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|
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|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
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|
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Cherry rusty mottle associated virus
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|
Betaflexiviridae
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| 37,163 |
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|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13C237
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,390 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus persica
| null |
2013
| null | null |
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|
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| 37,164 |
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|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13C286
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,405 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus
| null |
2013
| null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 13C286, complete genome
|
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| 37,165 |
MZ221022.1
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13TF134
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,405 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus
| null |
2013
| null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 13TF134, complete genome
|
GAAAACAAACAGACCAAAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGCACGTAGGCTTGCAGTCTGCCCTCTTCGAACCTAATCAGTTCTAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACAATCACACCTGCTGAAGGTGTTCTTGCTCAATTCTCTTCGGAGGAAGCTAGTAGAATTGGAGCTTCCGCAATCTCCAATTTCTCTAAGCTTGAGTCAGAATACCATTCTCTTTTCCATTACCACCTCCCTGCTTATGCCAAAAACAAGCTCTCAAGCAGGGGTTTTTACCTCTCACCATTCTCTTATGAGACTCATAGTCACCCTGTAAGTAAAACTATTGAGTCCCACTTGATAAATGTCAAGCTTCCTCATTACATTAGTGAGGAATTTTTGATTGTTGGTATTAAAGATAATAAACTCAGTGTTCTAAGAAAAGAAAAAAAATTGAGATTCCTAGAAGCCCTAAATCGCTGCGTGACGTCTCACGATATTCAGAGGTATGGACCCAGCTTCCATTTTGAAAAGGCTAAATCAAACTGGAAGAGCAACTTTTCCGATGTCAACCTCTCCGCTGGTGTTCAGAGTTTATTGCCAAGGGTTCTGTTTGATAAAGGAAGGCTATTTGACGCCCAGATATTTTTGTATGATGAACTTCATTACTGGAGCTTGAAGGATATTGTTGACTTCCTTGAAATTTCTAGGGCAAAAACTGTGATTGGTTCCTTTGTGTTTCCTTCAGAAATCCTGGCTGGAGCCAGAACGAGTCTGAATCCCTGGGCATATGAATTTAAAATTGAAGGGGAGAAATTGATATATGCTCCTGATGGGGTTTGGGCTGAATCCTATGAGCAGCCCCTTGCTGCAGGTCAAATTTTAAGGTATAATAAGATCATGACTAGGAATGGTAATTACTCTGTTCAAGTTAGGGACTCCATCTTTAGTCACTGTCTTGTTATCATCAACAGAGATGATTTGATTAATGAGGAATTCAGGGTTTTCAGTGACTTTGATGCCATTTCTATTCGTAGAATTGGTTACCTTGGTGGGAATGCTGATGATATAATTCCAGTCAGGCATGAGGTCGTTCTGTCAATATTTAAGTATATTAGGACTCTCAAGAAGCCAGATCTACAATCTGGAATGGCCAAGCACAGACAGCTGGTTGATAACCCAACTGGGTTGGAAATCAGATTTATTGAGGACTTTGTTCACTTCATCCTGGAGCATCATGAAAAATTTAATCTCATTGAACAGAAATTTTCAAATTTCTTTAGTGCCGCCTGCATTGAAATGCTTCCCAGATACATGCAGAGATTTTTCAATAGCTTCAAGGGTTACAGTCTGGGTAAGTTCATTGAGGAGATAGAACCCTTTTCTTTCACATTAAAATGCAGGGTTTATTCAAGGTTTGGATTTAAAACTAGCTTTACTGATGAGGAAGAACAGCTCAACATCAAGAACGATCCCATGTGTCTTTTGATTGGCAATAATAGGGAATTGAGAGGTGATGATTGTGGTTACCCTGATTTGATTTTAAACGCTCACATCTCAGTGTTTGCTAATGCCCACCCCATGCTGGTTAAGATGCTTGTTAGAATCTTCATTAATGTTTGGGTGGGTAAAACTGGAGACAGTTATTATGAGTCACTTTTAGCTCTCAGGAAGAGTTTGAATCAGAAGGGCTCCAAGCTTTTCATGTTACATGATGAGAGGTACAATTCACTAGTGATTCTTGCCAATCTCACTGATTCTCATCTTTTCAAAAATCTCCTTAGAAATGAAGTAAGTAGGAGATTAAGGAGATCAGGCCACATCAGGGGTTTGCTGAGGAACGATCTTCCACCAGGTTGTCCAAACAGTAAAAGGGAGGTTAGGTTCCTCTCTTGCTACAATTACTTGGTCTCAGATCTCAAGAAAATCAGTGAAGAATGTTTACCAGTTTCTGCCCTAGTTCAAACTACTGGGTTGGAGGCACAACTCATGAACATGAAGAAACCATTTGGACTAGTCAAGCAAAAGTGTTTGAATAAGGAAGCTGCTCAAAAACCATTCTTGGGAGAAGTCACTAATAATAGTGCTGAAATCAATAAAGATCAAGCCTTGAGGTCTGTGGTTGCCAATGAGGGAGGTCCAAATGGAACATTCCACACCCCTCAACTTGCAGAAGGGATTCCAATTAAAGCTTCATCTGCCATGGTTAATAAGCATAGTAGTGATGCTTTCATTTCAAGCATTATCAGGGTGGGTCCTTTTAAGGATGCTGCAACCATATCTTTTGTAGAAAGTCTTGACTTTTCAGCTGGTTTCAAGCACAAGAATCGAACTGCTTTATTTTTCTCTAATGGTGGCTTTACATATGGCTTCAACAATGTGCTTTATGAATCAAGTGGGTGGCCTGCAGCTTTTAATGAATTGTATGGTGATAGATTCAACTCATGCTTAGTGCAGAAATATGATGAGGCTGCAACCCTTGGGTTTCATGCAGATGATGAGAAATGCTATGATCAAGATCATGAAGTTATGACAGTGAACTTGTTTGGGTCTGCCACCATCTCTTTCTCTAAGGGCAGTTTCTCTTCTGCCAATTCTAGCTATCCTGAACTTTACTTTGAAATGCAACTTGATCATGGGGATTGGCTTCTAATGCCAAAGACTTTTCAGAAAAGTTACAAGCACAGCATCAAAAACACCACTGTTGGCCGCATTTCTTTAACATTCAGAAAGCAAGCAAGAACTATGGATGGTTCTGTTATAGAGAGCTCTGTACCTAAAGGTGGACATGATGATAAGGGAGGAGAGCATGATTTTTACTTTGAAGAGATCAATAAATGCTCAATTGTTTCTGCTCCCGAAACTGTGAAGTGTAGCCTTTCAATATTCCCAGTTAAAGCTGATGGAGATTGCTTTTGGCATGCTGTCTCATCCATCTTTGGATTGGAGGCTCAGGAACTGAAGCAGCTTGTGAAAGAGAGGGCCATAGCAGAAGATTGTATAGATCAGCAACACATGAAGGATTTCTTGCATGAGATGGAGCCCAAAGTTTACGCTAGTAATGCGTCACTAGCTGCAACCTGTTACTTGATGAATTTGAAGCTAATAATCAAACTCACAGGTTTGGATGATGACAGTTGGGTTGTTGTTGAGCCATTGTCTTTATCAAATGAAAAGGCCTCCATCGGTTATCTTGTGCTGAATCAGAAGTGCCACCACTTTGATCTCGCTGTGCCTAAAGAAGGGTGTGTAGTTAGGGCAGTGAGTGAGTTCTTAAAACAAAATCCAACAAAAATTTTGAGTGTGCTTAGTGCCAACTGTTCGAAAGAATTGCTGCATGAATTGATGAGTGGCCTTGGGATTCAGGAATTCCATCTCGAAGAAATCTTTTCAATCTTTGATATCTGTGCTGAAGTTAGTGATGGCATCAGCTCCAGGGTTCTTAATAAAAAGGGTTCAAGAGCAGCTAAATTTGTTGTTGATAAGGATCACTTCTCTTTCTGCCCAGGAACCAAAGTTTCAACTAATCTGGGTGCCTTCAAGTCTCCAAGTGGCTGTGCTATGATAGCAATAGAGAAGTATGAGGAATTTTTAAAGACCAATGCAAATGTTGTTCCTTTTACTCCTTCTTTACCATTAGCCAGAAAATTGGCTGATTCCTTCTTGAGTGGCCAAACTGGGGTCATCAACTCAAAAATAGTTGCAGGGCAGTATGATTGGTTGTCCAACACCAATAAACTCTGCTTTGATGAAAGGAAGATTGGTGCCATTGTTGGCACTTTTGGATCGGGGAAGAGTCACAATGTTATCGAGTTGATAAGACATAACCTTGGCTACCAAAATCTGATTATATCCCCAAGGAGGAGTCTAAAGGATCAGTTTATTAGCATGCTTGATTTGGTGAGTGCTCGCAGCAAAGGAAAAAGAGCTTCAACTGAGGTTGTGACCTTTGAGGTTGCTCTCAAGAAGAATGGTCTTCTCAAGAAGGCTAGAATTTTTATTGATGAGGCTCAGCTTCTACCGCCTGGGTATCTAGACCTGATATGTTTGATTGCAGGCAGTGATTCATCAATTCTTGTGATGGGTGACCCAGCTCAGAGCAGTTATGACTCTGCTGAAGATAGAATGATGTTTGTTGGAGACAAGGGATGTCTCGATAGGCTCCTGGAAGGGAAGAAGTATGTGTACCTGAGTGAATCAAAGCGATTCCGGAATCCAATGTTTGTTGGTAGACTGCCATGCACTTTTGACTCAAACCGGCTCACCCTTGAAAAAGAGGAGTACGCTGTCTTTGACTCTTTCAAGAGCTTTAAAGCTGACTATTTGTCCCCAAAGATTAACACTTTCTTGGTTAGCTCCTTCACTGAAAAAACTGTGATTAAAGCTAATATGGGTCGAAATGTTTCCATATTCACTTTTGGTGAAAGCACGGGTATGAACTTTGATTACGTTTGTGTATTACTCACTCAGGACAGCATGCTAGTGGATGAAAGAAGGTGGGTAGTGGCATTATCAAGGGCAAAGATAAATATTTCATTCATTAACTTGTCTGGTCTTTCTTTGCCTGAATTCTGTACTCAAATGATGGGGGGGGTTGTCCATAAATTCTTTACATCTACTGCTACCTTCAATGATTTGCGAGAACTGCTGCCAGGCGATCCAATTTTTTCAAAAAGATTTCAGAGATTGGGTAAAGATGAGGTGAATAGAGAAGAGAGGCTCTCTGGGGACCCATGGTTGAAGACAAAGATTTTCTTGGGCCAGAGGGAAGAAAATGTTGAATCTGTCACTGCTAATGACGAAGGTCTCAAGGATATCAAGATCAAGGTGCACTGTCCAGTTGGTTCAATTGGCTCCACTTTAGCTGACATTCAAGCGGGGGTTAAAGTTAAGGAAGTAAGGGAGTTCAGGATAGATAATTTGGTCACTGAACAGTTCTCTGAGTCACACAAAGGTAAGGGGAAGGTTCTCACTGCTGCACCTGACAATTTTGAAGCCA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| 37,166 |
MZ221023.1
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
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2021-10-13
|
13TF135
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,405 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus
| null |
2013
| null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 13TF135, complete genome
|
GAAAACAAACAGACCAAAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGCGCGTAGGCTTGCAGTCTGCCCTCTTCGAACCTAATCAGTTCTAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACAATCACACCTGCTGAAGGTGTTCTTGCTCAATTCTCTTCGGAGGAAGCTAGTAGAATTGGAGCTTCCGCAATCTCCAATTTCTCTAAGCTTGAGTCAGAATACCATTCTCTTTTCCATTACCACCTCCCTGCTTATGCCAAAAACAAGCTCTCAAGCAGGGGTTTTTACCTCTCACCATTCTCTTATGAGACTCATAGTCACCCTGTAAGTAAAACTATTGAGTCCCACTTGATAAATGTCAAGCTTCCTCATTACATTAGTGAGGAATTTTTGATTGTTGGTATTAAAGATAATAAACTCAGTGTTCTAAGAAAAGAAAAAAAATTGAGATTCCTAGAAGCCCTAAATCGCTGCGTGACGTCTCACGATATTCAGAGGTATGGACCCAGCTTCCATTTTGAAAAGGCTAAATCAAACTGGAAGAGCAACTTTTCCGATGTCAACCTCTCCGCTGGTGTTCAGAGTTTATTGCCAAGGGTTCTGTTTGATAAAGGAAGGCTATTTGACGCCCAGATATTTTTGTATGATGAACTTCATTACTGGAGCTTGAAGGATATTGTTGACTTCCTTGAAATTTCTAGGGCAAAAACTGTGATTGGTTCCTTTGTGTTTCCTTCAGAAATCCTGGCTGGAGCCAGAACGAGTCTGAATCCCTGGGCATATGAATTTAAAATTGAAGGGGAGAAATTGATATATGCTCCTGATGGGGTTTGGGCTGAATCCTATGAGCAGCCCCTTGCTGCAGGTCAAATTTTAAGGTATAATAAGATCATGACTAGGAATGGTAATTACTCTGTTCAAGTTAGGGACTCCATCTTTAGTCACTGTCTTGTTATCATCAACAGAGATGATTTGATTAATGAGGAATTCAGGGTTTTCAGTGACTTTGATGCCATTTCTATTCGTAGAATTGGTTACCTTGGTGGGAATGCTGATGATATAATTCCAGTCAGGCATGAGGTCGTTCTGTCAATATTTAAGTATATTAGGACTCTCAAGAAGCCAGATCTACAATCTGGAATGGCCAAGCACAGACAGCTGGTTGATAACCCAACTGGGTTGGAAATCAGATTTATTGAGGACTTTGTTCACTTCATCCTGGAGCATCATGAAAAATTTAATCTCATTGAACAGAAATTTTCAAATTTCTTTAGTGCCGCCTGCATTGAAATGCTTCCCAGATACATGCAGAGATTTTTCAATAGCTTCAAGGGTTACAGTCTGGGTAAGTTCATTGAGGAGATAGAACCCTTTTCTTTCACATTAAAATGCAGGGTTTATTCACGGTTTGGATTTAAAACTAGCTTTACTGATGAGGAAGAACAGCTCAACATCAAGAACGATCCCATGTGTCTTTTGATTGGCAATAATAGGGAATTGAGAGGTGATGATTGTGGTTACCCTGATTTGATTTTAAACGCTCACATCTCAGTGTTTGCTAATGCCCACCCCATGCTGGTTAAGATGCTTGTTAGAATCTTCATTAATGTTTGGGTGGGTAAAACTGGAGACAGTTATTATGAGTCACTTTTAGCTCTCAGGAAGAGTTTGAATCAGAAGGGCTCCAAGCTTTTCATGTTACATGATGAGAGGTACAATTCACTAGTGATTCTTGCCAATCTCACTGATTCTCATCTTTTCAAAAATCTCCTTAGAAATGAAGTAAGTAGGAGATTAAGGAGATCAGGCCACATCAGGGGTTTGCTGAGGAACGATCTTCCACCAGGTTGTCCAGACAGTAAAAGGGAGGTTAGGTTCCTCTCTTGCTACAATTACTTGGTCTCAGATCTCAAGAAAATCAGTGAAGAATGTTTACCAATTTCTGCCCTAGTTCAAACTACTGGGTTGGAGGCACAACTCATGAACATGAAGAAACCATTTGGACTAGTCAAGCAAAAGTGTTTGAATAAGGAAGCTGCTCAAAAACCATTCTTGGGAGAAGTCACTAATAATAGTGCTGAAATCAATAAAGATCAAGCCTTGAGGTCTGTGGTTGCCAATGAGGGAGGTCCAAATGGAACATTCCACACCCCTCAACTTGCAGAAGGGATTCCAATTAAAGCTTCATCTGCCATGGTTAATAAGCATAGTAGTGATGCTTTCATTTCAAGCATTATCAGGGTGGGTCCTTTTAAGGATGCTGCAACCATATCTTTTGTAGAAAGTCTTGACTTTTCAGCTGGTTTCAAGCACAAGAATCGAACTGCCTTATTTTTCTCTAATGGTGGCTTTACATATGGCTTCAACAATGTGCTTTATGAATCAAGTGGGTGGCCTGCAGCTTTTAATGAATTGTATGGTGATAGATTCAACTCATGCTTAGTGCAGAAATATGATGAGGCTGCAACCCTTGGGTTTCATGCAGATGATGAGAAATGCTATGATCAAGATCATGAAGTTATGACAGTGAACTTGTTTGGGTCTGCCACCATCTCTTTCTCTAAGGGCAGTTTCTCTTCTGCCAATTCTAGCTATCCTGAACTTTACTTTGAAATGCAACTTGATCATGGGGATTGGCTTCTAATGCCAAAGACTTTTCAGAAAAGTTACAAGCACAGCATCAAAAACACCACTGTTGGCCGCATTTCTTTAACATTCAGAAAGCAAGCAAGAACTATGGATGGTTCTGTTATAGAGAGCTCTGTACCTAAAGGTGGACATGATGATAAGGGAGGAGAGCATGATTTTTACTTTGAAGAGATCAATAAATGCTCAATTGTTTCTGCCCCCGAAACTGTGAAGTGTAGCCTTTCAATATTCCCAGTTAAAGCTGATGGCGATTGCTTTTGGCATGCTGTCTCATCCATCTTTGGATTGGAGGCTCAGGAACTGAAGCAGCTTGTGAAGGAGAGGGCCATAGCAGAAGATTGTATAGATCAGCAACACATGAAGGATTTCTTGCATGAGATGGAGCCCAAAGTTTACGCCAGTAATGCGTCACTAGCTGCAACCTGTTACTTGATGAATTTGAAGCTAATAATCAAACTCACAGGTTTGGATGATGACAGTTGGGTTGTTGTTGAGCCATTGTCTTTATCAAATGAAAAGGCCTCCATCGGTTATCTTGTGCTGAATCAGAAGTGCCACCACTTTGATCTCGCTGTGCCTAAAGAAGGGTGTGTAGTTAGGGCAGTGAGTGAGTTCCTAAAACAAAATCCAACAAAAATTTTGAGTGTGCTTAGTGCCAACTGTTCGAAAGAATTGCTGCATGAATTGATGAGTGGCCTTGGGATTCAGGAATTCCATCTCGAAGAAATCTTTTCAATCTTTGATATCTGTGCTGAAGTTAGTGATGGCATCAGCTCCAGGGTTCTTAATAAAAAGGGTTCAAGAGCAGCTAAATTTGTTGTTGATAAGGATCACTTCTCTTTCTGCCCAGGAACCAAAGTTTCAACTAATCTGGGTGCCTTCAAGTCTCCAAGTGGCTGTGCTATGATAGCAATAGAGAAGTATGAGGAATTTTTAAAGACCAATGCAAATGTTGTTCCTTTTACTCCTTCTTTACCATTAGCCAGAAAATTGGCTGATTCCTTCTTGAGTGGCCAAACTGGGGTCATCAACTCAAAAATAGTTGCAGGGCAGTATGATTGGTTGTCCAACACCAATAAACTCTGCTTTGATGAAAGGAAGATTGGTGCCATTGTTGGCACTTTTGGATCGGGGAAGAGTCACAATGTTATCGAGTTGATAAGACATAACCTTGGCTACCAAAATCTGATTATATCCCCAAGGAGGAGTCTAAAGGATCAGTTTATTAGCATGCTTGATTTGGTGAGTGCTCGCAGCAAAGGAAAAAGAGCTTCAACTGAGGTTGTGACCTTTGAGGTTGCTCTCAAGAAGAATGGTCTTCTCAAGAAGGCTAGAATTTTTATTGATGAGGCTCAGCTTCTACCGCCTGGGTATCTAGACCTGATATGTTTGATTGCAGGCAGTGATTCATCAATTCTTGTGATGGGTGACCCAGCTCAGAGCAGTTATGACTCTGCTGAAGATAGAATGATGTTTGTTGGAGACAAGGGATGTCTCGATAGGCTCCTGGAAGGGAAGAAGTATGTGTACCTGAGTGAATCAAAGCGATTCCGGAATCCAATGTTTGTTGGTAGACTGCCATGCACTTTTGACTCAAACCGGCTCACCCTTGAAAAAGAGGAGTACGCTGTCTTTGACTCTTTCAAGAGCTTTAAAGCTGACTATTTGTCCCCAAAGATTAACACTTTCTTGGTTAGCTCCTTCACTGAAAAAACTGTGATTAAAGCTAATATGGGTCGAAATGTTTCCATATTCACTTTTGGTGAAAGCACGGGTATGAACTTTGATTACGTTTGTGTATTACTCACTCAGGACAGCATGCTAGTGGATGAAAGAAGGTGGGTAGTGGCATTATCAAGGGCAAAGATAAATATTTCATTCATTAACTTGTCTGGTCTTTCTTTGCCTGAATTCTGTACTCAAATGATGGGGGGGGTTGTCCATAAATTCTTTACATCTACTGCTACCTTCAATGATTTGCGAGAACTGCTGCCAGGCGATCCAATTTTTTCAAAAAGATTTCAGAGATTGGGTAAAGATGAGGTGAATAGAGAAGAGAGGCTCTCTGGGGACCCATGGTTGAAGACAAAGATTTTCTTGGGCCAGAGGGAAGAAAATGTTGAATCTGTCACTGCTAATGACGAAGGTCTCAAGGATATCAAGATCAAGGTGCACTGTCCAGTTGGTTCAATTGGCTCCACTTTAGCTGACATTCAAGCGGGGGTTAAAGTTAAGGAAGTAAGGGAGTTCAGGATAGATAATTTGGTCACTGAACAGTTCTCTGAGTCACACAAAGGTAAGGGAAAGGTTCTCACTGCTGCACCTGACAATTTTGAAGCCA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| 37,167 |
MW334940.1
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Diaz-Lara,A., Al Rwahnih,M.
|
University of California-Davis, Department of Plant Pathology
|
USA
|
2021-04-03
|
CRMAV/FT155
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,395 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus
| null |
2018-07-10
| null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate CRMAV/FT155, complete genome
|
AACAGACCAAAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGAACATAGGCTTGCAGTCTGCCCTCTCTGAGCCCTACCAGTTCAAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCCTGCATACAATCACTCCTGCTGAAGGTGTTCTGGCTCAATTCTCCTCTGAGGAAGCTAGCCGAATTGGAGCCTCTGCTATCTCCAATTTCTCAAAGCTTGAGTCAGAGTACCACTCACTCTTTCATTTCCACCTTCCTGCATATGCCAAGAGCAAACTCTCTAACAGGGGTTTCTACCTTTCACCATTTTCTTATGAGACTCATAGCCACCCTGTTAGCAAAACCATTGAGTCCCACTTAATTAATGTAAAGTTGCCCAATTATATTAATGAAGATTTTTTAATTGTAGGAATTAAAGAAAATAAATTAAGTGTGCTTAGAAAAGACAAAAAAATGAGATTCCTTGAAGCTCTCAATCGCTGCGTGACGTCTCACGATATTCAGAGGTATGGACCAAGTTTCCATTTTGAAAAAGCCAAATCTAACTGGAGAAGTGACTTTTCAGGAGTCGATCTGTCTGTTAGTGTTCAGAGTTTGCTGCCGAGGGTCCTTTTTGATAAAGGAAAGATGTTTGATGCCCAGATCTTTTTGTATGATGAACTTCATTATTGGAGCATGAAAGATATAGTGGATTTCCTAGAAATCTCACGAGCAAAAACAGTCATTGGCTCCTTTGTTTTCCCTTCTGAAATACTGGCAGGTGCTCGAACCAGTTTGAATCCCTGGGCTTACGAATTCAAAATTAAAGGGGACAAAATGATATATGCGCCAGATGGTGTTTGGGCAGAATCCTATGAGCAACCTTTATCTGCAGGGCAGTTGTTAAAGTTCAATAGAATTATGACTAGGAATGGTGTCTACTCCGTACAGGTGAGGGATTCTATTTACAGCCATTGTCTAGTTATCATCAATAGGGATGAGTTGCTTTGTGAGGAGTTCAGGGTGTTTAGCGATTTTGATGCCATTTCTATTCGCAGAATAGGCTACCTGGGTGGTAACGCAGATGATGTTATTCCTGTAAGGCACGAGGTCGTTCTGTCAATCTTCAAATACATCAGAACTCTTAAGAAGCCTGACCTTCAGTCCGGGATGGCCAAACATAGGCAACTGGTGGACAACCCTACAGGGTTTGAAATTCGCTTTATAGAGGACTTCGTGCAATTCATACTTGAACATCATGAAAAGTTCAACCTCATTGAGCAGAAGTTCTCAAACTTTTTCAGCTCTGCTTGCATAAGTTTGCTTCCAAGGTACATGCAGAGGTTCTTCAACAGTTTTAAGGGTTACAGCCTTGGAAAATTCATTGAGGAGATAGAACCTTTCTCATTCACTCTGAAGTGCAGAACCTATTCACGATTTGGTTTCAAAACTAGCTTTGCTGAAGAGGAGGAGGGTGCAACTGCTGCTGATGATTCTATGTGTTTAAGTCTTAAGCAAATTAACAGCAAGCAAGTCTGTCTTGATGATTACCCAGATCTGATATTCAACGCACACTCATCAGTCTTTTCTGGCTCCCATCCAAACATCGTTCTGATGTTAGTGAAAATGTTCATCAATATGTGGGTTGGGAAAACTGCTGATTGCTATTACTCTTCACTCACCGCCCTTAAGCAAGCGCTCAATCAGAAGGGAGCAAAGCTGTTCATGCTTCATAACGAAAATTACAATTCACTTGTGATTTTCGCCAATCTTGTTGATTCACACCTCTTTAAGAATCTTCTCAGGAATGAAATTAAAAAGAGGCTGAGGTTGAGAAACAGTGTGAGAGGACTCTTGAGGAATGACCTACCACCAAGTTGTCCTGATGCTAAAAGGGAAGTCAGGTTCATTTCCTGTTACAAATCCTTACTTGCTGACTTTAAAAAAATGAGTGAAGAATGCTCACCAATTCTGACATTAACAGCCACCAGCGGTCTCAGAGAACAGCTTTGTGCCATGAAGGAGAACTTTGTTGTGGTTAATCAACCTTTGGTTAAAAAAATTCAAGGGAGGAAAGAGTGTGCTCCAACGCAATCTGATGTTAATTTGAACAACAGTGGCGAGTATGAGTTGGTTGATCAAAGTGGTTGTGAAGTGGTTAATGCGGGCAAACAAGTGGTCAGTGAGGCGCGTGACTCAGATATACCAAAACCAAAAGATGCCAAGGTCAGTGGTAGTGATCTATTCATTTCAAGCATTATAAAGATAGGACCATTCAAAGACGCTTCAACCATATCCTTTATTGAAGGTCTTGATTTTTCAAAAGGGCACAATCACAGAGGGAGAAAATCACTTTTCTTTTCAAATGGTGGTTTTTCATATGGGTTCAATGACGTCGTGTATCAATCACAAGGCTGGCCCAATGCTTTCAAGGAGCTATATGGAGACAGGTTCAATTCCTGCCTTGTTCAGAAATACAGTGATAATGCCACCCTTGGCTTTCATTCCGATAATGAAAAGTGCTATGATCAAGATCATGAGGTTTTGACAGTCAATCTCTTTGGATCAGCAACCATTGCTTTCTCAAAAGGTAACTTCACCACTTCTAACATGAACAATCCAGAAATGTATTTGGAAGTAAAGCTTGATCATTGTGACTGGCTCCTTATGCCCAAAGAATTCCAAAAAGGTTACAAACATAGCGTGAAGGGTACTTCTGAGGGCAGGATTTCTCTAACCTTCAGGAAGCAAAGTCGAACTCTGGAAGGTTCCTTGATACAAAATAAATCATCAGACAGTGATGCAGGTGCTGATGATCATGATGGTGGGTTCTACTTCGAGGAGATCAACAAATGTTCAATCACCTCTGCCCCTGATTCTGTGAAATGCAGCTTGTCAATTTTTCCAGTTAAGGCTGATGGTGACTGCTTTTGGCATGCAGTTTCTTCCATATTTGGACTCGAGGCTAAAGAGTTAAAACAACTTGTTCATGATAGGGCTATAGCTGAGGGGTGCATTGATCAATGCCACATGAAAGACTTCTTGCATGAGATGGAACCAAAAGTTTATGCTAGCAATGCTTCTCTAGCAGCCACATGTTACCTCATGAATCTCAAACTCATCATTAAACTTACTGGTCTTGAAGATGATAGTTGGGTTGTTGTTGAACCATTGGCTCTTTCCAATGAGAAATCCTCCATCGGCTACTTAGTCCTGAATCAAAAGTGCCACCACTTTGATCTGGCTGTACCAAAGGAAGGTTGTGTTGTTAGAGCAGTGAGTGAATTTCTAAAGCAAAATCCAACGAAAATTTTGAGCGTCCTCAGTGCCAACTGTTCCAAGGAGTTACTACATGAGCTAATGAGTGGGTTAGGCATACAGGAGTTTCATCTGGAGGAGATCTTCTCTATTTTTGACATCTGCGCTGAAGTTAGCGATGGGGTTAGCTCAAGGGTGCTGAACAAGAAGGGATCTAGGTCAGCAAAATTTGTCGTTGACAAGGATCACTTCTCCTTCTGCCCTGGTACAAAAGCTTCCACCAATTTGGGCGCCTTCAAATCTCCAAGTGGTAGTTCCATGATTGCAATAGAGAAGTATGATGAATTTTTGAAATCAAGTGCCAATGTTATTCCTTTCACACCATCCCTCCCATTGGCAAAGAAACTCGCAGACTCTTTTCTGAGCGGGCAAACCGGTGTCATTAATTCAAAGATTGTTGCAGGCCAATACGACTGGTTAGCCAACACTAACAAGCTTTGCTTTGATGAGAGAAGAATTGGTGCCATTGTTGGCACTTTTGGGTCTGGTAAGAGCCACAACGTTATTGAGCTAATAAGGCACAATCTTGGGTACCAGAATCTGATCATCTCCCCAAGAAGGAGTCTGAAGGATCAATTTATAAGCATGCTTGATTTGGTCAATGCCAGAAGCAAGGGGAAGAAAACATCCACTGATGTAGTTACCTTTGAAGTTGCCCTTAAGAAAAATGGGCTCCTCAAAAAGGCCAGAATTTTCATTGACGAGGCTCAACTGTTGCCCCCTGGTTATCTGGACTTAATTTGCTTGATTGCGGGGAGTGATTCTTCCGTTTTGGTGATGGGTGATCCAGCACAAAGTAGCTACGATTCTGCTGAGGACAGGGTGGTGTTCGCCGGAGAGAAGGGGTGTCTTGACAGACTGCTTGAGGGGAAGAGGTATGTTTATCTGAGCGAATCAAAGCGTTTCAGGAACCCAATGTTCGTTGGGAGGTTACCATGCACTTTTGATTCTAGCAGGTTGACTCTCGAGAAGGAAGAGTATGCGGTCTTTGACTCTTTCAAAGCTTTTAAAGGTGACTATCTATCTCCAAAGATTAAAACCTTCTTGGTAAGTTCTTTCACGGAGAAAACAGTAGTCAAGGCCAACATGGGAAGGAATGTGTCCATCTTTACCTTTGGGGAGAGTACCGGTATGAATTTTGACTACGTTTGTGTCCTTCTCACCCAAGACAGTATGCTTGTTGATGAGCGCAGGTGGGTTGTGGCGCTTTCTCGTGCAAAGATCAACATTTCATTCATCAATTTATCTGGTTTATCTCTTCCTGAGTTCTGCACACAAATGATGGGTGGTGTTGTCCACAAATTTTTCACATCTACTGCAACCTTCAATGATCTGAGAGACCTTCTTCCTGGTGATCCTATCTTTTCAAAGAAATTCCAGAGGCTTGGTAAAGATGAAGTTGATAGGGAGGCCAGATTGTCAGGTGATCCCTGGTTAAAGACGAAGGTGTTTCTTGGGCAGAGAGAAGGGAAGATTGAAAATGTTGACACAACTGATGAGGGGTTGAAGGACATTAAAATTAAAGTTCATTGTCCTGTGGGTTCAATTGGTTCAACCTTAGCAGATATTCAGGCAGGCATCAGAGTTAAAGAAGCTAGAGAGTTCAGGATTGGCAACCTTGTCACAGAGCAATTCTCGGAAACTCACAAAGGAAAAGGTAAAGTGCTCACGGCGGCTCCTGATAATTTTGAAGCTATTTACCCGAGGCA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| 43,121 |
KX389311.1
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Poudel,B., Scott,S.W.
|
Clemson University, Biological Sciences
|
USA
|
2017-04-03
|
CRMAV-SC
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,377 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null |
2012-08-10
| null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate CRMAV-SC, complete genome
|
GACCAAAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGCGCATAGGCTTGCAGCCTGCCCTCTTCGGACTTAACCAGTTCAAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACAATCACTCCAGCTGAAGGTGTTCTTGCTCAATTCTCCTCTGAGGAGGCCAGTCGAATTGGAGCTTCTGCTATCTCCAATTTTTCAAAACTTGAGTCAGAATACCACTCCCTCTTTCATTTCCACCTCCCTGCTTATGCGAAAAGTAAACTCTCCAACAGGGGTTTTTACCTTTCACCCTTTTCTTATGAGACTCACAGTCATCCTGTCAGTAAAACCATTGAGTCTCATTTAATAAATGTGAAGTCACCCAATTATATTAATGAGGATTTTTTAATTGTAGGAATAAAAGAAAATAAATTAAGTGTACTCAGAAAAGACAAAAAAATGAGATTTCTTGAAGCTCTTAATCGCTGCGTGACGTCTCACGATGTCCAAAGGTATGGACCGAGCTTTCACTTTGAAAAAGCCAAATCCAACTGGAGGAGTGACTTCTCAGGGGTCAATTTATCTGTTGGTGTGCAAAGTTTGTTGCCAAGAGTGCTGTTCGACAAAGGGAAAATGTTTGACTCTCAGATCTTTCTGTATGATGAGCTCCACTACTGGAGTATGAAGGACATAGTGGATTTCCTTGAAATTTCAAGAGCGAAGACCATTATAGGATCCTTTGTTTTTCCTTCTGAGATATTGGCTGGTGCACGGACCAGTTTAAATCCCTGGGCTTATGAGTTCAAAATCAAAGGGGATAAGATGATATATGCCCCGGATGGTGTCTGGTCGGAATCTTATGAACAACCTTTATCCGCTGGACAACTGTTGAAGTTTAACAAGATAATGACCAGAAATGGCAGCTACTCAGTTCAGGTAAGAGATTCCATTTACAGTCATTGCCTGGTCATTATCAACAGGGATGAACTGCTCTGCGAGGAATTCCGGGTGTTCAGCGACTTTGACGCAATTTCCATTCGCAGAATTGGTTATTTGGGGGGTAATGCTGATGATGTTATTCCAGTTAGACACGAGGTTATTTTGTCCATCTTCAAGTACATCAGAACCTTGAAGAAACCTGACCTCCAGTCTGGAATAGCCAAACATAGGCAATTGGTCGACAACCCAACTGGCTTCGAGATACGGTTTGTGGAGGATTTTGTGCAATTCATACTAGAGCATCATGAGAGGTTCAACCTCATTGAGCAGAAATTTTCAAATTTCTTCAGTTCTGCCTGCATAAGTCTGCTCCCAAGATACATGCAGCGATTCTTCAACAGCTTCAAGGGCTACAGTTTAGGTAAGTTCATTGAGGAGATAGAGCCCTTCACGTTCACTTTGAAATGCCAGACTTACTCACGGTTTGGCTTCAGGACTAGTTTCACTGATGAAGAGGATGAAATAGTTGCCGCCACAGACCCAATGTGTTTAACCATCAAGCAGTCCAATAGCAAGTTAATTTGCTTCAATGACTATCCTGATTTGATCTTTAATGCACACATTTCAGTTTTTGCCAACCCCCACCCGAGTATTACCCTGATGTTGGTTAAAATGTTTATCAATGTGTGGGTTGGCAAAACATCTGATGGTTATTACCAATCACTCATTGCCCTCAAACAAGCACTCAATCAAAAAAGTTCAAAGCTGTTCATGCTTCACAATGAAAACTACAATTCATTGGTGATTTTTGCCAACCTTGTTGATTCATATTTGTTCAAGAACTTACTGAGGAATGAGATCAGAAGGAGGTTAAGGCTTAGGAATTGCGTGAGAGGGCTTTTAAGGAATGATTTGCCACCAAGTCACCCAGACGCCAAGAGAGAAGTCAGATTCATTTCAAGTTACAAATCTTTGCTGGCTGACTTTAAAAAGATGAATGAGGAATGCCTACCCGCGTTCACTTTGATTAAAACATGTGGTCTCGATGATCAAATTTATGCCATGAAAAAAAATTTTGTTGTTGATCAGCCACTGATCAAGAATACGCAAAAAAAGAAAGAGCACAAGCCAGAATCATCTGACACCAATCTGGGCTACACTGAAGAGCACCACCTGGAGGCCCCAATTAATGGTATGACAAACGGTGAGACCAGTCAAGCAGTCAGTAAGGAAAATACCACATCTGCATTGGCATCAGAGGAAACCAAGGTTGGTAGCAGTGATCTGTTCATATCAAGCATAATAAAAGTTGGACCTTTTAAGGATTCCCAAACTATATCTTTTGTTGAGGGCCTTGATTTCTCAAAGGGGCACAACCACAATGGGAGAAAGTCACTTTTCTTTTCAGATGGAGGTTTTTCATATGGATTCAACAATACTGTGTACCAGTCACAAGGTTGGCCCAATGTCTTCAAGGAGCTGTATGGATCCAGATTTAATTCCTGTCTCATTCAAAGGTACAGCAGTGGTGCCACCCTCGGTTTCCATGCTGATGATGAGAAATGCTATGACCAAGATCATGAGGTTTTAACTGTTAATCTCTTTGGATCAGCCACCATTGCTTTTTCGAAGGGTAACTTTGCATCCTCAAATGTGAGTAATCCTGAACTGTATTTGGAGATGAATCTTGATCATTGTGACTGGCTTTTAATGCCTAAAGGATTCCAGAGGGGGTACAAGCATAGTGTCAGGGATACCACTGAAGGCAGAATCTCTCTCACATTTAGAAAGCAAAGCCGCACTCTAGAGGGAACCTCAATCCAAAGTGGAACCACAAGTGATAATTCAGATGCTGACAACCATGATGGCGGGTTTTACTTTGAGGAAATCAATAAGTGTTCGATCACCTCCGCCCCTGATTCTGTGAAGTGCAGCTTATCAATATTCCCTGTGAAGGCTGATGGTGATTGTTTCTGGCATGCAGTCTCTTCCATATTTGGGCTTGAAGCTAAGGAATTAAAGCAACTGGTTCATGACAGAGCTATAGCTGAAAATTGCATTGATCAATGTCACATGAAGGATTTCCTGCATGAGATGGAACCTAAGGTGTATGCCAGCAACGCATCATTAGCTGCCACATGCTATCTTATGAACCTCAAGCTCATAATCAAGCTCACCGGCCTTGAAGATGATAGCTGGGTTGTTGTTGAACCATTGGCCCTATCTAATGAAAAAGCTTCCATCGGTTACTTGGTGTTGAACCAAAAATGCCATCATTTTGACCTAGCTGTGCCAAAGGAGGGCTGCGTCGTTAGAGCAGTCAGTGAGTTTTTGAAGCAGAATCCAACAAAAATTCTGAGTGTGCTGAGTGCCAATTGTTCAAAGGAATTGCTGCATGAACTAATGAGCGGGCTGGGTATTCAGGAATTTCATCTGGAAGAGATCTTTTCCATCTTCGATATTTGTGCCGAGGTTAGCGATGGAGTTAGTTCAAGAGTGCTAAATAAAAAGGGTTCTAGAGCAGCAAAATTCATTGTCGATAAGGACCACTTTTCCTTCTGTCCTGGCACAAAGGCTTCCACCAATCTAGGAGCTTTCAAATCCCCAAACGGTAGCTCCATGATTGCAATTGAAAAGTATGATGAGTTTTTGAAGTCCAATGCCAATGTTGTCCCTTTCACTCCATCTCTGCCCCTAGCTAAAAAACTTGCAGATTCTTTCTTAAGCGGTCAAACTGGTGTTATCAATTCCAAAATTGTGGCAGGTCAGTATGACTGGCTGGCTAATACTAATAAGCTTTGCTTCGATGAGAGAAGAGTGGGGGCCATTGTTGGAACATTTGGGTCCGGCAAAAGTCACAATGTAATTGAGTTGATAAGGCACAATTTGGGATACCAGAATTTGATCATCTCCCCAAGAAGGAGCCTGAAGGATCAATTCATAAGCACGCTGGATTTGGTGAATGCTAGGAGTAAAAGGAAAGAAACTTCCACTGATGTGGTCACATTTGAGGTTGCATTGAAGAAAAATGGACTCCTCAAGAAAGCTAGAATCTTCATTGACGAAGCTCAACTGCTGCCCCCTGGTTATCTCGATTTGATTTGCTTGATAGCTGGTAGTGACTCATCTATTCTGGTGATGGGTGATCCGGCACAAAGCAGTTATGATTCAGCTGAGGACAGGGTAATTTTCGCTGGGGAGAAAGGGTGTTTGGACCGTTTGCTTGAAGGGAAAAAGTACGTCTACCTCAGCGAGTCAAAACGTTTTAGGAATCCTATGTTTGTTGGAAGATTGCCCTGCACGTTTGACTCCAGCAGGTTAACCCTTGAGAAAGAGGAGTACGCTGTTTTTGACTCCTTCAAAGCTTTTAAGGCTGATTATCTATCCCCAAAGATCAAAACTTTCCTTGTGAGCTCATTTACTGAAAAAAATGTGGTCAAGGCCAACATGGGAAGAAATGTTTCAATTTTTACCTTTGGAGAAAGTACAGGTATGAATTTTGATTATGTCTGTGTTCTCCTGACTCAAGATAGCATGCTTGTTGATGAACGAAGATGGGTGGTAGCACTTTCCAGAGCAAAAATCAACATTTCTTTTATCAATTTGTCTGGTTTGTCACTCCCTGAATTCTGCACTCAGATGATGGGTGGAGTTGTGCATAAGTTCTTCACATCCACGGCAACCTTTAATGACCTGAGAGAGCTCCTTCCTGGTGACCCTATTTTTTCAAAAAAATTCCAGCGACTTGGCAAGGATGAAGTTGATAGGGAGGGTAGACTGTCCGGCGATCCTTGGTTGAAAACAAAGGTGTTCCTCGGGCAGAGAGAAGAAAGAATTGAGGAAACCAGTGTTAATGATGAAGGGCTAAAAGACGTAAAGGTTAAAGTTCACTGCCCAGTTGGTTCAATTGGTTCAACATTGGCAGACATTCAAGCTGGGGTAAGGGTCAAAGAAGCAAGGGAATTCAGGGTTGAAAATCTGGTCACTGAACAATTCTCAGAAACTCACAAAGGTAAGGGTAAAGTGCTCACTGCTGCCCCTGATAATTTTGAAGCTATTTACCCAAGACATAAAGCC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| 77,219 |
KP258176.1
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Su,L., Bhagwat,B., Li,Z., Bernardy,M., Wiersma,P.A., You,F.M., Xiang,Y.
