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National Center for Biotechnology Information, NIH
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Saudi Arabia
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| 5,674 |
MF593473.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Li,Y., Khalafalla,A.I., Paden,C.R., Yusof,M.F., Eltahir,Y.M., Al Hammadi,Z.M., Tao,Y., Queen,K., Al Hosani,F., Gerber,S.I., Hall,A.J., Al Muhairi,S., Tong,S., hALL,A.J.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Viral Diseases
|
USA
|
2017-10-10
| null |
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,389 |
GenBank
| null |
United Arab Emirates
|
United Arab Emirates
|
Camelus
|
oronasopharynx
|
2015
| null | null |
Camel alphacoronavirus Abu Dhabi B38, complete genome
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| 74,407 |
KT368892.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
|
camel/Jeddah/Jd29/2014
|
Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,391 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-06
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/Jd29/2014, complete genome
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| 84,543 |
KT368893.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
|
camel/Jeddah/Jd55/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,386 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-06
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/Jd55/2014, complete genome
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| 84,544 |
KT368894.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
|
camel/Jeddah/Jd63/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,397 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-06
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/Jd63/2014, complete genome
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| 84,545 |
KT368895.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
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2015-12-17
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camel/Jeddah/O23(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,396 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-10
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/O23(a)/2014, complete genome
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| 84,546 |
KT368896.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
|
China
|
2015-12-17
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camel/Jeddah/O47(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,389 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-10
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/O47(a)/2014, complete genome
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| 84,547 |
KT368897.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
|
China
|
2015-12-17
|
camel/Jeddah/O100/2014
|
Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,395 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-10
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/O100/2014, complete genome
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| 84,548 |
KT368898.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
|
China
|
2015-12-17
|
camel/Jeddah/N38/2014
|
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,395 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-11
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/N38/2014, complete genome
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| 84,549 |
KT368899.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
|
China
|
2015-12-17
|
camel/Jeddah/N60/2014
|
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,390 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-11
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/N60/2014, complete genome
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| 84,550 |
KT368900.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
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camel/Jeddah/N62(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,390 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-11
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/N62(a)/2014, complete genome
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| 84,551 |
KT368901.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
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camel/Jeddah/N68(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,396 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-11
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/N68(a)/2014, complete genome
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| 84,552 |
KT368902.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
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2015-12-17
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camel/Jeddah/D33(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,396 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-12
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/D33(a)/2014, complete genome
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| 84,553 |
KT368903.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
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camel/Jeddah/D38(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,384 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-12
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/D38(a)/2014, complete genome
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| 84,554 |
KT368904.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
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2015-12-17
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camel/Jeddah/D43(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,395 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-12
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/D43(a)/2014, complete genome
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| 84,555 |
KT368905.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
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camel/Jeddah/D46(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,397 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-12
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/D46(a)/2014, complete genome
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| 84,556 |
KT368906.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
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The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
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2015-12-17
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camel/Jeddah/D50(a)/2014
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,395 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2014-12
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/D50(a)/2014, complete genome
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| 84,557 |
KT368907.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
|
camel/Riyadh/Ry141/2015
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,395 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2015-03
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Riyadh/Ry141/2015, complete genome
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| 84,558 |
KT368908.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
|
China
|
2015-12-17
|
camel/Riyadh/Ry159(a)/2015
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,395 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2015-03
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Riyadh/Ry159(a)/2015, complete genome
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| 84,559 |
KT368909.1
|
Camel alphacoronavirus
|
Sabir,J.S.M., Lam,T.Y., Ahmed,M.M., Li,L., Shen,Y., AboAba,S., Qureshi,M.I., Abu-Zaid,M., Zhang,Y., Khiyami,M.A., Alharbi,N.S., Hajrah,N.H., Sabir,M.J., Mutwakil,M.H.Z., Kabli,S.A., Alsulaimany,F.A.S., Obaid,A.Y., Zhou,B., Smith,D.K., Holmes,E.C., Zhu,H., Guan,Y.
|
The University of Hong Kong, Centre of Influenza Research & State Key Laboratory of Emerging Infectious Diseases
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China
|
2015-12-17
|
camel/Jeddah/Jd1(a)/2015
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Human coronavirus 229E
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,386 |
GenBank
| null |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus
| null |
2015-01
| null | null |
Camel alphacoronavirus isolate camel/Jeddah/Jd1(a)/2015, complete genome
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| 84,560 |
KT253324.1
|
Camel alphacoronavirus Camel229E
|
Corman,V.M., Eckerle,I., Memish,Z.A., Liljander,A.M., Dijkman,R., Jonsdottir,H., Juma Ngeiywa,K.J., Kamau,E., Younan,M., Al Masri,M., Assiri,A., Gluecks,I., Musa,B.E., Meyer,B., Muller,M.A., Hilali,M., Bornstein,S., Wernery,U., Thiel,V., Jores,J., Drexler,J.F., Drosten,C.
|
University of Bonn Medical Centre, Institute of Virology
|
Germany
|
2016-09-07
|
Camel229E-CoV/JC50/KSA/2014
|
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,395 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus dromedarius
|
oronasopharynx
|
2014
| null | null |
Camel alphacoronavirus Camel229E isolate Camel229E-CoV/JC50/KSA/2014, complete genome
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| 80,021 |
KT253325.1
|
Camel alphacoronavirus Camel229E
|
Corman,V.M., Eckerle,I., Memish,Z.A., Liljander,A.M., Dijkman,R., Jonsdottir,H., Juma Ngeiywa,K.J., Kamau,E., Younan,M., Al Masri,M., Assiri,A., Gluecks,I., Musa,B.E., Meyer,B., Muller,M.A., Hilali,M., Bornstein,S., Wernery,U., Thiel,V., Jores,J., Drexler,J.F., Drosten,C.
|
University of Bonn Medical Centre, Institute of Virology
|
Germany
|
2016-09-07
|
Camel229E-CoV/JC49/KSA/2014
|
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,193 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus dromedarius
| null |
2014
| null | null |
Camel alphacoronavirus Camel229E isolate Camel229E-CoV/JC49/KSA/2014, complete genome
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| 80,022 |
KT253326.1
|
Camel alphacoronavirus Camel229E
|
Corman,V.M., Eckerle,I., Memish,Z.A., Liljander,A.M., Dijkman,R., Jonsdottir,H., Juma Ngeiywa,K.J., Kamau,E., Younan,M., Al Masri,M., Assiri,A., Gluecks,I., Musa,B.E., Meyer,B., Muller,M.A., Hilali,M., Bornstein,S., Wernery,U., Thiel,V., Jores,J., Drexler,J.F., Drosten,C.
|
University of Bonn Medical Centre, Institute of Virology
|
Germany
|
2016-09-07
|
Camel229E-CoV/JC52/KSA/2014
|
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,193 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus dromedarius
| null |
2014
| null | null |
Camel alphacoronavirus Camel229E isolate Camel229E-CoV/JC52/KSA/2014, complete genome
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| 80,023 |
KT253327.1
|
Camel alphacoronavirus Camel229E
|
Corman,V.M., Eckerle,I., Memish,Z.A., Liljander,A.M., Dijkman,R., Jonsdottir,H., Juma Ngeiywa,K.J., Kamau,E., Younan,M., Al Masri,M., Assiri,A., Gluecks,I., Musa,B.E., Meyer,B., Muller,M.A., Hilali,M., Bornstein,S., Wernery,U., Thiel,V., Jores,J., Drexler,J.F., Drosten,C.
|
University of Bonn Medical Centre, Institute of Virology
|
Germany
|
2016-09-07
|
Camel229E-CoV/AC04/KSA/2014
|
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,241 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus dromedarius
| null |
2014
| null | null |
Camel alphacoronavirus Camel229E isolate Camel229E-CoV/AC04/KSA/2014, complete genome
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| 80,024 |
KT253328.1
|
Camel alphacoronavirus Camel229E
|
Corman,V.M., Eckerle,I., Memish,Z.A., Liljander,A.M., Dijkman,R., Jonsdottir,H., Juma Ngeiywa,K.J., Kamau,E., Younan,M., Al Masri,M., Assiri,A., Gluecks,I., Musa,B.E., Meyer,B., Muller,M.A., Hilali,M., Bornstein,S., Wernery,U., Thiel,V., Jores,J., Drexler,J.F., Drosten,C.
|
University of Bonn Medical Centre, Institute of Virology
|
Germany
|
2016-09-07
|
Camel229E-CoV/JC50_HUH7/KSA/2014
|
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,270 |
GenBank
| 1 |
Saudi Arabia
|
Saudi Arabia
|
Camelus dromedarius
| null |
2014
| null | null |
Camel alphacoronavirus Camel229E isolate Camel229E-CoV/JC50_HUH7/KSA/2014, complete genome
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| 80,025 |
KU291449.1
|
Camel alphacoronavirus Camel229E
|
Corman,V.M., Eckerle,I., Memish,Z.A., Liljander,A.M., Dijkman,R., Jonsdottir,H., Juma Ngeiywa,K.J., Kamau,E., Younan,M., Al Masri,M., Assiri,A., Gluecks,I., Musa,B.E., Meyer,B., Muller,M.A., Hilali,M., Bornstein,S., Wernery,U., Thiel,V., Jores,J., Drexler,J.F., Drosten,C.
|
University of Bonn Medical Centre, Institute of Virology
|
Germany
|
2016-09-04
|
Camel229E-CoV/KCSP1/KEN/2015
|
Human coronavirus 229E
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,164 |
GenBank
| 1 |
Kenya
|
Kenya
|
Camelus dromedarius
| null |
2015
| null | null |
Camel alphacoronavirus Camel229E isolate Camel229E-CoV/KCSP1/KEN/2015, complete genome
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| 80,036 |
NC_041831.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-05-02
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 27,985 |
RefSeq
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig3, complete sequence
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| 3,542 |
NC_041832.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-05-02
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 14,701 |
RefSeq
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null |
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|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig4, complete sequence
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| 3,543 |
NC_041833.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-05-02
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 51,534 |
RefSeq
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null |
PRJNA485481
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Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig2, complete sequence
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| 3,544 |
NC_041834.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-05-02
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 24,608 |
RefSeq
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig5, complete sequence
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| 3,545 |
NC_027989.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2015-10-07
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 53,237 |
RefSeq
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig1, complete genome
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| 6,045 |
HM246720.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
|
Universidade do Minho, Institute for Biotechnology and Bioengineering
|
Portugal
|
2012-01-31
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 53,237 |
GenBank
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null | null |
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig1, complete genome
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|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
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Universidade do Minho, Institute for Biotechnology and Bioengineering
|
Portugal
|
2012-01-31
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Campylobacter virus IBB35
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Firehammervirus
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dsDNA
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GenBank
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Campylobacter
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Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig2, complete sequence
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| 97,595 |
HM246722.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
|
Universidade do Minho, Institute for Biotechnology and Bioengineering
|
Portugal
|
2012-01-31
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 27,985 |
GenBank
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null | null |
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig3, complete sequence
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| 97,596 |
HM246723.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
|
Universidade do Minho, Institute for Biotechnology and Bioengineering
|
Portugal
|
2012-01-31
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 14,701 |
GenBank
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null | null |
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig4, complete sequence
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| 97,597 |
HM246724.1
|
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35
|
Carvalho,C.M., Kropinski,A.M., Lingohr,E.J., Santos,S.B., King,J., Azeredo,J., Carvalho,C.A., Azeredo,J.C.
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Universidade do Minho, Institute for Biotechnology and Bioengineering
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Portugal
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2012-01-31
| null |
Campylobacter virus IBB35
|
Firehammervirus
| null |
dsDNA
| 24,608 |
GenBank
| 1 | null | null |
Campylobacter
| null | null | null | null |
Campylobacter phage vB_CcoM-IBB_35 clone Contig5, complete sequence
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| 97,598 |
AC_000020.1
|
Canine adenovirus 2
|
Davison,A.J., Benko,M., Harrach,B., Shibata,R., Shinagawa,M., Iida,Y., Tsukiyama,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2004-12-01
| null |
Canine mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 31,323 |
RefSeq
| 2 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Canine adenovirus type 2, complete genome
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| 8,346 |
OP060355.1
|
Canine adenovirus 2
|
Wang,J.
|
Southwest Minzu University, The Department of Life Science
|
China
|
2023-03-26
| null |
Canine mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 31,786 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Canis lupus familiaris
| null |
2021
| null | null |
Canine adenovirus 2 strain G1, complete genome
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| 17,219 |
OP644981.1
|
Canine adenovirus 2
|
Kim,Y.J., Lee,S.Y., Kim,Y.S., Na,E.J., Park,J.S., Oem,J.K., Kim,Y.
|
Jeonbuk National University, Veterinary Medicine
| null |
2022-11-23
|
Korea/18Ra-54/2020
|
Canine mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 31,323 |
GenBank
| 1 |
South Korea
|
South Korea
|
Nyctereutes procyonoides
| null |
2018
| null | null |
Canine adenovirus 2 isolate Korea/18Ra-54/2020, complete genome
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| 22,091 |
MN304825.1
|
Canine adenovirus 2
|
Laborda,E., Puig-Saus,C., Rodriguez-Garcia,A., Moreno,R., Cascallo,M., Pastor,J., Alemany,R.
|
Auburn University, Scott-Ritchey Research Center
|
USA
|
2020-05-17
| null |
Canine mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 31,503 |
GenBank
| 1 |
Spain
|
Spain
|
Canis lupus familiaris
| null |
2014-03-04
| null | null |
UNVERIFIED: Canine adenovirus 2 strain Toronto A26/61 other sequence, sequence
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| 50,442 |
U77082.1
|
Canine adenovirus 2
|
Shibata,R., Shinagawa,M., Iida,Y., Tsukiyama,T., Campbell,J.B., Zhao,Y.
|
Campbell J.B., University of Toronto, Medical Genetics and Microbiology, 150 College Street, Toronto, Ontario M5S 3E2
|
Canada
|
1996-12-14
| null |
Canine mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 31,323 |
GenBank
| 1 | null | null |
Canis lupus familiaris
| null | null | null | null |
Canine adenovirus type 2 strain Toronto A26/61 complete genome
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| 111,805 |
NC_026814.1
|
Canine astrovirus
|
Caddy,S.L., Goodfellow,I.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2015-04-16
| null |
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,617 |
RefSeq
| 1 |
United Kingdom
|
United Kingdom
| null | null |
2012-08
| null |
PRJNA485481
|
Canine astrovirus strain Gillingham/2012/UK, complete genome
|
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| 6,182 |
OR220022.1
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Canine astrovirus
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Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
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Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
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Thailand
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2023-09-20
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V91_VN_2022
|
Canine astrovirus
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Mamastrovirus
|
Astroviridae
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ssRNA(+)
| 6,478 |
GenBank
| 1 |
Viet Nam
|
Viet Nam
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Canis lupus familiaris
|
feces
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2022
| null | null |
Canine astrovirus isolate V91_VN_2022, complete genome
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Canine astrovirus
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Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
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Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
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Thailand
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2023-09-20
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V194_VN_2022
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Canine astrovirus
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Mamastrovirus
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Astroviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
| 1 |
Viet Nam
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Viet Nam
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Canis lupus familiaris
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2022
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|
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|
Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
|
Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
|
Thailand
|
2023-09-20
|
V196_VN_2022
|
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,478 |
GenBank
| 1 |
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2022
| null | null |
Canine astrovirus isolate V196_VN_2022, complete genome
|
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Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
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Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
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Thailand
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2023-09-20
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V138_VN_2022
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Canine astrovirus
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Mamastrovirus
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Astroviridae
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| 6,478 |
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| 1 |
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Viet Nam
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Canis lupus familiaris
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|
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|
Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
|
Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
|
Thailand
|
2023-09-20
|
V98_VN_2022
|
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,478 |
GenBank
| 1 |
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2022
| null | null |
Canine astrovirus isolate V98_VN_2022, complete genome
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Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
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Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
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Thailand
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2023-09-20
|
V107_VN_2022
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Canine astrovirus
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Mamastrovirus
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Astroviridae
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| 6,478 |
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| 1 |
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Viet Nam
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Canis lupus familiaris
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2022
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|
Canine astrovirus
|
Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
|
Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
|
Thailand
|
2023-09-20
|
V111_VN_2022
|
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,478 |
GenBank
| 1 |
Viet Nam
|
Viet Nam
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2022
| null | null |
Canine astrovirus isolate V111_VN_2022, complete genome
|
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Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
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Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
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Thailand
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2023-09-20
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S76_TH_2021
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Canine astrovirus
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Mamastrovirus
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Astroviridae
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ssRNA(+)
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Canis lupus familiaris
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2021
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| 12,769 |
OR220030.1
|
Canine astrovirus
|
Nguyen,T.V., Piewbang,C., Techangamsuwan,S.
|
Faculty of Veterinary Science, Chulalongkorn University, Department of Pathology
|
Thailand
|
2023-09-20
|
G21_TH_2021
|
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,460 |
GenBank
| 1 |
Thailand
|
Thailand
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2021
| null | null |
Canine astrovirus isolate G21_TH_2021, complete genome
|
GATCTCTAGTATGTGTTCAGTGCCACCTTACTTCCGCAACCAAGCGGACCAAGATTTCTCCTTCGGGAGCACTATGGCAAGGAGGATGATGACCATTAATATGGTCAACACCCTCCCACCATTTGAAGAGCACACACCACTTCATTATGACTGGGTTGTTAAACATCTTATATTTCCAGGACCAAATACCACTGAGCGTTGTGTAGTCATAACCGGTGGTCTTGAAAACGGTAACTATGTTACTGTTGCTCATGATGGTGACACCTGGATAGAAATAAACCCGGCATACAAGTTTGAAGGACTGCTCAGAGTGCTCCGCATGACAGCTCGCAACAACTCCTTGCGCGAGCGTCTGCGTCTTAGTCAGGAGGAAAAATCGAAATTGATTCTTGACCATCAACTCTTGAGGCATGACTATGAACGCATCAAATCTCAAACTAGCACTAGCACTAAGACTAAAATCCCTATATTTGTTGTGTTTGTTGCTGCATTGATTATCTTCCTGAACTTTGTGCCAACCACGGAGGCAGCACAGGCTTACACAAGCAAGTATACTCAAACTGGTACTGAGGGATTTAGCCTATTGGACAAATGCGCACAAAATGTGGCCAGGCTTAACAACGAAATAAGTCTAAGACTGAAGCTGGCCCTAGGCAATGTGACTTGGTCTGACCGCTATGGTGCAATCAAAGAGATCTTCTATGCCAACCTCTTGCCGAGATCGCACTGGATTGTGCGTCTCTTCTCTTTCCTTTCATACTTCCATATTTGGACCATCTTTTCAACATGCATTGCTGTGGCAACATTGACTCGGTCTACAAACCCTATCGTTGACATAGTATTTCTGTTCTTTGCCCACATATCAAAATGGCAGTTGGGTATTGTCCCAGCTCTTCCATATTTCACCACCACTATTGTATGGATCGCCATAACCTGTATGGGAGCTTATGTACTGGATCCATACCTTGCCATCACATTAACATGGCTCCAGCTCCCTTTTTGTGTTGTGTGCCTTTCTTTCCTAAGTGATGACAAGTTCATTGAGCATGTGAGAGGATCATTCATTCTAACTGTAACAGCAACATCCATCCACACCTGCCTTGTTCTAACTGGTAGTACCACCTACTGCTTCATACTTCTGATGTTCTTTAGGAGTCTTCGACTTCTAATGTCCTCTGTCGGTAACAAGATAGAGTTTAAAGATTTCCAGGGTAAGGTCGTTGGATCGATTTCTTCAGGAACACGTAACCGTGTCTGGAACTTCATCCAGCGAATGAAGCAGGTCAGAACTGGTTCTAATCCATTTGCTATCATAAAACCTGAAGCACTTGTCAAAATCGTAACCGATGAAGGATGTGGAACCGGTTTCTTTTGTGGTAATGACATAGTTACAGCAGGTCACGTGGTCGGTAGCCATCGCGTTGTTGAAGCCTGGTATGAAGGCTCATGCTACCAAGCAAGAGTTCGCTACAAGCCAGACAAAGACATCGCCTTCCTGGCTTTACCAGGTGACATGAAACCTAAAGCGCGCTATAAAATAGCGCAACAACCTGACTACTCCACTGTGGTTGTGTTAGCATACAGCTCTAATGGACTTGTTGTCTCACAAGCGCAAGGCCAATGTCACGGGGATACCATCTCCTATACTGTCCCAACTCAGGATGGTATGTCAGGGGCACCCGTCACTGACTTACATGGCCGTGTGCTTGGTGTGCATCAAACCAACACTGGCTTTACTGGTGGTGCCGTAGTCATTAAAACATCAGATGTAACACCTCCAACACGCCCAACTGAGGACGACTTGCGTAAACAAATTGAAGACCTACGTAAGCAACTTGAGGAAGTTAACAAACCCCAACCTCAAGAGACATTGGAACAGTCAAACTCAGGTGCTGAGGTGGTTTCTCTCGTGAGAGAAGCCGTGAGGCGTGAAATGGACATACTACGGCAAGAAATAAACCAGCAGCTAATGTTGCAGAAGAAGAAAGGTAAAAACAAGGGTGGTGGTCGTGGTAACGTCAGAAAACATGTTGGCAAGGTTAAGGGCAGGAAATACCTAACTGAGAAAGAATACAAAGAACTCTTGGAGAAAGGTCTTGACAGAGAAGAGCTCCTCGACCTAATTGATGACATCATAGACAAGAGGATAGGATTTCCTGAATGGAGTGACCCAGAGCTAAGTGATGATGATGATTCAAACTGGGACACATATGGTGATGAATTTGACCATCGTGATGTGGGTTTACAATCAAGACCCAAACAGAAAATCAAGGAAGCAACCCAATGTGTCATACAGGTTCAGGAAGTTGTCCCAATTGATGAGGTTACAATCTCAAAAGCAACTGAGTCTAAAGACTTTACTCAACATTGGGGCAAGGAACCTGTGTTTGAATCATACGATTTTGACTGGACTGCTGAGGATGCAAAGAACATACTACCTGAGAACTCACGTTTGACTAAATGTGACTACATAGTCCTTGGTAGCCACATCCTCAAGCTTAGGCACATAATAACAACAGCACTTGAAACCAACAACTTCAGTGAGTTGCCTAAGGCAGTCTATGCACTTGATCACTTTGCTTGGGACCATGGTCTAGAGGGCTTCCTACAACGGATTAAATCCAAGAAGCCAAAAAACGTGAAAGGGGCTCCCAAGGGAGCCCCGAAAAATGGCAACTAGACTACTGGCAAAAACTCCTTGAGGAACCACGGTCAAGACGTTGTGTACCGGAAAGCTACCCATTATTAGGCCACTTAAAATTAGATAGACCAATTTATGATGACAAAATACCCAAAGATGATTTGCTCAAATCCCTACCAGTTCCTGATTGGCACGAATTTGAAAAATTTGGACCAACTGTGTGGGGACCACAAGCTTTCACCAAGTCTTTTGAAAAATTTGATTATGCACCACCTTCAAATTTCTTTGAGCAGTATCCAGAATTTTGTAAATTTGCTGATTGGGCATTTTATAAACAATATGGGTTTCTTGAAGATTCTCGTGTGATACATGTTTCAGCCACTGAAAAAAATCAAGACTCCACGCCTGCCTATCCCAAGATGCTCGACTATGACACCGAAGCCGACTTCTTGGAAGCGAATGGTTGGTCACCTTATGTTTCTGAGATCTCGAGGATTATGTCCGGAGCAAAACCTAAGGTTCTCTGGTACCTGTTCCTCAAGAAAGAAGTCATTAAAGTTGACAAAATTGCTGATTCAGACATAAGGCAAATTCTATGCAGTGACCCCATTTATGTTAGGATAGGTGCGGTACTTGAAGGACACCAAAACCAACTTATGAAGAACAACACTGAAAAGACCCATGGACAATGTGGCTGGACACCAATGGAAGGTGGCTTCACCTCTCGCATGAAACGCCTTATCTCCAAAGGTAACGCACATTTCATCGAGTTTGATTGGACCAGATTTGATGGCACTATACCATCTGATTTAATTCGACATATCAAGAAACTCCGTTGGAGTTTGGTTAATGCCGAACAGAGGAGGAAATACCAAAAACTTCATGATTGGTATGTTGAAAATCTGGTCAATCGTACTGTGCTACTTCCATCTGGTGAGGTTACAGAACAACATCGTGGTAACCCATCTGGCCAATTCTCCACTACCATGGATAACAACATGATCAACACATGGCTCCAGGCTTTTGAATTTGCCTATTTCCATGGACCTAACAAACAGCTCTGGCTGAATTATGACACCTTGGTCTATGGTGATGACAGGCTGTCAACAACCCCACTTATTCCTGACAACTATGTTGAGAGAGTCGTACTAATGTACAAAGATGTCTTTGGAATGTGGGTTAAGCCTGAGAAAGTCAAAATTTCAAACACCATTGTTGGTCTCAGTTTTTGTGGCTTTACTGTAGATGAGAATCTTGAACCAATACCCACGCAACCTGACAAATTGATGGCCTCACTTCTTAAACCAGCATCCAAACTTCCGGATCTTGAATCACTCCATGGGAAACTCCTGTGCTATCAGCTCCTCTCGGCATTCCTACCTGAGGAACACCCTTTCAAGGTGTATGTCGAGAGTTGTCTGGCTGCCACTAGCAGGCAGCTTCGTGATTCTGGTTTACCTACCAGATTCACAGAAGAGCAAATGCATCGCATATGGAGGGGAGGACCAAAAAATTGCGATGGCTAGCAAGCCAGGCAAAGATGTTACCGTCGAGGTTAAATCCTCCGGGACAAAATCAACATCCTCCAGGAGCAAATCCCGTGGCCGAACCCGGAATGTCAAAATCACTGTCAACTCACAACCAAGGGCAAACCGAAGGAGACGAAACAGACCTAACAATCGTGGTCGCAAGAGAGTTGAGGCTGTCGTTAAACGACAGCTCGATAAGGCTGGAGTCACAGGACCAAGACCAGCGATCACCCAAACTGCTACATCTACTCTGGGGACTATTGGCCCGAATACTTCGGGTGCAGTAGAGCTGGAACTTGCAACCTTCATGAACCCATGCTTGGTCAAAGAATCAACAGCCTCCAACTCTTTTGGACCCATCCAAGCCTCAGCTGCCCAATATAACCTCTGGCGTGTAACCAGAGCAGAGGTTAGGCTTACACCCATGGTTGGACCCTCTGCAATTTCTGGAACAGCCTACCGTGTCTCACTTAACACAGCGGGCACTCCATCCTCCACAGGATGGTCTGGTCTAGGCGCCAGGAAACACAAAGATGTCAGGGTTGGTGCCATGTCCACCTTCAGAGTAACAGCTAGGGACTTAGCTGGTCCACGTGAAGGCTGGTTCGTAACCAACACCAATGAATCAGGAGGAGAGTCTGTAGGTCCCACTATAGAGTTACATTCTCTTGGTGAAACCAAATCTACTTACCAAAATAGTTCCTACACAGGCCCTGTTTTCCTTGTTGAGCTTCATTGCACGTGGCAATTTACCAATTATAGTGCAAATCCAGCATTAGCACAACTTGAGAAAGGTGAAGACAAGGATGCCCAAATTAAGTTTGAAGGAACTGCAGGCCAGCCCCTAACCATGACAATTGCACCACATTCATCTTTTGCTCGAGCCCTTGAAACTCGTTCAACAGTTCCATATTCTTCAGGTACTCGAGCTGCGGGGGACTCTACTTCTGACACAATCTGGCAAATTGCGTCCACAGCAGTGGATGCAACCTCAGTCATAGTCCCTCCTCCTTTCAACTGGCTAATAAAGGGTGGTTGGTGGTTTGTGAAGAAATTGGCTGGTCGCACAAGGACTGGTGAACTTCAAGTCCAGGTCTATGCTAGCTATGAAGACGCCCAAAACAACAGACCAGCAATTTGCACAGGGCCAGCTGAGGGCAACAACGTTCCCAGGCTGCATAATGTCAAATTTGTCCAGATGAATGCACCTTCAACAGGCATGCCACCTGAATCAGCCCTTGGTGCTTTCAGTATGCCTACACCAGATGCACCTGTCGTCATTGGCGACAATTTCAGACTCATCACAGGGGTTTACCAACAGTTCCAACAGAACCCCCCGTGTCCGACTTATGTCTACCATAGCACCAACAAAATGGTAGCTAAAGTTGGAACTCACTACGATGAGCTTAACTTTGTATTTAGAGCAACAACTCCACACATCTGGTTAGCCGGTGGACCTCAAGTTTGGCAAATTGCAGATAAACCTGATGAACTGGGTTTTATGGAGATTGGCATTAAATCAGGGTCAACCTACTTGAAACGTGGCATAATCTGGGGCTACTCACAGCATAAGATAGTCAGTGGTAGCGAGCTTAGTGTCCTCACATTCTATGTGGGTAAACTTGACAACCAAATACGCTACACCAACTACAAGAAAGTTCGCTACCTGTTTACTGGCACAGGTTCCAACTTGAACATGGCCCCTGATTCTACTACTACTGAACTTCAGGTTTTGGAACTCAATCCTGGTCCTTGGTTTGTCTTTGCTTCGATTCATCTTGTTAACTCTTCACAGCAACAGAGTTTCATTGCAACTGAGAACACCAACAGGCCAACAATAGTCTGTCCTGCTGCCGCTCAAAATCTATTTGTTTGCACAAACAACACCGTTGCAAGCACCATGGCAATTGATTTTCTCAGGACACAACCAGTCTTTACACAGCAGGAAGAACAGGCCTTGTTTAATTTGCCACAGCCCATTGAAGATGGTTTTCTCCTAGATTCTGAAGATGAAGATTTTTCTGATGATGATTCTCTTCTTGATGATGATGATTTTTTCCCTGCTTCTGATCAGCAGGTTTTTTCAAGTCGCCAGGTCCTCTTCAGAGCAATGGTCAACGAGGGTTGGCCAGAGGACCAGGCTGAGCGCCTTGCCAAACGCGCTCTCCCTACACTAAGTGAGAAAGAACTTAGGGATGAATTTTTAGTCGGACTTGCTGACGGCTTCTCGCCACGTCAAGCAGCCGCAAATGCTCGTGAAAAGTGTTCCCGAGGCCACGCCGAGTAGGAT
| 12,770 |
OP093958.1
|
Canine astrovirus
|
de Deus,D.R., Siqueira,J.A.M., Cardoso,B.T.M., Teixeira,D.M., Maues,M.A.C., de Figueiredo,M.J.F.M., Junior,E.C.S., Bandeira,R.S., Pinheiro,K.C., Guerra,S.F.S., Soares,L.S., Resque,H.R., da Silva,L.D., Gabbay,Y.B.
