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A variant has been detected on Chromosome 2 in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
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Pathogenic; Primary congenital glaucoma
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Task1_train_3401
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This is a variant in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Congenital glaucoma
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TGGTTCTAATGAAAAACAAAGGCCGTTTCAAAAGTTAAAATGCCTATCTGCGGATGCACAAAAACCTATGGAACCTATTCCGGGATTTCCTTTTCCCTGATCTCTGGTTGACTTTTCTTTATTCGATTTCTGCCTCTCCCTCACCCACCATGGGTGTTTCTATGATTTTAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACC
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Task1_train_3402
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Here is a mutation in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
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Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3403
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The gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Glaucoma 3A
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3404
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Located on Chromosome 2, this mutation impacts CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; Glaucoma 3, primary infantile, B
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Task1_train_3405
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A variant on Chromosome 2 in gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; Primary congenital glaucoma
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3406
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Here is a variant affecting CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Congenital glaucoma
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3407
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Given this context: Chromosome 2, gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
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Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3408
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This sequence change occurs on Chromosome 2, altering CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
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Pathogenic; Glaucoma 3A
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3409
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Here is a variant affecting CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3410
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Chromosome 2 houses a mutation in gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Glaucoma 3A
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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TAATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTTCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCA
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Task1_train_3411
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The gene CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Anterior segment dysgenesis 6
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AATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCAC
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AATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCTGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCAC
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Task1_train_3412
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A genetic alteration is present in CYP1B1 (cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; Glaucoma 3A
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AATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCCGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCAC
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AATACTAAAAAGCCATTTTAAGTATACAGAAACTTTTAATTTGTGAAGGTAGCTGTACAGTATCTAAGGAAATATAGATTGCAGTGGATTTTAATAAGGAAAGAGTCATTCTCTGCCTTCCAAACACCTTTCTGTGGCGCCTGCAGATTCAGCATCTCCAACTGCTCACTTGTGCTCCAAGAAATGACACAAAACCAGGATTTCTGGTCTCTTCGGCAATCAAAATTTGCCTTGCGAAACATTTGCCCCTAGGGATAGTGTTTCCACAGTAAATACTACAGGCCGCCCAGTTAAATATGGATTTCAGATCAACAAGGGCTAATCTTTTAGTGTGAGTATTCCCGTGTAAAACTTACTTTTCTTTTGCCAAATCTGGCAACCCGACACCAGGGACCTGTTGAATCCGTGCTTAGTAGAGACCAACGTGGGCATCAGGGGGTCCGCTAACTGAGCCAAGCGCAGGGGCCAGAAACGTCTGCAGGCGCCTCCTGGATATCCCATCTGCCTTTCTGAATGCTACTCTGCTTTCGTAAAAGTGACTGCTTCTTGTCTTCTACCCCGGCATTTCTCAAACTCCTAGCGCGGAGGTTTTATAAACCTAGCGCTGCCCGCTAGTTGTGGCCGCCTTCTGAAAGTTTCTGTGCGGGTTACCTGTCGGCTGGCCCGGCCTCCATGGGCTTCCTTGGCCTGGAACAAAGCCCTGACGGGCGGCCCGCTTTTAGCGCCAGGGCTGGGCGGCCTCGGATGCACGCCGAGGACTAGCCTAGGAGAGGCTGCTGTGTTTAACATATTTATGACATTACCTTTTCTTTCGGAACTATTCCAGTTCTGATTGTAATGCGCCAGGGAGAGAGATATCAGGGCTCATCTCCAAGCATTTAAAAACTCTTGTTTTTCCGGGGGGTGGAGGGGTCTTTGCAAATGTGTTCTCACTCGCAAGCAGGGGAGGGGACGATAGAGACAAGATAGGAGACCGGAGGGGTCGGGGCACCGCTGGGTGGGGCGCGTGCGCGTGTCGCAGCCCTCACTGTGAGTCCCTTTACCGACGCGATCTTGGTTTTGAGGGGTGGGGACCTGGAGCGAAACCCCAAACCCGGGGCCCTGCTTGCAAACTCAGCATATTCTGTCTCTACTCCGCCTTTTTCAGAGGAGAAAAGACCTGGCCCACGCCTCCCAGAGGCTTTACCTGGTGAAGAGGAGGAGCAGCCACTGCAGCGCGGTGGACAGGGTGTCCTGGCTGGCGCCGAAGATGTCAGTGATAGTGGCCGGTACGTTCTCCAAATCCAGCCGCGCGCCACCACCGTGCGAGTCCCCGGCCGCCTTCTTTTCCGCAGAGAGGATAAAGGCGTCCATCATGTCGCGGGGGGCGGCCCCGGGCCGAAGGCTTTCGCAGTGCCTCAAGAACTTGTCCAGGATGAAGTTGCTGAAGTTGCGGTTGAGCTGCTCGAATTCGCGGAAAACGGTGCGCACCGGGTTGGGGAAGTACTGCAGCCAGGGCATCACGTCCACCAGGCTGCCCGCGCCCACCGTGCGCCCGAACTCTTCGTTGTGGCTGAGCAGCTCACGGAACTCGGGGTCGTCGTGGCTGTAGCGGCAGCCGAAACACACGGCACTCATGACGTTGGCCACGGCCACGACGGTCAGCGGCCTCGGGTCGAGGAAGGCGCCGTCCGCGCTGCCGCGCACCAGCAGCGCCACCAGCTCGCGCGCCTCGCTCAGCACGTGGCCCTCGAGGACTTGGCGGCTGCGCGGCTGGCGCGTGAAGAAGTTGCGCATCATGCTGTGGGCTGCGCGCCGCTGCACCTTCCAGTGCTCCGAGTAGTGGCCGAAAGCCATGCTGCGGCCGCCGGACACCACACGGAAGGAGGCGAAGGCCGGCCGGTCGGCGAAGGCCGAGCCCTGCTGCACCAGGGCCTGGTGGATGGCGCGCTCGCCATTCAGCACCACTATGGGGCAGCTGCCCAGGCGGATCTGGAAAACGTCGCCGTAGCGCCGCGCCAGGCGAGCGAACGAGAGGTGAGCCGCCTGGCCCACCGCCGCCGCGTTTCTGATCAGTGGCCACGCAAACGGGCCCGGGGGCGCGGACCGGAGCTGCCGCCTCCGTTGCCTCAGCAGCCGCTGGCCCACATGCACAGTGGCCAGCACCGACAGGAGTAGCAGGAGCGTGGTCTGCTGGATGGACAGCGGGTTTAGCGGCCAAGGGTCGTTCGGGCTGAGGCTGGTGCCCATGCTGGGGACAGAGAGGAGAAGGCGTGACACTCAGGGGTGCAGAGACAGGAGCGGGCGCCCCACGCCCCTACCCCAGCCTCTGGGGACTGAGTGCCGTTGGGTGGAGAGGTCGGAGCTGACTCTCTGGAGAAATGGCCGAAGACGCCCCTTCCCATCCCCAACCCACTCTCCCTTGGAGAAGAGAAGGGGCGTGTTTCCACCTCGCTGTAACCCAGCGCCAAACCCTTCCCCTCCCCGCAAGGCGCGTAACGGTTCCTGCAATCTGGGGACAACGCTGCGGGCATCGAGGCGGTGGCGCTTGATTTCCTTTAAAGTACCTACCACGCCACCCGCTACCTGTAATAATCCATCTGAAGAGGTCGCCGGGCAGCGCCTCGGCAGACAGACTGACCTGCGGGGAGGTGCGGTTTCCAGTGGCGCGGGACAGCCGGCTCCGAGAAGGAACTGGGACCTTTGCCTAGGGCAAGACGTCAACAGGAACCCGCAGGCCCGGCCTGGACACCTGCTGCCCTCACTGGAAGCTTTAACTCCCACTCGAGTCTCTTGGCGTCGTCAGTGCCAGGAGCGCTTGGATTGGGATGGGGACGGAGAAGGGTGCCTCGCTCGCCGAGCCCCGCTGCCCTTGGGGACCTGGCAAAGTCGAGGTTTCCTCACAGCGTTGAGATTGAGACTGGGGGTCGGTGAGTGGCGTCAATTCCCATGCCCTTGCGGCTCTCACAACTGGAGTCGCAGAAGCGCTCGCTCCCACTCCCACTCCAGAGTCAAAGCGCGCCATCCCGCTCCTCCGGGTTTTAAGGACTGGGTAGAAGGAGGGCAGCGCGACCTGGCAGGGCGGGGCCTGCGGGGGGCGGGGCGCGCCGCACACCAGGCCGCTTTGACCCGGACTCCCGTCCAGGCGCACCGGCCGGCCTCGGAGCTCTACCAGCAGGCTTTCATGGGAGCGGAGGTGCCCACGTTTCCATTGTGCGGTAACCGCGCTTCATCACAGCCACCTCCAATCGAGGCCGCACGGTGTCCCCAGAACCACGCTCGGTACAACCTGCCCCGGCCGCTGCGCTCGACTTGGGAGCGCGCCCCGCCCCGAGCGCACGACCTCCCTTCCCTCTCCGCGACTTGAGCTTGCTTCCCGGAAAGCCAGTGTAGTGGCAGCGGTTTGCCTCACAGCGCCCCTGGTTGGTTGTTTAAATTTTATCTTAGGTTCTCGCAAACAAATTGCCACCTCAGTGGAGGCTCTTTGGCATGCTAAATTTTTTCCAGTTCTTGCGGCGAGATCAGGAATCCCTAAAAGTAGCCGCTCCCCCGCCCCGGGGCCCCGACAGTGCTTGGGCACACAAAGGCTCCTGGGGCGCAGCTGGCCCTGAGATTTCCCGCGTAGAGGCCACTCCAGGTGGCGCCGCCCGCTGGTGGGCGCGGGGCCGCCCAGGCTGCGATGGAAGCCGTTGGCGCAGGGCGGGGAGCCAAGCTGGGGCGACTGGGGGGGCCTGGGGGAGCTAGCGGGGCGGGACCCGAGCGGGGCGGAGAGTGGCAGGAGGAGGCGAATCTCCGCGCTCCGGCGAACTTTATCGGGTTGAAGTTTCTGCTGTCGCCTCCCCTTTGCGTGCGGAGCTGGGCTTTGCGTGCGCCGCTTCTGGAAAGTCGGCTCCAGTCATATCCCTGGGCGCTGCCTGCGGCCGCTCCTCCCGCGCTTCTCACGGCACCTGACACGCGGAGGCGGCGGCCGAGGGTGGGGTGCCGGCCACCACCACCCTTGGCGTGGGGTGCCGGCCGCCACCACCCTCGGCTGCGCACGCACAGTCGCGCCTGCCAGGCCAGCGAGGCGGACGCTTGGGCCACCACCCGCAGGCCGAGCCCGGGCGCGTATCGCCAC
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Task1_train_3413
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A variant affecting Chromosome 2, within the gene GALM (galactose mutarotase), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; GALM-related disorder
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TTCACTTCCTGAGTCTGTAAGGAAGAAATGACACCAAGTCCTATTTTCCTTTGGAGCTTTTCCTCTGGCCATATCAATAGCATTTACTATGCTACAAGTGACCCAATACCACATCCCATATTTTCTCAAAGCTCCCATGGCACAGGTGAGCTCTGTAGAATTTATCCCAGTCCCCCACCTGCCATTACCCCTATTCCCCCTGCTTGGCACCCGCTCTCTCCCTCTCTGCCTGTTCTTTAAGGCCCATTTTCTGTTAGAAGCCTTAACTCTTCCTAGTGAAGTCACCTCGGCTGTCACTGAACTTCCAGAGCCTTTGTGCTTTCTCGATCTGTGACTTATGCCTGCCTACTCCATGGCCAGTTGGAGGCTAGGCATCTCCTGCAGCACTCACCGCCTCCAGCCTTGACCGATAGACACTTGTGTGCACGCTCTCGCCTTCTCACCAAATCCCAGTTCCTCATGCCATTTCATCTTTGTGAAGCCCTACCTCTACCCCAACACCTAATATCATCCTTGGCACTAGCAAATAATGAATAAATGTTTGCAGAATTAACAGTTTTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGACTGGAATGCAGTGGTGCGATCTAGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATAACAGGCACGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACAATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTAATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTGCACCCGGTCAACAGTTTTTAAATAAAGCAGAAAAAATGACTCAAACCAAATAGTGACAGAAAGAAGATCAAAGACCTTCTCCGGGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGTGGCTGAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTCGCCAACATGGTGAAACGCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGGGCACCTATAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGTGGAAGTTGTAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGGCTAGGCAACAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGAATCTCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCTGAGGTGGTCAGATCACCTGAGGTCAGTAGTTCAAGACCAGTTGGGCCAACATGATGAAACCCCGACAATACTAAAAGTACAAAAAATTAGCCGGATGTGGTGGCAGGTACCTGTAATCCCAGCTACTCTAGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCAAGGGGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCTCCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCATCTCAAAACAAACAAACAAACAAAAATTAGCTGGACATGGTAGTGCGCACCTGCAGTCCCAGCTACTGGGGAGCTGAAGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGTCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGAAAGACTCTATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCTCAGCCTCTCCAGGACCTTCCTCTCTCCAACCTGGCTGCTGCCTTCCTCCCTACTCCCCAGCTGGCAGGAGTGAGTCTGTTTTGTGATGCCCCAAAGAAGCTACTGAGGATCCTGAAAGCCACCTGCTCATGCCTTGCCTTTGAGACTGGAAGAATTTTCCATCATGCTCTTCCTACCTTCATCTCCTCCTTATATCTTGTCCCTGCTCTGTGGCTGGGTCTGATTCCTGTCTCAAAGCCGCTTCCCAGCTTCTACTCCTCCCCACCTGCTTTTCTGCCCTGGACTCATGTTGTTTGTATTTCTTACCAGGGTGCATCATGCTGCAAGCGGGCGGGTACTAGAAGTATACACCACCCAGCCCGGGGTCCAGTTTTACACGGGCAACTTCCTGGATGGCACATTAAAGGGCAAGAATGGAGCTGTCTATCCCAAGCACTCCGGTTTCTGCCTGGAGACTCAGAACTGGCCTGATGCAGTCAATCAGGTAATGCCACAGGCTGGCTTTTCAGAGTAGAGTTGTGTCCAAGGTCACACTGTACGACAGAGTTCACTACACTCGAATCAGCTTGTATGATTCAAAAGTTCATGCTTTGTTTGTTTGGTTTGTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTTGTCGCCTAGGCTGTAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCGATTCTCCTGCCCCAGCCTTCCAAGTAGCTAGGATTACAGGCGCCTACCACCATGCCTGCTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAAACCCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCTCAAAAGTTCATGCTTATTCTCTTCTGCAAGTCACAGAAAACCCATAGCCAAGCTACTAACATGGGATTTACATGGTTTTAAGAAAGCTGAAATTTTGTACCTTCAAAGCCTTTATCCAGTTTGTTTCTCCTTAACAATACCTTCTCGTTTTCTGCAGCCACACTTAAGGAGAGCTTCCATATCGTCTCCTCCTATGTGCTCCCTCATAACTTTCTTTTCTGGTTGTTACCCAGAGCAGTACTCCTGAAAGTGCCAGCCCACAATAAGAAGCTTGCACCTTGGGCTGGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGAGGATTGCTTGAGCCTGAGATTGAGGCTAACCTGGGCAACACAGGGAGACCCCATCTTTACAGATTATTAGAAAAATTAGCCAGGTGTGGTAGTGCACACCTGTGGCCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCCCTGAGCCTGGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCATGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACAGAATGAGACCCTGTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCCAGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGTCTGAGGCAGGTGTATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCCGGTCAACATGACAAAACCCTGTCTCTAGTAAAAATAAAAAAATTATCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTGATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAAGCGGGGTTTGCAGTGAGCTGAGATCGCCCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCTACACCTTACACCAGATTATAGATCAACACACTGCTTCCCTTCATCAGGAAAGCCTTCCTTTAACAAAGTGTGCTTTTTTCACTCTGATTAAAGTTCTTTATCTCACTATGAACCAATCATAAACAGTTCCCGCACTGGCAGCCATCCACAGAGCACTGGTCTAGAAGCCCGTCCAGAAGCACACCCAAATGGTTAATGTTGCAGCCTGCGGTGTCAAGCATCACCTGTGTTGTTTCCCCTTCACAGCCCCGCTTCCCTCCTGTGCTGCTGAGGCCTGGTGAGGAGTATGACCACACCACCTGGTTCAAGTTTTCTGTGGCTTAAGGAAGTGTGAAGATATGATCCAGTCCAGGGCTAGGCTCAGCCACCTGTCTCCTGTCCAGAAAAAAGGTGAAGATTAAGAAGCTTTCAGAATGATTCTATGGATTAAAATCATACAAATGGTGGCTGTTCTGAGAATCAGTCTGGGTATTGATTTCCTTTTCCAGTGACTGGCTCCAGGCCATGTCTAATGACCAGCTCGATTCCCTGTGCAGTTCAGAGGGCAAGTGAACCCAACCAAC
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TTCACTTCCTGAGTCTGTAAGGAAGAAATGACACCAAGTCCTATTTTCCTTTGGAGCTTTTCCTCTGGCCATATCAATAGCATTTACTATGCTACAAGTGACCCAATACCACATCCCATATTTTCTCAAAGCTCCCATGGCACAGGTGAGCTCTGTAGAATTTATCCCAGTCCCCCACCTGCCATTACCCCTATTCCCCCTGCTTGGCACCCGCTCTCTCCCTCTCTGCCTGTTCTTTAAGGCCCATTTTCTGTTAGAAGCCTTAACTCTTCCTAGTGAAGTCACCTCGGCTGTCACTGAACTTCCAGAGCCTTTGTGCTTTCTCGATCTGTGACTTATGCCTGCCTACTCCATGGCCAGTTGGAGGCTAGGCATCTCCTGCAGCACTCACCGCCTCCAGCCTTGACCGATAGACACTTGTGTGCACGCTCTCGCCTTCTCACCAAATCCCAGTTCCTCATGCCATTTCATCTTTGTGAAGCCCTACCTCTACCCCAACACCTAATATCATCCTTGGCACTAGCAAATAATGAATAAATGTTTGCAGAATTAACAGTTTTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGACTGGAATGCAGTGGTGCGATCTAGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATAACAGGCACGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACAATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTTGTAATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTGCACCCGGTCAACAGTTTTTAAATAAAGCAGAAAAAATGACTCAAACCAAATAGTGACAGAAAGAAGATCAAAGACCTTCTCCGGGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGTGGCTGAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTCGCCAACATGGTGAAACGCCGTCTCTACTAAAAATATAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGGGCACCTATAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGTGGAAGTTGTAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAGGCTAGGCAACAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGAATCTCAGGCCAGGTGCAGTGGCTCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCTGAGGTGGTCAGATCACCTGAGGTCAGTAGTTCAAGACCAGTTGGGCCAACATGATGAAACCCCGACAATACTAAAAGTACAAAAAATTAGCCGGATGTGGTGGCAGGTACCTGTAATCCCAGCTACTCTAGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTTAACCAAGGGGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCTCCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCATCTCAAAACAAACAAACAAACAAAAATTAGCTGGACATGGTAGTGCGCACCTGCAGTCCCAGCTACTGGGGAGCTGAAGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCCGAGGTCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGAAAGACTCTATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCTCAGCCTCTCCAGGACCTTCCTCTCTCCAACCTGGCTGCTGCCTTCCTCCCTACTCCCCAGCTGGCAGGAGTGAGTCTGTTTTGTGATGCCCCAAAGAAGCTACTGAGGATCCTGAAAGCCACCTGCTCATGCCTTGCCTTTGAGACTGGAAGAATTTTCCATCATGCTCTTCCTACCTTCATCTCCTCCTTATATCTTGTCCCTGCTCTGTGGCTGGGTCTGATTCCTGTCTCAAAGCCGCTTCCCAGCTTCTACTCCTCCCCACCTGCTTTTCTGCCCTGGACTCATGTTGTTTGTATTTCTTACCAGGGTGCATCATGCTGCAAGCGGGGGGGTACTAGAAGTATACACCACCCAGCCCGGGGTCCAGTTTTACACGGGCAACTTCCTGGATGGCACATTAAAGGGCAAGAATGGAGCTGTCTATCCCAAGCACTCCGGTTTCTGCCTGGAGACTCAGAACTGGCCTGATGCAGTCAATCAGGTAATGCCACAGGCTGGCTTTTCAGAGTAGAGTTGTGTCCAAGGTCACACTGTACGACAGAGTTCACTACACTCGAATCAGCTTGTATGATTCAAAAGTTCATGCTTTGTTTGTTTGGTTTGTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTTGTCGCCTAGGCTGTAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTCCAAGCGATTCTCCTGCCCCAGCCTTCCAAGTAGCTAGGATTACAGGCGCCTACCACCATGCCTGCTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAAACCCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCTCAAAAGTTCATGCTTATTCTCTTCTGCAAGTCACAGAAAACCCATAGCCAAGCTACTAACATGGGATTTACATGGTTTTAAGAAAGCTGAAATTTTGTACCTTCAAAGCCTTTATCCAGTTTGTTTCTCCTTAACAATACCTTCTCGTTTTCTGCAGCCACACTTAAGGAGAGCTTCCATATCGTCTCCTCCTATGTGCTCCCTCATAACTTTCTTTTCTGGTTGTTACCCAGAGCAGTACTCCTGAAAGTGCCAGCCCACAATAAGAAGCTTGCACCTTGGGCTGGGCAAGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGAGGATTGCTTGAGCCTGAGATTGAGGCTAACCTGGGCAACACAGGGAGACCCCATCTTTACAGATTATTAGAAAAATTAGCCAGGTGTGGTAGTGCACACCTGTGGCCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCCCTGAGCCTGGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCATGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGTGCAACAGAATGAGACCCTGTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCCAGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGTCTGAGGCAGGTGTATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCCGGTCAACATGACAAAACCCTGTCTCTAGTAAAAATAAAAAAATTATCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTGATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAAGCGGGGTTTGCAGTGAGCTGAGATCGCCCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCTACACCTTACACCAGATTATAGATCAACACACTGCTTCCCTTCATCAGGAAAGCCTTCCTTTAACAAAGTGTGCTTTTTTCACTCTGATTAAAGTTCTTTATCTCACTATGAACCAATCATAAACAGTTCCCGCACTGGCAGCCATCCACAGAGCACTGGTCTAGAAGCCCGTCCAGAAGCACACCCAAATGGTTAATGTTGCAGCCTGCGGTGTCAAGCATCACCTGTGTTGTTTCCCCTTCACAGCCCCGCTTCCCTCCTGTGCTGCTGAGGCCTGGTGAGGAGTATGACCACACCACCTGGTTCAAGTTTTCTGTGGCTTAAGGAAGTGTGAAGATATGATCCAGTCCAGGGCTAGGCTCAGCCACCTGTCTCCTGTCCAGAAAAAAGGTGAAGATTAAGAAGCTTTCAGAATGATTCTATGGATTAAAATCATACAAATGGTGGCTGTTCTGAGAATCAGTCTGGGTATTGATTTCCTTTTCCAGTGACTGGCTCCAGGCCATGTCTAATGACCAGCTCGATTCCCTGTGCAGTTCAGAGGGCAAGTGAACCCAACCAAC
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Task1_train_3414
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The variant affects gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3415
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This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Noonan syndrome
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ACATACATACATACGTATGAGCTTAATTTATAAATTAGGCACAGTAAGATTAAAAATAGCTAAAAGTTACATGAATGTGGTCTTTCTCTCCCAAAATATCTCATGTTTTTGGACCAAAGCTGACCATGGATAACTGAAACCGTGGAAAGTGAAACCGTGGAGATGGGAGCACTACTGTAATTCCTCCTCTGGTTATTTGTCTCAAGAAGATATTTTCAAATACAGAAAAATAGTATAAATGAAAATGTGAATCAGAAAATCATGTGGAAAGCAAAAAAGCTGGAAACAATGTGTCCAATCACAGGGTAATGGTTAAAACAAATTGTCCAACTTTATGGAATATTATGCAGCCATTATAAATAATTAAGATTATTTAATAAAATACAAAAATATAAGATATGATAAGTGAATAACCTTAATATGCACATCATACAATTACAATTATATACAATGTGCACAGCAAAAAGATTAGAAGTAAATACAAAAATGGTTGCTATAAAGCCCAAACAATAAAATGTGGGAAAATATATTAAAAGTATCAGGACATAACATTGTTATATGCAGTGGGATTTAAAACTATATAAAAAATATAGATGAGGAAAAGGCTAGAAGAAACTATAGCACATACTAAAGAGACTATAGAGAGATCATAATTTCTATAAGCATTCAAAAGAAGGATCATCAGAGCATATACTCAGGCAGAGAAAAGATGAGAGTAGGAAAGAGATATTGAATACATGAAAATAAAGGAAATAAAGAACGGAAAAAGATAGAGGAACCTACAGAAAGGGAGATTCAGGTGGTAGATTCAGTCCTAAAAAGGAAGGAAAAGGTACTTCCTTCCTCTGATGCAGAAGGGGAAAAATAGGAGAGGATGAAGAGAATAAAATTTTGATGTGCCAGAGGTGTGGGCCCAAAGGCACAGCAGGCACACTATGATTTTTAGCCATGTGAAACTGTTTACAAAAATGATTATAAATATAGTTGAGTTTGGCTATGCCTCTGCTGTATTTAGTTTATTAAAATGCAATTAAAAAGGCTTTTATAAATATAAAAACACAAGTATTAAATAATATCTAATGGCTGCCTAAGATGAAAATAGAAAATGAAATGTATATTAGACTTCACCTTAAGTCTTAATGAGAAAAATTCTAAAGGGCTTCAGGTGCTAAATATTGATCAAACAAGTATTTTCTGCTGGCATATTACACATGTAATTATTCAGTCATTTAATGAAATGAGTGTTTTGTTTTATCCAGAAATGCAATAAAAATTCAGAAAGAAATACTTACCAAAGAAAGGCACACATGGTGGATTAATAGACCTGAGTTTTGCCAAATATTTCTTATAGTGATCTTCACTCAATTCATGAGCTTCTTCTAAAATTTTCTTCTGGCGACTTGGTATTTGCTATAAGGAAAAAAAATAGGCGTAAGTTTACAAAAGGAATCAAAGGTCTTGTCAAAAAAAATACTAGGCTAACAGAAACGCCCAAATACAACAGTATCAATTTGATTTTATGACTGTAACATTGCTTCAAATATTGCTTCAAATAAATTATCTTCATAGACCTCAGTATAAACTTAAAGTATGTGTGTGTGTGAGAGAGATCTAGTTTATCATGTCATTCCTTACACAATTATGTGAACATTTAACTGTACATTATCTTACAAATTAAGTGCCGAAAGTTTTTTCTTCTAGCTTAGGCTGGGACCTGTGAATACATTTTAATAGGAATGCTTAAATTTTAAAAAGCAACCAATTCATTACAAAACTTAGATAATTCAGTCTTTTAATCTACTACTGAAAAGACAAATGAGACATTTAAAAATTAAAGATAATAATTGTTAAAAATCTAATTTTTCTAATAGGGAATGAAAGTTCATTTTAAAAACACATGTAGAAACCTACCTCAAATGTGTGGTCTAGTCTGTAAACAGGTGATGAATTCATAGCACTGACAACCTCAAGGACACCATTAAAGTTGTTCAACTCTTGAAAGACTTGTAGAATCTCAATAATTCGACTCACCACAGCTACTCTTTCTTCTAAATTTTCAGTTTCTACAATACATCTGGGAATAAAAAAAAAGTGAACTAAAGGTTTTAGAGTTTTTCCAATAAAGTTATAGCTTAAAGAATTTAGTAAATAAAATAATGTAGAGAGTAGGGGGGTGGCGATAGTATAACTACTATAGAGAAGACACATTCAGGGTGACTGATAGAAGGAAGGCAGTGCCTCCAGTCAGGCATACTGCTCTTTCCCGTCTTCTAGACTGGTACAGTCAAACAATCATTTTCCTACTATATTTGGTGCATCCTCTATTAGCATCAGAATTAACTGGTGAGGCCACTATCTTGTGGAATGTATGGAGGTCTTTGTGAGGTCTTTGTGATGTGGGTGTATTCTAGTAGAATTCAAGAATTCTGTTGTGTTCTATTCTTCATCTAATTGCAAGATTTTAGTGATTAATGCTCAATTTCTTTCTTTCATATATTATTGGCTACATACATTTCTAGGAACAGCTCTGTTCCTATGTTTCCTACATTTCTACGAACAGCATTAAATGTAATGGCAAAAACTGCAATTACTTTTGCACCAACCTAATATATAATTGCATTGAGATTCTGGACTTGTGGTATGATAGTATGAGGAGCTTCACTGAGTGAAACTGGTAAAAATTATTAAAACACACATACACACAAACACACACATGCACACGCACACACACACATTTAAAGTCTCTAGTAATGGCCCTGAGAGCAAATGGCAAAAGAAACATCTATTCAGGAAAATCTACAAAAATTTGGTAAGAGAGGGGAGAGAGTCTGTGGTATTTGAACCAAGACTGGTCCCTCCCTTCTTTCTCCCAGCTCAGTGAGGGTGAACTGAGCATCTACTCCAGATTCCTGCAGTCAAGAACACCTAGCTCCCGGTGAGGTGCAGGAGCAGGACTTCAGTTTTCTCATCCTGTCCCTGCTGCCTGTTGCTGAGGCCAAGTCCCAGTTGAGTGCAGCTGAGAAGTAGGAATACCCTTTTTTGCCCAACTTCCACTTATGGAATGGAGACGCTACCTTGGGTGTGATGTTTTGAGCATACTGAGAAAAGAGCCCTTCCTCTGGTTCCTGAGGGCGTGGTTCCATGCCAGAAGAGGCGGGTAAGAAGACCTCAGGCTGCAGTAGCATCCGTCTGCCACTCTACCTGCTCAACCAAGCACTTAGCTCCTAGGGCAGAAGTGTCACTCAGAGAAAAGCTTGCCATTGTTGCCCAGCCCCAGAGCCCTGTTTCAAACAGATAGCTCCTAATTTCTTGTCATTTGCAACAAAGTATAAAGTAGTTTAAATTTAATGGTGCCCTTAGGAACAGTGGAAATTGTGGTGAAAGGCAATGGGGAAGAGATTTGTGGATCTAATGAAGATACACCCTAGACTGTAGGCAGAGTAGTTTGCAGGAGACAACTAGGAAATAAGACGGCTGAGAGGAGCCCTCCTGGGGTCAGAACAAGTATCAAACAGAAATCTCAGAAACCATTCCTTCAAAGGAGCCACAATTTGATTGCATTATTTTGTATAGCATTTATGCCACCAGAAAATTGTTGAAAACATCAGAGCAATCAGCTGGCAAATTGTGGAGTTTCATAGCTGGGTGTGTGTGGTCAGGTAAGGAGTGGATGAGTCTTTCCAGTACCACTGCCATGCAATAAGAAGCCCTGGAAAGGGGGCTGGGGAAGGAGGAGCAGTACTCAGAGTTGCTACACTATATTATCTGAAATGTCAGGTTTCCAGCAAAAACAGATGAGGTATGCAAACCAATAGGAAAGTATGACTCTTACAAGGGGTGGGGGTGGGGCGGAGGGGGTGGAAGGAACAGAAACTGCCTGTGAGAGCAACCAAATGTCAGATTTAACAACAGTAACAAAAAAGATTTCTAAGTAGCCATTATGAATACGGTCACGGAATTAAAGGAAAGCATGAAAAAGAAGGAAAGGAAGGTATTGATGACAATGTGCATCGAAGAGAGGATATCATTAAAGAGATAGAAACTATAAAAAGGAACCAAAGGGAAATTCTGGAATTAAAAAGTACAATAACTGAAA
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Task1_train_3416
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Here is a mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
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Pathogenic; Fibromatosis, gingival, 1
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Task1_train_3417
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Mutation context: Chromosome 2, Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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GGTCCTAGGAAATAAAATAGATTCTAACACTGTAATTTTCAGAAATACGATTTTCAGTGGGAGATCTATAAATTTATCTCATTTTCTCATTTAGTTATTAAAAAGTGAATAATTTAAGATTCTAAGTAGTCTCCATTTAAAATCAGAAGGACATTTTTGAGATAATTACATCAATGTAGTATGATTAAAAAAGACTATAATGGCTGTAAGTTCACAATAAAGCAGTAGCTAACATTTATTGAGCCCTTACTTTGTGCTAGGTAATGTACATATATTGACTTGCAAACCTCAAAACAGCCCCAGGAGTAGGTACTATCAGTAGCCCCATTTTACTCTTGAGGAAAATAAGGGGCAGAAGGATAAAGTCACACAAGGAGGTTAAAGTTGCCCAGGGCCAGCAATTGGTAAAGCCAGGATTTGAACCTAGCCTTACCAACTAGGGGTGAACACAGAAAGACAGAAGGTGTAAATTCAGCTAGAGGGACCAGGGGAGTAAAAGAACAGGAACTGCCTGCCTGGCCTTATTACTAGACACTTCATGTAATATTTCAGTTAAGTCTTATGAAAACCCTATAAGGCAGAAATCAGTATTTCATTTTAAAAGTTAACTCTTTTGAAATGACTTTTCAACTTGAATGTTAAATTACATACCGGTATAGATCTGATTCAAGTAAAGTGAGTTGTCGAGCAATTTCTATTGGGTGTAAGGTGAGCAGGTCAAAAGTCTCTATGTGCCCAGGTCTGCTTATATGCCACTCAACTGTGGGAGGTGAACTCTGAAATGTAATATTATGACCTGGTCCATTGTCTCTTGCAATTTTTTTCCTTTGGATTATTTTAGTGATGGATTCAACCCATTTTTTCATTGCTTTACCTGCAATACATTATATTTTAAATAACATTTAAATATTCTTTATTTAATATTTTATATTTTAAAAATGGTTTAAAGTCACACGGATGACACCTGAATGTATCTTTGCTATAAAAAGTTCAAATGATCAAAATGAAAAATGCAAGTTCTCCTTTTCCATTTCCCGGTCCCCAATCCTAATCTTATTCTTCTTCATTTGGGTAACCACTGTTAATAGCCTGGTATGTATTCTTCCAGATCCTTTCCAAATAAAATTAGAAAGTACTTAATTTGTAGAGACTGTCCATCCCATTGTTCTGATCTTCAGTTTAATGTATTATTTTATAATCCTCCAAGAAAAGGTATATCTTATGTAAATCACAAGATTTATAAGGATAGATTATACACAATATTCATCTAATTAACACTGCATTTTATAAACCAATAAATATCAGTGCCAGAGGACTGATTCCTTAGTGTGAGTTTTGATGTGGCTCTGTTTTATATTGTACATGAAAGTACTATTATTTAACTATTTTCTGATTATCATTTAGAGCATACAAAGGAAATAAAAATAAGTTTGTCTAAGATATCCTTAGAGCCATACACTCACGTAATCTTTAAAACTAGAAGGAAAACCTTAGAGATCGACAAACCTAGCTCCTTATGTTATTGATAAGAAAACTGAAGTCTAAAGAATCTAAGTGATTTTGCCCAAAGTCACGTATCTGATTAGTGGCAGTGTTAGACATAGAGTCTCAATTTAATCCACTCTGCTTCCTCTCTGATTCTATTTGCCTGTGGCCCACTCGACCTCCATCAGTGGTGTTATAATGGCACAACGTAATTCCCAAATGCCCTCATACTTTGGGATATATATGAAGACTTGGCTTAATCAACTCTAAAATAATCAGTAAGTTGAGTCACTAAATGAAAATACATTGGATCAACAGGGTGACTTGAGCCATTTGCAGGTCTAAATGCTATTTGATGAAAATTTTTAACTTTTTGAAATGGTTATGCTGGTACTATTATAAACATCTTACATTACTGAGCCCCAATGACATCAATTGATAGTCACCGTGTTGGTACTTTTATTACATATAAAACTAGGCACCTAAAAAAAAAAACATACCTCTTACTGTTCCAATAAATTCTTCCATTCGTTGCAAAAGATATGCATCTCTTTCAAAATCATAGAAGTGGTGCTCTACCCAGTGCCGACATACATTTAATACTCTATGGCATTAACACAGAATTGAATTACATGGGAATCAAACATAAATGTTTATCACAATGCACAGTACAATACAAATGAAAATGCAGTAACTCTTACCAAATTAATCTTATCAGTGTGCTTAACACTTCCAAAATTCTATGTTAAGGCTTATACTATAATTTCTGATAACTGCTCTAATTAGTAAATTTAATTTACTAATTTTATTGTCACCCCTCTCCTTGTTTGGGAAAGGTCCTTATATACTTCAACATTGAAACGAAAGTTTGATAAAGACTTATTTACTTCATTTATTTAATGCTTACCGCAGTTGCACAGGCTGTATATATTCTTTTCTAAATCTTTTCAGTTCTGCACTCAAGGGTTGATCTCCATTCTCTATAGCTATGCGATCAGCTTCTGTTGGCTCAGGCTCTGGAATTTCAAACCTAACATAAAATAGAACAAATTAATGAAAAGACTAATTATATCGAGTTATACAAATAGAAAACCACAAACGTTTTCACCAGTCAGCAAAATCAAGAGAATACTGTAAAAAATTACTGAAGATATGCATATCAGTGTAAACAAGTGAGACTCCTATAGTATTAAAGGCTAATAAAATTATTTTAAAATTTTTAAAAGAAATTAGTACTTGCCAATATAGATAAAACTAACTACAAACAAAATAAAGAATACATGCAAATTCTAAAAATAAATGTGACTATAAAGTTACGGGACTGATATTCATTTTTGGTCTGTGGAATTACTCTAAATCAGGTGACATAATCACTGTTAAGGGTAATTCCAGAAAAACTGACTGCTCTTTGTTTGGGTACATGAAATATTTTCCTTCCATCACAGTATTTGTTCACTGACAAGTTCCATTTTACTCAACATGAAGTATGTTTGAAAACTTACTTAGAACATCTAACTCATCAGAATTTGAATTTCTTGACTCTATAAATTTTATATAGGTCTTTAGTTCTGTAAATTTGAAATTTCAAATACTGAGTTTTCACATACAAAAAAGAATATTTTTGTATTGAAATAATAAAAGCTAACATTATTATAAAATAAATGTTCATCTAAGAGATTTTATTTATTGAAAAAGTGCTTGTGAAGTATATTTTAAAGCTCATCTAACATTTCTGAAAAGGATCTTAGCTCAATCTCTTTTTTAACAAAAAATAATGAATTTAAATATTTTTTAAATGGACAGACCTTTCTATTATAAGACTCAGTAGTTCTTGAGGTTTGCAAAAGGATCTGTATGTTGTAAGAAATGTCCGAACAAAATTGGGATCTAAGAAGAAAAAGGAAAAATATCTTATTAAACTCTATGATTCAAAATGATTAAAACTGTTATGTACATTTTCAAAATAGATCAAATAGTCAAGTTTAAAAGTTCCAAAATGTTTTGCCAAGTAGAAGGCTTTGGACTTGGTAATGCACTGCTAGCTTAGTGCCTCCTAAATTAGTGGTGATATTAAAACTTTACATCAACTTATTTCTTGCCCTCTGCACACTGACAAGATGATCTTAAACTCATCGGCCACAGGAATGAGCAAGAAAGAAAAGCAAAGGTAAAGCAGGGAACCAGGCTCCCCTCCCACCTGCTACCAGGATCTCAAAGTATCACCAGTTGGTTTATCCCCCTTATAAAGAGAAAGGCCACAGCAATAACCCATTACTTTTCCTTACATCAAGATGAGTTTATCTAGGATGACTTATCTAGCTTTCTTTAAATCATGTTAACAGAGCATGCAACTGGAAATTGGAACTTATAAAGTAGTAGCTAAAGTTAAATACAGTTTTTAAATTATTTGCTAAAAATCTCACAACTACTTAAAGATGCTTACAAATACTTATAAGCTATTAAAACTATTAAATGTGATAGAATATGTTGGTTTGGTCCTATTCCAACCTTTAATTGCCTTTATTTCAAGTAGTCACAATGAGAGGTCAATCATAAATATAGGAGTCTCCAATCCCTTCCATGAAAGGACCTACTTTTCATTCACATCTCC
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Task1_train_3418
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This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_3419
