id
stringlengths 1
4
| tokens
sequence | ner_tags
sequence |
---|---|---|
900 | [
"Accordingly",
",",
"the",
"WT",
"and",
"complemented",
"mutant",
"strains",
"showed",
"no",
"significant",
"decrease",
"in",
"CFU",
"following",
"LL",
"-",
"37",
"exposure",
",",
"whereas",
"the",
"number",
"of",
"graRS",
"mutant",
"bacteria",
"recovered",
"was",
"only",
"25",
"%",
"of",
"the",
"original",
"inoculum",
"(",
"Fig",
".",
"2A",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
901 | [
"Next",
"we",
"investigated",
"whether",
"the",
"graRS",
"mutant",
"is",
"killed",
"faster",
"than",
"the",
"parental",
"strain",
"by",
"human",
"neutrophils",
",",
"which",
"produce",
"high",
"amounts",
"of",
"LL",
"-",
"37",
"and",
"other",
"CAMPs",
"as",
"components",
"of",
"their",
"antibacterial",
"killing",
"arsenal",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
902 | [
"The",
"graRS",
"mutant",
"was",
"killed",
"by",
"neutrophils",
"considerably",
"faster",
"than",
"the",
"WT",
"strain",
"."
] | [
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
903 | [
"After",
"15",
"and",
"30",
"min",
",",
"the",
"recovered",
"CFU",
"of",
"the",
"graRS",
"mutant",
"were",
"significantly",
"lower",
"than",
"those",
"of",
"the",
"WT",
"(",
"Fig",
"2B",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
904 | [
"Of",
"note",
",",
"our",
"previous",
"studies",
"had",
"shown",
"that",
"altered",
"alanylation",
"of",
"teichoic",
"acids",
"does",
"not",
"affect",
"the",
"rate",
"of",
"PMN",
"phagocytosis",
"[",
"9",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
905 | [
"Taken",
"together",
",",
"these",
"data",
"indicate",
"that",
"graRS",
"-",
"mediated",
"control",
"of",
"CAMP",
"resistance",
"mechanisms",
"is",
"of",
"importance",
"for",
"S",
".",
"aureus",
"evasion",
"from",
"neutrophil",
"killing",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
906 | [
"Deletion",
"of",
"graRS",
"leads",
"to",
"attenuated",
"virulence",
"in",
"a",
"mouse",
"infection",
"model"
] | [
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
907 | [
"To",
"investigate",
"the",
"impact",
"of",
"reduced",
"resistance",
"of",
"the",
"graRS",
"mutant",
"to",
"neutrophil",
"and",
"CAMP",
"-",
"mediated",
"killing",
"on",
"the",
"ability",
"of",
"the",
"bacteria",
"to",
"cause",
"infections",
"in",
"vivo",
",",
"we",
"compared",
"the",
"virulence",
"of",
"WT",
"and",
"mutant",
"bacteria",
"in",
"a",
"mouse",
"challenge",
"model",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O"
] |
908 | [
"Therefore",
"female",
"BALB",
"/",
"c",
"mice",
"(",
"12",
"to",
"15",
"weeks",
"old",
")",
"were",
"infected",
"with",
"S",
".",
"aureus",
"WT",
"or",
"graRS",
"mutant",
"bacteria",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O"
] |
909 | [
"72",
"h",
"after",
"infection",
"numbers",
"of",
"CFU",
"/",
"kidney",
"were",
"determined",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
910 | [
"Significantly",
"less",
"bacteria",
"were",
"detected",
"in",
"the",
"kidneys",
"of",
"animals",
",",
"which",
"had",
"been",
"infected",
"with",
"the",
"graRS",
"mutant",
"than",
"those",
"infected",
"with",
"the",
"WT",
"bacteria",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
911 | [
"(",
"Fig",
".",
"3",
")",
"This",
"finding",
"is",
"in",
"coincidence",
"with",
"the",
"increased",
"susceptibility",
"to",
"clearance",
"by",
"CAMPs",
"and",
"neutrophils",
",",
"corroborating",
"the",
"central",
"importance",
"of",
"these",
"host",
"factors",
"in",
"innate",
"defense",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
912 | [
"Incompetence",
"of",
"Neutrophils",
"to",
"Invasive",
"Group",
"A",
"streptococcus",
"Is",
"Attributed",
"to",
"Induction",
"of",
"Plural",
"Virulence",
"Factors",
"by",
"Dysfunction",
"of",
"a",
"Regulator"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
913 | [
"Group",
"A",
"streptococcus",
"(",
"GAS",
")",
"causes",
"variety",
"of",
"diseases",
"ranging",
"from",
"common",
"pharyngitis",
"to",
"life",
"-",
"threatening",
"severe",
"invasive",
"diseases",
",",
"including",
"necrotizing",
"fasciitis",
"and",
"streptococcal",
"toxic",
"shock",
"-",
"like",
"syndrome",
"."
