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| 69,560 |
MH552508.1
|
CRESS virus sp.
|
Tisza,M., Buck,C., Pastrana,D., Welch,N., Peretti,A.
|
National Cancer Institute, Lab of Cellular Oncology
|
USA
|
2018-07-28
|
ctdh33
|
CRESS virus sp.
| null | null |
ssDNA
| 6,089 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2017-06-01
|
SAMN09074551
|
PRJNA393166
|
MAG: CRESS virus sp. isolate ctdh33, complete genome
|
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| 69,709 |
NC_033738.1
|
Cacao mild mosaic virus
|
Chingandu,N., Zia-Ur-Rehman,M., Sreenivasan,T.N., Surujdeo-Maharaj,S., Umaharan,P., Gutierrez,O.A., Brown,J.K., Guttierez,O.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2017-02-16
|
SCA6
|
Badnavirus tessellotheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,533 |
RefSeq
| 1 |
Trinidad and Tobago
|
Trinidad and Tobago
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2015-07-13
| null |
PRJNA485481
|
Cacao mild mosaic virus isolate SCA6, complete genome
|
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| 4,556 |
MW052520.1
|
Cacao mild mosaic virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Ferro,M.M.M., Nagata,T., Puig,A.S., Keith,C.V., Britto,D.S., Gutierrez,O.A., Marelli,J.P., Brown,J.K., Marelli,J.-P.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2021-05-09
|
PR3
|
Badnavirus tessellotheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,514 |
GenBank
| 1 |
Puerto Rico
|
USA
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2019-12
| null | null |
Cacao mild mosaic virus isolate PR3, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTATGTTTGGTAAAAGCATGGCTGGCTAAACACTTTGTGAGGTCAAAAGGAAAGAGTGACGAGGTTTTTGATTCTTGACGATTGTTTTGTTAAGGCAGATTCTTATCAAGAAGACATTAGCAGGAAGAGCGTTAAGATCGAAGAAGTGTCCTCTGAGAAGGAGCAAAAGGACAAGGCCATAACACTAAGAAGCCGAAGAAGGCAAAGAAGGTGTGAACCCTTGTATGAGCTTTGAATAGGAGTGAAAGGTCGTGGCAAGCTTTGGAGGAAGTTGATGTCTGAAAGGTGGGAACGAGCAATAGCAGAGTGGTATGATAAGTCAAGAACCTCTGATCTTGAGTACTTAGATCTCGCATCTTCACATAAGGTTTCGAATTCAGATCTTGCAAACAATATAGCTGTAGTGTACGATCGTTTAGATTTACTCTCTCGTGCCCATATTAAAGACTGTAAAAAGATCCTTGAAGAAATCGACAGTGTGAAAAGGGAAAGCAGGAAGTTGAGACAGGAGGTGTCTAACCTGACTGTTACTGTTCTTGAGAACAAGCCCATCACAAAGGCCCAAGTTCTTGAGATCACGGAGCAGATTTCCAAACAGCCCAAGGAAATCGAAGAGCAGGCTTTGGCCCTTTTAACTAAGGTAAATCAAAAGCTAGCACAAGTAGAAGTATTGGTGGCTAAGCTTGAGGCTTGGACCAATACATGAGTAATCTTGCTAACAGAAGAGCAAGCAGTGCATATACTGATTCTCTTGAAGCCACGGAAGAATTGAATAGCCCAGCACTTGGATTCATCGTCCCAACACAGTATCGAGGACCAACTGCTAGTGCTATTGCACAGATAAAACAGGTTAACACTTTAATCTGTTTAGTTATTGACTTGACAGAGAAGGTTGAAGCCCTTACAGCTAAGGTAAGGAGCTTAGAAGCGGTTTTTAAGGCAACTGAAAAGGATAAGGGCACCGAGGAGCTGTTGAAGCAACTTCAGGGACTGAAGCTTGGAGAAACTTCGAGACCTCCACAGAAGGAAGGAACTTTACGAGTGTTTGTAGATCCAAAGACACTTGTTGAGAAGGCTAGAAACGAGAAACGATGACTTCTCGTACAGAGACTATGACTCAACCACAGACTGGTATCAACTTTGAGGACCAGATCCGTGGATATAGGACAGGACAGAGGCGGCGCTACAACTGGGCGCGACAAGCGAGAAGGTTAAGAAATAGGATCAGACGATCGCCTAGACAACCTGAGACGTTAGAAACACAGATAGACCCCCAGGCTGAGCTAAGCATGTCACTGCAAAGGCGTGCTAGTATAGTACCAGCTGAGGTACTGTACCACTCAAGACAAGATGATATCAATCACCGTGTCTACCAGCACTGGAGTGAGGAGGCTGTCAACTGCACTGACGGACAGCAGATTGATAGAACACTGGTCACGATGGAGAGCTTTAGTACCTTAAACCGTGCAGGTTTTCGGTATATCCATATTGGCGTGATCCAGGTAAGACTGCAGATCTTACATAGGCGAGAGATGGGAACGTTAGCCTATGTTGTCTTCAGAGATAACCGACTACTTGGTGATCAAGCAATCTTGGCGCAGATGGAAGTTAGTCTGGCTGACGGTGGTCACCAGATGATTTATGTCGTACCAGACATAATGATGACGGTTGGAGACTTTTACAGGAACATCCAGATCTCCATACAAACTAGAGGGTACGGCAACTGGAGGAATGCAGAAGCAAATCTACTAGTAACAAGGGGACTAGTAGGAAGGTTATCCAACACCTCAAATGTTGGATTTGAATACTCCATCAGTAATGTTACAGATTATCTCACTAGTCATGGAGTAAGAGCTATTCCAGGGAAGAGGGTGTCAGAATCAGAGCACCTTGGAAGAAGCTGGATACTTAGGGAGCCAGAAGTATCAATCATACAACAACCCACAATTGCAGACACAAGGAACCTACCAAACGGTTCAGTAAGTGTGAGGTTCGGAGGATATGGGGCAGCACCTGAAACCTCAAGGACGAGGTTTGATGAAAACGACAACGAAATCATGGATGACGATGAAAGTCAGATAGCTGAGGAAGTCCATGTTATGATCATTGATGAAGACGATGAGGAATGGGAAGAGCTGAACAGGCAAATGGTGGCTGACTTTGCAGAAGAAGAGCAAAAACACACAGAGCCAATCATTGCGGAGGAGGATATCTATCTCTTACCAGGAATGGAGGACTTGCTGAACATCTCAACACACGCAGATTTGAGCAATGGTAACAACCTAACAAGTGCAATTAATGGTTTTATCATTGTCAGTATCTATCACAATGGTAAAGACATGAAGATCCTGAAAGTCAGGAATGACACGAAGGAGATCAAGTTGATTAGCAAAGGAGATATCATTGGACAAGGTAAAGTCCAACAGGAGGAAGTTCACTTTACTGAGGAAGAAGCTCGGGCGGAGCTTAAGAAGCTAATTGCAGGAGAAGAAGTGTATATGGAGGCTGAGTCTTCGGTACAGTCCGGATCTTACAGATTACCAACGGACGCTACCATGGGACCACCAATCTATCCACCTGCAAGACAGAGGTTTGATGGACCATCTACATCCTCTATTCCGATGGATCCACCGACATATAGAGCACCACCAAGGGCAAAGGTTCCAGATTATCAGAACTGGTGGAACCTTCCAACTGCACAAATAAACGGAGGCGCAATGTTCATAATCCCATCAGATTTCAGCAAATTTGATGATGTTTTTATGCGATGGGAGAGCATTACAAAGAACGTGGTGGCACTACAAAATTTCTCAGACAACAAAGACAAGGCGGAATTCATTGAGAACTTGCTAGGAGAAACAGAAAAGTTAGCATGGATACAATGGCGAAGTATCTATGAGGAGGAATACCAGGCCCTTATTGGTACGATGGATGGAAGGTCTGGAACACAAAACATGTTATCACAGATTAGAAGGATCTTTACATTGGAAGACCCATATCAGGGCTCTACAATGAGTCAAGATCAGGCGTACAAAGACTTAGAGCGCTTAACCTGTACAGATGTCAAGCACATTCTGGAGTACCTAAGGCAGTTCATGTACCTTGCATCAAAAACGGGACGATTGTTTACATCATCAGAACTGTCTTCAAAGCTGTTCGTAAAGATGCCAGGAGACTTGGGGAAACGAATAGAAGACTCATTTAAGGCTAAGTACCCAGGTAACACGGTTGGAGTATTTCCTCGTATTATCTTTTCATTTAAATACTTGGAAAACCAGTGCAAGGAGGCATCATTCCAGAGAAGCCTGAAGAGCCTGGAATTCTGCAAGCAAATGCCCATCCCAGGGTATTACGGAACTGATAAGAAGCGCCTAGGTATCAGGAAGGCTACACATTACAAAGGAAAGCCGCATAGCACGCACGTAAAGATAGAGAAGCACAAACATTTGAGAACGAAGAAGTGCAAGTGCTACCTTTGTGGAGAAGAAGGTCGTTTTGCAAGGGAGTGCAAGAATGACAGCAGAAACATTCATAGACAGACTATGTACCAACCATTGGAGCTACCAAGGGATTTTGAGTTGGTATCTGCTGAGGAGAATGATTCAGGAGATGAGATATACAGTATGTCTGAAGGTGAAGATCCAACCACAATGTTTATGAATCTAACACCTTTAGCGCAGGTTGAAGACTGTCTCACTCTTGACTGGGAATATAAAGACGTCTATGAGTACAGACATTTTGGTACTTGTACATCTGACATCCAGCAACCACAGCCTTGGAAGCAACGAACAAAGGTCTATGAAGAGGGAGGAAATGGTCATGATAGAACCTTTTATCGCTATTACGGACCACCAGATGGACGTGAAAACTGGCCGGAAACACCTATCCCTACGGGTTGGGGTAGTGATTTTGACTCTGATAGTGACACTAATGATATCGAGGATGAAGAAATCTACATGATGCAAGAAGAACAGTTTAACGAACATTGGATTGGAAAACGTGGTGGATGGCAGCCCCTAATTAAACTCTCTGATATTGAGTTTAACTGTGTACATCAATGGCAGCATAACACCCAAGTTCGTAACTGTCCTGAACATTGCAGGTGCTGTAACAAGGAGACTTCAGACAGATGCAGGATACAATGTGGGTACTGCAAGATCACAGCCTGCAGTTTGTGTGCATTTAGTTACTTTGACATCAAGGTAACTCAAAGAAAGGAATTTGTTTCACCTTATTATGCTACACCATCTTTGTTAAAGGAAAACCAGGAGTACATTTCGTGGTGTCAAGCGGAGCTAAACAAGACCGGTGAGGCAATGATGCACATTAGGAAGGAAAATGCAGCGCAAAGCGAAGTCATCACAGCGCAAGAAGATGTCATCAACAAACTCAAGGAGGAGAAGGTGGATAAAGAAAAGATTCTGAAGGAGCTCAAACAGGAGCTACAGCAGGAAAAGGAAAAGTTCTTACGGGAAATTGAAGAACAGAAAGAGCTTTTCAAAAGGCAGATTGAAGAGGAAAAGGCTAAATTCCTTAGCCTAAAGCAAAAACAGACGGAGGAAGAAGAATGTCTTCTTGTAAAAGAAGAACCAGAAGAGCAAAAGGTTGAAGAAACATTGGCAATATCCGGAAAGCTGATCATCATAGAAGGACGCATTGAGATAGAAGGAGTTAAGCCCTTCACAGTTAAAGCTTTGTTGGATACAGGAGCACCATGTTGTAACATCAAGAAGGAATTTGTACCAATGGACGCGGTTGAACAGTGCAACTATCCAGTCTTGATTCACGGCGTAAATTCAACCTTAGAAGTCAACCAAAAGCTGAAGCAGGGAAAGTTTATCATTGGAAGTCAGGAGTACAGGTTACCTCATACCTACGTACTTCCTATGAACAAAAATTTGGTCACTGACATGCAGATGATCATTGGTTGCAACTTCATACGCTCACTACATGGCGGAGTAAGGATAGAAGGGAATGAAGTCACCTTCT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| 42,216 |
MW052521.1
|
Cacao mild mosaic virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Ferro,M.M.M., Nagata,T., Puig,A.S., Keith,C.V., Britto,D.S., Gutierrez,O.A., Marelli,J.P., Brown,J.K., Marelli,J.-P.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2021-05-09
|
BR321
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Badnavirus tessellotheobromae
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
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GenBank
| 1 |
Brazil
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Brazil
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2019-09
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Cacao mild mosaic virus isolate BR321, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTATGTCTGTTAAAAGCATGGCTGGTTAAACACTTTGTGAGATCGAAAGGAAAAAGTGACGAGGTTTTTCTTAACGATTATTTTGTTAAAGCAGATTCTTATCAGGAAGACATTAGCAGGAAGAGCGGTAAGACCGAAGAAGTGTCCTCTGAAAAGGAGCAAAAGGACAAGGCCATAGCACTAAGAAGCCAAGGAAGGTGAAAGAAGGTGCGAACCCTTGTATGAGCTTTGAATAGGAGTGAAAGGTCGTGGCAAGCTTTGGAGGAAGTTGATGTCTGAAAGGTGGGAACGAGCAATAGCAGAGTGGTATGATAAGTCAAGAACTTCTGATCTTGAGTACTTAGATCTCGCATCTTCTCATAAGGTTTCAAATTCAGATCTTGCAAACAATATAGCTGTAGTGTACGATCGTTTAAATTTACTTTCTCGTGTCCATATTAAAGACTGTAAAAAGATCCTTGAAGAAATCGACGGTGTGAAAAGGGAAAGCAGGAAGTTGAGACAGGAGGTGTCTAACTTGACTATTACTGTTCTTGAGAACAAGCCCATCACAAAGGCCCAAGTTCTTGAGATCACGGAGCAGATTTCCAAACAGCCCAAGGAAATCGAAGAGCAGGCTTTGGCCCTTTTAACTAAGGTAAACCAAAAGTTAGCACAGGTGGAAGCATTGGTGGCTAAGCTTGAGGCTTGGACCAATACATGAGTAATCTTGCTAACAGAAGAGCAAGCAGTGCATATACTGATTCTCTTGAAGCCACTGAAGAATTGAGTAGCCCAGCACTTGGATTCATCGACCCAACACAGTATCGAGGACCAACTGCTAGTGCTATTGCACAGATAAAACAGGTTAACACTTTAATCTGTTTAGTTGTTGACTTGACAGAGAAGGTTGAAGCTCTTACAGCTAAGGTGAGGAGCTTAGAAGCGGTTTTTAAGGCAACTGAAAAGGATAAGGGCACCGAGGAGCTGTTGAGGCAACTTCAGGGACTGAAGCTTGGAGAAACTTCGAGACCTCCACAGAAGGAAGGAACTTTACGAGTGTTTGTTGATCCAAAGACACTTGTAGAGAAGGCTAGAAACGAAAAACGATGACTTCTCGTACAGAGACTGTGACTCAACCACAAACTGGTATCAACTTTGAGGACCAGATCCGTGGATACAGGACAGGACAGAGGCGGCGCTACAACTGGGCACGACAAGCAAGAAGGTTAAGGAATAGGATCAGACGATCGCCTAGACAACCTGAGACGTTGGAAACACAGATAGACCCCCAGGCTGAGCTGAGCATGTCACTACAAAGGCGTGCTAGTATAGTACCAGCTGAGGTACTGTACCACTCAAGACAGGATGATATCAATCACCGTGTCTACCAGCACTGGAGTGAGGAGGCTGTCAATTGCATTGACGGACAGCAGATTGATAGAACACTGGTCACGATGGAGAGTTATAGTACCTTAAACCGTGCAGGTTTTCGGTATATCCATGTTGGCGTGATCCAGGTAAGATTGCAGATCTTACATAGGCGGGAGATGGGAACGTTAGCCTATGTTGTCTTCAGAGATAACCGACTACTCGGTGATCAAGCAATCTTGGCACAGATGGAAGTTAGTCTGGCTGACGGTGGTCACCAGATGATTTATGTCGTACCAGACATAATGATGACGATTGGAGACTTTTACAGAAACATCCAGATCTCCATACAGACTAGAGGGTACGGCAACTGGAGGAATGCAGAAGCAAATCTACTAGTAACAAGGGGACTAGTAGGAAGGTTATCCAACACCTCAAATGTGGGATTTGAATACTCCATCAGTAACGTTACAGATTATCTCACTAGTCATGGAGTAAGAGCTATTCCAGGAAAGAGGGTGTCAGAATCGGAGCACCTTGGAAGAAGCTGGATACTTAGGGAGCCAGAAGTATCAATCATACAACAACCCACAATTGCAGACACAAGGAACCTACCAAACGGTTCAGTAAGTGTGAGGTTCGGAGGATATGAGGCAGCACCTGAAACCTCAAGGGCGAGGTTTGATGAAAACGACAACGAAATCATGGATGACGATGAGAGTCAGATAGCTGAGGAAGTCCATGTTATGATCATTGATGAAGACGATGAGGAATGGGAAAAGCTGAACAGGCAAATGATGGCTGACTTTGCAGAAGAAGAGCAAAAACACACAGAGCCAATCATTGCGGAGGAGGATATCTATCTCTTACCAGAGATGGAGGACTTGCTGAACATCTCAACACACGCAGATTTGAATGGTAACAACCTAACAAGTGCAATTAATGGTTTTATCATTGTCAGTATCTATCACAATGGTGAAGACATGAAGATCCTTAAAGTCAGGAATGACACGAAGGAGATCAAGTTGATCAGCAAAGGAGATATCATTGGACAAGGTGAAGTCCAACAGGAGGAAATTCACTTTACTGAAGAAGAAGCTCGGGCGGAGCTTAAGAAGCTAATTGCAGGAGAAGAAGTACATATGGAGGCAGAATCTTCGGTACAGTCCGGATCCTACAGATTACCAACGGACGCTACCATGGGACCACCAATCTATCCACCTGCAAGGCAGAGGTTTGATGGACCATCTACATCTTCTATTCCGATGGATCCACCGGTATATAGAGCACCACCAAAGGCAAGGGTTCCAGATTATCAGAACTGGTGGAACCTCCCAACTGCACAAATAAACGGAGGCGCAATGTTCATAATCCCATCAGATTTCAGCAAATTTGATGATGTTTTCATGCGATGGGAAAGCATTACAAAGAACGTGGTGGCACTACAAAACTTCTCAGACAACAAAGACAAGGCGGAGTTCATTGAGAACTTGCTAGGAGAAACAGAGAAGTTAGCATGGATACAATGGCGAAGTATCTATGAGGAGGAATATCAGGCCCTTATTGGTACGATGGATGGAAGGTCTGGAACACAAAACATGTTATCACAGATTAGAAGGATCTTTACATTGGAGGACCCATATCAGGGCTCTACAATGAGTCAAGATCAGGCGTACAAAGACTTAGAACGCTTAACCTGTACAGATGTCAAGCACATTCTGGAGTACCTAAGGCAGTTCATGTACCTTGCATCAAAGACGGGACGATTATTTACATCATCAGAGCTGTCTTCAAAACTGTTCGTAAAGATGCCAGGAGACTTGGGGAAACGAATAGAAGACTCATTCAAGGCTAAGTACCCAGGTAACACGGTTGGAGTATTTCCTCGTATTGTCTTTTCATTTAAATACTTGGAAAACCAGTGCAAGGAGGCATCATTCCAGAGAAGCCTGAAGAGCCTGGAATTCTGCAAGCAAATGCCCATCCCAGGGTATTACGGAACTGATAAGAAGCGCCTAGGTATCAGGAAGGCTACACATTACAAAGGAAAGCCGCATAGCACGCACGTAAAGATAGAGAAGCACAAACATTTGAGAACGAAGAAGTGTAAGTGCTACCTTTGTGGAGAAGAAGGTCATTTTGCAAGGGAGTGCAAGAATGACAACAGGAACATTCATAGACAGACTATGTACCAATCATTGGAGCTACCAAAGGATTTTGAGTTGGTATCTGCTGAGGAGAATGATTCAGGAGATGAGATATACAGTATGTCTGAAGGTGAAGATCCAACCACAATGTTCATGAATCTAACACCTTTAGCGCAGGTTGAAGACTGTCTCACTCTTGACTGGGAGTATAAAGATGTCTATGAGTACCGACATTTTGGTACTTGTACATCTGACATCCAGCAACCACAAAAGCAACGAACAAAGGTCTATGAAGAGGGAGGAAATGGTCACGATAGAGCCTTTTATCGCTATTACGGACCACCAGATGGACGTGAAAGCTGGCCGGAAACACCTATCCCTACGGGTTGGGGTAGTGACTTTGACTCTGACAGTGACACTAATGATATCAAGGATGAAGAGATCTACATGATGCAAGAAGAACAGTTTAACGAACATTGGATTGGAAAACGTGGTGGATGGCAGCCCCTAATTAAACTCTCGGATATTGAGTTTAACTGTGTACATCAATGGCAGCATAACACCCAAGTTCGTGACTGTCCTGAACATTGCAGATGCTGTAACAAGGAGACTTCAGACAGATGCAGGATACAATGTGGATACTGCAAGATCACAACCTGCAGTTTGTGTGCATTTAGTTACTTTGACATCAAGGTAACTCAAAGAAAGGAATTTGTTTCACCTTATTATGCTACACCATCTTTGTTAAAGGAAAACCAGGAGTACATTTCATGGTGTCAAGCGGAGCTAAACAAGACCGGTGAGGCAATGATGCACATTAGGAAGGAAAATGCAGCACAAAGCGAAGTCATCACAGCGCAAGAAGACATCATCAACAAACTCAAGGAGGAGAAGTTGGATAAAGAAAAGATTCTGAAGGAGCTCAAACAGGAGCTACAGCAGGAAAAGGAAAAGTTCTTGCGGGAAATTGAAGAACAGAAAGAGCTTTTCAAAAGGCAGATTGAAGAGGAAAAGGCTAAATTCCTTAGCCTAAAGCAAAAACAGACGGAGGAAGAAGAGTGTCTTCTTGTAAAAGAAGAATCAGAAGAGCAAAAGGTTGAAGAAACATTGGCAATATCCGGAAAGCTAATCATCATAGAAGGACGCATTGAGATAGAAGGAGTTAAGCCCTTCACAGTTAAAGCTTTGTTGGATACAGGAGCATCATGTTGTAACATCAAGAAGGAATTTGTACCAATAAACGCGGTCGAACAATGCAACTATCCAGTCTTGATTCACGGCGTAAATTCAACCTTAGAAGTCAACCAAAAGCTGAAGCAAGGAAAGCTTATCATTGGAAGTCAGGAGTTCAGGTTACCTCATACCTACGTACTTCCTATGAACAAAAATTTGGTCACTGACATGCAGATGATCATTGGTTGCAACTTCATACGCTCACTACATGGCGGAGTGAGGATAGAAGGGAATGAAGTCACCTTCTACAAGTATCTTA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| 42,217 |
MW052522.1
|
Cacao mild mosaic virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Ferro,M.M.M., Nagata,T., Puig,A.S., Keith,C.V., Britto,D.S., Gutierrez,O.A., Marelli,J.P., Brown,J.K., Marelli,J.-P.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2021-05-09
|
BR322
|
Badnavirus tessellotheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,524 |
GenBank
| 1 |
Brazil
|
Brazil
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2019-09
| null | null |
Cacao mild mosaic virus isolate BR322, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTATGTTTGTTAAAAGCATGGCTGGCTAAACACTTGGTGAGATTGAAAGGAAAGAGTGACGAGGTTTTTCTTAACGATTATTTTGTTAAAGCAGATTCTTATCAGAAAGACATTAGCAGGAAGAGCGGTAAGACCGAAGAAGTGTCCTCTGAAAAGGAGCAAAAGGACAAGGCCATAGCACTAAGAAGCCAAGGAAGGTGAAAGAAGGTGCGAACCCTTGTATGAGCTTTGAATAGGAGTGAAAGATCGTGGCAAGCTTTGGAGGAAGTTGATGTCTGAAAGGTGGGAACGAGCAATAGCAGAATGGTATGATAAGTCAAGAACCTCTGATCTTGAGTACTTAGATCTCGCATCTTCTCATAAGGTTTCGAATTCAGATCTTGCAAACAATATAGCTGTAGTGTACGATCGTTTAAATTTACTTTCTCGTGTCCATATTAAGGACTGTAAAAAGATCCTTGAAGAAATCGACGGTGTAAAAAGGGAAAGCAGGAAGTTGAGACAGGAGGTGTCTAACTTGACTATTACTGTTCTTGAGAACAAGCCCATCACAAAAGCCCAAGTTCTTGAGATCACGGAGCAGATTTCCAAACAGCCCAAGGAAATCGAAGAGCAGGCTTTGGCCCTTTTAACTAAGGTAAACCAAAAGCTAGCACAGGTAGAAGTATTGGTGGCTAAGCTTGAGGCTTGGACCAATACATGAGTAATCTTGCTAACAGAAGAGCAAGCAGTGCATATACTGATTCTCTTGAAGCCACTGAAGAGTTGAATAGCCCAGCACTTGGATTCATCGACCCAACACAGTATCGAGGACCAACTGCTAGTGCTATTGCACAGATAAAACAGGTTAACACTTTAATCTGTTTAGTTGTTGACTTGACAGAAAAGGTTGAAGCTCTTACAGCTAAGGTAAGGAGCTTAGAAGCGGTCTTTAAGGCAACTGAAAAGGATAAGGGCACCGAGGAGCTGTTGAAGCAACTTCAGGGACTGAAGCTTGGAGAAACTTCGAGACCTCCACAGAAGGAAGGAACTTTACGAGTGTTTGTTGATCCAAAGACACTTGTAGAGAAGGCTAGAAACGAGAAACGATGACTTCTCGTACAGAAACTGTGACTCAACCACAAACTGGTATCAACTTTGAGGACCAGATCCGTGGATACAGGACAGGACAGAGGCGGCGCTACAACTGGGCACGACAAGCAAGAAGGTTAAGGAGTAGGATCAGACGATCGCCTAGACAACCTGAGACGTTGGAAACACAGATAGACCCCCAGGCTGAGCTGAGCATGTCACTGCAGAGGCGTGCTAGTATAGTACCAGCTGAGGTATTGTACCACTCAAGACAGGATGATATCAATCACCGTGTCTACCAGCACTGGAGTGAAGAGGCTGTCAACTGCATTGACGGACAGCAGATCGATAGAACACTGGTTACGATGGAGAGTTATAGTACCTTAAACCGTGCAGGTTTTCGGTATATCCATGTTGGCGTGATCCAGGTAAGATTGCAGATCTTACATAGGCGGGAGATGGGAACGTTAGCCTATGTTGTCTTCAGAGATAACCGACTACTCGGTGATCAAGCAATCTTGGCACAGATGGAAGTTAGTCTGGCTGACGGTGGTCACCAGATGATTTATGTCGTACCAGACATAATGATGACGGTTGGAGACTTTTACAGAAACATCCAGATCTCCATACAGACTAGAGGGTACGGCAACTGGAGGAATGCAGAAGCAAATCTATTAGTAACAAGGGGACTAGTAGGAAGGTTATCCAACACCTCAAATGTGGGATTTGAATACTCCATCAGTAACGTTACAGATTATCTCACTAGTCATGGAGTAAGAGCTATTCCAGGGAAAAGGGTATCAGAATCGGAGCACCTTGGAAGAAGCTGGATACTTAGGGAGCCAGAAGTATCAATCATACAACAACCCACAATTGCAGACACAAGGAACCTACCAAACGGTTCAGTAAGTGTGAGGTTCGGAGGATATGAGGCAGCACCTGAAACCTCAAGGGCAAGGTTTGATGAAAACGACAACGAAATCATGGATGACGATGAGAGTCAGATAGCTGAGGAAGTCCATGTTATGATCATTGATAAAGACGATGAGGAATGGGAAGAGCTGAACAGGCAAATGATGGCTGACTTTGCAGAAGAAGAGCAAAAACACACAGAGCCAATCATTGCGGAGGAGGATATCTATCTCTTACCAGAGATGGAGGACTTGCTGAACATCTCAACATACGCAGATTTGAGCAATGGTAACAACCTAACAAGTGTAATTAATGGTTTTATCATTGTCAGTATCTATCACAATGGTAAAGACATGAAGATCCTGAAAGTCAGAAATGACACGAAGGAGATCAAGTTGATCAGCAAAGGAGATATCATTGGACAAGGTAAAGTCCAACAGGAGGAAATTCACTTTACTGAGGAAGAAGCTCGGGCGGAGCTTAAGAAGCTAATTGCAGGAGAAGAAGTACATATGGAGGCAGAATCTTCGGTACAGTCCGGATCTTATAGATTACCAACGGACGCTACCATGGGACCACCAATTTATCCACCTGCAAGGCAAAGGTTTGATGGACCATCTACATCTTCTATTCCGATGGATCCACCGGTATATAGAGCACCACCAAAGGCAAAGGTTCCAGATTATCAGAACTGGTGGAACCTCCCAACTGCACAAATAAACGGAGGCGCAATGTTCATAATCCCAGCAGATTTCAGCAAATTTGATGATGTTTTTATGCGATGGGAGAGCATTACAAAGAACGTGGTGGCACTACAAAACTTCTCAGACAACAAAGACAAGGCGGAGTTCATTGAGAACTTGCTAGGAGAAACAGAGAAGTTAGCATGGATACAATGGCGAAGTATCTATGAGGAGGAATACCAGACCCTTATTGGTACGATGGATGGAAGGTCTGGAACACAGAACATGTTATCACAGATTAGAAGGATCTTTACATTGGAGGACCCATATCAGGGCTCTACAATGAGTCAAGATCAGGCGTACAAAGACTTAGAGCGCTTAACCTGTACAGATGTCAAGCACATTCTGGAGTACCTAAGGCAGTTCATGTACCTTGCATCAAAGACGGGACGATTGTTTACATCATCAGAGCTGTCTTCAAAACTGTTCGTAAAGATGCCAGGAGACTTGGGGAAACGAATAGAAGACTCATTCAAGGCTAAGTACCCAGGTAACACGGTTGGGGTATTTCCTCGTATTGTCTTTTCATTTAAATACTTGGAAAACCAGTGCAAGGAGGCATCATTCCAGAGAAGCCTGAAGAGCCTAGAATTCTGCAAGCAAATGCCCATCCCAGGGTATTACGGAACTGATAAGAAGCGCCTAGGTATCAGGAAGGCTACACATTACAAAGGAAAGCCGCATAGCACGCACGTAAAGATAGAGAAGCACAAACATTTGAGGACGAAGAAGTGTAAGTGCTACCTTTGTGGAGAAGAAGGTCATTTTGCAAGGGAGTGCAAGAATGACAACAGGAACATTCATAGACAGACTATGTACCAATCATTGGAGCTACCAAAGGATTTTGAGTTGGTATCTGCTGAGGAGAATGATTCAGGAGATGAGATATACAGTATGTCTGAAGGTGAAGATCCAACCACAATGTTCATGAATCTAACACCTTTAGCGCAGGTTGAAGACTGTCTCACTCTTGACTGGGAATATAAAGATGTCTATGAGTACCGACATTTTGGTACTTGTACATCTGACATCCAGCAACCACAAAAGCAACGAACAAAGGTCTATGAAGAGGGAGGAAATGGTCATGATAGAGCCTTTTATCGCTATTACGGACCACCAGATGGACGTGAAAACTGGCCGGAAACACCTATCCCTACGGGTTGGGGTAGTGACTTTGACTCTGACAGCGACACTAATGATACCGAGGATGAAGAGATCTACATGATGCAAGAAGAACAGTTGTTTAACGAACATTGGATTGGAAAACGTGGTGGATGGCAGCCCCTAATTAAACTCTCTGATATTGAGTTTAACTGTGTACATCAATGGCAGCACAACACCCAAGTTCGTGACTGTCCTGAACATTGCAGATGCTGTAACAAGGAGACTTCAGACAGATGCAGGATACAATGTGGATACTGCAAGATCACAGCCTGCAGTTTGTGTGCATTTAGTTACTTTGACATCAAGGTAACTCAAAGAAAGGAATTTGTTTCACCTTATTATGCTACACCATCTTTGTTAAAGGAAAACCAGGAGTACATTTCATGGTGTCAAGCGGAGCTAAACAAGACCGGTGAGGCAATGATGCACATTAGGAAGGAAAATGCAGCACAAAGCGAAGTCATCACAGCGCAGGAAGACATCATCAACAAACTCAAGGAGGAGAAGTTGGATAAAGAAAAGATTCTGAAGGAGCTCAAACAGGAGCTACAGCAGGAAAAGGAAAAGTTCTTACGGGAAATTGAAGAACAGAAAGAGCTTTTCAAAAGGCAGATTGAAGAGGAAAAGGCTAAGTTCCTTAGCCTAAAGCAAAAACAGACGGAGGAAGAAGAATGTCTTCTTGTAAAAGAGGAACCAGAAGAGCAAAAGGTTGAAGAAACATTGGCAATATCCGGAAAGCTGATCATCATAGAAGGACGCATTGAGATAGAAGGAGTTAAGCCCTTCACAGTTAAAGCTTTGTTGGATACAGGAGCATCATGTTGTAACATCAAGAAGGAATTTGTACCAATAAACGCGGTCGAACAATGCAACTATCCAGTCTTGATTCACGGCGTAAATTCAACCTTGGAAGTCAACCAAAAGCTGAAGCAGGGAAAGCTTATCATTGGAAGTCAGGAGTTCAGGTTACCTCATACCTACGTACTTCCTATGAACAAAAATTTGGTCACTGACATGCAGATGATCATTGGTTGCAACTTCATACGCTCACTACATGGTGGAGTAAGGATAGAAGGGAACGAAGTCACCTTCTACAAGTATCTTACAAAATTGGAGTCTATCAACCTTATCGAGGACGACAATTTTAGTAAGAATTTCTCTGAATATATGTTGCTTAATGATACTGGAACAGATGAGCTGCAAAATGAGCAGGAAAACTTGAGGATCAAGAAGGCAGTAGCTCACAAGCTACTTCAATTATCTGACATGGGATATATTGGTGAGGAACCTCTCAAACACTGGAGGAAGAACCAGGTGGAGTGCAAACTGGAGATCATCAATCCGCAGCTGAAGATAGAGGACAAGCCCTTGAAGCACATAACGCCTCAGATGCAAGAATCATTCAACAAGCAGGTGGACAGCTTGCTGAAACTTGGAGTTATTAGGCCCTCTAAAAGCCCACACAGGACAACGGCCTTTTTGGTAAAATCAGGCACAACAGTGGATCCAAAAACAGGCAAGGAGACAAAAGGCAAGGAAAGAATGGTATTTAATTACCAGAGGCTCAACGACAATACTGAGAAGGACCAATACCCACTACCAGGGATCAACACGATACTGCAACGGATTGGTAAAACTAAGATTTATTCTAAGTTTGACTTAAAATCTGGTTTCCATCAGGTTGCTATGGCAGAAGAATCAATTCCTTGGACTGCATTCACTATTCCTGGAAAAGGATTATTTGAATGGTTGGTCATGCCTTTTGGGCTGAAGAATGCCCCTTCAGTCTTTCAACGAAAAATGGATCTATGCTTTACAGGCCTTGAGGAATTTGTGGCTGTTTACATTGATGATGTTCTGATCTTCTCAAATTCAGAACAAGAGCACTTGGAACATTTGGGCCGATTCTTTGAAAGAGTCCAACAACATGGACTAGTCTTAAGCCCAACAAAGATGAAGATCGGGGTTCGCAAGGTAGACTTCCTTGGCACTGTTATTTCTAACGGTTTGCTACATATGCAAGAACATATTCTCAAGAAAATAGCAGCTTTTGGACCTGAGCAGTATAAGTCCAAGAAGGATTTGAGATCATGGCTAGGCCTCATCAACTATGCACGAAACCATATTCCTAATGTTGGAAGGATGCTAGGCCCAATATATGCGAAAACCAGCCCACGAGGAGAACCCAGGATGAATGCACAGGATTGGAAGATTATCCAGGACATCCAGGCCCAGATCTATCAATTGCCGACACTGGAAATTCCGGATAAGGATGCTGTCATAATCATCGAAACAGATGGGTGCATGACAGGCTGGGGCGCAATATGTAAGTGGAAGAAAAAGGAGAAAGATCCTAAAACAACGGAGAAGATTTGTGCGTACGCAAGTGGTCCCTACAATCCACTAAAGAGCACAATTGACGCCGAGATTTGTGCGGTCCTACACGCACTAGAGACCTTTAAGATATTCTATCTTAGCCAACCGACGATAATAATCCGGACTGACTGCCAAGCAATCATAAGCTTTTACAATAAAAGCTTTAATCATAAACCTTCGCGGCTAAGGTGGATACGTTTATCTGATTGGTTGACAGGAACTGGCGTAGGCTATAAATTCGAACATATTAAGGGTGAACAAAATAACCTAGCTGATCATTTATCAAGAAACCCTGAAATAGCCCTAACCAAGTTAGTCTCTACACTAATCTCCGAATGGCAGGATCTTCCAGAACCAATTTATCACTTACTCTCGGAAACCCTCAGCATGGGAGAGGAAACGCAAGCCTTGATGACCTCATATCTCAATACAAGGAGCAGGTCGAAAACCATCTCAAAGCATGTACTGAACCAAGGACAATGGATGAATTCATCGAATCAAGGTTCCAAATCAAGGACACGCAGTACGAATTGTACGCCAAAATGCGTGAAGAACTCACAAAGATACACTCAATTCTTGAATTCCACAGGGACGCAATTAGATCCCAGGCAACAGGGGATAATGCATGGGGAGACAATCTTCCCTACATCCAAAAGGAAATCAAAACCGCCTACTATCACCTCTGCGAATTAGGAGCTATCCTTCACAAAATAGCTGATGTTTCAATCTGAAGAAATGTCGCGGAAGCAATGGTACGGGCCCTACCATTCCACCAAATGGGGTCCACCACTATCCTTTGTTTTCTTAGTGCGGTGGTTGTGAAAACGCACTAACTTTCGCTTTTCTCAGTGCGCTTTGTGTGTCGTGCACTTATTGTATCTTACTTTTCATAGTGCGTATTGTGTGTAACGCACTAGTCTGTAATAATTTGCCGGTAGCAGGTTATCTCCTTATGACTATAAAAGGAGACCACTACTTCTTAGAGAAGGCATCCCAGAACCCAGAGCAATACTCTAAGTTCAATTGCTATCTCTCTAAGCTTAAGTGTGTTTGTTTGTTTGTAACGATATCGGTATTCATAAGTAGTCTACGTAGTAGCAGCTTATGGTATTGGTATTTTGTTATATTAAATAAGAATTTCCGCAAGTTTGTTTACTCTGAATCGTTATAGTTTACATGTTTTAATAGTAGCAACCCTATCTATTAGCGTGTAGACTTTGATCCAAAATTTTATTACGGGACCTTTT
| 42,218 |
KX276640.1
|
Cacao mild mosaic virus
|
Chingandu,N., Zia-Ur-Rehman,M., Sreenivasan,T.N., Surujdeo-Maharaj,S., Umaharan,P., Gutierrez,O.A., Brown,J.K., Guttierez,O.