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The variant affects gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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GGTCCTAGGAAATAAAATAGATTCTAACACTGTAATTTTCAGAAATACGATTTTCAGTGGGAGATCTATAAATTTATCTCATTTTCTCATTTAGTTATTAAAAAGTGAATAATTTAAGATTCTAAGTAGTCTCCATTTAAAATCAGAAGGACATTTTTGAGATAATTACATCAATGTAGTATGATTAAAAAAGACTATAATGGCTGTAAGTTCACAATAAAGCAGTAGCTAACATTTATTGAGCCCTTACTTTGTGCTAGGTAATGTACATATATTGACTTGCAAACCTCAAAACAGCCCCAGGAGTAGGTACTATCAGTAGCCCCATTTTACTCTTGAGGAAAATAAGGGGCAGAAGGATAAAGTCACACAAGGAGGTTAAAGTTGCCCAGGGCCAGCAATTGGTAAAGCCAGGATTTGAACCTAGCCTTACCAACTAGGGGTGAACACAGAAAGACAGAAGGTGTAAATTCAGCTAGAGGGACCAGGGGAGTAAAAGAACAGGAACTGCCTGCCTGGCCTTATTACTAGACACTTCATGTAATATTTCAGTTAAGTCTTATGAAAACCCTATAAGGCAGAAATCAGTATTTCATTTTAAAAGTTAACTCTTTTGAAATGACTTTTCAACTTGAATGTTAAATTACATACCGGTATAGATCTGATTCAAGTAAAGTGAGTTGTCGAGCAATTTCTATTGGGTGTAAGGTGAGCAGGTCAAAAGTCTCTATGTGCCCAGGTCTGCTTATATGCCACTCAACTGTGGGAGGTGAACTCTGAAATGTAATATTATGACCTGGTCCATTGTCTCTTGCAATTTTTTTCCTTTGGATTATTTTAGTGATGGATTCAACCCATTTTTTCATTGCTTTACCTGCAATACATTATATTTTAAATAACATTTAAATATTCTTTATTTAATATTTTATATTTTAAAAATGGTTTAAAGTCACACGGATGACACCTGAATGTATCTTTGCTATAAAAAGTTCAAATGATCAAAATGAAAAATGCAAGTTCTCCTTTTCCATTTCCCGGTCCCCAATCCTAATCTTATTCTTCTTCATTTGGGTAACCACTGTTAATAGCCTGGTATGTATTCTTCCAGATCCTTTCCAAATAAAATTAGAAAGTACTTAATTTGTAGAGACTGTCCATCCCATTGTTCTGATCTTCAGTTTAATGTATTATTTTATAATCCTCCAAGAAAAGGTATATCTTATGTAAATCACAAGATTTATAAGGATAGATTATACACAATATTCATCTAATTAACACTGCATTTTATAAACCAATAAATATCAGTGCCAGAGGACTGATTCCTTAGTGTGAGTTTTGATGTGGCTCTGTTTTATATTGTACATGAAAGTACTATTATTTAACTATTTTCTGATTATCATTTAGAGCATACAAAGGAAATAAAAATAAGTTTGTCTAAGATATCCTTAGAGCCATACACTCACGTAATCTTTAAAACTAGAAGGAAAACCTTAGAGATCGACAAACCTAGCTCCTTATGTTATTGATAAGAAAACTGAAGTCTAAAGAATCTAAGTGATTTTGCCCAAAGTCACGTATCTGATTAGTGGCAGTGTTAGACATAGAGTCTCAATTTAATCCACTCTGCTTCCTCTCTGATTCTATTTGCCTGTGGCCCACTCGACCTCCATCAGTGGTGTTATAATGGCACAACGTAATTCCCAAATGCCCTCATACTTTGGGATATATATGAAGACTTGGCTTAATCAACTCTAAAATAATCAGTAAGTTGAGTCACTAAATGAAAATACATTGGATCAACAGGGTGACTTGAGCCATTTGCAGGTCTAAATGCTATTTGATGAAAATTTTTAACTTTTTGAAATGGTTATGCTGGTACTATTATAAACATCTTACATTACTGAGCCCCAATGACATCAATTGATAGTCACCGTGTTGGTACTTTTATTACATATAAAACTAGGCACCTAAAAAAAAAAACATACCTCTTACTGTTCCAATAAATTCTTCCATTCGTTGCAAAAGATATGCATCTCTTTCAAAATCATAGAAGTGGTGCTCTACCCAGTGCCGACATACATTTAATACTCTATGGCATTAACACAGAATTGAATTACATGGGAATCAAACATAAATGTTTATCACAATGCACAGTACAATACAAATGAAAATGCAGTAACTCTTACCAAATTAATCTTATCAGTGTGCTTAACACTTCCAAAATTCTATGTTAAGGCTTATACTATAATTTCTGATAACTGCTCTAATTAGTAAATTTAATTTACTAATTTTATTGTCACCCCTCTCCTTGTTTGGGAAAGGTCCTTATATACTTCAACATTGAAACGAAAGTTTGATAAAGACTTATTTACTTCATTTATTTAATGCTTACCGCAGTTGCACAGGCTGTATATATTCTTTTCTAAATCTTTTCAGTTCTGCACTCAAGGGTTGATCTCCATTCTCTATAGCTATGCGATCAGCTTCTGTTGGCTCAGGCTCTGGAATTTCAAACCTAACATAAAATAGAACAAATTAATGAAAAGACTAATTATATCGAGTTATACAAATAGAAAACCACAAACGTTTTCACCAGTCAGCAAAATCAAGAGAATACTGTAAAAAATTACTGAAGATATGCATATCAGTGTAAACAAGTGAGACTCCTATAGTATTAAAGGCTAATAAAATTATTTTAAAATTTTTAAAAGAAATTAGTACTTGCCAATATAGATAAAACTAACTACAAACAAAATAAAGAATACATGCAAATTCTAAAAATAAATGTGACTATAAAGTTACGGGACTGATATTCATTTTTGGTCTGTGGAATTACTCTAAATCAGGTGACATAATCACTGTTAAGGGTAATTCCAGAAAAACTGACTGCTCTTTGTTTGGGTACATGAAATATTTTCCTTCCATCACAGTATTTGTTCACTGACAAGTTCCATTTTACTCAACATGAAGTATGTTTGAAAACTTACTTAGAACATCTAACTCATCAGAATTTGAATTTCTTGACTCTATAAATTTTATATAGGTCTTTAGTTCTGTAAATTTGAAATTTCAAATACTGAGTTTTCACATACAAAAAAGAATATTTTTGTATTGAAATAATAAAAGCTAACATTATTATAAAATAAATGTTCATCTAAGAGATTTTATTTATTGAAAAAGTGCTTGTGAAGTATATTTTAAAGCTCATCTAACATTTCTGAAAAGGATCTTAGCTCAATCTCTTTTTTAACAAAAAATAATGAATTTAAATATTTTTTAAATGGACAGACCTTTCTATTATAAGACTCAGTAGTTCTTGAGGTTTGCAAAAGGATCTGTATGTTGTAAGAAATGTCCGAACAAAATTGGGATCTAAGAAGAAAAAGGAAAAATATCTTATTAAACTCTATGATTCAAAATGATTAAAACTGTTATGTACATTTTCAAAATAGATCAAATAGTCAAGTTTAAAAGTTCCAAAATGTTTTGCCAAGTAGAAGGCTTTGGACTTGGTAATGCACTGCTAGCTTAGTGCCTCCTAAATTAGTGGTGATATTAAAACTTTACATCAACTTATTTCTTGCCCTCTGCACACTGACAAGATGATCTTAAACTCATCGGCCACAGGAATGAGCAAGAAAGAAAAGCAAAGGTAAAGCAGGGAACCAGGCTCCCCTCCCACCTGCTACCAGGATCTCAAAGTATCACCAGTTGGTTTATCCCCCTTATAAAGAGAAAGGCCACAGCAATAACCCATTACTTTTCCTTACATCAAGATGAGTTTATCTAGGATGACTTATCTAGCTTTCTTTAAATCATGTTAACAGAGCATGCAACTGGAAATTGGAACTTATAAAGTAGTAGCTAAAGTTAAATACAGTTTTTAAATTATTTGCTAAAAATCTCACAACTACTTAAAGATGCTTACAAATACTTATAAGCTATTAAAACTATTAAATGTGATAGAATATGTTGGTTTGGTCCTATTCCAACCTTTAATTGCCTTTATTTCAAGTAGTCACAATGAGAGGTCAATCATAAATATAGGAGTCTCCAATCCCTTCCATGAAAGGACCTACTTTTCATTCACATCTCC
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Task1_train_3420
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This gene mutation involves SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_3421
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A mutation on Chromosome 2 affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
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Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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CTTCAGTAACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACT
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Task1_train_3422
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A variant has been detected on Chromosome 2 in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
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Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3423
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Here’s a variant in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) located on Chromosome 2. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Noonan syndrome
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TTCAGTAACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTA
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Task1_train_3424
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The variant affects gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3425
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Assess the clinical impact of this variant on gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
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AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCGGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
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Task1_train_3426
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A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_3427
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A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; SOS1-related disorder
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AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
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Task1_train_3428
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A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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AACAGACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCGGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAAT
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Task1_train_3429
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A mutation on Chromosome 2 affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
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Pathogenic; RASopathy
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ACCTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACA
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Task1_train_3430
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A variant affecting Chromosome 2, within the gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3431
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Here is a variant affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Noonan syndrome
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CTTACAGAATAGCCCAAATAAGCTAACAGTTAACACTAATGTGTGTGTACTGTAAACCACAACTCACGAAAGCTGCTTGTAGACTCCAGTTTCACCAGTAATATATTTATGACATAAATTAAAATATTCAGTTAAGCTTCAAAAGAAGACAGAAAAGAAAAATATCAAAAAACTTAGCCACAACACTGGCCTTTTATTTCTCAAAAAATTATTGGAAGGAATTTTTTAAAAACATTTTTTTTAAGTAAAATAATCTCATCAACTTAAATTTTCAATACACTTAACTTTGGCAAAGTTCTATAAATCTTGAAATTTAAGTGTTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATT
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Task1_train_3432
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Given this context: Chromosome 2, gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
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Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3433
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Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
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Pathogenic; RASopathy
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TTTTATATTCATTATAAGTAAAAGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCT
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Task1_train_3434
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Here is a variant affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3435
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This variant affects the gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) found on Chromosome 2. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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AGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGT
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Task1_train_3436
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A genomic change on Chromosome 2 affects SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
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Pathogenic; Fibromatosis, gingival, 1
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Task1_train_3437
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Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
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Pathogenic; not specified
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AGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGT
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Task1_train_3438
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Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
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Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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Task1_train_3439
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A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; RASopathy
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AGCACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGT
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Task1_train_3440
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Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), found on Chromosome 2, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
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Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_3441
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A mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), located on Chromosome 2, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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ACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGG
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Task1_train_3442
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An alteration has been detected in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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Task1_train_3443
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This variant affects gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
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Pathogenic; Noonan syndrome
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ACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGG
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ACTCAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTTCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGG
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Task1_train_3444
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Here is a genetic alteration in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_3445
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A variant found in Chromosome 2 affects SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
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Task1_train_3446
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Given a variant located on Chromosome 2 and affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
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Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3447
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Gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
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Pathogenic; RASopathy
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CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCAACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
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CAAAATATTACTCTATACCAAAGCTAAAAATTGATATAGAAAAGAAGTATCAGACAGAAATAACTAATAAAACATCATTACAAAAGTACCATGTCCACGGACTTTACCTAACATTGTACACATTAAGGAAAGAAGACTTTCAGGACTACAAAACAAGTATCAGCTTGTTCCAGTTAATTTTGCTTTAAAGTGTCCTCATTTAAAAAAATAAATAAAAGGGACAGTTCCCCAGACAATAGTTGTAACCATTCTTCAGCTGCTTATTAATAATCATAAATTAACTTTGTGAAATATAGCAATTTAGAGAAAACTTCTATCACTCAATCAAGTCTTACAGAAACAATTAAAAATTTTGTAATTTGAAAATGTTTTCCTGCCCAAGTATCACTGACTTGTGACAGTAAACACTAGTAGTAAGTCTTCTTACAATGCTCTACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAACTTCTTTCTTACAAACACAGAGAAAAATCTAAAGATTAATTTTACTCCAAATGAGTCTAGGAACCCCAAACAAAAGTACTTAGGATGAAATGATAAAGTTTAGAATGCTCATGTTATAAAAATTCTATGAGTCCTCTAAGGGGACTTAAAAACCAGGAAAATGTGGCAAGAAGGGCAATTTGAACTTTTATAGCCTTAAAAATCTCTTAAGCAGAAAAGAAGTATTTTGCAATCACAAATTTTGGGTAACTGAATAAAAAACATTTTTATAGTTGTAGTCTAGATCATAAAGAACATAGAAAAGGTTGGTGAAGCACAACTAAATCGGCAGGTCATACTACCGAAAAATTGTACCTCTCAAAAAACAGCTTTATATGGAAAAAAATGACAATAACCTATTTGTTTTTCATGTAAAATCTAGGCAGCCTATTTACATTTCCTATGATTTTTTAAATTTTTGGGTCAGTAAAATAAATACACTGACTATAGACATTTCTAGGTGAAAAATTATAATAAAACTGGAATCCTTGGCTTCCAGGATTGCAACATTTATTATTAAATAATCAGGTTTAGGAGTGGAAACTGAGAGAAAGCAATGCCGTGTATATTTGTACTACCAGCACAATTTTGTTATATTAAAATTTTTATTTATAATCTCAGAAATGGAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAAGATAAAGGAGTAAAAAACTTTTTAGATCCCAATAATGATGATTTACTACTAACTTTAGTCTTGTTTCTGTCACTTTCTAACTGGATAAATTTAGCCAAGTGACCTCATTTTCTCATCTATAACTGATGGTAAGGTTAAAAAAAAGTATTTAAGTGTAGTAGAAAAAGTAAAACATTCCAAAGAAATATAAAGTGGGGTATTTTTAGTCAAAGAAAAGAGGTCTTTGGTTGTTAGTTTCTTTTCTATTTTAGGCACAATAAACCCATGCAGGAAAGAAAATCAGTTTGAAGCAGGAAAACAAAAGTGACAGGCAACTGCATAATTCTTACCTGCGTACATATGGTACGTAAGCCTCTCTATAAGTTTAATAACAGTTCCTGCTTTGATAATTGGAATTCCAGCCTTGGGCTGCATGTTCTCTTCAAATATAATATTCTCTTCAGAGTCAGGCTCTGCAAATCTATAAACATCAGCACTAGGCAGCCTCATCTGCTCCTCTTTCTCTTCCTGTAGCATTGTTACATCAAGCATCCTTTCCAGTGTACTCCGGTACTGTAAAGATATCAATGCTGCCATCCAATTGTTTTTCTCTTCAGCTGACTTGGCAGAAAATATAACACTATTTTCATCTTTTAAAATTATTTCAAAAGCATGCTTGTATTCATTGGTGTCATCTTTATCATTAATTTGTACCTTTCGCATAAAAAACTTTTCTTTAAGACGATATTCTGCATTGCTAGCACCAGGAAGTCTTGGCTGCCCATGATTTGATTTACAGCAAATCATTAAGCCATCAAAGAGAAATATGTGTCTCTCATGTTTGGCTCCTACACGTGTAAGAGTTCCTTCCATTATAAATTCATTACAACACTGTCCAATGTCTTTTCCCTCCCTACCATCAATATTCTTCTGAATCTCGTTCATCTTCTTGATTGCTAGTTGTTTCCCCTTCATTTGCTGACTATAAAACCGACATGCAGATTCACTGGAATAAAGAAAAAGACATTATTAGTACATAGATGACAGAAAACCTAGAGCTCATGTAAGTAAGGGAAAGTGTAAAAGTAGATTTTTACAAGTCTCACTGAGAAGGTATTCACTAATTCCCCAAATAGATTAGAATTACAAAATTACACAATTTTGAAAATTAAAGCAACCTAGAAATTTTTTTCAGTGTTCTAAAAAGCACAATGATTGCTGACAAAATTCTCCTTAAATGTAACTACAAAATGATTATTTCTATCTTGGCTACTAAATATTTAGAATGACAACTAATAAAAAGTAGCCCAATACAGTAAAAAAAAGTAATCTGAAAGATTAAAATAAATTATTTAGAAGAGTTTAAATGGACAAGACCCAAAGCTAAAAACATGTAGCACATATTATAATCAGGAAAGTGGAAGCAATGTTATCTGAATTAATGCCTCAAGTTATATAATCCCTAAAATAAAGGACACTAATAATTTTACTTTGACAGAATAACGATGCCAACATAAATCTACCCGATACATTTTACTCTGTCTCTCCTTCAGCTTACCAGTTGACTCTCAGGAGGTCTTGTCTGGGAGTATGCAAGGAAAATGCACAAATATGAAAGGTTTTTCAAACAATAACAATTCTCTTGGCTTTGATGTCACTTCCTCTAAAAGACCAGGCTTGTCACTAAAACTATTTTCTTCATTGTTTACTTGAGGAGGGAACTGGGATCCCTGAATTTACACCACAATATTCAGGGAAAAAAGGATATTTTAAAAAGTAAAAATATTCACCTCAGTCTTCGTTTTGCAAGACTTTTAGAACATATTTTTTCCATACCACTCTGAACATTAAGCAAAGCTGTTATTGCTTGTTTTAAACATTCCTTGTCTTCTTGATCTTCACTTTTTTCTTCTAACTGCTGTAAAGCCAAAATGACAAATCTGAACCAGTAGTACATTTTTGGATAAAATAATAATAAACTCATTTAAGGATAAAAATAACATTTATTCAACTGTCACAATAAAAATTTTAAATGTGTCATCAAATATTCTTTTTAAAAGTGTTTTTCTTGTGTGTTACTATTAATACACAACCAAGTTTTCTACATTAAAAGACCAAGATTAGCAGTGTTAAGATGGGTTATATCTTGTGACAGGCAGTAATATGTAGTTTTTCAAGGTGCATACCACTGAAAAGAAATGGGGAGCATAATCGATCTACTGAATTATCATAGAGTTAGCATACCACTAAGCATGTAGACGAGGTTTTTTTTTTTTTAAGTGTGGAATTTGGTCTTAGGTTTCTGACCCCTATATTATTGTTATATAATATTGAGATGATAAGGAAGATAAATATACAGAGAACGATGCAATATAGTAGAAGGAATCTCAATTACAAAATCTAGGATCAAATTTTGACTCTACTTCTGTGTGACCTTGGGGCAAGTCACTTGATCTCTGAGTCTTACTTTTCCCATTTGCCAAATAAGGCTTATAAAAAGCCTACCCTGCCTACTTTTAGGGGTTGTTATTAAAAACCAAAGCACTTTGTAAATGGTAACACACAATGTAAGTGTAAATGGTTTTCTTTGTAATTATACTACAGAATTAACATTAGTATAATAAAGAACTTTGTCCATATCCACATTAAGATTTTGAGTGAAGCTATAATATACATATTTATGAAACTGAAACTCAAGCATATTTTCTATTACTGGCAAATATCTGTGTCAGACAGAACGTCTCTACTTAACAAGAACTAAGTCATCAGTAACTAATTGTCAATACAGTAAGGTGGCTATGATTCAAGCAAGCACTTAACAGATGTATGAGTCACAATAATTCACTCATACATCTTAAACCTGTTCCTGGTTACCAAAAGGAAAAGTTAAGAAATCACATATTGGCTGGCTGCAATGGCCTATGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGG
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Task1_train_3448
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A genetic alteration is present in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
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Pathogenic; RASopathy
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Task1_train_3449
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This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Noonan syndrome
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TATTAATGTAAGTTATAATTTTAGAAATTTTAATTGCCTACACTTGAAGGAGTAAAAATTTCTTTTATATTATTAAGATGATTGGGTTTTATAGCCTTCTGAACTTTCATCAAAGCTTCTTGGGTTCATTTGGAGGGGAAGGTTGTTTTGTTTTGTATTTTTGAGACAGGGGCTTGCTCTGTTTCTCAGGCTGGAGTACAGAGGCGTGGTCATGGCTCACTGCAGCCTCGACCTCCTGAGCTCAAGTGTTCCTCCTGCCCAGCCTTTTGAGTAGCTGGAACCACAGGTGTGCACCACCATTCCTGGCTAATTTTATTTCTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACACCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGTCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGAACTACAGGCGTGTGCCAACACACCTGGCATTCTTGTTTTTATTTATAAACTGATAACGGCCTTAAGATTTTATATGGCCTTTGAATCTTTCTGAATTTCATTACAGGCTCAGGTTAAAAAAAAAAAAATCCCGTTATTAGAGAAACCATTACAAAGAAAAATTCTATATAACAAAACAGTGTGTAAATGTCCCATTATAACTATAGTTAGTAATAATGAATTCTTTCTAAAGATTTTACATACTAAATGCTTCCTCTCTTGATTATCCTCTTAAGATACTCATCCTGTATTTCCAAAGACCTTAAATGGTATGCTATTGCTAAGAGCTTTGTCATTTCTGCCTAGTGATTAAAAATACCTTTTAACTCCCTTAGTCCTTTCTCAATGTAAACATTCCTAATTGAGAAATCAAACTGAATTCCAAATGACTACTATGCAGTGCAGAGACCTGAGAAAATGTAAGGATGAGAGTTCCTCCAGTTTACTGTTAATAAATTCACAGACCTTCTATTCATTCATTGATTCATTACAGAGAGCCCATTTTATCATCTGCAAACTATAAATATGATTTCCAGTAATATATTCTCTGTGAAAGAATCATGATACTAAACAGAAGTTTTCTTTGATGAAACAAATACTCATTTGAAAGCTAAAGAAATAATAACGCTATTAATGCATGTCTTCTTTTGTCTTTACAAGGCTAGTCCATTAAAGGTAGAGAGAATATCACTTTGAGCTACACTATTGAATTATAATTTATACAGACTTTTATTTAATTTCAGTATATAACAGGAAAAGAAAAAAGAGACAACCCCTTTCCTTTCAGTCAGTGCTTAGTATTTTGAACTGTGATCAAATGGGCAATTTTTACTGAGATTACAGAAATTTATTGTTTCTAAAGTAATGATAAACAGTTTAATACAGATAGTTGCAAACTTGAGCTATGAAAGTCAGGTAAACTAACCTTCCCCATTACTTTGGCCTTATCCTCACACTGGCTCCCTTATCCTCACACTGAGTCCCTGAGTCTGCTGAGGTCCCCAAATGGAAACTGCGATGCATAAATCCAAGGTTGTTTTCAAAGAATCAGCCATGTAAACAAAAAGTAAAGGTACAAGACAAAAATATCTGACAATTGCTTTAACATTCACTAAAAAACCAAAAATAAAAAAAAGAAAAAACAAAAAACAAAAAAATTAAAAAACAACAAAAATAAAATTCACTACTAAGACGAGAAAATATGCTACTCTTTTGCAGACTGATTTCCATTTGCTTCTTGACTGGAAAAAGAAAACAGAAACACACTAATGTGCAGGGTACTCACACAATAATTTACAAATGAAGTAGCAAAAAAAAAAATTCACACTTGAATATGTTACAAATAACAATAAAGAGTTTTCTTACCTTCAAAAGTTCAAAGTAATGGAGACAGTGGTAAACAGGGGCCAGAAGCAGCCTGGGTAAAACATATTGAACAGCTTCTTTGAAACCTTCGCCTATTGACTGGAAAAAAAAGTGATTTAATTTTTTTTTTAAGTTTACTTTTCAGACATTGTACATCTTCATTTAAAAATTACTATACCTGCAAATAAAGTGCTGCCCCAGGCTTTGATAACTGACTAAGGAAACGATCATGAAAACCAGGTCGCAAAATATCTCGAGCATACGATTCATATGGATCAAATGCCAGTTCCTTAGAAAATAAAGAAGGTAAAACATAAATAATTTACCATTACAAACACAGAAAGATTTAATTATGGGGCACGACTATGCGAGCACAATTATGTATGTCTTTGAAAGTCTCTAAGCAAAAATTATATGACTACTAATTATAATTTTAATAGAAGAGATCCCAATATTCTCAAGTAAGAGAGTAAATCAGTTCTTTCTGATGAATAATAAAATCCTTATATGTTATAACAGCTCTCATTAAAGGTTTCCAGTAGAGTATTATCAACAAACATGGCCATAAGAGTGGGCAGACTTTTGGTTCTAGAAAACAAATCTTAACTTGACAACAACAAAGAATATAGATATGTACAACTAGGTAAGGTATAAACATTTAGAATACTGAAGCCAGACATGTTTTTATAGTTCTCAGTGGTGGACATGTACTTTCGTATTCTATAAACCAGAAGTAACAGTTCATGTCATCTAAAATTCATTGTGATAATTTCACAAAACAATTAAACAAAATCCGAACTGCCCAAAATTTTGCCATCATTAATATCACCAATCAATAAACTAAATTCTAATGGCTCAGTTAAAAAGACCAGAATCTACTGGTTTTGAAGATTTCTGGGGAAAAAGAGAGTAGGTATCTTGATTTTAGCAGGAGAAATAGAGTCGCTACTCTTCTATCTTGTATAAAACTATTATGAAAATGGTGCTCTAGATTCTAGCATGAGCTCATTTCCATAAAGGGTAATTCTAGCAAGAGGAATAGGACATCTAGTGGAGGAGCATAGTAGAAAAAGGCAGAAGGGAATGAAACAACGAAAGGTTGTTATGAATTAAATCACCCTTAATGTTATTTTTCAGATTGCTTTTTTTTTGAAACAGGATCTTGGTCTTACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCCGTAGTGCAATCTTGGCTCACTACAACCTCTGCCCCCTGGGCTCAAACAATCCTCCCACCTCAGTCTCCTGAGTATCTGGGACCACAGGCGCACACCACCGCGCCTGGTTACATTTTTTGTGTATTTTGTAGGGACAGGGTTTCTGCCATGTTGACCACCCTGGTCGTTTTTTGTTTTTTCTTTTTGGGACGGAGTCTCCCTCTGTCGGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAAGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCGCCACCACGCCCGGCTATTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTAAGCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTGACCAGGCTGGTCTTGATCTGCTGGACTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTCAGATTGCTTTTTAAGAAATGATTGAACAGTAATACCACCAGATCAGAAATCAGAAGACGTGAGTTCTGGTTGTTGCATTTTGCAATATGGCATGTAAACTTCCAAGTCATACTGGATTCCTTGAGCTGGCTCTTAGTTGACTTCCCAATTTTTAACTCCTTCAACTTTCTTCTCAACTAAAAATTGCTATCATAATATAACACCAGAAATTGGAGTCTATTACGTTTTACAGAAATTGATAGTAAAGTTTCAAAAACAACAAGAGGATGGAGTCAGGCATGAATACAGTGGACGGAAGAGAAGACTAAAAATGTGAAGAGATGCTTATAGCTTAGGTCTCTTCCAATTCAGAAATGATCATATGCCAAATATCATAATGTATACATTCATCTATAAGTTGCCTTTTATACTCAAAAATTTTTCAAGATTCATCTATTTTGATTCATACAGTTCCTTTCAGTTTATTTTAAAACTATAATATTCTACTGTATGAATATATCAGTTTTCTCTAATCC
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Task1_train_3450
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An alteration has been detected in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3451
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This mutation is located in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
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Pathogenic; Noonan syndrome and Noonan-related syndrome
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TATTAATGTAAGTTATAATTTTAGAAATTTTAATTGCCTACACTTGAAGGAGTAAAAATTTCTTTTATATTATTAAGATGATTGGGTTTTATAGCCTTCTGAACTTTCATCAAAGCTTCTTGGGTTCATTTGGAGGGGAAGGTTGTTTTGTTTTGTATTTTTGAGACAGGGGCTTGCTCTGTTTCTCAGGCTGGAGTACAGAGGCGTGGTCATGGCTCACTGCAGCCTCGACCTCCTGAGCTCAAGTGTTCCTCCTGCCCAGCCTTTTGAGTAGCTGGAACCACAGGTGTGCACCACCATTCCTGGCTAATTTTATTTCTATTTTTGTAGAGACAGGGTCTTGCCATGTTGCCCAAGCTGGTCTTGAACACCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTGTCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGAACTACAGGCGTGTGCCAACACACCTGGCATTCTTGTTTTTATTTATAAACTGATAACGGCCTTAAGATTTTATATGGCCTTTGAATCTTTCTGAATTTCATTACAGGCTCAGGTTAAAAAAAAAAAAATCCCGTTATTAGAGAAACCATTACAAAGAAAAATTCTATATAACAAAACAGTGTGTAAATGTCCCATTATAACTATAGTTAGTAATAATGAATTCTTTCTAAAGATTTTACATACTAAATGCTTCCTCTCTTGATTATCCTCTTAAGATACTCATCCTGTATTTCCAAAGACCTTAAATGGTATGCTATTGCTAAGAGCTTTGTCATTTCTGCCTAGTGATTAAAAATACCTTTTAACTCCCTTAGTCCTTTCTCAATGTAAACATTCCTAATTGAGAAATCAAACTGAATTCCAAATGACTACTATGCAGTGCAGAGACCTGAGAAAATGTAAGGATGAGAGTTCCTCCAGTTTACTGTTAATAAATTCACAGACCTTCTATTCATTCATTGATTCATTACAGAGAGCCCATTTTATCATCTGCAAACTATAAATATGATTTCCAGTAATATATTCTCTGTGAAAGAATCATGATACTAAACAGAAGTTTTCTTTGATGAAACAAATACTCATTTGAAAGCTAAAGAAATAATAACGCTATTAATGCATGTCTTCTTTTGTCTTTACAAGGCTAGTCCATTAAAGGTAGAGAGAATATCACTTTGAGCTACACTATTGAATTATAATTTATACAGACTTTTATTTAATTTCAGTATATAACAGGAAAAGAAAAAAGAGACAACCCCTTTCCTTTCAGTCAGTGCTTAGTATTTTGAACTGTGATCAAATGGGCAATTTTTACTGAGATTACAGAAATTTATTGTTTCTAAAGTAATGATAAACAGTTTAATACAGATAGTTGCAAACTTGAGCTATGAAAGTCAGGTAAACTAACCTTCCCCATTACTTTGGCCTTATCCTCACACTGGCTCCCTTATCCTCACACTGAGTCCCTGAGTCTGCTGAGGTCCCCAAATGGAAACTGCGATGCATAAATCCAAGGTTGTTTTCAAAGAATCAGCCATGTAAACAAAAAGTAAAGGTACAAGACAAAAATATCTGACAATTGCTTTAACATTCACTAAAAAACCAAAAATAAAAAAAAGAAAAAACAAAAAACAAAAAAATTAAAAAACAACAAAAATAAAATTCACTACTAAGACGAGAAAATATGCTACTCTTTTGCAGACTGATTTCCATTTGCTTCTTGACTGGAAAAAGAAAACAGAAACACACTAATGTGCAGGGTACTCACACAATAATTTACAAATGAAGTAGCAAAAAAAAAAATTCACACTTGAATATGTTACAAATAACAATAAAGAGTTTTCTTACCTTCAAAAGTTCAAAGTAATGGAGACAGTGGTAAACAGGGGCCAGAAGCAGCCTGGGTAAAACATATTGAACAGCTTCTTTGAAACCTTCGCCTATTGACTGGAAAAAAAAGTGATTTAATTTTTTTTTTAAGTTTACTTTTCAGACATTGTACATCTTCATTTAAAAATTACTATACCTGCAAATAAAGTGCTGCCCCAGGCTTTGATAACTGACTAAGGAAACGATCATGAAAACCAGGTCGCAAAATATCTCGAGCATACGATTCATATGGATCAAATGCCAGTTCCTTAGAAAATAAAGAAGGTAAAACATAAATAATTTACCATTACAAACACAGAAAGATTTAATTATGGGGCACGACTATGCGAGCACAATTATGTATGTCTTTGAAAGTCTCTAAGCAAAAATTATATGACTACTAATTATAATTTTAATAGAAGAGATCCCAATATTCTCAAGTAAGAGAGTAAATCAGTTCTTTCTGATGAATAATAAAATCCTTATATGTTATAACAGCTCTCATTAAAGGTTTCCAGTAGAGTATTATCAACAAACATGGCCATAAGAGTGGGCAGACTTTTGGTTCTAGAAAACAAATCTTAACTTGACAACAACAAAGAATATAGATATGTACAACTAGGTAAGGTATAAACATTTAGAATACTGAAGCCAGACATGTTTTTATAGTTCTCAGTGGTGGACATGTACTTTCGTATTCTATAAACCAGAAGTAACAGTTCATGTCATCTAAAATTCATTGTGATAATTTCACAAAACAATTAAACAAAATCCGAACTGCCCAAAATTTTGCCATCATTAATATCACCAATCAATAAACTAAATTCTAATGGCTCAGTTAAAAAGACCAGAATCTACTGGTTTTGAAGATTTCTGGGGAAAAAGAGAGTAGGTATCTTGATTTTAGCAGGAGAAATAGAGTCGCTACTCTTCTATCTTGTATAAAACTATTATGAAAATGGTGCTCTAGATTCTAGCATGAGCTCATTTCCATAAAGGGTAATTCTAGCAAGAGGAATAGGACATCTAGTGGAGGAGCATAGTAGAAAAAGGCAGAAGGGAATGAAACAACGAAAGGTTGTTATGAATTAAATCACCCTTAATGTTATTTTTCAGATTGCTTTTTTTTTGAAACAGGATCTTGGTCTTACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCCGTAGTGCAATCTTGGCTCACTACAACCTCTGCCCCCTGGGCTCAAACAATCCTCCCACCTCAGTCTCCTGAGTATCTGGGACCACAGGCGCACACCACCGCGCCTGGTTACATTTTTTGTGTATTTTGTAGGGACAGGGTTTCTGCCATGTTGACCACCCTGGTCGTTTTTTGTTTTTTCTTTTTGGGACGGAGTCTCCCTCTGTCGGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAAGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATCCGCCACCACGCCCGGCTATTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTAAGCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTGACCAGGCTGGTCTTGATCTGCTGGACTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTCAGATTGCTTTTTAAGAAATGATTGAACAGTAATACCACCAGATCAGAAATCAGAAGACGTGAGTTCTGGTTGTTGCATTTTGCAATATGGCATGTAAACTTCCAAGTCATACTGGATTCCTTGAGCTGGCTCTTAGTTGACTTCCCAATTTTTAACTCCTTCAACTTTCTTCTCAACTAAAAATTGCTATCATAATATAACACCAGAAATTGGAGTCTATTACGTTTTACAGAAATTGATAGTAAAGTTTCAAAAACAACAAGAGGATGGAGTCAGGCATGAATACAGTGGACGGAAGAGAAGACTAAAAATGTGAAGAGATGCTTATAGCTTAGGTCTCTTCCAATTCAGAAATGATCATATGCCAAATATCATAATGTATACATTCATCTATAAGTTGCCTTTTATACTCAAAAATTTTTCAAGATTCATCTATTTTGATTCATACAGTTCCTTTCAGTTTATTTTAAAACTATAATATTCTACTGTATGAATATATCAGTTTTCTCTAATCC
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Task1_train_3452
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This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3453
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A variant on Chromosome 2 in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