] | [
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
914 | [
"The",
"characteristic",
"of",
"invasive",
"GAS",
"infections",
"has",
"been",
"thought",
"to",
"attribute",
"to",
"genetic",
"changes",
"in",
"bacteria",
",",
"however",
",",
"no",
"clear",
"evidence",
"has",
"shown",
"due",
"to",
"lack",
"of",
"an",
"intriguingly",
"study",
"using",
"serotype",
"-",
"matched",
"isolates",
"from",
"clinical",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"infections",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
915 | [
"In",
"addition",
",",
"rare",
"outbreaks",
"of",
"invasive",
"infections",
"and",
"their",
"distinctive",
"pathology",
"in",
"which",
"infectious",
"foci",
"without",
"neutrophil",
"infiltration",
"hypothesized",
"us",
"invasive",
"GAS",
"could",
"evade",
"host",
"defense",
",",
"especially",
"neutrophil",
"functions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
916 | [
"Herein",
"we",
"report",
"that",
"a",
"panel",
"of",
"serotype",
"-",
"matched",
"GAS",
",",
"which",
"were",
"clinically",
"isolated",
"from",
"severe",
"invasive",
"but",
"not",
"from",
"non",
"-",
"invaive",
"infections",
",",
"could",
"abrogate",
"functions",
"of",
"human",
"polymorphnuclear",
"neutrophils",
"(",
"PMN",
")",
"in",
"at",
"least",
"two",
"independent",
"ways",
";",
"due",
"to",
"inducing",
"necrosis",
"to",
"PMN",
"by",
"enhanced",
"production",
"of",
"a",
"pore",
"-",
"forming",
"toxin",
"streptolysin",
"O",
"(",
"SLO",
")",
"and",
"due",
"to",
"impairment",
"of",
"PMN",
"migration",
"via",
"digesting",
"interleukin",
"-",
"8",
",",
"a",
"PMN",
"attracting",
"chemokine",
",",
"by",
"increased",
"production",
"of",
"a",
"serine",
"protease",
"ScpC",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O"
] |
917 | [
"Expression",
"of",
"genes",
"was",
"upregulated",
"by",
"a",
"loss",
"of",
"repressive",
"function",
"with",
"the",
"mutation",
"of",
"csrS",
"gene",
"in",
"the",
"all",
"emm49",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"isolates",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
918 | [
"The",
"csrS",
"mutants",
"from",
"clinical",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"isolates",
"exhibited",
"high",
"mortality",
"and",
"disseminated",
"infection",
"with",
"paucity",
"of",
"neutrophils",
",",
"a",
"characteristic",
"pathology",
"seen",
"in",
"human",
"invasive",
"GAS",
"infection",
",",
"in",
"a",
"mouse",
"model",
"."
] | [
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
919 | [
"However",
",",
"GAS",
"which",
"lack",
"either",
"SLO",
"or",
"ScpC",
"exhibit",
"much",
"less",
"mortality",
"than",
"the",
"csrS",
"-",
"mutated",
"parent",
"invasive",
"GAS",
"isolate",
"to",
"the",
"infected",
"mice",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O"
] |
920 | [
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"the",
"abilities",
"of",
"GAS",
"to",
"abrogate",
"PMN",
"functions",
"can",
"determine",
"the",
"onset",
"and",
"severity",
"of",
"invasive",
"GAS",
"infection",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
921 | [
"Introduction"
] | [
"O"
] |
922 | [
"Streptococcus",
"pyogenes",
"(",
"group",
"A",
"streptococcus",
";",
"GAS",
")",
"is",
"one",
"of",
"the",
"most",
"common",
"human",
"pathogens",
"."
] | [
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
923 | [
"It",
"causes",
"a",
"wide",
"variety",
"of",
"infections",
"ranging",
"from",
"uncomplicated",
"pharyngitis",
"and",
"skin",
"infections",
"to",
"severe",
"and",
"even",
"life",
"-",
"threatening",
"manifestations",
",",
"such",
"as",
"necrotizing",
"fasciitis",
"(",
"NF",
")",
"and",
"streptococcal",
"toxic",
"shock",
"-",
"like",
"syndrome",
"(",
"STSS",
")",
"[",
"1",
"]",
",",
"[",
"2",
"]",
",",
"with",
"high",
"mortality",
"rates",
"ranging",
"from",
"20",
"%",
"to",
"60",
"%",
"[",
"3",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
924 | [
"Several",
"streptococcal",
"virulence",
"factors",
",",
"including",
"streptolysin",
",",
"and",
"M",
"protein",
",",
"have",
"been",
"reported",
"to",
"be",
"involved",
"in",
"these",
"diseases",
",",
"by",
"genetic",
"studies",
"or",
"animal",
"-",
"passaged",
"models",
"[",
"1",
"]",
",",
"[",
"2",
"]",
",",
"[",
"4",
"]",
"-",
"[",
"6",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
925 | [
"However",
",",
"which",
"of",
"factors",
"are",
"involved",
"in",
"pathogenesis",
"mediated",
"by",
"clinically",
"isolated",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"remains",
"obscure",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O"
] |
926 | [
"The",
"strains",
"of",
"emm1",
"genotype",
",",
"among",
"more",
"than",
"100",
"emm",
"genes",
"encoding",
"the",
"serotype",
"-",
"determinant",
"M",
"protein",
",",
"are",
"the",
"predominant",
"cause",
"of",
"severe",
"GAS",
"infections",
"in",
"Japan",
"[",
"7",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