|
Evandro Chagas Institute, Virology
|
Brazil
|
2022-10-26
|
PK01
|
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,620 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2019
| null | null |
Canine astrovirus strain CAstV/PK01/2019/BRA, complete genome
|
CCAAGAGTTGGTTTGGGTGATTAAATCGCCCAATAAGATCTCTAGTATGTGTTCAGTGCCACCTTACTTCCGCAACCAAGCGGATCAAGATTTCTCCTTCGGGAGCACTATGGCGCGGAGGATGATGACTGTTAATATGGTCAACACCCTCCCACCATTTGAAGAGCACACACCACTTCACTATGACTGGGTTGTTAAACATCTTATATTTCCAGGACCAAACACCACTGAGCGTTGTGTAGTCATAACCGGTGGTCTTGAAAACGGTAACTATGTTACTGTTGTTCATGATGGTGAAACCTGGATTGAAATAAACCCGGCATACAAATTTGAAGGATTGCTCAGAGTGCTCCGCATGACAGCCCGCAACAATTCCTTGCGCGAGCGTCTGCGTCTCAGCCAGGAGGAAAAATCGAAACTGATTCTTGACCATCAACTCTTGAGGCATGACTATGAACGCATCAAATCTCAGACTAACACCAGCACTAAGACTAAAATCCCTATGTTTGTTGTGTTTGTCGCTGCATTGGTCATCTTTCTGAATTTTGTACCAACCACGGAGGCAGCACAGGCTTACACAAGCAAGTTTACCCAGACTGGCACCGAGGGATTTAGTCTTTTGGATAAATGTGCCCAAAATGTAGCCAGGCTTAACAACGAAATTAGTCTAAGACTAAAACTGGCTCTGGGTAATGTGACTTGGTCTGATCGCTATGATGCAATTAAAGAGATCTTTTATGCCAACCTCTTGCCGAGATCGCACTGGATAGTGCGTCTCTTTTCTTTTCTTTCAAATTTCCATATTTGGACCATCTTTTCAACATGCATCGCTGTGGCAACATTGACTCGATCCACCAACCCTATTGTTGACATAGTGTTTCTCTTCTTTGCCCACATATCAAAATGGCAGTTGGGTATTGTACCAGCCCTTCCATACTTCACCACTACTATCGTCTGGATTGCTATAACTTGCATGGGGGCTTATGTGCTGGACCCATATCTTGCCATCACACTAACATGGCTCCAGCTCCCCTTTTGTGTGGTATGCCTTTCTTTCCTAAGTGACGATAAGTTCATAGAGCATGTGAGAGGTTCATTCATTCTTACTGTGACAGCAACATCTATTCATACTTGCCTTGTTCTAACTGGCAGTACCACCTACTGCTTTATACTCCTGATGTTCTTCAGAAGTCTTCGACTTCTGATGTCCTCTGTCGGTAACAAGATAGAGTTTAAGGACTTCCAGGGTAAGGTCGTTGGATCGATTTCTTCAGGAACACGTAACCGTGTCTGGAATTTCATCCAGCGAATGAAGCAGGTTAGAACTGGTTCCAATCCATTTGCTATCATAAAACCTGAAGCACTTGTCAAAATCGTAACCGATGAAGGATGTGGAACCGGTTTCTTTTGTGGTAATGATATTGTCACAGCAGGCCACGTGGTTGGTAGTCATCGCGTTGTTGAGGCCTGGTATGAGGGCTCGTGCTACCAAGCAAGAGTCCGATACAAGCCAGAAAAAGACATCGCCTTCCTGGCTCTACCAGGTGACATGAAACCTAAAGCGCGCTATAAGATAGCGCAACAACCTGACTACTCCACTGTGGTTGTGTTAGCATACAGCTCTAATGGACTTGTTGTCTCACAAGCGCAAGGCCAATGTCACGGGGATACCATCTCCTATACCGTCCCAACACAGGATGGTATGTCAGGGGCACCTGTCACTGACTTGCATGGTCGTGTGCTTGGTGTACACCAAACCAACACTGGCTTTACTGGTGGTGCCGTAGTTATTAAAACAACTGATGTAACACCTCCAACACGCCCAACTGAGGATGACTTGCGCAAACAAATTGAGGACCTACGTAAGCAACTTGAGGAAGTTAACAAACCTCAACCTCAAGAAACATTGGAGCAGTCAAACTCAGGTGCTGAAGTAGTCTCTCTCGTGAGAGAGGCCGTGAGGCGTGAAATGGACATACTACGGCAAGAGATAAACCAGCAGCTAATGTTGCAAAAGAAGAAAGGAAAAAACAAGAGTGGTGGTCGTGGTAACATCAGAAAACATGTTGGTAAGGTTAAGGGCAGGAAATACCTAACTGAAAAGGAATACAAAGAACTGTTGGAAAAGGGTCTTGACAGAGAAGAGCTCCTTGACTTGATTGATGACATCATAGACAAGAGGATAGGATTTCCTGAATGGAGTGACCCAGAGCTAAGTGATGATGATGATTCAAACTGGGACACATATGGTGATGAATTTGACCATCGTGATGTGGGTTTACAATCAAAACCCAAACAGAAAATCAAGGAAGCAACCCAATGTGTCATACAGGTTCAGGAAGTTGTCCCAATTGATGAGGTTACAATTTCAAAAGCAACTGAGTCTAAAGACTTTACTCAACATTGGGGTAAGGAACCTGTGTTTGAATCATACGACTTTGACTGGACTGCTGAGGATGCAAAGAACATACTACCTGAAAACTCTCGTTTAACCAAATGTGACTACATAGTCCTTGGTAGCCATATCCTCAAGCTTAGGCACATAATAACAACAGCACTTGAAACCAACAACTTCAGTGAGTTGCCTAAAGCAGTCTATGCACTTGATCATTTTGCTTGGGACCATGGTCTAGAGGGCTTCCTACAACGGATTAAATCCAAGAAGCCAAAAAACGTGAAAGGGGCTCCCAAGGGAGCCCCGAAAAATGGCAACTAGACTACTGGCAAAAACTCCTTGAGGAACCACGGTCAAGACGTTGTGTACCGGAAAGCTACCCATTATTAGGCCATTTGAAATTAGATAGACCAATTTATGATGATAAAATACCCAAAGATGATCTGCTCAAATCCCTACCAGTTCCTGATTGGCATGAATTTGAAAAATTTGGACCAACTGTGTGGGGACCACAAGCTTTTACCAAATCTTTTGAGAAATTTGATTATGCACCACCTTCAAATTTCTTTGAGCAGTATCCAGAATTTTGTAAATTTGCTGATTGGGCATTTTATAAACAATATGGGTTTCTTGAGGATTCTCGTGTGATACATGTTTCAGCCACTGAAAAGAACCAAGAGTCCACGCCTGCCTACCCCAAGATGCTCGACTATGACACCGAAGCCGACTTCTTGGAAGCGAATGGTTGGTCACCTTATGTTTCTGAGATTTCGAGGATTATGTCCGGAGCAAAACCTAAGGTTCTCTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAGTCATTAAAGTTGACAAAATTGCTGACTCAGACATAAGACAAATTCTATGTAGTGACCCCATCTATGTTAGGATAGGTGCGGTACTTGAAGGGCATCAAAATCAGCTCATGAAGAACAACACTGAAAAGACCCATGGTCAATGTGGATGGACACCAATGGAAGGTGGCTTCACCTCTCGCATGAAACGCCTTATCTCCAAAGGCAATGCACATTTCATCGAGTTTGATTGGACCAGATTTGATGGTACTATACCATCTGATTTAATTCGACATATCAAGAAACTCCGCTGGAGTTTGGTTAATGCCGAACAGAGGAGGAAATATCAAAAGCTTCATGATTGGTATGTTGAAAATCTGGTCAATCGTACTGTGCTACTTCCATCTGGTGAGGTCACAGAGCAACATCGTGGTAATCCATCTGGCCAATTCTCCACTACCATGGATAACAACATGATCAACACATGGCTTCAGGCTTTTGAATTTGCCTATTTCCATGGACCTAACAAACAGCTTTGGCTGAACTATGACACCTTGGTCTATGGTGATGACAGGCTGTCAACAACCCCACTGATTCCTGACAACTATGTTGAGAGAGTTGTACTAATGTACAAAGATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCTGAAAAAGTCAAAATTTCAAACACCATTGTTGGTCTCAGTTTTTGTGGCTTTACTGTAGATGAGAATCTTGAACCAATACCCACACAACCTGATAAATTGATGGCCTCACTTCTCAAACCAGCATCCAAACTTCCGGATCTTGAATCACTCCATGGGAAACTCCTGTGCTATCAGCTCCTCTCGGCTTTCCTACCTGAGGAACACCCTTTCAAGGTGTATGTCGAGAGTTGTCTGGCTGCCACTAGCAGGCAGCTTCGTGATTCTGGTCTACCTACCAGATTCACAGAAGAGCAAATGCATCGCATATGGAGGGGAGGACCAAAAAATTGCGATGGCTAGCAAGCCAGGCAAGGATGTTACCGTTGAGGTTAAATCCTCCGGAACAAAATCAACATCCTCCAGGAGCAAGTCCAGGGGGCGAAACCGGAATGTCAAAATCACAGTCAATTCACAACCCAAAACAAATCGGAGGAGACGAAACAGACCTAACAATCGTGGTCGCAAGAGAGTTGAGGCTGTCGTTAAACGACAGCTCGATAAGGCTGGAGTCACAGGACCAAGGCCAGCGATTACCCAAACTGCTACATCTACTCTGGGAACTATTGGCCCGAATACTTCGGGTGCAGTAGAGCTGGAACTTGCAACATTCATGAATCCATGCTTAGTTAAAGAATCAACAGCTTCCAACTCTTTTGGGCCCATACAAGCATCAGCTGCACAGTACAATCTATGGAGGGTCACAAAAGCTCAAGTTCGACTTACTCCAATGGTAGGCCCATCTGCAATCTCAGGTACTGCCTATAGAGTTTCTCTGAACACTGCGGGAACCCCTTCTTCTACAGGCTGGTCAGGCTTAGGGGCAAGAAAGCACAAAGATGTCAAAGTTGGCTCCATGTCCGTTTTCACCATCACTGCTAGAGACATGGCTGGACCACGTGAAGGCTGGTTTGTCACTAATACCAATGAATCAGGTGGTGAGTCTGTTGGACCAACAATTGAATTACATTCACTTGGTGAGACCCAATCAACCTACCAAAATCAGAGGTATACTGGGCCTGTCTTCCTTGTCGAGTTGCATTGCACATGGCAATTTTCAAACTACAGTGCAAATCCCGCTCTAGCCCAGCTAGAGAAAG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| 22,595 |
ON733251.1
|
Canine astrovirus
|
Boros,A., Albert,M., Urban,P., Herczeg,R., Gaspar,G., Balazs,B., Csagola,A., Pankovics,P., Gyenesei,A., Reuter,G.
|
Medical School, University of Pecs, Medical Microbiology and Immunology
|
Hungary
|
2022-10-04
| null |
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,569 |
GenBank
| 1 |
Hungary
|
Hungary
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2021-07-02
| null | null |
Canine astrovirus strain FR1/CaAstV-2021-HUN, complete genome
|
AAGAGTTGGTTTGGGTGATTAAATCGCCCATAAGATCTCTAGTATGTGTTCAGTGCCACCTTACTTCCGCAACCAAGCGGATCAAGATTTCTCCTTCGGGAGCACTATGGCGCGGAGGATGATGACCATTAATATGATCAACACCCTCCCACCATTTGAAGAGCACACACCACTTCATTATGACTGGGTTGTTAAACATCTTATATTTCCAGGACCAAACACCACTGAGCGTTGTGTAGTCATAACCGGTGGTCTTGAAAACGGTAACTATGTTACTGTTGTTCATGATGGTGATACCTGGATAGAAGTCAACCCGGCATACAAATTTGAAGGACTGCTCAGAGTGCTCCGCATGACAGCCCGCAACAACTCCTTGCGTGAACGTCTGCGTCTTAGTCAGGAGGAAAAATCGAAACTGATCCTTGACCATCAACTTTTAAGGCATGACTATGAACGCATCAAATCTCAAACCAGCACCAGTACCAAGACTAAAATTCCTATGTTTGTTGTGTTTGTCGCTGCACTAGTCATCTTCCTGAACTTCGTGCCAACAACGGAGGCAGCACAGGCTTACACAAGCAAGTTCACTCAAACTGGCACCGAGGGATTTAGTCTTTTGGATAAATGTGCCCAGAACGTGGCCAGGCTCAACAACGAAATTAGTCTAAGACTAAAATTGGCCCTAGGCAATGTCACCTGGTCTGACCGTTATGATGCAATTAAAGAGATCTTTTATGCCAACCTCTTGCCGAGATCGCACTGGATAGTGCGTCTCTTTTCTTTTCTTTCAAATTTCCATATTTGGACCATCTTCTCAACATGCATCGCTGTGGCAACATTGACTCGATCCACCAACCCTATTGTTGACATAGTGTTTCTATTCTTTGCCCACATATCAAAATGGCAATTGGGTATTGTGCCAGCCCTTCCATACTTCACCACTACTATTGTCTGGATTGCTATAACTTGCATGGGGGCCTATGTTTTGGACCCATATCTTGCCATCACACTCACATGGCTCCAGCTTCCCTTTTGTGTTGTATGCCTTTCTTTTCTAAGTGATGATAAGTTCATAGAGCACGTGAGAGGGTCATTCATTCTCACTATGACAGCAACATCTATTCATACTTGCCTTGTTCTAACTGGCAGCACCACCTACTGCTTTATACTCCTGATGTTTTTTAGAAGCCTTCGGCTTCTGATGTCTTCTGTCGGTAACAAGATAGAGTTTAAGGACTTCCAGGGTAAGGTCGTTGGATCGATTTCTTCAGGAACACGTAACCGTGTCTGGAATTTCATCCAGCGAATGAAGCAGGTTAGAACTGGTTCCAATCCATTTGCTATCATAAAACCTGAAGCACTTGTCAAAATCGTAACCGATGAAGGATGTGGAACTGGTTTCTTTTGTGGTAATGATATAGTCACAGCAGGCCACGTAGTCGGTAGTCATCGCGTTGTTGAAGCCTGGTATGAGGGCTCGTGCTACCAAGCAAGAGTTCGCTACAAGCCAGAAAAAGACATCGCCTTCCTGGCTTTACCAGGTGACATGAAACCTAAAGCGCGCTATAAGATAGCGCAACAACCTGACTACTCTACTGTGGTTGTGCTAGCATACAGCTCTAATGGACTTGTTGTTTCACAAGCGCAAGGCCAATGTCATGGGGATACCATCTCCTATACCGTCCCAACGCAGGATGGTATGTCAGGGGCACCTGTCACTGACTTACATGGCCGTGTGCTTGGTGTACACCAAACCAACACTGGCTTCACTGGTGGTGCCGTAGTTATTAAAACATCAGATGTAACACCTCCAACCCGACCAACTGAGGATGACTTACGTAAACAAATTGAAGATCTACGTAAGCAACTTGAGGAAGTTAACAAATCCCAACCTCAAGAGACATTGGAACAGTCAAACTCAGGTGCTGAGGTGGTTTCTCTCGTGAGAGAAGCCGTGAGGCGTGAAATGGACATACTACGGCAAGAGATTAACCAGCAGCTAATGTTGCAAAAGAAGAAAGGTAAAAACAAGAGTGGTGGTCGTGGTAACATCAGAAAACATGTTGGTAAGGTAAAGGGCAGGAAATACCTAACTGAGAAAGAATACAAAGAACTGTTGGAGAAAGGTCTTGACAGAGAAGAGCTCCTTGACTTAATTGATGACATCATAGACAAGAGGATAGGTTTTCCTGAATGGAGTGACCCAGAGCTAAGTGATGATGATGATTCAAACTGGGACACATATGGTGATGAATTCGACCATCGTGATGTAGGTTTACAATCAAAACCCAAACAGAAAATCAAGGAAGCAACCCAATGTGTCATACAGGTTCAGGAAGTTGTCCCAATCGATGAGGTTACAATTTCAAAAGCAACTGAGTCTAAAGACTTTACTCAGCATTGGGGTAAGGAACCTGTGTTTGAATCATATGATTTTGACTGGACTGCTGAGGATGCAAAAAACATACTACCTGAAAATTCTCGTTTAACTAAATGTGACTACATAGTCCTTGGTAGCCACATCCTCAAACTTAGGCACATAATAACAACAGCACTTGAAACTAACAACTTCAGTGAGTTGCCTAAAGCAGTCTATGCACTTGATCATTTTGCCTGGGACCATGGTCTAGAGGGCTTCTTACAACGGATTAAATCCAAGAAGCCAAAAAACGTGAAAGGGGCTCCCAAGGGAGCCCCGAAAAATGGCAACTAGACTACTGGCAAAAACTCCTTGAGGAACCACGGTCAAGACGATGTGTACCGGAAAATTACCCATTATTAGGCCATCTGAAATTAGATAGACCAATTTATGATGATAAAATACCTAAAGATGATCTGCTCAAATCCCTACCAGTTCCTGATTGGTATGAATTTGAAAAATTTGGACCAACTGTGTGGGGACCACAAGCTTTTACTAAATCTTTTGAGAAATTTGATTATGCACCACCTTCACATTTCTTTGAGCAGTATCCAGAATTTTGTAAATTTGCTGATTGGGCATTCTATAAACAATATGGGTTTCTTGAGGATTCTCGTGTGATACATGTTTCAGCCACTGAAAAAAATCAAGATTCCACGCCTGCCTACCCCAAGATGCTCGACTATGACACCGAAGCCGACTTCTTGGAAGCAAATGGCTGGTCACCTTATGTTTCTGAGATCTCGAGGATTATGTCCGGAGCAAAACCTAAGGTCCTCTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAGTCATTAAAGTTGACAAAATTGCTGACTCAGACATAAGACAAATTCTATGCAGTGACCCCATTTATGTTAGGATAGGTGCGGTACTTGAGGGACATCAGAATCAGCTTATGAAGAACAACACTGAAAAAACCCATGGACAATGTGGTTGGACACCAATGGAAGGTGGCTTCACTTCTCGTATGAAACGCCTTATCTCCAAAGGCAATGCACATTTCATCGAGTTTGATTGGACCAGATTTGATGGTACTATACCGTCTGATTTAATTCGACATATCAAGAAACTCCGCTGGAGTTTGGTTAATGCCGAACAGAGGAGGAAATACCAAAAGCTTCATGATTGGTATGTTGAAAACCTGGTCAATCGTACTGTGCTACTTCCATCTGGTGAGGTCACAGAGCAACATCGTGGTAATCCATCTGGCCAATTCTCCACTACCATGGATAACAATATGATCAACACATGGCTTCAGGCTTTTGAATTTGCCTACTTCCATGGACCCAACAAACAGCTTTGGCTGAACTATGACACCTTGGTCTATGGTGATGATAGGCTGTCAACAACACCACTAATTCCTGACAACTATGTTGAGAGAGTTGTACTAATGTACAAAGATGTCTTTGGAATGTGGGTTAAGCCTGAAAAAATCAAGATTTCAAACACCATTGTTGGTCTCAGTTTTTGTGGCTTTACAGTAGATGAGAATCTTGAACCCATACCTACACAACCTGATAAACTGATGGCCTCACTGCTTAAACCAGCATCCAAACTTCCGGATCTTGAATCACTCCATGGGAAACTCCTGTGCTATCAGCTCCTCTCGGCCTTCCTACCTGAGGAACACCCTTTTAAGGTGTACGTCGAGAGTTGTCTGGCTGCCACTAGCAGGCAGCTTCGTGATTCTGGCTTACCTACCAGATTCACAGAAGAGCAAATGCATCGCATATGGAGGGGAGGACCAAAAAATTGCGATGGCTAGCAAGCCAGGCAAAGATGTTACCGTTGAGGTTAAATCCTCCGGGACAAAGTCAACATCCTCCAGGAGTAAATCCCGGGGACGGAGCCGGAATGTCAAGATCACTGTCAACTCACAACCAAGGGCAAATCGAAGGAGACGAAACAGACCTAACAATCGTGGTCGCAAGAGAGTTGAGGCTGTCGTTAAACGACAGCTCGATAAGGCTGGAGTCACAGGACCAAGACCAGCAATCACCCAGACTGCTACATCTACTCTGGGGACTATTGGCCCGAATACTTCGGGTGCGGTAGAGCTGGAACTTGCAACATTCATGAACCCATGCTTGGTCAAAGAATCAACAGCCTCCAACTCTTTTGGACCCATCCAAGCCTCTGCAGCCCAATATAATCTATGGCGGGTAACTAAAGCAGATGTACGGCTTACACCTATGGTAGGCCCGTCTGCAATTTCTGGCACCGCTTATCGAGTATCCCTCAATACAGCGGGGACCCCTTCATCAACAGGATGGTCTGGCCTAGGCGCCAGAAAACACAAAGATGTTAGGGTTGGTGCTATGTCAACTTTCAGAGTTACCGCGCGAGATATGGCGGGCCCACGCGAGGGCTGGTTTGTCACCAACACAAATGAATCAGGTGGTGAATCAGTGGGACCAACAATAGAGCTACACTCACTTGGACAGACACAATCCACCTACCAGAATGCTCCCTATTCAGGCCCTGTGTTCCTTGTTGAACTTCACTGCACATGGCAGTTTGCCAACTACAGTGCCAATCCAGCACTCGCCTCTCTTGAGAAAGGAG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| 23,830 |
MT894143.1
|
Canine astrovirus
|
Reddy,M., Putty,K., Ganji,V., Lakshmi,B.
|
Pvnrtvu, Veterinary Biotechnology
|
India
|
2021-11-08
|
PVNRTVU2020
|
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,554 |
GenBank
| null |
India
|
India
|
Canis lupus familiaris
| null | null | null | null |
Canine astrovirus isolate PVNRTVU2020, complete genome
|
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|
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|
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|
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|
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|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
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|
China
|
Canis lupus familiaris
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
China
|
Canis lupus familiaris
|
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|
2019-01-27
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|
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|
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|
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|
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|
China
|
Canis lupus familiaris
|
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|
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|
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Nanjing Agricultural University, College of Veterinary Medicine
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2020-10-25
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Mamastrovirus
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|
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|
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|
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|
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| 46,298 |
MN882005.1
|
Canine astrovirus
|
Zhang,W.
|
Nanjing Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-10-25
| null |
Canine astrovirus
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,474 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2019-04-23
| null | null |
Canine astrovirus strain B234/China/AH/2019, complete genome
|
ATGTGTTCAGTGCCACCTTACTTCCGCAACCAAGCGGATCAAGATTTCTCCTTCGGGAGCACTATGGCGCGGAGGATGATGACCATTAATATGATCAACACCCTCCCACCATTTGAAGAGCACACACCACTTCACTATGACTGGGTTGTTAAACATCTTATATTTCCAGGACCAAACACCACTGAGCGTTGTGTAGTCATAACCGGTGGTCTTGAAAACGGTAACTATGTTACTGTTGTTCATGATGGTGATACCTGGATAGAAATAAACCCGGCATACAAGTTTGAAGGTCTGCTCAGAGTGCTCCGCATGACAGCTCGCAACAACTCTTTGCGTGAGCGTCTGCGTCTTAGTCAGGAGGAAAAATCGAAACTGATCCTTGACCATCAACTCTTGAGGCATGACTATGAACGCATCAAATCTCAAACTAGCACCAGCACTAAGACTAAAATCCCTATGTTTGTTGTGTTTGTCGCTGCATTGATTATCTTCCTGAACTTTGTACCAACCACGGAGGCAGCACAGGCTTACACAAGCAAATATACTCAAACTGGCACTGAGGGATTTAGCCTTTTGGACAAATGTGCACAAAATGTGGCCAGGCTTAACAACGAAATAAGTCTAAGACTGAAACTGGCCCTAGGCAATGTGACTTGGTCTGACCGCTATGGTGCAATCAAAGAGATCTTCTATGCCAACCTCTTGCCGAGATCGCACTGGATTGTGCGTCTCTTTTCTTTCCTTTCATACTTCCATATTTGGACCATCTTTTCAACATGCATCGCTGTGGCAACATTGACTCGGTCTACAAACCCTATTGTTGACATAGTATTTCTGTTCTTTGCCCACATATCAAAATGGCAGTTGGGTATTGTTCCAGCTCTTCCATATTTCACCACCACTATTGTATGGATTGCCATAACCTGTATGGGAGCTTATGTACTGGATCCATACCTTGCCATCACATTAACATGGCTCCAGCTCCCTTTTTGTGTTGTGTGCCTTTCTTTCCTAAGCGATGACAAGTTCATTGAGCATGTGAGAGGATCATTCATTCTAACTGTAACAGCAACATCCATCCACACCTGCCTTGTTCTAACTGGTAGTACCACCTACTGCTTCATACTCCTTATGTTCTTTAGGAGTCTCCGACTTCTAATGTCCTCTGTTGGTAACAAGATAGAGTTTAAGGATTTCCAGGGTAAGGTCGTTGGATCGATTTCTTCAGGAACACGTAACCGTGTCTGGAATTTCATCCAGCGAATGAAGCAGGTCAGAACTGGTTCTAATCCATTTGCTATCATAAAACCTGAAGCACTTGTCAAAATCGTAACCGATGAAGGATGTGGAACCGGTTTCTTTTGTGGTAATGACATAGTTACAGCAGGCCATGTGGTCGGTAGTCATCGTGTTGTTGAAGCCTGGTATGAGGGCTCATGCTACCAAGCAAGAGTTCGCTACAAGCCAGACAAAGACATCGCCTTTCTGGCTCTACCGGGTGACATGAAACCTAAAGCGCGCTATAAGATAGCGCAACAACCTGACTACTCCACTGTGGTTGTGTTAGCATACAGCTCTAATGGACTTGTTGTCTCACAAGCGCAAGGCCAATGTCACGGGGAAACCATCTCCTACACTGTCCCAACTCAGGACGGTATGTCAGGGGCACCCGTCACTGACCTACATGGCCGTGTGCTTGGTGTGCATCAAACCAACACTGGCTTAACTGGTGGTGCCGTAGTGATTAAAACATCAGATGTAACACCTCCAACACGCCCAACTGAGGATGACTTGCGTAAACAAATTGAAGACCTACGTAAGCAACTTGAGGAAGTTAACAAACCCCAACCTCAAGAGACATTGGAACAGTCAAACTCAGGTGCTGAGGTGGTTTCTCTCGTGAGAGAAGCCGTGAGGCGTGAGATGGATATACTACGGCAAGAAATAAACCAGCAGCTAATGTTGCAAAAGAAGAAAGGTAAAAACAAGGGTGGTGGTCGTGGCAACGTCAGGAAACATGTTGGTAAGGTTAAGGGCAGGAAATACCTAACTGAGAAAGAATACAAAGAACTTTTGGAGAAAGGTCTTGACAGAGAAGAGCTCCTCGACCTAATTGATGACATCATAGACAAGAGGATAGGATTTCCTGAATGGAGTGACCCAGAGCTAAGTGATGAGGATGATTCAAACTGGGACACATATGGTGATGAATTTGACCATCGTGATGTGGGATTACAATCAAAACCCAAACAGAAAATTAAGGAAGCAACCCAATGTGTCATACAGGTTCAGGAGGTTGTCCCAATTGATGAGGTTACAATTTCAAAAGCAACTGAGTCTAAAGACTTTACTCAACATTGGGGTAAGGAACCTGTGTTTGAATCATACGACTTTGACTGGACTGCTGAGGATGCAAAGAACATACTACCTGAAAACTCACGTTTAACTAAATGTGACTACATAGTTCTTGGTAGCCACATCCTCAAGCTTAGGCACATAATAACGACAGCACTTGAAACCAACAACTTCAGTGAGTTGCCTAAGGCAGTCTATGCACTTGATCACTTTGCTTGGGACCATGGTCTAGAAGGCTTCCTACAACGGATTAAATCCAAGAAGCCAAAAAACGTGAAAGGGGCTCCCAAGGGAGCCCCGAAAAATGGCAACTAGACTACTGGCAAAAACTCCTTGAGGAACCACGGTCAAGACGTTGTGTACCGGAAAGCTACCCATTATTAGGCCATTTAAAATTAGACAGACCAATTTATGATGACAAAATACCCAAAGATGATCTGCTCAAATCCCTACCAGTCCCTGATTGGCACGATTTTGAAAAATTTGGACCAACTGTGTGGGGACCACAAGCTTTCACCAAGTCTTTTGAAAAATTTGACTATGCACCACCTTCAAATTTCTTTGAGCAGTATCCAGAATTTTGCAAATTTGCTGATTGGGCATTTTATAAACAATATGGGTTCCTTGAAGATTCTCGTGTGATACATGTTTCAGCCACTGAAAAGAATCAAGACTCCACACCTGCCTATCCCAAGATGCTCGACTATGACACCGAAGCCGACTTCTTGGAAGCGAATGGTTGGTCACCTTATGTTTCTGAGATCTCGAGGATTATGTCCGGAGCAAAACCTAAGGTTCTCTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAGTCATTAAAGTTGACAAAATTGCTGACTCAGACATAAGGCAAATTCTATGCAGTGACCCCATTTATGTTAGGATAGGTGCGGTACTTGAAGGGCATCAAAACCAGCTCATGAAAAATAACACTGAAAAAACCCATGGACAATGTGGTTGGACACCAATGGAAGGTGGCTTCACATCTCGCATGAAACGCCTTATCTCCAAAGGTAACGCACACTTCATCGAGTTTGATTGGACCAGATTTGATGGTACCATACCATCTGATTTGATTCGACATATCAAGAAACTCCGCTGGAGTTTGGTTAATGCCGAACAGAGGAGGAAATACCAAAAACTTCATGATTGGTATGTTGAAAATCTGGTCAATCGTACTGTGCTACTTCCATCTGGTGAGGTTACAGAACAACATCGTGGTAATCCATCTGGCCAATTCTCCACTACCATGGATAATAACATGATCAACACATGGCTCCAGGCTTTTGAATTTGCCTATTTCCATGGACCTAACAAAAAGCTTTGGCTGAACTATGACACCTTGGTCTATGGTGATGACAGGCTGTCAACAACCCCACTCATTCCTGACAAYTATGTTGAGAGAGTTGTACTAATGTACAAAGATGTTTTCGGAATGTGGGTTAAGCCTGAGAAAGTCAAGATTTCAAACACCATTGTTGGTCTCAGTTTCTGTGGCTTTACTGTAGATGAGAATCTTGAACCAATACCCACACAACCTGACAAATTGATGGCCTCACTTCTCAAACCAGCATCCAAACTTCCGGATCTTGAATCACTCCATGGGAAACTCCTGTGCTATCAGCTCCTCTCGGCTTTCCTACCCGAGGAACACCCTTTCAAGGTGTATGTCGAGAGTTGTCTGGCTGCCACTAGCAGGCAGCTTCGTGATTCTGGTTTACCTACCAGATTCACAGAAGAGCAAATGCATCGCATATGGAGGGGAGGACCAAAAAATTGCGATGGCTAGCAAGCCAGGCAAAGATGTCACCGTTGAGGTTAAAACCTCCGGAACAAAATCAACATCCTCTAGGAGCAAATCCCGGGGGCGAAACCGGAATGTCAAGATCACAGTCAATTCACAACCCAAAACAAATCGGAGGAGACGAAACAGACCTAACAATCGTGGTCGCAAGAGAGTTGAGGCTGTCGTTAAACGACAGCTCGATAAAGCTGGAGTCACAGGACCAAGGCCAGCGATCACCCAGACTGCTACATCTACTTTGGGAACTATTGGCCCGAATACTTCGGGTGCAGTAGAGCTGGAACTTGCGACATTCATGAATCCATGCTTAGTTAAAGAATCAACAGCTTCCAACTCTTTTGGACCCATTCAAGCATCAGCTGCACAGTACAATCTATGGAGGGTCACCAAAGCACAAGTTCGCCTGACCCCAATGGTCGGCCCATCTGCAATCTCAGGTACAGCCTACAGGGTTTCCCTGAACACCGCGGGAACACCTTCTTCCACAGGCTGGTCAGGCTTGGGGGCCAGAAAGCACAAAGATGTTAAGGTCGGCTCCATGTCTGTCTTTACCATCACTGCTAGAGACATGGCTGGACCACGTGAAGGCTGGTTTGTTACAAACACTAATGAGTCAGGTGGTGAGTCTGTTGGACCAACAATTGAATTACATTCACTTGGTGAAACCCAGTCAACCTACCAAAATCAGAGGTATACTGGACCTGTCTTCCTTGTCGAGCTGCATTGCACATGGCAATTTTCAAACTACAGTGCAAACCCAGCTCTAGCCCAGCTAGAGAAAGGAGAGGACAAGGATGCACAAATCAAGTTTGAGGGTACAGCAGGGCAACCACTCACCATGACAGTGGCACCTCACTCAGCTTTTGCCAGAGCAATTGAAACGCGCTCTGCGGTCCCTTACTCAGGGGCTGGTAGAGCTGCGGGAGAATCAACTTCAGACACAATCTGGCAAATTGCGTCTACAGCTGTTGACGCAGCATCTGTGGTTGTGCCACCACCCTTCAACTGGCTCATCAAAGGTGGTTGGTGGTTTGTTAAGAAACTTGCAGGAAGATCCCGCACAGGCGAGATCCAACTGCAAGTGTTTGCCAGCTACGAAGATGCTCAAAATAACCGCCCAGCAATTTGCACAGGGCCAGTGGCTGGTGAAAACCCATCACGCCTTCACAATGTGAAATTTGTGCAGATGAATTCTCCCTCAACTGGAATGCCACCTGAGTCAGCTATTGGAGCCTTTTCTCTGCCAATGATACCAAATCCACCTGCCACAATTGAAGACCGCTTCATGCTTGTTACTGGTGTCACACAGCCCTTCCAGGTTAACCCACCTTGTCCAACTTATACCTACAAAGATAACACCAGGATAGTGGTAAAAGTTGGCAACCACTATGATGAAGTAAACTTCATCTACAAGGCTACTCATCCACATGTTTGGCTTGCTGGTTCTCAAACCAGCTGGACGACATCGAGCAAGCCAGACTTTATGGATTTCATGGAAGTTGGCATCCGTGACACTGGTGGTAACTACAACAAGCGTGGGGGATTGTGGGGTTACTCCCAACACAAACTTGTGAGTTCAGGTATCACTAATGTTGTGACCTTCTATGTGGGTCAACTTTCCAACCAAATACGCATAACCAGCGTAAAACAACAGAGATACCAAATCACTGGTACTGGGAGTTCCACTACACTTGCACCCACAGGTCAAGAGACAACATTAAATGTTCAAGAGATTAATCCAGGTCCCTGGATTATTCTTGTGGCCATACATCAAGTTAGTGGATCCCCAACAGGTTTTGTCATGGCAGAAAACTCAACCAGACCTTCCATCATTTGCCCAGCAGCTGTACAGAACATGCTTGTTTTCAACAGTAACACAGTTGCCACCAACATGACTGTGGAGTACCTCCGCACACAGCCCGTGTTCACCCAGGAAGAACAACAACAGGTGCTTACTCTTCCCACCATCGAGGAGGAGCAACTGCCACAGCCAACTGAAGATGGTTTCTTTCCAGATTCTGAAGATGAAGATTTTTCTGATGATGATTCTCTTCTTGATGATGATGATTTTTTCCCTGCTTCTGATCAGCAGGTTTTTTCCAGTCGCCAGGTCCTCTTCAGAGCAATGGTCAACGAGGGTTGGCCAGAGGACCAGGCTGAGCGCCTTGCCAAACGCGCTCTCCCTACACTAAGTGAGAAAGAACTTAGGGATGAATTTTTAGTCGGACTCGCTGACGGGTTCTCGCCACGTCAAGCAGCCGCAAATGCTCGTGAAAAGTGTTCCCGAGGCCACGCCGAGTAG
| 46,299 |
KY038922.1
|
Canine bocavirus
|
Zhai,S.L., Lin,T., Chen,Y.W., Liu,R., Lv,D.H., Wen,X.H., Zhu,X.L., Wang,D., Li,F., Wei,W.K., Zhai,S.-L.