|
Agriculture and Agri-Food Canada, Pacific Agri-Food Research Centre
|
Canada
|
2015-12-31
|
CRMaV_S83-36
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,402 |
GenBank
| null |
Canada
|
Canada
|
Prunus avium
| null |
1983-07-26
| null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate CRMaV_S83-36, complete genome
|
GGAAAACAAACAGACCAAAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGCTCATAGGCTTGCAGTCTGCCCTCTCGAAATCTAAACAATTTCAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCCTGCACACTATTACTCCTGCTGAAGGTGTTCTGGCTCAATTCTCTTCTGAAGAAGCTAGCAGAATTGGAGCTTCTGCAATCTCCAACTTTTCTAAGCTTGAGTCAGATTACCACTCACTTTTCCACTACAGTCTTCCAGCTTATGCAAAGAAAAAACTCTCTGACAGAGGTTTTTATTTGTCCCCTTTCTCCTATGAAACTCATAGTCATCCTGTAAGTAAAACCATTGAGTCTCATTTAATTAACGTTAAATTACCTCACTATATTACTGAGGACTTTTTAATTGTTGGTATTAAGGATAATAAACTTAGTGTTTTGAGAAAAGAAAAAAAGATGCGTTTTTTAGAGGCTTTAAATAGATGCGTTACATCCCATGACATCCAAAGGTATGGTCCCAGCTTCCACTTTGAGCAGGCCAAATCTAGCTGGAAAACTGACTTTTCTGGCATTAATCTCTCTGCTGGGGTTCAAAGCCTTCTTCCCAGAGTTCTTTTCGACAAAGGCAAAACTTTTGATGCTCAAATCTTTTTGTATGATGAGCTGCATTACTGGAGCCTTAAAGACATAGTTGACTTTATTGAGATTTCCAGAGTGAGAACCATCATCGGTTCTTTTGTTTTTCCAGTGGAGATCCTTGCTGGTGCACGGACAAGCCTGAATCCTTGGGCATACGAATTCAAAATAAAAGGGGAAAAGTTGATCTATGCACCAGATGGCGTTTGGGCAGAATCATATGAGCAACCATTAGCTGCCGGTCAATTGCTCAAGTTTAATAAAATCATCACAAGAAATGGGACATACTCGGTGCAGGTTCGCGACTCCATATATAGCCATTGCCTAGTGATCATTAATCGCGACGACTTGCTCAATGAGGAATATCGCGTCTTTAGCGATTTTGATGCAATTTCAATTTCAAGACTCAACTACCTTGGTGGCAATGCTGAAGATGTTATTCCTGTCAGGCATGAGGTAATTTTGTCAATCTTCAAGTACATTCGTACCCTCAAGAAGCCTGACCTTCAATCAGGTATGGCAAAACATCGACAGCTGGTTGACAACCCTACAGGTTTTGAAGTTAGATTTATTGAAGACTTTGTTCAGTTCATCCTTGAAAATCATGAGAAATTCAACCTGATAGGTCAAAATTTTTCAAACTTTTTGAGTTCAGCATGCATTGAGTTTCTCCCCAAGTACATGCAACGCTTCTTTGTCAATTTCAGAGGCTACAGTCTTGGAAAATTTATAGAGGAGATTGAGCCCTTCAATTTCACCCTCAAATGCAAGACCTACTCCAGATTTGGCTTCAAAAGGCACTATTCTGAAGAGGAAGATGATTTGATTATGATTAATGATCCAATCAAGAACCAAGTTCTAACGTGCAAAGAAGCAAAAGTGACTGCTTATCATGATGACTTCTATCACGCCTATCTGTCACTTTTTGCAGATGTTCACAGCAATTTGGTTCCCAAGCTTGTTAAAATCTTTGTTGAAATGTGGGTTGGCAAGACGCCTGACGGTTACTACTTATCCCTTAGAGCCCTGAGAAAGAGTCTGAATCAAAAGGGTTCTAAACTGTTTCTTCTGCACAATGAGGAGTTTAACTCTCTTGTCAGTTTTGCCAATTTAATGAACTCTGCTTTCTTTAAGAACTCATTGAAAAATGAGGTGAGCAAAAGGTTGAGAAGGAAGAACTGTTTAAGAGGCCTCATTGCTTATGATGTTAAACCCACAAATCCATTTCAAAAAAAAGAGCAGAGGATTGTGGCTCATTACAGTGCTCTTGTGTCCGAGCTTAAAGACCTGGCATTTGAATGCAACCCTTCAGAAATTCTTTCTAAGGGTGGTGACCTGAAAGGGCAAATTTTAAAAATGAAGCGTCAATTTGTCAACAATTCCATGCTTAACGCTGTTCGACCATTTTCAGCACCTCACATAATACTTCAGGAGACAGTTAGAACTGAGAGAGCGCTTCAAGTATCTGAGAAGCAGGTAGATTCCGACACCTCACTGCCAAAAGAGAATTTGGAGTCCGAGATCCATACTGATGAAGGCCACCAAGAGAATGGCATTGATTTTAGCAAAAGAGCCGCTGTTGGCAGCAGTGATCTTTTTATATCAAACATCATTAAGGTGGGCCCCTTTGGGGATTCCAATGTCATCTCTTTTGTTAAGGGTCTCAATTTTGACGGTGGAGTGCAGCACAAGGGAAGAAGGGCTCTTTTCTTTTCAAATGGTGGCTTTTCCTATGGTTTCAATAGTACTGTTTACACTTCCTTAGGTTGGCCAAAAATTTTTTCTGAACTTTACGGGGAAAGATTCAACTCCTGTTTAGTGCAGATGTATGATGATGGAGCCAACCTAAATCTGCATAAAGATGATGAGAAATGTTACGATGCTGATCATGAAGTGATGACAGTGAATCTTTTTGGGTCTGCCACGATTTTCTTTTCAAAGAGCCGTCGAACAGAGGAAAGTTCCAGTAATCCAGAACAGCACTTTGAAATGAAAATTGACCATGCAGATTGGTTGCTCATGCCCAAAGGCTTTCAGAAAAATTATTTTCATGGCATTAAAGACACAACGTCTGGACGCATTTCACTGACATTTCGCCTTCAGACAAGAACTATGGAAGGAATTCACATAAAGGCTCTTAATAAGGATTCCAACAATGATGAGTTCCAAGTTGATGGCCAGCACTATTATGAGGAAATGAACAAATGCTCAATCTCTTCAGCACCAGACTCAATCAAATGCAATCTTTCTGTGTTCCCAGTTAAAGCTGATGGGGACTGTTTCTGGCATGCTGTCTCCTCGATTTTTGGTCTTGACGCTACTGAACTTAAGAGTCTAGTTAAAGAAAGAGCTTTAGCCGAGAATTGCATTGATAAGAAACATCTGGCTGAGTTCCTGCATGAGATGGAGCCTAAGGTTTATGCATCCAATTCTTCCCTCACTGCCACATGCTTTCTCATGAATATCAAGCTCATAATAAAGTTAACTGGTTTTGAGGAAGATAGTTGGGTCGTTGTGGAGCCTCTAGCTGCCGCTCATGATAAAATTTCAGTTGGCTACCTGGTGCTAAATCAAAAATGCCATCACTTTGATTTAGCTGTTCCAAAGGAGGGTTGCGTTGTCAGAGCCATCAGTGAGTTCCTTAAACAAAATCCAACAAAAATACTGAATGTGCTAAGCGCCAATTGTTCAAAAGAGCTCCTCCATGAGTTGATGAGTGGCCTTGGGATCCAGGAGTTTCACCTTGAGGAAATTTTTAAGGTTTTTGACATCTGTGCCGAAGTAAGTGATGGAAGTGAATCAAGGGTGCTGAATAAAAAGGGAGAGAGATCAGCTAAGTTTGTGGTGGATAAGGATCACTTCTCTTTTTGTTCAGGAGTAAAATCTTCCACAAACTTGGGAGCTTTCAAATCTCCAAGTGGCAGTGCAATGATCCCCATGGACAAGTATGATGAATTTTTGAGGATGAACGCCAATGTTATACCATTCACACCTTCTTTAACTGCCGCAAAAAAATTGGCAAAATCCTTTTTAAGTGGACAGACTGGCGTTATCAACTCAAAAATAGTTGCTGGGCAGTATGATTGGTTGTCTGACACCAACAAATTGTGCTTTGATGAAAGGAAGATTGGCGCTATAGTGGGCACTTTTGGATCAGGGAAGAGTCATAATGTTGTTGAGCTGCTAAGGCACAATTTGGGGCATCAAAATCTGATCATTTCACCTAGGAGGAGCCTCAAAGAACAGTTCATCAGTATGCTTGATCTGGTGAATGCTAGGAGCAAAGGGAAGAAATCCTCCACAGAAGTTGCAACTTTTGAGGTTGCTCTTAAAAAGAGTGGGATGCTTAAAAAAACCAGAATATTTATTGATGAAACTCAATTGCTCCCACCTGGTTATCTAGATCTAGTTTGCCTGATCGCTGGAAGTGACTCTTCCATCCTTGTGATGGGTGACCCTGCCCAGAGCAGCTATGATTCTGCAGAGGATAGGATGAATTTTATTGGTGATCAAGGCTGTCTGGACCATCTTCTTGAGGGAAAACGATATGTTTATCTAAGTGAGTCCAAAAGATTCAGGAATCCCATGTTTGTTGGCAGACTCCCTTGCACTTTTGACTCTAGCCGATTGACTTTGGAAAAGGAGGAGTACGCTGTCTTTGATTCATTCAACACATTCAAACAGGATTACCTTTTCCCAAAGACAAAGACTTTCCTTGTTAGCTCTTTCACCGAAAAAACTGTGGTTAAAGCCAACATTGGTAGAAATGCCTCCATATACACTTTTGGGGAAAGTACTGGAATGAATTTTGATTATGTTTGTGTTCTGCTCACTCAGGATAGCATGTTAGTTGATGAAAGAAGATGGGTTGTTGCCCTTTCTCGAGCTAAGATAAACATTACCTTCATTAATCTCTCTGGGCTATCACTCTCTGAATTCTGCACCCAAATGGTTGGTGGCGTTGTTCACAAATTTTTCACTGGTACAGCGACTTTCAATGATTTGAGGAATTTGCTACCTGGTGATCCCATTTTTTCAAAGAGATTTCAACGATTGGGCAAAGATGAGATTGACAGGGAAGCAAGGTTGGCTGGTGACCCTTGGTTGAAAACAAAAATTTTTTTGGGACAAAGGTCTGAAAAAGTTGAAGAGCTTCAAGTTGCTAATGAGGGATTGAGCAACATTAAGGTTAAAGTTCATTGTCCGATTGGTTCTATGGGGACCACGTTTGCAGACATTCAATCCAAGCTCAAGGCTAAAGAAACAAGGGAGAAGAGGTTGGATAATTTGGTCACTGAGCAATTCTCTGAGGTTCATAAGGGTAGGGGAAAAGTTCTGACAGCAGCCCCTGACAACTTTGAGGCCATTTATCCCAGACATAAGGCTGGAGATACAGCAACTTTTGTTATGGCTGCCAGAAAAAGATTGAAGTTCTCCTTCCCTGCTAGAGAAAAACAAAAGTATTTGTCTGCAATCCCTTATGGTGAAAGCATGCTTCAAGTTTTTCTCAAAAGAGTAAAACTGAATTCAAATTTCGATTACAATCTATTTGAGGAAGCAAGGGATGATTTTGAGGAGAAGAAACTGCAGAAATCCATGGCAACTTTGGAGAATCACAGTGGACGATCTGATCCTGACTGGAATGTGGAGAATGCATCAATTTTTATGAAGAGTCAATTGTGCACAAAATTTGACAATCGATTCAGGGATGCCAAAGCTGGGCAAACATTAGCTTGCTTTCATCATAATGTGCTTTGCAGGCTTGCACCATACATCCGATACATCGAGAAGAAGGTTTTTAAAGCCTTACCCAAGAACCTGTATATCCATTCAGGGAAAAATTTTGATGACTTACGCGATTGGGTGATAGCAAATAACTTCACTGGTTTGTGCACAGAGTCTGATTATGAAGCCTTTGACTCCTCGCAGGATGCAAACATTCTAGCTTTCGAGGTTAGTTTAATGACTTACCTCAAGTTGCCTAGAGACTTGATTGAGGATTACAAGCACCTTAAGTTTCACACCAAGTCAAAACTGGGGCAGTTTGCAGTCATGCGTTTCACAGGTGAAGCTGGCACTTTTCTTTTTAACACTTTGGCAAACATGGTTTTTACCTTCATGCGCTATGAGGTCAATGGCCGAGAATCCATATGTTTTGCCGGTGATGATATGTGCGCGAATAAATTGCTGAGAAAAAAAAGTGAATTTGAGCACATTCTTGAAAGGATGACTTTAAAGGCAAAAGTTCAGCACACCAATGAACCAACCTTCTGTGGATGGCGCTTGGGCAACTTTGGAATAATAAAGAGACCTCAACTTGTGCAGGAGCGAATTCTGATTGCTTTAGAGAAAGGGAACTTCCATGAATGTATTGACAATTACGCAATTGAAGTTTCCTACGCCTATAATTTAGGTGAGAGGCTGATCTCTATAATGTCCGAAAAAGAATTGGATGCTCATTATTTTTGTGTCAGAACGTTTTTGCGCAATAAGAATCTCTTCAGTTCTAATGCTCTTGAATTTTTCTCTGAATCTGAAGGTTGTTCGAGTCCAGAAAGAAATTTTGGTTGATGGAAGCTGCTCATACAAGTTTGTTAGATGCTGGTTTTTCTAGAACTTCTTTCTCCCTTAGCTTTCCTGTAGTTGTGCATGGTGTTCCTGGTTGTGGCAAATCAACTTTGGTTAAGCGTCTTTTGGACATTGAGGATTTTAACGCTCAGTCTTACGGTGTGGTTAAACCCACAACTCTTGCTGGGCGTGGCGTTGAAAAAGCTTTACAGCCTCTACAATCCGGCTTCAACATTCTTGACGAGTATTTATCTGGACCTTCTTACGAGGGTTTTGATTTGTTACTTTCCGATCCTTATCAGAACTTCAGGAAACCACTTACTGCACATTTCATTAATAGCTGTACTTATAGGTTTGGTAATTCAGTTTGTGAATATCTTAATAAGTTGGGTTTTGAGATTCAGTCAAAGCGTGAAAGGGACACTGAATTGATCTTTGGTCACATATTTGGGGGAAAAATACGAGGAGAAATAATTTGCTTTGAGAAAGAGGTTGAGGAGCTTCTCAACAGTCACTCAGCCAAATACCATCATCCCTGCAATCTGAGAGGAGCTGAATTTGAGCACGTCACTTTCATAACTGCTCACTCTGACTTGCAAGAAATCGTCGGCCCTGACCTATATGTTGCTCTAACTAGAGCTTCAGAAAGCTTAACCATCCTAAAGCCATAAATGAGTTTAAAGCCCCCTATTGATTACTCAAAGCCACTGCTTTGTGCTGCAATTGGGGTGACTGTTGCTTTGGTGGGAGCTGTTTTAAGGGCTGACAATCTGCCCAGAGTTGGCGACAATATACACTCTCTACCTCATGGTGGACTGTATAGGGATGGGACCAAATCAGTCAATTACAATGGTCTGAATTGCATTGAGAAATCCAATATTGATCCTTTTTACACTTCTCATAAGTTTATAGCTTTTTGTGTGGTTTGTCTTCTTAGTTTTTTGATCTATGTCTGTAGTCAATGTAATCGTAGGTCTGGCAGCATTCATCATCACTGTGTGCATCACCATTCTAGTTAACAAGGATTGCAGTCAGGTTTGTACGGTAGTCGTGACTGGGGAGAGGGCTGTTGTTAGTGGTTGCGATATAACTCCAGAGTTAAGCAATCTACTGTCTCATCTCAAACCTCATTCACATAGCTTAGGTTTTTAATCACTTTTATTTTGAAATTTAAAGTGTGTGTATGAGCTTTGCATTAACTAATAATGGCCGAAGAAATTGAGTATGAGAAAAATCTGGATGGAACCTTCAAGCTTGATAATCAACAGAGAAAGATCCCAAAGAAGAAGGAGACTGGGTCGAACCCTGAAACCTCAGGAAATGAAAGAGAGCAAGCAAAGAAGAGCGATCTTGAGATCCTCAGAGCCAGAAGAAGAAGGGTCACTTTTGACCCCAAAAATCCCACCTCAAGTCCTAGCAAAGATTTTATCAGAAACATTCAAGAAAAGGACCCAACTACACTCAATATCGCATCTGACGACGTCGTTAAGGCCATTGCTGCTGACTGGACTGAACACCTCAAGGTGCCTGAAGCTGAGACGTTTAATTGCATCTTTGATGTTGTCTGGTACTGTTATCATAACAGCTCCAGCGACAAAACAAAGTTTGTTGGGAGGGCCAAATGCGGAGTTGAGCTTGAAAATCTTGCAAGTACTGTTAGGAGCTACTGCTCTCTACGCAGTTTCTGCTCTAAATATGCTCCAATCGTCTGGGATTTCGCCATAAGCAATGATATACCTCCAGCTAATTGGCAGAGGAGGAAGGTTATAGAGGGGGCCAAATTTGCAGCATTCGATTTCTTTGAGGCAGTTACAAGTGCTGCCGCTCTTCAACCAATTGCTGGTTTGGTAAGGAATCCAACCGATAAGGAGATGATCGCCGGAGCATCCCTTAAAGAAATAAGTCTAATGAGAGACGAAATCCGGAGAGGCACCAGCTCAACCTTAATGACTGAGGTTACTGGTGGTAGGACTGGCCAAGTTCAGCCTATCAAGAAAATTGGTAGTGATGAATGATAAACCCCTACATCCCAACTTCTAGTTGGCCCGTTTAGCGTTACGGGGCGAAGCTAAAAACGCTAATCTATCTTTACAGTTTTACTTTTCTGTATTTCCAAATTTAAAATAAATTTAAAGAAACTTCTGATCTAATAGAAGTTTGGCTGCAGGGTTTTAATATATTTTCCTTTAGTTCATTATG
| 84,400 |
KF030849.2
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
98CI73R1 (s1)
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,404 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus mahaleb
| null | null | null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 98CI73R1 (s1), complete genome
|
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| 92,332 |
KF030850.2
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
98CI194 (s1)
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,404 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 98CI194 (s1), complete genome
|
GAAAACAAACAGACCAAAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGCACGTAGGCTTGCAGTCTGCCCTCTTTTAACTTAACCAGTTTCAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACAATCACTCCCGCTGAAGGTGTTCTCGCTCAGTTCTCTTCAGAGGAAGCTAGCAGAATTGGAGCTTCTGCAATCTCCAATTTTTCAAAACTTGAGTCAGAATACCACTCTCTCTTTCATTTCCACCTCCCTGCTTATGCCAAGAGCAAACTTTCAAACAGGGGCTTTTACCTTTCCCCATTCTCTTATGAAACTCATAGTCACCCTGTAAGTAAGACTATTGAGTCCCATCTAATAAATGTCAAGCTTCCTCATTACATTAATGAGGAATTTTTAATTGTGGGTATTAAAGATAATAAGCTCAGTGTTCTAAGAAAAGAAAAAAAATTAAGATTTTTAGAAGCTCTTAATCGCTGCGTGACGTCTCACGATGTTCAAAGATATGGGCCAAGCTTCCATTTTGAAAAAGCTAAATCAAACTGGAAGAGTGACTTCTCTGACGTTAACCTTTCAGCTGGTGTTCAAAGCTTGTTACCCAGAGTTTTATTCGACAAGGGGAAATTGTTTGATGCGCAGATTTTTCTGTATGATGAATTGCATTACTGGAGCTTGAAAGACATTGTTGATTTCCTCGAGATTTCAAGAGCAAAAACTGTGATTGGCTCCTTTGTGTTCCCTTCTGAAATTCTTGCTGGATCCAGGACCAGTCTGAACCCTTGGGCGTACGATTTTAAGATCAAGGGGGATAAATTGATATACGCTCCTGATGGTGTCTGGTCTGAGTCATATGAGCAACCTTTAGCTGCTGGTCAACTCTTAAAGTACAACAAAATTATGACTAGAAATGGCAGTTACTCTGTTCAGGTTAGAGATTCAATCTTTAGTCACTGCATTGTCATCATCAATAGGGATGATTTGGTCAATGAGGAGTTCAGAGTTTTTAGTGATTTTGATGCCATCTCCATCCATAGAATTGGTTATCTTGGGGGAAACGCTGATGACATAATTCCTGTTAGACATGAGGTTGTTCTGTCAATTTTCAAATACATCAGAACCCTCAAGAAGCCTGATCTTCAATCAGGGATGGCTAAGCACAGGCAGCTTGTTGATAACCCCACTGGGTTTGAAATTAGATTCATAGAAGATTTTGTTCAATTTGTCTTGGAGCATCATGAGAAGTTTAACCTCATTGAGCAAAAGTTCTCAAACTTTTTTAGCGCTGCCTGCATTGAAAAACTTCCCAGATATATGCAGAGATTCTTCTGTAGCTTCAAAGGTTACAGTCTTGGCAAATTCATTGAGGAGATAGAGCCCTTTTCCTTCACATTGAAGTGCAAAACTTATTCACGTTTTGGCTTCAAAACTAGCTTCACTGATGAAGAAGAGCAATTAAATGCCAAGAATGATCCCATGTGCATCATGATAAATAGCAGCAAAACGCTTGGTGGCGATGATAGTCATTATCCCAGTTCAATTTTCCACGCTCACACTTCAGCGTTCGCCAATGCTCATCCCACAATAGTGAAAATGCTTGTCAAATTTTTTATCAACATGTGGGTGGGTAAAACTGCTGACAGTTATTATAAGTCGCTCTCTGCCCTTAGAAAGAGTTTGAATCAAAGGGGGGCCAAGCTGTTCATGTTGCATGATGAAAATTACAATTCCTTGGTAATCCTTGCAAATCTCACTGATTCCCATCTCTTCAAGAATCTCCTCAGAAATGAAGTTAGTAAAAGATTAAGGAGGGCCGGCTGTATTAGGGGTCTTTTGAGGAACGATCTTCCGCCAAGTAGTCCAGATAGTAAAAGGGAAGTTCGATTCCTGTCTTGCTATAACTATTTGGTCTCAGATCTCAAAAAGATTAGTGAGGAATGCCCCCCAGCGTCTGCTCTGGTCCAAACCACTGGATTGAACGAACAACTTATGAATATGAGGAAACCATTTGGGTTAATTAAGCAAAGGTGTTCAGATGAAAGAACTATTCATAGACCTCTCTTGGAAAAATTTGTTGAAAAATCTGTTGAGGCCAATGAAAAATTGGCTCTTGAAAATGGAAACATAGGTGAGGGCAAATTGGAGGAAGAACCCCTTTCTGTGCAGCTTGAAAATAATTCTTCTGACAATACTCCATCTGCCACAGTTGGTAATTGTGGCAGTGACCTCTTCATTTCAAGCATCATTAAGGTTGGTCCATTTAAAGATGCTGCTACCATATCTTTTGTGGAGGGTCTTGATTTCTCAAATGGCTTTAAGCATAAAGGGCGGACAGCCTTATTTTTCTCAAATGGAGGTTTCACTTATGGCTTCAATAGTGTACTCTATGAGTCAAATGGATGGCCATCAGCTTTCAGAGAATTGTACGGTGATCGGTTCAACTCGTGTTTAGTACAAAGATATGACGAAAGTGCAACTCTTGGGTTTCATGCAGATGATGAGAAATGCTACGACCAAGATCATGAAGTTATGACAGTTAACCTTTTCGGGTCTGCTTTAATTTCTTTCTCAAAGGGCAGCTTTTCTTCCGTTAATCAGAGCAATCCTGAGCTCTATTTCGAGATGAAACTTGATCATGGGGACTGGCTGCTGATGCCAAAGGCTTTCCAGAGGAGTTACAAGCACAGCATCAAGGAAACAACTGTTGGCCGCATTTCTTTGACTTTCAGAAAGCAAGCCAGGACAATGGATGGTTCCATCATAGTGAGTTCCACAGATGGGGGTGGCCACAACAATGAGGGGAGAGAGAGTAGTTTTTACTATGAAGAAATCAATAAATGCTCAATTGTTTCCGCTCCAGAGACTGTAAAATGCGGCTTGTCAATATTTCCAGTTAAGGCAGATGGGGATTGCTTTTGGCATGCTGTTTCATCAATTTTTGGGCTTGAAGCTAAAGAATTAAAGCAACTAGTGAAGGAAAGGGCTGTTGCTGAAGGTTGCATAGATCAACAGCACATGAAAGATTTTTTGCATGAGATGGAACCTAAAGTGTATGCCAGCAATGCATCACTAGCTGCCACTTGTTACCTTATGAATCTGAAGCTGATTATCAAGCTCACAGGTTTAGATGATGACAGTTGGGTTGTTGTTGAGCCATTGTCCTTGTCCGGTGAAAAAGCTTCAATTGGTTATCTTGTGCTCAATCAAAAATGTCACCATTTTGATCTAGCTGTGCCTAAGGAGGGGTGTGTGGTTAGAGCAGTGAGCGAGTTTTTAAAACAAAATCCAACGAAGATCCTAAGTGTACTCAGTGCCAACTGCTCAAAAGAACTGCTGCACGAGCTAATGAGTGGTCTTGGCATTCAAGAATTTCATCTTGAGGAAATTTTCTCGATCTTTGACATTTGCGCCGAAGTTAGTGATGGTACCAGCTCCAGAGTTTTGAATAGAAAGGGTTCAAGAGCTGCAAAGTTCATTGTTGACAAAGATCACTTCTCTTTTTGCCCAGGAGTTAAAGCTTCAACCAATCTTGGAGCTTTCAGATCTCCAAGTGGTTGTGCAATGATAGCAATAGAGAAGTATGAAGAATTCTTGAAAATCAATGCCAACATTGTTTCATTCACTCCTTCTCTACCATTAGCTAGGAAACTAGCTGATTCCTTTTTGAGCGGGCAAACAGGAGTTATCAATTCAAAAATAGTTGCTGGGCAGTATGATTGGTTATCCAATACCAATAAGCTTTGTTTTGATGAGAGAAAGATTGGGGCAATAGTTGGCACTTTTGGCTCTGGAAAAAGTCACAATGTCATCGAGCTAATAAGACACAATCTTGGTTATCAGAACTTGATAATTTCCCCAAGAAGGAGCTTAAAAGATCAGTTCATAAGCATGCTTGACTTGGTAAATGCCCGAAGCAGGGGGAAAAGAGCTTCCACTGAAGTTGTCACTTTTGAGGTGGCTCTCAAAAAAAATGGTCTTCTTAAAAAAACTAGAATTTTCATTGATGAAGCCCAACTTTTACCACCTGGGTACCTGGATCTAATATGTTTGATTGCAGGCAGTGATTCCTCAATTCTTGTAATGGGGGATCCAGCACAAAGTAGTTATGATTCCGCTGAGGACAGAATGGTGTTTCTCGGAGACAAAGGATGTCTTGACAGGCTTTTGGAGGGGAAGAAGTATGTGTACTTAAGCGAGTCAAAGAGATTCCGGAACCCTATGTTTGTTGGTAGATTACCATGCACCTTTGATTCAAACCGGCTCACTTTAGAAAAAGAGGAGTATGCTGTTTTTGACTCCTTTAAGAGCTTCAAGGCTGACTACCTGTCCCCAAAAATTAATACCTTCTTGGTCAGCTCCTTCACTGAAAAAACTGTAATTAAGGCCAACATGGGTCGAAATGTCTCCATTTTCACATTTGGGGAGAGCACAGGTATGAATTTTGACTACGTTTGTGTGCTACTTACTCAAGACAGCATGTTGGTTGATGAGAGGAGATGGGTGGTTGCATTGTCAAGAGCAAAGATAAACATCTCTTTCATCAATTTGTCTGGTCTCTCTTTGCCTGAGTTCAGTACTCAAATGATGGGTGGCGTTGTTCATAAGTTCTTCACCTCCACAGCTACTTTTAATGATCTGCGAGAGTTGCTACCTGGTGATCCAATTTTCTCAAAGAAGTTCCAGAGATTGGGTAGAGATGAAGTGGATAGAGAGGAAAGGCTTTCTGGAGATCCATGGTTGAAAACAAAGATCTTCTTGGGTCAACGAGAAGAGAAAGTTGAAGCAGTTGCTGCTATGGATGAGGGTCTCAAGGATATCAAAGTCAAGGTACATTGCCCAATTGGATCAATTGGTGCTACTCTTGCTGACATTCAAGCTGGGGTTAAGGTAAAAGAATCAAGAGAGGTCAGGATAGATAACTTGGTCACTGAGCAATTTTCAGAAACTCATAAGGGTAAGGGCAAGATACTGACCGCTGCACCTGATAACTTTGAAGCCA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| 92,333 |
KF030869.2
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
8099-5 (s1)
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,404 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 8099-5 (s1), complete genome
|
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| 92,336 |
KF030870.2
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
8241-2 (s1)
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,405 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 8241-2 (s1), complete genome
|
GAAAACAAACAGACCAGAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGCTCATAGGCTTGCAGTCTGCCCTCTTCGAACCCTACCAGTTCAAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCCTACATACAATCACTCCTGCTGAAGGTGTTCTCGCTCAATTCTCCTCAGAAGAGGCTAGTCGAATTGGAGCTTCCGCTATCTCTAATTTTTCTAAGCTTGAGTCAGAATACCACTCATTCTTTCACTTCCACCTACCTGCATATGCAAAGGGAAAACTCTCTAACAGGGGTTTTTACCTTTCACCCTTCTCTTATGAGACTCATAGCCATCCTGTCAGTAAAACTATTGAGTCCCATTTAATAAATGTGAAGTTACCTAATTATATCAATGAAGATTTTTTAATTGTAGGAATTAAAGAGAATAAATTAAGTGTTCTCAGAAAAGATAAAAAAATGAGATTTCTAGAAGCTTTGAATCGCTGCGTGACGTCTCACGATATCCAAAGGTACGGACCGAGCTTTCACTTTGAAAAAGCCAAGTCCAACTGGAGGAGTGATTTCTCAGGGGTTAATTTATCTGTTGGTGTGCAAAGTTTGTTGCCTAGAGTTTTGTTTGATAAGGGGAAAATGTTTGATGCTCAAATTTTCCTGTATGATGAACTCCATTATTGGAGTATGAAGGACATCGTTGACTTTCTTGAGATTTCAAGGGCTAAGACAATAATTGGTTCATTCGTCTTCCCTTCTGAAATACTTGCTGGCGCTCGCACCAGTTTAAATCCTTGGGCCTATGAATTTAAGATCAAAGAGGATAAGCTAATATACGCACCTGATGGTGTTTGGTCTGAATCCTATGAGCAACCTCTGTCAGCTGGGCAACTTCTAAAATTCAATAAGATTATGACTAGAAATGGCTGCTACTCTGTTCAAGTCAGAGATTCAATCTATAGCCACTGTTTAGTTATCATCAATAGAGATGACTTGCTCTGTGAAGAATTTAGGGTCTTTAGTGACTTTGATGCGATCTCTATCCGGAGAATAGGTTACCTTGGGGGTAACGCTGATGATGTTATCCCAGTGAGACATGAGGTTGTTCTGTCAATTTTCACGTACATCAGAACACTGAAAAAACCTGACCTCCAATCTGGAATGGCCAAGCACACACAATTGGTTGACAATCCCACTGGCTTTGAAATTCGATTCGTGGAGGATTTTGTTCAGTTCCTTCTTGAGCACCATGAAAAGTTTACCCTCTTTGAACAGAAGTTTTCAAATTTCTTTAGCTCTGCCTGTATAAGCCTGCTGCCTAGGTACATGCAAAGATTTTTCAGCAGCTTTAAGGGGTACAGTCTTGGAAAATTCATTGAGGAAATAGAGCCTTTTTCATTCACTCTACGATGTAAGACGTACTCTCGATTTGGCTTCAAAACTAGCTTTGCTGAAGAAGAGGAAGGGCAATCAGCAACCAATGACCCACTGTGTTCAGCCCTTAAACAAGCTGGTGATAAGTTAATCTGCCCTAAAGACTACCCAGATTTAATCTTTAATGCTCATACATCAGTTTTTGCCAATCCTCATCCAAACATAGTCTTAAAATTGGTTAAAATATTCATCAATGTCTGGGTTGGTAAAACAGCTGATCATTATTACCAGTCCCTTACCGCGCTTAAACGGGCTCTCAACCAAAAGGGGTCAAAGTTGTTCATGCTGCATAATGAGGGGTACAATTCATTGGTGATCTTTGCTAATCTTGTTGACTCTCATCTGTTCAAGAATCTCATCAGAAATGAATTGAACAAAAGGTTAAGGCTGAGAGGCAGTGTTAGAGGACTATTGAGGAATGATTTACCACCGAGCTGTCCCGATGCCAAGAGAGAGGTGAGGTTTACTTCCTGTTACAAGTCCCTGCTGGCTGACTTCTTGAAAATGAGTGCAGAGTGCTCACCAATTCTCACGCTCACAACCACTAGTGGGCTTGATAAGCAGCTCTGTGCTTTGAAAAGGGATTTTGTTGTGATTAATCAACCATTGATGCAGAAGGGCAGCAAAGGAGAGGGAGAAAAGTGCACTCAGATCTTCTCTAGCACTAATTTGAGCGATGGTGATGGTAGCTGTAAAGGACCTCAAGGTTGTAAGGAGGCAGATGAAAAAGCTAGTCAATCAGCTTCACAAGGAGGTTGCTTGCCCATATCAAATTTGGAGGGGGGGCAAATGGGTAGCAGTGATTTGTTTATCTCCAGTATCATAAAAGCAGGTCCCTTCACTGACTCATCAACTATATCTTTTGTAGAGGGTCTTGACTTTTCTGCTGGATATAGCCATAAGGGGAGGCAATCTCTTTTCTTTTCTTGTGGTGGTTTCTCATATGGGTTCAACAATATTGTGTACCAGTCACTTGGTTGGCCTGAAGTTTTTAGGGAATTGTATGGAGAGAGATTCAACTCATGCCTCGTCCAGAAGTACGATGAAGGGGCAACCTTAGGATTCCATGCAGATGATGAGAAGTGCTATGATCCTGATCATGAAGTCATGACCGTCAACCTCTTCGGGTCAGCAATAATCTCCTTCTCAAGAGGAAAATTTTTAGCTTCAAATGTGGGCAACCCCGAACTTTTCTTTGAAATGAAGCTTGATCACTGCGATTGGCTCTTAATGCCCAAAGGCTTTCAGAGAGAACACAAGCATAGCATCAAGGACACATCTAAAGGCAGAATTTCCCTCACTTTTAGGAAGCAGCTTCGAACCTTGGAAGGATCTTTAATCCAGAGTGGAGCTCCAGGCATTGGTGCTGGTGGTGATGATCATGATGGTGGCTTTTACTTTGAGGAAATCAATAGATGTTCCATAACTTCAGCCCCTGATTCTGTGAGGTGCAGCCTATCTGTATTTCCGGTGAAAGCTGATGGTGACTGTTTCTGGCATGCCGTGTCTTCCATATTTGGACTTGAGGCTAAGGAGCTAAAGCAACTGGTTCATGATAGAGCCATTTCTGAAGGCTGCATTGACCAGTGCCACATGAAGGATTTCTTGCATGAGATGGAACAAAAAGTTTATGCCAGCAACGCCTCTCTAGCTGCCACCTGCTATCTCATGAATCTTAAACTCATCATCAAGCTCACTGGTTTAGGGGATGATAGCTGGGTTGTTGTTGAACCATTGGCCCTATCTAATGAGAAGGTTTCTATTGGCTATCTAGTGTTGAATCAAAAATGCCATCACTTTGATTTAGCTGTGCCCAAAGAAGGTTGTGTTGTTAGAGCAGTAAGTGAATTTTTGAAGCAAAATCCAACAAAAATCTTGAGTGTTCTCAGTGCTAACTGTTCCAAAGAGCTGCTGCACGAACTGATGAGCGGATTGGGCATACAGGAATTCCACTTAGAGGAGATCTTTTCTATCTTTGATATTTGTGCTGAGGTCAGTGACGGGACTAGTTCAAGAGTACTGAATAAGAAGGGCTCCAGGGCGGCTAAATTTGTAGTTGATAAGGATCATTTCTCATTCTGCCCCGGTACGAAAGCTTCCACCAACCTGGGGGCCTTCAGAGCTCAAACCGGTTGTTCTATGATTGCCATTGAGAAGTACGATGAGTTCTTGAGAGGTAACGCCAATGTTGTCCCTTTCACCCCATCTCTACCTCTAGCCAAGAAGCTGGCTGATTCTTTCCTAAGCGGGCAAACTGGGGTTATTAACTCAAAAATTGTGGCTGGTCAGTACGATTGGTTGGCAAATACTAATAAGCTCTGCTTTGATGAGAGGAGAATTGGTGCAATTGTTGGGACATTTGGATCAGGTAAAAGTCACAACGTTATTGAGCTAATAAGGCATAACCTGGGGTACCAAAATTTGATCATTTCCCCAAGGAGAAGCTTGAAGGATCAATTTATAAGCATGCTTGACCTGGTGAATGCTAGGAGCAAAGGGAAGAGAACATCTACAGATGTTGTGACATTTGAGGTTGCTTTGAAGAAAAACGGTTTGCTCAAAAAGGCCAGAATTTTTATTGATGAAGCTCAACTGCTCCCTCCAGGCTATCTTGATCTAATTTGTTTGATTGCAGGGAATGATTCATCTATTTTGGTGATGGGTGATCCAGCACAGAGCAGCTATGACTCAGCTGAGGATAGGGTAATGTTCGCAGGGGAGAAAGGTTGCTTAGACAGATTGCTTGAAGGAAAGAAGTACGTTTATTTGAGTGAGTCAAAGCGCTTTAGGAACCCAATGTTTGTTGGGAGGTTGCCATGCACATTTGATTCAAGCAGACTAACTCTTGAGAAGGAGGAATATGCTGTCTTTGACTCCTTCAAAGCGTTTAAGGCTGACTATCTGTCCCCAAAGATCAAAACTTTTCTTGTGAGCTCATTCACAGAAAAAACTGTAGTTAAGGCCAATATGGGGAGGAATGTTTCAATTTTTACCTTCGGGGAAAGTACTGGTATGAACTTTGACTATGTCTGTGTTCTCCTCACTCAAGATAGCATGCTGGTTGATGAAAGGAGGTGGGTAGTTGCATTATCAAGAGCAAAGATTAATATCTCATTCATTAACCTATCTGGTTTGTCTCTCTCTGAATTTTGCACCCAAATGATGGGTGGAGTTGTGCACAAGTTCTTCACTTCCACTGCAACTTTTAATGATTTGAGGGAGCTCCTTCCTGGGGATCCTATTTTTTCAAAAAAATTCCAAAGACTTGGTAAGGATGAGGTTGATAGAGAACTCAGATTGTCAGGTGACCCTTGGTTGAAGACTAAGGTGTTTCTTGGGCAGAGGGAGGAGAAGGTTGAAGAAGTTAGTGCAGATGATGAAGGGCTGAAAGATATAAAAGTGAAGGTGCACTGCCCTATTGGTTCCATTGGTTCAACCTTAGCAGATATTCAAGCTAGTGTGAGAGTCAAGGAGGCAAGGGAGTTCAGGATAGATAATTTGGTCACAGAACAGTTCTCAGAGGCTCATAAAGGAAAGGGTAAAGTGCTCACATCTGCTCCTGATAATTTTGAGGCTA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| 92,337 |
KF356396.2
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Villamor,D.E.V., Ward,K.F., Collman,S.J., Eastwell,K.C., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-10-22
|
8804
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,394 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus lusitanica
| null | null | null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 8804, complete genome
|
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| 92,851 |
KC218926.1
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Villamor,D.V., Druffel,K.L., Eastwell,K.C.
|
Washington State University, Department of Plant Pathology
|
USA
|
2013-04-14
|
95CI192R3
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,397 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate 95CI192R3, complete genome
|
GAAAACAAACAGACCAAAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGCACATAGGCTTGCAGTCTGCCCTCTTCGAACCTAACACGTTCAAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACAATTACTCCAGCTGAAGGTGTTCTCGCTCAATTCTCCTCTGAGGAGGCTAGCCGAATTGGAGCTTCTGCAATCTCCAATTTCTCTAAACTTGAGTCAGAATACCACTCCCTCTTCCATTTCCATCTCCCTGCTTATGCAAAAAGTAAGCTCTCCAACAGGGGTTTCTACCTTTCTCCTTTCTCTTATGAGACTCATAGTCACCCTGTCAGTAAAACTATTGAGTCCCATTTAATTAATGTAAAGTTACCAAATTACATAACTGAGGATTTTCTTATAGTAGGAATTAAGGAAAATAAATTGAGTGTACTTAGGAAAGACAAAAAAATGAGGTTCCTTGAAGCCCTCAATCGCTGCGTGACGTCTCACGATATTCAAAGGTATGGGCCAAGCTTCCACTTTGAAAAAGCGAGGTCCAACTGGAGAAGTGACTTTTCTGGAGTTAATCTATCCGCCGGTGTGCAAAGTTTATTACCAAGGATTCTGTTTGATAAAGGCAAGATGTTTGACTCCCAGATCTTTCTGTATGATGAGCTCCACTATTGGAGCATGAAGGACATAGTGGATTTCTTGGAAATTTCTAAGGCCAAGACCATTATCGGATCTTTTGTTTTTCCTTCTGAAATACTGGCTGGTGCTCGAACCAGTTTGAATCCCTGGGCTTATGAATTCAAAATTAAAGGGGATAAGCTGATATATGCCCCAGATGGGGTCTGGTCTGAATCCTATGAGCAACCCTTGTCAGCTGGGCAGTTACTGAAGTTTAACAAGATAATGACTAGGAATGGCAGCTATTCTGTTCAAGTGAGAGATTCCATCTATAGCCATTGCCTAGTTATCATAAATAGGGATGAACTGCTTTGCGAGGAGTTTAGGGTTTTTAGTGATTTTGATGCAATCTCTATTCGCAAAATTGGCTACCTTGGGGGTAATGCTGATGATATCATTCCTGTGAGGCATGAGGTTGTTCTATCAATATTCAAGTACATTAGGACCTTAAAGAAACCTGACCTTCAGTCAGGAATGGCAAAGCATAGACAGCTGGTTGATAACCCCACTGGTTTTGAAATCAGATTCATAGAGGACTTTGTGCAGTTTATACTAGAGCACCATGAAAAGTTCAATCTCATTGAGCAAAAATTTTCCAACTTTTTTAGCTCTGCTTGCATTAATCTATTGCCAAGGTACATGCAAAGGTTTTTCAACAGCTTCAAGGGTTATAGTCTTGGCAAATTCATTGAAGAGATAGAGCCATTCTCATTCACTCTGAGGTGCAGCACTTACTCACGATTTGGCTTCAAAACTAGCTTTATCGAGGAAGAAGAAGCGGCCGTTGCCGATAAAGATCCACTGTGTCTGACCCTCAAGTTAGCCAACAATAAACCATCTTGCTTTGAGAGCTACCCAGATCTGATTTTCAACGCACACACATTGGTTTTTGCTAGCTCACATCCAAGCATTACCCTAATGCTCGTGAAATCCTTTATCAACATGTGGGTTGGTAAAACTAATGACCGCTATTACCAATCTCTTGTGGCTCTGAGGCAGGCACTAAATCAGAAAGGGGCAAAACTGTTCATGCTCCACAATGAGAGTTACAATTCACTTGTGATTCTCGCTAATCTCATGGATTCACACCTGTTCAAAAATCTTTTGCGGAATGAGATCAGAAAGAGATTAAGGTTGAGGAATAGCGTGAGAGGGCTTTTGAGAAATGATCTTCCACCAAGCTGCCCCGATGCAAAAAGGGAAGTTAGGTTCATCTCCTGTTACAAGTCCCTATTGGCTGACTTCAAAAAAATGAGTGAAGAGTGCTCTCCAATACTTACTCTGATTGCTACAGGTGGCCCATTCGAGCAACTCAATGCCATGAAGAAAGATTTTGTCTTGATTAATCAACCGTCAGTTGGGAAATTTGAAAAGGTGAAGAAGTGCATTTCCAAATCAACTGATGCAAGTCCCGATGGTGGTAAAGAACATAAGTTAGAACCCCAGCATAGTGAGGGAGTGAATGCAAAGACAGATGAAGTAATCCCAAAGAGGGTTGATCAACCTGAACCAAAAACTGAAGAGGGCAAAACAGGAAGCAGTGATCAATTCATTTCAAGCATCATAAAGGTTGGACCCTTCAAAGAACCTTCAACCATCTCTTTTGTTGAGGGCCTTGATTTCTCAAAGGGGCACAATCACAAAGGAAGAAAGTCACTTTTTTTTTCAGAAGGTGGATTTTCATATGGATTTGGCAGTATTGTGTACCCATCACAGGGTTGGCCTAATGCTTTCAAAGAATTGTATGGGGACAGATTCAACTCCTGCCTTGTGCAGAAATATAATGCTGATGCAACTCTTGGATTCCATGCCGATGATGAACAGTGCTATGATCAGGATCATGAGGTTTTAACCATCAACCTTTTTGGGTCAGCCACCATATGCTTCACGAAGGGAGATTTTTCTGCTCTGAACACAAGCAACCCAAAATTATACTTGGAAGTGGGGTTAGATCACTGTGATTGGCTCCTTATGCCTAGAGGTTTCCAAAGGAATTATAAGCACAGCATCAAGGGCACCTCTGAAGGCAGGATTTCTCTCACCTTCAGAAAACAGCGCCGAACATTGGAAGGGTCCTTGATTCAGAGCAGAGCTGAGAGTGGTGATTCCAATTCAGATGATGGTGAAGGCGGGTTCTATTTTGAGGAAATTAATAAATGCTCGATCACATCTGCTCCTGATTCTGTCAAGTGTAGTTTGTCTGTATTTCCAGTGAAAGCCGATGGGGATTGTTTCTGGCATGCTGTTTCCTCCATTTTTGGGCTTGAGGCTAAAGAATTGAAACAACTTGTTCATGACAGGGCCATTGCTGAAGGTTGCATAGATAAGTGCCACATGAAAGATTTCCTACATGAGATGGAACCAAAGGTTTACGCCAGCAATGCTTCGTTGGCAGCCACATGCTACCTCATGAATCTGAAGTTGATCATTAAGCTCACTGGACTTGAGGACGATAGTTGGGTCGTCGTGGAACCCCTGGCTTTATCTAATGAGAGGGCTTCTATTGGTTATTTGGTGTTGAACCAAAAGTGTCACCACTTTGACTTGGCTGTGCCAAAAGAGGGTTGTGTTGTTAGAGCAGTGAGTGAGTTTTTAAAGCAGAACCCAACCAAAATCCTAAGTGTCCTTAGTGCTAACTGCTCCAAGGATTTGTTGCATGAGCTGATGAGCGGGTTAGGTATACAAGAGTTTCATCTTGAGGAAATTTTTTCAATTTTTGACATTTGCGCTGAAGTTAGTGATGGGGCAAGCTCAAGGGTGTTGAATAAGAAGGGATCTAGGTCAGCAAAATTCATTGTGGATAAGGATCACTTTTCTTTTTGTCCTGGTACGAAAGCATCCACCAATTTGGGAGTTTTCAAGGCTCCAAGCGGTTGCCCTATGATTGCCATTGAAAAGTATGATGAGTTCTTGAGATCCAGTGCCAACGTTGTACCCTTTACCCCTTCTCTCCCCCTGGCAAAGAAACTTGCAGACTCCTTTCTCAGTGGGCAAACTGGTGTCATCAATTCTAAAATAGTTGCGGGCCAATACGACTGGTTGGCTAATACTAACAAACTTTGCTTCGAAGAGAGAAGAGTTGGTGCCATTGTGGGCACATTTGGTTCCGGCAAGAGTCACAATGTTATTGAGTTAATAAGGCACAATCTGGGGTATCAAAATCTGATCATTTCGCCAAGGAGGAACTTGAAGGATCAATTCATAAACATGCTTGATTTGGTGAACGCTAGAAGTAAAGGAAAGAAGACCTCCACGGATGTTGTAACATTTGAAGTGGCTCTCAAAAAGAATGGTCTCCTCAAGAAAGCCAGAATTTTCATTGATGAAGCTCAGTTATTGCCTCCTGGCTACCTTGACTTGATTTGCCTTATCGCAGGAAGTGATTCGTCCATACTTGTTATGGGTGATCCAGCACAGAGTAGTTATGACTCAGCTGAGGACAGAATGATGTTTGCTGGAGATAAGGGATGCTTGGATAGATTGCTTGAGGGGAAGAAATATGTTTACCTTAGTGAGTCAAAGCGTTTCAGGAACCCGATGTTTGTTGGGAGGTTGCCATGCACTTTTGATTCTAGCAGGTTGACTCTTGAGAAGGAGGAGTATGCAGTTTTTGACTCATTCAAGGCTTTCAAGGCTGACTATTTGTCCCCAAAGATTAAGACTTTTCTAGTGAGTTCATTCACAGAGAAAACAGTGGTTAAGGCCAACATGGGGCGAAATGTTTCAATCTTTACTTTTGGGGAAAGCACTGGTATGAATTTCGATTACGTTTGCGTTCTTCTCACTCAGGATAGCATGTTAGTTGATGAGCGAAGATGGGTTGTTGCACTTTCAAGAGCAAAAATTAATATCTCTTTCATAAATCTGTCTGGCTTAACTCTTCCCGAGTTCTGCACCCAAATGATGGGTGGGGTTGTGCATAAGTTCTTTACCTCCACTGCAACTTTCAATGATTTAAGAGAACTCCTTCCTGGTGATCCAATTTTTTCAAAAAGGTTCCAGAGACTTGGCAAGGATGAAGTTGATAGAGAGGCAAGGTTGTTGGGTGATCCCTGGTTGAAAGCTAAAGTGTTCCTTGGGCAGAGAGAAGAAAAGATTGAAAGTATCCATGTCAATGATGAGGGTCTAAAGGACATCAAGGTAAAAGTTCATTGTCCAATAGGATCAATTGGTTCAACTTTAGCCGATATTCAAGCTGGAGTGAGGGTGAAAGAAGCAAGGGAATTCAGGATTGACAATTTGGTCACTGAGCAGTTTTCAGAAGTTCACAAAGGCAAAGGCAAAGTTCTAACTGCCGCACCTGATAACTTTGAAGCAATTTACC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| 94,366 |
KC218927.1
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Villamor,D.V., Druffel,K.L., Eastwell,K.C.
|
Washington State University, Department of Plant Pathology
|
USA
|
2013-04-14
|
B48-C
|
Cherry rusty mottle associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,398 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry rusty mottle associated virus isolate B48-C, complete genome
|
GAAAACAAACAGACCAAAACTAGCACAGATTAACACAATCTGCCCTAGAACATAGGCTTGCAGTCTGCCCTCTCTGAGCCCTACCAGTTCAAAGAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCCTGCATACAATCACTCCTGCTGAAGGTGTTCTGGCTCAATTCTCCTCTGAGGAAGCTAGCCGAATTGGAGCCTCTGCCATCTCCAATTTCTCAAAGCTTGAGTCAGAGTACCACTCACTCTTTCATTTCCATCTTCCTGCATATGCCAAGAGCAAACTCTCTAACAGGGGTTTCTACCTTTCACCATTTTCTTATGAGACTCATAGCCACCCTGTTAGCAAAACCATTGAGTCCCACTTAATTAATGTAAAGTTGCCCAATTATATTAATGAAGATTTTTTAATTGTAGGAATTAAAGAAAATAAATTAAGTGTGCTTAGAAAAGACAAAAAAATGAGATTCCTTGAAGCTCTCAATCGCTGCGTGACGTCTCACGATATTCAGAGGTATGGACCAAGTTTCCATTTTGAAAAAGCCAAATCTAACTGGAGAAGTGACTTTTCAGGAGTCGATCTGTCTGTTAGTGTTCAGAGTTTGCTGCCGAGGGTCCTTTTTGATAAAGGAAAGATGTTTGATGCCCAGATCTTTTTGTATGATGAACTTCATTATTGGAGCATGAAAGATATAGTGGATTTCCTAGAAATCTCACGAGCAAAAACAGTCATTGGCTCCTTTGTTTTCCCTTCTGAAATACTGGCAGGTGCTCGAACCAGTTTGAATCCCTGGGCTTACGAATTCAAAATTAAAGGGGACAAAATGATATATGCGCCAGATGGTGTTTGGGCAGAATCCTATGAGCAACCTTTATCTGCAGGGCAGTTGTTAAAGTTCAATAGAATTATGACTAGGAATGGTGTCTACTCCGTACAGGTGAGGGATTCTATTTACAGCCATTGTCTAGTTATCATCAATAGGGATGAGTTGCTTTGTGAGGAGTTCAGGGTGTTTAGCGATTTTGATGCCATTTCTATTCGCAGAATAGGCTACCTGGGTGGTAACGCAGATGATGTTATTCCTGTAAGGCACGAGGTCGTTCTGTCAATCTTCAAATACATCAGAACTCTTAAGAAGCCTGACCTTCAGTCCGGGATGGCCAAACATAGGCAACTGGTGGACAACCCTACAGGGTTTGAAATTCGCTTTATAGAGGACTTCGTGCAATTCATACTTGAACATCATGAAAAGTTCAACCTCATTGAGCAGAAGTTCTCAAACTTTTTCAGCTCTGCCTGCATAAGTTTGCTTCCAAGGTACATGCAGAGGTTCTTCAACAGTTTTAAGGGTTACAGCCTTGGAAAATTCATTGAGGAGATAGAACCTTTCTCATTCACTCTGAAGTGCAGAACCTATTCACGATTTGGTTTCAAAACTAGCTTTGCTGAAGAGGAGGAGGGTGCAACTGCTGCTGATGATTCTATGTGTTTAAGTCTTAAGCAAATTAACAGCAAGCAAGTCTGTCTTGATGATTACCCAGATCTGATATTCAACGCACACTCATCAGTCTTTTCTGGCTCCCATCCAAACATCGTTCTGATGTTAGTGAAAATGTTCATCAATATGTGGGTTGGGAAAACTGCTGATTGCTATTACTCTTCACTCACCGCCCTTAAGCAAGCGCTCAATCAGAAGGGAGCAAAGCTGTTCATGCTTCATAACGAAAATTACAATTCACTTGTGATTTTCGCCAATCTTGTTGATTCACACCTCTTTAAGAATCTTCTCAGGAATGAAATTAAAAAGAGGCTGAGGTTGAGAAACAGTGTGAGAGGACTCTTGAGGAATGACCTACCACCAAGTTGTCCTGATGCTAAAAGGGAAGTCAGGTTCATTTCCTGTTACAAATCCTTACTTGCTGACTTTAAAAAAATGAGTGAAGAATGCTCACCAATTCTGACATTAACAGCCACCAGCGGTCTCAGAGAACAGCTTCGTGCCATGAAGGAGAACTTTGTTGTGGTTAATCAACCTTTGGTTAAAAAAATTCAAGGGAGGAAAGAGTGTGCTCCGACGCAATCTGATGTTAATTTGAACAACAGTGGCGAGTATGAGTTGGTTGATCAAAGTGGTTGTGAAGTGGTTAATGCGGGCAAACAAGTGGTCAGTGAGGCGCGTGACTCAGATATACCAAAACCAAAAGATGCCAAGGTCAGTGGTAGTGATCTATTCATTTCAAGCATTATAAAGATAGGACCATTCAAAGACGCTTCAACCATATCCTTTATTGAAGGTCTTGATTTTTCAAAAGGGCACAATCACAGAGGGAGAAAATCACTTTTCTTTTCAAATGGTGGTTTTTCATATGGGTTCAATGACGTCGTGTATCAATCACAAGGCTGGCCCAATGCTTTCAAGGAGCTATATGGAGACAGGTTCAATTCCTGCCTTGTTCAGAAATACAGTGATAATGCCACCCTTGGCTTTCATTCCGATAATGAAAAGTGCTATGATCAAGATCATGAGGTTTTGACAGTCAATCTCTTTGGATCAGCAACCATTGCTTTCTCAAAAGGTAACTTCACCACTTCTAACATGAACAATCCAGAAATGTATTTGGAAGTAAAGCTTGATCATTGTGACTGGCTCCTTATGCCCAAAGAATTCCAAAAAGGTTACAAACATAGCGTGAAGGGTACTTCTGAGGGCAGGATTTCTCTAACCTTCAGGAAGCAAAGTCGAACTCTGGAAGGTTCCTTGATACAAAATAAATCATCAGACAGTGATGCAGGTGCTGATGATCATGATGGCGGGTTCTACTTCGAGGAGATCAACAAATGTTCAATCACCTCTGCCCCTGATTCTGTGAAATGCAGCTTGTCAATTTTTCCAGTTAAGGCTGATGGTGACTGCTTTTGGCATGCAGTTTCTTCCATATTTGGACTCGAGGCTAAAGAGTTAAAACAACTTGTTCATGATAGGGCTATAGCTGAGGGGTGCATTGATCAATGCCACATGAAAGACTTCTTGCATGAGATGGAACCAAAAGTTTATGCTAGCAATGCTTCTCTAGCAGCCACATGTTACCTCATGAATCTCAAACTCATCATTAAACTTACTGGTCTTGAAGATGATAGTTGGGTTGTTGTTGAACCATTGGCTCTTTCCAATGAGAAATCCTCCATCGGCTACTTAGTCCTGAATCAAAAGTGCCACCACTTTGATCTGGCTGTACCAAAGGAAGGTTGTGTTGTTAGAGCAGTGAGTGAATTTCTAAAGCAAAATCCAACGAAAATTTTGAGCGTCCTCAGTGCCAACTGTTCCAAGGAGTTACTACATGAGCTAATGAGTGGGTTAGGCATACAGGAGTTTCATCTGGAGGAGATCTTCTCTATTTTTGACATCTGCGCTGAAGTTAGCGATGGGGTTAGCTCAAGGGTGCTGAACAAGAAGGGATCTAGGTCAGCAAAATTTGTCGTTGACAAGGATCACTTCTCCTTCTGCCCTGGTACAAAAGCTTCCACCAATTTGGGCGCCTTCAAATCTCCAAGTGGTAGTTCCATGATTGCAATAGAGAAGTATGATGAATTTTTGAAATCAAGTGCCAATGTTATTCCTTTCACACCATCCCTCCCATTGGCAAAGAAACTCGCAGACTCTTTTCTGAGCGGGCAAACCGGTGTCATTAATTCAAAGATTGTTGCAGGCCAATACGACTGGTTAGCCAACACCAACAAGCTTTGCTTTGATGAGAGAAGAATTGGTGCCATTGTTGGCACTTTTGGGTCTGGTAAGAGCCACAACGTTATTGAGCTAATAAGGCACAATCTTGGGTACCAGAATCTGATCATCTCCCCAAGAAGGAGTCTGAAGGATCAATTTATAAGCATGCTTGATTTGGTCAATGCCAGAAGCAAGGGGAAGAAAACATCCACTGATGTAGTTACCTTTGAAGTTGCCCTTAAGAAAAATGGGCTCCTCAAAAAGGCCAGAATTTTCATTGACGAGGCTCAACTGTTGCCCCCTGGTTATCTGGACTTAATTTGCTTGATTGCGGGGAGTGATTCTTCCGTTTTGGTGATGGGTGATCCAGCACAAAGTAGCTACGATTCTGCTGAGGACAGGGTGGTGTTCGCCGGAGAGAAGGGGTGTCTTGACAGACTGCTTGAGGGGAAGAGGTATGTTTATCTGAGCGAATCAAAGCGTTTCAGGAACCCAATGTTCGTTGGGAGGTTACCATGCACTTTTGATTCTAGCAGGTTGACTCTCGAGAAGGAAGAGTATGCGGTCTTTGACTCTTTCAAAGCTTTTAAAGGTGACTATCTATCTCCAAAGATTAAAACCTTCTTGGTAAGTTCTTTCACGGAGAAAACAGTAGTCAAGGCCAACATGGGAAGGAATGTGTCCATCTTTACCTTTGGGGAGAGTACCGGTATGAATTTTGACTACGTTTGTGTCCTTCTCACCCAAGACAGTATGCTTGTTGATGAGCGCAGGTGGGTTGTGGCGCTTTCTCGTGCAAAGATCAACATTTCATTCATCAATTTATCTGGTTTATCTCTTCCTGAGTTCTGCACACAAATGATGGGTGGTGTTGTCCACAAATTTTTCACATCTACTGCAACCTTCAATGATCTGAGAGACCTTCTTCCTGGTGATCCTATCTTTTCAAAGAAATTCCAGAGGCTTGGTAAAGATGAAGTTGATAGGGAGGCCAGATTGTCAGGTGATCCCTGGTTAAAGACGAAGGTGTTTCTTGGGCAGAGAGAAGGGAAGATTGAAAATGTTGACACAACTGATGAGGGGTTGAAGGACATTAAAATTAAAGTTCATTGTCCTGTGGGTTCAATTGGTTCAACCTTAGCAGATATTCAGGCAGGCATCAGAGTTAAAGAAGCTAGAGAGTTCAGGATTGGCAACCTTGTCACAGAGCAATTCTCGGAAACTCACAAAGGAAAAGGTAAAGTGCTCACGGCGGCTCCTGATAATTTTGAAGCTATTTACC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| 94,367 |
NC_024449.1
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
James,D., Varga,A., Lye,D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-06-25
|
CTLV_8431
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,431 |
RefSeq
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null |
1991
| null |
PRJNA485481
|
Cherry twisted leaf associated virus isolate CTLV_8431, complete genome
|
GAGAACAATCTGACCAAAACTAGCACAGATTATCACAATCTGCCCTAGCAAATAGGCTTGCAGTCTGCCCTTTCTTGACCATCCCGTCCAGAAAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACCATTACCCCCGCTGAGAACGTTTTAGCTCAATTTTCCTCTGAAGAGGCTAGCAGAATCGGTGCTTCTGCCATTTCCAACTTCTCTAAGTTGGAAGCAGACTACCACAACCTGTTCCATTTCCATCTGCCTGCCTATGCCAAGAAGAAGCTCTCTGAAAGGGGTTTCTACCTTTCACCCTTCTCTTATGAGACTCACAGTCATCCTGTAAGTAAAACTATAGAGTCCCACTTAATTAATATTAAGTTGCCTAATTATATTAATGAGGATTTTTTAATTGTAGGAATTAAGGACAATAAACTTAGCGTTTTGAGAAAAGAAAAAAAATTGCGTTTTTTAGAAGCTGTGAATAGATGTGTTACCTCCCATGATATCCAAAGGTATGGTCCAAGCTTCCACTTTGAAAAGGCCAAATCCAATTGGAAGACTGATTTTTCAGAAGTGAACCTCTCTGCTGGGGTTCAAAGCCTTCTCCCAAGGGTTCTTTTCGATAAGGGTCGCATTCAGGATGCCCAGATTTTCCTTTATGATGAACTTCATTACTGGAGTATGAGGGACATTGTGGACTTCCTTGAGATCACACGAGCCAAAACTTTGATTGGATCCTTCGTGTTTCCAACTGAAATTCTTGCTGGTTCAGACCGAAGTCTCAACCCCTGGGCTTATGACTTTAAAATTCAAGGAGACAAATTAATATATGCTCCTGATGGAGTTTGGGCCGAATCTTATGAACAACCCCTTGCTGCTGGGCAAATCCTCAAGTACAACAAGATCATTACTCAACAAGGAGTTTACTCAGTTCAGGTTCGCGATTCCATTTATAGCCACTGCTTAGTTATAATTAATCGCGATAACCTTCTGAATGAGGAGTTCAGGGTCTACAGTGAGTTCGACGCAGTGTCAATTCGCAGATTGAATTACCTTGGCGGCAATTCTGACGACATTATTCCAGTCCGTTATGAGGTCATTTTGTCTGTCTTCAAATATATTCGAACTCTTAAAAAGCCAGATCTTCAATCCGGAATGGCAAAGCATAGACAGCTAGTTGATGAACCTACGGGTTTTGAGGTTCGCTTTATTGAAGATTTTGTCCAATTCATTTTGGAGAACCATGAAAAATTTAACTTGATCGGGCAAAAGTTCTCAAACTTTCTAAGCTCAGCCTGCATTGAGGTGCTTCCCAGGTACATGCAGAGATTCTTCAAGAGCTTTAAGGGTTATAGCCTTGGTAAATTTATCGAAGAAATTGAACCTTTTAGCTTTACAGTCAAGTGCCGCACCTACTCAAGATTCAGCTTCAAAAATAGCTTCATAGAGGAGGAAGAGGCCAGGGAAAGGGATGGTGATCCAATCTACAAGCAATTCTCAAAGTCTCAATCCTTCAATAGCACTGCTTACCCAGACTGCTTGTTTCATGCATCACAATCAGTTTTTTCAAACCCTCACCCTAATCTGATTAGGCGGTTAGTCACTTTATTTATCAGTACCTGGGTTGGAAAAACTGAGGCGGACTACTATACATCATTACTATCACTCAAAAAGAGTCTTAGTCAGAAGGGCCTCAAACTTTTTCGTCTTCATGATGATAGGTACTTTTCTTTGACTCGTCTGGCCAATCTGATGGATTCTTTTAGCTTCAAAGCTACACTTAAAAATGAAGTCATGAAAAGATTAAGATTGGGTGGTAGTCTTAGGGGCTTGCTAAGGTATGATCCCATTTCTGAAAATCCCTCAGACAAGAAGGATCAGAGGGCTAGAAGCAATTTTTCCTCTGTAGTTAGTGAATTGTTGAGCATCAGTTCTGAATGTCCACCTTCCAGCACTCTCACAAAAACCTCTGGCCTGCAGCAGGAGCTCTGGAAAATGAAAAAAGAAGTTGTAACCAAACAAGCTCCTGTCCTTAATGAGGAACAAAAACCATATAAGATTCCCTCAGAAAGAGAAAAGTGTTCCACTCAAGCCATTGAGAAGAACGAAGAACCTAAGTCGGAGGTTGTCAGTACCAAAGGTGAGACCCCACCTGAAACAAGTAAAACTACCTCAAAATTTGGGGAGCTACTTGCCACCCCTGAGGCAACTGCTGTGTCTGAACCCACTGATAATGTCCTTGCCAGCAGTGACCTGTTTATTTCAAGCATCATCAAGACTGGGCCATTTGGTGATCATGGCGTCATTGAATTTATCAGGAGTCTCAGTTTTAATGATGGTCACTCTCACAATGGGAGAAAGGCACTTTTTTTCTCCCGAGGAGGTTTTGCCTATGGATTCAATTCGGTGACTTACCAGTCCTCTGGCTGGCCATCCGCTTTTGAGGAAATTTATGGGGATAGGTTCAATTCCTGTTTGGTTCAGAAGTATGAAAAATCCGCCAAATTGGGGCTTCACAAGGATGATGAGGATTGCTATGATGATGAGCATGAAGTCATGACTGTTAATCTCTTTGGCACAGCTACTTTAATTTTCACTGCTGATGGTGCAAAGGGGTTGGAGAGAGCAGATCCATCCAAATTTCTTGAAATCACACTTAGCCATGGTGAGTATTTGCTGATGCCTAATGGTTTCCAAAAAAAATTCAAACATGGAGTTAGCTGCACCTCAGCTGGGCGTATTTCACTCACACTCAGGAAGCAGGCGAGATCCATGAGCGGAGCAACTCTGCATGCTGGTGCTGATGGAGGAAACAATAATGGTAGTGGCAACGAGGAAGATGATAGTTACTATGAGGAGATGAACAAGTGCTCAATATCTTCAGCGCCTGACTCTGCAAAGTGCAGCCTTTCTGTCTTTCCAGTGAAGGCTGATGGGGATTGTTTCTGGCACGCCGTTTCCTCAATTTTTGGCCTTGATGCTCTTGAACTGAAGAATTTGGTTAAAGAAAGAGCCATTGAAGAGGGGTGTGTGGACCAAAAACACATGAAGGATTTTCTGCATGAAATGGAAGCAAAAGTTTATGCTTCCAATGCCTCCATCACTGCCACATGTTTTCTCATGAACATCAAGCTGATTATCAAACTGGTTGAATCAAAACACTCTGGCTGGGTGGTTGTAGAACCTCTCAATTCTTCTAATGAAAAAATCTCATTGGGTTATCTCGTTTTGAATCAACGGGTCCAGCACTTTGATCTAGCTGTTCCAAAAGAGGGTTGTGTGATTCGTGCCATCAGTGAATTTTTGAAGCAGAACCCCACCAAAGTGCTAAGTGTTCTCAGTGCAAACTGCTCCAAGGAGCTTCTTCATGAGTTGATGAGTGGGCTTGGCATTCAAGAATTCTTCTTGGAAGAAATTTTTAAAGTTTTTGACATTTGTGCCGAGGTTAGCGATGGGGAGAAGTCAAGAATTTTGAATGCTAATGGTTCCAGGTCTGCAAAATTCACAGTGGAACAGGACCATTTCTCTTTCAGTCCTGGAGTAAAGGCCTCAACCAATCTCGGTTCATTCAAAGCTCCAAGTGGTGGTCAGACAATTCCAATCGAGCAGTATGAAACTTTCCTCAGAGGAAATGCAAATGTCATTCCATTCACACCTTCATTGATTGCTGCAAAGAAGTTAGCAAATTCCTTCTTGAGTGGTCAGACCGGTGTGATCAATTCAAAGATAATATCTGGGCAGTATGACTGGCTGGCAGACACCAACAAGCTCTGCTTTGATGAAAGGAAAATTGGGGCTATTGTTGGAACTTTTGGGTCCGGAAAGAGTCACAATGTTATTGAATTACTTAGACACAATTTGGGGTATCAAAATCTGATCATCTCACCCAGGAGGAGCTTGAAAGAACAATTTATTAACATGCTAGATTTGGTTCAAGCGAGGAGTAAAGGAAAGAAGGCCTCAACTGAGGTTGCCACATTTGAAGTTGCTCTCAAGAAAACAGGTATGCTGAAGAAGGTCAGAATTTTTATTGATGAAACCCAACTTTTACCACCTGGTTATCTGGATCTTGTGTGTCTGATTGCTGGGCCAGATGCCTCCATCTTGGTTATGGGAGACCCTGCTCAAAGTAGTTATGATTCTGCAGATGACAGAATGGCATTTATTGGAGATAGGGGTTGTCTCGATGTTTTACTGGATAACAAGCGTTATGTCTACCTCAGTGAATCTAAAAGGTTCCGGAATCCGATGTTCCTGGGGAGATTACCCTGCACCTTCGATCAAAGCAGAATGACCCTGGAGAAAGAAGAGTACGCCGTGTTTAGCTCTTTTAAAGACTTCAAAAATGACTACCTCTCCCCTAAAATCAAAACCTTTTTGGTCAGCTCCTTTACCGAAAAGACTGTGGTGAAGGCAAATATGGGGAGAAATGTTCTTGTGTACACTTTTGGGAAAAGCACTGGAATGAATTTTGATTATGTTTGTGTGCTGCTCACCCAGGATAGCATGCTTGTTGATGAAAGGAGATGGGTTGTGGCCTTATCGAGAGCAAAAATCAACATGTCTTTTGTCAACCTTTCCGGACTCTCTCTCCCTGAATTCTGCACACAAATGGTTGGTGGTGTAGTTCACAAGTTTTTTACAGGCACCGCCACCTTTAATGACCTACGCAGCTTACTCCCCGGAGATCCGATCTTTTCAAAGAAATTTCAAAGGCTTGGGAGTGATGAAGTTGATAGGGAAGCAAGACTTTCTGGTGACCCATGGCTCAAAACCAAGGTCTTTCTTGGGCAACGGGAGGTGAGGCCAGTTGAGGAACCAATTTCTGTTGAAAATCTAAAAGACATCAAAATTAAGGTTCATTGTCCTGTTGGTTCTATGGGTGCTACATTTGCTGAAGTTCAATCAAAACTCAAAGTTAAGGAGGCTAGAGAGCACAGAATTGATACCATAGTGACTGAACAATTTGCTGAGGTTCACAAGGGTAGGGGTAAGATTCTCACTGC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| 6,462 |