927 | [
"Recently",
",",
"GAS",
"with",
"diverse",
"emm",
"genotypes",
",",
"especially",
",",
"emm49",
"-",
"genotype",
",",
"have",
"been",
"isolated",
"from",
"patients",
"of",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"infections",
"since",
"2000",
";",
"however",
",",
"these",
"genotypes",
"were",
"not",
"isolated",
"before",
"1999",
"in",
"Japan",
"[",
"8",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
928 | [
"Therefore",
",",
"emm49",
"GAS",
"isolated",
"from",
"invasive",
"infections",
"seems",
"to",
"acquire",
"the",
"novel",
"or",
"altered",
"virulence",
"factors",
"by",
"mutations",
",",
"genomic",
"additions",
",",
"or",
"deletions",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
929 | [
"Epidemiological",
"and",
"pathological",
"findings",
",",
"including",
"sporadic",
"incidents",
"of",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"infections",
"[",
"9",
"]",
",",
"high",
"frequency",
"of",
"severe",
"invasive",
"infections",
"in",
"immunocompromised",
"host",
"[",
"9",
"]",
",",
"and",
"aggregation",
"of",
"bacteria",
"and",
"a",
"paucity",
"of",
"polymorphnuclear",
"neutrophils",
"(",
"PMN",
")",
"in",
"foci",
"of",
"invasive",
"GAS",
"infection",
"[",
"10",
"]",
"suggest",
"that",
"host",
"defense",
"factors",
"play",
"an",
"important",
"role",
"in",
"the",
"onset",
"of",
"invasive",
"infections",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
930 | [
"These",
"findings",
"led",
"us",
"to",
"postulate",
"that",
"invasive",
"GAS",
"infections",
"hampered",
"host",
"innate",
"immune",
"defense",
",",
"especially",
"on",
"PMN",
",",
"providing",
"the",
"front",
"-",
"line",
"defense",
"against",
"GAS",
"infection",
"by",
"quick",
"recruitment",
"to",
"infection",
"site",
"and",
"clearance",
"of",
"bacteria",
"following",
"phagocytosis",
"[",
"11",
"]",
",",
"[",
"12",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
931 | [
"So",
"far",
",",
"using",
"animal",
"-",
"passaged",
"GAS",
"mutants",
",",
"gene",
"-",
"manipulated",
"GAS",
",",
"many",
"virulence",
"-",
"associated",
"molecules",
"are",
"pointed",
"out",
"to",
"play",
"some",
"roles",
"in",
"the",
"bacterial",
"evasion",
"from",
"phagocytic",
"ingestion",
"by",
"neutrophils",
"[",
"13",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
932 | [
"However",
",",
"restricted",
"availability",
"of",
"clinical",
"isolates",
"with",
"the",
"same",
"serotypes",
"fail",
"to",
"elucidate",
"direct",
"relationship",
"between",
"definitive",
"genetic",
"changes",
"in",
"clinically",
"isolated",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"and",
"the",
"lack",
"of",
"PMN",
"at",
"the",
"site",
"of",
"bacterial",
"growth",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
933 | [
"In",
"the",
"present",
"study",
",",
"we",
"aimed",
"to",
"explore",
"the",
"crucial",
"factors",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"infections",
"in",
"the",
"context",
"of",
"PMN",
"-",
"GAS",
"relationship",
",",
"using",
"a",
"panel",
"of",
"emm49",
"clinical",
"isolates",
"from",
"patients",
"with",
"or",
"without",
"severe",
"invasive",
"infection",
",",
"and",
"their",
"gene",
"-",
"manipulated",
"mutants",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
934 | [
"We",
"now",
"show",
"a",
"direct",
"and",
"previously",
"unrecognized",
"link",
"between",
"functional",
"loss",
"of",
"a",
"factor",
"CsrS",
"of",
"two",
"-",
"component",
"sensor",
"/",
"regulator",
"system",
"(",
"CsrS",
"/",
"CsrR",
":",
"also",
"known",
"as",
"CovS",
"/",
"CovR",
")",
"and",
"escape",
"from",
"killing",
"by",
"PMN",
"via",
"inducing",
"necrosis",
"to",
"them",
"and",
"digesting",
"IL",
"-",
"8",
",",
"a",
"PMN",
"-",
"attracting",
"chemokine",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
935 | [
"We",
"further",
"determined",
"CsrS",
"mutations",
"in",
"the",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"was",
"essential",
"to",
"control",
"the",
"expression",
"of",
"various",
"virulence",
"genes",
"and",
"contributed",
"to",
"the",
"in",
"vivo",
"virulence",
"and",
"disease",
"-",
"specific",
"pathophysiology",
"in",
"a",
"mouse",
"model",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
936 | [
"These",
"data",
"may",
"participate",
"in",
"prediction",
"of",
"GAS",
"potential",
"for",
"future",
"invasive",
"infection",
"as",
"well",
"as",
"risk",
"assessment",
"of",
"patients",
"by",
"measuring",
"PMN",
"function",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
937 | [
"Results"
] | [
"O"
] |
938 | [
"Group",
"A",
"streptococcus",
"isolates",
"from",
"severe",
"invasive",
"infections",
"is",
"resistant",
"to",
"killing",
"by",
"human",
"PMN",
"To",
"examine",
"whether",
"emm49",
"GAS",
"isolated",
"from",
"severe",
"invasive",
"infection",
"might",
"alter",
"human",
"PMN",
"function",
",",
"we",
"performed",
"phagocytosis",
"assay",
"in",
"vitro",
"."