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Pathogenic; Noonan syndrome
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GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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Task1_train_3454
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Here is a variant affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Noonan syndrome 1
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GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCCTTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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Task1_train_3455
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A genomic change on Chromosome 2 affects SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
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Pathogenic; RASopathy
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GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCCTTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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Task1_train_3456
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Here is a variant affecting SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
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Pathogenic; Cardiovascular phenotype
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GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCCTTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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Task1_train_3457
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Given this variant in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Noonan syndrome
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GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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GTGATCTGCCCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCGTTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGT
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Task1_train_3458
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Here’s a variant in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) located on Chromosome 2. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
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Pathogenic; Noonan syndrome
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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Task1_train_3459
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Located on Chromosome 2, this mutation impacts SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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Task1_train_3460
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Consider this mutation in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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Task1_train_3461
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Chromosome 2 houses a mutation in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Fibromatosis, gingival, 1
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTGTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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Task1_train_3462
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Assess the clinical impact of this variant on gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; RASopathy
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CCGCTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCTATCCTTATTACTTTCAATTGGCCTTTCATATTTCTTATCTTGGTCTGTGTGTCACATTCTCAGTGAAGTCCTCAATTCCATCTTCCAATTTACTAATTTTATCCTTGAACTGGGTCCAGCAAATGTTATACTACATGAGTTATTTCAATGCTTGTATATTTAATTCTCGAAATCTCTGTCTTTTGATATCTAGAAATCTGCTCATTTCCTTTCCACCTATTTTTGTTTCACAATATCTTCTTTATAAATGGATCATATTCCTTCACTTATCTCTTTCAGCATCCTAAACTTCTTTTAAACTTTTTGTATGTCTATTATACAAAATCAATTTCATCTGGAATAAATTCATGTTGTAATTGTTGATTTTATTAATTACCATTCTGAGAATTAGAATTTGCCTTGTTTTTTGGAATTCTGTATTATATGCTTCTTAGTGGGAGACTTAATGTTTTGTTTCCTTTTTTTCTCCCATTATGATCACTCTTCCAAACCAGAACCTGCTCTTAAAATGACTTTGCGGGTTCAGGCTTCATATTGACTTAATATTGTGGGAAACTTTGTTAAGTTATTATTGTAAGGCAACGTTTTTGTCTCCCCACATCAAGTCCACAACTTTTTAGAAAACTTTACTGTAGATACCAGGTTGGCAGATTTTCCCAGCATCCTGTTATAAGGAGGGACTTGAGCAAGAAATCTTGCTCTGGCTTTCATGGAACACATTTGAAACAATTCATTGTCCTTAACAGCCTGAACACCCAGATACCAGAGTTCACTACCTTGAATGTCTATTCCATTCCTGATCTTGTTTTCAAGTCTAGTTATATATATATTCCACATTTTTCTTTTTATACTTTATTACTTATGTGTGTTTGGAGCAGGAATGGAAGGGCTGTGGTGATGCTTGAACTTACCATTCTATTTTGCCTGAAAGTCTTAATTAAAAAAATATTTTACAAGCTCAATGCTGTATCATAATGAGTGGATTTTAGAGTGAGAACACAGCAAATGCTAGAAACCTCAGAATGACTCTTAATGCTAACTTATTAGGACTGACTCATGTTATTTTAGCATTTGAAATATCTGAGGAGTTAGTTACCTTTCTTTCTATCTCGTGGTATCTGAATCACCCAGGTCCTGGACCTTATTGTCCTATTTACCTCATTCCTATTCTAAATAATAATGCACTTATCACATACTGAGTAAGCTTACTATGTGAAGGTAGATAGGTAAATATTTCAGATAGGTTATTTAATTTTTCACAAAAATCCTGAGATTACAGATTGAGTATCTCTTACCCAAAATGAAGTGTTTAAGATTTCAGATTTTGGATTATTTGTATTATACCTACTGCTTCAGCACCCCAAGTCTGAAAATCCCAAATCTGAAATGCTCCAATGAGCATTTCCTTTGAGCATCATGTTGGAATAGTTTCAGATTTTGGAGCATTTCATATTTGGGATTTTTGGATTAGGAATACTCAACCTGTATTATCATTCTTATTTTACAAATAAAGATACGGAGGTTTAAAGAAATGAAATAACTTGCCACTGGTCACACAACTAATAAGCAGCAGAGCTTAGACTGGAACACAAGTAATCTGACCTCAGGTGCAAGTTCTGTGGTCTCTTACTTAATAGTCATTCATTGACATTTCTTAACGTTTTACAGTAGGCCATTGGGTGACAGCTGTAATACCTCCCCCCTTGGCGGTATCTGTCTTTCTATAATTAACAAGAGACCACTTTTTCTGTTTGCTAAGATAACAGAAACATATGTTGACAATGACCCTATGAAAAAGGAGCAATAACAGATAAATAGTCAACAATTAGTATCTATGACTTTAGCTGGAAAGAAGTAAGACTCTCAATTTTAATGTAAATGTAGGCTTTTATGCAGACTTTTCGGGTATATAATTGAAGTACTTACCTCTGCTAAGTCTTCAAAGCAGCTTCCTACTAGTGGATGGGGACTGCCTTCATCTGTCATTTCTACTTTATCTTCTATATGGCCCAGTAACTTTACACTAAGTTCATGTATATCTACTATGCGACTAAATATATTTTCTACATCCTGTTTGGGGGAAAACACATTAATTCAGTGAGGCTGTATTATTATAATATTAAACAAATTTTGAGCCAATAAGTCATTTTATAATCACAAAATTTAACATGTCAGACACAGTGAAAAATTTTAATGACTTAGAAATATGAATAAAGGACAATTCAAGAATTCCTTCTGCAAAGGTGTACAATTTGCAAATACATTTCTCTAGGTCAGTGGTCTTGTAACTTTCTGGTCTCAGGACTCCTTCACACTCTTAAAAATTATTGAAGATTCTAAAAACCTTTTGTTTATAACTATGTATTTCAATGTTTACCATATTAGAAGTTAAAACCAAAAATTTCAAAAAATATTTAATTCATTAAAAATAATAAACCCATTATGTGTTTAACATAAATAGCACTTTTATAAAAAGTAACCAAATTTTTTTTAAGCCATAACAAAAAACATTTAGTAGAAGAATGGCAATGTTTTACATTTGCAAATCTCTAACATAGCGTACTAGAAGACAGCAGGATTTTCATATCTATTTCTGCATACAATCTGTTGTGACACATTATTTCAAAGTATACGAAAAATCTAGCTTTTCTGTGTAATTTTTTTATTGAGATAAAACTCACATACCATAAAATTCACTCATTAAAAGTGTAGTTACTAGTCAATGGTTTTCAATATTGGTTGTGCAGTCATCACCAGTATCAAATTCTAGAACATTTCATTACCACAAGAAGAAAACCTATGATTTTTTTGGAAGGTGGATACCTAAATACCCAGTAAAGTCACTCTCCATTCCTTTCCTCTCCCCAGTGCCTGACAACCACTAATCTACTTTGTCTCTATGGATTTGCCTATTCTGGACTTTCCATATAAATAGAGTGACTATCCTTTTATGATACTATACTAAAATTCAACAAATGATAGTTTCTTAAGGGTTAGTTGCAATGTAGAATCTGCAACCATATCCATTTTGTATTTAAATTAAAATTGGTTACTATTATTTGATTTTTTTATCAGTGACTATATTTATCAAGTTGACTTTGAGGCATAGTTTATATACGAAACTCCTATTTTAAATGTTCTTTTGGTGAGATTTTGTGTAGTTATTCACCCTTCTAACCATCGGCACAATCAAGATACAGTACCTTTTCATCGTCTTAAGAAGTTTCTTTGTCCCCCATTTCCATCAACCCTTACTATGCCTCACTCCCAGGAAACCTGTGATCTCCTTTTTGTCTCTATAGACATGTCTTTTCTAGAATATTAAATAAATGGAATCATATATTGTCTTTTGTGCCTAGTTTTTTGCTTATATTTCTGAGATGCACCCATGCTGTTGCACGCATAACTATTTCTTTTTATTCCTGAGTAGCATTCCACTGTATGGTCATACCACAGTTTGTTTATACATTCACCTGCTGATGGACATTTGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTATTACAAATAAAGCCGCTATGAACATTCATGAACCAGTTTTTGCATGGACATGTTTTCATTTCTTCTGGGTAAAAACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGCAATATGGTTAGTTTATGTTTATTGTTATAAAGAACTGCCAAACTGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATGAGCCAGGCGTGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATCACGGCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGCCGAGACTACGTCTCAAGAAAAAAAAAAGAGAGAGAACCACCAAACTGTTTTCCAAAATATACTAGTTTACTTTCTCAGGTAATGTGGGAATTTTATATTCCCACAAGTAGTTGCTCCATA
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Task1_train_3463
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A variant found in Chromosome 2 affects SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; Noonan syndrome
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AAAAACTTTTATAATTAGATTTAGTTCCCTTATATATTGTCGAATTTCTGCCATAAATGCTTTTACCAAATCATAGTAAGTTTGTTCTCCTGAGGTGGAAGGCTCTTCGTCAGTTAAAGATAATATATTAATATCTTCTACATCTTGATGAAACATATCCATCAATACCTATACAGTCAGAGATATAAAAAAGTATAATAAAATATGAAGCTTTCGTAGAATTTGATGTGAAATGCTCTAAGTTCTCTGAATAAAGTTCTTAAATGATAAAAAAGCAGACAAACAAATTTCTCTTCTTGGATATATTGCCAGCATCCCTCCACAGCTTCTCTAAAACAGAATTCAACATGTGATATAACTTACTACACTCCTCCAAGTTCTCTATCACTACTAGTATTTATCTGTCTGTCTCTCTTGTTAACCTATTACTTCCAATTTGTTTCCAGATCCTGTCTTTAATTTCCCTGACTTGGTTTTCTCTGTTTTATACCCTGCCATCATCACTTTATTCCATGGCCTCAGTATCTCATATTTAAATGTTTATAGCTGTCTATTCGGCCGATTTTCCTACATTTGTTGGGAATAGGTCAAAATAAGCTATTATTTTCTGCAAGAAGTCTACTGTTACTACTCTTGCTACAACACATCTTTCCCCTTCTTGAGAACTTCTACAGCATCATATCTCTATAACACAATAAAATATTATTTTATCTTGTGTGCTTTCTGATTGTTTCATGAATATAAGTATACCTTCATCAACTCTGGAGCCTTGTTTTATATATACTTATCTTGCATCTCCTCTCTGTGTAAACATGTAGTAGGTACTCAAAAATATTTTATTTATCTGATTCATTAAAAAGCATCAAGTATTTCGTATTCGTGTCTTCAGTTAAAAATACCCAAACATTTGAAATTCTTCTTCAAATCAGGTGGGTTTTTTCACTCTATATGGCCACATTCTCAAAGAACAAATAAATACTAAAACATAATTTAGTGGAATCAGCAATCAGAAATAATATTCCAAATCAGTAAGAGTATAATGAGGAAAATGGAATGAAATGCTTCATCAGAAAACATTTTCCTTTCTGCAAAGTTGTTTTCATAAAGTGAACATCCTTAGGTAATGACTAAAAGCTTTAGACTCAGAGAGACCTGGAGTTCAAGTCTAGGCTTTGAAACTTCTCAGAAAATTCTGGACCAATTTCTTTATCCCTGTGAATTTCAGTCTCCCTTTTATAAAATGTAGCTAAGATCACTTACCTTAGAGGAATATCATAAGGACCAACGGAGATAAGCCACATATATGCTTAACCTTCAATAAGTGTTTGCTCTTATTATTATTATTGTAAAACCACAAAGTAGTATCTGAAGAAAGCTAGGTGCTGAAGTAAAACTATCGTTTTGTGGTTTTACATTTTGAAAAATTGTTTTTAAGTAAATCCGTAACCTTACAAATCTTTCAATCCAAATAAATTTTAAGAAATTAACTACTAGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGGAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCTAGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGACAATCACTTGAATCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGATTCCGTCTCAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAATTAACTATTAAGAGATTACTCTAATTAACCCTAGTTGCAACAGCACAGAAGAAAAAAACTGCATGACATATTTAAACACATTTTAATATTATATATCTAATGTCTTATTTCTATAAAGTGGTATCTTGAATCCCTACTATTAGGTTACTGGAGATATTCCCCAACACATAATACAATTTTATTCTATATGAATAGTACGTTAGCATCTAATAAGTCATAAAAAGAAACTTAAGAAAAAAATAGAAAAGCTCAGTTTCCTACCTTGTCAGCACACATTGCCACTTTAATATCTTGTTTTGTAATTTCATAATGCCGTATATTTCTTACATAATTCCCAACCAGCTTTAAAATGTCTGCAGAAATGTATTCTAAGACTGCTACTATGTAAACAGAAACCTGGTGGTCAATTTTATAACCTAGGACCTCCTGCAAAATTAAAAGAAAAGCATGTTTAAACATCATATACTGTACATTTAACACACTGATTAAAAATAAAAAACATATTTGCACCTTAACTTACACTTTTTTTCCTGAGGCCTGTGCTTACCAACAACATTTAATTGTAAGTGGTTCAACAATGAATAATATATGTATTACTATTGAAAATGTAAGCTAAGAAAAGGCAAGGCAAAATTACCTCTAATGATGTAAAATACTTAAGCGGAGATTACAAATAGATAATCCCTAACCTATAAAGGAAGGCCCAAGTTTGGGGAAGGGAGCAAATGCTCTTTGTTACCTAATTCAGAATACCTGGAAGTAACTATAACAAACAAGTTTTTTCTTTTACAAAAAATGAGAGTTAATATATTATTGGTATCTAGGAATCTCTACCAGGCTTATACTTTTAACTTTTCCAAGGGAAGATGAGCTCCCCAAAACCACAGCGGGCATATTCCTGGTATTCCTGGCAATTTCTACGAAAATAAAATTCATGTTATGTCCTACTGAATAATGGTTGCTGTTAAGAAAATGTTAAATAGCCCTAATATTAAACTTCAAAGAGAATATGGGCTTTTGTGGGACTGGTCTGTTCATACAGAATAACAAATTCTATTTTCCAAACAACCCATTTAAGGGAAAAAAACAACTTTGAAATAAGAAGTTTGTTACAAATTGGAGACAGGCTGCATTTACCTTTTAGGGTATATAAAAACTAATAAGGGTATCATGATAAAGGTGTATTAAAATAAATTGAAATGATATTCACAATTAGCACATAAAACTCAAAATTTAGGATTATTAACATAATATTTATATACCTCAATTTGTTAATTCCCTTAGAATACAATTCAACATATGGCCAATGAAAATCATGAAGAGAATGATGAATGCCTTTTCCATAAGGCAGGTATTTCTATTCAAAGAACTGAATGCAAAATACAACCTTAAACTCATTCAAGTGTTTAACTTTAAATTTTGGACAACATCAAGCAAACCTGAACTTTCTAACACTATCACTTAAGAGTCTTGTGAACTTGGCATAGAAGTTACTTAATCACTTTCTGCCTCTGTCACCTCATTTACAAACTGTGGATAATAATAACTTTGTTGAATAATAAAACTCAGACAATGTATACAAGTATTAGCATTTTGTCTGTATTATAGTATGTACAAAATTACTGGCATCTAAGTTTTTAATTATTATAATACCTATATTTTTGTTGTGAAAGGTAATAGTAGTTCGTTACATTAACTAAAATAGAAATAGCATTATTCGAGCTTCCGGCAGTTATTCTATTAGTTCTATAGAGATTCAACTGACTGACTGACTTATTTACATGATAAGTAGGACTGGAGAGTTTAGGTTATCTTTTTGTTCCAAGATTACACATAGCCTTGTAGCCTTTTCACAGAGGTCTCTACACAAAGTACTAACATCAAAAGGATTTATAGGAACACTTAGGTCTAACCAACAAGAAAGGAGGAGTTTTATAAATTCTCTTTGTGGTCCTAATTACATCTGAGATAAACAAAATCCACAATAACTTTCTTAGTCCTCTCAACTTGCTTATTACTATTGATATGAAATTACTTTAAATCATGTTGCCCAGTTTATATTTTCTTATTATCATAGCATCCCTTCTCACCACATAAATCTCTGGAAAACTTAGAATGAGAGAATTTTACTCTTAAGTTGACTCAATTATCCATAAAATATATTCTTATTGTATAAAAATGGTGGGTTTTATTTTTCCCTTAAAAGGCAAGAAGGCAGTAGTTCAGCATTACCTTTAATAAAGGATGAATTTTTTCTACTGGGAGAGATAAAGGGTTTCTTCGCTTCCTCTTTTCAATAGCTGATTGGGCA
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Task1_train_3464
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A mutation found in SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Noonan syndrome
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Task1_train_3465
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This mutation is located in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
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Pathogenic; RASopathy
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TGCCACTTTAATATCTTGTTTTGTAATTTCATAATGCCGTATATTTCTTACATAATTCCCAACCAGCTTTAAAATGTCTGCAGAAATGTATTCTAAGACTGCTACTATGTAAACAGAAACCTGGTGGTCAATTTTATAACCTAGGACCTCCTGCAAAATTAAAAGAAAAGCATGTTTAAACATCATATACTGTACATTTAACACACTGATTAAAAATAAAAAACATATTTGCACCTTAACTTACACTTTTTTTCCTGAGGCCTGTGCTTACCAACAACATTTAATTGTAAGTGGTTCAACAATGAATAATATATGTATTACTATTGAAAATGTAAGCTAAGAAAAGGCAAGGCAAAATTACCTCTAATGATGTAAAATACTTAAGCGGAGATTACAAATAGATAATCCCTAACCTATAAAGGAAGGCCCAAGTTTGGGGAAGGGAGCAAATGCTCTTTGTTACCTAATTCAGAATACCTGGAAGTAACTATAACAAACAAGTTTTTTCTTTTACAAAAAATGAGAGTTAATATATTATTGGTATCTAGGAATCTCTACCAGGCTTATACTTTTAACTTTTCCAAGGGAAGATGAGCTCCCCAAAACCACAGCGGGCATATTCCTGGTATTCCTGGCAATTTCTACGAAAATAAAATTCATGTTATGTCCTACTGAATAATGGTTGCTGTTAAGAAAATGTTAAATAGCCCTAATATTAAACTTCAAAGAGAATATGGGCTTTTGTGGGACTGGTCTGTTCATACAGAATAACAAATTCTATTTTCCAAACAACCCATTTAAGGGAAAAAAACAACTTTGAAATAAGAAGTTTGTTACAAATTGGAGACAGGCTGCATTTACCTTTTAGGGTATATAAAAACTAATAAGGGTATCATGATAAAGGTGTATTAAAATAAATTGAAATGATATTCACAATTAGCACATAAAACTCAAAATTTAGGATTATTAACATAATATTTATATACCTCAATTTGTTAATTCCCTTAGAATACAATTCAACATATGGCCAATGAAAATCATGAAGAGAATGATGAATGCCTTTTCCATAAGGCAGGTATTTCTATTCAAAGAACTGAATGCAAAATACAACCTTAAACTCATTCAAGTGTTTAACTTTAAATTTTGGACAACATCAAGCAAACCTGAACTTTCTAACACTATCACTTAAGAGTCTTGTGAACTTGGCATAGAAGTTACTTAATCACTTTCTGCCTCTGTCACCTCATTTACAAACTGTGGATAATAATAACTTTGTTGAATAATAAAACTCAGACAATGTATACAAGTATTAGCATTTTGTCTGTATTATAGTATGTACAAAATTACTGGCATCTAAGTTTTTAATTATTATAATACCTATATTTTTGTTGTGAAAGGTAATAGTAGTTCGTTACATTAACTAAAATAGAAATAGCATTATTCGAGCTTCCGGCAGTTATTCTATTAGTTCTATAGAGATTCAACTGACTGACTGACTTATTTACATGATAAGTAGGACTGGAGAGTTTAGGTTATCTTTTTGTTCCAAGATTACACATAGCCTTGTAGCCTTTTCACAGAGGTCTCTACACAAAGTACTAACATCAAAAGGATTTATAGGAACACTTAGGTCTAACCAACAAGAAAGGAGGAGTTTTATAAATTCTCTTTGTGGTCCTAATTACATCTGAGATAAACAAAATCCACAATAACTTTCTTAGTCCTCTCAACTTGCTTATTACTATTGATATGAAATTACTTTAAATCATGTTGCCCAGTTTATATTTTCTTATTATCATAGCATCCCTTCTCACCACATAAATCTCTGGAAAACTTAGAATGAGAGAATTTTACTCTTAAGTTGACTCAATTATCCATAAAATATATTCTTATTGTATAAAAATGGTGGGTTTTATTTTTCCCTTAAAAGGCAAGAAGGCAGTAGTTCAGCATTACCTTTAATAAAGGATGAATTTTTTCTACTGGGAGAGATAAAGGGTTTCTTCGCTTCCTCTTTTCAATAGCTGATTGGGCATCAGCTATTGCCCATTTATCAATTGGATGAGGGAAACTTTTTTGAACACGTTCCTTGGAAAATAGGAAAATAACAACTAAGCAAAAAATATATTAAATAGTGCTCTTCACTTAAAATTTACTTTTAAAATCAAAGAATACCAAAAGTAGAGCTTTTCACATGTGGTATAATTTACATTACAAACATATGAAGCTAAGAGAAAACAGTAATTGTCAATGTATTAGTTCCTTAATTAGACAATAAGAGACTAAACATTCTTTCTATTATCTAGGGGGAATATCACATCCTGAATTTCAACTTCACTGTGATAAAGCTAATTACAAGAATGAGTAGAAGCTACTTTAAATAGTACTTGTATAAAATTTCAAGGAACAACACCCAAGATCAAGAAGTAAATATCTAAATCCAGTTCTCACTCACTTGTCCTTACTTTCAGTGGTAATTACATGCAGCATTTTTCAATTGAAACCTCTATGAATATTCTTTATCCACCATGCAAAGGCACTTCAAAACTATTTACAAATCATGGAAAGCAATGGTTTGCATTGGTGACAGCAATTTTAATACATTGTAGTTTCTTTAAAGTCCTCCCATAGTCATTCGTTTTTAACAAAATACTTCAATTTAATTTCCAGAAATTCTTTAGTTAAAATTTCCACTGAGAGTGAAAGAACTCAGGTTACTATCACAGCTGAATTTCCTTCCTTATTAAACTAATATAATTCACTTCAAAAAGGCGCTTTCATCCTCTCAAAACTTTAAAAAATCCACTTGCAGGATACCATAACTAAAACCAGTAGAGGTCGCTATTACATAACTTTTACACATGTGTTTTGAATAAATGAGTATTCAACTAGTATGTAAAAACTACTAGATGAAATTAAACATCATCATAATTATAAATCTGAATAAAAAGTTTTATTATTTGCTAGTAAAATGGAAAATTAAAAAAGTGTGATGCCATGTGATGCCCTTGGTGGTGAGGGAGGGGTGGAGAACACAATGATTCTTGGAAATCTTAAGAGCAAATCTATAAATTAAGGAGTGTAATCCATTCAATTTTAATAAATTTCCATTATGTCCAAGGCTAAGTCAGCTTCCAAATAAAGTTATTTTAATTCTAATTAATGGAATTAGAAGCATGTTGAAAGAAATTATAGCAGTTAAAAATGGGGTTTACAAACCTTTTCAACTGTCTAGTTGAAAAGCTGTTTGCCAGGACACCAGCCTCATGCAGTAAAACGCAATACAAAGGCCCAAAATATTGAGGAGGCATCGCAGGTGAAAAGGGAGAAAAGGGAAGGGGTAAAGGGAGAGAAGGGAACATCCAAAACAAGAATTCTTTTCTTTTTTCCAAGTTTATTTTACAGACTTGTTAATCCAAAAATGACAAGATATTTAGGACTAACTTACGTGGTTTTCAGTTAAAATGTTTATAGTGATGGGTTTAACCCATGATTAACTAAGTGCAACCATGGTACAAACCTAATCATGTTATGACCCTGTGGCTTTCCAACATTTTTTAAAACCTCAACTCATAGTAAGAATAAATTTTCAACACATTTTTACATTATACCCTTACATACTGCACACATACTCAAATGAAACAGTTTCCTAAAACAAACCTGTCCTTATTATATGTAGCACACTGGCATTTGCTATTCTGTTTTTTATTTGTATATTTATTTATTCTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCGCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGTTCACTGCGACCACCACTCTCAGGTTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGCATTACAGGCGTGTGCTACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCCCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCCGGCCTGTTTTATTTTTTAAAATGAGGGTTGGGCAATGCACTAAAGTAATTTTATGACTTACTAATGGCCATGACCTGGAGTCTAAAAACACT
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Task1_train_3466
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A variant was discovered in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
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Pathogenic; Noonan syndrome 4
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Task1_train_3467
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The gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
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Pathogenic; Fibromatosis, gingival, 1
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TGCCACTTTAATATCTTGTTTTGTAATTTCATAATGCCGTATATTTCTTACATAATTCCCAACCAGCTTTAAAATGTCTGCAGAAATGTATTCTAAGACTGCTACTATGTAAACAGAAACCTGGTGGTCAATTTTATAACCTAGGACCTCCTGCAAAATTAAAAGAAAAGCATGTTTAAACATCATATACTGTACATTTAACACACTGATTAAAAATAAAAAACATATTTGCACCTTAACTTACACTTTTTTTCCTGAGGCCTGTGCTTACCAACAACATTTAATTGTAAGTGGTTCAACAATGAATAATATATGTATTACTATTGAAAATGTAAGCTAAGAAAAGGCAAGGCAAAATTACCTCTAATGATGTAAAATACTTAAGCGGAGATTACAAATAGATAATCCCTAACCTATAAAGGAAGGCCCAAGTTTGGGGAAGGGAGCAAATGCTCTTTGTTACCTAATTCAGAATACCTGGAAGTAACTATAACAAACAAGTTTTTTCTTTTACAAAAAATGAGAGTTAATATATTATTGGTATCTAGGAATCTCTACCAGGCTTATACTTTTAACTTTTCCAAGGGAAGATGAGCTCCCCAAAACCACAGCGGGCATATTCCTGGTATTCCTGGCAATTTCTACGAAAATAAAATTCATGTTATGTCCTACTGAATAATGGTTGCTGTTAAGAAAATGTTAAATAGCCCTAATATTAAACTTCAAAGAGAATATGGGCTTTTGTGGGACTGGTCTGTTCATACAGAATAACAAATTCTATTTTCCAAACAACCCATTTAAGGGAAAAAAACAACTTTGAAATAAGAAGTTTGTTACAAATTGGAGACAGGCTGCATTTACCTTTTAGGGTATATAAAAACTAATAAGGGTATCATGATAAAGGTGTATTAAAATAAATTGAAATGATATTCACAATTAGCACATAAAACTCAAAATTTAGGATTATTAACATAATATTTATATACCTCAATTTGTTAATTCCCTTAGAATACAATTCAACATATGGCCAATGAAAATCATGAAGAGAATGATGAATGCCTTTTCCATAAGGCAGGTATTTCTATTCAAAGAACTGAATGCAAAATACAACCTTAAACTCATTCAAGTGTTTAACTTTAAATTTTGGACAACATCAAGCAAACCTGAACTTTCTAACACTATCACTTAAGAGTCTTGTGAACTTGGCATAGAAGTTACTTAATCACTTTCTGCCTCTGTCACCTCATTTACAAACTGTGGATAATAATAACTTTGTTGAATAATAAAACTCAGACAATGTATACAAGTATTAGCATTTTGTCTGTATTATAGTATGTACAAAATTACTGGCATCTAAGTTTTTAATTATTATAATACCTATATTTTTGTTGTGAAAGGTAATAGTAGTTCGTTACATTAACTAAAATAGAAATAGCATTATTCGAGCTTCCGGCAGTTATTCTATTAGTTCTATAGAGATTCAACTGACTGACTGACTTATTTACATGATAAGTAGGACTGGAGAGTTTAGGTTATCTTTTTGTTCCAAGATTACACATAGCCTTGTAGCCTTTTCACAGAGGTCTCTACACAAAGTACTAACATCAAAAGGATTTATAGGAACACTTAGGTCTAACCAACAAGAAAGGAGGAGTTTTATAAATTCTCTTTGTGGTCCTAATTACATCTGAGATAAACAAAATCCACAATAACTTTCTTAGTCCTCTCAACTTGCTTATTACTATTGATATGAAATTACTTTAAATCATGTTGCCCAGTTTATATTTTCTTATTATCATAGCATCCCTTCTCACCACATAAATCTCTGGAAAACTTAGAATGAGAGAATTTTACTCTTAAGTTGACTCAATTATCCATAAAATATATTCTTATTGTATAAAAATGGTGGGTTTTATTTTTCCCTTAAAAGGCAAGAAGGCAGTAGTTCAGCATTACCTTTAATAAAGGATGAATTTTTTCTACTGGGAGAGATAAAGGGTTTCTTCGCTTCCTCTTTTCAATAGCTGATTGGGCATCAGCTATTGCCCATTTATCAATTGGATGAGGGAAACTTTTTTGAACACGTTCCTTGGAAAATAGGAAAATAACAACTAAGCAAAAAATATATTAAATAGTGCTCTTCACTTAAAATTTACTTTTAAAATCAAAGAATACCAAAAGTAGAGCTTTTCACATGTGGTATAATTTACATTACAAACATATGAAGCTAAGAGAAAACAGTAATTGTCAATGTATTAGTTCCTTAATTAGACAATAAGAGACTAAACATTCTTTCTATTATCTAGGGGGAATATCACATCCTGAATTTCAACTTCACTGTGATAAAGCTAATTACAAGAATGAGTAGAAGCTACTTTAAATAGTACTTGTATAAAATTTCAAGGAACAACACCCAAGATCAAGAAGTAAATATCTAAATCCAGTTCTCACTCACTTGTCCTTACTTTCAGTGGTAATTACATGCAGCATTTTTCAATTGAAACCTCTATGAATATTCTTTATCCACCATGCAAAGGCACTTCAAAACTATTTACAAATCATGGAAAGCAATGGTTTGCATTGGTGACAGCAATTTTAATACATTGTAGTTTCTTTAAAGTCCTCCCATAGTCATTCGTTTTTAACAAAATACTTCAATTTAATTTCCAGAAATTCTTTAGTTAAAATTTCCACTGAGAGTGAAAGAACTCAGGTTACTATCACAGCTGAATTTCCTTCCTTATTAAACTAATATAATTCACTTCAAAAAGGCGCTTTCATCCTCTCAAAACTTTAAAAAATCCACTTGCAGGATACCATAACTAAAACCAGTAGAGGTCGCTATTACATAACTTTTACACATGTGTTTTGAATAAATGAGTATTCAACTAGTATGTAAAAACTACTAGATGAAATTAAACATCATCATAATTATAAATCTGAATAAAAAGTTTTATTATTTGCTAGTAAAATGGAAAATTAAAAAAGTGTGATGCCATGTGATGCCCTTGGTGGTGAGGGAGGGGTGGAGAACACAATGATTCTTGGAAATCTTAAGAGCAAATCTATAAATTAAGGAGTGTAATCCATTCAATTTTAATAAATTTCCATTATGTCCAAGGCTAAGTCAGCTTCCAAATAAAGTTATTTTAATTCTAATTAATGGAATTAGAAGCATGTTGAAAGAAATTATAGCAGTTAAAAATGGGGTTTACAAACCTTTTCAACTGTCTAGTTGAAAAGCTGTTTGCCAGGACACCAGCCTCATGCAGTAAAACGCAATACAAAGGCCCAAAATATTGAGGAGGCATCGCAGGTGAAAAGGGAGAAAAGGGAAGGGGTAAAGGGAGAGAAGGGAACATCCAAAACAAGAATTCTTTTCTTTTTTCCAAGTTTATTTTACAGACTTGTTAATCCAAAAATGACAAGATATTTAGGACTAACTTACGTGGTTTTCAGTTAAAATGTTTATAGTGATGGGTTTAACCCATGATTAACTAAGTGCAACCATGGTACAAACCTAATCATGTTATGACCCTGTGGCTTTCCAACATTTTTTAAAACCTCAACTCATAGTAAGAATAAATTTTCAACACATTTTTACATTATACCCTTACATACTGCACACATACTCAAATGAAACAGTTTCCTAAAACAAACCTGTCCTTATTATATGTAGCACACTGGCATTTGCTATTCTGTTTTTTATTTGTATATTTATTTATTCTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCGCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGTTCACTGCGACCACCACTCTCAGGTTCAAGTGATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGCATTACAGGCGTGTGCTACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCCCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCCGGCCTGTTTTATTTTTTAAAATGAGGGTTGGGCAATGCACTAAAGTAATTTTATGACTTACTAATGGCCATGACCTGGAGTCTAAAAACACT
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Task1_train_3468
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With a mutation on Chromosome 2 in gene SOS1 (SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
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Pathogenic; not provided
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Task1_train_3469
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Here is a genetic alteration in HAAO (3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Congenital NAD deficiency disorder
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CACCAACTCTGCACCAGGCTGTGTGCACATACTCTATGCACATTGAATTCTTCCACCAGACAGGGGCTGTTGTCCCCATGTGCTTATGGAAACAGGCTTGGAGAGGTGACATGATGTGCCCTGTCCAAGATCCCGGGGTTAGTAAGCGGCAGAGAATTCCCCCAATGCAAGTTCATCTGCCTCTGGCCCCCCTGCACCTGCACGCTCCAAGAAAGGAGTGAGGTAGGTGGAGTATAGGTGGTAGGTGGCGCTGGGGAGTGGGGAGCCGGGCCAGGGAGCTGGAGGTACCCTGACCGCTATTGCAGAGGCAGAGCTCAGTGAGGAGGAAAGTGTGGTTTGGTAAGAGGTGTGATTTGAACCCAGGTCTGAGCAACTCCCCTTTTCTCACTATTCAGGAGGAGCCCGGACCCTGAGTTACGCCACTTCCACAGCGCATCCTGGAGTCTCCCCAGGCTCCAGCTGGGTGAGGATAGGCAGGGACAGAGAGGAGGCCGACCCTCAGCCCTGAGGCTGCCCAAGTGCTGCACCACCCCGCCACCAAAACCTCAGCAGGGTGGGACCAAGCCCTGTCACAAGCCCACCTCCAGCCAGATTCCTCCCAGACACCTGGGCGTCCCTCCAGAGTGAGGACACCTGTGCTGGCCAGCTCTCCTTATCACTCAATCCCTCAGCTGCCATCTGAGTCAGGACGTGAGCTGCTGGCCAGGCCCCTCAGGGGACACTCAGGCACCTGAGCTTGGAGAAACCATGGGATGGGGCATGGAGCAGAGGCAGCAGGGGGCGAGAAGGGAAGCAAAGACAGAGGGAGACAGGAGAGGCGGGTGCTGAGACCAGGGCCAACAGAGAAGGCAGAAGCCTCTGGAAGACTCCGCAGCCAGCTGTGCCTCCCATGCCATAGCCATGCCAGGTCTACCCACCTCCTCAGTATAGTTTTAGATTTTCCTATTGACTTTTTCCACCAAGGAAACGGTCTCCAGTGAGGTGTGTTTGTGAGAAGGGGGTGGCCAGGGGAGGTGCAGGGCCCCTGGAGCGTGAGAGGTGAGGAGTTGGCTGGTTCTGCTGGCCCAGGGCCCATCGTTCCTCCACACAGCCTTGGGTGTCCCAGTGCACACATGAGGTGCTCAGCAAATATTTATTGAACAAGTGATTCTCCCATGCTCACCACAGTCCCTGGCTGTGGCCTGGATGCCCTCAGTGGGGACAGAGGCTGTTGATCAAGCTGGACTCTGGATCCTGAACCCCCAGAATGAGGCTCCCTGAGAGGATGGGGAGCCCCTCTACTGATCCTTTTCCACCAGAGGAGATTCTGTGTCTCTCCTTAAGGGGACACACCTTTCTCTTTAAATTTTGCTTTTGTTTATTTATTTTGGGGTAGGTAGTAGAGAAGCACAGTCCAAACTTCAAGGTGCAAAAGGTGATTCAAGGCAAATTCCCCCTCCCACCTGCCCCAGCCACAAGCCACGAATGGGTTTTGCAGCCTCTAGTTAAGGAAGGGCCACCCTGCCCCAACTCCTCCTTCAGCTCCAGGCACCTCCCTACCATGCCTACCCCTCAGCCACTAGCTCCTCCTCCCTCAGCCCCTCGAACTCCCTCTGCCACCCACTCAGCCCAGCCCTCACCCACGGTGTTTTTGCACTTTGCCCCCGTCTGCGGGGGAGGATCTCATTTTGGAGACCAATTGAATCTGTCAAGTTTGTGGGGAGGGGACCAGGACGTCCCCCTTCACATGGCCAGCCCCTATATCCAGGGGGAGGATGCCCCATGGCTAAAACCTCTCACCCGCAGGGCATGGGTTGTTTCCTGGGGCTCCCCCAGCAGAGGTGCTAGCTGTGGAGGCGTCACTGCCTGACCACCAGCTTGGAGGCAGCAGTCGTGCCCTGTGATTTCAGCTGTGCCCCCTCCACTCATCAGCCACATGTCCACCCCTCTCCAGTCCATCATCTCTGGGCCTCGAGTGGGAAGCGCCCCCTCCCGCTAGGGCCAGGCTCCTTGCCCGCAGGCCTAGATCCAGGGAGACCAGTCAAACCTACCTCTTCACCCTCTTCGATGTGATAGTCCTTCCTGGTGTTGGGGCCTCCGATGAACATGACTTTGAGCTGCTCCTGGTGCCTGCAATGCGCAAAGTGGGGGAGACGTTCTAAACCATCTCCTAGGAGTGAAGAGAGCACGGGTCCCGTGGGGGCCAGGAGGGAGCCTGAGGGCCCCTGGGAGAGGAGCAGGGCTGTTTTGGCCTCACTGTCCCTGTTCCCCAACTCTCATCCCCGGTTCATGCCTGCGTGCATCTAAGTGTCTATGTGTCTGGGATCGTGTCTGTGTGTCTGTCTGTCATTGTTTGTGTGTCCCCCCACATCGTCTGACCCAACAAGGGAAATGATGTGGTGGTGAATCTATGGCTTCATCAACCAGGATCACAGGATCAAGATCTCGAATTACAGGAGAGTAGCAAATTGAAGACCCCTTCCCAGGATGGGGCAGTGTAGGGGCAAAACGACCTTGACCTGCCACTCACCCATGCTGTCTGACTATAGGACCCTGCACTCTCCCCTGGCTGGAGGCATGGCTCAGTGGATGCAGGAGACCGTGACATCTAGCAGGGGCCTCAGGCGGTGTCAAGTCAGTGTGGCATGTGTTTATAAGCACAGGCCCTGGGGCATGTTACTAACCTTATCTGTAAAATAGAGGAACAGTTCTTACCTCACAGAGTTTAAACAGAATACATGAATTAATATTTGGAAGCTCTCAGAATGGTGCCTAGCATATAGTAAGCACTATTTAAGTATTTGATAAAATAAATAAACCCGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCAGAGGCGGATGTATTGCTTGAGGCCACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCCTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAAGCACGAGAATCGCTTGAACCTGAGAGGTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCTACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGGGGGAGACTCTGTCTTAAATAAATAAATAAATAAATAAACTCAATACAACCCTCTCATTTTACAGCCGATTTAGCCAGCCAAGAGAGGGTCACAAAGCCAGGGAATGACTGAACCTGAGCCAGGTCTCAGGCTCCTTGACTCCCACGCTGGCGTTGGGTCTGTGGGGCATCTAGTCAGCTGTTTGGAACAAAAGGGTTCCCAAACTCCTCAGTCTTTCTGCTGTTGGTGTGGTGTTACCTTTTTATGCAAAAAATACCTCAGCACCTCCTGAGAACAGCCTGCCCCATCCCCACAGCAGGGTCCCCTTTCAGGGTGCAGACACTGGGGTGAATAAGCAGCAGAATGTGTCTGTGTAGGGCTTCAGGGTGTTCTCAGGTGGCCCTGCCACAGAGGGCAGGGGCAAGGGCTTTCCTCTGGGAAGGGGAGGCGCTGGGTCTGGGACCATTTGTACACACAGGGCACAGCAGCCTAGAGGCTGCCTGCATGGATGACGATGGTGTGGATGGCAGGGGAGGGGCTATGGGGGAGGTCTGAGCCCCCAAACTAGACTGGCAGGTCCTTTCTGAGTGTCCTGTCCTGTGGGCTGCTTTCCAGCCCAGCTGGGAGGCATGGAGGCAAGACGGAAGAGCCAGTCTCTTTCCTTTTCCTTCCCTTTTGGGAGGCTGGGCCCAATAAACCGGAAACACACGTGTGGACCTGATGTTTGGAAAGGTGGATGAGGTTGCAGGGCAGGAGAAGGCTGTCATGAACAGTCCATGCTTAAAGAACTTAAAGCTGCATAGAGCTTCAAGGAGGGGAGGGAAGCCGCAAGGAACTTGACTGGGGAAGAGTGTGCACAGGAGAGCTGGGTGCAGAGGCTCTGAGATTAGAAGCACTGGGGGTGAGCTTGGGGAACGATTGAGAAGGCTGGTCCAGGAGGGTGGACCAGCCATGGAGTCTGGTCTTGGCCTAAGGGGTGCTGGGGAACCTGGAAAGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGATAGAGTCTTGCTTGCCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGCAC
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Task1_train_3470
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The gene HAAO (3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase) on Chromosome 2 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
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Pathogenic; Vertebral, cardiac, renal, and limb defects syndrome 1
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Task1_train_3471
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This is a variant in ZFP36L2 (ZFP36 ring finger protein like 2), located on Chromosome 2. Is this mutation a likely cause of disease or not?