MZ220952.1
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13C202
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,433 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus
| null |
2013
| null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 13C202, complete genome
|
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| 37,143 |
MZ220953.1
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13C233
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,424 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus
| null |
2013
| null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 13C233, complete genome
|
GAGAACAATCTGACCAAAACTAGCACAGATTATCACAATCTGCCCTAGAAAGTAGGCTTGCAGTCTGCCCTTTCTTGACCAACTCGTCTAGAAAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACTATTACTCCAGCTGAGAGCGTTCTAGCTCAATTTTCTTCTGAGGAGGCTAGCAGAATTGGTGCCTCTGCCATTTCCAACTTCTCTAAATTGGAGGCAGATCACCACAACCTGTTTCACTACCATTTACCTGCCTATGCCAAGAAGAAACTTTCTGAAAGAGGCTTTTACCTCTCTCCTTTTGCTTATGAGACCCATAGTCACCCTGTTAGTAAAACTATTGAGTCTCACTTGATAAATATTAAGCTCCCTAACTATATTACTGAAGAGTTTTTAATTGTAGGAATAAAAGAAAATAAACTTAGTGTTTTAAGAAAAGACAAAAAATTAAGATTTTTAGAAGCTGTAAATAGATGTGTGACCTCCCATGACATCCAAAGGTACGGCCCAAGTTTTCATTTTGAAAAAGCAAAGTCTAATTGGAAAACAAATTTTTTTGAGGTGAATCTTTCAGCTGGGGTTCAAAGTCTTTTACCAAGAGTTCTTTTTGACAAAGGTCGCGTTCAGGATGCGCAAATTTTCCTTTATGATGAACTTCATTATTGGAGTATGAAGGATATTGTTGACTTCCTTGAAATTTCACGAGCCAGGACTGTTATTGGTTCCTTTGTTTTCCCAACTGAAATTTTGGCTGGTTCTGACCGAAGCCTCAATCCCTGGGCCTATGACTTCAAGATTCAAGGGGAAAAGTTAATCTATGCGCCTGATGGAGTTTGGGCTGAGTCTTATGAGCAACCTTTAGCTGCCGGGCAGCTTCTCAAGTATAACAAGATTATTACTCAGCAAGGTGTTTATTCTGTTCAAGTGCGCGATTCTATCTATAGCCATTGCTTAGTCATAATTAACCGCGATAATCTCCTAAATGAGGAATTCAGAGTTTACAGTGAGTTTGATGCTGTGTCAATCCGTAGGCTCAACTATCTTGGAGGTAACTCTGATGACATTATTCCTGTTCGCTATGAAGTTATCCTGTCTGTCTTCAAGTACATCAGAACTTTGAAAAAGCCTGACCTCCAGTCCGGCATGGCAAAACACAGACAGCTAGTTGAAGACCCCACTGGCTTTGAAATACGATTCATTGAGGATTTTGTCCAGTTTATTTTGGATAATCATGAGAAGTTCAACCTGATCGGACAGAAGTTCTCCAACTTTTTGAGTTCAGCGTGTATTGAAATGCTTCCAAGATACATGCAAAGATTTTTTAAGAGCTTCAAAGGTTACAGCCTTGGAAAATTTATTGAGGAGATTGAACCTTTCAATTTCACAGTTAAGTGTCGCACTTACTCAAGGTTCAGCTTTAAGCACAGCTTCGTGGAGGAGGAGGAAGCAAGGGAAAGAGTTGGTGACCCAATCAATCTTCAAATCTTCAAATCTCAATCTTTTAAGAATTCCAGTTATCCAGATTGTCTGTTCCATGCTTCACAATCAATCTTCTCCAACCCTCACTCCAATCTGATCAAGCAGCTGGTGGTTACTTTTATCAACACTTGGGTTGGTAAGACTGAAGAGGATTATTACACTTCACTGCTTTCACTCAAGAAAAGTCTTAGTCAGAAGGGTTTCAAGCTTTTCCTCCTTCATGATAACAGATACTTCTCCTTGATTCGCTTGGCCAATTTGATGAATTCTTTCAGCTTCAAAGCTACTTTAAAAAATGAAGTAGTGAAAAGATTGAGACTGGGTGGTAGCCTTAGGGGCTTGCTGAGGTATGATCCTGTTTCTGAGAACCCTTCGGACAAAAAGGAGCAGAGGATGCTAAAAAATTTTTCAGTAGCTGTTGGTGAATTGCTGAGTATTAGTGCAGAGTGCCCAATCTCAAATATTCTCACAGGAACATCCAGTCTACAACAGGAGCTTTGGAATATGAAAAAATGGGCAGTTGTTCGTCAAAATTCAAATTCTAAAATGATCCAAGAAGTTAAAAAAAATACCATTGAGAAAGTTGAAGCCACCACCCACACAATTAAAGATGATGATGATGATGAACAGAAGACCGGGTGTGCAGAAGGTAAGATACCAAAAGATGAAAGCACTCAAAGTTCAAAAGTTGAGATCCTGCAATCAATCACAAGACCCACCCCAGAGCCGGAATTTACTACCCATCCCCAGGCTGGTGGTGAATCATTCATCTCAAGTATCATTAAAACTGGCCCCTTCTGCGATAATGGCACTATTGAGTTTGTACGGAACCTCAGCTTCAGCGATGGTCACCCTCACAATGGAAGGGTTGCTCTTTTCTTTTCAAGAGAAGGCTTCTCTTATGGCTTTAACTCTGTAACTTACAAGTCCGCTGGCTGGCCATCAGCATTTGAAGAGCTTTATGGTTCAAGATTTAATTCTTGCTTGGTGCAGAAATATGAAAAGTCTGCCAGGTTGGGCCTTCACAAAGATGACGAGAAATGCTATGATGAGGATCATGAAGTTATGACTGTCAATCTTTTTGGTACTGCAACCCTTGCTTTTACTGCTGACAGTGCAAAGGGATTGGAAAAACAGGATCCTTCCAAATTTCTTGAAATTACTCTGAGTCATGGCGAGTACCTACTGATGCCTAAAAGTTTCCAAAAGAATTTTAAGCATGGTGTCAGTTGCACTTCAGCTGGCCGCATTTCACTCACTTTCAGAAAGCAGGTGAGAACAATTGATGGCACAGCTCTTTGTACTGGTACAAAGGAAAAGGGTGGTGATGGAAACAATAATGATGGAGGTGATAGCTACTATGAAGAAATGAATAAATGTTCAGTTTCAGCAGCTCCCGACTCTGTGAAATGCAGTCTTTCTGTTTTCCCCGTGAAGGCTGATGGGGACTGCTTCTGGCACGCAGTTTCCTCAATATTTGGCCTAGATGCTTTGGAACTTAAAAATTTGGTTAAAGAAAGAGCCGTCGCTGAAGGGTGTGTTGAGCCAAAGCATATGAAAGAATTTCTGCACGAAATGGAACCAAAGGTTTATGCCTCCAATGCCTCCATTACTGCTACCTGCTTCCTCATGAATATCAAGTTGATCATCAAGTTAACCGAATCCAAGCATGCTGGCTGGGTTGTTGTTGAACCACTTACATCTTCAAATGAGAAGATTTCCCTTGGTTATCTTGTTCTAAATCAGCGAGCTCAGCACTTTGATTTGGCTGTTCCAAAAGAGGGTTGCGTGATTAGAGCCATTAGTGAATTTCTGAAGCAGAATCCAACCAAGGTGCTTAGTGTGCTTAGTGCCAATTGTTCAAAGGAACTTTTGCATGAACTAATGAGTGGGCTTGGTATACAGGAGTTTTTTTTAGAGGAAATCTTTAAGGTTTTTGATATATGTGCTGAAGTTAGCGATGGCGAGAAATCAAGGGTTCTAAATGCTAAAGGCTCTAGATCAGCAAAGTTTATTGTTGAGCAAGATCATTTTTCTTTCTGTCCCGGTGTGAAAGCTTCAACTAATCTTGGCTCATTCAGGGCACCAAGTGGCAGTCAAACCATTCCAACTGAGCAGTATGAAGTTTTTCTGAGAGGGAATGCAAATATTATTCCATTTACACCGTCTTTGGCCGCTGCAAAGAAACTGGCAAATTCATTCTTAAGTGGACAGACTGGAGTTATCAATTCAAAGATTATTTCTGGACAGTATGATTGGTTGGCTGACACAAATAAGCTTTGTTTTGATGAGAGAAAGATTGGGGCTATAGTCGGAACCTTCGGATCCGGAAAGAGTCACAATGTGGTTGAACTCCTCAGGCACAATTTGGGGTACCAAAATTTAATCATCTCTCCAAGAAGGAGCTTGAAGGAGCAATTCATCAACATGCTGGATCTGGTGCATGCACGAAGTAAGGGAAAGAAAACCTCAACCGAAGTTGCTACATTTGAGGTTGCTCTAAAAAAGACTGGTATGCTGAAGAAGGTGAGAATTTTTATCGACGAGACCCAGCTTTTACCACCAGGCTACTTGGACCTTATTTGCTTGATTGCTGGGCCTGATGCTTCCATTTTGGTTATGGGGGACCCTGCTCAAAGCAGTTACGATTCTGCAGATGACAGGATGGCTTTTATTGGGGACAAAGGATGCCTTGATGCTTTATTGGAAAATAAGAGATATGTTTATCTCAGCGAATCGAAAAGGTTCAGAAATCCAATGTTTTCTGGGAGGTTGCCTTGCACATTTGACCAGAGCAGAATGACTCTGGAGAAGGAGGAGTACGCAGTTTTTAATTCCTTCAAAGATTTTAAAGGTGATTATCTTACTCCAAAAATTAAAACTTTCCTAGTTAGCTCCTTCACTGAAAAAACTGTTGTCAAAGCTAATATGGGAAGGAATGTTCTTGTGTACACATTTGGAGAAAGTACAGGGATGAATTTTGATTACGTTTGCGTTTTGCTTACGCAAGATAGCATGTTGGTTGATGAGAGAAGATGGGTCGTTGCTTTGTCCAGGGCCAAGATCAACATGTCTTTCGTTAATCTGTCTGGGCTCACTCTATCAGAGTTCTGCACCCAAATGGTTGGTGGCGTTGTTCATAAATTCTTTACTGGTACGGCCACCTTTAATGATTTGCGCAACCTGCTTCCTGGAGATCCCATTTTTTCAAAAAAATTCCAAAGACTTGGGAGTGACGAGGTTGATAGAGAAGCTAGACTCTCTGGTGATCCCTGGCTAAAAACAAAAATTTTTCTCGGGCAAAGGGAGGTCAAACCCATTGAGGAACCAATCCCTTCAGAAGGTTTAAAGGACATCAAGATCAAGGTTCATTGCCCAGTGGGTTCTATGGGAACCACCTTTGCAGAAATTCAATCGAAACTCAAGGTTAAAGAAGCCAGGGAGCACAGGTTTGATTCCATAGTTACTGAACAGTTTGCTGAAGTTCACAAGGGCAGAGGCAAGATCCTCACAGC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| 37,144 |
MZ220954.1
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13C236A
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,434 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus armeniaca
| null |
2013
| null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 13C236A, complete genome
|
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| 37,145 |
MZ220955.1
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13C236B
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,425 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus armeniaca
| null |
2013
| null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 13C236B, complete genome
|
GAGAACAATCTGACCAAAACTAGCACAGATTATCACAATCTGCCCTAGAAAGTAGGCTTGCAGTCTGCCCTTTCTTGACCAACTCGTCCAGAAAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACTATTACTCCAACTGAGAGCGTTCTAGCTCAATTTTCTTCTGAGGAGGCTAGCAGAATTGGTGCCTCTGCCATTTCCAACTTCTCTAAATTGGAGGCAGATCACCACAACCTGTTTCACTACCATTTACCTGCCTATGCCAAGAAGAAACTTTCTGAAAGAGGTTTTTACCTCTCTCCTTTTGCTTATGAGACCCATAGTCACCCTGTTAGTAAAACTATTGAGTCTCACTTGATAAATATTAAGCTCCCTAACTATATTACTGAAGAGTTTTTGATTGTAGGAATAAAAGAAAATAAACTTAGTGTTTTAAGAAAAGACAAAAAATTAAGATTTTTAGAAGCTGTAAATAGATGTGTGACCTCCCATGACATCCAAAGGTACGGCCCAAGTTTTCATTTTGAAAAAGCAAAGTCCAATTGGAAAACAAATTTTTCTGAGGTGAATCTTTCAGCTGGGGTTCAAAGTCTTTTACCAAGAGTTCTTTTTGACAAAGGTCGCGTTCAGGATGCGCAAATCTTCCTTTATGATGAACTTCATTATTGGAGTATGAAGGATATTGTTGACTTCCTTGAAATTTCACGAGCCAGGACTGTTATTGGTTCCTTTGTTTTCCCAACTGAAATTTTGGCTGGTTCTGACCGAAGCCTCAATCCCTGGGCCTATGACTTCAAGATTCAAGGGGAAAAGTTAATCTATGCGCCTGATGGAGTTTGGGCTGAGTCTTATGAGCAACCTTTAGCTGCCGGGCAGCTTCTCAAGTATAACAAGATTATTACTCAGCAAGGCATTTATTCTGTTCAAGTGCGCGATTCTATCTATAGCCATTGCTTAGTCATAATTAACCGCGATGATCTCCTAAATGAGGAATTCAGAGTTTACAGTGAGTTTGATGCTGTGTCAATCCGTAGGCTCAACTATCTTGGAGGCAACTCTGATGACATTATTCCTGTTCGCTATGATGTTATCCTGTCTGTCTTCAAGTACATCAGAACTTTGAAAAAGCCTGACCTCCAGTCCGGCATGGCAAAACACAGACAGCTAGTTGAAGACCCCACTGGCTTTGAAATACGATTCATTGAGGATTTCGTCCAGTTTATTTTGGATAATCATGAGAAGTTTAACCTGATCGGACAGAAGTTCTCCAACTTTTTGAGTTCAGCATGTATTGAAATGCTTCCAAGATACATGCAAAGATTTTTCAAGAGCTTCAAAGGTTACAGCCTTGGAAAATTTATTGAGGAGATTGAACCTTTCAATTTCACAATTAAGTGTCGCACTTACTCAAGGTTCAGTTTTAAGCACAGCTTCGTGGAGGAGGAGGAAGCAAGAGAAAGAGTTGGTGACCCAATCAATCTTCAAATCTCCAAATCTCAATCTTTTAAGAATTCCAGTTATCCAGATTGTCTATTCCATGCTTCACAATCAATCTTCTCCAACCCTCACTCTAATCTGATCAAGCAGCTGGTGATTACTTTTATCAATACTTGGGTTGGTAAGACTGAAGAGGATTATTACACTTCACTGCTTTCACTCAAGAAAAGTCTTAGTCAGAAGGGTTTCAAGCTTTTCCTCCTTCATGACAACAGATACTTCTCCTTGATTCGCTTGGCCAATTTGATGAATTCTTTCAGTTTCAAAGCTACTTTGAAAAATGAAGTAGTGAAAAGATTGAGACTGGGTGGTAGCCTTAGGGGCTTGCTGAGGTATGATCCTGTTTCTGAGAATCCTTCGGATAAAAAAGAGCAGAGGATGCTAAAAAATTTTTCAATGGCTGTTGGTGAATTGCTGAGTATTAGTGCAGAGTGCCCAATCTCAAATATTCTCACAGGGACATCCGGTCTGCAACAGGAGCTTTGGAATATGAAAAAATGGGCAGTTGTTCGTCAAAATCCAAATTCTAAAATGCTCCAAGAAGTTGAAGAAATTACCATTGAGAAAGTTGAAGCCACCACCCACACAATTAAAAATGATGATGATGATGAACAGAAGATCAGGTGTGCAGAAGGTAAGATACCAAAAGATGAAAGTACTCAAAGTACAAAAGTTGAGATCCTGCAATCAATCACAAGACCCACCCCAGAGCCGGAATTCACTACCCATCCCCAGGCTGGCAGTGAATCATTCATCTCAAGTATCATCAAAACTGGCCCCTTCTGCGATAATGGTACTATTGAGTTTGTACGGAACCTCAGCTTCAGCGATGGTCACCCTCACAATGGAAGGGTTGCTCTTTTCTTTTCAAGAGAAGGCTTCTCTTATGGCTTTAACTCTGTAACTTACAAGTCCTCTGGCTGGCCATCAGCATTTGAAGAGCTTTATGGTTCAAGATTTAATTCTTGCTTGGTGCAGAAATATGAAAAGTCTGCCAGGTTGGGCCTTCACAAAGATGACGAGAAATGCTATGATGAGGATCATGAAGTTATGACTGTCAACCTTTTTGGTACTGCAACCCTTGCTTTCACTGCTGATAGTGCAAAGGGATTGGAAAAACAGGATCCTTCCAAATTTCTTGAAATTACTCTGAGTCATGGCGAGTACCTGCTGATGCCTAAAAGTTTCCAAAAGAATTTCAAGCATGGTGTCAGTTGCACTTCAGCTGGCCGCATTTCACTCACTTTCAGAAAGCAGGTGAGGACAATTGATGGCACAGCTCTTTGTACTGGTACAGAGGAAAAGGGTGGTTATGGAAACAATAATGATGGAGGTGATAGCTACTATGAAGAAATGAATAAATGTTCAGTTTCAGCAGCTCCCGACTCTGTGAAATGCAGTCTTTCTGTTTTCCCCGTGAAAGCTGATGGGGACTGCTTCTGGCACGCAGTTTCCTCAATATTTGGCCTGGATGCTTTGGAACTTAAAAATTTAGTCAAAGAAAGAGCCGTCGCTGAAGGATGTGTTGAGCCAAAGCATATGAAAGAATTTCTGCACGAAATGGAACCAAAGGTTTATGCCTCCAATGCCTCCATCACTGCTACCTGCTTCCTCATGAATATCAAGTTGATCATCAAGTTAACCGAATCCAAGCATGCTGGCTGGGTTGTTGTTGAACCACTCACATCTTCAAATGAGAAGATATCCCTTGGTTATCTTGTTCTAAATCAGCGAGCTCAGCACTTTGATTTGGCTGTTCCAAAAGAGGGTTGCGTGATTAGAGCCATTAGTGAATTTCTGAAGCAGAATCCAACCAAGGTACTTAGTGTGCTTAGTGCCAATTGTTCAAAGGAACTGTTGCATGAACTAATGAGTGGGCTTGGCATACAGGAGTTTTTTTTGGAGGAAATCTTTAAGGTTTTTGATATATGTGCTGAAGTTAGCGATGGCGAGAAATCAAGGGTTCTAAATGCTAAAGGTTCTAGATCAGCAAAGTTCATTGTTGAGCAAGATCATTTTTCTTTCTGTCCAGGTGTGAAAGCTTCAACTAATCTTGGCTCATTCAGGGCACCAAGTGGCAGTCAAACCATTCCAACTGAGCAGTATGAAGTTTTTCTGAGAGGGAATGCAAATATTATTCCATTTACACCGTCTTTGGCTGCTGCAAAGAAACTGGCAAATTCATTCTTGAGTGGACAGACTGGAGTTATCAATTCAAAGATTATTTCTGGACAGTATGATTGGTTGGCTGACACAAATAAGCTTTGTTTTGATGAGAGAAAAATTGGGGCTATAGTCGGAACCTTCGGATCCGGAAAGAGTCACAATGTGGTTGAACTCCTCAGGCACAATTTGGGGTACCAAAATTTAATCATCTCTCCAAGAAGGAGCTTGAAGGAGCAATTCATCAATATGCTGGATCTGGTGCATGCACGAAGTAAGGGAAAGAAAACCTCAACCGAAGTGGCTACATTTGAGGTTGCTCTTAAAAAAACTGGTATGCTGAAGAAGGTGAGAATTTTTATCGACGAGACCCAGCTTTTACCGCCAGGCTACTTGGACCTTATTTGCTTGATTGCCGGGCCTGATGCTTCCATTTTGGTTATGGGGGACCCTGCTCAAAGCAGTTACGATTCTGCAGATGACAGGATGGCTTTTATTGGGGACAAAGGATGCCTTGATGCTTTATTGGAAAATAAGAGGTATGTTTATCTCAGCGAATCGAAAAGGTTCAGAAATCCAATGTTTTCTGGGAGGTTGCCTTGCACATTTGACCAGAGCAGAATGACTCTGGAGAAGGAGGAGTACGCAGTTTTCAATTCCTTCAAAGATTTTAAAGGTGATTATCTCACTCCAAAAATTAAAACTTTCTTAGTTAGCTCCTTCACTGAAAAAACTGTTGTCAAAGCCAATATGGGAAGGAATGTTCTTGTGTACACATTTGGAGAAAGTACAGGAATGAATTTTGATTACGTTTGCGTTTTGCTTACGCAAGATAGCATGTTGGTTGATGAGAGAAGATGGGTCGTTGCTTTATCCAGGGCCAAGATCAACATGTCTTTTGTTAATCTGTCTGGGCTCTCTCTCTCAGAGTTCTGCACCCAAATGGTTGGTGGTGTTGTTCATAAATTCTTTACTGGTACGGCCACCTTTAATGATTTGCGCAACCTGCTTCCTGGAGATCCCATTTTTTCAAAGAAATTCCAAAGACTTGGGAGTGACGAGGTTGACAGAGAAGCTAGACTCTCTGGTGATCCCTGGCTGAAAACAAAAATTTTTCTCGGGCAAAGGGAGGTCAAACCCACTGAGGAACCAATCCCTTCAGAAGGTTTAAAGGACATCAAGATCAAGGTTCATTGCCCAGTGGGTTCTATGGGAACCACCTTTGCAGAAATTCAATCGAAACTCAAGGTTAAAGAAGCCAGGGAGCACAGGTTTGATTCCATAGTTACTGAACAGTTTGCTGAAGTTCACAAGGGCAGAGGCAAGATCCTCACAGC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| 37,146 |
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Cherry twisted leaf associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
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2021-10-13
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13C236C
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Cherry twisted leaf associated virus
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Robigovirus
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Betaflexiviridae
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ssRNA(+)
| 8,428 |
GenBank
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Prunus armeniaca
| null |
2013
| null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 13C236C, complete genome
|
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| 37,147 |
MZ220957.1
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-13
|
13C242
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,413 |
GenBank
| null | null | null |
Prunus armeniaca
| null |
2013
| null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 13C242, complete genome
|
GAGAACAATCTGACCAAAACTAGCACAGATTATCACAATCTGCCCTAGAAAGTAGGCTTGCAGTCTGCCCTTTCTCGACCAATCAGTCCAGAAAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACAATCACCCCTGCTGAGAGCGTTTTAGCTCAATTTTCTTCTGAAGAGGCTAGCAGAATCGGTGCTTCCGCCATCTCAAATTTTTCTAAATTGGAAGCAGACCACCACAACTTGTTTCACTACCATCTGCCTGCCTATGCCAAGAAGAAACTTTCTGAGAGAGGTTTTTACCTTTCACCTTTTGCTTATGAGACCCATAGTCATCCTGTAAGTAAAACTATTGAGTCTCATTTAATAAATATTAAGTTGCCTAATTATATTACTGAAGATTTTCTCATTGTAGGTATAAAAGAAAATAAACTTAGTGTTTTAAGAAAAGACAAAAAATTACGTTTTTTAGAAGCTGTAAATAGATGTGTGACTTCCCATGATATCCAAAGGTACGGTCCAAGCTTCCATTTCGAGAAGGCCAAATCTAATTGGAGAACTACCTTCTCCGAAGTAAATCTCTCCGCTGGGGTTCAAAGCCTTCTGCCAAGAATTCTCTTTGATAAGGGCCGTATTCAAGATGCTCAGGTTTTCCTTTATGATGAACTCCATTACTGGAGCATGAGGGACATTGTTGATTTCCTTGAAATTTCACGAGCTCAAACTGTCATTGGGTCCTTTGTTTTCCCAACTGAAATTTTGGCTGGCTCTGATCGAAGTCTTAATCCATGGGCTTATGACTTCAAGATTCAAGGGGATAAATTAATATATGCTCCCGATGGGGTTTGGGCTGAATCCTATGAACAACCCCTAGCTGCTGGGCAACTCCTCAAATACAATAAGATTATCACGCAGCAAGGTATTTATTCTGTTCAAGTTCGTGACTCCATTTATAGTCACTGCTTGGTCATAATTAATCGCGACAATCTTTTGAATGAAGAATTTAGGGTTTACAGTGAGTTTGATGCTGTATCAATCCGTAGGCTGAATTATCTTGGTGGCAACTCTGATGACATCATTCCTGTTCGTTATGAAGTCATTCTATCTGTTTTCAAGTACATCAGAACGCTCAAAAAGCCTGACCTCCAATCTGGCATGGCTAAACACAGGCAGCTGGTGGAAGATCCCACAGGTTTTGAAATACGGTTCATCGAAGACTTTGTTCAATTCATTCTGGAGAATCATGAAAAGTTCAACCTGATTGGGCAAAAATTTTCAAACTTCTTGAGCTCAGCCTGCATTGAAATGCTCCCAAGATACATGCAGAGATTCTTCAAGGGCTTCAAGGGTTACAGCCTCGGCAAATTCATTGAAGAAATAGAACCTTTCAGCTTCACAATTAAGTGCCGTACTTATTCAAGGTTCAGTTTTAAGCACAGCTTTACTGAGGAGGAAGAAGCAAAGGAAAGAGCTGGTGATCCAATTCATCTTCAAATATCCAACTCTCAGACTTTCAGAAGCACTGCTTACCCAGACTGTTTGTTTCATGCATCTCAGTCAATCTTCTCAAACCCTCACCCAAATTTAATCAAGCAGTTGGTGACTTCCTTCATCAGCACCTGGGTTGGCAAAACTGAAGAAGATTACTACACATCGTTACTATCATTGAAGAAAAGCCTCAGTCAAAAGGGTTTCAAGCTGTTTCTCCTTCACGATAATAGGTACTCCTCCTTAATCCATCTGGCTAACCTGATGAATTCTTTCAGCTTCAAAGCCACATTAAAGAATGAGGTAGCCAAAAGGTTAAGATTGGGGAAAAGTCTCAGAGGATTGTTAAGATATGATCCTGTCTCTGAAAATCCATCTGACAAGAGAGACCGGAGAGTGCATAAGAGCCTTGCAGTTGTAGTGAGTGAGTTACTGAGTATTAGTGATGAATGTCCAATCTCAAGCATCCTGACTAGAACTTCCGGGCTGCATCAGGAGCTTTGGAACATGAAGAAGGGTGCAGTTATTCATCAGACATCAAGCTCCAAAGAAGTATTGGGAGCTAATAAGATTGGTATTGAAAAAGAGAAAACCAATGCTTGCACTGCAAAAGAAAGCAATGAATGTAAGGAGGAAAGTCAGCTCTCTGAGAGTGAAAAGCAAAAAGGTGAGTTAGAGCATGCAAAAGGAGTTGTTGTGTTGCCCTCAGCCACAGAATCCATTGCTGAGCCTGAATCTACCACCCACTTCTCTGCTGGCAGTGAATCATTCATTTCCAGCATCATTAAAACAGGACCTTTTTGCGACCAAGGAACCATTGAGTTTATCCGAAACCTCAGCTTCAGCGATGGCTATTCCCATAATGGAAGGGTTGCCCTATTCTTTTCAAGGGAGGGTTTCTCTTATGGTTTCAATTCAGTAACCTACAAATCTTCTGGCTGGCCATCTGCGTTTGAAGAGCTTTACGGGACCAGATTTAACTCCTGTTTGGTGCAGAAGTACGAGAAATCTGCCAGATTGGGCCTCCATAAGGATGATGAAGAGTGCTATGATGATGATCATGAAGTGATGACCGTTAACCTTTTTGGCACCGCAACTCTTGCTTTTACCGCTGATTGCGCTAGAGGATTGGAAAAGCAGGACCCCTCCAAATTTCTTGAGATTACATTAAGTCACGGTGAATATCTGTTGATGCCCAAGGGTTTTCAAAAGAATTTCAAGCATGGCGTTAGTTGCACTTCAGCTGGCAGAATTTCACTCACTTTCAGAAAGCAAGCGAGAACCATAGAGGGAACAGCTCTTTATGCTGACACAAAAGAGAAGGGTAATGATGGAAACAGTGACAATGAGAGCAACAACTACTACGAGGAAATGAATAAGTGCTCAATTTCAGCTGCCCCTGACTCTGTCAAGTGCAGTCTTTCCGTTTTTCCTGTAAAGGCTGATGGAGATTGCTTTTGGCACGCTGTTTCTTCAATTTTTGGTCTTGATGCTCTAGAGCTTAAAAATTTGGTCAAAGAAAGGGCCATTGCTGAGGGGTGTATTGAGCAAAAACATATGAAAGATTTCCTGCATGAAATGGAGTCAAAAGTTTATGCATCTAACGCTTCCATCACTGCCACCTGCTTTCTCATGAATATCAAGTTAATCATCAAATTAATGGAAACCAAGCACGCAGGATGGGTTGTGGTGGAACCACTCACTTCTTCAAATGAAAAAATCTCCCTTGGTTATCTTGTTCTCAACCAGCGAGCACAACACTTTGACTTGGCTGTCCCAAAAGAGGGTTGTGTGATTAGAGCAATAAGTGAGTTCTTGAAGCAGAATCCAACCAAAGTACTTAGTGTACTTAGTGCCAATTGCTCCAAAGAACTTCTCCATGAATTAATGAGTGGACTCGGTATACAGGAGTTCTTTTTGGATGAGATTTTCAAGGTTTTTGATATCTGTGCTGAAGTTAGTGATGGAGAGAAGTCAAGAATTCTGAATGCTAAGGGCTCTCGGTCTGCAAAGTTCACAGTGGAGCAGGACCATTTCTCTCTCTGTCCAGGCGTCAAAGCTTCAACTAATCTTGGTTCATTCAGAGCTCCAAGTGGCAGTCAAACAATCCCCACCGAGCAGTATGAAACTTTTCTTAGAGGGAATGCAAACATTATTCCATTCACACCATCTCTAGCTGCTGCAAAGAAGCTTGCAAGCTCATTCTTGAGTGGGCAAACTGGTGTGATCAATTCAAAAATCATTTCAGGGCAATATGACTGGTTAGCTGACACCAATAAGCTCTGTTTTGATGAGAGAAAAATTGGAGCCATTGTTGGAACTTTTGGGTCAGGGAAGAGTCACAATGTTGTTGAACTTCTTAGGCACAACTTGGGGTATCAGAATCTGATCATTTCACCAAGGAGGAGTTTGAAGGAACAGTTTATCAGCATGTTAGATCTTGTGCAGGCTAGAAGTAAGGGAAAGAAGACCTCCACTGAAGTTGCAACATTTGAGGTTGCCCTTAAGAAAACTGGAATGCTCAAGAAGGTCAGAATTTTTATTGATGAGACTCAGCTCCTGCCACCAGGCTATTTGGATCTTATTTGTCTAATTGCAGGGCCAGACGCCTCCATTTTGGTTATGGGGGATCCAGCCCAAAGCAGTTATGATTCTGCAGATGATAGGATGGCCTTCATCGGGGACAAGGGTTGCCTTGATGTATTGTTGGGCAACAAAAGATATGTTTATCTCAGCGAGTCAAAAAGGTTCAGAAACCCAATGTTTTCTGGCAGGCTGCCATGTACATTTGACCAGAGCAGAATGACCTTGGAGAAAGAGGAGTATGCAGTTTTCAACTCCTTTAAAGATTTTAAGAGTGATTACCTTTCTCCAAAAATTAAAACCTTTTTGGTCAGCTCCTTCACTGAAAAGACTGTGGTCAAGGCCAACATGGGGAGGAATGTCCTTGTATACACATTCGGAGAAAGTACTGGAATGAACTTTGACTATGTCTGTGTTTTACTCACTCAGGATAGCATGCTGGTTGATGAAAGGAGGTGGGTTGTTGCTTTATCAAGAGCTAAGATCAACATGTCTTTTGTCAATCTTTCTGGACTCTCACTCTCAGAATTTTGTACTCAAATGGTTGGTGGCGTGGTTCATAAATTTTTCACTGGCACAGCCACCTTCAATGACTTGCGCAACTTGCTTCCCGGAGACCCCATTTTTTCAAAGAGATTTCAAAGGCTTGGAAGTGATGAGGTTGATAGGGAGGCCAGACTTTCTGGTGATCCCTGGCTTAAGACTAAAGTCTTTCTTGGGCAGCGAGAGGTTAAGCCAACTGAAGAACAACTCTCTCAAGGAGGTCTAAAAGACATCAAGATTAAGGTTCATTGCCCAGTGGGTTCTATGGGAGCTACATTTTCAGAGATCCAAGCTAAACTTAAAGTCAAGGAGGCTAGGGAACATAGAATTGATTCAATAGTTACAGAGCAGTTTGCCGAAGTTCACAAGGGTAGAGGTAAAATTCTCACAGC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| 37,148 |
KP258177.1
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Su,L., Bhagwat,B., Li,Z., Bernardy,M., Wiersma,P.A., You,F.M., Xiang,Y.
|
Agriculture and Agri-Food Canada, Pacific Agri-Food Research Centre
|
Canada
|
2015-12-31
|
CTLaV_S83-36
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,428 |
GenBank
| null |
Canada
|
Canada
|
Prunus avium
| null |
1983-07-26
| null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate CTLaV_S83-36, complete genome
|
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| 84,401 |
KF958838.1
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
James,D., Varga,A., Lye,D.
|
Centre for Plant Health, Canadian Food Inspection Agency, Sidney Laboratory
|
Canada
|
2014-06-23
|
CTLV_8431
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,431 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null |
1991
| null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate CTLV_8431, complete genome
|
GAGAACAATCTGACCAAAACTAGCACAGATTATCACAATCTGCCCTAGCAAATAGGCTTGCAGTCTGCCCTTTCTTGACCATCCCGTCCAGAAAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACCATTACCCCCGCTGAGAACGTTTTAGCTCAATTTTCCTCTGAAGAGGCTAGCAGAATCGGTGCTTCTGCCATTTCCAACTTCTCTAAGTTGGAAGCAGACTACCACAACCTGTTCCATTTCCATCTGCCTGCCTATGCCAAGAAGAAGCTCTCTGAAAGGGGTTTCTACCTTTCACCCTTCTCTTATGAGACTCACAGTCATCCTGTAAGTAAAACTATAGAGTCCCACTTAATTAATATTAAGTTGCCTAATTATATTAATGAGGATTTTTTAATTGTAGGAATTAAGGACAATAAACTTAGCGTTTTGAGAAAAGAAAAAAAATTGCGTTTTTTAGAAGCTGTGAATAGATGTGTTACCTCCCATGATATCCAAAGGTATGGTCCAAGCTTCCACTTTGAAAAGGCCAAATCCAATTGGAAGACTGATTTTTCAGAAGTGAACCTCTCTGCTGGGGTTCAAAGCCTTCTCCCAAGGGTTCTTTTCGATAAGGGTCGCATTCAGGATGCCCAGATTTTCCTTTATGATGAACTTCATTACTGGAGTATGAGGGACATTGTGGACTTCCTTGAGATCACACGAGCCAAAACTTTGATTGGATCCTTCGTGTTTCCAACTGAAATTCTTGCTGGTTCAGACCGAAGTCTCAACCCCTGGGCTTATGACTTTAAAATTCAAGGAGACAAATTAATATATGCTCCTGATGGAGTTTGGGCCGAATCTTATGAACAACCCCTTGCTGCTGGGCAAATCCTCAAGTACAACAAGATCATTACTCAACAAGGAGTTTACTCAGTTCAGGTTCGCGATTCCATTTATAGCCACTGCTTAGTTATAATTAATCGCGATAACCTTCTGAATGAGGAGTTCAGGGTCTACAGTGAGTTCGACGCAGTGTCAATTCGCAGATTGAATTACCTTGGCGGCAATTCTGACGACATTATTCCAGTCCGTTATGAGGTCATTTTGTCTGTCTTCAAATATATTCGAACTCTTAAAAAGCCAGATCTTCAATCCGGAATGGCAAAGCATAGACAGCTAGTTGATGAACCTACGGGTTTTGAGGTTCGCTTTATTGAAGATTTTGTCCAATTCATTTTGGAGAACCATGAAAAATTTAACTTGATCGGGCAAAAGTTCTCAAACTTTCTAAGCTCAGCCTGCATTGAGGTGCTTCCCAGGTACATGCAGAGATTCTTCAAGAGCTTTAAGGGTTATAGCCTTGGTAAATTTATCGAAGAAATTGAACCTTTTAGCTTTACAGTCAAGTGCCGCACCTACTCAAGATTCAGCTTCAAAAATAGCTTCATAGAGGAGGAAGAGGCCAGGGAAAGGGATGGTGATCCAATCTACAAGCAATTCTCAAAGTCTCAATCCTTCAATAGCACTGCTTACCCAGACTGCTTGTTTCATGCATCACAATCAGTTTTTTCAAACCCTCACCCTAATCTGATTAGGCGGTTAGTCACTTTATTTATCAGTACCTGGGTTGGAAAAACTGAGGCGGACTACTATACATCATTACTATCACTCAAAAAGAGTCTTAGTCAGAAGGGCCTCAAACTTTTTCGTCTTCATGATGATAGGTACTTTTCTTTGACTCGTCTGGCCAATCTGATGGATTCTTTTAGCTTCAAAGCTACACTTAAAAATGAAGTCATGAAAAGATTAAGATTGGGTGGTAGTCTTAGGGGCTTGCTAAGGTATGATCCCATTTCTGAAAATCCCTCAGACAAGAAGGATCAGAGGGCTAGAAGCAATTTTTCCTCTGTAGTTAGTGAATTGTTGAGCATCAGTTCTGAATGTCCACCTTCCAGCACTCTCACAAAAACCTCTGGCCTGCAGCAGGAGCTCTGGAAAATGAAAAAAGAAGTTGTAACCAAACAAGCTCCTGTCCTTAATGAGGAACAAAAACCATATAAGATTCCCTCAGAAAGAGAAAAGTGTTCCACTCAAGCCATTGAGAAGAACGAAGAACCTAAGTCGGAGGTTGTCAGTACCAAAGGTGAGACCCCACCTGAAACAAGTAAAACTACCTCAAAATTTGGGGAGCTACTTGCCACCCCTGAGGCAACTGCTGTGTCTGAACCCACTGATAATGTCCTTGCCAGCAGTGACCTGTTTATTTCAAGCATCATCAAGACTGGGCCATTTGGTGATCATGGCGTCATTGAATTTATCAGGAGTCTCAGTTTTAATGATGGTCACTCTCACAATGGGAGAAAGGCACTTTTTTTCTCCCGAGGAGGTTTTGCCTATGGATTCAATTCGGTGACTTACCAGTCCTCTGGCTGGCCATCCGCTTTTGAGGAAATTTATGGGGATAGGTTCAATTCCTGTTTGGTTCAGAAGTATGAAAAATCCGCCAAATTGGGGCTTCACAAGGATGATGAGGATTGCTATGATGATGAGCATGAAGTCATGACTGTTAATCTCTTTGGCACAGCTACTTTAATTTTCACTGCTGATGGTGCAAAGGGGTTGGAGAGAGCAGATCCATCCAAATTTCTTGAAATCACACTTAGCCATGGTGAGTATTTGCTGATGCCTAATGGTTTCCAAAAAAAATTCAAACATGGAGTTAGCTGCACCTCAGCTGGGCGTATTTCACTCACACTCAGGAAGCAGGCGAGATCCATGAGCGGAGCAACTCTGCATGCTGGTGCTGATGGAGGAAACAATAATGGTAGTGGCAACGAGGAAGATGATAGTTACTATGAGGAGATGAACAAGTGCTCAATATCTTCAGCGCCTGACTCTGCAAAGTGCAGCCTTTCTGTCTTTCCAGTGAAGGCTGATGGGGATTGTTTCTGGCACGCCGTTTCCTCAATTTTTGGCCTTGATGCTCTTGAACTGAAGAATTTGGTTAAAGAAAGAGCCATTGAAGAGGGGTGTGTGGACCAAAAACACATGAAGGATTTTCTGCATGAAATGGAAGCAAAAGTTTATGCTTCCAATGCCTCCATCACTGCCACATGTTTTCTCATGAACATCAAGCTGATTATCAAACTGGTTGAATCAAAACACTCTGGCTGGGTGGTTGTAGAACCTCTCAATTCTTCTAATGAAAAAATCTCATTGGGTTATCTCGTTTTGAATCAACGGGTCCAGCACTTTGATCTAGCTGTTCCAAAAGAGGGTTGTGTGATTCGTGCCATCAGTGAATTTTTGAAGCAGAACCCCACCAAAGTGCTAAGTGTTCTCAGTGCAAACTGCTCCAAGGAGCTTCTTCATGAGTTGATGAGTGGGCTTGGCATTCAAGAATTCTTCTTGGAAGAAATTTTTAAAGTTTTTGACATTTGTGCCGAGGTTAGCGATGGGGAGAAGTCAAGAATTTTGAATGCTAATGGTTCCAGGTCTGCAAAATTCACAGTGGAACAGGACCATTTCTCTTTCAGTCCTGGAGTAAAGGCCTCAACCAATCTCGGTTCATTCAAAGCTCCAAGTGGTGGTCAGACAATTCCAATCGAGCAGTATGAAACTTTCCTCAGAGGAAATGCAAATGTCATTCCATTCACACCTTCATTGATTGCTGCAAAGAAGTTAGCAAATTCCTTCTTGAGTGGTCAGACCGGTGTGATCAATTCAAAGATAATATCTGGGCAGTATGACTGGCTGGCAGACACCAACAAGCTCTGCTTTGATGAAAGGAAAATTGGGGCTATTGTTGGAACTTTTGGGTCCGGAAAGAGTCACAATGTTATTGAATTACTTAGACACAATTTGGGGTATCAAAATCTGATCATCTCACCCAGGAGGAGCTTGAAAGAACAATTTATTAACATGCTAGATTTGGTTCAAGCGAGGAGTAAAGGAAAGAAGGCCTCAACTGAGGTTGCCACATTTGAAGTTGCTCTCAAGAAAACAGGTATGCTGAAGAAGGTCAGAATTTTTATTGATGAAACCCAACTTTTACCACCTGGTTATCTGGATCTTGTGTGTCTGATTGCTGGGCCAGATGCCTCCATCTTGGTTATGGGAGACCCTGCTCAAAGTAGTTATGATTCTGCAGATGACAGAATGGCATTTATTGGAGATAGGGGTTGTCTCGATGTTTTACTGGATAACAAGCGTTATGTCTACCTCAGTGAATCTAAAAGGTTCCGGAATCCGATGTTCCTGGGGAGATTACCCTGCACCTTCGATCAAAGCAGAATGACCCTGGAGAAAGAAGAGTACGCCGTGTTTAGCTCTTTTAAAGACTTCAAAAATGACTACCTCTCCCCTAAAATCAAAACCTTTTTGGTCAGCTCCTTTACCGAAAAGACTGTGGTGAAGGCAAATATGGGGAGAAATGTTCTTGTGTACACTTTTGGGAAAAGCACTGGAATGAATTTTGATTATGTTTGTGTGCTGCTCACCCAGGATAGCATGCTTGTTGATGAAAGGAGATGGGTTGTGGCCTTATCGAGAGCAAAAATCAACATGTCTTTTGTCAACCTTTCCGGACTCTCTCTCCCTGAATTCTGCACACAAATGGTTGGTGGTGTAGTTCACAAGTTTTTTACAGGCACCGCCACCTTTAATGACCTACGCAGCTTACTCCCCGGAGATCCGATCTTTTCAAAGAAATTTCAAAGGCTTGGGAGTGATGAAGTTGATAGGGAAGCAAGACTTTCTGGTGACCCATGGCTCAAAACCAAGGTCTTTCTTGGGCAACGGGAGGTGAGGCCAGTTGAGGAACCAATTTCTGTTGAAAATCTAAAAGACATCAAAATTAAGGTTCATTGTCCTGTTGGTTCTATGGGTGCTACATTTGCTGAAGTTCAATCAAAACTCAAAGTTAAGGAGGCTAGAGAGCACAGAATTGATACCATAGTGACTGAACAATTTGCTGAGGTTCACAAGGGTAGGGGTAAGATTCTCACTGC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| 90,113 |
KF030846.2
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
95CI205R1 (s1)
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,426 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus armeniaca
| null | null | null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 95CI205R1 (s1), complete genome
|
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| 92,330 |
KF030848.2
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
95CI206 (s1)
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,428 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus armeniaca
| null | null | null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 95CI206 (s1), complete genome
|
GAGAACAATCTGACCAAAACTAGCACAGATTAACACGATCTGCCCTAGCAAATAGGCTTGCAATCTGCCCTTCTAAGATTCCATAATCTCAGAAGCACAATCTGCAACCCTATAATGGCCTTGCATACTATTACCCCCGCTGAAAGCGTTCTTGCTCAATTTTCTTCTGAAGAGGCTAGCAGGATAGGTGCTTCTGCAATCTCTAATTTTTCAAAGTTGGAGGCTGAGAATCACAACCTATTTCACTATCATCTCCCTGCCTATGCAAAGAAGAAACTCTCTGAGAGAGGTTTTTACCTTTCTCCTTTTTCTTATGAGACTCACAGCCATCCTGTAAGTAAAACCATCGAGTCTCACCTCATAAATATTAAGCTTCCTAATTACATTAGTGAGGATTTTTTAATAGTAGGTATCAAAGATAATAAATTAGGAGTCCTAAGAAAAGAAAAAAAATTACGTTTTTTAGAAGCAGTAAATAGATGTGTGACTTCCCATGATATCCAAAGGTATGGTCCGAGTTTTCATTTTGAGAAGGCTAAAGCAAACTGGAAAACTGACTTTTCAGGAATAAATCTGTCAGCTGGCGTTCAAAGTCTACTCCCCCGTGTCATTTTTGATAAGGGTAAGACACAAGATGCGCAGATTTTTCTATATGACGAGCTCCACTACTGGAGCATGAAGGACATTGTTGACTTTTTGGAAATATCTAAAGCCAAAACGGTTATTGGCTCCTTTGTTTTCCCAGTTGAGATTCTTGCAGGATCTAACAAAAGCCTCAATCCCTGGGTTTATGATTTCAAAATTGAGGGTGACAAACTTATCTATGCCCCAGATGGTGTTTGGGCTGAATCATATGAGCAACCTCTTGCATCAGGACAGCTTTTGCGGTACAACAAGATAATTACTCAAGAGGGCATATATTCCGTTCAAGTGCGAGATTCAATCTTCAGTCATTGTCTGGTCATCATCAATAGGGATAGCTTAATAACAGAGGAATACAGGACCTTCAGCGACTTTGATGCCATTTCCATCCGCAGGCTCAATTATCTTGGTGGTAATTCAGATGACATTATACCCATAAGGTATGAGGTTATTTTGTCTGTTTTTAAATACATTCGCACTCTCAAGAAACCAGACCTCCAATCCGGGATGGCCAAACATCGTCAGTTAGTTGATGATCCTTCAGGTTTTGAAATCAGATTCATAGAAGATTTTGTCCAATTCATTCTCGATAATCATGAAAGATTCAACCTCATTGGTCAAAAATTTTCAAACTTCTTCAGTGCAGCCTGCATTGAAATGTTACCTAGGTATTTACAGAGGTTTTTCTCGAGCTTTAAGGGTTATAGCCTTGGTAAATTCATTGAGGAAATTGAGCCTTTGAAATTTACTCTGAAATGCAGAACCTACTCCAGATTTAGTTTCAAAGGAAGTTACATGGATGATGAAATTCAGAATGAAGGAGAAGGAGACCCCATAATTCCCCTCATTAAAATGGGAAAGAGGAGTTCAAAGGATGAATACCCCAGTTTCTTCCTCCATGCTTCCACGAGCATTTTTTCAAATCCTCATCCAAATTTGGTTAAACGCCTTGTTTCTCTTTTCATAAGTGCATGGGTTGGTAAAACAAATGAGGATTATTACACTTCACTTCTTTACCTTAAGAAAAGTCTAAGCCAGAAAGGTCCTAAGTTGTTTTTGCTCCATGATGACCGGTTCCTTTCTTTAACTCTTTTGGCCAACTCTATTGACTCATTCAATTTTAAGGCCACTTTGAAGAATGAAGTGGCCAAGAGGTTACGATTGGGTGGAAGTCTCCGAGGATTGATAAGCTACAGCCCAATTTCCAAGAATCCTGAGGAGAAAAAAGATTTGAGAGTTCACAGTGGCTTGGCTAAAGTGGTTAAGGAGCTTCTTGAGATCTCTGCCGAATGCAATCCCATCAGTACTCTTACACTAAGTAGATGCTACCAGCAGGAGCTCATCAATCTCAAGAAGAGTTTTATCAGCCCACTCCCCTTCAGTGAAAGGGTGAAAAGTGAGTCTCAATCTAAGGTGTGCGAGAAAAAGGTTCATAAATTGGTTGAGAATGAAGCGGAGAAACAAGATAAGATGATCAAGTTAACGCTAGAAGATGAGCACTGCATTGAGACCCCTCATAGCTTCTTCATTGATGAGGAAGTTTCAGACAAGGTCATTGAGCGTGGTAATAACTCGGTCAAAGCTCACACTGCTGCCACCAGCAGTGATTCATTCATCTCCAGCATCATCAAGACTGGACCTTTCACTGAGGTGAGTGTTATTGAGTTCGTTCGGAATTTGAGTTTTACTAACAGCCACGCGCACTCTGGACGCCAGGCCATCTTCTTCTCAAAAGGTGGTTTTTCATATGGTTTTAACAGCACAACTTACAAATCTTCTGGTTGGCCATCTGCCTTTGATGATCTGTACGGTGACCGATTCAACTCTTGTTTAGTTCAGAAGTACAACCAGGATGCCAGGCTGGGTTTGCATAAAGATGATGAAGCTTGCTATGATGATAATCATGAAGTGATGACTGTGAACCTCTTTGGTAATGCAACTTTGGTTTTCACTTCAGATACATCCAATGGACTGGAGAAGCAAGATCCATGCAAATTTTTAGAGCTTTCCCTCATGCATGGGGAGTATTTACTCATGCCTCATGGCTTCCAAAAACAGTTCAAGCATGGCGTCAAGTCCACATCTGCTGGTCGAGTCTCCCTAACATTCAGAAAGCAAGCAAGGACCTTGTCCGGTTCAAGTATCTCTGGGGATGTCAGCAAAAGAAGAGATGATGAGAGTGACAATGGTGAAAATCCTTACTATGAAGAGATGAATAAGTGCTCCATTTCTGCGGCTCCAAGTTCAGTGAAATGTAGTCTTTCTGTTTTCCCCGTTAAAGCTGATGGAGACTGCTTTTGGCATGCTGTCTCATCAATTTTCGGTCTGGAGGCAATGGAATTAAAGGGGCTCATTCAGGAACGGGCGATCAGTGAAGGCTGTGTTGATCCATTGAGACTTGAGGAATTTCTTCACGAAATGAAGCCCAAGGTTTACGCCTCCAATTCATCCTTAACAGCCACCTGTTTTTTAATGAATATCAAGCTTATTATCAAACTGACAGGTTTGGCTGAGGAGGGGTGGGTCGTGGTTGAACCACTTTCTGCTTCTAATGAAAAGATTACTCTTGGTTACTTGGTTCTAAATCAAAAAACTCACCATTTTGATCTTGCTGTTCCAAAAGAGGGTTGTGTTATTAGGGCTGTGAGTGAATTTCTGAAGCAAAATCCAACCAAAATCCTGAGTGTGTTGAGTGCCAATTGCTCCAAAGAACTTCTTCATGAATTGATGAGTGGCCTCGGTATACAGGAGTTCTTCTTGGAGGAAATTTTTTCAATCTTTGACATTTGCGCTGAGGTGAGTGATGGTCAAACCTCTAGAACTCTGAATAAAAAGGGTTCTCGAGCAGCAAAGTTCATAGTTGACAATGATCACTTCTCTTACTGTCCAGGGGTTAAAGCTTCAACCAATTTGGGTTCTTTCAAAGCTCCCAGCGGCAGTCAAATGATCCCATCTGATAAATATGAGAATTTTTTGAAGAACAATGCCAACATAGTTGCTTTCACACCTTCCCTTCCTGCAGCTAAAAAGCTTGCCAACTCATTCCTCAGCGGGCAAACCGGAGTCATCAATTCAAAAGTTATATCTGGACAGTATGACTGGTTAGCTGATACAAACAAATTGTGCTTTGAGGAGAGAAAGATTGGAGCCATAGTGGGTACATTTGGTTCTGGTAAAAGCCATAATGTCATTGAACTTTTAAGGCACAACCTTGGGTATCAGAATTTGATCATTTCGCCAAGAAGAAGTCTTAAGGAACAGTTCATCAATCTCCTTGATTTAGTGAAAGCAAGGAGCAAGGGAAAGAAAACTTCCACTGAGGTGGCCACCTTTGAAGTGGCTCTCAAGAAAACTGGACTGCTTAAGAAGGTAAGGATTTTTATAGATGAGACCCAGCTTCTGCCACCCGGGTATCTTGATTTGATCTGCTTGATAGCTGGCTCTGATTCATCTATCTTGGTTATGGGTGATCCAGCCCAAAGCAGCTATGATTCAGCTGATGATCGGATGGCTTTTGTTGATGATGAGGGCTGTCTGGATGTGCTTTTGAAAGGGAAAAGGTACGTTTACCTTAGCGAGTCTAAAAGGTTCCGTAATCCAATGTTTGTTGGAAGGTTGCCATGCACCTTTGACTCTAGCAGATTAACTCTTGAGAAGGAGGAGTATGCTGTTTTCTCATCCTTCAAGGACTTTAAGGGTGATTACCTATCCCCAAAAATTAAGACCTTTTTAGTGAGTTCATTCACTGAAAAGACTGTGGTGAAAGCTAATATGGGAAGGAATGTTATGGTTTACACTTTTGGTGAGAGCACAGGGATGAATTTTGACTACACTTGTGTGCTTCTTACTCAGGACAGCATGTTAGTGGATGAACGTAGGTGGGTCGTTGCTTTATCTAGAGCCAAAGTGAACATGTCTTTCGTTAACCTCTCTGGATTGTCTTTGGCTGAGTTTTGCACACAAATGGTTGGAGGAGTGGTTCACAAATTTTTTACTGGAACAGCCACATTCAATGATTTACGTGGTATGCTTCCCGGTGACCCCATATTCTCAAAGAAGTTTCAAAGGTTGGGTAGCGATGAGGTTGACAGGGAAGCTCGTCTTTCTGGTGATCCTTGGCTAAAAACAAAAATCTTTCTGGGACAACGTGAAGTCAAAGCTGAGGCAGAGGCTGCTCCCAAAGAGGAGCTGCAAAATATTAAGGTTAAGGTACACTGCCCCATCAGTTCCATTGGTTCTACCTTTGCGGATATCCAGTCCAAGCTAAAGGCCAAAGAGGTGAGGGAGAAGAGAATTGATTCTATTGTCACTGAGCAATTTGCTGAAACCCACAAGGGAAAAGGAAAAATAATGACTGC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| 92,331 |
KF030859.2
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
101-13 (s2)
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,434 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 101-13 (s2), complete genome
|
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| 92,334 |
KF030865.2
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
103-15 (s3)
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,433 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 103-15 (s3), complete genome
|
GAGAACAATCTGACCAAAACTAGCACAGATTATCACAATCTGCCCTAGCAAATAGGCTTGCAGTCTGCCCTTTCTTGACCATCCCGTCCAGAAAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACCATTACCCCCGCTGAGAGCGTTTTAGCTCAATTTTCCTCTGAAGAGGCTAGCAGAATCGGTGCTTCTGCCATTTCCAACTTCTCTAAGTTGGAAGCAGACCACCACAACCTGTTCCATTTCCATCTGCCTGCCTATGCCAAGAAGAAGCTCTCTGAGAGGGGTTTCTACCTTTCACCCTTCTCTTATGAGACTCACAGTCATCCTGTAAGTAAAACTATAGAGTCCCACTTAATTAATATTAAGTTGCCTAATTATATTAATGAGGATTTTTTAATTGTAGGAATTAAGGACAATAAACTTAGCGTTTTGAGAAAAGAAAAAAAATTGCGTTTTTTAGAGGCTGTGAATAGATGTGTTACCTCCCATGATATCCAAAGGTATGGTCCAAGCTTCCACTTTGAAAAGGCCAAATCCAATTGGAAGACTGATTTTTCAGAAGTGAACCTCTCTGCTGGGGTTCAAAGCCTTCTCCCAAGGGTTCTTTTTGATAAGGGTCGCATTCAGGATGCCCAGATTTTCCTTTATGATGAACTTCATTACTGGAGTATGAGGGACATTGTGGACTTCCTTGAGATCACACGAGCCAAAACTCTGATTGGATCCTTCGTGTTTCCAACTGAAATTCTTGCTGGTTCAGACCGAAGTCTCAACCCCTGGGCTTATGACTTTAAAATTCAAGGAGACAAATTAATATATGCTCCTGATGGAGTTTGGGCCGAATCTTATGAACAACCTCTTGCTGCTGGGCAAATCCTCAAGTACAACAAGATCATTACTCAACAAGGAGTTTACTCAGTTCAGGTTCGCGATTCCATTTATAGCCACTGCTTAGTTATAATTAATCGCGATAACCTTCTGAATGAGGAGTTCAGGGTCTACAGTGAGTTCGACGCAGTGTCAATTCGCAGATTGAATTACCTTGGCGGCAATTCTGACGACATTATCCCAGTCCGTTATGAGGTCATTTTATCTGTCTTCAAATATATTCGAACTCTTAAAAAGCCAGATCTTCAATCCGGAATGGCAAAGCATAGACAGCTAGTTGATGAACCTACGGGTTTTGAGGTTCGCTTTATTGAAGATTTTGTCCAATTCATTTTGGAGAACCATGAAAAATTTAACTTGATCGGGCAAAAGTTCTCAAACTTTCTAAGCTCAGCCTGCATTGAGGTGCTTCCCAGGTACATGCAGAGATTCTTCAAGAGCTTTAAGGGTTATAGCCTTGGTAAATTTATCGAAGAAATTGAACCTTTTAGCTTTACAGTCAAGTGCCGTACCTACTCAAGATTCAGCTTCAAAAATAGCTTCATAGAGGAGGAAGAGGCCAGGGAAAGGGATGGTGATCCAATCTACAAGCAATTCTCAAAGTCTCAATCCTTCAATAGCACTGCTTACCCAGACTGCTTGTTTCATGCATCACAATCAGTCTTTTCAAACCCTCACCCTAATCTGATTAGGCAGTTAGTCACTTTATTCATCAGTACCTGGGTTGGAAAAACTGAGGCGGACTACTATACATCATTACTATCACTCAAAAAGAGTCTTAGCCAAAAGGGCCTCAAACTTTTTCGTCTTCATGATGATAGGTACTTTTCTTTGACTCGTCTGGCCAATCTGATGGATTCTTTTAGCTTTAAAGCTACACTCAAAAATGAAGTCATGAAAAGATTAAGATTGGGTGGTAGTCTTAGGGGCTTGCTAAGGTATGATCCCATTTCTGAAAATCCCTCAGACAAGAAGGATCAGAGGGTTAGAAGCAATTTTTCCTCTGTGGTTGGTGAATTGTTGAGCATCAGTTCTGAATGTCCACCTTCCAGCACTCTCACAAAAACCTCTGGCCTGCAGCAGGAGCTCTGGAAAATGAAAAAAGAAGTTGTAACTAAACAAGCTCCTGTCCTTAATGAGGAACAAAAAGCATATAAGATTCCCTCAGAAAGAGAAAAGTGTTCCACTCAAGCCATTGAGAAGAACGAAGAACCTAAGTCGGAGGTTGTCAGTACCAAAGGTGAGACCCCACCTGAAACAAGTAAAACTACCTCAAAATTTGGGGAGCTACTTGCCACCCATGAGGCAACTGCTGTGTCTGAACCCACTGATAATGTCCTTGCCAGCAGTGACCTGTTTATTTCAAGCATCATCAAGACTGGGCCATTTGGTGATCATGGCGTCATTGAATTTATCAGGAGTCTCAGTTTTAATGATGGTCACTCTCACAATGGGAGAAAGGCACTTTTTTTTTCCCGAGGAGGTTTTGCTTATGGATTCAATTCGGTGACTTACCAGTCCTCTGGCTGGCCATCCGCTTTTGAGGAAATTTATGGGGATAGGTTCAATTCCTGTTTGGTTCAGAAGTATGAAAAATCCGCCAAATTGGGGCTTCACAAGGATGATGAGGATTGCTATGATGATGAGCATGAAGTCATGACTGTTAATCTCTTTGGCACAGCTACTTTAATTTTCACTGCTGATGGTGCAAAGGGGTTGGAGAGAGCAGATCCATCCAAATTTCTTGAAATCACACTTAGCCATGGTGAGTATTTGCTGATGCCTAATGGTTTCCAAAAGAAATTCAAACATGGAGTTAGTTGCACCTCAGCTGGGCGTATTTCACTCACATTCAGAAAGCAGGCGAGATCCATGAGCGGAGCAACTCTGCATGCTGGTGCTGATGGAGGAAACAATAATGGTAGTAGCAACAAGGAAGATGATAGTTACTATGAGGAGATGAACAAGTGCTCAATATCTTCAGCGCCTGACTCTGCAAAGTGCAGCCTTTCTGTCTTTCCAGTGAAGGCTGATGGGGATTGTTTTTGGCACGCCGTTTCCTCAATTTTTGGCCTTGATGCTCTTGAACTGAAGAATTTGGTTAAAGAAAGAGCCATTGAAGAGGGGTGTGTGGACCAAAAACACATGAAGGATTTTCTGCATGAAATGGAAACAAAAGTTTATGCTTCCAATGCCTCCATCACTGCCACATGTTTTCTTATGAACATCAAGCTGATTATCAAACTGGTTGAATCAAAACACTCTGGCTGGGTGGTTGTAGAACCTCTCAATTCTTCTAATGAAAAAACCTCATTGGGTTATCTCGTTTTGAATCAACGGGTCCAGCACTTTGATCTAGCTGTTCCAAAAGAGGGTTGTGTGATTCGTGCCATCAGTGAATTTTTGAAGCAGAACCCCACCAAAGTGCTAAGTGTTCTCAGTGCAAACTGCTCCAAGGAGCTTCTTCATGAGTTGATGAGTGGGCTTGGCATTCAAGAATTCTTCTTGGAAGAAATTTTTAAAGTTTTTGACATTTGTGCCGAGGTTAGCGATGGGGAGAAGTCAAGAATTTTGAATGCTAATGGTTCCAGGTCTGCAAAATTCACAGTGGAACAGGACCATTTCTCTTTCAGTCCTGGAGTAAAGGCCTCAACCAATCTCGGTTCATTCAAAGCTCCAAGTGGTGGTCAGACGATTCCAATCGAGCAGTATGAAACTTTCCTCAGAGGAAATGCAAATGTCATTCCATTCACACCTTCATTGATTGCTGCAAAGAAGTTAGCAAATTCCTTTTTGAGTGGTCAGACCGGTGTGATCAATTCAAAGATAATATCTGGGCAGTATGACTGGCTGGCAGACACCAACAAGCTCTGCTTTGATGAAAGGAAAATTGGGGCTATTGTTGGAACTTTTGGGTCTGGAAAGAGTCACAATGTTATTGAGTTACTCAGACACAATTTGGGTTATCAAAATCTGATCATCTCACCCAGGAGGAGCTTGAAAGAACAATTTATTAGCATGCTAGATTTGGTTCAAGCGAGGAGTAAAGGAAAGAAGGCCTCAACTGAGGTTGCCACATTTGAAGTTGCTCTCAAGAAAACAGGTATGCTGAAGAAGGTCAGAATTTTTATTGATGAAACCCAACTTTTACCACCTGGTTATCTGGATCTTGTGTGTCTGATTGCTGGGCCAGATGCCTCCATCTTGGTTATGGGAGACCCTGCTCAAAGTAGTTATGATTCTGCAGATGACAGAATGGCATTTATTGGAGATAGGGGTTGTCTCGATGTTTTACTGGATAACAAGCGTTATGTCTACCTCAGTGAATCTAAAAGGTTCCGGAATCCGATGTTCTTGGGGAGATTACCCTGCACCTTCGATCAAAGCAGAATGACCCTGGAGAAAGAAGAGTACGCTGTGTTTAGCTCCTTTAAAGACTTCAAAAATGACTACCTCTCCCCTAAAATCAAAACCTTTTTGGTCAGTTCCTTTACCGAAAAGACTGTGGTGAAGGCAAATATGGGGAGAAATGTTCTTGTGTACACTTTTGGGGAAAGCACTGGAATGAATTTCGATTATGTTTGTGTGCTGCTCACCCAGGATAGCATGCTTGTTGATGAAAGGAGATGGGTTGTGGCCTTATCAAGAGCAAAAATCAACATGTCTTTTGTCAACCTTTCCGGACTCTCTCTCCCTGAATTCTGCACACAAATGGTTGGTGGTGTAGTTCACAAGTTTTTTACAGGTACCGCCACCTTTAATGACCTACGCAGCTTACTCCCCGGAGATCCGATCTTCTCAAAGAAATTTCAAAGGCTTGGGAGTGATGAAGTTGATAGGGAAGCAAGACTTTCTGGTGACTCATGGCTCAAAACCAAGGTCTTTCTTGGGCAACGGGAGGTGAGGCCAGTTGAGGAACCAATTTCTGTTGAAAATCTAAAAGACATCAAAATTAAGGTTCATTGTCCTGTTGGTTCTATGGGTGCTACATTTGCTGAAGTTCAATCAAAACTCAAAGTTAAGGAGGCTAGAGAGCACAGAATTGATACCATAGTGACCGAACAATTTGCTGAGGTTCATAAGGGTAGGGGTAAGATTCTCACTGC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| 92,335 |