|
Animal Disease Diagnostic Center, Institute of Animal Health, Guangdong Academy of Agricultural Sciences
|
China
|
2017-04-26
|
GZHD15
|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,059 |
GenBank
| 1 |
China: Guangzhou
|
China
|
Canis lupus familiaris
| null |
2015
| null | null |
Canine bocavirus isolate GZHD15, complete genome
|
GATTGGTTGGTGTTTTATGACTATATATATAAGTGTGCTTCCTGCTTCGTGTCATTCTGCTTCCGGCTTTCGTCGCGGTGACATCTCGCTGCTCTGTCTGGGGGTGAGTGATGGCTCTTGCTCTGGCCGGGGTCGACGATATCATTCACTTTGCTCGTCCTGCCTATACCTATGTTCTCAAATTTCCTTACGCTGATTGGCGGCGGGATGAGGCTCGTCTTCAGAGCGCTCTGGGGTACCCGCATCATGATTTACTCAAGGACTCGACTCCGTTCCTTACTATGCCGGGGCAAGATTCTCCGGCCGAGCAGGCTTCATTTTTGGAGTCTAAGGGTCCTCAGTACGGATATGCCTTATTACTGGCACGCACGGCTCACGCTGCTGCATATTCTATATTCTCGCAGAAGCAGGGTAAATATCCTCCTGCTGCTAGCATATATGTTCAGTGCGAGCTGGGCATTAAGTACCTTCACGTACACGTCGTGATGGGCGGTGACGGCTTGAACCGGTACAACGCCAAGGCCACTTGCTCTAACCTGGCCTACAAGTGGCTGGACAATATTCAGTCTCAGCTCGAGGTTAACGTCAAGACCGGTCACAACACCGACCTTGACATGTGCAATTCTCTCATCGGCTGCGTCTACCAGGCCAAGAGAGAGTGCTTTGACATGAGGACCGAGATTTGTACCATCCTGCAATACAAGTGCCGGAACGGCGAGATGTACGCCTGCCGGGTCGATCCTATAGAGTTTATCTGTAACTACCTGTTGTGCAAAAACTTGAAATTCTTTACTATGGTCGACCCTGACAGAGCAACTCCGTTTGTCTCTCACTTTGCCTGTTCTGGTAAAACGTACGCGGCTACGTTTGTCAATGGGAAGTGGGTCTTGCCTCAGGTTAGGAAGCAGTGGCTAAATTATCTTCGAGACTCTGTCTGTCAGAAGGCCGATCCCGTCTTTTCCGGCGACATGTTTGAAAATCTACCTAAGGTACCTCGCGCGACCTGGTCTGCAGACGTTTCCTCTAATAAGTCTAAAATCACTAAAAAGGAAACTCTGATGATTGACTGTATCGATCGCTGCGAAAAAAATCACTTGCTTACCTATGAAGATTTGGTCAATGAATGTTCTGATCTTGTAATCATGCTCGGGTCTCAGCCGGGCGGAACTAAACTGATTGAGACCTTGCTTCAGATGGTTCACATTAAGATTTGTCAGAAATATACGGCCTTGTCTTATGTCTTGTCGCGGTACTCGTCGATCGAGCTGCTGCCTGAGAATAAGGCTATACAGCTCTTGGTCTTTCAGGGATACAATCCCTGGCAGGTCGGCCACTGGCTGTGCTGCGTGCTGCACAAGACGGCCGGTAAACAGAATACAGTGCGCTTTTTCGGGCCGGCCAGCACCGGCAAGACCAATTTTGCCAAGGCTATAGTGAATGCCGTTAAGCTGTACGGATGTGTGAACCATCAGAATAAGAATTTTGTGTTTAACGACTGCGCGTCCAAGCTGGTCAATTGGTGGGAAGAGTGCCTCATGCACAACGATTGGGTGGAGCAGGCCAAGTGTCTGCTGGGAGGAACGGAGTTTAGGATCGACCGTAAGCATAAAGACTCTCAGCTGCTGCCGCAGACTCCTGTTGTGATCAGTACCAATCACGACGTGTACACCGTGGTCGGTGGGAACACCACTACTATGGTTCACGCTAAGCCGCTTCGGGAGAGGATCGTTCAGTTTAATTTCATGAAACAGCTCTCTTCCACATTTGGGGAGATTGATCCTATGGATGTGGTGGCTCTGTTGCAAGCCTGCTCTTCTCGATTCGATGCGTCGCTCGACTCGTTTTACGCTCAGTGGCAGCTTCAGTGCACTCCTAACGATTTTCCTCTCGCTTCGTTCTGTGACGGCCATTCGCAGGATTTCGTCCATCACGAGGTGGGCTTCTGCGACACGTGCGGTGGCTACGCTCCTCTGGAGACTACGGACCGCAGTCAGCCGCTGCCGGCTCGACCTGCTTCGTCCGGTGAGTCTTTATTCTTTGCCTGTATACTGCCTTACATGTTCCATTTTCTATATGCTGTAGTTGACTCTGTGCTCTTGTTAGTGTCGGGTGTGAAGCGTCGCCTGGACTTTGACCCTGATCCTGTTCCTTCCACGTCGACGGCTCCTCCGGCGAAGCGCCACTCCAAGGTGAGGCGTCCCGTGTTCCACGACGACTGGTGTAGTCAGCCGGTAGATCGCCTAGACCGCATCCGCTATGAAAAGTTCGTCGAGAGCGTCGTCGGCGCGTCAGACGAGTCACCATCGGAGCCGGAGTCGGAGTCCACGGGACTCACGCCTTCAGAGTGGGGAGAGATGCTCGGAGTCGTCTGCAAGTCGCTGGAGGAAGAGCCGATCGTCTTACACTGCTTCGAAGACATCGCCTCTCTCTCGGAGACCGAAGACGACTCCGATGGAGGTCTTCAATCAACACCGCGCCAAAACAAAGACTGACATTTCAATGTGTGGCTTTTACTGGCACAGTACTCGCCTCGCGCGGTCGGGTACAGACTGGATCTTTAACAGTGGAAAACCTCTGTTTCAATCTAAATGTTCTAATAATCTTGTGTCTTGGGATGTGGTTCGTGAGATTCTGTTTGAATTTAAAAAAACTATAGATCAGAAATATAGAAATATGCTGTGGCACTTTGGCCGGGGTGGGTACTGTAATAAATGTGAGTACTGGGATAATGTGTACCTTGAACACTTGGCTAATGTAGACTCCTCTAATGATGTTGTTATGCAGGAGATAAGTGACGCTGAGATGCTGGAGGCTGCCATGGAGATTGATGGCGCCAGCGAATAGAAAGCTCGGTGGTTGGGTCGTGCCTGGCTATAAATATTTGGGTCCCTTTAACCCTGCTGACAACGGGGAACCTGTAAATTCTGCTGACGAGGCCGCTCGGTCTCGTGATCTCGCCTATCAGTCCTATCTCGATGCTGGTGTAGACCCGTACTTTAGCTACAATAAAGCTGATTCTGATTTTATTGAGACCTTGGCTCACGACTCTTCATTCGGCGGCTGGCTGGGGCGCTCGGCCTTTGGCCTCAAGAAATTGCTTGCGCCGCATCTCGCGGATACAAAGGGCAATCCTGACGCTCCGTCCACCTCGAGGGCGGGTTCCTCTATATCCAAGTCAGACAGAGCACAAAAGAGAAAACTCTATTTTGCCAGATCAAACAAACAGGCCAAACAACAAAAGATGTCAGCTCCAGAAGCTCCGACCGAAGATGTGGCAGAACCGGGTCCATCTGGCTCCGATCCACGGGCAGGAGGAAATGGAAGTGGTGGAGGCATGGGAGGAGGTGGAGGACATGGAGTGGGAGTGAGCACCGGCGGGTGGAAGGCGGGGACCGTGTTTGGAAATGATTTTGTCATTACCACCAACACCAGACAGTGGTACGCTCCCATCTTTAACGGCCATGAATACAAACGCATGGCACCGGGCGAGAATAGCGAACAAGCCACCAACAGACACTGGGTGGGCATCAGTACTCCGTGGGGATACTTTAACTTTAATGAGTACAGTTCGCATTTTTCGCCACAAGACTGGCAGCGTCTCACCAATGAATATAAACGGTGGAGACCCAAGGCGATGAGAATCAAAGTGTACAACCTACAGATAAAACAGGTAGTCACTCTGGGGGCTGACACTTTATATAATAATGATCTAACTGCCGGCGTTCACATCTTTTGTGACGGGAGCCATCAGTTTCCGTACTCTCAGCATCCGTGGGACACCGGGACCATGCCCGAACTGCCTCATCGCATCTGGAGGATCTCGCAGTACGGGTACTTTCAACTACAGTCTGACCTGACGGACGGGGGCGCATCATCGGAGAGGCCAGACGTCGAGAACCAAGAAAAACAGCTGCTAAAAAGTGCACCGCTGTACATGCTAGAGACGGCGTCGCACCAAGTGTTGAGAACTGGGGAGGAATCTAGCTTCTCTTTCTCGTTTGACAGCGGGTGGGTTATCAACGATAAAGCGTACGCCATTCCACAAGCAGACTTTAACCCTCTAATTCACACCAGACGATACTTTCCTACACGAAACAATAACACCACAGCGTCAGGGGGCCTCATGTTTTATCACAGGTATAATCCATACAACAAACTAAGCAACTGGATGCCAGGGCCGAGCTTAGGTTATCTGGGATCAACACAAACATCAACCAATCCACAATATGCGCGTGGTCCGATTACCGTCGTCACGCAGCCGCCGGGAACAACCGCACAGGGGGTCATTAGGGACGAGCAATCGACTACAAACGTCCCATCAGAGGCGACCATGCAAAATTCAGGGTACGACGTGAACCCTGTCAACTGCGGTAGCAGCAGATTAGACGCGCACTCGCTTGCGTACGATTCAGGCCCAGAAAGTCGAGGACAAAACATCATCACCGTGAGGGGGATAGACTTAGATATGGCCAGATGGTCATCTGTCATGGTGCAGGACGGAACAAAAACAGAAATTGGTACATCAACTGAAAGAAATAATTTTACAGAACTTAAAAACGTGTGGATGTACCCAAATCAGGCGTGGGACACCACTCCGATATCCAGGGACACTCCCATTTGGGTCAAAATTCCAAGAACAGACAGGCACACCATGCATGATACCTCGGATGGGACGCTGCCGATGGCGCATCCACCGGGAACCATCTTTGTCAGGGTCGCAAAGGTGCCAATCCCGGGGGAGTCAGACTCTTACCTAAACCTATACGTTACGGGACAAATCACCTGTGAACTCTTATGGGAAACTGAACGCTTCCAAACCAAAAATTGGAGACCGGAAATCAAAAATGATCCTTCCATGTTTAGCGACCCTCTATTATACACCTTTGACAGGCAAGGGGTCTATAATACTCCAGAAACTTTCATTGAGGGCATGCCCACTAAACGGGGAATAAACAGGGTACTGTAACTTTAAGAAACAATAAAGCCATAAAACGAAAAGTTTTGCGCAAAACTTTTCGTTTTATGGCGATTACATTTGTCCGTCAGGTCAGACTGTAGT
| 76,909 |
KP281713.1
|
Canine bocavirus
|
Choi,J.W., Lee,K.H., Lee,J.I., Lee,M.H., Lee,K.K., Oem,J.K., Choi,J.-W., Lee,K.-H., Lee,M.-H., Lee,K.-K., Oem,J.-K.
|
Animal Disease Diagnostic Division, Animal and Plant Quarantine Agency
| null |
2015-05-13
|
13D003
|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,348 |
GenBank
| 1 |
South Korea: Republic of Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
| null |
2014-10-07
| null | null |
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|
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|
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|
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|
Animal Disease Diagnostic Division, Animal and Plant Quarantine Agency
| null |
2015-05-13
|
13D095
|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,157 |
GenBank
| 1 |
South Korea: Republic of Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
| null |
2014-10-07
| null | null |
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|
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|
Canine bocavirus
|
Choi,J.W., Lee,K.H., Lee,J.I., Lee,M.H., Lee,K.K., Oem,J.K., Choi,J.-W., Lee,K.-H., Lee,M.-H., Lee,K.-K., Oem,J.-K.
|
Animal Disease Diagnostic Division, Animal and Plant Quarantine Agency
| null |
2015-05-13
|
13D226-1
|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,174 |
GenBank
| 1 |
South Korea: Republic of Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
| null |
2014-10-07
| null | null |
Canine bocavirus isolate 13D226-1, complete genome
|
TACACCGAGCGGCTTCGCCGCTGCGCCCTGCGGGCGCGCTGTTTATGTTCCTCGGCGAACGTGACGTCATGTAGTAGGAGTGCCTATAAAGATTATATCAATTGTGCTGTCTTGTGGCCTGTTAATGTATAACGTGCTGTGTCAGCTGTTTGTGATTGGTTGGTATTTTATGACTTTGTTATGTTCATGGTTACTGATTGATGAATTTTGGGCGGGCTTACTGACTATATATATAAGTGTGCTTCCTGCTTCGTGTCATTCTGCTTCCGGCTTTCGTCGCGGTGACATCTCGCTGCTCTATCTGGGGGTGAGTGATGGCTCTTGCTCTGGCCGGGGTCGACGATATCATTCACTTTGCTCGTCCTGCCTATACCTATGTTCTCAAATTTCCTTACGCTGAGTGGCGGCGGGATGAGGCTCGTCTTCAGAGCGCTCTGGGGTACCCGCATCATGATTTACTCAAGGACTCGACTCCGTTCCTTACTATGCCGGGGCAGGATTCTCCGGCCGAGCAGGCTTCCTTTTTGGAGTCTAAGGGTCCTCAGTATGGATATGCCTTATTACTGGCACGCACGGCTCACGCTGCTGCATATTCTATATTCTCGCAGAAGCAGGGTAAATATCCTCCTGCTGCTAACATATATGTTCAGTGTGAGCTTGGCATTAAGTACCTTCACGTACACGTCGTGATGGGCGGTGACGGCTTGAACCGGTACAACGCCAAGGCCACTTGCTCTAACCTGGCCTACAAGTGGCTGGACAATATTCAGTCTCAGCTCGAGATTAACGTCAAGACCGGTCACAACACCGACCTTGACATGTGCAATTCTCTCATCGGCTGCGTCTACCAGGCCAAGAGAGAGTGCTTTGACATGAGGACCGAGATTTGTACCATCCTGCAGTACAAGTGCCGGAACGGCGAGATGTACGCCTGCCGGGTCGATCCTATAGAGTTTATCTGTAACTACCTGTTGTGCAAAAACTTGAAGTTCTTTTCTATGGTCGACCCTGACAGAGCAACTCCGTTTGTCTCTCACTTTGCCTGTTCTGGTAAAACGTACGCGGCTACGTTTGTGAATGGGAAGTGGGTCTTGCCTCAGGTTAGGAAGCAGTGGCTAAATTATCTTCGAGACTCTGTCTGCCAGAAGGCCGATCCCGTCTTTTCCGGCGACATGTTTGAAAATCTACCTAAGGTACCTCGCGCGACCTGGTCGGCAGACGTTTCCTCTAATAAGTCTAAAATCACTAAAAAGGAAACTCTGATGATTGACTGTATCGATCGCTGCGAAAAGAATCACTTGCTTACCTATGAAGATTTGGTCAATGAGTGCTCTGATCTTGTAATCATGCTCGGCTCTCAGCCGGGCGGGACTAAACTGATTGAGACCTTGCTTCAGATGGTTCACATTAAGATTTGTCAGAAATACACGGCCTTGTCTTATGTCTTGTCGCGGTACTCGTCGATCGAGCTGCTGCCTGAGAATAAGGCTATACAGCTCTTGATCTTTCAGGGATACAATCCCTGGCAGGTCGGCCACTGGCTGTGCTGCGTGCTGCACAAGACGGCCGGTAAACAGAATACCGTGTGCTTTTTCGGTCCGGCCAGCACCGGCAAGACCAACTTTGCCAAGGCTATAGTGAATGCCGTTAAACTGTACGGATGTGTGAACCATCAGAATAAGAATTTTGTGTTTAACGACTGCGCGTCCAAGCTGGTCAATTGGTGGGAAGAGTGCCTCATGCACAACGATTGGGTGGAGCAGGCCAAGTGTCTGCTGGGAGGAACGGAGTTTAGGATCGACCGTAAGCATAAAGACTCTCAGCTGCTGCCGCAGACTCCTGTTGTGATCAGTACCAATCACGACGTGTACACCGTGGTCGGTGGAAACACCACTACTATGGTTCACGCTAAGCCGCTTCGGGAGAGGATCGTTCAGTTTAATTTCATGAAACAGCTCTCTTCCACATTTGGGGAGATTGATCCTATGGATGTGGTGGCTCTGTTGCAAGCCTGCTCTTCTCGATTCGAGGCGTCGCTCGACTCGTTTTACGCTCAGTGGCAGCTTCAGTGCACTCCTAACGATTTTCCTCTCGCTTCGTTCTGTGACGGCCATTCGCAGGATTTCGTCCTTCACGAGGTGGGCTTCTGCGACACGTGCGGTGGCTACGCTCCTCTGGAGACTACGGACCGCAGTCAGCCGCTGCCGGCTCGACCTGCTTCGTCCGGTGAGTCTTGGTCTCTGCCTGTATACTGCCTTCAATGTTCCATTCTCCGTGTGCTGTACTTGACTCTGTGCTCTTGTTGGTGTCAGGTGTAAAGCGTCGCCTGGACTTTGACCCGGATCCTGCTCCTTCCACGTCGACGGCTCCTCCGGCGAAACGCCACTCTAAGGTGAGGCGTCCCGTGTTCCACGACGATTGGTGTAGTCAGCCGGTAGATCGCCTGGACCGCATCCGCTATGAAAAGTTCGTCGAGAGCGTCGTCAACGCGTCAGACGAGTCACCATCGGAGCCGGAGTCGGAGTCCACGGGACTCACGCCTTCAGAGTGGGGAGAGATGCTCGGAGTCGTCTGCAAGTCGCTGGAGGAAGAGCCGATCGTCTTACACTGCTTCGAAGACATCGCCTCTCTCTCGGAGACCGAAGACGACTCCGATGGAGGTCTTCAATCAACACCGCGCCAAAACAAAGACTGACATTTCAATGTGTGGCTTTTACTGGCACAGTACTCGCCTCGCGCGGTCGGGTACAGATTGGATCTTTAACAGTGGAAAGCCTCTGTTTCAATCTAAATGTTCTAATAATCTTGTGTCTTGGGATGTGGTTCGTGAGATTCTGTTTGAATTTAAGAAAACTATAGATCAGAAATATAGAAATATGCTGTGGCACTTTGGCCGGGGTGGGTACTGTAATAAATGTGAGTACTGGGATAACGTGTACCTTGAACACCTGGCTAATGTAGACTCCTCTAATGATGTTGTTATGCAGGAGATAAGTGACGCTGAGATGCTGGAGGCTGCCATGGAGATTGATGGCGCCAGCGAATAGAAAGCCCGGTGGTTGGGTCGTGCCTGGCTATAGATATTTGGGTCCCTTTAACCCTGCTGACAACGGGAAACCTGTAAATTCTGCTGACGAGGCCGCTCGGTCTCATGATCTCGCCTATCAGTCCTATCTCGATGCTGGTGTAAACCCGTACTTTAGCTACAATAAAGCTGATTCTGATTTTATTGAGTCCTTGGCTCACGACTCTTCATTCGGCGGCTGGCTGGGGCGCTCGGCCTTTGGCCTCAAGAAATTGCTTGCGCCGCATCTCGCGGATACAAAGGGCAATCCTGACGCTCCGTCCACCTCGCGGGGAGGTTCCTCTGTATCCAAGTCAGACAGAGCTCAAAAGAGAAAACTCTATTTTGCCAGATCAAACAAACAGGCCAAACAACAAAAGATGTCAGCTCCAGAAGCTCCGACCGAAGATGTGGCAGAACCGGGTCCATCTGGCTCCGATCCGAGGGCGGGAGGAAATGGAGGTGGTGGAGGCATGGGAGGAGGTGGAGGACATGGAGTGGGAGTGAGCACCGGAGGGTGGAAGGCGGGGACCGTGTTTGGAAATGATTTTGTCATCACCACCAACACCAGGCAGTGGTTCGCTCCCATCTTTAACGGTCATGAATATAAACGCATGTCACCGGGCGAGAATAGCGAGCAGGCCACCAACAGACACTGGGTGGGAATCAGTACTCCGTGGGGATATTTTAACTTTAACGAGTACAGTTCACATTTCTCGCCACAAGACTGGCAGCGTCTCACCAATGAATACAAACGATGGAGACCCAAGGCGATGAGAATCAAAGTGTACAACCTACAAATAAAACAGGTGGTCACTTTGGGATCAGACACTTTATATAATAATGATCTGACTGCCGGTGTTCACATCTTTTGTGACGGGAGCCATCAGTTTCCGTACTCTCAGCATCCATGGGACACGGGGACCATGCCCGAACTGCCTCATCGCATCTGGAGGATCTCACAATACGGGTACTTTCAGCTACAGGCTGACCTGACGGATGGAGGCGCATCATCAGAGACACCAGACGTCCAAAACCAAGAAAAACAGCTGCTAAAAAGTGCGCCGCTGTACATGCTCGAAACGGCGTCGCACCAAGTGTTAAGAACGGGGGAAGAATCCAGCTTTTCTTTCACGTTTGACAGCGGGTGGGTTATCAACGACAAGGCGTACGCCATTCCACAGGCAGACTTTAACCCTCTGATTCATACCAGACGATACTTTCCTACACGAAACAACACCACAGGGGCGGGGGGACTTATGTTTTATCACAGATATAATCCATACAACAAACCAAGCAACTGGATGCCAGGGCCAAGCTTAGGCTACTTAGGGGCGACACAAACATCGCAAAATCCACAATATGCACGTGGTCCGATCACTGTCGTCACGCAACCGCCAGGAACGACGGCACAAGGCGCCGACCGGGACGAGCAATCGACTACATTCGTCCCGTCAAAGGCGACCATGCAAAATTCAGGGTACGACGTGAACCCTGTCAACTGCGCCAGCAGCAGGCTAGACGCGCACTCGCTCGCGTACGATTCGGGGCCGGAGAGTCGAGGACAAAACATCATCACCGTGAGGGGGATAGATCTAGATATGGCCAGATGGTCGTCTGTCATGGTGCAGGACGGGACAGAAACAGAGATTGGTACCCAAAATACCAGAACTAATTTTACAGAACTCAAAAATGTGTGGATGTACCCAAATCAGGCGTGGGACACCACTCCGATATCCAGGGACACTCCTATATGGGTCAAAATTCCAAGAACAGACAGGCACACCATGCACGATACCTCGGACGGAACGCTGCCGATGGCGCATCCGCCGGGAACCATCTTTGTCAGGGTCGCAAAGGTACCCATTCCGGGGGAGTCAGACTCTTATTTGAACCTATATGTCACGGGACAAATCACCTGCGAACTCTTATGGGA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| 87,044 |
KP281716.1
|
Canine bocavirus
|
Choi,J.W., Lee,K.H., Lee,J.I., Lee,M.H., Lee,K.K., Oem,J.K., Choi,J.-W., Lee,K.-H., Lee,M.-H., Lee,K.-K., Oem,J.-K.