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Pathogenic; Oocyte maturation defect 13
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CTCTCAAGCACTAATAAAATACTTATTTGGTTGAGGAAGATTTAAGGCAAGTTCGGGCCCTTCCAAAGGCACTGTGAGACTCCCCCCCCACTCCCCGTTATTGCTACATGTCTTTATACTCGAGTATGTCACAGTAGAACTGGTGGAATAAGCAAACACTTTTTTGCTAGTTTATAAAGTTGGAATTAGAAAAGCATGCCACATTTCAGCCTGATTGCAAAGTATGTGGTCATTTTTTTCTTTGAAGTTGGATGGGCTACAACCTTTATACATTCTAAGAAAACTCATAGGATGTTCCTCAAACTACTTCCACAGCATCAAGATCGATTTCTGTCAAGAAATCATGCAATCTTTCAAAATTTACGTAAACAAGGAAAGAAATTAATGAAATAAATATTACATACAATCTCTTAAATTAAGAATTTTGTACTCATTTACAATAAAATAACCAAGTGAAGTTACAAAAGGCATATATTACTGTGAAAAGAACATACACTCCACATTTTGCCGATTAATAATGGCAATCATAATTTAACATAATAAAAGAATATATATCTATTGCTTTTCATCATACTTGATAAATACAGTATGAACAAAATTTTCATTGTATACTTTTCACAAGATAATAAATAAGTTAAATAGTTTTCATATTGAGTTGTGGTGCAGTGGTGCGAATCAACTCAAAACAGCTAAAAATTCAGCAGTTATTCTCCAACAATTACAAAGTAAGCTCTGCGCAAGGCTTCCAGAGGGAGCAGACAAAATGGTTCTAAACTGAACATCCACTAAGTGGTGGCAATGAAACCAAGTAACCAGTATGGACCTTTGGAATGCAAGGGTTTTTTCACCCCCAGACATATATAATTCTGTTAAAAAACAAAAAACACCTATGGGCTGAGGGCTAACTATCAAGGCATATTCTTGGCAGAATATATTGGATTTTAAAAAGCTTATAGGTTTAGCAAGGTGGCGGCTGGCTGGTTTGTTTACACCGGTCTGAGACACAATTAGGAACTTCTTCCAAGAGAAGGGTTCCCACATCTGGACTTAACTAATGCTGTTCAAGTGAAGAGATGGAATGGTGGTTGGTAGCTGCTGGTGCTGGGTTGATTTTTCCTGAAGTCCCAAACTCATCGGAGTCCTAACAAAGTTTAAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTATTCGTATCACAACTGCCCTGTTGTGAATATTTTGTTCAACAGAAAAAGTTCGACTTTTTTGCTCAAAAAGAATGAAACTTCGTAATAAAAATAAAAAAAAAAAGACAAGAGGAAACCGAAAAAGGAGGGGTGGGGGCCCCTCCCGGCACAGAGTTCGAGTCCAAGTGCTCGGTCGGGCTTGCAGTCTGCCTAGGGCCCATGTCACCCCCCCCACTCCCGTGCCCCCAGCAAGGGCGAGATGGCGAGGGGTGTCCTCCAACATCTCTGAACCGCCTTCCCTTCCTCCTCACTGGCGCCCTCTTGCCTCAGTCGTCGGAGATGGAGAGGCGGCTGAAGATTGGCAGGCGGCGGCCAGGGTCGAGGCTGGGAGACTCAGAGCCGCTGAGGCTGCCGGAGCTCAGGGAGCCGCTTAGGTAGCTGTCGCGGTCCGACAGCGAGTCCGGGGGGCTGGGGGGCGCGTCGAACACGGGCGAGTCGGACAGGCGGCGCGGCAGCTGGAAGCTGAAGGGCGGCGAGGGAGGTGCGGCGGCCCCGGCGGGGAGGGTCGCGCTGGGCGGCGCCGGCGGCTGCGCGGGGGGCGCCAGGCCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGACTGCGGTAGTAGGCGGCGGCGGCCACGGCGGCAAAGTTGTGGGTCTGGATGGCGAGCGGCGTGATGAGGCTGCTGAGCTCCGGACCGAAGGCGAAGGCGTTGTTGGCGCACGAGGCCGACGAGCAGGCCGCGCACGGGGCCCCCGGCGCCAGCAGGTCCTCGGCGCCCCCGGTGCCGTACAGCAGAGCGGCCGCAGCCGCGGCCGCCGCGGAGGCGCAGCATGTCGGGGCGCCCGAGGGCGTGGAGGCCGCGGAGGCCGAGGAACAGGAGGAGGCGGAGGAGGAGCAGGACGAGGCCGAAGAGCAGGAGGGCGGCGGCGGCGTGCGCGACGTGGGGCTGTCGAGCAGCAGCGGCGACTCGAGGCCGCCCGGGGGCTGATGGTGGCCCGACGGGAAGCCCGAGAAGCTGAGGCTGTGGTGCAACTTGGGCCGCGGCTCCCGCGGGAAGCCCAGGTGCAACGCATCGCGCGTGCCAAAGGCACGCAGGTCCCCGGAGGCGCCCCCCGACGGCGCGGGCCGCCGCTCGTCCGCGTTGTGGATGAAGTGGCAGCGCGGCCCATAGGGGCAGAAGCCGATGGTATGAAAGGTGCGGCACAGCTCGGTCTTGTACTTCGGATGGCGAGTCAGGCTGCGCAGCTCGTGGAAGCCATGCGCGAACTGGCACTTTTCGCCGTACTTGCACGTGCCGCTCTCCTCGAAGGGCCGGCACAGCTCGGTCTTGTAGCGCGTGGAGTTGATCTGGGAGCCGCCGCCCCCCTTCTGCTGCTGCTGCAGGTGCAGGAGGTGCTGGCTGCGATCGCCGTTCTCGCTAAACGAGCGGTCCCGGAATTTGTTCTCCTTGTTGAGCAGGGCTGTGCCGCCGCCCCCCGACGGCTCCTTAAGGGTGCCGTAGGAGGTCGGACCGCCGGCCGCCGCGCTGCCGCAGCTGCTGCCGTTAGCGGCGCCCGGGAACTTGGGCGAGCAGCTGCCGGGGCTGGGCGCGGGGTGGGCGAGTGCATGCAGGTTGCTGGCCGAGTGCCGTCGGAGGAATCCCGGCGCGAAGCCCGAGCTGGGGGCGGCGGCCACAGGCGTCCCCACCGCCTTCTTGTCCAGCATGTTGTTCAGGTTGAGGTTGGCCAGGGATTTCTCTGTCTGCCAAAGGGAGGGGAGCGGGGAAGGGATGAAAAACGGAAGGGGAAGACAGACTCGGGGCGAGCCGCAGAGGAACTCCCAGCCTGATTCTTTTCCTTTTTTTCCCCCACTCTTGGCGGATCCCGACTCGGCCTCCACCCTCCACCTATACACGCGCAAAACCAGCAAGATCTTGCTGGACGGAGCGGGAGAGGGGAGGACGCCCACCGTGGGCCGCGCTGGGTTTCGACACGTGATCCTCCGCCCCGGCTGCCGAGGTGGGCGGCGCGAAGCCTGTCCGGGAAGCCCCGGGCAGCGTGGCCGCGGTCGGCAGTGGAGAAACTCAACCGCGACACCGGCGCCCTCCTTGCCGCCCTCCCCGCCTCCAGGGCGCTCGGACACTCTTTTGCAAACCCCGGGACTTTCCCGACCTGAAAGGCAGGGCGGGAGGGGCGTCCCCCAGAACCTGGGGACAGAGGCAAAGTCCAAGAACTACAACGGCTGCTGCCGGCCGGGCCCGCTCCCTGGCCTACCTTGCACAAGAAGTCGACATCGTAGAAGGCGGACAGAAGTGTGGTCGACATGTTTCTGGATCCCGCAGTGGCCGGAGCGGCAGGCCGGGAGGTCGGGAGGAGCCCTTGGGGCGGCGTGGCCGGGCTTGAGCCACGACGAATAACGGGCGAGGGGCGGGGAGGGGCCGAAAGTTTGCCGGGGGGCGAGAGGAGAGGGCGAGTGCAGCGGCGCGGGCCGGCGGGAGGGTCCGGCGGAGTGCGGCAGGGGGGAAGGAGAGAAGCGAGGAGCGCTCCTCCGCGCCCCGGGGTGCCCGGCCCGCCCCCCCCGCGGAGCCGACGGCAGCTCGCGGACTGCTGGAACTCGGCGGCCTCCGAGCGCGCGCCCTATATAGAGCCCGGGAGTGCGGCTGCGGCGGGGCGGGCGCGCCGGGGGAGGGGACAGAACTCGGCCCCCGCCGGGGTCTCCAGGCAACGCCGCCCGCCCGCTCGCGGACGTCAGGCGCCTTCCCGGCCTCCCATTGGCCGCCGCCAATTTTTTTCCTCCGGGGGAGGGTGCTGGAGGCCTCCGGGCGGGGCCGGCGGCCCGGGCGGCCGGTGTGGCGTGTAGCTCTCGGCCCCAGTGGATGCCGCCGGGTGGCGGCGGGAAGGCACGGCTGTTCTCCTCCGGGGCTGCGCGGTCGGAGAGC
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CTCTCAAGCACTAATAAAATACTTATTTGGTTGAGGAAGATTTAAGGCAAGTTCGGGCCCTTCCAAAGGCACTGTGAGACTCCCCCCCCACTCCCCGTTATTGCTACATGTCTTTATACTCGAGTATGTCACAGTAGAACTGGTGGAATAAGCAAACACTTTTTTGCTAGTTTATAAAGTTGGAATTAGAAAAGCATGCCACATTTCAGCCTGATTGCAAAGTATGTGGTCATTTTTTTCTTTGAAGTTGGATGGGCTACAACCTTTATACATTCTAAGAAAACTCATAGGATGTTCCTCAAACTACTTCCACAGCATCAAGATCGATTTCTGTCAAGAAATCATGCAATCTTTCAAAATTTACGTAAACAAGGAAAGAAATTAATGAAATAAATATTACATACAATCTCTTAAATTAAGAATTTTGTACTCATTTACAATAAAATAACCAAGTGAAGTTACAAAAGGCATATATTACTGTGAAAAGAACATACACTCCACATTTTGCCGATTAATAATGGCAATCATAATTTAACATAATAAAAGAATATATATCTATTGCTTTTCATCATACTTGATAAATACAGTATGAACAAAATTTTCATTGTATACTTTTCACAAGATAATAAATAAGTTAAATAGTTTTCATATTGAGTTGTGGTGCAGTGGTGCGAATCAACTCAAAACAGCTAAAAATTCAGCAGTTATTCTCCAACAATTACAAAGTAAGCTCTGCGCAAGGCTTCCAGAGGGAGCAGACAAAATGGTTCTAAACTGAACATCCACTAAGTGGTGGCAATGAAACCAAGTAACCAGTATGGACCTTTGGAATGCAAGGGTTTTTTCACCCCCAGACATATATAATTCTGTTAAAAAACAAAAAACACCTATGGGCTGAGGGCTAACTATCAAGGCATATTCTTGGCAGAATATATTGGATTTTAAAAAGCTTATAGGTTTAGCAAGGTGGCGGCTGGCTGGTTTGTTTACACCGGTCTGAGACACAATTAGGAACTTCTTCCAAGAGAAGGGTTCCCACATCTGGACTTAACTAATGCTGTTCAAGTGAAGAGATGGAATGGTGGTTGGTAGCTGCTGGTGCTGGGTTGATTTTTCCTGAAGTCCCAAACTCATCGGAGTCCTAACAAAGTTTAAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTATTCGTATCACAACTGCCCTGTTGTGAATATTTTGTTCAACAGAAAAAGTTCGACTTTTTTGCTCAAAAAGAATGAAACTTCGTAATAAAAATAAAAAAAAAAAGACAAGAGGAAACCGAAAAAGGAGGGGTGGGGGCCCCTCCCGGCACAGAGTTCGAGTCCAAGTGCTCGGTCGGGCTTGCAGTCTGCCTAGGGCCCATGTCACCCCCCCCACTCCCGTGCCCCCAGCAAGGGCGAGATGGCGAGGGGTGTCCTCCAACATCTCTGAACCGCCTTCCCTTCCTCCTCACTGGCGCCCTCTTGCCTCAGTCGTCGGAGATGGAGAGGCGGCTGAAGATTGGCAGGCGGCGGCCAGGGTCGAGGCTGGGAGACTCAGAGCCGCTGAGGCTGCCGGAGCTCAGGGAGCCGCTTAGGTAGCTGTCGCGGTCCGACAGCGAGTCCGGGGGGCTGGGGGGCGCGTCGAACACGGGCGAGTCGGACAGGCGGCGCGGCAGCTGGAAGCTGAAGGGCGGCGAGGGAGGTGCGGCGGCCCCGGCGGGGAGGGTCGCGCTGGGCGGCGCCGGCGGCTGCGCGGGGGGCGCCAGGCCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGACTGCGGTAGTAGGCGGCGGCGGCCACGGCGGCAAAGTTGTGGGTCTGGATGGCGAGCGGCGTGATGAGGCTGCTGAGCTCCGGACCGAAGGCGAAGGCGTTGTTGGCGCACGAGGCCGACGAGCAGGCCGCGCACGGGGCCCCCGGCGCCAGCAGGTCCTCGGCGCCCCCGGTGCCGTACAGCAGAGCGGCCGCAGCCGCGGCCGCCGCGGAGGCGCAGCATGTCGGGGCGCCCGAGGGCGTGGAGGCCGCGGAGGCCGCGGAACAGGAGGAGGCGGAGGAGGAGCAGGACGAGGCCGAAGAGCAGGAGGGCGGCGGCGGCGTGCGCGACGTGGGGCTGTCGAGCAGCAGCGGCGACTCGAGGCCGCCCGGGGGCTGATGGTGGCCCGACGGGAAGCCCGAGAAGCTGAGGCTGTGGTGCAACTTGGGCCGCGGCTCCCGCGGGAAGCCCAGGTGCAACGCATCGCGCGTGCCAAAGGCACGCAGGTCCCCGGAGGCGCCCCCCGACGGCGCGGGCCGCCGCTCGTCCGCGTTGTGGATGAAGTGGCAGCGCGGCCCATAGGGGCAGAAGCCGATGGTATGAAAGGTGCGGCACAGCTCGGTCTTGTACTTCGGATGGCGAGTCAGGCTGCGCAGCTCGTGGAAGCCATGCGCGAACTGGCACTTTTCGCCGTACTTGCACGTGCCGCTCTCCTCGAAGGGCCGGCACAGCTCGGTCTTGTAGCGCGTGGAGTTGATCTGGGAGCCGCCGCCCCCCTTCTGCTGCTGCTGCAGGTGCAGGAGGTGCTGGCTGCGATCGCCGTTCTCGCTAAACGAGCGGTCCCGGAATTTGTTCTCCTTGTTGAGCAGGGCTGTGCCGCCGCCCCCCGACGGCTCCTTAAGGGTGCCGTAGGAGGTCGGACCGCCGGCCGCCGCGCTGCCGCAGCTGCTGCCGTTAGCGGCGCCCGGGAACTTGGGCGAGCAGCTGCCGGGGCTGGGCGCGGGGTGGGCGAGTGCATGCAGGTTGCTGGCCGAGTGCCGTCGGAGGAATCCCGGCGCGAAGCCCGAGCTGGGGGCGGCGGCCACAGGCGTCCCCACCGCCTTCTTGTCCAGCATGTTGTTCAGGTTGAGGTTGGCCAGGGATTTCTCTGTCTGCCAAAGGGAGGGGAGCGGGGAAGGGATGAAAAACGGAAGGGGAAGACAGACTCGGGGCGAGCCGCAGAGGAACTCCCAGCCTGATTCTTTTCCTTTTTTTCCCCCACTCTTGGCGGATCCCGACTCGGCCTCCACCCTCCACCTATACACGCGCAAAACCAGCAAGATCTTGCTGGACGGAGCGGGAGAGGGGAGGACGCCCACCGTGGGCCGCGCTGGGTTTCGACACGTGATCCTCCGCCCCGGCTGCCGAGGTGGGCGGCGCGAAGCCTGTCCGGGAAGCCCCGGGCAGCGTGGCCGCGGTCGGCAGTGGAGAAACTCAACCGCGACACCGGCGCCCTCCTTGCCGCCCTCCCCGCCTCCAGGGCGCTCGGACACTCTTTTGCAAACCCCGGGACTTTCCCGACCTGAAAGGCAGGGCGGGAGGGGCGTCCCCCAGAACCTGGGGACAGAGGCAAAGTCCAAGAACTACAACGGCTGCTGCCGGCCGGGCCCGCTCCCTGGCCTACCTTGCACAAGAAGTCGACATCGTAGAAGGCGGACAGAAGTGTGGTCGACATGTTTCTGGATCCCGCAGTGGCCGGAGCGGCAGGCCGGGAGGTCGGGAGGAGCCCTTGGGGCGGCGTGGCCGGGCTTGAGCCACGACGAATAACGGGCGAGGGGCGGGGAGGGGCCGAAAGTTTGCCGGGGGGCGAGAGGAGAGGGCGAGTGCAGCGGCGCGGGCCGGCGGGAGGGTCCGGCGGAGTGCGGCAGGGGGGAAGGAGAGAAGCGAGGAGCGCTCCTCCGCGCCCCGGGGTGCCCGGCCCGCCCCCCCCGCGGAGCCGACGGCAGCTCGCGGACTGCTGGAACTCGGCGGCCTCCGAGCGCGCGCCCTATATAGAGCCCGGGAGTGCGGCTGCGGCGGGGCGGGCGCGCCGGGGGAGGGGACAGAACTCGGCCCCCGCCGGGGTCTCCAGGCAACGCCGCCCGCCCGCTCGCGGACGTCAGGCGCCTTCCCGGCCTCCCATTGGCCGCCGCCAATTTTTTTCCTCCGGGGGAGGGTGCTGGAGGCCTCCGGGCGGGGCCGGCGGCCCGGGCGGCCGGTGTGGCGTGTAGCTCTCGGCCCCAGTGGATGCCGCCGGGTGGCGGCGGGAAGGCACGGCTGTTCTCCTCCGGGGCTGCGCGGTCGGAGAGC
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Task1_train_3472
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This variant affects gene DYNC2LI1 (dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
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Pathogenic; not provided
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Task1_train_3473
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The gene DYNC2LI1 (dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1), on Chromosome 2, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
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Pathogenic; not provided
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TCAAGGATTATGGTTCTACATACTTATTATAACCATTTTTAAAAATACTCCTAGATTTACAAATGTTTAGTTTTTATTGTCGTAAAATATACATAGCGTAAAATTTTAGTCATTTTTAACTGTGCAGTTCAGTAACATCAAGTATATTCTCATCACCATACATCTCCAGAACTTTTTGATCTTCTCAAACTGAAACTCTTTACCTATTAAACAATAACTCCTTGTTTTTCCTTCCCCAGCTCCTGGCAACTATCATCCCTACTGCCTGTCTCTATGAATTTGACCACTCCAGTACCTCATATAAATGAAATCATTCATTATTTGTCCTTTTGTTATTTATTTCATTTAGCATAACGTCTTCAGGGTTCTTCCGTTTGTAGTATGTGTCAGGATTTCCCTCACTTCTAAGGCTAAATAATGTTCCATTGTGTAAACAAATACCACAGTTCAGTTATCCGTTAATCCATGCAGAACATTTGGGTTGTTTTCATCTTTTGACTATTGTGAGTAATGCTGGTATGAACATTGGTGTACATTATCTGTTTAAATCTCTTCCTTCAGTTCTTTTGGGTTTAGACTCAGAAGTGGAATTGCTGGATCATCTGGTAATTCTATGGTGAATTTTTTGAGGAATCACTATACTATTTTACACAGTGGCTGCACCATTTTACATTCCCATAAGCAATGTACAGGGGTTCTAATTTCTCTGTATCCTCACTAATACTTGTTATCTTCTCATTTAAAAAAATGTTTTAGGCCAGGAGTGGTGGCTTACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGATGTGGTGGTGCATGCCTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTACTCCAGCCTGGACAATAGAGACTCCTCCTCCAAAAACAACAACAAAAAAATGTTTTGACAATAGCTAGCCTAATGGATAGGAAGTTGGACATCTTTTCATGTGTTAATTGGCCATCTGTATATCTTCTTTGGCGAAATGTCTATTTGAGTCTTTTGCCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAATATAGTTGAGTTGGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAAGCTCTAGAATTACAGACATGAGCCACCATCCCTGGCCTCTTTGCCCATTTTTGAACAGGAATGTTTGTTTTTGTTGCCGAGTCTAGGTTTATGTTTGATGGGCATGAACAGAATACAAGTGCATGTGGTGATGGTGGTCATGTATCTGGTGGTCAGGAGTGTGCTTTCAGAGAGACAGAATGGTATTGCAGAAAAACGTGTAACTTTGGATCTAAATACCAGTTCTACAATTTACTAATTATATAAATCTGTGCCTCAGACTTCTAATCTATAAAATGGACATTATAACATCTTCTGGAGAGGGTTATTGTGGAGATTAACTAGGTAGTTCCCTAGCAAGGTCCACCCATATATCTATTTTCTTCTCCTTTACCTGATTATTGTGTTACTGTTTTTGCTTCTTTTATTATTTTTGCTTCCCTTTTTTGGAGCACACAGTAAAACTGGATGTAAACGTGGCATTGTCGATGCAAATGCTTGGAGCTTCTCTATTTGAACTAAACTACTTTTAATTTTAGTTCAAACAGAAACTTAGTTCCACTATTGTAACACTTAAATATTACTAGAGGAAAGTATTGGAATAAATAAGGCTATGACTTTGGTTTTTTGTTTTTGGGAGTCTTAGAATAATGCTACGGTTTTTTTTTCCCCTTAAGGTATATTTTAGTTATTCTTAGATAAATTTCAGTACATTAGGATTTCAAAATGGTAATTATTTTGAGTCTTTTTTGAAAAGTGTTTTTATTTCTTTAGGACGTTTTCTCTTGTTCTCGTTCTGGATCTTTCAAAACCTAATGATCTCTGGCCCACCATGGAAAATCTCTTGCAAGCCACAAAAAGCCATGTAGACAAAGTGATAATGAAACTGGGAAAGACAAATGCTAAAGCAGTTTCTGAAATGAGACAGAAGATCTGGAATAATATGCCGAAGGATCATCCTGTGAGTTGCTGTTTGGGATTATTACTGGAATCCTTAGTCCCATTTATAGTTAATGATAACATCACAAACAACTTCTTTAGATTTTTATGCATGACTTGAAATTCATTTGATGTAGATGAACCTGTTCACTGGAAAATTACAGCAATTTATTAAAACCTCAGTAAGAGCAAAACAAGGAAGAAGATTCCTTATATCTTCTTGTTAGACATCTTCTGTGATTGTTATGGCATATTACACCAATCAGAGAAATAGAGTTTTAAAGTAGTGGTTTGATATTGATTTTATAATCTCTGTAAAAATGAAGATAAAAAGCCAGATTGTACAAAAGTCACCTGACAAAGACTAGATGAAGCTACAACTTTAAGCAAGGGGTAGAGTTGTAATAGCCTTCACCATCACTCTGTATTTTACATTCATTTCGTTTCTGTCACTTATTCAGTATCTTTTTATCATCTGACAGCTAATTAAATTATAAAGTTGCTATGATGGTAACACAAGTTCTTCAAATACAATAATAAATATCATCATCTGGAAAACTGAGAGCAGCATTTTATATTATCCAGAGTTTATAAGAAAGTGTAGCAGGGTGCGATGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGTGGCCGAGGCGGGCGGATCACGACGTCAAGAGATCAAGACCATCCTGGCCGACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTTAAGATACTAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTACACTCCAGCCTGACTCCAGAGGGAGACTCTGCCTCAAAAGAAAAAAAAAGAGAGGAAGTGTTTTTCATAGGAAATAATGGAACAAAACAAATCTATGCTGGATAAATGCTGTTCCAACAGTCAACATAAAATAGAATAAAAAAAAACCAGGAAGGTAATATGTTATATAAGGAAATAAAAGGGTAGAAAAAGGAAAATAATAAATATCATAGTAATTTAGGGAATTGCCATTTCTAGTTTTACACTTATGAAATATAGCTTAGGAAGTGAAAGTTAAATATTAGAACAAATTCTATGTCAAGCAAATTAAGTAAACATCTATGAAGAGACTGAAAATGGAATGTTTTTGGAAGTAAATAGAAATTGCTAAGCACCTAGCAATAAAGAATTACAACAACTCAAGGAAATATGTTTATTAGCAGGATCATGAATTAATTGACCCATTTCCGGTACCTCTGGTCATAATTGGAAGTAAATATGATGTTTTTCAGGTAAGCTCTTCCGCTTCTAGCTGAGTTTGTTGTACATATATGGCTGTGCTTTTTATGAGGGAGGTACAAAAATAATATCAAAATAAGAAAAATAATTATTGAAGGAATCGGTTAAGTCATGCATCTTAAAGATTTTGGAAAAGACATAGTTGGGACAGAAAAAAATAGGTAAAGAAAATAAATGCAGTGATTAGAATGGGGATAAGGCAGATTTAGAAAATGAATCTTGCCGGGCACAGTGGCTTATGCCAGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGGGGGAGGATCAATTGAGCCCAGGAATTTGAGGTTACAGTGAGCTGTAATCACACCACTATACTCCAGCCTGGGTTACACAGTGAGACACTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTTCAACCCAGTCACTGGGGAATATGACTTACTTCCCAACTTTTAAATGGAAGAAAGTAGAAAATTAGTTCCTTCTTATCTTTGCTTGTCAGAGAATCGTTAGAATTCCACACTATGAAATGTGTGCTTATATCTAAATTCTATTGAGCTAAGTATTTAAACAAAGAAAGATCTGTTAGCT
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Task1_train_3474
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A variant was discovered on Chromosome 2, affecting DYNC2LI1 (dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; not provided
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Task1_train_3475
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This variant affects gene ABCG5, DYNC2LI1 (ATP binding cassette subfamily G member 5| dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1) located on Chromosome 2. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
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Pathogenic; Sitosterolemia 2
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GATCCCATGTTATTCTGATTCCCCTATCCCTACCTTGGTCTACTCTGGGAACTTCCTCTTTGACTTATCCAAATTTTGGCTGCATTTTCATCTACTCTCAATCTGATGTTTTTTGATGGTCTTATTTACCACATCCTAAAATAACCATTTTTTGAACTTGATCATCATTTAAGTAACTGCCCCTCTTCATCCTACCCTGTAACACCAAGTTTCTCAAAACAGAATCTGCTTCCTCCATCTTACACCTTCCCTTCTTGTAAACCTGACTTGCACCCCCATGACTCTACCGAAGCTCTTTTTTGGGAAATTGCAATGGCCTTCTCCCTTTATGCTTCACCTCCTTTAACCCCTGCAATATTGAAGTGTTTATGACACTTCCTTGAAACTCTCTCCTTCCTCATCCTCTCTGATGCTGCCCAATCCTGCTTCTCTTTCTACCTCCCTGATCACCCTCTGCCTCCTCTGTTGGTTGCTGTCCTCTTCCCACCCTCTGAATGTGTCTGTTTTAAGGTTTTACATTCAGGCTGCTTTCTCCCCTCCCCCAGGCCCCCCCCCATGCACCTGGGTCCTAGCTACTTCAGAGTCCTCTCTTCTCTGGCCCAGGCCCTGCCGTGAATGTGGGACAGGTCATTCCCAGGCACATGTCATCTTGTTGGTTTGTTCTCAGGTCTCCTGCAACCCACAGTTGGGCTATTTACAATAAAATTAATGTCCTGGAAGATACGACATTGCACTAGACACTGATGGGCAAAGTGTAGATCCTCCAGAGCAGAGAACTTCACCCTGGAGCTCTCCCTGCACGAGTCCCACTAGCTCCATGACTCCATGGGAGCCCGGCCCTGGGTGAACTGAACAACCCCTCACCAGTAGCACACACTGCTGAAAATCATGGTGGCAACAACGCTGAAGGGGAGGACGTGCAGTGCATAGGCCAGCATCATCTGCCACTTCTGGTAGAGGCCGTCCTGACTCTCCTGGTCGCTGACAGCTCGCAGCACGGGAACTGGGGATGGAAGGCAGGTTTCAGAACAGTCAGTCACCACCCAGCTGAAAAAGGGAGGGCTAGCCCAAGCTGAATGTGAGGTCTGTCAGGGCTGGATGGTGAGGACCAGCTAGGGGGGTTCCCTAGTCATAGAAGGAGGGGACCTGCCATCCACAGGACAATAAATCCCCACCCCGGAAATCTACACTCTACCAGAATTGCAATACAATTGCAAAAGATGTCATTTATTTCCTTCTCTCTAAAGTGGGGAGTTGTCACCAATTCACGAAAAGTACATGCAAAAGGGGCATGAATAAGTGATTTGAAGCACTTTGTCTTCTTTCTGTGCAGGATTCCCCCCACCCCACCCCGCCCCCACCACCAGCAGCCTGCATTTTAGACTTGCTCTCGGAAGGCCAGGCAAACCCCACAGATGCAGACACTTAGCATTGCCCCTCATGTCAAGCTCTAGAGCAACTTCACAATAGCGAAGTCCTTCCCTCTTATTCCCTAACAGTGTTGCCTTTGGGGAATCCCTCTAACACCTGCTTCCTGCAACGTTAGGCAACCAGGTTTTGTCTCTGGAATTCCACTGAATTTGAAAATTAGGTGCTGGCTGTCCTAAAATCAGCTCCAAAGAGAAGCTAACGGTACAAAGTTGGCCTGGTCGCTGAGCACCCCATGGGCTGTGCATCTGAGATGGCCAAGATGAGATAGGAGGAATGATCTTTTGAAAAACTCCTCAAACTCTCCCCACCAGTACATTGTCACTTCATGTTTCCCTGGATCCTTAGCCCTCAGAGAGATCCACCTGGTGAGCTCATTCATATTAACGTGTTGGTAACTCAATAGTTGCCTTTCCCCAGAGAGGGAACCTGGAGAGGGCTGGGTTTAGCTCAGAGAAAAACCCTTATAATGGTAGACTTTTGTAAGGTTACAGCTGGAGAAGGGAGGTATTTAGGGAGAAAGAGGTGCACCTCCAGCACGTGGGCACTTACACAGATTCACAGCGTTCAGCATGCCTGTGTACGGGGTGGCGCCCACAAACTGGTAAAGGAGACCTACGCGGTCCTGGATAGCACCCTTTAGCACATTGCTTCGGACCCGCAGAACGAAGAAAAGGAGGAACAAACCCATGATCAGATTCTGAAGGAGACGCGTAATCACTGCCAGCTTATTTCTCACCAAGTTTCTTGTCACTCTCCTGAAAACAAACAACCCTGTTTTAATTCCTTTTCAGAATTGTTATTGGGGGATGGCTAAAGACCTCTAACAGGCATTTCTCACATTTGTGAGCCTCTTACCTCAGGAGAACACCCAGTTTAGAGAAAACTCCAGGAGAATCTTTGGTTTTGAAAGGAACCATTGGTAACGTTTTCAGGTGTTTCATTCTTTCAATATTCTTCAAAGTTTTATGACAAATTGCTGATTTCTTGTAGGCAGATTCTATCATCTGGACTCTCTTGGAGGTTTCTATTTCCCGTTCCTTGCTTTGGGTATCCACTGACGTCAGGTCCACTAAAAGTTTTTCCCAAAAGATGTCACCCATGTGTTTTTAAATGCATGTATGTACATGGATATACAATTGGTACAGGAGTACTGGCCATAATACCTCATCCCATCAAGATAAAATTTGTGGTTAATGCCCACCTATAAAATCAGAATACTTTAAAGCATCCCAGCAGGGCCTTGAGGATCCCATTGGGATTGTCTGGGAGAATTCAGAAGCTCAGCTAATTATGCTCTGATAAAGTAGTAGCAGTGCGCCAGTTTGTTTGAGAGAGATCCCTGACCTCATTCTGATAGTCATCTCTGGCAAGTTCATTGACCCGGCCAAATTGATTCCTTGAAGAGTATAAAACACAAAAACAAAAGCAAAAATCAAATCCACTAGACTGGTGTCATCCAGGCAGAAGTCTGAGATGAGAAAGTTTAAAAAACATTCATGATGGGGAATGTGAAAGAAAAACTTACTATAGAAGTCAAAAGGGTTTGAATGTTCAGGACAAGGGTAACCGCAGTCATTGAAGAAATCAAGCATTTCCGCTGGCGTGCCACAGAAAATCAGCTCTCCGAAGCTCAGGATGGCAATTTTGTCAAAGAGCTGACCAGACAACAGACGTAGTTAGTGTGTGATCACAAGGGTAGCGATGCACTTTGAATGTCTCTGGGAACACTGATGCAGGGCCAAGGTCAGGTATTCCTTATGGTCACCAAGTCCTTATGGGAAATGCATTTCCCATAAGCAGTCAGTCCTTCGATGACCTTGGCCCTGCATCAGTATTCTTGGAGACATTCGAAATGCATCCCTACCCTTGTGAGCCTAGGCTACCACTGTGGGTCATGCTGCCTCCCATCCTGACGCCCAGCTTCATATCTGGGATAGACAAGCATGACTGGACCTGGGCGTAAGTCCCAGCCAAGCCAAGTGAGTGACCTCGGGCGAGCAGGGGTGGGTCTTAGTTTGTTTTTTTGTTTTCATTTTAAATCTCAGCTCCTCCTCTGTAAAAAGCAAATAATAGCTAACTAAAGGGATACTGGGCGGAGAAAGTGAGTTTTTTTGGAAGGAAATCAGTATGATTTCGTGGAAAAACACAGCCTTTGAAGCCAACTTGGCTGTGAAAGGCTAATGCTAGCTTTTTACTATTAACAACTGTGTGATCTTGGCTTAATTTGTTGTTGTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTCTGAGACCGAATCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCCCAGCTCTCTGCAACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGCGCACACCACCACGCCCAACTATCAATTTTGAATCATTGCTAAGTTTCACTCTTTTCCTCTGTAAGGTGAATACACTGAAACACACCTCATAGGAGTGTTGTGCAGATGAAATGAGCTATGTACAGAAAGTATTTGGAACATGGTAGGTGCTGAAAGAAGTGAGTTTTCATCCTTTGCTCTTCCCCTCTCAGGAGCTGTTGGCTCCAATTCTCTAGCACTAACGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGAGATGAGGTCTTCCTCTGTCACCCAGGCTAGAGT
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Task1_train_3476
