTTACTTTTGGGGAATCAACAGGCTTAACTTTCAACCGGGGCATCATTCTCATCTCTCACGAAAGTACCCTCACTGGTGAAAGGAGATGGATCACAGCGCTATCAAGGTTTAGACTAAATATCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAATAATATTGAGGATGTGTGCCAAGTTTTCCATGACCGAACACTATTCAAATTCCTCAACCGCACTGCAACAGTTGGAGACATTGTCAAACAACTCCCTGGCCACCCAGAGCTAACAAATGATTTTGGTGATAAGGTTGGGAAGTCTGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGGCTGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAAATGATTGAGTTGGCTGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCATCTCCCCTTGTTTGAGTTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAGAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTGCGTTGCGGAACGGAAATGTCTACCCAGTTTCCTGAGGACCATCCCAGCAAGTTTAAGGTGACTCTAGCCAATGCAGCCGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACATAGGGGGAGCGATTCTGTAACCTTCCTAATGGCTGTTAAAAAAA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| 53,949 |
KY445748.1
|
Asian prunus virus 2
|
Jo,Y., Lian,S., Cho,J.K., Chu,H., Choi,H., Cho,W.K.
|
Seoul National University, Department of Agricultural Biotechnology
|
Korea
|
2017-07-23
|
WY
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,389 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Prunus mume
| null |
2014-07-25
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate WY, complete genome
|
CAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAATCACAAACTCTTTTCATTCGCTTTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGTCCATTTTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGACAATAGTTTTTATGCAATAGGCATTAAGGGTTCTAAGGTCAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAACCTGAGTATGCTGGAGTATGTGAACCGTGTCGTAACCAGTGCAGATAAGTACAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGTTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAGAGCCTCAGTGAGTGTGGCACATTGAAGGAACTTGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGAAATTTTTTTTTACATGATGAGCTTCATTACTGGAGCCCACAAGACTTGATGCTTTTTTTGGACTCAGTTAACCCTGATCACTTGGTAGCAACAGTGGTCTTTCCTCCCGAAATACTAGCTGGAGCCAAGGAAAGTCTCAACCCATGGTGCTATTCGTTTCACCGGCAGGGCGGCAAATTAACGTTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAATCATACACACAACCTCTCAGCTCTGGTTACATCCTGAAGGCGTCCAAGATTGTGTGTCCAAGTGGTCAAATCTACTCCGTGGATCTTGTGTACTCAGCCTTTGCACACCATGTAGTGAGCATAACAAAGGGAAATCTACCAGGACTTGAGAGGCGGTTCTTCTCAAATTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACATCTATCAGGCCTCTCCCATTCAGTGAGGGACTGCATCCCAGTCAGTGCTGACCTAATATCTAAGATCTACAGGTATATTCGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTACAGTCCTGCATGGCTAAGCTCAGCCAAATTGTTCCCAATCCAACTGGCATTGAAATTAAATTCACAGAGGACTTCTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTCTAAAGTCCCTTCTCATGCCAGACACTGCTAAACTCATTGGGGCTCTGTTCGCTTCCTTCTTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTTATTCATGACTTGGAACCATTTAGTTTCTCTGTGCCCACAGAAGTTATTGACTGCAACACAATGCCAGTTTTTGAAGCAATCTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAAGAGGTTGTCCAAATTTTAAACCGAATGGAAATTGGGGCATTCGCTGGGTCATGTAACTTGGTAGGGAAATTCAAGTACTCAAACGAGGCCTACCACTGCCTACACCATGTTCTTGATGGTTGCAAGCCTGAAGTTTTTAAGAGGTTGATTAGAAGAGTAGCAGGTGCCTTCTGCAATGAGTTCGGTGTTTACCGGAGGAGTAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATTAATGTGTTCCAGAGAAGATCAAACCTAAATCTTGACTTCATCTTTGGATCTGATCTGAATCAGAAGGTTGTCTGCATTGTTCGCAACTTCTTTTCCTCAAAGAAATCCTCTCAGCTTATCTGGCATTCCACAAATTCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCAAGGTTGAGAGCTAACCAAAAATTTCTAAGATCACCAATTTTCCCTGCCTCCATGGATTGCAAGGACCTTTCAACTAGGAAAAATCTGATTTTTGACTTCGAGGTTTTTGGTTTTTGTGCTGGTTTAAGAAAGCTTGGGTCCCCAGGAGTTTCTCCAGTGGTTCCCCCTAAGCCTGTCCTTGGTGGCTTTGAATTCGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCATGAGGATGATGTTAAGGTTGAATTGAACGTCACGACAGAAATGTTTAATCCACAAGTGCAGGTAGTCCCTGGAGTTGAAAGTCCAGCTGTTTATGTGCATGGGATTGACCTACAGGATCAAACTTTCTCCTCCAAAGCTACCAATCCTGAAGAACGAAATGGCCTTATTTTTGGATGTGTTCCTGAGTCAAGCTTGGGAAATTTTTCATTTAGTTCAGCAAATCAAGGTGATCGACTCTTCGCCAACATTGTAAATGAAAATATAATAGATGTCGGAATCCTTCCTCCCACTGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAAGTCACACAAGTCAATGGTCGGGACTGCTTCTTCTTCACAAGGTGTTCATGCATAGACTATGGCCACAACAAGATTAAGTATATTGCTAATAACTGGTTTGCAGGCCTTGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCATGCCTTCTGCAAGTTTACAAGGCCGGCAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTTTACCACAGAAGTCCGATCAAAACCGTTAATCTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGAGACTTGGGGACTGTCGCAAGGGGGCATCTCTTCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAACTTCCAGTCTTACTACCAACATTCGGTTCAAGATTGCAGCGAGGGGAGGGTTTCCTTAACCTTTCGCCATCATGTAAACAATATCACAGGGCTGCCAATTAAACACACTTGCGGAGAATTTGGCGATACCGAGATCCTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAGAACTTTCATACCTTCCCGGTTCCTGGGGATGGTAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTGAAAAAGATATCCGCGAGGGAGATTCAGAAGAACGAAGTTTTACTATCCAACCTGAACCTTCGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCCTTCTGCAGGATCCAGTCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTGCCGTCACAAAATCCTGAAGTTACCCAGCTGTTTGTCAAATTGACGGATGAGCACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTTAACGGATGTGTTGTCAAGTCAATTGCAGAAACCCTAAATCAGACCGAGGCGAAGATCTTGTCAGTAATTGGGAGGCCTACAAATAGAATGATTCTCGACAACTTAGTCGAGGGAGAGGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTCACAATCTTTGGGATATGTGCCAGAGTCAGCTCAGAACATGGGGTTTTCACCTTAAACAGGGATGGCAACCTGCACGCGAACTATGAATTGAAGTCTGGTCATATAATGTACTTGAAGAAAGTCTCCAGCTCACAGTTTGCTCCATCCACACCAATCCAGAATTTTAATGGGCAAGGACCAGAGTTGTTCCTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTTAAATATAAGCCAGATTGGGAACGAGCCAGGAATTTGGAGGAATCGTTTCTTAATGGCACAACAGGGGTTCTGTGTGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAGAATTGGTTAACTGAGGGAAGAAAGCTGGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGGGTTGTTCTCGGCACTTTTGGATCTGGTAAAAGCACATTATTCAAACGATTCATCGTTAAAAATCCTTCAAGGTCAATCATTTTTGTTTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAGATTAAGGAGGACTTAGGCCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTAAGAGTCAGGGTCTTAACCTTAGAGAGCTTCATTAAAGCGGTTTTCACTTTCAAGGCAGCAAGTGTGGTGCTCGATGAGGTGCAACTGTATCCTCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGTTATGTCTTAGTGGAAACTGTCAGATCTACCTCTCCGGGGATCCATGCCAGAGTGATTACGATTCAGCCAAGGACAGAGCGCTCTTTGATGGCATGAAGGGGGACATTTTCGAAGTGCTTGAAGGAAGAAGCTACAAATTCAATGCAACCAGCAGGAGGTTTCAGTCCCAGATGTTTGTGGGAAGGCTTCCCTGCCGTTTGGATCCAAAAGACATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGTATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGTAACACCGAATACGATGTTGTTCTAGTTTCAAGCTTCGAAGAGAAAAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGAAGTTGAGGTCCTCACTTTTGGAGAGTCAACAGGTTTAACATTTAACAGGGGTATTATTCTCATCTCTCATGAAAGCACCCTCACTGGTGAGAGAAGATGGATTACAGCGCTGTCAAGATTTAGACTGAACATTATCTTTGTTAATTTGGTTGGCAACAGTATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTCCATGACCGGACACTATTCAGGTTCCTCAATCGCACCGCAACAGTTGGGGACATCCTCAAGCAACTCCCTGGCCATCCAGAACTAACGAATGACTTTGGTGACAAGGTTGGGAAGTCGGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTGAAGGCTGAGATCGATCTGCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGATTGAGCTGGCAGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAAACCCACCTGCCCTTGTTTGAGTTGGAATCCATAAGGGCAAATTGGGTACATAAGATAATGAACAGGGAGTACCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCGACCCAGTTCCCCGAGGACCACCCCAGCAAATATAAGGTGACCTTAGCCAATGCAGCCGAGCGCTTTGAAGCAATTTATCCAAGACACAAGGGGAGCGATTCTGTGACCTTCCTAATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTT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| 75,602 |
KY310581.1
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Asian prunus virus 2
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Jo,Y., Lian,S., Chu,H., Choi,H., Cho,J.K., Cho,W.K.
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Seoul National University, Department of Agricultural Biotechnology
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Korea
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2017-07-10
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BC
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Asian prunus virus 2
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Foveavirus
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Betaflexiviridae
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ssRNA(+)
| 9,402 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
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Prunus persica
| null |
2014-05-18
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate BC, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGTCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCTAAGGAAAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATCTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCGCATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATCTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTGGACAACAGTTTCTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTTTTAAAAAGTAGATCAAAGAACCTAAGCATGCTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGTGCAGATAAGTACAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGTTCAAAGCAAATCGATAACCTCTGCTCAAAAAAGAGCCTTAGTGAGTGTGGCACACTGAAAGAATTAGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGGAATTTTTTCTTGCATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTGATGCTCTTTTTGGACTCGGTCAATCCTGATCATCTGGTAGCGACGGTGGTTTTTCCTCCCGAAATACTGGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTAAACCCATGGTGTTATTCATTCCACCGACAAGGCAGTAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCCAAAATCGTATGTCCGAGTGGTCAGATTTACTCTGTGGATCTTGTGTACTCAGCCTTCGCGCACCATGTTGTAAGCATAACAAAAGGGAATTTGCCAGGGCTTGAAAGGCGTTTTTTTTCAAATTTCGAGGCAACTGGGGTGAAACAACTATCTGGCCTCTCCTATTCTGTGAGGGACTGTATTCCAGTTAGCACTGATCTAATATCTAAAATCTACAGATATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAAATAGTCCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATAAAATTCACAGAGGATTTTTCACGACTGGTCATGGAAATTCAGCCTCTAAAGTCCCTCCTCATGCCAGACACTGCTAAATTGATTGGGGCTTTGTTCGCTTCCTTTCTGCCCTTTAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTGGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCGTTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAGGTTATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGCGAGTCAATGAGCACAGAGGAGGTTATGCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGTAACTTGGTGGGGAAGTTCAGATACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCACCACGTTCTTGATGGTTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGTTGATTAGGAAGGTCGCAGGTTCCTTCTGTAATGAGTTTGGCGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCTGTTGCAATCAATGTGTTCCAGAGAAGATCAAACCTAAATCTTGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTTGTATTGTCCGTAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCCTCGCAACTTATTTGGTATTCCACAAATTCTACGGCTTGGTTCCGCTTTTCAAAGCTGAGAGCCAATCAAAAATTCCTGAGATCACCAATTTTCCCTTCCTCCATGAATTGCAAAGATCTTTCGATTAGGAAAAATCTGATGTTTGATTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTAAGAAAGCTTGGGTCTTCGGGAATTTCTTCAGTGGTGCCCCCTGAACCAGCTCTGGGTGGCTTTGAGTTTGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATAATATTGAGGTGGAGTTGAATGCCATGAAAAAAAAATCTGATCCATCAGCACAGGTAGTTCTTGGAATTGAAAGTCCAGCTGTTTGTATGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAACTCTCTCTTCCAAAGCAGCTTACCCTGAGGAACGAAATGGTCTTATCTTTGGATGTGTTCCTGAGCCAAGCTTAGGGAATTTTTCGTTCAGTTCAGCCAATCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATTGTGAATGAAAACATAGTTGATGTTGGGATTCTCCCTCCCACTGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAGGTTACACGAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGTCATAATAAGATCAAATACACTGCCAATAACTGGTTTTCAGGCCTCGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAACGCATGCCTCCTGCAAGTTTACAGGGCTGGCAGTGGAATCGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGTCCTATCAAAACCGTTAATTTGTGTGGAGAGGCAGATTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTAGGAACTATTGCAAGAGGACACCTCTCCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCAGTCCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACATTTCGCCATCATGTAAATAATATCACAGGGCTGCCAATCAAGCACACCTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAAATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGGAGGAGTTTCACCTACGCAGCAAAAAACTTTCACACCTTCCCAGTTCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTATTAGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAGTTTTACTATCCAACCTGAGTCTACGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAAAGAGAATCAATTGCGGCTTTTTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCCTATGAGTTCCTTCCGTCACAAAACCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAACTAACAGATGAGCACTTTGAACCCGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTCGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACCGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATTCTCGACAACTTGGTCGAGGGAGAAGGACTGAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGGGTCAGCTCAGAACATGGGGTGTTCACCCTAAATAGGGACGGTAATCTGCATGCAAACTATGAATTAAAATCAGGTCATATAATGTACTTAAAGAAAGTTCCTAACTCACAGTTTGCTCCCTCAACACCAATCCAAAATTTTAATGGACAGGGGCCTGAGCTATTTTTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTGAAATATAAGCCAGATTGGGAAAGGGCTAGGAATTTGGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTGTGCGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAGAATTGGTTGACTGAAGGAAGAAAGCTTGTGAGGGATGAGCGAAATCTGGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTCAAGCGGTTCATTGTTAAAAATCCTTCAAGGTCAATCGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATTTAGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTAAGAGTCAGGGTCTTAACCTTAGAAAGTTTCATCAAAGCAGTTTTTACTTTCAAAGCAGCAAGTGTGGTGCTTGATGAGGTGCAACTGTATCCTCCCGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGTCTTAGTGGAAATTGTCAGATCTACCTCTCAGGAGATCCTTGCCAAAGCGACTACGATTCAGCCAGGGACAGAGCGCTCTTTGATGGAATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGGAAAAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTTGGTAGGCTTCCCTGTCGTCTGGACTCAAAAGACATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGTAACACCGAATACGATGTTGTTCTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATCATTTGGGCACATCTTGGGAGAGACGTTGAGGTCCTCACTTTTGGAGAGTCAACAGGCTTAACCTTCAACCGGGGCATTATCCTCATTTCTCATGAAAGCACTCTCACTGGTGAAAGGAGATGGATTACTGCGCTGTCAAGGTTTAGACTGAATATCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAGGTTTTCCATGACCGAACATTATTCAAATTCCTCAATCGCACCGCAACAATTGGAGACATTATTAAGCAACTCCCTGGCCACCCAGAACTTACAAATGACTTTGGTGATAAGGTTGGGAGGTCGGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAAACTGAGATTGATCTTCTACAAGATGAGGATCAGGAGATGATTGAGCTGGCTGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCTTGTTTGAGTTAGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATACCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCAACTCAGTTCCCTGAGGACCACCCCAACAAGCATAAGGTGACTTTAGCCAATGCAGCTGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACATAAGGGAAGTGATTCTGTAACCTTCCTGATGGCTGTTAAAAAGA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| 75,893 |
KY310582.1
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Asian prunus virus 2
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Jo,Y., Lian,S., Chu,H., Choi,H., Cho,J.K., Cho,W.K.
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Seoul National University, Department of Agricultural Biotechnology
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Korea
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2017-07-10
|
JH
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Asian prunus virus 2
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Foveavirus
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Betaflexiviridae
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ssRNA(+)
| 9,393 |
GenBank
| null |
South Korea
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South Korea
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Prunus persica
| null |
2014-05-18
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate JH, complete genome
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| 75,894 |
KR998048.1
|
Asian prunus virus 2
|
Pu,L., Bateman,M., Kinard,G.R., Li,R.
|
USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
|
USA
|
2016-06-30
|
APV_2_Q65a
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,393 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null |
2013-05-15
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate APV_2_Q65a, complete genome
|
GATAACCAGAACGATCTATCAGCAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTGAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAAGAGCAGTCCAGGGTGAGCTCAACGTCAGTGGCTAGATTAACCCAAGTTGAGGTCAGCAATCACAAGCTTTTCTCATTTTCATTGAGTGAGAAAGCCAAAGAAAAGCTGATTAAAGTTGGGATATATTTAAGCCCTTTCTCTTTTGAGCCTCATTCTCACCCAGTTTGCAAAACCTTGGAGAATCACATATTATATAATATACTAGCTAACAAGTTAGATAATAGTTTTTATGCAATAGGCATTAAGGGGTCCAAGGTCAACTTTCTCAAGAGTAGATCAAAGAACCTAAGTATGTTAGAGTATGTCAATCGTGTTGTCACCAGTGCCGACAAGTACAGATATGGTAGTGACTTCACCACATTAAGCTCAAAGCAAATTGACAACTTGTGCTCAAAAAAAAGCTTGAGTGAATGCGGAACTTTGAAGGAATTGGTCCCGCTAGTTAAAATGAGCAAAAAGAGGAATTTCTTCCTCCATGATGAACTCCACTATTGGAGTCCACAGGATTTAATGCTTTTCCTGGATTCAGTCAATCCAGACCATCTAGTGGCCACAGTGGTTTATCCTCCTGAAATACTTGCTGGGGCTAAGGAAAGTTTGAACCCATGGTGCTACTCATTCCACAGACACGGTAGTAAACTGACATTCTTCCCAGATGGTGTAAGGAGTGAGTCTTACACTCAACCATTAAGCTCCGGGTACATCCTTAAGGCATCTAAGATCATTTGTCCAAGTGGTCAAATATACTCTGTTGATCTTGTTTACTCAGTCTTTGCGCACCATGTGGTCAGCATTACAAAGGGGAGCCTACCAGGGCTGGAAAGACGGTTCTTCTCAAACTTTGACGCCACTGGAGTGAAGCACCTGTCTGGTCTTTCACACTCCGTGAGAGATTGTATTCCAGTCAATGCTGAACTAATCTCGAAGCTTTATAGGTACATCAGGACCTTGAAGAAACCTGATTTGCAATCCTGCATGGCCAAACTTAGCCAAATTGTTCCCAACCCAACAGGCACTGAAATCAAATTTACAGAGGACTTTTCCAGGTTGGTTATGGACATTCAGCCAATGAAGTCTCTTCTTATGCCTGACACTGCAAAGCTGATTGGAGCCCTGTTTGCCTCTTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAGGCCAGCTCCCTCGACAAGTTCATTCACGATTTGGAGCCGTTCAGTTTTTCAGTAGCCACTGAAGTCATCGACAGCCGCACCATGCCCATATTTGATGCTGTCACTCTTGGTGAATCGATGAGTTCTGAGGAGGTCATTAAGATTTTGAGCAAAATGGAGTTGGGTGCCTCTGTCGGATCAAGCTGTTTGATGGGAAAGTTCATGTATTCAAATGAGGCTTATCATTGCCTCCATCATGTCCTGGATGGTTGCAAACCCGAAGTTTTCAAAAGATTGATACGAAGGATTGCAAGTGCCTTCTGCAATGACTTTGGTGTTTACAGGAAGAGCAGCTACGTCTCATCAGTTGCAATTAATGTGCTTCAAAGAAAGTCAAATCTGAATCTCAACTATATTCTAGGAATTGAACTGAATCAAAAGGTTGTGGATGTGGTCCGAAATTTTTTTTCCTCAAAAAAATCCTCTCTGTTGATTTGGTTTTCAACGAGTCCAATGGCCTGGTTTCGGTTCTCTAAGCTACGTGCCAATCAGAAATTTCTCAGGTCACCAATATATCCCGACTCGATGGGCTGCGAGGATTTCAGCATTAGGAAAAGGCTTGTTACTGATCTTGAATCTTTTGGGTTCAGCAAGGGCTTAAGGAGGCTTGGGTCATCTGACTCTCTTCCCACAAAATCATCAAAGCCTGACTTTAGTGAATTCAAATTTGAGCCTGTTAATGATGGGGTTAGTCAAGGTGGGGTCGATGCGAACCCAGCAAACGGAGTGGAAGAAGCTGGGTTCCCAGAACAAGTAATGCTTGAAATTGAGCCCTCGACTGTGGTTCCAAATAGTGGGAAATCCCAAGGTTTGGCTCCTCCCCATGATGCATCCAGCGCAGTGAGTCAGCCTGGTCTCCTGTTTGGGTGTATCCCTGAGCCAAATTTGGGAGGATTCTCATTTAGCTCAGCTAATCAAGGGGATCGACTCTTTGCAAATGTAGTGAACGAGAACATCATTGATATTGGAGTCCTCCCTCCCACTGAATTGAAGATCCCATTGGATGCAAGAGCCACGCACGTTAATGGTCGGGACTGCTTCTTCTTCACGAGGTGCCCTTGCATAGATTATGGCCACAACAAAATCAGGTACATCCCGAATAATTGGTTTTCTGGGCTTGATCAGTTCCTATCCAATGAGGGAACATATTACAATGCATGCCTTCTACAGATATATAGCGCTGGGAGTGGGATCGGTTTCCATTCGGATAATGAGAAGGTCTATCATAGAAGTCCAATTAAAACAGTGAATTTGTGCGGAGAAGCTGACTTCTTGGTCAAAGCAAAGGGTAGAAGGGACCTGGGAACCATAGTGACAGGACATCTTTCCCCAGGCCATTACTTTACAATGGACTCGAGTTTTCAGTCCTACTACCAGCATTCTGTCCAAAACTGCAGTGAAGGCAGGGTTTCCCTAACATTTCGCCATCATGTGAATAATATTTCAGGGCTCCCCATTAAGCACACCTGTGGAGAGTTTGGTGACACCGAAGTCCTTTTCGATGTTTTGATAAGGAGGAGTTTTACCTATGCTGCAAAAAATTTTCACACCTTTCCGGTCCCTGGGGATGGGAGTTGCTTTTGGCACAGCATGGGAGCTTTGTTGGGAGTTGATGGCGAGGAACTCAAAAGAATATCTGCTAGGGAGATCCAAAAGAGTGACTCTCTGTCCACAAACTTAAGTTTGCGTCAACAGATGGTCAACAAGCAATATGCGGAGAGGGAATCAATTGCTGCGTTTTGCAGAATCCAATCAATCCACCTTGTTGTCCTACTTCCAGGTAACAACTTTTCTTATGAGTTTTTACCTTCACAGAATTCTGAGGTGACGCAGCTGTTTGTCAAGTTGACTGAGGAGCATTTCGAGCCTGCCTTGCCAATCAACGGGTGCGTTGTTAAGTCGATTGCGGAAACCCTTAATCAAACTGAAGCGAAGATCTTGTCCGTAATCGGTAGACCAACAAACAGGATGATTCTTGATAACTTGATCGAGGGGGAGGGCCTGAATCTTGAGGATTTGGAAGCGGCTTTCACCATTTTTGGAATATGTGCCAGAGTGAGCTCAGAAAGCGGGGTCTTTACCCTAAACAAGGATGGCAATCTACATGCCAACTATGAGCTGAAGGCCGGCCACATCATGTACCTTAAAAAAACGTCCAGCTCACAATTTGCCCCCTCTACTCCAATTCAAAACTTCAATGGGCAGGGGCCGGAGTTGTTTTTGAAGGGAATAGTTAGTGAGGTCAGACACAAACCGGACTGGGAGAGGGCAAGAAATCTGGAAGAGTCTCTCCTCAATGGCACCACAGGGGTGTTGTGTGACCGCACGGTTAATCTCCAGAAGAATTGGTTGACAGAGGATAGGAAACTGGTTAAAGATGAACGCAACCTAGGTGTGGTTCTTGGCACCTTCGGGTCTGGAAAAAGCACATTGTTCAAAAGATTTATCGTTAAAAACCCCTCGAGGTCCATAGTTTTCGTCTCACCAAGGAGATCACTGGCTGATCAAATTAAAGATGATTTGGGTCTAAACACAAAAAGGGGAAGATCTCTCAGGGTTAGAGTATTAACACTTGAGAGCTTCATCAAGGCCGTTTTCAATTTTAAGGCAGCAAGTATAGTGCTTGATGAAGTTCAATTGTATCCCCCTGGATATCTTGACCTTGTGATGCTCTGCCTCAACGGAAATTGCCAAATATATCTCTCTGGAGACCCATGCCAGAGCGACTACGACTCAGCGAAGGATAGGACTCTTTTTGATGGGATCAAAGGGGACATCTTCGAAGTACTTGAGGGCAAGAGCTATAAATTCAATGCAGCAAGTAGAAGATTCCAGTCTCAAATGTTTGTTGGCAGACTCCCTTGCCGCATGGACTCCAAGAACATGATTGAAGATGAGGATTTCCACTGGCTTCAAAGCATTGAGTCCGCAGCTGAGGTCAGCAATACAGAATATGATGTTGTTCTTGTTTCAAGCTTTGAAGAGAAGAAAATTATCTGGGCGCACCTTGGGAGGGAGGTTGAAGTCTTGACTTTTGGGGAGTCAACTGGTTTGACATTCAATAGGGGCATGATCCTCATTTCCCATGAGAGCACTCTAACCAGTGAACGAAGGTGGATTACTGCCCTATCAAGGTTCAGACTGAATATAATCTTCGTGAATTTAGTGGGGAACAACGTCGAGGATGTGTGTCAAGTCTTCCATGACAGAACCTTGTTTAGATTCCTAAGCCGCACGGCCACAATTGGGGACATTTTAAATCAACTTCCTGGCCATCCTGAACTGACAAATGACTTTGGTGACAAAGTGGGCAAGTCAGAGGGGGTAATGGAAGAAAAACTTGTAGGGGACCCATGGTTGAAGGCGGAGATTGACCTTCTGCAAGATGAGGACCAAGAGATGATTGAGCTTGCTGAGGAGGTCAAAGACGAGCCTTGGTTCAAAACACACCTCCCTCTGTTTGAGTTGGAGTCCATAAGGGCAAGTTGGGTCCACAGAATAATGAACAGGGAGTATCGTGAAGTCCGGTGCGGTACTGAAGTTTCGACTCAATTTCCTGAAGATCACCCGAGCAACCATAAAATCACCTTAGCAAATGCAGCTGAACGTTTTGAGGCAATCTACCCAAGGCATAGGGGTAGTGATTCGGTCACTTTTCTGATGGCAGTTAAGAAACG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| 81,486 |
KR998049.1
|
Asian prunus virus 2
|
Pu,L., Bateman,M., Kinard,G.R., Li,R.