|
University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
USA
|
2017-02-04
|
SCA6
|
Badnavirus tessellotheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,533 |
GenBank
| 1 |
Trinidad and Tobago
|
Trinidad and Tobago
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2015-07-13
| null | null |
Cacao mild mosaic virus isolate SCA6, complete genome
|
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| 78,313 |
MH785297.1
|
Cacao red vein-banding virus
|
Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
USA
|
2019-04-20
|
NIG1
|
Cacao red vein-banding virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,839 |
GenBank
| 1 |
Nigeria
|
Nigeria
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2017-03-18
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Cacao red vein-banding virus isolate NIG1, complete genome
|
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| 63,184 |
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|
Cacao red vein-banding virus
|
Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
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2019-04-20
|
NIG7
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Cacao red vein-banding virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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| 1 |
Nigeria
|
Nigeria
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2017-03-18
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Cacao red vein-banding virus isolate NIG7, complete genome
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| 63,185 |
MH785299.1
|
Cacao red vein-banding virus
|
Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
USA
|
2019-04-20
|
NIG9
|
Cacao red vein-banding virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,890 |
GenBank
| 1 |
Nigeria
|
Nigeria
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2017-03-18
| null | null |
Cacao red vein-banding virus isolate NIG9, complete genome
|
TGGTATCAGAGCGAGGTTTAATTATGTCTAGCTAAACCTATAGCCTAGGTCTAGGGATAGAGTGAGGCAGCCATTTGAATTCAAATAGTACTTGTTGGTACTATTACCCTAAACCATTAGAGAATAAACTATTCTTGCTGTAAAAGACGTAACCCAGTGAAACAAGAGAGGGAGTAACTAGGGGAGAAGGTGAACAGTAGAAGAGTTTATGTCTAGTCGTTGGGAAAATAGTATCATTGAGTGGTATGAGAAGTCACATACTGCCAACCTCGAATACCTAGATCTAGCCTCTACCGTCAAAGTTAGCACAAACCAGTTAGCACATAACCTTGCAGTCCTCTTTGATAGAGTTAACCTAGGAAACCGTGTCTTCATTAAGAACCTTAAGCAAATCCAAGAATCCTTACTAGAAGTAAACAGTAGAATCGAGTCTGTTGAAACTAGTGTTAAGAAATTAACCAAACAGTTTCGAGAAAACAAACCTCTTTCCGAGTCAGAGGTAAAGCATCTCGTCTCCGAGATTGCTAAACAGCCTAAAATTGTTGAGAAACAAGCCTTAAAGATCTCTCAACAGTTAGAGCAAAAACTTGAGAGAGTTGAGAAACTACTTGGAAAGCTGAATCAGTGGGTTGGTCAATGACCGACAGCCGTTCTTACGAACAAGCTTTAAAGGAAGCAGAGAAGACTGATCCACCAGCCATCGGGCTAACAACATCCAGTGGAGTCACAGCAACACAAGGTTTCAAAACCTTAATCAAACAAAACAACGTCCAGATCTGCTTACTTGCTCAGATTGCAGATAGGCTTGAGGAGCTAGCCTTCGATCAGAAAAAGGCCAGGCAAGAAAAAGCTAAAGAGGTCACTGTCCCAGAAGATCTCATCACAAAACTACAGAACCTATCACTAAAGGACGAGGAAAAACCTACACCTTCCAAGAAAAGAGAAGGAAAAGGCATCTTGTACGGTTTCAAAGACCCGTATAAGATTCTCGCTGCTGAGAAAGCTAAACTTCCTACCCAAAAGAAAGAGATCCAGAAGAAAGATGAGTCGAGCTCGGACAATAACTGAAAACCCGAGTGTAACGAACCAGGAAAGGCAAAGAGAAGGCCCTCTCTTCGAAGATCAAATCAGAGACTACAGAAGGAGTCAAAGGAGGATCTTTAACCTCCGGCGCAACGCAAGAAGATTGCGAAGGCAGATGATAGGGACAAGGTACCAAGATACCTTAGAACAAGAAATTGATCCCCAGACAACCTTGAGGTTATCAATGCAAGAACGGGCAAGATTAGTCCCTGCCGAGGTACTGTATCGATCAAGAAGAGACACTGTTCATCATCGTGTCTACACACACAGATCGGAGGAATCTATCCTCTGTGTCAATGGAAACCAGATCGACAGAGCCTTCATACAACCAGAGAGTCTAGAACAGTTACAAAGGACGGGAATGGCCTTTGTACACATTGGTATACTCCAAGTTAGGGTGCAGATCCTGCACAGACAGGAAGAAGGAACAATGGCCCTAATAGTGTTCAGGGATAACCGTTGGAGTGGTGACCAGGCGATCTTTGCGCAAATGGAAGTTGACCTGACAAAAGGAAGCCAGTTAGTGTTTGTAATACCAGACACTATGATGACAATTGGAGATTTTGCCAGAAATGTACAACTCTCTATCCTTACCAGAGGATATGACAACTGGCAAAACGGTGAAGCAAACCTGTTAATCACAAGAAGTATGACAGGGAGACTATCCAACACTCCCAATGTTGCGTTTGCTTACCAGATAGAAAGTGCTACAGACTATCTAGCCAGCCATGGTGTAAGAGCCATAGCAGGAAAAAGGTTTGACCTGCAAAGACTGCGAAGCCAACAGTGGATACTAAGACCTCCACAAGTGGACATAACCCCCATGCAACCACGGGCGGTCGAAACAAGGAATTTGGTTGATGGAAGCATCTCAATCAGATTTCATGATTACGAAGCAGCACCATCGACATCAAGGCCAACCTACAATGAACAAGACGAAGAAGTTGAGTCAGATGAGGAAGCAGAACTGAGGGAACATACCGTTGCAGTCTGGATTGGACCAGAGGAAGCCCCAGATGCAACTGGCAGAAGAAAAGTTTGGGAAGAATCTGCAAATGGAAATGGAAGATTCTTCAGATACTATACACCCCCTCCAGAAAACACTGAACAAATAGTTGCCACAGGGTGGGATGATGAACCACCAGTTTGGGATACATACCCAGATGATGAGTATGAGGATGAAGATGATCCCAACACCTACATGGTAAGACTGCAAAAAGAAGAAGACGAGTGGCATGCAGTAATACAGGAAGAATTAGCAGCTGGGTGGAAGGAGGAACTTGAATACCCGATGAAGAAACCGCTAACAGGAAAGAAACTGCAAACGGAAACTATCCTGTCAGAAGTGGTGGATTATAATCCGCCAAGCGACACCTTAATGACACCTGTTGGATACCCGCCAGCCTCATCAACAAATCCACAGGCACCTGTTAGACCTCCACTGTTCGAGGGACAATCATCACGTGTGCCTAAGTTCAAAAAGGAAAACTATTCAGAATGGTGGCAGTTACCGTCATCACAAAGCACAACAGGAGCACTGTTCGTAATGCCTAAACAGATAGGCCTGTTCCACGACGTTTTCTCCAGATGGGAGTCAATAACAAAGAACTACGTGGCAGCACAAGGCTTCACCGACCCTGCTGAAAAGGTCGAATTCATGGAGAACCTGCTAGGAGAAACAGAAAAGCTAACGTGGATACAATGGCGAATGAACTATGAAGCAGAATACCAACAGCTTATTACACAAGCTGACGGAAGGCAAGGAACACAGAATGTCCTCTCACAGATAAAGAGGATCTTTTCACTTGAAGATCCAGCCTCAGGATCTACAAAGGTACAAGACGCTGCTTACAGAGACTTAGAAAGGTTAACATGTCATAATATTAAGGATATTGTTCAATTCCTTAATGATTATGGAAGACTAGCAGCAAAATCCGGAAGAATGTTCTTAGGAACAGAGCTAAGTGAAAAGCTGTGGATGAAAATGCCCCCGGAGCTAGGGCATAGGATGAGAGATGCATTCCAAAAAGAATATTCCGGGAACGAAGTAGGAGTATTTCCAAGAATACTCTTTGCATACAAATACCTGGAACAAGAATGCAAAGACGCAGCATTCAAAAGAAGCCTAAAGTCTTTATCTTTCTGCAAAGAGATGCCTATTACAGGATACTATGATAAAAGTCCTAAATACGGCATGAGAAGATCGAAGACCTATAGAGGAAAGCCCCATGAGACACACGCGCGCGTGGAGAAGAGGAAGCATCTAATCAGAAATAAGAAGTGCAAATGCTACCTATGTGGAGATGAAGGTCACTTTGCACGAGAATGTCCAAATACAAAGAGAGATGTTAAACGCGTGGCAATCTTTGAAGGAATTGATCTACCAGAAGGCTACGATATAATCTCTGTCGAAGAAGGAGAAGCAGAATCTGATGCTATTTATAGCATTTCAGAAAATGAAGATGAAGAACTTCAAGAGGAAGTAGTTAAGACAGAGAAAGTCTTCATGTTTCGTGAAGAAGATCAAACCTATTGGTTGGGGAAAAAGAACCATTGGACAGCAATGGTCAAAGTCTCATCTCAGCAATACAACTGCCTACATCAGTGGGAACACAACCAAGAAATTACACAAGTAGCTTACCTCAACTGCTACTTCTGTAAGCAACCTACCCACATAAGGAGTCGGATACACTGCAGTACCTGCACACTTACAGCATGCTTCATGTGTGCCCCAATTTACTGCAACACAACAGTTCAACCTACTCCTAAACCAGCCATACCATACAACCCTAATACCCTTCTGCAACAACAACAAGGGTATATTCAATGGCTCGAGGCAGAAAACAAGAGACTTGTGGAAACTGTAGAGCTCTATAAGCAAGAGATTGCAGAACTCAGACTGGAAAAAGAATTAGAGCAATCACGAAGAGAGCTTGAAGCAAAAACGCCCAATAAACCTCATGGCAAAGGCATCCAAATCAAGGAAGACGATGAACAATCAGCTGACGATGAACAATTAGCCTACCTAGAGGAAGACACTATTGTACGTATCATTGGGCATGGCGCAGAAGAACAACAGGTAACTAAACCTGTTAAAAAGGGGAACATGTTATATAACATGGACGTGGTACTGATGATCCCAGAAGTCGGGAGACCAATCAAAGTCAAGGCTATCCTCGACACAGGAGCAACCACCTGTTGCATCAACATAGCATCAGTACCAGCAAAGGCGATTGAGCAGAACACCTTCATGGTGCACTTCAAAGGTATTAACTCATCTCAATCAGTCGATAAAAAGTTAAAGTATGGCAAGATGATGATCAGTAACCATCAGTTCAGAATTCCTTATTGCTATGCTTTTCCAATATCCCTCGGAGATGGGATAGAGATGATACTGGGATGTAACTTCATCCGCGGTATGTATGGTGGTCTACGTATCGAAGGCAATACAGTCACTTTTTACAAAAATGTGACTACTATTCAGACCAGACTAGCAGCCCTAGCAGTTGGTGGAACAACCGCTTCTGAAGCGGGTGGGGAGGATAACAATTCTTCCGATTTTTCAGATCCAGACCAAGATCAAGAAGTCCAAGAATTTTTCGATCCGGAAATCCACCACCACATCATGACCATTGGAGTAACCCAAACCCAGAAAGCCCAAATTGACCCAATGTTGGAAAAGATTCTGACCCAGCTCAAGGAACAAGGCTATATCGGGGACAACCCTATGAAGCATTGGGCCAAGAATAAGATTGTCTGCAGACTTGAGATCAAGAATCCAGATCTAGTCATAGAAGATAAACCCATCAAGCACCTGACCCCTGCGATGGAGCAACAATTCAAAAGGCATATCCAGGCCTTACTTGACATTGGGGTTATCAGGCCCAGTAAATCCAAGCATAGGACGACTGCTTTCA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| 63,186 |
MH785300.1
|
Cacao red vein-banding virus
|
Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
USA
|
2019-04-20
|
NIG10
|
Cacao red vein-banding virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,846 |
GenBank
| 1 |
Nigeria
|
Nigeria
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
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2017-03-18
| null | null |
Cacao red vein-banding virus isolate NIG10, complete genome
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| 63,187 |
MH785301.1
|
Cacao red vein-banding virus
|
Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
USA
|
2019-04-20
|
NIG12
|
Cacao red vein-banding virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,885 |
GenBank
| 1 |
Nigeria
|
Nigeria
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2017-03-18
| null | null |
Cacao red vein-banding virus isolate NIG12, complete genome
|
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Cacao red vein-banding virus
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Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, The School of Plant Sciences
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2019-04-20
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NIG13
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Cacao red vein-banding virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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GenBank
| 1 |
Nigeria
|
Nigeria
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2017-03-18
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Cacao red vein-banding virus isolate NIG13, complete genome
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| 63,189 |
MH785303.1
|
Cacao red vein-banding virus
|
Chingandu,N., Dongo,L., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
USA
|
2019-04-20
|
NIG16
|
Cacao red vein-banding virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,852 |
GenBank
| 1 |
Nigeria
|
Nigeria
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2017-03-18
| null | null |
Cacao red vein-banding virus isolate NIG16, complete genome
|
TGGTATCAGAGCCAGATTTAAGTTATGTCTAGCTAAATCCATTGCCTAGATTTAGGGAAAGGGGTTTGGCAGTTATTCAAATAGTACTCATTGTTACTCTAGCCTAACCATTAGGAAAGACCTTTTTTTCTGTAAAAGACGTAACCCAGTGAAATAAGAGGGAGTAACTAGGGGAGAAGGTGAATAGAAAGAGGGTTTATGTCTAGTCGTTGGGAAAAGAGTATCCATGAGTGGTATGAGAAGTCACATACTGCTAACCTTGAGTACCTAGATCTAGCCTCCACCTCTAAAGTTAGCACAAACCAGTTAGCACATAACCTTGCAGTTATCTTTGATAGAATCAACCTAGGAAACCGTGTTTTTATCAAAAACCTTAAGCAAATTCAGGAATCCCTATTAGAAGCAAACAGTAGAATAGAGACTGTTGAAACCAGAGTTAGTAAGCTAGTCAAACAGTTCAGAGAAAACAAACCTCTATCCGAGTCAGAGGTAAAGCATCTCGTCTCCGAGATTGCTAAACAACCCAAAATTGTGGAAAAACAAGCTTTAGAAATATCACAACAGTTGGAACAAAAACTCGAAAGAGTTGAAAAACTCCTTGGAAAACTGGATCAGTGGGTCGGTCAATGACTGAAGAGAGCCGATCTTACCAACAAGCATTAAAAGAAGCAGAGAAGTCAGATCCACCAGCCGTTGGATTAACAACATCCAGTGGAGTAACAGCAACCCAAGGTTTCAGAATCTTGATTAAGCAGAACAACGTTCAGATCTGCTTACTTGCCCAGATCGCTGACAGACTTGAGGAGCTAGCTTTCGACCAGAAAAAGGCCAGACAAGAAAAAGCTAAAGAGGTCACAGTTCCAGAGGACCTTATCACACAACTCCAGAACTTGTCACTAAAAGACGAGGGAAGATCTACACCAACAACCAAGAAGAGAGAAGGAAAAGGAATACTATACGGTTTCAAAGACCCGTATAAAATCCTTGCAGAAGAAAAGGCTAAACTCTCTACATCCAGGAAAGAGTCCAAGAAGGATGAGTCGAGCTCGGACAATCAGTGAAAACCCTGGCGTCACCAGTCAGGAAAGACAAAGGGAGGGTCCCTTATTTGAAGATCAAGTCCGTGACTACAGAAGAAATCAAAGGAGGATCTTTAACCTCCGGCGTAACGCAAGGAGATTACGCAGACACATGATGGGGACAAGGTATCAAGATACCTTAGAACAAGAAATTGACCCTCAGACAACCTTGAGGTTATCCATGCAAGAAAGAGCACGATTAGTCCCTGCAGAAGTACTGTACAGATCAAGAAGAGATACTGTTCACCACCGTGTTTATACACACAGATCGGAGGAATCTATCCTCTGTGTCAATGGAAACCAGATCGACAGAGCTTTCATACAACCAGAAAGCTTAGAACAACTACAAAGGACTGGGATGGCCTTTGTACACATTGGAATACTCCAAGTAAGAGTGCAGATCTTGCACAGGCAAGAGGAGGGAACAATGGCCCTCATCGTTTTCAGAGATAATCGATGGAGTGGTGACCAGTCGATCTTTGCGCAGATGGAAGTCGATCTAACCAAAGGAAGTCAGCTAGTGTTTGTCATACCAGACACTATGATGACAATTGGTGACTTCGCCCGAAATATACAACTATCTATCCTTACCAGAGGATATGATAACTGGCAAAATGGCGAGGCCAACCTGTTAATCACAAGAAGTATGACAGGGAGACTATCCAACACACCTAATGTTGCGTTTGCTTATCAAATCGCAAGTGCAACAGACTACCTGGCAAGCCATGGTGTAAGAGCTATAGCTGGAAAGAAATTCGACTTGCATAAGCTGCGAGGACAACAATGGATACTAAGGCCTCCACAGGCAGATATCACCCCTATGCAGCCCAGAACGGTCGAAACAAGGAATTTGATCGATGGCAGTATTTCAATCAGGTTCCATGATTATGAAGCAGCACCATCTACATCAAGACCAACCTACAATGAACAAGATGAAGAGGTTGAGTCAGATGAAGAATCTGAGCTAAGGGAACATATTATTGCAGTCTGGTTTGGACCAGAAGAACTCCCAGATGCAACTGGTAGAATTAAAGTGTGGGAAGAATCTATGAATGGAAATGGAAGGTTCTTCAGATACTATACACCCCCTCCAGAGAATAATACACAAATAGTAGCCACAGGATGGGATGATGATGAACCACCAATTTGGGATAAAAGTTCAGAAGATGAAGATGATCCCAACACCTACATGCTACAACTACAGAAAGAAGAAGATGAGTGGCAAGAAATTAAGGAGGAGATAGCAGCCGGATGGCAAGAGGATTTGGAGTATCCAGTCAAGAAACCGCTAACGGAGACGGTCTTATCAGAGGTGGTAGACTATAATCCGCCAGGCGATACACTAATGACACCTGTTGGATATCCACCGGCTTCAACAACAAAGTCACAAGTACCTGATAAACCACCACTGTTTGAAGGACAATCTTCACACGTGCCTAGATTCAAGAAAGACAACTATTCAGAATGGTGGCAGTTACCATCATCACAAGGCACAACTGGAGCTCTGTTCGTTATGCCTAAACAGATAGGCTTATTCCACGATGTCTTCTCCAGATGGGAATCAGTAACCAAGAACTACGTGGCAGCACAAGGTTTTACTGACCCTACCGAAAAAGTTGAGTTCATGGAAAATCTACTTGGAGAAACAGAAAAGCTGACGTGGATACAATGGCGAATGAATTATGAAGCAGAGTATCAACAGCTTATCACACAAGCTGATGGAAGGCAAGGAACCCAGAATATCCTCTCACAGATCAAGAGGGTCTTTTCACTAGAAGATCCAGCATCAGGGTCTACAAGAGTTCAAGACGCTGCATACAGAGACCTAGAAAGGTTAACTTGCCATAATATTAAGGATATTGTACAGTTCCTTAATGACTATGGTAGACTTGCAGCAAAATCTGGAAGGATGTTCCTCGGAACAGAATTAAGTGAGAAGCTTTGGATGAAGATGCCCCCCGAACTAGGGCATAGGATGAAGGAAGCATTCCACAAAGAATACTCCGGAAACGAAGTAGGAGTATTTCCAAGAATACTCTTTGCATATAAATACTTGGAACAAGAATGTAAAGATGCAGCCTTCAAAAGAAGTTTAAAGTCTCTGTCCTTTTGCAAAGACATGCCGATCACAGGGTACTACGATAGGGGTCCCAAATACGGCATACGGAGATCAAAGACATACAGAGGAAAGCCCCATGAGACACATGCACGCGTAGAGAAAAGAAAGCATTTAATAAGAAATAAGAAGTGTAAGTGTTACCTGTGTGGAGATGAAGGTCACTTTGCACGAGAATGTCCTAATTCAAAAAGGGATGTTAAACGAGTTGCGATCTTTGAAGGAATTGATCTACCTGAGGGCTATGATATAATCTCAGTGGAGGAAGGTGAAGCTGAGTCTGATGCTATTTATAGCATTTCAGAAAACGAAGATGAAGTACTTCCTGAAGAAGGAGTCAAGACAGAAAAGGTCTTTATGTTTCGAGAAGAAGACCAAACCTATTGGCTTGGAAGAAAGAACCATTGGACAGCGATGGTAAAAGTCTCAAGTCAACAATACAACTGCCTGCACCAGTGGGAACACAACCAGGAGATTACACAAGTAGCCTACCTCAAATGCTACTTCTGTAAGCAACAAACCCACATCAGGAGTCGGATACATTGCAGTACCTGTACACTCACAGCATGCTTTATGTGTGCTCCAGTATACTGCAATACCACAGTTCAACAAGCTCCTAAACAAGCTATACCATACAATCCCAATACTCTGCTACAACAGCAGCAAGGGTATATCCAATGGCTAGAGGCAGAAAACAAAAGACTTGCGGAGACGGTGGAACTACACAAACATGAAATTGCAGAGCTCAAGATGGAGAAAGAATTAGAATTATCCAGAAGAGAACTTGAAAGAGAAACTCCCAAAAAACCTCATGGTAAAGGCATCCAGATCAAAGAAGATGATGAACAGTCAGCCTACCTCGAAGAAGACACCATTGTACGTGTTATTGGACACGGTACAGAAGAGCAACAGGTATCTAAACCTGTGAAAAAGGGGAACATGTTATACAACATGGATGTGGTACTGATGATTCCGGAGGTTGGCAGGCCCATTAAAGTTAAAGCTATCTTAGATACAGGGGCAACTACTTGCTGTATCAATATAGCCTCAGTACCAGCAACGGCAATTGAGCAAAATACCTTCATGGTACAATTCAAAGGTATTAACTCCTCTCAATCTGTTGATAAAAAATTAAAGTATGGAAAGATGATGATCAGCAATCACCAGTTCAGAATTCCTTATTGCTATGCTTTTCCAATATCCCTTGGTGATGGGATAGAGATGATACTGGGATGTAATTTCATCCGTGGTATGTATGGCGGTCTACGTATTGAAGGCAACACAGTCACTTTCTACAAAAACGTGACTACTATCCAGACACGCCTTGCAGCTATAACAGTTGGTGGAACAACTGCTTCTGACGTGGGTGGGGAGGATAGCTACTTCTCCGATTCGGATCCTGATCAAGAACCAGCAACTCAGGAATTCTTTGATCCAGAAACCCACTATCAAATTATGGCCATTGGAGCAGCCCAGACTCAGAAAGCCCAACTGGACCCAAGACTAGAAAAGATTCTAGCCCAACTCAAGGAACAAGGCTACATTGGAGACAACCCTATGAAGCATTGGGCCAAGAACAAAGTAGTCTGCAAACTGGAAATAAAAAACCCGGACCTGGTCATAGAAGATAAGCCCATTAAGCACATGACCCCCACAATGGAGCAACAGTTCAAAAGGCACATCCAAGCCTTACTCAATATTGGGGTAATAAGGCCTAGTAAATCCAAACACAGGACGACTGCCTTCATCATACAATCGGGCACAACAGTCGATCCAGTAACAAAGAAGACCATTCATGGCAAGGA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| 63,190 |
MH029281.1
|
Cacao red vein-banding virus
|
Dongo,L., Chingandu,N., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
USA
|
2019-01-16
|
NIG5
|
Cacao red vein-banding virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,869 |
GenBank
| null |
Nigeria
|
Nigeria
|
Theobroma cacao
| null |
2017-02-01
| null | null |
Cacao red vein-banding virus isolate NIG5, complete genome
|
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| 65,714 |
MH029282.1
|
Cacao red vein-banding virus
|
Dongo,L., Chingandu,N., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, The School of Plant Sciences
|
USA
|
2019-01-16
|
NIG18
|
Cacao red vein-banding virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,820 |
GenBank
| null |
Nigeria
|
Nigeria
|
Theobroma cacao
| null |
2017-02-01
| null | null |
Cacao red vein-banding virus isolate NIG18, complete genome
|
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| 65,715 |
NC_038378.1
|
Cacao swollen shoot CD virus
|
Kouakou,K., Kebe,B.I., Kouassi,N., Ake,S., Cilas,C., Muller,E.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
|
CI152-09
|
Badnavirus alphainflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,203 |
RefSeq
| null |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
| null |
2009-01
| null |
PRJNA485481
|
Cacao swollen shoot CD virus isolate CI152-09, complete genome
|
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| 4,038 |
MN433935.1
|
Cacao swollen shoot CD virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
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2020-04-26
|
Buyo2
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Badnavirus alphainflatheobromae
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Badnavirus
|
Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 7,211 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
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Cacao swollen shoot CD virus isolate Buyo2, complete genome
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Cacao swollen shoot CD virus
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Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, School of Plant Sciences
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USA
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2020-04-26
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Kipi7a
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Badnavirus alphainflatheobromae
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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| 7,212 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
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Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot CD virus isolate Kipi7a, complete genome
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TGGTATCAGAGCAAGGTTAGAATCATGGTCATGTCCGGCTAAAACCTAAGGTTAGGGAAGGGGAAAGAGTGAGGCTACCGTTAGAGTTTAAACACCAGTCCCAAAATACTGTTCCGACATCCACTAGAAGTAAACCAAACCGTTGGAAGTTTGTTGTCTTAAAAGAAAAAGGCGTAACCCTAAAGAGTACCTAGAGAGAGGGAAGAGAGGGGAGAAGATGATCTTTTGAAGGCAAAAATCAAGACTATTCCTATTATGCTCTACAGTTGCAGCGAAAGCTGATCTTCTGTATCAGAACGGGAGAAAACTTGGTTGATGTCTAGTCGATGGGAGAATAGTATCCAAGAGTGGTATGAGAAGTCTCACACAGCCAATCTCGAGTACCTAGACCTAGCCTCTGTCAGTAAAGTGACCAACAACCAGATAGCTCATAACCTTGCAGTAACTTTTGATAGATTGAACTTAGGAAACCGTGTTTTCATCAAAAACCTAAAACAAATTCAAGAGTCTTTAGCTGAAACAAACACTAGGATTGACACCCTAGAAGTAGGCCTAAGAAGGCTAACCAAACAACTCAAAGAAAACAAACCTTTAACCGAGCAGGAAGTCCGTCGGTTAGTAGGAGAAATTGCACAGCAACCCAAGATCGTTGAGGAACAGGCCCTCAAGATCTCTCAAGAGCTTGAACAAAAGCTTGCAGAAGTTGAAAAACTTCTCCACAATCTTGGCCTTGTAATTGGTCAATGACTGATAGCCTCAGCTATCAACAAGCTCTCAAAGAAGCTGAGAAAGTTGACCCTCCAGCAGTCGGGTTAACAACTACTGAAGGAGTAACCGCACTCAACGGGTTGAGGACGGTGATAAAGCAGAACAACTTGCAGATCTGGCTACTGGCCGATATAGCAGACAAGTTAGCTGATCTTCTGACTGAGCAGAAGAAATCAAGGAAGGAAAAGGCGAAGGAAGTAGCCATCCCAGAAGACCTAATATCCAAACTCCAAGGATTATCCATCCAGGAGAGAGGAGACGAAAAGGTCACAAGAAAGAAGGAGACTAAAGGAAACCTCTACGGTTTCAAAGATCCTTACAAGATCCTAGCCGCAGAAGTAGCAAAGATCACTCCAAAGCCTCCTGCAAAAGAGAAAAAGGATGAGTCAAACCAGAGCTCATCAGATGCCTAGCGTCACCACCACGGTGAATGAACAGGGAGAAGGTCCTCTCTTTGAGGATCAAGTCAGAGATTACAGGAGAAGCCAAAGGCGTCTATTCAACTTGAGGAGAAAAGCCAGAAGAGCACAAAGTGCTTTAACAGGGTCCAGATCTAGACACCAAGAGACCCTTGAACAAGAAATAGACCCTCAGACTACTCTGAGACTGTCCATGCAAGAAAGGGCAAGGCTAGTACCAGCTGAGGTACTGTACAGATCAAGGAGAGACACAGTGCACCACCGTGTCTATACGCATAGATCGGAAGAATCTATCCTATGCGTCGGAGGAAGTCAAGTCGACAGGACGTTTATACAACCATCCAGTCTAGAAAGACTACAAAGGACGGGGATGTCCTTTATACATATTGGTATTCTGCAAGTCAGAATCCAGATCCTGCATCGACAAGAAGAAGGAACGATGGCCTTAGTGGTATTCCGTGACAATAGATGGGCCGGAGATCAAGCCATCTTTGCACAAATGGAAGTTGACCTAACCAAAGGTAGCCAATTGGTGTTCGTGGTACCTGATACCATGATGACAATTGGAGATTTTGCTAGAAACGTACAACTATCTATTCTAACAAGGGGATACGATAACTGGCAAAATGGAGAGGCCAATCTACTAGTAACCAGGAGCATGACAGGTAGACTGTCAAACACACCAAACGTAGCCTTTGCGTACCAAATAGCAAGCGCTACAGACTACTTGGCCAGTCATGGTGTTAAGGCAATAGCAGGAAAGAAGGTAAATCTGCAGCAACTAAGGAACCAACAATGGGTTCTACGACCTCCACAGGCAGATGTACTACCGATGCAGCCAAGATCAGTAGAAACAAGAAACCTGATAGATGGAAGTATATCCATCAGATTCCATGATTATGAGGTAGCTCCTTCAACATCAGGACCTCATTACAACGAAAATGATGAAGAAGTGGAATCAGAATCAGAGGCAGAAATCAGGGAGCATACAGTCGCAGTCTGGATAATTGGGGAAGAAGAATATCCAGATGAGTATGGAAGAACTAAAATCTGGGAAGAATCAAGCAATGGCAATGGACGATTCTTCAGATATTACACACCTCCACCAGTATCCAACGAACCCATTATCGCCACAGGATGGGATGATGATGAGGAAGATGATTGTGACTCAAGGTGGGATACTAGTCCAGAAAGTGAGGGTGAAGAACCAGACGAGCCTTTATGGGATGAAGAGGATAATGAAGAAGAAGAAGTACAGGATGAACCTGTATGGCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTATGACCCTAATGCATACATGGCATACTTGCAGAAAGAAGCAGATGACTGGACAGAAATTATTGCCAGTCTTAACCCAGAAATGGAGTACCCACAAAGAAGGGCAGCAGTAGCGGAGACTGTTTTCTCAGAAACAGTAGATTACACCCCACCAGGAGATACGTTGATGACACCAGTAGGATACCCTCCTGCTTCATCATCAAGATCAACGGTCACAACTCCTAGTAGGCCCCCGCTATACGAAGGAAGGATACCAAGTGCATCAAGGGTCCTTAGAAGAGATGACTACACAGAATGGTGGCAATTACCATCATCACAAGGGACCACAGGAGCACTGTTTGTGATGCCAAAACAGATTGGGCTATTTCATGATGTTTTCTCAAGATGGGAGTCCATTACAAAGAACTATGTTTCGGCCCAAGGCATTACTGACTCAACAGAAAAGATGGAGTTTATTGAAAATCTGTTAGGAGAAACAGAAAAACTTACCTGGATCCAATGGAGAATGAAGTATGAAGCTGAATATCAACAGCTGCTGACTCTAGCAGAAGGGAGGCAAGGAACTCAAAATATCCTGTCTCAAATAAAAAGAGTCTTCTCACTTGAAGACCCAGCTTCAGGATCCACTAGAATCCAAGACTCTGCTTACAGAGATTTGGAGAGATTGACATGCCACAATATAAAAGACATAGTCCAGTTTCTGAATGACTATGGAAGATTGGCAGCTAAGAGTGGAAGACTGTTCATTGGAACAGAGCTTAGTGAAAAACTCTGGATGAAGATGCCACCGGAGTTAGGCCACAGAATGAGAGAAGCTTTCCAGAGAGAGTATGAAGGCAATGAAGTAGGAGTATTCCCACGAATACTATTCGCCTATCGTTACCTTGAGCAAGAATGCAAGGATGCTGCTTTCAAAAGAAGCTTGAAGTCCCTGAGTTTTTGCAAAGATATGCCTATAACAGGCTATTATGACAAAAGCTCCAGATATGGAATGCGAAGATCCAAGACGTACAAAGGGAAGCCTCATGCATCTCATGCGAGGATTGAGAAGAGGAAACACCTGGTAAGAAACAAGAGGTGCAAATGTTATCTCTGTGGAGATGAAGGCCACTTCGCAAGGGAATGTCCCAATGACAAAAGAGATGTTAAAAGAGTGGCAATATTTGAAGGCATCAACCTCCCAGATAACTATGAGATAGTTTCAGTGGAAGAGGGAGAGGAAGACTCAGACGCTATCTATAGCTTGTCTGAAAATGAAGAAGAACTTCAGGATGAAGTACTTCATGAGAAAGTCTTCATGATGCGAGAAGGAGACCGATCCTATTGGTTGGGAAAAGCAAATCACTGGACAGCTATGGTCAAAGTTAGTTATCAACAGTATCACTGTCCACATCAGTGGGAGCACAACAAAGAAATTCCAATAATGGCCCTTATCAACTGCCATTTTTGTAAGCAGCCCACAAATCTTAGAGGAAGAGTGCACTGCCCAACATGTCAGCTCACCAGCTGCTATATGTGTGCACCAATCTACTGTGATGTCCAAGTCCAACAACAACCAAAGGCCCCTGTACCATTTAGCCCAAATGCATTGCTACAACAGCAGGCCGCATATATCCGCTGGCTCGAATCTGAAAATAAAAGGCTTAATGAGCTCGTGGAGTTCTACAAAAGGCTCTTGGACGGAGAATCCAAACTCCAACAGGAGTTGGAAGCTGACAGAAAGGAATTGGAAGCCTTGGAAGCTGACAGAAAGGAATTGGAAGCCCATGACAAAGGAAAAAGGGTCCAATTCACGGAAGAAGAAAAGGTCCAGCTCACTGAAGAGTTAGAAGAGACCTATATGGCCTATCTTGAAGAGGACACAACCACACGTGTCGTGGGTCATACAACAGAAGGACCTTCAGAAGTTAAGAAAGTGGTAAAGAAAAGCAACATGCTATATAACCTCGAGGTTATCCTGATCATACCTGAGGTAGGAAAACCACTAAAAGTCAAAGCGATATTGGATACAGGAGCAACTACATGCTGTATCAATATCAATTCTGTTCCAAAGGTGGCTATCGAACAGAATACATTCCTGGTGCAGTTCAGGGGAATCAACTCCACACAATCCGTTGATAAGAAGCTCCGTTACGGACGTATGACTATTAGCGGACATCAATTCAGAATTCCCTATTGCTATGCATTCCCATTATCTCTTGGCGACGGTATCGAAATGATACTTGGTTGCAATTTCATCAGAGGAATGTACGGTGGACTTAGGATTGAAGGCTCTACAATCACATTCTACAAGAATGTCACTACGATCCATACTAAGTTAGCCGCTGGAATGGTTGGTGGAACAACCTCTTTTTGTCCGGAGGAAGGAGGAAGCAGTAGTTGTCACCAATTTGAATTCGAAGAATCAGAAGTATTGGATGATGATGCAGAAATAGACTTCGAATCCCACCAACAGAT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| 51,741 |
MN433937.1
|
Cacao swollen shoot CD virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Kipi10a
|