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A genomic change on Chromosome 2 affects ABCG5, DYNC2LI1 (ATP binding cassette subfamily G member 5| dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
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Pathogenic; Sitosterolemia 2
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GATCCCATGTTATTCTGATTCCCCTATCCCTACCTTGGTCTACTCTGGGAACTTCCTCTTTGACTTATCCAAATTTTGGCTGCATTTTCATCTACTCTCAATCTGATGTTTTTTGATGGTCTTATTTACCACATCCTAAAATAACCATTTTTTGAACTTGATCATCATTTAAGTAACTGCCCCTCTTCATCCTACCCTGTAACACCAAGTTTCTCAAAACAGAATCTGCTTCCTCCATCTTACACCTTCCCTTCTTGTAAACCTGACTTGCACCCCCATGACTCTACCGAAGCTCTTTTTTGGGAAATTGCAATGGCCTTCTCCCTTTATGCTTCACCTCCTTTAACCCCTGCAATATTGAAGTGTTTATGACACTTCCTTGAAACTCTCTCCTTCCTCATCCTCTCTGATGCTGCCCAATCCTGCTTCTCTTTCTACCTCCCTGATCACCCTCTGCCTCCTCTGTTGGTTGCTGTCCTCTTCCCACCCTCTGAATGTGTCTGTTTTAAGGTTTTACATTCAGGCTGCTTTCTCCCCTCCCCCAGGCCCCCCCCCATGCACCTGGGTCCTAGCTACTTCAGAGTCCTCTCTTCTCTGGCCCAGGCCCTGCCGTGAATGTGGGACAGGTCATTCCCAGGCACATGTCATCTTGTTGGTTTGTTCTCAGGTCTCCTGCAACCCACAGTTGGGCTATTTACAATAAAATTAATGTCCTGGAAGATACGACATTGCACTAGACACTGATGGGCAAAGTGTAGATCCTCCAGAGCAGAGAACTTCACCCTGGAGCTCTCCCTGCACGAGTCCCACTAGCTCCATGACTCCATGGGAGCCCGGCCCTGGGTGAACTGAACAACCCCTCACCAGTAGCACACACTGCTGAAAATCATGGTGGCAACAACGCTGAAGGGGAGGACGTGCAGTGCATAGGCCAGCATCATCTGCCACTTCTGGTAGAGGCCGTCCTGACTCTCCTGGTCGCTGACAGCTCGCAGCACGGGAACTGGGGATGGAAGGCAGGTTTCAGAACAGTCAGTCACCACCCAGCTGAAAAAGGGAGGGCTAGCCCAAGCTGAATGTGAGGTCTGTCAGGGCTGGATGGTGAGGACCAGCTAGGGGGGTTCCCTAGTCATAGAAGGAGGGGACCTGCCATCCACAGGACAATAAATCCCCACCCCGGAAATCTACACTCTACCAGAATTGCAATACAATTGCAAAAGATGTCATTTATTTCCTTCTCTCTAAAGTGGGGAGTTGTCACCAATTCACGAAAAGTACATGCAAAAGGGGCATGAATAAGTGATTTGAAGCACTTTGTCTTCTTTCTGTGCAGGATTCCCCCCACCCCACCCCGCCCCCACCACCAGCAGCCTGCATTTTAGACTTGCTCTCGGAAGGCCAGGCAAACCCCACAGATGCAGACACTTAGCATTGCCCCTCATGTCAAGCTCTAGAGCAACTTCACAATAGCGAAGTCCTTCCCTCTTATTCCCTAACAGTGTTGCCTTTGGGGAATCCCTCTAACACCTGCTTCCTGCAACGTTAGGCAACCAGGTTTTGTCTCTGGAATTCCACTGAATTTGAAAATTAGGTGCTGGCTGTCCTAAAATCAGCTCCAAAGAGAAGCTAACGGTACAAAGTTGGCCTGGTCGCTGAGCACCCCATGGGCTGTGCATCTGAGATGGCCAAGATGAGATAGGAGGAATGATCTTTTGAAAAACTCCTCAAACTCTCCCCACCAGTACATTGTCACTTCATGTTTCCCTGGATCCTTAGCCCTCAGAGAGATCCACCTGGTGAGCTCATTCATATTAACGTGTTGGTAACTCAATAGTTGCCTTTCCCCAGAGAGGGAACCTGGAGAGGGCTGGGTTTAGCTCAGAGAAAAACCCTTATAATGGTAGACTTTTGTAAGGTTACAGCTGGAGAAGGGAGGTATTTAGGGAGAAAGAGGTGCACCTCCAGCACGTGGGCACTTACACAGATTCACAGCGTTCAGCATGCCTGTGTACGGGGTGGCGCCCACAAACTGGTAAAGGAGACCTACGTGGTCCTGGATAGCACCCTTTAGCACATTGCTTCGGACCCGCAGAACGAAGAAAAGGAGGAACAAACCCATGATCAGATTCTGAAGGAGACGCGTAATCACTGCCAGCTTATTTCTCACCAAGTTTCTTGTCACTCTCCTGAAAACAAACAACCCTGTTTTAATTCCTTTTCAGAATTGTTATTGGGGGATGGCTAAAGACCTCTAACAGGCATTTCTCACATTTGTGAGCCTCTTACCTCAGGAGAACACCCAGTTTAGAGAAAACTCCAGGAGAATCTTTGGTTTTGAAAGGAACCATTGGTAACGTTTTCAGGTGTTTCATTCTTTCAATATTCTTCAAAGTTTTATGACAAATTGCTGATTTCTTGTAGGCAGATTCTATCATCTGGACTCTCTTGGAGGTTTCTATTTCCCGTTCCTTGCTTTGGGTATCCACTGACGTCAGGTCCACTAAAAGTTTTTCCCAAAAGATGTCACCCATGTGTTTTTAAATGCATGTATGTACATGGATATACAATTGGTACAGGAGTACTGGCCATAATACCTCATCCCATCAAGATAAAATTTGTGGTTAATGCCCACCTATAAAATCAGAATACTTTAAAGCATCCCAGCAGGGCCTTGAGGATCCCATTGGGATTGTCTGGGAGAATTCAGAAGCTCAGCTAATTATGCTCTGATAAAGTAGTAGCAGTGCGCCAGTTTGTTTGAGAGAGATCCCTGACCTCATTCTGATAGTCATCTCTGGCAAGTTCATTGACCCGGCCAAATTGATTCCTTGAAGAGTATAAAACACAAAAACAAAAGCAAAAATCAAATCCACTAGACTGGTGTCATCCAGGCAGAAGTCTGAGATGAGAAAGTTTAAAAAACATTCATGATGGGGAATGTGAAAGAAAAACTTACTATAGAAGTCAAAAGGGTTTGAATGTTCAGGACAAGGGTAACCGCAGTCATTGAAGAAATCAAGCATTTCCGCTGGCGTGCCACAGAAAATCAGCTCTCCGAAGCTCAGGATGGCAATTTTGTCAAAGAGCTGACCAGACAACAGACGTAGTTAGTGTGTGATCACAAGGGTAGCGATGCACTTTGAATGTCTCTGGGAACACTGATGCAGGGCCAAGGTCAGGTATTCCTTATGGTCACCAAGTCCTTATGGGAAATGCATTTCCCATAAGCAGTCAGTCCTTCGATGACCTTGGCCCTGCATCAGTATTCTTGGAGACATTCGAAATGCATCCCTACCCTTGTGAGCCTAGGCTACCACTGTGGGTCATGCTGCCTCCCATCCTGACGCCCAGCTTCATATCTGGGATAGACAAGCATGACTGGACCTGGGCGTAAGTCCCAGCCAAGCCAAGTGAGTGACCTCGGGCGAGCAGGGGTGGGTCTTAGTTTGTTTTTTTGTTTTCATTTTAAATCTCAGCTCCTCCTCTGTAAAAAGCAAATAATAGCTAACTAAAGGGATACTGGGCGGAGAAAGTGAGTTTTTTTGGAAGGAAATCAGTATGATTTCGTGGAAAAACACAGCCTTTGAAGCCAACTTGGCTGTGAAAGGCTAATGCTAGCTTTTTACTATTAACAACTGTGTGATCTTGGCTTAATTTGTTGTTGTTTTGTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTCTGAGACCGAATCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCCCAGCTCTCTGCAACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGCGCACACCACCACGCCCAACTATCAATTTTGAATCATTGCTAAGTTTCACTCTTTTCCTCTGTAAGGTGAATACACTGAAACACACCTCATAGGAGTGTTGTGCAGATGAAATGAGCTATGTACAGAAAGTATTTGGAACATGGTAGGTGCTGAAAGAAGTGAGTTTTCATCCTTTGCTCTTCCCCTCTCAGGAGCTGTTGGCTCCAATTCTCTAGCACTAACGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGAGATGAGGTCTTCCTCTGTCACCCAGGCTAGAGT
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Task1_train_3477
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Here is a genetic alteration in ABCG8 (ATP binding cassette subfamily G member 8) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Sitosterolemia 1
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ACTTGAGTGCAATGAATCTTTTTTTAACTTTTATTTTAGGTTTGGGGATGCACAAGTAGGTTTGTTATATAGGTAAACTAGTGTCACGGGGTTTTGTTGTACAGATTATTTAATCACCCAGGTAGTAAGCTTTGTACCCAAGTGTTTTTTCCTGCTCTCCCTCCTCCCATCCTCCACCCTCAGTTAGGTGAATCCTTTTTTAAAAAAGAGTATTAAAAATACCACTGATGCACTTTGGGAGGCCCAGGCGGGTAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTCGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTAGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGGAGAATTGCTTGAACTCGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGTGGGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGTAAAAGTACCACTGATGAAAAGAAGAGAGATGGGTGTAGATACAGTCAGAACATATATGTACACTGTGCTGTAGTTTTAAATTGTTTCCACTTCTATTATTTCTCTATTTTTTTCTCCATTATTTCTCAAAATAGATTTGGTTTTGCATGTTTAAAAGACGCTCTATAAATGCTCCAAATTAGTCCTCACAAAGCCAGCTTCTGAGCCAACCGACATTGAATAATGAGACATTGCTGGCATGTTTGCCAGCCAAAAATAGTTATGTTAACACCAGCCTGCCTTGGGGAGAAAGGGCCTTGGTGGGTGGCAGGAGGGGACAAATGCTCCAGGCACCAGCTGGCCCTGTGGCATCTAGGACTCTAGCTTTCTCCTGTCAGGCCACCACTGGCTGGCCTGGCCTGAACCCCCAGCGCCATCATGCCTTGCAGCCCCACAGGGGTGCTCACGTTGGCTGCAGACAGAAGGCTTGGAGCTCCATGTCCTGGGCCCACCCCATCTAGGTCCAGGGACTATGCCACCTCTCTAGGGGCTGGTCACATCTGCACGGACAGAGTAGTCCGGGGTCCTGGAGAGTGTATGGGGAGCAGTGGCTGACAGCCTGGCCCCCACAGAAGCTCCGCTCTCAGGGATATCCCTGGTGGCTTTGCAGGTTGTGGGAGAGCCTCCTTGCTAGATGTGATCACTGGCCGAGGTCACGGCGGCAAGATCAAGTCAGGCCAGATCTGGATCAATGGGCAGCCCAGCTCGCCTCAGCTGGTGAGGAAGTGTGTGGCCCACGTGCGCCAGCACAACCAGCTGCTCCCCAACTTGACTGTGCGAGAGACCTTGGCCTTCATTGCCCAGATGCGGCTGCCCAGAACCTTCTCCCAGGCCCAGCGTGACAAAAGGGTAACTAACTGGCCCCAGTGGTGACCCCCAGGTCCAAGAAGCTACAGTGTCCATGCCCCGCTCCTCCCCTGCTGCCTTGCCTCAGGACCCAGCCGCAGGTCGAGTTTGAACAACTCAGCTTGCCTTCCGCCAGCCCTGGGCTGCAGCCCACCCTCCACCCTCCTTTCAAACCCCACAGCCCGCCAGAAGCTAGCTCAGCCCATTGGTTCCCTTCACTGCACTTGTCAAGATGTGGGATGAGTGTATTTGTTTGTGTGTTTTCTGGGCCTCCATGTGGGTAGAGAGCCATGGTCCCCAATACACTGCCACGTTCCTAACACAGGGCACCATGCCCAGCACGTCGAGGCCCCTCGGGACCTGTGGAAAGAATCAGGGGAACCAATGTTGCAGCTTGGAACTCAAGTGCTGGAGCTGTCTCCCTTCACTTTCAAACCCAGCCGGAGGAGCGGGCGCCTTTATCCTTGGGGTCACAATGTGTCCAGCCCTGAAGGAGGCCCCTGAGGTGGCCTCAAAGCTCCTTCTGGCCCACAGGTGGAGGACGTGATCGCGGAGCTGCGGCTTAGGCAGTGCGCTGACACCCGCGTGGGCAACATGTACGTGCGGGGGTTGTCGGGGGGTGAGCGCAGGAGAGTCAGCATTGGGGTGCAGCTCCTGTGGAACCCAGGTGAGGGCCTGGGGGGCAGATGGGGGCAGAGGGACCTGTGCGGTCCCCTCAGGCTTGGCTTGGTCTGGCCAGAGCCCCACCGACTCACCAGGCTCCTCTCTGTGTTGGAAAGGAATCCTTATTCTCGACGAACCCACCTCTGGGCTCGACAGCTTCACAGCCCACAACCTGGTGAAGACCTTGTCCAGGCTGGCCAAAGGCAACCGGCTGGTGCTCATCTCCCTCCACCAGCCTCGCTCTGACATCTTCAGGCTGTTTGATCTGGTCCTCCTGATGACGTCTGGCACCCCCATCTACTTAGGGGCGGCCCAGCACATGGTCCAGTATTTCACAGCCATCGGCTACCCCTGTCCTCGCTACAGCAATCCTGCTGACTTCTATGGTGAGTCCCCAAGGCCAGCAGCCAGGGCCCTGGCACACAGGGCCTCCCCGATGCTTAAACCCTGCCCAAGCTTGCTGGAAAGATTCAGGGGAGAAACTCCCAGAGGTTTCAGGAGAGGAGGAGCAATGATGGGGAAGAACATGGGGTGGTTTGCCAGGTATCAAATGCTAGAAATGAGGGCCTGGAAATAGAAGCTTCTGACAAAGAGCTACCCTTCTGTGCATGATAGATTAGAAACTTGCAAACTCCAAAGATGGGAGGGCATGGAATTCAAGAGGGTGGGGATCAATAAATATCAGAGTCTTTATTCAGACTCAGTAGGGAAACAACCTTTAAGGTCAAGAAGTCACCAGATCTTAAAACATGCCCTGGTGTTCCCACAGTGGCAGGGAGCCTGAAGGTGCAGGGTGGCAGAGGGGGGCCCAGGGTGGTGGCCTTGGCCAGGGAATCTCTAGATGTGAAAATTGCTCTGGCAGCCCCAGGCTTGCCCTTTGCTTGGGTCCTGAACACTCAGCATATTACACTCAGGGAGCATGAGCCGCTTCCTTCATTCTGCAGGGGACAGTTGCCTTCCCAGGTACCTGGCCTGAAATCCTGAGTGCTGAGGAAGGGCATGGCTGCTGGACAGGCGTCATGGTTGTACCAGGTCCCAGGGAGACAGCTGTCATGGCTTATGCTATAGGTCGCCTGAGCCCCCAGCTTCCACCCAGGATGGCAAACTGTAGCAAGGACCCCACCAGTAAACAGGACAACAGCGATCATCTCCTTGAAGGCAAACATGGGGCCCAAACATGCCAGGCTCAAAGGGTCTCCTGTTTGACTCTCAAGCCCCGGCCAGGCCAAGGCCATCTCCATCTTTACAGATGAGAAGCCTGGAGCTTGCAGAGCTAAACACCTGTTCCAGCACAGTTGTAAGGCACAGAACTGGGACTGGTGCCCAGCCCTGGCTGTGACTCCTCGTCCAGCAGCCCACACCCTCCTCCTAGTGTCCCAAGTTCTCCACCATCCTTCCCCCAGGAGGACAGGCCGCCCCTTGCCCTCTGTACTCACATTCTGCATGAACTCACAGAAAGGTCACCTCCCTCCCTGTGCTCAGGTGGCAGCCTGGCTTCCTGACGGTGTGTCATCCTCAGGCCAGCCATCCCCAGAATAGGGGCCAAAAGGCACCTGCCGACCTGGCCATCGGGGAATAATTTAAAGTAACCCCAGAGAGGGGTTACCAGAAGTCAAGTGTCCACAGCAAACCTGAAAACTCTTTTTTACATTTTATATTGTTACTGGAAGGGGCTCTGGCCTGCAAGCCCTGGGGCAGGAACCTCTCACCAACCTGGGATGCAAGAGCTACACGGGGCCTGGGTTACCCAAAAATCTGATGTTTTGAGCTACAGTGCTGCACACTAGGGGGCCACATCATGGTTTATAAGACCCCACCTAGACATTATCTTGTCTTGAGATGTGTTATGAAAATGGGAGGAAGGGCCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTGTCTCTAATAAAAATATATGAATTAGCTGGGTGCGTGACGCTTGCCTATAGTACCAGCTACTTGGGAGGCTGAG
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Task1_train_3478
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A variant was discovered on Chromosome 2, affecting ABCG8 (ATP binding cassette subfamily G member 8). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
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Pathogenic; Sitosterolemia 1
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GCCTTTGCCCACTGCCCTGGAGGCCAAAGGAATGATTCCATTAGAGATTCCAGATGCACCTCCTCCTATCCCACAGCTGATATCCAGAAGTCGCCCTTGACTGTCTCCCTCCCTCTCCACATCCACCTGTGAGCCAGGTCGATTCTGCCTCCTGTTTCTCTGAAATGTCTGCTTGGCTGTGTCTCCATCCCTGGCCACCATTGTTTGAGCCTGGGCCACTGCCATAGCCTGGTCTCTGTAACCTGGGCCCCTCCACATCCCTCTCGACTCAGCCACGCAGAGTGAGCTTTCCAAGGTGCAAACCCATGCCCCCCTTTGTTCAAATCTTCCCAGGGTTGCTCAATCCCTGCGGCCTCCCCAGCTTTCTGAAGCCCCCAGCACACCCCACCCTCTCACCTCTGAGCCTGCCCAGCTATTGTCTCTGGGAATGTCATGCCCGCCTTCCATGGGGCATCTCTTCTGCCAGGGCTTTCCTGATGCACCCAGGCAGGGCTCATTGCCTCCTTCCCCTCCCCATACCATGCCACCTCCATAGGATCAGGGCACAGGCTCCATTGTCTCTGGTGTGGGGCCGCTGAGTCTCCTCAGCCCACACAGTCCATGAAGCTGAGCACGTGCAGGGATGCCTCATCACATCCCTCTCGAGAATTGCTATGGATCAAATGTGTGGGTGACCCCGTGGCCTCTCAGCTCCCTCGGCCCCAGTCCATGTCCCCAGCAACCCCTCTGCCCTTTTGCCTCTTGGTCTCTGGTCTCTCTCCCCTCCTTGCTCATCAGAGAACTTGGGCCAGAGCCACCATGGCCCTGTCTCAGAGAGTGGGATGTGCCCTTGTGCAGGTAAGAGAGACTGTGTGACTGTGGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTGAATACGGGGGAGACTGTGTCGATATAAAGGAGATCATGGGAATACGGGGAGACCATGAGAATAGGAGGAGACCGTGGGAATATGGGGAGACGGTGAGAATATGGGAAGACTGCAAGAATATAGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTATGGGAATATGGGGAGATCACATGAATATGCAGGAGACTGTGAGAATATGGGGAGACCGTGAGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGAGGAAAGTGTGAATATGGGGGAGACCATGTCAATATAAAGGAGCCGTGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGGGAGAGAGAGTGTCAATATAAAGGAGACTGTGGGAATAGGGGGAGACCGTGGGAATATGAAGAGACTGTGTGAATATGGGGGAGACCATGTCAATATAAAGGAGATCGTCGGAATATGGGGAGATTGTGCGAATATGGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGATCATGTGAATATGCAGGAGACCGTGTCAATATAAAGGAGACAGTGGGGATATGGGGAGACCATGAGAATATAGGGAGACCATGGGAATATGAAGAAACTGTGTGAATATGGGGGAGACTGGGAGTATGGGGAGACTCTAGTAATATGGGGAGACTGGGAATATGAGGAAACTGTGAATATGGGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGACCGTGGGAATATGAGGAGACTGTGTGAATATGGGGAAGACCATGTCAATATAAAGAAGACCATGGGAATATGGGGAGACCATGGGAATATGAGGAAACTGGATATGGGGGAGGCCGTGTCAATATAAAGGAGACCGTGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGAGCAGACTGTGTGAATATGGGGGAGACCACATCAATATAAAGGAGATCGTGGGAATATGGGGAGATCGTGCGAATATGGGGAGCCCATGGGAATATGGGGAGACTGAATATATGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGATCATGCAAATATGGGCAGACCATGGGAATATGGGGAGACTCTGTGAATATGGGGGAGACCATGCGAATATGGGGAAACCATGAGAATATGAGGGACACCTGTGAGTAACGCGGCTGTCTGTCTCCAGTGCCCGCGTGGATTTCCAAAGTGTCCTTCCTGCGGTGGTGTTTTGAAGGGCTGATGAAGATTCAGTTCAGCAGAAGAACTTATAAAATGCCTCTCGGGAACCTCACCATCGCGGTCTCAGGAGATAAAGTAAGCGGGGAAGGCCTCGGGTTCTAAATTATTGGACGTCCGGCTTTCCATCCTCCTCATGAGCCCACTGCATGTCTGTGTCTCCAGATCCTCAGTGTCATGGAGCTGGACTCGTACCCTCTCTACGCCATCTACCTCATCGTCATTGGCCTCAGCGGTGGCTTCATGGTCCTGTACTACGTGTCCTTAAGGTTCATCAAACAGAAACCAAGTCAAGACTGGTGATTCACGCCAGACGTCTGCCCGCTGGTGGGGGACCTGAGCAGACCCTTCAACTGCACTCCCTCCTCAGGAGCCCCTTCCTGGGGACAGTGAGGACAATGACCCTACAGATGCTCAGCTACATCCGGCCCAGGGTGCTGCAGTGGCACAGACCAGCCACAGGATGGCAGTAGAATAAAGACAGTCGAAAGGGATTTCTGCTCACTGGCAGGAGACTGCGATGACTGGGAGAAAACCTGCACTCGGTGGCACCTACAACGTTGCTAATTTATTTCCTTTTGATATGCATTTATATAGGCAACTCGATATAGGATGGGAGCAAACTAGGAATGAATTGGGTAGCTAGACTGTGCAGGAATTGTTGGAACCTGGAGGGAACAATAACAGTAGCTAGCAGATTTGGCTTCATCTTCCAGGGGCCCCACACTCCGTGGTGAGCCACCATCAATACAGAAAGTGACCTAAGATGTACCAGCAAGATGCCATCCCTTCTTTTTGTGTGGGGTCATGGGCTCCAAAAGCCAACGTGAACAATTAAAAATGTATTGAGCATCTACTCTGTAGCAGGTCCTGTGAAAACACTTTAGGTGGACAATCCCTTGAGGTAAGTGGTATCCCATTTTATAGGTGTGAAAACTGAAGCAAAAATTCATTTTCCTAAGGGCACATGGATACTTTGTGGTGGAGTCATATGGGGATCAGAAAAGCCTTTGAGGCCTTTGGAGTTAGAGGGCAGAAGGCAAGGCCTGAGCCGCTGTAAGCCTTAGGAGTTTAGGAAGGCTCCAGAAGACAAATGGGGTCTGTAGAGGCTGTTAACTCAGCCAGGCTTCTTAGAGTTGCATTTCACTAACTGATATGGTTTGGCTCTGCGTCCTCACCCAAATCTCACCTTGAATTGTAATAATCCCCAAGTGTCAAGGGCGGGACCAGATGGAGATAATTGAATCATAGGGGTGGTTTCTCTGATGCTGTTCTCCTGAGAGTGAGTGAGTTCTGATGAGATCCGACGGTTTTATAAGGGGCTTCCCTCTTCGCTCGGCTCTCATTCTCTCTCCCGCTACCCTGTGAAGAGGAGCCTTCCACCACGACTGCAAGTTTCCTGAGGCTGCCCCAGCCGTGCTGAACTGTGAGTCAGTTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCAGTCTTGGGTATTTCTTCATAGCAGTGTGAGAGCAGATGAATACACTGGCCCTGCCTGGGTTTCAGAACCAGCCTTGAACCTTTCACAGTGGCCAGAGGATGGGGAGGCAGAGGCCCAGGTTGCACACTTCTTGCCTGAGTGTTGGGGACTATCTGACCCAAAACAGGTGCACAGAGGGCAGGAGAGGATGTTCCCAAAGGAAAATTAGAGTTTAGAATCAAAAGAAGGGGAAGGTGCGTGTTTGGGAGGTAAATAGCAAATACTCTTCATAGGTTCACTAGAGTCTTGCTACTCCAAGTACGATCCCTGGGCCAGCAGAATGGGCACAGCTGGAGCTGATTGGATAGGTCCCATGAGCCTCAGGCCCCACCCAGGCTCAATGAGTCAGAGTCTGCGTCTTAAGAAGACCCCCTGGTGATCTGTGCACATTCAAGCATGCTGCCGTTTTCCAAAGCACTTGCAACACTCAGGATGCTTGCACGGTCATGTTGCCACCATCCAACCTGCAGACCCCATTCTTGAGATTGACTGGGAGTTCCTATCATGTCCTCCATAGCAAGGGGA
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GCCTTTGCCCACTGCCCTGGAGGCCAAAGGAATGATTCCATTAGAGATTCCAGATGCACCTCCTCCTATCCCACAGCTGATATCCAGAAGTCGCCCTTGACTGTCTCCCTCCCTCTCCACATCCACCTGTGAGCCAGGTCGATTCTGCCTCCTGTTTCTCTGAAATGTCTGCTTGGCTGTGTCTCCATCCCTGGCCACCATTGTTTGAGCCTGGGCCACTGCCATAGCCTGGTCTCTGTAACCTGGGCCCCTCCACATCCCTCTCGACTCAGCCACGCAGAGTGAGCTTTCCAAGGTGCAAACCCATGCCCCCCTTTGTTCAAATCTTCCCAGGGTTGCTCAATCCCTGCGGCCTCCCCAGCTTTCTGAAGCCCCCAGCACACCCCACCCTCTCACCTCTGAGCCTGCCCAGCTATTGTCTCTGGGAATGTCATGCCCGCCTTCCATGGGGCATCTCTTCTGCCAGGGCTTTCCTGATGCACCCAGGCAGGGCTCATTGCCTCCTTCCCCTCCCCATACCATGCCACCTCCATAGGATCAGGGCACAGGCTCCATTGTCTCTGGTGTGGGGCCGCTGAGTCTCCTCAGCCCACACAGTCCATGAAGCTGAGCACGTGCAGGGATGCCTCATCACATCCCTCTCGAGAATTGCTATGGATCAAATGTGTGGGTGACCCCGTGGCCTCTCAGCTCCCTCGGCCCCAGTCCATGTCCCCAGCAACCCCTCTGCCCTTTTGCCTCTTGGTCTCTGGTCTCTCTCCCCTCCTTGCTCATCAGAGAACTTGGGCCAGAGCCACCATGGCCCTGTCTCAGAGAGTGGGATGTGCCCTTGTGCAGGTAAGAGAGACTGTGTGACTGTGGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTGAATACGGGGGAGACTGTGTCGATATAAAGGAGATCATGGGAATACGGGGAGACCATGAGAATAGGAGGAGACCGTGGGAATATGGGGAGACGGTGAGAATATGGGAAGACTGCAAGAATATAGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTATGGGAATATGGGGAGATCACATGAATATGCAGGAGACTGTGAGAATATGGGGAGACCGTGAGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGAGGAAAGTGTGAATATGGGGGAGACCATGTCAATATAAAGGAGCCGTGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGGGAGAGAGAGTGTCAATATAAAGGAGACTGTGGGAATAGGGGGAGACCGTGGGAATATGAAGAGACTGTGTGAATATGGGGGAGACCATGTCAATATAAAGGAGATCGTCGGAATATGGGGAGATTGTGCGAATATGGGGAGACCATGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGATCATGTGAATATGCAGGAGACCGTGTCAATATAAAGGAGACAGTGGGGATATGGGGAGACCATGAGAATATAGGGAGACCATGGGAATATGAAGAAACTGTGTGAATATGGGGGAGACTGGGAGTATGGGGAGACTCTAGTAATATGGGGAGACTGGGAATATGAGGAAACTGTGAATATGGGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGACCGTGGGAATATGAGGAGACTGTGTGAATATGGGGAAGACCATGTCAATATAAAGAAGACCATGGGAATATGGGGAGACCATGGGAATATGAGGAAACTGGATATGGGGGAGGCCGTGTCAATATAAAGGAGACCGTGGGAATATGGGGAGACTGTGGGAATATGAGCAGACTGTGTGAATATGGGGGAGACCACATCAATATAAAGGAGATCGTGGGAATATGGGGAGATCGTGCGAATATGGGGAGCCCATGGGAATATGGGGAGACTGAATATATGGGAGACTGTGGGAATATGGGGAGATCATGCAAATATGGGCAGACCATGGGAATATGGGGAGACTCTGTGAATATGGGGGAGACCATGCGAATATGGGGAAACCATGAGAATATGAGGGACACCTGTGAGTAACGCGGCTGTCTGTCTCCAGTGCCCGCGTGGATTTCCAAAGTGTCCTTCCGGCGGTGGTGTTTTGAAGGGCTGATGAAGATTCAGTTCAGCAGAAGAACTTATAAAATGCCTCTCGGGAACCTCACCATCGCGGTCTCAGGAGATAAAGTAAGCGGGGAAGGCCTCGGGTTCTAAATTATTGGACGTCCGGCTTTCCATCCTCCTCATGAGCCCACTGCATGTCTGTGTCTCCAGATCCTCAGTGTCATGGAGCTGGACTCGTACCCTCTCTACGCCATCTACCTCATCGTCATTGGCCTCAGCGGTGGCTTCATGGTCCTGTACTACGTGTCCTTAAGGTTCATCAAACAGAAACCAAGTCAAGACTGGTGATTCACGCCAGACGTCTGCCCGCTGGTGGGGGACCTGAGCAGACCCTTCAACTGCACTCCCTCCTCAGGAGCCCCTTCCTGGGGACAGTGAGGACAATGACCCTACAGATGCTCAGCTACATCCGGCCCAGGGTGCTGCAGTGGCACAGACCAGCCACAGGATGGCAGTAGAATAAAGACAGTCGAAAGGGATTTCTGCTCACTGGCAGGAGACTGCGATGACTGGGAGAAAACCTGCACTCGGTGGCACCTACAACGTTGCTAATTTATTTCCTTTTGATATGCATTTATATAGGCAACTCGATATAGGATGGGAGCAAACTAGGAATGAATTGGGTAGCTAGACTGTGCAGGAATTGTTGGAACCTGGAGGGAACAATAACAGTAGCTAGCAGATTTGGCTTCATCTTCCAGGGGCCCCACACTCCGTGGTGAGCCACCATCAATACAGAAAGTGACCTAAGATGTACCAGCAAGATGCCATCCCTTCTTTTTGTGTGGGGTCATGGGCTCCAAAAGCCAACGTGAACAATTAAAAATGTATTGAGCATCTACTCTGTAGCAGGTCCTGTGAAAACACTTTAGGTGGACAATCCCTTGAGGTAAGTGGTATCCCATTTTATAGGTGTGAAAACTGAAGCAAAAATTCATTTTCCTAAGGGCACATGGATACTTTGTGGTGGAGTCATATGGGGATCAGAAAAGCCTTTGAGGCCTTTGGAGTTAGAGGGCAGAAGGCAAGGCCTGAGCCGCTGTAAGCCTTAGGAGTTTAGGAAGGCTCCAGAAGACAAATGGGGTCTGTAGAGGCTGTTAACTCAGCCAGGCTTCTTAGAGTTGCATTTCACTAACTGATATGGTTTGGCTCTGCGTCCTCACCCAAATCTCACCTTGAATTGTAATAATCCCCAAGTGTCAAGGGCGGGACCAGATGGAGATAATTGAATCATAGGGGTGGTTTCTCTGATGCTGTTCTCCTGAGAGTGAGTGAGTTCTGATGAGATCCGACGGTTTTATAAGGGGCTTCCCTCTTCGCTCGGCTCTCATTCTCTCTCCCGCTACCCTGTGAAGAGGAGCCTTCCACCACGACTGCAAGTTTCCTGAGGCTGCCCCAGCCGTGCTGAACTGTGAGTCAGTTAAACCTCTTTTCTTTATAAATTACCCAGTCTTGGGTATTTCTTCATAGCAGTGTGAGAGCAGATGAATACACTGGCCCTGCCTGGGTTTCAGAACCAGCCTTGAACCTTTCACAGTGGCCAGAGGATGGGGAGGCAGAGGCCCAGGTTGCACACTTCTTGCCTGAGTGTTGGGGACTATCTGACCCAAAACAGGTGCACAGAGGGCAGGAGAGGATGTTCCCAAAGGAAAATTAGAGTTTAGAATCAAAAGAAGGGGAAGGTGCGTGTTTGGGAGGTAAATAGCAAATACTCTTCATAGGTTCACTAGAGTCTTGCTACTCCAAGTACGATCCCTGGGCCAGCAGAATGGGCACAGCTGGAGCTGATTGGATAGGTCCCATGAGCCTCAGGCCCCACCCAGGCTCAATGAGTCAGAGTCTGCGTCTTAAGAAGACCCCCTGGTGATCTGTGCACATTCAAGCATGCTGCCGTTTTCCAAAGCACTTGCAACACTCAGGATGCTTGCACGGTCATGTTGCCACCATCCAACCTGCAGACCCCATTCTTGAGATTGACTGGGAGTTCCTATCATGTCCTCCATAGCAAGGGGA
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Task1_train_3479
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Chromosome 2 houses a mutation in gene LRPPRC (leucine rich pentatricopeptide repeat containing). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
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Pathogenic; Congenital lactic acidosis, Saguenay-Lac-Saint-Jean type
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CACTGAATGTCTGTGTGGCCCTCAGTTCCTTCATTCACGTAATGTGAGCTTTCAGTACAGCACTTTTAAAATCTAAATTCTGAGATTCTAAGACAAGATGGATTTGAGATAAAGCCCATTTTCTACTATTTCAACTGCTACAACCATAGAAAGAAATTACCTAACTCTTTTATGTTTACTAAGTAGTAAAAATGTAGTAATCAATTCAACTGTGACATGGTTGTGGAAAGCAGATTAACCTGATGAACAAACATTTCAACTGGTACCAAAAAAATTTTCATACTTGTGTAAAGGTGGACAATACTAACATGCCTGAAGAGTTTGATGGAATGATGTAAACTTTCTGTGGTTCCAAAACACTGGGTTATAGGTTACCTTTTGGAGCTTTCAGACTGGAGGATATACAAAGAGTTAATCAAACTAGCATATTGTTTTCACAAAGATTTTTCTAAAAAGGATTTAGAGACTTTTATAGCCAGAAACAATTAGGGAATACTTGTTTCACTATTTCCTTTAAACCAGAAGACGGCTGTACATTTAAAATAAAATTGCAATATGAAAGTCTGCTAAAAGCACTTTTTTTGTTGTTTGTGCATTCTGTTTGTCACCCAATGTCACACTAACAATTCTGCATCTCATTCCAAAGCACATTATACTTCGAGATAAAATGAAAAAGACCATTTTTTGTTTCCCCAAGGGGAAAGTACTTCTGTTAAAAGCATCTTTTTATGAGACTACTCTTTCTGAATTACCAATAATGCAAACCGAAGAATTAGATACTGTACTCTAAAATTTAATATTTGTTCAATTCTTATTCATATCCTATAGACATCCCATGTGTACAAGGGAAAAGTATGATAAATGCTTAAACGTACTTAAGAACCTGAAAGATTGAACATTTTTGTCCTTCAATCAGCAGGCTGTCAGGTCATGAGTACTCATTTCACAATAAAAGTTTTCCTGCCTTTCCTATTATTCTAACTAAGCTCAGTTAAAAAGAAATAGATTGGCCCACAAAGAAAATGACCATACTTTTTGTTTTCATGAACCTAATTGTATATACAACTTTATCTTTATTAAAGGTAGACAATCTGATTTCAAACACTATATATAAAATCAAGAACTAAAGAGTTTTTTTAAGAACTTAAAAAAACTACGTTCATTAAGTTTGAATATCAAGATCAGAGATGAAATAAGAAATGAAATTAATGAAATTCAGATGAAAGAAATCCATCATGTTTTGTTTTTTAAAATGCTTACACATAATACTTCATGATGACTTAAAACAATTCCATTATCTCATAATACTCAGGAATAAGTATGCTTTTCCAAAGAATCCAATTAGATGTGCGTGCAAACTGTCATACTGGCTCTGGGAACCATTACAAATCGGTAAAAGGCAAAATCTAACCTTGAACATTTTTTTCCTTCCGACGTCCAACTAGCAATGGCCAGAAATAGTGAGGTCTGATAGGAAAACCTTCCTCCTTCACAGCCTTCATTAAGGCTTTTGCCAAATCTGAAAGAGATATCATAAAAGATCACAAAGCTACCTCAGCAAAACTTCCTTACTTGGCTTTAACTTTAAGAATGTAGTACCAGTTTTATTGGCGAGTAAAGCACAATGGAGGGTGAACTGCAGAGGAAAGGAGTGCATCTGGACTTCCTTTAACTTCTTACAGTAGTCTGTTAGCTTCTCCACAGGCTGTGGGAAAAAAGTCACCACATTAGCTGGATTGGCAAACACCCCACCGTTTGACCTGCTGCAAATATTCTACCACTTCTGAGATGAGCATTTTAAACCCCGCATCCTCTTTCTACCCAAAAATCTTGCAACACAAGAACATTGTTATGATGTTTACAACTGGTCTAATCTTATAAATGTTCCTATACTTTAAAGAATCTTATTTCACTGCCAATTACATTGTCTACAAAGTAAAAGTGGACAGAATACCGTATTCATAGTCACACAGTGTTGTAAAAAGAAACTGCCAAAGACACTTGGGCCATCTTCCTTTGATACGGGGCATGCTAGTAAAATTTGCAACGCTACATCTTCCAATTTTTCAGTGACTAAAAGTAAAATGAGGTTCATTGCATCTGGGAAGAAAACAAAGACATCTTTTGTTAATAAACTGAACAATATTTTTACACTGCAACCAATGTTCCAATACTGAAGACAAAATAAGAATTGCAAACATCAAAAGCATATAACTGCCTAAATAACAATAAAACACCTGCAAATCAAATCATCCCCATGTGTTCATTAACTCATGTTTTTGGGCTTATTTAACTGACTTTAAGAGTTCTATGTTCAACTCCCACAATGCCCATTGTTAGAAAATGTCCTTTCCATCATGTAAGAATAGCAATTCAGATTTTTATAAAAATCATGTAAATAGATTTTTTTAAAACTACCTGGAATATATCTTCTTTCACATGTAACTTTTTCCAAAATTTCTGAGACATACTGAGGATACCCAGCTTTACTGAAGCTAAAAATAATTTGCAGTAAATCACGGTCCATAAGGTGAAGCTCGGACTTCTCCACCTTCTCCAGAGTCTATAGAGAGTTCCAGAAATTAGAAGACAAAGTTAGAGTGTTTTTATTTAAGTATTAAAGCTAAATAAAATATCCAGATTCAAAAAACTAGGGAAAAATACCACCTAAAGGTTTACGACTTCTTTTAAAAAACAGGAAATACTCTACTTCAACAGTAACTGTTACATACCAGCACCGAGATACTAAACTATAATAATTCTCCATAAATACTACTTTCTGCAAGGAAACATCTTTGAAAACAGGTATAAACTTCACTTTCCTGCCTCATGTAAAACATAACACAAATTTTTACAAATGATTTTAAAGTATGTTTATTTAGACATAAGTCATACCTGCTTAACATGGTCAATGTCGCCCTTCTCAGCATATGCATTCAATAATGCGAGGTATGTGTCTGGACCAGGCTCAATTCCGGCATCTCTCATCACTGTGAGAATGTTTTCTGCATTCTCCATATCACTACAAGTTAATTCAAAAAACAGATTATTATGCTTTTGCCAAATTTAATATAGTTATTCAAACTAAAACATATGCTTATTAAAATAAAAAATGCTAAGTACCATTTGGAATTATGATGTCAGAAAAGAACTAATGTATATTAAACTGGATATATGTTTCTGAAATAATAAAGATCATAAACATCTGATCCCCCATTAAAAAATAATAATAATTACATAGACATTAAATAACATACCCTCTTAATATTATGTAGGTTATGACTCAGACTTAACTTTCGAGGTAAGAATAACATTTAGTAAATTACTCTTCAAAAATAAAAATATTTTCCAGAGCAGTTACTTCAGATCAGATCAAGCCCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAACGCTCCTGCCTCAGACTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCATCATGCCCGGCTAAATTTTTATATTTTTGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCGGCTTCAAGCCCAATTTCTAAAAATTCAAATAAAAGAAAGATTTGTGGAACAAATGTAAAAGCTCATTATAAAAATATTAGTATGCTCTACCTCATATACTACAGATTTTTTTTTGAAGGGATAGACAAATGTATTTTAAGAACTGTCTACAATAATTTTCTCTAATTTAAACCCCACTTAACAAACAAAAAAGGAGTAAAATGACCACTTTAGCATCTCAGCCATCTATCACTTAAGAACCAAAACCTTAGGTTGAACATTACCCAGCTCTGGCATGCCCTGTCACAAGGGCACTGAATACTGCCTCTGTAACTGGGAGATCCTTAGTTTTCATAAATCCAAGAATCTTGCTGCAAAGGAAAAACGAAGATACTCATTGAAAGTATTTATAAGAACACTCTTTACAACATGT
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CACTGAATGTCTGTGTGGCCCTCAGTTCCTTCATTCACGTAATGTGAGCTTTCAGTACAGCACTTTTAAAATCTAAATTCTGAGATTCTAAGACAAGATGGATTTGAGATAAAGCCCATTTTCTACTATTTCAACTGCTACAACCATAGAAAGAAATTACCTAACTCTTTTATGTTTACTAAGTAGTAAAAATGTAGTAATCAATTCAACTGTGACATGGTTGTGGAAAGCAGATTAACCTGATGAACAAACATTTCAACTGGTACCAAAAAAATTTTCATACTTGTGTAAAGGTGGACAATACTAACATGCCTGAAGAGTTTGATGGAATGATGTAAACTTTCTGTGGTTCCAAAACACTGGGTTATAGGTTACCTTTTGGAGCTTTCAGACTGGAGGATATACAAAGAGTTAATCAAACTAGCATATTGTTTTCACAAAGATTTTTCTAAAAAGGATTTAGAGACTTTTATAGCCAGAAACAATTAGGGAATACTTGTTTCACTATTTCCTTTAAACCAGAAGACGGCTGTACATTTAAAATAAAATTGCAATATGAAAGTCTGCTAAAAGCACTTTTTTTGTTGTTTGTGCATTCTGTTTGTCACCCAATGTCACACTAACAATTCTGCATCTCATTCCAAAGCACATTATACTTCGAGATAAAATGAAAAAGACCATTTTTTGTTTCCCCAAGGGGAAAGTACTTCTGTTAAAAGCATCTTTTTATGAGACTACTCTTTCTGAATTACCAATAATGCAAACCGAAGAATTAGATACTGTACTCTAAAATTTAATATTTGTTCAATTCTTATTCATATCCTATAGACATCCCATGTGTACAAGGGAAAAGTATGATAAATGCTTAAACGTACTTAAGAACCTGAAAGATTGAACATTTTTGTCCTTCAATCAGCAGGCTGTCAGGTCATGAGTACTCATTTCACAATAAAAGTTTTCCTGCCTTTCCTATTATTCTAACTAAGCTCAGTTAAAAAGAAATAGATTGGCCCACAAAGAAAATGACCATACTTTTTGTTTTCATGAACCTAATTGTATATACAACTTTATCTTTATTAAAGGTAGACAATCTGATTTCAAACACTATATATAAAATCAAGAACTAAAGAGTTTTTTTAAGAACTTAAAAAAACTACGTTCATTAAGTTTGAATATCAAGATCAGAGATGAAATAAGAAATGAAATTAATGAAATTCAGATGAAAGAAATCCATCATGTTTTGTTTTTTAAAATGCTTACACATAATACTTCATGATGACTTAAAACAATTCCATTATCTCATAATACTCAGGAATAAGTATGCTTTTCCAAAGAATCCAATTAGATGTGCGTGCAAACTGTCATACTGGCTCTGGGAACCATTACAAATCGGTAAAAGGCAAAATCTAACCTTGAACATTTTTTTCCTTCCGACGTCCAACTAGCAATGGCCAGAAATAGTGAGGTCTGATAGGAAAACCTTCCTCCTTCACAGCCTTCATTAAGGCTTTTGCCAAATCTGAAAGAGATATCATAAAAGATCACAAAGCTACCTCAGCAAAACTTCCTTACTTGGCTTTAACTTTAAGAATGTAGTACCAGTTTTATTGGCGAGTAAAGCACAATGGAGGGTGAACTGCAGAGGAAAGGAGTGCATCTGGACTTCCTTTAACTTCTTACAGTAGTCTGTTAGCTTCTCCACAGGCTGTGGGAAAAAAGTCACCACATTAGCTGGATTGGCAAACACCCCACCGTTTGACCTGCTGCAAATATTCTACCACTTCTGAGATGAGCATTTTAAACCCCGCATCCTCTTTCTACCCAAAAATCTTGCAACACAAGAACATTGTTATGATGTTTACAACTGGTCTAATCTTATAAATGTTCCTATACTTTAAAGAATCTTATTTCACTGCCAATTACATTGTCTACAAAGTAAAAGTGGACAGAATACCGTATTCATAGTCACACAGTGTTGTAAAAAGAAACTGCCAAAGACACTTGGGCCATCTTCCTTTGATACGGGGCATGCTAGTAAAATTTGCAACACTACATCTTCCAATTTTTCAGTGACTAAAAGTAAAATGAGGTTCATTGCATCTGGGAAGAAAACAAAGACATCTTTTGTTAATAAACTGAACAATATTTTTACACTGCAACCAATGTTCCAATACTGAAGACAAAATAAGAATTGCAAACATCAAAAGCATATAACTGCCTAAATAACAATAAAACACCTGCAAATCAAATCATCCCCATGTGTTCATTAACTCATGTTTTTGGGCTTATTTAACTGACTTTAAGAGTTCTATGTTCAACTCCCACAATGCCCATTGTTAGAAAATGTCCTTTCCATCATGTAAGAATAGCAATTCAGATTTTTATAAAAATCATGTAAATAGATTTTTTTAAAACTACCTGGAATATATCTTCTTTCACATGTAACTTTTTCCAAAATTTCTGAGACATACTGAGGATACCCAGCTTTACTGAAGCTAAAAATAATTTGCAGTAAATCACGGTCCATAAGGTGAAGCTCGGACTTCTCCACCTTCTCCAGAGTCTATAGAGAGTTCCAGAAATTAGAAGACAAAGTTAGAGTGTTTTTATTTAAGTATTAAAGCTAAATAAAATATCCAGATTCAAAAAACTAGGGAAAAATACCACCTAAAGGTTTACGACTTCTTTTAAAAAACAGGAAATACTCTACTTCAACAGTAACTGTTACATACCAGCACCGAGATACTAAACTATAATAATTCTCCATAAATACTACTTTCTGCAAGGAAACATCTTTGAAAACAGGTATAAACTTCACTTTCCTGCCTCATGTAAAACATAACACAAATTTTTACAAATGATTTTAAAGTATGTTTATTTAGACATAAGTCATACCTGCTTAACATGGTCAATGTCGCCCTTCTCAGCATATGCATTCAATAATGCGAGGTATGTGTCTGGACCAGGCTCAATTCCGGCATCTCTCATCACTGTGAGAATGTTTTCTGCATTCTCCATATCACTACAAGTTAATTCAAAAAACAGATTATTATGCTTTTGCCAAATTTAATATAGTTATTCAAACTAAAACATATGCTTATTAAAATAAAAAATGCTAAGTACCATTTGGAATTATGATGTCAGAAAAGAACTAATGTATATTAAACTGGATATATGTTTCTGAAATAATAAAGATCATAAACATCTGATCCCCCATTAAAAAATAATAATAATTACATAGACATTAAATAACATACCCTCTTAATATTATGTAGGTTATGACTCAGACTTAACTTTCGAGGTAAGAATAACATTTAGTAAATTACTCTTCAAAAATAAAAATATTTTCCAGAGCAGTTACTTCAGATCAGATCAAGCCCAGTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAACGCTCCTGCCTCAGACTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCATCATGCCCGGCTAAATTTTTATATTTTTGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCGGCTTCAAGCCCAATTTCTAAAAATTCAAATAAAAGAAAGATTTGTGGAACAAATGTAAAAGCTCATTATAAAAATATTAGTATGCTCTACCTCATATACTACAGATTTTTTTTTGAAGGGATAGACAAATGTATTTTAAGAACTGTCTACAATAATTTTCTCTAATTTAAACCCCACTTAACAAACAAAAAAGGAGTAAAATGACCACTTTAGCATCTCAGCCATCTATCACTTAAGAACCAAAACCTTAGGTTGAACATTACCCAGCTCTGGCATGCCCTGTCACAAGGGCACTGAATACTGCCTCTGTAACTGGGAGATCCTTAGTTTTCATAAATCCAAGAATCTTGCTGCAAAGGAAAAACGAAGATACTCATTGAAAGTATTTATAAGAACACTCTTTACAACATGT
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Task1_train_3480
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The gene SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Cystinuria
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Task1_train_3481
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This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; Cystinuria
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GCCCTTCACTCTGATCCCCTTTGCCCACACCATCCTGGACCTTCTCTGTCCTTACCCTCAGGGGTCATCAGCTTCCTCTGCCCCTGGGGGTCAAGGGCCAATGCCCTGATGCCCTTAAAGCACTTTCTGCAGCTCTTCCTTAGCTCTTCAGTCTGATCATCATCCCACCCCTGCCTGCAGACACTTCCGAGACCAACACCGCCCAAAAGAAATACAATGGGAGCCACATAAGAAATTGTAAATTTTGTAGTAGCCACATTAAAAAAAGGAAAAAAGAAGCAGGTGAAATTAATTTTCATATGTTCTGTTTAATCCAATGTATCATTTCAACACATAATCAGTATAAAAATATATACATATTGTTATTTTTTTTTGTATTTTAAGACGGGGTTTTATCATGTTACCCAGACTGGTCTCGAACACCTGAGCCCAAACAATCTGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACCATGCCCGGCCCAGTATAAAAATATTAATGAGATTTTTACATTCTTTCTTTTTGTACAGGGTCTTCAAAATCCAATACATGTTGTTCCCTTACAGCACATCTCAATTCCAACCAGCCACCCTGCAAGTGCTCAGTAGCCACATGTGGCTCTTAGACAGAACAGTGCAGTGTAGACCACATGACCGACAGGGGCCATGCGTTACTCTGCTCTGTTCCTTGACACTTAGCCCAGCAGCTGGCATAGATTAGCTGCTCAAAAACCATGTGTAGAATAAATGAACAATACCACAGTCTTGGTTTTAAATATAAAATATGAGTAAGTCACAGAGATTTTTTTTAATGCTATGTTAAATGTCATCGATTACTGATAGATGACTAATTTGATTTTCTCTTTCTTTTTTTTTTGAGAAAGGGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTACAGTGGTGTGATCTTGAGTCATTGTAGCCTCCGATTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATCATAGGCATGTGGTACTGTACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAGCTCTTGACCTTAGGTATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCACTACACCCGACCTAATTTGATATTTTTTGTAGAGCTAGATCTTCCTATTTGAATTATACTCAAATTCAACAAAATTCTAAGTATTTTTGCCTTCATGTAAATATTTCTATCTTAGGCATATTTGTTATATTTTTTGTCCTTTAACTAAAACAAAGTAGGGTTTATTCATGACTTTGACTTTTTTCTTCAGGTATTCAAGATAAACTGGACTACATCACAGCTTTAAATATAAAAACTGTTTGGATTACTTCATTTTATAAATCGTCCCTTAAAGATTTCAGATATGGTGTTGAAGATTTCCGGGAAGTTGATCCCATTTTTGGAACGATGGAAGATTTTGAGAATCTGGTTGCAGCCATACATGATAAAGGTAAGTTGAATGGAAAGTGGGCAAGATGGGGATGAGGTTTGAGAGAAGCACTTTTTCAAATGTTTACTTAAAGCATTTCTTCTCCTTAACTGTCATATACTATTTCTTTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCTTTCTTTCCTTCCCGCTTTCTCTTTCTTCCTTTCCTTCCCTTCCCTTCTGTTTCCTTTTTTCCTTTCTCCTTTCCTTTTTCCTTCCCTATCTCCTTTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTTTCCCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGGCAGGGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCATGGCTCACTTCAGCCTCCACCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTTAGCCTCCCAGTGTATTGGGGTTACAGGCGTTAGCCATTACTGTGCCTGGCCTGTCATATGTTATTCTAATACAATCTTTCCCTAGCATTTGAAATGTCTTTTACTCATTAGGTTTAAAATTAATCATCGATTTCATACCAAACCACACGAGTGATAAACATATTTGGTTTCAATTGAGTCGGACACGGACAGGAAAATATACTGATTATTATATCTGGCATGACTGTACCCATGAAAATGGCAAAACCATTCCACCCAACAACTGGGTAAGTATCAACCTGTCTGACTTACAAAGGGGTAAAAGGCAGATATGTAGTGATTGAACTGATTTAGTAAAACCCTTTTGAGGGAAAAATGAATGAATATAGTTTATCGGAAGGGGGCAAGTTTCTGAAAGAAATAGAAATAAGGTTTCCAGTTGTTATTTACTCAGGCTTCCAATTATTATTTAGATTTCTGATTTCATCATAGAGATGATGTGTTCTAGCAAATTCAAACCTATTTTCTCTCCTTCCACCCTTCCTTCACTTCCTACCCGGTCCAACTTGGATTCCATGTCCCATTAGTTTGATAACCATTTTTCTACTATCCATACCCCTTTGCATTTTTTTTTCTTGAGATGTAGTTTTGCTCTTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCACAATCTCAGCTCACTGCAAACTCCACCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTTACCAGTAGCTATGATTACAGGCGCGCGTCATCATACTCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGTAGGGTTTCACCATGTTGGCCACTCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACCGCTCCTGGCCCCCTTTGCCTTTCTGACTTTTTGTCTCCTCTGTCTGACAAAACCCTAGCCATGAATGAACCCAATTATCTATTTTCTTTTTGCCTAAACCTTAGTAGTTGAGTCTCTGGAGACATCACACCTTCATTGTCCCCACCTGAACTGAGCCATCCACTCTTCTTGGGAATTTTGCTAATTTCAACCGATCAACTTTCCCTCCCTCCCTCATTTCAAACATCGTATCTGCCTCTACCCCATCTTATCACTCTCAGCAGCAAACTCGACTTCACAGAGAAAACAGAAGCCATCAAGCCTGCCTGCCCCATTCCCACCCTCTTCCTACTCACTCCTTTTACAACAGAAGCCAGATCCCTCCTTTCTGGGGTGACCAGATTTAGCAAATAAAAATTCAGAATGCCCAGTTAAATCTGAATTTTGGACAAGCAGTGCATAAAAAATTTTTTAGTGTGGACCATACTTTCTTTTTTATTTTTATTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTTTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGATCATGGCTTACTGCAGTGGCTTGATCATGGCTCACCGCAGTCTTTGCCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCAGCTATTCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAAATGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATATTTTATTTTTTTGTAAAGACAGGGCCTCACTCTGTTGTCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCGGCCTTGCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTGTGCCCGGCCACATGAGTAATACTTATACTCAACAATATGCGTGTTGATCTGAATTCAGATGTAACTGGGCATCCTGCACTTCATCTGGCAGTTCTGCTTCTGTCTCAGGCCAGAGCTTCCCCTTGCCCGGGTTTGTGTTCTCTCCTGCCTTTATTCTGGATCATCCCTCCCTCCTCCAGTCCCTCCTTCTCTCTTCTGGACCTTCTCCATAAATATTTAAACATCAACTTTTAGGTGATCCAAGGACACTCAGAATTGATATATTTGCAGGTCAACTTTGTGATGTGTGATTTTCTCCCTATAACCTTCCGTCTCCCAGGTTCAGTGAATGGTACTACCATGCAGCCTGAGGAACAGGCTGTCAGCAAGTCCTGGCAGTTTCACCTCTTTTTTTCCTCCAGTTCACTGACTTGTTAAAATTGCAATGACATTAGCAAACATTTACAAAATACTTACTCTGTGCCAGGCTCTGTGCTAAGTGTTTTATATTCATTAATTTAGTTAATCCACTCT
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GCCCTTCACTCTGATCCCCTTTGCCCACACCATCCTGGACCTTCTCTGTCCTTACCCTCAGGGGTCATCAGCTTCCTCTGCCCCTGGGGGTCAAGGGCCAATGCCCTGATGCCCTTAAAGCACTTTCTGCAGCTCTTCCTTAGCTCTTCAGTCTGATCATCATCCCACCCCTGCCTGCAGACACTTCCGAGACCAACACCGCCCAAAAGAAATACAATGGGAGCCACATAAGAAATTGTAAATTTTGTAGTAGCCACATTAAAAAAAGGAAAAAAGAAGCAGGTGAAATTAATTTTCATATGTTCTGTTTAATCCAATGTATCATTTCAACACATAATCAGTATAAAAATATATACATATTGTTATTTTTTTTTGTATTTTAAGACGGGGTTTTATCATGTTACCCAGACTGGTCTCGAACACCTGAGCCCAAACAATCTGCCCACCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACCATGCCCGGCCCAGTATAAAAATATTAATGAGATTTTTACATTCTTTCTTTTTGTACAGGGTCTTCAAAATCCAATACATGTTGTTCCCTTACAGCACATCTCAATTCCAACCAGCCACCCTGCAAGTGCTCAGTAGCCACATGTGGCTCTTAGACAGAACAGTGCAGTGTAGACCACATGACCGACAGGGGCCATGCGTTACTCTGCTCTGTTCCTTGACACTTAGCCCAGCAGCTGGCATAGATTAGCTGCTCAAAAACCATGTGTAGAATAAATGAACAATACCACAGTCTTGGTTTTAAATATAAAATATGAGTAAGTCACAGAGATTTTTTTTAATGCTATGTTAAATGTCATCGATTACTGATAGATGACTAATTTGATTTTCTCTTTCTTTTTTTTTTGAGAAAGGGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTACAGTGGTGTGATCTTGAGTCATTGTAGCCTCCGATTCCCAGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATCATAGGCATGTGGTACTGTACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTTGTCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAGCTCTTGACCTTAGGTATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACCACTACACCCGACCTAATTTGATATTTTTTGTAGAGCTAGATCTTCCTATTTGAATTATACTCAAATTCAACAAAATTCTAAGTATTTTTGCCTTCATGTAAATATTTCTATCTTAGGCATATTTGTTATATTTTTTGTCCTTTAACTAAAACAAAGTAGGGTTTATTCATGACTTTGACTTTTTTCTTCAGGTATTCAAGATAAACTGGACTACATCACAGCTTTAAATATAAAAACTGTTTGGATTACTTCATTTTATAAATCGTCCCTTAAAGATTTCAGATATGGTGTTGAAGATTTCCGGGAAGTTGATCCCATTTTTGGAACGATGGAAGATTTTGAGAATCTGGTTGCAGCCATACATGATAAAGGTAAGTTGAATGGAAAGTGGGCAAGATGGGGATGAGGTTTGAGAGAAGCACTTTTTCAAATGTTTACTTAAAGCATTTCTTCTCCTTAACTGTCATATACTATTTCTTTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCTTTCTTTCCTTCCCGCTTTCTCTTTCTTCCTTTCCTTCCCTTCCCTTCTGTTTCCTTTTTTCCTTTCTCCTTTCCTTTTTCCTTCCCTATCTCCTTTCTTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCTCCTTTCCCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGGCAGGGTCTTGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCATGGCTCACTTCAGCCTCCACCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTTAGCCTCCCAGTGTATTGGGGTTACAGGCGTTAGCCATTACTGTGCCTGGCCTGTCATATGTTATTCTAATACAATCTTTCCCTAGCATTTGAAATGTCTTTTACTCATTAGGTTTAAAATTAATCATCGATTTCATACGAAACCACACGAGTGATAAACATATTTGGTTTCAATTGAGTCGGACACGGACAGGAAAATATACTGATTATTATATCTGGCATGACTGTACCCATGAAAATGGCAAAACCATTCCACCCAACAACTGGGTAAGTATCAACCTGTCTGACTTACAAAGGGGTAAAAGGCAGATATGTAGTGATTGAACTGATTTAGTAAAACCCTTTTGAGGGAAAAATGAATGAATATAGTTTATCGGAAGGGGGCAAGTTTCTGAAAGAAATAGAAATAAGGTTTCCAGTTGTTATTTACTCAGGCTTCCAATTATTATTTAGATTTCTGATTTCATCATAGAGATGATGTGTTCTAGCAAATTCAAACCTATTTTCTCTCCTTCCACCCTTCCTTCACTTCCTACCCGGTCCAACTTGGATTCCATGTCCCATTAGTTTGATAACCATTTTTCTACTATCCATACCCCTTTGCATTTTTTTTTCTTGAGATGTAGTTTTGCTCTTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCACAATCTCAGCTCACTGCAAACTCCACCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTTACCAGTAGCTATGATTACAGGCGCGCGTCATCATACTCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGTAGGGTTTCACCATGTTGGCCACTCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACCGCTCCTGGCCCCCTTTGCCTTTCTGACTTTTTGTCTCCTCTGTCTGACAAAACCCTAGCCATGAATGAACCCAATTATCTATTTTCTTTTTGCCTAAACCTTAGTAGTTGAGTCTCTGGAGACATCACACCTTCATTGTCCCCACCTGAACTGAGCCATCCACTCTTCTTGGGAATTTTGCTAATTTCAACCGATCAACTTTCCCTCCCTCCCTCATTTCAAACATCGTATCTGCCTCTACCCCATCTTATCACTCTCAGCAGCAAACTCGACTTCACAGAGAAAACAGAAGCCATCAAGCCTGCCTGCCCCATTCCCACCCTCTTCCTACTCACTCCTTTTACAACAGAAGCCAGATCCCTCCTTTCTGGGGTGACCAGATTTAGCAAATAAAAATTCAGAATGCCCAGTTAAATCTGAATTTTGGACAAGCAGTGCATAAAAAATTTTTTAGTGTGGACCATACTTTCTTTTTTATTTTTATTTTTCAGAGACAGGGTCTTGCTCTTTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGATCATGGCTTACTGCAGTGGCTTGATCATGGCTCACCGCAGTCTTTGCCTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCAGCTATTCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAAATGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATATTTTATTTTTTTGTAAAGACAGGGCCTCACTCTGTTGTCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCGGCCTTGCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTGTGCCCGGCCACATGAGTAATACTTATACTCAACAATATGCGTGTTGATCTGAATTCAGATGTAACTGGGCATCCTGCACTTCATCTGGCAGTTCTGCTTCTGTCTCAGGCCAGAGCTTCCCCTTGCCCGGGTTTGTGTTCTCTCCTGCCTTTATTCTGGATCATCCCTCCCTCCTCCAGTCCCTCCTTCTCTCTTCTGGACCTTCTCCATAAATATTTAAACATCAACTTTTAGGTGATCCAAGGACACTCAGAATTGATATATTTGCAGGTCAACTTTGTGATGTGTGATTTTCTCCCTATAACCTTCCGTCTCCCAGGTTCAGTGAATGGTACTACCATGCAGCCTGAGGAACAGGCTGTCAGCAAGTCCTGGCAGTTTCACCTCTTTTTTTCCTCCAGTTCACTGACTTGTTAAAATTGCAATGACATTAGCAAACATTTACAAAATACTTACTCTGTGCCAGGCTCTGTGCTAAGTGTTTTATATTCATTAATTTAGTTAATCCACTCT
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Task1_train_3482
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This alteration occurs within gene SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) located on Chromosome 2. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
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Pathogenic; Cystine urolithiasis
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Task1_train_3483
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Consider this mutation in SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) on Chromosome 2. Is this a benign change or a disease-causing variant?
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Pathogenic; Cystinuria
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TTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCCCAATCTCGGCTCACCACAACTTCCACCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTATGGGCACCCGCCACCATGCCTGGCTACTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTGTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCCATTTCATCTTTTATTATCTGAGTGTATTCAAGACAACACTAGTATCTGAGTTTTACCACAGGATCGTCACTATTCTTAGTTATTTACTTGGTTGATGGTTGATTCTATTTTTTTTCTGTGTGTTCCTTCCATATTACTCCTAGCAGGAGATCCTTTAATATCTAAGCACTTCACCTCTCATCTGCCTTCCTAGTAAGGAGTGAAATATTTAACTATTGAACAATGTGTTATTTTCTTTGAGTTTGCAGTGACAGTTAAGGAGTTGGGCATGAGGGAGATGAGAAACTTTCCTAGTTTATTCTGAGTCCTATCTTTTCTTATGGTTTCATTCTTTCATTTTTAGTAGACTCTCTAAACTTTGAAAACATCCTTATAACATCCATTACAAATGTAACTAATTGTAATTCTGAATTCACATATGAAGGAGGTGTGGGAGTCGCTAAATGCAGTTAGAGTGCATTTTAGTAAGACAGTTATGCTAAATAGATAAAAATAGACTGTGAATACTGTGCTTGTTCTGTATGTAGATATCTGTTTTATGATGCCAAGTTGTTAACAGTCAAAACTTTGATTAAACGTTGTGATAATAACGTAGTTAATGTAACCAAGCATTTTGCTTCTTCATCTTTAGGAAATTTTACGGTTCTGGCTCACAAAGGGTGTTGATGGTTTTAGTTTGGATGCTGTTAAATTCCTCCTAGAAGCAAAGCACCTGAGAGATGAGATCCAAGTAAATAAGACCCAAATCCCGGTAAAGTTTTATTTTAAACGTTTTTCTTTTGCCTTTTCTGAAAATGTCATCAGAGTGTTTTCTTTCTCAGCCTGAGATACCAGTTACAAAGATGAGTTTTGTCCTGTGTCTAGCAAGTACCCTGATTTATTTCTTTAGGAAATGTGCAAGAGTTTGAAATGCATATGCACTCGATGTTTTTTTCCACTGGTTCCCTCCAGAGCGAGGGATCCCTTGAGGAGTCCTTCAGTGACAAGGGTTCTGAAGACATGGACAGTGTGGGCTCTACCAAGGGCCACAAAATAGAGGACATTTACTCCTGCAATTTTATCATCTGACATAGGCTCAAGTGAGGAGGCCTTGGCTTGGATGAGATGTAATTTTTTGTTTTGATTCTAGGAGATTATTGTCATCCTAGAAAGACATAGAAATGAGACACTGACATAGAAATCCTACAAAGATACAGAAACTAGGAAAAATTTACTGAAACCCCGAGAAAGTATAACAGTTAGGAGAAAGGATAGTGATGGTAAAGAAACAAATTTAAGTGCATGATGTTAATAGTTTTGTGAGCAGATAAAGTATACATGTAATAATGAGCTCTATAACCACTAAGATCTTTTTTTTTGTTTTTAAAAGGGTCTGAAACATTTTGACAATTACGTGTTGAGAACTTTGTAATCAGTGTTTTGCTTGGTAAAATTTATTTGCTAAAATGGGTGACAGTTTATTAGAGAAATATTGCTTAGTAGATTTATAAAGTTAACAACTTGAGCATCAAATGAAGCATTCTTCTCCATCCACAAAACCATGTTTGAGTGTGCGTCTCGCTTGGCTTGAGCCCTTTGAAGAGGTTGTCTACATTCATATAGAGCGAGCTGTGGGCATGCAATGTATGAAATGAGGGTAACCATGTCGTCCTGGTTTTCAAAGGACACGGTCACACAATACTCGGAGCTGTACCATGACTTCACCACCACGCAGGTGGGAATGCACGACATTGTCCGCAGCTTCCGGCAGACCATGGACCAATACAGCACGGAGCCCGGCAGATACAGGTTGACCACGGCATATGCTCTCATTTCTTCCCAGGCTTAGTGTGTGATCTGCAGTGTATCCCTCACAACCAAGTGTATTTGGAGGTTCAAGTAATAATGTAACAAGCCTGCATAACTCTAATTGATTACAGTTTGGTTGTACCAGGGCCTGCCATATTCCTTTCCTGTTTGCTTATTTTGCTGACTTTCAGTTTCCTCTTTTGTAAAATGATGCAGATCACACTACGTACTTCACAGGAGTTTTGTGAAAATTAGGTTAATGAAAAAGAGATTATATTAGCTAAATGTTAGCCATGAGCTATTATTTTTTCTTTTTCAAAAACCAGTTCCAGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAAACCCAGCACTGTAGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAAGCAGAGGTTGCAGCGAGTCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCATCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACCAAAAAAACAAAACCAGCTCCACCTGGGTGCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTGTGTGAGGTCGAGGCTGGTGGATCACCTGACGGTGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCCTCCTCTACTAGAACTACAAAAATGGGCAAGGTGGCACATGCCTGTAATACCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCGGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGTGCTCCAGTCTGGGCAACAGAGCAATACTCCATCTCAAGAAAAAAATAAAAATACCAGCTCCTTCTCTGCAGTATTATTTTTATCATTGTTATTGGATCTATAGTTTCCTAGTACAGTATATAAATCCATATGTTTCAGCTAAAGTATCAGGAACACAGCTTTGGAATCAGGTAGGTCTGAAGGAGTCCTGCTCTGTAGCTGTGTGACCTAGGGCCAGTTAATTAACATAAGTCTCAGTTGTCTCATCAATAAAAAAGTGATAGCAATAACCTCTATAAGGCTGTTGTGAGATTAAATTAGATAATGTATATAAAGTAGTGCCTGGATCATAGTAAACACTCAATAAAATTACCCATCATTAAGTTTACATAGATCACTCAACAGAATCAATAGGAAGGAATTAAAGAAATTTCATCTCCTTAAAGTAGGTACTCCGATTACTCTGTCTCCATTTTATAGACAAGGAAACTGAGGCTCTGAGCATGTAAGTAATGTCCACAGGTAGGAGTGGCAGCTATGGGATTTGAACTGAAGCAGTTGGGCTCCAGAGACCATGCACTTATCCATAAATATGCTGCCTCAAATAGCTAAAGCCAGCATTGATCGGAGTCATTTCAGGTGAATGTGTCTTCCCCCAGGGTTTTGCTTTCAGCAATTGAGAGTGCACACCAATAATAAGGCAAGATGTTATAGGGACTCCAATACAAGGGGGAAGTTCTTTTGAAGAAAATACCCCACCTAATTTGCAGACATAAACTTTAGATTCTAAATGGAGTGATGAGAATTGCTAAAGAAAGTCTTCATGGATGTCAACGAGTTTTAGTGTCAGGATGTTACTGAATTTTGATTCTAGGAGATTATTTCTCCTAGGATTCTAGGTTTAGAAAGAAAAGAACAGGCTTGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAATAGTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCACATCATCAGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTGTCTACTAAAAACACAAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGCACCTGGGAGGT
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Task1_train_3484
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With a mutation on Chromosome 2 in gene SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
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Pathogenic; Cystinuria
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Task1_train_3485
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A mutation on Chromosome 2 affecting SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
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Pathogenic; Cystine urolithiasis
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GTCCTACTTGGAGTTCATTGAGGTTCTTAGATACACAATTTTTAAAAAAATCAAATTTGGGAAGTTGTTGGCTATTTTTTTTTTAAATATTGTTTCTGACCATTTCTCTTCCTTCTCTCCTTTTGAGACTCCCATTATGCATATGTTGGTATGCATGATAGTATCCCACAGGTCTCTGAGAGTCTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTTTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTAAACATGGCTCACTGCAACCTTGATGTCCTGTGCTCAATTTTCCCATCTCAGCTTCTTGAGTAGCTGAGACTACAGGTGCATGCCACCATGCCTGGCTAAATTTTTAATTTTTTTGTAGACATGGGGTCTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTTTAGAACTCCTGAGCTCAAGCATCTTCCTGCCTTGGCATCCCAAAGCACTGGGATTACAGGTGGGAGCCACAGTGCCTGGCCTCATTCTTCTTTTTCTTTCTGGTTCTCAGGCCAGATACTCTCAATTGAGTCTTCAAGTTTTCTGATTCCTTTGCTAGTTCAAATTTGTCAAGTCCCTCTAGTAAACGTCTCACTTTAGCTATTGTACTTTTTAACTCTAACAGTTTTATTTTTTCATAATTTCTCTTATCTATTTGATAACTGTTCATATACTTTAAATTCTTCAGGCACAGGTTTTTTCTTTGAATATCAAAATATTAGCTGGTTTAAAATCTTTGTCTAGTAAGTCCAATGTTTGGTCTTCCTAAGCAATATTTGCTATTGACTCCCCCCACCATTATATGAGCCATATTTTCCTGTTTTCTTTGACTGTTTTGTATATTTGTTGTTGTTGTTAAAAACCGGACATTTTAAGTAGTATGACAATTCTGGAAATCACATTCTTCCTTTCCCAGTGTTTGTTGTGCTCTATGTCCAGAAGTCTTGAGAAATCAAAGGGTTTCTTGTCAGAAGATCTCATGACAGTGAAAAGAATAAAAGGATGGAGGCAAAAATTGACCTAATTTTCTGGCCATAAACATAGAAAAATACTTCACAATGGTCTATAAAAACGTAATTATAAAGATCATTTTCATACAGCTAAGGAAGTTAAAAAAAAAAAAACCCAACCTCCTATTTCTTGAATTGTAGCAATTAAGTCTTGTCCTAAGACTCAAGTTCGAACGCTAGTTCTGTCTTAGACTACTACTTGAATAAATGATGTAATTTCTCAGAGCTTGTTTCCTCATTTGTAAAACGGAGATAGTACTTGCTAGCACTGTTGTGTGAAGGAGGGAAATATAGGTGTGAAAGTACTTTTTAAAAAGTAAAGTGCCATGCTCAGCGTATGCACATGAGGGTTTGAGTTGTGGGTTATGGAGAGAGTTGTCAGGTGATTTAAATAAATTCTTATTTAAACAAACTTATTTAAATAAGGGCTAGAATATACCTAGAACGTTTAACATGGAAATATATTTACAAATAGAAAACACTTTATAAAATTTCATCTTGGAGTATGTAAATTCTTTCTAAAAGTTGATTTACTTTAAAAATTTTGTCTGAATAATTCATAAGTCAAAACAATTTTTTAAAAGAGGACACATCAGAAGTCTCTCATGCCTGTCCCTTTCACCTGGGTTCCCTTGTCTTGCTCTCTGCCACAGTTTTGCTTCCTTTCCTGTCAATATTCTCTTATCCAAATATGAGAAAATATGACTATGTACCCTCTGAGTTTTATTTGCAATATCATTGTACAATAAATTCTTATCACCCTTTTCTTGCTCATCAGTGGCCAAGATAATAAATTGGTCAGTTACACAGCAAATAGCAGGCCTAGGACTCAAGTCCAGGCTTGCTAGTACCAAGGTACCACATCTACTTTGTTTTGCTACGTTGTGAACTTTCTGTGAAATAGGGTAAATCTTTCAGAAAACTGTGTATACAGCTGTGTTCTTAAAAATATCTGCCTTTCAGATTGGTGGACCAGACAGTTCACGGCTGACTTCGCGTTTGGGGAATCAGTATGTCAACGTGATGAACATGCTTCTTTTCACACTCCCTGGAACTCCTATAACTTACTATGGAGAAGAAATTGGAATGGGAAATATTGTAGCCGCAAATCTCAATGAAAGCTATGATATTGTAAGTTGAATACAACTTGACTATTCATCACAGCTATAAAACCAAGTATTCATTTTTTATTTTTTGCCAAATCAGAGAACTTACTATCTCTCTATTGCATTGCTGAAAATCATGGTTACTTTGCTTTTCTTTCTTACTGTTAGTAAGAATTCTCAGCTTTCTTGGTGGTCTGAGAGCTTATTTTAAAAATGCTTTGGAGCCATACAACTAAAAGTTTCTTGGGTAGGGCATTTTAAAGATGTTTTCTACCTGATAGGCACATTAAAATTTATTTATTTATTTTGCCAGGAATACTGTGTTGAGAGGCACACTAAAATTGGAGAACCGGTGGTTTAGTTTAGAATATGACTCATTTCCCTCTACTTGAAATGTGGAGTTAGGAACACTTATTTCTTTAGTTCTCATTTGTCCTGTTTGGTCTTGGGTGACCACAGCACAAGGACCCTTTTCTTTTCTGTTATCAGGTGCAGTGCACAGCCTCAGAGTTAAGCAGTTTTTATTTTGTAGCTACAGATTTCAGAATTGTGTTGCTGGGTAGACGACTATCTTGCAACTTTAATTGCCTAGTTAGCTTTCAACTATATGAGATCCAATTTCCCTAATATTTGATTAAGGTGAAGCTTTTTTCCCTCTATCAGCTCCTACATTTGTGTGTGTGCACTCATGAGCAATAATCAGGCTGAATAAACGAGTAGGACAGAATTCATACTCACTTGTACATGGCAGTGTTCTTAAATTCACCAACACTGTACCATAGTAGAAGTCGTGTAAACTGGCAATAGCACATTTTGAAATCCTGTATTATTGATTTTTAGGAAAAAGCAGCAGAGATTTCAAGCATGTATTAAAGTTCGATTAGTATTGTCTATTCAAACTCAAAATGTTATTAGGTACTTTCTAGTTAAAAGGGTGAAACTGGTTTATGTACCGAAAGTTGAGGCCTTTTCATCACAAATGCTAATGAGTACAAACACTAGCTAAGAACTATGGGGAATTAAATAATTATGAAGTAAATCAGGACCAAAGCACATTTCTTCTAATAACCAAACCACTGTTTTCCCTTTCTGGTCTTTTGACATAGAATACCCTTCGCTCAAAGTCACCAATGCAGTGGGACAATAGTTCAAATGCTGGTTTTTCTGAAGCTAGTAACACCTGGTTACCTACCAATTCAGATTACCACACTGTGAATGTTGATGTAAGTATCAGTGAAAATTTTATGTTGATTCTAGAAACAAAGAAATGGGTTTCTACTGAAAGTACACACTCACCCTGAATGTGTCTAAACCTTAACGGATACTCTTTAAATCAATCACAGACTTCCTTGCAGTTTTCCATTTGTAAGGAGTTTGTAAATCATGCCTTTGTGAAAATACAAACTGGTACAAATCTACCAAGTGAAGTGAAGTATCATATAGAATATACAAGTCTTCATTGCAATGACCTTTACTAAGGCCTTTGAGCTATGAAGGAAATTTTATGAAGTTTTTTAGCTAGCCCAGCTGCCTTTCCTCCTCTCTTCCCCTCAAAAGGCAGGGAGAGAGGCGAGTGGATAGGCAGCCATGCAGGCAGTAAGGAGATCAATCAATCAACCCAGAGCAAGGCTCAAATCCACACTACTGTTCTGAAGAAACAGAAGCCATACATGATCCTTAAAGTGGTTGCTCTGGCATACTAATACAACTTTGGCTTTTACCCTTTTTTCTGTTCCCATAGTGATCAAGCACTAATGTCATTCACTAGTGAAAACTTCACTGGAAAACAAACTAAACCAATTTAGGGGAAATGAAATTATAGATGCCACATGGAGATAGTTAAGAAATGCATAGCACCCTCTGCCACACACACACACACACCATGCCCATCCCACTCTACTGAGTAATCTGAGGAAACTCCCCAGGATATTCAGATATAGAAAGCCACACAAACCCTCCTGCTCCCACAGCTCCCTGCTACAAGCA
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Task1_train_3486
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A mutation found in SLC3A1 (solute carrier family 3 member 1) on Chromosome 2 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
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Pathogenic; Cystinuria
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Task1_train_3487
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Assess the clinical impact of this variant on gene PREPL, SLC3A1 (prolyl endopeptidase like| solute carrier family 3 member 1), found on Chromosome 2. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
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Pathogenic; Cystinuria
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TAAAAATGACAGTTCTATATACATTGATATGAGACCATTTCAAACAGGTATTCAATAAAGTATAGAATGGTAACATATCACCAACTGTGTAAAGAAAAATATATAAACATATGAAATGATACATTCTGTGCCTATGCAAACATATGATACATTAAAAACAAAAGAACATATAGTGCCTGTCTCTGAGGGGAACTGTGAAGCTATGGAAAGGTGTTGAAGAAAACCTTTTTATAGTATGTATTCTTGTAATTGAATAAAAAATAAAATTACAAAAATCAGGCTTGGAAGTATTTAATAGCAGACAAAATATAGTTCAATATGAAAAGCATTATATGAGACAAAGGCAATTTTCAAAAATTGATAAAACATTCCACCAAAAATCATGACTACGCATCTAACAGCTTCAAAATATAGAAAATACTCAAATGCAAAATCAACAAATCTGCAATTACAGAAAAAGACTTCAACATACTTTTAGAAAGTAGTAACTCAAGTAGACAATAATAGCTAACACTTACCGGGCACTTCTTATGTGAGTGGCACTGAAACATGTGCTTTCATGCATTACCTAAGGCTAGAGAAAATGTTAATAACTTAGACAAGTCATACATGTATCATAAATATCTTTGTACCTGACAAACAGAATAAACATCTTTTTAAACACCATTAGATAATTATTTAAAGACCACATATTGGGAACCTACCCCTAAAGAACAATAACAACCACAATAACAACTATCACCCCAGTAAACATGGCTGGCAAGAATACAATTAAATGAACATTATCACTGATTTGGCAACAGCTCTTATGAAGAATAATTTGGCATTATGTATCAAGTGCCCATACTCTTTGACAAAGTAACTGTCTTTCTGATAATCTATCTTAAGTAATACAAAAATGGGGGGAGGGGAATAAAAATACAAAATATTAGAAACACTATCGTCAAAATGAAAGGGCATGGCTGAGTATGGTACAACCGTTCAACAGAATATTGTCATTAAAAACATTTATGGAGGCTATATTATATAGTCAATAACAGAAAATGCTTGAAAGGTTAGAAGTACATCATCAAATTATGTTTTATATAGCTGTAAAATAAACCCAAATCATCTTTAATGAACACATACTATTATGGTAAAAAAAAGTCTACAATTTCTAACTTTCACCTTAGGCAGCTTTTTATTTTGCATCCTTTTTTTCAACTTTGTCTTCTATTAGCTGTGCAAGAAATACATGTCTGCTAAAGTTACACGATCTTCGCACAACAGCAACCTACACATTAGTCTACAAAGGGGAACAAACCCAAATTCCTCAGAAGTCTGAGTCCACTGTTGCCTTCTTTCTGGCCATCTGGCAGTTACAATATAGCACAGAATGACTATGCAAGTTAAATATTCATCTTAGACATGGACATTTGCTTTGGGACTCCTAAAGTGGAGTCAAATTTGATCTCTACAGAAACTCTACAATGTAGCAGAGCACTGTGCGTACTTATTGACTCCCAGACAAGCCGAAACCCCGAATTTGTCATTTCTATCAGTTTTTATATAAATTGTTCTTACCTACTTATTGATGCTTACAATTTGGCAATTATAAGGGGCAAAATTGGAGCAAGTGTTTTGGGTAAATAACTCCTTACAATATATTAAAAATACTTACAAACAATTCTTAGAATCAAACACTTACGTAAATACTTTTTTAAAAAAATAGGTCCAAAAGACTCAGCCCAGATCGGCTTTGAAGTTATATCAAGATTTAAGTCTACTTCATGCCAATGAGCTACTCCTCAACAGGGGCTGGTTTTGCCATTTGAGGAATGACAGCCACTATGTTGTGTACACAAGAGAGCTGGATGGCATCGACAGAATCTTTATCGTGGTTCTGAATTTTGGAGAATCAACACTGTTAAATCTACATAATATGATTTCGGGCCTTCCCGCTAAAATGAGAATAAGGTTAAGTACCAATTCTGCCGACAAAGGCAGTAAAGTTGATACAAGTGGCATTTTTCTGGACAAGGGAGAGGGACTCATCTTTGAACACAACACGAAGAATCTCCTTCATCGCCAAACAGCTTTCAGAGATAGATGCTTTGTTTCCAATCGAGCATGCTATTCCAGTGTACTGAACATACTGTATACCTCGTGTTAGGCACCTTTATGAAGAGATGAAGACACTGGCATTTCAGTGGGATTGTAAGCATTTGTAATAGCTTCATGTACAGCATGCTGCTTGGTGAACAATCATTAATTCTTCGATATTTCTGTAGCTTGAATGTAACTGCTTTAAGAAAGGTTCTCAAATGTTTTGAAAAAAATAAAATGTTTAAAAGTAAATTATGGCTTATAGGAGCTTATAACTTTATTCAGATAGCATCAATCAGGGATGACCAGAACACATTAGGACCCCAGATTATTCAAAAACTTTAACGAATTTTAAGGGGAAGAATTTTATCTTTTCCCTTAAAATGCAGTCATAGAAATTAGAGGATGACTCACTGCCACAGTGTCTAAAAGCATTTGCTAGCAAAGAGGCAGGACACTAATTTGTAAACTGCTCAACTGTTCTGACTGGAAGGGAGGCCTGGAGCTCTGCTATCACCAATCCTTCCCTTCCCTCTACTCCACATCCTTCTAAGGAGCATGATTTGAAAATTACTTTCCTAGGTTAATGGGCATGTGCATCAATGGAGAGAATAGTATAAGCAAGTGAGATGTAGACTAAGCAAAATTTAGATGGAGAAGCACATTTTAAAAAATTAATAACTTAAAAGTCTCAAGTTATTAATTTTTTTTTTGCTAACTCAATTGGAAGTAAGACTATGAAATATTTCAGTGTGTTTCCAATTCCCAGTTGAATGCAGTGTTTCAGAATTTCAGGTATTTCTTAAGATCCTCGAAAACACTGGTGCTGTCAAGTCCAAGTTCCTCGTACAGGAATTTAATTTGGGCTGTAATCTAAAAGAAACACATTAAAAAAATTAAATAGAAGGCCTTTGTAGTAAAATGCCACTGTTTAAGCTTCTCTTTATCTATCCATCTTTACCTAACCGTGAAGTCAGCAATTTATGGCAAGAATACTTTCATTCGAGAGAGAGGCAGAAGGCTTCCAACAATTAAGATTAAATTATTTTCTTTAACAGAGCTCACGTATCAAGTACAAGAGAGAGACATTTCTCTTGATTGACACAGTGTCCCTCCCTCCCCTCCTGGGTCTCACCCATAGATAGGACATTTGTGAAGTGGCTTTGTCATAAACCTGCTGCAACCACTGAAAATGTGAAAACAACATGTATCTAGTTCGGGAATCTGTCCACTGAGAGGGCCTTGATAACATACCTTTTTGTGAGAATCCTCAATTACATGATTGCCTCCAGGCTGAATATCTAGAATAATATTAGGGGTCTGATAGCCTGGAAGAGTTAACATGTAGAACAATTAGAAGATTGTATGGGATCTTCTTTGGAAGATCGAGACCCATTCCTCCCCTCTTCTTTGAGTACTCAGTTCAAATAATAGTAAAGGAATAAAAAGCAAAAACCACCATCATCAACAAAAAGATGGGAGGGGACAAGCAACAGAAGACAAACTTCTGACACAGCGAAAGCAGGAAGAGGCCGTATGGAAAAGACTATATGGTGCCACACGGACAAGGTTGAAACCCAGGAGATCATCAACCTGCCCTGTGGAATCTGAGAGTCTTATGCCCTGGAAACACCAACTACAGCAATGGATGGGGGTGACAAATGGAGATGAATACAGGGAGACTGATATGGCATGTAGTTTCAAGGCAAAAGGGAGGGATTCTTATCTCATAAAGCTGAAACAGCTAGCTAGAGGAAATTCATGCAGCTAAACAGTTTGGGCACTGATGGCCCAAAACAAAAATCTCAGAATCTGTCTTTTAGAGATTCCCAAGAATAACGGCTCAATAAATATTGTTAAATGAATTAATAATTGTATGGCAGTGCATCTCCAAGTTATATCTGATTCTTAAATTTCCTGTTTCCTTTGTGTCCTGCCTATCTATTTTAATACTGTCCTTTGAAAAAGAGGTGAGGCAGTGTATGTATAGACATGTAGTTACGTACACTTT
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Task1_train_3488
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Given this variant in gene PREPL, SLC3A1 (prolyl endopeptidase like| solute carrier family 3 member 1) on Chromosome 2, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
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Pathogenic; Cystinuria
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Task1_train_3489
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The variant affects gene SIX3 (SIX homeobox 3), which is on Chromosome 2. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
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Pathogenic; not specified
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TCACAAAGGGAGGCCCGGCTCAAGATGCTGATTACAGCTTCTTAAAAGCAACATACCTAAGAATAAATACCCATGCCTGGCCTAGGGGCTGTGGTGGCCAGAGGCAGAGAGGGCCCTCTGTGTTCTATGGGCCTTTTGGCGTCTGTTTTAGGCTTTCGATGTTACTTTCCCTAGAGAAATTAGACAGTTTAAAAATAATAATGGTAATTATTATTATTTTACAATACGAGCAAACAAGCAATTTTCAGGCCTTATTCACTTCATCCGGGTGGCTGGCCTCCAAAGTTTGAGTGCCCTCTGGGGCTGGCAGGCAGGACCAGAGCTCCTTCTGTTGTGTGGTGAGGAGTGGGCATCTGTAGGACTTTTCTGGGTCCAGAGGGCTCTTGGGCTTCTCGGCTCCCGCAGCTCCTCCACCACTCCTCAGAGAGGCAGCTGAATTCTGGGAAGAAACAAAGAGTTGAGTTGCTTCTTAAGATGGAAAGAAGTGTACTGTTTGGACTGTTATTTTAAAATACAGGGTGGTGGGGGAAATCGAGGCTCCTTGGCCGGGGAGGGAGTAAAGAGAAGCCTAATTGATGAAGAGGGAGTTGAGGTGAATGCGGTCCATGGGCACCGATGGGGGAGGCAAGAGCGGCCTCCAGCACCCTGGGAATTGGGCTCAGGCTCCCTGGCGCCAGATACCCTCGGAATCCGGGATCCCCGGCTGGCGCCACGGCCCGCTGGGCCAAGGTCGGTGCTTGGTGGGCCCCATGATCTCATCTCTCCTTTCTTCCTTGCCACTATTAGTGCTCACATAGGCAGAAAGAGGCGGCCCGACGTGCAAACCATGTGCAAACCGCGCCCGCTGGGCTGGTCAGCCGTCTTTCCTTGCCTGCCGACCTGGACTATGTGGAGCCTGGGGGACCCTCTTGCCTCCCAACAAAATCCCCTCTCTAATTGCACATCCCATTCAACAACTCTGCCCAGGGCTTTTCGAATTTCTGGATCAACTTCTTTAGGAAAAAGGGAAGAAGAAGTCTCAGAGACAGCGGTAGAGAAAAGAGGAGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAGAGAGGAGGGGGAGGTAGCGAGATTAAGAGTTGCAAAGATAAAAAAAATTCTCTTTATCCCCCCACTTCTCCCTCCTTCCCTGCTCTCCCCCTCCCCCCGCCCTCTGGCTAAGTGGTAAAACCGTCCTTACGTTCTCGGTATTGATTGGCAGGGCTGACAGTGATTGGCAGTGGTTGCCGTGGCAACGCCACAACGACACGCCACAGACCAATAGAAAAGCGAAACAAAATGTTTCAATGCTGCACTCACTGTGGATTTAGGGGAGATATTATGAGGCTGTTGTCATTAGGGCGATTGCGGTGGAATCGCTGAATCTTGACTCGGCGGTGGTTGGCTCTCCCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTGTCTCGGGTTCTCTCTCTGCGCGCGCGCACCGGGCCGCTCTCCTACCTCCCTCTCTATGTGGCTGCGCGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGTGTGTGGGGTGTGGGTGTCCCTTACGCCCTTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCCTGCTCCCCCCTCCTTTCCTTCTCCTCCTCCCCCCTCTCCTCTCCCTCCTCCTGGTCCTCATCGCCCCTCTCCTCCTCTTCCTCCCCTCTCTCTTCCTCTCCCTGAATTTTCTCCTCTCCTCTCAGGTCAGTCCATGGTATTCCGCTCCCCCCTAGACCTCTATTCCTCCCACTTCTTGTTGCCAAACTTCGCCGATTCTCACCACCGCTCCATACTTCTGGCGAGTAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGCGGCGCGGGAGGCGGCAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGTGCTGGCGGAGCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCAGGGCCCCCCCGGAAGAGTTGTCCATGTTCCAGCTGCCCACCCTCAACTTCTCGCCGGAGCAGGTGGCCAGCGTCTGTGAGACGCTGGAGGAGACGGGCGACATCGAGCGGCTGGGCCGCTTCCTCTGGTCGCTGCCCGTGGCCCCCGGGGCGTGCGAGGCCATCAACAAACACGAGTCGATCCTGCGCGCGCGCGCCGTGGTCGCCTTCCACACGGGCAACTTCCGCGACCTCTACCACATCCTTGAGAACCACAAGTTCACCAAGGAGTCTCACGGCAAGCTGCAGGCCATGTGGCTCGAGGCGCACTACCAGGAGGCCGAGAAGCTGCGCGGCCGCCCACTCGGCCCGGTGGACAAGTACCGCGTGCGCAAGAAGTTCCCGCTGCCACGCACCATCTGGGACGGCGAGCAGAAGACGCATTGCTTCAAGGAGCGGACTCGGAGCCTGTTGCGGGAGTGGTACCTACAGGACCCCTACCCCAACCCCAGCAAGAAACGCGAACTGGCGCAGGCCACCGGCCTCACTCCCACACAAGTAGGCAACTGGTTTAAGAACCGGCGGCAGCGCGACCGCGCCGCGGCGGCCAAGAACAGGTTAGTGGCGGGGCCCGCGGCCTGGCTACAGCCTCAGAGGCCTGGGAAGGGGAGAGGGGTTGAGATGGGGCTAGCGGAGCGGCCGCTGAGAGCCAGGGAAGCCGTGACTCCTGGCCAGTCGGAGAAAGTTTCCGCTTGTCCGGGACGCGCGGAAGAGGGGGCCGGGCTGGCTGTGGGTGTATTGATTGCTTTGACCAAGAGGGGCTTTCGTCAGGGCAGAGAGTGTGTGCTTGCGACCCGAGTACCCGCAGCCCCTGGGAGACTTAGCCCTGCGCTGCACCCGTGCCTGCCTCCTCAGCCCTGCCGCCAGCTCGGCGATCCTCTGGAGCCTAGAGACAGGGAGGGAAGGAAAGCACTCTTTGCCATCTGGTTCTTATTTCTGTGCGTTGCAAAACCCCGAGAGAAATCCACTAGCGTCAGAGAGAGGAAAGTGAACCTGGGTCCCTATCACAAGGGGAAAAGGCCAGAGGCCACTGCGCAGCGGGCCTGTTTCCCCGCAACGCTGCACGTTGCCTGACCGGGAGCAGGAGAGCCGGGCTGGGAGTGGAGAGGCCTAGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGCACGCCCGTGTGCATGTACTCGCCCTCCTGTTTCAGCCGAGGAGAATCCCTTTGGTCCTCTAAGCTGGGAAGCGGGCACGAGCAGCCTCGTTGCCGGCAAGTTGGCCACAAAGTCACAAAATTGTATAGGGCTTGACCAACATCACAGGAGCTGGGCCTGGGGGAAGGAGAAAAAGAACCAGAGGGAAAGAAGTGGATAGGCGAAAGGAGTGGGGAGAGAAGGGAGAAAGAAAAGAGGAAGTTGGGTGAAAGCCCTGATGTGGAGCCTGTGTCTTTCTCTATCCAGCCAGGAAGGCCCAGGGCCTGGTGTACTTCAGGGAGCAGGACCCCCAGCTGCTGACAGCTGCCCGTGGGTGGGGGCTGGGTGTGAGTTTCTGGAGGTGTGTTCGAGTTTAGGCGGCCGGGACCTGAGCCCATGGCCCTCTCACCCCTGCCGTGGAGCCCACTTTTCGTCTGATGAGGGGAGCGCCCAGGGTCAAGCCAAGGCCTCCTTGTGGAGAGAATTCCAGACACCAGGTCCAGGCAGAAGGTTCCCGGTGGGGGAAAGGGCAGCTGGAGACTGCTCTGTGCGCCTCTCTTGCCTTCTCCTTTGCCCCTTTTCTGTCTCCCTGCTCTTTCCCCACTTTTCCACCGCCAGCTTTCCTATTTTCTCTACCCTCGGTCCTGCGCTCTGCGCTGGCATCCAGAGAGCAAAGTATGCAGTTCTACCCGGAGACTGGCCGGGCGGTGGGGAACCCGCAGCTCCCGGTGTGTGTTTGAGGGAGCAGGGACGGGGTTACTAGGGGAACTCGACCGGTCGCGGGGCAGCCGGCTCAGTTTGAAGAGCCCCAGGGACTGCGGAGGGAAGAAGCGCCCGGCTCCTCTCCGACTTCTGCTTCTCCAGGGCTTGGCGTACTTTGTCGCTTGCACCCAGGCCTCCCCAAGCGGCCGGGCTCGGGTTCTGCCTCTCCTCCGAGGCCAGCCTCTATCTGAGAAGACTTGGGATGCTCCCGAAAGCGG
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Task1_train_3490
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This genomic variant is located on Chromosome 2, within the SIX3 (SIX homeobox 3) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
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Pathogenic; Holoprosencephaly 2
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Task1_train_3491
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This mutation occurs in SIX3 (SIX homeobox 3) on Chromosome 2. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
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Pathogenic; Holoprosencephaly 2
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CCACCACTCCTCAGAGAGGCAGCTGAATTCTGGGAAGAAACAAAGAGTTGAGTTGCTTCTTAAGATGGAAAGAAGTGTACTGTTTGGACTGTTATTTTAAAATACAGGGTGGTGGGGGAAATCGAGGCTCCTTGGCCGGGGAGGGAGTAAAGAGAAGCCTAATTGATGAAGAGGGAGTTGAGGTGAATGCGGTCCATGGGCACCGATGGGGGAGGCAAGAGCGGCCTCCAGCACCCTGGGAATTGGGCTCAGGCTCCCTGGCGCCAGATACCCTCGGAATCCGGGATCCCCGGCTGGCGCCACGGCCCGCTGGGCCAAGGTCGGTGCTTGGTGGGCCCCATGATCTCATCTCTCCTTTCTTCCTTGCCACTATTAGTGCTCACATAGGCAGAAAGAGGCGGCCCGACGTGCAAACCATGTGCAAACCGCGCCCGCTGGGCTGGTCAGCCGTCTTTCCTTGCCTGCCGACCTGGACTATGTGGAGCCTGGGGGACCCTCTTGCCTCCCAACAAAATCCCCTCTCTAATTGCACATCCCATTCAACAACTCTGCCCAGGGCTTTTCGAATTTCTGGATCAACTTCTTTAGGAAAAAGGGAAGAAGAAGTCTCAGAGACAGCGGTAGAGAAAAGAGGAGAGAGAGGGAGAAGAGAGAAGAGAGGAGGGGGAGGTAGCGAGATTAAGAGTTGCAAAGATAAAAAAAATTCTCTTTATCCCCCCACTTCTCCCTCCTTCCCTGCTCTCCCCCTCCCCCCGCCCTCTGGCTAAGTGGTAAAACCGTCCTTACGTTCTCGGTATTGATTGGCAGGGCTGACAGTGATTGGCAGTGGTTGCCGTGGCAACGCCACAACGACACGCCACAGACCAATAGAAAAGCGAAACAAAATGTTTCAATGCTGCACTCACTGTGGATTTAGGGGAGATATTATGAGGCTGTTGTCATTAGGGCGATTGCGGTGGAATCGCTGAATCTTGACTCGGCGGTGGTTGGCTCTCCCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTGTCTCGGGTTCTCTCTCTGCGCGCGCGCACCGGGCCGCTCTCCTACCTCCCTCTCTATGTGGCTGCGCGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGTGTGTGGGGTGTGGGTGTCCCTTACGCCCTTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCCTGCTCCCCCCTCCTTTCCTTCTCCTCCTCCCCCCTCTCCTCTCCCTCCTCCTGGTCCTCATCGCCCCTCTCCTCCTCTTCCTCCCCTCTCTCTTCCTCTCCCTGAATTTTCTCCTCTCCTCTCAGGTCAGTCCATGGTATTCCGCTCCCCCCTAGACCTCTATTCCTCCCACTTCTTGTTGCCAAACTTCGCCGATTCTCACCACCGCTCCATACTTCTGGCGAGTAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGCGGCGCGGGAGGCGGCAGCGGCGGCGGGAACGGTGCGGGAGGCGGCGGTGCTGGCGGAGCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCAGGGCCCCCCCGGAAGAGTTGTCCATGTTCCAGCTGCCCACCCTCAACTTCTCGCCGGAGCAGGTGGCCAGCGTCTGTGAGACGCTGGAGGAGACGGGCGACATCGAGCGGCTGGGCCGCTTCCTCTGGTCGCTGCCCGTGGCCCCCGGGGCGTGCGAGGCCATCAACAAACACGAGTCGATCCTGCGCGCGCGCGCCGTGGTCGCCTTCCACACGGGCAACTTCCGCGACCTCTACCACATCCTTGAGAACCACAAGTTCACCAAGGAGTCTCACGGCAAGCTGCAGGCCATGTGGCTCGAGGCGCACTACCAGGAGGCCGAGAAGCTGCGCGGCCGCCCACTCGGCCCGGTGGACAAGTACCGCGTGCGCAAGAAGTTCCCGCTGCCACGCACCATCTGGGACGGCGAGCAGAAGACGCATTGCTTCAAGGAGCGGACTCGGAGCCTGTTGCGGGAGTGGTACCTACAGGACCCCTACCCCAACCCCAGCAAGAAACGCGAACTGGCGCAGGCCACCGGCCTCACTCCCACACAAGTAGGCAACTGGTTTAAGAACCGGCGGCAGCGCGACCGCGCCGCGGCGGCCAAGAACAGGTTAGTGGCGGGGCCCGCGGCCTGGCTACAGCCTCAGAGGCCTGGGAAGGGGAGAGGGGTTGAGATGGGGCTAGCGGAGCGGCCGCTGAGAGCCAGGGAAGCCGTGACTCCTGGCCAGTCGGAGAAAGTTTCCGCTTGTCCGGGACGCGCGGAAGAGGGGGCCGGGCTGGCTGTGGGTGTATTGATTGCTTTGACCAAGAGGGGCTTTCGTCAGGGCAGAGAGTGTGTGCTTGCGACCCGAGTACCCGCAGCCCCTGGGAGACTTAGCCCTGCGCTGCACCCGTGCCTGCCTCCTCAGCCCTGCCGCCAGCTCGGCGATCCTCTGGAGCCTAGAGACAGGGAGGGAAGGAAAGCACTCTTTGCCATCTGGTTCTTATTTCTGTGCGTTGCAAAACCCCGAGAGAAATCCACTAGCGTCAGAGAGAGGAAAGTGAACCTGGGTCCCTATCACAAGGGGAAAAGGCCAGAGGCCACTGCGCAGCGGGCCTGTTTCCCCGCAACGCTGCACGTTGCCTGACCGGGAGCAGGAGAGCCGGGCTGGGAGTGGAGAGGCCTAGCGTGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTGCACGCCCGTGTGCATGTACTCGCCCTCCTGTTTCAGCCGAGGAGAATCCCTTTGGTCCTCTAAGCTGGGAAGCGGGCACGAGCAGCCTCGTTGCCGGCAAGTTGGCCACAAAGTCACAAAATTGTATAGGGCTTGACCAACATCACAGGAGCTGGGCCTGGGGGAAGGAGAAAAAGAACCAGAGGGAAAGAAGTGGATAGGCGAAAGGAGTGGGGAGAGAAGGGAGAAAGAAAAGAGGAAGTTGGGTGAAAGCCCTGATGTGGAGCCTGTGTCTTTCTCTATCCAGCCAGGAAGGCCCAGGGCCTGGTGTACTTCAGGGAGCAGGACCCCCAGCTGCTGACAGCTGCCCGTGGGTGGGGGCTGGGTGTGAGTTTCTGGAGGTGTGTTCGAGTTTAGGCGGCCGGGACCTGAGCCCATGGCCCTCTCACCCCTGCCGTGGAGCCCACTTTTCGTCTGATGAGGGGAGCGCCCAGGGTCAAGCCAAGGCCTCCTTGTGGAGAGAATTCCAGACACCAGGTCCAGGCAGAAGGTTCCCGGTGGGGGAAAGGGCAGCTGGAGACTGCTCTGTGCGCCTCTCTTGCCTTCTCCTTTGCCCCTTTTCTGTCTCCCTGCTCTTTCCCCACTTTTCCACCGCCAGCTTTCCTATTTTCTCTACCCTCGGTCCTGCGCTCTGCGCTGGCATCCAGAGAGCAAAGTATGCAGTTCTACCCGGAGACTGGCCGGGCGGTGGGGAACCCGCAGCTCCCGGTGTGTGTTTGAGGGAGCAGGGACGGGGTTACTAGGGGAACTCGACCGGTCGCGGGGCAGCCGGCTCAGTTTGAAGAGCCCCAGGGACTGCGGAGGGAAGAAGCGCCCGGCTCCTCTCCGACTTCTGCTTCTCCAGGGCTTGGCGTACTTTGTCGCTTGCACCCAGGCCTCCCCAAGCGGCCGGGCTCGGGTTCTGCCTCTCCTCCGAGGCCAGCCTCTATCTGAGAAGACTTGGGATGCTCCCGAAAGCGGAATGGGGAGCGGCGGCGCGGGGGAGCCGGGTGGCGGGCCTCTGTGTCAGGGCGGGCGCGGATCTCTTTCTCCCGCAGGCTCCAGCACCAGGCCATTGGACCGAGCGGCATGCGCTCGCTGGCCGAGCCCGGCTGCCCCACGCACGGCTCGGCAGAGTCGCCGTCCACGGCGGCCAGCCCGACCACCAGCGTGTCCAGCCTGACGGAGCGCGCAGACACCGGCACCTCCATCCTCTCGGTAACCTCCAGCGACTCGGAATGTGATGTATGATAGCCAAGGCCGCCCTCCTCCCTCTCCTTCCCCTCCTCCCCCACTCCTTCCCCTCCGCCTCCTAGCCCTCCTCCTCTTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCATCCCCAGAACAAACCGAAATCAGGATACCCAACCATAC
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Task1_train_3492
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Here is a mutation in PRKCE (protein kinase C epsilon) on Chromosome 2. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
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Pathogenic; not provided
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Task1_train_3493
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This variant lies on Chromosome 2 and affects the gene EPAS1 (endothelial PAS domain protein 1). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
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Pathogenic; Erythrocytosis, familial, 4
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CTACCAGGTATCAGAGCTGTTTTCTTCCTTTTAGTGTTCATCCCCCAACTCCATTGAAATAAGCTCCTTGAAGGGCTTTGAGCCCCCAGCTCAGTCCCCATACAGGGCAGTAACATCCCGTATGTGGCACAGAGCTGCACAGTTTGCACAGCCCTGCTGGCCACAGCCTGTATCCTGTTTGGTCCTCAAGACAGGACAACCTGTGAAGCGACAGTAGCCTCATTTTATGATGAGGAGACTGGAATTTAGAGAGGTTGATGAATTGACCTAATTCATACAGCTTGTTAATTAGCAGCCCCTCTACAAATAGTTGTGTGGTGGAATGGAATTGAACCTTTGGGTCCAGGAAGGTATTTCTTCTTCCATGCTGGACTTCTGGGGAGACCAGTGCCATATCTTTGACTCTGTCCCCCTCCTTCCTGGCCCCTAGCCCAATAGCCCTGAAGACTATTACACATCTTTGGATAACGACCTGAAGATTGAAGTGATTGAGAAGCTCTTCGCCATGGACACAGAGGCCAAGGACCAATGCAGTACCCAGGTAGATGGCTGTGGAGATCAGGCTAGGGTGTGTGCCTGCTGTCTGGTGGACAGCAAAGGCTCACATCCATTCTTGTAGCCTCATCCCTTTGTTGTAAAGAGCAGTGGAGACGTTTGGCCAAGGCCCAGGTCCCCTAAAGAGGTAGGGGTACAGGGTAATGGAGCCTGTGGTCACCCCCTCCTCCCACTGTCAAATCCAGCTCTTCCAGCATATGTGTCTCCTACTTAGATAGCTTTCTTAGCACACATGAAAACCGAAATGATACCACTGCACCTTTCTTTAAACAGGCCCTACATTTAACAAGCATAGCCAGATGTATAAAACATGTATAAACATAGGGGACAATTAATCCCTTTATAAACACATTCATCTTGTGATTTTAAAAAAATAATCATTTTTATATGAAATGCACTTTAAAATAAATAACATCTGTTTGACAATTTTTCATTTACATAAAACTTTTCAGGAACACATTTATTACATAAGGCCAATGTTCTTGCAAAAACTATGTAAACAAGGATAAGGTAGAGGGAGGGGTACGTGTTTTACAAAACCCCAGGGAAAACCATTAATCCCCCATTTGTCTTAGTCTTGAGTTCAACCAGATTTCTGCCTTGCCACTTAGTTTGTTTCTTGATCCTACTTGGCACAAATCCCAGCTACTCTGCAAAACATGCCCAATTTTAGCTTTTCTATCACCCTCCCTCCTCAGCACTCCTGTAGTATATATCATGTGGCACTTAATCACAGCTATCTGCTTCTGCTCCTTAAAGATTGCTTAGTATTGCAGTCATTAGTCAGCTGACACCCACTGAGGGTGTCAGTCTCTGAAGTTAGAAACTGTTTTCCGCATCTGCTTGTATTCCCCTGCTTGTATCATGCGTCCGTCATGATACTGCCACCCTAAGGGATGATCTGAGTATCTGCTGATTGGAACCAAAGTCTCTGTCCCTGGGGTCTGGCTGTTAGGCTGTTACTCTGCGAGAGTCCACAGATGGACCTGGGCACTTACTGCTTGCTTAGGCCCGTGCCAGCTTACAGGAGGGAGAAGAGGACAAAAAAAAGCCACAGTGTGCACCACAGGCCTAAGCATTGTAGGACAAGGATAACCACCACAGGCTGGAGTAGGCAGGGCTGACTCTGTGGAAGAGGGGCTGCCTCGGCTTCAAGAGAGAAGGCGGGCTCCGGACAGGTGGGATGGGGAGAGGAGAACATTTCTCAATGTGCAGGGTGAAGAGGGGATAAACATGGGGGAAGGCTGGTACATGATACAAGGTCGTGTACATGACACAGCCAAGTCTGAGGTTTTCCTGATAGGCCCTCGGGAGCCAGTGGAGGCGTTTGAGCAGCACTGTGAAACAGTGCTTGAGATGAATGGCTCTGCAGGAGCTGAGTTGGAATAGTGTTTGTGAGGTCGTACCAACCCCCTTGCCTCTTTGCCGGTGCTGTCTCCCCTCAGACGGATTTCAATGAGCTGGACTTGGAGACACTGGCACCCTATATCCCCATGGACGGGGAAGACTTCCAGCTAAGCCCCATCTGCCCCGAGGAGCGGCTCTTGGCGGAGAACCCACAGTCCACCCCCCAGCACTGCTTCAGTGCCATGACAAACATCTTCCAGCCACTGGCCCCTGTAGCCCCGCACAGTCCCTTCCTCCTGGACAAGTTTCAGCAGCAGCTGGAGAGCAAGAAGACAGAGCCCGAGCACCGGCCCATGTCCTCCATCTTCTTTGATGCCGGAAGCAAAGCATCCCTGCCACCGTGCTGTGGCCAGGCCAGCACCCCTCTCTCTTCCATGGGGGGCAGATCCAATACCCAGTGGCCCCCAGATCCACCATTACATTTTGGGCCCACAAAGTGGGCCGTCGGGGATCAGCGCACAGAGTTCTTGGGAGCAGCGCCGTTGGGGCCCCCTGTCTCTCCACCCCATGTCTCCACCTTCAAGACAAGGTAAGTGGCAGATACTCAGCTGTACCAGCAGGGCCGAACCGAGAGGCACCCACTAGTAAGATAGCTGGACCCCCAGGGAGGCCCCTGCCCCTCTCCCCAGCCATCTGATACCCCATTTAGCCCTTCTCTGAGCTCAGACTTTGGGGAATCACCTCAAGCCATGTGAGGCCTAGTGTAGGATGGGTTTTTATCTGGGCTGCCACTGAGGGCAGGCAAAGAAGTGGCTTGTTGAGAGCCCTGTACCTCAGTGTCTCCCTTCGGACCACCACCAGAGTGCCTTTCGTATCTCGGTTCATCATCTGAGCCACACAGAAAATTGAGTGATGATTTTCCCTGGTTGAAAACAGCAAAAAGATACCCCTGCCTCCCCTTGCCTTTTGGCTGCCCCCGGGTCCTCGCCACTGCAGCCTCTCCCAGCTGTGCCTAGGCTCCAGAAATGCCTTCCCATCTCCCCAGCATGCTCATTTCACCAGCTGCGAGCTCACTGGGCTAAGGCACAGGGGTTGGTACATGACCTGCCACTCCCAGGGGCCGCTGGTACTTGCCCTTTATAGAGCAGCCAAACTAGTTTTCAGTGGGAGCAAAAGGCAGAGGAGAGACATGGGCAGAAGAAACCCTCCTAAGGACTAACATTGCCCAGCCAGGCAGCCATCCCCCAGACCAGGAGGCTTGAGCCCTTCAGCATCTTATAGCTGAGGAAGGAGACAGAGCTCGAGCTCGGCCTGCAGGTGCACAGCCTGCCTCTGAGACTCTGCCTTTTGGGTCTTTGAGTCATCACAGGCATCAGCATTGGGACTGGAAGGGCCCCTAAGATGAGAAGGCACTGAGTGGCATGTGGCTCCAGACTCCCTCATAGCCTGCTCTCTCGGGCTTGGCAGGTCTGCAAAGGGTTTTGGGGCTCGAGGCCCAGACGTGCTGAGTCCGGCCATGGTAGCCCTCTCCAACAAGCTGAAGCTGAAGCGACAGCTGGAGTATGAAGAGCAAGCCTTCCAGGACCTGAGCGGGGTGAGTCATCCCCACTGGCCACAGGGGCCTCTCCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCAAGTGCCAGCCCTGTTCCAGGCCCACCCAACCCACCCAGTCTGGGGACCTGGTTCTCTGGCCATTTCCCCTTTCCATCTGCCCTTCTTACTCCCAGGGGGACCCACCTGGTGGCAGCACCTCACATTTGATGTGGAAACGGATGAAGAACCTCAGGGGTGGGAGCTGCCCTTTGATGCCGGACAAGCCACTGAGCGCAAATGTACCCAATGGTGAGCAGCGGCCACAGGCCTGGGCCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAGGACTGGGGCTCGGGAGCCCATCCTGGTTCTTCCATTCACCACAGGCCGTACCTGCCTCTCTGAGCCTTGTTAGAATGGGGCGATGTCCTCTGTCTCTCCCGCAGTCCCACACACCCAACTTTTCCATCTCCACTCTGACTTAGATGATGCCATCAGAGGGTCCTGAAGGTTGGCTGTAGTTCTGGT
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Task1_train_3494
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A variant found in Chromosome 2 affects EPAS1 (endothelial PAS domain protein 1). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
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Pathogenic; Erythrocytosis, familial, 4
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Task1_train_3495
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This alteration in EPAS1 (endothelial PAS domain protein 1) on Chromosome 2 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
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Pathogenic; Erythrocytosis, familial, 4
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GGTATCAGAGCTGTTTTCTTCCTTTTAGTGTTCATCCCCCAACTCCATTGAAATAAGCTCCTTGAAGGGCTTTGAGCCCCCAGCTCAGTCCCCATACAGGGCAGTAACATCCCGTATGTGGCACAGAGCTGCACAGTTTGCACAGCCCTGCTGGCCACAGCCTGTATCCTGTTTGGTCCTCAAGACAGGACAACCTGTGAAGCGACAGTAGCCTCATTTTATGATGAGGAGACTGGAATTTAGAGAGGTTGATGAATTGACCTAATTCATACAGCTTGTTAATTAGCAGCCCCTCTACAAATAGTTGTGTGGTGGAATGGAATTGAACCTTTGGGTCCAGGAAGGTATTTCTTCTTCCATGCTGGACTTCTGGGGAGACCAGTGCCATATCTTTGACTCTGTCCCCCTCCTTCCTGGCCCCTAGCCCAATAGCCCTGAAGACTATTACACATCTTTGGATAACGACCTGAAGATTGAAGTGATTGAGAAGCTCTTCGCCATGGACACAGAGGCCAAGGACCAATGCAGTACCCAGGTAGATGGCTGTGGAGATCAGGCTAGGGTGTGTGCCTGCTGTCTGGTGGACAGCAAAGGCTCACATCCATTCTTGTAGCCTCATCCCTTTGTTGTAAAGAGCAGTGGAGACGTTTGGCCAAGGCCCAGGTCCCCTAAAGAGGTAGGGGTACAGGGTAATGGAGCCTGTGGTCACCCCCTCCTCCCACTGTCAAATCCAGCTCTTCCAGCATATGTGTCTCCTACTTAGATAGCTTTCTTAGCACACATGAAAACCGAAATGATACCACTGCACCTTTCTTTAAACAGGCCCTACATTTAACAAGCATAGCCAGATGTATAAAACATGTATAAACATAGGGGACAATTAATCCCTTTATAAACACATTCATCTTGTGATTTTAAAAAAATAATCATTTTTATATGAAATGCACTTTAAAATAAATAACATCTGTTTGACAATTTTTCATTTACATAAAACTTTTCAGGAACACATTTATTACATAAGGCCAATGTTCTTGCAAAAACTATGTAAACAAGGATAAGGTAGAGGGAGGGGTACGTGTTTTACAAAACCCCAGGGAAAACCATTAATCCCCCATTTGTCTTAGTCTTGAGTTCAACCAGATTTCTGCCTTGCCACTTAGTTTGTTTCTTGATCCTACTTGGCACAAATCCCAGCTACTCTGCAAAACATGCCCAATTTTAGCTTTTCTATCACCCTCCCTCCTCAGCACTCCTGTAGTATATATCATGTGGCACTTAATCACAGCTATCTGCTTCTGCTCCTTAAAGATTGCTTAGTATTGCAGTCATTAGTCAGCTGACACCCACTGAGGGTGTCAGTCTCTGAAGTTAGAAACTGTTTTCCGCATCTGCTTGTATTCCCCTGCTTGTATCATGCGTCCGTCATGATACTGCCACCCTAAGGGATGATCTGAGTATCTGCTGATTGGAACCAAAGTCTCTGTCCCTGGGGTCTGGCTGTTAGGCTGTTACTCTGCGAGAGTCCACAGATGGACCTGGGCACTTACTGCTTGCTTAGGCCCGTGCCAGCTTACAGGAGGGAGAAGAGGACAAAAAAAAGCCACAGTGTGCACCACAGGCCTAAGCATTGTAGGACAAGGATAACCACCACAGGCTGGAGTAGGCAGGGCTGACTCTGTGGAAGAGGGGCTGCCTCGGCTTCAAGAGAGAAGGCGGGCTCCGGACAGGTGGGATGGGGAGAGGAGAACATTTCTCAATGTGCAGGGTGAAGAGGGGATAAACATGGGGGAAGGCTGGTACATGATACAAGGTCGTGTACATGACACAGCCAAGTCTGAGGTTTTCCTGATAGGCCCTCGGGAGCCAGTGGAGGCGTTTGAGCAGCACTGTGAAACAGTGCTTGAGATGAATGGCTCTGCAGGAGCTGAGTTGGAATAGTGTTTGTGAGGTCGTACCAACCCCCTTGCCTCTTTGCCGGTGCTGTCTCCCCTCAGACGGATTTCAATGAGCTGGACTTGGAGACACTGGCACCCTATATCCCCATGGACGGGGAAGACTTCCAGCTAAGCCCCATCTGCCCCGAGGAGCGGCTCTTGGCGGAGAACCCACAGTCCACCCCCCAGCACTGCTTCAGTGCCATGACAAACATCTTCCAGCCACTGGCCCCTGTAGCCCCGCACAGTCCCTTCCTCCTGGACAAGTTTCAGCAGCAGCTGGAGAGCAAGAAGACAGAGCCCGAGCACCGGCCCATGTCCTCCATCTTCTTTGATGCCGGAAGCAAAGCATCCCTGCCACCGTGCTGTGGCCAGGCCAGCACCCCTCTCTCTTCCATGGGGGGCAGATCCAATACCCAGTGGCCCCCAGATCCACCATTACATTTTGGGCCCACAAAGTGGGCCGTCGGGGATCAGCGCACAGAGTTCTTGGGAGCAGCGCCGTTGGGGCCCCCTGTCTCTCCACCCCATGTCTCCACCTTCAAGACAAGGTAAGTGGCAGATACTCAGCTGTACCAGCAGGGCCGAACCGAGAGGCACCCACTAGTAAGATAGCTGGACCCCCAGGGAGGCCCCTGCCCCTCTCCCCAGCCATCTGATACCCCATTTAGCCCTTCTCTGAGCTCAGACTTTGGGGAATCACCTCAAGCCATGTGAGGCCTAGTGTAGGATGGGTTTTTATCTGGGCTGCCACTGAGGGCAGGCAAAGAAGTGGCTTGTTGAGAGCCCTGTACCTCAGTGTCTCCCTTCGGACCACCACCAGAGTGCCTTTCGTATCTCGGTTCATCATCTGAGCCACACAGAAAATTGAGTGATGATTTTCCCTGGTTGAAAACAGCAAAAAGATACCCCTGCCTCCCCTTGCCTTTTGGCTGCCCCCGGGTCCTCGCCACTGCAGCCTCTCCCAGCTGTGCCTAGGCTCCAGAAATGCCTTCCCATCTCCCCAGCATGCTCATTTCACCAGCTGCGAGCTCACTGGGCTAAGGCACAGGGGTTGGTACATGACCTGCCACTCCCAGGGGCCGCTGGTACTTGCCCTTTATAGAGCAGCCAAACTAGTTTTCAGTGGGAGCAAAAGGCAGAGGAGAGACATGGGCAGAAGAAACCCTCCTAAGGACTAACATTGCCCAGCCAGGCAGCCATCCCCCAGACCAGGAGGCTTGAGCCCTTCAGCATCTTATAGCTGAGGAAGGAGACAGAGCTCGAGCTCGGCCTGCAGGTGCACAGCCTGCCTCTGAGACTCTGCCTTTTGGGTCTTTGAGTCATCACAGGCATCAGCATTGGGACTGGAAGGGCCCCTAAGATGAGAAGGCACTGAGTGGCATGTGGCTCCAGACTCCCTCATAGCCTGCTCTCTCGGGCTTGGCAGGTCTGCAAAGGGTTTTGGGGCTCGAGGCCCAGACGTGCTGAGTCCGGCCATGGTAGCCCTCTCCAACAAGCTGAAGCTGAAGCGACAGCTGGAGTATGAAGAGCAAGCCTTCCAGGACCTGAGCGGGGTGAGTCATCCCCACTGGCCACAGGGGCCTCTCCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCATAGCCCTTAGGGAACCCAGGGCTGCTGAGAGGGGTGGGGATGTGGCCCTTCCAAGCCAGCAAGTGCCAGCCCTGTTCCAGGCCCACCCAACCCACCCAGTCTGGGGACCTGGTTCTCTGGCCATTTCCCCTTTCCATCTGCCCTTCTTACTCCCAGGGGGACCCACCTGGTGGCAGCACCTCACATTTGATGTGGAAACGGATGAAGAACCTCAGGGGTGGGAGCTGCCCTTTGATGCCGGACAAGCCACTGAGCGCAAATGTACCCAATGGTGAGCAGCGGCCACAGGCCTGGGCCTCCTGGGGGTTCTGGTGGAAGGACTGGGGCTCGGGAGCCCATCCTGGTTCTTCCATTCACCACAGGCCGTACCTGCCTCTCTGAGCCTTGTTAGAATGGGGCGATGTCCTCTGTCTCTCCCGCAGTCCCACACACCCAACTTTTCCATCTCCACTCTGACTTAGATGATGCCATCAGAGGGTCCTGAAGGTTGGCTGTAGTTCTGGTGACTCT
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Task1_train_3496
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The gene EPAS1 (endothelial PAS domain protein 1) on Chromosome 2 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
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Pathogenic; Erythrocytosis, familial, 4
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Task1_train_3497
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This sequence variant lies in PIGF (phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class F) on Chromosome 2. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
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Pathogenic; Onychodystrophy, osteodystrophy, impaired intellectual development, and seizures syndrome
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TAAACAGAAAAGACTTAAATTATGTGTAATATATCAAACCTTTACACTCTAATGTATTGCATCATATACAAAATGATTATTATATCTTACCAACTCATTAAAGCTAATGTCCCATAGTACTTTATTTATCAATACTTTCTATTTAGATTTAATTGCATTACTTGATAGCAATGAATCTACACAGTTTCAATTTTCTGTGTATACTTTTCAATGATTTTGATTGTCCTCCAATTTAGAAATCACTGACACTCTGTTGAATGACATCAAGTATGGATGACTTCTATAAGATGTCAACTTAAGAAACCTTTACTAGCACCAAAAACTTGAGATGGGAATCTGTGACGATACACACACCAAACCTCCAAGGATTTCTCTAATATAGTGATGAAGAGTTAAAACAGGGAAGGGCAAACCTATCAGACCTATTAAACATGAAACAACAATTTGACTTTCGGGGAGACACGACATCTAACTGAAAGCACAAAGAATAGAGCTAAATGTAGGCAGTTATGTGCAAGGCACACAATCTGGATCCCACATTTGGCAAATGAGGTATGTATCAAAGATTTAATTCATCAATTCATTAGGTAGGACTCTACCCTACAGAGAAAATTGGACAAATATGCAAAGATGTATAAGTATGATAATGACCATATTTGATAATAAAATAATAATAGTAAAATAGGAAATGACCTAAATGTTCTTTAATAAAAAACTGGTACAATATTTTACACAAATAATCGAATATTACATATATGTAAGTTTTCATTGACATAGAATGAGCTCCATAATATACTGCTGAGGGGAAAAAGCAGATTAAAAACAACATGAATATTATAGTTACAGGCATGGAGAGAGACAGCTGCAAAAATTATCACCAAAAGCAAATGGAGGTTTCCTCTGGGTGGTTGGGGAGGAAAGTAATTTTTACTTTCTTCCTTAGAATTACTAATATTGCTTTAATTTTCTAAATAAATATACATTATCTTCGTGATCAGAAAAAAATTATCTTCATGTTGGAAAAAGAAAGCACATTTATTTTTTAATACCATAATTCTTTTTGGGAGTAATTACTCTGTGAACCTAATTAGAAAAATTCAAGAAGCTATAGATTCAAAGATTTTATCACAGCAGTGTTTATTATCACAAAATACTGGCAATAATCTAAATGATCAATAGTGAATTTGTTAAATAAGTTATAAAGTATATAATGGCATACTACAAAGTCATTAATATTAAGATAAAGATACAGTCATCACTGTAAGTTCAGTGACCTTGGGAATGTTACATACCCTCTAGGTGTCAGTTTCCTCATCTGTAAAATGGGTATAAAAAGAGCACTTACCTCACAGTGCTTTACCTAGCATATCAGCTTTATCTTATTGTGATACAAGACGAAAAATCTGATGTTTGTGAGCTTTCTTGATAACACAGGCCGCTGCTGCAAAAATTACCTTGCTATCTGCTTCTAAAAATTTCAAGAGGAACATTCAATTTGGCCATCAATCAAGTTCAGAAAATATGAATATAAGACCACAAGGGCAATAAATATCAAAGTTGAAAATAGGAAATTTCTGCAGCTATTAACCTAGTTTTTAAAAATTCCTATACTGGCTGGGCTCGGTGGCACACACCTGTAGTCCCAGCCACTTGGGAGGCTGAAGCAGGAAGATCGTTTAGGCCCAAGCATTAGAGGACAGCCTGGGCAAGAGAGTGAGAACCTGTCTTTTTTAAAAACAATAAACAAACCGCCTATATACAATCACAAAATAAGCTTGTTTATTCATCTACACATGTGCAAAAAATAGTGCTAGAAGATAAAACCAGGGCTACCTAGACACCTGTGGCACTGGACAGTCCCCATTAAGAAGCTGCCCAGATTACAGTGACTGATAGAAGTGGTATCCCTACTTAATTGAACAACAAAACAATTTACATATACACACTAGTTTGCTTCATCTGTTTTACTATCATTGTACAAACATTTATTTTGTTGCTTTAAGTAACTGAAACCAACCTGCCATGGTCTTTCCCAATCCAGTGGAATAGGAAGTGCTCCAAGCCATGCTCCTACAAAGCTAGAAATTGTAGTGATCTGGAGACTATTCTCCCATATGGATGTAACTCTGTGAAACACAAATTGGTACATCGTTGGTGGTATATACATGAGCTGCTGGAGAATCCAACAAGCACTAGCACACATTATCAGTATACATATATTTCCTGCTAATTTAAAATGAAAATCTCAAAATGACATATACATATTTACCATGAACTATTAATAGTTAATTGGTAAGAAGATGTAAATGTTTTCCATTGGAAAGGTAATATACAGACGCACTAGGAGTCAAACCATGTTAAAGAGCATTTGTAGAAACAGCTAAGTCTTCCACCCCTATCATCAACTCCTGGTTCCTTTCCCCACAGGCAACTGCTATTATGCTAAATTATTACATATTCTTCCAGAAATATTTTATACAGGCACAAATACACACATAATTTTGTTTTGAAGGATATATGTACATTTGCATAAATACACATGTACATATGTATATTTCTTCAAAACAAAACTCAGATGCATCATGTTATAAACCAAGTTTTGCTTGTTTTTCCTTGTTAACAGCTGTAACAGTATTCCATTGTATGGATGGTGCATCATTTATTCAACCAGTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGACGGAGTCTCACTCTGTGTCCAGGCTGGAGTGCAATGGAGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCAGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAACCTTGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGCACCCGGCCTCAACTAGTCTTTCTTACAGCACACTTCATTTATATAAACCAATTCAATTTACTTGGCAAGAAACAGGCAGAGAACAAGAACAAAGTATTTCAAAAGATCTGGTGATTCTGCCTACCGTTCCTATTTACTAAGTGCACATCTGAGAGTGTAAAGGTGGAAAGACTTAATTCTGCCATTCTCTTAGTAGGTGTTAGTTTCAGCCTGGCCCTCATAGGGTGAACACTTCATCATGTAGAACAGGAGTCTGGTTACAGTCAGGTAAAAGCCCACTGCAATGCACTAAGTGGGGTCCAAATATTCAATTGTTTAAATTGCAAGGTGAAGTTATTGAAAAGTAGCCTCTTCTAGATAGTATGGGGGAAAACATTTGTTTTGTTAGATGATTTATTTAACTAGAAACAGGCCAATTATTACACGCAAAATGTACACTGAATTTTAAAAGTCCCAAATGATGACAAGTCAGTTCACAAACCAATCCCTCTATCATCCTCCATCTCATACTCCCCAACTACACAAGATAAGAGCCTTAGCTTGTTTCCATTGAGAAGCAGGGCTAAGAACGGGCTGGAGCCAATCACATATATCCAAATTTGTACTATTTGTAGGGCTTTATTATTCTTTTTTATTTCATGTAACACCTATAAATATAAGTCAGCTTTTTCAACTAGCATTCAATAGAACAGAGATGTGTTCCAATGTTGGAAGGAAAAACTGGCCAAGTTCAATGTAAAGGGAATTGTACTATTTTAGCAATTTAAAGGATTTCCTAGGCCAATTTTTGACTACATGTGGCTGACAATGATGACTAAGCTTCAACTTAACACACACCTCCTCTATACTGTAATACATAAAGTGATGTGCCTGGAAACATAAGGTGTGGTAGAGGTTGAGAGCAGAGATTACTTTCTGTTGGGAAGAATTCACTTTTTCTATTTTATGGAACAGGAGGAAGTTCAGCTGGATTGGAAAGAATAGGTAGCATCAGGTCTTAAACTGGAGGACTGGAGAAAAGAGCTGCACTGCAGACAAGAGAACACAAGTCAGATTGCTAGAGGCCACGTGGAAGAACGAGAAATAAGGCTGGAAAAGTAGGGCAGAGTTAGGATTTTTTTTTTTTTTTTG
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Task1_train_3498
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Here is a genetic alteration in MCFD2 (multiple coagulation factor deficiency 2, ER cargo receptor complex subunit) on Chromosome 2. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
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Pathogenic; Factor 5 and Factor VIII, combined deficiency of, 2
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Task1_train_3499
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A variant was discovered in gene MCFD2 (multiple coagulation factor deficiency 2, ER cargo receptor complex subunit), Chromosome 2. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
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Pathogenic; Factor 5 and Factor VIII, combined deficiency of, 2
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AGGAAAATGTGGGAAAGTTTGGAACTTCCTACAGACTTGTTGAATGGCTTTGCCCCAAATGCTGATAGCAATATGGACAACAAAGTCCAGGCTGAGGTGGCCTCAGATGAAGATGAGGAACTTGTTGGGAACTGGAGTAAAGGTGACTCTTGTTATGTTTTAGCAAAGAGACTGGCAGCATTTTGCCCCTTCCATAGGGATTTGTGGAACTTTGAACTTGAGAGAGATGATTTAGGTTAACTAGCGGAAGAAATTTCTAAGCAGCAAAGTGTTCAACAGGTGACTTGGGTGCTTTTAAAGGCATTCCCTTATAAATAAGGGAAGCAAAGCATAAAAGTTTGGAAATTTGCAGCCTGACTATGCAATAGAAAAGAAAAACCCATTTTCTGGGGAGAAATTCAAGCCAGCTGCAGAAATTTGCATAAGTAGCAAGGAGCCTAATGTTAATCCCCAACACCATGGGGAAAATGTCTCCAGGCCATGTCAGGGCAGCCCCTGACATGTGTGTGCAGCCTAGGGACTTGGTGTCTTGTGTCCCAGCCACTCCAGCCATGGCTGAAAGGGGCCAACATACAGCTCGGGCTGTGGCTTCAGAGTGGAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCTATGTGCTGTTAAGCCTGCAGGTGCACAGAAGTCAAGAATTGAGATTTGGAAACCTCCGCCTAGTTTTCAGAAGATGTATGGAAATGCCTCAATGCCCAGGCAAACGTTTGCTGCAGGGGAGAGGCCCTCTCAGCGGCAGGGGAGAGAACCTCTGCTAGGGCAGTGCAGAAGGGAAATGTGGTGTGGGAGCCCCCACACAGAGTCCCTACTGGGGCACTGCCTAGTGGAGCTGTGAGAAGAGGGCCACCGTCCTCCAGACCCCAGAATGGTAGATCCACCAACAGCTTGCACCGTGCACCTGGAAAAGCCGCAGGCACTGAACAACAGCCGTGAAAGCAGCCAGGAGGGAGGCTGTACCCTACAAAGCCACAGGGGCAGAGCTGCCCAAGACCATGGGAACCCACTTCTTGCATCAGTATGACCTGGATGTGAGACCTGGAGTCAAAGGAGATTATTCTGGAACTTTAAAATTTGACAGCCCTGCTGGATTTCGGACTTGCATGGGCCCTGTAACCCCTTTATTTTGGCCAATTTCTCCCATTTGGAACAGCCGTCTTTAATCAATACCTGTACCCCTGTTGGTATCTAGGAAGTAACTAGCTTGCTTTTGATTTTACAGGCTCATAGGTGGAAGGGACTTGCCTTGTCTCAGATGAGACTTTGGACTGTGGATTTTTGCGTTAATGCTGAAAAGAGTTAAGACTTTGGGGGACTGTTAGGAAGGCATGATTGGTTTTGAATAGTGAGGACATGAGATTTGGAGGGGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGGCTATGTCCCCACCCAAATCTCAACTTGAAATTGTATCTACCAGAATTCCCACGTGTTGTGGGAGAGACCCAAGGGGAGGTAATTGAATCATGGGGGCCAGTCTTTCCCATGCTATTCTTGTGATAGTGAATAAGTTTCACAAGATCTGATGGCTTATCAGGGGTTTCCACTTTTGCTTCTTCCTCATTTTCTCTTGCTGCCATGTAAGAAGTGCCTTTCACCTCCCGCCATGATTCTGAGGCCTCCCCAGCCATGTGGAACTGTAAGTCCAAGTAAACCTCTTTTTCTTCCCAGTCTCGGGTACGTCTTTATCAGCAGCATTAATACAGACTAATACAGATGCTTGAAGCAAGCCCTTGTCCAATAAGGTATTTAATAGCACTTAGGGACTATTAGATGTCCCATTTCTCTTCTCTTTCATTTCTCTTATCTCTTCTCACCCCAGTGTAACGAATCGCTACAGGTTTTTACCAAAATGCTGCAGCAGTAGTTGGAAATGAGTTATTTTGCATTACTAAAGTGTTCAATCACATTATCACGGGTCACATTTGTATATAACCAGGAGATGGCCAAATAACATCTACTGCAGTGATTTTGCAAATTCAGCATAGTCAATGTATCCATCATTGTTCTTGTCATCATCTCTCAAAACACCATCTATTATGTTAATCAGTTCATCTTCACTCATTAGTGGTGCCTGTTCACTCCCTTCCTACAAAATACAAATTAGACAATGATGAGTTGCGCATTTTACCGGAAGAAGTGCTTAACTAACGTCCAAAATATCCATGTTCTTTCATGGCACTGTTTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAACAAAACAACAAAATATCCACGCTCATATGTGTCCAAAAACTTTCAATGGAGTATGGGGCTACTTCTAGGAATCTAGATATATAGAGAGAGAATATGTATTATTGAGTCAATTTATCATAATCCAGTTTAGAAATTACATTTGCCAGTTAAAAGAAGGCCCTTCAAAATAGGCTTTTGCTTATTTGTTTCATTATGGCTCATTCTTCTTTAATTGGAAAAGTGCCAGTCCTCCTGAGGGTCAGCTCTGTGCACAAATTTGCCTGATAAAATAGAAACAGTGACGAATTGGACAACAAGTTGGCATCAAAACAAGAGGAAGAAGGCACTGCCGATGAGCAGAACCTGTTATGATCTTTGAGGAGAAAGTATTTCCCATGCTCCAAGAGCAGGGTTAGTGGGCTGAGGCTGTTCACATCCTTGGCTGGTTCTTCCTTTGCCACATCTCCCACATTCACCATTCCCTCTCCTGTCACCACCACTATCCTCATCTGCCAGGACTGCTGACCCCTAATTCCTCCGCCTAACACTAGTCTCTCCTCATGTCCTTCAGTCTGTCTCCCACAACCAAGGATCTTCCCTAAACAATGCCATTCTCCTGTGCAAAATCATTCATGCTCCCTGCTGCCTTCAAACCTCACCTGCACTCCTAGCAGCGAATGTAATCCCACTCACCTGGCTAACTTTGCCTTGCTTCCTCTCTATAGAGGGCAGTGTGGCAGAAGGGGAATGACATTAAATGTGGAGGCACGAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTGACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTCCAGTAGCACGATCACAGCTCACTGCAGCCTCGACCTCCCAGGCTCAGGTGTTCCTCCCCACTACCCTCCCACCCCGTCACCCCAGCAGCTGGGATTACAGGCAAGCATCACTATGTCCAGCTAATTTTTGTAGAGACGGGATATCACCATGCTGCCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTCAACCTCCCAAAGTGCTGGGATAATAGGCATGAGCCACTGTGCTTAGCCTGGCACAAGATCTTGATTTCAGTGTCTTCACCTAGAAAATGGGAGGGTTTTGTTTGTTTTTTGTTTTCTGAGACAGGATCTCGCTCTATTGCCCAGGCTGGAATTCAGTGGCAACATCGCAGCTTGCCACAGCCTCAACCTCTCAGGTTCAAGTGATCCTCCTACTTCAGCATCATGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACTGAAAATGGAAGTATTAACAATGCCTGCCACTGCCTACTCAAGATGTTGCAAAGATCCAACGAGATCTCTAACCTACTTGAAAGGGCTTCAGAAACTTTGGAGCACCATACAGTATCACACAAGCCCTCAATTACTGCCACGTCCCTGAATCCCTTGGTGTCAATTCACCATTAAACAACTTCTCCCTTGCTCTGCAGTTTGAATACGGTCTGTCTTTTAGGCACTGATTCTCATACTCTGGTGTGTAACAGAAATGCCTGTAGCACTTAAAGATACAAATGCCCAGCCCTGGGACTTCTGCCTCAGCAAGTTATCCTTTGCGGGAAGGATCGTTGGACAGAAAGAGGCAGAACACAGAAGAGAAAGAAGCAGCAGCACCTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTCTCTTTTTGAGACAAGGCCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCGGTGGCATGATTATGGCTCACTATAGCCTCGACATCCTGGACTCAAGCAATCCTCCCACCTTAGCCTCCTGAGTACGTAGAACTACGGGCATGCACTACCAGGCCTGGCTAATTTTTTAATTTTT
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