] | [
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
939 | [
"As",
"non",
"-",
"opsonized",
"GAS",
"was",
"resistant",
"to",
"the",
"phagocytosis",
"by",
"PMN",
"[",
"14",
"]",
",",
"we",
"opsonized",
"GAS",
"with",
"human",
"plasma",
"in",
"advance",
"to",
"the",
"assay",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
940 | [
"As",
"shown",
"in",
"Figure",
"1A",
",",
"there",
"was",
"no",
"significant",
"difference",
"between",
"GAS",
"that",
"were",
"isolated",
"from",
"non",
"-",
"invasive",
"and",
"severe",
"invasive",
"infections",
"in",
"phagocytosis",
"by",
"PMN",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"5556",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
941 | [
"However",
",",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"1B",
",",
"in",
"vitro",
"killing",
"assay",
"revealed",
"that",
"PMN",
"killed",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
",",
"resulting",
"in",
"15",
"-",
"42",
"%",
"of",
"initial",
"number",
"of",
"bacteria",
",",
"but",
"not",
"invasive",
"GAS",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"019",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
942 | [
"The",
"similar",
"results",
"were",
"obtained",
"when",
"opsonized",
"with",
"either",
"FCS",
"or",
"human",
"serum",
"regardless",
"of",
"complements",
"immobilization",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
943 | [
"These",
"results",
"were",
"common",
"among",
"all",
"PMN",
"donors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
944 | [
"These",
"data",
"indicated",
"that",
"clinically",
"isolated",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"were",
"phagocytosed",
",",
"but",
"escaped",
"from",
"killing",
"by",
"human",
"PMN",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
945 | [
"Severe",
"invasive",
"GAS",
"rapidly",
"induce",
"necrosis",
"to",
"human",
"PMN"
] | [
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O"
] |
946 | [
"In",
"an",
"acute",
"bacterial",
"infection",
",",
"PMN",
"were",
"quickly",
"recruited",
"at",
"the",
"site",
"of",
"infectious",
"foci",
"according",
"to",
"the",
"gradient",
"of",
"chemoattractants",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
947 | [
"Therefore",
",",
"we",
"examined",
"whether",
"GAS",
"clinically",
"isolated",
"from",
"severe",
"invasive",
"infections",
"could",
"affect",
"the",
"migration",
"ability",
"of",
"PMN",
"in",
"response",
"to",
"chemokines",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
948 | [
"As",
"a",
"model",
"of",
"local",
"infection",
"of",
"the",
"initial",
"phase",
",",
"we",
"utilized",
"a",
"transwell",
"system",
"and",
"added",
"IL",
"-",
"8",
"and",
"GAS",
"in",
"culture",
"medium",
"within",
"the",
"lower",
"wells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
949 | [
"PMN",
"were",
"applied",
"in",
"the",
"upper",
"wells",
"and",
"subsequently",
"incubated",
"for",
"90",
"min",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
950 | [
"As",
"shown",
"in",
"Figure",
"2A",
"and",
"2B",
",",
"a",
"substantial",
"number",
"of",
"PMN",
",",
"consisted",
"largely",
"of",
"viable",
"cells",
",",
"was",
"detected",
"in",
"the",
"lower",
"wells",
"consisted",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"and",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
",",
"as",
"a",
"control",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
951 | [
"Contrarily",
",",
"number",
"of",
"PMN",
"was",
"significantly",
"low",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"016",
")",
"compared",
"to",
"that",
"of",
"control",
"culture",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
952 | [
"Flow",
"cytometry",
"analysis",
"suggested",
"that",
"although",
"PMN",
"was",
"detected",
"in",
"the",
"lower",
"well",
"consisted",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"and",
"severe",
"invasive",
"GAS",
",",
"but",
"most",
"of",
"them",
"were",
"dead",
"as",
"defined",
"by",
"propidium",
"iodine",
"staining",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"016",
")",
"(",
"Figure",
"2A",
"and",
"2C",
")",
"demonstrating",
"that",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"affected",
"survival",
"of",
"PMN",
"and",
"its",
"migration",
"activity",
"in",
"a",
"transwell",
"system",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
953 | [
"PMN",
"were",
"killed",
"by",
"streptolysin",
"O",
"(",
"SLO",
")",
"from",
"severe",
"invasive",
"GAS"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM"
] |
954 | [
"PMN",
"death",
"was",
"induced",
"shortly",
"after",
"encounter",
"with",
"severe",
"invasive",
"GAS",
",",
"and",
"PMN",
"were",
"not",
"in",
"apoptotic",
"death",
"because",
"of",
"low",
"frequency",
"of",
"cells",
"positive",
"for",
"annexin",
"V",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
",",
"which",
"was",
"seen",
"in",
"the",
"case",
"of",
"cytolysin",
"-",
"dependent",
"cell",
"injury",
"[",
"15",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
955 | [
"GAS",
"produce",
"two",
"cytolysins",
"that",
"may",
"contribute",
"to",
"pathogenesis",
"."
