Datasets:

---

google

/

code_x_glue_cc_code_completion_token

like 7

Follow

Google 12k

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "exporter", ";", "import", "annis", ".", "exceptions", ".", "AnnisCorpusAccessException", ";", "import", "annis", ".", "exceptions", ".", "AnnisQLSemanticsException", ";", "import", "annis", ".", "exceptions", ".", "AnnisQLSyntaxException", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResult", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResultSet", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisAttribute", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "annis", ".", "utils", ".", "LegacyGraphConverter", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "GenericType", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "UniformInterfaceException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "SaltProject", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "rmi", ".", "RemoteException", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "GeneralTextExporter", "implements", "Exporter", ",", "Serializable", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "GeneralTextExporter", ".", "class", ")", ";", "@", "Override", "public", "void", "convertText", "(", "String", "queryAnnisQL", ",", "int", "contextLeft", ",", "int", "contextRight", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ",", "String", "keysAsString", ",", "String", "argsAsString", ",", "WebResource", "annisResource", ",", "Writer", "out", ")", "{", "try", "{", "SaltProject", "queryResult", "=", "null", ";", "LinkedList", "<", "String", ">", "keys", "=", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "keysAsString", "==", "null", ")", "{", "keys", ".", "add", "(", "\"tok\"", ")", ";", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", "attributes", "=", "new", "LinkedList", "<", "AnnisAttribute", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "corpus", ":", "corpora", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "attributes", ".", "addAll", "(", "annisResource", ".", "path", "(", "\"corpora\"", ")", ".", "path", "(", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpus", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ".", "path", "(", "\"annotations\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"fetchvalues\"", ",", "\"false\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"\"", ",", "\"false\"", ")", ".", "get", "(", "new", "GenericType", "<", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", ">", "(", ")", "{", "}", ")", ")", ";", "}", "for", "(", "AnnisAttribute", "a", ":", "attributes", ")", "{", "if", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "String", "[", "]", "namespaceAndName", "=", "a", ".", "getName", "(", ")", ".", "split", "(", "\":\"", ",", "2", ")", ";", "if", "(", "namespaceAndName", ".", "length", ">", "1", ")", "{", "keys", ".", "add", "(", "namespaceAndName", "[", "1", "]", ")", ";", "}", "else", "{", "keys", ".", "add", "(", "namespaceAndName", "[", "0", "]", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "else", "{", "String", "[", "]", "keysSplitted", "=", "keysAsString", ".", "split", "(", "\"\\\\,\"", ")", ";", "for", "(", "String", "k", ":", "keysSplitted", ")", "{", "keys", ".", "add", "(", "k", ".", "trim", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "args", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "s", ":", "argsAsString", ".", "split", "(", "\"&\"", ")", ")", "{", "String", "[", "]", "splitted", "=", "s", ".", "split", "(", "\"=\"", ",", "2", ")", ";", "String", "key", "=", "splitted", "[", "0", "]", ";", "String", "val", "=", "\"\"", ";", "if", "(", "splitted", ".", "length", ">", "1", ")", "{", "val", "=", "splitted", "[", "1", "]", ";", "}", "args", ".", "put", "(", "key", ",", "val", ")", ";", "}", "int", "offset", "=", "0", ";", "while", "(", "offset", "==", "0", "||", "(", "queryResult", "!=", "null", "&&", "queryResult", ".", "getSCorpusGraphs", "(", ")", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", ")", "{", "try", "{", "queryResult", "=", "annisResource", ".", "path", "(", "\"search\"", ")", ".", "path", "(", "\"annotate\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"q\"", ",", "queryAnnisQL", ")", ".", "queryParam", "(", "\"limit\"", ",", "\"\"", "+", "50", ")", ".", "queryParam", "(", "\"offset\"", ",", "\"\"", "+", "offset", ")", ".", "queryParam", "(", "\"left\"", ",", "\"\"", "+", "contextLeft", ")", ".", "queryParam", "(", "\"right\"", ",", "\"\"", "+", "contextRight", ")", ".", "queryParam", "(", "\"corpora\"", ",", "StringUtils", ".", "join", "(", "corpora", ".", "keySet", "(", ")", ",", "\",\"", ")", ")", ".", "get", "(", "SaltProject", ".", "class", ")", ";", "}", "catch", "(", "UniformInterfaceException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getEntity", "(", "String", ".", "class", ")", ",", "ex", ")", ";", "}", "convertText", "(", "LegacyGraphConverter", ".", "convertToResultSet", "(", "queryResult", ")", ",", "keys", ",", "args", ",", "out", ",", "offset", ")", ";", "out", ".", "flush", "(", ")", ";", "offset", "=", "offset", "+", "50", ";", "}", "out", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "out", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "out", ".", "append", "(", "\"finished\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "AnnisQLSemanticsException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "catch", "(", "AnnisQLSyntaxException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "catch", "(", "AnnisCorpusAccessException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "catch", "(", "RemoteException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "convertText", "(", "AnnisResultSet", "queryResult", ",", "LinkedList", "<", "String", ">", "keys", ",", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "args", ",", "Writer", "out", ",", "int", "offset", ")", "throws", "IOException", "{", "int", "counter", "=", "0", ";", "for", "(", "AnnisResult", "annisResult", ":", "queryResult", ")", "{", "Set", "<", "Long", ">", "matchedNodeIds", "=", "annisResult", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getMatchedNodeIds", "(", ")", ";", "counter", "++", ";", "out", ".", "append", "(", "(", "counter", "+", "offset", ")", "+", "\".", "\"", ")", ";", "List", "<", "AnnisNode", ">", "tok", "=", "annisResult", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getTokens", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "annisNode", ":", "tok", ")", "{", "Long", "tokID", "=", "annisNode", ".", "getId", "(", ")", ";", "if", "(", "matchedNodeIds", ".", "contains", "(", "tokID", ")", ")", "{", "out", ".", "append", "(", "\"[\"", ")", ";", "out", ".", "append", "(", "annisNode", ".", "getSpannedText", "(", ")", ")", ";", "out", ".", "append", "(", "\"]\"", ")", ";", "}", "else", "{", "out", ".", "append", "(", "annisNode", ".", "getSpannedText", "(", ")", ")", ";", "}", "out", ".", "append", "(", "\"", "\"", ")", ";", "}", "out", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "exporter", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResult", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResultSet", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "public", "class", "TextExporter", "extends", "GeneralTextExporter", "{", "@", "Override", "public", "void", "convertText", "(", "AnnisResultSet", "queryResult", ",", "LinkedList", "<", "String", ">", "keys", ",", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "args", ",", "Writer", "out", ",", "int", "offset", ")", "throws", "IOException", "{", "int", "counter", "=", "0", ";", "for", "(", "AnnisResult", "annisResult", ":", "queryResult", ")", "{", "Set", "<", "Long", ">", "matchedNodeIds", "=", "annisResult", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getMatchedNodeIds", "(", ")", ";", "counter", "++", ";", "out", ".", "append", "(", "(", "counter", "+", "offset", ")", "+", "\".", "\"", ")", ";", "List", "<", "AnnisNode", ">", "tok", "=", "annisResult", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getTokens", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "annisNode", ":", "tok", ")", "{", "Long", "tokID", "=", "annisNode", ".", "getId", "(", ")", ";", "if", "(", "matchedNodeIds", ".", "contains", "(", "tokID", ")", ")", "{", "out", ".", "append", "(", "\"[\"", ")", ";", "out", ".", "append", "(", "annisNode", ".", "getSpannedText", "(", ")", ")", ";", "out", ".", "append", "(", "\"]\"", ")", ";", "}", "else", "{", "out", ".", "append", "(", "annisNode", ".", "getSpannedText", "(", ")", ")", ";", "}", "for", "(", "Annotation", "annotation", ":", "annisNode", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "out", ".", "append", "(", "\"/\"", "+", "annotation", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "}", "out", ".", "append", "(", "\"", "\"", ")", ";", "}", "out", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "exporter", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResult", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResultSet", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeMap", ";", "public", "class", "GridExporter", "extends", "GeneralTextExporter", "{", "@", "Override", "public", "void", "convertText", "(", "AnnisResultSet", "queryResult", ",", "LinkedList", "<", "String", ">", "keys", ",", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "args", ",", "Writer", "out", ",", "int", "offset", ")", "throws", "IOException", "{", "boolean", "showNumbers", "=", "true", ";", "if", "(", "args", ".", "containsKey", "(", "\"numbers\"", ")", ")", "{", "String", "arg", "=", "args", ".", "get", "(", "\"numbers\"", ")", ";", "if", "(", "arg", ".", "equalsIgnoreCase", "(", "\"false\"", ")", "||", "arg", ".", "equalsIgnoreCase", "(", "\"0\"", ")", "||", "arg", ".", "equalsIgnoreCase", "(", "\"off\"", ")", ")", "{", "showNumbers", "=", "false", ";", "}", "}", "int", "counter", "=", "0", ";", "for", "(", "AnnisResult", "annisResult", ":", "queryResult", ")", "{", "HashMap", "<", "String", ",", "TreeMap", "<", "Long", ",", "Span", ">", ">", "annos", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "TreeMap", "<", "Long", ",", "Span", ">", ">", "(", ")", ";", "counter", "++", ";", "out", ".", "append", "(", "(", "counter", "+", "offset", ")", "+", "\".", "\"", ")", ";", "long", "tokenOffset", "=", "annisResult", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getTokens", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getTokenIndex", "(", ")", "-", "1", ";", "for", "(", "AnnisNode", "resolveNode", ":", "annisResult", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getNodes", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "resolveAnnotation", ":", "resolveNode", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "String", "k", "=", "resolveAnnotation", ".", "getName", "(", ")", ";", "if", "(", "annos", ".", "get", "(", "k", ")", "==", "null", ")", "{", "annos", ".", "put", "(", "k", ",", "new", "TreeMap", "<", "Long", ",", "Span", ">", "(", ")", ")", ";", "}", "annos", ".", "get", "(", "k", ")", ".", "put", "(", "resolveNode", ".", "getLeftToken", "(", ")", ",", "new", "Span", "(", "resolveNode", ".", "getLeftToken", "(", ")", ",", "resolveNode", ".", "getRightToken", "(", ")", ",", "resolveAnnotation", ".", "getValue", "(", ")", ")", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "String", "k", ":", "keys", ")", "{", "if", "(", "\"tok\"", ".", "equals", "(", "k", ")", ")", "{", "out", ".", "append", "(", "\"t", "\"", "+", "k", "+", "\"t", "\"", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "annisNode", ":", "annisResult", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getTokens", "(", ")", ")", "{", "out", ".", "append", "(", "annisNode", ".", "getSpannedText", "(", ")", "+", "\"", "\"", ")", ";", "}", "out", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "annos", ".", "get", "(", "k", ")", "!=", "null", ")", "{", "out", ".", "append", "(", "\"t", "\"", "+", "k", "+", "\"t", "\"", ")", ";", "for", "(", "Span", "s", ":", "annos", ".", "get", "(", "k", ")", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "out", ".", "append", "(", "s", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "showNumbers", ")", "{", "long", "leftIndex", "=", "Math", ".", "max", "(", "1", ",", "s", ".", "getStart", "(", ")", "-", "tokenOffset", ")", ";", "long", "rightIndex", "=", "s", ".", "getEnd", "(", ")", "-", "tokenOffset", ";", "out", ".", "append", "(", "\"[\"", "+", "leftIndex", "+", "\"-\"", "+", "rightIndex", "+", "\"]\"", ")", ";", "}", "out", ".", "append", "(", "\"", "\"", ")", ";", "}", "out", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "}", "}", "out", ".", "append", "(", "\"nn\"", ")", ";", "}", "}", "private", "static", "class", "Span", "{", "private", "long", "start", ";", "private", "long", "end", ";", "private", "String", "value", ";", "public", "Span", "(", "long", "start", ",", "long", "end", ",", "String", "value", ")", "{", "this", ".", "start", "=", "start", ";", "this", ".", "end", "=", "end", ";", "this", ".", "value", "=", "value", ";", "}", "public", "long", "getStart", "(", ")", "{", "return", "start", ";", "}", "public", "void", "setStart", "(", "long", "start", ")", "{", "this", ".", "start", "=", "start", ";", "}", "public", "long", "getEnd", "(", ")", "{", "return", "end", ";", "}", "public", "void", "setEnd", "(", "long", "end", ")", "{", "this", ".", "end", "=", "end", ";", "}", "public", "String", "getValue", "(", ")", "{", "return", "value", ";", "}", "public", "void", "setValue", "(", "String", "value", ")", "{", "this", ".", "value", "=", "value", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "exporter", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "public", "interface", "Exporter", "{", "public", "void", "convertText", "(", "String", "queryAnnisQL", ",", "int", "contextLeft", ",", "int", "contextRight", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ",", "String", "keysAsString", ",", "String", "argsAsString", ",", "WebResource", "annisResource", ",", "Writer", "out", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "GenericType", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "util", ".", "BeanItemContainer", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ".", "Notification", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "MetaDataPanel", "extends", "Panel", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "MetaDataPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "VerticalLayout", "layout", ";", "private", "String", "toplevelCorpusName", ";", "private", "String", "documentName", ";", "public", "MetaDataPanel", "(", "String", "toplevelCorpusName", ")", "{", "this", "(", "toplevelCorpusName", ",", "null", ")", ";", "}", "public", "MetaDataPanel", "(", "String", "toplevelCorpusName", ",", "String", "documentName", ")", "{", "super", "(", "\"Metadata\"", ")", ";", "this", ".", "toplevelCorpusName", "=", "toplevelCorpusName", ";", "this", ".", "documentName", "=", "documentName", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "layout", "=", "new", "VerticalLayout", "(", ")", ";", "setContent", "(", "layout", ")", ";", "layout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", "mData", "=", "new", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", "(", "Annotation", ".", "class", ")", ";", "if", "(", "documentName", "==", "null", ")", "{", "mData", ".", "addAll", "(", "getMetaData", "(", "toplevelCorpusName", ",", "null", ")", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "setupTable", "(", "mData", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "Map", "<", "Integer", ",", "List", "<", "Annotation", ">", ">", "hashMData", "=", "splitListAnnotations", "(", ")", ";", "List", "<", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", ">", "l", "=", "putInBeanContainer", "(", "hashMData", ")", ";", "Accordion", "accordion", "=", "new", "Accordion", "(", ")", ";", "accordion", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "accordion", ")", ";", "for", "(", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", "item", ":", "l", ")", "{", "String", "corpusName", "=", "item", ".", "getIdByIndex", "(", "0", ")", ".", "getCorpusName", "(", ")", ";", "accordion", ".", "addTab", "(", "setupTable", "(", "item", ")", ",", "(", "toplevelCorpusName", ".", "equals", "(", "corpusName", ")", ")", "?", "\"corpus:", "\"", "+", "corpusName", ":", "\"document:", "\"", "+", "corpusName", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "List", "<", "Annotation", ">", "getMetaData", "(", "String", "toplevelCorpusName", ",", "String", "documentName", ")", "{", "List", "<", "Annotation", ">", "result", "=", "new", "ArrayList", "<", "Annotation", ">", "(", ")", ";", "WebResource", "res", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "try", "{", "res", "=", "res", ".", "path", "(", "\"corpora\"", ")", ".", "path", "(", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "toplevelCorpusName", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ";", "if", "(", "documentName", "!=", "null", ")", "{", "res", "=", "res", ".", "path", "(", "documentName", ")", ";", "}", "res", "=", "res", ".", "path", "(", "\"metadata\"", ")", ";", "result", "=", "res", ".", "get", "(", "new", "GenericType", "<", "List", "<", "Annotation", ">", ">", "(", ")", "{", "}", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ",", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "}", "return", "result", ";", "}", "private", "Table", "setupTable", "(", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", "metaData", ")", "{", "final", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", "mData", "=", "metaData", ";", "Table", "tblMeta", "=", "new", "Table", "(", ")", ";", "tblMeta", ".", "setContainerDataSource", "(", "mData", ")", ";", "tblMeta", ".", "addGeneratedColumn", "(", "\"genname\"", ",", "new", "Table", ".", "ColumnGenerator", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "Component", "generateCell", "(", "Table", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "columnId", ")", "{", "Annotation", "anno", "=", "mData", ".", "getItem", "(", "itemId", ")", ".", "getBean", "(", ")", ";", "String", "qName", "=", "anno", ".", "getName", "(", ")", ";", "if", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "qName", "=", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", "+", "\":\"", "+", "qName", ";", "}", "Label", "l", "=", "new", "Label", "(", "qName", ")", ";", "l", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "return", "l", ";", "}", "}", ")", ";", "tblMeta", ".", "addGeneratedColumn", "(", "\"genvalue\"", ",", "new", "Table", ".", "ColumnGenerator", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "Component", "generateCell", "(", "Table", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "columnId", ")", "{", "Annotation", "anno", "=", "mData", ".", "getItem", "(", "itemId", ")", ".", "getBean", "(", ")", ";", "Label", "l", "=", "new", "Label", "(", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ",", "Label", ".", "CONTENT_RAW", ")", ";", "return", "l", ";", "}", "}", ")", ";", "tblMeta", ".", "setVisibleColumns", "(", "new", "String", "[", "]", "{", "\"genname\"", ",", "\"genvalue\"", "}", ")", ";", "tblMeta", ".", "setColumnHeaders", "(", "new", "String", "[", "]", "{", "\"Name\"", ",", "\"Value\"", "}", ")", ";", "tblMeta", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "tblMeta", ".", "setColumnWidth", "(", "\"genname\"", ",", "-", "1", ")", ";", "tblMeta", ".", "setColumnExpandRatio", "(", "\"genvalue\"", ",", "1.0f", ")", ";", "return", "tblMeta", ";", "}", "private", "Map", "<", "Integer", ",", "List", "<", "Annotation", ">", ">", "splitListAnnotations", "(", ")", "{", "List", "<", "Annotation", ">", "metadata", "=", "getMetaData", "(", "toplevelCorpusName", ",", "documentName", ")", ";", "Map", "<", "Integer", ",", "List", "<", "Annotation", ">", ">", "hashMetaData", "=", "new", "TreeMap", "<", "Integer", ",", "List", "<", "Annotation", ">", ">", "(", "Collections", ".", "reverseOrder", "(", ")", ")", ";", "for", "(", "Annotation", "metaDatum", ":", "metadata", ")", "{", "int", "pre", "=", "metaDatum", ".", "getPre", "(", ")", ";", "if", "(", "!", "hashMetaData", ".", "containsKey", "(", "pre", ")", ")", "{", "hashMetaData", ".", "put", "(", "pre", ",", "new", "ArrayList", "<", "Annotation", ">", "(", ")", ")", ";", "hashMetaData", ".", "get", "(", "pre", ")", ".", "add", "(", "metaDatum", ")", ";", "}", "else", "{", "hashMetaData", ".", "get", "(", "pre", ")", ".", "add", "(", "metaDatum", ")", ";", "}", "}", "return", "hashMetaData", ";", "}", "private", "List", "<", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", ">", "putInBeanContainer", "(", "Map", "<", "Integer", ",", "List", "<", "Annotation", ">", ">", "splittedAnnotationsList", ")", "{", "List", "<", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", ">", "listOfBeanItemCon", "=", "new", "ArrayList", "<", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "List", "<", "Annotation", ">", "list", ":", "splittedAnnotationsList", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", "metaContainer", "=", "new", "BeanItemContainer", "<", "Annotation", ">", "(", "Annotation", ".", "class", ")", ";", "metaContainer", ".", "addAll", "(", "list", ")", ";", "listOfBeanItemCon", ".", "add", "(", "metaContainer", ")", ";", "}", "return", "listOfBeanItemCon", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Color", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Locale", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "public", "enum", "MatchedNodeColors", "{", "Red", "(", "new", "Color", "(", "255", ",", "0", ",", "0", ")", ")", ",", "MediumVioletRed", "(", "new", "Color", "(", "199", ",", "21", ",", "133", ")", ")", ",", "LimeGreen", "(", "new", "Color", "(", "50", ",", "205", ",", "50", ")", ")", ",", "Peru", "(", "new", "Color", "(", "205", ",", "133", ",", "63", ")", ")", ",", "IndianRed", "(", "new", "Color", "(", "205", ",", "92", ",", "92", ")", ")", ",", "YellowGreen", "(", "new", "Color", "(", "173", ",", "255", ",", "47", ")", ")", ",", "DarkRed", "(", "new", "Color", "(", "139", ",", "0", ",", "0", ")", ")", ",", "OrangeRed", "(", "new", "Color", "(", "255", ",", "69", ",", "0", ")", ")", ";", "private", "final", "Color", "color", ";", "private", "MatchedNodeColors", "(", "Color", "color", ")", "{", "this", ".", "color", "=", "color", ";", "}", "public", "Color", "getColor", "(", ")", "{", "return", "color", ";", "}", "public", "String", "getHTMLColor", "(", ")", "{", "StringBuilder", "result", "=", "new", "StringBuilder", "(", "\"#\"", ")", ";", "result", ".", "append", "(", "twoDigitHex", "(", "color", ".", "getRed", "(", ")", ")", ")", ";", "result", ".", "append", "(", "twoDigitHex", "(", "color", ".", "getGreen", "(", ")", ")", ")", ";", "result", ".", "append", "(", "twoDigitHex", "(", "color", ".", "getBlue", "(", ")", ")", ")", ";", "return", "result", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "private", "String", "twoDigitHex", "(", "int", "i", ")", "{", "String", "result", "=", "Integer", ".", "toHexString", "(", "i", ")", ".", "toLowerCase", "(", "new", "Locale", "(", "\"en\"", ")", ")", ";", "if", "(", "result", ".", "length", "(", ")", ">", "2", ")", "{", "result", "=", "result", ".", "substring", "(", "0", ",", "2", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "result", ".", "length", "(", ")", "<", "2", ")", "{", "result", "=", "StringUtils", ".", "leftPad", "(", "result", ",", "2", ",", "'0'", ")", ";", "}", "return", "result", ";", "}", "public", "static", "String", "colorClassByMatch", "(", "Long", "match", ")", "{", "if", "(", "match", "==", "null", ")", "{", "return", "null", ";", "}", "long", "m", "=", "match", ";", "m", "=", "Math", ".", "min", "(", "m", ",", "8", ")", ";", "return", "\"match_\"", "+", "m", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "impl", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "graph", ".", "Edge", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SSpan", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SSpanningRelation", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SToken", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SAnnotation", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SGraph", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collections", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "emf", ".", "common", ".", "util", ".", "EList", ";", "public", "class", "TimeHelper", "{", "public", "static", "double", "[", "]", "getOverlappedTime", "(", "SSpan", "node", ")", "{", "SGraph", "graph", "=", "node", ".", "getSGraph", "(", ")", ";", "final", "List", "<", "Double", ">", "startTimes", "=", "new", "LinkedList", "<", "Double", ">", "(", ")", ";", "final", "List", "<", "Double", ">", "endTimes", "=", "new", "LinkedList", "<", "Double", ">", "(", ")", ";", "EList", "<", "Edge", ">", "outEdges", "=", "graph", ".", "getOutEdges", "(", "node", ".", "getSId", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "outEdges", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "Edge", "e", ":", "outEdges", ")", "{", "if", "(", "e", "instanceof", "SSpanningRelation", ")", "{", "SToken", "tok", "=", "(", "(", "SSpanningRelation", ")", "e", ")", ".", "getSToken", "(", ")", ";", "SAnnotation", "anno", "=", "tok", ".", "getSAnnotation", "(", "\"annis::time\"", ")", ";", "if", "(", "anno", "!=", "null", ")", "{", "String", "[", "]", "split", "=", "anno", ".", "getSValueSTEXT", "(", ")", ".", "split", "(", "\"-\"", ")", ";", "if", "(", "split", ".", "length", "==", "1", ")", "{", "startTimes", ".", "add", "(", "Double", ".", "parseDouble", "(", "split", "[", "0", "]", ")", ")", ";", "}", "if", "(", "split", ".", "length", "==", "2", ")", "{", "startTimes", ".", "add", "(", "Double", ".", "parseDouble", "(", "split", "[", "0", "]", ")", ")", ";", "endTimes", ".", "add", "(", "Double", ".", "parseDouble", "(", "split", "[", "1", "]", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "if", "(", "startTimes", ".", "size", "(", ")", ">", "0", "&&", "endTimes", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "return", "new", "double", "[", "]", "{", "Collections", ".", "min", "(", "startTimes", ")", ",", "Collections", ".", "max", "(", "endTimes", ")", "}", ";", "}", "else", "if", "(", "startTimes", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "return", "new", "double", "[", "]", "{", "Collections", ".", "min", "(", "startTimes", ")", "}", ";", "}", "return", "new", "double", "[", "0", "]", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "impl", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "VisualizationToggle", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaController", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaPlayer", ";", "import", "annis", ".", "visualizers", ".", "LoadableVisualizer", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "concurrent", ".", "locks", ".", "ReadWriteLock", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "concurrent", ".", "locks", ".", "ReentrantReadWriteLock", ";", "public", "class", "MediaControllerImpl", "implements", "MediaController", "{", "private", "Map", "<", "String", ",", "List", "<", "MediaPlayer", ">", ">", "mediaPlayers", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "MediaPlayer", ">", "lastUsedPlayer", ";", "private", "Map", "<", "MediaPlayer", ",", "VisualizationToggle", ">", "visToggle", ";", "private", "ReadWriteLock", "lock", "=", "new", "ReentrantReadWriteLock", "(", ")", ";", "public", "MediaControllerImpl", "(", ")", "{", "lock", ".", "writeLock", "(", ")", ".", "lock", "(", ")", ";", "try", "{", "mediaPlayers", "=", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "List", "<", "MediaPlayer", ">", ">", "(", ")", ";", "lastUsedPlayer", "=", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "MediaPlayer", ">", "(", ")", ";", "visToggle", "=", "new", "HashMap", "<", "MediaPlayer", ",", "VisualizationToggle", ">", "(", ")", ";", "}", "finally", "{", "lock", ".", "writeLock", "(", ")", ".", "unlock", "(", ")", ";", "}", "}", "private", "MediaPlayer", "getPlayerForResult", "(", "String", "resultID", ")", "{", "List", "<", "MediaPlayer", ">", "allPlayers", "=", "mediaPlayers", ".", "get", "(", "resultID", ")", ";", "if", "(", "allPlayers", "!=", "null", "&&", "allPlayers", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "MediaPlayer", "lastPlayer", "=", "lastUsedPlayer", ".", "get", "(", "resultID", ")", ";", "MediaPlayer", "player", ";", "if", "(", "lastPlayer", "==", "null", ")", "{", "player", "=", "allPlayers", ".", "get", "(", "0", ")", ";", "}", "else", "{", "player", "=", "lastPlayer", ";", "}", "return", "player", ";", "}", "return", "null", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "play", "(", "String", "resultID", ",", "final", "double", "startTime", ")", "{", "lock", ".", "readLock", "(", ")", ".", "lock", "(", ")", ";", "try", "{", "final", "MediaPlayer", "player", "=", "getPlayerForResult", "(", "resultID", ")", ";", "if", "(", "player", "!=", "null", ")", "{", "closeOtherPlayers", "(", "player", ")", ";", "VisualizationToggle", "t", "=", "visToggle", ".", "get", "(", "player", ")", ";", "if", "(", "t", "!=", "null", ")", "{", "t", ".", "toggleVisualizer", "(", "true", ",", "new", "LoadableVisualizer", ".", "Callback", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "visualizerLoaded", "(", "LoadableVisualizer", "origin", ")", "{", "player", ".", "play", "(", "startTime", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "}", "}", "}", "finally", "{", "lock", ".", "readLock", "(", ")", ".", "unlock", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "play", "(", "String", "resultID", ",", "final", "double", "startTime", ",", "final", "double", "endTime", ")", "{", "lock", ".", "readLock", "(", ")", ".", "lock", "(", ")", ";", "try", "{", "final", "MediaPlayer", "player", "=", "getPlayerForResult", "(", "resultID", ")", ";", "if", "(", "player", "!=", "null", ")", "{", "closeOtherPlayers", "(", "player", ")", ";", "VisualizationToggle", "t", "=", "visToggle", ".", "get", "(", "player", ")", ";", "if", "(", "t", "!=", "null", ")", "{", "t", ".", "toggleVisualizer", "(", "true", ",", "new", "LoadableVisualizer", ".", "Callback", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "visualizerLoaded", "(", "LoadableVisualizer", "origin", ")", "{", "player", ".", "play", "(", "startTime", ",", "endTime", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "}", "}", "}", "finally", "{", "lock", ".", "readLock", "(", ")", ".", "unlock", "(", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "closeOtherPlayers", "(", "MediaPlayer", "doNotCloseThisOne", ")", "{", "for", "(", "List", "<", "MediaPlayer", ">", "playersForID", ":", "mediaPlayers", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "MediaPlayer", "player", ":", "playersForID", ")", "{", "if", "(", "player", "!=", "doNotCloseThisOne", ")", "{", "VisualizationToggle", "t", "=", "visToggle", ".", "get", "(", "player", ")", ";", "if", "(", "t", "!=", "null", ")", "{", "t", ".", "toggleVisualizer", "(", "false", ",", "null", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "pauseAll", "(", ")", "{", "lock", ".", "readLock", "(", ")", ".", "lock", "(", ")", ";", "try", "{", "for", "(", "List", "<", "MediaPlayer", ">", "playersForID", ":", "mediaPlayers", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "MediaPlayer", "player", ":", "playersForID", ")", "{", "player", ".", "pause", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "finally", "{", "lock", ".", "readLock", "(", ")", ".", "unlock", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "addMediaPlayer", "(", "MediaPlayer", "player", ",", "String", "resultID", ",", "VisualizationToggle", "toggle", ")", "{", "if", "(", "resultID", "==", "null", ")", "{", "return", ";", "}", "lock", ".", "writeLock", "(", ")", ".", "lock", "(", ")", ";", "try", "{", "if", "(", "mediaPlayers", ".", "get", "(", "resultID", ")", "==", "null", ")", "{", "mediaPlayers", ".", "put", "(", "resultID", ",", "new", "LinkedList", "<", "MediaPlayer", ">", "(", ")", ")", ";", "}", "List", "<", "MediaPlayer", ">", "playerList", "=", "mediaPlayers", ".", "get", "(", "resultID", ")", ";", "playerList", ".", "add", "(", "player", ")", ";", "visToggle", ".", "put", "(", "player", ",", "toggle", ")", ";", "}", "finally", "{", "lock", ".", "writeLock", "(", ")", ".", "unlock", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "clearMediaPlayers", "(", ")", "{", "lock", ".", "writeLock", "(", ")", ".", "lock", "(", ")", ";", "try", "{", "mediaPlayers", ".", "clear", "(", ")", ";", "visToggle", ".", "clear", "(", ")", ";", "lastUsedPlayer", ".", "clear", "(", ")", ";", "}", "finally", "{", "lock", ".", "writeLock", "(", ")", ".", "unlock", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "impl", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaController", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerFactory", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerHolder", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "MediaControllerFactoryImpl", "implements", "MediaControllerFactory", "{", "@", "Override", "public", "MediaController", "getOrCreate", "(", "MediaControllerHolder", "holder", ")", "{", "if", "(", "holder", "==", "null", ")", "{", "return", "new", "MediaControllerImpl", "(", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "holder", ".", "getMediaController", "(", ")", "==", "null", ")", "{", "holder", ".", "setMediaController", "(", "new", "MediaControllerImpl", "(", ")", ")", ";", "}", "return", "holder", ".", "getMediaController", "(", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "resultview", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "Match", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisUser", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "IllegalCorpusAccessException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "GenericType", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "UniformInterfaceException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeSet", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "AnnisResultQuery", "implements", "Serializable", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "AnnisResultQuery", ".", "class", ")", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "corpora", ";", "private", "String", "aql", ";", "private", "Application", "app", ";", "public", "AnnisResultQuery", "(", "Set", "<", "String", ">", "corpora", ",", "String", "aql", ",", "Application", "app", ")", "{", "this", ".", "corpora", "=", "corpora", ";", "this", ".", "aql", "=", "aql", ";", "this", ".", "app", "=", "app", ";", "}", "public", "List", "<", "Match", ">", "loadBeans", "(", "int", "startIndex", ",", "int", "count", ",", "AnnisUser", "user", ")", "throws", "IllegalCorpusAccessException", "{", "Set", "<", "String", ">", "filteredCorpora", "=", "new", "TreeSet", "<", "String", ">", "(", "corpora", ")", ";", "if", "(", "user", "!=", "null", ")", "{", "filteredCorpora", ".", "retainAll", "(", "user", ".", "getCorpusNameList", "(", ")", ")", ";", "}", "if", "(", "filteredCorpora", ".", "size", "(", ")", "!=", "corpora", ".", "size", "(", ")", ")", "{", "throw", "new", "IllegalCorpusAccessException", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "List", "<", "Match", ">", "result", "=", "new", "LinkedList", "<", "Match", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "app", "!=", "null", ")", "{", "WebResource", "annisResource", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "app", ")", ";", "try", "{", "annisResource", "=", "annisResource", ".", "path", "(", "\"search\"", ")", ".", "path", "(", "\"find\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"q\"", ",", "aql", ")", ".", "queryParam", "(", "\"offset\"", ",", "\"\"", "+", "startIndex", ")", ".", "queryParam", "(", "\"limit\"", ",", "\"\"", "+", "count", ")", ".", "queryParam", "(", "\"corpora\"", ",", "StringUtils", ".", "join", "(", "corpora", ",", "\",\"", ")", ")", ";", "result", "=", "annisResource", ".", "get", "(", "new", "GenericType", "<", "List", "<", "Match", ">", ">", "(", ")", "{", "}", ")", ";", "}", "catch", "(", "UniformInterfaceException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getEntity", "(", "String", ".", "class", ")", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "resultview", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "PluginSystem", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "VisualizationToggle", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerFactory", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerHolder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaPlayer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerPlugin", ";", "import", "annis", ".", "resolver", ".", "ResolverEntry", ";", "import", "annis", ".", "visualizers", ".", "LoadableVisualizer", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ApplicationResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "StreamResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ThemeResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Component", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "CustomLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "SaltProject", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sCorpusStructure", ".", "SDocument", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "STextualDS", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SToken", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SNode", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "ByteArrayInputStream", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "ByteArrayOutputStream", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "InputStream", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Random", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "VisualizerPanel", "extends", "CustomLayout", "implements", "Button", ".", "ClickListener", ",", "VisualizationToggle", "{", "private", "final", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "VisualizerPanel", ".", "class", ")", ";", "public", "static", "final", "ThemeResource", "ICON_COLLAPSE", "=", "new", "ThemeResource", "(", "\"\"", ")", ";", "public", "static", "final", "ThemeResource", "ICON_EXPAND", "=", "new", "ThemeResource", "(", "\"\"", ")", ";", "private", "ApplicationResource", "resource", "=", "null", ";", "private", "Component", "vis", ";", "private", "SDocument", "result", ";", "private", "PluginSystem", "ps", ";", "private", "ResolverEntry", "entry", ";", "private", "Random", "rand", "=", "new", "Random", "(", ")", ";", "private", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ";", "private", "List", "<", "SToken", ">", "token", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markersExact", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markersCovered", ";", "private", "Button", "btEntry", ";", "private", "String", "htmlID", ";", "private", "String", "resultID", ";", ";", "private", "VisualizerPlugin", "visPlugin", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "visibleTokenAnnos", ";", "private", "STextualDS", "text", ";", "private", "String", "segmentationName", ";", "private", "boolean", "showTextID", ";", "private", "final", "String", "PERMANENT", "=", "\"permanent\"", ";", "private", "final", "String", "ISVISIBLE", "=", "\"visible\"", ";", "private", "final", "String", "HIDDEN", "=", "\"hidden\"", ";", "private", "final", "String", "PRELOADED", "=", "\"preloaded\"", ";", "private", "final", "static", "String", "htmlTemplate", "=", "\"\"", "+", "\"\"", ";", "public", "VisualizerPanel", "(", "final", "ResolverEntry", "entry", ",", "SDocument", "result", ",", "List", "<", "SToken", ">", "token", ",", "Set", "<", "String", ">", "visibleTokenAnnos", ",", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ",", "@", "Deprecated", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markedAndCoveredMap", ",", "@", "Deprecated", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markedExactMap", ",", "STextualDS", "text", ",", "String", "htmlID", ",", "String", "resultID", ",", "SingleResultPanel", "parent", ",", "String", "segmentationName", ",", "PluginSystem", "ps", ",", "boolean", "showTextID", ")", "throws", "IOException", "{", "super", "(", "new", "ByteArrayInputStream", "(", "htmlTemplate", ".", "replace", "(", "\":id\"", ",", "htmlID", ")", ".", "getBytes", "(", "\"UTF-8\"", ")", ")", ")", ";", "visPlugin", "=", "ps", ".", "getVisualizer", "(", "entry", ".", "getVisType", "(", ")", ")", ";", "this", ".", "ps", "=", "ps", ";", "this", ".", "entry", "=", "entry", ";", "this", ".", "markersExact", "=", "markedExactMap", ";", "this", ".", "markersCovered", "=", "markedAndCoveredMap", ";", "this", ".", "result", "=", "result", ";", "this", ".", "token", "=", "token", ";", "this", ".", "visibleTokenAnnos", "=", "visibleTokenAnnos", ";", "this", ".", "markedAndCovered", "=", "markedAndCovered", ";", "this", ".", "text", "=", "text", ";", "this", ".", "segmentationName", "=", "segmentationName", ";", "this", ".", "htmlID", "=", "htmlID", ";", "this", ".", "resultID", "=", "resultID", ";", "this", ".", "showTextID", "=", "showTextID", ";", "this", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "PANEL_BORDERLESS", ")", ";", "this", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "if", "(", "visPlugin", "==", "null", ")", "{", "entry", ".", "setVisType", "(", "PluginSystem", ".", "DEFAULT_VISUALIZER", ")", ";", "visPlugin", "=", "ps", ".", "getVisualizer", "(", "entry", ".", "getVisType", "(", ")", ")", ";", "}", "if", "(", "entry", "!=", "null", ")", "{", "if", "(", "HIDDEN", ".", "equalsIgnoreCase", "(", "entry", ".", "getVisibility", "(", ")", ")", ")", "{", "btEntry", "=", "new", "Button", "(", "entry", ".", "getDisplayName", "(", ")", "+", "(", "showTextID", "?", "\"", "(\"", "+", "text", ".", "getSName", "(", ")", "+", "\")\"", ":", "\"\"", ")", ")", ";", "btEntry", ".", "setIcon", "(", "ICON_EXPAND", ")", ";", "btEntry", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_BORDERLESS", "+", "\"", "\"", "+", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btEntry", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "addComponent", "(", "btEntry", ",", "\"btEntry\"", ")", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "ISVISIBLE", ".", "equalsIgnoreCase", "(", "entry", ".", "getVisibility", "(", ")", ")", "||", "PRELOADED", ".", "equalsIgnoreCase", "(", "entry", ".", "getVisibility", "(", ")", ")", ")", "{", "btEntry", "=", "new", "Button", "(", "entry", ".", "getDisplayName", "(", ")", "+", "(", "showTextID", "?", "\"", "(\"", "+", "text", ".", "getSName", "(", ")", "+", "\")\"", ":", "\"\"", ")", ")", ";", "btEntry", ".", "setIcon", "(", "ICON_COLLAPSE", ")", ";", "btEntry", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_BORDERLESS", "+", "\"", "\"", "+", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btEntry", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "addComponent", "(", "btEntry", ",", "\"btEntry\"", ")", ";", "}", "try", "{", "vis", "=", "createComponent", "(", ")", ";", "vis", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "addComponent", "(", "vis", ",", "\"iframe\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "visPlugin", ".", "getShortName", "(", ")", ",", "ex", ".", "toString", "(", ")", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "log", ".", "error", "(", "\"\"", "+", "visPlugin", ".", "getShortName", "(", ")", ",", "ex", ")", ";", "}", "if", "(", "PRELOADED", ".", "equalsIgnoreCase", "(", "entry", ".", "getVisibility", "(", ")", ")", ")", "{", "btEntry", ".", "setIcon", "(", "ICON_EXPAND", ")", ";", "vis", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "private", "Component", "createComponent", "(", ")", "{", "Application", "application", "=", "getApplication", "(", ")", ";", "VisualizerInput", "input", "=", "createInput", "(", ")", ";", "Component", "c", "=", "this", ".", "visPlugin", ".", "createComponent", "(", "input", ",", "application", ")", ";", "c", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "return", "c", ";", "}", "private", "VisualizerInput", "createInput", "(", ")", "{", "VisualizerInput", "input", "=", "new", "VisualizerInput", "(", ")", ";", "input", ".", "setAnnisWebServiceURL", "(", "getApplication", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "input", ".", "setContextPath", "(", "Helper", ".", "getContext", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ")", ";", "input", ".", "setDotPath", "(", "getApplication", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"DotPath\"", ")", ")", ";", "input", ".", "setId", "(", "resultID", ")", ";", "input", ".", "setMarkableExactMap", "(", "markersExact", ")", ";", "input", ".", "setMarkableMap", "(", "markersCovered", ")", ";", "input", ".", "setMarkedAndCovered", "(", "markedAndCovered", ")", ";", "input", ".", "setVisPanel", "(", "this", ")", ";", "input", ".", "setResult", "(", "result", ")", ";", "input", ".", "setToken", "(", "token", ")", ";", "input", ".", "setVisibleTokenAnnos", "(", "visibleTokenAnnos", ")", ";", "input", ".", "setText", "(", "text", ")", ";", "input", ".", "setSegmentationName", "(", "segmentationName", ")", ";", "if", "(", "entry", "!=", "null", ")", "{", "input", ".", "setMappings", "(", "entry", ".", "getMappings", "(", ")", ")", ";", "input", ".", "setNamespace", "(", "entry", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ";", "String", "template", "=", "Helper", ".", "getContext", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "+", "\"/Resource/\"", "+", "entry", ".", "getVisType", "(", ")", "+", "\"/%s\"", ";", "input", ".", "setResourcePathTemplate", "(", "template", ")", ";", "}", "if", "(", "visPlugin", ".", "isUsingText", "(", ")", "&&", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ".", "getSNodes", "(", ")", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "SaltProject", "p", "=", "getText", "(", "result", ".", "getSCorpusGraph", "(", ")", ".", "getSRootCorpus", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getSName", "(", ")", ",", "result", ".", "getSName", "(", ")", ")", ";", "input", ".", "setDocument", "(", "p", ".", "getSCorpusGraphs", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getSDocuments", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "input", ".", "setDocument", "(", "result", ")", ";", "}", "return", "input", ";", "}", "public", "void", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "Set", "<", "String", ">", "annos", ")", "{", "this", ".", "visibleTokenAnnos", "=", "annos", ";", "if", "(", "visPlugin", "!=", "null", "&&", "vis", "!=", "null", ")", "{", "visPlugin", ".", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "vis", ",", "annos", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "setSegmentationLayer", "(", "String", "segmentationName", ",", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ")", "{", "this", ".", "segmentationName", "=", "segmentationName", ";", "this", ".", "markedAndCovered", "=", "markedAndCovered", ";", "if", "(", "visPlugin", "!=", "null", "&&", "vis", "!=", "null", ")", "{", "visPlugin", ".", "setSegmentationLayer", "(", "vis", ",", "segmentationName", ",", "markedAndCovered", ")", ";", "}", "}", "public", "ApplicationResource", "createResource", "(", "final", "ByteArrayOutputStream", "byteStream", ",", "String", "mimeType", ")", "{", "StreamResource", "r", ";", "r", "=", "new", "StreamResource", "(", "new", "StreamResource", ".", "StreamSource", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "InputStream", "getStream", "(", ")", "{", "return", "new", "ByteArrayInputStream", "(", "byteStream", ".", "toByteArray", "(", ")", ")", ";", "}", "}", ",", "entry", ".", "getVisType", "(", ")", "+", "\"_\"", "+", "rand", ".", "nextInt", "(", "Integer", ".", "MAX_VALUE", ")", ",", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "r", ".", "setMIMEType", "(", "mimeType", ")", ";", "return", "r", ";", "}", "private", "SaltProject", "getText", "(", "String", "toplevelCorpusName", ",", "String", "documentName", ")", "{", "SaltProject", "txt", "=", "null", ";", "try", "{", "toplevelCorpusName", "=", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "toplevelCorpusName", ",", "\"UTF-8\"", ")", ";", "documentName", "=", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "documentName", ",", "\"UTF-8\"", ")", ";", "WebResource", "annisResource", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "txt", "=", "annisResource", ".", "path", "(", "\"graphs\"", ")", ".", "path", "(", "toplevelCorpusName", ")", ".", "path", "(", "documentName", ")", ".", "get", "(", "SaltProject", ".", "class", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "e", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "e", ")", ";", "}", "return", "txt", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "detach", "(", ")", "{", "super", ".", "detach", "(", ")", ";", "if", "(", "resource", "!=", "null", ")", "{", "getApplication", "(", ")", ".", "removeResource", "(", "resource", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "toggleVisualizer", "(", "!", "visualizerIsVisible", "(", ")", ",", "null", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "visualizerIsVisible", "(", ")", "{", "if", "(", "vis", "==", "null", "||", "!", "vis", ".", "isVisible", "(", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "return", "true", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "toggleVisualizer", "(", "boolean", "visible", ",", "LoadableVisualizer", ".", "Callback", "callback", ")", "{", "if", "(", "visible", ")", "{", "if", "(", "visPlugin", "!=", "null", "&&", "vis", "==", "null", ")", "{", "try", "{", "vis", "=", "createComponent", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "visPlugin", ".", "getShortName", "(", ")", ",", "ex", ".", "toString", "(", ")", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "log", ".", "error", "(", "\"\"", "+", "visPlugin", ".", "getShortName", "(", ")", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "if", "(", "callback", "!=", "null", "&&", "vis", "instanceof", "LoadableVisualizer", ")", "{", "LoadableVisualizer", "loadableVis", "=", "(", "LoadableVisualizer", ")", "vis", ";", "if", "(", "loadableVis", ".", "isLoaded", "(", ")", ")", "{", "callback", ".", "visualizerLoaded", "(", "(", "LoadableVisualizer", ")", "vis", ")", ";", "}", "else", "{", "loadableVis", ".", "clearCallbacks", "(", ")", ";", "loadableVis", ".", "addOnLoadCallBack", "(", "callback", ")", ";", "}", "}", "btEntry", ".", "setIcon", "(", "ICON_COLLAPSE", ")", ";", "vis", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "if", "(", "getComponent", "(", "\"iframe\"", ")", "==", "null", ")", "{", "addComponent", "(", "vis", ",", "\"iframe\"", ")", ";", "}", "}", "else", "{", "if", "(", "vis", "!=", "null", ")", "{", "vis", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "if", "(", "vis", "instanceof", "MediaPlayer", ")", "{", "removeComponent", "(", "vis", ")", ";", "}", "}", "btEntry", ".", "setIcon", "(", "ICON_EXPAND", ")", ";", "}", "}", "public", "String", "getHtmlID", "(", ")", "{", "return", "htmlID", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "resultview", ";", "import", "annis", ".", "exceptions", ".", "AnnisCorpusAccessException", ";", "import", "annis", ".", "exceptions", ".", "AnnisQLSemanticsException", ";", "import", "annis", ".", "exceptions", ".", "AnnisQLSyntaxException", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "CitationWindow", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "PluginSystem", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "paging", ".", "PagingCallback", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "paging", ".", "PagingComponent", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisUser", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "Match", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "PaintException", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "PaintTarget", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Alignment", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "MenuBar", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "MenuBar", ".", "MenuItem", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "ProgressIndicator", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "VerticalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ".", "Entry", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeSet", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "ResultViewPanel", "extends", "Panel", "implements", "PagingCallback", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "ResultViewPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "PagingComponent", "paging", ";", "private", "ResultSetPanel", "resultPanel", ";", "private", "String", "aql", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ";", "private", "int", "contextLeft", ",", "contextRight", ",", "pageSize", ";", "private", "AnnisResultQuery", "query", ";", "private", "ProgressIndicator", "progressResult", ";", "private", "PluginSystem", "ps", ";", "private", "MenuItem", "miTokAnnos", ";", "private", "MenuItem", "miSegmentation", ";", "private", "TreeMap", "<", "String", ",", "Boolean", ">", "tokenAnnoVisible", ";", "private", "String", "currentSegmentationLayer", ";", "private", "VerticalLayout", "mainLayout", ";", "public", "ResultViewPanel", "(", "String", "aql", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ",", "int", "contextLeft", ",", "int", "contextRight", ",", "String", "segmentationLayer", ",", "int", "pageSize", ",", "PluginSystem", "ps", ")", "{", "this", ".", "tokenAnnoVisible", "=", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "Boolean", ">", "(", ")", ";", "this", ".", "aql", "=", "aql", ";", "this", ".", "corpora", "=", "corpora", ";", "this", ".", "contextLeft", "=", "contextLeft", ";", "this", ".", "contextRight", "=", "contextRight", ";", "this", ".", "pageSize", "=", "pageSize", ";", "this", ".", "ps", "=", "ps", ";", "this", ".", "currentSegmentationLayer", "=", "segmentationLayer", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "mainLayout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "mainLayout", ".", "setMargin", "(", "false", ")", ";", "mainLayout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "MenuBar", "mbResult", "=", "new", "MenuBar", "(", ")", ";", "mbResult", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "miSegmentation", "=", "mbResult", ".", "addItem", "(", "\"\"", ",", "null", ")", ";", "miTokAnnos", "=", "mbResult", ".", "addItem", "(", "\"\"", ",", "null", ")", ";", "mbResult", ".", "addItem", "(", "\"\"", ",", "new", "MenuBar", ".", "Command", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "menuSelected", "(", "MenuItem", "selectedItem", ")", "{", "showCitationURLWindow", "(", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "paging", "=", "new", "PagingComponent", "(", "0", ",", "pageSize", ")", ";", "paging", ".", "setInfo", "(", "\"\"", "+", "aql", ".", "replaceAll", "(", "\"n\"", ",", "\"", "\"", ")", "+", "\"\\\"\"", ")", ";", "paging", ".", "addCallback", "(", "(", "PagingCallback", ")", "this", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "mbResult", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "paging", ")", ";", "mainLayout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "progressResult", "=", "new", "ProgressIndicator", "(", ")", ";", "progressResult", ".", "setIndeterminate", "(", "true", ")", ";", "progressResult", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "progressResult", ".", "setPollingInterval", "(", "250", ")", ";", "progressResult", ".", "setCaption", "(", "\"\"", "+", "aql", ".", "replaceAll", "(", "\"n\"", ",", "\"", "\"", ")", "+", "\"\\\"\"", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "progressResult", ")", ";", "mainLayout", ".", "setComponentAlignment", "(", "progressResult", ",", "Alignment", ".", "TOP_CENTER", ")", ";", "mainLayout", ".", "setExpandRatio", "(", "paging", ",", "0.0f", ")", ";", "mainLayout", ".", "setExpandRatio", "(", "progressResult", ",", "1.0f", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "try", "{", "query", "=", "new", "AnnisResultQuery", "(", "corpora", ".", "keySet", "(", ")", ",", "aql", ",", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "createPage", "(", "0", ",", "pageSize", ")", ";", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "setCount", "(", "int", "count", ")", "{", "paging", ".", "setCount", "(", "count", ",", "false", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "createPage", "(", "final", "int", "start", ",", "final", "int", "limit", ")", "{", "if", "(", "query", "!=", "null", ")", "{", "progressResult", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "progressResult", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "if", "(", "resultPanel", "!=", "null", ")", "{", "resultPanel", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "}", "final", "ResultViewPanel", "finalThis", "=", "this", ";", "Runnable", "r", "=", "new", "Runnable", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "try", "{", "AnnisUser", "user", "=", "null", ";", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "getApplication", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", ";", "}", "}", "List", "<", "Match", ">", "result", "=", "query", ".", "loadBeans", "(", "start", ",", "limit", ",", "user", ")", ";", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "resultPanel", "!=", "null", ")", "{", "mainLayout", ".", "removeComponent", "(", "resultPanel", ")", ";", "}", "resultPanel", "=", "new", "ResultSetPanel", "(", "result", ",", "start", ",", "ps", ",", "contextLeft", ",", "contextRight", ",", "currentSegmentationLayer", ",", "finalThis", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "resultPanel", ")", ";", "mainLayout", ".", "setExpandRatio", "(", "resultPanel", ",", "1.0f", ")", ";", "mainLayout", ".", "setExpandRatio", "(", "progressResult", ",", "0.0f", ")", ";", "resultPanel", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "AnnisQLSemanticsException", "ex", ")", "{", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "paging", ".", "setInfo", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "AnnisQLSyntaxException", "ex", ")", "{", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "paging", ".", "setInfo", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "AnnisCorpusAccessException", "ex", ")", "{", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "paging", ".", "setInfo", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "paging", ".", "setInfo", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "finally", "{", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "progressResult", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "progressResult", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "}", "}", "}", "}", ";", "Thread", "t", "=", "new", "Thread", "(", "r", ")", ";", "t", ".", "start", "(", ")", ";", "}", "}", "public", "Set", "<", "String", ">", "getVisibleTokenAnnos", "(", ")", "{", "TreeSet", "<", "String", ">", "result", "=", "new", "TreeSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "Entry", "<", "String", ",", "Boolean", ">", "e", ":", "tokenAnnoVisible", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getValue", "(", ")", ".", "booleanValue", "(", ")", "==", "true", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "e", ".", "getKey", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "private", "void", "showCitationURLWindow", "(", ")", "{", "final", "Window", "w", "=", "new", "CitationWindow", "(", "getApplication", "(", ")", ",", "aql", ",", "corpora", ",", "contextLeft", ",", "contextRight", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "addWindow", "(", "w", ")", ";", "w", ".", "center", "(", ")", ";", "}", "public", "void", "updateSegmentationLayer", "(", "Set", "<", "String", ">", "segLayers", ")", "{", "miSegmentation", ".", "removeChildren", "(", ")", ";", "segLayers", ".", "add", "(", "\"\"", ")", ";", "for", "(", "String", "s", ":", "segLayers", ")", "{", "MenuItem", "miSingleSegLayer", "=", "miSegmentation", ".", "addItem", "(", "\"\"", ".", "equals", "(", "s", ")", "?", "\"<default>\"", ":", "s", ",", "new", "MenuBar", ".", "Command", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "menuSelected", "(", "MenuItem", "selectedItem", ")", "{", "currentSegmentationLayer", "=", "selectedItem", ".", "getText", "(", ")", ";", "for", "(", "MenuItem", "mi", ":", "miSegmentation", ".", "getChildren", "(", ")", ")", "{", "mi", ".", "setChecked", "(", "mi", "==", "selectedItem", ")", ";", "}", "resultPanel", ".", "setSegmentationLayer", "(", "currentSegmentationLayer", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "miSingleSegLayer", ".", "setCheckable", "(", "true", ")", ";", "miSingleSegLayer", ".", "setChecked", "(", "(", "currentSegmentationLayer", "==", "null", "&&", "\"\"", ".", "equals", "(", "s", ")", ")", "||", "s", ".", "equals", "(", "currentSegmentationLayer", ")", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "updateTokenAnnos", "(", "Set", "<", "String", ">", "tokenAnnotationLevelSet", ")", "{", "for", "(", "String", "s", ":", "tokenAnnotationLevelSet", ")", "{", "if", "(", "!", "tokenAnnoVisible", ".", "containsKey", "(", "s", ")", ")", "{", "tokenAnnoVisible", ".", "put", "(", "s", ",", "Boolean", ".", "TRUE", ")", ";", "}", "}", "miTokAnnos", ".", "removeChildren", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "a", ":", "tokenAnnotationLevelSet", ")", "{", "MenuItem", "miSingleTokAnno", "=", "miTokAnnos", ".", "addItem", "(", "a", ",", "new", "MenuBar", ".", "Command", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "menuSelected", "(", "MenuItem", "selectedItem", ")", "{", "if", "(", "selectedItem", ".", "isChecked", "(", ")", ")", "{", "tokenAnnoVisible", ".", "put", "(", "selectedItem", ".", "getText", "(", ")", ",", "Boolean", ".", "TRUE", ")", ";", "}", "else", "{", "tokenAnnoVisible", ".", "put", "(", "selectedItem", ".", "getText", "(", ")", ",", "Boolean", ".", "FALSE", ")", ";", "}", "resultPanel", ".", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "getVisibleTokenAnnos", "(", ")", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "miSingleTokAnno", ".", "setCheckable", "(", "true", ")", ";", "miSingleTokAnno", ".", "setChecked", "(", "tokenAnnoVisible", ".", "get", "(", "a", ")", ".", "booleanValue", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "paintContent", "(", "PaintTarget", "target", ")", "throws", "PaintException", "{", "super", ".", "paintContent", "(", "target", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "resultview", ";", "import", "annis", ".", "CommonHelper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "PluginSystem", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaController", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerFactory", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerHolder", ";", "import", "annis", ".", "resolver", ".", "ResolverEntry", ";", "import", "annis", ".", "resolver", ".", "ResolverEntry", ".", "ElementType", ";", "import", "annis", ".", "resolver", ".", "SingleResolverRequest", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "Match", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "GenericType", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "UniformInterfaceException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "util", ".", "BeanItemContainer", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "WebApplicationContext", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "SaltProject", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sCorpusStructure", ".", "SDocument", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SLayer", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SNode", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SRelation", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "UnsupportedEncodingException", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "concurrent", ".", "*", ";", "import", "javax", ".", "ws", ".", "rs", ".", "core", ".", "Response", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "Validate", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "ResultSetPanel", "extends", "Panel", "implements", "ResolverProvider", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "ResultSetPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "Map", "<", "HashSet", "<", "SingleResolverRequest", ">", ",", "List", "<", "ResolverEntry", ">", ">", "cacheResolver", ";", "public", "static", "final", "String", "FILESYSTEM_CACHE_RESULT", "=", "\"\"", ";", "private", "BeanItemContainer", "<", "Match", ">", "container", ";", "private", "List", "<", "SingleResultPanel", ">", "resultPanelList", ";", "private", "PluginSystem", "ps", ";", "private", "String", "segmentationName", ";", "private", "int", "start", ";", "private", "int", "contextLeft", ";", "private", "int", "contextRight", ";", "private", "ResultViewPanel", "parent", ";", "private", "List", "<", "Match", ">", "matches", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "tokenAnnotationLevelSet", "=", "Collections", ".", "synchronizedSet", "(", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ")", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "segmentationLayerSet", "=", "Collections", ".", "synchronizedSet", "(", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ")", ";", "private", "ProgressIndicator", "indicator", ";", "private", "VerticalLayout", "layout", ";", "public", "ResultSetPanel", "(", "List", "<", "Match", ">", "matches", ",", "int", "start", ",", "PluginSystem", "ps", ",", "int", "contextLeft", ",", "int", "contextRight", ",", "String", "segmentationName", ",", "ResultViewPanel", "parent", ")", "{", "this", ".", "ps", "=", "ps", ";", "this", ".", "segmentationName", "=", "segmentationName", ";", "this", ".", "start", "=", "start", ";", "this", ".", "contextLeft", "=", "contextLeft", ";", "this", ".", "contextRight", "=", "contextRight", ";", "this", ".", "parent", "=", "parent", ";", "this", ".", "matches", "=", "Collections", ".", "synchronizedList", "(", "matches", ")", ";", "resultPanelList", "=", "Collections", ".", "synchronizedList", "(", "new", "LinkedList", "<", "SingleResultPanel", ">", "(", ")", ")", ";", "cacheResolver", "=", "Collections", ".", "synchronizedMap", "(", "new", "HashMap", "<", "HashSet", "<", "SingleResolverRequest", ">", ",", "List", "<", "ResolverEntry", ">", ">", "(", ")", ")", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "layout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "layout", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "layout", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "PANEL_BORDERLESS", ")", ";", "layout", ".", "setMargin", "(", "false", ")", ";", "addStyleName", "(", "\"result-view\"", ")", ";", "container", "=", "new", "BeanItemContainer", "<", "Match", ">", "(", "Match", ".", "class", ",", "this", ".", "matches", ")", ";", "indicator", "=", "new", "ProgressIndicator", "(", ")", ";", "indicator", ".", "setIndeterminate", "(", "true", ")", ";", "indicator", ".", "setValue", "(", "0f", ")", ";", "indicator", ".", "setPollingInterval", "(", "250", ")", ";", "indicator", ".", "setCaption", "(", "\"\"", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "indicator", ")", ";", "layout", ".", "setComponentAlignment", "(", "indicator", ",", "Alignment", ".", "BOTTOM_CENTER", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "MediaControllerFactory", "mcFactory", "=", "ps", ".", "getPluginManager", "(", ")", ".", "getPlugin", "(", "MediaControllerFactory", ".", "class", ")", ";", "if", "(", "mcFactory", "!=", "null", "&&", "getApplication", "(", ")", "instanceof", "MediaControllerHolder", ")", "{", "mcFactory", ".", "getOrCreate", "(", "(", "MediaControllerHolder", ")", "getApplication", "(", ")", ")", ".", "clearMediaPlayers", "(", ")", ";", "}", "String", "propBatchSize", "=", "getApplication", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"\"", ")", ";", "final", "int", "batchSize", "=", "propBatchSize", "==", "null", "?", "5", ":", "Integer", ".", "parseInt", "(", "propBatchSize", ")", ";", "indicator", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "ExecutorService", "singleExecutor", "=", "Executors", ".", "newSingleThreadExecutor", "(", ")", ";", "Runnable", "run", "=", "new", "AllResultsFetcher", "(", "batchSize", ")", ";", "singleExecutor", ".", "submit", "(", "run", ")", ";", "}", "private", "Map", "<", "Integer", ",", "Future", "<", "SingleResultPanel", ">", ">", "loadNextResultBatch", "(", "int", "batchSize", ",", "int", "offset", ",", "ExecutorService", "executorService", ",", "WebResource", "resWithoutMatch", ")", "{", "Map", "<", "Integer", ",", "Future", "<", "SingleResultPanel", ">", ">", "tasks", "=", "Collections", ".", "synchronizedMap", "(", "new", "HashMap", "<", "Integer", ",", "Future", "<", "SingleResultPanel", ">", ">", "(", ")", ")", ";", "ListIterator", "<", "Match", ">", "it", "=", "matches", ".", "listIterator", "(", "offset", ")", ";", "while", "(", "it", ".", "hasNext", "(", ")", "&&", "(", "it", ".", "nextIndex", "(", ")", "-", "offset", ")", "<", "batchSize", ")", "{", "int", "i", "=", "it", ".", "nextIndex", "(", ")", ";", "Match", "m", "=", "it", ".", "next", "(", ")", ";", "List", "<", "String", ">", "encodedSaltIDs", "=", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "s", ":", "m", ".", "getSaltIDs", "(", ")", ")", "{", "try", "{", "encodedSaltIDs", ".", "add", "(", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "s", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "UnsupportedEncodingException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "WebResource", "res", "=", "resWithoutMatch", ".", "queryParam", "(", "\"q\"", ",", "StringUtils", ".", "join", "(", "encodedSaltIDs", ",", "\",\"", ")", ")", ";", "if", "(", "res", "!=", "null", ")", "{", "Future", "<", "SingleResultPanel", ">", "f", "=", "lazyLoadResultPanel", "(", "executorService", ",", "res", ",", "i", ",", "this", ")", ";", "tasks", ".", "put", "(", "i", ",", "f", ")", ";", "}", "}", "return", "tasks", ";", "}", "@", "Override", "public", "ResolverEntry", "[", "]", "getResolverEntries", "(", "SDocument", "doc", ")", "{", "HashSet", "<", "ResolverEntry", ">", "visSet", "=", "new", "HashSet", "<", "ResolverEntry", ">", "(", ")", ";", "HashSet", "<", "SingleResolverRequest", ">", "resolverRequests", "=", "new", "HashSet", "<", "SingleResolverRequest", ">", "(", ")", ";", "Set", "<", "String", ">", "nodeLayers", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "SNode", "n", ":", "doc", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ".", "getSNodes", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "SLayer", "layer", ":", "n", ".", "getSLayers", "(", ")", ")", "{", "nodeLayers", ".", "add", "(", "layer", ".", "getSName", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "Set", "<", "String", ">", "edgeLayers", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "SRelation", "e", ":", "doc", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ".", "getSRelations", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "SLayer", "layer", ":", "e", ".", "getSLayers", "(", ")", ")", "{", "try", "{", "edgeLayers", ".", "add", "(", "layer", ".", "getSName", "(", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "NullPointerException", "ex", ")", "{", "log", ".", "warn", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "for", "(", "String", "ns", ":", "nodeLayers", ")", "{", "resolverRequests", ".", "add", "(", "new", "SingleResolverRequest", "(", "doc", ".", "getSCorpusGraph", "(", ")", ".", "getSRootCorpus", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getSName", "(", ")", ",", "ns", ",", "ElementType", ".", "node", ")", ")", ";", "}", "for", "(", "String", "ns", ":", "edgeLayers", ")", "{", "resolverRequests", ".", "add", "(", "new", "SingleResolverRequest", "(", "doc", ".", "getSCorpusGraph", "(", ")", ".", "getSRootCorpus", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getSName", "(", ")", ",", "ns", ",", "ElementType", ".", "edge", ")", ")", ";", "}", "if", "(", "cacheResolver", ".", "containsKey", "(", "resolverRequests", ")", ")", "{", "visSet", ".", "addAll", "(", "cacheResolver", ".", "get", "(", "resolverRequests", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "List", "<", "ResolverEntry", ">", "resolverList", "=", "new", "LinkedList", "<", "ResolverEntry", ">", "(", ")", ";", "WebResource", "resResolver", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ".", "path", "(", "\"resolver\"", ")", ";", "for", "(", "SingleResolverRequest", "r", ":", "resolverRequests", ")", "{", "List", "<", "ResolverEntry", ">", "tmp", ";", "try", "{", "String", "corpusName", "=", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "r", ".", "getCorpusName", "(", ")", ",", "\"UTF-8\"", ")", ";", "String", "namespace", "=", "r", ".", "getNamespace", "(", ")", ";", "String", "type", "=", "r", ".", "getType", "(", ")", "==", "null", "?", "null", ":", "r", ".", "getType", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ";", "if", "(", "corpusName", "!=", "null", "&&", "namespace", "!=", "null", "&&", "type", "!=", "null", ")", "{", "WebResource", "res", "=", "resResolver", ".", "path", "(", "corpusName", ")", ".", "path", "(", "namespace", ")", ".", "path", "(", "type", ")", ";", "try", "{", "tmp", "=", "res", ".", "get", "(", "new", "GenericType", "<", "List", "<", "ResolverEntry", ">", ">", "(", ")", "{", "}", ")", ";", "resolverList", ".", "addAll", "(", "tmp", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", "+", "res", ".", "toString", "(", ")", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "visSet", ".", "addAll", "(", "resolverList", ")", ";", "cacheResolver", ".", "put", "(", "resolverRequests", ",", "resolverList", ")", ";", "}", "ResolverEntry", "[", "]", "visArray", "=", "visSet", ".", "toArray", "(", "new", "ResolverEntry", "[", "0", "]", ")", ";", "Arrays", ".", "sort", "(", "visArray", ",", "new", "Comparator", "<", "ResolverEntry", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "ResolverEntry", "o1", ",", "ResolverEntry", "o2", ")", "{", "if", "(", "o1", ".", "getOrder", "(", ")", "<", "o2", ".", "getOrder", "(", ")", ")", "{", "return", "-", "1", ";", "}", "else", "if", "(", "o1", ".", "getOrder", "(", ")", ">", "o2", ".", "getOrder", "(", ")", ")", "{", "return", "1", ";", "}", "else", "{", "return", "0", ";", "}", "}", "}", ")", ";", "return", "visArray", ";", "}", "public", "void", "setSegmentationLayer", "(", "String", "segmentationLayer", ")", "{", "for", "(", "SingleResultPanel", "p", ":", "resultPanelList", ")", "{", "p", ".", "setSegmentationLayer", "(", "segmentationLayer", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "Set", "<", "String", ">", "annos", ")", "{", "for", "(", "SingleResultPanel", "p", ":", "resultPanelList", ")", "{", "p", ".", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "annos", ")", ";", "}", "}", "private", "Future", "<", "SingleResultPanel", ">", "lazyLoadResultPanel", "(", "final", "ExecutorService", "executorService", ",", "final", "WebResource", "subgraphRes", ",", "final", "int", "offset", ",", "final", "ResolverProvider", "rsProvider", ")", "{", "final", "int", "resultNumber", "=", "start", "+", "offset", ";", "Callable", "<", "SingleResultPanel", ">", "run", "=", "new", "SingleResultFetcher", "(", "subgraphRes", ",", "resultNumber", ",", "rsProvider", ")", ";", "return", "executorService", ".", "submit", "(", "run", ")", ";", "}", "public", "class", "SingleResultFetcher", "implements", "Callable", "<", "SingleResultPanel", ">", "{", "private", "WebResource", "subgraphRes", ";", "private", "int", "resultNumber", ";", "private", "ResolverProvider", "rsProvider", ";", "public", "SingleResultFetcher", "(", "WebResource", "subgraphRes", ",", "int", "resultNumber", ",", "ResolverProvider", "rsProvider", ")", "{", "this", ".", "subgraphRes", "=", "subgraphRes", ";", "this", ".", "resultNumber", "=", "resultNumber", ";", "this", ".", "rsProvider", "=", "rsProvider", ";", "}", "@", "Override", "public", "SingleResultPanel", "call", "(", ")", "{", "SaltProject", "p", "=", "null", ";", "int", "tries", "=", "0", ";", "while", "(", "p", "==", "null", "&&", "tries", "<", "100", ")", "{", "try", "{", "p", "=", "subgraphRes", ".", "get", "(", "SaltProject", ".", "class", ")", ";", "}", "catch", "(", "UniformInterfaceException", "ex", ")", "{", "if", "(", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getStatus", "(", ")", "!=", "Response", ".", "Status", ".", "SERVICE_UNAVAILABLE", ".", "getStatusCode", "(", ")", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ",", "ex", ")", ";", "break", ";", "}", "try", "{", "Thread", ".", "sleep", "(", "500", ")", ";", "}", "catch", "(", "InterruptedException", "ex1", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex1", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ",", "ex", ")", ";", "break", ";", "}", "tries", "++", ";", "}", "Validate", ".", "notNull", "(", "p", ")", ";", "SingleResultPanel", "result", ";", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "segmentationLayerSet", ".", "addAll", "(", "CommonHelper", ".", "getOrderingTypes", "(", "p", ")", ")", ";", "tokenAnnotationLevelSet", ".", "addAll", "(", "CommonHelper", ".", "getTokenAnnotationLevelSet", "(", "p", ")", ")", ";", "parent", ".", "updateSegmentationLayer", "(", "segmentationLayerSet", ")", ";", "parent", ".", "updateTokenAnnos", "(", "tokenAnnotationLevelSet", ")", ";", "if", "(", "p", "!=", "null", "&&", "p", ".", "getSCorpusGraphs", "(", ")", ".", "size", "(", ")", ">", "0", "&&", "p", ".", "getSCorpusGraphs", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getSDocuments", "(", ")", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "result", "=", "new", "SingleResultPanel", "(", "p", ".", "getSCorpusGraphs", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getSDocuments", "(", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ",", "resultNumber", ",", "rsProvider", ",", "ps", ",", "parent", ".", "getVisibleTokenAnnos", "(", ")", ",", "segmentationName", ")", ";", "}", "else", "{", "log", ".", "warn", "(", "\"\"", ",", "subgraphRes", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "result", "=", "null", ";", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "}", "public", "class", "AllResultsFetcher", "implements", "Runnable", "{", "private", "int", "batchSize", ";", "public", "AllResultsFetcher", "(", "int", "batchSize", ")", "{", "this", ".", "batchSize", "=", "batchSize", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "ExecutorService", "executorService", "=", "Executors", ".", "newFixedThreadPool", "(", "batchSize", ")", ";", "WebResource", "res", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "res", "!=", "null", ")", "{", "res", "=", "res", ".", "path", "(", "\"\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"left\"", ",", "\"\"", "+", "contextLeft", ")", ".", "queryParam", "(", "\"right\"", ",", "\"\"", "+", "contextRight", ")", ";", "if", "(", "segmentationName", "!