Badnavirus alphainflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,173 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot CD virus isolate Kipi10a, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTAGAATCATGGTCATGTCCGGCTAAAACCTAAGGTTAGGGAAGGGGAAAGAGTGAGGCTACTGTTAGAGTTTAAACACCAGTCCCAAAATACTGTTCCGACATCCACTAGAAGTAAACCAAACCGTTGAAAGTTTGTTGTCTTAAAAGAAAAAGGCGTAACCCTAAAGAGTACCTAGAGAGAGGGAAGAGAGGGGAGAAGATGATCTTTTGAAGGCAAAAATCAAGACTATTCCTATTATGCTCTACAGTTGCAGCGAAAGCTGATCTTCTGTATCAGAACGGGAGAAAACTTGGTTGATGTCTAGTCGATGGGAGAATAGTATCCAAGAGTGGTATGAGAAGTCTCACACAGCCAATCTCGAGTACCTAGACCTAGCCTCTGTTAGTAAAGTGACCAACAACCAGATAGCTCATAACCTTGCAGTAACTTTTGATAGATTGAACTTAGGAAACCGTGTTTTCATCAAAAACCTAAAACAAATTCAAGAGTCTTTAGCTGAAACAAACACTAGGATTGACACCCTAGAAGTAGGCCTAAGAAGGCTAACCAAACAACTCAAAGAAAACAAACCTTTAACCGAGCAAGAAGTCCGTCGGTTAGTAGGAGAAATTGCACAGCAACCCAAGATCGTTGAGGAACAGGCCCTCAAGATCTCTCAAGAGCTTGAACAGAAGCTTGCAGAAGTTGAAAAACTTCTCCACAATCTTGGCCTTGTAATTGGTCAATGACTGATAGCCCCAGCTATCAACAAGCTCTCAAAGAAGCTGAGAAAGTTGATCCTCCAGCAGTCGGGTTAACAACTACTGAAGGAGTAACCGCACTCAACGGGTTGAGGACGGTGATAAAGCAGAACAACTTGCAGATCTGGCTACTGGCCGATATAGCAGACAAGTTAGCTGATCTTCTGACTGAGCAGAAGAAATCAAGGAAGGAAAAGGCGAAGGAAGTAGCCATCCCAGAAGACCTAATATCCAAACTCCAAGGATTATCCATCCAGGAGAGAGGAGACGAAAAGGTCACAAGAAAGAAGGAGACTAAAGGAAACCTCTACGGTTTCAAAGATCCTTACAAGATCCTAGCCGCAGAAGTAGCAAAGATCACTCCAAAGCCTCCTGCAAAAGAGAAAAAGGATGAGTCAAACCAGAGCTCATCAGATGCCTAGCGTCACCACCACGGTGAATGAACAGGGAGAAGGTCCTCTCTTTGAGGATCAAGTCAGAGATTACAGGAGAAGCCAAAGGCGTCTATTCAACTTGAGGAGAAAAGCCAGAAGAGCACAAAGTGCTTTAACAGGGTCCAGATCTAGACACCAAGAGACCCTTGAACAAGAAATAGACCCTCAGACTACTCTGAGACTGTCCATGCAAGAAAGGGCAAGACTAGTACCAGCTGAGGTACTGTACAGATCAAGGAGAGACACAGTGCACCACCGTGTCTATACGCATAGATCGGAAGAATCTATCCTATGCGTCGGAGGAAATCAAGTCGACAGAACGTTTATACAACCATCCAGTCTAGAAAGACTACAAAGGACGGGGATGTCCTTTATACATATTGGTATTCTGCAAGTCAGAATCCAGATCCTGCATCGACAAGAAGAAGGAACGATGGCCTTAGTGGTATTCCGTGACAATAGATGGGCCGGAGATCAAGCCATCTTTGCACAAATGGAAGTTGACCTAACCAAAGGTAGCCAATTGGTGTTCGTGGTACCTGATACCATGATGACTATTGGAGATTTTGCTAGAAACGTACAACTATCTATCCTAACAAGGGGATACGATAACTGGCAAAATGGAGAGGCCAATCTACTAGTAACCAGGAGCATGACAGGTAGACTGTCAAACACACCAAACGTAGCCTTTGCGTACCAAATAGCAAGCGCTACAGACTACTTGGCCAGTCATGGTGTTAAAGCAATAGCAGGAAAGAAGGTAAATCTGCAGCAACTAAGAAACCAACAATGGGTTCTACGACCCCCACAGGCAGATGTACTACCGATGCAGCCAAGATCAGTAGAAACAAGAAACCTGATAGATGGAAGTATATCCATCAGATTCCATGATTATGAGGTAGCTCCTTCAACATCAGGACCTCATTACAACGAAAATGATGAAGAAGTGGAATCAGAATCAGAGGCAGAAATCAGGGAGCATACAGTCGCAGTCTGGATAATTGGGGAAGAAGAATATCCAGATGAGTATGGAAGAACTAAAATCTGGGAAGAATCAAGCAATGGCAATGGACGATTCTTCAGATATTACACACCTCCACCAGTATCCAACGAACCCATTATCGCCACAGGATGGGATGATGATGAGGAAGATGATTGTGACTCAAGGTGGGATACTAGTCCAGAAAGTGAGGGTGAAGAACCAGACGAGCCTTTATGGGATGAAGAGGATGATGAAGAAGAAGAAGTACAGGATGAACCTGTATGGCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTATGACCCTAATGCATACATGGCATACTTGCAGAAAGAAGCAGATGACTGGACAGAAATTATTGCCAGTCTTAACCCAGAAATGGAGTACCCACAAAGAAGGGCAGCAGTAGCGGAGACTGTTTTCTCAGAAACAGTAGATTACACCCCACCAGGAGATACGTTGATGACACCAGTAGGATACCCTCCTGCTTCATCATCAAGATCAACGGTCACAACTCCTAGTAGGCCCCCGCTATACGAAGGAAGGATACCAAGTGCATCAAGGGTCCTTAGAAGAGATGACTACACAGAATGGTGGCAATTACCATCATCACAAGGGACCACAGGAGCACTGTTTGTGATGCCAAAACAGATTGGGCTATTTCATGATGTTTTCTCAAGATGGGAGTCCATTACAAAGAACTATGTTTCGGCCCAAGGCATTACTGACCCAACAGAAAAGATGGAGTTTATTGAAAATCTGTTGGGAGAAACAGAAAAACTTACCTGGATCCAATGGAGAATGAAGTATGAAGCTGAATATCAACAGCTGCTGACTCTAGCAGAAGGGAGGCAAGGAACTCAAAATATCCTGTCTCAAATAAAAAGAGTCTTCTCACTTGAAGACCCAGCTTCAGGATCCACTAGAATCCAAGACTCTGCTTACAGAGATTTGGAGAGATTGACATGCCACAATATAAAAGACATAGTCCAGTTTCTGAATGACTATGGAAGATTGGCAGCTAAGAGTGGAAGACTGTTCATTGGAACAGAGCTTAGTGAAAAACTCTGGATGAAGATGCCACCGGAGTTAGGCCACAGAATGAGAGAAGCTTTCCAGAGGGAGTATGAAGGCAATGAAGTAGGAGTATTCCCACGAATACTATTCGCCTATCGTTACCTTGAGCAAGAATGCAAGGATGCTGCTTTCAAAAGAAGTTTGAAGTCCCTGAGTTTTTGCAAAGATATGCCTATAACAGGCTATTATGACAAAAGCTCCAGATATGGAATGCGAAGATCCAAGACGTACAAAGGGAAGCCTCATGCATCTCATGCGAGGATTGAGAAGAGGAAACACCTGGTAAGAAACAAGAGGTGCAAATGTTATCTCTGTGGAGATGAAGGCCACTTCGCAAGGGAATGTCCCAATAACAAAAGGGATGTTAAAAGAGTGGCAATATTTGAAGGCATTAACCTCCCAGATAACTATGAGATAGTTTCAGTGGAAGAGGGAGAGGAAGACTCAGACGCTATCTATAGCTTGTCTGAAAATGAAGAAGAACTTCAGGATGAAGTACTTCATGAGAAAGTCTTCATGATGCGAGAAGGAGACCGATCCTATTGGTTGGGAAAAGCAAATCACTGGACAGCTATGGTCAAAGTTAGTTATCAACAGTATCACTGTCCACATCAGTGGGAGCACAACAAAGAAATTCCAATAATGGCCCTTATCAACTGCCATTTTTGTAAGCAGCCCACAAATCTTAGAGGAAGAGTGCACTGCCCAACATGTCAGCTCACCAGCTGCTATATGTGTGCACCAATCTACTGTGATGTCCAAGTCCAACAACAACCAAAGGCCCCTGTACCATTTAGCCCAAATGCATTGCTACAACAGCAGGCCGCATATATCCGCTGGCTCGAATCTGAAAATAAAAGGCTTAATGAGCTCGTGGAGTTCTACAAAAGGCTCTTGGACGGAGGATCCAAACTCCAACAGGAGTTGGAAGCTGACAGAAAGGAATTGGAAGCTTTGGAAGCTGACAGAAAGGAATTGGAAGCCCATGACAAAGGAAAAAGGGTCCAATTCACGGAAGAAGAAAAGGTCCAGCTCACTGAAGAGTTAGAAGAGACCTATATGGCCTATCTTGAAGAGGACACAACCACACGTGTCGTGGGTCATACAACAGAAGGACCTTCAGAAGTTAAGAAAGTGGTAAAGAAAAGCAACATGCTATATAACCTCGAGGTTATCCTGATCATACCTGAGGTAGGAAAACCACTAAAAGTCAAAGCGATATTGGATACAGGAGCAACTACATGCTGTATCAATATCAATTCTGTTCCGAAGGAGGCTATCGAACAGAATACATTCCTGGTGCAGTTCAGGGGAATCAACTCCACACAATCCGTTGATAAGAAGCTCCGTTACGGACGTATGACTATTAGCGGACATCAATTCAGAATTCCCTATTGCTATGCATTCCCATTATCTCTCGGCGACGGTATCGAAATGATACTTGGTTGCAATTTCATCAGAGGAATGTACGGTGGACTTAGGATCGAAGGCTCTACAATTACATTCTACAAGAATGTCACTACAATCCACACTAAGTTAGCCGCTGGAATGGTTGGTGGAACAACCTCTTTTTGTCCGGAGGAAGGAGGAAGCAGTAGTTGTCACAAATTTGAATTCGAAGAATCAGAAGTATTGGATGATGATGCAGAAATAGACTTCGAATCCCACCAACAGATCATAAGCCATGCAGTAACACAAGTTACAGCACCAAG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| 51,742 |
MF642718.1
|
Cacao swollen shoot CD virus
|
Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A.
|
CIRAD, UMR BGPI
|
France
|
2017-12-09
|
CIDivo-15
|
Badnavirus alphainflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,205 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2015
| null | null |
Cacao swollen shoot CD virus isolate CIDivo-15, complete genome
|
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| 73,309 |
JN606110.1
|
Cacao swollen shoot CD virus
|
Kouakou,K., Kebe,B.I., Kouassi,N., Ake,S., Cilas,C., Muller,E.
|
CIRAD, UMR BGPI
|
France
|
2012-06-30
|
CI152-09
|
Badnavirus alphainflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,203 |
GenBank
| null |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
| null |
2009-01
| null | null |
Cacao swollen shoot CD virus isolate CI152-09, complete genome
|
TGGTATCAGAGCAAGGTTTGAAAATGGTCATGTCCGGCTAAAACCCTAAGGTTAGGAAAAGGGAAAGAGTGAGGCTGTCGTTAGAGTTTAAACACCGGTCCTAAGATACTGTTCCGACCTCCACTAGAGAGAGACCAAACCCGTTGGAAGTTTGCTGTTTTAAAAGAAAAAGGCGTAACCCTAAAGAGTACCTAGAGAGAGGGAAGAAAGGGGAGAAGATGATCTTTTGAAAACAGAAAATCAAGACTATTCCCGTTATGCTCTACAGTTGCAGCGAAAGCTGATCTTCTGTATCAGAAAGGAAGAAAACTTGGTTAATGTCTAGCCGTTGGGAGAATAGTATCCAAGAATGGTATGAAAAGTCTCACACAGCCAATCTCGAGTACCTAGACCTAGCCTCTGTTAGTAAAGTGACCAACAACCAGATTGCTCATAACCTTGCAGTAACCTTTGATAGGTTAAATTTAGGAAACCGTGTTTTCATCAAAAACCTAAAACAAATTCAAGAGTCTTTAGTTGAAGTAAACACTAGGATCGACACCCTAGAAGTAGGCTTAAGAAGGCTAACCAAACAGCTTAAAGAAAACAAACCTTTAACCGAGCCTGAAGTCCGTCGGTTAGTAGGAGAGATTGCACAGCAACCCAAGATCGTTGAGGAACAAGCTCTTAAGATCTCTCAGGAGCTTGAACAGAAGCTTGCAGAAGTTGAAAAACTTCTTCGCAATCTTGGCCTTGTAATTGGTCAATGACTGATAGCCCCAGCTATCAACAAGCTCTGAAGGAAGCTGAGAAGGTTGACCCACCAGCACTTGGGTTAACAACTACTGAAGGAGTAACCGCACTCAACGGGTTGAGGACGGTTATAAAGCAAAATAATTTGCAGATCTGCTTACTGGCAGATATAGCAGACAAGCTTGCTGATCTTCTGACTGAGCAGAAGAAATCAAGGAAGGAAAAGGCGAAGGAAGTCGCTATTCCAGAAGATCTCATATCCAAACTCCAAGGATTATCCATCCAGGAGAGAGGAGACGAGAAAGTAACAAGAAGAAAGGAGACTAAAGGAAACCTCTACGGTTTCAAAGATCCTTACAAGATCTTAGCAGCAGAAGTTGCAAAGATCACTCCAAAGCCTCCTACAACAGAGAAAGAGGATGAGTCAAACTAGAACTCATCAGATGCCTAGTGTCACCACTACGGTGAATGAACAAGGAGAAGGTCCTCTCTTTGAGGATCAAGTCAGAAATTACCGGAGAAACCAAAGACGTCTATTCAACTTAAGGAAAAAGGCCAGAAGAGCACAAAAGGCTTTAACAGGGTCCAGATCTAGACACCAAGAGACCCTTGAACAAGAAATAGACCCTCAGGTTACCCTGAGACTGTCCATGCAGGAAAGGGCACGACTAGTACCAGCTGAGGTACTGTACAGATCAAGGAGAGACACAGTGCACCACCGTGTCTATACGCATAGATCAGAGGAATCTATCCTATGCGTCGGAGGAAATCAAGTCGACAGGACGTTTATACAACCATCCAGTCTAGAGAGACTACAAAGAACGGGAATGTCCTTTATACATATTGGCATCCTGCAAGTTAGGATCCAGATCCTGCATCGACAAGAAGAAGGAACAATGGCCTTAGTGGTTTTCCGTGACAACAGATGGGCTGGAGATCAAGCCATCTTTGCACAAATGGAAGTTGACCTGACCAAAGGCAGCCAATTGGTGTTCGTGGTACCTGATACCATGATGACCATTGGAGATTTTGCTAGAAACGTGCAACTATCTATCCTAACAAGGGGATATGATAACTGGCAGAATGGAGAGGCCAATCTACTAGTAACCAGAAGCATGACAGGGAGACTGTCAAATACACCAAACGTAGCCTTCGCATGCCAGATAGCAAGTGCTACAGACTACCTGGCCAGTCACGGTGTGAAAGCAATAGCAGGGAAGAAAGTAAATCTGCAACAACTAAGAAACCAACAGTGGGTTCTACGACCCCCACAAGCAGATGTACTACCAATGCAACCAAGGTCAGTCGAGACAAGAAACCTGATTGATGGAAGCATATCCATCAGATTCCACGATTATGAGGTAGCTCCTTCAACATCAGGACCTCATTACAATGAAAATGACGAGGAAGTGGAATCAGAATCAGAGGCAGAGATCAGAGAGCATACAGTTGCAGTCTGGATAATTGGAGAAGAAGAATATCCAGATGATAATGGAAGAATTAAAGTCTGGGAAGAATCCAGTAATGGCAACGGAAGATTCTTCAGATATTACACACCTCCATCAGTATCCAATGAACCTATTATCGCCACAGGCTGGGACGATGATGAGGATGATGATTATGATTATGACCCAAGGTGGGATACTAATCTAGAAAGTGAAGGTGAAGAACCAGACGAGCCTCTGAGGAGTGAAGAGGATGAAGAAGAAGAAGTACAGGATGAACCTGTATGGCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGAGTATGACCCTAATACATACATGGCATACTTGCAGAAGGAAGAAGATGACTGGACAGAAATCATCGCCAGTCTTAACCCAGAAATGGAGTATCCACAGAGAAGGACAGAAGTAGCGGAGACTGTTTTCTCAGAAATAGTAGATTACACCCCACCAGGAGATACGTTGATGACACCAGTAGGATACCCTCCTGCTTCATCATCAAGATCAACGGTCACAACTCCTAGTAGACCACCGCTATACGAAGGAAGGATACCAAGTGCATCAAGGGTCCTCAGAAGAGATGACTACACAGAGTGGTGGCAACTGCCATCATCACAAGGGACCACAGGAGCACTGTTTGTGATGCCAAAGCAAATTGGGCTATTCCACGATGTTTTCTCAAGATGGGAGTCCATTACAAAGAACTATGTTTCGGCCCAAGGCATTACTGACCCAACAGAGAAAATGGAATTCATTGAAAATCTGCTTGGAGAAACGGAGAAACTTACCTGGATCCAATGGAGAATGAGGTATGAAGCTGAATATCAACAGCTGCTAACTTTAGCAGAAGGGAGACAAGGGACTCAGAATATTCTGTCTCAGATAAAGAGAGTCTTCTCACTTGAAGACCCAGCTTCAGGATCCACCAGAATCCAAGACTCTGCTTACAGAGATTTGGAAAGATTGACTTGCCACAACATCAAGGACATAGTCCAGTTTCTGAATGACTATGGAAGATTGGCAGCTAAAAGTGGAAGACTGTTCATTGGAACAGAGCTGAGTGAAAAACTTTGGATGAAGATGCCACCGGAGTTAGGTCACAGAATGAGGGAAGCGTTCCAGAAGGAATATGAAGGCAATGAAGTAGGAGTATTTCCTCGAATACTATTTGCCTATCGTTACCTGGAACAAGAATGCAAAGACGCTGCTTTCAAAAGAAGTTTGAAGTCCCTTAGCTTTTGCAAAGATATGCCTTTAACAGGTTATTATGACAAAAGCTCCAGATATGGGATGCGGAGATCCAAGACATACAAAGGAAAACCTCATGCGTCTCATGCAAGAATTGAAAAGAGAAAGCATCTAGTAAGAAACAAGAGGTGCAAGTGCTACCTCCGTGGAGATGAAGGCCATTTCGCAAGGGAATGTCCCAATAATAAAAGGGATGTTAAAAGAGTGGCAATATTTGAAGGCATCAACCTCCCAGATGACTATGAGATAGTTTCAGTGGAAGAGGGAGAGGAAGACTCAGACGCTATCTATAGCTTGTCTGAAAATGAAGAAGAACTTCAGGATGAAGTACTTCATGAAAAAGTCTTCATGATACGAGAAGGAGATCAATCCTATTGGATGGGAAAAGCAAATCACTGGACAGCTATGGTCAGAGTCAGTTATCAACAGTATCACTGTCCACATCAGTGGGAGCACAACAAAGAGATTCCAATAATGGCCCTTATCAACTGCCATTTTTGTAAGCAGCCCACAAATCTTAGAGGAAGAGTGCACTGCCCCACATGCCAGCTCACCAGCTGTTATATGTGTGCACCAATCTATTGTGATGTCCAAGTCCAACAACAGCCAAAGACCCCCATACCATTCAGCCCAAATGCATTGCTACAGCAGCAGGCCGCCTATATCCGTTGGCTCGAATCTGAAAATAAAAGACTTAATGAGCTCGTGGAATTCTACAAAAGGCTCTTGGACGGAGGATCCAGACTCCAACAGGAGTTGGAAGCTGATCAAAAAGAATTGGAGGAGTTGGAAGCTGATCGAAAAGAATTGGAGGCCCATGACAAAGGAAAAAGGGTCCAATTCACAGAAGAAGAAAAGGTCCAGCTCACCGAAGAATTAGAGGAAATCCATATGGCCTATCTTGAGGAGGACACAATCACACGTGTCGTGGGTCATACTACAGAAGGACCTTCAGAAGCCAAGAAAGTGGTGAAAAAGAGCAATATGCTATATAACCTCGAGGTTATCCTAATCATACCTGAGGTTGGAAAACCACTAAAAGTCAAAGCGATATTGGATACAGGAGCAACTACATGCTGTATCAATATCAATTCTGTTCCAAAGATGGCTATCGAACAGAATACATTCCTGGTGCAATTTCGGGGAATTAATTCTACACAATCCGTTGATAAGAAGCTCCGTTATGGACGAATGACTATTAGCGGACACCAATTCAGATTTCCCTATTGCTATGCATTCCCACTATCCCTTGGCGATGGTATCGAAATGATACTAGGTTGCAATTTTATCCGCGGAATGTACGGTGGACTTAGAATCGAAGGCTCTACAATCACATTCTACAAAAATGTCACTACGATCCAAACTAAGTTAGCCGCTGGAATGGTTGGTGGAACAACCTCTTTTTATCCGGGGGAAGGAGGAGGCAGTCACTTTGAATTCAAAGCCTCAGAAGAATCGGATGATGACGCGGAGATAGATTTCGAAATCCACCAGCAGATCATAAGCCATGCAGTAGCCCAAGCT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| 96,862 |
NC_043535.1
|
Cacao swollen shoot Ghana Q virus
|
Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-06-28
|
Gha40-15
|
Badnavirus epsiloninflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,102 |
RefSeq
| 1 |
Ghana
|
Ghana
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2015
| null |
PRJNA485481
|
Cacao swollen shoot Ghana Q virus isolate Gha40-15, complete genome
|
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France
|
2017-12-09
|
Gha2-15
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|
Caulimoviridae
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GenBank
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Ghana
|
Ghana
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Ghana
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Cacao swollen shoot Ghana Q virus isolate Gha34Q-15, complete genome
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CIRAD, UMR BGPI
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France
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2017-12-09
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Gha40-15
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Caulimoviridae
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Ghana
|
Ghana
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Cacao swollen shoot Ghana Q virus isolate Gha40-15, complete genome
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|
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|
Ghana
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Cacao swollen shoot Ghana Q virus isolate Gha64-99, complete genome
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|
Cacao swollen shoot Ghana Q virus
|
Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A.
|
CIRAD, UMR BGPI
|
France
|
2017-12-09
|
Gha53-15
|
Badnavirus epsiloninflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
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GenBank
| 1 |
Ghana
|
Ghana
|
Theobroma cacao
|
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|
2015
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Cacao swollen shoot Ghana Q virus isolate Gha53-15, complete genome
|
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|
Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-02-12
|
Gha53-15
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Cacao swollen shoot Ghana R virus
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Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
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RefSeq
| 1 |
Ghana
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Ghana
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Theobroma cacao
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2015
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Cacao swollen shoot Ghana R virus isolate Gha53-15, complete genome
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|
Cacao swollen shoot Ghana R virus
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Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A.
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CIRAD, UMR BGPI
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France
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2017-12-09
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Gha29-15
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Cacao swollen shoot Ghana R virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
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GenBank
| 1 |
Ghana
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Ghana
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Theobroma cacao
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2015
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Cacao swollen shoot Ghana R virus isolate Gha29-15, complete genome
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Gha34R-15
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Ghana
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Cacao swollen shoot Ghana R virus isolate Gha34R-15, complete genome
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|
Cacao swollen shoot Ghana R virus
|
Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A.
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CIRAD, UMR BGPI
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France
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2017-12-09
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Gha37-15
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Cacao swollen shoot Ghana R virus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
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GenBank
| 1 |
Ghana
|
Ghana
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2015
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Cacao swollen shoot Ghana R virus isolate Gha37-15, complete genome
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Cacao swollen shoot Ghana R virus isolate Gha39-15, complete genome
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| 73,324 |
MF642735.1
|
Cacao swollen shoot Ghana R virus
|
Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A.
|
CIRAD, UMR BGPI
|
France
|
2017-12-09
|
Gha54-15
|
Cacao swollen shoot Ghana R virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,990 |
GenBank
| 1 |
Ghana
|
Ghana
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2015
| null | null |
Cacao swollen shoot Ghana R virus isolate Gha54-15, complete genome
|
TTTGAGCTACAAAATCTGTAATAGCTTTGTAATACCTCTTTTGAAATATATTGTGAGAATTCCGCAATCATCTAGTTTTATCCATTTTCTAGGTGATTCTCACCGATCCTTACCTTCATTTCTTTTTGGTATCAGAGCTCCTAAAATGGAGTTCTAAATTTCTTTTCTAGCAATGGCTTGACGGGAATGAGGAGATTTTCCTAATTTTCTTTAAGAGAATCCAGACGACCAAAGTCTTGAAAAGATTAAGTTTATTGCAAAAGACGTACGTCGAAGTAAGACCCGGGAGGGGCAGCAGACAAGAAGGTGAGCAATAAGACTTAGTTGTATCAAGTACCAAGGGAATTGACGAAAAAGGGGGGGACTTCTTCTCTAACCTCGAGGAGCCAAAGCTAGAATTCTTACAATTATCAACAGTCTATATTTTCATGTCCGAGAGATTTGAGGAATCAATCATCCAATTTTACGAACGAGAAAGAATAGCCAACACACAGCTCTTAAACCTTTCTGAAGAACCCAAAGTCACAAACCGTGATCTAGCCAACAACCTTGATTTCAATCTTAAACACTTAATACTCTTATCTAGAGTATCTCTGAAAAATTATCATCAAATTATTCAAAACCAAGAAGCAATTACTAAGAAACTTGACAACCTTGAATTACAGGTTCAGGAACTCTCTAAGCGCAGTTCTTTGACGAAGAAGACGGTCCAGAACATCGTCACAGAGGTTTCGAAACAACCCAAGGAGATCGAGGAGCAAGCTTTGAATCTGATCTCAAAGCTCGAGGAGAAACTGGTACGAGTTGAGCATCTGGTGGAAAAGCTCAACAACTGGGTTGGTTGATGTCAGGGAATTCATATCAGGAAGCTTTCAGAAACGCAGCCGCTTACAAACCCACTGGTTTTCTGAAATCTGAGGAAGCAGGATCTGGGAGAGAACAATTACTGAGTTGTATTTCCCAACATAATCTTATTATACAACTCTTGGTTGATCTACACGACAAGGTAGATAATCTCTCAGCGGAGTTAAAGGTCTTAAGGAAAGAAAAGACCAAGGCGCAGAATCCGGAGGAGATCGAAGGGTTGATTAGTCAACTTAAAGGGTTGTCTATCGGTCCTAAGGAGAAAGTACCGGAGAAGAAAGGAAATCTCTACGCATTCAAGGATCCATACGTAATCCTTGAAGAGGTCAAGAGCAAGAAATGAACACCAGAACGGAGACTATGATGGAGACACCTGTCTCAGGAAGAAGGAATGAAGAAGCATCTGGCCCTTCATTCGATGATCAGATCAGATCATACAGAAACAATCAAAGACGGCGATACAATGTCCAGAGGAGTTTTCGAAGAATGAGAGGAAGGTTGACGGGACAACCTTACGAAAGAACGTTGGAGCAGGAGATAGATCCTCAAGCTACTTTGAGGATGTCTATGAGGGAAAGGGCTAGGTTAGTACCAGCTGAGGTACTATATCACAGTCGTGAAGACTCGGCACATCACAGAGTCTACAATCACAGATCTGAGGAGGCCCTAAGTTGCAGAGAGGGAGAGCAGATTGATAGGAATTTCATACAACCACAAAGTATGGAAAGCTTAAGGAGAAGTGGGTATAACTTTATCCACGTCGGGATCTTGCAAGTTCGCATACAAATCTTGCACAGACAAAGAGAAGGAACTATGGCTCTCGTGGTCTTCCGAGACACTAGATGGGAGGGAGATCGTTCTATATTCGCTACAATGGAAGTAGATCTCACCCGAGGCAGTCAGCTGGTTTATGCTATCCCAGACACAATGATGACCATCAATGACTTTTGCCAGCATGTACAAATCTCAATCCTCACCAGAGGATATGACCAATGGCAAGCAGGAGAAGCTAACCTACTGGTAACACGAGGAATGGTTGGACGTTTGTCTAATACATCTAACGTGGGTTTTGCTTACAGTATACAGGGAGTCACAGACTACCTTGCCAGTCATGGAGTACGTGCAATACAAGGTCGGGAATATAGCACTGCGGAAGTCCAAGGAAGAAATTGGACAATCAGACCAGCAAGGCCAATTGCAACAGCGATGCAGCCTAGTTCAGTACAGACGAGGAATCTCTTGGGAGGAGCTATCTCAATGAGATTTGGAAACTATGGTGTGGCCAGAGAAGCAGAACCTCCTAGATACAATTCTGATGACGAAGAAGATGAGGATGAAGCATCAATAACATCAGAACAACAGACAGTATTCTTGCTTATCCAGCAGGAAGCGCCACAGACACAATACATTCCAGGAGTTGGTCGCAGGCCAATTCATGAAAAATGGGGACCCCTTGGAGAAGACATCGGGAGGTTCCAATACTGGGTCAGATATGACCGTGATGAGGAGGAACAGCAACCTCAAGCACCAATCGTAGCCACTGGTTGGGGTGATGATTTCGATGATAATAACCCAGATCAACCAGACAATGATGATGATGCAGATGGTGATGATCAACCATGGTGGGATCAATGTGAAATGCATCAAACAGAAGCGGAGCAGCAAGAGATTGTTGCTGCAGGAGCGGAGGACGAAGAGTGGAGTGATTATCCATCTCTTCAAAACTTGAAACAAAAGGTGGGAAAGACCGCAACAAAGGAGATTGTTGCCGCCGAAAGCAGCTCAGTGACAGGAGCTTACAGACCACCAGACGATGTAGCCATGACCCCAGTTGGTTACCCTCCAGCAGGAGAAAGGAGTCAGTCGGTACCTATTTTCGAAGGCTATAACAGGCGTGGAAAATTTGTACGCGACGGAGGAAATGAAAACTGGCAACTTCCATCAGCTCAAGTGCAGCAGGGAGCAATCTTGGTCATTCCTCAAAATCTAGGGATGTTCCATGATGTGTATTCCAGATGGGAGTCAATAACTAAGAATGCCACTTCACAAATTAGCTTTATCTCTGGAGAAGAGAAGATAGATTTCATAGAAAATCTATTGGGCGAAAAGGAAAAGCTAACTTTCGTGGCCTGGAGAATGATGTACCAGGATGAATATCAGCAGCTGATTACATCCGCAGAAGGTAATCAAGGGATTCAGAACATCCTGTCCCAGATTCGCAGAATCTTTACATTGGAAGATCCAGCTACGGGATCAACCAAGCAGCAGGAGGATGCCTACAGAGACATTGAGAAACTAAACTGCAATGATATGAAAAATATTGTTCCATTTCTCAATGATTATTTTAGGCTTGCAGCAAAGACAGGACGAATGTACGTGAATGCAGAACTATCCGAGAAGCTATGGATGAAGCTTCCAGGCGAAGTAGGAAAGAGGATCAAAACGGCGTTTGACGCGAAATATCCGGGAGTAACCATTGGAGTGCCTCCTAGAATCCTGTTTACTTATCAGTACTTGCAGGATCAGTGCAAAGAAGCAGCGTTTGCAAGGAGCCTAAAATCTCTGGATTTTTGTAGAGATTTTCCAATACCGGGTTACTACAATAATAGGAGAGCGTCGTCCTCAAAGGGCAGAAGTTCAGTAAGGAGGAGTACGACTTACAAAGGAAAGCCGCATCAATCACATGCCAGGATTGATCGCACCAAATATCTGAGAAACAGAAAATGCAAATGCTTCCTTTGCGGAGAAGAAGGTCATTACTCACGTGAATGTCCTAATGACAAAAAGAGTACCAAACGGGTAGCAATGTGGGAGACAATTGAGCTACCTGACGGTTATGAGGTAGTCTCAGTAGATGAAGGAGACCAGCAATCTGATGGAATCTATAGCATTTCTGATGGAGACGATGAACGCCAAGATCACATCGATGAGGAATTGCTATGTGTCATAACTCATCAGAAGAAGGATTATTGGCTGGGTAAATCTGAAGGATACTTGCCGATGGTTGCAGTCTCAAAGGAACAATACAAATGCAATCACGCATGGAATGACAATCAGGAGATCCCAATTCCATATCTAAAGTGTCATTTTTGCAAGCAAGTACCGGATAGGAGAAGTAGATCACATTGTTCGCAATGTTTTCTAACAACATGTCTTATGTGTTCTCAACATTACACAGGAAGGCAGATCAAACCAGCGCCACCATTGGAGCCAAGGAAACTTCCTATACAACCTTCACTCATTCAACAGCAAGCTGAATACATATCTCAACTGGTAGCAGAAAATAAACAGCTTAAGCAGCAGATTGAGTACTGGAAGGAAAAGGCTCAGGGAAAAGCTAAGGTGCAGGAGGTTTCTACGCCTTTAACAATCAGAGAACCACAGGACGCAGCAAAAGTTGGTGGGGAAAGCTCTTCAGAACCAAGCTCTTCAGAACCGTTTCCAAAACCTTCAACGCAGGAAGAAGGTGAAATCCATATTGTAGCAGCTGGAGCAAAGACAAACAATCTCTACAATATGAGGATAATACTGGAGGTCCCTGGAGAGAAACCGATAGAAGTAAAAGCTATTCTGGATACTGGAGCGACAACGTGCTGTATTGACCTAGAGACAATTCCGGAAGGACTCTTAGAAGATAACACCTTCGTGGTCCATTTCAGTGGAATCAACTCTACATCGACATCCAGAAAGAAGCTGAAGAATGGTAGGATGAGAATTGGCGAAAACTCATTCAGAATACCATACACATATGCCTTCCCAATGAAGATAGCAGATGGAATACAGATGATCGTTGGCTGTAATTTCATCAGGAATATGCAAGGGGGACTGAGGATAGAAGGTAACACAATTACATTCTATAAATTCTTAACTTCTGTCCAGACAAGTACCATTGCAGCTGTCATTGAGGAAGAGGAGGTAGAGGAGACAGACTACCTAAGGTTGACAGAGATTCTGGCAGTTGAAACCATCCAGCAGGATAATCATTTCAGCAGCAGATTCAAAGGAGTCATAGAGGAGCTGAAACAGCAAGGTTTCATCGGGGAGAATCCTCTGCAACACTGGAGCAAAAACAGAGTCACATGTTATCTGGACATCAAAAATCCGGATCTCACTGTGGAGGACAAGCCACTAGACAA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| 73,326 |
NC_076048.1
|
Cacao swollen shoot Togo A virus
|
Muller,E., Sackey,S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
Wobe12
|
Badnavirus zetainflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,297 |
RefSeq
| 1 |
Togo:Litime
|
Togo
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
| null | null |
PRJNA485481
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Cacao swollen shoot Togo A virus complete genome
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| 410 |
NC_038379.1
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Cacao swollen shoot Togo A virus
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Duan,X., Di,D., Yu,Q., Zhang,A., Miao,H., Yang,Z.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
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2018-08-24
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Hebei
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Badnavirus zetainflatheobromae
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 13,221 |
RefSeq
| null |
China
|
China
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Triticum aestivum
| null |
2009-04
| null |
PRJNA485481
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Cacao swollen shoot Togo A virus isolate Hebei, complete genome
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| 4,039 |
MF642716.1
|
Cacao swollen shoot Togo A virus
|
Muller,E., Ravel,S., Agret,C., Abrokwah,F., Dzahini-Obiatey,H., Galyuon,I., Kouakou,K., Jeyaseelan,E.C., Allainguillaume,J., Wetten,A.