] | [
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
956 | [
"Streptolysin",
"S",
"(",
"SLS",
")",
"is",
"an",
"oxygen",
"-",
"stable",
"beta",
"-",
"hemolysin",
"and",
"Streptolysin",
"O",
"(",
"SLO",
")",
"is",
"a",
"pore",
"-",
"forming",
"cholesterol",
"-",
"binding",
"toxin",
"[",
"16",
"]",
"."
] | [
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
957 | [
"Therefore",
",",
"to",
"know",
"the",
"mechanism",
"underlying",
"GAS",
"-",
"mediated",
"killing",
"of",
"PMN",
",",
"we",
"investigated",
"whether",
"SLO",
"produced",
"by",
"invasive",
"GAS",
"affect",
"survival",
"of",
"PMN",
"in",
"an",
"in",
"vitro",
"migration",
"assay",
"system",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
958 | [
"Figure",
"3A",
"shows",
"that",
"PMN",
"killing",
"by",
"invasive",
"GAS",
"was",
"blocked",
"by",
"anti",
"-",
"SLO",
"Ab",
"in",
"culture",
"medium",
"within",
"lower",
"wells",
"of",
"a",
"transwell",
"system",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"018",
"compared",
"with",
"control",
"Ig",
")",
",",
"at",
"similar",
"extent",
"by",
"adding",
"free",
"cholesterol",
"in",
"the",
"medium",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
959 | [
"Furthermore",
",",
"an",
"SLO",
"deficient",
"mutant",
"from",
"a",
"STSS",
"isolate",
"NIH230",
"(",
"NIH230slo",
")",
"lost",
"the",
"killing",
"activity",
"for",
"PMN",
"(",
"Figure",
"3A",
")",
",",
"thereby",
",",
"strongly",
"suggesting",
"that",
"SLO",
"is",
"a",
"key",
"element",
"for",
"PMN",
"killing",
"mediated",
"by",
"invasive",
"GAS",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O"
] |
960 | [
"Contrarily",
",",
"SLS",
"-",
"deficient",
"mutant",
"from",
"NIH230",
"strain",
"(",
"NIH230sagA",
")",
"killed",
"PMN",
",",
"as",
"efficiently",
"as",
"did",
"parent",
"strain",
",",
"indicating",
"that",
"SLS",
"is",
"dispensable",
"for",
"killing",
"of",
"PMN",
"mediated",
"by",
"invasive",
"GAS",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O"
] |
961 | [
"SLO",
"and",
"SLS",
"double",
"mutant",
"GAS",
"from",
"NIH230",
"strain",
"(",
"NIH230slosagA",
")",
"displayed",
"the",
"killing",
"activity",
"indistinguishable",
"from",
"that",
"of",
"NIH230slo",
",",
"confirming",
"the",
"primarily",
"role",
"of",
"SLO",
"for",
"GAS",
"-",
"mediated",
"PMN",
"killing",
"."
] | [
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
962 | [
"As",
"shown",
"in",
"Figure",
"3B",
",",
"incubation",
"of",
"PMN",
"with",
"supernatant",
"from",
"co",
"-",
"culture",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"and",
"invasive",
"or",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
"did",
"not",
"affect",
"PMN",
"viability",
",",
"suggesting",
"that",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"causes",
"PMN",
"killing",
"following",
"encounter",
"with",
"bacteria",
"in",
"a",
"contact",
"-",
"dependent",
"manner",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
963 | [
"To",
"confirm",
"that",
"SLO",
"activity",
"is",
"increased",
"in",
"invasive",
"GAS",
"strain",
",",
"we",
"measured",
"SLO",
"hemolytic",
"activity",
"of",
"GAS",
"strains",
"used",
"in",
"this",
"study",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
964 | [
"As",
"shown",
"in",
"Figure",
"3C",
",",
"SLO",
"activity",
"of",
"severe",
"invasive",
"isolate",
"NIH230",
"is",
"increased",
"as",
"twice",
"as",
"that",
"of",
"non",
"-",
"invasive",
"strain",
"1566",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"017",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
965 | [
"Impaired",
"migration",
"of",
"PMN",
"is",
"due",
"to",
"degradation",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"by",
"serine",
"proteinase",
"ScpC"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN"
] |
966 | [
"Although",
"NIH230slo",
"lost",
"the",
"killing",
"activity",
"for",
"PMN",
",",
"migration",
"of",
"PMN",
"in",
"response",
"to",
"IL",
"-",
"8",
"in",
"a",
"transwell",
"system",
"was",
"not",
"restored",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"this",
"mutant",
"(",
"Figure",
"4A",
")",
",",
"thereby",
",",
"suggesting",
"that",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"blocks",
"PMN",
"migration",
"by",
"influence",
"on",
"IL",
"-",
"8",
"activity",
"."