=", "null", ")", "{", "res", "=", "res", ".", "queryParam", "(", "\"seglayer\"", ",", "segmentationName", ")", ";", "}", "for", "(", "int", "offset", "=", "0", ";", "offset", "<", "matches", ".", "size", "(", ")", ";", "offset", "+=", "batchSize", ")", "{", "Map", "<", "Integer", ",", "Future", "<", "SingleResultPanel", ">", ">", "tasks", "=", "loadNextResultBatch", "(", "batchSize", ",", "offset", ",", "executorService", ",", "res", ")", ";", "waitForTasks", "(", "tasks", ",", "offset", ")", ";", "}", "}", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "indicator", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "indicator", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "for", "(", "SingleResultPanel", "panel", ":", "resultPanelList", ")", "{", "layout", ".", "addComponent", "(", "panel", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "void", "waitForTasks", "(", "Map", "<", "Integer", ",", "Future", "<", "SingleResultPanel", ">", ">", "tasks", ",", "int", "offset", ")", "{", "for", "(", "int", "i", "=", "offset", ";", "i", "<", "offset", "+", "batchSize", ";", "i", "++", ")", "{", "if", "(", "tasks", ".", "containsKey", "(", "i", ")", ")", "{", "Future", "<", "SingleResultPanel", ">", "future", "=", "tasks", ".", "get", "(", "i", ")", ";", "try", "{", "SingleResultPanel", "panel", "=", "future", ".", "get", "(", ")", ";", "if", "(", "panel", "==", "null", ")", "{", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "i", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "}", "else", "{", "panel", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "panel", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "resultPanelList", ".", "add", "(", "panel", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "resultview", ";", "import", "annis", ".", "CommonHelper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MatchedNodeColors", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MetaDataPanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "PluginSystem", ";", "import", "static", "annis", ".", "model", ".", "AnnisConstants", ".", "*", ";", "import", "annis", ".", "resolver", ".", "ResolverEntry", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ThemeResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "CssLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "HorizontalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Label", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "graph", ".", "GRAPH_TRAVERSE_TYPE", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sCorpusStructure", ".", "SDocument", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "*", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SFeature", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SGraphTraverseHandler", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SNode", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SRelation", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collections", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ".", "Entry", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Properties", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Random", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "emf", ".", "common", ".", "util", ".", "BasicEList", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "emf", ".", "common", ".", "util", ".", "EList", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "SingleResultPanel", "extends", "CssLayout", "implements", "Button", ".", "ClickListener", "{", "private", "static", "final", "String", "HIDE_KWIC", "=", "\"hide_kwic\"", ";", "private", "static", "final", "String", "INITIAL_OPEN", "=", "\"initial_open\"", ";", "private", "static", "final", "ThemeResource", "ICON_RESOURCE", "=", "new", "ThemeResource", "(", "\"info.gif\"", ")", ";", "private", "SDocument", "result", ";", "private", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markedCoveredMap", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markedExactMap", ";", "private", "ResolverProvider", "resolverProvider", ";", "private", "PluginSystem", "ps", ";", "private", "List", "<", "VisualizerPanel", ">", "visualizers", ";", "private", "Button", "btInfo", ";", "private", "int", "resultNumber", ";", "private", "List", "<", "String", ">", "path", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "visibleTokenAnnos", ";", "private", "String", "segmentationName", ";", "private", "List", "<", "SToken", ">", "token", ";", "private", "boolean", "wasAttached", ";", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "SingleResultPanel", ".", "class", ")", ";", "public", "SingleResultPanel", "(", "final", "SDocument", "result", ",", "int", "resultNumber", ",", "ResolverProvider", "resolverProvider", ",", "PluginSystem", "ps", ",", "Set", "<", "String", ">", "visibleTokenAnnos", ",", "String", "segmentationName", ")", "{", "this", ".", "ps", "=", "ps", ";", "this", ".", "result", "=", "result", ";", "this", ".", "resolverProvider", "=", "resolverProvider", ";", "this", ".", "resultNumber", "=", "resultNumber", ";", "this", ".", "visibleTokenAnnos", "=", "visibleTokenAnnos", ";", "this", ".", "segmentationName", "=", "segmentationName", ";", "calculateHelperVariables", "(", ")", ";", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "setMargin", "(", "false", ")", ";", "HorizontalLayout", "infoBar", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "infoBar", ".", "addStyleName", "(", "\"docPath\"", ")", ";", "infoBar", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "infoBar", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "addComponent", "(", "infoBar", ")", ";", "Label", "lblNumber", "=", "new", "Label", "(", "\"\"", "+", "(", "resultNumber", "+", "1", ")", ")", ";", "infoBar", ".", "addComponent", "(", "lblNumber", ")", ";", "lblNumber", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "btInfo", "=", "new", "Button", "(", ")", ";", "btInfo", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_LINK", ")", ";", "btInfo", ".", "setIcon", "(", "ICON_RESOURCE", ")", ";", "btInfo", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "infoBar", ".", "addComponent", "(", "btInfo", ")", ";", "path", "=", "CommonHelper", ".", "getCorpusPath", "(", "result", ".", "getSCorpusGraph", "(", ")", ",", "result", ")", ";", "Collections", ".", "reverse", "(", "path", ")", ";", "Label", "lblPath", "=", "new", "Label", "(", "\"Path:", "\"", "+", "StringUtils", ".", "join", "(", "path", ",", "\"", ">", "\"", ")", ")", ";", "lblPath", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "lblPath", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "infoBar", ".", "addComponent", "(", "lblPath", ")", ";", "infoBar", ".", "setExpandRatio", "(", "lblPath", ",", "1.0f", ")", ";", "infoBar", ".", "setSpacing", "(", "true", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "try", "{", "if", "(", "wasAttached", ")", "{", "return", ";", "}", "wasAttached", "=", "true", ";", "ResolverEntry", "[", "]", "entries", "=", "resolverProvider", ".", "getResolverEntries", "(", "result", ")", ";", "visualizers", "=", "new", "LinkedList", "<", "VisualizerPanel", ">", "(", ")", ";", "List", "<", "VisualizerPanel", ">", "openVisualizers", "=", "new", "LinkedList", "<", "VisualizerPanel", ">", "(", ")", ";", "token", "=", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ".", "getSortedSTokenByText", "(", ")", ";", "List", "<", "SNode", ">", "segNodes", "=", "CommonHelper", ".", "getSortedSegmentationNodes", "(", "segmentationName", ",", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ")", ";", "markedAndCovered", "=", "calculateMarkedAndCoveredIDs", "(", "result", ",", "segNodes", ")", ";", "calulcateColorsForMarkedAndCoverd", "(", ")", ";", "String", "resultID", "=", "\"\"", "+", "new", "Random", "(", ")", ".", "nextInt", "(", "Integer", ".", "MAX_VALUE", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "entries", ".", "length", ";", "i", "++", ")", "{", "int", "textNr", "=", "0", ";", "EList", "<", "STextualDS", ">", "allTexts", "=", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ".", "getSTextualDSs", "(", ")", ";", "for", "(", "STextualDS", "text", ":", "allTexts", ")", "{", "String", "htmlID", "=", "\"resolver-\"", "+", "resultNumber", "+", "\"_\"", "+", "textNr", "+", "\"-\"", "+", "i", ";", "VisualizerPanel", "p", "=", "new", "VisualizerPanel", "(", "entries", "[", "i", "]", ",", "result", ",", "token", ",", "visibleTokenAnnos", ",", "markedAndCovered", ",", "markedCoveredMap", ",", "markedExactMap", ",", "text", ",", "htmlID", ",", "resultID", ",", "this", ",", "segmentationName", ",", "ps", ",", "allTexts", ".", "size", "(", ")", ">", "1", ")", ";", "visualizers", ".", "add", "(", "p", ")", ";", "Properties", "mappings", "=", "entries", "[", "i", "]", ".", "getMappings", "(", ")", ";", "if", "(", "Boolean", ".", "parseBoolean", "(", "mappings", ".", "getProperty", "(", "INITIAL_OPEN", ",", "\"false\"", ")", ")", ")", "{", "openVisualizers", ".", "add", "(", "p", ")", ";", "}", "textNr", "++", ";", "}", "}", "for", "(", "VisualizerPanel", "p", ":", "visualizers", ")", "{", "addComponent", "(", "p", ")", ";", "}", "for", "(", "VisualizerPanel", "p", ":", "openVisualizers", ")", "{", "p", ".", "toggleVisualizer", "(", "true", ",", "null", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "setSegmentationLayer", "(", "String", "segmentationName", ")", "{", "this", ".", "segmentationName", "=", "segmentationName", ";", "List", "<", "SNode", ">", "segNodes", "=", "CommonHelper", ".", "getSortedSegmentationNodes", "(", "segmentationName", ",", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ")", ";", "markedAndCovered", "=", "calculateMarkedAndCoveredIDs", "(", "result", ",", "segNodes", ")", ";", "for", "(", "VisualizerPanel", "p", ":", "visualizers", ")", "{", "p", ".", "setSegmentationLayer", "(", "segmentationName", ",", "markedAndCovered", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "Set", "<", "String", ">", "annos", ")", "{", "for", "(", "VisualizerPanel", "p", ":", "visualizers", ")", "{", "p", ".", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "annos", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "calculateHelperVariables", "(", ")", "{", "markedExactMap", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "String", ">", "(", ")", ";", "markedCoveredMap", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "String", ">", "(", ")", ";", "SDocumentGraph", "g", "=", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ";", "if", "(", "g", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "SNode", "n", ":", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ".", "getSNodes", "(", ")", ")", "{", "SFeature", "featMatched", "=", "n", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_MATCHEDNODE", ")", ";", "Long", "match", "=", "featMatched", "==", "null", "?", "null", ":", "featMatched", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "if", "(", "match", "!=", "null", ")", "{", "int", "color", "=", "Math", ".", "max", "(", "0", ",", "Math", ".", "min", "(", "(", "int", ")", "match", ".", "longValue", "(", ")", "-", "1", ",", "MatchedNodeColors", ".", "values", "(", ")", ".", "length", "-", "1", ")", ")", ";", "SFeature", "feat", "=", "n", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_INTERNALID", ")", ";", "if", "(", "feat", "!=", "null", ")", "{", "markedExactMap", ".", "put", "(", "\"\"", "+", "feat", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ",", "MatchedNodeColors", ".", "values", "(", ")", "[", "color", "]", ".", "name", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "private", "void", "calulcateColorsForMarkedAndCoverd", "(", ")", "{", "for", "(", "Entry", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedEntry", ":", "markedAndCovered", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "int", "color", "=", "Math", ".", "max", "(", "0", ",", "Math", ".", "min", "(", "(", "int", ")", "markedEntry", ".", "getValue", "(", ")", ".", "longValue", "(", ")", "-", "1", ",", "MatchedNodeColors", ".", "values", "(", ")", ".", "length", "-", "1", ")", ")", ";", "SFeature", "feat", "=", "markedEntry", ".", "getKey", "(", ")", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_INTERNALID", ")", ";", "if", "(", "feat", "!=", "null", ")", "{", "markedCoveredMap", ".", "put", "(", "\"\"", "+", "feat", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ",", "MatchedNodeColors", ".", "values", "(", ")", "[", "color", "]", ".", "name", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "calculateMarkedAndCoveredIDs", "(", "SDocument", "doc", ",", "List", "<", "SNode", ">", "segNodes", ")", "{", "Set", "<", "String", ">", "matchedNodes", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "initialCovered", "=", "new", "HashMap", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "SNode", "n", ":", "doc", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ".", "getSNodes", "(", ")", ")", "{", "SFeature", "featMatched", "=", "n", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_MATCHEDNODE", ")", ";", "Long", "match", "=", "featMatched", "==", "null", "?", "null", ":", "featMatched", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "if", "(", "match", "!=", "null", ")", "{", "matchedNodes", ".", "add", "(", "n", ".", "getSId", "(", ")", ")", ";", "initialCovered", ".", "put", "(", "n", ",", "match", ")", ";", "}", "}", "SingleResultPanel", ".", "CoveredMatchesCalculator", "cmc", "=", "new", "SingleResultPanel", ".", "CoveredMatchesCalculator", "(", "doc", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ",", "initialCovered", ")", ";", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "covered", "=", "cmc", ".", "getMatchedAndCovered", "(", ")", ";", "if", "(", "segmentationName", "!=", "null", ")", "{", "Map", "<", "SToken", ",", "Long", ">", "coveredToken", "=", "new", "HashMap", "<", "SToken", ",", "Long", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "Map", ".", "Entry", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "e", ":", "covered", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getKey", "(", ")", "instanceof", "SToken", ")", "{", "coveredToken", ".", "put", "(", "(", "SToken", ")", "e", ".", "getKey", "(", ")", ",", "e", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "SNode", "segNode", ":", "segNodes", ")", "{", "if", "(", "segNode", "!=", "null", "&&", "!", "covered", ".", "containsKey", "(", "segNode", ")", ")", "{", "long", "leftTok", "=", "segNode", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_LEFTTOKEN", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "long", "rightTok", "=", "segNode", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_RIGHTTOKEN", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "for", "(", "Map", ".", "Entry", "<", "SToken", ",", "Long", ">", "e", ":", "coveredToken", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "long", "entryTokenIndex", "=", "e", ".", "getKey", "(", ")", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_TOKENINDEX", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "if", "(", "entryTokenIndex", "<=", "rightTok", "&&", "entryTokenIndex", ">=", "leftTok", ")", "{", "covered", ".", "put", "(", "segNode", ",", "e", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "break", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "return", "covered", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btInfo", ")", "{", "Window", "infoWindow", "=", "new", "Window", "(", "\"Info", "for", "\"", "+", "result", ".", "getSId", "(", ")", ")", ";", "infoWindow", ".", "setModal", "(", "false", ")", ";", "MetaDataPanel", "meta", "=", "new", "MetaDataPanel", "(", "path", ".", "get", "(", "0", ")", ",", "path", ".", "get", "(", "path", ".", "size", "(", ")", "-", "1", ")", ")", ";", "infoWindow", ".", "setContent", "(", "meta", ")", ";", "infoWindow", ".", "setWidth", "(", "\"400px\"", ")", ";", "infoWindow", ".", "setHeight", "(", "\"400px\"", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "addWindow", "(", "infoWindow", ")", ";", "}", "}", "public", "static", "class", "CoveredMatchesCalculator", "implements", "SGraphTraverseHandler", "{", "private", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "matchedAndCovered", ";", "private", "long", "currentMatchPos", ";", "public", "CoveredMatchesCalculator", "(", "SDocumentGraph", "graph", ",", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "initialMatches", ")", "{", "this", ".", "matchedAndCovered", "=", "initialMatches", ";", "currentMatchPos", "=", "1", ";", "if", "(", "initialMatches", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "graph", ".", "traverse", "(", "new", "BasicEList", "<", "SNode", ">", "(", "initialMatches", ".", "keySet", "(", ")", ")", ",", "GRAPH_TRAVERSE_TYPE", ".", "TOP_DOWN_DEPTH_FIRST", ",", "\"\"", ",", "(", "SGraphTraverseHandler", ")", "this", ",", "true", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "nodeReached", "(", "GRAPH_TRAVERSE_TYPE", "traversalType", ",", "String", "traversalId", ",", "SNode", "currNode", ",", "SRelation", "edge", ",", "SNode", "fromNode", ",", "long", "order", ")", "{", "if", "(", "matchedAndCovered", ".", "containsKey", "(", "fromNode", ")", "&&", "!", "matchedAndCovered", ".", "containsKey", "(", "currNode", ")", ")", "{", "currentMatchPos", "=", "matchedAndCovered", ".", "get", "(", "fromNode", ")", ";", "matchedAndCovered", ".", "put", "(", "currNode", ",", "currentMatchPos", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "nodeLeft", "(", "GRAPH_TRAVERSE_TYPE", "traversalType", ",", "String", "traversalId", ",", "SNode", "currNode", ",", "SRelation", "edge", ",", "SNode", "fromNode", ",", "long", "order", ")", "{", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "checkConstraint", "(", "GRAPH_TRAVERSE_TYPE", "traversalType", ",", "String", "traversalId", ",", "SRelation", "edge", ",", "SNode", "currNode", ",", "long", "order", ")", "{", "if", "(", "edge", "==", "null", "||", "edge", "instanceof", "SDominanceRelation", "||", "edge", "instanceof", "SSpanningRelation", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "else", "{", "return", "false", ";", "}", "}", "public", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "getMatchedAndCovered", "(", ")", "{", "return", "matchedAndCovered", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "resultview", ";", "import", "annis", ".", "resolver", ".", "ResolverEntry", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sCorpusStructure", ".", "SDocument", ";", "public", "interface", "ResolverProvider", "{", "public", "ResolverEntry", "[", "]", "getResolverEntries", "(", "SDocument", "result", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "beans", ".", "CorpusBrowserEntry", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ".", "ControlPanel", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisAttribute", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "GenericType", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Item", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "util", ".", "BeanItemContainer", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "util", ".", "DefaultItemSorter", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Accordion", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Table", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ".", "Notification", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "CorpusBrowserPanel", "extends", "Panel", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "CorpusBrowserPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "static", "final", "long", "serialVersionUID", "=", "-", "1029743017413951838L", ";", "private", "AnnisCorpus", "corpus", ";", "private", "Table", "tblNodeAnno", ";", "private", "BeanItemContainer", "<", "CorpusBrowserEntry", ">", "containerNodeAnno", ";", "private", "Table", "tblEdgeTypes", ";", "private", "BeanItemContainer", "<", "CorpusBrowserEntry", ">", "containerEdgeType", ";", "private", "Table", "tblEdgeAnno", ";", "private", "BeanItemContainer", "<", "CorpusBrowserEntry", ">", "containerEdgeAnno", ";", "private", "CitationLinkGenerator", "citationGenerator", ";", "private", "ControlPanel", "controlPanel", ";", "public", "CorpusBrowserPanel", "(", "final", "AnnisCorpus", "corpus", ",", "ControlPanel", "controlPanel", ")", "{", "super", "(", "\"\"", ")", ";", "this", ".", "corpus", "=", "corpus", ";", "this", ".", "controlPanel", "=", "controlPanel", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "Accordion", "accordion", "=", "new", "Accordion", "(", ")", ";", "setContent", "(", "accordion", ")", ";", "accordion", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "containerNodeAnno", "=", "new", "BeanItemContainer", "<", "CorpusBrowserEntry", ">", "(", "CorpusBrowserEntry", ".", "class", ")", ";", "containerNodeAnno", ".", "setItemSorter", "(", "new", "ExampleSorter", "(", ")", ")", ";", "containerEdgeType", "=", "new", "BeanItemContainer", "<", "CorpusBrowserEntry", ">", "(", "CorpusBrowserEntry", ".", "class", ")", ";", "containerEdgeType", ".", "setItemSorter", "(", "new", "ExampleSorter", "(", ")", ")", ";", "containerEdgeAnno", "=", "new", "BeanItemContainer", "<", "CorpusBrowserEntry", ">", "(", "CorpusBrowserEntry", ".", "class", ")", ";", "containerEdgeAnno", ".", "setItemSorter", "(", "new", "ExampleSorter", "(", ")", ")", ";", "citationGenerator", "=", "new", "CitationLinkGenerator", "(", ")", ";", "tblNodeAnno", "=", "new", "ExampleTable", "(", "citationGenerator", ",", "containerNodeAnno", ")", ";", "tblNodeAnno", ".", "addListener", "(", "new", "ExampleListener", "(", ")", ")", ";", "tblEdgeTypes", "=", "new", "ExampleTable", "(", "citationGenerator", ",", "containerEdgeType", ")", ";", "tblEdgeTypes", ".", "addListener", "(", "new", "ExampleListener", "(", ")", ")", ";", "tblEdgeAnno", "=", "new", "ExampleTable", "(", "citationGenerator", ",", "containerEdgeAnno", ")", ";", "tblEdgeAnno", ".", "addListener", "(", "new", "ExampleListener", "(", ")", ")", ";", "accordion", ".", "addTab", "(", "tblNodeAnno", ",", "\"\"", ",", "null", ")", ";", "accordion", ".", "addTab", "(", "tblEdgeTypes", ",", "\"Edge", "types\"", ",", "null", ")", ";", "accordion", ".", "addTab", "(", "tblEdgeAnno", ",", "\"\"", ",", "null", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "citationGenerator", ".", "setMainWindow", "(", "getApplication", "(", ")", ".", "getMainWindow", "(", ")", ")", ";", "boolean", "stripNodeAnno", "=", "true", ";", "boolean", "stripEdgeName", "=", "true", ";", "boolean", "stripEdgeAnno", "=", "true", ";", "HashSet", "<", "String", ">", "nodeAnnoNames", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "HashSet", "<", "String", ">", "edgeAnnoNames", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "HashSet", "<", "String", ">", "edgeNames", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "HashSet", "<", "String", ">", "fullEdgeNames", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "boolean", "hasDominance", "=", "false", ";", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", "attributes", "=", "fetchAnnos", "(", "corpus", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "for", "(", "AnnisAttribute", "a", ":", "attributes", ")", "{", "if", "(", "a", ".", "getType", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "Type", ".", "node", ")", "{", "String", "name", "=", "killNamespace", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "nodeAnnoNames", ".", "contains", "(", "name", ")", ")", "{", "stripNodeAnno", "=", "false", ";", "}", "nodeAnnoNames", ".", "add", "(", "name", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "a", ".", "getType", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "Type", ".", "edge", ")", "{", "fullEdgeNames", ".", "add", "(", "a", ".", "getEdgeName", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "a", ".", "getSubtype", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "SubType", ".", "d", ")", "{", "hasDominance", "=", "true", ";", "}", "String", "annoName", "=", "killNamespace", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "edgeAnnoNames", ".", "contains", "(", "annoName", ")", ")", "{", "stripEdgeAnno", "=", "false", ";", "}", "edgeAnnoNames", ".", "add", "(", "annoName", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "String", "edgeName", ":", "fullEdgeNames", ")", "{", "String", "name", "=", "killNamespace", "(", "edgeName", ")", ";", "if", "(", "edgeNames", ".", "contains", "(", "name", ")", ")", "{", "stripEdgeName", "=", "false", ";", "}", "edgeNames", ".", "add", "(", "name", ")", ";", "}", "if", "(", "hasDominance", ")", "{", "CorpusBrowserEntry", "cbe", "=", "new", "CorpusBrowserEntry", "(", ")", ";", "cbe", ".", "setName", "(", "\"(dominance)\"", ")", ";", "cbe", ".", "setCorpus", "(", "corpus", ")", ";", "cbe", ".", "setExample", "(", "\"\"", ")", ";", "containerEdgeType", ".", "addBean", "(", "cbe", ")", ";", "}", "for", "(", "AnnisAttribute", "a", ":", "attributes", ")", "{", "if", "(", "a", ".", "getType", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "Type", ".", "node", ")", "{", "String", "name", "=", "stripNodeAnno", "?", "killNamespace", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", ":", "a", ".", "getName", "(", ")", ";", "CorpusBrowserEntry", "cbe", "=", "new", "CorpusBrowserEntry", "(", ")", ";", "cbe", ".", "setName", "(", "name", ")", ";", "cbe", ".", "setExample", "(", "name", "+", "\"=\\\"\"", "+", "getFirst", "(", "a", ".", "getValueSet", "(", ")", ")", "+", "\"\\\"\"", ")", ";", "cbe", ".", "setCorpus", "(", "corpus", ")", ";", "containerNodeAnno", ".", "addBean", "(", "cbe", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "a", ".", "getType", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "Type", ".", "edge", ")", "{", "CorpusBrowserEntry", "cbeEdgeType", "=", "new", "CorpusBrowserEntry", "(", ")", ";", "String", "name", "=", "stripEdgeName", "?", "killNamespace", "(", "a", ".", "getEdgeName", "(", ")", ")", ":", "a", ".", "getEdgeName", "(", ")", ";", "cbeEdgeType", ".", "setName", "(", "name", ")", ";", "cbeEdgeType", ".", "setCorpus", "(", "corpus", ")", ";", "if", "(", "a", ".", "getSubtype", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "SubType", ".", "p", ")", "{", "cbeEdgeType", ".", "setExample", "(", "\"\"", "+", "killNamespace", "(", "name", ")", "+", "\"", "#2\"", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "a", ".", "getSubtype", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "SubType", ".", "d", ")", "{", "cbeEdgeType", ".", "setExample", "(", "\"\"", "+", "killNamespace", "(", "name", ")", "+", "\"", "#2\"", ")", ";", "}", "containerEdgeType", ".", "addBean", "(", "cbeEdgeType", ")", ";", "CorpusBrowserEntry", "cbeEdgeAnno", "=", "new", "CorpusBrowserEntry", "(", ")", ";", "String", "edgeAnno", "=", "stripEdgeAnno", "?", "killNamespace", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", ":", "a", ".", "getName", "(", ")", ";", "cbeEdgeAnno", ".", "setName", "(", "edgeAnno", ")", ";", "cbeEdgeAnno", ".", "setCorpus", "(", "corpus", ")", ";", "if", "(", "a", ".", "getSubtype", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "SubType", ".", "p", ")", "{", "cbeEdgeAnno", ".", "setExample", "(", "\"\"", "+", "killNamespace", "(", "a", ".", "getEdgeName", "(", ")", ")", "+", "\"[\"", "+", "killNamespace", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", "+", "\"=\\\"\"", "+", "getFirst", "(", "a", ".", "getValueSet", "(", ")", ")", "+", "\"\\\"]", "#2\"", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "a", ".", "getSubtype", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "SubType", ".", "d", ")", "{", "cbeEdgeAnno", ".", "setExample", "(", "\"\"", "+", "killNamespace", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", "+", "\"=\\\"\"", "+", "getFirst", "(", "a", ".", "getValueSet", "(", ")", ")", "+", "\"\\\"]", "#2\"", ")", ";", "}", "containerEdgeAnno", ".", "addBean", "(", "cbeEdgeAnno", ")", ";", "}", "}", "tblNodeAnno", ".", "setSortContainerPropertyId", "(", "\"name\"", ")", ";", "tblEdgeTypes", ".", "setSortContainerPropertyId", "(", "\"name\"", ")", ";", "tblEdgeAnno", ".", "setSortContainerPropertyId", "(", "\"name\"", ")", ";", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "}", "private", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", "fetchAnnos", "(", "String", "toplevelCorpus", ")", "{", "Collection", "<", "AnnisAttribute", ">", "result", "=", "new", "ArrayList", "<", "AnnisAttribute", ">", "(", ")", ";", "try", "{", "WebResource", "service", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "service", "!=", "null", ")", "{", "WebResource", "query", "=", "service", ".", "path", "(", "\"corpora\"", ")", ".", "path", "(", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "toplevelCorpus", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ".", "path", "(", "\"annotations\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"fetchvalues\"", ",", "\"true\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"\"", ",", "\"true\"", ")", ";", "result", "=", "query", ".", "get", "(", "new", "GenericType", "<", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", ">", "(", ")", "{", "}", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ",", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "}", "return", "new", "LinkedList", "<", "AnnisAttribute", ">", "(", "result", ")", ";", "}", "public", "static", "class", "ExampleTable", "extends", "Table", "{", "public", "ExampleTable", "(", "CitationLinkGenerator", "citationGenerator", ",", "BeanItemContainer", "<", "CorpusBrowserEntry", ">", "container", ")", "{", "setContainerDataSource", "(", "container", ")", ";", "addGeneratedColumn", "(", "\"genlink\"", ",", "citationGenerator", ")", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "setSelectable", "(", "true", ")", ";", "setMultiSelect", "(", "false", ")", ";", "setVisibleColumns", "(", "new", "String", "[", "]", "{", "\"name\"", ",", "\"example\"", ",", "\"genlink\"", "}", ")", ";", "setColumnHeaders", "(", "new", "String", "[", "]", "{", "\"Name\"", ",", "\"\"", ",", "\"URL\"", "}", ")", ";", "setColumnExpandRatio", "(", "\"name\"", ",", "0.3f", ")", ";", "setColumnExpandRatio", "(", "\"example\"", ",", "0.7f", ")", ";", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "}", "}", "public", "class", "ExampleListener", "implements", "ValueChangeListener", "{", "@", "Override", "public", "void", "valueChange", "(", "ValueChangeEvent", "event", ")", "{", "CorpusBrowserEntry", "cbe", "=", "(", "CorpusBrowserEntry", ")", "event", ".", "getProperty", "(", ")", ".", "getValue", "(", ")", ";", "HashMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpusMap", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ";", "corpusMap", ".", "put", "(", "corpus", ".", "getName", "(", ")", ",", "corpus", ")", ";", "if", "(", "controlPanel", "!=", "null", ")", "{", "controlPanel", ".", "setQuery", "(", "cbe", ".", "getExample", "(", ")", ",", "corpusMap", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "static", "class", "ExampleSorter", "extends", "DefaultItemSorter", "{", "@", "Override", "protected", "int", "compareProperty", "(", "Object", "propertyId", ",", "boolean", "sortDirection", ",", "Item", "item1", ",", "Item", "item2", ")", "{", "if", "(", "\"name\"", ".", "equals", "(", "propertyId", ")", ")", "{", "String", "val1", "=", "(", "String", ")", "item1", ".", "getItemProperty", "(", "propertyId", ")", ".", "getValue", "(", ")", ";", "String", "val2", "=", "(", "String", ")", "item2", ".", "getItemProperty", "(", "propertyId", ")", ".", "getValue", "(", ")", ";", "if", "(", "sortDirection", ")", "{", "return", "val1", ".", "compareToIgnoreCase", "(", "val2", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "val2", ".", "compareToIgnoreCase", "(", "val1", ")", ";", "}", "}", "else", "{", "return", "super", ".", "compareProperty", "(", "propertyId", ",", "sortDirection", ",", "item1", ",", "item2", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "String", "killNamespace", "(", "String", "qName", ")", "{", "String", "[", "]", "splitted", "=", "qName", ".", "split", "(", "\":\"", ")", ";", "return", "splitted", "[", "splitted", ".", "length", "-", "1", "]", ";", "}", "private", "String", "getFirst", "(", "Collection", "<", "String", ">", "list", ")", "{", "Iterator", "<", "String", ">", "it", "=", "list", ".", "iterator", "(", ")", ";", "return", "it", ".", "hasNext", "(", ")", "?", "it", ".", "next", "(", ")", ":", "null", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "servlets", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URI", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URISyntaxException", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "ServletException", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServlet", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServletRequest", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServletResponse", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "CitationRedirectionServlet", "extends", "HttpServlet", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "CitationRedirectionServlet", ".", "class", ")", ";", "@", "Override", "protected", "void", "doGet", "(", "HttpServletRequest", "req", ",", "HttpServletResponse", "resp", ")", "throws", "ServletException", ",", "IOException", "{", "try", "{", "URI", "uri", "=", "new", "URI", "(", "req", ".", "getRequestURI", "(", ")", ")", ";", "req", ".", "getSession", "(", ")", ".", "setAttribute", "(", "\"citation\"", ",", "uri", ".", "getPath", "(", ")", ")", ";", "resp", ".", "sendRedirect", "(", "req", ".", "getContextPath", "(", ")", "+", "\"/?citation\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "URISyntaxException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "resp", ".", "sendError", "(", "500", ",", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "servlets", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "ResourcePlugin", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URL", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLConnection", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "ServletException", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServlet", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServletRequest", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServletResponse", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "Plugin", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "events", ".", "PluginLoaded", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "ResourceServlet", "extends", "HttpServlet", "implements", "Plugin", "{", "private", "static", "final", "long", "serialVersionUID", "=", "-", "8182635617256833563L", ";", "private", "static", "final", "Map", "<", "String", ",", "ResourcePlugin", ">", "resourceRegistry", "=", "Collections", ".", "synchronizedMap", "(", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "ResourcePlugin", ">", "(", ")", ")", ";", "@", "Override", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"unchecked\"", ")", "public", "void", "doGet", "(", "HttpServletRequest", "request", ",", "HttpServletResponse", "response", ")", "throws", "ServletException", ",", "IOException", "{", "OutputStream", "outStream", "=", "response", ".", "getOutputStream", "(", ")", ";", "String", "completePath", "=", "request", ".", "getPathInfo", "(", ")", ";", "if", "(", "completePath", "==", "null", ")", "{", "response", ".", "sendError", "(", "404", ",", "\"\"", ")", ";", "return", ";", "}", "completePath", "=", "completePath", ".", "substring", "(", "1", ")", ";", "String", "[", "]", "pathComponents", "=", "completePath", ".", "split", "(", "\"/\"", ")", ";", "String", "vistype", "=", "pathComponents", "[", "0", "]", ";", "if", "(", "pathComponents", ".", "length", "<", "2", ")", "{", "response", ".", "sendError", "(", "404", ",", "\"\"", ")", ";", "return", ";", "}", "String", "path", "=", "StringUtils", ".", "join", "(", "Arrays", ".", "copyOfRange", "(", "pathComponents", ",", "1", ",", "pathComponents", ".", "length", ")", ",", "\"/\"", ")", ";", "ResourcePlugin", "vis", "=", "resourceRegistry", ".", "get", "(", "vistype", ")", ";", "if", "(", "vis", "==", "null", ")", "{", "response", ".", "sendError", "(", "500", ",", "\"\"", "+", "vistype", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "path", ".", "endsWith", "(", "\".class\"", ")", ")", "{", "response", ".", "sendError", "(", "403", ",", "\"\"", ")", ";", "}", "else", "{", "URL", "resource", "=", "vis", ".", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "path", ")", ";", "if", "(", "resource", "==", "null", ")", "{", "response", ".", "sendError", "(", "404", ",", "path", "+", "\"", "not", "found\"", ")", ";", "}", "else", "{", "URLConnection", "resourceConnection", "=", "resource", ".", "openConnection", "(", ")", ";", "long", "resourceLastModified", "=", "resourceConnection", ".", "getLastModified", "(", ")", ";", "long", "requestLastModified", "=", "request", ".", "getDateHeader", "(", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "requestLastModified", "!=", "-", "1", "&&", "resourceLastModified", "<=", "requestLastModified", ")", "{", "response", ".", "setStatus", "(", "HttpServletResponse", ".", "SC_NOT_MODIFIED", ")", ";", "}", "else", "{", "response", ".", "addDateHeader", "(", "\"\"", ",", "resourceLastModified", ")", ";", "if", "(", "\"localhost\"", ".", "equals", "(", "request", ".", "getServerName", "(", ")", ")", ")", "{", "response", ".", "addDateHeader", "(", "\"Expires\"", ",", "new", "Date", "(", ")", ".", "getTime", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "response", ".", "addDateHeader", "(", "\"Expires\"", ",", "new", "Date", "(", ")", ".", "getTime", "(", ")", "+", "60000", ")", ";", "}", "String", "mimeType", "=", "getServletContext", "(", ")", ".", "getMimeType", "(", "path", ")", ";", "response", ".", "setContentType", "(", "mimeType", ")", ";", "if", "(", "mimeType", ".", "startsWith", "(", "\"text/\"", ")", ")", "{", "response", ".", "setCharacterEncoding", "(", "\"UTF-8\"", ")", ";", "}", "OutputStream", "bufferedOut", "=", "new", "BufferedOutputStream", "(", "outStream", ")", ";", "InputStream", "resourceInStream", "=", "new", "BufferedInputStream", "(", "resource", ".", "openStream", "(", ")", ")", ";", "try", "{", "int", "v", "=", "-", "1", ";", "while", "(", "(", "v", "=", "resourceInStream", ".", "read", "(", ")", ")", "!=", "-", "1", ")", "{", "bufferedOut", ".", "write", "(", "v", ")", ";", "}", "}", "finally", "{", "resourceInStream", ".", "close", "(", ")", ";", "bufferedOut", ".", "flush", "(", ")", ";", "outStream", ".", "flush", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "@", "PluginLoaded", "public", "void", "newResourceAdded", "(", "ResourcePlugin", "vis", ")", "{", "resourceRegistry", ".", "put", "(", "vis", ".", "getShortName", "(", ")", ",", "vis", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "servlets", ";", "import", "annis", ".", "provider", ".", "SaltProjectProvider", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisBinary", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisBinaryMetaData", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "Client", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "ClientHandlerException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "UniformInterfaceException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "config", ".", "ClientConfig", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "config", ".", "DefaultClientConfig", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "rmi", ".", "RemoteException", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "ServletConfig", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "ServletException", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "ServletOutputStream", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServlet", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServletRequest", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServletResponse", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "Validate", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "BinaryServlet", "extends", "HttpServlet", "{", "private", "final", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "BinaryServlet", ".", "class", ")", ";", "private", "static", "final", "int", "MAX_LENGTH", "=", "50", "*", "1024", ";", "private", "String", "toplevelCorpusName", ";", "private", "String", "documentName", ";", "private", "Client", "client", ";", "@", "Override", "public", "void", "init", "(", "ServletConfig", "config", ")", "throws", "ServletException", "{", "super", ".", "init", "(", "config", ")", ";", "ClientConfig", "cc", "=", "new", "DefaultClientConfig", "(", "SaltProjectProvider", ".", "class", ")", ";", "cc", ".", "getProperties", "(", ")", ".", "put", "(", "ClientConfig", ".", "PROPERTY_THREADPOOL_SIZE", ",", "10", ")", ";", "cc", ".", "getProperties", "(", ")", ".", "put", "(", "ClientConfig", ".", "PROPERTY_CONNECT_TIMEOUT", ",", "500", ")", ";", "client", "=", "Client", ".", "create", "(", "cc", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "doGet", "(", "HttpServletRequest", "request", ",", "HttpServletResponse", "response", ")", "throws", "ServletException", "{", "Map", "<", "String", ",", "String", "[", "]", ">", "binaryParameter", "=", "request", ".", "getParameterMap", "(", ")", ";", "toplevelCorpusName", "=", "binaryParameter", ".", "get", "(", "\"\"", ")", "[", "0", "]", ";", "documentName", "=", "binaryParameter", ".", "get", "(", "\"documentName\"", ")", "[", "0", "]", ";", "ServletOutputStream", "out", "=", "null", ";", "try", "{", "out", "=", "response", ".", "getOutputStream", "(", ")", ";", "String", "range", "=", "request", ".", "getHeader", "(", "\"Range\"", ")", ";", "String", "annisServiceURL", "=", "getServletContext", "(", ")", ".", "getInitParameter", "(", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "annisServiceURL", "==", "null", ")", "{", "throw", "new", "ServletException", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "WebResource", "annisRes", "=", "client", ".", "resource", "(", "annisServiceURL", ")", ";", "WebResource", "binaryRes", "=", "annisRes", ".", "path", "(", "\"corpora\"", ")", ".", "path", "(", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "toplevelCorpusName", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ".", "path", "(", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "documentName", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ".", "path", "(", "\"binary\"", ")", ";", "if", "(", "range", "!=", "null", ")", "{", "responseStatus206", "(", "binaryRes", ",", "out", ",", "response", ",", "range", ")", ";", "}", "else", "{", "responseStatus200", "(", "binaryRes", ",", "out", ",", "response", ")", ";", "}", "out", ".", "flush", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "debug", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "catch", "(", "ClientHandlerException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "response", ".", "setStatus", "(", "500", ")", ";", "}", "catch", "(", "UniformInterfaceException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "response", ".", "setStatus", "(", "500", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "responseStatus206", "(", "WebResource", "binaryRes", ",", "ServletOutputStream", "out", ",", "HttpServletResponse", "response", ",", "String", "range", ")", "throws", "RemoteException", ",", "IOException", "{", "AnnisBinaryMetaData", "bm", "=", "binaryRes", ".", "path", "(", "\"meta\"", ")", ".", "get", "(", "AnnisBinary", ".", "class", ")", ";", "String", "[", "]", "rangeTupel", "=", "range", ".", "split", "(", "\"-\"", ")", ";", "int", "offset", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "rangeTupel", "[", "0", "]", ".", "split", "(", "\"=\"", ")", "[", "1", "]", ")", ";", "int", "slice", ";", "if", "(", "rangeTupel", ".", "length", ">", "1", ")", "{", "slice", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "rangeTupel", "[", "1", "]", ")", ";", "}", "else", "{", "slice", "=", "bm", ".", "getLength", "(", ")", ";", "}", "int", "lengthToFetch", "=", "slice", "-", "offset", ";", "response", ".", "setHeader", "(", "\"\"", ",", "\"bytes", "\"", "+", "offset", "+", "\"-\"", "+", "(", "bm", ".", "getLength", "(", ")", "-", "1", ")", "+", "\"/\"", "+", "bm", ".", "getLength", "(", ")", ")", ";", "response", ".", "setContentType", "(", "bm", ".", "getMimeType", "(", ")", ")", ";", "response", ".", "setStatus", "(", "206", ")", ";", "response", ".", "setContentLength", "(", "lengthToFetch", ")", ";", "writeStepByStep", "(", "offset", ",", "lengthToFetch", ",", "binaryRes", ",", "out", ")", ";", "}", "private", "void", "responseStatus200", "(", "WebResource", "binaryRes", ",", "ServletOutputStream", "out", ",", "HttpServletResponse", "response", ")", "throws", "RemoteException", ",", "IOException", "{", "AnnisBinaryMetaData", "binaryMeta", "=", "binaryRes", ".", "path", "(", "\"meta\"", ")", ".", "get", "(", "AnnisBinary", ".", "class", ")", ";", "response", ".", "setStatus", "(", "200", ")", ";", "response", ".", "setHeader", "(", "\"\"", ",", "\"bytes\"", ")", ";", "response", ".", "setContentType", "(", "binaryMeta", ".", "getMimeType", "(", ")", ")", ";", "response", ".", "setHeader", "(", "\"\"", ",", "\"bytes", "0-\"", "+", "(", "binaryMeta", ".", "getLength", "(", ")", "-", "1", ")", "+", "\"/\"", "+", "binaryMeta", ".", "getLength", "(", ")", ")", ";", "response", ".", "setContentLength", "(", "binaryMeta", ".", "getLength", "(", ")", ")", ";", "getCompleteFile", "(", "binaryRes", ",", "out", ")", ";", "}", "private", "void", "getCompleteFile", "(", "WebResource", "binaryRes", ",", "ServletOutputStream", "out", ")", "throws", "RemoteException", ",", "IOException", "{", "AnnisBinaryMetaData", "annisBinary", "=", "binaryRes", ".", "path", "(", "\"meta\"", ")", ".", "get", "(", "AnnisBinary", ".", "class", ")", ";", "int", "offset", "=", "0", ";", "int", "length", "=", "annisBinary", ".", "getLength", "(", ")", ";", "writeStepByStep", "(", "offset", ",", "length", ",", "binaryRes", ",", "out", ")", ";", "}", "private", "void", "writeStepByStep", "(", "int", "offset", ",", "int", "completeLength", ",", "WebResource", "binaryRes", ",", "ServletOutputStream", "out", ")", "throws", "IOException", "{", "int", "remaining", "=", "completeLength", ";", "while", "(", "remaining", ">", "0", ")", "{", "int", "stepLength", "=", "Math", ".", "min", "(", "MAX_LENGTH", ",", "remaining", ")", ";", "AnnisBinary", "bin", "=", "binaryRes", ".", "path", "(", "\"\"", "+", "offset", ")", ".", "path", "(", "\"\"", "+", "stepLength", ")", ".", "get", "(", "AnnisBinary", ".", "class", ")", ";", "Validate", ".", "isTrue", "(", "bin", ".", "getBytes", "(", ")", ".", "length", "==", "stepLength", ")", ";", "out", ".", "write", "(", "bin", ".", "getBytes", "(", ")", ")", ";", "out", ".", "flush", "(", ")", ";", "offset", "+=", "stepLength", ";", "remaining", "=", "remaining", "-", "stepLength", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ".", "ControlPanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MimeTypeErrorListener", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "querybuilder", ".", "TigerQueryBuilder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "resultview", ".", "ResultViewPanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "tutorial", ".", "TutorialPanel", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisSecurityManager", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisUser", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "SimpleSecurityManager", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "validator", ".", "EmailValidator", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "ShortcutListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ParameterHandler", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ThemeResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "WebApplicationContext", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "WebBrowser", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "LoginForm", ".", "LoginEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "regex", ".", "Matcher", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "regex", ".", "Pattern", ";", "import", "javax", ".", "naming", ".", "AuthenticationException", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpSession", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "netomi", ".", "vaadin", ".", "screenshot", ".", "Screenshot", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "SearchWindow", "extends", "Window", "implements", "LoginForm", ".", "LoginListener", ",", "Screenshot", ".", "ScreenshotListener", ",", "MimeTypeErrorListener", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "SearchWindow", ".", "class", ")", ";", "private", "Pattern", "citationPattern", "=", "Pattern", ".", "compile", "(", "\"\"", ",", "Pattern", ".", "MULTILINE", "|", "Pattern", ".", "DOTALL", ")", ";", "private", "Label", "lblUserName", ";", "private", "Button", "btLoginLogout", ";", "private", "Button", "btBugReport", ";", "private", "ControlPanel", "control", ";", "private", "TutorialPanel", "tutorial", ";", "private", "TabSheet", "mainTab", ";", "private", "Window", "windowLogin", ";", "private", "ResultViewPanel", "resultView", ";", "private", "AnnisSecurityManager", "securityManager", ";", "private", "PluginSystem", "ps", ";", "private", "TigerQueryBuilder", "queryBuilder", ";", "private", "String", "bugEMailAddress", ";", "private", "boolean", "warnedAboutMediaFormat", "=", "false", ";", "public", "SearchWindow", "(", "PluginSystem", "ps", ")", "{", "super", "(", "\"\"", ")", ";", "this", ".", "ps", "=", "ps", ";", "setName", "(", "\"search\"", ")", ";", "getContent", "(", ")", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setMargin", "(", "false", ")", ";", "HorizontalLayout", "layoutToolbar", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "Panel", "panelToolbar", "=", "new", "Panel", "(", "layoutToolbar", ")", ";", "panelToolbar", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "panelToolbar", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "addComponent", "(", "panelToolbar", ")", ";", "panelToolbar", ".", "addStyleName", "(", "\"toolbar\"", ")", ";", "Button", "btAboutAnnis", "=", "new", "Button", "(", "\"About", "ANNIS\"", ")", ";", "btAboutAnnis", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btAboutAnnis", ".", "setIcon", "(", "new", "ThemeResource", "(", "\"info.gif\"", ")", ")", ";", "btAboutAnnis", ".", "addListener", "(", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "Window", "w", "=", "new", "Window", "(", "\"About", "ANNIS\"", ",", "new", "AboutPanel", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ")", ";", "w", ".", "setModal", "(", "true", ")", ";", "w", ".", "setResizable", "(", "true", ")", ";", "w", ".", "setWidth", "(", "\"500px\"", ")", ";", "w", ".", "setHeight", "(", "\"500px\"", ")", ";", "addWindow", "(", "w", ")", ";", "w", ".", "center", "(", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "final", "SearchWindow", "finalThis", "=", "this", ";", "final", "Screenshot", "screenShot", "=", "new", "Screenshot", "(", ")", ";", "screenShot", ".", "addListener", "(", "finalThis", ")", ";", "addComponent", "(", "screenShot", ")", ";", "btBugReport", "=", "new", "Button", "(", "\"Report", "Bug\"", ")", ";", "btBugReport", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btBugReport", ".", "setDisableOnClick", "(", "true", ")", ";", "btBugReport", ".", "setIcon", "(", "new", "ThemeResource", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "btBugReport", ".", "addListener", "(", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "btBugReport", ".", "setCaption", "(", "\"\"", ")", ";", "screenShot", ".", "makeScreenshot", "(", "finalThis", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "lblUserName", "=", "new", "Label", "(", "\"\"", ")", ";", "lblUserName", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "lblUserName", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "lblUserName", ".", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "btLoginLogout", "=", "new", "Button", "(", "\"Login\"", ",", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "isLoggedIn", "(", ")", ")", "{", "getApplication", "(", ")", ".", "setUser", "(", "null", ")", ";", "showNotification", "(", "\"Logged", "out\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "else", "{", "showLoginWindow", "(", ")", ";", "}", "}", "}", ")", ";", "btLoginLogout", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "btLoginLogout", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btLoginLogout", ".", "setIcon", "(", "new", "ThemeResource", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "addComponent", "(", "btAboutAnnis", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "addComponent", "(", "btBugReport", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "addComponent", "(", "lblUserName", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "addComponent", "(", "btLoginLogout", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "setSpacing", "(", "true", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "setComponentAlignment", "(", "btAboutAnnis", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_LEFT", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "setComponentAlignment", "(", "lblUserName", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "setComponentAlignment", "(", "btLoginLogout", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "layoutToolbar", ".", "setExpandRatio", "(", "lblUserName", ",", "1.0f", ")", ";", "HorizontalLayout", "hLayout", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "hLayout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "Panel", "hPanel", "=", "new", "Panel", "(", "hLayout", ")", ";", "hPanel", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "hPanel", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "PANEL_BORDERLESS", ")", ";", "addComponent", "(", "hPanel", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setExpandRatio", "(", "hPanel", ",", "1.0f", ")", ";", "control", "=", "new", "ControlPanel", "(", "this", ")", ";", "control", ".", "setWidth", "(", "30f", ",", "Layout", ".", "UNITS_EM", ")", ";", "control", ".", "setHeight", "(", "100f", ",", "Layout", ".", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "hLayout", ".", "addComponent", "(", "control", ")", ";", "tutorial", "=", "new", "TutorialPanel", "(", ")", ";", "mainTab", "=", "new", "TabSheet", "(", ")", ";", "mainTab", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "mainTab", ".", "addTab", "(", "tutorial", ",", "\"Tutorial\"", ",", "null", ")", ";", "queryBuilder", "=", "new", "TigerQueryBuilder", "(", "control", ")", ";", "mainTab", ".", "addTab", "(", "queryBuilder", ",", "\"\"", ",", "null", ")", ";", "hLayout", ".", "addComponent", "(", "mainTab", ")", ";", "hLayout", ".", "setExpandRatio", "(", "mainTab", ",", "1.0f", ")", ";", "addAction", "(", "new", "ShortcutListener", "(", "\"\"", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "handleAction", "(", "Object", "sender", ",", "Object", "target", ")", "{", "mainTab", ".", "setSelectedTab", "(", "queryBuilder", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "addAction", "(", "new", "ShortcutListener", "(", "\"Tutor^eial\"", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "handleAction", "(", "Object", "sender", ",", "Object", "target", ")", "{", "mainTab", ".", "setSelectedTab", "(", "tutorial", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "addParameterHandler", "(", "new", "ParameterHandler", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "handleParameters", "(", "Map", "<", "String", ",", "String", "[", "]", ">", "parameters", ")", "{", "if", "(", "parameters", ".", "containsKey", "(", "\"citation\"", ")", ")", "{", "HttpSession", "session", "=", "(", "(", "WebApplicationContext", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getContext", "(", ")", ")", ".", "getHttpSession", "(", ")", ";", "String", "citation", "=", "(", "String", ")", "session", ".", "getAttribute", "(", "\"citation\"", ")", ";", "if", "(", "citation", "!=", "null", ")", "{", "citation", "=", "StringUtils", ".", "removeStart", "(", "citation", ",", "Helper", ".", "getContext", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "+", "\"/Cite/\"", ")", ";", "evaluateCitation", "(", "citation", ")", ";", "session", ".", "removeAttribute", "(", "\"citation\"", ")", ";", "}", "}", "}", "}", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "String", "bugmail", "=", "getApplication", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"bug-e-mail\"", ")", ";", "if", "(", "bugmail", "!=", "null", "&&", "!", "bugmail", ".", "isEmpty", "(", ")", "&&", "!", "bugmail", ".", "startsWith", "(", "\"${\"", ")", "&&", "new", "EmailValidator", "(", "\"\"", ")", ".", "isValid", "(", "bugmail", ")", ")", "{", "this", ".", "bugEMailAddress", "=", "bugmail", ";", "}", "btBugReport", ".", "setVisible", "(", "this", ".", "bugEMailAddress", "!=", "null", ")", ";", "initSecurityManager", "(", ")", ";", "updateUserInformation", "(", ")", ";", "}", "public", "void", "evaluateCitation", "(", "String", "relativeUri", ")", "{", "AnnisUser", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", ";", "if", "(", "user", "==", "null", ")", "{", "return", ";", "}", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "userCorpora", "=", "user", ".", "getCorpusList", "(", ")", ";", "Matcher", "m", "=", "citationPattern", ".", "matcher", "(", "relativeUri", ")", ";", "if", "(", "m", ".", "matches", "(", ")", ")", "{", "String", "aql", "=", "\"\"", ";", "if", "(", "m", ".", "group", "(", "1", ")", "!=", "null", ")", "{", "aql", "=", "m", ".", "group", "(", "1", ")", ";", "}", "HashMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "selectedCorpora", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "m", ".", "group", "(", "2", ")", "!=", "null", ")", "{", "String", "[", "]", "cids", "=", "m", ".", "group", "(", "2", ")", ".", "split", "(", "\",\"", ")", ";", "for", "(", "String", "name", ":", "cids", ")", "{", "AnnisCorpus", "c", "=", "userCorpora", ".", "get", "(", "name", ")", ";", "if", "(", "c", "!=", "null", ")", "{", "selectedCorpora", ".", "put", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ",", "c", ")", ";", "}", "}", "}", "if", "(", "m", ".", "group", "(", "4", ")", "!=", "null", "&&", "m", ".", "group", "(", "6", ")", "!=", "null", ")", "{", "int", "cleft", "=", "0", ";", "int", "cright", "=", "0", ";", "try", "{", "cleft", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "m", ".", "group", "(", "4", ")", ")", ";", "cright", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "m", ".", "group", "(", "6", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "NumberFormatException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "control", ".", "setQuery", "(", "aql", ",", "selectedCorpora", ",", "cleft", ",", "cright", ")", ";", "}", "else", "{", "control", ".", "setQuery", "(", "aql", ",", "selectedCorpora", ")", ";", "}", "Set", "<", "Window", ">", "all", "=", "new", "HashSet", "<", "Window", ">", "(", "getChildWindows", "(", ")", ")", ";", "for", "(", "Window", "w", ":", "all", ")", "{", "removeWindow", "(", "w", ")", ";", "}", "}", "else", "{", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "initSecurityManager", "(", ")", "{", "securityManager", "=", "new", "SimpleSecurityManager", "(", ")", ";", "Enumeration", "<", "?", ">", "parameterNames", "=", "getApplication", "(", ")", ".", "getPropertyNames", "(", ")", ";", "Properties", "properties", "=", "new", "Properties", "(", ")", ";", "while", "(", "parameterNames", ".", "hasMoreElements", "(", ")", ")", "{", "String", "name", "=", "(", "String", ")", "parameterNames", ".", "nextElement", "(", ")", ";", "properties", ".", "put", "(", "name", ",", "getApplication", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "name", ")", ")", ";", "}", "securityManager", ".", "setProperties", "(", "properties", ")", ";", "getApplication", "(", ")", ".", "setUser", "(", "null", ")", ";", "}", "public", "void", "updateUserInformation", "(", ")", "{", "AnnisUser", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", ";", "if", "(", "btLoginLogout", "==", "null", "||", "lblUserName", "==", "null", "||", "user", "==", "null", ")", "{", "return", ";", "}", "if", "(", "isLoggedIn", "(", ")", ")", "{", "lblUserName", ".", "setValue", "(", "\"\"", "+", "user", ".", "getUserName", "(", ")", "+", "\"\\\"\"", ")", ";", "btLoginLogout", ".", "setCaption", "(", "\"Logout\"", ")", ";", "}", "else", "{", "lblUserName", ".", "setValue", "(", "\"\"", ")", ";", "btLoginLogout", ".", "setCaption", "(", "\"Login\"", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "showQueryResult", "(", "String", "aql", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ",", "int", "contextLeft", ",", "int", "contextRight", ",", "String", "segmentationLayer", ",", "int", "pageSize", ")", "{", "warnedAboutMediaFormat", "=", "false", ";", "if", "(", "resultView", "!=", "null", ")", "{", "mainTab", ".", "removeComponent", "(", "resultView", ")", ";", "}", "resultView", "=", "new", "ResultViewPanel", "(", "aql", ",", "corpora", ",", "contextLeft", ",", "contextRight", ",", "segmentationLayer", ",", "pageSize", ",", "ps", ")", ";", "mainTab", ".", "addTab", "(", "resultView", ",", "\"Query", "Result\"", ",", "null", ")", ";", "mainTab", ".", "setSelectedTab", "(", "resultView", ")", ";", "}", "public", "void", "updateQueryCount", "(", "int", "count", ")", "{", "if", "(", "resultView", "!=", "null", "&&", "count", ">=", "0", ")", "{", "resultView", ".", "setCount", "(", "count", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "showLoginWindow", "(", ")", "{", "if", "(", "windowLogin", "==", "null", ")", "{", "LoginForm", "login", "=", "new", "LoginForm", "(", ")", ";", "login", ".", "addListener", "(", "(", "LoginForm", ".", "LoginListener", ")", "this", ")", ";", "windowLogin", "=", "new", "Window", "(", "\"Login\"", ")", ";", "windowLogin", ".", "addComponent", "(", "login", ")", ";", "windowLogin", ".", "setModal", "(", "true", ")", ";", "windowLogin", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "login", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "windowLogin", ".", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "}", "addWindow", "(", "windowLogin", ")", ";", "windowLogin", ".", "center", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "onLogin", "(", "LoginEvent", "event", ")", "{", "try", "{", "AnnisUser", "newUser", "=", "securityManager", ".", "login", "(", "event", ".", "getLoginParameter", "(", "\"username\"", ")", ",", "event", ".", "getLoginParameter", "(", "\"password\"", ")", ",", "true", ")", ";", "getApplication", "(", ")", ".", "setUser", "(", "newUser", ")", ";", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "newUser", ".", "getUserName", "(", ")", "+", "\"\\\"\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "catch", "(", "AuthenticationException", "ex", ")", "{", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "}", "finally", "{", "removeWindow", "(", "windowLogin", ")", ";", "}", "}", "public", "boolean", "isLoggedIn", "(", ")", "{", "AnnisUser", "u", "=", "(", "AnnisUser", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", ";", "if", "(", "u", "==", "null", "||", "AnnisSecurityManager", ".", "FALLBACK_USER", ".", "equals", "(", "u", ".", "getUserName", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "else", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "String", "getName", "(", ")", "{", "return", "\"Search\"", ";", "}", "public", "AnnisSecurityManager", "getSecurityManager", "(", ")", "{", "return", "securityManager", ";", "}", "public", "ControlPanel", "getControl", "(", ")", "{", "return", "control", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "screenshotReceived", "(", "byte", "[", "]", "imageData", ")", "{", "btBugReport", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "btBugReport", ".", "setCaption", "(", "\"Report", "Bug\"", ")", ";", "if", "(", "bugEMailAddress", "!=", "null", ")", "{", "ReportBugPanel", "reportBugPanel", "=", "new", "ReportBugPanel", "(", "getApplication", "(", ")", ",", "bugEMailAddress", ",", "imageData", ")", ";", "Window", "w", "=", "new", "Window", "(", "\"Report", "Bug\"", ",", "reportBugPanel", ")", ";", "w", ".", "setModal", "(", "true", ")", ";", "w", ".", "setResizable", "(", "true", ")", ";", "addWindow", "(", "w", ")", ";", "w", ".", "center", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "notifyCannotPlayMimeType", "(", "String", "mimeType", ")", "{", "if", "(", "!", "warnedAboutMediaFormat", ")", "{", "String", "browserList", "=", "\"<ul>\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"</ul>\"", ";", "WebApplicationContext", "context", "=", "(", "(", "WebApplicationContext", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getContext", "(", ")", ")", ";", "WebBrowser", "browser", "=", "context", ".", "getBrowser", "(", ")", ";", "Set", "<", "String", ">", "supportedByIE9Plugin", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "supportedByIE9Plugin", ".", "add", "(", "\"video/webm\"", ")", ";", "supportedByIE9Plugin", ".", "add", "(", "\"audio/ogg\"", ")", ";", "supportedByIE9Plugin", ".", "add", "(", "\"video/ogg\"", ")", ";", "if", "(", "browser", ".", "isIE", "(", ")", "&&", "browser", ".", "getBrowserMajorVersion", "(", ")", ">=", "9", "&&", "supportedByIE9Plugin", ".", "contains", "(", "mimeType", ")", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "browserList", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ",", "true", ")", ";", "}", "else", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "browserList", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ",", "true", ")", ";", "}", "warnedAboutMediaFormat", "=", "true", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "beans", ".", "CitationProvider", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ThemeResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Table", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "BaseTheme", ";", "public", "class", "CitationLinkGenerator", "implements", "Table", ".", "ColumnGenerator", ",", "Button", ".", "ClickListener", "{", "private", "Window", "mainWindow", ";", "@", "Override", "public", "Object", "generateCell", "(", "Table", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "columnId", ")", "{", "Button", "btLink", "=", "new", "Button", "(", ")", ";", "btLink", ".", "setStyleName", "(", "BaseTheme", ".", "BUTTON_LINK", ")", ";", "btLink", ".", "setIcon", "(", "new", "ThemeResource", "(", "\"url.png\"", ")", ")", ";", "btLink", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "btLink", ".", "addListener", "(", "this", ")", ";", "if", "(", "itemId", "instanceof", "CitationProvider", ")", "{", "final", "CitationProvider", "citationProvider", "=", "(", "CitationProvider", ")", "itemId", ";", "btLink", ".", "addListener", "(", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "mainWindow", "==", "null", ")", "{", "event", ".", "getButton", "(", ")", ".", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "\"\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "citationProvider", "!=", "null", ")", "{", "CitationWindow", "c", "=", "new", "CitationWindow", "(", "mainWindow", ".", "getApplication", "(", ")", ",", "citationProvider", ".", "getQuery", "(", ")", ",", "citationProvider", ".", "getCorpora", "(", ")", ",", "citationProvider", ".", "getLeftContext", "(", ")", ",", "citationProvider", ".", "getRightContext", "(", ")", ")", ";", "mainWindow", ".", "addWindow", "(", "c", ")", ";", "c", ".", "center", "(", ")", ";", "}", "else", "{", "mainWindow", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "\"\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "}", "}", "}", "}", ")", ";", "}", "return", "btLink", ";", "}", "public", "void", "setMainWindow", "(", "Window", "mainWindow", ")", "{", "this", ".", "mainWindow", "=", "mainWindow", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Rectangle2D", ";", "public", "interface", "GraphicsItem", "{", "void", "setZValue", "(", "int", "zValue", ")", ";", "void", "setParentItem", "(", "GraphicsItem", "parent", ")", ";", "Rectangle2D", "getBounds", "(", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "public", "enum", "VerticalOrientation", "{", "TOP_ROOT", "(", "1", ")", ",", "BOTTOM_ROOT", "(", "-", "1", ")", ";", "final", "int", "value", ";", "private", "VerticalOrientation", "(", "int", "v", ")", "{", "value", "=", "v", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "class", "NodeStructureData", "{", "private", "int", "height", ";", "private", "final", "NodeStructureData", "parent", ";", "private", "boolean", "isContinuous", ";", "private", "long", "leftCorner", ";", "private", "long", "rightCorner", ";", "private", "long", "leftmostImmediate", "=", "-", "1", ";", "private", "long", "rightmostImmediate", "=", "-", "1", ";", "private", "long", "arity", "=", "0", ";", "private", "long", "tokenArity", ";", "private", "int", "step", "=", "0", ";", "public", "NodeStructureData", "(", "NodeStructureData", "parent_", ")", "{", "parent", "=", "parent_", ";", "}", "public", "long", "getLeftCorner", "(", ")", "{", "return", "leftCorner", ";", "}", "public", "void", "setLeftCorner", "(", "long", "leftCorner", ")", "{", "this", ".", "leftCorner", "=", "leftCorner", ";", "}", "public", "long", "getRightCorner", "(", ")", "{", "return", "rightCorner", ";", "}", "public", "void", "setRightCorner", "(", "long", "rightCorner", ")", "{", "this", ".", "rightCorner", "=", "rightCorner", ";", "}", "public", "long", "getLeftmostImmediate", "(", ")", "{", "return", "leftmostImmediate", ";", "}", "public", "void", "setLeftmostImmediate", "(", "long", "leftmostImmediate", ")", "{", "this", ".", "leftmostImmediate", "=", "leftmostImmediate", ";", "}", "public", "long", "getRightmostImmediate", "(", ")", "{", "return", "rightmostImmediate", ";", "}", "public", "void", "setRightmostImmediate", "(", "long", "rightmostImmediate", ")", "{", "this", ".", "rightmostImmediate", "=", "rightmostImmediate", ";", "}", "public", "long", "getArity", "(", ")", "{", "return", "arity", ";", "}", "public", "void", "setArity", "(", "long", "arity", ")", "{", "this", ".", "arity", "=", "arity", ";", "}", "public", "long", "getTokenArity", "(", ")", "{", "return", "tokenArity", ";", "}", "public", "void", "setTokenArity", "(", "long", "tokenArity", ")", "{", "this", ".", "tokenArity", "=", "tokenArity", ";", "}", "public", "NodeStructureData", "getParent", "(", ")", "{", "return", "parent", ";", "}", "public", "int", "getHeight", "(", ")", "{", "return", "height", "+", "step", ";", "}", "public", "void", "setChildHeight", "(", "int", "height", ")", "{", "this", ".", "height", "=", "height", ";", "}", "public", "boolean", "isContinuous", "(", ")", "{", "return", "isContinuous", ";", "}", "public", "void", "setContinuous", "(", "boolean", "isContinuous", ")", "{", "this", ".", "isContinuous", "=", "isContinuous", ";", "}", "public", "boolean", "encloses", "(", "NodeStructureData", "other", ")", "{", "return", "leftCorner", "<", "other", ".", "leftCorner", "&&", "rightCorner", ">", "other", ".", "rightCorner", ";", "}", "public", "void", "increaseStep", "(", ")", "{", "step", "+=", "1", ";", "parent", ".", "newChildHeight", "(", "getHeight", "(", ")", ")", ";", "}", "public", "void", "setStep", "(", "int", "newValue", ")", "{", "step", "=", "newValue", ";", "}", "private", "void", "newChildHeight", "(", "int", "newHeight", ")", "{", "if", "(", "newHeight", ">", "this", ".", "height", ")", "{", "setChildHeight", "(", "newHeight", ")", ";", "if", "(", "parent", "!=", "null", ")", "{", "parent", ".", "newChildHeight", "(", "getHeight", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "boolean", "canHaveVerticalOverlap", "(", ")", "{", "if", "(", "arity", "==", "0", ")", "{", "return", "getHeight", "(", ")", "+", "1", "<", "parent", ".", "getHeight", "(", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "isContinuous", ";", "}", "}", "public", "boolean", "hasPredecessor", "(", "NodeStructureData", "node", ")", "{", "if", "(", "node", "==", "parent", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "else", "if", "(", "parent", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "else", "{", "return", "parent", ".", "hasPredecessor", "(", "node", ")", ";", "}", "}", "public", "boolean", "hasVerticalEdgeConflict", "(", "NodeStructureData", "other", ")", "{", "return", "hasPredecessor", "(", "other", ".", "parent", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "public", "class", "LayoutOptions", "{", "private", "final", "VerticalOrientation", "orientation", ";", "private", "final", "HorizontalOrientation", "h_orientation", ";", "public", "LayoutOptions", "(", "VerticalOrientation", "vor", ",", "HorizontalOrientation", "hor", ")", "{", "orientation", "=", "vor", ";", "h_orientation", "=", "hor", ";", "}", "public", "VerticalOrientation", "getOrientation", "(", ")", "{", "return", "orientation", ";", "}", "public", "HorizontalOrientation", "getHorizontalOrientation", "(", ")", "{", "return", "h_orientation", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "public", "enum", "RectangleSide", "{", "TOP", ",", "LEFT", ",", "RIGHT", ",", "BOTTOM", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "GraphicsBackend", ".", "Alignment", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "edu", ".", "uci", ".", "ics", ".", "jung", ".", "graph", ".", "DirectedGraph", ";", "import", "edu", ".", "uci", ".", "ics", ".", "jung", ".", "graph", ".", "util", ".", "Pair", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "CubicCurve2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Line2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Point2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Rectangle2D", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "public", "class", "ConstituentLayouter", "<", "T", "extends", "GraphicsItem", ">", "{", "private", "class", "TreeLayoutData", "{", "private", "double", "baseline", ";", "private", "double", "ntStart", ";", "private", "T", "parentItem", ";", "private", "final", "Map", "<", "AnnisNode", ",", "Double", ">", "positions", ";", "private", "final", "VerticalOrientation", "orientation", ";", "private", "final", "List", "<", "Line2D", ">", "lines", "=", "new", "ArrayList", "<", "Line2D", ">", "(", ")", ";", "private", "final", "OrderedNodeList", "nodeList", "=", "new", "OrderedNodeList", "(", "styler", ".", "getVEdgeOverlapThreshold", "(", ")", ")", ";", "private", "final", "Map", "<", "AnnisNode", ",", "Rectangle2D", ">", "rectangles", "=", "new", "HashMap", "<", "AnnisNode", ",", "Rectangle2D", ">", "(", ")", ";", "public", "void", "setBaseline", "(", "double", "baseline", ")", "{", "this", ".", "baseline", "=", "baseline", ";", "}", "public", "TreeLayoutData", "(", "VerticalOrientation", "orientation_", ",", "Map", "<", "AnnisNode", ",", "Double", ">", "positions_", ")", "{", "positions", "=", "positions_", ";", "orientation", "=", "orientation_", ";", "}", "public", "VerticalOrientation", "getOrientation", "(", ")", "{", "return", "orientation", ";", "}", "public", "double", "getYPosition", "(", "AnnisNode", "node", ")", "{", "return", "ntStart", "-", "orientation", ".", "value", "*", "dataMap", ".", "get", "(", "node", ")", ".", "getHeight", "(", ")", "*", "styler", ".", "getHeightStep", "(", ")", ";", "}", "public", "Point2D", "getTokenPosition", "(", "AnnisNode", "terminal", ")", "{", "return", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "positions", ".", "get", "(", "terminal", ")", ",", "baseline", ")", ";", "}", "public", "void", "addEdge", "(", "Point2D", "from", ",", "Point2D", "to", ")", "{", "getLines", "(", ")", ".", "add", "(", "new", "Line2D", ".", "Double", "(", "from", ",", "to", ")", ")", ";", "}", "public", "void", "addNodeRect", "(", "AnnisNode", "node", ",", "Rectangle2D", "nodeRect", ")", "{", "rectangles", ".", "put", "(", "node", ",", "nodeRect", ")", ";", "}", "public", "Point2D", "getDominanceConnector", "(", "AnnisNode", "node", ",", "Rectangle2D", "bounds", ")", "{", "if", "(", "node", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "return", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "bounds", ".", "getCenterX", "(", ")", ",", "(", "orientation", "==", "VerticalOrientation", ".", "TOP_ROOT", ")", "?", "bounds", ".", "getMinY", "(", ")", ":", "bounds", ".", "getMaxY", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "bounds", ".", "getCenterX", "(", ")", ",", "bounds", ".", "getCenterY", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "setParentItem", "(", "T", "parentItem", ")", "{", "this", ".", "parentItem", "=", "parentItem", ";", "}", "public", "T", "getParentItem", "(", ")", "{", "return", "parentItem", ";", "}", "public", "void", "setNtStart", "(", "double", "ntStart", ")", "{", "this", ".", "ntStart", "=", "ntStart", ";", "}", "public", "double", "getNtStart", "(", ")", "{", "return", "ntStart", ";", "}", "public", "List", "<", "Line2D", ">", "getLines", "(", ")", "{", "return", "lines", ";", "}", "public", "OrderedNodeList", "getNodeList", "(", ")", "{", "return", "nodeList", ";", "}", "public", "Rectangle2D", "getRect", "(", "AnnisNode", "source", ")", "{", "return", "rectangles", ".", "get", "(", "source", ")", ";", "}", "}", "private", "static", "final", "AnnisNode", "TOKEN_NODE", "=", "new", "AnnisNode", "(", ")", ";", "static", "{", "TOKEN_NODE", ".", "setToken", "(", "true", ")", ";", "}", "private", "final", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", "graph", ";", "private", "final", "AnnisNode", "root", ";", "private", "final", "TreeElementLabeler", "labeler", ";", "private", "final", "GraphicsBackend", "<", "T", ">", "backend", ";", "private", "final", "Map", "<", "AnnisNode", ",", "NodeStructureData", ">", "dataMap", ";", "private", "final", "TreeElementStyler", "styler", ";", "private", "final", "VisualizerInput", "input", ";", "public", "ConstituentLayouter", "(", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", "graph_", ",", "GraphicsBackend", "<", "T", ">", "backend_", ",", "TreeElementLabeler", "labeler_", ",", "TreeElementStyler", "styler_", ",", "VisualizerInput", "input_", ")", "{", "this", ".", "backend", "=", "backend_", ";", "this", ".", "labeler", "=", "labeler_", ";", "this", ".", "graph", "=", "graph_", ";", "this", ".", "styler", "=", "styler_", ";", "this", ".", "input", "=", "input_", ";", "root", "=", "findRoot", "(", ")", ";", "dataMap", "=", "new", "HashMap", "<", "AnnisNode", ",", "NodeStructureData", ">", "(", ")", ";", "fillHeightMap", "(", "root", ",", "0", ",", "null", ")", ";", "adaptNodeHeights", "(", ")", ";", "}", "private", "NodeStructureData", "fillHeightMap", "(", "AnnisNode", "node", ",", "int", "height", ",", "NodeStructureData", "parent", ")", "{", "if", "(", "node", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "NodeStructureData", "structureData", "=", "new", "NodeStructureData", "(", "parent", ")", ";", "structureData", ".", "setChildHeight", "(", "0", ")", ";", "structureData", ".", "setTokenArity", "(", "1", ")", ";", "structureData", ".", "setLeftCorner", "(", "node", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ".", "longValue", "(", ")", ")", ";", "structureData", ".", "setRightCorner", "(", "node", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ".", "longValue", "(", ")", ")", ";", "dataMap", ".", "put", "(", "node", ",", "structureData", ")", ";", "return", "structureData", ";", "}", "else", "{", "int", "maxH", "=", "0", ";", "long", "leftCorner", "=", "Integer", ".", "MAX_VALUE", ";", "long", "rightCorner", "=", "0", ";", "boolean", "hasTokenChildren", "=", "false", ";", "long", "leftmostImmediate", "=", "Integer", ".", "MAX_VALUE", ";", "long", "rightmostImmediate", "=", "0", ";", "int", "tokenArity", "=", "0", ";", "int", "arity", "=", "0", ";", "NodeStructureData", "structureData", "=", "new", "NodeStructureData", "(", "parent", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "graph", ".", "getSuccessors", "(", "node", ")", ")", "{", "NodeStructureData", "childData", "=", "fillHeightMap", "(", "n", ",", "height", "+", "1", ",", "structureData", ")", ";", "maxH", "=", "Math", ".", "max", "(", "childData", ".", "getHeight", "(", ")", ",", "maxH", ")", ";", "leftCorner", "=", "Math", ".", "min", "(", "childData", ".", "getLeftCorner", "(", ")", ",", "leftCorner", ")", ";", "rightCorner", "=", "Math", ".", "max", "(", "childData", ".", "getRightCorner", "(", ")", ",", "rightCorner", ")", ";", "tokenArity", "+=", "childData", ".", "getTokenArity", "(", ")", ";", "arity", "+=", "1", ";", "if", "(", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "hasTokenChildren", "=", "true", ";", "leftmostImmediate", "=", "Math", ".", "min", "(", "leftmostImmediate", ",", "childData", ".", "getLeftCorner", "(", ")", ")", ";", "rightmostImmediate", "=", "Math", ".", "max", "(", "rightmostImmediate", ",", "childData", ".", "getLeftCorner", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "structureData", ".", "setStep", "(", "1", ")", ";", "structureData", ".", "setArity", "(", "arity", ")", ";", "structureData", ".", "setTokenArity", "(", "tokenArity", ")", ";", "structureData", ".", "setChildHeight", "(", "maxH", ")", ";", "structureData", ".", "setLeftCorner", "(", "leftCorner", ")", ";", "structureData", ".", "setRightCorner", "(", "rightCorner", ")", ";", "structureData", ".", "setContinuous", "(", "tokenArity", "==", "rightCorner", "-", "leftCorner", "+", "1", ")", ";", "if", "(", "hasTokenChildren", ")", "{", "structureData", ".", "setLeftmostImmediate", "(", "leftmostImmediate", ")", ";", "structureData", ".", "setRightmostImmediate", "(", "rightmostImmediate", ")", ";", "}", "dataMap", ".", "put", "(", "node", ",", "structureData", ")", ";", "return", "structureData", ";", "}", "}", "public", "void", "adaptNodeHeights", "(", ")", "{", "List", "<", "NodeStructureData", ">", "allNonterminals", "=", "new", "ArrayList", "<", "NodeStructureData", ">", "(", ")", ";", "boolean", "allContinuous", "=", "true", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "this", ".", "graph", ".", "getVertices", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "allNonterminals", ".", "add", "(", "dataMap", ".", "get", "(", "n", ")", ")", ";", "allContinuous", "&=", "dataMap", ".", "get", "(", "n", ")", ".", "isContinuous", "(", ")", ";", "}", "}", "if", "(", "allContinuous", ")", "{", "return", ";", "}", "for", "(", "int", "level", "=", "1", ";", ";", "level", "++", ")", "{", "List", "<", "NodeStructureData", ">", "levelNodes", "=", "new", "ArrayList", "<", "NodeStructureData", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "NodeStructureData", "n", ":", "allNonterminals", ")", "{", "if", "(", "n", ".", "getHeight", "(", ")", "==", "level", ")", "{", "levelNodes", ".", "add", "(", "n", ")", ";", "}", "}", "if", "(", "levelNodes", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "return", ";", "}", "Collections", ".", "sort", "(", "levelNodes", ",", "new", "Comparator", "<", "NodeStructureData", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "NodeStructureData", "o1", ",", "NodeStructureData", "o2", ")", "{", "int", "o1k", "=", "o1", ".", "isContinuous", "(", ")", "?", "1", ":", "0", ";", "int", "o2k", "=", "o2", ".", "isContinuous", "(", ")", "?", "1", ":", "0", ";", "return", "o1k", "-", "o2k", ";", "}", "}", ")", ";", "int", "d", "=", "findFirstContinuous", "(", "levelNodes", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "d", ";", "i", "++", ")", "{", "NodeStructureData", "iNode", "=", "levelNodes", ".", "get", "(", "i", ")", ";", "for", "(", "int", "j", "=", "i", "+", "1", ";", "j", "<", "levelNodes", ".", "size", "(", ")", ";", "j", "++", ")", "{", "NodeStructureData", "jNode", "=", "levelNodes", ".", "get", "(", "j", ")", ";", "if", "(", "iNode", ".", "getHeight", "(", ")", "!