|
Animal Disease Diagnostic Division, Animal and Plant Quarantine Agency
| null |
2015-05-13
|
13D250
|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,174 |
GenBank
| 1 |
South Korea: Republic of Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
| null |
2014-10-07
| null | null |
Canine bocavirus isolate 13D250, complete genome
|
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|
Animal Disease Diagnostic Division, Animal and Plant Quarantine Agency
| null |
2015-05-13
|
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|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
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GenBank
| 1 |
South Korea: Republic of Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
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|
Animal Disease Diagnostic Division, Animal and Plant Quarantine Agency
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2015-05-13
|
14D193
|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,157 |
GenBank
| 1 |
South Korea: Republic of Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
| null |
2014-10-07
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|
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Canine bocavirus
|
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|
Animal Disease Diagnostic Division, Animal and Plant Quarantine Agency
| null |
2015-05-13
|
14Q209
|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,156 |
GenBank
| 1 |
South Korea: Republic of Korea
|
South Korea
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Canis lupus familiaris
| null |
2014-10-07
| null | null |
Canine bocavirus isolate 14Q209, complete genome
|
TACACCGAGCGGCTTCGCCGCTGCGCCCTGCGGGCGCGCTGTTTATGTTCCTCGGCGAACGTGACGTCATGTAGTAGGAGTGCCTATAAAGATTATATCAATTGTGCTGTCTTGTGGCCTGTTAATGTATAACGTGCTGTGTCAGCTGTTTGTGATTGGTTGGTGTTTTATGACTTTGTTATGTTCATGGTTACTGATTTATGAATTTTGGGCGGGCTTACTGACTATATATATAAGTGTGCTTCCTGCTTCGTGTCATTCTGCTTCCGGCTTTCGTCGCGGTGACATCTCGCTGCTCTATCTGGGGGTGAGTGATGGCTCTTGCTCTGGCCGGGGTCGACGATATCATTCACTTTGCTCGTCCTGCCTATACCTATGTTCTCAAATTTCCTTACGCTGAGTGGCGGCGGGATGAGGCTCGTCTTCAGAGCGCTCTGGGGTACCCGCATCATGATTTACTCAAGGACTCGACTCCGTTCCTTACTATGCCGGGGCAGGATTCTCCGGCCGAGCAGGCTTCCTTTTTGGAGTCTAAGGGTCCTCAGTATGGATATGCCTTATTACTGGCACGCACGGCTCACGCTGCTGCATATTCTATATTCTCGCAGAAGCAGGGTAAATATCCTCCTGCTGCTAGCATATATGTTCAGTGTGAGCTTGGCATTAAGTACCTTCACGTACACGTCGTGATGGGCGGTGACGGCTTGAACCGGTACAACGCCAAGGCCACTTGCTCTAACCTGGCCTATAAGTGGCTGGACAATATTCAGTCTCAGCTCGAGATTAACGTCAAGACCGGTCACAACACCGACCTTGACATGTGCAATTCTCTCATTGGCTGCGTCTACCAGGCCAAGAGAGAGTGCTTTGACATGAGGACCGAGATTTGTACCATCCTGCAGTACAAGTGCCGGAACGGCGAGATGTACGCCTGCCGGGTCGATCCTATAGAGTTTATCTGTAACTACCTGTTGTGCAAAAACTTGAAATTCTTTTCTATGGTCGACCCTGACAGAGCAACTCCGTTTGTCTCTCACTTTGCCTGTTCTGGTAAAACGTACGCGGCTACATTTGTCAATGGGAAGTGGGTCTTGCCTCAGGTTAGGAAGCAGTGGCTAAATTATCTCCGAGACTCTGTCTGCCAGAAGGCCGATCCCGTCTTTTCCGGCGACATGTTTGAAAATCTACCTAAGGTACCTCGCGCGACCTGGTCGGCAGACGTTTCCTCTAATAAGTCTAAAATCACTAAAAAGGAAACTCTGATGATTGACTGTATCGATCGCTGCGAAAAGAATCACTTGCTTACCTATGAAGATTTGGTCAATGAGTGCTCTGATCTTGTAATCATGCTCGGCTCTCAGCCGGGCGGGACTAAACTGATTGAGACCTTGCTTCAGATGGTTCACATTAAGATTTGTCAGAAATACACGGCCTTGTCTTATGTCTTGTCGCGGTACTCGTCGATCGAGCTGCTGCCCGAGAATAAGGCTATACAGCTCTTGATCTTTCAGGGATACAATCCCTGGCAGGTCGGCCACTGGCTGTGCTGCGTGCTGCACAAGACGGCCGGTAAACAGAATACCGTGTGCTTTTTCGGTCCGGCCAGCACCGGCAAGACCAACTTTGCCAAGGCTATAGTGAATGCCGTTAAGCTGTACGGATGTGTGAACCATCAGAATAAGAATTTTGTGTTTAACGACTGCGCGTCCAAGCTGGTCAATTGGTGGGAAGAGTGCCTCATGCACAACGATTGGGTGGAGCAGGCCAAGTGTCTGCTGGGAGGAACGGAGTTTAGGATCGACCGTAAGCATAAAGACTCTCAGCTGCTGCCGCAGACTCCTGTTGTGATCAGTACCAATCACGACGTGTACACCGTGGTCGGTGGAAACACCACTACTATGGTTCACGCTAAGCCGCTTCGGGAGAGGATCGTTCAGTTTAATTTCATGAAACAGCTCTCTTCCACATTTGGGGAGATTGATCCTATGGATGTGGTGGCTCTGTTGCAAGCCTGCTCTTCTCGATTCGAGGCGTCGCTCGACTCGTTTTACGCTCAGTGGCAGCTTCAGTGCACTCCTAACGATTTTCCTCTCGCTTCGTTCTGTGACGGCCATTCGCAGGATTTCGTCCTTCACGAGGTGGGCTTCTGCGACACGTGCGGTGGCTACGCTCCTCTGGAGACTACGGACCGCAGTCAGCCTCTGCCGGCTCGACCTGCTTCGTCCGGTGAGTCTTGGTCTCTGCCTGTATACTGCCTTCAATGTTCCATGTTCCGTGTGCTGTACTTGACTCTGTACTTTTGTTAGTATCAGGTGTGAAGCGTCGCCTGGACCTTGACCCGGATCCTGCTCCTTCCACGTCGACGGCTCCTCCGGCGAAACGCCACTCTAAGGTGAGGCGTCCCGTGTTCCACGACGACTGGTGTAGTCAGCCGGTAGATCGCCTGGACCGCATCCGCTATGAAAAGTTCGTCGAGAGCGTCGTCAACGCGTCAGACGAGTCACCATCGGAGCCGGAGTCGGAGTCCACGGGACTCACGCCTTCAGAGTGGGGAGAGATGCTCGGAGTCGTCTGCAAGTCGCTGGAGGAAGAGCCGATCGTCTTACACTGCTTCGAAGACATCGCCTCTCTCTCGGAGACCGAAGACGACTCCGATGGAGGTCTTCAATCAACACCGCGCCAAAACAAAGACTGACATTTCAATGTGTGGCTTTTACTGGCACAGTACTCGCCTCGCGCGGTCGGGTACAGATTGGATCTTTAACAGTGGAAAGCCTCTGTTTCAATCTAAATGTTCTAATAATCTTGTGTCTTGGGATGTGGTTCGTGAGATTCTGTTTGAATTTAAGAAAACTATAGATCAGAAATATAGAAATATGCTATGGCACTTTGGCCGGGGTGGGTACTGTAATAAATGTGAGTACTGGGATAACGTGTACCTTGAACACTTGGCTAATGTAGACTCCTCTAATGATGTTGTTATGCAGGAGATAAGTGACGCTGAGATGCTGGAGGCTGCCATGGAGATTGATGGCGCCAGCGAATAGAAAGCCCGGTGGTTGGGTCGTGCCTGGCTATAAATATTTGGGTCCCTTTAACCCTGCTGACAACGGGGAACCTGTAAATTCCGCTGACGAGGCCGCTCGGTCTCATGATCTCGCCTATCAGTCCTATCTCGATGCTGGTGTAAACCCGTACTTTAGCTACAATAAAGCTGATTCTGATTTTATTGAGTCCTTGGCTCACGACTCTTCATTCGGCGGCTGGCTGGGGCGCTCGGCCTTTGGCCTCAAGAAATTGCTTGCGCCGCATCTCGCGGATACAAAGGGCAATCCTGACGCTCCGTCCACCTCGCGGGGAGGTTCCTCTGTATCCAAGTCAGACAGAGCACAAAAGAGAAAGCTCTATTTTGCCAGATCAAACAAACAGGCCAAACAACAAAAGATGTCAGCTCCAGAAGCTCCGACCGAAGATGTGGCAGAACCGGGTCCATCTGGCTCCGATCCGCGGGCGGGAGGAAATGGAGGTGGTGGAGGCATGGGAGGAGGTGGAGGACATGGAGTGGGAGTGAGCACCGGAGGGTGGAAGGCGGGGACCGTGTTTGGAAATGATTTTGTCATCACCACCAACACCAGACAGTGGTACGCTCCCATCTTTAACGGTCATGAATACAAACGTTTACACCCAGACGTTGATAGAAACTGGGCGGGCATCAGCACTCCATGGGGATACTTTAACTTTAACGAGTACAGTTCGCATTTCTCGCCACAAGACTGGCAGCGTCTCACCAATGAGTACAAGCGGTGGAGACCCAAAGCGATGAGAGTTAAAGTGTACAACCTGCAGATAAAACAGGTGGTCAATCTGGGGTCTGACACTTTATACAATAATGACCTGACGGCCGGCGTTCACATCTTTTGTGACGGGAGCCATCAGTTTCCGTACTCTCAGCATCCGTGGGACACGGGGACCATGCCGGAACTGCCTCATCGCATCTGGAGGATCTCACAATACGGGTACTTTCAGCTACAGGCTGACCTGACGGATGGGGGCGCATCATCAGAGACACCAGACGTCCAAAACCAAGAAAAACAGCTGCTAAAAAGTGCTCCGCTTTTTATGCTGGAGACTGCGTCTCATCAAGTATTGAGAACGGGGGAAGAATCCAGCTTTTCATTCTCCTTTGACTGTGGGTGGGCTATTAACGACAAAGCGTACGCCATTCCACAGGCAGACTTTAACCCTCTGATTCCAACCAGACGATACTTTCCTACACGAAACAGTGCCACGGGAGCGGGGGGCCTTATGTTTTATCATAGATATAATCCATACAACAAACCAAGCAACTGGATGCCGGGACCGAGCTTAGGTTATCTAGGGTCAACACAAACATCGCAAAATCCACACAAAGCACGTGGTCCGATCACTGTCGTCACGCAGCCGCCCGGCACGACGGCACAAAGCGCCAACAGGGACGAACAATCAACTACATTCGTCCCGTCAGAAACGACCATGCAAAATTCAGGGTACGACGTGAACCCTGTCAACTGCGCCAGCAGCAGGCTAGACGCGCACTCGCTCGCGTACGATTCAGGGCCGGAGAGTGCCGGACAAAACATCATCACCGTGAGAGGCATAGACTTAGACATGGCCAGGTGGTCGTCCGTCATGGTGCAGGACGGAACAAATAACGAACTTGGAACATCTACACCTAGAACACACTTTACAGAACTCAAAAACGTGTGGATGTACCCAAATCAGGCGTGGGACACCACTCCGATATCCAGGGACACTCCTATCTGGGTCAAAATTTCAAAAACAGACAGGCACACCATGCACGACACCTCGGACGGAACGCTGCCGATGGCGCATCCGCCGGGAACCATCTTTGTCAAGGTTGCAAAAGTGCCCATTCCGGGGGAGTCAGACTCTTACCTGAACCTGTACGTGACAGGACAGATAACTTGTGAAATACTCTGGGAGACAGAGAGGTTCCAGACCAAAAATTGGAGACCGGAAATCAAAAACGATCCTTCCATGTTTAGCGACCCTCTACTGTATACATTTAACGACACAGGGGTCTACAATACTCCAGAAACATTCATCGAGGGCATGCCCACTAAACGGGGAATAAACAGGGTACTGTAACTTTAAGA
| 87,048 |
KP281720.1
|
Canine bocavirus
|
Choi,J.W., Lee,K.H., Lee,J.I., Lee,M.H., Lee,K.K., Oem,J.K., Choi,J.-W., Lee,K.-H., Lee,M.-H., Lee,K.-K., Oem,J.-K.
|
Animal Disease Diagnostic Division, Animal and Plant Quarantine Agency
| null |
2015-05-13
|
14Q216
|
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,174 |
GenBank
| 1 |
South Korea: Republic of Korea
|
South Korea
|
Canis lupus familiaris
| null |
2014-10-07
| null | null |
Canine bocavirus isolate 14Q216, complete genome
|
TACACCGAGCGGCTTCGCCGCTGCGCCCTGCGGGCGCGCTGTTTATGTTCCTCGGCGAACGTGACGTCATGTAGTAGGAGTGCCTATAAAGATTATATCAATTGTGCTGTCTTGTGGCCTGTTAATGTATAACGTGCTATGTCAGCTGTTTGTGATTGGTTGGTGTTTTATGACTTTGTTATGTTCATGGTTACTGATTGATGAATTTTGGGCGGGCTTAGTGACTATATATATAAGTGTGCTTCCTGCTTCGTGTCATTCTGCTTCCGGCTTTCGTCGCGGTGACATCTCGCTGCTCTATCTGGGGGTGAGTGATGGCTCTTGCTCTGGCCGGGGTCGACGATATCATTCACTTTGCTCGTCCTGCCTATACCTATGTTCTCAAATTTCCTTACGCTGAGTGGCGGCGGGATGAGGCTCGTATTCAGAGCGCTCTGGGGTACCCGCATCATGATTTACTCAAGGACTCGACTCCGTTCCTTACTATGCCGGGGCAGGATTCTCCGGCCGAGCAGGCTTCCTTTTTGGAGTCTAAGGGTCCTCAGTATGGATATGCCTTATTACTGGCACGCACGGCTCACGCTGCTGCATATTCTATATTCTCGCAGAAGCAGGGTAAATATCCTCCTGCTGCTAGCATATATGTTCAGTGTGAGCTTGGCATTAAGTACCTTCACGTACACGTCGTGATGGGCGGTGACGGCTTGAACCGGTACAACGCCAAGGCCACTTGCTCTAACCTGGCCTACAAGTGGCTGGACAATATTCAGTCTCAGCTCGAGATTAACGTCAAGACCGGTCACAACACCGACCTTGACATGTGCAATTCTCTCATTGGCTGCGTCTACCAGGCCAAGAGAGAGTGCTTTGACATGAGGACCGAGATTTGTACCATCCTGCAGTACAAGTGCCGGAACGGCGAGATGTACGCCTGCCGGGTCGATCCTATAGAGTTTATCTGTAACTACCTGTTGTGCAAAAACTTGAAATTCTTTTCTATGGTCGACCCTGACAGAGCAACTCCGTTTGTCTCTCACTTTGCCTGTTCTGGTAAAACGTACGCGGCTACGTTTGTCAATGGGAAGTGGGTCTTGCCTCAGGTTAGGAAGCAGTGGCTAAATTATCTTCGAGACTCTGTCTGCCAGAAGGCCGATCCCGTCTTTTCCGGCGACATGTTTGAAAACCTACCTAAGGTACCTCGCGCGACCTGGTCGGCAGACGTTTCCTCTAATAAGTCTAAAATCACTAAAAAGGAAACTCTGATGATTGACTGTATCGATCGCTGCGAAAAGAATCACTTGCTTACCTATGAAGATTTGGTCAATGAATGTTCTGATCTTGTAATCATGCTCGGCTCTCAGCCGGGCGGGACTAAACTGATTGAGACCTTGCTTCAGATGGTTCACATTAAGATTTGTCAGAAATATACGGCCTTGTCTTATGTCTTGTCGCGGTACTCGTCGATCGAGCTGCTGCCCGAGAATAAGGCTATACAGCTCTTGATCTTTCAGGGATACAATCCCTGGCAGGTCGGCCACTGGCTGTGCTGCGTGCTGCACAAGACGGCCGGTAAACAGAATACCGTGTGCTTTTTCGGTCCGGCCAGCACCGGCAAGACCAACTTTGCCAAGGCCATAGTGAATGCCGTTAAGCTGTACGGATGTGTGAACCATCAGAATAAGAATTTTGTGTTTAACGACTGCGCGTCCAAGCTGGTCAATTGGTGGGAAGAGTGCCTCATGCACAATGATTGGGTGGAGCAGGCCAAGTGTCTGCTGGGAGGAACGGAGTTTAGGATCGACCGTAAGCATAAAGACTCTCAGCTGCTGCCACAGACTCCTGTTGTGATCAGTACCAATCACGACGTGTACACCGTGGTCGGTGGAAACACCACTACTATGGTTCACGCTAAGCCGCTTCGGGAGAGGATCGTTCAGTTTAATTTCATGAAACAGCTCTCTTCCACCTTTGGGGAGATTGATCCTATGGATGTGGTGGCTCTGTTGCAAGCCTGCTCTTCTCGATTCGAGGCGTCGCTCGACTCGTTTTACGCTCAGTGGCAGCTTCAGTGCACTCCTAACGATTTTCCTCTCGCTTCGTTCTGTGACGGCCATTCGCAGGATTTTGTCCTTCACGAGGTGGGCTTCTGCGACACGTGCGGTGGCTACGCTCCTCTGGAGACTACGGACCGCAGTCAGCCGCTGCCGGCTCGACCTGCTTCGTCCGGTGAGTCTTGGTCTCTGCCTGTATACTGCCTTCAATGTTCCATTTTCCGTGTGCTGTACTTGACTCTGCGCTCTTGTTGGTGTCAGGTGTGAAGCGTCGCCTGGACTTTGACCCGGATCCTGCTCCTTCCACGTCGACGGCTCCTCCGGCGAAACGCCACTCTAAGGTGAGGCGTCCCGTGTTCCACGACGACTGGTGTAGTCAGCCGGTAGATCGCCTAGACCGCATCCGCTATGAAAAGTTCGTCGAGAGCGTCGTCGGGACGTCAGACGAGTCACCATCGGAGCCGGAGTCGGAGTCCACGGGACTCACGCCTTCAGAGTGGGGAGAGATGCTCGGAGCCGTCTGCAAGTCGCTGGAGGAAGAGCCGATCGTCTTACACTGCTTCGAAGACATCGCCTCTCTCTCGGAGACCGAAGACGACTCCGATGGAGGTCTTCAATCAACACCGCGCCAAAACAAAGACTGACATTTCAATGTGTGGCTTTTACTGGCACAGTACTCGCCTCGCGCGGTCGGGTACAGATTGGATCTTTAACAGTGGAAAGCCTCTGTTTCAATCTAAATGTTCTAATAATCTTGTGTCTTGGGATGTGGTTCGTGAGATTCTGTTTGAATTTAAAAAAACTATAGATCAAAAATATAGAAATATGCTGTGGCACTTTGGCCGGGGTGGGTACTGTAATAAATGTGAGTACTGGGATAACGTGTACCTTGAACACCTGGCTAATGTAGACTCCTCTAATGATGTTGTTATGCAGGAGATAAGTGACGCTGAGATGCTGGAGGCTGCCATGGGGATTGATGGCGCCAGCGAATAGAGAGCCCGGTGGTTGGGTCGTGCCTGGCTATAAATATTTGGGTCCCTTTAACCCTGCTGACAACGGGGAACCTGTAAATTCTGCTGACGAGGCCGCTCGGTCTCATGATCTTGCCTATCAGTCCTATCTCGATGCTGGTGTAAACCCGTACTTTAGCTACAATAAAGCTGATTCTGATTTCATTGAGTCATTGGCTCACGACTCTTCATTCGGCGGCTGGCTGGGGCGCTCGGCCTTTGGCCTCAAGAAATTGCTTGCGCCGCATCTCGCGGATACAAAGGGCAATCCTGACGCTCCGTCCACCTCGCGGGGAGGTTCCTCTATATCCAAGTCAGACAGAGCACAAAAGAGAAAACTCTATTTTGCCAGATCAAACAAACAGGCCAAACAACAAAAGATGTCAGCTCCAGAAGCTCCGACCGAAGATGTGGCAGAACCGGGTCCATCTGGCTCCGATCCGCGGGCGGGAGGAAATGGAAGTGGTGGAGGCATGGGAGGAGGTGGAGGACATGGAGTGGGAGTGAGCACCGGAGGGTGGAAGGCGGGGACCGTATTTGGAAATGATTTTGTCATCACCACCAACACCAGACAGTGGTTCGCTCCCATCTTTAACGGTCATGAATATAAACGCATGTCACCGGGCGAGAATAGCGAGCAGGCCACCAACAGGCACTGGGTGGGAATCAGTACTCCGTGGGGATATTTTAACTTTAACGAGTACAGTTCGCATTTCTCGCCACAAGACTGGCAGCGTCTCACCAATGAATACAAACGATGGAGACCCAAGGCGATGAGAGTCAAAGTGTACAACCTGCAAATAAAACAGGTGGTCACTTTAGGGTCTGACACTTTATATAATAATGATCTAACGGCCGGCGTTCACATCTTTTGTGACGGGAGCCATCAGTTTCCGTACTCTCAGCATCCGTGGGACACGGGGACCATGCCCAAATTGCCTCATCGCATCTGGAGAATCTCACAATACGGGTACTTTCAGCTACAGGCTGACCTGACGGATGGGGGCGCATCATCAGAAACACCAGACGTCCAAAACCAAGAAAAACAGCTGCTAAAAAGTGCGCCGCTGTACATGCTCGAGACGGCGTCGCATCAAGTGTTGAGAACGGGGGAAGAATCCAGCTTCTCTTTCTCGTTTGACAGCGGGTGGGTTATCAACGACAAGGCGTACGCCATTCCACAGGCAGACTTTAACCCTCTGATTCACACCAGACGATACTTTCCTACACGAAACAACACCACAGGGGCGGGGGGACTTATGTTTTATCACGGATATAATCCATACAACAAACCGAGCAACTGGATGCCAGGGCCAAGCTTAGGCTACCTGGGGGCGACACAGACATCAACCAATCCACAATATGCGCGTGGTCCTATCACTGTCGTCACGCAGCCGCCAGGAACGATGGCACAGAGCGCCGACCGGGACGAACAATCGACTACATTTGTCCCGTCAAAGGCGACCATGCAAAATTCAGGGTACGACGTGAACCCTGTCAACTGTGGTAGCAGCAGATTAGACGCGCACTCGCTCGCGTACGATTCGGGGCCAGAGAGTCGAGGACAAAACATCATCACCGTAAGGGGAATAGATTTAGATATGGCCCGGTGGTCCTCTGTCATGGTGCAGGACGGAACAGAAACAGAAGTTGGTACCCAAAATCCTAGAACTAATTTTACAGAACTTAAAAACGTGTGGATGTACCCAAATCAGGCGTGGGACACCACTCCGATATCCAGGGACACTCCCATTTGGGTCAAAATTCCAAGAACAGACAGGCACACCATGCAAGACACATCGGACGGAACGCTGCCGATGGCCCATCCGCCGGGAACCATCTTTGTCAGGGTCGCAAAGGTACCCATTCCGGGGGAGTCAGACTCTTATTTGAACCTATATGTCACGGGACAAATCACCTGCGAACTCTTGTGGGA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| 87,049 |
JQ692588.1
|
Canine bocavirus
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yeung,H.C., Teng,J.L., Wu,Y., Bai,R., Fan,R.Y., Chan,K.H., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Teng,J.L.L., Fan,R.Y.Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
China
|
2012-04-23
| null |
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,057 |
GenBank
| 1 |
Hong Kong
|
Hong Kong
|
Canis lupus familiaris
| null |
2010-03-12
| null | null |
Canine bocavirus strain HK880N, complete genome
|
TTTGTGATTGGTTGGTGTTTTATGACCTTGTTATGTTCATGGTTACTGATTGATGAATTGTGGGCGGGCTTACTAACTATATATATAAGTGTGCTTCCTGCTTCGTGTCATTCTGCTTCCGGCTTTCGTCGCGGTGACATCTCGCTGCTCTGTCTGGGGGTGAGTGATGGCTCTTGCTCTGGCCGGGGTCGACGATATTATTCACTTTGCTCGTCCTGCCTATACCTATGTTCTCAAATTTCCTTATGCTGAGTGGCGGCGGGATGAGGCTCGTCTTCAGAGCGCTCTGGGGTACCCGCATCATGATTTACTCAAGGACTCGACTCCGTTCCTTACTATGCCGGGGCAAGATTCTCCGGCCGAGCAGGCTTCCTTTTTGGAGTCTAAGGGTCCTCAATACGGATATGCCTTATTACTGGCACGCACGGCTCACGCTGCTGCATATTCTATATTCTCGCAGAAGCAGGGTAAATATCCTCCTGCTGCTAGCATATATGTTCAGTGTGAGCTGGGCATTAAGTACCTTCACGTACACGTCGTGATGGGCGGTGACGGCTTGAACCGGTACAACGCCAAGGCCACTTGCTCTAACCTGGCCTATAAGTGGCTGGACAATATTCAGTCTCAGCTCGAGATTAACGTCAAGACCGGTCACAATACAGACCTTGACATGTGCAATTCTCTCATTGGCTGCGTTTACCAGGCCAAGAGAGAGTGCTTTGACATGAGGACCGAGATTTGTACCATCCTGCAGTACAAGTGCCGGAACGGCGAGATGTACGCCTGCCGGGTCGATCCTATCGAGTTTATCTGTAACTACCTGTTGTGCAAAAACTTGAAATTCTTTTCTATGGTCGACCCTGACAGAGCAACTCCGTTTGTCTCTCACTTTGCCTGTTCTGGTAAAACATACGCGGCTACGTTTGTGAATGGGAAGTGGGTCTTGCCTCAGGTTAGGAAGCAGTGGCTAAATTATCTTCGAGACTCTGTCTGTCAGAAGGCCGATCCCGTCTTTTCCGGCGACATGTTTGAAAATCTACCTAAGGTACCTCGCGCGACCTGGTCGGCAGACGTTTCCTCTAATAAGTCTAAAATCACTAAAAAGGAAACTCTGATGATTGACTGTATCGATCGCTGCGAAAAGAATCACTTGCTTACCTATGAAGATTTGGTCAATGAGTGTTCTGATCTTGTAATCATGCTCGGCTCACAGCCGGGCGGGACTAAACTGATTGAGACCTTGCTTCAGATGGTTCACATTAAGATTTGTCAGAAATACACGGCCTTGTCTTATGTCTTGTCGCGGTACTCGTCGATCGAGCTGCTGCCTGAGAATAAGGCTATACAGCTCTTGATCTTTCAGGGATACAATCCCTGGCAGGTCGGCCACTGGCTGTGCTGCGTGCTACACAAGACGGCCGGTAAACAGAATACCGTGTGCTTTTTCGGTCCGGCCAGCACCGGCAAGACAAATTTTGCCAAGGCTATAGTGAATGCCGTTAAGCTGTACGGATGTGTGAACCATCAGAATAAGAATTTTGTGTTTAACGACTGCGCGTCCAAGCTGGTCAATTGGTGGGAAGAGTGCCTCATGCACAACGATTGGGTAGAGCAGGCCAAGTGTCTGCTGGGAGGAACAGAGTTTAGGATCGACCGTAAGCATAAAGACTCTCAGCTACTGCCGCAGACTCCTGTTGTGATCAGTACCAATCACGACGTGTACACCGTGGTCGGTGGGAACACCACTACTATGGTTCACGCTAAACCGCTTCGGGAGAGGATCGTTCAATTTAATTTCATGAAACAACTCTCTTCCACGTTTGGGGAGATTGATCCTATGGATGTGGTGGCTCTGTTGCAAGCCTGCTCTTCTCGATTCGATGCGTCGCTCGACTCGTTTTACGCTCAGTGGCAGCTTCAGTGCACTCCTAACGATTTTCCTCTCGCTTCGTTCTGTGACGGCCATTCGCAGGATTTTGTCCTTCACGAGGTGGGCTTCTGCGACACGTGCGGTGGCTACGCTCCTCTGGAGACTACGGACCGCAGTCAGCCGCTGCCGGCTCGACCTACTTCGTCCGGTAAGTCTTTACTCTTTACCTGTATACTGCCTTAAATGTTCCATTTTCTATATGCTGTACTTGACTCTGTGCTTTTATTAGTGTCAGGTGTGAAACGTCGCCTGGACTTTGACCCGGATCCTGCTCCTTCCACGTCGACGGCTCCTCCGGCGAAGCGCCACTCCAAGGTGAGGCGTCCCGTGTTCCACGACGACTGGTGTAGTCAGCCGGTAGATCGCCTAGACCGCATCCGCTATGAAAAGTTCGTCGAGAGCGTCGTCGGCGCGTCAGACGAGTCACCATCGGAGCCGGAGTCGGAGTCCACGGGACTCACGCCTTCAGAGTGGGGAGAGATGCTCGGAGTCGTCTGCAAATCGCTGGAGGAAGAGCCGATCGTCTTACACTGCTTCGAAGACATCGCCTCTCTCTCGGAGACCGAAGACGACTCCGATGGAGGTCTTCAATCAACACCGCGCCAAAACAAAGACTGACATTTCAATGTGTGGCTTTTACTGGCACAGTACTCGCCTCGCGCGGTCGGGTACAGATTGGATCTTTAACAGTGGAAAGCCTCTGTTTCAATCTAAATGTTCTAATAATCTTGTGTCTTGGGATGTGGTTCGTGAGATTCTATTTGAATTTAAGAAAACTATAGATCAGAAATATAGAAATATGCTGTGGCACTTTGGTCGGGGTGGGTACTGTAATAAATGTGAGTACTGGGATAACGTGTACCTTGAACACTTGGCTAATGTAGACTCCTCTAATGATGTTGTTATGCAGGAGATAAGTGACGCTGAGATGCTGGAGGCTGCCATGGAGATTGATGGCGCCAGCGAATAGAAAGCCCGGTGGTTGGGTCGTGCCTGGCTATAAATATTTGGGTCCCTTTAACCCTGCTGACAACGGGGAACCTGTAAATTCTGCTGACGAGGCCGCTCGGTCTCATGATCTCGCCTATCAGTCCTATCTCGATGCTGGTGTAAACCCGTACTTTAGCTACAATAAAGCTGATTCTGATTTTATTGAGTCCTTGGCTCACGACTCTTCATTCGGCGGCTGGCTGGGGCGCTCGGCCTTTGGCCTCAAGAAATTGCTTGCGCCGCATCTCGCGGATACAAAGGGCAATCCTGACGCTCCGTCCACTTCACGGGCAGGTTCCTCTATATCCAAGTCAGACAGAGCACAAAAGAGAAAACTCTATTTTGCCAGATCAAACAAACAGGCCAAACAACAAAAGATGTCAGCTCCAGAAGCTCCGACCGAAGATGTGGCAGAACCGGGTCCATCTGGCTCCGATCCACGGGCAGGAGGAAATGGAGGTGGTGGAGGCATGGGAGGAGGTGGAGGACATGGAGTGGGAGTGAGCACCGGCGGGTGGAAGGCGGGGACCGTGTTTGGAAATGATTTTGTCATCACCACCAACACCAGACAGTGGTACGCTCCCATCTTTAACGGCCATGAATACAAACGCATGGCGCCGGGCGAGAATAGCGAACAGGCCACCAACAGACACTGGGTGGGCATCAGTACTCCATGGGGATATTTTAACTTTAACGAATACAGTTCGCATTTCTCGCCACAAGACTGGCAGCGTCTCACCAACGAATACAAGCGGTGGAGACCCAAGGCAATGAGGATCAAAGTATACAACCTGCAAATAAAACAAGTGGTCACTGTAGGGGATGACACTTTATATAATAATGATCTAACGGCCGGCGTCCACATCTTTTGTGACGGGAGCCATCAGTTTCCGTACTCTCAGCATCCGTGGGACACCGGAACCATGCCCGAACTGCCTCATCGCATCTGGAGGATCTCGCAGTACGGGTACTTTCAACTACAATCTGACCTGACGGACGGGGGCGCATCATCCGAGAGGCCAGACGTCGAGAACCAAGAAAAACAGCTGCTAAAAAGTGCGCCGCTATACATGCTAGAGACGGCGTCGCACCAAGTGTTAAGAACTGGGGAGGAATCTAGCTTCTCTTTTTCATTTGACTGCGGGTGGGTTATCAACGATAAGGCGTACGCCATTCCACAGGCAGACTTTAACCCTCTAATTCACACCAGACGATACTTTCCTACACGAAACAATAACACCACAGCGTCAGGGGGCCTCATGTTTTATCACAGGTATAATCCATACAACAAACCAAGCAACTGGATGCCAGGGCCAAGCTTAGGTTATCTAGGATCAACACAAACATCAACCAATCCACAATATGCGCGTGGTCCGATTACCGTCGTCACGCAACCGCCAGGAACGACGGCACAAGGGGTCATTAGGGACGAGCAGTCGACTACAAACGTCCCGTCAGAGGCGACCATGCAAAATTCAGGGTACGACGTGAACCCTGTCAACTGCGGTAGCAGCAGATTAGACGCACACTCGCTTGCGTACGATTCGGGGCCAGAGAGTCGCGGGCAAAACATCATCACCGTAAGAGGAATAGATCTAGACATGGCCAGGTGGTCGTCTGTCATGGTGCAGGACGGAACAAAAACAGAAATTGGTACATCAACTGAAAGAAATAATTTTACAGAACTTAAAAACGTGTGGATGTACCCAAATCAGGCGTGGGACACCACTCCGATATCCAGGGACACTCCCATTTGGGTCAAAATTCCAAGAACAGACAGGCACACCATGCATGATACCTCGGATGGAACGCTGCCGATGGCGCATCCACCGGGAACCATCTTTGTTAGGGTCGCAAAGGTACCCATTCCGGGAGAGTCAGACTCTTACCTAAACCTATACGTCACGGGACAAATTACCTGTGAACTCTTATGGGAAACTGAACGCTTCCAAACCAAAAATTGGAGACCGGAAATCAAAAATGATCCTTCAATGTTTAGCGACCCTCTATTATACACTTTTGACAGGCAAGGGGTCTATAATACTCCAGAAACTTTCATTGAGGGCATGCCCACTAAACGGGGAATAAACAGGGTACTGTAACTTTAAGAAACAATAAAGCCATAAAACGAAAACTT
| 97,232 |
JQ692589.1
|
Canine bocavirus
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yeung,H.C., Teng,J.L., Wu,Y., Bai,R., Fan,R.Y., Chan,K.H., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Teng,J.L.L., Fan,R.Y.Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
China
|
2012-04-23
| null |
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,140 |
GenBank
| 1 |
Hong Kong
|
Hong Kong
|
Canis lupus familiaris
| null |
2010-03-12
| null | null |
Canine bocavirus strain HK882F, complete genome
|
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| 97,233 |
JQ692590.1
|
Canine bocavirus