|
CIRAD, UMR BGPI
|
France
|
2017-12-09
|
Gha25-15
|
Badnavirus zetainflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,229 |
GenBank
| 1 |
Ghana
|
Ghana
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2015
| null | null |
Cacao swollen shoot Togo A virus isolate Gha25-15, complete genome
|
TGGTATCAGAGCAAGGTTTTAGAATGGTCATGTCCGGCTAAACACCAGTGTTAGGTTCGGGGAAAGAGGTCCAGAGTGTGTGAAGCTAGTATTACCCTAGTTCTCCATTCAAACAATGTCTGTTCCTTTGAAATCTAAGAGTGTGGAAATCACTTTAAAAGGAATTTTTGATTATCGTATGCTCTAGACTCGCCCTGTTATAACAACAGAGGATCTTGTCTATCAGAAAATAGTCAAAATAATTCCGGTGATCACTTATCTTAGAATAATAACATCAGGTATTGAGAAGCTAGTTCTTTTGTAAAAGACGTAACCCAGATGAGAGTACCCAGAGAGGGGGAAGACTTGGGGAAAAGGTGAACAAAAGGGAGAGTTTACTGTACCTGATTTTATAGGAAGAATTGTTATGTCCAGCCGTTGGGAGAATAGTATACAAGAGTGGTACGAGAAGTCACACACAGCAAACCTCGAGTACCTTGACCTAGCATCTACCAGTAAAGTGACCAACAACCAGTTAGCACACAACCTTGCAGTAACTTTTGACAGGATAAACCTAGGAAATAGAGTTTTCATTAAAAACCTAAAGCAAATTCAGGAGTCTATTCTTGAGTTGCATACCCGTATTGATACTACAGAAGTAACTTTGAGAAGGTTAACTAAGACCTTCAAAGAAAGCAAACCACTTACTGAGAGTGAAGTCCGTAGGTTGGTTGAAGAGATAGCTCAACAACCTAAGATCGTTGAGAAGCAGGCACTGGAAATTTCTCAACAGTTGGAACAAAAGCTTGAGAAAGTTGAAAAATTTCTTCATAAGCTTGACCAGTGGGTTGGTCAATGACCAACAGCCCAGCCTATCAAGAAGCCTTGAAAGAAGCAGAGAAAGTTGATCCACCTGCAGTTGGGTTAACTACCTCCACAGGAGTGACAGCAGTCCAAGGATTCAGGACTGTCATCAAACAGAACAACGTGCAAATCTGCTTACTAGCTGCCATAGCAGACAAGCTTGACGATCTTATTCAAGATCAGAAGAAGGCACGTAAGGAGAAAGCAAAAGAGGTCTCCATCCCTGAAGACCTAATCTCTAAACTCAAAGGATTATCCCTCCAGGAGTCAGGAGAGGAGAGAGTATCCAGAAGAGAAGAACCAAAAGGGAAGTTAGTGGTTTTCAAAGATCCCTACAAAATCTTGGCAGCTGAGAAATCCAAGATAAATCCCAAGATCTCTAAGAAGGATGAGTCAAGCACGACCTCCATACACGATTCCTAGTGTAACTACCACTAGTGAACAGGGGAGAGAAGGTCCTCTCTATGAGGATCAGATCAGAGATTACAGACGCGGACAAAGGCGAATCTTCAACCTGCGAAGACGAGCCAGAAGATTAAGAAGATCCATGACGGGATCTCGATACCAGGAGACACTAGAACAAGAGATAGATCCGCAGACAACACTGAGGCTCTCAATGCAAGAGAGAGCAAGATTAGTACCAGCTGAAGTACTATACAGATCCAGACGTGACACTGTGCACCATAGGGTTTACACCCACCGATCGGAGGAATCAGTCCTTTGCGTCGGAAATCAAATTGATAGGGCGTTCATCCAGCCCGAAAGTCTGGAACAACTACAGAGGACAGGAATGTCCTTCATCCATATCGGGATTCTTCAAGTAAGAATTCAGATATTGCACCGGCAGGAGGAAGGAACAATGGCACTAGTTGTCTTTAGAGACAACCGATGGACCGGTGACCAATCTATCTTTGCCCAGATGGAGATAGATCTGACAAAAGGCAGCCAATTGGTGTTTGTCATACCAGACACCATGATGACTATTGGAGATTTCGCAAGAAATGTTCAGCTGTCTATATTGACAAGGGGATATGAGAATTGGCAGAATGGAGAGGCCAATTTACTGATTACAAGAAGCATGACAGGAAGGCTATCTAACACACCAAATGTAGCCTTCGCGTATCAAATATCCAGCGCAACAGATTATTTGGCAAGCCATGGAGTAAAGGCTATTGCAGGAAAGAAACTCAACTTGCAACATTTGCGCAATCAACAATGGATATTACGACCACCTCAGACAGATATCACACCAATGCAACCACGGTCGGTCGAAACCAGAAACCTAGTTGATGGAAGCATTTCCATCAGGTTCCATGACTATGAGGCGGCCCCTTCTACTTCCACACCCCATTACAATGAAGAAGATGAAGAAGTAGAGTCAGAATCAGAGTCAGAAATAAGGGAGCACTTAGCCGCAGTATGGATAATAGGCGAGGAAGAAATAGCAGATCAGGATGGAAGAAGAAAAGTATGGGAAGAATCTGCTAATGGAAACGGAAGGTTTTTCCGTTACTACACGCCCCCACCTATAACCAATGATCTCATAATAGCAACAGGATGGGGAGACGATAACGAATATGACAACGAAGAATACTATGAAGATGAGGAAGATTATGAAGGAGATAATCCTCCAAGATGGGATACTAGCCCGGAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAGAAGAAAGCAATGAGGATTATGACAGCACCAGTAAAGATGAAGAGGAAGAAGAGGTGACCATTATTAGGGAAGAAAGTGAAGAAGATGAATACGACCCTAATGTCTACATGGCCTACCTTCAGAAGGAGGAAGATGACTGGACAGAAATAATCGCTAGTCTCAATAATGAACTGGAATACCCGCAGAGGAGACCACAACCAATTGAAACGGTTGTTTATTCAGAAACTGTTGATTACACTCCACCTAGCGATACAGTAATGACGCCAGTTGGATACCCACCTGCATCATCTTCAAGGTCTACAGTTACAACCCCAACTAGACCTCCACTGTACGAAGGAAGAATGCCACATACACCAAGATTCTTGAGGCGTGATGACTATACAGAATGGTGGCAATTGCCTTCATCACAAGGAACAACAGGAGCCTTGTTCGTTATGCCAAAACAAGTGGGCCTATTTCATGAAGTATTCTCGAGATGGGAGTCCATTACGAAGAACTATGTTGCGGCCCAAGGCTTTACTGACCCAGTAGAAAAGATGGAGTTTATTGAAAATCTATTGGGAGAGACTGAGAAGCTTACCTGGATTCAGTGGCGTATGAGCTACGAAAATGAATACCAGACGTTGCTGACTTTGGCTGAAGGTCGGCAAGGGACGCAAAATATACTGTCCCAAATCAAGCGAGTCTTCTCTTTAGAAGACCCCGCATCTGGCTCAACCAGAATTCAAGATGCTGCATACAGAGACCTGGAAAGGTTAACATGCAACAACATCAAAGACATAGTCCAATTCTTAAATGACTATGGAAGACTTGCAGCAAAGAGTGGAAGACTGTTCTTAGGAACAGAATTAAGTGAAAAATTATGGATGAAGATGCCTCCTGAGTTAGGCCTCAGAATGAAAGAAGCATTCCAGAAGGAGTATTCTGGAAATGAGGTGGGAGTATTCCCGCGAATTTTATTTGCCTACAGGTACTTAGAGCAAGAATGTAAGGACGCTGCATTCAGAAGAAGTCTAAAGTCCTTATCTTTCTGCAAAGATATGCCCATAACAGGGTATTATGATAAAGCTCCAAAGTACGGAATGAGGAGGTCTAAGACATACAAAGGAAAACCCCATGCCTCTCATGCAAGGGTAGAGAAGCGAAAGCATCTCATCAGAAATAAGAAATGCAAATGCTACCTATGTGGAGATGAAGGCCATTTCGCTAGAGAATGTCCAAATACAAAGCGAGATGTGAAAAGAGTAGCAATCTTTGAGGGCATCAATCTCCCAGATGATTATGATATTGTCTCTGTTGATGAGGGGGAAGAAGAATCCGATGCTATATATAGCATCTCTGAGAATGAAGAAGAACTTCAAGAAGAAGGAGTTCACGAAAAGATCTTCATGATAAAGGAGGAAGATCAATCCTATTGGTTAGGGAAACCTAATCATTGGACAGCGATGGTACGTGTGACTCAGCAACAGTATCATTGCAAGCACCAATGGGAGCACAACAAAGAGATAGTAATACTGGCCCACATCAACTGCCACTTCTGCAAGCAGACTACAAACCTTAAAGGCCGGGTCCACTGTCCCACATGTAAACTTACAAGTTGTTTCATGTGTGCACCCATTTACTGTGGAATTCAAGTTCAACAGCAGCCAAAGGCACCATTGCCATTTAACGCCAATGCACTACTTCAACAACAAGCAGCGTATATCCAATGGTTGGAAACTGAGAACAAGCGTCTGCAAGGGCTCGTAGACTTCTACAAAGATTTGCATGACAATAAAGAGCTCAAAATGCAACAGGAACTTGAGATTGATAGGCAACATCTGGAGGACCATGATAAAAGGAACGACAGGGGCAAACGGGTCCAGATCAGTACAGAAAGCCCAGAAGAATTAGCCTATCTTGAAGAAGACACAATCACACGAGTCGTAGGACATACAGTCGAAGAGCAACAGCAGAAAGTCAAGACTATAAAGAAGGGAAATATGCTCTATAACCTCGATGTGATCCTGATAATACCTGAAGTTGGGAAACCAATTAAGGTTAAAGCAATACTGGACACAGGCGCTACCACATGCTGCATCAACATCAACTCAGTGCCTAAATCTGCCATTGAGCAAAATACTTTCTTAGTCCAGTTCAGAGGAATCAATTCTACACAATCTGTTGATAAAAAGCTCCGCTACGGAAGAATGACAATCAGCGGACATCAATTTCGGATTCCTTACTGTTACGCATTTCCATTATCTCTGGGTGATGGAATTGAGATGATCCTCGGCTGCAATTTCATACGAGGAATGTACGGCGGTCTACGTATTGAAGGTCACACTATCACCTTCTACAAAAATATTACAACAATTCAGACCCGTCTAGCAGCAGGAATGGTTGGTGGTACAACCCTTTCTAATTTGGGGGAGGGAGAGGGCACCACGGTCAAATTCATCAATCCAATCCATGATGTTTTTGAAGCCACAGATGAAAAGGAAG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| 73,307 |
GU985153.1
|
Cacao swollen shoot Togo A virus
|
Duan,X., Di,D., Yu,Q., Zhang,A., Miao,H., Yang,Z.
|
Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Plant Protection Institute
|
China
|
2010-04-12
|
Hebei
|
Badnavirus zetainflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 13,221 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Triticum aestivum
| null |
2009-04
| null | null |
Cacao swollen shoot Togo A virus isolate Hebei, complete genome
|
CACGACCAGTGATCGAACAACCTGAATCATTGGTGACCCCAGCCCTGGGTACCTAGGTGCAATGGCCCCAATCTGCGGATTAAAATAAAATCTGAGATCGCCACTCTCATTTATCGCAACTAATATTTGGAAGTTTTCAAAATGGCAAATGAGCACAAGAGTCCTCTTGACAAGCGTGTCACTGACCTTTTCAAGGACATACCAACTGATATCTCCACTCATTTGATCACTGGTGAGACCTTTTCTAATGAAAGTTTCCAGGCTATACCAGTTTATACCTTAACCAATGTAACAGTCAAGCAAGCTGTGCATCTCTCATACAAGCTGTTTGAGAGTATGAAAACCACAAAGTGTGCTGCGGGGTACCAATATGCCGTATATCTTTTAGCACAGAGACTGTTGACACCTGCAGCAGGATCAAATGATCTAGTGTTCAAAGACTACATTCCTCAGGGAGGAGCAGATCTTCCACAGGAGATTAAGAACAAAATATACGTCACCACGGAATTGTCAGACTCGCAAACAGCTGGTAAGTCAGAGGCGGAGAAGAAGAAAGCAACTGCAGATCTAATTTTCGGAGACAATACAGATCATGACCTACAACAGGTGAGATCCCAAGATGATGAGACAATCATTAGATTCGGGAGTTTCATCTCTGCCTTCCTGATGAAATTGATTGTAAAGCAACAGAGCAATGTAGTAGATGGGTGGAACGGGATGTTAGAGAGGTATACCAATTTTTATGGAGAATCACCTATAACAGCCGTACCGAAGCCCAATGCTGATTGGTTGGCAGGGTTGAAGAACTATCTTATCTCGGATCCCAAAATTGGACATACCTGGGTCAGGGTCATATCTGCTGCTGAGAATGCGCTGTCGGTAGGGGACAAATCTTTCCAAATGGTCAGATATCTGGCATCACTTCCTCTTTCTCTGACTGGAATGCACGCATATAAGCTCTTCTTAGAGGTCCAGAAACAATCCAATTTGGGGATGCAGTGGCTCCTCGAAGAAATGGTCTCACCGAAGACATTGCCTGCACTGGAAGGAATTGCTAAGATTCTCAAGTACTTTGAGTCAAGGACATCTACTAGAAAACCTCCATATTTCAGGTATGCAAGGATTATGAGTCCTGCGTACTTCCAGGAGCTCCAGACTAAGAACTGCCCTGAGTTGGTATACCTATTGGTCTGTCTCCTGCAAAAGTATGAGGCATTTGGTGCTGGACAAGAACCTACAAAGATTGTTGGAATAGAGAGAGTCCCAGCTAATATTCGAGCTGAAATGTCCAGGGCTGCTGGATATATATTCAGTGTTGCACCACAACGTAATATGGGGATGTACTCAGACAGTATGAGGAAGGCATTGGTGCACCAGGAGAAAGCCTCCACCTCTCGAGCCGGAAAGGAGAAAGCGGATGAAGTGTTCGGAATGTAACCTGCTATTCTGCTAAGAAATAATTTGTATCAGTGTGTAAGGTATTTCCTAAATAAGAAAAACTGAGAACGTCATCTCATAATCTTTACTTTCTTATAGATTTCTGAAACAAATTGAATTTGCCAGCAAAATGGATAAGAAAGCAAGTGGAATCTCTGGTGAGAATGCACTATTCGGGGATGTTCCGAATGATGTTGTTGGAACAACATACGAAATGGGTCTAGATGGAATCCTTGATGATGGTGAAACTGATGTGATAGAGTCTCCTGCTGATGCTGAAGAACGGGTAACTACTGACATTGTTGCAGACGAAGGAGATAATCTGATTACTAAGGTTGATGATATGATAGGTTATCTAAAAAGAGAGTGTCAAGACCACGGGATTGCAGTAAGAAAAGAGTGGGTGAATGTCTTAACACGGAAGTTCCATATGTCTAAGAAGATTTATGCGTCTCATCTTGATTTCTTTCTTCTCGGGGTTATGGGAGAAAGACACGTGGCGGTCGAGAAGGACTTTAAGGATACAGCTGTACGTCTTAGTGATGAGGTGAATAAGATGTCTGGGATATCTAAGAAGGTTGCTGATAATGAGACTAGGATGATTAAAGAGCTTGATGCTAAAATGAAAGAGATGGGCTCTCTGATTGGGAAGTTCAATGGGGTCCTAAATGAATTCAAGGGAAGCATGGCTGTTAGCTCAAGGCCAGCATCTGTTGCTAGTTGGGCATTAGATCAAACTAACGAGACGAGCAGGGAGAAAAACTACAATGAATTCCTGAAAAAGCTGGGATTTCAAGATCATCACATAAAATCCCCTTTGATGAAGAAATGCACTGTTATGATAACAGATGAGATGTATGATGAAGTCATGCTGGAGAATACCTCTGAGGACACTCTTGGAATCTATAAAGAGCAGATAATCACTTACGGACAATCCATCCAGAAGAAAGTTGAAAAGCCAATTAAGAAGGACCCGTATGCCGACTTTTAAGGAGGAGGATTAAGAGGGATATCAGCTTTGCAGGTGAGTCAGATTAATAAATAATAAAAACTGAGATCAAGATGTCTTCGAAATTCGGAAATCAATGTGGCAAGACCCAGAAAATTTACATCAGGAATGAGCTAATCAATCCAGATATTGAATTCTCAGTGCCGAATAGTATCTTTTCTTGCATTGGTCCTAAGTATGCTTATGCTTCTTTGCAGTCAATCGTGGTGAAATACACCCCAGTAATCACGGAAAGGAGCACGGGGTCTATCGGGATATCTGTATCAGACAGGAGGTTCTCAGCTTCGGAAGTTGTCAGCAACATAAGTTTAGACACATCCTCGAAGGCCAATCTAATGATATCTGGATTCTCTTGCTGCCCCCTGGAAGAAGGTTGCCCATATACGATCACGATATCAACTAAGCTAGAAGGGGTCAATTACGGGGCTGCAGTAGGGAGTTTAGTGGTCAGCCCATCATTTCGTCTCTCAAATGAACCAATCCCTACAACTGGGATAACATACCAGATGATCAAGTTGGGGGATGTGCAGAAAACCTATCAAGGTGTTGCAATCACTGATGAGAAGAAGTAAGAAAAACGAGATCACAATGCCGTGCTGTGTAATAAAAGGTTATGCTTCAGCGAATCAAATTGTGGAAGGTCAAGTATTAAAGGAGGGTTGTCGAGTTAGGTTTATGTGGGACCAGAAGGGAATAAGTTGGGGGATGTCTCTTTCTCCCGAGGGAGGCTTATCTTTCCGTTTAGTTCCAGAGCGTCATGTTCAATCATATTTAAAGCGGTTGATGATCACAGTTGGTGATGATCAATCTAGCTTTGTGACCATGACATCTGAGTGTCGTATATCTATGTTTTTATTCAAGGTGTCAATCTCTGTAGGGACTTTACCAGACGTTGTGGTCCCTGTGGAACGTCTAGAGAAGTTATCTATCTAATTAAGAAAAACTGAGATCAAGATGGATGAGTTAAGGTTAATAGGAAGATGTATTGCAGTTAAAATGGTATCACCACGCCCAAGAACCTCTTTAACGAGAGGAGACTTTAGGGGTGTGAGTTGGGACAAGAGAGAGTGGAAGGCGATTATTAAACGCAGAGGGTCCAGATTCGTTCGTGCAGAACTCATTCCTAGGTCTAGGGATGATAATGGGCAATGTATTAGTATATTGTTTTCTGATGACACTTCAGGGATAACTATGTCCGCTGGCGTTTGCAAGTTTCTTTTAGTATTCGATCCTACTGTGGAAATCTTTCTTGATATCCCTCGTGATGCTCAATTGAATGATTCAATTACCTTTGAGGAATTGGATCCACCAGTTACAATTTCCCCTTATTAGGAAGTAAGTTGTTAATTAAGAAAAACTGAGATCATAATGGCCGCCGTTCTCGTTGGTTCCGAGGTCTCAGTTGCAGGAAAGCTGAGCAAGGTCACTGTCGACGTAGATGCCTCGAAGAAATTCTCATGGGCCGAGGGGAAAGGGTCACTGGTCTGGAAGATCAATGACAGTGACCTCGCACTCCGCTCAACCAATGCAGGGATAGAGGTCAAACTGACCCCGAAGAAGGGGACCACTACGTCTGGCATAGTACTGGATCTGGAAGGTGCAAAGCTCACCCTTAGCTGCGGGTACAAATCCGTGGTAGTACTCTTCGAACTTGGAGAGACACCAGAGGGAAGGGGCTTCTCTGAAATGAGGAGCCTGAGTGCATCCAACCTCTCACTTCTGAGGATGGCAAATTAGAGACAGAAGTCTCACAAATAATGCTGGCATGTGGGTATGTTATAAGGACAATGCCTAGGCCTGGTTCACCATTATAGGTGCATTAATGTTATCACAATACAAAATATGATAAATAAGTGATAATTAATAAAAACTGAGACCAACACGGACAAAATGGCAACCGAAGTATCTACTAGATTTATCTTCATTAAGATTGATGCTCTCTCAACTCTGCACTTCATAGATGAAGGGGGAGCACTAAGTATGAATGGAGATTCTATAGAATTCCTCATCGGGAAATCATCACTTGACAAGGGGCTGTTAAAGAGGGCTACAAAGTTGTTTACGTGGCTGTTCCCTCCTGAAATCGCAAAACAACACTCATCAATAACAAGATCCACAGAATCCAACGTTTACATGACAGATGCAACTCGCTACAAATACATATTCCCCGAATATCTTCTTGTTAGATACGTCGGGACCAAGTTTCCAGACATGAAAATAGTGGCTGATGCTACCTTCAAAAGGAGGAATCCTAAAGGAGATGTGATAGGGATGTTGGACCTTAGCTTCAAAGAGGTCAGAGTCAAAGAAGTATCTGAGACAAAGGCCATTGAACTTAGAGATTCTAATCCTGGTTATCTGCTCTCAACCACTTATCGGGAGTCAGAATCCCTGCCAGTAGTATCAAAGCCCTAGGTCTTGATATAGATTTGGGAACAAGTTAGGTAAGGGTATGGTAATCTAGCTATCATAAATAAATGGAGGAATATTTGAATAAATAAATAAAACTGAGATCAACAAGCAGATAATCCTAGGTATTCATATCTAAGATGAA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| 101,115 |
AJ781003.1
|
Cacao swollen shoot Togo A virus
|
Muller,E., Sackey,S.
|
Muller E., UMR BGPI, Cirad, TA 41/K, Campus International de Baillarguet, 34398 Montpellier cedex 5
|
France
|
2004-11-25
|
Wobe12
|
Badnavirus zetainflatheobromae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,297 |
GenBank
| 1 |
Togo:Litime
|
Togo
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
| null | null | null |
Cacao swollen shoot Togo A virus complete genome
|
TGGTATCAGAGCGAGGTTAAACATGGTCATGTCAGGCTAAAAACTTAGTGTTAGGTTCGGGGAAAGAGGTCTACTGTGTGTTTCGAATATCCATTTGTTATTATCCATACAGTGTCTGTTCCTTGTGTTAGGCTGAAAACCTGAGGTTGTGAACTACGGAGTGATCATTTCAAAAGGAATTTCATTCTAACTATCGTATGCTCTAGACTTGCCCTGTTATAGCAACAGAGGATCCTGTCTATCAGAAAATAGTTTGAATAATTCCGATGATCTCTCATACTTTAGGTATAACAACGCCACGTATAAGGAGCTAATTCTTTTGTAAAAGACGTAACCCAGAAGAGAGTACCCAGAGAGGGAGAAGACTTGGGGAGAAGGTGAACAGAAGAGAGAGCTTACTGTACCTGGTACTGTTATAGGAAGATTTTGTTATGTCCAGTCGCTGGGAGAGTAGTATACAAGAGTGGTATGAGAAGTCACACACAGCAAACCTTGAGTACCTTGACCTAGCATCTACTAGTAAAGTGACCAACAACCAGTTAGCACATAACCTTGCAGTAACCTTTGATAGAGTAAATTTAGGTAACCGAGTTTTTATTAAAAACCTGAAGCAGATTCAAGAGTCTATTCTTGAATTAAACACCCGTGTTGATACTATAGAAGCAGTTTTAAGAAGGTTAACCAAGACCTTCCGAGAAAACAAACCACTTACCGAAAGTGAAGTCCGTAAGTTGGTTGAAGAAATTGCCCAACAACCTAAGATCGTCGAGAAACAAGCACTCGAGATCTCTCAACAGCTTGAGCAGAAGCTGGAGAAAGTTGAAAAACTTCTCCATAAGCTTGACCAGTGGGTTGGTCAATGACCGACAGCCCGTCTTACCAAGAAGCCTTAAAAGAAGCAGAAAAGGTTGACCCACCAGCAGTTGGATTAACTACTTCTACAGGAGTAACAGCAGTCCAAGGATTTAGGGCTGTCATCAAGCAGAATAACGTTCAGATTTGCTTACTAGCTGCCATAGCAGATAAGCTTGACGATCTTGTCCAAGATCGGAAGCAAGCAAGGAAAGAAAAGGCAAAAGAAGTCGCCATTCCCGAAGACCTAATCACCAAACTCAAGGGATTATCCCTCCAGGAGAAAGGTGAAGAAAAAGTAACCAGAAAAGAAGAACCAAAAGGAAAATTGGTGGTATTCAAAGATCCTTATAAGATCTTAGCAGCTGAAAAAGCTAAGATAACGCCAAAGATTCCCAAGGAGAAAAAGGAAGATAAGAAGGATGAGCCGGGCCAGAACTCAGCACTCAGTTCCTAGTGTCACTTCCACTAGTGAACAACAGAGGGAAGGTCCTCTCTACGAGGATCAGATCAGAGATTACAGACGCGGACAAAGGCGAATCTTCAACCTGCGAAGACAAGCCAGAAGGTTAAGAAGATCCGTGACTGGATCTAGATACCAGGAGACACTAGAACAAGAAATAGATCCGCAAACAACGTTAAGGCTCTCAATGCAAGAGAGGGCGAGATTAGTACCAGCCGAAGTACTGTACAGATCCAGACGAGACACTGTGCATCACAGAGTCTACACACACCGATCAGAGGAATCAGTCCTATGCATCGGAAACAATCAAGTTGACAGGGCATTCATTCAGCCCGAAAGTCTGGAACAACTACAGAGGACAGGGATGTCCTTCATACACATCGGTATTCTCCAAGTAAGAATTCAAATACTGCACCGGCAAGAGGAAGGAACTATGGCGTTAGTTGTCTTCAGAGACAACAGGTGGACCGGTGACCAATCTATCTTTGCTCAAATGGAGATAGATCTGACAAAGGGCAGCCAATTGGTGTTTGTCGTACCAGACACCATGATGACTATTGGAGATTTCGCAAGGAATGTCCAACTGTCCATTTTGACAAGAGGATACGAGAGTTGGCAGAACGGAGAAGCCAATTTGCTGATTACACGTGGTATGACTGGAAGGTTATCCAACACACCCAACGTAGCCTTCGCCTATCAAATAGCCAGCGCAACAGATTATCTGGCAAGCCACGGAGTAAAAGCAATCGCAGGAAAGAAACTAAACCTGCAGCATTTGCGTAACCAACAGTGGATATTACGACCGCCGCAAGCAGATGTCACACCAATGCAACCACGGTCAGTTGAAACCAGAAATCTGGTTGATGGGAGCATCTCCATCAGATTCCATGACTACGAAGCGGCCCCTTCAACTTCCAGACCTCATTATAATGAGGAAGATGAGGAAATAGAATCAGAAGCAGAATCAGAAATAAGGGACCATACAGTCGCAGTATGGATAATTGGTGAAGAAGAAATAGCAGATCAGACAGGCAGAAGAAAAGTATGGGAAGAATCTGCTAATGGAAACGGGAGATTTTTCCGTTATTATACACCCCTACCAACAACTAATGAACAGATAGTAGCAACAGGATGGGGAAGCGATGATGAAGATGACCATTCTCCTAGATGGGATACTAGCCCGGAAGAGGATGAAGATGACGAAGAAGAACCTATTTGGTCGAATGAGACCGATAGTGAAGAAGGAGATGAGGAGCCAGTATGGGATAAAGAAGAAAATGAAGAGGAAGAGGAAACCATTATTAGGGAAGAAAGCGAAGAAGATGAATATGACCCTAATATTTACATGGCCTACCTTCAAAGGGAAGAAGATGACTGGACGGAAATAATCGCCGGCATTAACAGTGAAATGGAGTACCCGCAGAGGCGACCACAACAAACAGAAACAGTTGTTTATTCAGAAACCGCTGATTACACTCCACCTGGCGATACTGTAATGACACCTGTTGGATATCCACCAGCCTCCTCTTCAAGGTCTACAGTTACAGCTCCAACTAGACCTCCACTATATGAAGGAAGAATGCCACACGCGCCCAGATTCTTGAAGCGCGATGACTACACCGAGTGGTGGCAATTGCCCTCATCACAAGGGACAACAGGAGCGTTGTTCGTTATGCCAAGACAAGTGGGCCTATTCCATGAAGTGTTCTCAAGATGGGAGTCCATTACGAAAAACTATGTTGCGGCCCAAGGCTTTACTGACCCAGTAGAAAAAATGGAATTTATAGAAAATCTATTGGGAGAAACTGAAAAACTTACCTGGATTCAGTGGCGTATGAATTACGAGACAGAATACCAGACGTTGTTGACCTTGGCAGATGGTCGACAAGGGACGCAGAACATACTGTCCCAAATCAAGAGAGTCTTCTCCTTAGAAGACCCTGCTTCTGGATCTACCAGAATTCAAGATGCTGCATACAGAGACCTGGAAAGGTTAACATGCAACAATATCAAAGACATAGTCCAATTCTTAAATGGCTATGGAAGACTTGCAGCAAAAAGCGGAAGACTGTTCTTAGGGGCAGAATTAAGTGAAAAGTTATGGATGAAAATGCCCCCTGAGTTAGGCCATAGGATGAAAGAAGCATTCCAGAAGGAATATGCTGGGAATGAAGTCGGAGTGTTCCCACGAATCCTATTTGCCTACAGATATCTGGAGCAAGAATGTAAGGACGCCGCATTCAAAAGGAGTCTAAAGTCCTTATCCTTCTGCAAAGATATGCCCTTAACTGGGTATTACGATAAAGCTCCAAGGTACGGGATGAGAAGGTCTAAGACCTACAAGGGAAAACCTCATGCTTCCCACGCAAGGGTGGAAAAGAGGAAGCATCTCATCAGGAACAAGAAATGCAAATGCTACTTGTGCGGAGATGAAGGCCATTTCGCAAGGGAATGCCCTAATACAAAGCGAGATGTAAAAAGGGTAGCAATATTTGAAGGCATCAACCTCCCAGAAGATTATGACATAGTCTCTGTGGAAGAAGGAGAAGAAGAGTCCGATGCCATATATAGCATTTCTGAAAATGAGGAGGAGCTTAAGGAAGAAGTAGTCCACCAGGAGAAGATCTTCATGATGAAGGAGGAAGATCAATCTTATTGGTTAGGGAAACCTAATCACTGGACAGCGATGGTACGAGTAAATCATCAACAGTACCATTGCGAACACCAATGGGAGCACAACAAGGAGATAACGGTATTGGCCCACATCAGCTGCCACTTCTGCAAGCAGCCTACAAACTTCAAAAGTCGGGTCCACTGCCCTATTTGCAAACTTACAAGTTGCTTCATGTGCTCACCCATATATTGCAACATTCAAGTTCAACAGCAGCCAAAGGCGCCTTTGCCATTTAATGCCAACTCATTACTCCAGCAACAGGCAGCATACATCCAATGGTTGGAAACTGAAAATAAAAGGCTGCAAGAGCTCGTGAATTTCTACAAAGATCTTTATGAGAATGAAGAGCTGAAGCTTCAACAGGAACTTGAAATTGATAGGCAAGACCTAGAAGAACATGACAGAAGAAGACGGGTTCAATTAAGCACAGAGAACCCAGAAGAATTAGCTTATCTTGAGGAAGATACAATCACGCGAGTCATAGGACATACAGTCGAAGAAAAACAAGAAGTCAGGAAGACTGTAAAAAGGGGAAATATGCTCTACAACCTCGACGTGATCCTCATAATACCTGAAGTAGGAAAACCTATCAAGGTAAAAGCTATACTGGACACAGGCGCTACAACGTGTTGTACCAATATCAACTCAGTGCCTAAAACTGCTATTGAGCAAAACACTTTCCTAGTCCAGTTCAGAGGAATCAATTCAACTCAATCCGTTGATAAGAAGCTCCGCTACGGAAGAATGACAATTAGCGGGCATCAATTCAGGATTCCTTACTGTTACGCATTTCCATTATCCCTCGGTGATGAAATTGAGATGATCCTCGGTTGTAATTTTATACGAGGAATGTATGGCGGTTTACGTATTGAAGGTCATACTATCACCTTCTACAAAAACGTAACAACAATCCAAACCCGCCTAGCCGCAGGAATGGTTGGTGGTACAACCCTTTCAAATTTGGGGGAGGAAGAGGGCCCAAGCTGCTGCTCCAGCTCCTGCTCCAGCTCA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| 109,352 |
NC_001574.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Hagen,L.S., Jacquemond,M., Lepingle,A., Lot,H., Tepfer,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-04
| null |
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,161 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Cacao swollen shoot virus, complete genome
|
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| 8,954 |
MN433933.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Ghana6
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,314 |
GenBank
| 1 |
Ghana
|
Ghana
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2013-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Ghana6, complete genome
|
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| 51,738 |
MN433934.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Ghana1b
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 6,978 |
GenBank
| 1 |
Ghana
|
Ghana
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2013-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Ghana1b, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTAGTTAGAATGTCCGGCTAAGTTCATCAGCCTAGGTTTAAGGAAAGAGGCGTAGTATGTTATGATCATATTGTTTGAGGTATTAAATTTCCACAGTAGATGTTCTTGGAATAGTAAAAAGAGGAGACCCTGCCAAAGTACCAAGAGGAGGGAAAAAGGGATACCGTGATACTATTCTAGTGTTTATCTCTCGTATGCTCTACAGTTGCGGCCCGGGGCTGATCTTCTGTATCAGAAAAGAGATAATGTAATGTCTGCTAGGTGGGAAAATAGTATTCAAGAATGGTATGAGAAGTCACATACTGCAAACCTCGAGTACTTAGATCTAGCCTCCACAGCAAAAGTTACAAACAACCAGTTAGCTCATAATCTTGCAGTTACCTTTGATCGAGTCAGTCTTAGTAGTCGAGTTTTTATTAAAAACCTAAAGCAAATTAGAGAGTCTATCCAAAGTTTAGAGAAACAGTTAGAGTCAGTCGAGAGTTCCATAAAAAGAGTCAGTAAACAGTTGAGAGAAAACAAACCACTCACAGAGGAGGCTGTCAGGCTTCTTGTGAAAGAAATAGCTCAACAACCTAAACTAGTAGAAGAACAGGCTCTTAGTCTCACACAGGAGCTTGAAAAGAAACTAGAAAGAGTAGAGAAGGTGCTGAACCAACTTGGCCTTGTGATTGGCCAATGAGTGATAGTCCCGCATACCAAAGGGCTATAAGAGAAGCAGAAAGAGTTGATCCTCCAGCAGTAGGATTAACATCAACCACAGGAATCACTGCAGTTAACGGCGTACGAACGATTGTCAAACAAAACAACGTTCAGATCCAGTTATTGGCAGAAATAGCAGACAAGCTTGAGGAGCTAGTAACACGCCAGAAGCAGGCAAACAAAGCTGAGGTGAAAACCACCTTACCTGAAGACCTGATAGAAAAACTACAAAAGCTCTCCATCCAAGAGTCAGGAAGTAGCCAAAAATCCAGATTAAGGGAAGGAAAGGGCACTTTGTACGGTTTCAAAGACCCCTATACTATCTTAGCTGAAGAGAGGGCGAAGCTACAACCACCACCCAAGAAGGATGAGTCAAAGGGGAAGGGAACCACAGAGACCTAGTGTCACCACCACTGTCTCAGACCCTGAAACAAGAGGGCAACCCCTGTTCGAAGACCAAATTAGAGGGTACAGGCAGAGACAGAGACGGATGCACAACCTCCGACGAAGGGCACGAAGTCTAAGCAGGTCTCTATCCAGAGAACCCAGAAGTCAGGGGAGGTACCAGGAGACACTAGAACAGGAGATTGATCCGCAGGCAACTTTGCGGCTATCAATGCAAGAAAGGGCACGACTTGTGCCAGCAGAGGTATTGTACAGATCCAGGAGGGATACTGTTAATCACAGGGTTTACACCCACAGATCAGAAGAATCAATCCTATGTACAGATGGCAATCAAATCGACAGAACTTTCATACAACCTGGAAGTTTTGAACGATTACAACAAACAGGATTTTCCTTTATTCACATAGGAATTCTGCAAGTTAGGATTCAGATTCTGCATCGACAAGAAGAGGGAACAATGGCGCTCGTTGTCTTTAGGGACAACAGATGGGCAGGAGATCAAGCCATATTTGCACAGATGGAGATTGATCTCACCAAAGGGAGCCAATTGGTGTATGTCATACCAGACACCATGATGACTATCGGAGACTTTGCCAGGAATGTTCAGATCTCTATCCTAACAAGAGGATATGAGAATTGGCAAAATGGAGAATCTAACCTACTGATAACCAGGGCAATGACAGGACGGTTATCCAACACCCCAAATGTTGCGTTTGCCTACCAAATTGAAGGGGCAACCGATTATTTAGCAAGCCATGGAGTGCGAGCAATTGCAGGAAGACGGTTAGATCTACAACACCTAAGGAACCAGCAATGGGTTCTGAGACCACCACAGGCAGACATCATGCCTATGCAACCACGGGCTGTTGACACAAGGAATCTTGTGGATGGAACCATTTCCCTACGATTCAGGGATTATGAAGTACAACCAACAGCACACCTACCTCATTATAATGAGCAAGATGAGGAAATCGAATCGGACGATGAGGAGGCCATTCGTGAACACACAGTAGCTGTCTGGATCATAGGAGAAGATGACCCAGAAGAAGACGGCAGAAAGAAAGTATGGGAAGAATCAGCCAATGGAAATGGGAGATTTTTCCGATACTATTCTATACCTTCCAGCTACTATGATGATATTGAAATCGTCGCGTCCGGATGGGGAGATAAAGAAGAAGAAACCCCTATAAACACAAAATGTGATCTAGCAGAGTCGGACGAGGATGATGATGATGAAGAAGGTTGGGAAGCACTCCCAATCATGACAAATGAAGAGCCTTGTGCAGAGAGAACAGCACAAGAAGAATGGGAAAGAGAGTGGTATGAGGAAGACGAGGAAGTAGAAGAAGATGATTTCTTCCGCCAAATGTCCACAGAACTCATAGGGACATTGGAAATGGAGTATCCACAGAGAAAGAAAGAAGTAGTTCTTTCTGAGGTCGTTGATTATTCACCACCTGGTGACACTCTAATGACGCCTGTCGGATATCCCCCAGCATCAACCTCAAGACAACCACCGGAGAGACCCCCATTATATGAAGGAAGAATTCCACAGACTCCAAGATTTAAGAGAGACGATTATACTGAATGGTGGCAGTTGCCAYCTTCACAGGCAACAACAGGGGCTTTATTTGTTATGCCAAAACAAATAGGCCTATTCCATGATGTCTTCTCTAGATGGGAGTCCATTACCAAAAATTATGTTGCACTGCAGGAGTTTACTGATTCTGCTGACAAAGTGGAGTTCATCGAAAATCTCTTGGGCGAAACGGAGAAATTAACATGGATTCAATGGCGGATGAACTATGTAGCAGAGTACCAACAGCTGCTAACACAGGCAGATGGGAGACAAGGAACACAGAATATCCTATCCCAGCTCAAAAGAATCTTCTCTTTAGAAGACCCTGCCTCAGGATCCACAAGGATACAGGATGCAGCATACAGAGACTTAGAAAGGCTCACCTGCAACAACATGAAGGACATAGTTCAGTTTTTAAATGACTATGGCAGACTTGCAGCGAAAAGTGGTAGAATGTTCGTTGGGGAAGAACTGAGTGAGAAACTCTGGCTCAAAATGCCACCAGAGTTAGGAACAAGAATGAAAGAAGGCTTCCAGCGAGAATACCCCGGCAACCAAGTTGGAGTATTTCCTCGAATACTCTACGCCTACAAATACCTGGAGCAGGAATGTAAAGATGCAGCATTCAAAAGAAGCTTAAAGTCTTTAAGTTTCTGTAAAGATATGCCACTTACAGGTTACTATGAGAAGCCAAAGTCAAAGTATGGAGTACGTAGATCCCAAACATACARAGGARAGCCACACTCAACACATGCCAGGATTGAGAAAAAGAAACACCTGATCAGAACTAAAAGGTGTAAATGCTATTTGTGTGGAGATGAAGGACATTTTGCTCGAGRATGCCCTAATTCAAAAAGGGATGTCWAACGAGTAGCCATGTTCGAAGGGATCAATTTACCTGAAGAATACGAAATAGTATCTGTGGAAGAAGGAGAAGATATTTCAGATGCTATTTATAGTATTTCAGAACATGAGGATGAACTTCAACCCGAAGTTCAGGAGAAGGTCTTCATGCTGAAGGAGGAAGACCAATCTTATTGGTTAGGAAAAACCAATCACTGGACTGCAATGATACGTGTCACACGGCAGCAATACTACTGTCCACATCAATGGGACCACAATGGTGACATCAGTCTGAAGGAGTTTCTTAACTGCTTATTCTGCAAGCAGCGGACTAATAACAACAGTAGAATACACTGTCCCTTGTGCAGCATTACTAGTTGTGCTCTCTGCTCACCAATTTACTGTGATATAACAGTCCAGCCAAAGCCTAAAGTTCCAATACCATTCCGCAGCAATTCCCTTATTGGACAACAGGCTGCTTATATACTCTGGCTTGAAGAAGAAAATAAACGGCTTCAGAGTCTCCTCGACAGTAAGCTCCAACAAGAACTCGAAGCTGATCGTCAGGAACTTGAGCAAAAGGCCAGTACAAAAGATAAAGGGAAGAATGTTGTGTTCTATGAAGACGAAGAATCCAAGGAACATTTAGCATACTTGGAGGAACACATCCATGCTTCCGAAAAGGTTGTTACAAATCGAGGGAATATGTTATACAACCTTGATGTCCTACTCAGCATACCAGACGTTAAAAGTCCTATTTCAGTCAAAGCAATACTGGATACAGGGGCAACTACATGCTGTATCGACATCCATTCAGTACCAAAGGAAGCTATTGAACAGAATACCTTCCAGGTACAGTTCAAAGGGATTAATTCACAACAAATGGTGGATAAAAAGCTCAAATATGGTCGCATGACCATCAGCAATCACCAATTCAGAATCCCTTACTGTTATGCCTTCCCACTACAACTGGGCGATGGAATTCAAATGATCCTTGGCTGCAACTTTATTCGCAGCATGTATGGTGGCTTGCGTATTGAAGGTCATACCATTACCTTCTACAAAAATGTCACTACAATCCATTCCAAAGCCGGTGCAATAGTTGGTGGTACAACTATTCCTAATTTGGGGGAAGAGGAGCTGCTATCCCTGTCATTCGAAGAAGAAGATGACGCAGAGGCCCAATTCTTTAATCTCGAAGTTCATCAGCAAATTGTGGGCCATACTATTCAAAACCACCACCAGTTAAGTCCAGGACTCAAGGACTTACTGAGTAAACTCAAGGAGCAAGGGTACATTGGTGAAAGCCCATTAAAGCATTGGGTTAATAATCGGATTCTTTGCAGGCTTGATATTAAAAACCCGGAGTTAATCATTGAAGACAAGCCCATTAAACATCTGACCCCGGTTATGGAACAGAAGTTCCAAAAACATGTCAAAGCCCTCCTTGACATTGGAGT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| 51,739 |
