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NC_055208.1
Citrus chlorotic spot virus
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Tassi,A., Kitajima,E.W., Harakava,R., Beserra,E., Freitas-Astua,J.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2021-06-01
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Dichorhavirus citri
Dichorhavirus
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Brazil: Teresina/Piaui
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Citrus sinensis
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PRJNA485481
Citrus chlorotic spot virus strain Trs1 segment RNA1, complete sequence
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1,817
NC_055209.1
Citrus chlorotic spot virus
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Tassi,A., Kitajima,E.W., Harakava,R., Beserra,E., Freitas-Astua,J.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2021-06-01
null
Dichorhavirus citri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
5,987
RefSeq
null
Brazil: Teresina/Piaui
Brazil
Citrus sinensis
null
2015
null
PRJNA485481
Citrus chlorotic spot virus strain Trs1 segment RNA2, complete sequence
GGGACACGGGCAGGGTCACAAGTCATCGTCTAGCACATGGTTTCGCTTAGTTGCATGTTCCGCAAGGTTCGATGTTAACTGGGCAGGTCAACCTTTTGCCCCTCACCAGGTCTACCTACAGGGTCTAGAGAATGATAGGGCATTAAACACAAAATAACAATAGTGCATTAGCAATGGAATCACTACTAAACACATCATATACTGAAACAAACCTTTCCGATAACATACAGCATGATCATGCTGAAGGAGAGGCAGTAGAAACGGGGGGCTCCTATCATCTCAAATCAGCACTGAGGACACATGATGATTACAAGAAGAACCACGGATGCAGACAGGACCTTGCAGTGCTTCTCGAATACAAATCGGGTCATCCTGTATCAAACCCATGCAAGTTGCTTCCTCTGTTGTGGTCCTTTATTGTGACAGGTGCTGCATCAATGTTCGACAGCAATGTTCACAATGAATTGACCGAACACTATAAGGATGAGGATATGTTGGCAGAGATGCTACATCTAACCGAGGAGGAGCTGCCGCTTGTGATGAATCAGCAAGATGCCTCACTGATCAATGATGAGGTCACAAGGATAATAGATGAGTCATGGAGGGTGGAGACATTCCTGGGAAGACTCAACTTCTTGAGATGGTTCTTGACACACCTTGTCATCAATCACAACAGAGGGGAGAACGGCATTGAGGATGGCCTATGCTACAAGGAGGGGATGGGAGTGTATACATATTATCTGGGAACCTCTCTGTCCATCACCACATCCAAAATGTGGGCTAACATAGATATCAATGGGGATAAGAGTATAATCCACATGAGTCACATTGTTAACGTGTTAGACAAACTCACTGAAAGATACAACTCCATAATCTACAACAGAATGTGCAGATCCACCTCTATGAGCTCGATCTACCCTTCAGACAGCACTCTTCAAAGTGTAATCAGCCTGGGAGACAGCCTACTGTTGGCAGAAGGGAATGAAGCCTATAGAGGCCTGGCCAGTTTCGAGGCTCTATGTGTAGGGGAGATTATCAACAAGGGGGACAAGGGAGTTTGGGATGTCAATAAGTTCCTGAGGACAATGAAACAGGAGGTGGGTCAATTGGGAGCTCAGTTTGACCACTGGTGTACGTCATTGTGCCGTATATTGGAGGGGCTGAATGTACAGCAGATCTCTTGCTTACATGGATTGTATAGAATATGGGGTCATCCGGTAGTGGATCTGGAGAAAGGGTTAGAAAAGCTAAGGTCTGTTGCGTTGGTTGAAAAATTCATTCCTAGAAGCTTCTCCATCAACACGTCCAACATGTTCAAGGAGACATTCTTCATGAACTATTACAAGAAGCACAAGTTTTATCCTCCCTATACTTGGATTGGCCCACCAGGCTCTCATTATCTGCAGCAGAATCTCCTCCTTGAGAAGGAAATTGACCGCCATAATATCAGGTATCACATAGAGGATTGGCAGAGTGTTCAGTGTGAGAAGACCTTTGAGATCCCAGCTACTTACAGCCTGGCCTCGTGCATCAAGGATAGGGCAATATCTCCTACTCGATCTGAACTGGAGAGAATGGTCCAGTCAAGCAGGTCTGTTATGAATCAGGATGCCAGGAGGGGGGTTCTTAAATGGCTAAACAGTAGCATGATACCGGTTAGGGACTTCCTTCAGAACATCAACGACAATAGCCTCAATTTTGATGACTGCATCATCGGCCTGTATCCTAAAGAAAGGGAGTTAAAATTGGAGGCCAGGTATTTTGCCTTAATGTCTTTCAAGATGAGGCTCTACTTTACTATCACTGAGCATTTAGCCAATGATCATCTCCTAGAGTATTTCCCCATGGTGACCATGTCAGACAGCATGTTGGAGTTGCAAAAGAAGTTGGATGCACTGAGCAGGAAGCAGACCTCATCCAAGAGGGGGGTTGTGCATTATGTCGTCAACATAGATTTCAGGAAGTGGAATCAGCAGATGAGGGAGGAAATGACAGTGGACCTATTTCATGACACAGACCGTCTGTTTGGCTTCACTAATCTTGTGGGTAGGACTCATGAGATCTTCAAGAGATCATACATTTATCTCTCATCCGGGGAATATGTGCCCACACTCAACAGCCGAGGGAAGCTAAAGACAGAAGCACCGTACAGCTGGACCAATGACCCCTCAGGCAAGGAGGGTCTCAGACAAAAATACTGGACTATTATGACTGCCTGTGATCTCATGGTTGTCGCGAGGAAATTCAACATGAAGATCGACCTGGTCGGTGGCGGAGATAATCAGGTGCTGATAGTGGAGGTCAGTTCTGACAGGCTAGACCATGATGGTACCATGAGTCAGGAAGGGAAGGCTGAGTGTCAAGAGAAGATGAATTCATTCATGCAGTCACTCTCAGAATATATGGAAGCAAAGGGCCTGCCCCTCAAGATGGAGGAAACATGGATATCCCCTGACCTGTTAATGTTCTTCAAAATGATGTATTTCAGGCATGTTACACTGATTTCACCTCTAAAGCAAGCATCAAGGGTGTTCCCATTGTCCAATGATCAAGTGATGACTATTGGGAACATGGCTTCCACGATCTCATCTGCAGTCACTGTACTATCATCCAAGGACATGCAGGTGGGGCCCGCCATCATGTTGGGAAGGCTCACTGTGGGAGACCTCAGTGTGATGGTGTGCAACAACCACCCCCTGTCATTGGACAAACGCATGTGGTCTGAGAAGGTCCCGATCTGCAGAGGGGGAGTGAGGAGGATAATTAATGTGCCGCCCCACAGGAGAGTTCCCAAAAAGATTTTCCTATCGTTGACACTCCACCACAAAGTTCTTGGAGGGTCCGCGATCATTAGCCCTCTCGGGATGCTGATGAGGGGGTTCCCAGACCCGTTATGCGAGCATTTAACATGGATGTCCATGATAATAAGGTCCAGGCCTGAGTACAGGATTTTCGCATGCATGTCATTAAACAACAAGTCTCCTTGGTCTCATCTCCTTGAGGACCCTGTAAGTGTGAATCATGATGCCCCCATACATGGATTAGCAGTCCTTCGCAGGGAGGCTGAAAATGCTCTTGCCTCTGCAAGGAAGTACACAAACAAGGACTTCCTTGAGCTCGCTCACACATGCAACAAGCAAATGATGGAGGGGCTAGCGGATGCCCTTTGCTCAGGTGATAACATAGACATCAGAGTCCTGCATGACATCATGGGTGCCAACCTTGGGGGGTATTTTAACTCCATTGCATCCAAGGTGAACAAGGCCTCCACTGTTCTAAGGATGAACAAAACATCCAAGGTGATTGAGACAATAACCGGTCAGGAAAAGGTGTGCATGTCCTATTATGCATCATATGGTATGATTGACCACGACTTGACTCCCTCAGCTTGCCCTACTGTGACTGCAAGAAGGTACAGGGCCCTCAGCTGGGGAAAGAACATAATGGGGATCACAACCCCCCATCCGGCTGCATTCTTGGAATATGTGTCAGGACCTCATGACTGCGACCACAACTATGTGCAGACCAAGACCTTGTCGTCTGGGGAAGTTGACCCACAAGTCAGAGGGCCCTTCATGGTCTATCAGGGATCGTACACCAAGGAGAAGTTCAAGCCTACTGAGATGGCTGCTGCATACGGGGAGGAGGATCTGTTATCTAGAGCCATTCACCTCATGAAGCTTATAAACTGGAGGTACCCCCCAGACTCATCCATGGCAAAGATCATTCGAGGCCTGCTGGGGTCGTTAACAGATGCTGATCCCTCCCTGTTTTATGGGATGATGGAATGGATATCAGGAGACGCCGAGCACAGATATCAGGACATGGCAACGAAACATGGAGGAGTTCCGAACATAGCATACTCCATACTCTCCTACGTCAGGGCAAACACTTCAACCTTCCGTAAACATTCCAGAGGAGGGAAGAATGAGACTATACATTTCCAAGCTGTTCTCATATACACCTCGATGATGAGTCTCTTCAAACATTATGGTGGGATAGGGCACTGGCATGAAAAGTGTAGCAAATGCATAACAAGGACAACAGCTGACCCTGACTTCCAGTTCAAGAAAAGGGTGTCATTCCCTATGTTGCCAGGCAACATGTTCGCATATGTCCCCTCGGAGATGATAAAGTTCCATTACCATGACCTGAGAAGGATAAGGGCACAGGAGATGGCAGATGATAGAATTGTGAGTCTGACAACCATGTCTGCCAGGGAGAAGGCGACTGCTGCTTGCAGCTTGCTATCAGCAGTGATTGCGGCAAGCCAGAGTAAAGACAGGTCAAATGACACTGTCAGTAGCATCACAATGTGGTCATCAATAATTCATGTGAAAGACCTCGTCCCGATGGTGTGCCTCAGATTGTCAGTGGATCACTTGATGAAAAGAAAGGAATGGGTTTGGCCTAAGCCCCACATACCTCAGAAAGTAGCCATGCTACTGGAGCCCTTCATCATGTCACCCTCCGGTAGAGACTGGATAACCGCCATGGGCCTTGACACGTCTGAGATGGGTCTGGGGCAGATCGGCATTATCAGGGACATCATCTCGAATGTGGTGGATGGAAGGGTGATACCAAAGGTGATGCCCAACAGGGTTTCCCCATTGTGGACCAATGATGTGATTTGTGCCAAGATCTTTGAGAACAACCACATAGTGGGCTGTGAAGAGTGCCTCAACAAAGGGTCAACCCTGGCGAGGACCGAGATTTGCAATGACATGAGGATAGAATATCTGTTCAAGATTTGCTCAGTGACACTGCCAGTATTCAAGGGGGACCTGACTCAGATGGACATCCCTATCTCAGTTGCCCCTCATTATGATTGGGAATCATCCCCTGTTCAAGTATACAGCGTGATAGCTGACGGCACCGAGTATGTCCCTTTCCCCAAAGATGGCCCCATAACCAGGTCAATACCCCTAGGAGCATCTGGGGTATCATCAATAATGGACATATTGCATGAGACGAGGGGAACCATATTAGTGTCCACAGAT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1,818
MG970598.1
Citrus chlorotic spot virus
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Tassi,A.D., Guerra-Peraza,O., Kitajima,E.W., Harakava,R., Beserra,J.E.A. Jr., Salaroli,R.B., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2020-02-24
Trs3
Dichorhavirus citri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,078
GenBank
1
Brazil: Teresina/Piaui
Brazil
Talipariti tiliaceum
null
2017
null
null
Citrus chlorotic spot virus isolate Trs3 segment RNA1, complete sequence
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53,802
MH595621.1
Citrus chlorotic spot virus
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Kitajima,E.W., Tassi,A.D., Harakava,R., Beserra,J.E.A. Jr., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2019-03-16
Trs4
Dichorhavirus citri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,082
GenBank
null
Brazil: Teresina/Piaui
Brazil
Agave
null
2018
null
null
Citrus chlorotic spot virus isolate Trs4 segment RNA1, complete sequence
ATGGCCAGATACGCAGATGTCGACTACACCTCTGTCCTAGACATATACTCGGACACTCCCGAGGAGAGCCAGGTGGCATCCAGCGCACCCACGCCTGTAACCTACAGCAGGGAAGCAGCTGTAGCCAAGCCTATAGTGGCCTTGGAAGCCCCCCCTGACACACACGCTGATGTTATTACATTATTCCAAACGATCATGGATCATGCAAACAGCCGAATGACCAAGAAGGATCTATTGGTCATAATGTCTCTCGGATTCTGCCTCACACCTCCCGGCTGCGAAGGGCCATCAATGTGGTCTGTGGCGCAGGGCGCTGTGGTCCAGCCGCTGTCCATGCCAGGAATAACCGCTGTGTATGATTCCCGGGCTGCTGCTGCCAGCTCAACCATGAACATTGACCCTGATGAAGGTGATCAGGCTGAAGACCGCCAGGCCCCACCTGATGATGAGGACGCTGCATCCCAGTGTCGTGCTATATCATACATATGCCTCAGTCTTATGAGGCTTGCTGTCAAGAGAGTTGAGACCTTTATGAAGGGAACACCTCAATTAGTCACAGCATACCACATACTCATGGGAGATCACTCCCCATTCCTTGCATCATTCAATTACAGCAGGGGTCTGTGCTCCAACATAAGCTCCCTATTCAACCAATGTGATGATATGAAGAGGACACTAGCACACCACTGCGCGGTGGCTGATGAGAGTCATCATAACAACAGAACAGTTCATGGTCCGCTGAGATTCCTGATTCTCCAGCATATGGATCTGAATGGAATGGTGCCCTACGGCATGTATGTCGATATGAAGAGAGGTCTCCCTCTGCTGAAGCCAGGGACAATACTCACATGGCTTCATGATGCCCAGGTTGCATCCACATTAATGCTAATATCCAAGATCAACAAGGACCATGATAGGACTGACAAGGCAGACAGGTTCTGGAGGTACTGTAGATGCATCGACCCGGGGTTCTTCATAGAGCTTCAGCAGTCAAGATGTTACATTCTAATCGCTAGAATGGCAGACATACTCGTCAGGGGAGGTTGCGTGAATGTAACTGAATACTCCGACCCCAAGAAGGCTGAGAGCATAAAGGACAAAGCCAACATACTAGCCAATGCTGAGAGGTTCGGGATAGAGTTCATGGCTGCTTACAATGCACTGTCAGGCACGTCAGAGGGAGCAGGGCCTGTGGCCAGAGCTCTTGCCAGTGCTGCAGTGGGCCAACCCACCAGGAGGATTCTGGTGCCCAGAAACCCAAGGCCCCAGCCAACGGTGAATGTGACCAGCAACCCTCCTCCCCAAAGAGTGGGAGCTCTGGACAGCATGATACAGGACCAAAGCTAAGTTGAGTTGTAGTTAACCTATAAGATCTAAATAATCGGTGTGCCAATCCTCATGTTGTTTATCTATTTGGTAGTCTTGTCATTTAAATAAAACATCAAAGACCAAGCTTGTACTCTCACAGACACATGTGTGCTCAGCAAATCTCTGGTTATCATAAATAAGTCCGATCACTAACGCTCTCTTTTGATATTAATACGCAGGTATGGCTAACATAGGATCGACATCCACATTGTACCCCGACATCCCTGACATGTCCCAGGTTCAACAAGACTTAGACAACCAGGCGTCTAATGACCCTGTTGATGCATTCATTTCTAAGTGGCCAACTCTGGGTGTCACACCGCCATTGTCTCTGTCCTCAAAAATCAAAGGACTAATATCCCGTAAATACTCCGGAAGACACGTGGTTCTAGATGAGTTCACCATGGACTTGTGCTGTCTAGTTTGGAATGCCAGCTCAGAGCATCACCATCTCATAAATAAATCACAGGTCAACAAGATGAGCTCTCTAATAGACCAGCTTTCTGAAATAATGAAAGACAAGAACCACACCCCCACTGTGGACATGTCTCCCCCAAAGCCTCCCATGAAGAGGAAAGTCCCTATCCAAGAGGATGAAACTGACATCCATGCTCTCATTGCAGACACTTGGACACCTGGCCGATCATCTAGCTGGTCCAAGAAACCCCTCAGTGAGCATTTTGAGTCCCTGGTCTGGCTCCTAAAAGACCATCTGAAGCTAGTCACTAAAGACTTCAGTGAGGAGTGGATAAAGAAGCAAGACCTTCCCAGCCTGTTAGGTGATATCACCATTTTCTGCTACATCAACAGAGACTCTCTCACTGAGGAACAGCTGGACACAATAAGGGCAATCGTCGTGGATCGCATGAATAGGAAGAAGAAAAGATGCCTGGATTAAGGGACATTGCAGACCTCCTATCGTATGTTGTGTTATCATACTCCACTATGAAGACTTTATTATTATCCATAGAGAGGGAAGATACTGAAACATGCTCTCTTCTTCTGGCAATCATGGTTTGCTTAATTATACTACTCAGCAGAAATAAATGACATTTAAATAAAACATCAATGATATGATATTAATACTCTTGACTATTTTGCTAATATACATTGCTGCATTAATAATATCTGCATTATTTGAGTTAAAATGTCCACACTGCCACCTTCAGTTATTTCAGGGCCCGTACATAGGGACGAGGTACGGGAGACAGCCAGCAGACGGATGGCCAGCAGGGATGAGTCGTTAGATGAGTTCAACAAGGAGTTGCAGACCGCACAGGCATGGCAAAGGAAGTTAATCCAGAAGCACCCCATCAAAGTTCTAGGAAGAGAGGGGGAAGGTAAGATAATCATGATTAAGAAGCCAATAATTATAAATGTTGCAAACATGATATCAAGGACTGTGGGAGGCGCGGTCAAGCCCATTTGGATAGTGGGCATAGCCATAAAGTGGAAGCCCTCTTGTGACCTGGCAACATCAGGTGTTTTGAAGTTGTCCATTCAAAACAAAGCAGTCAACAACCCCGTGCTGAGAGACCATACTGTGGTGCAGATAAGCCAAAGGGTGTCCTCTGCATTCGACATCCAATACACATCATCCTCCAAGCACAATGAGAGTGGGAACCCTTGGTCCTACAGCTATGAGATCAGCAATATGGATGATGCCCCTGTCAACATGGAGCTCGGGACAGCCATAATAATGCCCATAATCAAGCAGGACAACAGCAACACCCAGATGTTTGGAGGGGTGCAGTGCGAGATATACGGGGGGCACTTTCCTCTCAACATACCTGCTGTGTGTTACTGTGCACCAGGCCCCAGGTTCAAGACCAACCTGTCTGAGATTGAGAAGAATGTTCAGATGATTCTCAGGTTCCTCAATGTTCAAGGTATAACTGACATTGATGAAGAGCTAGCGTATAAGGTTATACAGTGTTGTGACCCTGAATCTGCCAGGATCCTTTACACAGGTGTACGGAAACAGGTATGGAGCATGGTGGACTCTGACCACATCAATACTCTCAAGTCTCTGGTGTATGACTGCAAGTCGGGAAGGGCAGTCTCTTACATCACCTTGGATTATATGAGGAACCTTGGCAGCCTGGGGGGAACCAAAACCCACACCTATGTGTGATAATCATGTACTACACCCGGAGACTACCTCGCAATAATGATAGTAATAACATATAGCATCATGTCCATCTTCCTCACGCTGAGGGGTCTATTTAAATAAAACCTCAAAGACAATCCTTTATATTGTTGATTCAAAAATTCTTTTACTTTCACGCTGATATTCTATTTTCCAGGTCGATCAACATGGCTGCAAGTTCAAAGAGCACGGAAGAGCTATGCACTGTCATGTCTGTTAGGTCCAGGGTCACCCTCACATCGTCCAGCAAGCCCCCGATGGATGCAGCAACCATTGCCAGCATGGTCAAGGCTATAGGCAGCATGAAGTCTAAGGCTCTCACTCCTGAGGGGACAGAGGTGTCAGGAGACTGGCAAGCGCTTATCACTGAGGTTGCCCGACAGTCCAAGCCTCAGGTGTCAGGCCCGTTTCTAACTAAGGATCTTGAGTCCGGGAACATATACACTATCAACATGATAATCGGAGGCCCCCTGAATGTCAGAGACAACAACCACGGCAGGGTCATGACCCTAAGAGCAGGGCCACTATACGACACGCCCCACTACAGCTCCAATGACAGGGTGGATATTATGCTCAGCAGCGGCAAGGCATCTGTAGGAATCTCAACGTCCATTGCCACTGTCAAGAGGCCCAGGTCTAGCTGCGAGAAGCTGGTAAACCAATATATAATCCTCCCAAAGGAGAAAATTAATCCCCCAGCCCCAAGACCCAGTGGTTAGAACCTTATCTGGGAAACCAGGAGATGCTCTCCCTCCTATCAGACGTGGCTAGTATATTAAAGACGAGGAAAGGTCCCAGGCTTGGTTATAGTCTCCATGATGATGACCTAAATCAAGGAGAGAAGTAATAATGTCAACAATATATATGTATTTGTATTGTGCTACATGATCGTATGCATTTAAATAAAACATCAAGGATATCAGATTCACGCGCATGAAACACAAGATGGCTCACACTGAAAGGACCATAAATTTCCTTGCTGTGTTACTAATTTCTGTCTCACATTTCTTTTCAGGTACCATGTGCTTCAACATAGTCCCCTCGGTCATGTGCCCACACAAAGATGGGGTGTCACTCAATGATTGGAGGCATTTGTGCTTAGGGGCATGTAGTCCAACTGACATAGAGCATGGGATGCATCGATACATGATTCTGCACAATGCACTAGTGGATTACAAGGCCTACGGCTATAGAATAACAGCCGAGAGGAAGACCTTGTCCTCTCATGTGTCCTTCTTCGGCAGTTGTCATATATCGGAGTCTGTATCACCGATGAGTGCAGGTGATGTACCTGAAGGAGACATCAATGAGATACTAAGGCATGGAGGAGCGGGGGGGGTTATGGATCATGTCAAAACCCCATCTTGTGATTGGATAGCAGATAATCATGTGAGCGGAATCAAGCTCACCTATCAACGTGTGTCTGTCAGTGTCACTGATGATGACGGCAAGATGGTCGTGGAGTTCCCATCCCAGTCCCTCT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64,643
MH595622.1
Citrus chlorotic spot virus
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Kitajima,E.W., Tassi,A.D., Harakava,R., Beserra,J.E.A. Jr., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2019-03-16
Trs4
Dichorhavirus citri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
5,688
GenBank
null
Brazil: Teresina/Piaui
Brazil
Agave
null
2018
null
null
Citrus chlorotic spot virus isolate Trs4 segment RNA2 RNA-dependent RNA polymerase (ORF6) gene, complete cds
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64,644
KY700685.1
Citrus chlorotic spot virus
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Tassi,A., Kitajima,E.W., Harakava,R., Beserra,E., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2017-04-24
null
Dichorhavirus citri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,518
GenBank
null
Brazil: Teresina/Piaui
Brazil
Citrus sinensis
null
2015
null
null
Citrus chlorotic spot virus strain Trs1 segment RNA1, complete sequence
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76,919
KY700686.1
Citrus chlorotic spot virus
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Tassi,A., Kitajima,E.W., Harakava,R., Beserra,E., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
null
2017-04-24
null
Dichorhavirus citri
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
5,987
GenBank
null
Brazil: Teresina/Piaui
Brazil
Citrus sinensis
null
2015
null
null
Citrus chlorotic spot virus strain Trs1 segment RNA2, complete sequence
GGGACACGGGCAGGGTCACAAGTCATCGTCTAGCACATGGTTTCGCTTAGTTGCATGTTCCGCAAGGTTCGATGTTAACTGGGCAGGTCAACCTTTTGCCCCTCACCAGGTCTACCTACAGGGTCTAGAGAATGATAGGGCATTAAACACAAAATAACAATAGTGCATTAGCAATGGAATCACTACTAAACACATCATATACTGAAACAAACCTTTCCGATAACATACAGCATGATCATGCTGAAGGAGAGGCAGTAGAAACGGGGGGCTCCTATCATCTCAAATCAGCACTGAGGACACATGATGATTACAAGAAGAACCACGGATGCAGACAGGACCTTGCAGTGCTTCTCGAATACAAATCGGGTCATCCTGTATCAAACCCATGCAAGTTGCTTCCTCTGTTGTGGTCCTTTATTGTGACAGGTGCTGCATCAATGTTCGACAGCAATGTTCACAATGAATTGACCGAACACTATAAGGATGAGGATATGTTGGCAGAGATGCTACATCTAACCGAGGAGGAGCTGCCGCTTGTGATGAATCAGCAAGATGCCTCACTGATCAATGATGAGGTCACAAGGATAATAGATGAGTCATGGAGGGTGGAGACATTCCTGGGAAGACTCAACTTCTTGAGATGGTTCTTGACACACCTTGTCATCAATCACAACAGAGGGGAGAACGGCATTGAGGATGGCCTATGCTACAAGGAGGGGATGGGAGTGTATACATATTATCTGGGAACCTCTCTGTCCATCACCACATCCAAAATGTGGGCTAACATAGATATCAATGGGGATAAGAGTATAATCCACATGAGTCACATTGTTAACGTGTTAGACAAACTCACTGAAAGATACAACTCCATAATCTACAACAGAATGTGCAGATCCACCTCTATGAGCTCGATCTACCCTTCAGACAGCACTCTTCAAAGTGTAATCAGCCTGGGAGACAGCCTACTGTTGGCAGAAGGGAATGAAGCCTATAGAGGCCTGGCCAGTTTCGAGGCTCTATGTGTAGGGGAGATTATCAACAAGGGGGACAAGGGAGTTTGGGATGTCAATAAGTTCCTGAGGACAATGAAACAGGAGGTGGGTCAATTGGGAGCTCAGTTTGACCACTGGTGTACGTCATTGTGCCGTATATTGGAGGGGCTGAATGTACAGCAGATCTCTTGCTTACATGGATTGTATAGAATATGGGGTCATCCGGTAGTGGATCTGGAGAAAGGGTTAGAAAAGCTAAGGTCTGTTGCGTTGGTTGAAAAATTCATTCCTAGAAGCTTCTCCATCAACACGTCCAACATGTTCAAGGAGACATTCTTCATGAACTATTACAAGAAGCACAAGTTTTATCCTCCCTATACTTGGATTGGCCCACCAGGCTCTCATTATCTGCAGCAGAATCTCCTCCTTGAGAAGGAAATTGACCGCCATAATATCAGGTATCACATAGAGGATTGGCAGAGTGTTCAGTGTGAGAAGACCTTTGAGATCCCAGCTACTTACAGCCTGGCCTCGTGCATCAAGGATAGGGCAATATCTCCTACTCGATCTGAACTGGAGAGAATGGTCCAGTCAAGCAGGTCTGTTATGAATCAGGATGCCAGGAGGGGGGTTCTTAAATGGCTAAACAGTAGCATGATACCGGTTAGGGACTTCCTTCAGAACATCAACGACAATAGCCTCAATTTTGATGACTGCATCATCGGCCTGTATCCTAAAGAAAGGGAGTTAAAATTGGAGGCCAGGTATTTTGCCTTAATGTCTTTCAAGATGAGGCTCTACTTTACTATCACTGAGCATTTAGCCAATGATCATCTCCTAGAGTATTTCCCCATGGTGACCATGTCAGACAGCATGTTGGAGTTGCAAAAGAAGTTGGATGCACTGAGCAGGAAGCAGACCTCATCCAAGAGGGGGGTTGTGCATTATGTCGTCAACATAGATTTCAGGAAGTGGAATCAGCAGATGAGGGAGGAAATGACAGTGGACCTATTTCATGACACAGACCGTCTGTTTGGCTTCACTAATCTTGTGGGTAGGACTCATGAGATCTTCAAGAGATCATACATTTATCTCTCATCCGGGGAATATGTGCCCACACTCAACAGCCGAGGGAAGCTAAAGACAGAAGCACCGTACAGCTGGACCAATGACCCCTCAGGCAAGGAGGGTCTCAGACAAAAATACTGGACTATTATGACTGCCTGTGATCTCATGGTTGTCGCGAGGAAATTCAACATGAAGATCGACCTGGTCGGTGGCGGAGATAATCAGGTGCTGATAGTGGAGGTCAGTTCTGACAGGCTAGACCATGATGGTACCATGAGTCAGGAAGGGAAGGCTGAGTGTCAAGAGAAGATGAATTCATTCATGCAGTCACTCTCAGAATATATGGAAGCAAAGGGCCTGCCCCTCAAGATGGAGGAAACATGGATATCCCCTGACCTGTTAATGTTCTTCAAAATGATGTATTTCAGGCATGTTACACTGATTTCACCTCTAAAGCAAGCATCAAGGGTGTTCCCATTGTCCAATGATCAAGTGATGACTATTGGGAACATGGCTTCCACGATCTCATCTGCAGTCACTGTACTATCATCCAAGGACATGCAGGTGGGGCCCGCCATCATGTTGGGAAGGCTCACTGTGGGAGACCTCAGTGTGATGGTGTGCAACAACCACCCCCTGTCATTGGACAAACGCATGTGGTCTGAGAAGGTCCCGATCTGCAGAGGGGGAGTGAGGAGGATAATTAATGTGCCGCCCCACAGGAGAGTTCCCAAAAAGATTTTCCTATCGTTGACACTCCACCACAAAGTTCTTGGAGGGTCCGCGATCATTAGCCCTCTCGGGATGCTGATGAGGGGGTTCCCAGACCCGTTATGCGAGCATTTAACATGGATGTCCATGATAATAAGGTCCAGGCCTGAGTACAGGATTTTCGCATGCATGTCATTAAACAACAAGTCTCCTTGGTCTCATCTCCTTGAGGACCCTGTAAGTGTGAATCATGATGCCCCCATACATGGATTAGCAGTCCTTCGCAGGGAGGCTGAAAATGCTCTTGCCTCTGCAAGGAAGTACACAAACAAGGACTTCCTTGAGCTCGCTCACACATGCAACAAGCAAATGATGGAGGGGCTAGCGGATGCCCTTTGCTCAGGTGATAACATAGACATCAGAGTCCTGCATGACATCATGGGTGCCAACCTTGGGGGGTATTTTAACTCCATTGCATCCAAGGTGAACAAGGCCTCCACTGTTCTAAGGATGAACAAAACATCCAAGGTGATTGAGACAATAACCGGTCAGGAAAAGGTGTGCATGTCCTATTATGCATCATATGGTATGATTGACCACGACTTGACTCCCTCAGCTTGCCCTACTGTGACTGCAAGAAGGTACAGGGCCCTCAGCTGGGGAAAGAACATAATGGGGATCACAACCCCCCATCCGGCTGCATTCTTGGAATATGTGTCAGGACCTCATGACTGCGACCACAACTATGTGCAGACCAAGACCTTGTCGTCTGGGGAAGTTGACCCACAAGTCAGAGGGCCCTTCATGGTCTATCAGGGATCGTACACCAAGGAGAAGTTCAAGCCTACTGAGATGGCTGCTGCATACGGGGAGGAGGATCTGTTATCTAGAGCCATTCACCTCATGAAGCTTATAAACTGGAGGTACCCCCCAGACTCATCCATGGCAAAGATCATTCGAGGCCTGCTGGGGTCGTTAACAGATGCTGATCCCTCCCTGTTTTATGGGATGATGGAATGGATATCAGGAGACGCCGAGCACAGATATCAGGACATGGCAACGAAACATGGAGGAGTTCCGAACATAGCATACTCCATACTCTCCTACGTCAGGGCAAACACTTCAACCTTCCGTAAACATTCCAGAGGAGGGAAGAATGAGACTATACATTTCCAAGCTGTTCTCATATACACCTCGATGATGAGTCTCTTCAAACATTATGGTGGGATAGGGCACTGGCATGAAAAGTGTAGCAAATGCATAACAAGGACAACAGCTGACCCTGACTTCCAGTTCAAGAAAAGGGTGTCATTCCCTATGTTGCCAGGCAACATGTTCGCATATGTCCCCTCGGAGATGATAAAGTTCCATTACCATGACCTGAGAAGGATAAGGGCACAGGAGATGGCAGATGATAGAATTGTGAGTCTGACAACCATGTCTGCCAGGGAGAAGGCGACTGCTGCTTGCAGCTTGCTATCAGCAGTGATTGCGGCAAGCCAGAGTAAAGACAGGTCAAATGACACTGTCAGTAGCATCACAATGTGGTCATCAATAATTCATGTGAAAGACCTCGTCCCGATGGTGTGCCTCAGATTGTCAGTGGATCACTTGATGAAAAGAAAGGAATGGGTTTGGCCTAAGCCCCACATACCTCAGAAAGTAGCCATGCTACTGGAGCCCTTCATCATGTCACCCTCCGGTAGAGACTGGATAACCGCCATGGGCCTTGACACGTCTGAGATGGGTCTGGGGCAGATCGGCATTATCAGGGACATCATCTCGAATGTGGTGGATGGAAGGGTGATACCAAAGGTGATGCCCAACAGGGTTTCCCCATTGTGGACCAATGATGTGATTTGTGCCAAGATCTTTGAGAACAACCACATAGTGGGCTGTGAAGAGTGCCTCAACAAAGGGTCAACCCTGGCGAGGACCGAGATTTGCAATGACATGAGGATAGAATATCTGTTCAAGATTTGCTCAGTGACACTGCCAGTATTCAAGGGGGACCTGACTCAGATGGACATCCCTATCTCAGTTGCCCCTCATTATGATTGGGAATCATCCCCTGTTCAAGTATACAGCGTGATAGCTGACGGCACCGAGTATGTCCCTTTCCCCAAAGATGGCCCCATAACCAGGTCAATACCCCTAGGAGCATCTGGGGTATCATCAATAATGGACATATTGCATGAGACGAGGGGAACCATATTAGTGTCCACAGATGCAGTTAGCCTCATGATATGGAGGAGAATGTATGGAAGAAGAACGGTCAAGATCTACAACGACTCCAATAAAAGCCTAGACAGTGTCTGCGAAATGAACTCCATGAGTGAGGAGATGTCCGACAAGTACATGGATGATGAGCACACAAATGAGGTGGCTGATGTGATCTACTGTAACACCTATCCCAACCCATCAGGCTGGTGCATAGTGACTTCCAGAGATGAAGTGAATGCACTCTATGAGAGGGCCAAGGGTGTGACCCCAGTTTCTGTCATGGTGTCAAGCTTGAGGAACCCCACCAGAGTTATTTGTGCTGTGAAGATAGATCAAGGTGACGATGGAGGATGGGGCAACTTCCAATCCCTGTACAGAAGTCTGGAGGCTCGATGTCAGCCACATGTGAGTCAAGTCAAGAAGCCGTCGGTCAAAACCAAGCTAATATCTCAATTAGTTTCTCTTTTCCAAGCATGTGATGGTTCCTTCCAGGGATGCTTAGACCATTTGATAATACACGTAAGGACCATGGTGCATAAGAGAGAAATCTATAGTAGGAAGGGTAGGGATGCCATGTACATGTTAATCATCCTGGAGCTGGTCAGGCACAATGGCGGAGTATCTAAAGCCTTCAACCTGGGAAGGATAAAGTACGTTAACAGACCCAGGATGATCAAGGCAAGTCTGCTGAGCAACAACAACAGGAAGGCTGCGTCTGACGTCAGGGATGCAAGGGAGGTCTTCAAAAGGGCAAACATAAGCACGGTCTTATGTAATGATAATGATGTAAGAATTATATTGTAAATAACATAATGCAAATACTTGTGCTGGATCTTAAAATTAAATTTAATCAAAACATGCGGTCTATGCGGCCATGTCTCCCTCATCTTTGGCTGCGTTGAGAAGGACGGGGAGCGAAGACGGACCTTGCTTATAAAGCGGAGACCTACCACAGTCGTGGTAATGCGGACTCTGTTGTCTTGTCCCGTGTCC
76,920
NC_035759.1
Citrus concave gum-associated virus
Navarro,B., Minutolo,M., De Stradis,A., Palmisano,F., Alioto,D., Di Serio,F.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2017-08-31
CGW2
Coguvirus citri
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
6,681
RefSeq
1
Italy
Italy
Citrus sinensis
null
null
null
PRJNA485481
Citrus concave gum-associated virus isolate CGW2 segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGACTCCCAAACCTTTTTTAAAAAAAAAGTTTTAAGAATTAATTAAGATAACTCATTCACAATAAAGTCTTTGTGTTGTCTGCTCATAATGTAATTTCATGCTCACCTGAGGTTCCATACCCACAACATGAAATCCTGAGATTATAGCGAGAACTCAAAATATCTAAAAATAAAGTAGTGAGATAGGATTTACAAGTGGATTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAAGGTTAGCTTGCCATCCTTGGTTAATTCATCTATGTGTGTGTCTAACTCAGCCTTTAATATCTGATGAAACACATGTGTACTCAGCATCCTGTAACTGCTAGGCACTAACTCCAAATTCAGTAGTCGATCTTTGACTTTATGACAAACATCCACAACGTTGTAAGTGTCCATATCACTTTCTTTTGTCTTGCTTAACTTAGATATAGTCATCGCATTTTCATACCTGTTCAGAATATTCATAAGGGTTTGTTGTAATCCAACAGGAGCTTTTCCAATTTCATCTCTCAAATAATTAATTCTTGACTCTAGATCATTTATGTCCAAACTATCTAAACCTGTTGCATCAGATGCTATTGAAGAGATTCTGGCACTATCTTGCTCTAAGTATGTGATTAATTCACTTTCAGTGTTAGGAACTGGTAAACATACCCGGCCACAATAAAATGACAATAGAAGGCCCATGAACCCTGGTGCAACTAGAGATTGGTCAGTCTTAAACTTTTTTACTGTGCTCACGAAATCAGCATCACCTAACAAAACTCTACTGAGGGTGTCAATGTTTGACAAGGCTAAGTTGGTCTTAGGCATTGAGTTCCTATCATTCAGAGTGAATTCATCCAATAAAGGATTAACTGTGAATAAAGCCAGTTGATTTTCTATTTGATCAAACAAATCAATATTGGTGTCGAATAAATCATCATCATCAATATCTGACTCTAACTCATCAAACTTGTCATCCATAGTCCAGTCAATGGCTTCATCTATATCCATATTCATCTCGTTAAGCAATGCTTCTATGTCTTCATTCATATCTTCATCCACTTCATCATCTGCAACCATCTCAAGAATGTCTTCAGTGGTTAGTAGCTGTTTTTTTATTGAATCCAGCAACTCGCCTAAGTTCCAGCCTGATTTAGTTAGTGCAGTTCGTCTGTTTCTATTTGCTTTCATGATGTCGCCTGGTAGAGGTTTGCATACTGATGATATTTCCTCGTCTAAGACTTCAATTGGTATGGGAGTGCCTGAAGACCAATGTTTCAGTAACTTATCATCATCTATTGTAAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCAAGAAAACCCTTCACTTAATATCGTAATCTTCTGATTTTCCCCGTATTCTGCTTGGAGTCTAATTCTGTTGTTCCCCACTGACCAACTCCATGTGTAATCCGATATCTGGTCTATGATATCAATTTTAAGTATGTTGTCCACCTTGATTGGGTAATAAGTTGCTTTACCAAATCCACCTACTATTCTCCCACTGCCAGTTAACCAGTGATCATAATTATCATTATTTATGTCTGGTGACTCTAATGAAAAGCTATTCATAAGGTCAAGTAGAAGTGGCCCAAGAGTCCTTAAGTCAATGAGCTTAGATAATGTTATTTGACTACAACAGTTCCCTGACATGCTGATAATGACAGATACATCTAAACATTTCCCTCTCCACTCTCCTAGTCCTGATCTAGTTTTGCCCCAGCCCCTTTGCCTACTTGTAAAAAAACCTACTGTGCCCAGCTTTTCATCAGAAATATATTTCACAATTGAACTTTTATCTTGATTTGTGAACCACTTTCTTAGCACTCTTAGCTTCTTAATCCTTTGAGGTACTCTTATCTTCCCTAAGATAGGGCTGTCCATTATAATCTCTTGAATTCTTTTTTTCTTTATAGTGTCACTATACCAGGAGGTTAGTATAGTGAACAGCTTGGAACGTATTGAATAGGAGGTTTCTTCTTCATCAGATTTACCAGGTAATACTAATTTAATCCCTGTCCAGAAAATTCTAGAAATTGAATTAAACAAAGATGAGGACTTTGCACTAGTGTCTAAAAGAACAATGTGTCTTGGTTTCGATGTGATAGACTCCAAGAACCCTTTTAACTCAATTTCATTGTACTTTAGAATTGATTTTGTTTCCTGTCTATCATCTTTAATAAAAGGATACTTTAGCTTGACATCCTGCCAAAAGGTTTCAAATTGTCTCTTAGATAATGGTAACCTACCAATTCCGAACCATCTTTTGCGGCATAAATCTATCAGAGGGATATCATCTATTGCTCTCTCAAAAACTGAAATCTTTTGCTTATTTCTAGTCCGTAGTTTAGAAGGCACCATTGTCGATTTAGATTCTAAATCTATTATATAATCCATAACCTCTCTGTATTCTTCTGAGTGTGTGAATGTAAGAGATGGATCCAATTTCACTTTACCCTCAGTCTCTAATTTATTATATGCCAAAGCTCTAAGTAGGCTTACTTTCATGAGATCCCCTGATACATAAATTGATACACATGGTCTGGAAATCAGGTAAGCAGATGCTGACATCACTCTCGCTGTAGCTGCATGCTTGCTTATTGACTCTTTCACACCTGGTTGAAACATTTTTAAGAACACAGCAAACTTTGCTTCTGACCATGCTTTGTGCCTTGCATATATCAGGTATGGATTTTCCTCTACTTCTGAAACCAGTTGCTCTAGTTCTGGGATGCCCATCCTTCTAACCTGATCATGCCAAAGTTTCATATTGGAGAAGCTTATTTTAACTGATCTTAGAGATTTGCTAACACTCTGATCGGGAATTTCCTCTTCTTCATATTTTATATCTGGCTCATGTATATTTGCATATGTAAGACCTCTGCCATAATCTGTGGACATAAACAACCTATAAATTTGAAATTCAACACCAGTGATTCCGGCACAGAAATCTGAATCTAGAGGATAAAATCCCAAAGCAGGGTCTTGTTGGTCCAAAATGTCCGATGCAGCTTTTAAACTCAATTTAGAAGTATGCAAACCAATTAACAAGTAATGCATCCATGCTTGACAAAGCTGGATTAAAGCAACCTCTAACACTTTTCCCCCCCCTTCCAACACTTGACTACTCACATTATAGTTCATTCTGATTCTATCTATAAATCTTTCTGTAACAGAAGTTTCCAAACAGGCAGACACCCATCTGAAAGTGGGCTTAGCCACATTGCTTCTAACCATCCATTCCGAGTTATACTCTATCAGATCTAAACATCCAATTGATGACTTAGCCCTGCTAGTATAGATTGAGAAATATTTTGAAACATTTTCTTTCCAGTGTAACAAGGTTGTTGCTAACCTTATCCTGTTATGACTAGGAGTTCCCATCAAACTTAAAAGTTGGCCAGAGTCATCACTTCCTTGCACAACTGTTATATTGCATAGAATACCTCTCCGCTTTAAATAGTCTGTCTGTAGCTTTTTCATGACTTCTTGTATCATAGCGTGAGTGAACGAGCTTGTATAATGAAGTATGCCTTGCATCATTCCTGATTTAATGAACATTTTGTTACTCTGTGCTTGAGAAAAGATACCATCACCATTGAAAAATTCTTTCTTCATTCTAGTGTAGATATGATTAGATTTTGTTTTCCTATTGGCTTGGAAATTTGCGGCAAACTGTATGGGAAAGCTAATTCTCTTGCATTTCCACAGACTCATCACATGTACGAAGAAAGGCTTGAATTCATCAGGGAGGAAAGGTGAGATCACAGCGGCAAACTTGGAACTATCATTTCTCTGACACCACTTTGTTGCATCAGCTGATTTCCCCATTGTGAAAAATTGCTTGCCCAACTTTTGTGCAGATTCTTGGTAATGTTTTTTCACAAATGTTTCTTTTTCATATGGGTGGGTTAGTGTATCTGAGGGGATGAGTCTGCACAGAGTCTTACTCATTGATTCAACAAAGTACTGTAGGACCCTCATTTTGACCTCCAGCACATGAATCTCCCTATCTCCTCCATGCTGAGATTTTGGAAATATATCACTGTCCCAAAACCCTCTTTTCTCTATCTCTTTCAAGCAGTAAGGGATTAATTCCACTGGATGCTTTATCTTCCTGTTTTCAGCTTCTTCACACTCTTCCACCAACAAGCTGATTGACTCCATCACTCTTGGCCTCTTGACCTTTTCTAGCGGGTTAGATTTCTCATACAGATCCTTCATCATCTTATTCGTCATAGAGTCATCCAGATTTGGAATTATTATAGAATCATTATATGATCTGGATGAGACTTTCAAAGTTGCTAAGTCCTCAAATGAGCATTGAGCTAATGACCTTATTATCTCTTTTTTTATAATTAGCTCATAATCCTTCCCCAAAATTTCTTTCAATATTGATTTGAAGATGTTAACAAACACTTTGATCATTATTCTATTACTCACATGGATTTGAGTGTCTAAAGATTCATTAAATGTGGACAAAACTGTGTCTCTGAATCTATATTCCTCTGCTACTATTTTTTTCATGATTTTAAAGTTCCTATCACTACCTCTGCCTCTCTCTTTGCTTACCACATACCCAAAGTAAAACTCATTTATTTTCTGTTTAAGTGATGGCTCGAAATCTGAAATCATGCTCTTAAGACCTGAATAAACAATATCATACTCTAAAGTTTCTTTATTTGGTATCTTTAAAACCTTCGTCTCAGTATAATATTGCATGTGTCTGATAGTTTTTTTAAGGAAATAACATGTTAATCTGGATCTTATCACCTCTGGCAACCTCTCACAAAATCTGTATGGATTGGGATCCAATTCCTCCAATACACCCATAGTTAAATATCTCTGACTTGTTATCAGCTCTTCACAATCTGCTTTGTTGTTCAAGAATAACAAGAGAATCCCTGCAACATGCTGGTTTAGAACTACATTCATGAAGTCAATGTTAGATAGATCTAGTTCCAAGTGAGACAACATGTGTGAAGCTATAGAAAT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4,288
OR640153.1
Citrus concave gum-associated virus
Akdura,N., Mendoza,J., Hasselhoff,S., Carvalho Costa,L., Yang,Y., Hu,X., Joseph,J.A., McFarland,C., Hurtado-Gonzales,O.P.