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yeung,H.C., Teng,J.L., Wu,Y., Bai,R., Fan,R.Y., Chan,K.H., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Teng,J.L.L., Fan,R.Y.Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
China
|
2012-04-23
| null |
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,117 |
GenBank
| 1 |
Hong Kong
|
Hong Kong
|
Canis lupus familiaris
| null |
2010-03-12
| null | null |
Canine bocavirus strain HK882U, complete genome
|
CAACGCAGAGTACATGGGCTGTCTTGTGGCCTGTTAATGTATAACATGCTATGTCAGCTGTTTGTGATTGGTTGGTGTTTTATGACCTTGTTATGTTCATGGTTACTGATTGATGAATTGTGGGCGGGCTTACTAACTATATATATAAGTGTGCTTCCTGCTTCGTGTCATTCTGCTTCCGGCTTTCGTCGCGGTGACATCTCGCTGCTCTGTCTGGGGGTGAGTGATGGCTCTTGCTCTGGCCGGGGTCGACGATATTATTCACTTTGCTCGTCCTGCCTATACCTATGTTCTCAAATTTCCTTATGCTGAGTGGCGGCGGGATGAGGCTCGTCTTCAGAGCGCTCTGGGGTACCCGCATCATGATTTACTCAAGGACTCGACTCCGTTCCTTACTATGCCGGGGCAAGATTCTCCGGCCGAGCAGGCTTCCTTTTTGGAGTCTAAGGGTCCTCAATACGGATATGCCTTATTACTGGCACGCACGGCTCACGCTGCTGCATATTCTATATTCTCGCAGAAGCAGGGTAAATATCCTCCTGCTGCTAGCATATATGTTCAGTGTGAGCTGGGCATTAAGTACCTTCACGTACACGTCGTGATGGGCGGTGACGGCTTGAACCGGTACAACGCCAAGGCCACTTGCTCTAACCTGGCCTATAAGTGGCTGGACAATATTCAGTCTCAGCTCGAGATTAACGTCAAGACCGGTCACAATACAGACCTTGACATGTGCAATTCTCTCATTGGCTGCGTTTACCAGGCCAAGAGAGAGTGCTTTGACATGAGGACCGAGATTTGTACCATCCTGCAGTACAAGTGCCGGAACGGCGAGATGTACGCCTGCCGGGTCGATCCTATCGAGTTTATCTGTAACTACCTGTTGTGCAAAAACTTGAAATTCTTTTCTATGGTCGACCCTGACAGAGCAACTCCGTTTGTCTCTCACTTTGCCTGTTCTGGTAAAACATACGCGGCTACGTTTGTGAATGGGAAGTGGGTCTTGCCTCAGGTTAGGAAGCAGTGGCTAAATTATCTTCGAGACTCTGTCTGTCAGAAGGCCGATCCCGTCTTTTCCGGCGACATGTTTGAAAATCTACCTAAGGTACCTCGCGCGACCTGGTCGGCAGACGTTTCCTCTAATAAGTCTAAAATCACTAAAAAGGAAACTCTGATGATTGACTGTATCGATCGCTGCGAAAAGAATCACTTGCTTACCTATGAAGATTTGGTCAATGAGTGTTCTGATCTTGTAATCATGCTCGGCTCACAGCCGGGCGGGACTAAACTGATTGAGACCTTGCTTCAGATGGTTCACATTAAGATTTGTCAGAAATACACGGCCTTGTCTTATGTCTTGTCGCGGTACTCGTCGATCGAGCTGCTGCCTGAGAATAAGGCTATACAGCTCTTGATCTTTCAGGGATACAATCCCTGGCAGGTCGGCCACTGGCTGTGCTGCGTGCTACACAAGACGGCCGGTAAACAGAATACCGTGTGCTTTTTCGGTCCGGCCAGCACCGGCAAGACAAATTTTGCCAAGGCTATAGTGAATGCCGTTAAGCTGTACGGATGTGTGAACCATCAGAATAAGAATTTTGTGTTTAACGACTGCGCGTCCAAGCTGGTCAATTGGTGGGAAGAGTGCCTCATGCACAACGATTGGGTAGAGCAGGCCAAGTGTCTGCTGGGAGGAACAGAGTTTAGGATCGACCGTAAGCATAAAGACTCTCAGCTACTGCCGCAGACTCCTGTTGTGATCAGTACCAATCACGACGTGTACACCGTGGTCGGTGGGAACACCACTACTATGGTTCACGCTAAACCGCTTCGGGAGAGGATCGTTCAATTTAATTTCATGAAACAACTCTCTTCCACGTTTGGGGAGATTGATCCTATGGATGTGGTGGCTCTGTTGCAAGCCTGCTCTTCTCGATTCGATGCGTCGCTCGACTCGTTTTACGCTCAGTGGCAGCTTCAGTGCACTCCTAACGATTTTCCTCTCGCTTCGTTCTGTGACGGCCATTCGCAGGATTTTGTCCTTCACGAGGTGGGCTTCTGCGACACGTGCGGTGGCTACGCTCCTCTGGAGACTACGGACCGCAGTCAGCCGCTGCCGGCTCGACCTACTTCGTCCGGTAAGTCTTTACTCTTTACCTGTATACTGCCTTAAATGTTCCATTTTCTATATGCTGTACTTGACTCTGTGCTTTTATTAGTGTCAGGTGTGAAACGTCGCCTGGACTTTGACCCGGATCCTGCTCCTTCCACGTCGACGGCTCCTCCGGCGAAGCGCCACTCCAAGGTGAGGCGTCCCGTGTTCCACGACGACTGGTGTAGTCAGCCGGTAGATCGCCTAGACCGCATCCGCTATGAAAAGTTCGTCGAGAGCGTCGTCGGCGCGTCAGACGAGTCACCATCGGAGCCGGAGTCGGAGTCCACGGGACTCACGCCTTCAGAGTGGGGAGAGATGCTCGGAGTCGTCTGCAAATCGCTGGAGGAAGAGCCGATCGTCTTACACTGCTTCGAAGACATCGCCTCTCTCTCGGAGACCGAAGACGACTCCGATGGAGGTCTTCAATCAACACCGCGCCAAAACAAAGACTGACATTTCAATGTGTGGCTTTTACTGGCACAGTACTCGCCTCGCGCGGTCGGGTACAGATTGGATCTTTAACAGTGGAAAGCCTCTGTTTCAATCTAAATGTTCTAATAATCTTGTGTCTTGGGATGTGGTTCGTGAGATTCTATTTGAATTTAAGAAAACTATAGATCAGAAATATAGAAATATGCTGTGGCACTTTGGTCGGGGTGGGTACTGTAATAAATGTGAGTACTGGGATAACGTGTACCTTGAACACTTGGCTAATGTAGACTCCTCTAATGATGTTGTTATGCAGGAGATAAGTGACGCTGAGATGCTGGAGGCTGCCATGGAGATTGATGGCGCCAGCGAATAGAAAGCCCGGTGGTTGGGTCGTGCCTGGCTATAAATATTTGGGTCCCTTTAACCCTGCTGACAACGGGGAACCTGTAAATTCTGCTGACGAGGCCGCTCGGTCTCATGATCTCGCCTATCAGTCCTATCTCGATGCTGGTGTAAACCCGTACTTTAGCTACAATAAAGCTGATTCTGATTTTATTGAGTCCTTGGCTCACGACTCTTCATTCGGCGGCTGGCTGGGGCGCTCGGCCTTTGGCCTCAAGAAATTGCTTGCGCCGCATCTCGCGGATACAAAGGGCAATCCTGACGCTCCGTCCACTTCACGGGCAGGTTCCTCTATATCCAAGTCAGACAGAGCACAAAAGAGAAAACTCTATTTTGCCAGATCAAACAAACAGGCCAAACAACAAAAGATGTCAGCTCCAGAAGCTCCGACCGAAGATGTGGCAGAACCGGGTCCATCTGGCTCCGATCCACGGGCAGGAGGAAATGGAGGTGGTGGAGGCATGGGAGGAGGTGGAGGACATGGAGTGGGAGTGAGCACCGGCGGGTGGAAGGCGGGGACCGTGTTTGGAAATGATTTTGTCATCACCACCAACACCAGACAGTGGTACGCTCCCATCTTTAACGGCCATGAATACAAACGCATGGCGCCGGGCGAGAATAGCGAACAGGCCACCAACAGACACTGGGTGGGCATCAGTACTCCATGGGGATATTTTAACTTTAACGAATACAGTTCGCATTTCTCGCCACAAGACTGGCAGCGTCTCACCAACGAATACAAGCGGTGGAGACCCAAGGCAATGAGGATCAAAGTATACAACCTGCAAATAAAACAAGTGGTCACTCTAGGGGCTGACACTTTATATAATAATGATCTAACGGCCGGCGTCCACATCTTTTGTGACGGGAGCCATCAGTTTCCGTACTCTCAGCATCCGTGGGACACCGGAACCATGCCCGAACTGCCTCATCGCATCTGGAGGATCTCGCAGTACGGGTACTTTCAACTACAATCTGACCTGACGGACGGGGGCGCATCATCCGAGAGGCCAGACGTCGAGAACCAAGAAAAACAGCTGCTAAAAAGTGCGCCGCTATACATGCTAGAGACGGCGTCGCACCAAGTGTTAAGAACTGGGGAGGAATCTAGCTTCTCTTTTTCATTTGACTGCGGGTGGGTTATCAACGATAAGGCGTACGCCATTCCACAGGCAGACTTTAACCCTCTAATTCACACCAGACGATACTTTCCTACACGAAACAATAACACCACAGCGTCAGGGGGCCTCATGTTTTATCACAGGTATAATCCATACAACAAACCAAGCAACTGGATGCCAGGGCCAAGCTTAGGTTATCTAGGATCAACACAAACATCAACCAATCCACAATATGCGCGTGGTCCGATTACCGTCGTCACGCAACCGCCAGGAACGACGGCACAAGGGGTCATTAGGGACGAGCAGTCGACTACAAACGTCCCGTCAGAGGCGACCATGCAAAATTCAGGGTACGACGTGAACCCTGTCAACTGCGGTAGCAGCAGATTAGACGCACACTCGCTTGCGTACGATTCGGGGCCAGAGAGTCGCGGGCAAAACATCATCACCGTAAGAGGAATAGATCTAGACATGGCCAGGTGGTCGTCTGTCATGGTGCAGGACGGAACAAAAACAGAAATTGGTACATCAACTGAAAGAAATAATTTTACAGAACTTAAAAACGTGTGGATGTACCCAAATCAGGCGTGGGACACCACTCCGATATCCAGGGACACTCCCATTTGGGTCAAAATTCCAAGAACAGACAGGCACACCATGCATGATACCTCGGATGGAACGCTGCCGATGGCGCATCCACCGGGAACCATCTTTGTTAGGGTCGCAAAGGTACCCATTCCGGGAGAGTCAGACTCTTACCTAAACCTATACGTCACGGGACAAATTACCTGTGAACTCTTATGGGAAACTGAACGCTTCCAAACCAAAAATTGGAGACCGGAAATCAAAAATGATCCTTCAATGTTTAGCGACCCTCTATTATACACTTT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| 97,234 |
JQ692591.1
|
Canine bocavirus
|
Lau,S.K., Woo,P.C., Yeung,H.C., Teng,J.L., Wu,Y., Bai,R., Fan,R.Y., Chan,K.H., Yuen,K.Y., Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Teng,J.L.L., Fan,R.Y.Y.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
China
|
2012-04-23
| null |
Canine bocavirus
|
Bocaparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,054 |
GenBank
| 1 |
Hong Kong
|
Hong Kong
|
Canis lupus familiaris
| null |
2010-01-22
| null | null |
Canine bocavirus strain HK831F, complete genome
|
TTTGTGATTGGTTGGCTTTTATGACTTTGGTTATGTTCATAGTTACTGATTAATGATTTTTGGGCCGGCTTACTAACTATATATATAAATGTGCTTCCTGCTTCCTGTCATTCTGCTTCCGGATTTCCTCCCGGTGACCTCTCCCTGCTCTATCTGGGGGTGAGTGATGGCTCTTGCTCTGGCCGGGGTCGACGATATCATTCACTTTGCTCGTCCTGCCTATACCTATGTTCTCAAATTTCCTTACGCTGAGTGGCGGCGGGATGAGGCTCGTATTCAGAGCGCTCTGGGGTACCCGCATCATGATTTACTCAAGGACTCGACTCCGTTCCTTACTATGCCGGGGCAAGATTCTCCGGCCGAGCAGGCTTCCTTTTTGGAGTCTAAGGGTCCTCAGTACGGATATGCCTTATTACTGGCACGCACGGCTCACGCTGTTGCATATTCTATATTCTCGCAGAAGCAGGGTAAATATCCTCCTGCTGCTAGCATATATGTTCAGTGTGAGCTGGGCATTAAGTACCTTCACGTACACGTCGTGATGGGCGGTGACGGCTTGAACCGGTACAACGCCAAGGCCACTTGCTCTAACCTGGCCTATAAGTGGCTGGACAATATTCAGTCTCAGCTCGAGATTAACGTCAAGACCGGTCACAACACCGACCTTGACATGTGCAATTCTCTCATTGGCTGCGTCTACCAGGCCAAGAGAGAGTGTTTTGACATGAGGACCGAGATTTGTACCATCCTGCAGTACAAGTGCCGGAACGGCGAGATGTACGCCTGCCGGGTCGATCCTATCGAGTTTATCTGTAACTACCTGTTGTGCAAAAACTTGAAATTCTTTTCTATGGTCGACCCTGACAGAGCAACTCCGTTTGTCTCTCACTTTGCCTGTTCTGGTAAAACGTACGCGGCTACGTTTGTCAATGGGAAGTGGGTCTTGCCTCAGGTTAGGAAGCAGTGGCTAAATTATCTTCGAGACTCTGTCTGTCAGAAGGCCGATCCCGTCTTTTCCGGCGACATGTTTGAAAACCTACCTAAGGTACCTCGCGCGACCTGGTCGGCAGACGTTTCCTCTAATAAGTCTAAAATCACTAAAAAGGAAACTCTGATGATTGACTGTATCGATCGCTGCGAAAAGAATCATTTGCTTACCTATGAAGATTTGGTCAATGAATGTTCTGATCTTGTAATCATGCTCGGCTCTCAGCCGGGCGGAACTAAACTGATTGAGACCTTGCTTCAGATGGTTCACATTAAGATTTGTCAGAAATATACGGCCTTGTCTTATGTCTTGTCGCGGTACTCGTCGATCGAGCTGCTGCCTGAAAATAAGGCTATACAGCTCTTGATCTTTCAGGGATACAATCCCTGGCAGGTCGGCCACTGGCTGTGCTGCGTGCTGCACAAGACGGCCGGTAAACAGAATACCGTGTGCTTTTTCGGGCCGGCCAGCACCGGCAAGACCAATTTTGCCAAGGCTATAGTAAATGCCGTTAAGCTGTACGGATGTGTGAACCATCAGAATAAGAATTTTGTGTTTAACGACTGCGCGTCCAAGCTGGTCAATTGGTGGGAAGAGTGCCTCATGCACAACGATTGGGTGGAGCAGGCCAAGTGTCTGCTGGGAGGAACGGAGTTTAGGATCGACCGTAAGCATAAAGACTCTCAGCTGCTGCCGCAGACTCCTGTTGTGATCAGTACCAATCACGACGTGTACACCGTGGTCGGTGGGAACACCACTACTATGGTTCACGCTAAACCGCTTCGGGAGAGGATCGTTCAGTTTAATTTCATGAAACAACTGTCTTCCACATTTGGGGAGATTGATCCTATGGATGTGGTGGCTCTGTTGCAAGCCTGCTCCTCTCGATTCGATGCGTCGCTCGACTCGTTTTACGCTCAATGGCAGCTTCAGTGCACTCCTAACGATTTTCCTCTCGCTTCGTTCTGTGACGGCCATTCGCAGGATTTCGTCCTTCACGAGGTGGGCTTCTGCGACACGTGCGGTGGCTACGCTCCTCTGGAGACTACGGACCGCAGTCAGCCGCTGCCGGCTCGACCTACTTCGTCCAGTGAGTCTTTACTCTCTGCCTGAATACTGCCTTAAATGTTCCATTTTCCGTGTGCTGTACTTGACTCTATGCTCTTGTTGGTATCAGGTGTGAAGCGTCGCCTGGACTTTGACCAGGATCCTGCTCCTTCCACGTCGACGGCTCCTCCGGCGAAACGCCACTCCAAGGTGAGGCGTCCCGTGTTTCACGACGACTGGTGTAGTCAGCCGGTAGATCGCCTAGACCGCATCCGCTATGAAAAGTTCGTCGAGAGCGTCGTCGGCGCGTCATACGAGTCACCATCGGAGCCGGAGTCGGAGTCCACGGGACTCACGCCTTCAGAGTGGGGAGAGATGCTCGGAGTCGTCTGCAAGTCGCTGGAGGAAGAGCCGATCGTCTTACACTGCTTCGAAGACATCGCCTCTCTCTCGGAGACCGAAGACGACTCCGATGGAGGTCTTCAATCAACACCGCGCCAAAACAAAGACTGACATTTCAATGTGTGGCTTTTACTGGCACAGTACTCGCCTCGCGCGGTCGGGTACAGACTGGATCTTTAACAGTGGAAAACCTCTGTTTCAATCTAAATGTTCTAATAATCTTGTGTCTTGGGATGTGGTTCGTGAGATTCTATTTGAATTTAAAAAAACTATAGATCAAAAATATAGAAATATGCTGTGGCACTTTGGCCGGGGTGGGTACTGTAATAAATGTGAGTACTGGGATAATGTGTACCTTGAACACTTGGCTAATGTAGACTCCTCTAATGATGTTGTTATGCAGGAGATAAGTGACGCTGAGATGCTGGAGGCTGCCATGGAGATTGATGGCGCCAGCGAATAGAAAGCCCGGTGGTTGGGTCGTGCCTGGCTATAAATATTTGGGTCCCTTTAACCCTACTGACAACGGGGAACCTGTAAATTCTGCTGACGAGGCCGCTCGGTCTCATGATCTCGCCTATCAGTCCTATCTCGATGCTGGTGTAAATCCGTACTTTAGCTACAATAAAGCTGATTCTGATTTTATTGAGTCCTTGGCTCACGACTCTTCATTCGGCGGCTGGCTGGGRCGCTCGGCCTTTGGCCTCAAGAAATTGCTTGCGCCGCATCTCGCGGATACAAAGGGCAATCCTGACGCTCCGTCCACCTCGAGGGCGGRTTCCTCTATATCCAAGTCAGACAGAGCACAAAAGAGAAAACTCTATTTTGCCAGATCAAACAAACAGGCCAAACAACAAAAGATGTCAGCTCCAGAAGCTCCAACCGAAGATGTGGCAGAACCGGGTCCATCTGGCTCCGATCCGCGGGCAGGAGGAAATGGAGGTGGTGGAGGCATGGGAGGAGGTGGAGGACATGGAGTGGGAGTGAGCACCGGAGGGTGGAAGGCGGGGACCGTATTTGGAAATGATTTTGTCATCACCACCAACACCAGACAGTGGTTCGCTCCCATCTTTAACGGTCATGAATATAAACGAATGTCACCGGGCGAAAATAGCGAGCAGGCCACCAACAGGCACTGGGTGGGAATCAGTACTCCATGGGGATATTTTAACTTTAACGAGTACAGTTCGCATTTTTCGCCACAAGACTGGCAGCGTCTCACCAACGAATACAAACGATGGAGACCCAAGGCGATGAGAATCAAAGTATACAACCTGCAGATAAAACAGGTAGTCACTTTGGGGTCTGATACTCTATACAATAATGACCTAACTGCCGGCGTTCACATCTTTTGTGACGGAAGCCATCAGTTTCCGTACTCTCAGCATCCGTGGGACACCGGGACCATGCCCGAACTGCCTCATCGCATCTGGAGAATTTCACAATACGGGTACTTTCAGCTACAGGCTGACCTGACAGATGGGGGCGCATCATCAGAGACACCAGACGTCCAAAACCAAGAAAAACAGCTGCTAAAAAGTGCGCCGCTGTATATGCTCGAAACGGCGTCGCACCAAGTATTAAGAACGGGAGAGGAATCCAGCTTTTCTTTCACGTTTGACAGCGGGTGGGTTATCAACGACAAGGCGTACGCCATTCCACAGGCAGACTTTAACCCTCTGATTCACACCAGACGATACTTTCCTACACGAAACAACACCACAGGGGCAGGGGGACTTATGTTTTATCACAGATATAATCCATACAACAAACCGAGCAGCTGGATGCCGGGGCCAAGCTTAGGCTACCTGGGGGCGACACAGACGTCAACCAATCCACAATATGCGCGTGGTCCGATTACTGTCGTCACGCAACCGCCAGGAACGATGGCACAAAGCGCCGAACGGGACGAGCAATCAACTACATTTGTCCCGTCAAAGGCGACCATGCAAAATTCAGGGTACGACGTGAACCCTGTCAACTGTGGTAGCAGCAGATTAGACGCGCACTCGCTCGCATACGATTCGGGGCCAGAGAGTCGAGGACAAAACATCATCACCGTGAGGGGGATAGATTTAGATATGGCCAGGTGGTCGTCTGTCATGGTGCAGGACGGAACAAAAACAGAAGTTGGTACCCAAAATCCTAGAACTAATTTTACAGAACTTAAAAACGTGTGGATGTACCCAAATCAGGCGTGGGACACCACTCCGATATCCAGGGACACTCCCATTTGGGTCAAAATTCCAAGAACAGACAGGCACACCATGCAAGACACATCGGACGGAACGCTGCCAATGGCGCATCCGCCGGGAACCATATTTGTCAGGGTCGCAAAAGTGCCCATTCCGGGGGAGTCAGACTCTTATTTGAACCTATATGTCACGGGACAAATCACCTGCGAACTCTTATGGGAAGCTGAAAGATACCAAACCAAAAATTGGAGACCAGAAATCAAAAATGATCCTTCCGTGTTTAGCGACCCTCTATTGTACACTTTCAACGCACAAGGGGTCTACAATACTCCAGAAACATTCATTGAGGGCATGCCCACTAAACGGGGAATAAACAGGGTACTGTAACTTTAAGACACAATAAAGCCATAAAACGAAAACTT
| 97,235 |
OQ540908.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191134SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,826 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191134SY, complete genome
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| 13,142 |
OQ540909.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191128SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,825 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191128SY, complete genome
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| 13,143 |
OQ540910.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191101SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,829 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191101SY, complete genome
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| 13,144 |
OQ540911.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191102SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,712 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191102SY, complete genome
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| 13,145 |
OQ540912.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191106SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,362 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191106SY, complete genome
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Canine coronavirus
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Liu,Y.
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Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
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China
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2023-08-31
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VuCCoV_191118SY
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Alphacoronavirus 1
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,368 |
GenBank
| null |
China
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China
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Vulpes
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feces
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2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191118SY, complete genome
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GACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATATCTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTTTCTATGCAACCATAGAGGACAAGCGTTGATTATTTCCAACCAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGCGAACGGTGCAGTAGGGTTCCGTCCCTATTTCGTAAGTCGCCTAGTAGTAGCGCGTGCGGTTCCGCCCGTACYCGTTGGTGAGCTCAGGTTCCGTCCTGTAYCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTCAAGATCCTCGTCAAYGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTATCCGYGACGTGTTACAGGAAATTAAGTACTGTTAYCGTAATGGATTYGAGGGCTATGTTTTCGTGCCAGAATACTGTCGTGACCTAGTTGATTGCAATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTTGGTAACGGAGTAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTYACCGAACCCTCCGTCATGYTGCAAGGCTTTATTGTTAGAGCTAACTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATCGCTCGTACTGGAAGAGGTGCYATATATGTTGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAGGGTGAGTTTAAGGATTAYTTCGGTGATGAGGACATYATTGAATTTGAAGGAGAGGAGTACCATTGCGCTTGGACAACTGTGCGCGATGAGAAACCGCTGAACCAGCAAACTCTCTTTACCATACAGGAAATCCAATACAATCTGGACATTCCWCACAAATTGCCAAATTGTGCTACTAGACATGTAGCACCGCCAGTCAAAAAGAACTCTAAAATAGTTCTGTCTGAAGATTACAAGAAGCTTTATGAAATCTTCGGATCACCTTTTATGGGAAATGGTGACTGTCTTAGCAAATGCTTTGACACTCTTCATTTTATTGCTGCTACTCTTAGATGCCCATGTGGTGCTGAGAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTGTTGGCAAAGTTAAAGGTGTCACTTTAGGTGATGTAAAACCTGGTGATGCTGTTATTACTAGCATGAGCGCAGGTAAGGGTGTTAAATTCTTTGCCAATTGTGTTCTCCAACATGCTGGTGATGTTGAAAACGTCTCAGTCTGGAAAGTGATTAAAACTTTTACGGTTGATGAGACTGTTTGCACCCCTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCTGAGAGTAAGTCACCAACTGCATGCAGCATTAAGAGAGCATTCATTACTGGTGAAATTGATGACGCTGTACATGATTGTATCATTACAGGAAAGTTGGATCTTAGTACCAACCTTTTTGGTAATGTTGGTCTATTATTCAGGAAAACTCCATGGTTTGTACAAAAGTGTGGTGCACTTTTTGTAGATGCTTGGAAAGTAGTAGAGGAGCTACTTGGTTCACTCAAACTTACTTACAAGCAGATTTACGAAGTTGTAGCATCACTTTGCACTTCTGCTTTCACGATTGTAGATTACAAACCAATGTTTGTAGTYTCAGACAACCGTGTTAAAGATCTTGTTGACAAGTGTGTGAAGATTCTTATGAAAGCATTTGATGTTTTCACTCAGACTATCACAATTGCTGGTATTGAGGCCAAATGTTTTGTGCTTGGCGCTAAATACCTGTTATTCAACAATGCACTTGTTAAACTTGTCAGTGTTAAATTACTTGGTAAGAAACAAAARGGTCTTGAAAGTGCCTTCTTTGCTACCAGCTTAGTTGGTGCAACTATTAATGTGACACCAAAACGGACTGAGACTGCCAACATCAGCTTGAATAAGGTTGATGATGTGGTGACACCAGGAGAGGGTTATATTGTTATTATTGGTGATATGGCTTTCTACAAGAGTGGTGAATACTACTTCATGATGGCTAGTCCCGATTCTGTTCTTATTAACAATGTTTTTAAAGCAGCTAGAGTTTCATCTTATGACATCATGTATGATGTTGATGATGACACCAAGAACAAGATGACTGCAAAACTTGGTTTATCATTTGAATATGATGGTGACATCGAAGCTGCTATTGTGAAATTTAATGAATTACTCGCTGAATTTAGGCAGCAGAATTTGTGTTTTAGAGCTCTTAAAGGGAACAAAAGCATTTTTGTTGAAGCTTATCTTAAAAAGTACAAAATGCCTGCATGCCTTAAAAGCCATATTGGTTTGTGGAACATCATAAAGAAAGATTCATGTAAGAAGGGTTTTCTTAGTCTCTTCAATCACTTGAATGAATTGGCAGATATCAAAGAAACCAATGTTCAGGCTATTAAAAAYATTCTTTGTCCTGATCTTCTTCTTGATCTAGATTATGGTGCCATTTGGTACAAGTGCATGCCAAGTTGCTCTGATCCTTCAGTGTTGGGGAGTGTCCAACTTTTGATTGGCAATGGTGTGAAAGTAGTTTGTGATGGCTGCAAAGTTTTTGCTAACCAACTTTCAAATGGTTACAATAAGCTCTGTAATGCTGCTCGTACTGACATTGAGATYGGTGGTATACCATTTTCTACTTTCAAAACACCCACAAAYACTTTTATTGAAATGACAGATGCTATCTACTCAGTTATTGAACAAGGTAAGGCATTATCCTTYGGAAATGCTGATGTGCCAGTTGTAGAYAATGGTACCATTTCTACTGATGACTGGTCAGAACCCATTTTGCTTGARCCTGCTGAATATGTGAAACCCAARAACAATGGTAATATCATTGTTATTGCWGGTTACACATTTTATAARGATGAGGATGAACATTTCTATCCTTATGGTTCAGGTATGGTCGTACAGAAAATGTAYAATAAAATGGGTGGTGGTGACAAAACAGTATCATTTGCAGAAGAAGTAGATGTTCAAGARATTGCACCTGTTACACGTGTTAAACTTGAATTTGAGTTTGACAATGAAATTGTAACTAGTGTTCTTGARCAAGCTATTGGCACCAAATACAARTTCACTGGTACAACTTGGGAAGAATTTGAAGATTCTATTTCTGAAGAACTTGATGTAATTTTTGACACTCTAGCAAACCAAGGTGTCGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACTTGTGGTGGTTTTGATATCAGAAACCCAGATGGTATTATGATTTCTCARTATGACATCAATAATACTACTGATGACAAATCTGAATCTGGTACATCAAGTGACGAAGAAGAAGTTGAATCTGTTGAAGAAGACTCTGAACAGAAGATTGTAGAGGCATCTGAAATTATTGATGAAACCCCTATTCAGGAAGTGGTTGAAACGGTAGAAGTTGAAGATGTCACTTCTACAGAAGATGTTGAAATTGTTGAAGTATCTGCTAAGGATGACCCATGGGCTGCKGCTGTTGATGTACAAGAAGCTGAACAAMTTAAACCTTCTTTACCACCTTTCAAGACAACAAATCTCAATAGCAAAATTATCATTAAACAACARGATAACAATTGTTGGATAAATGCTTGTTGCTATCARCTTCAGGCYTTTGATTTTTTCAACAATGAAGCTTGGGARAAATTCAAGAAAGGTGATGTTATGGATTTTGTAAACCTTTGTTATGCAGCMACAACRCTTGAAAGAGGTCATTCTGGTGATGCAGAATATCTTCTTGAACTTATGCTCAATGATTATAGCACAGCCAAAATAGTACTTGCTGCTAAGTGTGGTTGTGGTGAAAAAGAAATTGTTTTGGAAAGAACYGTATTCAAACTCACTCCHTTAAAGGATAAGTTTAAATACGGTGTTTGTGGTGATTGTATGCARGTTAATGATTGTGAATTTCTTAGTGTTGAAGGCTCTGGTGTTTTTGTTCATGATATAATGAAARATACACAATCAAAGAGCAAATTTATTGTTAAGCCGATTATGCATGCAGTATACACTGGCACAACTCAAAATGGTCATTACATGGTTGATGACATTGAACATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGTATTAAGCCACTTAAGAAAAGATTTTATACATCCACACTATTTATCAACGCTAATGTAAAAACTAGAGTTGAAAGACCAAAACAACAACTTAAAGTTGAAAAAGTAGAACAGCAACCAGAAGTAGAAGAAAAGAAACCTTCAATTGAAAAAGAGGAAGTTCAAAGTCCTAAAAATGATGATCTCATACTTCCATTTTACAAAGCTGGTAAACTTTCCTTTTAYCAGGGTGATTTGGATGTCTTGATCAATTTCTTGGAACCTGATGTCATTGTTAATGCTGCCAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGTGTCGCAAGAGCCATCGATGTGTTCACTAGTGGCAAATTAACAGAACGTTCTAAGGATTACCTTAAAAAGAACAAATCTATTGCTCCTGGTAACGCTGTTTTCTTTGAAAATGTCATTGAGCATCTTAGTGTTTTGAATGCAGTTGGACCACGTAATGGTGACAGCCGAGTTGAGGCAAAACTTAACAATGTTTACAAAGCAATTGCAAAATGTGAAGGAAAAATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATCTTCAGTGTTAAACTTGAAACATCATTGCAGTGCTTACTTAAGACTGTGAATGACAGAGAATTGCATGTCTTCGTGTACACTGACCAGGAGAGACAAGCCGTTGAGAACTTTTTCTCTGGTTCCATCCCTGTCAAAGTTACTGAAGATAATGTCAACCATGAACGTGTGTCTGTTTCTTTTGATAAAACATATGGTGAACAACTTAAAGGCACCGTGGTTATTAAAGACAAGGATGTTACAAACCAGTTGCCTAGTGCTTTTGATGTTGGGCAAAAAGTTGTTAAGGCTATTGACTTAGATTGGCAAGCKCATTATGGTTTCCATGATGCTGCTGCCTTCAGTGCTAGTA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Canine coronavirus
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Liu,Y.