MN433938.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
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2020-04-26
|
Buyo15
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Cacao swollen shoot virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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| 7,090 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
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plant leaf
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Cacao swollen shoot virus isolate Buyo15, complete genome
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| 51,743 |
MN433939.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Buyo17
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,066 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Buyo17, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTAGTAATGGTCATGTCCGGCTAAAAACCTAAGGTTAGGTAAGGGGAAAGAGTGAGGTTACCGTTAGGCTTCAAGTCCCAGTCCCAAAAATACTGTTCCCACACCAGTTAGAAGAAGACCAAACCGTTGGAAGTTTGTTGCTTCAAAAGAGAAAGGCGTAACCCAAATAGTACCTACAGAGAGGGAAGACGGGGAAAAGATGATCATTTGAAGGCAAAAATCAAGACTATTCCTATTATGCTCTACAGTTGCAGCGAAAGCTGATCTTCTGTATCAGAAAGGGAAGAAAACTTGGTTAATGTCTAGCCGTTGGGAGAATAGTATCCAAGAATGGTATGAGAAGTCTCACACAGCCAACCTCGAGTACCTAGACCTAGCCTCTACTAGCAAAGTGACCAACAACCAATTAGCTCATAACCTTGCAGTGACTTTTGATAGAATCAATTTAGGAAACAGAGTCTTCATCAAAAACCTAAAACAAATCCAAGAGTCTATCTTAGAACTACATACCAGAGTCGATACCGTAGAAGTAGCCTTGAGACGGCTAACCAAGCTATTCAAAGAAAATAAACCTTTGTCTGAGTCTGAAGTTAAGAGATTGGTAGAAGAGATAGCTCAGCAACCAAAGATCGTTGAGGAACAAGCCCTCAGGATCTCTCAGGAGCTTGAGTTAAAGCTCAAGGAAGTAGAAAAGCTTCTCCACAACCTTGGCCAAGTAATTGGTCAATGACTGATAGCCCCTGCTATCAAGAAGCACTGAAAGAAGCTGAGAAAGTTGACCCTCCTGCAGTCGGGTTAACTAACACCGGAAAAGTAACAGCACTTGACGGACTAAGGACGGTGATAAAGCAAAACAACGTCCAGATTTGCTTGCTAGCCTCTATAGCAGATAAACTTGAAGAACTGGTTCAAGACCAGAAGAAGGCAAGAAAGGAGAAGGCAAAGGAAGTTGCCATCCCAGAGGATCTCATCACAAAACTCCAAGGATTATCCATTCGGGAGAAAGGTGAATCGAAAATCACAAAGAAACCAGAGCCAAAAGGGACACTGTTTGGATACAAAGATCCATACAAGATTTTAGCAGCAGAAAAAGCTAAGATCACTCCTAAACAAAAGAGAGATGAGTCGAGCAAGGACACATCCTCCAGTTCCTAGTGTCACAGCCACCACTAGTGAGCAAAACAGAGAAGGACCTCTTTACGAGGACCAGATCAGAGACTACCGAAGGAGTCAGAGGAGGATCTTCAATCTAAGAAGAAAAGCTAGAAGATTGAGGAGATCCATGATGGGGTCAAGATACCAGGAAACCCTAGAACAAGAGATTGACCCACAAACAACACTGAGGTTGTCCATGCAAGAAAGAGCGAGACTAGTGCCAGCTGAAGTACTGTACAGATCACGACGAGACACTGTTCACCACAGAGTCTATACCCATCGCTCGGAAGAATCCGTCCTATGTGTCGGAGGAAATCAAGTAGACAGGGCCTTTATCCAGCCCGAAAGTCTAGAACAACTGCAAAGGACTGGAATGTCCTTCATCCATATAGGAATCCTGCAAGTAAGGATTCAGATCTTACATCGCCAAGAAGAAGGTACTATGGCCCTAGTAGTTTTCCGTGACAACAGATGGTCCGGAGACCAATCTATCTTCGCACAAATGGAGGTAGATTTAACTAAGGGAAGTCAGTTGGTATTTGTCATACCAGATACCATGATGACCATCGGAGATTTTGCCCGGAACGTACAGCTATCAATCCTCACAAGAGGATATGAGAATTGGCAAAACGGGGAGTCAAACCTGCTAATAACACGTGGCATGACGGGACGACTGTCTAACACACCTAATGTCGCCTTTGCCTATCAAATTGCCAGCGCAACTGATTATCTGACAAGCCATGGGGTAAAAGCAATCGCAGGGAAAAAGATGAACTTGCAACACCTGAGAAATCAACAGTGGATTCTAAAACCACCGCAAGTTAACATCATACCAATGCAACCTAGATCGGTAGAAACCAGAAATCTGGTAGATGGAAGTATTTCCATCAGATTCCATGATTATGAAGCAGCTCCTTCAACGTCCAGACGTCACTACAATGAGGAAGACGAAGAAGTAGAGTCTGAGACAGAATCGGAGATAAGGGAGCATACCATAGCAGTCTGGATTGGTGAAGAAGAAATTCCAGACCAAACAGGAAGAAAGAAGGTATGGGAAGAATCCAGCAATGGAAATGGAAGGTTCTTCCGATACTACACTCCTCCACCAACAACAGATGAACAGATTGTAGCTACTGGTTGGGGAAGTGATAATGATGAAGATGAGGATGAAAGCCCTCCAAAATGGGATGAAAATCCTGATGAAGAAGAAGCAGTGGAGCCAATCTGGGATCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAATATGATCCTAATGTCTATATGGCTTATTTGCAAAAGGAGGAGAATGAGTGGCAAGAAATTGCCGCCGGCTTACAAGAAAAAGTGGAAATGGAGTATCCACGGCGGAAGCCACAGACGGAGACTGTATTTTCTGAAACGGTGGACTACAACCCACCTACGGATACAATGATGACACCTGTCGGATATCCACCGGCCTCGTCATCAAGATCAACAGTCACCGCACCTGATAAGCCCCCTCTATTTGAAGGAAGGATGACACACGTGCCAAAATTCAAAAGAGATAATTACACAGAATGGTGGCAGTTACCATCATCTCAAGGCACAACTGGGGCGATGTTTGTGATGCCCAAACAAATGGGCCTATTCCATGAAGTTTTCTCACGATGGGAGTCCATCACCAAAAACTATGTTGCGGCCCAAGGTTTCACGGACCCAACAGAAAAGATGGAGTTCATGGAAAACCTGTTAGGAGAAACAGAAAAGCTGACCTGGATCCAATGGAGAATGAACTATGAGATTGAATATCAGCAGTTATTAACTCAGGCTGATGGACGTCAAGGGACCCAAAACATCTTGTCCCAGATCAAAAGAGTCTTTTCTTTAGAAGACCCAGCCACAGGATCCACGAAGATACAGGATGCTGCATACAGAGACCTTGAAAGATTAACCTGCAACAACATTAAAGATATCGTTCAGTTTCTGAATGATTATGGAAGGTTAGCAGCAAAAAGTGGGCGATTGTTCTTAGGAACTGAGCTCAGTGAGAAGTTATGGATGAAGATGCCACCAGAACTAGGGCATCGTATGAGAGAAGCATTTCAGAAAGAATACGCAGGCAATGAAGTAGGTGTCTTCCCGCGTATCTTGTTTGCATACAAGTACTTGGAACAAGAATGCAAAGACGCAGCGTTTAAACGCAGCCTGAAATCACTAAGCTTCTGCAAGGACATGCCATTAACAGGTTACTATGATCAACCACCCAAATATGGCATGAGAAAATCCAAGACTTACAAAGGAAAGCCACACGCATCACATGCGAGGGTCGAAAAGAGAAAGCACTTAATCAGGAACAAGAAGTGTAAGTGTTACCTGTGTGGAGATGAAGGGCACTTTGCCAGAGAATGCCCTAATAACAAAAGAGATGTCAAGAGAGTAGCTATTTTTGAAGGCATCAATCTTCCTGAGGGTTTTGATATTGTCTCAGTTGAAGAAGGGGAAGATGATTCAGATGCTATTTATAGCATATCTGAAAATGAAAATGGAGAAGAGCTTGACGCAGAAGTAGTCCAAGAGAAAGTCTTCATGATAAGAGAAGAGGACCAATCCTACTGGTTAGGAAAAACTAATCATTGGACAATGATGGTGCGAGTCAGCAGCCAGCAATATCATTGCTTGCACCAATGGGAGCACAATAAGGAGATCACGACGGTGGCCCACATTAACTGCCACTTCTGCAAGCAACCCACCCAACTAAGGAGTCGAATACACTGTCCTACGTGTAAACTCACAAGTTGCTTCATGTGTGCCCCAATATACTGTAATACAACGGTTCAACAACAGCCTAAACCGCCTGCGCCATTCAACACCAACACTTTGCTTCAACAGCAAGCGGCGTATATCCAATGGTTAGAAGGAGAAAACCAGCGGTTAACACAGGCCGTTGAATTTTACAAAAAGGAAGCTGCAGACCTTAGGCTCGAGAAAGAATTGGAGGAAGATAGAAGGAATCTGGAGCCAAAGACACAAAACAGGGGGAAGAAAGTTCTCACTATCAATGAATCCTCTGAAGATGAACACATAGCGTATCTTGAGGAAGATACCGTCAGCCGAATCATCGGCCATACTGTGGAAGAGCAACAGGAGATCAAAAAGCCAGTCAAAAGAGGAAACATGCTATACAACCTCGACGTGGTTTTATCTATCCCTGAAGTTGGGCGACCAATCAAGGTTAAAGCTATCCTTGATACGGGCGCAACCACCTGTTGCATCAACATTAACTCCGTTCCCAAAACGGCGATTGAACAGAACACCTTTCTGGTTCAATTTAGAGGCATTAATTCCACACAATCAGTTGACAAAAAGCTTAAATACGGGCGCATGACTATCAGTAATCATCAGTTTCGCATCCCGTACTGTTATGCCTTTCCTCTATCTTTGGGCGACGGAATAGAAATGATCCTAGGATGTAATTTCATCCGTGGGATGTACGGCGGTTTGAGGATTGAAGGTCATACTATCACCTTCTACAAGAATGTTACCACTATTCAAACCCGCCTTACTGCTGTAATGGTTGGTGGTACAACCACTTCTGAGTTGGGGGAGGATGATGAAGAACCCATTTTTGAAACCCAAGAAGAAACAGAAGAATTTGACTCAGAAGCCCATCAACAGATCATAAGTCATGCTGCAACACAAGCCCAACAGCATAAACTAAACCCAAAGCTCCAACAACTGATGGACCAACTAAAGGATCAGGGCTTTATTGGGGAGAATCCGATGCAATATTGGGCTAAAAACAAGATTCTGTGTAGGTTGGATATCAAGAATCCAGACCTTATAATAGAAGACAA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| 51,744 |
MN433940.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, School of Plant Sciences
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USA
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2020-04-26
|
Buyo7
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Cacao swollen shoot virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 7,055 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
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Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Buyo7, complete genome
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| 51,745 |
MN433941.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Buyo4
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,045 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Buyo4, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTAACAATGGTCATGTCCGGCTAAAAACTTAAGGTTAGGTAAGGGGAAAGAGTGAGGTTACTGTTAGGCTTCAAAGTCCCAGTCCAAAAATACTGTTCCCACACCAGTTAGAATAAGACCAAACTGTTGGAAGTTTGTTGCTTCAAAAGAAAAAGGCGTAACCCAAATAGTACCTACAGAGGGGGAAGATGGGGAAAAGATGATCCTTTGAAAGCAAAAATCAAGACTATTCCTATTATGCTCTACAGTTGCAGCGAAAGCTGATCTTCTGTATCAGAAAGGGAAGAAAACTTGGTTAATGTCTAGCCGTTGGGAGAATAGTATCCAAGAATGGTATGAGAAGTCTCACACAGCCAACCTCGAGTACCTAGACCTAGCCTCTACTAGCAAAGTGACCAACAACCAACTAGCTCATAACCTTGCAGTTACATTTGACAGAGTCAATTTAGGAAACCGAGTCTTCATTAAAAACCTAAAACAAATCCAAGAGTCTATTTTAGAACTACATACCAGAGTCGACACCTTAGAAGTAGCCTTAAAACGGCTAACCAAGCTATTTAAAGAAAACAAACCTTTATCTGAGATTGAGGTAAAGAGACTGGTAGAAGAGATAGCCCAGCAACCAAAGATCGTTGAGGAACAAGCCCTCAGGATTTCTCAGGAGCTTGAACTAAAGCTCAAGGAAGTAGAGAAGCTGCTCCACAATCTTGGCCAAGTAATTGGTCAATGACTGATAGCCCCAGCTATCAAGGAGCACTGAAAGAAGCTGAGAAAGTTGACCCTCCTGCAGTCGGGTTAACTAACACCGGGAAAGTAACAGCACTTGACGGACTAAGGACGGTAATAAAGCAAAACAACGTCCAGATCTGCCTGCTAGCCTCTATAGCAGATAAACTTGAAGAACTGGTACAAGACCAGAAGAAAGCAAGAAAGGATAAGGCAAAGGAGGTTGCCATCCCAGAGGATCTCATCACAAAACTCCAAGGATTGTCTATCCAGGAGAAAGGTGAAACAAAGATCACAAAGAAACCAGAGCCAAAAGGAACACTGTTTGGATACAAAGATCCTTACAAGATTTTGGCAGCAGAAAAGGCTAAGATCACGCCTAAGCCCTTAAAAGAAAAGAGAGATGAGTCGAGCAAGGACACATCCTCCAGTTCCTAGTGTCACAACTACCACTAGTGAACAGAACAGGGAAGGACCTCTTTACGAGGACCAGATCAGAGACTACCGAAGGAGTCAAAGAAGGATCTTCAATCTAAGAAGAAAAGCCAGAAGATTGAGGAGATCGATGATGGGGTCTAGATACCAGGAGACCCTAGAGCAAGAAATTGACCCACAGACAACACTAAGGTTGTCCATGCAAGAAAGAGCGAGATTAGTGCCAGCTGAGGTACTGTACAGATCACGGCGAGACACTGTTCACCACAGAGTCTACACCCATCGCTCGGAAGAATCCGTCCTGTGTGTCGGAGGAAATCAAGTAGACAGGGCCTTTATCCAGCCCGAAAGCTTAGAACAACTGCAAAGGACGGGAATGTCCTTCATCCATATAGGAATCCTGCAAGTAAGGATTCAGATCTTGCATCGCCAAGAAGAAGGCACCATGGCCTTGGTGGTTTTCCGTGACAACAGATGGTCCGGAGACCAATCTATCTTTGCACAAATGGAGGTAGATTTAACTAAGGGAAGTCAATTGGTATTTGTCATACCAGATACCATGATGACCATCGGAGATTTTGCCCGGAATGTACAGCTATCAATCCTCACAAGGGGATATGAGAATTGGCAAAATGGAGAGTCAAACCTGCTAATAACACGTGGCATGACGGGACGACTGTCTAATACACCTAATGTCGCCTTTGCCTACCAAATTGCTAGTGCGACTGACTATCTGACAAGCCACGGGGTGAAAGCAATCGCAGGAAAGAAGATGAACTTGCAACATCTGAGAAACCAACAGTGGGTTCTAAGACCACCGCAAGTTAACACCATACCGATGCAACCTAGATCGGTAGAAACCAGGAACCTGGTAGATGGTAGTATTTCCATCCGATTTCATGATTATGAAATAGCCCCTTCAACGTCCAGACCCCACTACAATGAAGAAGACGAAGAAGTAGAGTCTGAGACAGAATCGGAGATAAGGGAACATACTATAGCAGTCTGGATTGGTGAAGAAGAAATCCCAGACCAAACAGGAAGAAAGAAAGTATGGGAAGAATCCAGCAATGGAAATGGGAGGTTCTTTCGATACTACACTCCCCTACCAATATCTGATGAACAAATTATAGCTACTGGTTGGGGAAGTGATGATGATGATAGGGATGAAAGTCCCTACGAGGATGAAAATCCTGATGAAGAAGAAGCAGCTGAGCCAATTTGGGATCAAGAAGAAGAAGACGAATATGATCCTAATATCTACATGGCTTATTTGCAAAAGGAAGAAAATGAGTGGCAAGAAATCGCCGCTGGACTGCAAGAAGAAACAGAAATGGAATATCCACGGCGGAAGCCACAGATGGAGACTGTATTTTCTGAAACGGTGGACTACAACCCACCTACTGATACAATGATGACACCTGTCGGATATCCACCGGCCTCGTCATCAAGATCAACAGTCACTACACCAGATAGGCCCCCTTTATTTGAAGGAAGGATGACACACGTGCCAAAATTCAAAAGAGATAACTACACAGAATGGTGGCAGCTACCATCATCTCAAGGCACAACTGGGGCGATATTTGTTATGCCCAAACAAATGGGCTTATTCCATGAAGTTTTCTTACGATGGGAGTCCATCACCAAAAACTATGTTGCGGCCCAAGGTTTCACGGACCCAACAGAAAAGATGGAGTTCATGGAAAATCTGTTAGGAGAAACAGAAAAGCTGACCTGGATCCAATGGAGGATGAACTATGAGGCTGAATATCAGCAGTTGTTAACTCAAGCTGATGGACGTCAAGGGACCCAAAACATCTTGTCCCAGATCAAAAGAGTCTTTTCTTTAGAAGACCCAGCCACAGGATCCACAAAAATACAAGATGCTGCATACAGAGACCTGGAGAGATTAACCTGCAACAACATCAAAGATATCGTTCAGTTCTTGAATGATTATGGAAGGTTAGCAGCAAAAAGTGGGCGATTGTTCTTAGGAACTGAGCTCAGTGAAAAGCTATGGATGAAGATGCCACCAGAGCTAGGGCATCGTATGAGAGAAGCATTTCAGAAAGAATACGCAGGCAATGAAGTAGGTGTCTTCCCGCGTATCTTGTTTGCATACAAATACTTGGAACAAGAGTGCAAAGACGCAGCGTTTAAACGCAGCCTGAAATCCTTAAGCTTCTGTAAGGATATGCCATTAACAGGTTACTATGATCAACCACCCAAGTATGGCATGAGAAAGTCTAAGACCTACAAAGGAAAGCCACACGCATCACATGCGAGAGTTGAAAAAAGAAAGCACTTAATCAGGAATAAGAAGTGCAAGTGTTACCTGTGTGGAGATGAAGGGCACTTTGCCAGAGAATGCCCTAATAACAAAAGAGATGTCAAGAGAGTAGCCATTTTCGAGGGAATCAATCTTCCTGATGGTTTCGACATTGTCTCAGTTGAAGAAGGGGAAGATGATTCAGATGCTATTTATAGTATATCTGAAAATGAGAATGGAGAAGAACTTGACGCGGAAGTAGTCCAAGAGAAAGTCTTCATGATAAGAGAAGAGGACCAATCCTATTGGTTAGGAAAGACTAATCATTGGACAATGATGGTGCGAGTCAGCAGCCAGCAGTATCATTGCTTGCACCAATGGGAACACAATAAGGAGATCACAACGGTGGCCCACATTAACTGCCACTTCTGTAAGCAACCCACTCAACTAAGGAGTCGAATACACTGTCCTACGTGTAAACTCACGAGTTGCTTCATGTGTGCCCCTATTTACTGCAATACAACTGTTCAACAACAGCCTAAACCACCTGCGCCATTCAACACCAACACTTTGCTTCAACAGCAAGCGGCGTATATTCAGTGGTTAGAAGGAGAAAACCAGCGGTTAACACAGGCAGTTGAATTTTACAAGAAGGAAGCTGCAGACCTTAGGCTCGAGAAAGAATTGGAGAAAGATAGAAAGGATCTGGAGCCAAAGACACAAGACAGAGGGAAGAAAGTTCTCATTATCAATCCACAAGAACCCTCTGAGGATGAACATACAGCGTATCTTGAGGAAGATACTGTCAGCCGAATCATCGGCCATACTGTGGAAGAACAGGAAATCAAAAAGCCCGTCAAACGAGGAAACATGCTATACAACCTCGACGTGGTTTTATCTATCCCTGAAGTTGGACGACCAATCAAGGTTAAAGCCATCCTTGATACAGGCGCAACCACCTGTTGCATCAATATCAACTCCGTTCCCAAAACGGCAATTGAACAGAATACCTTTCTGGTTCAATTTCGAGGCATTAATTCCACCCAATCAGTGGATAAAAAGCTGAAATACGGGCGAATGACTATCAGTAATCATCAGTTTCGCATCCCATACTGTTATGCCTTTCCCCTATCTTTGGGCGACGGAATAGAGATGATCCTAGGATGTAACTTCATCCGTGGGATGTATGGCGGTTTGAGGATTGAAGGTCATACTATCACTTTCTACAAAAATGTCACCACTATCCAAACCCGCCTTGCCGCTGTAATGGTTGGTGGTACAACCACTTCTGAGTTGGGGGAAGATGAAGAACCCATTTTTGAAACCGAAGAAGAAGTAGAAGAATTTGACTCAGAAGCCCATCAACAAATCATAAGTCATGCTGCAACACAAGCCCAACAGCAAAAGCTAAACCCAAAGCTCCAGCAACTGATGGATCAACTTAAAGATCAGGGCTTCATTGGGGACAATCCGATGCAGCATTGGGCTAAGAACAAGATTCTGTGCAGGTTGGATATCAAGAATCCAGACCTCATCATAGAAGATAAGCCCAT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| 51,746 |
MN433942.1
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Cacao swollen shoot virus
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Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, School of Plant Sciences
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USA
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2020-04-26
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Buyo5
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Cacao swollen shoot virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 7,045 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
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Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Buyo5, complete genome
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| 51,747 |
MN433943.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Kipi7b
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 7,080 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Kipi7b, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTAGCAATGGTCATGTCCGGCTAAAAACCTAAGGTTAGGAAAGGGGAAAGAGTGAGGTTATCGTTAGGCTTCAAAGTCCCAGACCCAAAATACTGTTCCCACACCAGTTAGAAGGAGACCAAACTGTTGGAAGTTTGTTGCTTCAAAAGAAAAAGGCGTAACCCAAATAGTACCTACAGGAAGGGAAGACGGGGAAAAGATGATCTTTTGAGGGCAAAAATCAAGACTATTCCTATTATGCTCTACAGTTGCAGCGAAAGCTGATCTTCTGTATCAGAAAGGGGAGAAAACTTGGTTAATGTCTAGCCGTTGGGAGAATAGTATCCAGGAATGGTATGAGAAGTCTCACACAGCCAACCTTGAGTACCTAGACCTAGCCTCTACTAGCAAAGTGACCAACAACCAATTAGCTCATAACCTAGCAGTAACATTTGACAGAGTCAACTTAGGAAACCGAGTCTTCATCAAAAACCTAAAACAAATCCAAGAGTCTATCTTAGAACTACATACCAGAATTGACACCGTAGAAGTAGCCTTGAAACGACTAACCAAGCTATTCAAAGAAAACAAACCTTTGTCTGAGTTTGAGGTAAAAAGACTAGTAGAAGAGATAGCCCAGCAACCAAAGATCGTTGAGGAACAAGCCCTCAGGATCTCTCAAGAGCTTGAACTAAAGCTCAAGGAAGTAGAAAAGCTGCTCCACAACCTTGGCCAAGTAATTGGTCAATGACTGATAGTCCCAGCTATCAAGAAGCACTGAAAGAAGCTGAGAAAGTTGACCCTCCTGCAGTCGGGTTAACTAATACCGGAAAAGTAACAGCACTTGACGGACTAAGGACGGTAATAAAGCAAAATAACGTCCAGATCTGTCTGCTAAGCTCCATAGCAGATAAACTTGAAGAACTGGTGCAAGACCAGAAGAAAGCAAGAAAGGATAAGGCAAAGGAGGTTGCCATCCCAGAGGATCTCATCACAAAACTCCAGGGGTTATCTATCCAGGAGAGAGGTGAAACGAAGGTCACAAAGAAACAAGAGCCAAAAGGAACACTGTTTGGATACAAAGATCCTTACAAGATTTTGGCAGCAGAAAAGGCTAAGATCACGCCTAAGCCCTTGAAAGAAAAAAGAGATGAGTCGAGCAAGGACACATCCTCCAGCTCCTAGTGTCACAGCTACCACTAGTGAGCAGAACAGGGAAGGACCTCTTTACGAGGACCAGATCAGAGACTACCGAAGGAGTCAAAGAAGGATCTTCAATCTAAGGAGAAGAGCTAGAAGATTAAGAAGATCAATGATGGGGTCTAGATATCAGGAGACCCTAGAACAAGAAATCGATCCACAGACAACACTGAGGTTGTCTATGCAAGAAAGAGCGAGACTAGTGCCAGCTGAGGTACTATACAGGTCACGACGAGACACTGTTCACCACAGAGTCTACACCCATCGCTCGGAAGAATCCATCCTTTGTGTCGGAGGAAATCAAGTAGACAGGGCCTTTATCCAGCCCGAAAGTTTAGAACAACTGCAAAGGACTGGAATGTCCTTCATCCATATAGGAATCCTGCAAGTAAGGATTCAGATCTTGCATCGCCAAGAGGAAGGTACCATGGCCTTAGTAGTCTTCCGTGACAACAGATGGACCGGAGACCAATCTATCTTCGCACAAATGGAGGTAGATTTAACTAAGGGGAGTCAATTGGTATTTGTTATACCAGATACTATGATGACCATTGGAGATTTTGCCCGGAACGTACAGTTATCAATCCTCACAAGAGGATATGAGAATTGGCAAAATGGGGAGTCAAACCTGCTAATAACACGTGGCATGACGGGACGACTGTCTAATACACCTAATGTCGCTTTTGCATATCAGATTGCTAGCGCGACTGACTATCTAACAAGCCACGGGGTAAAAGCAATCGCAGGGAAAAAGATGAACTTGCAACACCTGAGAAATCAACAGTGGATTCTAAGACCACCGCAAGTTAACATCACACCGATGCAACCTAGATCGGTAGAAACCAGGAATCTGGTAGATGGTAGTATTTCCATCCGATTCCAGGATTATGAAGTAGCCCCTTTAACGTCCAGACCCCACTACAATGAAGAAGATGAGGAAGTAGAGTCTGAGACAGAATCGGAGATAAGGGAACATACTATAGCAGTCTGGATTGGTGAAGAAGAAATCCCAGACCAAACAGGAAGAAAGAAAGTATGGGAAGAATCCAGCAATGGAAATGGGAGATTCTTCCGGTACTACACTCCTCCACCAACGCCTAATGAACAGATTATAGCTACTGGTTGGGGAAGTGATGATGATGATGAGAAAGAGGATGAAATCACTCTAAAATGGGATGAAAGTCCTTATGAGGATGAAAATCCTGATGAAGAAGAAGTAGCTAAGCCAATTTGGGATCAAGAAGAGGAGGAGGATGAATATGATCCTAATGTCTACATGGCTTATTTGCAAAAGGAAGAAAATGAGTGGCAAGAAATCGCCGCCGGCTTGCATGAAGAAATGGAGTACCCACGGCGGAAGCCACAAACGGAGACTGTATTTTCTGAAACGGTGGACTACAACCCACCTACTGATACAATGATGACACCCGTCGGATATCCACCAGCCTCGTCATCAAGATCAACAGTCACCACACCTGATAGGCCCCCTTTATTTGAAGGGAGAATGACACACGTGCCAAAATTCAAAAGGGACAACTACACAGAATGGTGGCAATTACCATCATCTCAGGGCACAACTGGGGCGCTGTTTGTAATGCCCAAACAAATGGGCTTATTCCATGAAGTTTTCTCACGATGGGAGTCCATCACCAAAAACTATGTTGCGGCCCAAGGTTTCACGGACCCAACAGAAAAGATGGAGTTCATGGAAAATCTGTTAGGAGAAACAGAAAAGCTGACCTGGATCCAATGGAGGATGAACTATGAGGCTGAGTATCAGCAGTTATTAACTCAAGCTGATGGGCGTCAAGGGACCCAAAACATCTTGTCCCAGATCAAAAGAGTCTTTTCTCTAGAAGACCCAGCCACAGGATCCACAAGAATACAGGATGCTGCATACAGGGACCTGGAAAGGTTAACCTGCAATAACATCAAAGATATCGTTCAGTTCTTGAATGATTATGGAAGGTTAGCAGCAAAAAGTGGGCGATTGTTCTTAGGAACTGAGCTCAGTGAAAAGCTATGGATGAAGATGCCACCAGAGCTAGGGCATCGTATGAGAGAAGCATTTCAAAAGGAATACGCAGGCAATGAAGTAGGCGTTTTCCCGCGTATCTTGTTTGCATACAAATACTTGGAACAAGAATGCAAAGACGCAGCGTTTAAACGCAGCCTGAAATCATTAAGCTTCTGCAAGGACATGCCATTAACAGGTTACTATGATCAACCATCCAAGTATGGCATAAGAAAGTCCAAGACTTACAAAGGAAAGCCACACGCATCACATGCGAGGGTTGAAAAGAGAAAGCACTTAATCAGAAACAAGAAGTGCAAGTGCTATCTGTGTGGAGATGAAGGGCACTTTGCCAGAGAATGCCCTAATAACAAAAGAGATGTCAAGAGAGTAGCCATTTTCGAAGGCATCAACCTTCCTGAAGGTTTCGACATTGTCTCAGTCGAAGAAGGGGAAGAGGACTCAGATGCTATTTATAGCATATCTGAGAATGAAAATGGAGAAGAACTTGACACAGAAGTAGTCCAAGAGAAAGTCTTCATGATAAGAGAAGAGGACCAATCCTACTGGTTAGGAAAGACTAATCATTGGACGATGATGGTGCGAGTCAGCAGCCAGCAGTATCATTGCTTGCACCAATGGGAGCACAATAAGGAGATCACAACGGTGGCCCACATCAATTGCCACTTCTGTAAGCAACCCACTCAACTAAGGAGTCGAATACACTGTCCTACGTGTAAACTCACAAGTTGCTTTATGTGTGCCCCTATCTACTGCAATACAACTGTTCAACAACAGCCTAAACCGCCTGCGCCATTCAACACCAACACTTTGCTTCAACAGCAAGCGGCGTATATTCAGTGGTTAGAAGGAGAAAACCAGCGGTTAACACAGGCAGTAGAATTCTACAAAAAGGAAGCTGCAGACCTTAGGCTCGAAAAAGAATTGGAGAAAGATAGAAAGGATCTGGAGCCAAAAACACAAGACAGAGGGAAGAAGGTTCTCATTATCGATTCACAAGAACCCTCTGAGGATGAACACATAGCGTATCTTGAAGAAGATACTATCAGCCGAATCATCGGCCATACTGTGGAAGAGCAACGGGAAATCAAAAAGCCCGTCAAACGAGGAAACATGCTATATAACCTCGACGTGGTTTTATCTATCCCTGAAGTGGGACGACCAATCAAGGTTAAAGCTATCCTTGATACAGGCGCAACCACCTGTTGCATCAACATCAACTCCGTTCCCAAAACGGCAATTGAACAGAATACCTTTCTAGTTCAATTTCGAGGCATTAATTCCACACAATCAGTGGATAAAAAGCTGAGATACGGGCGCATGGCCATCAGTAATCATCAGTTTCGCATCCCGTACTGTTATGCCTTCCCACTATCTTTGGGTGACGGAATAGAGATGATCCTAGGATGTAATTTCATCCGTGGGATGTATGGCGGTTTGAGGATTGAAGGGCATACCATCACCTTCTACAAAAATGTTACCACTATTCAAACCAGCCTTGCTGCTGTAATGGTTGGTGGTACAACCACTTCTGAGTTGGGGGAGGATGAAGAACCCATTTTTAAAACCCAAAAAGAAATAGAAGTAGAAGAATTTGACTCAGAAGCCCATCAACAAATTATAAGTCATGCTGCAACACAAGCCCAACAGCAAAAGCTAAACCCAAAGCTCCAACAACTGATGGATCAACTAAAAGAGCAGGGCTTCATTGGGGAGAATCCAATGCAGCATTGGGCCAAGAACAAGATTCTGTGTAGGTTGGATATCAA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| 51,748 |
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|
Cacao swollen shoot virus
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Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, School of Plant Sciences
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USA
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2020-04-26
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Kipi10b
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Cacao swollen shoot virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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| 7,055 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
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Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Kipi10b, complete genome
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| 51,749 |
MN433945.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Kipi26
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,064 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Kipi26, complete genome
|
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| 51,750 |
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Cacao swollen shoot virus
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Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, School of Plant Sciences
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USA
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2020-04-26
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Krag15
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Cacao swollen shoot virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
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GenBank
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Cote d'Ivoire
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Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
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Cacao swollen shoot virus isolate Krag15, complete genome
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| 51,751 |
MN433947.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Kipi12
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,007 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Kipi12, complete genome
|
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| 51,752 |
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Cacao swollen shoot virus
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University of Arizona, School of Plant Sciences
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2020-04-26
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Krag1
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Cacao swollen shoot virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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Cote d'Ivoire
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Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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2016-02
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Cacao swollen shoot virus isolate Krag1, complete genome
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| 51,753 |
MN433949.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Krag5
