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CHANGED
@@ -2,7 +2,6 @@ import re
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import fitz
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import gradio as gr
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import pandas as pd
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-
tmpfile = None
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6 |
import tempfile
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import pytesseract
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8 |
from PIL import Image, ImageEnhance, ImageFilter
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@@ -43,16 +42,14 @@ def classificar(nome, valor):
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43 |
except:
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44 |
return valor
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-
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47 |
# Ajustes para melhorar OCR
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-
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49 |
img = img.convert("L")
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50 |
img = ImageEnhance.Contrast(img).enhance(2)
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51 |
return img.filter(ImageFilter.SHARPEN)
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-
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54 |
# Extrai texto nativo + OCR
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-
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56 |
if isinstance(pdf_input, dict):
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57 |
pdf_path = pdf_input.get("name") or pdf_input.get("file_path")
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58 |
elif hasattr(pdf_input, "name") and isinstance(pdf_input.name, str):
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@@ -71,10 +68,64 @@ def classificar(nome, valor):
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71 |
tocr = re.sub(r"\s+", " ", " ".join(pytesseract.image_to_string(im) for im in ocr_imgs))
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72 |
return tn, tocr
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74 |
-
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75 |
# Padrões de extração incluindo EAS completo
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76 |
-
exames = {
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-
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80 |
def extrair_exames_formatado(pdf_file):
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@@ -99,14 +150,13 @@ def extrair_exames_formatado(pdf_file):
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99 |
line_main = ' / '.join(main_fields)
|
100 |
final = '\n'.join([l for l in (line_eas, line_main) if l])
|
101 |
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102 |
-
# CSV
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103 |
df = pd.DataFrame([[k, resultados[k]] for k in resultados], columns=["Exame", "Valor"])
|
104 |
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv")
|
105 |
df.to_csv(tmp.name, index=False)
|
106 |
return final, tmp.name
|
107 |
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108 |
-
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109 |
-
# Gradio UI
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110 |
with gr.Blocks() as demo:
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111 |
gr.Markdown("## 🧪 Extrator Avançado com OCR + EAS + Troponina (Quant. e Qual.)")
|
112 |
pdf_input = gr.File(file_types=[".pdf"], label="📄 PDF de exames")
|
|
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2 |
import fitz
|
3 |
import gradio as gr
|
4 |
import pandas as pd
|
|
|
5 |
import tempfile
|
6 |
import pytesseract
|
7 |
from PIL import Image, ImageEnhance, ImageFilter
|
|
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42 |
except:
|
43 |
return valor
|
44 |
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45 |
# Ajustes para melhorar OCR
|
46 |
+
def melhorar_imagem(img: Image.Image) -> Image.Image:
|
47 |
img = img.convert("L")
|
48 |
img = ImageEnhance.Contrast(img).enhance(2)
|
49 |
return img.filter(ImageFilter.SHARPEN)
|
50 |
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51 |
# Extrai texto nativo + OCR
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52 |
+
def extrair_texto_pdf(pdf_input):
|
53 |
if isinstance(pdf_input, dict):
|
54 |
pdf_path = pdf_input.get("name") or pdf_input.get("file_path")
|
55 |
elif hasattr(pdf_input, "name") and isinstance(pdf_input.name, str):
|
|
|
68 |