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Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
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China
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2023-08-31
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VuCCoV_191133SY
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Alphacoronavirus 1
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,363 |
GenBank
| null |
China
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China
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Vulpes
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feces
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2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191133SY, complete genome
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GACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATATCTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTTTCTATGCAACCATAGAGGACAAGCGTTGATTATTTCCAACCAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGCGAACGGTGCAGTAGGGTTCCGTCCCTATTTCGTAAGTCGCCTAGTAGTAGCGAGTGCGGTTCCGCCCGTACAACGTTGGTGAGCTCAGGTTCCGTCCTGTGATCTCCCTCGCCGKCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTYAAGATCCTCGTCAAYGAGGACTAYCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTATYCGYGACGTGTTACAGGAAATTAAGTACTGTTACCGTAATGGATTYGAGGGCTATGTTTTCGTACCAGAATACTGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTTGGTAACGGAATAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTYACCGAACCCTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATTGTTAGAGCTAAYTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATYGCTCGTACTGGAAGRGGTGCTATATATGTTGAYCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTCATTGAAGGTGATTTTAAGGAYTACTTCGGTGATGAGGACATYATYGAATTTGAAGGGGAGGAGTATCATTGCGCTTGGACAACAGTGCGCGATGAGAAACCGCTGAATCAGCAAACTCTCTTTACCATTCAGGAAATCCAATACAATCTGGACATTCCTCACAAACTGCCAAACTGTGCTACTAGACATGTAGCACCGCCAGTCAAAAAGAACTCTAAAATAGTTCTGTCTGAAGATTACAAGAAGCTCTATGAAATCTTCGGGTCACCCTTTATGGGAAATGGTGACTGTCTTAGCAAGTGCTTTGACACTCTTCATTTTATCGCTGCCACTCTTAGGTGCCCATGTGGTGCTGAGAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTGTTGGCAAAGTTAAAGGTGTCACTTTAGGTGATGTAAAACCTGGTGACGCTGTTATTACTAGCATGAGCGCAGGTAAGGGTGTTAAATTCTTTGCCAATTGTGTTCTACAACATGCTGGTGATGTTGAAAACGTCTCAGTCTGGAAAGTGATTAAAACTTTTACGGTTGATGAGACTGTYTGCACTCCTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGCCTTCATCAAACCTGAGAGTAARTCACCAACTGCATGCAGCATTAAGAGAGCATTCATTACTGGTGAAATTGATGATGCTGTACATGATTGTATCATTACAGGAAAGTTGGATCTTAGTACCAACCTTTTTGGTAATGTTGGTCTATTATTCAGGAAAACTCCATGGTTTGTACAAAAGTGTGGTGCACTTTTTGTAGATGCTTGGAAGGTAGTAGAGGAGCTACTTGGTTCACTCAAGCTTACTTACACGCAGATTTACGAAGTTGTAGCATCACTTTGCACTTCTGCTTTCACGATTGTAGATTACAAACCAATGTTTGTAGTCTCAGACAACCGTGTTAAAGATCTTGTTGACAAGTGTGTGAAGATTCTTATGAAAGCATTTGATGTTTTCACTCAGACTATCACAATTGCTGGTATTGAGGCCAAATGTTTTGTGCTTGGCGCTAAATACCTGTTATTCAACAATGCACTTGTTAAACTTGTCAGTGTTAAATTACTTGGTAAGAAACAAAAAGGTCTTGAAAGTGCCTTCTTTGCTACCAGCTTAGTTGGTGCAACTATTAATGTGACACCAAAACGGACTGAGACTGCCAACATCAGCTTGAATAAGGTTGATGATGTGGTGACACCAGGAGAGGGTTATATTGTTATTATTGGTGATATGGCTTTCTACAAGAGTGGTGAGTACTATTTTATTATGGATAGTCCCGACTCTGTTCTTATTAACAATGTCTTCAAAGCAGCAAGAGTTCCATCTTATGATATTGTTTATGATGTCGATGATGACACCAAAAGCAAAATGATTGCAAAATTTGGCTCATCATTTGAATATGATGGTGACATTGATGCTGCTATTGTAAAAGTCAATGAATTACTCATTGAATTTAAACAGCAAAATTTATGTTTCAGAGCTCTTAAAGAAGACAAAAGCATTTTTGTTGAAGCTTTTCTTAAAAAGTACAAAATGCCTACATGTCTTGCAAAACATATTGGTTTGTGGAGCATCATAAAGAAAGATTCATGTAAGAAGGGTTTTCTTAGTCTCTTCAATCACTTGAATGAATTGGAAGATATCAAAGAAACCAATGTTCAGGCTATTAAAAACGTTCTTTGTCCTGATCTTCTTCTTGATCTAGATTATGGTGCCATTTGGTACAAGTGCATGCCAAGTTGCTCTGATCCTTCAGTGTTGGGGAGTGTCCAACTTTTGATTGGCAATGGTGTGAAAGTAGTTTGTGATGGCTGCAAAGTTTTTGCTAACCAACTTTCAAATGGTTACAATAAGCTCTGTAATGCTGATCGTACTGACATTGAGATCGGTGGTATACCATTTTCTACTTTCAAAACACCCACAAAYACTTTTATTGAAATGACAGATGCTATCTACTCAGTTATTGAACAAGGTAAGGCATTATCCTTYGGAAATGCTGATGTGCCAGTTGTAGATAATGGTACCATTTCTACTGATGACTGGTCAGAACCCMTTTTGCTTGAGCCTGCTGAATATGTGAAACCCAAAAACAATGGYAATATCATTGTTATTGCTGGTTACACATTTTATAAGGATGAGGAYGAACATTTCTATCCTTATGGTTCAGGTATGGTCGTACAGAAAATGTACAATAAAATGGGTGGTGGTGACAAAACAGTRTCATTTGCAGAAGAAGTAGATGTTCAAGAGATTGCACCTGTTACACGTGTTAAACTTGAATTTGARTTTGACAATGAAATTGTAACTAGTGTTCTTGAGCAAGCTATTGGCACCAAATACAAGTTCACTGGTACAACYTGGGAAGAATTTGAAGATTCTATTTCTGAAGAACTTGATGTAATTTTTGACACTCTAGCAAACCAAGGTGTCGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACTTGTGGTGGTTTTGATATCAAAAACCCAGATGGTATTATGATTTCTCAGTATGACATCAATAATACTACTGATGAAAAATCAGAATCTGGTACATCAAGCGAAGAGGAAGAAATTGAATCTGCTGAAGAAGACGCTGAACATGAAATTGTAGATGCATCCGAAACTGTTGAGGAAACCTCCATTCAGGAGGAGGTTGAAACAGTAGAAGTTGAAGATGTCACTTCTACAGAAGATGTTGAAATTGTCGAAGTGTCTGCTAAAGATGACCCATGGGCWGCTGCTGTWGATGTACAAGAAGCTGAACAAATTAAACCTTCYTTACCACCTTTCAAGACAAAAAATCTCAATGGCAAAATTATCCTTAAACAACAGGATAACAATTGTTGGATAAATGCTTGTTGCTATCAGCTTCAGGCYTTTGATTTTTTCAACAATGAAGCTTGGGARAAATTYAAGAAAGGTGATGTTATGGATTTTGTAAACCTTTGTTATGCAGCMACAACRCTWGARAGAGGTCATTCTGGTGATGCAGAATATCTTCTTGAACTTATGCTCAATGATTATAGCACAGCCAAAATAGTACTTGCTGCTAAGTGTGGTTGTGGTGAAAAAGAAATTGTTTTGGAAAGAACTGTTTTTAAGCTCACTCCATTTAAAGAGAAGTTTAAATACGGTGTTTGTGGTGATTGCATGCAAGTTAATACTTGTAAATTTTTAAGTGTTGACGGTTCTGGTGTTTTTGTCCATGATATAATGAAAGATACACAAAAGAGCAAATTTATTGTTAAACCTGTTATGCATGCAGTGTACACTGGCACAACTCAAAATGGTCATTACATGGTTGATGATATTGAACATGATTACTGTGTGGATGGTATGGGTATTAAGCCACTTAAGAGAAGATATTATACATCCACTCTATTTATCAATGCTAATGTAATGACTAGAGTTGAAAAACCAAAACAAGAATCTAAAGTTGAAAAAGTAGAACAGCAACCAGAAGTAGAAGAAAAGAAACCTTCAATTGAAAARGAGGAAGTTCAAAGTCCTAAAAACGATGAYCTCATACTTCCATTTTACAAAGCTGGTAAACTTTCCTTTTATCAGGGTGAYTTGGATGTCTTGATCAACTTCTTGGAACCTGATGTCATTGTTAATGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGTGTCGCAAGAGCCATTGATGTGTTCACTGGTGGTAAATTAACAGAATGTTCTAAGGATTATCTTAAGAARAACAAATCTATTGCTCCTGGTAATGCTGTTTTCTTTGAAAATGTCATTGAGCATCTTAGTGTCTTGAATGCAGTTGGACCACGTAATGGTGACAGCCGAGTTGAGGCCAAACTTAACAATGTTTACAAAGCAATTGCAAAATGTGAAGGAAAAATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATTTTYAGTGTTAAGCTTGAAACATCATTGCAATGCCTACTTAAGACTGTGAATGATAGAGAATTGCATGTCTTCGTGTACACTGATCAAGAGAGACAAGCCATTGAGAACTTTTTCTCTGGTTCCATTCCTGTCAAAGTTACTGAAGACAATGTCAACCATGAGCGTGTGTCTGTTTCTTTTGATAAAACATAYGGTGAACAACTTAAAGGCACCGTGGTTATTAAAGACAAGGATGTTACAAACCAGTTGCCTAGTGCTTTTGATGTTGGGCAAAAAGTTGTTAAGGCTATTGACTTAGATTGGCAAGCGCATTATGGTTTCCATGATGCTGCTGCTTTCAGTGCTAGTAG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OQ540915.1
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Canine coronavirus
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Liu,Y.
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Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
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China
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2023-08-31
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VuCCoV_191140SY
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Alphacoronavirus 1
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,263 |
GenBank
| null |
China
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China
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Vulpes
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feces
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2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191140SY, complete genome
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ACATGGGGACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATATCTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTTTCTATGCAACCATAGAGGACAAGCGTTGATTATTTCCAACCAGTTTGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGCGAACGGTGCAGTAGGGTTCCGTCCCTATTTCGTAAGTCGCCTAGTAGTAGCGCGTGCGGTTCCGCCCGTACCCGTTGGGATACCAGGTTCCGTCCTGYGACTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTYAAGATCCTCGTCAATGAGGACTAYCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTATTCGTGACGTGTTACAGGAAATTAAGTACTGTTAYCGTAATGGATTYGAGGGCTATGTTTTCGTGCCAGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTTGGTAACGGAGTAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTTACCGAACCCTCCGTCATGCTGCAAGGCTTTATTGTTAGGGCCAACTGCAATGGCGTACTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCTCGTACTGGAAGAGGTGCYATATATGTTGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAGGGTGATTTTAAGGATTAYTTCGGTGATGAGGACATYATTGAATTTGAAGGAGAGGAGTACCATTGCGCTTGGACAACTGTGCGYGATGAGAAACCGCTGAATCAGCAAACTCTCTTTACTATTAAGGAAATCCAATACAATCTGGACATTCCTCACAAATTGCCAAACTGTGCTACTAGACATGTAGCACCACCAGTCAAAACGAACTCTAAAATAGTTCTGTCTGAAGATTATAAGAAACTTTATGATATCTTCGGRTCACCCTTTATGGGGAATGGTGACTGTCTTAGCAAATGCTTTGACACTCTTCATTTTATTGCTGCTACTCTTAGATGCCCATGTGGTGCTGAGAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTGTTGGCAAAGTTAAAGGTGTCACTTTAGGTGATGTAAAACCTGGTGATGCTGTTATTACTAGCATGAGCGCAGGTAAGGGTGTTAAATTCTTTGCCAATTGTGTTCTCCAACATGCTGGTGATGTTGAAAACGTMTCAGTCTGGAAAGTGATTAAAACTTTTACGGTTGATGAGACTGTTTGCACCCCTGATTTTGGAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCTGAGAGTAAGTCACCAACTGCATGCAGCATTAAGAGAGCATTCATTACTGGTGAAATTGATGACGCTGTACATGATTGTATCATTACAGGAAAGTTGGATCTTAGTACCAACCTTTTTGGTAATGTTGGTCTATTATTCAGGAAAACTCCATGGTTTGTACAAAAGTGTGGTGCACTTTTTGTAGATGCTTGGAAAGTAGTAGAGGAGCTACTTGGTTCACTCAAACTTACTTACAAGCAGATTTACGAAGTTGTAGCATCACTTTGCACTTCTGCTTTCACGATTGTAGATTACAAACCAATGTTTGTAGTCTCAGACAACCGTGTTAAAGATCTTGTTGACAAGTGTGTGAAGATTCTTATGAAAGCATTTGATGTTTTCACTCAGACTATCACAATTGCTGGTATTGAGGCCAAATGTTTTGTGCTTGGCGCTAAATACCTGTTATTCAACAATGCACTTGTTAAACTTGTCAGTGTTAAATTACTTGGTAAGAAACAAAAAGGTCTTGAAAGTGCCTTCTTTGCTACCAGCTTAGTTGGTGCAACTATTAATGTGACACCAAAACGGACTGAGACTGCCAACATCAGCTTGAATAAGGTTGATGATGTGGTGACACCAGGAGAGGGTTATATTGTTATTATTGGTGATATGGCTTTCTACAAGAGTGGTGAGTACTATTTTATTATGGCTAGTCCCGACTCTGTTCTTATTAACAAYGTCTTCAAAGCAGCAAGAGTTCCATCTTATGATATTGTTTATGATGTCGATGATGACACCAAAAGCAAAATGATTGCAAAATTTGGCTCATCATTTGAATATGATGGTGACATTGATGCTGCTATTGTAAAAGTCAATGAATTACTCATTGAATTTAAACAGCAAAACTTRTGTTTCAGAGCTCTTAAAGARGACAAAAGCATTTTTGTTGAAGCTTATCTTAAAAAGTACAAAATGCCTGCATGCCTTACAAAACACGTTGGTTTGTGGAACATYATAAAGAAAGATTCATGTAAGAAGGGTTTTCTTAGTCTCTTCAATCACTTGAATGAATTGGAAGATATCAAAGAAACCAATGTTCAGGCTATTAAAAACATTCTTTGTCCTGATCTTCTTCTTGATCTAGATTATGGTGCCATTTGGTACAAGTGCATGCCAAGTTGCTCTGATCCTTCAGTGTTGGGGAGTGTCCAACTTTTGATTGGCAATGGTGTGAAAGTAGTTTGTGATGGCTGCAAAGTTTTTGCTAACCAACTTTCAAATGGTTACAATAAGCTCTGTAATGCTGCTCGTACTGACATTGAGATCGGTGGTATACCATTTTCTACTTTCAAAACACCCACAAAYACTTTTATTGAAATGACAGATGCTATCTACTCAGTTATTGAACAAGGTAAGGCATTATCCTTYGGAAATGCTGATGTGCCAGTTGTAGAYAATGGTACCATTTCTACTGATGACTGGTCAGAACCCATTTTGCTTGAGCCTGCTGAATATGTGAAACCCAAAAACAATGGYAATATCATTGTTATTGCTGGTTACACATTTTATAAGGATGAGGATGAACATTTCTATCCTTATGGTTCAGGTATGGTCGTACAGAAAATGTACAATAAAATGGGTGGTGGTGACAAAACAGTATCATTTGCAGAAGAAGTAGATGTTCAAGAGATTGCACCTGTTACACGTGTTAAACTTGAATTTGAGTTTGACAATGAAATTGTAACTAGTGTTCTTGAGCAAGCTATTGGCACCAAATACAAGTTCACTGGTACAACTTGGGAAGAATTTGAAGATTCTATTTCTGAAGAACTTGATGTAATTTTTGATACTCTAGCAAACCAAGGTGTCGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACTTGTGGTGGTTTTGAAATCAAAAACCCAGATGGTATTATGATTTCTCAGTATGACATCAATAATACTACTGATGAAAAATCAGAATCTGGTACATCAAGCGAAGAGGAAGAAATTGAATCTGCTGAAGAAGACTCTGAACATGAAATTGTAGATGCATCCGAAACTGTTGAGGAAACCTCCATTCAGGAAGAGGTTGAAACAGTRGAAGTTGAAGATGTCACTTCTACAGAAGATGTTGAAATTGTTGAAGTGTCTGCTAAAGATGACCCATGGGCTGCAGCTGTTGATGTACAAGAAGCTGAACAAATTAAACCTTCTTTACCACCTTTCAAGACAACAAATCTCAATGGCAAAATTATCCTTAAACAACAGGATAACAATTGTTGGATAAATGCTTGTTGCTATCAGCTTCAGGCCTTTGATTTTTTCAACAATGAAGCTTGGGAAAAATTTAAGAAAGGTGATGTTATGGATTTTGTAAACCTTTGTTATGCAGCCACAACACTYGAAAGAGGTCATTCTGGTGATGCAGAATATCTTCTTGAACTTATGCTCAATGATTATAGCACAGCCAAAATAGTACTTGTTGCTAAGTGTGGTTGTGGTGAAAAAGAAATTGTTTTGGAAAGAACTGTATTTAAGCTCACTCCAATCAAAAAGACTTTTAAATATGGTGTTTGTGGTGATTGCATGCAAGTTAATATTTGTAAATTTTTAAGTGTTAAAGGTTCTGGTGTTTTTGTTCATGATATGTTAGAAAAGCAAAGATCAGAAGCGATGTTTATTGTTAAACCTATTATGCATGCAGTATACACTGGAACAACTCAAAATGGTCATTATATGGTTGATGACATCGAATACGGTTATTGTGTGGATGGTGTGAGTATTAAGCCACTTAAGAAACGTTACTATACATCTACATTGTTCATCAATGCCAATGTAATGACTAGAGCTGAAAAACCAAAACAAGAATCTAAAGTTGAAAAAGTAGAACAGCAACCAGAAGTAGAAGAAAAGAAACCTTCAATTGAAAAAGAGGAAGTTCAAAGTCCTAAAAATGATGATCTCATACTTCCATTTTACAAAGCTGGTAAACTTTCCTTTTATCAGGGTGATTTGGAAGTTTTGATCAACTTCTTGGAACCTGATGTCATTGTTAATGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGTGTCGCAAGAGCCATTGATGTGTTCACTGGTGGTAAATTAACAGAACGTTCTAAGGATTATCTTAAGAAGAACAAATCTATTGCTCCTGGTAACGCTGTTTTCTTTGAAAATGTCATTGAGCATCTTAGTGTTTTGAATGCAGTTGGACCACGTAATGGTGACAGTCGAGTTGAGGCCAAGCTTAACAATGTTTACAAAGCAATTGCAAAATGTGAAGGAAAAATACTAACACCACTTATTAGTGTTGGTATTTTTAGTGTTAAGCTTGAAACATCATTGCAATGCCTACTTAAGACTGTGAATGATAGAGAATTGCATGTCTTCGTATACACTGATCAAGAGAGACAAGCCATTGAGAACTTTTTCTCTGGTTCCATTCCTGTCAAAGTTACTGAAGACAATGTCAACCATGAGCGTGTGTCTGTTTCTTTTGATAAAACATAYGGTGAACAACTTAAAGGCACCGTGGTTATTAAAGACAAGGATGTTACAAACCAGTTGCCTAGTGCTTTTGATGTTGGGCAAAAAGTTGTTAAGGCTATTGACTTAGATTGGCAAGCGCATTATGGTTTCCATGATGCTGCTGCTTTCAGTGC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OQ540916.1
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Canine coronavirus
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Liu,Y.
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Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
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China
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2023-08-31
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VuCCoV_191135SY
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Alphacoronavirus 1
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,821 |
GenBank
| null |
China
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China
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Vulpes
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feces
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2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191135SY, complete genome
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GACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATATCTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTTTCTATGCAACCATAGAGGACAAGCGTTGATTATTTCCAACCAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGCGAACGGTGCAGTAGGGTTCCGTCCCTATTTGGTAAGTCGCCTAGTATTAGCTGCTGCGGTTCCGCCCGTACTAGTTGGGAGGTCAGGTTCCGTCCTACGCCTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTCAAGATCCTCGTTAATGAGGACTATCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTATCCGTGACGTATTACAGGAAATCAAGTACTGTTATCGTAATGGATTTGAGGGCTATGTTTTCGTGCCAGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCGATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTTGGTAACGGAGTAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTCACCGAACCCTCCGTCATGTTGCAAGGCTTTATTGTTAGGGCTAACTGCAATGGCGTACTTGAGGACTTTGATCTTAAAATCGCTCGTACTGGAAGAGGTGCTATATATGTTGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTGTTGAAGGCGATTTTAAGGATTACTTCGGTGATGAGGACATCATTGAATTTGAAGGAGAGGAGTATCATTGCGCTTGGACAACTGTGCGCGATGAGAAACCGCTGAACCAGCAAACTCTCTTTACCATACAGGAAATCCAATACAATCTGGACATTCCTCACAAATTGCCTAACTGTGCCACTAGACATGTAGCACCGCCAATCAAAACGAACTCTAAAATAGTTCTGTCTGAAGATTATAAGAAACTTTATGATATCTTCGGATCACCCTTTATGGGGAATGGTGACTGTCTTAGCAAATGCTTTGACACTCTTCATTTTATTGCTGCTACTCTTAGATGCCCATGTGGTGCTGAGAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTGTTGGCAAAGTTAAAGGTGTCACTTTAGGTGATGTAAAACCTGGTGATGCTGTTATTACTAGCATGAGCGCAGGTAAGGGTGTTAAATTCTTTGCCAATTGTGTTCTCCAACATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCAGTCTGGAAAGTGATTAAAACTTTTACAGTTGATGAGACTGTTTGCACCCCTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCTGAGAGTAAGTCACCAACTGCATGCAGCATTAAGAGAGCATTCATTACTGGTGAAATTGATGACGCTGTACATGATTGTATCATTACAGGAAAGTTGGATCTTAGTACCAATCTTTTTGGTAATGTTGGTCTATTATTCAGGAAAACTCCATGGTTTGTACAAAAGTGTGGTGCACTTTTTGTAGATGCTTGGAAGGTAGTAGAGGAGCTACTTGGTTCACTCAAACTTACTTACAAGCAAATTTACGAGGTTGTAGCATCACTTTGCACTTCTGCTTTCACGATTGTAGATTACAAACCAATGTTTGTAGTCTCAGACAACCGTGTTAAAGATCTTGTTGACAAGTGTGTGAAGATTCTTATGAAAGCATTTGATGTTTTCACTCAGACTATCACAATTGCTGGTATTGAGGCCAAATGTTTTGTGCTTGGCGCTAAATACCTGTTATTCAACAATGCACTTGTTAAACTTGTCAGTGTTAAATTACTTGGTAAGAAACAAAAAGGTCTTGAAAGTGCCTTCTTTGCTACTAGCTTAGTTGGTGCAACTATTAATGTGACACCAAAACGGACTGAGACTGCCAACATCAGYTTGAATAAGGTAGATGATGTGGCGACACCAGGAGAGGGTTATATTGTTATTATTGGTGATATGGCTTTCTACAAGAGTGGTGATTACTATTTTATTATGGCTAGTCCAGACTCTGTTCTTATTAACAATGTYTTCAAAGCAGCAAGAGTTCCATCTTATGAYATYGTTTATGATGTYGATGATGATACCAAAAGCAAAATGATTGCAAAAATTGGCACATCATTTGAATATGATGGTGATATTGCTGCTGCTATTGTAAAAGTCAATGAATTACTCATTGAATTTAAACAACAAAACTTGTGCTTCAGAGCTCTTAAAGAGGACAAAAGCATTTTTGTTGAAGCTTATCTTAAAAAGTACAAAATGCCTGCATGCCTTACAAAACACGTTGGTTTGTGGAACATCATAAAGAAAGATTCATGTAAGAAGGGTTTTCTTAGTCTCTTCAATCACTTGAATGAATTGGAAGATATCAAAGAAACCAATGTTCAGGCTATTAAAAATATTCTTTGTCCTGATCTTCTTCTTGATCTAGATTGTGGTGCCAATTGGTACAAGTGCATGCCAAGTTGCTCTGATCCTTCAGTGTTGGGGAGTGTCCAACTTTTGATTGGCAATGGTGTGAAAGTAGTTTGTGATGGCTGCAAAGTTTTTGCTAATCAACTTTCAAATGGTTACAATAAGCTCTGTAATGCTGCTCGTACTGACATTGAGATCGGTGGTATACCATTTTCTACTTTCAAAACACCCACAAATACCTTTATTGAAATGACAGATGCTATCTACTCAGTTATTGAACAAGGTAAGGCATTATCCTTCGGAAATGCTGATGTGCCAGTTGTAGACAATGGTACCATTTCTACTGATGACTGGTCAGAACCCATTTTGCTTGAGCCTGCTGAATATGTGAAACCCAAAAACAATGGCAATATCATTGTTATTGCTGGTTACACATTTTATAAGGATGAGGATGAACATTTCTATCCTTATGGTTCAGGTATGGTCGTACGGAAAATGTACAATAAAATGGGTGGTGGTGACAAAACAGTATCATTTGCAGAAGAAGTAGATGTTCAAGAAATTGCACCTGTTACACGTGTTAAACTTGAATTTGAGTTTGACAATGAAATTGTAGCAGGTGTTCTTGCGCAAGCTATTGGTACCAAATATAAGTTCACTGGTACTACTTGGGAAGAATTTGAAGATTCTATTTCTGAAGAACTTGATATTATTTTTGATACTTTAGCAAACCAAGGTATCGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGATACTTGCGGTGGCTTTGACATCACAAACCCAGATGGTATTATGATTTCTCAATATGACATCAATAATACTACTGGTGACAAGTCTGAACTTGGTGCATCAAGCGACGAAGAAGAAGTTGAATCTGTTGAAGAAGATTCTGAACAGGAGATTGTAGAGGCATCTGAAATTATTGATGAAACCCCGATTCAGGAAGAGGTTGAAACAGTGGAAGTTGAAGATGTCACTTCTACAGAAGATGTTGAAATTGTTGAAGTATCTGCTAAGGATGACCCGTGGGCTGCTGCTGTTGATGTACAAGAAACCGAACAACTTAAACCTTCTTTACCACCTTTTAAAACAACAAATCTTAATGGAAAAATTATCCTTAAACAACAGGATAACAATTGTTGGATAAATGCTTGTTGCTATCAGCTTCAGGCTTTTGATTTTTTCAACAATGAAGCTTGGGAGAAATTTAAGAAAGGTGATGTCGTGGATTTTGTAAACCTTTGTTATGCAGCAACAACGCTAGAAAGAGGTCATTCTGGTGATGCAGAATATCTTCTTGAACTTATGCTCAATGATTATAGCACAGCCAAAATAGTACTTGCTGCTAAGTGTGGTTGTGGTGAAAAAGAAATTGTTTTGGAAAGAACCGTATTCAAACTCACTCCATTAAAGAACGAGTTTAAATACGGTGTTTGTGGTGATTGTATGCAAATTAATATGTGTAAGTTTTTAAGTGTTGAAGGATCTGGTGTATTTGTCCATGATAGGATGGAAAAACCTAGACCCGTGTCTGATTTTATTGTAAAACCTATTATGCATGCAGTCTACATTGGTTCAGCTCAGAATGGTCATTATATGATTGATGATTGTGAACACGATTATTGTGTGGATGGTATGGGTATTAAACCACGTAAAGGTAAACTTTACACATCCACCCTATTTATCAATGCTAATGTAATGACTAGAGCTGAAAAGCCAAAACAAGAATCTAAAGTTGAAAAAGTTGAGCAGCGACCAGAAGTAGAAGAAAAGAAACCTTCAATTGAAAAAGAGGAAGTTCAAAGTCCTAAAAATGATGATCTTATACTTCCATTTTACAAAGCTGGTAAACTTTCCTTTTATCAGGGTGATTTGGATGTCTTGATCAACTTCTTGGAACCTGATGTCATTGTTAATGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGTGTCGCAAGAGCCATTGATGTGTTCACTGGTGGTAAATTAACAGAACGTTCTAAGGATTATCTTAAAAAGAACAAATCTATTGCTCCTGGTAACGCTGTTTTCTTTGAAAATGTCATTGAGCATCTTAGTGTTTTGAATGCAGTTGGACCACGTAATGGTGACAGCAGAGTTGAGGCCAAACTTAACAATGTTTACAAAGCAATTGCAAAATGTGAAGGAAAAATACTAACACCACTTATCAGTGTTGGTATTTTCAGTGTTAAGCTTGAAACATCATTGCAGTGCTTACTTAAGACTATAAATGACAGAGAATTGCATGTCTTCGTGTACACTGACCAAGAGAGACAAGCCATTGAGAACTTTTTCTCTGGTTCCATTCCTGTCAAAGTTACTGAAGACAATGTCAACCATGAGCGTGTGTCTGTTTCTTTTGATAAAACATACGGTGAACAACTTAACGGCACCGTGGTTATTAAAGACAAGGATGTTACAAACCAGTTGCCTAGTGCTTTTGATGTTGGGCAAAAAGTTGTTAAGGCTATTGACTTAGATTGGCAAACTCATTATGGTTTCCATGATGCTGCTGCCTTTAGTGCTAGTAG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| 13,150 |
OQ540917.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191120SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,833 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191120SY, complete genome
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| 13,151 |
OQ540918.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191142SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,931 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191142SY, complete genome
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| 13,152 |
OQ540919.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191110SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,245 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191110SY, complete genome
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OQ540920.1
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Canine coronavirus
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Liu,Y.
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Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
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China
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2023-08-31
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VuCCoV_191107SY
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Alphacoronavirus 1
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,826 |
GenBank
| null |
China
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China
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Vulpes
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feces
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2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191107SY, complete genome
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GACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTGGCTATATCTCTTCTTTTACTTTAACTAGCCTTGTGCTAGATTTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTTTCTATGCAACCATAGAGGACAAGCGTTGATTATTTCCAACCAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGCGAACGGTGCACCAGGGTTCCGTCCCTGTTTGGTAAGTCGCCTAGTATTAGCGCGTGCGGTTCCGCCCGTAGTAGTTGGGAGGTCTAGGTTCCGTCCTAACGTCACCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTCAAGATCCTCGTCAAYGAGGACTAYCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTATCCGYGACGTGTTACAGGAAATYAAGTACTGTTAYCGTAATGGATTTGAGGGCTATGTTTTCGTGCCWGAATACCGTCGTGACCTAGTTGATTGCRATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTTGGTAACGGAGTAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTCACCGAACCCTCCGTCATGYTGCAAGGCTTTATTGTTAGRGCTAACTGCAATGGCGTWCTTGAGGACTTTGAYCTTAAAATCGCTCGTACTGGAAGAGGTGCTATATATGTTGATCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTGTTGAAGGCGATTTTAAGGATTACTTCGGTGATGAGGACATCATTGAATTTGAAGGAGAGGAGTATCATTGCGCTTGGACAACTGTGCGCGATGAGAAACCGCTGAAYCAGCAAACTCTCTTTACCATACAGGAAATCCAATACAATCTGGACATTCCTCACAAATTGCCTAACTGTGCCACTAGACATGTAGCACCGCCAATCAAAACGAACTCTAAAATAGTTCTGTCTGAAGATTATAAGAAACTTTATGATATCTTCGGATCACCCTTTATGGGGAATGGTGACTGTCTTAGCAAATGCTTTGACACTCTTCATTTTATTGCTGCTACTCTTAGATGCCCATGTGGTGCTGAGAGTAGTGGTGTTGGTGATTGGACTGGTTTTAAGACTGCTTGTTGTGGTCTTGTTGGCAAAGTTAAAGGTGTCACTTTAGGTGATGTAAAACCTGGTGATGCTGTTATTACTAGCATGAGCGCAGGTAAGGGTGTTAAATTCTTTGCCAATTGTGTTCTCCAACATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCAGTCTGGAAAGTGATTAAAACTTTTACAGTTGATGAGACTGTTTGCACCCCTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCTGAGAGTAAGTCACCAACTGCATGCAGCATTAAGAGAGCATTCATTACTGGTGAAATTGATGACGCTGTACATGATTGTATCATTACAGGAAAGTTGGATCTTAGTACCAATCTTTTTGGTAATGTTGGTCTATTATTCAGGAAAACTCCATGGTTTGTACAAAAGTGTGGTGCACTTTTTTTAGATGCTTGGAAAGTAGTAGAGGAGCTACTTGGTTCACTCAAACTTACTTACAAGCAAATTTACGAAGTTGTAGCATCACTTTGCACTTCTGCTTTCACGATTGTAGATTACAAACCAATGTTTGTGGTCTCAGACAACCGTGTTAAAGATCTTGTTGACAAGTGTGTGAAGATTCTTATGAAAGCATTTGATGTTTTCACTCAGACTATCACAATTGCTGGTATTGAGGCCAAATGTTTTGTGCTTGGCGCTAAATACCTGTTATTCAATAATGCACTTGTTAAACTTGTCAGTGTTAAATTACTTGGTAAGAAACAAAAAGGTCTTGAAAGTGCCTTCTTTGCTACCAGCTTAGTTGGTGCAACTATTAATGTGACACCAAAACGGACTGAGACTGCCAACATCAGCTTGAAYAAGGTAGATGATGTGGTGACACCAGGAGARGGTTATATTGTTATTATTGGTGATATGGCTTTCTACAAGAGTGGTGAGTACTATTTTATTATGGCTAGTCCAGATTCTGTTCTTATTAACAATGTYTTCAAAGCAGCAAGAGTTCCATCTTATGACATYGTTTATGATGTYGATGATGATACCAAAAGCAAAATGATTGCAAAAATTGGCACATCATTTGAATATGATGGTGATATTGATGCTGCTATTGTAAAAGTCAATGAATTACTCATTGAATTTAAACAACAAAACTTGTGCTTCAGAGCTCTTAAAGAGGACAAAAGCATTTTTGTTGAAGCTTATCTTAAAAAGTACAAAATGCCTGCATGCCTTACAAAACACGTTGGTTTGTGGAACATCATAAAGAAAGATTCATGTAAGAAGGGTTTTCTTAGTCTCTTCAATCACTTGAATGAATTGGAAGATATCAAAGAAACCAATGTTCAGGCTATTAAAAATATTCTTTGTCCTGATCTTCTTCTTGATCTAGATTGTGGTGCCAATTGGTACAAGTGCATGCCAAGTTGCTCTGATCCTTCAGTGTTGGGGAGTGTCCAACTTTTGATTGGCAATGGTGTGAAAGTAGTTTGTGATGGCTGCAAAGTTTTTGCTAATCAACTTTCAAATGGTTACAATAAGCTCTGTAATGCTGCTCGTACTGACATTGAGATCGGTGGTATACCATTTTCTACTTTCAAAACACCCACAAATACCTTTATTGAAATGACAGATGCTATCTACTCAGTTATTGAACAAGGTAAGGCATTATCCTTCGGAAATGCTGATGTGCCAGTTGTAGACAATGGTACCATTTCTACTGATGACTGGTCAGAACCCATTTTGCTTGAGCCTGCTGAATATGTGAAACCCAAAAACAATGGCAATATCATTGTTATTGCTGGTTACACATTTTATAAGGATGAGGATGAACATTTCTATCCTTATGGTTCAGGTATGGTCGTACAGAAAATGTACAATAAAATGGGTGGTGGTGACAAAACAGTATCATTTGCAGAAGAAGTAGATGTTCAAGAAATTGCACCTGTTACACGTGTTAAACTTGAATTTGAGTTTGACAATGAAATTGTAGCAGGTGTTCTTGCGCAAGCTATTGGTACCAAATATAAGTTCACTGGTACTACTTGGGAAGAATTTGAAGATTCTATTTCTGAAGAACTTGATATTATTTTTGATACTTTAGCAAACCAAGGTATCGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGATACTTGCGGTGGCTTTGACATCACAAACCCAGATGGTATTATGATTTCTCAATATGACATCAATAATACTACTGGTGACAAGTCTGAACTTGGTGCATCAAGCGACGAAGAAGAAGTTGAATCTGTTGAAGAAGATTCTGAACAGGAGATTGTAGAGGCATCTGAAATTATTGATGAAACCCCGAGTCAGGAAGAGGTTGAAACAGTGGAAGTTGAAGATGTCACTTCTACAGAAGATGTTGAAATTGTYGAAGTATCTGCTAATGATGACCCATGGGCTGCTGCTGTTGATGTACAAGAAGCTGAACAACTTAAACCTTCTTTACCACCTTTYAAGACAACAAATCTCAATGGAAAAATTATCCTTAAACAACAGGATAACAATTGTTGGATAAATGCTTGTTGCTATCAGCTTCAGGCTTTTGATTTTTTCAACAATGAAGCTTGGGAGAAATTTAAGAAAGGTGATGTTGTGGATTTTGTAAACCTTTGTTATGCAGCAACAACGCTAGAAAGAGGTCATTCTGGTGATGCAGAATATCTTCTTGAACTTATGCTCAATGATTATAGCACAGCCAAAATAGTACTTGTTGCTAAGTGTGGTTGTGGTGAAAAAGAAATTGTTTTGGAAAGAACCGTATTCAAACTCACTCCATTAAAGAACGAGTTTAAATACGGTGTTTGTGGTGATTGTATGCAAATTAATATGTGTAAGTTTTTAAGTGTTGAAGGATCTGGTGTATTTGTCCATGATAGGATGGAAAAACCTAGTCCTGTGTCTGATTTTATTGTAAAACCTATTATGCATGCAGTGTACATTGGTTCAGCTCAGAATGGTCATTATATGATTGATGATTGTGAACACGATTATTGTGTGGATGGTATGGGTATTAAACCACGTAAAGGTAGACTTTACACATCCACCCTATTTATCAATGCTAATGTAATGACTAGAGCTGAAAAGCCAAAACAAGAATCTAAAGTTGAAAAAGTTGAGCAGCGACCAGAAGTAGAAGAAAAGAAACCTTCAATTGAAAAAGAGGAAGTTCAAAGTCCTAAAAATGATGATCTTATACTTCCATTTTACAAAGCTGGTAAACTTTCCTTTTATCAGGGTGATTTGGATGTCTTGATCAACTTCTTGGAACCTGATGTCATTGTTAATGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGTGTCGCAAGAGCCATTGATGTGTTCACTGGTGGTAAATTAACAGAACGTTCTAAGGATTATCTTAAAAAGAACAAATCTATTGCTCCTGGTAACGCTGTTTTCTTTGAAAATGTCATTGAGCATCTTAGTGTTTTGAATGCAGTTGGACCACGTAATGGTGACAGCAGAGTTGAGGCCAAACTTAACAATGTTTACAAAGCAATTGCAAAATGTGAAGGAAAAATACTAACACCACTTATCAGTGTTGGTATTTTCAGTGTTAAGCTTGAAACATCATTGCAGTGCTTACTTAAGACTGTAAATGACAGAGAATTGCATGTCTTCGTGTACACTGACCAAGAGAGACAAGCCATTGAGAACTTTTTCTCTGGTTCCATTCCTGTCAAAGTTACTGAAGACAATGTCAACCATGAGCGTGTGTCTGTTTCTTTTGATAAAACATACGGYGAACAACTTAAAGGCACCGTGGTTATTAAAGACAAGGATGTTACAAACCAGTTGCCTAGTGCTTTTGATGTTGGGCAAAAAGTTGTTAAGGCTATTGACTTAGATTGGCAAGCTCATTATGGTTTCCATGATGCTGCTGCCTTTAGTGCTAGT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| 13,154 |
OQ540921.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191108SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,825 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191108SY, complete genome
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| 13,155 |
OQ540922.1
|
Canine coronavirus
|
Liu,Y.