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,027 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Krag5, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTTAGCAATGGTCATGACCGGCTAAGTTAGTCAGTCTAGGTTCAGGGAAAGAGTGAGGTAACCGTTAGGCGTCAAAATACTGTTCCAAAATACTATTCACCAAACCACTAGGGGTATCCTGTTTATGTGAAAAAGACGTAACCCAGACGAAAAGTACCCACGAGGGGGAAAACTTGGGGAAAAGGTGATCAGTAAACAGAAACCAAACTATTCCTCGTATGCTCTACGGTTGCAGCTACGGCTGATCCTCTGTATCAGAAAAGGAAAAATTTGGCGTATGTCTAGCCGATGGGAAAATAGTATCCAGGAATGGTATGAGAAGTCTCACACTGCCAACCTTGAGTACCTTGACCTAGCCTCTACCAGTAAAGTGACCAACAACCAACTAGCTCATAACCTCGCAGTAACCTTTGATAGAGTTAACTTGGGAAACCGAGTCTTCATTAAAAACCTTAAACAAATTCAAGAATCTATCCTAGAACTAAATACCAGAATTGACACTATAGAAGTAGCCTTGAGAAGGCTAACCAAGCAGTTCCGAGAAAACAAACCACTGTCTGAATCTGAAGTAAAGAGATTAGTGGAAGAGATAGCCCAGCAACCCAAAATTGTTGAGAAACAGGCACTGGAAATATCTCAACAGTTAGAACTCAAACTAGAAAAAGTGGAAAAGCTTCTACACAAGCTTGACCAGTGGGTTGGTCAATGAGTGAAAGCCCCTCTTACCAAGAAGCACTTAAGGAAGCTGAAAAGATCGACCCTCCAGCGATTGGACTAACCACATCCAGTGGAGTGACTGCGGTCCAAGGCTTCAGGACCGTCATCAAACAAAACAACGTCCAGATTTGCCTACTTGCGGCTATAGCAGACAAACTTGAAGAACTGGTGCAAGATCAGAAGAAAGCAAGAAAAGACAAGGCTAAGGAGGTTGCCATTCCTGAGGATCTTATCACAAAACTCCAAGGATTATCCATCCAGGAGAAAAGTGAAGCAAAGGTCACAAGGAAACCAGAGCCAAAAGGAACACTGTTTGGATTCAAAGATCCTTACAAAATTTTGGCAGCAGAAAAGGCTAAGATCACACCAAAGCCTGTAAAAGAAAAGAAAGATGAGTCGAGCAAGACCGCAACCTCCAGTTCCTAGTGTGACATCTACCACTAGTGAACAGAACAGAGAAGGGCCTCTTTATGAGGACCAAATCAGAGACTACAGAAGGAGTCAGAGGAGGATCTTCAACCTAAGAAGGAATGCCAGAAGGTTGAGAAGATCAATGATGGGGTCTAGATACCAGGAGACCCTAGAACAAGAAATTGATCCACAGACAACACTGAGGTTGTCCATGCAAGAAAGGGCGCGATTAGTACCAGCTGAAGTACTGTACAGATCACGACGAGACACTGTTCACCACAGGGTCTACACCCATCGCTCTGAAGAATCCGTCCTATGTGTCGGCGGAAATCAAGTTGACAGGGCCTTTATTCAGCCCGAAAGTTTAGAGCAACTTCAGAGGACTGGAATGTCCTTTATTCATATAGGAATCCTGCAAGTTAGGATTCAAATCCTGCATCGTCAAGAAGAAGGTACCATGGCTTTAGTTGTCTTCCGTGACAACAGATGGTCTGGAGACCAGTCTATCTTCGCACAAATGGAGATAGATTTAACTAAAGGCAGCCAGTTGGTATTTGTCATACCGGATACCATGATGACGATCGGAGATTTTGCCCGGAACGTACAACTATCAATCCTCACACGAGGATATGAGAATTGGCAAAATGGAGAAGCCAATCTTTTAATCACACGTGGCATGACGGGACGTCTATCCAACACACCTAATGTCGCCTTTGCCTACCAAATTGCCAGCGCGACAGATTATCTGGCAAGCCACGGAGTAAAAGCCATCGCAGGGAAAAAGATGAACTTACAACACCTGCGAAATCAACAGTGGATTCTACGACCACCGCAAGCTGACATCACACCGATGCAACCAAGATCGGTAGAAACCAGGAACCTGGTAGATGGCAGCATTTCCATCAGATTCCATGATTATGAGGCAGCCACCTCAACATCAAGAACCCATTACAACGAAGAAGATGAAGAAGTGGAGTCTGAAACAGAATCTGAAATAAGAGAACACACTGTAGCAGTCTGGATTGGGGAAGAAGAAGTTCCAGACCAAACAGGAAGAAAGAAAGTATGGGAAGAATCTAGTAATGGAAATGGAAGGTTCTTCCGATACTACACTCCTCCACCAACATCTGATGAACAAATCATAGCCACTGGTTGGGGAAGTGATGATGATTATGATGATGAAATCCCTCTAAAATGGGATGAAAGTCCTGATGAAGAAGGATCAAGTGAGCCAATTTGGGATCAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGATGAATACGATCCCAACATCTATATGGCTTATTTACAAAAGGAAGAAGATGAGTGGCAAGAAATCGCCGCCAGTTTACAAGAAGAAATGAAAATGGAATATCCACGGCGGAGGCCACAGACGGAGACAGTATTCTCTGAAACAGTTGACTATACACCACCTGGTGACACAATGATGACACCTGTCGGATATCCACCAGCCTCGTTATCAAGATCAACAGTCACAACACCAAGTAGGCCCCCTTTATTTGAAGGAAGGGTTACACACGTGCCAAGATTCTTAAAACGGGATGACTACACAGAATGGTGGCAACTACCATCATCCCAAGGCACAACTGGGGCATTATTTGTGATGCCCAAACAAATGGGCCTATTTCATGATGTCTTCTCCAGATGGGAGTCCATCACCAAAAACTATGTTGCGGCCCAAGGTTTCACGGACCCAACAGAAAAGATGGAGTTCATAGAAAACTTACTTGGAGAAACAGAAAAACTAACCTGGATCCAATGGAGAATGAATTATGAGGCTGAGTACCAGCAGCTGTTAACCCAAGCTGATGGACGGCAAGGGACCCAGAATATCTTGTCCCAAATTAAGAGAGTCTTCTCTCTAGAAGACCCCGCCTCAGGATCCACGAGGATACAAGATGCTGCATACAGAGACCTTGAAAGATTGACCTGTCACAACATAAAAGATATCGTTCAGTTCCTGAATGATTATGGGCGGTTAGCAGCAAAAAGTGGACGACTGTTTCTAGGAACAGAGCTCAGTGAAAAGCTATGGATGAAGATGCCACCAGAACTAGGGCATCGCATGAAGGAAGCATTTCAAAAGGAATACTCAGGCAATGAAGTAGGAGTCTTCCCGCGTATCTTGTTCGCGTACAGATACTTAGAACAAGAATGCAAAGACGCAGCGTTTAAGCGCAGCCTGAAATCGTTGAGCTTCTGTAAGGACATGCCGTTGACAGGTTACTATGATAAAACACCCAAGTACGGCATGAGGAAGTCAAAAACTTACAAAGGAAAGCCACACGCATCACATGCAAGAGTAGAAAAGAGAAAGCACTTAATCAGGAATAAAAAGTGCAAATGCTATCTGTGTGGAGATGAAGGACATTTTGCCAGAGAATGCCCTAATAACAAAAGAGACGTCAAGAGAGTAGCCATTTTTGAAGGCATCAATCTTCCTGAGGGTTTCGACATTGTCTCAGTAGAAGAAGGGGAAGATGACTCAGATGCTATTTATAGCATATCTGAGAATGAAAATGAGGAAGAACTTGACGCAGAAGTAGTCCAAGAGAAGGTCTTCATGATGAGAGAAGAGGACCAATCCTACTGGCTAGGAAAAACAAATCACTGGACAGCAATGGTGCGAGTCAGCAGCCAACAGTATTATTGCTTGCACCAATGGGAGCACAACAAGGAGATCACGATGGTGGCCCACATCAACTGCCACTTCTGTAAGCAGCCCACTCAACTGAGGAGTCGAATACACTGTCCCACGTGTAAACTCACCAGTTGCTTCATGTGTGCCCCTATCTACTGCAATATAACGGTCCAACAGCAGCCTAAACCGCCTACGCCATTCAACACCAACACCTTGCTCCAACAACAAGCGGCGTATATCCAATGGTTAGAAGGAGAAAACCAGCGGTTAACAGAGGCAGTTGAATTTTATAAAAAGGAAGCTGCAGATCTAAGGCTCGAGAAAGAATTGGAAAAAGATAGAAAAGATTTAGAGCCAAAAATACAAGACAGAGGGAAGAAGGTTCAAATCCTTGATCCAGAAGCAGGACCCTCTGATGATGAACAAATAGCGTATCTTGAGGAAGATACCGTTAGCCGAATTATCGGCCATACTGTGGAAGAGCAACAAGAGGTCAAAAAACCAGTCAAAAGGGGGAACATGTTATACAACCTCGACGTGGTTTTACTTATCCCTGAAGTTGGAAGGCCTATCAAGGTTAAAGCTATCCTTGATACCGGCGCAACTACCTGTTGCATCAACATCAACTCTGTTCCCAAGACAGCAATTGAACAGAACACTTTTCTGGTTCAATTCAGAGGCATTAATTCCACGCAATCAGTAGATAAAAAGCTAAAATACGGGCGGATGACTATTAGCAACCACCAGTTCCGGATCCCGTACTGTTATGCCTTTCCTCTATCTCTTGGAGACGGAATAGAAATGATCCTCGGGTGTAACTTCATCCGTGGGATGTATGGCGGTTTGAGGATTGAAGGTCACACAATCACCTTCTACAAAAACGTCACCACTATTCAAACCCGCCTTGCTGCTGTAATGGTTGGTGGTACAACCACTTCTGAGTTGGGGGAGGAAGGTACTGAACCCATTTTTGAAACTGAAGAAGAAACAGAAGAGTTTGACTCAGAAGTCCATCAACAAATTGTGAGTCATGTTGCAGCCCAAGCCCAACAACAAAAACTAGATCCAAAACTCCAACAACTAATGGAACGGTTAAAGGATCAGGGCTTTATTGGGGAAAATCCGATGCAACATTGGGCTAAAAACAAGATCCTGTGTAGGTTGGATATCAAGAATCCAGACCTTATCATAGAAGACAAGCC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| 51,754 |
MN433950.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Pbou21
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,031 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Pbou21, complete genome
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| 51,755 |
MN433951.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Pbou3
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,024 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Pbou3, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTGGTTTTAGCAATGGTCATGTCCGGCTAAGTTAGTCAGTCTAGGTTCAGGGAAAGAGTGAGGTAACCGTTAGGCGTCAAAATACTGTTCCAAAATACTATTCACCAAACCACTAGGGGTATCCTGTTTATATGAAATAGACGTAACCCAGACGAAAAGTACCCACGAGGGGGAAAACTTGGGGAAAAGGTGATCAGTAAACAGAAACCAAACTATTCCTCGTATGCTCTACGGTTGCAGCCACGGCTGATCCCCCGTATCAGAAAAGGAAAAATTTGGCGTATGTCTAGCCGATGGGAAAATAGTATCCAGGAATGGTATGAGAAGTCTCACACTGCCAACCTTGAGTACCTTGACCTAGCCTCTACCAGTAAAGTGACCAACAACCAACTAGCTCATAACCTCGCAGTAACCTTTGATAGAGTCAACTTAGGAAACCGAGTCTTCATTAAAAACCTTAAACAAATTCAAGAGTCTATCCTAGAACTAAATACCAGAATTGACACTGTAGAAGTAACCTTGAGAAGGCTAACCAAGCAGTTCCGAGAAAACAAACCACTGTCTGAATCTGAAGTAAAGAGACTAGTGGAAGAGATAGCCCAGCAACCCAAAATTGTTGAGAAACAGGCACTGGAAATATCTCAACAGTTAGAACTCAAACTAGAAAAAGTGGAAAAGCTTCTACACAAGCTTGACCAGTGGGTTGGTCAATGAGTGAAAGCCCCTCTTACCAAGAAGCACTTAAGGAAGCTGAAGAGATCGACCCTCCAGCGATTGGACTAACCACATCCAGTGGAGTGACTGCGGCCCAAGGCTTCAGGACCGTCATCAAACAAAACAACGTCCAGATTTGCTTACTTGCGGCTATAGCAGACAAACTTGAAGAACTGGTGCAAGATCAGAAGAAAGTAAGAAAAGACAAGGCTAAGGAGGTTGCCATTCCTGAGGATCTTATCACAAAACTCCAAGGATTATCCATCCAGGGGAAAGGTGAAGCAAAGGTCACAAGGAAACCAGAGCCAAAAGGAACACTGTTTGGATTCAAAGATCCTTACAAAATTTTGGCAGCAGAAAAGGCTAAAATCACATCAAAGCCTGTAAAAGAAAAGAAAGATGAGTCGAGCAAGACCGCAACCCCCAGTTCCTAGTGTGACATCTACCACTAGTGAACAGAACAGAGAAGGGCCTCTTTATGAGGACCAAATCAGAGACTACAGAAGGAGTCAGAGGAGGATCTTCAACCTAAGAAGGAATGCCAGAAGGTTGAGAAGATCAATGATGGGGTCTAGATACCAGGAGACCCTAGAACAAGAAATTGATCCACAGACAACACTGAGGTTGTCCATGCAAGAAAGAGCGCGATTAGTACCAGCTGAAGTACTGTACAGATCACGACGAGACACTGTTCACCACAGGGTCTACACCCATCGCTCTGAAGAATCCGTCCTATGTGTCGGCGGAAATCAAGTTGACAGGGCCTTTATTCAGCCCGAAAGTTTAGAGCAACTTCAGAGGACTGGAATGTCCTTTATTCATATAGGAATCCTGCAAGTTAGGATTCAAATCCTGCATCGTCAAGAAGAAGGTACCATGGCTTTAGTTGTCTTCCGTGACAACAGATGGTCTGGAGACCAGTCTATCTTTGCACAAATGGAGATAGATTTAACTAAAGGCAGCCAGTTGGTATTTGTCATACCGGATACCATGATGACGATCGGAGATTTTGCCCGGAACGTACAACTATCAATCCTCACACGAGGATATGAGAATTGGCAAAATGGAGAAGCCAATCTTTTAATCACACGTGGCATGACGGGACGACTATCCAACACACCTAATGTTGCCTTTGCCTACCAAATTGCCAGCGCGACAGATTATCTGGCAAGCCACGGAGTAAAAGCCATCGCAGGGAAAAAGATGAACTTACAACACCTGCGAAATCAACAGTGGATTCTACGACCACCGCGAGCTGACATCACACCGATGCAACCAAGATCGGTAGAAACCAGGAACCTGGTAGATGGCAGCATTTCCATCAGATTCCATGATTATGAGGTAGCCACCTCAACATCAAGACCCCATTACAACGAAGAAGATGAAGAAGTGGAGTCTGAAACAGAATCTGAAATAAGAGAACACACTGTAGCAGTCTGGATTGGGGAAGAAGAAGTTCCAGACCAAACAGGAAGAAAGAAAGTATGGGAAGAATCCAGTAATGGAAATGGAAGGTTCTTCCGGTACTACACTCCTCCACCAACATCTGATGAACAAATCATAGCCACTGGTTGGGGAAGTGATGATGATTATGATGATGAAATCCCTCCAAAATGGGATGAAAACCCTGATGAAGAAGGATCAAGTGAGCTAATTTGGGATCAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAATACGATCCCAACATCTATATGGCTTATTTACAAAAGGAAGAAGATGAGTGGCAAGAAATCACCGCCAGTTTACAAGAAGAAAGGGAAATGGAATATCCACGGCGGAGGCCACAGACGGAGACAGTATTCTCTGAAACAGTTGACTATACACCACCTGGTGACACAATGATGACACCTGTCGGATATCCACCGGCCTCGTCATCAAGATCAACAGTCACAACACCAAGTAGGCCCCCTTTATTTGAAGGAAAGGTTACACACGTGCCAAGATTCAAACGGGATGACTACACAGAATGGTGGCAACTACCATCATCCCAAGGCACAACTGGGGCATTATTTGTGATGCCCAAACAAATAGGCCTATTTCATGATGTCTTCTCCAGATGGGAGTCCATCACCAAAAATTATGTTGCGGCCCAAGGTTTCACGGACCCAACAGAAAAGATGGAGTTCATAGAAAACTTACTTGGAGAAACAGAAAAACTAACCTGGATCCAATGGAGAATGAATTATGAGGCTGAGTACCAGCAGCTGTTAACCCAAGCTGATGGACGGCAAGGGACCCAGAATATCTTGTCCCAAATTAAGAGAGTCTTCTCTCTAGAAGACCCCGCCTCAGGATCCACGAGGATACAAGATGCTGCATACAGAGACCTTGAAAGATTGACCTGCCACAACATAAAAGATATCGTTCAGTTCCTGAATGATTATGGGCGGTTAGCAGCAAAAAGTGGACGACTGTTTCTAGGAACAGAGCTCAGTGAAAAGCTATGGATGAAGATGCCACCAGAACTAGGGCATCGCATGAAGGAAGCATTTCAAAAGGAATACTCAGGCAATGAAGTAGGAGTCTTCCCGCGTATCTTGTTCGCGTACAGATACTTAGAACAAGAATGCAAAGACGCAGCGTTTAAGCGCAGCCTGAAATCGTTGAGCTTCTGTAAGGACATGCCGTTGACAGGTTACTATGATAAAACACCCAAGTACGGCATGAGGAAGTCAAAAACTTACAAAGGAAAGCCACACGCATCACATGCAAGAATAGAAAAGAGAAAGCACTTAATCAGGAATAAAAAGTGCAAGTGCTATCTGTGTGGAGATGAAGGACATTTTGCCAGAGAATGCCCTAATAACAAAAGAGATGTCAAGAGAGTAGCCATTTTTGAAGGTATCAATCTTCCTGAGGGTTTCGACATTGTCTCAGTAGAAGAAGGGGAAGATGACTCAGATGCTATTTATAGCATATCTGAGAATGAAAATGGGGAAGAACTTGACGCAGAAGTAGTCCAAGAGAAGGTCTTCATGATGCGAGAAGAGGACCAATCCTACTGGCTAGGAAAAACAAATCACTGGACAGCAATGGTGCGAGTCAGCAGCCAACAGTATTATTGCTTGCACCAATGGGAGCACAACAAGGAGATCACGATGGTGGCCCACATCAACTGCCACTTCTGTAAGCAGCCCACTCAACTGAGGAGTCGAATACACTGTCCCACGTGTAAACTCACCAGCTGCTTCATGTGTGCCCCTATCTACTGCAATATAACGGTCCAACAGCAGCCTAAACCGCCTACGCCATTCAACACCAACACCTTGCTCCAACAACAAGCGGCGTATATCCAATGGTTAGAAGTAGAAAACCAGCGGTTAACAGAGGCAGTTGAATTTTATAAAAAGGAAGCTGCAGATCTAAGGCTCGAGAAAGAATTGGAAAAAGATAGAAAAGATTTAGAGCCAAAAATACAAGACAGAGGGAAGAAGGTTCAAATTCTTGATCCAGAAGCAGGACCCTCTGATGATGAACAAATAGCGTATCTTGAGGAAGATACCATTAGCCGAATTATCGGCCATACTGTGGAAGAGCAACAAGAGGTCAAAAAACCAGTCAAAAGGGGGAACATGTTATACAACCTCGACGTAGTTTTACTTATCCCTGAAGTTGGAAGACCTATCAAGGTTAAAGCTATCCTTGATACTGGCGCAACTACCTGTTGCATCAACATCAACTCTGTTCCCAAGACAGCAATTGAACAGAACACTTTTCTGGTTCAATTCAGAGGCATTAATTCCACGCAATCAGTAGATAAAAAGCTAAAATACGGGCGGATGACTATTAGCAACCACCAGTTCCGGATCCCGTACTGTTATGCCTTTCCTCTATCTCTTGGAGACGGAATAGAAATGATCCTCGGGTGTAACTTCATCCGTGGGATGTATGGCGGTTTGAGGATTGAAGGTCACACAATCACCTTCTACAAAAACGTCACCACTATTCAAACCCGCCTTGCTGCTGTAATGGTTGGTGGTACAACCACTTCTGAGTTGGGGGAGGAAGGTACTGAACCCATTTTTGAAACTGAAGAAGAAACAGAAGAGTTTGACTCAGAAGTCCATCAACAAATTGTGAGTCATGTTGCAGCCCAAGCCCAACAACAAAAACTAGATCCAAAACTCCAACAACTAATGGAACGGTTAAAGGATCAGGGCTTTATTGGGGAAAATCCGATGCAACATTGGGCTAAAAACAAGATCCTGTGTAGATTGGATATCAAGAATCCAGACCTTATCATAGAAGACAAGCCCAT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| 51,756 |
MN433952.1
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Cacao swollen shoot virus
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Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
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2020-04-26
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Pbou12
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Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
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Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,018 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
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Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Pbou12, complete genome
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| 51,757 |
MN433953.1
|
Cacao swollen shoot virus
|
Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
|
University of Arizona, School of Plant Sciences
|
USA
|
2020-04-26
|
Krag8
|
Cacao swollen shoot virus
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,023 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Theobroma cacao
|
plant leaf
|
2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Krag8, complete genome
|
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| 51,758 |
MN433954.1
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Cacao swollen shoot virus
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Ramos-Sobrinho,R., Chingandu,N., A Gutierrez,O., Marelli,J.P., K Brown,J., Gutierrez,O.A., Brown,J.K.
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University of Arizona, School of Plant Sciences
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USA
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2020-04-26
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Krag9
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Cacao swollen shoot virus
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Badnavirus
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Caulimoviridae
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dsDNA-RT
| 7,041 |
GenBank
| 1 |
Cote d'Ivoire
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Cote d'Ivoire
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Theobroma cacao
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plant leaf
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2016-02
| null | null |
Cacao swollen shoot virus isolate Krag9, complete genome
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| 51,759 |
NC_043618.1
|
Cache Valley virus
| null |
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-06-28
| null |
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
RefSeq
| null |
USA
|
USA
|
Culiseta inornata
| null |
1956
| null |
PRJNA485481
|
Cache Valley virus strain 6V633 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAAAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATTTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTTTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTCAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTGATTCTACCAGTTATGGAGCAAATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAACCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAGCTAGATTTTTCAAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTTGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGACTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTGAACTTATTCGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCCACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAAAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGTATGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCTTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGACAAAACTACAACTGACCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATAAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTTAACACATTAAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGGCTAGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGCGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCCGGTAGAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGATCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGAAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTCAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTAGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAGAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTCTTTAATAAAGGACAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATCTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTGGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTAGATCAAAAAACTCCATACAACAATGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAGACTATGAAGTTGCTGGACGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAATCAGACATCCCTTGCCATTATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACTTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGCAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCATTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCCCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGATAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGATCTGGAGGACATAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGAAATATGAAATTAATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCACTTGAATGAGTTTTTAGAAAGCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGATAACCCACCCAAGCATTTAACTGGGATGGAAATTACAATGTACAAGATCAGAGAATTAACAAAGTTGTATCAATTGTGCTATGATTATATAAAATCTACTGAGCACAAGGTTAAAGTCTTTATATTGCCAATGAAAGCATATACATCTGTGGACTTTTGCACATTAGTTCAGGGTAATACTATTTCTGATGATAAATGGTTCACGATGCATTATTTGAAACAAATTCTAAGTGGATCAGCAAAGGGCAATATAGTAACTACAAGTACAACTGAGCAAATTATAGCAAATGAATGTTTTAGGGTATTAACACACTTTGCAGATTCATTTGTGGAGGAGGCAAGTCGTTTGAGTTTTATCACAGAGGTAGTAGATAATTTTTCATATAAGAATATACCAGTTAATTCATTATACAATACAATTTTAGGAAGCAATTTGAGATTGGATTTTATCCCATTACTTTTTAGAATGCAAGCACTAACACAGGCAGATTTGAACAAATTCGATGCTCTAAAGACAAATGAAAGAGTGTCCTGGAATAATTGGCAGACTAATAGATCTCTTAATTCAGGTGTCATAGATTTAACAATCTCAGGTTACCTGAGGTCTATAAGAATTGTTGGTGAAGATAAAATCTTAAAGATTGCAGAGTTAACAATACCGAATTTTTACCCAAATACAGTTTTCCATGCGGGGAATAAACTATTGAATTCTAGACATGGTTTGAAATTCGAATTTATGTCAGAGCAAGTTCTAGATGATAAATTTAGTTATTATATCACATACCAAAAAAAACGTGCCCATATGTATACATATCAAGTATCGACAATAGAACATATATATAGAAGAAACCAGGAAGGCCTTGCTGCTAGAGGAAATAGATACAACCGAATGGTCCCAGTGTGCCCAGTTGTACTGTCAGTTCGAGATGAATTGTTCCGAATGAGTATGAACAATGTTTTTAGTTTAAATATGACCAATTTTACTATGTCCAGGTTATATATCTCACCAGATGAAATGGCAACTATAAAGAAAGCTCATATGTCAAAAATGATGTTCTTTAATGGGCCAGACATAAAGGCAGGTATAATAAATTTAACAGCTCTAATGAGGACACAAGAGCTTCTATCATTAAATTATGATAATATTTGTAAATCCAGTATAGTTCCATTTTGTAGAATACTTTCATGTGAAGGGAGTGAAGATAATGGGGAATTAATATTTCTATCAGATGAAGTGATGGATTTTACAATATCTGAAGAAATAGAATCTATGCCAATATTCACTATTAAATATCAAAAGAGGGGAAATGAGAAAATGACATATAAAAATGCAATATCTAAGTTAGTCTCACATGGTGTTGAAGAAATCACAACAGTCTTTGACTTTTCTAAAGATGGGTTTTATTCGAAGAAAAACCTTGGAATAATAAATACCCTATGCTCAATAATAAATCTACTGGAAACGAATGAGTGGTCGTCGATTCTTTTAAATTCATTTCATATTGCTATGTTGTTAGAGGGGATGGACAGGGAATTCCACCTCTTTTCCCTACCATCTGCATTTTTCAATAATGTAGCCTCTGGGAACATAAACTGGACAAAACTTTTAAAATTCATCAAATCCCTCCCAAAAATCCACAATGAGCCTTGGTCAATGATGATGGAGAGGTTTATAGAAAAGACAATATATTTAATAGAAAAGGAGTTGAATAAGGAGGCCAATTTTAGCGATTTCCTAGATGAGCTAGAGTTCCAGACAGGAAAATCAATGTTTAGTTTTTTCTAGATTTAGAACGTTCTCATATCAACCCCTAATTGGACATCTTCAAAAGCCTATATGGCACAAAAAAACAGCGAATTTATCAATTTCTTTATATAGGAGCACACTACT
| 3,470 |
OK523474.1
|
Cache Valley virus
|
Lamboo,L., Ambagala,A., Lung,O., Pickering,B., Rahim,N.M., Tomczyk,M., Bryan,B., Duizer,G., Copeland,S.
|
Canadian Food Inspection Agency, Mammalian Diseases Unit
|
Canada
|
2022-11-02
|
SK/Canada/WIN-AH-2021-OTH-0002
|
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,835 |
GenBank
| null |
Canada: Saskatoon, SK
|
Canada
|
Ovis aries
|
placenta
|
2020-12-31
| null | null |
Cache Valley virus isolate SK/Canada/WIN-AH-2021-OTH-0002 segment L, complete sequence
|
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| 22,406 |
OL555724.1
|
Cache Valley virus
|
Al-Heeti,O., Wu,E.L., Ison,M.G., Saluja,R.K., Ramsey,G., Matkovic,E., Ha,K., Hall,S., Banach,B., Wilson,M.R., Miller,S., Chiu,C.Y., McCabe,M., Bari,C., Zimler,R.A., Babiker,H., Freeman,D., Popovitch,J., Annambhotla,P., Lehman,J.A., Fitzpatrick,K., Velez,J.O., Davis,E.H., Hughes,H.R., Panella,A., Brault,A., Erin Staples,J., Gould,C.V., Tanna,S., Brault,A.C., Gould,Cv., Staples,E.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-borne Diseases
|
USA
|
2022-08-08
|
R132738d
|
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,871 |
GenBank
| 1 |
USA: Illinois
|
USA
|
Homo sapiens
|
cerebrospinal fluid
|
2021
| null | null |
Cache Valley virus isolate R132738d segment L, complete sequence
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AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACCAAACCAAGAATAATATGGAGGACCAAATGCATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAGTCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATCTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTCTGTGCCTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTTAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGACGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTGATACTACCAGTTATGGAGCAGATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAATCCTGTGACATATCAAATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAGCTAGATTTTTCAAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTCGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGATTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTGAACTTATTTGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTACACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCTACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTGGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGACTCATTAAAAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGCTTGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTTTTCAAAGGACAAGAAAGACAAAAATTCCTCAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAGGACAAAACTACAACCGATCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATAAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGAGTATTCTCAGACCAGATAAAAGAGGCTTCAGAAGATACATTCAACACACTAAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGATATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGTAAGGCTATTAGGCTGGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTATCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGTGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTGAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCTGGTAAAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGACCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGGAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCCAGACATAATCATCTGAGAAACAGAGTGGAAAGCCGTAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCGAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTTAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCTACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTATCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTGGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAAAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGACAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCATAAGGATTTTTCATTTACATTTTTTAATAAAGGGCAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATTTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTAGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAAACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGACGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCAAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTGGATCAAAAAACTCCATACAACAACGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGAAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTATATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAAACTATGAAGTTGCTGGACGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAACCAGACATCCCTTGCCATCATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACCTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGTAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGGTGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATCTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCATTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCACTTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCGAATGATGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGCGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAGAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCTCATAAACCAATCATTGATTATAGCAGTATCTTTGATAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGATCTGGAAGACGTAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCAGAATTCAGAAATATGAAATTAATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCATTTGAATGAGTTTTTAGAAACCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGACAACCCACCCAAGCATTTAAC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| 27,291 |
MZ612422.1
|
Cache Valley virus
|
Lopez,K., Wilson,S.N., Coutermash-Ott,S., Tanelus,M., Stone,W.B., Porier,D.L., Auguste,D.I., Muller,J.A., Allicock,O.M., Paulson,S.L., Erasmus,J.H., Auguste,A.J.
|
Virginia Polytechnic Institute and State University, Entomology
|
USA
|
2021-08-16
|
W08491
|
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,866 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Culex tarsalis
| null | null | null | null |
Cache Valley virus isolate W08491 segment L, complete sequence
|
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| 39,478 |
MZ612423.1
|
Cache Valley virus
|
Lopez,K., Wilson,S.N., Coutermash-Ott,S., Tanelus,M., Stone,W.B., Porier,D.L., Auguste,D.I., Muller,J.A., Allicock,O.M., Paulson,S.L., Erasmus,J.H., Auguste,A.J.