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USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
|
USA
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2016-06-30
|
APV_2_Q86
|
Asian prunus virus 2
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Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,400 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null |
2013-05-15
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate APV_2_Q86, complete genome
|
GATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCAGCTCGAAACAGACCCAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCGGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAATCATAAGCTTTTCTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCAAAGGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTCTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGACAATAGTTTTTACGCAATAGGTATCAAGGGTTCCAAGGTCAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAACCTAAGTATGTTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACTAGCGCAGATAAGTACAGATATGGTAGTGACTTTACCACACTCAGCTCAAAGCAGATCGACAACCTCTGTTCAAAGAAAAGCCTTAGCGAGTGTGGCACACTGAAAGAGCTGGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGGAATTTCTTTATACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTAATGCTCTTTTTGGACTCAGTTAATCCCGACCACCTAGTAGCAACGGTGGTCTTTCCTCCCGAAATATTAGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTTAACCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAGGGCAGTAAATTAACATTTTTTCCAGACGGGGTCCAAAGTGAATCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATTTTGAAGGCATCCAAGATTGTGTGTCCGAGTGGTCAAATATACTCTGTTGATCTTGTGTACTCAGCCTTTGCGCACCACGTCGTGAGCCTAACGAAAGGGAATCTACCAGGGCTTGAAAGGCGGTTCTTTTCAAATTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACACCTATCCGGCCTCTCCTACTCTGTGAGGGATTGTATTCCTGTAAGCACTGATCTAATATCTAAGATTTACAGGTACATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTGCAGTCCTGCATGGCGAAGCTCAGCCAAATAGTTCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATTAAGTTCACAGAGGATTTTTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTCTGAAGTCCCTTCTTATGCCAGACACTGCTAAACTAATTGGGGCTTTGTTCGCTTCCTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGACTTGGAACCATTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTTATTGACTGTAATACAATGCCGGCCTTTGAAGCAGTTTCTTTGGGTGAGTCAATAAGTCCAGAGGAGGTTATTCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCACTGGGCCATATGACTTGGTGGGGAAGTTCAAGTACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCACCATGTTCTTGATGGCTGCAGGCCTGAGGTTTTTAAGAGGTTGATTAGAAGGGTAGCAAGTTCATTCTGTAATGAATTTGGGGTCTACAGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTTTTCCAGAGAAGGTCAAACCTGAATCTCGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTGGTATTGTCCGCAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCCTCTCAGCTCATCTGGTATTCCACAAATTCCATGGCTTGGTTCAGGTTTTCAAAGTTGAGAGCTAATCAAAAATTCCTAAGATCACCATTTTTTCCTGCCTCTATGGATTGCAAAGACCTTTCAATTAGGAAAAAACTGATGTTTGACTTTGAGGTCTTTGGTTTCTGTGCCGGTTTAAGAAAGCTTGGGCCTTCAGGAGTTTTTTCAGTGGCGCCCCCTAAACCTGTTGTCGGTGGCTTTGAGTTCGTGCCTCCTGGGGAGGAGACCCACGAGGATGATATTGAGGTGGAGTTGAGCACCATGGCTAAAATGTCAGATCCATCAACACAGGTAGTTTTTGGAATTGAAGGTCCAGCTGTTCCTGTGCATGAGATTGCCCCACAAGACCAAACTTTCTCTCCCAAAGCAGCTAACCTTGAGGAACGAACTGGTCTTATTTTTGGATGTGTCCCTGAAACAAACTTAGAGAATTTTTCATTCAGTTCAGCCAATCAGGGTGATCGCCTCTTTGCCAACATTGTAAATGAGAACATAATAGATGTTGGAATCCTTCCTCCCACCGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAAGTCACACAAATCAATGGTCGGGACTGCTTCTTCTTTACAAGGTGTTCATGTATTGACTATGGCCACAACAAGATCAAATACACTGCTAATAACTGGTTTTCAGGCCTTGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCATGCCTCCTGCAGGTTTACAAGGCTGGTAGTGGAATTGGTTTCCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGTCCTATCAAAACTGTTAATCTGTGTGGAGAGGCTGACTTCCTCGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTGGGTACTGTTGCAAGAGGACATCTCTTCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAATTTTCAGTCCTACTATCAACATTCAGTCCAAGATTGCAGTGAGGGGAGGGTTTCCTTAACTTTCCGCCATCATGTGAATAATGTCACAGGGTTGCCAATCAAGCACACTTGTGGAGAGTTTGGTGACACTGAAATTCTGTTTGATGTGCTCATCAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCACACCTTCCCAGTTCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGCATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTGAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATTCAAAAGAACGAAATTTTACTATCCAATCTAAGCCTACGTCAGCAGATGGCCAACAAACAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTCCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTCCCGTCACAAAATCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAGCTAACAGGTGAACACTTTGAGCCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCCGAAACCCTGAATCAAACTGAAGCAAAGATCTTGTCAGTAATCGGGAGACCTACAAATAGGATGATTCTCGACAACTTGGTCGAGGGAGAGGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAGGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGGGTCAGCTCAGAACATGGGGTTTTCACCCTAAATAGGGATGGCAATCTGCATGCAAACTATGAATTGAAGTCTGGCCACATAATGTATTTGAGAAAAGTTCCTAGCTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATTCAAAATTTTTATGGACAAGGGCCTGAGTTGTTTCTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTGAGATACAAGCCAGATTGGGAAAGGGCCAGGAACTTGGAGGAATCATTCCTTAATGGCACGACAGGGGTTTTATGTGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAAAATTGGTTGACTGAAGGAAGAAGGCTGGTGAGGGATGAGCGGAATCTGGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTCAAGCGGTTCATCGTGAAAAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATCTGGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTGAGAGTCAGGGTTTTAACCTTAGAGAGCTTCATCAAAGCGGTTTTCACTTTCAAGGCAGCAAGTGTTGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTACCCCCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGTCTTAGTGGAAATTGTCAGATCTACCTCTCAGGAGATCCGTGCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAGGACAGGGCACTCTTTGATGGGATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAGAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTAGATTCAAAGGACATGGTTGGGGATGAGGACTTTCACTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGTAACACTGAATATGACGTTGTTTTGGTCTCAAGCTTTGAAGAAAAGAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAAGTCCTCACTTTTGGGGAATCAACAGGCTTGACCTTCAACCGGGGCATAATTCTCATTTCTCACGAAAGTACCCTCACTAGTGAAAGGAGATGGATTACAGCGCTGTCAAGGTTTAGACTGAATGTCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTTCATGACCGAACACTGTTCAAATTCCTCAACCGCACCGCAACAATTGGAGACATTGTCAAACAACTCCCTGGCCACCCAGAGCTGACAAATGACTTTGGTGATAAGGTTGGGAGGTCGGAAGGGGTTATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGGCCGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGATTGAGTTGGCTGAGGAGGTTAGAAATGAGCCATGGTTCAAGACCCACCTCCCCTTGTTTGAGTTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAGTATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCGACTCAGTTCCCTGAGGATCATCCCAACAAATATAAGGTGACTCTAGCCAATGCAGCCGAGCGCTTCGAAGCAATTTACCCAAGACATAGGGGAAGCGATTCTGTAACCTTCCTAATGGCTGTTAAAAAAAG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| 81,487 |
KT893294.1
|
Asian prunus virus 2
|
Marais,A., Faure,C., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2015-12-26
|
Bungo Q-1256-01
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,362 |
GenBank
| 1 |
Japan
|
Japan
|
Prunus mume
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 2 isolate Bungo Q-1256-01, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACATCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTCTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGATAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCTAAGGTTAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAACCTAAGCATGTTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGCGCAGATAAGTATAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGTTCAAAAAAAAGCCTTAGTGAGTGTGGCACATTAAAGGAACTGGTTCCACTGGTCAAAATGAGCAAGAAGAGGAATTTTTTCTTACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACCTGATGCTATTTTTGGACTCAGTCAATCCTGATCACTTGGTAGCAACGGTGGTCTTTCCTCCCGAGATATTAGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTGAATCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAGGGCAGCAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCCTGAAGGCATCAAAAATTGTGTGTCCAAGTGGTCAGATCTACTCTGTGGATCTTGTGTATTCAGCCTTTGCACACCATGTTGTAAGCATAACAAAGGGAAATTTACCAGGGCTTGAAAGGAGGTTTTTTTCGAACTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCCACTCTGTGAGGGACTGCATTCCAGTCAGCACTGATCTAATATCTAAGATCTACAGATATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACTTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAGATAGTCCCTAATCCAACTGGTGTTGAAATTAAATTCACAGAGGATTTCTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTTTAAAGTCCCTTCTTATGCCTGACACTGCGAAATTAATTGGGGCTTTGTTTGCTTCCTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTCTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCATTTAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTCATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAGGAAGTTATCCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGTAACCTGGTGGGAAAGTTCAAATACTCAAATGAGGCCTATCATTGTCTTCACCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGTTGATTAGAAGAGTGGCAGGTTCCTTCTGTAATGAATTCGGCGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTGTTCCAAAGGAGGTCAAACCTAAATCTTGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTAAATCAAAAGGTTGTTTGCATTGTCCGCAATTTCTTTTCCTCAAAGAAATCTTCTCAGCTTATCTGGTATTCCACAAATTCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCGAAGCTGAGAGCCAATCAAAAGTTTCTGAGATCACCAATTTTTCCTGCCTCCATGAACTGCAAAGACCTTTCAACTAGGAAAAATCTAATACTTGACTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTAAGAAAGCTTGGGTCTTCGGGAGTTTCTTCAGTGGTGCCTCCCAAACCTGTTCTTGGTGGCTTTGAGTTTGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATGATATTGAGGTGAAGTCGAATACCATGGCAAAGATGTTTGATCCATCACCACAGGCAGTTCTTGGAATTGAAGGTCCAGCTGCTGGTGTGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAACTCTCTCTCCCAAAGCTGCTGACCTTGAGGAACGAAATGGTCTTATTTTTGGATGTGTTCCTGAACCAAGCTTGATGAATTTTTCATTCAGTTCAGCCAACCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATCGTGAATGAAAACATAGTAGATGTTGGAATTCTCCCTCCCACCGAACTGAAAATCCCATTGGATGCCAAGGTCACACAAATCAATGGTCGAGATTGCTACTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGCCACAATAAGATCAAGTACACTGCTAATAACTGGTTTTCAGGCCTAGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCGTGCCTTCTGCAAGTTTACAGGGCTGGCAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCATAGAAGTCCTATCAAAACTGTCAATCTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTAGGGACTGTTGCAAGAGGACATCTCTTTCCAGGACACTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCGGTCCAAGATTGCAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACTTTCCGCCATCATGTAAACAATGTCACAGGACTGCCAATCAAACATACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCATACCTTCCCAGTCCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTCTGCTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAATTTTACTATCCAACCTGAGCCTACGTCAGCAGATGGCAAATAAGCAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTTCCGTCACAAAATCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAGCTAACGGATGAACACTTCGAGCCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTTAATCAAACCGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATTCTCGACAATTTAGTCGAGGGAGAAGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAGGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGAGTTAGCTCAGAAAATGGTGTTTTTACCCTAAATAGGGATGGCAATCTGCATGCAAACTATGAGTTGAAATCTGGTCATATAATGTACTTGAGGAAAGTCCCTAACTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATCCAAAACTTTAATGGACAAGGGCCTGACCTGTTTGGGAAGGGGGCTAGAAATTTAGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTGTGTGACCGCACTGTCAATCTCCAGAAGAATTGGTTGACTGAGGGAAGAAGGTTAGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTTAAGCGGTTCATCGTAAAAAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATTTAGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCTTGAGAGTCAGAGTTTTAACCTTGGAGAGCTTCATCAAAGCAGTCTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTAGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTATCCCCCTGGGTACCTTGACTTGGTGATGCTATGTCTCAGTGGAAATTGTCAAATCTACCTCTCAGGAGATCCGTGCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAAGACAGAGCGCTCTTTGATGGGATGAAGGGGGATATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAAAGCTATAAATTCAATGCATCCAGTAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGATATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGCAACACTGAATACGACGTTGTTCTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTCCTAACTTTTGGAGAATCAACAGGCTTGACCTTCAACCGGGGCATTATCCTCATTTCTCACGAAAGTACCCTCACTGGTGAAAGAAGATGGATTACTGCGCTGTCAAGGTTTAGACTAAACATTATCTTTGTCAACTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTTCATGATCGAACATTGTTCAAATTTCTCAATCGCACCGCAACAATTGGAGACATTATTAAGCAACTTCCTGGCAACCCAGAATTGACAAATGACTTTGGTGATAAAGTTGGGAAGTCGGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGACTGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGGTCGAGCTGGCAGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCCTATTTGAGTTGGAATCAATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCAACCCAGTTCCCTGAGGACCACCCCAATAAGTATAAGGTGACCCTAGCCAATGCAGCCGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACACAAGGGAAGTGATTCTGTAACCTTTCTAATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCAAGACCATCAGTTGAGTCAGCCAAGT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| 84,422 |
KT893295.1
|
Asian prunus virus 2
|
Marais,A., Faure,C., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2015-12-26
|
Bonsai
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,375 |
GenBank
| 1 |
Japan
|
Japan
|
Prunus mume
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 2 isolate Bonsai, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCAGCTCGAAATAGACCCAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTTTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGACAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAATCTAAGCATGTTGGAGTATGTTAACCGTGTTGTCACTAGTGCAGATAAGTACAGATACGGTAGTGACTTTACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAAAGCCTGAGTGAGTGTGGTACATTAAAAGAACTGGTGCCTCTGGTGAAAATGAGCAAAAAAAGAAACTTCTTTTTACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTAATGCTCTTTTTGGATTCAGTCAATCCTGATCATTTGGTCGCAACTGTGGTCTTTCCCCCCGAAATACTAGCTGGAGCTAAGGAGAGTCTTAATCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAAGGCAGCAAATTGACATTTTTCCCAGACGGGGTTCAAAGCGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCAAAAATTGTGTGTCCGAGTGGTCAAATATACTCTGTGGATCTTGTGTACTCGGTCTTTGCGCACCATGTTGTAAGCATAACAAAGGGAAATCTACCAGGGCTTGAAAGGCGGTTCTTTTCAAACTTTGAGGCAACCGGGGTGAGACACCTATCTGGCCTCTCCTATTCCGTGAGGGACTGCATTCCAGTTAGCACTGATTTAATATCCAAGATCTACAGGTATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTACAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAAATAGTTCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATCAAATTCACAGAGGATTTTTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTCTGAAGTCCCTTCTCATGCCAGACACCGCTAAACTAATTGGGGCTCTGTTTGCTTCCTTTTTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTCTTTGATTGCTACAAGTCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCACGACTTGGAACCATTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTTATTGACTGCAATACCATGCCCGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAGGAGGTCATCCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGCAACTTGGTAGGAAAGTTTAAATACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCACCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTCTTCAAGAGGTTGGTTAGAAGAGTGGCAAGTTCCTTCTGTAATGAATTTGGTGTTTACCGAAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTTTTCCAGAGGAGATCAAACCTAAATCTCGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTTGTATTGTCCGCAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCTTCTCAGCTCATTTGGTATTCCATAAATTCTATGGCTTGGTTCCGCTTTTCAAAGTTGAGAGCTAATCAAAAATTTCTAAGATCACCAATTTTTCCTGCCTCCATGAACTGCAAAGACCTTTCAATTAGGAAAAATTTGATGCTTAACTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCGGGCTTGAGAAAGCTTGGGTCTTCAGGAATTTCTTCAGTGGTGCCCCCTAAGCCTGTCCTTGGTGGCTTTGAGTTCGTACCTCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATGATATTGAGGTAGAGTTAGATGTTGTGGCAAAAATGTCTGATTCAGCGCCACAGGTGGTTCTTGGAATTGAAGGCCCAGCTATTTTAATGCAGGAGACTGACCCACAAGATCAAACTTTCTCTCCTAAAGCTACTAACCTTGAGGAACGAACTGGTCTTATTTTTGGATGCATTCCTGAACCAAGCTTAGGGAATTTTTCATTCAGTTCAGCTAATCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATTGTAAACGAAAACATAATAGATGTTGGAATTCTTCCTCCCACCGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAGGTTACACAAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATTGACTATGGTCACAATAAGATCAAATACACTGCTAATAATTGGTTTTCAGGCCTTGATCAATTTCTATCCAATGAGGGGACATACTACAATGCATGCCTCCTGCAGGTTTACAGGGCTGGTAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAATGAAAAGGTCTACCATAGAAGTCCTATCAAAACTGTTAATTTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTGGGGACCGTTGCAAGAGGACATCTCTTCCCAGGACATTACTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCGGTCCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACTTTTCGCCATCATGTCAATAACGTCACAGGGTTGCCAATCAAACACACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCGGCAAAAAACTTTCACACCTTTCCGGTTCCTGGGGATGGTAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCAGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAGTTCTGCTGTCCAATCTGAGCCTACGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCCTTTTGCAGGATTCAATCAATCCATTTGGTTGTCCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTACGAGTTTCTTCCGTCACAAAACCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAACTAACGGATGAGCACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACTGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCTACAAATAGAATGATTCTCGACAACTTGGTCGAGGGAGAGGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTCACAATCTTTGGAATATGCGCTAGAGTCAGCTCAGAACATGGGGTCTTTACCCTAAATAGGGATGGTAATCTGCATGCGAACTATGAACTGAAATCTGGTCATATAATGTACTTAAGAAAAGTCCCTAGCTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATCCAAAATTTTAATGGACAGGGGCCTGAGCTGTTCCTGAAGGGAATTGTCAGTGAGGTAAAATATAAGCCAGATTGGGAAAGGGCCAGGAATTTAGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTATGTGACCGCACCGTCAATCTCCAAAAAATTAGGTTGACTGAGGAAAGAAGGCTGGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACTTTATTCAAGCGGTTTATCGTGAAAAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTTTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGACCAGATTAAGGAGGATTTGGGCCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTGAGAGTCAGGGTCTTAACTTTGGAGAGCTTCATCAAAGCCGTTTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTGGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTACCCCCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGCCTTAGTGGAAACTGTCAGATTTACCTCTCAGGAGATCCGTGCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAGGACAGAGCACTCTTTGATGGGATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAAAGCTACAAATTTAACGCAGCCAGCAGGAGGTTCCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGACATGGTTGGGGACGAGGACTTTCACTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTCAGCAACACCGAATACGACGTTGTTTTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAGAAGATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTTCTTACTTTTGGAGAATCAACAGGCTTGACATTCAACCGGGGCATCATTCTCATATCTCACGAAAGCACGCTCACTGGTGAAAGGAGATGGATCACAGCACTATCAAGGTTTAGACTAAATATCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAATAATATTGAGGATGTGTGCCAAGTTTTCCATGACCGAACACTATTCAAATTTCTCAACCGCACCGCAACAGTTGGAGACATTGTCAAACAGCTCCCTGGCCACCCAGAGCTAACAAATGATTTTGGTGATAAGGTTGGGAAGTCTGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGGCCGAGATCGACCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAAATGGTTGAGTTGGCTGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCCTGTTTGAGCTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAGAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAATGTCGACCCAGTTTCCTGAGGACCATCCCAGCAAGTATAAAGTGACTCTAGCCAATGCGGCCGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACATAGGGGAAGCGATTCTGTAACCTTCCTAATGGCTGTCAAAAAAA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| 84,423 |
NC_025821.1
|
Asparagus virus 1
|
Blockus,S., Lesker,T., Maiss,E.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-12-09
|
DSMZ PV-0954
|
Asparagus virus 1
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Potyvirus
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Potyviridae
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ssRNA(+)
| 9,741 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
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Asparagus virus 1 isolate DSMZ PV-0954, complete genome
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AAATTATCAAAACTCAACACAACACAACACAACACAGCACAACACAACTCAACTCAACAACTGAATTCTTAGACTACCATATCTGAATTCAAAACAACCGATCACACAAACCAAACACGCTTTATAATTTGTAATCGACATGGACTGCATACAGATTGGAAGCATGATCATTTCCATCCCAACCGCGCAGGCATCCACATTAGCCTGCACCGCTGTCAAACCCACATCCACCAAGCCGACACAAGCCGATCTTAAAATGGTTGGCTTTCATCCAAAGGAACCAACTCGCGTAGCATCTGTTACGCCAGTACTAGTGAAGAAAGCCTTATTCAAAAAGGCTGAAGTGGAGAAGAGCGCCCTCGACAAGTGGGCAGAAGCCTATGAAAATGCCAATCATAGGAAGGATGACAAGATAGTCACTACCAGGCGTGGAGTGACAAGGTTTGTTCGCAAGAACCGAAAGGACTTGCGCCGCGAGAGAGATGAGCTGGCTGCAACAGCTCGTGAAAAGTTGGCACAGGAAATTCGCCACCTCAAAATTAGGCGAAACGAAAACCAATTGAAAAATAGTCACGTAAGTATTATTTCAAAAATTTCAATTGGTGGAGCTCCCAGATCTGCATCTGAGGAGGAGATCACACCAGTACAGAAGTGGGGTCTCAACAAAACAGCAAGTTCCAAAACTTGCAAGAAACAAACCCATTTGACTGTTTCAAATGGGGAATTCAAGAAACTGCTCCGCTCATTAGCCCAAATAATGCGCGAAAAAGCATCCACAATAGAAATTGTGGAAAAGACAACGCTACGAGCACGTAGCAAAGAGTTTAAGGGACGTCAAAGAATGTTTGTTGACGTACTACATCAAACTGGCATATATCGGTCATTTGATGTAAAGATGGGCTCCTGGACTGAGAGTGTATTTGGATACATGTTTAAGTATTTTGAGAAAGGGCCCATAATACATCACACAAAAATTCAGCCAGGTTGTAGTGGACTCGTCGTACGGAGAAGTTCATTGAAGGACTGCATTTCAGGAAATCACACGGAATTTTTCATTGTGCGTGGTCGAATCAGAAACATTCTCTGCGACGCACGTGCATTTATACCATATGAGTCACTATTTGATGTGCATCACTACTCAAGTCTTGGAGAAAAATTTTGGAAAGGTTTCACCAACGTCTTTCTAGAATTGAAACCAACACAGATTAGCCATGACTGCACATCAGACCTTGATGTTGTTAGATGTGGGGAGGTCTCCGCACTGGTTTGTCAAACAGTGTTTCCTTGTGGAAAAATAACTTGTAACAAATGCGTGGAAAGTTACACGCTCTTGGATGAGGAAAGCAAGAAGGCACAAATTCAACAGTCTTTGGAGCGAATCGAGAAAGACTTGACTCACAAGTACACTGATTTCCCTCACGTTCACGAGATTCTGAAGGTGTTTGGAAATTCCTTGTTAATTCCTAACAAGAATTACAAGGCATTTGCTGACATTAAACACATGATCGGGGATCGAACTGAAGCACCTTTTAGTCATGTCAATAAATTGAACGAAATTATAATAAAAGGTAGCATGTCAACAACTGCTGACTATTTTGATGCTTCCAACACTTTGTTGGAGGTAGCAAGATATCTCAAGAATCGGACAGAGAACATACAGAAAGGCTCACTTGCAGCTTTTAGAAATAGAGCTTCTGCGAAAGCACATATCAACACAATCTTGCTGTGTGATAACCAACTTGACAAGAATGGAAATTTCGTTTGGGGAAAAAGAGGCTATCATGCAAAGAGATTCTTTAAGAATTACTTTGAACTTGTTGATCCATCAAATGGATATGCAAAACACATCGTCAGAAATGGACCAAATGGAGAAAGACAACTAGCAATTGGTCATTTGGTTATGTCGACGAATTTCCAAACCTTGAGGCTGCAACTCGAGGGAAACCAAGTTGAAAAATTCCCAGTAACCAAAGCTTGCATCAGTAAACGAAATGAAAATTTCATATATCCATGCTGCTGCGTCACAACCGAAACTGGAGAACCATTGGAGTCACCATTATACACTCCAACAAAAGGTCATCTTGTAATTGGCAACACTGGTGATGCTAAGTATATAGACTTACCTGAGCAGGAGAATGAACGATTGTACATATCACAAGAAGGGTATTGTTATGTAAATGTATTCTTAGCAATGTTGGTGAACGTCAACGAGGATGATGCCAAGAATTTCACAAAGATTGTACGTGACGATGTGGTCAGGAAGCTTGGGAAGTGGCCGACACTGATAGATTTAGCAACTGCTTGCTATTATCTCACAATGTTTTTCCCAGAAACACGAAATGCAGAATTACCTAGAATTCTGGTTGATCATAAACACAACACGATGCATGTCATTGATGCATATGGTTCAAAGAACACAGGATATCACATTTTGAAGGCAGGAACTATTGCACAATTGATCTTATTCGCTAGTGAGTCACTTGATTCTGAGATCAAGGAATATCGCGTTGGAGGCTTGATAGAGGACACAGCTGTTGTACAAACGGGTATCAAAACATTGATTCGATCTATTTACAGACCCAAAATGTTCAAAGAACTCTTGTTGACAGAACCATATTTGATAACTCTGAGTGTTTTATCACCAGGAGTTCTTTTGGCAATGTACAACAATGGATCTTTTGAACAAGCCACTCAAAAATTCATAACACACAATGATTCACTTGCAACCATTTCCACTACTCTGGCATTACTCGCAACGAAAGTCTCTCTCGCACAAACCCTCAATGAGCAATGTAACATAATTGATGCACATGCACAATTATTGTTGCAAGCGATTGGTGAGGGACAAAGTGAGATTAGTCACACAAAACGACTGGCAAAAGAAGCTCTTCAAGTGATGATTGCACAAAATGAGAATGACTCTTCACTCTTGGATGGAGGTTACTTTGTTTTACGCGAATCTTCTAAGGGTTTTACTGAGAAAAAATATCTGCGCCTTTTGGAGGAATCATGGGAAGATCTAAACTTGTTGGAAAAATATTATGCAGTAAGAGCATCATATTCTTGGCGACGCGTTATTCAGCGACCTTTAAACCCCACAAAAGGTGCAGATTTGAAAGGCAGATACGATATATCCATCAATGCATTACTCAAGAAAGCATCTGAAGCCATGAACGTAATTGTCAGGAAGAATTTGGCAAAAGGTGAACTTGTATATAAAAATGTGACAAGGAAAGGTTTAGAGTTATCTTATTCTGCATGTAGATATTTAATACCAGATTTCATGCGTGCTGTTAGTGTTTTAACTGTTTTAAGTTTGTTTGTTTCTTTAATAGCAGCTTTAAATAACATGTTGGTTGCTCATAAACATCTTAAAATGAAAAATTTCGAATTTGAACAACAAATGACTGATAGGACTTTATATAAGTTGTACAAAAGCTTGAAGCGAAACATGAAAGGTAACCCTAGCCTGGAAGAATTCAGAGATTTTGTGGGAGAGAGAAACCCTGAACTGGTTAAGAAAATTGATCCGGATGAGTTTGATCTTGAAGGGGTACAACATCAGCACAAGAGTAAGTCACAAGATACTCTTCAGAAAATCGTCGCTTTTGTAGCATTAATAATGATGACATTTGACGCTGACCGAAGCGATTGTGTGTACAAAATTTTAAACAAGCTGAAGGGGATAATTGGAACAATCGAGTATGAAGTGCAACATCAGGCGATTGATGACATCAAACTTGGTTTGGAGGAGGAGAATACAAAGATTGATTTTGAAGTGTCAACAGATCCACAGCTAGACAAGACATTCAGCGAACCAACTTTTTCTGACTGGTGGAGCAATCAACTAACAAATAATAACGTGATTCCACACTACCGAACTGAAGGATTTTTTATGGAATTCACTCGACAATCCGCCATTGAAGTTTCAAATCAGATTGCACATGGCCCACACATGGATATTTTATTACGAGGTGCAGTAGGATCTGGTAAGTCAACAGGATTACCATATCATCTTTCAAAACGTGGTCAAGTACTGCTACTTGAACCAACAAGACCATTGGCAGAAAACGTCTGTACACAATTGCGCGGAGACCCTTTTCACACAAATCCAACATTGCGTATGCGTGGCATGACTTCGTTTGGATCAGCACCAATCACAGTCATGACAAGCGGTTATGCTCTACATTATTTAGCCAACAACCCACATCTTTTGCGCGACTATAACTACATCATATTCGATGAATGTCATGTTAGTGATAGTTCAGCAATGGCTTTTAGGTGTTTGCTACATGAATATAGTTTCAACGGGAAGATAATCAAAGTTTCAGCAACACCACAAGGTAGAGAGGTTGAATTCAAGACACAATTTCCAGTAACTCTTATTACCGAGGAGCATCTCTCTTTCAGTCAGTTTTGTGAAGCCCAGAGAACGAACGCAAAGTGCGATGTTGCGACAAGTGGAGAGAATATCTTGGTCTATGTTGCGAGTTATAACGAAGTGGATCAACTCAGTAGGATGCTTGTCGAAAGGAAGTTTAAGGTGACAAAGGTGGACGGTCGAACAATGAAAGTTGGAAAAGTTGCCATTGAAACACACGGAAGTGTCGGAGCACCTCATTTTATTGTGGCGACCAACATCATTGAGAATGGAGTAACTTTGGATGTGGACACAGTTGTTGATTTTGGGCAGAAAATTTCACCTACACTGGACGTCGACAATCGTTGTATACACTATTCGAAACAATGTGTCACATACGGAGAGCGAATTCAGAGACTTGGAAGAGTTGGACGTCATAAGCAAGGAAAAGCTTTGAGAATAGGTTTCACTGAGAAAGGACAGGTAGCAATACCTGACATTGTAGCCACAGAAGCAGCTTTTCTCTGCTTCACATATGGGTTGCCTGTCATGACACACAATGTTTCAGTTAGTTTACTGTCTAAATGCACGGTTAAACAAGCAAGAACAATGCATTTATTCGAACTACCTGCATTTTATA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| 6,274 |
OP150412.1
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Asparagus virus 1
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2022-11-21
|
DSMZ PV-0954
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Asparagus virus 1
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Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741 |
GenBank
| null |
Germany: Rastatt
|
Germany
|
Asparagus officinalis
| null | null | null | null |
Asparagus virus 1 isolate DSMZ PV-0954, complete genome
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| 22,116 |
MW848534.1
|
Asparagus virus 1
|
Gaafar,Y.Z.A., Westenberg,M., Botermans,M., Laszlo,K., De Jonghe,K., Foucart,Y., Ferretti,L., Kutnjak,D., Pecman,A., Mehle,N., Kreuze,J., Muller,G., Vakirlis,N., Beris,D., Varveri,C., Ziebell,H.