] | [
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
967 | [
"Therefore",
",",
"we",
"quantified",
"the",
"amount",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"in",
"culture",
"before",
"and",
"after",
"co",
"-",
"culture",
"with",
"clinically",
"isolated",
"GAS",
"or",
"its",
"mutants",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O"
] |
968 | [
"Figure",
"4B",
"shows",
"that",
"the",
"amount",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"was",
"significantly",
"reduced",
"by",
"60",
"-",
"min",
"co",
"-",
"culture",
"with",
"NIH230",
",",
"as",
"well",
"as",
"NIH230slo",
",",
"but",
"not",
"with",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
"1556",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O"
] |
969 | [
"As",
"previous",
"reports",
"suggested",
"that",
"the",
"GAS",
"envelope",
"peptidase",
"ScpC",
"(",
"also",
"known",
"as",
"SpyCEP",
")",
"degrades",
"the",
"CXC",
"chemokines",
",",
"such",
"as",
"human",
"IL",
"-",
"8",
",",
"Groalpha",
",",
"murine",
"KC",
"and",
"MIP",
"-",
"2",
"[",
"17",
"]",
"-",
"[",
"19",
"]",
",",
"we",
"established",
"a",
"NIH230",
"mutant",
"deficient",
"with",
"ScpC",
"(",
"NIH230scpC",
")",
"and",
"analyzed",
"the",
"property",
"in",
"a",
"PMN",
"migration",
"assay",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-ORGANISM",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
970 | [
"The",
"results",
"showed",
"that",
"NIH230scpC",
"neither",
"digested",
"IL",
"-",
"8",
",",
"like",
"1566",
"strain",
",",
"(",
"Figure",
"4B",
")",
"nor",
"abrogated",
"the",
"migration",
"of",
"PMN",
"in",
"response",
"to",
"IL",
"-",
"8",
",",
"comparable",
"to",
"1566",
"strain",
"(",
"Figure",
"4A",
")",
",",
"whereas",
"the",
"mutant",
"killed",
"the",
"migrated",
"PMN",
"as",
"well",
"as",
"the",
"parent",
"strain",
"NIH230",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
971 | [
"These",
"results",
"demonstrate",
"that",
"clinically",
"isolated",
"invasive",
"GAS",
"impaired",
"PMN",
"recruitment",
"and",
"its",
"survival",
",",
"as",
"a",
"result",
"of",
"productions",
"of",
"ScpC",
"and",
"SLO",
",",
"respectively",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O"
] |
972 | [
"Enhanced",
"expression",
"of",
"the",
"slo",
"and",
"the",
"scpC",
"genes",
"in",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"is",
"attributed",
"to",
"mutation",
"of",
"a",
"transcriptional",
"regulator",
"CsrS"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN"
] |
973 | [
"Although",
"sequences",
"of",
"the",
"slo",
"gene",
"and",
"the",
"scpC",
"gene",
"were",
"identical",
"among",
"clinically",
"isolated",
"non",
"-",
"invasive",
"and",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
",",
"Figure",
"5A",
"shows",
"that",
"the",
"slo",
"and",
"the",
"scpC",
"genes",
"were",
"expressed",
"in",
"the",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"greater",
"in",
"extent",
"than",
"those",
"in",
"the",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O"
] |
974 | [
"The",
"expression",
"of",
"the",
"other",
"virulence",
"-",
"associated",
"genes",
",",
"such",
"as",
"IgG",
"degrading",
"protease",
"of",
"GAS",
",",
"Mac",
"-",
"1",
"-",
"like",
"protein",
"(",
"mac",
")",
",",
"nicotine",
"adenine",
"dinucleotide",
"glycohydrolase",
"(",
"nga",
")",
",",
"polysaccharide",
"capsule",
"production",
"(",
"hasA",
")",
",",
"and",
"C5a",
"peptidase",
"(",
"scpA",
")",
",",
"was",
"also",
"upregulted",
"in",
"the",
"severe",
"invasive",
"GAS",
",",
"greater",
"than",
"that",
"detected",
"in",
"the",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
"(",
"Figure",
"5A",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
975 | [
"Contrarily",
",",
"the",
"levels",
"of",
"streptococcal",
"pyrogenic",
"endotoxin",
"(",
"speB",
")",
",",
"SLS",
"(",
"sagA",
")",
",",
"and",
"mitogenic",
"factor",
"(",
"speF",
")",
"genes",
"were",
"downregulated",
"in",
"the",
"severe",
"invasive",
"GAS",
",",
"compared",
"to",
"that",
"found",
"in",
"the",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
"(",
"Figure",
"5A",
"and",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
976 | [
"These",
"results",
"demonstrate",
"the",
"prominent",
"changes",
"in",
"the",
"transcriptional",
"profile",
"of",
"several",
"virulence",
"-",
"associated",
"genes",
",",
"including",
"the",
"slo",
"and",
"the",
"scpC",
",",
"in",
"the",
"all",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O"
] |
977 | [
"Mutation",
"of",
"csrR",
"or",
"csrS",
"can",
"cause",
"significant",
"alterations",
"in",
"virulence",
"in",
"mouse",
"models",
"of",
"infection",
",",
"either",
"increasing",
"lethality",
"or",
"the",
"severity",
"of",
"localized",
"soft",
"tissue",
"lesions",
"[",
"5",
"]",
",",
"[",
"6",
"]",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
978 | [
"GAS",
"isolates",
"from",
"mice",
"with",
"severe",
"invasive",
"disease",
"had",
"mutations",
"in",
"csrS",
",",
"raising",
"the",
"notion",
"that",
"CsrR",
"/",
"S",
"function",
"is",
"important",
"in",
"modulating",
"gene",
"expression",
"during",
"infection",
"."