tocr = re.sub(r"\s+", " ", " ".join(pytesseract.image_to_string(im) for im in ocr_imgs))
|
69 |
return tn, tocr
|
70 |
|
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71 |
# Padrões de extração incluindo EAS completo
|
72 |
+
exames = {
|
73 |
+
# Hemograma
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74 |
+
"LEUCO": r"leuc[óo]citos.*?([\d.,]+)\s*/u?l",
|
75 |
+
"B": r"bas[óo]filos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
76 |
+
"SS": r"segmentados.*?([\d.,]+)\s?%",
|
77 |
+
"EOS": r"eosin[óo]filos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
78 |
+
"LINF": r"linf[oó]citos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
79 |
+
"MONO": r"mon[óo]citos.*?([\d.,]+)\s?%",
|
80 |
+
"HB": r"hemoglobina.*?([\d.,]+)\s?g/dl",
|
81 |
+
"HT": r"hemat[óo]crito.*?([\d.,]+)\s?%",
|
82 |
+
"PLT": r"plaquetas.*?([\d.,]+).*?/u?l",
|
83 |
+
# Bioquímica
|
84 |
+
"AMIL": r"amilase.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
85 |
+
"BT": r"bilirrubina total.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
86 |
+
"BD": r"bilirrubina direta.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
87 |
+
"BI": r"bilirrubina indireta.*?([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
88 |
+
"CR": r"creatinina.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
89 |
+
"UREIA":r"ureia.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
90 |
+
"FAL": r"fosfatase alcalina.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
91 |
+
"GGT": r"ggt.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
92 |
+
"TGO": r"tgo.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
93 |
+
"TGP": r"tgp.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
94 |
+
"GLI": r"glicose(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
95 |
+
"LIP": r"lipase.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?u/l",
|
96 |
+
"MG++": r"magn[eé]sio.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)\s?mg/dl",
|
97 |
+
# Coagulação
|
98 |
+
"TAP": r"tempo de protrombina.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
99 |
+
"INR": r"inr.*?([\d.,]+)",
|
100 |
+
"TTP": r"ttpa.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
101 |
+
"DIMERO D": r"d[ií]mero d.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
102 |
+
# Inflamatório e Cardíacos
|
103 |
+
"PCR": r"pcr.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
104 |
+
"CKMB": r"ck[- ]?mb.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
105 |
+
"CPK": r"cpk.*?resultado[:\s]*([\d.,]+)",
|
106 |
+
"TROPONINA": r"troponina(?! qualitativa).*?resultado[:\s]*([>\d.,]+)",
|
107 |
+
"TROPONINA QUAL": r"troponina qualitativa.*?resultado[:\s]*(positivo|negativo)",
|
108 |
+
# EAS completo (Urina)
|
109 |
+
"PROTEINA UR": r"prote[ií]na\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
110 |
+
"GLI UR": r"glicose\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
111 |
+
"CETONAS UR": r"corpos cet[oô]nicos.*?(ausente|positivo|negativo)",
|
112 |
+
"SANGUE UR": r"sangue\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
113 |
+
"LEUC ESTERASE": r"leuc[óo]citos? esterase\s*[:\-]?\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
114 |
+
"NITRITO UR": r"nitrito\s*(ausente|positivo|negativo)",
|
115 |
+
"LEUCO EAS": r"leuc[óo]citos?\s*([\d]+[-\/–][\d]+)",
|
116 |
+
"HEMA EAS": r"hem[áa]cias?\s*([\d]+[-\/–][\d]+)",
|
117 |
+
"BACTERIAS UR": r"bact[ée]rias?\s*(raras|ausentes|positivas|negativas)"
|
118 |
+
}
|
119 |
+
|
120 |
+
ordem = [
|
121 |
+
"LEUCO","B","SS","EOS","LINF","MONO",
|
122 |
+
"HB","HT","PLT","AMIL","BT","BD","BI",
|
123 |
+
"CR","UREIA","FAL","GGT","TGO","TGP","GLI","LIP","MG++",
|
124 |
+
"PCR","CKMB","CPK","TROPONINA","TROPONINA QUAL",
|
125 |
+
"TAP","INR","TTP","DIMERO D",
|
126 |
+
# EAS
|
127 |
+
"PROTEINA UR","GLI UR","CETONAS UR","SANGUE UR","LEUC ESTERASE","NITRITO UR","LEUCO EAS","HEMA EAS","BACTERIAS UR"
|
128 |
+
]
|
129 |
|
130 |
|
131 |
def extrair_exames_formatado(pdf_file):
|
|
|
150 |
line_main = ' / '.join(main_fields)
|
151 |
final = '\n'.join([l for l in (line_eas, line_main) if l])
|
152 |
|
153 |
+
# Gera CSV
|
154 |
df = pd.DataFrame([[k, resultados[k]] for k in resultados], columns=["Exame", "Valor"])
|
155 |
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(delete=False, suffix=".csv")
|
156 |
df.to_csv(tmp.name, index=False)
|
157 |
return final, tmp.name
|
158 |
|
159 |
+
# UI Gradio
|
|
|
160 |
with gr.Blocks() as demo:
|
161 |
gr.Markdown("## 🧪 Extrator Avançado com OCR + EAS + Troponina (Quant. e Qual.)")
|
162 |
pdf_input = gr.File(file_types=[".pdf"], label="📄 PDF de exames")
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