|
Veterinary Medicine, Shenyang Agriculture University
|
China
|
2023-08-31
|
VuCCoV_191109SY
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,824 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Vulpes
|
feces
|
2019-11
| null | null |
Canine coronavirus isolate VuCCoV_191109SY, complete genome
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| 13,156 |
MZ320953.1
|
Canine coronavirus
|
Wang,X., Ren,Z., Wang,L., Chen,J., Zhang,P., Chen,J.P., Chen,X., Li,L., Lin,X., Qi,N., Luo,S., Xiang,R., Yuan,Z., Zhang,J., Wang,G., Sun,M.H., Huang,Y., Hua,Y., Zou,J., Hou,F., Huang,Z., Du,S., Xiang,H., Sun,M., Liu,Q., Liao,M., Wang,H.X.
|
Institute of Animal Health, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Zoonoses Department
|
China
|
2022-09-03
|
CCoV/GD/2020/X8
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,823 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Rhizomys sinensis
| null |
2020-02
| null | null |
UNVERIFIED: Canine coronavirus isolate CCoV/GD/2020/X8, complete genome
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| 25,855 |
MZ320954.1
|
Canine coronavirus
|
Wang,X., Ren,Z., Wang,L., Chen,J., Zhang,P., Chen,J.P., Chen,X., Li,L., Lin,X., Qi,N., Luo,S., Xiang,R., Yuan,Z., Zhang,J., Wang,G., Sun,M.H., Huang,Y., Hua,Y., Zou,J., Hou,F., Huang,Z., Du,S., Xiang,H., Sun,M., Liu,Q., Liao,M., Wang,H.X.
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Institute of Animal Health, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Zoonoses Department
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China
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2022-09-03
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CCoV/GD/2020/X9
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Alphacoronavirus 1
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 28,807 |
GenBank
| 1 |
China
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China
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Rhizomys sinensis
| null |
2020-02
| null | null |
Canine coronavirus isolate CCoV/GD/2020/X9, complete genome
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| 25,856 |
OP179857.1
|
Canine coronavirus
|
De Deus,D.R., Siqueira,J.A.M., Cardoso,B.T.M., Teixeira,D.M., Maues,M.A.C., De Figueiredo,M.J.F.M., Junior,E.C.S., Bandeira,R.S., Pinheiro,K.C., Guerra,S.F.S., Soares,L.S., Resque,H.R., Da Silva,L.D., Gabbay,Y.B.
|
Evandro Chagas Institute, Virology
|
Brazil
|
2022-08-15
|
CCov/PK02/2019/BRA
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,412 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
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Canis lupus familiaris
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feces
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2019
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Canine coronavirus isolate CCov/PK02/2019/BRA, complete genome
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OM950728.1
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Canine coronavirus
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Wang,W., Tian,J.H., Chen,X., Hu,R.X., Lin,X.D., Pei,Y.Y., Lv,J.X., Zheng,J.J., Dai,F.H., Song,Z.G., Chen,Y.M., Zhang,Y.Z., Hu,R.-X., Zhang,Y.-Z.
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National Institute of Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Ecological Medicine Research Center
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China
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2022-05-17
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GH8-2
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Alphacoronavirus 1
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,367 |
GenBank
| 1 |
China
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China
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Nyctereutes procyonoides
| null |
2020
| null | null |
Canine coronavirus isolate GH8-2, complete genome
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ACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTAGCTATCTCTCGTCTTTTACTTTAACTAGCTTTGTGCTAGATTTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTTTCTATGAAACCATAGAGGACAAGCGTTGATTATTTCCAACCAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGCGAACGGTGCAGTAGGGTTCCGTCCCTATTTCGTAAGTCGCCTAGTAGTAGCGCGTGCGGTTCCGCCCGTACCCGTTGGGATACCAGGTTCCGTCCTGCGACTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTCAAGATCCTCGTCAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTATTCGTGACGTGTTACAGGAAATTAAGTACTGTTATCGTAATGGATTCGAGGGCTATGTTTTCGTACCAGAATACTGTCGTGACCTAGTTGATTGCAATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTCGGTAACGGAGTAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTTACCGAACCCTCCGTCATGCTGCAAGGCTTTATTGTTAAAGCTAGCTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCTCGTACAGGAAGAGGTGCCATATATGTTGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAGGGTGATTTTAAGGATTATTTCGGTGATGAGGACATTATTGAATTTGAAGGAGAGGAGTACCATTGCGCTTGGACAACTGTGCGCGATGAGAAACCGCTGAACCAGCAAACTCTCTTTACCATACAGGAAATCCAATATAATCTGGACGTTCCTCACAAATTGCCAAATTGTGCTACTAGATGTGTGGCACCACCAGTCAAAAAGAACTCTAAAATAGTTCTGTCTGAAGATTACATGAAGCTCTATGAAATCTTCGGTTCACCTTTTATGGGAAATGGTGACTGTCTTAGCAAATGCTTTGACACTCTTCATTTTATCGCTGCTACTCTTAGATGTCCATGTGGTTCTGAAAGTAGTGGTGTTGGAGATTGGACTGGTTTTAAGACAGCTTGTTGTGGTCTTTCTGGCAAAGTTAAGGGTGTCACTCTGGGTGATGTTAAACCTGGTGATGCTGTTGTCACTAGTATGAGCGCAGGTAAGGGAGTCAAGTTCTTTGCCAATTGTGTTCTCCAATATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTATCTGGAAAGTGGTTAAAACTTTCACAGTGGATGAGAATGTTTGCACCCCTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCTGAGAGTAAGTCACCAACTGCATGCAGTATTAAGAGAGCATTCATTACTGGTGAAATTGATGACGCTGTACATGATTGTATCATTACAGGAAAATTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAATGTTGGTCTATTATTCAAGAAGACTCCGTGGTTTGTACAAAAATGCGGTGCACTTTTTGTTGATGCTTGGAAGGTTGTTGAGGAACTACTTGGTTCACTCAAACTCACATACAAGCAAATTTATGACGTTGTGGCATCACTTTGCACTTCTGCTTTTACGATCGTAAACTACAAACCAATATTCGTAGTTTCAGACAATCGTGTCAAGGATCTTGTAGACAAGTGTGTGACAGTTCTTGTAAAGGCGTTTGATGTCTTTACTCAAACTATCACTATTGCCGGTATCGAAGCCAAATGCTTTGTGCTTGGTGCTAAGTACCTGCTGTTTAACAATGCACTTGTCAAACTTGTCAGTGTGAAAATACTTGGCAAGAAGCAAAAGGGTCTTGAAAGTGCATTCTTTGCTACTAGCTTGGTTGGTGCAACTGTTAATGTGACACCTAAAAGAACTGAGACTGCTACTATCAGCTTGAACAAAGTTGATGATGTGGTGGCACCAGGAGAAGGTTATATTGTCATTGTTGGTGATATGGCTTTCTACAAGAGTGGTGAATACTACTTCATGATGGCTAGTCCTGATTCTGTTCTTGTTAATAATGTTTTTAAAGCAGCTATAGTTCCATCTTATGACATCGTGTATGACGTTGATGATGACACCAAAAGCAAGATGATTGCAAAACTTGGTTTATCATTCGAATATGATGGTGACATCGCAGCTGCTATTGTGAAATTTAATGAACTACTCGTTGAATTTAGGCAGCAGAATCTGTGTTTCAGAGCTCTTAAAGAGGACAAAAGCATTTTTGTTGAAGCTTATCTTAAAAAGTACAAAATGCCTGCATGCCTTACAAAACACATTGGTTTGTGGAACATCATAAAGAAAGATTCATGTAAGAAGGGTTTTCTTAGTCTCTTCAATCATTTGAATGAATTGGAAGATATCAAAGAAACTACTTTCCTGGCTATTAAAAATATTCTGTGCCCTGAGCTTCTTCTTGAATTAGACTATGGTGCTATTTGGTACAAGTGCATGCCAAGTTGCTCTGATCCATCAGTGTTGGGGAGTGTCCAACTTTTAATTGGCAATGGTGTGAAAGTTGTTTGTAATGGCTGCAAAGTGTTTGCTAACCAACTTTCAAATGGTTATAACAAGCTCTGTAATGCGGCTCGCACTGATATTGAGATCGGTGGTATACCATTTTCTACTTTCAAAACACCAACAAACACTTTTATTGAAATGACAGATGCTATCTACTCAGTTATTGAGCAAAACAAGGCTTTATCCTTTGGAAATGCTGATGTACCAGTTGTAGATAATGGTACCATTTCTATTGATGATTGGTCTGAACCCATTTTGCTGGAGCCTGCTGAATATGTGCAACCTAAAAACAATGGTAATATCATTGTTATTGCTGGTTACACATTTTACAAAGATGAGGATGAACATTTCTACCCTTATGGTTCTGGTAAAATTGTGCAAAGGATGTACAATAAAATGGGTGGCGGTGATAAAACTGTCTCATTTTCAGAGGAAGTAGATGTTCAAGAAATAGCACCTGTTACACGTGTTAAACTTGAATTCGAGTTTGACAATGAAATTGTAGCAGGTGTTCTTGAACAAGCTATTGGTACTAAATACAAATTTACTGGTACAACTTGGGAGGAGTTTGAGGATTCTATTTCTGAAGAACTTGATGCAATTTTTGATACTCTAGCAAACCAAGGTGTCGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACTTGTGGTGGCTTTGATATCAAAAATCCAGATGGTATTATGATCTCTCAGTATGACATCAATATGACTGATGACAAATCTGAATCTGGTATATCAAGTGAAGAAGAAGAAGTTGAATCTGCTGAAGAAAAATCTGAACATGACATTGTAGATGCATCTGAAGTTGTTGAGGAAACTTCTATTCAAGAAGAGGTTGAAGTAGTGGAGGTTGAAGATGTCACTTCCACAGAAAATGTTGAAATTGTTGAGGTGTCTGCTAAAGATGACCCTTGGGCTGCAGCTGTTGATGTACAAGAAGCTGAACATATTAAACCTTCTTTACCACCTTTCAAGACAACAAATCTCAATGGCAAAATTATCCTTAAACAACAGGATAACAATTGTTGGATAAATGCTTGTTGCTATCAGCTTCAAGCCTTTGATTTTTTCAACAATGAGGCTTGGGAGAAATTTAAGAGAGGTGATGTTATGGACTTTGTAAACCTTTGCTATGCAGCGACTACACTTGAAAGAGGTCATTCTGGTGACGCAGAGTATCTTCTCGAACTTATGCTCAATGATTACAGCACAGCTAAAATAGTACTTGTTGCTAGTTGCGGTTGTGGTGAGAAAGAAATTGTTTTGGAAAGATCTGTATTTAAATTGAGTCCTATCAATAAGACTTTTAAATATGGTGTGTGTGGTGATTGCATGCAGGTGAATAATTGTAAATTTTCTAGTGTTGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTATATGATAGGATTGAAAAACAGCATCCGCTAGAAAAATTCATTGTAAAACCTGCTATGCATGCAGTATACACTGGTTCAACTCAAAGTGGCCATTACATGATTGAAGACTGCGAGCATGATTATTGTGTGGATGGTATGGGACTCAAACCTCGTAAATTCAGACTTTACACATCCACACTCTTTATCAACGCTAATGTAAGGACTAGAGTTGAAAGACCAAAACAACAATCTAAAGTTGAAAAAGTAGAACAGCAACCAGAAGTAGAAGAAAAGAAGTCTTCAATTGAAAAAGAGGAAGTTCAAAGTCCTAAAAAAGATGATCTCATACTTCCATTTTACAAAGCTGGTAAACTTTCCTTTTATCAGGGTGATTTGGATGTTTTGATCAATTTCTTGGAACCTGATGTCATTGTTAATGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGTGTCGCAAGAGCCATCGATGTGTTCACTGGTGGCAAATTAACTGAACGTTCTAAGGATTATTTTAAAAAGAACAAATCTATTGCTCCTGGTAACGCTGTTTTCTTTGAGAATGTCATTGAGCATCTTAGTGTTTTGAATGCAGTTGGACCACGTAATGGTGACAGCCGCGTTGAGGCCAAACTTAACAATGTTTACAAAGCAATTGCAAAATGTGAAGGAAAAATACTAACACCACTTATCAGTGTTGGTATTTTCAGTGTTAAGCTTGAAACATCATTGCAGTGCTTACTTAAGACTGTAAATGACAGAGAATTGCATGTCTTCGTGTACACTGACCAGGAGAGACAAGCCATTGAGAACTTCTTCTCTGGTTCTATCCCTGTCAAAGTTACTGAAGATAATGTCAACCATGAACGTGTGTCTGTTTCTTTTGACAAAACATACGGTGAACAACTTAAAGGCACCGTAGTTATTAGAGACAAGAATGTTACAAACCAGTTGCCTAGTGCCTTTGATGTTGGTCAGAAAGTTGTTAAGGCTATAGACGTAGATTGGCAAGCGCATTATGGTTTCCATGATGCTGCTGCCTTCAGTGCTAGTAACCAT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Canine coronavirus
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Wang,W., Tian,J.H., Chen,X., Hu,R.X., Lin,X.D., Pei,Y.Y., Lv,J.X., Zheng,J.J., Dai,F.H., Song,Z.G., Chen,Y.M., Zhang,Y.Z., Hu,R.-X., Zhang,Y.-Z.
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National Institute of Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Ecological Medicine Research Center
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China
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2022-05-17
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GH4-2
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Alphacoronavirus 1
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,366 |
GenBank
| 1 |
China
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China
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Nyctereutes procyonoides
| null |
2020
| null | null |
Canine coronavirus isolate GH4-2, complete genome
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ACTTTTAAAGTAAAGTGAGTGTAGCGTAGCTATCTCTCGTCTTTTACTTTAACTAGCTTTGTGCTAGATTTTGTCTTCGGACACCAACTCGAACTAAACGAAATATTTGTCTTTCTATGAAACCATAGAGGACAAGCGTTGATTATTTCCAACCAGTTTGGCAATCACTCCTTGGAACGGGGTTGAGCGAACGGTGCAGTAGGGTTCCGTCCCTATTTCGTAAGTCGCCTAGTAGTAGCGCGTGCGGTTCCGCCCGTACCCGTTGGGATACCAGGTTCCGTCCTGCGACTCCCTCGCCGGCCGCCAGGAGAATGAGTTCCAAACAATTCAAGATCCTCGTCAATGAGGACTACCAAGTCAACGTGCCTAGTCTTCCTATTCGTGACGTGTTACAGGAAATTAAGTACTGTTATCGTAATGGATTCGAGGGCTATGTTTTCGTACCAGAATACTGTCGTGACCTAGTTGATTGCAATCGTAAGGATCACTACGTCATTGGTGTTCTCGGTAACGGAGTAAGTGATCTTAAACCTGTTCTTCTTACCGAACCCTCCGTCATGCTGCAAGGCTTTATTGTTAAAGCTAGCTGCAATGGCGTTCTTGAGGACTTTGACCTTAAAATTGCTCGTACAGGAAGAGGTGCCATATATGTTGACCAATACATGTGTGGTGCTGATGGAAAACCAGTTATTGAGGGTGATTTTAAGGATTATTTCGGTGATGAGGACATTATTGAATTTGAAGGAGAGGAGTACCATTGCGCTTGGACAACTGTGCGCGATGAGAAACCGCTGAACCAGCAAACTCTCTTTACCATACAGGAAATCCAATATAATCTGGACGTTCCTCACAAATTGCCAAATTGTGCTACTAGATGTGTGGCACCACCAGTCAAAAAGAACTCTAAAATAGTTCTGTCTGAAGATTACATGAAGCTCTATGAAATCTTCGGTTCACCTTTTATGGGAAATGGTGACTGTCTTAGCAAATGCTTTGACACTCTTCATTTTATCGCTGCTACTCTTAGATGTCCATGTGGTTCTGAAAGTAGTGGTGTTGGAGATTGGACTGGTTTTAAGACAGCTTGTTGTGGTCTTTCTGGCAAAGTTAAGGGTGTCACTCTGGGTGATGTTAAACCTGGTGATGCTGTTGTCACTAGTATGAGCGCAGGTAAGGGAGTCAAGTTCTTTGCCAATTGTGTTCTCCAATATGCTGGTGATGTTGAAAATGTCTCTATCTGGAAAGTGGTTAAAACTTTCACAGTGGATGAGAATGTTTGCACCCCTGATTTTGAAGGCGAATTGAACGACTTCATCAAACCTGAGAGTAAGTCACCAACTGCATGCAGTATTAAGAGAGCATTCATTACTGGTGAAATTGATGACGCTGTACATGATTGTATCATTACAGGAAAATTGGATCTTAGTACTAACCTTTTTGGTAATGTTGGTCTATTATTCAAGAAGACTCCGTGGTTTGTACAAAAATGCGGTGCACTTTTTGTTGATGCTTGGAAGGTTGTTGAGGAACTACTTGGTTCACTCAAACTCACATACAAGCAAATTTATGACGTTGTGGCATCACTTTGCACTTCTGCTTTTACGATCGTAAACTACAAACCAATATTCGTAGTTTCAGACAATCGTGTCAAGGATCTTGTAGACAAGTGTGTGACAGTTCTTGTAAAGGCGTTTGATGTCTTTACTCAAACTATCACTATTGCCGGTATCGAAGCCAAATGCTTTGTGCTTGGTGCTAAGTACCTGCTGTTTAACAATGCACTTGTCAAACTTGTCAGTGTGAAAATACTTGGCAAGAAGCAAAAGGGTCTTGAAAGTGCATTCTTTGCTACTAGCTTGGTTGGTGCAACTGTTAATGTGACACCTAAAAGAACTGAGACTGCTACTATCAGCTTGAACAAAGTTGATGATGTGGTGGCACCAGGAGAAGGTTATATTGTCATTGTTGGTGATATGGCTTTCTACAAGAGTGGTGAATACTACTTCATGATGGCTAGTCCTGATTCTGTTCTTGTTAATAATGTTTTTAAAGCAGCTATAGTTCCATCTTATGACATCGTGTATGACGTTGATGATGACACCAAAAGCAAGATGATTGCAAAACTTGGTTTATCATTCGAATATGATGGTGACATCGCAGCTGCTATTGTGAAATTTAATGAACTACTCGTTGAATTTAGGCAGCAGAATCTGTGTTTCAGAGCTCTTAAAGAGGACAAAAGCATTTTTGTTGAAGCTTATCTTAAAAAGTACAAAATGCCTGCATGCCTTACAAAACACATTGGTTTGTGGAACATCATAAAGAAAGATTCATGTAAGAAGGGTTTTCTTAGTCTCTTCAATCATTTGAATGAATTGGAAGATATCAAAGAAACTACTTTCCTGGCTATTAAAAATATTCTGTGCCCTGAGCTTCTTCTTGAATTAGACTATGGTGCTATTTGGTACAAGTGCATGCCAAGTTGCTCTGATCCATCAGTGTTGGGGAGTGTCCAACTTTTAATTGGCAATGGTGTGAAAGTTGTTTGTAATGGCTGCAAAGTGTTTGCTAACCAACTTTCAAATGGTTATAACAAGCTCTGTAATGCGGCTCGCACTGATATTGAGATCGGTGGTATACCATTTTCTACTTTCAAAACACCAACAAACACTTTTATTGAAATGACAGATGCTATCTACTCAGTTATTGAGCAAAACAAGGCTTTATCCTTTGGAAATGCTGATGTACCAGTTGTAGATAATGGTACCATTTCTATTGATGATTGGTCTGAACCCATTTTGCTGGAGCCTGCTGAATATGTGCAACCTAAAAACAATGGTAATATCATTGTTATTGCTGGTTACACATTTTACAAAGATGAGGATGAACATTTCTACCCTTATGGTTCTGGTAAAATTGTGCAAAGGATGTACAATAAAATGGGTGGCGGTGATAAAACTGTCTCATTTTCAGAGGAAGTAGATGTTCAAGAAATAGCACCTGTTACACGTGTTAAACTTGAATTCGAGTTTGACAATGAAATTGTAGCAGGTGTTCTTGAACAAGCTATTGGTACTAAATACAAATTTACTGGTACAACTTGGGAGGAGTTTGAGGATTCTATTTCTGAAGAACTTGATGCAATTTTTGATACTCTAGCAAACCAAGGTGTCGAACTTGAAGGTTACTTCATTTATGACACTTGTGGTGGCTTTGATATCAAAAATCCAGATGGTATTATGATCTCTCAGTATGACATCAATATGACTGATGACAAATCTGAATCTGGTATATCAAGTGAAGAAGAAGAAGTTGAATCTGCTGAAGAAAAATCTGAACATGACATTGTAGATGCATCTGAAGTTGTTGAGGAAACTTCTATTCAAGAAGAGGTTGAAGTAGTGGAGGTTGAAGATGTCACTTCCACAGAAAATGTTGAAATTGTTGAGGTGTCTGCTAAAGATGACCCTTGGGCTGCAGCTGTTGATGTACAAGAAGCTGAACATATTAAACCTTCTTTACCACCTTTCAAGACAACAAATCTCAATGGCAAAATTATCCTTAAACAACAGGATAACAATTGTTGGATAAATGCTTGTTGCTATCAGCTTCAAGCCTTTGATTTTTTCAACAATGAGGCTTGGGAGAAATTTAAGAGAGGTGATGTTATGGACTTTGTAAACCTTTGCTATGCAGCGACTACACTTGAAAGAGGTCATTCTGGTGACGCAGAGTATCTTCTCGAACTTATGCTCAATGATTACAGCACAGCTAAAATAGTACTTGTTGCTAGTTGCGGTTGTGGTGAGAAAGAAATTGTTTTGGAAAGATCTGTATTTAAATTGAGTCCTATCAATAAGACTTTTAAATATGGTGTGTGTGGTGATTGCATGCAGGTGAATAATTGTAAATTTTCTAGTGTTGAAGGTTCTGGTGTTTTTGTATATGATAGGATTGAAAAACAGCATCCGCTAGAAAAATTCATTGTAAAACCTGCTATGCATGCAGTATACACTGGTTCAACTCAAAGTGGCCATTACATGATTGAAGACTGCGAGCATGATTATTGTGTGGATGGTATGGGACTCAAACCTCGTAAATTCAGACTTTACACATCCACACTCTTTATCAACGCTAATGTAAGGACTAGAGTTGAAAGACCAAAACAACAATCTAAAGTTGAAAAAGTAGAACAGCAACCAGAAGTAGAAGAAAAGAAGTCTTCAATTGAAAAAGAGGAAGTTCAAAGTCCTAAAAAAGATGATCTCATACTTCCATTTTACAAAGCTGGTAAACTTTCCTTTTATCAGGGTGATTTGGATGTTTTGATCAATTTCTTGGAACCTGATGTCATTGTTAATGCTGCTAATGGTGATCTTAAACACATGGGTGGTGTCGCAAGAGCCATCGATGTGTTCACTGGTGGCAAATTAACTGAACGTTCTAAGGATTATTTTAAAAAGAACAAATCTATTGCTCCTGGTAACGCTGTTTTCTTTGAGAATGTCATTGAGCATCTTAGTGTTTTGAATGCAGTTGGACCACGTAATGGTGACAGCCGCGTTGAGGCCAAACTTAACAATGTTTACAAAGCAATTGCAAAATGTGAAGGAAAAATACTAACACCACTTATCAGTGTTGGTATTTTCAGTGTTAAGCTTGAAACATCATTGCAGTGCTTACTTAAGACTGTAAATGACAGAGAATTGCATGTCTTCGTGTACACTGACCAGGAGAGACAAGCCATTGAGAACTTCTTCTCTGGTTCTATCCCTGTCAAAGTTACTGAAGATAATGTCAACCATGAACGTGTGTCTGTTTCTTTTGACAAAACATACGGTGAACAACTTAAAGGCACCGTAGTTATTAGAGACAAGAATGTTACAAACCAGTTGCCTAGTGCCTTTGATGTTGGTCAGAAAGTTGTTAAGGCTATAGACGTAGATTGGCAAGCGCATTATGGTTTCCATGATGCTGCTGCCTTCAGTGCTAGTAACCAT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Canine kobuvirus
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Li,X.M., Tang,C., Wang,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2017-06-13
|
SMCD-59
|
Canine kobuvirus
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,216 |
RefSeq
| null |
China
|
China
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2015-09
| null |
PRJNA485481
|
Canine kobuvirus isolate SMCD-59, complete genome
|
TTTAAGTGTTGTGCCCAATCTCTTGACTCCTGCTGGAACCACCGACCAGTAGTGTCCAAAATGCCAGGTGGAAAATCCTCCCTTCCCCTCTGGGCTTCATGCCCGGCATCCTCCCCCCAGCCTGACGTGCCACAGGCTGTGCAAAGACCCCGCGAAAGCTGCCAAAAGTGGCAATTGTGGGTCCCCCCTTTGTCAAGGCGTCGAGTCTTTCTCCCTTAAGGCTAGTCCTGTCAGTGAACTCTGTCGGGCAACTAGTGACGCCACTGCATGCCTCCGACCTCGGCCGCGGAGTGCTGCCCCCCAAGTCATGCCCCTGACCACAAGTTGTGCTGTCTGGCAAACATTGTCTGTGAGAATGTTCCGCTGTGGCTGCCAAGCCTGGTAACAGGCTGCCCCAGTGTGCGTAATTCTCATCCAGACTTCGGTCTGGCAACTTGCTGTTAAGACATGGCGTAAGGGGCGTGTGCCAACGCCCTGGAACGAGTGTCCACTCTAATACCCCGAGGAATGCTACGCAGGTACCCCTGGCTCGCCAGGGATCTGAGCGTAGGCTAATTGTCTAAGGGTATTTTCATTTCCCACCCTCTTCTTCTTGTTCATAATGGCAGGCAGAATGGAATCTCGTTCTGCGCGCTCCACTGTGAACTCTTTCTACCGCCTCACCTACATCACTGCTACTGACTACCAAGACTTCCTCTACCTACAGTCTTTCCCCCAAATGTCTTATCCCCTCCCCAAACCATCCTACTTCCCGTGTCCTTATTGCCACTGTGATGAGGAACACGGCTTCCTTTCCCCCGAGTCACTCTGTGGTGAAGGCTTCGAGCCCTGCCACAGGTGCACCAACCCCCTCCCCCGGCGCAAGTACAACATTGTGCCCCCCGAAGACTGGCTCCTGGACTCCAATGTCCAGGACTGGTTTGAGCCCCCCACCTTCCTCTCTGACTTTCAGCAGAAGGTCTTTGACAAGATCGCCCTGCTGTCTCTCCCAGGCCCTTTCCAAGCAAAAACTCCTGAAGAATTGGCCATCCTTGGAGCTCTCAAACAGCTCCTCAAATTCCCCGACCTCCCCCCCCAACGGATGCCCCTTGCTGTCAACCAACTCAAACCCCAAGGAAACTCTGTCACCAACATTTACGGCAATGGCAACAACGTCACCACTGATGTTGGCGCCAATGGCTGGACCCCCACTGTCTCTGTGGGCGTTGGAGACGCTCCCGTCTCCGCGTCCGCTGACCAGCTGCCTGGTCGCCCAGGTGGTGCTTCCTCTGACAAAGCCCACTCTTCCTCCTCCTCCAAAACCACCATCGAAACTGGCAATCGTGTAGGCTCCCGCTTCTCCAAGTGGTGGGAACCTGCCGCTGCCCGCGCTCTTGAGCGCGCCACCGATGCCGCCTGCGACGGCATCGAGGGAGCTGGGAAACTCGCTGGAAAGGCGATTTCCCGCAAGCTCACAGGCCCTGCCCCTGCCTCCTCTACCTCCACCCCTCAGCCTGGCCTGGCTGCTCTCAATCCATCTGCCACCCAGGCCGGGAACGCCGCGATCCTCACCGGGTCGACGGCACCCTCATTCCTTGCTTACCCCACTGCCTCCTCCGTCCCCCTCCCAAACCCGGATGAACCATCAATGCCGGGACCCTCAGGTGACCGTACCTGGCTCCTTGACACGGTCACTTGGGAACAGAGCCAAGAAGCCGGCTGGAACCTGGCCGGCAACAATGGCATGCTCTGGGGAGCCCTCGACAACCCTACATTCCCCATCTCATCATCCAACAACTGGGGAATCGAAGGGTCGGGCTCCCAAGCCATCTACCCTACTGCCTACCCCCTCCCCTTCTCCTTCGTGCGTGCGTACCCAGACTCTCCCTGGGCTGCCATGTACAATACCCACTCCATGTGGAACTGTGGTTGGCGCGTGCAGGTCACCGTCAACGGTTCACAGTTTCATGCTGGTGCCCTCATCCTCTACCTCATCCCAGAAGCCGCGACCAAAGCGATCGAGTCCGCCCGCCGCAACGCCGGCTTCGTCTACCCCTATGTCATCCTCAACCTCTATGAGAGCAACACCGCCACTCTAGAGGTCCCTTACATCTCCCCCACTCCCAACACCTCCTCCGGTCTCCATGCCCCCTGGACCTCCTACCTACAAGTCCTCTCACCACTCAACCCACCCACTGGTGTCCCCACCTCTCTTTCTTGCTCCATCTACGTCACCCCCATCGACTCCACCTTCCATGGCCTCCGCTACGTGGCGCCGCAACACTGGAAAACCCGGATCGTCCCGGGTGCCGGTGCCTTTGGCTCCGCCGTGGCTGGCCAAGAACTCCCCCTTTGTGGAGTTCGCGCTTTCTACCCCCCCAATGACTACATCCCTGCCAGGGTCCACGATTGGCTCGAGTTCGCTCACCGCCCTGGACTTATGGCCACCCTCCCCTGGACCATGGCCGAGGAGGCTGGCGACAGGCTCGCCATCCTCCCCGTCTCCCCAAGCGCCATTGCTGGTACTGGCGCTCCCATCTCCTACGTCCTCTCCCTCTTTTCCCAGTGGCGCGGTGAACTCGCCGCCCACCTCCTCTTCACTGGATCAGCCCAGCATTACGGCCGTCTGGTCGTATGCTACACCCCCGCTGCCCCCAACCCTCCCCAAACCATGCAGGACGCCATGCGCGGTACCTACACCGTGTGGGACGTCAATGCAGCCTCCACCCTCGAATTCACCATCCCCTTCATCTCCCAGTCCTACTGGAAGACAGTGGACATCTTCAACCCTGATGCCCTCCTCTCCACCACAGGCTACCTCTCTGTGTGGGTCCTGAATCCTCTCACAGGACCCCATTCTGCCCCCGCTTCTGCCCTCATCCAAGGCTTCCTTTCCGCGGGCGAATCCTTTAACGTCCGCTTCATGCAAAACCCCGCCCTCACCTCCCAGGCGAACTCAGAAGATCTCAATGCACCGCAGGACACTGCCAACATTGAGAATGGTGCTTCTGACAACACACCTCAGCCACGCACCACCTTTGAGTACACCGAAAATTCCCTCCCTCCTGACTCCAATCTGGAAAATTTCTTCTCATTCTACCGCCTCCTCCCTCTCGGCTCTAACACCCAACCCTCCATCCCTGTCCCTGACGGTGCCGTCGCCCGGCTGCCACTGGATCCACTCAACTGGCAGCAGTCGGCCGACGTTGCCGGTCTCACCGCGATGCTCTCCTGCTTCACCTACATTGCAGCTGACCTTCGCTTCACCCTTCGCATCTCTAACCCCAATGGTCTCCCCACCTCTCTGCTGATTGCTTACGCCCCCCCCGGTGCTACAATCCCTCAGAGTCCTGACCGCCAAACACTGTCCAACTTCTTCATGGCGGAAACACCCATCCCCATGTCAGACACAACTCTCATCTCCTTTTCCATTCCCTACACCTCCCCTCTCTCAGCCATCCCCACCTCCTACTATGGCTGGGAGGATTGGTCTGGTACCAACTTTGGTGTCCTCCAGGCTGGCTCCTGGGGCACCCTCCTCTTCCTCCCCTCCTATCCACAACAAATTGTCCAACCGCAACCCTTGACCATCACCGCATGGGTCGCCTTTGGCAACTTCAAAGGGTGGGTCCCCCGCGCCCCACCTCCCCTCCCGCCCCTTCCCACTCCCGAAACCAATCCGGAAAAATCTGTGGCCGTCGTCAAACAGGGAGCTCACACCTCCCTGGGAGATGTCGACCCAGATGACCGTGTCTACATCGTTCGTGCAGATAGGCCCACCTATGTGCACTGGGCGCTCCGAAAGGTCGCCCGCGATGGAAGCACAAAGCAAATTTCCCTCTCCCGTGACAAGACCACTGCGGTTGTCGCCTACGAACCGCTCGAAGGTGAACTCTACCAAGAGGTCTTCCCCTCCGCTTGGACCATCGCCGAACTCCAACTCGGCAAACCGTGGGAGTACAGTGCAACACATAACTGTACCCACTTCGTCCAAGGTGCCACTAATGTGGAACTTCCCAACACCGGCTTCTCATTGGCTCTTGGAGTCGGTGCCCTTGCCCTTGTCGCAGCCTCGGCTGCTGGTGCCGTGCAAGCACTCAAAGGCATCAAGCGCCAAGGTCTCCTCACCCTGACCGCTGACGCTGACACCAACCGCACCCTCACCCGCATCTCAGAATCTGTCACCCAAGCCACCCAAGCTGTCACCAACTTTGATCTGCAAGGTCCCGCAAATTCTGTCACTCTTGCTGCTTCTGACATCCGTGAGGCCGCCACCAGGGTCGCTTCGTCCCTGGACGGTTTCACGGACGTTCTCCACGATCTCAAATCCTCTCTCTTCTCCCGAGTCTCAGACGCTGTCGAGGCCGGGGTCGTGTCCTTCCTCACTTGGCTGGCCAAGATCTTTGGATACCTCCTCGTCCTCTTCGGTTCTCCCACCCCCATGTCCATCTCTGGACTCCTCGTCATCATCTGTGCTGACCTTGCCCCCCACGCCCGCGACTTCTTCGCCGCCACCGGCAATGTCCTCTCTTCCCTCTACTACTGGATTGCCACCAAACTTGGCTTTTCAGTAACCCCTGAAGAATGTGAACAGGCAACCCTTGAGCCGCAAGGCCTCAAGGACTTCAATGACGGTGCACTCGCCATGCGAAATGTCGAGTGGATCGGAGAAACTGCCTGGAAATGGGCCCAGCGGATCCTCACTTGGATTCGCGGAAAGGCCCAGACTGACCCCCAAGCCAAACTTGCTGATGCACATGACGAAATCATGATGCATTACTCGGATTCCATATTGGCCCTCGGAACCGAGAAACCCCCGGTGGAGCACATCACCACCGCAATTTCACGCTGTCGTGAGCTCGTCACGATAGCTCAGGATGCGAAATCAGGCCCCCACTCTGCATTCCTGAACCAGGCCCTCAAAAACTACACCCTTGCCCTCTCCCAACACCGCAAGCGCCAAGTCGGGCCCCGCCCCGAACCCGTTGTGGTCTACCTCTATGGACCACCGGGCACTGGCA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| 4,354 |
OP093966.1
|
Canine kobuvirus
|
de Deus,D.R., Siqueira,J.A.M., Cardoso,B.T.M., Teixeira,D.M., Maues,M.A.C., de Figueiredo,M.J.F.M., Junior,E.C.S., Bandeira,R.S., Pinheiro,K.C., Guerra,S.F.S., Soares,L.S., Resque,H.R., da Silva,L.D., Gabbay,Y.B.
|
Evandro Chagas Institute, Virology
|
Brazil
|
2022-10-26
|
PK02
|
Canine kobuvirus
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,209 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2019
| null | null |
Canine kobuvirus strain CaKoV/PK02/2019/BRA, complete genome
|
ACCAAGTGTGTGCCCAATCCCTTGACTCCTGCTGGAACCACCGACCAGCAGTGTCCAAAATGCTAGGTGGAAAATCCTCCCCTCCCCTCTGGGCTCCATGCCCAGCATCCTCCCCCCAGCCTGACGTGCTACAGGCTGTGCAAAGACCCCGCGAAAGCTGCCAAAAGTGGCAATTGTGGGTCCCCCCTTTGTCAAGGCGTCGAGTCTTTCTCCCTTAAGGCTAGACCTGCCAGTGAATTCTGTCGGGCAACTAGTGACGCCACTGCATGCCTCCGACCTCGGCTGCGGAGTGCTGCCCCCCAAGCCGTGCCCCTGACTACAAGTTGTGCTGTCTGGCAAACACTGTCTGTGAGAATGTTCCGCTGTGGCTGCCAAGCCTGGTAACAGGCTGCCCCAGTGTGCGTAGTTCTCATCCAGACTTCGGTCTGGCAACTTGCTGTTAAGACATGGCGTAAGGGGCGTGTGCCAACGCCCTGGAACGAGTGTCCACTCTAATACCCCGAGGAATGCTACGCAGGTACCCCTGGCTTGCCAGGGATCTGAGCGTAGGCTAATTGTCTAAGGGTATTTTCATTTCCTACTCTCTCTCTCTTGTTCATAATGGCAGGCAGAATGGAATCTCGTTCTGTGCGCTCCACTGTGAACTCTTTCTACCGCCTCACCTACATCACTGCTACTGACTACCAGGACTTCCTCTACCTCCAGTCCTTCCCTCAAATGTCCTACCCCCTCCCCAAACCCTCCTACTTCCCGTGTCCATATTGCCACTGCGATGAGGAACACGGATTCCTCTCCCCCGAGTCACTGTGTGGTGAAGGCTTCGAGCCTTGCCACAGGTGTACTAACCCCCCACCCCGACGCAAGTACAACATTGTGCCCCCCGAGGACTGGCTCCTGGACTCCAACGTCCAGGACTGGTTTGAACCTCCCACTTTCCTCTCTGACTTCCAGCAAAAGGTCTTCGACAAGATCGCCCTGCTATCCCTCCCAGGCCCTTTCCAAGCAAAAACTCCTGAAGAATTGGCCATTCTCGGAGCTCTCAAACAGCTCCTCAAATTCCCCGACCTCCCCCCCCAACGGATGCCCCTTGCTGTCAACCAAATCAAGCCCCAAGGAAATTCTGTCACCAACATCTACGGCAATGGCAACAACGTCACCACCGACGTTGGGGCCAATGGCTGGACCCCCACTGTCTCCGTCGGCGTCGGAGATGCTCCTGTCTCCGCGTCTGCTGACCAGCTACCTGGACGCCCAGGTGGCGCCTCCTCTGACAAAGCCCACTCCTCCTCCTCTTCCAAAACCACCATTGAGACTGGTAATCGCGTCGGTTCCCGCTTCTCCAAGTGGTGGGAGCCTGCCGCTGCCCGCGCTCTCGAGCGCGCCACCGATGCCGCCTGTGACGGCATCGAAGGAGCTGGGAAACTCGCTGGAAAAGCGATTTCCAAAAAGCTCGCAGGCCCAACCCCTGCCTCCTCCACTGCCACCCCCCAACCAGGCCTTGCCGCACTCAACCCATCTGCGACTCAGGCCGGAAACGCCGCCATCCTCACTGGGTCGACGGCGCCCTCCTTCCTCGCTTACCCCACTGCCTCTTCTGTCCCCCTTCCCAACCCGGATGAACCATCCATGCCGGGACCCTCCGGTGACCGCACCTGGCTCCTTGACACGGTCACCTGGGAGCAAAGCCAACAAGCTGGCTGGAACCTGGCCGGCAACAATGGCATGCTCTGGGGAGCCCTCGATAACCCTACCTTCCCCATCTCCTCATCCAACAACTGGGGAATCGAAGGGTCGGGCTCCCAAGCCATCTATCCCACTGCCTACCCACTCCCTTTCTCATTCGTGCGTGCGTACCCAGACTCCCCCTGGGCTGCCATGTACAACACCCACTCCATGTGGAACTGCGGCTGGCGCGTGCAAGTCACCGTCAACGGTTCACAGTTCCATGCTGGTGCCCTCATCCTCTACCTCATCCCCGAGGCCGCGACCAAAGCGATCGAGTCCGCTCGGCGCAACGCTGGCTTCGTCTACCCTTATGTCATCCTCAACCTCTACGAAAGCAATACCGCAACTCTAGAGGTGCCCTACATCTCTCCCACTCCCAACACCTCCTCTGGCCTCCATGCCCCCTGGACCTTCTACCTACAAGTTCTTTCCCCACTCAACCCACCTACCGGTGTTCCCACTTCTCTCTCCTGCTCCATCTATGTCACCCCCATTGACTCCACCTTCCATGGCCTCCGTTACGTGGCGCCGCAACACTGGAAAACCCGGATCGTCCCGGGTGCCGGTGCTTTCGGCTCTGCCGTGGCTGGCCAAGAACTCCCCCTCTGTGGAGTTCGAGCCTTCTACCCCCCCAACAGTTACATCCCAGCTAGAGTCCATGACTGGCTTGAGTTCGCTCACCGTCCTGGGCTCATGGCCACCCTCCCCTGGACCATGGCCGAGGAGGCTGGCGACAGGCTCGCCATCCTCCCCGTCTCCCCAAGCGCCATTGCTGGCACTGGCGCCCCCATTTCCTATGTCCTCTCCCTCTTCTCCCAATGGCGCGGTGAACTCGCCGCCCACCTCCTCTTTACCGGATCTGCCCAGCACTACGGCCGTCTGGTCGTGTGCTACACTCCCGCTGCCCCCAACCCTCCCCAAACCATGCAAGACGCGATGCGCGGTACCTACACCGTGTGGGACGTCAACGCAGCCTCCACCCTCGAATTCACCATCCCCTTCATCTCCCAGTCCTACTGGAAGACAGTGGACATCTTCAACCCTGATGCCCTCCTCTCAACCACTGGCTACCTCTCCGTGTGGGTCCTGAACCCTCTCACAGGGCCCCACTCTGCCCCTGCTTCCGCCCTCATCCAAGGCTTCCTTTCCGCGGGCGAATCCTTCAACGTCCGCTTCATGCAGAACCCCGCCCTCACCTCCCAGGCAAACTCAGAAGAACTCAATGCGCCGCAGGACACTGCCAACATTGAGAATGGTGCTGCTGACAACTCACCTCAGCCACGCACTACCTTCGAGTACACCGAAAACTCCCTCCCCCCTGACTCCAATCTTGAGAACTTCTTCTCTTTCTACCGCCTACTCCCCCTCGGCTCTGCCACCAACCCTTCCATCCCCCTTCCAAACGGCACAGTCGCACAGCTGCCACTGGACCCACTCCATTGGCAACAATCTGCTGACGTCGCCGGGCTCACCGCAATGCTTTCCTGCTTTACCTACATTGCTGCTGACCTCCGTTTCACACTCCGCATCTCCAATCCAAATGGTCTCCCCACTTCTGTCCTGATTGCTTACGCCCCTCCCGGTGCCACAATCCCACAGAACCCTGACCGCCAGATGCTTTCCAATTTCTTCATGGCCGAGACTCCCATCTCGGAATCCAACACCACTCTCATCTCCTTCTCTATCCCCTACACCTCGCCCCTCTCAGCCATCCCCACTTCCTATTATGGCTGGGAGGATTGGTCTGGAACCAACTTCGGCGTTCTCCAGGCTGGCTCCTGGGGAACCCTCCTTTTCCTACCCACCTACCCCGTGGAGGATGTCCAACCGTCCCCCATGTCCATCACCGCTTGGATTGCCTTCGGCAATTTCAAGGGGTGGGTGCCCCGTGCCCCTCCCCCTCTTCCTCCTCTCCCCACCCCCGCCACCACCCCGGAAAAGTCTGTAGCCGTCGTCAAACAGGGAGCCCACGCCTCCCTGGGAGATGTCGACCCAGACGATCGTGTCTACATCGTCCGTGCAGATAGGCCCACCTATGTGCACTGGGCGCTCCGAAAGGTCGCCCGCGATGGAAGCACAAAACAAATTTCCCTCTCCCGTGACAAGACCACCGCGGTTGTCGCCTACGAACCACTCGAAGGCGAACTTTACCAGGAGGTCTTCCCCTCCGCCTGGACCATTGCCGAACTCCAACTCGGCAAGCCCTGGGAGTACAGTGCAACACACAACTGTACTCACTTTGTCCAAGGTGCCACCAATGTGGAACTTCCCAACACCGGCTTCTCATTGGCTCTTGGAGTCGGTGCTCTTGCCCTTGTCGCAGCCTCGGCTGCTGGTGCCGTGCAAGCACTCAAAGGCATCAAGCGCCAAGGTCTCCTCACCCTGACCGCTGACGCTGACACCAACCGCACCCTTACCCGCATTTCAGAATCTGTCACCCAAGCCACCCAAGCTGTCACTAACTTTGACCTTCAAGGCCCCGCAAATTCTGTCACCCTCGCTGCTTCCGACATTCGTGAGGCTGCCACCAGGGTCGCCTCGTCCCTGGATGGTTTCACGGATGTCCTCCATGACCTCAAATCTTCTCTCTTCTCCCGTGTTTCTGACGCTGTCGAGGCCGGGGTTGTGTCCTTCCTCACTTGGCTGGCCAAGATCTTTGGATACCTCCTCGTCCTCTTCGGTTCCCCCACCCCCATGTCCATCTCTGGACTCCTCGTCATCATCTGTGCTGACCTTGCCCCCCATGCCCGCGACTTCTTCGCCGCTACCGGCAATGTCCTCTCCTCCCTTTACTACTGGATAGCCACCAAACTTGGCTTTTCAGTGACCCCTGAAGAATGTGAACAGGCAACCCTCGAGCCGCAAGGCCTCAAGGACTTCAATGACGGTGCACTCGCCATGCGCAATGTCGAGTGGATCGGAGAAACTGCCTGGAAATGGGCTCAACGGATCCTCACCTGGATTCGCGGAAAAGCCCAAACTGACCCCCAAGCCAAACTTGCTGATGCACATGACGAAATCATGATGCATTACTCGGATTCCATATTGGCCCTTGGAACCGAGAAACCCCCGGTGGACCACATCACCACCGCAATTTCACGCTGTCGTGAACTCGTCACGATAGCTCAGGATGCAAAATCTGGCCCCCACTCTGCATTCCTGAACCAGGCCCTCAAAAACTACACCCTTGCCCTCTCCCAACACCGCAAGCGCCAAGTCGGGCCCCGCCCCGAACCCGTTGTGGTCTACCTCTACGGACCACCGGGCACTGGCAA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| 22,596 |
OP093967.1
|
Canine kobuvirus
|
de Deus,D.R., Siqueira,J.A.M., Cardoso,B.T.M., Teixeira,D.M., Maues,M.A.C., de Figueiredo,M.J.F.M., Junior,E.C.S., Bandeira,R.S., Pinheiro,K.C., Guerra,S.F.S., Soares,L.S., Resque,H.R., da Silva,L.D., Gabbay,Y.B.
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Evandro Chagas Institute, Virology
|
Brazil
|
2022-10-26
|
PK01
|
Canine kobuvirus
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,216 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2019
| null | null |
Canine kobuvirus strain CaKoV/PK01/2019/BRA, complete genome
|
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| 22,597 |
OP093968.1
|
Canine kobuvirus
|
de Deus,D.R., Siqueira,J.A.M., Cardoso,B.T.M., Teixeira,D.M., Maues,M.A.C., de Figueiredo,M.J.F.M., Junior,E.C.S., Bandeira,R.S., Pinheiro,K.C., Guerra,S.F.S., Soares,L.S., Resque,H.R., da Silva,L.D., Gabbay,Y.B.
|
Evandro Chagas Institute, Virology
|
Brazil
|
2022-10-26
|
PK04
|
Canine kobuvirus
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,209 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Canis lupus familiaris
|
feces
|
2019
| null | null |
Canine kobuvirus strain CaKoV/PK04/2019/BRA, complete genome
|
ACCAAGTGTGTGCCCAATCCCTTGACTCCTGCTGGAACCACCGACCAGCAGTGTCCAAAATGCTAGGTGGAAAATCCTCCCCTCCCCTCTGGGCTCCATGCCCAGCATCCTCCCCCCAGCCTGACGTGCTACAGGCTGTGCAAAGACCCCGCGAAAGCTGCCAAAAGTGGCAATTGTGGGTCCCCCCTTTGTCAAGGCGTCGAGTCTTTCTCCCTTAAGGCTAGACCTGCCAGTGAATTCTGTCGGGCAACTAGTGACGCCACTGCATGCCTCCGACCTCGGCTGCGGAGTGCTGCCCCCCAAGCCGTGCCCCTGACTACAAGTTGTGCTGTCTGGCAAACACTGTCTGTGAGAATGTTCCGCTGTGGCTGCCAAGCCTGGTAACAGGCTGCCCCAGTGTGCGTAGTTCTCATCCAGACTTCGGTCTGGCAACTTGCTGTTAAGACATGGCGTAAGGGGCGTGTGCCAACGCCCTGGAACGAGTGTCCACTCTAATACCCCGAGGAATGCTACGCAGGTACCCCTGGCTTGCCAGGGATCTGAGCGTAGGCTAATTGTCTAAGGGTATTTTCATTTCCTACTCTCTCTCTCTTGTTCATAATGGCAGGCAGAATGGAATCTCGTTCTGTGCGCTCCACTGTGAACTCTTTCTACCGCCTCACCTACATCACTGCTACTGACTACCAGGACTTCCTCTACCTCCAGTCCTTCCCTCAAATGTCCTACCCCCTCCCCAAACCCTCCTACTTCCCGTGTCCATATTGCCACTGCGATGAGGAACACGGATTCCTCTCCCCCGAGTCACTGTGTGGTGAAGGCTTCGAGCCTTGCCACAGGTGTACTAACCCCCCACCCCGACGCAAGTACAACATTGTGCCCCCCGAGGACTGGCTCCTGGACTCCAACGTCCAGGACTGGTTTGAACCTCCCACTTTCCTCTCTGACTTCCAGCAAAAGGTCTTCGACAAGATCGCCCTGCTATCCCTCCCAGGCCCTTTCCAAGCAAAAACTCCTGAAGAATTGGCCATTCTCGGAGCTCTCAAACAGCTCCTCAAATTCCCCGACCTCCCCCCCCAACGGATGCCCCTTGCTGTCAACCAAATCAAGCCCCAAGGAAATTCTGTCACCAACATCTACGGCAATGGCAACAACGTCACCACCGACGTTGGGGCCAATGGCTGGACCCCCACTGTCTCCGTCGGCGTCGGAGATGCTCCTGTCTCCGCGTCTGCTGACCAGCTACCTGGACGCCCAGGTGGCGCCTCCTCTGACAAAGCCCACTCCTCCTCCTCTTCCAAAACCACCATTGAGACTGGTAATCGCGTCGGTTCCCGCTTCTCCAAGTGGTGGGAGCCTGCCGCTGCCCGCGCTCTCGAGCGCGCCACCGATGCCGCCTGTGACGGCATCGAAGGAGCTGGGAAACTCGCTGGAAAAGCGATTTCCAAAAAGCTCGCAGGCCCAACCCCTGCCTCCTCCACTGCCACCCCCCAACCAGGCCTTGCCGCACTCAACCCATCTGCGACTCAGGCCGGAAACGCCGCCATCCTCACTGGGTCGACGGCGCCCTCCTTCCTCGCTTACCCCACTGCCTCTTCTGTCCCCCTTCCCAACCCGGATGAACCATCCATGCCGGGACCCTCCGGTGACCGCACCTGGCTCCTTGACACGGTCACCTGGGAGCAAAGCCAACAAGCTGGCTGGAACCTGGCCGGCAACAATGGCATGCTCTGGGGAGCCCTCGATAACCCTACCTTCCCCATCTCCTCATCCAACAACTGGGGAATCGAAGGGTCGGGCTCCCAAGCCATCTATCCCACTGCCTACCCACTCCCTTTCTCATTCGTGCGTGCGTACCCAGACTCCCCCTGGGCTGCCATGTACAACACCCACTCCATGTGGAACTGCGGCTGGCGCGTGCAAGTCACCGTCAACGGTTCACAGTTCCATGCTGGTGCCCTCATCCTCTACCTCATCCCCGAGGCCGCGACCAAAGCGATCGAGTCCGCTCGGCGCAACGCTGGCTTCGTCTACCCTTATGTCATCCTCAACCTCTACGAAAGCAATACCGCAACTCTAGAGGTGCCCTACATCTCTCCCACTCCCAACACCTCCTCTGGCCTCCATGCCCCCTGGACCTTCTACCTACAAGTTCTTTCCCCACTCAACCCACCTACCGGTGTTCCCACTTCTCTCTCCTGCTCCATCTATGTCACCCCCATTGACTCCACCTTCCATGGCCTCCGTTACGTGGCGCCGCAACACTGGAAAACCCGGATCGTCCCGGGTGCCGGTGCTTTCGGCTCTGCCGTGGCTGGCCAAGAACTCCCCCTCTGTGGAGTTCGAGCCTTCTACCCCCCCAACAGTTACATCCCAGCTAGAGTCCATGACTGGCTTGAGTTCGCTCACCGTCCTGGGCTCATGGCCACCCTCCCCTGGACCATGGCCGAGGAGGCTGGCGACAGGCTCGCCATCCTCCCCGTCTCCCCAAGCGCCATTGCTGGCACTGGCGCCCCCATTTCCTATGTCCTCTCCCTCTTCTCCCAATGGCGCGGTGAACTCGCCGCCCACCTCCTCTTTACCGGATCTGCCCAGCACTACGGCCGTCTGGTCGTGTGCTACACTCCCGCTGCCCCCAACCCTCCCCAAACCATGCAAGACGCGATGCGCGGTACCTACACCGTGTGGGACGTCAACGCAGCCTCCACCCTCGAATTCACCATCCCCTTCATCTCCCAGTCCTACTGGAAGACAGTGGACATCTTCAACCCTGATGCCCTCCTCTCAACCACTGGCTACCTCTCCGTGTGGGTCCTGAACCCTCTCACAGGGCCCCACTCTGCCCCTGCTTCCGCCCTCATCCAAGGCTTCCTTTCCGCGGGCGAATCCTTCAACGTCCGCTTCATGCAGAACCCCGCCCTCACCTCCCAGGCAAACTCAGAAGAACTCAATGCGCCGCAGGACACTGCCAACATTGAGAATGGTGCTGCTGACAACTCACCTCAGCCACGCACTACCTTCGAGTACACCGAAAACTCCCTCCCCCCTGACTCCAATCTTGAGAACTTCTTCTCTTTCTACCGCCTACTCCCCCTCGGCTCTGCCACCAACCCTTCCATCCCCCTTCCAAACGGCACAGTCGCACAGCTGCCACTGGACCCACTCCATTGGCAACAATCTGCTGACGTCGCCGGGCTCACCGCAATGCTTTCCTGCTTTACCTACATTGCTGCTGACCTCCGTTTCACACTCCGCATCTCCAATCCAAATGGTCTCCCCACTTCTGTCCTGATTGCTTACGCCCCTCCCGGTGCCACAATCCCACAGAACCCTGACCGCCAGATGCTTTCCAATTTCTTCATGGCCGAGACTCCCATCTCGGAATCCAACACCACTCTCATCTCCTTCTCTATCCCCTACACCTCGCCCCTCTCAGCCATCCCCACTTCCTATTATGGCTGGGAGGATTGGTCTGGAACCAACTTCGGCGTTCTCCAGGCTGGCTCCTGGGGAACCCTCCTTTTCCTACCCACCTACCCCGTGGAGGATGTCCAACCGTCCCCCATGTCCATCACCGCTTGGATTGCCTTCGGCAATTTCAAGGGGTGGGTGCCCCGTGCCCCTCCCCCTCTTCCTCCTCTCCCCACCCCCGCCACCACCCCGGAAAAGTCTGTAGCCGTCGTCAAACAGGGAGCCCACGCCTCCCTGGGAGATGTCGACCCAGACGATCGTGTCTACATCGTCCGTGCAGATAGGCCCACCTATGTGCACTGGGCGCTCCGAAAGGTCGCCCGCGATGGAAGCACAAAACAAATTTCCCTCTCCCGTGACAAGACCACCGCGGTTGTCGCCTACGAACCACTCGAAGGCGAACTTTACCAGGAGGTCTTCCCCTCCGCCTGGACCATTGCCGAACTCCAACTCGGCAAGCCCTGGGAGTACAGTGCAACACACAACTGTACTCACTTTGTCCAAGGTGCCACCAATGTGGAACTTCCCAACACCGGCTTCTCATTGGCTCTTGGAGTCGGTGCTCTTGCCCTTGTCGCAGCCTCGGCTGCTGGTGCCGTGCAAGCACTCAAAGGCATCAAGCGCCAAGGTCTCCTCACCCTGACCGCTGACGCTGACACCAACCGCACCCTTACCCGCATTTCAGAATCTGTCACCCAAGCCACCCAAGCTGTCACTAACTTTGACCTTCAAGGCCCCGCAAATTCTGTCACCCTCGCTGCTTCCGACATTCGTGAGGCTGCCACCAGGGTCGCCTCGTCCCTGGATGGTTTCACGGATGTCCTCCATGACCTCAAATCTTCTCTCTTCTCCCGTGTTTCTGACGCTGTCGAGGCCGGGGTTGTGTCCTTCCTCACTTGGCTGGCCAAGATCTTTGGATACCTCCTCGTCCTCTTCGGTTCCCCCACCCCCATGTCCATCTCTGGACTCCTCGTCATCATCTGTGCTGACCTTGCCCCCCATGCCCGCGACTTCTTCGCCGCTACCGGCAATGTCCTCTCCTCCCTTTACTACTGGATAGCCACCAAACTTGGCTTTTCAGTGACCCCTGAAGAATGTGAACAGGCAACCCTCGAGCCGCAAGGCCTCAAGGACTTCAATGACGGTGCACTCGCCATGCGCAATGTCGAGTGGATCGGAGAAACTGCCTGGAAATGGGCTCAACGGATCCTCACCTGGATTCGCGGAAAAGCCCAAACTGACCCCCAAGCCAAACTTGCTGATGCACATGACGAAATCATGATGCATTACTCGGATTCCATATTGGCCCTTGGAACCGAGAAACCCCCGGTGGACCACATCACCACCGCAATTTCACGCTGTCGTGAACTCGTCACGATAGCTCAGGATGCAAAATCTGGCCCCCACTCTGCATTCCTGAACCAGGCCCTCAAAAACTACACCCTTGCCCTCTCCCAACACCGCAAGCGCCAAGTCGGGCCCCGCCCCGAACCCGTTGTGGTCTACCTCTACGGACCACCGGGCACTGGCAA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| 22,598 |
MN337880.1
|
Canine kobuvirus
|
van Dyck,L., Pfankuche,V.M., Jo,W.K., Kaiser,F.K., Wohlsein,P., Peters,M., Baumann,I., Jung,K., Osterhaus,A., Baumgartner,W., Ludlow,M.
|
University of Veterinary Medicine Hannover Foundation, Research Center for Emerging Infections and Zoonoses (RIZ)
|
Germany
|
2020-03-04
| null |
Canine kobuvirus
|
Kobuvirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,312 |
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Vulpes vulpes
| null |
2016-04-13
| null | null |
Canine kobuvirus strain S272/16, complete genome
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