Animal and Plant Health Inspection Service, Plant Germplasm Quarantine Program
USA
2023-10-25
CCGaV_RNA1_T
Coguvirus citri
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
6,652
GenBank
null
Turkey
Turkey
Malus domestica
plant leaf
2022-06-02
null
null
Citrus concave gum-associated virus isolate CCGaV_RNA1_T segment RNA1, complete sequence
CTTTTTTAAANNNAAAGTTTTAAGAATTAATTAAGATAGCTCATTCACAATGAAGTCTTTGTGTTGCCAGCTCATAATGTGATTTCATGCTCACCTGAGGTTTCATACCCACAACATGAGATCCTGAGATTAAAGCGAGAACTCAAAATATCTAAAAATAAAGTTGTGAGATAGGATTTACATGTGGATTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAAGGTTAGCTTGCCATCCTTGGTTAAGTCATCTATGTGTGTGTCCAACTCAGCCTTTAATATCTGATGAAACACATGTGTACTCAGCATCCTGTAACTGCTAGGCACTAACTCCAAATTCAGCAGTCGATCTTTGACTTTATGACAAACATCTACAACTTTATAGGTGTCCATGTCACTTTCTTTTGTTTTGCTTAACTTAGACATAGTCATCGCATTTTCATACCTGTTCAGAATATTCATAAGGGTTTGTTGCAATCCAACAGGAGCTTTTTCAATTTCATCTCTCAAATAATTAATTCTTGACTCTAGATCATTTATGTCCAAACTATCTAGACCTGTTGCATCAGATGCTATTGAAGAGATTCTGGCACTATCTTGCTCTAAGTATGTGATTAATTCACTCTCAGTGTTTGGAACTGGTATACATACCCGGCCACAATAAAATGACAATAGAAGGCCCATGAACCCTGGTGCAACTAGAGAATGGTCAGTTTTAAACTTTTTTACTGTGCTCATGAAATCAGCATCACCTAACAAAACTCTACTTAAGGTGTCAATGTTTGACAAGGCTAAGTTGGTCTTAGGCATTGAGTTCCTATCATTCAAAGTGAATTCATCCAACAAAGGATTAATTGTGAATAAAGCCAGTTGATTTTCTATTTGATCAAACAAATCAATATTGGTTTCAAATAAATCATCATCATCAATATCTGACTCTAACTCATCAAACTTGTCATCCATAGTCCAGTCAATGGCTTCATCTATATCCATATTCATCTCGTTAAGCAATGCTTCAATGTCTTCATTCATATCTTCATCCACTTCATCATCTGCAACCATCTCTAGAACGTCTTCAGTGGATAGTAGCTGTTTTTTTATTGAATCCAGCAACTCGCCTAAATTCCAGCCTGATTTAGTTAGTGCAGTTCGTCTGTTTCTATTTGCTTTCATGATATCACCTGGTAGAGGTTTGCATACTGATAATATTTCCTCGTCTATGACTTCAATTGGTATAGGAGTGCCTGAAGACCAATGTTTCAGTAACTTATCATCATCTATTGTAAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCAAGAAAACCCTTCACTCAATATTGTAATTTTCTGATTTACCCCGTATTCTGCTTGGAGTCTAATTCTGTTGTTTCCCACTGACCAACTCCATGTGTAATCAGATATCTGGTCTATGATGTCAATTTTAAGTGTGTTATCCACCTTGATTGGGTAATAAGTTGCTTTACCAAATCCACCTACTATTCTCCCACTGCCAGTTAGCCAGTGATCATAATTATCATTATTTATGTCTGGTGACTCTAATGAAAAGCTATTCATAAGGTCAAGTAGAAGTGGCCCAAGAGTTCTTAAGTCAGTGAGCTTAGATAATGTTATTTGACTACAACAGTTCCCTGACATGCTGATAATGACAGATACATCTAAACATTTCCCTCTCCACTCTCCTAGTCCTGATCTAGTCTTGCCCCAGCCCCTTTGCCTACTTGTAAAAAAACCTACTGTCCCCAGCTTTTCATCAGAAATATATTTTACAATTGAACTTTTATCTTGATTTGTGAGCCACTTCCTTAGCACTCTTAGCTTTTTAATCCTTTGAGGTACTCTTATCTTCCCTAAGGTAGGGCTGTCCATTATAATCTCTTGAATTCTTTTTTTCTTTATGGTGTCACTATACCAAGAGGTTAGTATAGTAAACAGCTTGGAACGTATTGAATAGGAGGTTTCTTCTTCATCAGATTTACCAGGTAATACTAATTTAACCCCTGTCCAGAAAATTCTAGAAATTGAATTAAATAAAGATGAGGACTTTGCACTAGTGTCTAGAAGAACAATGTGTCTTGGTTTTGATGTGATAGACTCCAAGAACCCTTTTAACTCAACTTCATTGCACTTTAGAATTAATTTTGTTTCCTGTCTATCATCTTTGATAAAAGGATACTTTAGCTTGACATCCTGCCAAAAGGTTTCAAATTGTCTCTTAGATAGTGGTAACCTACCGATTCCAAACCATCTTTTGCGGCACAAATCTATCAGAGGGATGTCATCTATTGCTCTCTCAAAGACTGAAATCTTCTGCTTATTTCTAGTTCGTAGTTTAGAAGGCACCATTGTCGATTTAGATTCTAAATCTATTATATAATCCATAACTTCTCTGTATTCTTCTGAGTGTGTGAATGTAAGAGATGGATCTAATTTCACTTTACCCTCAGTCTCTAATTTATTATATGCCAAAGCTCTGAGTAGACTTACTTTCATAAGATCCCCTGATACATAAATTGATACGCATGGTCTGGAAATCAGGTAAGCAGATGCTGACATCACTCTCGCTGTGGCTGCATGCTTACTTATTGACTCTTTTACACCTGGTTGAAACATTTTTAAGAACACAGCAAACTTTGCTTCTGACCATGCTTTGTGCCTTGCATATATCAGGTATGGATTTTCCTCTACTTCTGAAACCAGTTGCTCTAGTTCTGGGATGCCCATCCTTCTAACCTGATCATGCCAAAGTTTCATATTGGAAAAGCTTATTTTAACTGATCTTAGAGATTTGCTAACACTCTGATCAGGAATTTCCTCTTCTTCATATTTTATATCTGGCTCATGTATATTTGCATATGTAAGACCTCTGCCATAATCTGTGGACATAAACAACCTATAAATTTGAAATTCAACACCAGTGATTCCGGCACAGAAATCTGAATCTAGAGGATAAAATCCCAAAGCAGGGTCTAGTTGGTCCAAAATGTCCGATGCAGCTTTTAAACTCAACTTAGAAGTGTGCAAACCAATTAACAAGTAATGCATCCATGCTTGACAAAGCTGGATTAAAGCAACCTCTAACACTTTTCCCCCCCCTTCCAACACTTGACTACTCACATTATAGTTCATTCTGATTCTATCTATAAATCTTTCTGTAACAGATGTTTCCAAACAGGCAGACACCCATCTGAAAGTGGGCTTAACCACATTGCTTCTAACCATCCATTCTGAATTAAACTCTATCAGATCTAAACATCCAATTGATGACTTAGCCCTGCTAGTATAGATTGAGAAATATTTTGAAACATTTTCTTTCCAGTGTAACAAGGTTGTTGCTAACCTTGTCCTGTTATGACTAGGAGTTCCCATTAAGCTTAAAAGTTGGCCAGAGTCATCACTTCCTTGCACAACTGTTATATTGCATAGAATGCCTCTCCGCTTTAAATAGTCTGTCTGTAGCTTTTTCATGACTTCTTGTATCATAGTGTGAGTGAACGAGCTTGTATAGTGAAGAATACCTTGCATCATCCCTGATCTAATAAACATTTTGTTACTCTGTGCCTGAGAAAAGATACCATCACCATTGAAAAATTCTGTCTTCATTCTAGTGTAGATGTGATTAGATTTTGTTTTCCTATTGGCTTGGAAATTTGCGGCAAACTGTATGGGAAAGCTAATTCTCTTGCATTTCCACAGACTCATCACATGTACGAAGAAAGGCTTGAATTCATCAGGGAGGAAAGGTGAGATCACAGCTGCAAACTTGGAACTGTCATTTCTCTGACACCACTTTGTTGCATCAGCTGATTTCCCCATTGTGAAAAATTGCTTGCCCAACTTTTGTGCAGATTCTTGGTAATGTTTTTTTACAAATGTTTCTTTTTCATATGGGTGGGTTAGTGTATCTGAGGGGATGAGTCTGCACAGAGTCTTGCTCATTGATTCAACAAAGTACTGTAGAACCCTCATTTTGACTTCCAACACATGAATCTCCCTATCTCCTCCATGCTGAGATTTTGGAAATATATCACTGTCCCAAAACCCTCTTTTCTCTATCTCTTTCAAGCAGTAAGGAATTAATTCCACTGGATGCTTTATCTTCCTGTTTTCAGCTTCTTCAAACTCTTCCACTAACAAGCTGATTGATTCCATCACTCTTGGCCTCTTGACCTTTTCTTGCGGGTTAGATTTCTCATACAGATCCTTCATCATCTTATTCGTCATAGAGTCATCCAGATTTGGAACTACTATAGAATCATTATATGATCTGGATGAGACTTTCAAAGTTGCTAAGTCCTCGAATGAGCATTGAGCTAATGACCTTATTATCTCTTTTTTTATAATTAGCTCATAATCCTTCCCCAAAATTTCTTTTAATATTGATTTGAAGATGTTAACAAACACTTTGATCATTATTCTATTACTCACATGGATTTGAGTGTTTAAAGATTCATTAAATGTGGACAAAACTGTGTCTCTGAATCTATATTCCTCTGCTACTATTTTTTTCATGATTTTAAAGTTTCTATCACTACCTCTGCCTCTCTCCTTGCTTACCACATACCCAAAGTAAAACTCATTTATTTTCTGTTTAAGTGATGGCTCGTAATCTGCAAACATGCTCTTAAGACCTGAATAAACAATATCATATTCTAAAGTTTCTTTATTTGGTATCTTTAAAACCTTTGTCTCAGAATAATATTGCATGTGTCTGATAGTTTTTTTAAGGAAATAACATGTTAATCTGGATCTTATCACCTCTGGCAACCTCTCACAAAATCTGTATGGATTGGGATCCAATTCCTCTAATACACCCATAGTCAAATATCTCTGACTTGTTATCAGCTCTTCACAATCTGTTTTGTTGTTCAAGAATAACAAGAGAATCCCTGCAATATGCTGGTTTAGAACTACATTCATGAAATCAATGTTAGATAGATCTAGTTCCAAGTGAGACAACATGTGTGAAGCTATAGAAATCATGTAAGGACCACTCTTTACAAAGTGCTCAATGCTAGGTTCATTGAAAGAACACACATCAGTAAAATAAAAGTTGTTTGATTCCCAGATTCTGGGTCCTATTCTCCCCACTTCTAATAACTTGCAGGAGGATTTAGGGAATGCAAATATTGCAAATATATGATCACCTGTGCACCTAATCAGAATGTGTATACCTTTGTGGATCTTATGGTAAAAATCAGACCTTTTAATCCAATACTTGTGAGAATAACATATTTCTGTCATAATATTTGATATGGTTTGACCAAAGTTTGCTAACACAGTGTGCTGTAATTTATTGAAAATGTTCACAGACAAAGATTTTTTGCCGCCCCAAATCTGTTTCCCTTTACAAATCAGCTTAAAAATTTCTTTAGGGACAATTGTATTCACTTCACTCTTCAATAAAATTTTATTGTGAAACTCAAGTATGTCACTTGTCTCCGTCAAAGTTGGATGAAAACTCTTCTTATCATCGGCTGACTTAGCAATGAGATCTGGATTTTCACTCAATGCTTTTGCCCACAGCCCTGATTTTGCAGCCTCAATTTTGTCAGCCTCAGTCAGATTTTTAACATTGAAGGCAGCACCTTTTTGTATTCTATGCCTTTCATAATACTTTAATCCCATAGCTTCTTCTAACTGTTCTTCTTTTGATAAATCTCTGGGTTTGGCTGATGAAGAAGCACCCCATATCTTTTTTAGATACAAAGGCATGTCTCGACAGTTTTCCTCGTCAGTTTCTATATCATCTAGTGGAATCTTATTCTGATATATCATAGGGATATTTGTGATCCTCTTATCTGATGTCTTACTAAAACCTTCAAAACCATCTAAATACCTTTTCAACTCTTCGGAACTGTTGCTACTACTCATGGTTGATTCTGCTAGAGTGGCTTTTAATATCTTACCTACATGTTTTTTATCATCTATTGTCATGGGATCATTAATTGAAGATATTTTATCCAAATCAAAATCAGAACTTGACTTTGTGTTCATGGTCAATCCCCTGAAAACATCTTTAACAATCGCTTCATCTGCAGTGTGATCTTCTGAAAACATGTCTTGGCCTAAATACTCACTAATGACTGATTCTAGAGCTAACCCAATTCTAGCCCTTAAGCATAAGCAATTGACTAAATCCTGTGTCATTTCAAAATTGCAATAAACCCTAGATGGAGACACAATCAACACGAATAAATCATAATCTGTAGGCTCAATCAGATAAGAGTATTTAATGACTTTCCCAGTGTACAGTTTCTTCAAAGAGTACAGTTCAGAGATTGCAGAGGTTCCAACTTCTAACACTGATTTATAGGTTGTGTTTATATAATCAGGTGTTAGATCTCCTTCTTCTCCCTTCACCCCTATTGTTTTAAGTGGCATATCTGATTCAAACAGCATGACACTGCAGACTATTTCATGGCGAATCTTCCTGAGATTCTCAGAAGAAACATCTAGATATCTTTCCCGGCCATTAACACTTATCTTAAATACAGAACCATTGTATGAGCAATTGTATGAAGGCTCCGGCAGTTCTCCACAGACATACAATGTTGGCTCAATTTTGTTCAATCTGAGAGAGCCTACAGAGAAGTTGGAGTCTATTCTCAAATTGTTAGTCATGATAGCGTTAACTAAAAATAGTTTGG
11,596
OP547337.1
Citrus concave gum-associated virus
Nickel,O., Grynberg,P., Fajardo,T.V.M.
Embrapa Uva e Vinho - Embrapa, Laboratorio de Virologia
Brazil
2023-01-02
Fuji-BJ
Coguvirus citri
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
6,665
GenBank
null
Brazil
Brazil
Malus domestica
null
2022-01-26
null
null
Citrus concave gum-associated virus isolate Fuji-BJ segment RNA1, complete sequence
CTCCCAAACTTTTTTAAAGTTTTAAGAATTAATTAAGATAGCTCATTCACAATGAAGTCTTTGTGTTGCCAGCTCATAATGTGATTTCATGCTCACCTGAGGTTTCATACCCACAACATGAGATCCTGAGATTAAAGCGAGAACTCAAAATATCTAAAAATAAAGTTGTGAGATAGGATTTACATGTGGATTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAAGGTTAGCTTGCCATCCTTGGTTAAGTCATCTATGTGTGTGTCCAACTCAGCCTTTAATATCTGATGAAACACATGTGTACTCAGCATCCTGTAACTGCTAGGCACTAACTCCAAATTCAGCAGTCGATCTTTGACTTTATGACAAACATCTACAACTTTATAGGTGTCCATGTCACTTTCTTTTGTTTTGCTTAACTTAGACATAGTCATCGCATTTTCATACCTGTTCAGAATATTCATAAGGGTTTGTTGCAATCCAACAGGAGCTTTTTCAATTTCATCTCTCAAATAATTAATTCTTGACTCTAGATCATTTATGTCCAAACTATCTAGACCTGTTGCATCAGATGCTATTGAAGAGATTCTGGCACTATCTTGCTCTAAGTATGTGATTAATTCACTCTCAGTGTTTGGAACTGGTATACATACCCGGCCACAATAAAATGACAATAGAAGGCCCATGAACCCTGGTGCAACTAGAGAATGGTCAGTTTTAAACTTTTTTACTGTGCTCATGAAATCAGCATCACCTAACAAAACTCTACTTAAGGTGTCAATGTTTGACAAGGCTAAGTTGGTCTTAGGCATTGAGTTCCTATCATTCAAAGTGAATTCATCCATCAAAGGATTAATTGTGAATAAAGCCAGTTGATTTTCTATTTGATCAAACAAATCAATATTGGTTTCAAATAAATCATCATCATCAATATCTGACTCTAACTCATCAAACTTGTCATCCATAGTCCAGTCAATGGCTTCATCTATATCCATATTCATCTCGTTAAGCAATGCTTCAATGTCTTCATTCATATCTTCATCCACTTCATCATCTGCAACCATCTCAAGAACGTCTTCAGTGGATAGTAGCTGTTTTTTTATTGAATCCAGCAACTCGCCTAAATTCCAGCCTGATTTAGTTAGTGCAGTTCGTCTGTTTCTATTTGCTTTCATGATGTCACCTGGTAGAGGTTTGCATACTGATAATATTTCCTCGTCTATGACTTCAATTGGTATAGGAGTGCCTGAAGACCAATGTTTCAGTAACTTATCATCATCTATTGTAAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCAAGAAAACCCTTCACTCAATATTGTAATTTTCTGATTTACCCCGTATTCTGCTTGGAGTCTAATTCTGTTGTTTCCCACTGACCAACTCCATGTGTAATCAGATATCTGGTCTATGATGTCAATTTTAAGTGTGTTATCCACCTTGATTGGGTAATAAGTTGCTTTACCAAATCCACCTACTATTCTCCCACTGCCAGTTAGCCAGTGATCATAATTATCATTATTTATGTCTGGTGACTCTAATGAAAAGCTATTCATAAGGTCAAGTAGAAGTGGCCCAAGAGTTCTTAAGTCAGTGAGCTTAGATAATGTTATTTGACTACAACAGTTCCCTGACATGCTGATAATGACAGATACATCTAAACATTTCCCTCTCCACTCTCCTAGTCCTGATCTAGTCTTGCCCCAGCCCCTTTGCCTACTTGTAAAAAAACCTACTGTCCCCAGCTTTTCATCAGAAATATATTTTACAATTGAACTTTTATCTTGATTTGTGAGCCACTTCCTTAGCACTCTTAGCTTCTTAATCCTTTGAGGTACTCTTATCTTCCCTAAGGTAGGGCTGTCCATTATAATCTCTTGAATTCTTTTTTTCTTTATGGTGTCACTATACCAAGAGGTTAGTATAGTAAACAGCTTGGAACGTATTGAATAGGAGGTTTCTTCTTCATCAGATTTACCAGGTAACACTAATTTAACCCCTGTCCAGAAAATTCTAGAAATTGAATTAAATAAAGATGAGGACTTTGCACTAGTGTCTAGAAGAACAATGTGTCTTGGTTTTGATGTGATAGACTCCAAGAACCCTTTTAACTCAACTTCATTGCACTTTAGAATTAATTTTGTTTCCTGTCTATCATCTTTGATAAAAGGATACTTTAGCTTGACATCCTGCCAAAAGGTTTCAAATTGTCTCTTAGATAGTGGTAACCTACCGATTCCAAACCATCTTTTGCGGCATAAATCTATCAGAGGGATATCATCTATTGCTCTCTCAAAGACTGAAATCTTCTGCTTATTTCTAGTTCGTAGTTTAGAAGGCACCATTGTCGATTTAGATTCTAAATCTATTATATAATCCATAACTTCTCTGTATTCTTCTGAGTGTGTGAATGTAAGAGATGGATCTAATTTCACTTTACCCTCAGTCTCTAATTTATTATATGCCAAAGCTCTGAGTAGACTTACTTTCATAAGATCCCCTGATACATAAATTGATACGCATGGTCTGGAAATCAGGTAAGCAGATGCTGACATCACTCTCGCTGTGGCTGCATGCTTACTTATTGACTCTTTTACACCTGGTTGAAACATTTTTAAGAACACAGCAAACTTTGCTTCTGACCATGCTTTGTGCCTTGCATATATCAGGTATGGATTTTCCTCTACTTCTGAAACCAGTTGCTCTAGTTCTGGGATGCCCATCCTTCTAACCTGATCATGCCAAAGTTTCATATTGGAAAAGCTTATTTTAACTGATCTTAGAGATTTGCTAACACTCTGATCAGGAATTTCCTCTTCTTCATATTTTATATCTGGCTCATGTATATTTGCATATGTAAGACCTCTGCCATAATCTGTGGACATAAACAACCTATAAATTTGAAATTCAACACCAGTGATTCCGGCACAGAAATCTGAATCTAGAGGATAAAATCCCAAAGCAGGGTCTAGTTGGTCCAAAATGTCCGATGCAGCTTTTAAACTCAACTTAGAAGTGTGCAAACCAATTAACAAGTAATGCATCCATGCTTGACAAAGCTGGATTAAAGCAACCTCTAACACTTTTCCTCCCCCTTCCAACACTTGACTACTCACATTATAGTTCATTCTGATTCTATCTATAAATCTTTCTGTAACAGATGTTTCCAAACAGGCAGACACCCATCTGAAAGTGGGCTTAACCACATTGCTTCTAACCATCCATTCTGAATTAAACTCTATCAGATCTAAACATCCAATTGATGACTTAGCCCTGCTAGTATAGATTGAGAAATATTTTGAAACATTTTCTTTCCAGTGTAACAAGGTTGTTGCTAACCTTGTCCTGTTATGACTAGGAGTTCCCATTAAGCTTAAAAGTTGGCCAGAGTCATCACTTCCTTGCACAACTGTTATATTGCATAGAATGCCTCTCCGCTTTAAATAGTCTGTCTGTAGCTTTTTCATGACTTCTTGTATCATAGTGTGAGTGAACGAGCTTGTATAGTGAAGAATACCTTGCATCATTCCTGATCTAATAAACATTTTGTTACTCTGTGCCTGAGAAAAGATACCATCACCATTGAAAAATTCTGTCTTCATTCTAGTGTAGATGTGATTAGATTTTGTTTTCCTATTGGCTTGGAAATTTGCGGCAAACTGTATGGGAAAGCTAATTCTCTTGCATTTCCACAGACTCATCACATGTACGAAGAAAGGCTTGAATTCATCAGGGAGGAAAGGTGAGATCACAGCTGCAAACTTGGAACTGTCATTTCTCTGACACCACTTTGTTGCATCAGCTGATTTCCCCATTGTGAAAAATTGCTTGCCCAACTTTTGTGCAGATTCTTCGTAATGTTTTTTTACAAATGTTTCTTTTTCATATGGGTGGGTTAGTGTATCTGAGGGGATGAGTCTGCACAGAGTCTTGCTCATTGATTCAACAAAGTACTGTAGAACCCTCATTTTGACTTCCAACACATGGATCTCCCTATCTCCTCCATGCTGAGATTTTGGAAATATATCACTGTCCCAAAACCCTCTTTTCTCTATCTCTTTCAAGCAGTAAGGAATTAATTCCACTGGATGCTTTATCTTCCTGTTTTCAGCTTCTTCAAACTCTTCCACTAACAAGCTGATTGATTCCATCACTCTTGGCCTCTTGACCTTTTCTTGCGGGTTAGATTTCTCATACAGATCCTTCATCATCTTATTCGTCATAGAGTCATCCAGATTTGGAACTACTATAGAATCATTATATGATCTGGATGAGACTTTCAAAGTTGCTAAGTCCTCGAATGAGCATTGAGCTAATGACCTTATTATCTCTTTTTTTATAATTAGCTCATAATCCTTCCCCAAAATTTCTTTTAATATTGATTTGAAGATGTTAACAAACACTTTGATCATTATTCTATTACTCACATGGATTTGAGTGTTTAAAGATTCATTAAATGTGGACAAAACTGTGTCTCTGAATCTATATTCCTCTGCTACTATTTTTTTCATGATTTTAAAGTTTCTATCACTACCTCTGCCTCTCTCCTTGCTTACCACATACCCAAAGTAAAACTCATTTATTTTCTGTTTAAGTGATGGCTCGTAATCTGCAAACATGCTCTTAAGACCTGAATAAACAATATCATATTCTAAAGTTTCTTTATTTGGTATCTTTAAAACCTTTGTCTCAGAATAATATTGCATGTGTCTGATAGTTTTTTTAAGGAAATAACATGTTAATCTGGATCTTATCACCTCTGGCAACCTCTCACAAAATCTGTATGGATTGGGATCCAATTCCTCTAATACACCCATAGTCAAATATCTCTGACTTGTTATCAGCTCTTCACAATCTGTTTTGTTGTTCAAGAATAACAAGAGAATCCCTGCAATATGCTGGTTTAGAACTACATTCATGAAATCAATGTTAGATAGATCTAGTTCCAAGTGAGACAACATGTGTGAAGCTATAGAAATCATGTAAGGACCACTC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19,794
OK495690.1
Citrus concave gum-associated virus
Minutolo,M., Cinque,M., Chiumenti,M., Di Serio,F., Alioto,D., Navarro,B.
Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante
Italy
2021-11-12
CE-c3
Coguvirus citri
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
6,674
GenBank
null
Italy
Italy
Malus domestica
plant leaf
2020
null
null
Citrus concave gum-associated virus isolate CE-c3 segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGACTCCCAAACCTTTTTAAAGTTTTAAGAATTAATTAAGATAGCTCATTCACAATGAAGTCTTTGTGTTGCCTGCTCATAATGTGATTTCATGCTCACCTGAGGTTTCATACCCACAACATGAAATCCTGAGATTATAGCGAGAACTCAAAATATCCAAAAATAAAGTCGTGAGATAGGATTTACATGTGGATTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAAGGTTAGCTTGCCATCCTTGGCTAATTCATCTATGTGTGTGTCCAACTCAGCCTTTAATATCTGATGAAACACATGTGTACTCAGCATCCTGTAACTGCTAGGCACTAACTCCAAATTCAGCAGTCGATCTTTGACTTTATGACAAACATCTACAACTTTATAGGTGTCCATGTCACTTTCTTTTGTTTTGCTTAACTTAGATATAGTCATCGCATTTTCATACCTGTTCAGAATATTCATAAGGGTTTGTTGCAATCCAACAGGAGCTTTTTCAATTTCATCTCTCAAATAATTAATTCTTGACTCTAGATCATTTATGTCCAAACTATCTAGACCTGTTGCATCAGATGCTATTGAAGAGATTCTAGCACTATCTTGCTCTAAGTATGTGATTAATTCACTCTCAGTGTTTGGAACTGGTATACATACCCGGCCGCAATAAAATGATAATAGAAGTCCCATGAACCCTGGTGCAACTAGAGAATGGTCGGTTTTAAACTTTTTTACTGTGCTCATGAAATCAGCATCACCTAACAAAACTCTACTTAGGGTGTCAATGTTTGACAAGGCTAAGTTGGTCTTAGGCATTGAGTTCCTATCATTCAAAGTGAATTCATCCAACAAAGGATTAATTGTGAATAAAGCCAATTGATTTTCAATTTGATCAAACAAATCAATATTGGTTTCAAATAAATCATCATCATCAATATCTGACTCTAACTCATCAAACTTGTCATCCATAGTCCAGTCAATGGCTTCATCTATATCCATATTCATCTCGTTAAGCAATGCTTCAATGTCTTCATTCATATCCTCATCCACTTCATCATCTGCAACCATCTCAAGAACGTCTTCAGTGGATAGTAGCTGTTTTTTTATTGAATCCAGCAACTCGCCTAAATTCCAGCCTGATTTAGTTAGTGCAGTTCGTCTGTTTCTATTTGCTTTCATGATGTCACCTGGTAGAGGTTTGCATACTGATAATATTTCCTCGTCTATGACTTCAATTGGTATAGGAGTGCCTGAAGACCAATGTTTCAGTAACTTATCATCATCTATTGTAAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCAAGAAAACCCTTCACTCAATATTGTAATCTTCTGATTTACCCCGTATTCTGCTTGGAGTCTAATTCTGTTGTTTCCCACTGACCAACTCCATGTGTATTCAGATATCTGGTCTATGATGTCAATTTTAAGTGTGTTATCCACCTTGATTGGGTAATAAGTTGCTTTACCAAATCCACCTACTATTCTCCCACTACCAGTTAGCCAGTGATCATAATTATCATTATTTATTTCTGGTGACTCTAATGAAAAGCTATTCATAAGGTCAAGTAGAAGTGGCCCAAGAGTCCTTAAGTCAGTGAGCTTAGATAATGTTATTTGACTACAACAGTTCCCTGACATGCTGATAATGACAGATACATCTAAACATTTCCCTCTCCACTCTCCTAGTCCTGATCTAGTCTTGCCCCAACCCCTTTGCCTACTTGTAAAAAAACCTACTGTCCCCAGCTTTTCATCAGAAATATATTTCACAATTGAACTTTTATCTTGATTTGTGAACCACTTCCTTAGCACTCTTAGCTTCTTAATCCTTTGAGGTACTCTTATCTTCCCTAAGGTAGGGCTGTCCATTATAATCTCTTGAATTCTTTTTTTCTTTATGGTGTCACTATACCAAGAGGTTAGTATAGTAAACAGCTTGGAACGTATTGAATAGGAGGTTTCTTCTTCATCAGATTTACCAGGTAATACTAATTTAACCCCTGTCCAGAAAATCCTAGAAATTGAATTAAATAAAGATGAGGACTTTGCGCTAGTGTCTAGAAGAACAATGTGTCTTGGTTTTGATGTGATAGACTCCAAGAACCCTTTTAACTCAACTTCATTGTACTTTAGAATTAATTTTGTTTCCTGTCTATCATCTTTGATAAAAGGGTACTTTAGCTTGACATCCTGCCAAAAGGTTTCAAATTGTCTCTTAGATAGTGGTAACCTACCAATTCCAAACCATTTTTTGCGGCATAAATCTATCAGAGGGATATCATCTATTGCTCTCTCAAAAACTGAAATCTTCTGCTTATTTCTAGTTCGTAGTTTAGAAGGCACCATTGTCGATTTAGATTCTAAATCTATTATATAATCCATAACCTCTCTGTATTCTTCTGAGTGTGTGAATGTAAGAGATGGATCTAATTTCACTTTACCCTCAGTCTCTAATTTATTATATGCCAAAGCTCTAAGTAGACTTACTTTCATAAGATCCCCTGATACATAAATTGATACGCATGGTCTGGAAATCAGGTAAGCAGATGCTGACATCACTCTCGCTGTAGCTGCATGCTTGCTTATTGACTCTTTTACACCTGGTTGAAACATTTTTAAGAACACAGCAAACTTTGCTTCTGACCATGCTTTGTGCCTTGCATATATCAGGTATGGATTTTCCTCTACATCTGAAACCAGTTGCTCTAGTTCTGGGATGCCCATCCTTCTAACCTGATCATGCCAAAGTTTCATATTGGAAAAGCTTATTTTAACTGATCTTAGAGATTTGCTAACACTCTGATCAGGAATTTCCTCTTCTTCATATTTTATATCTGACTCATGTATATTTGCATATGTAAGACCTCTGCCATAATCTGTGGACATAAACAACCTATAAATTTGAAATTCAACACCAGTGATTCCGGCACAGAAATCTGAATCTAGAGGATAAAATCCCAAAGCAGGGTCTAGTTGGTCCAAAATGTCCGATGCAGCTTTTAAACTCAACTTAGAAGTGTGCAAACCAATTAACAAATAATGCATCCATGCTTGACAAAGCTGGATTAAAGCAACCTCTAACACTTTTCCCCCCCCTTCCAACACTTGACTACTCACATTATAGTTCATTCTGATTCTATCTATAAATCTTTCTGTAACAGATGTTTCTAAACAGGCAGACACCCATCTGAAAGTGGGCTTAACCACATTGCTTCTAACCATCCATTCTGAATTAAACTCTATCAGATCTAAACATCCAATTGATGACTTAGCCCTGCTAGTATAGATTGAGAAATATTTTGAAACATTTTCTTTCCAGTGTAACAAGGTTGTTGCTAACCTTGTCCTGTTATGACTAGGAGTTCCCATTAAACTTAAAAGTTGGCCAGAGTCATCACTTCCTTGCACAACTGTTATATTGCATAGAATGCCTCTCCGCTTTAAATAGTCTGTCTGTAGCTTTTTCATGACTTCTTGTATCATAGTGTGAGTGAACGAGCTTGTATAGTGAAGAATACCTTGCATCATTCCTGATCTAATAAACATTTTGTTACTCTGTGCCTGAGAAAAGATACCATCACCATTGAAAAATTCTGTCTTCATTCTAGTGTAGATATGATTAGATTTTGTTTTCCTATTGGCTTGGAAATTTGCGGCAAACTGTATGGGAAAGCTAATTCTCTTGCATTTCCACAGACTCATCACATGTACGAAGAAAGGCTTGAATTCATCAGGGAGGAAAGGTGAGATCACAGCTGCAAACTTGGAACTGTCATTTCTCTGACACCACTTTGTTGCATCAGCTGATTTCCCCATTGTAAAAAATTGCTTGCCCAACTTTTGTGCAGATTCTTGGTAATGTTTTTTTACAAATGTTTCTTTTTCATATGGGTGGGTTAGTGTGTCTGAGGGGATGAGTCTGCACAGAGTCTTGCTCATTGATTCAACAAAGTACTGTAGAATCCTCATTTTGACCTCCAACACATGAATCTCCCTATCTCCTCCATGCTGAGATTTTGGAAATATATCACTGTCCCAAAACCCTCTTTTCTCTATCTCTTTCAAGCAGTAAGGGATTAATTCCACTGGATGCTTTATCTTCCTGTTTTCAGCTTCTTCAAACTCTTCCACCAACAAGCTGATTGATTCCATCACTCTTGGCCTCTTGACTTTTTCTAGCGGGTTAGATTTCTCATACAGATCCTTCATCATCTTATTCGTCATAGAGTCATCCAGATTTGGGACTACTATAGAATCATTATATGATCTGGATGAGACTTTCAAAGTTGCCAAGTCCTCGAATGAGCATTGAGCTAATGACCTTATTATCTCTTTTTTTATAATTAGCTCATAATCCTTCCCCAAAATTTCTTTTAATATTGATTTGAAGATGTTAACAAACACTTTGATCATTATTCTATTACTCACATGGATTTGAGTGTTTAAAGATTCATTAAATGTGGACAAAACTGTGTCTCTGAATCTATATTCCTCTGCTACTATTTTTTTCATGATTTTAAAGTTTCTATCACTACCTCTGCCTCTCTCTTTGCTTACCACATACCCAAAGTAAAACTCATTTATTTTCTGTTTAAGTGATGGCTCGTAATCTGCAAACATGCTCTTAAGACCTGAATAAACAATATCATATTCTAAAGTTTCTTTATTTGGTATCTTTAAAACCTTTGTCTCAGAATAATATTGCATGTGTCTGATAGTTTTTTTAAGGAAATAACATGTTAATCTGGATCTTATCACCTCTGGCAACCTCTCACAAAATCTGTATGGATTGGGATCCAATTCCTCTAATACACCCATAGTCAAATATCTCTGACTTGTTATCAGCTCTTCACAATCTGTTTTGTTGTTCAAGAATAACAAGAGAATCCCTGCAATATGCTGGTTTAGAACTACATTCATGAAATCAATGTTAGATAGATCTAGTTCCAAGTGAGACAACATGTGTGAAGCTATAGAAATCATGTAGGGACCACTCTTTACAAAGTGCTCAATGCTAGGTTCATTGAAAGAACACACATCAGTAAAATAAAAGTTGTTTGATTCCCAGATTCTGGGTCCTATTCTCCCCACTTCTAATAACTTGCAGGAGGATTTAGGAAATGCAAATATTGCAAATACATGATCACCTGTGCACCTAATCAGAATGTGTATGCCTTTGTGGATCTTATGGTAAAAATCAGACCTTTTAATCCAATACTTGTGAGAATAACATATTTCTGTCATAATATTTGATATGGTTTGACCAAAGTTTGCTAACACAGTGTGCTGTAATTTATTGAAAATATTCACAGACAAAGATTTTTTGCCGCCCCAAATCTGTTTCCCTTTACAGATCAGCTTAAAAATTTCTTTAGGGACAATTGTATTCACTTCACTCTTCAATAAAGTTTTATTGTGAAACTCAAGTATGTCACTTGTCTCCGTCAAAGTTGGATGAAAACTCTTCTTATCATCAGCTGACTTAGCTATGAGATCTGGATTTTCACTCAATGCTTTTGCCCACAGCCCTGATTTTGCAGCCTCAATTTTATCAGCCTCAGTAAGATTTTTAACATTGAAGGCAGCACCTTTTTGTATTCTATGCCTCTCATAATACTTTAGTCCCATAGCTTCTTCTAACTGTTCTTCTTTTGACAAATCTCTGGGTTTGGCTGATGAAGAAGCACCCCATATCTTTTTTAGATACAAAGGCATGTCTCGACAGTTTTCCTCGTCAGTTTCTATATCATCTAGTGGAATCTTATTCTGATATATCATAGGGATGTTTGTGATCCTCTTATCTGATATCTTACTAAAACCTTCAAAACCATCTAAATACCTTTTCAACTCTTCGGAACTGTTGCTACTACTCATGGTTGATTCTGCTAGAGTGGCTTTTAATATCTTACCTACATGTTTTTTATCATCTATTGTCATGGGATCATTAATTGAAGATATTTTATCCAAATCAAAATCAGAACTTGACTTTGTGTTCATGGTCAATCCCCTGAAAACATCTTTAACAATCGCTTCATCTGCAGTGTGATCTTCTGAAAACATGTCTTGGCCTAAATACTCACTAATAACTGATTCTAGAGCTAACCCAATTCTAGCCCTTAAGCATAAGCAATTGACTAAATCCTGTGTCATTTCAAAATTGCAATAAACCCTAGATGGAGACACAATCAACACGAATAAATCATAATCTGTAGGCTCAATCAGATAAGAGTATTTAATGACTTTCCCAGTGTATAGTTTCTTCAAAGAGAACAGTTCAGAGATTGCAGAGGTTCCAACTTCTAACACTGATTTATAGGTTGTGTTTATATAATCAGGTGTTAGATCTCCTTCTTCTCCCTTCACCCCTATTGTTTTAAGTGGCATATCTGATTCAAACAGCATGACACTGCAGACTATTTCATGGCGAATCTTCCTGAGATTCTCAGAAGAAACATCTAGATATCTCTCCCGGCCATTAACACTTATCTTAAATACAGAACCATTGTATGAGCAATTGTATGAAGGCTCTGGCAGTTCTCCACAGACATATAATGTTGGCTCGATTTTGTTCAATCTGAGAGAGCCTACAGAGAAGTTGGAGTCTATTCTCAAGTTGTTAGTCATGATAGCGTTTACTAAAAATAGTTTGGGATCTGTGTGT
35,930
MZ926713.1
Citrus concave gum-associated virus
Liu,Z., Dong,Z., Zhan,B., Li,S.