|
Julius Kuehn Institute, Institute for Epidemiology and Pathogen Diagnostics
|
Germany
|
2021-10-10
|
NGSTPS18/IT 1770
|
Asparagus virus 1
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741 |
GenBank
| 1 |
Italy
|
Italy
|
Asparagus officinalis
| null |
2018
| null | null |
Asparagus virus 1 isolate NGSTPS18/IT 1770, complete genome
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AAATTATCAAAACTCAACACAACATAACACAACACAGCTCAACACAACTCAATTCAACAACTGAATTCCTAGACTACCATATCTGAATTCAAAACAACCAACCACACAAACCAAACATTCTTCATAATTTGTAATCGACATGGACTGCATACAGATTGGAAGCATGATCATCTCCATCCCGACCGCACAGGCACCCACATTAGCCTGTACCATTGCCAAACCCACATCCACCACACCCACACAAGCTGATCTCAAAATGGTTGGCTTTCACTCGAAAGAACCAAAGCGCGTAGTACCGACTACGCCGGCATTGATTAAGAAGGCCTTATTTAAAAAGGCTGAGGTGGAAAAGAGCGCCCTCGACAAGTGGGCAGAGACCTATGAGGCTGCAAATCATAGGAAGGATGAGAAGATAGTCACTACCAGGCGTGGAGTGACAAGGTTTGTTCGCAAGAACCGAAAGGACTTGCGAAGGGAGAGGGACGAGTTGGCTGCAACAGCTCGTGAAAAGTTGGCTCAGGAGATTCGCCTCCTTAAAATTAAGCGAAATGAAAACCAATTGAAAAATAATCATGTGAGTATTGTCTCATCAATTTCAATTGGCGGAGCTCCCAGATCTGCGTCTGAGGAGGAGACCACACCAGTACAAAAATGGGGTCTCAACAAAACAGCAAGCTCCAAGACTTGCAAGAAGCAAACCCACTTAGTTGTTTCAAGTGGGGAATTCAGGAGACTGCTACGCTCACTAGCTCAAATAGTGCGCGAGAAATCATCCACAATTGAAATTGTGGAAAAATCGACAGTCAGAGCACGCAGCAAGGTGTTCAAAGGACGTCAACGGATGTTCGTTGACGTGCTACACCAAAAAGGAACTTACCGATCGTTTGACGTGAAGATGAGTCCTTGGACTGAGAGATTGTTCGGATACATATTCAAGCATTTTGAGAGAGGACCTACAATTCACCATACTGAAATTCAACCAGGTTGTAGTGGACTCGTTGTGCGGAGAGATTCGTTGGCGGATTGTATTTCAGGGAACCATACGAAATTCTTTATCGTGCGAGGTCGAATTAAGAACATTCTTTGTGACGCACGTGCATACATACCATACAGTTCACTATTCGACGTGCACCATTACACAAGTCCTGGAGAAAAGTTTTGGAAAGGTTTCACCGAAGTCTTTCAAGAACTAAAGCCAACACAAATTAGACACGATTGTACATCGGATCTTGATGTAGTCAAGTGTGGAGAAGTCTCCGCATTGGTTTGCCAAGCAGTGTTTCCTTGTGGGAAGATTACTTGCAATAAATGCGTGGAAAATTACACACTTGTGGGTGAAGAAAGCAAGAAAGCACAAATCCAGCAATCTTTGGAACGGATTGAAAAAGACCTGGCTCATAAATACGCTGATTTTCCTCACGTTCACGAGATTTTGAAGGTGTTTGGAAATTCTTTATTAGTTCCTAACAAGAACTACAAGGCATTTGCTGACATCAAACATATGATTGGAGAGCGAACTGAAGCACCTTTTAGTCATATCAATAAATTGAACGAAATCATAATAAAAGGTGGCACATCAACAACTTCTGACTACTTTGATGCTTCTAGTGCTCTATTAGAAGTAGCAAGGTATCTTAAGAACCGGACCGAGAACATACAAAAAGGATCACTTGCATCTTTCAGAAACAAAGCATCAGCAAAAGCACATGTTAATACGATCTTATTGTGTGATAATCAACTTGATAAGAATGGAAATTTTGTATGGGGAAAGAGAGGCTATCATGCAAAAAGATTTTTCAAGAATTATTTCGAACTCGTCAACCCATCAAACGGATACGCAAAACACATCATCAGGAATGGGCCAAGTGGTGAGAGACAGTTGGCCATTGGTCATTTAGTCATGTCAACAAACTTTCAAACTTTGAGGCTGCAACTCGAAGGAAACCAAGTTGAGAAGTTTCCAGTGACAAAAGCCTGCATCAGCAAACGAAACGAAAATTTCATATATCCATGTTGCTGCGTCACAACTGAAACTGGGGAACCATTGGAATCACCGCTATACACCCCAACGAAAGGTCATCTTGTTGTTGGCAACACTGGTGATGCCAAGTACATAGACTTACCCGAGCAAGAAAATGAACGACTGTACATATCACAAGAGGGGTTTTGCTATGTAAATATATTCCTAGCAATGTTAGTGAATGTTAACGAAGATGATGCCAAAAATTTCACGAAAATTGTGCGCGATGATGTGGTCAGAAAACTTGGAAAGTGGCCGACGCTGATAGATTTAGCAACTGCTTGCTACTATCTCACGATGTTTTTCCCAGAAACGCGGAATGCTGAACTACCCAGAATTCTGGTTGATCACAAACACAATACGATGCATGTCATTGATGCATATGGTTCGAAGGACACAGGGTATCATGTTTTGAAAGCAGGAACTATCGCACAGTTAATTCTGTTTGCTAGTGAGTCACTTGAATCCAAGATCAAGGAATATCGTGTCGGAGGTCTCGTTGAGGATACAGCCATTGTACAGACAGGTATCAAGACACTGATTCGAGCCATTTATAGACCTAAAATGTTCAAAGAACTTTTGTTGACAGAACCATACTTAATCACTTTGAGTGTTTTGTCACCAGGAGTACTTTTGGCAATGTATAATAATGGTTCTTTTGAGCAGGCTACGCAGAAATTCATAACACAAAACGATTCTCTCGCAACCATCTCCACCACTTTAGCACTTCTTGCAACAAAAGTTTCTCTTGCACAAACTCTAAATGAACAATGTAACATTATTGATGCACATGCACAATTACTGTTGCAAGCAATAGGTGAAGGGCAAAGTGAGATCAGTCACACAAAACGGTTAGCTAAAGAAGCCCTTCAAGTCATGATTGCGCAGACTGAAAACAATGCTTCACTTTTGGATGGAGGTTACTTCGTTCTGCGTGAATCCTCTAAACACTTCACTGAGAAAAAATATCTGCGCCTTTTGGAGGAATCATGGGAAGAGCTAAACTTGTTGGAAAAATATTATGCGGTAAGAGCATCATATTCCTGGCGACGCGTTATTCAGCGACCTTTAAACCCCACAAAAGGCGCAGATTTGAAAGGCAGATACGATATATCCATCAATGCATTACTCAAGAAAGCGTCTGAGGCCATGAATGAAATCGTCAGAAAGAACTTGGCAAAAGGTGAACTTGCATATAAAAATGTGACAAAGAAAGGTTTAGAGTTATCTTATTCTGCATGTAGATATTTAATACCGGACTTCATGCGTGCTGTTAGTATTTTAACTGTTTTAAGTTTGTTTGTTTCTTTAATTGCAGCTTTAAATAACATGTTGGTTGCTCATAAACGTCTTAAAATGGAAAATCACGTATTTGAACAACAAATGGTTGATAGGAATTTATCTAAGTTGTACAAAAGTTTGAAGCGAAACATTAAAGGTAACCCTAGCCTAGAAGAATTCAGAGATTTTGTGGGAGAGAGAAACCCTGAACTGGTAAAGAAAATTGATTCGGATGAATTTGATCTTGAAGGGGTACAACATCAGCACAAGAGTAAGTCACAAGATACTCTCCAGAAAATCGTCGCTTTTGTAGCATTAATTATGATGACATTCGATGCTGACCGAAGCGATTGTGTGTACAAAATTTTAAACAAGCTGAAAGGGATAATTGGAACAATCGAATATGAAGTACAACATCAGGCGATTGATGACATCAAACTTGGTTTGGAGGAGCAGAATACAAAGATCGATTTTGAAGTTTCAACAGATCCACAGCTAGACAAGACATTCAGCGAACCAACTTTTTCTGACTGGTGGAGTAATCAACTGACAAATAATAACGTGATTCCACACTACCGAACTGAAGGATTTTTCATGGAATTCACTCGACAGTCCGCCATTGAAGTTTCAAATCAGATTGCACATGGTCCACACATGGATATTTTGTTGCGAGGTGCAGTAGGATCTGGTAAGTCAACAGGATTACCATACCATCTTTCAAAACGTGGTCAAGTACTGCTACTTGAACCAACAAGACCATTGGCAGAAAACGTCTGTACACAATTACGCGGAGACCCTTTTCACACAAATCCAACATTGCGTATGCGTGGCATGACTTCATTTGGATCAGCACCAATCACAGTTATGACAAGCGGTTATGCTCTACATTATTTAGCCAACAACCCACATCTTTTGCGCGACTATAACTACATCATATTCGATGAATGTCATGTTAGTGATAGTTCAGCAATGGCTTTTAGGTGTTTGCTACATGAATATAGTTTCAATGGGAAGATAATCAAAGTTTCAGCAACACCACAAGGTAGAGAGGTTGAATTCAAGACACAATTTCCAGTGACTCTCATCACCGAGGAGCATCTCTCTTTCAGTCAGTTTTGTGAAGCTCAGAGAACGAACGCTAAATGCGATGTTGCGACAAGTGGAGAGAACATCTTAGTCTATGTTGCGAGTTATAACGAAGTGGATCAACTCAGTAGGATGCTTGTCGAAAGGAGGTTTAAGGTGACAAAGGTGGATGGTCGAACAATGAAAGTTGGAAAAGTTGCCATTGAAACACACGGATGTGCCGGAGCACCTCACTTTATTGTGGCAACCAACATCATTGAGAATGGAGTAACTTTGGATGTGGATACAGTTGTTGATTTTGGACAGAAAATTTCACCTACACTGGACGTCGACAATCGTTGTATACACTATTCGAAACATTGCGTCACATACGGAGAGCGAATTCAGAGACTGGGAAGAGTTGGACGTCATAAGCAAGGAAAAGCTTTGAGAATAGGATTCACTGAGAAAGGACAGGTAGCAATACCTGACATTGTAGCCACAGAAGCGGCTTTTCTTTGCTTCACATATGGGTTGCCTGTCATGACACATAATGTTTCAGTTAGTTTACTGTCTAAATGCACGGTTAAACAAGCAAGAACAATGCATTTATTCGAACTACCTGCATTTTATA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| 37,346 |
KJ830760.1
|
Asparagus virus 1
|
Blockus,S., Lesker,T., Maiss,E.
|
Leibniz Universitaet Hannover, Institute for Horticultural Production Systems / Phytomedicine
|
Germany
|
2014-12-03
|
DSMZ PV-0954
|
Asparagus virus 1
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741 |
GenBank
| 1 | null | null | null | null | null | null | null |
Asparagus virus 1 isolate DSMZ PV-0954, complete genome
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| 88,612 |
KJ830761.1
|
Asparagus virus 1
|
Blockus,S., Lesker,T., Maiss,E.
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Leibniz Universitaet Hannover, Institute for Horticultural Production Systems / Phytomedicine
|
Germany
|
2014-12-03
|
DSMZ PV-0955
|
Asparagus virus 1
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741 |
GenBank
| 1 | null | null | null | null | null | null | null |
Asparagus virus 1 isolate DSMZ PV-0955, complete genome
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| 7,871 |
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|
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|
Che,J., Zheng,H.Y., Chen,J.P., Adams,M.J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
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|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,985 |
RefSeq
| 1 |
China:Zhejiang: Hangzhou
|
China
|
Allium chinense
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Scallion virus X, complete genome
|
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| 8,598 |
MN059098.1
|
Asparagus virus 3
|
Jo,Y., Cho,W.K.
|
Seoul National University, Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences
|
Korea
|
2020-06-13
|
G87
|
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,976 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Allium sativum
| null |
2017-10-11
| null | null |
Asparagus virus 3 isolate G87, complete genome
|
GAAAACAAAACAACATCAAACACTCGCAACTTAACTGCCCATATAAGGAGAATAACCGCACACCGCACTATACTCCCATATGGCCAGAGTCCGAGCGTCGTTGGAGAAGATCCGGGACCCATCTGTACAAACAGCAATCTCTGAAGCTGCATATGCACATGTACGCCCCGTTCTCAAAGAAGCCCTCGTCAACTGCCCATACGCACTCAACGATGCCGAAGCAGACTGCCTAGAAAGTTTCGGCATCACCGTGAATCCATACGCCACGCAAACCCACACACACGCCGCTTGTAAAGCTATAGAAAATAGAATGTTAGAAATAGTAGGTAGACACCTCCCTAAGGAACGCTGCACTATGCTCTTTCTAAAACGCAGCAAATTAAGATATCTTAGACGCGCCGCCGCATTAAAAGACGATTTCTTGAATCAAGACATTGAGCCTAAAGACCTCTTCCGCTACGATCGAGACACCATTCGCACCCGACTGAAAAATATTGCTACTCCCATAGCTTACATATCGGACACACTCCACTTCATGTCTCGCTTGGAGCTAATGATGCTCTTTTCCGACTCCCCGCAACTCCAAACCTTGTTAGCCACTCTAGTTTTGCCCGTGGAAGCCATGCACCGCCGTACTACACTCTACCCCGCACTTTACAGCGTCAACTATGGGCCTAAAGGTTTCGAATATATACCCGGAAATCACGGCGGTGGAGCTTACTTCCACCCCTACGACACCTTAGACTGGCTTAAAGTGCGACAACTCAGGGGGGAGGACCACCACGGCATTGACCCCACCATCACCCTTACTTTCCAACTTGTCGAAAGCCTAGGCGCCAACCACCTTTTCATCATTCAACGCGGTGACCTTCGGACCCCACTGGTACGAACGTTTTGCAGGGATACCCTCGTGACTATGCCTAAAGTGTTTTGCCCTGATTCTATGAACGCCAATCGTCCCCTCAGCAAGACCAAGGCCATGCAGATGCTGATGTACTGCAAGTCGGTTAAGCAGGTCAGCGAACGGGACATCTACGCAAAATTTCGACAGATGATCTCAACGCCCGAGCTAGAACTTTACGAGCCCGACGAGATAGTGCATCTCTGCAATTACTTTCACTTTATAACCCACCTGGACTCCATCACCTGCTACGAAGATCTGCTGGGCAATTCCCTCTGGAGGCGGCTCACCATCCCTGTGCGTACCAAAATCACTCAATTTCTAGATTTCTTCCGGGGCCAAAATAACTTCAGCAAACTGCTTGCCGCTCTCAAGTGGGAATCGTTTTCCTACTCCTTGGAACCCACCGACTTCACCGTAACATACGACGGCCATGCCACCCGGGCCCTGTCGGACAGGCTTAGCTTGCCTCTCGCAGATGCAGCCACCATCATTAAGGACAGCCGGTCGGATCCAACCCTTTTCACCGAGGAAGACTTGGAGGACACCCCATTTGAGGACTTCCTCGATCGGCTCAAGTATCCCCCACACCACTACAAGGCTGAAATTACCTCACCCAGTGGAACCAACACCCCTGCTACCAACATTTCCCCACAACCTCCCCAGTCCGGAACTCATTCCCCTGCGCCTACCAGCATTCCCGACTCTGTAAACGATCGGGAAAACATTGAGATCCACAATAGCAGTTGGTTAGCTGCCACTATACACCATATGCTGGCGGACCTGCCTTTCGTCCAATCGGAAAGTAAGCGCACCTATTTTTTCGCTTCTCCACCCGTACTCCTCTCTGATCCAGACCTCACTCACCACACTAACCTAGCCTGGCCGCCCATTCTGTCCGACATGGTTGACTCCCTCAACATTAACGCCAACGCTTGTTTCGTGCAGGTGTACGACAACGGTTACAGCCGACCCTGGCGATGTGACTACGGACGCAAGCCGGAATCTGACGCCATCACGACCCTGATACTGGGCGAGGTCAACCTTAAAGCCGGAGGGGAGGCCGAAATCCCGCTAAAGGAAGGGGACTGGTTCACCATTAGCGGAGCACTCCTGACACGCTGCCACCATATCTCGGTCAGATCAGCCCTATGCATCTCTCTCACTTTCTGGGTCCACGGCAGCCCTGTGCTAAGCGCACTACCCACCGAAGGATGGACAACTCCCCAATCAGCCCCATTTTCTGTCCATTCACGCCAACAGCTCGACGGAGGACCTCCATGCCAACCGGCTGATTGCTCCGGCAGCCCCCAGCCGCATTTTCTCGAGCGTCCTCAGATTTCCACGGTCGACAGCACACCGCCCATCCCAAAGGCTACTAGCTTCCGCGCCCCTCTCCAGCCGACCGCCGTAGAGACCGCCACGACCAACCCTGATGGTGCTCTGCCCTGGACGACCTGGGTGCCTCTCCTCCAAAGTCATGGTTTTGACGGCAAGCAACTCCAGTATGACCCCACAGGCAACCTGATTGTGCCCGTCCAGGACATCCGCCGTTTAGACCATGCCCGTTACCCAGACGAGGTGCCAGTCAGCCTACAAGACACTTTGAATGCAATCAAACGGTTCCCTGTGGAAATTAGAATGGACCATCAACGAGCCAGTTCTTACGCCTCAGACATTAAAAATTGCCGAACCGGTAAGTTGCTCACCCAAATGGACACTAAATGGAAGGCCTCCTTTGCCTATAAAATGCAACATGAGGATAAATACGTAGCCGGCACGGTCATCCATGGGTGTGGTGGCTCCGGCAAGTCCCACGCCATTCAGACGTGGATGCGTACACTACCCGCAGACCAGAACACAGTCACCATCATTACTCCCACCGTCATCCTCAGAAACGACTGGAGCACCAAGTTACCAATACTACCCAGTGACGTCTTTAAAACCTTTGAGAAGGCCATCATCCAGCCCTGTAACCCAGTTGTGATTTTTGACGACTACACCAAGCTTCCTCCAGGTTCTATCGAGGCTACCGTGATGCACCACAGTAACATAGCTTATGTAGTTCTCACTGGAGACAGTCGCCAATCAGTCTATCACGAAATCAACCCTGAGGCTTACATTGCCATGCTACCGGAGGCGGTCGACGTTTTCACTCCTTTCTGTGAGTTTTATTTGAACGCCACCCACCGTAATGTGCAAGCCCTGGCCAACAAACTGGGCGTTTATTCCGAACGTCAAGGCCGACTCAAAGTCAATTTCGCCTCTCACCACCTCAAAGCATCCAGAACACCGTTGCTTGTGCCCTCTACAATGAAGAGGAACGCCATGGCGGACATGGGCCACCATAGCATGACGTACGCAGGCTGTCAAGGTCTCACTGCCCCAAAGATCCAAATACTTCTTGACAATCACACCCAATTTTGTTCGGACCGGGTGCTTTACACGTGTCTCTCCCGCGCGGTAGACTCAATACACTTCATAAATACAGGGCCCACCACCGGGGACTACTGGACCAAACTCGAAAGCACGCCATACTTGAAGGCGTTCATAGACACCTACCGGGACGAAAAGACGGAGATGTACAACAGCGACCCTGCTTCTGAAGCTCCCACCGAGCCGGAAGCTCCTAGCACACATTTCCCACTAGCACCAAAACCACTGCTCGAACCTATTGTGTCCGAGCTACCCGCCAAAGAGGCGAGAGAAATTTTCTCCCATTCCGCTGGGTACTCTGACACCATCCAGACTGAAGACCCAGTCGTACAACTATTCCAACATCAACAGGCTAGGGACGAGACTCTATATTGGGCTACCATCGAAGCTAGGCTTTCCCTCTCCACTCCTGAAGACAACTTGTCAGAGTTCAACATGAAGCGAGATGTGGGAGACATCCTCTTCATGAACTACTCAAAAGTCATGAACCTCCCCGCCGAACCAGTTGAATTCGAGGAACGCTTATGGGAGATCTCCGCCGCCGAAGTGAGGAATGTCTATCTCAGCAAACCTATCGGGAATTTGGTCAACGCTGCCTCCCGACAGTCTCCAGACTTCCCAAAACACAAAATTGCACTCTTCCTAAAATCTCAATGGGTGAAGAAAGTCGAGAAATTAGGGGCCCTAAAGGTCAAGCCGGGACAAACCATAGCTTCGTTCATGCAGGAAACAGTGATGCTTTACGGCACAATGGCCCGATACTTGCGCAAGATGCGCCAACGCTTCCAACCGCCGAATATTTTCATCAACTGCGAAAAAACTCCCGACGACCTCGACTCCTTTGTGAAAACCCATTGGAACTTTGCACGTCCGGCCCACACTAACGATTTCACAGCGTTCGACCAGTCGCAAGACGGGGCAATGCTGCAATTCGAAGTTATGAAAGCGAAATTCTTCAATGTGCCCCCAGAAATTATAGAAGGTTACATTTACATCAAACTAAATGCAGCTATCTTCCTCGGCACCCTCGGCATCATGCGTCTCTCCGGAGAGGGGCCTACATTTGACGCTAATACGGAATGCTCCATCGCCTACAACGCCACGCGATTTCACATCGACAGCGGCACGGCTCAAGTTTACGCCGGTGACGACATGGCCCTAGATCGCATATGCCCAGAGAAAGCCAGCTTCCACCGGCTGGAGAATCAGCTTAAACTGACCTCCAAGCCTATGTTCCCACGACAGACCACGGGGGATTACGCAGAATTCTGTGGCTGGGTTTTCACCCCCGCGGGCATCATCAAACATTCCCTTAAGATGTACGCTTCTATTCAACTCCAAAAGAAGCTGAACAACATCAAAGAAAGTGCCCGCTCGTACGCCCTAGATCTTAGGTACGCTTACAAATTGGGTGACAGTCTTCAAGAGCATCTAACAGAAGAAGAGGCGGCATACCACCAACAATCCGTACGGGACATGCACCTATTACACCAGGCTGAGGTCCTAGCCCATGGCTCCTCCAGTCCGCCACATCCATTCTCTACCGCAGAGGCTGCCCGCACGAAAACGCAAAAACGCAATGCCACGAAACGAAAACAGAAAGTGCGGATTGCAGAAATTCTACCCCCCGATTACTAACGGGGTTAAGTAACCTTTTAATATT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| 49,140 |
KJ544560.1
|
Asparagus virus 3
|
Wylie,S.J., Li,H., Saqib,M., Jones,M.G., Jones,M.G.K.
|
Murdoch University, Plant Virology, WA State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2014-08-27
|
SW12
|
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,398 |
GenBank
| 1 |
Australia
|
Australia
|
Allium vineale
| null |
2013-01-16
| null | null |
Asparagus virus 3 isolate SW12, complete genome
|
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| 89,105 |
AB304848.1
|
Asparagus virus 3
|
Hashimoto,M., Ozeki,J., Komatsu,K., Senshu,H., Kagiwada,S., Mori,T., Yamaji,Y., Namba,S., Oshima,K.