|
Virginia Polytechnic Institute and State University, Entomology
|
USA
|
2021-08-16
|
4B
|
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,866 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Aedes japonicus
| null | null | null | null |
Cache Valley virus isolate 4B segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAAAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATTTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTTTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTCCTCTTGGATGAGATCGTCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTCAATATACCAAATGTCACACCTGATAATTACATTTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATAGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGACAGCACCGAAATAACATACAAAAAGTATACAACTCTGATTTTACCAGTCATGGAACAAATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAACCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAACTAGATTTTTCAAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAATTTGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGACTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGGTGATACTCCAGAGTTGTATGATCATCCAATTTATAAAGAATTTATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTAAACTTATTCAATGAGGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAACGGCGAATATATGAAACCTACACAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTGATGAGTCAAAGAATCTCTGAAGAAAGGGATATCACAACAGATATAAATAAGCAGAAGCCATCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAACAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTTATATTTTTGTCAAACTCTTTACAATCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAGAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAATGTTGGAGCTTATGAGAACCTCTGTATGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCTTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGATAAAACTACAACTGACCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACTATTGTTCTGATGGCAGCGAGATCAATGATAAACAAAAATAAGACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTTAACACATTAAAAAAGATAAACAAAACATGTTTTTGGCAATGTATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGGAATATTCTCTCAGTATCACAATACAACAGGCATAACACTTTCAGAGTGGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACCTTAGAATTAAAGACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGACTGGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCTCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTACTGTATAATAACAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTGAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAGAGTATGTTATCTCTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCTAGTCATGTAAAGGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGCGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTTCCTGGTAGAGTAAACCTTAAAGAATATATCAATCAAATCTACTTGCCTTTTTACTTTAATGCAAAGGGCCTTCATGAAAAGCATCACGTTATGATAGATCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACCCAAAGGATGGATGATTTGGGCATATGGTCTAAGCATGAAAAGAAGCAACATGTTAATTTGCCAATATTGATCCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTCAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTAGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCAAATTATAGAGATTATATCTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATACGAGTTATTTAAATTAAAAGAACTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTCTTTAATAAAGGACAAAAGACAGCAAAGGACAGGGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATCTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTGGAGAAAAAAGCAGAAGAAGAGATAAGATACATTGTAGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCCACAAAAGCATTGAAATTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTGCCAGATGATTTGCTATCTAACATATTAGATCAAAAAACTCCATATAACAATGATTTAATCCTAAATTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAAACTATGAAGCTGCTAGATGGAGATTGTCTGGTGAATTCAATGGTTCATTCAGATGACAATCAAACATCTCTTGCCATTATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACTTTTGGATGCCAAGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGCAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATACAACATGCTAGATGAACAAGTAAATTGCCCGACAAATCATTTACCATTTACAGATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTACATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGGAGTAGATCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGACTATAAAGAAACATTGGGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCGCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGATAAATTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGAGACATCAATCATTTACCCTTAGATCTGGAGGACATAAGCATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGGAATATGAAATTGATACATCACTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGACTTACCTGGTGCTGAGCCCACAGAGCTTGAAAAAGACTTGCATCACTTAAATGAGTTTTTAGAAAACACTGGTATCAAGGAAAAAATAGAGCAAAACATGGACAACCCACCCAAGCACTTAAC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| 39,479 |
MK861967.1
|
Cache Valley virus
|
Hughes,H.R., Yates,K., Naqvi,S.H., Lambert,A.J., Velez,J., Kosoy,O., Turabelidze,G., Staples,J.E.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-Borne Diseases
|
USA
|
2020-01-27
|
R103016b
|
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| null |
USA: Missouri
|
USA
|
Homo sapiens
|
blood
|
2015-09
| null | null |
Cache Valley virus isolate R103016b segment L, complete sequence
|
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| 54,421 |
MH166879.1
|
Cache Valley virus
|
Dunlop,J.I., Szemiel,A.M., Navarro,A., Wilkie,G.S., Tong,L., Modha,S., Mair,D., Vattipally,S.B., Da Silva Filipe,A., Li,P., Vanlandingham,D.L., Higgs,S., Elliott,R.M., Kohl,A.
|
University of Glasgow, MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2018-09-11
| null |
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
| null | null |
2018-03-09
| null | null |
Cache Valley virus strain 6V633 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAAAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATTTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTTTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTCAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTGATTCTACCAGTTATGGAGCAAATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAACCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAGCTAGATTTTTCAAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTTGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGACTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTGAACTTATTCGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCCACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAAAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGTATGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCTTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGACAAAACTACAACTGACCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATAAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTTAACACATTAAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGGCTAGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGCGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCCGGTAGAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGATCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGAAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTCAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTAGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAGAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTCTTTAATAAAGGACAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATCTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTGGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTAGATCAAAAAACTCCATACAACAATGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAGACTATGAAGTTGCTGGACGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAATCAGACATCCCTTGCCATTATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACTTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGCAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCATTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCCCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGATAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGATCTGGAGGACATAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGAAATATGAAATTAATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCACTTGAATGAGTTTTTAGAAAGCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGATAACCCACCCAAGCATTTAACTGGGATGGAAATTACAATGTACAAGATCAGAGAATTAACAAAGTTGTATCAATTGTGCTATGATTATATAAAATCTACTGAGCACAAGGTTAAAGTCTTTATATTGCCAATGAAAGCATATACATCTGTGGACTTTTGCACATTAGTTCAGGGTAATACTATTTCTGATGATAAATGGTTCACGATGCATTATTTGAAACAAATTCTAAGTGGATCAGCAAAGGGCAATATAGTAACTACAAGTACAACTGAGCAAATTATAGCAAATGAATGTTTTAGGGTATTAACACACTTTGCAGATTCATTTGTGGAGGAGGCAAGTCGTTTGAGTTTTATCACAGAGGTAGTAGATAATTTTTCATATAAGAATATACCAGTTAATTCATTATACAATACAATTTTAGGAAGCAATTTGAGATTGGATTTTATCCCATTACTTTTTAGAATGCAAGCACTAACACAGGCAGATTTGAACAAATTCGATGCTCTAAAGACAAATGAAAGAGTGTCCTGGAATAATTGGCAGACTAATAGATCTCTTAATTCAGGTGTCATAGATTTAACAATCTCAGGTTACCTGAGGTCTATAAGAATTGTTGGTGAAGATAAAATCTTAAAGATTGCAGAGTTAACAATACCGAATTTTTACCCAAATACAGTTTTCCATGCGGGGAATAAACTATTGAATTCTAGACATGGTTTGAAATTCGAATTTATGTCAGAGCAAGTTCTAGATGATAAATTTAGTTATTATATCACATACCAAAAAAAACGTGCCCATATGTATACATATCAAGTATCGACAATAGAACATATATATAGAAGAAACCAGGAAGGCCTTGCTGCTAGAGGAAATAGATACAACCGAATGGTCCCAGTGTGCCCAGTTGTACTGTCAGTTCGAGATGAATTGTTCCGAATGAGTATGAACAATGTTTTTAGTTTAAATATGACCAATTTTAGTATGTCCAGGTTATATATCTCACCAGATGAAATGGCAACTATAAAGAAAGCTCATATGTCAAAAATGATGTTCTTTAATGGGCCAGACATAAAGGCAGGTATAATAAATTTAACAGCTCTAATGAGGACACAAGAGCTTCTATCATTAAATTATGATAATATTTGTAAATCCAGTATAGTTCCATTTTGTAGAATACTTTCATGTGAAGGGAGTGAAGATAATGGGGAATTAATATTTCTATCAGATGAAGTGATGGATTTTACAATATCTGAAGAAATAGAATCTATGCCAATATTCACTATTAAATATCAAAAGAGGGGAAATGAGAAAATGACATATAAAAATGCAATATCTAAGTTAGTCTCACATGGTGTTGAAGAAATCACAACAGTCTTTGACTTTTCTAAAGATGGGTTTTATTCGAAGAAAAACCTTGGAATAATAAATACCCTATGCTCAATAATAAATCTACTGGAAACGAATGAGTGGTCGTCGATTCTTTTAAATTCATTTCATATTGCTATGTTGTTAGAGGGGATGGACAGGGAATTCCACCTCTTTTCCCTACCATCTGCATTTTTCAATAATGTAGCCTCTGGGAACATAAACTGGACAAAACTTTTAAAATTCATCAAATCCCTCCCAAAAATCCACAATGAGCCTTGGTCAATGATGATGGAGAGGTTTATAGAAAAGACAATATATTTAATAGAAAAGGAGTTGAATAAGGAGGCCAATTTTAGCGATTTCCTAGATGAGCTAGAGTTCCAGACAGGAAAATCAATGTTTAGTTTTTTCTAGATTTAGAACGTTCTCATATCAACCCCTAATTGGACATCTTCAAAAGCCTATATGGCACAAAAAAACAGCGAATTTATCAATTTCTTTATATAGGAGCACACTACT
| 68,688 |
KX100135.1
|
Cache Valley virus
|
Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H.
|
Friedrich-Loeffler-Institut
|
Germany
|
2017-07-27
| null |
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Culiseta inornata
| null |
1956
| null | null |
Cache Valley virus strain 6V633 segment L, complete sequence
|
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| 75,556 |
KX100138.1
|
Cache Valley virus
|
Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H.
|
Friedrich-Loeffler-Institut
|
Germany
|
2017-07-27
| null |
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
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GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Ochlerotatus communis
| null |
1967
| null | null |
Cache Valley virus strain W728-67 segment L, complete sequence
|
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Cache Valley virus
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Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H.
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Friedrich-Loeffler-Institut
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Germany
|
2017-07-27
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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GenBank
| 1 |
USA
|
USA
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Ochlerotatus trivittatus
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1967
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Cache Valley virus strain W308-67 segment L, complete sequence
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| 75,558 |
KX100144.1
|
Cache Valley virus
|
Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H.
|
Friedrich-Loeffler-Institut
|
Germany
|
2017-07-27
| null |
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
Mexico
|
Mexico
|
Psorophora confinnis
| null |
1971
| null | null |
Cache Valley virus strain MPB1-1551 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAGAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATCTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTCTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTTAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTGATTCTACCAGTTATGGAGCAGATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAATCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCCATACAGCTAGATTTTTCAAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTTGCAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGATTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTGAACTTATTCGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCCACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAAAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGCATGGAAAGGAAGTTGATAGCTAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCCTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGACAAAACTACAACTGATCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATAAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTCAACACACTGAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGGCTAGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAGAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGTGTTTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTGAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACGCAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCCGGTAGAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGACCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGAAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTCAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTGGATGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAGAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTTTTTAATAAAGGGCAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGCATGTATGTTATAGAGAGAATCTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTAGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTTTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTGGATCAAAAAACTCCATACAACAATGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAGACTATGAAGTTGCTGGACGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAACCAGACATCCCTTGCCATTATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACTTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGTAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGCTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCATTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAACGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAGTGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCCCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGACAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCGGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGATCTGGAGGACATAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGAAATATGAAATTGATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCACTTGAATGAGTTTTTAGAAAGCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGATAACCCACCCAAGCATTTAAC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| 75,559 |
KX100147.1
|
Cache Valley virus
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Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H.
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Friedrich-Loeffler-Institut
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Germany
|
2017-07-27
| null |
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Ovis aries
| null |
1980
| null | null |
Cache Valley virus strain CK-102 segment L, complete sequence
|
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| 75,560 |
KX100150.1
|
Cache Valley virus
|
Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H.
|
Friedrich-Loeffler-Institut
|
Germany
|
2017-07-27
| null |
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Equus caballus
| null |
1980
| null | null |
Cache Valley virus strain MI80-1-450 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAAACTAAACCAAGAACAATATGGAGGACCAAATGTATGATCAATTCCTCAAGAGGATTCAATCAGCTAAAACAGCCACTGTAGCAAAGGACATCAGCACTGACATCTTGGAAGCACGTCATGATTATTTTGGTCGAGAACTCTGTGCTTCAATAGGCATAGAGTTTAGAAACAACGTTCTCTTAGATGAGATCATCCTGGATGTTGCACCTGGAATTAACCTGATGAACTTTAATATACCAAATGTTACACCTGATAATTACATCTGGGATGATGATTTCCTAATTATAATGGATTACAAAGTCTCAGTAGGGAATGATAGTACAGAAATAACATACAAAAAATATACAACCCTAATACTACCAGTTATGGAGCAGATAGGTATACCAACTGAAATAGCAATCATAAGGGCAAATCCTGTGACATATCAGATCAGTATAATAGGTGAAAATTTTAAAGCTAAATATCCAAATATACCTATACAGCTAGATTTTTCGAAGTTTTTTGAGTTGAGGAAATTATTACTGGACAAGTTTGAAGATGATGAGGAGTTTCTACTTATGATTGCTCATGGTGATTTTACACTGACAGCACCATGGTGTATGGATGATACTCCAGAATTGTATGACCACCCAATTTATAAAGAATTCATAGGATCCATGCCCCCTAGATTTGTGAACTTATTCGATGAAGCCATTTCATTCAGTGCCTATTCTGCTGAACGCTGGAACAGCCTGTTGTATACTGCAAAAGCAAAGACAGAACAAGATTATCAAGAGTTCCTCTCAGAAAAGTCACATGCTATATTTAACATGAATGGTGAATATATGAAACCTACGCAATCTGAAATTGATAAAGGCTGGGAATTAATGAGCCGAAGAATTTCTGAAGAAAGGGATATCATAACAGATATAAATAAACAGAAGCCGTCCATACATTTTATATGGGCAAAAAATGCTAATAGGAAACTAAGTAGTGCAACTGCAAAGCTCATATTTTTGTCAAACTCTTTACAGTCTATCATTGAGCCTTCAACTTGGACAGATTCATTAAAAGCAATTGGCAAAAGTATGGATATAGATGGCAACGTTGGAGCATATGAGAATCTCTGCATGGAAAGGAAGTTGATAGCCAGATCAACAGGAAAAAAGATAGACAATAAGAGGCTAGAAGCCATTAAAATAGGAAATGCATTAGTGCTTTGGGAGCAACAATTTATCTTGGCAAATGATCTCTTCAAAGGACAGGAAAGACAAAAATTCCTTAAGAATTTCTTAGGTATTGGGAAACACAAAAATTTCAAAGACAAAACTACAACCGATCTAGAACTAGATAAGCCAAAGATATTAGACTTCAACAATACCATTGTCCTGATGGCAGCAAGGTCAATGATAAACAAAAACAAAACATTCTTGGCACAAACTAATACATTGGAAAATCTACATCCAATAATGGGGGTATTCTCAGACCAAATAAAGGAGGCTTCAGAAGATACATTCAACACACTAAAAAAGATTAATAAAACATGTTTTTGGCAATGCATAACAGACATCTCAATGTTAATGAGAAATATTCTTTCAGTATCACAATATAACAGGCATAATACTTTCAGAGTAGCTATGTGTGCAAATGACTCTATGTATGCCCTCGTGTTCCCTTCTTCAGACATCAAGACAAAAAGAGCAACAGTTGTTTTCTCAGTAGTCTGTATTCATCAAGAAAAGCAATCTATTATGGATGCAGGTGCCTTATTTACAACTTTAGAATTAAAAACAAAAAACTTTATATCTATTAGCAAGGCTATTAGGCTAGATAAAGAAAGATGCCAGAGAATAGTGTCATCCCCAGGCTTATTCCTTCTAAGTGCTCTATTATTGTATAATAATAACCCAAACATATCTCTTGTAGATGTTTTAAATTTTGCATTTTATACAAGTTTATCTATAACTAAAAGTATGTTATCTTTAACTGAACCATCTAGATATATGATAATGAACTCTTTAGCCATCTCCAGTCATGTAAAAGATTATATATCTGAAAAGTTCTCACCCTATACTAAGACACTTTTTAGTGTCTATATGGTAAATTTAATCAAGAGAGGTTGTAGCTCTGCCAATGAACAATCCAGCAAAATACAGTTAAGGAATATTTATCTTTCAGATTATGAAATAACACAGAAAGGTGTAAACGATGAGAGGAACTTGGAATCTATATGGTTCCCCGGTAGAGTAAACCTCAAAGAATATATCAATCAGATTTACTTACCTTTTTATTTTAACGCAAAAGGCCTTCATGAAAAGCATCATGTTATGATAGACCTAGCCAAGACAGTTCTTGAAATAGAAATGACTCAGAGGATGGATGACTTGGGCATATGGTCTAAGCATGGAAAGAAACAACATGTTAATCTACCAATATTGATTCATTCCCTAGCTAAATCATTAATTTTAGACACTTCTAGACATAATCATTTGAGAAACAGAGTGGAGAGCCGCAACAATTTCAAGAGAAGTATAACAACCATTAGTACATTTACCAGCTCAAAATCATGCATTAAGATTGGAGATTTTAGGGAGATCAAGGCAAAAAACCTAGCCACATCAGTAAAATCTCAACAGAAAGCTTGTGAGAAGTACCGCTTATCGAATCCTTTATTTTTAGTGGACGAGGAATCTACATTAGAAACCAGACATTGCAGCTATGAAGATTTAGTTGCAAAGATCCCGAATTATAGAGATTACATTTCTGTTAAAGTATTTGATAGATTATATGAGTTATTCAAATTAAAAGAATTAGATGATAGGCCATTTATAGATCAGGCTATGGAGATGATGCAAAAGCACAAGGACTTTTCATTTACATTTTTTAATAAAGGGCAAAAGACAGCAAAGGACAGAGAAATATTTGTAGGTGAGTTTGAAGCAAAAATGTGTATGTATGTTATAGAGAGAATTTCTAAAGAAAGATGTAAGTTAAATACAGATGAAATGATTAGTGAACCAGGAGATTCAAAATTGAGGATCTTAGAGAAAAAAGCAGAGGAAGAGATAAGATACATCGTGGAGAAGACGAAGGATAGTATTCAGAAAGGTGATCCTACAAAAGCATTGAAACTAGAGATTAATGCTGATATGTCGAAATGGAGTGCGCAAGATGTTTTCTATAAGTATTTCTGGCTTATAGTTTTGGATCCAATACTTTACCCGAATGAGAAAAAGAGGATGTTATTTTTCATGTGTAATTATATGCAGAAAGTGCTGATCTTACCAGATGATTTGCTATCCAACATATTGGATCAAAAAACTCCATACAACAATGATTTAATTCTAAACTCAACTAATGGTTTAAATGCCAACTTTGTAAACATAAAAAGGAATTGGTTACAAGGGAATTTTAATTACATCTCTAGCTATGTACATAGTTGTGCAATGATGGTTTACAAAGATATTTTCAAAGAAACTATGAAGTTGCTGGACGGAGATTGTCTGGTAAATTCTATGGTTCATTCGGACGACAACCAGACATCCCTTGCCATCATGCAAAATAAAGTCAAAGATGACATGGTTATACAATTTGCTGCACATACATTTGAATCTGTCTGTCTCACTTTTGGATGCCAGGCAAATATGAAAAAAACATATATAACCCATACATGTAAAGAGTTTGTGTCACTTTTTAACTTACATGGTGAGCCATTGTCTATATATGGGAGATTCTTACTACCTAGTGTAGGAGATTGTGCATATATAGGGCCATATGAAGATCTGGCAAGTAGGCTATCAGCCACACAACAAAGCATAAAGCATGGATGCCCACCTAGCTTAGCATGGCTTGCAATAAGTTGCAGCCATTGGATAACTCATTTAACATATAACATGCTAGATGAGCAAGTGAATTGCCCAACAAATCATTTACCATTTACAAATAGAAAGGATATACCAGTTGAGCTAAATGGCTATATCAATGCGCCATTATACCTTATATCATTAGTAGGCCTTGAAGCTGGCAACCTATGGTTTCTTATAGAGATGTTGAAGAAATTGGTACCAATTGATAAGCAAAGAGAAACAATACAGACTCAATGCCAATGGCTAGCTCAATTAGGTAATCTAACAGAATCAGAAAAATTTAGATTCAAAATTCTAAGATATCTGACACTTGACACAGAAGTAAGTACAGACTCGAACATGGGGGAGACCAGTGACATGAGAAGTAGGTCCTTGTTGACACCAAGAAAGTTCACCACTCCAGGATCATTAAATAAATTAGTTTCATATCTAGACTTCAAAAATTCTATGTCTAATGATGATTATAAAGAAACATTGAGTTATATGTTACAAAATCCAGAGCTATTAGTTACAAAAGGTGAGAATAAAGAACAATTTATGACATCAGTATTGTATCGTTACAATTCCAAGCGATTTAAAGAAAGTCTATCTATCCAAAATCCAGCTCAATTATTTATAGAGCAAGTACTTTTCTCCCATAAACCAATCATTGACTATAGCAGTATCTTTGATAAGTTGAGTTCTTTAGTGGAATCTGACATAATTGCTGATTTGCCAGAAATCATCGGTAGGGTCACATTTCCACAAGCATACCAGATGATAGTTAGGGACATCAATCATCTACCCTTAGACCTGGAGGACATAAGTATAGTGTATAAATACTGTATATTAAATGACCCACTGATGATAACTGCAGCAAACACTTCTCTACTGTGTGTCAAAGGGACACCACAAGATAGGAATGGATTGAGTGCTAACCAGATGCCGGAATTCAGAAATATGAAATTAATACATCATTCTCCTGCATTGGTATTAAAAGCCTTCAGTAAAGGGACAACTGATCTACCCGGTGCTGAGCCAACAGAGCTTGAGAAAGACTTACACCATTTGAATGAGTTTTTAGAAAGCACTGGTATCAAAGAAAAAATAGGGCAAAATATGGATAACCCACCCAAGCATTTAAC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| 75,561 |
KX100153.1
|
Cache Valley virus
|
Groseth,A., Vine,V., Weisend,C., Guevara,C., Watts,D., Russell,B., Tesh,R.B., Ebihara,H.
|
Friedrich-Loeffler-Institut
|
Germany
|
2017-07-27
| null |
Orthobunyavirus cacheense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2003
| null | null |
Cache Valley virus strain WI-03BS7669 segment L, complete sequence
|
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| 75,562 |
NC_002815.2
|
Cactus virus X
|
Liou,M.R., Chen,Y.R., Liou,R.F., Liou,M.-R., Hung,C.-L., Liou,R.-F.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2001-07-02
| null |
Cactus virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,614 |
RefSeq
| 1 | null | null |
Selenicereus undatus
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Cactus virus X, complete genome
|
GAAAACCAACCCAACACCAAACCAACTCACTCACACCTATCCAACTCAGAAGGGAGCTACCGTTACCGGTATATATTCTGTGGGATGGCCCGTGTGCGTGAAGTTTTCTCATCGATCACTGACTCATCTCTTAAAGCCGTAATTCAGGAGGAGGCCTATAAGACCATCCAAACTCAATTACAACTCGCGGCCACAATCAACCCATACTCACAACCCACCGACGCTGCTGATGTTTTAGAGAACTTAGGAATCATCACTAACCCATTGGCCATTGAAGCCCATACCCATGGGGCGGCAAAGGCCATTGAAAATGACATGTATAACATAGTTGCTAATTATCTGCCCAAGGGGAATCCAGTCACATTCTACTACATGAAGAAAGGCAAGCTCGGAAAATTTAGGAGAGGCCCACACCAGAATGATCGTTTTGTCAACTCCCATTTTGAGCCCAAGGACATAGCCCGCTACCCAGAGGAAACGGTTGTGGAACACCTTGAGTCCACTCCCTGCACTACGAAGCTGGATTTCATGGGCGACACTCTCCACTTCTGGACGCCAAAGCAACTACTAACTCTCTTCAACTTTAGTCCCAAACTAACCACTCTCTACGCTACTATAGTCTTGCCTATAGAGGCTACACATAGACTACCCTCTCTACACCCCGCCATATATACTCTGAAGTACTTCGGGGACTTCTTTATGTACATCCCTGGTGGACACGCAGGCGCCTCCTACACCCATCACCAGAAACAACTAGCATGGCTTTTTGCCGGTCAAGTGTCTGGCCTAGGCATTAAGCTCACCATACAGATTCTGGAGAGCAAGGGTGCAAATCACCTGCTCATAATTCAAAGGGGTGATCTGCTCACTCCTCCCCTGAGGACTTTCGGCTCTGACTCCCCCTATGTGCAAATCCCACCTATCTTCCTCCCCAAAGACCATAATATGTCCCAGCCCATCCCCACGGTGTTTGCAATGAAAATGTTCATGTATACCAAGTCCCTGAAAGAGGTCACTCCGCGTGATCTTTATGCGAAAATGAGACAGCTGCTCCCGGATAAAGAACTGGCTAAATTCTCCCCAAGCCACATTGTTCACATGATGAACTATTTCTTCCTGCTCGGAAAATTAGACTCTGTTAATCACTTTGAAAACTTGCTATCAGGGTCAATCGTCCGCAGGACATTTAAGCCACTCATCGTCTGGTGGCAGCATTTTAAGGAAAAAATCAAGGGGCCTGCTGATTTTACAAAGATCTGCAAAGCGATTCAGTGGACTAATCTCGACCTCACATACAAAGTCCAATCCTTCACTCTCAGCACATGGGAGAATTTCTTCTCAAAGCAGATCATGCCAGAAGGGAAGAATGACGAGGACTTTTCGGACTTCTGGGACCCGAACTCCTACAACCCCTTAGACTCTGTGGATGATCTTAATGCTGAGCAGCTCAAAGCCTGGGACTTCCTGCAACAGCGCAACACCGGCGCTTACCCTGAGCCCAAATTCCATGACGATCCCCTTGAAAACAAGTCTAACAAGGAGAAATGCACTGCGGAACAAAGGAACTTCACTGAGGGCCCTCAGACTAGTCAGGCCTCCTGCTCCACCCCACACAATGACTCGCAGGCCCCCAATGAAGAGAAACCAGAGACGCAGCCCCACATCACCCCACCCAAGGTTTTCACCACACCCCACGGGGTGGTGGTACGCCCTTTCACCGCTGATCGCGACTGCGAGGAAACCTGGGAACATTTCATCATGGGCCATCTCAGGCTGTGCGACAAAGTTGGTCAGAGGCAGGTCACTCTCTATGCCAGAAATGGAAAGATAAAGACCTACAGTTACGGAAATGTAACCCACAAGGCTCAACCCTGGCCCGCTGAGCTCACGGCCATCGCCAAAGCCCTTGATGTGCCTGAGGAGCACGACCACTGCCTCTTCCAGGTCTTCCAACAGGGAGCTGCAATCAACTTTCATTCTGACGACGAGCCACTGATTCAACCAGGCTCACCCATCACCACTCTTAGCATTGGGCATTGTGAACTGCTCACCAGGGATAAATCCAACAAAAAAATTCACAAGCAACTCCTCTCCGGCCCCATCATCTACACCATGCCATCAGGCTTCCAGGAGACCCACCAACACTCAGTGCGTTCTCTACAAAAGAACCGACTCTCCATCACTTTCCGCACCAGTGTACACTGCAACCAAGAGGACACCCTCCCATGGCACAAGTGGCTGCCCATTCTGAGTGCAGCCGGGTTCAAAGGCAATCAGAGACAGGTCAATCCCAATGGCGGGTCGCTCATTCTCCCAATCTCCGACATCAAAAAACTGCCCACAATTGAGACTGGTGACCCAGGCTTGCTAGAAAAAATCAAGAAAATCCATAGGAGTCCCACACCCTTCACATATGACCCACTCCGAGCCAAGGCTTTTGGTTCAGATGTCAAGAATCTCAGAGTAGGCGCCCTACTCCGACACCAGTCCAAAGAATGGCTTGAGAGCTTTTCCAGAAGGACTGAGAAAGACAGCCGCTCTCTTGCTCTAACGGTCATTCATGGTGCTGGGGGTAGCGGCAAGTCTCAGGCACTGCAGGACTTCCTCCGGGCCAACCCAGACAATCGCATAACGGTGGTCCTGCCCACCAATGAGCTGAGACTCGACTGGGTACGCAAACTGCCACAAGCCCATCCTTCCTCTCTAAAGACCTTTGAGAAGAGTCTGCTCACGCCAGCCAGTTCTACTACTATCATGGACGATTACTCCAAGCTTCCCGCGGGATTCATTGAGGCCTACATCGCAAACAACCCCGGATTGGAGTGTCTGATACTCACAGGGGATTCAAAGCAAAGCCACCACCATGAGCCTAACGACGGAGCCATGACCAGCAAACTGTCGCCATTCACTGAGACCGCGTCACTCCACTGCAGATACTACCTCAATGCCACACACCGCAACAGGCAGGACCTGGCGAACATGCTCGGAGTCTACTCAGAGGTTGAGGGACGCACCAACATCACCATGGACACCACCATTCTTCCCGGCAGGCATCTGCTCGTCCCATCCATGTTCAAGAAACAAGCATACGGGGAGTTGGGACACAAGGTTTCAACCTACGCCGGGTGTCAAGGAATCACGGCGAATGAGATCCAAATACTGATTGACTCTGACACCCCAATGTGCTCCCAGCAGGTCATGTACACCGCCCTCAGTAGGGCCGTGCACGCCATTCACTTCGTCAACACAGGGATAAACAATGATGCCTTCTGGAACAAGCTGGCAGCCACGCCCTATCTCGCGGCATTTCTGAGGTTGGTCCGGGAAGAGAAGACGAAAGAGCATCAACCCACAGAAGAGGGGCCCAGTGCACCGCCCGCTCCCGAGACCCACTTCCCAGTGGAGAACGAGTCCACATTCTTTGACAAGGTCACAGACAGCATGCCGGAGGAGCATGAGAAAGAACTCTTTCACACTAGCGATGGTTTCAGCAATTGCGTTCAGACTGAAGATCCCATCATCCAAATGTTCCCCCACCAACAAGCAAAAGATGAGACTCTCTTCTGGGCAACAATTGAGGCTCGACTGAAAATAACGAGCCCCGAGAAAGACTTCACCGAGTTCATCTCCAAGGTACACATTGGGGACATTCTCTTCCAGAATTACAAGCTTGCCATGGGGCTCCCGAAAGAGCCAATCGCATTCGACGAACGTCTTTGGAACTGCTGCGCGGACGAGGTGCAGAAGACCTACCTGTCTAAGCCACTGCACATGCTTCAAAACGGACAGGCTAGGCAGTCCCCTGACTTTGACCCCAAAATGATCAGCCTCTTCCTCAAGTCACAATGGGTTAAGAAGATTGAGAAACTTGGCCAACCGCGCATTAAGGCTGGGCAGACCATCGCCTCTTTCCAACAAGAGGCGGTCATGCTTTACGGAACAATGGCCCGATACATGAGGCGTGTCCGCGAGGTTTTTCAGCCTAAGAATATCATGATCAACTGCGAGAGGACCCCTGAAGAGCTTACCAGCTGGGCAGCCGAGCACTGGAACTTCAATCGCAATTCATATGCCAACGACTACACGGCTTTTGACCAGTCTCAGGACGGTGCGATGCTCCAATTTGAAATTCTCAAAGCTAGGCACCACTCCATCCCGGAAGTGTACATTGAGGGCTACCTGGACTTGAAATGCTCATCCATGACCTTCCTTGGCATATTGAAAATCATGCGACTCACTGGAGAGGGGCCCACTTTCGACGCCAACACTGAATGCAACATCGCCTTCGCCCACACCAAGCTGAAAATACCAATCGGCACTGCTCAGCTCTACGCGGGTGACGACTGCGCTTTGGCTACTGTCCCAGAGGATAAGCCAAGCTTCAAAATGATTGAAACCGAGGTCTCCCTCAAAGCCAAACCGGTCATCAAAAGGCAGGTCCAAGGGGAATGGGCAGAATTTTGTGGGATGTTAGTTACCCCCCTTGGCGTCATCAAGGACCCCATCAAGACCTGGGCGGCACTGAAGCTTGCCGAAAAGAAGAGGCGACATGAAAGACATGAGGGACAGTTATTGAAAGAAATGCTTGGCCTTGTCTACCAACACAAGGACCCTCTCCACTCAATCTTCTCAGAAAGCAATCCATGGCCCACCAAATTAACCGTTCGAAAGATCATCAAAGCAGGTGGAGGCCGTGTTTTCTCAACTTTTGACTGATGGAGACGCTAACTGCCCTACTAATCGCTAACGGATACACTAGGACTGACTTGCCCATTTCCAAGCCCTTAGTCATCCATGCTGTGGCCGGTGCAGGAAAGACCACCCTGATTAGGCAATTTCTACACCAACACTCGGCCACGAATGCTCAGACGCTGGGCACGCCAGACAAGCCCAACCTCTCTAGGAAGATGATCCGACAATTCTCCATGCCCAAGGCCAACCATTTCAACATCCTCGATGAGTACTGTGCACAGCCTCTGAAAGGAAGTTGGGATGCGGTG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| 8,649 |
BK011045.1
|
Cactus virus X
|
Jiang,P., Shao,J., Nemchinov,L.G.