Institute of Plant Protection, China Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory for Plant Disease and Insect Pest
China
2021-11-08
Weihai
Coguvirus citri
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
6,674
GenBank
null
China
China
Malus domestica
null
2020-10
null
null
Citrus concave gum-associated virus isolate Weihai segment RNA 1, complete sequence
ACACAAAGACTCCCAAACTTTTTTAAAGTTTTAAGAATTAATTAAGATAGCTCATTCACAATGAAGTCTTTGTGTTGCCAGCTCATAATGTGATTTCATGCTCACCTGAGGTTTCATACCCACAACATGAGATCCTGAGATTATAGCGAGAACTCAAAATATCTAAAAATAAAGTCGTGAGATAGGATTTACATGTGGATTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAAGGTTAGCTTGCCATCCTTGGTTAAGTCATCTATGTGTGTGTCCAACTCAGCCTTTAATATCTGATGAAACACATGTGTACTCAGCATCCTGTAACTGCTAGGCACTAACTCCAAATTCAGCAGTCGATCTTTGACTTTATGACAAACATCTACAACTTTATAGGTGTCCATGTCACTTTCTTTTGTTTTGCTTAACTTAGACATAGTCATCGCATTTTCATACCTGTTCAGAATATTCATAAGGGTTTGTTGCAATCCAACAGGAGCTTTTTCAATTTCATCTCTCAAATAATTAATTCTTGACTCTAGATCATTTATGTCCAAACTATCTAGACCTGTTGCATCAGATGCTATTGAAGAGATTCTGGCACTATCTTGCTCTAAGTATGTGATTAATTCACTCTCAGTGTTTGGAACTGGTATACATACCCGGCCACAATAAAATGACAATAGAAGGCCCATGAACCCTGGTGCAACTAGAGAATGGTCGGTTTTAAACTTTTTTACTGTGCTCATGAAATCAGCATCACCTAACAAAACTCTACTTAAGGTGTCAATGTTTGACAAGGCTAAGTTGGTCTTAGGCATTGAGTTCCTATCATTCAAAGTGAATTCATCCAACAAAGGATTAATTGTGAATAAAGCCAGTTGATTTTCTATTTGATCAAACAAATCAATATTGGTTTCAAATAAATCATCATCATCAATATCTGACTCTAACTCATCAAACTTGTCATCCATAGTCCAGTCAATGGCTTCATCTATATCCATATTCATCTCGTTAAGCAATGCTTCAATGTCTTCATTCATATCTTCATCCACTTCATCATCTGCAACCATCTCAAGAACGTCTTCAGTGGATAGTAGCTGTTTTTTTATTGAATCCAGCAACTCGCCTAAATTCCAGCCTGATTTAGTTAGTGCAGTTCGTCTGTTTCTATTTGCTTTCATGATGTCACCTGGTAGAGGTTTGCATACTGATAATATTTCCTCGTCTATGACTTCAATTGGTATAGGAGTGCCTGAAGACCAATGTTTCAGTAACTTATCATCATCTATTGTAAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCAAGAAAACCCTTCACTCAATATTGTAATCTTCTGATTTACCCCGTATTCTGCTTGGAGTCTAATTCTGTTGTTTCCCACTGACCAACTCCATGTGTAATCAGATATCTGGTCTATGATGTCAATTTTAAGTGTGTTATCCACCTTGATTGGGTAATAAGTTGCTTTACCAAATCCACCTACTATTCTCCCACTGCCAGTTAGCCAGTGATCATAATTATCATTATTTATGTCTGGTGACTCTAATGAAAAGCTATTCATAAGGTCAAGTAGAAGTGGCCCAAGAGTTCTTAAGTCAGTGAGCTTAGATAATGTTATTTGACTACAACAGTTCCCTGACATGCTGATAATGACAGATACATCTAAACATTTCCCTCTCCACTCTCCTAGTCCTGATCTAGTCTTGCCCCAGCCCCTTTGCCTACTTGTAAAAAAACCTACTGTCCCCAGCTTTTCATCAGAAATATATTTCACAATTGAACTTTTATCTTGATTTGTGAACCACTTCCTTAGCACTCTTAGCTTCTTAATCCTTTGAGGTACTCTTATCTTCCCTAAGGTAGGGCTGTCCATTATAATCTCTTGAATTCTTTTTTTCTTTATGGTGTCACTATACCAAGAGGTTAGTATAGTAAACAGCTTGGAACGTATTGAATAGGAGGTTTCTTCTTCATCAGATTTACCAGGTAATACTAATTTAACCCCTGTCCAGAAAATTCTAGAAATTGAATTAAATAAAGATGAGGACTTTGCACTAGTGTCTAGAAGAACAATGTGTCTTGGTTTTGATGTGATAGACTCCAAGAACCCTTTTAACTCAACTTCATTGCACTTTAGAATTAATTTTGTTTCCTGTCTATCATCTTTGATAAAAGGATACTTTAGCTTGACATCCTGCCAAAAGGTTTCAAATTGTCTCTTAGATAGTGGTAACCTACCAATTCCAAACCATCTTTTGCGGCATAAATCTATCAGAGGGATATCATCTATTGCTCTCTCAAAGACTGAAATCTTCTGCTTATTTCTAGTTCGTAGTTTAGAAGGCACCATTGTCGATTTAGATTCTAAATCTATTATATAATCCATAACTTCTCTGTATTCTTCTGAGTGTGTGAATGTAAGAGATGGATCTAATTTCACTTTACCCTCAGTCTCTAATTTATTATATGCCAAAGCTCTGAGTAGACTTACTTTCATAAGATCCCCTGATACATAAATTGATACGCATGGTCTGGAAATCAGGTAAGCAGATGCTGACATCACTCTCGCTGTGGCTGCATGCTTACTTATTGACTCTTTTACACCTGGTTGAAACATTTTTAAGAACACAGCAAACTTTGCTTCTGACCATGCTTTGTGCCTTGCATATATCAGGTATGGATTTTCCTCTACTTCTGAAACCAGTTGCTCTAGTTCTGGGATGCCCATCCTTCTAACCTGATCATGCCAAAGTTTCATATTGGAAAAGCTTATTTTAACTGATCTTAGAGATTTGCTAACACTCTGATCAGGAATTTCCTCTTCTTCATATTTTATATCTGGCTCATGTATATTTGCATATGTAAGACCTCTGCCATAATCTGTGGACATAAACAACCTATAAATTTGAAATTCAACACCAGTGATTCCGGCACAGAAATCTGAATCTAGAGGATAAAATCCCAAAGCAGGGTCTAGTTGGTCCAAAATGTCCGATGCAGCTTTTAAACTCAACTTAGAAGTGTGCAAACCAATTAACAAGTAATGCATCCATGCTTGACAAAGCTGGATTAAAGCAACCTCTAACACTTTTCCCCCCCCTTCCAACACTTGACTACTCACATTATAGTTCATTCTGATTCTATCTATAAATCTTTCTGTAACAGATGTTTCCAAACAGGCAGACACCCATCTGAAAGTGGGCTTAACCACATTGCTTCTAACCATCCATTCTGAATTAAACTCTATCAGATCTAAACATCCAATTGATGACTTAGCCCTGCTAGTATAGATTGAGAAATATTTTGAAACATTTTCTTTCCAGTGTAACAAGGTTGTTGCTAACCTTGTCCTGTTATGACTAGGAGTTCCCATTAAGCTTAAAAGTTGGCCAGAGTCATCACTTCCTTGCACAACTGTTATATTGCATAGAATACCTCTCCGCTTTAAATAGTCTGTCTGTAGCTTTTTCATGACTTCTTGTATCATAGTGTGAGTGAACGAGCTTGTATAGTGAAGAATACCTTGCATCATTCCTGATCTAATGAACATTTTGTTACTCTGTGCCTGAGAAAAGATACCATCACCATTGAAAAATTCTGTCTTCATTCTAGTGTAGATATGATTAGATTTTGTTTTCCTATTGGCTTGGAAATTTGCGGCAAACTGTATGGGAAAGCTAATTCTCTTGCATTTCCACAGACTCATCACATGTACGAAGAAAGGCTTGAATTCATCAGGGAGGAAAGGTGAGATCACAGCTGCAAACTTGGAACTGTCATTTCTCTGACACCACTTTGTTGCATCAGCTGATTTCCCCATTGTGAAAAATTGCTTGCCCAACTTTTGTGCAGATTCTTGGTAATGTTTTTTTACAAATGTTTCTTTTTCATATGGGTGGGTTAGTGTATCTGAGGGGATGAGTCTGCACAGAGTCTTGCTCATTGATTCAACAAAGTACTGTAGAACCCTCATTTTGACTTCCAACACATGAATCTCCCTATCTCCTCCATGCTGAGATTTTGGAAATATATCACTGTCCCAAAACCCTCTTTTCTCTATCTCTTTCAAGCAGTAAGGAATTAATTCCACTGGATGCTTTATCTTCCTGTTTTCAGCTTCTTCAAACTCTTCCACTAACAAGCTGATTGATTCCATCACTCTAGGCCTCTTGACCTTTTCTTGCGGGTTAGATTTCTCATACAGATCCTTCATCATCTTATTCGTCATAGAGTCATCCAGATTTGGAACTACTATAGAATCATTATATGATCTGGATGAGACTTTCAAAGTTGCTAAGTCCTCGAATGAGCATTGAGCTAATGACCTTATTATCTCTTTTTTTATAATTAGCTCATAATCCTTCCCCAAAATTTCTTTTAATATTGATTTGAAGATGTTAACAAACACTTTGATCATTATTCTATTACTCACATGGATTTGAGTGTTTAAAGATTCATTAAATGTGGACAAAACTGTGTCTCTGAATCTATATTCCTCTGCTACTATTTTTTTCATGATTTTAAAGTTTCTATCACTACCTCTGCCTCTCTCTTTGCTTACCACATACCCAAAGTAAAACTCATTTATTTTCTGTTTAAGTGATGGCTCGTAATCTGCAAACATGCTCTTAAGACCTGAATAAACAATATCATATTCTAAAGTTTCTTTATTTGGTATCTTTAAAACCTTTGTCTCAGAATAATATTGCATGTGTCTGATAGTTTTTTTAAGGAAATAACATGTTAATCTGGATCTTATCACCTCTGGCAACCTCTCACAAAATCTGTATGGATTTGGATCCAATTCCTCTAATACACCCATAGTCAAATATCTCTGACTTGTTATCAGCTCTTCACAATCTGTTTTGTTGTTCAAGAATAACAAGAGAATCCCTGCAATATGCTGGTTTAGAACTACATTCATGAAATCAATGTTAGATAGATCTAGTTCCAAGTGAGACAACATGTGTGAAGCTATAGAAATCATGTAA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36,003
MZ220967.1
Citrus concave gum-associated virus
Rast,H., Boyes,I., Rott,M.
Canadian Food Inspection Agency, Plant Health
Canada
2021-10-13
15AH001
Coguvirus citri
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
6,690
GenBank
null
null
null
Pyrus communis
null
2015
null
null
Citrus concave gum-associated virus isolate 15AH001 segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGACTCCCAAACTTTTATAAGTTTTTTTATCAAGAATCGAATAACTAAATTATGTTGAGGCCTTTGTGCGAGTAGTGAATTAAATCTCAACTCTGTGAATTCCTTCAGTCTTGTAACCACAACAAGTTATTGCTAGGCCATATCTAGAACTAAGCATGTCCAATGTAAGTGTTGTTAGATAGGGCTTACCAATTGCTTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAATGTTAATCTGTCTTCTTTGGTTAAATTATCAACATGTTGGTCCAGCTCAGCTCTCAATATTTGAAGGAAAACCCCTTTATTCAAAAGTTTATAACTCTCTGGGATATAATTGTTTTCTAACAGCAAAGGTTTTACTTTTTCTGCCACATCTATTAATTTTATTGAGTCCATGTCACTGTCCTTTGTAACACTTAATTTTGAGATCGTTCTTACATTCTCATACCTGATTTTAATATTGTTCAACATGTTGAAGAGATCAGCTGGGGCACCATCCATTTGTTTTTCTAAATAATCAATTCTCGAGTCTAAGTCAGCCGGATCTAATTTTGCAATCTCTGTTGCGTCAGAAGCCATGGAAGAAATTTTAGCACTGTCTTTATCTAACTCACTAATAACTCCATAAACCTCATCCGGAGCGGGTATGCAAACCCTACCACAGAAGAATGACAGTAGCATACCCATGAACCCTGGTGCTGTTAGATCATTATTTAGCTTAAATCTTTTAATTGTTTGTAATATCCCTTCATCCCCCAAAAGCACTCTGCTGAGAGTATCTATATTGGATAGAGCTAAATTAGATTTTGGCATACTAGTTTTATCATTCAGTGTGTACTCTTCAATCAAAGGGTTAACAGTAAACAATGCTAGCTGATTTTCAATTTGTTCAAACATATCAATGTTAGTGCTAAACAAATCTTCTTCAAGGGTTAGATCTTCAATGTCATCAAATCTATCATCTAGTGTCCAGTCTAGTGTGTCTGTCATATCCATATTCATTTCATCTAACAAAGCCTCAACATCTAAATCAACATCATAATCTTCAAAAATTGGCTCTTCATGTTCTAAAATATCTTCAGTAGATAATAGTTGTTTCTTTACAGTATCTAAAAAGTCTCCTAACACCCACCCAGACTTTGTCAATGCTTCTCTTCTATTTCTAAAAGCTTTTAAGATTTGTCCAGGTAGAGGTTTGCAGATGGAGACCATCTCTTCTTCTATTGTTTCAATCGGTATAGGTGTTCCTGAAGACCAATGTTCTAATAAGATATCATTATTAATGTTGAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCTAGTGAAGCCCTCACTCAAAATTGTCATGCGCTGATTTTCACCATACTCAGCTTGCAATCTGATTCTATTATTTGATACAGACCAGCTCCAGGTGTAATCTGATATTTGGTCTATGATGTCTATCTTTAGTGATGTATCAATATCAATTGGGTAGTAAGAAGCCTTACCATATCCTCCAGTTATCCTGCCACTTCCAGTTAGCCAGTGGTCATACTTGTCATTTTCTATCTTAGGGGTGTCTAAGGAAAAACTGTTCATTAATTCTAAGAGTAGTGGACCAAGAGTCCTAAGATCTATTAACTTGCTTACAGTGATTTTAGAGCAATAATTATCCCTCATGCTAACAACAACAGACACATCTAAACATTTCCCTCTCCATTCTCCTCTTCCAGATCTTGTTTTGCCCCATCCCTTTTGCCTACTAGTAAAAAAACCAACTGTTCCCAATTTCTCTTCTGAGATGTATCTAACTATTGATGCTTTGTCTTGATCAGCAAACCATTTTCTCAAAACCCTAAGTTTTTTTATTCTATGAGGAACTCGTATCTTATTCAATGCAGGACTCTCAGTGATTATCTCTTGTATTTTTTTCTTTTTAATCATTTCAGAATACCAACTAGACAAAACAGTGAATATCTTTGATCTTATGGAGTAAGAAGTCTCCTCTTCATCTGACCTACCTGGCAATACTAGTTTGACCCCATTCCAGAAAATTCTTGATATGGAATTGAACAAAGATGCAGATTTTGCACTGGTATCTAAAAGTACAATGTGCCGTGGTTTAGATGTTATAGACTCTAAAAAACCCTTTAACTCAACCTCATTGTAGTTTAACATCTCTTTGGTTTCATTTCTATTATCTTTTAAAAAAGGATATTTTAATTTTGCTTCATTCCAAAAGCTGTCAAATTGTCTTCTAGAAAGAGGTAACCTTCCAATTCCAAACCATTTTTTTCTGCATAAATCCACTATTGGTACATCATCTAATGACCGCTCGAAAACAGAAATCTTTTGCTTGTTTCTTGTTCTTAATCTAGAAGGAACCATTGTAGACTTTGTTTCCAAATCCTCAATATACTCCATAACTTCCTTATACTCTTCCGCATGGGTGAATGCTAAGTTAGGTTCTAGCTTGGTCTTACCTTCTTTATCAATCTTGTTGTATGCCAGAGCTCTTAACAAACTCACTTTACACACATCACCATTTATATGGATTGTGACACAAGGCCTAGAAATCATATATGCTGATGCCGACATTAACCGAGCTGTTGCTGCATGTCGACTTATTGATTCTTTGACCCCAGGTTGGAACATTTTTAAGAAAACTGCAAACTTAGCCTCTGACCAGGCTTTGTGCCTAGCATAGATTAGATATGGATTCTCTTCCACTTCTAAAATCAATTCTTCTAGGTCTGGCATGCCCATTCTCCTCACTTGCTCTTGCCATAATTTCATGTTTGAGAATGTTACTTTGGCAGATCTTAAAGCTTTACTCACTGATTGATCAGGAATTTCTTCCTCCTCATACTTGGTATTTGACTCATGAATGTTCGCATAAGACAAGCCACGACCATAGTTTGTTCTCACAAACAGTCTGTAAATTTGGAACTCGACACCAGTGATGCCAGCACAAAAGTCAGAATCTAATGGATAAAATCCTAGAGAAGGATCCAACTGATCAATCATGAATGAGCAGGCTTTTGTTGCAAGTTTTGATGTGTGTAATCCTAATAACAAGTAGTGCATCCATGCCTGACATAATTGAACTAATGCCACTTCTAGCACTTTACCCCCCCCTTCCAACACTTGGGATGCAACATTGTAGTTGATTCTTATTCTGTCAATAAACCTCTCTGTAACAGTCGTCTCCAAGCAAGCTGACACCCACCTGAAGGTTGGCTTCACCACATTGTTCCTCACCATCCATTCAGAGTTGTATTCTATTAGGTCCAGGCAGCCTATTGAAGATTTAGCTCTACTAGTGTAAATTGAAAAGTACTTGGATACATTTTCCTTCCAATGCAATAAAGTAGTGGCCAACCTGGTCTTATTATGGGATGGCAGCCCTGTTAAGCTGATCATCTGAGCTGAGTCATCACTTCCTTGAACTACTGTGATGTTGCAGTGTATTCCTCTTCTCTTCAAGTAGTCTATCTGTAATTTTTTCATGACTTCTTGGATGAGAGTATGTGTGAAAGAGCTCGTATAATGTAATATTCCTTGCATCATGCCTGAACGTATGAACATTTTGTTACTTTGAGCTTGCTGGAAGATACCCTCCCCTGAAAAAAACTCTTCTTTCATTCTCATGTAAATTTTGTTGGATTTAACGTTCTTGTTAGCTTGAAAATTTGCTGCAAACTGAACAGGGAAGCTTATTCTTTTTACCTTCCATAGACTCATTACATGAATGAAGAAAAACCTAAATTCAATTGGGAGGAAAGGAGAAATTACCGCAGCAAATTTTGAGCTATCATTCCTTTGACACCATTTTGTAGCATCAGCAGACTTCCCCATTGTAAAAAATTGTTTCCCTAGTTTGTTGGCAGAGTCTTGATAATGTTTTCTAACAAAGGATTCTTTTTCATATGGGTGTGTTAGTGTATCTGAAGGAACCAATCTGCATAGAGATTTACTCATGCTCTCACAAAAGAATTGCAGGACTCTCATTTTAATTTCTAAGACATGTATTTCCCTATCTCCTCCATGCTGTGACTTAGGGAAAATGTCACTGTCCCAAAATCCCCTCTTATCTATCTCTTTTAAGCAGTAGGGTATTAATTCAACAGGGTGTCTTATCTTTTTACACTCAACTTTCTCATACTCTTCAACAAGAAGGCTTATTGATTCCATAACTCTAGGTCTCTTTGTTTTCTCTTTTGGATTTGATTTTTCATATAAGTCTCTCATGACCTTATTGGTCATATCTTCTTTGATGTTTGGTATTATTAGAGAGTCATCATAGGATCTGGATGACACTTTCAGTGTGGCTAGGTCTTCAAAAGAACACTGTGCCATGGATTTTATTATTTCTTTTTTTATTATTAAAGAATAATCCTTTCCTAGGATTTCAATTAATATGGATTTAAATATGTGTACAAAGACTTTAATCATAACAGGATTGCTCACATGTATTTTGGGTTCCAAGCTTCTGCTGAAGGTGGAAGTGACTGTATCTCTGAACCTATACTCCTCAGCAACGATCTTCTTCATTATTTTGAAGTTTCTATCACTACCTCTACCTCTTACTTTACTAACCACATAACCAAAATAGAATTCATTTACCTTCTGCTTTAAAGAAGGCTCATAATCCCCAAAAAGACTTTTTAATCCTGAGTACACTATGTCATATTCTAGTGTTTCTTTATTTGGTATCTTAAGAACTTTTGTCTCTGCATAATATTGCATGTGAGATATAGATTTTTTGAGGAAAAAACTAGTTAGTCTAGATCTTAACACTTCTGGGAGTCTTTCGCAGAATCTATAGGGATTTGGATCTAATTCTTCTAGTACTCCCATTGTTAAATATCTCTGATTTGTAATCAATTCTTCGCAATCTGTTTTATTGTTTAAGAAGAGCAAGAGTATTGAAGCTAAATGTTGATTAAGAACCTTACTAGATAAGTCTATATTAGACAAATCAAATTCTAGATGAGATATTAGATGGGAAATGATTGAGCAGATA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37,156
MG764563.1
Citrus concave gum-associated virus
Navarro,B., Zicca,S., Minutolo,M., Saponari,M., Alioto,D., Di Serio,F., Tessitori,M.
Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante
Italy
2019-10-30
LR3
Coguvirus citri
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
6,674
GenBank
1
Italy
Italy
Citrus sinensis
null
null
null
null
Citrus concave gum-associated virus isolate LR3 segment RNA1, complete sequence
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58,491
MK940540.1
Citrus concave gum-associated virus
Nickel,O., Fajardo,T.V.M., Candresse,T.
Embrapa Uva e Vinho, Laboratory of Virology
Brazil
2019-07-16
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Coguvirus citri
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Phenuiviridae
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Brazil
Brazil
Malus domestica
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1999-08-10
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Citrus concave gum-associated virus isolate Gala segment RNA 1, complete sequence
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Mishima
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Citrus concave gum-associated virus isolate Mishima segment RNA 1, complete sequence
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61,736
KX960112.1
Citrus concave gum-associated virus
Navarro,B., Minutolo,M., De Stradis,A., Palmisano,F., Alioto,D., Di Serio,F.
Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante
Italy
2017-08-14
CGW2
Coguvirus citri
Coguvirus
Phenuiviridae
ssRNA(-)
6,681
GenBank
1
Italy
Italy
Citrus sinensis
null
null
null
null
Citrus concave gum-associated virus isolate CGW2 segment RNA1, complete sequence
ACACAAAGACTCCCAAACCTTTTTTAAAAAAAAAGTTTTAAGAATTAATTAAGATAACTCATTCACAATAAAGTCTTTGTGTTGTCTGCTCATAATGTAATTTCATGCTCACCTGAGGTTCCATACCCACAACATGAAATCCTGAGATTATAGCGAGAACTCAAAATATCTAAAAATAAAGTAGTGAGATAGGATTTACAAGTGGATTCTCTATAAACAGATTGTTGTGCAAAGGTTAGCTTGCCATCCTTGGTTAATTCATCTATGTGTGTGTCTAACTCAGCCTTTAATATCTGATGAAACACATGTGTACTCAGCATCCTGTAACTGCTAGGCACTAACTCCAAATTCAGTAGTCGATCTTTGACTTTATGACAAACATCCACAACGTTGTAAGTGTCCATATCACTTTCTTTTGTCTTGCTTAACTTAGATATAGTCATCGCATTTTCATACCTGTTCAGAATATTCATAAGGGTTTGTTGTAATCCAACAGGAGCTTTTCCAATTTCATCTCTCAAATAATTAATTCTTGACTCTAGATCATTTATGTCCAAACTATCTAAACCTGTTGCATCAGATGCTATTGAAGAGATTCTGGCACTATCTTGCTCTAAGTATGTGATTAATTCACTTTCAGTGTTAGGAACTGGTAAACATACCCGGCCACAATAAAATGACAATAGAAGGCCCATGAACCCTGGTGCAACTAGAGATTGGTCAGTCTTAAACTTTTTTACTGTGCTCACGAAATCAGCATCACCTAACAAAACTCTACTGAGGGTGTCAATGTTTGACAAGGCTAAGTTGGTCTTAGGCATTGAGTTCCTATCATTCAGAGTGAATTCATCCAATAAAGGATTAACTGTGAATAAAGCCAGTTGATTTTCTATTTGATCAAACAAATCAATATTGGTGTCGAATAAATCATCATCATCAATATCTGACTCTAACTCATCAAACTTGTCATCCATAGTCCAGTCAATGGCTTCATCTATATCCATATTCATCTCGTTAAGCAATGCTTCTATGTCTTCATTCATATCTTCATCCACTTCATCATCTGCAACCATCTCAAGAATGTCTTCAGTGGTTAGTAGCTGTTTTTTTATTGAATCCAGCAACTCGCCTAAGTTCCAGCCTGATTTAGTTAGTGCAGTTCGTCTGTTTCTATTTGCTTTCATGATGTCGCCTGGTAGAGGTTTGCATACTGATGATATTTCCTCGTCTAAGACTTCAATTGGTATGGGAGTGCCTGAAGACCAATGTTTCAGTAACTTATCATCATCTATTGTAAAATCAGGATCCCAGTCTTTGCAAGAAAACCCTTCACTTAATATCGTAATCTTCTGATTTTCCCCGTATTCTGCTTGGAGTCTAATTCTGTTGTTCCCCACTGACCAACTCCATGTGTAATCCGATATCTGGTCTATGATATCAATTTTAAGTATGTTGTCCACCTTGATTGGGTAATAAGTTGCTTTACCAAATCCACCTACTATTCTCCCACTGCCAGTTAACCAGTGATCATAATTATCATTATTTATGTCTGGTGACTCTAATGAAAAGCTATTCATAAGGTCAAGTAGAAGTGGCCCAAGAGTCCTTAAGTCAATGAGCTTAGATAATGTTATTTGACTACAACAGTTCCCTGACATGCTGATAATGACAGATACATCTAAACATTTCCCTCTCCACTCTCCTAGTCCTGATCTAGTTTTGCCCCAGCCCCTTTGCCTACTTGTAAAAAAACCTACTGTGCCCAGCTTTTCATCAGAAATATATTTCACAATTGAACTTTTATCTTGATTTGTGAACCACTTTCTTAGCACTCTTAGCTTCTTAATCCTTTGAGGTACTCTTATCTTCCCTAAGATAGGGCTGTCCATTATAATCTCTTGAATTCTTTTTTTCTTTATAGTGTCACTATACCAGGAGGTTAGTATAGTGAACAGCTTGGAACGTATTGAATAGGAGGTTTCTTCTTCATCAGATTTACCAGGTAATACTAATTTAATCCCTGTCCAGAAAATTCTAGAAATTGAATTAAACAAAGATGAGGACTTTGCACTAGTGTCTAAAAGAACAATGTGTCTTGGTTTCGATGTGATAGACTCCAAGAACCCTTTTAACTCAATTTCATTGTACTTTAGAATTGATTTTGTTTCCTGTCTATCATCTTTAATAAAAGGATACTTTAGCTTGACATCCTGCCAAAAGGTTTCAAATTGTCTCTTAGATAATGGTAACCTACCAATTCCGAACCATCTTTTGCGGCATAAATCTATCAGAGGGATATCATCTATTGCTCTCTCAAAAACTGAAATCTTTTGCTTATTTCTAGTCCGTAGTTTAGAAGGCACCATTGTCGATTTAGATTCTAAATCTATTATATAATCCATAACCTCTCTGTATTCTTCTGAGTGTGTGAATGTAAGAGATGGATCCAATTTCACTTTACCCTCAGTCTCTAATTTATTATATGCCAAAGCTCTAAGTAGGCTTACTTTCATGAGATCCCCTGATACATAAATTGATACACATGGTCTGGAAATCAGGTAAGCAGATGCTGACATCACTCTCGCTGTAGCTGCATGCTTGCTTATTGACTCTTTCACACCTGGTTGAAACATTTTTAAGAACACAGCAAACTTTGCTTCTGACCATGCTTTGTGCCTTGCATATATCAGGTATGGATTTTCCTCTACTTCTGAAACCAGTTGCTCTAGTTCTGGGATGCCCATCCTTCTAACCTGATCATGCCAAAGTTTCATATTGGAGAAGCTTATTTTAACTGATCTTAGAGATTTGCTAACACTCTGATCGGGAATTTCCTCTTCTTCATATTTTATATCTGGCTCATGTATATTTGCATATGTAAGACCTCTGCCATAATCTGTGGACATAAACAACCTATAAATTTGAAATTCAACACCAGTGATTCCGGCACAGAAATCTGAATCTAGAGGATAAAATCCCAAAGCAGGGTCTTGTTGGTCCAAAATGTCCGATGCAGCTTTTAAACTCAATTTAGAAGTATGCAAACCAATTAACAAGTAATGCATCCATGCTTGACAAAGCTGGATTAAAGCAACCTCTAACACTTTTCCCCCCCCTTCCAACACTTGACTACTCACATTATAGTTCATTCTGATTCTATCTATAAATCTTTCTGTAACAGAAGTTTCCAAACAGGCAGACACCCATCTGAAAGTGGGCTTAGCCACATTGCTTCTAACCATCCATTCCGAGTTATACTCTATCAGATCTAAACATCCAATTGATGACTTAGCCCTGCTAGTATAGATTGAGAAATATTTTGAAACATTTTCTTTCCAGTGTAACAAGGTTGTTGCTAACCTTATCCTGTTATGACTAGGAGTTCCCATCAAACTTAAAAGTTGGCCAGAGTCATCACTTCCTTGCACAACTGTTATATTGCATAGAATACCTCTCCGCTTTAAATAGTCTGTCTGTAGCTTTTTCATGACTTCTTGTATCATAGCGTGAGTGAACGAGCTTGTATAATGAAGTATGCCTTGCATCATTCCTGATTTAATGAACATTTTGTTACTCTGTGCTTGAGAAAAGATACCATCACCATTGAAAAATTCTTTCTTCATTCTAGTGTAGATATGATTAGATTTTGTTTTCCTATTGGCTTGGAAATTTGCGGCAAACTGTATGGGAAAGCTAATTCTCTTGCATTTCCACAGACTCATCACATGTACGAAGAAAGGCTTGAATTCATCAGGGAGGAAAGGTGAGATCACAGCGGCAAACTTGGAACTATCATTTCTCTGACACCACTTTGTTGCATCAGCTGATTTCCCCATTGTGAAAAATTGCTTGCCCAACTTTTGTGCAGATTCTTGGTAATGTTTTTTCACAAATGTTTCTTTTTCATATGGGTGGGTTAGTGTATCTGAGGGGATGAGTCTGCACAGAGTCTTACTCATTGATTCAACAAAGTACTGTAGGACCCTCATTTTGACCTCCAGCACATGAATCTCCCTATCTCCTCCATGCTGAGATTTTGGAAATATATCACTGTCCCAAAACCCTCTTTTCTCTATCTCTTTCAAGCAGTAAGGGATTAATTCCACTGGATGCTTTATCTTCCTGTTTTCAGCTTCTTCACACTCTTCCACCAACAAGCTGATTGACTCCATCACTCTTGGCCTCTTGACCTTTTCTAGCGGGTTAGATTTCTCATACAGATCCTTCATCATCTTATTCGTCATAGAGTCATCCAGATTTGGAATTATTATAGAATCATTATATGATCTGGATGAGACTTTCAAAGTTGCTAAGTCCTCAAATGAGCATTGAGCTAATGACCTTATTATCTCTTTTTTTATAATTAGCTCATAATCCTTCCCCAAAATTTCTTTCAATATTGATTTGAAGATGTTAACAAACACTTTGATCATTATTCTATTACTCACATGGATTTGAGTGTCTAAAGATTCATTAAATGTGGACAAAACTGTGTCTCTGAATCTATATTCCTCTGCTACTATTTTTTTCATGATTTTAAAGTTCCTATCACTACCTCTGCCTCTCTCTTTGCTTACCACATACCCAAAGTAAAACTCATTTATTTTCTGTTTAAGTGATGGCTCGAAATCTGAAATCATGCTCTTAAGACCTGAATAAACAATATCATACTCTAAAGTTTCTTTATTTGGTATCTTTAAAACCTTCGTCTCAGTATAATATTGCATGTGTCTGATAGTTTTTTTAAGGAAATAACATGTTAATCTGGATCTTATCACCTCTGGCAACCTCTCACAAAATCTGTATGGATTGGGATCCAATTCCTCCAATACACCCATAGTTAAATATCTCTGACTTGTTATCAGCTCTTCACAATCTGCTTTGTTGTTCAAGAATAACAAGAGAATCCCTGCAACATGCTGGTTTAGAACTACATTCATGAAGTCAATGTTAGATAGATCTAGTTCCAAGTGAGACAACATGTGTGAAGCTATAGAAAT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75,168
NC_003877.1
Citrus leaf blotch virus
Vives,M.C., Galipienso,L., Navarro,L., Moreno,P., Guerri,J.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2001-05-25
SRA-153
Citrus leaf blotch virus
Citrivirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
8,747
RefSeq
1
France:Corsica
France
null
null
null
null
PRJNA485481
Citrus leaf blotch virus, complete genome
GAAAAGCAACGAAAGCAACCTACACAACCCAAAATTAATATATTGCAATAACTGTTATCACTCAATATAAGCCATGGCTTTGATGAGCAACAAAACTGCAATTGAATCTATTTTGGGTAACTTTGAAAAGAAACACGTCGATGCAATCTACAATGCCGCCGCACAAACTATCCTCTCTCACTCTGAATTTAGGAATAAGCATTTTGCTTATTCACTCAATTCTTATCAAAAGAAGATAGCCTCAAAGGTGGGTATTGAATTGTATCCAAATGGTTATTTACCACATTCCCATCCATTGTCAAAAATTTTTGAGAACCATTTGCTTTTTGATGTACTTCCTGGCGTAGTAAATACTAGTAGATTAGTTATGTGTAGCATAAAGGAGTCCAAAGTTCTGGTTTTTAAAGGGATTCGCGACAAATCCAGAAGACAGGTTTCAGACCTCAATGCCCTCAATTCCTTAAATAATAGTCATACATCATTCATTAATAGGTTAGTTGCATCCAAAGATGTGAGTAGATATACGGAAGAAGCTGATGCTTTTTTTCAATCCAAGAAAGGGAGTCCGGAGCTATTTTCAAGGAATTTCATCAAAAGCTTGGAAAATAAAGAGGCTGTTTTTTTTCATGATGAAGTTCATCACTGGACTAAGGCCCAAATGTTCTCATTTCTTAAAAGCACGAAGGTCAAAAGGTTCATTTTCACTGTAGTCTATCCACCAGAAATTCTCAAAAAATTTGCCAATTCCCAGAACCCAAAGGTTTATGATTTCAAAGTTGATAAGGGTCGGCTTTTTTTTTTTCCGGATGGGGTTAAGACAGAGGCCTATGAGCAGAAATTGAATATGGAGTGGCTCTTTTCAGCATCACATCTTCGCAGTGGAGACTGTGTATGGACTGTAACAAGACATAAGAGTATTTATGCTCATCACCTGTTTGAGATATCCATTGGCGAACTAGTCACGGACTCAAAACTTTTTTTTTCCGATTATAACTCCATTGACATGTCTAAAATATTTCTTGATCGTTTTCGGAGTTATGAGGTATTCCCCATTTCGATTGAGCACCTTTATAAGGTCTACTCTTATCTGCTTTGCCTCAAAAAACCTGACTTGGAGAGTGGTCTAGCTAAATTAAGGCAAATTATTGGAGATGATGTCGAAATCAAAGAATTCCTCTTCTTTGAACAATTTTGTAAGCGCTTAATTGAACGCCAAACCTCTTGGGGGCTATTTGGGCACTCTTTCTTTGAAAAATTAACCGATATGGCATTGTCATCCTTGCCCAACTCTATAGCCCGAATTTTTCCTCAATGGAAAAAAAAAAACACATTTGAGTTCCTTTTCTCACTTGGGACTCTTGTTGTGGATGTGGAGAGAAAGGTGTGTTTTGAACATGTGCTTGAGGAATGGGGATTTGAAGTTGTTATCACTGATGAAAATGCCTATCTTGATCCACTATCTATCTTTGCTATCAATGAAAATTTTAATGAGGATAGAGTGGACGATGGTTATTTGGAAAGAATCCGTCTTCCCTTCTGGAATCTGAATGACTATGACTTGAAAAGAAAGAGGGTAAATGCGTATAACATTCTCTCTTATCGATTTGAAGAGGAGCGAAAAATTGAATCAGCGCAAAAAGGTCCAAATAAGATGCTCCAGATTGAGTGGTACGGGATTAAAGAATTTAAAGTTGACCCTTTTATCAGCAACTCCATAACTGAATTTACTCTTTTAGAAGCATTGCTGGGAAAGAGGATAGATCCAAAAAAATACTCATATTCAAAGCAAGCCTGCACTCTTTCCAACTATCTCACATTTTTGTGTGCTGAGGGTTTGGATGGATTCAATTTGGAAGAGCACCTTGAACGAAGGTTGAAAGCGGCCGGTCATGACGTTTCAGATGACGAGGAGGAAGAATTGACTTCAGCTGAACAAGCGGGGCCTATCAAGATATTGGCTGATCCACTTGGTTTTATGAAAGAGTGTTTGGAGGAGATCCCAATCGAAACTGAACCATCACTGGAAGAAAGAGGGCAGTTTTCCACTGATTATCATTCTGAGAAATTTGAAATCAATTACAATGACATTTTTAATCCTCACAATTGCATGAACACTCACGGCGATGAAATTCCCACACCGTCAGATGGCAATTGTTTTTTTTCAGCATTTACTGAAACTTTTGAAGTTGAAAGACCTGACACCTTGAGGTCTGATTTCTCAGACTGGCTTATGGAATTTAATGGGGGGTCCTATGCTTCACTTGCAGAAATGATCAGACCGAATGGAGTTTTTATGGAGGCAGAACTCATATACTTGTTTTGTGTATTTAGAGGAGTCACGTTGATTATTCATGATAGAACTCATGAAAAAGAGAATGTTTATGCTGTACACCGCGGGTTTGAGGAGGGCCATATGGTACATAGAGGCAATCATTTTGTCGGGATTGAAACTTACAATATTAGTACTTTAACCTCAGACCCCTTACTTGGTGACATCCCATGCGGTTTTTCAGAGGAAATTACAAAATTCCATTTTCGGCCTGATCATTTCAACTGTGCCCAGTTCAGAGGAAGGAAGGCGGCTTTTATCACCAAAGTTGATGCAGATTACGGGCACAACGGTATGGTTTACCCCCACAATTCATGGGTACCTTCTTTAGAAGAGATCATTCAGATCTGTGGTCAGGGAGATGATTTCAATTGTGCATTAATAAATTTCTATGAGGCAAACTCATCTCTTGGGTTCCATAGGGATAATGAACGGGTGTACAATGATGATCCTATTTTGACCGTCTGCACATTCGGTGAAGGTAGATTCACCATTGAATTTAAGGATCAGGTAACTTCTTTTCTAATGACTGCTGGCTCTTTCTTTTTAATGCCTAAAGGGTTCCAGAAGAAGGCAAGACACTCTGTCTCAAATGAAATGTCGAGAGTCTCGATTACTTTCAGGAAGCATGTTAGAAGGTTGAATGGGTCACCGATTGCCATCAGGGAAGAAAATTACAAAAATACATGCCTCATTAATGCCTTTTCAAAAGCAATGAAAAGGAGCAAACAGGCAATCATTGCAAAACTGAAGACTGTTAATAGCCCTTTCTGGAGTAGATACCTATCTGAGGGTAACGGTGGCTCCATTGAAGATTGTCAATCGGCCTGTGAGGCACTGGATGTTACTGTCGACCTTAATGTAAATGGAAAATGTGTGGTTCTTGGAAAAGGGGCTTTAAGAATCTCAATGGCTTTAAGAAACAACCATTTTTCAGTTATCAATGCTGCACAACTGATGGAGAGGACTTTTGTTAGCCACTTGCTTGAAAAAGGAAATGTCAATGTGTTAGAAGGATTTGACGCAATGCTAAGTGGTGATGTGGGCGCAGCAGGTGTTAACAAAATTCAATTTGCAGCCAATTTTGAATTTGCTAGAATTTTGGCAAATTCATTTCTAAATATGACAACTGGCATCTGCCTGGGCAAGGCATTGGATAATGGGGAAAAGTATTTTCTCCACATTTTGAAAGATAGAGTGAAACAGATTGGTATAGACGTCACAATGGTGTGCGGATTTGCTGGATCGGGGAAAAGTCGCAAACTGCAGTCCTGGCTGCATTCAAGGAAAAAAGGGAACTTCTGTGTGGTTTCCCCAAGAACAAACTTAGCCGCTGACTGGGCATTCAAGTTAGAATTAGAGCCCAATGAACAGAGAAAGGTTTCAACATTTGAAAAATTCATCAAAACTGATAAAAGCAAATTAGATCTCATAGTTATTGATGAATTGACATTGTTTCCAAATGGTTACCTGGATCTCCTCGTGTATGAATTGGCTGATGTCAATAGGCATTGTCAAATCATCCTTCTGTTTGATCCATTGCAAGCAAGATACCACAACAAAATGGATGAATCAATCCTGACATTTGAACATGACGTGGACAGGCTTATTGGTGGACAGAACATTGAGTACATTTACAGCACGCATCGGATGTCCAGATACTTCAATAGATTTTTTGATGTACCTTGCTTCAATCAGGCTGATAGAACAGAGGAACAAAGGTTGTGGATATTTGATGACGTTTACTCCATACCATCCATTTGCTCCGACCGTCAGGAACCATGTGATGTTCTTTTGGTTGAATCTGACCTTGAAAAGAAGGCATTTTCACCCATCATAAATGTTATGACATTTGGTGAATCCCAGGGACTCACATTTAATCATGTTTGTATTTTGCTGTCAGAGTCCAGTGCAGCTTCAAACGAATTTAGATGGATGGTGGCGCTGACGAGAGCAAGGACCAGGTTTTCACTCTGTTCAACCTTCTTAGGTGGAATTGAAGAATTTAAAGTCAAAAGGAAGGAAAGTCTCATCACATCCATACTCCAAGGCGAGAAGATCACATTCAACAGATTAAATCTGATGCTGAAATGCAATTTAATTAGGAGAGAAAAAGAAAATGGGTGCAGAGATGAGGTCGATAGGGAGGAAAGGTTGGAGGGTGACCCTTTCCTCAAACCATTTATCTTCTTGGGACAAAGAGTTGAGAAGGATGAAGATGAGGTAGAAGAAGTGAAGATCAGGGAACCAACCTGTCAAACTCATCTGTATATAACAGAGCCTAATTTTGGTTTGTGCTACAATTTCGACTTCATTAGGGAAAAAGAACAGCGGGAATACAGAGAGGATATGCTTGTAACTAACCAATTCTGTGACAGTTATGATAAGGTTCATATAAACGGCAAAAGAGAAACCCCTGGTCCCCTGCGATTCAAAGCGATTTATCCAAAGCACTCAGCCGATGATGACATGACGTTCTGGATGGCCGTCAGAAAAAGGCTTGTATTTAGAGAAGAGGAGGAGAATTATCAAAGGTTGTCAAGGGCGCATTTAGTTGGGGGTTTGCTATACACCAACTTCAAAAAAAAAATGGGCCTGGAATTTACGTTTGACCAAGGTCTACTGGAGGAAAGCATAAATGCATTTGAAAAGAAAAAGCTGGAAAAATCAT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8,653
OR838782.1
Citrus leaf blotch virus
Margaria,P., Knierim,D., Hrabar,V., Skoric,D.