KF030873.2
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
8242-3 (s1)
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,425 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 8242-3 (s1), complete genome
|
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| 92,338 |
KF030878.2
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
8265 (s3)
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,434 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate 8265 (s3), complete genome
|
GAGAACAATCTGACCAGAACTAGCACAGATCACACTAATCTGTCCTAGCAAATAGGCTTGCAGTCTGCCCTTTCTAGACCAACCAGTCCAGGAAGCACAATCTACAACCCTATAATGGCCTTGCACACTATTACTCCTGCTGAGAGCGTTTTAGCTCAATTTTCTTCTGAAGAGGCTAGCAGAATCGGTGCTTCTGCTATTTCCAACTTCTCTAAGCTGGAAGCAGACCACCACAACCTGTTCCACTATCATCTGCCTGCCTATGCCAAGAAGAAACTTTCTGAAAGAGGTTTTTATCTCTCACCATTTGCTTATGAGACTCACAGTCATCCAGTCAGTAAAACTATTGAGTCTCATTTAATTAATATTAAGCTACCAAATTATATTACCGAGGATTTTTTGATTGTAGGTATTAAAGAAAATAAACTTGGTGTTTTAAGAAAAGAAAAAAAATTACGGTTTTTAGAAGCTATAAATAGATGTGTGACTTCCCACGATATCCAAAGATATGGCCCTAGTTTCCATTTTGAAAAGGGCAGAGCCAATTGGAAAACTGACTTCTCTGAGGTCAACTTATCCGCAGGTGTCCAAAGTCTTCTCCCACGAATCCTTTTTGACAAGGGTCGAGTCCAAGATGCTCAGATCTTCCTTTATGATGAGCTCCATTATTGGAGTATGAAAGACATTGTGGATTTTCTTGAAATTTCGAGGGCCAAAACTGTTATCGGTTCTTTTGTTTTCCCGACAGAGATCCTCGCTGGTTCAGAAAAGAGCCTCAATCCCTGGGCATATGATTTTAAGATTCAAGGTGATAAATTGATCTATGCTCCAGATGGAGTTTGGGCTGAATCTTATGAGCAACCACTAGCTGCTGGGCAAATTCTTAAATATAATAAGATCATTACGCAACAGGGCGTTTATTCCGTTCAGGTTCGTGATTCAATCTTCAGCCACTGTCTAGTTATTATTAATCGTGATTGCCTCCTCACCGAGGAATTTCGAGTTTACAGTGAATTTGATGCTGTTTCCATAAGAAGATTAAATTACCTTGGAGGTAACTCTGATGATATTATACCTGTTCGTTATGAAGTCATTCTCTCGGTCTTCAAGTACATTCGTACCTTGAAGAAACCTGACCTTCAATCAGGGATGGCCAAACATAGGCAGCTAATTGATGACCCTACTGGATTTGAAGTGCGCTTCATTGAGGATTTTGTGCAGTTTATCCTTGAGAATCATGAGAGATTTAATTTGATTGGGCAAAAATTCTCCAATTTCCTGAGCTCTGCCTGCATTGACATGCTCCCAAGGTATCTGCAGAGATTTTTCAAAAGCTTCAAGGGTTACAGTCTTGGCAAATTCATTGAAGACATTGAGCCCTTCAATTTCACTGTTAAGTGTCGCACTTACTCGCGCTTCAGTTTTAAGCAGAGCTTCATTGAAGAGGAGGAGGAAAGAGGGAAAACAGGCGATCCAATTTATGCTCAGCTGCAAAGATCAGGCACCTTTAAAAGCACTGAGTACCCGACTAGCTTGTTTCATGCCTCTTTGTCACTCTTCTCAAATCCACATGCCAACTTGATGAGACAACTTGTGCTCTCCTTTATAAATACCTGGGTTGGCAAGACTGAGGAAGATTACTACACTTCCCTGCTCTCACTCAAGAAGAGTCTCAGCCAAAAAGGCTTCAAGCTTTTTCTTCTTCATGATGCTCGTTACTATTCCCTCATTCAGTTGGCCAATCAGATGAATTCCTTCGGTTTTAAAGCTACCCTTAAGAATGAGGTTGCAAAAAGGTTGAGGTTAGGTGGTAGTCTCAGGGGTTTGATAAGATATGATCCAGTTTCCGAAAACCCTTCAGACAAAAGAGATCAGAGGGTTCACCAGCACTTTTTAGTTGCAATCAGTGAGCTCTTAAATATCACTTCTGAGTGCCCCCCTTCAAGTGTACTTACCAGAACCACTGGATTGCAAAATGAACTTGCAAAGATGAGGAAGGGCTTTGTGCGTGATCAGGTACCAATTCCAAAGAATTTGCATGGTGAAGAGAAAGATAACGAAGAGAAAAAGGAATGCAAATCTGCTGAAAGGGAAAAAGAAATTGAAAAAACTGATCAGGGCACTTCTAGCTTCTCTGGGGAGGAGAAACAGACCAGGGATGACTCCCAGCTCTCCAATGACCATGAGCAACTCACCCACCAGGAGGAAACTATTGAGAATAAAGGAGTTGTTGTTAAGCATTCCTCCAGCGAAACATTTATTTCAAGCATTATTAAGACTGGTCCCTTCAGTGATAGCAGCACTATAGAATTTGTGAGGGGCCTTAGCTTCAATGATGGTCATACGCACAATGGCAGGAAGGCTCTCTTTTTCTCTCGAGGCAACTTTTCTTATGGCTTCAACTCCACAATTTACAAGTCATCCGGTTGGCCATCAGTTTTTGAGGATCTCTACGGGGCCAGATTCAACTCCTGTTTAGTGCAAAAATATGAAAAATCAGCAAGATTGGGGCTGCATAAAGATGATGAGAGCTGCTACGATGAAGATCATGAAGTAATGACCATCAACTTGTTTGGAACTGCTTCCTTGGTTTTCACATCTGATGATTCTAATGGGTTGGAGAAGCAAGACCCTTCCAAATTCTTGGAAATAAATCTTTGTCATGGGGAGTATCTGCTTATGCCCAGTGGTTTTCAGAAAAATTTCAAACATGGGGTTAGCCACACTTCTGCTGGTAGAATCTCACTCACATTCAGAAAGCAGATCAGAACCATGGATGGAACCATTTTGGAGAAAAACGAAAATCATGGTGATTCCAGTGAGGGGAAGAATAATGATGGTGATCACTACTATGAGGAAATGAATAAATGTTCAATATCTGCAGCTCCAGATTCAATCAAGTGCAGCTTGTCAGTTTTTCCAGTTAAGGCTGATGGGGATTGCTTTTGGCACGCTGTTTCCTCAATTTTTGGCTTGGACGCTTTGGAACTAAAAGGTTTAGTTAAAGAGAGATCGCTGGCAGAGGGGAGCGTAGATCAAGCACACATGAAGGACTTTCTGCATGAAATGGAGCCAAAGGTCTATGCCTCAAATGCTTCAGTAACTGCCACATGCTTCTTGATGAATATAAAGCTAATCATTAAGTTGACAGAATCGGAGCACTCCGGTTGGGTAGTTGTTGAGCCATTAGCATCCTCAACTGAGAAAACATCTCTTGGTTACCTTGTTTTGAATCAAAAAGTCCAACATTTTGATCTTGCCGTCCCTAAAGAGGGTTGTGTGATAAGAGCCATCAGTGAATTTCTAAAGCAAAATCCAACTAAAGTTCTTAGTGTGCTTAGTGCCAATTGTTCTAAGGAGCTTCTACATGAATTGATGAGTGGCCTTGGCATACAAGAGTTTTTCTTGGAGGAAATTTTCAAAGTTTTTGACATTTGTGCTGAAGTTAGTGACGGTGAAAAGTCAAGGATCATCAATAGTAAGGGGTCAAGATCTGCTAAATTCACAGTCGAGCAAGATCACTTTTCCTTTTGCCCAGGAGTTAAGGCTTCAACTAATCTTGGTTCATTCAAGGCGCCAAGTGGAAGCCAAACTATCCCAATTGAGCAGTATGAAGCTTTTCTCAGAAGCAATGCAAACATTGTTCCATTCACACCTTCTTTGACTGCTGCTAAGAAGTTAGCCAATTCATTTTTGAGCGGACAGACTGGTGTAATCAATTCGAAAATTATCTCTGGGCAGTATGATTGGCTCGCTGACACGAACAAGCTTTGCTTTGATGAGAGGAAAATAGGGGCTATTGTGGGCACTTTTGGGTCTGGAAAAAGTCATAACGTTGTTGAACTTCTGAGACACAATTTGGGTTATCAAAATTTGGTAATCTCTCCAAGAAGAAGTTTGAAGGAGCAATTCATCAGTATGCTTGATCTAGTGCAAGCCAGAAGCAAAGGAAAGAAGGCATCAACTGAGGTTGCCACCTTTGAAGTGGCTCTCAAAAAGACTGGAATGCTTAAAAAAGTCAGAATCTTCATAGATGAAACGCAGCTTCTGCCCCCTGGTTATCTGGATTTAATCTGCCTCATTGCTGGGCCGGATGCTTCAATTCTTGTTATGGGTGATCCAGCTCAGAGCAGCTATGATTCAGCTGATGATCGAATGGCATTCATAGGGGATAAAGGTTGTCTTGACACTCTGCTTGAGAATAAGCGTTACGTTTACCTCAGTGAATCAAAGAGGTTTCGCAATCCTATGTTCATCGGCAGACTACCCTGCACTTTTGATCAAAATAGGATGACCCTGGAAAAAGAAGAGTATGCAGTCTTTAACTCTTTCAAGGACTTTAAAGGAGATTATCTCTCCCCAAAAATCAAAACCTTCCTTGTTAGTTCTTTTACTGAGAAAACGGTTGTCAAAGCAAATATGGGGAGGAATGCAATGGTGTACACTTTCGGGGAGAGTACTGGGATGAATTTCGATTATGTTTGCATTTTACTCACTCAGGACAGTATGCTTGTTGATGAAAGGAGATGGGTTGTTGCACTGTCAAGGGCCAAAATCAATATGTCCTTTGTCAATCTTTCTGGACTTTCCCTTTCTGAGTTCTGCACTCAAATGGTTGGTGGTGTGGTTCACAAATTTTTCACTGGGACAGCGACATTCAATGATCTTCGAAGCTTGTTACCAGGTGATCCAATTTTTTCGAAAAAATTCCAGAGATTGGGTAGTGATGAAATAGATCGGGAAGCAAGATTGGCTGGCGACCCATGGTTGAAGACAAAAATTTTTTTGGGGCAGAGAGAAGTCAAACCTACTGAGGAAGTGATGCCAGAGGGGAGCTTGCCTGATATTAAAGTTAAAGTTCACTGCCCTGTTGGCTCCATGGGCACCACATTTGCTGAGATTCAATCAAGACTCAAGGTCAAAGAAGCTAGAGAGCAAAGAATTGGGTCTATTGTTACTGAGCAGTTTGCTGAAGTGCACAAGGGTAGAGGAAAGATTCTTACAGCTGCACCAGACAATTTTGAAGCTATATACCCACGACACAGAGCTGGTGATACAGCAACATTTGTAATGGCAGCAAGAAAAAGATTGAAATTTTCTCTCCCAGCCAATGAACAACAAAAGTTTTTGTCCGCCATTCCTTATGGAGACACAATGCTAAAGGTTTTTCTCAATAAAGTAAAATTGAAGCCCAACTTTGATTACAGGCTTTTTGAGGAAGCTAGAAATGATTTTGAGGAAAAAAAATTGCAGAAATCAATGGCTACTTTGGAGAATCACAGTGGACGTTCAGATCCAGACTGGGAGGTAGAGAAAGCTTTAATATTCATGAAGAGCCAATTGTGCACGAAATTCGACAACAGGTTCAGGGACGCCAAGGCTGGTCAAACCTTAGCCTGTTTTCACCATAATGTTCTTTGTAGACTGGCTCCATATATTCGGTACATTGAGAAGAAGGTTTTCAATTCCCTCCCAAAAAATTTGTACATCCATTCTGGGAAAAATTTTGATGATCTTAGGGATTGGGTAATTAAAAGCAATTTCTCTGGTATGTGCACTGAGTCTGATTATGAAGCCTTTGACTCTTCTCAAGATGCAAACATTCTTGCTTTTGAAGTGAGTCTCATGAACTATCTCAACTTACCTAGGGATCTCATTGAAGATTACAAGCATTTGAAGTTCAACACTCATTCAAAGCTCGGCCAGTTTGCTGTCATGAGGTTCACAGGTGAGGCAGGAACTTTCCTCTTCAACACTCTTGCAAATATGGTCTTCACATTCATGAGGTACGAGACCAATGGTAGGGAATCCATTTGCTTCGCTGGGGACGATATGTGCGCCAATAAGTTGTTGAGAAAGAGGAAAGAGTATGAGCATGTATTGGAAAGAATGACTCTCAAGGCTAAAGTTCAACACACCACTGAACCAACTTTTTGTGGTTGGAGACTTGGCCCATTCGGTATAATTAAAAGGCCTCAACTTGTCCAGGAGAGAATTCTAATAGCTTTGGAGAAAGGGAACTTCAATGAATGTATTGACAATTATGCAATTGAAGTTTCCTACGCCTATAATTTAGGTGAGAGGCTGATCTCCATAATGTCTGAAAAAGAATTGGATGCTCATTATTTTTGTGTTCGAACATTCCTGCAGCACAAAAATCTGTTCAGTTCAAATGCTCTTGAATTTTTCTCTGAAAGTGAAGGTTGCAAAAGCCCTGACAGGAATTTTGGTTGATGGAAGCTATTTACAGCAAATTGTTAGATGCTAACTTTTCTAGGACTGCCTACTCACTTAGTTTTCCTATTGTTGTGCATGGTGTGCCTGGCTGCGGGAAGTCAACTCTGGTTAAAAATTTGCTTGATCTTGAGGAGTTTAGTGCTCAGTCTTACGGTGTTGTTAGACCCACAAATCTTGCTGGGCGTGGTGTTGAAAAAGCTCTACAGCCTCTACAACAGGGATTCAACATTCTTGACGAGTATCTTTCTGGACCTTCTTACGAGGGTTTTGATTTGCTCCTTTCCGACCCTTATCAGAATTTCCGCAAACCACTCACTGCTCATTTCATTAACAGTAATACTTATAGGTTTGGTCCTTCGGTTTGTAAATACCTTAATCTACTAGGTTTTGAAATTAATTCTGTACGTGAGGAAGATACTGAACTCATTTTCGGAAAGATTTTTGGTGGGGAAATTCGTGGTGAAATTATCTGCTTTGAAAAAGAGGTTGAAGAATTGCTGAATAGACACTCTGCTAAATTCCATCACCCCTGTGATCTCAGGGGCGCAGAGTTTGATCACGTTACATTTATCTCCGCTCACTCTGACCTTCAGGAAATTGTTGGGCCGGATCTTTATGTTGCACTTACAAGAGCTTCAAAAAGCTTGACCATTCTTCAACCATAAATGAGCTTAAAGCCACCCACTGATTACTCAAAACCGTTGCTATTTGCTGCTGCTGGTGTCTCACTCGCCTTACTGTGTGCAACATTCAAAGCTAATTATTTGCCTGCTGTTGGCGATAACATTCACTCCTTGCCACACGGAGGTTCTTACAGAGATGGTACCAAAGCGGTTAATTACAATGGTTTGAAATGCATTGAAAATTCCAACATCAGCCCGTTGTATTCTCCTCATAAGTTTGTTGCATTTTGCTTAGTTTGTTTGCTTAGTTTCCTAATTTATGTTTTCTCAAAATTTAGTCATAGGTCTAGTCGCATTCAGCATCACTGCCTGCATCATCATGTTGTTTAGTTCTAGTAATAATAATGTGTGCACAGTTGTAGTTACAGGTGAAAGGGCTGTCGTTACTGGCTGTGAGATTACTCCTGAACTTAGCAATTTGTTAGCCAACCTTAAACCTCATTCACATAGCTTAGGTTTTTAGTCACTTTATATTGAAATTTAAAAGTGTGTGTTTGAGCTTTGTTTGATTAGTATTATGGCTGACGAATTTGAAACCAATGAGGATGGGTCCTTTAAGCTTGACAGTGCAGGAAACAAGATCCCGAAGAAGATGGAAACGAGGACGCCCCTTATCGACGGAAGAGCGACGGGCCAGCCTCAAAGAAAGAGTGATATGGAAGTGCTTCGAGCTAGAAGAAAGAGAGTCACTTTTGACCCAAAGAATCCCACTTCAAGTCCTAACAAGGATTTTATCAGCAAGATTAAGGAAGTTGACCCCATTACACTCAATATTGCCACTGATGACTCCGTCAAAGCCATCGCTGCAGACTGGGTTGAGCACCTCAAGGTTCCTGAGGGTGAAACGTTCTCTTGCATTTTCGATGTTGTTTGGTACTGCTACCACAACAGTTCAAGCGATAAAACCAAACTTATTGGAAGGGCAAGTTGCAATGTTGAACTGGAGGATCTGGCGAGCACTATTAGGAGCTACTGTTCTTTACGTAGCTTTTGTTCAAAATATGCGCCAGTGATCTGGAATTACGGGATCCAAAATGACATACCTCCCGCTAATTGGCAGAGGAGGAAAGTGGTGGAGGGCGCTAAATTTGCAGCTTTTGACTTTTTTGAAGCTGTAACTAGTGCAGCAGCACTACAGCCAGTGGAAGGGCTTGTTAGAAACCCAACAGATAAAGAGATGACTGCCGGAGCATCTCTAAAAGAAATCAGTTTAATGAGAGACGAAATCCGGAGAGGTACCAGCTCAACTCTAATGACAGAGGTAACTGGTGGTAGGACTGGCCAAATTCAACCCATTAAGAAAATTGGTGGAGATGAATGATAAACCCCTACATCCCTAACCTTCATGGTTAGCCCGTTTAACAACACGGGGCGAAGCTAAAGTTGTTAATTCTATGTTTACAGTTTTATAAATTTCTGTATTTCCAAGTTTAAAATAAACTTAAAGAGATTCATAATTTAATTTGAGTCTGGCTGCAGGGTTTTAATATATTTTCCTTTAGTTCCTTTAACGG
| 92,339 |
KF030880.2
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Villamor,D.E., Eastwell,K.C., Villamor,D.V., Villamor,D.E.V., Susaimuthu,J.
|
Washington State University, Plant Pathology
|
USA
|
2013-12-09
|
C3 (s1)
|
Cherry twisted leaf associated virus
|
Robigovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,428 |
GenBank
| 1 |
USA
|
USA
|
Prunus armeniaca
| null | null | null | null |
Cherry twisted leaf associated virus isolate C3 (s1), complete genome
|
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| 92,340 |
NC_003689.1
|
Cherry virus A
|
Jelkmann,W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1995-10-03
| null |
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,383 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Cherry virus A, complete genome
|
TCACTTCCATCAATTTCCAAACACTTTCAAAACTCCCAAACACAAGCAAGTGCAATGGCATTTGTGGCTAAATTTGCTGAAGAAAACTACTTCAACTCACTCCCTAGTAATGTCACTGACGCATTTCTTAGGGATGGATTCAATGCTGAGCATAACCGTTTTGAGATTCTCTCAAGACATTTTGCCTTTGCATTAAAACCAAGTCAGAGAACTTATTTGAATGATTGTGGCATTCAACTAGCACCTATTGCATCCAAGACACACCCACACCCTGTGTCTAAGATTATTGAAAATCATCTCCTCTATTGTGTAGTATCAAATATGATTTCCAACTTCAAGTTTCTGGTCTTCTTAAGCATTAAGGAAGTCAAAGCTGAATACATCTGGAACAAAAATACAGCTGACACAGTTAGAGAGATTTCCAATCGCATTCTTGATATCAAGGATGCTTTCCGCTATGGTCCAACCAATACAGTCAATGGTGGCATAAACAACTTTAGTTTCTTCTGTGCCAACCTCAATAGAAGATTCAATAACAGAGCCATCAAACCTGACTGTTTTTTTATTCATGATGAGGTGCATTTTTGGAGCCCAGCTGAACTTTGTGAATTTCTTTTCACTGTTGAGCCCAAAAATGTTTTAGCAACAGTTGTCATTCCACCAGAGCTATTGGAAGGGTTGGATTACAGCTTCAACTCGGTTGCTTATGACTTCAAGAAGGTGGATGGTAACTTGTATTACTTTCCTGACAAATCCAAAGGCAAACCTTACCAACAACCCATGGATCCATGGTTGCTTAAATGCAACAAAATTTCAATGATTAAGAATGGGGAAATTTTTTCCTACTCTATAGGTCTTCTTGAGTCTGTTGGAGCCAATCATCTTTTCTCCTTCCAAAGGAATAAAGTTGTTGAATCTACCCGTTTCTTCAATGACTTTGATTGTCTGGATATGAGAAAGTTACTGCCCATAAATGTGGAGAATGGAAAAATCAAGGGGTATAACATCAGGACTTGGGTTTTCAAGAAAATCTTGTCCTATATAGTTTGTCTTAAGAAGGGAGACTCTGAATCATCCTTGGCCAAGCTGAGGCAGCTGAGTGATTCCTCACCAAGCTCTGATGAGCTTCTGTTGATTGGTGACTTCTTTGACTTGATGACCAGAGTCAAAATTTTTAATAAACGTAGCCCTTGGAGTTTTCTAAGTGATGCTAAGAATTATGTTGACTCTTGGATCATTCAATCTCCCTTTCTTCGAAGGATTTTTCCAGTAGGCAGTAGGGCCATTACTGAACTCATAAGAGACTGGATTGCCAATGCTGAATCTTTGAAGATTCAAACAACTTGCTCTTCTCTCACTTTCTCAGATTCTTTTGAGATGATAAAAACAGACAGCATATCTGAGTTTGGTGAACACATCTTGGGGAACATCTCTGGTGGATTATCAAGCGCCATTGAAGCCTGTAGAAATTGGTTAACATCAAAGAGATTCTCTGGTGGGAGTTATTCAATGGTTAGTAGAAATGGTCTTCTCGTGGACTCAATGCGCCAGAATACTTCTTTCTCTTGTGAAGTATTTGTTGATCTTTTTCCTTCAACCATTAGGCCTGCCTTTTACTCAGACCCTAATTTCACTAAAGTGGAATCCTTTGAGCCTGAATGGGATTTCTTACTTGGGTCTTGGATTTTCAATCATAAGCAGGTTAGATTGTGTTATGAGCCGAGTAATTCACATGCCGACAGTGAGGAGGATGTCAATAGAACTTCTGAAACTTCAAGCCCTGAGAAGACTATTGCAGATTCAAGTTCAGTGTCACCTTTTGTGAGCTCTAATCACGAGGAGGGAACATCATCTCAACAATCTGAAGAAAAACCAATATCTGAGCAGGAGAAAAAGGAGACAAGGAAAAATGATTGTTTCTTTAAAGCAGTTGGTGAAACCATTGGGATTCCTGCCAATTCACTAATTGAAAGAATTTTATGTTCAGATTCAGAAGACCTCAAGCCGGTGATTGAACAATTGAATTTAGATCACCCAATAAGTTCAAAGTTATTGGAGGTTTGTTGTAAATTCCTGGGATACAGAGTGCATATTTATTATGGGGATAGCATAATAAAACTCAATGATGACATCAATATGCACGCAATTCACATTGGAGGGAAGCCAGGTCATCTTTTTTGCATCAACCAGGAAAGATCCAAAATTCCAAAGGATAGCCAGATCAAAGTCCCTGAAGTTGGACCTCAGTCCTTCATTGGATCGATTTTTTCAAAGACTTACGGCTCAGGATCAAGTGCTCCAATTCATTTGGGTCAAATTGATATCACAAAGGCTCTGGTCCTTGTTTCAGCCTTTGAGTCTATGAATCTGGGGGTTCGTGTTGACAGGAAAGCCATACTTGAGGGCCAGCTCATATCCAATGGTTTCTTGGCTTTTCTTAAAAGAAAGAATAATGAGGGGCATAAGGTCATTAAAATTCAATCTCTTCCAGTTTACCCATTCATTGGCTTTGCTGGCTCTGGTAAATCCTTTGGATTAACTGAGAAGTTAATCAATGGTGATTGCAGTCAGAATTTCATGTTCACCGCTCCCAGAAAGAAAATCATAGGGCAAATTCATGAGAGAATTGATTCAAGGCAATATGATGACAAGCTAAAAATCAGCAGGAAGAAAAATTTTAGTACTTTTGAGAACACTTTGCTTTCATTAGTTAACAAACCTCTAGTGATCATGGATGAATGCTCCTTGAACCCACCTGGCTTCATTGATTTGGTTCTCATCAAGTCTTTGGATTCTATCATCCGGAAGAGCAATAAGGACTTTGATCACTTCTTTTCTTCCAGTGTTTTGTCAGAGGGGATAATTGCGAATGTTGCTTCACCCATTGCTTGCATAGCAGTGACAGGTGATACATTACAATCCAGTTTTTACTCTGAAAGCTGTGGCAAGCTGATGCAATACAAGAATGACATCAAGACTTTGTGTGCTTTGAGTCATACGAGATTGCCCTATCTTTTTGGATCCAAAAGGTTTGGCTACTTCACTGGCTTCCTCAAGCTTGGATATTACAATCAAATGGAATCAAAGGCTTTCACCATTGACAATATGGAAACTCTACAGAAAGCCATTGGTACCTCCATGGACAAATTCGGGGTTTTAGTTACCTCAAGAGCAGACAAATCAGATTTTGAGCTAGATTTTCCAAATGTCTGCACAATCAATGAAGCACAAGGAAGCACCTTCAATAGCGTCATTTTGATTGTGACAAGAGATTTCTTCTCCAATCCAATTGAGTCAATCATAGTGGCAATAACAAGACATCAAAAAAATCTTTTGATTTATTTTCCTGCTGCTATACAAGGTGAGATGGATTTTCTTAGCAGAAGATTTCCAATTCATTCAAATGTTGTGCTGAAGAACTTTAGTGTTTTGGACAACTTGATCAAGGATAAACTGAATCCATTCCAATTAATTCAAGAAGATCCATTTGGTCATGATTTTGAGGTTAAGCTTGAAGGAGATCCTTTCTTGAAGAGTGAATTGAGTTTGGTTAACGAGATTAAATTGCAACAGATTGAAGAAAACTCAATTGAATCTAAGGAAAATCTCAAAACTCATTTGCCGATATCTTACAGCGGGCTGTGGAATCTGGAGATCAGTGAGATGAGGGCTAGAGAAGATAGAGAATTTAAAAAATTTGGTGTTGGATGGAGTAAGCAATTTAAAGATGAGCCAAATCAGAAAGATCAGGTGGAAGATAATTGTGCGATGCTCCCTGAAGCTGTTTTCCCACGGCACTTTGCCAATGATGATTTAACTTTCTGGAGTGCAGTCAAAAAAAGATTGGTCTTCAAAAACCCCTTGAGTAATGCTCATGATTTTGAAAAGGCCAAACCCTTTGGCAAGGAGTTGTTAAATATATTCCTGAGGAAGGTGCCACTCATGCCTAACTTTGATCAGAGAATGTATGACGAGTCTGTCTCTGAGTTTGAGGAGAAGAAAATAAGTAAAAATGCAGCCATGATAGGAGCTCATCATGACAGGTCAACCACTGACTGGCCAACAAACGAAATCTTCCTCTTCATTAAATCTCAGCTATGCACAAAGAAGGAGAAGATGTTTTGCGACGCTAAAGCTGGTCAGACCCTTGCTTGCTTTTCTCATCTCATTCTCTGCAAGTTCGCTCCTCTCAACAGGTACATCGAAAAGAAAGTCACTCAAAGCCTTCCAGGAAATTTCTACATACATCAGAAGAAAAACTTTGATGAGCTTGAAAGATGGGTGAAATCATATAATTTCAGTGGGGTCTGTACAGAGTCAGATTACAAAGCTTATGATGCCTCACAGGATTCTTGCACTCTAGCCTTCGAGTATAAGCTTTTAAGGTACCTTGCCTTTTCAAATAGTTTGATTGAGGATTATCTTTACCTGAAAATGCATTTGAATTGCAAACTTGGAAATCTTGCTATAATCCGTTTCACTGGAGAGTTTTGCACCTTCCTATTCAACACATTAACTAACATGTTGTTCACTTTCATGAAGTATGATGTTAGAAAGACTCATGCGATATGCTTCGCAGGTGACGATATGTGTGCTAATGTAAGATTGCCAGAAAATCATGAATACTCAAGCTTACTGAAGAAGTTTTCCTTGAAAGCTAAAGTGGACTTCACTCGCTCTCCAACTTTCTGTGGATGGAACCTTTCAAGGTATGGAATAGTCAAAAAGCCGGAGTTAATTGCTGCAAGATTAGCTGTTGCCAGGCAAAAAGGGGAAGTTAATCTGGTCTTGGATTCATACTTCCTTGAGCATCTCTATGCGTACAATAAAGGCGATCACCTTTTTGAAATCTTGAGTGAAAAGGAACTAGAACACCATTACAATCTCACCAGATTCTTTGTGAAGAATAGTAAGCTTTTAAAAGGTGAGTCAAAAAAAAAATTCATGGAAACCAAAGAAATTGAAGGGGGGTTATTTGGGGAGTGTGATTTTGGGAATGA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| 8,899 |
OQ865368.1
|
Cherry virus A
|
Chirkov,S., Sheveleva,A., Sharko,F., Tsygankova,S.
|
Lomonosov Moscow State University, Virology
|
Russia
|
2023-08-12
|
PTC
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,426 |
GenBank
| null |
Russia
|
Russia
|
Prunus
|
plant leaf
|
2020
| null | null |
Cherry virus A isolate PTC, complete genome
|
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| 14,036 |
LC752551.1
|
Cherry virus A
|
Jeong,R.D., Lee,G.E.
|
Department of Applied Biology; 77 Yongbong-ro Buk-gu, Gwangju, Jeollanm-do 61186
|
Korea
|
2023-02-01
|
CVA_CNU-1
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,382 |
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Prunus avium
| null |
2022-02-16
| null | null |
Cherry virus A CVA_CNU-1 RNA, complete genome
|
TCACTTCCATCAACTTCCAAAAACTTTCAACACTTCCAAAAACAAACAAGTGCAATGGCATTTGTGGCTAAATTTGCTGAAGAAAATTACTTCAACTCACTCCCTAGTAATGTCACTGACGCATTTCTTAGGGATGGATTCAATGCAGAGCACAACCGCTTTGAGATCCTCTCAAAACATTTCGCTTTCGCATTAAAACCAAGTCAGAGAAATTACTTGAATGATTGTGGCATTCAACTAGCACCAATAGCATCCAAGACACATCCACACCCTGTGTCAAAAATTATTGAAAATCATCTCCTCTATTGTGTGGTATCAAACATGATTTCCAATTTCAAGTTCTTGGTTTTCTTGAGCATTAAGGAAACTAAAGCCGAATACATTTGGAATAAAAACACGGCCGACACAGTTAGAGAGATTTCGAATCGCATTCTTGATATCAAGGATGCTTTCCGTTACAGTCCAACCAACACAGTCAATGGTGGCATAAACAACTTCAGCTCCTTCTGTGCTAATCTTGCCAGAAGATTCAACACTGGAGCCATCAAACCTGACTGTTTTTTCATTCATGATGAAATTCATTTTTGGAGCTCATCTGAACTTTGTGAATTCCTTTTCACAATTGAACCCAAAAATGTTTTGGCAACAGTTGTCATTCCACCAGAATTAWTAGAAGGGCTGGATTACAGCTTCAATTCAGTTGCTTATGATTTCAAGAAGGTGGATGGCAACTTGTATTACTTCCCTGACAAATCCAAAGGCAAACCTTACCAACAGCCCATAGACCCATGGCTCCTCAGATGCAACAAAATTTCAATGATCAAGGATGGGGAGACTTTCTCTTACTCCATTGGCCTTCTTGAGTCTGTTGGAGCAAACCATCTCTTCTCATTCCAGAGAAATAAAGTCGTTGAATCTATCCGGTTCTTCAATGATTTTGATTGTTTGGATATGAGGAAGTTACTGCCCATTAATGTGGAGAATGGGAAAATCAAGGGCTATAACATTAGAACTTGGGTTTTCAAGAAAATCTTGTCTTATATAGTGTGTCTCAAGAAGGGAGACTCTGAATCATCCTTGGCCAAACTGAGGCAATTAAGTGATTCCTCACCAAGTTCTGATGAGCTTCTGCTCATTGGTGACTTCTTTGATTTGATGACCAGAGTCAAAATTTTCAATAAACGCAGCCCTTGGAGCTTTCTAAGTGATGCTAAAAACTATGTCGACTCTTGGATTATACAATCTCCCTTCCTTCGAAGGATTTTTCCAGTGGGTAGTAGAGCCATCACTGAACTCATTAGGGACTGGATCGCCAATGCTGAGTCCTTAAAGATTCAAACAACATGCTCAATCCTCACTTTCTCAAGCTCATTTGAAATGATTAAAACAGACAGCATATCTGAGCTTGGTGAACACATCTTGGGGAACATCTCTGGTGGATTATCAAGCGCCATTGAAGCCTGCAAAAATTGGTTAACATCAAAGAGATTTTCTGGTGGGGGTTATTCAATGGTCAGCAGGAATGGTCTGCTTGTTGACTCAATGCATCAGAATACTTCTTTCTCTTCTGAAGTWTTTGTTGATCTTTTTCCTTCAACTATTAGGCCTGCCTTTTACTCAGATCCTAATTTCAATAAAGTGGAATCCTTTGAGCCTGAATGGGATTTCTTACTTGGGTCTTGGATTTTCAATCATAAGCAGGTTAGATTGTGTTATGAGCCAAGTGATTCACATGCCGACAGTGAGGAGGATGTCAATAGAACTTCTGAAACTTCAAGCCCTGAGAAGACTATTGCAGATTCAAGTTCAGTGTCACCTTTTGTGAGCTCTAATCACGAGGAGGGAACATCATCTCAACAATCTGAAGAAAAACCAATATCTGAGCAGGAGAAAAAGGAGACAAGGAAAAATGATTGTTTCTTTAAAGCAGTTGGTGAAACCATTGGGATTCCTGCCAATTCACTAATTGAAAGAATCTTATGTTCAGATTCAGAAGACCTCAAGCCGGTGATTGAACAATTGAATTTAGATCACCCAATAAATTCAAAGTTATTGGAGGTTTGTTGTAAATTCCTGGGATACAGAGTGCATATTTATTATGGGGATAGCATAATAAAACTCAATGATGACATCAATATGCACGCAATTCACATTGGAGGGAAACCTGGCCATCTCTTCTGCATTAATCAAGAAAGATCCAGAATACCAAAGGATAGCCAAATTAAAACTCCTGAAGTTGGACCTCAATCATTCATCGGCTCAATTTTTTCAAAGACTTACGGTTCAGGATCAAGCGCTCCAATTCACATGAGCCAAATAGACATCACAAAAGCTCTAACTCTTATTTCAGCTTTTGAATCTATGAATTTAGGAGTTCGTGTTGACAGAAAAGCCATACTTGAAGGTCAGCTCATCTCTAACAGTTTCTTGGCTTTTCTCAAAAGAAAGAGCAATGAAGGTCATAAAGTCATCAAGATTCAATCTCTCCCAGTTTATCCGTTCATTGGCTTTGCTGGTTCTGGTAAATCCTTTGGATTAACTGAGAAGCTAATCAATGGTGATTGCAGTCAGAATTTTATATTCACTGCCCCCAGGAAGAAGATTATAGGACAAATTCATGAGAGAATTGACTCAAGGCAATATGATGAGAAGTTGAAGATCAGCAGGAAGAAAAATTTTAGCACTTTTGAAAACACTTTGCTTTCATTAGTCAATAAACCTCTGATCATCATGGATGAATGCTCCTTGAATCCACCTGGCTTCATTGATCTGGTTCTCATTAAGTCTTTGGATTCTATCATCCGGAAGAGCAATAAGGACTTTGATCACTTCTTTTCTTCCAGTGTWTTGTCAGAGGGGATAATTGCGAATGTTGCTTCACCCATTGCTTGCATAGCAGTGACAGGTGATACATTACAATCCAGTTTTTACTCTGAAAGCTGTGGCAAACTAATGCAACACAAAAATGATATCAAAACTTTGTGTGCTCTGAGCCATACAAGATTGCCCTATCTTTTTGGGTCAAAGAGGTTTGGCTACTTCACCGGCTTTCTTAAGCTTGGATACTACAATCAAATGGAATCAAAAGCTTTCACCATCGACAACATGGACACTCTGCAGAAAGCTATTGGCACCTCCATGGACAAATTCGGGGTCTTAGTCACTTCAAGGGCAGACAAGTCAGATTTTGAGCTAGATTTCCCAAATGTCTGTACAATTAATGAAGCACAAGGTAGCACTTTCAATAGTGTCATTTTGATCGTGACAAGGGATTTCTTCTCCAACCCAATTGAGTCAATCATAGTGGCCATAACAAGACATCAAAAAAATCTCTTGATCTACTTTCCTGCTGCAATCCAGGGTGAGATGGATTTTCTTAGCAGAAGATTTCCAATTCATTCAAATGTTGTGCTGAAGAACTTTAGTGTTTTGGACAACTTGATCAAGGATAAACTGAATCCATTCCAATTGATTCAAGAAGATCCATTTGGTCATGATTTTGAGGTTAAGCTTGAAGGAGATCCTTTCTTGAAGAGTGAATTGAGTTTGGTTAACGAGATTAAATTGCAACAGATTGAAGAAAATTCAATTGAATCTAAGGAGAATCTCAAAACTCATTTGCCAATATCATATAGCGGATTGTGGAATCTAGAGCTTAGTGAAATGAGAGCCAGGGAAAACAGAGAATTCAAGAAATTTGGTGTCGGATGGAGTAAGCAGTTCAAAGATGAGCCAAATCAGAAAGATCAGGTGGAGGATAATTGCGCAATGCTCCCTGAAGCTGTTTTCCCGAGACATTTTGCTAATGATGATTTAACTTTCTGGAGCGCAGTCAAGAAAAGATTGGTTTTCAAGAACCCATTGAGTAATGCACATGATTTTGAGAAGGCCAAGCCATTTGGTAAGGAATTGCTGAATATCTTTTTGAGGAAAGTGCCACTCAAACCTAGTTTTGATCAAAGAATGTATGATGAGTCTGTCTCCGAATTTGAAGAGAAGAAAATAAGCAAAAATGCAGCTATGATAGGAGCTCATCATGACAGGTCCACAACTGACTGGCCAACAAACGAAATTTTTCTTTTCATCAAATCCCAGTTGTGCACAAAGAAGGAGAAGATGTTCTGTGATGCCAAAGCAGGTCAAACTCTTGCTTGCTTTTCWCATCTCATTCTCTGCAAGTTTGCTCCCCTCAATAGGTACATTGAAAAGAAAGTCACTCAAAGTCTTCCAGGGAATTTCTATATACATCAGAAGAAGAACTTTGATGAGCTTGAAAAATGGGTGAAATCATATGATTTCAGTGGAGTCTGTACAGAATCTGATTATGAAGCTTATGATGCCTCACAAGACTCTTACACTTTAGCCTTCGAGTATGAGCTTTTGAGATACCTTGGTGTGTCAAACAGCTTGATTGAGGATTATCTCTATCTGAAGATGCATTTGAATTGCAAACTTGGAAATCTCGCCATAATGCGGTTCACTGGAGAATTCTGCACCTTTCTTTTCAATACATTAACTAACATGTTGTTCACCTTCATGAAGTATGATGTAAGGAAAACCCATGCAATATGTTTTGCAGGTGATGATATGTGTGCTAATGTAAGATTGCCAGAGAATCATCAATACTCAGATTTGCTGAAAAAGTTTTCTTTGAAAGCTAAGGTGGATTTTACTCGTTCTCCAACTTTCTGCGGATGGAATCTCTCAAAGTATGGGATAGTCAAGAAGCCAGAATTGATTGCTGCAAGATTAGCTGTTGCCAAACAGAAAGGGGAGGTCAATTTGGTTTTAGACTCATATTTCCTTGAGCATCTCTATGCGTACAATAAAGGAGATCATCTTTTTGAGATTTTAAGTGAGAAAGAATTGGAACACCATTATAATCTCACTAGATTTTTTGTGAAAAATAGCAGGCTTTTAAAAGGTGAGTCGAAGAAAAAATTCATGGAAACTAAAGAAATTGAGGGAGGATTGTTTGGGGAGTGTGACTTTGGAAATGA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| 18,766 |
ON088603.1
|
Cherry virus A
|
Kominek,P., Kominkova,M.
|
Crop Research Institute, Plant virology and phytoplasmatology
|
Czech Republic
|
2023-01-23
|
CVA-Ruzyne
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,415 |
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Prunus cerasifera
| null |
2017-06-09
| null | null |
Cherry virus A isolate CVA-Ruzyne, complete genome
|
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| 19,217 |
MZ291921.1
|
Cherry virus A
|
Phelan,J., Boyes,I., Rott,M.
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
|
2021-10-11
|
19SP003
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,441 |
GenBank
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2019
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| 37,311 |
MZ291922.1
|
Cherry virus A
|
Phelan,J., Boyes,I., Rott,M.
|
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
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2021-10-11
|
19SP013
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Cherry virus A
|
Capillovirus
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Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,432 |
GenBank
| null | null | null | null | null |
2019
| null | null |
Cherry virus A isolate 19SP013, complete genome
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| 37,312 |
MZ291923.1
|
Cherry virus A
|
Phelan,J., Boyes,I., Rott,M.
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
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2021-10-11
|
19SP014
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,438 |
GenBank
| null | null | null | null | null |
2019
| null | null |
Cherry virus A isolate 19SP014, complete genome
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| 37,313 |
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Cherry virus A
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
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Canada
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2021-10-11
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19SP016
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Betaflexiviridae
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ssRNA(+)
| 7,431 |
GenBank
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2019
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Cherry virus A isolate 19SP016, complete genome
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| 37,314 |
MZ291925.1
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Cherry virus A
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Phelan,J., Boyes,I., Rott,M.
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
|
Canada
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2021-10-11
|
19SP057A
|
Cherry virus A
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Capillovirus
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Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,430 |
GenBank
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2019
| null | null |
Cherry virus A isolate 19SP057A, complete genome
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Cherry virus A
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Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
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Canada
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2021-10-11
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19SP057B
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Betaflexiviridae
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| 7,433 |
GenBank
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2019
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Cherry virus A isolate 19SP057B, complete genome
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| 37,316 |
LC522999.1
|
Cherry virus A
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
QLD11
|
Cherry virus A
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Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,364 |
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry virus A QLD11 RNA, complete genome
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| 53,963 |
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Cherry virus A
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Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
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Bundoora, VIC 3083
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Australia
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2020-02-11
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TAS1
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Cherry virus A
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Capillovirus
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Betaflexiviridae
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ssRNA(+)
| 7,364 |
GenBank
| null |
Australia
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Australia
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Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry virus A TAS1 RNA, complete genome
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| 53,964 |
LC523001.1
|
Cherry virus A
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS2S1
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,364 |
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry virus A TAS2S1 RNA, complete genome
|
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| 53,965 |
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|
Cherry virus A
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS2S2
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,362 |
GenBank
| null |
Australia
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Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry virus A TAS2S2 RNA, complete genome
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|
Cherry virus A
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS4S1
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,369 |
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
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|
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Bundoora, VIC 3083
|
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2020-02-11
|
TAS4S2
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Cherry virus A
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Capillovirus
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Betaflexiviridae
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ssRNA(+)
| 7,362 |
GenBank
| null |
Australia
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Australia
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Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry virus A TAS4S2 RNA, complete genome
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LC523005.1
|
Cherry virus A
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS5S1
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,363 |
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
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| 53,969 |
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|
Cherry virus A
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS5S2
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Cherry virus A
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Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,366 |
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
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Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry virus A TAS5S2 RNA, complete genome
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| 53,970 |
LC523007.1
|
Cherry virus A
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS12S1
|
Cherry virus A
|
Capillovirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 7,362 |
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus avium
| null | null | null | null |
Cherry virus A TAS12S1 RNA, complete genome
|
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2020-02-11
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Capillovirus
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GenBank
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Australia
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Cherry virus A TAS12S2 RNA, complete genome
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| 53,972 |
NC_003790.1
|
Chicken astrovirus
|
Imada,T., Yamaguchi,S., Mase,M., Tsukamoto,K., Kubo,M., Morooka,A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2000-03-22
| null |
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,927 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Chicken astrovirus, complete genome
|
CCGAATAGATGGGATGGCTTCGGCCGGCCCTACTGGGGCGGGGGCTCGCCCCCCAAAGGCTTTCACTGCTCAGGCCGGACTGGCCAAATTGGTCAATCCGGCCGGCTTAAATAGCATCCTCGCTAGAGGGAAAGAAAAGTTTGGAGGCACCCAAGCTTGGAAAGAACTCATGGGATGTGATGTTATTTTTGCAAGATCCATCAGTCACTGGTATGGGATTAAGGGGACGACTTACTATGAGCTTACTGTCGCACTCGGCCAACCTCTGTACAAACCAGTTACAGATCCTGAACTGACTGAAGAGGAAAAGGCCGTGATGACTGCAGTTCAATCTCGGTTTGCGCAAAGTAACTCTAGTGTTGTTCTCACCCGCACGCTCCTGAATAAAACCTGTGAACTCAAGGACAGAATTCGCGAACTTACTGATGAATTGGGACAAACAGAAGTTCACCTGGCGCGTGAAAAAGTGAAAGCAGCGGCCTTGAAGCTTGAGAATAGAAAACTTTTTGTTGAAAATCAGGAACTTAAAGACCAACTTGAGAAGGAGAGAACCAAACACGGCTGGAAGGGCTTGAAAACACTGTGCCTCTGGATCTTTCTTGCGACATTAATTGGTGGTTACATCACTGGCTCTAACGCAGCGTGTACCCTTGTCGATGTTCCATCCCCAATGAAAGTTGGTTATGACACTTTTAAACAAATGTGCATCCATAAGGACTCCTATCTACCTGATGGTGCCTTTGACAAAGAATCTCTGGCACTTGAGTGTTCCAAGCAAATGGACTATATGGATTGCAAAGAAGTTATAACCGACTCGATTTCAGGGAAGACTTCCTTTGCTGGTATGCTGCGTGATGTTTTTAGAGTCGATGAGATTGTTACTGCTATAAGGACTGTTGTTCGCTTTGCAATGGACTTCAGTCTTGCATACCCAATTTGTGTCATGTTCGTGCTCATCTTGACCAGAAACAAAAAACATGCAATAATATCAGCGTGTTGTGCCCTTGTTGCCAAGTGTTGTGGATTAAGACTTTTACCATTCACTTTAGTTCTCACTTATGCCCCATCTGAAACAGCTATAGCAGGTTGTATTTATGGCCTTGGCTATATTAGTATACCATTGGTAACGTTTCTCCATTGGGTCGGTCTTGTACTTAAGGCTATTCTCGTTCCCGATGATTGCTATATAGGTACTAGGGTGTCACATGCACTTGCCTGGTCCATAATGTTACCAATGTGGATTATAACGCAAGAACTTATGGCATTTACAGAGTTTCCTCTTGAACTCCAAATAGTCACTACCGTGGTTGTTTGTACGGCTGGGTTCGGCTTCCGTTATCTAACTGGTACGGTTACGATTACTGAACCAGATGGAACCGTAAAGAAGTACAAGAGGATTTTTAATGCCAAGAGTGCAATTGGCACTATTTCAACAGTTTTTTTTGAAAAAGCCAAGGCCATACGTGGGGTGATACCTTCCTTCCCAAGTAAGGCCGATAACATCGTAAAAATTGAGGTAGATGTTGATGGTGGTTCTGCTGGAGTTGGCTTTAGACTTGGCAACTACATCTACACAGCAGGCCATGTTGTTGGAGAAGCAAAAATAGCTAAAATCACCTGGAAAGGCTTAACATCTCAAGCCAAGGTTCTCGGTCACATTGAGTTACCACTCTTCACAGATACGCTTGCTCGTCTTGAAATTCCAAAACCTTTTCAACAACTCCCAGTCTTTAGACTAGCAAAGTCTTCTGAGAACGACTATGTGCAGATGGTCTGTTTTGACAATCAATTGCAAAACGTTGTCACTTTCTCAGGCTGGGCTAATATTGACGGCGATTACCTGAATGCTCCCTTCGAAACCTATGCAGGTACATCGGGTTCACCTATTATAAATAGGGACGGGAGGATGCTTGGTGTCCATTTTGGTAGTAACGCCGTTGTGTCACAAGGTTTTGTGATCACTAGGCTTTTTGCAACTGAGCCAGCGGTTAAGCAGTGCAAGTCTGATGAAGACCTCGCTGATGAGATTGTTCGTAAGGTCATGGGCGGTATTAGGATTTCCTTTGCTTCACTCACATCAGAGCTCGAGAAGCAGCGCGATGAACTTAACGCGCTCAAACAAATGGTCAATGATCTTATAGACACTGACCTTGTTGCCCTCGAGAAGAAGAAAGGTAAGACTAAGAGGACCGTTCGTGGGCAGAAACATAAGACCAAAGCGATCTCTAAGGCTGCCTTCATGAAAACTAAAGTCCTCACCGAAGAAGAATATCGCCGGTTAGAGGAGGAAGGCTTCACTAAAGATGAGATCAAGGACATCGTTGACAATCTCAGAGAGCAGGCGTGGCTCGACTATCAGAACCAACTTGATGAAGAAGGTGATGATGACTGGTACGAACAAATGGAAGAGGATCAAAGAATTAATGATCAAATTGACCAAAACATTGAAAGAGACCTCGAGGATAGAGGTGAATGGTATGGTCAGAGGAAAATAACCTTCAAGCAAAGAGCGATGCTTCGTTTCATTCAACTTGGCCGGCAACAACAGGTGGCCACTGTCTCATTTCCTGATGGTTATGAGGACAGAGCTGAAGAACTCTACAATAAGGTCGTCACAACTGAAGACCTTCCAGAAGGCGAAACTTCAGAAGCAGCGCTTAGCCTCCCCAATAAAATTGTTCATCAGGCGGGGAAGAGGTTAAACTTCAAACATGTTAAGATACACCCAGATAAGACTTTTATGAAGTCTGGTGTTACACAAATTGAAGAAAAGCCAGAAGGTGATATTATCCTCAAAGCCAAAACAACAACTTTGGCCCCTAAGGAAGAACCAGTCATCCAACAGGTTGAACAACAACCTCAAGTTGAGCAACAACAACAACCTCAACAGCCTGTTGTGGAGGAGAAGAAAAGAACACCACCACCAAAACCACAAAGAAAACCAAAGACAGGTGCAAAAGCGAAATGCCTCGATTGTGGCGAGACTTTCGTTGAAAGGCAAGACTTCCACGTTTGTAAGTCAAAAAACTAAATGAGCCCCCTTCGGGGGGCTACACACCTGTCCCTGACCATCTTAGGTGGAACAACTGGCAAATCTATATGGAACCTCTTGACTTGAGAATAACAGTACCTGAAAACTATCCTATTCTGGGTCATATCGCCATAGATAAATTGGTTGAACGTAAGAAAAAGGTCAATGACCCGCTTCTCAAAATGCTTGAACAACCAAAATGTGAGGGCTTTACATCAACAACTTGGACTCGTAAAGCGTACACAAAATCTTTTGAGAAGTTTGACTATGGCGATGCGGTTGATTTTGTGCAGGACTATCCTGAACTCACTGCTTTCGCAGATGCAGCTGTACTTGCTGAGGTTGGTTACATGGAGGGAACACATGTCATTCCCATCCAAGAAACCAGCAAGAACATGGATTCTACACCTGCCTTTCCCAAAATGCTTGACTTCGATAGTGAAAGGGACTATCTCGAAGCACATGGGATGAAAGAGTACATTGATACTCAGTTAGGTGTGCAATCTGGCAAACCACTTTGGTGGTGCTTCCTTAAAAATGAGATCCTTAAGGAAAAGAAAGTCAGTGAAGATGATATCAGGATTATCACCTGTTCAGACCCAGTAATAACTAGGCTAGGCGCCTCTTTTGATTCAGAACAAAATGAGCGCATGAAGGAGAGAACAGAAACGCATCATGCTCAGGTGGGCTGGACCCCCTTCTTTGGTGGACTGGATAAGCGTGTCAGGAGAATTACGTCCTGTGGCAGGACCCAAGTCCTAGAACTTGATTGGACGCGATTCGATGGCACCATTCCGGTTCAGCTCTTCCAAAGAATGCGTGAGCTGCGTAAATTCTTTCTCACTAGGCGTTCAAGGAGGCGCTATGGCAAGTTACTTGACTGGTACAACGCCCAGTTAACAGATAGAATCACTCTTCTTCCAACTGGAGAGGTAACTCATGTCAAGAAAGGCAACCCATCTGGGCAATTTTCAACAACAGTTGACAACAACCTTGTTAATGAGTGGTTGACTGCTTTTGAGTTTGGTTACCAACACTTGGAGAACCATGGCATTATTCCAACAGTCAGAGACTACCGGGCCAACGTTGACTTTCTTTGCTATGGAGATGATAGGCTTTTAGCTTTCAATCCATCCTTTGTCAACTACGACCCTCAGGTGACCATTGATATGTATAAAAATATCTTTGGGATGTGGGTCAAACCTGAAAACATTAAGCTCTTTGACTCGCCAACTGGTTCTTCCTTCTGCGGCTTCACTTTAGTTAAGCCGCATGGGCAATGGGTGGGAGTAGTTAATGTCAACAAACTCCTTCAGAGTCTTAAAACACCCACGCGCAGGCTGCCAGACCTTGAATCCCTGTGGGGCAAGCTCGTGTCGCTGAAGATTATGTGCTATCACAGTGACCCTGAGGCTGTGTCCTACCTTTCCAACCAGATAAGGCGTGTTGAAGAATACGCTCGTGCTGAAGGGATTGAACTTCCTGAAGTCGGGCCCGACTTCTACAGAAAAATCTGGTGAGCGGAGGACCAAAATAACTATGGCTGGCGGTGCCACCGCACCTGCGGGCGCTAAGCCCAAGCAACCTAAACAGAAGCAGAAAAAACCATCTTCACAGGCAAGAAAGAAGCCTTCCCAAAAACAGAAGGCAATGAAACCAGTCAAACAGGAGTTGAGGAAGGTTGAAAAGCAAGTGAGAGTCCTCAAGGCGCGTACAAACGGACCTAAAGTCAATGACACAATGAAGACCACCGTAACAGTGGGCACTCTTGTTGGACAAACACAAAGTGGATTAAATCGCCAACTCAGGGTCTCTTTTAACCCACTTCTTATGAAGTCGACAGAAGGCGGTAGCACTACTCCACTCTCCATTCGTGCCTCAATGTACGAGATGTGGAAACCACTGAGTGTGGAAATTTTTGCCACGCCACTTAGTGGCTTCTCTAGCGTGGTAGGCTCAGTTGGTTTTA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| 8,716 |
OR571426.1
|
Chicken astrovirus
|
Bi,X.