|
USDA-ARS Beltsville Agricultural Research Center, Molecular Plant Pathology Laboratory
|
USA
|
2021-02-20
|
alfalfa A
|
Cactus virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,603 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Medicago sativa
| null |
2018-01-08
| null | null |
TPA_asm: Cactus virus X isolate alfalfa A, complete genome
|
CCAACACCAAACCAACTCACTCACACCTATCCAACTCAGAAGGGAGCTACCGTTACCGGTATATATTCTGTGGGATGGCTCGTGTGCGTGAAGTTTTCTCATCGATCACCGACTCGTCGCTTAAAGCCGTAATTCAGGAGGAGGCCTATAAGACCATCCAAACTCAATTACGACTCGCGGCCACAATCAACCCATACTCACAACCCACCGACGCTGCTGATGTTTTAGAGAACTTAGGAATTATCACTAACCCATTGGCCATTGAAGCCCATACCCATGGGGCGGCAAAGGCCATTGAAAATGACATGTATAACATAGTTGCTAATTATTTGCCCAAGGAGAATCCAGTCACATTCTACTATATGAAGAAAGGCAAGCTCGGAAAATTTAGGAGAGGCCCACACCAGAATGATCGTTTTGTCAACTCCCATTTTGAGCCCAAGGACATAGCCCGATACCCAGAGGAAACGGTTGTGGAACACCTTGAGTCCACTCCCTGCACTACGAAGCTGGCTTTCATGGGCGACACTCTCCACTTCTGGACGCCAAAGCAACTACTAACTCTCTTTAACTTTAGTCCCAAACTAACCACTCTCTACGCTACTATAGTCTTACCTATAGAGGCTACACATAGACTACCCTCTCTACACCCCGCCATATATACTCTGAAGTACTTCGGGGACTTCTTTATGTACATCCCTGGTGGACATGCAGGCGCCTCCTACACTCATCACCAGAAACAACTAGCATGGCTTTTTGCCGGTCAAGTGTCTGGCCTAGGCATTAAGCTCACCATACAGATTCTGGAGAGCAAGGGTGCAAATCACCTGCTCATAATTCAAAGGGGTGATCTGCTCACTCCTCCCCTGAGGACTTTCGGCTCTGACTCCCCCTATGTACAAATCCCACCCATCTTCCTCCCCAAAGACCATAATATGTCCCAGCCCATCCCCACGGTGTTTGCAATGAAAATGTTCATGTACACCAAGTCCCTGAAAGAGGTCACTCCGCGTGATCTTTATGCGAAAATGAGACAGCTGCTCCCGGACAAGGAACTGGCTAAATTCTCCCCAAGCCACATTGTCCACATGATGAACTATTTCTTCCTGCTCGGAAAATTAGACTCTGTGAATCACTTTGAAAACTTGCTATCAGGGTCAATCGTCCGCAGGACATTTAAGCCACTCATCGTCTGGTGGCAGCATTTTAAGGAAAAAATCAAGGGGCCCGCTGACTTTACAAAGATCTGCAAAGCGATTCAGTGGACCAATCTCGACCTCACATACAAAGTCCAATCCTTCACTCTCAGCACATGGGAGAATTTCTTCTCAAAGCAGATCACGCCTGAAGGGAAGAACGACGAGGACTTTTCGGACTTCTGGGATCCGAACTCCTACAACCCCTTAGACTCTGTGGATGATTTAAATGCTGAGCAGCTTAAAGCCTGGGACTTCCTGCAGCAGCGCAACACCGGCGCCAACCCTGAGCCCAAATTCCATGACGATCCCCTTGAGAACAAGTCTAACAAGGAAAAGTGCACTGCGGAACGAAGGGACTCCACTGAGGGCCCTCAGACCAATCAGGCCTCCTGCTCCACCCCACACAATGACTCGCAGGCCCCCAATGAAGAGAAACCAGAGGCGCCGCCCTACTTCACCTCACCCAAAGTTTTCACCACACCCCACGGGGTGGTGGTACGCTCTTTCCCCGCTGATCGCGACTGCGAGGAAACCTGGGAACATTTCATTATGGGCCATCTCAGGCTGTGCGACAAAGTTGGTCAGAGGCAGGTCACTCTCTATGCCAGAAATGGAAAGATAAAGACCTACAGTTACGGAAATGTAACCCACAAGGCTCAACCCTGGCCCGCTGAGCTCACGGCCATCGCCAAAGCCCTTGATGTGCCTGAGGAGCACGACCACTGCCTCTTCCAGGTCTTCCAACAGGGAGCTGCAATCAACTTTCATTCTGACGACGAGCCACTGATTCAACCAGGCTCACCCATCACCACTCTTAGCATTGGGCATTGTGAACTGCTCACCAGGGATAAATCTACAAAAAAAATTCACAAGCAACTCCTCTCCGGCCCCATCATCTACACCATGCCATCAGGCTTCCAGGAGACCCACCAACACTCAGTGCGCTCCCTACAAAAGAACCGACTCTCCATCACTTTCCGCACCAGCGTGCACTGCAACCAAGAGGACACCCTCCCATGGCACAAGTGGCTGCCCATTCTGAATGCAGCCGGGTTCAAAGGCAATCTGAGACAGGTCAATCCCAATGACGGGTCGCTCATTCTCCCAATCTCCGACATAAGAAAACTGCCCACAATTGAAGCTGGTGACCCAGGCTTGCTAGAGGTACTCAAGAAAATCCATAGGAGTCCCACACCCTTCACATATGACCCACTCCGAGCCAAGGCTTTTGGTTCAGATGTCAAGAATCTCAGAGTAGGCGCCCTACTCCGACACCAGTCTAAAGAATGGCTTGAGAGCTTTTCCAGAAGGACGGAGAAAGACAGCCGCTCTCTTGCTCTAACGGTCATTCATGGTGCTGGGGGCAGCGGCAAGTCTCAGGCACTGCAGGACTTCCTCCGGGCCAACCCAGACAATCGCATAACGGTGGTCCTGCCCACCAATGAGCTGAGACTCGACTGGGTACGCAAACTGCCACAAGCCCATCCTTCCTCTCTCAAGACCTTTGAGAAGAGCCTGCTCGCGCCAGCCAGTTCTACTACTATCATGGACGACTACTCCAAGCTTCCCGCGGGATTCATTGAGGCCTACATCGCAAACAACCCCGGACTGGAGTGTCTGATACTCACAGGGGATTCAAAGCAAAGCCACCACCATGAGCCTAACGACGGAGCCATGACCAGCAAACTGTCGCCATTCACTGAGACCGCGTCACTCCACTGCAGATACTACCTCAATGCCACACACCGCAACAGGCAGGACCTGGCGAACATGCTCGGAGTCTACTCAGAGGTTGAGGGACGCACTAACATCACCATGGACACCACCATTCTTCCCGGCAGGCATCTGCTCGTCCCATCCATGTTCAAGAAACAAGCATACGGGGAGTTAGGACACAAGGTCTCAACCTACGCCGGGTGTCAAGGAATCACGGCGAATGAGATCCAAATACTGATTGACTCTGACACCCCAATGTGCTCCCAGCAGGTCATGTACACCGCCCTCAGTAGGGCCGTGCATGCCATTCACTTCGTCAACACAGGGATAAACAATGATGCCTTCTGGAACAAGCTGGCAGCCACGCCCTATCTCGCGGCATTTCTGAGGTTGGTCCGGGAAGAGAAGACGAAAGAGCATCAACCTACAGAAGAGGGGCCCAGTGCACCGCCCGCTCCCGAGACCCACTTCCCAGTGGAGAACGAGTCCACATTCTTTGACAAGGTCACAGACAACATGCCGGAGAAGCATGAGAGGGAACTCTTTTCCACTCGCGATGGTTTCAGCAATTGCGTCCAGACTGAAGATCCCATCATCCAAATGTTCCCCCACCAACAAGCAAAAGATGAGACTCTCTTCTGGGCAACAATTGAGGCTCGGCTGAAGATAACGAGCCCAGAGAAGAACTTCACTGAGTTCATCTCCAAGAAGCACATTGGGGACATTCTCTTCGAGAATTACAAGCTTGCCATGGGGCTCCCAAAAGAACCAATCGCCTTCGACGAACGTCTTTGGAACTGTTGCGCGGACGAGGTGCAGAAGACCTACCTGTCTAAGCCACTGCACATGCTTCAAAACGGACAGGCTCGGCAGTCCCCTGACTTCGACCCCAAAATGATCAGCCTCTTCCTCAAGTCACAATGGGTTAAGAAGATTGAGAAACTTGGCCAACCGCGCATTAAGGCTGGGCAGACCATCGCCTCTTTTCAACAAGAGGCAGTCATGCTTTACGGAACAATGGCTCGATACATGAGGCGTGTCCGCGAGGTCTTTCAGCCTAAGAATATCATGATCAACTGCGAGAAGACCCCTGAAGAGCTTACCAGCTGGGCAGCCGAGCACTGGAACTTCAATCGCAATTCATATGCCAACGACTACACGGCTTTTGACCAGTCTCAGGACGGTGCGATGCTCCAATTTGAAATTCTCAAAGCTAGGCACCACTCTATCCCGGAAGTGTACATTGAGGGCTACCTGGACTTGAAATGCTCATCCAAGACCTTCCTTGGCATACTGAAAATCATGCGACTCACTGGAGAGGGGCCTACTTTCGACGCCAACACTGAATGCAACATCGCCTTCGCCCACACCAAGCTGAAAATACCAATCGGCACTGCTCAGCTCTACGCGGGTGATGACTGCGCCTTTGACTACGCCCCAGAGGATAAGCCAAGCTTCAAAATGATCGAGACCGAGGTCTCCCTCAAAGCCAAACCGGTCATCAAAAGGCAGGTCCAAGGGGAATGGGCAGAATTTTGTGGGATGTTAGTTACCCCCCTTGGCGTCATCAAGGACCCCATCAAGACCTGGGCGGCACTGAAACTTGCCGAAAAGAGAGGCGACATGAAAGACATGAGGGATAGTTATGAAAGAGATGTCTGCCTTGCCTACCAGCACAAGGACGCTCTCCACTCAATCTTCTCAGAAGAGCAATCCATGGCCCATCAATTAACCGTTCGAAAGATCATCAAAGCAGGTGGAGGCCGTGTTTTCTCAACTTTTGACTGATGGAGACGCTAACTGCCCTACTAATTGCTAACGGATACACTAGGACTGACTTGCCCATTTCAAAACCCTTAGTCATCCATGCTGTGGCCGGTGCAGGAAAGACCACCCTGATTAGGCAATTTCTACACCAACACTCGGCCACGAATGCTCAGACGTTAGGCACGCCAGACAAGCCCAACCTCTCTAGGAAGATGATCCGACAGTTTTCAATGCCCAAGGCCAACCATTTCAACATCCTCGATGAGTACTGTGCACAGCCTCTGAAAGGAAGTTGGGATGCGGTGTTCGCCGACCCTC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| 44,082 |
LC128411.1
|
Cactus virus X
|
Park,C.Y., Kim,J.S., Lee,J.H., Lee,S.H.
|
College of Agriculture and Life Sciences, Kyungpook National University, Plant virus laboratory; 80 Daehakro, Bukgu, Daegu 702-701
|
Korea
|
2016-03-30
| null |
Cactus virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,618 |
GenBank
| null |
South Korea:Jeju
|
South Korea
|
Selenicereus undatus
| null | null | null | null |
Cactus virus X genomic RNA, complete genome
|
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| 83,157 |
JF937699.1
|
Cactus virus X
|
Lu,Y.-C., Mao,C.-H., Li,Y.-S., Chang,Y.-C.
|
National Taiwan University, Plant Pathology and Microbiology
|
Taiwan
|
2014-07-01
|
NTU
|
Cactus virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,627 |
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
|
Hylocereus
| null |
2005
| null | null |
Cactus virus X isolate NTU, complete genome
|
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| 89,641 |
AF308158.2
|
Cactus virus X
|
Liou,M.-R., Hung,C.-L., Liou,R.-F., Liou,M.R., Chen,Y.R., Liou,R.F.
|
National Taiwan University, Plant Pathology
|
Taiwan
|
2001-07-02
| null |
Cactus virus X
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,614 |
GenBank
| 1 | null | null |
Selenicereus undatus
| null | null | null | null |
Cactus virus X, complete genome
|
GAAAACCAACCCAACACCAAACCAACTCACTCACACCTATCCAACTCAGAAGGGAGCTACCGTTACCGGTATATATTCTGTGGGATGGCCCGTGTGCGTGAAGTTTTCTCATCGATCACTGACTCATCTCTTAAAGCCGTAATTCAGGAGGAGGCCTATAAGACCATCCAAACTCAATTACAACTCGCGGCCACAATCAACCCATACTCACAACCCACCGACGCTGCTGATGTTTTAGAGAACTTAGGAATCATCACTAACCCATTGGCCATTGAAGCCCATACCCATGGGGCGGCAAAGGCCATTGAAAATGACATGTATAACATAGTTGCTAATTATCTGCCCAAGGGGAATCCAGTCACATTCTACTACATGAAGAAAGGCAAGCTCGGAAAATTTAGGAGAGGCCCACACCAGAATGATCGTTTTGTCAACTCCCATTTTGAGCCCAAGGACATAGCCCGCTACCCAGAGGAAACGGTTGTGGAACACCTTGAGTCCACTCCCTGCACTACGAAGCTGGATTTCATGGGCGACACTCTCCACTTCTGGACGCCAAAGCAACTACTAACTCTCTTCAACTTTAGTCCCAAACTAACCACTCTCTACGCTACTATAGTCTTGCCTATAGAGGCTACACATAGACTACCCTCTCTACACCCCGCCATATATACTCTGAAGTACTTCGGGGACTTCTTTATGTACATCCCTGGTGGACACGCAGGCGCCTCCTACACCCATCACCAGAAACAACTAGCATGGCTTTTTGCCGGTCAAGTGTCTGGCCTAGGCATTAAGCTCACCATACAGATTCTGGAGAGCAAGGGTGCAAATCACCTGCTCATAATTCAAAGGGGTGATCTGCTCACTCCTCCCCTGAGGACTTTCGGCTCTGACTCCCCCTATGTGCAAATCCCACCTATCTTCCTCCCCAAAGACCATAATATGTCCCAGCCCATCCCCACGGTGTTTGCAATGAAAATGTTCATGTATACCAAGTCCCTGAAAGAGGTCACTCCGCGTGATCTTTATGCGAAAATGAGACAGCTGCTCCCGGATAAAGAACTGGCTAAATTCTCCCCAAGCCACATTGTTCACATGATGAACTATTTCTTCCTGCTCGGAAAATTAGACTCTGTTAATCACTTTGAAAACTTGCTATCAGGGTCAATCGTCCGCAGGACATTTAAGCCACTCATCGTCTGGTGGCAGCATTTTAAGGAAAAAATCAAGGGGCCTGCTGATTTTACAAAGATCTGCAAAGCGATTCAGTGGACTAATCTCGACCTCACATACAAAGTCCAATCCTTCACTCTCAGCACATGGGAGAATTTCTTCTCAAAGCAGATCATGCCAGAAGGGAAGAATGACGAGGACTTTTCGGACTTCTGGGACCCGAACTCCTACAACCCCTTAGACTCTGTGGATGATCTTAATGCTGAGCAGCTCAAAGCCTGGGACTTCCTGCAACAGCGCAACACCGGCGCTTACCCTGAGCCCAAATTCCATGACGATCCCCTTGAAAACAAGTCTAACAAGGAGAAATGCACTGCGGAACAAAGGAACTTCACTGAGGGCCCTCAGACTAGTCAGGCCTCCTGCTCCACCCCACACAATGACTCGCAGGCCCCCAATGAAGAGAAACCAGAGACGCAGCCCCACATCACCCCACCCAAGGTTTTCACCACACCCCACGGGGTGGTGGTACGCCCTTTCACCGCTGATCGCGACTGCGAGGAAACCTGGGAACATTTCATCATGGGCCATCTCAGGCTGTGCGACAAAGTTGGTCAGAGGCAGGTCACTCTCTATGCCAGAAATGGAAAGATAAAGACCTACAGTTACGGAAATGTAACCCACAAGGCTCAACCCTGGCCCGCTGAGCTCACGGCCATCGCCAAAGCCCTTGATGTGCCTGAGGAGCACGACCACTGCCTCTTCCAGGTCTTCCAACAGGGAGCTGCAATCAACTTTCATTCTGACGACGAGCCACTGATTCAACCAGGCTCACCCATCACCACTCTTAGCATTGGGCATTGTGAACTGCTCACCAGGGATAAATCCAACAAAAAAATTCACAAGCAACTCCTCTCCGGCCCCATCATCTACACCATGCCATCAGGCTTCCAGGAGACCCACCAACACTCAGTGCGTTCTCTACAAAAGAACCGACTCTCCATCACTTTCCGCACCAGTGTACACTGCAACCAAGAGGACACCCTCCCATGGCACAAGTGGCTGCCCATTCTGAGTGCAGCCGGGTTCAAAGGCAATCAGAGACAGGTCAATCCCAATGGCGGGTCGCTCATTCTCCCAATCTCCGACATCAAAAAACTGCCCACAATTGAGACTGGTGACCCAGGCTTGCTAGAAAAAATCAAGAAAATCCATAGGAGTCCCACACCCTTCACATATGACCCACTCCGAGCCAAGGCTTTTGGTTCAGATGTCAAGAATCTCAGAGTAGGCGCCCTACTCCGACACCAGTCCAAAGAATGGCTTGAGAGCTTTTCCAGAAGGACTGAGAAAGACAGCCGCTCTCTTGCTCTAACGGTCATTCATGGTGCTGGGGGTAGCGGCAAGTCTCAGGCACTGCAGGACTTCCTCCGGGCCAACCCAGACAATCGCATAACGGTGGTCCTGCCCACCAATGAGCTGAGACTCGACTGGGTACGCAAACTGCCACAAGCCCATCCTTCCTCTCTAAAGACCTTTGAGAAGAGTCTGCTCACGCCAGCCAGTTCTACTACTATCATGGACGATTACTCCAAGCTTCCCGCGGGATTCATTGAGGCCTACATCGCAAACAACCCCGGATTGGAGTGTCTGATACTCACAGGGGATTCAAAGCAAAGCCACCACCATGAGCCTAACGACGGAGCCATGACCAGCAAACTGTCGCCATTCACTGAGACCGCGTCACTCCACTGCAGATACTACCTCAATGCCACACACCGCAACAGGCAGGACCTGGCGAACATGCTCGGAGTCTACTCAGAGGTTGAGGGACGCACCAACATCACCATGGACACCACCATTCTTCCCGGCAGGCATCTGCTCGTCCCATCCATGTTCAAGAAACAAGCATACGGGGAGTTGGGACACAAGGTTTCAACCTACGCCGGGTGTCAAGGAATCACGGCGAATGAGATCCAAATACTGATTGACTCTGACACCCCAATGTGCTCCCAGCAGGTCATGTACACCGCCCTCAGTAGGGCCGTGCACGCCATTCACTTCGTCAACACAGGGATAAACAATGATGCCTTCTGGAACAAGCTGGCAGCCACGCCCTATCTCGCGGCATTTCTGAGGTTGGTCCGGGAAGAGAAGACGAAAGAGCATCAACCCACAGAAGAGGGGCCCAGTGCACCGCCCGCTCCCGAGACCCACTTCCCAGTGGAGAACGAGTCCACATTCTTTGACAAGGTCACAGACAGCATGCCGGAGGAGCATGAGAAAGAACTCTTTCACACTAGCGATGGTTTCAGCAATTGCGTTCAGACTGAAGATCCCATCATCCAAATGTTCCCCCACCAACAAGCAAAAGATGAGACTCTCTTCTGGGCAACAATTGAGGCTCGACTGAAAATAACGAGCCCCGAGAAAGACTTCACCGAGTTCATCTCCAAGGTACACATTGGGGACATTCTCTTCCAGAATTACAAGCTTGCCATGGGGCTCCCGAAAGAGCCAATCGCATTCGACGAACGTCTTTGGAACTGCTGCGCGGACGAGGTGCAGAAGACCTACCTGTCTAAGCCACTGCACATGCTTCAAAACGGACAGGCTAGGCAGTCCCCTGACTTTGACCCCAAAATGATCAGCCTCTTCCTCAAGTCACAATGGGTTAAGAAGATTGAGAAACTTGGCCAACCGCGCATTAAGGCTGGGCAGACCATCGCCTCTTTCCAACAAGAGGCGGTCATGCTTTACGGAACAATGGCCCGATACATGAGGCGTGTCCGCGAGGTTTTTCAGCCTAAGAATATCATGATCAACTGCGAGAGGACCCCTGAAGAGCTTACCAGCTGGGCAGCCGAGCACTGGAACTTCAATCGCAATTCATATGCCAACGACTACACGGCTTTTGACCAGTCTCAGGACGGTGCGATGCTCCAATTTGAAATTCTCAAAGCTAGGCACCACTCCATCCCGGAAGTGTACATTGAGGGCTACCTGGACTTGAAATGCTCATCCATGACCTTCCTTGGCATATTGAAAATCATGCGACTCACTGGAGAGGGGCCCACTTTCGACGCCAACACTGAATGCAACATCGCCTTCGCCCACACCAAGCTGAAAATACCAATCGGCACTGCTCAGCTCTACGCGGGTGACGACTGCGCTTTGGCTACTGTCCCAGAGGATAAGCCAAGCTTCAAAATGATTGAAACCGAGGTCTCCCTCAAAGCCAAACCGGTCATCAAAAGGCAGGTCCAAGGGGAATGGGCAGAATTTTGTGGGATGTTAGTTACCCCCCTTGGCGTCATCAAGGACCCCATCAAGACCTGGGCGGCACTGAAGCTTGCCGAAAAGAAGAGGCGACATGAAAGACATGAGGGACAGTTATTGAAAGAAATGCTTGGCCTTGTCTACCAACACAAGGACCCTCTCCACTCAATCTTCTCAGAAAGCAATCCATGGCCCACCAAATTAACCGTTCGAAAGATCATCAAAGCAGGTGGAGGCCGTGTTTTCTCAACTTTTGACTGATGGAGACGCTAACTGCCCTACTAATCGCTAACGGATACACTAGGACTGACTTGCCCATTTCCAAGCCCTTAGTCATCCATGCTGTGGCCGGTGCAGGAAAGACCACCCTGATTAGGCAATTTCTACACCAACACTCGGCCACGAATGCTCAGACGCTGGGCACGCCAGACAAGCCCAACCTCTCTAGGAAGATGATCCGACAATTCTCCATGCCCAAGGCCAACCATTTCAACATCCTCGATGAGTACTGTGCACAGCCTCTGAAAGGAAGTTGGGATGCGGTGTTCGCCGACCCTCTCCAGCATCCTGACTATGCCCTGGAACCCCATTTCATCAAAGAGACCTCCCACCGACTTGGTCCAAGCACATGCGAGCTGATCTCCAGCCTTGGAATCCTCATTTATCCTGACTCAGAGGATCAAGTAGTCACAAGGAAAGGGGTTTTCGAGTCTGAACTCTTCGGTGTAGTCATAGCCCTTGACGAAGCCATCTTCCAACTCGCGAGCAGGCACGGACTCAAACCGCTCTGCCCCAAAGCAACCATTGGCCTCCAATTTCCTGTCGTGACAGTTCTATCTTCCCTAGCCCTCGAGCAGGTCGAAGACAGCACAGCGCTCTACATTGCGCTCACGCGTCACACAAAAGAACTCCATGTCCGGTGCCCCACTGAGGCTGACGCCACCACCTGATCACACTAGAACCCTTTTTCCACTAACCCTAGGCTTAGGACTATCGCTAGTAGTATTCGCACTGACTAGGTCCACATTACCCAGTGTCGGGGATTCTTCCCACAGTTTACCACACGGAGGCTGGTATCGTGACGGCACGAAAACAGTCTTCTACTCAGGCCCTAAGAAAACGGCCATTAACTGGAGTCCACCCATCTTTGTCCTTTTCCTGACCTTAGCCCTCTATGTTTCTTACCTATTTGAGTCTAGGAGTCGTGCTGGGTCTTGCAGTCATTGCGGGTCTAACCACACTTAACACCCCTAGTTGTCTGATCGTCTTGTCGGGTGACCAGACTGTTGTCAAGGGCTGTGAACACATTGGCAATCTCGCCGACGTCATTACGGCACTTAATAACCGCTTAAGTTTCAACAAATTGTGAAAATCAAGACTAATCATGTCTACTACTGGAGTCCAGTCTTCTCAGTCCTCCGGACCCCGCTCCACTCCTCAGTCCGGACCTTTCCAAACCTTGTCCTCCTCCCAGCTTGCGGCCCTCTCACTCGGGGTCACCAGCTCTCTTCTACCTTCCCCAGCTGAGCTAGTCAGCATCTCACAAGCCCTGACCACCCTAGGCGCGTCTGCCACCAACCTCACTCCACTATCACTAGAAATAGTTAATTACTGCTTTGACAACGGGTCTTCACCAGAAACAGTCTTCAAGGGTGACTCAACCGTGCTCCAGATGCCGTCTCCAAAGTCGCCATGCCATCACCCAATTACCACTCTGAGACAATTCTGCAGATACTTTGCAAAGATCATCTGGAATTATCGAGTTTCAAAGAATCTCCCTCCAGCGGCATGGGAAGCCTGGGCTTACAAACCCGAGCAAAAGTTTGCTGCCTTCGACTTCTTCGACGGCGTTCTCAATGAGGCGGCCCTCAACCCCATAGATGGACTTGTGCGTGTACCTAACGAGGCTGAACGACTCGCCAACCAAACTAATCGCAACGTCCATCTCTTCGAGAGCAACGCACAAAAGAACAGAGCCCTTACCACCTCGGCTCTTGTCACCAAGGGGCTCCAAGGTTCAGAGTCTCCAAGGATCCAATTTCTCCCAGGCCCTGAGTAGTTTAGAAATGAACAAGGCTCCCGCAGTAGCCTCCCACCGGGTTCCAACTGTGCCTATCCTGCTTAACTTAATAAGCCTAGCCTTCTGTTTTAATGCAAGT
| 111,082 |
OY979772.1
|
Cafeteriavirus-dependent mavirus
|
Hackl,T.
|
Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
|
Netherlands
|
2023-12-15
| null |
Cafeteriavirus-dependent mavirus
|
Mavirus
|
Lavidaviridae
|
dsDNA
| 19,452 |
GenBank
| null | null | null | null | null | null |
SAMEA112966047
|
PRJEB61642
|
Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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OY515905.1
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Hackl,T.
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Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
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Netherlands
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2023-07-27
| null |
Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Mavirus
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Lavidaviridae
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dsDNA
| 19,832 |
GenBank
| null | null | null | null | null | null |
SAMEA112966039
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Hackl,T.
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Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
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Netherlands
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2023-05-04
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Mavirus
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Lavidaviridae
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dsDNA
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GenBank
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Mavirus
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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|
Cafeteriavirus-dependent mavirus
|
Hackl,T.
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Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
|
Netherlands
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2023-05-04
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
|
Mavirus
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Lavidaviridae
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dsDNA
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GenBank
| null | null | null | null | null | null |
SAMEA112966046
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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| 16,160 |
OX559518.1
|
Cafeteriavirus-dependent mavirus
|
Hackl,T.
|
Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
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Netherlands
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2023-05-04
| null |
Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Mavirus
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Lavidaviridae
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dsDNA
| 19,961 |
GenBank
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SAMEA112966044
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Hackl,T.
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Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
|
Netherlands
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2023-05-04
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Mavirus
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Lavidaviridae
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GenBank
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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OX560864.1
|
Cafeteriavirus-dependent mavirus
|
Hackl,T.
|
Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
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Netherlands
|
2023-05-04
| null |
Cafeteriavirus-dependent mavirus
|
Mavirus
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Lavidaviridae
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dsDNA
| 19,992 |
GenBank
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SAMEA112966045
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Hackl,T.
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Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
|
Netherlands
|
2023-05-04
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Mavirus
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Lavidaviridae
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dsDNA
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GenBank
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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Hackl,T.
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Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Eco-Evolutionary Bioinformatics, Nijenborgh 7, 9747 AG Groningen
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Netherlands
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2023-05-04
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Mavirus
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GenBank
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PRJEB61642
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Cafeteriavirus-dependent mavirus genome assembly, complete genome: monopartite
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Fischer,M.G., Hackl,T.
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Max Planck Institute for Medical Research, Biomolecular Mechanisms
|
Germany
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2016-12-09
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endo_mavirus
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Cafeteriavirus-dependent mavirus
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Mavirus
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Lavidaviridae
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dsDNA
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GenBank
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Cafeteria roenbergensis
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2014-01-20
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Cafeteriavirus-dependent mavirus, complete genome
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| 79,144 |
KJ542626.1
|
Calovo virus
|
Dufkova,L., Pachler,K., Kilian,P., Chrudimsky,T., Danielova,V., Ruzek,D., Nowotny,N.
|
Veterinary Research Institute, Virology
|
Czech Republic
|
2014-05-20
| null |
Calovo virus
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
Czech Republic
|
Czech Republic
| null | null |
1963
| null | null |
Calovo virus strain 134 segment L, complete sequence
|
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| 90,391 |
KJ542629.1
|
Calovo virus
|
Dufkova,L., Pachler,K., Kilian,P., Chrudimsky,T., Danielova,V., Ruzek,D., Nowotny,N.
|
Veterinary Research Institute, Virology
|
Czech Republic
|
2014-05-20
| null |
Calovo virus
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
Croatia
|
Croatia
| null | null |
1969
| null | null |
Calovo virus strain JAn (MS3) segment L, complete sequence
|
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Calovo virus
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Dufkova,L., Pachler,K., Kilian,P., Chrudimsky,T., Danielova,V., Ruzek,D., Nowotny,N.
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Veterinary Research Institute, Virology
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Czech Republic
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2014-05-20
| null |
Calovo virus
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
Slovakia
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Slovakia
| null | null |
1975
| null | null |
Calovo virus strain 8020 segment L, complete sequence
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| 90,393 |
KJ542635.1
|
Calovo virus
|
Dufkova,L., Pachler,K., Kilian,P., Chrudimsky,T., Danielova,V., Ruzek,D., Nowotny,N.
|
Veterinary Research Institute, Virology
|
Czech Republic
|
2014-05-20
| null |
Calovo virus
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,870 |
GenBank
| 1 |
Slovakia
|
Slovakia
| null | null |
1975
| null | null |
Calovo virus strain 8040 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTACTCCTATATAAAGAAATTACAATAAAATTCATCAATAAAATGGATGACCAAATGTATGATCAATTTCTGAAAAGAATTCAAGCTTCCAAAACTGCTGTTGTTGCTAAAGACATCAGCACTGACATTTTAGAAGCAAGGCATGATTATTTTGGTCGTGAATTGTGTTCAGCAATAGGAATTGAATACAAAAACAATGTCCTCTTGGATGAGATTATTCTAGATATATGCCCTGGGGTGAATCTCATGGATTATAATATTCCAAATGTCACCCCGGATAATTACATCTGGGATGGCAATTTCCTGATTATAATAGATTACAAAGTTTCAGTTGGGACTGATAGTAGTGAGATCACTTACAAAAAATACACCACCTTAATTTTACCAATTATGGAGAGTTTGGGTATCCCTACAGAGGTGGCTATAATACGTGCCAACCCACTTACATATCAATTAACAATTATAGGCGAAAATTTCCGTGAGAGATACCCTAACATCCCATTACAGTTAGATTTTACAAAATTCTTTGAGCTACGCAAAATGCTATTGGATAAATTTGCAGATGACGAAGAGTTCCTGCTGATGATCGCACATGGTGATTTCACCTTAACAGCACCTTGGTGTGTTGATGACACCCCAGAATTACTAGACCATCCAATATACCAAGAATTCCTTGGCTCCATGCCGAGAAGATTTGTTGATCTTTTTAATGAAGCCATTGACTTTAGTGCTTACTCTGCAGAAAGATGGAACACATTACTGCATAAAGCAAAATCTATAACAGGTGATGATTATCAAGATTACCTATCAAGGAAAGCGCACAATATATTCAATATGGATGGAAATTATATGAGACCAACTCAAGATGAAATTGATAAGGGTTGGGAAATGATGAGCAAGAGAGTTGCTCAAGAGCGAGATATCATAACAGATACAACAAAGCAGAAACCCTCAGTGCATTTCATCTGGACAAGAAATAACAATAGGAAACTTTTAGGATCAACTGCAAAATTAATTTTCTTGTCAAATTCACTTAAATCTATAAACGAACAGTCTACTTGGTCAGAGTCATTGATCGCAATTGGCATGAGCATGGACATAGGCAATAATATAGGTCAATATGAATCACTATGTGCAGAAAGGAAAATGATTGCTAGGTCGACAGGAAAAAAGATAGACAATAAAAGGCTAGATGCAGTTAAAGTTGGCAATGCACTTGTTTTGTGGGAACAGCAATTTATCTTAGCAAACGAACTTTTTAAAAATCAAGAGAGGCAAAAATTCCTAAAAAACTTTTTTGGAATAGGTAAGCATAAATCATTCAAGGATAAAACTGCTACAGATATTGACATTGAAAAGCCAAGAATATTAGACTTTAATAACAGTATTGTTTTGATGGCTGCCAAGGCTATGGTTAATAAAAACAAAGTATTCCTTTCCCAGCAGAATACATTAAATGAACTCCACCCAATAATTTCTACATTTTATGATAAAATAGAAGAAGCATCTGAAGAAACAGGAGAAATACTAAAAAAGATTTCAAAAACTTGTTTTTGGCAGTGCATTACCGACATATCTACATTGATGCGAAACATACTATCAGTTTCCCAATATAACAGACATAACACCTTCAGGGTGGCAATGTGTGCAAATGACTCAGTCTATGGATTAGTTTTTCCATCTTCAGACATAAAGACAAAAAGAGCAACAGTGGTTTTCTGCATCGTGTGCATCCACGAAGATAAAAGAGATATTATGGATGCAGGGGCTTTATTCACTACACTTGAATTGAAAACAAAAAATTATATTTCTATTAGTAAGGCAATTAGATTGGACAAAGAGAGATGTCAGAGAATCGTGTCATCACCCGGCTTGTTTTTACTGAGCTCATTATTGCTATATAATAACAATCCTCAGATATCTCTCATTGATGTACTAAATTTCACATTTTACACCAGCTTATCAATAACTAAGAGCATGCTATCTTTAACTGAACCATCTAGGTATATGATAATGAATTCACTGGCTATATCTAGCCATGTCAGAGATTATATAGCAGAGAAGTTCTCACCATATACTAAGACTTTGTTTAGTGTTTATATGGTTAATTTGATCAAAATAGGATGCAGCTCTGCAAATGAACAATCTAGCAAAATACAATTAAGAAATATCTACTTATCTGATTATGATATAACTCAAAAAGGTGTGCATGATGAAAGAAATCTAGAGTCTATATGGTTTCCAGGTAAAGTTAATCTTAAGGAATATATAAATCAAATTTACTTACCTTTTTATTTTAATGCTAAAGGGTTGCACGAAAAGCATCATGTGATGATGGACTTAGCAAAAACAGTTTTAGAGATTGAGATGAACCAACGCTCTGAAAACTTAGGGATATGGTCAAAAGCAGAAAAGAAACAGCATGTAAATTTACCAATCCTGATTCATTCTTTATCAAAGTCACTCATTTTAGATACATCAAGACATAATCATCTCAGAAATAGGGTGGAAAGTAGAAACAACTTCAGAAGAAGCATAACTACTATTAGCACATTTACTAGTTCAAAATCTTGTATTAAAATTGGAGATTTTAGAGATTTGAAGTCTAAGGAGTTTCAAAAACAGAAGAAAACAAATAGTAAAGCTCTAGAAAAATATAGATTATCTAACCCTCTGTTTTTGGAAGATGAAGAGCAGACATTAGAGACACAGCACTGCAATTATGAGGCACTAACCAAGAAGATACCAAATTATAAGGACTACATATCTGTTAAAGTTTTTGACAGGCTTTATGAATTGCTAAAGAATGAAAAACTAAATAATGATTCTTTTATTGAGCAGGCAATGTTAATGATGAAAAACCATAGAGAGTTCGCATTCACATTTTTTAATAAAGGACAAAAAACTGCAAAAGATAGAGAGATCTTTGTAGGCGAATTTGAAGCCAAAATGTGTATGTATGTTGTGGAAAGGATATCAAAAGAAAGATGCAAATTAAACACTGATGAAATGATAAGTGAGCCTGGTGATGCAAAACTGAGAATCCTAGAGAAGAAGGCTGAAGAGGAGATAAGATTTATTGTTGAGAGGACAAAGGACAATATATTAAAAGGTAATCCCACAAAAGCATTGAAACTTGAGATAAATGCTGACATGTCAAAATGGAGTGCCCAAGATGTATTTTACAAATACTTTTGGCTAATTGCCTTAGACCCAATACTATATCCTAAAGAAAAGAAGCGTATCTTGTTCTTTATGTCAAACTACATGCAAAAACATTTGATTATACCAGACGACCTTATTGCAAATATCCTTGATCAGAAGACCCCTTATAAAAATGATTTAATACTTGATGCAACTAATGGACTGAATAGGAACTTTGTTAATATTAAGAGAAATTGGCTTCAAGGTAATTTTAATTATATATCCAGTTATGTACACAGTTGTGCAATGCTGGTCTATAAAGATATAATTAAAGAATCTTTTAAATTACTTGAGGGAGACTGCCTGGTCAATTCTATGGTTCATTCAGATGACAACCAGACTTCACTAGCAATTTTACAGAATAAAGTCTCTGATGACATGGTCATACAATTCTCAACAATAACATTTGAACAAGTCTGCCTGGCATTTGGCTGTCAGGCAAATATGAAGAAGACATATGTAACACACACTTGTAAAGAATTTGTTTCACTCTTCAATCTTCATGGGGAACCTTTATCTGTTTATGGCCGGTTCTTATTGCCTAGTGTAGGTGATTGTGCATATATTGGCCCTTATGAGGATTTAGCAAGTAGATTATCAGCAGCACAACAAAGTATAAAACATGGTTGTCCACCAAGTTTAGCATGGGTAGCAATAAGTTGTAGCCATTGGATAACATACTTGACATACAACATGCTAGATGATCAAGTAAATTCCCCCCTCAATTATCTCCCTTTCAAAAATCGCCATGAAATACCTGTAGAATTAAATGGTTACATTGATGCACCATTATATTTAATAGCTTTGGTTGGATTGGAAGCAGGCAATCTCTGGTTTTTGATGAATATTTTGAAAAAACTTGTTCCTCTGGACAAACAACGAGAAACAGTTCAAACTCAATTTCAAACAATTAAGTCATTACAAGGTTTAAGCGATTCCGACATTTTCAGGCTCAAAATACTTAGATATTTGACCTTAGATACGGAAATAACTGGAGATAATAATATGGGTGAAACTAGTGACATGAGAAGTAGATCTTTACTCACACCGAGGAAATTCACAACTGTAGGTTCTTTAAATAAATTAGTATCATATAATGATTTCAAGGAATCTATGTCTACTGAAAAATATAAGGAAAATCTTACATACATGTTACACAACCCAGAGCTGTTGGTCACAAAAGGTGAAGATAAAGAACAGTTTATGGAATCCATATTATATAGATACAATTCAAAACGATTCAAAGAAAGTTTGTCTATACAGAACCCAGCTCAGTTGTTCATTGAACAAATATTATTCTCTCACAAACCAATTATAGATTATAGTAGTATCTTTGACAAATTAACTTCTCTAGCAGAATCAGATTTAATTGCAGAATTACCAGAGATTATAGGAAGGGTGACATTCCCTCAAGCTTATCAGATGATTAATAGAGACATAAGCCAGTTGCCATTAGACATTAATGATGTAAAAGTAGTATTTAAATATTGCATCTTAAATGATCCATTAATGATAACTGCTGCAAACACAGCTCTGTTATGTGTTAGGGGAACCCCGCAAGATAGAACAGGACTAAGTGCTAACCAAATGCCTGAATTTAGGAACATGAAACTTATCCATCACTCTCCAGCATTAGTTCTGAAGGCATTTAGTAAATCCACCACTGATATAGCAGGTGCTGACCCAACAGAATTAGCAAAAGACTTACATCACCTTGAGGAATTCTTATCAAATACAGGGATACAGGACAAGATAAATCAAAATATAGATAATCCACCGAAGCACTTAGT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