University of Zagreb, Faculty of Science, Department of Biology
Croatia
2023-12-06
null
Citrus leaf blotch virus
Citrivirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
8,737
GenBank
null
Croatia
Croatia
Citrus sinensis
null
2023-02
null
null
Citrus leaf blotch virus strain Cu2_9CV, complete genome
AACGAAAGCAACCTACACAACCCAAAATTAACATATTGCAACAACTGTTATCACTCAATATAAGCCATGGCTTTGATGAGCAACAAAACTGCAATTGAATCCATTTTGGGTAACTTTGAAAAAAAACACGTCGATGCAATCTACAATGCTGCTGCACAAACTATCCTCTCTCACTCTGAATTTAGGAATAAGCATTTTGCCTATTCACTCAATTCTTATCAAAAGAAGATAGCCTCAAAGGTGGGTATTGAATTGTATCCAAATGGTTATTTACCACATTCCCATCCATTGTCAAAAATTTTTGAGAACCATTTGCTTTTTGATGTACTTCCTGGCGTAGTAAATACTAGTAGATTAGTTATGTGTAGCATAAAGGAGTCCAAAGTTCTGGTCTTTAAAGGAATTCGCGACAAATCAAGAAGACAGGTTTCAGACCTCAATGCCCTCAATTCCTTAAATAATAGCCATACATCATTCATTAATAGGTTAGTTGCATCCAAAGATGTGAGCAGATATACAGAGGAAGCTGATGCTTTTTTTCAATCTAAGAAAGGGAGTCCGGAGCTATTTTCAAGGAATTTCATCAAAAGCTTGGAAAATAAAGAGGCTGTTTTTTTTCATGATGAAGTTCATCACTGGACTAAGGCCCAAATGTTTTCATTTCTTAAAAGCACGAAAGTCAAAAGATTCATCTTCACTGTGGTCTATCCACCAGAAATTCTCAAAAAATTTGCCAATTCCCAGAACCCAAAGGTGTATGACTTCAAAGTTGATAAGGGTCGGCTTTTTTTTTTTCCAGATGGGGTTAAGACAGAAGCCTATGAGCAGAAATTAAATATGGAGTGGCTCTTTTCAGCATCACATCTTCGCAGTGGAGACTGTGTATGGACTGTAACAAGACATAAGAGTATCTATGCTCATCACCTGTTTGAGATATCCATTGGTGAACTAGTCACAGACTCAAAACTTTTTTTTTCCGATTATAACTCCATTGACATGTCTAAAATATTTCTTGATCGTTTTCGGAGTTATGAAGTATTTCCCATTTCGATTGAGCACCTTTATAAGGTCTACTCTTATCTGCTTTGCCTCAAAAAACCTGACTTGGAGAGTGGCCTAGCTAAATTGAGGCAAATTATTGGAGATGATGTCGAAATCAAAGAATTCCTCTTCTTTGAACAGTTTTGTAAGCGCTTAATTGAACGTCAAACCTCTTGGGGGCTATTTGGGCACTCTTTCTTTGAAAAATTGACCGATATGGCATTGTCATCCTTGCCCAACTCTATAGCCCGAATTTTCCCTCAATGGAAAAAAAAAAACACATTTGAGTTCCTTTTCTCACTTGGGACTCTTGTCGTGGATGTGGAAAGAAAGGTGTGTTTTGAACATGTGCTTGAAGAATGGGGATTTGAAGTCGTTATCACTGATGAAAATGCCTATCTTGATCCACTATCTATCTTCGCTATTAATGAAAATTTTAATGAGGATAGAGTGGATGATGGCTATTTGGAAAGAATCCGTCTTCCCTTCTGGAATCTGGATGATTATGACTTGAAAAGGAAGAGGAAAAATGCGTATGACATTCTCTCTTATCGATTAAAAGAGGAACAAGAAATTGAATCAGCGCAAAAAGGTCCAAATAAGATGCTCCAGATTGAGTGGCACGGGATTAAAGAATTTGAAGTTGACCCTTTTATCAGCAACTTCATAACTGAATTTACTCTTTTAGAAGCATTGCTGGGAAAGAGGATAGATCCAAAAAAATACTCATATTCAAAGCAAGCTTGCACTCTTTCTAACTATCTCACATTTTTGTGTGCTGAGGGTTTGGATGGATTCAATTTGGAAGAGCACCTTGAACGAAGGTTGAAAGCGGCCGGTCATGACACTTCGGATGACGGGGATGAAGAATTGACTTCAATTGAACAGGCGAGACATATCAAGATATTGGCTGACCCACTTAGTTTCATGAAAGAGTGTTTGGAGGGGATCCCAATCGAAACTGAACCCTCACTAGGAGAAAGGGGGCAGTTCTCTACTGATTATCATTCTGAGAAATTTGAAATCAATTACAATGACATTTTCAATCCTCACAATTGTATGAACACTCATGGCGATGAAATTCCCACACCATCAGATGGTAACTGTTTTTTCTCAGCATTCACTGAAACTTTTGAAGTTGAAAGGCCTGACACCTTAAGGTCTGATTTCTCAGACTGGCTTATGGAATTTAATGGGGGATCCTATGCTTCACTTGCAGAAATGATCAGGCCAGATGGGGTTTTCATGGAGGCGGAACTTATATACCTGTTTTGTGTATTTAGAGGAGTCACGTTAATTATTCATGATAGAACTCATGAAAAGGAGAATGTTTATGCTGTACACCGCGGGTTTGAAGAGGGCCACATGGTACATAGAGGTGATCATTTTATCGGGATTGAAACTTACAATATTAGTACTTTAACCTCAGATCCCTTACTTAGTGACATCCCATGCGGTTTTTCAGAAGAGATTACAAAATTCCACTTTCGGCCTGATCATTTCAACTGTGCCCAGTTCAGAGGAAGGAAAGCAGCTTTTATCACCAAAGTTGATGCAGATTACGGACACAATGGTATGGTTTACCCCCACAATTCATGGGTGCCCTCTTTAGACGAGATTGTTCAAATCTGTGGTCAGGGAGATGATTTCAATTGTGCATTGATAAATTTCTGTGAGGCCAACTCATCTCTTGGGTTCCATAGAGACAATGAACGGGTGTACAATGATGACCCTATTTTGACCGTCTGCACATTCGGTGAAGGCACATTCACCATCGAATTTAAGAATCAGGCAACTTCTTTTCTAATGACCGCTGGCTCTTTCTTTTTAATGCCTAAAGGGTTCCAGAAGAAGGCAAGACACTCTGTCTCAAATGAAATGCCGAGAGTTTCAATCACTTTCAGGAAGCATGTTAGGAGGTTGAATGGGTCACCAATTGCCATCAGGGAAGAAAATTATAAAAATACATGCCTCATTGATGCTTTCTCAAAAGCAATGAAAAGGAGCAAACAGGCAATCATTGCAAAACTGAAGACTGTTAATAGCCCTTTTTGGAGTAGATACCTATCTGAGGGTAACGGTGGCTCCATTGAAGATTGCCAATCGGCCTGTGAGGCACTAGATGTTACTGTCGACCTTAATGTAAATGGAAAATGTGTGATTCTTGGAAAAGGGGCTTTTAGAATCTCAATGGCTTTAAAAGATAACCATTTCTCAGTTGTCAATGCTGCACAACTGATGGAAAGAACTTTTGTTAGCCACTTACTTGAAAAAGGAAATGTCAATGTGTTAGAAGGATTTGACGAAATGCTAAGTGGTGATGTGGGTGCAGCAGGTGTCAACAAAATTCAATTTGCAGCGAATTTCGAATTTGCCAGAATTTTGGCAAATTCATTTCTAAATATGACAACTGGCATCTGCCTGGGCAAGGCTTTGGATAATGGGGAAAAGTATTTTTTCCACATTTTAAAAGATCGAGTCAAACAGATTGGTATAGACGTCACAGTGGTGTGCGGATTTGCTGGATCAGGGAAAAGTCGCAAACTGCAGTCCTGGCTGCACTCAAGAAAAAAAGGAAACTTCTGTGTGGTTTCCCCAAGAACAAACTTAGCCGCTGACTGGGCATTTAAGTTAGAATTAGAGCCAAATGAACAGAGGAAAGTTTCAACATTTGAAAAATTCATCAAAACTGATAAAAGCAAATTAGATCTCATAGTTATTGATGAATTGACATTGTTTCCAAATGGTTACCTGGATCTCCTCGTGTATGAATTGGCCGATGTCAACAGACATTGTCAAATTATCCTTTTGTTTGATCCATTGCAAGCGAGATACCACAACAAAATGGATGAATCAATCCTGACATTTGAACATGACGTGGATAGACTTATAAGTGGACAGAGCATTGAGTACATCTACAGTACGCATCGGATGTCCAAATACTTCAATAGATTTTTTGATGTGCCTTGCTTCAATCAAGCTGATAGAACAGAGGAACAGAGGTTGTGGATATTTGATGACGTTTACTCCATACCATCCATTTGCTCCGACCGTCAAGAGCCATGTGATGTTCTTTTGGTTGAATCTGACCTTGAAAAGAAGGCATTTTCACCCATCATGAATGTTATGACATTTGGTGAATCCCAGGGACTCACATTTAATCATGTCTGTATTTTGCTGTCAGAGTCTAGTGCAGCTTCAAACGAGTTTAGATGGATGGTGGCGCTGACAAGATCGAGAACCAGGTTTTCACTCTGTTCGACCTTTTTAGGCGGAATTGAAGAATTTAAAGTTAAAAGGAAGGAAAGTTTTATCACATCCATACTCCAAGGCGAGAAGATCACATTCAACAGATTAAATCTGATGCTGAAATGCAATTTAATTAGGAAAGAAAAAGAAAATGGGTGCAGAGATGAGGTAGATAGGGAGGAAAGATTGGAAGGTGATCCTTTCCTTAAACCATTTATCTTCTTGGGACAAAGGATTGAGAAAGATGAAGATGAGGTAGAGGAAGTGAAGATCAGGGAACCGACCTGTCAAACTCATTTGTATATAACAGAGCCTAATTTTGGTTTGTGCTACAATTTTGACTTCATTAGGGAAAAAGAACAGCGGGAATACAGAGAGGATATGCTTGTGACCAACCAATTCTGTGACAGTTATGATAAGGTTCATATAAACGGCAAAAGAGAAACCCCTGGTCCCCTGCGATTCAAAGCGATTTATCCAAAGCACTCAGCCGATGATGACATGACGTTCTGGATGGCCGTCAGAAAAAGGCTTGTATTCAGAGAGGAGGAGGAGAATTATCAAAGGTTGTCAAGGGCGCATTTAGTTGGGGGTTTGCTATACACCAACTTCAAAAAGAAAATGGGCCTGGAATTTACGTTTGACCAAGGTCTGCTGGAGGAAAGCACAAATGCATTTGAAAAGAAAAAGCTGGAAAAATCATGTGGCAC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10,440
OK513320.1
Citrus leaf blotch virus
Zhao,L., Wang,J., Sujata,S., Sun,J., Wang,Y., Hou,C., Cao,M., Wu,Y.
Northwest A&F University, College of Protection
China
2023-10-27
A1A-2-RC
Citrus leaf blotch virus
Citrivirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
8,809
GenBank
1
China
China
Actinidia
null
2019-05
SAMN21891080
PRJNA767123
MAG: Citrus leaf blotch virus isolate A1A-2-RC, complete genome
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Northwest A&F University, College of Protection
China
2023-10-27
A3A-C
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Betaflexiviridae
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8,705
GenBank
1
China
China
Actinidia
null
2019-05
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MAG: Citrus leaf blotch virus isolate A3A-C, complete genome
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11,533
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Zhao,L., Wang,J., Sujata,S., Sun,J., Wang,Y., Hou,C., Cao,M., Wu,Y.
Northwest A&F University, College of Protection
China
2023-10-27
A4A-4
Citrus leaf blotch virus
Citrivirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
8,988
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China
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2019-05
SAMN21891083
PRJNA767123
MAG: Citrus leaf blotch virus isolate A4A-4, complete genome
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2023-10-27
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1
China
China
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2023-10-27
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1
China
China
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Northwest A&F University, College of Protection
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CG-3
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OK513327.1
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Northwest A&F University, College of Protection
China
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Betaflexiviridae
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1
China
China
Actinidia
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1
China
China
Actinidia
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Zhao,L., Wang,J., Sujata,S., Sun,J., Wang,Y., Hou,C., Cao,M., Wu,Y.
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SAMN21892139
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Northwest A&F University, College of Protection
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2023-10-27
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GenBank
1
China
China
Actinidia
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11,543
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Citrus leaf blotch virus
Zhao,L., Wang,J., Sujata,S., Sun,J., Wang,Y., Hou,C., Cao,M., Wu,Y.
Northwest A&F University, College of Protection
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2023-10-27
MZ2-10
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2023-10-27
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Betaflexiviridae
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GenBank
1
China
China
Actinidia
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Zhao,L., Wang,J., Sujata,S., Sun,J., Wang,Y., Hou,C., Cao,M., Wu,Y.
Northwest A&F University, College of Protection
China
2023-10-27
XL2-14
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2018-05
SAMN21892142
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China
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1
China
China
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PRJNA767181
MAG: Citrus leaf blotch virus isolate XL6-1, complete genome
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11,548
OK513339.1
Citrus leaf blotch virus
Zhao,L., Wang,J., Sujata,S., Sun,J., Wang,Y., Hou,C., Cao,M., Wu,Y.
Northwest A&F University, College of Protection
China
2023-10-27
XL6-2
Citrus leaf blotch virus
Citrivirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
8,729
GenBank
1
China
China
Actinidia
null
2019-05
SAMN21892144
PRJNA767181
MAG: Citrus leaf blotch virus isolate XL6-2, complete genome
GGTAACTTTGAAAAGAAACAATCTATAGCAAACTGTAACTGCCCAGTATAAGCCATGGCTTTGATGAGCAACAAAACTGCTATTGAATCTATTTTGGGTAACTTTGAAAAGAAACACGTGGATGCTGTCTACAATGCCGCTGCCCAGACACTTATATCTCATTCTGAATTCAGAAACAAGCACTTTGCTTATGCTCTGACTTCCTATCAAAAAAAAGTTGCTTCGAAGGTGGGCATTGAACTTTATCCTAATGGTTACTTACCTCACTCCCACCCTTTATCCAAAATATTTGAGAATCATATTCTTTTTGATGTGCTTCCAAATGTTGTGAATACTAGTAAATTGATTATGTGTAGCATTAAGGAATCAAAAGTCTTAGTTTTTAAAAAAATTAGAGATAATCGTAATGGAACACTTAGCTCAGATTGTGGAAAAACTTCTACCTTTGACCACACCAGCTTTATCAACAGATTAGTGGCATCTAAAGACATAAGCAGATACACAGAAGAAGCAGATGCCTTTTTCTCTTCTAAAAGGGGCAGTGTAGAGTTGTTTTCAAATAATTTCATCAAGTGCATTAGCGGTAAAGATGCCGTTTTCTTCCATGATGAAGTGCACCATTGGACCAAAGCCCAAATGTTTTCCTTCTTAAAAAGAACGAGGGTCAAAAGGTTCATCTTCACGATCGTGTATCCACCAGAGCTTCTTAAGAGATTTGCCAACTCACAAAATCCAAAAATTTATGACTTCAAAGTCGACAAAGGTAGACTCTTCTTCTTCCCTGATGGAGTTAAAACTGAGGCGTATGAACAGAAATTGAACATGGAGTGGCTCTTCTCTGCTTCTCACTTCAAGAGTGGGGATCAGGTTTGGACAGTTACCAGGCACAAGAGCATTTATTCTCATCATCTATTTGAAGTGTCTGCTGGTGAGCTGGTGTCCGATTCAAAAATCTTTTTTTCTGATTACGGGTCCATAGACATGTCAAAAATTTTTTTGAATCGCTTCCGCAGCTATGAAGTGTTCCCAATTGCCATTGAACATTTATACAAAGTATATTCATACCTTCTGTGTCTCAAGAAACCGGATCTGGAAAGTGGATTAGCGAAATTGAGGCAGATAATTGGAGATGACGTAGAAATCAAGGAGTTCCTTTTTTTTGAACAATTTTGCAAGAGGCTGATTGAAAGGCAAACTTCCTGGGGTCTTTTTGGACATAGCTTCTTTGACAAATTAACTGATATGGCCCTATCTAAAATGCCAAACGTTGTTGCCCGCATGTTTCCGCAGTGGAAAAAGAAGAATACTTTTGAGTTCTTGTTCTCATTGGGAACATTGGTTGTTGAGATCGAGAGGAGGGTTTGTTTCGAGCATGTTCTAGAGAAATGGGGATTTGAAGTCGTAATTACAGACGAAAATGCCTATCTGGATCCACTCTCAGTGTTTGGTATCAATGAAAATTTTAATGAGGAAAGGGTTGACGATGGTTATGTCGAACGGATCAAACTTCCCTTCTGGAACCTTAAAGATTATGATCTCAAAAGGGGGAGAGTTAATAAGTATGACATCTTGTGTCATCAATTCAGAGTGGAACGTGAAAATGACCTTAGAGAGAGGGGGCCGCACAAAATGCTGCAAATTGAATGGTACGGAGTCAGGGAGTTTGATGACCCTTTCATTAGCAATGGCATACACGAATTTACCCTTCTTGAGGCATTGATTGGTAAAAGAATTAGAAAAGAAAAGTACTCTCATTTAAAACAGGCAGATGTGCTAACCAAATGTTTATCATTTGTCTGCGAGGTCGGTGGGGACGGTGCTGGTCTCGAATTTGTACTTGAAAAAAGGTTGCAACTGGCAGGTCATGATCCGATTGAAAGTGAAGAAGAAAAGTTGGAGAGGGAGATTGCGAAATTCAATAAGGAGGTTGATGAAGCTAAGGTATCATTATCAGAAAAAAAGACTTCAAATTTGACTGCATTTATCCCCACCTTCTCCGATGAAGATGAGTTGCTATTCGCAATTGATCCAGAAATGGAGCCTGAAGTGGAAAATGATGAAGGAGAGATTTTTGTGGAGGAAATTCATTCATGCGCATTGAGCGATGAAGTCAGAAAATTTGAAATTGATTATTCAGACATTTTCCGTCCTCACGATTGCATGAACACACATGGCTCTGAGATTCCCACTCCGATGGACGGCAATTGCTTCTTTTCTGCATTTGCTGCAACTTTTGACTGCCCAGATTTCAAGGATTTGAGATCCAACTTTGCTGATTGGTTGGGCGCCTTCAATGGAGGTAGCTATGCAGACATGGGGGTCAAAATTAGGCCTGATGGCGTCTTTATGGAGGCTGAGCTAATTTACCTTTTCTGCATTTATAGAGAGGTCACTTTAATTATGCATGACCGTACCTATGACCAAGAAAAGGTATTTGCCATTCATTTTGGGTTTGAAGAGGGACATATGATTCAGAAAGGGGACCATTTTCTCGGTGTTGAAACTTATAAAATCAGTGGATTTGCCCTGGACCCAAATTTAAGTGAGTTGCCTTGTGGCTACAACGGAAAGCTTAGAGATTTCCATTTCAGACCAGAACATTTCAATTGTGCTCAATTTAGGGGAAGAAAAGGTGCTTTTTTAACGAAAGTCGATGCTGATTATGGGCATAATGGGATGGTTTACCCACACAATGCATGGACACCATCGCTTGATGAAATAATTAAAATATGTGATCAGGGTGATGACTTCAATTGCGCTTTGATAAATTTCTACAGCCCGAACTCATCCTTAGGCTTCCACAGAGACAATGAAAGGGTATACAATGATGATCCTATTTTGACTGTTTGCACAGAGGGTGAAGGGATTTTCTCAATTGAGTTCAAAGAGCAATCCTCATCATTTCTTATGACTGCAGGTTCATTTTTCTTGATGCCCAAGGGGTTTCAAAAGAAAGCAAGGCATTCTGTTTGTAATGAGTTATCCAGGGTATCGATAACTTTCAGAAAGCATGTCAGAAGATTGGATGGTTCTCCAATAGCTATCCGGCAGGATAACTACAAGAATGTCTGCTTGATCAAAGCTCTCTCAAAAGCCTTGAACAGGGGAATGCAAGTAATCATTGCGAAGCTGAAATCTGTCAATAACCCTTTTTGGAGCAGGTTTCTCTCTGATGGAAATGGTGGATCAATCGAAGACTGTCAAGCAGCCTGTGAAGTGTTGGGAGTCACTGCTGATTTATTTGTCAATGGGGAGTGCCTAGTGTTGGGGGAAGGTGCAGTTAGAATATCTCTTGCTTTGGAAGACAATCACTTTTCTGTGGTTGAGGGGCACAGATCCATTCAGAGAACATTTGTGAGTCATCTGGCCAAGAAGGGGAATTTAAATGTCTTGGATGGTCTAAATGAAATGCTTCAAAGTAAGGTGAATGCTGGGATTAACCGGGCTCAATTCACTGCTAACTTTGAGAATGCAAGAGTCCTAGCCAACTCTTTTCTCAACATGACTACCGGCATATGTCTTGGTCGGGTGTTGGATAACGGTGAGAAATACTTCTCGCACATGTTTGAAGAAAGACCCAAACAGATAGGGTTTGATGTGACATCAATTTGTGGGTTTGCTGGTTCTGGAAAAAGTCGGCAATTGCAGTCCTGGCTTCATGCGAGAAAAAAAGGGAATTTCTGCGTGGTCTCACCCAGGAATAACTTGGCGGCAGACTGGTCTTTCAAATTGGAATTGGAACCAAATGAAAGAAGAAAAGTGGCCACATTTGAGTCATTCATCAAGATGGACAAAAGCAAATTGGACATGATAATTATAGATGAATTGACCCTCTTTCCCAATGGATATCTAGACCTGTTGATATATGAATTAGACAGATGCAATGCCCACTGCCAACTGATTCTGCTATTTGATCCCCTGCAAGCAAGGTACCACAATAAAATGGATGAGTCGGTACTTAATTTCGAACATGACGTTGACAGATTGATAGGAGGACAAGATTTGAGGTACATTTACAGTTCTCACAGAATGTCAAAGTACTTCAATCGCTTCTTTGACGTGCCCTGTTTCAACCAGGCAGAGACGACAGAAGAGCAAAAGTTGTGGATCTTTGATGACATCTACTCCATGTCATCCATTTGCATTGATCGAGAAGAGCCATGCGACATTTTGCTGGTTGAGTCAGATCTGGAAAAGAAAGCCTTTTCACCAATAGTTAATGTCATGACTTTTGGTGAATCACAAGGTTTAACCTTCAACCATGTTTGCATTTTACTTTCAGAATCAAGCGCAGCATCCAATGAATTCAGGTGGATGGTGGCACTCACGCGTGCGAAGACTAGGTTCTCATTTTGCTCTACATTCCTCGGTGGGATAGATGAATTTAAGATCAGAAAGGGAGAGAGCTTAATCACTTCGATTCTCCAAGGGGAAAAAATTACGTTTGAGAAATTGAACATGATGGTCAAGTGCAATCTAATTAAGCAAGAGAAAAAAAATGGGTGCAGTGACGAAGTTAATCGTGAAGAAAGGTTAGAAGGGGATCCATTTCTGAAACCCTTCATTTTTCTTGGGCAGAGAATTCAAAAAGACCGAGACGAAATAGAAGAAATTGAGGTAAGGGAACCCACATGTCAAACCCATTTGTACATAACTGAACCCAATTTTGGTCTGTGTTACAACTTTGATTTCATCAGGGAGAAGGAGCAACGAGAGTATAGAGAAGATATGCTTGTGACCAATCAGTTCTGTGACAGTTATGACAAAGTGCACATCAATGGGAAAAGAGAAACTCCCGGACCTATGAGATTTAAAGCCATTTACCCTAAACATTCTGCAGATGATGATATGACCTTTTGGATGGCTGTTAAGAAACGGTTGGTTTTTAGGGAGGAAGAGGAGAATTATCAGAGGTTATCAAGAGCACATTTGGTCGGAGGCTTGCTATACAGAAATTTCAAAAATAAATTGGGTCTTGAATTCACCTTCGATCAGGGCTT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11,549
NC_008169.1
Citrus leprosis virus C
Locali-Fabris,E.C., Freitas-Astua,J., Souza,A.A., Takita,M.A., Astua-Monge,G., Antonioli-Luizon,R., Rodrigues,V., Targon,M.L., Machado,M.A., Locali,E.C., Targon,M.L.P.N.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2006-06-19
Cordeiropolis
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,745
RefSeq
1
Brazil
Brazil
Citrus sinensis
null
null
null
PRJNA485481
Citrus leprosis virus C RNA-1, complete genome
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Citrus leprosis virus C
Pereira,L.R., Ramos-Gonzalez,P.L., Barro,M.P., Laurindo,N.S.S., Novelli,V.M., Freitas-Astua,J., Sinico,T.E., Harakava,R.
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AAAAAAA
12,713
MW574401.1
Citrus leprosis virus C
Chabi De Jesus,C., Ramos Gonzalez,P.L., Barro Potsclam,M., Salgado Fontenele,R., Harakava,R., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E., Varsani,A., Freitas Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2022-06-06
BR_PA_CaP01
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,737
GenBank
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Brazil: Para, Capitao Poco
Brazil
Citrus sinensis
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2020
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null
Citrus leprosis virus C isolate BR_PA_CaP01 segment RNA1, complete sequence
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30,336
MW574402.1
Citrus leprosis virus C
Chabi De Jesus,C., Ramos Gonzalez,P.L., Barro Potsclam,M., Salgado Fontenele,R., Harakava,R., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E., Varsani,A., Freitas Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2022-06-06
BR_SP_Jmr01
Cilevirus leprosis
Cilevirus
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ssRNA(+)
8,748
GenBank
null
Brazil: Sao Paulo, Jumirim
Brazil
Citrus reticulata
plant leaf
2020
null
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Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_Jmr01 segment RNA1, complete sequence
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30,337
MW574403.1
Citrus leprosis virus C
Chabi De Jesus,C., Ramos Gonzalez,P.L., Barro Potsclam,M., Salgado Fontenele,R., Harakava,R., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E., Varsani,A., Freitas Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2022-06-06
BR_SP_SdM15
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,755
GenBank
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Brazil: Sao Paulo, Sud Mennucci
Brazil
Citrus sinensis
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2018
null
null
Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_SdM15 segment RNA1, complete sequence
TCTTCCATGTCAAGTGATATACCATTTCGCTTGACAAAACCTTTCTGTTGCGATAGCAGAATACGTAAGATATACCAAATTTTACCAGTGTAGAGCTATACCAAAGATGTCTACACATAACGCCGTCGAAACTCTGGACGCAAACAGAGTTAGGGAACTTCTCAGAGGTCATCGAGAAGCTTCATCACAGTGTGATGATGCTAGGTTTGCGACGACTCATACCAAAAGTCATGTCGCATCCTCATCTGAAAAGCTCCCTGTTTCTTTTACAATCGCAAATGGGCAGATCGTTAGCGACAGTGAGACCATCACTTCTACTGAAGCTAAGGCTGCAGCGATTTTATCTGTGATATCTTCCTACCCGAAGGAGATACGCGATCAGCTCAATGGGAGAATTGAGCGTGGTTTCACCGACAATCCAGATGTCGATGAGGCCGCGCGTTGTATCCATTCGGCTCGTTTGCATAATATCACGACAACTGCTCTTCGTAAGAAACCTCTTCTTGTACATGAGAATGTCTCCAATGATATGGAGAGATTCTTAAACGAGAAGTTTTTGGGCTATAAGATTAGGCTCACTTTTAGTAAGAATGTCGCACATAATAACGCTGCTGCGTTACGTCGTGTGCTTCGACACTATATGCGTGATAAGGTCGGTTACAGAAAAGACGATGATATCCCCGAGGGGTACCATGTCAAGAACAAAGATGTCGGTGCATCGGGCTTTGATGTTATTATCGATGAACTGACAGATGTTCATTGCTGTACACCAGACCTTGATTTTCGGGACCACATAAGGTTAGAGAGACTTAAGAAGTATATCTATTCTCATGTGTGCCCGACATCTAAAGATCACAGCATTATTTGCGAAGGCTTTCGTGAAGGATCCACAAAATACAGATGTGAAAATATAGGTCAGCAGTGTTATATTAAGGCACCAACTTTAACTTTTGTACATAGTGCGTATGATATTACTGCTGCTGGCATTGTTGATTGCATGATCGCCGCTAATGCTCATCATGCTATCATGTGCTTGCATTTTCCATCTGCTATACTTTCTGGCTCAACGTCTGGTAAAGACGAGCTACTGCAATATAAATGGGATATTGTGGTGGAAGATGGCATTAAGTATTATAAGCAAAAATTTTTGAATGATACACAGGCATCATATGTTCATAGGTTGGATGTGTATCTTGATAAATTTTTGACTAAAGTGGTCCTCGGGAGCGATAAAAGATTCTACATGTTCGAGATTACTGAGATGTTTGGTTCTGTTGCCATTATTGAAGTATTCCGTCGTGAGAAGGATTTTATTGCTGGTTCAAAACTCACTTTTAATATACCCAGAACAGAACATCCTAACACGGTCACTATCCATACTTGGGAGTATGTGACTGGTTATGAGAGTCTGTTCAAGGGTCGTAATGGGCTCAAATCCGGTGTCATGCGACCAGTGTCTATAGAAGTTCCTGAGGAGTTTTTCCTCAGTGTATTTAAGTATGGCATGACCGTTGACTCCAACAAGTTCGTTTATGACGGGTTGCTTAAAAGTGGTGTTGGAATTGCTGCTAGGCGGAACATTGGTGGTACTACCATGGTGGATCCGTCTTTGCCTATTCCTGTACGTAAGTTGCAGACTTTCATAGTCACTATGTATATGCTGCTTTACCAAGAAAAATGGGAGGCAACACAGGGCCTAGTGACTATGAAGATGTTGGCCGATCAGTATAGGGTTAGAAGTTCCAAAAACGGTATAGTTCGGTTCCTTACGAACATGTTTTCCTCTGATAAGAGTGGTGAGACCCGACATCCATCATCTGCTTATGATTTAAGTATGTTGGGATTTTCTCACTCAGAGGACAACAAGTTCGTTTGTGATAGGAACCTTAATACCGAGGAGAGGTCTCGTTTAGGTCAGTTTGAGCGCTTAGTTCAATGGTTCCGTGAATTTTCGCGTGTCCATAGAAAGTGTCCTATAGTTGTGCATGATTCTACGCATATGCTAGAGTATGTTTTGGACATCCCAGATATGGTTGTGCAGAACATAAAGAGTCTTCGTGATGAGCTTACTCTTAGTAATTTGTGTGATCATGACTTTGACGCTTATTTGCCGAATCACGTTGAGGTTAATGATACAAGGTGTACCAAAAACCTCACAGTGATCCAAGTTCCCGGTGACGGTAATTGCTTGTACTATTGCTTTGTTAAGGCATGTTTGTATCGGGGAATAACCGTCTGTGACTTGAAGAGCAGATTAAGAGACTCGCCCTATTTTTTGGAAGTTGCAAAGCTTGCTCGTGATGCTGGCGAAGATGAATTTCTTGAGTCATTAGAGCGTGATGGTGTTTACGGTAATAAGTTTACACTGATCCTTATCAGTAAAACTTTTAACGTTAATATTTGCGTTCACCTTAAGGGTGGTCGTGAATTGATTACCCATTTCATCTCAAATAAAGGCTCAAGATTTATTCACCTTCAATTAGAGTATAGTCATTACAGCTTGCTTGTACCATGTGTTAAGGCTGGTCTCATTGATGAGCATGTCTTATATCATGGGGCACTAAGCATGGTAGTGCCAACCGCACATGACTTTAAACGTCTCGTGGATCTCTATAAGGTTTATGTTAAGGATGGTACCGTTACATCATACTTCAACATATTCAATAGTTCTTATAAGGGTCCATTTCTTAACGTTTATGAGTTAGGTTTTATGGAGATTGTTTCCTCACTTGAGATTCCATCAAGTAGTGGGAACAAGTTCCTAATTACCGATGTGTGGTTACACCATTGCATTAAGGCTCTTAGGGTTTTGGACCCGCATTCTAATGTTATAGTTATGCGGAGTTCAAATACTTCCAGAATCCCTGACAGGTATGGTGTGTGCGATTTTACGATGGACTCAGAGTTTCATGAAGAATCCTTCTGTTTATCAACCACACTATCTGATATACTTAATTTGGGAATATATTCCCAATGTATGGTGGTCTTTTCCGACTTGTCACGGGTTCCTATTAAGCCTTTTTCACTTGGTTTTAGGACGCGCACTTCTGCTGCAGAACGTTCCAATAAGATTTTGCTAGCTTGGTCTGCATTATCTTCTGGTGGAACTGCGGTATTTAGGGTATTTCGTCCTGAGGAAGTTATTGAGTCCTTGAACATGCTATCCTCTCTTTTTGAGGATATAAGATTCTTTAAACCAAAAGCTATTTCAACGTCAATTGTTGATGGATACCTACTTTGTAGTGGTAAACGCTCTCATCCTGGTAGTGAGTTCTCTATCACTAATGAAGTACGCAGCCATTTTTATACAGTCAATGTTGAAAACTTTTATAAGCAGACTTTAGATGAGTCTGAAGTATCCAACTATGTTAAGGATCTGTGCGGTTTGTACGCAGGTGGTGGTTTCGTTAAACCGACACGCAGGCACTCGTACAATCGTTCATTTGTTTTGGATAGGTCTCTTATTCTATCAAAGCTTATGGAATTTTCGAACAGTGTGTCTTTTGGACTATTTGGTAGAAAATTTTCAACTTACAAATTACATGTAGGTTGTGACACCAAGCTGAAGTTTTGTAATAGAAGTATTGAAGAGATACTTGAATCCGAATGCTTACATTGTAAGTATTCCAAGTATGACTTCAATTCTTTGAGATCTGTATCAGATCTAGTCTCTTCTGCTACACATGAACGTGCCGTTATTGTGGAGACATTTGACGATTGTCGCGATTATGTTTCAATCGTCTCATTATTCCACAAGCTGTACTCCATGTGTTTTAAGGATCTTCGCGTGGTTAGTGACTGCTTCCTAAATAGTGTTGTGCTAAAGAGCTTTTTAGCTTATGCACGATGCTATTCAGATGTTGAGATATCCCTTTGTCAATTGAAGGGAAGGTTGCTGGTTGACATCACATGCCGTTTAAATTGGTATAATGGATGTGAGTTCAGCGACTTTGAGTTGGTTTCGTGCAATAGGCATGATTATGATATTACCTTCGTTGAGGTATTAGTTCAACATGCTATGCACAACCAGCGTTACAACAATGAGACCGTTGTTATAAACTCGAAGGCTGATGCTATACGTGCTGGCTTATCGGTACGTAAGATCAAACCTTGTGTTAATGTGCTTGACGATTTGAATAAATCAGTTAAGTACAAGCCTAGGTTTGTTACTTACAATACTGAAAGTTTAGCTAACAGCATTAAGGCTATCGTTGGTGTTGGTGATGAGACTACGAAGGAACCTACCGGTAATTCAGTTGTTGAAAAGCCGGCAGTAATCTTTGAGAAGGTTGATTCGCCAAACCTTGACGATCGCATTAGAGCTGTTTATGAGTATAGGTCATACTTGGGTAAGGAATTATCCCATAGTAATGATGTACTCGAAAAGACTGTCTCTAGTTTATTACGCTTTACGGAGACACGTGATCCGAAGAGGCTGAATGAGATGTATTTTCCAAACTCATCCTTTTTATCTGATGAGATAAAACTTAGGGATAGTATTGGAATAATTACCTGCAGTGGTAAGATTCTCAAAAATTCTGAACCTATTGTGCAATTTGACGATATCTCTGCTGTTTATGATATAGTCAATGGCGCTGTAGTTGACAAGTCTGACTACTTCAAGATGCATAGGGGTAAGACCACCAGACAAGTTGGTGGTTTTGCAATCTATACTAGCTTGGTTGCGCATAACCAGGTTGAGAGCATCTTGAAAGCAGTAGACTATGTCTATGCCTCTGAGAAGATTAACGATCTTAGTGCGATTTCAATTGATTGGGTGCAGGCTGTTGCCGGTGCTGGGAAGACGACCTTGTTGGTCGATACTTTCTTGATCACCGACTTAGTCGTGTGCCCAACTGTTGAGAACCGCGATTCAATTCGATTGCGTATTAAGCGTCGTTATCCAGATTTGGATCCGAAGGAGGTCGATTGTCGCGTCAGAACCATCAATGGGTATCTTGTCGATTTTTCTGTTAAGTTGGCTAAGGTCATACTTAATG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30,338
MW574404.1
Citrus leprosis virus C
Chabi De Jesus,C., Ramos Gonzalez,P.L., Barro Potsclam,M., Salgado Fontenele,R., Harakava,R., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E., Varsani,A., Freitas Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2022-06-06
BR_SP_Lim09
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,746
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Brazil: Sao Paulo, Limeira
Brazil
Citrus sinensis
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2020
null
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Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_Lim09 segment RNA1, complete sequence
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30,339
MW574405.1
Citrus leprosis virus C
Chabi De Jesus,C., Ramos Gonzalez,P.L., Barro Potsclam,M., Salgado Fontenele,R., Harakava,R., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E., Varsani,A., Freitas Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2022-06-06
BR_SP_SAP03
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,743
GenBank
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Brazil: Sao Paulo, Santo Antonio da Posse
Brazil
Citrus sinensis
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2020
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Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_SAP03 segment RNA1, complete sequence
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30,340
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Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
AR04
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
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GenBank
null
Argentina: ND, ND
Argentina
Citrus
plant leaf
2006
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null
Citrus leprosis virus C isolate AR04 segment RNA1, complete sequence
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42,279
MT554527.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
AR05
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,749
GenBank
null
Argentina: ND, ND
Argentina
Citrus
plant leaf
2017
null
null
Citrus leprosis virus C isolate AR05 segment RNA1, complete sequence
TGTGCTCTTCCGATCTAGTGATATACCACATTACTTGGCAAAATTTTTCTGTTGTGCTTACAGACTACGTGAAATATACCAAATTTTAACCAGTGTAGAGCTATACCAAAGATGTCTACACATAGCACCGTTGAAACTCTGGACGTTAACAGAGTTAGGGAGCTTCTCAGAAGCCATCGTGAGGCTTCATCACATTGTGATGAACCTAGGTTCACGGCGACACATACCAAAGGTCGGGTCGTGGCCTCATCTGAGAAGCCCCCTGTATCCTTTACAATCGCAAATGGGCAGATCGTTAGCGACAGTGAGGTCATTACTTCCACTGAAGCTAAGGCTGCGGCGATTTTATCTGTGATTTCCTCCTACCCAAAGGAGATTCGTGAGCAGCTTAATGGGAGAATTGAACGTGGCTTCACCGACAACCCAGATGTCGATGAGGCCGCGCGTTGTATCCATTCTGCTCGTTTACACAATATCACAACGACTGCTCTTCGTAAGAAACCCCTTCTCGTACATGAGAATGTCTCCAATGATATGGAAAGATTCTTAAACGAGAAGTTTCTGGGCTATAAGATTAGGCTCACCTTTAGTAAAAATGTGGCACATAACAACGCTGCTGCGTTGCGTCGTGTGCTACGTTTTTACATGCGTGATAAAGTGGGTTACAGGAAAGACGATGACATACCCGAGGGGTATCACGTCAAGAACAAAGACGTTGGTGCATCGGGGATGGATGTTATCGCCGATGAATTGACCGATGTTCATTGCTGTACACCAGACTTAGACTTTCGTGACCACATAAGGCTAGAGAGGCTGAAGAAGTATATCTACTCTCATGTATGTCCAACGTCTAAGGATCACAGTATTATATGCGAGGGCTTTCGTGAAGGATCCACAAAATACAGATGTGAAAATATAGGTCAGCAATGTTATATTAAGGCACCAACGTTGACTTTTGTCCACAGTGCCTATGATATTACTGCTGCTGGTATTGTCGACTGTATGATTGCAGCTAATGCTCATCATGCTATCATGTGCCTACATTTTCCATCTGCTATACTTTCTGGTTCAACATCTGGTAAAGATGATCTACTGCAATACAAATGGGATATTGTGGTGGAGGATGGCATTAAGTATTATAAACAAAAATTTTTGAACGATACACAGGCATCATATGTTCATAGGTTGGATGTGTATCTCGATAAGTTTTTGACTAAAGTGGTCCTTGGGAGCGATAAGCGATTCTACATGTTCGAGATTACTGAGATGTTTGGCTCTGTTGCCATAATCGAAGTATTTCGCCGTGAGAAGGATTTTATTGCTGGTTCCAAACTCACTTTTAATATACCCAGGACAGAGCATCCTAACACAGTCACAATTCACACTTGGGAATATGTGACTGGTTATGAGAGTCTGTTCAAGGGTCGTAATGGACTTAAGTCCGGTGTTATGCGTCCCGTATCTATTGAAGTCCCTGAGGAATTTTTCCTCAGTGTTTTCAAGTATGGTATGACCGTTGACTCCAACAAGTTTGTTTACGATGGGTTGCTTAAAAGTGGTGTTGGGATTGCTGCAAGGCGGAATATTGGTGGTACCACCATGGTCGATCCGTCTTTGCCTATTCCTGTACGTAAGTTGCAAACCTTTATTGTTACTATGTATATGCTGCTTTACCAGGAGAAGTGGGAAGCGACACAGGGTTTGGTAACTATGAAGATGTTAGCTGATCAGTACAGGACTAGGAGCTCCAAAAATGGTATTGTACGGTTTCTTACAAACGTCTTTTCTCCTGACAAAGTTGGTGAGACGCAACACCCTTCATCCGCCTATGATTTAGGTAAGTTGGGTTTCTCCCACTCGGAGGACAATAAGTTCGTTTGCGATAGGAATCTGAATACCGAGGAGAGGTCTCGTCTGAGTCAGTTCGAGAGGCTGGTTCAATGGTTCCGTGAGTTTTCACGTGTCCATAGAAAGTGCCCTATTGTCGTCCATGACTCTACACATATGCTTGAGTATGTTCTGGACATCCCAGATATGGTTGTGCAGAACATAAAGAGCTTGCGTGATGATCTTACCCTTAGTAATTTATGCGATCATGATTTTGATGCATACTTACCAAGTCACATTGAGGTTAATGATGCGAAGTGCACCAAAGACCTCACAGTGATCCAGGTGCCTGGCGATGGTAATTGTTTGTACTACTGTTTCGTCAAGGCGTGCCTGTATAGGGGTATATCAGTCTGCGATTTGAAAAGTAGGCTGAGAGACTCTCCATACTTTCTGGAGGTCGCGAAACTTGCTCGCGACGCCGGCGAAGATGAGTTCCTTGACTCTTTGGAACGTGATGGTGTTTACGGTAATAAGTTTACGCTGATTCTTATCAGCAAAACTTTTAACGTTAATATTTGTGTTCACCTTAAAGGTGGTCGCGAATTGATTACACACTTCATCTCTAACAAAGGTTCGAGGTTCATTCATCTTCAATTAGAGCATAGCCATTATAGCTTGCTTGTACCATGTATTAAAGCTGGTCTTATTGATGAGCATGTTTTATGTCATGGTGCACTGAGCATGGTACTGCCAACCGCGCATGATTATAGGCGTCTTGTGGACCTTTATAAGATCTATACTAGAGATGGCACTATTGCGTCATACTTTAATATATTTAACAATTCTTATAAGGGCCCGTTCTTAAATGTCTATGAGCTAGGCTTTATGGAAATTGCTTCCTCACTTGAGATTCCCTCAAGTAGTGGGAACAAATTCCTTATTACCGATGTGTGGTTACATCATTGCATTAAGGCTTTGAGAGTTTTGGACCCGCATTCTAATGTTATAGTTTTACGGAGTTCCAATACTTCTAAGATCCCTGATAGATATGGTGTGTGTGACTTTACAATGGATTCGGAGTTTCACGAAGAATCCTTTTGCTTGTCAACCACGCTATCCGACGTACTTAATTTGGGAATTTATTCTCAATGTATGGTAGTCTTTTCTGATCTCTCACGGGTTCCTCTAAAGCCTTTTGCTCCCGGATTCAGGACGCGCACTTCTGTTGCTGAACGTTCCAATAAGATTTTGCTGGCTTGGTCAGCGTTGTCTTCAGGTGGGACCGCAGTTTTTAGGGTATTTCGTCCTGAAGAAGTTCCAGAATCCTTGAATATGCTAACCACGCTATTTGAGGATATTAGGTTCTTCAAACCAAAGGCTATCTCGACATCAATTGTTGATGGATATCTACTTTGTAGTGGTAAACGCTCTCACCCTGGTAGTGAGTTCTCAATCACAAGCGAGGTGCGTAACCATTTTTATACGGTTAATGTCGAGAACTTTTATAAACAAACCTTAGAAGAGTCCGAAGTGTCCAATTATGTTAAGGACTTGTGCGGTTTGTATGCTGGTGGTGGATTCGTTAAACCAACACGTAAGCATTCGTATAACCGCTCGTTTGTTTTGGACAGATCTCTTATTCTATCAAAACTTATGGAATTCTCAAGCAGCGTCTCGTTTGGGCTGTTTGGTAGGAAGTTCTCGACTTACAAATTACATGTCGGTTGTGATACTAAACTGAAGTTTTGTAATAGGAGCATTGAGGAAATACTTGACTCGCAATGTTTACATTGTAAGTACTTTAAGTACGACTTCAATTCTTTGAGATCGGTGTCGGACTTGGCTTCGTTTGCTACGCGTGAACGTGCTGTGGTTGTGGAGACATTTGATGATTGTGGCGATTATGTTTCAATCATATCATTTTTCCACAAGCTATATTCTATGTGTTTTAAGGACCTTCGCGTTGTTAGTGATTGTTTCCTGAATAATGTCGTGCTTAAGAGCTTTTTAGCTTACGCGCGATGCTATTCAGATGTTGAGATATCTTTATGCCAACTTAAGGGAAGGTTGCTAGTTGACATCACTTGTCGCTCTAATTGGTACAATGGATGTGAATTTGGTGACTTCGAGCTGGTTTCGTGCAATAGGCATGACTATGACACAGCTTTTGTTGAGGTGTTAATTCAGCATGCAATGCATAACCAGCGCTACAACAATGAGACAATCGTTATAAATTCGAGGGCTGATGCCATTCGCGCAGGTCTCTCAGTGCGTAAGTTCAAACCATGCGGTGATGTACTTGACGATTTGAATAAGTCTGTTAAGTACAAGCCTAAGTTTGTCACTTACAACACTGAAAGTCTTGTAAACAGTATTAAGGCCATCGTTGGTGTTGGTGACGAAACTACCAAGGAGCCTACCGTCAATTCGGTTGTTGAAAAGCCGGTAGTAGTCTTTGAGAAGGTTGATTCACCTAACCTCGACGATCGTATTAAAGCTGTCTACGAGTACAGGTCGTACATGGGTAGGGAGCTATCTCATAGTAACGACGTACTCGAAAAGACCGTCTCCAACTTGTTGCGGTTTACGGAGACACGTGATCCTAAGAGGCTTAATGAGATGTACTTTCCAAATTCATCTTTCTTGTCTGATGAGATGAAGCTTAAAGATAGTGTCGGAATAATCACTTGCAATGGTAAGATTCTTAAGAATTCTGAACCCATTGTGCAATTTGACGATATCTCTGCTGTTTATGATATAGTCAATGGTTCTGTGGTTGATAAGTCTGACTACTTCAAGATGCATAGAGGTAAGACCACCAAACAAGTCGGTGGTTTTGCGATTTATACTAGCCTCGTTGCACATAATCAGGTTGAAAGTATCTTGAAGGCAGTAGACTACGTTTATGCCTCTGAAAAGATTAATGACCTTAGTGCGATTTCGATTGATTGGGTACAGGCTGTGGCTGGTGCTGGGAAGACGACTTTGTTAGTCGAGACCTTTTTAATTACCGACTTAGTCGTATGCCCAACCGTCGAAAATCGCGATTCCATTCGTTTACGCATTAAGCGTCGTTATCCTGATTTGGATCCGAAAGAAGTCGATTGCCGTGTCAGAACCATCAACGGGTATCTTGTTGACTTCTCTACTAAGTTGGCAAAGGTCACTCT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42,280
MT554528.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
AR06
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,745
GenBank
null
Argentina: Misiones, Santa Ana
Argentina
Citrus sinensis
null
1937
null
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Citrus leprosis virus C isolate AR06 segment RNA1, complete sequence
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42,281
MT554529.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
BR_SP_Jbt02
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,745
GenBank
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Brazil: Sao Paulo, Jaboticabal
Brazil
Citrus sinensis
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1975
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Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_Jbt02 segment RNA1, complete sequence
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42,282
MT554530.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
BR_SP_Jac01
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
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Brazil
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Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_Jac01 segment RNA1, complete sequence
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42,283
MT554531.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
BR_SP_Lim01
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,731
GenBank
null
Brazil: Sao Paulo, Limeira
Brazil
Citrus sinensis
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1939
null
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Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_Lim01 segment RNA1, complete sequence
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42,284
MT554532.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
PY_Asu02
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,745
GenBank
null
Paraguay: Assuncion, ND
Paraguay
Citrus sinensis
null
1937
null
null
Citrus leprosis virus C isolate PY_Asu02 segment RNA1, complete sequence
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42,285
MT554533.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
BR_SP_Prb02
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,729
GenBank
null
Brazil: Sao Paulo, Piracicaba
Brazil
Citrus sinensis
plant leaf
2016
null
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Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_Prb02 segment RNA1, complete sequence
GTGATATACCACATTACTTGGCAAAATTTTCTGTTGTGCTTACAGACTACGTGAAATATACCAAATTTTAACCAGTGTAGAGCTATACCAAAGATGTCTACACATAGCACCGTTGAAACTCTGGACGTTAACAGAGTTAGGGAGCTTCTCAGAAGCCATCGTGAGGCTTCATCACATTGTGATGAACCTAGGTTCACGGCGACACATACCAAAGGTCGGGTCGTGGCCTCATCTGAGAAGCCCCCTGTATCCTTTACAATCGCAAATGGGCAGATCGTTAGCGACAGTGAGGTTATTACTTCCACTGAAGCTAAGGCTGCGGCGATTTTATCTGTGATTTCCTCCTACCCAAAGGAGATTCGTGAGCAGCTCAATGGGAGAATTGAACGTGGCTTCACCGACAACCCAGATGTCGATGAGGCCGCGCGTTGTATCCATTCTGCTCGTTTACACAATATCACAACGACTGCTCTTCGTAAGAAACCCCTTCTTGTGCATGAGAACGTCTCCAATGATATGGAAAGATTCTTAAACGAGAAGTTTTTGGGCTATAAGATTAGGCTCACCTTTAGTAAAAATGTAGCACATAACAACGCTGCTGCGTTGCGTCGTGTGCTACGGTTTTACATGCGTGATAAAGTGGGTTACAGGAAAGACGATGACATACCCGATGGGTATCACGTCAAGAACAAAGACGTTGGCGCATCGGGGATGGATGTTATCGCCGATGAATTGACCGATGTTCATTGCTGTACACCAGACTTAGACTTTCGTGACCACATAAGGCTAGAGAGGCTGAAGAAGTATATCTACTCTCATGTATGTCCAACGTCTAAGGATCACGGTATTATATGCGAGGGCTTTCGTGAAGGATCCACAAAATACAGATGTGAAAATATAGGTCAGCAGTGTTATATTAAGGCACCAACGTTGACTTTTGTCCATAGTGCCTATGATATTACCGCTGCTGGTATTGTCGACTGTATGATTGCAGCTAATGCTCATCATGCTATCATGTGCCTACATTTTCCATCTGCTATACTTTCTGGTTCAACATCTGGTAAAGATGATCTACTGCAATACAAATGGGATATTGTGGTGGAGGATGGAATTAAGTATTATAAACAAAAATTTTTGAACGATACACAGGCATCATATGTTCATAGGTTGGATGTGTATCTCGATAAGTTTTTGACTAAAGTGGTCCTTGGGAGCGATAAGCGATTCTACATGTTCGAGATTACTGAGATGTTTGGTTCTGTTGCCATAATCGAAGTATTTCGTCGTGAGAAGGATTTTATTGCTGGTTCCAAACTCACTTTTAATATACCCAGGACAGAGCATCCTAACACAGTCACAATTCACACTTGGGAATATGTGACTGGTTATGAGAGTCTGTTCAAGGGCCGTAATGGACTTAAGTCTGGTGTTATGCGTCCCGTATCTATTGAAGTCCCTGAGGAATTTTTCCTCAGTGTTTTCAAGTATGGTATGACCGTTGACTCCAACAAGTTCGTTTATGATGGGTTACTTAAAAGTGGTGTTGGGATTGCTGCAAGGCGGAATATTGGTGGTACCACCATGGTCGATCCGTCTTTGCCTATTCCTGTACGTAAGTTGCAAACCTTTATTGTTACTATGTATATGCTGCTTTACCAGGAGAAGTGGGAAGCGACACAGGGTTTGGTAACTATGAAGATGTTAGCTGATCAGTACAGGACTAGGAGCTCCAAAAATGGTATTGTACGGTTCCTTACAAACGTCTTTTCTCCTGACAAAGTTGGTGAGACGCAACACCCTTCATCCGCTTATGATTTAGGTAAGCTGGGTTTCTCCCACTCGGAGGACAATAAGTTCGTTTGCGATAGGAATCTGAATACCGAGGAGAGGTCTCGTCTGAGTCAGTTCGAGAGGCTGGTTCAATGGTTCCGTGAGTTTTCACGTGTCCATAGAAAGTGCCCTATTGTCGTCCATGACTCTACACATATGCTTGAGTATGTTCTGGACATCCCAGATATGGTTGTGCAGAACATAAAGAGCTTGCGTGATGATCTTACCCTTAGTAATTTATGCGATCATGATTTTGATGCATACTTACCGAGTCACATTGAGGTTAATGATGCGAAGTGCACCAAAGACCTCACAGTGATCCAGGTGCCTGGCGATGGTAATTGTTTGTACTACTGTTTCGTCAAGGCGTGCCTGTATAGGGGTATATCAGTCTGCGATTTGAAAAGTAGGCTGAGAGACTCTCCATACTTTTTGGAGGTCGCGAAACTTGCTCGCGACGCTGGCGAAGATGAGTTCCTTGACTCTTTGGAACGTGATGGTGTTTACGGTAATAAGTTTACGCTGATTCTTATCAGCAAAACTTTTAACGTTAATATTTGTGTTCACCTTAAAGGTGGTCGCGAATTGATTACACACTTCATCTCTAACAAAGGTTCGAGGTTCATTCATCTTCAATTAGAGCATAGCCATTATAGCTTGCTTGTACCATGTATTAAAGCTGGTCTTATTGATGAGCATGTTTTATGTCATGGTGCACTGAGCATGGTAGTGCCAACCACGCATGATTATAGGCGTCTTGTGGACCTTTATAAGATTTATACTAGAGATGGCACTATTGCGTCATACTTTAATATATTTAACAATTCTTATAAGGGCCCGTTCTTAAATGTCTATGAGCTAGGCTTTATGGAAATTGCTTCCTCACTTGAGATTCCCTCAAGTAGTGGGAACAAATTCCTTATTACCGATGTGTGGTTACATCATTGCATTAAGGCTTTGAGAGTTTTGGATCCGCATTCTAATGTTATAGTTTTACGGAGTTCCAATACTTCTAGGATCCCTGATAGATATGGTGTGTGTGACTTTACAATGGATTCGGAGTTTCACGAAGAATCCTTTTGCTTGTCAACCACGCTATCCGACGTACTTAATTTGGGAATTTATTCTCAGTGTATGGTAGTCTTTTCTGATCTCTCACGGGTTCCTCTAAAGCCTTTTGCTCCCGGATTCAGGACGCGCACTTCTGTTGCTGAACGTTCCAACAAGATTTTGCTGGCTTGGTCAGCGTTGTCTTCAGGTGGGACTGCAGTTTTTAGAGTATTTCGTCCTGAAGAAGTTCCAGAATCCTTGAATATGCTAACCACGCTATTTGAGGATATTAGGTTCTTCAAACCAAAGGCTATCTCGACATCAATTGTTGATGGATACCTACTTTGTAGTGGTAAACGCTCTCACCCTGGTAGTGAGTTCTCAATCACGAGCGAGGTGCGTAACCATTTTTATACGGTTAATGTCGAGAACTTTTATAAACAAACCTTAGAAGAGTCTGAAATGTCCAATTATGTTAAGGACTTGTGCGGTTTGTATGCTGGTGGTGGATTCGTTAAACCAACGCGTAAGCATTCATATAACCGCTCGTTTGTCTTGGACAGATCTCTTATTCTATCAAAACTTATGGAATTCTCAAGCAGCGTCTCGTTTGGGCTGTTTGGTAGGAAGTTCTCGACTTACAAATTACATGTCGGTTGTGATACTAAACTAAAGTTTTGTAATAGGAGCATTGAGGAAATACTTGACTCGCAATGTTTACATTGTAAGTATTCTAAGTACGACTTCAATTCTTTGAGATCGGTGTCGGACTTGGCTTCGTTTGCCACGCGTGAACGTGCTGTGGTTGTGGAGACATTTGATGATTGTGGCGATTATGTTTCGATCATATCATTTTTCCACAAGCTATATTCTATGTGTTTTAAGGAACTTCGCGTTGTTAGTGATTGTTTCCTGAATAATGTCGTACTTAAGAGCTTTTTAGCTTACGCGCGATGCTATTCAGATGTTGAGATATCTTTATGCCAACTCAAGGGAAGGTTGCTAGTTGACATCACTTGTCGCTCTAACTGGTACAATGGATGTGAATTTGGTGACTTCGAGCTGGTTTCGTGCAATAGGCATGACTATGACACAGCCTTTGTTGAGGTGTTAATTCAGCATGCAATGCATAACCAGCGCTACAACAATGAGACAATCGTTATAAATTCGAAGGCTGATGCCATTCGCGCAGGTCTCTCAGTGCGTAAGTTCAAGCCATGCGGTGATGTACTTGACGATTTGAATAAGTCTGTTAAGTACAAGCCTAAGTTTGTCACTTACAACACTGAAAGTCTTGTAAACAGTATTAAGGCCATCGTTGGTGTTGGTGACGAAACTACCAAGGAGCCTACCGACAATTCGGTTGTTGAAAAGCCGGTAGTAGTCTTTGAGAAGGTTGATTCACCTAACCTCGACGATCGTATTAAAGCTGTCTACGAGTACAGGTCGTACATGGGTAGGGAGCTATCTCATAGTAACGACGTACTCGAAAAGACCGTCTCCAACTTGTTGCGGTTTACGGAGACACGTGATCCTAAGAGGCTTAATGAGATGTACTTTCCAAATTCATCTTTCTTATCTGATGAGATGAAGCTTAAAGACAGTGTCGGAATAATCACTTGCAATGGTAAGATTCTTAAGAATTCTGAACCCATTGTGCAATTTGACGATATCTCTGCTGTTTATGATATAGTCAATGGTTCTGTGGTTGATAAGTCTGACTACTTCAAGATGCATAGAGGTAAGACCACCAAACAAGTCGGTGGTTTTGCGATTTATACTAGCCTTGTTGCACATAATCAGGTTGAAAGTATCTTGAAGGCAGTAGACTACGTTTATGCCTCTGAAAAGATTAATGACCTTAGTGCGATTTCGATTGATTGGGTACAGGCTGTGGCTGGTGCTGGGAAGACGACTTTGTTAGTCGAGACCTTTTTAATTACTGACTTAGTCGTGTGCCCAACCGTCGAAAATCGCGACTCTATTCGTTTACGCATTAAGCGTCGTTATCCTGATTTGGATCCGAAAGAAGTCGATTGCCGTGTCAGAACCATCAACGGGTATCTTGTTGATTTCTCTACTAAGTTGGCAAAGGTTACTCTTAATGAGAACACTAGGTT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42,286
MT554534.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
BR_SP_Prb03
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,731
GenBank
null
Brazil: Sao Paulo, Piracicaba
Brazil
Citrus reticulata
plant leaf
2018
null
null
Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_Prb03 segment RNA1, complete sequence
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42,287
MT554535.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
BR_SP_Prb04
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,730
GenBank
null
Brazil: Sao Paulo, Piracicaba
Brazil
Citrus sinensis
null
1932
null
null
Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_Prb04 segment RNA1, complete sequence
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42,288
MT554536.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
BR_SP_SJP05
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,753
GenBank
null
Brazil: Sao Paulo, Sao Jose do Rio Preto
Brazil
Arabidopsis thaliana
plant leaf
2015
null
null
Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_SJP05 segment RNA1, complete sequence
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42,289
MT554537.1
Citrus leprosis virus C
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Postclam-Barro,M., Fontenele,R.S., Harakava,R., Bassanezi,R.B., Moreira,A.S., Kitajima,E.W., Varsani,A., Freitas-Astua,J., Barro-Potsclam,M., Beozzo Bassanezi,R., Souza Moreira,A., Watanabe Kitajima,E.
Instituto Biologico, Phytopathology and Plant Biochemistry Laboratory
Brazil
2021-05-05
BR_SP_SPa11
Cilevirus leprosis
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,745
GenBank
null
Brazil: Sao Paulo, Sao Paulo
Brazil
Citrus sinensis
null
1941
null
null
Citrus leprosis virus C isolate BR_SP_SPa11 segment RNA1, complete sequence
TATAAAACTGTCAAGTGATATACCACTTTACTTGGCAAAAATTTTCTGTTGTGCTTACAGACTACGTGAAATATACCAAATTTTAACCAGTGTAGAGCTATACCAAAGATGTCTACACATAGCACCGTTGAAACTCTGGACGTTAACAGAGTTAGGGAGCTTCTCAGAAGCCATCGTGAGGCTTCATCACATTGTGATGAACCTAGGTTCACGGCGACACATACCAAAGGTCGGGTCGTGGCCTCATCTGAGAAGCCCCCTGTATCCTTTACAATCGCAAATGGGCAGATCGTTAGCGACAGTGAGGTTATTACTTCCACTGAAGCTAAGGCTGCGGCGATTTTATCTGTGATTTCCTCCTACCCAAAGGAGATTCGTGAGCAGCTCAATGGTAGAATTGAACGTGGCTTCACCGACAACCCAGATGTCGATGAGGCCGCGCGTTGTATCCATTCTGCTCGTTTACACAATATCACAACGACTGCTCTTCGTAAGAAACCCCTTCTTGTGCATGAGAATGTCTCCAATGATATGGAAAGATTCTTAAACGAGAAGTTTCTGGGTTATAAGATTAGGCTCACCTTTAGTAAAAATGTGGCACATAACAACGCTGCTGCGTTGCGTCGTGTGCTACGTTTTTACATGCGTGATAAAGTGGGTTACAGGAAAGACGATGACATACCCGAGGGGTATCACGTCAAGAACAAAGACGTTGGCGCATCGGGGATGGATGTTATCGCCGATGAATTGACCGATGTTCACTGCTGTACACCAGACTTAGACTTTCGTGACCACATAAGGCTAGAGAGGCTGAAGAAGTATATCTACTCTCATGTATGTCCAACGTCTAAGGATCACGGTATTATATGCGAGGGCTTTCGTGAAGGATCCACGAAATACAGATGTGAAAATATAGGTCAGCAGTGTTATATTAAGGCACCAACCTTGACTTTTGTCCATAGTGCCTATGATATTACCGCTGCTGGTATTGTCGACTGTATGATTGCAGCTAATGCTCATCATGCTATCATGTGCCTACATTTTCCATCTGCTATACTTTCTGGCTCAACATCTGGTAAAGATGATCTACTGCAATACAAATGGGATATTGTGGTGGAGGATGGCATTAAGTATTATAAACAAAAATTTTTGAACGATACACAGGCATCATATGTTCATAGGTTGGATGTGTATCTCGATAAGTTTTTGACTAAAGTGGTCCTTGGGAGCGATAAGCGATTCTACATGTTCGAGATTACTGAGATGTTTGGTTCTGTTGCCATAATCGAAGTATTTCGCCGTGAGAAGGATTTTATTGCTGGTTCCAAACTCACTTTTAATATACCCAGGACAGAGCATCCTAACACAGTCACAATTCACACTTGGGAATATGTGACTGGTTATGAGAGTCTGTTCAAGGGCCGTAATGGACTTAAGTCTGGTGTTATGCGTCCCGTATCTATTGAAGTCCCTGAGGAGTTTTTCCTCAGTGTTTTCAAGTATGGTATGACCGTTGACTCCAACAAGTTCGTTTACGATGGGTTGCTTAAAAGTGGTGTTGGGATTGCTGCAAGGCGGAATATTGGTGGTACCACCATGGTCGATCCGTCTTTTCCTATTCCTGTACGTAAGTTGCAAACCTTTATTGTTACTATGTATATGCTGCTTTACCAGGAGAAGTGGGAAGCGACACAGGGTTTGGTAACTATGAAGATGTTAGCTGATCAGTACAGGACTAGGAGCTCCAAAAATGGTATTGTACGGTTTCTTACAAACGTCTTTTCTCCTGACAAAGTTGGTGAGACGCAACACCCTTCATCCACTTATGATTTAGGTAAGCTGGGTTTCTCCCACTCGGAGGACAATAAGTTCGTTTGCGATAGGAATCTGAATACCGAGGAGAGGTCTCGTCTGAGTCAGTTCGAGAGGCTGGTTCAATGGTTCCGTGAGTTTTCACGTGTCCATAGAAAGTGCCCTATTGTCGTCCATGACTCTACACATATGCTTGAGTATGTTCTGGACATCCCAGATATGGTTGTGCAGAACATAAAGAGCTTGCGTGATGATCTTACCCTTAGTAATTTATGCGATCATGATTTTGATGCATACTTACCGAGTCACATTGAGGTTAATGATGCGAAGTGCACCAAAGACCTCACAGTGATCCAGGTGCCTGGCGATGGTAATTGTTTGTACTACTGTTTCGTCAAGGCGTGCCTGTATAGGGGTATATCAGTCTGCGATTTGAAAAGTAGACTGAGAGACTCTCCATACTTTTTGGAGGTCGCGAAACTTGCTCGCGACTCTGGCGAAGATGAGTTCCTTGACTCTTTGGAACGTGATGGTGTTTACGGTAATAAGTTTACGCTGATTCTTATCAGCAAAACTTTTAACGTTAATATTTGTGTTCACCTTAAAGGTGGTCGCGAATTGATTACACACTTCATCTCTAACAAAGGTTCGAGGTTCATTCATCTTCAATTAGAGCATAGCCATTATAGCTTGCTTGTACCATGTATTAAAGCTGGTCTTATTGATGAGCATGTTTTATGTCATGGTGCACTGAGCATGGTAGTGCCAACTGCGCATGATTATAGGCGTCTTGTGGACCTTTATAAGATTTATACTAGAGATGGCACTATTGCGTCATACTTTAATATATTTAACAATTCTTATAAGGGCCCGTTCTTAAATGTCTATGAGCTAGGCTTTATGGAAATTGCTTCCTCACTTGAGATTCCCTCAAGTAGTGGGAACAAATTCCTTATTACCGATGTGTGGTTACATCATTGCATTAAGGCTTTGAGAGTTTTGGATCCGCATTCTAATGTTATAGTTTTACGGAGTTCCAATACTTCTAGGATCCCTGATAGATATGGTGTGTGTGACTTTACAATGGATTCGGAGTTTCATGAAGAATCCTTTTGCTTGTCAACCACGCTATCCGACGTACTTAATTTGGGAATTTATTCTCAATGTATGGTAGTCTTTTCTGATCTCTCACGGGTTCCTTTAAAGCCTTTTGCTCCCGGATTCAGGACGCGCACTTCTGTTGCTGAACGTTCCAACAAGATTTTGCTGGCTTGGTCAGCGTTGTCTTCAGGTGGGACTGCAGTTTTTAGGGTATTTCGTCCTGAAGAAGTTCCAGAATCCTTGAATATGCTAACCACGCTATTTGAGGATATTAGGTTCTTCAAACCAAAGGCTATCTCGACATCAATTGTTGATGGATATCTACTTTGTAGTGGTAAACGCTCTCACCCTGGTAGTGAGTTCTCAATCACGAGCGAGGTGCGTAACCATTTTTATACGGTTAATGTCGAGAACTTTTATAAACAAACCTTAGAAGAGTCTGAAGTGTCCAATTATGTTAAGGACTTGTGCGGTTTGTATGCTGGTGGTGGATTCGTTAAACCAACACGTAAGCATTCGTATAACCGCTCGTTTGTCTTGGATAGATCTCTTATTCTATCAAAACTTATGGAATTCTCAAGCAGCGTCTCGTTTGGGCTGTTTGGTAGGAAGTTCTCGACTTACAAATTACATGTCGGTTGTGATACTAAACTAAAGTTTTGTAATAGGAGTATTGAGGAAATACTTGACTCGCAATGTTTACATTGTAAGTACTCTAAGTACGACTTCAATTCTTTGAGATCGGTGTCGGACTTGGCTTCGTTTGCTACGCGTGAACGTGCTGTGGTTGTGGAGACATTTGATGATTGTGGCGATTATGTTTCGATCATATCATTTTTCCACAAGCTATATTCTATGTGTTTTAAGGACCTTCGCGTTGTTAGTGATTGTTTCCTGAATAATGTCGTACTTAAGAGCTTTTTAGCTTACGCGCGATGCTATTCAGATGTTGAGATATCTTTATGCCAACTTAAGGGAAGGTTGCTAGTTGACATCACTTGTCGCTCTAGTTGGTACAATGGATGTGAATTTGGTGACTTCGAGCTGGTTTCGTGCAATAGGCATGACTATGACACAGCTTTTGTTGAGGTGTTAATTCAGCATGCAATGCATAACCAGCGTTACAACAATGAGACAATCGTTATAAATTCGAGGGCTGATGCCATTCGCGCGGGTCTCTCAGTGCGTAAGTTCAAACCATGCGGTGATGTACTTGACGATTTGAATAAGTCTGTTAAGTACAAGCCTAAGTTTGTCACTTACAACACTGAAAGTCTTGTAAACAGTATTAAGGCCATCGTTGGTGTTGGTGACGAAACTACCAAGGAGCCTACCGACAATTCGGTTGTTGAAAAGCCGGTAGTAGTCTTTGAGAAGGTTGATTCACCTAACCTCGACGATCGTATTAAAGCTGTCTACGAGTACAGGTCGTACATGGGTAGGGAGCTATCTCATAGTAACGACGTACTCGAAAAGACCGTCTCCAACTTGTTGCGGTTTACGGAGACACGTGATCCTAAGAGGCTTAATGAGATGTACTTTCCGAATTCATCTTTCTTGTCTGATGAGATGAAGCTTAAAGACAGTGTCGGAATAATCACTTGCAATGGTAAGATTCTTAAGAATTCTGAACCCATTGTGCAATTTGACGATATCTCTGCTGTTTATGATATAGTCAATGGTTCTGTGGTTGATAAGTCTGATTACTTCAAGATGCATAGAGGTAAGACCACCAAACAAGTCGGTGGTTTTGCGATTTATACTAGCCTTGTTGCACATAATCAGGTTGAAAGTATCTTGAAGGCAGTAGACTGCGTTTATGCCTCTGAAAAGATTAATGACCTTAGTGCGATTTCGATTGATTGGGTACAGGCTGTGGCTGGTGCTGGGAAGACGACTTTGTTAGTCGAGACCTTTTTAATTACTGACTTAGTCGTATGCCCAACCGTCGAAAATCGCGATTCTATTCGTTTACGCATTAAGCGTCGTTATCCTGATTTGGATCCGAAAGAAGTCGATTGCCGTGTCAGAACCATCAACGGGTATCTTGTTGACTTCTCTACTAAGTTGGCAAAGGTCACTCTTAA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42,290
NC_038848.1
Citrus leprosis virus C2
Roy,A., Choudhary,N., Guillermo,L.M., Shao,J., Govindarajulu,A., Achor,D., Wei,G., Picton,D.D., Levy,L., Nakhla,M.K., Hartung,J.S., Brlansky,R.H., Leon,G., Nakhla,M.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2018-08-24
L147V1
Cilevirus colombiaense
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,717
RefSeq
1
Colombia
Colombia
Citrus sinensis
plant leaf
2011-07-01
null
PRJNA485481
Citrus leprosis virus C2 isolate L147V1 segment RNA1, complete sequence
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4,133
OP761816.1
Citrus leprosis virus C2
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United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
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THM
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Cilevirus
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GenBank
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Colombia
Colombia
Hibiscus rosa-sinensis
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20,193
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Citrus leprosis virus C2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
MRNV
Cilevirus colombiaense
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,802
GenBank
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Colombia
Colombia
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SAMN31571469
PRJNA895362
MAG: Citrus leprosis virus C2 isolate MRNV segment RNA1, complete genome
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20,195
OP761820.1
Citrus leprosis virus C2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
MRNV
Cilevirus colombiaense
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Kitaviridae
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5,129
GenBank
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Colombia
Colombia
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null
null
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PRJNA895362
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20,196
OP761821.1
Citrus leprosis virus C2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
MGD
Cilevirus colombiaense
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,726
GenBank
null
Colombia
Colombia
Dieffenbachia
null
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SAMN31571470
PRJNA895362
MAG: Citrus leprosis virus C2 isolate MGD segment RNA1, complete genome
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20,197
OP761823.1
Citrus leprosis virus C2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
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Colombia
Colombia
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20,199
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Citrus leprosis virus C2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
VSLP
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8,726
GenBank
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Colombia
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SAMN31571471
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MAG: Citrus leprosis virus C2 isolate VSLP segment RNA1, complete genome
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United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
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GenBank
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Colombia
Colombia
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United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
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Cilevirus colombiaense
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5,013
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SAMN31571462
PRJNA895362
MAG: Citrus leprosis virus C2 isolate SW-PC segment RNA2, complete genome
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TTGTCATTATGAC
20,204
OP761830.1
Citrus leprosis virus C2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
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GenBank
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Colombia
Colombia
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PRJNA895362
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20,205
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Citrus leprosis virus C2
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United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
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2022-12-25
MRNC
Cilevirus colombiaense
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,736
GenBank
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SAMN31571467
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MAG: Citrus leprosis virus C2 isolate MRNC segment RNA1, complete genome
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Colombia
Colombia
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Cilevirus colombiaense
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5,110
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SAMN31571464
PRJNA895362
MAG: Citrus leprosis virus C2 isolate MLH segment RNA2, complete genome
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Citrus leprosis virus C2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
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Colombia
Colombia
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VSAN
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Colombia
Colombia
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United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
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Cilevirus colombiaense
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5,031
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SAMN31571466
PRJNA895362
MAG: Citrus leprosis virus C2 isolate VSAN segment RNA2, complete genome
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TTTCTTTCTTTTCTTTTTTTGTCATTTTGAC
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National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2021-01-05
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Dichorhavirus leprosis
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,045
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Brazil: Ibiuna
Brazil
Citrus sinensis
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2015-10
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PRJNA485481
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2,305
KX982176.1
Citrus leprosis virus N
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Harakava,R., Tassi,A., Kitajima,E.W., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathological Biochemistry Laboratory
null
2017-02-18
null
Dichorhavirus leprosis
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,724
GenBank
null
Brazil: Ibiuna
Brazil
Citrus sinensis
null
2015-10
null
null
Citrus leprosis virus N strain ibi1 segment RNA1, complete sequence
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78,079
KX982177.1
Citrus leprosis virus N
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Harakava,R., Tassi,A., Kitajima,E.W., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathological Biochemistry Laboratory
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2017-02-18
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Dichorhavirus leprosis
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,722
GenBank
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Brazil: Sao Roque
Brazil
Citrus sinensis
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2015-05
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Citrus leprosis virus N strain srq1 segment RNA1, complete sequence
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78,080
KX982178.1
Citrus leprosis virus N
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Harakava,R., Tassi,A., Kitajima,E.W., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathological Biochemistry Laboratory
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2017-02-18
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Dichorhavirus leprosis
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
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6,708
GenBank
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Brazil: Sao Bento do Sapucai
Brazil
Citrus sinensis
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2015-02
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Citrus leprosis virus N strain sbs1 segment RNA1, complete sequence
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78,081
KX982179.1
Citrus leprosis virus N
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Harakava,R., Tassi,A., Kitajima,E.W., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathological Biochemistry Laboratory
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2017-02-18
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Dichorhavirus
Rhabdoviridae
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6,045
GenBank
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Brazil
Citrus sinensis
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2015-10
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78,082
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Citrus leprosis virus N
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Harakava,R., Tassi,A., Kitajima,E.W., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathological Biochemistry Laboratory
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2017-02-18
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Dichorhavirus leprosis
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
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6,048
GenBank
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Brazil: Sao Roque
Brazil
Citrus sinensis
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2015-05
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Citrus leprosis virus N strain srq1 segment RNA2, complete sequence
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78,083
KX982181.1
Citrus leprosis virus N
Chabi-Jesus,C., Ramos-Gonzalez,P.L., Guerra-Peraza,O., Harakava,R., Tassi,A., Kitajima,E.W., Freitas-Astua,J.
Instituto Biologico, Phytopathological Biochemistry Laboratory
null
2017-02-18
null
Dichorhavirus leprosis
Dichorhavirus
Rhabdoviridae
ssRNA(-)
6,051
GenBank
null
Brazil: Sao Bento do Sapucai
Brazil
Citrus sinensis
null
2015-02
null
null
Citrus leprosis virus N strain sbs1 segment RNA2, complete sequence
GGGGGAAAAATCACCAGTTCTATCACTAACACAAGTTAGGGGAGCTCCCTACTGTCTTCTTAAGGGCAGAGGATTTATCGAGGCTTCCTCTTCCCAAACTACGGACACGGCATGCCCCACAAAGGTTGCACACAATGATTATGAGGCAATTGATTATTAACACATATCAAAAAAATCAACATAACTCATTAATCTTGATGCAATTATGGATTCACTTCTTGACACTTCTTTTACAGAAAGGTTCATGTCAGACCCAATCTATGATGGAGAGGAAAAAGAGAAATCCCCTGTGGAGGATGGGAATGATTATCATCTCAAGTCAGCATTGCGAAGTCACCAAGACTATATCAAGAACAAGTATCAAAAGGAACATCTCCGGGCATTGAGGACAGTGAAGAACCCACCCATGGCAGAGAATCCATGTAAATTGCTCCCCATCATATGGTACTATGTGATATCCGGATTATCTATCGTAGGTGAGGCGTCAGCCAAATTCCTCCAGGAAACGTACCATAATGAGGAGGCCTCTGAGGAAATGATACATCTGTCAACAGTGGAGCTAGGCCAGGTGCTGTCACAGAAGGACACAAAGTCACTCATAGATGAGTCACTTCGTCTCATGGGTGACATCTGGGATCAGGGGTGTGTTTTGGGCAGGCTCAACATTATCAGGTTGGGATTAACTCATCTAGTCATAAACAAGAATAGGGGCATCAAGGCTACTGAAGACCCCATCAGTGTCCGTGTCAATGATAACACATTTTCTTATTACTTTGGTGATTCATTTGTGATAACGTGCAACCCAGCTTGGGCAATCGTCAGCCTTGATGGCTCTGAACACATACTGAATATGCAGCATGTTATAAATGTACTCGATAAGATAACCGAAAGATATAACATGGTAGTCTACAACAGGCTGAGCAGCTCAACAAGCCTTCAGAGCCTCTACCCTGAGGAGGACTCTCTCATAGATGTGATATCAATGGGAGATGATCTTGTGATGAGTGAAGGCAATGAAGCCTATAGGGGACTGTCAGCCTTCGAGGCAATATGTGTGGGGGAGATCATATCACGCGGGGACTCCAGTGTTTGGGATGTCTCTAGGTTTTTAAGAACAATGATCGATGAGGTCTCTTCCTTGGGGAAGAACTATGAGATATGGGTAGAAAAGCTTCTTGATGTCCTAAGGAACCAAAATATTCAGCAACTGTCATGCCTGCATGGAATCTACAGGATCTGGGGACACCCGGTGGTTGACCTTGAGAAAGGTCTGGAGAAGCTCCGATCTGTGGCTTTGATGGACAAGCAGATAAGCCCTGAATTCTCCAGGAATACATCAAATATGTTCAAGGAGACCTTCTTCTGCAATTATTACAAGAAGCACAAATTCTATCCTCCATACACATGGATTGGGAGCCCTGCCACAAACTACATCAGGCAAAACCTTGTGCTTGACAAAGAGATAGACAGGCATAACATCAGGTATCATTTGGAGGATTGGTCTCATGTCCAGTGTGAGAAGACGTTTGAAATACCTGCTACATACAGCCTCGCATCATGCATCAAGGACAGAGCCATCTCACCGAAAAGATCAGAGCTAATCCAGATGATAAGGGAGAGGGGGACAATAATGGACCAAACATCCAGGAGGGGGGTGTTGAAGTGGCTGAACAGCTCAATGGTGCCTGTCCGGGAGTTCCTCGAGGGGATAGACAAATCAGGGCTTCAAACTGATGACTGCATCATAGGACTGTATCCAAAGGAGAGAGAGCTGAAAAATGAAGCAAGATACTTCTCCCTGATGTCATTCACCATGAGGTTATACTTCACCATCACAGAGCATCTTGCAAATGATCATCTTCTGGAGTATTTTCCGATGGTAACCATGTCTGACAGCATGCTGGAACTGCAGAAGAAGCTAGATATGTTGAGCAGGAAACAGTCTACCACCAGAGAGGGGACCCTCTACTATGTTGTGAACATTGACTTCAGGAAGTGGAATCAACAGATGAGAGAGGAGATGACAACAGACCTGTTCTATGACACAGACAGGTTATTCGGATTCACCAACCTGGTGGGGAGAACGCATGAGATTTTCAAGAAATCATACATATACCTCTCATCTGGAGAATATGTTCCAAGATTGTCTCATAGAGGGAATCTGACTTATGAGAAGCCATACAGCTGGACCAATGATCCATCAGGGAAGGAGGGCCTAAGGCAGAAATATTGGACTATAATGACTGCATGTGATCTAATGTTTGTTGCAAGAAAACACAACATGAAGGTTGACTTAGTTGGAGGGGGTGACAATCAAGTCCTCATCGTTGAGGTCAACACAGATCTTACCAACCCGGATGGGACAATGTCAGAGGAGGGGAAAAATGACTGCAAGCAAAAGATGGCATCTTTCATGAGATCTCTCTCAGCCTACATGGAGGAGAAAGGTCTTCCGTTGAAGGTAGAGGAAACTTGGATATCACCTGACCTTCTAATGTTCTTCAAGATGATGTACTTCAACAACGTGACCCTAATATCACCCCTAAAACAGGCATCCAGAGTTTTCCCATTGTCCAATGACCAGGTCATGACAGTCGGGAACATGGCATCCACAGTATCATCAGCCGTGACCGTGCTATCATCCAAGGATATGCAGTTAGGCCCTGCAATAATGCTCGGGAGGTTTGTGGTCACTGACCTAAGTTGCATGGTGGTCAACAACCATCCACTATCGAAAGGCAAAGAGCGTGTAAGGTCAATGTGGTCCACACATATAAGTGTATGTCATGGAGGATCAAGGAGGCGTGTGGCTGTGAGGACTGGAGTCAAGACTGTGAAGAACATATTCCTGTCACTAACCTTGCATCATAAGGTTATGGGGGGATCAGCCATCATTTCACCCCTAGGCATGATGATGAGAGGGTTCCCAGACCCCCTATGTGAGCACCTGACCTGGATATCAAAAATCTCCAACGAGGATCACAAATACACGGTTTACGGGTCGATGTCCATAAATAACAAGACTCCCTGGTCTCATCTGCTTGAAGACCCTGTCAGTGTCAATCACGATGCTCCCATGCACGGGCTAGCAGTGCTGAGAAGGGAGGCTGAGAGGGCGCTAGCAACTGCTACAAATTACAAGAACACAGACTTCCTGGACTTGGCACACAGCTGCAACAAGGAGATGATGGAGGGATTGGCTGACAGTTTATGCTCTGGTGATACGATAGACATTAGAATATTGCATGACATAATGGGAGCCAACCTCGGGGGGTACTTCAACTCAATTGCCTCCAAGGTGAATAAGACATCTACAGTCATGAGGATGAACAGGACCTCCGAGGTAGTGGAAATAATAGCGGGTCAGGAGGCAGTTTGTATGAGTTACCTTGCCTCATTCCCCACAAGGGACCATGATCTCCACTTGACGGGTTGCCCCACTGAAACAGCAAGAAGGTACCGCCATGTCAGTTGGGGGAAGAATATCATAGGCATTACAACCCCACATCCAGCAGCTTTCTTGCAGTACTCAGATCCTGACCATGTATGTGATCATAATTATGTTCAGGTCAAGACTTCTGCATCAGAAAGCATTGACCCATTCATTAGGGGATGTTACCCTGTGTACCAGGGGTCCTACACAAAGGAGAAGTTCAAGCCCACAGAAATGGCAGCTGCTTACGGAGAAGAGGACTTGCTCTCGAGAGCCATTCATTTAATGAAGCTCATCAATTGGAGGTATCATCCTGAGTCACAGATGGCAAAAGTGATCAGGGGACTATTGGCCTCTTTAACGGATGCTGAACCATCCCTGTTCTATGGTATGATGGAATGGATCTCTGGGGACGCTGAGCACAGATACCAAGACATGGCAACCAAACACGGAGGGGTCCCGAATATAGCATACTCAATACTTTCATATGTCCGGGCAAATACATCAACCTTCCGGAAGCATTCCAGGGGGGGTAAAAATGAGACAATCCACTTCCAGGCTATTATTATATATACATCAATGATGAGCCTCTTCAAGAGCTATGGTGGCATCAGTCACTGGCACGAGAGCTGCACCTCCTGCATAACCACTACAACAAGGGATCCTTTATTCAAGGTGCCTAAGAGGATTTCGTTCCCCACATTAAAACACAATATGTTTGCATATGTTCCAGCTGAATCAGTGAAGTTCCATTATCATGATATCAAGCGGATTGGAATGTATGAACACTTAAGCAGCAGGGCGATATCCATCACTGAAATGTCTGATGCAGAGAAACTGGTGGCAGCATCTAGCCTATTGTCCGCTGTTATAGCGTCATGTGATACAAAGGACAGAACATCCGACACAGTCAGCAGCATAGTGTTATGGGCAGATTACATCAGAATAGACATGCTCCTCCCTATGGTTTGTCTTCGGCTTTCTGTGGATCATATGATGAGGAGACACGAGTGGACATGGCCTAAGCCTCTAATATCAAAGAAGTCCATCAGGTTGCTTGAGCCGTTCATCATGTCTTCCAGTGGAAGGTCGATACTGAACCGGTTGGGTCTGGAGGTCTCGGAGCTTGCACAAGGCGACGTAGCTCTACTCAGGGATGTCATTTACAGCTCAGTAAACCCTAGTGTATACCCAAGGATAGTCCCAAACAGGGTGTCTCCGATATGGAGCAATGATGTTATATGTGCCAAAATATTTGAGAGTGATCACATAATTAGCTGTTTTAGTTGTTTCAACAGGGGGGGAGAAATCAGTGCATTTGATGTATGTGGGGACACCAGGCTGGAATACCTATTCAAGGTATGCTCCATCACTCTGCCTGTACTGAAAGGAGATTTATCACAAATACCCAAGGCGCCAGAGGAGCATGGACACTTGGCATGGGACTCAACACCAGTCCAGATATTCGAGGTGATGGAATCAAATTATCCTTTCGTTCCCTTTCCAAGGGACGGGCCTATAACCAGATCAATTCCTCTTGGGATCCAGGGGGTTGGAGCTATACTGGACATAATATCTGAAACAAAGGGCAGAATCACAGTGTCCACAAACACTGTAGGTCTTGCCATATGGAGAACCTTCCATCACACACGGGACATCAAGATCTATAATGAGGGTGGATCCTCTTTGGATTTGGTCTGTGACATGAACAATCTAGGAGTGGAGTCATCCGATGAATATATGGACTCCGAAATGACTGATCAATTGTCGGATGTCATATATGATGTTCCACTACCCTGCCAGCCAGGATGGTGGGTAGTCACCAGTCGGGATGAGCTCAATCTCCTATATGAGAGATGCAAAACACTGCAGCCATTCTCAATCCTTGCATCAGGAGTCCGGCCACTCAACAGGGCAATATGTGCTGTGCGCCTCACTAACTCGGGAGATGAAAGATGGGGAGGCCTTCAGTCGTTATATAGATCACTTGAAGGAAGATGCCAGCCATATGTAAGTAAGATAAGATCACCAATATCAAAGACTAAGACCCTGTCAACAGCCATAGCTTTGTTTCATTCACATGATGGATCATATACAGCTGCCATAGATCACCTCATCATAATGGTTAGAAACCTTTTCTGGAAGAAAGAGCTATATACAAAGAAAGGGAGGGAACTATTATATTTGGTTGTTGTCATGGAACTGTCCAGGAATCATGATTACACCAGCCTCGCCTTGTCCTTGGGGAGGATTAGGGCACTGGAGGGGCCGAGAAGGATCAGAGCACAAATGAACAGAAAAGACAACAGACCAGCTGCCAGGGACGTCAGGGATATAAAAGAGCTGTTTCGGGATGATGGAACAAGGAGGGGAGGAATCCATCCAAGACTTGGGTTTGTGCTGGTGATCTGATACCTCAAATACAACTGATTTAAACAAAACTAATTTTGTTATTAATCCTCCAGATAAGACACACAAGAATTTCCAGTAACTTAAAAATGATCCTGATGAGCAATATCTTCAGTGTGCGTTGAGACTGAAGAGAGAGCACATAGAAGGTATTTCGCCAACATCAATAGATGGTGCTATTTTAAGAACTTGTATATGTCTCTGTGTCC
78,084
OP761814.1
Citrus leprosis virus cytoplasmic type 2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2023-01-16
THM
Cilevirus colombiaense
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,724
GenBank
null
Colombia
Colombia
Hibiscus rosa-sinensis
null
null
SAMN31571468
PRJNA895362
MAG: Citrus leprosis virus cytoplasmic type 2 isolate THM segment RNA1, complete sequence
CATAGAATCAACGATAGTTACTATTACCGATAGCAACTGTTTAAGATTCGTTGCTTGTCTACCACAGGTTCAGGTGCCAGTCATACCAATACTGTCGCGGTGTAGAGCTTTTACCTAAGATGTCTACACATGGTAATTTACGTAAATTGGATTTCGGCAAAGTGCGTCAGTTGTTAGGTGAAGCACCTAGCACTAGCGTAGTTCGGACGGAACCGAAGCCTGATGCTCCAGTATCGCACTCTTCTGAGAAACAACCTCTGAGTTATGTTATAGCCAATGGACAATTGGTTAGTAATTCGGAAGTTGTTACCAGCACTGAAGCGAAAGCTGCAGCACTTTTAGCTGTTATGGGATCTTATCCTCAAGACACTCAAAGAGCTATTGCTAATAAGCTCGATAGGTGTGCTGTGGATAATCCAGATGTTGAAGAAGCAGCGCGATGCATTCACTCAGCACGTATGCATAATGTTTTGACTAATGTGCTGCAAAAACGTGTCATTACAGTACCAGAGAACGTCTCTAGTGATATGGAAAGATTATTGTCAGAACAATTCTTGTCATATAAAATTAGAGTCACATTTAGCAAGAATGTAACACATAATAATGCTGCTGCCCTGCGTAGGGTATTACGTCATTATATGCGTGACATTGTTGGATACCGTAAGGACAATGGTATTCCTGATGGTTATGATGCTCAGTTATGTGATGTAGGTTCGAATGGATTTGATATCCTGACGGAAGAACTTGTTGGTGTTCATGCTTCCATGCCCGATTTGGACTTCCGTGATCATATTCGTTTGGAACGTTACAAACACTTTTTATACTCGCATCTTTGTCCCAATTCCAAAGATCATAGAGTTATCTGTGACGGATTGCGTGAAGGATCCACCCTATATCGTTGTGAAAATATTGGACAACACTGTAATATTCGTGCACCTCTTTTGACATTTGTCCATAGTGCGTATGATATAACCGCAGCCGGTATCGTCGACTGTATGGTTGCTTCTAACGCACATCGCGCCATTATGTGCCTCCATTTTGATTCAGCAATGGTGAACGGTGAAACATCCGGCATTAACAAATTACTGAATTATAAATGGGATATTATCAGTATTAAAGGTGTTAAATATTATCAACAGAAGTTTTTGAACGATACACAAGCTGCGTACGTTCACAGACTAGATGTTTATTTAGATAAATTTTTCACCAAGGTAGTTTTAGGCAGTGATAAGCGGTTTTACATGTTCGAGATTACTGAAATCATATGTGGCGTTGCCATTATTGAAGTGTTTCGGCGAGATAAAGAGTTTATTGCTGGTTCGCGTTTGACCTTTAACATACCTCGCACAGCTCCATCAGGCACTGTCACGATTCATACCTGGGAGTATAATACTGGTTATGAGAGTTTCTTTCGCTCGCGATCCAGTATTAACTCGGCGGTTATGAAGCCAGTGAGTATTACACTCTCAGAGGAGTACTTTCTCACTTTGTTTAAGTATGGTCTTACCGTCGACCCTAATAAGTTTATATATGACGGTTTACTGAAGAGTGGAGTTGGACTATCAGCTCGCAGGAATCTAGGCGGTACTACGATTGTAAGCACCGACTATGATATTCCTGTTCGCAAGTTGACCACTATAGTGGTCGCAGTCTACATGTTGCTCTATTCGGAGAAATGGGAAGCAACACAAGGACTAGTGACTATTAAAAATTTAGTTGATCAATATAGAGCTAAGAGTTCCAGCTCCGGTATCGTGCGGTTTTTCACGAATATGATGAGCTCAAAAGGACATAACGTTGTGCATCCGAGCAATGACACTAATATTGATAATATCAAGACTAGTCTCATGGTCGATCCTAGGGTCATCTCTAAGCAGTTTGATCTTAGTGATGATGAGAGAGAACGCGTTGGTGGATTTAACTCCATTATTGAATGGTTTATAAATTTTTCCCGCGTCAAGCAACGTTGTCCTGTTGTTGTTCATGATTCTTCACATAGTGTTGAGTACATTGTGGATATTCCAGATATGGTTGTTTTGAATATCAAGAGTATCCGTGATGATACGACTCTAGGGCATTTGTGTCATATTGATTATGATGACTACATAACTCCCCTAGTAGTTGATTATAGCGATAAACACGTATGTGATACACCTCTTCAGCATATTTCAGTTGCAGGAGACGGTAACTGTTTGTACAACTGCCTTGTTAAGGCGGGTTTGTACAGGGGTATTACCGTATGTGATCTCAAGGCACGGTTAAGAGATTCTCCGTTTTTCTTTGAGGTAGACAAACTTGCAACTGATGAAGGTGATACTGAGTTTGTTGATTCACTATATCGAGATGGCGTCTTTGGCAATAAGTTTACTTTAATGCTTATTGCAAAGACGTTTTACATTAATATATGTGTTCATCTCGTATTTAGGGAAACAACATTTATGAGATTTACAGGCAACAAAGGGTCGAGATACATTCACCTACAATTACGTGACCAACACTATGACTTATTGATTCCACACGTTAAGACGGGATTAGTGGATCAGGTAATTGTATCTTGTGGTGCACTGGTTATGCAAATTTCATCCGATTCCACCAAGAATAGACTGGATACTTTGTATAAAGTCTATTCTACTGATGGTACTCTGTCGAAGTATCGTAATGTCTTTTGCAACGTCTTTAAAGGACCTTTTATTGACCTTCGAGAAATGCGATATATGGAGTTGATCAATGCAATTGGATTGTGTCAACGTCATTCTAACAAGTTTCTCATTACTGATGCCAATATGCACAAGTCCATTCGCGCACTTCGTGCATATGATCCATCTTCTATAGTAGTTGCAATGAGATGTACCAACAATAGGAAGCCTAATGATCGACTAGGTGTTTGCGATTTCACTATGGACTCCTCATTTCATGAAGAATCCTTTTGTTTGAGCACCGTGCTGGCCGACGTTTTGGATATCGGTGTATACTCTCAATGTAATTTGACTATTGCTGATTTAAGTCGAGTTTCTGATGTATCATATTCGACATACATGCGAACTCGTACATCAGAGGCTGAGAGATCCCATAAGATTTATCTTACTTGGGCAGCTTTGAGTTCAGGAGGAGTTGCAGTTTATAAAATATTTTGTCCAGAACAGATTGTTGAGAGTTTAAATCTCATCTCAAGTCTGTTCGAAGACATTAGATTTTATAGACCTCATGTAACACCCACTAGTGCCGTTGAAGGTTTCCTTATCTGTTGTGGAAAAAGACACAGTCAAGGTAAACCTTTTTCGATACTTACAGAGGTTAGCGAATGTTTTTACAAGGTGCACATTGACAATTATTGTGTGAATGCCTTGAGTGAGAGTAAAGCGCAAAAGTTCGCGAAGGATCTTTGTGGTTTCTACTCCGGAGGATCGAACTTTCGGTCATCCCGAAAGCACTCTCATAACAGGTCTTATATTGTCGATAGGTCCCTAGTGGTGTCAAAATTTTTGTCTTATATCAGCACAGCATCGTTTGGAGTTTTTTGTAATAGATTTTCATCATACAAACTCCATGTCGGTGTAGATCGTGATCTACAGTTTCATAGTCGTGAACTCGATGCATTGCTCGACTCGAAGTGTCTGCATTGTGAATCTCGATTCTTGAAATTTCCAGATCTTAAGGATATAGGACAATTTGACAATACCGTCACTGAAACTACCTTTAACTATTTACAATACTTCGATAACTGTAACGATTTTTCGTCCATTTTGTCATTTATTATTTATGTAGTTAAAGGTGGTTTCTCCAATATCTGTGTTGTTTCTAACTGTTTTTTGAACGAGAAGATCCTGACCAGTTTTCTAGCCTTTTGCAGATGTTTCAAATTTGTAGAAATTTGTCTGCGAATGTGGCAAGACAACCTGGTTATGATGATTTCGTGCAAGGACAATTGGTATGGTCCGCTCGATGGTAATTTTGAGTTGATCTCCTGTAACCGTCGTGAGTTTTGCACTGACTTTGTTAAGACTATGCTTGAGCATGCAAAGCTAAAAGCTAGATTTAACGATAAATCTGATGCAATACGCACCAAAGCGGACGCCATCAGGTTAGGTTTGTCTATTGGGAAATTTGACCCCAAGTGTCAGATTAAGTCTGATCTAGACAAGTTCCCAAAATTCAAACCACAGATTAAGTTACATAACACCGATGCTCTTGTTAATAGTGTTAAACAGATTGTTGGTGGGAACAATAAGCTACCTTTATCGGCTCAGTCCAGTAAGGAAGTAGAGTTTGTTCCCGTCGACCATCCACAAGATATGGGCAAGCGTTTAGCTTCAATATTCGAATTTGAGAAGTATATGGAGGCTGAACTTGCTCATAGCTCTAGTACTATTAGCAAGGCTGTAGACCATTTGCTCAGTTTTACCACTACTAGAGATCCGAAAAGGTTAAACGAGCTATGGTTTCCGAATAGATCCTTTTACACGGACCAGAAGAAACTCAAGGATGGAATAGGTATCATCGCTGCGAATGGTAAGATTTTGAAAAATTCAGAACCTATTGTCTGCGCTGATGACATCAATGCCGTCTTTGACTTGGTTTCCGGTTCTGTGGTTTTTAAAACCGATTATCTTAGGATGTATCGTGGACGCTCTGTAGATCAGGTCGGCGGATTTGCTATATTTACTAACTTAGTCGCACACAATCAAGTTGAACCTATGTTACGTGCTATCTCAGATGTTACTAGCAGGGAACATAGACTTGACTTTGTAAGAACAGTTTCTGTAGATTGGATCCAAGCGGTTGCCGGTGCAGGAAAGACGACATTATTGGTTGAAACGTTTACACCTAATGATATAGTCGTTTGCCCGACTGTTGAGAATCGTGATTCATTACGAAGAAAGTTGATAAGTGCGTATCCTGACATGAAGAGTGATGAGATTAACTCTAGGGTTAGGACACTTAATGGTTTCCTAGTTGATCATAATAGCAAGATCGGTAAGATTAGTGCAGGGTTGGTTTCT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19,412
OP761818.1
Citrus leprosis virus cytoplasmic type 2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
MRNV
Cilevirus colombiaense
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,725
GenBank
null
Colombia
Colombia
Citrus sinensis
null
null
SAMN31571469
PRJNA895362
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20,194
OP761822.1
Citrus leprosis virus cytoplasmic type 2
Padmanabhan,C., Nunziata,S., Guillermo,L.M., Rivera,Y., Mavrodieva,V.A., Nakhla,M.K., Roy,A.
United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
MGD
Cilevirus colombiaense
Cilevirus
Kitaviridae
ssRNA(+)
8,725
GenBank
null
Colombia
Colombia
Dieffenbachia
null
null
SAMN31571470
PRJNA895362
MAG: Citrus leprosis virus cytoplasmic type 2 isolate MGD segment RNA1, complete genome
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United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
USA
2022-12-25
VSLP
Cilevirus colombiaense
Cilevirus
Kitaviridae
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8,726
GenBank
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Colombia
Colombia
Swinglea glutinosa
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null
SAMN31571471
PRJNA895362
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United States Department of Agriculture, Plant Pathogen Confirmatory Diagnostics Laboratory
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2022-12-25
VSLP
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ssRNA(+)
5,016
GenBank
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SAMN31571471
PRJNA895362
MAG: Citrus leprosis virus cytoplasmic type 2 isolate VSLP segment RNA2, complete genome
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TTTTTGTCATTTTGAC
20,201
NC_006950.1
Citrus sudden death-associated virus
Maccheroni,W., Alegria,M.C., Greggio,C.C., Piazza,J.P., Kamla,R.F., Zacharias,P.R., Bar-Joseph,M., Kitajima,E.W., Assumpcao,L.C., Camarotte,G., Cardozo,J., Casagrande,E.C., Ferrari,F., Franco,S.F., Giachetto,P.F., Girasol,A., Jordao,H. Jr., Silva,V.H., Souza,L.C., Aguilar-Vildoso,C.I., Zanca,A.S., Arruda,P., Kitajima,J.P., Reinach,F.C., Ferro,J.A., da Silva,A.C., Silva,A.C.R.
National Center for Biotechnology Information, NIH
USA
2005-04-07
null
Marafivirus citri
Marafivirus
Tymoviridae
ssRNA(+)
6,820
RefSeq
1
null
null
null
null
null
null
PRJNA485481
Citrus sudden death-associated virus, complete genome
GTCCCCTGTGATCGTCTCTCCCGCCCTCCAGCCGGAAAGATATTTTTGCTTTAACTTTTCTTCGCACTCCTACGCCAGATCTACGTGCCTTAGGTCATCTAAGCCGCTATGGATCGCATCTCTGCCCGCATTCCCGTCGCGCCCGCTTCCGCCGGCCCGACCGAGTACACTCCATACCCACACACTCACCCACTCCTACCCCGAGGTGTCTTCACCTCCGGGCCTATTCAACCCTGTCTCCACTTTCTTCCTCACCATGCCCAAGATGCCCCCATCCGCTGCTACAGACCCCTCACCTTCGCCAACCATCTCCGCTATGACCGTTCCGCCTCATCGCTCAAGACTCCGCCCGTCAAACTCCCACTGACCGGTGGTACCCTTGCCGATGCCATCCTTTCCTTGGCACCCACCACTCACCGCGACACCATCGCCACCCCCCTCATGGAAGCCCTTGCTGAACCTTACCGCCAATCCTTGAGCACCTACCCATGGCACATTCCAACCAATCTTCAGCCCTTCCTCACCTCTTGCGGAATCACCACTGCTGGCCAAGGCTTCAAGGCCCACCCTCACCCAGTGCACAAGACCATCGAGACCAATCTCCTCACTAATGTCTGGCCCCACTACGCCACCACTCCTAGTGGCGTCATGTTCATGAAACCATCAAAGTTTGAGAAGCTCAAAATCAAACAGCCCAACTTCTCCAAGCTCTACAACTACCGCATCACAGCCAAGGACACCACCCGTTACCCCTCCACTTCCCCAGACTTGCCCACCGAGGACACCTGCTTCATGCACGATGCCCTCATGTACTATTCCCCTGGACAGATCTGTGACCTCTTCCTCTCCCGCCCCAGCCTCCAAAAGCTCTATGCTTCCCTTGTTGTTCCTCCGGAGAGCGACTTCACCACCATCTCCCTCTTCCCAGATCTCTACCGCTACCGGATCGAGAAAGATCAGCTCATCTACGAGCTCGAGCAGAACCCCGCCCACAACTACATCCAGCCTCGCTCTGCCATCGACTGGCTCAAGACCACCACCATCCGCTGCCAGGACCTCACTCTCACCATCTCCCGCCTAGATTCCTGGGGCCCAGTCCACTCTCTCCTGATCCAAAGAGGCAAGCCCCCTATCCATCTTGAGGAGGACTCCATCAGCTTCCGTGCCCCAAAAGCAGTCCTCCTGCCTGAGCCAGCTTCACTCTCCCAATCAGTCCGCGACCGCCTGGTCCCTGCTGATGTTTACCAGGCTCTCTTCATCTATGTCCGGGCTGTCCGCACCCTCCGTGTGACCGACCCGGCTGGCTTCGTTCGCACTCAGATCTCTAAGCCCGAGTACTCTTGGGTCACTTCCTCCGCCTGGGACAATCTGGCCCACTTTGCCTTGGCCACAGCTCCGCACAGACCCCACACCACCTACTTCCTGTTCAACTCAACCGCTGCTCGGGTGGCCCATTGGTTCCGCACTCATACCCTGGCTCCGCTCTCTGGCGCCACTGCTGCCGCCGCGAGCCTTCTCATGACCGCCAGCTGGGGATTCCGTGCCATGATCTCCTCTCATCTTGTCTCCCTCTCCATCTGCAAGCGCTGGCTCAAAGCTCCTCCTCATCTCCTCTGGCCCGAGAAAGCTCCCTGGTTCCAGCTCACCCTGAGGCCCAAAGTCACTGGCCCTCTGATTGACCTGCCCATTCTCCGACCCTTTAGGCTGTTCCCTTCCACATGCGCCAAACTGGGCGCCAAGCACCCTGCTCTTGCCACATTGCTTCCTGCTGCTCCCAGGCCCACATGGCCCCTAAAGGTTGGCCTCGCACTCGCTGCTGTCCCAGTCTGCCTGTTCTTGTGGCGGAAATTCATTGGTCCCGATTCTCCACAGGACATGCATGACAGCTATCATGCCATGTTTCATCCACAGCCTTGGGGCCTCACTCTCACTCGCAAGGCTATCTGCTGCGATAGGGCCCCCTTTCTGCCCATCCCTGTTGTTCCCAGCTCTGACTTCAAGGCCCCGCCAACACCTGCCACCCCACTATTGACTTCCATCCCTATTAAGGGTGTGGAGCCTCAAGTTTCTGGAGAAGGAGTACCTCCGCAGTCGGCTTCATCAACCGGCCCGGCATCGGACTCCCGTCGTGCCCCGCAACCAGCTTCATCAACTGGTCCGGATCCGCCCACCCAGAACACGAGTGCTGCCCCCCAACCTCCCATCGAATCCAAAGTTACCTTTGCCCAACCCATTGAGAGTGTGGCACCTGTAGTTCCAGGAGCAGGAGAACCTCCGCAGTCGGCTTCATCAACCGGCCCGGCATCGGTCTCCCGTCGTGACCCGCAAGTGGCTTCATCAACCACTCCGGATGCTCCCACCCTGGACGTCAGCGTGACCCCTCCAAAGACTATCTATCCTATTGACCACCTCCAGAACGACTTCGGCCCTTGCCGTTGCTCCGTCTGTGAACCACTTCAGCCTGCCCCCGTCCCCTCCACTCCTCTCACCGTCTCGGATCATAAAGAAGCCCAGGACGCCGAAGCTCTTTCCTCGGCCCTCCAAGCCCTCGGGCTCGCTCCCACCCCACCAGCTCCACAGTCTCAGAACCTCACTGTAGAGTCCTCAGGAGCCATGCATGCCTCATCTTGGGATCAGCTCTCCTCCCCATCATCTGACTGGGATCCTTCCCCTCTGGCCCGTGATAGCTCCGCCTCTGGTCCCCCAGGCATGTACTCAGATCTCTTTCCAGCTCCCTACCTTCCAGGCACCGGTCAGTTCATCTTCCGCTCCAGGGCCAATGGTCGGGCCAACATCCCTTATCCCGACATGGATTGCCTCTTGCTTTCCATCGAGCAAGCCACCCGCCTTCCCAAGGAGGCTCTCTGGGACACCCTCTGTGCCACATGCCCCGACTCTCTCCTTGATCCTGATACCATTCGCCGAGTCGGATTGTCCACTGACCACTTTGCCATCCTGGCCCACCACTACTCCCTCAGGTGCCGCTTTCACACCGCCCATGGTGTCATTGAGCTCGGCATGGCTGATGCCACCTCCTCATTCGACATCGACCACACTGCTGGCAACCCCGGCCACTTCTCCCTCCGGCAATCTGCCACTCCGAGGCTAAATGGAGGAATTGCTCAAGATCTCGCTGTGGCCGCTCTCAGGTTCAACATTGATGGCACTCTCCTCCCAATCCGCTCAGTTCATGTCTATTCCACTTGGCCAAAGAGAGCAAAGAACCTGTCGTCGAACATGAAGAACGGCTTTGACGGCATCATGGCCAACATCCACCCCACCAAGACCAATGAATCGAGAGAGAAGATCTTGGCACTCGATTCGCAGCTGGACATCGCTGTCAGGAGATCCGTCCGTCTGATCCATATTGCCGGGTTCCCAGGGTGCGGCAAGTCCTTTCCCATCTCCCGCCTCCTCCGCACTCCAACCTTCAGGAACTTTAAGGTGGCAGTTCCCACTGTTGAGCTCCGAGCCGAGTGGAAAACCATTACTGGTCTCCCGGCCTCAGAAGCCTGGCGCATCGGCACCTGGGAATCCTCTCTCCTCAAGTCTGCCCGGGTCCTGGTCATTGATGAAATCTACAAGATGCCAAGAGGCTACATTGATCTCGCCATCCACTCTGATCCCACCATTGAAATGGTCATTGCTCTCGGTGATCCACTCCAAGGAGAGTACCACTCCACTCATCCTTCCTCTACCAACTCCCGCCTTCTCTCTGAGCCCCAGCATCTCTCCATGTACCTTGACTTCTACTGCTTGTGGTCCCACCGCGTTCCGCAGAACGTGGCCGCCTTCTTCCATGTCAAGACCACCTCCAAACAGCCTGGCTTCTGCCGCTACCAGAGAGAGCTGCCGAACTCCAGAATCCTGGCCAACTCTCAGAATGCAGGCCATACCCTCCAGCAGTGTGGCTACGCTGCCGTCACCATTGCCTCCAGTCAGGGCTCCACCTATGAAAATGCGGCCTGCATTCACCTGGACCGAAACAGCTCCTTGCTCTCCCCTGCTCACTCCATGGTTGCTCTCACTCGCTCAAAGGTTGGTGTCATCTTCACCGGCGATCCCGCCCAGCTCTCCAATGCTCCAAGCTCCAACCGAATGTTCTCAGAGTTCTTCTCAGGCCGCACCCGCCCTCTTCATGACTGGTTCCACAATGAGTTCCCAAAGGCCACTGTCCTCACCGAGCCCCTCAAGACTCGGGGGCCCCGCCTCACCGGTGCTGCCTCACCATACTCCAAGGCTGTCCCAATCCGCCAAGCCTCCACCCCAGCTCTCAAGCCTGATTTCCAAGGGGACGTCATAATCTCAGCACCCATAGTTCTCGGCTCCGGCGAGCTCAATGCCCCTCAAGTCTCCTCTCACTTCCTCCCCGAGACTCGCCGTCCTCTCCACTGGGACATTCCATCTGCCATCCCTGAGAGTGCCACCAGACCGGACTCCACTGAGCCCACCACCTCCCATCCAGAGCCAGTCTACCCCGGGGAAACTTTTGAGAATCTTGCTGCCCACTTTCTCCCTGCCCACGACCCAACCGATCGTGAGATCTACTGGCAGGGTCAGCTGTCCAACCAGTTCCCACACATGGACAAGGAATTCCATTTGGCTGCACAACCCATGAGTCTCCTGGCTGCCGTTCATCAAGAGAAGCAAGATCCCACTCTACTGCCAGCTTCAATCCAAAAGAGACTCCGCTTCCGCCCCTCCGACAAGCCCTACCAGATCACCCCAAAAGATGAAATCCTGGGCCAGCTCCTCTTTGAAGGCCTCTGCCGAGCCTACCACAGATCTCCATTTCACACTGAGGCCTTTGATCCCGTGCTTTTCGCCGAGTGCATCAATCTCAATGAGTTCGCCCAGCTCTCGTCCAAGACCCAGGCTACTATTATGGGCAATGCTCGCCGCTCAGACCCTGATTGGCGGTGGAGCGCAGTTCGCATCTTCTCCAAGACCCAACACAAGGTGAATGAAGGGTCCATTTTCCGCTCCTGGAAGGCCTGCCA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8,275
MH784438.1
Citrus sudden death-associated virus
Matsumura,E.E., Coletta-Filho,H.D., Machado,M.A., Nouri,S., Falk,B.W.
UC Davis, Plant Pathology
USA
2018-09-30
CSDaV_EM2018
Marafivirus citri
Marafivirus
Tymoviridae
ssRNA(+)
6,820
GenBank
null
Brazil
Brazil
Citrus sinensis
plant leaf
2014-10-03
null
null
Citrus sudden death-associated virus isolate CSDaV_EM2018, complete genome
GTCCCCTGTGATCGTCTCTCCCGCCCTCCCGCCGGAAAGATATTTTTGTTTTAACTTTTCTTGCACTCTTACGCTCAGATCTACGTGCCTTAGGTCATCTAAGCCGCTATGGATCGCATCTCTGCCCGCATTCCCGTCGCGCCCGCCACCGCCGGCCCGACCGTTTATGTCCCTTACCCCCACACTCACCCCCTCCTACCCCGAGGCGTTTTCACCTCCGGGCCCATCCAACCCCGCCTTCATTTCCTTCCTCACCATGCCCAAGATGCCCCCATCCGCTGCTATCGACCCCTCACCTATGCCAACCATCTCCGCTATGACCGCTCCGCCTCATCGCTCAAGACTTCGCCCGTCAAGCTCCCGCTGACCGGTGGTACTCTTGCCGATGCTATCCTTTCCCTAGCTCCCACCACTCACCGTGATACCATTGCCACCCCCCTTATGGAAGCCCTTGCTGAACCTTACCGCCAGTCCCTGAGCACCTACCCCTGGCACATTCCAACCAATCTTCAGCCCTTCCTCACCTCCTGTGGAATCACCACTGCTGGCCAAGGTTTTAAGGCCCACCCTCACCCTGTGCACAAGACCATTGAGACCAATCTCCTCTCTAATGTCTGGTCCCACTACGCCACCACCCCTAGTGGCGTCATGTTCATGAAACCATCCAAGTTCGAGAAGCTCAGAATCAAACAGCCTAACTTCTCCAAGCTCTACAACTACCGCATCACAGCCAAGGACTCCACCCGTTATCCCTCCACTTCACCAGACCTACCCACTGAGGACACCTGCTTTATGCACGATGCCCTCATGTACTACTCCCCCGGACAGATCTGTGACCTCTTCCTCTCCCGCCCTAGCCTCCAAAAGCTTTATGCCTCCCTTGTGGTTCCCCCGGAGAGTGACTTCACCACCATCTCCCTCTTCCCAGATCTCTATCGCTACCGGATCGAGAAAGACCAGCTCATCTACGAGCTGGAGCAGAACCCCGCTCACAACTACATTCAGCCCCGCTCTGCCCTCGACTGGCTCAAGACCACCACCATCCGCTGCCAGGACCTCACTCTCACCATCTCCCGCCTAGATTCCTGGGGCCCAGTCCACTCTCTCCTGATCCAAAGAGGCAAGCCTCCAATCCACCTTGAGGAAGATTCCCTGAGCTTCCGTGCCCCAAAAGCTGTCCTCCTGCCTGAGCCCTCTTCCCTCTCCCAAGCAGTCCGCGACCGCCTGGTCCCTGCTGATGTCTACCAGGCCCTCTTCATCTATGTCCGGGCTGTCCGCACTCTCAGAGTCACGGACCCTGCTGGCTTTGTCCGCACTCAGATCTCCAAGCCCGAGTATTCCTGGGTCACTTCTTCCGCCTGGGATAATCTGGCCCACTTTGCCCTGGCCACAGCTCCGCACAGGCCCCACACCACCTACTTCCTGTTCAACTCAACTGCAGCTCGGGTTGCCCACTGGTTCCGCACTCACACCCTAGCTCTGCTCTCTGGCGCCACAGCAGCCGCCGCGGGTCTCCTCATGACTGCCAGCTGGGGATTCCGCGCAATGATCTCCTCTCATCTTGTCTCCCTCTCCATCTGCAAGCGCTGGCTGAGAGCTCCTCCTCATCTCCTCTGGCCCGAAAAAGCCCCCTGGTTCCAGCTCACCCTGAGACCAAAAGTCACTGGCCCTCTGATTGACCTGCCCATTCTCCGACCCTTTAGGCTGTTCCCTTCCACATGCGCCAAGCTGGGCGCCAAGCACCCTGCTCTTGCCACATTGCTTCCTGCTGCTCCCAGGCCCACATGGCCCCTAAAGGTTGGCCTCGCACTCGCTGCTGTCCCAGTCTGCCTGTTCTTGTGGCGGAATTTCATTGGTCCCGATTCTCCACAGGACATGCATGACAGCTATCATGCCATGTTTCATCCACAGCCTTGGGGCCTCACTCTCACTCGCAAGGCTATCTGCTGCGACAGGGCCCCCTTTCTGCCCATCCCTGTTGTTCCCAGCTCTGACTTCAAGGCCCCGCCAACACCTGCCACCCCACTATTGACTTCCATCCCTATTAAGGGTGTGGAGCCTCAAGTTTCTGGAGAAGGAGTACCTCCGCAGTCGGCCTCATCAACCGGCCCGGCATCGGACTCCCGTCGTGCCCCGCAACCAGCTTCATCAACTGGTCCGGATCCGCCCACCCAGAACACGAGTGCTGCCCCCCAACCTCCCATCGAATCCAAAGTTACCTTTGCCCAACCCATTGAGAGTGTGGCACCTGTAGTTCCAGGAGCAGGAGAACCTCCGCAGTCGGCTTCATCAACCGGCCCGGCATCGGTCTCCCGTCGTGACCCGCAAGTGGCTTCATCAACCACTCCGGATGCTCCCACCCTGGACGTCAGCGTGACCCCTCCAAAGACTATCTATCCCATTGACCACCTCCAGAACGACTTCGGCCCTTGCCGTTGCTCCGTCTGTGAACCACTTCAGCCTGCCCCCGTCCCCTCCACTCCTCTCACCGTCTCGGATCATAAAGAAGCCCAGGACGCCGAAGCTCTTTCCTCGGCCCTCCAAGCCCTCGGGCTCGCTCCCACCCCAACAGCTCCACAGTCTCAGAACCTCACTGTGGAGTCCTCAGGAGCCATGCATGCCTCATCTTGGGATCAGCTCTCCTCCCCATCATCTGACTGGGATCCTTCCCCTCTGGCCCGTGATAGCTCCGCCTCTGGTCCCCCAGGCATGTACTCAGATCTCTTTCCAGCTCCCTACCTTCCAGGCACCGGTCAGTTCATCTTCCGCTCCAGGGCCAATGGTCGGGCCAACATCCCTTATCCCGACATGGATTGCCTCTTGCTTTCCATCGAGCAGGCCACACGCCTCCCCAAAGAGGCTCTCTGGGACACTCTCTGTGCCGCCTGCCCCGACTCTCTGCTTGATCCTGACATCATTCGCCGAGTCGGACTGTCCACTGATCACTTTGCCATCTTGGCCCATCACTACTCCCTCAGGTGCCGCTTTCACACTGCCCATGGTGTCATCGAGCTCGGCATGGCCGATGCCACCTCTTCATTTGACATTGATCACACTGCCGGAAACCCTGGCCACTTCTCTCTCCGGCAATCTGCCACTCCAAGGCTAAATGGAGGGATCGCCCAAGATCTTGCTGTGGCCGCTCTGAGGTTCAACATTGATGGCACCCTCCTCCCTATCCGCTCTGTGCATGTCTACTCCACCTGGCCAAAGAGAGCGAAGAATCTATCATCAAACATGAAGAATGGCTTCGATGGCATCATGGCCAACATCCACCCCACCAAGACCAATGAATCGAGAGAGAAGATCTTGGCACTCGATTCGCAGCTGGACATCGCTGTCAGGAGATCCGTCCGTCTGATCCATATTGCCGGGTTCCCAGGGTGCGGCAAGTCCTTTCCCATCTCCCGCCTCCTCCGCACTCCAACCTTCAGGAACTTTAAGGTGGCAGTTCCCACTGTTGAGCTCCGAGCCGAGTGGAAAACCATTACTGGTCTCCCGGCCTCAGAAGCCTGGCGCATCGGCACCTGGGAATCCTCTCTCCTCAAGTCTGCCCGTGTCCTGGTCATTGATGAAATCTACAAGATGCCAAGAGGCTACATTGATCTCGCCATCCACTCTGATCCCACCATTGAAATGGTCATTGCTCTCGGTGATCCACTCCAAGGAGAGTACCACTCCACTCATCCTTCCTCTACCAACTCCCGCCTTCTCTCTGAGCCCCAGCATCTCTCCATGTACCTTGACTTCTACTGCTTGTGGTCCCACCGCGTTCCGCAGAACGTGGCCGCCTTCTTCCATGTCAAGACCACCTCCAAACAGCCTGGCTTCTGCCGCTACCAGAGAGAGCTGCCGAACTCCAGAATCCTGGCCAACTCTCAGAATGCAGGCCATACCCTCCAGCAGTGTGGCTACGCTGCCGTCACCATTGCCTCCAGTCAGGGCTCCACCTATGAAAATGCGGCCTGCATTCACCTGGACCGAAACAGCTCCTTGCTCTCCCCTGCTCACTCCATGGTTGCTCTCACTCGCTCAAAGGTTGGTGTCGTCTTCACCGGCGATCCCGCCCAGCTCTCCAATGCTCCAAGCTCCAACCGAATGTTCTCAGAGTTCTTCTCAGGCCGCACCCGCCCACTTCATGACTGGTTCCACAATGAGTTTCCAAAGGCCACAATCCTCACCGAGCCCCTCAAGACTCGGGGACCCCGCCTCACCGGTGCTGCTTCACCATACTCCAAAGCTGTCCCAATCCGCCAAGCATCCACCCCAGCTCTCAAGCCTGATTTCCAAGGAGACGTCATCATCTCCGCTCCCATAGTTCTCGGCTCCGGTGAACTCAATGCTCCTCAAGTCTCAACTCATTTCCTCCCCGAGACTCGCCGCCCTCTTCACTGGGACATTCCCTCAGCCATCCCTGAAAGTGCCACCAGACCGGACTCCACTGAACCTACCACCTGTCATCCTGAACCGGTCTACCCTGGTGAAACTTTTGAGAATCTTGCTGCCCACTTTCTCCCTGCCCACGACCCAACCGATCGTGAGATCTACTGGCAGGGTCAGCTGTCCAACCAGTTCCCACACATGGACAAGGAATTCCACTTGGCTGCCCAACCCATGAGCCTTCTGGCCGCCGTTCATCAAGAGAAGCAAGACCCCACTCTCCTGCCAGCTTCCATCCAAAAGAGACTCCGCTTCCGCCCATCTGACAGGCCCTACCAGATCACTCCAAAAGATGAAATTCTGGGCCAGCTCCTCTTTGAAGGCCTCTGCCGAGCTTACCACAGATCCCCATTCCACACTGAGGCCTTTGACCCTGTGCTGTTTGCCGAATGCATCAATCTCAATGAGTTTGCCCAGCTCTCGTCCAAGACCCAGGCCACCATTATGGGCAATGCTCGCCGCTCGGACCCTGATTGGCGGTGGAGTGCAGTCCGTATCTTCTCCAAGACCCAACACAAGGTGAATGAAGGGTCCATCTTCGGCTCCTGGAAGGCCTGCCA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68,223
KY110735.1
Citrus sudden death-associated virus
Matsumura,E.E., Coletta-Filho,H.D., Nouri,S., Falk,B.W., Nerva,L., Oliveira,T.S., Dorta,S.O., Machado,M.A.
Centro APTA Citros Sylvio Moreira-IAC, Laboratorio de Biotecnologia
Brazil
2017-05-08
null
Marafivirus citri
Marafivirus
Tymoviridae
ssRNA(+)
6,820
GenBank
1
Brazil
Brazil
Citrus sinensis
plant leaf
2007
null
null
Citrus sudden death-associated virus strain CSRL01, complete genome
GTCCCCTGTGATCGTCTCTCCCGCCCTCCAGCCGGAAAGATATTTTTGTTTTAACTTTCTCTGCACTCTTACGCCCAGATCTACGTGCCTTAGGTCATCTAAGCCGCTATGGATCGCATTTCTGCCCGCATTCCCGTCGCGCCCGCCACCGCCGGCCCGACTGAGTACACTCCATACCCACACACCCACCCCCTCCTACCCCGAGGTGTCTTCACCTCCGGGCCCATCCAGCCCCGCCTCCATTTCCTTCCTCACCATGCCGAAGATGCCCCCATCCGCTGCTACAGACCCCTCACCTTTGCCAACCATCTCCGCTATGACCGCTCCGCCTCATCGCTCAAGACTCCGCCCATCAAGCTCCCGCTGACCGGTGGTACCCTTGCCGATGCCATCCTTTCCTTGGCACCCACCACTCACCGTGATACCATTGCCACCCCCCTCATGGAAGCCCTTGCTGAACCTTACCGCCAGTCTCTGAGCACCTTCCNNNNNCACATTCCAACCAATCTTCAGCCCTTCCTCACCTCTTGCGGAATCACCACCGCTGGCCAAGGCTTTAAGGCCCATCCTCACCCAGTGCACAAGACCATTGAAACAAATCTCCTCACCAATGTCTGGTCCCACTACGCCACCACCCCTAGTGGCGTCATGTTCATGAAACCATCAAAGTTCGAGAAGCTCAAAATCAAACAGCCCAACTTCTCCAAGCTCTACAACTACCGCATCACAGCTAAGGACTCCACCCGCTACCCATCCACTTCACCGGACTTGCCCACTGAAGACACGTGCTTCATGCACGATGCCCTCATGTACTATTCCCCCGGACAGATCTGTGACCTCTTCCTCTCCCGCCCCAGTCTCCAGAAGCTTTACGCCTCCCTAGTGGTTCCCCCGGAAAGTGATTTCACTACCATCTCCCTCTTCCCAGATCTCTACCGTTACCGGATTGAGAAAGACCAGCTCATCTACGAGCTCGAGCAGAACCCCGCCCACAACTACATTCAGCCCCGCTCTGCCATCGATTGGCTCAAAACCACCACCATCCGCTGCCAGGACCTCACTCTCACCATCTCCCGCTTAGATTCCTGGGGCCCAGTGCATTCTCTCCTGATCCAAAGAGGCAGGCCCCCAGTCCATCTTGAGGAGGACTCCATCAGCTTCCGGGCCCCGAAAGCAGTCCTCCTGCCTGAGCCCGCCTCCCTTTCTCAAGCAGTCCGCGACCGCCTGGTCCCTGCCGATGTCTACCAGGCCCTCTTCATCTATGTCCGGGCTGTTCGCACTCTCCGAGTCACGGACCCTGCCGGCTTTGTTCGCACTCAGATCTCCAAGCCCGAGTACTCCTGGGTCACTTCTTCCGCCTGGGACAATCTGGCCCACTTTGCCCTAGCCACAGCTCCGCACAGACCCCATACCACCTACTTCCTGTTCAACTCAACCGCGGCTCGGGTGACCCACTGGTTCCGCACTCATACCCTGGCTCTACTTTCTGGCGCCACTGCTGCCGCCGCCAGCCTCCTTATGACCGCCAGCTGGGGATTCCGTGCATTGATCTCCTCTCATCTTGTCTCTCTCTCCATCTGCAAACGCTGGCTAAAAGCTCCTCCTCATCTCCTCTGGCCCGAGAGAGCTCCCTGGTTTCAGCTCACTCTGCGACCCAAAGTCACTGGCCCTCTGATTGACCTCCCCATTCTCCGACCTTTCAGGCTGTTCCCTACCACATGCGCCAAATTGGGCGCCAAGTACCCAGCTCTTGCCACTCTTCTTCCTGCCGCCCCCAGGCCCATCTGGCCCCTCAAAGTCGGCCTCGCCCTTGCTGCTGTCCCAGTCTGCCTGTTCCTGTGGCGGAAATTCATTGGTCCTGACTCTCCACAGGACATGCACGACAGCTATCATGCCATGTTCCATCCACAGCCATGGGGCCTCACTCTCACCCGCAAGGCCATCTGCTGCGATAGGGCTCCCTTCCTCCCCATTCCTGTCGTCCCCAGCTCTGATTTTAAGGCCCCACCAACACCTGCCACTCCACTTTTAACCTCCATTCCTATCAAGGGTGTGGAGCCTCAAGTTTCTGGAGAAGGAGTACCTCCGCAGTCGGCTTCATCAACCGGCCCGGCATCGGACTCCCGTCGTGCCCCGCAATCAGCTTCATCAACTGGTCCGGATCCGCCCACCCAGAACACGAGTGCTGCCCCCCAGCCTCCCAGTGAATCCAAAGTTACCTTTGCCCAACCAATTGAGAGTGTGGCGCCTGTAGTTCCAGGAGCAGGAGAACCTCCGCAGTCGGCTTCATTAACCGGCCCGGCATCGGTCTCCCGTCGTGACCCGCAAGCGACTTCATCAACCGCTCCGGATGCTCCCACCCTGGACATCAGTGTGACCCCTCCAAAGACCATCTATCCCATCGACCATCTTCAGAACAACTTCGGCCCATGCCGTTGCTCTGTCTGTGAGCCACCAAAGCCCGCCCCCATTCCTTCCACCCCTCTCACCGTCTCAGATCACAAAGAGGCCCAGGATGCCGAAGCTCTTTCCTCGGCCCTCCAAGCTCTCGGGCTCGCTCCCACTCCACCAGCTCCACTGTCTCAGAACCTGACCGTCGAATCCTCTGGGGATGTGCATGCCTCCTCTTGGGATCAGCTCTCCTCCCCATCCTCGGACTGGGATCCTTCTCCTCTGGCCCGTGACAGCTCCGCCTCTGGTCCCCCAGGCATGTACTCTGATCTCTTTCCAGCTCCTTACCTCCCAGGCACCGGCCAGTTCATTTTCCGATCCAGAGCCAATGGTCGGGCCAACATTCCTTATCCCGACATGGATTGCCTCTTGCTCTCCATCGAGCAGGCCACCCGCCTTCCAAAAGAGGCGCTCTGGGACACCCTCTGTGCCACTTGCCCCGACTCTCTCCTTGATCCTGACACCATCCGTCGAGTCGGACTGTCCACTGACCACTTCGCCATTCTGGCTCACCACTACTCCCTCAGATGCCGCTTTCATACTGCCCATGGTGTCATTGAGCTCGGCATGGCTGACGCCACCTCCTCATTTGACATTGATCACACTGCCGGCAACCCTGGCCACTTTTCTCTCCGGCAGTCTGCCACTCCAAGGCTAAATGGAGGAATTGCCCAAGATCTTGCTGTGGCCGCTCTGAGGTTCAACATTGATGGCACTCTCCTCCCAATCCGCTCAGTTCATGTCTACTCCACCTGGCCAAAGAGAGCAAAGAATCTGTCATCAAACATGAAGAATGGTTTCGATGGAATCATGGCCAACATCCACCCCACCAAGACCAACGAGTCGAGAGAGAAGATCCTGGCACTTGACTCACAGCTGGACATTGCTGTCAGGAGATCTGTTCGTCTGATCCACATTGCCGGGTTCCCGGGATGTGGCAAGTCTTTCCCTATCTCCCGTCTCCTCCGCACTCCGACCTTCAGGAACTTCAAGGTCGCGGTCCCCACTGTTGAGCTCCGAGCCGAATGGAAAGCCATCACTGGTCTCCCGGCCTCTGAAGCCTGGCGCATCGGCACTTGGGAATCCTCTCTTCTGAAATCTGCCCGGGTCCTGGTCATTGATGAAATCTACAAGATGCCAAGGGGCTACATTGATCTTGCCATCCACTCTGATCCCACCATCGAGATGGTCATTGCCCTCGGTGATCCACTCCAAGGGGAGTACCACTCTACTCACCCTTCTTCCACCAACTCCCGCCTTCTCTCTGAGCCTCAGCACCTCTCCATGTATCTCGACTTCTACTGCTTGTGGTCCCACCGCGTTCCCCAAAACGTGGCTGCCTTCTTCCATGTCAAGACCACTTCCAAGCAGCCTGGCTTCTGTCGCTACCAAAGGGAGCTCCCGAACTCCAGAATTCTGGCCAACTCTCAGAATGCCGGCCATACTCTCCAGCAGTGCGGATATGCCGCCGTTACCATCGCCTCTAGCCAGGGGTCGACCTATGAAAATGCAGCCTGCATCCACCTGGACCGCAACAGCTCCTTGCTCTCTCCTGCTCACTCCATGGTCGCTCTCACCCGCTCCAAGGTTGGTGTCATCTTCACTGGCGATCCTGCCCAGCTCTCCAATGCTCCAAGTTCCAACCGAATGTTCTCAGAGTTCTTCTCAGGCCGCACTCGCCCACTTCATGACTGGTTCCACAATGAGTTCCCAAAGGCCACAGTCCTCACCGAGCCCCTCAAGACTCGGGGGCCTCGCCTCACTGGTGCTGCTTCACCATACTCCAGGGCTGTCCCAATCCGCCAAGCATCCACCCCAGCTCTCAGGCCCGATTTCCAAGGGGATGTCATCTTCTCTGCCCCCATAGTTCTCGGCTCCGGCGAGCTCAATGCTCCTCAAGTCTCAACTCACTTCCTCCCCGAGACTCGCCGCCCTCTCCACTGGGACATTCCATCAGCTATCCCTGAAAGTGCCACCAGACCGGATTCCACTGAACCCACCACCTGCCATCCTGAACCGGTCTACCCTGGGGAAACTTTTGAGAATCTTGCAGCCCACTTTCTCCCTGCCCATGACCCAACTGATCGCGAGATCTACTGGCAAGGCCAGCTGTCCAACCAGTTCCCACATATGGACAAGGAATTCCACTTGGCTGCACAACCCATGAGTCTCCTGGCTGCTGTTCATCAAGAGAAGCAAGATCCCACTCTGCTGCCAGCTTCAATCCAAAAGAGACTCCGCTTCCGCCCCTCTGACAGGCCCTACCAGATCACTCCAAAAGATGAAATCCTGGGCCAGCTCCTCTTTGAAGGCCTCTGCCGAGCCTACCACAGATCCCCATTCCACACTGAGGCTTTTGATCCTGTGCTCTTTGCCGAGTGCATTAATCTCAATGAGTTTGCCCAGCTCTCATCCAAGACCCAGGCTACCATCATGGGCAATGCCCGCCGCTCAGATCCTGATTGGCGGTGGAGTGCAGTCCGCATTTTCTCCAAGACCCAACACAAGGTGAATGAAGGGTCTATCTTCGGCTCCTGGAAGGCCTGCCA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76,726
KY110736.1
Citrus sudden death-associated virus
Matsumura,E.E., Coletta-Filho,H.D., Nouri,S., Falk,B.W., Nerva,L., Oliveira,T.S., Dorta,S.O., Machado,M.A.
Centro APTA Citros Sylvio Moreira-IAC, Laboratorio de Biotecnologia
Brazil
2017-05-08
null
Marafivirus citri
Marafivirus
Tymoviridae
ssRNA(+)
6,821
GenBank
1
Brazil
Brazil
Citrus sinensis
plant leaf
2007
null
null
Citrus sudden death-associated virus strain CSRL02, complete genome
GTCCCCTGTGATCGTCTCTCCCGCCTCATCGCCGGAAAGATATTTTTGTTTTAACTTTTCTTTTGCACACCTACGCCAGATCTCCGTGCCTTAGGTCATCTAAGCCGCTATGGATCGCATCTCTGCCCGCATCCCCGTCGCGCCCGCTTCTGCCGGCCCGACCGAGTATGTTCCTTACCCCCACACCCACCCCCTCCTACCCCGAGGTGTGTTCACCTCCGGGCCCATTCAACCCCGCCTTAATTTCCTCCCACACCATGCCCAAGATGCTCCCATCCGCTGCTACAGACCCCTCACCTTCGCCAATTACCTTCGCTATGACCGCTCCGCTGCATCGCTCAAGGTTTCGCCCGTCCAGCTCCCGCTGACCGGTGGCACTCTTGCCGATGCCATCCTCTCCCTTGCACCCACCACCCACCGTGATACCATCGCCACTCCTCTCATGGAAGCTCTTGCCGAGCCATACCGCCAGTCCCTGAGCACCTACCCCTGGCACATTCCAACCAATCTTCAGCCCTTCCTCACCTCCTGTGGAATCACCACCGCTGGCCAAGGCTTTAAGGCCCACCCTCACCCAGTGCACAAGACCATCGAGACCAACCTTCTCACCAATGTCTGGTCCCACTACGCCACCACCCCCAGTGGCGTCATGTTCATGAAGCCCTCAAAGTTCGAAAAGCTCAGGATCAAGCAGCCCAACTTCACAAAGCTCTACAACTACCGCATCACAGCCAAAGACTCCACCCGTTACCCCACCACTTCCCCAGATCTGCCCACCGAGGACACCTGCTTCATGCATGATGCCCTCATGTACTACTCCCCCGGCCAGATCTGTGACCTCTTCATCTCTCGCCCCAGCCTCCAAAAGCTCTATGCCTCTCTCGTCGTTCCTCCTGAAAGCGACTTCACCACCATCTCCCTCTTCCCCGACTTGTATCGCTACAGGATTGAGAAGGACCAGCTTGTCTATGAGCTAGAGCAGAACCCGGCCCACAACTACATTCAGCCCCGCTCCGCCATTGACTGGCTGAAGACCACCACCATCCGCTGCCAAGACCTAACCCTCACAATCTCCCGCCTTGACTCCTGGGGCCCAGTTCACTCTCTTTTGATCCAAAGAGGCAGGCCACCCATCCACCTTGAAGAGGACTCCATCAGCTTCCGCACTCCCAAAGCTGTCCTCCTTCCTGAACCATCTTCTTTATCCCAGGCGGTTCGTGACCGCCTTGTTCCTGCTGATGTCTACCAGGCTCTCTTCATCTATGTCAGAGCCGTTCGGACCCTCCGTGTCACTGACCCCGCTGGGTTTGTCCGAACTCAGATTTCAAAGCCCGAGTACTCCTGGGTCACCTCCTCCGCCTGGGACAACTTGGCCCACTTCGCCCTTGCCACTGCTCCACACAGACCCCACACCACTTACTTCCTTTTCAATTCCACTGCGGCCCGGGTATCCCACTGGTTCCGCACCCATACCTTGGCCCTGCTCTCTGGCGCCACTGCAGCCGCCGCCAGCCTCCTCATGACCGCCAGTTGGGGCTTCCGCGCTCTCATTTCTTCTCACCTTGTCTCCCTCTCCATCTGCAAGCGCTGGCTGAGGGCCCCTCCCCATCTCCTTTGGCCCGAGAAGGCTCCATGGTTCCAACTCACACTGCGGCCTAAAGTCACCGGCCCCATGATTGACCTGCCCATCCTCCGACCATTCAGATTGTTCCCATCTACCTGTGCTAAATTGGGCGCCAAGTATCCTGCCCTCGCCACCTTGTTGCCAGCTGCACCCAGGCCCCTCTGGCCCCTGAAAGTTGGCTTTGCCCTTGCCACCGTGCCCGTCTGTTTATTCTTGTGGCGGAAGTTCATTGGTCCCGACTCTCCCCAGGACATGCACGACAGCTACCATGCTATGTTTCATCCACAGCCCTGGGGACTCTCTCTGGCCCGCAAGGCCATTTGCTGTGACAGAGCTCCATTCCTCCCCATCCCTCTTGTGCCCAGCTCTGACTTCAAAGCCCCACCCACACCAGCTACCCCTCTACTGACCTCCATCCCAATCAAGGGTGTGGAGCCTCAAGTTCCTGGAGAAGGAGTACCTCCGCAGTCGGCTTCATCAACCGGCCCGGCATCGGACTCCCGCTGCGCCCCGCAACCAGCTTCATCAACTGGTCCGGATCAGCTCGCCCAGGACACGAGTGCTGCCCCCCAAGCTCCCACAAAATCCAAAGTTACTTTTGCTCAACCCCTTGAGAGCGTGACACCTGTAGTTCCAGGAGCAGGAGAACCTCCGCAGTCGGCTTCATCAACCGGCCCGGCATCGGTCTCCCGTCGTGACCCGCAAACGGCTTCATCAACCGTTCCGGATGCTCCCACCCTGGACAGCAGTGTGACCCCTCCACCGATTATCTACCCAGTTGACCATCTCCAGAATGACTTCGGCCCCTGCCGTTGTTCACTCTGCGACCCGCCCCAGCCAGCCCCAGTTCCCTCTGCCCCTCTCACTGTCTCTGACCACAAGGAATCCCAAGATGGTGAGGCCCTCGCTTCCGCCCTCCAAGCTCTCGGGCTCGCCCCTGCTCCACCAGCTCCTCTGTCTCAGAATCTAACCATCGAGTCCTCAGGAGCCATGCATGCCTCTTCTTGGGATCAGCTCTCTTCCCCATCATCGGACTGGGATCCCTCCCCCCTGGCTCGCGACAGCTCTGCCACCGGTCCACCAGGCATGTACTCTGATCTCTTCCCGGCTCCTTATCTCCCAGGCACCGGCCAATTTATCTTCCGCTCCAGAGCCAACGGCCGGGCCAACATTCCCTACCCCGACATGGATTGTCTCCTACTTTCCATCGAGCAGGCTACCCGCCTTCCTAAGGAGGCCCTCTGGGACACTCTCTGTGCCACCTGCCCCGACTCTCTGCTTGACCCTGACACCATCCGCCGAGTCGGCCTCTCCACAGACCATTTTGCTATCCTCGCCCACCACTACTCCCTCAGGTGCCGGTTCCATACCGCCCATGGTGTCATTGAGTTGGGCATGGCCGACGCCACTTCATCTTTTGATATCGACCACACTGCCGGCAATCCTGGCCACTTCTCCCTCCGGCAGTCTGCCACGCCCCGGCTCAATGGTGGCATTGCTCAGGACCTTGCTGTGGCCGCCTTAAGGTTCAACATTGACGGCACTCTCCTCCCCATCCGCTCAGTTCATGTCTATTCCACCTGGCCCAAGAGAGCCAAGAACCTGTCCTCAAATATGAAAAACGGCTTTGATGGAATCATGGCCAACATTCATCCCACCAAGACCAATGAATCCAGAGAAAAGATTTTGGCCCTGGACTCCCAGCTTGATATTGCAGTCCGGAGATCTGTCCGCCTCATCCACATTGCCGGCTTTCCAGGCTGCGGCAAGTCCTTCCCCATCTCCCGCCTCCTCCGCACTCCCACCTTCAGGAACTTTAAGGTGGCTGTGCCAACTGTCGAGCTTCGAGCTGAATGGAAAGCAATCATTGGCCTCCCAACTTCTGAGGCATGGCGCATCGGTACCTGGGAATCCTCCCTGCTCAAATCTGCCCGGGTTCTCGTCATTGATGAAATCTACAAGATGCCCCGGGGCTACATTGATCTCGCCATCCACTCTGATCCAACCATTGAGATGGTCATTGCTCTCGGTGACCCACTCCAAGGCGAGTACCACTCCACTCATCCTTCTTCCACCAACTCCCGCCTTCTTGCTGAACCACACCACCTCTCCATGTATCTCGACTACTACTGTATGTGGTCCCATAGAGTCCCTCAGAATGTCGCTGCTTTCTTCCACATCAAGACCACCTCCAAGCAGCCAGGCTTCTGCCGCTACCAGCGAGAGCTTCCCAACTCCAGGATCCTAGCCAACTCTCAAAATGCAGGCCATACTCTTCAGCAATGCGGCTATGCCGCCGTCACCATTGCCTCAAGTCAGGGTTCCACTTATGACAATGCGGCCTGCATCCATCTTGACCGCAACAGCTCCCTGCTCTCCCCTGCTCATTCCATGGTCGCTCTCACCCGCTCCAAGGTTGGTGTCATCTTCACCGGGGATCCCGCCCAGCTGTCCAATGCCCCGAGCTCCAACAGAATGTTCTCTGAATTCTTCTCGGGCCGCACTCGCCCTCTGCATGACTGGTTCCACAATGAGTTCCCCAAGGCCACCGTCCTCACTGAGCCTCTCAAGACTCGGGGCCCCCGGTTGACAGGAGCTGCCTCCCCCTACTCCAAGGCCGTTCCAATCCGACAGGCATCCACCCCGGCCCTCAAGCCAGACTTCCAGGGGGACGTCGTTCTCTCGGCCCCCATCGTTTTGGGCTCCGGCGAGCTCAATGCTCCACAGGTCTCAACTCACTTCCTTCCTGAGACTCGCCGCCCTCTTCACTGGGACATCCCTTCTGCCATCCCTGAGAGTGCCACCAGGCCTGATTCCACTGAGCCCACCACTTGCCATCCTGAGCCGGTTTACCCAGGGGAAACCTTTGAAAATCTTACTGCCCACTTTCTCCCGGCTCACGATCCCACTGATCGAGAAATCTACTGGCAGGGCCAGCTGTCCAACCAGTTCCCTCACATGGACAAAGAGTTCCACCTGGCCGCTCAGCCCATGAGCCTCCTGGCTGCGATTCATCAAGAGAAACAGGATCCCACTCTGCTCCCAGCTTCCATCCAGAAGAGGCTCCGCTTCCGCCCATCAGACAGGCCTTACCAGATCACTCCAAAAGATGAAATCCTGGGCCAATTGCTCTTTGAAGGCCTCTGCCGAGCCTATCATCGGTCCCCTTTCCACACTGAGGCCTTTGATCCTGTTCTGTTCGCCGAGTGCATCAATCTGAATGAATTCGCCCAGCTCTCCTCCAAGACTCAGGCCACCATCATGGGCAATGCTCGCCGCTCTGATCCAGACTGGCGGTGGAGTGCTGTCCGCATCTTCTCCAAGACCCAGCACAAAGTAAATGAAGGGTCCATCTTTGGTTCCTGGAAGGCATGTC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76,727
DQ185573.1
Citrus sudden death-associated virus
Barros,C.C.P., Jesus,W.C. Jr., Teixeira,D.C., Santos,M.A., Nagata,T.
Catholic University of Brasilia
Brazil
2005-10-05
null
Marafivirus citri
Marafivirus
Tymoviridae
ssRNA(+)
6,806
GenBank
null
null
null
null
null
null
null
null
Citrus sudden death-associated virus strain P15, complete genome
GTCCCCTGTGATCGTCTCTCCCGCCTCATCGCCGGAAAGATATTTTTGTTTTAACTTTTCTTTGCACACCTACGCCAGATCTACGTGCCTTAGGTCATCTAAGCCGCTATGGATCGCATCTCTGCCCGCATTCCCGTCGCGCCCGCTTCTGCCGGCCCGACCGAGTATGTTCCTTACCCCCACACTAACCCCCTCCTACCCCGAGGCGTTTTCACCTCCGGGCCCATCCAACCCCGCCTTCATTTCCTTCCTCACCATGCCCAAGATGCCCCCATCCGCTGCTATCGACCCCTCACCTATGCCAACCATCTCCGCTATGACCGCTCCGCCTCATCGCTCAAGACTTCGCCCGTCAAGCTCCCGCTGACCGGTGGTACTCTTGCCGATGCCATCCTTTCCCTAGCTCCCACCACTCACCGTGATACCATTGCCACCCCCCTTATGGAAGCCCTTGCTGAACCTTACCGCCAGTCCTTGAGCACCTACCCCTGGCACATTCCAACCAATCTTCAGCCCTTCCTCACCTCCTGTGGAATCACCACTGCTGGCCAAGGCTTTAAGGCCCACCCTCACCCTGTGCACAAGACCATTGAGACCAATCTCCTCTCTAATGTCTGGTCCCACTACGCCACCACCCCCAGTGGCGTCATGTTCATGAAACCATCCAAGTTCGAGAAGCTCAGAATCAAACAGCCTAACTTCTCCAAGCTCTACAACTACCGCATCACAGCCAAGGACTCCACCCGTTATCCCTCCACTTCACCAGACCTACCCACTGAGGACACCTGCTTTATGCATGACGCCCTGATGTACTACTCCCCCGGCCAGATCTGTGACCTCTTCATCTCTCGCCCCAGCCTCCAAAAGCTCTATGCCTCTCTCGTGGTTCCCCCTGAAAGTGACTTCACCACCATCTCCCTCTTCCCCGACTTGTATCGCTACAGGATTGAGAAGGACCAGCTTGTCTATGAGCTGGAGCAGAACCCGGCCCACAACTACATTCAGCCCCGCTCCGCCATTGACTGGCTGAAGACCACCACCATCCGCTGCCAAGACCTAACCCTCACAATCTCCCGCCTTGACTCCTGGGGCCCAGTTCACTCTCTTTTGATCCAAAGAGGTAGGCCACCCATCCACCTTGAAGAGGACTCCATCAGCTTCCGCACTCCCAAAGCTGTCCTCCTTCCTGAACCAGCTTCTTTATCCCAGGGGGTTCGTGACCGCCTTGTTCCTGCTGATGTCTACCAGGCTCTCTTCATCTATGTCAGAGCCGTTCGGACCCTCCGTGTCACTGACCCCGCTGGGTTTGTCCGAACTCAGATTTCAAAGCCCGAGTACTCCTGGGTCACCTCCTTCCGCTGGGACAACTTTCCCCCCTTGGCCCTTGCCACTGCTCCACACAGACCCCACACCACTTACTTCCTCTTCAATTCCACTGCGGCCCGGGTATCCCACTGGTTCCGCACCCATACCTTGGCCCTGCTCTCTGGCGCCACTGCAGCCGCCGCCAGCCTCCTCATGACCGCCAGTTGGGGCTTCCGCGCTCTCATTTCTTCTCACCTTGTCTCCCTCTCCATCTGCAAGCGCTGGCTGAGGGCCCCTCCCCATCTCCTTTGGCCCGAGAAGGCTCCATGGTTCCAACTCACACTGCGGCCTAAAGTCACCGGCCCCATGATTGACCTGCCCATCCTCCGACCATTCAGATTGTTCCCATCCACCTGTGCTAAATTGGGCGCCAAGTATCCTGCCCTCGCCACCTTGTTGCCAGCAGCACCCAGGCCCCTCTGGCCCCTGAAAGTTGGCCTTGCCCTTGCCACCGTGCCCGTCTGTTTATTCTTGTGGCGGAAGTTCATTGGTCCCGACTCTCCCCAGGACATGCACGACAGCTACCATGCTATGTTTCATCCACAGCCCTGGGGACTCTCTCTGGCCCGCAAGGCCATTTGCTGTGACAGAGCTCCATTCCTCCCCATCCCTCTTGTGCCCAGCTCTGACTTCAAAGCCCCACCCACACCAGCTACCCCTCTACTGACCTCCATCCCAATCAAGGGTGTGGAGCCTCAAGTTCCTGGAGAAGGAGTACCTCCGCAGTCGGCTTCATCAACCGGCCCGGCATCGGACTCCCGCTGCGCCCCGCAACCAGCTTCATCAACTGGTCCGGATCAGCCCGCCCAGGACATGAGTGCTGCCCCCCAAGCTCCCACAAAATCCAAAGTTACTTTTGCTCAACCCCTTGAGAGCGTGACACCTGTAGTTCCAGGAGCAGGAGAACCTCCGCAGTCGGCTTCATCAACCGGCCCGGCATCGGTCTCCCGTCGTGACCCGCAAACGGCTTCATCAACCGTTCCGGATGCTCCCACCCTGGACAGCAGTGTGACCCCTCCACCGATTATCTACCCAGTTGACCATCTCCAGAATGACTTCGGCCCCTGCCGTTGTTCACTCTGCGAACCGCCCCAGCCAGCCCCAGTTCCCTCTGCCCCTCCCACTGTCTCTGACCACAAGGAATCCCAAGATGGTGAGGCCCTCGCTTCCGCCCTCCAAGCTCTCGGGCTCGCCCCTGCTCCACCAGCTCCTCTGTCTCAGAATCTAACCATCGAGTCCTCAGGAGCCATGCATGCCTCTTGTTGGGATCAGCTCTCTTCCCCATCATCGGACTGGGATCCCTCCCCCGTGGCTCGCGACAGCTCTGCCACCGGTCCACCAGGCATGTACTCTGATCTCTTCCCGGCTCCTTATCTCCCAGGCACCGGCCAATTCATCTTCCGCTCCAGAGCCAACGGCCGGGCCAACATTCCCTACCCCGACATGGATTGTCTCCTACTTTCCATCGAGCAGGCTACCCGCCTTCCCAAGGAGGCCCTCTGGGACACTCTCTGTGCCACCTGCCCCGACTCTCTGCTTGACCCTGACACCATCCGCCGAGTCGGCCTCTCCACAGACCATTTTGTTATCTTCGCCCACCACTACTCCCTCAGGTGCCGGTTCCATACCGCCCATGGTGTCATTGAGCTGGGCATGGCCGACGCCACTTCATCTTTTGATATCGACCACACTGCCGGCAATCCTGGCCACTTCTCCCTCCGGCAGTCTGCCACGCCCCGGCTCAATGGTGGCATTGCTCAGGACCTTGCTGTGGCCGCCTTAAGGTTCAACATTGACGGCACTCTCCTCCCCATCCGCTCAGTTCATGTCTATTCCACCTGGCCCAAGAGAGCCAAGAACCTGTCCTCAAATATGAAAAACGGCTTTGATGGAATCATGGCCAACATTCATCCCACCAAGACCAATGAATCCAGAGAAAAGATTTTGGCCCTGGACTCCCAGCTTGATATTGCAGTCCGGAGATCTGTCCGCCTCATCCACATTGCCGGCTTTCCAGGCTGCGGCAAGTCCTTCCCCATCTCCCGCCTCCTCCGCACTCCCACCTTCAGGAACTTTAAGGTGGCTGTGCCAACTGTCGAGCTTCGAGCTGAATGGAAAGCAATCATTGGCCTCCCAACTTCTGAGGCATGGCGCATCGGTACCTGGGAATCCTCTCTGCTCAAATCTGCCCGGGTTCTCGTCATTGATGAAATCTACAAGATGCCCCGGGGCTACATTGATCTCGCCATCCACTCTGATCCAACCATTGAGATGGTCATTGCTCTCGGTGACCCACTCCAAGGCGAGTACCACTCCACTCATCCTTCTTCCACCAACTCCCGCCTTCTTGCTGAACCACACCACCTCTCCATGTATCTCGACTACTACTGTATGTGGTCCCATAGAGTCCCTCAGAATGTCGCTGCTTTCTTCCACATCAAGACCACCTCCAAGCAGCCAGGCTTCTGCCGCTACCAGCGAGAGCTTCCCAACTCCAGGATCCTGGCCAACTCTCAAAATGCAGGCCATACTCTTCAGCAATGCGGCTATGCCGCCGTCACCATTGCCTCAAGTCAGGGTTCCACTTATGACAATGCGGCCTGCATCCATCTTGACCGCAACAGCTCCCTGCTCTCCCCTGCTCATTCCATGGTCGCTCTCACCCGCTCCAAGGTTGGTGTCATCTTCACCGGGGATCCTGCCCAGCTGTCCAATGCCCCGAGCTCCAACAGAATGTTCTCTGAATTCTTCTCAGGCCGCACCCGCCCTCTTCATGACTGGTTCCACAATGAGTTCCCAAAGGCCACTGTCCTCACCGAGCCCCTCAAGACTCGGGGGCCCCGCCTCACCGGTGCTGCCTCACCATACTCCAAGGTGTTCCCATCCGGCAAGGATTCCACCCCGGCCCTCAAACCTGATTTCCAGGGGGACGTTCGTTCTTCTCGGGCCCCCATCGTTCTGGGCTCCGGCGAGCTCAATGCTCCACAGGTCTCAACTCACTTCCTTCCTGAGACTCGCCGCCCTCTTCACTGGGACATCCCTTCTGCCATCCCTGAGAGTGCCACCAGGCCTGATTCCACTGAGCCCACCACTTGCCATCCTGAGCCGGTTTACCCAGGGGAAACCTTTGAAAATCTTGCTGCCCACTTTCTCCCGGCTCACGATCCCACTGATCGAGAAATCTACTGGCAGGGCCAGCTGTCCAACCAGTTCCCTCACATGGACAAAGAGTTCCACCTGGCCGCTCAGCCCATGAGCCTCCTGGCTGCGATTCATCAAGAGAAACAGGACCCCACTCTGCTCCCAGCTTCCATCCAGAAGAGGCTCCGCTTCCGCCCATCAGACAGGCCTTACCAGATCACTCCAAAAGATGAAATCCTGGGCCAATTGCTCTTTGAAGGCCTCTGCCGAGCCTATCATCGGTCCCCTTTCCACACTGAGGCCTTTGATCCTGTTCTGTTCGCCGAGTGCATCAATCTGAATGAATTCGCCCAGCTCTCCTCCAAGACTCAGGCCACCATCATGGGCAATGCTCGCCGCTCTGATCCAGACTGGCGGTGGAGTGCTGTCCGCATCTTCTCCAAGACCCAGCACAAAGTAAATGAAGGGTCCATCTTTGGTTCCTGGAAGGCATGTCAGACTTTGGCCCTCATGCATGATGCTGTTGTCCTTATCCTGGGCCCCGTCAAGAAGTACCAGAGAGTGTTTGACCAGAGAGACAGACCCCGGCACCTTTACATCCATGCCGGCAACACTCCTTCACAGATGAGCAACTGGTGCCAGCAGCATCTCACCACCGCTGTCAAGCTGGCCAATGATTACACCGCCTTTGATCAATCTCAGCATGGGGAGGCAGTTGTTCTCGAAAGAAAGAAGATGGAAAGGCTCTCCATTCCACAGGCCCTCATTGACCTCCACATCCATCTCAAGACCCATGTCTCCACCCAGTTCGGCCCCCTCACTTGCATGCGCCTGACTGGCGAACCTGGCACCTATGATGACAATTCTGACTATAATCTTGCGGTGATCAACTGTGAGTACATGGCTGCCAACACTCCCACTATGGTCTCAGGCGACGACTCCCTCCTGGATCGTGAGCCTCCCACTCGCCCTGAATGGGTCATCCTCCAGCCTCTTCTCAGTCTCCGCTTCAAGAAAGAAAGGGGTCGGTACGCCACCTTCTGTGGCTACTACGCCTCCCATGTCGGCTGTGTCCGCTCCCCCGTGGCTCTCTTTGCCAAGCTGGCCATAGCTGTCGATGACGGCTCCATCTCTGACAAAATGGCCTCATACCTCTCTGAATTTGCTCTTGGCCACTCCCTTGGAGACCATCTCTGGGAAGCTTTGCCCCTCGAGGCCGTTCCCTTCCAATCTGCCTGCTTTGACTTCTTCTGCCGCCGGGCCCCCAGACACCTCAAGCTCTCTCTCATGCTCGGCGAGGTCCCAGAATCCATCATTGCCCGCATCGGGTCATCCTTGAAGTGGGCCTCTCATGCCATCTACACCACACTCTCCTCTGCCGCTCGAGTGGCCATTCTGAGATCCTCCCGCAACAGCAGATCCATGCCAGATGACCCCGACACCACTCTGCTACAAGGTGAATTGCTTCAGCACTTTCAAGTACCATTCATGCAATCTGACACTCTCCTGCCTCTCACTGGTGGTTCCTCTGCTCCCATCCTCACACCAGAAGCCTTCTCCACCTCTCTCGCTTTCTCCATGGCCAGCGATGCCCAAGCAGGTCCGGCCCCCAGTCGCGATGATCGCGTTGACCGCCAGCCTCGCCTTCCTGCTGCTCCTCGCGTTGCTGAAGTTGGTCTCAATGCCCCGTCGGTCGACTACCCGTTCCAGTGGGTCGTCGCCTCCTACGACGGATCAGAAGCCAAGAACCTAAGTGATGATCTCTCTGGCTCTGCCACTCTCACCAAAGTCATGGCCAACTACCGACATGCTGAGCTCACATCTGTTGAGCTGGAGGTCTGCCCTCTTGCTGCAGCCTTCTCCAAGCCCATCTCTGTGTCGGCCGTCTGGACCATTGCCTCCATCTCCCCAGCTTCCGCCTCTGAAACCTCCTACTATGGCGGTCGCCTCTTCACTGTCGGTGGTCCAGTCCTCATGTCCAGTACCACTCACCTTCCAGCAGATCTCACCCGCCTCAATCCTGTGCTCAAGGGCCCTGTCAAGTACACCGACTGCCCCAGATTCTCCTACTCCGTCTACTCCAACGGCGGAACTAAGGGCACCAACCTCTGCACCATCATCCTCCGGGGAGTTGTCCGCCTCAGCGGCCCCTCCGGTAATCTCCTCGCTTAGGCGAGCCACTTCAGGTGAAGGAAAACACCTCCTGGTCTCAGCCAGGTAATGATGCTAAACCTCCCCCGCTCAAGCAGCAATGCCTAGGGTTGCCGGTCGATCCAAAGACCGTTTTTCTTTTATTTAAT
108,749
AY884005.1
Citrus sudden death-associated virus
Maccheroni,W., Silva,A.C.R., Alegria,M.C., Greggio,C.C., Piazza,J.P., Kamla,R.F., Zacharias,P.R., Bar-Joseph,M., Kitajima,E.W., Assumpcao,L.C., Camarotte,G., Cardozo,J., Casagrande,E.C., Ferrari,F., Franco,S.F., Giachetto,P.F., Girasol,A., Jordao,H. Jr., Silva,V.H., Souza,L.C., Aguilar-Vildoso,C.I., Zanca,A.S., Arruda,P., Kitajima,J.P., Reinach,F.C., Ferro,J.A., da Silva,A.C.
Alellyx SA
Brazil
2005-02-16
null
Marafivirus citri
Marafivirus
Tymoviridae
ssRNA(+)
6,820
GenBank
1
null
null
null
null
null
null
null
Citrus sudden death-associated virus, complete genome
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109,162
MZ330115.1
Citrus tatter leaf virus
Keremane,M., Singh,K., Ramadugu,C., Skaggs,T.
USDA-ARS, National Clonal Germplasm Repository for Citrus and Dates
USA
2022-08-27
TL 101/CTLV
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
6,364
GenBank
null
USA
USA
Citrus medica
null
null
SAMN18377117
PRJNA715742
Citrus tatter leaf virus isolate TL 101/CTLV, complete genome
TCAATGGCTTTCACTTACAGGAACCCTCTAGAAATTGCAATCAACAAACTTCCCAGCAAGCAATCTGATCAATTACTTGCACTGACCACAGACGAGATTGAAAAGACCCTAGAAGTGACTAATCGCTTCTTTTCTTTTTCAATCACCCCAGAAGATCAAGAATTGTTGACCAAGCATGGGTTAACACTTGCACCCATTGGATTCAAATCACACTCTCACCCTATCTCTAAGATGATAGAAAATCATCTTTTGTACATATGTATTCCAAGCCTTCTGTCTTCCTTTAAGTCAGTTGCTTTTTTTTCACTTAGGGAAAATAAAGTAAATAGTTTTCTTAAAATGCATTCGGTCTTTTCCCATGGAAAAATAAAGTCTCTAGGTATGTACAATGCCATTATTGATGGAAAAGATAAATATAGATACGGAGACGTTGAGTTCTCCTCTTTTAGAGATAGAGTGATTGGTCTTAGAGATCAATGCCTTACACGTAATAAATTTCCAAAAGTTCTTTTCCTTCATGATGAACTACATTTCCTCAACCCCTTTGACATTGCCTTTCTATTTGAAACAATCCCAGAGATCGATAGAGTTGTGGCGACCACTGTGTTTCCGATCGAACTGCTCTTTGGGGATAAAGTTTCAAAGGAGCCCAGAGTTTATTCTTATAAGGTGCATGGTTCATCTTTTTCATTCTACCCTGATGGTGTCGCTTCAGAATGTTATGAACAAAATCTTGCAAACTCAAAATGGCCCTTTACATGTAGTGGCATTCAGTGGGCTAACAGGAAAATAAGGGTCACCAAACTTCAAAGCCTTTTTGCTCACCATGTTTTTTCATTTGACAGGGGGAGGGCCTGTAACGACTTTAATCATTTTGATAAACCAAGCTGTTTACTTGCAGAGGAAATGCGGCTCTTGACAAAGAGATTTGACAAGGCAGTTATAAATAGAAGCACGGTTTCTTCACTCAGCACGTACATGGCATGTCTTAAAACTGCAAATGCAGCTTCAGCAGTGGCCAAGTTAAGGCAGTTGGAGAAGAGGGACCTCTACCCAGACGAGTTGAATTTTGTTTACTCCTTTGGGGAGCATTTTAAAAACTTTGGGATGAGGGATGATTTTGACGTATCAGTTTTGCAGTGGGTCAAAGATAAATTCTGCCAGGTTATGCCTCACTTCATTTCTGCCAGTTTCTTTGAATCCACAGAGTTTCATTTGAATATGCGCAAGTTGTTGAATGATTTGGCCACCAAAGGAATCGAGGTGCCTCTCTCGGTCATTGTTCTGGACAAAGTGAACTTCATAGAGACCAGATTTCATGCCAGAATGTTCGAAATTGCAGATGCCATTGGGGTGAATTTGGACCTACTTGGTAAAAGGTTTGATTTTGAAACTCAGAGTGAGGAGTACTTCTCAGAAAATGGCTACCTTTTCATGCCTTCCAAGGCTAACCCTGATAGGAATTGGATCTTGAATTCTGGCAGCTTAAAAGTTGACTACTCGAAAATTAAGAGGGCAAAAAGATTCAGACTGAAAAAAGATTTCGTTGACTTTATCTCCAAAGGAAAAGAGCCTAAAAGGCAGCTTTTTCTTGAATTCGCCACCAATCAAGGAAATAAACTTGCAGACGTGGAAGGAACCACAAGTTCAATAACGAAGTCTGCAGAAAGTTCTGCAATCAACCAAGAACCTGAAACATTGAGCACTCCGATGATAACTGAGGATGGACAGGGTTTTGAGGGTTCACTTCCAATTGATCTGATAAACTCTTTTGAAGTTGAAGAAGTGAAACTTCCAAACAGAAAGAGGAAGAATGACTGTGTCTTCAAAGCAATTTCAGCACATCTTGGGATCAGTACCCAAGATCTCTTAAACTTCCTAGTCAACGAAGATATATCAGATGAGTTACTTGACTGCATTGAAGAGGATAAAGGCCTTTCACATGAAATGATTGAAGAGGTCCTTGTGACTAAAGGTCTTTCTATGGTCTACACTTCTGATTTCAAAGAAATGGCGGTGCTTAATAGAAAATATGGGGTTAATGGAAAAATGTACTGCACAATTAAGGGTAACCACTGTGAGCTCAGTTCTAAGGAATGTTTCGTCAGGTTATTGAAGGAAGGCGGAGGAGCACAAATGTCAAATGAGAACTTGAATGCTGACTCCTTGTTTGACCTTGGAAAATTTGTACACAACAGAGATCGAGCCACAAAGTTGGCGAAGTCCATGGCTAGAGGTACGACAGGTCTCCTTAATGACTTTGATCCTGCTTTTTGCAAGAGTATTGTTACTCTTTCAGAACTATTCCCTGAAAACTTCAGTTCCGTTGTTGGGCTGAGATTGGGTTTTGCTGGATCAGGGAAGACCCATAAAGTGCTTCAATGGATCAACTATACACCGAGTGTAAAAAGAATGTTTATAAGTCCAAGGAGAATGCTGGCTGATGAAGTTGAAGTGCAACTGAAAGGAACAGCTTGCCAAGTACACACATGGGAGACGGCCCTAAAAAAAATAGATGGGACTTTCATGGAGGTATTTGTTGATGAGGTGGGTTTGTATCCGCCTGGGTATCTCACATTGTTGCAGATGTGTGCATTTAGAAAAATTGTTAAAGGGCAAAGTGAAAAATTATTGAGGGGTAAGCTTGCTGAACTTTCAAAAACTTGCCTGAACATAAGGTGTTTTGGCGATCCATTGCAATTGAGGTATTATTCTGCTGAAGACACAAACCTTTTGGACAAGACACATGAAATAGACTTGATGATCGGGACAATTAAACATAAGTACCTTTTTCAGGGGTATAGATTTGGTCAATGGTTCCAAGAATTGATAAACATGCCAACCAGAATTGACGAGTCAAAGTTTTCAAGAAAATTTTTTGCAGACATTTCAAGTGTAAAAATAGAAGATTATGGACTCATACTTGTAGCCAAAAGAGAAGACAAAGGTGTCTTTGCTGGCAGGATCCCCGTGGCCACAGTGAGCGAATCTCAAGGAATGACCATAAGCAAAAGGGTGCTTATTTGTTTAGATCAAAATATCTTTGCCGGGGGGGCTAACGCAGCCATTGTCGCAATAACAAGGTCGAAAGTTGGATTTGACTTTATTCTGAAAGGGAATTCATTAAAGGAGGTGCAGAGAATGGCTCAAAAAACTATCTGGCAATTCATAATTGAGGGAAGGGCTATTCCAATGGAAAGAATTGTCAACATGAATCCAGGGGCAAGTTTTTATGAGAGTCCTCTAGACGTTGGGAATTCGTCAATCCAGGACAAAGCCTCGCACGACCTGTTCATAATGCCTTTCATAAATTTAGCTGAAGAAGAGGTTGACCCGGAAGAAGTGGTGGGGGATGTAATCCAACCCGTTGAATGGTTCAAATGCCATGTGCCAGTTTTTGATACGGATCCGATGCTCGCAGAAATTTTTGACAAAGTAGCAGCGAAGGAAAAGAGAGAGTTCCAGTCTGTTCTTGGCCTCTCTAATCAATTTCTCGACATGGAGAAAAATGGTTGCAAAATTGACATACTGCCCTTTGCGAGACAAAACGTATTTCCACACCATCAAGCCTCAGATGACGTCACCTTTTGGGCAGGTGTTCAGAAAAGGATAAGGAAGTCAAACTGGAGAAGGGAGAAATCAAAATTTGAAGAATTCAGAGGTCAAGGGGAGGAGCTCCTTTCTGAATTTATCTCAATGCTACCATTTGAGTTTAAAGTTAACATTAAAGATATTGAAGATGGAGAAAAAAGTTTTATAGAAAAAAGGAAGCTTAAATCTGAAAAAATGTGGGCCAACCATTCAGAAAGATCAGATATAGATTGGAAGCTTGACCATGTTTTCCTTTTCATGAAGTCACAATACTGCACAAAAGAAGGAAAAATGTTCACTGAAGCTAAAGCTGGTCAGACGTTGGCCTGCTTCCAACACATAGTTCTATTCAGGTTTGGTCCTATGCTGAGGGCGATTGAGAGTGCTTTCCTGAGAAGTTGTGGGGAATCATATTATATACATTCCGGGAAGAACTTTTTTTGCTTGGATAGCTTTGTGACAAAAAATGCAGACGTGTTTGATGGGTTTTCCATTGAATCTGACTACACAGCTTTTGACTCGTCCCAAGACCACGTGATTCTGGCATTTGAGATGGCGCTGCTTCAGTACTTGGGTGTATCAAAGGAATTCCAGCTAGACTACTTGAGATTGAAGCTAACGCTTGGATGCCGACTCGGGTCACTGGCAATCATGAGATTCACTGGGGAATTTTGCACCTTTTTGTTCAATACATTTGCAAACATGCTCTTTACCCAATTGAAGTACAAAATCGACCCTAGGAAACACAGAATTTTGTTTGCTGGAGATGACATGTGTTCTTTGAGCTCTCTCAAAAGGAGGAGAGGGGAAAAAGCCACAAGACTGATGAAGAGCTTTTCCTTAACTGCCGTTGAGGAAGTTAGAAAATTCCCCATGTTCTGTGGATGGTACTTAAGCCCCTATGGAATCATCAAATCTCCAAAACTATTGTGGGCAAGAATTAAGATGATGAGTGAGAGACAGCTCCTAAAGGAATGTGTTGACAACTACCTGTTTGAGGCAATCTTTGCCTACAGATTAGGTGAGAGGCTCTATACAATCTTGAAAGAAGAGGACTTCGAATATCATTATCTTGTCATCAGATTTTTTGTTAAGAACTCAAAGTTACTCACTGGTCTTAGCAAAAGCCTAATTTTTGAAATTGGTGAAGGAATTGGATCCGAATGGCCATCGTCAACGTCAATCACTTCCTCAAAGAGGTCGAATCAACTGACCTCAAGATCGATGCAATCTCTTCCTCTGAGCTTTACAAAGATGCAACTTTTTTCAAGCCAGATGTACTCAACTGTATCAAGAGATTTGAGTCGAATGTCAAAGTTTCATCAAGGTCTGGAGACGGCCTGGTGCTGTCTGACTTTAAACTCCTTGATGATACCGAAATTGATTCAATTAGGAAAAAAAGTAATAAGTACAAGTACTTGCACTACGGAGTTATCTTGGTTGGAATCAAAGCCATGCTACCAAATTTCAGGGGGATGGAAGGGAGAGTTATCATATATGATGGAGCCTGTTTGGACCCAGAAAGGGGTCACATCTGCTCCTACCTGTTCAAATTCGAGTCTGATTGCTGCTACTTTGGACTTAGACCTGAACATTGTCTTTCAACAACAGACGCCAATCTGGCAAAGAGGTTCAGGTTTCGAGTGGATTTTGACTGTCCACAATATGAGCAAGACACAGAACTGTTCGCCTTGGATATTGGAGTTGCTTACAGATGTGTTAATTCAGCAAGATTTCTTGAAACCAAAACTGGTGATTCAGGGTGGGCCTCACAGGCAATCAGTGGATGTGAGGCACTTAAGTTCAATGAAGAAATCAAAAGGGCCATCCTGGATCACAAATCTCCACTGTTTCTGGAGGAAGGTGCACCAAATGTGCACATTAAAAGAAAACTGTTTAGAGGTGACAAGGTTAGGCGGTCACGCTCTATTACAGCAAAAAGGGGGCCAAACTCAAAGCCACAGGAAAAGAGAGGATTTAGGTCCCTCTCGGCGAGAATTGAAAGATTTGGAGAAAATGAGTTTGGAAGACGTGCTTCAACAAGCGAGGCGCCACCGGGTAGGAGTATATCTTTGGAAGACTCACATAGACCCGAAAAAGGAAATTCTGACGGTTCCTCCCCCTGAAGGATTTAAAGAAGGTGAAAGCTTTGAAAGCAGAGAGCTTTACCTTCTTCTCTGCAATCACTATTGTAAATATTTATTTGGCAATATTGCTGTTTTCGGGTCATCTGATAAGACCCAGTTTCCCGCTGTTGGATTTGATACCCCTCCGGTTCATTACAATTTGACAACGATCCCGAGAGAAGAGGAGACTGAAGAGAAAAAGAAGGCCAGAGAGGGATCGTCTGGCGAAAAAACAAAAATTTGGAGAATCGACTTGTCAAATGTTGTACCTGAATTGAAGACCTTTGCTGCAACTTCTAAGCAGAACTCTTTGAACGAATGTACGTTCAGAAAGCTTTGTGAGCCATTTGCTGATCTAGCACGTGAGTTTCTACATGAAAGGTGGTCCAAAGGACTGGCCACCAATATTTACAAGAAATGGCCCAAAGCTTTTGAAAAAAGTCCATGGGTGGCATTCGACTTTGCCACTGGTCTGAAAATGAATCGCTTGACACCTGATGAAAAACAGGTGATTGATAGAATGACCAAGAGACTTTTTCGTACTGAAGGACAAAAAGGGGTTTTCGAGGCAGGTTCGGAGAGTAACCTGGAACTGGAGGGTTAGGAGTCGTGTGAAATTCCGCAAACTTGGTCGCGGTCTTGCAGGT
26,600
MN495981.1
Citrus tatter leaf virus
Zhang,J., Zou,C., Huang,J., Zhang,M.
Guangxi University, Agricultural College
China
2020-05-31
GXZG-3
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
6,497
GenBank
null
China
China
Citrus
null
2019
null
null
Citrus tatter leaf virus, complete genome
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50,023
MH144341.1
Citrus tatter leaf virus
Li,P., Li,Z., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2018-11-01
HJY
Apple stem grooving virus
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Betaflexiviridae
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GenBank
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China
China
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null
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China
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Citrus tatter leaf virus isolate ASGV-1-HJY, complete genome
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67,562
MH144343.1
Citrus tatter leaf virus
Li,P., Li,Z., Cao,M.
Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, National Center for Citrus Virus Exclusion
China
2018-11-01
ASGV-2-HJY
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
6,496
GenBank
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China
China
Citrus maxima
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2016-04-15
null
null
Citrus tatter leaf virus isolate ASGV-2-HJY, complete genome
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67,563
MH108975.1
Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2018-10-28
TL100
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
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USA
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Citrus tatter leaf virus isolate TL100, complete genome
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67,710
MH108976.1
Citrus tatter leaf virus
Tan,S.-H., Osmen,F., Bodaghi,S., Dang,T., Greer,G., Abu-Hajar,S., Hammado,S., Vidalakis,G.
University of California Riverside, Department of Microbiology and Plant Pathology
USA
2018-10-28
TL101
Apple stem grooving virus
Capillovirus
Betaflexiviridae
ssRNA(+)
6,494
GenBank
null
USA: California
USA
Citrus
null
1969
null
null
Citrus tatter leaf virus isolate TL101, complete genome
AATTTAACAGCGCTTAATTTCCGCGCATTACGTCAATGGCTTTCACTTACAGAAACCCCCTCGAAATTGCCATCAACAAACTTCCAAGCAAACAATCAGATCAATTGCTTGCTTTAACCACAGACGAGATTGAAAAGACCTTAGAAGTGACTAACCGCTTCTTTTCTTTTTCAATCACCCCAGAGGATCAAGAATTGTTAACCAAACATGGTTTGACACTTGCACCTATTGGATTCAAGTCACATTCCCATCCAATATCCAAAATGGTAGAAAATCACCTTTTGTACATTTGTGTGCCTAGTCTTTTGTCTTCTTTTAAGTCAGTAGCCTTTTTTTCCCTTAGAGAAAGCAAAGTTAATAGCTTCTTGAAAATGCATTCAGTCTTTTCACACGGAAAAATCAAATCTCTAGGTATGTACAATGCCATTATTGATGGAAAAGACAAATATAGATATGGTGATGTCCCCTTCGACTCATTCAGAGATAGAGTGATTGGTCTCAGAGACCAATGCCTTGAACGTAATAAGTTTCCAAAAGTCCTTTTTCTCCACGATGAATTGCACTTCCTTAGCCCCTTTGATGTCGCCTTCTTATTTGAAACGATTCCGGAAATTGATAGGGTTGTTGCGACAACTGTGTTCCCAATTGAACTGCTTTTTGGGGATAAGGTTTCAAAAGAGCCTAGAGTTTATACTTATAAGGTCCATGGCTCTTCTTTCTCTTTTTACCCTGATGGTGTGGCTTCTGAGTGTTATGAACAAAACATTGCAAATTCTAAGTGGCCTTTTACCTGCAGTGGCATTCAATGGGCTAACAGAAAGATAAGGGTTACCAAACTGCAGAGTCTCTTTGCTCACCACGTCTTCTCATTTGATAGAGGGAGGGCCTGCAATGAATTCAATCACTTCGACAAACCAAGCTGTTTGCTTTCTGAAGAAATGCGCCTTTTGACCAAAAGGTTTGACGAAGCAGTGATCAACAGAAGCACGGTTTCTAGTCTTAGCACTTATATGGCTTGTCTTAAGACTGCAAATGCAGCTTCAGCAGTTGCAAAGTTGAGGCAACTAGAGAAAAGGGATCTTTACCCAGATGAGTTAAACTTTGTTTATTCCTTTGGGGAACACTTCAAAAATTTTGGGATGAGGGATGATTTTGACATTTCAGTTTTGCAGTGGGTGAAGGACAAATTTTGTCAAGTCATGCCCCATTTTATCTCCGCCAGTTTTTTTGAACCTACAGAGTTCCACTTAAATATGAGGAAATTATTGAACGATCTAGCAACTAAAGGGATTGAAGTTCCTCTTTCAGTTATCATTTTGGACAAGGTGAATTTCATTGAAACTAGGTTTCACTCCAGAATGTTTGATATTGCCCAGGCTATTGGAGTCAATTTAAGCCACCTTGGACGAAGATTTGACTATGAAACTGAAAGTGAGGAATACTTCTCTGAAGGTGGTTACCTTTTTATTCCCTCAAAGGTCAACCCAGATAGAAACTGGATTCTAAATTCAGACCCACTGAAAGTTGACTATTTTAAATTGAGAAGGGCCAGGAGGTTTAGACTGAAAAGAGATTTCCTCGACCTCATATCTAAAGGGATGGCCCCTAAAAAACAGCTCTTTTTAGAGTTACCCTGCAACTTCGAGTTAAAATCTGAAATCATTAAAGCAAGTTTGACTCAGGGAATGGAGAACAAAGAGGGCAAAGCAGAAGAGGAAACGCCTAGAGTCGCATGTACCCCCATGTCCACTGAAGACGGGCAAGGTTTCGAAGGTTCAATTCCAATCGACTTGATAAATTCCTTTGAACCTGAGAAGATCGAGCTTCCAAGAAGGAAAAGGAAAAATGACTGTGTTTTCAAAGCCATAGCCGCTCATTTGGGGATAGAGTCTCAAGATCTTCTAAACTTTTTGGTCAACGAAGACATATCAGATGAACTGCTAGAATGTATTGAGGAGGATAAAGGTCTGTCACATGAGATGATTGAGGAAGTGCTCATAACCAAAGGTCTTTCAATGGTTTACACTTCTGATTTCAAAGAGATGGCGGTCCTCAATAGGAAGTATGGAGTTAACGGGAAAATGTACTGTACAATAAAAGGTAATCACTGTGAGTTAAGCTCAAAGGAGTGCTTTGTAAGACTGCTAAAGGAGGGTGGTGAGGCTCAAATGTCTAATGAGAATTTGAATGCTGATTCTATGTTTGACCTCGGAAAATTTGTGCACAGCAGGGAACGAGCAGTCAAGCTAGCCAAATCTATGGCTAGGGGGACGACTGGTCTTTTAAATGATTTTGACCCTGGCTTTTGCAAGAGCATGGTAACCCTTTCTGAGTTGTTCCCGGAAAATTTTTCCTCTACCGTTGGCTTAAGGCTGGGTTTTGCTGGTTCTGGAAAAACCCACAAGGTTCTTCAGTGGATTAACTACACTCCAAGCGTGAAGAGAATGTTCATTAGTCCAAGGAGGATGTTGGCTGATGAAGTTGAGGGTCAACTCAAGGGGACATCTTGCCAAGTTCATACTTGGGAGACCGCCCTAAAGAAAATAGATGGGACATTTATGGAAGTCTTTGTTGATGAAATAGGTCTATATCCACCTGGGTATCTCACATTGTTGCAAATGTGTGCCTTTAGGAGAATCGTGAAAGGACAAAGTGAAAGAATTCTGAGAGAGAAACTTGCCGAGCTATCAAAGAGTTGTTTAAACATAAGATGCTTTGGCGACCCACTGCAACTACGATATTACTCCGCTGAAGATGCAAATCTCTTGGACAAAACCCACGAGATTGATTTAATGGTGAGGACAATTAAACACAAGTACCTTTTGCAGGGGTATAGATTTGGCCAGTGGTTTCAAGAACTATTGAGCATGCCCACCAGGATGGACGAATCAAAATTCTCAAGAAGATTTTTTGCTGACATTTCTAGTGTAAAGATTGAGGAGTATGGGCTCATTCTAGTAGCAAAGAGAGAAGATAAAGGAGTTTTCGCCGGAAGGGTGCCAGTGGCCACAGTCAGTGAGTCCCAGGGAATGACAATCAATAAAAGGGTGTTAATATGTTTGGACCAAAATCTTTTTGCTGGGGGGGCCAATGCAGCAATTGTTGCAATAACAAGGTCCAAGACTGGATTTGACTTCATTCTCAAAGGGAATTCACTAAAAGAAGTGCAAAGAATGGCACAAAAAACGATATGGCAATTTATAATCGAGGGTAAAAGCATCCCAATGGAGAGGATAGTGAACATGAATCCCGGAGCAAGTTTCTATGAAAGCCCTTTAGATGTTGGGAATTCATCAATTCAGGACAAGGCTTCACATGACCTGTTCATAATGCCCTTTATTAATCTGGCTGAGGAGGAAGTTGATCCAGAAGAAATCACTGGAGACGTTGTCGAACCTGCCGAGTGGTTTAAATGCCATATACCAGTTTTTGACACGGACCCAATGCTTGCTGAAATCTTTGACAAGGTGGCTGCAAAAGAGAAGCGTGAGTTTCAGTCAATACTTGGTTTTTCCAATCAATTCCTTGACATGGAAAAAAACGGGTGCAAAATAGATATATTGCCTTTTGCAAGGCAAAATGTTTTTCCACACCACCAGGCTTCAGATGATGTCACTTTTTGGGCAGGTGTTCAAAAAAGAATAAGAAAATCTAACTGGAGAAGAGAAAAGTCAAAGTTTGAAGAATTTGAAAGTCAAGGGAAAGAGCTTCTTTCAGAGTTCTTGTCAATGCTGCCATTTGAATTCAAGGTAAACATCAAGGACATTGAAAGCGGAGAAAAAAGCTTTCTGGAGAAAAGGAAGTTGAAGTCCGAGAAAATGTGGGCCAACCATGCAGAAAGGTCTGACATAGATTGGAAGCTTGATCACGTCTTTCTCTTTATGAAATCACAGTACTGCACAAAGGAAGGGAAAATGTTCACTGAAGCAAAAGCTGGCCAAACCTTAGCATGTTTCCAACACATTGTTCTATTTAGGTTTGGCCCTATGCTAAGGGCGATTGAAAGTGCTTTTTTGAGGAGCTGTGGAGATTCATATTATATACATTCTGGAAAGAATTTCTTTTGCCTGGACAGCTTTGTCACAAAAAATGCAGGAGTGTTTGACGGATTCTCCATTGAATCTGACTACACAGCGTTTGATTCATCTCAAGACCATGTCATTCTTGCATTTGAAATGGCATTGCTACAATATCTCGGCGTTTCAAAGGAGTTTCAACTAGACTACTTGAGATTGAAATTGACTCTTGGGTGCAGGCTTGGGTCATTAGCCATAATGAGGTTCACCGGAGAATTCTGTACCTTTTTATTCAACACATTTGCCAACATGCTCTTTACCCAGCTAAAGTACAAAATTGATCCGAGAAGGCATAGAATTTTATTTGCTGGAGACGACATGTGTTCTCTGAGTTCTCTAAGGAGAAGAAGGGGAGAGAAAGCAACAAGGCTCTTGAAAAGCTTTTCCCTCACGGCTGTAGAAGAGGTCAGGAAGTTCCCAATGTTCTGTGGGTGGTATTTGAGCCCATATGGAATAATCAAGTCCCCAAAACTATTATGGGCTAGGATTAAAATGATGAGTGAAAGACAACTTTTAAAAGAGTGTGTAGACAACTACTTGTTTGAAGCAATATTCGCCTACAGATTAGGTGAGAGGCTGTACACAATCTTGAAAGAAGAAGATTTTGAGTATCACTACCTTGTCATTAGGTTTTTTGTCAAAAACTCAAAGCTGTTAACGGGGCTCAGTAAAAGCCTGATTTTTGAGATTGGAGAAGGAATAGGGTCGGAATGGCAATCGTCAATGTCAACCACTTCCTCAAAGAGGTTGAGTCAACAGACCTTAAAATTGATGCGATCTCCTCCTCTGAGTTGTACAAAGATGCAACCTTTTTTAAGCCAGATGTACTCAACTGCATCAAAAGGTTTGAATCAAACGTTAAGGTGTCATCCCGGTCTGGCGATGGATTGGTGCTTTCAGATTTCAAACTCCTTGATGACACTGAAATCGACTCCATTAGGAAAAAGAGTAACAAATACAAGTACCTACACTATGGAGTCATCTTGGTTGGAATCAAAGCAATGCTGCCAAACTTTAGGGGAATGGAGGGGAGAGTTATCGTGTATGACGGAGCTTGCCTGGACCCAGAGAGAGGTCACATCTGTTCGTATTTGTTCAAATTTGAGTCCGACTGTTGTTATTTTGGACTTAGACCTGAACACTGTCTTTCCACAACTGACGCTAATCTGGCAAAAAGATTCAGGTTTAGAGTGGATTTCGACTGCCCACAGTATGAACAGGACACAGAACTGTTTGCTCTTGATATTGGGGTTGCTTACAGATGTGTTAATTCTGCTAGATTCCTTGAAACAAAAACTGGTGATTCAGGGTGGGCTTCGCAAGCTATCAGCGGTTGTGAAGCACTCAAATTCAATGAAGAGATCAAAATGGCCATCTTGGATCACAAATCCCCACTGTTTCTGGAGGAGGGTGCACCAAATGTGCACATTGAAAAAAGACTATTTAGAGGTGACAAAGTTAGAAGGTCACGTTCTATTTCTGCAAAAAGGGGGCCAAACTCAAAACTACAGGAAAAGAGAGGATTTAGGTCCCTCTCAGCAAGAATTGAAAGATTCGGAAAGGATGAGTTTGGAAGACGTGCTTCAACAAGCGAGGCGCCACCGGGTAGGAGTATATCTGTGGAAGACCCATATAGACCCGGGAAAGGAAATTCTGACGGTTCCTCCCCCTGAAGGGTTCAAGGAAGGTGAAAGCTTTGAAGGCAGAGAGCTTTACCTTCTTCTCTGCAATCACTACTGTAAATATTTATTTGGAAATATAGCTGTTTTTGGGTCATCTGATAAGACCCAGTTTCCCGCTGTCGGATTTGATACCCCTCCGGTTCATTACAATTTGACATCGTCCCCAAAAGAAAAGGAAACTGAAGAGCAAAAGAAGGCCAGGGAAGGGACGTCTGGTGAAAAAACTAAAATTTGGAGAATTGACTTGTCAAATATAGTACCTGAATTGAAAACCTTTGCTGCTACTTCTAAGCAAAATTCTTTGAACGAATGTACGTTCAGAAAGCTTTGCGAGCCTTTTGCTGATTTGGCTCGTGAATTTCTTCATGAAAGGTGGTCTAAAGGATTGGCCACAAATATTTATAAGAAATGGCCCAAAGCTTTCGAAAAGAGCCCTTGGGTGGCGTTTGATTTTGCCACCGGTCTTAAAATGAATCGTCTAACACCTGATGAAAAACAGGTGATTGATAGAATGACAAAGAGGCTTTTTCGTACTGAAGGACAAAAAGGGGTTTTCGAGGCAGGTTCGGAGAGTAACCTGGAACTGGAGGGTTAGAAGTCGTGTGAAATTCCGCAAAATTGGTCGCGGTCTTGCAGGTTGACATGCCTGCCTTTATACTTAAATAAAGGGTTCACCCTGTTTTCTGAGCATTTCAGGGTTTATGTGGTTTTTCTAGTACCTGGAGTTTATCCATTT
67,711