|
College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University
|
China
|
2023-10-22
|
SDAU2022-3
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,331 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2023
| null | null |
Chicken astrovirus isolate SDAU2022-3, complete genome
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| 11,790 |
OR286521.1
|
Chicken astrovirus
|
Bi,X.
|
College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University
|
China
|
2023-10-18
|
SDAU2022-2
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,331 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2022
| null | null |
Chicken astrovirus isolate SDAU2022-2, complete genome
|
CCGAAAGCGAGGGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGCGGGGGCTTTTTCAGCTTACAGGCGAGAAGACCGTAAGTCAGCCCAAGTAACAACTGGGCTTGACAAGGTCTTCTCGTTCCAGGGTGTGCACGAGCTTTTTGTGAGAATGCGTGCGCTGTATGGAACAACCGCAGCATGGAAAGCCCTGATGGATTGTGAAGCTGTGTACATTAAAGATGTAAAAACGGCTTTTGGCGCGAATGGTTCCCAAATTGGTTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCAGATGCTGGGATTGCTATACTGACTGAAGGTGAAAAAACTTGCCTTGCAGCACAGCAGGCAAGGGATTTGCGCCTGAAAGCGTCATTAAGCACAAACAGCTCTCTAGTCCACCAAATTATGGAAAAAACAAGAGAGGCCAAGGAGAAAACGAAACAACTCGAAGAACTTCAACAACGGATTGACAACATGGTGGACACCAACAAAGTTCTCTATCAACGTATGGAACAGCGGCACCAGGAAAAATTGGAAACTCTTGGTGAGAAGATTAGCAAACTTAGGCATGATAATCATCAGTGGTTCATGACTTGTGAGAAAAAGGATGAGGAAATAGCAAGACTTAAACAGCAACTTGAAACCAAAAAGAATGGCTATAAGAAAATGGCCTGGGATGCAGTTGCCTGGTGTGTGTTAGCTATCCTCTTGTTTAGCTTTTTCTCGGTGAGTGAAGGTGCTACACCGAATGGAACCCTGCCAATTAAGGAAGTTAGTTGGAACTTTGATGATGTGGAAAAGACGTGCATGAAACCTGACTTTGGTTGTCTGGTTATGGACACATGGTTGCCGCATCCCGTCTTAACATTTGAGGACCTAATGTCTAAGTGCTACAACACTCATGGGAATGTCATACCTCGTAGTGCTTTAAATAGTGAACAACTCTTGTATGACTGCACAAAAACGGCACATTATTTTAATGATGGGCATGATTACATTGAGAACTATCACTGGTGTGAGAAGAGGCTGGCAACCCTGGTGGCAGCAAACTGTCAAGGAGATAATGGTGTTGACAAGATCTACACGCAAGTTGTTGAGGCTGTGGCAGCAAGTAGGAAATTCTTCCAGAAGATGGCACTTTACAAACTTGATGTATGGATACTAGCCATTTTTAGTATTGTGCTAGCGGGAAATAAGGAAAAAATAGTTAAATTGACCCCCTTTATAGCATTGGGGTGGTGGTTCAATTTACCTATATTCCTATTGAGTACCGCTGTTAATTTCTTTCCTACAATGGCCTTGCCATTTGTTGCACTCCAAATTCTCCAACCAGGGTTCCTAGTTGTAACAGCATTTACCTTGTGGTTGACATTAACACTTGCTGCTTTCTTTTGGAACGATGGAATAGCCATTTTGGTTGAGACATCATTTGCCTTGTTTTACACAATCTTGTTTTTTGTCTGGTCAATGGCGATGACAGTCTGCGTCAGTTTACAGCTGAGTTTAGCTTACCAAATACTCTTATTTTGTGTTTCGCTTAGTGTATATTGCGGAACGAAATTTGCATGTAGTCAGGTTGTTATAACAAATCCTGATGGAACAACAGAAAAAATTTCAAGAGTAGGTAAGGCTAGGAAAGCGGCTTTTCAGCAGTGTAAGGGTGTGTTAACCTTCCTACAAACAAGGGGAATTATACCTTCTAGCCCTGTTAAAATTAATAGTGTAGTTGTGATTACAGGTAAGAATGGTGCACGCACTGGCTTTATGTTTATGAATTACATCGTTACAGCAGGCCATGTTGTTAATGGCAGTGAGTGGGCAACGGCGAAATTTGGTGACGTTTCTGTCAAGATTAAAAAGGAGAGGGAAATTGATATGTGTGAATGTCCTGACACACTTGTTCTTTTTAAGTTACCAAAGGAGCTGCAGGGAGTTAAACCATTGAGATTGGCGCAGAATGTGAAATCAAATTATATGACACTACATGGCTTTTGCCCTAATTTTGTTAATCCGGTTAGCTTTACAGGTTGGTGTACCATTGATGGGCCTTGGTTAAATAATGCCTTTAATACAACTTTTGGTAATAGTGGTGCACTTTATTGTGATCCCGATGGGAAGCTCGTTGGAATTCATCTMGGTACTCAAGGAGTAACTTCACAAGGTTTTGTTATAAGTGATGTCCTTAGGAAGCAGTTTGAAACACATTATCAGTGTTCGTGTAGGAAAGAGGAAAGTGACCAACAACCTACACCTGCGCCGCCCGCACAGTTTGATTATGAAGAATTCTTGTCCAAAGTTATAACAGGAACAAAAATTTCTCATCAAGCCATATTAAAACAACAAGAAGAAATGTTGGAGCAAATTCAGCTTGTAACAAAGATTCTTCAGGAAAATGGCTTGTTAGTAGAACAAAAGAAGAAAGGGAAAACTAAGAGAACTGCTCGTGGCGCTAAGGCTACAATGACAAAGAAATACCTTTCTAAAGGGCATTTTATGAAAATGAAAATGCTAAGTGAGGAGGAGTACCAAAAATTAGTGGATGAGGGCTTCACTGCTGATGAGATCAAAGAAGTTGTCAATAATCTTCGGGAACAAGCCTGGCTTGAGTATTGTATTGACAATGATATTGATGATGAAGGAGCAGAGGATTGGTACGACCAGATGCTAAATGATGAGGCCATTAATGACCAAATTGATAGGGAAATTGAAGCAAAGATGGAAGATGAAGGCTTCTACCAATCAAAAGCTCGAGAAACTTTGGCATCACAGTGCAGAAATAAAAAACGTAAAACTTTTGTTGAACAAGCTCTTCTGCACATTATAGATCTGAAACCTCACAAGGTTAGGACAGTCAAGGTTGAGGTTCAGGATGAGAGTGCCAATCAGTTGAGAAAGGTCTTTAAAAGAATGGTTAAGGATGAGGAAGTAGAACAGGGACAAACAAAGGCCTTCTTTTCCTCAGGTGATGATATAGAATATTTTGAAAACCGTGGTATTGCATTCCGAATAAAAGTAGAAATGAGAAAATTACAGGATGAGGTTAAATTTGAGACCATTACACGCAATGGCATAACTCAGATTTCCACTGGTGAGGACAATAAGAAAAATATCCTCAAAGAAAAGGTTACTAATATACCACCACCGTTATCACCAGTTCCACCTTTTACAGAAACCACTCCGGACACTAAGCCAAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAGCAGAGGAAGAGGGTTTGTAGGTCATGTGGAAGTGACAAGCCCCATAACTTTGCCCTGTGTAAGAAAAAGAACGAACTTTTGTTCTGTGTCTGGTGTGGTGTGATGCATTCTGAGAATCAGGGCCATTCGCGGAAAATTGAATGTCCAAAATGTAATAAAACATTCCCTGGGATAGAGGGTCTTGAACGCCATGCAAGTGAATGTCCTTCAAAAAACTAGTAGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCAACTATGAACCTGTCCCTGATAACTTAAAAATTTTTTCTTGGGAAAATGATTTGTTACCCCCAATTGGAAAAGAAGCTCTGCCTGACAATGTTATACTTCTTGGCCATATTCCTGTTGATAAATTGGTTTCTAGAACAAAGAAGGTCACCGACCCACTACTTGGTGTCATTACGTCCTGGAAACAGGATGAGTATGATAGTACTACATGGACAGTGAAGGCGTATACAAAGATGTTTGAAAAATTCTTTTATAAAGAGCCATCTGATTTTGTGAATAATGAGCCAGAAATGACCATCCTTTGTGACAGAGTGGTGCTTGATGAGCACGATTATATGGCTAATAGCTCTATGACGCCTATTACTGCGACTGTAAAAAATGTAGACTCAACACCAGCCTACCCAAAATTCCAGGAATTTGACACCGAGGAAGAATATCTTATTCGTTGTGGATGGAGTGAATATCTTGATGTCATCAAGGATAAAGAAACCCTCAATCATAGGCCATTATGGTGGTGCTTCCTCAAAAATGAAGTTCTCAAGAAAAAGAAAATTCAAGAAAATGATATTAGGATGATCTTATGTACAGATCCAGTGTTTACTCGGATTGGTGCGATGTTTGATCAAGATCAGAACTCAAAAATGAAAAATATGACAGAGACGAGGGCTGCACAAGTAGGCTGGACTCCCTTCTTTGGTGGACTTGATCAGCGAATGCGAAGGTTGGAGAAGATAAAAAACGCTCAGTTTGTTGAGATGGATTGGACCCGCTTTGATGGCACCATTCCTAAAGCGCTCTTCTGGCGAATCCGGCAGATAAGATTCTTTTTCCTTGCACCCCGGTATAAAACCGAGGATAACAAGGAGTTGTTTGATTGGTATACAAAAAATCTGCTGGAGAAAATTATTTTGTTACCAACCGGAGAGGTGTGCCAAGTTAAGAGAGGGAATCCTTCTGGGCAATTCTCCACAACAGTTGACAACAACATGTGCAATGTGTGGTTAACTACCTTTGAAATTGCATGGCTCCACCGTAAGCAAAAAGGTAAACTACCCACCCCTATTGAGTTGAGTAAAAATCTTAAATACATCTGTTACGGTGATGACAGGCTCCTGGCAGTCTCTAAAGACTTTGTCAAATATGAGCCTGATTCCGTGGTTAAGATGTATGCAGATGTGTTTGGGATGTGGGTGAAACCTGAAAATGTGAAGGTCAGAGACAGCCTAGTAGGTCTCTCGTTCTGTGGGATGACAATTATTAAAAACTCAAGCAACCGCTATGTTGGCGTTCCTAATGTGAATAAAATTCTTTCTACGCTTAGCACTCCTACGAAAAGGCTTCCAAATATCGAGGCCTTGTGGGGAAAACTTATTTCACTGCGGATTCTGTGTGAGAATGCTGATCCCGACGTTAGGGATTATTTAGATAAACAGATCCACTGCGTCGAGGAGTATGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAATAG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OR286522.1
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Chicken astrovirus
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Bi,X.
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College of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Agricultural University
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China
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SDAU2022-1
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Chicken astrovirus
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Avastrovirus
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Astroviridae
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GenBank
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China
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China
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Gallus gallus
| null |
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Chicken astrovirus isolate SDAU2022-1, complete genome
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| 11,856 |
OR545548.1
|
Chicken astrovirus
|
Qian,K., Qian,H., Qin,A.
|
Yangzhou University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-10-17
|
AAstV/Chicken/CHN/2022/SQ2201
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,542 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2022
| null | null |
Chicken astrovirus isolate AAstV/Chicken/CHN/2022/SQ2201, complete genome
|
GGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGGTGGAGCTTTTGCAAGCCTTAACAAGCGTGAGGACCGTAAGTCGGCCCAAATGGCAACTGGGCTCGACAAGGTTTTCTCGTTCCAAGGGGTTCACGACCTATTTGATAGGATGCGTGTCCTCTATGGTTCAACACCAGCTTGGAAAGCTCTAATGAGTAGCGAGGCTGTGTACATCAAAGATGTTAAAACGGCTTTCGGTGCTAATGGAACCCAGATTGGCTTCTTCTTTGCGGAGACACCCACCACTCCAACTTGGTCTCCTAATGCTGGAGATGCCATTTTAACCGCAGGAGAAAAAACCTGCCTCGCAGCACAGCAAGCGAGGGAGGTGAGGTTGAAGGCTTCTCTCAGCACAAACAGTTCCCTAGTCCACCAAATTATGGAAAAGACAAGGGAGGCCAAGGATAAAACAAAACAACTTGAGGAATTACAACATAAGATTGACAGCATGGTGGACACTAACAAAATCCTGTACCAGCGTATGGAACAACGTCACCAGGAGAAATTGGAAATTCTCGGAGAGAAGATAAGTAAGCTTAGGTATGACAATCACCAGTGGTTTATGACCGTTGAGAAGAAGGATGAGGAAATCTCCACCTTGAAACGACAGTTGGAAAACAAAAAGGGTACGTGTAGAAGGATCTTTTGGGATACTTTGACCTGGATTATTCTGGCTGTCCTCCTTTTCGGTTTCTTTTCTGTGAGTGAAGGTGCTACCCCAAACGGGACTCTGACCATTAAGGAAAAGACCTGGAGTTTCGAGGATGTGGAGAAAACGTGTATGAAACCTGACTTTGGTTGCCTAGTCATGGACACATGGTTACCTCATCCGGCTATGGACTTTGAAGATCTTATGTCTAAATGCTACAACACTCACGGGAACGTTATACCACGTAGCGCCTTTAATAGTGAACAGCTCTTATATGATTGCACCAAGACAGCACATTATTTCAATGATGGGCATGATTACATTGAAAATTATAAATGGTGCGAAAAAAGGATGGCTACGTTGGTGGCGGCTGATTGCCATGGAGACACTGGTATTGACAAGGTGTACACCCAAGTGGTTGAGGCAATAGCATCTAGTAGAAAATTCTTTAACAAGCTGGCAATTTACAAATTGGACGTCTGGATACTAGCGATTTTCAGTATCGTCCTAGCCGGTAATAAAGAAAAGATGATAAAATTGCTTCCTTTTATAGCACTTGGTTGGTGGTTCAACTTGCCTATTTTCTTGTTATCAACAGCAGTTAACTTCTTTCCGACAATTGCATTGCCATTCATAGCTTTCCAAGTTATACAGCCTGGTTTTCTTGTGATAACGGCTTTCACTTTGTGGCTAACGCTAACTCTAGTGGCCTTCTTTTGGCACGATGGCCTGACTATCTTAATGGAGGCGTCATTTGCTATTGTTTACACTTTTTTCTTCTTTGCGTGGTCAGTATCTATGACAGTGTGTGCAAGCCTTCAGATGAGCTTAACATATCAGATATTGCTCTTCTGTGTTTCACTTAGTATTTACTGTGGAACTAAGTTTGCTTGCAGCCAAGTCATTATAACAAATCCTGACGGAACTACAGAGAAGATAACTCGTGTTGGGAAAGTTAAGAAAGCAGCTTTCCAACAGTGTAAGAGGGGCCTGACGTACCTCCAGACTAGGGGAATTATACCTTCTAGTCCAGTTAAAATAAATAGCGTGGTTGTTATTACAGGTAAAAATGGTGTTGGTACGGGCTTTAGATTCATGAACTATATTGTTACAGCAGGTCATGTTGTGGCTGGTAGTGACTGGGCAACAGCTAAGTTTGGAGATACAGTAGTTAAGATCAAAAAAGAGAGGGAGATTGATATGTGTGAATGTCCTGATACCTTAGTGCTGTTCAAATTACCAAAGGAGCTTCAGGGGGTGAAACCGCTTAAACTCACACAAAACGTAAAGTCCAATTACATGACTTTGCATGGGTTTTGCCCCAACTTTGTTAACTCCGTGAGCTTTACTGGTTGGTGCACTGTAGATGGGCCCTGGCTTAACAATGCTTTCAACACCACTTTCGGTAATAGCGGGGCACCTTACTGTGACCCTGATGGAAAGTTGGTAGGAATTCATTTAGGAACCCAGGGTGTTACATCACAGGGATTCGTCGTGAGTGACGTCCTGAGAAAACAGTTTGAACCTCAGTATCAATGCTCATGCAAACAGCAGGAGATGGACCAAACCCCTACTCCAATGCCTCCAGCCCAATTTGACTATGAGGAGTTTTTATCCAGGGTCATTACTGGAACTAAAATATCTCACCAAGCTATCTTAAAACAACAAGAGGAGATGTTAGAGCAAATCCAAATTGTAACAAAGATCTTGCAGGACAATGGTCTACTAGCCGAACAGAAAAAGAAGGGCAAAACTAAAAGAACAGCCCGTGGGGCAAAGGCAGTTATGACCAAGAAGTACTTGTCAAAAGGGCATTTTATGAAAATGAAAATGTTAAGTGAAGAAGAGTACCAAAAATTGGTGGATGAAGGCTTTACTGCTGATGAGATCAAAGAAGTTGTGAACAATCTTCGGGAACAGGCATGGCTTGAGTACTGCATTGATAATGATATAGATGATGAAGGGGCAGAGGATTGGTATGACCAAATGCTTAATGATGAAGAGATCAATGATCAGATTGATAGAGAGATTGAAGCTAAAATGGAAGAGGAAGGATTTTACCAGTCCAAGGCAAGAGAAACTTTAGCTTCACAGTGTAGGGACAAGAAGCGAAAGACCTTTGTTGAACAAGCCTTGCTCCATATCATTGATATCAAGCCCCATAAAGTTAGAACTGTTAAGGTTGAAGTCCAGGATAAGAGTGCTAACCAATTGAAAAAGGTTTTCAAAAAGATGGTCAAAGACGAAGAGGTTGAACAAGGGCAAACAAAAGCCTTTTTCTCTTCGGGTGATGACATTGAGTATTTTGAGAACCGTGACATCGATTGGAAGAAATTAGAGATGCCAAAATTACAAGATGAAGTCAAGTTTGAGACCATAACGCGGAATGGAATTACGCAGATCTCTACTGGAGAAGATAATAAGAAGAACATCCTGAAAGAGAAAGTCACTAACATACCACAACCTCTGAATCCAGTTCCTCCCTTTGTTGAAGGGGGTGGTGATGTTAGACCCAAAAAGGAACAGGTGCTTGAACAGAGGAAAAGAGTGTGTAGATCGTGTGGAAGTGACAAGTCTCATAACTTTGCTGCGTGCAAGAAAAAGAACGAGCAACTTTTCTGCGTGTGGTGTGGCATCATGCACTCTGAAAATCAAGGACATGCTAGGAAGATAGAGTGCCCCAAATGTGGTAAGGGTTTCCCTGGGGTTCAAGGGCTTGAGCGTCATGCATTAGAATGCCAGTCAAAAAACTAGAAGAGGGCCCAGTTGATACTGGGCCCTTATTCGAACCAGTACCCGAACACCTAAAAATTTTTTCTTGGGAAAAAGATCTTCTTCCACCAATTGGCAAAGAAGCACTACCTGATAATGTCACACTTTTGGGCCATATACCAGTGGACAAACTTGTCTCAAGGACTAAAAAGGTTAATGATCCACTGTTAGGTATTATAACTGGATGGCAACAAGATGAGTATGATAGCACTACATGGACCGTCAAGGCGTACACAAAAATGTTTGAGAAGTTCTTCTATCGAGAACCTTCCGACTTTGTTAATGATGAGCCTGAGTTAACCATGCTGAGTGATAGAATTGTACTCGAAGAGCATGATTACATGGCTAATAGTGTTGTAACGCCTATTACAGCGACAGTCAAAAATGTAGAATCCACACCAGCATACCCCAAATTCCAAGAATATGGTACAGAAGAGGAGTACCTTGCTTGTTGTGGTTGGGGTGAATATCTTGATGTCATAAAAAATAAAGATACATTAAATCATAGGCCCTTATGGTGGTGTTTTCTCAAAAATGAAGTATTGAAAAAGAAGAAAATACAGGATAATGACATTCGAATGATATTGTGCACAGATCCTGTCTTCACTAGAATTGGTGCCATGTTCGATCAGGACCAGAATTCAAGAATGAAAAATATGACAGAAAAGAGAGCAGCACAAGTTGGTTGGACTCCCTTTTTTGGGGGTATAGACCAAAGAATGAGGCGGTTAGAGAAAGTTAAAAATGCCCAGTTTATTGAAATGGATTGGACTCGATTTGATGGAACAATCCCAAAACCCTTGTTCTGGCGCATCAGGCAGATTCGCTTCTTTCTTCTAGCCTCGAAGTATAAGACGCCTGAAAACAAGGAATTGTTTGATTGGTACACTAAAAATCTCCTAGAGAAGGTGATATTGTTACCTACTGGAGAAGTGTGCCAAATAAAACGGGGCAATCCATCCGGGCAGTTCTCTACTACCGTGGATAACAACATGTGCAATGTCTGGTTAACCACATTCGAAATTGCATGGCTTCACCGCAAGCAGCATGGTAGGTTGCCAACTCCAGCTGAACTTCGTGAAAACGTTTGCTACATTTGTTATGGTGATGATAGGCTCTTGTCAGTTTCAAGAGACTTTGTTATCTATGAGCCTGATACCATAGTAGCAATGTATGCTGATGTATTTGGCATGTGGGTGAAACCAGAGAATGTGAAAGTGAAGAGCACTCTTAGCGGCCTCTCTTTCTGTGGCATGACGATCACAAAAAATGAACATGGTCGTTATATCGGAATTCCGAACGTCAATAAAATCTTATCTACTTTGAGGTCTCCTACAAAGCGCCTCCCTAATATCGAGGCACTCTGGGGTAAGTTAATATCATTGAGAATTCTGTGTGAAAATGCAGATCCCGACGTAAAGGACTACTTGGATAAGCAGATTAATTGCGTCGAGGAGTATGCCGCTGCTGAGGAAATACAATTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAATAGAGCAGCATGGC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| 12,007 |
OR351273.1
|
Chicken astrovirus
|
Yin,L., Yu,S.
|
Wen's Foodstuffs Group Co, Ltd, Wen's Group Academy
|
China
|
2023-09-27
|
JS202103
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,507 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2021
| null | null |
Chicken astrovirus isolate JS202103, complete genome
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| 12,689 |
OQ685946.1
|
Chicken astrovirus
|
Kariithi,H.M., Volkening,J.D., Chiwanga,G.H., Pantin-Jackwood,M.J., Msoffe,P.L.M., Suarez,D.L.
|
United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service (USDA-ARS), Exotic and Emerging Avian Viral Disease Research Unit, Southeast Poultry Research Laboratory, United States National Poultry Research Center
|
USA
|
2023-04-12
|
CAstV/ck/TZ/Iringa/2151-IM162/2019
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,337 |
GenBank
| null |
Tanzania: Iringa (Miomboni)
|
Tanzania
|
Gallus gallus
|
feces
|
2019-04-11
|
SAMN33770568
|
PRJNA945007
|
MAG: Chicken astrovirus isolate CAstV/ck/TZ/Iringa/2151-IM162/2019, complete genome
|
GACCTCCACAATTCATCAGGGCTTGACAAGGTCTTCTCGTTCCAGGGCGTGCACGATCTTTTTGATAGAATGCGTGCGCTGTATGGAACAACTGCAGCGTGGAAAGCCCCGATGAATTGTGAAGCTGTATACATTAAGGATGTGAAGACGGCTTTTGGCGCGAATGGCACCCAAATTGGTTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCAAATGCTGGGGATGCTCTTCTAACCGCAGGTGAAAGAACCTGCCTTGCAGCACAGCAGGCAAGGGAAATGCGGTTGAAAGCTTCTTTGAGCACAAATAGCTCTTTAGTCCACCAGATTATGGAAAAAACAAGAGAGGCCAAGGAGAAAACCAAACAGCTTGAAGAACTTCAACAACGTATTGATAACATGGTGGACACTAATAAAGTTTTGTACCAACGTATGGAACAGCGGCATCAGGAGAAATTGGAAGTTCTTGGAGAAAAAATTAGTAAACTCAGGCATGATAATCATCAATGGTTTATGACTTGTGAGAAGAAGGATGAGGAGATAGCAAGCCTCAAGCGTCAACTTGAAGCTGGAAAGAATGGTTTCAAGAAAGTGGCTTGGGACGCAGTTGCTTGGATTTTGCTAGCTATTCTCTTATTTAGCTTCTTCTCTGTGAGTGAAGGTGCCAAACCAAATGGAACCTTGCCAATTAGAGAACTCAATTGGAATTTTGATGATGTGGAAAAAACTTGTATGAAGCCTGATTTTGGTTGCTTGGTTATGGATACCTGGTTACCGCACCCCGTGCTTACATTTGAAGATCTAATGTCCAAGTGCTACAACACCCATGGGAATGTCATACCCCGTAGTGCTTTCAATAGTGAACAACTCTTATATGATTGCACCAAGACAGCACATTATTTTAATGACAAGCATGATTACATTGAGAACTACCACTGGTGTGAGAAAAGACTAGCAACCCTGGTTGCAGCAAATTGTGAAGGGGATAATAGTGTTGATAAAATCTATACGCAAGTTGTTGAGGCCGTGGCGGCTAGTAGGAAATTTTTCCAGAAAATGGCTATTTATAAACTTGATGTGTGGATATTGGCCATCTTTAGTGTTGTACTAGCGGGAAATAAGGAGAAAATTGTTAAACTAATCCCATTTATAGCATTGGGGTGGTGGTTTAACTTGCCTATCTTCTTATTGAGTACCGCTGTCAATTTTTTTCCTACAATGGCCTTACCCTTTATTGCGTTCCAGATTCTTCAACCGGGGTTCTTGGTGGTGACAGCATTTACGCTGTGGCTAATGTTAACACTTGCTGCTTTCTTCTGGAATGATGGAATAGCAATTCTAATTGAAACATCTTTTGCTTTGTTTTACACGATACTCTTTTTCGTGTGGTCAATGGCAATGACAGTATGTGCTAGCCTACAGTTGAGTTTAACATACCAAATACTCTTATTTTGTGTTTCACTTAGTGTTTATTGCGGAACGAAATTTGCATGTAGTCAGGTTGTGGTAACAAATCCTGACGGTACCACAGAAAAAGTTTCTAGAGTAGGTAAGGCCAGGAAGGCAGCTTTCCAGCAGTGCAAGGGTGTGATAACTTTCCTACAAACACGGGGAATTATACCATCAAGCCCTGTCAAAACCAATAGTGTGGTTGTTATTACAGGAAAGAATGGTGTAGGCACTGGATTCAGGTTTATGAATTATATTGTTACAGCAGGTCATGTTGTCAATGGTAGTGAATGGGCAACAGCTAAATTTGGTGATGTCTCAGTTAAAATTAAAAAGGAAAAGGAAATTGACATGTGTGAGTGTCCTGACACTCTTGTCCTTTTTAAGTTGCCAAAGGAACTGCAGGGTGTTAAACCATTGAGGTTAGCCCAAAATATAAAATCAAATTATATGACATTGCATGGTTTTTGCCCAAATTTTGTTAACCCTGTTAGTTTTACAGGCTGGTGCACTATTGATGGGCCTTGGCTAAATAATGCTTTTAATACAACTTTTGGCAATAGTGGTGCTCCCTACTGTGACCCCGATGGGAAGCTTGTTGGTGTCCATCTAGGAACCCAAGGGGTAACTTCACAAGGGTTCGTTATATGTGATGCCCTTAGAAAACAATTTGAAACACATTATCAGTGCTCGTGCAGGAGAGAGGAGTGTGATCAACAACCTGCACCGGTGCCACTCGCACAGTTCGACTACGAAGAGTTCTTGTCTAAAGTTATAACAGGAACAAAAATTTCCCACCAAGCCATCTTGAAACAACAGGAGGAAATGTTGGAGCAAATTCAGCTCGTAACAACAATTCTTAAGGACAATGGCTTATTAGCTGACCAGAAGAAGAAAGGGAAGACCAAAAGAACTGCTCGTGGTGCTAAAGCCACAATGACGAAGAAATACCTTTCTAAGGGGCATTTCATGAAAATGAAAATGTTAAGTGAAGAGGAATACCAAAAATTAGTGGATGAGGGGTTTACTGCTGATGAGATCAAAGAAGTTGTCAACAACCTTCGGGAGCAAGCCTGGCTTGAGTATTGCATTGATAATGACATAGATGATGAAGGAGCAGAAGATTGGTATGACCAGATGTTAAATGATGAGGCGATTAATGATCAAATTGATAGGGAAATTGAAGCAAAAATGGAAGATGAAGGGTTCTACCAATTAAAAGCCCGAGAAACTTTAGCATCACAATGTCGAAATAAAAAACGTAAAACTTTCGTTGAGCAGGCCCTTTTGCATATTATAGATCTTAAGCCTCATAAAGTTAGAACAGTTAAGGTTGAGGTTCAGGATGAGAGTGCCAACCAACTTAAAAAGGTCTTTAAGAGAATGGTCAAAGATGAGGAGGTCGAACAGGGACAAACAAAGGCCTTCTTTTCCTCAGGTGATGATATAGAATATTTTGAAAATCGTGATATTGATTGGAAAAAATTGGAAATGCCAAAATTACAGGATGAGGTTAAATTTGAGACCATCACACGCAATGGCATAACTCAAATTTCCACTGGTGAGGACAATAAGAAAAACATCCTCAAAGAAAAGGTTACAAATATACCACAACCGTTAACACCAGTTCCACCGTTTACGGAGAATGGTCCGGACACTAAGCCTAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAACAACGGAAGAGGGTTTGTAGATCATGTGGTAGCGACAAACCCCACAACTTCGTTGTGTGTAAGAAGAAGAATGAACTCTTGTTCTGTGTCTGGTGTGGTATAGTTCACTCAGAGAATCAAGGCCACTCACGGAAAATTGAATGCCCTAAATGCAACAAAGCATTCTCTGGGATAGAGGGTCTTGAACGCCATGCGAGTGAATGCCCTCCAAAAAACTAGTGGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCGATTATGAACCTGTCCCCGATCATTTGAGGATTTTTTCTTGGGAAGATGATTTGTTACCCCCAATTAGAAAAGAAGCTTTACCTGAAAATGTTATACTTCTTGGCCATATTCCGGTTGATAAATTGGTTTCTAGAACAAAGAAGGTGACTGATCCACTACTTGGAGTTATCACTTCCTGGAAACAGGATGAATATGATAGTACCACATGGACTGTTAAGGCGTACACTAAAATGTTTGATAAATTTTTTTATAAAGAACCGTCAGATTTTGTGAACAATGAGCCAGAGCTCACCATCCTATGTGACAGGGTGGTGCTTGATGAACACGACTATATGTCGAATAGTTCTGTAACGCCTATTACAGCGACTATTAAAAATGTGGATTCAACACCTGCTTATCCAAAATTCCAGGAGTTTGATACCGAAGAAGACTATCTCACTCGTTGTGGATGGAGTGAATACCTCGATGTTATTAAGGACAAAGAAACTCTAAACCATAGGCCATTATGGTGGTGCTTCCTTAAAAATGAAGTTCTCAAGAAAAAGAAAATTCAAGATAATGATATCAGGATGATTTTATGTACAGATCCAGTTTTCACACGAATTGGAGCAATGTTTGACCAGGACCAAAATTTAAAAATGAAAAACATGACAGAAACGAGAGCTGCGCAAGTGGGCTGGACTCCCTTCTTTGGTGGACTTGACCAGCGAATGCGGAGGTTGGAGAAGATTGAAAATGCCCAGTTTGTAGAGATGGATTGGACCCGCTTTGATGGCACTATTCCAAAAGCGCTTTTTTGGCGCATTCGACAGATTAGATTCTTCTTCCTAGCGCCCCGGTATAAAACCGCGGCTAACAAGGAATTGTTTGATTGGTACACTAAAAATTTGTTGGAGAAAGTGATTCTCTTGCCAACTGGAGAAGTGTGTCAGATAAAAAGGGGCAATCCTTCTGGACAATTTTCTACCACAGTTGATAATAATATGTGTAATGTGTGGTTAACCACCTTTGAAATAGCATGGCTCCACCGTAAACAGAAGGGTAGACTCCCCACTCCCACTGAGTTGAGGAAAAATCTTAAGTATATTTGCTATGGTGATGACAGGCTCTTGGCAGTTTCAAAGGACTTTGTAGCCTACGAGCCTGATACTGTTGTTAAGATGTATGCAGATGTTTTTGGGATGTGGGTGAAACCAGAAAATGTGAAAGTCAGAGACAGCCTTGTTGGTCTCTCGTTCTGTGGGATGACAATTATTAAAAATTCAGGTAACCGTTATGTAGGGGTTCCCAATGTAAATAAGATTCTTTCTACTCTTAGTACTCCTACAAAAAGGCTTCCAAATATCGAGGCCTTGTGGGGGAAATTGATCTCACTGCGGATTCTTTGTGAGAATGCTGATCCCGACGTTAGGGATTACTTAGATAAGCAGATTCACTGCGTCGAGGAGTATGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAATTATAGCAGCATGGCCGAGAAGGCTGTGGTGGTTAAGAAAACCACGCTTCAAAGAACACGTAGACCGCGGCAGCGATCTGCT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| 16,710 |
OP169001.1
|
Chicken astrovirus
|
Qian,K., Song,R., Qin,A., Shao,H.
|
Yangzhou University, College of Veterinary
|
China
|
2023-04-03
|
AAstV/Chicken/CHN/2021/HA2101
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,632 |
GenBank
| null |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2021
| null | null |
Chicken astrovirus isolate AAstV/Chicken/CHN/2021/HA2101, complete genome
|
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| 16,954 |
MW846319.1
|
Chicken astrovirus
|
Yin,L., Zhou,Q., Mai,K., Huang,J., Yan,Z., Wei,X., Shen,H., Li,Q., Chen,L.
|
Wen' s Foodstuffs Group Co, Ltd, Wen' s Group Academy
|
China
|
2021-08-24
|
CAstV/Chicken/CHN/2020/GD202013
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,520 |
GenBank
| 1 |
China
|
China
|
Gallus gallus
| null |
2020
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/Chicken/CHN/2020/GD202013, complete genome
|
CCGAAAGCGAGGGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGCGGGGGCTTTTTCAAGCCTTAACAGGCGAGAAGACCGTAAGTCGGCCCAAGTAACAGCTGGGCTTGACAAGGTCTTCTCGTTCCAAGGCGTGCACGAACTTTTTGTAAGAATGCGTGCGCTGTATGGAGAAACTACAGCATGGAAAGCCCTGATGAATTGTGAAGCTGTATATATTAAAGATGTAAAAACGGCTTTTGGCGCGAATGGCACCCAAATTGGCTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCGGATGCTGGGATTGCTATATTGACTGAAGGTGAAAAGACATGCCTTGCAGCACAGCAGGCAAGGGACTTGCGCCTGAAAGCTTCATTACGCACAAACAGCTCCCTAGTCCACCAGATTATGGAAAAGACAAGAGAGGCCAAGGACAAAACGAAACAACTTGAAGAACTTCAACAACGGATTGACAACATGGTGGACACTAATAAAGTTCTTTACCAACGTATGGAACAGCGGAACCAGGAAAAATTGGAAGCTCTTGGTGAGAAAATTAGTAAACTTAGGCATGATAATCATCAGTGGTTCATGACTTGTGAGAAAAAGGATGAGGAAATAGCAAAACTTAAACAGCAACTTGAAAATAAAAAGAATGGCTATAAAAAAATGGCCTGGGATGCAGTTGCTTGGTGTGTGTTAGCTATCCTTTTGTTTAGCTTTTTCTCGGTAAGTGAAGGTGCTACACCAAATGGAACTCTACCAATTAAGGAAGTCAGCTGGAACTTTGATGATGTGGAAAAAACGTGTGTGAAACCTGATTTTGGTTGTCTGGTTATGGACACATGGTTGCCACATCCCACCTTGACATTTGAGGACTTAATGTCTAAGTGCTATAATACTCATGGGAATGTCATACCTCGTAGTGCTTTTAATAGTGAACAACTTTTGTATGATTGTACGAAAACAGCTCATTATTTTAATGATGGTCACGATTACATTGAGAACTATCATTGGTGTGAGAAGAGACTGGCAACCCTGGTGGCAGCAAACTGCCAAGGAGATAATGGGTTTGACAAGATCTACACGCAGGTTGTTGAGGCTGTGGCAGCAAGTAGGAAATTCTTTCAGAAAATGGCACTTTACAAACTTGATGTATGGATACTAGCTATTTTTAGTATTGTACTAGCGGGAAATAAGGAAAAAATAATGAAATTGACCCCTTTTATAGCGTTAGGGTGGTGGTTCAATTTGCCCATATTCCTATTGAGTACCGCTGTCAATTTCTTTCCTACAATGGCCCTACCCTTCATTGCGTTTCAGATTCTCCAACCAGGGTTCCTGGTAGTAACAGCCTTTACACTATGGTTGACATTGACACTTGCTGCTTTCTTTTGGAATGATGGAATAGCCATTTTGGTTGAGACATCATTTGCTTTGTTTTACACGATTTTGTTCTTTGCTTGGTCAATGGCAATGACAGTTTGCGCCAGCTTACAATTAAGTTTGGCGTACCAGATTCTCTTATTTTGTGTCTCGCTTAGTGTATACTGTGGAACAAAATTCGCCTGTAGTCAGGTTGTTGTGACAAATCCTGATGGTACAACTGAAAAAATATCCAGAGTAGGTAAGGCTAGGAAGGCGGCTTTCCAACAGTGTAAGGGTGTATTAACCTTTTTGCAAACAAGGGGAATTATACCATCCAGCCCTGTTAAAATAAATAGTATAGTTGTAATTACAGGAAAGAATGGTGCAGGTACTGGATTTAGGTTCATGAATTATATTGTTACAGCAGGCCATGTTGTTACTGGAAGTGAATGGGCAACAGCAAAATTTGGTGATGTTTCGGTAAAGATTAAGAAGGAAAAAGAAATTGACATGTGTGAATGCCCTGATACAATTGTTCTTTTTAAACTACCGAAAGAACTGCAGGGAGTTAAACCATTGAGATTGGCTCAAAACGTAAAATCAAATTATATGACATTACATGGCTTTTGCCCTAATTTTGTTAATCCTGTTAGCTTCACTGGCTGGTGTACCGTTGACGGGCCTTGGTTAAATAATGCTTTTAATACAACATTTGGCAACAGTGGCGCACCTTACTGCGACCCCGATGGTAAGCTTATTGGCATCCATTTGGGAACCCAAGGGGTAACATCACAAGGCTTTGTTATAAGCGATGTTCTTAGGAAGCAGTTCGAAATGCATAACCAGTGTTCGTGTAGGAAGGAAGAAGGTATTCAACAATCCACACCGGCACCTCCTGCACAATTCGATTATGAAGAGTTCCTTTCTAAAGTTATAACAGGTACAAAGATTTCCCATCAAGCCATATTGAAACAACAAGAGGAAATGTTGGAGCAAATTCAGCTCGTAACAAAAATTCTTAAGGAAAATGGCTTGTTAGCTGAACAGAAAAAGAAAGGAAAAACCAAAAGAACTGCTCGTGGCGCTAAGGCTGTAATGACAAAGAAATATCTTTCTAAGGGACATTTTATGAAAATGAAAATGCTAAGTGAGGAAGAGTACCAAAAATTAGTGGACGAGGGCTTTACCGCTGATGAGATCAAAGAAGTTGTTAACAACCTTCGGGAGCAGGCCTGGCTCGAATACTGTATTGACAATGACATTGATGATGAAGGGGCAGAAGATTGGTATGACCAGATGCTAAACGACGAGGCGATTAACGACCAAATTGACAGGGAAATTGAAGCCAAAATGGAAGATGAAGGCTTCTACCAATCAAAAGCCCGAGAAACTTTGGCATCACAGTGTAGAGACAAAAAACGTAAAACCTTTGTCGAACAGGCCCTTCTGCATATTATAGATCTCAAGCCTCACAAAGTTAGGACAGTTAAGGTTGAAGTGCAGGATGAGAGTGCCAGTCAATTGAAAAAGGTCTTTAAAAGGATGGTTAAAGATGAGGAAGTTGAACAGGGACAAACAAAGGCCTTCTTTTCCTCAGGTGATGACATAGAATACTTTGAAAACCGTGATATCGATTGGAAAAAATTGGAAATGCCAAAACTTCAGGATGAGGTTAAATTTGAGACCATCACACGCAATGGCATAACCCAAATTTCCACTGGTGAGGATAATAAGAAAAACATCCTCAAAGAAAAGGTCACAAATATACCACAACCGTTGACACCAGTTCCACCGTTTACGGAGAATACCCCTGACGTTAAGCCTAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAACAACGGAAGAGGGTTTGTAGGTCATGTGGCAGTGACAAGCCCCATAATTTCGTTGTGTGCAAGAAAAAGAATGAGCTCTTGTTTTGTGTCTGGTGTGGTATAGTGCACTCTGAGAATCAGGGCCATTCACGGAAAATCGAATGCCCTAAGTGCAATAAAGTATTCTCTGGGATAGAAGGCCTTGAACGCCATGCGAGTGAATGCCCTTCAAAAAACTAGTGGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCAATTATGAACCTGTTCCCGATAATTTGAAAATTTTTTCTTGGGAAAATGACTTGATACCTCCAATTGGAAAAGAAGCTCTACCAGAAAATGTCATTCTTCTTGGTCATATTCCGGTTGATAAATTGGTTTCTAGAACAAAAAAGGTCTCTGATCCACTCTTGGGTGTTATTACATCATGGAAACAGGATGAGTATGACAGTACTACATGGACTGTAAAGGCGTACACGAAAATGTTTGAGAAATTCTTTTATAAAGAACCATCAGATTTCGTGAACAATGAGCCAGAGCTAACCATCTTATGTGACAGGGTGGTACTCGATGAACATGACTACATGGCTAACAGTTCCATGACGCCAATAACGGCGACTGTGAAAAATGTAGACTCAACACCTGCTTATCCAAAGTTTCAGGAATTTGATACTGAGGAAGAATATCTTACCCGTTGTGGATGGAGTGAATACCTTGATGTCATTAAAGATAAGGAGACCCTTAACCATAGACCATTATGGTGGTGCTTCCTTAAAAATGAAGTTCTCAAGAAAAGGAAAATTCAGGAAAATGATATTAGAATGATATTATGTACAGATCCAGTTTTCACTCGAATTGGCGCAATGTTTGACCAGGATCAAAATTCAAAAATGAAATCCATGACAGAAACGAGGGCTGCACAAGTGGGCTGGACTCCCTTCTTTGGTGGACTTGACCAGCGGATGCGAAGGTTGGAAAAAATTAAAAATGCCCAGTTTGTTGAGATGGATTGGACCCGTTTTGATGGCACCATTCCAAAAGCACTCTTCTGGCGTATTCGGCAGATTAGATTCTTCTTCTTGGCGCCCCGGTATAAGACCGAGGAGAACAAAGAGTTGTTTAACTGGTACACAAAAAATTTGCTAGAGAAGATCATTTTGCTTCCAACAGGAGAGGTGTGCCAAGTCAAAAGAGGGAATCCTTCTGGGCAATTCTCCACAACAGTTGACAACAATATGTACAATGTGTGGTTAACTACCTTTGAAATTGCATGGCTCCACCGTAAACAAAAAGGTAGATTGCCCACTCCCACTGAGTTGAGTAAAAATCTTAGGTACATCTGCTACGGCGATGACAGGCTCTTGGCAGTCTCTAAAGATTTTGTGACTTATGAGCCTGATTCCGTAGTCCAAATGTATGCAGATGTGTTTGGGATGTGGGTGAAACCCGAAAATGTGAAGGTCAGGGATAGCCTGGTTGGCCTCTCGTTCTGTGGTATGACAATTATTAAGAATTCAGGTAATCGCTATGTCGGCGTTCCCAATGTGAATAAAATTTTGTCTACACTCAGTACTCCTACAAAAAGGCTCCCAAATATTGAAGCTTTGTGGGGAAAATTAATCTCACTGCGGATCTTGTGTGAAAATGCTGATCCCGACGTTAGGGACTATTTAGATAAACAGATCCACTGCGTCGAGGAGTACGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAATAG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| 38,708 |
MT789774.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
|
University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/14-1235a/14
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,501 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2014-12-08
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/14-1235a/14, complete genome
|
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| 46,385 |
MT789775.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
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University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/14-1235b/14
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,501 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2014-12-08
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/14-1235b/14, complete genome
|
CCGAAAGCGAGGGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGTGGGGGCTTTTTCAAGCCTTAACAGGCGAGAAGACCGTAAGTCGGCCCAAGTAACAACTGGGCTTGACAAGGTCTTCTCGTTCCAGGGCGTGCACGAGCTTTTTGTAAGGATGCGTGCACTGTATGGAATGACTACAGCATGGAAAGCCCTGATGGATTGTGAAGCTGTGTACATCAAAGATGTGAAAACGGCTTTTGGCGCGAATGGTTCCCAAATTGGCTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCGGATGCTGGGATTGCTATACTGACTGAAGGTGAAAAAACTTGTCTTGCGGCACAACAGGCAAGGGATCTTCGCCTGAAAGCTTCATTAAGCACAAACAGCTCTCTAGTCCACCAGATCATGGAGAAAACAAGAGAGGCCAAGGAGAAAACGAAACAACTTGAAGAACTTCAACACCGGATTGATAACATGGTGGACACTAATAAGGTTCTTTACAAACGCATGGAACAGCGGCACCAAGAAAAATTGGAAGCTCTTGGTGAAAAAGTTAGTAAACTTAGGCATGATAATCATCAGTGGTTCATGACTTGTGAGAAAAAGGATGAGGAAATAGCAAAACTTAAACATCAACTTGAAGTCAAAAAGAATGGCTATAAAAAAATGGCCTGGGATGCAGTTGCTTGGCTTATGCTGGCCATCCTTTTGTTTAGTTTCTTTTCTGTGAGTGAGGGTGCCATACCGAATGGAACTCCACCAATCAAGGAAGTCAGTTGGAATTTTGATGATGTGGAAAAAACATGCATGAAACCTGACTTTGGCTGTTTGGTTATGGACACCTGGCTGCCACATCCTGTCTTAACGTTTGAGGACCTAATGTCTAAGTGCTACAATACCCACGGGAATGTTATACCTCGTAGTGCTTTTAATAGTGAACAACTCTTGTATGACTGCACAAAAACGGCACACTATTTTAATGATGGTCATGATTACATTGAGAACTATCACTGGTGTGAGAAGAGGTTAGCAACTCTGGTGGCAGCAAACTGTCAAGGAGATAATGGGGTTGATAAGATCTACACGCAAGTTGTTGAGGCTGTGGCAGCGAGTAGGAAATTCTTTCAGAAAATGGCACTTTACAAGCTTGATGTTTGGATACTAGCCATTTTTAGCATAGTACTAGCGGGAAATAAGGAAAAAATAGTGAAATTGACCCCTTTTATAGCGTTAGGGTGGTGGTTTAATTTACCTATATTTCTGTTGAGTACCGCTGTTAATTTCTTTCCTACAATGGCCTTGCCTTTTATTGCGGTTCAAATTCTCCAACCAGGGTTCTTGGTTGTGACAGCCTTTACATTGTGGTTGACATTGACACTTGTTGCTTTCTTCTGGAATGATGGTATAGCCATTTTGGTTGAGACATCATTTGCTTTGCTTTATACAATCTTATTCTTTGTCTGGTCAATGGCAATGACAGTTTGTGCCAGCTTACAGTTAAGCTTAGCGTACCAAATACTTTTATTTTGTGTTTCGCTTAGCGTGTATTGTGGAACAAAGTTTGCTTGTAGTCAGGTTGTGATAACAAATCCTGATGGCACAACTGAAAAAATTTCCAGGGTAGGAAAAGCTAGGAAAGCTGCTTTCCAGCAATGTAAGGGCATATTAACCTTCTTACAAACACGGGGAATTATACCATCTACCCCTGTTAAAACTAATAGTGTGGTTGTTATTACAGGAAAGAATGGTGTAGGTACTGGGTTTAGGTTTATGAATTATATTGTTACAGCAGGTCATGTTGTCAATGGTAGTGAATGGGCAACAGCGAAATTTGGTGATGTTTCAGTCAAAATTAAAAAGGAAAAGGAAATTGACATGTGTGAGTGCCCTGACACACTTGTCCTTTTTAAGTTGCCAAAGGAACTGCAGAGTGTTAAACCGTTGAGATTAGCCCAAAATATAAAATCAAATTATATGACATTGCATGGGTTTTGCCCAAATTTTGTTAACCCTGTTAGTTTTACAGGCTGGTGTACTATTGATGGGCCTTGGTTAAATAATGCTTTTAACACAACTTTTGGTAATAGTGGCGCTCCCTACTGCGACCCCGATGGGAAGCTTGTTGGCATCCATTTAGGAACTCAAGGGGTAACTTCACAAGGGTTTGTTATATGTGATACCCTTAGAAAGCAATTTGAGACACATTACCAGTGTTCGTGCAGAAGAGAGGAGTGTGATCAACAACAACCTGCACCAGCGCCACCCGCACAGTTCGATTACGAAGAGTTCTTGGCTAAAGTTATAACAGGAACAAAGATTTCCCATCAAGCCATTTTGAAACAACAAGAGGAAATGTTAGAGCAAATTCAGCTCGTAACAAAAATTCTTAAAGACAATGGCTTGCTAGTTGAACAGAAGAAGAAAGGGAAGACTAAAAGAACTGCTCGCGGTGCTAAGGCTACAATGACAAAGAAATACCTTTCTAAGGGACATTTCATGAAAATGAAAATGTTAAGTGAAGAAGAATACCAAAAATTGGTGGATGAGGGCTTCACTGCCGATGAGATCAAAGAAGTTGTTAACAACCTTCGGGAACAAGCCTGGCTTGAGTACTGCATTGACAATGATATTGATGATGAAGGAGCAGAAGATTGGTATGACCAGATGTTAAATGATGAGGCGGTTAATGATCAAATTGATAGGGAAATTGAAGCAAAAATGGAAGATGAAGGATTTTACCAATCGAAAGCCCGGGAAACTCTAGCATCACAATGTAGAAACAAAAAACGTAAAACCTTTGTTGAGCAGGCCCTTTTGCATATCATAGATCTTAAACCTCATAAAGTTAGGACGGTTAAGGTTGAGGTTCAGGATGAGAGTGCTAATCAACTTAAAAAGGTCTTTAAGAGAATGGTCAAAGACGAGGAGGTTGAGCAGGGGCAAACAAAGGCCTTCTTTTCTTCAGGTGATGATATAGAATATTTTGAAAATCGTGATATCGATTGGAAAAAATTGGAAATGCCAAAATTACAAGATGAGGTTAAATTTGAGACCATCACACGCAATGGCATAACTCAAATTTCTACTGGTGAGGATAATAAGAAGAATATCCTCAAAGAAAAGGTCACAAATATACCACAACCGTTGACACCAGTTCCACCCTTTACGGAGAATAATCCGGACATTAAGCCTAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAACAACGGAAAAGGGTTTGTAGGTCATGTGGTAGCGACAAACCCCACAATTTCGTTGTGTGTAAGAAAAAGAATGAGCTCCTGTTTTGTGTTTGGTGTGGTATAGTGCATTCTGAGAATCAAGGCCACTCACGGAAAATTGAATGCCCTAAATGCAACAAAGCATTTTCTGGGATAGAAGGCCTTGAACGCCATGCGAGTGAATGCCCTTCAAAAAACTAGTGGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCGATTATGAACCTGTCCCTGATTATTTGAAGATTTTTTCTTGGGAAGATGATTTGTTACCTCCAATTGGGAAAGAAGCTCTACCTGAAAATGTTATACTTCTTGGCCACATTCCGGTTGATAAGTTGGTTTCTAGAACAAAGAAAGTAACTGATCCACTGCTTGGAGTTATCACTTCCTGGAAACAGGATGAATATGATAGCACCACATGGACTGTTAAGGCGTACACTAAAATGTTTGAGAAATTTTTTTATAAAGAACCATCAGATTTTGTGAACAATGAGCCAGAGCTCACCATCCTATGTGATAGGGTGGTGCTTGATGAGCATGATTATATGGCGAATAGTTCTATGACGCCTATCACAGCGACTATTAAAAATGTGGACTCAACACCTGCTTATCCAAAATTCCAGGAGTTTGACACCGAGGAAGAATACCTTACCCGTTGTGGGTGGAGTGAATACCTCGATGTCATTAAGGATAAAGAAACTCTCAACCATAGGCCATTATGGTGGTGCTTCCTTAAAAATGAAGTTCTCAAGAAAAAGAAAATTCAGGAAAATGACATTAGGATGATTCTATGCACAGATCCAGTGTTTACCCGAATTGGAGCAATGTTTGACCAGGATCAAAATTCTAAGATGAAAAATATGACAGAAACGAGGGCTGCGCAAGTGGGCTGGACCCCCTTCTTTGGTGGACTTGATCAGCGAATGCGGAGGTTAGAGAAGATTGAAAACGCCCAGTTTGTGGAAATGGATTGGACCCGCTTTGATGGCACTATTCCAAAGGCGCTCTTTTGGCGCATCCGGCAGATTAGGTTCTTTTTCCTAGCGCCCCGGTATAAGACCGCGGCCAACAAGGAATTGTTTGATTGGTATACTAAAAATCTGCTGGAGAAAATAATTCTCTTACCAACTGGAGAAGTGTGTCAGATTAAAAGGGGGAATCCCTCTGGGCAGTTCTCCACCACAGTTGATAATAATATGTGCAATGTGTGGTTAACTACCTTTGAAATAGCATGGCTCCACCGTAAACAGAAGGGTAGACTCCCCACTCCCACTGAGTTGAGGACAAATCTTACGTACATCTGTTATGGTGACGACAGGCTCTTGGCAGTTTCTAAGGACTTTGTGGTCTATGAGCCTGACACTGTTGTTGAGATGTATGCAAATGTTTTTGGGATGTGGGTGAAACCAGAAAATGTGAAAATCAGAGATAGCCTAGTTGGTCTTTCGTTCTGTGGGATGACAATTATTAAGAACTCAAGCAATCGCTATGTTGGCGTTCCCAATGTGAATAAAATCCTGTCTACTCTCAGCACTCCTACAAAAAGGCTCCCAAACATCGAGGCATTGTGGGGAAAATTAATCTCTCTGCGGATACTGTGTGAGAATGCTGATCCCGACGTTAGGGACTACCTAGATAAGCAGATCCACTGCGTCGAGGAGTATGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAT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| 46,386 |
MT789776.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
|
University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/14-1235c/14
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,459 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2014-12-08
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/14-1235c/14, complete genome
|
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| 46,387 |
MT789777.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
|
University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/14-1235d/14
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Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,459 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2014-12-09
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/14-1235d/14, complete genome
|
CCGAAAGCGAGGGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGTGGGGGCTTTTTCAAGCCTTAACAGGCGAGAAGACCGTAAGTCGGCCCAAGTAACAACTGGGCTTGACAAGGTCTTCTCGTTCCAGGGCGTGCACGAGCTTTTTGTAAGGATGCGTGCACTGTATGGAATGACTACAGCATGGAAAGCCCTGATGGATTGTGAAGCTGTGTACATCAAAGATGTGAAAACGGCTTTTGGCGCGAATGGTTCCCAAATTGGCTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCGGATGCTGGGATTGCTATACTGACTGAAGGTGAAAAAACTTGTCTTGCGGCACAACAGGCAAGGGATCTTCGCCTGAAAGCTTCATTAAGCACAAACAGCTCTCTAGTCCACCAGATCATGGAGAAAACAAGAGAGGCCAAGGAGAAAACGAAACAACTTGAAGAACTTCAACACCGGATTGATAACATGGTGGACACTAATAAGGTTCTTTACAAACGCATGGAACAGCGGCACCAAGAAAAATTGGAAGCTCTTGGTGAAAAAGTTAGTAAACTTAGGCATGATAATCATCAGTGGTTCATGACTTGTGAGAAAAAGGATGAGGAAATAGCAAAACTTAAACATCAACTTGAAGTCAAAAAGAATGGCTATAAAAAAATGGCCTGGGATGCAGTTGCTTGGCTTATGCTGGCCATCCTTTTGTTTAGTTTCTTTTCTGTGAGTGAGGGTGCCATACCGAATGGAACTCCACCAATCAAGGAAGTCAGTTGGAATTTTGATGATGTGGAAAAAACATGCATGAAACCTGACTTTGGCTGTTTGGTTATGGACACCTGGCTGCCACATCCTGTCTTAACGTTTGAGGACCTAATGTCTAAGTGCTACAATACCCACGGGAATGTTATACCTCGTAGTGCTTTTAATAGTGAACAACTCTTGTATGACTGCACAAAAACGGCACACTATTTTAATGATGGTCATGATTACATTGAGAACTATCACTGGTGTGAGAAGAGGTTAGCAACTCTGGTGGCAGCAAACTGTCAAGGAGATAATGGGGTTGATAAGATCTACACGCAAGTTGTTGAGGCTGTGGCAGCGAGTAGGAAATTCTTTCAGAAAATGGCACTTTACAAGCTTGATGTTTGGATACTAGCCATTTTTAGCATAGTACTAGCGGGAAATAAGGAAAAAATAGTGAAATTGACCCCTTTTATAGCGTTAGGGTGGTGGTTTAATTTACCTATATTTCTGTTGAGTACCGCTGTTAATTTCTTTCCTACAATGGCCTTGCCTTTTATTGCGGTTCAAATTCTCCAACCAGGGTTCTTGGTTGTGACAGCCTTTACATTGTGGTTGACATTGACACTTGTTGCTTTCTTCTGGAATGATGGTATAGCCATTTTGGTTGAGACATCATTTGCTTTGCTTTATACAATCTTATTCTTTGTCTGGTCAATGGCAATGACAGTTTGTGCCAGCTTACAGTTAAGCTTAGCGTACCAAATACTTTTATTTTGTGTTTCGCTTAGCGTGTATTGTGGAACAAAGTTTGCTTGTAGTCAGGTTGTGATAACAAATCCTGATGGCACAACTGAAAAAATTTCCAGGGTAGGAAAAGCTAGGAAAGCTGCTTTCCAGCAATGTAAGGGCATATTAACCTTCTTACAAACACGGGGAATTATACCATCTACCCCTGTTAAAACTAATAGTGTGGTTGTTATTACAGGAAAGAATGGTGTAGGTACTGGGTTTAGGTTTATGAATTATATTGTTACAGCAGGTCATGTTGTCAATGGTAGTGAATGGGCAACAGCGAAATTTGGTGATGTTTCAGTCAAAATTAAAAAGGAAAAGGAAATTGACATGTGTGAGTGCCCTGACACACTTGTCCTTTTTAAGTTGCCAAAGGAACTGCAGAGTGTTAAACCGTTGAGATTAGCCCAAAATATAAAATCAAATTATATGACATTGCATGGGTTTTGCCCAAATTTTGTTAACCCTGTTAGTTTTACAGGCTGGTGTACTATTGATGGGCCTTGGTTAAATAATGCTTTTAACACAACTTTTGGTAATAGTGGCGCTCCCTACTGCGACCCCGATGGGAAGCTTGTTGGCATCCATTTAGGAACTCAAGGGGTAACTTCACAAGGGTTTGTTATATGTGATACCCTTAGAAAGCAATTTGAGACACATTACCAGTGTTCGTGCAGAAGAGAGGAGTGTGATCAACAACAACCTGCACCAGCGCCACCCGCACAGTTCGATTACGAAGAGTTCTTGGCTAAAGTTATAACAGGAACAAAGATTTCCCATCAAGCCATTTTGAAACAACAAGAGGAAATGTTAGAGCAAATTCAGCTCGTAACAAAAATTCTTAAAGACAATGGCTTGCTAGCTGAACAGAAGAAGAAAGGGAAGACTAAAAGAACTGCTCGCGGTGCTAAGGCTACAATGACAAAGAAATACCTTTCTAAGGGACATTTCATGAAAATGAAAATGTTAAGTGAAGAAGAATACCAAAAATTGGTGGATGAGGGCTTCACTGCCGATGAGATCAAAGAAGTTGTTAACAACCTTCGGGAACAAGCCTGGCTTGAGTACTGCATTGACAATGATATTGATGATGAAGGAGCAGAAGATTGGTATGACCAGATGTTAAATGATGAGGCGGTTAATGATCAAATTGATAGGGAAATTGAAGCAAAAATGGAAGATGAAGGATTTTACCAATCGAAAGCCCGGGAAACTCTAGCATCACAATGTAGAAACAAAAAACGTAAAACCTTTGTTGAGCAGGCCCTTTTGCATATCATAGATCTTAAACCTCATAAAGTTAGGACGGTTAAGGTTGAGGTTCAGGATGAGAGTGCTAATCAACTTAAAAAGGTCTTTAAGAGAATGGTCAAAGACGAGGAGGTTGAGCAGGGGCAAACAAAGGCCTTCTTTTCTTCAGGTGATGATATAGAATATTTTGAAAATCGTGATATCGATTGGAAAAAATTGGAAATGCCAAAATTACAAGATGAGGTTAAATTTGAGACCATCACACGCAATGGCATAACTCAAATTTCTACTGGTGAGGATAATAAGAAGAATATCCTCAAAGAAAAGGTCACAAATATACCACAACCGTTGACACCAGTTCCACCCTTTACGGAGAATAATCCGGACATTAAGCCTAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAACAACGGAAAAGGGTTTGTAGGTCATGTGGTAGCGACAAACCCCACAATTTCGTTGTGTGTAAGAAAAAGAATGAGCTCCTGTTTTGTGTTTGGTGCGGTATAGTGCATTCTGAGAATCAAGGCCACTCACGGAAAATTGAATGCCCTAAATGCAACAAAGCATTTTCTGGGATAGAAGGCCTTGAACGCCATGCGAGTGAATGCCCTTCAAAAAACTAGTGGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCGATTATGAACCTGTCCCTGATTATTTGAAGATTTTTTCTTGGGAAGATGATTTGTTACCTCCAATTGGGAAAGAAGCTCTACCTGAAAATGTTATACTTCTTGGCCACATTCCGGTTGATAAGTTGGTTTCTAGAACAAAGAAAGTAACTGATCCACTGCTTGGAGTTATCACTTCCTGGAAACAGGATGAATATGATAGCACCACATGGACTGTTAAGGCGTACACTAAAATGTTTGAGAAATTTTTTTATAAAGAACCATCAGATTTTGTGAACAATGAGCCAGAGCTCACCATCCTATGTGATAGGGTGGTGCTTGATGAGCATGATTATATGGCGAATAGTTCTATGACGCCTATCACAGCGACTATTAAAAATGTGGACTCAACACCTGCTTATCCAAAATTCCAGGAGTTTGACACCGAGGAAGAATACCTTACCCGTTGTGGGTGGAGTGAATACCTCGATGTCATTAAGGATAAAGAAACTCTCAACCATAGGCCATTATGGTGGTGCTTCCTTAAAAATGAAGTTCTCAAGAAAAAGAAAATTCAGGAAAATGACATTAGGATGATTCTATGCACAGATCCAGTGTTTACCCGAATTGGAGCAATGTTTGACCAGGATCAAAATTCTAAGATGAAAAATATGACAGAAACGAGGGCTGCGCAAGTGGGCTGGACCCCCTTCTTTGGTGGGCTTGATCAGCGAATGCGGAGGTTAGAGAAGATTGAAAACGCCCAGTTTGTGGAAATGGATTGGACCCGCTTTGATGGCACTATTCCAAAGGCGCTCTTTTGGCGCATCCGGCAGATTAGGTTCTTTTTCCTAGCGCCCCGGTATAAGACCGCGGCCAACAAGGAATTGTTTGATTGGTATACTAAAAATCTGCTGGAGAAAATAATTCTCTTACCAACTGGAGAAGTGTGTCAGATTAAAAGGGGGAATCCCTCTGGGCAGTTCTCCACCACAGTTGATAATAATATGTGCAATGTGTGGTTAACTACCTTTGAAATAGCATGGCTCCACCGTAAACAGAAGGGTAGACTCCCCACTCCCACTGAGTTGAGGACAAATCTTACGTACATCTGTTATGGTGACGACAGGCTCTTGGCAGTTTCTAAGGACCTTGTGGTCTATGAGCCTGACACTGTTGTTGAGATGTATGCAAATGTTTTTGGGATGTGGGTGAAACCAGAAAATGTGAAAATCAGAGATAGCCTAGTTGGTCTTTCGTTCTGTGGGATGACAATTATTAAGAACTCAAGCAATCGCTATGTTGGCGTTCCCAATGTGAATAAAATCCTGTCTACTCTCAGCACTCCTACAAAAAGGCTCCCAAACATCGAGGCATTGTGGGGAAAATTAATCTCTCTGCGGATACTGTGTGAGAATGCTGATCCCGACGTTAGGGACTACCTAGATAAGCAGATCCACTGCGTCGAGGAGTATGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAT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| 46,388 |
MT789778.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
|
University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/15-1262a/15
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,506 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2015-11-19
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/15-1262a/15, complete genome
|
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| 46,389 |
MT789779.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
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University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/15-1262b/15
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,495 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2015-11-19
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/15-1262b/15, complete genome
|
CCGAAAGCGAGGGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGTGGGGGCTTTTTCAAGCCTTAACAGGCGAGAAGACCGTAAGTCGGCCCAAGTAACAACTGGGCTTGACAAGGTCTTCTCGTTCCAGGGCGTGCACGAGCTTTTTGTAAGGATGCGTGCACTGTATGGAATGACTACAGCATGGAAAGCCCTGATGGATTGTGAAGCTGTGTACATCAAAGATGTGAAAACGGCTTTTGGCGCGAATGGTTCCCAAATTGGCTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCGGATGCTGGGATTGCTATACTGACTGAAGGTGAAAAAACTTGTCTTGCGGCACAACAGGCAAGGGATCTTCGCTTGAAAGCTTCATTAAGCACAAACAGCTCTCTAGTCCACCAGATCATGGAGAAAACAAGAGAGGCCAAGGAGAAAACGAAACAACTTGAAGAACTTCAACACCGGATTGATAACATGGTGGACACTAATAAGGTTCTTTACAAACGCATGGAACAGCGGCACCAAGAAAAATTGGAAGCTCTTGGTGAAAAAATTAGTAAACTTAGGCATGATAATCATCAGTGGTTCATGACTTGTGAGAAAAAGGATGAGGAAATAGCAAAACTTAAACATCAACTTGAAGTCAAAAAGAATGGCTATAAAAAAATGGCCTGGGATGCAGTTGCTTGGCTTATGCTGGCCATCCTTTTGTTTAGTTTCTTTTCTGTGAGTGAGGGTGCCATACCGAATGGAACTCCACCAATCAAGGAAGTCAGTTGGAATTTTGATGATGTGGAAAAAACATGCATGAAACCTGACTTTGGCTGTTTGGTTATGGACACCTGGCTGCCACATCCTGTCTTAACGTTTGAGGACCTAATGTCTAAGTGCTACAATACCCACGGGAATGTTATACCTCGTAGTGCTTTTAATAGTGAACAACTCTTGTATGACTGCACAAAAACGGCACACTATTTTAATGATGGTCATGATTACATTGAGAACTATCACTGGTGTGAGAAGAGGTTAGCAACTCTGGTGGCAGCAAACTGTCAAGGAGATAATGGGGTTGATAAGATCTACACGCAAGTTGTTGAGGCTGTGGCAGCGAGTAGGAAATTCTTTCAGAAAATGGCACTTTACAAGCTTGATGTTTGGATATTAGCCATTTTTAGCATAGTACTAGCGGGAAATAAGGAAAAAATAGTGAAATTGACCCCTTTTATAGCGTTAGGGTGGTGGTTTAATTTACCTATATTTCTGTTGAGTACCGCTGTTAATTTCTTTCCTACAATGGCCTTGCCTTTTATTGCGGTTCAAATTCTCCAACCAGGGTTCTTGGTTGTGACAGCCTTTACATTGTGGTTGACATTGACACTTGTTGCTTTCTTCTGGAATGATGGTATAGCCATTTTGGTTGAGACATCATTTGCTTTGTTTTATACAATCTTATTCTTTGTCTGGTCAATGGCAATGACAGTTTGTGCCAGCTTACAGTTAAGCTTAGCGTACCAAATACTTTTATTTTGTGTTTCGCTTAGCGTGTATTGTGGAACAAAGTTTGCTTGTAGTCAGGTTGTGGTAACAAATCCTGATGGCACAACTGAAAAAATTTCCAGGGTAGGAAAAGCTAGGAAAGCTGCTTTCCAGCAATGTAAGGGCATATTAACCTTCTTACAAACACGGGGAATTATACCATCTACCCCTGTTAAAACTAATAGTGTGGTTGTTATTACAGGAAAGAATGGTGTAGGTACTGGGTTTAGGTTTATGAATTATATTGTTACAGCAGGTCATGTTGTCAATGGTAGTGAATGGGCAACAGCGAAATTTGGTGATGTTTCAGTTAAAATTAAAAAGGAAAAGGAAATTGACATGTGTGAGTGCCCTGACACACTTGTTCTTTTTAAGTTGCCAAAGGAACTGCAGAGTGTTAAACCGTTGAGATTAGCCCAAAATATAAAATCAAATTATATGACATTGCATGGGTTTTGCCCAAATTTTGTTAACCCTGTTAGTTTTACAGGCTGGTGTACTATTGATGGGCCTTGGTTAAATAATGCTTTTAACACAACTTTTGGTAATAGTGGCGCTCCCTACTGCGATCCCGATGGGAAGCTTGTTGGCATCCATTTAGGAACTCAAGGGGTAACTTCACAAGGGTTTGTTATATGTGATACCCTTAGAAAGCAATTTGAGACACATTACCAGTGTTCGTGCAGAAGAGAGGAGTGTGATCAACAACAACCTGCACCAGCGCTACCCGCACAGTTCGATTACGAAGAGTTCTTGGCTAAAGTTATAACAGGAACAAAGATTTCCCATCAAGCCATTTTGAAACAACAAGAGGAAATGTTAGAGCAAATTCAGCTCGTAACAAAAATTCTTAAAGACAATGGCTTGCTAGCTGAACAGAAGAAGAAAGGGAAGACTAAAAGAACTGCTCGCGGTGCTAAGGCTACAATGACAAAGAAATACCTTTCTAAGGGACATTTCATGAAAATGAAAATGTTAAGTGAAGAAGAATACCAAAAATTGGTGGATGAGGGCTTCACTGCCGATGAGATCAAAGAAGTTGTTAACAATCTTCGGGAACAAGCCTGGCTTGAGTACTGCATTGACAATGATATTGATGATGAAGGAGCAGAAGATTGGTATGACCAGATGTTAAATGATGAGGCGGTTAATGATCAAATTGATAGGGAAATTGAAGCAAAAATGGAAGATGAAGGATTTTACCAATCGAAAGCCCGGGAAACTCTAGCATCACAATGTAGAAACAAAAAACGTAAAACCTTTGTTGAGCAGGCCCTTTTGCATATCATAGATCTTAAACCTCATAAAGTTAGGACGGTTAAGGTTGAGGTTCAGGATGAGAGTGCTAATCAACTTAAAAAGGTCTTTAAGAGAATGGTCAAAGACGAGGAGGTTGAGCAGGGGCAAACAAAGGCCTTCTTTTCTTCAGGTGATGATATAGAATATTTTGAAAATCGTGATATCGATTGGAAAAAATTGGAAATGCCAAAATTACAAGATGAGGTTAAATTTGAGACCATCACACGCAATGGCATAACTCAAATTTCTACTGGTGAGGATAATAAGAAGAATATCCTCAAAGAAAAGGTCACAAATATACCACAACCGTTGACACCAGTTCCACCCTTTACGGAGAATAATCCGGACATTAAGCCTAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAACAACGGAAAAGGGTTTGTAGGTCATGTGGTAGCGACAAACCCCACAATTTCGTTGTGTGTAAGAAAAAGAATGAGCTCCTGTTTTGTGTTTGGTGTGGTATAGTGCATTCTGAGAATCAAGGCCACTCACGGAAAATTGAATGCCCTAAATGCAACAAAGCATTTTCTGGGATAGAAGGCCTTGAACGCCATGCGAGTGAATGCCCTTCAAAAAACTAGTGGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCGATTATGAACCTGTCCCTGATTATTTGAAGATTTTTTCTTGGGAAGATGATTTGTTACCTCCAATTGGGAAAGAAGCTCTACCTGAAAATGTTATACTTCTTGGCCACATTCCGGTTGATAAGTTGGTTTCTAGAACAAAGAAAGTAACTGATCCACTGCTTGGAGTTATCACTTCCTGGAAACAGGATGAATATGATAGCACCACATGGACTGTTAAGGCGTACACTAAAATGTTTGAGAAATTTTTTTATAAAGAACCATCAGATTTTGTGAACAATGAGCCAGAGCTCACCATCCTATGTGATAGGGTGGTGCTTGATGAGCATGATTATATGGCGAATAGTTCTATGACGCCTATCACAGCGACTATTAAAAATGTGGACTCAACACCTGCTTATCCAAAATTCCAGGAGTTTGACACCGAGGAAGAATACCTTACCCGTTGTGGGTGGAGTGAATACCTCGATGTCATTAAGGATAAAGAAACTCTCAACCATAGGCCATTATGGTGGTGCTTCCTTAAAAATGAAGTTCTCAAGAAAAAGAAAATTCAGGAAAATGACATTAGGATGATTCTATGCACAGATCCAGTGTTTACCCGAATTGGAGCAATGTTTGACCAGGATCAAAATTCTAAGATGAAAAATATGACAGAAACGAGGGCTGCGCAAGTGGGCTGGACCCCCTTCTTTGGTGGACTTGATCAGCGAATGCGGAGGTTAGAGAAGATTGAAAACGCCCAGTTTGTGGAAATGGATTGGACCCGCTTTGATGGCACTATTCCAAAGGCGCTCTTTTGGCGCATCCGGCAGATTAGGTTCTTTTTCCTAGCGCCCCGGTATAAGACCGCGGCCAATAAGGAATTGTTTGATTGGTATACTAAAAATCTGCTGGAGAAAATAATTCTCTTACCAACTGGAGAAGTGTGTCAGATTAAAAGGGGGAATCCCTCTGGGCAGTTCTCCACCACAGTTGATAATAATATGTGCAATGTGTGGTTAACTACCTTTGAAATAGCATGGCTCCACCGTAAACAGAAGGGTAGACTCCCCACTCCCACTGAGTTGAGGACAAATCTTACGTACATCTGTTATGGTGACGACAGGCTCTTGGCAGTTTCTAAGGACTTTGTGGTCTATGAGCCTGACACTGTTGTTGAGATGTATGAAAATGTTTTTGGGATGTGGGTGAAACCAGAAAATGTGAAAATCAGAGATAGCCTAGTTGGTCTTTCGTTCTGTGGGATGACAATTATTAAGAACTTAAGCAATCGCTATGTTGGCGTTCCCAATGTGAATAAAATCCTGTCTACTCTCAGCACTCCTACAAAAAGGCTCCCAAACATCGAGGCATTGTGGGGAAAATTAATCTCTCTGCGGATACTGTGTGAGAATGCTGATCCCGACGTTAGGGACTACCTAGATAAGCAGATCCACTGCGTCGAGGAGTATGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAT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| 46,390 |
MT789780.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
|
University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/15-1262c/15
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,504 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2015-11-19
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/15-1262c/15, complete genome
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| 46,391 |
MT789781.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
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University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/15-1262d/15
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,507 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2015-11-19
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/15-1262d/15, complete genome
|
CCGAAAGCGAGGGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGTGGGGGCTTTTTCAAGCCTTAACAGGCGAGAAGACCGTAAGTCGGCCCAAGTAACAACTGGGCTTGACAAGGTCTTCTCGTTCCAGGGCGTGCACGAGCTTTTTGTAAGGATGCGTGCACTGTATGGAATGACTACAGCATGGAAAGCCCTGATGGATTGTGAAGCTGTGTACATCAAAGATGTGAAAACGGCTTTTGGCGCGAATGGTTCCCAAATTGGCTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCGGATGCTGGGATTGCTATACTGACTGAAGGTGAAAAAACTTGTCTTGCGGCACAACAGGCAAGGGATCTTCGCTTGAAAGCTTCATTAAGCACAAACAGCTCTCTAGTCCACCAGATCATGGAGAAAACAAGAGAGGCCAAGGAGAAAACGAAACAACTTGAAGAACTTCAACACCGGATTGATAACATGGTGGACACTAATAAGGTTCTTTACAAACGCATGGAACAGCGGCACCAAGAAAAATTGGAAGCTCTTGGTGAAAAAATTAGTAAACTTAGGCATGATAATCATCAGTGGTTCATGACTTGTGAGAAAAAGGATGAGGAAATAGCAAAACTTAAACATCAACTTGAAGTCAAAAAGAATGGCTATAAAAAAATGGCCTGGGATGCAGTTGCTTGGCTTATGCTGGCCATCCTTTTGTTTAGTTTCTTTTCTGTGAGTGAGGGTGCCATACCGAATGGAACTCCACCAATCAAGGAAGTCAGTTGGAATTTTGATGATGTGGAAAAAACATGCATGAAACCTGACTTTGGCTGTTTGGTTATGGACACCTGGCTGCCACATCCTGTCTTAACGTTTGAGGACCTAATGTCTAAGTGCTACAATACCCACGGGAATGTTATACCTCGTAGTGCTTTTAATAGTGAACAACTCTTGTATGACTGCACAAAAACGGCACACTATTTTAATGATGGTCATGATTACATTGAGAACTATCACTGGTGTGAGAAGAGGTTAGCAACTCTGGTGGCAGCAAACTGTCAAGGAGATAATGGGGTTGATAAGATCTACACGCAAGTTGTTGAGGCTGTGGCAGCGAGTAGGAAATTCTTTCAGAAAATGGCACTTTACAAGCTTGATGTTTGGATATTAGCCATTTTTAGCATAGTACTAGCGGGAAATAAGGAAAAAATAGTGAAATTGACCCCTTTTATAGCGTTAGGGTGGTGGTTTAATTTACCTATATTTCTGTTGAGTACCGCTGTTAATTTCTTTCCTACAATGGCCTTGCCTTTTATTGCGGTTCAAATTCTCCAACCAGGGTTCTTGGTTGTGACAGCCTTTACATTGTGGTTGACATTGACACTTGTTGCTTTCTTCTGGAATGATGGTATAGCCATTTTGGTTGAGACATCATTTGCTTTGTTTTATACAATCTTATTCTTTGTCTGGTCAATGGCAATGACAGTTTGTGCCAGCTTACAGTTAAGCTTAGCGTACCAAATACTTTTATTTTGTGTTTCGCTTAGCGTGTATTGTGGAACAAAGTTTGCTTGTAGTCAGGTTGTGGTAACAAATCCTGATGGCACAACTGAAAAAATTTCCAGGGTAGGAAAAGCTAGGAAAGCTGCTTTCCAGCAATGTAAGGGCATATTAACCTTCTTACAAACACGGGGAATTATACCATCTACCCCTGTTAAAACTAATAGTGTGGTTGTTATTACAGGAAAGAATGGTGTAGGTACTGGGTTTAGGTTTATGAATTATATTGTTACAGCAGGTCATGTTGTCAATGGTAGTGAATGGGCAACAGCGAAATTTGGTGATGTTTCAGTTAAAATTAAAAAGGAAAAGGAAATTGACATGTGTGAGTGCCCTGACACACTTGTTCTTTTTAAGTTGCCAAAGGAACTGCAGAGTGTTAAACCGTTGAGATTAGCCCAAAATATAAAATCAAATTATATGACATTGCATGGGTTTTGCCCAAATTTTGTTAACCCTGTTAGTTTTACAGGCTGGTGTACTATTGATGGGCCTTGGTTAAATAATGCTTTTAACACAACTTTTGGTAATAGTGGCGCTCCCTACTGCGATCCCGATGGGAAGCTTGTTGGCATCCATTTAGGAACTCAAGGGGTAACTTCACAAGGGTTTGTTATATGTGATACCCTTAGAAAGCAATTTGAGACACATTACCAGTGTTCGTGCAGAAGAGAGGAGTGTGATCAACAACAACCTGCACCAGCGCTACCCGCACAGTTCGATTACGAAGAGTTCTTGGCTAAAGTTATAACAGGAACAAAGATTTCCCATCAAGCCATTTTGAAACAACAAGAGGAAATGTTAGAGCAAATTCAGCTCGTAACAAAAATTCTTAAAGACAATGGCTTGCTAGCTGAACAGAAGAAGAAAGGGAAGACTAAAAGAACTGCTCGCGGTGCTAAGGCTACAATGACAAAGAAATACCTTTCTAAGGGACATTTCATGAAAATGAAAATGTTAAGTGAAGAAGAATACCAAAAATTGGTGGATGAGGGCTTCACTGCCGATGAGATCAAAGAAGTTGTTAACAATCTTCGGGAACAAGCCTGGCTTGAGTACTGCATTGACAATGATATTGATGATGAAGGAGCAGAAGATTGGTATGACCAGATGTTAAATGATGAGGCGGTTAATGATCAAATTGATAGGGAAATTGAAGCAAAAATGGAAGATGAAGGATTTTACCAATCGAAAGCCCGGGAAACTCTAGCATCACAATGTAGAAACAAAAAACGTAAAACCTTTGTTGAGCAGGCCCTTTTGCATATCATAGATCTTAAACCTCATAAAGTTAGGACGGTTAAGGTTGAGGTTCAGGATGAGAGTGCTAATCAACTTAAAAAGGTCTTTAAGAGAATGGTCAAAGACGAGGAGGTTGAGCAGGGGCAAACAAAGGCCTTCTTTTCTTCAGGTGATGATATAGAATATTTTGAAAATCGTGATATCGATTGGAAAAAATTGGAAATGCCAAAATTACAAGATGAGGTTAAATTTGAGACCATCACACGCAATGGCATAACTCAAATTTCTACTGGTGAGGATAATAAGAAGAATATCCTCAAAGAAAAGGTCACAAATATACCACAACCGTTGACACCAGTTCCACCCTTTACGGAGAATAATCCGGACATTAAGCCTAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAACAACGGAAAAGGGTTTGTAGGTCATGTGGTAGCGACAAACCCCACAATTTCGTTGTGTGTAAGAAAAAGAATGAGCTCCTGTTTTGTGTTTGGTGTGGTATAGTGCATTCTGAGAATCAAGGCCACTCACGGAAAATTGAATGCCCTAAATGCAACAAAGCATTTTCTGGGATAGAAGGCCTTGAACGCCATGCGAGTGAATGCCCTTCAAAAAACTAGTGGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCGATTATGAACCTGTCCCTGATTATTTGAAGATTTTTTCTTGGGAAGATGATTTGTTACCTCCAATTGGGAAAGAAGCTCTACCTGAAAATGTTATACTTCTTGGCCACATTCCGGTTGATAAGTTGGTTTCTAGAACAAAGAAAGTAACTGATCCACTGCTTGGAGTTATCACTTCCTGGAAACAGGATGAATATGATAGCACCACATGGACTGTTAAGGCGTACACTAAAATGTTTGAGAAATTTTTTTATAAAGAACCATCAGATTTTGTGAACAATGAGCCAGAGCTCACCATCCTATGTGATAGGGTGGTGCTTGATGAGCATGATTATATGGCGAATAGTTCTATGACGCCTATCACAGCGACTATTAAAAATGTGGACTCAACACCTGCTTATCCAAAATTCCAGGAGTTTGACACCGAGGAAGAATACCTTACCCGTTGTGGGTGGAGTGAATACCTCGATGTCATTAAGGATAAAGAAACTCTCAACCATAGGCCATTATGGTGGTGCTTCCTTAAAAATGAAGTTCTCAAGAAAAAGAAAATTCAGGAAAATGACATTAGGATGATTCTATGCACAGATCCAGTGTTTACCCGAATTGGAGCAATGTTTGACCAGGATCAAAATTCTAAGATGAAAAATATGACAGAAACGAGGGCTGCGCAAGTGGGCTGGACCCCCTTCTTTGGTGGACTTGATCAGCGAATGCGGAGGTTAGAGAAGATTGAAAACGCCCAGTTTGTGGAAATGGATTGGACCCGCTTTGATGGCACTATTCCAAAGGCGCTCTTTTGGCGCATCCGGCAGATTAGGTTCTTTTTCCTAGCGCCCCGGTATAAGACCGCGGCCAATAAGGAATTGTTTGATTGGTATACTAAAAATCTGCTGGAGAAAATAATTCTCTTACCAACTGGAGAAGTGTGTCAGATTAAAAGGGGGAATCCCTCTGGGCAGTTCTCCACCACAGTTGATAATAATATGTGCAATGTGTGGTTAACTACCTTTGAAATAGCATGGCTCCACCGTAAACAGAAGGGTAGACTCCCCACTCCCACTGAGTTGAGGACAAATCTTACGTACATCTGTTATGGTGACGACAGGCTCTTGGCAGTTTCTAAGGACTTTGTGGTCTATGAGCCTGACACTGTTGTTGAGATGTATGCAAATGTTTTTGGGATGTGGGTGAAACCAGAAAATGTGAAAATCAGAAATAGCCTAGTTGGTCTTTCGTTCTGTGGGATGACAATTATTAAGAACTTAAGCAATCGCTATGTTGGCGTTCCCAATGTGAATAAAATCCTGTCTACTCTCAGCACTCCTACAAAAAGGCTCCCAAACATCGAGGCATTGTGGGGAAAATTAATCTCTCTGCGGATACTGTGTGAGAATGCTGATCCCGACGTTAGGGACTACCTAGATAAGCAGATCCACTGCGTCGAGGAGTATGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAT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| 46,392 |
MT789782.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
|
University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/17-0773a/17
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,452 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2017-07-25
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/17-0773a/17, complete genome
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| 46,393 |
MT789783.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
|
University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/17-0773b/17
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,490 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2017-07-25
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/17-0773b/17, complete genome
|
CCGAAAGCGAGGGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGCGGGGGCTTTTTCAAGCCTTAATAGGCGAGAAGACCGCAAGTCGGCCCAAGTGACAACTGGGCTTGATAAGGTCTTCTCGTTCCAGGGCGTGCACGAACTCTTTGCAAGAATGCGTGCGCTGTATGGAACAACTACAGCATGGAAAGCCCTGATGAGTTGCGAAGCTGTGTACATTAAAGATGTAAAAACGGCTTTTGGCGCGAATGGTTCCCAAATTGGCTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCGGATGCTGGGATTGCTATACTGACTGAAGGTGAAAAAACTTGTCTTGCAGCACAGCAGGCAAGGGATCTGCGCCTGAAAGCTTCACTAAGCACAAACAGCTCTTTAGTTCATCAGATTATGGAGAAAACAAGAGAGGCCAAGGAGAAAGCAAAACAACTTGAAGAGCTCCAGCACCGTATTGACAACATGGTGGATACTAATAAAGTTTTGTATCAACGCATGGAACAGCGTCATCAGGAGAAGTTGGAAGCCCTTGGTGAGAAGATCAGCAAACTTAGACATGACAACCATCAGTGGTTTATGACTTGTGAGAAAAAGGATGAGGAAATAGCAAATCTTAAATGTCAACTTGAAACCAAAAAGAATGGCTACAAGAAAATGGCCTGGGATGCATTTGCTTGGTTTGTATTGGCTATCCTCTTATTTAGCTTTTTCTCTGTGAGTGAAGGTGCTACACCAAATGGGACTCTGCCAATTAAAGAAGTCAGTTGGAGTTTTGATGACGTGGAGAAAACGTGTATGAAACCTGACTTTGGCTGCTTGGTTATGGACACCTGGTTACCACATCCTGTTTTAACTTTTGAAGACCTAATGTCTAAGTGTTATAACACCCATGGGAATGTCATACCTCGTAGTGCTTTTAGTAGTGAACAACTCTTATATGACTGCACTAAAACAGCGCACTATTTTAATGATGGTCATGACTACATTGAGAACTACCGCTGGTGTGAGAAAAGACTGGCAACCCTGGTGGCAGCAAACTGTCAAGGTGATAATGGTATTGATAAAATCTACACGCAAGTTGTTGAGGCTGTAGCAGCAAGTAGGAAATTCTTCCAGAAAATGGCGCTTTATAAGCTTGATGTCTGGATATTAGCCATCTTTAGTATTGTGTTAGCGGGAAACAAGGAAAAAATTGTAAAGTTGACCCCTTTTATAGCGTTAGGGTGGTGGTTCAATTTACCTATATTCCTATTGAGTACCGCTGTTAACTTCTTTCCTACGATGGCCTTACCCTTCATAGCGTTCCAAATTCTTCAACCAGGGTTCTTAGTAGTAACAGCATTTACATTGTGGCTAACATTGACACTTGCTGCTTTCTTTTGGAATGATGGAATAGCTATCTTGGTTGAGACGTCATTTGCTTTGTTTTACACGATCTTGTTTTTTATTTGGTCGATGGCAATGACAGTCTGTGCCAGCTTGCAGCTGAGTTTAGCTTACCAAATACTTTTATTTTGTGTTTCGCTTAGTGTGTATTGTGGAACTAAATTTGCATGTAGTCAGGTTGTCATAACAAACCCTGACGGAACAACAGAAAAAATTTCAAGAGTAGGTAAAGTTAGGAAAGCAGCCTTCCAGCAGTGCAAGGGTGTATTAACTTTCTTACAAACAAGGGGAATTATACCAGCTAGCCCTGTTAAGACTAACAGTGTGGTTGTGATTACAGGTAAGAATGGTGCAGGCACTGGTTTTAGGTTTATGAATCATATTGTTACTGCGGGCCATGTTGTTACTGGCAGTGATTGGGCAACAGCGAAATTCGGTGATGTTACTGTTAAGATTAAAAAGGAGAGGGAGATTGATATGTGTGAATGTCCTGATACACTCGCCCTTTTTAAGTTACCAAAGGAGCTGCAGGGGGTTAAACCATTGAGATTGGCGCAGAATGTGAAATCAAATTATATGACACTACATGGCTTCTGCCCTAATTTTGTCAATTCTGTCAGTTTTACAGGCTGGTGCACTGTTGATGGGCCTTGGCTGAATAACGCCTTTAATACAACTTTTGGCAATAGTGGTGCACCCTATTGTGACCCCGATGGTAAGCTCGTTGGAATCCACCTGGGCACTCAGGGAGTAACCTCACAAGGTTTTGTTATAAGTGATGTCCTTAAGAAACAGTTTGAAACACACTATCAGTGTTCGTGTAGGAAGGAGGAAGGTGTACAACAATCTACACCTGCACCGCCCGCACAGTTCGATTATGAAGAGTTCTTATCTAAAGTTATAACAGGAACAAAGATTTCCCACCAAGCCATATTGAAACAACAAGAAGAAATGTTGGAGCAAATTCAGCTTGTAACAAAGATTCTTCAGGAGAATGGCTTGTTAGCTGAACAGAAGAAGAAAGGGAAAACTAAGAGAACTGCTCGTGGCGCAAAGGCTACAATGACAAAAAAATATCTTTCTAAAGGTCATTTTATGAAAATGAAAATGCTAAGTGAGGAGGAGTACCAAAAGTTAGTGGATGAAGGCTTCACTGCTGATGAGATCAAAGAAGTTGTCAACAACCTTCGGGAACAAGCCTGGCTTGAGTATTGTATTGACAATGATATTGATGATGAAGGAGCAGAAGATTGGTATGACCAGATGTTAACCGATGAGGCGATTAACGATCAAATTGATAGGGAAATTGAAGCAAAAATGGAAGACGAAGGATTTTATCAATCAAAAGCCCGAGAAACTTTAGCATCACAATGCAGAAACAAAAAACGTAAAACCTTCGTTGAGCAGGCCCTTTTGCATATTATAGATCTTAAGCCTCATAAAGTTAGGACAGTTAAGGTTGAGGTTCAGGATGAGAGTGCCAACCAACTTAAAAAGGTCTTTAAAAAAATGGTCAAAGAAGAGGAGGCAGAGCAAGGGCAAACGAAGGCCTTCTTTTCTTCAGGTGATGACATAGAATATTTTGAAAATCGTGATATTGATTGGAAAAAATTGGAAATGCCAAAATTACAGGATGAGGTTAAATTTGAGACCATTACACGCAATGGCATAACTCAGATTTCTACTGGTGAGGACAATAAGAAAAATATCCTCAAAGAAAAGGTCACAAATATACCACAACCGTTAACACCAGTCCCACCGTTTACGGAGACTAATCCGGACACTAAGCCTAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAACAACGGAAGAGGGTTTGCAGGTCATGTGGCAGCGACAAGCCCCACAATTTCGTTGTGTGTAAGAAAAAGAATGAGCTCTTGTTCTGTGTCTGGTGTGGTGTAGTGCATTCTGAGAATCAAGGCCATTCACGGAAAATTGAGTGCCCCAAATGCAACAAAGCATTTTCTGGGATAGAGGGCCTTGAGCGCCATGCAAGTGAATGCTCCTCAAAAAACTAGTGGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCGATTATGAACCTGTCCCTGACTATTTGAAGATTTTTTCTTGGGAAGATGACCTGTTGCCCCCAATTGGAAAAGAAGCTCTGCCTGAAAATGTTATACTTCTTGGCCATATTCCGGTTGATAAATTGGTTTCTAGAACAAAGAAGGTAACCGACCCACTACTTGGAGTTATTACTTCCTGGAAACAGGATGAATATGATAGTACCACATGGACTGTTAAGGCGTATACTAAAATGTTTGAGAAATTCTTTTATAAAGAACCATCAGATTTTGTGAACAATGAACCAGAGCTTACCATCCTATGTGACAGGGTGGTGCTCGATGAACATGACTATATGTCAAATAGTTCTATAACGCCTATTACAGCGACTATTAAAAATGTGGACTCAACACCTGCCTATCCAAAATTCCAGGAGTTCGATACCGAAGAAGACTATCTTACCCGTTGTGGATGGAGTGAATACCTTGATGTCATTAAGGATAAAGAAACTCTTAACCATAGGCCATTATGGTGGTGCTTCCTTAAAAACGAAGTTCTCAAGAAAAAGAAAATTCAAGAGAATGACATTAGGATGATTTTATGTACAGATCCAGTCTTCACTCGAATTGGAGCAATGTTTGATCAGGACCAAAATTCAAAAATGAAAAATATGACAGAAACGAGGGCTGCACAAGTGGGCTGGACCCCCTTCTTTGGTGGACTTGACCAGCGAATGCGAAGGTTGGAGAAGATTGAAAATGCCCAGTTTGTAGAAATGGATTGGACCCGGTTTGATGGCACTATTCCAAAAGCGCTCTTTTGGCGCATCCGGCAGATCAGATTCTTCTTCCTAGCGCCTCGGTATAAAACCGCGGCTAATAAGGAATTGTTTGATTGGTACACTAAAAATCTGCTGGAGAAAATAATTCTCTTACCAACTGGGGAAGTTTGTCAGATAAAAAGGGGTAATCCTTCTGGGCAGTTCTCTACCACAGTTGACAACAATATGTGCAATGTGTGGTTAACTACCTTTGAAATAGCATGGCTCCACCGTAAACAAAAGGGTAGACTCCCCACTCCCACTGAGTTGAGGAAAAATCTTAAATACATTTGTTATGGTGATGATAGGCTCTTGGCAGTTTCAAAGGACTTTGTGACCTACGAGCCTGATACTGTTGTTAAGATGTATGCAGATGTCTTTGGGATGTGGGTGAAACCTGAAAATGTGAAAGTCAGAGATAGCCTTGTCGGTCTTTCGTTTTGTGGTATGACAATTGTCAAAAAATCGAGCAACCGTTATGTAGGGGTTCCCAATGTAAATAAAATCCTTTCCACTCTCAGTACTCCTACAAAAAGGCTTCCAAATATCGAGGCCCTGTGGGGGAAATTGATCTCACTGCGGATCCTTTGCGAGAATGCTGATCCCGACGTTAGGGACTACTTAGATAAGCAAATTCACTGCGTCGAGGAGTATGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAATAG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| 46,394 |
MT789784.1
|
Chicken astrovirus
|
Palomino-Tapia,V., Mitevski,D., Inglis,T., van der Meer,F., Martin,E., Brash,M., Provost,C., Gagnon,C.A., Abdul-Careem,M.F., Palomino-Tapia,V.A., Abdul-Careem,F.M.
|
University of Calgary, Ecosystem and Public Health
|
Canada
|
2020-10-14
|
CAstV/CA-AB/Chicken/17-0823/17
|
Chicken astrovirus
|
Avastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,480 |
GenBank
| 1 | null | null |
Gallus gallus
| null |
2017-08-09
| null | null |
Chicken astrovirus isolate CAstV/CA-AB/Chicken/17-0823/17, complete genome
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CCGAAAGCGAGGGTGTGGGCGATGGCCCAGGCCATGGCGGGGGCTTTTTCAAGCCTTAATAGGCGAGAAGACCGCAAGTCGGCCCAAGTGACAACTGGGCTTGATAAGGTCTTCTCGTTCCAGGGCGTGCACGAACTCTTTGCAAGAATGCGTGCGCTGTATGGAACAACTACAGCATGGAAAGCCCTGATGAGTTGCGAAGCTGTGTACATTAAAGATGTAAAAACGGCTTTTGGCGCGAATGGTTCCCAAATTGGCTTCTTCTTTGCTGAGACACCCACAACACCAACTTGGTCTCCGGATGCTGGGATTGCTATACTGACTGAAGGTGAAAAAACTTGTCTTGCAGCACAGCAGGCAAGGGATCTGCGCCTGAAAGCTTCACTAAGCACAAACAGCTCTTTAGTTCATCAGATTATGGAGAAAACAAGAGAGGCCAAGGAGAAAGCAAAACAACTTGAAGAGCTCCAGCACCGTATTGACAACATGGTGGATACTAATAAAGTTTTGTATCAACGCATGGAACAGCGTCATCAGGAGAAGTTGGAAGCCCTTGGTGAGAAGATCAGCAAACTTAGACATGACAACCATCAGTGGTTTATGACTTGTGAGAAAAAGGATGAGGAAATAGCAAATCTTAAATGTCAACTTGAAACCAAAAAGAATGGCTATAAGAAAATGGCCTGGGATGCATTTGCTTGGTTTGTATTGGCTATCCTCTTATTTAGCTTTTTCTCTGTGAGTGAAGGTGCTACACCAAATGGGACTCTGCCAATTAAAGAAGTCAGTTGGAGTTTTGATGACGTGGAGAAAACGTGTATGAAACCTGACTTTGGCTGCTTGGTTATGGACACCTGGTTACCACATCCTGTTTTAACTTTTGAAGACCTAATGTCTAAGTGTTATAACACCCATGGGAATGTCATACCTCGTAGTGCTTTTAGTAGTGAACAACTCTTATATGACTGCACTAAAACAGCGCACTATTTTAATGATGGTCATGACTACATTGAGAACTACCGCTGGTGTGAGAAAAGACTGGCAACCCTGGTGGCAGCAAACTGTCAAGGTGATAATGGTATTGATAAAATCTACACGCAAGTTGTTGAGGCTGTAGCAGCAAGTAGGAAATTCTTCCAGAAAATGGCGCTTTATAAGCTTGATGTCTGGATATTAGCCATCTTTAGTATTGTGTTAGCGGGAAACAAGGAAAAAATTGTAAAGTTGACCCCTTTTATAGCGTTAGGGTGGTGGTTCAATTTACCTATATTCCTATTGAGTACCGCTGTTAACTTCTTTCCTACGATGGCCTTACCCTTCATAGCGTTCCAAATTCTTCAACCAGGGTTCTTAGTAGTAACAGCATTTACATTGTGGCTAACATTGACACTTGCTGCTTTCTTTTGGAATGATGGAATAGCTATCTTGGTTGAGACGTCATTTGCTTTGTTTTACACGATCTTGTTTTTTATTTGGTCGATGGCAATGACAGTCTGTGCCAGCTTGCAGCTGAGTTTAGCTTACCAAATACTTTTATTTTGTGTTTCGCTTAGTGTGTATTGTGGAACTAAATTTGCATGTAGTCAGGTTGTCATAACAAACCCTGACGGAACAACAGAAAAAATTTCAAGAGTAGGTAAAGTTAGGAAAGCAGCCTTCCAGCAGTGCAAGGGTGTATTAACTTTCTTACAAACAAGGGGAATTATACCAGCTAGCCCTGTTAAGACTAACAGTGTGGTTGTGATTACAGGTAAGAATGGTGCAGGCACTGGTTTTAGGTTTATGAATCATATTGTTACTGCGGGCCATGTTGTTACTGGCAGTGATTGGGCAACAGCGAAATTCGGTGATGTTACTGTTAAGATTAAAAAGGAGAGGGAGATTGATATGTGTGAATGTCCTGATACACTCGCCCTTTTTAAGTTACCAAAGGAGCTGCAGGGGGTTAAACCATTGAGATTGGCGCAGAATGTGAAATCAAATTATATGACACTACATGGCTTCTGCCCTAATTTTGTCAATTCTGTCAGTTTTACAGGCTGGTGCACTGTTGATGGGCCTTGGCTGAATAACGCCTTTAATACAACTTTTGGCAATAGTGGTGCACCCTATTGTGACCCCGATGGTAAGCTCGTTGGAATCCACCTGGGCACTCAGGGAGTAACCTCACAAGGTTTTGTTATAAGTGATGTCCTTAAGAAACAGTTTGAAACACACTATCAGTGTTCGTGTAGGAAGGAGGAAGGTGTACAACAATCTACACCTGCACCGCCCGCACAGTTCGATTATGAAGAGTTCTTATCTAAAGTTATAACAGGAACAAAGATTTCCCACCAAGCCATATTGAAACAACAAGAAGAAATGTTGGAGCAAATTCAGCTTGTAACAAAGATTCTTCAGGAGAATGGCTTGTTAGCTGAACAGAAGAAGAAAGGGAAAACTAAGAGAACTGCTCGTGGCGCAAAGGCTACAATGACAAAAAAATATCTTTCTAAAGGTCATTTTATGAAAATGAAAATGCTAAGTGAGGAGGAGTACCAAAAGTTAGTGGATGAAGGCTTCACTGCTGATGAGATCAAAGAAGTTGTCAACAACCTTCGGGAACAAGCCTGGCTTGAGTATTGTATTGACAATGATATTGATGATGAAGGAGCAGAAGATTGGTATGACCAGATGTTAACCGATGAGGCGATTAACGATCAAATTGATAGGGAAATTGAAGCAAAAATGGAAGACGAAGGATTTTATCAATCAAAAGCCCGAGAAACTTTAGCATCACAATGCAGAAACAAAAAACGTAAAACCTTCGTTGAGCAGGCCCTCTTGCATATTATAGATCTTAAGCCTCATAAAGTTAGGACAGTTAAGGTTGAGGTTCAGGATGAGAGTGCCAACCAACTTAAAAAGGTCTTTAAAAAAATGGTCAAAGAAGAGGAGGCAGAGCAAGGGCAAACGAAGGCCTTCTTTTCTTCAGGTGATGACATAGAATATTTTGAAAATCGTGATATTGATTGGAAAAAATTGGAAATGCCAAAATTACAGGATGAGGTTAAATTTGAGACCATTACACGCAATGGCATAACTCAGATTTCTACTGGTGAGGACAATAAGAAAAATATCCTCAAAGAAAAGGTCACAAATATACCACAACCGTTAACACCAGTCCCACCGTTTACGGAGACTAATCCGGACACTAAGCCTAAAAAGGAGCAAGTTCTTGAACAACGGAAGAGGGTTTGCAGGTCATGTGGCAGCGACAAGCCCCACAATTTCGTTGTGTGTAAGAAAAAGAATGAGCTCTTGTTCTGTGTCTGGTGTGGTGTAGTGCATTCTGAGAATCAAGGCCATTCACGGAAAATTGAGTGCCCCAAATGCAACAAAGCATTTTCTGGGATAGAGGGCCTTGAGCGCCATGCAAGTGAATGCTCCTCAAAAAACTAGTGGAGGGCCCAGATGATTCTGGGCCCGATTATGAACCTGTCCCTGACTATTTGAAGATTTTTTCTTGGGAAGATGACCTGTTGCCCCCAATTGGAAAAGAAGCTCTGCCTGAAAATGTTATACTTCTTGGCCATATTCCGGTTGATAAATTGGTTTCTAGAACAAAGAAGGTAACCGACCCACTACTTGGAGTTATTACTTCCTGGAAACAGGATGAATATGATAGTACCACATGGACTGTTAAGGCGTATACTAAAATGTTTGAGAAATTCTTTTATAAAGAACCATCAGATTTTGTGAACAATGAACCAGAGCTTACCATCCTATGTGACAGGGTGGTGCTCGATGAACATGACTATATGTCAAATAGTTCTATAACGCCTATTACAGCGACTATTAAAAATGTGGACTCAACACCTGCCTATCCAAAATTCCAGGAGTTCGATACCGAAGAAGACTATCTTACCCGTTGTGGATGGAGTGAATACCTTGATGTCATTAAGGATAAAGAAACTCTTAACCATAGGCCATTATGGTGGTGCTTCCTTAAAAACGAAGTTCTCAAGAAAAAGAAAATTCAAGAGAATGACATTAGGATGATTTTATGTACAGATCCAGTCTTCACTCGAATTGGAGCAATGTTTGATCAGGACCAAAATTCAAAAATGAAAAATATGACAGAAACGAGGGCTGCACAAGTGGGCTGGACCCCCTTCTTTGGTGGACTTGACCAGCGAATGCGAAGGTTGGAGAAGATTGAAAATGCCCAGTTTGTAGAAATGGATTGGACCCGGTTTGATGGCACTATTCCAAAAGCGCTCTTTTGGCGCATCCGGCAGATCAGATTCTTCTTCCTAGCGCCTCGGTATAAAACCGCGGCTAATAAGGAATTGTTTGATTGGTACACTAAAAATCTGCTGGAGAAAATAATTCTCTTACCAACTGGGGAAGTTTGTCAGATAAAAAGGGGTAATCCTTCTGGGCAGTTCTCTACCACAGTTGACAACAATATGTGCAATGTGTGGTTAACTACCTTTGAAATAGCATGGCTCCACCGTAAACAAAAGGGTAGACTCCCCACTCCCACTGAGTTGAGGAAAAATCTTAAATACATTTGTTATGGTGATGATAGGCTCTTGGCAGTTTCAAAGGACTTTGTGACCTACGAGCCTGATACTGTTGTTAAGATGTATGCAGATGTCTTTGGGATGTGGGTGAAACCTGAAAATGTGAAAGTCAGAGATAGCCTTGTCGGTCTTTCGTTTTGTGGTATGACAATTGTCAAAAATTCGAGCAACCGTTATGTAGGGGTTCCCAATGTAAATAAAATCCTTTCCACTCTCAGTACTCCTACAAAAAGGCTTCCAAATATCGAGGCCCTGTGGGGGAAATTGATCTCACTGCGGATCCTTTGCGAGAATGCTGATCCCGACGTTAGGGACTACTTAGATAAGCAAATTCACTGCGTCGAGGAGTATGCTGCTGCTGAAGATATACAGTTACCAGAAGTCGGGCCCGACTTCTTTCAGAAAATCTGGTAGAGGGATGGACCGAAATAG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| 46,395 |
NC_033081.1
|
Chicken calicivirus
|
Lima,D.A., Cibulski,S.P., Finkler,F., Varela,A.P.M., Teixeira,T.F., Cerva,C., Domingues,G., Loiko,M.R., Scheffer,C.M., Santos,H.F., Mayer,F.Q., Roehe,P.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2017-01-17
| null |
Bavaria virus
|
Bavovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 8,176 |
RefSeq
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Gallus gallus
|
feces
|
2015-07-31
| null |
PRJNA485481
|
Chicken calicivirus strain RS/BR/2015, complete genome
|
GGTGCATCATCACTGAACACCCTCGGGCAGAGATGCAAGGGTGGAAGTCACTCCTGCCCCCTGGCAACATGCAGGTGCCCGATCCCAAGCTTAGTTCTGACTTCCTCTCCTGGGTGGTGCAACACTCCAAGGTTGATGAACAAACCTGGAGGGACCTCTGGGCAACCTGGTCTCTCGAGGATCTCCGGCGCATCTCCACAGACTACCTCATGCTCCCGGAACCTGAGAAGAACACTGATGCCTATGATGGCTGGCTGATGGTCGGCGAGATGTTGACCTTTGCCGGTCTCATTGGCTGGGAGGATGATGATGGTGATCTTAGCTTTGGCTCCAACCACACCTATTGGGGGCTCTTTGGTGATCCCGCCACCGTTCGCAAGAAGGTGGATGGCCTCTTCCATGACATTCGGACTGGTGGCTCACGCCACCCAAGCAACCACCACCTCTAGCCCTGAAGCTAACACTAACTCAGAACAGGTCCTCCCCAACCCACCAGAACCCAGCTTTTGGCACCGGTTGATTGATGGGGTTACACCCCCCCAGGAACCCCCACTTCTCTCTGCCATCACTAGTCTTATCTCGCTCCTTGGTGGCCTAGCCAACCTAACCTTCACTGCCCTGGTTGAAAAGGTCAAGCCCGTGGCCCTCCTCACCATCCTTCGGGCTCATGGCTGGAGCTTAACCATACCCTGCCTTACTGCTGTCCTTGAACTCTATGGGATGGTGCGTTCAACAACCGACCTTCTGATTGATGGTATCGGCTGGTTCATTGACTTTATCAGTAAACACCTCCCTTGCAAGCTCCAGGCTGGAGGGGGGGATGAATCTGATACAGACTTGGAGGAGCTCTATACAGCAGAGAATCCCTCCCGTCTCTCCCCCAGGATCATACAGCTTATTGGGGCTGTTGCTGCACTGCCAGTTGCACTTCTCCTAGGCCGTGCGGCTTGTCGGCCTATTCTGCGGTTCTTAGGCTCACTCTCACGTGTGAACACCATAGCAACCTTTGTGAAGAATGTGGCTAGCCTGGTCAGCTGGGGGAAAAATCACCTTGCCTCCCAGCGGATTAGGAGAACTATTGGGGGTCTCATCATGGTCGAAGATGAGGTGGCAAGGAACATCAACAATTCGACAGCACCACAACTTGAAGCCTACTCCAGCACAATAGACCAGCTCTTGGAGGAAGCTCGTGAACGTCAAGTCTCCCACCCGGGGCACCCCTTACTCTCTGCCCTAACAAAACATGCCTCGGACCTTAAAGAGCTCCAGAATCAGCTTCGGGGCAAGCTCTCCCTACTTGCCAAGCGTGAACCCCCGGCCTTTTACCTCTTTACTGGCCCACCTGGTATTGGCAAGACCACACTTGTGCAACATTTGGCAACCCGTCTCTCACCCATTGCTCCCTCAAACTTCCCTGGGCACCTAGACCACTATGACACCTACAACCCGGGGCCTGTCTGCATCTGGGATGAGATGACTAACACACCACCTGATCTGATGGTTCAACATGTCCTGGGGATGGTTAACTCCACACCATATCCTCTGAACTGCGATCGACCTGAGAATAAGGGGATGGTTTTCAACTCACGTGTTGTCTTTGCAACTAGTAACCTCCCCACCCCTCTGGATCCAGGACATCCCCTAGCCGGCGCCTTTTACCGGCGTGTTCAGATTATTGACTGCTCCGCTCCCACCATCTCCAACTATATAACTGAGACTGGGGAGATGCCACCATCTACTCACTACCGTCAGGATGGTAGCCACATTACCCTTCGGAAGCGACCCCGTATGGCCTATACACCCCAGGGTGACCTCCTAACATCTGATGGGGTCGCCCGCAAAGGGCGTGTCTCTCCCACAACACCTGATGCAATTCTTAGTGCCCTCCGTGGCACTGTAGTGATGGAGTCAGGTAGGCGTATTCTTCTGGTTGTTGATAAGAACTGGCCAGAGGCGCTTCCATCCAGTTGGATGTTTGAATCCCGTGGCCACCAGGTGGATGTCGTTGTGGATGGACCAGAAACCAACCAAGAGGCCAATGTCCTGATTCTTGCAGTCATGAATGCTAATGACTGGCCAGCCCATCGTGTGGCTGGTCTCTTGAAGAAGGTTAACCCCGCACTCTGGTCCCTAGCGTACGTGGCTGGAACACCTGAGGTAGTGGTCGCCTCGAAACGGATAAGCCCCTGTGACCTGATGGACCATGTCAAGCGCACCTGGACTGCCCCTCAGAATTTTCGTGAGGAACAAGGCTGGCATCCTGACTGGCCGGCCTACTATGCTAAGTGTCGTGAGGCAGGACGTCTACCAGGCTATATTCTCCTGGGAATAGACCCTGCCTTAGCACCGGACCTTGCGACCCATCTCCATCAGTGGGCAGCTAGACGGGGCATCCCACTTCCCATCTATGATGGGACTAAGAACCCCTGCGCAGCAATTGAGCGAGCTGAGACTGAGATCCTCACTGCAATTGTTATGGTCAAACCCATTGATGACCCAGACCTTAAGGTCACCCACTTCGACCCAACACGACCTCCCGGCTTGGCCCTTTCGGACGTAATTCAAACAGAGAATAATGATGCCCTGGAGAAGTTCCTAGGCCATGTCTGGGCCCCTGGGACCATAAGCCCCCACATCCATCACAGGATAACACCAGCCTGTGAGCTAGATGTGAGCGACTCAAGCACTGGGGTTGGGGCTGTCATGAACCACTTTAGCTTGGCCAGTGGTGTGCGTGTCATCTGGCAGGCCTGGAAAAATGCTGGTTCCACCTCACAGTTTTTCCAGACCCTCTTGACTATGGCCGCTCGCCCCGAACCGCGGTTAACTGTCCTCCATTGGGGCGACTCGACCTACTGGCTCTACACATCTACCTGTGTTGGCTTTGCAATCACCCCACGCATTGCTCCCCACCGCCTACCAGGCTGTGCACGGCCCCGACCTGCTGGGGACCGTTCACTCTATGGTCTCCTCAGCGAGATGCTAAGTACCTTTCTCACTGCACTTAGGAATGCAGCCCCCCTCATTCTCACACTCTATTCCTGGAACCAGTTGAACTCTACTGAGATGGAGAAGAAGAAGGGAAAGACCAAGCATGGACGTGGTCGGAAACACCTTGGGGGTGGTCGAGGCCCACGCCTCACTGATGAAGACTATGATGAATGGCAGCAGATGCGAGAAGATTGGCGCGAGGATGTCACTGCTGAACAATACTATCAAGCAAAGTATGGTGAAAACCGTGATACAAAGACCTCACAACGGTATGATGCCTGGCGGCGCCTCAAAGATCTTCGCGCTGGACAAAATGATCCTCGTATGTCCCGCCCTGAAACCCGCCGCGAGGCTGGTCTTGTCTCACGACATCACGGACTCTCAAGACAGGACCTAGGCTTTGCCACCTCGCGCGCTGAACGGCGCCTCGCCACTTATGATGCCTCTAATCCAGGTGATGACGAGGCCCCGCGTCGACTGCGACATCATATGGAGGGTGGGATAACCTCTCCAGTTGTCCCCGCCCTTTCTGGCTCACTTGAGGTCGGCTGGGCAGTTCATCTTGGGTCTGGCCGTTTTATACTTCCTAAACATCTTGGCGCAACAACGATTGCAGGTCACCCCTTCGTTGTCTGTGGGCTTCGTAATGTTGATTTGCTCTTTGTGGACTGCCAGGCACTCCGCTCTATACCCCAGGTTAGAATTGGTACAGGTCACCCGGTCAAGCTGCATGGGCGGGGCTATGTGACCGCTGCAAAGACTACTGCAACACATCTCCTCCCTGTTGGTACAGTCCAGGGGTATTCATATAACCTCCTTGTCGGTGTCACCAAGCAGGGCGACTGCGGTCTGCCCCTCTATGATGCAGCTGGTGGTGTTGTCGGCATTCATGTTGCAAGGAACCAGGTTGGCTCGATCTGCCTTGCCTACCAACAACTCACTGAGGCAGCCGCGAGACCTCTACGCTCGTTCCGCGGTCTTGACGTTGTTGACTCTGAAGTTCCTAGTGGTCCCCCAATGACTGTGACCCGCTACTGGGTAGCACCTGGCATGGAATTTGATGAACAAATGCCCTATCAGCCGGGCTTGGTTGGCTCCAACGATCCTAGGAACCCAGCACCACTTGTGACCATCCTCACCTCAGGTTTGGCCCCCTATACGGACCCTGGACCAGATATCCCACCAGCGGAGCTTGCCCTAGCACGTGCACAGGTTACTGCTGCCCTTCAGGCACTCATAGGTGTTGAAGTTTCTCCCAACCTGGACTTTGCTGCTGCCTGGGGCTCGCTTAATAAGGATACATCTTGTGGGCCTCTGGTGCCGGGCAAGAAACGCGACTACATGGATGAAGCTGGCACACTTCTCCCAGGAGCCCTTCGTGACCACCTTTCTACTTCCTGGGGGATTGCCACCACTGGGAAAGCCCTGCGTCATATCTACGCCCTGGCTTTGAAGGATGAGCTCTTACCAAGAAGGAAGATCTATGAAACTCCCAAGAAGAGACTTCTCTGGGGATGTGACGCTGGTGTTGCACTAGCTGCTGCTGGGGTCTTTCAGCCTGTCTATGAGCGCATTAAAGCAACTGCTGCCTGGGGTCCAATCTCTGTTGGCATCTGCTTGGAACGACCTGAGGTCTTTAATGCATTTCAACATCGCTTTGGTGGCTTGGTATCTTGCCTTGACTATTCTGGCTGGGACTCAACCATGCACCATGCCGTGATCACTGCGGCTGTTGAGATCCTCTCAGTCTTTGCAGAGGATACCCCCCTCACGCACTCTGTGGTTTCCACCTTGACCTCACCAGCCATTGGCTGTTTCATGGGGTGTGAGGTGACAGTTAAGCGTGGTCTCCCCTCTGGACAACCTGGGACCTCAATGATCAACTCAGTCTGTCACATGCTCTACTTCTGTATGGCCCTTAATATCTCGGCCAGGGGGGCTTGTCTCCCACCCCTCCAAAACCCTATTCTTGACTGTGAGCTTGCAACCTATGGCGATGACTGCATTTACAAATTCCCCACTCTCTATCAGGGGGCCTTTGGAAACTTTATCCAGGCACTTCGTACCCTGGGCCTGAAACCCACTGCACCGGATAAGACCTCGGACATAGCACTTGGCCTCCGCATTGTCTACCTCAAACGAGAGCTCCGCGATGCTGAGGGGAATTGGAGGGATGGACCTGTCTTGGACCTGGATTCCATCATCAGACAGGCCTACTGGGTCCGCGGGACTGCACACAAGGATCCGAGAGAGGTTGCCACTAGGGTCCATGATGGGCGTGGGCTCCAACTTGATCTGGCATTGGCCGCCCTCTCACAACATGGTCCAGAGGTCTTTTCTCAGAATGTACATCCCTTCATACGCACAGCCCTGGCCTCAGGTTGCCCGATCTCCCTTACGACCTGGGAGGTTGCACATCAGTGGTGGAAAGATTTCTCCGCAAGCCTTAGCACTGCGGAAGGAGACATAACAACCTTAGTCATGTCACCAAACGTTGATTATGTTATGGAGGGTGTCACCACACCCCCGGCCCCTCGGGGCCAGGCGCCTACGGGCACCCCACAAACAACACAAGAACTCTCACTCGCCACCTCTGGTATGGTGGTCACCGCTCCTGACACAGGAGTACCGGTGGCCCCCCAGCCAGTGGCCCCTCAGGCCCCAACCATCATTGAGGCCTCAGGGGGAATCACTACCTTGCCCCCTGACATGGCGAGTATGTTCGTGCAGATTGGGCGTCTTGGATGGAATGGTACCAACCCAACTGGTACTATGCTCGGCACCTTCGATCTTGGCCCTAGCCTGAACCCTTTTACACGACTCATCGCTCAGGCCTACTGTGCCTGGGGGGGTGGCTTTGAGTTTCAGGTCATGCTCTCAGGCTCAGGGGCCTATGGTGGTCGCTTACTGATTGGCATCTTTCCACCAGGAATTAACCCAGGTAATCAGGATCCAACAGCTTTTCCACACTTCTATGTGGATGCGCGGGAATCATCTCCAGTCACCTTCCCGGTCCCTGATCTTAACCCTGCCCGGTACCATTCGACAACTGGTGCCGATCTCACAACTTCAGTTGCCATCTTCGTTGCTGCACCTCTCTTGAATCCCTTTTCAGCGAATAATGGCTACTCCTGTGAGATAACCATCCTTGCCCGCCCTGGTCCTGACTTTGGCTTTGCAATGCTCCGCACTCCAACAACCACAGAGGTCACAATTATTCGGGATGCACTTGGGCGCAGTACGGCAGGCTGGCTTGGGTGCCGCTGGGCCACCACAATTAACTCCATTACACCCTTCCTCGGCGCAAGAGACACCCGGGTATATAATCATTTCACTTCCCAAGGCACGACTGCTGGCTGGGGCAATGGATGGCCCTACACTCGGATTTATGTCAACATCTACAACACAACGACCAACCGTCCTAGTAACCCTGGTAGTGGTGGCCTCGTTGCGGGGCAATTTCTCTCAGTGCAGGCTGCCCCAGACTCTGGGCAAGCCCCAGCAGTCATACCTGGAATTCCTCCCGGGTGGACTGACTTACCCACTTCTCAGATTACAGTTGGGCAAGGTGCCGATCCTACAGCAGGCACTGGTGCTATGTATGTTGGTGTTCTTGCCACCCATGTTGCTGGTAGTGGTCCAGATATCTCTGAGGCCTACTCTGAGAGACTTTTCCAACAGAATGGCATGATCTCAGGTGGTGCCACTTCTGGCACCATCCTGCCTGTCCCCAACAATGTTTCCAACCAGACCCTTGCCTTTGCCATTGGGGAAACTAGGACTGGTTCCTCAGCCACTGCAGCACAGACTATCGTGGCATCATGCATGTGTTGGTTCACTGCCACTAACACCTCACCTGGTGATAATGCCCTCACTGTTCCAGGCTATAATGGTCGAGCTGCCCCCTACCATCACACGATCTTGTCATTTAACTCACACGTACCAACAAACTATCCTGGTGGCGGTACTATTGGATCCTCACAGCCAGTTCCCTTGTCATCCACACTTGCTGCCAACCCCTCAGATGGCTGGGACTCAACTAGGATGGCTGTCTGGAATCTCACTGGCGGTGGCTATACCTGGCAATTAGGCATGCTTTCAGATGGGACTATGGTGACTGGCAACTTCACCGGCACAGTCAGTTTGACCACACCACATGAGATTAGTTTCCAGGGGTTCTCGAGCATCACCGCCCCTCTACAGCCCCCAACGCCGAATGGGAACGATGCGGCGTTTCGTCTTGTTAATTGGTAATGGCTGCGGCGGGGTTTGCAGCCGTTGCTGGGGGTGCCAGCAACCTGATTTCATCCTTGGGTTCCACAGCAACAAACGCTGCTTCATTAGCCATTCAGAAGGAATTGGGTGAAAAGTCTCTGGCAATCCAACAACAGGGTCAAATGCTCTCAGCGGTCTCTCCCTACATCTCAGCAGATGCCTACATGAAGACCATTGGTTCAGCCATCACTGCGCGTTACGATGCCCTAACAGCCATGGGTGTTGATAAGTCTTACGCCATGATGCGCTCCCTTAATCCCAACTGGGGTTACACCTTAAACGGTAACCACACCATGCCTGAGGTCAGGACACCAACTGTAGGCTCGGTGAGTGCACCGGTTCTCTCACCCCTGCATCTCTCCAACAACTTTCAGAGCACCCAATCATATACCATCAATAATGGTCAGGCTACTGATCGCCAGTCCAACTGGGGCTCAGTGCGGGCCAGTTCCTGGGTTAACAACCCCTCACAATACTCGAGGGACACAACGATGTCTGGCACACATGGCTCATCCATTGGGACAGTGAGTCCGTTCTCTTCAGTTCGGTCCTCTAGCTCATCTAACAGTAGCTTCACTGTCCTTAACTGGGAGGGTTATGTCTATAATAGCTGGCCAGGTCGTACCATCTCAACCCAAACTGATCCTCACACCACCCCGGTGGCTGACGCTGGTGTGCAGGCCACAGTCAGTAGTGCTGATGCTTCTGTTGGCACACGTCCTAGGACATACAGATTCAACTCTAGCAGGAGCAGCTGGAATCCAAATGCCTTCCGGAACCCCCAGATGGCAATTGACTTGAACACCCCCCATGGGGGTCCCCCTGCAAGATATCCCCGTTGATATCCCTTAATCACAACAGTGAAAATTTCTTTGCTGATTATCTATAGTTTAACTCTAATGGTAAGGTA
| 4,826 |
MT239355.1
|
Chicken calicivirus
|
Ghalyanchi Langeroudi,A., Hosseini,H.
|
University of Tehran, Microbiology and Immunology
|
Iran
|
2021-06-13
|
UT-Shahhosseini 1
|
Bavaria virus
|
Bavovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 7,826 |
GenBank
| null |
Iran
|
Iran
|
Gallus gallus
|
feces, abdominal cavity
|
2018
| null | null |
UNVERIFIED: Chicken calicivirus isolate UT-Shahhosseini 1, complete genome
|
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| 41,572 |
MN810874.1
|
Chicken calicivirus
|
Goraichuk,I.V., Davis,J.F., Afonso,C.L., Suarez,D.L.
|
USDA-ARS, Southeast Poultry Research Laboratory
|
USA
|
2020-09-09
|
GA/1478/2003
|
Bavaria virus
|
Bavovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 8,319 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null |
feces
|
2003-04-28
| null | null |
Chicken calicivirus isolate GA/1478/2003, complete genome
|
TTGTGAACCCTTTCCTCAAACTTCGGACACGGACTACTCTCCGTGTTTCCCTCATCAAAGAGGGCCTCAGCTGGCGTAAGTCAGCTGAGGCCCCAAAAATCTCCTGGGTGGAACTCTATGGTGACTGGGGTCACTTTGACTGTGATCCAACCCCCCTCTTTGCTCGTGATGGGTGCATCATCACAGAACACCCCCGATCTGAGATGCAGGGTTGGAAGTCACTCCTGCCCCCTGGCAACATGCAGGTACCCGACCCCAAGCTCAGCTCCGACTTTCTCTCCTGGGTGGTACAGCACTCCAAGGTTGATGAACAGACCTGGAAGGACCTCTGGGCAACCTGGTCCCTCGAGGATCTCCGGCGAATCTCTACCGACTACCTCATGCTCCCAGAACCTGAGAAGAACACTGATGCCTATGATGGCTGGCTAATGGTTGGTGAAATGCTAACCTTTGCTGGCCTTATTGGCTGGGAGGATGATGATGGTGATCTCAGCTTTGGCTCCAATCACACCTACTGGGGTCTTTTTGGCGATCCTGCCACCGTTCGCAAGAAGGTGGATGGCCTCTTTCATGACATCCGGACTGGTGACTCACGCCCCCCAGGCAACCACCATGCCCACACCTGAGGCTAACACCACCTCGGAACAGGTTCTCCCCAATCCACCTGAACCTAGTTTCTGGCGTCGGCTGATTGATGGGGTCACACCCCCCCAGGAACCCCCACTTCTTTCTGCCATCACCAGTCTTGTCTCACTCTTAGGTGGCCTGGCCAACCTGACCTTTACAGCCCTTGTTGAAAAGGTGAAACCTGTGGCCCTCCTCACCATTCTCCGGGCTCATGGCTGGCGCCTAACCATACCCTGCCTTACTGCTGTTCTTGAGCTCTATGGAATGGTACGGTCGACAACCGACCTTCTGATTGATGGGATTGGCTGGTTCATTGACTTCATTGGCAGGCACCTTCCCTGTAAGATGCAAGCTGGCGGGGAAGAGGACTCGGATACCGACCTGGAAGAGCTCTACTCTGCAGAGAACCCTTCCCGACTCTCCCCTAGAGTTATACAACTCATTGGTGCCGTTGCCTCACTACCTATTGCACTCCTTCTAGGTCGCGCTGCCTGTCGGCCCATTCTGCGCTTCCTTGGCTCGCTCTCACGCGTGAACAGTGTAGCAACCTTTGTGAAGAATGTGGCTAGTCTAGTTAGCTGGGGAAAGAATCACCTTGCTTCCCAGCGGATTAGGCGGACCATTGGGGGTCTCATCATGGTCGAGGATGAAGTAGCAAGGAATATTAACAACTCAACTGCCCCTCAGCTTGAGGCCTACTCCAACACTATAGATCAACTCTTGGAGGAGGCCCGTGAGCGTCAGGTCTCCCATCCAGGGCACCCTCTGCTCTCGGCCTTAACAAAACATGCCTCAGACCTTAAAGAGCTTCAAAATCAGCTCCGGGGGAAGCTCTCCTTGCTTGCTAAGCGTGATCCACCAGCCTTTTACCTCTTCACTGGTCCACCTGGCATTGGGAAGACCACGCTTGTGCAACATCTAGCAACGCGCCTCTCACCAATAGCCCCATCCAACTTTCCTGGACACCTAGACCACTATGACACCTATAATCCTGGGCCAGTCTGTATCTGGGATGAGATGACAAATACACCACCTGATCTCATGGTCCAGCATGTCTTGGGTATGGTTAACTCCACGCCATACCCCTTGAACTGTGATCGACCTGAGAACAAGGGGATGGTCTTCAACTCACGAGTTGTCTTTGCAACTAGCAACCTCCCCACCCCCTTGGACCCAGGGCATCCCTTGGCTGGCGCATTCTATCGTCGTGTCCAGATCATTGACTGCTCTGCCCCCACTATCTCCAACTACATTACTGAGACTGGGGAGATGCCACCCTCAACACACTATCGTCAGGATGGTAGTCATATCACCCTGCGGAAGCGACCCCGTATGGCCTACACACCCCAGGGTGACCTTCTAACCTCTGATGGGGTCGCCCGTAAGGGGCGCGTCACCCCCACAACACCTGATGCAATTCTTAGTGCCCTCCGCGGAACTGTGGTGATGGAAGCAGGGAGGCGCATCCTCCTAGTGGTGGACAAGAACTGGCCAGAGGCTCTTCCAAGTAGTTGGATGTTTGAATCTCGTGGTCATCAGGTGGATGTTGTTGTAGATGGACCAGAGACTAATCAAGAGGCCAACGTCCTGATTCTAGCAGTCATGAACGCCAACGACTGGCCAGCCCATCGTGTGGCCGGTCTTTTAAAGAAAGTTAACCCTGCACTTTGGTCCCTGGCCTACGTGGCTGGGAGTCCTGAGGTTGTTGTTGCATCAAAGCGGATAAGCCCCTGTGATCTGATGGATCATGTTAAGCGTACTTGGACAGCTCCTCAGAACTTCCGTGAGGAGCAGGGCTGGCACCCTGACTGGCCGGCCTACTATGCCAAGTGTCGTGAGGCAGGACGTCTACCAGGTTACATCCTCCTGGGAATAGACCCAGCCTTGGCACCAGATCTTGCAACCCACCTCCATCAGTGGGCTGCCAGGAGGGGTATTCCGCTCCCCATTTACGATGGGACCAAGAACCCCTGTGCTGCAATTGAACGTGCTGAGACGGAGATCCTCACTGCAATTGTGATGGTTAAACCCATTGACGACCCAGATCTTAAGGTCACTCACTTTGACCCAACACGGCCTCCTGGCTTGACCCTCTCAGACGTGATACAGACTGAGAATAATGATGCTCTGGAAAAATTCTTGGGACATGTCTGGGCACCCGGGACCATAAGTCCCCACATCCTTCATAGGATAACGCCGGCTTGTGAATTAGATGTGAGTGACTCAAGTACAGGGGTTGGGGCTGTCATGAATCACTTCAGCCTGGCTAGTGGTGTGCGCGTCATCTGGCAAGCCTGGAAGAATGCTGGCTCCACCTCGCAATTCTTCCAGACCCTTCTAACCATGGCTGCTCGTCCTGAACCGAGGCTAACTATCCTTCACTGGGGTGACTCCACCTACTGGCTCTACACCTCTACCTGTGTTGGCTTTGCAATCACCCCCCGCATTGCCCCCCACCGGCTACCAGGTTGTGCCCGGCCCCGACCTGCTGGAGATCGGTCACTCTATGGCCTCCTCAGTGAGATGTTAAGTACTTTTCTCACTGCACTCAGAAATGCAGCCCCCCTCATCCTCACACTCTACTCCTGGAACCAGCTGAACTCCACTGAGATGGAGAAGAAGAAGGGGAAGACAAAACATGGTCGCGGGCGACGCCATGCTGGTGGTGGTCGTGGCCCACGCCTGACTGATGAGGACTATGATGAATGGCAACAGATGCGGGAAGACTGGCGAGAGGATGTCACTGCTGAACAGTATTATCAGGCCAAGTATGGTGAGAACCGAGATACAAAGACCTCACAGCGCTATGATGCCTGGCGGCGTCTTAAAGATCTTCGCGCTGGGCAGAATGACCCTCGCATGTCCCGTCCTGAGACTCGTCGTGAAGCTGGTCTTGTCTCACGACATCATGGACTATCAAGGCAGGACCTGGGGTTTGCAACCTCACGTGCTGAACGGCGTCTTGCCACCTATGACGCCTCCAATCCAGGTGATGATGAGGCCCCACGCCGTCTTCGACATCATATGGAAGGTGGGATAACCTCCCCAGTAGTTCCTGCCCTTTCTGGCTCCCTTGAAGTCGGCTGGGCAGTCCACCTTGGTTCTGGTCGCTTCATTCTACCAAAACACCTTGGTGCAACAACGATTGCTGGCCACCCCTTCGTTGTTTGTGGCCTTCGGAATGTCGATCTACTCTTTGTAGATTGCCAGGCACTACGCTCAATACCCCAAGTGAGGATTGGTACAGGTCATCCAGTTAAACTGCATGGTCGAGGCTATATTAATGCCTCAAAGACCACCGCGACACATCTCCTCCCTGTTGGTACAGTCCAGGGCTACTCCTACAACCTCCTTGCTGGGATCACCAAGCAAGGTGACTGTGGCCTACCTCTCTATGATGCGGCTGGTGGTGTCGTGGGCATCCATGTTGCGAGAAATCAGGTTGGCTCGATCTGCCTTGCCTATCAACAACTCACTGAAGCAGCTGCAAGACCCTTACGCTCCTTCCGTGGTCTTGATGTTGTTGACTCTGAGGTCCCTAGTGGCCCCCCAATGACTGTGACCCGTTACTGGGTCGCACCTGGCATGGAATTTGATGAACAGATGCCCTATCAACCAGGCCTTGTTGGTTCTAATGATCCTAGGAATCCGGCACCACTCGTAACTATCCTCACATCTGGGCTAGCACCCTACACAGACCCCGGACCAGACATCCCACCAGCAGAGCTTGCTCTGGCACGTGCACAGGTCACTGCTGCCCTCCAGGCACTTATAGGTGTTGAAGTGTCCCCCAATCTGGACTTTGCTGCTGCATGGGGCTCACTCAATAAGGATACATCCTGTGGGCCCCTAGTGCCGGGTAAGAAGCGTGACTATATGGACGAAGCTGGTAACCTCCTCCCAGGCACCCTCCGTGACCACCTTTCCACCGCCTGGGGAATCGCCACGACTGGGAAAGCCCTACGCCACATCTACGCCCTGGCATTGAAGGATGAGCTCTTACCTAGGAGGAAGATCTATGAAACCCCCAAAAAGAGACTTCTCTGGGGGTGCGATGCTGGTGTTGCACTTGCTGCTGCTGGGGTTTTCCAACCAGTCTATGAGCGCATTAAAGCAACTGCTGCCTGGGGCCCAATCTCTGTTGGCATTTGTTTGGAGCGCCCTGAGGTCTTCAATGCATTTCAACATCGCTTCACTGGCCCGGTTTCCTGCCTTGACTATTCTGGCTGGGACTCGACCATGCACCATGCCGTAATCACCGCGGCTGTTGAGATCCTCTCAGTCTTTGCGGAAGACACCCCCCTTACCCACTCAGTGGTCTCCACACTGACTTCACCAGCAATTGGGTGCTTCATGGGCTGCGAGGTAACAGT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| 47,149 |
MN810875.1
|
Chicken calicivirus
|
Goraichuk,I.V., Davis,J.F., Afonso,C.L., Suarez,D.L.
|
USDA-ARS, Southeast Poultry Research Laboratory
|
USA
|
2020-09-09
|
GA/1479/2004
|
Bavaria virus
|
Bavovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 8,327 |
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Gallus gallus
|
feces
|
2004-06-08
| null | null |
Chicken calicivirus isolate GA/1479/2004, complete genome
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| 47,150 |
MH992118.1
|
Chicken calicivirus
|
Castro,C.M.O., Chagas,E.H.N., Bezerra,D.A.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R., Silva,R.R., Siqueira,J.A.M., Junior,E.C.S., Resque,H.R., Mascarenhas,J.D.P.
|
Instituto Evandro Chagas, Virology
|
Brazil
|
2018-10-09
| null |
Bavaria virus
|
Bavovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 8,347 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Gallus gallus
|
feces
|
2009
| null | null |
Chicken calicivirus, complete genome
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GTGGGAACCCTTTCCTCAAACTCCGGACACGGACTACTCTCCGTGTTTCCCTCATCAAAGAGGGCCTCAGCTGGCGCAAGTCGGCTGGGGCCCCAAGAATCACCTGGGTGGATCTCTATGGCGACTGGGGTCGCTTTGACTGTGATCCCACCCCACTCTTTGCTCGTGAAGGGTGCATCCTCACTGAACACCCTCGGGCAGAGATGCAAGGGTGGAAGTCGCTCCTGCCCCCTGGCAACATGCAGGTGCCCGATCCCAAGCTCAGCTCTGACTTCCTCTCCTGGGTGGTGCAACACTCCAAGGTTGATGAACAAACCTGGAGGGACCTCAAGGCAACCTGGTCTCTCGAGGATCTCCGGCGCATCTCCACAGACTACCTCATGCTCCCGGAACCTGAGAAGAACACTGATGCCTATGATGGCTGGCTAATGGTCGGCGAGATGTTGACCTTAGCCGGTCTCATTGGCTGGGAGGATGATGACGGTGATCTTAGGTTTGGCTCCAATGACACCTATTGGGGCCTCTTCGGTGATCCCGCCACCGTTCGCAAGAAGGTGGATGGTCTTTTCCATGACATTCGGACTGGTGGCTCACGCCACCCAAGCAACCACCACCTCTAGCCCTGAAGTTAATACTAACTCAGAACAGGTCCTCCCCAACCCACCAGAACCCAGCTTTTGGCACCGGTTGATTGATGGGGTCACACCCCCCCCGGAACCCCCACATCTCTCTGCCAACACAAGTCTTATATCGCTCCTTGGTAGCCTAGCCAACCTAACCTTCACTGCCCTGGTTGAAAAGGTTAAGCCCGTGGCCCTCCTCACCATCCTTCGGGCTCATGGCTGGAGCTTAACCATACCCTGCCTTACAGCTGTCCTTGAACTCTATGGGATGGTGCGTTCAACAACCGACCTCCTAATTGACGGTATTGGCTGGTTTATTGACTTCATCAGTAAGTATCTCCCTTGCAAGATGCAGGCTGGTGGGGGGGATGAATCTGATACAGACTTGGAGGAGCTCTATACAGCTGAGAATCCCTCCCGTCTCTCTCCCAGGATCATACAGCTTATTGGAGCCGTTGCTGCACTGCCAGTTGCACTCCTCTTAGGCCGTGCGGCTTGTCGGCCTATCCTGCGGTTCTTAGGCTCACTCTCACGTGTAAACACCATAGCAACATTTGTGAAGAATGTGGCTAGCCTGGTCAGCTGGGGGAAGAACCACCTTGCCTCCCAGCGGATTAGGCGAACTATTGGGGGTCTCATCATGGTTGAGGATGAGGTGGCAAGGAACATCAACAACTCGACAGCACCACAACTTGAGGCCTACTCCAGCACTATAGACCAACTTCTGGAGGAAGCTCGTGAACGTCAAGTTTCCCATCCGGGGCACCCTCTACTCTCTGCCTTGACAAAGCATGCCTCGGACCTCAAAGAGCTCCAGAATCAGCTTCGGGGCAAGCTCTCCTTACTTGCCAAGCGTGATCCCCCGGCCTTCTACCTCTTTACTGGCCCACCTGGTATTGGGAAGACCACACTTGTGCAACATTTGGCAACCCGTCTCTCACCCATTGCTCCCTCAAACTTCCCTGGGCACTTAGACCACTATGACACCTACAACCCGGGGCCTGTCTGCATCTGGGATGAGATGACTAACACACCACCTGACCTGATGGTTCAACATGTCTTGGGGATGGTTAACTCCACACCGTACCCCTTGAACTGTGATCGGCCTGAGAACAAGGGGATGGTCTTCAACTCACGAGTTGTCTTTGCAACCAGCAATCTTCCCACCCCCTTAGATCCAGGGCATCCCCTAGCGGGTGCTTTCTACCGGCGTGTTCAGATTATTGACTGCTCCGCCCCCACCATCTCCAACTACATAACTGAGACTGGGGAGATGCCGCCATCCACACACTACCGTCAGGATGGTAGCCACATTACCCTTCGGAAGCGACCCCGTATGGCCTACACACCCCAGGGTGACCTCCTAACATCTGATGGGGTTGCCCGCAAGGGGCGCGTCTCCCCTACGACACCCGATGCAATTCTTAGTGCTCTCCGTGGTACTGTGGTGATGGAGTCAGGTAGGCGCATTCTCCTGGTTGTTGATAAGAACTGGCCAGAGGCGCTTCCATCCAGTTGGATGTTTGAATCCCGTGGCCACCAGGTGGATGTTGTTGTGGATGGACCAGAAACCAACCAAGAGGCCAATGTCCTGATTCTTGCAGTCATGAATGCTAATGACTGGCCAGCCCATCGTGTGGCTGGTCTCTTGAAGAAGGTCAATCCTGCACTCTGGTCCCTGGCGTACGTGGCTGGGACGCCTGAGGTAGTGGTCGCCTCGAAACGGATAAGCCCCTGTGACCTGATGGATCATGTCAAACGCACCTGGACTGCCCCTCAGAACTTCCGTGAAGAACAAGGCTGGCATCCTGACTGGCCAGCCTACTATGCTAAGTGTCGTGAGGCGGGACGCCTACCAGGCTATATTCTCCTGGGAATAGACCCTGCCTTAGCACCGGACCTTGCAACCCATCTCCATCAGTGGGCAGCTAGACGGGGCATCCCACTTCCCATCTATGATGGGACTAAGAATCCTTGCGCAGCAATTGAGCGTGCTGAGACTGAGATCCTCACTGCAATTGTTATGGTCAAACCTATTGATGACCCAGATCTTAAGGTCACCCACTTCGACCCAACACGACCTCCTGGCTTGGCCCTTTCGGACGTAATTCAAACAGAGAATAATGATGCCCTGGAGAAGTTCCTAGGCCATGTCTGGGCCCCTGGAACCATAAGCCCCCATATCCTTCACAGGATAACACCAGCCTGTGAGCTAGATGTGAGCGACTCAAGCACTGGGGTTGGGGCTGTCATGAACCACTTTAGCCTGGCTAGTGGTGTGCGTGTCATCTGGCAGGCCTGGAAGAATGCTGGTTCTACCTCACAGTTCTTCCAGACCCTCTTGACTATGGCCGCTCGTCCCGAACCGCGGTTGACTGTCCTCCACTGGGGCGACTCGACCTATTGGCTCTACACATCTACCTGTGTTGGCTTTGCAATCACCCCACGCATTGCCCCCCACCGCCTACCAGGCTGTGCACGGCCCCGACCTGCTGGGGACCGGTCACTCTATGGTCTCCTCAGCGAGATGCTAAGCACCTTTCTCACTGCACTTAGGAATGCAGCCCCCCTCCTTCTCACACTCTATTCCTGGAATCAGTTGAACTCTACTGAGATGGAGAAGAAGAAGGGAAAGACCAAGCATGGACGTGGTCGGAAACATCTTGGGGGTGGCCGAGGCCCACGACTCACTGATGAAGACTATGATGAATGGCAGCAGATGCGAGAAGACTGGCGCGAGGATGTCACTGCTGAACAATACTATCAAGCAAAGTATGGTGAGAACCGTGATACAAAGACCTCACAACGGTATGATGCCTGGCGGCGCCTCAAAGACCTTCGCGCTGGGCAAAATGACCCTCGCATGTCCCGCCCTGAAACCCGCCGCGAGGCTGGTCTTGTCTCACGACATCATGGACTCTCAAGACAGGACCTAGGCTTTGCCACCTCGCGCGCTGAACGGCGCCTCGCCACCTATGATGCCTCGAATCCTGGTGATGACGAGGCCCCACGTCGACTGCGACATCACATGGAGGGTGGGATAACCTCCCCAGTTGTCCCCGCCCTCTCTGGCTCACTTGAGGTCGGCTGGGCAGTTCATCTTGGCTCTGGTCGTTTCATACTTCCTAAACATCTTGGCGCAACAACGATTGCAGGTCACCCCTTCGTTGTCTGTGGGCTTCGTAATGTTGACTTGCTTTTTGTGGACTGCCAGGCACTCCGCTCTATACCCCAGGTTAGAATTGGTACAGGTCACCCGGTCAAGTTGCATGGGCGGGGCTACGTGACCGCTGCAAAGACTACTGCAACACATCTCCTCCCTGTTGGCACAGTCCAGGGGTACTCATATAACCTCCTTGTTGGTGTCACCAAGCAGGGCGACTGCGGTCTGCCCCTCTATGATGCAGCTGGTGGTGTTGTCGGCATTCATGTTGCAAGGAACCAGGTTGGCTCGATCTGCCTTGCCTACCAACAACTCACTGAGGCGGCCGCGAGACCTCTACGCTCGTTCCGCGGTCTTGACGTTGTTGACTCTGAAGTTCCTAGTGGTCCCCCAATGACTGTGACCCGCTACTGGGTAGCACCTGGCATGGAATTTGATGAGCAGATGCCCTATCAGCCGGGCTTGGTTGGTTCCAACGATCCTAGGAACCCAGCACCACTTGTGACCATCCTCACCTCAGGTTTGGCGCCCTATACGGACCCTGGACCAGATATCCCACCAGCGGAGCTTGCCCTAGCACGTGCACAGGTCACTGCTGCCCTTCAGGCACTCATAGGTGTTGAAGTTTCTCCCAACTTGGATTTTGCTGCTGCCTGGGGCTCACTTAACAAGGATACATCTTGTGGGCCTCTGGTACCAGGCAAGAAACGCGACTACATGGATGAAGCTGGCACACTTCTCCCAGGAGCCCTCCGTGACCACCTTTCTACTTCCTGGGGGATTGCCACTACTGGGAAAGCCCTGCGCCACATCTACGCCCTGGCTTTGAAGGATGAGCTCTTACCAAGAAGGAAGATCTATGAAACTCCCAAGAAGAGACTCCTCTGGGGGTGTGACGCTGGTGTTGCACTAGCTGCTGCTGGAGTCTTTCAACCTGTCTATGAGCGCATTAAAGCAACTGCCGCCTGGGGTCCAATTTCTGTTGGTATCTGCTTGGAACGACCTGAGGTCTTCAATGCATTTCAACATCGTTTTGGTGGCTTGGTATCTTGCCTTGACTATTCTGGCTGGGACTCAACCATGCACCATGCCGTGATCACTGCGGCTGTTGAGATCCTCTCAGTCTTTGCAGAGGATACCCCCCTCACGCACTCTGTGGTCTCCACCTTGACCTCACCAGCCATTGGCTGCTTCATGGGGTGTGAGGTAACGGT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| 67,932 |
KY120883.1
|
Chicken calicivirus
|
Lima,D.A., Cibulski,S.P., Finkler,F., Varela,A.P.M., Teixeira,T.F., Cerva,C., Domingues,G., Loiko,M.R., Scheffer,C.M., Santos,H.F., Mayer,F.Q., Roehe,P.M.
|
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Microbiologia, Parasitologia e Imunologia
|
Brazil
|
2017-01-08
| null |
Bavaria virus
|
Bavovirus
|
Caliciviridae
|
ssRNA(+)
| 8,176 |
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
|
Gallus gallus
|
feces
|
2015-07-31
| null | null |
Chicken calicivirus strain RS/BR/2015, complete genome
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| 78,737 |
NC_004162.2
|
Chikungunya virus
|
Khan,A.H., Morita,K., Parquet Md Mdel,C., Hasebe,F., Mathenge,E.G., Igarashi,A., del Carmen Parquet,M., Mathenge,E.G.M.
|
Institute of Tropical Medicine, Nagasaki University, Department of Virology
|
Japan
|
2002-09-06
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,826 |
RefSeq
| 1 | null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Chikungunya virus, complete genome
|
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| 8,564 |
MW588418.1
|
Chikungunya virus
|
Chua,C.L., Chan,Y.F., Sam,I.C.
|
University Malaya, Department of Medical Microbiology, Faculty of Medicine
|
Malaysia
|
2024-02-01
|
MY/2017/0040
|
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,743 |
GenBank
| null |
Malaysia
|
Malaysia
|
Homo sapiens
|
blood
|
2017-06-13
| null | null |
Chikungunya virus isolate MY/2017/0040, complete genome
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CGTATAAGACTCTAGTCAATAGACCTGGCTACAGCCCCATGGTATTGGAGATGGAACTACTGTCAGTCACTTTGGAGCCAACACTATCGCTTGATTACATCACATGCGAGTACAAAACCGTCATCCCGTCTCCGTACGTGAAGTGCTGCGGTACAGCAGAGTGCAAGGACAAAAACCTACCTGACTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCCTACTGCTTCTGCGACGCTGAAAACACGCAGTTGAGCGAAGCACATGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCTGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGGAATAACATCACTGTAACTGCCTATGCAAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCCAAATTCATTGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTTGACAACAAAATTGTGGTGTACAAAGGTGACGTCTATAACATGGACTACCCGCCCTTTGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGATATCCAAAGTCGCACACCTGAGAGTGAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGGCTGCAGGTACGGTACATGTGCCATACTCTCAGGCACCATCTGGCTTTAAGTATTGGCTAAAAGAACGCGGGGCGTCACTGCAGCACACAGCACCATTCGGCTGCCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGGTGAACTGCGCCGTAGGGAACATGCCCATCTCCATCGACATACCGGAAGCGGCCTTCACTAGGGTCGTCGACGCGCCCTCTTTGACGGACATGTCGTGCGAGGTACCAGCCTGCACCCATTCCTCAGACTTTGGGGGCGTCGCCGTTATTAAATATGCAGCCAGCAAGAAAGGCAAGTGCGCGGTGCATTCGATGACTAACGCCGTCACTATTCGGGAAGCTGAGATAGAAGTTGAAGGGAATTCTCAGCTGCAAATCTCTTTCTCGACGGCCTTGGCCAGCGCCGAATTCCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGCAGCTGAGTGCCACCCCCCGAAGGACCACATAGTCAACTACCCGGCGTCACATACCACCCTCGGGGTCCAGGACATCTCCGCTACGGCGATGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGTGTGGGACTGGTTGTTGCTGTTGCCGCACTGATTCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTCAGCAGGCACTAACTTGACAATTAAGTATGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACTGTATATAGCAAATAATCTATAGATCAAAGGGCTACGCAACCCCTGAATAGTAACAAAATACAAAATCACAAAAAATTATAAAAACAGAAAAATACATAAACAGGTATACGTGTCCCCTAAGAGACACATTGTATGTAGGTGATAAGCATAGATCAAAGGGCCGAATAACCCCTGAATAGTAACAAAATATGAAAATCAATAAAAATCATAAAATAGAAAAACCATAAACAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATAAAACCCCTGAATAGTAACAAAACATAAAGTTAATAAAAATCAAATGAATACCATAATTGGCAAACGGAAGAGATGTAGGTACTTAAGCTTCCTAAAAGCAGCCGAACTCACTTTGAGAAGTAGGCATAGCATACCGAACTCTTCCACGATTCTCCGAACCATAGG
| 9,203 |
MW588419.1
|
Chikungunya virus
|
Chua,C.L., Chan,Y.F., Sam,I.C.
|
University Malaya, Department of Medical Microbiology, Faculty of Medicine
|
Malaysia
|
2024-02-01
|
MY/2017/2968
|
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,743 |
GenBank
| null |
Malaysia
|
Malaysia
|
Homo sapiens
|
blood
|
2017-06-01
| null | null |
Chikungunya virus isolate MY/2017/2968, complete genome
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| 9,204 |
OQ148617.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,873 |
GenBank
| null |
Brazil: Acre
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-11-20
| null | null |
Chikungunya virus strain AC3670/H813993, complete genome
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TGTCAGCGTCTATATCCACGTACACAGAATCCATGATGGGTTATTAATCTCTTGCTTTGCAGAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCATCCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGAAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGTTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGTGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAATGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGT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| 9,899 |
OQ148618.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,983 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-09-12
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2807/H804770, complete genome
|
GCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGCTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCATTTCCCCTTCCAAAGTACAAGATAGAAGGAGTGCAAAAAGTCAAATGCTCCAAGGTAATGTTATTTGATCACAATGTGCC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| 9,900 |
OQ148619.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 12,130 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-10
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2852/H805986, complete genome
|
GAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGTTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAATGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCATTTCCCCTTCCAAAGTACAAGATAGAAGGAGTGCAA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GCGTACGAACATGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAACAGACCGGGCTACAGCCCCATGGTATTGGAGATGGAGCTTCTGTCTGTCACCTTGGAACCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTATAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGTAAGGACAAGAGCCTACCTGATTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCCTACTGCTTCTGCGACACCGAAAATACGCAATTGAGCGAAGCACATGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAATATCACTGTGGCTGCTTATGCAAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCTAAATTCATAGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAATAAAATCGTGGTGTACAAAGGCGACGTCTACAACATGGACTACCCGCCCTTCGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGACATCCAAAGTCGCACGCCTGAGAGCGAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGTCCGCGGGTACGGTGCACGTGCCGTACTCTCAGGCACCATCTGGCTTCAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGTCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGATGAACTGCGCCGTAGGGAACATGCCTATCTCCATCGACATACCGGACGCGGCCTTTACCAGGGTCGTCGACGCGCCATCTTTAACGGACATGTCGTGTGAGGTATCAGCCTGCACCCATTCCTCAGACTTTGGGGGCGTAGCCATCATTAAATATGCAGCCAGTAAGAAAGGCAAGTGTGCAGTGCACTCGATGACTAACGCCGTCACTATTCGGGAAGCTGAAATAGAAGTAGAAGGGAACTCTCAGTTGCAAATCTCTTTTTCGACGGCCCTAGCCAGCGCCGAATTTCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGCAGCCGAGTGCCATCCACCGAAAGACCATATAGTCAATTACCCGGCGTCACACACCACCCTCGGGGTCCAAGACATTTCCGCTACGGCGATGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGTGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATCCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTTAGCAGGCACTAACTTGACAACTAGGTATGAAGGCATACGCGTCCCTAAAGAGACACACCGCATATAGCTAGGAATCAACAGATAAGTATAGATCTAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAACAAAATATAAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATTAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATCAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAACCACAAATAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATAAAACCCCTGAATAGTAACAAAATATAAAACTAATAAAAATCAAACGAATACCATAATTGGCAATCGGAAGAGATGTAGGTACTTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAACTCGCTTTGAGATGTAGGCGTAGCACACCGAACTCTTCCATAATTCTCCGAACCCACAGGGACGTAGGAGATGTTCAAAGTGACTATAAAACCCTGAACAGTAATAAAATATAAAATTAATAATGAGTACCATAATTGGCAAATGGAAGAGACGTAGGTACTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAACTCACTTTGAGAT
| 9,901 |
OQ148620.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 12,058 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-02-10
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2861/H806034, complete genome
|
GAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACACCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGTTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAATGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCATTTCCCCTTCCAAAGTACAAGATAGAAGGAGTGCAA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GCGTACGAACACGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAACAGACCGGGCTACAGCCCCATGGTATTGGAGATGGAGCTTCTGTCTGTCACCTTGGAACCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTATAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGTAAGGACAAGAGCCTACCTGATTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCCTACTGCTTCTGCGACACCGAAAATACGCAATTGAGCGAAGCACATGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAATATCACTGTGGCTGCTTATGCAAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCTAAATTCATAGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAATAAAATCGTGGTGTACAAAGGCGACGTCTACAACATGGACTACCCGCCCTTCGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGACATCCAAAGTCGCACGCCTGAGAGCGAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGTCCGCGGGTACGGTGCACGTGCCGTACTCTCAGGCACCATCTGGCTTCAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGTCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGATGAACTGCGCCGTAGGGAACATGCCTATCTCCATCGACATACCGGACGCGGCCTTTACCAGGGTCGTCGACGCGCCATCTTTAACGGACATGTCGTGTGAGGTATCAGCCTGCACCCATTCCTCAGACTTTGGGGGCGTAGCCATCATTAAATATGCAGCCAGTAAGAAAGGCAAGTGTGCAGTGCACTCGATGACTAACGCCGTCACTATTCGGGAAGCTGAAATAGAAGTAGAAGGGAACTCTCAGTTGCAAATCTCTTTTTCGACGGCCCTAGCCAGCGCCGAATTTCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGCAGCCGAGTGCCATCCACCGAAAGACCATATAGTCAATTACCCGGCGTCACACACCACCCTCGGGGTCCAAGACATTTCCGCTACGGCGATGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGTGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATCCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTTAGCAGGCACTAACTTGACAACTAGGTATGAAGGCATACGCGTCCCTAAAGAGACACACCGCATATAGCTAGGAATCAACAGATAAGTATAGATCTAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAACAAAATATAAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATTAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATCAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAACCACAAATAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATAAAACCCCTGAATAGTAACAAAATATAAAACTAATAAAAATCAAACGAATACCATAATTGGCAATCGGAAGAGATGTAGGTACTTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAACTCGCTTTGAGATGTAGGCGTAGCACACCGAACTCTTCCATAATTCTCCGAACCCACAGGGACGTAGGAGATGTTCAAAGTGACTATAAAACCCTGAACAGTAATAAAATATAAAATTAATAATG
| 9,902 |
OQ148621.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 12,055 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-06-10
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2876/H806747, complete genome
|
GTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTACGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGTTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGGGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAATGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCATTTCCCCTTCCAAAGTACAAGATAGAAGGAGTGCAAAA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| 9,903 |
OQ148622.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 12,077 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-07-10
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2877/H806748, complete genome
|
GAATCCATGATGGGTTATTAATCTCTTGCTTTGCAGAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGCTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTTAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGATAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCAT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TAGCCGTACTGAGCGTCGGTGCCCACACTGTGAGCGCGTACGAACACGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAACAGACCGGGCTACAGCCCCATGGTATTGGAGATGGAGCTTCTGTCTGTCACCTTGGAACCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTATAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGTAAGGACAAGAGCCTACCTGATTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCCTACTGCTTCTGCGACACCGAAAATACGCAATTGAGCGAAGCACATGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAATATCACTGTGGCTGCTTATGCAAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCTAAATTCATAGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAATAAAATCGTGGTGTACAAAGGCGACGTCTACAACATGGACTACCCGCCCTTCGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGACATCCAAAGTCGCACGCCTGAGAGCGAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGTCCGCGGGTACGGTGCACGTGCCGTACTCTCAGGCACCATCTGGCTTCAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGTCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGATGAACTGCGCCGTAGGGAACATGCCTATCTCCATCGACATACCGGACGCGGCCTTTACCAGGGTCGTCGACGCGCCATCTTTAACGGACATGTCGTGTGAGGTATCAGCCTGCACCCATTCCTCAGACTTTGGGGGCGTAGCCATCATTAAATATGCAGCCAGTAAGAAAGGCAAGTGTGCAGTGCACTCGATGACTAACGCCGTCACTATTCGGGAAGCTGAAATAGAAGTAGAAGGGAACTCTCAGTTGCAAATCTCTTTTTCGACGGCCCTAGCCAGCGCCGAATTTCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGCAGCCGAGTGCCATCCACCGAAAGACCATATAGTCAATTACCCGGCGTCACACACCACCCTCGGGGTCCAAGACATTTCCGCTACGGCGATGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGTGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATCCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTTAGCAGGCACTAACTTGACAACTAGGTATGAAGGCATACGCGTCCCTAAAGAGACACACCGCATATAGCTAGGAATCAACAGATAAGTATAGATCTAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAACAAAATATAAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATGTAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATTAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATCAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAACCACAAATAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATAAAACCCCTGAATAGTAACAAAATATAAAACTAATAAAAATCAAACGAATACCATAATTGGCAATCGGAAGAGATGTAGGTACTTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAACTCGCTTTGAGATGTAGGCGTAGCACACCGAACTCTTCCATAATTCTCCGAACCCACAGGGACGTAGGAGATGTTCAAAGTGACTATAAAACCCTGAACAGTAATAAAA
| 9,904 |
OQ148623.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 12,085 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-16
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2885/H806757, complete genome
|
GAATCCATGATGGGTTATTAATCTCTTGCTTTGCAGAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGCTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAGGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTTAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCAT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TAGCCGTACTGAGCGTCGGTGCCCACACTGTGAGCGCGTACGAACACGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAACAGACCGGGCTACAGCCCCATGGTATTGGAGATGGAGCTTCTGTCTGTCACCTTGGAACCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTATAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGTAAGGACAAGAGCCTACCTGATTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCCTACTGCTTCTGCGACACCGAAAATACGCAATTGAGCGAAGCACATGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAATATCACTGTGGCTGCTTATGCAAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCTAAATTCATAGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAATAAAATCGTGGTGTACAAAGGCGACGTCTACAACATGGACTACCCGCCCTTCGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGACATCCAAAGTCGCACGCCTGAGAGCGAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGTCCGCGGGTACGGTGCACGTGCCGTACTCTCAGGCACCATCTGGCTTCAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGTCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGATGAACTGCGCCGTAGGGAACATGCCTATCTCCATCGACATACCGGACGCGGCCTTTACCAGGGTCGTCGACGCGCCATCTTTAACGGACATGTCGTGTGAGGTATCAGCCTGCACCCATTCCTCAGACTTTGGGGGCGTAGCCATCATTAAATATGCAGCCAGTAAGAAAGGCAAGTGTGCAGTGCACTCGATGACTAACGCCGTCACTATTCGGGAAGCTGAAATAGAAGTAGAAGGGAACTCTCAGTTGCAAATCTCTTTTTCGACGGCCCTAGCCAGCGCCGAATTTCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGCAGCCGAGTGCCATCCACCGAAAGACCATATAGTCAATTACCCGGCGTCACACACCACCCTCGGGGTCCAAGACATTTCCGCTACGGCGATGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGTGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATCCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTTAGCAGGCACTAACTTGACAACTAGGTATGAAGGCATACGCGTCCCTAAAGAGACACACCGCATATAGCTAGGAATCAACAGATAAGTATAGATCTAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAACAAAATATAAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATTAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATCAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAACCACAAATAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATAAAACCCCTGAATAGTAACAAAATATAAAACTAATAAAAATCAAACGAATACCATAATTGGCAATCGGAAGAGATGTAGGTACTTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAATTCGCTTTGAGATGTAGGCGTAGCACACCGAACTCTTCCATAATTCTCCGAACCCACAGGGACGTAGGAGATGTTCAAAGTGACTATAAAACCCTGAACAGTAATAAAATATAAAAT
| 9,905 |
OQ148624.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 12,148 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-15
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2887/H806759, complete genome
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CCTCAAACATGGGGTACGCACGTTGCAGGGCCTTCAAAAAGGCGCTGTCAGCGTCTATATCCACGTACACAGAATCCATGATGGGTTATTAATCTCTTGCTTTGCAGAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGCTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTTAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTA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| 9,906 |
OQ148625.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,811 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-16
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2889/H806761, complete genome
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GTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGCTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAGGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTTAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCATTTCCCCTTCCAAAGTACAAGATAGAAGGAGTGCAAAA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| 9,907 |
OQ148626.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,830 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-16
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2890/H806762, complete genome
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ATCCATGATGGGTTATTAATCTCTTGCTTTGCAGAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACACCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGTTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAATGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCATTT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GCCGTACTGAGCGTCGGTGTCCACACTGTGAGCGCGTACGAACACGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAACAGACCGGGCTACAGCCCCATGGTATTGGAGATGGAGCTTCTGTCTGTCACCTTGGAACCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTATAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGTAAGGACAAGAGCCTACCTGATTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCCTACTGCTTCTGCGACACCGAAAATACGCAATTGAGCGAAGCACATGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAATATCACTGTGGCTGCTTATGCAAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCTAAATTCATAGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAATAAAATCGTGGTGTACAAAGGCGACGTCTACAACATGGACTACCCGCCCTTCGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGACATCCAAAGTCGCACGCCTGAGAGCGAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGTCCGCGGGTACGGTGCACGTGCCGTACTCTCAGGCACCATCTGGCTTCAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGTCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGATGAACTGCGCCGTAGGGAACATGCCTATCTCCATCGACATACCGGACGCGGCCTTTACCAGGGTCGTCGACGCGCCATCTTTAACGGACATGTCGTGTGAGGTATCAGCCTGCACCCATTCCTCAGACTTTGGGGGCGTAGCCATCATTAAATATGCAGCCAGTAAGAAAGGCAAGTGTGCAGTGCACTCGATGACTAACGCCGTCACTATTCGGGAAGCTGAAATAGAAGTAGAAGGGAACTCTCAGTTGCAAATCTCTTTTTCGACGGCCCTAGCCAGCGCCGAATTTCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGCAGCCGAGTGCCATCCACCGAAAGACCATATAGTCAATTACCCGGCGTCACACACCACCCTCGGGGTCCAAGACATTTCCGCTACGGCGATGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGTGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATCCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTTAGCAGGCACTAACTTGACAACTAGGTATGAAGGCATACGCGTCCCTAAAGAGACACACCGCATATAGCTAGGAATCAACAGATAAGTATAGATCTAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAACAAAATATAAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATTAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATCAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAA
| 9,908 |
OQ148627.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 12,214 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-28
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2895/H806983, complete genome
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GTTGCAGGGCCTTCAAAAAGGCGCTGTCAGCGTCTATATCCACGTACACAGAATCCATGATGGGTTATTAATCTCTTGCTTTGCAGAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGCTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGCTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCCGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTTAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGT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ATGTAACTGTCTGAGACTCTTACCATGCTGTTGTAAAATGTTGACTTTTTTAGCCGTACTGAGCGTCGGTGCCCACACTGTGAGCGCGTACGAACACGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAACAGACCGGGCTACAGCCCCATGGTATTGGAGATGGAGCTTCTGTCTGTCACCTTGGAACCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTATAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGTAAGGACAAGAGCCTACCTGATTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCCTACTGCTTCTGCGACACCGAAAATACGCAATTGAGCGAAGCACATGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAATATCACTGTGGCTGCTTATGCAAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCTAAATTCATAGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAATAAAATCGTGGTGTACAAAGGCGACGTCTACAACATGGACTACCCGCCCTTCGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGACATCCAAAGTCGCACGCCTGAGAGCGAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGTCCGCGGGTACGGTGCACGTGCCGTACTCTCAGGCACCATCTGGCTTCAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGTCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGATGAACTGCGCCGTAGGGAACATGCCTATCTCCATCGACATACCGGACGCGGCCTTTACCAGGGTCGTCGACGCGCCATCTTTAACGGACATGTCGTGTGAGGTATCAGCCTGCACCCATTCCTCAGACTTTGGGGGCGTAGCCATCATTAAATATGCAGCCAGTAAGAAAGGCAAGTGTGCAGTGCACTCGATGACTAACGCCGTCACTATTCGGGAAGCTGAAATAGAAGTAGAAGGGAACTCTCAGTTGCAAATCTCTTTTTCGACGGCCCTAGCCAGCGCCGAATTTCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGCAGCCGAGTGCCATCCACCGAAAGACCATATAGTCAATTACCCGGCGTCACACACCACCCTCGGGGTCCAAGACATTTCCGCTACGGCGATGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGTGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATCCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTTAGCAGGCACTAACTTGACAACTAGGTATGAAGGCATACGCGTCCCTAAAGAGACACACCGCATATAGCTAGGAATCAACAGATAAGTATAGATCTAAGGGCTGAATAACCCCTGAATAACAAAATATAAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATTAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATCAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAACCACAAATAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATAAAACCCCTGAATAGTAACAAAATATAAAACTAATAAAAATCAAACGAATACCATAATTGGCAATCGGAAGAGATGTAGGTACTTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAACTCGCTTTGAGATGTAGGCGTAGCACACCGAACTCTTCCATAATTCTCCGAACCCACAGGGACGTAGGAGATGTTCAAAGTGACTATAAAACCCTGAACAGTAATAAAATATAAAATTAATAATGAGTACCATAATTGGCAAATGGAAGAGACGTAGGTACTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAACTCACTTTGAGA
| 9,909 |
OQ148628.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 12,195 |
GenBank
| null |
Brazil: Amapa
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-02-12
| null | null |
Chikungunya virus strain AMA2971/H808223, complete genome
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TGGGTTATTAATCTCTTGCTTTGCAGAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAATAACCCATCATGGATTCTGTGTACGTGGATATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCTAGGCAGGTCACATCAAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCCATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGATATAGGTAGTGCGCCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTTTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCTAATTATGCGAGAAAGCTCGCATCTGCCGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATTTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGAGGTGATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTTTGCTTACACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACATGCACCCACGTCGCTATATCACCAGGCGATTAAAGGAGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAACGCTATGGCGGGTGCCTACCCCTCATACTCGACAAATTGGGCGGATGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACAGAAGGTAGACGAGGCAAATTGTCTATCATGAGAGGGAAAAAGCTAAAACCGTGCGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTTTACCCGGAAAGCCGCATGCTACTTAAGAGCTGGCACCTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAGCTTAGCTTCACATGCCGCTGTGACACAGTGGTTTCGTGTGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACGGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTAGACGGTGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACGTACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAACACGAACACCATGAAGAACTACCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGTAAGTGGGCGAAGGAGTGCCGGAAGGACATGGAAGATGAGAAGCTTTTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTGTGGGCATTTAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATCCAGAAGGTTCAGGCCGAATTCGACAGCTTTGTAGTACCAGGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCGTTGAGGACTAGAATCAAGTGGCTGTTACGCAAGGTGCCGAAAGCAGACCTGATCCCATACAGCGGAAATGCCCAAGAAGCCCAGGATGCTGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCATGAGGCTCTACCACCCCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTCCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAACTTGAGGATAGAGCTGGTGCTGGAATAATAGAGACTCCGAGAGGCGCTATTAAAGTTACTGCCCAACTAACGGACCACGTCGTGGGGGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTATTACGCAGCCAGAAGCTCAGCCTGATCCACGCTTTAGCGGAGCAAGTGAAGACGTGTACGCATAGCGGACGAGCAGGGAGGTATGCGGTCGAAGCGTACGATGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATTTCGCCCGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTACAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGTTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCTCTGAACACTGACGAAGAGTCGTATGAGCTTGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGACGTGGACCAGAGAAGATGCTGCAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGATTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATACGAAGGGCTAAAAATTCGCCCCGCTTGTCCATATAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGGGTACCAGGATCTGGTAAGTCAGCCATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCAGCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAAATATCTGCACGTACGGTTGATTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAATAGACCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCCTTGATCGCCTTGGTGAGACCAAGACTGAAAGTTGTACTTTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTACAATCATAACATCTGCACTCAAGTGTACCACAAAAGTATTTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACTGCCATTGTGTCGTCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACATGCCGATTGTAGTGGACACTACGGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGACCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGACACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTACGCAGTTAGGCAAAAAGTTAACGAAAACCCACTCTATGCATCAACATCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACGCGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTCTCTGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAGGCAACTATTAAGGAGTGGGAGGTGGAGCACGCATCGATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAGTGACCTTTGACACGTTCCAAAACAAAGCCAACGTTTGCTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCTTTCAAAGAAGACAAAGCATACTCACCCGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATCTAGACAGCGGGCTATTCTCTAAACCGTTGGTATCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCGGGAGGAAAGATGTTCGGATTCAACCCTGAGGCAGCGTCCATTCTAGAAAGAAAGTACCCGTTTACAAAAGGAAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACTACCAGGAGGATAGAAGACTTCAACCCTACCACCAACATTATACCGGCCAACAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAACAAGATAAACGGACATCATGTGCTCCTGGTTAGCGGCTATAACCTTGCACTGCCTACTAAGAGAGTCACCTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTATACATACAACCTAGAGCTGGGTCTACCGGCAACACTTGGTAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGATCACGCAATGAAACTGCAAATGCTAGGAGGTGACTCACTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATACGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTAATCTGCGTACTGGGACGTAAGTTTAGATCGTCCAGAGCATTGAAACCACCATGTATCACCAGTAATACTGAGATGTTCTTCCTATTTAGCAGTTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTTACAACGCATGTTATGAACAATCAACTGAACGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCATCGTACCGGGTAAAGCGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTGGTCAACGCCGCCAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATATAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAAAATAGTGCAACACCAGTAGGAACCGCAAAAACAGTTATGTGCGGTACATATCCAGTAATCCATGCCGTAGGACCAAACTTCTCAAATTACACGGAGTCCGAAGGGGACCGGGAATTGGCGGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGCGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGACAGGCTAACCCAGTCACTGAACCACCTCTTTACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGCCGAGACAAGGAATGGGAGAAGAAAATATCTGAGGCCATACAGATGCGGACCCAAGTGGAGCTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATGTCATTCGCGTGCACCCTGACAGTAGTTTGGCAGGTAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTATTCATATCTAGAAGGGACACGTTTTCACCAGACGGCAGTGGATGTGGCAGAGATACATACTATGTGGCCAAAGCAAATAGAGGCCAATGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAGTCAATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCATCTCCCCCGAAAACCGTCCCGTGCCTTTGCCGTTATGCCATGACTCCTGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCATGTCACAAATATAATTGTGTGTTCTTCATTTCCCCTTCC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GAGCGTCGGTGCCCACACTGTGAGCGCGTACGAACATGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAACAGACCGGGCTACAGCCCCATGGTATTGGAGATGGAGCTTCTGTCTGTCACCTTGGAACCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTATAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGTAAGGACAAGAGCCTACCTGATTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTCATGTGGGGCGGCGCCTACTGCTTCTGCGACACCGAAAATACGCAATTGAGCGAAGCACATGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAATATCACTGTGGCTGCTTATGCAAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCTAAATTCATAGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAATAAAATCGTGGTGTACAAAGGCGACGTCTACAACATGGACTACCCGCCCTTCGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGACATCCAAAGTCGCACGCCTGAGAGCGAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGTCCGCGGGTACGGTGCACGTGCCGTACTCTCAGGCACCATCTGGCTTCAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGTCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGATGAACTGCGCCGTAGGGAACATGCCTATCTCCATCGACATACCGGACGCGGCCTTTACCAGGGTCGTCGACGCGCCATCTTTAACGGACATGTCGTGTGAGGTATCAGCCTGCACCCATTCCTCAGACTTTGGGGGCGTAGCCATCATTAAATATGCAGCCAGTAAGAAAGGCAAGTGTGCAGTGCACTCGATGACTAACGCCGTCACTATTCGGGAAGCTGAAATAGAAGTAGAAGGGAACTCTCAGTTGCAAATCTCTTTTTCGACGGCCCTAGCCAGCGCCGAATTTCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGCAGCCGAGTGCCATCCACCGAAAGACCATATAGTCAATTACCCGGCGTCACACACCACCCTCGGGGTCCAAGACATTTCCGCTACGGCGATGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGTGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATCCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTTAGCAGGCACTAACTTGACAACTAGGTATGAAGGCATACGCGTCCCTAAAGAGACACACCGCATATAGCTAGGAATCAACAGATAAGTATAGATCTAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAACAAAATATAAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATTAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAATCAACAAAAATCATAAAATAGAAAACTAGAAATAGAAGTAGGTAAGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACCATATATAGCTAAGAATCAATAGATAAGCATAGATCAAAGGGCTGAACAACCCCTGAATAATAACAAAATATAAAAACCAATAAAAATCATAAAATAGAAAACCACAAATAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATAAAACCCCTGAATAGTAACAAAATATAAAACTAATAAAAATCAAACGAATACCATAATTGGCAATCGGAAGAGATGTAGGTACTTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAACTCGCTTTGAGATGTAGGCGTAGCACACCGAACTCTTCCATAATTCTCCGAACCCACAGGGACGTAGGAGATGTTCAAAGTGACTATAAAACCCTGAACAGTAATAAAATATAAAATTAATAATGAGTACCATAATTGGCAAATGGAAGAGACGTAGGTACTAAGCTTCTTAAAAGCAGCCGAACTCACTTTGAGATGTAGGCATAGCATACCGAACTCTTCCACAATTCTCCGTAC
| 9,910 |
OQ148629.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,647 |
GenBank
| null |
Brazil: Bahia
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-08-28
| null | null |
Chikungunya virus strain BHI3737/H804701, complete genome
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GAGTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAAGAACCCATCATGGATCCTGTGTACGTGGACATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCCAGGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCTATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGACATCGGCAGTGCACCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTCTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCCAATTATGCGAGAAAGCTAGCATCTGCTGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATCTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGCAGTAATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTCTGCTTGCACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACACGCACCCACGTCGCTATACCACCAGGCGATTAAAGGGGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAATGCCATGGCGGGTGCCTACCCCTCATATTCGACAAACTGGGCAGACGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACGGAAGGTAGACGAGGTAAATTGTCTATTATGAGAGGGAAGAAGCTAAAACCGTGTGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTCTACCCGGAAAGCCGCAAGCTACTTAAGAGCTGGCACTTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAACTCAGCTTCACATGCCGCTGTGATACAGTGGTTTCGTGCGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACAGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTTGACGGCGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACATACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAATACGAACACCATGAAAAACTATCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAAGCCTTCAGTAAGTGGGCAAAGGAGTGCCGGAAAGACATGGAAGATGAAAAACTCCTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTATGGGCATTCAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATTCAGAAGGTTCAGGCCGAGTTTGACAGCTTTGTGGTACCGAGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCCTTGAGGACTAGAATCAAATGGTTGTTAAGCAAGGTGCCAAAAACCGACCTGATCCCATATAGCGGGGACGCCCAAGAAGCCCGGGACGCAGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCGTGAAGCCCTACCACCTCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTTCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAGCTTGAGGACAGAGCGGGTGCAGGAATAATAGAGACTCCTAGAGGAGCTATCAAAGTTACTGCCCAACCAACAGACCACGTCGTGGGAGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTACTACGGAGCCAGAAGCTCAGCCTAATTCACGCTTTGGCGGAGCAAGTGAAGACGTGCACGCACAGCGGACGAGCAGGGAGGTACGCGGTCGAAGCGTACGACGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATCTCGCCTGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTATAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGCTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCCCTGAACACCGACGAAGAGTCGTATGAGCTGGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGATGTGGACCAGAGAAGATGCTGTAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGACTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATATGAAGGGCTAAAAATCCGCCCTGCCTGCCCATACAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGAGTACCAGGATCTGGCAAGTCAGCTATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCACCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAGATATCTGCACGTACGGTTGACTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAACAGGCCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCTTTGATCGCCTTGGTTAGACCAAGGCAGAAAGTTGTACTCTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTATAATCACAACATCTGCACCCAAGTGTACCACAAAAGTATCTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACCGCCATTGTGTCATCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACAAGCCGATTGTAGTGGACACTACAGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGATCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGATACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTATGCAGTTAGGCAAAAAGTTAATGAAAACCCGCTCTATGCATCAACGTCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACACGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTTTCCGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAAGCAACTATCAAGGAGTGGGAGGTGGAGCATGCATCAATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAATGACCTTTGATACATTCCAAAACAAAGCCAATGTTTGTTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCCTTCAAAGAAGATAAAGCATACTCACCTGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATTTAGACAGTGGGCTATTTTCTAAACCATTGGTGTCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCTGGAGGGAAGATGTTCGGATTCAACCCCGAGGCAGCATCCATTCTAGAAAGAAAGTATCCATTCACAAAAGGGAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACCACCAGGAGGATAGAAGACTTTAACCCTACCACCAATATTATACCGGCCAATAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAATAAGATAAACGGCCACCACGTGCTCCTGGTCAGTGGCTATAATCTTGTACTGCCTACTAAGAGAGTCACTTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTACACATACAACCTAGAGTTGGGTCTGCCAGCAACGCTTGGCAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGACCACGCAATGAAACTGCAAATGCTCGGGGGTGACTCATTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATATGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTCATCTGCGTGTTGGGACGCAAGTTCAGATCGTCTAGAGCGTTGAAACCACCATGTGTCACCAGCAACACTGAGATGTTTTTCCTATTCAGCAACTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTCACAACTCATGTCATGAATAATCAACTGAATGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCGTCGTACCGGGTAAAACGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTAGTTAACGCCGCTAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATACAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAGAATAGTGCAACACCAGTGGGAACCGCAAAAACAGTCATGTGCGGTACGTATCCAGTAATCCACGCCGTTGGACCGAACTTCTCTAATTATTTGGAATCTGAAGGGGACCGGGAATTGGCAGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGTGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGATAGGCTGACCCAGTCACTGAACCACCTCTTCACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGTCGCGACAAAGAATGGGAGAAGAAAATATCCGAGGCCATACAGATGCGGACTCAAGTGGAGTTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATATTGTTCGCGTGCACCCTGACAGCAGCTTGGCAGGCAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTACTCATATCTAGAAGGGACTCGTTTTCACCAGACGGCAGTGGACATGGCAGAGATATATACTATGTGGCCAAAGCAAACAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAATCGATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCGTCTCCTCCAAAAACTGTCCCGTGCCTTTGCCGTTACGCCATGACTCCGGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCACGTCACAAGTATAATTGTGTGTTCCTCGTTTCCCCTTCCAAAGTACAAAATAGAAGGAGTGCAA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CACACTGTGAGCGCGTACGAACACGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAATAGACCGGGCTACAGTCCCATGGTATTGGAGATGGAACTACTGTCAGTCACTTTGGAGCCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTACAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGCAAGGACAAAAACCTACCTGACTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTTATGTGGGGCGGAGCCTACTGCTTCTGCGACGCTGAAAACACGCAATTGAGCGAAGCACACGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAACATCACTGTAACTGCCTATGCTAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCCAAATTCATTGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAACAAAATTGTGGTGTACAAAGGTGACGTCTATAACATGGACTACCCGCCCTTTGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGATATCCAAAGTCGCACACCTGAGAGTAAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGGCTGCGGGTACGGTACATGTGCCATACTCTCAGGCACCATCTGGCTTTAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGCCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGGTGAATTGCGCCGTAGGGAACATGCCCATCTCCATCGACATACCGGATGCGGCCTTCATTAGGGTCGTCGACGCGCCCTCTTTAACGGACATGTCGTGCGAGGTACCAGCCTGCACCCATTCCTCAGATTTCGGGGGCGTCGCCATTATTAAATATGCAGCCAGCAAGAAAGGCAAGTGTGCGGTGCATTCGATGACCAACGCCGTCACAATTCGGGAAGCTGAGATAGAAGTTGAAGGGAATTCTCAGCTGCAAATCTCTTTCTCGACGGCCTTGGCCAGCGCCGAATTCCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGTAGCCGAGTGCCACCCTCCGAAGGACCACATAGTCAATTACCCGGCGTCACATACCACCCTCGGGGTCCAGGACATTTCCGCTACGGCGCTGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGCGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATTCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTCAGCAGGCACTAACTTGACAACTAAGTATGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACTGTAAATAGCTAATAATCTATAGATCAAAGGGCTATACAACCCCTGAATAGTAACAAAATACAAAATCACTAAAAATTATAAAAACAGAAAAATACATAAATAGGTATACGTGTCCCCTAAGAGACACATTGTATGTAGGTGATAAGTATAGATCAAAGGGCCGAACAACCCCTGAATAGTAACAAAACATGAAAATCAATAAAAATCATAAAATAGAAAAACCATAAACAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATACAACCCCTGAATAG
| 9,911 |
OQ148630.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,662 |
GenBank
| null |
Brazil: Bahia
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-10
| null | null |
Chikungunya virus strain BHI4442/H806889, complete genome
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CCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAAGAACCCATCATGGATCCTGTGTACGTGGACATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCCAGGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCTATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGACATCGGCAGTGCACCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTCTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCCAATTATGCGAGAAAGCTAGCATCTGCTGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATCTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGCAGTAATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTCTGCTTGCACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACACGCACCCACGTCGCTATACCACCAGGCGATTAAAGGGGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAATGCCATGGCGGGTGCCTACCCCTCATATTCGACAAACTGGGCAGACGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACGGAAGGTAGACGAGGTAAATTGTCTATTATGAGAGGGAAGAAGCTAAAACCGTGTGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTCTACCCGGAAAGCCGCAAGCTACTTAAGAGCTGGCACTTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAACTCAGCTTCACATGCCGCTGTGATACAGTGGTTTCGTGCGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACAGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTTGACGGCGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACATACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAATACGAACACCATGAAAAACTATCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAAGCCTTCAGTAAGTGGGCAAAGGAGTGCCGGAAAGACATGGAAGATGAAAAACTCCTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTATGGGCATTCAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATTCAGAAGGTTCAGGCCGAGTTTGACAGCTTTGTGGTACCGAGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCCTTGAGGACTAGAATCAAATGGTTGTTAAGCAAGGTGCCAAAAACCGACCTGATCCCATATAGCGGGGACGCCCAAGAAGCCCGGGACGCAGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCGTGAAGCCCTACCACCTCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTTCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAGCTTGAGGACAGAGCGGGTGCAGGAATAATAGAGACTCCTAGAGGAGCTATCAAAGTTACTGCCCAACCAACAGACCACGTCGTGGGAGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTACTACGGAGCCAGAAGCTCAGCCTAATTCACGCTTTGGCGGAGCAAGTGAAGACGTGCACGCACAGCGGACGAGCAGGGAGGTACGCGGTCGAAGCGTACGACGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATCTCGCCTGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTATAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGCTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCCCTGAACACCGACGAAGAGTCGTATGAGCTGGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGATGTGGACCAGAGAAGATGCTGTAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGACTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATATGAAGGGCTAAAAATCCGCCCTGCCTGCCCATACAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGAGTACCAGGATCTGGCAAGTCAGCTATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCACCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAGATATCTGCACGTACGGTTGACTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAACAGGCCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCTTTGATCGCCTTGGTTAGACCAAGGCAGAAAGTTGTACTCTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTATAATCACAACATCTGCACCCAAGTGTACCACAAAAGTATCTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACCGCCATTGTGTCATCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACAAGCCGATTGTAGTGGACACTACAGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGATCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGATACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTATGCAGTTAGGCAAAAAGTTAATGAAAACCCGCTCTATGCATCAACGTCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACACGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTTTCCGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAAGCAACTATCAAGGAGTGGGAGGTGGAGCATGCATCAATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAATGACCTTTGATACATTCCAAAACAAAGCCAATGTTTGTTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCCTTCAAAGAAGATAAAGCATACTCACCTGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATTTAGACAGTGGGCTATTTTCTAAACCATTGGTGTCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCTGGAGGGAAGATGTTCGGATTCAACCCCGAGGCAGCATCCATTCTAGAAAGAAAGTATCCATTCACAAAAGGGAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACCACCAGGAGGATAGAAGACTTTAACCCTACCACCAATATTATACCGGCCAATAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAATAAGATAAACGGCCACCACGTGCTCCTGGTCAGTGGCTATAATCTTGTACTGCCTACTAAGAGAGTCACTTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTACACATACAACCTAGAGTTGGGTCTGCCAGCAACGCTTGGCAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGACCACGCAATGAAACTGCAAATGCTCGGGGGTGACTCATTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATATGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTCATCTGCGTGTTGGGACGCAAGTTCAGATCGTCTAGAGCGTTGAAACCACCATGTGTCACCAGCAACACTGAGATGTTTTTTCTATTCAGCAACTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTCACAACTCATGTCATGAATAATCAACTGAATGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCGTCGTACCGGGTAAAACGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTAGTTAACGCCGCTAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATACAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAGAATAGTGCAACACCAGTGGGAACCGCAAAAACAGTCATGTGCGGTACGTATCCAGTAATCCACGCCGTTGGACCGAACTTCTCTAATTATTTGGAATCTGAAGGGGACCGGGAATTGGCAGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGTGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGATAGGCTGACCCAGTCACTGAACCACCTCTTCACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGTCGCGACAAAGAATGGGAGAAGAAAATATCCGAGGCCATACAGATGCGGACTCAAGTGGAGTTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATATTGTTCGCGTGCACCCTGACAGCAGCTTGGCAGGCAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTACTCATATCTAGAAGGGACTCGTTTTCACCAGACGGCAGTGGACATGGCAGAGATATATACTATGTGGCCAAAGCAAACAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAATCGATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCGTCTCCTCCAAAAACTGTCCCGTGCCTTTGCCGTTACGCCATGACTCCGGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCACGTCACAAGTATAATTGTGTGTTCCTCGTTTCCCCTTCCAAAGTACAAAATAGAAGGAGTGCAAAAAGTCAAATGCTCTAAGGTAATGCTATTTGACCACAACGTGCCATCAC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GAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAATAGACCGGGCTACAGTCCCATGGTATTGGAGATGGAACTACTGTCAGTCACTTTGGAGCCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTACAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGCAAGGACAAAAACCTACCTGACTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTTATGTGGGGCGGAGCCTACTGCTTCTGCGACGCTGAAAACACGCAATTGAGCGAAGCACACGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAACATCACTGTAACTGCCTATGCTAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCCAAATTCATTGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAACAAAATTGTGGTGTACAAAGGTGACGTCTATAACATGGACTACCCGCCCTTTGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGATATCCAAAGTCGCACACCTGAGAGTAAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGGCTGCGGGTACGGTACATGTGCCATACTCTCAGGCACCATCTGGCTTTAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGCCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGGTGAATTGCGCCGTAGGGAACATGCCCATCTCCATCGACATACCGGATGCGGCCTTCATTAGGGTCGTCGACGCGCCCTCTTTAACGGACATGTCGTGCGAGGTACCAGCCTGCACCCATTCCTCAGATTTCGGGGGCGTCGCCATTATTAAATATGCAGCCAGCAAGAAAGGCAAGTGTGCGGTGCATTCGATGACCAACGCCGTCACAATTCGGGAAGCTGAGATAGAAGTTGAAGGGAATTCTCAGCTGCAAATCTCTTTCTCGACGGCCTTGGCCAGCGCCGAATTCCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGTAGCCGAGTGCCACCCTCCGAAGGACCACATAGTCAATTACCCGGCGTCACATACCACCCTCGGGGTCCAGGACATTTCCGCTACGGCGCTGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGCGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATTCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTCAGCAGGCACTAACTTGACAACTAAGTATGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACTGTAAATAGCTAATAATCTATAGATCAAAGGGCTATACAACCCCTGAATAGTAACAAAATACAAAATCACTAAAAATTATAAAAACAGAAAAATACATAAATAGGTATACGTGTCCCCTAAGAGACACATTGTATGTAGGTGATAAGTATAGATCAAAGGGCCGAACAACCCCTGAATAGTAACAAAACATGAAAATCAATAAAAATCATAAAATAGAAAAACCATAAACAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATACAACCCCTGAATAGTAACAAAACACAAAACTAATAAAAATTAAATGAATACCATAATTGGCAAACGGAAGAGATGTAG
| 9,912 |
OQ148631.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,682 |
GenBank
| null |
Brazil: Bahia
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-10-20
| null | null |
Chikungunya virus strain BHI4458/H806905, complete genome
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GTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAAGAACCCATCATGGATCCTGTGTACGTGGACATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCCAGGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCTATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGACATCGGCAGTGCACCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTCTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCCAATTATGCGAGAAAGCTAGCATCTGCTGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATCTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGCAGTAATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTCTGCTTGCACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACACGCACCCACGTCGCTATACCACCAGGCGATTAAAGGGGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAATGCCATGGCGGGTGCCTACCCCTCATATTCGACAAACTGGGCAGACGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACGGAAGGTAGACGAGGTAAATTGTCTATTATGAGAGGGAAGAAGCTAAAACCGTGTGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTCTACCCGGAAAGCCGCAAGCTACTTAAGAGCTGGCACTTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAACTCAGCTTCACATGCCGCTGTGATACAGTGGTTTCGTGCGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACAGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTTGACGGCGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACATACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAATACGAACACCATGAAAAACTATCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAAGCCTTCAGTAAGTGGGCAAAGGAGTGCCGGAAAGACATGGAAGATGAAAAACTCCTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTATGGGCATTCAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATTCAGAAGGTTCAGGCCGAGTTTGACAGCTTTGTGGTACCGAGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCCTTGAGGACTAGAATCAAATGGTTGTTAAGCAAGGTGCCAAAAACCGACCTGATCCCATATAGCGGGGACGCCCAAGAAGCCCGGGACGCAGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCGTGAAGCCCTACCACCTCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTTCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAGCTTGAGGACAGAGCGGGTGCAGGAATAATAGAGACTCCTAGAGGAGCTATCAAAGTTACTGCCCAACCAACAGACCACGTCGTGGGAGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTACTACGGAGCCAGAAGCTCAGCCTAATTCACGCTTTGGCGGAGCAAGTGAAGACGTGCACGCACAGCGGACGAGCAGGGAGGTACGCGGTCGAAGCGTACGACGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATCTCGCCTGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTATAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGCTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCCCTGAACACCGACGAAGAGTCGTATGAGCTGGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGATGTGGACCAGAGAAGATGCTGTAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGACTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATATGAAGGGCTAAAAATCCGCCCTGCCTGCCCATACAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGAGTACCAGGATCTGGCAAGTCAGCTATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCACCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAGATATCTGCACGTACGGTTGACTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAACAGGCCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCTTTGATCGCCTTGGTTAGACCAAGGCAGAAAGTTGTACTCTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTATAATCACAACATCTGCACCCAAGTGTACCACAAAAGTATCTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACCGCCATTGTGTCATCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACAAGCCGATTGTAGTGGACACTACAGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGATCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGATACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTATGCAGTTAGGCAAAAAGTTAATGAAAACCCGCTCTATGCATCAACGTCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACACGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTTTCCGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAAGCAACTATCAAGGAGTGGGAGGTGGAGCATGCATCAATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAATGACCTTTGATACATTCCAAAACAAAGCCAATGTTTGTTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCCTTCAAAGAAGATAAAGCATACTCACCTGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATTTAGACAGTGGGCTATTTTCTAAACCATTGGTGTCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCTGGAGGGAAGATGTTCGGATTCAACCCCGAGGCAGCATCCATTCTAGAAAGAAAGTATCCATTCACAAAAGGGAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACCACCAGGAGGATAGAAGACTTTAACCCTACCACCAATATTATACCGGCCAATAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAATAAGATAAACGGCCACCACGTGCTCCTGGTCAGTGGCTATAATCTTGTACTGCCTACTAAGAGAGTCACTTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTACACATACAACCTAGAGTTGGGTCTGCCAGCAACGCTTGGCAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGACCACGCAATGAAACTGCAAATGCTCGGGGGTGACTCATTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATATGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTCATCTGCGTGTTGGGACGCAAGTTCAGATCGTCTAGAGCGTTGAAACCACCATGTGTCACCAGCAACACTGAGATGTTTTTCCTATTCAGCAACTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTCACAACTCATGTCATGAATAATCAACTGAATGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCGTCGTACCGGGTAAAACGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTAGTTAACGCCGCTAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATACAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAGAATAGTGCAACACCAGTGGGAACCGCAAAAACAGTCATGTGCGGTACGTATCCAGTAATCCACGCCGTTGGACCGAACTTCTCTAATTATTTGGAATCTGAAGGGGACCGGGAATTGGCAGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGTGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGATAGGCTGACCCAGTCACTGAACCACCTCTTCACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGTCGCGACAAAGAATGGGAGAAGAAAATATCCGAGGCCATACAGATGCGGACTCAAGTGGAGTTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATATTGTTCGCGTGCACCCTGACAGCAGCTTGGCAGGCAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTACTCATATCTAGAAGGGACTCGTTTTCACCAGACGGCAGTGGACATGGCAGAGATATATACTATGTGGCCAAAGCAAACAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAATCGATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCGTCTCCTCCAAAAACTGTCCCGTGCCTTTGCCGTTACGCCATGACTCCGGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCACGTCACAAGTATAATTGTGTGTTCCTCGTTTCCCCTTCCAAAGTACAAAATAGAAGGAGTGCAAAA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CACTGTGAGCGCGTACGAACACGTAACAGTGATCCCGAACACGGTGGGAGTACCGTATAAGACTCTAGTCAATAGACCGGGCTACAGTCCCATGGTATTGGAGATGGAACTACTGTCAGTCACTTTGGAGCCAACGCTATCGCTTGATTACATCACGTGCGAGTACAAAACCGTTATCCCGTCTCCGTACGTGAAATGCTGCGGTACAGCAGAGTGCAAGGACAAAAACCTACCTGACTACAGCTGTAAGGTCTTCACCGGCGTCTACCCATTTATGTGGGGCGGAGCCTACTGCTTCTGCGACGCTGAAAACACGCAATTGAGCGAAGCACACGTGGAGAAGTCCGAATCATGCAAAACAGAATTTGCATCAGCATACAGGGCTCATACCGCATCCGCATCAGCTAAGCTCCGCGTCCTTTACCAAGGAAATAACATCACTGTAACTGCCTATGCTAACGGCGACCATGCCGTCACAGTTAAGGACGCCAAATTCATTGTGGGGCCAATGTCTTCAGCCTGGACACCTTTCGACAACAAAATTGTGGTGTACAAAGGTGACGTCTATAACATGGACTACCCGCCCTTTGGCGCAGGAAGACCAGGACAATTTGGCGATATCCAAAGTCGCACACCTGAGAGTAAAGACGTCTATGCTAATACACAACTGGTACTGCAGAGACCGGCTGCGGGTACGGTACATGTGCCATACTCTCAGGCACCATCTGGCTTTAAGTATTGGCTAAAAGAACGAGGGGCGTCGCTGCAGCACACAGCACCATTTGGCTGCCAAATAGCAACAAACCCGGTAAGAGCGGTGAATTGCGCCGTAGGGAACATGCCCATCTCCATCGACATACCGGATGCGGCCTTCATTAGGGTCGTCGACGCGCCCTCTTTAACGGACATGTCGTGCGAGGTACCAGCCTGCACCCATTCCTCAGATTTCGGGGGCGTCGCCATTATTAAATATGCAGCCAGCAAGAAAGGCAAGTGTGCGGTGCATTCGATGACCAACGCCGTCACAATTCGGGAAGCTGAGATAGAAGTTGAAGGGAATTCTCAGCTGCAAATCTCTTTCTCGACGGCCTTGGCCAGCGCCGAATTCCGCGTACAAGTCTGTTCTACACAAGTACACTGTGTAGCCGAGTGCCACCCTCCGAAGGACCACATAGTCAATTACCCGGCGTCACATACCACCCTCGGGGTCCAGGACATTTCCGCTACGGCGCTGTCATGGGTGCAGAAGATCACGGGAGGCGTGGGACTGGTTGTCGCTGTTGCAGCACTGATTCTAATCGTGGTGCTATGCGTGTCGTTCAGCAGGCACTAACTTGACAACTAAGTATGAAGGTATATGTGTCCCCTAAGAGACACACTGTAAATAGCTAATAATCTATAGATCAAAGGGCTATACAACCCCTGAATAGTAACAAAATACAAAATCACTAAAAATTATAAAAACAGAAAAATACATAAATAGGTATACGTGTCCCCTAAGAGACACATTGTATGTAGGTGATAAGTATAGATCAAAGGGCCGAACAACCCCTGAATAGTAACAAAACATGAAAATCAATAAAAATCATAAAATAGAAAAACCATAAACAGAAGTAGTTCAAAGGGCTATACAACCCCTGAATAGTAACAAAACACAAAACTAATAAAAATTAAATGAATAC
| 9,913 |
OQ148632.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,645 |
GenBank
| null |
Brazil: Bahia
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014-06-11
| null | null |
Chikungunya virus strain BHI4550/H807284, complete genome
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GTAGAGCAGTAAGAAACTGGTAGGCTACGTGTGTCTCACGCAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAAGAACCCATCATGGATCCTGTGTACGTGGACATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCCAGGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCTATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGACATCGGCAGTGCACCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTCTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCCAATTATGCGAGAAAGCTAGCATCTGCTGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATCTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGCAGTAATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTCTGCTTGCACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACACGCACCCACGTCGCTATACCACCAGGCGATTAAAGGGGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAATGCCATGGCGGGTGCCTACCCCTCATATTCGACAAACTGGGCAGACGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACGGAAGGTAGACGAGGTAAATTGTCTATTATGAGAGGGAAGAAGCTAAAACCGTGTGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTCTACCCGGAAAGCCGCAAGCTACTTAAGAGCTGGCACTTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAACTCAGCTTCACATGCCGCTGTGATACAGTGGTTTCGTGCGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACAGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTTGACGGCGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACATACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAATACGAACACCATGAAAAACTATCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAAGCCTTCAGTAAGTGGGCAAAGGAGTGCCGGAAAGACATGGAAGATGAAAAACTCCTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTATGGGCATTCAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATTCAGAAGGTTCAGGCCGAGTTTGACAGCTTTGTGGTACCGAGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCCTTGAGGACTAGAATCAAATGGTTGTTAAGCAAGGTGCCAAAAACCGACCTGATCCCATATAGCGGGGACGCCCAAGAAGCCCGGGACGCAGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCGTGAAGCCCTACCACCTCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTTCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAGCTTGAGGACAGAGCGGGTGCAGGAATAATAGAGACTCCTAGAGGAGCTATCAAAGTTACTGCCCAACCAACAGACCACGTCGTGGGAGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTACTACGGAGCCAGAAGCTCAGCCTAATTCACGCTTTGGCGGAGCAAGTGAAGACGTGCACGCACAGCGGACGAGCAGGGAGGTACGCGGTCGAAGCGTACGACGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATCTCGCCTGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTATAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGCTACACCACATTGCGATGCACGGACCAGCCCTGAACACCGACGAAGAGTCGTATGAGCTGGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGATGTGGACCAGAGAAGATGCTGTAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGACTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATATGAAGGGCTAAAAATCCGCCCTGCCTGCCCATACAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGAGTACCAGGATCTGGCAAGTCAGCTATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCACCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAGATATCTGCACGTACGGTTGACTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAACAGGCCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCTTTGATCGCCTTGGTTAGACCAAGGCAGAAAGTTGTACTCTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTATAATCACAACATCTGCACCCAAGTGTACCACAAAAGTATCTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACCGCCATTGTGTCATCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACAAGCCGATTGTAGTGGACACTACAGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGATCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGATACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTATGCAGTTAGGCAAAAAGTTAATGAAAACCCGCTCTATGCATCAACGTCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACACGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTTTCCGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAAGCAACTATCAAGGAGTGGGAGGTGGAGCATGCATCAATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAATGACCTTTGATACATTCCAAAACAAAGCCAATGTTTGTTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCCTTCAAAGAAGATAAAGCATACTCACCTGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATTTAGACAGTGGGCTATTTTCTAAACCATTGGTGTCTGTGTATTACGCGGATAACCACTGGGATAATAGGCCTGGAGGGAAGATGTTCGGATTCAACCCCGAGGCAGCATCCATTCTAGAAAGAAAGTATCCATTCACAAAAGGGAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACCACCAGGAGGATAGAAGACTTTAACCCTACCACCAATATTATACCGGCCAATAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAATAAGATAAACGGCCACCACGTGCTCCTGGTCAGTGGCTATAATCTTGTACTGCCTACTAAGAGAGTCACTTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTACACATACAACCTAGAGTTGGGTCTGCCAGCAACGCTTGGCAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGACCACGCAATGAAACTGCAAATGCTCGGGGGTGACTCATTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATATGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTCATCTGCGTGTTGGGACGCAAGTTCAGATCGTCTAGAGCGTTGAAACCACCATGTGTCACCAGCAACACTGAGATGTTTTTCCTATTCAGCAACTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTCACAACTCATGTCATGAATAATCAACTGAATGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCGTCGTACCGGGTAAAACGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTAGTTAACGCCGCTAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATACAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAGAATAGTGCAACACCAGTGGGAACCGCAAAAACAGTCATGTGCGGTACGTATCCAGTAATCCACGCCGTTGGACCGAACTTCTCTAATTATTTGGAATCTGAAGGGGACCGGGAATTGGCAGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGTGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGATAGGCTGACCCAGTCACTGAACCACCTCTTCACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGTCGCGACAAAGAATGGGAGAAGAAAATATCCGAGGCCATACAGATGCGGACTCAAGTGGAGTTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATATTGTTCGCGTGCACCCTGACAGCAGCTTGGCAGGCAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTACTCATATCTAGAAGGGACTCGTTTTCACCAGACGGCAGTGGACATGGCAGAGATATATACTATGTGGCCAAAGCAAACAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAATCGATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCGTCTCCTCCAAAAACTGTCCCGTGCCTTTGCCGTTACGCCATGACTCCGGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCACGTCACAAGTATAATTGTGTGTTCCTCGTTTCCCCTTCCAAAGTACAAAATAGAAGGAGTGCAAAA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| 9,914 |
OQ148633.1
|
Chikungunya virus
|
Santos,A.C.M., Silva,S.P., Cruz,A.C.R.
|
Evandro Chagas Institute, Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers
|
Brazil
|
2023-12-29
| null |
Chikungunya virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,710 |
GenBank
| null |
Brazil: Para
|
Brazil
|
Homo sapiens
|
blood
|
2016-02-16
| null | null |
Chikungunya virus strain BNV1022/H830130, complete genome
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CACGTAGCCTACCAGTTTCTTACTGCTCTACTCTGCAAAGCAAGAGATTAAGAACCCATCATGGATCCTGTGTACGTGGACATAGACGCTGACAGCGCCTTTTTGAAGGCCCTGCAACGTGCGTACCCCATGTTTGAGGTGGAACCCAGGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAATGCTAGAGCGTTCTCGCATCTAGCTATAAAACTAATAGAGCAGGAAATTGATCCCGACTCAACCATCCTGGACATCGGCAGTGCACCAGCAAGGAGGATGATGTCGGACAGGAAGTACCACTGCGTCTGCCCGATGCGCAGCGCAGAAGATCCCGAGAGACTCGCCAATTATGCGAGAAAGCTAGCATCTGCTGCAGGAAAAGTCCTGGACAGAAACATCTCTGGAAAGATCGGGGACTTACAAGCAGTAATGGCCGTGCCAGACACGGAGACGCCAACATTCTGCTTGCACACAGATGTCTCATGTAGACAGAGAGCAGACGTCGCGATATACCAAGACGTCTATGCTGTACACGCACCCACGTCGCTATACCACCAGGCGATTAAAGGGGTCCGAGTGGCGTACTGGGTAGGGTTCGACACAACCCCGTTCATGTACAATGCCATGGCGGGTGCCTACCCCTCATATTCGACAAACTGGGCAGACGAGCAGGTACTGAAGGCTAAGAACATAGGATTATGTTCAACAGACCTGACGGAAGGTAGACGAGGTAAATTGTCTATTATGAGAGGGAAGAAGCTAAAACCGTGTGACCGTGTGCTGTTCTCAGTAGGGTCAACGCTCTACCCGGAAAGCCGCAAGCTACTTAAGAGCTGGCACTTACCATCGGTGTTCCATCTAAAGGGCAAACTCAGCTTCACATGCCGCTGTGATACAGTGGTTTCGTGCGAGGGCTACGTCGTTAAGAGAATAACGATGAGCCCAGGCCTTTATGGAAAAACCACAGGGTATGCGGTAACCCACCACGCAGACGGATTCTTGATGTGCAAGACTACCGACACGGTTGACGGCGAAAGAGTGTCATTCTCGGTGTGCACATACGTGCCGGCGACCATTTGTGATCAAATGACCGGCATCCTTGCTACAGAAGTCACGCCGGAGGATGCACAGAAGCTGTTGGTGGGGCTGAACCAGAGAATAGTGGTTAACGGCAGAACGCAACGGAATACGAACACCATGAAAAACTATCTGCTTCCCGTGGTCGCCCAAGCCCTCAGTAAGTGGGCAAAGGAGTGCCGGAAAGACATGGAAGATGAAAAACTCCTGGGGGTCAGAGAAAGAACACTGACCTGCTGCTGTCTATGGGCATTCAAGAAGCAGAAAACACACACGGTCTACAAGAGGCCTGATACCCAGTCAATTCAGAAGGTTCAGGCCGAGTTTGACAGCTTTGTGGTACCGAGCCTGTGGTCGTCCGGGTTGTCAATCCCCTTGAGGACTAGAATCAAATGGTTGTTAAGCAAGGTGCCAAAAACCGACCGGATCCCATATAGCGGGGACGCCCAAGAAGCCCGGGACGCAGAAAAAGAAGCAGAGGAAGAACGAGAAGCAGAACTGACTCGTGAAGCCCTACCACCTCTACAGGCAGCACAGGAAGATGTTCAGGTCGAAATCGACGTGGAACAGCTTGAGGACAGAGCGGGTGCAGGAATAATAGAGACTCCTAGAGGAGCTATCAAAGTTACTGCCCAACCAACAGACCACGTCGTGGGAGAGTACCTGGTACTTTCCCCGCAGACCGTACTACGGAGCCAGAAGCTCAGCCTAATTCACGCTTTGGCGGAGCAAGTGAAGACGTGCACGCACAGCGGACGAGCAGGGAGGTACGCGGTCGAAGCGTACGACGGCCGAGTCCTAGTGCCCTCAGGCTATGCAATCTCGCCTGAAGACTTCCAGAGTCTAAGCGAAAGCGCAACGATGGTGTATAACGAAAGAGAGTTCGTAAACAGAAAGCTACATCACATTGCGATGCACGGACCAGCCCTGAACACCGACGAAGAGTCGTATGAGCTGGTGAGGGCAGAGAGGACAGAACACGAGTACGTCTACGATGTGGACCAGAGAAGATGCTGTAAGAAGGAAGAAGCTGCAGGACTGGTACTGGTGGGCGACTTGACTAATCCGCCCTACCACGAATTCGCATATGAAGGGCTAAAAATCCGCCCTGCCTGCCCATACAAAATTGCAGTCATAGGAGTCTTCGGAGTACCAGGATCTGGCAAGTCAGCTATTATCAAGAACCTAGTTACCAGGCAAGACCTGGTGACTAGCGGAAAGAAAGAAAACTGCCAAGAAATCACCACCGACGTGATGAGACAGAGAGGTCTAGAGATATCTGCACGTACGGTTGACTCGCTGCTCTTGAATGGATGCAACAGGCCAGTCGACGTGTTGTACGTAGACGAGGCGTTTGCGTGCCACTCTGGAACGTTACTTGCTTTGATCGCCTTGGTTAGACCAAGGCAGAAAGTTGTACTCTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTCTTCAATATGATGCAGATGAAAGTCAACTATAATCACAACATCTGCACCCAAGTGTACCACAAAAGTATCTCCAGGCGGTGTACACTGCCTGTGACCGCCATTGTGTCATCGTTGCATTACGAAGGCAAAATGCGCACTACGAATGAGTACAACAAGCCGATTGTAGTGGACACTACAGGCTCAACAAAACCTGACCCTGGAGATCTCGTGTTAACGTGCTTCAGAGGGTGGGTTAAACAACTGCAAATTGACTATCGTGGATACGAGGTCATGACAGCAGCCGCATCCCAAGGGTTAACCAGAAAAGGAGTTTATGCAGTTAGGCAAAAAGTTAATGAAAACCCGCTCTATGCACCAACGTCAGAGCACGTCAACGTACTCCTAACACGTACGGAAGGTAAACTGGTATGGAAGACACTTTCCGGTGACCCGTGGATAAAGACGCTGCAGAACCCACCGAAAGGAAACTTCAAAGCAACTATCAAGGAGTGGGAGGTGGAGCATGCATCAATAATGGCGGGCATCTGCAGTCACCAAATGACCTTTGATACATTCCAAAACAAAGCCAATGTTTGTTGGGCTAAGAGCTTGGTCCCTATCCTCGAAACAGCGGGGATAAAACTAAATGATAGGCAGTGGTCCCAGATAATTCAAGCCTTCAAAGAAGATAAAGCATACTCACCTGAAGTAGCCCTGAATGAAATATGCACGCGCATGTATGGGGTGGATTTAGACAGTGGGCTATTTTCTAAACCATTGGTGTCTGTGTATTACGCGGATAATCACTGGGATAATAGGCCTGGAGGGAAGATGTTCGGATTCAACCCCGAGGCAGCATCCATTCTAGAAAGAAAGTATCCATTCACAAAAGGGAAGTGGAACATCAACAAGCAGATCTGCGTGACCACCAGGAGGATAGAAGACTTTAACCCTACCACCAATATTATACCAGCCAATAGGAGACTACCACACTCATTAGTGGCCGAACACCGCCCAGTAAAAGGGGAAAGAATGGAATGGCTGGTTAATAAGATAAACGGCCACCACGTGCTCCTGGTCAGTGGCTATAATCTTGTACTGCCTACTAAGAGAGTCACTTGGGTAGCGCCACTAGGTGTCCGCGGAGCGGACTACACATACAACCTAGAGTTGGGTCTGCCAGCAACGCTTGGCAGGTATGACCTAGTGGTCATAAACATCCACACACCTTTTCGCATACACCATTACCAACAGTGCGTAGACCACGCAATGAAACTGCAAATGCTCGGGGGCGACTCATTGAGACTGCTCAAACCGGGTGGCTCTCTATTGATCAGAGCATATGGTTACGCAGATAGAACCAGTGAACGAGTCATCTGTGTGTTGGGACGCAAGTTCAGATCGTCTAGAGCGTTGAAACCACCATGTGTCACCAGCAACACTGAGATGTTTTTCCTATTCAGCAACTTTGACAATGGCAGAAGGAATTTCACAACTCATGTCATGAATAATCAACTGAATGCAGCCTTTGTAGGACAGGCCACCCGAGCAGGATGTGCACCGTCGTACCGGGTAAAACGCATGGACATCGCGAAGAACGATGAAGAGTGCGTAGTTAACGCCGCTAACCCTCGCGGGTTACCGGGTGACGGTGTTTGCAAGGCAGTATACAAAAAATGGCCGGAGTCCTTTAAGAATAGTGCAACACCAGTGGGAACCGCAAAAACAGTCATGTGCGGTACGTATCCAGTAATCCACGCCGTTGGACCGAACTTCTCTAATTATTTGGAATCTGAAGGGGACCGGGAATTGGCAGCTGCCTATCGAGAAGTCGCAAAGGAAGTAACTAGACTGGGAGTAAATAGTGTAGCTATACCTCTCCTCTCCACAGGTGTATACTCAGGAGGGAAAGATAGGCTGACCCAGTCACTGAACCACCTCTTCACAGCCATGGACTCGACGGATGCAGACGTGGTCATCTACTGTCGCGACAAAGAATGGGAGAAGAAAATATCCGAGGCCATACAGATGCGGACTCAAGTGGAGTTGCTGGATGAGCACATCTCCATAGACTGCGATATTGTTCGCGTGCACCCAGACAGCAGCTTGGCAGGCAGAAAAGGATACAGCACCACGGAAGGCGCACTGTACTCATATCTAGAAGGGACTCGTTTTCACCAGACGGCAGTGGACATGGCAGAGATATATACTATGTGGCCAAAGCAAACAGAGGCCAACGAGCAAGTCTGCCTATATGCCCTGGGGGAAAGTATTGAATCGATCAGGCAGAAATGCCCGGTGGATGATGCAGATGCATCGTCTCCTCCAAAAACTGTCCCGTGCCTTTGCCGTTACGCCATGAATCCGGAACGCGTCACCCGACTTCGCATGAACCACGTCACAAGTATAATTGTGTGTTCCTCGTTTCCCCTTCCAAAGTACAAAATAGAAGGAGTGCAAAAAGTCAAATGCTCTAAGGTAATGCTATTTGACCACAA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| 9,915 |
NC_005778.1
|
Chilli veinal mottle virus
|
Joseph,J., Savithri,H.S.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2004-03-04
| null |
Chilli veinal mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,711 |
RefSeq
| 1 |
India
|
India
|
Capsicum annuum
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Chilli veinal mottle virus, complete genome
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AATACAAACATACAGAAAACAAACGAATTCAAGCAATCAAGCATTCAAGCGCTCTTTTATTTTACAAAATTTTCAAAGATTCTTGCTTTCTCCACTCCTTAAGTTCTATTAGTTTTCATCAATTTCAATTGTAGTTCACTCTCATTCCATCCTACAAGGGACGATGGCAGCACAAGTTATTTTCTCGTATCTTAAGAGCGGCAGTGGAGTTACCACAGACGCATGTCGTGCTCAGGCGATGCAATTCACATTTGGCAGTTTTACGCCTGGAAAAGTTAACTGGAACACTTTATCCAGTGCAATGATTGAGGAGTATGAAACTCGACAAGAAAGTTTTGAGCTGGCTTGTGAGAAGTTTCGGAAAGAACGAACAGATATGCGTATCGTTCGAAGGAAGGAGACCTTTCAGTATTCGCCTAAAACCAAATACCAACTTAAAGGGGCGCGAAGAAAGGAGAGGAAAGAAGAGCAAGAACGGAAGTTTCTTGCATCTAGTGACACAATTGTCGCACGAATTGTGTTCCCACCTGAGGCAATGAAAGTTGAGGCCCCAGTGGAGCCCATCCGCTTTCCTCCTGTGGTTGTGCGGAAGGTGAGGAAGCAACCAAGGCCGAATATTACGCGAGTTAGCACTGGTAGTTTCTCGCTCTTCATCAAGGAGTTGGTGAACACTTGTGATGATAGGCAGATACCTCTTGAAATGATCGCCAACAAGAGAGAGAGAGTCCATGTAAGGATTCGAAGGTTTACACCATCGCACCGTTGTGCACAAGTAAAGACACTCCACCACCGAGGCATATATCAGAATGTTGATTTTGAGTGTCCAATAGCACTCAAGAGTTTATTTGGTCTCATCGCACAACATGCATGGAAAGGCCAAGATGTCGACGAACTTAAGATTTCCATAGGGGATAGTGGTCTTTGTATTCCACATGGGAAACTCATCGGACGGGTGCTATCTGGTGATTCTGACTTCTTTACAGTCAGAGGTAGATATGGTTCACTATTGATAGATTCGCAAGCATATCTTCCGAAGAAAATTATCTCAAGAATTAATCATTATTCAGCAGGTGAACTCTTTTGGAAGGGATTCGATCGTGAGTTCAAAACTCACCGAACAACACCAGTCATTCACGCTGGAATGAACACCATGAATGTAGAGGAGTGCGGCTCTGTCGCTGCAATTGTTTGCCAAGCACTCATGCCATGTTGCAGAATCACGTGCACAGTGTGTGCAAAAGCGAATGTTGATCAAGGAACATCAGGACTACAGGAGCGATTGATTCACTCACTTGAAACTGGCATTAAAGAACTGGAGGATAGATATAAATCTTTCCCTCATGCTGCACAGTTACTCAAAGGTCATCTGTCAAGTTATAAGAAGCCTAATCCAAATCATGAGGCAACGAGTAAAGTGCAATTCTTAATCGGTGATAGGAAAGAGCAACCCTTTTCATATATCCTCGAAGTAAATGAAGTTCTCATTAGAGGCGGAAGAGCGACAAGTGAGGAATTCTCAAGAGCTTCAGATTGCTTATTAGAACTAGCCCGATTCCACAAGAATCGTGTTGAGTCATTGAAGAAAGGGTCTCTACACCTATTTAGAAATAAAGTGACATCAAAATCACACATAAACCCATCGTTGATGTGCGACAATCAATTAGATGCCAATGGTAACTTCATATGGGGAAAGCGCGGATATCACGCTAAGAGGTTTTTCTCAAATTACTTTGAGTTAATCCAGCCAACTGATGGGTATGATAAATATGTTATCAGAAAGTTTCCAAACGGAACCCGCAAGTTGGCAACAATTGGCAACCTCATCCTCTCAACCAACTTAGATCAGCTCAGGAAACAACTGGAAGGAGAAAGTATTGAAGCTATGCCATTAACACAGCAATGTGTTAGCAAGAGGTATGAATCATTTATACATCCATGTTGCTGTGTCACTTATGATGATGGATCACCAGTTTTGTCTGAGTTCAAAGCCCCAACAAAGAACCACCTCGTACTTGGCAACACGGGTGACTCTAAATATTTGGATCTACCGGCTGAAATTAGTGAAAATTTGTACATAGCAAAGGAGGGTTATTGTTATGTGAATATTTTCTTAGCTATGTTGGTTGATGTGGATGAGAAGGATGCAAAGGATTTCACTAAGTGGGTGCGAGACATAATTGTACAGCAGTTAGGACAGTGGCCAACGATGACTGATGTTGCACTTGCTTGTTACCAGCTTTCAGTGTTATTCCCATCAACTCGATCGGCTGAATTGCCGAGAATCTTGGTTGATCACAAGACTATGACAATGCATGTGATTGATTCATTTGGGTCATTGACAACAGGCTATCATGTTTTAAAGGCAAACACAACGAGTCAATTAATATTATTTGCCAGTGACACACTTGAATCCGAGATGAAAATGTACAGAGTTGGTGGTGAGGAAACACAAAGCATCCCGGGATTCAAAACCCGTTTGATGCGATCAGTCTATCGCCCATCTGTTTTTGAACAACTCATGATAGACGAGCCTCTCACCCTAACATTAGCACTCGCATCACCAACTTTGTTGAATGAGTTTTATACAAATGGCAGTTTGTATGAAGCCATGGAATTTGTAGGTCACACACAGATGCCAGTGCGCGTTGCAGTTACCAAGATACTGGAATTAGCACAGAAAGTCAATAGGGCAGAATCGATCTATGAGCAAGCTTCACTCATTAGTAATCACCTGTCTGAGTTGCATGGGATAATTGACCAAATGCCGTGTCGATCGGCATCCATATGCTGCGTACTCGAGTTCTTGCTAACCTCTCAACTAGACACAGAATGTGATGGAGAGCTGAATGCAATTGGTTTCAGAACACTCAAACATAAATCTCTCCACATCATGGAAAAAATCTACAAGGAGGATTTAAGAGCACTATGGTGCGAGTTAAGCTGGTCGGAAAAATTGCGATTCAAATTACATGTACTAAGATCAAGAAAGCAGTATATTCGCGATTCGCGAGAGATAATCTCAGGAACTTTGAAAGAAGCATTACATTGTTCCACAAGATTTGTACAGGAGAAGATAGTATTAATACCAACACCACTTCGCTACGTATCTGGTAAAATTGGGTGTGGAATAGCTAAAGTTAGGAAAAATGTATGGAGTATAATATATGGGCGTGCTGTTCATAATTTTAGAGATGCTCTTAGGTTTATACACACGTTGGCTATATTAAGCATTCTTTTAACAGTATATACTAATATAGTAGATATAAAGAATAAACATAAGAAAATGAATCTTCTGCACATAGAGGAACAAGAGATGAAGATTCAAAGCAGAATTAATAAGCATTATAATGATTTGACATTGTTGCATAATAGCCCACCTAGTGAAGTAGAGTTTATTCAATATGTCAGGGAGCATGATCCCTCCGCTTTGGCATATTGGAGCACGCAGGAAAAGTCAGTTGACCATCAAGCAAGTAAGAGACCATCGGAGGCTAAACTGGAACAAATCGTTGCATTTGTCGCATTAATGATGATGGTCTTCGACACTGATCGCAGTGATTGTGTATATAAAGTTCTTAATAAACTGCGGAATGTCATGGGCGTTGTCGATAATGATGCAGTGAATCATCAGAGCCTGGACACTATCCTGGAAAATTTTGATGAAAGGGATGAGATGATTGAATTCGAGATAACAGCGCCAGATGCAAAATCGATTGCGTACAAGTCATCAACGTTTCAGGTCTGGTGGGATAACCAACTGGCATTGAACAATGTAATTTCTCATTACAGAACAGAAGGTCACTTTGTTGAATTTACTCGTGACACATCAGCACAAGTGGCAAGTGACATTGCCAACAGTGACATGAAGGATTTTCTTGTGCGTGGTGCTGTTGGATCTGGGAAATCAACTGGACTCCCAAGTGCATTGTGTAAAAGGGGAAGAGTTCTGTTGTTGGAACCCACTCGACCTCTTGCAGAGAATGTACATGCACAATTGTCTGCCAGCCCATTTCACCTCAACCCAACACTTATGATGAGAAATAAATCTGTTTTTGGCTCCACCCCCATTACAGTTATGACAAGTGGCTATGCACTACATTATCTTGCAAATGATGCACAACGGCTTAAAGAGTTTAGTTTCATATTATTTGATGAATGCCATGTGTTAGATGCGAGTGCAATGGCCTTTAAGAGTTTACTGGTGGATAGGGAATTTGAAGGAAAGATTCTTAAAGTATCAGCCACACCGCCAGGGCGTGAAACTGAATTTTCCACACAATATCCTGTTCAGCTTAAAACTGAGGAGCACCTCAGTTTCCAACAGTTTGTGGATGCACAAGGCACAGGTGTCAATGCGGACGTAACAAGCATCGCAGACAACATCCTTGTCTACGTGTCAAGCTACAATGAAGTGGATCAACTTTCAAAGTTGTTAACCGATAAAAAGTTCAAGGTGACAAAAGTTGATGGTAGGACGATGAAATCAGGAGCCACAGAAATCAAGACAGTTGGTTCAAAGCATCGAAAGCACTTCATAGTCGCAACAAACATTATTGAGAATGGTGTGACAATTGACATTGAAGCGGTGGTTGATTTTGGTCTTAAAGTGAGTGCTGTGGTTGACGCTGATTTGCGTATGGTAAGAATTCTCAAAGTGCATTCAATAATGGAGAAGAATTCAGCGCTTGGTCGAGTTGGAAGAACGAAACCAGGATGTGCGTTGAGAATTGGTCACACAAATAAAGGAGTTGAAGCAATTCCAACAATGATAGCAAATGAAGCCGCCTTTCTTTGCTTAATTTATGGATTGCCTGTTATGACTGCGCAAGTGAGCACAAGTCTCATAAGTAACTGTACAGTGCAACAAGCTCGCACCATGGCACTCTTTGAGCTTCCTTTCTACTTCACACAAGATTATGTCTCAGCAGATGGCTCCTTGCACCCAGCCATTCATGCATTGCTCAGAATTCAGCTCCGAGAAAGTGAAATCCTTTTGAATA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| 8,412 |
OR590618.1
|
Chilli veinal mottle virus
|
Fan,Y., Wang,G.J.
|
Faculty of Ecology and Environment, Yunnan University
|
China
|
2023-10-24
|
YNpe
|
Chilli veinal mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,738 |
GenBank
| null |
China: Yunan,Puer
|
China
|
Nicotiana tabacum
| null |
2021-07
| null | null |
Chilli veinal mottle virus isolate YNpe, complete genome
|
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| 11,705 |
OR347840.1
|
Chilli veinal mottle virus
|
Venkataravanappa,V., Lakshminarayana Reddy,C.N., Krishna Reddy,M.
|
ICAR-Indian Institute of Horticultural Research, Division of Crop Protection
|
India
|
2023-09-25
|
To
|
Chilli veinal mottle virus
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,737 |
GenBank
| null |
India: Karnataka
|
India
|
Solanum lycopersicum
|
plant leaf
|
2022
| null | null |
Chilli veinal mottle virus isolate To, complete genome
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