sentence
stringlengths 23
282
| entities
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|
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
other laboratory data were also insignificant. | [] | [
"other",
"laboratory",
"data",
"were",
"also",
"insignificant",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1605,
27692,
828,
1051,
1101,
73521,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the physical examination was unremarkable. | [] | [
"the",
"physical",
"examination",
"was",
"unremarkable",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
7106,
24481,
574,
653,
38548,
481,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the patient was transferred to the recovery room with complete stability. | [] | [
"the",
"patient",
"was",
"transferred",
"to",
"the",
"recovery",
"room",
"with",
"complete",
"stability",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
8893,
574,
23217,
311,
279,
13654,
3130,
449,
4686,
20334,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
he had clinical signs of severe dehydration without fever or vomiting. | [
{
"offsets": [
32,
43
],
"text": "dehydration",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
52,
57
],
"text": "fever",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
61,
69
],
"text": "vomiting",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"he",
"had",
"clinical",
"signs",
"of",
"severe",
"dehydration",
"without",
"fever",
"or",
"vomiting",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
1,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O"
] | [
383,
1047,
14830,
12195,
315,
15748,
99857,
2085,
34653,
477,
63571,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
1,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O"
] |
brain and spine MRI and physical examination showed no evidence of other schwannoma or evidence of neurofibromatosis. | [
{
"offsets": [
73,
83
],
"text": "schwannoma",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
99,
116
],
"text": "neurofibromatosis",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"brain",
"and",
"spine",
"MRI",
"and",
"physical",
"examination",
"showed",
"no",
"evidence",
"of",
"other",
"schwannoma",
"or",
"evidence",
"of",
"neurofibromatosis",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
54160,
323,
35776,
52460,
323,
7106,
24481,
8710,
912,
6029,
315,
1023,
36615,
1036,
7942,
477,
6029,
315,
18247,
76426,
442,
266,
10934,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
the patient had no other known pathology that could be held responsible for retina edema. | [
{
"offsets": [
76,
88
],
"text": "retina edema",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"patient",
"had",
"no",
"other",
"known",
"pathology",
"that",
"could",
"be",
"held",
"responsible",
"for",
"retina",
"edema",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] | [
1820,
8893,
1047,
912,
1023,
3967,
77041,
430,
1436,
387,
5762,
8647,
369,
84827,
1608,
9355,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
the output's weight was 2400g which signify the loss of 630g. | [] | [
"the",
"output's",
"weight",
"was",
"2400g",
"which",
"signify",
"the",
"loss",
"of",
"630g",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
2612,
596,
4785,
574,
220,
8273,
15,
70,
902,
89522,
279,
4814,
315,
220,
18660,
70,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
she had no history of neurofibromatosis in her family. | [
{
"offsets": [
22,
39
],
"text": "neurofibromatosis",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"she",
"had",
"no",
"history",
"of",
"neurofibromatosis",
"in",
"her",
"family",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
32158,
1047,
912,
3925,
315,
18247,
76426,
442,
266,
10934,
304,
1077,
3070,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the histopathology slides show a well-defined mass composed of bland looking spindle cells. | [] | [
"the",
"histopathology",
"slides",
"show",
"a",
"well-defined",
"mass",
"composed",
"of",
"bland",
"looking",
"spindle",
"cells",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
13034,
36211,
2508,
22245,
1501,
264,
1664,
39817,
3148,
24306,
315,
50531,
3411,
99291,
7917,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the pupil was sluggish to react to light. | [] | [
"the",
"pupil",
"was",
"sluggish",
"to",
"react",
"to",
"light",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
61072,
574,
88046,
311,
14085,
311,
3177,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
subsequent immunohistochemistry ( IHC ) was done which showed diffuse immunoreactivity for S100, but other markers including smooth muscle actin ( SMA ), desmin, cytokeratin, CD34 and beta catenin were negative. | [] | [
"subsequent",
"immunohistochemistry",
"(",
"IHC",
")",
"was",
"done",
"which",
"showed",
"diffuse",
"immunoreactivity",
"for",
"S100",
",",
"but",
"other",
"markers",
"including",
"smooth",
"muscle",
"actin",
"(",
"SMA",
")",
",",
"desmin",
",",
"cytokeratin",
",",
"CD34",
"and",
"beta",
"catenin",
"were",
"negative",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
2008,
72457,
33119,
2319,
26407,
52755,
320,
358,
23263,
883,
574,
2884,
902,
8710,
55517,
33119,
461,
7323,
369,
328,
1041,
1174,
719,
1023,
24915,
2737,
11113,
16124,
1180,
258,
320,
96996,
883,
1174,
951,
1083,
1174,
79909,
10668,
15111,
1174,
11325,
1958,
323,
13746,
8415,
101998,
1051,
8389,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
through a routine evaluation, urinary system ultrasonography ( US ) revealed a bladder lesion measuring 7 mm. | [
{
"offsets": [
80,
94
],
"text": "bladder lesion",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"through",
"a",
"routine",
"evaluation",
",",
"urinary",
"system",
"ultrasonography",
"(",
"US",
")",
"revealed",
"a",
"bladder",
"lesion",
"measuring",
"7",
"mm",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
20322,
264,
14348,
16865,
1174,
72735,
1887,
37232,
1525,
5814,
320,
2326,
883,
10675,
264,
62564,
93217,
30090,
220,
22,
9653,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
we report a case of a male near-term neonate with gestational age of 35 weeks. | [] | [
"we",
"report",
"a",
"case",
"of",
"a",
"male",
"near-term",
"neonate",
"with",
"gestational",
"age",
"of",
"35",
"weeks",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
906,
1934,
264,
1162,
315,
264,
8762,
3221,
9860,
47752,
349,
449,
13033,
1697,
4325,
315,
220,
1758,
5672,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
she underwent a brain computed tomography ( CT ) scan with the suspicion of leukemic involvement or any other intracranial event ( cerebral edema ) ; however, nothing was found. | [
{
"offsets": [
76,
84
],
"text": "leukemic",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
131,
145
],
"text": "cerebral edema",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"she",
"underwent",
"a",
"brain",
"computed",
"tomography",
"(",
"CT",
")",
"scan",
"with",
"the",
"suspicion",
"of",
"leukemic",
"involvement",
"or",
"any",
"other",
"intracranial",
"event",
"(",
"cerebral",
"edema",
")",
";",
"however",
",",
"nothing",
"was",
"found",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
32158,
55093,
264,
8271,
25157,
10390,
5814,
320,
19084,
883,
8737,
449,
279,
38141,
315,
57381,
8274,
22315,
477,
904,
1023,
10805,
582,
6713,
532,
1567,
320,
60745,
1608,
9355,
883,
2652,
4869,
1174,
4400,
574,
1766,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
on examination, patient was afebrile and appeared pale. | [] | [
"on",
"examination",
",",
"patient",
"was",
"afebrile",
"and",
"appeared",
"pale",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
263,
24481,
1174,
8893,
574,
264,
1897,
1347,
458,
323,
9922,
28639,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the infant was treated with intravenous fluids and electrolytes as well as antibiotics after obtaining blood and stool cultures, assuming an infectious etiology. | [] | [
"the",
"infant",
"was",
"treated",
"with",
"intravenous",
"fluids",
"and",
"electrolytes",
"as",
"well",
"as",
"antibiotics",
"after",
"obtaining",
"blood",
"and",
"stool",
"cultures",
",",
"assuming",
"an",
"infectious",
"etiology",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
31383,
574,
12020,
449,
10805,
81443,
56406,
323,
73396,
2392,
439,
1664,
439,
46850,
1306,
19546,
6680,
323,
64172,
27833,
1174,
26619,
459,
50600,
1880,
31226,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
then, it was resected by monopolar cautery from superficial to deeper parts with removal of the muscle layers. | [] | [
"then",
",",
"it",
"was",
"resected",
"by",
"monopolar",
"cautery",
"from",
"superficial",
"to",
"deeper",
"parts",
"with",
"removal",
"of",
"the",
"muscle",
"layers",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
3473,
1174,
433,
574,
312,
9885,
291,
555,
1647,
454,
7569,
36204,
727,
505,
59915,
311,
19662,
5596,
449,
17065,
315,
279,
16124,
13931,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
A subsequent bone marrow exam showed no morphologic or molecular evidence of CML or acute leukemia. | [
{
"offsets": [
77,
80
],
"text": "CML",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
84,
98
],
"text": "acute leukemia",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"A",
"subsequent",
"bone",
"marrow",
"exam",
"showed",
"no",
"morphologic",
"or",
"molecular",
"evidence",
"of",
"CML",
"or",
"acute",
"leukemia",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
1,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"O"
] | [
32,
17876,
17685,
83748,
7151,
8710,
912,
27448,
39227,
477,
31206,
6029,
315,
356,
2735,
477,
30883,
96306,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
1,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
A bone marrow aspiration was done to evaluate the status of her chronic myelogenous leukemia and result was consistent with a chronic phase. | [
{
"offsets": [
64,
92
],
"text": "chronic myelogenous leukemia",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"A",
"bone",
"marrow",
"aspiration",
"was",
"done",
"to",
"evaluate",
"the",
"status",
"of",
"her",
"chronic",
"myelogenous",
"leukemia",
"and",
"result",
"was",
"consistent",
"with",
"a",
"chronic",
"phase",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
32,
17685,
83748,
98741,
574,
2884,
311,
15806,
279,
2704,
315,
1077,
21249,
856,
301,
53595,
96306,
323,
1121,
574,
13263,
449,
264,
21249,
10474,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
she was not a case of von recklinghausen disease. | [
{
"offsets": [
22,
48
],
"text": "von recklinghausen disease",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"she",
"was",
"not",
"a",
"case",
"of",
"von",
"recklinghausen",
"disease",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] | [
32158,
574,
539,
264,
1162,
315,
6675,
29299,
2785,
77247,
8624,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
flow cytometry of the CSF showed that blast cells were positive for a cluster of differentiation markers ( CD ) ( CD34, CD19, CD10, CD22 and partially positive for CD45 ) confirming CNS extramedullary lymphoid blast infiltration. | [
{
"offsets": [
219,
231
],
"text": "infiltration",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"flow",
"cytometry",
"of",
"the",
"CSF",
"showed",
"that",
"blast",
"cells",
"were",
"positive",
"for",
"a",
"cluster",
"of",
"differentiation",
"markers",
"(",
"CD",
")",
"(",
"CD34",
",",
"CD19",
",",
"CD10",
",",
"CD22",
"and",
"partially",
"positive",
"for",
"CD45",
")",
"confirming",
"CNS",
"extramedullary",
"lymphoid",
"blast",
"infiltration",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
5072,
79909,
7133,
315,
279,
10211,
37,
8710,
430,
21327,
7917,
1051,
6928,
369,
264,
10879,
315,
60038,
24915,
320,
11325,
883,
320,
11325,
1958,
1174,
11325,
777,
1174,
11325,
605,
1174,
11325,
1313,
323,
26310,
6928,
369,
11325,
1774,
883,
50096,
93643,
11741,
3690,
620,
661,
43745,
590,
21327,
98835,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
allogenic stem cell transplantation was not feasible. | [] | [
"allogenic",
"stem",
"cell",
"transplantation",
"was",
"not",
"feasible",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
278,
848,
56989,
19646,
2849,
98702,
574,
539,
43303,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the patient was put on an anti-edema therapy ( mannitol, dexamethasone ). | [] | [
"the",
"patient",
"was",
"put",
"on",
"an",
"anti-edema",
"therapy",
"(",
"mannitol",
",",
"dexamethasone",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
8893,
574,
2231,
389,
459,
7294,
35535,
9355,
15419,
320,
38908,
27094,
1174,
294,
42716,
774,
300,
606,
883,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the analysis of the BCR-ABL shows 94% in the peripheral blood. | [] | [
"the",
"analysis",
"of",
"the",
"BCR-ABL",
"shows",
"94%",
"in",
"the",
"peripheral",
"blood",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
6492,
315,
279,
426,
9150,
12,
95035,
5039,
220,
6281,
4,
304,
279,
35688,
6680,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
he was born by means of normal vaginal delivery with a normal extra-uterine adaptation. | [] | [
"he",
"was",
"born",
"by",
"means",
"of",
"normal",
"vaginal",
"delivery",
"with",
"a",
"normal",
"extra-uterine",
"adaptation",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
574,
9405,
555,
3445,
315,
4725,
58159,
9889,
449,
264,
4725,
5066,
12,
29051,
483,
34185,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
intraocular muscle testing was normal ; however, there was an exophthalmia in both eyes. | [
{
"offsets": [
63,
75
],
"text": "exophthalmia",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"intraocular",
"muscle",
"testing",
"was",
"normal",
";",
"however",
",",
"there",
"was",
"an",
"exophthalmia",
"in",
"both",
"eyes",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
258,
2221,
68797,
16124,
7649,
574,
4725,
2652,
4869,
1174,
1070,
574,
459,
506,
5237,
78743,
689,
304,
2225,
6548,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
before starting the procedure, the urethra was dilated till fr : 28 ; at first, the tumor location was specified by cystoscopy. | [
{
"offsets": [
86,
91
],
"text": "tumor",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"before",
"starting",
"the",
"procedure",
",",
"the",
"urethra",
"was",
"dilated",
"till",
"fr",
":",
"28",
";",
"at",
"first",
",",
"the",
"tumor",
"location",
"was",
"specified",
"by",
"cystoscopy",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
15145,
6041,
279,
10537,
1174,
279,
53560,
339,
969,
574,
19371,
660,
12222,
1448,
551,
220,
1591,
2652,
520,
1176,
1174,
279,
36254,
3813,
574,
5300,
555,
63581,
437,
8728,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
thus, a diagnosis hypothesis of MVID was raised. | [
{
"offsets": [
33,
37
],
"text": "MVID",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"thus",
",",
"a",
"diagnosis",
"hypothesis",
"of",
"MVID",
"was",
"raised",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O"
] | [
34232,
1174,
264,
23842,
31178,
315,
386,
7635,
574,
9408,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
he had developed no symptoms during his hospitalization. | [] | [
"he",
"had",
"developed",
"no",
"symptoms",
"during",
"his",
"hospitalization",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
1047,
8040,
912,
13803,
2391,
813,
8952,
2065,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
ki67 was 2 - 3%, so the diagnosis of schwannoma was confirmed. | [] | [
"ki67",
"was",
"2",
"-",
"3%",
",",
"so",
"the",
"diagnosis",
"of",
"schwannoma",
"was",
"confirmed",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
6780,
3080,
574,
220,
17,
482,
220,
18,
4,
1174,
779,
279,
23842,
315,
36615,
1036,
7942,
574,
11007,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
we suggested that it was a side effect of imatinib so its administration was temporary interrupted. | [] | [
"we",
"suggested",
"that",
"it",
"was",
"a",
"side",
"effect",
"of",
"imatinib",
"so",
"its",
"administration",
"was",
"temporary",
"interrupted",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
906,
12090,
430,
433,
574,
264,
3185,
2515,
315,
737,
15111,
581,
779,
1202,
8735,
574,
13643,
37883,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the CD10 immunostain was positive. | [] | [
"the",
"CD10",
"immunostain",
"was",
"positive",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
11325,
605,
33119,
537,
467,
574,
6928,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
he was discharged after 32 days with output's weight 3250g. | [] | [
"he",
"was",
"discharged",
"after",
"32",
"days",
"with",
"output's",
"weight",
"3250g",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
574,
57191,
1306,
220,
843,
2919,
449,
2612,
596,
4785,
220,
15257,
15,
70,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
fundus examination showed bilateral optic atrophy. | [
{
"offsets": [
26,
49
],
"text": "bilateral optic atrophy",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"fundus",
"examination",
"showed",
"bilateral",
"optic",
"atrophy",
"."
] | [
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] | [
58703,
355,
24481,
8710,
52303,
81209,
520,
58175,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
the chest radiograph showed "" bat wings "" pattern and the cardiothoracic index was 0, 45. | [] | [
"the",
"chest",
"radiograph",
"showed",
"\"\"",
"bat",
"wings",
"\"\"",
"pattern",
"and",
"the",
"cardiothoracic",
"index",
"was",
"0",
",",
"45",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
15489,
12164,
3257,
8710,
1621,
16120,
27296,
1621,
5497,
323,
279,
32844,
339,
269,
94257,
1963,
574,
220,
15,
1174,
220,
1774,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the laboratory findings revealed hypernatremia of 152meq / L, hyperkalemia of 7,8meq / L and severe metabolic acidosis : blood PH : 7,1, HCO3 : 4meq / L. | [
{
"offsets": [
33,
46
],
"text": "hypernatremia",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
63,
75
],
"text": "hyperkalemia",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
94,
119
],
"text": "severe metabolic acidosis",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"laboratory",
"findings",
"revealed",
"hypernatremia",
"of",
"152meq",
"/",
"L",
",",
"hyperkalemia",
"of",
"7,8meq",
"/",
"L",
"and",
"severe",
"metabolic",
"acidosis",
":",
"blood",
"PH",
":",
"7,1",
",",
"HCO3",
":",
"4meq",
"/",
"L",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
27692,
14955,
10675,
17508,
34397,
1864,
689,
315,
220,
9756,
2727,
80,
611,
445,
1174,
17508,
74,
22317,
689,
315,
220,
22,
11,
23,
2727,
80,
611,
445,
323,
15748,
41861,
13935,
10934,
551,
6680,
15001,
551,
220,
22,
11,
16,
1174,
473,
8445,
18,
551,
220,
19,
2727,
80,
611,
445,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
back home, he received exclusive maternal breastfeeding. | [] | [
"back",
"home",
",",
"he",
"received",
"exclusive",
"maternal",
"breastfeeding",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1445,
2162,
1174,
568,
4036,
14079,
50150,
65864,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
he was the third born child to a 27 - year-old mother with no significant past history. | [] | [
"he",
"was",
"the",
"third",
"born",
"child",
"to",
"a",
"27",
"-",
"year-old",
"mother",
"with",
"no",
"significant",
"past",
"history",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
574,
279,
4948,
9405,
1716,
311,
264,
220,
1544,
482,
1060,
6418,
6691,
449,
912,
5199,
3347,
3925,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
A 12 - year-old girl presented an abdominal pain, high persistent fever of ( 40 ° C ) and severe fatigue. | [
{
"offsets": [
34,
48
],
"text": "abdominal pain",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
67,
72
],
"text": "fever",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
98,
105
],
"text": "fatigue",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"A",
"12",
"-",
"year-old",
"girl",
"presented",
"an",
"abdominal",
"pain",
",",
"high",
"persistent",
"fever",
"of",
"(",
"40",
"°",
"C",
")",
"and",
"severe",
"fatigue",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
32,
220,
717,
482,
1060,
6418,
3828,
10666,
459,
57056,
6784,
1174,
1579,
26048,
34653,
315,
320,
220,
1272,
37386,
356,
883,
323,
15748,
36709,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
we noticed a rapidly progressive amelioration in her neurological status after finishing systemic chemotherapy and physical therapy ; however, the patient's visual loss showed no signs of improvement. | [
{
"offsets": [
158,
169
],
"text": "visual loss",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"we",
"noticed",
"a",
"rapidly",
"progressive",
"amelioration",
"in",
"her",
"neurological",
"status",
"after",
"finishing",
"systemic",
"chemotherapy",
"and",
"physical",
"therapy",
";",
"however",
",",
"the",
"patient's",
"visual",
"loss",
"showed",
"no",
"signs",
"of",
"improvement",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
906,
14000,
264,
19019,
23053,
126641,
2521,
367,
304,
1077,
64908,
2704,
1306,
25270,
46417,
62730,
323,
7106,
15419,
2652,
4869,
1174,
279,
8893,
596,
9302,
4814,
8710,
912,
12195,
315,
16048,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
CT of the brain revealed subdural chronic hematoma and a serpenginous gyriform enhancement around the contusion in the right parietal and occipital lobes. | [
{
"offsets": [
25,
50
],
"text": "subdural chronic hematoma",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
102,
111
],
"text": "contusion",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"CT",
"of",
"the",
"brain",
"revealed",
"subdural",
"chronic",
"hematoma",
"and",
"a",
"serpenginous",
"gyriform",
"enhancement",
"around",
"the",
"contusion",
"in",
"the",
"right",
"parietal",
"and",
"occipital",
"lobes",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1182,
315,
279,
8271,
10675,
1207,
67,
4269,
21249,
96849,
7942,
323,
264,
1446,
64183,
61798,
80605,
7398,
27886,
2212,
279,
687,
7713,
304,
279,
1314,
1370,
3978,
278,
323,
3056,
575,
2223,
41253,
288,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
she received a chemotherapy protocol made of hyperalkalinisation, allopurinol, hydroxyurea and a treatment based on imatinib at the dose of 400mg per day. | [] | [
"she",
"received",
"a",
"chemotherapy",
"protocol",
"made",
"of",
"hyperalkalinisation",
",",
"allopurinol",
",",
"hydroxyurea",
"and",
"a",
"treatment",
"based",
"on",
"imatinib",
"at",
"the",
"dose",
"of",
"400mg",
"per",
"day",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
32158,
4036,
264,
62730,
11766,
1903,
315,
17508,
1727,
36207,
8082,
1174,
453,
23085,
324,
258,
337,
1174,
17055,
4223,
554,
64,
323,
264,
6514,
3196,
389,
737,
15111,
581,
520,
279,
19660,
315,
220,
3443,
12591,
824,
1938,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the diagnosis of extramedullary isolated CNS blast crises ( lymphoid type ) was based on the presence of blasts in CSF ( confirmed by flow cytometry ). | [] | [
"the",
"diagnosis",
"of",
"extramedullary",
"isolated",
"CNS",
"blast",
"crises",
"(",
"lymphoid",
"type",
")",
"was",
"based",
"on",
"the",
"presence",
"of",
"blasts",
"in",
"CSF",
"(",
"confirmed",
"by",
"flow",
"cytometry",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
23842,
315,
11741,
3690,
620,
661,
25181,
93643,
21327,
58187,
320,
43745,
590,
955,
883,
574,
3196,
389,
279,
9546,
315,
75141,
304,
10211,
37,
320,
11007,
555,
6530,
79909,
7133,
883,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
she was treated as urinary tract infection, but there was no improvement in her symptoms. | [
{
"offsets": [
19,
42
],
"text": "urinary tract infection",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"she",
"was",
"treated",
"as",
"urinary",
"tract",
"infection",
",",
"but",
"there",
"was",
"no",
"improvement",
"in",
"her",
"symptoms",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
32158,
574,
12020,
439,
72735,
42929,
19405,
1174,
719,
1070,
574,
912,
16048,
304,
1077,
13803,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
on the 11 th day of life, he was transferred to the pediatric intensive care unit. | [] | [
"on",
"the",
"11",
"th",
"day",
"of",
"life",
",",
"he",
"was",
"transferred",
"to",
"the",
"pediatric",
"intensive",
"care",
"unit",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
263,
279,
220,
806,
270,
1938,
315,
2324,
1174,
568,
574,
23217,
311,
279,
53166,
37295,
2512,
5089,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
he was derived from a third degree consanguineous marriage. | [] | [
"he",
"was",
"derived",
"from",
"a",
"third",
"degree",
"consanguineous",
"marriage",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
574,
14592,
505,
264,
4948,
8547,
1615,
2379,
483,
788,
11103,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
his birth weight was 3030g ( 75 th percentile ). | [] | [
"his",
"birth",
"weight",
"was",
"3030g",
"(",
"75",
"th",
"percentile",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
26301,
7342,
4785,
574,
220,
13236,
15,
70,
320,
220,
2075,
270,
66257,
883,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the patient was a 35 - year old female who presented with urinary frequency for 2 months. | [
{
"offsets": [
58,
75
],
"text": "urinary frequency",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"patient",
"was",
"a",
"35",
"-",
"year",
"old",
"female",
"who",
"presented",
"with",
"urinary",
"frequency",
"for",
"2",
"months",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
8893,
574,
264,
220,
1758,
482,
1060,
2362,
8954,
889,
10666,
449,
72735,
11900,
369,
220,
17,
4038,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the patient's peripheral blood smear revealed marked leukocytosis with a significant number of immature myeloid precursors and 21% blasts. | [
{
"offsets": [
53,
65
],
"text": "leukocytosis",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"patient's",
"peripheral",
"blood",
"smear",
"revealed",
"marked",
"leukocytosis",
"with",
"a",
"significant",
"number",
"of",
"immature",
"myeloid",
"precursors",
"and",
"21%",
"blasts",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
8893,
596,
35688,
6680,
81603,
10675,
13160,
57381,
511,
16820,
10934,
449,
264,
5199,
1396,
315,
86525,
856,
301,
590,
5956,
34291,
323,
220,
1691,
4,
75141,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
fundoscopy revealed bilateral stade III disc edema and hemorrhages of the retina. | [
{
"offsets": [
20,
50
],
"text": "bilateral stade III disc edema",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
55,
80
],
"text": "hemorrhages of the retina",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"fundoscopy",
"revealed",
"bilateral",
"stade",
"III",
"disc",
"edema",
"and",
"hemorrhages",
"of",
"the",
"retina",
"."
] | [
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] | [
58703,
437,
8728,
10675,
52303,
357,
1037,
14767,
2624,
1608,
9355,
323,
71417,
1154,
315,
279,
84827,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
in the submucosa, there were numerous brunner glands. | [] | [
"in",
"the",
"submucosa",
",",
"there",
"were",
"numerous",
"brunner",
"glands",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
258,
279,
1207,
76,
1791,
12252,
1174,
1070,
1051,
12387,
42707,
1215,
82375,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
he presented a profuse diarrhea during each attempt to introduce enteral feeding by hydrolyzed milk formula. | [
{
"offsets": [
23,
31
],
"text": "diarrhea",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"he",
"presented",
"a",
"profuse",
"diarrhea",
"during",
"each",
"attempt",
"to",
"introduce",
"enteral",
"feeding",
"by",
"hydrolyzed",
"milk",
"formula",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
10666,
264,
2848,
817,
69393,
2391,
1855,
4879,
311,
19678,
1218,
3333,
26040,
555,
17055,
398,
16284,
14403,
15150,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
in order to confirm the diagnosis, magnetic resonance imaging ( MRI ) of the abdomen and pelvic cavity was done ; it revealed a lesion in the dome of the bladder. | [
{
"offsets": [
129,
162
],
"text": "lesion in the dome of the bladder",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"in",
"order",
"to",
"confirm",
"the",
"diagnosis",
",",
"magnetic",
"resonance",
"imaging",
"(",
"MRI",
")",
"of",
"the",
"abdomen",
"and",
"pelvic",
"cavity",
"was",
"done",
";",
"it",
"revealed",
"a",
"lesion",
"in",
"the",
"dome",
"of",
"the",
"bladder",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] | [
258,
2015,
311,
7838,
279,
23842,
1174,
24924,
58081,
32758,
320,
52460,
883,
315,
279,
64772,
323,
84168,
56429,
574,
2884,
2652,
433,
10675,
264,
93217,
304,
279,
58438,
315,
279,
62564,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
the osmotic gap was 45. | [] | [
"the",
"osmotic",
"gap",
"was",
"45",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
125452,
14546,
13225,
574,
220,
1774,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the electron microscopic examination confirmed the diagnosis. | [] | [
"the",
"electron",
"microscopic",
"examination",
"confirmed",
"the",
"diagnosis",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
17130,
90090,
24481,
11007,
279,
23842,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
nervous system examination revealed neck rigidity, presence of meningeal signs and lower limb paraplegia. | [
{
"offsets": [
36,
49
],
"text": "neck rigidity",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
84,
105
],
"text": "lower limb paraplegia",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"nervous",
"system",
"examination",
"revealed",
"neck",
"rigidity",
",",
"presence",
"of",
"meningeal",
"signs",
"and",
"lower",
"limb",
"paraplegia",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] | [
77,
651,
788,
1887,
24481,
10675,
13272,
13552,
19025,
1174,
9546,
315,
3026,
18177,
278,
12195,
323,
4827,
48694,
1370,
391,
1978,
689,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
blood pressure was 100 / 60mm / hg and the heart rate 98 beat / minute. | [] | [
"blood",
"pressure",
"was",
"100",
"/",
"60mm",
"/",
"hg",
"and",
"the",
"heart",
"rate",
"98",
"beat",
"/",
"minute",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
51105,
7410,
574,
220,
1041,
611,
220,
1399,
3906,
611,
74394,
323,
279,
4851,
4478,
220,
3264,
9567,
611,
9568,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
she described a recurrence of the same character of headaches accompanied with weakness of extremities and seizures. | [
{
"offsets": [
52,
61
],
"text": "headaches",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
107,
115
],
"text": "seizures",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"she",
"described",
"a",
"recurrence",
"of",
"the",
"same",
"character",
"of",
"headaches",
"accompanied",
"with",
"weakness",
"of",
"extremities",
"and",
"seizures",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
32158,
7633,
264,
76293,
315,
279,
1890,
3752,
315,
55403,
24895,
449,
23948,
315,
6000,
1385,
323,
55998,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
the abdomen appeared neither tender nor distended, and the rest of his physical examination was normal. | [] | [
"the",
"abdomen",
"appeared",
"neither",
"tender",
"nor",
"distended",
",",
"and",
"the",
"rest",
"of",
"his",
"physical",
"examination",
"was",
"normal",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
64772,
9922,
14188,
28682,
6463,
1612,
2954,
1174,
323,
279,
2800,
315,
813,
7106,
24481,
574,
4725,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
since his admission, he had developed a slimy diarrhea with 3 to 4 stools per day. | [] | [
"since",
"his",
"admission",
",",
"he",
"had",
"developed",
"a",
"slimy",
"diarrhea",
"with",
"3",
"to",
"4",
"stools",
"per",
"day",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
11536,
813,
26360,
1174,
568,
1047,
8040,
264,
30453,
88,
69393,
449,
220,
18,
311,
220,
19,
90872,
824,
1938,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the oesophago-gastro-duodenoscopy and duodenal biopsy showed partial villous atrophy associated to the brush border abnormalities. | [
{
"offsets": [
61,
84
],
"text": "partial villous atrophy",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"oesophago-gastro-duodenoscopy",
"and",
"duodenal",
"biopsy",
"showed",
"partial",
"villous",
"atrophy",
"associated",
"to",
"the",
"brush",
"border",
"abnormalities",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
297,
288,
5237,
6438,
2427,
23834,
98305,
55836,
437,
8728,
323,
3930,
55836,
278,
99647,
8710,
7276,
9077,
788,
520,
58175,
5938,
311,
279,
15998,
3973,
75815,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the evolution was burdened by cholestasis due to the prolonged parenteral feeding and nosocomial infection by staphylococcus epidermidis. | [
{
"offsets": [
30,
41
],
"text": "cholestasis",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
86,
106
],
"text": "nosocomial infection",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"evolution",
"was",
"burdened",
"by",
"cholestasis",
"due",
"to",
"the",
"prolonged",
"parenteral",
"feeding",
"and",
"nosocomial",
"infection",
"by",
"staphylococcus",
"epidermidis",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
15740,
574,
23104,
291,
555,
523,
62095,
10949,
4245,
311,
279,
44387,
2748,
3333,
26040,
323,
12155,
12255,
532,
19405,
555,
357,
1366,
88,
1092,
92411,
4248,
1814,
16497,
285,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
patient achieved complete hematological remission at three months and complete cytogenetic remission at 12 months. | [] | [
"patient",
"achieved",
"complete",
"hematological",
"remission",
"at",
"three",
"months",
"and",
"complete",
"cytogenetic",
"remission",
"at",
"12",
"months",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
23557,
17427,
4686,
96849,
5848,
1323,
7711,
520,
2380,
4038,
323,
4686,
79909,
11968,
5411,
1323,
7711,
520,
220,
717,
4038,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
her past medical history showed a nonsmoking history and no significant family history. | [] | [
"her",
"past",
"medical",
"history",
"showed",
"a",
"nonsmoking",
"history",
"and",
"no",
"significant",
"family",
"history",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1964,
3347,
6593,
3925,
8710,
264,
32795,
76,
10979,
3925,
323,
912,
5199,
3070,
3925,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the baby had normal physical examination at birth aside transitory respiratory distress. | [
{
"offsets": [
67,
87
],
"text": "respiratory distress",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"baby",
"had",
"normal",
"physical",
"examination",
"at",
"birth",
"aside",
"transitory",
"respiratory",
"distress",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] | [
1820,
8945,
1047,
4725,
7106,
24481,
520,
7342,
16038,
1380,
10843,
42631,
35104,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"I",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
she was treated with 24 gy of whole-brain radiation therapy. | [] | [
"she",
"was",
"treated",
"with",
"24",
"gy",
"of",
"whole-brain",
"radiation",
"therapy",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
32158,
574,
12020,
449,
220,
1187,
29720,
315,
4459,
31217,
467,
25407,
15419,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the patient received a high-dose systemic induction chemotherapy and intrathecal therapy ( methotrexate, arabinoside and dexamethasone ). | [] | [
"the",
"patient",
"received",
"a",
"high-dose",
"systemic",
"induction",
"chemotherapy",
"and",
"intrathecal",
"therapy",
"(",
"methotrexate",
",",
"arabinoside",
"and",
"dexamethasone",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
8893,
4036,
264,
1579,
1773,
974,
46417,
38156,
62730,
323,
10805,
70036,
5531,
15419,
320,
21747,
354,
38639,
349,
1174,
802,
9068,
437,
579,
323,
294,
42716,
774,
300,
606,
883,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
mutation analysis of peripheral blood samples of the neonate revealed a mutation at the homozygous status of MYO5B gene. | [] | [
"mutation",
"analysis",
"of",
"peripheral",
"blood",
"samples",
"of",
"the",
"neonate",
"revealed",
"a",
"mutation",
"at",
"the",
"homozygous",
"status",
"of",
"MYO5B",
"gene",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
32071,
6492,
315,
35688,
6680,
10688,
315,
279,
47752,
349,
10675,
264,
27472,
520,
279,
55513,
4341,
70,
788,
2704,
315,
18725,
46,
20,
33,
15207,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
cytological evaluation of cerebrospinal fluid ( CSF ) was also negative. | [] | [
"cytological",
"evaluation",
"of",
"cerebrospinal",
"fluid",
"(",
"CSF",
")",
"was",
"also",
"negative",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
11377,
83,
5848,
16865,
315,
28091,
15222,
2203,
992,
15962,
320,
10211,
37,
883,
574,
1101,
8389,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
skin examination was normal and had no café au lait spot. | [
{
"offsets": [
39,
56
],
"text": "café au lait spot",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"skin",
"examination",
"was",
"normal",
"and",
"had",
"no",
"café",
"au",
"lait",
"spot",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] | [
37282,
24481,
574,
4725,
323,
1047,
912,
53050,
8065,
1208,
275,
7858,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
he needed mechanical ventilation for three days and exclusive parenteral feeding by central catheter. | [] | [
"he",
"needed",
"mechanical",
"ventilation",
"for",
"three",
"days",
"and",
"exclusive",
"parenteral",
"feeding",
"by",
"central",
"catheter",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
4460,
22936,
56234,
369,
2380,
2919,
323,
14079,
2748,
3333,
26040,
555,
8792,
31747,
1430,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the renal ultrasound showed discretely hyperechoic kidneys cortex and the absence of renal malformations. | [
{
"offsets": [
85,
104
],
"text": "renal malformations",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"renal",
"ultrasound",
"showed",
"discretely",
"hyperechoic",
"kidneys",
"cortex",
"and",
"the",
"absence",
"of",
"renal",
"malformations",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] | [
1820,
63915,
63859,
8710,
28558,
989,
9950,
486,
971,
292,
81960,
49370,
323,
279,
19821,
315,
63915,
8811,
630,
811,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
we observed a 29 y.o. female proband with the episode of venous thrombosis at the age of 18 and family history of thrombosis. | [
{
"offsets": [
58,
75
],
"text": "venous thrombosis",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
115,
125
],
"text": "thrombosis",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"we",
"observed",
"a",
"29",
"y.o",
".",
"female",
"proband",
"with",
"the",
"episode",
"of",
"venous",
"thrombosis",
"at",
"the",
"age",
"of",
"18",
"and",
"family",
"history",
"of",
"thrombosis",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
906,
13468,
264,
220,
1682,
379,
14778,
662,
8954,
3650,
438,
449,
279,
9417,
315,
11457,
788,
84664,
65,
10934,
520,
279,
4325,
315,
220,
972,
323,
3070,
3925,
315,
84664,
65,
10934,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
the imatinib was replaced by dasatinib at the dose of 100 mg per day. | [] | [
"the",
"imatinib",
"was",
"replaced",
"by",
"dasatinib",
"at",
"the",
"dose",
"of",
"100",
"mg",
"per",
"day",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
737,
15111,
581,
574,
12860,
555,
6754,
15111,
581,
520,
279,
19660,
315,
220,
1041,
14060,
824,
1938,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the patient was diagnosed with CML. | [
{
"offsets": [
31,
34
],
"text": "CML",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"patient",
"was",
"diagnosed",
"with",
"CML",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
1820,
8893,
574,
29704,
449,
356,
2735,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
we find the existence of numerous hemorrhagic suffusions. | [
{
"offsets": [
34,
56
],
"text": "hemorrhagic suffusions",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"we",
"find",
"the",
"existence",
"of",
"numerous",
"hemorrhagic",
"suffusions",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] | [
906,
1505,
279,
14209,
315,
12387,
71417,
13070,
8657,
36807,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
to confirm the diagnosis and for histopathological examination, the patient underwent transurethral resection of bladder tumor ( TURBT ) in april 2018. | [
{
"offsets": [
114,
127
],
"text": "bladder tumor",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"to",
"confirm",
"the",
"diagnosis",
"and",
"for",
"histopathological",
"examination",
",",
"the",
"patient",
"underwent",
"transurethral",
"resection",
"of",
"bladder",
"tumor",
"(",
"TURBT",
")",
"in",
"april",
"2018",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
998,
7838,
279,
23842,
323,
369,
13034,
36211,
5848,
24481,
1174,
279,
8893,
55093,
1380,
554,
339,
3545,
312,
2879,
315,
62564,
36254,
320,
350,
1539,
18066,
883,
304,
74800,
220,
679,
23,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
meconium-stained amniotic fluid was noted. | [] | [
"meconium-stained",
"amniotic",
"fluid",
"was",
"noted",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
2727,
444,
2411,
5594,
2692,
1097,
7907,
14546,
15962,
574,
10555,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
there was no lymphadenopathy and the nervous system examination was normal. | [
{
"offsets": [
13,
28
],
"text": "lymphadenopathy",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"there",
"was",
"no",
"lymphadenopathy",
"and",
"the",
"nervous",
"system",
"examination",
"was",
"normal",
"."
] | [
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
19041,
574,
912,
43745,
21825,
54042,
323,
279,
23418,
1887,
24481,
574,
4725,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
proper bleeders were taken and three way foley catheter was applied for a continuous irrigation. | [] | [
"proper",
"bleeders",
"were",
"taken",
"and",
"three",
"way",
"foley",
"catheter",
"was",
"applied",
"for",
"a",
"continuous",
"irrigation",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
81768,
67106,
388,
1051,
4529,
323,
2380,
1648,
282,
50099,
31747,
1430,
574,
9435,
369,
264,
19815,
63566,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
we used in silico tools to evaluate the possible impact of p.w221s variant on protein structure and function. | [] | [
"we",
"used",
"in",
"silico",
"tools",
"to",
"evaluate",
"the",
"possible",
"impact",
"of",
"p.w221s",
"variant",
"on",
"protein",
"structure",
"and",
"function",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
906,
1511,
304,
5554,
4042,
7526,
311,
15806,
279,
3284,
5536,
315,
281,
1444,
12425,
82,
11678,
389,
13128,
6070,
323,
734,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
PNN : 49,050 / mm³, hemoglobin : 11.6g / dl, platelets : 328,000 / mm³. | [] | [
"PNN",
":",
"49,050",
"/",
"mm³",
",",
"hemoglobin",
":",
"11.6g",
"/",
"dl",
",",
"platelets",
":",
"328,000",
"/",
"mm³",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
47,
9944,
551,
220,
2491,
11,
16193,
611,
9653,
44301,
1174,
17728,
94855,
551,
220,
806,
13,
21,
70,
611,
28613,
1174,
12235,
10145,
551,
220,
16884,
11,
931,
611,
9653,
44301,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the baby died, after 97 days of life, of septic shock and multiple organ failure. | [] | [
"the",
"baby",
"died",
",",
"after",
"97",
"days",
"of",
"life",
",",
"of",
"septic",
"shock",
"and",
"multiple",
"organ",
"failure",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
8945,
8636,
1174,
1306,
220,
3534,
2919,
315,
2324,
1174,
315,
513,
27330,
10988,
323,
5361,
2942,
8060,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
A new genetic variant c.662G > C ( p.w221s ) in the SERPINC1 gene was detected in proband and affected father but was absent in healthy sister. | [] | [
"A",
"new",
"genetic",
"variant",
"c",
".662G",
">",
"C",
"(",
"p.w221s",
")",
"in",
"the",
"SERPINC1",
"gene",
"was",
"detected",
"in",
"proband",
"and",
"affected",
"father",
"but",
"was",
"absent",
"in",
"healthy",
"sister",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
32,
502,
19465,
11678,
272,
662,
24199,
38,
871,
356,
320,
281,
1444,
12425,
82,
883,
304,
279,
14311,
47,
39539,
16,
15207,
574,
16914,
304,
3650,
438,
323,
11754,
7126,
719,
574,
28310,
304,
9498,
13219,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
he had been hospitalized for four days in a private clinic, for the suspicion of materno-foetal infection, where he had antibiotics for 48 hours. | [
{
"offsets": [
97,
106
],
"text": "infection",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"he",
"had",
"been",
"hospitalized",
"for",
"four",
"days",
"in",
"a",
"private",
"clinic",
",",
"for",
"the",
"suspicion",
"of",
"materno-foetal",
"infection",
",",
"where",
"he",
"had",
"antibiotics",
"for",
"48",
"hours",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
1047,
1027,
70340,
369,
3116,
2919,
304,
264,
879,
28913,
1174,
369,
279,
38141,
315,
5634,
25980,
12,
831,
22029,
19405,
1174,
1405,
568,
1047,
46850,
369,
220,
2166,
4207,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
he lost 930g relative to the birth's weight. | [] | [
"he",
"lost",
"930g",
"relative",
"to",
"the",
"birth's",
"weight",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
383,
5675,
220,
19306,
70,
8844,
311,
279,
7342,
596,
4785,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
after 26 hours of rehydration therapy, the dehydration resolved, however, a functional acute renal failure complicated by acidosis and hyperkalemia appeared. | [
{
"offsets": [
44,
55
],
"text": "dehydration",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
79,
109
],
"text": "functional acute renal failure",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
125,
133
],
"text": "acidosis",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
138,
150
],
"text": "hyperkalemia",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"after",
"26",
"hours",
"of",
"rehydration",
"therapy",
",",
"the",
"dehydration",
"resolved",
",",
"however",
",",
"a",
"functional",
"acute",
"renal",
"failure",
"complicated",
"by",
"acidosis",
"and",
"hyperkalemia",
"appeared",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
1,
0,
1,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O"
] | [
10924,
220,
1627,
4207,
315,
312,
81824,
15419,
1174,
279,
99857,
20250,
1174,
4869,
1174,
264,
16003,
30883,
63915,
8060,
17395,
555,
13935,
10934,
323,
17508,
74,
22317,
689,
9922,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
1,
2,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
the physical exam revealed pallor, hepatomegaly, and grade III splenomegaly. | [
{
"offsets": [
27,
33
],
"text": "pallor",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
36,
48
],
"text": "hepatomegaly",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
65,
77
],
"text": "splenomegaly",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"physical",
"exam",
"revealed",
"pallor",
",",
"hepatomegaly",
",",
"and",
"grade",
"III",
"splenomegaly",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
1820,
7106,
7151,
10675,
67597,
269,
1174,
58259,
638,
70,
5893,
1174,
323,
12239,
14767,
12786,
268,
638,
70,
5893,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
however, few months later, the patient presented in the emergency room with a headache and severe vomiting. | [
{
"offsets": [
80,
88
],
"text": "headache",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
100,
108
],
"text": "vomiting",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"however",
",",
"few",
"months",
"later",
",",
"the",
"patient",
"presented",
"in",
"the",
"emergency",
"room",
"with",
"a",
"headache",
"and",
"severe",
"vomiting",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
98936,
1174,
2478,
4038,
3010,
1174,
279,
8893,
10666,
304,
279,
13147,
3130,
449,
264,
47846,
323,
15748,
63571,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
then, the neck, abdomen, pelvic and chest computed tomography ( CT ) scans were done that were normal. | [] | [
"then",
",",
"the",
"neck",
",",
"abdomen",
",",
"pelvic",
"and",
"chest",
"computed",
"tomography",
"(",
"CT",
")",
"scans",
"were",
"done",
"that",
"were",
"normal",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
3473,
1174,
279,
13272,
1174,
64772,
1174,
84168,
323,
15489,
25157,
10390,
5814,
320,
19084,
883,
43739,
1051,
2884,
430,
1051,
4725,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the investigation revealed an elevated white blood cell count ( WBC ) : 545,000 / mm³. | [
{
"offsets": [
30,
61
],
"text": "elevated white blood cell count",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"investigation",
"revealed",
"an",
"elevated",
"white",
"blood",
"cell",
"count",
"(",
"WBC",
")",
":",
"545,000",
"/",
"mm³",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
8990,
10675,
459,
32389,
4251,
6680,
2849,
1797,
320,
468,
5002,
883,
551,
220,
20749,
11,
931,
611,
9653,
44301,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
analysis of the CSF collected showed lymphoblasts in a WBC count of 11000cells / ml. | [] | [
"analysis",
"of",
"the",
"CSF",
"collected",
"showed",
"lymphoblasts",
"in",
"a",
"WBC",
"count",
"of",
"11000cells",
"/",
"ml",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
35584,
315,
279,
10211,
37,
14890,
8710,
43745,
677,
4354,
82,
304,
264,
468,
5002,
1797,
315,
220,
5120,
410,
37791,
611,
16116,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the periodic acid schiff ( PAS ) stain revealed abnormalities in the brush border characterized by loss of the linear part of enterocytes with the presence of intra-cytoplasmic PAS + band in the apical pole of enterocytes uneven thickness and sometimes with double contours pattern. | [
{
"offsets": [
48,
61
],
"text": "abnormalities",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"periodic",
"acid",
"schiff",
"(",
"PAS",
")",
"stain",
"revealed",
"abnormalities",
"in",
"the",
"brush",
"border",
"characterized",
"by",
"loss",
"of",
"the",
"linear",
"part",
"of",
"enterocytes",
"with",
"the",
"presence",
"of",
"intra-cytoplasmic",
"PAS",
"+",
"band",
"in",
"the",
"apical",
"pole",
"of",
"enterocytes",
"uneven",
"thickness",
"and",
"sometimes",
"with",
"double",
"contours",
"pattern",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
39445,
13935,
5817,
3168,
320,
61017,
883,
53064,
10675,
75815,
304,
279,
15998,
3973,
32971,
555,
4814,
315,
279,
13790,
961,
315,
3810,
57878,
449,
279,
9546,
315,
50938,
1824,
88,
99705,
10753,
292,
61017,
489,
7200,
304,
279,
1469,
950,
26078,
315,
3810,
57878,
61437,
26839,
323,
7170,
449,
2033,
50131,
5497,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
in mutated SERPINC1 protein a new n-linked glycosylation site is formed, however, it is unclear if the glycosylation at 219 - 221 site is possible. | [] | [
"in",
"mutated",
"SERPINC1",
"protein",
"a",
"new",
"n-linked",
"glycosylation",
"site",
"is",
"formed",
",",
"however",
",",
"it",
"is",
"unclear",
"if",
"the",
"glycosylation",
"at",
"219",
"-",
"221",
"site",
"is",
"possible",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
258,
85922,
14311,
47,
39539,
16,
13128,
264,
502,
308,
55514,
37807,
9594,
79933,
2816,
374,
14454,
1174,
4869,
1174,
433,
374,
25420,
422,
279,
37807,
9594,
79933,
520,
220,
13762,
482,
220,
12425,
2816,
374,
3284,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
urine analysis and culture were performed several times that was negative for infection. | [
{
"offsets": [
78,
87
],
"text": "infection",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"urine",
"analysis",
"and",
"culture",
"were",
"performed",
"several",
"times",
"that",
"was",
"negative",
"for",
"infection",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] | [
324,
483,
6492,
323,
7829,
1051,
10887,
3892,
3115,
430,
574,
8389,
369,
19405,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
the patient was readmitted into our pediatric department with complains of severe headache, vomiting, pain and bilateral visual loss since three days. | [
{
"offsets": [
75,
90
],
"text": "severe headache",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
93,
101
],
"text": "vomiting",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
104,
108
],
"text": "pain",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"offsets": [
113,
134
],
"text": "bilateral visual loss",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"the",
"patient",
"was",
"readmitted",
"into",
"our",
"pediatric",
"department",
"with",
"complains",
"of",
"severe",
"headache",
",",
"vomiting",
",",
"pain",
"and",
"bilateral",
"visual",
"loss",
"since",
"three",
"days",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
1,
0,
1,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
8893,
574,
1373,
5600,
1139,
1057,
53166,
9476,
449,
90058,
315,
15748,
47846,
1174,
63571,
1174,
6784,
323,
52303,
9302,
4814,
2533,
2380,
2919,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
1,
0,
1,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
on his fifth day of life, he presented multiple yellowish-watery stools ( ab 12 times ) and refuse feeding with apyrexia context. | [] | [
"on",
"his",
"fifth",
"day",
"of",
"life",
",",
"he",
"presented",
"multiple",
"yellowish-watery",
"stools",
"(",
"ab",
"12",
"times",
")",
"and",
"refuse",
"feeding",
"with",
"apyrexia",
"context",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
263,
813,
18172,
1938,
315,
2324,
1174,
568,
10666,
5361,
14071,
819,
2695,
266,
727,
90872,
320,
671,
220,
717,
3115,
883,
323,
26122,
26040,
449,
1469,
88,
38639,
689,
2317,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
the antithrombin level in our patient was low, 44 - 48% ( AT deficiency type I ). | [] | [
"the",
"antithrombin",
"level",
"in",
"our",
"patient",
"was",
"low",
",",
"44",
"-",
"48%",
"(",
"AT",
"deficiency",
"type",
"I",
")",
"."
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
1820,
3276,
411,
442,
7006,
2237,
304,
1057,
8893,
574,
3428,
1174,
220,
2096,
482,
220,
2166,
4,
320,
7520,
48294,
955,
358,
883,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
there was no leukocytosis, and the serum level of c-reactive protein was normal. | [
{
"offsets": [
13,
25
],
"text": "leukocytosis",
"type": "CLINENTITY"
}
] | [
"there",
"was",
"no",
"leukocytosis",
",",
"and",
"the",
"serum",
"level",
"of",
"c-reactive",
"protein",
"was",
"normal",
"."
] | [
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
19041,
574,
912,
57381,
511,
16820,
10934,
1174,
323,
279,
41529,
2237,
315,
272,
31696,
535,
13128,
574,
4725,
662
] | [
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1,
1
] | [
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
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