|
Graduate School of Agricultural and Life Sciences, Department of Agricultural and Environmental Biology, Laboratory of Plant Pathology; 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8657
|
Japan
|
2008-03-01
| null |
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,937 |
GenBank
| 1 | null | null | null | null | null | null | null |
Asparagus virus 3 genomic RNA, complete genome
|
GAAAACAAAACGACATCGAAACACTCGCAGCTTATCTGSCCATATAAGGGAGAATAACCGCAAACCGCACTATACTCCCATATGGCCAAAGTTCGAGCGTCGTTAGAGAGGATCCGGGACCCATCAGTGCAAACTGCTATCTCAGAAGCAGCTTACGCTCATGTACGCCCCGTCCTCAAAGAAGCATTAGTTAATTGCCCCTACGCCCTCACCGATGCCGAAGCGGACTGTTTAGAAAACTTCGGTATCACTGTAAATCCATACGCCACCCAAACACATACCCACGCCGCATGTAAAGCTATAGAAAATAGATTATTAGAAATAGTAGGTAAACACCTCCCTAAGGAACGCTGCACCATGCTCTTCCTCAAACGCAGCAAACTTAGGTACCTCCGACGTGCCGCCGCTCTCAAAGACGACTTCATCAACCAGGACGTCGAGCCTAAAGACCTCTTCCGGTATGATCGGGACACCATTCGCACCAGACTCAAGGACATCAACACCCCGATCGCCTACATGTCTGACACGCTCCATTTTATGTCTCACTCGGAGCTTATCCATATCTTCGCCGATTCCCCGAAGCTCCAAACCATGTTGGCCACGGTTGTCCTACCAATCGAGGCCGTGCACCGACGCTCCGCCCTATATCCAGCCCTCTACAGCATCAACTACGGACCCAAAGGGTTCGAGTACATTCCTGGAAATCACGGCGGCGGAGCCTACTTCCACCCGTATGACACCTTGGACTGGTTAAAGGTGCGCCAGCTCCAAGGTAAGGACTACTACGGCATCGACACCGACCTCACTCTCACCTTCCAACTCGTCGAAAGCCTCGGGGCCAACCACCTCTTCATCATCCAACGTGGTGACCTCCGCACCCCCCTTATGCGGACCTTCTGCCGCAATGCCCTTGTCACCATGCCCAAAATCTTCTGCCCCGAGTCTATGAACGCCAACCGCCCACTCACCAAAACGAAGGCAATGCAGATGCTCATGTATTGCAAGTCCGTCAAACAAGTGTCAGAGAGAGACATATATGCAAAATTCCGACAGATCATCTCCACGCAAGAGTTGGAGCTGTATGAGCCTGACGAAATAGTGCATTTGTGCAACTACTTCAACTTCGTCGCTCACCTCGACTCCATCACCTGCTACGAAGACCTGTTAGGCAACTCTCTGTGGCGCCGGCTCACCATCCCCATTCGCACCACGATCACCAAGGCCCTAGACTTCTTCCGCGGCCAGCAAAGCTTCAGTAAACTGCTGGGTGCGCTTAAATGGGAATCCTTCTCCTACTCTCTCGAGCCGATCGATTTCACAGTGCGCTACCACAGCGCCTCAGCTCGACTCCTCTCCAGCAAGACCGGTCTCGCTGTCCCAGCCGCTGCCGCCATCATCAAAGACAGCCGGTCCGACCCCACTCTGTTCTCCGAAGAGGACCTCGAAGAAGCCCCCTTCGAGGATTTCCTAGGCCGACTCTCCTTCCCCCCCAACGCCCCCCGCAACGACCCCACTTCCACCGACGACTCCGACGGCTCTCCCGATACACCCGACGACCCACCAGTTGAGCCGTCTCCCGCCGGACCCGCCCCCGCTAACGAAGCCTCCACGTCCAGCACCTCATCAGGCCCGCCTGTCCACCACAGCGACTGGCAGTCAGCAACCATTCTCCATATGCTGACCAACCTACCTTTCCTCCAATTGAAAGGCAGACGGGCATACTTCTTCGCCACCCACCCCGTCATAGATTACGGCCACGACCGTGTGCTTTACTCCACTCTCGCTTGGCCCTCCACGCTTACCGACATCGTCAGCTCTCTTCACATCCTCACCAACGCATGTTTGGTGCAAGTTTATGAAGAAGGAGCTTCCATCCCATGGCACCGGGACAACGAAAGGTGCTATGAGTTTGACCCAATCACTACGCTAAACTTCGGCAAGGCCACCTTTGAATTCGAAGGTGGCGTTGCCCTGAAACTAGACGAAGGTGATTGGTTCTCCATGGCCGGGCCACTACTCCACCTGCGCCACCGAGTCACCGCACATTCTCCCATGCGCATATCCCTCACGTTTCGGTTGCATAAGCACAACATGCTGGGCGTGCCCCTCCCCGACGGCCTGACTCTCCCTTTCACGCCCGCACCAGAAGAACCTACGACACCTCACTCTAACGACGGAACCAGCTCCGGGGCGAATGACACAACCGCCACGAAACCCGACCCCCCCCCCACCAGCTTTCGGTCACCAATCCACCCCGACCCAGCGGCTGACCTCACCAAGCAGCCCGTCACCCCGCTTCCTTGGGCCAGCTGGGTTCCCCTGCTCCAAAACCATGGCTTCGACGGCCAACAAATGCAACACGACCCGGCAGGGAATTTGATCATTCCCGTGCAGGACATCCATCGGCTGGCCCACTGCGCTTACCCTGACGAAGTYCCTGAGTGTCTGCGCCACACCCTCAACACCATCAAGAGGCACCCTGTTGAGATCACCATCGACCACCAACGCGCCAGCTCCTACGCATCCGACATCAAGAATTGCCGCACTGGCAAGCTGCTGGCTCAGATGGACATGAAGTGGAAGGCCTCCTTCGCTTACAAGATGCAGCACGAAAGCAAAACTGTGACTGGCACAGTCATCCACGGGTGCGGGGGTTCAGGCAAGTCACACGCTATCCAAACTTGGATGCGCACTCTCCCCGCTGATCAAACCATTGTCACTGTCATCACACCCACTGTTCTGCTCCGCAACGACTGGAGCACCAAGCTGCCCATCCTCCCCAGCGACGTCTTCAAAACTTTTGAGAAGGCGATCGTTCAACCATGTAACCCGGTGGTCATCTTCGACGACTATACCAAACTCCCACCCGGTTCCATTGAAGCAACCGTCATGCATCACAGCAACATCTCCTACATTGTCCTAACTGGAGATAGCAGACAGTCGGTGTACCACGAGCTCAATGCCGAGGCTTACATCGCCACCTTACCAGAGGCTGTGGACGTCTTCACCCCCTTCTGCGAGTTCTACCTCAACGCTACACACAGAAATGTGCAGTCCCTCGCCAACAAACTGGGAGTCTACTCAGAGAGACAAGGTCGGCTCAAAATAAACTTCGCTTCTCACCACCTCAAGGCTTCTAGGACACCACTGCTGGTGCCCTCCACAATGAAGCGGAATGCTATGGCGGACATGGGTCACCATAGCATGACCTACGCAGGGTGTCAAGGGCTCACCGCACCGAAGATCCAGATCTTGCTTGACAGTCACACCCAGTTCTGTTCCGACCGTGTGTTGTACACCTGCCTCTCCCGCGCCGTCGATTCAATACACTTCATCAACACTGGCCCGACTACCGGCGACTACTGGGCAAAACTCGAGAGCACTCCCTACCTCAAAGCTTTCATTGACACCTACCGGGACGAGAAGACCGAGCTCTACAACAGTGAGCCCGCTTCTGACCAGCCCAGAGAGCCGGAAGCTCCCACCACTCATTTTCCCCTCGCCCCCAAACCACTACTCGAGCCGCTCGTGTCGACACTGCCCACCAAAGAGGAAAGGGAAATTTTCTCTCGCTCCACCGGCTACTCCGACACCATCCAAACCGAAGATCCGGAAGTGCAGCTCTTCCAGCACCAACAAGCCCGAGACGAAACCCTATACTGGGCCACTATTGACGCTCGCCTCTCTCTCGCCACCCCCGAAGAGAATCTCCAAGAATTCAACATGAAAAAAGACGTGGGAGACATCCTCTTCATGAACTACGCCAAAGTCATGAACCTCCCCGCCGAGCCGGTGGAGTTCGAAGAGAGATTGTGGGAGGTTTCTGCTGCTGAAGTCAGAAACGTCTACCTCAGCAAGCCTGTGGGTAACCTCATCAACGCAGCCGCCCGCCAATCACCCGACTTCCCAAAACACAAAATCGCCCTTTTCCTGAAGTCTCAGTGGGTGAAGAAGGTCGAGAAATTGGGTGCTCTCAAAGTGAAGCCCGGACAGACTATCGCCTCCTTCATGCAGGAAACTGTGATGCTCTACGGGACGATGGCCCGTTACTTACGCAAAATGAGGCAAAGATTCCAGCCGCCCAACATCTTCATCAACTGCGAGCGAACTCCTGAGGACTTGGACACCTTTGTCAAAACTCAATGGAATTTCGCCCGCCCAGCCCACACCAACGACTTCACCGCCTTCGACCAATCTCAGGATGGCGCCATGCTGCAATTTGAGGTCATGAAAGCTAAATTCTTCAACGTGCCCTCCGAGATCATCGAGGGATACATTTACATCAAGCTTAACGCGGCCATCTTCCTCGGGACTCTGGGCATCATGCGCCTGTCTGGCGAGGGTCCAACTTTCGACGCAAATACCGAATGCTCCATCGCCTACAACGCCACCCGCTTCCACATTGACAGCGGTACCGCCCAGGTTTACGCTGGAGATGACATGGCCCTTGACCGCATCTGCCCCGAGAAGAGCAGCTTCCACCGTTTGGAACGACAACTCAAGCTCACATCCAAACCCATGTTCCCAAAGCAAGTCAAAGGGGATTACGCTGAATTCTGCGGCTGGGTCATCACCCCTGCCGGCATCATTAAGCATTCCCTGAAGATGTACGCCTCCATCCAACTCCAGAAGAAGCTGAACAACATCAAAGAGAGTGCCCGTTCTTACGCTCTCGACCTCCGTTACGCTTACAAGCTGGGTGATTCACTCCAAGATCACCTCACAGAAGAGGAGGCCGCCTACCACCAACAATCCGTGCGGGACATGCATCTCCTCCACCAATCAGAGACTCTCGCCCACGGACCCTCCAGCCCGCCACACCACTTCGCCACAACAGAACCCATCCGCACCAAAACACAGAAGAGAAACGCCACCAAGCGTAAACAAAAAGTGCGGTTGGCCGACATTGCACCACCCGCTTACTAGCGGGGTTAAGTAGCCTTTTCTTTTTCTTTGAAATGGAAATTAGTTATATAGTAGATCTTTTGAACTTCTTAGGC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| 106,210 |
AJ316085.1
|
Asparagus virus 3
|
Che,J., Zheng,H.Y., Chen,J.P., Adams,M.J.
|
Adams M.J., Plant Pathogen Interactions Division, IACR-Rothamsted, Harpenden, Herts AL5 2JQ
|
United Kingdom
|
2002-02-06
| null |
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,985 |
GenBank
| 1 |
China:Zhejiang, Hangzhou
|
China
|
Allium chinense
| null | null | null | null |
Scallion virus X, complete genome
|
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Jiangsu University, School of Medicine
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|
China
|
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MAG: Astroviridae sp. isolate stc111ast1, complete genome
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China
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China
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| 50,615 |
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|
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|
Finkbeiner,S.R., Kirkwood,C.D., Wang,D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2008-10-22
|
MLB1
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,171 |
RefSeq
| 1 |
Australia
|
Australia
| null |
feces
|
1999-10-06
| null |
PRJNA485481
|
Astrovirus MLB1, complete genome
|
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| 7,767 |
MZ707081.1
|
Astrovirus MLB1
|
Wang,Y., Li,J., Gao,S., Duan,Z.
|
China Cdc, Department of Viral Diarrhea, Institute for Viral Disease Control and Prevention
|
China
|
2022-06-26
|
WYL077032
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,247 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2020-07
| null | null |
Astrovirus MLB1 isolate WYL077032, complete genome
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Japan
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2022-05-03
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| 30,921 |
LC695000.1
|
Astrovirus MLB1
|
Asakura,H., Yaoita,Y., Nagano,M., Isogai,M., Hasegawa,M., Fujiwara,T., Miyake,H., Nagashima,M., Suzuki,J., Sadamasu,K.
|
Department of Microbiology; Hyakunincho3-24-1, Shinjyuku-ku, Tokyo 169-0073
|
Japan
|
2022-05-03
|
MLB1/210749/Tokyo/2021
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,162 |
GenBank
| null |
Japan:Tokyo
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2021-11
| null | null |
Astrovirus MLB1 MLB1/210749/Tokyo/2021 RNA, nearly complete genome
|
GTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATGTTGGTGTGTCAGACAAAGTTTTGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATTTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAGTATGGATCGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAACCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCCGAAGATTGGCATGACCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATACTACAGTCTCCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTTAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGCTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGATGTTTACAGCACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTGTACTTTTTGGTGCCTCATGTAGCTATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTACTGTTTACCATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCACCAATTCATCATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGCATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTACTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTACCAAGGTGCCCGAAATATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTCCGGGTCAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGCACAGGCTTTAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTTCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGGGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGCGTTCATCAAACAAATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTCAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAAGTTGTAGGTATAGTCCGTGCAGCTGTTCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTCTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGCCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGGTTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAGCAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTCTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTACGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAATTGTTAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATCGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCCTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCATACTCTTTTATCATCTGGACAATGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTTGAGCTTGACTGGACTCGATTTGATGGCACGATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTCACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCGCAACAACGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGTATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAAATAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTCATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCCACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGCTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGACGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTATTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTTCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCCTTGGGCGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTCGAAGTCAGACTTCAGCCTTTGGTGGGAAACTCAGCTGTGAGTGGTACCGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCTCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGGCTATTCCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTGCTGATGGTGCTAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACCAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAGACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACTCTTACAGCAGACGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACAGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTTATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATTAGTGACAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGACGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAACGACAATGTTGCCAAGGTTATTACCATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAACAGAGGAGCCACCTTGATGCTATGTAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGCTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGATGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCCATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAGATGATGATGAAGTAAGCAGTGGTGGTGATACTGATTATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATTGCTGCATTGCACGCTATTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGGTTAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATGCAATTGTAAATAATCAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGG
| 30,922 |
LC064152.1
|
Astrovirus MLB1
|
Sato,M., Kuroda,M., Kasai,M., Matsui,H., Fukuyama,T., Katano,H., Tanaka-Taya,K., Taya,K.
|
Pathogen Genomics Center; 1-23-1 Toyama, Shinjyuku-ku, Tokyo, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2016-03-09
| null |
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,181 |
GenBank
| 1 |
Japan: Nagano
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2015-05-31
| null | null |
Astrovirus MLB1 genomic RNA, complete genome, strain: NAGANO1545
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Japan
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Bhutan
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Japan
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2013-06-15
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BtnMLB1-86
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Astrovirus MLB1
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Mamastrovirus
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| 93,920 |
JQ086552.1
|
Astrovirus MLB1
|
Wang,Z.
|
Liaoning Center For Disease Control and Prevention, Arbovirus Laboratory
| null |
2012-03-20
|
SY071
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,171 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
feces
|
2010
| null | null |
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|
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| 97,372 |
FJ402983.1
|
Astrovirus MLB1
|
Finkbeiner,S.R., Le,B.M., Holtz,L.R., Storch,G.A., Wang,D., Le,B.-M.
|
Washington University, Molecular Microbiology
|
USA
|
2009-03-08
| null |
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,169 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
| null | null |
2008
| null | null |
Astrovirus MLB1 strain WD0016, complete genome
|
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| 103,557 |
FJ222451.1
|
Astrovirus MLB1
|
Finkbeiner,S.R., Kirkwood,C.D., Wang,D.
|
Washington University School of Medicine, Molecular Microbiology and Pathology
|
USA
|
2008-10-21
|
MLB1
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,171 |
GenBank
| 1 |
Australia
|
Australia
| null |
feces
|
1999-10-06
| null | null |
Astrovirus MLB1, complete genome
|
CCAAGAGTGGTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTATGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGCACAGCACTCAACCAGCTGCGTGACATCTTCCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCCAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGCACATATGCACTTGATGGTGAAGCATGGATTGAAGTTGATGAAACCAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTTATGGATCGCAACAAAGAACTGCAGCTGGATAATGCATCAATGAGTGTTGATTTGCAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAACCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTTTTCTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTCCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTGTCTAATTTGGATACATATTATAGCCTTCTTTTACATGTAGTCAGGTGGGAGGTGGTTTCATGCATTATAGCGATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGACCCTGTGTTGCAATAATTGGTTTATTTTTGGCAACTATATCCAGATACAATTATGCAGCATTGTCCATTGTACCATTTCTGGATGTCTACAGCACTGTTTTCTTGTACACCACCATGGTTGTGTATTTTTTGGTACCCCATGTGGCTATAATTACATCATTAGTTTGTGCACTACTATTTACTATTGTAAGTATGGTATGTGCACATCACCAATTCATCATACGTGTGCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACATATATCTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCCATTGCTGCATCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCGGCTAACGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTGCTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTATCAAGGTGCCCGAAACATGTTGCAAAAAGTCAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTTCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGTACAGGCTTCAGGTTAGGTAATGACATAGTTACCGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTACAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCCAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTTATATTACCAGAGGGTCTTAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAACCCAAATTATGAACAGGTCACAATAATAGCATTAGAGGGCAATTGCATGCTTGTTTCCACTACAGAGGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTCAATGGAAATGTTCTTGGTGTTCATCAAACAAATACTGGATATACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGATGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTTAAGAAAGAAATAGAGGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTCCAAGATAATGAGGTTGTAGGAATAGTTCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAGATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGACGCGGTGCACGACATCGTATGCTGCGTCGTGGACAAAAATTTCTGACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGACTGACTAGGGAACAACTACTTGATGCAATTGAGGAAATTGTCAGGGCACGTATCGGATTCCCTGACTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTGCCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAGTATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAGGATGTTAGTGAAGAACTGTCTGCTTTGCAATCTATAGTAGATGGAGTGAAGAAGGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTCTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTTCCGGAACGCTTTCCTTTGTATGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTTAATGAAGATTTGTTGGGGTTACTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCCACTGTATGGGATGAAATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTCAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCTTATCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGATTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACCTATTCCTCAAGAAAGAAATTATCAGGCAACAAAAAATTGATGAAGGGGATGTCAGACAAATAGTGTGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCATGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCACACTCTTTCATCATCTGGACAGTGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAAGCAAGGATGTCCAGGTTGCGCTCCAAAGGTAATAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGATTTGATGGTACAATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAATAGGTTTGTTGTGCTACCTTCAGGTGAAGTTACAGCACAGCAGCGTGGAAATCCATCAGGTCAGATGTCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATACAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGCAGCATCCCTAATGAATATACCAAGACAATAGTTGACATGTACAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTTAAAGTCTCAGAGTCCTTGGAGGGGCTCTCATTCTGTGGTTTCACTTACACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTATAAACTTATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAACTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGACACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGTTTGCAGTACACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTACCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGCGGACCAAATGATGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTCAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGATTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCTCTGGGTGCACAGTATGCACTATGGAGGCTCAAGTGGCTGGAAGTCAGACTCCAGCCTTTGGTGGGTAACTCAGCTGTGAGTGGCACTGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAACTCATGGTCTGGTCTTGGAGCCCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACTAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGTACTTACAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGACTATTTCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAGGATGACAGTGAGACTACAAAAACACTTGCAATCAGTTCTGATGGTGCCAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGTGGAAATGGCACGCTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACTAGTGTCACAGTTGTGACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGCAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACACTTACAGCGGATGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCAAAGCATCTAACTGGTGCA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| 104,596 |
OQ032517.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Song,H., Gao,X., Fu,Y., Li,J., Fan,G., Shao,L., Zhang,J., Qiu,H.J., Luo,Y., Qiu,H.-J.
|
Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute
|
China
|
2023-12-03
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,511 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain China/HLJ491/2017, complete genome
|
AGCTCTGCAGTACGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCAATTGACAGGGCAACTCGAGCCTGGGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCATGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTTGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCGTGCCCCTTTATGGGGTGGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTCTATTAACATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAGCTGGTGGTGGGTGAAAGTCATATGAAAATAACCACACTTTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAAGAGCTCACAGCTTTACACCCACACCCGGTAGTAAACTGCAAAATGATGGAGTACAAGGGGGCGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAGCACAAATGGAGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGCCCCCCATTAGGTATCTGGAAGATAAGGCTGGACTACAATGAGCTGGTAAATATAAGTAGACCAATCTTTACCAGCGGAAGAAGCTTATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAGTTGGCCACCATAACGCTGGAGCACGATAGGGTGCTTGTGGACGACCGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCTAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACATGTTCTGACTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCAAAACCTCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCCCGAAAAGGGTTGCAGCCACAAGTCCCTAAAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAACCGAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTATAAGGGTAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGGGTTTATAAATACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTCAAGAAAATGTTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTGATATTTCTCGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCGACAGGGATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAATAGGTCTTTACATGGAGAGTGGCCCAATCAGATCTGTCACGGAATGCCAAACGAAACCATCACAGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGTCAATTGCAGTACCATGAATGGAAAAAACATGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAGCAAGCTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACTGGAGCTTACGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGCTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAGGTAAGCCCGTTGACAGGGTGCAAAGAAGGGTATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGCCTAAAAAATCCATCCACTAGTTGGGTCAGGCCGGTGAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCAATAATATTAATCAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAGCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACTTACACCGTAACAGGGATGTATGTTCATGTAAAGCATTGCCTCCCCAGGGGACTACCTAAGCATTCGAAAATAATTTCCCCGACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCGGTCCATAATATCCAGCACTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAGGTGGGTCCTGGTTTTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCTTCCACGATATACCTGCTGCTGGAATACGGAACTGAATGGTTGGAACATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGATTGATCCCTGGTATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCAGATCTGGATTGAGACCGTAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATTAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAATCTAGAATTAGTCTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAAGGAAACTTGATGGGCGCTATATTGTGGTGCCTCTTACTGTCAGGGGCTGAGGGGTCATGCCACAAGAGACAAGACTATTACAACATCCAACTAGTTGTTGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGGTCTGTAATGGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGATGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAAATAAAGATGGTGTCGAATGGGACCCTGTCGGAAACTTACTGCTATAATAGGCTGAACACCAGTAATTGGGGACGGCAACCGACGAGACAGAGAGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAAGAACAATACTACAGTACAGGTTACTGGGTGAATGCAACGGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTACAGTGTCAGCGCAATGGTACTTCCTTGATATTGCAACTGGCGATAAAAGAAGAAAACGACACTATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAGACTGAGAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACGTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAGGACGGTTACTGGCTTCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACTACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTGTCTCTACAAGTAGAGGCTAGTGAAGTCGGCACCAAGCAATTAGCTGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTTATAATGCTAGTTGTCAAGGAAGATCTTATAAAGAAAGTGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCCTGAGCTTCCTTATTGTGTTAAGGCTGGTGGGAGGCAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTACCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCCTAGTCAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTCTTAGCCACACATATAACAGCGCTGACATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTATGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTTTAATAAAGACATTCATATATCTGTTGGGGGTCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAGCATGCTGCAGTCTGTCATCAAGATGAGAACGAACTAGCTAGCAAGTTCAATAAGATAACCGTGAATGCAGATTTTACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCTCTGTGCTTTTCCTATTACAAGCCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTAATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGTGGGCGAAGCATGATTCACAGATTATTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACAGCCCAGTGTCTACTGTCCAGTCCAAGAAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCGATTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGGGAAACGGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGTCAGTCCAAAATAGTTAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAACTACACAAAGGCATGTGTGGCCTACCAACTGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACTAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATTCCAAAGATCACCAACGTTGAGTCAGCCAAGATGGACCTACTCTCTAAACTCATGACTTTCCTGGGGATTGAAACTTCCAGAGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTATTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAGACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGAGGGGTTAGCAGTGCCAAACACGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGCAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTTAAGACTGACCAAAAAGCACCCGATAATGCTCTGTGTTATTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTATTCATGAAAAAAATAGGGAAAAAATGGACCCTCGTAACATCAGATGGCAACAAAGCTTATTATAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACTTAGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTAGACCACCTTATTAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGGACGGGCGCCGGAAAAACAACAGAACTGCCCAGACAA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| 10,464 |
OP381297.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Huang,J., Sun,X.
|
Qingdao Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-04-15
|
APPV-SDHY-2022
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,556 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2022-05
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV-SDHY-2022, complete genome
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CGTTGATTGGCTGCATTATGTGTTGGACATCTCAAATTACCATGCGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCAATTGACAGGGCAACTCGAGCCTGGGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCATGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTTGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCGTGCCCCTTTATGGGGTGGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTGAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAGCTGGTGGTAGGTGAAAGTCATATGAAAATAACCACACTTTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAGGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCGAGAGCTCACAGCTTTACACCCACACCCGGTAGTAAACTGCAAAATGATGGAGTACAAGGGGGCTGATCCTGATTATGGCGATTGTCCAAACACAAATGGAGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGCCCCCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGGCTGGACTACAATGAGCTGGTAAATATAAGTAGACCAATCTTTACCAGCGGAAGAAGTTTATACCGGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCCACCATAACGCTGGAGCCCGACAGGGTGCTTGTGGACGACCGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCTAACTGCGAAGGAATGGTGCTCTATGTGAAGACTTGTTCTGACTGGGCAGATCAAGTAGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCAAAACCTCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCCCGAAAAGGATTGCAGCCACAAGTCCCTAAAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAACCGAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTATAAGGGTAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGGGTTTATAAGTACCCGGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTCAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGTCCTGGTGATGTGCCTGATATTTCTCGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCGACAGGGATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAATAGGTCTTTACATGGAGAGTGGCCCAATCAGATCTGTCACGGAATGCCAAACGAAACCATCACAGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGTCAATTGCAGTACCATGAATGGAAAAAACATGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAACAAGCTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACTGGAGCTTACGAGGGGCCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGCTATAACATAGTGAGACAGGCCAGGGACGAGGTAAGCCCGTTGACAGGGTGCAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGCCTAAAAACTCCATCCACTAGTTGGGTCAGGCCGGTGAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGTTTTGCCCATGGAGTAGACAAGGCAATAATACTAATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCAGTATCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACTTACACTGTAACAGGGATGTATGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCCAGGGGACTACCTAAGCATTCGAAAATAATTTCCCCGACGATGATATACCTGGGAGAAGGTGACCCGGCCCATAATATCCAGCACTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAGGTGGGTCCTGGTTTTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCTTCCACGATATACTTGCTGCTGGAGTACGGAACTGAATGGTTGGAACATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGATTGATCCCTGGTATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCAGATCTGGATTGAGACCGTAGTAACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATTAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAATCTGGAATTAGTCTATCTGGTTATAATACTAGTTAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGCGCTATATTGTGGTGCCTCTTACTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCCACAAGAGACAAGACTATTACAATATCCAACTAGTCGTTGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGGTCTGTAATGGGTAAGTGGACTGTGATAACTAGGGATGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAAATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATAGACTGAACACCAGTAATTGGGGACGGCAACCGATGAGACAGAGAGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGCCCTTGAAGAACAATACTACAGTACAGGTTACTGGGTGAATGCAACGGGTGGTTGTCAGTTAAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTACAGTGTCAGCGCAATGGTACTTCCTTGATATTGCAACTGGCGATAAAAGAAGAGAACGACACTATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAGACAGAGAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACGTGCGTGTACAGCTGGGCAGTAGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAGGATGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACTACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCTGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGTTCTTTTACGTCGTTATAATGCTAGTTGTGAAGGAAGACCTTATAAAGAAAGTGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCTCTGAGCTTCCTTATTGTGTTAAGGCTGGTGGGGGGCAGTGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTACCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCCTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTCTTAGCCACACATGTAACAGCGCTGGCATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTATGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTCTAATAAAGACATTCATATATCTGTTGGGAGTCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAGTCTGTCATCAAGGCGAGAACGAACTAGCTAGCAAGTTCAATAAGATAACCGTGAATGCAGACTTTACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCTCTGTGCTTTTCCTATTACAAGCCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTAATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGCAGCATGATTCACAGATTATTAGCCACGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACAGCCCAGTGTCTACTGTCCAGTCCAAGAAAAATCATGAAACACATGATAGAAAATCCGGTTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGGGAAACGGAACTTTTCAACCAAGGTGTCAGTCAGTCCAAAATAGTTAACCCAAGGAAAATAGGGTTGGAGGAACTACACAGAGGCATGTGTGGCCTACCAACTGTAGTGCAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCCTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCCGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCCAAACTCATGACTTTCCTGGGGATTGAAACTTCCAGAGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTATTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGTGCCAAGCACGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACTCATATGGAGGGCAGAAAAGGTAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTTAAGACTGATCAAAAAGCACCCGACAATGCTCTGTGTTACTGCTTCAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGGGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAAAAAATAGGAAAAAAATGGACCCTCGTAACATCAGATGGCAACAAAGCTTATTATAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATTAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCA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| 16,694 |
OL603844.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Hou,Z., Liu,W., Cao,N., Xu,D., Tian,Y., Huang,Y., Fu,X.
|
Zhongkai University of Agriculture and Engineering, College of Animal Science & Technology
|
China
|
2023-01-15
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,989 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-03
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain APPV-China/GD-ZK/2018, complete genome
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CAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACTACACTTTCCGGAAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCCTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCCTGCACCCACACCCGGTGGTGAACTGCAAGATGATTGAGTACGAGGGGGTGGATCCTGATTATGGTGATTGCCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTAGTAAATGTAAGCCGACCAATCTTTACTAGCGGAAGAAATTCATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCTACCATAACACTGGAGCACGATAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCTCAACGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTACAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAGCCGAGTGTCACCTTAGTATCAGGGGGGCAAAAAGCCCAAGTCATCTATAAGGGTAGGACCAAGAATAAAAAGACTCCAGATGGGGTTTATAAGTACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTTAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTGATATTTTTCGCAAATCCAAGTCTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCGAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAATGGCCTAATCAGATCTGTCGCGGAATGCCAAACGAAACCATCACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCTAACCTAACCGGAACTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGCAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGTCTAAAACCTCCATCCACTAGTTGGGTTAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATTATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGATGGTTGCCAGTGGCTGAGGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACCTATACTGTAACAGGGATGTATGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACGATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTATCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTATTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGCCTAGTCACAGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGCTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTTTGTGTGAAACCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAACATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGCGCTATATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCCGAGGGGTCGTGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTCGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCCATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGGTTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCAGAAACTTATTGCTACAACAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGAAGGCAACCGATAAGACAGAGGGGGTGTGGGCAGACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAGGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGCAATAAAAAAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGCGACCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAGGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCTACAATGTATCGCCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTCTTAATGCTAGTTGTTAAGGAAGACCTAATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTATTGCTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACTATAAAATTGGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACATTAACTGGTTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTTTAATAAAGACATTTATATATTTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAGAAGAAGTTGCTGGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAGCCCCTCTTGTACGCTGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGCCCAAGGAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCGATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTACACAAAGGCATGTGTGGCCTACCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATCCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATCACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACCTTCCTGGGGATCGAAACTTCTAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGCGCTAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGTAAATACATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACAGATCAAAAAGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAGAATAGGAAAGAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTACAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGATTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCAGTATTGGTCCTGGTCCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGTGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCCACCATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGCGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTTAACCTAATCCAACTCAAGGAATGGGTATCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGAT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| 19,421 |
OL603845.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Hou,Z., Liu,W., Cao,N., Xu,D., Tian,Y., Huang,Y., Fu,X.
|
Zhongkai University of Agriculture and Engineering, College of Animal Science & Technology
|
China
|
2023-01-15
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,989 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-05
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain APPV-China/GX-WZ/2017, complete genome
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CAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTCTATTAACATGGAAAAGCAGATTTCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAAAAATGGGTGGACGGAACTGGTGGTAGGAGAAAGTAGTACAAAAATAACTACGCTATCTGGAAAGACCTATCGAGGAACTTGGGAGATGGAGAAACGAACGAACCCTTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTTACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGGGGTGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCGAATACAAATGGGGTATTTATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCCCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTATAGTGACCTGGTAAATATAAATAGGCCAATCCCCGCTAGTGGGATGAACTCTTACCGAGTCGAGACATGCAGTGGGGAGTTGGCTATTGTAACACCGCTACATGATAGGGTGCTTGTAGAAGACTACAGGAGACTATATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATAGTACTCTATGTGAAAACATGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTTGAAAAACAAGAGAGGGAAAGTCCTCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAAACAACCCAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTTATCTACAAAGGCAAGACTAAGAACAAAAAGACTCCGGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAAAGAGGGGGACGTAGTGAAGGTCAGGAAGATGTTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACTTGATGTATATCATAACCCCAAGCTTTGCTAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACGGGGATCAGTCAGATACTGTGGCAAAGACGAATCAATAGATCTCTGCATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACTGATGAGGAATTACGTAGTCTGGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACCTGTTGCCAGCTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTACCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACAGCCTTACAAGCTAACCTCACTGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCTATAACATAGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGGCATCCTTTTCTATTTTCTGGTGAAAGATCCGACTCCTCATGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTAAAGATGGACGAGGCATCAATGGCCGACGGCTTCGCTCATGGTGTCGACAGGGCAATAATCCTGATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAATTTCTTAGATGCTATTGGGAGGTGGTTACCTATAGCTGAAGCAGCTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACCGTGACGGGGATGTACGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATATCTGGGGGAGGGTGACCCAGCCCACAACATTCAGCACTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGGGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCCTCTACGATATATCTACTATTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTAGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTTCCAGCCAGTCATACGGTGCCTGGTTGGATTTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCGTGGTAACAGAGGTCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCCTGGTGAATATAGTCACTGCCTTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGCTCATGCCACAAAAGACAAGACTATTACAGTCTCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAAAACAGGCGTAGAAAAACGATCCGTGGTGGGCAAGTGGACTGTGATAACCAGGGAAGACCGAGAACCAAGATTAATGGAGCAAATAAATATGGTGTCAAATGGTAGCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATAGGCTAAATACCAGTAGTTGGGGACGACAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGTCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGATAACGTTCTAGAAGAACAATACTATAGTACAGGTTACTGGGTGAACGCAACAGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCAATGTACAGTGCCAGCGCAACGGCTCATCCTTAATACTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGATCCTGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTCGCACAGGGCACTTGCGTATATAGCTGGGCATTTGCCCCAAGGGGGTGGTACTATAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAACGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACCGTCTCATCCGCCGCAACGATGTACCGTCATCTGCTCCCCTTACTTGTAGCTTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTATCTCTGCAGGTGGAAGCTAGCGAAGTAGGTACAAAGCAATTGGCCGTCACGCTGACACTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTACTCTTCTATATTATCATAATGCTAGCCGTTAAGGAAGACCTCATAAAGAAAATAGTAACCGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAATAGTCCAGTAGCCTTAAGCTTTCTCATTGTGCTCAGGCTTGTAGGAGGCAGTGAAGCGCTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCGGAATTTGGAACCCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCGCTGAATCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGCTATTGGCAACACACATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGACTCAATCTTCTATATGATGCTTATAATGACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATACTTATTGGGGGCCAGCATGAATTGGGTTGAGAAAGAAAAAAAGAAGTTGTTAGTCAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAGTCTGCAGACAAGGTGAGAATGAGTTAGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGCAAACTTGAACTTTTACAACTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTCTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCTTGACTGTTATAGTAATCGGTGTACAGGAGTATAATGTAGCTATGGCCCGCGGGAGAAGCGTGGTCCATAGACTACTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACTGTCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACACTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACACAAGGGTATGTGTGGCCTCCCAACTGTAGTGCAAAATTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAGCTGGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGCGACGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACTAATGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTGCTCTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATAGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAATTACTGAAAATAGTCAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATCAGTAGCGCAAAACACGTGACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTACATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCAGATAATGCTTTATGCTATTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGACAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGACGGTAATAGAGCTTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCATATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTCATTGACTCCAGAACTATCAGCAAAAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGAGAGTTTCGCTCAATTACCCTTGGAACGGGAGCTGGGAAAACTACGGAACTGCCCAGGCAATACCTCGCAACAGTAGGTGCCCATAAGTCTGTGTTAGTTTTAGTCCCTTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGAAAAGAGGGAGACGTGAGCAGCGGTATCACTTACGCTACTTACGGATTCTGCTGCCAGCTAAACCTGGTACAACTCAAAGAATGGATATCCAGATACTCAATGGTGTTTTTCGATGAATACCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGAT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| 19,422 |
OL603846.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Hou,Z., Liu,W., Cao,N., Xu,D., Tian,Y., Huang,Y., Fu,X.
|
Zhongkai University of Agriculture and Engineering, College of Animal Science & Technology
|
China
|
2023-01-15
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,989 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain APPV-China/JX-YC/2018, complete genome
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CAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACTACACTTTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCTTACACCCACACCCGGTGGTGAATTGCAAGATGATAGAGTACAAGGGGGCGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTAGTAAATGTAAGCCGACCAATCTTTACTAGCGGAAGAAATTCATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCTACCATAACACTGGAGCACGATAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAAGAAAAACCTCCGAAACCTCAGCGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAGCCACAAGTCCCCAGAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAACCGAGTGTTACCTTAGTATCCGGGGGGCAAAAAGCCCAAGTCATCTATAAGGGTAGGACCAAGAATAAAAAGACTCCAGATGGGGTTTATAAGTACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTTAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTGATATTTTTCGCAAATCCAAGTCTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCGAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAATGGCCTAATCAGATCTGTCGCGGAATGCCAAACGAAACCATCACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGTAATTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCCGACACCTCATGTCTAAAGCCTCCATCCACTAGTTGGGTCAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATTATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGATGGTTGCCAGTGGCTGAGGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACCTATACTGTAACAGGGATGTATGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACGATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTGGTCCTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTATTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGCCTAGTCACAGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGCTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTTTGTGTGAAACCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAACATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGTGCTGTATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTCGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCTATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCGGAAACTTACTGCTACAATAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGAAGGCAACCGATAAGACAGAGGGGGTGTGGGCAGACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAGGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGCAATAAAAAAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGCGACCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAAGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTTATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTAGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTCTTAATGCTAGTTGTTAAGGAAGACCTAATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTATTGCTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACTATAAAATTGGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACGTTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTACGTAGTGCTCATAATGACCAACCTTCTAATAAAGACATTTATATATCTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTGGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAGCCCCTCTTGTACGCTGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGCCCAAGGAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCAATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTGCACAAAGGCATGTGTGGCCTGCCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATCCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATCACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACCTTCCTGGGGATCGAAACTTCTAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGCGCTAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGCAAATACATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAAAAAGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACGAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAGAATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTACAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGATTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCAGTATTGGTCCTGGTCCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGTGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCCACCATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGCGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTTAACCTAATCCAACTCAAGGAATGGGTATCTAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACCGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGAT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| 19,423 |
OK564403.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Lamp,B.
|
Justus-Liebig-University Giessen, Institute of Virology
|
Germany
|
2022-07-13
|
AUT-2016_C
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,564 |
GenBank
| null |
Austria
|
Austria
|
Sus scrofa
| null |
2016
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate AUT-2016_C, complete genome
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GCATAATGCTTTGATTGGCTGCATTATGTATGGGACATCCTAAATTGTTACTAGTCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCAATGAACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACTGAGTAGTACACCCAAAGACCACCGCTCCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCAGGTGGACGTGGGCGTGCCCAGAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCATGCCCCTTTAGGGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATCAACATGGAAAAACAGATTGCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAATTGGTGGTGGGGGAAAGCCATACAAAAATAACCACACTCTCTGGAAAGATCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCGAATCCTTACGGAACCTACCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTTACAGCCCTACACCCTCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGATCGAGTATAAGGAGCTGGACCCTAACTATGGTGACTGCCCGAATACAAACGGGGTGTTCATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCTCCATTAGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAGCGACCTGATAAATATAAACAGACCAGCCCCCGCTAGTGGGAAAAACTCTTATCGAGTCGAGACGTGCAGTGGGGAGCTGGCTACTGTAACATCGGTTCATGACAGGGTGCTTGTAGAAGACTGCAGGGGGCTATACCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTCTATGTGAAAACGTGCTCTGATTGGGCAGATCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGATGACCCCCCAAAACCTCAGCGACCACCGAGGCGAGACCCACGAAAGGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAAAAGAAACAACCTAGCGTTACCTTAGTGTCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTCATCTATAAAGGCAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGAATTTATAAGTATCCAGGAGCCAGAGAAGGGGATGTGGTAAAGGTTAGGAAGATGCTGAAGAATTGGCATATAGCTGTAGTAATATACCTGATTTATATCATAACCCCAAGCTTTGCCAAGGTTCAATGGTTCTTGAAGGATGAAAACTCGACGGGGATCAACCAGATACTGTGGCTACGACAGATCAATAGATCCTTGCATGGAGAGTGGCCCAACCAAATCTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACAGATGAGGAATTACGTAGTCTGAGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAGTTGCAATATCACGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCACAAAAGCAGACTTGGATTAGGAGGATAACGGCCCTACAAGCTAACCTCACCGGAGTTTATGAGGGACCTGAGTGCGCTGTCATCTGTCGATTTAACGGCAGTTATAACATCGTAAAACAGGCTAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAGGAAGGGCACCCTTTCCTATTTTCTGGTGAAAGATCTGACACCTCGTGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTGAAGATGGATGAGGCATCAATGGCCGACGGCTTTGCCCATGGGGTTGACAAAGCAATAATACTAATCAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAATCTCCTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCGGTTGCCGAGGCAACTATAGTGCCATATTGTGAAACTTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGGGGGCTACCTAAGCATTCGAAAATAATTTCCCCGACAATGATATACCTGGGGGAAGGCGACCCAGCCCATAACATCCAGCACTTATTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTTCTAGTCTTACTCGGAGTTCTGGGTGAGTGGTATGGAGAACTGGCTTCTACAATATACCTACTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGCTGATCCCTGGCATCAATATTACAATAGAACTCCCAGCTAGTCAAACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTTGCAGGCCAGTGGGTGTGTGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAGGCCTGGCATATACTGAAAATACTGGCCTCAGCCCTGGTGAACATAGTCACTGCATTTGTGAACCTGGAATTGGTCTACCTGGCCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTGATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTATTGTCAGGGGCAGAAGGCTCGTGTCATAAAAGACAAGACCATTATAATATCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAAGACAGGTGTAGAAAAACGATCCATAATGGGCAAATGGACTGTGATAAGCAGGGAAGGTAGGGAACCAAGATTAATGGAGCAAATAAATATGGTGTCAAATGACAGTTTGTCAGAAATTTACTGCTATAATAGGCTAAACACTAGTAGTTGGGGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGCGGTCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAATGTCCTAGAAGAACAATACTATAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGCGATTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTATGGCTATCAAGAAAGGGTAATGTACAGTGCCAGCGTAATGGCTCATCCTTGATATTACAATTAGCGATAAAGGAAGAGAATGACACTATGGAGATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACCTGCGTGTATAGCTGGGCTTTCGCCCCAAGAGGGTGGTATTATAACAGGAAAGACGGTTACTGGCTTCAGTACATAAAGAAAAACGACTACCAGTACTGGACAAGAATGCCTACGGCCTCATCCGCTACAACGATGTACCGTCATTTGCTCCCCCTACTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGAAGGATATCAGTGTGGATTGTAGCAATGCTCCTATCCCTACAAGTGGAAGCTAGCGAAGTAGGTACTAAGCAACTGGCTGTCACACTGACTCTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTACTCTTTTATATTATTATAATGCTAGCCGTTAAGGAGGAGCTCATTAAAAAAATAGTGACTGCAAGCCTAGTGGCCATAAAAAACAGCCCAGTGGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAGCCGGAGTTTGGAACTCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCTGCGCTGAACCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAGTTGCTATTGGCCACACATATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGACTCAATCTTCTACATGATGCTTATAATGACCAACCTACTAATAAAGACATTTATATATCTACTAGGGGCCAGCATAAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAGAAAGTTGCTTGTAAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCGATTTGCAGTCAGGGTGAGAATGAATTGGGGGATAAATTCAACAGGATAACTGTGAATGCGGATTTCACCCCATGCAAACTTGAACTTTTACAATTACTTAGGGCTTTTTTAGTTTCCTTATGTTTTTCTTATTACAAGCCTCTCCTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTTATAGTAATTGGCGTACAGGAGTACAATGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGTGTGGTCCACAGGCTACTAGCTATGGCCTACTACATATATGGCCGTATACAGGGTGACATGTTCCAACTCGCCACTGTTCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGAAAAATTATGAAACACATGATAGAGAATCCAACTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAGACAGAACTTTTCAACCAGGGTGTCAGCCAGTCCAAAATAGTAAATTCAAGAAAAATTGGGCTGGGGGAATTGCAAAAGGGCATGTGCGGCCTCCCAACTGTAGTACAAAATTTGGTTATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTCATTTTAGGAGAGTTGGGTTACCCCCCAGGGGACCTCACCAATGATGGGTGGGAAATCTTAGGCCCCGGCAGAATACCAAAGATCACTAATGTTGAATCTGCTAAAATGGACTTATTCTCTAAACTTATGACCTTTCTGGGGATTGAAAGTTCAAGAGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCAACAAGGAAATTATTGAAGATAGTAAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGAATCAGTAGCGCAAAACACGTTACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGCAGGAAGGGTAAATATATCCTACAATCCCAAGAACATGGAGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGACCAAAAAGCACCCGACAATGCCTTATGCTACTGTTTTAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGTGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGGAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGATGGTAACAAAGCCTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCATATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAACTCATCGACTCCAGGACCATCAGCAAGAGCAATGAGGCAAACCTGGAACACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTTC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| 28,867 |
LC700403.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Ikeda,K., Miyazawa,K., Takagi,M., Tomochi,H., Ishii,K., Araki,M., Iwamaru,Y.
|
Tsukuba, Ibaraki 305-0856
|
Japan
|
2022-07-02
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,567 |
GenBank
| null |
Japan: Okinawa
|
Japan
|
Sus scrofa
| null |
2021-02-05
| null | null |
Atypical porcine pestivirus OKN/2021 RNA, complete genome
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GCATAATGCATAAATTGGCTGCATTATGTGCACAACATCCCAAATTGTAACAAGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAAAGGTTAACCAGGCCTTTAGTACCACAGGCACCAATGTACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCATATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATACCCCTTATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATCACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGAGAAAGCCATACAAAAATAACCACACTTTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGCCCAACCCTTATGGAATTTATCTCCCTAGGCCAAACCCCCAACAGCTCACGGCCTTGCACCCACATCCAGTCATAAACTGTAGGATGATGGAGTACAAAGAAGCGGACCCTAATTATGGCGACTGCCCAGACACAAACGGAGTATTCATCGATGAAAAAGGTAGGAAATTTAGTGGCCCTCCTTTAGGCTTTTGGAAGATAAGGCTGGACTACAATGAATTGGTGAATGCCAACAAACCAACTCTCACAAGTAAACAGATTTCTTATCGGGTCGAAACCTGTAGTGGAGAATTAGCCACCGTAGTACCTATACACGGCAGGGTGCTCGTGAATGATTACAGGGGGTTTTACCAATGGAAGCCTAGGTGTGAAGGAATGGTGCTCTACGTAAAAACCTGTTCCGACTGGGCGGACCAAGTGGACAAGCAAGAAAAAGCAAGCCCCCCAAAACCACAAAGACCACCAAGACGAGACCCACGGAAAGGATTGCAGCCTCAAGTTCCCAAAGAAACTGAAATCACAGAAAGAAAAAGACAACCTAGTGTAACTTTAGTGTCTGGGGGGCAGAAGGCCCAGATCATTTATAAAGGTAAGACCAAAAACAAAAAGACCCCGGACGGAGTCTATAAGTACCCAGGGGCTAAAGAAGGGGACGTAGTAAAAGTGAGGAAGATGTTAAAAAACTGGCACTTAGCTCTGGTGATGTGCCTGATATATCTCATAAGTCCAAGCCTTGCAAAAGTCCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCAACGGGAATTAACCAGATACTGTGGCAAAGACGGCTTAATAGGTCCTTGCATGGAGAGTGGCCAAACCAAATCTGCCATGGCATGCCAAATGAAACTATCACCGACGAGGAGCTATATAGCTTGGGAATGATAGATACTAGCCCAAGAACGAACTACACCTGCTGCCAATTACAATACCACGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCACAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTGCAAGCCAACCTTACTGGGTCCTATGAAGGGCCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTCAACGGCAGTCATAACATCGTCAGACAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCGCCCTTTCCTGTTCGCTGGTGAAAGATCTGAGGCCTCGTGTTTAAGACCGCCTTCCACCAGCTGGGTGAGACCAGTGAAGATGGATGAGGCATCAGTGGCAGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGTAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCAGGAATCGTTAATTTTCTAGACACTATCGGAAGATGGTTGCCAGTGGCTGATGCTATCATTACACCATACTGTGAAACATACACCGTAACGGGGATGTATGTCCATGTTAAGCATTGCCTTCCCAAGGGGTTGCCCAAGCACTCGAAAATAATTTCCCCGACATTGATATACCTGGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATCTATTTGGCTCAGGTATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTACTCGGGGTCTTGGGCGAGTGGTATGGGGAACTAGCCTCAACTATATACTTACTACTGGAGTATGGGACAGAATGGTTGGAACATGAAAACCTGATCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATTACAGTGGAGCTCCCAGCCAGTCATACAGTACCTGGCTGGGTATGGGTCGCAGGCCAGTGGGTGTGCGTAAAGCCAGACTGGTGGCCAACACACATTTGGATCGAAACTGTAGTGGCGGAAGCCTGGCATGTGCTGAGGATACTGGCCTCAGCCTTGGTGAACATAGTTACTGCATTTGTTAACTTAGAATTGGTCTACCTGGTCATAATACTAGTCAAAGTATCAAAAGGCAATTTGATAGGTGCTATCCTATGGTGCCTATTATTGTCAGGGGCCGAAGGGTCGTGTTACAAGAGACAGGACTATTACAGTATCCAGTTAGTTGTCGAGGAAAAAACAGGCATAGAAAAACGGTCCGTAATGGGCAAGTGGACTGTGGTGACTAGAGAGGGTCGAGAGCCAAGACTGATGGAGCAGATCAGCATGGTATCAAACAGTAGTCTGACAGAGACCTACTGCTATAATGAACTAAACACCAGCAGTTGGGGACGACATCCAATGAAACAAAGGGGGTGTGGGCAGACCGTACCCTACTGGCCTGGCGATAATGTCCTTGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTAAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCGAGGAAAGGTAATGTCCAGTGCCAACGCAATGGCTCATCCCTGATCCTGCAGTTGGCAATTAAAGAGGAGAATGATACCATGGAAATACCGTGCGACCCGGTGGAAACTGAGAGCATGGGCCCAGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGCTGGGCAGTAGCCCCAAGAGGTTGGTATTACAACAAGAAAGATGGTTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCTGCGGTCTCTTCCGCTGCAACAATGTACCGTCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGGATTTCAGTATGGTTTGTAGCAATGCTTCTCTCCCTACAAGTGGAGGCCAGTGAGGTGGGGACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTATATGGAAGATGGATTGGACGGAATTACTCTTTTACATCATCATAATCCTGTCCGTAAAGGAAGACTTTATAAAGAAGATAGTAACAGCAAGCCTAGTGGCCCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTGAGCTTCTTAATTGTGCTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCGGTAGGGCTTCTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGGACCCCTTTCCTAATTTACTTATGGGATAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAAACCATAAAGTTAGCAAGGAAACTTTTATTAGCCACACACATCACAGCACTGACGCTGACCGGCCTGAGTGATTCAATTTTTTACGTGATGCTCATAATAACCAATTTGCTAATAAAGACATTCATATACCTACTGGGGGCAAGTATTAACTGGGTAGAGAAGGAAAAAAGGAGGCTGCTAATGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAGGCCATAGTTCGCCATCAGGATGGGGATGAACTAGTGAGTAAATTCAACAAAATAGCAATAAACACGGACTTTACTCCGTGTAGGCTTGAACTGCTGCAATTACTCAGAGCTTTTCTGGTTTCTCTATGCTTCTCTTATTACAAACCCCTCCTATATGCGGAAACCACCCTAACTGTCATAGTGATTGGTGTACAAGAGTACAGCATGGCAATGGTCCGTGGGCGAAGTGTGGTCCACAGACTACTAGCCATGGCTTACTATATATATGGTCGCCTGCATGGGGATATGTTCCAGCTCGCCACAATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAAATAATGAAACATATGATAGAAAATCCAACCCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGGGAGACAGAGCTATTCAATCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAGTAGTGGACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTGGAACTGCAAAAAGGTATGTGCGGTTTGCCGACCGCAGTGCAAAACTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATCTTGGGAGAGGTGGGTTACCCACCCGGTGACCTCACCATCGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATTACTAATGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTCTCAAAACTCATGACTTTTCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCAACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGGGGCATGGAAACCGGGTGGGGGTACACTCATGCAGGGGGAATTAGTAGTGCAAGGCACGTCACTGGTGAGAAAAACCTAATGACTCACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAATACATCCTGCAGTCTCAAGAGCATGGTGCTGATGAAATAGAATACGGGGTGAAAACTGATCAGAAAGCACCTGATAATGCCTTGTGCTATTGCTTCAACCCTGAGGCCACAAATATAAAAGGAGAGACAGGGGCTATGGTATTTATGAAGAAAATTGGAAAAAAATGGACTCTCGTGACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGTAACTTAAAAGGGTGGTCTGGCCTACCGATAATGCTGCATTCTACTGGAGCAATAGTGGGGAGGATCAAGTCGGCGTACTCAGATGAAAATGACCTGGTGGAAGAGCTAATTGACTCCAGGACCATCAGTAGAAGCAATGAGACAAACCTGGAACACCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGC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| 29,162 |
MW401769.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Ren,X.J., Hu,Z.H., Qian,P., Chen,H.C., Li,X.M.
|
Huazhong Agricultural University, State Key Laboratory of Agriculture Microbiology
|
China
|
2022-05-02
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,360 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020-11-11
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain CH-HB2020, complete genome
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TGCTTTGATTGGGTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGTCATAAGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCTATGGACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCATTTCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGGCCACCATACCCCGTTATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTCTATTAACATGGAAAAACAGATTTCATACTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTGGTAGGTGAAAGTAGTACAAAAATAACTACGCTATCTGGAAAGACCTATCGAGGAACTTGGGAGATGGAGAAACGAACGAACCCTTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTCACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGAGGTGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCGAATACAAATGGGGTGTTTATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTATAGCGACCTGGTAAATATAAATAGACCAATCCCCGCTAGTGGGATGAACTCTTACCGAGTCGAGACCTGCAGTGGGGAGATGGCTATTGTAACACCGCTACATGATAGGGTGCTTGTAGAAGACTACAGGGGACTATATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATAGTGCTCTATGTGAAAACATGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTTGAAAAACAAGAGAGGGAAAGTCCTCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAAACAACCCAGTGTTACCTTAGTATCAGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTTATCTACAAAGGCAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGAATCTATAAGTATCCAGGAGCCAAAGAGGGGGACGTAGTGAAGGTCAGGAAGATGTTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACCTGATGTATATCATAACCCCAAGCTTTGCTAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACAGGGATCAGTCAGATACTGTGGCAAAGACGAATCAATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCTAACCAGATTTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACGGATGAGGAATTACGTAGTCTGGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACCTGTTGCCAGCTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAATTACCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACAGCCTTACAAGCTAACCTCACTGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCCATAACATAGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGGCACCCTTTCCTATTCTCTGGTGAAAGATCCGACTCCTCATGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTAAAGATGGACGAGGTATCAATGGCCGACGGCTTCGCTCATGGTGTCGACAGGGCAATAATCCTGATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAATTTCCTAGATGCTATTGGGAGGTGGTTACCTATAGCTGAAGCAGCTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACCGTGACGGGGATGTACGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATATCTGGGGGAGGGTGACCCAGCCCACAACATTCAGCACTTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGGGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCCTCTACGATATATCTACTATTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTCCCAGCCAGTCATACGGTGCCCGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCCACACAGATTTGGATTGAGACCGTGGTAACAGAGGTCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCCTGGTGAATATAGTCACTGCCTTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGCTCGTGCCACAAAAGACAAGACTATTACAATCTCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAGGACAGGCGTAGAAAAACGGTCCATAATGGGCAAGTGGGCTGTGATAACCAGAGAAGGTCGGGAACCAAAACTAATGGAGCAAATAAAAATAGTGTCGAATAACAGCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATACGCTAAATACTAGCAGTTGGAGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGCCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCTTAGAAGAACAGTATTACAGCTCAGGCTACTGGGTGAATGCGACGGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTGTGGCTGTCAGGAAAGGGCAATGTACAGTGCCAACGCAATGGCTCATCCTTGATACTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTCGCACAGGGCACTTGCGTGTACAGCTGGGCATTCGCCCCAAGGGGGTGGTACTATAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAACGATTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACCGTCTCATCCGCCGCAACGATGTACCGTCATCTGCTCCCCCTACTTGTAGCCTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTAGGTACCAAGCAATTGGCCGTCACGCTGACACTGTGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTCTTCTATATTATCATAATGCTAGCCGTCAAGGAAGAACTCATTAAGAAAATTGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTTATTGTGCTCAGGCTTGTGGGAGGCAGTGAAGCGCTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCGGAATTTGGAACCCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCACTGAATCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGCTATTGGCAACACACATAACAGCGCTCACATTGACTGGCCTGAGTGACTCAATCTTCTATATGATGCTTATAATGACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATACTTATTGGGGGCCAGCATGAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAAGAAGTTGTTAGTTAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAGTCTGCAGACAAGGTGAGAATGAGTTAGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGTAAACTTGAACTTTTACAACTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTCTCTTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCCGAGACTACCTTGACTGTTATAGTAATCGGCGTACAGGAGTATAACGTAGCTATGGCCCGCGGGAGAAGCGTGGTCCATAGACTACTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGTTAGCCACTGTCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACACTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAGTTACACAAGGGTATGTGCGGCCTCCCAACTGTAGTGCAAAATTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTGGGAGAGCTGGGTTACCCCCCTGGGGATCTCACCAGCGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACTAATGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTGCTCTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATAGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAATTGCTGAAAATAGTCAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATCAGTAGCGCAAAACACGTGACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTACATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCAGATAATGCCTTGTGCTATTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGACGGTAATAAAGCTTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGGGCCATAGTGGGGAGGATTAAGTCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTCATTGACTCCAGAACTATCAGCAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGAGAGTTTCGCTCAAT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| 30,923 |
LC596433.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Kamiie,M., Nagai,M., Sunaga,F.
|
Sagamihara 252-5201
|
Japan
|
2021-06-09
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,567 |
GenBank
| null |
Japan: Gunma, Annaka
|
Japan
|
Sus scrofa
| null |
2020-04-01
| null | null |
Atypical porcine pestivirus Annaka/2020 RNA, complete genome
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TGCATAATGCAAAAATTGGCTGCATTATGTGCATAACATCCCAAATTGTAATAAGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAAGGGTTAACCAGGCCTTTAGTACCACAGGCACCAATTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTTATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATCACATATTATCTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTGGGAGAAAGCCATATGAAAATAACCACACTTTCCGGGAGGACTTACCGAGGTACCTGGGAAATGGAGAAACGGCCCAACCCTTACGGAATTTACCTCCCTAGGCCAAACCCACAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACATCCAGTCGTAAACTGTAGGATGATGGAGTACAAAGAAGCGGACCCTAATTATGGCGACTGCCCAAATACAAACGGAGTATTCATCGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGTGGCCCTCCGTTAGGCTTCTGGAAGATAAGGCTGGACTACAATGATTTGGTGAATGCCAACGAACCAACTCTCACAAGTAAACAGATTTCTTATCGGGTCGAAACTTGCAGTGGAGAATTAGCCACCGTAACACCTATACACGGCAGGGTGCTCGTGAATGATTACAGAGGCTTCTATCAATGGAAGCCTAGGTGTGAAGGAATGGTGCTCTACGTAAAAACCTGTTCCGATTGGGCGGATCAAGTGGATAAGCAAGAAAAAGAAAGCCCCCCAAAACCACAAAGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGATTGCAGCCTCAAGTCCCTAAAGAAACCGAAATCACTGAAAAAAAAAGACAGCCTAGTGTGACTTTAGTGTCTGGGGGGCAGAAGGCCCAAATTATTTATAGAGGTAAAACCAAGAACAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGGGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAGAGTGAAGAAGATGTTAAAGAATTGGCACTTAGCTCTGGTGATGTGCCTGATATATCTCATAAATCCAAGCTTTGCAAAAGTCCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCAACGGGAATTAACCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAATAGGTCCTTGCATGGAGAGTGGCCAAACCAAATCTGCCATGGCATGCCAAATGAAACCATCACCGATGAGGAGCTACATAGCTTGGGAATGATAGACACTAGTCCAAGAACAAACTACACCTGCTGCCAATTACAATACCATGAATGGAAAAAACATGGCTGGTGTAATTACCCACAAAAACAAACATGGATCAGAAGAATTACAGCTTTGCAAGCCAACCTTACTGGGCCCTATGAAGGGCCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAATGGCAGTCATAACATCGTCAGACAGGCCAGGGATGAGGTCAGCCCACTAACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTCCTATTCGCTGGTGAAAAATCTGAGGCCTCGTGTTTAAGACCGCCTTCCACTAGCTGGGTAAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCTTCAGTGGCAGATAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCAGGAATCATCAATTTCTTAGACACCATAGGAAGATGGTTGCCAGTAGCTGATGCTATCATCACACCATACTGTGAAACATACACCGTAACGGGGATGTATGTCCATGCCAAGCATTGCCTTCCTAAGGGGTTGCCCAAGCACTCGAAAATAATTTCCCCGACATTGATATACTTGGGGGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTTGGCTCAGGAATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTACTCGGAGTTTTGGGCGAGTGGTATGGGGAACTAGCCTCAACTATATATTTACTACTGGAGTATGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAACTTGATCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATTACAGTGGAGCTCCCAGCCAGTCATACAGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCAGGCCAGTGGGTGTGCGTGAAACCAGACTGGTGGCCAACACACATTTGGATCGAAACCGTAGTGGCAGAAGCCTGGCATGTGCTGAGGATACTGGCCTCAGCCTTGGTGAACATAGTCACTGCATTTGTGAACTTAGAATTGGTTTACCTGGTCATAATACTAGTCAAAGTATCAAAAGGCAACTTGATAGGTGCTATTTTATGGTGCCTACTACTGTCGGGGGCTGAAGGGTCATGCTACAAGCGACAAGACTATTACAATATCCAGTTAGTCGTCGAGGAAAAAACAGGCTTGGAAAAACGGTCCGTAATGGGCAAGTGGACTGTGGTGACTAGAGAGGGTCGAGAGCCAAGACTGATGGAACAGATAAGCATGGTATCAAACAGCAGCCTGACAGAGACTTACTGCTATAATGAACTAAACACCAGCAGTTGGGGACGACATCCAATGAAACAAAGGGGATGTGGGCAGACCGTACCCTACTGGCCTGGCGATAATGTCCTTGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTAAATACTACAGGAGGTTGCCAGCTGAGGGAAGGTGTGTGGCTGTCAAGAAAAGGTAGTGTCCAGTGCCAACGCAATGGCTCATCTTTGATCCTACAGTTGGCAGTCAAAGAGGAGAATGATACCATGGAAATACCGTGCGACCCGGTAGAAACCGAGAGCATGGGCCCAGTGACACAGGGTACTTGTGTGTACAGCTGGGCGGTGGCCCCAAGAGGGTGGTATTACAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAGATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCTGCGGTTTCCTCTGCTGCAACAATATACCGTCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTAATGGGTGGTAGGATTTCAGTGTGGATTGTAGCAATGCTTCTCTCCTTACAAGTGGAGGCCAGTGAGGTGGGGACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACCTTATGGAAGATGGATTGGACGGAACTACTCTTCTACATCATCATAATCCTGTCCGTAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACCGCAAGCCTAGTGGCCCTTAAAAATAGCCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTAATCGTGCTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTGCTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGGACTCCTTTCCTAATCTACTTATGGGATAATTGGAAGTGGACTGTTTTGGTCAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAGAAAACCATAAAGTTAGCAAGAAAACTCTTATTGGCCACACACATAACGGCACTGACGCTAACCGGCTTAAGTGATTCAATTTTTTATATAATGCTCATAATAACCAATCTGCTAATAAAGACATTCATATACCTACTGGGGGCAAGTATTAATTGGGTAGAGAAGGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAATTGATATACAAACAGGCCGTAGCTCGCCACCAGGATGGGGACGAACTAGTGAGTAAATTCAACAAAATAACAATAAACACGGACTTTACCCCGTGTAGGCTTGAACTGCTGCAATTACTTAGAGCTTTTCTGGTCTCTCTATGCTTCTCTTATTACAAACCCCTCCTGTATGCGGAGACCACCCTATCTGTCATAGTGATTGGTGTACAAGAGTATAACATAGCAATGGCCCGCGGGCGCAGTGTGGTCCACAGACTACTAGCCATGGCTTACTATATATATGGCCGCCTGCAAGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACAATTCAGTGCCTGATGTCGAGTCCAAGAAAAATAATGAAGCACATGATAGAAAATCCAACCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCCAAAGTGGTGGACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAACTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCAACCGCAGTGCAAAATTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATCTTGGGGGAGGTGGGTTACCCACCCGGAGACCTCACTGTTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGTAGGATCCCAAAAATTACTAATGTAGAGTCCGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAACTACTGAAGATAGTGAAGGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACTCATGCAGGGGGAATTAGTAGTGCAAAGCACGTCACTGGTGAGAAAAACCTAATGACTCACATGGAGGGCAGGAAGGGTAAATATATCCTGCAGTCTCAAGAGCACGGTGCTGATGAAGTAGAATATGGGGTGAAAACTGACCAGAAAGCACCTGACAATGCCTTGTGCTATTGCTTTAACCCTGAGGCTACAAACATAAAAGGAGAGACAGGGGCTATGGTATTTATGAAGAAAATAGGGAAAAAATGGACTCTTGTGACCTCAGATGGCAACAAAGCATATTACAATGTGAGTAACTTAAAAGGGTGGTCTGGGCTACCGATAATGCTGCATTCAACTGGAGCAATAGTGGGGAGGATCAAGTCGGCATACTCAGATGAAAATGACCTGGTAGAAGAGTTGATTGACTCTAGGACCATCAGTAGAAGCAATGAAACAAACCTGGAACACCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCG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| 41,604 |
MW183241.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Yuan,F., Feng,Y., Bai,J., Liu,X., Arruda,B., Anbalagan,S., Peddireddi,L.
|
Kansas State University, Kansas State Veterinary Diagnostic Laboratory
|
USA
|
2021-03-09
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,567 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2016
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain USA/023005/2016, complete genome
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GCAGATATCGGCTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGCTATGGGCCCCGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCCCTAGTACCACAGGCACCGATAGACGGGGTAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACTCCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGCGCCCAAAGAGAAAACGGTGGTGGACCTGGGGGCCGGGGCCACCATGCCCCTTTACGGGGCAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAAATCCGTTGTTTATTAACATGGAAAAACAAATCGCATACTACTTAAAAAAAGAAAAACAAACAAATGGATGGACGGAACTGGTGGTAGGGGAAAGTCGTACAAAAATAACTACACTATCTGGAAAAACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCGAATCCCTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCCCAACAGCTTACAGCCCTACACCCCCACCCAGTAGTGAATTGTAAGGTGGTTGAATACAAGGAGAAGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCGAACACAAACGGGGTGTTCATCGACGAAAAAGGCAGAAGGCTGAGTAGCCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGATTGGACTACAGCGACTTGGTGAATATAAATAGACAAATCCCTACTGGTGAAAAACACTCTTACCAAGTCGAAACCTGCAGCGGGGAGCTGGCTACTGTAACACTAGCACACAAAAGGGTATTTGTGGAAGACCGCAGGGGATTATACCAATGGAAGCCCAACTGTGAAGGGATGGTGCTTTATGTGAAAACTTGTTCTGATTGGGCAGATCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAGCCCCCCAAAACCTCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCCCGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACCGAAAAGAAGAGACAACCTAGCGTCACATTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTCATCTACAAAGGCAGGACTAAGAATAAAAAGACCCCGGATGGGGTCTATAAGTACCCGGGAGCTAAAGAAGGGGATGTGACAAAGGTCAAGAAGATGCTGAAGAATTGGCATGTAGCCTTGGTAATATGCCTAATATATATCATAACCCCAGGCTTCGCCAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACGGGGATCAGCCAGATACTGTGGCAAAGACAAATCAATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCCAATCAGATCTGCCACGGCATGCCAAATGAAACTATTACGGATGGGGAATTACGCAGCCTGGGAATGATAGACACAAGCCCCAGAACAAACTACACGTGTTGCCAGTTGCAATATCATGAGTGGAAGAAGCATGGTTGGTGTAACTATCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACGGCCTTACAAGCCAACCTCACCGGAGCTTATGAGGGACCCGAGTGCGCTGTCATCTGTCGATTCAACGGCAGTTATAACATCGTAAAACAGGCCAGAGATGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGGTACCCCTTCCTATTCTCTGACGAAAGATCTGACACCTCATGCCTGAGGCCTCCTCCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTGAAAATGGATGAGGTCTCAATGGCTGATGGCTTTGCCCATGGAGTTGACAAGGCAATAATACTTATCAGAAAAGGGGCATCAGGAATTATTAATTTCCTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCGGTAGCTGAAGCAACTATAGCACCATATTGTGAAACTTACACCGTAACAGGGATGTATGTCCATGTAAAGAATTGCCTCCCCAGAGGGTTACCTAAGCATTCGAAAATAATTTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATTCAGCACCTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTTCTGGTCTTGCTTGGAGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCTTCTACAATATACCTGTTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGTCTGACCACAGAAGGGTTGATTCCTGGCATCAATATCACAATAGAACTCCCAGCTAGCCATACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATCGAGACTGTGGTGGCGGAGGCCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCTTGGTGAATATAGTCACTGCATTTGTAAACCTGGAATTAGTCTACCTGGTCATAATACTAGTCAAGATATCAAAGGGGAACTTGATTGGCGCCATATTATGGTGCTTACTACTATCAGGGGCTGAAGGCTCTTGCCACAAGAGACAAGACTATTACAATATCCAGTTAGTTGTCAATGAAAAGACAGGCATAGAAAAACGATCTATAGTAGGCAAGTGGACCGTGATAACTAGGGAAGGTAGGGAACCAAGATTGATGGAGCAAATAAACATGGTGTCAAATGATAGCCTGTCAGAGACTTACTGCTATAATAGACTAAATACCAGCAGCTGGAGGCGGCAACCGGTAAAACAGAGAGGGTGTGGTCAAACTGTGCCCTATTGGCCCGGTGACAATGTTCTAGAAGAACAATACTATAGCACAGGTTACTGGGTGAACGCAACAGGTGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTATGGCTATCAAGGAAGGGCAATGTACAGTGCCAGCGCAATGGCTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAGGAAAATGACACTATGGAAATACCATGCGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACTTGTGTGTACAGCTGGGCATTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAATAGGAAAGACGGTTACTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTGCTGCCTCGTCCGCCGCAACAATGTACCGCCATTTGCTCCCCTTGCTAGTGGCTTGCCTGATGGGCGGCAGGATATCGGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTGTCTCTACAGGTGGAAGCCAGCGAAGTGGGTACTAAGCAACTGGCTGTCACTCTAACTCTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTGCTTTTCTATGTCGTCATAATGCTAGCTGTTAGGGAAGAACTCGTAAAGAAAATAGTGACCGCAAGCCTTGTGGCCCTAAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTTATTGTTCTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTCGGTTTACTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCGGAGTTCGGAACTCCATTCCTGATCTACCTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTACTAGTTAGCTTCTCTGCACTAAATCATGAAAGAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGTTGTTGGCAACACACATAACAGCGCTAACATTGACCGGTTTGAGTGACTCAATTTTTTATGTGATGCTTATAACGACCAACCTACTAATAAAGACATTCATATACCTACTGGGGGCTAGTATGAATTGGGTTGAGAGAGAAAAAAAGAAGTTACTAGTAAAGAGGAAACTAATATATAAGAAACCCGCAATTTGCAGACAAGATGAGAATGAATTGGAGAATAAATTTAACAAGATAACCGTAAATGCGGATTTCACCCCATGTAAACTTGAACTTTTACAACTGCTCAGGGCCTTTCTAGTCTCTTTATGTTTCTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCCTAACTGTTATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATGTAGCTATGGCCCGCGGGCGAAGCGTAGTCCATAGACTACTAGCCATGGCTTACTACATATACGGCCGCATGCAGGGTGATATGTTTCAGCTCGCCACAATCCAGTGCCTGTTGTCGAGTCCGAGGAAAGTCATGAAACACATGATAGAAAATCCAACTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGTGAAACAGAACTTTTTAACCAGGGTGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAACCCAAAGAAAATTGGGCTAGAAGAATTACATAAGGGCATGTGCGGCCTCCCAACTGCTGTGCAAAATTTGGTCATATATGCGAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAGTTGGGCTATCCCCCTGGGGACCTCACTAGTGATGGGTGGGAAATACTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACTAATGTCGAGTCTGCTAAAATGGACTTACTCTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATTGAAAGCTCAAGGGTCCCCAGGACTCCAGTCCACCCAACAAGGAAATTATTGAAGATAGTAAGAGGCCTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCATGCAGGGGGGATAAGCAGCGCAAAACATGTTACAGGTGAAAAAAATCTGATGACCCACATGGAGGGCCGGAAGGGCAAGTATATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCAGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCCGACAATGCCCTATGCTACTGCTTTAATCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGATGGTAACAAGGCCTATTATAATGTGAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCTACTGGGGCCATAGTGGGGAGGATAAAGTCAGCATATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACTATCAGCAAGAGTAATGAAACAAACCTGGACCACCTTATTAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTTCGCTCAAT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| 43,602 |
MW183242.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Yuan,F., Feng,Y., Bai,J., Liu,X., Arruda,B., Anbalagan,S., Peddireddi,L.
|
Kansas State University, Kansas State Veterinary Diagnostic Laboratory
|
USA
|
2021-03-09
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,545 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain USA/047310/2017, complete genome
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GGCCAATTAAAGCATTATGCGTAGGACATCCTAAATTCTTATGAGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGACCTCTAGTACCACAGGCACCAATGGACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCACTTCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGACCACCATGCCCATTTACGGGGTAGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTACTAACATGGAAAAACAGATTGCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGATGGACGGAACTGGTGGTAGGAGAAAGTCACACAAAAATAACCACGCTTTCTGGAAAGACCTATAGAGGTACTTGGGAAATGGAAAAACGGTCGAATCCTTATGGAACCTATCTCCCCAAACCTAGTCCCCAACAGCTTACAGCCCTACACCCTCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAGGGAGATGGACCCTAATTATGGTGACTGCCCGAACACAAACGGGGTGTTTATTGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGATTGGACTATAGTGACCTGGTCAATATAAACAGACCAATTCCCGTCAGTGAGAAAATTTCTTACCGAATCGAGACCTGCAGTGGGGAGCTGGCTACTGTAATACCGGTACACAATAGGGTACTTGTAGAAGATTGCAGGGGGCTATACCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATTGTGCTCTATGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAGCCCCCCAAAACCACAGAGGCCACCAAGGCGAGACCCACGGAAAAGGTTACAACCACAGGTCCCGAAAGAGGCAGAGGTCACAGAAAAGAAGAGACAACCTAGCGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAAGCCCAAGTCATCTATAAAGGCCGGACCAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAAAGATGGGGATGTAGCAAAGGTCAGGAAGATGCTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACCTGATATATATCATAACCCCAGGCTTTGCCAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACGGGCATCAACCAGATACTGTGGCGAAGACAGATTAACAGATCTCTGCATGGAGAATGGCCTAATCAGATCTGCCACGGTATGCCGAATGAAACCATCACGGACGAGGAACTACGCAGCCTAGGAATGGTGGATACAAGCCCCAGAACAAACTATACCTGTTGTCAGCTGCAATATCACGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCACAAAAACAGGCGTGGATTAGGAGGATAACGGCCCTACAAGCCAACCTCACCGGAGCTTACGAGGGACCTGAGTGTGCCGTTGTTTGTCGATTTAACGGCAGTTATAACATCGTAAGACAGGCCAGAGATGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGCAAAGAAGGACACCCCTTCCTATTCTCTGATGAAAGATCCGACACCTCATGCCTGAGGCGCCCTTCCACCAGTTGGGTAAGGCCGGTAAAAATGGACGAAGCATCAGTGGCTGATGGTTTTGCCCATGGGGTTGACAAGGCAATAATACTAATCAGAAAAGGAGCATCAGGAATAATTAATTTCCTGGATACTATCGGGAGGTGGCTGCCGGTAGCTGAAGCAACTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCCAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATATCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCATCATTTATTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTGGTCCTACTCGGGATTCTGGGTGAGTGGTATGGGGAATTGGCCTCTACTATATATCTACTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGTCTGGTCACGGAAGGCTTGATCCCCGGCATCAATATTACAATAGAACTTCCGGCTAGTCATACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGTGTAAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACTGTAGTGGCAGAAGCCTGGCACATACTAAAAATATTGGCGTCAGCCCTGGTGAACATAATTGCTGCGTTTGTAAACTTGGAATTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTGATAGGTGCTGTACTATGGTGCTTATTACTGTCAGGGGCTGAAGGCTCGTGCTATAAAAGACAAGACTATTACAATATCCAACTAGTTGTTGAAGAAAAAACAGGCGTAGAAAAAAGATCCATAATGGGCAAGTGGACTGTGATAACCAGAGAAGGTCGGGAACCAAGATTGATGGAGCAAATAAATTTGGTCTCAAATGACAGCGTGTCAGAAACTTACTGCTATAATAGGTTAAATACTAGCAGTTGGGGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGTCAAACTGTGCCCTACTGGCCTGGTGACAACGTCCTAGAAGAACAATATTATAACACAGGTTACTGGGTAAATGCAACAGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGCGTGTGGCTATCAAGAAAAGGTAATGTACAGTGCCAGCGTAACGGCTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACCATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAAACAGAAAGTATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACTTGCGTGTACAGCTGGGCATTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAATAGGAAAGATGGCTATTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAACGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCTGCTGCCTCGTCTGCCGTAACGATGTACCGCCATTTACTACCCTTACTGGTAGCCTGCCTCATGGGCGGCAGGATATCGGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTTTACAGGTGGAAGCCAGCGAAGTAGGTACCAAACAACTGGCTGTCACGCTAACTTTGTGGAAGATGGACTGGACAGAACTACTCTTCTATATCATTTTAATGCTAGCCGTAAAGGAAGAACTTATAAAAAAATTGGTGACTGCTAGCCTTGTGGCCTTAAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTAGGTTTACTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCGGAGTTTGGAACCCCTTTCCTGGTCTATCTATGGGACAATTGGAAGTGGACTGTGCTAGTCAGCTTTTCCGCACTGAACCATGAAAAAACTATAAAAATAGCAAGAAAACTGCTGTTGGCGACGCACATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGATTCAATCTTCTATGTAATGCTTATAATCACCAATGTGTTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCTAGTATGAATTGGGTAGAGAGAGAAAAGAGGAAGTTGCTAGTGAAGAGAAAACTAATATACAAGAAAGCCGCTATCTGCAGCCAGAATGAGAATGAATTGGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTGAACGCGGATTTCACCCCATGCAAGCTTGAACTTTTACAGTTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTTTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACAACCCTAACCGTCATAGTAATTGGTGTACAGGAGTACAACGTAGCTATGGCTCGCGGGCGAAGCGTGGTCCATAGACTGCTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATACAGGGTGACATGTTCCAGCTCGCTACTATCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACTCTTAAGAAACTCTGGCAAGGCGAAACAGAGCTTTTTAACCAGGGTGTCAGTCAGTCCAAGATAGTGAACCCAAAGAAAATTGGGCTAGAAGAATTACATAAGGGCATGTGTGGCCTCCCAACTGTAGTGCAGAATTTGGTCATATATGCAAAGAAAAATGACTCTCTTATTCTAGGAGAGTTGGGTTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGCGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACCAATGTTGAGTCTGCCAAGATGGACTTACTCTCCAAACTAATGACTTTTCTGGGGATCGAAAGCTCAAGGGTCCCCAGGACTCCAGTCCACTCAACAAGAAAATTATTGAAGATAGTAAGGGGCCTGGAAACTGGATGGGGGTACACCCACGCAGGAGGGATAAGTAGCGCAAAACACGTTACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGAAAGTATATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCAGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACCGACCAAAAAGCACCCGATAATGCCTTATGCTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAACATAAAAGGGGAAACAGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGATGGTAATAAAGCCTATTATAATGTGAACAATCTGAAAGGGTGGTCCGGACTGCCAATAATGTTGCACTCTACCGGGGCCATAGTAGGGAGGATCAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATTAGCAAGAGCAATGAGACAAACCTGGATCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCGATTAC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| 43,603 |
MN080493.1
|
Atypical porcine pestivirus
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Guo,Z.
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Henan Academy of Agricultural Sciences, Henan Provincial Key Laboratory of Animal Immunology
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China
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2020-07-10
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APPV-China/HeNLY/2017
|
Pestivirus scrofae
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Pestivirus
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Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,477 |
GenBank
| null |
China: Henan, Luoyang
|
China
|
Sus scrofa
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spleen, abdominal cavity
|
2017-12-25
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV-China/HeNLY/2017, complete genome
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TGCATAATGCTTCGATTGGCTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGTTAAGCGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTGGACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCTCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCATGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAAGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCATGCCCCCCTTACGGGGTAGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTGAGAGTATAAAATCCGTTGTTCGTTAACATGGAAAAACAGATCGCACATTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACAGAATTGGTAGTAGGAGAAAGCCATACGAAAATAACCACACTCTCTGGAAAAACCTATCGCGGTACCTGGGAAATGGAGAAGCGGTCGAATCCTTACGGAATCTACCTCCCCAGGCCTAGCCCTCGACAGCTCACTGCTATACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGCAAGGTAATGGAGTACAAGGAGAGGGACCCTAATTATGGTGACTGCCCGAATACGAATGGGGTATTCATCGATGAAAAGGGTAGAAGACTGAGTAGCCCCCCATTGGGTATCTGGAAGATAAGATTGGACTATGGTGACCTGGTAAATATAAACAGACCAATTCCTGTTAGTGGGAAAAACTCTTATCAAGTCGAGACCTGCAGCGGGGAGCTGGCTACTGTAACACTAGTACACGATAGGGTACTTGTGGAAGACTATAGAGGGCTTTATCAATGGAAACCCAGTTGTGAAGGAATTGTGCTCTATGTGAAAACTTGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAGCCCCCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGATCCCAGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAAGTCACAGAAAAAAAGAGACAACCTAGTGTCACCTTAGTATCAGGGGGACAGAAGGCCCAAGTCATCTATAAAGGCAGGACTAAAAATAAAAAGACTCCGGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAGAGAAGGAGATGTGGCAAAGGTCAGGAAGATGCTGAAGAACTGGCATATAGCATTGGTAATGTACTTGATATATATTATAACTCCAAGTTTTGCCAAGGTCCAGTGGTTTTTAAAGGATGAAAATTCGTCGGGGATCAACCAGGTACTATGGCGAAGACAGATTAACAGATCTCTACATGGGGAATGGCCTAACCAGATTTGCCACGGTATGCCAAATGAAACTATCACCGACGAGGAATTACGCAGTCTAGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACTTGTTGTCAGTTACAATATCATGAATGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCGCAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACGGCCCTGCAAGCCAATCTTACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGCGCTGTCATCTGTCGATTTAACGGAACCTATAATATCGTAAGACAAGCCAGAGATGAGGTGAGTCCATTGACAGGGTGTAAGGAAGGGCACCCTTTTCTATTTTCTGAGGAGAGGTCCGACACCTCATGTTTGAGGCCGCCTTCCACCAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCATCAGTGGCTGACAGCTTCGCCCATGGGGTCGACAAGGCCATAATATTAATCAGAAAAGGGGCATCGGGAATTATCAATTTCTTAGATACTATTGGGAGATGGTTACCGGTGACTGAAGCAACTATAGTGCCATATTGCGAAACCTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCACGTAAAAAATTGTCTTCCTAGAGGGCTACCTAGACATTCGAAAATAATCTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCGGCCCATAACATCCAGCACTTATTCGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTCGGGATCCTGGGTGAGTGGTACGGGGAATTAGCCTCTACAATCTATTTACTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAGCACGAAAGCTTGATCACAGAAGGGTTGATCCCGGGTATCAATATTACAATAGAACTCCCGGCTAGCCACACTGTACCTGGTTGGGTGTGGGTCGCGGGCCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCCACACAGATTTGGATTGAAACTGTAGTGGCAGAAGCCTGGCACATATTAAAAATCCTAGCATCAGCCTTGGTGAACATAGTTACTGCATTTGTAAACCTAGAACTGGTCTACTTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAAGGGAACCTGATAGGTGCTATATTATGGTGCCTATTACTGTCTGGGGCTGAGGGGTCATGTATAAAAAGGCAAGACTACTACAATGTCCAGCTAGTCGTTGAAGAAAAGACAGGCGTAGAAAAAAGATCTATAATGGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGCCGAGAACCAAGATTAATGGAACAGATAAATATGGTGTCAAATGAAAGTGTGTTAGAAACTTACTGCTATAATAGGCTCAATACCAGCAGTTGGGGGCGGCGACCGATAAGACAGAGAGGGTGCGGTCAAACAGTGCCCTACTGGCCCGGTGATAATGTCCTAGAAGAACAATACTATAGCATGGGCTACTGGGTGAACGCAACAGGCGGTTGCCAACTTAGGGAAGGCGTATGGCTATCAAGAAAGGGCAATGTGCAGTGCCAGCGTAATGGTTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAAGACAATGACACCATGGAAATACCGTGCGACCCAGTGGAAACAGAAAGCATGGGCCCAGTTGCGCAGGGTACTTGCGTGTACAGCTGGGCAGTCGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAATAGGAAAGATGGTTACTGGCTGCAGTACATAAAGAAAAATGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACTGCTTCGTCCGCGGCAACGATGTACCGCCACCTGCTCCCTTTGCTGGTAGCCTGCCTTATGGGCGGCAGGATATCGGTGTGGATTGTTGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTGGGCACCAAACAACTGGCCGTCACACTAACTCTATGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTTTTCTACATCGTCATAATGCTAGTCGTTAAGGAAGACCTCATAAAGAAAATAGTGACCGCAAGTCTTGTGACCTTAAAAAATAGTCCAGTGGCCTTGAGCTTTCTCATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGCGAAGCACTCCCAGTGGGTTTACTACTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCAGAGTTTGGAACTCCTTTCTTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAATGGACTGTCTTAGTCAGTTTCTCCGCACTAAATCACGAGAAAACTATAAAATTGGCAAGGAAGCTATTATTGGCTACACATATAACAGCGCTCACGTTGACTGGTCTAAGTGATTCAATCTTTTATATCATGCTTATAATTACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATATCTATTGGGGGCTAGCATAAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAAGAAGTTGCTGGTAAAGAGGAAGCTAATATATAAGAAAGCCGCAATTTGCAATCGGGACGAGAATGAACTGGAGTACAAATTCAACAAGATAACCGTGAACGCCGATTTCACCCCATGCAAACTTGAATTATTACAACTACTTAGGGCTTTTTTAGTATCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAACCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCCTAACTGTTATAGTAATTGGTGTACAAGAATACAATGTGGCAATGGCCCGTGGGCGAAGCATGATCCACAGATTACTAGCTATGGCCTACTATATATATGGTCGCATACAGGGTAATACGTTCCAGCTTGCCAGTATCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCAAGGAAAATCATGAAACACATGATAGAAAACCCAACCCTTAGGAAGTTCTGGCAGGGTGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAGTCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACATAAGGGTATGTGCGGCCTACCAACTGTAGTACAAAATTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATCCTAGGAGAATTGGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTTTAGGCCCCGGCAGGATCCCAAAGATCACTAATGTTGAGTCTGCTAAGATGGACTTACTCTCCAAACTCATGACTTTTCTGGGGATTGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGAACCCCAATCCACTCAACAAGGAAATTACTGAAGATAGTGAGAGGCTTGGAAACTGGGTGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATTAGTAGCGCAAAACATGTTACAGGTGAAAAAAACTTAATGACCCACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTACATCTTACAATCCCAAGAACATGGCGCCGATGAGGTTGAGTATGGAGTAAAAACTGACCAAAAAGCACCCGATAACGCTTTATGCTATTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAACATAAAGGGAGAAACAGGGGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAACAAAGCCTATTACAATGTAAACAATCTGAAAGGGTGGTCCGGACTACCAATAATGCTGCACTCCACAGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAGCTTATCGACTCCAGGACTATCAGTAAGAGTAATGAGACAAACCTGGATCACCTTATTAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTC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| 48,470 |
MK948872.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Zhou,X., Shi,J., Si,G., Li,J., Liang,W., Liu,B., Feng,J., Yu,L., Wei,L., Xiong,J., Xie,Y., Cai,W., Li,G., Zhai,S., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-30
|
APPV/CNYJ/2018
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,908 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV/CNYJ/2018, complete genome
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ATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACTACACTTTCCGGAAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCCTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCCTGCACCCACACCCGGTGGTGAACTGCAAGATGATTGAGTACAAGGGGGTGGATCCTGATTATGGTGATTGCCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTAGTAAATGTAAGCCGACCAATCTTTACTAGCGGAAGAAATTCATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCTACCATAACACTGGAGCACGATAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCCCAACGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTACAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAGATCATGGAAAAAAAGAAACAGCCGAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCCCAAGTCATCTATAAGGGTAGGACCAAGAATAAAAAGACTCCAGATGGGGTTTATAAGTACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTTAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTGATATTTTTCGCAAATCCAAGTCTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCGAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCTTACATGGAGAATGGCCTAATCAGATCTGTCGCGGAATGCCAAACGAAACCATCACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCTAACCTAACCGGAACTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGCAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGTCTAAAACCTCCATCCACTAGTTGGGTTAGACCAGCAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATTATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGATGGTTGCCAGTGGCTGAGGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACCTATACTGTAACAGGGATGTATGTCCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACGATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTATCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTATTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGCCTAGTCACAGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGCTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAACATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGCGCTATATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCCGAGGGGTCGTGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTCGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCCATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGGTTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCAGAAACTTATTGCTACAACAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGAAGGCAACCGATAAGACAGAGGGGGTGTGGGCAGACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAGGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGCAATAAAAGAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGCGACCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAGGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCTACAATGTATCGCCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTCATAATGCTAGTTGTTAAGGAAGACCTAATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTATTGCTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTCGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACTATAAAATTGGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACATTAACTGGTTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTTTAATAAAGACATTTATATATTTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAGAAGAAGTTGCTGGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAGCCCCTCTTGTACGCTGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGCCCAAGGAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCGATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTACACAAAGGCATGTGTGGCCTACCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATCCTAGGCCCTGGCAGAATCCCGAAGATCACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACCTTCCTGGGGATCGAAACTTCTAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGCGCTAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGTAAATACATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACAGATCAAAAAGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAGAATAGGAAAGAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTACAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGATTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCAGTATTGGTCCTGGTCCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGTGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCCACCATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGCGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTTAACCTAATCCAACTCAAGGAATGGGTATCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCATGCACTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGC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| 48,750 |
MK948873.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Zhou,X., Shi,J., Si,G., Li,J., Liang,W., Liu,B., Feng,J., Yu,L., Wei,L., Xiong,J., Xie,Y., Cai,W., Li,G., Zhai,S., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-30
|
APPV/CNGL/2017
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,908 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV/CNGL/2017, complete genome
|
ATGGAAAAGCAGATTTCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTAGTAGGAGAAAGTAGTACAAAAATAACTACGCTATCTGGAAAGACCTATCGAGGAACTTGGGAGATGGAGAAACGAACGAACCCTTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTTACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGAGGTGGACCCTAATTATGGTGACTGCCCGAATACAAATGGGGTGTTTATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCCCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTATAGCGACCTGGTAAATATAAATAGACCAATCCCCGCTAGTGGGATGAACTCTTACCGAGTCGAGACCTGCAGTGGGGAGTTGGCTATTGTAACACCGCTACATGATAGGGTGCTTGTAGAAGACTACAGGAGACTATATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATAGTGCTCTACGTGAAAACATGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTTGAAAAACAAGAGAGGGAAAGTCCTCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAACCACAAGTCCCTAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAAACAACCCAGTGTTACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTTATCTACAAAGGCAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCAGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAAAGAGGGGGACGAAGTGAAGGTCAGGAAGATGTTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACCTGATGTATATCATAACCCCAAGCTTTGCTAAGGTTCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACGGGGATCAGTCAGATACTGTGGCAAAGACGAATCGATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACGGATGAGGAATTACGTAGTCTGGGAATGATAGACACAAGCCCCAGAACAAATTACACCCGTTGTCAGCTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTACCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACAGCCTTACAAGCTAACCTCACTGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCTATAACATAGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGACACCCTTTCCTATTCTCTGGTGAAAGATCCGACTCCTCATGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTAAAGATGGACGAGGCATCAATGGCCGACGGTTTCGCTCATGGTGTCGACAGGGCAATAATCCTGATTAGGAAAGGGGCATCAGGAATCGTCAATTTTTTAGATGCTATTGGGAGGTGGTTACCTATAGCTGAAGCCGCTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACCGTGACGGGGATGTACGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATATCTGGGGGAGGGTGACCCAGCCCACAATATTCAGCACTTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGGGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCCTCTACGATATATCTACTATTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTCCCAGCCAGTCATACGGTGCCCGGTTGGGTTTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGTGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCGTGGTAACAGAGGTCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCCTGGTGAATATAGTCACTGCCTTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGCTCATGCTACAAAAGACAAGACTATTACAATCTCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAAGACAGGCGTAGAAAAACGATCCATAGTGGGCAAGTGGACTGTGATAACCAGAGAAGGTCGGGAACCAAAATTAATGGAGCAAATAAACATGGTGTCAAATGACAGCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATACGCTAAATACTAGCAGTTGGAGGCAGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGTCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAATGTCTTAGAAGAACAGTATTATAGCTCAGGCTACTGGGTGAATGCGACAGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGCGTATGGCTGTCAAGAAAGGGCAATGTACAGTGCCAACGCAATGGCTCATCCTTGATACTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTCGCACAGGGCACTTGCGTGTACAGCTGGGCATTTGCCCCAAGGGGGTGGTACTATAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAACGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACCGTCTCATCCGCCGCAACGATGTACCGTCATCTGCTCCCCTTACTTGTAGCCTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGCGAAGTAGGTACCAAGCAATTGGCCGTCACGCTGACACTGTGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTCTTCTATATTATCATAATGCTAGCCGTCAAGGAAGAACTTATTAAGAAAATTGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGTCCAGTTGCCTTGAGCTTTCTTATTGTGCTCAGGCTTGTAGGAGGCAGTGAAGCGCTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCGGAATTTGGAACCCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCACTGAATCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGCTATTGGCAACACACATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGACTCAATCTTCTATATGATGCTCATAATGACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATACTTATTGGGGGCCAGCATGAATTATTACGAGAAAGAAAAAAAGAAGCTGTTAGTCAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAGTTTGTAGACAAGGTGAGAATGAGTTAGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGCGAACTTGAACTTTTACAACTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTCTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACCACCTTGACTGTTATAGTAATCGGCGTACAGGAGTATAACGTAGCTATGGCCCGCGGGAGAAGCGTGGTCCATAGACTACTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACTGTCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACACTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACACAAGGGTATGTGCGGTCTCCCAACTGTAGTGCAAAATTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAACTGGGTTACCCCCCTGGGGACCTCACCAACGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCGGAATCCCAAAGATTACTAACGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTGCTTTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATAGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAATTACTGAAAATAGTCAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATCAGTAGCGCAAAACACGTGACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTACATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCAGATAATGCTTTATGCTACTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGACGGTAATAAAGCTTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTCATTGACTCCAGAACTATCAGCAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGAGAGTTTCGTTCAATCACCCTTGGAACGGGAGCTGGGAAAACTACGGAACTGCCCAGGCAATACCTCGCAACAGTAGGTGCCCATAAGTCTGTGTTAGTCTTAGTCCCTTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTCATGAGGTCCAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGAAAAGAGGGAGACGTGAGCAGCGGCATCACTTACGCTACTTACGGATTCTGCTGCCAGCTAAACCTGGTACAACTCAAAGAATGGATATCCAGATACTCAATGGTGTTTTTCGATGAATACCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCATGCACTGAAAGTCAAGACCAGGATAGTGGC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| 48,751 |
MH307700.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Jin,H.
|
CAU, CVM
|
China
|
2019-12-10
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,556 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-03-31
| null | null |
Atypical porcine pestivirus, complete genome
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TAATGCTTTGATTGGCTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGTTAAGCGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTGGACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCTCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCATGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAAGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCATGCCCCTCTTACGGGGTAGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTGAGAGTATAAAATCCGTTGTTCGTTAACATGGAAAAACAGATCGCATATTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACAGAATTGGTAGTAGGAGAAAGCCATACGAAAATAACCACACTCTCTGGAAAAACCTATCGCGGTACTTGGGAAATGGAGAAGCGGTCGAATCCTTACGGAATCTACCTCCCCAGGCCTAGCCCTCGACAGCTCACCGCTATACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGCAAGGTAATGGAGTACAAGGAGAGGGACCCTAATTATGGTGACTGCCCGAATACGAATGGGGTATTCATCGATGAAAAGGGCAGAAGACTGAGTAGCCCCCCATTGGGTATCTGGAAGATAAGATTGGACTATGGTGACCTGGTAAATATAAACAGACCAATTCCTGTTAGTGGGAAAAACTCTTATCAAGTCGAGACCTGCAGCGGGGAGCTGGCTACTGTAACACTAGTACACGATAGGGTACTTGTGGAAGACTATAGAGGGCTTTATCAATGGAAACCCAGTTGTGAAGGAATTGTGCTCTATGTGAAAACTTGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAGCCCCCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGATCCCAGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAAGTCACAGAAAAAAAGAGACAACCTAGTGTCACCTTAGTATCAGGGGGACAGAAGGCCCAAGTCATCTATAAAGGCAGGACTAAAAATAAAAAGACTCCGGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAGAGAAGGAGATGTGGCAAAGGTCAGGAAGATGCTGAAGAACTGGCATATAGCATTAGTAATGTACTTGATATATATTATAACTCCAAGTTTTGCCAAGGTCCAGTGGTTTTTAAAGGATGAAAATTCGTCGGGGATCAACCAGGTACTATGGCGAAGACAGATTAACAGATCTCTACATGGGGAATGGCCTAACCAGATTTGCCACGGTATGCCAAATGAAACTATCACCGACGAGGAATTACGCAGTCTAGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACTTGTTGTCAGTTACAATATCATGAATGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCGCAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACGGCCCTGCAAGCCAATCTTACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGCGCTGTCATCTGTCGATTTAACGGAACCTATAATATCGTAAGACAAGCTAGAGATGAGGTGAGTCCATTGACAGGGTGTAAGGAAGGGCACCCTTTTCTATTTTCTGAGGAGAGGTCCGACACCTCATGCTTGAGGCCGCCTTCCACCAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCATCAGTGGCTGACAGCTTCGCCCATGGGGTCGACAAGGCCATAATATTAATCAGAAAAGGGGCATCGGGAATTATCAATTTCTTAGATACTATTGGGAGATGGTTACCGGTGACTGAAGCAACTATAGTGCCATATTGCGAAACCTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCACGTAAAAAATTGTCTTCCTAGAGGGCTACCTAGACATTCGAAAATAATCTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCGGCCCATAACATCCAGCACCTATTCGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTCGGGATCCTGGGTGAGTGGTACGGGGAATTAGCCTCTACAATCTACTTACTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAGCACGAAAGCTTGATCACAGAAGGGTTGATCCCGGGTATCAATATTACAATAGAACTCCCGGCTAGCCACACTGTACCTGGTTGGGTGTGGGTCGCGGGCCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCCACACAGATTTGGATTGAAACCGTAGTGGCAGAAGCCTGGCACATATTAAAAATCCTAGCATCAGCCTTGGTGAACATAGTTACTGCATTTGTAAACCTAGAACTGGTCTACTTGGTCATAATACTAGTTAAAATATCAAAAGGGAACCTGATAGGTGCTATATTATGGTGCCTATTACTGTCTGGGGCTGAGGGGTCATGTATAAAAAGGCAAGACTACTACAATGTCCAGCTAGTCGTTGAAGAAAAGACAGGCGTAGAAAAAAGATCTATAATGGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGCCGAGAACCAAGATTAATGGAACAGATAAATGTGGTGTCAAATGAAAGTGTGTTAGAAACTTACTGCTATAATAGGCTCAATACCAGCAGTTGGGGGCGGCGACCGATAAGACAGAGAGGGTGCGGTCAAACAGTGCCCTACTGGCCCGGTGATAATGTCCTAGAAGAACAATACTATAGCATGGGCTACTGGGTGAACGCAACAGGCGGTTGCCAACTTAGGGAAGGCGTATGGCTATCAAGAAAGGGCAATGTGCAGTGCCAGCGTAATGGTTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAAGACAATGACACCATGGAAATACCGTGCGACCCAGTGGAAACAGAAAGCATGGGCCCAGTTGCGCAGGGTACTTGCGTGTACAGCTGGGCAGTCGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAATAGGAAAGATGGTTACTGGCTGCAGTACATAAAGAAAAATGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACTGCTTCGTCCGCGGCAACGATGTACCGCCACCTGCTCCCTTTGCTGGTAGCCTGCCTTATGGGCGGCAGGATATCAGTGTGGATTGTTGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTGGGCACCAAACAACTGGCCGTCACACTAACTCTATGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTTTTCTACATCGTCATAATGCTAGTCGTTAAGGAAGACCTCATAAAGAAAATAGTGACCGCAAGTCTCGTGACCTTAAAAAATAGTCCAGTGGCCTTGAGCTTTCTCATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTGGGTTTACTACTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCAGAGTTTGGAACTCCTTTCTTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAATGGACTGTCTTAGTCAGTTTCTCCGCACTAAATCACGAGAAAACTATAAAATTGGCAAGGAAGCTATTATTGGCTACACATATAACAGCGCTCACGTTGACTGGTCTAAGTGATTCAATCTTTTATATCATGCTTATAATTACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATATCTATTGGGGGCTAGCATAAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAAAAAGTTGCTGGTAAAGAGGAAGCTAATATATAAAAAAGCCGCAATTTGCAATCGGGACGAGAATGAACTGGAGTACAAATTCAACAAGATAACCGTGAACGCCGATTTCACCCCATGCAAACTTGAATTATTACAACTACTTAGGGCTTTTTTAGTATCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAACCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCCTAACTGTTATAGTAATTGGTGTACAAGAATACAATGTGGCAATGGCCCGTGGGCGAAGCATGGTCCACAGATTACTAGCTATGGCCTACTATATATATGGTCGCATACAGGGTAATACGTTCCAGCTTGCCAGTATCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCAAGGAAAATCATGAAACACATGATAGAAAACCCAACCCTTAGGAAGTTCTGGCAGGGTGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAGTCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACATAAGGGTATGTGCGGCCTACCAACTGTAGTACAAAATTTGGTTATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATCCTAGGAGAATTGGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTTTAGGCCCCGGCAGAATCCCAAAGATTACCAATGTTGAGTCTGCTAAGATGGACTTACTCTCCAAACTCATGACTTTTCTGGGGATTGAAAGTTCAAGGGTTCCCAGAACCCCAATCCACTCAACAAGGAAATTACTGAAGATAGTGAGAGGCTTGGAAACTGGGTGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATTAGTAGCGCAAAACATGTTACAGGTGAAAAAAACTTAATGACCCACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTACATCTTACAATCCCAAGAACATGGCGCCGATGAAGTTGAGTATGGAGTAAAAACTGACCAAAAAGCACCCGATAACGCTTTATGCTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAACATAAAGGGAGAAACAGGGGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAACAAAGCCTATTACAATGTAAACAATCTGAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGCTGCACTCCACAGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAGCTTATCGACTCCAGGACTATCAGTAAGAGTAATGAGACAAACCTGGATCACCTTATTAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCT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| 57,674 |
MN584737.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Yan,H., Wang,X., Wang,G.
|
South China University of Technology, School of Food Science and Engineering
|
China
|
2019-11-18
|
GD-CT4
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,101 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate GD-CT4, complete genome
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GGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTCATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGAAATGGGTGGACAGAACTGGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACTACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGGATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCGACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTATACACGGCAGGGTGTTTGTGAATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCCTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAATATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCCTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGATAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAGAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCACACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCTAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGCTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTACTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTTACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCTAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGGTTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATAAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCGGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAAAATGGTATCAAATAGCAGTCTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGACACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGATACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCCGCGACTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTAGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGGATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGCTTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTCTGTGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGTTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTCCTAATTTACTTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGACTAGCAAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACCTTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTGGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAGTAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGTTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTAACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAACCTGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGCCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTTAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTGCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTGGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCATTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACATATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCGGATGAAAATGATCTGGTGGAGGAGCTGATCGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGCAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACTACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACACAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCCACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATA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| 58,226 |
MK347474.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Xie,Y., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2019-05-25
|
GD-LDCT1
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,089 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate GD-LDCT1, complete genome
|
GGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTCATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAGATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGTTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTCGTGGATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGCTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGGCTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTGAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATTAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATCACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATCATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCCAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGCTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCCAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGATTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATAAGCGACAGGACTATTATAATGTTCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAAGGTCGAGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAAAATGGTATCAAATAGCAGTCTAACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGATACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGGCTACCAATACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGGATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGCTTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCTTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTTCTAATTTACTTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCAAGGAAACTTTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACCGGCCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGAATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTAACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATCTGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTACAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTGGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCCGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGTAATGAGACAAGTCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACTACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACATAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCTACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTATTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATA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| 62,667 |
MK347475.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Xie,Y., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2019-05-25
|
GD-YJHSEY2N
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,043 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate GD-YJHSEY2N, complete genome
|
GGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTTTAACATGAAGAAGCAGATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACGGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACCACACTCTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCTTACACCCACACCCGGTGGTGAACTGCAAGATGATAGAGTACAAGGGGGTGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTGGTAAATGCAAGTAGACCAGTCTTTACCAGCGGAAGAAATTTATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCCACCATAATACTGGAGCACGACAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAAGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCTCAGCGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAAATCACGGAGAAAAAGAAACAACCGAGCGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTATAAGGGTAAGACCAAGAATAAAAAGACCCCGGATGGGGTTTATAAGTACCCGGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTCAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTAATATTTTTCGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGTCGTGGAATGCCAAACGAAACCATTACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGGATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTATACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGTAATTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCCGACACCTCATGTCTAAAGCCTCCATCCACTAGTTGGGTCAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCGTCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCAGTGGCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGTGAAACTTACACTGTAACAGGGATGTACGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTGCTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGTGCTGTATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTTGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCCATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCAGAAACTTACTGCTACAATAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGACGGCAGCCGATAAGACAGAGGGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAAGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGAAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGTGATAAAAGAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGTGATCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGTGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAAGAAAGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACCAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTTATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTTACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACATCGTCATAATGCTAGTTGTCAAGGAAGACCTTATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTCGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTTGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGTCTATTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAACCACGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCACATAACAGCACTGACATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTCTAATAAAGACATTTATATATCTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTCCTTGTCTCCCTATGTTTTTCCTATTACAAACCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGTAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGTCCAAGGAAAATCATGAAACACATGATAGAAAATCCGATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACGGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTGCACAAAGGCATGTGTGGCCTGCCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACTAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATTACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTTATGACCTTCCTGGGGATCGAAACCTCCAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTATTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGTGCCAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACTCATATGGAGGGCAGAAAGGGTAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACTGATCAAAAGGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTATAATGTAAATAACCTTAAGGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGCTGCACTCTACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCTTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCGGTATTGGTTCTGGTTCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGCGTGTGCCGCTTTATGAGATCCAAATATCCCACTATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGTGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTCAACCTAACCCAACTCAAGGAATGGGTGTCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAA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| 62,668 |
MK347476.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Xie,Y., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2019-05-25
|
GD-YJHSEY3N
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,043 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate GD-YJHSEY3N, complete genome
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GGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTTTAACATGAAGAAGCAGATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACGGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACCACACTCTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCTTACACCCACACCCGGTGGTGAACTGCAAGATGATAGAGTACAAGGGGGTGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTGGTAAATGCAAGTAGACCAGTCTTTACCAGCGGAAGAAATTTATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCCACCATAATACTGGAGCACGACAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAAGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCTCAGCGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAAATCACGGAGAAAAAGAAACAACCGAGCGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTATAAGGGTAAGACCAAGAATAAAAAGACCCCGGAAGGGGTTTATAAGTACCCGGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTCAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTAATATTTTTCGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGTCGTGGAATGCCAAACGAAACCATTACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGGATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTATACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGTAATTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCCGACACCTCATGTCTAAAGCCTCCATCCACTAGTTGGGTCAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCGTCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCGGTGGCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGTGAAACTTATACTGTAACAGGGATGTACGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTGCTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGTGCTGTATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTTGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCCATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCAGAAACTTACTGCTACAATAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGACGGCAGCCGATAAGACAGAGGGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAAGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGAAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGTGATAAAAGAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGTGATCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGTGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAAGAAAGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACCAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTTATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTTACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACATCGTCATAATGCTAGTTGTCAAGGAAGACCTTATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTCGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTTGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGTCTATTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAACCACGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTCTAATAAAGACATTTATATATCTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTCCTTGTCTCCCTATGTTTTTCCTATTACAAACCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGTAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGTCCAAGGAAAATCATGAAACACATGATAGAAAATCCGATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACGGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTGCACAAAGGCATGTGTGGCCTGCCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACTAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATTACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTTATGACCTTCCTGGGGATCGAAACCTCCAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTATTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGTGCCAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACTCATATGGAGGGCAGAAAGGGTAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACTGATCAAAAGGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTATAATGTAAATAACCTTAAGGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGCTGCACTCTACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATCAAGTCAGCTTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCGGTATTGGTTCTGGTTCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGCGTGTGCCGCTTTATGAGATCCAAATATCCCACTATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGTGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTCAACCTAACCCAACTCAAGGAATGGGTGTCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAA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| 62,669 |
MH221022.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Li,Y.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-04-30
|
APPV-China/GD-GL/2016
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,043 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
brain
|
2016-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV-China/GD-GL/2016, complete genome
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GGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTTTAACATGAAGAAGCAGATTACATACTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACACGAAAATAACCACACTTTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCTTACACCCACACCCGGTGGTGAATTGCAAGATGATAGAGTACAAGGGGGCGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTGGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGATTACAATGAACTGGTAAATGTAAGTAGACCAATCTTTACCAGCGGAAGAAAATCATACCAAGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCCACCATAATACTGGAGCACGACAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGGCACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAGGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCTCAGCGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTACAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAACCGAGCGTTACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTACAAGGGTAAGACCAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGGGTTTATAAGTACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTAAAAGTCAAGAAAATGTTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTAATATTTTTTGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAGTGGCCCAACCAGATCTGTCGTGGAATGCCAAACGAAACCATCACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAACAAGTTTGGATCAAGAGAATAGCAGCTTTACAATCCAACCTAACTGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTAACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGTCTAAAACCTCCATCCACTAGTTGGGTCAGACCAGCAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGACAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCAATAATATTAATTAGAAGAGGGGCATCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCAGTGGCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGTGAAACCTATACTGTAACAGGGATGTACATTCATGTGAAGCATTGCCTCCCCAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACGATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCTCACAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTGTCATGGGTGAGTGGTATGGGGAGCTGGCCTCTACGATATATCTGCTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAGCATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTGTGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACACAGGTGTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTACCTGGTTATAATACTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGTGCCATATTATGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCTACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTCGTCGAGGAAAAGACAGGAATAGAGAAGCGATCTATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCAAATGGGACCCTATCAGAAACTTACTGCTACAATAGGCTGAATACCAGTAGTTGGGGACGGCAACCGATAAGACAGAGGGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAAGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATTCAACAGGTGGTTGCCAATTAAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGCGATAAAAGAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAAGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAGATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTTATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTAGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTCATAATGCTAGTTGTCAAGGAAGACCTTATAAGGAAAATGGTGACTGCAAGTCTCGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCTTGAGTTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTGTTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTTTTGATCTACCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTGTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCACGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACTAACCTTCTAATAAAGATATTTATATATCTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGTAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGTAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTCCTTGTCTCCCTGTGTTTTTCCTATTACAAGCCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTGATAGTAATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGCATGATCCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGTCCAAGGAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCAATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACGGAACTTTTCAATCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCGACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTACACAAAGGCATGTGTGGCCTACCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATTACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACCTTCCTGGGGATTGAAACTTCTAGGGTCCCCAGAACCCCGGTCCACTCGACAAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGTGCTAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGCAAATATATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACTGATCAAAAAGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAATCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTTATGAAGAAAATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTATAATGTAAATAATCTCAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGCTGCACTCCACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAATCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGATTCTAGGACTATCAATAAGAGTAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGAACGGGTGCTGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACTACAGTAGGTGCCCATAAGTCGGTATTAGTTCTGGTTCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGCGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCCACTATCAACTTTTCCCTAAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGTGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTCAACCTAATCCAGCTCAAGGAATGGGTGTCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAA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| 62,994 |
NC_030653.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Postel,A., Hansmann,F., Baechlein,C., Fischer,N., Alawi,M., Grundhoff,A., Derking,S., Tenhundfeld,J., Pfankuche,V.M., Herder,V., Baumgartner,W., Wendt,M., Becher,P.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-07-25
|
Bavaria S5/9
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,908 |
RefSeq
| 1 |
Germany
|
Germany
|
Sus scrofa
| null |
2015
| null |
PRJNA485481
|
Atypical porcine pestivirus 1 isolate Bavaria S5/9 polyprotein gene, complete cds
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ATGGAAAAACAGATTGCATATTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTAGTAGGAGAAAGCCATACAAAAATAACCACACTCTCTGGAAAGATCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGACCGAATCCTTACGGAACCTATCTTCCTAGACCTAACCCCCAACAGCTCACAGCCCTACACCCCCACCCGGTGGTGAATTGTAGGGTGACTGAGTATAAGGGGCTGGACCCCAATTATGGTGATTGCCCGAATACAAACGGGGTGTTCATCGACGAAAAAGGTAGAAGGCTGAGCAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTAGACTACAGCGATCTGGTAAATATAAACAGACCAGCTCCCGCTAGCGGGAAAAACTCTTATCGAGTCGAGACCTGCAGTGGGGAACTAGCTACTATAACACCGGTACACGATAGGGTACTTGTAGAAGACTGCAGGGGGCTATACCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATGGTGCTCTATGTGAAAACTTGCTCTGATTGGGCGGATCAGGTGGAAAAACAAGAAAGGGGAAACCCCCCAAAACCTCAGCGACCACCGAGGCGAGACCCACGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCTAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAGACAACCCAGCGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTCATCTATAAAGGTAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGAATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCCAGAGAAGGGGACGTGGTAAAGGTTAAGAAGATGCTGAAGAATTGGCATATAGCTGTAGTAATGTACCTGATTTATATCATAACCCCAAGCTTTGCCAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAGAACTCAACGGGGATCAACCAGATACTGTGGCAGAGACAGATCAATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCCAACCAGATCTGCCATGGCATGCCGAATGAAACCATCACGGATGAGGAATTACGCAGCTTGGGAATGATAGATACAAGTCCCAGAACAAACTACACTTGTTGCCAGTTACAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCACAAAAACAGACTTGGATTAGGAGGATAACAGCCCTACAAGCTAACCTCACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAGTGCGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCTATAACATCGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAGGAGGGGCACCCTTTCCTATTTTCTGGTAAGAGATCCGACACTTCGTGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTCAGACCAGTGAAGATGGACGAGGCATCAATGGCCGACGGCTTTGCCCATGGGGTTGACAAGGCAATAATACTGATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATTAATTTCCTAGACACCATTGGGAGGTGGCTACCAGTAGCCGAAGCAACTATAATACCATATTGTGAAACTTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCCAGAGGGTTACCTAAGCACTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAACATCCAGCACTTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAATGGGTTCTAGTCTTACTCGGGGTTCTGGGTGAGTGGTATGGAGAGTTGGCCTCTACAATATACTTACTACTAGAGTATGGATCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCTTGATTACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACGATAGAACTCCCAGCCAGTCAAACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGTGTGAAGCCAGACTGGTGGCCCACACAGATTTGGATAGAAACCGTGGTGGCAGAGGCCTGGCATATATTAAAAATACTGGCATCAGCCCTTGTGAATATAGTCACTGCATTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTAGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATATTATGGTGCCTGTTATTGTCAGGGGCTGAAGGCTCGTGCCACATAAGACAAGACTATTACAACATCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAAAACAGGTGTAGAAAAACGATCCATAATGGGCAAATGGTCCGTGATAACCAGGGAAGGTCGGGAACCAAAATTAATGGAGCAAATAAATATAGTGTCCAATAATAGCCTGTCAGAAACTTATTGCTATAATAGGCTAAATACCAGTAGCTGGGGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGTCAGACCGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTCCTGGAAGAACAATATTATAGTACAGGTTACTGGGTGAACGCAACGGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAAGGCAATGTACAGTGCCAGCGAAATGGCTCATCCTTGATACTGCAATTAGCAATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACTTGCGTATATAGCTGGGCATTCGCCCCAAGAGGGTGGTATTATAATAGGAAAGACGGTTATTGGCTTCAGTACATAAAGAAAAACGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACTGCCTCGTCCGCTGCGACAATGTACCGCCATTTGCTTCCCTTACTGGTGGCCTGCCTCATGGGTGGCAGGATATCGGTGTGGATTGTAGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGCGAAGTGGGTACCAAGCAACTGGCTGTCACACTAACTCTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTACTTTTTTATATTGTCATAATGCTAGCTGTCAAGGAAGAACTCATAAAGAAAGTAGTGACTGCCAGCCTAGTGGCCTTAAAAAATAGTCCAGTGGCCCTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTGGGTTTGCTGTTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCGGAGTTTGGAACCCCCTTCCTGATCTACCTGTGGGATAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCGCTGAACCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGTTACTGGCCACACATATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGATTCAATCTTCTACATGATGCTTATAATGACCAACTTACTAATAAAAACATTCATATATCTACTGGGGGCCAGCATAAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAGAAAATTGCTGGTAAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAATTTGTAATCAGGAAGAGAATGAATTGGAGAATAAATTTAACAGGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGCAAACTTGAACTCTTACAATTACTTAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTTTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACCACCCTAACTGTTATAGTAATTGGCGTACAAGAGTACAATGTAGCAATAGCCCGTGGGCGAAGTGTGATCCATAGACTACTAGCCATGGCCTACTACGTATATGGCCGCATACAGGGTGACATGTTCCAACTCGCCACTATCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACTCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACAGAACTTTTTAACCAGGGTGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCGAGGAAAATTGGGCTGGAGGAATTACATAAGGGCATGTGCGGCCTCCCAACTGTAGTGCAAAACCTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTCATTCTAGGAGAGTTGGGTTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTTTAGGCCCTGGCAGAATCCCAAAAATCACCAACGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTACTCTCCAAACTCATGACCTTTCTGGGGATTGAAAGCTCAAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCAACTAGGAAATTATTAAAGATAGTAAGAGGCCTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCATGCAGGAGGAATCAGTAGCGCGAAACACGTGACAGGCGAGAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTATATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGACCAAAAAGCACCCGACAATGCCTTATGCTACTGCTTCAACCCTGAAGCCACAAACATAAAAGGTGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGATGGTAATAAAGCCTATTATAACGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCATATTCGGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAACTTATCGACTCCAGGACCATCAGCAAGAGCAATGAGGCAAACCTGGATCACCTTATCAAGGAACTGGCAAATATGCGGAGGGGGGAGTTTCGCTCAATTACTCTTGGAACGGGAGCTGGGAAAACTACCGAGCTGCCCAGGCAATACCTCACAACAGTAGGAGCCCATAAATCTGTGTTGGTCCTAGTCCCCTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTCATGAGATCCAAATACCCTACCATCAATTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGGAAAGAGGGAGACGTGAGTAGCGGCATCACTTACGCTACTTACGGATTCTGCTGTCAGCTAAACCTGGTCCAACTCAAAGAGTGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTTTTTGACGAATACCATACGGCTACTCCAGAACAGATAGCTATAATAAGCAAGATCCATGCCCTAAAAATCAAAACTAGGATAGTGGC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| 5,525 |
MZ542765.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Ren,X.J., Hu,Z.H., Qian,P., Chen,H.C., Li,X.M.
|
Huazhong Agricultural University, State Key Laboratory of Agriculture Microbiology
|
China
|
2022-05-02
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,454 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-02-06
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 strain CH-HB2021, complete genome
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TGCTTTGATTGGCTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGTCATAAGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCTATGGACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCATTTCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGGCCACCATACCCCGTTATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTCTATTAACATGGAAAAACAGATTTCATACTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTGGTAGGTGAAAGTAGTACAAAAATAACTACGCTATCTGGAAAGACCTATCGAGGAACTTGGGAGATGGAGAAACGAACGAACCCTTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTCACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGAGGTGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCGAATACAAATGGGGTGTTTATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTATAGCGACCTGGTAAATATAAATAGACCAATCCCCGCTAGTGGGATGAACTCTTACCGAGTCGAGACCTGCAGTGGGGAGATGGCTATTGTAACACCGCTACATGATAGGGTGCTTGTAGAAGACTACAGGGGACTATATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATAGTGCTCTATGTGAAAACATGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTTGAAAAACAAGAGAGGGAAAGTCCTCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAAACAACCCAGTGTTACCTTAGTATCAGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTTATCTACAAAGGCAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGAATCTATAAGTATCCAGGAGCCAAAGAGGGGGACGTAGTGAAGGTCAGGAAGATGTTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACCTGATGTATATCATAACCCCAAGCTTTGCTAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACAGGGATCAGTCAGATACTGTGGCAAAGACGAATCAATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCTAACCAGATTTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACGGATGAGGAATTACGTAGTCTGGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACCTGTTGCCAGCTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAATTACCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACAGCCTTACAAGCTAACCTCACTGGAGGCTATGAGGGACCTGAATGTGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCCATAACATAGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGGCACCCTTTCCTATTCTCTGGTGAAAGATCCGACTCCTCATGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTAAAGATGGACGAGGTATCAATGGCCGACGGCTTCGCTCATGGTGTCGACAGGGCAATAATCCTGATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAATTTCCTAGATGCTATTGGGAGGTGGTTACCTATAGCTGAAGCAGCTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACCGTGACGGGGATGTACGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCTCCGACAATGATATATCTGGGGGAGGGTGACCCAGCCCACAACATTCAGCACTTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGGGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCCTCTACGATATATCTACTATTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTCCCAGCCAGTCATACGGTGCCCGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCCACACAGATTTGGATTGAAACCGTGGTAACAGAGGTCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCCTGGTGAATATAGTCACTGCCTTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGCTCGTGCCACAAAAGACAAGACTATTACAATCTCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAGGACAGGCGTAGAAAAACGGTCCATAATGGGCAAGTGGGCTGTGATAACCAGAGAAGGTCGGGAACCAAAACTAATGGAGCAAATAAAAATAGTGTCGAATAACAGCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATACGCTAAATACTAGCAGTTGGAGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGCCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCTTAGAAGAACAGTATTACAGCTCAGGCTACTGGGTGAATGCGACGGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTGTGGCTGTCAGGAAAGGGCAATGTACAGTGCCAACGCAATGGCTCATCCTTGATACTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTCGCACAGGGCACTTGCGTGTACAGCTGGGCATTCGCCCCAAGGGGGTGGTACTATAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAACGATTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACCGTCTCATCCGCCGCAACGATGTACCGTCATCTGCTCCCCCTACTTGTAGCCTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTAGGTACCAAGCAATTGGCCGTCACGCTGACACTGTGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTCTTCTATATTATCATAATGCTAGCCGTCAAGGAAGAACTCATTAAGAAAATTGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTTATTGTGCTCAGGCTTGTGGGAGGTAGTGAAGCGCTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCGGAATTTGGAACCCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCACTGAATCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGCTATTGGCAACACACATAACAGCGCTCACATTGACTGGCCTGAGTGACTCAATCTTCTATATGATGCTTATAATGACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATACTTATTGGGGGCCAGCATGAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAAGAAGTTGTTAGTTAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAGTCTGCAGACAAGGTGAGAATAAGTTAGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGTAAACTTGAACTTTTACAACTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTCTCTTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCCGAGACTACCTTGACTGTTATAGTAATCGGCGTACAGGAGTATAACGTAGCTATGGCCCGCGGGAGAAGCGTGGTCCATAGACTACTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGTTAGCCACTGTCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACACTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAGTTACACAAGGGTATGTGCGGCCTCCCAACTGTAGTGCAAAATTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAGCTGGGTTACCCCCCTGGGGATCTCACCAGCGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACTAATGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTGCTCTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATAGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAATTGCTGAAAATAGTCAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATCAGTAGCGCAAAACACGTGACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTACATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCAGATAATGCCTTGTGCTATTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGACGGTAATAAAGCTTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGGGCCATAGTGGGGAGGATTAAGTCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTCATTGACTCCAGAACTATCAGCAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGAGAGTTTCGCTCAAT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| 30,924 |
MK216749.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
AH-GL-2017.04
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate AH-GL-2017.04, complete genome
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ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCATAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCATCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTATCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACGCGGCAGGGTGTTTGTGAATGACTACAGGAGATTTTATCAGTGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTTGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACTAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGTTACCCAAGCACTCGAAGATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATAACGGTGGAGCTTCCTGCCAGTCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGGTTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATAAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATAGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCGGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATGTGGTATCAAATAGCAGACTGACAGAAATTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGACACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTCTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGATTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACTCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTTCTAATTTACTTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCGAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTAGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTGACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATATGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGCCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTTTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGATCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTTCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTAGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGTTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGCAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGTATGCGGAGAGGGG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| 62,109 |
MK216750.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
AH-GL-2018.01
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-01
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate AH-GL-2018.01, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCATAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCATCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAAATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTATCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTTGTGAATGACTACAGGAGATTTTATCAGTGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATTATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTTGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACTAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATCGTAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGTTACCCAAGCACTCGAAGATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATAACGGTGGAGCTTCCTGCCAGTCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGGTTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTATTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATGAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATAGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCGGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATGTGGTATCAAATAGCAGACTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGACACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTATAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGTAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGATTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACTCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTTCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTTCTAATTTACTTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGTTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCGAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGTAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTGACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATATGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTTTGATGTCGAGTCCAAGAAAAATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGATCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGTTTGCCGACTGCAGTTCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTAGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGCAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGTATGCGGAGAGGGG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| 62,110 |
MK216751.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
AH-SG-2018.01
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-01
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate AH-SG-2018.01, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCATAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCATCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTATCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGAAGGGTGTTTGTGAATGACTACAGGAGATTTTATCAGTGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTTGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATTAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACTAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGTTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGTTACCCAAGCACTCGAAGATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAGCTAGCCTCAACAATATATTTGATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATAACGGTGGAGCTCCCTGCCAGTCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATGCTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGGTTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATGAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTGGTCGTTAACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATAGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCAGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATGTGGTATCAAATAGCAGACTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGACACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCATGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGGCTATCAGTACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGATTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACTCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTCCTAATTTACTTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCGAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTGACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATATGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTTTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGATCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTTCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTAGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGCAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGTATGCGGAGAGGGG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| 62,111 |
MK216752.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
GD-HJ-2017.04
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate GD-HJ-2017.04, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCAAAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGACCGAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAATTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTTGTGGATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGCTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAGAAGACCCCCGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTACACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAATTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCGCTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGATGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGAATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCCAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAACATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGATTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAATTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCCAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTGCTGCATTTGTGAACTTGGAATTGATTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGGTCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAGGGATCATGCCATAAGCGACGGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCAGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATATGGTATCAAATAGCAGTCTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGATACCCAATAAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTTGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAACGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTACCAATACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGATTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACTCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTTCTAATTTACTTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCGAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTAGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTGACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATATGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTTTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGATCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTTCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTAGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCTATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGTAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGG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| 62,112 |
MK216753.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
GD-LN-2017.04
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate GD-LN-2017.04, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCAAAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGACCGAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAATTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTTGTGGATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGCTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAGAAGACCCCCGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTACACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAATTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCGCTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGATGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGAATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCCAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAACATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGATTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAATTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCCAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTGCTGCATTTGTGAACTTGGAATTGATTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGGTCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAGGGATCATGCCATAAGCGACGGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCAGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATATGGTATCAAATAGCAGTCTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGATACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAATGACTATCAATACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGCTTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTGCTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTCCTAATTTACTTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCAAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATACCTACTGGGGGCCGGCATTAATTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGATGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGATTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTAACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATCTGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTGCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTGGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCCGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTGAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTGCCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGCCGGCGTATTCAGACGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGTAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGG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| 62,113 |
MK216754.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
GD-ZW-2017.10
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-10
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate GD-ZW-2017.10, complete genome
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ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCATAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTCATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGAYTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTTGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACCATGACTTGGTGAATGTTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTCGTGGATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATAGTGCTCTACGTGAAAACCTGCTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTGACTTTAGTGGCTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAACGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGTCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGCTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCAGGAATCATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCCAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCGGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCCAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGATTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCCATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATAAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCGAGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATATGGTATCAAATAGCAGTCTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGATACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGTAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTACCAATACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGCTTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGATAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTCCTAATTTACTTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCAAGGAAACTTTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACCGGCCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGAATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTAACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATCTGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTACAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTGGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCCGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCTATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGTAATGAGACAAGTCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGG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University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
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OM456553.1
|
Aurora borealis virus 3
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Hepojoki,J.
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University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
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2022-09-03
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CR-wild1-FFPE
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Aurora borealis virus 3
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Reptarenavirus
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Arenaviridae
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Costa Rica
|
Costa Rica
|
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1989
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University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
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Finland
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2022-09-03
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CR-wild2-FFPE
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Aurora borealis virus 3
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Reptarenavirus
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Arenaviridae
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GenBank
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Costa Rica
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Costa Rica
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Boa constrictor
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Aurora borealis virus 3 isolate CR-wild2-FFPE segment L, complete sequence
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| 25,860 |
OM456557.1
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Aurora borealis virus 3
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Hepojoki,J.
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University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
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Finland
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2022-09-03
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CR-wild3-FFPE
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Aurora borealis virus 3
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Reptarenavirus
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Arenaviridae
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GenBank
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Costa Rica
|
Costa Rica
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Boa constrictor
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2012
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Aurora borealis virus 3
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Hepojoki,J.
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University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
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Finland
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Aurora borealis virus 3 isolate CR-wild4-FFPE segment L, complete sequence
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CGGGATCCGCGTTTTCCAGTATCCATCTAAAGAGTTAAATCTCAACAAATTAAATCCAAAGTTTGACATCTGAGAGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAGGACATTCAACATGAGTGATTCGACCTCCATAGGTCTAACCACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTAGAGATTGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCAATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAAAATGCAAGTCTTGTAATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAGTGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGCTATGAGGCATGTCTCTGGTGTGAAAACCCAGATGGCTCTCTTACATCATTGGCACTTGTCAACAAAGAGAGAAGCAGACACACCGGAGGTGAAGGAGACATCCAGGGGCCCTAAGAGACCACAGCAGAGCAGAGAGACAACAGCAAAAACCCAGAAAGGACAAGAGAAAGGGACAACCCAGACCGCCGAGGGGAGCAGCGCTCCCCTCGGCGGTCTGGGGGGTCTCGAGCATGGCCCTGCGATCTAGTCTTCCAGGGTCTCGGGCTCGGGAGTTCCGGACGCCCAATCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGCCCAGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAACCTGTGAAACACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTAAAGACTCTATCTGTAAATGTTAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGCTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACTTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAGATTCTACTTACCATTCCCCATAGAGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGACAAGATATTTCCCCCTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCTTCTGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCCAGGGGAATTATACAGCCCATGAACAAGAAACATGGCTTTCCATTTGGCTTGGGATTTTCTATAATTGTAACATCTCTAAACTCTAGCATGTCCAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTCTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTTACCTGCTGAAAGCAGCACTGTAACTTTATTGGATTAGATGTTCCTAGTTTAGCGCCTCTAATCCATGTGCCATCTTCCAGAGGGGCCTCTGGAGCACCTCTCCCATACACAACGACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTGCCTAATAGAATTTGTTGGATGTATCTTCTGACACCAGATTCTCCATGTGTCTTTAGCTCGTCCATAGAACCTTCATATGGAGCAAGTTTTGTTGCATCCAGAACCATAACTTTATCTATAATCTTCGGCTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATTCTCTCAGGTCCTCTTTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCCTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAACCCTTCATTCGCACATTCTATTAACAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAAAGATCAGGCATGGTCATCTCAATGGCTGCAGTCAATTCATCCAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTAACAAGTGATGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCTAATCCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATCACTAAGGAGGGGAAGACTTCAGCCACAGATTTTACTACAACTTTAGATTCCTTTAGAGTCAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTTTCAAGTCCTTCTGCAATCAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAACTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTGAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAATTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATCTGCTAATTTCTACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCTTTGATCACCTTTAATAGTTCAAGTTTCAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATATCCATCAACCAGCTCTCCAATGACCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAGTCTTGTTGTCTTGATTCTACAGGCTTCATCAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCTCTTCAATGAATCAGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAGGCTGCAAAAAACTTTGTGAAAAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACCTCAAAGTGAGACTTGAATTCCCCAACAAGTGGGCTGCAGCAAAACTTTGGTGAGATGTGTTTATTCAAACAGTTGGACACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTCTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTGTTCATAGTGCTCGACCTGATCCCAAATATATCTCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCTAGAGACCCATAAAGGTCAGATGTATGGTGTAAGATTCCCTGACCCATGTCAAACCATGAATGGACTTGTGAAGGCACAGGTCTATTGGACAAGACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTATCTCTTCTCCCTAGACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCTGCCAGGATCTGAGGCGTTTCCACCGCTTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAAAAATCTAATCTTTTCCCCTCAGTGTCATTGATACTTTCCATTGCCTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTATTGAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTCAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTGAGTTTATTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCTACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCTTTTATTGCAAGCCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAGTCCTTAATCTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAAGAGTCTATCCTGCAATGCTTCTGAATTGGTAACTCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATACTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTGAATCCCGCCCAGAGGAGCAAGAATTTGAAGCTCGAGAAAAACTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCTGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCCTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTGACATTATCTCACTGACAACTTTCTCATAGGTTTCCTCCTTTAAGAGATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTGGAGCGAACAAGATCACAAATTTCAGGACCCAGTAGCTCACGAATCACATCCAAGACCAAGCAGTATTTAGTTTTTTGAAGATCACTCACATCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATCAATTTCTGACATGCACTTGCTGATCCGAAGAAGAAAATCACTCAAACCCTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCATAAGCCAACCTAGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTGGCAAGCTTATCCTTTGACTTTGAACCTTTGACTTCTTCCAATTTATTTTCTGCCCCTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAACCTCTCACTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATCTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTATTTGAAGTCAAGTCCAAAACATCAATATTTGATGTTAGGTAATCTTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATTGATATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATATAAGAATGGCTTGGTTTCAAAAGAGGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAGTCATAGATCATGTTAGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTGTCTGGAGTTTCTTTTGTAATCAAGTGACACAAGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTAATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTTAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTACCAACAACTTTATCTTTTAAATCTTTGTGGTGAATGAGGGA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| 25,862 |
OM456562.1
|
Aurora borealis virus 3
|
Hepojoki,J.
|
University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
|
2022-09-03
|
CR-Wild5-brain
|
Aurora borealis virus 3
|
Reptarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,898 |
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Boa constrictor
| null |
2018
| null | null |
Aurora borealis virus 3 isolate CR-Wild5-brain segment L, complete sequence
|
CTGGGGATCCGCGTTTTCCAGTATCCATCTAAAGAGTTAAATCCAAACAAATTAGATCCAAAGATTGACATCTGAAGGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAAGACACTCAACATGAGTGGGTCGACCTCCATAGGTCTAACTACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTGGAGATCGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCGATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAGAATGCAAGTCTTGTGATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAATGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGTTATGAGGCATGTCTCTGGTGCGAAAACCCGGATGGTTCTCTTACATCATTAGCACTTGTAAACAAAGAGAGGAACAGACACACCAGAGGCGAAGGAGACACCCAAGAGCCCTGAGAAGCCAGAAGCAGAGCAGAGAGACAACAACAAAAGACCCAGGAAGGACAGGAGCAGGGAACAACCCAGACCGCCGAGGAGAGCAGCGCTCTCCTCGGCGGTCTGGGGGGTTCCGGGGCGTGGCCCAGCGATCTAGTCCTCCAGGGTCTCGGGCTCAGGAGTTCCGGACGCCCAGTCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGACCCGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAGCCTGTGAAATACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTGAAGACTCTATCTGTGAATGATAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGTTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACCTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAAATTCTACTTACCATTCCCCATAAGGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGGCAAGATATTTCTCCTTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCTTCTGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCTAAGGGAATTATACAACCCATGAACAAGAAGCATGGCTTTCCATTTGGTTTGGGATTCTCTATAATTGTGACATCTCTAAACTCTAGCATGTCTAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTTTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTCACCTGTTGAAAGCAGCACTGCAACTTTATTGGATTAGATGTTCCTAGTTTAGCACCTCTAACCCATGTGCCATCTTCCAGAGGAGCCTCTGGAGCACCTCTTCCATACACAACAACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTACCTAATAGAATTTGTTGGATATATCTTCTAACACCAGATTCCCCATGTGTCTTCAGCTCATCCATAGAACCTTCATATGGGGCAAGTTTTGTTGCGTCCAGAACCATGACCTTATCTATAATCTTCGGTTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATCCTCTCAGGTCCTCTCTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCTTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAATCCTTCATTTGCACATTCTATTAGCAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAGAGATCAGGCATAGTCATCTCAATAGCTGCAGTCAATTCATCTAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTGACAAGTGACGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCCAACTCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATTACTAAGGAGGGGAAGATTTCAGCTACAGGTTTTACTACTGCTTTAGATTCCTTTAGAGTTAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTCTCAAGTCCCTCTGCAATTAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAATTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTAAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAACTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATTTGCTAATTTCCACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCCTTAATCACTTTTAATAGTTCAAGTTTTAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATGTCCATCAACCAGCTCTCCAATGATCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAATCTTGTTGTCTTGATTCCACAGGCTTCATCAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCCCTTCAATGAGTCGGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAAGCTGCAAAAAACTTTGTGAAGAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACTTCAAAGTGAGACTTGAACTCCCCAACAAGTGGACTGCAGCAAAACTTTGGTGAAATGTGTTTATTTAAACAGTTGGATACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTTTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTATTCATAGTGCTCGATCTGATTCCAAATATATCCCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCCAGAGACCCGTAGAGGTCAGATGTATGGTGCAAGATTCCCTGACCCATATCAAACCATGAATGGATTTGTGAAGGCACAGGCCTATTGGACAGAACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTGTCTCTTCTCCCTAAACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCCGCCAAGATCTGAGGTGTTTCCACCGCCTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAAAAATCTAACCTTTTCCCCTCAGTGTCATTAATACTCTCCATAGCTTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTGTTAAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTTAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTGAGTTTGTTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCAACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCCTTTATTGCAAGTCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAATCCTTAATCTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAGGAGCCTATCCTGCAATGCCTCTGAATTGGTAACCCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATATTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTGAATCCCGCCCAAAGGAGCAAGAATTTAAAGCTCGAGAAAAATTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCCGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCTTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTGACATTATCTCATTGACAACTTTCTCATAGGCTTCCTCCTTTAACAAATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTAGAGCGAACAAGGTCACAAATTTCAGGACCCAGTAGTTCACGAATTACGTCCAAGACTAAGCAGTATTTAGTCTTTTGAAGATCACTCACCTCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATTAATTTCTGACATACATTTGCTAATCCGAAGAAGAAAATCACTCAACCCTTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCGTAAGCCAACCTGGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTTGCAAGCTTATCCTTTGACTTTAAACCTTTGACTTCCTCCGATTCATTCTCTGCCCTTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAATCTCTCGCTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATTTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTGTTTGAAGTCAAATCTAAAACATCAATATTTGATGTTAGGTAATCCTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATCGAGATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATACAAGAATGGCTTGGTTTCAAAGGAAGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAATCATAGATCATGTTGGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTATCTGGAGTTTCTTTTGTGATTAAGTGACACAGGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTGATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTCAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTGCCAACAACTTTAACTTTTAAATCTTTGTGGTGAATG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| 25,864 |
MT138209.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb009ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,208 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb009ave01, complete genome
|
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|
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|
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|
China
|
2020-05-06
|
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|
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|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
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| 5,334 |
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China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
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|
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|
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|
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|
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|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
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|
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|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
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|
China
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|
feces
|
2018
|
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|
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|
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|
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Jiangsu University, School of Medicine
|
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2020-05-06
|
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Aveparvovirus
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Parvoviridae
|
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China
|
China
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2018
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MT138213.1
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Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb013ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
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| 5,619 |
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China
|
China
|
Aves
|
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|
2018
|
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|
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|
Jiangsu University, School of Medicine
|
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|
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|
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|
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|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
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China
|
China
|
Aves
|
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|
2018
|
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|
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| 50,628 |
MT138215.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb098ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
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GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
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|
2018
|
SAMN13782218
|
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|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb098ave01, complete genome
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