] | [
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
979 | [
"Therefore",
",",
"we",
"analyzed",
"the",
"linkage",
"between",
"the",
"csrS",
"and",
"/",
"or",
"csrR",
"genes",
"and",
"the",
"property",
"of",
"invasive",
"GAS",
"infection",
"by",
"sequencing",
"these",
"genes",
"in",
"the",
"emm49",
"strains",
"used",
"in",
"this",
"study",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
980 | [
"The",
"nucleotide",
"sequence",
"of",
"the",
"csrR",
"gene",
"was",
"identical",
"in",
"all",
"the",
"isolates",
",",
"and",
"that",
"of",
"the",
"csrS",
"gene",
"was",
"identical",
"among",
"the",
"all",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
"isolates",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
981 | [
"However",
",",
"as",
"shown",
"in",
"Figure",
"5B",
",",
"the",
"csrS",
"genes",
"of",
"all",
"clinically",
"isolated",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"had",
"a",
"deletion",
",",
"a",
"point",
"mutation",
",",
"or",
"an",
"insertion",
",",
"thereby",
",",
"resulting",
"in",
"the",
"creation",
"of",
"translational",
"stop",
"codons",
"(",
"NIH147",
",",
"NIH226",
",",
"NIH230",
",",
"and",
"NIH269",
")",
"or",
"in",
"a",
"mutation",
"in",
"the",
"presumed",
"kinase",
"domain",
"(",
"NIH200",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
982 | [
"In",
"order",
"to",
"clarify",
"the",
"role",
"of",
"CsrS",
"regarding",
"expression",
"of",
"the",
"virulence",
"-",
"associated",
"genes",
"and",
"resistance",
"to",
"PMN",
"killing",
",",
"we",
"introduced",
"the",
"intact",
"csrS",
"gene",
"of",
"the",
"1566",
"strain",
"into",
"the",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"(",
"see",
"Figure",
"5A",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
983 | [
"The",
"csrS",
"-",
"introduced",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"reduced",
"the",
"expression",
"levels",
"of",
"the",
"slo",
"and",
"the",
"scpC",
"genes",
",",
"comparable",
"to",
"those",
"detected",
"in",
"the",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
"."
] | [
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O"
] |
984 | [
"In",
"contrast",
",",
"the",
"expression",
"of",
"speB",
"was",
"upregulated",
"to",
"the",
"level",
"observed",
"in",
"the",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
"(",
"Figure",
"5A",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
985 | [
"In",
"parallel",
"with",
"the",
"expression",
"profile",
"of",
"slo",
"and",
"scpC",
"in",
"the",
"severe",
"invasive",
"GAS",
",",
"introduction",
"of",
"the",
"intact",
"csrS",
"gene",
"into",
"the",
"severe",
"invasive",
"GAS",
"restored",
"the",
"susceptibility",
"to",
"the",
"killing",
"by",
"PMN",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"015",
"compared",
"with",
"severe",
"invasive",
"isolates",
"+",
"CsrS",
")",
"(",
"Figure",
"6A",
")",
",",
"abrogated",
"the",
"inhibition",
"of",
"PMN",
"migration",
"by",
"degradation",
"of",
"IL",
"-",
"8",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"002",
"compared",
"with",
"invasive",
"isolates",
"+",
"CsrS",
")",
"(",
"Figure",
"4A",
",",
"4B",
",",
"and",
"6B",
")",
",",
"and",
"diminished",
"the",
"killing",
"activity",
"for",
"PMN",
"by",
"necrosis",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"00016",
"compared",
"with",
"invasive",
"isolates",
"+",
"CsrS",
")",
"(",
"Figure",
"3A",
",",
"3C",
",",
"and",
"6C",
")",
",",
"These",
"results",
"strongly",
"suggest",
"that",
"mutations",
"in",
"the",
"csrS",
"gene",
"correspond",
"to",
"the",
"immunocompromized",
"activity",
"in",
"the",
"severe",
"invasive",
"isolates",
",",
"associated",
"with",
"inhibition",
"of",
"PMN",
"recruitment",
"and",
"survival",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
986 | [
"csrS",
"mutation",
"is",
"important",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"invasive",
"infections",
"in",
"a",
"mouse",
"model"
] | [
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O"
] |
987 | [
"In",
"order",
"to",
"elucidate",
"the",
"role",
"of",
"csrS",
",",
"in",
"infections",
"in",
"vivo",
",",
"we",
"compared",
"the",
"virulence",
"of",
"GAS",
"isolates",
"using",
"a",
"mouse",
"model",
"which",
"infected",
"GAS",
"intraperitoneally",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
988 | [
"The",
"non",
"-",
"invasive",
"1566",
"strain",
"displayed",
"the",
"LD50",
"value",
"approximately",
"100",
"-",
"fold",
"higher",
"than",
"that",
"of",
"the",
"severe",
"invasive",
"NIH230",
"strain",
"(",
"Table",
"1",
")",
",",
"whereas",
"a",
"csrS",
"deletion",
"(",
"1566DeltacsrS",
")",
"caused",
"an",
"increase",
"in",
"the",
"LD50",
"value",
"comparable",
"to",
"that",
"of",
"the",
"NIH230",
"strain",
"."