=", "jNode", ".", "getHeight", "(", ")", ")", "{", "continue", ";", "}", "if", "(", "jNode", ".", "isContinuous", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "iNode", ".", "encloses", "(", "jNode", ")", ")", "{", "iNode", ".", "increaseStep", "(", ")", ";", "break", ";", "}", "}", "else", "{", "bubbleNode", "(", "iNode", ",", "jNode", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "private", "void", "bubbleNode", "(", "NodeStructureData", "iNode", ",", "NodeStructureData", "jNode", ")", "{", "if", "(", "iNode", ".", "getLeftCorner", "(", ")", "<", "jNode", ".", "getLeftCorner", "(", ")", "&&", "jNode", ".", "getLeftCorner", "(", ")", "<", "iNode", ".", "getRightCorner", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "jNode", ".", "getRightCorner", "(", ")", "<", "iNode", ".", "getRightCorner", "(", ")", ")", "{", "iNode", ".", "increaseStep", "(", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "jNode", ".", "getLeftmostImmediate", "(", ")", "<", "iNode", ".", "getRightmostImmediate", "(", ")", ")", "{", "NodeStructureData", "x", "=", "(", "iNode", ".", "getArity", "(", ")", "<", "jNode", ".", "getArity", "(", ")", ")", "?", "iNode", ":", "jNode", ";", "x", ".", "increaseStep", "(", ")", ";", "}", "}", "else", "if", "(", "jNode", ".", "getLeftCorner", "(", ")", "<", "iNode", ".", "getLeftCorner", "(", ")", "&&", "jNode", ".", "getLeftCorner", "(", ")", "<", "jNode", ".", "getRightCorner", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "iNode", ".", "getRightCorner", "(", ")", "<", "jNode", ".", "getRightCorner", "(", ")", ")", "{", "jNode", ".", "increaseStep", "(", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "iNode", ".", "getLeftmostImmediate", "(", ")", "<", "jNode", ".", "getRightmostImmediate", "(", ")", ")", "{", "NodeStructureData", "x", "=", "(", "iNode", ".", "getArity", "(", ")", "<", "jNode", ".", "getArity", "(", ")", ")", "?", "iNode", ":", "jNode", ";", "x", ".", "increaseStep", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "int", "findFirstContinuous", "(", "List", "<", "NodeStructureData", ">", "levelNodes", ")", "{", "for", "(", "int", "d", "=", "0", ";", "d", "<", "levelNodes", ".", "size", "(", ")", ";", "d", "++", ")", "{", "if", "(", "levelNodes", ".", "get", "(", "d", ")", ".", "isContinuous", "(", ")", ")", "{", "return", "d", ";", "}", "}", "return", "levelNodes", ".", "size", "(", ")", ";", "}", "private", "AnnisNode", "findRoot", "(", ")", "{", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "graph", ".", "getVertices", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "graph", ".", "getInEdges", "(", "n", ")", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "return", "n", ";", "}", "}", "throw", "new", "RuntimeException", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "private", "double", "computeTreeHeight", "(", ")", "{", "return", "(", "dataMap", ".", "get", "(", "root", ")", ".", "getHeight", "(", ")", ")", "*", "styler", ".", "getHeightStep", "(", ")", "+", "styler", ".", "getFont", "(", "TOKEN_NODE", ")", ".", "getLineHeight", "(", ")", "/", "2", ";", "}", "private", "List", "<", "AnnisNode", ">", "getTokens", "(", "LayoutOptions", "options", ")", "{", "List", "<", "AnnisNode", ">", "tokens", "=", "new", "ArrayList", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "graph", ".", "getVertices", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "tokens", ".", "add", "(", "n", ")", ";", "}", "}", "Collections", ".", "sort", "(", "tokens", ",", "options", ".", "getHorizontalOrientation", "(", ")", ".", "getComparator", "(", ")", ")", ";", "return", "tokens", ";", "}", "private", "Map", "<", "AnnisNode", ",", "Double", ">", "computeTokenPositions", "(", "LayoutOptions", "options", ",", "int", "padding", ")", "{", "Map", "<", "AnnisNode", ",", "Double", ">", "positions", "=", "new", "HashMap", "<", "AnnisNode", ",", "Double", ">", "(", ")", ";", "double", "x", "=", "0", ";", "boolean", "first", "=", "true", ";", "List", "<", "AnnisNode", ">", "leaves", "=", "getTokens", "(", "options", ")", ";", "GraphicsBackend", ".", "Font", "tokenFont", "=", "styler", ".", "getFont", "(", "leaves", ".", "get", "(", "0", ")", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "token", ":", "leaves", ")", "{", "if", "(", "first", ")", "{", "first", "=", "false", ";", "}", "else", "{", "x", "+=", "styler", ".", "getTokenSpacing", "(", ")", ";", "}", "positions", ".", "put", "(", "token", ",", "x", ")", ";", "x", "+=", "2", "*", "padding", "+", "tokenFont", ".", "extents", "(", "labeler", ".", "getLabel", "(", "token", ")", ")", ".", "getWidth", "(", ")", ";", "}", "return", "positions", ";", "}", "public", "T", "createLayout", "(", "LayoutOptions", "options", ")", "{", "TreeLayoutData", "treeLayout", "=", "new", "TreeLayoutData", "(", "options", ".", "getOrientation", "(", ")", ",", "computeTokenPositions", "(", "options", ",", "5", ")", ")", ";", "treeLayout", ".", "setParentItem", "(", "backend", ".", "group", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "options", ".", "getOrientation", "(", ")", "==", "VerticalOrientation", ".", "TOP_ROOT", ")", "{", "treeLayout", ".", "setNtStart", "(", "computeTreeHeight", "(", ")", ")", ";", "treeLayout", ".", "setBaseline", "(", "treeLayout", ".", "getNtStart", "(", ")", "+", "styler", ".", "getFont", "(", "TOKEN_NODE", ")", ".", "getLineHeight", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "treeLayout", ".", "setBaseline", "(", "styler", ".", "getFont", "(", "TOKEN_NODE", ")", ".", "getLineHeight", "(", ")", ")", ";", "treeLayout", ".", "setNtStart", "(", "styler", ".", "getFont", "(", "TOKEN_NODE", ")", ".", "getLineHeight", "(", ")", ")", ";", "}", "calculateNodePosition", "(", "root", ",", "treeLayout", ",", "options", ")", ";", "Edge", "e", "=", "getOutgoingEdges", "(", "root", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ";", "GraphicsItem", "edges", "=", "backend", ".", "makeLines", "(", "treeLayout", ".", "getLines", "(", ")", ",", "styler", ".", "getEdgeColor", "(", "e", ")", ",", "styler", ".", "getStroke", "(", "e", ")", ")", ";", "edges", ".", "setZValue", "(", "-", "4", ")", ";", "edges", ".", "setParentItem", "(", "treeLayout", ".", "getParentItem", "(", ")", ")", ";", "addSecEdges", "(", "treeLayout", ",", "options", ")", ";", "return", "treeLayout", ".", "getParentItem", "(", ")", ";", "}", "private", "Point2D", "calculateNodePosition", "(", "final", "AnnisNode", "current", ",", "TreeLayoutData", "treeLayout", ",", "LayoutOptions", "options", ")", "{", "double", "y", "=", "treeLayout", ".", "getYPosition", "(", "current", ")", ";", "List", "<", "Double", ">", "childPositions", "=", "new", "ArrayList", "<", "Double", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "Edge", "e", ":", "getOutgoingEdges", "(", "current", ")", ")", "{", "AnnisNode", "child", "=", "graph", ".", "getOpposite", "(", "current", ",", "e", ")", ";", "Point2D", "childPos", ";", "if", "(", "child", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "childPos", "=", "addTerminalNode", "(", "child", ",", "treeLayout", ")", ";", "}", "else", "{", "childPos", "=", "calculateNodePosition", "(", "child", ",", "treeLayout", ",", "options", ")", ";", "}", "childPositions", ".", "add", "(", "childPos", ".", "getX", "(", ")", ")", ";", "NodeStructureData", "childData", "=", "dataMap", ".", "get", "(", "child", ")", ";", "if", "(", "childData", ".", "canHaveVerticalOverlap", "(", ")", ")", "{", "treeLayout", ".", "getNodeList", "(", ")", ".", "addVerticalEdgePosition", "(", "childData", ",", "childPos", ")", ";", "}", "treeLayout", ".", "addEdge", "(", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "childPos", ".", "getX", "(", ")", ",", "y", ")", ",", "childPos", ")", ";", "GraphicsItem", "label", "=", "backend", ".", "makeLabel", "(", "labeler", ".", "getLabel", "(", "e", ")", ",", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "childPos", ".", "getX", "(", ")", ",", "y", "+", "treeLayout", ".", "orientation", ".", "value", "*", "styler", ".", "getHeightStep", "(", ")", "*", "0.5", ")", ",", "styler", ".", "getFont", "(", "e", ")", ",", "styler", ".", "getTextBrush", "(", "e", ")", ",", "Alignment", ".", "CENTERED", ",", "styler", ".", "getShape", "(", "e", ")", ")", ";", "label", ".", "setZValue", "(", "10", ")", ";", "label", ".", "setParentItem", "(", "treeLayout", ".", "parentItem", ")", ";", "}", "double", "xCenter", "=", "treeLayout", ".", "getNodeList", "(", ")", ".", "findBestPosition", "(", "dataMap", ".", "get", "(", "current", ")", ",", "Collections", ".", "min", "(", "childPositions", ")", ",", "Collections", ".", "max", "(", "childPositions", ")", ")", ";", "GraphicsItem", "label", "=", "backend", ".", "makeLabel", "(", "labeler", ".", "getLabel", "(", "current", ")", ",", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "xCenter", ",", "y", ")", ",", "styler", ".", "getFont", "(", "current", ")", ",", "styler", ".", "getTextBrush", "(", "current", ")", ",", "Alignment", ".", "CENTERED", ",", "styler", ".", "getShape", "(", "current", ")", ")", ";", "treeLayout", ".", "addNodeRect", "(", "current", ",", "label", ".", "getBounds", "(", ")", ")", ";", "label", ".", "setZValue", "(", "11", ")", ";", "label", ".", "setParentItem", "(", "treeLayout", ".", "getParentItem", "(", ")", ")", ";", "treeLayout", ".", "addEdge", "(", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "Collections", ".", "min", "(", "childPositions", ")", ",", "y", ")", ",", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "Collections", ".", "max", "(", "childPositions", ")", ",", "y", ")", ")", ";", "return", "treeLayout", ".", "getDominanceConnector", "(", "current", ",", "label", ".", "getBounds", "(", ")", ")", ";", "}", "private", "Point2D", "addTerminalNode", "(", "AnnisNode", "terminal", ",", "TreeLayoutData", "treeLayout", ")", "{", "GraphicsItem", "label", "=", "backend", ".", "makeLabel", "(", "labeler", ".", "getLabel", "(", "terminal", ")", ",", "treeLayout", ".", "getTokenPosition", "(", "terminal", ")", ",", "styler", ".", "getFont", "(", "terminal", ")", ",", "styler", ".", "getTextBrush", "(", "terminal", ")", ",", "Alignment", ".", "NONE", ",", "styler", ".", "getShape", "(", "terminal", ")", ")", ";", "label", ".", "setParentItem", "(", "treeLayout", ".", "getParentItem", "(", ")", ")", ";", "treeLayout", ".", "addNodeRect", "(", "terminal", ",", "label", ".", "getBounds", "(", ")", ")", ";", "return", "treeLayout", ".", "getDominanceConnector", "(", "terminal", ",", "label", ".", "getBounds", "(", ")", ")", ";", "}", "private", "List", "<", "Edge", ">", "getOutgoingEdges", "(", "final", "AnnisNode", "current", ")", "{", "List", "<", "Edge", ">", "outEdges", "=", "new", "ArrayList", "<", "Edge", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "Edge", "e", ":", "graph", ".", "getOutEdges", "(", "current", ")", ")", "{", "if", "(", "AnnisGraphTools", ".", "hasEdgeSubtype", "(", "e", ",", "AnnisGraphTools", ".", "PRIMEDGE_SUBTYPE", ",", "input", ")", ")", "{", "outEdges", ".", "add", "(", "e", ")", ";", "}", "}", "Collections", ".", "sort", "(", "outEdges", ",", "new", "Comparator", "<", "Edge", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "Edge", "o1", ",", "Edge", "o2", ")", "{", "int", "h1", "=", "dataMap", ".", "get", "(", "graph", ".", "getOpposite", "(", "current", ",", "o1", ")", ")", ".", "getHeight", "(", ")", ";", "int", "h2", "=", "dataMap", ".", "get", "(", "graph", ".", "getOpposite", "(", "current", ",", "o2", ")", ")", ".", "getHeight", "(", ")", ";", "return", "h1", "-", "h2", ";", "}", "}", ")", ";", "return", "outEdges", ";", "}", "private", "CubicCurve2D", "secedgeCurve", "(", "VerticalOrientation", "verticalOrientation", ",", "Rectangle2D", "sourceRect", ",", "Rectangle2D", "targetRect", ")", "{", "Pair", "<", "RectangleSide", ">", "sidePair", "=", "findBestConnection", "(", "sourceRect", ",", "targetRect", ")", ";", "Point2D", "startPoint", "=", "sideMidPoint", "(", "sourceRect", ",", "sidePair", ".", "getFirst", "(", ")", ")", ";", "Point2D", "endPoint", "=", "sideMidPoint", "(", "targetRect", ",", "sidePair", ".", "getSecond", "(", ")", ")", ";", "double", "middleX", "=", "(", "startPoint", ".", "getX", "(", ")", "+", "endPoint", ".", "getX", "(", ")", ")", "/", "2.0", ";", "double", "middleY", "=", "50", "*", "-", "verticalOrientation", ".", "value", "+", "(", "startPoint", ".", "getY", "(", ")", "+", "endPoint", ".", "getY", "(", ")", ")", "/", "2", ";", "return", "new", "CubicCurve2D", ".", "Double", "(", "startPoint", ".", "getX", "(", ")", ",", "startPoint", ".", "getY", "(", ")", ",", "middleX", ",", "middleY", ",", "middleX", ",", "middleY", ",", "endPoint", ".", "getX", "(", ")", ",", "endPoint", ".", "getY", "(", ")", ")", ";", "}", "private", "Point2D", "sideMidPoint", "(", "Rectangle2D", "rect", ",", "RectangleSide", "side", ")", "{", "switch", "(", "side", ")", "{", "case", "TOP", ":", "return", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "rect", ".", "getCenterX", "(", ")", ",", "rect", ".", "getMinY", "(", ")", ")", ";", "case", "BOTTOM", ":", "return", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "rect", ".", "getCenterX", "(", ")", ",", "rect", ".", "getMaxY", "(", ")", ")", ";", "case", "LEFT", ":", "return", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "rect", ".", "getMinX", "(", ")", ",", "rect", ".", "getCenterY", "(", ")", ")", ";", "case", "RIGHT", ":", "return", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "rect", ".", "getMaxX", "(", ")", ",", "rect", ".", "getCenterY", "(", ")", ")", ";", "default", ":", "throw", "new", "RuntimeException", "(", ")", ";", "}", "}", "private", "Pair", "<", "RectangleSide", ">", "findBestConnection", "(", "Rectangle2D", "sourceRect", ",", "Rectangle2D", "targetRect", ")", "{", "Pair", "<", "RectangleSide", ">", "result", "=", "null", ";", "double", "minDist", "=", "Float", ".", "MAX_VALUE", ";", "for", "(", "RectangleSide", "orig", ":", "RectangleSide", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "RectangleSide", "target", ":", "RectangleSide", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "Point2D", "o", "=", "sideMidPoint", "(", "sourceRect", ",", "orig", ")", ";", "Point2D", "t", "=", "sideMidPoint", "(", "targetRect", ",", "target", ")", ";", "double", "dist", "=", "Math", ".", "hypot", "(", "o", ".", "getX", "(", ")", "-", "t", ".", "getX", "(", ")", ",", "t", ".", "getY", "(", ")", "-", "t", ".", "getY", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "dist", "<", "minDist", ")", "{", "result", "=", "new", "Pair", "<", "RectangleSide", ">", "(", "orig", ",", "target", ")", ";", "minDist", "=", "dist", ";", "}", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "private", "void", "addSecEdges", "(", "TreeLayoutData", "treeLayout", ",", "LayoutOptions", "options", ")", "{", "for", "(", "Edge", "e", ":", "graph", ".", "getEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "AnnisGraphTools", ".", "hasEdgeSubtype", "(", "e", ",", "AnnisGraphTools", ".", "SECEDGE_SUBTYPE", ",", "input", ")", ")", "{", "continue", ";", "}", "Rectangle2D", "sourceRect", "=", "treeLayout", ".", "getRect", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ")", ";", "Rectangle2D", "targetRect", "=", "treeLayout", ".", "getRect", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ")", ";", "CubicCurve2D", "curveData", "=", "secedgeCurve", "(", "treeLayout", ".", "getOrientation", "(", ")", ",", "sourceRect", ",", "targetRect", ")", ";", "T", "secedgeElem", "=", "backend", ".", "cubicCurve", "(", "curveData", ",", "styler", ".", "getStroke", "(", "e", ")", ",", "styler", ".", "getEdgeColor", "(", "e", ")", ")", ";", "secedgeElem", ".", "setZValue", "(", "-", "2", ")", ";", "T", "arrowElem", "=", "backend", ".", "arrow", "(", "curveData", ".", "getP1", "(", ")", ",", "curveData", ".", "getCtrlP1", "(", ")", ",", "new", "Rectangle2D", ".", "Double", "(", "0", ",", "0", ",", "8", ",", "8", ")", ",", "styler", ".", "getEdgeColor", "(", "e", ")", ")", ";", "arrowElem", ".", "setZValue", "(", "-", "1", ")", ";", "arrowElem", ".", "setParentItem", "(", "secedgeElem", ")", ";", "Point2D", "labelPos", "=", "evaluate", "(", "curveData", ",", "0.8", ")", ";", "T", "label", "=", "backend", ".", "makeLabel", "(", "labeler", ".", "getLabel", "(", "e", ")", ",", "labelPos", ",", "styler", ".", "getFont", "(", "e", ")", ",", "styler", ".", "getTextBrush", "(", "e", ")", ",", "Alignment", ".", "CENTERED", ",", "styler", ".", "getShape", "(", "e", ")", ")", ";", "label", ".", "setParentItem", "(", "secedgeElem", ")", ";", "secedgeElem", ".", "setParentItem", "(", "treeLayout", ".", "getParentItem", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "private", "Point2D", "evaluate", "(", "CubicCurve2D", "curveData", ",", "double", "t", ")", "{", "double", "u", "=", "1", "-", "t", ";", "return", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "curveData", ".", "getX1", "(", ")", "*", "u", "*", "u", "*", "u", "+", "3", "*", "curveData", ".", "getCtrlX1", "(", ")", "*", "t", "*", "u", "*", "u", "+", "3", "*", "curveData", ".", "getCtrlX2", "(", ")", "*", "t", "*", "t", "*", "u", "+", "curveData", ".", "getX2", "(", ")", "*", "t", "*", "t", "*", "t", ",", "curveData", ".", "getY1", "(", ")", "*", "u", "*", "u", "*", "u", "+", "3", "*", "curveData", ".", "getCtrlY1", "(", ")", "*", "t", "*", "u", "*", "u", "+", "3", "*", "curveData", ".", "getCtrlY2", "(", ")", "*", "t", "*", "t", "*", "u", "+", "curveData", ".", "getY2", "(", ")", "*", "t", "*", "t", "*", "t", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Comparator", ";", "public", "enum", "HorizontalOrientation", "{", "LEFT_TO_RIGHT", "(", "1", ")", ",", "RIGHT_TO_LEFT", "(", "-", "1", ")", ";", "private", "final", "int", "directionModifier", ";", "HorizontalOrientation", "(", "int", "directionModifier_", ")", "{", "directionModifier", "=", "directionModifier_", ";", "}", "Comparator", "<", "AnnisNode", ">", "getComparator", "(", ")", "{", "return", "new", "Comparator", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "AnnisNode", "o1", ",", "AnnisNode", "o2", ")", "{", "return", "directionModifier", "*", "(", "o1", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ".", "intValue", "(", ")", "-", "o2", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ".", "intValue", "(", ")", ")", ";", "}", "}", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "public", "interface", "TreeElementLabeler", "{", "String", "getLabel", "(", "AnnisNode", "n", ")", ";", "String", "getLabel", "(", "Edge", "e", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Color", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Stroke", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "CubicCurve2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Line2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Point2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Rectangle2D", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collection", ";", "public", "interface", "GraphicsBackend", "<", "T", "extends", "GraphicsItem", ">", "{", "class", "Alignment", "{", "public", "static", "final", "Alignment", "NONE", "=", "new", "Alignment", "(", "0", ",", "0", ")", ";", "public", "static", "final", "Alignment", "CENTERED", "=", "new", "Alignment", "(", "0.5", ",", "0.5", ")", ";", "private", "final", "double", "x", ";", "private", "final", "double", "y", ";", "public", "Alignment", "(", "double", "x", ",", "double", "y", ")", "{", "super", "(", ")", ";", "this", ".", "x", "=", "x", ";", "this", ".", "y", "=", "y", ";", "}", "public", "double", "getXAlign", "(", ")", "{", "return", "x", ";", "}", "public", "double", "getYAlign", "(", ")", "{", "return", "y", ";", "}", "}", "interface", "Font", "{", "Rectangle2D", "extents", "(", "String", "string", ")", ";", "double", "getLineHeight", "(", ")", ";", "public", "double", "getAscent", "(", ")", ";", "}", "Font", "getFont", "(", "String", "family", ",", "int", "pointSize", ",", "int", "style", ")", ";", "T", "group", "(", ")", ";", "T", "makeLabel", "(", "String", "label", ",", "Point2D", "pos", ",", "Font", "font", ",", "Color", "color", ",", "Alignment", "alignment", ",", "Shape", "shape", ")", ";", "T", "makeLines", "(", "Collection", "<", "Line2D", ">", "lines", ",", "Color", "color", ",", "Stroke", "strokeStyle", ")", ";", "T", "cubicCurve", "(", "CubicCurve2D", "curveData", ",", "Stroke", "strokeStyle", ",", "Color", "color", ")", ";", "T", "arrow", "(", "Point2D", "tip", ",", "Point2D", "fromDirection", ",", "Rectangle2D", "dimensions", ",", "Color", "fillColor", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "backends", ".", "staticimg", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "GraphicsItem", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Graphics2D", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collection", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "public", "abstract", "class", "AbstractImageGraphicsItem", "implements", "GraphicsItem", "{", "private", "List", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "children", "=", "new", "ArrayList", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "(", ")", ";", "private", "int", "zValue", ";", "public", "void", "addChildItem", "(", "AbstractImageGraphicsItem", "childItem", ")", "{", "children", ".", "add", "(", "childItem", ")", ";", "}", "public", "abstract", "void", "draw", "(", "Graphics2D", "canvas", ")", ";", "@", "Override", "public", "void", "setParentItem", "(", "GraphicsItem", "parent", ")", "{", "(", "(", "AbstractImageGraphicsItem", ")", "parent", ")", ".", "addChildItem", "(", "this", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "setZValue", "(", "int", "newZValue", ")", "{", "zValue", "=", "newZValue", ";", "}", "public", "int", "getZValue", "(", ")", "{", "return", "zValue", ";", "}", "public", "Collection", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "getChildren", "(", ")", "{", "return", "children", ";", "}", "public", "void", "getAllChildren", "(", "List", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "outputList", ")", "{", "outputList", ".", "addAll", "(", "children", ")", ";", "for", "(", "AbstractImageGraphicsItem", "child", ":", "children", ")", "{", "child", ".", "getAllChildren", "(", "outputList", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "backends", ".", "staticimg", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "GraphicsBackend", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "Shape", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Color", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Graphics2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Stroke", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "font", ".", "FontRenderContext", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "font", ".", "LineMetrics", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "font", ".", "TextLayout", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collection", ";", "public", "class", "Java2dBackend", "implements", "GraphicsBackend", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "{", "public", "static", "final", "FontRenderContext", "FRC", "=", "new", "FontRenderContext", "(", "new", "AffineTransform", "(", ")", ",", "true", ",", "true", ")", ";", "public", "static", "class", "Java2dFont", "implements", "GraphicsBackend", ".", "Font", "{", "private", "final", "java", ".", "awt", ".", "Font", "awtFont", ";", "public", "Java2dFont", "(", "String", "family", ",", "int", "pointSize", ",", "int", "style", ")", "{", "awtFont", "=", "new", "java", ".", "awt", ".", "Font", "(", "family", ",", "style", ",", "pointSize", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "Rectangle2D", "extents", "(", "String", "string", ")", "{", "if", "(", "string", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "return", "new", "Rectangle2D", ".", "Double", "(", "0", ",", "0", ",", "0", ",", "0", ")", ";", "}", "else", "{", "TextLayout", "tl", "=", "new", "TextLayout", "(", "string", ",", "awtFont", ",", "FRC", ")", ";", "return", "tl", ".", "getBounds", "(", ")", ";", "}", "}", "public", "java", ".", "awt", ".", "Font", "getAwtFont", "(", ")", "{", "return", "awtFont", ";", "}", "@", "Override", "public", "double", "getLineHeight", "(", ")", "{", "return", "lineMetrics", "(", ")", ".", "getHeight", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "double", "getAscent", "(", ")", "{", "return", "lineMetrics", "(", ")", ".", "getAscent", "(", ")", ";", "}", "private", "LineMetrics", "lineMetrics", "(", ")", "{", "return", "awtFont", ".", "getLineMetrics", "(", "\"Xg-UNK-\"", ",", "FRC", ")", ";", "}", "}", ";", "@", "Override", "public", "AbstractImageGraphicsItem", "group", "(", ")", "{", "return", "new", "GraphicsItemGroup", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "AbstractImageGraphicsItem", "makeLabel", "(", "String", "label", ",", "Point2D", "pos", ",", "Font", "font", ",", "Color", "color", ",", "Alignment", "alignment", ",", "Shape", "shape", ")", "{", "return", "new", "LabelItem", "(", "label", ",", "pos", ",", "(", "Java2dFont", ")", "font", ",", "color", ",", "alignment", ",", "shape", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "Font", "getFont", "(", "String", "family", ",", "int", "pointSize", ",", "int", "style", ")", "{", "return", "new", "Java2dFont", "(", "family", ",", "pointSize", ",", "style", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "AbstractImageGraphicsItem", "makeLines", "(", "final", "Collection", "<", "Line2D", ">", "lines", ",", "final", "Color", "color", ",", "final", "Stroke", "stroke", ")", "{", "return", "new", "AbstractImageGraphicsItem", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "Rectangle2D", "getBounds", "(", ")", "{", "return", "null", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "draw", "(", "Graphics2D", "canvas", ")", "{", "canvas", ".", "setColor", "(", "color", ")", ";", "canvas", ".", "setStroke", "(", "stroke", ")", ";", "for", "(", "Line2D", "l", ":", "lines", ")", "{", "canvas", ".", "draw", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "}", ";", "}", "private", "double", "getRotationAngle", "(", "Point2D", "origin", ",", "Point2D", "target", ")", "{", "double", "l", "=", "Math", ".", "hypot", "(", "origin", ".", "getX", "(", ")", "-", "target", ".", "getX", "(", ")", ",", "origin", ".", "getY", "(", ")", "-", "target", ".", "getY", "(", ")", ")", ";", "double", "x", "=", "Math", ".", "acos", "(", "(", "origin", ".", "getX", "(", ")", "-", "target", ".", "getX", "(", ")", ")", "*", "Math", ".", "signum", "(", "origin", ".", "getX", "(", ")", "-", "target", ".", "getX", "(", ")", ")", "/", "l", ")", ";", "if", "(", "origin", ".", "getX", "(", ")", ">", "target", ".", "getX", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "origin", ".", "getY", "(", ")", "<", "target", ".", "getY", "(", ")", ")", "{", "x", "=", "-", "x", ";", "}", "x", "+=", "Math", ".", "PI", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "origin", ".", "getY", "(", ")", ">", "target", ".", "getY", "(", ")", ")", "{", "x", "=", "-", "x", ";", "}", "}", "return", "x", ";", "}", "@", "Override", "public", "AbstractImageGraphicsItem", "arrow", "(", "final", "Point2D", "tip", ",", "Point2D", "fromPoint", ",", "Rectangle2D", "dimensions", ",", "final", "Color", "color", ")", "{", "final", "GeneralPath", "path", "=", "new", "GeneralPath", "(", ")", ";", "path", ".", "moveTo", "(", "0", ",", "0", ")", ";", "path", ".", "lineTo", "(", "dimensions", ".", "getHeight", "(", ")", ",", "dimensions", ".", "getWidth", "(", ")", "/", "2", ")", ";", "path", ".", "lineTo", "(", "dimensions", ".", "getHeight", "(", ")", ",", "-", "dimensions", ".", "getWidth", "(", ")", "/", "2", ")", ";", "path", ".", "closePath", "(", ")", ";", "final", "double", "angle", "=", "getRotationAngle", "(", "tip", ",", "fromPoint", ")", ";", "return", "new", "AbstractImageGraphicsItem", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "Rectangle2D", "getBounds", "(", ")", "{", "return", "new", "Rectangle2D", ".", "Double", "(", "0", ",", "0", ",", "0", ",", "0", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "draw", "(", "Graphics2D", "canvas", ")", "{", "AffineTransform", "t", "=", "canvas", ".", "getTransform", "(", ")", ";", "canvas", ".", "setColor", "(", "color", ")", ";", "canvas", ".", "translate", "(", "tip", ".", "getX", "(", ")", ",", "tip", ".", "getY", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "rotate", "(", "angle", ")", ";", "canvas", ".", "fill", "(", "path", ")", ";", "canvas", ".", "setTransform", "(", "t", ")", ";", "}", "}", ";", "}", "@", "Override", "public", "AbstractImageGraphicsItem", "cubicCurve", "(", "final", "CubicCurve2D", "curveData", ",", "final", "Stroke", "strokeStyle", ",", "final", "Color", "color", ")", "{", "return", "new", "AbstractImageGraphicsItem", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "Rectangle2D", "getBounds", "(", ")", "{", "return", "curveData", ".", "getBounds2D", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "draw", "(", "Graphics2D", "canvas", ")", "{", "canvas", ".", "setStroke", "(", "strokeStyle", ")", ";", "canvas", ".", "setColor", "(", "color", ")", ";", "canvas", ".", "draw", "(", "curveData", ")", ";", "}", "}", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "backends", ".", "staticimg", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "GraphicsBackend", ".", "Alignment", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "Shape", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "backends", ".", "staticimg", ".", "Java2dBackend", ".", "Java2dFont", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Color", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Graphics2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "font", ".", "GlyphMetrics", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Point2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Rectangle2D", ";", "public", "class", "LabelItem", "extends", "AbstractImageGraphicsItem", "{", "private", "final", "java", ".", "awt", ".", "Font", "awtFont", ";", "private", "final", "String", "label", ";", "private", "final", "Point2D", "pos", ";", "private", "final", "Color", "color", ";", "private", "final", "Rectangle2D", "rect", ";", "private", "Shape", "shape", ";", "public", "LabelItem", "(", "String", "label_", ",", "Point2D", "pos_", ",", "Java2dFont", "font", ",", "Color", "color_", ",", "Alignment", "alignment", ",", "Shape", "shape_", ")", "{", "this", ".", "color", "=", "color_", ";", "this", ".", "label", "=", "label_", ";", "this", ".", "awtFont", "=", "font", ".", "getAwtFont", "(", ")", ";", "GlyphMetrics", "gm", "=", "awtFont", ".", "createGlyphVector", "(", "Java2dBackend", ".", "FRC", ",", "label", ".", "substring", "(", "0", ",", "1", ")", ")", ".", "getGlyphMetrics", "(", "0", ")", ";", "Rectangle2D", "size", "=", "font", ".", "extents", "(", "label", ")", ";", "double", "text_x", "=", "pos_", ".", "getX", "(", ")", "-", "size", ".", "getWidth", "(", ")", "*", "alignment", ".", "getXAlign", "(", ")", ";", "double", "text_y", "=", "pos_", ".", "getY", "(", ")", "+", "shape_", ".", "getInternalYOffset", "(", "label_", ",", "font", ",", "alignment", ")", ";", "double", "rect_y", "=", "pos_", ".", "getY", "(", ")", "+", "size", ".", "getHeight", "(", ")", "*", "alignment", ".", "getYAlign", "(", ")", "-", "(", "font", ".", "getAscent", "(", ")", "+", "shape_", ".", "getYPadding", "(", ")", ")", ";", "rect", "=", "new", "Rectangle2D", ".", "Double", "(", "text_x", "+", "gm", ".", "getLSB", "(", ")", "-", "shape_", ".", "getXPadding", "(", ")", ",", "rect_y", ",", "size", ".", "getWidth", "(", ")", "+", "2", "*", "shape_", ".", "getXPadding", "(", ")", ",", "font", ".", "getLineHeight", "(", ")", "+", "2", "*", "shape_", ".", "getYPadding", "(", ")", ")", ";", "this", ".", "pos", "=", "new", "Point2D", ".", "Double", "(", "text_x", "-", "rect", ".", "getX", "(", ")", ",", "text_y", "-", "rect", ".", "getY", "(", ")", ")", ";", "this", ".", "shape", "=", "shape_", ";", "}", "@", "Override", "public", "Rectangle2D", "getBounds", "(", ")", "{", "return", "rect", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "draw", "(", "Graphics2D", "canvas", ")", "{", "if", "(", "shape", "instanceof", "Shape", ".", "Ellipse", ")", "{", "canvas", ".", "setStroke", "(", "shape", ".", "getPenStyle", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "setColor", "(", "shape", ".", "getFillColor", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "fillOval", "(", "(", "int", ")", "rect", ".", "getX", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getY", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getWidth", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getHeight", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "setColor", "(", "shape", ".", "getStrokeColor", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "drawOval", "(", "(", "int", ")", "rect", ".", "getX", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getY", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getWidth", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getHeight", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "shape", "instanceof", "Shape", ".", "Rectangle", ")", "{", "canvas", ".", "setStroke", "(", "shape", ".", "getPenStyle", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "setColor", "(", "shape", ".", "getFillColor", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "fillRect", "(", "(", "int", ")", "rect", ".", "getX", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getY", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getWidth", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getHeight", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "setColor", "(", "shape", ".", "getStrokeColor", "(", ")", ")", ";", "canvas", ".", "drawRect", "(", "(", "int", ")", "rect", ".", "getX", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getY", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getWidth", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "rect", ".", "getHeight", "(", ")", ")", ";", "}", "canvas", ".", "setFont", "(", "awtFont", ")", ";", "canvas", ".", "setColor", "(", "color", ")", ";", "canvas", ".", "drawString", "(", "this", ".", "label", ",", "(", "float", ")", "(", "this", ".", "pos", ".", "getX", "(", ")", "+", "this", ".", "rect", ".", "getX", "(", ")", ")", ",", "(", "float", ")", "(", "this", ".", "pos", ".", "getY", "(", ")", "+", "this", ".", "rect", ".", "getY", "(", ")", ")", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "backends", ".", "staticimg", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Graphics2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Rectangle2D", ";", "public", "class", "GraphicsItemGroup", "extends", "AbstractImageGraphicsItem", "{", "@", "Override", "public", "Rectangle2D", "getBounds", "(", ")", "{", "Rectangle2D", "r", "=", "new", "Rectangle2D", ".", "Double", "(", ")", ";", "for", "(", "AbstractImageGraphicsItem", "c", ":", "getChildren", "(", ")", ")", "{", "Rectangle2D", "childBounds", "=", "c", ".", "getBounds", "(", ")", ";", "if", "(", "childBounds", "!=", "null", ")", "{", "r", ".", "add", "(", "childBounds", ")", ";", "}", "}", "return", "r", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "draw", "(", "Graphics2D", "canvas", ")", "{", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Point2D", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collection", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collections", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "public", "class", "OrderedNodeList", "{", "private", "final", "double", "minDistance", ";", "private", "final", "List", "<", "NodeStructureData", ">", "nodes", "=", "new", "ArrayList", "<", "NodeStructureData", ">", "(", ")", ";", "private", "final", "List", "<", "Double", ">", "points", "=", "new", "ArrayList", "<", "Double", ">", "(", ")", ";", "public", "OrderedNodeList", "(", "double", "minDistance_", ")", "{", "minDistance", "=", "minDistance_", ";", "}", "public", "void", "addVerticalEdgePosition", "(", "NodeStructureData", "structData", ",", "Point2D", "pos", ")", "{", "int", "idx", "=", "findInsertionIndex", "(", "pos", ".", "getX", "(", ")", ")", ";", "nodes", ".", "add", "(", "idx", ",", "structData", ")", ";", "points", ".", "add", "(", "idx", ",", "pos", ".", "getX", "(", ")", ")", ";", "}", "private", "int", "findInsertionIndex", "(", "double", "pos", ")", "{", "int", "idx", "=", "Collections", ".", "binarySearch", "(", "points", ",", "pos", ")", ";", "if", "(", "idx", "<", "0", ")", "{", "idx", "=", "-", "(", "idx", "+", "1", ")", ";", "}", "return", "idx", ";", "}", "public", "double", "findBestPosition", "(", "NodeStructureData", "nodeStructureData", ",", "double", "minX", ",", "double", "maxX", ")", "{", "double", "optimalPos", "=", "(", "minX", "+", "maxX", ")", "/", "2", ";", "if", "(", "nodeStructureData", ".", "isContinuous", "(", ")", ")", "{", "return", "optimalPos", ";", "}", "else", "if", "(", "hasConflict", "(", "nodeStructureData", ",", "optimalPos", ")", ")", "{", "double", "lastPos", "=", "minX", ";", "double", "bestPos", "=", "minX", "+", "minDistance", "/", "2", ";", "double", "bestDist", "=", "Integer", ".", "MAX_VALUE", ";", "for", "(", "double", "x", ":", "findConflicts", "(", "nodeStructureData", ",", "minX", ",", "maxX", ")", ")", "{", "double", "space", "=", "Math", ".", "abs", "(", "x", "-", "lastPos", ")", ";", "if", "(", "space", ">", "2", "*", "minDistance", ")", "{", "double", "regionOptimalPos", "=", "nearest", "(", "optimalPos", ",", "lastPos", "+", "minDistance", ",", "x", "-", "minDistance", ")", ";", "double", "dist", "=", "Math", ".", "abs", "(", "regionOptimalPos", "-", "optimalPos", ")", ";", "if", "(", "dist", "<", "bestDist", ")", "{", "bestPos", "=", "regionOptimalPos", ";", "bestDist", "=", "dist", ";", "}", "}", "lastPos", "=", "x", ";", "}", "return", "bestPos", ";", "}", "else", "{", "return", "optimalPos", ";", "}", "}", "private", "double", "nearest", "(", "double", "optimalPos", ",", "double", "min", ",", "double", "max", ")", "{", "return", "Math", ".", "max", "(", "min", ",", "Math", ".", "min", "(", "max", ",", "optimalPos", ")", ")", ";", "}", "private", "Collection", "<", "Double", ">", "findConflicts", "(", "NodeStructureData", "nodeStructureData", ",", "double", "minX", ",", "double", "maxX", ")", "{", "List", "<", "Double", ">", "result", "=", "new", "ArrayList", "<", "Double", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "pos", ":", "findInRegion", "(", "minX", ",", "maxX", ")", ")", "{", "if", "(", "nodeStructureData", ".", "hasVerticalEdgeConflict", "(", "nodes", ".", "get", "(", "pos", ")", ")", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "points", ".", "get", "(", "pos", ")", ")", ";", "}", "}", "result", ".", "add", "(", "maxX", ")", ";", "return", "result", ";", "}", "private", "boolean", "hasConflict", "(", "NodeStructureData", "nodeStructureData", ",", "double", "atPos", ")", "{", "for", "(", "int", "lower", ":", "findInRegion", "(", "atPos", "-", "minDistance", ",", "atPos", "+", "minDistance", ")", ")", "{", "if", "(", "nodeStructureData", ".", "hasVerticalEdgeConflict", "(", "nodes", ".", "get", "(", "lower", ")", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "return", "false", ";", "}", "private", "Collection", "<", "Integer", ">", "findInRegion", "(", "double", "low", ",", "double", "high", ")", "{", "int", "start", "=", "findInsertionIndex", "(", "low", ")", ";", "int", "end", "=", "findInsertionIndex", "(", "high", ")", ";", "List", "<", "Integer", ">", "l", "=", "new", "ArrayList", "<", "Integer", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "start", ";", "i", "<", "end", ";", "i", "++", ")", "{", "l", ".", "add", "(", "i", ")", ";", "}", "return", "l", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "GraphicsBackend", ".", "Alignment", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "GraphicsBackend", ".", "Font", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Color", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Stroke", ";", "public", "interface", "Shape", "{", "double", "getXPadding", "(", ")", ";", "double", "getYPadding", "(", ")", ";", "double", "getInternalYOffset", "(", "String", "label", ",", "GraphicsBackend", ".", "Font", "font", ",", "GraphicsBackend", ".", "Alignment", "alignment", ")", ";", "Color", "getStrokeColor", "(", ")", ";", "Color", "getFillColor", "(", ")", ";", "Stroke", "getPenStyle", "(", ")", ";", "abstract", "class", "AbstractShape", "implements", "Shape", "{", "private", "final", "double", "xPadding", ";", "private", "final", "double", "yPadding", ";", "private", "final", "Color", "stroke", ";", "private", "final", "Color", "fill", ";", "private", "final", "Stroke", "penStyle", ";", "public", "AbstractShape", "(", "double", "xPadding_", ",", "double", "yPadding_", ",", "Color", "stroke_", ",", "Color", "fill_", ",", "Stroke", "penStyle_", ")", "{", "this", ".", "xPadding", "=", "xPadding_", ";", "this", ".", "yPadding", "=", "yPadding_", ";", "this", ".", "stroke", "=", "stroke_", ";", "this", ".", "fill", "=", "fill_", ";", "this", ".", "penStyle", "=", "penStyle_", ";", "}", "@", "Override", "public", "double", "getXPadding", "(", ")", "{", "return", "xPadding", ";", "}", "@", "Override", "public", "double", "getYPadding", "(", ")", "{", "return", "yPadding", ";", "}", "public", "Color", "getStrokeColor", "(", ")", "{", "return", "stroke", ";", "}", "public", "Color", "getFillColor", "(", ")", "{", "return", "fill", ";", "}", "public", "Stroke", "getPenStyle", "(", ")", "{", "return", "penStyle", ";", "}", "@", "Override", "public", "double", "getInternalYOffset", "(", "String", "label", ",", "Font", "font", ",", "Alignment", "alignment", ")", "{", "return", "font", ".", "extents", "(", "label", ")", ".", "getHeight", "(", ")", "*", "alignment", ".", "getYAlign", "(", ")", ";", "}", "}", "class", "Invisible", "extends", "AbstractShape", "{", "public", "Invisible", "(", "double", "padding", ")", "{", "super", "(", "padding", ",", "padding", ",", "null", ",", "null", ",", "null", ")", ";", "}", "}", "class", "Rectangle", "extends", "AbstractShape", "{", "public", "Rectangle", "(", "Color", "stroke", ",", "Color", "fill", ",", "Stroke", "penStyle", ",", "double", "padding", ")", "{", "super", "(", "padding", ",", "padding", ",", "stroke", ",", "fill", ",", "penStyle", ")", ";", "}", "}", "class", "Ellipse", "extends", "AbstractShape", "{", "public", "Ellipse", "(", "Color", "stroke", ",", "Color", "fill", ",", "Stroke", "penStyle", ",", "double", "padding", ")", "{", "super", "(", "padding", "+", "4", ",", "padding", ",", "stroke", ",", "fill", ",", "penStyle", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "double", "getInternalYOffset", "(", "String", "label", ",", "Font", "font", ",", "Alignment", "alignment", ")", "{", "return", "(", "font", ".", "getLineHeight", "(", ")", "-", "font", ".", "getAscent", "(", ")", "*", "alignment", ".", "getYAlign", "(", ")", ")", "*", "alignment", ".", "getYAlign", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MatchedNodeColors", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "AbstractIFrameVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "backends", ".", "staticimg", ".", "AbstractImageGraphicsItem", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "backends", ".", "staticimg", ".", "Java2dBackend", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResult", ";", "import", "edu", ".", "uci", ".", "ics", ".", "jung", ".", "graph", ".", "DirectedGraph", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "AffineTransform", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Rectangle2D", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "image", ".", "BufferedImage", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "OutputStream", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "javax", ".", "imageio", ".", "ImageIO", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "TigerTreeVisualizer", "extends", "AbstractIFrameVisualizer", "{", "private", "VisualizerInput", "input", "=", "new", "VisualizerInput", "(", ")", ";", "private", "static", "final", "int", "SIDE_MARGIN", "=", "20", ";", "private", "static", "final", "int", "TOP_MARGIN", "=", "40", ";", "private", "static", "final", "int", "TREE_DISTANCE", "=", "40", ";", "private", "final", "Java2dBackend", "backend", ";", "private", "final", "DefaultLabeler", "labeler", ";", "private", "final", "DefaultStyler", "styler", ";", "private", "final", "AnnisGraphTools", "graphtools", ";", "public", "class", "DefaultStyler", "implements", "TreeElementStyler", "{", "private", "final", "BasicStroke", "DEFAULT_PEN_STYLE", "=", "new", "BasicStroke", "(", "1", ")", ";", "public", "static", "final", "int", "LABEL_PADDING", "=", "2", ";", "public", "static", "final", "int", "HEIGHT_STEP", "=", "40", ";", "public", "static", "final", "int", "TOKEN_SPACING", "=", "15", ";", "public", "static", "final", "int", "VEDGE_OVERLAP_THRESHOLD", "=", "20", ";", "private", "final", "Java2dBackend", "backend", ";", "public", "DefaultStyler", "(", "Java2dBackend", "backend_", ")", "{", "backend", "=", "backend_", ";", "}", "public", "int", "getLabelPadding", "(", ")", "{", "return", "LABEL_PADDING", ";", "}", "public", "GraphicsBackend", ".", "Font", "getFont", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "if", "(", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "return", "backend", ".", "getFont", "(", "Font", ".", "SANS_SERIF", ",", "12", ",", "java", ".", "awt", ".", "Font", ".", "PLAIN", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "backend", ".", "getFont", "(", "Font", ".", "SANS_SERIF", ",", "15", ",", "java", ".", "awt", ".", "Font", ".", "BOLD", ")", ";", "}", "}", "public", "GraphicsBackend", ".", "Font", "getFont", "(", "Edge", "e", ")", "{", "return", "backend", ".", "getFont", "(", "Font", ".", "SANS_SERIF", ",", "10", ",", "java", ".", "awt", ".", "Font", ".", "PLAIN", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "Shape", "getShape", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "if", "(", "isQueryMatch", "(", "n", ")", ")", "{", "String", "backColorName", "=", "input", ".", "getMarkableMap", "(", ")", ".", "get", "(", "\"\"", "+", "n", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "Color", "backColor", "=", "Color", ".", "RED", ";", "try", "{", "backColor", "=", "MatchedNodeColors", ".", "valueOf", "(", "backColorName", ")", ".", "getColor", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "IllegalArgumentException", "ex", ")", "{", "}", "if", "(", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "return", "new", "Shape", ".", "Rectangle", "(", "Color", ".", "WHITE", ",", "backColor", ",", "DEFAULT_PEN_STYLE", ",", "getLabelPadding", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "new", "Shape", ".", "Ellipse", "(", "Color", ".", "WHITE", ",", "backColor", ",", "DEFAULT_PEN_STYLE", ",", "getLabelPadding", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "else", "{", "if", "(", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "return", "new", "Shape", ".", "Invisible", "(", "getLabelPadding", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "new", "Shape", ".", "Ellipse", "(", "Color", ".", "BLACK", ",", "Color", ".", "WHITE", ",", "DEFAULT_PEN_STYLE", ",", "getLabelPadding", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "boolean", "isQueryMatch", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "return", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "containsKey", "(", "Long", ".", "toString", "(", "n", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "Shape", "getShape", "(", "Edge", "e", ")", "{", "if", "(", "AnnisGraphTools", ".", "hasEdgeSubtype", "(", "e", ",", "AnnisGraphTools", ".", "SECEDGE_SUBTYPE", ",", "input", ")", ")", "{", "return", "new", "Shape", ".", "Rectangle", "(", "getEdgeColor", "(", "e", ")", ",", "Color", ".", "WHITE", ",", "DEFAULT_PEN_STYLE", ",", "getLabelPadding", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "new", "Shape", ".", "Rectangle", "(", "new", "Color", "(", "0.4f", ",", "0.4f", ",", "0.4f", ")", ",", "Color", ".", "WHITE", ",", "DEFAULT_PEN_STYLE", ",", "getLabelPadding", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "Color", "getTextBrush", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "if", "(", "isQueryMatch", "(", "n", ")", ")", "{", "return", "Color", ".", "WHITE", ";", "}", "else", "{", "return", "Color", ".", "BLACK", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "Color", "getTextBrush", "(", "Edge", "n", ")", "{", "return", "Color", ".", "BLACK", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "getHeightStep", "(", ")", "{", "return", "HEIGHT_STEP", ";", "}", "@", "Override", "public", "Color", "getEdgeColor", "(", "Edge", "e", ")", "{", "if", "(", "AnnisGraphTools", ".", "hasEdgeSubtype", "(", "e", ",", "AnnisGraphTools", ".", "SECEDGE_SUBTYPE", ",", "input", ")", ")", "{", "return", "new", "Color", "(", "0.5f", ",", "0.5f", ",", "0.8f", ",", "0.7f", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "new", "Color", "(", "0.3f", ",", "0.3f", ",", "0.3f", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "int", "getTokenSpacing", "(", ")", "{", "return", "TOKEN_SPACING", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "getVEdgeOverlapThreshold", "(", ")", "{", "return", "VEDGE_OVERLAP_THRESHOLD", ";", "}", "@", "Override", "public", "Stroke", "getStroke", "(", "Edge", "e", ")", "{", "if", "(", "AnnisGraphTools", ".", "hasEdgeSubtype", "(", "e", ",", "AnnisGraphTools", ".", "SECEDGE_SUBTYPE", ",", "input", ")", ")", "{", "return", "new", "BasicStroke", "(", "2", ",", "BasicStroke", ".", "CAP_BUTT", ",", "BasicStroke", ".", "JOIN_MITER", ",", "10", ",", "new", "float", "[", "]", "{", "2", ",", "2", "}", ",", "0", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "new", "BasicStroke", "(", "2", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "class", "DefaultLabeler", "implements", "TreeElementLabeler", "{", "@", "Override", "public", "String", "getLabel", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "if", "(", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "String", "spannedText", "=", "n", ".", "getSpannedText", "(", ")", ";", "if", "(", "spannedText", "==", "null", "||", "\"\"", ".", "equals", "(", "spannedText", ")", ")", "{", "spannedText", "=", "\"", "\"", ";", "}", "return", "spannedText", ";", "}", "else", "{", "return", "extractAnnotation", "(", "n", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ",", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"node_anno_ns\"", ",", "input", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ",", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"node_key\"", ",", "\"cat\"", ")", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "String", "getLabel", "(", "Edge", "e", ")", "{", "return", "extractAnnotation", "(", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ",", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"edge_anno_ns\"", ",", "input", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ",", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"edge_key\"", ",", "\"func\"", ")", ")", ";", "}", "private", "String", "extractAnnotation", "(", "Set", "<", "Annotation", ">", "annotations", ",", "String", "namespace", ",", "String", "featureName", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "a", ":", "annotations", ")", "{", "if", "(", "a", ".", "getNamespace", "(", ")", ".", "equals", "(", "namespace", ")", "&&", "a", ".", "getName", "(", ")", ".", "equals", "(", "featureName", ")", ")", "{", "return", "a", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "return", "\"--\"", ";", "}", "}", "public", "TigerTreeVisualizer", "(", ")", "{", "backend", "=", "new", "Java2dBackend", "(", ")", ";", "labeler", "=", "new", "DefaultLabeler", "(", ")", ";", "styler", "=", "new", "DefaultStyler", "(", "backend", ")", ";", "graphtools", "=", "new", "AnnisGraphTools", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"tree\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "OutputStream", "outstream", ")", "{", "this", ".", "input", "=", "input", ";", "AnnisResult", "result", "=", "input", ".", "getResult", "(", ")", ";", "List", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "layouts", "=", "new", "LinkedList", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "(", ")", ";", "double", "width", "=", "0", ";", "double", "maxheight", "=", "0", ";", "for", "(", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", "g", ":", "graphtools", ".", "getSyntaxGraphs", "(", "input", ")", ")", "{", "ConstituentLayouter", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "cl", "=", "new", "ConstituentLayouter", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "(", "g", ",", "backend", ",", "labeler", ",", "styler", ",", "input", ")", ";", "AbstractImageGraphicsItem", "item", "=", "cl", ".", "createLayout", "(", "new", "LayoutOptions", "(", "VerticalOrientation", ".", "TOP_ROOT", ",", "AnnisGraphTools", ".", "detectLayoutDirection", "(", "result", ".", "getGraph", "(", ")", ")", ")", ")", ";", "Rectangle2D", "treeSize", "=", "item", ".", "getBounds", "(", ")", ";", "maxheight", "=", "Math", ".", "max", "(", "maxheight", ",", "treeSize", ".", "getHeight", "(", ")", ")", ";", "width", "+=", "treeSize", ".", "getWidth", "(", ")", ";", "layouts", ".", "add", "(", "item", ")", ";", "}", "BufferedImage", "image", "=", "new", "BufferedImage", "(", "(", "int", ")", "(", "width", "+", "(", "layouts", ".", "size", "(", ")", "-", "1", ")", "*", "TREE_DISTANCE", "+", "2", "*", "SIDE_MARGIN", ")", ",", "(", "int", ")", "(", "maxheight", "+", "2", "*", "TOP_MARGIN", ")", ",", "BufferedImage", ".", "TYPE_INT_ARGB", ")", ";", "Graphics2D", "canvas", "=", "createCanvas", "(", "image", ")", ";", "double", "xOffset", "=", "SIDE_MARGIN", ";", "for", "(", "AbstractImageGraphicsItem", "item", ":", "layouts", ")", "{", "AffineTransform", "t", "=", "canvas", ".", "getTransform", "(", ")", ";", "Rectangle2D", "bounds", "=", "item", ".", "getBounds", "(", ")", ";", "canvas", ".", "translate", "(", "xOffset", ",", "TOP_MARGIN", "+", "maxheight", "-", "bounds", ".", "getHeight", "(", ")", ")", ";", "renderTree", "(", "item", ",", "canvas", ")", ";", "xOffset", "+=", "bounds", ".", "getWidth", "(", ")", "+", "TREE_DISTANCE", ";", "canvas", ".", "setTransform", "(", "t", ")", ";", "}", "try", "{", "ImageIO", ".", "write", "(", "image", ",", "\"png\"", ",", "outstream", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "e", ")", "{", "throw", "new", "RuntimeException", "(", "e", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "renderTree", "(", "AbstractImageGraphicsItem", "item", ",", "Graphics2D", "canvas", ")", "{", "List", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "allItems", "=", "new", "ArrayList", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "(", ")", ";", "item", ".", "getAllChildren", "(", "allItems", ")", ";", "Collections", ".", "sort", "(", "allItems", ",", "new", "Comparator", "<", "AbstractImageGraphicsItem", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "AbstractImageGraphicsItem", "o1", ",", "AbstractImageGraphicsItem", "o2", ")", "{", "return", "o1", ".", "getZValue", "(", ")", "-", "o2", ".", "getZValue", "(", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "for", "(", "AbstractImageGraphicsItem", "c", ":", "allItems", ")", "{", "c", ".", "draw", "(", "canvas", ")", ";", "}", "}", "private", "Graphics2D", "createCanvas", "(", "BufferedImage", "image", ")", "{", "Graphics2D", "canvas", "=", "(", "Graphics2D", ")", "image", ".", "getGraphics", "(", ")", ";", "canvas", ".", "setRenderingHint", "(", "RenderingHints", ".", "KEY_TEXT_ANTIALIASING", ",", "RenderingHints", ".", "VALUE_TEXT_ANTIALIAS_ON", ")", ";", "canvas", ".", "setRenderingHint", "(", "RenderingHints", ".", "KEY_ANTIALIASING", ",", "RenderingHints", ".", "VALUE_ANTIALIAS_ON", ")", ";", "canvas", ".", "setRenderingHint", "(", "RenderingHints", ".", "KEY_RENDERING", ",", "RenderingHints", ".", "VALUE_RENDER_QUALITY", ")", ";", "canvas", ".", "setRenderingHint", "(", "RenderingHints", ".", "KEY_STROKE_CONTROL", ",", "RenderingHints", ".", "VALUE_STROKE_PURE", ")", ";", "return", "canvas", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getContentType", "(", ")", "{", "return", "\"image/png\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getCharacterEncoding", "(", ")", "{", "return", "\"ISO-8859-1\"", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "GraphicsBackend", ".", "Font", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Color", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Stroke", ";", "public", "interface", "TreeElementStyler", "{", "Font", "getFont", "(", "AnnisNode", "n", ")", ";", "Font", "getFont", "(", "Edge", "e", ")", ";", "Color", "getTextBrush", "(", "AnnisNode", "n", ")", ";", "Color", "getTextBrush", "(", "Edge", "n", ")", ";", "Color", "getEdgeColor", "(", "Edge", "n", ")", ";", "Stroke", "getStroke", "(", "Edge", "n", ")", ";", "Shape", "getShape", "(", "AnnisNode", "n", ")", ";", "Shape", "getShape", "(", "Edge", "e", ")", ";", "int", "getLabelPadding", "(", ")", ";", "int", "getHeightStep", "(", ")", ";", "int", "getTokenSpacing", "(", ")", ";", "int", "getVEdgeOverlapThreshold", "(", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnotationGraph", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "edu", ".", "uci", ".", "ics", ".", "jung", ".", "graph", ".", "DirectedGraph", ";", "import", "edu", ".", "uci", ".", "ics", ".", "jung", ".", "graph", ".", "DirectedSparseGraph", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "class", "AnnisGraphTools", "{", "public", "static", "final", "String", "PRIMEDGE_SUBTYPE", "=", "\"edge\"", ";", "public", "static", "final", "String", "SECEDGE_SUBTYPE", "=", "\"secedge\"", ";", "public", "List", "<", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", ">", "getSyntaxGraphs", "(", "VisualizerInput", "input", ")", "{", "AnnotationGraph", "ag", "=", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ";", "String", "namespace", "=", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"node_ns\"", ",", "input", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ";", "List", "<", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", ">", "resultGraphs", "=", "new", "ArrayList", "<", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "ag", ".", "getNodes", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "isRootNode", "(", "n", ",", "namespace", ",", "input", ")", ")", "{", "resultGraphs", ".", "add", "(", "extractGraph", "(", "ag", ",", "n", ",", "input", ")", ")", ";", "}", "}", "return", "resultGraphs", ";", "}", "private", "boolean", "copyNode", "(", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", "graph", ",", "AnnisNode", "n", ",", "VisualizerInput", "input", ")", "{", "boolean", "addToGraph", "=", "n", ".", "isToken", "(", ")", ";", "for", "(", "Edge", "e", ":", "n", ".", "getOutgoingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "includeEdge", "(", "e", ",", "input", ")", "&&", "copyNode", "(", "graph", ",", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ",", "input", ")", ")", "{", "addToGraph", "|=", "true", ";", "graph", ".", "addEdge", "(", "e", ",", "n", ",", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "if", "(", "addToGraph", ")", "{", "graph", ".", "addVertex", "(", "n", ")", ";", "}", "return", "addToGraph", ";", "}", "private", "boolean", "isRootNode", "(", "AnnisNode", "n", ",", "String", "namespace", ",", "VisualizerInput", "input", ")", "{", "if", "(", "!", "n", ".", "getNamespace", "(", ")", ".", "equals", "(", "namespace", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "for", "(", "Edge", "e", ":", "n", ".", "getIncomingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "hasEdgeSubtype", "(", "e", ",", "AnnisGraphTools", ".", "PRIMEDGE_SUBTYPE", ",", "input", ")", "&&", "e", ".", "getSource", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "}", "return", "true", ";", "}", "private", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", "extractGraph", "(", "AnnotationGraph", "ag", ",", "AnnisNode", "n", ",", "VisualizerInput", "input", ")", "{", "DirectedGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", "graph", "=", "new", "DirectedSparseGraph", "<", "AnnisNode", ",", "Edge", ">", "(", ")", ";", "copyNode", "(", "graph", ",", "n", ",", "input", ")", ";", "for", "(", "Edge", "e", ":", "ag", ".", "getEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "hasEdgeSubtype", "(", "e", ",", "AnnisGraphTools", ".", "SECEDGE_SUBTYPE", ",", "input", ")", "&&", "graph", ".", "containsVertex", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ")", "&&", "graph", ".", "containsVertex", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ")", ")", "{", "graph", ".", "addEdge", "(", "e", ",", "e", ".", "getSource", "(", ")", ",", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "return", "graph", ";", "}", "private", "boolean", "includeEdge", "(", "Edge", "e", ",", "VisualizerInput", "input", ")", "{", "return", "hasEdgeSubtype", "(", "e", ",", "AnnisGraphTools", ".", "PRIMEDGE_SUBTYPE", ",", "input", ")", ";", "}", "public", "static", "boolean", "hasEdgeSubtype", "(", "Edge", "e", ",", "String", "edgeSubtype", ",", "VisualizerInput", "input", ")", "{", "String", "name", "=", "e", ".", "getName", "(", ")", ";", "if", "(", "PRIMEDGE_SUBTYPE", ".", "equals", "(", "edgeSubtype", ")", ")", "{", "edgeSubtype", "=", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"edge\"", ")", "!=", "null", "?", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"edge\"", ")", ":", "PRIMEDGE_SUBTYPE", ";", "}", "if", "(", "SECEDGE_SUBTYPE", ".", "equals", "(", "edgeSubtype", ")", ")", "{", "edgeSubtype", "=", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"secedge\"", ")", "!=", "null", "?", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"secedge\"", ")", ":", "SECEDGE_SUBTYPE", ";", "}", "return", "e", ".", "getEdgeType", "(", ")", "==", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "DOMINANCE", "&&", "name", "!=", "null", "&&", "name", ".", "equals", "(", "edgeSubtype", ")", ";", "}", "public", "static", "HorizontalOrientation", "detectLayoutDirection", "(", "AnnotationGraph", "ag", ")", "{", "int", "withHebrew", "=", "0", ";", "for", "(", "AnnisNode", "token", ":", "ag", ".", "getTokens", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "isHebrewToken", "(", "token", ".", "getSpannedText", "(", ")", ")", ")", "{", "withHebrew", "+=", "1", ";", "}", "}", "return", "(", "withHebrew", ">", "ag", ".", "getTokens", "(", ")", ".", "size", "(", ")", "/", "3", ")", "?", "HorizontalOrientation", ".", "RIGHT_TO_LEFT", ":", "HorizontalOrientation", ".", "LEFT_TO_RIGHT", ";", "}", "private", "static", "boolean", "isHebrewToken", "(", "String", "text", ")", "{", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "text", ".", "length", "(", ")", ";", "++", "i", ")", "{", "char", "c", "=", "text", ".", "charAt", "(", "i", ")", ";", "if", "(", "(", "c", ">=", "0x0590", "&&", "c", "<=", "0x06f9", ")", "||", "(", "c", ">=", "0xfb1e", "&&", "c", "<=", "0xfdff", ")", "||", "(", "c", ">=", "0xfe70", "&&", "c", "<=", "0xfeff", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "return", "false", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "graph", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MatchedNodeColors", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "AbstractDotVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "DotGraphVisualizer", "extends", "AbstractDotVisualizer", "{", "private", "VisualizerInput", "input", ";", "private", "int", "scale", "=", "50", ";", "private", "StringBuilder", "dot", ";", "private", "boolean", "displayAllNamespaces", "=", "false", ";", "private", "String", "requiredNodeNS", ";", "private", "String", "requiredEdgeNS", ";", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"dot_vis\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "createDotContent", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "StringBuilder", "sb", ")", "{", "this", ".", "input", "=", "input", ";", "displayAllNamespaces", "=", "Boolean", ".", "parseBoolean", "(", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"all_ns\"", ",", "\"false\"", ")", ")", ";", "requiredNodeNS", "=", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"node_ns\"", ",", "input", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ";", "requiredEdgeNS", "=", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"edge_ns\"", ",", "input", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "requiredEdgeNS", "==", "null", "&&", "requiredNodeNS", "==", "null", ")", "{", "displayAllNamespaces", "=", "true", ";", "}", "dot", "=", "sb", ";", "internalCreateDot", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "internalCreateDot", "(", ")", "{", "w", "(", "\"digraph", "G", "{n\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "List", "<", "AnnisNode", ">", "token", "=", "new", "LinkedList", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getNodes", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "token", ".", "add", "(", "n", ")", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "testNode", "(", "n", ")", ")", "{", "writeNode", "(", "n", ")", ";", "}", "}", "}", "w", "(", "\"t{n\"", "+", "\"trank=max;n\"", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "tok", ":", "token", ")", "{", "w", "(", "\"t\"", ")", ";", "writeNode", "(", "tok", ")", ";", "}", "writeInvisibleTokenEdges", "(", "token", ")", ";", "w", "(", "\"t}n\"", ")", ";", "for", "(", "Edge", "e", ":", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", "!=", "null", "&&", "testEdge", "(", "e", ")", ")", "{", "writeEdge", "(", "e", ")", ";", "}", "}", "w", "(", "\"}\"", ")", ";", "}", "private", "void", "w", "(", "String", "s", ")", "{", "dot", ".", "append", "(", "s", ")", ";", "}", "private", "void", "w", "(", "long", "l", ")", "{", "dot", ".", "append", "(", "l", ")", ";", "}", "private", "boolean", "testNode", "(", "AnnisNode", "node", ")", "{", "if", "(", "displayAllNamespaces", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "if", "(", "requiredNodeNS", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "node", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "requiredNodeNS", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "node", ".", "getEdgeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "requiredNodeNS", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "}", "return", "false", ";", "}", "private", "void", "writeNode", "(", "AnnisNode", "node", ")", "{", "w", "(", "\"t\"", ")", ";", "w", "(", "node", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\"", "[", "\"", ")", ";", "w", "(", "\"label=\\\"\"", ")", ";", "appendLabel", "(", "node", ")", ";", "appendNodeAnnotations", "(", "node", ")", ";", "w", "(", "\"\\\",", "\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "w", "(", "\"fillcolor=\\\"\"", ")", ";", "String", "colorAsString", "=", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "Long", ".", "toString", "(", "node", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ";", "if", "(", "colorAsString", "!=", "null", ")", "{", "MatchedNodeColors", "color", "=", "MatchedNodeColors", ".", "valueOf", "(", "colorAsString", ")", ";", "w", "(", "color", ".", "getHTMLColor", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "w", "(", "\"#ffffff\"", ")", ";", "}", "w", "(", "\"\\\"", "\"", ")", ";", "w", "(", "\"];n\"", ")", ";", "}", "private", "void", "writeInvisibleTokenEdges", "(", "List", "<", "AnnisNode", ">", "token", ")", "{", "Collections", ".", "sort", "(", "token", ",", "new", "Comparator", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "AnnisNode", "o1", ",", "AnnisNode", "o2", ")", "{", "return", "o1", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ".", "compareTo", "(", "o2", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "AnnisNode", "lastTok", "=", "null", ";", "for", "(", "AnnisNode", "tok", ":", "token", ")", "{", "if", "(", "lastTok", "!=", "null", ")", "{", "w", "(", "\"tt\"", ")", ";", "w", "(", "lastTok", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\"", "->", "\"", ")", ";", "w", "(", "tok", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "lastTok", "=", "tok", ";", "}", "}", "private", "void", "appendLabel", "(", "AnnisNode", "node", ")", "{", "if", "(", "node", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "w", "(", "node", ".", "getSpannedText", "(", ")", ".", "replace", "(", "\"\\\"\"", ",", "\"\\\\\\\"\"", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "w", "(", "node", ".", "getQualifiedName", "(", ")", ")", ";", "}", "w", "(", "\"\\\\n\"", ")", ";", "}", "private", "void", "appendNodeAnnotations", "(", "AnnisNode", "node", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "node", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "displayAllNamespaces", "||", "requiredNodeNS", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ")", "{", "w", "(", "\"\\\\n\"", ")", ";", "w", "(", "anno", ".", "getQualifiedName", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\"=\"", ")", ";", "w", "(", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ".", "replace", "(", "\"\\\"\"", ",", "\"\\\\\\\"\"", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "boolean", "testEdge", "(", "Edge", "edge", ")", "{", "if", "(", "displayAllNamespaces", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "if", "(", "requiredEdgeNS", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "edge", ".", "getAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "requiredEdgeNS", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "return", "false", ";", "}", "private", "void", "writeEdge", "(", "Edge", "edge", ")", "{", "w", "(", "\"t\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", "+", "(", "edge", ".", "getSource", "(", ")", "==", "null", "?", "\"null\"", ":", "edge", ".", "getSource", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ";", "w", "(", "\"", "->", "\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", "+", "(", "edge", ".", "getDestination", "(", ")", "==", "null", "?", "\"null\"", ":", "edge", ".", "getDestination", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ";", "w", "(", "\"", "[\"", ")", ";", "if", "(", "edge", ".", "getEdgeType", "(", ")", "==", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "POINTING_RELATION", ")", "{", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "edge", ".", "getEdgeType", "(", ")", "==", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "COVERAGE", ")", "{", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "w", "(", "\"label=\\\"\"", ")", ";", "w", "(", "edge", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\".\"", ")", ";", "w", "(", "edge", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\"\\\\n\"", ")", ";", "Iterator", "<", "Annotation", ">", "itAnno", "=", "edge", ".", "getAnnotations", "(", ")", ".", "iterator", "(", ")", ";", "while", "(", "itAnno", ".", "hasNext", "(", ")", ")", "{", "Annotation", "anno", "=", "itAnno", ".", "next", "(", ")", ";", "w", "(", "anno", ".", "getQualifiedName", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\"=\"", ")", ";", "w", "(", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "itAnno", ".", "hasNext", "(", ")", ")", "{", "w", "(", "\"\\\\n\"", ")", ";", "}", "}", "w", "(", "\"\\\"\"", ")", ";", "w", "(", "\"];n\"", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "graph", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "AbstractDotVisualizer", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "resources", ".", "dot", ".", "Salt2DOT", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "File", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "io", ".", "FileUtils", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "emf", ".", "common", ".", "util", ".", "URI", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "DebugVisualizer", "extends", "AbstractDotVisualizer", "implements", "Serializable", "{", "private", "final", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "DebugVisualizer", ".", "class", ")", ";", "@", "Override", "public", "void", "createDotContent", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "StringBuilder", "sb", ")", "{", "try", "{", "File", "tmpFile", "=", "File", ".", "createTempFile", "(", "\"\"", ",", "\".dot\"", ")", ";", "tmpFile", ".", "deleteOnExit", "(", ")", ";", "Salt2DOT", "converter", "=", "new", "Salt2DOT", "(", ")", ";", "converter", ".", "salt2Dot", "(", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ",", "URI", ".", "createFileURI", "(", "tmpFile", ".", "getCanonicalPath", "(", ")", ")", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "FileUtils", ".", "readFileToString", "(", "tmpFile", ")", ")", ";", "if", "(", "!", "tmpFile", ".", "delete", "(", ")", ")", "{", "log", ".", "warn", "(", "\"\"", "+", "tmpFile", ".", "getAbsolutePath", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"dot\"", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "gridtree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "WriterVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnotationGraph", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collections", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "GridTreeVisualizer", "extends", "WriterVisualizer", "{", "final", "private", "String", "PROPERTY_KEY", "=", "\"node_key\"", ";", "private", "VisualizerInput", "input", ";", "private", "class", "Span", "implements", "Comparable", "<", "Span", ">", "{", "Long", "left", ";", "Long", "right", ";", "AnnisNode", "root", ";", "String", "anno", ";", "int", "height", ";", "long", "offset", ";", "public", "Span", "(", "AnnisNode", "root", ",", "long", "offset", ",", "int", "length", ",", "String", "anno", ")", "{", "this", ".", "root", "=", "root", ";", "this", ".", "offset", "=", "offset", ";", "this", ".", "anno", "=", "anno", ";", "left", "=", "(", "root", ".", "getLeftToken", "(", ")", "<", "offset", ")", "?", "offset", ":", "root", ".", "getLeftToken", "(", ")", ";", "right", "=", "(", "root", ".", "getRightToken", "(", ")", ">", "offset", "+", "length", ")", "?", "offset", "+", "length", ":", "root", ".", "getRightToken", "(", ")", ";", "calculateHeight", "(", "root", ",", "0", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "compareTo", "(", "Span", "sp", ")", "{", "if", "(", "this", ".", "height", ">", "sp", ".", "height", ")", "{", "return", "1", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "height", "==", "sp", ".", "height", ")", "{", "if", "(", "this", ".", "left", ">", "sp", ".", "right", ")", "{", "return", "1", ";", "}", "else", "{", "return", "-", "1", ";", "}", "}", "return", "-", "1", ";", "}", "private", "void", "calculateHeight", "(", "AnnisNode", "current", ",", "int", "height", ")", "{", "if", "(", "current", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "Edge", "incoming", ":", "current", ".", "getIncomingEdges", "(", ")", ")", "{", "AnnisNode", "tmp", "=", "incoming", ".", "getSource", "(", ")", ";", "if", "(", "hasAnno", "(", "tmp", ",", "anno", ")", ")", "{", "calculateHeight", "(", "tmp", ",", "height", "+", "1", ")", ";", "}", "calculateHeight", "(", "tmp", ",", "height", ")", ";", "}", "}", "this", ".", "height", "=", "Math", ".", "max", "(", "this", ".", "height", ",", "height", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "return", "super", ".", "equals", "(", "obj", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "return", "super", ".", "hashCode", "(", ")", ";", "}", "public", "void", "colspan", "(", "StringBuilder", "sb", ",", "String", "anno", ")", "{", "String", "annoValue", "=", "getAnnoValue", "(", "this", ".", "root", ",", "anno", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "Math", ".", "abs", "(", "this", ".", "right", "-", "this", ".", "left", ")", "+", "1", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "this", ".", "hashCode", "(", ")", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\":\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "left", "+", "1", "-", "offset", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"-\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "right", "+", "1", "-", "offset", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\\\"", "title=\\\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "anno", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"=\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "annoValue", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ".", "append", "(", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "Long", ".", "toString", "(", "this", ".", "root", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ")", ".", "append", "(", "\"\\\">\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "annoValue", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"</td>\"", ")", ";", "}", "public", "boolean", "isInIntervall", "(", "long", "l", ")", "{", "if", "(", "this", ".", "left", "<=", "l", "&&", "l", "<=", "this", ".", "right", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "return", "false", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"grid_tree\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "Writer", "writer", ")", "{", "ArrayList", "<", "Span", ">", "spans", "=", "new", "ArrayList", "<", "GridTreeVisualizer", ".", "Span", ">", "(", ")", ";", "this", ".", "input", "=", "input", ";", "try", "{", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"partitur.css\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"gridtree.css\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "findAnnotation", "(", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ",", "input", ",", "spans", ")", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"</table>n\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "e", ")", "{", "}", "}", "private", "String", "findAnnotation", "(", "AnnotationGraph", "graph", ",", "VisualizerInput", "input", ",", "ArrayList", "<", "Span", ">", "spans", ")", "{", "List", "<", "AnnisNode", ">", "nodes", "=", "graph", ".", "getNodes", "(", ")", ";", "List", "<", "AnnisNode", ">", "result", "=", "graph", ".", "getTokens", "(", ")", ";", "StringBuilder", "sb", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "String", "anno", "=", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "PROPERTY_KEY", ")", ";", "anno", "=", "(", "anno", "==", "null", ")", "?", "\"cat\"", ":", "anno", ";", "anno", "=", "input", ".", "getNamespace", "(", ")", "+", "\":\"", "+", "anno", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "nodes", ")", "{", "if", "(", "hasAnno", "(", "n", ",", "anno", ")", ")", "{", "Span", "tmp", "=", "new", "Span", "(", "n", ",", "result", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ",", "result", ".", "size", "(", ")", ",", "anno", ")", ";", "spans", ".", "add", "(", "tmp", ")", ";", "}", "}", "Collections", ".", "sort", "(", "spans", ")", ";", "htmlTableRow", "(", "sb", ",", "result", ",", "spans", ",", "anno", ")", ";", "htmlTableRow", "(", "sb", ",", "result", ")", ";", "return", "sb", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", ";", "private", "String", "getAnnoValue", "(", "AnnisNode", "n", ",", "String", "anno", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "a", ":", "n", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "a", ".", "getQualifiedName", "(", ")", ".", "equals", "(", "anno", ")", ")", "{", "return", "a", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "return", "null", ";", "}", "private", "boolean", "hasAnno", "(", "AnnisNode", "n", ",", "String", "annotation", ")", "{", "if", "(", "n", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "for", "(", "Annotation", "x", ":", "n", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "x", ".", "getQualifiedName", "(", ")", ".", "equals", "(", "annotation", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "return", "false", ";", "}", "private", "void", "htmlTableRow", "(", "StringBuilder", "sb", ",", "List", "<", "AnnisNode", ">", "result", ",", "ArrayList", "<", "Span", ">", "spans", ",", "String", "anno", ")", "{", "int", "j", "=", "0", ";", "while", "(", "j", "<", "spans", ".", "size", "(", ")", ")", "{", "Span", "tmp", "=", "spans", ".", "get", "(", "j", ")", ";", "int", "level", "=", "tmp", ".", "height", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "level", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"</th>\"", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "result", ".", "size", "(", ")", ";", "i", "++", ")", "{", "if", "(", "j", "<", "spans", ".", "size", "(", ")", ")", "{", "tmp", "=", "spans", ".", "get", "(", "j", ")", ";", "}", "long", "index", "=", "i", "+", "result", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ";", "if", "(", "tmp", ".", "isInIntervall", "(", "index", ")", "&&", "level", "==", "tmp", ".", "height", ")", "{", "tmp", ".", "colspan", "(", "sb", ",", "anno", ")", ";", "i", "+=", "Math", ".", "abs", "(", "tmp", ".", "right", "-", "tmp", ".", "left", ")", ";", "j", "++", ";", "}", "else", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"<td></td>\"", ")", ";", "}", "}", "sb", ".", "append", "(", "\"</tr>n\"", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "htmlTableRow", "(", "StringBuilder", "sb", ",", "List", "<", "AnnisNode", ">", "result", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"<tr>n\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "result", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"<td>\"", ")", ".", "append", "(", "n", ".", "getSpannedText", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "\"</td>\"", ")", ";", "}", "sb", ".", "append", "(", "\"</tr>n\"", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "partitur", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnotationGraph", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "public", "class", "PartiturParser", "implements", "Serializable", "{", "private", "List", "<", "Token", ">", "token", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "knownTiers", ";", "private", "HashMap", "<", "String", ",", "String", ">", "tier2ns", ";", "private", "TreeSet", "<", "String", ">", "nameslist", ";", "private", "List", "<", "List", "<", "ResultElement", ">", ">", "resultlist", ";", "public", "PartiturParser", "(", "AnnotationGraph", "graph", ",", "String", "namespace", ")", "{", "resultlist", "=", "new", "LinkedList", "<", "List", "<", "ResultElement", ">", ">", "(", ")", ";", "nameslist", "=", "new", "TreeSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "graph", ".", "getTokens", "(", ")", ")", "{", "List", "<", "ResultElement", ">", "helper", "=", "new", "LinkedList", "<", "ResultElement", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "Edge", "edge", ":", "n", ".", "getIncomingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "edge", ".", "getEdgeType", "(", ")", "==", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "COVERAGE", ")", "{", "AnnisNode", "parentNode", "=", "edge", ".", "getSource", "(", ")", ";", "if", "(", "parentNode", ".", "getNamespace", "(", ")", ".", "equals", "(", "namespace", ")", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "parentNode", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "String", "newId", "=", "\"\"", "+", "parentNode", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"_\"", "+", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", "+", "\"_\"", "+", "anno", ".", "getName", "(", ")", ";", "helper", ".", "add", "(", "new", "ResultElement", "(", "newId", ",", "parentNode", ".", "getId", "(", ")", ",", "anno", ".", "getName", "(", ")", ",", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ")", ")", ";", "if", "(", "!", "nameslist", ".", "contains", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "nameslist", ".", "add", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "resultlist", ".", "add", "(", "helper", ")", ";", "}", "token", "=", "new", "LinkedList", "<", "Token", ">", "(", ")", ";", "knownTiers", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "tier2ns", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "graph", ".", "getTokens", "(", ")", ")", "{", "long", "tokenID", "=", "n", ".", "getId", "(", ")", ";", "Token", "currentToken", "=", "new", "Token", "(", "tokenID", ",", "new", "Hashtable", "<", "String", ",", "Event", ">", "(", ")", ",", "n", ".", "getSpannedText", "(", ")", ")", ";", "token", ".", "add", "(", "currentToken", ")", ";", "for", "(", "Edge", "edge", ":", "n", ".", "getIncomingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "edge", ".", "getEdgeType", "(", ")", "==", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "COVERAGE", ")", "{", "AnnisNode", "parentNode", "=", "edge", ".", "getSource", "(", ")", ";", "if", "(", "parentNode", ".", "getNamespace", "(", ")", ".", "equals", "(", "namespace", ")", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "parentNode", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "Event", "newEvent", "=", "new", "Event", "(", "parentNode", ".", "getId", "(", ")", ",", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "currentToken", ".", "getTier2Event", "(", ")", ".", "put", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ",", "newEvent", ")", ";", "knownTiers", ".", "add", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "tier2ns", ".", "put", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ",", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "Iterator", "<", "Token", ">", "it", "=", "token", ".", "iterator", "(", ")", ";", "Token", "current", "=", "it", ".", "hasNext", "(", ")", "?", "it", ".", "next", "(", ")", ":", "null", ";", "Token", "next", "=", "it", ".", "hasNext", "(", ")", "?", "it", ".", "next", "(", ")", ":", "null", ";", "Token", "last", "=", "null", ";", "while", "(", "current", "!=", "null", ")", "{", "current", ".", "setBefore", "(", "last", ")", ";", "current", ".", "setAfter", "(", "next", ")", ";", "last", "=", "current", ";", "current", "=", "next", ";", "next", "=", "it", ".", "hasNext", "(", ")", "?", "it", ".", "next", "(", ")", ":", "null", ";", "}", "}", "public", "TreeSet", "<", "String", ">", "getNameslist", "(", ")", "{", "return", "nameslist", ";", "}", "public", "List", "<", "List", "<", "ResultElement", ">", ">", "getResultlist", "(", ")", "{", "return", "resultlist", ";", "}", "public", "Set", "<", "String", ">", "getKnownTiers", "(", ")", "{", "return", "knownTiers", ";", "}", "public", "String", "namespaceForTier", "(", "String", "tier", ")", "{", "return", "tier2ns", ".", "get", "(", "tier", ")", ";", "}", "public", "List", "<", "Token", ">", "getToken", "(", ")", "{", "return", "token", ";", "}", "public", "static", "class", "Token", "implements", "Serializable", "{", "private", "Map", "<", "String", ",", "Event", ">", "tier2Event", ";", "private", "long", "id", ";", "private", "String", "value", ";", "private", "Token", "before", ";", "private", "Token", "after", ";", "public", "Token", "(", "long", "id", ",", "Map", "<", "String", ",", "Event", ">", "tier2Event", ",", "String", "value", ")", "{", "this", ".", "tier2Event", "=", "tier2Event", ";", "this", ".", "id", "=", "id", ";", "this", ".", "value", "=", "value", ";", "before", "=", "null", ";", "after", "=", "null", ";", "}", "public", "Map", "<", "String", ",", "Event", ">", "getTier2Event", "(", ")", "{", "return", "tier2Event", ";", "}", "public", "long", "getId", "(", ")", "{", "return", "id", ";", "}", "public", "Token", "getAfter", "(", ")", "{", "return", "after", ";", "}", "public", "void", "setAfter", "(", "Token", "after", ")", "{", "this", ".", "after", "=", "after", ";", "}", "public", "Token", "getBefore", "(", ")", "{", "return", "before", ";", "}", "public", "void", "setBefore", "(", "Token", "before", ")", "{", "this", ".", "before", "=", "before", ";", "}", "public", "String", "getValue", "(", ")", "{", "return", "value", ";", "}", "}", "public", "static", "class", "Event", "implements", "Serializable", "{", "private", "long", "id", ";", "private", "String", "value", ";", "public", "Event", "(", "long", "id", ",", "String", "value", ")", "{", "this", ".", "id", "=", "id", ";", "this", ".", "value", "=", "value", ";", "}", "public", "long", "getId", "(", ")", "{", "return", "id", ";", "}", "public", "String", "getValue", "(", ")", "{", "return", "value", ";", "}", "}", "public", "static", "class", "ResultElement", "implements", "Serializable", "{", "private", "String", "id", ";", "private", "long", "nodeId", ";", "private", "String", "name", ",", "value", ";", "public", "String", "getName", "(", ")", "{", "return", "name", ";", "}", "public", "String", "getId", "(", ")", "{", "return", "id", ";", "}", "public", "String", "getValue", "(", ")", "{", "return", "value", ";", "}", "public", "long", "getNodeId", "(", ")", "{", "return", "nodeId", ";", "}", "ResultElement", "(", "String", "id", ",", "long", "nodeId", ",", "String", "name", ",", "String", "value", ")", "{", "this", ".", "id", "=", "id", ";", "this", ".", "nodeId", "=", "nodeId", ";", "this", ".", "name", "=", "name", ";", "this", ".", "value", "=", "value", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "partitur", ";", "import", "annis", ".", "CommonHelper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "WriterVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisToken", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collections", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Iterator", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedHashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringEscapeUtils", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "PartiturVisualizer", "extends", "WriterVisualizer", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "PartiturVisualizer", ".", "class", ")", ";", "private", "List", "<", "AnnisNode", ">", "nodes", ";", "private", "List", "<", "AnnisNode", ">", "token", ";", "public", "enum", "ElementType", "{", "begin", ",", "end", ",", "middle", ",", "single", ",", "noEvent", "}", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"iframegrid\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "Writer", "writer", ")", "{", "try", "{", "nodes", "=", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getNodes", "(", ")", ";", "token", "=", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getTokens", "(", ")", ";", "PartiturParser", "partitur", "=", "new", "PartiturParser", "(", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ",", "input", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ";", "boolean", "isRTL", "=", "checkRTL", "(", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getTokenList", "(", ")", ")", ";", "List", "<", "String", ">", "tierNames", "=", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", "partitur", ".", "getKnownTiers", "(", ")", ")", ";", "Collections", ".", "sort", "(", "tierNames", ")", ";", "LinkedHashSet", "<", "String", ">", "keys", "=", "new", "LinkedHashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "String", "mapping", "=", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"annos\"", ")", ";", "if", "(", "mapping", "==", "null", ")", "{", "keys", ".", "addAll", "(", "partitur", ".", "getNameslist", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "String", "[", "]", "splitted", "=", "mapping", ".", "split", "(", "\",\"", ")", ";", "for", "(", "int", "k", "=", "0", ";", "k", "<", "splitted", ".", "length", ";", "k", "++", ")", "{", "String", "s", "=", "splitted", "[", "k", "]", ".", "trim", "(", ")", ";", "if", "(", "partitur", ".", "getNameslist", "(", ")", ".", "contains", "(", "s", ")", ")", "{", "keys", ".", "add", "(", "s", ")", ";", "}", "}", "}", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"jbar.css\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"partitur.css\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "convertToJavacSriptArray", "(", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", ")", ")", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "int", "i", "=", "0", ";", "for", "(", "String", "levelName", ":", "tierNames", ")", "{", "if", "(", "keys", ".", "contains", "(", "levelName", ")", ")", "{", "writer", ".", "append", "(", "(", "i", "++", ">", "0", "?", "\",", "\"", ":", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"\"", "+", "levelName", "+", "\"\\\"\"", ")", ";", "}", "}", "writer", ".", "append", "(", "\"];n</script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"</head>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<body>n\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "isRTL", ")", "{", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "else", "{", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "for", "(", "String", "tier", ":", "keys", ")", "{", "List", "<", "String", ">", "indexlist", "=", "new", "ArrayList", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "List", "<", "PartiturParser", ".", "ResultElement", ">", "span", ":", "partitur", ".", "getResultlist", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "PartiturParser", ".", "ResultElement", "strr", ":", "span", ")", "{", "if", "(", "strr", ".", "getName", "(", ")", ".", "equals", "(", "tier", ")", "&&", "!", "indexlist", ".", "contains", "(", "strr", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "indexlist", ".", "add", "(", "strr", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "String", "[", "]", "currentarray", ";", "while", "(", "!", "indexlist", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "List", "<", "String", ">", "currentdontuselist", "=", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "tier", "+", "\"\\\"><th>\"", "+", "tier", "+", "\"</th>\"", ")", ";", "currentarray", "=", "new", "String", "[", "partitur", ".", "getResultlist", "(", ")", ".", "size", "(", ")", "]", ";", "for", "(", "int", "iterator3", "=", "0", ";", "iterator3", "<", "partitur", ".", "getResultlist", "(", ")", ".", "size", "(", ")", ";", "iterator3", "++", ")", "{", "currentarray", "[", "iterator3", "]", "=", "null", ";", "}", "int", "spanCounter", "=", "0", ";", "for", "(", "List", "<", "PartiturParser", ".", "ResultElement", ">", "span", ":", "partitur", ".", "getResultlist", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "PartiturParser", ".", "ResultElement", "annotationelement", ":", "span", ")", "{", "if", "(", "indexlist", ".", "contains", "(", "annotationelement", ".", "getId", "(", ")", ")", "&&", "!", "currentdontuselist", ".", "contains", "(", "annotationelement", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "boolean", "neu", "=", "false", ";", "if", "(", "currentarray", "[", "spanCounter", "]", "==", "null", ")", "{", "indexlist", ".", "remove", "(", "annotationelement", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "currentarray", "[", "spanCounter", "]", "=", "annotationelement", ".", "getId", "(", ")", ";", "neu", "=", "true", ";", "}", "int", "span2Counter", "=", "0", ";", "for", "(", "List", "<", "PartiturParser", ".", "ResultElement", ">", "span2", ":", "partitur", ".", "getResultlist", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "PartiturParser", ".", "ResultElement", "strr2", ":", "span2", ")", "{", "if", "(", "strr2", ".", "getId", "(", ")", ".", "equals", "(", "annotationelement", ".", "getId", "(", ")", ")", "&&", "neu", ")", "{", "if", "(", "currentarray", "[", "span2Counter", "]", "==", "null", ")", "{", "currentarray", "[", "span2Counter", "]", "=", "annotationelement", ".", "getId", "(", ")", ";", "}", "}", "if", "(", "span2Counter", "<=", "spanCounter", "&&", "!", "currentdontuselist", ".", "contains", "(", "strr2", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "currentdontuselist", ".", "add", "(", "strr2", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "span2Counter", "++", ";", "}", "}", "}", "spanCounter", "++", ";", "}", "int", "length", "=", "1", ";", "for", "(", "int", "iterator5", "=", "0", ";", "iterator5", "<", "currentarray", ".", "length", ";", "iterator5", "+=", "length", ")", "{", "StringBuffer", "tokenIdsArray", "=", "new", "StringBuffer", "(", ")", ";", "StringBuffer", "eventIdsArray", "=", "new", "StringBuffer", "(", ")", ";", "boolean", "unused", "=", "true", ";", "length", "=", "1", ";", "if", "(", "currentarray", "[", "iterator5", "]", "==", "null", ")", "{", "writer", ".", "append", "(", "\"<td></td>\"", ")", ";", "}", "else", "{", "PartiturParser", ".", "ResultElement", "element", "=", "null", ";", "HashSet", "<", "Integer", ">", "common", "=", "new", "HashSet", "<", "Integer", ">", "(", ")", ";", "boolean", "found", "=", "false", ";", "int", "outputSpanCounter", "=", "0", ";", "for", "(", "List", "<", "PartiturParser", ".", "ResultElement", ">", "outputSpan", ":", "partitur", ".", "getResultlist", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "PartiturParser", ".", "ResultElement", "strr", ":", "outputSpan", ")", "{", "if", "(", "strr", ".", "getId", "(", ")", ".", "equals", "(", "currentarray", "[", "iterator5", "]", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "found", ")", "{", "element", "=", "strr", ";", "}", "if", "(", "!", "common", ".", "contains", "(", "outputSpanCounter", ")", ")", "{", "common", ".", "add", "(", "outputSpanCounter", ")", ";", "}", "found", "=", "true", ";", "if", "(", "unused", ")", "{", "tokenIdsArray", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "strr", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"_\"", "+", "outputSpanCounter", ")", ";", "eventIdsArray", ".", "append", "(", "tier", "+", "\"_\"", "+", "strr", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"_\"", "+", "outputSpanCounter", ")", ";", "unused", "=", "false", ";", "}", "else", "{", "tokenIdsArray", ".", "append", "(", "\",\"", "+", "strr", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"_\"", "+", "outputSpanCounter", ")", ";", "eventIdsArray", ".", "append", "(", "\",\"", "+", "tier", "+", "\"_\"", "+", "strr", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"_\"", "+", "outputSpanCounter", ")", ";", "}", "}", "}", "outputSpanCounter", "++", ";", "}", "for", "(", "int", "iterator7", "=", "iterator5", "+", "1", ";", "iterator7", "<", "currentarray", ".", "length", ";", "iterator7", "++", ")", "{", "if", "(", "common", ".", "contains", "(", "iterator7", ")", ")", "{", "length", "++", ";", "}", "else", "{", "break", ";", "}", "}", "for", "(", "int", "iterator8", "=", "0", ";", "iterator8", "<", "currentarray", ".", "length", ";", "iterator8", "++", ")", "{", "if", "(", "common", ".", "contains", "(", "iterator8", ")", ")", "{", "Long", "id", "=", "(", "(", "PartiturParser", ".", "Token", ")", "partitur", ".", "getToken", "(", ")", ".", "toArray", "(", ")", "[", "iterator8", "]", ")", ".", "getId", "(", ")", ";", "if", "(", "unused", ")", "{", "tokenIdsArray", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "id", ")", ";", "eventIdsArray", ".", "append", "(", "tier", "+", "\"_\"", "+", "id", ")", ";", "unused", "=", "false", ";", "}", "else", "{", "tokenIdsArray", ".", "append", "(", "\",\"", "+", "id", ")", ";", "eventIdsArray", ".", "append", "(", "\",\"", "+", "tier", "+", "\"_\"", "+", "id", ")", ";", "}", "}", "}", "String", "color", "=", "\"black\"", ";", "if", "(", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "containsKey", "(", "\"\"", "+", "element", ".", "getNodeId", "(", ")", ")", ")", "{", "color", "=", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "\"\"", "+", "element", ".", "getNodeId", "(", ")", ")", ";", "}", "if", "(", "found", ")", "{", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "\"id=\\\"event_\"", "+", "tier", "+", "\"_\"", "+", "element", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"_\"", "+", "iterator5", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "\"\"", "+", "color", "+", "\";\\\"", "\"", "+", "\"colspan=\"", "+", "length", "+", "\"", "\"", "+", "\"\"", "+", "tokenIdsArray", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "\"\"", "+", "eventIdsArray", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "\"title=\\\"\"", "+", "partitur", ".", "namespaceForTier", "(", "tier", ")", "+", "\":\"", "+", "tier", "+", "\"", "=", "\"", "+", "StringEscapeUtils", ".", "escapeXml", "(", "element", ".", "getValue", "(", ")", ")", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "addTimeAttribute", "(", "element", ".", "getNodeId", "(", ")", ")", "+", "\">\"", "+", "element", ".", "getValue", "(", ")", "+", "\"</td>\"", ")", ";", "}", "else", "{", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "}", "}", "writer", ".", "append", "(", "\"</tr>\"", ")", ";", "}", "}", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "for", "(", "PartiturParser", ".", "Token", "token", ":", "partitur", ".", "getToken", "(", ")", ")", "{", "String", "color", "=", "\"black\"", ";", "if", "(", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "containsKey", "(", "\"\"", "+", "token", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "color", "=", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "\"\"", "+", "token", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "}", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "color", "+", "\";\\\"", "\"", "+", "\"id=\\\"token_\"", "+", "token", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "\">\"", "+", "token", ".", "getValue", "(", ")", "+", "\"</td>\"", ")", ";", "}", "writer", ".", "append", "(", "\"</tr>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"</table>n\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"</div>n\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "try", "{", "String", "annisLine", "=", "\"\"", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "ex", ".", "getStackTrace", "(", ")", ".", "length", ";", "i", "++", ")", "{", "if", "(", "ex", ".", "getStackTrace", "(", ")", "[", "i", "]", ".", "getClassName", "(", ")", ".", "startsWith", "(", "\"annis.\"", ")", ")", "{", "annisLine", "=", "ex", ".", "getStackTrace", "(", ")", "[", "i", "]", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "}", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getClass", "(", ")", ".", "getName", "(", ")", "+", "\"):", "\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", "+", "\"<br/>\"", "+", "annisLine", "+", "\"\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex1", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex1", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "ElementType", "getTypeForToken", "(", "PartiturParser", ".", "Token", "token", ",", "String", "tier", ")", "{", "PartiturParser", ".", "Token", "beforeToken", "=", "token", ".", "getBefore", "(", ")", ";", "PartiturParser", ".", "Token", "afterToken", "=", "token", ".", "getAfter", "(", ")", ";", "PartiturParser", ".", "Event", "event", "=", "token", ".", "getTier2Event", "(", ")", ".", "get", "(", "tier", ")", ";", "if", "(", "event", "!=", "null", ")", "{", "PartiturParser", ".", "Event", "beforeEvent", "=", "beforeToken", "==", "null", "?", "null", ":", "beforeToken", ".", "getTier2Event", "(", ")", ".", "get", "(", "tier", ")", ";", "PartiturParser", ".", "Event", "afterEvent", "=", "afterToken", "==", "null", "?", "null", ":", "afterToken", ".", "getTier2Event", "(", ")", ".", "get", "(", "tier", ")", ";", "boolean", "left", "=", "false", ";", "boolean", "right", "=", "false", ";", "if", "(", "beforeEvent", "!=", "null", "&&", "beforeEvent", ".", "getId", "(", ")", "==", "event", ".", "getId", "(", ")", ")", "{", "left", "=", "true", ";", "}", "if", "(", "afterEvent", "!=", "null", "&&", "afterEvent", ".", "getId", "(", ")", "==", "event", ".", "getId", "(", ")", ")", "{", "right", "=", "true", ";", "}", "if", "(", "left", "&&", "right", ")", "{", "return", "ElementType", ".", "middle", ";", "}", "else", "if", "(", "left", ")", "{", "return", "ElementType", ".", "end", ";", "}", "else", "if", "(", "right", ")", "{", "return", "ElementType", ".", "begin", ";", "}", "else", "{", "return", "ElementType", ".", "single", ";", "}", "}", "return", "ElementType", ".", "noEvent", ";", "}", "private", "boolean", "checkRTL", "(", "List", "<", "AnnisToken", ">", "tokenList", ")", "{", "Iterator", "<", "AnnisToken", ">", "itToken", "=", "tokenList", ".", "listIterator", "(", ")", ";", "while", "(", "itToken", ".", "hasNext", "(", ")", ")", "{", "AnnisToken", "tok", "=", "itToken", ".", "next", "(", ")", ";", "String", "tokText", "=", "tok", ".", "getText", "(", ")", ";", "if", "(", "CommonHelper", ".", "containsRTLText", "(", "tokText", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "return", "false", ";", "}", "private", "String", "convertToJavacSriptArray", "(", "List", "<", "String", ">", "mediaIDs", ")", "{", "if", "(", "mediaIDs", "==", "null", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "StringBuilder", "sb", "=", "new", "StringBuilder", "(", "\"\"", ")", ";", "int", "size", "=", "mediaIDs", ".", "size", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "size", ";", "i", "++", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"\\\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "mediaIDs", ".", "get", "(", "i", ")", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\\\"\"", ")", ";", "if", "(", "!", "(", "size", "-", "1", "-", "i", "==", "0", ")", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\",", "\"", ")", ";", "}", "}", "return", "sb", ".", "append", "(", "\"", "];n\"", ")", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "private", "String", "addTimeAttribute", "(", "long", "nodeId", ")", "{", "DetectHoles", "detectHoles", "=", "new", "DetectHoles", "(", "token", ")", ";", "AnnisNode", "root", "=", "null", ";", "TimeHelper", "t", "=", "new", "TimeHelper", "(", "token", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "nodes", ")", "{", "if", "(", "n", ".", "getId", "(", ")", "==", "nodeId", ")", "{", "root", "=", "n", ";", "break", ";", "}", "}", "AnnisNode", "leftNode", "=", "detectHoles", ".", "getLeftBorder", "(", "root", ")", ";", "AnnisNode", "rightNode", "=", "detectHoles", ".", "getRightBorder", "(", "root", ")", ";", "return", "t", ".", "getTimeAnno", "(", "leftNode", ",", "rightNode", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "partitur", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "public", "class", "DetectHoles", "{", "private", "List", "<", "AnnisNode", ">", "token", ";", "public", "DetectHoles", "(", "List", "<", "AnnisNode", ">", "token", ")", "{", "this", ".", "token", "=", "token", ";", "}", "public", "AnnisNode", "getLeftBorder", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "AnnisNode", "tmp", "=", "null", ";", "for", "(", "AnnisNode", "tok", ":", "token", ")", "{", "if", "(", "n", ".", "getLeftToken", "(", ")", "==", "tok", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ")", "{", "return", "tok", ";", "}", "if", "(", "n", ".", "getLeftToken", "(", ")", "<=", "tok", ".", "getTokenIndex", "(", ")", "&&", "tmp", "==", "null", ")", "{", "tmp", "=", "tok", ";", "}", "}", "return", "tmp", ";", "}", "public", "AnnisNode", "getRightBorder", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "AnnisNode", "tmp", "=", "null", ";", "for", "(", "AnnisNode", "tok", ":", "token", ")", "{", "if", "(", "n", ".", "getRightToken", "(", ")", "==", "tok", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ")", "{", "return", "tok", ";", "}", "if", "(", "tok", ".", "getTokenIndex", "(", ")", "<=", "n", ".", "getRightToken", "(", ")", ")", "{", "tmp", "=", "tok", ";", "}", "}", "return", "tmp", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "partitur", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "public", "class", "TimeHelper", "{", "private", "List", "<", "AnnisNode", ">", "token", ";", "public", "TimeHelper", "(", ")", "{", "}", "public", "TimeHelper", "(", "List", "<", "AnnisNode", ">", "token", ")", "{", "this", ".", "token", "=", "token", ";", "}", "public", "String", "getStartTime", "(", "String", "time", ")", "{", "return", "getTimePosition", "(", "time", ",", "true", ")", ";", "}", "public", "String", "getEndTime", "(", "String", "time", ")", "{", "return", "getTimePosition", "(", "time", ",", "false", ")", ";", "}", "private", "String", "getTimePosition", "(", "String", "time", ",", "boolean", "first", ")", "{", "if", "(", "time", "==", "null", ")", "{", "return", "\"undefined\"", ";", "}", "String", "[", "]", "splittedTimeAnno", "=", "time", ".", "split", "(", "\"-\"", ")", ";", "if", "(", "splittedTimeAnno", ".", "length", ">", "1", ")", "{", "if", "(", "first", ")", "{", "return", "splittedTimeAnno", "[", "0", "]", ".", "equals", "(", "\"\"", ")", "?", "\"undefined\"", ":", "splittedTimeAnno", "[", "0", "]", ";", "}", "else", "{", "return", "splittedTimeAnno", "[", "1", "]", ".", "equals", "(", "\"\"", ")", "?", "\"undefined\"", ":", "splittedTimeAnno", "[", "1", "]", ";", "}", "}", "if", "(", "first", ")", "{", "return", "splittedTimeAnno", "[", "0", "]", ".", "equals", "(", "\"\"", ")", "?", "\"undefined\"", ":", "splittedTimeAnno", "[", "0", "]", ";", "}", "return", "\"undefined\"", ";", "}", "String", "getTimeAnnotation", "(", "AnnisNode", "node", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "node", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ".", "equals", "(", "\"time\"", ")", ")", "{", "return", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "return", "\"\"", ";", "}", "public", "String", "getTimeAnno", "(", "AnnisNode", "leftNode", ",", "AnnisNode", "rightNode", ")", "{", "String", "startTime", "=", "getStartTime", "(", "getTimeAnnotation", "(", "leftNode", ")", ")", ";", "String", "endTime", "=", "getEndTime", "(", "getTimeAnnotation", "(", "rightNode", ")", ")", ";", "if", "(", "\"undefined\"", ".", "equals", "(", "startTime", ")", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "if", "(", "\"undefined\"", ".", "equals", "(", "endTime", ")", ")", "{", "endTime", "=", "getNextEndTime", "(", "rightNode", ")", ";", "}", "return", "(", "\"time=\\\"\"", "+", "startTime", "+", "\"-\"", "+", "endTime", "+", "\"\\\"\"", ")", ";", "}", "private", "String", "getNextEndTime", "(", "AnnisNode", "rightNode", ")", "{", "int", "offset", "=", "getOffset", "(", "rightNode", ")", ";", "String", "time", "=", "null", ";", "TimeHelper", "t", "=", "null", ";", "for", "(", "long", "i", "=", "offset", "+", "1", ";", "i", "<", "token", ".", "size", "(", ")", ";", "i", "++", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "token", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "i", ")", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"time\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "time", "=", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ";", "break", ";", "}", "}", "String", "startTime", "=", "getStartTime", "(", "time", ")", ";", "String", "endTime", "=", "getEndTime", "(", "time", ")", ";", "if", "(", "startTime", "!=", "null", "&&", "!", "\"undefined\"", ".", "equals", "(", "startTime", ")", ")", "{", "return", "startTime", ";", "}", "if", "(", "endTime", "!=", "null", "&&", "!", "\"undefined\"", ".", "equals", "(", "endTime", ")", ")", "{", "return", "endTime", ";", "}", "}", "return", "\"undefined\"", ";", "}", "private", "int", "getOffset", "(", "AnnisNode", "rightNode", ")", "{", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "token", ".", "size", "(", ")", ";", "i", "++", ")", "{", "if", "(", "rightNode", "==", "token", ".", "get", "(", "i", ")", ")", "{", "return", "i", ";", "}", "}", "return", "0", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "AbstractIFrameVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "logging", ".", "Level", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "logging", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "abstract", "class", "WriterVisualizer", "extends", "AbstractIFrameVisualizer", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "WriterVisualizer", ".", "class", ")", ";", "@", "Override", "public", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "OutputStream", "outstream", ")", "{", "try", "{", "OutputStreamWriter", "writer", "=", "new", "OutputStreamWriter", "(", "outstream", ",", "getCharacterEncoding", "(", ")", ")", ";", "writeOutput", "(", "input", ",", "writer", ")", ";", "writer", ".", "flush", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "StringWriter", "strWriter", "=", "new", "StringWriter", "(", ")", ";", "ex", ".", "printStackTrace", "(", "new", "PrintWriter", "(", "strWriter", ")", ")", ";", "try", "{", "outstream", ".", "write", "(", "strWriter", ".", "toString", "(", ")", ".", "getBytes", "(", "\"UTF-8\"", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex1", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "abstract", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "Writer", "writer", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "dependency", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "WriterVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResult", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "org", ".", "json", ".", "JSONException", ";", "import", "org", ".", "json", ".", "JSONObject", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "VakyarthaDependencyTree", "extends", "WriterVisualizer", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "VakyarthaDependencyTree", ".", "class", ")", ";", "private", "Writer", "theWriter", ";", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "Writer", "writer", ")", "{", "theWriter", "=", "writer", ";", "try", "{", "AnnisResult", "result", "=", "input", ".", "getResult", "(", ")", ";", "println", "(", "\"<html>\"", ")", ";", "println", "(", "\"<head>\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"fcolors={};\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "HashMap", "<", "Long", ",", "Integer", ">", "id2pos", "=", "new", "HashMap", "<", "Long", ",", "Integer", ">", "(", ")", ";", "int", "counter", "=", "0", ";", "for", "(", "AnnisNode", "tok", ":", "result", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getTokens", "(", ")", ")", "{", "id2pos", ".", "put", "(", "tok", ".", "getId", "(", ")", ",", "counter", ")", ";", "counter", "++", ";", "}", "counter", "=", "0", ";", "for", "(", "AnnisNode", "tok", ":", "result", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getTokens", "(", ")", ")", "{", "JSONObject", "o", "=", "new", "JSONObject", "(", ")", ";", "o", ".", "put", "(", "\"t\"", ",", "tok", ".", "getSpannedText", "(", ")", ")", ";", "JSONObject", "govs", "=", "new", "JSONObject", "(", ")", ";", "Set", "<", "Edge", ">", "edges", "=", "tok", ".", "getIncomingEdges", "(", ")", ";", "for", "(", "Edge", "e", ":", "edges", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getEdgeType", "(", ")", "==", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "POINTING_RELATION", ")", "{", "String", "label", "=", "\"\"", ";", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", "!=", "null", "&&", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ")", "{", "label", "=", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ";", "break", ";", "}", "}", "if", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", "==", "null", ")", "{", "govs", ".", "put", "(", "\"root\"", ",", "label", ")", ";", "}", "else", "{", "govs", ".", "put", "(", "\"\"", "+", "id2pos", ".", "get", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ",", "label", ")", ";", "}", "}", "}", "o", ".", "put", "(", "\"govs\"", ",", "govs", ")", ";", "JSONObject", "attris", "=", "new", "JSONObject", "(", ")", ";", "JSONObject", "tAttris", "=", "new", "JSONObject", "(", ")", ";", "String", "tokenColor", "=", "\"black\"", ";", "if", "(", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "containsKey", "(", "\"\"", "+", "tok", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "tokenColor", "=", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "\"\"", "+", "tok", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "}", "tAttris", ".", "put", "(", "\"fill\"", ",", "tokenColor", ")", ";", "tAttris", ".", "put", "(", "\"font\"", ",", "\"\"", ")", ";", "attris", ".", "put", "(", "\"t\"", ",", "tAttris", ")", ";", "o", ".", "put", "(", "\"attris\"", ",", "attris", ")", ";", "theWriter", ".", "append", "(", "\"tokens[\"", ")", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "counter", ")", ".", "append", "(", "\"]=\"", ")", ";", "theWriter", ".", "append", "(", "o", ".", "toString", "(", ")", ".", "replaceAll", "(", "\"n\"", ",", "\"", "\"", ")", ")", ";", "theWriter", ".", "append", "(", "\";n\"", ")", ";", "counter", "++", ";", "}", "println", "(", "\"</script>\"", ")", ";", "println", "(", "\"</head>\"", ")", ";", "println", "(", "\"<body>\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"</body>\"", ")", ";", "println", "(", "\"</html>\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "JSONException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "println", "(", "String", "s", ")", "throws", "IOException", "{", "println", "(", "s", ",", "0", ")", ";", "}", "private", "void", "println", "(", "String", "s", ",", "int", "indent", ")", "throws", "IOException", "{", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "indent", ";", "i", "++", ")", "{", "theWriter", ".", "append", "(", "\"t\"", ")", ";", "}", "theWriter", ".", "append", "(", "s", ")", ";", "theWriter", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "dependency", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MatchedNodeColors", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "AbstractDotVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "ProielRegularDependencyTree", "extends", "AbstractDotVisualizer", "{", "private", "VisualizerInput", "input", ";", "private", "StringBuilder", "dot", ";", "private", "List", "<", "AnnisNode", ">", "realToken", ";", "private", "List", "<", "AnnisNode", ">", "pseudoToken", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "alreadyWrittenEdge", ";", "private", "Random", "rand", "=", "new", "Random", "(", ")", ";", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "createDotContent", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "StringBuilder", "sb", ")", "{", "this", ".", "dot", "=", "sb", ";", "this", ".", "input", "=", "input", ";", "w", "(", "\"digraph", "G", "{n\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "realToken", "=", "new", "LinkedList", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", ";", "pseudoToken", "=", "new", "LinkedList", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", ";", "alreadyWrittenEdge", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "writeAllRealToken", "(", ")", ";", "writeAllPseudoToken", "(", ")", ";", "writeAllTokenConnections", "(", ")", ";", "writeAllDepEdges", "(", ")", ";", "w", "(", "\"}\"", ")", ";", "}", "private", "void", "writeAllRealToken", "(", ")", "{", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getTokens", "(", ")", ")", "{", "realToken", ".", "add", "(", "n", ")", ";", "writeToken", "(", "n", ")", ";", "}", "writeInvisibleTokenEdges", "(", "realToken", ")", ";", "w", "(", "\"", "}n\"", ")", ";", "}", "private", "void", "writeAllPseudoToken", "(", ")", "{", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getNodes", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "n", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "boolean", "isDepNode", "=", "false", ";", "String", "word", "=", "null", ";", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "n", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"tiger\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", "&&", "\"word\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "isDepNode", "=", "true", ";", "word", "=", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ";", "break", ";", "}", "}", "if", "(", "isDepNode", ")", "{", "writeNode", "(", "n", ")", ";", "pseudoToken", ".", "add", "(", "n", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "private", "void", "writeAllDepEdges", "(", ")", "{", "for", "(", "Edge", "e", ":", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", "!=", "null", "&&", "!", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "boolean", "isDepEdge", "=", "false", ";", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"tiger\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", "&&", "\"func\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "isDepEdge", "=", "true", ";", "break", ";", "}", "}", "if", "(", "isDepEdge", ")", "{", "writeEdge", "(", "e", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "private", "void", "writeAllTokenConnections", "(", ")", "{", "for", "(", "AnnisNode", "tok", ":", "pseudoToken", ")", "{", "AnnisNode", "realTok", "=", "getCorrespondingRealToken", "(", "tok", ")", ";", "if", "(", "realTok", "!=", "null", ")", "{", "w", "(", "\"\"", "+", "tok", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"", "->", "\"", "+", "realTok", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "AnnisNode", "getCorrespondingRealToken", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "if", "(", "n", "==", "null", ")", "{", "return", "null", ";", "}", "for", "(", "Edge", "e", ":", "n", ".", "getOutgoingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"tiger\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", "&&", "\"func\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", "&&", "\"--\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "return", "null", ";", "}", "private", "void", "writeInvisibleTokenEdges", "(", "List", "<", "AnnisNode", ">", "token", ")", "{", "Collections", ".", "sort", "(", "token", ",", "new", "Comparator", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "AnnisNode", "o1", ",", "AnnisNode", "o2", ")", "{", "return", "o1", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ".", "compareTo", "(", "o2", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "AnnisNode", "lastTok", "=", "null", ";", "for", "(", "AnnisNode", "tok", ":", "token", ")", "{", "if", "(", "lastTok", "!=", "null", ")", "{", "w", "(", "\"tt\"", ")", ";", "w", "(", "lastTok", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\"", "->", "\"", ")", ";", "w", "(", "tok", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "lastTok", "=", "tok", ";", "}", "}", "private", "void", "writeNode", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "String", "color", "=", "\"#000000\"", ";", "String", "shape", "=", "\"point\"", ";", "String", "colorAsString", "=", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "Long", ".", "toString", "(", "n", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ";", "if", "(", "colorAsString", "!=", "null", ")", "{", "MatchedNodeColors", "matchedColor", "=", "MatchedNodeColors", ".", "valueOf", "(", "colorAsString", ")", ";", "color", "=", "matchedColor", ".", "getHTMLColor", "(", ")", ";", "shape", "=", "\"circle\"", ";", "}", "w", "(", "\"", "\"", "+", "n", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"[shape=\\\"\"", "+", "shape", "+", "\"\\\",", "label=\\\"\\\"", "\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "w", "(", "\"fillcolor=\\\"\"", ")", ";", "w", "(", "color", ")", ";", "w", "(", "\"\\\"", "color=\\\"\"", ")", ";", "w", "(", "color", ")", ";", "w", "(", "\"\\\"", "];n\"", ")", ";", "}", "private", "void", "writeToken", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "w", "(", "\"", "\"", "+", "n", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"[label=\\\"\"", "+", "n", ".", "getSpannedText", "(", ")", "+", "\"\\\"", "\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "w", "(", "\"fillcolor=\\\"\"", ")", ";", "String", "colorAsString", "=", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "Long", ".", "toString", "(", "n", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ";", "if", "(", "colorAsString", "!=", "null", ")", "{", "MatchedNodeColors", "color", "=", "MatchedNodeColors", ".", "valueOf", "(", "colorAsString", ")", ";", "w", "(", "color", ".", "getHTMLColor", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "w", "(", "\"#ffffff\"", ")", ";", "}", "w", "(", "\"\\\"", "];n\"", ")", ";", "}", "private", "void", "writeEdge", "(", "Edge", "e", ")", "{", "AnnisNode", "srcNode", "=", "e", ".", "getSource", "(", ")", ";", "AnnisNode", "destNode", "=", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ";", "if", "(", "e", ".", "getName", "(", ")", "==", "null", "||", "srcNode", "==", "null", "||", "destNode", "==", "null", ")", "{", "return", ";", "}", "else", "{", "String", "srcId", "=", "\"\"", "+", "srcNode", ".", "getId", "(", ")", ";", "String", "destId", "=", "\"\"", "+", "destNode", ".", "getId", "(", ")", ";", "StringBuilder", "sbAnno", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "boolean", "first", "=", "true", ";", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "first", ")", "{", "sbAnno", ".", "append", "(", "\"\\\\n\"", ")", ";", "}", "first", "=", "false", ";", "sbAnno", ".", "append", "(", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "}", "String", "style", "=", "\"solid\"", ";", "if", "(", "\"secedge\"", ".", "equals", "(", "e", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "style", "=", "\"dashed\"", ";", "}", "String", "edgeString", "=", "srcId", "+", "\"", "->", "\"", "+", "destId", "+", "\"\"", "+", "sbAnno", ".", "toString", "(", ")", "+", "\"\\\"", "style=\\\"\"", "+", "style", "+", "\"\\\"];n\"", ";", "if", "(", "!", "alreadyWrittenEdge", ".", "contains", "(", "edgeString", ")", ")", "{", "w", "(", "edgeString", ")", ";", "alreadyWrittenEdge", ".", "add", "(", "edgeString", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "void", "w", "(", "String", "s", ")", "{", "dot", ".", "append", "(", "s", ")", ";", "}", "private", "void", "w", "(", "long", "l", ")", "{", "dot", ".", "append", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "dependency", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MatchedNodeColors", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "AbstractDotVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "ProielDependecyTree", "extends", "AbstractDotVisualizer", "{", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "private", "VisualizerInput", "input", ";", "private", "StringBuilder", "dot", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "alreadyWrittenEdge", ";", "@", "Override", "public", "void", "createDotContent", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "StringBuilder", "sb", ")", "{", "this", ".", "input", "=", "input", ";", "this", ".", "dot", "=", "sb", ";", "alreadyWrittenEdge", "=", "new", "HashSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "w", "(", "\"digraph", "G", "{n\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "w", "(", "\"\"", ")", ";", "writeAllNodes", "(", ")", ";", "writeAllEdges", "(", ")", ";", "w", "(", "\"}n\"", ")", ";", "}", "private", "void", "writeAllNodes", "(", ")", "{", "for", "(", "AnnisNode", "n", ":", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getNodes", "(", ")", ")", "{", "boolean", "isDepNode", "=", "false", ";", "String", "word", "=", "null", ";", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "n", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"tiger\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", "&&", "\"word\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "isDepNode", "=", "true", ";", "word", "=", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ";", "break", ";", "}", "}", "if", "(", "isDepNode", ")", "{", "writeNode", "(", "n", ",", "word", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "void", "writeAllEdges", "(", ")", "{", "for", "(", "Edge", "e", ":", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ".", "getEdges", "(", ")", ")", "{", "boolean", "isDepEdge", "=", "false", ";", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"tiger\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", "&&", "\"func\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "isDepEdge", "=", "true", ";", "break", ";", "}", "}", "if", "(", "isDepEdge", ")", "{", "writeEdge", "(", "e", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "void", "writeEdge", "(", "Edge", "e", ")", "{", "AnnisNode", "srcNode", "=", "e", ".", "getSource", "(", ")", ";", "AnnisNode", "destNode", "=", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ";", "if", "(", "e", ".", "getName", "(", ")", "==", "null", "||", "srcNode", "==", "null", "||", "destNode", "==", "null", ")", "{", "return", ";", "}", "String", "srcId", "=", "\"\"", "+", "srcNode", ".", "getId", "(", ")", ";", "String", "destId", "=", "\"\"", "+", "destNode", ".", "getId", "(", ")", ";", "StringBuilder", "sbAnno", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"func\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "if", "(", "\"--\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ")", ")", "{", "return", ";", "}", "sbAnno", ".", "append", "(", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "}", "break", ";", "}", "String", "style", "=", "null", ";", "if", "(", "\"secedge\"", ".", "equals", "(", "e", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "style", "=", "\"\"", ";", "}", "else", "{", "style", "=", "\"\"", ";", "}", "String", "edgeString", "=", "srcId", "+", "\"", "->", "\"", "+", "destId", "+", "\"[\"", "+", "style", "+", "\"", "label=\\\"\"", "+", "sbAnno", ".", "toString", "(", ")", "+", "\"\\\"]\"", ";", "if", "(", "!", "alreadyWrittenEdge", ".", "contains", "(", "edgeString", ")", ")", "{", "w", "(", "\"", "\"", "+", "edgeString", ")", ";", "alreadyWrittenEdge", ".", "add", "(", "edgeString", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "writeNode", "(", "AnnisNode", "n", ",", "String", "word", ")", "{", "String", "shape", "=", "\"box\"", ";", "String", "id", "=", "\"\"", "+", "n", ".", "getId", "(", ")", ";", "String", "fillcolor", "=", "\"#ffffff\"", ";", "String", "fontcolor", "=", "\"black\"", ";", "String", "style", "=", "\"filled\"", ";", "String", "label", "=", "\"\"", ";", "String", "posAnno", "=", "\"\"", ";", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "n", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"tiger\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", "&&", "\"pos\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", "&&", "anno", ".", "getValue", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "posAnno", "=", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "if", "(", "isEmptyNode", "(", "word", ")", ")", "{", "if", "(", "isRootNode", "(", "n", ")", ")", "{", "shape", "=", "\"circle\"", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "posAnno", ".", "length", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "switch", "(", "posAnno", ".", "charAt", "(", "0", ")", ")", "{", "case", "'V'", ":", "shape", "=", "\"circle\"", ";", "label", "=", "posAnno", ";", "break", ";", "case", "'C'", ":", "shape", "=", "\"diamond\"", ";", "label", "=", "posAnno", ";", "break", ";", "case", "'P'", ":", "shape", "=", "\"hexagon\"", ";", "label", "=", "posAnno", ";", "break", ";", "default", ":", "shape", "=", "\"circle\"", ";", "label", "=", "posAnno", ";", "break", ";", "}", "}", "}", "}", "else", "{", "if", "(", "\"C-\"", ".", "equals", "(", "posAnno", ")", ")", "{", "shape", "=", "\"diamond\"", ";", "}", "label", "=", "word", ";", "}", "String", "matchColorAsString", "=", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "Long", ".", "toString", "(", "n", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ";", "if", "(", "matchColorAsString", "==", "null", ")", "{", "AnnisNode", "token", "=", "getCorrespondingRealToken", "(", "n", ")", ";", "if", "(", "token", "!=", "null", ")", "{", "matchColorAsString", "=", "input", ".", "getMarkableExactMap", "(", ")", ".", "get", "(", "Long", ".", "toString", "(", "token", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", ";", "}", "}", "if", "(", "matchColorAsString", "!=", "null", ")", "{", "MatchedNodeColors", "matchColor", "=", "MatchedNodeColors", ".", "valueOf", "(", "matchColorAsString", ")", ";", "fillcolor", "=", "matchColor", ".", "getHTMLColor", "(", ")", ";", "}", "w", "(", "id", ")", ";", "w", "(", "\"", "[\"", ")", ";", "wAtt", "(", "\"fontcolor\"", ",", "fontcolor", ")", ";", "wAtt", "(", "\"shape\"", ",", "shape", ")", ";", "wAtt", "(", "\"fillcolor\"", ",", "fillcolor", ")", ";", "wAtt", "(", "\"style\"", ",", "style", ")", ";", "wAtt", "(", "\"label\"", ",", "label", ")", ";", "w", "(", "\"];n\"", ")", ";", "}", "private", "AnnisNode", "getCorrespondingRealToken", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "if", "(", "n", "==", "null", ")", "{", "return", "null", ";", "}", "for", "(", "Edge", "e", ":", "n", ".", "getOutgoingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "anno", ":", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "\"tiger\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", "&&", "\"func\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", "&&", "\"--\"", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getValue", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "return", "null", ";", "}", "private", "boolean", "isRootNode", "(", "AnnisNode", "node", ")", "{", "boolean", "result", "=", "true", ";", "for", "(", "Edge", "e", ":", "node", ".", "getIncomingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "result", "=", "false", ";", "break", ";", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "private", "boolean", "isEmptyNode", "(", "String", "word", ")", "{", "if", "(", "word", "==", "null", "||", "\"\"", ".", "equals", "(", "word", ")", "||", "\"--\"", ".", "equals", "(", "word", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "else", "{", "return", "false", ";", "}", "}", "private", "void", "w", "(", "String", "s", ")", "{", "dot", ".", "append", "(", "s", ")", ";", "}", "private", "void", "w", "(", "long", "l", ")", "{", "dot", ".", "append", "(", "l", ")", ";", "}", "private", "void", "wAtt", "(", "String", "key", ",", "String", "value", ")", "{", "w", "(", "key", ")", ";", "w", "(", "\"=\\\"\"", ")", ";", "w", "(", "value", ")", ";", "w", "(", "\"\\\"\"", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "dependency", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "public", "class", "Vector2", "{", "private", "long", "x", ";", "private", "long", "y", ";", "public", "Vector2", "(", "AnnisNode", "n", ")", "{", "this", ".", "x", "=", "n", ".", "getLeftToken", "(", ")", ";", "this", ".", "y", "=", "n", ".", "getRightToken", "(", ")", ";", "}", "public", "Vector2", "(", "long", "x", ",", "long", "y", ")", "{", "this", ".", "x", "=", "x", ";", "this", ".", "y", "=", "y", ";", "}", "public", "long", "getX", "(", ")", "{", "return", "x", ";", "}", "public", "void", "setX", "(", "long", "x", ")", "{", "this", ".", "x", "=", "x", ";", "}", "public", "long", "getY", "(", ")", "{", "return", "y", ";", "}", "public", "void", "setY", "(", "long", "y", ")", "{", "this", ".", "y", "=", "y", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "getClass", "(", ")", "!=", "obj", ".", "getClass", "(", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "final", "Vector2", "other", "=", "(", "Vector2", ")", "obj", ";", "if", "(", "this", ".", "x", "!=", "other", ".", "x", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "y", "!=", "other", ".", "y", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "return", "true", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "int", "hash", "=", "7", ";", "hash", "=", "83", "*", "hash", "+", "(", "int", ")", "(", "this", ".", "x", "^", "(", "this", ".", "x", ">>>", "32", ")", ")", ";", "hash", "=", "83", "*", "hash", "+", "(", "int", ")", "(", "this", ".", "y", "^", "(", "this", ".", "y", ">>>", "32", ")", ")", ";", "return", "hash", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Edge", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisToken", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnotationGraph", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResult", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "CorefVisualizer", "extends", "WriterVisualizer", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "CorefVisualizer", ".", "class", ")", ";", "VisualizerInput", "theInput", ";", "Writer", "theWriter", ";", "long", "globalIndex", ";", "List", "<", "TReferent", ">", "ReferentList", ";", "List", "<", "TComponent", ">", "Komponent", ";", "HashMap", "<", "Long", ",", "List", "<", "Long", ">", ">", "ComponentOfToken", ",", "TokensOfNode", ";", "HashMap", "<", "Long", ",", "HashMap", "<", "Long", ",", "Integer", ">", ">", "ReferentOfToken", ";", "List", "<", "Long", ">", "visitedNodes", ";", "LinkedList", "<", "TComponenttype", ">", "Componenttype", ";", "private", "HashMap", "<", "Integer", ",", "Integer", ">", "colorlist", ";", "static", "class", "TComponenttype", "{", "String", "Type", ";", "List", "<", "Long", ">", "NodeList", ";", "TComponenttype", "(", ")", "{", "Type", "=", "\"\"", ";", "NodeList", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "}", "}", "static", "class", "TComponent", "{", "List", "<", "Long", ">", "TokenList", ";", "String", "Type", ";", "TComponent", "(", ")", "{", "TokenList", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "Type", "=", "\"\"", ";", "}", "TComponent", "(", "List", "<", "Long", ">", "ll", ",", "String", "t", ")", "{", "TokenList", "=", "ll", ";", "Type", "=", "t", ";", "}", "}", "static", "class", "TReferent", "{", "Set", "<", "Annotation", ">", "Annotations", ";", "long", "Component", ";", "TReferent", "(", ")", "{", "Component", "=", "-", "1", ";", "Annotations", "=", "new", "HashSet", "<", "Annotation", ">", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"discourse\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "isUsingText", "(", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "Writer", "writer", ")", "{", "this", ".", "theInput", "=", "input", ";", "this", ".", "theWriter", "=", "writer", ";", "try", "{", "println", "(", "\"<html>\"", ")", ";", "println", "(", "\"<head>\"", ")", ";", "println", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "theInput", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", "+", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "println", "(", "\"<link", "href=\\\"\"", "+", "theInput", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", "+", "theInput", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", "+", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "println", "(", "\"</head>\"", ")", ";", "println", "(", "\"<body>\"", ")", ";", "globalIndex", "=", "0", ";", "int", "toolTipMaxLineCount", "=", "1", ";", "TokensOfNode", "=", "new", "HashMap", "<", "Long", ",", "List", "<", "Long", ">", ">", "(", ")", ";", "ReferentList", "=", "new", "LinkedList", "<", "TReferent", ">", "(", ")", ";", "Komponent", "=", "new", "LinkedList", "<", "TComponent", ">", "(", ")", ";", "ReferentOfToken", "=", "new", "HashMap", "<", "Long", ",", "HashMap", "<", "Long", ",", "Integer", ">", ">", "(", ")", ";", "ComponentOfToken", "=", "new", "HashMap", "<", "Long", ",", "List", "<", "Long", ">", ">", "(", ")", ";", "Componenttype", "=", "new", "LinkedList", "<", "TComponenttype", ">", "(", ")", ";", "AnnisResult", "anResult", "=", "input", ".", "getResult", "(", ")", ";", "AnnotationGraph", "anGraph", "=", "anResult", ".", "getGraph", "(", ")", ";", "if", "(", "anGraph", "==", "null", ")", "{", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "return", ";", "}", "List", "<", "Edge", ">", "edgeList", "=", "anGraph", ".", "getEdges", "(", ")", ";", "if", "(", "edgeList", "==", "null", ")", "{", "return", ";", "}", "for", "(", "Edge", "e", ":", "edgeList", ")", "{", "if", "(", "includeEdge", "(", "e", ")", ")", "{", "visitedNodes", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "boolean", "gotIt", "=", "false", ";", "int", "Componentnr", ";", "for", "(", "Componentnr", "=", "0", ";", "Componentnr", "<", "Componenttype", ".", "size", "(", ")", ";", "Componentnr", "++", ")", "{", "if", "(", "Componenttype", ".", "get", "(", "Componentnr", ")", "!=", "null", "&&", "Componenttype", ".", "get", "(", "Componentnr", ")", ".", "Type", "!=", "null", "&&", "Componenttype", ".", "get", "(", "Componentnr", ")", ".", "NodeList", "!=", "null", "&&", "Componenttype", ".", "get", "(", "Componentnr", ")", ".", "Type", ".", "equals", "(", "e", ".", "getName", "(", ")", ")", "&&", "Componenttype", ".", "get", "(", "Componentnr", ")", ".", "NodeList", ".", "contains", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "gotIt", "=", "true", ";", "break", ";", "}", "}", "TComponent", "currentComponent", ";", "TComponenttype", "currentComponenttype", ";", "if", "(", "gotIt", ")", "{", "currentComponent", "=", "Komponent", ".", "get", "(", "Componentnr", ")", ";", "currentComponenttype", "=", "Componenttype", ".", "get", "(", "Componentnr", ")", ";", "}", "else", "{", "currentComponenttype", "=", "new", "TComponenttype", "(", ")", ";", "currentComponenttype", ".", "Type", "=", "e", ".", "getName", "(", ")", ";", "Componenttype", ".", "add", "(", "currentComponenttype", ")", ";", "Componentnr", "=", "Komponent", ".", "size", "(", ")", ";", "currentComponent", "=", "new", "TComponent", "(", ")", ";", "currentComponent", ".", "Type", "=", "e", ".", "getName", "(", ")", ";", "currentComponent", ".", "TokenList", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "Komponent", ".", "add", "(", "currentComponent", ")", ";", "currentComponenttype", ".", "NodeList", ".", "add", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "}", "TReferent", "Ref", "=", "new", "TReferent", "(", ")", ";", "Ref", ".", "Annotations", "=", "e", ".", "getAnnotations", "(", ")", ";", "Ref", ".", "Component", "=", "Componentnr", ";", "ReferentList", ".", "add", "(", "Ref", ")", ";", "List", "<", "Long", ">", "currentTokens", "=", "getAllTokens", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ",", "e", ".", "getName", "(", ")", ",", "currentComponenttype", ",", "Componentnr", ")", ";", "setReferent", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ",", "globalIndex", ",", "0", ")", ";", "setReferent", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ",", "globalIndex", ",", "1", ")", ";", "for", "(", "Long", "l", ":", "currentTokens", ")", "{", "if", "(", "!", "currentComponent", ".", "TokenList", ".", "contains", "(", "l", ")", ")", "{", "currentComponent", ".", "TokenList", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "globalIndex", "++", ";", "}", "}", "colorlist", "=", "new", "HashMap", "<", "Integer", ",", "Integer", ">", "(", ")", ";", "List", "<", "Long", ">", "prevpositions", ",", "listpositions", ";", "List", "<", "Long", ">", "finalpositions", "=", "null", ";", "int", "maxlinkcount", "=", "0", ";", "Long", "lastId", "=", "null", ",", "currentId", "=", "null", ";", "for", "(", "AnnisToken", "tok", ":", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getTokenList", "(", ")", ")", "{", "prevpositions", "=", "finalpositions", ";", "if", "(", "prevpositions", "!=", "null", "&&", "prevpositions", ".", "size", "(", ")", "<", "1", ")", "{", "prevpositions", "=", "null", ";", "}", "lastId", "=", "currentId", ";", "currentId", "=", "tok", ".", "getId", "(", ")", ";", "listpositions", "=", "ComponentOfToken", ".", "get", "(", "currentId", ")", ";", "List", "<", "Boolean", ">", "checklist", "=", "null", ";", "if", "(", "prevpositions", "==", "null", "&&", "listpositions", "!=", "null", ")", "{", "finalpositions", "=", "listpositions", ";", "}", "else", "if", "(", "listpositions", "==", "null", ")", "{", "finalpositions", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "}", "else", "{", "checklist", "=", "new", "LinkedList", "<", "Boolean", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "prevpositions", ".", "size", "(", ")", ";", "i", "++", ")", "{", "if", "(", "listpositions", ".", "contains", "(", "prevpositions", ".", "get", "(", "i", ")", ")", ")", "{", "checklist", ".", "add", "(", "true", ")", ";", "}", "else", "{", "checklist", ".", "add", "(", "false", ")", ";", "}", "}", "List", "<", "Long", ">", "remains", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "listpositions", ".", "size", "(", ")", ";", "i", "++", ")", "{", "if", "(", "!", "prevpositions", ".", "contains", "(", "listpositions", ".", "get", "(", "i", ")", ")", ")", "{", "remains", ".", "add", "(", "listpositions", ".", "get", "(", "i", ")", ")", ";", "}", "}", "int", "minsize", "=", "checklist", ".", "size", "(", ")", "+", "remains", ".", "size", "(", ")", ";", "int", "number", "=", "0", ";", "finalpositions", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "minsize", ";", "i", "++", ")", "{", "if", "(", "checklist", ".", "size", "(", ")", ">", "i", "&&", "checklist", ".", "get", "(", "i", ")", ".", "booleanValue", "(", ")", ")", "{", "finalpositions", ".", "add", "(", "prevpositions", ".", "get", "(", "i", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "remains", ".", "size", "(", ")", ">", "number", ")", "{", "Long", "ll", "=", "remains", ".", "get", "(", "number", ")", ";", "finalpositions", ".", "add", "(", "ll", ")", ";", "number", "++", ";", "minsize", "--", ";", "}", "else", "{", "finalpositions", ".", "add", "(", "Long", ".", "MIN_VALUE", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "String", "onclick", "=", "\"\"", ",", "style", "=", "\"\"", ";", "if", "(", "input", ".", "getMarkableMap", "(", ")", ".", "containsKey", "(", "\"\"", "+", "tok", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "style", "+=", "\"color:red;", "\"", ";", "}", "boolean", "underline", "=", "false", ";", "if", "(", "!", "finalpositions", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "style", "+=", "\"\"", ";", "underline", "=", "true", ";", "onclick", "=", "\"\"", ";", "}", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "int", "currentlinkcount", "=", "0", ";", "if", "(", "underline", ")", "{", "boolean", "firstone", "=", "true", ";", "int", "index", "=", "-", "1", ";", "String", "tooltip", "=", "\"\"", ";", "if", "(", "!", "finalpositions", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "Long", "currentPositionComponent", ":", "finalpositions", ")", "{", "index", "++", ";", "String", "left", "=", "\"\"", ",", "right", "=", "\"\"", ";", "List", "<", "Long", ">", "pi", ";", "TComponent", "currentWriteComponent", "=", "null", ";", "String", "currentType", "=", "\"\"", ";", "if", "(", "!", "currentPositionComponent", ".", "equals", "(", "Long", ".", "MIN_VALUE", ")", "&&", "Komponent", ".", "size", "(", ")", ">", "currentPositionComponent", ")", "{", "currentWriteComponent", "=", "Komponent", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "currentPositionComponent", ")", ";", "pi", "=", "currentWriteComponent", ".", "TokenList", ";", "currentType", "=", "currentWriteComponent", ".", "Type", ";", "left", "=", "ListToString", "(", "pi", ")", ";", "right", "=", "\"\"", "+", "currentPositionComponent", "+", "1", ";", "}", "String", "Annotations", "=", "getAnnotations", "(", "tok", ".", "getId", "(", ")", ",", "currentPositionComponent", ")", ";", "if", "(", "firstone", ")", "{", "firstone", "=", "false", ";", "if", "(", "currentWriteComponent", "==", "null", ")", "{", "String", "left2", "=", "\"\"", ",", "right2", "=", "\"\"", ";", "List", "<", "Long", ">", "pi2", ";", "long", "pr", "=", "0", ";", "TComponent", "currentWriteComponent2", "=", "null", ";", "String", "currentType2", "=", "\"\"", ";", "String", "Annotations2", "=", "\"\"", ";", "for", "(", "Long", "currentPositionComponent2", ":", "finalpositions", ")", "{", "if", "(", "!", "currentPositionComponent2", ".", "equals", "(", "Long", ".", "MIN_VALUE", ")", "&&", "Komponent", ".", "size", "(", ")", ">", "currentPositionComponent2", ")", "{", "currentWriteComponent2", "=", "Komponent", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "currentPositionComponent2", ")", ";", "pi2", "=", "currentWriteComponent2", ".", "TokenList", ";", "currentType2", "=", "currentWriteComponent2", ".", "Type", ";", "left2", "=", "ListToString", "(", "pi2", ")", ";", "right2", "=", "\"\"", "+", "currentPositionComponent2", "+", "1", ";", "Annotations2", "=", "getAnnotations", "(", "tok", ".", "getId", "(", ")", ",", "currentPositionComponent2", ")", ";", "pr", "=", "currentPositionComponent2", ";", "break", ";", "}", "}", "tooltip", "=", "\"\"", "+", "(", "pr", "+", "1", ")", "+", "\"\"", "+", "currentType2", "+", "Annotations2", "+", "\"\\\"\"", ";", "if", "(", "tooltip", ".", "length", "(", ")", "/", "40", "+", "1", ">", "toolTipMaxLineCount", ")", "{", "toolTipMaxLineCount", "=", "tooltip", ".", "length", "(", ")", "/", "40", "+", "1", ";", "}", "println", "(", "\"\"", "+", "tok", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "tooltip", "+", "\"", "style=\\\"\"", "+", "style", "+", "\"\\\"", "onclick=\\\"\"", "+", "onclick", "+", "\"\"", "+", "left2", "+", "\"\"", "+", "right2", "+", "\"\\\"", ">", "&nbsp;\"", "+", "tok", ".", "getText", "(", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "}", "else", "{", "tooltip", "=", "\"\"", "+", "(", "currentPositionComponent", "+", "1", ")", "+", "\"\"", "+", "currentType", "+", "Annotations", "+", "\"\\\"\"", ";", "if", "(", "tooltip", ".", "length", "(", ")", "/", "40", "+", "1", ">", "toolTipMaxLineCount", ")", "{", "toolTipMaxLineCount", "=", "tooltip", ".", "length", "(", ")", "/", "40", "+", "1", ";", "}", "println", "(", "\"\"", "+", "tok", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "tooltip", "+", "\"", "style=\\\"\"", "+", "style", "+", "\"\\\"", "onclick=\\\"\"", "+", "onclick", "+", "\"\"", "+", "left", "+", "\"\"", "+", "right", "+", "\"\\\"", ">", "&nbsp;\"", "+", "tok", ".", "getText", "(", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "}", "}", "currentlinkcount", "++", ";", "if", "(", "currentPositionComponent", ".", "equals", "(", "Long", ".", "MIN_VALUE", ")", ")", "{", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "else", "{", "int", "color", "=", "0", ";", "if", "(", "colorlist", ".", "containsKey", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "currentPositionComponent", ")", ")", "{", "color", "=", "colorlist", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "currentPositionComponent", ")", ";", "}", "else", "{", "color", "=", "getNewColor", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "currentPositionComponent", ")", ";", "colorlist", ".", "put", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "currentPositionComponent", ",", "color", ")", ";", "}", "if", "(", "color", ">", "16777215", ")", "{", "color", "=", "16777215", ";", "}", "String", "addition", "=", "\"\"", ";", "if", "(", "lastId", "!=", "null", "&&", "currentId", "!=", "null", "&&", "checklist", "!=", "null", "&&", "checklist", ".", "size", "(", ")", ">", "index", "&&", "checklist", ".", "get", "(", "index", ")", ".", "booleanValue", "(", ")", "==", "true", ")", "{", "if", "(", "connectionOf", "(", "lastId", ",", "currentId", ",", "currentPositionComponent", ")", ")", "{", "addition", "=", "\"\"", ";", "}", "}", "tooltip", "=", "\"\"", "+", "(", "currentPositionComponent", "+", "1", ")", "+", "\"\"", "+", "currentType", "+", "Annotations", "+", "\"\\\"\"", ";", "if", "(", "tooltip", ".", "length", "(", ")", "/", "40", "+", "1", ">", "toolTipMaxLineCount", ")", "{", "toolTipMaxLineCount", "=", "tooltip", ".", "length", "(", ")", "/", "40", "+", "1", ";", "}", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", "+", "\"", "style=\\\"\"", "+", "style", "+", "addition", "+", "\"\\\"", "onclick=\\\"\"", "+", "onclick", "+", "\"\"", "+", "left", "+", "\"\"", "+", "right", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "tooltip", "+", "\"BGCOLOR=\\\"\"", "+", "Integer", ".", "toHexString", "(", "color", ")", "+", "\"\\\"></td></tr>\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "}", "}", "if", "(", "currentlinkcount", ">", "maxlinkcount", ")", "{", "maxlinkcount", "=", "currentlinkcount", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "currentlinkcount", "<", "maxlinkcount", ")", "{", "println", "(", "\"\"", "+", "(", "maxlinkcount", "-", "currentlinkcount", ")", "*", "5", "+", "\"\"", ")", ";", "}", "}", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "else", "{", "println", "(", "\"\"", "+", "tok", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"\\\"", "\"", "+", "\"", "style=\\\"\"", "+", "style", "+", "\"\\\"", "onclick=\\\"\"", "+", "onclick", "+", "\"\\\"", ">", "&nbsp;\"", "+", "tok", ".", "getText", "(", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "maxlinkcount", ">", "0", ")", "{", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", "+", "maxlinkcount", "*", "5", "+", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "}", "println", "(", "\"</table>\"", ")", ";", "}", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "toolTipMaxLineCount", ">", "10", ")", "{", "toolTipMaxLineCount", "=", "10", ";", "}", "println", "(", "\"\"", "+", "(", "toolTipMaxLineCount", "*", "15", "+", "15", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "println", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "private", "List", "<", "Long", ">", "getAllTokens", "(", "AnnisNode", "a", ",", "String", "name", ",", "TComponenttype", "c", ",", "long", "cnr", ")", "{", "List", "<", "Long", ">", "result", "=", "null", ";", "if", "(", "!", "visitedNodes", ".", "contains", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "result", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "visitedNodes", ".", "add", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "TokensOfNode", ".", "containsKey", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "for", "(", "Long", "l", ":", "TokensOfNode", ".", "get", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "if", "(", "ComponentOfToken", ".", "get", "(", "l", ")", "==", "null", ")", "{", "List", "<", "Long", ">", "newlist", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "newlist", ".", "add", "(", "cnr", ")", ";", "ComponentOfToken", ".", "put", "(", "l", ",", "newlist", ")", ";", "}", "else", "{", "if", "(", "!", "ComponentOfToken", ".", "get", "(", "l", ")", ".", "contains", "(", "cnr", ")", ")", "{", "ComponentOfToken", ".", "get", "(", "l", ")", ".", "add", "(", "cnr", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "else", "{", "result", "=", "searchTokens", "(", "a", ",", "cnr", ")", ";", "if", "(", "result", "!=", "null", ")", "{", "TokensOfNode", ".", "put", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ",", "result", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "Edge", "e", ":", "a", ".", "getOutgoingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "includeEdge", "(", "e", ")", "&&", "name", ".", "equals", "(", "e", ".", "getName", "(", ")", ")", "&&", "!", "visitedNodes", ".", "contains", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "c", ".", "NodeList", ".", "add", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "List", "<", "Long", ">", "Med", "=", "getAllTokens", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ",", "name", ",", "c", ",", "cnr", ")", ";", "for", "(", "Long", "l", ":", "Med", ")", "{", "if", "(", "!", "result", ".", "contains", "(", "l", ")", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "for", "(", "Edge", "e", ":", "a", ".", "getIncomingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "includeEdge", "(", "e", ")", "&&", "name", ".", "equals", "(", "e", ".", "getName", "(", ")", ")", "&&", "!", "visitedNodes", ".", "contains", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "c", ".", "NodeList", ".", "add", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "List", "<", "Long", ">", "Med", "=", "getAllTokens", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ",", "name", ",", "c", ",", "cnr", ")", ";", "for", "(", "Long", "l", ":", "Med", ")", "{", "if", "(", "!", "result", ".", "contains", "(", "l", ")", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "private", "void", "setReferent", "(", "AnnisNode", "a", ",", "long", "index", ",", "int", "value", ")", "{", "if", "(", "a", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "ReferentOfToken", ".", "containsKey", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", ")", "{", "HashMap", "<", "Long", ",", "Integer", ">", "newlist", "=", "new", "HashMap", "<", "Long", ",", "Integer", ">", "(", ")", ";", "newlist", ".", "put", "(", "index", ",", "value", ")", ";", "ReferentOfToken", ".", "put", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ",", "newlist", ")", ";", "}", "else", "{", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", ".", "put", "(", "globalIndex", ",", "value", ")", ";", "}", "}", "else", "{", "for", "(", "Edge", "e", ":", "a", ".", "getOutgoingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getEdgeType", "(", ")", "!=", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "POINTING_RELATION", "&&", "e", ".", "getSource", "(", ")", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getDestination", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "setReferent", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ",", "index", ",", "value", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "private", "List", "<", "Long", ">", "searchTokens", "(", "AnnisNode", "a", ",", "long", "cnr", ")", "{", "List", "<", "Long", ">", "result", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "a", ".", "isToken", "(", ")", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "ComponentOfToken", ".", "get", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", "==", "null", ")", "{", "List", "<", "Long", ">", "newlist", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "newlist", ".", "add", "(", "cnr", ")", ";", "ComponentOfToken", ".", "put", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ",", "newlist", ")", ";", "}", "else", "{", "List", "<", "Long", ">", "newlist", "=", "ComponentOfToken", ".", "get", "(", "a", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "!", "newlist", ".", "contains", "(", "cnr", ")", ")", "{", "newlist", ".", "add", "(", "cnr", ")", ";", "}", "}", "}", "else", "{", "for", "(", "Edge", "e", ":", "a", ".", "getOutgoingEdges", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getEdgeType", "(", ")", "!=", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "POINTING_RELATION", "&&", "e", ".", "getSource", "(", ")", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getDestination", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "List", "<", "Long", ">", "Med", "=", "searchTokens", "(", "e", ".", "getDestination", "(", ")", ",", "cnr", ")", ";", "for", "(", "Long", "l", ":", "Med", ")", "{", "if", "(", "!", "result", ".", "contains", "(", "l", ")", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "private", "String", "getAnnotations", "(", "Long", "id", ",", "long", "component", ")", "{", "String", "result", "=", "\"\"", ";", "String", "incoming", "=", "\"\"", ",", "outgoing", "=", "\"\"", ";", "int", "nri", "=", "1", ",", "nro", "=", "1", ";", "if", "(", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "id", ")", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "long", "l", ":", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "id", ")", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "l", ")", "!=", "null", "&&", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "l", ")", ".", "Component", "==", "component", "&&", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "l", ")", ".", "Annotations", "!=", "null", "&&", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "l", ")", ".", "Annotations", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "int", "num", "=", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "id", ")", ".", "get", "(", "l", ")", ";", "if", "(", "num", "==", "0", "||", "num", "==", "2", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "an", ":", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "l", ")", ".", "Annotations", ")", "{", "if", "(", "nri", "==", "1", ")", "{", "incoming", "=", "\"\"", "+", "an", ".", "getName", "(", ")", "+", "\"=\"", "+", "an", ".", "getValue", "(", ")", ";", "nri", "--", ";", "}", "else", "{", "incoming", "+=", "\",", "\"", "+", "an", ".", "getName", "(", ")", "+", "\"=\"", "+", "an", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "if", "(", "num", "==", "1", "||", "num", "==", "2", ")", "{", "for", "(", "Annotation", "an", ":", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "(", "long", ")", "l", ")", ".", "Annotations", ")", "{", "if", "(", "nro", "==", "1", ")", "{", "outgoing", "=", "\"\"", "+", "an", ".", "getName", "(", ")", "+", "\"=\"", "+", "an", ".", "getValue", "(", ")", ";", "nro", "--", ";", "}", "else", "{", "outgoing", "+=", "\",", "\"", "+", "an", ".", "getName", "(", ")", "+", "\"=\"", "+", "an", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "}", "if", "(", "nro", "<", "1", ")", "{", "result", "+=", "outgoing", ";", "}", "if", "(", "nri", "<", "1", ")", "{", "result", "+=", "incoming", ";", "}", "return", "result", ";", "}", "private", "boolean", "connectionOf", "(", "long", "pre", ",", "long", "now", ",", "long", "currentComponent", ")", "{", "List", "<", "Long", ">", "prel", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ",", "nowl", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "pre", "!=", "now", "&&", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "pre", ")", "!=", "null", "&&", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "now", ")", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "long", "l", ":", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "pre", ")", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "l", ")", "!=", "null", "&&", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "l", ")", ".", "Component", "==", "currentComponent", "&&", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "pre", ")", ".", "get", "(", "l", ")", ".", "equals", "(", "0", ")", ")", "{", "prel", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "long", "l", ":", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "now", ")", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "l", ")", "!=", "null", "&&", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "l", ")", ".", "Component", "==", "currentComponent", "&&", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "now", ")", ".", "get", "(", "l", ")", ".", "equals", "(", "0", ")", ")", "{", "nowl", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "long", "l", ":", "nowl", ")", "{", "if", "(", "prel", ".", "contains", "(", "l", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "}", "prel", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "nowl", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "pre", "!=", "now", "&&", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "pre", ")", "!=", "null", "&&", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "now", ")", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "long", "l", ":", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "pre", ")", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "l", ")", "!=", "null", "&&", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "l", ")", ".", "Component", "==", "currentComponent", "&&", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "pre", ")", ".", "get", "(", "l", ")", ".", "equals", "(", "1", ")", ")", "{", "prel", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "long", "l", ":", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "now", ")", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "l", ")", "!=", "null", "&&", "ReferentList", ".", "get", "(", "(", "int", ")", "l", ")", ".", "Component", "==", "currentComponent", "&&", "ReferentOfToken", ".", "get", "(", "now", ")", ".", "get", "(", "l", ")", ".", "equals", "(", "1", ")", ")", "{", "nowl", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "long", "l", ":", "nowl", ")", "{", "if", "(", "prel", ".", "contains", "(", "l", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "}", "}", "return", "false", ";", "}", "private", "String", "ListToString", "(", "List", "<", "Long", ">", "ll", ")", "{", "StringBuilder", "result", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "int", "i", "=", "1", ";", "for", "(", "Long", "l", ":", "ll", ")", "{", "if", "(", "i", "==", "1", ")", "{", "i", "=", "0", ";", "result", ".", "append", "(", "l", ")", ";", "}", "else", "{", "result", ".", "append", "(", "\",\"", ")", ";", "result", ".", "append", "(", "l", ")", ";", "}", "}", "return", "result", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "private", "int", "getNewColor", "(", "int", "i", ")", "{", "int", "r", "=", "(", "(", "(", "i", ")", "*", "224", ")", "%", "255", ")", ";", "int", "g", "=", "(", "(", "(", "i", "+", "197", ")", "*", "1034345", ")", "%", "255", ")", ";", "int", "b", "=", "(", "(", "(", "i", "+", "23", ")", "*", "74353", ")", "%", "255", ")", ";", "if", "(", "(", "(", "r", "+", "b", "+", "g", ")", "/", "3", ")", "<", "100", ")", "{", "r", "=", "255", "-", "r", ";", "g", "=", "255", "-", "g", ";", "b", "=", "255", "-", "b", ";", "}", "else", "if", "(", "(", "(", "r", "+", "b", "+", "g", ")", "/", "3", ")", ">", "192", ")", "{", "r", "=", "1", "*", "(", "r", "/", "2", ")", ";", "g", "=", "1", "*", "(", "g", "/", "2", ")", ";", "b", "=", "1", "*", "(", "b", "/", "2", ")", ";", "}", "if", "(", "r", "==", "255", "&&", "g", "==", "255", "&&", "b", "==", "255", ")", "{", "r", "=", "255", ";", "g", "=", "255", ";", "b", "=", "0", ";", "}", "return", "(", "r", "*", "65536", "+", "g", "*", "256", "+", "b", ")", ";", "}", "private", "void", "println", "(", "String", "s", ")", "throws", "IOException", "{", "println", "(", "s", ",", "0", ")", ";", "}", "private", "void", "println", "(", "String", "s", ",", "int", "indent", ")", "throws", "IOException", "{", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "indent", ";", "i", "++", ")", "{", "theWriter", ".", "append", "(", "\"t\"", ")", ";", "}", "theWriter", ".", "append", "(", "s", ")", ";", "theWriter", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "private", "boolean", "includeEdge", "(", "Edge", "e", ")", "{", "if", "(", "e", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getName", "(", ")", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getEdgeType", "(", ")", "==", "Edge", ".", "EdgeType", ".", "POINTING_RELATION", "&&", "e", ".", "getSource", "(", ")", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getDestination", "(", ")", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getNamespace", "(", ")", "!=", "null", "&&", "e", ".", "getNamespace", "(", ")", ".", "equals", "(", "theInput", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "else", "{", "return", "false", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "media", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "VideoVisualizer", "extends", "MediaVisualizer", "{", "@", "Override", "public", "String", "getTag", "(", ")", "{", "return", "\"iframevideo\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getMediaMime", "(", ")", "{", "return", "\"video/ogg\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"video\"", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "media", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "AudioVisualizer", "extends", "MediaVisualizer", "{", "@", "Override", "public", "String", "getTag", "(", ")", "{", "return", "\"iframeaudio\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getMediaMime", "(", ")", "{", "return", "\"audio/ogg\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"audio\"", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "media", ";", "import", "annis", ".", "CommonHelper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "WriterVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisNode", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "Annotation", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnotationGraph", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URI", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "public", "abstract", "class", "MediaVisualizer", "extends", "WriterVisualizer", "{", "@", "Override", "public", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "Writer", "writer", ")", "{", "List", "<", "String", ">", "corpusPath", "=", "CommonHelper", ".", "getCorpusPath", "(", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ".", "getSCorpusGraph", "(", ")", ",", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ")", ";", "try", "{", "String", "binaryServletPath", "=", "input", ".", "getContextPath", "(", ")", "+", "\"/Binary?\"", "+", "\"\"", "+", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpusPath", ".", "get", "(", "0", ")", ",", "\"UTF-8\"", ")", "+", "\"\"", "+", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpusPath", ".", "get", "(", "corpusPath", ".", "size", "(", ")", "-", "1", ")", ",", "\"UTF-8\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<html>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<head>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "input", ".", "getResourcePath", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\\\"></script>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"</head>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<body>\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"<\"", "+", "getTag", "(", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "binaryServletPath", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\\\"", "type=\\\"\"", "+", "getMediaMime", "(", ")", "+", "\"\\\">\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"</\"", "+", "getTag", "(", ")", "+", "\">\"", ")", ";", "writer", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "e", ")", "{", "e", ".", "printStackTrace", "(", ")", ";", "}", "}", "private", "String", "getTimeRange", "(", "VisualizerInput", "input", ")", "{", "AnnotationGraph", "g", "=", "input", ".", "getResult", "(", ")", ".", "getGraph", "(", ")", ";", "List", "<", "AnnisNode", ">", "resultList", "=", "g", ".", "getNodes", "(", ")", ";", "AnnisNode", "n", "=", "resultList", ".", "get", "(", "0", ")", ";", "Set", "<", "Annotation", ">", "nodeAnnotations", "=", "n", ".", "getNodeAnnotations", "(", ")", ";", "StringBuffer", "ret", ";", "for", "(", "Annotation", "annotation", ":", "nodeAnnotations", ")", "{", "if", "(", "\"time\"", ".", "equals", "(", "annotation", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "ret", "=", "new", "StringBuffer", "(", "\"\"", ")", ";", "ret", ".", "append", "(", "annotation", ".", "getValue", "(", ")", ".", "split", "(", "\"-\"", ")", "[", "0", "]", ")", ";", "ret", ".", "append", "(", "\";\"", ")", ";", "return", "ret", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "}", "return", "\"no", "time", "anno\"", ";", "}", "public", "abstract", "String", "getTag", "(", ")", ";", "public", "abstract", "String", "getMediaMime", "(", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MainApp", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "KWICPanel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Component", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SNode", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "Plugin", ";", "public", "interface", "VisualizerPlugin", "<", "I", "extends", "Component", ">", "extends", "Plugin", "{", "public", "String", "getShortName", "(", ")", ";", "public", "I", "createComponent", "(", "VisualizerInput", "visInput", ",", "Application", "application", ")", ";", "public", "boolean", "isUsingText", "(", ")", ";", "public", "void", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "I", "visualizerImplementation", ",", "Set", "<", "String", ">", "annos", ")", ";", "public", "void", "setSegmentationLayer", "(", "I", "visualizerImplementation", ",", "String", "segmentationName", ",", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MatchedNodeColors", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "resultview", ".", "VisualizerPanel", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "ifaces", ".", "AnnisResult", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisResultImpl", ";", "import", "annis", ".", "utils", ".", "LegacyGraphConverter", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sCorpusStructure", ".", "SDocument", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "STextualDS", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SToken", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SNode", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Writer", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Properties", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "public", "class", "VisualizerInput", "{", "private", "SDocument", "document", ";", "private", "String", "namespace", "=", "\"\"", ";", "private", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markableMap", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "String", ">", "(", ")", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markableExactMap", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "String", ">", "(", ")", ";", "private", "String", "id", "=", "\"\"", ";", "private", "String", "contextPath", ";", "private", "String", "annisWebServiceURL", ";", "private", "String", "dotPath", ";", "private", "AnnisResult", "result", ";", "private", "Properties", "mappings", ";", "private", "String", "resourcePathTemplate", "=", "\"%s\"", ";", "private", "List", "<", "SToken", ">", "token", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "tokenAnnos", ";", "private", "STextualDS", "text", ";", "private", "String", "segmentationName", ";", "private", "VisualizerPanel", "visPanel", ";", "public", "String", "getAnnisWebServiceURL", "(", ")", "{", "return", "annisWebServiceURL", ";", "}", "public", "void", "setAnnisWebServiceURL", "(", "String", "annisRemoteServiceURL", ")", "{", "this", ".", "annisWebServiceURL", "=", "annisRemoteServiceURL", ";", "}", "public", "String", "getContextPath", "(", ")", "{", "return", "contextPath", ";", "}", "public", "void", "setContextPath", "(", "String", "contextPath", ")", "{", "this", ".", "contextPath", "=", "contextPath", ";", "}", "@", "Deprecated", "public", "String", "getDotPath", "(", ")", "{", "return", "dotPath", ";", "}", "@", "Deprecated", "public", "void", "setDotPath", "(", "String", "dotPath", ")", "{", "this", ".", "dotPath", "=", "dotPath", ";", "}", "public", "String", "getId", "(", ")", "{", "return", "id", ";", "}", "public", "void", "setId", "(", "String", "id", ")", "{", "this", ".", "id", "=", "id", ";", "}", "public", "Properties", "getMappings", "(", ")", "{", "return", "mappings", ";", "}", "public", "void", "setMappings", "(", "Properties", "mappings", ")", "{", "this", ".", "mappings", "=", "mappings", ";", "}", "@", "Deprecated", "public", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "getMarkableExactMap", "(", ")", "{", "return", "markableExactMap", ";", "}", "@", "Deprecated", "public", "void", "setMarkableExactMap", "(", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markableExactMap", ")", "{", "this", ".", "markableExactMap", "=", "markableExactMap", ";", "}", "@", "Deprecated", "public", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "getMarkableMap", "(", ")", "{", "return", "markableMap", ";", "}", "@", "Deprecated", "public", "void", "setMarkableMap", "(", "Map", "<", "String", ",", "String", ">", "markableMap", ")", "{", "this", ".", "markableMap", "=", "markableMap", ";", "}", "public", "void", "setMarkedAndCovered", "(", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ")", "{", "this", ".", "markedAndCovered", "=", "markedAndCovered", ";", "}", "public", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "getMarkedAndCovered", "(", ")", "{", "return", "markedAndCovered", ";", "}", "public", "String", "getNamespace", "(", ")", "{", "return", "namespace", ";", "}", "public", "void", "setNamespace", "(", "String", "namespace", ")", "{", "this", ".", "namespace", "=", "namespace", ";", "}", "@", "Deprecated", "public", "AnnisResult", "getResult", "(", ")", "{", "if", "(", "result", "==", "null", ")", "{", "result", "=", "new", "AnnisResultImpl", "(", "LegacyGraphConverter", ".", "convertToAnnotationGraph", "(", "document", ")", ")", ";", "}", "return", "result", ";", "}", "public", "SDocument", "getDocument", "(", ")", "{", "return", "document", ";", "}", "public", "void", "setDocument", "(", "SDocument", "document", ")", "{", "this", ".", "document", "=", "document", ";", "}", "public", "void", "setResult", "(", "SDocument", "document", ")", "{", "setDocument", "(", "document", ")", ";", "}", "public", "SDocument", "getSResult", "(", ")", "{", "return", "getDocument", "(", ")", ";", "}", "public", "String", "getResourcePathTemplate", "(", ")", "{", "return", "resourcePathTemplate", ";", "}", "public", "void", "setResourcePathTemplate", "(", "String", "resourcePathTemplate", ")", "{", "this", ".", "resourcePathTemplate", "=", "resourcePathTemplate", ";", "}", "public", "String", "getResourcePath", "(", "String", "resource", ")", "{", "return", "String", ".", "format", "(", "resourcePathTemplate", ",", "resource", ")", ";", "}", "public", "void", "setToken", "(", "List", "<", "SToken", ">", "token", ")", "{", "this", ".", "token", "=", "token", ";", "}", "public", "List", "<", "SToken", ">", "getToken", "(", ")", "{", "return", "this", ".", "token", ";", "}", "public", "void", "setVisibleTokenAnnos", "(", "Set", "<", "String", ">", "tokenAnnos", ")", "{", "this", ".", "tokenAnnos", "=", "tokenAnnos", ";", "}", "public", "Set", "<", "String", ">", "getVisibleTokenAnnos", "(", ")", "{", "return", "this", ".", "tokenAnnos", ";", "}", "public", "void", "setText", "(", "STextualDS", "text", ")", "{", "this", ".", "text", "=", "text", ";", "}", "public", "STextualDS", "getText", "(", ")", "{", "return", "this", ".", "text", ";", "}", "public", "void", "setSegmentationName", "(", "String", "segmentationName", ")", "{", "this", ".", "segmentationName", "=", "segmentationName", ";", "}", "public", "String", "getSegmentationName", "(", ")", "{", "return", "segmentationName", ";", "}", "public", "VisualizerPanel", "getVisPanel", "(", ")", "{", "return", "visPanel", ";", "}", "public", "void", "setVisPanel", "(", "VisualizerPanel", "visPanel", ")", "{", "this", ".", "visPanel", "=", "visPanel", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "Plugin", ";", "public", "interface", "ResourcePlugin", "extends", "Plugin", "{", "public", "String", "getShortName", "(", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "widgets", ".", "AutoHeightIFrame", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ApplicationResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Component", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "ByteArrayOutputStream", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "OutputStream", ";", "public", "abstract", "class", "AbstractIFrameVisualizer", "extends", "AbstractVisualizer", "implements", "ResourcePlugin", "{", "public", "String", "getCharacterEncoding", "(", ")", "{", "return", "\"utf-8\"", ";", "}", "public", "String", "getContentType", "(", ")", "{", "return", "\"text/html\"", ";", "}", "public", "abstract", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "OutputStream", "outstream", ")", ";", "@", "Override", "public", "Component", "createComponent", "(", "VisualizerInput", "vis", ",", "Application", "application", ")", "{", "AutoHeightIFrame", "iframe", ";", "ApplicationResource", "resource", ";", "ByteArrayOutputStream", "outStream", "=", "new", "ByteArrayOutputStream", "(", ")", ";", "writeOutput", "(", "vis", ",", "outStream", ")", ";", "resource", "=", "vis", ".", "getVisPanel", "(", ")", ".", "createResource", "(", "outStream", ",", "getContentType", "(", ")", ")", ";", "String", "url", "=", "vis", ".", "getVisPanel", "(", ")", ".", "getApplication", "(", ")", ".", "getRelativeLocation", "(", "resource", ")", ";", "iframe", "=", "new", "AutoHeightIFrame", "(", "url", "==", "null", "?", "\"/error.html\"", ":", "url", ")", ";", "return", "iframe", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Component", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SNode", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "public", "abstract", "class", "AbstractVisualizer", "<", "I", "extends", "Component", ">", "implements", "VisualizerPlugin", "<", "I", ">", "{", "@", "Override", "public", "boolean", "isUsingText", "(", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "setSegmentationLayer", "(", "I", "visualizerImplementation", ",", "String", "segmentationName", ",", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ")", "{", "}", "@", "Override", "public", "void", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "I", "visualizerImplementation", ",", "Set", "<", "String", ">", "annos", ")", "{", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ";", "import", "annis", ".", "CommonHelper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MatchedNodeColors", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaController", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerFactory", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerHolder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "AbstractVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "model", ".", "AnnisConstants", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "util", ".", "BeanItemContainer", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "ItemClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "AbstractSelect", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Component", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Table", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sCorpusStructure", ".", "SDocument", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "*", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SAnnotation", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SFeature", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SNode", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "*", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "injections", ".", "InjectPlugin", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "emf", ".", "common", ".", "util", ".", "BasicEList", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "emf", ".", "common", ".", "util", ".", "EList", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "KWICPanel", "extends", "AbstractVisualizer", "<", "KWICPanel", ".", "KWICPanelImpl", ">", "{", "@", "InjectPlugin", "public", "MediaControllerFactory", "mcFactory", ";", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"kwic\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "KWICPanelImpl", "createComponent", "(", "VisualizerInput", "visInput", ",", "Application", "application", ")", "{", "MediaController", "mediaController", "=", "null", ";", "if", "(", "mcFactory", "!=", "null", "&&", "application", "instanceof", "MediaControllerHolder", ")", "{", "mediaController", "=", "mcFactory", ".", "getOrCreate", "(", "(", "MediaControllerHolder", ")", "application", ")", ";", "}", "return", "new", "KWICPanelImpl", "(", "visInput", ",", "mediaController", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "KWICPanelImpl", "visualizerImplementation", ",", "Set", "<", "String", ">", "annos", ")", "{", "visualizerImplementation", ".", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "annos", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "setSegmentationLayer", "(", "KWICPanelImpl", "visualizerImplementation", ",", "String", "segmentationName", ",", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ")", "{", "visualizerImplementation", ".", "setSegmentationLayer", "(", "segmentationName", ",", "markedAndCovered", ")", ";", "}", "public", "static", "class", "KWICPanelImpl", "extends", "Table", "implements", "ItemClickEvent", ".", "ItemClickListener", "{", "private", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "KWICPanelImpl", ".", "class", ")", ";", "private", "SDocument", "result", ";", "private", "static", "final", "String", "DUMMY_COLUMN", "=", "\"dummyColumn\"", ";", "private", "BeanItemContainer", "<", "String", ">", "containerAnnos", ";", "private", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ";", "private", "MediaController", "mediaController", ";", "private", "String", "[", "]", "media_annotations", "=", "{", "\"time\"", "}", ";", "private", "List", "<", "Object", ">", "generatedColumns", ";", "private", "VisualizerInput", "visInput", ";", "public", "KWICPanelImpl", "(", "VisualizerInput", "visInput", ",", "MediaController", "mediaController", ")", "{", "this", ".", "generatedColumns", "=", "new", "LinkedList", "<", "Object", ">", "(", ")", ";", "this", ".", "visInput", "=", "visInput", ";", "this", ".", "mediaController", "=", "mediaController", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "if", "(", "visInput", "!=", "null", ")", "{", "initKWICPanel", "(", "visInput", ".", "getSResult", "(", ")", ",", "visInput", ".", "getVisibleTokenAnnos", "(", ")", ",", "visInput", ".", "getMarkedAndCovered", "(", ")", ",", "visInput", ".", "getText", "(", ")", ",", "visInput", ".", "getSegmentationName", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "initKWICPanel", "(", "SDocument", "result", ",", "Set", "<", "String", ">", "tokenAnnos", ",", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ",", "STextualDS", "text", ",", "String", "segmentationName", ")", "{", "this", ".", "result", "=", "result", ";", "this", ".", "markedAndCovered", "=", "markedAndCovered", ";", "this", ".", "addListener", "(", "(", "ItemClickEvent", ".", "ItemClickListener", ")", "this", ")", ";", "this", ".", "addStyleName", "(", "\"kwic\"", ")", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "PANEL_BORDERLESS", ")", ";", "containerAnnos", "=", "new", "BeanItemContainer", "<", "String", ">", "(", "String", ".", "class", ")", ";", "containerAnnos", ".", "addItem", "(", "\"tok\"", ")", ";", "setColumnHeaderMode", "(", "Table", ".", "COLUMN_HEADER_MODE_HIDDEN", ")", ";", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "TABLE_BORDERLESS", ")", ";", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "setPageLength", "(", "0", ")", ";", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "CommonHelper", ".", "containsRTLText", "(", "text", ".", "getSText", "(", ")", ")", ")", "{", "addStyleName", "(", "\"rtl\"", ")", ";", "}", "SDocumentGraph", "graph", "=", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ";", "ArrayList", "<", "Object", ">", "visible", "=", "new", "ArrayList", "<", "Object", ">", "(", "10", ")", ";", "Long", "lastTokenIndex", "=", "null", ";", "List", "<", "SNode", ">", "token", "=", "CommonHelper", ".", "getSortedSegmentationNodes", "(", "segmentationName", ",", "graph", ")", ";", "for", "(", "SNode", "t", ":", "token", ")", "{", "STextualDS", "tokenText", "=", "null", ";", "EList", "<", "STYPE_NAME", ">", "types", "=", "new", "BasicEList", "<", "STYPE_NAME", ">", "(", ")", ";", "types", ".", "add", "(", "STYPE_NAME", ".", "STEXT_OVERLAPPING_RELATION", ")", ";", "EList", "<", "SDataSourceSequence", ">", "dataSources", "=", "graph", ".", "getOverlappedDSSequences", "(", "t", ",", "types", ")", ";", "if", "(", "dataSources", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "SDataSourceSequence", "seq", ":", "dataSources", ")", "{", "if", "(", "seq", ".", "getSSequentialDS", "(", ")", "instanceof", "STextualDS", ")", "{", "tokenText", "=", "(", "STextualDS", ")", "seq", ".", "getSSequentialDS", "(", ")", ";", "break", ";", "}", "}", "}", "SFeature", "featTokenIndex", "=", "t", ".", "getSFeature", "(", "AnnisConstants", ".", "ANNIS_NS", ",", "segmentationName", "==", "null", "?", "AnnisConstants", ".", "FEAT_TOKENINDEX", ":", "AnnisConstants", ".", "FEAT_SEGLEFT", ")", ";", "if", "(", "tokenText", "==", "text", ")", "{", "if", "(", "lastTokenIndex", "!=", "null", "&&", "featTokenIndex", "!=", "null", "&&", "featTokenIndex", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ".", "longValue", "(", ")", ">", "(", "lastTokenIndex", ".", "longValue", "(", ")", "+", "1", ")", ")", "{", "Long", "gapColumnID", "=", "featTokenIndex", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "addGeneratedColumn", "(", "gapColumnID", ",", "new", "KWICPanelImpl", ".", "GapColumnGenerator", "(", ")", ")", ";", "generatedColumns", ".", "add", "(", "gapColumnID", ")", ";", "setColumnExpandRatio", "(", "gapColumnID", ",", "0.0f", ")", ";", "visible", ".", "add", "(", "gapColumnID", ")", ";", "}", "try", "{", "addGeneratedColumn", "(", "t", ",", "new", "KWICPanelImpl", ".", "TokenColumnGenerator", "(", "t", ",", "segmentationName", ")", ")", ";", "generatedColumns", ".", "add", "(", "t", ")", ";", "setColumnExpandRatio", "(", "t", ",", "0.0f", ")", ";", "}", "catch", "(", "IllegalArgumentException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"unknown\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "visible", ".", "add", "(", "t", ")", ";", "if", "(", "featTokenIndex", "!=", "null", ")", "{", "lastTokenIndex", "=", "featTokenIndex", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "addGeneratedColumn", "(", "DUMMY_COLUMN", ",", "new", "Table", ".", "ColumnGenerator", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "Object", "generateCell", "(", "Table", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "columnId", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "}", ")", ";", "generatedColumns", ".", "add", "(", "DUMMY_COLUMN", ")", ";", "setColumnWidth", "(", "DUMMY_COLUMN", ",", "0", ")", ";", "setColumnExpandRatio", "(", "DUMMY_COLUMN", ",", "1.0f", ")", ";", "visible", ".", "add", "(", "DUMMY_COLUMN", ")", ";", "containerAnnos", ".", "addAll", "(", "tokenAnnos", ")", ";", "setContainerDataSource", "(", "containerAnnos", ")", ";", "setVisibleColumns", "(", "visible", ".", "toArray", "(", ")", ")", ";", "setCellStyleGenerator", "(", "new", "KWICPanelImpl", ".", "KWICStyleGenerator", "(", ")", ")", ";", "setItemDescriptionGenerator", "(", "new", "KWICPanelImpl", ".", "TooltipGenerator", "(", ")", ")", ";", "}", "public", "void", "setVisibleTokenAnnosVisible", "(", "Set", "<", "String", ">", "annos", ")", "{", "if", "(", "containerAnnos", "!=", "null", ")", "{", "containerAnnos", ".", "removeAllItems", "(", ")", ";", "containerAnnos", ".", "addItem", "(", "\"tok\"", ")", ";", "containerAnnos", ".", "addAll", "(", "annos", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "setSegmentationLayer", "(", "String", "segmentationName", ",", "Map", "<", "SNode", ",", "Long", ">", "markedAndCovered", ")", "{", "if", "(", "generatedColumns", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "Object", "o", ":", "generatedColumns", ")", "{", "removeGeneratedColumn", "(", "o", ")", ";", "}", "}", "generatedColumns", "=", "new", "LinkedList", "<", "Object", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "visInput", "!=", "null", ")", "{", "initKWICPanel", "(", "visInput", ".", "getSResult", "(", ")", ",", "visInput", ".", "getVisibleTokenAnnos", "(", ")", ",", "markedAndCovered", ",", "visInput", ".", "getText", "(", ")", ",", "segmentationName", ")", ";", "}", "}", "public", "static", "class", "TooltipGenerator", "implements", "AbstractSelect", ".", "ItemDescriptionGenerator", "{", "public", "String", "generateDescription", "(", "String", "layer", ",", "SToken", "token", ")", "{", "SAnnotation", "a", "=", "token", ".", "getSAnnotation", "(", "layer", ")", ";", "if", "(", "a", "!=", "null", ")", "{", "return", "a", ".", "getQName", "(", ")", ";", "}", "return", "null", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "generateDescription", "(", "Component", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "propertyId", ")", "{", "if", "(", "propertyId", "!=", "null", "&&", "propertyId", "instanceof", "SToken", ")", "{", "return", "generateDescription", "(", "(", "String", ")", "itemId", ",", "(", "SToken", ")", "propertyId", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "null", ";", "}", "}", "}", "public", "class", "KWICStyleGenerator", "implements", "Table", ".", "CellStyleGenerator", "{", "public", "String", "getStyle", "(", "String", "layer", ",", "SNode", "token", ")", "{", "if", "(", "\"tok\"", ".", "equals", "(", "layer", ")", ")", "{", "if", "(", "markedAndCovered", ".", "containsKey", "(", "token", ")", ")", "{", "return", "MatchedNodeColors", ".", "colorClassByMatch", "(", "markedAndCovered", ".", "get", "(", "token", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "null", ";", "}", "}", "else", "{", "SAnnotation", "a", "=", "token", ".", "getSAnnotation", "(", "layer", ")", ";", "if", "(", "a", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "String", "media_anno", ":", "media_annotations", ")", "{", "if", "(", "media_anno", ".", "equals", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "a", ".", "getValueString", "(", ")", ".", "matches", "(", "\"\"", ")", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "return", "\"kwic-anno\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getStyle", "(", "Object", "itemId", ",", "Object", "propertyId", ")", "{", "if", "(", "propertyId", "!=", "null", "&&", "propertyId", "instanceof", "SNode", ")", "{", "return", "getStyle", "(", "(", "String", ")", "itemId", ",", "(", "SNode", ")", "propertyId", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "null", ";", "}", "}", "}", "public", "static", "class", "GapColumnGenerator", "implements", "Table", ".", "ColumnGenerator", "{", "public", "Object", "generateCell", "(", "String", "layer", ")", "{", "if", "(", "\"tok\"", ".", "equals", "(", "layer", ")", ")", "{", "return", "\"(...)\"", ";", "}", "return", "\"\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "Object", "generateCell", "(", "Table", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "columnId", ")", "{", "return", "generateCell", "(", "(", "String", ")", "itemId", ")", ";", "}", "}", "public", "class", "TokenColumnGenerator", "implements", "Table", ".", "ColumnGenerator", "{", "private", "Map", "<", "String", ",", "SAnnotation", ">", "annotationsByQName", ";", "private", "SNode", "token", ";", "private", "String", "segmentationName", ";", "public", "TokenColumnGenerator", "(", "SNode", "token", ",", "String", "segmentationName", ")", "{", "this", ".", "token", "=", "token", ";", "this", ".", "segmentationName", "=", "segmentationName", ";", "annotationsByQName", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "SAnnotation", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "SAnnotation", "a", ":", "token", ".", "getSAnnotations", "(", ")", ")", "{", "annotationsByQName", ".", "put", "(", "a", ".", "getQName", "(", ")", ",", "a", ")", ";", "if", "(", "a", ".", "getSName", "(", ")", ".", "equals", "(", "segmentationName", ")", ")", "{", "annotationsByQName", ".", "put", "(", "a", ".", "getSName", "(", ")", ",", "a", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "Object", "generateCell", "(", "String", "layer", ")", "{", "BasicEList", "<", "STYPE_NAME", ">", "textualRelation", "=", "new", "BasicEList", "<", "STYPE_NAME", ">", "(", ")", ";", "textualRelation", ".", "add", "(", "STYPE_NAME", ".", "STEXT_OVERLAPPING_RELATION", ")", ";", "SDocumentGraph", "docGraph", "=", "result", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ";", "if", "(", "\"tok\"", ".", "equals", "(", "layer", ")", ")", "{", "if", "(", "segmentationName", "==", "null", ")", "{", "SDataSourceSequence", "seq", "=", "docGraph", ".", "getOverlappedDSSequences", "(", "token", ",", "textualRelation", ")", ".", "get", "(", "0", ")", ";", "return", "(", "(", "String", ")", "seq", ".", "getSSequentialDS", "(", ")", ".", "getSData", "(", ")", ")", ".", "substring", "(", "seq", ".", "getSStart", "(", ")", ",", "seq", ".", "getSEnd", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "SAnnotation", "a", "=", "annotationsByQName", ".", "get", "(", "segmentationName", ")", ";", "if", "(", "a", "!=", "null", ")", "{", "return", "a", ".", "getValueString", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "else", "{", "SAnnotation", "a", "=", "annotationsByQName", ".", "get", "(", "layer", ")", ";", "if", "(", "a", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "String", "media_anno", ":", "media_annotations", ")", "{", "if", "(", "media_anno", ".", "equals", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "a", ".", "getSValueSTEXT", "(", ")", ";", "}", "}", "return", "a", ".", "getValueString", "(", ")", ";", "}", "}", "return", "\"\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "Object", "generateCell", "(", "Table", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "columnId", ")", "{", "return", "generateCell", "(", "(", "String", ")", "itemId", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "itemClick", "(", "ItemClickEvent", "event", ")", "{", "String", "buttonName", "=", "(", "String", ")", "event", ".", "getItemId", "(", ")", ";", "if", "(", "buttonName", "==", "null", ")", "{", "return", ";", "}", "if", "(", "!", "buttonName", ".", "matches", "(", "\"\"", ")", ")", "{", "return", ";", "}", "String", "time", "=", "null", ";", "SToken", "token", "=", "(", "SToken", ")", "event", ".", "getPropertyId", "(", ")", ";", "for", "(", "SAnnotation", "anno", ":", "token", ".", "getSAnnotations", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "String", "media_anno", ":", "media_annotations", ")", "{", "if", "(", "media_anno", ".", "equals", "(", "anno", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "time", "=", "anno", ".", "getValueString", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "if", "(", "time", "!=", "null", "&&", "time", ".", "matches", "(", "\"\"", ")", ")", "{", "return", ";", "}", "if", "(", "time", "!=", "null", ")", "{", "startMediaVisualizers", "(", "time", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "startMediaVisualizers", "(", "String", "time", ")", "{", "if", "(", "mediaController", "!=", "null", ")", "{", "String", "[", "]", "split", "=", "time", ".", "split", "(", "\"-\"", ")", ";", "if", "(", "split", ".", "length", "==", "1", ")", "{", "mediaController", ".", "play", "(", "visInput", ".", "getId", "(", ")", ",", "Double", ".", "parseDouble", "(", "split", "[", "0", "]", ")", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "split", ".", "length", "==", "2", ")", "{", "mediaController", ".", "play", "(", "visInput", ".", "getId", "(", ")", ",", "Double", ".", "parseDouble", "(", "split", "[", "0", "]", ")", ",", "Double", ".", "parseDouble", "(", "split", "[", "1", "]", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ";", "import", "annis", ".", "CommonHelper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaController", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerFactory", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerHolder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "AbstractVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "widgets", ".", "VideoPlayer", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "WebApplicationContext", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "UnsupportedEncodingException", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "injections", ".", "InjectPlugin", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "VideoVisualizer", "extends", "AbstractVisualizer", "<", "VideoPlayer", ">", "{", "private", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "VideoVisualizer", ".", "class", ")", ";", "@", "InjectPlugin", "public", "MediaControllerFactory", "mcFactory", ";", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"video\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "VideoPlayer", "createComponent", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "Application", "application", ")", "{", "List", "<", "String", ">", "corpusPath", "=", "CommonHelper", ".", "getCorpusPath", "(", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ".", "getSCorpusGraph", "(", ")", ",", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ")", ";", "String", "binaryServletPath", "=", "\"\"", ";", "try", "{", "binaryServletPath", "=", "input", ".", "getContextPath", "(", ")", "+", "\"/Binary?\"", "+", "\"\"", "+", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpusPath", ".", "get", "(", "0", ")", ",", "\"UTF-8\"", ")", "+", "\"\"", "+", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpusPath", ".", "get", "(", "corpusPath", ".", "size", "(", ")", "-", "1", ")", ",", "\"UTF-8\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "UnsupportedEncodingException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "VideoPlayer", "player", "=", "new", "VideoPlayer", "(", "binaryServletPath", ",", "\"video/webm\"", ")", ";", "if", "(", "mcFactory", "!=", "null", "&&", "application", "instanceof", "MediaControllerHolder", ")", "{", "mcFactory", ".", "getOrCreate", "(", "(", "MediaControllerHolder", ")", "application", ")", ".", "addMediaPlayer", "(", "player", ",", "input", ".", "getId", "(", ")", ",", "input", ".", "getVisPanel", "(", ")", ")", ";", "}", "return", "player", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ";", "import", "annis", ".", "CommonHelper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerFactory", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerHolder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "AbstractVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "widgets", ".", "AudioPlayer", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "UnsupportedEncodingException", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "injections", ".", "InjectPlugin", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "AudioVisualizer", "extends", "AbstractVisualizer", "<", "AudioPlayer", ">", "{", "private", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "AudioVisualizer", ".", "class", ")", ";", "@", "InjectPlugin", "public", "MediaControllerFactory", "mcFactory", ";", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"audio\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "AudioPlayer", "createComponent", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "Application", "application", ")", "{", "List", "<", "String", ">", "corpusPath", "=", "CommonHelper", ".", "getCorpusPath", "(", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ".", "getSCorpusGraph", "(", ")", ",", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ")", ";", "String", "binaryServletPath", "=", "\"\"", ";", "try", "{", "binaryServletPath", "=", "input", ".", "getContextPath", "(", ")", "+", "\"/Binary?\"", "+", "\"\"", "+", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpusPath", ".", "get", "(", "0", ")", ",", "\"UTF-8\"", ")", "+", "\"\"", "+", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpusPath", ".", "get", "(", "corpusPath", ".", "size", "(", ")", "-", "1", ")", ",", "\"UTF-8\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "UnsupportedEncodingException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "AudioPlayer", "player", "=", "new", "AudioPlayer", "(", "binaryServletPath", ",", "\"audio/ogg\"", ")", ";", "if", "(", "mcFactory", "!=", "null", "&&", "application", "instanceof", "MediaControllerHolder", ")", "{", "mcFactory", ".", "getOrCreate", "(", "(", "MediaControllerHolder", ")", "application", ")", ".", "addMediaPlayer", "(", "player", ",", "input", ".", "getId", "(", ")", ",", "input", ".", "getVisPanel", "(", ")", ")", ";", "}", "return", "player", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "grid", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "widgets", ".", "grid", ".", "GridEvent", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "widgets", ".", "grid", ".", "Row", ";", "import", "annis", ".", "CommonHelper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaController", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerFactory", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerHolder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "impl", ".", "TimeHelper", ";", "import", "static", "annis", ".", "model", ".", "AnnisConstants", ".", "*", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "AbstractVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "widgets", ".", "grid", ".", "AnnotationGrid", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "VerticalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "graph", ".", "Edge", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SDocumentGraph", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SSpan", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SSpanningRelation", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "STYPE_NAME", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCommon", ".", "sDocumentStructure", ".", "SToken", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SAnnotation", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SFeature", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SLayer", ";", "import", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "saltnpepper", ".", "salt", ".", "saltCore", ".", "SNode", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collections", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Comparator", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedHashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ListIterator", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Random", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeSet", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "PluginImplementation", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "annotations", ".", "injections", ".", "InjectPlugin", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "CompareToBuilder", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "emf", ".", "common", ".", "util", ".", "BasicEList", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "emf", ".", "common", ".", "util", ".", "EList", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "@", "PluginImplementation", "public", "class", "GridVisualizer", "extends", "AbstractVisualizer", "<", "GridVisualizer", ".", "GridVisualizerComponent", ">", "{", "@", "InjectPlugin", "public", "MediaControllerFactory", "mcFactory", ";", "@", "Override", "public", "String", "getShortName", "(", ")", "{", "return", "\"grid\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "GridVisualizerComponent", "createComponent", "(", "VisualizerInput", "visInput", ",", "Application", "application", ")", "{", "MediaController", "mediaController", "=", "null", ";", "if", "(", "mcFactory", "!=", "null", "&&", "application", "instanceof", "MediaControllerHolder", ")", "{", "mediaController", "=", "mcFactory", ".", "getOrCreate", "(", "(", "MediaControllerHolder", ")", "application", ")", ";", "}", "GridVisualizerComponent", "component", "=", "new", "GridVisualizerComponent", "(", "visInput", ",", "mediaController", ")", ";", "return", "component", ";", "}", "public", "static", "class", "GridVisualizerComponent", "extends", "Panel", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "GridVisualizerComponent", ".", "class", ")", ";", "public", "static", "final", "String", "MAPPING_ANNOS_KEY", "=", "\"annos\"", ";", "public", "static", "final", "String", "MAPPING_HIDE_TOK_KEY", "=", "\"hide_tok\"", ";", "private", "AnnotationGrid", "grid", ";", "private", "VisualizerInput", "input", ";", "private", "MediaController", "mediaController", ";", "public", "enum", "ElementType", "{", "begin", ",", "end", ",", "middle", ",", "single", ",", "noEvent", "}", "public", "GridVisualizerComponent", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "MediaController", "mediaController", ")", "{", "this", ".", "input", "=", "input", ";", "this", ".", "mediaController", "=", "mediaController", ";", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "setHeight", "(", "\"-1\"", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "PANEL_BORDERLESS", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "String", "resultID", "=", "input", ".", "getId", "(", ")", ";", "grid", "=", "new", "AnnotationGrid", "(", "mediaController", ",", "resultID", ")", ";", "grid", ".", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "addComponent", "(", "grid", ")", ";", "SDocumentGraph", "graph", "=", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ";", "List", "<", "String", ">", "annos", "=", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", "getAnnotationLevelSet", "(", "graph", ",", "input", ".", "getNamespace", "(", ")", ")", ")", ";", "String", "annosConfiguration", "=", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "MAPPING_ANNOS_KEY", ")", ";", "if", "(", "annosConfiguration", "!=", "null", "&&", "annosConfiguration", ".", "trim", "(", ")", ".", "length", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "String", "[", "]", "split", "=", "annosConfiguration", ".", "split", "(", "\",\"", ")", ";", "annos", ".", "clear", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "s", ":", "split", ")", "{", "annos", ".", "add", "(", "s", ".", "trim", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "EList", "<", "SToken", ">", "token", "=", "graph", ".", "getSortedSTokenByText", "(", ")", ";", "long", "startIndex", "=", "token", ".", "get", "(", "0", ")", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_TOKENINDEX", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "long", "endIndex", "=", "token", ".", "get", "(", "token", ".", "size", "(", ")", "-", "1", ")", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_TOKENINDEX", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "LinkedHashMap", "<", "String", ",", "ArrayList", "<", "Row", ">", ">", "rowsByAnnotation", "=", "parseSalt", "(", "input", ".", "getDocument", "(", ")", ".", "getSDocumentGraph", "(", ")", ",", "annos", ",", "(", "int", ")", "startIndex", ",", "(", "int", ")", "endIndex", ")", ";", "Row", "tokenRow", "=", "new", "Row", "(", ")", ";", "for", "(", "SToken", "t", ":", "token", ")", "{", "long", "idx", "=", "t", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_TOKENINDEX", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", "-", "startIndex", ";", "String", "text", "=", "CommonHelper", ".", "getSpannedText", "(", "t", ")", ";", "GridEvent", "event", "=", "new", "GridEvent", "(", "t", ".", "getSId", "(", ")", ",", "(", "int", ")", "idx", ",", "(", "int", ")", "idx", ",", "text", ")", ";", "SFeature", "featMatched", "=", "t", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_MATCHEDNODE", ")", ";", "Long", "match", "=", "featMatched", "==", "null", "?", "null", ":", "featMatched", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "event", ".", "setMatch", "(", "match", ")", ";", "tokenRow", ".", "addEvent", "(", "event", ")", ";", "}", "ArrayList", "<", "Row", ">", "tokenRowList", "=", "new", "ArrayList", "<", "Row", ">", "(", ")", ";", "tokenRowList", ".", "add", "(", "tokenRow", ")", ";", "if", "(", "Boolean", ".", "parseBoolean", "(", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "MAPPING_HIDE_TOK_KEY", ",", "\"false\"", ")", ")", "==", "false", ")", "{", "rowsByAnnotation", ".", "put", "(", "\"tok\"", ",", "tokenRowList", ")", ";", "}", "grid", ".", "setRowsByAnnotation", "(", "rowsByAnnotation", ")", ";", "}", "private", "long", "clip", "(", "long", "value", ",", "long", "min", ",", "long", "max", ")", "{", "if", "(", "value", ">", "max", ")", "{", "return", "max", ";", "}", "else", "if", "(", "value", "<", "min", ")", "{", "return", "min", ";", "}", "else", "{", "return", "value", ";", "}", "}", "private", "Set", "<", "String", ">", "getAnnotationLevelSet", "(", "SDocumentGraph", "graph", ",", "String", "namespace", ")", "{", "Set", "<", "String", ">", "result", "=", "new", "TreeSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "graph", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "SSpan", "n", ":", "graph", ".", "getSSpans", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "SLayer", "layer", ":", "n", ".", "getSLayers", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "namespace", ".", "equals", "(", "layer", ".", "getSName", "(", ")", ")", ")", "{", "for", "(", "SAnnotation", "anno", ":", "n", ".", "getSAnnotations", "(", ")", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "anno", ".", "getQName", "(", ")", ")", ";", "}", "break", ";", "}", "}", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "private", "LinkedHashMap", "<", "String", ",", "ArrayList", "<", "Row", ">", ">", "parseSalt", "(", "SDocumentGraph", "graph", ",", "List", "<", "String", ">", "annotationNames", ",", "long", "startTokenIndex", ",", "long", "endTokenIndex", ")", "{", "LinkedHashMap", "<", "String", ",", "ArrayList", "<", "Row", ">", ">", "rowsByAnnotation", "=", "new", "LinkedHashMap", "<", "String", ",", "ArrayList", "<", "Row", ">", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "anno", ":", "annotationNames", ")", "{", "rowsByAnnotation", ".", "put", "(", "anno", ",", "new", "ArrayList", "<", "Row", ">", "(", ")", ")", ";", "}", "EList", "<", "STYPE_NAME", ">", "types", "=", "new", "BasicEList", "<", "STYPE_NAME", ">", "(", ")", ";", "types", ".", "add", "(", "STYPE_NAME", ".", "SSPANNING_RELATION", ")", ";", "types", ".", "add", "(", "STYPE_NAME", ".", "STEXTUAL_RELATION", ")", ";", "types", ".", "add", "(", "STYPE_NAME", ".", "STEXT_OVERLAPPING_RELATION", ")", ";", "types", ".", "add", "(", "STYPE_NAME", ".", "SSEQUENTIAL_RELATION", ")", ";", "int", "eventCounter", "=", "0", ";", "for", "(", "SSpan", "span", ":", "graph", ".", "getSSpans", "(", ")", ")", "{", "long", "leftLong", "=", "span", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_LEFTTOKEN", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "long", "rightLong", "=", "span", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_RIGHTTOKEN", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "leftLong", "=", "clip", "(", "leftLong", ",", "startTokenIndex", ",", "endTokenIndex", ")", ";", "rightLong", "=", "clip", "(", "rightLong", ",", "startTokenIndex", ",", "endTokenIndex", ")", ";", "int", "left", "=", "(", "int", ")", "(", "leftLong", "-", "startTokenIndex", ")", ";", "int", "right", "=", "(", "int", ")", "(", "rightLong", "-", "startTokenIndex", ")", ";", "for", "(", "SAnnotation", "anno", ":", "span", ".", "getSAnnotations", "(", ")", ")", "{", "ArrayList", "<", "Row", ">", "rows", "=", "rowsByAnnotation", ".", "get", "(", "anno", ".", "getQName", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "rows", "==", "null", ")", "{", "rows", "=", "rowsByAnnotation", ".", "get", "(", "anno", ".", "getSName", "(", ")", ")", ";", "}", "if", "(", "rows", "!=", "null", ")", "{", "Row", "r", "=", "new", "Row", "(", ")", ";", "String", "id", "=", "\"event_\"", "+", "eventCounter", "++", ";", "GridEvent", "event", "=", "new", "GridEvent", "(", "id", ",", "left", ",", "right", ",", "anno", ".", "getSValueSTEXT", "(", ")", ")", ";", "SFeature", "featMatched", "=", "span", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_MATCHEDNODE", ")", ";", "Long", "match", "=", "featMatched", "==", "null", "?", "null", ":", "featMatched", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "event", ".", "setMatch", "(", "match", ")", ";", "EList", "<", "Edge", ">", "outEdges", "=", "graph", ".", "getOutEdges", "(", "span", ".", "getSId", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "outEdges", "!=", "null", ")", "{", "for", "(", "Edge", "e", ":", "outEdges", ")", "{", "if", "(", "e", "instanceof", "SSpanningRelation", ")", "{", "SSpanningRelation", "spanRel", "=", "(", "SSpanningRelation", ")", "e", ";", "event", ".", "getCoveredIDs", "(", ")", ".", "add", "(", "spanRel", ".", "getSTarget", "(", ")", ".", "getSId", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "double", "[", "]", "startEndTime", "=", "TimeHelper", ".", "getOverlappedTime", "(", "span", ")", ";", "if", "(", "startEndTime", ".", "length", "==", "1", ")", "{", "event", ".", "setStartTime", "(", "startEndTime", "[", "0", "]", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "startEndTime", ".", "length", "==", "2", ")", "{", "event", ".", "setStartTime", "(", "startEndTime", "[", "0", "]", ")", ";", "event", ".", "setEndTime", "(", "startEndTime", "[", "1", "]", ")", ";", "}", "r", ".", "addEvent", "(", "event", ")", ";", "rows", ".", "add", "(", "r", ")", ";", "}", "}", "}", "for", "(", "Map", ".", "Entry", "<", "String", ",", "ArrayList", "<", "Row", ">", ">", "e", ":", "rowsByAnnotation", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "mergeAllRowsIfPossible", "(", "e", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "}", "for", "(", "Map", ".", "Entry", "<", "String", ",", "ArrayList", "<", "Row", ">", ">", "e", ":", "rowsByAnnotation", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "Row", "r", ":", "e", ".", "getValue", "(", ")", ")", "{", "sortEventsByTokenIndex", "(", "r", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "Map", ".", "Entry", "<", "String", ",", "ArrayList", "<", "Row", ">", ">", "e", ":", "rowsByAnnotation", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "Row", "r", ":", "e", ".", "getValue", "(", ")", ")", "{", "splitRowsOnGaps", "(", "r", ",", "graph", ",", "startTokenIndex", ",", "endTokenIndex", ")", ";", "}", "}", "return", "rowsByAnnotation", ";", "}", "private", "void", "splitRowsOnGaps", "(", "Row", "row", ",", "final", "SDocumentGraph", "graph", ",", "long", "startTokenIndex", ",", "long", "endTokenIndex", ")", "{", "ListIterator", "<", "GridEvent", ">", "itEvents", "=", "row", ".", "getEvents", "(", ")", ".", "listIterator", "(", ")", ";", "while", "(", "itEvents", ".", "hasNext", "(", ")", ")", "{", "GridEvent", "event", "=", "itEvents", ".", "next", "(", ")", ";", "int", "lastTokenIndex", "=", "Integer", ".", "MIN_VALUE", ";", "LinkedList", "<", "String", ">", "sortedCoveredToken", "=", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", "event", ".", "getCoveredIDs", "(", ")", ")", ";", "Collections", ".", "sort", "(", "sortedCoveredToken", ",", "new", "Comparator", "<", "String", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "String", "o1", ",", "String", "o2", ")", "{", "SNode", "node1", "=", "graph", ".", "getSNode", "(", "o1", ")", ";", "SNode", "node2", "=", "graph", ".", "getSNode", "(", "o2", ")", ";", "if", "(", "node1", "==", "node2", ")", "{", "return", "0", ";", "}", "if", "(", "node1", "==", "null", ")", "{", "return", "-", "1", ";", "}", "if", "(", "node2", "==", "null", ")", "{", "return", "+", "1", ";", "}", "long", "tokenIndex1", "=", "node1", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_TOKENINDEX", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "long", "tokenIndex2", "=", "node2", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_TOKENINDEX", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "return", "(", "(", "Long", ")", "(", "tokenIndex1", ")", ")", ".", "compareTo", "(", "tokenIndex2", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "List", "<", "GridEvent", ">", "gaps", "=", "new", "LinkedList", "<", "GridEvent", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "id", ":", "sortedCoveredToken", ")", "{", "SNode", "node", "=", "graph", ".", "getSNode", "(", "id", ")", ";", "long", "tokenIndexRaw", "=", "node", ".", "getSFeature", "(", "ANNIS_NS", ",", "FEAT_TOKENINDEX", ")", ".", "getSValueSNUMERIC", "(", ")", ";", "tokenIndexRaw", "=", "clip", "(", "tokenIndexRaw", ",", "startTokenIndex", ",", "endTokenIndex", ")", ";", "int", "tokenIndex", "=", "(", "int", ")", "(", "tokenIndexRaw", "-", "startTokenIndex", ")", ";", "int", "diff", "=", "tokenIndex", "-", "lastTokenIndex", ";", "if", "(", "lastTokenIndex", ">=", "0", "&&", "diff", ">", "1", ")", "{", "GridEvent", "gap", "=", "new", "GridEvent", "(", "event", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"_gap\"", ",", "lastTokenIndex", "+", "1", ",", "tokenIndex", "-", "1", ",", "\"\"", ")", ";", "gap", ".", "setGap", "(", "true", ")", ";", "gaps", ".", "add", "(", "gap", ")", ";", "}", "lastTokenIndex", "=", "tokenIndex", ";", "}", "for", "(", "GridEvent", "gap", ":", "gaps", ")", "{", "int", "oldRight", "=", "event", ".", "getRight", "(", ")", ";", "event", ".", "setRight", "(", "gap", ".", "getLeft", "(", ")", "-", "1", ")", ";", "itEvents", ".", "add", "(", "gap", ")", ";", "GridEvent", "after", "=", "new", "GridEvent", "(", "event", ".", "getId", "(", ")", "+", "\"_after\"", ",", "gap", ".", "getRight", "(", ")", "+", "1", ",", "oldRight", ",", "event", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "after", ".", "getCoveredIDs", "(", ")", ".", "addAll", "(", "event", ".", "getCoveredIDs", "(", ")", ")", ";", "itEvents", ".", "add", "(", "after", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "void", "sortEventsByTokenIndex", "(", "Row", "row", ")", "{", "Collections", ".", "sort", "(", "row", ".", "getEvents", "(", ")", ",", "new", "Comparator", "<", "GridEvent", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "int", "compare", "(", "GridEvent", "o1", ",", "GridEvent", "o2", ")", "{", "if", "(", "o1", "==", "o2", ")", "{", "return", "0", ";", "}", "if", "(", "o1", "==", "null", ")", "{", "return", "-", "1", ";", "}", "if", "(", "o2", "==", "null", ")", "{", "return", "+", "1", ";", "}", "return", "(", "(", "Integer", ")", "o1", ".", "getLeft", "(", ")", ")", ".", "compareTo", "(", "o2", ".", "getLeft", "(", ")", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "}", "private", "void", "mergeAllRowsIfPossible", "(", "ArrayList", "<", "Row", ">", "rows", ")", "{", "Random", "rand", "=", "new", "Random", "(", "5711l", ")", ";", "int", "tries", "=", "0", ";", "final", "int", "maxTries", "=", "rows", ".", "size", "(", ")", "*", "2", ";", "while", "(", "rows", ".", "size", "(", ")", ">", "1", "&&", "tries", "<", "maxTries", ")", "{", "int", "oneIdx", "=", "rand", ".", "nextInt", "(", "rows", ".", "size", "(", ")", ")", ";", "int", "secondIdx", "=", "rand", ".", "nextInt", "(", "rows", ".", "size", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "oneIdx", "==", "secondIdx", ")", "{", "continue", ";", "}", "Row", "one", "=", "rows", ".", "get", "(", "oneIdx", ")", ";", "Row", "second", "=", "rows", ".", "get", "(", "secondIdx", ")", ";", "if", "(", "one", ".", "merge", "(", "second", ")", ")", "{", "rows", ".", "remove", "(", "secondIdx", ")", ";", "tries", "=", "0", ";", "}", "else", "{", "tries", "++", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "ImagePanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "AbstractVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerInput", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "StreamResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Embedded", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "File", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "FileInputStream", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "InputStream", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "OutputStream", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "PipedInputStream", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "PipedOutputStream", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Random", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "io", ".", "FileUtils", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "abstract", "class", "AbstractDotVisualizer", "extends", "AbstractVisualizer", "<", "ImagePanel", ">", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "AbstractDotVisualizer", ".", "class", ")", ";", "@", "Override", "public", "ImagePanel", "createComponent", "(", "final", "VisualizerInput", "visInput", ",", "Application", "application", ")", "{", "try", "{", "final", "PipedOutputStream", "out", "=", "new", "PipedOutputStream", "(", ")", ";", "final", "PipedInputStream", "in", "=", "new", "PipedInputStream", "(", "out", ")", ";", "new", "Thread", "(", "new", "Runnable", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "writeOutput", "(", "visInput", ",", "out", ")", ";", "}", "}", ")", ".", "start", "(", ")", ";", "String", "fileName", "=", "\"dotvis_\"", "+", "new", "Random", "(", ")", ".", "nextInt", "(", "Integer", ".", "MAX_VALUE", ")", "+", "\".png\"", ";", "StreamResource", "resource", "=", "new", "StreamResource", "(", "new", "StreamResource", ".", "StreamSource", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "InputStream", "getStream", "(", ")", "{", "return", "in", ";", "}", "}", ",", "fileName", ",", "application", ")", ";", "Embedded", "emb", "=", "new", "Embedded", "(", "\"\"", ",", "resource", ")", ";", "emb", ".", "setMimeType", "(", "\"image/png\"", ")", ";", "emb", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "emb", ".", "setStandby", "(", "\"\"", ")", ";", "emb", ".", "setAlternateText", "(", "\"\"", ")", ";", "return", "new", "ImagePanel", "(", "emb", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "return", "new", "ImagePanel", "(", "new", "Embedded", "(", ")", ")", ";", "}", "public", "void", "writeOutput", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "OutputStream", "outstream", ")", "{", "StringBuilder", "dot", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "try", "{", "File", "tmpInput", "=", "File", ".", "createTempFile", "(", "\"\"", ",", "\".dot\"", ")", ";", "tmpInput", ".", "deleteOnExit", "(", ")", ";", "StringBuilder", "dotContent", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "createDotContent", "(", "input", ",", "dotContent", ")", ";", "FileUtils", ".", "writeStringToFile", "(", "tmpInput", ",", "dotContent", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "ProcessBuilder", "pBuilder", "=", "new", "ProcessBuilder", "(", "input", ".", "getMappings", "(", ")", ".", "getProperty", "(", "\"dotpath\"", ",", "\"dot\"", ")", ",", "\"-Tpng\"", ",", "tmpInput", ".", "getCanonicalPath", "(", ")", ")", ";", "pBuilder", ".", "redirectErrorStream", "(", "false", ")", ";", "Process", "process", "=", "pBuilder", ".", "start", "(", ")", ";", "int", "resultCode", "=", "process", ".", "waitFor", "(", ")", ";", "if", "(", "resultCode", "!=", "0", ")", "{", "InputStream", "stderr", "=", "process", ".", "getErrorStream", "(", ")", ";", "StringBuilder", "errorMessage", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "chr", "=", "stderr", ".", "read", "(", ")", ";", "chr", "!=", "-", "1", ";", "chr", "=", "stderr", ".", "read", "(", ")", ")", "{", "errorMessage", ".", "append", "(", "(", "char", ")", "chr", ")", ";", "}", "if", "(", "!", "\"\"", ".", "equals", "(", "errorMessage", ".", "toString", "(", ")", ")", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "new", "Object", "[", "]", "{", "StringUtils", ".", "join", "(", "pBuilder", ".", "command", "(", ")", ",", "\"", "\"", ")", ",", "errorMessage", ".", "toString", "(", ")", ",", "dot", ".", "toString", "(", ")", "}", ")", ";", "}", "}", "InputStream", "fileInput", "=", "process", ".", "getInputStream", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "chr", "=", "fileInput", ".", "read", "(", ")", ";", "chr", "!=", "-", "1", ";", "chr", "=", "fileInput", ".", "read", "(", ")", ")", "{", "outstream", ".", "write", "(", "chr", ")", ";", "}", "fileInput", ".", "close", "(", ")", ";", "if", "(", "!", "tmpInput", ".", "delete", "(", ")", ")", "{", "log", ".", "warn", "(", "\"\"", "+", "tmpInput", ".", "getAbsolutePath", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "public", "abstract", "void", "createDotContent", "(", "VisualizerInput", "input", ",", "StringBuilder", "sb", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "public", "class", "CitationWindow", "extends", "Window", "implements", "Button", ".", "ClickListener", "{", "public", "CitationWindow", "(", "Application", "app", ",", "String", "query", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ",", "int", "contextLeft", ",", "int", "contextRight", ")", "{", "super", "(", "\"Citation\"", ")", ";", "VerticalLayout", "wLayout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "wLayout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "List", "<", "String", ">", "corpusNames", "=", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", "corpora", ".", "keySet", "(", ")", ")", ";", "String", "url", "=", "Helper", ".", "generateCitation", "(", "app", ",", "query", ",", "corpusNames", ",", "contextLeft", ",", "contextRight", ")", ";", "TextArea", "txtCitation", "=", "new", "TextArea", "(", ")", ";", "txtCitation", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "txtCitation", ".", "setHeight", "(", "\"100%\"", ")", ";", "txtCitation", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "TEXTFIELD_BIG", ")", ";", "txtCitation", ".", "addStyleName", "(", "\"citation\"", ")", ";", "txtCitation", ".", "setValue", "(", "url", ")", ";", "txtCitation", ".", "setWordwrap", "(", "true", ")", ";", "txtCitation", ".", "setReadOnly", "(", "true", ")", ";", "addComponent", "(", "txtCitation", ")", ";", "Button", "btOk", "=", "new", "Button", "(", "\"OK\"", ")", ";", "btOk", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btOk", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "addComponent", "(", "btOk", ")", ";", "wLayout", ".", "setExpandRatio", "(", "txtCitation", ",", "1.0f", ")", ";", "wLayout", ".", "setComponentAlignment", "(", "btOk", ",", "Alignment", ".", "BOTTOM_CENTER", ")", ";", "setWidth", "(", "\"400px\"", ")", ";", "setHeight", "(", "\"200px\"", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "this", ".", "getParent", "(", ")", ".", "removeWindow", "(", "this", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "querybuilder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ".", "ControlPanel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "HorizontalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "VerticalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "public", "class", "TigerQueryBuilder", "extends", "Panel", "implements", "Button", ".", "ClickListener", "{", "private", "Button", "btAddNode", ";", "private", "Button", "btClearAll", ";", "private", "TigerQueryBuilderCanvas", "queryBuilder", ";", "public", "TigerQueryBuilder", "(", "ControlPanel", "controlPanel", ")", "{", "VerticalLayout", "layout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "layout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "HorizontalLayout", "toolbar", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "toolbar", ".", "addStyleName", "(", "\"toolbar\"", ")", ";", "btAddNode", "=", "new", "Button", "(", "\"Add", "node\"", ",", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btAddNode", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btAddNode", ".", "setDescription", "(", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", ")", ";", "toolbar", ".", "addComponent", "(", "btAddNode", ")", ";", "btClearAll", "=", "new", "Button", "(", "\"Clear", "all\"", ",", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btClearAll", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btClearAll", ".", "setDescription", "(", "\"\"", "+", "\"\"", ")", ";", "toolbar", ".", "addComponent", "(", "btClearAll", ")", ";", "toolbar", ".", "setWidth", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "toolbar", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "addComponent", "(", "toolbar", ")", ";", "queryBuilder", "=", "new", "TigerQueryBuilderCanvas", "(", "controlPanel", ")", ";", "addComponent", "(", "queryBuilder", ")", ";", "layout", ".", "setExpandRatio", "(", "queryBuilder", ",", "1.0f", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btAddNode", ")", "{", "queryBuilder", ".", "addNode", "(", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btClearAll", ")", "{", "queryBuilder", ".", "clearAll", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "querybuilder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "querybuilder", ".", "NodeWindow", ".", "SimpleNewItemHandler", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "public", "class", "EdgeWindow", "extends", "Panel", "implements", "Button", ".", "ClickListener", "{", "private", "static", "final", "String", "[", "]", "EDGE_OPERATORS", "=", "new", "String", "[", "]", "{", "\".\"", ",", "\".*\"", ",", "\".*\"", ",", "\">\"", ",", "\">*\"", ",", "\">@l\"", ",", "\">@r\"", ",", "\"$\"", ",", "\"$*\"", ",", "\"->\"", ",", "\"_=_\"", ",", "\"_i_\"", ",", "\"_l_\"", ",", "\"'_r_\"", ",", "\"_o_\"", ",", "\"_ol_\"", ",", "\"_or_\"", "}", ";", "private", "TigerQueryBuilderCanvas", "parent", ";", "private", "ComboBox", "cbOperator", ";", "private", "Button", "btClose", ";", "private", "NodeWindow", "source", ";", "private", "NodeWindow", "target", ";", "public", "EdgeWindow", "(", "final", "TigerQueryBuilderCanvas", "parent", ",", "NodeWindow", "source", ",", "NodeWindow", "target", ")", "{", "this", ".", "parent", "=", "parent", ";", "this", ".", "source", "=", "source", ";", "this", ".", "target", "=", "target", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "VerticalLayout", "vLayout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "vLayout", ".", "setMargin", "(", "false", ")", ";", "HorizontalLayout", "toolbar", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "toolbar", ".", "addStyleName", "(", "\"toolbar\"", ")", ";", "toolbar", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "toolbar", ".", "setHeight", "(", "\"20px\"", ")", ";", "addComponent", "(", "toolbar", ")", ";", "btClose", "=", "new", "Button", "(", "\"X\"", ")", ";", "btClose", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btClose", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "toolbar", ".", "addComponent", "(", "btClose", ")", ";", "toolbar", ".", "setComponentAlignment", "(", "btClose", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "cbOperator", "=", "new", "ComboBox", "(", ")", ";", "cbOperator", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbOperator", ".", "setNewItemHandler", "(", "new", "SimpleNewItemHandler", "(", "cbOperator", ")", ")", ";", "cbOperator", ".", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "addComponent", "(", "cbOperator", ")", ";", "for", "(", "String", "o", ":", "EDGE_OPERATORS", ")", "{", "cbOperator", ".", "addItem", "(", "o", ")", ";", "}", "cbOperator", ".", "setValue", "(", "EDGE_OPERATORS", "[", "0", "]", ")", ";", "cbOperator", ".", "addListener", "(", "new", "ValueChangeListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "valueChange", "(", "ValueChangeEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "parent", "!=", "null", ")", "{", "parent", ".", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "}", "}", ")", ";", "cbOperator", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "cbOperator", ".", "setHeight", "(", "\"20px\"", ")", ";", "vLayout", ".", "setExpandRatio", "(", "cbOperator", ",", "1.0f", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btClose", ")", "{", "parent", ".", "deleteEdge", "(", "this", ")", ";", "}", "}", "public", "NodeWindow", "getSource", "(", ")", "{", "return", "source", ";", "}", "public", "NodeWindow", "getTarget", "(", ")", "{", "return", "target", ";", "}", "public", "String", "getOperator", "(", ")", "{", "return", "(", "String", ")", "cbOperator", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "querybuilder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ".", "ControlPanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "widgets", ".", "SimpleCanvas", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisAttribute", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "GenericType", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "dd", ".", "DragAndDropEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "dd", ".", "DropHandler", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "dd", ".", "acceptcriteria", ".", "AcceptAll", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "dd", ".", "acceptcriteria", ".", "AcceptCriterion", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "AbsoluteLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "AbsoluteLayout", ".", "ComponentPosition", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "DragAndDropWrapper", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "DragAndDropWrapper", ".", "WrapperTargetDetails", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "DragAndDropWrapper", ".", "WrapperTransferable", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Layout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ".", "Notification", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "geom", ".", "Line2D", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeSet", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "TigerQueryBuilderCanvas", "extends", "Panel", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "TigerQueryBuilderCanvas", ".", "class", ")", ";", "private", "SimpleCanvas", "canvas", ";", "private", "Map", "<", "NodeWindow", ",", "DragAndDropWrapper", ">", "nodes", ";", "private", "List", "<", "EdgeWindow", ">", "edges", ";", "private", "AbsoluteLayout", "area", ";", "private", "AbsoluteDropHandler", "handler", ";", "private", "int", "number", "=", "0", ";", "private", "NodeWindow", "preparedEdgeSource", "=", "null", ";", "private", "ControlPanel", "controlPanel", ";", "public", "TigerQueryBuilderCanvas", "(", "ControlPanel", "controlPanel", ")", "{", "this", ".", "controlPanel", "=", "controlPanel", ";", "nodes", "=", "new", "HashMap", "<", "NodeWindow", ",", "DragAndDropWrapper", ">", "(", ")", ";", "edges", "=", "new", "ArrayList", "<", "EdgeWindow", ">", "(", ")", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "area", "=", "new", "AbsoluteLayout", "(", ")", ";", "area", ".", "setWidth", "(", "\"2000px\"", ")", ";", "area", ".", "setHeight", "(", "\"2000px\"", ")", ";", "area", ".", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "area", ".", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "area", ".", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "canvas", "=", "new", "SimpleCanvas", "(", ")", ";", "canvas", ".", "setWidth", "(", "\"2000px\"", ")", ";", "canvas", ".", "setHeight", "(", "\"2000px\"", ")", ";", "handler", "=", "new", "AbsoluteDropHandler", "(", "this", ",", "area", ")", ";", "DragAndDropWrapper", "areaPane", "=", "new", "DragAndDropWrapper", "(", "area", ")", ";", "areaPane", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "areaPane", ".", "setDropHandler", "(", "handler", ")", ";", "area", ".", "addComponent", "(", "canvas", ",", "\"\"", ")", ";", "setContent", "(", "areaPane", ")", ";", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "}", "public", "void", "updateQuery", "(", ")", "{", "controlPanel", ".", "setQuery", "(", "getAQLQuery", "(", ")", ",", "null", ")", ";", "}", "public", "Set", "<", "String", ">", "getAvailableAnnotationNames", "(", ")", "{", "Set", "<", "String", ">", "result", "=", "new", "TreeSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "WebResource", "service", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpusSelection", "=", "controlPanel", ".", "getSelectedCorpora", "(", ")", ";", "if", "(", "service", "!=", "null", ")", "{", "try", "{", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", "atts", "=", "new", "LinkedList", "<", "AnnisAttribute", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "corpus", ":", "corpusSelection", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "atts", ".", "addAll", "(", "service", ".", "path", "(", "\"corpora\"", ")", ".", "path", "(", "corpus", ")", ".", "path", "(", "\"annotations\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"fetchvalues\"", ",", "\"false\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"\"", ",", "\"true\"", ")", ".", "get", "(", "new", "GenericType", "<", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", ">", "(", ")", "{", "}", ")", ")", ";", "}", "for", "(", "AnnisAttribute", "a", ":", "atts", ")", "{", "if", "(", "a", ".", "getType", "(", ")", "==", "AnnisAttribute", ".", "Type", ".", "node", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "a", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "public", "void", "updateLinesAndEdgePositions", "(", ")", "{", "canvas", ".", "getLines", "(", ")", ".", "clear", "(", ")", ";", "for", "(", "EdgeWindow", "e", ":", "edges", ")", "{", "DragAndDropWrapper", "w1", "=", "nodes", ".", "get", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", ")", ";", "DragAndDropWrapper", "w2", "=", "nodes", ".", "get", "(", "e", ".", "getTarget", "(", ")", ")", ";", "ComponentPosition", "p1", "=", "area", ".", "getPosition", "(", "w1", ")", ";", "ComponentPosition", "p2", "=", "area", ".", "getPosition", "(", "w2", ")", ";", "float", "x1", "=", "p1", ".", "getLeftValue", "(", ")", "+", "(", "w1", ".", "getWidth", "(", ")", "/", "2", ")", ";", "float", "y1", "=", "p1", ".", "getTopValue", "(", ")", "+", "(", "w1", ".", "getHeight", "(", ")", "/", "2", ")", ";", "float", "x2", "=", "p2", ".", "getLeftValue", "(", ")", "+", "(", "w2", ".", "getWidth", "(", ")", "/", "2", ")", ";", "float", "y2", "=", "p2", ".", "getTopValue", "(", ")", "+", "(", "w2", ".", "getHeight", "(", ")", "/", "2", ")", ";", "float", "v_x", "=", "x2", "-", "x1", ";", "float", "v_y", "=", "y2", "-", "y1", ";", "canvas", ".", "getLines", "(", ")", ".", "add", "(", "new", "Line2D", ".", "Float", "(", "x1", ",", "y1", ",", "x2", ",", "y2", ")", ")", ";", "ComponentPosition", "posEdge", "=", "area", ".", "getPosition", "(", "e", ")", ";", "float", "vectorLength", "=", "(", "float", ")", "Math", ".", "sqrt", "(", "Math", ".", "pow", "(", "x2", "-", "x1", ",", "2", ")", "+", "Math", ".", "pow", "(", "y2", "-", "y1", ",", "2", ")", ")", ";", "float", "xM", "=", "x1", "+", "(", "vectorLength", "/", "2.0f", ")", "*", "(", "(", "x2", "-", "x1", ")", "/", "vectorLength", ")", ";", "float", "yM", "=", "y1", "+", "(", "vectorLength", "/", "2.0f", ")", "*", "(", "(", "y2", "-", "y1", ")", "/", "vectorLength", ")", ";", "double", "normV_x", "=", "v_x", "/", "vectorLength", ";", "double", "normV_y", "=", "v_y", "/", "vectorLength", ";", "double", "pos1_x", "=", "(", "2.1", "*", "vectorLength", "/", "3", ")", "*", "normV_x", "+", "x1", ";", "double", "pos1_y", "=", "(", "2.1", "*", "vectorLength", "/", "3", ")", "*", "normV_y", "+", "y1", ";", "double", "origDir", "=", "Math", ".", "atan2", "(", "normV_y", ",", "normV_x", ")", ";", "double", "pos2_x", "=", "(", "(", "1", "*", "vectorLength", ")", "/", "3", ")", "*", "normV_x", "+", "x1", ";", "double", "pos2_y", "=", "(", "(", "1", "*", "vectorLength", ")", "/", "3", ")", "*", "normV_y", "+", "y1", ";", "canvas", ".", "getLines", "(", ")", ".", "addAll", "(", "createArrow", "(", "pos1_x", ",", "pos1_y", ",", "origDir", ",", "20.0", ")", ")", ";", "canvas", ".", "getLines", "(", ")", ".", "addAll", "(", "createArrow", "(", "pos2_x", ",", "pos2_y", ",", "origDir", ",", "20.0", ")", ")", ";", "posEdge", ".", "setLeftValue", "(", "xM", "-", "e", ".", "getWidth", "(", ")", "/", "2.0f", ")", ";", "posEdge", ".", "setTopValue", "(", "yM", "-", "e", ".", "getHeight", "(", ")", "/", "2.0f", ")", ";", "}", "canvas", ".", "requestRepaint", "(", ")", ";", "}", "private", "List", "<", "Line2D", ">", "createArrow", "(", "double", "x", ",", "double", "y", ",", "double", "direction", ",", "double", "arrowLength", ")", "{", "LinkedList", "<", "Line2D", ">", "result", "=", "new", "LinkedList", "<", "Line2D", ">", "(", ")", ";", "double", "dir1", "=", "direction", "+", "Math", ".", "PI", "/", "8.0", ";", "double", "dir2", "=", "direction", "-", "Math", ".", "PI", "/", "8.0", ";", "double", "end1_x", "=", "x", "-", "arrowLength", "*", "Math", ".", "cos", "(", "dir1", ")", ";", "double", "end1_y", "=", "y", "-", "arrowLength", "*", "Math", ".", "sin", "(", "dir1", ")", ";", "double", "end2_x", "=", "x", "-", "arrowLength", "*", "Math", ".", "cos", "(", "dir2", ")", ";", "double", "end2_y", "=", "y", "-", "arrowLength", "*", "Math", ".", "sin", "(", "dir2", ")", ";", "result", ".", "add", "(", "new", "Line2D", ".", "Double", "(", "x", ",", "y", ",", "end1_x", ",", "end1_y", ")", ")", ";", "result", ".", "add", "(", "new", "Line2D", ".", "Double", "(", "x", ",", "y", ",", "end2_x", ",", "end2_y", ")", ")", ";", "return", "result", ";", "}", "public", "void", "prepareAddingEdge", "(", "NodeWindow", "sourceNode", ")", "{", "preparedEdgeSource", "=", "sourceNode", ";", "for", "(", "NodeWindow", "w", ":", "nodes", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "w", "!=", "sourceNode", ")", "{", "w", ".", "setPrepareEdgeDock", "(", "true", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "void", "addEdge", "(", "NodeWindow", "target", ")", "{", "for", "(", "NodeWindow", "w", ":", "nodes", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "w", ".", "setPrepareEdgeDock", "(", "false", ")", ";", "}", "if", "(", "preparedEdgeSource", "!=", "target", ")", "{", "boolean", "valid", "=", "true", ";", "for", "(", "EdgeWindow", "e", ":", "edges", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", "==", "preparedEdgeSource", "&&", "e", ".", "getTarget", "(", ")", "==", "target", ")", "{", "valid", "=", "false", ";", "break", ";", "}", "}", "if", "(", "valid", ")", "{", "EdgeWindow", "e", "=", "new", "EdgeWindow", "(", "this", ",", "preparedEdgeSource", ",", "target", ")", ";", "e", ".", "setWidth", "(", "\"70px\"", ")", ";", "e", ".", "setHeight", "(", "\"50px\"", ")", ";", "edges", ".", "add", "(", "e", ")", ";", "area", ".", "addComponent", "(", "e", ")", ";", "updateLinesAndEdgePositions", "(", ")", ";", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "else", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "void", "deleteEdge", "(", "EdgeWindow", "e", ")", "{", "area", ".", "removeComponent", "(", "e", ")", ";", "edges", ".", "remove", "(", "e", ")", ";", "updateLinesAndEdgePositions", "(", ")", ";", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "public", "void", "addNode", "(", ")", "{", "final", "NodeWindow", "n", "=", "new", "NodeWindow", "(", "number", "++", ",", "this", ")", ";", "DragAndDropWrapper", "wrapper", "=", "new", "DragAndDropWrapper", "(", "n", ")", ";", "nodes", ".", "put", "(", "n", ",", "wrapper", ")", ";", "wrapper", ".", "setDragStartMode", "(", "DragAndDropWrapper", ".", "DragStartMode", ".", "WRAPPER", ")", ";", "wrapper", ".", "setWidth", "(", "NodeWindow", ".", "WIDTH", ",", "Layout", ".", "UNITS_PIXELS", ")", ";", "wrapper", ".", "setHeight", "(", "NodeWindow", ".", "HEIGHT", ",", "Layout", ".", "UNITS_PIXELS", ")", ";", "area", ".", "addComponent", "(", "wrapper", ",", "\"top:\"", "+", "(", "40", "*", "(", "number", "+", "1", ")", ")", "+", "\"px;left:10px\"", ")", ";", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "public", "void", "deleteNode", "(", "NodeWindow", "n", ")", "{", "LinkedList", "<", "EdgeWindow", ">", "edgesToRemove", "=", "new", "LinkedList", "<", "EdgeWindow", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "EdgeWindow", "e", ":", "edges", ")", "{", "if", "(", "e", ".", "getSource", "(", ")", "==", "n", "||", "e", ".", "getTarget", "(", ")", "==", "n", ")", "{", "edgesToRemove", ".", "add", "(", "e", ")", ";", "area", ".", "removeComponent", "(", "e", ")", ";", "}", "}", "edges", ".", "removeAll", "(", "edgesToRemove", ")", ";", "area", ".", "removeComponent", "(", "nodes", ".", "get", "(", "n", ")", ")", ";", "nodes", ".", "remove", "(", "n", ")", ";", "updateLinesAndEdgePositions", "(", ")", ";", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "public", "void", "clearAll", "(", ")", "{", "for", "(", "EdgeWindow", "w", ":", "edges", ")", "{", "area", ".", "removeComponent", "(", "w", ")", ";", "}", "edges", ".", "clear", "(", ")", ";", "for", "(", "DragAndDropWrapper", "w", ":", "nodes", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "area", ".", "removeComponent", "(", "w", ")", ";", "}", "nodes", ".", "clear", "(", ")", ";", "number", "=", "0", ";", "updateLinesAndEdgePositions", "(", ")", ";", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "private", "static", "class", "AbsoluteDropHandler", "implements", "DropHandler", "{", "private", "AbsoluteLayout", "layout", ";", "private", "TigerQueryBuilderCanvas", "parent", ";", "public", "AbsoluteDropHandler", "(", "TigerQueryBuilderCanvas", "parent", ",", "AbsoluteLayout", "layout", ")", "{", "this", ".", "layout", "=", "layout", ";", "this", ".", "parent", "=", "parent", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "drop", "(", "DragAndDropEvent", "event", ")", "{", "WrapperTransferable", "t", "=", "(", "WrapperTransferable", ")", "event", ".", "getTransferable", "(", ")", ";", "WrapperTargetDetails", "details", "=", "(", "WrapperTargetDetails", ")", "event", ".", "getTargetDetails", "(", ")", ";", "if", "(", "t", "==", "null", "||", "details", "==", "null", ")", "{", "return", ";", "}", "int", "xChange", "=", "details", ".", "getMouseEvent", "(", ")", ".", "getClientX", "(", ")", "-", "t", ".", "getMouseDownEvent", "(", ")", ".", "getClientX", "(", ")", ";", "int", "yChange", "=", "details", ".", "getMouseEvent", "(", ")", ".", "getClientY", "(", ")", "-", "t", ".", "getMouseDownEvent", "(", ")", ".", "getClientY", "(", ")", ";", "ComponentPosition", "pos", "=", "layout", ".", "getPosition", "(", "t", ".", "getSourceComponent", "(", ")", ")", ";", "pos", ".", "setLeftValue", "(", "pos", ".", "getLeftValue", "(", ")", "+", "xChange", ")", ";", "pos", ".", "setTopValue", "(", "pos", ".", "getTopValue", "(", ")", "+", "yChange", ")", ";", "if", "(", "parent", "!=", "null", ")", "{", "parent", ".", "updateLinesAndEdgePositions", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "AcceptCriterion", "getAcceptCriterion", "(", ")", "{", "return", "AcceptAll", ".", "get", "(", ")", ";", "}", "}", "public", "String", "getAQLQuery", "(", ")", "{", "StringBuilder", "query", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "StringBuffer", "nodeIdentityOperations", "=", "new", "StringBuffer", "(", ")", ";", "Map", "<", "NodeWindow", ",", "Integer", ">", "nodeComponentMap", "=", "new", "HashMap", "<", "NodeWindow", ",", "Integer", ">", "(", ")", ";", "int", "componentCount", "=", "0", ";", "int", "nodeID", "=", "1", ";", "for", "(", "NodeWindow", "nodeWindow", ":", "nodes", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "List", "<", "NodeWindow", ".", "ConstraintLayout", ">", "constraints", "=", "nodeWindow", ".", "getConstraints", "(", ")", ";", "if", "(", "componentCount", "++", ">", "0", ")", "{", "query", ".", "append", "(", "\"", "&", "\"", ")", ";", "}", "if", "(", "constraints", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "int", "nodeComponentCount", "=", "0", ";", "for", "(", "NodeWindow", ".", "ConstraintLayout", "c", ":", "constraints", ")", "{", "if", "(", "nodeComponentCount", "++", ">", "0", ")", "{", "nodeIdentityOperations", ".", "append", "(", "\"n&", "#\"", ")", ".", "append", "(", "componentCount", ")", ".", "append", "(", "\"", "=", "#\"", ")", ".", "append", "(", "componentCount", "+", "1", ")", ";", "query", ".", "append", "(", "\"", "&", "\"", ")", ";", "componentCount", "++", ";", "}", "String", "operator", "=", "c", ".", "getOperator", "(", ")", ".", "replace", "(", "\"~\"", ",", "\"=\"", ")", ";", "String", "quotes", "=", "c", ".", "getOperator", "(", ")", ".", "equals", "(", "\"=\"", ")", "||", "c", ".", "getOperator", "(", ")", ".", "equals", "(", "\"!=\"", ")", "?", "\"\\\"\"", ":", "\"/\"", ";", "String", "prefix", "=", "\"\"", ";", "if", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ".", "trim", "(", ")", ".", "isEmpty", "(", ")", "||", "c", ".", "getName", "(", ")", ".", "trim", "(", ")", ".", "equals", "(", "\"tok\"", ")", ")", "{", "if", "(", "operator", ".", "equals", "(", "\"!=\"", ")", ")", "{", "prefix", "=", "\"tok\"", "+", "c", ".", "getName", "(", ")", "+", "operator", ";", "}", "}", "else", "{", "prefix", "=", "c", ".", "getName", "(", ")", "+", "operator", ";", "}", "if", "(", "\"\"", ".", "equals", "(", "c", ".", "getValue", "(", ")", ")", ")", "{", "query", ".", "append", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "query", ".", "append", "(", "prefix", ")", ".", "append", "(", "quotes", ")", ".", "append", "(", "c", ".", "getValue", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "quotes", ")", ";", "}", "}", "}", "else", "{", "query", ".", "append", "(", "\"node\"", ")", ";", "}", "nodeComponentMap", ".", "put", "(", "nodeWindow", ",", "componentCount", ")", ";", "nodeID", "++", ";", "}", "query", ".", "append", "(", "nodeIdentityOperations", ")", ";", "for", "(", "EdgeWindow", "edgeWindow", ":", "edges", ")", "{", "query", ".", "append", "(", "\"n&", "\"", ")", ";", "query", ".", "append", "(", "'#'", ")", ".", "append", "(", "nodeComponentMap", ".", "get", "(", "edgeWindow", ".", "getSource", "(", ")", ")", ")", ".", "append", "(", "\"", "\"", ")", ".", "append", "(", "edgeWindow", ".", "getOperator", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "\"", "\"", ")", ".", "append", "(", "\"#\"", ")", ".", "append", "(", "nodeComponentMap", ".", "get", "(", "edgeWindow", ".", "getTarget", "(", ")", ")", ")", ";", "}", "return", "query", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "querybuilder", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "LayoutEvents", ".", "LayoutClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "LayoutEvents", ".", "LayoutClickListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "AbstractSelect", ".", "NewItemHandler", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeSet", ";", "public", "class", "NodeWindow", "extends", "Panel", "implements", "Button", ".", "ClickListener", "{", "public", "static", "final", "int", "HEIGHT", "=", "100", ";", "public", "static", "final", "int", "WIDTH", "=", "200", ";", "private", "static", "final", "String", "[", "]", "NODE_OPERATORS", "=", "new", "String", "[", "]", "{", "\"=\"", ",", "\"~\"", ",", "\"!=\"", ",", "\"!~\"", "}", ";", "private", "Set", "<", "String", ">", "annoNames", ";", "private", "TigerQueryBuilderCanvas", "parent", ";", "private", "Button", "btEdge", ";", "private", "Button", "btAdd", ";", "private", "Button", "btClear", ";", "private", "Button", "btClose", ";", "private", "HorizontalLayout", "toolbar", ";", "private", "List", "<", "ConstraintLayout", ">", "constraints", ";", "private", "boolean", "prepareEdgeDock", ";", "private", "int", "id", ";", "public", "NodeWindow", "(", "int", "id", ",", "TigerQueryBuilderCanvas", "parent", ")", "{", "this", ".", "parent", "=", "parent", ";", "this", ".", "id", "=", "id", ";", "this", ".", "annoNames", "=", "new", "TreeSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "a", ":", "parent", ".", "getAvailableAnnotationNames", "(", ")", ")", "{", "annoNames", ".", "add", "(", "a", ".", "replaceFirst", "(", "\"^[^:]*:\"", ",", "\"\"", ")", ")", ";", "}", "constraints", "=", "new", "ArrayList", "<", "ConstraintLayout", ">", "(", ")", ";", "setWidth", "(", "\"99%\"", ")", ";", "setHeight", "(", "\"99%\"", ")", ";", "prepareEdgeDock", "=", "false", ";", "VerticalLayout", "vLayout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "vLayout", ".", "setMargin", "(", "false", ")", ";", "toolbar", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "toolbar", ".", "addStyleName", "(", "\"toolbar\"", ")", ";", "toolbar", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "toolbar", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "addComponent", "(", "toolbar", ")", ";", "btEdge", "=", "new", "Button", "(", "\"Edge\"", ")", ";", "btEdge", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btEdge", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btEdge", ".", "setDescription", "(", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", ")", ";", "toolbar", ".", "addComponent", "(", "btEdge", ")", ";", "btAdd", "=", "new", "Button", "(", "\"Add\"", ")", ";", "btAdd", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btAdd", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btAdd", ".", "setDescription", "(", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", ")", ";", "toolbar", ".", "addComponent", "(", "btAdd", ")", ";", "btClear", "=", "new", "Button", "(", "\"Clear\"", ")", ";", "btClear", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btClear", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btClear", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "toolbar", ".", "addComponent", "(", "btClear", ")", ";", "btClose", "=", "new", "Button", "(", "\"X\"", ")", ";", "btClose", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_SMALL", ")", ";", "btClose", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "toolbar", ".", "addComponent", "(", "btClose", ")", ";", "toolbar", ".", "setComponentAlignment", "(", "btClose", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "}", "public", "void", "setPrepareEdgeDock", "(", "boolean", "prepare", ")", "{", "this", ".", "prepareEdgeDock", "=", "prepare", ";", "btClear", ".", "setVisible", "(", "!", "prepare", ")", ";", "btClose", ".", "setVisible", "(", "!", "prepare", ")", ";", "btAdd", ".", "setVisible", "(", "!", "prepare", ")", ";", "if", "(", "prepare", ")", "{", "btEdge", ".", "setCaption", "(", "\"Dock\"", ")", ";", "}", "else", "{", "btEdge", ".", "setCaption", "(", "\"Edge\"", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btEdge", ")", "{", "if", "(", "prepareEdgeDock", ")", "{", "setPrepareEdgeDock", "(", "false", ")", ";", "parent", ".", "addEdge", "(", "this", ")", ";", "}", "else", "{", "parent", ".", "prepareAddingEdge", "(", "this", ")", ";", "setPrepareEdgeDock", "(", "true", ")", ";", "btEdge", ".", "setCaption", "(", "\"Cancel\"", ")", ";", "}", "}", "else", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btClose", ")", "{", "parent", ".", "deleteNode", "(", "this", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btAdd", ")", "{", "ConstraintLayout", "c", "=", "new", "ConstraintLayout", "(", "parent", ",", "annoNames", ")", ";", "c", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "c", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "constraints", ".", "add", "(", "c", ")", ";", "addComponent", "(", "c", ")", ";", "if", "(", "parent", "!=", "null", ")", "{", "parent", ".", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "}", "else", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btClear", ")", "{", "for", "(", "ConstraintLayout", "c", ":", "constraints", ")", "{", "removeComponent", "(", "c", ")", ";", "}", "constraints", ".", "clear", "(", ")", ";", "if", "(", "parent", "!=", "null", ")", "{", "parent", ".", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "int", "getID", "(", ")", "{", "return", "id", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "getClass", "(", ")", "!=", "obj", ".", "getClass", "(", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "final", "NodeWindow", "other", "=", "(", "NodeWindow", ")", "obj", ";", "return", "other", ".", "getID", "(", ")", "==", "getID", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "int", "hash", "=", "5", ";", "hash", "=", "41", "*", "hash", "+", "this", ".", "id", ";", "return", "hash", ";", "}", "public", "List", "<", "ConstraintLayout", ">", "getConstraints", "(", ")", "{", "return", "constraints", ";", "}", "public", "static", "class", "ConstraintLayout", "extends", "HorizontalLayout", "implements", "LayoutClickListener", ",", "ValueChangeListener", "{", "private", "TigerQueryBuilderCanvas", "parent", ";", "private", "ComboBox", "cbName", ";", "private", "ComboBox", "cbOperator", ";", "private", "TextField", "txtValue", ";", "public", "ConstraintLayout", "(", "TigerQueryBuilderCanvas", "parent", ",", "Set", "<", "String", ">", "annoNames", ")", "{", "this", ".", "parent", "=", "parent", ";", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "cbName", "=", "new", "ComboBox", "(", ")", ";", "cbName", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbName", ".", "setNewItemHandler", "(", "new", "SimpleNewItemHandler", "(", "cbName", ")", ")", ";", "cbName", ".", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "cbName", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbName", ".", "setNullSelectionItemId", "(", "\"tok\"", ")", ";", "cbName", ".", "addItem", "(", "\"tok\"", ")", ";", "for", "(", "String", "n", ":", "annoNames", ")", "{", "cbName", ".", "addItem", "(", "n", ")", ";", "}", "cbName", ".", "setValue", "(", "\"tok\"", ")", ";", "cbName", ".", "addListener", "(", "(", "ValueChangeListener", ")", "this", ")", ";", "cbOperator", "=", "new", "ComboBox", "(", ")", ";", "cbOperator", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbOperator", ".", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "for", "(", "String", "o", ":", "NODE_OPERATORS", ")", "{", "cbOperator", ".", "addItem", "(", "o", ")", ";", "}", "cbOperator", ".", "setValue", "(", "NODE_OPERATORS", "[", "0", "]", ")", ";", "cbOperator", ".", "addListener", "(", "(", "ValueChangeListener", ")", "this", ")", ";", "txtValue", "=", "new", "TextField", "(", ")", ";", "txtValue", ".", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "txtValue", ".", "addListener", "(", "(", "ValueChangeListener", ")", "this", ")", ";", "cbOperator", ".", "setWidth", "(", "\"3em\"", ")", ";", "cbName", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "txtValue", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "addComponent", "(", "cbName", ")", ";", "addComponent", "(", "cbOperator", ")", ";", "addComponent", "(", "txtValue", ")", ";", "setExpandRatio", "(", "cbName", ",", "0.8f", ")", ";", "setExpandRatio", "(", "txtValue", ",", "1.0f", ")", ";", "addListener", "(", "(", "LayoutClickListener", ")", "this", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "layoutClick", "(", "LayoutClickEvent", "event", ")", "{", "Component", "c", "=", "event", ".", "getClickedComponent", "(", ")", ";", "if", "(", "c", "!=", "null", "&&", "c", "instanceof", "AbstractField", ")", "{", "AbstractField", "f", "=", "(", "AbstractField", ")", "c", ";", "f", ".", "focus", "(", ")", ";", "if", "(", "event", ".", "isDoubleClick", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "f", "instanceof", "AbstractTextField", ")", "{", "(", "(", "AbstractTextField", ")", "f", ")", ".", "selectAll", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "public", "String", "getOperator", "(", ")", "{", "if", "(", "cbOperator", ".", "getValue", "(", ")", "==", "null", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "else", "{", "return", "(", "String", ")", "cbOperator", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "public", "String", "getName", "(", ")", "{", "if", "(", "cbName", ".", "getValue", "(", ")", "==", "null", ")", "{", "return", "\"tok\"", ";", "}", "else", "{", "return", "(", "String", ")", "cbName", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "public", "String", "getValue", "(", ")", "{", "if", "(", "txtValue", ".", "getValue", "(", ")", "==", "null", ")", "{", "return", "\"\"", ";", "}", "else", "{", "return", "(", "String", ")", "txtValue", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "valueChange", "(", "ValueChangeEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "parent", "!=", "null", ")", "{", "parent", ".", "updateQuery", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "static", "class", "SimpleNewItemHandler", "implements", "NewItemHandler", "{", "private", "ComboBox", "comboBox", ";", "public", "SimpleNewItemHandler", "(", "ComboBox", "comboBox", ")", "{", "this", ".", "comboBox", "=", "comboBox", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "addNewItem", "(", "String", "newItemCaption", ")", "{", "if", "(", "comboBox", "!=", "null", ")", "{", "comboBox", ".", "addItem", "(", "newItemCaption", ")", ";", "comboBox", ".", "setValue", "(", "newItemCaption", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "CorpusBrowserPanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MetaDataPanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "MainApp", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisSecurityManager", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisUser", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "ClientHandlerException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "GenericType", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "UniformInterfaceException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ".", "UserChangeEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ".", "UserChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Item", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "util", ".", "BeanContainer", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "util", ".", "DefaultItemSorter", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "Action", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ThemeResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "AbstractSelect", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Alignment", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "ComboBox", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Component", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "HorizontalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Label", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Table", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "VerticalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ".", "Notification", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "BaseTheme", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeMap", ";", "import", "javax", ".", "naming", ".", "AuthenticationException", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "CorpusListPanel", "extends", "Panel", "implements", "UserChangeListener", ",", "AbstractSelect", ".", "NewItemHandler", ",", "ValueChangeListener", ",", "Action", ".", "Handler", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "CorpusListPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "static", "final", "ThemeResource", "INFO_ICON", "=", "new", "ThemeResource", "(", "\"info.gif\"", ")", ";", "public", "static", "final", "String", "ALL_CORPORA", "=", "\"All\"", ";", "public", "static", "final", "String", "CORPUSSET_PREFIX", "=", "\"corpusset_\"", ";", "public", "enum", "ActionType", "{", "Add", ",", "Remove", "}", ";", "BeanContainer", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpusContainer", ";", "private", "Table", "tblCorpora", ";", "private", "ControlPanel", "controlPanel", ";", "private", "ComboBox", "cbSelection", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", ">", "corpusSets", "=", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", ">", "(", ")", ";", "public", "CorpusListPanel", "(", "ControlPanel", "controlPanel", ")", "{", "this", ".", "controlPanel", "=", "controlPanel", ";", "final", "CorpusListPanel", "finalThis", "=", "this", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "VerticalLayout", "layout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "layout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "HorizontalLayout", "selectionLayout", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "selectionLayout", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "selectionLayout", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "Label", "lblVisible", "=", "new", "Label", "(", "\"Visible:", "\"", ")", ";", "lblVisible", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "selectionLayout", ".", "addComponent", "(", "lblVisible", ")", ";", "cbSelection", "=", "new", "ComboBox", "(", ")", ";", "cbSelection", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "cbSelection", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "cbSelection", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "cbSelection", ".", "setInputPrompt", "(", "\"\"", ")", ";", "cbSelection", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbSelection", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbSelection", ".", "setNewItemHandler", "(", "(", "AbstractSelect", ".", "NewItemHandler", ")", "this", ")", ";", "cbSelection", ".", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "cbSelection", ".", "addListener", "(", "(", "ValueChangeListener", ")", "this", ")", ";", "selectionLayout", ".", "addComponent", "(", "cbSelection", ")", ";", "selectionLayout", ".", "setExpandRatio", "(", "cbSelection", ",", "1.0f", ")", ";", "selectionLayout", ".", "setSpacing", "(", "true", ")", ";", "selectionLayout", ".", "setComponentAlignment", "(", "cbSelection", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "selectionLayout", ".", "setComponentAlignment", "(", "lblVisible", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_LEFT", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "selectionLayout", ")", ";", "tblCorpora", "=", "new", "Table", "(", ")", ";", "addComponent", "(", "tblCorpora", ")", ";", "corpusContainer", "=", "new", "BeanContainer", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", "AnnisCorpus", ".", "class", ")", ";", "corpusContainer", ".", "setBeanIdProperty", "(", "\"name\"", ")", ";", "corpusContainer", ".", "setItemSorter", "(", "new", "CorpusSorter", "(", ")", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setContainerDataSource", "(", "corpusContainer", ")", ";", "tblCorpora", ".", "addGeneratedColumn", "(", "\"info\"", ",", "new", "InfoGenerator", "(", ")", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setVisibleColumns", "(", "new", "String", "[", "]", "{", "\"name\"", ",", "\"textCount\"", ",", "\"tokenCount\"", ",", "\"info\"", "}", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setColumnHeaders", "(", "new", "String", "[", "]", "{", "\"Name\"", ",", "\"Texts\"", ",", "\"Tokens\"", ",", "\"\"", "}", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setHeight", "(", "100f", ",", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setWidth", "(", "100f", ",", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setSelectable", "(", "true", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setMultiSelect", "(", "true", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setColumnExpandRatio", "(", "\"name\"", ",", "0.6f", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setColumnExpandRatio", "(", "\"textCount\"", ",", "0.15f", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setColumnExpandRatio", "(", "\"tokenCount\"", ",", "0.25f", ")", ";", "tblCorpora", ".", "addActionHandler", "(", "(", "Action", ".", "Handler", ")", "this", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "tblCorpora", ".", "addListener", "(", "new", "ValueChangeListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "valueChange", "(", "ValueChangeEvent", "event", ")", "{", "finalThis", ".", "controlPanel", ".", "corpusSelectionChanged", "(", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "layout", ".", "setExpandRatio", "(", "tblCorpora", ",", "1.0f", ")", ";", "Button", "btReload", "=", "new", "Button", "(", ")", ";", "btReload", ".", "addListener", "(", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "MainApp", "app", "=", "(", "MainApp", ")", "getApplication", "(", ")", ";", "try", "{", "app", ".", "getWindowSearch", "(", ")", ".", "getSecurityManager", "(", ")", ".", "updateUserCorpusList", "(", "app", ".", "getUser", "(", ")", ",", "true", ")", ";", "}", "catch", "(", "AuthenticationException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "updateCorpusSetList", "(", "false", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "Notification", ".", "TYPE_HUMANIZED_MESSAGE", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "btReload", ".", "setIcon", "(", "new", "ThemeResource", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "btReload", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "btReload", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_ICON_ONLY", ")", ";", "selectionLayout", ".", "addComponent", "(", "btReload", ")", ";", "selectionLayout", ".", "setComponentAlignment", "(", "btReload", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "getApplication", "(", ")", ".", "addListener", "(", "(", "UserChangeListener", ")", "this", ")", ";", "tblCorpora", ".", "setSortContainerPropertyId", "(", "\"name\"", ")", ";", "updateCorpusSetList", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "updateCorpusSetList", "(", ")", "{", "updateCorpusSetList", "(", "true", ")", ";", "}", "private", "void", "updateCorpusSetList", "(", "boolean", "showLoginMessage", ")", "{", "corpusSets", ".", "clear", "(", ")", ";", "AnnisUser", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", ";", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "allCorpora", "=", "getCorpusList", "(", "user", ")", ";", "corpusSets", ".", "put", "(", "ALL_CORPORA", ",", "allCorpora", ")", ";", "if", "(", "user", "!=", "null", ")", "{", "if", "(", "user", ".", "getUserName", "(", ")", ".", "equals", "(", "AnnisSecurityManager", ".", "FALLBACK_USER", ")", ")", "{", "if", "(", "corpusSets", ".", "get", "(", "ALL_CORPORA", ")", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "\"\"", ",", "Notification", ".", "TYPE_HUMANIZED_MESSAGE", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "showLoginMessage", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "String", "p", ":", "user", ".", "stringPropertyNames", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "p", ".", "startsWith", "(", "CORPUSSET_PREFIX", ")", ")", "{", "String", "setName", "=", "p", ".", "substring", "(", "CORPUSSET_PREFIX", ".", "length", "(", ")", ")", ";", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", "=", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ";", "String", "corpusString", "=", "user", ".", "getProperty", "(", "p", ")", ";", "if", "(", "!", "ALL_CORPORA", ".", "equals", "(", "setName", ")", "&&", "corpusString", "!=", "null", ")", "{", "String", "[", "]", "splitted", "=", "corpusString", ".", "split", "(", "\",\"", ")", ";", "for", "(", "String", "s", ":", "splitted", ")", "{", "if", "(", "!", "\"\"", ".", "equals", "(", "s", ")", ")", "{", "try", "{", "AnnisCorpus", "c", "=", "allCorpora", ".", "get", "(", "s", ")", ";", "if", "(", "c", "!=", "null", ")", "{", "corpora", ".", "put", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ",", "c", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "NumberFormatException", "ex", ")", "{", "log", ".", "warn", "(", "\"\"", "+", "setName", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "corpusSets", ".", "put", "(", "setName", ",", "corpora", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "Object", "oldSelection", "=", "cbSelection", ".", "getValue", "(", ")", ";", "cbSelection", ".", "removeAllItems", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "n", ":", "corpusSets", ".", "keySet", "(", ")", ")", "{", "cbSelection", ".", "addItem", "(", "n", ")", ";", "}", "if", "(", "oldSelection", "!=", "null", "&&", "cbSelection", ".", "containsId", "(", "oldSelection", ")", ")", "{", "cbSelection", ".", "select", "(", "oldSelection", ")", ";", "}", "else", "{", "cbSelection", ".", "select", "(", "ALL_CORPORA", ")", ";", "}", "updateCorpusList", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "updateCorpusList", "(", ")", "{", "corpusContainer", ".", "removeAllItems", "(", ")", ";", "String", "selectedCorpusSet", "=", "(", "String", ")", "cbSelection", ".", "getValue", "(", ")", ";", "if", "(", "selectedCorpusSet", "==", "null", ")", "{", "selectedCorpusSet", "=", "ALL_CORPORA", ";", "}", "if", "(", "corpusSets", ".", "containsKey", "(", "selectedCorpusSet", ")", ")", "{", "corpusContainer", ".", "addAll", "(", "corpusSets", ".", "get", "(", "selectedCorpusSet", ")", ".", "values", "(", ")", ")", ";", "}", "tblCorpora", ".", "sort", "(", ")", ";", "}", "private", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "getCorpusList", "(", "AnnisUser", "user", ")", "{", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "result", "=", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ";", "try", "{", "WebResource", "res", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "List", "<", "AnnisCorpus", ">", "corpora", "=", "res", ".", "path", "(", "\"corpora\"", ")", ".", "get", "(", "new", "GenericType", "<", "List", "<", "AnnisCorpus", ">", ">", "(", ")", "{", "}", ")", ";", "for", "(", "AnnisCorpus", "c", ":", "corpora", ")", "{", "if", "(", "user", "==", "null", "||", "user", ".", "getCorpusNameList", "(", ")", ".", "contains", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "{", "result", ".", "put", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ",", "c", ")", ";", "}", "}", "}", "catch", "(", "ClientHandlerException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ",", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "catch", "(", "UniformInterfaceException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ",", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"Exception:", "\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ",", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "return", "result", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "applicationUserChanged", "(", "UserChangeEvent", "event", ")", "{", "updateCorpusSetList", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "addNewItem", "(", "String", "newItemCaption", ")", "{", "if", "(", "!", "cbSelection", ".", "containsId", "(", "newItemCaption", ")", ")", "{", "cbSelection", ".", "addItem", "(", "newItemCaption", ")", ";", "cbSelection", ".", "setValue", "(", "newItemCaption", ")", ";", "corpusSets", ".", "put", "(", "newItemCaption", ",", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ")", ";", "updateCorpusList", "(", ")", ";", "Application", "app", "=", "getApplication", "(", ")", ";", "if", "(", "app", "instanceof", "MainApp", ")", "{", "AnnisSecurityManager", "sm", "=", "(", "(", "MainApp", ")", "app", ")", ".", "getSecurityManager", "(", ")", ";", "AnnisUser", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "app", ".", "getUser", "(", ")", ";", "if", "(", "sm", "!=", "null", "&&", "!", "AnnisSecurityManager", ".", "FALLBACK_USER", ".", "equals", "(", "user", ".", "getUserName", "(", ")", ")", ")", "{", "user", ".", "put", "(", "CORPUSSET_PREFIX", "+", "newItemCaption", ",", "\"\"", ")", ";", "try", "{", "sm", ".", "storeUserProperties", "(", "user", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ",", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "valueChange", "(", "ValueChangeEvent", "event", ")", "{", "updateCorpusList", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "Action", "[", "]", "getActions", "(", "Object", "target", ",", "Object", "sender", ")", "{", "String", "corpusName", "=", "(", "String", ")", "target", ";", "LinkedList", "<", "Action", ">", "result", "=", "new", "LinkedList", "<", "Action", ">", "(", ")", ";", "AnnisUser", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", ";", "if", "(", "user", "==", "null", "||", "AnnisSecurityManager", ".", "FALLBACK_USER", ".", "equals", "(", "user", ".", "getUserName", "(", ")", ")", ")", "{", "return", "new", "Action", "[", "0", "]", ";", "}", "for", "(", "Map", ".", "Entry", "<", "String", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", ">", "entry", ":", "corpusSets", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "entry", ".", "getValue", "(", ")", "!=", "null", "&&", "!", "ALL_CORPORA", ".", "equals", "(", "entry", ".", "getKey", "(", ")", ")", "&&", "corpusName", "!=", "null", ")", "{", "if", "(", "entry", ".", "getValue", "(", ")", ".", "containsKey", "(", "corpusName", ")", ")", "{", "result", ".", "add", "(", "new", "AddRemoveAction", "(", "ActionType", ".", "Remove", ",", "entry", ".", "getKey", "(", ")", ",", "corpusName", ",", "\"Remove", "from", "\"", "+", "entry", ".", "getKey", "(", ")", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "result", ".", "add", "(", "new", "AddRemoveAction", "(", "ActionType", ".", "Add", ",", "entry", ".", "getKey", "(", ")", ",", "corpusName", ",", "\"Add", "to", "\"", "+", "entry", ".", "getKey", "(", ")", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "return", "result", ".", "toArray", "(", "new", "Action", "[", "0", "]", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "handleAction", "(", "Action", "action", ",", "Object", "sender", ",", "Object", "target", ")", "{", "if", "(", "action", "instanceof", "AddRemoveAction", ")", "{", "AddRemoveAction", "a", "=", "(", "AddRemoveAction", ")", "action", ";", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "set", "=", "corpusSets", ".", "get", "(", "a", ".", "getCorpusSet", "(", ")", ")", ";", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "allCorpora", "=", "corpusSets", ".", "get", "(", "ALL_CORPORA", ")", ";", "if", "(", "a", ".", "type", "==", "ActionType", ".", "Remove", ")", "{", "set", ".", "remove", "(", "a", ".", "getCorpusId", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "set", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "corpusSets", ".", "remove", "(", "a", ".", "getCorpusSet", "(", ")", ")", ";", "cbSelection", ".", "removeItem", "(", "a", ".", "getCorpusSet", "(", ")", ")", ";", "cbSelection", ".", "select", "(", "ALL_CORPORA", ")", ";", "}", "}", "else", "if", "(", "a", ".", "type", "==", "ActionType", ".", "Add", ")", "{", "set", ".", "put", "(", "a", ".", "getCorpusId", "(", ")", ",", "allCorpora", ".", "get", "(", "a", ".", "getCorpusId", "(", ")", ")", ")", ";", "}", "Application", "app", "=", "getApplication", "(", ")", ";", "if", "(", "app", "instanceof", "MainApp", ")", "{", "AnnisSecurityManager", "sm", "=", "(", "(", "MainApp", ")", "app", ")", ".", "getSecurityManager", "(", ")", ";", "AnnisUser", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "app", ".", "getUser", "(", ")", ";", "LinkedList", "<", "String", ">", "keys", "=", "new", "LinkedList", "<", "String", ">", "(", "user", ".", "stringPropertyNames", "(", ")", ")", ";", "for", "(", "String", "key", ":", "keys", ")", "{", "if", "(", "key", ".", "startsWith", "(", "CORPUSSET_PREFIX", ")", ")", "{", "user", ".", "remove", "(", "key", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "Map", ".", "Entry", "<", "String", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", ">", "entry", ":", "corpusSets", ".", "entrySet", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "ALL_CORPORA", ".", "equals", "(", "entry", ".", "getKey", "(", ")", ")", ")", "{", "String", "key", "=", "CORPUSSET_PREFIX", "+", "entry", ".", "getKey", "(", ")", ";", "String", "value", "=", "StringUtils", ".", "join", "(", "entry", ".", "getValue", "(", ")", ".", "keySet", "(", ")", ",", "\",\"", ")", ";", "user", ".", "setProperty", "(", "key", ",", "value", ")", ";", "}", "}", "try", "{", "sm", ".", "storeUserProperties", "(", "user", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "updateCorpusList", "(", ")", ";", "}", "}", "public", "static", "class", "CorpusSorter", "extends", "DefaultItemSorter", "{", "@", "Override", "protected", "int", "compareProperty", "(", "Object", "propertyId", ",", "boolean", "sortDirection", ",", "Item", "item1", ",", "Item", "item2", ")", "{", "if", "(", "\"name\"", ".", "equals", "(", "propertyId", ")", ")", "{", "String", "val1", "=", "(", "String", ")", "item1", ".", "getItemProperty", "(", "propertyId", ")", ".", "getValue", "(", ")", ";", "String", "val2", "=", "(", "String", ")", "item2", ".", "getItemProperty", "(", "propertyId", ")", ".", "getValue", "(", ")", ";", "if", "(", "sortDirection", ")", "{", "return", "val1", ".", "compareToIgnoreCase", "(", "val2", ")", ";", "}", "else", "{", "return", "val2", ".", "compareToIgnoreCase", "(", "val1", ")", ";", "}", "}", "else", "{", "return", "super", ".", "compareProperty", "(", "propertyId", ",", "sortDirection", ",", "item1", ",", "item2", ")", ";", "}", "}", "}", "protected", "void", "selectCorpora", "(", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ")", "{", "if", "(", "tblCorpora", "!=", "null", ")", "{", "tblCorpora", ".", "setValue", "(", "corpora", ".", "keySet", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "protected", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "getSelectedCorpora", "(", ")", "{", "HashMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "result", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "id", ":", "corpusContainer", ".", "getItemIds", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "tblCorpora", ".", "isSelected", "(", "id", ")", ")", "{", "AnnisCorpus", "c", "=", "(", "AnnisCorpus", ")", "corpusContainer", ".", "getItem", "(", "id", ")", ".", "getBean", "(", ")", ";", "result", ".", "put", "(", "id", ",", "c", ")", ";", "}", "}", "return", "result", ";", "}", "public", "class", "InfoGenerator", "implements", "Table", ".", "ColumnGenerator", "{", "@", "Override", "public", "Component", "generateCell", "(", "Table", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "columnId", ")", "{", "final", "AnnisCorpus", "c", "=", "corpusContainer", ".", "getItem", "(", "itemId", ")", ".", "getBean", "(", ")", ";", "Button", "l", "=", "new", "Button", "(", ")", ";", "l", ".", "setStyleName", "(", "BaseTheme", ".", "BUTTON_LINK", ")", ";", "l", ".", "setIcon", "(", "INFO_ICON", ")", ";", "l", ".", "setDescription", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "l", ".", "addListener", "(", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "MetaDataPanel", "meta", "=", "new", "MetaDataPanel", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "controlPanel", "!=", "null", ")", "{", "CorpusBrowserPanel", "browse", "=", "new", "CorpusBrowserPanel", "(", "c", ",", "controlPanel", ")", ";", "HorizontalLayout", "layout", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "meta", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "browse", ")", ";", "layout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "layout", ".", "setExpandRatio", "(", "meta", ",", "0.5f", ")", ";", "layout", ".", "setExpandRatio", "(", "browse", ",", "0.5f", ")", ";", "Window", "window", "=", "new", "Window", "(", "\"\"", "+", "c", ".", "getName", "(", ")", "+", "\"", "(ID:", "\"", "+", "c", ".", "getId", "(", ")", "+", "\")\"", ",", "layout", ")", ";", "window", ".", "setWidth", "(", "70", ",", "UNITS_EM", ")", ";", "window", ".", "setHeight", "(", "40", ",", "UNITS_EM", ")", ";", "window", ".", "setResizable", "(", "false", ")", ";", "window", ".", "setModal", "(", "false", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "addWindow", "(", "window", ")", ";", "window", ".", "center", "(", ")", ";", "}", "}", "}", ")", ";", "return", "l", ";", "}", "}", "public", "static", "class", "AddRemoveAction", "extends", "Action", "{", "private", "ActionType", "type", ";", "private", "String", "corpusSet", ";", "private", "String", "corpusId", ";", "public", "AddRemoveAction", "(", "ActionType", "type", ",", "String", "corpusSet", ",", "String", "corpusId", ",", "String", "caption", ")", "{", "super", "(", "caption", ")", ";", "this", ".", "type", "=", "type", ";", "this", ".", "corpusSet", "=", "corpusSet", ";", "this", ".", "corpusId", "=", "corpusId", ";", "}", "public", "ActionType", "getType", "(", ")", "{", "return", "type", ";", "}", "public", "String", "getCorpusId", "(", ")", "{", "return", "corpusId", ";", "}", "public", "String", "getCorpusSet", "(", ")", "{", "return", "corpusSet", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "SearchWindow", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "beans", ".", "HistoryEntry", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisUser", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "UniformInterfaceException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "PaintException", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "PaintTarget", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeSet", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "collections15", ".", "set", ".", "ListOrderedSet", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "public", "class", "ControlPanel", "extends", "Panel", "{", "private", "static", "final", "long", "serialVersionUID", "=", "-", "2220211539424865671L", ";", "private", "QueryPanel", "queryPanel", ";", "private", "CorpusListPanel", "corpusList", ";", "private", "SearchWindow", "searchWindow", ";", "private", "Window", "window", ";", "private", "String", "lastQuery", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "lastCorpusSelection", ";", "private", "SearchOptionsPanel", "searchOptions", ";", "private", "ListOrderedSet", "<", "HistoryEntry", ">", "history", ";", "public", "ControlPanel", "(", "SearchWindow", "searchWindow", ")", "{", "super", "(", "\"Search", "Form\"", ")", ";", "this", ".", "searchWindow", "=", "searchWindow", ";", "this", ".", "history", "=", "new", "ListOrderedSet", "<", "HistoryEntry", ">", "(", ")", ";", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "PANEL_BORDERLESS", ")", ";", "addStyleName", "(", "\"control\"", ")", ";", "VerticalLayout", "layout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "layout", ".", "setHeight", "(", "100f", ",", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "Accordion", "accordion", "=", "new", "Accordion", "(", ")", ";", "accordion", ".", "setHeight", "(", "100f", ",", "Layout", ".", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "corpusList", "=", "new", "CorpusListPanel", "(", "this", ")", ";", "searchOptions", "=", "new", "SearchOptionsPanel", "(", ")", ";", "queryPanel", "=", "new", "QueryPanel", "(", "this", ")", ";", "queryPanel", ".", "setHeight", "(", "18f", ",", "Layout", ".", "UNITS_EM", ")", ";", "accordion", ".", "addTab", "(", "corpusList", ",", "\"Corpus", "List\"", ",", "null", ")", ";", "accordion", ".", "addTab", "(", "searchOptions", ",", "\"\"", ",", "null", ")", ";", "accordion", ".", "addTab", "(", "new", "ExportPanel", "(", "queryPanel", ",", "corpusList", ")", ",", "\"Export\"", ",", "null", ")", ";", "addComponent", "(", "queryPanel", ")", ";", "addComponent", "(", "accordion", ")", ";", "layout", ".", "setExpandRatio", "(", "accordion", ",", "1.0f", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "this", ".", "window", "=", "getWindow", "(", ")", ";", "}", "public", "void", "setQuery", "(", "String", "query", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ")", "{", "if", "(", "queryPanel", "!=", "null", "&&", "corpusList", "!=", "null", ")", "{", "queryPanel", ".", "setQuery", "(", "query", ")", ";", "if", "(", "corpora", "!=", "null", ")", "{", "corpusList", ".", "selectCorpora", "(", "corpora", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "void", "setQuery", "(", "String", "query", ",", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ",", "int", "contextLeft", ",", "int", "contextRight", ")", "{", "setQuery", "(", "query", ",", "corpora", ")", ";", "searchOptions", ".", "setLeftContext", "(", "contextLeft", ")", ";", "searchOptions", ".", "setRightContext", "(", "contextRight", ")", ";", "}", "public", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "getSelectedCorpora", "(", ")", "{", "return", "corpusList", ".", "getSelectedCorpora", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "paintContent", "(", "PaintTarget", "target", ")", "throws", "PaintException", "{", "super", ".", "paintContent", "(", "target", ")", ";", "}", "public", "void", "executeQuery", "(", ")", "{", "if", "(", "getApplication", "(", ")", "!=", "null", "&&", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", "==", "null", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "getApplication", "(", ")", "!=", "null", "&&", "corpusList", "!=", "null", "&&", "queryPanel", "!=", "null", ")", "{", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "rawCorpusSelection", "=", "corpusList", ".", "getSelectedCorpora", "(", ")", ";", "lastCorpusSelection", "=", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", "rawCorpusSelection", ")", ";", "AnnisUser", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", ";", "if", "(", "user", "!=", "null", ")", "{", "lastCorpusSelection", ".", "keySet", "(", ")", ".", "retainAll", "(", "user", ".", "getCorpusNameList", "(", ")", ")", ";", "}", "lastQuery", "=", "queryPanel", ".", "getQuery", "(", ")", ";", "if", "(", "lastCorpusSelection", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "return", ";", "}", "if", "(", "\"\"", ".", "equals", "(", "lastQuery", ")", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"Empty", "query\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "return", ";", "}", "HistoryEntry", "e", "=", "new", "HistoryEntry", "(", ")", ";", "e", ".", "setQuery", "(", "lastQuery", ")", ";", "e", ".", "setCorpora", "(", "getSelectedCorpora", "(", ")", ")", ";", "history", ".", "remove", "(", "e", ")", ";", "history", ".", "add", "(", "0", ",", "e", ")", ";", "queryPanel", ".", "updateShortHistory", "(", "history", ".", "asList", "(", ")", ")", ";", "queryPanel", ".", "setCountIndicatorEnabled", "(", "true", ")", ";", "CountThread", "countThread", "=", "new", "CountThread", "(", ")", ";", "countThread", ".", "start", "(", ")", ";", "searchWindow", ".", "showQueryResult", "(", "lastQuery", ",", "lastCorpusSelection", ",", "searchOptions", ".", "getLeftContext", "(", ")", ",", "searchOptions", ".", "getRightContext", "(", ")", ",", "searchOptions", ".", "getSegmentationLayer", "(", ")", ",", "searchOptions", ".", "getResultsPerPage", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "public", "Set", "<", "HistoryEntry", ">", "getHistory", "(", ")", "{", "return", "history", ";", "}", "public", "void", "corpusSelectionChanged", "(", ")", "{", "searchOptions", ".", "updateSegmentationList", "(", "corpusList", ".", "getSelectedCorpora", "(", ")", ".", "keySet", "(", ")", ")", ";", "}", "private", "class", "CountThread", "extends", "Thread", "{", "private", "int", "count", "=", "-", "1", ";", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "WebResource", "res", "=", "null", ";", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "res", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "}", "if", "(", "res", "!=", "null", ")", "{", "try", "{", "Set", "<", "String", ">", "corpusNames", "=", "new", "TreeSet", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisCorpus", "c", ":", "lastCorpusSelection", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "corpusNames", ".", "add", "(", "c", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "}", "count", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "res", ".", "path", "(", "\"search\"", ")", ".", "path", "(", "\"count\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"q\"", ",", "lastQuery", ")", ".", "queryParam", "(", "\"corpora\"", ",", "StringUtils", ".", "join", "(", "corpusNames", ",", "\",\"", ")", ")", ".", "get", "(", "String", ".", "class", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "UniformInterfaceException", "ex", ")", "{", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getStatus", "(", ")", "==", "400", ")", "{", "window", ".", "showNotification", "(", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getEntity", "(", "String", ".", "class", ")", ",", "\"\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "}", "else", "{", "window", ".", "showNotification", "(", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getEntity", "(", "String", ".", "class", ")", ",", "\"\"", "+", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getStatus", "(", ")", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "synchronized", "(", "getApplication", "(", ")", ")", "{", "queryPanel", ".", "setStatus", "(", "\"\"", "+", "count", "+", "\"", "matches\"", ")", ";", "searchWindow", ".", "updateQueryCount", "(", "count", ")", ";", "}", "queryPanel", ".", "setCountIndicatorEnabled", "(", "false", ")", ";", "}", "public", "int", "getCount", "(", ")", "{", "return", "count", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisAttribute", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "CorpusConfig", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "GenericType", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "validator", ".", "IntegerValidator", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "ComboBox", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "FormLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "UnsupportedEncodingException", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "SearchOptionsPanel", "extends", "Panel", "{", "public", "static", "final", "String", "DEFAULT_SEGMENTATION", "=", "\"\"", ";", "private", "static", "final", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "SearchOptionsPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "ComboBox", "cbLeftContext", ";", "private", "ComboBox", "cbRightContext", ";", "private", "ComboBox", "cbResultsPerPage", ";", "private", "ComboBox", "cbSegmentation", ";", "private", "static", "final", "String", "[", "]", "PREDEFINED_PAGE_SIZES", "=", "new", "String", "[", "]", "{", "\"1\"", ",", "\"2\"", ",", "\"5\"", ",", "\"10\"", ",", "\"15\"", ",", "\"20\"", ",", "\"25\"", "}", ";", "static", "final", "String", "[", "]", "PREDEFINED_CONTEXTS", "=", "new", "String", "[", "]", "{", "\"0\"", ",", "\"1\"", ",", "\"2\"", ",", "\"5\"", ",", "\"10\"", "}", ";", "public", "SearchOptionsPanel", "(", ")", "{", "setSizeFull", "(", ")", ";", "FormLayout", "layout", "=", "new", "FormLayout", "(", ")", ";", "setContent", "(", "layout", ")", ";", "cbLeftContext", "=", "new", "ComboBox", "(", "\"Left", "Context\"", ")", ";", "cbRightContext", "=", "new", "ComboBox", "(", "\"\"", ")", ";", "cbResultsPerPage", "=", "new", "ComboBox", "(", "\"\"", ")", ";", "cbLeftContext", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbRightContext", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbResultsPerPage", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbLeftContext", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbRightContext", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbResultsPerPage", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbLeftContext", ".", "addValidator", "(", "new", "IntegerValidator", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "cbRightContext", ".", "addValidator", "(", "new", "IntegerValidator", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "cbResultsPerPage", ".", "addValidator", "(", "new", "IntegerValidator", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "for", "(", "String", "s", ":", "PREDEFINED_CONTEXTS", ")", "{", "cbLeftContext", ".", "addItem", "(", "s", ")", ";", "cbRightContext", ".", "addItem", "(", "s", ")", ";", "}", "for", "(", "String", "s", ":", "PREDEFINED_PAGE_SIZES", ")", "{", "cbResultsPerPage", ".", "addItem", "(", "s", ")", ";", "}", "cbSegmentation", "=", "new", "ComboBox", "(", "\"\"", ")", ";", "cbSegmentation", ".", "setTextInputAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbSegmentation", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbSegmentation", ".", "setValue", "(", "\"tok\"", ")", ";", "cbLeftContext", ".", "setValue", "(", "\"5\"", ")", ";", "cbRightContext", ".", "setValue", "(", "\"5\"", ")", ";", "cbResultsPerPage", ".", "setValue", "(", "\"10\"", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "cbLeftContext", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "cbRightContext", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "cbResultsPerPage", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "cbSegmentation", ")", ";", "}", "public", "void", "updateSegmentationList", "(", "Set", "<", "String", ">", "corpora", ")", "{", "WebResource", "service", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "service", "!=", "null", ")", "{", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", "attributes", "=", "new", "LinkedList", "<", "AnnisAttribute", ">", "(", ")", ";", "String", "lastSelection", "=", "(", "String", ")", "cbSegmentation", ".", "getValue", "(", ")", ";", "cbSegmentation", ".", "removeAllItems", "(", ")", ";", "for", "(", "String", "corpus", ":", "corpora", ")", "{", "try", "{", "attributes", ".", "addAll", "(", "service", ".", "path", "(", "\"corpora\"", ")", ".", "path", "(", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpus", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ".", "path", "(", "\"annotations\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"fetchvalues\"", ",", "\"true\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"\"", ",", "\"true\"", ")", ".", "get", "(", "new", "GenericType", "<", "List", "<", "AnnisAttribute", ">", ">", "(", ")", "{", "}", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "UnsupportedEncodingException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "CorpusConfig", "config", "=", "Helper", ".", "getCorpusConfig", "(", "corpus", ",", "getApplication", "(", ")", ",", "getWindow", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "config", ".", "getConfig", "(", ")", ".", "containsKey", "(", "DEFAULT_SEGMENTATION", ")", ")", "{", "lastSelection", "=", "config", ".", "getConfig", "(", ")", ".", "get", "(", "DEFAULT_SEGMENTATION", ")", ";", "}", "}", "for", "(", "AnnisAttribute", "att", ":", "attributes", ")", "{", "if", "(", "AnnisAttribute", ".", "Type", ".", "segmentation", "==", "att", ".", "getType", "(", ")", "&&", "att", ".", "getName", "(", ")", "!=", "null", ")", "{", "cbSegmentation", ".", "addItem", "(", "att", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "cbSegmentation", ".", "setValue", "(", "lastSelection", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "setLeftContext", "(", "int", "context", ")", "{", "cbLeftContext", ".", "setValue", "(", "\"\"", "+", "context", ")", ";", "}", "public", "int", "getLeftContext", "(", ")", "{", "int", "result", "=", "5", ";", "try", "{", "result", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "(", "String", ")", "cbLeftContext", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "}", "return", "Math", ".", "max", "(", "0", ",", "result", ")", ";", "}", "public", "int", "getRightContext", "(", ")", "{", "int", "result", "=", "5", ";", "try", "{", "result", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "(", "String", ")", "cbRightContext", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "}", "return", "Math", ".", "max", "(", "0", ",", "result", ")", ";", "}", "public", "void", "setRightContext", "(", "int", "context", ")", "{", "cbRightContext", ".", "setValue", "(", "\"\"", "+", "context", ")", ";", "}", "public", "int", "getResultsPerPage", "(", ")", "{", "int", "result", "=", "10", ";", "try", "{", "result", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "(", "String", ")", "cbResultsPerPage", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "}", "return", "Math", ".", "max", "(", "0", ",", "result", ")", ";", "}", "public", "String", "getSegmentationLayer", "(", ")", "{", "return", "(", "String", ")", "cbSegmentation", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "exporter", ".", "Exporter", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "exporter", ".", "GridExporter", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "exporter", ".", "TextExporter", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "exporter", ".", "WekaExporter", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisUser", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "validator", ".", "IntegerValidator", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ExternalResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "StreamResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ".", "Notification", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Random", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "logging", ".", "Level", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "logging", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "ExportPanel", "extends", "Panel", "implements", "Button", ".", "ClickListener", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "ExportPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "static", "final", "Exporter", "[", "]", "EXPORTER", "=", "new", "Exporter", "[", "]", "{", "new", "WekaExporter", "(", ")", ",", "new", "TextExporter", "(", ")", ",", "new", "GridExporter", "(", ")", "}", ";", "private", "ComboBox", "cbExporter", ";", "private", "ComboBox", "cbLeftContext", ";", "private", "ComboBox", "cbRightContext", ";", "private", "TextField", "txtParameters", ";", "private", "Button", "btExport", ";", "private", "Map", "<", "String", ",", "Exporter", ">", "exporterMap", ";", "private", "QueryPanel", "queryPanel", ";", "private", "CorpusListPanel", "corpusListPanel", ";", "private", "final", "static", "Random", "rand", "=", "new", "Random", "(", ")", ";", "public", "ExportPanel", "(", "QueryPanel", "queryPanel", ",", "CorpusListPanel", "corpusListPanel", ")", "{", "this", ".", "queryPanel", "=", "queryPanel", ";", "this", ".", "corpusListPanel", "=", "corpusListPanel", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "FormLayout", "layout", "=", "new", "FormLayout", "(", ")", ";", "layout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "setContent", "(", "layout", ")", ";", "cbExporter", "=", "new", "ComboBox", "(", "\"Exporter\"", ")", ";", "cbExporter", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbExporter", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "exporterMap", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "Exporter", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "Exporter", "e", ":", "EXPORTER", ")", "{", "String", "name", "=", "e", ".", "getClass", "(", ")", ".", "getSimpleName", "(", ")", ";", "exporterMap", ".", "put", "(", "name", ",", "e", ")", ";", "cbExporter", ".", "addItem", "(", "name", ")", ";", "}", "cbExporter", ".", "setValue", "(", "EXPORTER", "[", "0", "]", ".", "getClass", "(", ")", ".", "getSimpleName", "(", ")", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "cbExporter", ")", ";", "cbLeftContext", "=", "new", "ComboBox", "(", "\"Left", "Context\"", ")", ";", "cbRightContext", "=", "new", "ComboBox", "(", "\"\"", ")", ";", "cbLeftContext", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbRightContext", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "cbLeftContext", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbRightContext", ".", "setNewItemsAllowed", "(", "true", ")", ";", "cbLeftContext", ".", "addValidator", "(", "new", "IntegerValidator", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "cbRightContext", ".", "addValidator", "(", "new", "IntegerValidator", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "for", "(", "String", "s", ":", "SearchOptionsPanel", ".", "PREDEFINED_CONTEXTS", ")", "{", "cbLeftContext", ".", "addItem", "(", "s", ")", ";", "cbRightContext", ".", "addItem", "(", "s", ")", ";", "}", "cbLeftContext", ".", "setValue", "(", "\"5\"", ")", ";", "cbRightContext", ".", "setValue", "(", "\"5\"", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "cbLeftContext", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "cbRightContext", ")", ";", "txtParameters", "=", "new", "TextField", "(", "\"Parameters\"", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "txtParameters", ")", ";", "btExport", "=", "new", "Button", "(", "\"\"", ")", ";", "btExport", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "btExport", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "try", "{", "String", "exporterName", "=", "(", "String", ")", "cbExporter", ".", "getValue", "(", ")", ";", "final", "Exporter", "exporter", "=", "exporterMap", ".", "get", "(", "exporterName", ")", ";", "if", "(", "exporter", "!=", "null", ")", "{", "if", "(", "corpusListPanel", ".", "getSelectedCorpora", "(", ")", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "return", ";", "}", "AnnisUser", "user", "=", "(", "AnnisUser", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getUser", "(", ")", ";", "if", "(", "user", "==", "null", "||", "!", "user", ".", "getCorpusNameList", "(", ")", ".", "containsAll", "(", "corpusListPanel", ".", "getSelectedCorpora", "(", ")", ".", "keySet", "(", ")", ")", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "return", ";", "}", "final", "PipedOutputStream", "out", "=", "new", "PipedOutputStream", "(", ")", ";", "final", "PipedInputStream", "in", "=", "new", "PipedInputStream", "(", "out", ")", ";", "new", "Thread", "(", "new", "Runnable", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "try", "{", "exporter", ".", "convertText", "(", "queryPanel", ".", "getQuery", "(", ")", ",", "Integer", ".", "parseInt", "(", "(", "String", ")", "cbLeftContext", ".", "getValue", "(", ")", ")", ",", "Integer", ".", "parseInt", "(", "(", "String", ")", "cbRightContext", ".", "getValue", "(", ")", ")", ",", "corpusListPanel", ".", "getSelectedCorpora", "(", ")", ",", "null", ",", "(", "String", ")", "txtParameters", ".", "getValue", "(", ")", ",", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ",", "new", "OutputStreamWriter", "(", "out", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "UnsupportedEncodingException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", ")", ".", "start", "(", ")", ";", "StreamResource", "resource", "=", "new", "StreamResource", "(", "new", "StreamResource", ".", "StreamSource", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "InputStream", "getStream", "(", ")", "{", "return", "in", ";", "}", "}", ",", "exporterName", "+", "\"_\"", "+", "rand", ".", "nextInt", "(", "Integer", ".", "MAX_VALUE", ")", ",", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "open", "(", "new", "ExternalResource", "(", "getApplication", "(", ")", ".", "getRelativeLocation", "(", "resource", ")", ",", "\"\"", ")", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "Helper", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "HistoryPanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "beans", ".", "HistoryEntry", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "ClientHandlerException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "UniformInterfaceException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "FieldEvents", ".", "TextChangeEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "FieldEvents", ".", "TextChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "ShortcutAction", ".", "KeyCode", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "ShortcutAction", ".", "ModifierKey", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ".", "Notification", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "import", "org", ".", "vaadin", ".", "hene", ".", "splitbutton", ".", "SplitButton", ";", "import", "org", ".", "vaadin", ".", "hene", ".", "splitbutton", ".", "SplitButton", ".", "SplitButtonClickEvent", ";", "public", "class", "QueryPanel", "extends", "Panel", "implements", "TextChangeListener", ",", "ValueChangeListener", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "QueryPanel", ".", "class", ")", ";", "public", "static", "final", "int", "MAX_HISTORY_MENU_ITEMS", "=", "5", ";", "private", "TextArea", "txtQuery", ";", "private", "Label", "lblStatus", ";", "private", "Button", "btShowResult", ";", "private", "SplitButton", "btHistory", ";", "private", "ListSelect", "lstHistory", ";", "private", "ControlPanel", "controlPanel", ";", "private", "ProgressIndicator", "piCount", ";", "private", "HorizontalLayout", "buttonPanelLayout", ";", "private", "GridLayout", "mainLayout", ";", "private", "Panel", "panelStatus", ";", "private", "String", "lastPublicStatus", ";", "private", "List", "<", "HistoryEntry", ">", "history", ";", "private", "Window", "historyWindow", ";", "public", "QueryPanel", "(", "final", "ControlPanel", "controlPanel", ")", "{", "this", ".", "controlPanel", "=", "controlPanel", ";", "this", ".", "lastPublicStatus", "=", "\"Ok\"", ";", "this", ".", "history", "=", "new", "LinkedList", "<", "HistoryEntry", ">", "(", ")", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "mainLayout", "=", "new", "GridLayout", "(", "2", ",", "3", ")", ";", "setContent", "(", "mainLayout", ")", ";", "mainLayout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "mainLayout", ".", "setSpacing", "(", "true", ")", ";", "mainLayout", ".", "setMargin", "(", "true", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "new", "Label", "(", "\"AnnisQL:\"", ")", ",", "0", ",", "0", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "new", "Label", "(", "\"Status:\"", ")", ",", "0", ",", "2", ")", ";", "mainLayout", ".", "setRowExpandRatio", "(", "0", ",", "1.0f", ")", ";", "mainLayout", ".", "setColumnExpandRatio", "(", "0", ",", "0.2f", ")", ";", "mainLayout", ".", "setColumnExpandRatio", "(", "1", ",", "0.8f", ")", ";", "txtQuery", "=", "new", "TextArea", "(", ")", ";", "txtQuery", ".", "addStyleName", "(", "\"query\"", ")", ";", "txtQuery", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "txtQuery", ".", "setTextChangeTimeout", "(", "1000", ")", ";", "txtQuery", ".", "addListener", "(", "(", "TextChangeListener", ")", "this", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "txtQuery", ",", "1", ",", "0", ")", ";", "panelStatus", "=", "new", "Panel", "(", ")", ";", "panelStatus", ".", "setWidth", "(", "100f", ",", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "panelStatus", ".", "setHeight", "(", "3.5f", ",", "UNITS_EM", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "panelStatus", ".", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setMargin", "(", "false", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "panelStatus", ".", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setSpacing", "(", "false", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "panelStatus", ".", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "lblStatus", "=", "new", "Label", "(", ")", ";", "lblStatus", ".", "setContentMode", "(", "Label", ".", "CONTENT_TEXT", ")", ";", "lblStatus", ".", "setValue", "(", "this", ".", "lastPublicStatus", ")", ";", "lblStatus", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "lblStatus", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "panelStatus", ".", "addComponent", "(", "lblStatus", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "panelStatus", ",", "1", ",", "2", ")", ";", "setScrollable", "(", "true", ")", ";", "Panel", "buttonPanel", "=", "new", "Panel", "(", ")", ";", "buttonPanelLayout", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "buttonPanel", ".", "setContent", "(", "buttonPanelLayout", ")", ";", "buttonPanelLayout", ".", "setWidth", "(", "100f", ",", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "mainLayout", ".", "addComponent", "(", "buttonPanel", ",", "1", ",", "1", ")", ";", "piCount", "=", "new", "ProgressIndicator", "(", ")", ";", "piCount", ".", "setIndeterminate", "(", "true", ")", ";", "piCount", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "piCount", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "piCount", ".", "setPollingInterval", "(", "500", ")", ";", "panelStatus", ".", "addComponent", "(", "piCount", ")", ";", "btShowResult", "=", "new", "Button", "(", "\"Show", "Result\"", ")", ";", "btShowResult", ".", "setWidth", "(", "100f", ",", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "btShowResult", ".", "addListener", "(", "new", "ShowResultClickListener", "(", ")", ")", ";", "btShowResult", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "btShowResult", ".", "setClickShortcut", "(", "KeyCode", ".", "ENTER", ",", "ModifierKey", ".", "CTRL", ")", ";", "buttonPanel", ".", "addComponent", "(", "btShowResult", ")", ";", "lstHistory", "=", "new", "ListSelect", "(", ")", ";", "lstHistory", ".", "setNullSelectionAllowed", "(", "false", ")", ";", "lstHistory", ".", "setValue", "(", "null", ")", ";", "lstHistory", ".", "addListener", "(", "(", "ValueChangeListener", ")", "this", ")", ";", "lstHistory", ".", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "btHistory", "=", "new", "SplitButton", "(", "\"History\"", ")", ";", "btHistory", ".", "addStyleName", "(", "SplitButton", ".", "STYLE_CHAMELEON", ")", ";", "btHistory", ".", "setWidth", "(", "100f", ",", "UNITS_PERCENTAGE", ")", ";", "btHistory", ".", "setComponent", "(", "lstHistory", ")", ";", "btHistory", ".", "setButtonDescription", "(", "\"\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", ")", ";", "buttonPanel", ".", "addComponent", "(", "btHistory", ")", ";", "btHistory", ".", "addClickListener", "(", "new", "SplitButton", ".", "SplitButtonClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "splitButtonClick", "(", "SplitButtonClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "historyWindow", "==", "null", ")", "{", "historyWindow", "=", "new", "Window", "(", "\"History\"", ")", ";", "historyWindow", ".", "setModal", "(", "false", ")", ";", "historyWindow", ".", "setWidth", "(", "\"400px\"", ")", ";", "historyWindow", ".", "setHeight", "(", "\"250px\"", ")", ";", "}", "historyWindow", ".", "setContent", "(", "new", "HistoryPanel", "(", "history", ",", "controlPanel", ")", ")", ";", "if", "(", "getWindow", "(", ")", ".", "getChildWindows", "(", ")", ".", "contains", "(", "historyWindow", ")", ")", "{", "historyWindow", ".", "bringToFront", "(", ")", ";", "}", "else", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "addWindow", "(", "historyWindow", ")", ";", "}", "}", "}", ")", ";", "}", "public", "void", "updateShortHistory", "(", "List", "<", "HistoryEntry", ">", "history", ")", "{", "this", ".", "history", "=", "history", ";", "lstHistory", ".", "removeAllItems", "(", ")", ";", "int", "counter", "=", "0", ";", "for", "(", "HistoryEntry", "e", ":", "history", ")", "{", "if", "(", "counter", ">=", "MAX_HISTORY_MENU_ITEMS", ")", "{", "break", ";", "}", "else", "{", "lstHistory", ".", "addItem", "(", "e", ")", ";", "}", "counter", "++", ";", "}", "}", "public", "void", "setQuery", "(", "String", "query", ")", "{", "if", "(", "txtQuery", "!=", "null", ")", "{", "txtQuery", ".", "setValue", "(", "query", ")", ";", "}", "validateQuery", "(", "query", ")", ";", "}", "public", "String", "getQuery", "(", ")", "{", "if", "(", "txtQuery", "!=", "null", ")", "{", "return", "(", "String", ")", "txtQuery", ".", "getValue", "(", ")", ";", "}", "return", "\"\"", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "textChange", "(", "TextChangeEvent", "event", ")", "{", "validateQuery", "(", "event", ".", "getText", "(", ")", ")", ";", "}", "private", "void", "validateQuery", "(", "String", "query", ")", "{", "try", "{", "WebResource", "annisResource", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "getApplication", "(", ")", ")", ";", "String", "result", "=", "annisResource", ".", "path", "(", "\"check\"", ")", ".", "queryParam", "(", "\"q\"", ",", "query", ")", ".", "get", "(", "String", ".", "class", ")", ";", "if", "(", "\"ok\"", ".", "equalsIgnoreCase", "(", "result", ")", ")", "{", "lblStatus", ".", "setValue", "(", "lastPublicStatus", ")", ";", "}", "else", "{", "lblStatus", ".", "setValue", "(", "result", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "UniformInterfaceException", "ex", ")", "{", "if", "(", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getStatus", "(", ")", "==", "400", ")", "{", "lblStatus", ".", "setValue", "(", "ex", ".", "getResponse", "(", ")", ".", "getEntity", "(", "String", ".", "class", ")", ")", ";", "}", "else", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ",", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "ClientHandlerException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", "+", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ",", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "valueChange", "(", "ValueChangeEvent", "event", ")", "{", "btHistory", ".", "setPopupVisible", "(", "false", ")", ";", "HistoryEntry", "e", "=", "(", "HistoryEntry", ")", "event", ".", "getProperty", "(", ")", ".", "getValue", "(", ")", ";", "if", "(", "controlPanel", "!=", "null", "&", "e", "!=", "null", ")", "{", "controlPanel", ".", "setQuery", "(", "e", ".", "getQuery", "(", ")", ",", "e", ".", "getCorpora", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "public", "class", "ShowResultClickListener", "implements", "Button", ".", "ClickListener", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "controlPanel", "!=", "null", ")", "{", "controlPanel", ".", "executeQuery", "(", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "void", "setCountIndicatorEnabled", "(", "boolean", "enabled", ")", "{", "if", "(", "piCount", "!=", "null", "&&", "btShowResult", "!=", "null", ")", "{", "lblStatus", ".", "setVisible", "(", "!", "enabled", ")", ";", "piCount", ".", "setVisible", "(", "enabled", ")", ";", "piCount", ".", "setEnabled", "(", "enabled", ")", ";", "}", "}", "protected", "void", "setStatus", "(", "String", "status", ")", "{", "if", "(", "lblStatus", "!=", "null", ")", "{", "lblStatus", ".", "setValue", "(", "status", ")", ";", "lastPublicStatus", "=", "status", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "provider", ".", "SaltProjectProvider", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "CorpusConfig", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "Client", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "UniformInterfaceException", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "WebResource", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "config", ".", "ClientConfig", ";", "import", "com", ".", "sun", ".", "jersey", ".", "api", ".", "client", ".", "config", ".", "DefaultClientConfig", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "WebApplicationContext", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "UnsupportedEncodingException", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URI", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URISyntaxException", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLEncoder", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeMap", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "Helper", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "Helper", ".", "class", ")", ";", "private", "static", "ThreadLocal", "<", "WebResource", ">", "annisWebResource", "=", "new", "ThreadLocal", "<", "WebResource", ">", "(", ")", ";", "public", "static", "WebResource", "createAnnisWebResource", "(", "String", "uri", ")", "{", "ClientConfig", "rc", "=", "new", "DefaultClientConfig", "(", ")", ";", "rc", ".", "getClasses", "(", ")", ".", "add", "(", "SaltProjectProvider", ".", "class", ")", ";", "Client", "c", "=", "Client", ".", "create", "(", "rc", ")", ";", "return", "c", ".", "resource", "(", "uri", ")", ";", "}", "public", "static", "WebResource", "getAnnisWebResource", "(", "Application", "app", ")", "{", "if", "(", "annisWebResource", ".", "get", "(", ")", "==", "null", ")", "{", "annisWebResource", ".", "set", "(", "createAnnisWebResource", "(", "app", ".", "getProperty", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "}", "return", "annisWebResource", ".", "get", "(", ")", ";", "}", "public", "static", "String", "getContext", "(", "Application", "app", ")", "{", "WebApplicationContext", "context", "=", "(", "WebApplicationContext", ")", "app", ".", "getContext", "(", ")", ";", "return", "context", ".", "getHttpSession", "(", ")", ".", "getServletContext", "(", ")", ".", "getContextPath", "(", ")", ";", "}", "public", "static", "String", "generateCitation", "(", "Application", "app", ",", "String", "aql", ",", "List", "<", "String", ">", "corpora", ",", "int", "contextLeft", ",", "int", "contextRight", ")", "{", "try", "{", "StringBuilder", "sb", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "URI", "appURI", "=", "app", ".", "getURL", "(", ")", ".", "toURI", "(", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "getContext", "(", "app", ")", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"/Cite/AQL(\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "aql", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"),CIDS(\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "StringUtils", ".", "join", "(", "corpora", ",", "\",\"", ")", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"),CLEFT(\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "contextLeft", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"),CRIGHT(\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "contextRight", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\")\"", ")", ";", "try", "{", "return", "new", "URI", "(", "appURI", ".", "getScheme", "(", ")", ",", "null", ",", "appURI", ".", "getHost", "(", ")", ",", "appURI", ".", "getPort", "(", ")", ",", "sb", ".", "toString", "(", ")", ",", "null", ",", "null", ")", ".", "toASCIIString", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "URISyntaxException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "return", "\"ERROR\"", ";", "}", "catch", "(", "URISyntaxException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "return", "\"ERROR\"", ";", "}", "public", "static", "Map", "<", "Long", ",", "AnnisCorpus", ">", "calculateID2Corpus", "(", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpusMap", ")", "{", "TreeMap", "<", "Long", ",", "AnnisCorpus", ">", "result", "=", "new", "TreeMap", "<", "Long", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisCorpus", "c", ":", "corpusMap", ".", "values", "(", ")", ")", "{", "result", ".", "put", "(", "c", ".", "getId", "(", ")", ",", "c", ")", ";", "}", "return", "result", ";", "}", "public", "static", "CorpusConfig", "getCorpusConfig", "(", "String", "corpus", ",", "Application", "app", ",", "Window", "window", ")", "{", "CorpusConfig", "corpusConfig", "=", "new", "CorpusConfig", "(", ")", ";", "corpusConfig", ".", "setConfig", "(", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "String", ">", "(", ")", ")", ";", "try", "{", "corpusConfig", "=", "Helper", ".", "getAnnisWebResource", "(", "app", ")", ".", "path", "(", "\"corpora\"", ")", ".", "path", "(", "URLEncoder", ".", "encode", "(", "corpus", ",", "\"UTF-8\"", ")", ")", ".", "path", "(", "\"config\"", ")", ".", "get", "(", "CorpusConfig", ".", "class", ")", ";", "}", "catch", "(", "UnsupportedEncodingException", "ex", ")", "{", "window", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_TRAY_NOTIFICATION", ")", ";", "}", "catch", "(", "UniformInterfaceException", "ex", ")", "{", "window", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_WARNING_MESSAGE", ")", ";", "}", "return", "corpusConfig", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Validator", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "validator", ".", "EmailValidator", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "WebApplicationContext", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "File", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "javax", ".", "activation", ".", "FileDataSource", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "mail", ".", "*", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "ReportBugPanel", "extends", "Panel", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "MetaDataPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "Form", "form", ";", "private", "TextField", "txtSummary", ";", "private", "TextArea", "txtDescription", ";", "private", "TextField", "txtName", ";", "private", "TextField", "txtMail", ";", "private", "Button", "btSubmit", ";", "private", "Button", "btCancel", ";", "public", "ReportBugPanel", "(", "Application", "app", ",", "final", "String", "bugEMailAddress", ",", "final", "byte", "[", "]", "screenImage", ")", "{", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "FormLayout", "layout", "=", "new", "FormLayout", "(", ")", ";", "layout", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "form", "=", "new", "Form", "(", "layout", ")", ";", "form", ".", "setCaption", "(", "\"Report", "Bug\"", ")", ";", "form", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "form", ".", "setInvalidCommitted", "(", "false", ")", ";", "form", ".", "setWriteThrough", "(", "false", ")", ";", "getContent", "(", ")", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "getContent", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "form", ")", ";", "txtSummary", "=", "new", "TextField", "(", "\"\"", ")", ";", "txtSummary", ".", "setRequired", "(", "true", ")", ";", "txtSummary", ".", "setRequiredError", "(", "\"\"", ")", ";", "txtSummary", ".", "setColumns", "(", "50", ")", ";", "txtDescription", "=", "new", "TextArea", "(", "\"\"", ")", ";", "txtDescription", ".", "setRequired", "(", "true", ")", ";", "txtDescription", ".", "setRequiredError", "(", "\"\"", ")", ";", "txtDescription", ".", "setRows", "(", "10", ")", ";", "txtDescription", ".", "setColumns", "(", "50", ")", ";", "txtDescription", ".", "setValue", "(", "\"\"", "+", "\"1.n\"", "+", "\"2.n\"", "+", "\"3.n\"", "+", "\"n\"", "+", "\"\"", "+", "\"n\"", "+", "\"n\"", "+", "\"\"", "+", "\"n\"", "+", "\"n\"", "+", "\"\"", ")", ";", "txtName", "=", "new", "TextField", "(", "\"Your", "Name\"", ")", ";", "txtName", ".", "setRequired", "(", "true", ")", ";", "txtName", ".", "setRequiredError", "(", "\"\"", ")", ";", "txtName", ".", "setColumns", "(", "50", ")", ";", "txtMail", "=", "new", "TextField", "(", "\"\"", ")", ";", "txtMail", ".", "setRequired", "(", "true", ")", ";", "txtMail", ".", "setRequiredError", "(", "\"\"", ")", ";", "txtMail", ".", "addValidator", "(", "new", "EmailValidator", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "txtMail", ".", "setColumns", "(", "50", ")", ";", "form", ".", "addField", "(", "\"summary\"", ",", "txtSummary", ")", ";", "form", ".", "addField", "(", "\"description\"", ",", "txtDescription", ")", ";", "form", ".", "addField", "(", "\"name\"", ",", "txtName", ")", ";", "form", ".", "addField", "(", "\"email\"", ",", "txtMail", ")", ";", "btSubmit", "=", "new", "Button", "(", "\"\"", ",", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "try", "{", "form", ".", "commit", "(", ")", ";", "sendBugReport", "(", "bugEMailAddress", ",", "screenImage", ")", ";", "Window", "subwindow", "=", "getWindow", "(", ")", ";", "Window", "parent", "=", "subwindow", ".", "getParent", "(", ")", ";", "parent", ".", "removeWindow", "(", "subwindow", ")", ";", "parent", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "\"\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_HUMANIZED_MESSAGE", ")", ";", "}", "catch", "(", "Validator", ".", "InvalidValueException", "ex", ")", "{", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "}", "}", "}", ")", ";", "btCancel", "=", "new", "Button", "(", "\"Cancel\"", ",", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "form", ".", "discard", "(", ")", ";", "Window", "subwindow", "=", "getWindow", "(", ")", ";", "subwindow", ".", "getParent", "(", ")", ".", "removeWindow", "(", "subwindow", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "HorizontalLayout", "buttons", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "buttons", ".", "addComponent", "(", "btSubmit", ")", ";", "buttons", ".", "addComponent", "(", "btCancel", ")", ";", "form", ".", "getFooter", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "buttons", ")", ";", "}", "private", "void", "sendBugReport", "(", "String", "bugEMailAddress", ",", "byte", "[", "]", "screenImage", ")", "{", "MultiPartEmail", "mail", "=", "new", "MultiPartEmail", "(", ")", ";", "try", "{", "mail", ".", "setHostName", "(", "\"localhost\"", ")", ";", "mail", ".", "addReplyTo", "(", "form", ".", "getField", "(", "\"email\"", ")", ".", "getValue", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ",", "form", ".", "getField", "(", "\"name\"", ")", ".", "getValue", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "mail", ".", "setFrom", "(", "bugEMailAddress", ")", ";", "mail", ".", "addTo", "(", "bugEMailAddress", ")", ";", "mail", ".", "setSubject", "(", "\"[ANNIS", "BUG]", "\"", "+", "form", ".", "getField", "(", "\"summary\"", ")", ".", "getValue", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "StringBuilder", "sbMsg", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "sbMsg", ".", "append", "(", "\"Reporter:", "\"", ")", ".", "append", "(", "form", ".", "getField", "(", "\"name\"", ")", ".", "getValue", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "\"", "(\"", ")", ".", "append", "(", "form", ".", "getField", "(", "\"email\"", ")", ".", "getValue", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "\")n\"", ")", ";", "sbMsg", ".", "append", "(", "\"Version:", "\"", ")", ".", "append", "(", "getApplication", "(", ")", ".", "getVersion", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "sbMsg", ".", "append", "(", "\"URL:", "\"", ")", ".", "append", "(", "getApplication", "(", ")", ".", "getURL", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "sbMsg", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "sbMsg", ".", "append", "(", "form", ".", "getField", "(", "\"description\"", ")", ".", "getValue", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "mail", ".", "setMsg", "(", "sbMsg", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "screenImage", "!=", "null", ")", "{", "try", "{", "mail", ".", "attach", "(", "new", "ByteArrayDataSource", "(", "screenImage", ",", "\"image/png\"", ")", ",", "\"\"", ",", "\"\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "WebApplicationContext", "context", "=", "(", "WebApplicationContext", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getContext", "(", ")", ";", "File", "logfile", "=", "new", "File", "(", "context", ".", "getHttpSession", "(", ")", ".", "getServletContext", "(", ")", ".", "getRealPath", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "if", "(", "logfile", ".", "exists", "(", ")", "&&", "logfile", ".", "isFile", "(", ")", "&&", "logfile", ".", "canRead", "(", ")", ")", "{", "mail", ".", "attach", "(", "new", "FileDataSource", "(", "logfile", ")", ",", "\"\"", ",", "\"\"", ")", ";", "}", "}", "mail", ".", "send", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "EmailException", "ex", ")", "{", "getWindow", "(", ")", ".", "showNotification", "(", "\"\"", ",", "\"\"", "+", "\"\"", ",", "Window", ".", "Notification", ".", "TYPE_ERROR_MESSAGE", ")", ";", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ApplicationResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ClassResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "FileResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "File", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "FileFilter", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "io", ".", "FileUtils", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "io", ".", "filefilter", ".", "WildcardFileFilter", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "AboutPanel", "extends", "Panel", "{", "private", "static", "final", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "AboutPanel", ".", "class", ")", ";", "private", "static", "ClassResource", "logo_sfb_res", ";", "private", "static", "ClassResource", "logo_annis_res", ";", "private", "VerticalLayout", "layout", ";", "public", "AboutPanel", "(", "Application", "app", ")", "{", "if", "(", "logo_sfb_res", "==", "null", ")", "{", "logo_sfb_res", "=", "new", "ClassResource", "(", "AboutPanel", ".", "class", ",", "\"sfb-logo.jpg\"", ",", "app", ")", ";", "}", "if", "(", "logo_annis_res", "==", "null", ")", "{", "logo_annis_res", "=", "new", "ClassResource", "(", "AboutPanel", ".", "class", ",", "\"\"", ",", "app", ")", ";", "}", "setSizeFull", "(", ")", ";", "layout", "=", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ";", "layout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "HorizontalLayout", "hLayout", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "Embedded", "logoAnnis", "=", "new", "Embedded", "(", ")", ";", "logoAnnis", ".", "setSource", "(", "logo_annis_res", ")", ";", "logoAnnis", ".", "setType", "(", "Embedded", ".", "TYPE_IMAGE", ")", ";", "hLayout", ".", "addComponent", "(", "logoAnnis", ")", ";", "Embedded", "logoSfb", "=", "new", "Embedded", "(", ")", ";", "logoSfb", ".", "setSource", "(", "logo_sfb_res", ")", ";", "logoSfb", ".", "setType", "(", "Embedded", ".", "TYPE_IMAGE", ")", ";", "hLayout", ".", "addComponent", "(", "logoSfb", ")", ";", "hLayout", ".", "setComponentAlignment", "(", "logoAnnis", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_LEFT", ")", ";", "hLayout", ".", "setComponentAlignment", "(", "logoSfb", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "addComponent", "(", "hLayout", ")", ";", "addComponent", "(", "new", "Label", "(", "\"\"", "+", "\"\"", ",", "Label", ".", "CONTENT_XHTML", ")", ")", ";", "addComponent", "(", "new", "Label", "(", "\"Homepage:", "\"", "+", "\"\"", "+", "\"\"", ",", "Label", ".", "CONTENT_XHTML", ")", ")", ";", "addComponent", "(", "new", "Label", "(", "\"Version:", "\"", "+", "getApplication", "(", ")", ".", "getVersion", "(", ")", ")", ")", ";", "TextArea", "txtThirdParty", "=", "new", "TextArea", "(", ")", ";", "txtThirdParty", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "StringBuilder", "sb", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", "+", "\"\"", ")", ";", "File", "thirdPartyFolder", "=", "new", "File", "(", "getApplication", "(", ")", ".", "getContext", "(", ")", ".", "getBaseDirectory", "(", ")", ",", "\"THIRD-PARTY\"", ")", ";", "if", "(", "thirdPartyFolder", ".", "isDirectory", "(", ")", ")", "{", "for", "(", "File", "c", ":", "thirdPartyFolder", ".", "listFiles", "(", "(", "FileFilter", ")", "new", "WildcardFileFilter", "(", "\"*.txt\"", ")", ")", ")", "{", "if", "(", "c", ".", "isFile", "(", ")", ")", "{", "try", "{", "sb", ".", "append", "(", "FileUtils", ".", "readFileToString", "(", "c", ")", ")", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "txtThirdParty", ".", "setValue", "(", "sb", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "txtThirdParty", ".", "setReadOnly", "(", "true", ")", ";", "txtThirdParty", ".", "addStyleName", "(", "\"license\"", ")", ";", "txtThirdParty", ".", "setWordwrap", "(", "false", ")", ";", "addComponent", "(", "txtThirdParty", ")", ";", "Button", "btOK", "=", "new", "Button", "(", "\"OK\"", ")", ";", "btOK", ".", "addListener", "(", "new", "Button", ".", "ClickListener", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "Window", "subwindow", "=", "getWindow", "(", ")", ";", "subwindow", ".", "getParent", "(", ")", ".", "removeWindow", "(", "subwindow", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "addComponent", "(", "btOK", ")", ";", "layout", ".", "setComponentAlignment", "(", "hLayout", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_CENTER", ")", ";", "layout", ".", "setComponentAlignment", "(", "btOK", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_CENTER", ")", ";", "layout", ".", "setExpandRatio", "(", "txtThirdParty", ",", "1.0f", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "tutorial", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ExternalResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "PaintException", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "PaintTarget", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "WebApplicationContext", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Embedded", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "HorizontalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpSession", ";", "public", "class", "TutorialPanel", "extends", "Panel", "{", "private", "Embedded", "embedded", ";", "public", "TutorialPanel", "(", ")", "{", "setSizeFull", "(", ")", ";", "HorizontalLayout", "layout", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "layout", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "setContent", "(", "layout", ")", ";", "embedded", "=", "new", "Embedded", "(", ")", ";", "embedded", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "addComponent", "(", "embedded", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "WebApplicationContext", "webappcontext", "=", "(", "WebApplicationContext", ")", "getApplication", "(", ")", ".", "getContext", "(", ")", ";", "HttpSession", "session", "=", "webappcontext", ".", "getHttpSession", "(", ")", ";", "String", "contextPath", "=", "session", ".", "getServletContext", "(", ")", ".", "getContextPath", "(", ")", ";", "embedded", ".", "setType", "(", "Embedded", ".", "TYPE_BROWSER", ")", ";", "embedded", ".", "setSource", "(", "new", "ExternalResource", "(", "contextPath", "+", "\"\"", ")", ")", ";", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "paintContent", "(", "PaintTarget", "target", ")", "throws", "PaintException", "{", "super", ".", "paintContent", "(", "target", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Embedded", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "VerticalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "public", "class", "ImagePanel", "extends", "Panel", "{", "public", "ImagePanel", "(", "Embedded", "image", ")", "{", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "PANEL_BORDERLESS", ")", ";", "addComponent", "(", "image", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerPlugin", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "PluginManager", ";", "public", "interface", "PluginSystem", "{", "public", "final", "static", "String", "DEFAULT_VISUALIZER", "=", "\"grid\"", ";", "public", "PluginManager", "getPluginManager", "(", ")", ";", "public", "VisualizerPlugin", "getVisualizer", "(", "String", "shortName", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "beans", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "public", "interface", "CitationProvider", "{", "public", "String", "getQuery", "(", ")", ";", "public", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "getCorpora", "(", ")", ";", "public", "int", "getLeftContext", "(", ")", ";", "public", "int", "getRightContext", "(", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "beans", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "public", "class", "HistoryEntry", "implements", "CitationProvider", ",", "Serializable", "{", "private", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ";", "private", "String", "query", ";", "public", "HistoryEntry", "(", ")", "{", "corpora", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "getCorpora", "(", ")", "{", "return", "corpora", ";", "}", "public", "void", "setCorpora", "(", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "corpora", ")", "{", "this", ".", "corpora", "=", "corpora", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getQuery", "(", ")", "{", "return", "query", ";", "}", "public", "void", "setQuery", "(", "String", "query", ")", "{", "this", ".", "query", "=", "query", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "getLeftContext", "(", ")", "{", "return", "5", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "getRightContext", "(", ")", "{", "return", "5", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "toString", "(", ")", "{", "return", "StringUtils", ".", "replaceChars", "(", "query", ",", "\"rn\"", ",", "\"", "\"", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "getClass", "(", ")", "!=", "obj", ".", "getClass", "(", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "final", "HistoryEntry", "other", "=", "(", "HistoryEntry", ")", "obj", ";", "if", "(", "this", ".", "corpora", "!=", "other", ".", "corpora", "&&", "(", "this", ".", "corpora", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "corpora", ".", "equals", "(", "other", ".", "corpora", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "query", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "query", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "query", ".", "equals", "(", "other", ".", "query", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "return", "true", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "int", "hash", "=", "5", ";", "hash", "=", "11", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "corpora", "!=", "null", "?", "this", ".", "corpora", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "hash", "=", "11", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "query", "!=", "null", "?", "this", ".", "query", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "return", "hash", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "beans", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "objects", ".", "AnnisCorpus", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "public", "class", "CorpusBrowserEntry", "implements", "CitationProvider", ",", "Serializable", "{", "private", "String", "name", ";", "private", "String", "example", ";", "private", "AnnisCorpus", "corpus", ";", "public", "String", "getExample", "(", ")", "{", "return", "example", ";", "}", "public", "void", "setExample", "(", "String", "example", ")", "{", "this", ".", "example", "=", "example", ";", "}", "public", "String", "getName", "(", ")", "{", "return", "name", ";", "}", "public", "void", "setName", "(", "String", "name", ")", "{", "this", ".", "name", "=", "name", ";", "}", "public", "AnnisCorpus", "getCorpus", "(", ")", "{", "return", "corpus", ";", "}", "public", "void", "setCorpus", "(", "AnnisCorpus", "corpus", ")", "{", "this", ".", "corpus", "=", "corpus", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "getClass", "(", ")", "!=", "obj", ".", "getClass", "(", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "final", "CorpusBrowserEntry", "other", "=", "(", "CorpusBrowserEntry", ")", "obj", ";", "if", "(", "(", "this", ".", "name", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "name", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "name", ".", "equals", "(", "other", ".", "name", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "corpus", "!=", "other", ".", "corpus", "&&", "(", "this", ".", "corpus", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "corpus", ".", "equals", "(", "other", ".", "corpus", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "return", "true", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "int", "hash", "=", "5", ";", "hash", "=", "13", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "name", "!=", "null", "?", "this", ".", "name", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "hash", "=", "13", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "corpus", "!=", "null", "?", "this", ".", "corpus", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "return", "hash", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getQuery", "(", ")", "{", "return", "example", ";", "}", "@", "Override", "public", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "getCorpora", "(", ")", "{", "Map", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "result", "=", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "AnnisCorpus", ">", "(", ")", ";", "result", ".", "put", "(", "corpus", ".", "getName", "(", ")", ",", "corpus", ")", ";", "return", "result", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "getLeftContext", "(", ")", "{", "return", "5", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "getRightContext", "(", ")", "{", "return", "5", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaController", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "MediaControllerHolder", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "media", ".", "impl", ".", "MediaControllerFactoryImpl", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "servlets", ".", "ResourceServlet", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "VisualizerPlugin", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "grid", ".", "GridVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "CorefVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "dependency", ".", "ProielDependecyTree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "dependency", ".", "ProielRegularDependencyTree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "dependency", ".", "VakyarthaDependencyTree", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "graph", ".", "DebugVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "graph", ".", "DotGraphVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "gridtree", ".", "GridTreeVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "AudioVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "KWICPanel", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "component", ".", "VideoVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "partitur", ".", "PartiturVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "visualizers", ".", "iframe", ".", "tree", ".", "TigerTreeVisualizer", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisSecurityManager", ";", "import", "annis", ".", "security", ".", "AnnisUser", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "classic", ".", "LoggerContext", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "classic", ".", "joran", ".", "JoranConfigurator", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "core", ".", "joran", ".", "spi", ".", "JoranException", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "Application", ".", "UserChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ClassResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "HttpServletRequestListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "gwt", ".", "server", ".", "WebApplicationContext", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Label", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Window", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URLDecoder", ";", "import", "java", ".", "text", ".", "DateFormat", ";", "import", "java", ".", "text", ".", "SimpleDateFormat", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collection", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collections", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Date", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Properties", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServletRequest", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpServletResponse", ";", "import", "javax", ".", "servlet", ".", "http", ".", "HttpSession", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "Plugin", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "PluginManager", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "impl", ".", "PluginManagerFactory", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "util", ".", "PluginManagerUtil", ";", "import", "net", ".", "xeoh", ".", "plugins", ".", "base", ".", "util", ".", "uri", ".", "ClassURI", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "bridge", ".", "SLF4JBridgeHandler", ";", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"serial\"", ")", "public", "class", "MainApp", "extends", "Application", "implements", "PluginSystem", ",", "UserChangeListener", ",", "HttpServletRequestListener", ",", "Serializable", ",", "MediaControllerHolder", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "MainApp", ".", "class", ")", ";", "public", "final", "static", "String", "USER_KEY", "=", "\"\"", ";", "public", "final", "static", "String", "CITATION_KEY", "=", "\"\"", ";", "private", "transient", "SearchWindow", "windowSearch", ";", "private", "transient", "PluginManager", "pluginManager", ";", "private", "static", "final", "Map", "<", "String", ",", "VisualizerPlugin", ">", "visualizerRegistry", "=", "Collections", ".", "synchronizedMap", "(", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "VisualizerPlugin", ">", "(", ")", ")", ";", "private", "static", "final", "Map", "<", "String", ",", "Date", ">", "resourceAddedDate", "=", "Collections", ".", "synchronizedMap", "(", "new", "HashMap", "<", "String", ",", "Date", ">", "(", ")", ")", ";", "private", "Properties", "versionProperties", ";", "private", "transient", "MediaController", "mediaController", ";", "@", "Override", "public", "void", "init", "(", ")", "{", "initLogging", "(", ")", ";", "ClassResource", "res", "=", "new", "ClassResource", "(", "\"\"", ",", "this", ")", ";", "versionProperties", "=", "new", "Properties", "(", ")", ";", "try", "{", "versionProperties", ".", "load", "(", "res", ".", "getStream", "(", ")", ".", "getStream", "(", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "addListener", "(", "(", "UserChangeListener", ")", "this", ")", ";", "initPlugins", "(", ")", ";", "setTheme", "(", "\"annis-theme\"", ")", ";", "initWindow", "(", ")", ";", "}", "protected", "void", "initLogging", "(", ")", "{", "SLF4JBridgeHandler", ".", "removeHandlersForRootLogger", "(", ")", ";", "SLF4JBridgeHandler", ".", "install", "(", ")", ";", "try", "{", "ClassResource", "res", "=", "new", "ClassResource", "(", "\"logback.xml\"", ",", "this", ")", ";", "if", "(", "res", "!=", "null", ")", "{", "LoggerContext", "context", "=", "(", "LoggerContext", ")", "LoggerFactory", ".", "getILoggerFactory", "(", ")", ";", "JoranConfigurator", "jc", "=", "new", "JoranConfigurator", "(", ")", ";", "jc", ".", "setContext", "(", "context", ")", ";", "context", ".", "reset", "(", ")", ";", "context", ".", "putProperty", "(", "\"webappHome\"", ",", "getContext", "(", ")", ".", "getBaseDirectory", "(", ")", ".", "getAbsolutePath", "(", ")", ")", ";", "jc", ".", "doConfigure", "(", "res", ".", "getStream", "(", ")", ".", "getStream", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "JoranException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "public", "void", "initWindow", "(", ")", "{", "try", "{", "windowSearch", "=", "new", "SearchWindow", "(", "(", "PluginSystem", ")", "this", ")", ";", "setMainWindow", "(", "windowSearch", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "e", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", "+", "\"\"", ",", "e", ")", ";", "Window", "debugWindow", "=", "new", "Window", "(", ")", ";", "Label", "lblError", "=", "new", "Label", "(", ")", ";", "lblError", ".", "setValue", "(", "\"\"", "+", "e", ".", "getClass", "(", ")", ".", "getSimpleName", "(", ")", "+", "\"", "is:n\"", "+", "e", ".", "getMessage", "(", ")", "+", "\"\"", "+", "e", ".", "getStackTrace", "(", ")", "[", "0", "]", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "lblError", ".", "setContentMode", "(", "Label", ".", "CONTENT_PREFORMATTED", ")", ";", "debugWindow", ".", "addComponent", "(", "lblError", ")", ";", "setMainWindow", "(", "debugWindow", ")", ";", "}", "}", "public", "SearchWindow", "getWindowSearch", "(", ")", "{", "if", "(", "windowSearch", "==", "null", ")", "{", "initWindow", "(", ")", ";", "}", "return", "windowSearch", ";", "}", "public", "String", "getBuildRevision", "(", ")", "{", "String", "result", "=", "versionProperties", ".", "getProperty", "(", "\"\"", ",", "\"\"", ")", ";", "return", "result", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "getVersion", "(", ")", "{", "String", "rev", "=", "getBuildRevision", "(", ")", ";", "Date", "date", "=", "getBuildDate", "(", ")", ";", "StringBuilder", "result", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "result", ".", "append", "(", "getVersionNumber", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "!", "\"\"", ".", "equals", "(", "rev", ")", "||", "date", "!=", "null", ")", "{", "result", ".", "append", "(", "\"", "(\"", ")", ";", "boolean", "added", "=", "false", ";", "if", "(", "!", "\"\"", ".", "equals", "(", "rev", ")", ")", "{", "result", ".", "append", "(", "\"rev.", "\"", ")", ";", "result", ".", "append", "(", "rev", ")", ";", "added", "=", "true", ";", "}", "if", "(", "date", "!=", "null", ")", "{", "result", ".", "append", "(", "added", "?", "\",", "built", "\"", ":", "\"\"", ")", ";", "SimpleDateFormat", "d", "=", "new", "SimpleDateFormat", "(", "\"\"", ")", ";", "result", ".", "append", "(", "d", ".", "format", "(", "date", ")", ")", ";", "}", "result", ".", "append", "(", "\")\"", ")", ";", "}", "return", "result", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "public", "String", "getVersionNumber", "(", ")", "{", "return", "versionProperties", ".", "getProperty", "(", "\"version\"", ",", "\"\"", ")", ";", "}", "public", "Date", "getBuildDate", "(", ")", "{", "Date", "result", "=", "null", ";", "try", "{", "DateFormat", "format", "=", "new", "SimpleDateFormat", "(", "\"\"", ")", ";", "result", "=", "format", ".", "parse", "(", "versionProperties", ".", "getProperty", "(", "\"build_date\"", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "debug", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "return", "result", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "setUser", "(", "Object", "user", ")", "{", "if", "(", "user", "==", "null", "||", "!", "(", "user", "instanceof", "AnnisUser", ")", ")", "{", "try", "{", "user", "=", "getWindowSearch", "(", ")", ".", "getSecurityManager", "(", ")", ".", "login", "(", "AnnisSecurityManager", ".", "FALLBACK_USER", ",", "AnnisSecurityManager", ".", "FALLBACK_USER", ",", "true", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "super", ".", "setUser", "(", "user", ")", ";", "getWindowSearch", "(", ")", ".", "updateUserInformation", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "AnnisUser", "getUser", "(", ")", "{", "Object", "u", "=", "super", ".", "getUser", "(", ")", ";", "return", "(", "AnnisUser", ")", "u", ";", "}", "private", "void", "initPlugins", "(", ")", "{", "log", ".", "info", "(", "\"\"", ")", ";", "pluginManager", "=", "PluginManagerFactory", ".", "createPluginManager", "(", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "CorefVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "DotGraphVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "DebugVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "GridTreeVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "GridVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "PartiturVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "ProielDependecyTree", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "ProielRegularDependencyTree", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "ResourceServlet", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "TigerTreeVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "VakyarthaDependencyTree", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "AudioVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "VideoVisualizer", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "KWICPanel", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "ClassURI", "(", "MediaControllerFactoryImpl", ".", "class", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "File", "baseDir", "=", "this", ".", "getContext", "(", ")", ".", "getBaseDirectory", "(", ")", ";", "File", "basicPlugins", "=", "new", "File", "(", "baseDir", ",", "\"plugins\"", ")", ";", "if", "(", "basicPlugins", ".", "isDirectory", "(", ")", ")", "{", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "basicPlugins", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "log", ".", "info", "(", "\"\"", ",", "basicPlugins", ".", "getPath", "(", ")", ")", ";", "}", "String", "globalPlugins", "=", "System", ".", "getenv", "(", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "globalPlugins", "!=", "null", ")", "{", "pluginManager", ".", "addPluginsFrom", "(", "new", "File", "(", "globalPlugins", ")", ".", "toURI", "(", ")", ")", ";", "log", ".", "info", "(", "\"\"", ",", "globalPlugins", ")", ";", "}", "StringBuilder", "listOfPlugins", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "listOfPlugins", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "PluginManagerUtil", "util", "=", "new", "PluginManagerUtil", "(", "pluginManager", ")", ";", "for", "(", "Plugin", "p", ":", "util", ".", "getPlugins", "(", ")", ")", "{", "listOfPlugins", ".", "append", "(", "p", ".", "getClass", "(", ")", ".", "getName", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "log", ".", "info", "(", "listOfPlugins", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "Collection", "<", "VisualizerPlugin", ">", "visualizers", "=", "util", ".", "getPlugins", "(", "VisualizerPlugin", ".", "class", ")", ";", "for", "(", "VisualizerPlugin", "vis", ":", "visualizers", ")", "{", "visualizerRegistry", ".", "put", "(", "vis", ".", "getShortName", "(", ")", ",", "vis", ")", ";", "resourceAddedDate", ".", "put", "(", "vis", ".", "getShortName", "(", ")", ",", "new", "Date", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "close", "(", ")", "{", "if", "(", "pluginManager", "!=", "null", ")", "{", "pluginManager", ".", "shutdown", "(", ")", ";", "}", "super", ".", "close", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "PluginManager", "getPluginManager", "(", ")", "{", "if", "(", "pluginManager", "==", "null", ")", "{", "initPlugins", "(", ")", ";", "}", "return", "pluginManager", ";", "}", "@", "Override", "public", "VisualizerPlugin", "getVisualizer", "(", "String", "shortName", ")", "{", "return", "visualizerRegistry", ".", "get", "(", "shortName", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "applicationUserChanged", "(", "UserChangeEvent", "event", ")", "{", "HttpSession", "session", "=", "(", "(", "WebApplicationContext", ")", "getContext", "(", ")", ")", ".", "getHttpSession", "(", ")", ";", "session", ".", "setAttribute", "(", "USER_KEY", ",", "event", ".", "getNewUser", "(", ")", ")", ";", "}", "public", "AnnisSecurityManager", "getSecurityManager", "(", ")", "{", "return", "getWindowSearch", "(", ")", ".", "getSecurityManager", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "onRequestStart", "(", "HttpServletRequest", "request", ",", "HttpServletResponse", "response", ")", "{", "String", "origURI", "=", "request", ".", "getRequestURI", "(", ")", ";", "String", "parameters", "=", "origURI", ".", "replaceAll", "(", "\".*?/Cite(/)?\"", ",", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "!", "\"\"", ".", "equals", "(", "parameters", ")", "&&", "!", "origURI", ".", "equals", "(", "parameters", ")", ")", "{", "try", "{", "String", "decoded", "=", "URLDecoder", ".", "decode", "(", "parameters", ",", "\"UTF-8\"", ")", ";", "getWindowSearch", "(", ")", ".", "evaluateCitation", "(", "decoded", ")", ";", "try", "{", "response", ".", "sendRedirect", "(", "getURL", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "UnsupportedEncodingException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "@", "Override", "public", "void", "onRequestEnd", "(", "HttpServletRequest", "request", ",", "HttpServletResponse", "response", ")", "{", "}", "@", "Override", "public", "MediaController", "getMediaController", "(", ")", "{", "return", "mediaController", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "setMediaController", "(", "MediaController", "mediaController", ")", "{", "this", ".", "mediaController", "=", "mediaController", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "paging", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "themes", ".", "ChameleonTheme", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Validator", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "validator", ".", "AbstractStringValidator", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "ShortcutAction", ".", "KeyCode", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "event", ".", "ShortcutListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "terminal", ".", "ThemeResource", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Alignment", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Button", ".", "ClickEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "CustomComponent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "HorizontalLayout", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Label", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "TextField", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "concurrent", ".", "atomic", ".", "AtomicInteger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "PagingComponent", "extends", "CustomComponent", "implements", "Button", ".", "ClickListener", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "PagingComponent", ".", "class", ")", ";", "public", "static", "final", "ThemeResource", "LEFT_ARROW", "=", "new", "ThemeResource", "(", "\"\"", ")", ";", "public", "static", "final", "ThemeResource", "RIGHT_ARROW", "=", "new", "ThemeResource", "(", "\"\"", ")", ";", "public", "static", "final", "ThemeResource", "FIRST", "=", "new", "ThemeResource", "(", "\"first.png\"", ")", ";", "public", "static", "final", "ThemeResource", "LAST", "=", "new", "ThemeResource", "(", "\"last.png\"", ")", ";", "private", "HorizontalLayout", "layout", ";", "private", "Button", "btFirst", ";", "private", "Button", "btLast", ";", "private", "Button", "btNext", ";", "private", "Button", "btPrevious", ";", "private", "TextField", "txtPage", ";", "private", "Label", "lblMaxPages", ";", "private", "Label", "lblStatus", ";", "private", "Set", "<", "PagingCallback", ">", "callbacks", ";", "private", "AtomicInteger", "count", ";", "private", "int", "pageSize", ";", "private", "int", "currentPage", ";", "private", "Label", "lblInfo", ";", "public", "PagingComponent", "(", "int", "count", ",", "int", "pageSize", ")", "{", "if", "(", "pageSize", "<=", "0", ")", "{", "pageSize", "=", "1", ";", "}", "if", "(", "count", "<", "0", ")", "{", "count", "=", "0", ";", "}", "currentPage", "=", "1", ";", "this", ".", "count", "=", "new", "AtomicInteger", "(", "pageSize", ")", ";", "this", ".", "pageSize", "=", "pageSize", ";", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "addStyleName", "(", "\"toolbar\"", ")", ";", "callbacks", "=", "new", "HashSet", "<", "PagingCallback", ">", "(", ")", ";", "layout", "=", "new", "HorizontalLayout", "(", ")", ";", "layout", ".", "setSpacing", "(", "true", ")", ";", "layout", ".", "setMargin", "(", "false", ",", "true", ",", "false", ",", "true", ")", ";", "Panel", "root", "=", "new", "Panel", "(", "layout", ")", ";", "root", ".", "setStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "PANEL_BORDERLESS", ")", ";", "setCompositionRoot", "(", "root", ")", ";", "lblInfo", "=", "new", "Label", "(", ")", ";", "lblInfo", ".", "addStyleName", "(", "\"\"", ")", ";", "layout", ".", "setWidth", "(", "\"100%\"", ")", ";", "layout", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "btFirst", "=", "new", "Button", "(", ")", ";", "btFirst", ".", "setIcon", "(", "FIRST", ")", ";", "btFirst", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "btFirst", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btFirst", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_ICON_ONLY", ")", ";", "btLast", "=", "new", "Button", "(", ")", ";", "btLast", ".", "setIcon", "(", "LAST", ")", ";", "btLast", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "btLast", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btLast", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_ICON_ONLY", ")", ";", "btNext", "=", "new", "Button", "(", ")", ";", "btNext", ".", "setIcon", "(", "RIGHT_ARROW", ")", ";", "btNext", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "btNext", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btNext", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_ICON_ONLY", ")", ";", "btPrevious", "=", "new", "Button", "(", ")", ";", "btPrevious", ".", "setIcon", "(", "LEFT_ARROW", ")", ";", "btPrevious", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "btPrevious", ".", "addListener", "(", "(", "Button", ".", "ClickListener", ")", "this", ")", ";", "btPrevious", ".", "addStyleName", "(", "ChameleonTheme", ".", "BUTTON_ICON_ONLY", ")", ";", "txtPage", "=", "new", "TextField", "(", ")", ";", "txtPage", ".", "setDescription", "(", "\"current", "page\"", ")", ";", "txtPage", ".", "setHeight", "(", "\"-1px\"", ")", ";", "txtPage", ".", "setWidth", "(", "3.f", ",", "UNITS_EM", ")", ";", "Validator", "pageValidator", "=", "new", "AbstractStringValidator", "(", "\"\"", ")", "{", "@", "Override", "protected", "boolean", "isValidString", "(", "String", "value", ")", "{", "try", "{", "int", "v", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "value", ")", ";", "if", "(", "v", ">", "0", ")", "{", "return", "true", ";", "}", "else", "{", "return", "false", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "}", "}", ";", "txtPage", ".", "addValidator", "(", "pageValidator", ")", ";", "root", ".", "addAction", "(", "new", "EnterListener", "(", "txtPage", ")", ")", ";", "lblMaxPages", "=", "new", "Label", "(", ")", ";", "lblMaxPages", ".", "setDescription", "(", "\"\"", ")", ";", "lblMaxPages", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "lblStatus", "=", "new", "Label", "(", ")", ";", "lblStatus", ".", "setSizeUndefined", "(", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "btFirst", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "btPrevious", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "txtPage", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "lblMaxPages", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "btNext", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "btLast", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "lblStatus", ")", ";", "layout", ".", "addComponent", "(", "lblInfo", ")", ";", "layout", ".", "setComponentAlignment", "(", "lblStatus", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_LEFT", ")", ";", "layout", ".", "setComponentAlignment", "(", "lblMaxPages", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_CENTER", ")", ";", "layout", ".", "setComponentAlignment", "(", "txtPage", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "layout", ".", "setExpandRatio", "(", "lblStatus", ",", "1.0f", ")", ";", "layout", ".", "setComponentAlignment", "(", "lblInfo", ",", "Alignment", ".", "MIDDLE_RIGHT", ")", ";", "layout", ".", "setExpandRatio", "(", "lblInfo", ",", "10.0f", ")", ";", "update", "(", "false", ")", ";", "}", "private", "void", "update", "(", "boolean", "informCallbacks", ")", "{", "int", "myCount", "=", "count", ".", "get", "(", ")", ";", "txtPage", ".", "setValue", "(", "\"\"", "+", "currentPage", ")", ";", "lblMaxPages", ".", "setValue", "(", "\"/", "\"", "+", "getMaxPage", "(", ")", ")", ";", "lblStatus", ".", "setValue", "(", "\"\"", "+", "(", "getStartNumber", "(", ")", "+", "1", ")", "+", "\"", "-", "\"", "+", "Math", ".", "min", "(", "getStartNumber", "(", ")", "+", "pageSize", ",", "myCount", ")", "+", "\"", "of", "\"", "+", "myCount", ")", ";", "btFirst", ".", "setEnabled", "(", "currentPage", ">", "1", ")", ";", "btPrevious", ".", "setEnabled", "(", "currentPage", ">", "1", ")", ";", "btLast", ".", "setEnabled", "(", "currentPage", "<", "getMaxPage", "(", ")", ")", ";", "btNext", ".", "setEnabled", "(", "currentPage", "<", "getMaxPage", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "informCallbacks", ")", "{", "for", "(", "PagingCallback", "c", ":", "callbacks", ")", "{", "c", ".", "createPage", "(", "getStartNumber", "(", ")", ",", "pageSize", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "void", "addCallback", "(", "PagingCallback", "callback", ")", "{", "callbacks", ".", "add", "(", "callback", ")", ";", "}", "public", "boolean", "removeCallback", "(", "PagingCallback", "callback", ")", "{", "return", "callbacks", ".", "remove", "(", "callback", ")", ";", "}", "public", "int", "getMaxPage", "(", ")", "{", "int", "mycount", "=", "Math", ".", "max", "(", "0", ",", "count", ".", "get", "(", ")", "-", "1", ")", ";", "return", "(", "1", "+", "(", "mycount", "/", "pageSize", ")", ")", ";", "}", "public", "int", "getStartNumber", "(", ")", "{", "return", "(", "currentPage", "-", "1", ")", "*", "pageSize", ";", "}", "public", "int", "getCount", "(", ")", "{", "return", "count", ".", "get", "(", ")", ";", "}", "public", "void", "setCount", "(", "int", "count", ",", "boolean", "update", ")", "{", "if", "(", "count", "<", "0", ")", "{", "count", "=", "0", ";", "}", "this", ".", "count", ".", "set", "(", "count", ")", ";", "update", "(", "update", ")", ";", "}", "public", "int", "getPageSize", "(", ")", "{", "return", "pageSize", ";", "}", "public", "void", "setPageSize", "(", "int", "pageSize", ")", "{", "if", "(", "pageSize", "<=", "0", ")", "{", "pageSize", "=", "1", ";", "}", "this", ".", "pageSize", "=", "pageSize", ";", "update", "(", "true", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "buttonClick", "(", "ClickEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btFirst", ")", "{", "currentPage", "=", "1", ";", "}", "else", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btLast", ")", "{", "currentPage", "=", "getMaxPage", "(", ")", ";", "}", "else", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btNext", ")", "{", "currentPage", "++", ";", "}", "else", "if", "(", "event", ".", "getButton", "(", ")", "==", "btPrevious", ")", "{", "currentPage", "--", ";", "}", "currentPage", "=", "sanitizePage", "(", "currentPage", ")", ";", "String", "clearglobalMediaList", "=", "\"\"", "+", "\"{\"", "+", "\"\"", "+", "\"}\"", ";", "getWindow", "(", ")", ".", "executeJavaScript", "(", "clearglobalMediaList", ")", ";", "update", "(", "true", ")", ";", "}", "private", "int", "sanitizePage", "(", "int", "page", ")", "{", "int", "val", "=", "Math", ".", "max", "(", "1", ",", "page", ")", ";", "val", "=", "Math", ".", "min", "(", "1", "+", "(", "count", ".", "get", "(", ")", "/", "pageSize", ")", ",", "page", ")", ";", "return", "val", ";", "}", "public", "class", "EnterListener", "extends", "ShortcutListener", "{", "private", "Object", "registeredTarget", ";", "public", "EnterListener", "(", "Object", "registeredTarget", ")", "{", "super", "(", "\"set", "page\"", ",", "KeyCode", ".", "ENTER", ",", "null", ")", ";", "this", ".", "registeredTarget", "=", "registeredTarget", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "handleAction", "(", "Object", "sender", ",", "Object", "target", ")", "{", "if", "(", "target", "!=", "registeredTarget", ")", "{", "return", ";", "}", "try", "{", "int", "newPage", "=", "Integer", ".", "parseInt", "(", "(", "String", ")", "txtPage", ".", "getValue", "(", ")", ")", ";", "currentPage", "=", "sanitizePage", "(", "newPage", ")", ";", "update", "(", "true", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "void", "setInfo", "(", "String", "text", ")", "{", "lblInfo", ".", "setValue", "(", "text", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ".", "paging", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "public", "interface", "PagingCallback", "extends", "Serializable", "{", "public", "void", "createPage", "(", "int", "start", ",", "int", "limit", ")", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "gui", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "beans", ".", "HistoryEntry", ";", "import", "annis", ".", "gui", ".", "controlpanel", ".", "ControlPanel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeEvent", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "Property", ".", "ValueChangeListener", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "data", ".", "util", ".", "BeanItemContainer", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Label", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Panel", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "Table", ";", "import", "com", ".", "vaadin", ".", "ui", ".", "VerticalLayout", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "public", "class", "HistoryPanel", "extends", "Panel", "implements", "ValueChangeListener", "{", "private", "Table", "tblHistory", ";", "private", "BeanItemContainer", "<", "HistoryEntry", ">", "containerHistory", ";", "private", "ControlPanel", "parent", ";", "private", "CitationLinkGenerator", "citationGenerator", ";", "public", "HistoryPanel", "(", "List", "<", "HistoryEntry", ">", "history", ",", "ControlPanel", "parent", ")", "{", "this", ".", "parent", "=", "parent", ";", "setSizeFull", "(", ")", ";", "(", "(", "VerticalLayout", ")", "getContent", "(", ")", ")", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "containerHistory", "=", "new", "BeanItemContainer", "(", "HistoryEntry", ".", "class", ")", ";", "containerHistory", ".", "addAll", "(", "history", ")", ";", "tblHistory", "=", "new", "Table", "(", ")", ";", "addComponent", "(", "tblHistory", ")", ";", "tblHistory", ".", "setSizeFull", "(", ")", ";", "tblHistory", ".", "setSelectable", "(", "true", ")", ";", "tblHistory", ".", "setMultiSelect", "(", "false", ")", ";", "tblHistory", ".", "setContainerDataSource", "(", "containerHistory", ")", ";", "tblHistory", ".", "addGeneratedColumn", "(", "\"gennumber\"", ",", "new", "Table", ".", "ColumnGenerator", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "Object", "generateCell", "(", "Table", "source", ",", "Object", "itemId", ",", "Object", "columnId", ")", "{", "return", "new", "Label", "(", "\"\"", "+", "(", "containerHistory", ".", "indexOfId", "(", "itemId", ")", "+", "1", ")", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "citationGenerator", "=", "new", "CitationLinkGenerator", "(", ")", ";", "tblHistory", ".", "addGeneratedColumn", "(", "\"genlink\"", ",", "citationGenerator", ")", ";", "tblHistory", ".", "setVisibleColumns", "(", "new", "String", "[", "]", "{", "\"gennumber\"", ",", "\"query\"", ",", "\"genlink\"", "}", ")", ";", "tblHistory", ".", "setColumnHeader", "(", "\"gennumber\"", ",", "\"#\"", ")", ";", "tblHistory", ".", "setColumnHeader", "(", "\"query\"", ",", "\"Query\"", ")", ";", "tblHistory", ".", "setColumnHeader", "(", "\"genlink\"", ",", "\"URL\"", ")", ";", "tblHistory", ".", "setColumnExpandRatio", "(", "\"query\"", ",", "1.0f", ")", ";", "tblHistory", ".", "setImmediate", "(", "true", ")", ";", "tblHistory", ".", "addListener", "(", "(", "ValueChangeListener", ")", "this", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "attach", "(", ")", "{", "super", ".", "attach", "(", ")", ";", "citationGenerator", ".", "setMainWindow", "(", "getApplication", "(", ")", ".", "getMainWindow", "(", ")", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "void", "valueChange", "(", "ValueChangeEvent", "event", ")", "{", "HistoryEntry", "e", "=", "(", "HistoryEntry", ")", "event", ".", "getProperty", "(", ")", ".", "getValue", "(", ")", ";", "if", "(", "parent", "!=", "null", ")", "{", "parent", ".", "setQuery", "(", "e", ".", "getQuery", "(", ")", ",", "e", ".", "getCorpora", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "annis", ".", "kickstarter", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Dialog", ";", "public", "class", "ExceptionDialog", "extends", "javax", ".", "swing", ".", "JDialog", "{", "public", "ExceptionDialog", "(", "Exception", "exception", ")", "{", "super", "(", "(", "Dialog", ")", "null", ",", "true", ")", ";", "init", "(", "exception", ",", "null", ")", ";", "}", "public", "ExceptionDialog", "(", "Exception", "exception", ",", "String", "caption", ")", "{", "super", "(", "(", "Dialog", ")", "null", ",", "true", ")", ";", "init", "(", "exception", ",", "caption", ")", ";", "}", "public", "ExceptionDialog", "(", "java", ".", "awt", ".", "Dialog", "parent", ",", "Exception", "exception", ")", "{", "super", "(", "parent", ",", "true", ")", ";", "init", "(", "exception", ",", "null", ")", ";", "}", "public", "ExceptionDialog", "(", "java", ".", "awt", ".", "Frame", "parent", ",", "Exception", "exception", ")", "{", "super", "(", "parent", ",", "true", ")", ";", "init", "(", "exception", ",", "null", ")", ";", "}", "private", "void", "init", "(", "Exception", "exception", ",", "String", "caption", ")", "{", "initComponents", "(", ")", ";", "if", "(", "caption", "!=", "null", ")", "{", "lblCaption", ".", "setText", "(", "caption", "+", "\":\"", ")", ";", "}", "if", "(", "exception", "!=", "null", ")", "{", "lblType", ".", "setText", "(", "exception", ".", "getClass", "(", ")", ".", "getName", "(", ")", ")", ";", "txtMessage", ".", "setText", "(", "exception", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ")", ";", "txtMessage", ".", "setCaretPosition", "(", "0", ")", ";", "StringBuilder", "details", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "details", ".", "append", "(", "exception", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ")", ";", "details", ".", "append", "(", "\"natn\"", ")", ";", "StackTraceElement", "[", "]", "st", "=", "exception", ".", "getStackTrace", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "i", "=", "0", ";", "i", "<", "st", ".", "length", ";", "i", "++", ")", "{", "details", ".", "append", "(", "st", "[", "i", "]", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "details", ".", "append", "(", "\"n\"", ")", ";", "}", "txtDetails", ".", "setText", "(", "details", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"unchecked\"", ")", "private", "void", "initComponents", "(", ")", "{", "lblCaption", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "btClose", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "spDetails", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JScrollPane", "(", ")", ";", "txtDetails", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JTextArea", "(", ")", ";", "btDetails", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JToggleButton", "(", ")", ";", "spMessage", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JScrollPane", "(", ")", ";", "txtMessage", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JTextArea", "(", ")", ";", "lblTypeCaption", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "lblType", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "setDefaultCloseOperation", "(", "javax", ".", "swing", ".", "WindowConstants", ".", "DISPOSE_ON_CLOSE", ")", ";", "setTitle", "(", "\"\"", ")", ";", "setLocationByPlatform", "(", "true", ")", ";", "addWindowListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "WindowAdapter", "(", ")", "{", "public", "void", "windowOpened", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "WindowEvent", "evt", ")", "{", "formWindowOpened", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "lblCaption", ".", "setFont", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "Font", "(", "\"DejaVu", "Sans\"", ",", "1", ",", "13", ")", ")", ";", "lblCaption", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "btClose", ".", "setMnemonic", "(", "'C'", ")", ";", "btClose", ".", "setText", "(", "\"Close\"", ")", ";", "btClose", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btCloseActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "txtDetails", ".", "setColumns", "(", "20", ")", ";", "txtDetails", ".", "setRows", "(", "5", ")", ";", "txtDetails", ".", "setText", "(", "\"<no", "details>\"", ")", ";", "spDetails", ".", "setViewportView", "(", "txtDetails", ")", ";", "btDetails", ".", "setMnemonic", "(", "'D'", ")", ";", "btDetails", ".", "setText", "(", "\"Details\"", ")", ";", "btDetails", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btDetailsActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "txtMessage", ".", "setColumns", "(", "20", ")", ";", "txtMessage", ".", "setEditable", "(", "false", ")", ";", "txtMessage", ".", "setLineWrap", "(", "true", ")", ";", "txtMessage", ".", "setRows", "(", "5", ")", ";", "txtMessage", ".", "setText", "(", "\"<no", "message>\"", ")", ";", "txtMessage", ".", "setWrapStyleWord", "(", "true", ")", ";", "spMessage", ".", "setViewportView", "(", "txtMessage", ")", ";", "lblTypeCaption", ".", "setText", "(", "\"Type:\"", ")", ";", "lblType", ".", "setText", "(", "\"<unknown>\"", ")", ";", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "layout", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "(", "getContentPane", "(", ")", ")", ";", "getContentPane", "(", ")", ".", "setLayout", "(", "layout", ")", ";", "layout", ".", "setHorizontalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addGap", "(", "24", ",", "24", ",", "24", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addComponent", "(", "spDetails", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "TRAILING", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "538", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "lblCaption", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "484", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "spMessage", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "538", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "btDetails", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "btClose", ")", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "lblTypeCaption", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "lblType", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ")", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ")", ";", "layout", ".", "setVerticalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "lblCaption", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "spMessage", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "lblTypeCaption", ")", ".", "addComponent", "(", "lblType", ")", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "spDetails", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "146", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "btDetails", ")", ".", "addComponent", "(", "btClose", ")", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ")", ";", "pack", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "btDetailsActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "spDetails", ".", "setVisible", "(", "btDetails", ".", "isSelected", "(", ")", ")", ";", "pack", "(", ")", ";", "validate", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "btCloseActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "this", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "this", ".", "dispose", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "formWindowOpened", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "WindowEvent", "evt", ")", "{", "spDetails", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "pack", "(", ")", ";", "validate", "(", ")", ";", "}", "public", "static", "void", "main", "(", "String", "args", "[", "]", ")", "{", "java", ".", "awt", ".", "EventQueue", ".", "invokeLater", "(", "new", "Runnable", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "ExceptionDialog", "dialog", "=", "new", "ExceptionDialog", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JFrame", "(", ")", ",", "null", ")", ";", "dialog", ".", "addWindowListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "WindowAdapter", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "windowClosing", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "WindowEvent", "e", ")", "{", "System", ".", "exit", "(", "0", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "dialog", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "}", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btClose", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JToggleButton", "btDetails", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "lblCaption", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "lblType", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "lblTypeCaption", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JScrollPane", "spDetails", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JScrollPane", "spMessage", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JTextArea", "txtDetails", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JTextArea", "txtMessage", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "annis", ".", "kickstarter", ";", "import", "annis", ".", "administration", ".", "CorpusAdministration", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "SwingWorker", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "table", ".", "DefaultTableModel", ";", "public", "class", "ListDialog", "extends", "javax", ".", "swing", ".", "JDialog", "{", "private", "DefaultTableModel", "tableModel", ";", "private", "CorpusAdministration", "corpusAdmin", ";", "public", "ListDialog", "(", "java", ".", "awt", ".", "Frame", "parent", ",", "boolean", "modal", ",", "CorpusAdministration", "corpusAdmin", ")", "{", "super", "(", "parent", ",", "modal", ")", ";", "this", ".", "corpusAdmin", "=", "corpusAdmin", ";", "initComponents", "(", ")", ";", "updateTable", "(", ")", ";", "}", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"unchecked\"", ")", "private", "void", "initComponents", "(", ")", "{", "jScrollPane1", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JScrollPane", "(", ")", ";", "tableList", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JTable", "(", ")", ";", "btClose", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "btDelete", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "pbDelete", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "(", ")", ";", "setDefaultCloseOperation", "(", "javax", ".", "swing", ".", "WindowConstants", ".", "DISPOSE_ON_CLOSE", ")", ";", "setTitle", "(", "\"\"", ")", ";", "setLocationByPlatform", "(", "true", ")", ";", "tableList", ".", "setModel", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "table", ".", "DefaultTableModel", "(", "new", "Object", "[", "]", "[", "]", "{", "}", ",", "new", "String", "[", "]", "{", "}", ")", ")", ";", "jScrollPane1", ".", "setViewportView", "(", "tableList", ")", ";", "btClose", ".", "setMnemonic", "(", "'c'", ")", ";", "btClose", ".", "setText", "(", "\"Close\"", ")", ";", "btClose", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btCloseActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "btDelete", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "btDelete", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "btDelete", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btDeleteActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "layout", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "(", "getContentPane", "(", ")", ")", ";", "getContentPane", "(", ")", ".", "setLayout", "(", "layout", ")", ";", "layout", ".", "setHorizontalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addComponent", "(", "jScrollPane1", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "627", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "TRAILING", ",", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "btDelete", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "188", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addGap", "(", "368", ",", "368", ",", "368", ")", ".", "addComponent", "(", "btClose", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "pbDelete", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "188", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addGap", "(", "427", ",", "427", ",", "427", ")", ")", ")", ")", ")", ";", "layout", ".", "setVerticalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "jScrollPane1", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "309", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addGap", "(", "7", ",", "7", ",", "7", ")", ".", "addComponent", "(", "pbDelete", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "btDelete", ")", ".", "addComponent", "(", "btClose", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "34", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ")", ".", "addContainerGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ")", ")", ";", "pack", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "btCloseActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "}", "private", "void", "btDeleteActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "int", "row", "=", "tableList", ".", "getSelectedRow", "(", ")", ";", "int", "col", "=", "tableModel", ".", "findColumn", "(", "\"id\"", ")", ";", "if", "(", "row", ">", "-", "1", "&&", "col", ">", "-", "1", ")", "{", "Object", "value", "=", "tableModel", ".", "getValueAt", "(", "row", ",", "col", ")", ";", "final", "LinkedList", "<", "Long", ">", "corpusListToDelete", "=", "new", "LinkedList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "long", "l", "=", "Long", ".", "parseLong", "(", "value", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "corpusListToDelete", ".", "add", "(", "l", ")", ";", "pbDelete", ".", "setIndeterminate", "(", "true", ")", ";", "btClose", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "btDelete", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "SwingWorker", "<", "String", ",", "Void", ">", "worker", "=", "new", "SwingWorker", "<", "String", ",", "Void", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "protected", "String", "doInBackground", "(", ")", "throws", "Exception", "{", "corpusAdmin", ".", "deleteCorpora", "(", "corpusListToDelete", ")", ";", "updateTable", "(", ")", ";", "return", "\"\"", ";", "}", "@", "Override", "protected", "void", "done", "(", ")", "{", "pbDelete", ".", "setIndeterminate", "(", "false", ")", ";", "pbDelete", ".", "setValue", "(", "100", ")", ";", "btClose", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "btDelete", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "}", "}", ";", "worker", ".", "execute", "(", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "updateTable", "(", ")", "{", "try", "{", "tableModel", "=", "new", "DefaultTableModel", "(", "new", "String", "[", "]", "{", "\"name\"", ",", "\"id\"", ",", "\"text\"", ",", "\"tokens\"", ",", "\"source_path\"", "}", ",", "0", ")", ";", "tableList", ".", "setModel", "(", "tableModel", ")", ";", "List", "<", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", ">", "stats", "=", "corpusAdmin", ".", "listCorpusStats", "(", ")", ";", "int", "row", "=", "0", ";", "for", "(", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", "map", ":", "stats", ")", "{", "String", "[", "]", "rowData", "=", "new", "String", "[", "tableModel", ".", "getColumnCount", "(", ")", "]", ";", "for", "(", "int", "j", "=", "0", ";", "j", "<", "rowData", ".", "length", ";", "j", "++", ")", "{", "String", "cName", "=", "tableList", ".", "getColumnName", "(", "j", ")", ";", "if", "(", "map", ".", "containsKey", "(", "cName", ")", ")", "{", "rowData", "[", "j", "]", "=", "map", ".", "get", "(", "cName", ")", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "else", "{", "rowData", "[", "j", "]", "=", "\"\"", ";", "}", "}", "tableModel", ".", "addRow", "(", "rowData", ")", ";", "row", "++", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "new", "ExceptionDialog", "(", "ex", ")", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "}", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btClose", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btDelete", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JScrollPane", "jScrollPane1", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "pbDelete", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JTable", "tableList", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "annis", ".", "kickstarter", ";", "import", "annis", ".", "administration", ".", "CorpusAdministration", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Frame", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "File", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "concurrent", ".", "ExecutionException", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "JFileChooser", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "JOptionPane", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "SwingWorker", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "InitDialog", "extends", "javax", ".", "swing", ".", "JDialog", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "InitDialog", ".", "class", ")", ";", "private", "CorpusAdministration", "corpusAdministration", ";", "private", "SwingWorker", "<", "String", ",", "Void", ">", "initWorker", ";", "private", "Frame", "parentFrame", ";", "private", "class", "InitDialogWorker", "extends", "SwingWorker", "<", "String", ",", "Void", ">", "implements", "Serializable", "{", "private", "InitDialog", "parent", ";", "private", "List", "<", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", ">", "corpora", ";", "public", "InitDialogWorker", "(", "InitDialog", "parent", ",", "List", "<", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", ">", "corpora", ")", "{", "this", ".", "parent", "=", "parent", ";", "this", ".", "corpora", "=", "corpora", ";", "}", "@", "Override", "protected", "String", "doInBackground", "(", ")", "throws", "Exception", "{", "try", "{", "corpusAdministration", ".", "initializeDatabase", "(", "\"localhost\"", ",", "\"5432\"", ",", "\"\"", ",", "\"\"", ",", "\"\"", ",", "\"postgres\"", ",", "txtAdminUsername", ".", "getText", "(", ")", ",", "new", "String", "(", "txtAdminPassword", ".", "getPassword", "(", ")", ")", ")", ";", "return", "\"\"", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "parent", ".", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "ExceptionDialog", "dlg", "=", "new", "ExceptionDialog", "(", "parent", ",", "ex", ")", ";", "dlg", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "return", "\"ERROR\"", ";", "}", "@", "Override", "protected", "void", "done", "(", ")", "{", "pbInit", ".", "setIndeterminate", "(", "false", ")", ";", "btOk", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "btCancel", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "try", "{", "if", "(", "\"\"", ".", "equals", "(", "this", ".", "get", "(", ")", ")", ")", "{", "pbInit", ".", "setValue", "(", "100", ")", ";", "if", "(", "corpora", "!=", "null", "&&", "corpora", ".", "size", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "ImportDialog", "importDlg", "=", "new", "ImportDialog", "(", "parentFrame", ",", "true", ",", "corpusAdministration", ",", "corpora", ")", ";", "importDlg", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "else", "{", "JOptionPane", ".", "showMessageDialog", "(", "null", ",", "\"\"", ",", "\"INFO\"", ",", "JOptionPane", ".", "INFORMATION_MESSAGE", ")", ";", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "}", "}", "else", "{", "pbInit", ".", "setValue", "(", "0", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "InterruptedException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "catch", "(", "ExecutionException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "public", "InitDialog", "(", "java", ".", "awt", ".", "Frame", "parent", ",", "boolean", "modal", ",", "final", "CorpusAdministration", "corpusAdministration", ")", "{", "super", "(", "parent", ",", "modal", ")", ";", "this", ".", "parentFrame", "=", "parent", ";", "initComponents", "(", ")", ";", "getRootPane", "(", ")", ".", "setDefaultButton", "(", "btOk", ")", ";", "this", ".", "corpusAdministration", "=", "corpusAdministration", ";", "}", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"unchecked\"", ")", "private", "void", "initComponents", "(", ")", "{", "fileChooser", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JFileChooser", "(", ")", ";", "jLabel1", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "jLabel2", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "btOk", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "btCancel", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "txtAdminUsername", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JTextField", "(", ")", ";", "txtAdminPassword", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JPasswordField", "(", ")", ";", "pbInit", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "(", ")", ";", "cbMigrate", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JCheckBox", "(", ")", ";", "fileChooser", ".", "setFileSelectionMode", "(", "javax", ".", "swing", ".", "JFileChooser", ".", "DIRECTORIES_ONLY", ")", ";", "setDefaultCloseOperation", "(", "javax", ".", "swing", ".", "WindowConstants", ".", "DISPOSE_ON_CLOSE", ")", ";", "setTitle", "(", "\"\"", ")", ";", "setLocationByPlatform", "(", "true", ")", ";", "jLabel1", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "jLabel2", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "btOk", ".", "setMnemonic", "(", "'o'", ")", ";", "btOk", ".", "setText", "(", "\"Ok\"", ")", ";", "btOk", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btOkActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "btCancel", ".", "setMnemonic", "(", "'c'", ")", ";", "btCancel", ".", "setText", "(", "\"Cancel\"", ")", ";", "btCancel", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btCancelActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "txtAdminUsername", ".", "setText", "(", "\"postgres\"", ")", ";", "cbMigrate", ".", "setSelected", "(", "true", ")", ";", "cbMigrate", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "cbMigrate", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "cbMigrateActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "layout", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "(", "getContentPane", "(", ")", ")", ";", "getContentPane", "(", ")", ".", "setLayout", "(", "layout", ")", ";", "layout", ".", "setHorizontalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addComponent", "(", "pbInit", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "jLabel1", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "txtAdminUsername", ")", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "jLabel2", ")", ".", "addGap", "(", "18", ",", "18", ",", "18", ")", ".", "addComponent", "(", "txtAdminPassword", ")", ")", ".", "addGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "TRAILING", ",", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "btCancel", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "105", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "btOk", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "105", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ")", ".", "addComponent", "(", "cbMigrate", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ")", ";", "layout", ".", "setVerticalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "jLabel1", ")", ".", "addComponent", "(", "txtAdminUsername", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "jLabel2", ")", ".", "addComponent", "(", "txtAdminPassword", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "UNRELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "cbMigrate", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ",", "4", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "pbInit", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "UNRELATED", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "btOk", ")", ".", "addComponent", "(", "btCancel", ")", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ")", ";", "pack", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "btCancelActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "}", "private", "void", "checkCorpusSourcePathExists", "(", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", "corpus", ")", "{", "if", "(", "!", "corpus", ".", "containsKey", "(", "\"source_path\"", ")", ")", "{", "int", "result", "=", "JOptionPane", ".", "showConfirmDialog", "(", "this", ",", "\"\"", "+", "\"corpus", "\\\"\"", "+", "corpus", ".", "get", "(", "\"name\"", ")", "+", "\"\"", ",", "\"\"", "+", "corpus", ".", "get", "(", "\"name\"", ")", "+", "\"\\\"\"", ",", "JOptionPane", ".", "YES_NO_OPTION", ")", ";", "if", "(", "result", "==", "JOptionPane", ".", "YES_OPTION", ")", "{", "int", "fileChooseResult", "=", "fileChooser", ".", "showDialog", "(", "this", ",", "\"Select\"", ")", ";", "if", "(", "fileChooseResult", "==", "JFileChooser", ".", "APPROVE_OPTION", ")", "{", "corpus", ".", "put", "(", "\"source_path\"", ",", "fileChooser", ".", "getSelectedFile", "(", ")", ".", "getAbsolutePath", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "private", "void", "btOkActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "pbInit", ".", "setIndeterminate", "(", "true", ")", ";", "btOk", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "btCancel", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "List", "<", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", ">", "existingCorpora", "=", "new", "LinkedList", "<", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", ">", "(", ")", ";", "if", "(", "cbMigrate", ".", "isSelected", "(", ")", ")", "{", "try", "{", "existingCorpora", "=", "corpusAdministration", ".", "listCorpusStats", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "warn", "(", "\"\"", "+", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "JOptionPane", ".", "showMessageDialog", "(", "parentFrame", ",", "\"\"", "+", "\"\"", ")", ";", "}", "for", "(", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", "corpus", ":", "existingCorpora", ")", "{", "checkCorpusSourcePathExists", "(", "corpus", ")", ";", "}", "}", "initWorker", "=", "new", "InitDialogWorker", "(", "this", ",", "existingCorpora", ")", ";", "initWorker", ".", "execute", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "cbMigrateActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "}", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btCancel", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btOk", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JCheckBox", "cbMigrate", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JFileChooser", "fileChooser", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "jLabel1", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "jLabel2", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "pbInit", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JPasswordField", "txtAdminPassword", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JTextField", "txtAdminUsername", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "annis", ".", "kickstarter", ";", "import", "annis", ".", "AnnisBaseRunner", ";", "import", "annis", ".", "administration", ".", "CorpusAdministration", ";", "import", "annis", ".", "service", ".", "internal", ".", "AnnisServiceRunner", ";", "import", "annis", ".", "utils", ".", "Utils", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Color", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Cursor", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Desktop", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "Image", ";", "import", "java", ".", "awt", ".", "image", ".", "BufferedImage", ";", "import", "java", ".", "beans", ".", "PropertyChangeEvent", ";", "import", "java", ".", "beans", ".", "PropertyChangeListener", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "IOException", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "net", ".", "URI", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "LinkedList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "javax", ".", "imageio", ".", "ImageIO", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "SwingWorker", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "UIManager", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "jetty", ".", "server", ".", "Server", ";", "import", "org", ".", "eclipse", ".", "jetty", ".", "webapp", ".", "WebAppContext", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "MainFrame", "extends", "javax", ".", "swing", ".", "JFrame", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "MainFrame", ".", "class", ")", ";", "private", "class", "MainFrameWorker", "extends", "SwingWorker", "<", "String", ",", "String", ">", "implements", "Serializable", "{", "@", "Override", "protected", "String", "doInBackground", "(", ")", "throws", "Exception", "{", "setProgress", "(", "1", ")", ";", "try", "{", "startService", "(", ")", ";", "setProgress", "(", "2", ")", ";", "startJetty", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "return", "ex", ".", "getLocalizedMessage", "(", ")", ";", "}", "return", "\"\"", ";", "}", "@", "Override", "protected", "void", "done", "(", ")", "{", "try", "{", "wasStarted", "=", "true", ";", "pbStart", ".", "setIndeterminate", "(", "false", ")", ";", "pbStart", ".", "setValue", "(", "100", ")", ";", "if", "(", "\"\"", ".", "equals", "(", "this", ".", "get", "(", ")", ")", ")", "{", "lblStatusService", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "btLaunch", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "btLaunch", ".", "setForeground", "(", "Color", ".", "blue", ")", ";", "}", "else", "{", "lblStatusService", ".", "setText", "(", "\"\"", "+", "this", ".", "get", "(", ")", "+", "\"</html>\"", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "new", "ExceptionDialog", "(", "ex", ")", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "CorpusAdministration", "corpusAdministration", ";", "private", "SwingWorker", "<", "String", ",", "String", ">", "serviceWorker", ";", "private", "boolean", "wasStarted", "=", "false", ";", "public", "MainFrame", "(", ")", "{", "Integer", "[", "]", "sizes", "=", "new", "Integer", "[", "]", "{", "192", ",", "128", ",", "64", ",", "48", ",", "32", ",", "16", ",", "14", "}", ";", "List", "<", "Image", ">", "allImages", "=", "new", "LinkedList", "<", "Image", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "int", "s", ":", "sizes", ")", "{", "try", "{", "BufferedImage", "imgIcon", "=", "ImageIO", ".", "read", "(", "MainFrame", ".", "class", ".", "getResource", "(", "\"logo/annis_\"", "+", "s", "+", "\".png\"", ")", ")", ";", "allImages", ".", "add", "(", "imgIcon", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "this", ".", "setIconImages", "(", "allImages", ")", ";", "System", ".", "setProperty", "(", "\"annis.home\"", ",", "\".\"", ")", ";", "this", ".", "corpusAdministration", "=", "(", "CorpusAdministration", ")", "AnnisBaseRunner", ".", "getBean", "(", "\"\"", ",", "true", ",", "\"file:\"", "+", "Utils", ".", "getAnnisFile", "(", "\"\"", ")", ".", "getAbsolutePath", "(", ")", ")", ";", "try", "{", "UIManager", ".", "setLookAndFeel", "(", "UIManager", ".", "getSystemLookAndFeelClassName", "(", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "initComponents", "(", ")", ";", "serviceWorker", "=", "new", "MainFrameWorker", "(", ")", ";", "serviceWorker", ".", "addPropertyChangeListener", "(", "new", "PropertyChangeListener", "(", ")", "{", "public", "void", "propertyChange", "(", "PropertyChangeEvent", "evt", ")", "{", "if", "(", "serviceWorker", ".", "getProgress", "(", ")", "==", "1", ")", "{", "pbStart", ".", "setIndeterminate", "(", "true", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "}", "}", "}", ")", ";", "if", "(", "isInitialized", "(", ")", ")", "{", "btImport", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "btList", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "serviceWorker", ".", "execute", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"unchecked\"", ")", "private", "void", "initComponents", "(", ")", "{", "btInit", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "btImport", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "btList", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "lblStatusService", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "btLaunch", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "pbStart", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "(", ")", ";", "btExit", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "setDefaultCloseOperation", "(", "javax", ".", "swing", ".", "WindowConstants", ".", "EXIT_ON_CLOSE", ")", ";", "setTitle", "(", "\"\"", ")", ";", "setLocationByPlatform", "(", "true", ")", ";", "btInit", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "btInit", ".", "setMnemonic", "(", "'d'", ")", ";", "btInit", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "btInit", ".", "setToolTipText", "(", "\"\"", ")", ";", "btInit", ".", "setName", "(", "\"btInit\"", ")", ";", "btInit", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btInitActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "btImport", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "btImport", ".", "setMnemonic", "(", "'i'", ")", ";", "btImport", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "btImport", ".", "setToolTipText", "(", "\"\"", ")", ";", "btImport", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "btImport", ".", "setName", "(", "\"btImport\"", ")", ";", "btImport", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btImportActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "btList", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "btList", ".", "setMnemonic", "(", "'l'", ")", ";", "btList", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "btList", ".", "setToolTipText", "(", "\"\"", ")", ";", "btList", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "btList", ".", "setName", "(", "\"btList\"", ")", ";", "btList", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btListActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setFont", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "Font", "(", "\"DejaVu", "Sans\"", ",", "0", ",", "18", ")", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setHorizontalAlignment", "(", "javax", ".", "swing", ".", "SwingConstants", ".", "CENTER", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "lblStatusService", ".", "setName", "(", "\"\"", ")", ";", "btLaunch", ".", "setForeground", "(", "java", ".", "awt", ".", "Color", ".", "lightGray", ")", ";", "btLaunch", ".", "setMnemonic", "(", "'u'", ")", ";", "btLaunch", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "btLaunch", ".", "setActionCommand", "(", "\"\"", ")", ";", "btLaunch", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "btLaunch", ".", "setName", "(", "\"btLaunch\"", ")", ";", "btLaunch", ".", "addMouseListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "MouseAdapter", "(", ")", "{", "public", "void", "mouseEntered", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "MouseEvent", "evt", ")", "{", "btLaunchMouseEntered", "(", "evt", ")", ";", "}", "public", "void", "mouseExited", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "MouseEvent", "evt", ")", "{", "btLaunchMouseExited", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "btLaunch", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btLaunchActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "pbStart", ".", "setName", "(", "\"pbStart\"", ")", ";", "btExit", ".", "setIcon", "(", "new", "javax", ".", "swing", ".", "ImageIcon", "(", "getClass", "(", ")", ".", "getResource", "(", "\"\"", ")", ")", ")", ";", "btExit", ".", "setMnemonic", "(", "'e'", ")", ";", "btExit", ".", "setText", "(", "\"Exit\"", ")", ";", "btExit", ".", "setToolTipText", "(", "\"\"", ")", ";", "btExit", ".", "setName", "(", "\"btExit\"", ")", ";", "btExit", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btExitActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "layout", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "(", "getContentPane", "(", ")", ")", ";", "getContentPane", "(", ")", ".", "setLayout", "(", "layout", ")", ";", "layout", ".", "setHorizontalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addComponent", "(", "btInit", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "TRAILING", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "376", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "btImport", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "TRAILING", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "376", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "btList", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "376", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "lblStatusService", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "TRAILING", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "376", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "pbStart", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "376", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "btLaunch", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "376", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "btExit", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "TRAILING", ")", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ")", ";", "layout", ".", "setVerticalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "btInit", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "btImport", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "btList", ")", ".", "addGap", "(", "18", ",", "18", ",", "18", ")", ".", "addComponent", "(", "lblStatusService", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "pbStart", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "btLaunch", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ",", "34", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "btExit", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ")", ";", "pack", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "btInitActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "InitDialog", "dlg", "=", "new", "InitDialog", "(", "this", ",", "true", ",", "corpusAdministration", ")", ";", "dlg", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "if", "(", "!", "wasStarted", "&&", "isInitialized", "(", ")", ")", "{", "btImport", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "btList", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "serviceWorker", ".", "execute", "(", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "btImportActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "ImportDialog", "dlg", "=", "new", "ImportDialog", "(", "this", ",", "true", ",", "corpusAdministration", ")", ";", "dlg", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "private", "void", "btListActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "ListDialog", "dlg", "=", "new", "ListDialog", "(", "this", ",", "true", ",", "corpusAdministration", ")", ";", "dlg", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "private", "void", "btLaunchActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "try", "{", "Desktop", ".", "getDesktop", "(", ")", ".", "browse", "(", "new", "URI", "(", "\"\"", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "new", "ExceptionDialog", "(", "this", ",", "ex", ")", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "btExitActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "System", ".", "exit", "(", "0", ")", ";", "}", "private", "void", "btLaunchMouseEntered", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "MouseEvent", "evt", ")", "{", "this", ".", "setCursor", "(", "new", "Cursor", "(", "Cursor", ".", "HAND_CURSOR", ")", ")", ";", "}", "private", "void", "btLaunchMouseExited", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "MouseEvent", "evt", ")", "{", "this", ".", "setCursor", "(", "new", "Cursor", "(", "Cursor", ".", "DEFAULT_CURSOR", ")", ")", ";", "}", "private", "void", "startService", "(", ")", "throws", "Exception", "{", "AnnisServiceRunner", "runner", "=", "new", "AnnisServiceRunner", "(", ")", ";", "runner", ".", "createWebServer", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "startJetty", "(", ")", "throws", "Exception", "{", "Server", "jetty", "=", "new", "Server", "(", "8080", ")", ";", "WebAppContext", "context", "=", "new", "WebAppContext", "(", "\"./webapp/\"", ",", "\"/annis-gui\"", ")", ";", "context", ".", "setInitParameter", "(", "\"\"", ",", "\"\"", ")", ";", "String", "webxmlOverrride", "=", "System", ".", "getProperty", "(", "\"annis.home\"", ")", "+", "\"\"", ";", "context", ".", "setOverrideDescriptor", "(", "webxmlOverrride", ")", ";", "jetty", ".", "setHandler", "(", "context", ")", ";", "jetty", ".", "start", "(", ")", ";", "}", "private", "boolean", "isInitialized", "(", ")", "{", "if", "(", "corpusAdministration", ".", "checkDatabaseSchemaVersion", "(", ")", "==", "false", ")", "{", "btInit", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "return", "false", ";", "}", "try", "{", "corpusAdministration", ".", "listCorpusStats", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "return", "true", ";", "}", "public", "static", "void", "main", "(", "String", "args", "[", "]", ")", "{", "java", ".", "awt", ".", "EventQueue", ".", "invokeLater", "(", "new", "Runnable", "(", ")", "{", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "MainFrame", "frame", "=", "new", "MainFrame", "(", ")", ";", "frame", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "}", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btExit", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btImport", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btInit", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btLaunch", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btList", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "lblStatusService", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "pbStart", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "de", ".", "hu_berlin", ".", "german", ".", "korpling", ".", "annis", ".", "kickstarter", ";", "import", "annis", ".", "administration", ".", "CorpusAdministration", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "classic", ".", "Level", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "classic", ".", "LoggerContext", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "classic", ".", "joran", ".", "JoranConfigurator", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "classic", ".", "spi", ".", "ILoggingEvent", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "core", ".", "Appender", ";", "import", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "core", ".", "AppenderBase", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "*", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Properties", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "JFileChooser", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "JOptionPane", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "SwingUtilities", ";", "import", "javax", ".", "swing", ".", "SwingWorker", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "ImportDialog", "extends", "javax", ".", "swing", ".", "JDialog", "{", "private", "static", "final", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "ImportDialog", ".", "class", ")", ";", "private", "File", "confFile", ";", "private", "Properties", "confProps", ";", "private", "static", "class", "Status", "{", "public", "boolean", "ok", "=", "true", ";", "public", "Exception", "ex", "=", "new", "Exception", "(", ")", ";", "}", "private", "class", "ImportDialogWorker", "extends", "SwingWorker", "<", "Status", ",", "Void", ">", "implements", "Serializable", "{", "@", "Override", "protected", "Status", "doInBackground", "(", ")", "throws", "Exception", "{", "Status", "status", "=", "new", "Status", "(", ")", ";", "StringBuilder", "errorMessages", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "if", "(", "corpora", "==", "null", ")", "{", "try", "{", "SwingUtilities", ".", "invokeLater", "(", "new", "Runnable", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "lblCurrentCorpus", ".", "setText", "(", "\"import", "\"", "+", "StringUtils", ".", "abbreviateMiddle", "(", "txtInputDir", ".", "getText", "(", ")", ",", "\"...\"", ",", "50", ")", ")", ";", "pbCorpus", ".", "setMaximum", "(", "1", ")", ";", "pbCorpus", ".", "setMinimum", "(", "0", ")", ";", "pbCorpus", ".", "setValue", "(", "0", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "corpusAdministration", ".", "importCorpora", "(", "txtInputDir", ".", "getText", "(", ")", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "status", ".", "ok", "=", "false", ";", "status", ".", "ex", "=", "ex", ";", "return", "status", ";", "}", "}", "else", "{", "SwingUtilities", ".", "invokeLater", "(", "new", "Runnable", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "pbCorpus", ".", "setMaximum", "(", "corpora", ".", "size", "(", ")", ")", ";", "pbCorpus", ".", "setMinimum", "(", "0", ")", ";", "pbCorpus", ".", "setValue", "(", "0", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "int", "i", "=", "0", ";", "for", "(", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", "corpus", ":", "corpora", ")", "{", "if", "(", "isCancelled", "(", ")", ")", "{", "status", ".", "ok", "=", "true", ";", "return", "status", ";", "}", "if", "(", "corpus", ".", "containsKey", "(", "\"source_path\"", ")", ")", "{", "final", "String", "path", "=", "(", "String", ")", "corpus", ".", "get", "(", "\"source_path\"", ")", ";", "final", "int", "finalI", "=", "i", ";", "SwingUtilities", ".", "invokeLater", "(", "new", "Runnable", "(", ")", "{", "@", "Override", "public", "void", "run", "(", ")", "{", "lblCurrentCorpus", ".", "setText", "(", "\"import", "\"", "+", "StringUtils", ".", "abbreviateMiddle", "(", "path", ",", "\"...\"", ",", "40", ")", "+", "\"", "[\"", "+", "(", "finalI", "+", "1", ")", "+", "\"/\"", "+", "corpora", ".", "size", "(", ")", "+", "\"]\"", ")", ";", "pbCorpus", ".", "setValue", "(", "finalI", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "try", "{", "corpusAdministration", ".", "importCorpora", "(", "path", ")", ";", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", ",", "ex", ")", ";", "errorMessages", ".", "append", "(", "\"[\"", ")", ".", "append", "(", "path", ")", ".", "append", "(", "\"]n\"", ")", ";", "errorMessages", ".", "append", "(", "ex", ".", "getMessage", "(", ")", ")", ".", "append", "(", "path", ")", ".", "append", "(", "\"nn\"", ")", ";", "}", "}", "i", "++", ";", "}", "}", "if", "(", "errorMessages", ".", "length", "(", ")", ">", "0", ")", "{", "status", ".", "ok", "=", "false", ";", "return", "status", ";", "}", "return", "status", ";", "}", "@", "Override", "protected", "void", "done", "(", ")", "{", "isImporting", "=", "false", ";", "btOk", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "btSearchInputDir", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "txtInputDir", ".", "setEnabled", "(", "true", ")", ";", "lblCurrentCorpus", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "pbCorpus", ".", "setValue", "(", "pbCorpus", ".", "getMaximum", "(", ")", ")", ";", "pbImport", ".", "setIndeterminate", "(", "false", ")", ";", "try", "{", "if", "(", "!", "isCancelled", "(", ")", ")", "{", "Status", "status", "=", "this", ".", "get", "(", ")", ";", "if", "(", "status", ".", "ok", ")", "{", "JOptionPane", ".", "showMessageDialog", "(", "null", ",", "\"\"", ",", "\"INFO\"", ",", "JOptionPane", ".", "INFORMATION_MESSAGE", ")", ";", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "}", "else", "{", "new", "ExceptionDialog", "(", "status", ".", "ex", ",", "\"\"", ")", ".", "setVisible", "(", "true", ")", ";", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "}", "}", "}", "catch", "(", "Exception", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "private", "CorpusAdministration", "corpusAdministration", ";", "private", "SwingWorker", "<", "Status", ",", "Void", ">", "worker", ";", "private", "boolean", "isImporting", ";", "private", "List", "<", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", ">", "corpora", ";", "public", "ImportDialog", "(", "java", ".", "awt", ".", "Frame", "parent", ",", "boolean", "modal", ",", "CorpusAdministration", "corpusAdmin", ")", "{", "this", "(", "parent", ",", "modal", ",", "corpusAdmin", ",", "null", ")", ";", "}", "public", "ImportDialog", "(", "java", ".", "awt", ".", "Frame", "parent", ",", "boolean", "modal", ",", "CorpusAdministration", "corpusAdmin", ",", "List", "<", "Map", "<", "String", ",", "Object", ">", ">", "corpora", ")", "{", "super", "(", "parent", ",", "modal", ")", ";", "this", ".", "corpusAdministration", "=", "corpusAdmin", ";", "this", ".", "corpora", "=", "corpora", ";", "confProps", "=", "new", "Properties", "(", ")", ";", "confFile", "=", "new", "File", "(", "System", ".", "getProperty", "(", "\"user.home\"", ")", "+", "\"\"", ")", ";", "try", "{", "if", "(", "!", "confFile", ".", "exists", "(", ")", ")", "{", "if", "(", "!", "confFile", ".", "getParentFile", "(", ")", ".", "mkdirs", "(", ")", ")", "{", "log", ".", "warn", "(", "\"\"", "+", "confFile", ".", "getAbsolutePath", "(", ")", ")", ";", "}", "if", "(", "!", "confFile", ".", "createNewFile", "(", ")", ")", "{", "log", ".", "warn", "(", "\"\"", "+", "confFile", ".", "getAbsolutePath", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "initComponents", "(", ")", ";", "loadProperties", "(", ")", ";", "getRootPane", "(", ")", ".", "setDefaultButton", "(", "btOk", ")", ";", "isImporting", "=", "false", ";", "worker", "=", "new", "ImportDialogWorker", "(", ")", ";", "addAppender", "(", ")", ";", "if", "(", "this", ".", "corpora", "!=", "null", ")", "{", "startImport", "(", ")", ";", "}", "}", "private", "void", "storeProperties", "(", ")", "{", "confProps", ".", "put", "(", "\"\"", ",", "txtInputDir", ".", "getText", "(", ")", ")", ";", "FileOutputStream", "oStream", "=", "null", ";", "try", "{", "oStream", "=", "new", "FileOutputStream", "(", "confFile", ")", ";", "confProps", ".", "store", "(", "oStream", ",", "\"\"", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "finally", "{", "if", "(", "oStream", "!=", "null", ")", "{", "try", "{", "oStream", ".", "close", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "private", "void", "loadProperties", "(", ")", "{", "FileInputStream", "iStream", "=", "null", ";", "try", "{", "iStream", "=", "new", "FileInputStream", "(", "confFile", ")", ";", "confProps", ".", "load", "(", "iStream", ")", ";", "String", "lastDirectory", "=", "confProps", ".", "getProperty", "(", "\"\"", ")", ";", "if", "(", "lastDirectory", "!=", "null", ")", "{", "txtInputDir", ".", "setText", "(", "lastDirectory", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "finally", "{", "if", "(", "iStream", "!=", "null", ")", "{", "try", "{", "iStream", ".", "close", "(", ")", ";", "}", "catch", "(", "IOException", "ex", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "null", ",", "ex", ")", ";", "}", "}", "}", "}", "private", "void", "addAppender", "(", ")", "{", "LoggerContext", "lc", "=", "(", "LoggerContext", ")", "LoggerFactory", ".", "getILoggerFactory", "(", ")", ";", "JoranConfigurator", "jc", "=", "new", "JoranConfigurator", "(", ")", ";", "jc", ".", "setContext", "(", "lc", ")", ";", "Appender", "appender", "=", "new", "AppenderBase", "<", "ILoggingEvent", ">", "(", ")", "{", "@", "Override", "protected", "void", "append", "(", "ILoggingEvent", "event", ")", "{", "if", "(", "event", ".", "getLevel", "(", ")", ".", "isGreaterOrEqual", "(", "Level", ".", "INFO", ")", ")", "{", "lblStatus", ".", "setText", "(", "event", ".", "getMessage", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ")", ";", "}", "}", "}", ";", "ch", ".", "qos", ".", "logback", ".", "classic", ".", "Logger", "rootLogger", "=", "lc", ".", "getLogger", "(", "Logger", ".", "ROOT_LOGGER_NAME", ")", ";", "rootLogger", ".", "addAppender", "(", "appender", ")", ";", "appender", ".", "start", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "startImport", "(", ")", "{", "btOk", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "btSearchInputDir", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "txtInputDir", ".", "setEnabled", "(", "false", ")", ";", "pbImport", ".", "setIndeterminate", "(", "true", ")", ";", "isImporting", "=", "true", ";", "worker", ".", "execute", "(", ")", ";", "}", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"unchecked\"", ")", "private", "void", "initComponents", "(", ")", "{", "fileChooser", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JFileChooser", "(", ")", ";", "jLabel1", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "txtInputDir", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JTextField", "(", ")", ";", "btCancel", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "btOk", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "btSearchInputDir", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "(", ")", ";", "pbImport", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "(", ")", ";", "jLabel2", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "lblStatus", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "pbCorpus", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "(", ")", ";", "lblCurrentCorpus", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "(", ")", ";", "fileChooser", ".", "setFileSelectionMode", "(", "javax", ".", "swing", ".", "JFileChooser", ".", "DIRECTORIES_ONLY", ")", ";", "setDefaultCloseOperation", "(", "javax", ".", "swing", ".", "WindowConstants", ".", "DISPOSE_ON_CLOSE", ")", ";", "setTitle", "(", "\"\"", ")", ";", "setLocationByPlatform", "(", "true", ")", ";", "jLabel1", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "btCancel", ".", "setMnemonic", "(", "'c'", ")", ";", "btCancel", ".", "setText", "(", "\"Cancel\"", ")", ";", "btCancel", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btCancelActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "btOk", ".", "setMnemonic", "(", "'o'", ")", ";", "btOk", ".", "setText", "(", "\"Ok\"", ")", ";", "btOk", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btOkActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "btSearchInputDir", ".", "setText", "(", "\"...\"", ")", ";", "btSearchInputDir", ".", "addActionListener", "(", "new", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionListener", "(", ")", "{", "public", "void", "actionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "btSearchInputDirActionPerformed", "(", "evt", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "jLabel2", ".", "setText", "(", "\"status:\"", ")", ";", "lblStatus", ".", "setText", "(", "\"...\"", ")", ";", "lblCurrentCorpus", ".", "setHorizontalAlignment", "(", "javax", ".", "swing", ".", "SwingConstants", ".", "RIGHT", ")", ";", "lblCurrentCorpus", ".", "setText", "(", "\"\"", ")", ";", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "layout", "=", "new", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", "(", "getContentPane", "(", ")", ")", ";", "getContentPane", "(", ")", ".", "setLayout", "(", "layout", ")", ";", "layout", ".", "setHorizontalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addComponent", "(", "pbImport", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "jLabel1", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "txtInputDir", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "462", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "btSearchInputDir", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "36", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "jLabel2", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "lblStatus", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ")", ".", "addGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "TRAILING", ",", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "lblCurrentCorpus", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addComponent", "(", "pbCorpus", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addComponent", "(", "btCancel", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "105", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "btOk", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "105", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ")", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ")", ";", "layout", ".", "setVerticalGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createSequentialGroup", "(", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "jLabel1", ")", ".", "addComponent", "(", "txtInputDir", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addComponent", "(", "btSearchInputDir", ")", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "LEADING", ",", "false", ")", ".", "addComponent", "(", "pbCorpus", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addComponent", "(", "lblCurrentCorpus", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ")", ".", "addGap", "(", "7", ",", "7", ",", "7", ")", ".", "addComponent", "(", "pbImport", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "UNRELATED", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "jLabel2", ")", ".", "addComponent", "(", "lblStatus", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ",", "15", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "PREFERRED_SIZE", ")", ")", ".", "addPreferredGap", "(", "javax", ".", "swing", ".", "LayoutStyle", ".", "ComponentPlacement", ".", "RELATED", ",", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "DEFAULT_SIZE", ",", "Short", ".", "MAX_VALUE", ")", ".", "addGroup", "(", "layout", ".", "createParallelGroup", "(", "javax", ".", "swing", ".", "GroupLayout", ".", "Alignment", ".", "BASELINE", ")", ".", "addComponent", "(", "btCancel", ")", ".", "addComponent", "(", "btOk", ")", ")", ".", "addContainerGap", "(", ")", ")", ")", ";", "pack", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "btCancelActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "if", "(", "isImporting", ")", "{", "worker", ".", "cancel", "(", "true", ")", ";", "}", "setVisible", "(", "false", ")", ";", "}", "private", "void", "btOkActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "startImport", "(", ")", ";", "}", "private", "void", "btSearchInputDirActionPerformed", "(", "java", ".", "awt", ".", "event", ".", "ActionEvent", "evt", ")", "{", "if", "(", "!", "\"\"", ".", "equals", "(", "txtInputDir", ".", "getText", "(", ")", ")", ")", "{", "File", "dir", "=", "new", "File", "(", "txtInputDir", ".", "getText", "(", ")", ")", ";", "if", "(", "dir", ".", "exists", "(", ")", "&&", "dir", ".", "isDirectory", "(", ")", ")", "{", "fileChooser", ".", "setSelectedFile", "(", "dir", ")", ";", "}", "}", "if", "(", "fileChooser", ".", "showDialog", "(", "this", ",", "\"Select\"", ")", "==", "JFileChooser", ".", "APPROVE_OPTION", ")", "{", "File", "f", "=", "fileChooser", ".", "getSelectedFile", "(", ")", ";", "txtInputDir", ".", "setText", "(", "f", ".", "getAbsolutePath", "(", ")", ")", ";", "storeProperties", "(", ")", ";", "}", "}", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btCancel", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btOk", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JButton", "btSearchInputDir", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JFileChooser", "fileChooser", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "jLabel1", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "jLabel2", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "lblCurrentCorpus", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JLabel", "lblStatus", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "pbCorpus", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JProgressBar", "pbImport", ";", "private", "javax", ".", "swing", ".", "JTextField", "txtInputDir", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "model", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "lang", ".", "annotation", ".", "ElementType", ";", "import", "java", ".", "lang", ".", "annotation", ".", "Retention", ";", "import", "java", ".", "lang", ".", "annotation", ".", "RetentionPolicy", ";", "import", "java", ".", "lang", ".", "annotation", ".", "Target", ";", "import", "java", ".", "lang", ".", "reflect", ".", "Field", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "SortedMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeMap", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "EqualsBuilder", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "HashCodeBuilder", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "Logger", ";", "import", "org", ".", "slf4j", ".", "LoggerFactory", ";", "public", "class", "DataObject", "implements", "Serializable", "{", "@", "Retention", "(", "RetentionPolicy", ".", "RUNTIME", ")", "@", "Target", "(", "value", "=", "ElementType", ".", "FIELD", ")", "public", "static", "@", "interface", "Transient", "{", "}", "private", "static", "final", "Logger", "log", "=", "LoggerFactory", ".", "getLogger", "(", "DataObject", ".", "class", ")", ";", "private", "interface", "FieldCallBack", "{", "void", "doForField", "(", "Field", "field", ")", "throws", "IllegalAccessException", ";", "}", "private", "void", "forEachFieldDo", "(", "FieldCallBack", "fieldCallBack", ")", "{", "Class", "<", "?", ">", "clazz", "=", "this", ".", "getClass", "(", ")", ";", "while", "(", "true", ")", "{", "Field", "[", "]", "fields", "=", "clazz", ".", "getDeclaredFields", "(", ")", ";", "try", "{", "for", "(", "Field", "field", ":", "fields", ")", "{", "if", "(", "field", ".", "getType", "(", ")", "==", "Logger", ".", "class", ")", "continue", ";", "if", "(", "field", ".", "getAnnotation", "(", "Transient", ".", "class", ")", "!=", "null", ")", "continue", ";", "if", "(", "\"\"", ".", "equals", "(", "field", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "continue", ";", "field", ".", "setAccessible", "(", "true", ")", ";", "fieldCallBack", ".", "doForField", "(", "field", ")", ";", "}", "}", "catch", "(", "IllegalArgumentException", "e", ")", "{", "throw", "new", "RuntimeException", "(", "e", ")", ";", "}", "catch", "(", "IllegalAccessException", "e", ")", "{", "throw", "new", "RuntimeException", "(", "e", ")", ";", "}", "if", "(", "clazz", ".", "getName", "(", ")", ".", "equals", "(", "DataObject", ".", "class", ".", "getName", "(", ")", ")", ")", "break", ";", "clazz", "=", "clazz", ".", "getSuperclass", "(", ")", ";", "}", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "final", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", ")", "return", "false", ";", "if", "(", "this", ".", "getClass", "(", ")", "!=", "obj", ".", "getClass", "(", ")", ")", "return", "false", ";", "final", "EqualsBuilder", "equalsBuilder", "=", "new", "EqualsBuilder", "(", ")", ";", "final", "Object", "_this", "=", "this", ";", "forEachFieldDo", "(", "new", "FieldCallBack", "(", ")", "{", "public", "void", "doForField", "(", "Field", "field", ")", "throws", "IllegalAccessException", "{", "Object", "thisValue", "=", "field", ".", "get", "(", "_this", ")", ";", "Object", "otherValue", "=", "field", ".", "get", "(", "obj", ")", ";", "if", "(", "log", ".", "isDebugEnabled", "(", ")", ")", "{", "String", "fieldName", "=", "field", ".", "getDeclaringClass", "(", ")", ".", "getSimpleName", "(", ")", "+", "\".\"", "+", "field", ".", "getName", "(", ")", ";", "try", "{", "boolean", "equal", "=", "thisValue", "!=", "null", "&&", "thisValue", ".", "equals", "(", "otherValue", ")", "||", "thisValue", "==", "null", "&&", "otherValue", "==", "null", ";", "log", ".", "debug", "(", "fieldName", "+", "\":", "\"", "+", "thisValue", "+", "\"", "\"", "+", "(", "equal", "?", "\"=\"", ":", "\"!=\"", ")", "+", "\"", "\"", "+", "otherValue", ")", ";", "}", "catch", "(", "RuntimeException", "e", ")", "{", "log", ".", "error", "(", "\"\"", "+", "fieldName", "+", "\"(\"", "+", "thisValue", "+", "\",", "\"", "+", "otherValue", "+", "\")\"", ")", ";", "throw", "e", ";", "}", "}", "equalsBuilder", ".", "append", "(", "thisValue", ",", "otherValue", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "return", "equalsBuilder", ".", "isEquals", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "final", "SortedMap", "<", "String", ",", "Object", ">", "fieldValues", "=", "new", "TreeMap", "<", "String", ",", "Object", ">", "(", ")", ";", "final", "Object", "_this", "=", "this", ";", "forEachFieldDo", "(", "new", "FieldCallBack", "(", ")", "{", "public", "void", "doForField", "(", "Field", "field", ")", "throws", "IllegalAccessException", "{", "fieldValues", ".", "put", "(", "field", ".", "getName", "(", ")", ",", "field", ".", "get", "(", "_this", ")", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "HashCodeBuilder", "hashCodeBuilder", "=", "new", "HashCodeBuilder", "(", ")", ";", "for", "(", "Object", "fieldValue", ":", "fieldValues", ".", "values", "(", ")", ")", "hashCodeBuilder", ".", "append", "(", "fieldValue", ")", ";", "return", "hashCodeBuilder", ".", "toHashCode", "(", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "model", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Arrays", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Collections", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Comparator", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashMap", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Map", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "StringUtils", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "EqualsBuilder", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "HashCodeBuilder", ";", "public", "class", "AnnotationGraph", "implements", "Serializable", "{", "private", "String", "documentName", ";", "private", "String", "[", "]", "path", ";", "private", "List", "<", "AnnisNode", ">", "nodes", ";", "private", "List", "<", "Edge", ">", "edges", ";", "private", "Set", "<", "Long", ">", "matchedNodeIds", ";", "private", "Map", "<", "Long", ",", "AnnisNode", ">", "tokenByIndex", ";", "public", "AnnotationGraph", "(", ")", "{", "this", "(", "new", "ArrayList", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", ",", "new", "ArrayList", "<", "Edge", ">", "(", ")", ")", ";", "}", "public", "AnnotationGraph", "(", "List", "<", "AnnisNode", ">", "nodes", ",", "List", "<", "Edge", ">", "edges", ")", "{", "this", ".", "nodes", "=", "nodes", ";", "this", ".", "edges", "=", "edges", ";", "this", ".", "matchedNodeIds", "=", "new", "HashSet", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "this", ".", "tokenByIndex", "=", "new", "HashMap", "<", "Long", ",", "AnnisNode", ">", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "toString", "(", ")", "{", "List", "<", "Long", ">", "ids", "=", "new", "ArrayList", "<", "Long", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "node", ":", "nodes", ")", "ids", ".", "add", "(", "node", ".", "getId", "(", ")", ")", ";", "List", "<", "String", ">", "_edges", "=", "new", "ArrayList", "<", "String", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "Edge", "edge", ":", "edges", ")", "{", "Long", "src", "=", "edge", ".", "getSource", "(", ")", "!=", "null", "?", "edge", ".", "getSource", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ":", "null", ";", "long", "dst", "=", "edge", ".", "getDestination", "(", ")", ".", "getId", "(", ")", ";", "String", "edgeType", "=", "edge", ".", "getEdgeType", "(", ")", "!=", "null", "?", "edge", ".", "getEdgeType", "(", ")", ".", "toString", "(", ")", ":", "null", ";", "String", "name", "=", "edge", ".", "getQualifiedName", "(", ")", ";", "_edges", ".", "add", "(", "src", "+", "\"->\"", "+", "dst", "+", "\"", "\"", "+", "name", "+", "\"", "\"", "+", "edgeType", ")", ";", "}", "return", "\"match:", "\"", "+", "StringUtils", ".", "join", "(", "matchedNodeIds", ",", "\"-\"", ")", "+", "\";", "nodes:", "\"", "+", "ids", "+", "\";", "edges:", "\"", "+", "_edges", ";", "}", "public", "void", "addMatchedNodeId", "(", "Long", "id", ")", "{", "matchedNodeIds", ".", "add", "(", "id", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addNode", "(", "AnnisNode", "node", ")", "{", "node", ".", "setGraph", "(", "this", ")", ";", "if", "(", "node", ".", "isToken", "(", ")", ")", "tokenByIndex", ".", "put", "(", "node", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ",", "node", ")", ";", "return", "nodes", ".", "add", "(", "node", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addEdge", "(", "Edge", "edge", ")", "{", "return", "edges", ".", "add", "(", "edge", ")", ";", "}", "public", "AnnisNode", "getToken", "(", "long", "tokenIndex", ")", "{", "return", "tokenByIndex", ".", "get", "(", "tokenIndex", ")", ";", "}", "public", "List", "<", "AnnisNode", ">", "getTokens", "(", ")", "{", "List", "<", "AnnisNode", ">", "tokens", "=", "new", "ArrayList", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", ";", "for", "(", "AnnisNode", "node", ":", "nodes", ")", "{", "if", "(", "node", ".", "isToken", "(", ")", ")", "tokens", ".", "add", "(", "node", ")", ";", "}", "Collections", ".", "sort", "(", "tokens", ",", "new", "Comparator", "<", "AnnisNode", ">", "(", ")", "{", "public", "int", "compare", "(", "AnnisNode", "o1", ",", "AnnisNode", "o2", ")", "{", "return", "o1", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ".", "compareTo", "(", "o2", ".", "getTokenIndex", "(", ")", ")", ";", "}", "}", ")", ";", "return", "tokens", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", "||", "!", "(", "obj", "instanceof", "AnnotationGraph", ")", ")", "return", "false", ";", "AnnotationGraph", "other", "=", "(", "AnnotationGraph", ")", "obj", ";", "return", "new", "EqualsBuilder", "(", ")", ".", "append", "(", "this", ".", "nodes", ",", "other", ".", "nodes", ")", ".", "append", "(", "this", ".", "edges", ",", "other", ".", "edges", ")", ".", "append", "(", "this", ".", "matchedNodeIds", ",", "other", ".", "matchedNodeIds", ")", ".", "isEquals", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "return", "new", "HashCodeBuilder", "(", ")", ".", "append", "(", "nodes", ")", ".", "append", "(", "edges", ")", ".", "append", "(", "matchedNodeIds", ")", ".", "toHashCode", "(", ")", ";", "}", "public", "List", "<", "AnnisNode", ">", "getNodes", "(", ")", "{", "return", "nodes", ";", "}", "public", "List", "<", "Edge", ">", "getEdges", "(", ")", "{", "return", "edges", ";", "}", "public", "Set", "<", "Long", ">", "getMatchedNodeIds", "(", ")", "{", "return", "matchedNodeIds", ";", "}", "public", "String", "getDocumentName", "(", ")", "{", "return", "documentName", ";", "}", "public", "void", "setDocumentName", "(", "String", "documentName", ")", "{", "this", ".", "documentName", "=", "documentName", ";", "}", "public", "String", "[", "]", "getPath", "(", ")", "{", "return", "Arrays", ".", "copyOf", "(", "path", ",", "path", ".", "length", ")", ";", "}", "public", "void", "setPath", "(", "String", "[", "]", "path", ")", "{", "this", ".", "path", "=", "Arrays", ".", "copyOf", "(", "path", ",", "path", ".", "length", ")", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "model", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "ArrayList", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "List", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeSet", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "Validate", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "EqualsBuilder", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "HashCodeBuilder", ";", "import", "annis", ".", "sqlgen", ".", "model", ".", "Join", ";", "import", "annis", ".", "sqlgen", ".", "model", ".", "RankTableJoin", ";", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"serial\"", ")", "public", "class", "QueryNode", "implements", "Serializable", "{", "private", "long", "id", ";", "private", "long", "corpus", ";", "private", "long", "textId", ";", "private", "long", "left", ";", "private", "long", "right", ";", "private", "String", "spannedText", ";", "private", "Long", "tokenIndex", ";", "private", "long", "leftToken", ";", "private", "long", "rightToken", ";", "private", "Set", "<", "QueryAnnotation", ">", "nodeAnnotations", ";", "private", "String", "name", ";", "private", "String", "namespace", ";", "private", "boolean", "partOfEdge", ";", "private", "boolean", "root", ";", "private", "boolean", "token", ";", "private", "TextMatching", "spanTextMatching", ";", "private", "List", "<", "Join", ">", "joins", ";", "private", "String", "variable", ";", "private", "Set", "<", "QueryAnnotation", ">", "edgeAnnotations", ";", "private", "Range", "arity", ";", "private", "Range", "tokenArity", ";", "private", "String", "marker", ";", "private", "Long", "matchedNodeInQuery", ";", "public", "enum", "TextMatching", "{", "EXACT_EQUAL", "(", "\"=\"", ",", "\"\\\"\"", ")", ",", "REGEXP_EQUAL", "(", "\"~\"", ",", "\"/\"", ")", ",", "EXACT_NOT_EQUAL", "(", "\"<>\"", ",", "\"\\\"\"", ")", ",", "REGEXP_NOT_EQUAL", "(", "\"!~\"", ",", "\"/\"", ")", ";", "private", "String", "sqlOperator", ";", "private", "String", "annisQuote", ";", "private", "TextMatching", "(", "String", "sqlOperator", ",", "String", "annisQuote", ")", "{", "this", ".", "sqlOperator", "=", "sqlOperator", ";", "this", ".", "annisQuote", "=", "annisQuote", ";", "}", "public", "String", "toString", "(", ")", "{", "return", "sqlOperator", ";", "}", "public", "String", "sqlOperator", "(", ")", "{", "return", "sqlOperator", ";", "}", "public", "String", "quote", "(", ")", "{", "return", "annisQuote", ";", "}", "}", ";", "public", "static", "class", "Range", "implements", "Serializable", "{", "private", "int", "min", ";", "private", "int", "max", ";", "public", "Range", "(", "int", "_min", ",", "int", "_max", ")", "{", "min", "=", "_min", ";", "max", "=", "_max", ";", "}", "public", "int", "getMin", "(", ")", "{", "return", "min", ";", "}", "public", "int", "getMax", "(", ")", "{", "return", "max", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "return", "new", "HashCodeBuilder", "(", ")", ".", "append", "(", "min", ")", ".", "append", "(", "max", ")", ".", "toHashCode", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "instanceof", "Range", ")", "{", "Range", "other", "=", "(", "Range", ")", "obj", ";", "return", "new", "EqualsBuilder", "(", ")", ".", "append", "(", "min", ",", "other", ".", "min", ")", ".", "append", "(", "max", ",", "other", ".", "max", ")", ".", "isEquals", "(", ")", ";", "}", "return", "false", ";", "}", "}", ";", "public", "QueryNode", "(", ")", "{", "nodeAnnotations", "=", "new", "TreeSet", "<", "QueryAnnotation", ">", "(", ")", ";", "edgeAnnotations", "=", "new", "TreeSet", "<", "QueryAnnotation", ">", "(", ")", ";", "joins", "=", "new", "ArrayList", "<", "Join", ">", "(", ")", ";", "}", "public", "QueryNode", "(", "long", "id", ")", "{", "this", "(", ")", ";", "this", ".", "id", "=", "id", ";", "}", "public", "QueryNode", "(", "long", "id", ",", "long", "corpusRef", ",", "long", "textRef", ",", "long", "left", ",", "long", "right", ",", "String", "namespace", ",", "String", "name", ",", "long", "tokenIndex", ",", "String", "span", ",", "long", "leftToken", ",", "long", "rightToken", ")", "{", "this", "(", "id", ")", ";", "this", ".", "corpus", "=", "corpusRef", ";", "this", ".", "textId", "=", "textRef", ";", "this", ".", "left", "=", "left", ";", "this", ".", "right", "=", "right", ";", "this", ".", "leftToken", "=", "leftToken", ";", "this", ".", "rightToken", "=", "rightToken", ";", "setNamespace", "(", "namespace", ")", ";", "setName", "(", "name", ")", ";", "setTokenIndex", "(", "tokenIndex", ")", ";", "setSpannedText", "(", "span", ",", "TextMatching", ".", "EXACT_EQUAL", ")", ";", "}", "public", "static", "String", "qName", "(", "String", "namespace", ",", "String", "name", ")", "{", "return", "name", "==", "null", "?", "null", ":", "(", "namespace", "==", "null", "?", "name", ":", "namespace", "+", "\":\"", "+", "name", ")", ";", "}", "public", "void", "setSpannedText", "(", "String", "span", ")", "{", "setSpannedText", "(", "span", ",", "TextMatching", ".", "EXACT_EQUAL", ")", ";", "}", "public", "void", "setSpannedText", "(", "String", "spannedText", ",", "TextMatching", "textMatching", ")", "{", "if", "(", "spannedText", "!=", "null", ")", "{", "Validate", ".", "notNull", "(", "textMatching", ")", ";", "}", "this", ".", "spannedText", "=", "spannedText", ";", "this", ".", "spanTextMatching", "=", "textMatching", ";", "}", "public", "void", "clearSpannedText", "(", ")", "{", "this", ".", "spannedText", "=", "null", ";", "this", ".", "spanTextMatching", "=", "null", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "toString", "(", ")", "{", "StringBuffer", "sb", "=", "new", "StringBuffer", "(", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"node", "\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "id", ")", ";", "if", "(", "marker", "!=", "null", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "marked", "'\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "marker", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"'\"", ")", ";", "}", "if", "(", "variable", "!=", "null", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "bound", "to", "'\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "variable", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"'\"", ")", ";", "}", "if", "(", "name", "!=", "null", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "named", "'\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "qName", "(", "namespace", ",", "name", ")", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"'\"", ")", ";", "}", "if", "(", "token", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "is", "a", "token\"", ")", ";", "}", "if", "(", "spannedText", "!=", "null", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "spans\"", ")", ";", "String", "op", "=", "spanTextMatching", "!=", "null", "?", "spanTextMatching", ".", "sqlOperator", "(", ")", ":", "\"", "\"", ";", "String", "quote", "=", "spanTextMatching", "!=", "null", "?", "spanTextMatching", ".", "quote", "(", ")", ":", "\"?\"", ";", "sb", ".", "append", "(", "op", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "quote", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "spannedText", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "quote", ")", ";", "}", "if", "(", "isRoot", "(", ")", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "root", "node\"", ")", ";", "}", "if", "(", "!", "nodeAnnotations", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "nodeAnnotations", ")", ";", "}", "if", "(", "!", "edgeAnnotations", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "edgeAnnotations", ")", ";", "}", "for", "(", "Join", "join", ":", "joins", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "join", ")", ";", "}", "return", "sb", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addEdgeAnnotation", "(", "QueryAnnotation", "annotation", ")", "{", "return", "edgeAnnotations", ".", "add", "(", "annotation", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addNodeAnnotation", "(", "QueryAnnotation", "annotation", ")", "{", "return", "nodeAnnotations", ".", "add", "(", "annotation", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addJoin", "(", "Join", "join", ")", "{", "boolean", "result", "=", "joins", ".", "add", "(", "join", ")", ";", "if", "(", "join", "instanceof", "RankTableJoin", ")", "{", "this", ".", "setPartOfEdge", "(", "true", ")", ";", "QueryNode", "target", "=", "join", ".", "getTarget", "(", ")", ";", "target", ".", "setPartOfEdge", "(", "true", ")", ";", "}", "return", "result", ";", "}", "public", "String", "getQualifiedName", "(", ")", "{", "return", "qName", "(", "namespace", ",", "name", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "getClass", "(", ")", "!=", "obj", ".", "getClass", "(", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "final", "QueryNode", "other", "=", "(", "QueryNode", ")", "obj", ";", "if", "(", "this", ".", "id", "!=", "other", ".", "id", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "corpus", "!=", "other", ".", "corpus", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "textId", "!=", "other", ".", "textId", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "left", "!=", "other", ".", "left", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "right", "!=", "other", ".", "right", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "spannedText", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "spannedText", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "spannedText", ".", "equals", "(", "other", ".", "spannedText", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "leftToken", "!=", "other", ".", "leftToken", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "nodeAnnotations", "!=", "other", ".", "nodeAnnotations", "&&", "(", "this", ".", "nodeAnnotations", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "nodeAnnotations", ".", "equals", "(", "other", ".", "nodeAnnotations", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "name", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "name", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "name", ".", "equals", "(", "other", ".", "name", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "namespace", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "namespace", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "namespace", ".", "equals", "(", "other", ".", "namespace", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "partOfEdge", "!=", "other", ".", "partOfEdge", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "root", "!=", "other", ".", "root", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "token", "!=", "other", ".", "token", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "spanTextMatching", "!=", "other", ".", "spanTextMatching", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "joins", "!=", "other", ".", "joins", "&&", "(", "this", ".", "joins", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "joins", ".", "equals", "(", "other", ".", "joins", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "variable", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "variable", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "variable", ".", "equals", "(", "other", ".", "variable", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "edgeAnnotations", "!=", "other", ".", "edgeAnnotations", "&&", "(", "this", ".", "edgeAnnotations", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "edgeAnnotations", ".", "equals", "(", "other", ".", "edgeAnnotations", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "marker", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "marker", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "marker", ".", "equals", "(", "other", ".", "marker", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "arity", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "arity", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "arity", ".", "equals", "(", "other", ".", "arity", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "tokenArity", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "tokenArity", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "tokenArity", ".", "equals", "(", "other", ".", "tokenArity", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "return", "true", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "return", "(", "int", ")", "id", ";", "}", "public", "Set", "<", "QueryAnnotation", ">", "getEdgeAnnotations", "(", ")", "{", "return", "edgeAnnotations", ";", "}", "public", "void", "setEdgeAnnotations", "(", "Set", "<", "QueryAnnotation", ">", "edgeAnnotations", ")", "{", "this", ".", "edgeAnnotations", "=", "edgeAnnotations", ";", "}", "public", "boolean", "isRoot", "(", ")", "{", "return", "root", ";", "}", "public", "void", "setRoot", "(", "boolean", "root", ")", "{", "this", ".", "root", "=", "root", ";", "}", "public", "String", "getMarker", "(", ")", "{", "return", "marker", ";", "}", "public", "void", "setMarker", "(", "String", "marker", ")", "{", "this", ".", "marker", "=", "marker", ";", "}", "public", "String", "getName", "(", ")", "{", "return", "name", ";", "}", "public", "void", "setName", "(", "String", "name", ")", "{", "this", ".", "name", "=", "name", ";", "}", "public", "String", "getNamespace", "(", ")", "{", "return", "namespace", ";", "}", "public", "void", "setNamespace", "(", "String", "namespace", ")", "{", "this", ".", "namespace", "=", "namespace", ";", "}", "public", "String", "getSpannedText", "(", ")", "{", "return", "spannedText", ";", "}", "public", "TextMatching", "getSpanTextMatching", "(", ")", "{", "return", "spanTextMatching", ";", "}", "public", "Set", "<", "QueryAnnotation", ">", "getNodeAnnotations", "(", ")", "{", "return", "nodeAnnotations", ";", "}", "public", "void", "setNodeAnnotations", "(", "Set", "<", "QueryAnnotation", ">", "nodeAnnotations", ")", "{", "this", ".", "nodeAnnotations", "=", "nodeAnnotations", ";", "}", "public", "String", "getVariable", "(", ")", "{", "return", "variable", ";", "}", "public", "void", "setVariable", "(", "String", "variable", ")", "{", "this", ".", "variable", "=", "variable", ";", "}", "public", "long", "getId", "(", ")", "{", "return", "id", ";", "}", "public", "List", "<", "Join", ">", "getJoins", "(", ")", "{", "return", "joins", ";", "}", "public", "boolean", "isToken", "(", ")", "{", "return", "token", ";", "}", "public", "void", "setToken", "(", "boolean", "token", ")", "{", "this", ".", "token", "=", "token", ";", "}", "public", "boolean", "isPartOfEdge", "(", ")", "{", "return", "partOfEdge", ";", "}", "public", "void", "setPartOfEdge", "(", "boolean", "partOfEdge", ")", "{", "this", ".", "partOfEdge", "=", "partOfEdge", ";", "}", "public", "long", "getCorpus", "(", ")", "{", "return", "corpus", ";", "}", "public", "void", "setCorpus", "(", "long", "corpus", ")", "{", "this", ".", "corpus", "=", "corpus", ";", "}", "public", "long", "getTextId", "(", ")", "{", "return", "textId", ";", "}", "public", "void", "setTextId", "(", "long", "textIndex", ")", "{", "this", ".", "textId", "=", "textIndex", ";", "}", "public", "long", "getLeft", "(", ")", "{", "return", "left", ";", "}", "public", "void", "setLeft", "(", "long", "left", ")", "{", "this", ".", "left", "=", "left", ";", "}", "public", "long", "getRight", "(", ")", "{", "return", "right", ";", "}", "public", "void", "setRight", "(", "long", "right", ")", "{", "this", ".", "right", "=", "right", ";", "}", "public", "Long", "getTokenIndex", "(", ")", "{", "return", "tokenIndex", ";", "}", "public", "void", "setTokenIndex", "(", "Long", "tokenIndex", ")", "{", "this", ".", "tokenIndex", "=", "tokenIndex", ";", "setToken", "(", "tokenIndex", "!=", "null", ")", ";", "}", "public", "long", "getLeftToken", "(", ")", "{", "return", "leftToken", ";", "}", "public", "void", "setLeftToken", "(", "long", "leftToken", ")", "{", "this", ".", "leftToken", "=", "leftToken", ";", "}", "public", "long", "getRightToken", "(", ")", "{", "return", "rightToken", ";", "}", "public", "void", "setRightToken", "(", "long", "rightToken", ")", "{", "this", ".", "rightToken", "=", "rightToken", ";", "}", "public", "Range", "getArity", "(", ")", "{", "return", "arity", ";", "}", "public", "void", "setArity", "(", "Range", "arity", ")", "{", "this", ".", "arity", "=", "arity", ";", "}", "public", "Range", "getTokenArity", "(", ")", "{", "return", "tokenArity", ";", "}", "public", "void", "setTokenArity", "(", "Range", "tokenArity", ")", "{", "this", ".", "tokenArity", "=", "tokenArity", ";", "}", "public", "Long", "getMatchedNodeInQuery", "(", ")", "{", "return", "matchedNodeInQuery", ";", "}", "public", "void", "setMatchedNodeInQuery", "(", "Long", "matchedNodeInQuery", ")", "{", "this", ".", "matchedNodeInQuery", "=", "matchedNodeInQuery", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "model", ";", "public", "class", "AnnisConstants", "{", "public", "static", "final", "String", "ANNIS_NS", "=", "\"annis\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_MATCHEDIDS", "=", "\"matchedids\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_MATCHEDNODE", "=", "\"matchednode\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_INTERNALID", "=", "\"internalid\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_CORPUSREF", "=", "\"corpusref\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_TEXTREF", "=", "\"textref\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_COMPONENTID", "=", "\"componentid\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_LEFT", "=", "\"left\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_LEFTTOKEN", "=", "\"lefttoken\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_RIGHT", "=", "\"right\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_RIGHTTOKEN", "=", "\"righttoken\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_TOKENINDEX", "=", "\"tokenindex\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_SEGLEFT", "=", "\"segleft\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_SEGRIGHT", "=", "\"segright\"", ";", "public", "static", "final", "String", "FEAT_SEGNAME", "=", "\"segname\"", ";", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "model", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "EqualsBuilder", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "HashCodeBuilder", ";", "public", "class", "Edge", "implements", "Serializable", "{", "public", "enum", "EdgeType", "{", "COVERAGE", "(", "\"c\"", ",", "\"Coverage\"", ")", ",", "DOMINANCE", "(", "\"d\"", ",", "\"Dominance\"", ")", ",", "POINTING_RELATION", "(", "\"p\"", ",", "\"\"", ")", ",", "UNKNOWN", "(", "null", ",", "\"\"", ")", ";", "private", "String", "type", ";", "private", "String", "name", ";", "private", "EdgeType", "(", "String", "type", ",", "String", "name", ")", "{", "this", ".", "type", "=", "type", ";", "this", ".", "name", "=", "name", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "toString", "(", ")", "{", "return", "name", "+", "(", "type", "!=", "null", "?", "\"(\"", "+", "type", "+", "\")\"", ":", "\"\"", ")", ";", "}", "public", "String", "getTypeChar", "(", ")", "{", "return", "type", ";", "}", "public", "static", "EdgeType", "parseEdgeType", "(", "String", "type", ")", "{", "if", "(", "\"c\"", ".", "equals", "(", "type", ")", ")", "{", "return", "COVERAGE", ";", "}", "else", "if", "(", "\"d\"", ".", "equals", "(", "type", ")", ")", "{", "return", "DOMINANCE", ";", "}", "else", "if", "(", "\"p\"", ".", "equals", "(", "type", ")", ")", "{", "return", "POINTING_RELATION", ";", "}", "else", "{", "return", "UNKNOWN", ";", "}", "}", "}", ";", "private", "AnnisNode", "source", ";", "private", "AnnisNode", "destination", ";", "private", "long", "pre", ";", "private", "long", "componentID", ";", "private", "EdgeType", "edgeType", ";", "private", "String", "namespace", ";", "private", "String", "name", ";", "private", "Set", "<", "Annotation", ">", "annotations", ";", "public", "Edge", "(", ")", "{", "annotations", "=", "new", "HashSet", "<", "Annotation", ">", "(", ")", ";", "edgeType", "=", "EdgeType", ".", "UNKNOWN", ";", "}", "public", "boolean", "addAnnotation", "(", "Annotation", "o", ")", "{", "return", "annotations", ".", "add", "(", "o", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "toString", "(", ")", "{", "String", "src", "=", "source", "!=", "null", "?", "\"\"", "+", "source", ".", "getId", "(", ")", ":", "\"(no", "source)\"", ";", "String", "dst", "=", "\"\"", "+", "destination", ".", "getId", "(", ")", ";", "String", "type", "=", "edgeType", "!=", "null", "?", "edgeType", ".", "toString", "(", ")", ":", "\"(no", "type)\"", ";", "String", "qname", "=", "getQualifiedName", "(", ")", "!=", "null", "?", "getQualifiedName", "(", ")", ":", "\"(no", "name)\"", ";", "return", "src", "+", "\"->\"", "+", "dst", "+", "\"", "\"", "+", "qname", "+", "\"", "\"", "+", "type", ";", "}", "public", "String", "getQualifiedName", "(", ")", "{", "return", "AnnisNode", ".", "qName", "(", "namespace", ",", "name", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "getClass", "(", ")", "!=", "obj", ".", "getClass", "(", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "final", "Edge", "other", "=", "(", "Edge", ")", "obj", ";", "if", "(", "this", ".", "source", "!=", "other", ".", "source", "&&", "(", "this", ".", "source", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "source", ".", "equals", "(", "other", ".", "source", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "destination", "!=", "other", ".", "destination", "&&", "(", "this", ".", "destination", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "destination", ".", "equals", "(", "other", ".", "destination", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "pre", "!=", "other", ".", "pre", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "componentID", "!=", "other", ".", "componentID", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "edgeType", "!=", "other", ".", "edgeType", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "namespace", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "namespace", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "namespace", ".", "equals", "(", "other", ".", "namespace", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "name", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "name", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "name", ".", "equals", "(", "other", ".", "name", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "return", "true", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "int", "hash", "=", "5", ";", "hash", "=", "17", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "source", "!=", "null", "?", "this", ".", "source", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "hash", "=", "17", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "destination", "!=", "null", "?", "this", ".", "destination", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "hash", "=", "17", "*", "hash", "+", "(", "int", ")", "(", "this", ".", "pre", "^", "(", "this", ".", "pre", ">>>", "32", ")", ")", ";", "hash", "=", "17", "*", "hash", "+", "(", "int", ")", "(", "this", ".", "componentID", "^", "(", "this", ".", "componentID", ">>>", "32", ")", ")", ";", "hash", "=", "17", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "edgeType", "!=", "null", "?", "this", ".", "edgeType", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "hash", "=", "17", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "namespace", "!=", "null", "?", "this", ".", "namespace", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "hash", "=", "17", "*", "hash", "+", "(", "this", ".", "name", "!=", "null", "?", "this", ".", "name", ".", "hashCode", "(", ")", ":", "0", ")", ";", "return", "hash", ";", "}", "public", "long", "getPre", "(", ")", "{", "return", "pre", ";", "}", "public", "void", "setPre", "(", "long", "pre", ")", "{", "this", ".", "pre", "=", "pre", ";", "}", "public", "long", "getComponentID", "(", ")", "{", "return", "componentID", ";", "}", "public", "void", "setComponentID", "(", "long", "componentID", ")", "{", "this", ".", "componentID", "=", "componentID", ";", "}", "public", "EdgeType", "getEdgeType", "(", ")", "{", "return", "edgeType", ";", "}", "public", "void", "setEdgeType", "(", "EdgeType", "edgeType", ")", "{", "this", ".", "edgeType", "=", "edgeType", ";", "}", "public", "String", "getNamespace", "(", ")", "{", "return", "namespace", ";", "}", "public", "void", "setNamespace", "(", "String", "namespace", ")", "{", "this", ".", "namespace", "=", "namespace", ";", "}", "public", "String", "getName", "(", ")", "{", "return", "name", ";", "}", "public", "void", "setName", "(", "String", "name", ")", "{", "this", ".", "name", "=", "name", ";", "}", "public", "Set", "<", "Annotation", ">", "getAnnotations", "(", ")", "{", "return", "annotations", ";", "}", "public", "AnnisNode", "getSource", "(", ")", "{", "return", "source", ";", "}", "public", "void", "setSource", "(", "AnnisNode", "source", ")", "{", "this", ".", "source", "=", "source", ";", "}", "public", "AnnisNode", "getDestination", "(", ")", "{", "return", "destination", ";", "}", "public", "void", "setDestination", "(", "AnnisNode", "destination", ")", "{", "this", ".", "destination", "=", "destination", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "model", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "HashSet", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "Set", ";", "import", "java", ".", "util", ".", "TreeSet", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "EqualsBuilder", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "HashCodeBuilder", ";", "@", "SuppressWarnings", "(", "\"serial\"", ")", "public", "class", "AnnisNode", "implements", "Serializable", "{", "private", "long", "id", ";", "private", "long", "corpus", ";", "private", "long", "textId", ";", "private", "long", "left", ";", "private", "long", "right", ";", "private", "String", "spannedText", ";", "private", "Long", "tokenIndex", ";", "private", "long", "leftToken", ";", "private", "long", "rightToken", ";", "private", "Set", "<", "Annotation", ">", "nodeAnnotations", ";", "private", "AnnotationGraph", "graph", ";", "private", "Set", "<", "Edge", ">", "incomingEdges", ";", "private", "Set", "<", "Edge", ">", "outgoingEdges", ";", "private", "String", "name", ";", "private", "String", "namespace", ";", "private", "boolean", "partOfEdge", ";", "private", "boolean", "root", ";", "private", "boolean", "token", ";", "private", "Set", "<", "Annotation", ">", "edgeAnnotations", ";", "private", "Long", "matchedNodeInQuery", ";", "public", "static", "class", "Range", "implements", "Serializable", "{", "private", "int", "min", ";", "private", "int", "max", ";", "public", "Range", "(", "int", "_min", ",", "int", "_max", ")", "{", "min", "=", "_min", ";", "max", "=", "_max", ";", "}", "public", "int", "getMin", "(", ")", "{", "return", "min", ";", "}", "public", "int", "getMax", "(", ")", "{", "return", "max", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "return", "new", "HashCodeBuilder", "(", ")", ".", "append", "(", "min", ")", ".", "append", "(", "max", ")", ".", "toHashCode", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "instanceof", "Range", ")", "{", "Range", "other", "=", "(", "Range", ")", "obj", ";", "return", "new", "EqualsBuilder", "(", ")", ".", "append", "(", "min", ",", "other", ".", "min", ")", ".", "append", "(", "max", ",", "other", ".", "max", ")", ".", "isEquals", "(", ")", ";", "}", "return", "false", ";", "}", "}", ";", "public", "AnnisNode", "(", ")", "{", "nodeAnnotations", "=", "new", "TreeSet", "<", "Annotation", ">", "(", ")", ";", "edgeAnnotations", "=", "new", "TreeSet", "<", "Annotation", ">", "(", ")", ";", "incomingEdges", "=", "new", "HashSet", "<", "Edge", ">", "(", ")", ";", "outgoingEdges", "=", "new", "HashSet", "<", "Edge", ">", "(", ")", ";", "}", "public", "AnnisNode", "(", "long", "id", ")", "{", "this", "(", ")", ";", "this", ".", "id", "=", "id", ";", "}", "public", "AnnisNode", "(", "long", "id", ",", "long", "corpusRef", ",", "long", "textRef", ",", "long", "left", ",", "long", "right", ",", "String", "namespace", ",", "String", "name", ",", "long", "tokenIndex", ",", "String", "span", ",", "long", "leftToken", ",", "long", "rightToken", ")", "{", "this", "(", "id", ")", ";", "this", ".", "corpus", "=", "corpusRef", ";", "this", ".", "textId", "=", "textRef", ";", "this", ".", "left", "=", "left", ";", "this", ".", "right", "=", "right", ";", "this", ".", "leftToken", "=", "leftToken", ";", "this", ".", "rightToken", "=", "rightToken", ";", "setNamespace", "(", "namespace", ")", ";", "setName", "(", "name", ")", ";", "setTokenIndex", "(", "tokenIndex", ")", ";", "setSpannedText", "(", "span", ")", ";", "}", "public", "static", "String", "qName", "(", "String", "namespace", ",", "String", "name", ")", "{", "return", "name", "==", "null", "?", "null", ":", "(", "namespace", "==", "null", "?", "name", ":", "namespace", "+", "\":\"", "+", "name", ")", ";", "}", "public", "void", "setSpannedText", "(", "String", "spannedText", ")", "{", "this", ".", "spannedText", "=", "spannedText", ";", "}", "public", "void", "clearSpannedText", "(", ")", "{", "this", ".", "spannedText", "=", "null", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "toString", "(", ")", "{", "StringBuffer", "sb", "=", "new", "StringBuffer", "(", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"node", "\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "id", ")", ";", "if", "(", "name", "!=", "null", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "named", "'\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "qName", "(", "namespace", ",", "name", ")", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"'\"", ")", ";", "}", "if", "(", "token", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "is", "a", "token\"", ")", ";", "}", "if", "(", "spannedText", "!=", "null", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "spans=\\\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "spannedText", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "\"\\\"\"", ")", ";", "}", "if", "(", "isRoot", "(", ")", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\";", "root", "node\"", ")", ";", "}", "if", "(", "!", "nodeAnnotations", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "nodeAnnotations", ")", ";", "}", "if", "(", "!", "edgeAnnotations", ".", "isEmpty", "(", ")", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "edgeAnnotations", ")", ";", "}", "return", "sb", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addIncomingEdge", "(", "Edge", "edge", ")", "{", "return", "incomingEdges", ".", "add", "(", "edge", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addOutgoingEdge", "(", "Edge", "edge", ")", "{", "return", "outgoingEdges", ".", "add", "(", "edge", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addEdgeAnnotation", "(", "Annotation", "annotation", ")", "{", "return", "edgeAnnotations", ".", "add", "(", "annotation", ")", ";", "}", "public", "boolean", "addNodeAnnotation", "(", "Annotation", "annotation", ")", "{", "return", "nodeAnnotations", ".", "add", "(", "annotation", ")", ";", "}", "public", "String", "getQualifiedName", "(", ")", "{", "return", "qName", "(", "namespace", ",", "name", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "getClass", "(", ")", "!=", "obj", ".", "getClass", "(", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "final", "AnnisNode", "other", "=", "(", "AnnisNode", ")", "obj", ";", "if", "(", "this", ".", "id", "!=", "other", ".", "id", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "corpus", "!=", "other", ".", "corpus", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "textId", "!=", "other", ".", "textId", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "left", "!=", "other", ".", "left", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "right", "!=", "other", ".", "right", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "spannedText", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "spannedText", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "spannedText", ".", "equals", "(", "other", ".", "spannedText", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "leftToken", "!=", "other", ".", "leftToken", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "nodeAnnotations", "!=", "other", ".", "nodeAnnotations", "&&", "(", "this", ".", "nodeAnnotations", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "nodeAnnotations", ".", "equals", "(", "other", ".", "nodeAnnotations", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "name", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "name", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "name", ".", "equals", "(", "other", ".", "name", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "(", "this", ".", "namespace", "==", "null", ")", "?", "(", "other", ".", "namespace", "!=", "null", ")", ":", "!", "this", ".", "namespace", ".", "equals", "(", "other", ".", "namespace", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "partOfEdge", "!=", "other", ".", "partOfEdge", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "root", "!=", "other", ".", "root", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "token", "!=", "other", ".", "token", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "if", "(", "this", ".", "edgeAnnotations", "!=", "other", ".", "edgeAnnotations", "&&", "(", "this", ".", "edgeAnnotations", "==", "null", "||", "!", "this", ".", "edgeAnnotations", ".", "equals", "(", "other", ".", "edgeAnnotations", ")", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "return", "true", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "return", "(", "int", ")", "id", ";", "}", "public", "Set", "<", "Annotation", ">", "getEdgeAnnotations", "(", ")", "{", "return", "edgeAnnotations", ";", "}", "public", "void", "setEdgeAnnotations", "(", "Set", "<", "Annotation", ">", "edgeAnnotations", ")", "{", "this", ".", "edgeAnnotations", "=", "edgeAnnotations", ";", "}", "public", "boolean", "isRoot", "(", ")", "{", "return", "root", ";", "}", "public", "void", "setRoot", "(", "boolean", "root", ")", "{", "this", ".", "root", "=", "root", ";", "}", "public", "String", "getName", "(", ")", "{", "return", "name", ";", "}", "public", "void", "setName", "(", "String", "name", ")", "{", "this", ".", "name", "=", "name", ";", "}", "public", "String", "getNamespace", "(", ")", "{", "return", "namespace", ";", "}", "public", "void", "setNamespace", "(", "String", "namespace", ")", "{", "this", ".", "namespace", "=", "namespace", ";", "}", "public", "String", "getSpannedText", "(", ")", "{", "return", "spannedText", ";", "}", "public", "Set", "<", "Annotation", ">", "getNodeAnnotations", "(", ")", "{", "return", "nodeAnnotations", ";", "}", "public", "void", "setNodeAnnotations", "(", "Set", "<", "Annotation", ">", "nodeAnnotations", ")", "{", "this", ".", "nodeAnnotations", "=", "nodeAnnotations", ";", "}", "public", "long", "getId", "(", ")", "{", "return", "id", ";", "}", "public", "boolean", "isToken", "(", ")", "{", "return", "token", ";", "}", "public", "void", "setToken", "(", "boolean", "token", ")", "{", "this", ".", "token", "=", "token", ";", "}", "public", "boolean", "isPartOfEdge", "(", ")", "{", "return", "partOfEdge", ";", "}", "public", "void", "setPartOfEdge", "(", "boolean", "partOfEdge", ")", "{", "this", ".", "partOfEdge", "=", "partOfEdge", ";", "}", "public", "long", "getCorpus", "(", ")", "{", "return", "corpus", ";", "}", "public", "void", "setCorpus", "(", "long", "corpus", ")", "{", "this", ".", "corpus", "=", "corpus", ";", "}", "public", "long", "getTextId", "(", ")", "{", "return", "textId", ";", "}", "public", "void", "setTextId", "(", "long", "textIndex", ")", "{", "this", ".", "textId", "=", "textIndex", ";", "}", "public", "long", "getLeft", "(", ")", "{", "return", "left", ";", "}", "public", "void", "setLeft", "(", "long", "left", ")", "{", "this", ".", "left", "=", "left", ";", "}", "public", "long", "getRight", "(", ")", "{", "return", "right", ";", "}", "public", "void", "setRight", "(", "long", "right", ")", "{", "this", ".", "right", "=", "right", ";", "}", "public", "Long", "getTokenIndex", "(", ")", "{", "return", "tokenIndex", ";", "}", "public", "void", "setTokenIndex", "(", "Long", "tokenIndex", ")", "{", "this", ".", "tokenIndex", "=", "tokenIndex", ";", "setToken", "(", "tokenIndex", "!=", "null", ")", ";", "}", "public", "long", "getLeftToken", "(", ")", "{", "return", "leftToken", ";", "}", "public", "void", "setLeftToken", "(", "long", "leftToken", ")", "{", "this", ".", "leftToken", "=", "leftToken", ";", "}", "public", "long", "getRightToken", "(", ")", "{", "return", "rightToken", ";", "}", "public", "void", "setRightToken", "(", "long", "rightToken", ")", "{", "this", ".", "rightToken", "=", "rightToken", ";", "}", "public", "Set", "<", "Edge", ">", "getIncomingEdges", "(", ")", "{", "return", "incomingEdges", ";", "}", "public", "void", "setIncomingEdges", "(", "Set", "<", "Edge", ">", "incomingEdges", ")", "{", "this", ".", "incomingEdges", "=", "incomingEdges", ";", "}", "public", "Set", "<", "Edge", ">", "getOutgoingEdges", "(", ")", "{", "return", "outgoingEdges", ";", "}", "public", "void", "setOutgoingEdges", "(", "Set", "<", "Edge", ">", "outgoingEdges", ")", "{", "this", ".", "outgoingEdges", "=", "outgoingEdges", ";", "}", "public", "AnnotationGraph", "getGraph", "(", ")", "{", "return", "graph", ";", "}", "public", "void", "setGraph", "(", "AnnotationGraph", "graph", ")", "{", "this", ".", "graph", "=", "graph", ";", "}", "public", "Long", "getMatchedNodeInQuery", "(", ")", "{", "return", "matchedNodeInQuery", ";", "}", "public", "void", "setMatchedNodeInQuery", "(", "Long", "matchedNodeInQuery", ")", "{", "this", ".", "matchedNodeInQuery", "=", "matchedNodeInQuery", ";", "}", "}", "</s>" ]

[ "<s>", "package", "annis", ".", "model", ";", "import", "java", ".", "io", ".", "Serializable", ";", "import", "javax", ".", "xml", ".", "bind", ".", "annotation", ".", "XmlRootElement", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "EqualsBuilder", ";", "import", "org", ".", "apache", ".", "commons", ".", "lang3", ".", "builder", ".", "HashCodeBuilder", ";", "@", "XmlRootElement", "public", "class", "Annotation", "implements", "Comparable", "<", "Annotation", ">", ",", "Serializable", "{", "private", "String", "namespace", ";", "private", "String", "name", ";", "private", "String", "value", ";", "private", "String", "type", ";", "private", "String", "corpusName", ";", "private", "int", "pre", ";", "public", "Annotation", "(", ")", "{", "}", "public", "Annotation", "(", "String", "namespace", ",", "String", "name", ")", "{", "this", "(", "namespace", ",", "name", ",", "null", ")", ";", "}", "public", "Annotation", "(", "String", "namespace", ",", "String", "name", ",", "String", "value", ")", "{", "this", ".", "namespace", "=", "namespace", ";", "this", ".", "name", "=", "name", ";", "this", ".", "value", "=", "value", ";", "}", "public", "Annotation", "(", "String", "namespace", ",", "String", "name", ",", "String", "value", ",", "String", "type", ",", "String", "corpusName", ")", "{", "this", "(", "namespace", ",", "name", ",", "value", ")", ";", "this", ".", "type", "=", "type", ";", "this", ".", "corpusName", "=", "corpusName", ";", "}", "public", "Annotation", "(", "String", "namespace", ",", "String", "name", ",", "String", "value", ",", "String", "type", ",", "String", "corpusName", ",", "int", "pre", ")", "{", "this", "(", "namespace", ",", "name", ",", "value", ",", "type", ",", "corpusName", ")", ";", "this", ".", "pre", "=", "pre", ";", "}", "@", "Override", "public", "String", "toString", "(", ")", "{", "StringBuilder", "sb", "=", "new", "StringBuilder", "(", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "AnnisNode", ".", "qName", "(", "namespace", ",", "name", ")", ")", ";", "if", "(", "value", "!=", "null", ")", "{", "sb", ".", "append", "(", "\"=\"", ")", ";", "sb", ".", "append", "(", "value", ")", ";", "}", "return", "sb", ".", "toString", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "compareTo", "(", "Annotation", "o", ")", "{", "String", "name1", "=", "getQualifiedName", "(", ")", ";", "String", "name2", "=", "o", ".", "getQualifiedName", "(", ")", ";", "return", "name1", ".", "compareTo", "(", "name2", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "boolean", "equals", "(", "Object", "obj", ")", "{", "if", "(", "obj", "==", "null", "||", "!", "(", "obj", "instanceof", "Annotation", ")", ")", "{", "return", "false", ";", "}", "Annotation", "other", "=", "(", "Annotation", ")", "obj", ";", "return", "new", "EqualsBuilder", "(", ")", ".", "append", "(", "this", ".", "namespace", ",", "other", ".", "namespace", ")", ".", "append", "(", "this", ".", "name", ",", "other", ".", "name", ")", ".", "append", "(", "this", ".", "value", ",", "other", ".", "value", ")", ".", "isEquals", "(", ")", ";", "}", "@", "Override", "public", "int", "hashCode", "(", ")", "{", "return", "new", "HashCodeBuilder", "(", ")", ".", "append", "(", "namespace", ")", ".", "append", "(", "name", ")", ".", "append", "(", "value", ")", ".", "toHashCode", "(", ")", ";", "}", "public", "String", "getValue", "(", ")", "{", "return", "value", ";", "}", "public", "void", "setValue", "(", "String", "value", ")", "{", "this", ".", "value", "=", "value", ";", "}", "public", "String", "getNamespace", "(", ")", "{", "return", "namespace", ";", "}", "public", "void", "setNamespace", "(", "String", "namespace", ")", "{", "this", ".", "namespace", "=", "namespace", ";", "}", "public", "String", "getName", "(", ")", "{", "return", "name", ";", "}", "public", "void", "setName", "(", "String", "name", ")", "{", "this", ".", "name", "=", "name", ";", "}", "public", "String", "getQualifiedName", "(", ")", "{", "return", "AnnisNode", ".", "qName", "(", "namespace", ",", "name", ")", ";", "}", "public", "String", "getType", "(", ")", "{", "return", "type", ";", "}", "public", "String", "getCorpusName", "(", ")", "{", "return", "corpusName", ";", "}", "public", "void", "setType", "(", "String", "type", ")", "{", "this", ".", "type", "=", "type", ";", "}", "public", "void", "setCorpusName", "(", "String", "corpusName", ")", "{", "this", ".", "corpusName", "=", "corpusName", ";", "}", "public", "void", "setPre", "(", "int", "pre", ")", "{", "this", ".", "pre", "=", "pre", ";", "}", "public", "int", "getPre", "(", ")", "{", "return", "pre", ";", "}", "}", "</s>" ]