] | [
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
989 | [
"Consistently",
",",
"an",
"introduction",
"of",
"the",
"intact",
"csrS",
"gene",
"into",
"the",
"NIH230",
"strain",
"(",
"NIH230",
":",
":",
"csrS",
"+",
")",
"reduced",
"the",
"LD50",
"value",
"to",
"the",
"level",
"observed",
"in",
"the",
"non",
"-",
"invasive",
"strain",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O"
] |
990 | [
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"csrS",
"is",
"an",
"important",
"virulence",
"factor",
"in",
"the",
"mouse",
"model",
"of",
"lethal",
"infections",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
991 | [
"As",
"shown",
"in",
"Figure",
"7A",
",",
"the",
"NIH230",
"strain",
"caused",
"bacteremia",
"in",
"mice",
"24",
"h",
"after",
"intraperitoneal",
"injection",
"whereas",
"the",
"bacteremia",
"was",
"barely",
"detected",
"in",
"mice",
"infected",
"with",
"NIH230",
":",
":",
"csrS",
"+",
"as",
"well",
"as",
"the",
"1566",
"strain",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"005",
"compared",
"with",
"non",
"-",
"invasive",
"isolates",
",",
"and",
"p",
"=",
"0",
".",
"005",
"compared",
"with",
"invasive",
"isolates",
"+",
"CsrS",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
992 | [
"Histopathologically",
",",
"in",
"the",
"mice",
"injected",
"with",
"the",
"NIH230",
"strain",
",",
"bacteria",
"formed",
"clusters",
"in",
"interstitial",
"tissues",
"in",
"the",
"kidneys",
"and",
"the",
"lungs",
",",
"accompanied",
"congestion",
"and",
"no",
"inflammatory",
"cells",
"at",
"infectious",
"foci",
"(",
"Figure",
"7B",
",",
"7C",
"and",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
993 | [
"Contrarily",
",",
"no",
"significant",
"pathological",
"alterations",
"were",
"observed",
"in",
"the",
"mice",
"injected",
"with",
"the",
"1566",
"and",
"NIH230",
":",
":",
"csrS",
"+",
"strains",
"(",
"Figure",
"7B",
"and",
"7C",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
994 | [
"Figure",
"7D",
"shows",
"that",
"subcutaneous",
"infection",
"of",
"NIH230",
"formed",
"the",
"infected",
"lesions",
"with",
"area",
"significantly",
"larger",
"than",
"those",
"of",
"1566",
"and",
"NIH230",
":",
":",
"csrS",
"+",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
995 | [
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"the",
"invasive",
"GAS",
"isolates",
"are",
"more",
"virulent",
"in",
"vivo",
"than",
"non",
"-",
"invasive",
"GAS",
",",
"and",
"impair",
"PMN",
"function",
"in",
"vivo",
",",
"owing",
",",
"at",
"least",
"in",
"part",
",",
"to",
"the",
"mutations",
"in",
"the",
"csrS",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
996 | [
"scpC",
"and",
"slo",
"are",
"insufficient",
"singly",
"for",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"invasive",
"infections"
] | [
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
997 | [
"Finally",
",",
"we",
"assessed",
"the",
"influence",
"of",
"enhanced",
"expression",
"of",
"the",
"scpC",
"or",
"the",
"slo",
"gene",
"on",
"the",
"virulence",
"in",
"a",
"mouse",
"model",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O"
] |
998 | [
"As",
"shown",
"in",
"Table",
"1",
",",
"NIH230scpC",
"and",
"NIH230slo",
"exerted",
"the",
"LD50",
"value",
"3",
"-",
"10",
"fold",
"lower",
"than",
"that",
"of",
"the",
"non",
"-",
"invasive",
"isolate",
"1566",
",",
"but",
"10",
"-",
"30",
"fold",
"higher",
"than",
"that",
"of",
"severe",
"invasive",
"isolates",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"I-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
999 | [
"Subcutaneous",
"inoculation",
"of",
"NIH230scpC",
"and",
"NIH230slo",
"yielded",
"the",
"local",
"infected",
"lesions",
"with",
"area",
"comparable",
"to",
"those",
"of",
"1566",
"and",
"NIH230",
":",
":",
"csrS",
"+",
"during",
"the",
"course",
"of",
"infection",
"(",
"Figure",
"7D",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ORGANISM",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits